TrkB

TrkB
PDB 1hcf.
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB 1HCF, 1WWB, 2MFQ, 4ASZ, 4AT3, 4AT4, 4AT5
Идентификаторы
Символ	NTRK2 ; GP145-TrkB; TRKB; trk-B
Внешние ID	OMIM: 600456 MGI: 97384 HomoloGene: 4504 ChEMBL: 4898 GeneCards: Ген NTRK2
номер EC	2.7.10.1
Генная онтология Функция • ATP binding • protein homodimerization activity • neurotrophin binding • brain-derived neurotrophic factor binding • brain-derived neurotrophic factor-activated receptor activity Компонент клетки • cytosol • integral component of plasma membrane • endosome membrane • terminal bouton • receptor complex • postsynaptic membrane • neuronal postsynaptic density Биологический процесс • vasculogenesis • neuron migration • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway • activation of adenylate cyclase activity • neuromuscular junction development • learning • circadian rhythm • feeding behavior • positive regulation of cell proliferation • positive regulation of gene expression • positive regulation of neuron projection development • glutamate secretion • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • peptidyl-tyrosine phosphorylation • central nervous system neuron development • cerebral cortex development • neuron differentiation • brain-derived neurotrophic factor receptor signaling pathway • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source • mechanoreceptor differentiation • regulation of GTPase activity • positive regulation of MAPK cascade • negative regulation of neuron apoptotic process • retinal rod cell development • protein autophosphorylation • neurotrophin TRK receptor signaling pathway • oligodendrocyte differentiation • peripheral nervous system neuron development • positive regulation of axonogenesis • regulation of protein kinase B signaling • positive regulation of synapse assembly • long-term synaptic potentiation • negative regulation of anoikis Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
Вид	Человек	Мышь
Entrez	4915	18212
Ensembl	ENSG00000148053	ENSMUSG00000055254
UniProt	Q16620	P15209
RefSeq (мРНК)	NM_001007097	NM_001025074
RefSeq (белок)	NP_001007098	NP_001020245
Локус (UCSC)	Chr 9: 84.67 – 85.03 Mb	Chr 13: 58.81 – 59.13 Mb
Поиск в PubMed	Искать	Искать

TrkB, тропомиозиновый тирозинкиназный рецептор (также известный как тирозинкиназный рецептор B, рецептор ростовых факторов BDNF/NT-3) — белок, кодируемый у человека геном NTRK2. В основном выступает в роли рецептора нейротропного фактора мозга (BDNF)

Функции

Тропомиозиновый тирозинкиназный рецептор B является каталитическим рецептором некоторых нейротропинов (маленьких белков, повышающих выживаемость определенных клеточных популяций). Нейротропины, активирующие TrkB -— BDNF, NT-4 и NT-3. В связи с этим TrkB влияет на различные процессы, например, на дифференцировку и выживание нейронов. Исследования показали, что активация TrkB ингибирует KCC2 — белок-транспортер хлорид-ионов в клетках центральной нервной системы.

TrkB — часть большой группы рецепторов-тирозинкиназ. Тирозинкиназа — это фермент, способен присоединять фосфат к конкретным тирозинам на белках-мишенях. TrkB расположен на клеточной мембране и активируется присоединением лиганда к внеклеточной части белка. Другие примеры тирозинкиназных рецепторов включают в себя рецептор инсулина, рецептор IGF1, рецептор белка MuSK, VEGF-рецептор и другие.

На данный момент в ЦНС млекопитающих открыто три вида TrkB. Длинный белок TK+ — типичный тирозинкиназный рецептор, преобразовывающий сигнал BDNF через Ras-ERK, PI3K и PLCy. В отличие от него, два укороченных варианта (TK-: T1 и T2) обладают таким же внеклеточным участком, трансмембранным участком и 12-ю первыми внутриклеточными аминокислотами, как и TK+. Однако C-терминальные последовательности разные у разных изоформ (11 аминокислот у ТК+ и 9 аминокислот ТК-). Тем не менее, T1 способен запускать стандартный сигнальный каскад, участвующий в регуляции клеточной морфологии и вхождения в клетку ионов кальция.

Активация TrkB

Группа рецепторов

TrkB — часть семейства белков-киназ, включающего также TrkA и TrkC. Существуют другие нейротрофические факторы структурно родственные BDNF: NGF, NT-3, NT-4. TrkB связывает BNDF и NT-4 лучше, чем NT-3, в отличие от TrkC.