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WO2001014552A1 - Proteine meg-1 - Google Patents

Proteine meg-1 Download PDF

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Publication number
WO2001014552A1
WO2001014552A1 PCT/JP2000/005551 JP0005551W WO0114552A1 WO 2001014552 A1 WO2001014552 A1 WO 2001014552A1 JP 0005551 W JP0005551 W JP 0005551W WO 0114552 A1 WO0114552 A1 WO 0114552A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
protein
meg
seq
cells
polynucleotide
Prior art date
Application number
PCT/JP2000/005551
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
Toshio Miyata
Original Assignee
Kurokawa, Kiyoshi
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Kurokawa, Kiyoshi filed Critical Kurokawa, Kiyoshi
Priority to EP00953507A priority Critical patent/EP1209231A4/en
Priority to KR1020027002058A priority patent/KR20020033763A/ko
Priority to CA002376404A priority patent/CA2376404A1/en
Priority to AU65965/00A priority patent/AU776341B2/en
Publication of WO2001014552A1 publication Critical patent/WO2001014552A1/ja
Priority to NO20020794A priority patent/NO20020794L/no

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides

Definitions

  • the present invention belongs to the field of genetic engineering, and in particular, relates to the isolation of genes of kidney cells. Background art
  • Mesangial cells (mesangi al cell) play a central role in maintaining the structure and function of renal glomeruli. And mesangial cells also have central pathophysiological significance in various types of nephritis. For example, proliferation of mesangial cells and accumulation of extracellular glomerular interstitial matrix are important pathological findings of glomerulosclerosis in patients with various glomerular diseases such as chronic nephritis and diabetic nephropathy. Therefore, finding genes that are expressed in mesangial cells and elucidating their functions is necessary to elucidate the biological properties of mesangial cells, to investigate the causes of diseases associated with mesangial cells, and, consequently, to relate to mesangial cells. It is effective for treating and diagnosing diseases.
  • Thyl antigen is known as a marker of mesangial cells in rats.
  • this gene is not specific to mesangial cells and is not expressed in mesangial cells in humans (Miyata T. et al., Immunology (1989); 67: 531-533; Miyata T. et. al., Immunology (1990); 69: 391-395).
  • mesangial cells express splenic muscle actin when activated. The gene is not mesangial cell-specific. Thus, there has been no report on genes characteristic of mesangial cells.
  • the present inventors have previously reported megsin as a protein specifically expressed in mesangial cells (J. Clin. Invest, 1998 Aug 15, 120: 4, 828-36). .
  • the present invention relates to a novel protein having a structure clearly different from that of megsin. Disclosure of the invention
  • An object of the present invention is to isolate a gene that is highly expressed in mesangial cells.
  • the present inventors isolated niRNA from an in vitro culture of human mesangial cells and created a 3 'cDNA library. Then, a large number of clones contained in this cDNA library were randomly selected and their nucleotide sequences were determined. Then, by comparing the determined nucleotide sequence with the nucleotide sequences of known 3 ′ cDNA clones obtained from various organs and cells, a clone specifically expressed in mesangial cells was selected. . Among them, one clone, which appeared particularly frequently in mesangial cells, was selected, and the full length 0 ⁇ (3928 &) was isolated by the 5'11 ⁇ 26 method.
  • the present invention was completed by determining the entire nucleotide sequence of this full-length cDNA. We also clarified the translation initiation codon of Kozak and estimated the open reading frame (0RF). The present inventor has named the protein according to the present invention having this putative amino acid sequence as Meg-1 (Meg-1).
  • the nucleotide sequence of cDNA of human Meg-1 is shown in SEQ ID NO: 1
  • the deduced amino acid sequence of human Meg-1 is shown in SEQ ID NO: 2.
  • the amino acid sequence was homology-searched with the amino acid sequence of the Database Database to confirm that Meg-1 was a novel protein. Further, when a motif search was performed on the deduced amino acid sequence of Meg-11 of the present invention, a motif common to many known protein phosphatases was found. Also, nuclear localization The signal (nuclear local izat ion signal) score was high, suggesting that it may be a nuclear protein.
  • the present invention specifically relates to the following polynucleotides, proteins, and uses thereof.
  • a protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 with one or more amino acids substituted, deleted, inserted, and / or added, and comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2
  • [2] a protein encoded by any of the polynucleotides of [1].
  • [3] A vector comprising any of the polynucleotides according to [1].
  • an oligonucleotide having a chain length of 15 nucleotides or more, consisting of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1 or a nucleotide sequence complementary to the complementary strand thereof;
  • a reagent for detecting mesangial cells comprising the oligonucleotide according to [6].
  • a method for detecting mesangial proliferative nephritis by measuring the expression level of the polynucleotide according to [1] in a biological sample and comparing the measured value with a measured value obtained from a normal sample.
  • the present inventors used a 3'-region cDNA library (3'-directed cDNA library). By this method, fluctuations in cloning efficiency reflecting the size of the cDNA can be avoided.
  • the sequence of the 3 'region is gene-specific and about 200-300 bp of sequence data is sufficient to characterize the gene (Yasuda, Y., Miyata, T. et al., Kidney Int, 1998 Jan, 53: 1, 154-8).
  • the polynucleotide encoding human Meg-1 of the present invention can be obtained by preparing mRNA from mesangial cells and converting it to double-stranded cDNA by a known method.
  • mRNA is prepared by the guanidine isothiosinate-cesium chloride method [Chirwin, et al. Biochemistry 18, 5294 (1979)], the method of treating with detergent and phenol in the presence of deoxyribonuclease [ Berger & Birkenmeier, Biochemistry 18, 5143 (1979)].
  • Preparation of poly (A) + RNA from total RNA can be carried out by affinity chromatography using a carrier (eg, sepharose, cellulose, latex particles, etc.) to which oligo (dT) is bound.
  • a carrier eg, sepharose, cellulose, latex particles, etc.
  • poly (A) at the 3 'end The cDNA can be obtained by reverse transcriptase treatment using oligo (dT) complementary to the strand, a random primer, or a synthetic oligonucleotide corresponding to a part of the amino acid sequence of Meg-11 as a primer. it can.
  • a hybrid mRNA composed of mRNA and its complementary cDNA is partially cut with E. coli RNase H, and cDNA (2nd str and) is digested with E. coli DNA polymerase I using this as a primer. Synthesized.
  • double-stranded cDNA can be obtained by treatment with E. coli DNA ligase.
  • mesangial cell poly (A) + RNA can be cloned into a rectangular form by RT-PCR.
  • a probe can be synthesized based on the human Meg-1 gene base sequence and the cDNA library can be directly screened to obtain the desired cDNA.
  • the gene of the present invention can be selected from the genes obtained by these methods by confirming the nucleotide sequence of the gene. For homologues of Meg-11 in non-human species such as mouse and rat, cDNA can be obtained by the same method.
  • the cDNA of the homologue of Meg-1 can be isolated by the following method. That is, a cDNA library is screened by colony hybridization or plaque hybridization using the nucleotide sequence of the human Meg-l cDNA as a probe, and cDNA encoding a homolog of Meg-1 is isolated. Can be released.
  • the cDNA library can synthesize mRNA extracted from mouse and rat tissues, cultured mesangial cells, etc. as type III. Alternatively, a commercially available cDNA library (such as Funakoshi) can also be used.
  • a method of designing a digenerating primer before and after 0RF based on the cDNA of human Meg-1 according to the present invention and amplifying a homologous cDNA by PCR using the primer may also be used. It can.
  • the Examples disclose homologues of Meg-1 in rats obtained by such a method.
  • the human Meg-1 genome can be obtained by screening a genomic library.
  • a genomic library can be synthesized, for example, by preparing a genome from human B lymphoblasts and incorporating DNA partially digested with Sau3 into a phage vector EMBL3 (Blood, vol 83, No 11, 1994). : pp 3126-3131).
  • a clone containing the target genome can be obtained.
  • the entire 0RF region (2850 bp) of the Megu1 cDNA or each exon-intron portion obtained by amplifying human genomic DNA by PCR using the cDNA portion as a primer can be used.
  • the regulatory region the 5 'RACE method (5'-Full RACE Core Set (Takara Shuzo Co., Ltd.)) was used, using mRNA from human cultured mesangial cells or human kidney niRNA (purchased from Clontech) as type III. Accordingly, 5) UTR can be sequenced using)).
  • the gene of the present invention can be obtained, for example, by the phosphoramidite method [Mattencci, MD & Caruthers, MHJ Am. Chem. Soc. 103, 3185 (1981)], the phosphite 'triester method [Hunkapiller,. Et al. Nature 310, 105 (1984)]. ] Can also be produced according to a conventional method using chemical synthesis of nucleic acids.
  • eukaryotic genes often show polymorphism, as is known for the human interferon gene. Due to this polymorphism, protein activity is usually maintained even if one or more amino acid substitutions occur in the amino acid sequence. In general, it is known that protein activity is often maintained by modification of one or several amino acids. Therefore, a polynucleotide encoding a protein obtained by artificially modifying the gene encoding the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 is characterized in that the protein is a characteristic of the gene of the present invention. As long as it has a proper function, it is all included in the present invention. Also shown in SEQ ID NO: 2 Any protein whose amino acid sequence is artificially modified is included in the present invention as long as it has the characteristics of the protein of the present invention.
  • the protein of the present invention includes the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 or an amino acid sequence in which one or more amino acids are substituted, deleted, added, and Z or inserted in these amino acid sequences, It includes proteins functionally equivalent to Meg-1 according to the present invention.
  • functionally equivalent means
  • Meg-1 has, in its amino acid sequence, a homology of 20-30% with the A unit (regulatory unit) of peptide tin phosphatase 2 A (PP2A) of not only human but also various species .
  • a unit regulatory unit
  • PP2A peptide tin phosphatase 2 A
  • C unit catalytic unit with enzymatic activity
  • B unit another regulatory unit specific for tissue and cells
  • a unit and C unit have a common structure between tissues and cells
  • B unit has a structure specific to tissues and cells.
  • the Bunit having the homology with PP2A and having the Meg-1 of the present invention as an Aunit may be a protein specific to mesangial cells. It is considered that the B unit, which uses Meg-1 as the A unit, is associated with a mesangial cell-specific activity control mechanism different from PP 2 A.
  • Meg-11 were characteristically highly expressed in primary cultured cells of mesangium. In other primary cultured cells, expression was observed in dermal fibroblasts / renal cortical epithelial cells, and slight expression was observed in umbilical vein endothelial cells and smooth muscle cells. In tissue-to-tissue comparisons, high expression was observed in the heart and placenta, then in the brain, skeletal muscle, kidney and knee. In addition, weak expression was observed in the liver, and no expression was observed in the lung.
  • HeLa cells S3 Strong expression was observed in chronic myeloid leukemia K-562, lymphoblastic leukemia MOLT-4, colorectal adenocarcinoma SW480, and lung cancer A549, and expression was also observed in promyelocytic leukemia HL-60 and melanoma G361. In Burki tt lymphoma Raj i, almost no expression was observed.
  • Expression analysis of rat Meg-1 in rats revealed that Meg-1 is highly expressed in kidneys (especially mesangial cells) commonly in humans and rats, and is involved in the function of mesangial cells. It is possible that this is one of the functional genes to perform.
  • the expression status of Meg-1 in each tissue or cultured cell can be determined by, for example, performing a Northern blot assay using a probe having a nucleotide sequence selected from SEQ ID NO: 1 and using mRNA prepared from each tissue as a sample. Can be.
  • Meg-11 All proteins having functionally equivalent biological characteristics as described above constitute Meg-11 according to the present invention. Therefore, not only human Meg-1 whose structure has been specifically clarified, but also homologs of other structurally or functionally equivalent species are included in the present invention.
  • PP4R is a protein reported as a human homolog of the protein serine Z-threonine phosphatase 4-regulated unit isolated from the small intestine of the Pacific.
  • S present at position 18 from the N-terminus of PP4 R1 is 18 amino acid residues of FGVDDYSSESDVI I IPSA in Meg-1 and both are proteins with different structures.
  • PP4 RI is a protein isolated neural epithelial cell-derived based on the Amino acid sequence of the protein from ⁇ shea intestine Thus, they are different proteins. From Rukoto amino acid sequences that differ between the two is not continuous, Aisofu ohmic potentially Ya splice variants are contemplated to be encoded into a plurality of genes each other and Meg one 1 and PP4 R1.
  • the polynucleotide of the present invention includes polynucleotides encoding these functionally equivalent proteins.
  • Polynucleotides encoding these proteins can be not only cDNA but also genomic DNA, synthetic DNA, RNA, and artificial polynucleotide molecules composed of nucleotide derivatives.
  • the codon for the desired amino acid is known per se, and its selection may be arbitrary, for example, it can be determined according to a conventional method in consideration of the frequency of codon usage of the host to be used [Grantham, R. et al. Ucleic Acids Res. 9, r43 (1981)]. Therefore, those in which the base is appropriately modified in consideration of the degeneracy of codons are also included in the polynucleotide of the present invention.
  • a site-specific mutagenesis method using a primer comprising a synthetic oligonucleotide encoding a desired modification (Mark, DF et al. Pro Natl. Acad. Sci. USA 81,5662 (1984)), etc.
  • the codons of these nucleotide sequences can be partially modified.
  • the polynucleotide Nucleotides are included in the polynucleotide according to the present invention. Many sequences that can hybridize to a specific sequence under stringent conditions are likely to have activities similar to the protein encoded by the specific sequence. Stringent conditions generally indicate the following conditions. That is, 4 XSS (;, hybridized with 65, and washed with 0.1 XSSC for 1 hour with 65T: 1 hour.
  • the temperature conditions can be adjusted according to the melting temperature (Tm), where Tm is the proportion of the constituent base in the hybridizing base pairs, and the composition of the hybridization solution (salt concentration, sodium formamide-dodecyl sulfate sodium). Therefore, a person skilled in the art can empirically set conditions that give equivalent stringency in consideration of these conditions.
  • Tm melting temperature
  • the nucleotide sequence of the polynucleotide according to the present invention, including the mutant, can be used for various purposes based on known techniques.
  • the polynucleotide encoding Meg-1 cloned in this way can be transformed into another prokaryotic or eukaryotic host by incorporating it into the appropriate expression vector DNA. it can. Furthermore, by introducing an appropriate promoter and a sequence relating to expression into these expression vectors, it is possible to express the gene in each host cell.
  • expression vectors include ET-3 [Studier & offatt, J. Mol. Biol. 189, 113 (1986)] for E. coli, and pEF-BOS [Nucleic Acids Research 18 for COS cells]. , 5322 (1990)], pS V2-gpt [Mulligan & Berg, Pro Natl. Acad. Sci.
  • Prokaryotic host cells among the hosts used in the expression system of the present invention include, for example, Escherichia coli.
  • examples of host cells for eukaryotic microorganisms include Saccharomyces cerevisiae.
  • host cells derived from mammals include, for example, COS cells, CH0 cells, BHK cells and the like.
  • the transformant of the present invention may be cultured by appropriately selecting culture conditions suitable for the host cell.
  • the transformant transformed with the polynucleotide encoding Meg-1 as described above is cultured, and the produced Meg-1 is isolated from the inside or outside of the cell and purified to a uniform protein. can do.
  • the purpose of the present invention is to Separation and purification of meg-1 which is a protein can be carried out by using the separation and purification methods used for ordinary proteins, and is not limited at all. For example, if various chromatographic proteins are appropriately selected and combined, Meg-1 can be separated and purified.
  • a recombinant vector containing the gene, a transformant using the vector, and a processing means for gene manipulation in the process of producing Meg-11 using the gene This can be carried out according to a conventional method described in “Molecule Coloring-A Laboratory Manual j (Cold Spring Harbor Laboratory, NY)”.
  • a probe for detecting the Meg-11 gene can be designed based on the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1.
  • a primer for amplifying DNA or RNA containing these nucleotide sequences can be designed. Designing probes and primers based on a given base sequence is routinely performed by those skilled in the art. Oligonucleotides having the designed base sequence can be obtained by chemical synthesis. If an appropriate label is added to the oligonucleotide, it can be used for hybridization assays of various formats. Alternatively, it can be used for a nucleic acid synthesis reaction such as PCR. Oligonucleotides used for probes and primers should have a length of at least 15 bases, preferably 25-50 bases.
  • the present invention provides a polynucleotide comprising the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, or a polynucleotide comprising at least 15 nucleotides complementary to a complementary strand thereof.
  • the “complementary strand” refers to one strand of a double-stranded polynucleotide consisting of A: T (replaced by T in RNA) and G: C base pair with respect to the other strand.
  • “complementary” is defined as complete at least 15 contiguous nucleotide regions. It is not limited to the case where they are completely complementary sequences, and they may have at least 70%, preferably at least 80%, more preferably 90%, even more preferably 95% or more homology on the base sequence.
  • the homology of the nucleotide sequences can be determined by the algorithm described in the present specification. Since Meg-11 exhibits high expression in mesangial cells, the probes and primers for detecting the Meg-11 gene according to the present invention can be used for identification and detection of mesangial cells. In particular, primers are also useful in the amplification of the Meg-1 gene.
  • the oligonucleotide according to the present invention can be provided with a label or a binding tag as necessary.
  • the present invention also provides a method for detecting mesangial proliferative nephritis using the expression level of Meg-11 as an index.
  • the expression of the polynucleotide of the present invention is enhanced in mesangial cells of renal tissue that has developed mesangial proliferative nephritis. This is supported by the fact that in the Examples, strong expression of rat Meg-1 mRNA was observed in mesangial cells of rats in which mesangial proliferative nephritis was induced by administration of the anti-Thyl monoclonal antibody.
  • the expression level of Meg-1 in a biological sample is measured, and when the expression is enhanced as compared with the measurement result of a normal biological sample, mesangial proliferative nephritis can be detected.
  • mesangial cells, urine, blood, and the like can be used as a biological sample.
  • the expression level of Meg-11 can be compared by measuring the mRNA, its translation product, Meg-11 protein, or fragments thereof. Methods for measuring these components in a biological sample are known. For example, Meg-l mRNA can be detected or measured by Northern blotting-RT-PCR. Meg-11 protein and fragments thereof can be detected by an antibody that recognizes Meg-11.
  • an antisense polynucleotide capable of controlling the expression of Meg-1 based on the nucleotide sequence of the gene encoding Meg-1 disclosed by the present invention is provided.
  • the antisense polynucleotide of the present invention is an important tool for elucidating the role of meg-1 in mesangial cells. Alternatively, it is useful for controlling the disease state caused by the increased expression of Meg-1.
  • the effect of the antisense polynucleotide on suppressing the expression of the target gene includes several factors as follows.
  • inhibition of transcription initiation by triplex formation suppression of transcription by hybrid formation with a site where an open loop structure was locally formed by RNA polymerase, inhibition of transcription by hybrid formation with RNA that is undergoing synthesis, and intron Inhibition of splicing by hybridization at the junction with the exon, inhibition of splicing by hybridization to the spliceosome-forming site, inhibition of translocation from the nucleus to the cytoplasm by hybridization to mRNA, cabling site and poly
  • A Inhibition of splicing by formation of a hybrid with an addition site, suppression of translation initiation by formation of a hybrid with a translation initiation factor binding site, suppression of translation by formation of a hybrid with a ribosome binding site near the start codon, translation region of mRNA ⁇ polysomal binding Hybrid type with parts Outgrowth inhibitory to the protein chains by, and gene silencing by Haiburitsudo forming the interaction site between a nucleic acid and protein, and the like.
  • the antisense sequence used in the present invention may suppress the expression of the target gene by any of the above actions.
  • designing an antisense sequence that is complementary to the untranslated region near the 5 'end of the gene mRNA would be effective in inhibiting translation of the gene.
  • a sequence complementary to the coding region or the 3 'untranslated region may be used.
  • the polynucleotide containing the antisense sequence of the sequence of the untranslated region as well as the translated region of the gene can be used as the antisense polynucleotide used in the present invention. Included in leotide.
  • the antisense polynucleotide to be used is ligated downstream of a suitable promoter, and preferably a sequence containing a transcription termination signal is ligated on the 3 'side.
  • the DNA thus prepared can be transformed into a desired host by a known method.
  • the sequence of the antisense polynucleotide is preferably a sequence complementary to an endogenous gene (or a homologous gene thereof) or a part thereof of the host to be transformed, but it is preferable that the sequence be able to effectively inhibit gene expression. However, they need not be completely complementary.
  • the RNA transcribed with the antisense polynucleotide as a type III is designed to have preferably 90, most preferably 95 complementarity to the transcript of the target gene.
  • the length of the antisense polynucleotide is at least 15 bases or more, preferably 100 bases or more, and more preferably 500 bases or more. It is. Usually, the length of the antisense RNA used is less than 2.5 kb.
  • a promoter region is a DNA region that controls the expression of a gene existing upstream of a transcription start site
  • an enhancer region is a DNA region that controls the expression of a gene present in an intron or 3 ′ UTR.
  • the promoter region can be obtained, for example, by the following method.
  • the upstream portion of the Meg-1 gene which contains 5 ′ end and 3 ′ end sequentially by restriction enzyme digestion or by PCR, so as to include each possible position of the promoter region, DNA fragments corresponding to various sites are prepared, and downstream of these DNA fragments, a CAT gene or a luciferase gene as a reporter gene is linked to construct a repo overnight plasmid.
  • the enhancer region in the 3 'UTR and intron is prepared by using the Meg-lcDNA as a probe, cloning the genomic gene of human Meg-1 from the human genomic library, and proceeding in the same manner as described above for the promoter.
  • a region having an enhancer activity can be obtained.
  • the transcription factors that control the expression of the Meg-1 gene include “New Cell Engineering Experimental Protocol (Shujunsha)”, “Biomanual Series 5 Transcription Factor Research Method (Yodosha)”, “DNA & Cell” Biology, 13, 731-742 (1994) ”, for example, a method using an affinity column, a Southwestern method, a footprinting method, and the like. It can be obtained by the gelling method, the gel shift method, or the one-hybrid method.
  • a transcription factor is a factor that regulates transcription of the Meg-1 gene, and includes a transcription initiation factor that induces a transcription initiation reaction and a transcription regulation factor that regulates transcription positively or negatively. As expected.
  • the nuclear extract is applied to the column obtained by the above method, in which the promoter region and enhancer region are immobilized on Sepharose or latex beads, and the column is washed and then immobilized on the column.
  • a transcription factor controlling the expression of the Meg-1 gene can be obtained.
  • the expression product of cDNA inserted into an E. coli expression vector (eg, ⁇ gtll) is screened with a labeled probe.
  • cDNA to be screened is expressed as a fusion protein with / 3-galactosidase, and this is adsorbed to a nitrocellulose membrane. Then, using the DNA fragment of the promoter region and the enhancer region labeled with a radioisotope as a probe, selecting a phage that synthesizes a fusion protein having a binding activity, the transcription factor controlling the expression of the Megu 1 gene is determined. Obtainable.
  • the gel shift method is based on the phenomenon that when free DNA binds to a protein, it causes a difference in the electrophoretic mobility of the polyacrylamide gel.
  • the gel shift method can separate transcription factors from a mixture of proteins with high sensitivity.
  • the binding site of the transcription factor can be determined. Footprinting protects against DNase I digestion when proteins bind to DNA Utilize the phenomenon. That is, the DNA of the promoter region, which is labeled with 32 P at the end, is partially digested with DNase I in the presence of a transcription factor, and separated on a denaturing polyacrylamide gel for nucleotide sequence determination. Compared to the result of performing the same treatment in the absence of the transcription factor, the disappearance of the band due to the binding of the transcription factor is observed, so that the binding site can be estimated.
  • the present invention also provides an antibody that recognizes Meg-1.
  • the antibodies of the present invention include, for example, antibodies against a protein having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2.
  • An antibody eg, a polyclonal antibody, a monoclonal antibody
  • an antiserum against Meg-1 or a partial peptide of Meg-1 of the present invention may be a Meg-1 of the present invention, a partial peptide of Meg-1 of the present invention or Using a fusion protein such as C-myc- (His) 6 -Tag-Meg-1 or MBP-Meg-1 as an antigen, it can be produced according to a known antibody or antiserum production method.
  • the meg-1 of the present invention or the partial peptide of meg-11 of the present invention is administered to a warm-blooded animal together with a known carrier or diluent at a site where the antibody can be produced by administration.
  • Complete Freund's adjuvant ⁇ incomplete Freund's adjuvant may be administered in order to enhance the antibody-producing ability upon administration.
  • the administration is usually performed once every 6 weeks, about 2 to 10 times in total.
  • Warm-blooded animals used for antibody production include, for example, monkeys, rabbits, dogs, guinea pigs, mice, rats, sheep, goats, and chickens, with mice and rabbits being preferred.
  • a warm-blooded animal immunized with the antigen for example, a mouse with an antibody titer is selected from the mouse, and the spleen or lymph node is collected 2 to 5 days after the final immunization and contained in them.
  • a monoclonal antibody-producing hybridoma can be prepared.
  • the measurement of the antibody titer in the antiserum is performed, for example, by reacting the labeled meg-1 described below with the antiserum, and then measuring the activity of the labeling agent bound to the antibody.
  • Fusion operations are known in the art, such as the method of Koehler and Milstein (Nature, 256, 495 (19 75)).
  • the fusion promoter include polyethylene glycol (PEG) and Sendai virus, and PEG is preferably used.
  • myeloma cells examples include X-63Ag8, NS-K P3UK SP2 / 0, AP-1 and the like.
  • X-63Ag8 is preferably used.
  • the preferred ratio between the number of antibody-producing cells (spleen cells) and the number of myeloma cells used is 1:20 to 20: 1, and PEG (preferably PEG1000 to PEG6000) is added at a concentration of about 10 to 8 ( ⁇ ).
  • Cell fusion can be carried out efficiently by incubating at 20 to 40, preferably 30 to 37 for 1 to 10 minutes.A variety of methods can be used for screening of anti-Megu-1 antibody-producing hybridomas.
  • a solid phase for example, a microplate
  • Meg-1 antigen is directly or adsorbed with a carrier
  • an anti-immunoglobulin antibody (used for cell fusion) labeled with a radioactive substance or enzyme.
  • mice an anti-mouse immunoglobulin antibody is used, or a method of adding protein A and detecting an anti-Megu-1 monoclonal antibody bound to a solid phase, Add the hybridoma culture supernatant to the solid phase to which the immunoglobulin antibody or protein A is adsorbed, add Meg-1 labeled with radioactive substances, enzymes, etc., and detect the anti-Meg-1 monoclonal antibody bound to the solid phase And the like.
  • Selection and cloning of the anti-Megu-1 monoclonal antibody can be performed according to a method known per se or a method analogous thereto. It is usually performed in a medium for animal cells supplemented with HAT (hypoxanthine, aminopterin, thymidine). As a medium for selection, cloning and breeding, any medium can be used as long as the hybridoma can grow.
  • HAT hypoxanthine, aminopterin, thymidine
  • RPMI 1640 medium (Dainippon Pharmaceutical Co., Ltd.) containing 1-20%, preferably 10-20% fetal bovine serum, GIT medium (Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) containing 1-10% fetal bovine serum )
  • SFM-101 serum-free medium for hybridoma culture
  • the cultivation temperature is usually 20 to 40, preferably about 37.
  • the culture time is generally 5 days to 3 weeks, preferably 1 week to 2 weeks. Culture is usually performed under carbon dioxide.
  • Hypri-Doma culture supernatant Can be measured in the same manner as the measurement of the anti-Megu-1 antibody titer in the antiserum described above.
  • Cloning can be usually performed by a method known per se, such as a semi-solid Atger method or a limiting dilution method.
  • the cloned hybridoma is preferably cultured in a serum-free medium, and an optimal amount of antibody is obtained. Give to the supernatant.
  • the desired monoclonal antibody can also be obtained by ascites.
  • the monoclonal antibody according to the present invention can be made not to cross with other proteins by selecting an antibody that recognizes an epitope specific to Meg-11.
  • the epitope represented by the amino acid sequence of at least 7 or more consecutive amino acid residues, preferably 10 to 20 amino acids in the amino acid sequence constituting the protein is unique to the protein. It is said to show epitopes. Therefore, a monoclonal antibody that recognizes an epitope selected from the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 and that is composed of a peptide having an amino acid sequence consisting of at least 7 consecutive amino acid residues, One can say that it is a specific monoclonal antibody.
  • an antibody that discriminates a structural difference from a highly likely protein can be said to be a preferable embodiment of the antibody that recognizes Meg-11 according to the present invention.
  • Separation and purification of the anti-Megu 1 monoclonal antibody is carried out according to the immunoglobulin separation and purification method in the same manner as ordinary polyclonal antibody separation and purification.
  • Known purification methods include, for example, salting-out method, alcohol precipitation method, isoelectric focusing method, electrophoresis method, adsorption / desorption method using ion exchanger (for example, DEAE), ultracentrifugation method, gel filtration method, antigen binding Techniques such as a specific purification method in which only the antibody is collected by a solid phase or an active adsorbent such as protein A or protein G and the bond is dissociated to obtain the antibody can be shown.
  • the monoclonal antibody or polyclonal antibody of the present invention recognizing Meg-1 thus obtained is useful for diagnosis and treatment of diseases associated with mesangial cells. It is possible to use it. Since Meg-1 is a protein highly expressed in mesangial cells, these antibodies can also be used as a tool for identifying and detecting mesangial cells. Methods for immunologically detecting proteins in cells are known. Methods for measuring Meg-1 using these antibodies include a sandwich method for detecting a sandwich complex formed by reacting Meg-1 with an antibody bound to an insoluble carrier and a labeled antibody, and a labeling method. The competitive method for reacting human MEG-1 with human-derived MEG-1 in a sample competitively with an antibody, and measuring human-derived MEG-1 in a sample based on the amount of labeled antigen reacted with the antibody can be shown. it can.
  • Meg-1 In the measurement of Meg-1 by the sandwich method, first, after reacting the immobilized antibody with Meg-1, unreacted substances are completely removed by washing, and the labeled antibody is added, followed by addition of the labeled antibody-Meg-1.
  • a two-step method of forming a labeled antibody or a one-step method of simultaneously mixing an immobilized antibody, a labeled antibody and Meg-1 can be used.
  • Insoluble carriers used for measurement include, for example, synthetic resins such as polystyrene, polyethylene, polypropylene, polyvinyl chloride, polyester, polyacrylate, nylon, polyacetal, and fluororesins, polysaccharides such as cellulose and agarose, glass, and metals. And the like.
  • synthetic resins such as polystyrene, polyethylene, polypropylene, polyvinyl chloride, polyester, polyacrylate, nylon, polyacetal, and fluororesins, polysaccharides such as cellulose and agarose, glass, and metals.
  • shape of the insoluble carrier various shapes such as a tray, a sphere, a particle, a fiber, a rod, a disk, a container, a cell, and a test tube can be used.
  • the antibody-adsorbed carrier is stored in a cool place in the presence of a preservative such as sodium azide as appropriate.
  • a known chemical bonding method or physical adsorption method can be used.
  • a chemical bonding method for example, a method using dartaraldehyde, N-succinimidyl-4- (N-maleimidomethyl) cyclohexane-1-carboxylate, N-succinimidyl-2-maleimidoacetate and the like are used.
  • Maleimide method carbodiimide using, for example, triethyl-3- (3-dimethylaminopropyl) carbodiimide hydrochloride C method.
  • a complex formed by reacting a test substance with two antibodies having different epitopes first may be captured by immobilizing a third antibody against the antibody by the above-described method. It is possible.
  • the labeling substance is not particularly limited as long as it can be used for an immunological assay. Specifically, enzymes, fluorescent substances, luminescent substances, radioactive substances, metal chelates and the like can be used. Preferred labeling enzymes include, for example, peroxidase, alkaline phosphatase, / 3-D-galactosidase, malate dehydrogenase, staphylococcal nuclease, Deruba-5-steroid isomerase, ⁇ -glycerol.
  • Phosphate dehydrogenase triose phosphate isomerase, horseradish peroxidase, asparaginase, glucose oxidase, ribonuclease, perase, lipase, glucose-16-phosphate dehydrogenase, darcoamylase, And acetylcholinesterase.
  • Preferred fluorescent substances include, for example, fluorescein isocyanate, phycobiliprotein, rhodamine, phycoerythrin, phycocyanin, allophycocyanine, and orthophthalaldehyde.
  • Preferred luminescent substances include isoluminol, lucigenin, luminol, aromatic acridinium ester, imidazole, acridinium salt and its modified ester, luciferin, luciferase, and aequorin.
  • Preferred examples of the radioactive substance include I, 127 I, I, 14 C, 3 ⁇ 4, 32 P, and 35 S.
  • Direct and indirect signs can be used.
  • a direct labeling method a method of chemically covalently bonding an antibody or an antibody fragment and a label with a crosslinking agent is generally used.
  • Crosslinking agents include ⁇ , ⁇ '-orthophenylenedimaleimide, 4- ( ⁇ -maleimidomethyl) cyclohexane Acid. N-succinimide ester, 6-maleimidohexanoic acid ⁇ N-succinimide ester, 4,4′-dithiopyridine, and other known crosslinking agents can be used.
  • the reaction between these cross-linking agents and the enzyme or antibody may be performed according to a known method depending on the properties of each cross-linking agent.
  • a method may be employed in which a low-molecular-weight hapten such as biotin, dinitrophenyl, pyridoxal or fluorescamine is bound to an antibody, and the antibody is indirectly labeled with a binding component that recognizes this.
  • Avidin and streptavidin are used as recognition ligands for biotin.
  • dinitrophenyl, pyridoxal or fluorescamine an antibody that recognizes these haptens is labeled.
  • horseradish peroxidase can be used as a labeling enzyme.
  • This enzyme is advantageous because it can react with many substrates and can be easily bound to an antibody by the periodate method.
  • a fragment thereof for example, Fab ', Fab, F (ab') 2 is used as the antibody.
  • Enzyme-labeled products can be obtained by the same treatment regardless of whether the antibody is a polyclonal antibody or a monoclonal antibody. If the enzyme-labeled product obtained by using the above-mentioned cross-linking agent is purified by a known method such as affinity chromatography, an immunoassay system with higher sensitivity can be obtained.
  • the purified enzyme-labeled antibody is preserved by adding thimerosal (Thimerosal) or the like as a preservative and glycerin or the like as a stabilizer.
  • the labeled antibody can be stored for a longer period by freeze-drying and storing it in a cold place.
  • the labeling agent is an enzyme
  • a substrate and, if necessary, a color former are used to measure its activity.
  • a Peruokishidaze as enzymes, using H 2 0 2 as substrate solution 2 as coloring agent, 2 '- azino - di - [3 - E chill benz thiazoline sulfonic acid]
  • Anmoniumu salt ABTS
  • 5- ⁇ Minosalicylic acid orthophenylenediamine, 4-aminoantipyrine, 3,3 ′, 5,5′_tetramethylbenzidine and the like
  • alkaline phosphatase is used as the enzyme, use ortho-nitrophenyl phosphate, para-nitrophenyl phosphate, etc. as the substrate.
  • the present invention also relates to a method for labeling or immobilizing the above-mentioned monoclonal antibody or polyclonal antibody to obtain a reagent for immunological measurement of Meg-1. This includes kits of indicators and control samples.
  • the subject of measurement of Meg-1 in the present invention is a biological sample containing Meg-1, or a precursor or fragment of Meg-1 or a body fluid such as plasma, serum, blood, urine, tissue fluid, or cerebrospinal fluid. It is not limited if it is.
  • the present invention relates to transgenic non-human vertebrates having altered expression levels of the Meg-11 gene.
  • the Meg-1 gene includes cDNA, genomic DNA or synthetic DNA encoding Meg-1. Gene expression also includes both transcription and translation steps.
  • the transgenic animal according to the present invention is useful for studying the regulation of the function or expression of Megu 1, elucidating the mechanism of diseases related to human mesangial cells, and developing disease model animals for drug screening and safety. .
  • mutation of deletion, substitution, insertion, or the like in a part of several important sites (enhancer, promoter, intron, etc.) that normally regulates the expression of the Meg-1 gene is performed.
  • the gene can be artificially increased or decreased as compared with the original gene expression level.
  • Such a modification is a regulation of transcription of the Meg-11 gene.
  • protein translation can be modified by deleting a part of the exon or replacing it with a stop codon by introducing a point mutation into the translation region. This mutation can be introduced by a known method, and a transgenic animal can be obtained.
  • a transgenic animal is an animal in which a foreign gene has been artificially introduced into germ cells by genetic recombination in a narrow sense.An antisense RNA is used in a broad sense. Including transgenic animals with specific gene functions suppressed, transgenic animals with specific genes knocked out using embryonic stem cells (ES cells), and animals into which point mutation DNA has been introduced. An animal in which a foreign gene is stably introduced into a chromosome early in development and can be transmitted to a progeny as a genetic trait. As used herein, transgenic animals include all vertebrates other than humans.
  • Transgenic animals can be prepared by mixing the gene and egg and treating with calcium phosphate, or by introducing the gene directly into the nucleus of a pronuclear egg under a phase-contrast microscope using a micropipette. (Microinjection method, U.S. Pat. No. 4,873,911) and a method using embryonic stem cells (ES cells).
  • ES cells embryonic stem cells
  • a method of inserting a gene into a retrovirus vector and infecting the egg, and a sperm vector method of introducing a gene into the egg via sperm have been developed.
  • the sperm vector method is a gene recombination method in which a foreign gene is introduced into sperm cells by a method such as attachment or electroporation to a sperm and then fertilized by an egg to introduce the foreign gene (M Lav it ranoe t et al Cell, 57, 71 7, 1989).
  • site-specific gene recombination can be used in invivo such as the cre / loxP recombinase system of bacteriophage PI and the FLP recombinase system of Saccharomyces cerevisi siae.
  • a method has been reported in which a transgene of a target protein is introduced into a non-human animal using a retrovirus.
  • a method for producing a transgenic animal by the microinjection method is performed, for example, as follows.
  • a promoter involved in the regulation of expression a gene encoding a specific protein, and a transgene consisting essentially of a polyA signal.
  • the expression style and expression level of a specific molecule depend on the promoter activity.
  • the transgenic animals created differ depending on the copy number of the introduced transgene and the introduced site on the chromosome.
  • Expression ⁇ Check the expression level. Untranslated region ⁇ Since splicing has been found to change the expression level, May be introduced. It is important to use as pure a gene as possible to introduce into a fertilized egg.
  • animals to be used a mouse for collecting fertilized eggs (5 to 6 weeks old), a male mouse for mating, a pseudopregnant female mouse, a male mouse ligated with vas deferens, and the like are used.
  • ovulation may be induced by gonadotropin or the like.
  • the fertilized egg is collected, and the gene in the injection pipette is injected into the male pronucleus of the egg by microinjection.
  • whether the transgene has been introduced into the born mouse whether the transgene has been detected by Southern or PCR by extracting genomic DNA from the tip of the tail, or when homologous recombination has occurred It can be selected by the positive cloning method in which a marker gene that activates only is inserted.
  • a transcript derived from the transgene is detected by the Northern method or the RT-PCR method. Alternatively, detection can be performed by stamp lotting using a specific antibody against the protein.
  • the knockout mouse of the present invention has been processed so that the function of the mouse Meg-1 gene is lost.
  • Knockout mice are transgenic mice in which any gene has been disrupted by homologous recombination technology and the function has been lost.
  • embryonic stem cells in which one allele has been modified or destroyed can be selected to produce knockout mice.
  • a genetically engineered embryonic stem cell is injected into a blastocyst or an 8-cell embryo of a fertilized egg to obtain a chimeric mouse in which cells derived from embryonic stem cells and cells derived from an embryo are mixed.
  • this chimeric mouse (a chimera is a single individual formed from somatic cells based on two or more fertilized eggs) is bred to a normal mouse, a heterozygous cell in which all of one allele has been altered or destroyed A zygote mouse can be produced. Furthermore, by breeding heterozygous mice, Mozygote mice can be produced.
  • the transgenic animal according to the present invention includes both these heterozygotes and homozygotes.
  • Homologous recombination refers to recombination that occurs between two genes having the same or very similar nucleotide sequences in the gene recombination mechanism.
  • PCR can be used to select cells that have undergone homologous recombination.
  • a PCR reaction was performed using a part of the inserted gene and a part of the region expected to be inserted as primers, and it was found that homologous recombination had occurred in the cells in which the amplification product was formed.
  • a neomycin resistance gene can be linked to the introduced gene, and the cells can be selected by making the cells neomycin resistant after introduction. The method can be easily selected using the methods described above and their modifications.
  • FIG. 1 is a photomicrograph ( ⁇ 40) showing the results of in situ hybridization of normal human glomerular tissue with a Meg-11 specific probe.
  • Figure 2 shows the results of in situ hybridization of normal human glomerular tissue with a Meg-1 specific probe at a higher magnification than in Figure 1.
  • Figure 3 is a photograph showing the results of electrophoresis of total RNA prepared from rat glomeruli in which mesangial proliferative nephritis was induced by anti-Thyl antibody (indicated by “total RNA” in the figure), and their Meg-1 It is a photograph (in the figure, it shows with "rat Meg-1") which shows the result of the Northern blot analysis by a specific probe.
  • Human glomerular kidney mesangial cells were isolated from normal human kidneys removed from a 58-year-old man.
  • the renal cortex was isolated under aseptic conditions, minced, and passed through several sieves. The sieve used was gradually reduced in pore size.
  • the glomeruli captured on a sieve with a pore size of 75-200 / m were washed and incubated with 100 / ig / mL collagenase (Washington Biochemical) at 37 for 20 minutes.
  • the glomeruli were washed with medium 199 (Gibco BRL, containing 10 mM Nu-serum (Collaborative Biomedical Products, Bedford, Mass.) And antibiotics (10 g / mL penicillin, streptomycin, and uangguisone). Gai thersburg, resuspended in MD), and incubated in a 5% C0 2 incubator.
  • medium 199 Gibco BRL, containing 10 mM Nu-serum (Collaborative Biomedical Products, Bedford, Mass.) And antibiotics (10 g / mL penicillin, streptomycin, and uangguisone).
  • mesangial cells were transformed with typical morphological characteristics, trypsin, puromycin and D-valine resistance, actin (Zymed Laboratories, San Francisco, CA), anti-VL A (very late ant igen) -l, 3, 5 (I band unotech) were identified by a series of criteria, such as positive for immunostaining, and negative for factor VIII (Dako, CA).
  • RNA was isolated from human mesangial cells using the guanidine isothiocyanate (GTC) method. That is, a mesangial cell confluent culture in a culture solution containing the serum of the cells of Example 1 was washed with phosphate buffered saline (PBS) and dissolved in a 5.5 mM GTC solution. DNA was removed by passing it through an 18 gauge needle. Nuclei and other cell debris were precipitated by centrifugation at 5, OOOXg for 90 seconds. The supernatant was carefully placed on a cesium trifluoroacetate (CsTFA) layer and centrifuged at 15 ⁇ 125, OOOXg for 24 hours. The RNA pellet was dissolved in TE buffer. Poly (A) + RNA was separated using an oligo dT cellulose column (Pharmacia).
  • GTC guanidine isothiocyanate
  • the transformants obtained were randomly selected and individually dissolved by simple heating.
  • the cDNA insert was amplified by paired PCR using the primers (5'-TGT AAAACGACGGCCAGT-3 '/ SEQ ID NO: 3 and 5'-ACCATGATTACGCCAAGCTTG-3' / SEQ ID NO: 4) flanking the PUC19 clone site. I let it.
  • the resulting short double-stranded DNA was used in a cycle sequencing reaction and analyzed with an automatic sequencer.
  • the reaction mixture from 15 5X hybrid RNA denature L buffer 15 L was added in 0.5mL microtube containing H 2 0 45. 1 L of RNaseH was added and reacted at 30 ° C for 1 hour. After the reaction was completed, 150 L of ethanol was added, the mixture was cooled at -70 for 30 minutes, centrifuged, the supernatant was removed, and the precipitate was collected.
  • the obtained circularized single-stranded cDNA was diluted 10-fold with a TE buffer, designated as type I, and subjected to primary PCR.
  • the reaction conditions were 10XLA PCR buffer II (Mg plus) dNTP mixture (2.5mM) 8 ⁇ L, primary PCR SI primer (5'-TCATTGATGGGTCCTCM / SEQ ID NO: 6, 20 pmol/L) 0.5 primary PCR A1 primer (5 ' -AGATTCTTGAGCT CAGAT / SEQ ID NO: 7, 20 pmol / iL) 0.5, and TaKaRa LA TaqTM (5 U / L) 0.5 L, The total volume was adjusted to 50 ⁇ L with sterile water. "It was set on a Takara PCR Thermal Cyclerj, heated at 94 for 3 minutes, and then subjected to 25 cycles of 94 30 seconds, 60 ° C 30 seconds, and 722 minutes.
  • the gene fragment inserted into the obtained plasmid was subcloned from the reaction solution using “0riginal TA Cloning Kitj (Invitrogen)”. Was determined by the didoxy termination method.
  • the obtained nucleotide sequence contained a region encoding the N-terminal part of the gene product and contained about 50 nucleotides as a 5 ′ untranslated region.
  • the position of the predicted start codon ATG was consistent with the consensus sequence and gave the longest 0RF (satisfying "the first ATG rule").
  • the 950 amino acid residue based on the longest 0RF in the nucleotide sequence of this cDNA was used as the deduced amino acid sequence of the gene product.
  • the present inventors named the protein having this amino acid sequence Meg-1 (Meg-1).
  • the nucleotide sequence of meg-1 cDNA is shown in SEQ ID NO: 1
  • the deduced amino acid sequence of meg-1 is shown in SEQ ID NO: 2.
  • This clone is derived from the Soares library 1NIB by the IMAGE consortium, and has only determined a part of the base sequence, and its function and body mapping are not known at all. Subsequently, a motif search was performed on the amino acid sequence of Meg-1. PSORT WWW Server (http: //psort.nibb.ajp: 8800 /) and MOTIF (http: @ www.motif.genome.ad.jp /) were used for the search. As a result, it became clear that Meg-1 contained several phosphorylation motifs. Specifically, the presence of the following phosphorylation motif by the kinase was confirmed. In addition, six N-glycosylation sites were identified. Furthermore, the existence of a nuclear localization signal was suggested, and the estimated nuclear localization was 52.2%.
  • Primary culture cells include mesangial cells, human skin epithelial cells, human renal cortical epithelium 2 g of poly (A) + RNA derived from primary cells of cells, human umbilical vein endothelial cells, and human smooth muscle cells were used as samples.
  • Northern blots of human cancer cell lines include: HL-60 promyelocyte leukemia, HeLa cell S3, chronic myelogenous leukemia K-562, lymphoblastic leukemia M0LT-4, Burkitt lymphoma Raj i, colon adenocarcinoma SW480 , P0ly (A) + RNA derived from lung cancer A549 and melanoma G361 was used as a sample.
  • Example 8 Functional analysis of Meg-1 (3) — In situ hybridization Tissue of Meg-1 mRNA by in situ hybridization using human kidney tissue obtained from healthy human kidney The expression state in the cells was evaluated. Insa Ichu hybridization was performed by a known method (Kidney Int., 52,
  • Antisense strand 2852nt-2872nt
  • the amplification product of the expected size was cloned and its nucleotide sequence was determined.
  • a part of the base sequence of the 3 terminal was determined by the marathorn method (the same method as when megsin was isolated and identified).
  • the obtained base sequence is shown in SEQ ID NO: 11, and the deduced amino acid sequence is shown in SEQ ID NO: 12.
  • Rat Meg-1 has a highly conserved structure with respect to human Meg-1 at 74.3% at the gene level and 86.3% at the protein level. Furthermore, the cell and tissue localization of rat Meg-1 in rats was analyzed by the same method as in Example 7, except that the sample and the probe were different. The results are as follows. Brain +
  • Meg-1 is highly expressed in kidneys (especially mesangial cells) across human and rat species, suggesting that it may be one of the functional genes involved in the function of mesangial cells.
  • the expression of 1 was detected by Northern blot analysis.
  • the anti-rat Thyl monoclonal antibody was prepared using a hybridoma producing this antibody (purchased from the European Collection of Animal Cell Cultures (Sulisbury, UK)) (Salant DJ, Darby C, Couser WG: Experimental membrano us glomerulonephritis in rats. J Clin Invest 66: 71-81, 1980). That is, after culturing this hybridoma in RPMI-1640 medium (containing 10% fetal calf serum), 1 ⁇ 10 6 cells are suspended in 0.5 mL of RPMI-1640 medium, and incomplete Freund's Balb / c mau with adjuvant injected intraperitoneally (Osos, 10 weeks old).
  • RPMI-1640 medium containing 10% fetal calf serum
  • Meg-1 mRNA in the glomeruli of rats induced with mesangial proliferative nephritis was detected as follows. All animal experiments were performed according to the Guide for Animal Experi- mentation (Faculty of Medicine, The University of Tokyo). First, after breeding Wiis Yuichi rats (Oss, 6 weeks old, purchased from Charles River verpan (Yokohama, Japan)) for 1 week, 1.2 mg of IgGl mouse monoclonal anti-Thyl antibody (kg / kg body weight) 0X7) was administered by intravenous injection. As a control, a rat to which only the vehicle was similarly administered was prepared.
  • RNA was isolated from this glomerulus and subjected to Northern blot analysis.
  • a fragment having the nucleotide sequence at positions 841 to 1979 of rat Meg-1 was used as a probe.
  • This region has low homology to the A unit (regulatory unit) of protein phosphatase 2A (PP2A) and is suitable as a probe.
  • the probe was prepared by subcloning a fragment amplified by PCR in which the cDNA of rat mesangial cells was type III into pGEM-T easy and excising it with EcoRI.
  • the function of the protein will reveal the function of the mesangial cells, and it is expected that the function of the proteins will be used to determine the cause of diseases associated with the mesangial cells. It is also expected to be applied to the treatment and diagnosis of diseases associated with mesangial cells such as mesangial proliferative nephritis. Specifically, for example, the onset and progress of glomerulonephritis may be controlled by artificial regulation of Meg-1. Alternatively, quantification of Meg-1 protein and mRNA in mesangial cells and body fluids can be expected to make it possible to diagnose renal diseases such as glomerulonephritis.
  • Meg-1 is involved in these conditions.
  • the meg-1 according to the present invention has the same features as the megsin previously reported by the present inventors in that it is highly expressed in mesangial cells.
  • Meg-1 according to the present invention shows homology to phosphatases, suggesting that it may be a nuclear protein with a nuclear translocation signal, whereas megsin is a protease inhibitor, SERPIN super. It is a protein with homology to one family.
  • Meg_1 according to the present invention has the potential to be an important protein that supports the function of mesangial cells. The significance of the present invention elucidating the existence of such important proteins is great.

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Description

明細書 メグ一 1タンパク質 技術分野
本発明は、 遺伝子工学の分野に属し、 特に腎細胞の遺伝子の単離に関する。 背景技術
体内の 60兆個もの様々な細胞が、 本質的に同一のゲノム DNAを有している。 正常な生理学的機能のために、 これらの遺伝子の発現は、 細胞系統、 および細胞 が受容するシグナルにより厳密に制御されている。 従って、 個々の細胞型に発現 している遺伝子を解明することは極めて重要である。
メサンギゥム細胞 (mesangi al ce l l)は、 腎糸球体の構造および機能の維持に中 心的な役割を果たしている。 そしてメサンギゥム細胞は、 各種腎炎においても中 心的な病態生理学的意義を有する。 例えばメサンギゥム細胞の増殖、 および細胞 外の糸球体間質マトリックスの蓄積は、 慢性腎炎および糖尿病性腎症のような 様々な糸球体疾患の患者の糸球体硬化症の重要な病理所見である。 従って、 メサ ンギゥム細胞で発現している遺伝子を見いだしその機能を明らかにすることは、 メサンギゥム細胞の生物学的性質の解明、 メサンギゥム細胞に関連する疾患の原 因の究明、 ひいては、 メサンギゥム細胞に関連する疾病の治療、 診断等に有効で ある。
メサンギゥム細胞のマーカ一としては、 ラットでは Thyl抗原が知られている。 しかしこの遺伝子はメサンギゥム細胞特異的ではないうえ、 ヒトではメサンギゥ ム細胞には発現していない (Miyata T. e t al . , Immuno l ogy (1989); 67 : 531-5 33 ; Miyat a T. e t al . , Immuno l ogy (1990); 69 : 391-395) 。 また、 メサンギゥ ム細胞は活性化されるとひ平滑筋ァクチンを発現することが知られているが、 こ の遺伝子もメサンギゥム細胞特異的ではない。 このように、 メサンギゥム細胞に 特徴的な遺伝子については、 従来報告がなかった。
なお本発明者は、 先にメサンギゥム細胞に特異的に発現しているタンパク質と してメグシンを報告している (J . C l i n. Inves t , 1998 Aug 15, 120 : 4, 828-36) 。 本 発明は、 このメグシンとも明確に異なった構造を持つ新規なタンパク質に関する。 発明の開示
本発明は、 メサンギゥム細胞で高度に発現される遺伝子を単離することを課題 とする。
本発明者は、 ヒトメサンギゥム細胞のインビトロ培養物から niRNAを単離し、 3 '側の cDNAライブラリーを作成した。 そしてこの cDNAライブラリ一に含まれる 多数のクローンをランダムに選択してその塩基配列を決定した。 次いで決定した 塩基配列を、 種々の臓器及び細胞から得られた既知の 3'側の cDNAクローンの塩 基配列と比較することによって、 メサンギゥム細胞で特異的に発現しているクロ ーンを選択した。 そのうち、 メサンギゥム細胞において特に出現頻度の高い 1ク ローンを選択し、 5' 1½ 6法にょって完全長じ0^ (3928& )を単離した。 この完全 長 cDNAの全塩基配列を決定して本発明を完成した。 更に Kozakの翻訳開始コド ンを明らかにし、 オープンリーディングフレーム(0RF)を推定した。 この推定ァ ミノ酸配列を持つ本発明によるタンパク質を、 本発明者はメグ一 1 (Meg-1 )と命 名した。 ヒト ·メグ— 1の cDNAの塩基配列を配列番号: 1に、 ヒト ·メグ一 1 の推定アミノ酸配列を配列番号: 2に示した。
このアミノ酸配列について、 Swi ssPro tデータベースのアミノ酸配列とホモ口 ジー検索を行い、 メグ一 1が新規なタンパク質であることを確認した。 更に本発 明のメグ一 1の推定アミノ酸配列についてモチーフ検索を試みたところ、 多くの 既知のプロテインホスファターゼに共通するモチーフが見られた。 また、 核局在 シグナル(nuc l ear local i zat ion s ignal)スコアが高く、 核タンパク質である可 能性が示唆された。
更にノーザンプロッティングによりメグ一 1の組織分布をみたところ、 メグ一 1は、 心および胎盤、 次いで脳、 骨格筋、 腎および膝において高度な発現が観察 された。 その他に肝で弱い発現が観察され、 肺での発現はほとんど観察されなか つた。 初代継代培養細胞の中では、 メサンギゥム細胞で特に高度に発現している ことが特徴的であつた。 本発明はこれらの知見に基づいて完成されたものである。 即ち、 本発明は具体的には以下のポリヌクレオチド、 タンパク質、 並びにそれ らの用途に関する。
〔1〕 下記 (a ) から (d ) のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
( a ) 配列番号: 1に記載された塩基配列の蛋白質コード領域を含むポリヌ クレオチド。
( b ) 配列番号: 2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質をコードするポリ ヌクレオチド。
( c ) 配列番号: 2に記載のアミノ酸配列において、 1若しくは複数のアミ ノ酸が置換、 欠失、 挿入、 および または付加したアミノ酸配列からなり、 配列番号: 2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質と機能的に同等な蛋白質 をコ一ドするポリヌクレオチド。
( d ) 配列番号: 1に記載された塩基配列からなる DNAとストリンジェント な条件下でハイプリダイズするポリヌクレオチドであって、 配列番号: 2に 記載のアミノ酸配列からなる蛋白質と機能的に同等な蛋白質をコードするポ リヌクレオチド。
〔2〕 〔1〕 に記載のポリヌクレオチドのいずれかによつてコードされる蛋白質。 〔3〕 〔1〕 に記載されたポリヌクレオチドのいずれかを含むベクタ一。
〔4〕 〔1〕 に記載されたポリヌクレオチドのいずれか、 または 〔3〕 に記載の ベクターを保持する形質転換体。 〔5〕 〔4〕 に記載の形質転換体を培養し、 発現産物を回収する工程を含む、
〔2〕 に記載の蛋白質の製造方法。
〔6〕 配列番号: 1に記載された塩基配列、 またはその相補鎖に相補的な塩基配 列からなる 1 5ヌクレオチド以上の鎖長を持つオリゴヌクレオチド。
〔7〕 〔6〕 に記載のオリゴヌクレオチドと被検試料を接触させ、 このオリゴヌ クレオチドのハイブリダィズを観察する工程を含む、 配列番号: 1に記載の 塩基配列からなるポリヌクレオチドの検出方法。
〔8〕 〔6〕 に記載のオリゴヌクレオチドと被検試料を接触させ、 このオリゴヌ クレオチドをプライマーとして相補鎖を合成する工程を含む、 配列番号: 1 に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドの合成方法。
〔9〕 〔6〕 に記載のオリゴヌクレオチドを含むメサンギゥム細胞の検出用試薬。 〔1 0〕 生体試料中における 〔1〕 に記載のポリヌクレオチドの発現レベル を測定し、 正常試料から得られた測定値と比較することによってメサンギゥ ム増殖性腎炎を検出する方法。
〔1 1〕 生体試料がメサンギゥム細胞である 〔1 0〕 に記載の方法。
〔1 2〕 発現レベルを、 配列番号: 1に記載の塩基配列から選択された塩基 配列からなる mRNAを指標として測定する 〔1 0〕 に記載の方法。
〔1 3〕 発現レベルを、 〔2〕 に記載のタンパク質またはその断片を指標と して測定する 〔1 0〕 に記載の方法。
〔1 4〕 〔1〕 に記載のポリヌクレオチド、 またはその一部に対するアンチ センスポリヌクレオチド。
〔1 5〕 〔2〕 に記載の蛋白質を認識する抗体。
〔1 6〕 配列番号: 2のアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列を持つ夕 ンパク質の一部を認識する 〔1 5〕 に記載の抗体。 〔1 7〕 〔1 5〕 に記載の抗体と 〔2〕 に記載のタンパク質、 またはその断 片との免疫学的な結合に基づいて 〔2〕 に記載のタンパク質またはその断片 を測定する免疫学的測定方法。
〔18〕 〔1 5〕 に記載の抗体を含む 〔2〕 に記載のタンパク質またはその 断片の免疫学的測定用試薬。
〔1 9〕 メグ一 1をコードする遺伝子の発現レベルを変化させたトランスジ エニック非ヒト脊椎動物。
〔20〕 非ヒト脊椎動物がマウスである 〔19〕 に記載のトランスジェニッ ク非ヒ卜脊椎動物。
〔2 1〕 メグ一 1をコードする遺伝子の発現が抑制されたノックアウトマウ スである 〔20〕 に記載のトランスジエニック非ヒト脊椎動物。 前記課題を達成するために本発明者は、 3'領域 cDNAライブラリー(3'-directe d cDNA library)を用いた。 この方法により、 cDNAの大きさを反映するクロー二 ング効率の変動を回避することができる。 3'領域の配列は遺伝子に特有なもので あり、 約 200〜300bpの配列データは、 遺伝子の特徴を明らかにするのに充分で ある(Yasuda, Y., Miyata, T. et al. , Kidney Int, 1998 Jan, 53:1, 154-8)。 本発明のヒト ·メグ一 1をコードするポリヌクレオチドは、 メサンギゥム細胞 から mRNAを調製した後、 既知の方法により二本鎖 cDNAに変換することにより得 ることができる。 mRNAの調製はグァニジンイソチオシァネート—塩化セシゥム 法 [Chirwin, et al. Biochemistry 18, 5294 (1979)] 、 デォキシリボヌクレア —ゼ存在下に界面活性剤処理、 フエノール処理を行なう方法 [Berger & Birkenm eier, Biochemistry 18, 5143 (1979)] などを用いることができる。 全 RNAから の poly(A)+RNAの調製はオリゴ (dT)を結合した担体 (例えばセファロース、 セル ロースやラテックス粒子等) を用いたァフィ二ティークロマトグラフィーなどを 用いて行なうことができる。 得られた mRNAを铸型として、 3'端にある poly(A) 鎖に相補的なオリゴ(dT)、 ランダムプライマー、 あるいはメグ一 1のアミノ酸配 列の一部に相応する合成オリゴヌクレオチドをプライマーとして逆転写酵素で処 理することによって cDNA l s t s t rand)を得ることができる。 mRNAとそれに相補 的な cDNAとで構成されるハイブリッドの mRNAを E. Co l i RNase Hで部分的に切 断し、 これをプライマーとして E. Co l i DNA po lymerase Iにより cDNA (2nd s t r and)が合成される。 最終的に E. Co l i DNA L igaseで処理することにより、 二本 鎖 cDNAを得ることができる。
ヒト ·メグ— 1遺伝子塩基配列をもとに合成したプライマーを用いて、 メサン ギゥム細胞 po ly (A) +RNAを铸形にして RT - PCR法によりクローニングすることも 可能である。 また、 PCRによらず、 ヒト ·メグ— 1遺伝子塩基配列をもとにプロ ーブを合成し、 直接 cDNAライブラリーをスクリーニングし、 目的とする cDNAを 得ることもできる。 本発明の遺伝子は、 これらの方法により得られた遺伝子の中 から、 その遺伝子の塩基配列を確認することにより、 選択することができる。 マ ウスとラット等、 ヒト以外の種におけるメグ一 1のホモログについても、 同様の 手法により cDNAの取得が可能である。
あるいは、 メグ— 1のホモログの cDNAを以下のような手法によって単離する ことも可能である。 すなわち、 前記ヒト ·メグ— l cDNAの塩基配列をプローブ として用い、 cDNAライブラリーをコロニーハイブリダィゼーシヨンやプラーク ハイブリダィゼ一シヨンによってスクリーニングして、 メグ— 1のホモログをコ —ドする cDNAを単離することができる。 cDNAライブラリ一は、 マウス、 ラット の組織や、 培養メサンギゥム細胞等から抽出した mRNAを铸型として合成するこ とができる。 あるいは、 市販 cDNAライブラリー (フナコシ製等) を用いること もできる。 この他に、 本発明によるヒト 'メグ一 1の cDNAをもとに、 0RFの前 後にディジエネレーティブプライマーを設計し、 これを利用した PCRによってホ モログの cDNAを増幅する方法を用いることもできる。 実施例にはこのような手 法に基づいて取得されたメグ— 1のラットにおけるホモログが開示されている。 ヒ卜 ·メグ一 1ゲノムは、 ゲノミックライブラリーのスクリーニングによって 得ることができる。 ゲノミックライブラリ一は、 たとえばヒト Bリンパ芽球から ゲノムを調製し、 Sau3で部分的に切断した DNAをファージベクターである EMBL3 に組み込むことにより合成することができる (Blood, vol 83, No 11, 1994: pp 3126-3131) 。 このようなゲノミックライブラリーについて、 プラークハイブリ ダイゼ一シヨン法 (新細胞工学実験プロトコ一ル、 秀潤社、 pp79- 92、 参照) を 行えば、 目的とするゲノムを含むクローンを取得できる。 プローブとしては、 メ グー 1 cDNAの 0RF全ての領域 (2850bp) 、 または cDNA部分をプライマーとして ヒトゲノム DNAを PCR法を用いて増幅することにより得られた各ェキソン—ィン トロン部分を用いることができる。 また、 同時に調節領域に関しても、 ヒト培養 メサンギゥム細胞由来 mRNA、 もしくはヒト腎臓 niRNA (Clontech社より購入) を 铸型として、 5' RACE法 (5' -Full RACE Core Set (宝酒造 (株) の方法に従 う) ) を用いて 5' UTRの配列決定を行うことができる。
本発明の遺伝子は、 例えばホスホアミダイド法 [Mattencci, M.D. &Caruthers, M. H. J. Am. Chem. Soc. 103, 3185 (1981)] 、 ホスファイト ' トリエステル法 [Hunkapiller, . et al. Nature 310, 105 (1984)] 等の核酸の化学合成を用 いる常法に従つて製造することもできる。
なお、 一般に、 真核生物の遺伝子はヒトインターフェロン遺伝子で知られてい るように多形現象を示すことが多い。 この多形現象によって、 アミノ酸配列に 1 個あるいはそれ以上のアミノ酸の置換を生じても、 通常タンパク質の活性は維持 される。 また一般に、 1個または数個のアミノ酸の改変では、 タンパク質の活性 は維持される場合が多いことが知られている。 従って、 配列番号: 2に示される アミノ酸配列をコードする遺伝子を人工的に改変したものを用いて得られたタン パク質をコ一ドするポリヌクレオチドは、 該タンパク質が本発明の遺伝子の特徴 的な機能を有する限り、 すべて本発明に含まれる。 また、 配列番号: 2に示され るアミノ酸配列を人工的に改変したタンパク質は、 本発明のタンパク質の特徴を 有する限り、 すべて本発明に含まれる。
その他、 本発明のタンパク質には、 配列番号: 2に記載のアミノ酸配列、 また はこれらアミノ酸配列において 1若しくは複数個のアミノ酸が置換、 欠失、 付加、 および Zまたは挿入されたアミノ酸配列を含み、 本発明によるメグ一 1と機能的 に同等なタンパク質が含まれる。 なお本発明において機能的に同等とは、 メグ一
1と同等の生物学的特性を持つことを意味する。 本発明者は、 メグ一 1にたとえ ば以下のような生物学的な特性を見出している。
まず、 メグ— 1はそのアミノ酸配列において、 ヒトのみならず様々な種属のプ 口ティンフォスファターゼ 2 A ( P P 2 A) の Aユニット (調節ユニット) と 2 0— 3 0 %のホモロジ一を有する。 一方 P P 2 Aでは、 Aユニットの C末端側に Cユニット (酵素活性の有る触媒ユニット) 、 そして N末端側には Bユニット (組織や細胞に特異的なもう一つの調節ュニッ卜) とが結合して 3量体を形成す ることが知られている。 そして Aュニットゃ Cュニッ卜が組織や細胞の間で共通 の構造を持つのに対して、 Bュニットは組織や細胞に特異的な構造を持つと考え られている。 これらの情報に基づけば、 P P 2 Aとのホモロジ一を持つ本発明の メグ— 1を Aュニッ卜とする Bュニットは、 メサンギゥム細胞に特異的なタンパ ク質である可能性が推測される。 メグ一 1を Aュニッ卜とする Bュニッ卜には、 P P 2 Aとは異なった、 メサンギゥム細胞に特異的な活性制御機構が伴っている ものと考えられる。
またメグ一 1の発現特性は、 メサンギゥム初代培養細胞で特に高度に発現して いることが特徴的であった。 その他の初代培養細胞では、 皮膚繊維芽細胞ゃ腎皮 質上皮細胞で発現が観察され、 臍帯静脈内皮細胞、 平滑筋細胞においてはわずか な発現が観察された。 組織間の比較においては、 心および胎盤、 次いで脳、 骨格 筋、 腎および膝において高度な発現が観察された。 その他に肝で弱い発現が観察 され、 肺での発現は観察されなかった。 培養癌細胞株においては HeLa細胞 S3、 慢性骨髄性白血病 K-562、 リンパ芽球白血病 MOLT- 4、 大腸腺癌 SW480、 および肺 癌 A549で強い発現が観察され、 前骨髄白血病 HL-60、 黒色腫 G361でも発現が見 られた。 Burki t tリンパ腫 Raj iでは、 ほとんど発現が見られなかった。 またラ ット ·メグ一 1のラットにおける発現解析の結果、 メグ一 1は、 ヒトとラットに 共通して腎臓 (特にメサンギゥム細胞) に高発現していることから、 メサンギゥ ム細胞の機能に関与する機能遺伝子の一つである可能性が考えられる。 各組織や 培養細胞におけるメグ一 1の発現状態は、 たとえば配列番号: 1から選択された 塩基配列を持つプローブによって、 各組織から調製した mRNAを試料としてノー ザンブロットアツセィを行うことによって知ることができる。
以上のような生物学的特性について、 機能的に同等なタンパク質は、 いずれも 本発明によるメグ一 1を構成する。 したがって、 具体的に構造を明らかにしたヒ トのメグ— 1のみならず、 構造的にあるいは機能的に同等な他の種のホモログは 本発明に含まれる。
ホモ口ジーサーチによつて確認された公知のァミノ酸配列のうち、 もっともメ グー 1に近い構造を持ったものは、 PP4R, (J . B i o l . Chem. 274 (9) , 5339-5347, 1999) である。 しかし PP4R,は、 ゥシの小腸から単離されたタンパク質セリン Zスレオ ニンフォスファタ一ゼ 4調整ュニットのヒト ·ホモログとして報告されたタンパ ク質である。 その構造においては、 PP4R1の N末端から 1 8位に存在する Sが、 メグ一 1では FGVDDYSSESDVI I IPSAの 1 8アミノ酸残基となっており、 両者は異 なった構造を持つタンパク質である。 また機能的に見ても、 メサンギゥム細胞に 高度に発現するメグ一 1に対して、 PP4RIはゥシ小腸由来のタンパク質のァミノ 酸配列に基づいて単離された神経上皮細胞由来のタンパク質であることから、 両 者は異なったタンパク質である。 両者の間で相違するアミノ酸配列が連続してい ることから、 メグ一 1と PP4R1とは互いに複数の遺伝子にコードされるアイソフ オームゃスプライシング変異体である可能性が考えられる。 また、 本発明のポリヌクレオチドには、 これらの機能的に同等なタンパク質を コードするポリヌクレオチドが含まれる。 これらのタンパク質をコードするポリ ヌクレオチドは、 cDNAのみならずゲノム DNAや合成 DNA、 RNA、 更にはヌクレオ チド誘導体で構成された人工的なポリヌクレオチド分子であることもできる。 また、 所望のアミノ酸に対するコドンはそれ自体公知であり、 その選択も任意 でよく、 例えば利用する宿主のコドン使用頻度を考慮して常法に従い決定できる [Grantham, R. et al. ucleic Acids Res. 9, r43 (1981)] 。 従って、 コドン の縮重を考慮して、 塩基を適宜改変したものもまた本発明のポリヌクレオチドに 含まれる。 所望の改変をコードする合成オリゴヌクレオチドからなるプライマー を利用した部位特異的変位導入法 (sitespecific mutagenesis) [Mark, D.F. e t al. Pro Natl. Acad. Sci. U.S.A. 81,5662 (1984)] 等にしたがって、 これ ら塩基配列のコドンを一部改変することができる。
更に、 配列番号: 1に記載の塩基配列を含むポリヌクレオチドとハイブリダィ ズすることができ、 かつそのポリヌクレオチドによってコードされるタンパク質 が本発明によるメグ一 1に特徴的な機能を有する限り、 そのポリヌクレオチドは 本発明によるポリヌクレオチドに含まれる。 ストリンジェントな条件下で特定配 列にハイプリダイズすることができる配列は、 特定配列がコードするタンパク質 と類似した活性を持つものが多いと考えられる。 ストリンジェントな条件とは、 一般的には以下のような条件を示すことができる。 すなわち、 4 XSS (;、 6 5で でハイブリダィゼーシヨンさせ、 0. 1 XSSCを用いて 6 5T:で 1時間洗淨する。 ストリンジエンシーを大きく左右するハイブリダィゼーシヨンや洗浄の温度条件 は、 融解温度 (Tm)に応じて調整することができる。 Tmはハイブリダィズする塩 基対に占める構成塩基の割合、 八イブリダィゼーシヨン溶液組成 (塩濃度、 ホル ムアミドゃドデシル硫酸ナトリウム濃度) によって変動する。 したがって、 当業 者であればこれらの条件を考慮して同等のストリンジエンシーを与える条件を経 験的に設定することができる。 変異体も含め本発明によるポリヌクレオチドの塩基配列は、 公知の技術に基づ いてさまざまな用途に利用することができる。
このようにしてクローン化されたメグ一 1をコ一ドするポリヌクレオチドは適 当な発現べク夕一 DNAに組み込むことにより、 他の原核細胞または真核細胞の宿 主を形質転換させることができる。 さらに、 これらの発現ベクターに適当なプロ モーターおよび形質発現に係る配列を導入することにより、 それぞれの宿主細胞 において遺伝子を発現することが可能である。 発現ベクターとしては、 例えば大 腸菌の場合は、 ET-3 [Studier & offatt, J. Mol. Biol. 189, 113(1986)] 等 が、 COS細胞の場合は pEF-BOS [Nucleic Acids Research 18,5322 (1990)] 、 pS V2-gpt [Mulligan & Berg, Pro Natl. Acad. Sci. U.S.A. 78, 2072 (1981)] 等が、 CHO細胞の場合は pVYl [国際公開第 89/03874号公報] 等がそれぞれ挙げ られる。 また、 目的とする遺伝子に他のポリペプチドをコードする遺伝子を連結 して融合タンパク質として発現させることにより、 精製を容易にし、 その後目的 タンパク質を切り出すことも可能である。 融合させるタンパク質としては、 ヒス チジンタグ、 C- mycタグ、 MBP-タグ、 あるいは GST -タグ等が知られている。 これ らのタグを融合させた状態でィンサートを発現させることができるベクターは巿 販されている。
本発明の発現系に用いる宿主のうち原核生物宿主細胞としては、 例えば、 大腸 菌 (Escherichia coli) が挙げられる。 また真核生物のうち、 真核微生物の宿主 細胞としては、 例えばサッカロミセス ·セレビシェ一 (Saccharomyces cerevisi ae) 等が挙げられる。 一方哺乳動物由来の宿主細胞としては、 例えば COS細胞、 CH0細胞、 BHK細胞等が挙げられる。 なお、 本発明の形質転換体の培養は、 宿主 細胞に適した培養条件を適宜選択して行なえばよい。
以上のようにして目的とするメグ一 1をコードするポリヌクレオチドで形質転 換した形質転換体を培養し、 産生されたメグ一 1は、 細胞内または細胞外から分 離し均一なタンパク質にまで精製することができる。 なお、 本発明の目的タンパ ク質であるメグ一 1の分離、 精製は、 通常のタンパク質で用いられる分離、 精製 方法を使用すればよく、 何ら限定されるものではない。 例えば各種クロマトダラ フィ一等を適宜選択し、 組み合わせれば、 メグ一 1を分離、 精製することができ る。
なお、 上述の他、 本発明の遺伝子、 該遺伝子を含有する組換えベクター、 該べ クタ一による形質転換体および該遺伝子を用いたメグ一 1の製造過程における遣 伝子操作の処理手段は、 「Mo l ecu l ar C l oning- A Laborat ory Manual j (Co l d Sp r ing Harbor Laboratory, N. Y. ) に記載の常法に従って行うことができる。
この他、 配列番号: 1に記載の塩基配列に基づいて、 メグ一 1遺伝子を検出す るためのプローブを設計することができる。 あるいは、 これらの塩基配列を含む DNAや RNAを増幅するためのプライマ一を設計することができる。 与えられた塩 基配列をもとに、 プローブやプライマーを設計することは当業者が日常的に行つ ていることである。 設計された塩基配列を持つオリゴヌクレオチドは化学合成に よって得ることができる。 そしてそのオリゴヌクレオチドに適当な標識を付加す れば、 さまざまなフォ一マツ卜のハイブリダィゼーシヨンアツセィに利用するこ とができる。 あるいは、 PCRのような核酸の合成反応に利用することができる。 プローブやプライマーに利用するオリゴヌクレオチドは、 少なくとも 15塩基、 好適には 25-50塩基の長さとするのが望ましい。 大部分の塩基配列を共有してい る PP4R1との間で構造上の違いとなっている 1 8アミノ酸残基をコードする領域 ( 7 4 - 1 2 7 ) に相当する部分から選択した塩基配列を含むようにすれば、 両 者の識別が可能なプローブ (あるいはプライマー) を設計することができる。 本発明は、 配列番号: 1に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチド、 または その相補鎖に相補的な少なくとも 1 5ヌクレオチドを含むポリヌクレオチドを提 供する。 ここで 「相補鎖」 とは、 A: T (RNAにおいては Tを!]に読みかえる) 、 G : Cの塩基対からなる 2本鎖ポリヌクレオチドの一方の鎖に対する他方の鎖を指 す。 また、 「相補的」 とは、 少なくとも 15個の連続したヌクレオチド領域で完 全に相補配列である場合に限られず、 少なくとも 70% 、 好ましくは少なくとも 8 0% 、 より好ましくは 90% 、 さらに好ましくは 95% 以上の塩基配列上の相同性を 有すればよい。 塩基配列の相同性は、 本明細書に記載したアルゴリズムにより決 定することができる。 メグ一 1がメサンギゥム細胞で高度な発現を示すことから、 本発明によるメグ一 1遺伝子を検出するためのプローブやプライマーは、 メサン ギゥム細胞の同定や検出に利用することができる。 特にプライマーは、 メグ一 1 遺伝子の増幅においても有用である。 本発明によるオリゴヌクレオチドには、 必 要に応じて標識や結合性のタグを付与することができる。
また本発明は、 メグ一 1の発現レベルを指標とする、 メサンギゥム増殖性腎炎 の検出方法を提供する。 本発明のポリヌクレオチドは、 メサンギゥム増殖性腎炎 を発症した腎組織のメサンギゥム細胞において発現が亢進している。 このことは 実施例において、 抗 Thylモノクローナル抗体の投与によってメサンギゥム増殖 性腎炎を誘導されたラットのメサンギゥム細胞において、 ラット ·メグ— l mRNA の強い発現が観察されたことからも裏付けられている。 したがって、 生体試料中 のメグ一 1の発現レベルを測定し、 正常な状態にある生体試料の測定結果と比較 して発現が亢進している場合に、 メサンギゥム増殖性腎炎を検出することができ る。 生体試料としては、 メサンギゥム細胞や、 尿、 血液などを用いることができ る。 メグ一 1の発現レベルは、 mRNAや、 その翻訳生成物であるメグ一 1蛋白質、 あるいはそれらの断片を測定することにより比較することができる。 生体試料中 の、 これらの成分を測定する方法は公知である。 たとえば、 メグ— l mRNAはノ —ザンブロット法ゃ RT- PCR法によって検出、 あるいは測定することができる。 またメグ一 1蛋白質やその断片は、 メグ一 1を認識する抗体によって検出するこ とができる。 メサンギゥム細胞を生体試料とする場合には、 i n s i tuハイブリダ ィゼーシヨンや、 免疫組織学的な検出方法を利用することにより、 細胞内でのこ れらの成分の局在を明らかにすることもできる。 更に本発明が明らかにしたメグ— 1をコードする遺伝子の塩基配列に基づいて、 メグ一 1の発現を制御しうるアンチセンスポリヌクレオチドが提供される。 本発 明によるアンチセンスポリヌクレオチドは、 メグ— 1のメサンギゥム細胞におけ る役割を明らかにするための重要なツールとなる。 あるいはメグ一 1の発現亢進 によってもたらされる病態の制御に有用である。 アンチセンスポリヌクレオチド が標的遺伝子の発現を抑制する作用としては、 以下のような複数の要因が存在す る。 すなわち、 三重鎖形成による転写開始阻害、 RNAポリメラーゼによって局部 的に開状ループ構造がつくられた部位とのハイプリッド形成による転写抑制、 合 成の進みつつある RNAとのハイプリッド形成による転写阻害、 イントロンとェキ ソンとの接合点でのハイブリツド形成によるスプライシング抑制、 スプライソソ —ム形成部位とのハイプリッド形成によるスプライシング抑制、 mRNAとのハイ プリッド形成による核から細胞質への移行抑制、 キヤッビング部位やポリ(A)付 加部位とのハイプリッド形成によるスプライシング抑制、 翻訳開始因子結合部位 とのハイプリッド形成による翻訳開始抑制、 開始コドン近傍のリボソーム結合部 位とのハイプリッド形成による翻訳抑制、 mRNAの翻訳領域ゃポリソ一ム結合部 位とのハイブリツド形成によるタンパク質鎖に伸長阻止、 および核酸とタンパク 質との相互作用部位とのハイブリツド形成による遺伝子発現抑制、 などである。 これらは、 転写、 スプライシング、 または翻訳の過程を阻害して、 標的遺伝子の 発現を抑制する(平島および井上 「新生化学実験講座 2 核酸 I V 遺伝子の複製 と発現」 ,日本生化学会編,東京化学同人, PP. 319-347, 1993)。
本発明で用いられるアンチセンス配列は、 上記のいずれの作用で標的遺伝子の 発現を抑制してもよい。 一つの態様としては、 遺伝子の mRNAの 5'端近傍の非翻 訳領域に相補的なアンチセンス配列を設計すれば、 遺伝子の翻訳阻害に効果的で あろう。 し力 ^し、 コード領域もしくは 3'側の非翻訳領域に相補的な配列も使用 し得る。 このように、 遺伝子の翻訳領域だけでなく非翻訳領域の配列のアンチセ ンス配列を含むポリヌクレオチドも、 本発明で利用されるァンチセンスポリヌク レオチドに含まれる。 使用されるアンチセンスポリヌクレオチドは、 適当なプロ モーターの下流に連結され、 好ましくは 3'側に転写終結シグナルを含む配列が 連結される。 このようにして調製された DNAは、 公知の方法で、 所望の宿主へ形 質転換できる。 アンチセンスポリヌクレオチドの配列は、 形質転換する宿主が持 つ内在性遺伝子 (あるいはその相同遺伝子) 、 またはその一部と相補的な配列で あることが好ましいが、 遺伝子の発現を有効に阻害できる限り、 完全に相補的で なくてもよい。
アンチセンスポリヌクレオチドを铸型として転写された RNAが、 標的遺伝子の 転写産物に対して好ましくは 90 、 最も好ましくは 95 の相補性を有するように 設計する。 アンチセンス配列を用いて、 効果的に標的遺伝子の発現を阻害するに は、 アンチセンスポリヌクレオチドの長さは、 少なくとも 15塩基以上であり、 好ましくは 100塩基以上であり、 さらに好ましくは 500塩基以上である。 通常、 用いられるアンチセンス RNAの長さは 2. 5kbよりも短い。
更に本発明が提供するメグ一 1の cDNA塩基配列に基づいて、 ゲノム中に存在 するメグ一 1遺伝子のプロモーター領域、 ェンハンサー領域を取得することがで きる。 具体的には、 特開平 6- 181767号公報、 「The Journal of Immuno l ogy (199 5) 155, 2477-2486, Proc. Nat l . Acad. Sc i . USA (1995) , 92, 3561-3565」 等と 同様の方法でこれらの制御領域の取得が可能である。 なお、 本明細書において、 プロモーター領域とは転写開始部位の上流に存在する遺伝子の発現を制御する D NA領域を、 ェンハンサー領域とはイントロンまたは 3' UTRに存在する遺伝子の 発現を制御する DNA領域をいう。
具体的には、 プロモーター領域は、 例えば、 以下の方法によって取得すること ができる。
1 ) メグ一 1の cDNAの 5'末端側をプロ一ブとし、 ヒトゲノムライブラリ一より メグー 1のプロモーター領域をクローニングする。 2) 制限酵素消化してメグ一 1遺伝子の翻訳開始コドンを含むその上流部分 (2 〜5kbp) のプロモーター領域を含む DNAを得、 塩基配列を決定する。 ヒトメサ ンギゥム細胞から調製した poly(A)+RNAを銬型とし、 メグ— 1遺伝子の 5'末端 側 cDNA配列より選択したプライマー DNAを用いたプライマー伸長法により、 転 写開始点 (+ 1) を決定する。 塩基配列から転写因子結合配列を検索し、 プロモ 一夕一活性を有する可能性がある箇所を予想する。
3) 2) で得た DNAからメグ一 1遺伝子のコード領域を除いた DNA断片をプラス ミド上にサブクローニングし、 この DNA断片の 2〜5kbp下流に、 レポーター遺 伝子としてのクロラムフエニコールァセチル転位酵素 (CAT) 遺伝子、 あるい は、 ルシフェラーゼ遺伝子を連結したレポータープラスミドを構築する。 同様に、 プロモーター領域の可能性がある各箇所を含むような形で、 制限酵素消化により、 或いは、 PCRにより、 5'末端側及び 3'末端側を順次削ったメグ— 1遺伝子上 流部分の様々な部位に該当する DNA断片を作成し、 これらの下流に、 レポーター 遺伝子としての CAT遺伝子、 あるいは、 ルシフェラーゼ遺伝子を連結したレポ 一夕一プラスミドを構築する。
4) 3) で作製したレポータープラスミドで形質転換した動物細胞の CAT或い はルシフェラーゼ活性を測定することにより、 メグ一 1遺伝子上流部分に存在す るプロモーター領域を得る。
また、 3' UTR、 イントロン中のェンハンサー領域は、 メグ一 lcDNAをプロ一 ブとし、 ヒトゲノムライブラリーよりヒト ·メグ一 1のゲノム遺伝子をクロー二 ングし、 上述のプロモータ一に関する方法と同様にして、 ェンハンサー活性を有 する領域を得ることができる。
メグ一 1遺伝子の発現を制御している転写因子は、 「新細胞工学実験プロトコ ール (秀潤社) 」 、 「バイオマニュアルシリーズ 5転写因子研究法 (羊土社) 」 、 「DNA & Cell Biology, 13, 731-742 (1994)」 に記載の方法等の公知の方法、 例 えば、 ァフィ二ティーカラムを用いた方法、 サウスウエスタン法、 フットプリン ティング法、 ゲルシフト法、 または one- hybr i d法で得ることができる。 なお、 本明細書において、 転写因子とはメグ一 1遺伝子の転写を調節している因子で、 転写の開始反応を誘導する転写開始因子と、 転写を正または負に調節する転写調 節因子をさす。
ァフィ二ティーカラム法を用いる場合は、 前述の方法で得た、 プロモーター領 域、 ェンハンサー領域をセファロース或いはラテックスビーズに固定化したカラ ムに、 核抽出液をかけ、 カラムを洗浄後、 カラムに固定化した配列と同様の配列 を有する DNAを用い、 結合した転写因子を溶出することによって、 メグ— 1遺伝 子の発現を制御している転写因子を得ることができる。
また、 サウスウエスタン法を用いる場合は、 大腸菌の発現ベクター (例えば λ gt l l ) に挿入した cDNAの発現産物を標識プローブによってスクリーニングする。 たとえばスクリ一ニングすべき cDNAを /3 _ガラクトシダーゼとの融合タンパク 質として発現させ、 これをニトロセルロース膜に吸着させる。 次いで放射性同位 元素で標識されたプロモーター領域ゃェンハンサー領域の DNA断片をプローブに し、 結合活性をもつ融合タンパク質を合成するファージを選択することによって、 メグー 1遺伝子の発現を制御している転写因子を得ることができる。
ゲルシフト法は、 遊離の DNAがタンパク質と結合したときにポリアクリルアミ ドゲルによる電気泳動の移動度に差を生じる現象に基づいている。 プロモーター 領域ゃェンハンサー領域の DNA断片をプローブとし、 転写因子が含まれる試料
(たとえば核タンパク質抽出液) と混合して、 低イオン強度の元で電気泳動分析 する。 転写因子の結合は、 遊離の DNAとは違った移動度のバンドとして検出され る。 ゲルシフト法は、 タンパク質の混合物から高い感度で転写因子を分離するこ とができる。
ゲルシフト法によって得られた DNAと転写因子の複合体を、 更にフットプリン ト法によって解析すると、 転写因子の結合部位を決定することができる。 フット プリント法は、 DNA上にタンパク質が結合すると DNase Iの消化から保護される 現象を利用している。 すなわち、 末端を32 Pで標識したプロモーター領域ゃェン ハンサー領域の DNAを、 転写因子の共存化で DNase Iによって部分消化し、 これ を塩基配列決定用の変性ポリアクリルアミドゲルで分離する。 転写因子の無い状 態で同様の処理を行った結果と比較すると、 転写因子の結合によってバンドの消 失が観察されることから、 その結合部位の推定が可能となる。
本発明はまた、 メグ一 1を認識する抗体を提供する。 本発明の抗体には、 例え ば、 配列番号: 2に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質に対する抗体が含ま れる。 メグ一 1または本発明のメグ一 1の部分ペプチドに対する抗体 (例えばポ リクローナル抗体、 モノクローナル抗体) または抗血清は、 本発明のメグ一 1、 本発明のメグ— 1の部分ペプチド、 あるいは本発明による C- myc- (Hi s) 6- Tag-メ グー 1や MBP-メグ— 1のような融合タンパク質を抗原として用い、 公知の抗体 または抗血清の製造法に従って製造することができる。
本発明のメグ— 1、 または本発明のメグ一 1の部分ペプチドは、 温血動物に対 して投与による抗体産生が可能な部位に、 公知の担体や希釈剤と共に投与される。 投与に際して抗体産生能を高めるため、 完全フロイントアジュバントゃ不完全フ ロイントアジュバントを投与してもよい。 投与は通常 〜 6週毎に 1回ずつ、 計 2〜10回程度行われる。 抗体産生に用いられる温血動物としては、 例えばサル、 ゥサギ、 ィヌ、 モルモット、 マウス、 ラット、 ヒッジ、 ャギ、 あるいはニヮトリ 等が挙げられるが、 マウスおよびゥサギが好ましく用いられる。
モノクローナル抗体産生細胞の作製に際しては、 抗原を免疫された温血動物、 例えばマウスから抗体価の認められた個体を選択し最終免疫の 2〜5日後に脾臓 またはリンパ節を採取し、 それらに含まれる抗体産生細胞を骨髄腫細胞と融合さ せることにより、 モノクローナル抗体産生ハイプリドーマを調製することができ る。 抗血清中の抗体価の測定は、 例えば後記の標識化メグ一 1と抗血清とを反応 させた後、 抗体に結合した標識剤の活性を測定することによりなされる。 融合操 作は既知の方法、 例えばケーラーとミルスタインの方法 (Nature, 256, 495 (19 75) ) に従い実施できる。 融合促進剤としてはポリエチレングリコール (PEG) や センダイウィルスなどが挙げられるが、 好ましくは PEGが用いられる。
骨髄腫細胞としては例えば X- 63Ag8、 NS-K P3UK SP2/0、 AP - 1などが挙げら れるが、 X-63Ag8が好ましく用いられる。 用いられる抗体産生細胞 (脾臓細胞) 数と骨髄腫細胞数との好ましい比率は 1 : 20〜20: 1であり、 PEG (好ましくは P EG1000〜PEG6000) が 10〜8 (^程度の濃度で添加され、 20〜40で、 好ましくは 30 〜37 で 1〜10分間インキュベートすることにより効率よく細胞融合を実施でき る。 抗メグー 1抗体産生ハイプリドーマのスクリーニングには種々の方法が使用 できるが、 例えばメグ一 1抗原を直接又は担体と共に吸着させた固相 (例えば、 マイクロプレート) にハイブリド一マ培養上清を添加し、 次に放射性物質や酵素 などで標識した抗免疫グロプリン抗体 (細胞融合に用いられる細胞がマウスの場 合、 抗マウス免疫グロブリン抗体) が用いられる。 またはプロテイン Aを加え、 固相に結合した抗メグー 1モノクローナル抗体を検出する方法、 抗免疫グロプリ ン抗体又はプロティン Aを吸着させた固相にハイプリドーマ培養上清を添加し、 放射性物質や酵素などで標識したメグ一 1を加え、 固相に結合した抗メグー 1モ ノクローナル抗体を検出する方法などが挙げられる。
抗メグー 1モノクローナル抗体の選別およびクローニングは、 自体公知または それに準じる方法に従って行うことができる。 通常 HAT (ヒポキサンチン、 アミ ノプテリン、 チミジン) を添加した動物細胞用培地で行われる。 選別、 クロー二 ングおよび育種用培地としては、 ハイプリドーマが生育できるものならばどのよ うな培地を用いてもよい。 例えば、 1〜20%、 好ましくは 10〜20%の牛胎児血清を 含む RPMI 1640培地 (大日本製薬 (株) ) 、 1〜10%の牛胎児血清を含む GIT培地 (和光純薬工業 (株) ) 、 またはハイプリドーマ培養用無血清培地 (SFM- 101、 日水製薬 (株) ) などを用いることができる。 培養温度は、 通常 20〜40で、 好 ましくは約 37 である。 培養時間は、 通常 5日〜 3週間、 好ましくは 1週間〜 2 週間である。 培養は、 通常^炭酸ガス下で行われる。 ハイプリ ドーマ培養上清 の抗体価は、 上記の抗血清中の抗メグー 1抗体価の測定と同様にして測定できる。 クロ一ニングは、 通常半固体アツガー法や限界希釈法などのそれ自体公知の方法 で行うことができ、 クローン化されたハイプリドーマは、 好ましくは無血清培地 中で培養され、 至適量の抗体をその上清に与える。 目的のモノクローナル抗体は 腹水化して得ることもできる。
本発明によるモノクローナル抗体は、 メグ一 1に特異的なェピトープを認識す るものを選択することによって他のタンパク質と交差しないものとすることがで きる。 一般的に、 そのタンパク質を構成するアミノ酸配列の中から、 連続する少 なくとも 7以上のアミノ酸残基、 望ましくは 10- 20アミノ酸のアミノ酸配列によ つて提示されるェピトープは、 そのタンパク質に固有のェピトープを示すといわ れている。 したがって、 配列番号: 2に記載されたアミノ酸配列から選択され、 かつ連続する少なくとも 7ァミノ酸残基からなるアミノ酸配列を持つペプチドに よって構成されるェピトープを認識するモノクローナル抗体は、 本発明における メグ— 1特異的なモノクローナル抗体といえる。 より具体的には、 たとえば前記 PP4R1との構造上の違いをもたらしている 1 8アミノ酸残基 (N末端から 1 8— 3 5位) からなる領域を認識し、 たとえば PP4R1のような相同性の高いタンパク質 との構造的な違いを識別する抗体は、 本発明によるメグ一 1を認識する抗体の望 ましい態様と言う事ができる。
抗メグー 1モノク口一ナル抗体の分離精製は通常のポリク口一ナル抗体の分離 精製と同様に免疫グロブリンの分離精製法に従って行われる。 公知の精製法とし ては、 例えば、 塩析法、 アルコール沈殿法、 等電点沈殿法、 電気泳動法、 イオン 交換体 (例えば DEAE) による吸脱着法、 超遠心法、 ゲル濾過法、 抗原結合固相 またはプロティン Aまたはプロティン Gなどの活性吸着剤により抗体のみを採取 し、 結合を解離させて抗体を得る特異的精製法のような手法を示すことができる。 このようにして得られたメグ一 1を認識する本発明によるモノクローナル抗体、 あるいはポリクローナル抗体は、 メサンギゥム細胞に関連する疾病の診断や治療 に利用することが可能である。 またメグ一 1がメサンギゥム細胞に高度に発現し ているタンパク質であることから、 メサンギゥム細胞の同定や検出のためのツー ルとしても、 これらの抗体を利用することができる。 細胞が持つタンパク質を免 疫学的に検出する方法は公知である。 またこれらの抗体を用いてメグ一 1を測定 する方法としては、 不溶性担体に結合させた抗体と標識化抗体とによりメグ一 1 を反応させて生成したサンドイッチ錯体を検出するサンドイッチ法、 また、 標識 ヒト ·メグ一 1と検体中のヒト由来メグ一 1を抗体と競合的に反応させ、 抗体と 反応した標識抗原量から検体中のヒト由来メグ一 1を測定する競合法等を示すこ とができる。
サンドイッチ法によるメグ一 1の測定においては、 まず、 固定化抗体とメグ— 1とを反応させた後、 未反応物を洗浄によって完全に除去し、 標識化抗体を添加 して固定化抗体ーメグー 1標識化抗体を形成させる 2ステツプ法、 もしくは固定 化抗体、 標識化抗体およびメグ一 1を同時に混合する 1ステップ法などを用いる ことができる。
測定に使用される不溶性担体は、 例えばポリスチレン、 ポリエチレン、 ポリプ ロピレン、 ポリ塩化ビニル、 ポリエステル、 ポリアクリル酸エステル、 ナイロン、 ポリアセタール、 フッ素樹脂等の合成樹脂、 セルロース、 ァガロース等の多糖類、 ガラス、 金属などが挙げられる。 不溶性担体の形状としては、 例えば卜レイ状、 球状、 粒子状、 繊維状、 棒状、 盤状、 容器状、 セル、 試験管等の種々の形状を用 いることができる。 抗体を吸着した担体は、 適宜アジ化ナトリウム等の防腐剤の 存在下、 冷所に保存する。
抗体の固相化は、 公知の化学結合法又は物理的吸着法を用いることができる。 化学的結合法としては例えばダルタルアルデヒドを用いる方法、 N-スクシ二イミ ジル -4- (N-マレイミドメチル) シクロへキサン- 1-カルボキシレート及び N-ス クシニイミジル- 2-マレイミドアセテートなどを用いるマレイミド法、 卜ェチル- 3- (3-ジメチルァミノプロピル) カルポジイミド塩酸などを用いるカルポジイミ ド法が挙げられる。 その他、 マレイミドベンゾィル -N-ヒドロキシサクシニミド エステル法、 N-サクシミジル- 3- (2-ピリジルジチォ) プロピオン酸法、 ビスジ ァゾ化べンジジン法、 ジパルミチルリジン法が挙げられる。 あるいは、 先に被検 出物質とェピトープの異なる 2種類の抗体を反応させて形成させた複合体を、 抗 体に対する第 3の抗体を上記の方法で固相化させておいて捕捉することも可能で ある。
標識物質は、 免疫学的測定法に使用することができるものであれば特に限定さ れない。 具体的には、 酵素、 蛍光物質、 発光物質、 放射性物質、 金属キレート等 を使用することができる。 好ましい標識酵素としては、 例えばペルォキシダ一ゼ、 アルカリフォスファタ一ゼ、 /3 - D-ガラクトシダーゼ、 リンゴ酸デヒドロゲナ一 ゼ、 ブドウ球菌ヌクレア一ゼ、 デル夕- 5-ステロイドイソメラーゼ、 α -グリセ口 —ルホスフェートデヒドロゲナーゼ、 トリオースホスフエ一トイソメラ一ゼ、 西 洋わさびパーォキシダ一ゼ、 ァスパラギナーゼ、 グルコースォキシダ一ゼ、 リボ ヌクレアーゼ、 ゥレアーゼ、 力夕ラーゼ、 グルコース一 6—ホスフェートデヒド 口ゲナ一ゼ、 ダルコアミラーゼ、 およびアセチルコリンエステラーゼ等が挙げら れる。 好ましい蛍光物質としては、 例えばフルォレセインイソチアネート、 フィ コビリプロテイン、 ローダミン、 フィコエリ トリン、 フィコシァニン、 ァロフィ コシァニン、 およびオルトフタルアルデヒド等が挙げられる。 好ましい発光物質 としてはイソルミノール、 ルシゲニン、 ルミノール、 芳香族ァクリジニゥムエス テル、 イミダゾール、 ァクリジニゥム塩及びその修飾エステル、 ルシフェリン、 ルシフェラーゼ、 およびェクオリン等が挙げられる。 そして好ましい放射性物質 としては、 I、 127I、 I、 l4C、 ¾、 32P、 あるいは35 S等が挙げられる。
前記標識物質を抗体に結合する手法は公知である。 具体的には、 直接標識と間 接標識が利用できる。 直接標識としては、 架橋剤によって抗体、 あるいは抗体断 片と標識とを化学的に共有結合する方法が一般的である。 架橋剤としては、 Ν, Ν' -オルトフエ二レンジマレイミド、 4- (Ν-マレイミドメチル) シクロへキサン 酸 . N-スクシンイミドエステル、 6-マレイミドへキサン酸 · N-スクシンイミドエ ステル、 4, 4' -ジチォピリジン、 その他公知の架橋剤を利用することができる。 これらの架橋剤と酵素および抗体との反応は、 それぞれの架橋剤の性質に応じて 既知の方法に従って行えばよい。 この他、 抗体にピオチン、 ジニトロフエニル、 ピリドキサール又はフルォレサミンのような低分子ハプテンを結合させておき、 これを認識する結合成分によって間接的に標識する方法を採用することもできる。 ピオチンに対してはアビジンやストレプトアビジンが認識リガンドとして利用さ れる。 一方、 ジニトロフエニル、 ピリ ドキサール又はフルォレサミンについては、 これらのハプテンを認識する抗体が標識される。 抗体を標識する場合、 西洋わさ びペルォキシダーゼを標識化酵素として用いることができる。 本酵素は多くの基 質と反応することができ、 過ヨウ素酸法によって容易に抗体に結合させることが できるので有利である。 また、 抗体としては場合によっては、 そのフラグメント、 例えば Fab'、 Fab、 F (ab' ) 2を用いる。 また、 ポリクローナル抗体、 モノクロ ーナル抗体にかかわらず同様の処理により酵素標識体を得ることができる。 上記 架橋剤を用いて得られる酵素標識体はァフィ二ティ一クロマトグラフィ一等の公 知の方法にて精製すれば更に感度の高い免疫測定系が可能となる。 精製した酵素 標識化抗体は、 防腐剤としてチメロサール (Th imerosal)等を、 そして安定剤とし てグリセリン等を加えて保存する。 標識抗体は、 凍結乾燥して冷喑所に保存する ことにより、 より長期にわたって保存することができる。
標識化剤が酵素である場合には、 その活性を測定するために基質、 必要により 発色剤が用いられる。 酵素としてペルォキシダーゼを用いる場合には、 基質溶液 として H202を用い、 発色剤として 2, 2' -アジノ-ジ - [3 -ェチルベンズチアゾリン スルホン酸]アンモニゥム塩 (ABTS) 、 5-ァミノサリチル酸、 オルトフエ二レン ジァミン、 4-ァミノアンチピリン、 3,3' , 5,5' _テトラメチルべンジジン等を使用 することができる。 酵素にアルカリフォスファタ一ゼを用いる場合は、 基質とし てオルトニトロフエニルフォスフエ一ト、 パラニトロフエ二ルリン酸等を使用す ることができる。 酵素に 3 -D-ガラクトシダーゼを用いる場合は基質としてフル ォレセイン-ジ- ()3 - D-ガラクトピラノシド) 、 4-メチルゥンベリフエニル - j3 - D -ガラクトピラノシド等を使用することができる。 本発明は、 また、 前述のモノ クローナル抗体、 あるいはポリクロ一ナル抗体を標識して、 あるいは固相化して メグ一 1の免疫学的測定用試薬としたもの、 更にはこの試薬に標識検出用の指示 薬や対照試料等をキット化したのものをも含むものである。
本発明におけるメグ一 1の測定対象は、 血漿、 血清、 血液、 尿、 組織液、 ある いは脳脊髄液等の体液等、 メグ— 1、 あるいはメグ一 1の前駆体や断片を含む生 体試料であれば限定されない。
加えて本発明は、 メグ一 1遺伝子の発現レベルを変化させたトランスジェニッ ク非ヒト脊椎動物に関する。 ここでメグ一 1遺伝子とは、 メグ一 1をコードする cDNA、 ゲノム DNAあるいは合成 DNAを含む。 また、 遺伝子の発現には、 転写と翻 訳のいずれのステップも含まれる。 本発明によるトランスジエニック動物は、 メ グー 1の機能あるいは発現調節の研究、 ヒトのメサンギゥム細胞に関連する疾患 のメカニズムの解明、 医薬品のスクリーニング ·安全性に用いる疾患モデル動物 の開発に有用である。
本発明においては、 メグ— 1遺伝子の発現を正常に調節しているいくつかの重 要な部位 (ェンハンサー、 プロモーター、 イントロン等) の一部に欠失、 置換、 挿入などの変異を起こさせることにより、 本来の遺伝子の発現レベルと比較して 人工的に上昇または下降するように修飾することができる。 このような修飾は、 メグ一 1遺伝子の転写の調節である。 一方、 ェキソンの一部を欠損させたり、 翻 訳領域への点突然変異の導入により終止コドンへ置換することにより、 タンパク 質への翻訳を修飾することもできる。 この変異の導入は、 公知の方法により行う ことができ、 トランスジエニック動物を得ることができる。
トランスジエニック動物とは狭義には遺伝子組換えにより、 外来遺伝子が生殖 細胞に人為的に導入された動物のことをいい、 広義にはアンチセンス RNAを用い て特定の遺伝子の機能を抑えたアンチセンス ' トランスジエニック動物や、 胚性 幹細胞 (ES細胞) を用いて特定の遺伝子をノックアウトさせた動物、 点突然変 異 DNAを導入した動物を含み、 個体発生の初期に外来遺伝子が安定して染色体に 導入され、 その子孫に遺伝形質として伝達され得る動物のことをいう。 本明細書 中でいうトランスジエニック動物とはヒト以外のすべての脊椎動物を含む。
トランスジエニック動物の作製方法は、 遺伝子と卵を混合させてリン酸カルシ ゥムで処理する方法や、 位相差顕微鏡下で前核期卵の核に、 微小ピペットで遺伝 子を直接導入する方法 (マイクロインジェクション法、 米国特許第 48731 91号) 、 胚性幹細胞 (ES細胞) を使用する方法などがある。 その他、 レトロウイルスべ クタ一に遺伝子を挿入し、 卵に感染させる方法、 また、 精子を介して遺伝子を卵 に導入する精子ベクター法等が開発されている。 精子ベクター法とは、 精子に外 来遺伝子を付着またはエレクトロポレーション等の方法で精子細胞内に取り込ま せた後に、 卵子に受精させることにより、 外来遺伝子を導入する遺伝子組換え法 である (M. Lav i t ranoe t ら Ce l l , 57, 71 7, 1989) 。
あるいはバクテリオファージ P Iの c re/l oxPリコンビナーゼ系や Saccharomyc es cerev i s i aeの FLPリコンビナーゼ系等の i n v i voにおいて部位特異的遺伝子 組み換えを用いることもできる。 また、 レトロウイルスを使用して、 非ヒト動物 へ目的タンパク質のトランスジーンを導入する方法も報告されている。
マイクロインジェクション法によるトランスジエニック動物作製方法は、 例え ば以下に示すようにして行われる。 まず、 発現制御に関わるプロモー夕一、 特定 のタンパク質をコードする遺伝子、 ポリ Aシグナルから基本的に構成されるトラ ンスジーンが必要である。 プロモーター活性により特定分子の発現様式や発現量 が左右され、 また、 導入トランスジーンのコピー数や染色体上の導入部位により 作製されたトランスジエニック動物は系統間で異なるため、 各系統間で発現様 式 ·発現量を確認する。 非翻訳領域ゃスプライシングにより発現量が変化するこ とが判明しているため、 予めポリ Aシグナルの前にスプライシングされるイント ロン配列を導入してもよい。 受精卵に導入する遺伝子はできるだけ純度の高いも のを使用することが重要である。 使用する動物としては、 受精卵採取用マウス (5〜6週齢) 、 交配用雄マウス、 偽妊娠雌マウス、 輸精管結紮雄マウス等が用 いられる。
効率よく受精卵を得るために、 ゴナドトロピン等により排卵を誘発してもよい。 受精卵を回収し、 マイクロインジェクション法にて卵の雄性前核にインジェクシ ヨンピペット中の遺伝子を注入する。 注入した卵を輸卵管に戻すための動物 (偽 妊娠雌マウス等) を用意し、 一匹に対して約 10〜15個を移植する。 その後、 誕 生したマウスにトランスジーンが導入されているか否か、 尾の先端部からゲノム DNAを抽出し、 サザン法あるいは PCR法によりトランスジーンを検出するか、 あ るいは相同組み換えが起こったときのみに活性化するマーカー遺伝子を挿入した ポジティブクローニング法により選択することができる。 さらに、 トランスジ一 ンの発現を確認するため、 ノザン法もしくは RT-PCR法によりトランスジーン由 来転写産物を検出する。 または、 タンパク質に対する特異的抗体によって、 ゥェ スタンプロッティング法による検出も可能である。
本発明のノックァゥトマウスは、 マウスメグ— 1遺伝子の機能が失われるよう に処理されたものである。 ノックァゥトマウスとは相同組換え技術で任意の遺伝 子を破壊し、 機能を欠損させたトランスジエニックマウスをいう。 胚性幹細胞を 用いて相同組換えを行い、 一方の対立遺伝子を改変 ·破壊した胚性幹細胞を選別 し、 ノックアウトマウスを作製することができる。 例えば、 受精卵の胚盤胞や 8 細胞期胚に遺伝子を操作した胚性幹細胞を注入して、 胚性幹細胞由来の細胞と胚 由来の細胞が混ざったキメラマウスを得る。 このキメラマウス (キメラとは、 2 個以上の受精卵に基づいた体細胞で形成される単一個体をいう) と正常マウスを 交配すると、 一方の対立遺伝子の全てが改変 ·破壊されたへテロ接合体マウスを 作製することができる。 さらに、 ヘテロ接合体マウス同士を交配することで、 ホ モ接合体マウスが作製できる。 本発明によるトランスジエニック動物は、 これら ヘテロ接合体と、 ホモ接合体のいずれをも含むものである。
相同組換えとは、 遺伝子組換え機構で塩基配列が同じ、 または非常に類似して いる 2つの遺伝子間で起こる組換えのことをいう。 相同組換えを起こした細胞の 選別には PCRを使用することができる。 挿入遺伝子の一部と挿入が期待される領 域の一部をプライマーとして使った PCR反応を行い、 増幅産物ができた細胞で相 同組換えを起こしていることが判明する。 また、 胚幹細胞で発現している遺伝子 に相同組み換えを起こさせる場合には、 導入遺伝子にネオマイシン耐性遺伝子を 結合させておき、 導入後に細胞をネオマイシン耐性にさせることにより選択する ことができる等、 公知の方法およびそれらの変法を用いて容易に選択することが できる。 図面の簡単な説明
図 1は、 正常ヒト糸球体組織の、 メグ一 1特異的なプローブによるインサイチ ュハイブリダィゼーシヨンの結果を示す顕微鏡写真 (40倍) である。
図 2は、 正常ヒト糸球体組織の、 メグ一 1特異的なプローブによるインサイチ ュハイブリダィゼーシヨンの結果を、 図 1の場合と比較して、 より高倍率で示す 顕微鏡写真 (80倍) である。
図 3は、 抗 Thyl抗体によりメサンギゥム増殖性腎炎を誘発したラッ卜の糸球 体から調製した全 RNAの泳動結果を示す写真 (図中、 「t o t a l RNA」 で示す) 、 およびそれらのメグ— 1特異的なプローブによるノーザンブロット解析の結果を 示す写真 (図中、 「ra t Meg- 1」 で示す) である。 発明を実施するための最良の形態
以下本発明を実施例として更に具体的に説明するが、 本発明は該実施例に限定 されるものではない。 [実施例 1] ヒトメサンギゥム細胞の初代培養
58才の男性から摘出した正常なヒト腎臓から、 ヒト糸球体腎臓メサンギゥム 細胞を単離した。 腎皮質を、 無菌条件下で分離し、 細分化し、 いくつかの篩を通 過させた。 用いる篩は、 段階的に孔径を小さくしていった。 75〜200/ mの孔径 の篩に捕捉された糸球体を、 洗浄し、 100/ig/mLのコラゲナーゼ (Washington B iochemical社製) と共に 37 で 20分間インキュベートした。 洗浄後、 糸球体を、 25mM HEPES, 10¾ Nu-serum (Collaborative Biomedical Products社, Bedford, MA) および抗生物質 (lO g/mLのペニシリン、 ストレプトマイシン、 およびフ アンギゾン) を含む培地 199 (Gibco BRL社, Gai thersburg, MD) に再懸濁させ、 5%C02インキュベーター内でインキュベートした。 3継代目に、 メサンギゥム細 胞を、 典型的な形態学的特徴、 トリプシン、 ピューロマイシンおよび D-バリン に対する耐性、 ァクチン (Zymed Laboratories社, San Francisco, CA) 、 抗 VL A(very late ant igen)-l, 3, 5 (I匪 unotech) の免疫染色に対して陽性を示すこと、 ならびに第 VIII因子 (Dako社, CA) の免疫染色に陰性を示すことなどの一連の 基準により同定した。
[実施例 2] ヒト培養メサンギゥム細胞からの mRNAの単離
6継代目に、 グァニジンイソチオシァネート (GTC) 法を用いて、 全 RNAをヒ トメサンギゥム細胞から単離した。 即ち、 実施例 1の細胞の血清を含む培養液中 のメサンギゥム細胞コンフルェント培養物をリン酸緩衝生理食塩水 (PBS) で洗 浄し、 5.5mM GTC溶液中で溶解させた。 DNAは 18ゲージの針を通過させることに より除去した。 核およびその他の細胞破片は 5, OOOXgで 90秒間遠心分離するこ とにより沈殿させた。 上清をセシウムトリフルォロアセテート (CsTFA) 層に注 意深く載せ、 15Τ 125, OOOXgで 24時間遠心分離した。 RNAペレットを TEバッ ファーに溶解させた。 オリゴ dTセルロースカラム (フアルマシア社) により、 p oly(A)+RNAを分離した。
[実施例 3] 3'領域 cDNAライブラリーの構築 poly(A)+RNAを铸型として、 pUC19を基礎とするベクタープライマ一 [Norrande r J.,et al.,Gene,26, 10卜106(1983)]を用いた cDNA合成を行った。 このべクタ 一プライマー DNAは、 HincII末端、 および Tテールをもつ Pstl末端を有し、 Mbo I部位 (GATC) でダム 'メチル化 (dam- methylated) されていた。 第 2鎖の合成 の後、 cDNA配列、 およびベクターの lacZ遺伝子内の単一 BamHI部位を、 それぞ れ Mbolおよび BamHIで切断し、 次に、 低 DNA濃度で環状化およびライゲーショ ンを行った。 ライゲーシヨン混合物のうちの一部を大腸菌に形質転換した。 得ら れた形質転換体をランダムに選択し、 簡単に加熱することにより個別に溶解させ た。 cDNA挿入配列を、 PUC19クロ一ニンダサイトに隣接するプライマ一 (5'- TGT AAAACGACGGCCAGT-3' /配列番号: 3および 5' -ACCATGATTACGCCAAGCTTG-3 ' /配列番 号: 4) を用いたペアード PCRにより増幅させた。 得られた短い二本鎖 DNAを、 サイクル配列決定反応に用い、 自動配列決定機で解析した。
[実施例 4] メサンギゥム細胞で特異的に発現している遺伝子の単離
メサンギゥム細胞で特異的に発現している遺伝子を同定するため、 本発明者は、 大規模な DNA配列決定およびコンピュータによるデータ処理を行った。 このこと により、 様々な異なる細胞および臓器における転写産物を同時に比較することが でさた (Y. Yasuda et al. , Kidney Internatinal 53:154-158, 1998; K. Matsub ara et al. , Gene. 135, 265 (1993); K. Okubo et al. , Nat. Gen. 2, 173 (19 92)) 。 ヒト培養メサンギゥム細胞の 3'領域 cDNAライブラリーの大規模 DNA配 列決定を行い、 ランダムに選択した 1836個のクローンの部分配列を決定した。 クローンの配列相同性を、 相互に比較し、 さらに FASTAプログラムを用いて DNA データバンク GenBankと比較した。 様々な臓器および細胞からの mRNAをドット ブロット解析することにより、 メサンギゥム細胞で特異的に発現しているクロ一 ンが選択された。 その結果、 本発明者のメサンギゥム細胞 cDNA
おいてきわめて高い頻度で検出されるいくつかのクローンが得られた。
[実施例 5] 5' RACE法による完全長 cDNAのクローニング 「5'- Full RACE Core Set」 (宝酒造 (株) 製) を用いて、 下記の実験を行つ た。 0.5mLマイクロチューブにヒト培養メサンギゥム細胞から調製した poly(A) + RNA (O. g/ l) 4.0 L、 10XRTバッファ一 1.5 L、 RNaseインヒビ夕一 (40 Wfil) 0.5 L、 AMV Reverse Transcriptase XL (W ml) L, 5'末端リン酸 化 RTプライマー (5' - pTCAGAGAGGTCATTC/配列番号: 5、 200PDIO1/ D Lを 加え、 RNase Free dH20 7 で全量を 15 Lとした。 この反応液を 「Takara PC R Thermal Cyclerj (宝酒造 (株) 製) にセットし、 30で10分、 50で60分、 8 0 2分、 4°C10分インキュベーションし、 第 1鎖 cDNAを得た。
反応液から 15 Lを 5Xハイブリッド RNA変性バッファー 15 L、 H20 45 を 含む 0.5mLマイクロチューブ中に加えた。 RNaseH 1 Lを加え、 30°Cで 1時間反 応させた。 反応終了後、 エタノール 150 Lを加え - 70でで 30分冷却後、 遠心し、 上清を除去し、 沈殿物を集めた。
得られた沈殿物に 5XRNA (ssDNA) ライゲーシヨンバッファ一8 し 40% PEG #600 20 L、 H20 を加え、 よく混ぜ、 T4リガーゼを L加えて 16 で 1 5時間反応し、 環化一本鎖 cDNAを得た。
得られた環化一本鎖 cDNAを TEバッファーで 10倍希釈したものを铸型とし、 一次 PCRをおこなった。 反応条件は、 10XLA PCRバッファ一 II (Mg plus) dNTP混合物 (2.5mM) 8^L、 一次 PCR SIプライマー (5' - TCATTGATGGGTCCTCM/ 配列番号: 6、 20pmol/ L)0.5 一次 PCR A1プライマー (5' - AGATTCTTGAGCT CAGAT/配列番号: 7、 20pmol/ iL) 0.5 し TaKaRa LA TaqTM (5U/ L) 0.5 L、 減菌水で全量を 50^Lとした。 「Takara PCR Thermal Cyclerj にセットし、 9 4で3分加熱後、 94 30秒、 60°C30秒、 72 2分を 25サイクル反応させた。
一次 PCR反応溶液から 1 /Lを铸型とし、 10XLA PCR TMバッファー II (Mg2+pl us) 5 し dNTP混合物 (2·5πιΜ) 8 L、 二次 PCR S2プライマー (5' - AATGGTGGCA TAMCATG/配列番号: 8、 20pmol/ L) 0.5 L, 二次 PCR A2プライマー (5' - ACA GACAMTTGMCTTC/配列番号: 9、 20pmol/ L) 0.5^し TaKaRa LA TaqTM (5U//X L) 0.5 L、 減菌水で全量を 50 Lとした。 「Takara PCR Thermal Cyclerj にセ ットし、 94°C30秒、 60°C30秒、 72で 2分で 30サイクル反応させた。
0.75 %ァガロースゲル電気泳動法でバンドが得られていることを確認し、 反応 溶液中から を 「0riginal TA Cloning Kitj (Invitrogen社) を用いてサ ブクローニングし、 得られたプラスミドに挿入された遺伝子断片の塩基配列をジ デォキシターミネ一シヨン法により決定した。
その結果、 得られた塩基配列は、 遺伝子産物の N末部分をコードする領域を含 み 5'非翻訳領域として約 50ヌクレオチドを含んでいた。 予想される開始コドン ATGの位置が、 コンセンサス配列と一致し、 最長の 0RF ( 「the first ATG rul e」 を満足する) を与えた。 この cDNAの塩基配列において最も長い 0RFに基づく 950アミノ酸残基を遺伝子産物の推定アミノ酸配列とした。 このアミノ酸配列 を持つタンパク質を本発明者はメグ一 1 (Meg- 1)と名づけた。 meg- 1 cDNAの塩基 配列を配列番号: 1に、 meg-1の推定アミノ酸配列を配列番号: 2に示す。
[実施例 6] メサンギゥム特異的遺伝子の機能解析 (1)
SwissProtデータベースで FASTAプログラムによりアミノ酸ホモロジ一検索を 行ったところ、 このメグ一 1が新規なタンパク質であることを確認した。 またホ モロジ一を持つタンパク質としては、 プロテインセリンノスレオニンフォスファ 夕一ゼ 4関連タンパク質 PP4R1が確認された。 メグ— 1と PP4RIは、 アミノ酸配列 において 97. 9 、 cDNAの塩基配列においては 98. 3%のホモロジ一を持つ。 その他、 配列番号: 2として示すアミノ酸配列の一部 (778位— 950位の 1 73アミノ酸残基) は、 胎児脳由来の ESTとして登録された cDNAの塩基配列 (HSU79267)と塩基配列で 99.4¾、 アミノ酸配列で 100%—致している。 このクロー ンは IMAGE consortiumによる Soares library 1NIBに由来するもので、 単に塩 基配列の一部を決定したにすぎず、 その機能やボディマッピングについてはまつ たく知られていない。 続いてメグ— 1のアミノ酸配列をモチーフ検索した。 検索には、 PSORT WWW Se rver (http://psort.nibb. a jp: 8800/)、 および MOTIF (ht tp:〃 www. mot i f . genom e.ad. jp/)を利用した。 その結果、 メグ— 1はいくつかのリン酸化モチーフを含 んでいることが明らかとなった。 具体的には、 以下のリン酸化酵素によるリン酸 化モチーフの存在が確認された。 その他に、 6つの N-グリコシレーシヨン部位 が認められた。 更に核移行シグナルの存在が示唆され、 推測される核局在は 52. 2%であった。
cAMP/cGMP依存性夕ンパク質リン酸化部位: 1
カゼィン ·カイネース II リン酸化部位: 2 2
プロテイン力イネ一ス Cリン酸化部位: 1 1
チロシンカイネースリン酸化部位: 2
また、 これらの事実に基づいて、 950アミノ酸残基からなる上記推定アミノ 酸配列がメグ一 1のアミノ酸配列であることが確認された。 このアミノ酸配列か らなるタンパク質の p Iの理論値は 4.49である。
[実施例 7] メグ一 1の機能解析 (2) —組織分布
メグ一 1のノーザンブロット解析は、 以下のようにして行った。 3'領域 cDNA ライブラリー (実施例 3) のポジティブクローンのインサートを、 ランダム DNA ラベリングによって RI標識しプローブとして用いた。 試料として以下の細胞か ら単離した poly(A)+RNA (2 fig) を、 2.2Mホルムアミドを含む ァガロースゲ ルで分離し、 ニトロセルロースフィルターへ転写した。 フィルターを Rapid Hyb 溶液 (Amersham ¾:, Arlington Heights, IL) 中でノ、イブリタィズさ "た。 ノ、ィ ブリダィズ後に、 60°Cで、 0.1XSSPE/0. SDSという最終ストリンジエンシーで 洗浄した。
ヒ卜の複数の初代培養細胞および組織のノーザンブロット、 ヒ卜の癌細胞株の ノーザンブロットのための試料は、 Clontech (Palo Alto, CA) から購入した。 初代培養細胞としては、 メサンギゥム細胞、 ヒト皮膚上皮細胞、 ヒト腎皮質上皮 細胞、 ヒ卜臍帯静脈内皮細胞、 およびヒ卜平滑筋細胞の初代培養細胞由来の 2 gの poly(A)+RNAを試料とした。 ヒトの癌細胞株のノーザンプロットには、 前骨 髄球白血病 HL-60、 HeLa細胞 S3、 慢性骨髄性白血病 K- 562、 リンパ芽球白血病 M 0LT- 4、 Burkitt リンパ腫 Raj i、 大腸腺癌 SW480、 肺癌 A549、 および黒色腫 G361 由来の の P0ly(A)+RNAを試料とした。 組織のノーザンブロットには、 心、 脳、 胎盤、 肺、 肝、 骨格筋、 腎、 および降由来の 2/ gの poly(A)+RNAを試料と した。 ハイブリダィゼーシヨンおよび洗浄は上記と同様にして行った。 結果は表 1—表 3に示すとおりである。
表 1
初代培養細胞
ヒトメサンギゥム細胞
ヒト皮膚繊維芽細胞 + +
ヒト腎皮質上皮細胞 +
ヒト臍帯静脈内皮細胞 土〜 +
ヒト平滑筋細胞 土〜_ h 表 2
ヒト癌細胞株
前骨髄球白血病 HL-60 + +
HeLa細胞 S3
慢性骨髄性白血病 K- 562
リンパ芽球白血病 M0LT-4
Burkitt リンパ腫 Raj i 土
大腸腺癌 SW480 + + +
肺癌 A549 + + +
黒色腫 G361 + + 表 3
ヒト組織
脳 + +
胎盤 + + +
肝 +
骨格筋 + +
+ +
塍 + +
メグ一 1 cDNAプローブを用いたノーザンブロット解析で、 メサンギゥム培養 細胞に単一の転写産物 (約 4. 5kb) が検出された。 ヒ卜の初代培養細胞において は、 メグ一 1遺伝子がメサンギゥム細胞で特に高度に発現していることが特徴的 であった。 その他の初代培養細胞では、 皮膚繊維芽細胞ゃ腎皮質上皮細胞で発現 が観察され、 臍帯静脈内皮細胞、 平滑筋細胞においてはわずかな発現が観察され た。 組織間の比較においては心および胎盤、 次いで脳、 骨格筋、 腎および Ji萃にお いて高度な発現が観察された。 その他に肝で弱い発現が観察され、 肺での発現は 観察されなかった。 培養癌細胞株においては HeLa細胞 S3、 慢性骨髄性白血病 K- 562、 リンパ芽球白血病 MOLT - 4、 大腸腺癌 SW480、 および肺癌 A549で強い発現が 観察され、 前骨髄白血病 HL-60、 黒色腫 G361でも発現が見られた。 Burki t tリン パ腫 Raj iでは、 ほとんど発現が見られなかった。
[実施例 8 ] メグ— 1の機能解析 (3) —インサイチュハイブリダィゼーショ 健常人の腎臓から得られたヒト腎組織を用いたインサイチュハイブリダィゼー シヨンにより、 メグ— 1の mRNAの組織内における発現状態を評価した。 インサ イチュハイブリダィゼ一シヨンは、 公知の方法により行った (Kidney Int., 52,
111 (1997)) 。 ヒト ·メグー1の 2879〜 29 1 2位の塩基配列 (配列番 号: 10) をプローブとして用いた。 図 1および図 2に示すように、 糸球体のメ サンギゥム領域の細胞がメグー 1 mRNA陽性であることを確認した。
[実施例 9] ラット ·メグ一 1
メグ一 1のラッ卜におけるホモログの取得を試みた。
ラットの腎メサンギゥム細胞から全 RNAを採取し、 cDNAを合成した。 この cDNA を铸型として、 ヒトメグー 1の塩基配列に基づいて各種の degenetative primer を用いて PC Rを行った。 degenetative primerは、 ヒト ·メグ— 1における以 下の領域に相当する部分に設定した。
センス鎖: lnt-18nt
アンチセンス鎖: 2852nt-2872nt
予測された大きさの増幅産物をクローニングし、 塩基配列を決定した。 更に、 3末端は marathorn法(メグシンを単離同定したときと同様の方法) によって、 一 部の塩基配列を決定した。 得られた塩基配列を配列番号: 1 1に、 また推定アミ ノ酸配列を配列番号: 12に示す。
その結果、 これまで報告されていない新規な塩基配列からなるラット ·メグ一 1ホモログが単離された。 ラット ·メグ— 1は、 遺伝子レベルで 74.3%、 蛋白レ ベルで 86.3%と、 ヒト ♦メグ一 1に対して高度に保存された構造を有する。 更に、 ラットにおけるラット ·メグ一 1の細胞、 組織局在を、 試料とプローブ が異なる他は実施例 7と同様の方法により解析した。 結果は次のとおりである。 脳 +
肺 +++
、臓 +
肝臓 + 脾臓 ++
腎臓 ++
平滑筋 -〜 +
メサンギゥム細胞 +++
腎上皮細胞 -〜十
腎内皮細胞 -〜 +
メグ— 1は、 ヒトにもラットにも種を越えて腎臓 (特にメサンギゥム細胞) に 高発現していることから、 メサンギゥム細胞の機能に関与する機能遺伝子の一つ である可能性が考えられる。
[実施例 10] メサンギゥム増殖性腎炎を誘発させた糸球体におけるメグ一 1 の特異的発現
ラットにおいて、 ラット Thyl抗原に対するモノクローナル抗体の投与により メサンギゥム増殖性腎炎が誘発されることが知られている (Yagi M, Yamamoto T,
Nagano N, Kato S, Kusaka M, Kawasaki K, Yaoita E, Kihara T: Transient e xpress ion of type I collagen in glomeruli with antト Thy - 1 ant i ody- indue ed mesangial proliferative lesions. Pathol Int 45: 409-414, 1995) 。 この 方法によりメサンギゥム増殖性腎炎を誘発させたラッ卜の糸球体におけるメグ—
1の発現をノーザンブロット解析により検出した。
抗ラット Thylモノクローナル抗体の調製は、 この抗体を産生するハイプリド 一マ (European Collection of Animal Cell Cultures (Sulisbury, UK)より購 入) を用レ、て行った (Salant DJ, Darby C, Couser WG: Experimental membrano us glomerulonephritis in rats. J Clin Invest 66: 71-81, 1980) 。 すなわち、 このハイブリ ドーマを RPMI- 1640培地 (10% ゥシ胎児血清を含む) で培養したの ち、 1X106個の細胞を RPMI- 1640培地 0.5mLに懸濁し、 7日前にあらかじめ不完 全フロイントアジュバントを腹腔内にィンジェクシヨンしておいた Balb/cマウ ス (ォス、 10週齢) の腹腔に接種した。 接種後 2週間以内にこのマウスから腹 水を得、 遠心で不溶物を除いたのち、 上清を回収した。 この上清を PBSに対して 透析し、 IgGを多く含む画分を 50% 飽和の硫酸アンモニゥムにより沈殿させた。 IgGを精製するために、 粗製抗体を HiTrap Pro te i n Aカラム (Pharmac i a Bi ote ch (Tokyo, Japan) ) にかけた。 カラムに吸着した IgGは溶出液 (0. 1 M クェン 酸ナトリウム, pH5) にて溶出し、 PBSに対して透析したのち、 実験に用いた。 メサンギゥム増殖性腎炎を誘発させたラッ卜の糸球体におけるメグ— 1 mRNA の発現は以下のように検出した。 なお、 すべての動物実験は Gu i de for An ima l Exper imentat i on (東京大学医学部) に従って行った。 まず、 ウイス夕一ラット (ォス、 6週齢、 Char l es Ri ver lapan (Yokohama, Japan)より購入) を 1週間 飼育したのち、 体重 lkgあたり 1. 2mgの IgGl マウスモノクローナル抗 Thyl抗 体 (0X7) を静脈内注射により投与した。 また、 コントロールとして媒体のみを 同様に投与したラットも用意した。 投与前、 および投与後 2, 4, 7, 14および 2 8日目にそれぞれ 6匹のラッ卜から腎臓を摘出し、 細分化して篩を通過させるこ とにより、 糸球体を分離した。 この糸球体から全 RNAを単離し、 ノーザンブロッ ト解析にかけた。 その際、 プロ一ブとして、 ラット ·メグ一 1の 841〜1979位の 塩基配列 (配列番号: 1 3 ) を持つフラグメントを用いた。 この領域はプロティ ンフォスファターゼ 2A (PP2A) の Aユニット (調節ユニット) とはホモロジ一 が低く、 プローブとして適している。 プローブの調製は、 ラットメサンギゥム細 胞の cDNAを铸型にした PCRにより増幅した断片を pGEM- T easyにサブクロー二 ングし、 EcoRIで切り出すことにより行った。
ノーザンブロット解析の結果、 抗 Thyl抗体によりメサンギゥム増殖性腎炎が 誘発された糸球体において、 メグ一 1の発現が著しく増加していることが確認さ れた (図 3 ) 。 産業上の利用の可能性 本発明により、 メサンギゥム細胞に高頻度に発現している DNA、 該 DNAのコー ドするタンパク質、 該タンパク質に結合する抗体等が提供された。 これらはメサ ンギゥム細胞に特異的な生理活性に深く関与していると推測され、 メサンギゥム 細胞の同定、 メサンギゥム細胞の異常の検出などに有用である。 更に、 該タンパ ク質の機能からメサンギゥム細胞の機能が明らかになり、 メサンギゥム細胞に関 連する疾患の原因究明への展開が期待される。 また、 メサンギゥム増殖性腎炎の ようなメサンギゥム細胞に関連する疾病の治療、 診断等への応用が期待される。 具体的には、 たとえばメグ一 1の人為的な調節によって、 糸球体腎炎の発症や 進展を制御できる可能性がある。 あるいはメサンギゥム細胞や体液中のメグ一 1 タンパク質や mRNAの定量によって、 糸球体腎炎などの腎疾患の診断が可能とな ることが期待できる。 糸球体腎炎ではメサンギゥム領域の機能異常が見られ、 メ サンギゥム細胞の増殖、 あるいは細胞からのマトリックス基質の産生亢進が起き ている。 これらの病態にメグ一 1が関与している可能性は十分に考えられる。 本発明によるメグ— 1は、 メサンギゥム細胞で高度に発現しているという点で は、 本発明者が先に報告したメグシンと共通の特徴を備えている。 しかしながら 本発明によるメグ一 1はホスファタ一ゼとの相同性を示し、 核移行シグナルを持 つた核タンパク質である可能性が示唆されるのに対して、 メグシンはプロテア一 ゼインヒビ夕一である SERPINスーパ一ファミリーとの相同性を持つタンパク質 である。 また本発明によるメグ一 1が比較的広範囲な組織において発現が観察さ れている点は、 メグシンのメサンギゥム細胞に特異的に発現しているという特徴 と相違する。 したがって本発明によるメグ _ 1は、 メサンギゥム細胞の機能を支 える重要なタンパク質である可能性を持っている。 このような重要なタンパク質 の存在を明らかにした本発明の意義は大きい。

Claims

請求の範囲
1. 下記 (a) から (d) のいずれかに記載のポリヌクレオチド。
(a) 配列番号: 1に記載された塩基配列の蛋白質コード領域を含むポリヌ クレオチド。
(b) 配列番号: 2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質をコードするポリ ヌクレオチド。
(c) 配列番号: 2に記載のアミノ酸配列において、 1若しくは複数のアミ ノ酸が置換、 欠失、 挿入、 および/または付加したアミノ酸配列からなり、 配列番号: 2に記載のアミノ酸配列からなる蛋白質と機能的に同等な蛋白質 をコードするポリヌクレオチド。
(d) 配列番号: 1に記載された塩基配列からなる DNAとストリンジェント な条件下でハイブリダィズするポリヌクレオチドであって、 配列番号: 2に 記載のアミノ酸配列からなる蛋白質と機能的に同等な蛋白質をコードするポ リヌクレオチド。
2. 請求項 1に記載のポリヌクレオチドのいずれかによつてコードされる蛋白質。
3.請求項 1に記載されたポリヌクレオチドのいずれかを含むベクター。
4.請求項 1に記載されたポリヌクレオチドのいずれか、 または請求項 3に記載 のベクターを保持する形質転換体。
5.請求項 4に記載の形質転換体を培養し、 発現産物を回収する工程を含む、 請 求項 2に記載の蛋白質の製造方法。
6.配列番号: 1に記載された塩基配列、 またはその相補鎖に相補的な塩基配列 からなる 15ヌクレオチド以上の鎖長を持つオリゴヌクレオチド。
7. 請求項 6に記載のオリゴヌクレオチドと被検試料を接触させ、 このオリゴヌ クレオチドのハイプリダイズを観察する工程を含む、 配列番号: 1に記載の 塩基配列からなるポリヌクレオチドの検出方法。 請求項 6に記載のオリゴヌクレオチドと被検試料を接触させ、 このオリゴヌ クレオチドをプライマーとして相補鎖を合成する工程を含む、 配列番号: 1 に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドの合成方法。
請求項 6に記載のォリゴヌクレオチドを含むメサンギゥム細胞の検出用試薬。. 生体試料中における請求項 1に記載のポリヌクレオチドの発現レベルを測 定し、 正常試料から得られた測定値と比較することによってメサンギゥム増 殖性腎炎を検出する方法。
. 生体試料がメサンギゥム細胞である請求項 1 0に記載の方法。
. 発現レベルを、 配列番号: 1に記載の塩基配列から選択された塩基配列か らなる mRNAを指標として測定する請求項 1 0に記載の方法。
. 発現レベルを、 請求項 2に記載のタンパク質またはその断片を指標として 測定する請求項 1 0に記載の方法。
. 請求項 1に記載のポリヌクレオチド、 またはその一部に対するアンチセン スポリヌクレオチド。
. 請求項 2に記載の蛋白質を認識する抗体。
. 配列番号: 2のアミノ酸配列から選択されたアミノ酸配列を持つタンパク 質の一部を認識する請求項 1 5に記載の抗体。
. 請求項 1 5に記載の抗体と請求項 2に記載のタンパク質、 またはその断片 との免疫学的な結合に基づいて請求項 2に記載のタンパク質またはその断片 を測定する免疫学的測定方法。
. 請求項 1 5に記載の抗体を含む請求項 2に記載のタンパク質またはその断 片の免疫学的測定用試薬。
. メグ一 1をコードする遺伝子の発現レベルを変化させたトランスジェニッ ク非ヒト脊椎動物。
. 非ヒト脊椎動物がマウスである請求項 1 9に記載のトランスジエニック非 ヒト脊椎動物。
. メグ— 1をコードする遺伝子の発現が抑制されたノックァゥトマウスであ る請求項 2 0に記載のトランスジエニック非ヒト脊椎動物。
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