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TW202503056A - 用於抑制補體因子B (CFB)之表現之RNAi藥劑、其醫藥組合物及使用方法 - Google Patents

用於抑制補體因子B (CFB)之表現之RNAi藥劑、其醫藥組合物及使用方法 Download PDF

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TW202503056A
TW202503056A TW113110602A TW113110602A TW202503056A TW 202503056 A TW202503056 A TW 202503056A TW 113110602 A TW113110602 A TW 113110602A TW 113110602 A TW113110602 A TW 113110602A TW 202503056 A TW202503056 A TW 202503056A
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濤 裴
卡西 史奇納貝
王禕琛
志鳴 丁
哥里葛瑞 雪克曼
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美商愛羅海德製藥公司
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Abstract

本發明係關於能夠抑制補體因子B (CFB)基因表現之RNAi藥劑。本發明亦揭示包括CFB RNAi藥劑之醫藥組合物及其使用方法。本發明所揭示之該等CFB RNAi藥劑可結合至靶向配位體(包括包含N-乙醯基-半乳糖胺之配位體),以便於活體內遞送至肝細胞。該等RNAi藥劑可用於治療部分藉由CFB基因表現所介導之疾病、病症或症狀的方法中,該等疾病、病症或症狀包括IgA腎病變(IgAN)、C3腎絲球病變(C3G)、免疫複合體介導之膜增生性絲球體腎炎(IC-MPGN)、狼瘡性腎炎(LN)、抗腎絲球基底膜病(抗GBM)、腎移植之缺血再灌注損傷及T細胞介導之排斥反應(TCMR)、抗嗜中性白血球細胞質抗體(ANCA)相關血管炎、包括早期及/或中期年齡相關黃斑退化(AMD)之AMD、地圖樣萎縮(GA)、青光眼、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮、陣發性夜間血紅素尿症(PNH)、非典型溶血性尿毒性症候群(aHUS)、子癇前症、類風濕性關節炎(RA)及/或其他補體介導之疾病。

Description

用於抑制補體因子B (CFB)之表現之RNAi藥劑、其醫藥組合物及使用方法
本發明係關於用於抑制補體因子B (CFB)基因表現之RNA干擾(RNAi)藥劑,例如雙股RNAi藥劑,諸如經化學修飾之小干擾RNA (siRNA);包括CFB RNAi藥劑之醫藥組合物;及其用於治療CFB相關疾病及病症之使用方法。
補體級聯為先天性免疫系統之關鍵部分,其提供抵禦感染之第一防線且藉由標記凋亡細胞及碎片進行處置而協調將其移除。(Defendi等人, Clin Rev Allergy Immunol.2020, 58(2):229-51)。然而,補體系統之活化失調藉由發揮直接致病作用或藉由放大或加劇非補體疾病誘因之發炎及損傷作用而可能導致某些腎臟疾病進展。(Schroder-Braunstein等人, Mol Immunol.2019,114:299-311)。
可透過三種不同路徑活化補體系統:替代路徑、經典路徑及凝集素路徑。三種補體活性路徑中之各者具有重要的生理學功能且可在各種疾病之發病機制中起作用。補體系統之活化最終會集中於形成攻膜複合物(Membrane Attack Complex,MAC) (系統之細胞毒性單元),而在補體系統活化期間產生之補體蛋白之片段可充當調理素或促發炎化學引誘劑。補體系統之概述描述於Garred等人, Pharmacol. Rev.2021, 73:792-827中(參見例如其中圖1)。
補體因子B (CFB)為補體系統之替代路徑之中心組分。其先前已被鑑別為與涉及替代路徑之補體失調相關之疾病的潛在治療目標,該等疾病諸如IgA腎病變(IgAN)、C3腎絲球病變(C3G)、免疫複合體介導之膜增生性絲球體腎炎(IC-MPGN)、狼瘡性腎炎(LN)、抗腎絲球基底膜病(抗GBM)、腎移植中之缺血再灌注損傷及T細胞介導之排斥反應(TCMR)、抗嗜中性白血球細胞質抗體(ANCA)相關血管炎、包括早期及/或中期年齡相關黃斑退化(AMD)之AMD、地圖樣萎縮(geographic atrophy,GA)、青光眼、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮(Doyne honeycomb retinal dystrophy)、陣發性夜間血紅素尿症(PNH)、非典型溶血性尿毒性症候群(aHUS)、子癇前症、類風濕性關節炎(RA)及/或其他補體介導之疾病(van Lookeren等人, Immunobiology2016, 221:733-739;Casiraghi等人, Am. J. Transplantation2017, 17:2312-2325;Wong及Kavanaugh, Seminars in Immunopathology2018, 40:49-64;Holers及Banda, Frontiers in Immunology2018, 9:1057 Poppelaars及Thurman, Molecular Immunology, 2020, 188:175-187,Crowley等人, Human Molecular Genetics, 2023, 32(2):204-217;Blakey等人, Int'l J. Women's Cardiovascular Health2023, 32:43-49;Hoppe及Gregory-Ksander Int'l J. Med. Sci.2024, 25:2307)。然而,儘管在研發用於治療一或多種此等病狀的補體靶向療法方面受到相當多的關注,但仍存在大量未滿足的醫療需求。
舉例而言,當前對IgAN及C3G之管理限於支持性照護(包括生活方式改變及靶向腎素-血管收縮素系統之腎臟保護性藥品)及廣泛作用的免疫抑制劑(包括皮質類固醇及黴酚酸嗎啉乙酯),但由於其缺乏對潛在疾病過程之特異性及/或長期使用之不利副作用概況而具有顯著侷限性(Gleeson及O'Shaugnessy, Nephrol Dial Transplant, 2023, 38:2464-2473)。儘管補體失調在IgAN或C3G之病理生理學中的作用得到廣泛認識,但尚未有針對IgAN或C3G之補體靶向療法得到批准。在PNH中,靶向替代補體路徑之藥劑已展現出與現有作用更廣泛的療法相比改善的臨床結果,從而使其得到批准且突顯出更精確地靶向疾病及特定言之補體失調的病理生理學之療法的潛在優勢(Hillmen等人, NEJMED2021, 384:1028-37;Peffault de Latour等人, NEJMED2022, 390:994-1008)。
雖然靶向替代路徑之補體抑制劑作為一些補體介導之疾病的潛在治療劑正進行研發,但其研發存在大量侷限性及挑戰。舉例而言,廣泛抑制補體級聯之藥劑可能大大增加感染及其他不良事件之風險。對於其中特別涉及替代路徑之失調的疾病,更較佳的為選擇性靶向此路徑,而使經典及凝集素路徑不受影響。在當前正在研發之CFB抑制劑中,遞送及黏著性問題亦為關注點。一些CFB抑制劑為大分子,諸如單株抗體,其通常需要靜脈內投與且組織滲透性有限。替代地,某些研發中的經口遞送之小分子CFB抑制劑簡化遞送,但需要頻繁投與(多達每日兩次(BID)),其可能增加患者之用藥負荷且在錯過給藥時易發生反彈效應。
此外,特異性靶向CFB提供相對於靶向其他補體組分之潛在優勢,此係由於其在補體活化中的主要作用且與疾病易感性明確相關。靶向CFB抑制可使補體系統之其他路徑保持完整且降低患者對由抑制經典及凝集素路徑導致之感染的易感性。利用RNAi機制以靶向CFB之方法亦在經由皮下途徑(subcutaneous enroute)投與之簡單性及不頻繁給藥方面提供潛在優勢。儘管各種出版物已提出靶向CFB之siRNA或其他寡核苷酸分子,但先前所揭示之抑制性分子中無一者顯示出充分基因緘默、適合安全概況以及穩定性及長期抑制活性之必要組合,從而需要偶爾投與來解決對任何現有療法或已知治療候選項有困難之某些患者的任何依從性問題。
需要能夠選擇性且有效抑制CFB基因表現之新穎RNA干擾(RNAi)藥劑(稱為RNAi藥劑、RNAi觸發劑或觸發劑),例如雙股RNAi藥劑。此外,需要新穎的CFB特異性RNAi藥劑之組合物以用作治療與替代補體路徑失調相關之疾病或病症的治療劑或藥物,該等疾病或病症包括以下非限制性實例:IgA腎病變(IgAN)、C3腎絲球病變(C3G)、免疫複合體介導之膜增生性絲球體腎炎(IC-MPGN)、狼瘡性腎炎(LN)、抗腎絲球基底膜病(抗GBM)、腎移植中之缺血再灌注損傷及T細胞介導之排斥反應(TCMR)、抗嗜中性白血球細胞質抗體(ANCA)相關血管炎、包括早期及/或中期年齡相關黃斑退化(AMD)之AMD、地圖樣萎縮(GA)、青光眼、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮、陣發性夜間血紅素尿症(PNH)、非典型溶血性尿毒性症候群(aHUS)、子癇前症、類風濕性關節炎(RA)及/或其他補體介導之疾病(van Lookeren等人, 2016,Casiraghi等人, 2017,Wong及Kavanaugh 2018,Holers及Banda 2018,Poppelaars及Thurman 2020,Crowley等人, 2023,Blakey等人, 2023,Hoppe及Gregory-Ksander 2024)。
本文所揭示之CFB RNAi藥劑的核苷酸序列及化學修飾不同於先前所揭示或此項技術中已知的彼等核苷酸序列及化學修飾。本文所揭示之CFB RNAi藥劑提供對CFB基因表現之高度特異性、強效且高效的活體內抑制。
在一些實施例中,有義股包含與表2、表4A、表4B或表5C之有義股序列中之任一者的15個連續核苷酸之差異為0或1個核苷酸的至少15個連續核苷酸之核苷酸序列,且其中有義股具有在15個連續核苷酸上與反義股至少85%互補的區域。
在一些實施例中,RNAi藥劑之至少一個核苷酸包括經修飾之核苷間鍵聯。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑的經修飾之核苷酸係選自由以下組成之群:2′-O-甲基核苷酸、2′-氟核苷酸、2′-去氧核苷酸、2′,3′-斷核苷酸模擬物、鎖定核苷酸、2'-F-阿拉伯糖核苷酸、2′-甲氧基乙基核苷酸、無鹼基核苷酸、核糖醇、反向核苷酸、反向2′-O-甲基核苷酸、反向2′-去氧核苷酸、2′-胺基修飾之核苷酸、2′-烷基修飾之核苷酸、含嗎啉核苷酸(諸如用亞甲基嗎啉環置換核糖環)、含膦酸乙烯酯核苷酸、含膦酸環丙酯核苷酸及3′­O-甲基核苷酸。
在其他實施例中,本文所揭示之RNAi藥劑的所有或實質上所有經修飾之核苷酸為2′-O-甲基核苷酸、2′-氟核苷酸或其組合。
在一些實施例中,反義股由表3之經修飾之反義股序列中之任一者的核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列。
在一些實施例中,有義股由表4A或表4B之經修飾之有義股序列中之任一者的核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列。
在一些實施例中,反義股包含表3之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列且有義股包含表4A或表4B之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列。
本文所揭示之RNAi藥劑連接至包含N-乙醯基-半乳糖胺之靶向配位體。在其他實施例中,靶向配位體連接至有義股。在一些實施例中,靶向配位體連接至有義股之5'末端。
在一些實施例中,有義股之長度在15與30個核苷酸之間,且反義股之長度在18與30個核苷酸之間。在其他實施例中,有義股及反義股之長度各自在19與27個核苷酸之間。在其他實施例中,有義股及反義股之長度各自在21與24個核苷酸之間。在又其他實施例中,有義股及反義股之長度各自為21個核苷酸。
在一些實施例中,RNAi藥劑具有兩個鈍端。
在一些實施例中,有義股包含一或兩個端帽。在其他實施例中,有義股包含一或兩個反向無鹼基殘基。
在一些實施例中,RNAi藥劑包含有義股及反義股,該有義股及該反義股形成表5C中所示之雙螺旋體結構之雙螺旋體序列。
在一些實施例中,有義股在核苷酸序列之3'末端處、核苷酸序列之5'端處或兩者處進一步包括反向無鹼基殘基。
在其他實施例中,靶向配位體包含: 。 在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑包括由一核鹼基序列組成、基本上由該核鹼基序列組成或包含該核鹼基序列之反義股,該核鹼基序列與以下核苷酸序列(5′ 3′)中之一者之差異為0或1個核鹼基: AAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1275); UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC (SEQ ID NO:1283); UAAGUACUCAGACACUACAGC (SEQ ID NO:1332); UAAGUACUCAGACACCAUAGC (SEQ ID NO:1333); UAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1326); UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC (SEQ ID NO:1310); AAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:359); UAGAAAACCCAAAUCCUCA (SEQ ID NO:474); UAAGUACUCAGACACUACA (SEQ ID NO:367); UAAGUACUCAGACACCAUA (SEQ ID NO:361); UAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:360);或 UCAAUGACAGUAAUUGGGU (SEQ ID NO:246)。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑包括由如下核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列之反義股,該核苷酸序列與以下核苷酸序列(5′ 3′)中之一者之差異為不超過1個核苷酸: AAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1275); UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC (SEQ ID NO:1283); UAAGUACUCAGACACUACAGC (SEQ ID NO:1332); UAAGUACUCAGACACCAUAGC (SEQ ID NO:1333); UAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1326); UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC (SEQ ID NO:1310); AAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:359); UAGAAAACCCAAAUCCUCA (SEQ ID NO:474); UAAGUACUCAGACACUACA (SEQ ID NO:367); UAAGUACUCAGACACCAUA (SEQ ID NO:361); UAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:360);或 UCAAUGACAGUAAUUGGGU (SEQ ID NO:246); 其中所有或實質上所有核苷酸為經修飾之核苷酸。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑包括由一核鹼基序列組成、基本上由該核鹼基序列組成或包含該核鹼基序列之反義股,該核鹼基序列與以下核苷酸序列(5′ 3′)中之一者之差異為0或1個核鹼基: AAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1275); UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC (SEQ ID NO:1283); UAAGUACUCAGACACUACAGC (SEQ ID NO:1332); UAAGUACUCAGACACCAUAGC (SEQ ID NO:1333); UAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1326); UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC (SEQ ID NO:1310); AAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:359); UAGAAAACCCAAAUCCUCA (SEQ ID NO:474); UAAGUACUCAGACACUACA (SEQ ID NO:367); UAAGUACUCAGACACCAUA (SEQ ID NO:361); UAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:360);或 UCAAUGACAGUAAUUGGGU (SEQ ID NO:246); 其中該核苷酸序列位於該反義股之位置1-21 (5′ 3′)。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑包括由如下核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列之反義股,該核苷酸序列與以下核苷酸序列(5′ 3′)中之一者之差異為0或1個核苷酸: AAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1275); UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC (SEQ ID NO:1283); UAAGUACUCAGACACUACAGC (SEQ ID NO:1332); UAAGUACUCAGACACCAUAGC (SEQ ID NO:1333); UAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1326); UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC (SEQ ID NO:1310); AAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:359); UAGAAAACCCAAAUCCUCA (SEQ ID NO:474); UAAGUACUCAGACACUACA (SEQ ID NO:367); UAAGUACUCAGACACCAUA (SEQ ID NO:361); UAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:360);或 UCAAUGACAGUAAUUGGGU (SEQ ID NO:246); 其中該CFB RNAi藥劑進一步包括與該反義股至少部分互補之有義股;且其中該反義股及該有義股上之所有或實質上所有核苷酸均為經修飾之核苷酸。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑包括由如下核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列之反義股,該核苷酸序列與以下核苷酸序列(5′ 3′)中之一者之差異為0或1個核苷酸: AAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1275); UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC (SEQ ID NO:1283); UAAGUACUCAGACACUACAGC (SEQ ID NO:1332); UAAGUACUCAGACACCAUAGC (SEQ ID NO:1333); UAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1326); UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC (SEQ ID NO:1310); AAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:359); UAGAAAACCCAAAUCCUCA (SEQ ID NO:474); UAAGUACUCAGACACUACA (SEQ ID NO:367); UAAGUACUCAGACACCAUA (SEQ ID NO:361); UAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:360);或 UCAAUGACAGUAAUUGGGU (SEQ ID NO:246); 其中該CFB RNAi藥劑進一步包括與該反義股至少部分互補之有義股;其中該反義股及該有義股上之所有或實質上所有核苷酸均為經修飾之核苷酸;且其中該有義股進一步包括在該核苷酸序列之3'末端及5'端處的反向無鹼基殘基,且該有義股亦包括共價連接至5'末端的靶向配位體,其中該靶向配位體包括對去唾液酸糖蛋白受體具有親和力之化合物,較佳其中該靶向配位體包含N-乙醯基-半乳糖胺。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑包括由如下核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列之反義股,該核苷酸序列與以下核苷酸序列(5′ 3′)中之一者之差異為0或1個核苷酸: AAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1275); UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC (SEQ ID NO:1283); UAAGUACUCAGACACUACAGC (SEQ ID NO:1332); UAAGUACUCAGACACCAUAGC (SEQ ID NO:1333); UAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1326); UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC (SEQ ID NO:1310); AAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:359); UAGAAAACCCAAAUCCUCA (SEQ ID NO:474); UAAGUACUCAGACACUACA (SEQ ID NO:367); UAAGUACUCAGACACCAUA (SEQ ID NO:361); UAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:360);或 UCAAUGACAGUAAUUGGGU (SEQ ID NO:246); 其中該CFB RNAi藥劑進一步包括與該反義股至少部分互補之有義股;其中該反義股及該有義股上之所有或實質上所有核苷酸均為經修飾之核苷酸;且其中該有義股進一步包括在該核苷酸序列之3'末端及5'端處的反向無鹼基殘基,且該有義股亦包括共價連接至5'末端的靶向配位體,其中該靶向配位體包括對去唾液酸糖蛋白受體具有親和力之化合物,較佳其中該靶向配位體包含N-乙醯基-半乳糖胺;且其中各別反義股序列位於該反義股之位置1-21處。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑包括反義股及有義股,其中反義股及有義股由核苷酸序列組成、基本上由該等核苷酸序列組成或包含該等核苷酸序列,該等核苷酸序列與以下核苷酸序列(5′ 3′)對中之一者之差異為0或1個核苷酸: AAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1275)及GCUGUGGUGUCUGAGUACUUU (SEQ ID NO:1355); UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC (SEQ ID NO:1283)及GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA (SEQ ID NO:1363); UAAGUACUCAGACACUACAGC (SEQ ID NO:1332)及GCUGUGGUGUCUGAGUACUUA (SEQ ID NO:1406); UAAGUACUCAGACACCAUAGC (SEQ ID NO:1333)及GCUGUGGUGUCUGAGUACUUA (SEQ ID NO:1406); UAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1326)及GCUGUGGUGUUUGAGUACUUA (SEQ ID NO:1409); UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC (SEQ ID NO:1310)及GGACCCAAUUACUGUCAUUGA (SEQ ID NO:1390); AAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:359)及UGUGGUGUCUGAGUACUUU (SEQ ID NO:1410); UAGAAAACCCAAAUCCUCA (SEQ ID NO:474)及UGAGGAUUUGGGUUUUCUA (SEQ ID NO:1408); UAAGUACUCAGACACUACA (SEQ ID NO:367)及UGUGGUGUCUGAGUACUUA (SEQ ID NO:779); UAAGUACUCAGACACCAUA (SEQ ID NO:361)及UGUGGUGUCUGAGUACUUA (SEQ ID NO:779);或 UAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:360)及UGUGGUGUUUGAGUACUUA (SEQ ID NO: 1439) UCAAUGACAGUAAUUGGGU (SEQ ID NO:246)及ACCCAAUUACUGUCAUUGA (SEQ ID NO:665); 其中該反義股及該有義股上之所有或實質上所有核苷酸均為經修飾之核苷酸。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑包括反義股及有義股,其中反義股及有義股由核苷酸序列組成、基本上由該等核苷酸序列組成或包含該等核苷酸序列,該等核苷酸序列與以下核苷酸序列(5′ 3′)對中之一者之差異為0或1個核苷酸: AAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1275)及GCUGUGGUGUCUGAGUACUUU (SEQ ID NO:1355); UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC (SEQ ID NO:1283)及GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA (SEQ ID NO:1363); UAAGUACUCAGACACUACAGC (SEQ ID NO:1332)及GCUGUGGUGUCUGAGUACUUA (SEQ ID NO:1406); UAAGUACUCAGACACCAUAGC (SEQ ID NO:1333)及GCUGUGGUGUCUGAGUACUUA (SEQ ID NO:1406); UAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1326)及GCUGUGGUGUUUGAGUACUUA (SEQ ID NO:1409); UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC (SEQ ID NO:1310)及GGACCCAAUUACUGUCAUUGA (SEQ ID NO:1390); AAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:359)及UGUGGUGUCUGAGUACUUU (SEQ ID NO:1410); UAGAAAACCCAAAUCCUCA (SEQ ID NO:474)及UGAGGAUUUGGGUUUUCUA (SEQ ID NO:1408); UAAGUACUCAGACACUACA (SEQ ID NO:367)及UGUGGUGUCUGAGUACUUA (SEQ ID NO:779); UAAGUACUCAGACACCAUA (SEQ ID NO:361)及UGUGGUGUCUGAGUACUUA (SEQ ID NO:779);或 UAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:360)及UGUGGUGUUUGAGUACUUA (SEQ ID NO: 1439) UCAAUGACAGUAAUUGGGU (SEQ ID NO:246)及ACCCAAUUACUGUCAUUGA (SEQ ID NO:665); 其中該反義股及該有義股上之所有或實質上所有核苷酸均為經修飾之核苷酸;且其中該有義股進一步包括在該核苷酸序列之3'末端及5'端處的反向無鹼基殘基,且該有義股亦包括共價連接至5'末端的靶向配位體,其中該靶向配位體包括對去唾液酸糖蛋白受體具有親和力之化合物,較佳其中該靶向配位體包含N-乙醯基-半乳糖胺。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑包括由一經修飾之核苷酸序列組成、基本上由該經修飾之核苷酸序列組成或包含該經修飾之核苷酸序列的反義股,該經修飾之核苷酸序列與以下核苷酸序列(5′ 3′)中之一者之差異為不超過1個核苷酸: asAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc (SEQ ID NO:983); usAfsgsAfaAfaCfcCfaAfaUfcCfuCfaUfsc (SEQ ID NO:913); usAfsgsaAfaacccaAfaUfcCfucausc (SEQ ID NO:915); usAfsaguaCfucagAfcAfcUfacagsc (SEQ ID NO:1013); usAfsaguaCfucagAfcAfcCfauagsc (SEQ ID NO:1014); usAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc (SEQ ID NO:994);或 usCfsaaugAfcaguAfaUfuGfggucsc (SEQ ID NO:1022); 其中a、c、g及u分別表示2′-O-甲基腺苷、胞苷、鳥苷及尿苷;Af、Cf、Gf及Uf分別表示2'-氟腺苷、胞苷、鳥苷及尿苷;且s表示硫代磷酸酯鍵聯,且其中有義股與反義股至少實質上互補。一般熟習此項技術者將清楚地理解,包括本文所揭示之經修飾之核苷酸序列中所示的硫代磷酸酯鍵聯替代寡核苷酸中通常存在之磷酸二酯鍵聯。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑包括由一經修飾之核苷酸序列組成、基本上由該經修飾之核苷酸序列組成或包含該經修飾之核苷酸序列的反義股,該經修飾之核苷酸序列與以下核苷酸序列(5′ 3′)中之一者之差異為不超過1個核苷酸: asAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc (SEQ ID NO:983); usAfsgsAfaAfaCfcCfaAfaUfcCfuCfaUfsc (SEQ ID NO:913); usAfsgsaAfaacccaAfaUfcCfucausc (SEQ ID NO:915); usAfsaguaCfucagAfcAfcUfacagsc (SEQ ID NO:1013); usAfsaguaCfucagAfcAfcCfauagsc (SEQ ID NO:1014); usAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc (SEQ ID NO:994);或 usCfsaaugAfcaguAfaUfuGfggucsc (SEQ ID NO:1022); 其中a、c、g及u分別表示2′-O-甲基腺苷、胞苷、鳥苷及尿苷;Af、Cf、Gf及Uf分別表示2'-氟腺苷、胞苷、鳥苷及尿苷;且s表示硫代磷酸酯鍵聯,且其中有義股與反義股至少實質上互補;且其中該有義股之所有或實質上所有核苷酸均為經修飾之核苷酸。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑包括由一經修飾之核苷酸序列組成、基本上由該經修飾之核苷酸序列組成或包含該經修飾之核苷酸序列的反義股,該經修飾之核苷酸序列與以下核苷酸序列(5′ 3′)中之一者之差異為不超過1個核苷酸: asAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc (SEQ ID NO:983); usAfsgsAfaAfaCfcCfaAfaUfcCfuCfaUfsc (SEQ ID NO:913); usAfsgsaAfaacccaAfaUfcCfucausc (SEQ ID NO:915); usAfsaguaCfucagAfcAfcUfacagsc (SEQ ID NO:1013); usAfsaguaCfucagAfcAfcCfauagsc (SEQ ID NO:1014); usAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc (SEQ ID NO:994);或 usCfsaaugAfcaguAfaUfuGfggucsc (SEQ ID NO:1022); 其中該CFB RNAi藥劑進一步包括與該反義股至少部分互補之有義股;其中該有義股之所有或實質上所有核苷酸均為經修飾之核苷酸;其中該反義股及該有義股上之所有或實質上所有核苷酸均為經修飾之核苷酸;且其中該有義股進一步包括在該核苷酸序列之3'末端及5'端處的反向無鹼基殘基,且該有義股亦包括共價連接至5'末端的靶向配位體,其中該靶向配位體包括對去唾液酸糖蛋白受體具有親和力之化合物,較佳其中該靶向配位體包含N-乙醯基-半乳糖胺。
在一些實施例中,本文中所揭示之CFB RNAi藥劑包括反義股及有義股,其由以下核苷酸序列對(5′ 3′)中之一者組成、基本上由該核苷酸序列對組成或包含該核苷酸序列對: asAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc (SEQ ID NO:983)及gcugugguGfUfCfugaguacuuu (SEQ ID NO:1176); usAfsgsAfaAfaCfcCfaAfaUfcCfuCfaUfsc (SEQ ID NO:913)及gaugaggaUfUfUfggguuuucua (SEQ ID NO:1184); usAfsgsaAfaacccaAfaUfcCfucausc (SEQ ID NO:915)及gaugaggaUfuUfGfgguuuucua (SEQ ID NO:1185); usAfsaguaCfucagAfcAfcUfacagsc (SEQ ID NO:1013)及gcugugguGfUfCfugaguacuua (SEQ ID NO:1235); usAfsaguaCfucagAfcAfcCfauagsc (SEQ ID NO:1014)及gcugugguGfUfCfugaguacuua (SEQ ID NO:1235); usAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc (SEQ ID NO:994)及gcugugguGfUfUfugaguacuua (SEQ ID NO:1248);或 usCfsaaugAfcaguAfaUfuGfggucsc (SEQ ID NO:1022)及ggacccAfaUfuAfcugucauuga (SEQ ID NO:1251); 其中a、c、g及u分別表示2′-O-甲基腺苷、胞苷、鳥苷及尿苷;Af、Cf、Gf及Uf分別表示2′-氟腺苷、胞苷、鳥苷及尿苷;且s表示硫代磷酸酯鍵聯;且其中有義股亦包括對去唾液酸糖蛋白受體具有親和力之靶向配位體,較佳其中該靶向配位體包含N-乙醯基-半乳糖胺,其中該靶向配位體視情況在有義股之5'端連接。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑包括由經修飾之核苷酸序列組成、基本上由該等經修飾之核苷酸序列組成或包含該等經修飾之核苷酸序列的反義股及有義股,該等經修飾之核苷酸序列與以下序列對(5′ 3′)中之一者之差異為0或1個核苷酸: asAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc (SEQ ID NO:983)及(NAG37)s(invAb)sgcugugguGfUfCfugaguacuuus(invAb) (SEQ ID NO:1077); usAfsgsAfaAfaCfcCfaAfaUfcCfuCfaUfsc (SEQ ID NO:913)及(NAG37)s(invAb)sgaugaggaUfUfUfggguuuucuas(invAb) (SEQ ID NO:1085); usAfsgsaAfaacccaAfaUfcCfucausc (SEQ ID NO:915)及(NAG37)s(invAb)sgaugaggaUfuUfGfgguuuucuas(invAb) (SEQ ID NO:1086); usAfsaguaCfucagAfcAfcUfacagsc (SEQ ID NO:1013)及(NAG37)s(invAb)sgcugugguGfUfCfugaguacuuas(invAb) (SEQ ID NO:1136); usAfsaguaCfucagAfcAfcCfauagsc (SEQ ID NO:1014)及(NAG37)s(invAb)sgcugugguGfUfCfugaguacuuas(invAb) (SEQ ID NO:1136); usAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc (SEQ ID NO:994)及(NAG37)s(invAb)sgcugugguGfUfUfugaguacuuas(invAb) (SEQ ID NO:1149);或 usCfsaaugAfcaguAfaUfuGfggucsc (SEQ ID NO:1022)及(NAG37)s(invAb)sggacccAfaUfuAfcugucauugas(invAb) (SEQ ID NO:1152); 其中a、c、g及u分別表示2′-O-甲基腺苷、胞苷、鳥苷及尿苷;Af、Cf、Gf及Uf分別表示2′-氟腺苷、胞苷、鳥苷及尿苷;(NAG37)s表示具有表6中所示之化學結構之三齒N-乙醯基-半乳糖胺肝細胞靶向配位體;(invAb)表示反向無鹼基去氧核糖核苷酸(亦參見表6),且s表示硫代磷酸酯鍵聯。
本文亦揭示包含所揭示之RNAi藥劑之組合物,其中該等組合物進一步包含醫藥學上可接受之賦形劑。
另外,本文提供用於活體內抑制人類個體之肝細胞中CFB基因之表現的方法,該等方法包含向個體中引入有效量的所揭示之CFB RNAi藥劑或所揭示之組合物。
本文進一步提供治療CFB相關疾病、病症或症狀之方法,該等方法包含向有需要之人類個體投與治療有效量的所揭示之組合物。
在一些實施例中,疾病為PNH、IgAN、C3G、包括早期及/或中期AMD之AMD、aHUS、GA、IC-MPGN、LN、抗GBM、RA、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮及/或其他補體介導之腎臟疾病。
在一些實施例中,RNAi藥劑以每公斤人類個體體重約0.05 mg至約6.0 mg之劑量投與。在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑以含有約25 mg、約50 mg、約100 mg、約200 mg、約300 mg或約400 mg CFB RNAi藥劑之單次注射的固定劑量投與。
本文亦提供所揭示之RNAi藥劑或所揭示之組合物的用途,其用於治療至少部分由CFB基因表現介導之疾病、病症或症狀。
本文進一步提供所揭示之RNAi藥劑或所揭示之組合物的用途,其用於製備用以治療至少部分由CFB基因表現介導之疾病、病症或症狀的醫藥組合物。
相關申請案之交互參考
本申請案主張2023年3月21日申請之美國臨時專利申請案第63/491,505號及2024年3月15日申請之美國臨時專利申請案第63/566,013號之優先權,該等案中之各者的內容以全文引用之方式併入本文中。 序列表
本申請案含有序列表(符合標準ST26),該序列表已以xml格式提交且以全文引用之方式併入本文中。該xml序列表檔案命名為30719-WO_SeqListing.xml,創建於2024年3月18日且大小為5066 kb。
所揭示之CFB RNAi藥劑、其組合物及使用方法可參考以下實施方式更容易地理解,該實施方式形成本發明之一部分。應理解,本發明不限於本文所特定描述及/或顯示之內容,且本文所使用之術語僅出於以舉例方式描述特定實施例之目的,且不意欲為限制性的。
應瞭解,雖然為了清楚起見,本文所包括之揭示內容的某些特徵係在單獨實施例之情形下在本文中予以描述的,但該等特徵亦可組合提供於單一實施例中。反之,為了簡便起見,在單一實施例之情形下描述的所揭示之方法的各種特徵亦可單獨或以任何子組合形式提供。
定義
本文所用之「RNAi藥劑」意謂含有RNA或RNA樣(例如經化學修飾之RNA)寡核苷酸分子之物質的化學組合物,該寡核苷酸分子能夠以序列特異性方式降低或抑制(例如在適當條件下降低或抑制)目標mRNA之信使RNA (mRNA)轉錄物的轉譯。依本文所用,RNAi藥劑可透過RNA干擾機制(亦即,透過與哺乳動物細胞之RNA干擾路徑機制(RNA誘導型緘黙化複合體或RISC)之相互作用誘導RNA干擾)或藉由任何替代機制或路徑來起作用。儘管咸信本文所用之術語RNAi藥劑主要透過RNA干擾機制起作用,但所揭示之RNAi藥劑不藉由任何特定路徑或作用機制結合或受限於任何特定途徑或作用機制。本文所揭示之RNAi藥劑包含有義股及反義股,且包括但不限於:短(或小)干擾RNA (siRNA)、雙股RNA (dsRNA)、微小RNA (miRNA)、短髮夾RNA (shRNA)及切丁酶受質(dicer substrate)。本文所描述之RNAi藥劑的反義股與所靶向之mRNA (亦即,CFB mRNA)至少部分互補。RNAi藥劑可包括一或多種經修飾之核苷酸及/或一或多種非磷酸二酯鍵聯。
依本文所用,當提及給定基因之表現時,術語「緘默」、「降低」、「抑制」、「下調」或「減弱(knockdown)」意謂當用本文所描述之RNAi藥劑治療細胞、細胞群、組織、器官或個體時,與未或尚未經歷治療之第二細胞、細胞群、組織、器官或個體相比,基因之表現降低,藉由在其中基因經轉錄之細胞、細胞群、組織、器官或個體中自基因轉錄之RNA的含量或自mRNA轉譯之多肽、蛋白質或蛋白質子單元的含量所量測。
本文所用之術語「序列」及「核苷酸序列」意謂使用標準命名法用一連串字母描述之一連串或一系列核鹼基或核苷酸。核酸分子可包含未經修飾及/或經修飾之核苷酸。核苷酸序列可包含未經修飾及/或經修飾之核苷酸。
本文所用之「鹼基」、「核苷酸鹼基」或「核鹼基」係作為核苷酸組分之雜環嘧啶或嘌呤化合物,且包括主要嘌呤鹼基腺嘌呤及鳥嘌呤以及主要嘧啶鹼基胞嘧啶、胸腺嘧啶及尿嘧啶。核鹼基可進一步經修飾以包括但不限於通用鹼基、疏水性鹼基、混雜鹼基、尺寸擴展鹼基及氟化鹼基。(參見例如Modified Nucleosides in Biochemistry, Biotechnology and Medicine, Herdewijn, P.編Wiley-VCH, 2008)。此類經修飾核鹼基(包括含有經修飾核鹼基之亞磷醯胺化合物)之合成係此項技術中已知的。
依本文所用,術語「核苷酸」具有與此項技術中通常所理解相同的含義。因此,本文所用之術語「核苷酸」係指包含糖部分、鹼基部分及共價連接基團(鍵聯基團) (諸如磷酸酯或硫代磷酸酯核苷間鍵聯基團)的醣苷,且涵蓋天然存在之核苷酸(諸如DNA或RNA)以及包含經修飾之糖及/或鹼基部分的非天然存在之核苷酸,該等非天然存在之核苷酸在本文中亦稱為核苷酸類似物。本文中,單個核苷酸可稱為單體或單元。
依本文所用且除非另外指示,否則術語「互補」在用於相對於第二核鹼基或核苷酸序列(例如RNAi藥劑反義股或單股反義寡核苷酸)描述第一核鹼基或核苷酸序列(例如RNAi藥劑有義股或靶向mRNA)時,意謂包括第一核苷酸序列之寡核苷酸或聚核苷酸在某些標準條件下與包括第二核苷酸序列之寡核苷酸雜交(在哺乳動物生理條件(或其他適合之活體內或活體外條件)下形成鹼基對氫鍵)且形成雙螺旋體或雙螺旋結構之能力。一般熟習此項技術者將能夠選擇最適合於雜交測試之條件組。至少在滿足以上雜交要求之範圍內,互補序列包括沃森-克里克鹼基對(Watson-Crick base pairs)或非沃森-克里克鹼基對且包括天然或經修飾之核苷酸或核苷酸模擬物。序列一致性或互補性與修飾無關。舉例而言,出於判定一致性或互補性之目的,本文所定義之a及Af與U (或T)互補,且與A一致。
依本文所用,「完全互補(perfectly complementary)」或「完全互補(fully complementary)」意謂在核鹼基或核苷酸序列分子之雜交對中,第一寡核苷酸之連續序列中之所有(100%)鹼基將與第二寡核苷酸之連續序列中之相同數目個鹼基雜交。連續序列可包含第一或第二核苷酸序列的全部或一部分。
依本文所用,「部分互補」意謂在核鹼基或核苷酸序列分子之雜交對中,第一寡核苷酸之連續序列中之至少70% (而並非所有)鹼基將與第二寡核苷酸之連續序列中之相同數目個鹼基雜交。連續序列可包含第一或第二核苷酸序列的全部或一部分。
依本文所用,「實質上互補」意謂在核鹼基或核苷酸序列分子之雜交對中,第一寡核苷酸之連續序列中之至少85% (而並非所有)鹼基將與第二寡核苷酸之連續序列中之相同數目個鹼基雜交。連續序列可包含第一或第二核苷酸序列的全部或一部分。
依本文所用,術語「互補」、「完全互補」、「部分互補」及「實質上互補」係相對於RNAi藥劑之有義股與反義股之間或RNAi藥劑之反義股與MUC5AC mRNA之序列之間的核鹼基或核苷酸匹配而使用。
依本文所用,適用於核酸序列之術語「實質上一致」或「實質一致性」意謂與參考序列相比,核苷酸序列(或核苷酸序列之一部分)具有至少約85%序列一致性或更高,例如至少90%、至少95%或至少99%一致性。序列一致性之百分比係藉由在比較窗內比較兩個最佳比對序列來測定。藉由如下步驟計算百分比:測定兩個序列中存在之相同類型的核酸鹼基的位置數以得到匹配位置數,將匹配位置數除以比較窗中之總位置數且將結果乘以100以得到序列一致性之百分比。本文所揭示之本發明涵蓋與本文所揭示之核苷酸序列實質上相同的核苷酸序列。
依本文所用,術語「個體(individual)」、「患者」及「個體(subject)」可互換使用以指任何動物物種之成員,包括但不限於鳥類、人類及其他靈長類動物,及包括商業上相關之哺乳動物或動物模型(諸如小鼠、大鼠、猴、牛、豬、馬、綿羊、貓及狗)的其他哺乳動物。較佳地,個體為人類。
依本文所用,術語「治療(treat)」、「治療(treatment)」及其類似術語意謂使個體中疾病之一或多種症狀之數目、嚴重程度及/或頻率得到減輕或緩解所採取之方法或步驟。依本文所用,「治療(treat)」及「治療(treatment)」可包括預防、控制、防治性治療及/或抑制或減少個體中之疾病之一或多種症狀的數目、嚴重程度及/或頻率。
依本文所用,當提及RNAi藥劑時,片語「向細胞中引入」意謂將RNAi藥劑功能性遞送至細胞中。片語「功能性遞送」意謂以使RNAi藥劑能夠具有預期生物活性(例如基因表現之序列特異性抑制)之方式將RNAi藥劑遞送至細胞中。
除非另外說明,否則使用本文所用之符號 意謂根據本文所描述之發明之範疇任一或多個基團可與其連接。
依本文所用,術語「異構體」係指具有相同分子式,但在性質或其原子結合序列或其原子空間排列方面不同的化合物。原子空間排列不同之異構體稱為「立體異構體」。彼此不為鏡像之立體異構體稱為「非鏡像異構體」且為不可重疊之鏡像的立體異構體稱為「鏡像異構體」或有時稱為光學異構體。結合於四個不相同取代基之碳原子稱為「對掌性中心」。
依本文所用,除非在結構中特定鑑別為具有特定構形,否則對於其中存在不對稱中心且因此產生鏡像異構體、非鏡像異構體或其他立體異構組態之各結構,本文所揭示之各結構意欲表示所有此類可能的異構體,包括其光學純及外消旋形式。舉例而言,本文所揭示之結構意欲涵蓋非鏡像異構體之混合物以及單個立體異構體。
依本文中之申請專利範圍中所使用,片語「由……組成」不包括申請專利範圍中未指定之任何元件、步驟或成分。當用於本發明之申請專利範圍時,片語「基本上由…組成」將申請專利範圍之範疇限制於所指定材料或步驟及實質上不影響所主張本發明之基礎及新穎特徵的材料或步驟。
一般熟習此項技術者將容易理解及瞭解,本文所揭示之化合物及組合物可具有呈質子化或去質子化狀態之某些原子(例如N、O或S原子),其取決於化合物或組合物所置放的環境。因此,依本文所用,本文所揭示之結構涵蓋可經質子化或去質子化之某些官能基,諸如OH、SH或NH。本文之揭示內容意欲涵蓋所揭示之化合物及組合物而與其基於環境(諸如pH)之質子化狀態無關,依一般熟習此項技術者將容易地理解。對應地,具有不穩定質子或鹼性原子的本文所描述之化合物亦應理解為表示對應化合物之鹽形式。本文所描述之化合物可呈游離酸、游離鹼或鹽形式。本文所描述之化合物的醫藥學上可接受之鹽應理解為在本發明之範疇內。
依本文所用,當參考兩種化合物或分子之間的連接時,術語「連接」或「結合」意謂兩種化合物或分子藉由共價鍵接合。除非加以說明,否則本文所用之術語「連接」及「結合」可指第一化合物與第二化合物之間在具有或不具有任何插入原子或原子團之情況下的連接。
本文所用之術語「包括」在本文中用於意謂片語「包括但不限於」且可與其互換使用。除非上下文以其他方式明確指示,否則術語「或」在本文中用於意謂術語「及/或」且可與其互換使用。
除非另外定義,否則本文所用之所有技術及科學術語均具有與一般熟習此項技術者通常理解相同之含義。儘管類似或等效於本文所描述之彼等方法及材料之方法及材料可用於實踐或測試本發明,但下文描述適合的方法及材料。所有出版物、專利申請案、專利及本文所提及之其他參考案均以全文引用的方式併入。在有衝突之情況下,將以本說明書(包括定義)為準。另外,材料、方法及實例僅為說明性的且並不意欲為限制性的。
在明確列舉值之情況下,應理解,與所列舉值大約相同數量或量之值亦在本發明之範疇內。在揭示組合之情況下,該組合之元件的各子組合亦經具體地揭示且在本發明之範疇內。相反,在個別地揭示不同元件或元件之群組的情況下,亦揭示其組合。在將本發明之任何元件揭示為具有複數個替代物之情況下,特此亦揭示其中各替代物單獨排除或與其他替代物以任何組合排除的本發明之實例;本發明之超過一個元件可具有此類排除,且特此揭示具有此類排除之元件的所有組合。
本發明之其他目標、特徵、態樣及優勢將自以下詳細說明、附圖及申請專利範圍而變得顯而易見。 詳細說明 RNAi 藥劑
本文描述用於抑制CFB基因之表現的RNAi藥劑。各CFB RNAi藥劑包含有義股及反義股。有義股之長度可為15至49個核苷酸。反義股之長度可為18至30個核苷酸。有義股及反義股可為相同長度或其可為不同長度。在一些實施例中,有義股及反義股之長度各自獨立地為21至27個核苷酸。在一些實施例中,有義股及反義股之長度各自均為21-26個核苷酸。在一些實施例中,有義股及反義股之長度各自為21-24個核苷酸。在一些實施例中,有義股之長度為約19個核苷酸,而反義股之長度為約21個核苷酸。在一些實施例中,有義股之長度為約21個核苷酸,而反義股之長度為約23個核苷酸。在一些實施例中,有義股之長度為23個核苷酸且反義股之長度為21個核苷酸。在一些實施例中,有義股及反義股之長度各自均為21個核苷酸。在一些實施例中,RNAi藥劑反義股之長度各自獨立地為18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30個核苷酸。在一些實施例中,RNAi藥劑有義股之長度各自獨立地為15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48或49個核苷酸。有義股及反義股黏接形成雙螺旋體,且在一些實施例中,雙股RNAi藥劑具有約15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30個核苷酸之雙螺旋體長度。
用於形成CFB RNAi藥劑之核苷酸序列的實例提供於表2、表3、表4A、表4B或表5C中。包括表2、表3、表4A、表4B或表5C中之有義股及反義股序列之RNAi藥劑雙螺旋體的實例顯示於表5A、表5B或表5C中。
在一些實施例中,有義股與反義股之間完全互補、實質上互補或部分互補的區域之長度為15-26 (例如15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25或26)個核苷酸,且存在於反義股之5'端或其附近(例如此區域可與反義股之5'端間隔0、1、2、3或4個並非完全互補、實質上互補或部分互補的核苷酸)。
本文所描述之CFB RNAi藥劑之有義股包括至少15個連續核苷酸,該等連續核苷酸與CFB mRNA中相同數目之核苷酸的核心伸長序列(在本文中亦稱為「核心伸長段」或「核心序列」)具有至少85%一致性。在一些實施例中,有義股核心伸長序列與反義股中之核心伸長序列100% (完全)互補或至少約85% (實質上)互補,且因此有義股核心伸長序列通常與CFB mRNA目標中存在之相同長度之核苷酸序列(有時稱為例如目標序列)完全一致或至少約85%一致。在一些實施例中,此有義股核心伸長段之長度為15、16、17、18、19、20、21、22或23個核苷酸。在一些實施例中,此有義股核心伸長段之長度為17個核苷酸。在一些實施例中,此有義股核心伸長段之長度為19個核苷酸。在一些實施例中,此有義股核心伸長段之長度為21個核苷酸。
本文所描述之CFB RNAi藥劑之反義股包括至少15個連續核苷酸,該等連續核苷酸與CFB mRNA中相同數目核苷酸之核心伸長段及對應有義股中相同數目核苷酸之核心伸長段具有至少85%互補性。在一些實施例中,反義股核心伸長段與CFB mRNA目標中存在之相同長度之核苷酸序列(例如目標序列) 100% (完全)互補或至少約85% (實質上)互補。在一些實施例中,此反義股核心伸長段之長度為15、16、17、18、19、20、21、22或23個核苷酸。在一些實施例中,此反義股核心伸長段之長度為21個核苷酸。在一些實施例中,此反義股核心伸長段之長度為19個核苷酸。有義股核心伸長序列可具有與對應反義核心序列相同的長度或其可為不同長度。
CFB RNAi藥劑有義股及反義股黏接形成雙螺旋體。CFB RNAi藥劑之有義股及反義股可彼此部分、實質上或完全互補。在互補雙螺旋體區內,有義股核心伸長序列與反義核心伸長序列至少85%互補或100%互補。在一些實施例中,有義股核心伸長序列含有至少15、至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、至少24或至少25個核苷酸之序列,其與反義股核心伸長序列之對應15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個核苷酸序列至少85%或100%互補(亦即,CFB RNAi藥劑之有義及反義核心伸長序列具有至少85%鹼基配對或100%鹼基配對的至少15、至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、至少24或至少25個核苷酸之區域)。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑的反義股與表2、表3或表5C中之反義股序列中之任一者之差異為0、1、2或3個核苷酸。在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑的有義股與表2、表4A、表4B或表5C中之有義股序列中之任一者之差異為0、1、2或3個核苷酸。
在一些實施例中,有義股及/或反義股可視情況且獨立地在核心伸長序列之3'端、5'端或3'及5'端兩者處含有額外1、2、3、4、5或6個核苷酸(延伸部分)。反義股額外核苷酸(若存在)可與或可不與CFB mRNA中之對應序列互補。有義股額外核苷酸(若存在)可與或可不與CFB mRNA中之對應序列一致。反義股額外核苷酸(若存在)可與或可不與對應有義股之額外核苷酸(若存在)互補。
依本文所用,延伸部分包含有義股核心伸長序列及/或反義股核心伸長序列之5'及/或3'端處之1、2、3、4、5或6個核苷酸。有義股上之延伸部分核苷酸可與或可不與對應反義股中之核苷酸(核心伸長序列核苷酸或延伸部分核苷酸)互補。相反,反義股上之延伸部分核苷酸可與或可不與對應有義股中之核苷酸(核心伸長段核苷酸或延伸部分核苷酸)互補。在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股及反義股均含有3'及5'延伸部分。在一些實施例中,一股之一或多個3'延伸部分核苷酸與另一股之一或多個5'延伸部分核苷酸鹼基配對。在其他實施例中,一股之一或多個3'延伸部分核苷酸不與另一股之一或多個5'延伸部分核苷酸鹼基配對。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑具有反義股(具有3'延伸部分)及有義股(具有5'延伸部分)。在一些實施例中,延伸部分核苷酸不配對且形成突出物(overhang)。依本文及此項技術中所用,「突出物」係指位於有義股或反義股之末端處的一或多個未配對核苷酸之伸長段的延伸部分,其不形成本文所揭示之RNAi藥劑之雜交或雙螺旋部分的一部分。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含具有1、2、3、4、5或6個核苷酸長度之3'延伸部分的反義股。在其他實施例中,CFB RNAi藥劑包含具有1、2或3個核苷酸長度之3'延伸部分的反義股。在一些實施例中,一或多個反義股延伸部分核苷酸包含與對應CFB mRNA序列互補之核苷酸。在一些實施例中,一或多個反義股延伸部分核苷酸包含與對應CFB mRNA序列不互補之核苷酸。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含具有1、2、3、4或5個核苷酸長度之3'延伸部分的有義股。在一些實施例中,一或多個有義股延伸部分核苷酸包含腺苷、尿嘧啶或胸苷核苷酸、AT二核苷酸或與CFB mRNA序列中之核苷酸對應或一致的核苷酸。在一些實施例中,3'有義股延伸部分包括以下序列中之一者或由其組成(但不限於):T、UT、TT、UU、UUT、TTT或TTTT (各自5'至3'列出)。
有義股可具有3'延伸部分及/或5'延伸部分。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含具有1、2、3、4、5或6個核苷酸長度之5'延伸部分的有義股。在一些實施例中,一或多個有義股延伸部分核苷酸包含與CFB mRNA序列中之核苷酸對應或一致之核苷酸。
用於形成CFB RNAi藥劑之序列的實例提供於表2、表3、表4A、表4B或表5C中。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑反義股包括表2、表3或表5C中之序列中之任一者的序列。在某些實施例中,CFB RNAi藥劑反義股包含表3中之經修飾序列中之任一者或由其組成。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑反義股包括表2、表3或表5C中之序列中之任一者的核苷酸(5'端 3'端) 1-17、2-15、2-17、1-18、2-18、1-19、2-19、1-20、2-20、1-21或2-21之序列。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑有義股包括表2、表4A、表4B或表5C中之序列中之任一者的序列。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑有義股包括表2、表4A、表4B或表5C中之序列中之任一者的核苷酸(5'端 3'端) 1-18、1-19、1-20、1-21、2-19、2-20、2-21、3-20、3-21或4-21之序列。在某些實施例中,CFB RNAi藥劑有義股包含表4A或表4B中之經修飾序列中之任一者的經修飾序列或由其組成。
在一些實施例中,本文所描述之RNAi藥劑的有義股及反義股含有相同數目之核苷酸。在一些實施例中,本文所描述之RNAi藥劑的有義股及反義股含有不同數目之核苷酸。在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股5'端及反義股3'端形成鈍端。在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股3'端及反義股5'端形成鈍端。在一些實施例中,RNAi藥劑之兩端均形成鈍端。在一些實施例中,RNAi藥劑之端均非鈍端。依本文所用之「鈍端」係指雙股RNAi藥劑之一端,其中兩個黏接股之末端核苷酸互補(形成互補鹼基對)。
在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股5'端及反義股3'端形成磨損端。在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股3'端及反義股5'端形成磨損端。在一些實施例中,RNAi藥劑之兩端均形成磨損端。在一些實施例中,RNAi藥劑之端均非磨損端。依本文所用,磨損端係指雙股RNAi藥劑之一端,其中兩個黏接股之末端核苷酸形成對(亦即,不形成突出物),但並不互補(亦即,形成非互補對)。在一些實施例中,雙股RNAi藥劑之一股之末端處的一或多個不成對核苷酸形成突出物。不成對核苷酸可位於有義股或反義股上,從而產生3'或5'突出物。在一些實施例中,RNAi藥劑含有:鈍端及磨損端、鈍端及5'突出端、鈍端及3'突出端、磨損端及5'突出端、磨損端及3'突出端、兩個5'突出端、兩個3'突出端、5'突出端及3'突出端、兩個磨損端或兩個鈍端。通常,突出物(若存在)位於有義股、反義股或有義股及反義股兩者之3'末端處。
本文所揭示之CFB RNAi藥劑亦可包含一或多個經修飾之核苷酸。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑之有義股的實質上所有核苷酸及反義股的實質上所有核苷酸為經修飾之核苷酸。本文所揭示之CFB RNAi藥劑可進一步包含一或多個經修飾之核苷間鍵聯,例如一或多個硫代磷酸酯鍵聯。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑含有一或多個經修飾之核苷酸及一或多個經修飾之核苷間鍵聯。在一些實施例中,將2′修飾之核苷酸與經修飾之核苷間鍵聯組合。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑以鹽、混合鹽或游離酸形式製備或提供。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑以醫藥學上可接受之鹽形式製備。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑以醫藥學上可接受之鈉鹽形式製備。此項技術中所熟知之此類形式在本文所揭示發明之範疇內。 經修飾之核苷酸
當用於各種寡核苷酸構築體中時,經修飾之核苷酸可保存細胞中化合物之活性,同時增加此等化合物之血清穩定性,且亦可最小化在投與寡核苷酸構築體時人類中活化干擾素活性之可能性。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑含有一或多個經修飾之核苷酸。依本文所用,「經修飾之核苷酸」為除核糖核苷酸(2'-羥基核苷酸)以外的核苷酸。在一些實施例中,至少50% (例如至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%、至少99%或100%)的核苷酸為經修飾之核苷酸。依本文所用,經修飾之核苷酸可包括但不限於去氧核糖核苷酸、核苷酸模擬物、無鹼基核苷酸、2′修飾之核苷酸、反向核苷酸、包含經修飾之核鹼基之核苷酸、橋連核苷酸、肽核酸(PNA)、2′,3′-斷核苷酸模擬物(未鎖定核鹼基類似物)、鎖定核苷酸、3′-O-甲氧基(2′核苷間連接)核苷酸、2'-F-阿拉伯糖核苷酸、5'-Me、2'-氟核苷酸、嗎啉核苷酸、膦酸乙烯酯去氧核糖核苷酸、含膦酸乙烯酯核苷酸及含膦酸環丙酯核苷酸。2'修飾之核苷酸(亦即,在五員糖環之2'位置處具有除羥基以外之基團的核苷酸)包括但不限於2′-O-甲基核苷酸(在本文中或在此項技術中亦稱為2'-甲氧基核苷酸)、2'-氟核苷酸(在本文中或在此項技術中亦稱為2'-去氧-2'-氟核苷酸)、2'-去氧核苷酸、2'-甲氧基乙基(2'-O-2-甲氧基乙基)核苷酸(在本文中或在此項技術中亦稱為2'-MOE核苷酸)、2'-胺基核苷酸及2'-烷基核苷酸。給定化合物之所有位置無需經均一修飾。相反,可在單個CFB RNAi藥劑中或甚至在其單個核苷酸中併入超過一個修飾。CFB RNAi藥劑有義股及反義股可藉由此項技術中已知之方法合成及/或修飾。一個核苷酸上之修飾獨立於另一核苷酸上之修飾。
經修飾之核鹼基包括合成及天然核鹼基,例如5-取代之嘧啶、6-氮雜嘧啶以及N-2、N-6及O-6取代之嘌呤(例如2胺基丙基腺嘌呤、5-丙炔基尿嘧啶或5-丙炔基胞嘧啶)、5-甲基胞嘧啶(5-me-C)、5-羥甲基胞嘧啶、肌苷、黃嘌呤、次黃嘌呤、2-胺基腺嘌呤、腺嘌呤及鳥嘌呤之6-烷基(例如6-甲基、6-乙基、6-異丙基或6-正丁基)衍生物、腺嘌呤及鳥嘌呤之2-烷基(例如2-甲基、2-乙基、2-異丙基或2-正丁基)及其他烷基衍生物、2-硫代尿嘧啶、2-硫代胸腺嘧啶、2-硫代胞嘧啶、5-鹵代尿嘧啶、胞嘧啶、5­丙炔基尿嘧啶、5­丙炔基胞嘧啶、6-偶氮尿嘧啶、6-偶氮胞嘧啶、6-偶氮胸腺嘧啶、5-尿嘧啶(假尿嘧啶)、4-硫代尿嘧啶、8-鹵基、8-胺基、8-硫氫基、8-硫烷基、8-羥基及其他8-取代之腺嘌呤及鳥嘌呤、5-鹵基(例如5-溴)、5-三氟甲基及其他5-取代之尿嘧啶及胞嘧啶、7-甲基鳥嘌呤及7-甲基腺嘌呤、8-氮雜鳥嘌呤及8-氮雜腺嘌呤、7-去氮鳥嘌呤、7-去氮腺嘌呤、3-去氮鳥嘌呤及3-去氮腺嘌呤。
在一些實施例中,反義股之5'及/或3'端可包括無鹼基殘基(Ab),其亦可稱為「無鹼基位點」或「無鹼基核苷酸」。無鹼基殘基(Ab)為在糖部分之1'位置處不具有核鹼基之核苷酸或核苷。在一些實施例中,無鹼基殘基可置放於核苷酸序列內部。在一些實施例中,Ab或AbAb可添加至反義股之3'端。在一些實施例中,有義股之5'端可包括一或多個額外無鹼基殘基(例如(Ab)或(AbAb))。在一些實施例中,將UUAb、UAb或Ab添加至有義股之3'端。在一些實施例中,可用核糖醇(無鹼基核糖)殘基替代無鹼基(去氧核糖)殘基。
在一些實施例中,RNAi藥劑之所有或實質上所有核苷酸為經修飾之核苷酸。依本文所用,其中所存在的實質上所有核苷酸為經修飾之核苷酸的RNAi藥劑為有義股及反義股兩者中有四個或更少(亦即,0、1、2、3或4個)核苷酸為核糖核苷酸(亦即,未經修飾)的RNAi藥劑。依本文所用,其中所存在的實質上所有核苷酸為經修飾之核苷酸的有義股為有義股中有兩個或更少(亦即,0、1或2個)核苷酸為未經修飾之核糖核苷酸的有義股。依本文所用,其中所存在的實質上所有核苷酸為經修飾之核苷酸的反義股為反義股中有兩個或更少(亦即,0、1或2個)核苷酸為未經修飾之核糖核苷酸的反義股。在一些實施例中,RNAi藥劑之一或多個核苷酸為未經修飾之核糖核苷酸。某些經修飾之核苷酸之化學結構闡述於本文表6中。 經修飾之核苷間鍵聯
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑之一或多個核苷酸藉由非標準鍵聯或主鏈(亦即,經修飾之核苷間鍵聯或經修飾之主鏈)連接。經修飾之核苷間鍵聯或主鏈包括但不限於硫代磷酸酯基(在本文中表示為小寫字母「s」)、對掌性硫代磷酸酯、硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、磷酸三酯、胺基烷基-磷酸三酯、膦酸烷酯(例如膦酸甲酯或3'-伸烷基膦酸酯)、對掌性膦酸酯、亞膦酸酯、胺基磷酸酯(例如3'-胺基胺基磷酸酯、胺基烷基胺基磷酸酯或硫羰基胺基磷酸酯)、硫羰基烷基-膦酸酯、硫羰基烷基磷酸三酯、嗎啉基鍵聯、具有正常3'-5'鍵聯之硼烷磷酸酯、硼烷磷酸酯之2'-5'連接之類似物或具有反向極性之硼烷磷酸酯,其中相鄰核苷單元對使3'-5'連接至5'-3'或使2'-5'連接至5'-2'。在一些實施例中,經修飾之核苷間鍵聯或主鏈不具有磷原子。不具有磷原子之經修飾之核苷間鍵聯包括但不限於短鏈烷基或環烷基糖間鍵聯、混合雜原子及烷基或環烷基糖間鍵聯,或一或多個短鏈雜原子或雜環糖間鍵聯。在一些實施例中,經修飾之核苷間主鏈包括但不限於矽氧烷主鏈、硫醚主鏈、亞碸主鏈、碸主鏈、甲醯基及硫甲醯基主鏈、亞甲基甲醯基及硫甲醯基主鏈、含有烯烴之主鏈、胺基磺酸酯主鏈、亞甲基亞胺基及亞甲基肼基主鏈、磺酸酯及磺醯胺主鏈、醯胺主鏈及其他具有混合N、O、S及CH 2組分之主鏈。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑之有義股可含有1、2、3、4、5或6個硫代磷酸酯鍵聯,CFB RNAi藥劑之反義股可含有1、2、3、4、5或6個硫代磷酸酯鍵聯,或有義股及反義股均可獨立地含有1、2、3、4、5或6個硫代磷酸酯鍵聯。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑之有義股可含有1、2、3或4個硫代磷酸酯鍵聯,CFB RNAi藥劑之反義股可含有1、2、3或4個硫代磷酸酯鍵聯,或有義股及反義股均可獨立地含有1、2、3或4個硫代磷酸酯鍵聯。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑有義股含有至少兩個硫代磷酸酯核苷間鍵聯。在一些實施例中,硫代磷酸酯核苷間鍵聯在有義股之3'端之位置1-3處的核苷酸之間。在一些實施例中,一個硫代磷酸酯核苷間鍵聯在有義股核苷酸序列之5'端,且另一硫代磷酸酯鍵聯在有義股核苷酸序列之3'端。在一些實施例中,兩個硫代磷酸酯核苷間鍵聯位於有義股之5'端,且另一硫代磷酸酯鍵聯在有義股之3'端。在一些實施例中,有義股不包括核苷酸之間的任何硫代磷酸酯核苷間鍵聯,但含有5'及3'端上之末端核苷酸之間的一個、兩個或三個硫代磷酸酯鍵聯且視情況存在反向無鹼基殘基端帽。在一些實施例中,靶向配位體係經由硫代磷酸酯鍵聯連接至有義股。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑反義股含有四個硫代磷酸酯核苷間鍵聯。在一些實施例中,四個硫代磷酸酯核苷間鍵聯位於自反義股之5'端之位置1-3處的核苷酸之間及自5'端之位置19-21、20-22、21-23、22-24、23-25或24-26處的核苷酸之間。在一些實施例中,三個硫代磷酸酯核苷間鍵聯位於自反義股之5'端之位置1-4之間,且第四個硫代磷酸酯核苷間鍵聯位於自反義股之5'端之位置20-21之間。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑含有反義股中之至少三個或四個硫代磷酸酯核苷間鍵聯。 加帽殘基或部分
在一些實施例中,有義股可包括一或多個加帽殘基或部分,在此項技術中有時稱為「帽」、「端帽」或「加帽殘基」。依本文所用,「加帽殘基」為非核苷酸化合物或可併入本文所揭示之RNAi藥劑之核苷酸序列的一或多個末端處之其他部分。在一些情況下,加帽殘基可為RNAi藥劑提供某些有益特性,諸如防止核酸外切酶降解。在一些實施例中,添加反向無鹼基殘基(invAb) (在此項技術中亦稱為「反向無鹼基位點」)作為加帽殘基。(參見例如F. Czauderna, Nucleic Acids Res.2003; 31(11), 2705-16;美國專利第5,998,203號)。加帽殘基一般為此項技術中已知,且包括例如反向無鹼基殘基以及碳鏈,諸如末端CFBH 7(丙基)、C 6H 13(己基)或C 12H 25(十二烷基)基團。在一些實施例中,在有義股之5'末端、3'末端或5'及3'末端兩者處存在加帽殘基。在一些實施例中,有義股之5'端及/或3'端可包括超過一個反向無鹼基去氧核糖部分作為加帽殘基。
在一些實施例中,將一或多個反向無鹼基殘基(invAb)添加至有義股之3'端。在一些實施例中,將一或多個反向無鹼基殘基(invAb)添加至有義股之5'端。在一些實施例中,將一或多個反向無鹼基殘基或反向無鹼基位點插入靶向配位體與RNAi藥劑之有義股的核苷酸序列之間。在一些實施例中,在RNAi藥劑之有義股之一或多個端末端或其附近包括一或多個反向無鹼基殘基或反向無鹼基位點允許增強RNAi藥劑之活性或其他所需特性。
在一些實施例中,將一或多個反向無鹼基殘基(invAb)添加至有義股之5'端。在一些實施例中,將一或多個反向無鹼基殘基插入靶向配位體與RNAi藥劑之有義股的核苷酸序列之間。反向無鹼基殘基可經由磷酸酯鍵聯、硫代磷酸酯鍵聯(例如本文中顯示為(invAb)s))或其他核苷間鍵聯連接。在一些實施例中,在RNAi藥劑之有義股之一或多個末端處或其附近包括一或多個反向無鹼基殘基可允許增強RNAi藥劑之活性或其他所需特性。在一些實施例中,可用反向核糖醇(無鹼基核糖)殘基替代反向無鹼基(去氧核糖)殘基。在一些實施例中,反義股核心伸長序列之3'端或反義股序列之3'端可包括反向無鹼基殘基。反向無鹼基去氧核糖殘基之化學結構顯示於下表6中。 CFB RNAi 藥劑
本文所揭示之CFB RNAi藥劑經設計以靶向CFB基因(例如SEQ ID NO:1)上之特定位置。 NM_001710.6 智人補體因子B (CFB),mRNA轉錄物(SEQ ID NO: 1):
如本文中所定義,反義股序列經設計以在與CFB基因鹼基配對時,當反義股之5′末端核鹼基與該基因上給定位置下游(朝向3′端)之21個核苷酸處的位置對準時,在該基因上之該給定位置靶向該基因。舉例而言,依本文中之表1及表2中所說明,經設計以在位置1667處靶向CFB基因之反義股序列需要在與該基因進行鹼基配對時,反義股之5′末端核鹼基與CFB基因之位置1687對準。
依本文所提供,CFB RNAi藥劑不需要反義股之位置1 (5′ 3′)處的核鹼基與基因互補,其限制條件為在至少15個連續核苷酸之核心伸長序列中,反義股與基因存在至少85%互補性(例如至少85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100%互補性)。舉例而言,對於經設計以靶向CFB基因之位置307的本文所揭示之CFB RNAi藥劑,CFB RNAi藥劑之反義股的5'末端核鹼基必須與基因之位置325對準;然而,反義股之5'末端核鹼基可(但並不需要)與CFB基因之位置325互補,其限制條件為在至少15個連續核苷酸之核心伸長序列中,反義股與基因存在至少85%互補性(例如至少85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100%互補性)。此外,依本文所揭示之實例所顯示且依此項技術中所熟知,CFB RNAi藥劑之反義股結合基因之特異性位點(例如CFB RNAi藥劑是否經設計以靶向位置325、位置1667、位置2399或在某一其他位置處之CFB基因)對於藉由CFB RNAi藥劑達成之抑製程度以及藉由分子達成之毒性概況至關重要。(參見例如Kamola等人, PLOS Computational Biology2015;11(12),圖1)。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑靶向表1中所示之CFB基因序列之位置處或其附近的CFB基因。在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑之反義股包括與表1中所揭示之目標CFB 19-mer序列完全、實質上或至少部分互補的核心伸長序列。 1.CFB 19-mer mRNA目標序列(獲自智人補體因子B (CFB),mRNA,GenBank NM_001710.6 (SEQ ID NO:1))
SEQ ID No. CFB 19-mer 目標序列 (5 ′ → 3′) SEQ ID NO: 1 上序列之對應位置 靶向基因位置 ( 本文所提及)
2 CGUGUGUCCUUCUGGCUUC 307-325 305
3 UGAGUGAUGAGAUCUCUUU 495-513 493
4 AGUGAUGAGAUCUCUUUCC 497-515 495
5 CUGCUAUGACGGUUACACU 517-535 515
6 GCCAAGACUCCUUCAUGUA 780-798 778
7 AAGACUCCUUCAUGUACGA 783-801 781
8 ACUCCUUCAUGUACGACAC 786-804 784
9 GACCAUAGAAGGAGUCGAU 847-865 845
10 UCCAUGAACAUCUACCUGG 929-947 927
11 ACAUCUACCUGGUGCUAGA 936-954 934
12 AUCUACCUGGUGCUAGAUG 938-956 936
13 UCUACCUGGUGCUAGAUGG 939-957 937
14 CUACCUGGUGCUAGAUGGA 940-958 938
15 UACCUGGUGCUAGAUGGAU 941-959 939
16 CCUGGUGCUAGAUGGAUCA 943-961 941
17 GUGCUAGAUGGAUCAGACA 947-965 945
18 UAGAUGGAUCAGACAGCAU 951-969 949
19 GGAUCAGACAGCAUUGGGG 956-974 954
20 GCCAAAAAGUGUCUAGUCA 992-1010 990
21 CAAAAAGUGUCUAGUCAAC 994-1012 992
22 AAAAGUGUCUAGUCAACUU 996-1014 994
23 GAAGGUGGCAAGUUAUGGU 1021-1039 1019
24 AAGGUGGCAAGUUAUGGUG 1022-1040 1020
25 GUUAUGGUGUGAAGCCAAG 1032-1050 1030
26 GCAGUGUACAGCAUGAUGA 1208-1226 1206
27 GAUGGAUUGCACAACAUGG 1292-1310 1290
28 ACCCAAUUACUGUCAUUGA 1317-1335 1315
29 CCCAAUUACUGUCAUUGAU 1316-1334 1316
30 CAAUUACUGUCAUUGAUGA 1320-1338 1318
31 CUGUCAUUGAUGAGAUCCG 1326-1344 1324
32 AGGAUUAUCUGGAUGUCUA 1386-1404 1384
33 UCUGGAUGUCUAUGUGUUU 1393-1411 1391
34 UGGAUGUCUAUGUGUUUGG 1395-1413 1393
35 ACCAAGUGAACAUCAAUGC 1431-1449 1429
36 AAGUGAACAUCAAUGCUUU 1434-1452 1432
37 GAACAUCAAUGCUUUGGCU 1438-1456 1436
38 ACAUCAAUGCUUUGGCUUC 1440-1458 1438
39 AGAAAGACAAUGAGCAACA 1461-1479 1459
40 AAGACAAUGAGCAACAUGU 1464-1482 1462
41 UCUGAGUCUCUGUGGCAUG 1549-1567 1547
42 UACCGAUUACCACAAGCAA 1588-1606 1586
43 CCGAUUACCACAAGCAACC 1590-1608 1588
44 UGGCAGGCCAAGAUCUCAG 1610-1628 1608
45 UGUGGUGUCUGAGUACUUU 1669-1687 1667
46 UGUCUGAGUACUUUGUGCU 1674-1692 1672
47 GUCUGAGUACUUUGUGCUG 1675-1693 1673
48 UGACAGCAGCACAUUGUUU 1692-1710 1690
49 GACGUUGCCCUGAUCAAGC 1853-1871 1851
50 ACGUUGCCCUGAUCAAGCU 1854-1872 1852
51 UUUCAUUCAAGUUGGUGUA 2257-2275 2255
52 AAUCAGCUGGGGAGUAGUG 2275-2293 2273
53 UCAGCUGGGGAGUAGUGGA 2277-2295 2275
54 CUGGGGAGUAGUGGAUGUC 2281-2299 2279
55 GGGGAGUAGUGGAUGUCUG 2283-2301 2281
56 CAAGAUGAGGAUUUGGGUU 2396-2414 2394
57 AAGAUGAGGAUUUGGGUUU 2397-2415 2395
58 UGAGGAUUUGGGUUUUCUA 2401-2419 2399
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包括反義股,其中反義股之位置19 (5′ 3′)能夠與表1中所揭示之19-mer目標序列之位置1形成鹼基對。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包括反義股,其中反義股之位置1 (5′ 3′)能夠與表1中所揭示之19-mer目標序列之位置19形成鹼基對。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包括反義股,其中反義股之位置2 (5′ 3′)能夠與表1中所揭示之19-mer目標序列之位置18形成鹼基對。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包括反義股,其中反義股之位置2至18 (5′ 3′)能夠與位於表1中所揭示之19-mer目標序列之位置18至2處的各別互補鹼基中之各者形成鹼基對。
對於本文所揭示之RNAi藥劑,反義股之位置1 (5'端 3'端)的核苷酸可與CFB基因完全互補,或可與CFB基因不互補。在一些實施例中,反義股之位置1 (5'端 3'端)處的核苷酸為U、A或dT。在一些實施例中,反義股之位置1 (5'端 3'端)處的核苷酸與有義股形成A:U或U:A鹼基對。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑反義股包含表2、表3或表5C中之反義股序列中之任一者的核苷酸(5'端 3'端) 2-18、2-19、2-20或2-21之序列。在一些實施例中,CFB RNAi有義股包含表2、表4A、表4B或表5C中之有義股序列中之任一者的核苷酸(5'端 3'端) 3-21、2-21、1-21、3-20、2-20、1-20、3-19、2-19、1-19、3-18、2-18或1-18之序列。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑反義股包含表2、表3或表5C之反義股序列中之任一者的核苷酸(5'端 3'端) 2-18、2-19、2-20或2-21之序列。在一些實施例中,CFB RNAi有義股包含表2、表4A、表4B或表5C之有義股序列中之任一者的核苷酸(5'端 3'端) 3-21、2-21、1-21、3-20、2-20、1-20、3-19、2-19、1-19、3-18、2-18或1-18之序列。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含(i)反義股,其包含表2或表3中之反義股序列中之任一者的核苷酸(5'端 3'端) 2-18或2-19之序列,及(ii)有義股,其包含表2或表4A或表4B中之有義股序列中之任一者的核苷酸(5'端 3'端) 3-21、2-21、1-21、3-20、2-20、1-20、3-19、2-19、1-19、3-18、2-18或1-18之序列。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含(i)反義股,其包含表2或表3之反義股序列中之任一者的核苷酸(5'端 3'端) 2-18或2-19之序列,及(ii)有義股,其包含表2或表4A或表4B之有義股序列中之任一者的核苷酸(5'端 3'端) 3-21、2-21、1-21、3-20、2-20、1-20、3-19、2-19、1-19、3-18、2-18或1-18之序列。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包括下表2中所示之核心19-mer核苷酸序列。 2.CFB RNAi藥劑反義股及有義股核心伸長鹼基序列(N=任何核鹼基;)
SEQ ID No. 反義股鹼基序列 (5 ′ → 3′) ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列) SEQ ID No. 有義股鹼基序列 (5 ′ → 3′) ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列) SEQ ID NO: 1 上之經 鑑別序列的對應位置 靶向基因位置
59 GAAGCCAGAAGGACACACG 478 CGUGUGUCCUUCUGGCUUC 307-325 305
60 UAAGCCAGAAGGACACACG 479 CGUGUGUCCUUCUGGCUUA 307-325 305
61 NAAGCCAGAAGGACACACG 480 CGUGUGUCCUUCUGGCUUN 307-325 305
62 UAAGCCAGAAGGACACACN 481 NGUGUGUCCUUCUGGCUUA 307-325 305
63 NAAGCCAGAAGGACACACN 482 NGUGUGUCCUUCUGGCUUN 307-325 305
64 GAAGCCAGAAGGACACACG 483 CGUGUGUCCUUCUGICUUC 307-325 305
65 UAAGCCAGAAGGACACACG 484 CGUGUGUCCUUCUGICUUA 307-325 305
66 NAAGCCAGAAGGACACACG 485 CGUGUGUCCUUCUGICUUN 307-325 305
67 UAAGCCAGAAGGACACACN 486 NGUGUGUCCUUCUGICUUA 307-325 305
68 NAAGCCAGAAGGACACACN 487 NGUGUGUCCUUCUGICUUN 307-325 305
69 AAAGAGAUCUCAUCACUCA 488 UGAGUGAUGAGAUCUCUUU 495-513 493
70 UAAGAGAUCUCAUCACUCA 489 UGAGUGAUGAGAUCUCUUA 495-513 493
71 NAAGAGAUCUCAUCACUCA 490 UGAGUGAUGAGAUCUCUUN 495-513 493
72 AAAGAGAUCUCAUCACUCN 491 NGAGUGAUGAGAUCUCUUU 495-513 493
73 UAAGAGAUCUCAUCACUCN 492 NGAGUGAUGAGAUCUCUUA 495-513 493
74 NAAGAGAUCUCAUCACUCN 493 NGAGUGAUGAGAUCUCUUN 495-513 493
75 GGAAAGAGAUCUCAUCACU 494 AGUGAUGAGAUCUCUUUCC 497-515 495
76 UGAAAGAGAUCUCAUCACU 495 AGUGAUGAGAUCUCUUUCA 497-515 495
77 NGAAAGAGAUCUCAUCACU 496 AGUGAUGAGAUCUCUUUCN 497-515 495
78 UGAAAGAGAUCUCAUCACN 497 NGUGAUGAGAUCUCUUUCA 497-515 495
79 NGAAAGAGAUCUCAUCACN 498 NGUGAUGAGAUCUCUUUCN 497-515 495
80 AGUGUAACCGUCAUAGCAG 499 CUGCUAUGACGGUUACACU 517-535 515
81 UGUGUAACCGUCAUAGCAG 500 CUGCUAUGACGGUUACACA 517-535 515
82 NGUGUAACCGUCAUAGCAG 501 CUGCUAUGACGGUUACACN 517-535 515
83 AGUGUAACCGUCAUAGCAN 502 NUGCUAUGACGGUUACACU 517-535 515
84 UGUGUAACCGUCAUAGCAN 503 NUGCUAUGACGGUUACACA 517-535 515
85 NGUGUAACCGUCAUAGCAN 504 NUGCUAUGACGGUUACACN 517-535 515
86 UACAUGAAGGAGUCUUGGC 505 GCCAAGACUCCUUCAUGUA 780-798 778
87 NACAUGAAGGAGUCUUGGC 506 GCCAAGACUCCUUCAUGUN 780-798 778
88 UACAUGAAGGAGUCUUGGN 507 NCCAAGACUCCUUCAUGUA 780-798 778
89 NACAUGAAGGAGUCUUGGN 508 NCCAAGACUCCUUCAUGUN 780-798 778
90 UCGUACAUGAAGGAGUCUU 509 AAGACUCCUUCAUGUACGA 783-801 781
91 NCGUACAUGAAGGAGUCUU 510 AAGACUCCUUCAUGUACGN 783-801 781
92 UCGUACAUGAAGGAGUCUN 511 NAGACUCCUUCAUGUACGA 783-801 781
93 NCGUACAUGAAGGAGUCUN 512 NAGACUCCUUCAUGUACGN 783-801 781
94 UCGUACAUGAAGGAGUCUU 513 AAGACUCCUUCAUGUACIA 783-801 781
95 NCGUACAUGAAGGAGUCUU 514 AAGACUCCUUCAUGUACIN 783-801 781
96 UCGUACAUGAAGGAGUCUN 515 NAGACUCCUUCAUGUACIA 783-801 781
97 NCGUACAUGAAGGAGUCUN 516 NAGACUCCUUCAUGUACIN 783-801 781
98 GUGUCGUACAUGAAGGAGU 517 ACUCCUUCAUGUACGACAC 786-804 784
99 UUGUCGUACAUGAAGGAGU 518 ACUCCUUCAUGUACGACAA 786-804 784
100 NUGUCGUACAUGAAGGAGU 519 ACUCCUUCAUGUACGACAN 786-804 784
101 UUGUCGUACAUGAAGGAGN 520 NCUCCUUCAUGUACGACAA 786-804 784
102 NUGUCGUACAUGAAGGAGN 521 NCUCCUUCAUGUACGACAN 786-804 784
103 GUGUCGUACAUGAAGGAGU 522 ACUCCUUCAUGUACIACAC 786-804 784
104 UUGUCGUACAUGAAGGAGU 523 ACUCCUUCAUGUACIACAA 786-804 784
105 NUGUCGUACAUGAAGGAGU 524 ACUCCUUCAUGUACIACAN 786-804 784
106 UUGUCGUACAUGAAGGAGN 525 NCUCCUUCAUGUACIACAA 786-804 784
107 NUGUCGUACAUGAAGGAGN 526 NCUCCUUCAUGUACIACAN 786-804 784
108 AUCGACUCCUUCUAUGGUC 527 GACCAUAGAAGGAGUCGAU 847-865 845
109 UUCGACUCCUUCUAUGGUC 528 GACCAUAGAAGGAGUCGAA 847-865 845
110 NUCGACUCCUUCUAUGGUC 529 GACCAUAGAAGGAGUCGAN 847-865 845
111 AUCGACUCCUUCUAUGGUN 530 NACCAUAGAAGGAGUCGAU 847-865 845
112 NUCGACUCCUUCUAUGGUN 531 NACCAUAGAAGGAGUCGAN 847-865 845
113 AUCGACUCCUUCUAUGGUC 532 GACCAUAGAAGGAIUCGAU 847-865 845
114 NUCGACUCCUUCUAUGGUC 533 GACCAUAGAAGGAIUCGAN 847-865 845
115 AUCGACUCCUUCUAUGGUN 534 NACCAUAGAAGGAIUCGAU 847-865 845
116 NUCGACUCCUUCUAUGGUN 535 NACCAUAGAAGGAIUCGAN 847-865 845
117 CCAGGUAGAUGUUCAUGGA 536 UCCAUGAACAUCUACCUGG 929-947 927
118 UCAGGUAGAUGUUCAUGGA 537 UCCAUGAACAUCUACCUGA 929-947 927
119 NCAGGUAGAUGUUCAUGGA 538 UCCAUGAACAUCUACCUGN 929-947 927
120 UCAGGUAGAUGUUCAUGGN 539 NCCAUGAACAUCUACCUGA 929-947 927
121 NCAGGUAGAUGUUCAUGGN 540 NCCAUGAACAUCUACCUGN 929-947 927
122 CCAGGUAGAUGUUCAUGGA 541 UCCAUGAACAUCUACCUIG 929-947 927
123 UCAGGUAGAUGUUCAUGGA 542 UCCAUGAACAUCUACCUIA 929-947 927
124 NCAGGUAGAUGUUCAUGGA 543 UCCAUGAACAUCUACCUIN 929-947 927
125 UCAGGUAGAUGUUCAUGGN 544 NCCAUGAACAUCUACCUIA 929-947 927
126 NCAGGUAGAUGUUCAUGGN 545 NCCAUGAACAUCUACCUIN 929-947 927
127 UCUAGCACCAGGUAGAUGU 546 ACAUCUACCUGGUGCUAGA 936-954 934
128 NCUAGCACCAGGUAGAUGU 547 ACAUCUACCUGGUGCUAGN 936-954 934
129 UCUAGCACCAGGUAGAUGN 548 NCAUCUACCUGGUGCUAGA 936-954 934
130 NCUAGCACCAGGUAGAUGN 549 NCAUCUACCUGGUGCUAGN 936-954 934
131 UCUAGCACCAGGUAGAUGU 550 ACAUCUACCUGGUICUAGA 936-954 934
132 NCUAGCACCAGGUAGAUGU 551 ACAUCUACCUGGUICUAGN 936-954 934
133 UCUAGCACCAGGUAGAUGN 552 NCAUCUACCUGGUICUAGA 936-954 934
134 NCUAGCACCAGGUAGAUGN 553 NCAUCUACCUGGUICUAGN 936-954 934
135 CAUCUAGCACCAGGUAGAU 554 AUCUACCUGGUGCUAGAUG 938-956 936
136 UAUCUAGCACCAGGUAGAU 555 AUCUACCUGGUGCUAGAUG 938-956 936
137 NAUCUAGCACCAGGUAGAU 556 AUCUACCUGGUGCUAGAUN 938-956 936
138 UAUCUAGCACCAGGUAGAN 557 NUCUACCUGGUGCUAGAUG 938-956 936
139 NAUCUAGCACCAGGUAGAN 558 NUCUACCUGGUGCUAGAUN 938-956 936
140 CCAUCUAGCACCAGGUAGA 559 UCUACCUGGUGCUAGAUGG 939-957 937
141 UCAUCUAGCACCAGGUAGA 560 UCUACCUGGUGCUAGAUGA 939-957 937
142 NCAUCUAGCACCAGGUAGA 561 UCUACCUGGUGCUAGAUGN 939-957 937
143 UCAUCUAGCACCAGGUAGN 562 NCUACCUGGUGCUAGAUGA 939-957 937
144 NCAUCUAGCACCAGGUAGN 563 NCUACCUGGUGCUAGAUGN 939-957 937
145 UCCAUCUAGCACCAGGUAG 564 CUACCUGGUGCUAGAUGGA 940-958 938
146 NCCAUCUAGCACCAGGUAG 565 CUACCUGGUGCUAGAUGGN 940-958 938
147 UCCAUCUAGCACCAGGUAN 566 NUACCUGGUGCUAGAUGGA 940-958 938
148 NCCAUCUAGCACCAGGUAN 567 NUACCUGGUGCUAGAUGGN 940-958 938
149 UCCAUCUAGCACCAGGUAG 568 CUACCUGGUGCUAGAUIGA 940-958 938
150 NCCAUCUAGCACCAGGUAG 569 CUACCUGGUGCUAGAUIGN 940-958 938
151 UCCAUCUAGCACCAGGUAN 570 NUACCUGGUGCUAGAUIGA 940-958 938
152 NCCAUCUAGCACCAGGUAN 571 NUACCUGGUGCUAGAUIGN 940-958 938
153 AUCCAUCUAGCACCAGGUA 572 UACCUGGUGCUAGAUGGAU 941-959 939
154 UUCCAUCUAGCACCAGGUA 573 UACCUGGUGCUAGAUGGAA 941-959 939
155 NUCCAUCUAGCACCAGGUA 574 UACCUGGUGCUAGAUGGAN 941-959 939
156 AUCCAUCUAGCACCAGGUN 575 NACCUGGUGCUAGAUGGAU 941-959 939
157 NUCCAUCUAGCACCAGGUN 576 NACCUGGUGCUAGAUGGAN 941-959 939
158 AUCCAUCUAGCACCAGGUA 577 UACCUGGUGCUAGAUIGAU 941-959 939
159 UUCCAUCUAGCACCAGGUA 578 UACCUGGUGCUAGAUIGAA 941-959 939
160 NUCCAUCUAGCACCAGGUA 579 UACCUGGUGCUAGAUIGAN 941-959 939
161 AUCCAUCUAGCACCAGGUN 580 NACCUGGUGCUAGAUIGAU 941-959 939
162 NUCCAUCUAGCACCAGGUN 581 NACCUGGUGCUAGAUIGAN 941-959 939
163 UGAUCCAUCUAGCACCAGG 582 CCUGGUGCUAGAUGGAUCA 943-961 941
164 NGAUCCAUCUAGCACCAGG 583 CCUGGUGCUAGAUGGAUCN 943-961 941
165 UGAUCCAUCUAGCACCAGN 584 NCUGGUGCUAGAUGGAUCA 943-961 941
166 NGAUCCAUCUAGCACCAGN 585 NCUGGUGCUAGAUGGAUCN 943-961 941
167 UGAUCCAUCUAGCACCAGG 586 CCUGGUGCUAGAUGIAUCA 943-961 941
168 NGAUCCAUCUAGCACCAGG 587 CCUGGUGCUAGAUGIAUCN 943-961 941
169 UGAUCCAUCUAGCACCAGN 588 NCUGGUGCUAGAUGIAUCA 943-961 941
170 NGAUCCAUCUAGCACCAGN 589 NCUGGUGCUAGAUGIAUCN 943-961 941
171 UGUCUGAUCCAUCUAGCAC 590 GUGCUAGAUGGAUCAGACA 947-965 945
172 NGUCUGAUCCAUCUAGCAC 591 GUGCUAGAUGGAUCAGACN 947-965 945
173 UGUCUGAUCCAUCUAGCAN 592 NUGCUAGAUGGAUCAGACA 947-965 945
174 NGUCUGAUCCAUCUAGCAN 593 NUGCUAGAUGGAUCAGACN 947-965 945
175 UGUCUGAUCCAUCUAGCAC 594 GUGCUAGAUGGAUCAIACA 947-965 945
176 NGUCUGAUCCAUCUAGCAC 595 GUGCUAGAUGGAUCAIACN 947-965 945
177 UGUCUGAUCCAUCUAGCAN 596 NUGCUAGAUGGAUCAIACA 947-965 945
178 NGUCUGAUCCAUCUAGCAN 597 NUGCUAGAUGGAUCAIACN 947-965 945
179 AUGCUGUCUGAUCCAUCUA 598 UAGAUGGAUCAGACAGCAU 951-969 949
180 UUGCUGUCUGAUCCAUCUA 599 UAGAUGGAUCAGACAGCAA 951-969 949
181 NUGCUGUCUGAUCCAUCUA 600 UAGAUGGAUCAGACAGCAN 951-969 949
182 AUGCUGUCUGAUCCAUCUN 601 NAGAUGGAUCAGACAGCAU 951-969 949
183 NUGCUGUCUGAUCCAUCUN 602 NAGAUGGAUCAGACAGCAN 951-969 949
184 AUGCUGUCUGAUCCAUCUA 603 UAGAUGGAUCAGACAGCAU 951-969 949
185 UUGCUGUCUGAUCCAUCUA 604 UAGAUGGAUCAGACAICAA 951-969 949
186 NUGCUGUCUGAUCCAUCUA 605 UAGAUGGAUCAGACAICAN 951-969 949
187 AUGCUGUCUGAUCCAUCUN 606 NAGAUGGAUCAGACAICAU 951-969 949
188 NUGCUGUCUGAUCCAUCUN 607 NAGAUGGAUCAGACAICAN 951-969 949
189 CCCCAAUGCUGUCUGAUCC 608 GGAUCAGACAGCAUUGGGG 956-974 954
190 UCCCAAUGCUGUCUGAUCC 609 GGAUCAGACAGCAUUGGGA 956-974 954
191 NCCCAAUGCUGUCUGAUCC 610 GGAUCAGACAGCAUUGGGN 956-974 954
192 UCCCAAUGCUGUCUGAUCN 611 NGAUCAGACAGCAUUGGGA 956-974 954
193 NCCCAAUGCUGUCUGAUCN 612 NGAUCAGACAGCAUUGGGN 956-974 954
194 CCCCAAUGCUGUCUGAUCC 613 GGAUCAGACAGCAUUGIGG 956-974 954
195 UCCCAAUGCUGUCUGAUCC 614 GGAUCAGACAGCAUUGIGA 956-974 954
196 NCCCAAUGCUGUCUGAUCC 615 GGAUCAGACAGCAUUGIGN 956-974 954
197 UCCCAAUGCUGUCUGAUCN 616 NGAUCAGACAGCAUUGIGA 956-974 954
198 NCCCAAUGCUGUCUGAUCN 617 NGAUCAGACAGCAUUGIGN 956-974 954
199 UGACUAGACACUUUUUGGC 618 GCCAAAAAGUGUCUAGUCA 992-1010 990
200 NGACUAGACACUUUUUGGC 619 GCCAAAAAGUGUCUAGUCN 992-1010 990
201 UGACUAGACACUUUUUGGN 620 NCCAAAAAGUGUCUAGUCA 992-1010 990
202 NGACUAGACACUUUUUGGN 621 NCCAAAAAGUGUCUAGUCN 992-1010 990
203 UGACUAGACACUUUUUGGC 622 GCCAAAAAGUGUCUAIUCA 992-1010 990
204 NGACUAGACACUUUUUGGC 623 GCCAAAAAGUGUCUAIUCN 992-1010 990
205 UGACUAGACACUUUUUGGN 624 NCCAAAAAGUGUCUAIUCA 992-1010 990
206 NGACUAGACACUUUUUGGN 625 NCCAAAAAGUGUCUAIUCN 992-1010 990
207 GUUGACUAGACACUUUUUG 626 CAAAAAGUGUCUAGUCAAC 994-1012 992
208 UUUGACUAGACACUUUUUG 627 CAAAAAGUGUCUAGUCAAA 994-1012 992
209 NUUGACUAGACACUUUUUG 628 CAAAAAGUGUCUAGUCAAN 994-1012 992
210 UUUGACUAGACACUUUUUN 629 NAAAAAGUGUCUAGUCAAA 994-1012 992
211 NUUGACUAGACACUUUUUN 630 NAAAAAGUGUCUAGUCAAN 994-1012 992
212 AAGUUGACUAGACACUUUU 631 AAAAGUGUCUAGUCAACUU 996-1014 994
213 UAGUUGACUAGACACUUUU 632 AAAAGUGUCUAGUCAACUA 996-1014 994
214 NAGUUGACUAGACACUUUU 633 AAAAGUGUCUAGUCAACUN 996-1014 994
215 AAGUUGACUAGACACUUUN 634 NAAAGUGUCUAGUCAACUU 996-1014 994
216 NAGUUGACUAGACACUUUN 635 NAAAGUGUCUAGUCAACUN 996-1014 994
217 ACCAUAACUUGCCACCUUC 636 GAAGGUGGCAAGUUAUGGU 1021-1039 1019
218 UCCAUAACUUGCCACCUUC 637 GAAGGUGGCAAGUUAUGGA 1021-1039 1019
219 NCCAUAACUUGCCACCUUC 638 GAAGGUGGCAAGUUAUGGN 1021-1039 1019
220 ACCAUAACUUGCCACCUUN 639 NAAGGUGGCAAGUUAUGGU 1021-1039 1019
221 NCCAUAACUUGCCACCUUN 640 NAAGGUGGCAAGUUAUGGN 1021-1039 1019
222 CACCAUAACUUGCCACCUU 641 AAGGUGGCAAGUUAUGGUG 1022-1040 1020
223 UACCAUAACUUGCCACCUU 642 AAGGUGGCAAGUUAUGGUA 1022-1040 1020
224 NACCAUAACUUGCCACCUU 643 AAGGUGGCAAGUUAUGGUN 1022-1040 1020
225 UACCAUAACUUGCCACCUN 644 NAGGUGGCAAGUUAUGGUA 1022-1040 1020
226 NACCAUAACUUGCCACCUN 645 NAGGUGGCAAGUUAUGGUN 1022-1040 1020
227 CUUGGCUUCACACCAUAAC 646 GUUAUGGUGUGAAGCCAAG 1032-1050 1030
228 UUUGGCUUCACACCAUAAC 647 GUUAUGGUGUGAAGCCAAA 1032-1050 1030
229 NUUGGCUUCACACCAUAAC 648 GUUAUGGUGUGAAGCCAAN 1032-1050 1030
230 UUUGGCUUCACACCAUAAN 649 NUUAUGGUGUGAAGCCAAA 1032-1050 1030
231 NUUGGCUUCACACCAUAAN 650 NUUAUGGUGUGAAGCCAAN 1032-1050 1030
232 CUUGGCUUCACACCAUAAC 651 GUUAUGGUGUGAAICCAAG 1032-1050 1030
233 UUUGGCUUCACACCAUAAC 652 GUUAUGGUGUGAAICCAAA 1032-1050 1030
234 NUUGGCUUCACACCAUAAC 653 GUUAUGGUGUGAAICCAAN 1032-1050 1030
235 UUUGGCUUCACACCAUAAN 654 NUUAUGGUGUGAAICCAAA 1032-1050 1030
236 NUUGGCUUCACACCAUAAN 655 NUUAUGGUGUGAAICCAAN 1032-1050 1030
237 UCAUCAUGCUGUACACUGC 656 GCAGUGUACAGCAUGAUGA 1208-1226 1206
238 NCAUCAUGCUGUACACUGC 657 GCAGUGUACAGCAUGAUGN 1208-1226 1206
239 UCAUCAUGCUGUACACUGN 658 NCAGUGUACAGCAUGAUGA 1208-1226 1206
240 NCAUCAUGCUGUACACUGN 659 NCAGUGUACAGCAUGAUGN 1208-1226 1206
241 CCAUGUUGUGCAAUCCAUC 660 GAUGGAUUGCACAACAUGG 1292-1310 1290
242 UCAUGUUGUGCAAUCCAUC 661 GAUGGAUUGCACAACAUGA 1292-1310 1290
243 NCAUGUUGUGCAAUCCAUC 662 GAUGGAUUGCACAACAUGN 1292-1310 1290
244 UCAUGUUGUGCAAUCCAUN 663 NAUGGAUUGCACAACAUGA 1292-1310 1290
245 NCAUGUUGUGCAAUCCAUN 664 NAUGGAUUGCACAACAUGN 1292-1310 1290
246 UCAAUGACAGUAAUUGGGU 665 ACCCAAUUACUGUCAUUGA 1317-1335 1315
247 NCAAUGACAGUAAUUGGGU 666 ACCCAAUUACUGUCAUUGN 1317-1335 1315
248 UCAAUGACAGUAAUUGGGN 667 NCCCAAUUACUGUCAUUGA 1317-1335 1315
249 NCAAUGACAGUAAUUGGGN 668 NCCCAAUUACUGUCAUUGN 1317-1335 1315
250 AUCAAUGACAGUAAUUGGG 669 CCCAAUUACUGUCAUUGAU 1316-1334 1316
251 UUCAAUGACAGUAAUUGGG 670 CCCAAUUACUGUCAUUGAA 1316-1334 1316
252 NUCAAUGACAGUAAUUGGG 671 CCCAAUUACUGUCAUUGAN 1316-1334 1316
253 AUCAAUGACAGUAAUUGGN 672 NCCAAUUACUGUCAUUGAU 1316-1334 1316
254 NUCAAUGACAGUAAUUGGN 673 NCCAAUUACUGUCAUUGAN 1316-1334 1316
255 UCAUCAAUGACAGUAAUUG 674 CAAUUACUGUCAUUGAUGA 1320-1338 1318
256 NCAUCAAUGACAGUAAUUG 675 CAAUUACUGUCAUUGAUGA 1320-1338 1318
257 UCAUCAAUGACAGUAAUUN 676 NAAUUACUGUCAUUGAUGA 1320-1338 1318
258 NCAUCAAUGACAGUAAUUN 677 NAAUUACUGUCAUUGAUGN 1320-1338 1318
259 CGGAUCUCAUCAAUGACAG 678 CUGUCAUUGAUGAGAUCCG 1326-1344 1324
260 UGGAUCUCAUCAAUGACAG 679 CUGUCAUUGAUGAGAUCCA 1326-1344 1324
261 NGGAUCUCAUCAAUGACAG 680 CUGUCAUUGAUGAGAUCCN 1326-1344 1324
262 UGGAUCUCAUCAAUGACAN 681 NUGUCAUUGAUGAGAUCCA 1326-1344 1324
263 NGGAUCUCAUCAAUGACAN 682 NUGUCAUUGAUGAGAUCCN 1326-1344 1324
264 CGGAUCUCAUCAAUGACAG 683 CUGUCAUUGAUGAIAUCCG 1326-1344 1324
265 UGGAUCUCAUCAAUGACAG 684 CUGUCAUUGAUGAIAUCCA 1326-1344 1324
266 NGGAUCUCAUCAAUGACAG 685 CUGUCAUUGAUGAIAUCCN 1326-1344 1324
267 UGGAUCUCAUCAAUGACAN 686 NUGUCAUUGAUGAIAUCCA 1326-1344 1324
268 NGGAUCUCAUCAAUGACAN 687 NUGUCAUUGAUGAIAUCCN 1326-1344 1324
269 UAGACAUCCAGAUAAUCCU 688 AGGAUUAUCUGGAUGUCUA 1386-1404 1384
270 NAGACAUCCAGAUAAUCCU 689 AGGAUUAUCUGGAUGUCUN 1386-1404 1384
271 UAGACAUCCAGAUAAUCCN 690 NGGAUUAUCUGGAUGUCUA 1386-1404 1384
272 NAGACAUCCAGAUAAUCCN 691 NGGAUUAUCUGGAUGUCUN 1386-1404 1384
273 AAACACAUAGACAUCCAGA 692 UCUGGAUGUCUAUGUGUUU 1393-1411 1391
274 UAACACAUAGACAUCCAGA 693 UCUGGAUGUCUAUGUGUUA 1393-1411 1391
275 NAACACAUAGACAUCCAGA 694 UCUGGAUGUCUAUGUGUUN 1393-1411 1391
276 AAACACAUAGACAUCCAGN 695 NCUGGAUGUCUAUGUGUUU 1393-1411 1391
277 NAACACAUAGACAUCCAGN 696 NCUGGAUGUCUAUGUGUUN 1393-1411 1391
278 CCAAACACAUAGACAUCCA 697 UGGAUGUCUAUGUGUUUGG 1395-1413 1393
279 UCAAACACAUAGACAUCCA 698 UGGAUGUCUAUGUGUUUGA 1395-1413 1393
280 NCAAACACAUAGACAUCCA 699 UGGAUGUCUAUGUGUUUGN 1395-1413 1393
281 UCAAACACAUAGACAUCCN 700 NGGAUGUCUAUGUGUUUGA 1395-1413 1393
282 NCAAACACAUAGACAUCCN 701 NGGAUGUCUAUGUGUUUGN 1395-1413 1393
283 GCAUUGAUGUUCACUUGGU 702 ACCAAGUGAACAUCAAUGC 1431-1449 1429
284 UCAUUGAUGUUCACUUGGU 703 ACCAAGUGAACAUCAAUGA 1431-1449 1429
285 NCAUUGAUGUUCACUUGGU 704 ACCAAGUGAACAUCAAUGN 1431-1449 1429
286 UCAUUGAUGUUCACUUGGN 705 NCCAAGUGAACAUCAAUGA 1431-1449 1429
287 NCAUUGAUGUUCACUUGGN 706 NCCAAGUGAACAUCAAUGN 1431-1449 1429
288 AAAGCAUUGAUGUUCACUU 707 AAGUGAACAUCAAUGCUUU 1434-1452 1432
289 UAAGCAUUGAUGUUCACUU 708 AAGUGAACAUCAAUGCUUA 1434-1452 1432
290 NAAGCAUUGAUGUUCACUU 709 AAGUGAACAUCAAUGCUUN 1434-1452 1432
291 AAAGCAUUGAUGUUCACUN 710 NAGUGAACAUCAAUGCUUU 1434-1452 1432
292 NAAGCAUUGAUGUUCACUN 711 NAGUGAACAUCAAUGCUUN 1434-1452 1432
293 AGCCAAAGCAUUGAUGUUC 712 GAACAUCAAUGCUUUGGCU 1438-1456 1436
294 UGCCAAAGCAUUGAUGUUC 713 GAACAUCAAUGCUUUGGCA 1438-1456 1436
295 NGCCAAAGCAUUGAUGUUC 714 GAACAUCAAUGCUUUGGCN 1438-1456 1436
296 AGCCAAAGCAUUGAUGUUN 715 NAACAUCAAUGCUUUGGCU 1438-1456 1436
297 NGCCAAAGCAUUGAUGUUN 716 NAACAUCAAUGCUUUGGCN 1438-1456 1436
298 AGCCAAAGCAUUGAUGUUC 717 GAACAUCAAUGCUUUGICU 1438-1456 1436
299 UGCCAAAGCAUUGAUGUUC 718 GAACAUCAAUGCUUUGICA 1438-1456 1436
300 NGCCAAAGCAUUGAUGUUC 719 GAACAUCAAUGCUUUGICN 1438-1456 1436
301 AGCCAAAGCAUUGAUGUUN 720 NAACAUCAAUGCUUUGICU 1438-1456 1436
302 NGCCAAAGCAUUGAUGUUN 721 NAACAUCAAUGCUUUGICN 1438-1456 1436
303 GAAGCCAAAGCAUUGAUGU 722 ACAUCAAUGCUUUGGCUUC 1440-1458 1438
304 UAAGCCAAAGCAUUGAUGU 723 ACAUCAAUGCUUUGGCUUA 1440-1458 1438
305 NAAGCCAAAGCAUUGAUGU 724 ACAUCAAUGCUUUGGCUUN 1440-1458 1438
306 UAAGCCAAAGCAUUGAUGN 725 NCAUCAAUGCUUUGGCUUA 1440-1458 1438
307 NAAGCCAAAGCAUUGAUGN 726 NCAUCAAUGCUUUGGCUUN 1440-1458 1438
308 GAAGCCAAAGCAUUGAUGU 727 ACAUCAAUGCUUUGICUUC 1440-1458 1438
309 UAAGCCAAAGCAUUGAUGU 728 ACAUCAAUGCUUUGICUUA 1440-1458 1438
310 NAAGCCAAAGCAUUGAUGU 729 ACAUCAAUGCUUUGICUUN 1440-1458 1438
311 UAAGCCAAAGCAUUGAUGN 730 NCAUCAAUGCUUUGICUUA 1440-1458 1438
312 NAAGCCAAAGCAUUGAUGN 731 NCAUCAAUGCUUUGICUUN 1440-1458 1438
313 UGUUGCUCAUUGUCUUUCU 732 AGAAAGACAAUGAGCAACA 1461-1479 1459
314 NGUUGCUCAUUGUCUUUCU 733 AGAAAGACAAUGAGCAACN 1461-1479 1459
315 UGUUGCUCAUUGUCUUUCN 734 NGAAAGACAAUGAGCAACA 1461-1479 1459
316 NGUUGCUCAUUGUCUUUCN 735 NGAAAGACAAUGAGCAACN 1461-1479 1459
317 UGUUGCUCAUUGUCUUUCU 736 AGAAAGACAAUGAICAACA 1461-1479 1459
318 NGUUGCUCAUUGUCUUUCU 737 AGAAAGACAAUGAICAACN 1461-1479 1459
319 UGUUGCUCAUUGUCUUUCN 738 NGAAAGACAAUGAICAACA 1461-1479 1459
320 NGUUGCUCAUUGUCUUUCN 739 NGAAAGACAAUGAICAACN 1461-1479 1459
321 ACAUGUUGCUCAUUGUCUU 740 AAGACAAUGAGCAACAUGU 1464-1482 1462
322 UCAUGUUGCUCAUUGUCUU 741 AAGACAAUGAGCAACAUGA 1464-1482 1462
323 NCAUGUUGCUCAUUGUCUU 742 AAGACAAUGAGCAACAUGN 1464-1482 1462
324 ACAUGUUGCUCAUUGUCUN 743 NAGACAAUGAGCAACAUGU 1464-1482 1462
325 NCAUGUUGCUCAUUGUCUN 744 NAGACAAUGAGCAACAUGN 1464-1482 1462
326 CAUGCCACAGAGACUCAGA 745 UCUGAGUCUCUGUGGCAUG 1549-1567 1547
327 UAUGCCACAGAGACUCAGA 746 UCUGAGUCUCUGUGGCAUA 1549-1567 1547
328 NAUGCCACAGAGACUCAGA 747 UCUGAGUCUCUGUGGCAUN 1549-1567 1547
329 UAUGCCACAGAGACUCAGN 748 NCUGAGUCUCUGUGGCAUA 1549-1567 1547
330 NAUGCCACAGAGACUCAGN 749 NCUGAGUCUCUGUGGCAUN 1549-1567 1547
331 CAUGCCACAGAGACUCAGA 750 UCUGAGUCUCUGUGICAUG 1549-1567 1547
332 UAUGCCACAGAGACUCAGA 751 UCUGAGUCUCUGUGICAUA 1549-1567 1547
333 NAUGCCACAGAGACUCAGA 752 UCUGAGUCUCUGUGICAUN 1549-1567 1547
334 UAUGCCACAGAGACUCAGN 753 NCUGAGUCUCUGUGICAUA 1549-1567 1547
335 NAUGCCACAGAGACUCAGN 754 NCUGAGUCUCUGUGICAUN 1549-1567 1547
336 UUGCUUGUGGUAAUCGGUA 755 UACCGAUUACCACAAGCAA 1588-1606 1586
337 NUGCUUGUGGUAAUCGGUA 756 UACCGAUUACCACAAGCAN 1588-1606 1586
338 UUGCUUGUGGUAAUCGGUN 757 NACCGAUUACCACAAGCAA 1588-1606 1586
339 NUGCUUGUGGUAAUCGGUN 758 NACCGAUUACCACAAGCAN 1588-1606 1586
340 UUGCUUGUGGUAAUCGGUA 759 UACCGAUUACCACAAICAA 1588-1606 1586
341 NUGCUUGUGGUAAUCGGUA 760 UACCGAUUACCACAAICAN 1588-1606 1586
342 UUGCUUGUGGUAAUCGGUN 761 NACCGAUUACCACAAICAA 1588-1606 1586
343 NUGCUUGUGGUAAUCGGUN 762 NACCGAUUACCACAAICAN 1588-1606 1586
344 GGUUGCUUGUGGUAAUCGG 763 CCGAUUACCACAAGCAACC 1590-1608 1588
345 UGUUGCUUGUGGUAAUCGG 764 CCGAUUACCACAAGCAACA 1590-1608 1588
346 NGUUGCUUGUGGUAAUCGG 765 CCGAUUACCACAAGCAACN 1590-1608 1588
347 UGUUGCUUGUGGUAAUCGN 766 NCGAUUACCACAAGCAACA 1590-1608 1588
348 NGUUGCUUGUGGUAAUCGN 767 NCGAUUACCACAAGCAACN 1590-1608 1588
349 GGUUGCUUGUGGUAAUCGG 768 CCGAUUACCACAAICAACC 1590-1608 1588
350 UGUUGCUUGUGGUAAUCGG 769 CCGAUUACCACAAICAACA 1590-1608 1588
351 NGUUGCUUGUGGUAAUCGG 770 CCGAUUACCACAAICAACN 1590-1608 1588
352 UGUUGCUUGUGGUAAUCGN 771 NCGAUUACCACAAICAACA 1590-1608 1588
353 NGUUGCUUGUGGUAAUCGN 772 NCGAUUACCACAAICAACN 1590-1608 1588
354 CUGAGAUCUUGGCCUGCCA 773 UGGCAGGCCAAGAUCUCAG 1610-1628 1608
355 UUGAGAUCUUGGCCUGCCA 774 UGGCAGGCCAAGAUCUCAA 1610-1628 1608
356 NUGAGAUCUUGGCCUGCCA 775 UGGCAGGCCAAGAUCUCAN 1610-1628 1608
357 UUGAGAUCUUGGCCUGCCN 776 NGGCAGGCCAAGAUCUCAA 1610-1628 1608
358 NUGAGAUCUUGGCCUGCCN 777 NGGCAGGCCAAGAUCUCAN 1610-1628 1608
359 AAAGUACUCAGACACCACA 778 UGUGGUGUCUGAGUACUUU 1669-1687 1667
360 UAAGUACUCAGACACCACA 779 UGUGGUGUCUGAGUACUUA 1669-1687 1667
361 UAAGUACUCAGACACCAUA 780 UGUGGUGUCUGAGUACUUA 1669-1687 1667
362 NAAGUACUCAGACACCACA 781 UGUGGUGUCUGAGUACUUN 1669-1687 1667
363 AAAGUACUCAGACACCACN 782 NGUGGUGUCUGAGUACUUU 1669-1687 1667
364 UAAGUACUCAGACACCACN 783 NGUGGUGUCUGAGUACUUA 1669-1687 1667
365 NAAGUACUCAGACACCACN 784 NGUGGUGUCUGAGUACUUN 1669-1687 1667
366 AAAGUACUCAGACACCACA 785 UGUGGUGUCUGAGUACUUU 1669-1687 1667
367 UAAGUACUCAGACACUACA 786 UGUGGUGUCUGAGUACUUA 1669-1687 1667
368 NAAGUACUCAGACACUACA 787 UGUGGUGUCUGAGUACUUN 1669-1687 1667
369 AAAGUACUCAGACACUACN 788 NGUGGUGUCUGAGUACUUU 1669-1687 1667
370 UAAGUACUCAGACACUACN 789 NGUGGUGUCUGAGUACUUA 1669-1687 1667
371 NAAGUACUCAGACACUACN 790 NGUGGUGUCUGAGUACUUN 1669-1687 1667
372 NAAGUACUCAGACACCAUA 791 UGUGGUGUCUGAGUACUUN 1669-1687 1667
373 UAAGUACUCAGACACCAUN 792 NGUGGUGUCUGAGUACUUA 1669-1687 1667
374 NAAGUACUCAGACACCAUN 793 NGUGGUGUCUGAGUACUUN 1669-1687 1667
375 AGCACAAAGUACUCAGACA 794 UGUCUGAGUACUUUGUGCU 1674-1692 1672
376 UGCACAAAGUACUCAGACA 795 UGUCUGAGUACUUUGUGCA 1674-1692 1672
377 NGCACAAAGUACUCAGACA 796 UGUCUGAGUACUUUGUGCN 1674-1692 1672
378 AGCACAAAGUACUCAGACN 797 NGUCUGAGUACUUUGUGCU 1674-1692 1672
379 NGCACAAAGUACUCAGACN 798 NGUCUGAGUACUUUGUGCN 1674-1692 1672
380 AGCACAAAGUACUCAGACA 799 UGUCUGAGUACUUUGUICU 1674-1692 1672
381 UGCACAAAGUACUCAGACA 800 UGUCUGAGUACUUUGUICA 1674-1692 1672
382 NGCACAAAGUACUCAGACA 801 UGUCUGAGUACUUUGUICN 1674-1692 1672
383 AGCACAAAGUACUCAGACN 802 NGUCUGAGUACUUUGUICU 1674-1692 1672
384 NGCACAAAGUACUCAGACN 803 NGUCUGAGUACUUUGUICN 1674-1692 1672
385 CAGCACAAAGUACUCAGAC 804 GUCUGAGUACUUUGUGCUG 1675-1693 1673
386 UAGCACAAAGUACUCAGAC 805 GUCUGAGUACUUUGUGCUA 1675-1693 1673
387 NAGCACAAAGUACUCAGAC 806 GUCUGAGUACUUUGUGCUN 1675-1693 1673
388 UAGCACAAAGUACUCAGAN 807 NUCUGAGUACUUUGUGCUA 1675-1693 1673
389 NAGCACAAAGUACUCAGAN 808 NUCUGAGUACUUUGUGCUN 1675-1693 1673
390 CAGCACAAAGUACUCAGAC 809 GUCUGAGUACUUUGUICUG 1675-1693 1673
391 UAGCACAAAGUACUCAGAC 810 GUCUGAGUACUUUGUICUA 1675-1693 1673
392 NAGCACAAAGUACUCAGAC 811 GUCUGAGUACUUUGUICUN 1675-1693 1673
393 UAGCACAAAGUACUCAGAN 812 NUCUGAGUACUUUGUICUA 1675-1693 1673
394 NAGCACAAAGUACUCAGAN 813 NUCUGAGUACUUUGUICUN 1675-1693 1673
395 AAACAAUGUGCUGCUGUCA 814 UGACAGCAGCACAUUGUUU 1692-1710 1690
396 UAACAAUGUGCUGCUGUCA 815 UGACAGCAGCACAUUGUUA 1692-1710 1690
397 NAACAAUGUGCUGCUGUCA 816 UGACAGCAGCACAUUGUUN 1692-1710 1690
398 AAACAAUGUGCUGCUGUCN 817 NGACAGCAGCACAUUGUUU 1692-1710 1690
399 NAACAAUGUGCUGCUGUCN 818 NGACAGCAGCACAUUGUUN 1692-1710 1690
400 GCUUGAUCAGGGCAACGUC 819 GACGUUGCCCUGAUCAAGC 1853-1871 1851
401 UCUUGAUCAGGGCAACGUC 820 GACGUUGCCCUGAUCAAGA 1853-1871 1851
402 NCUUGAUCAGGGCAACGUC 821 GACGUUGCCCUGAUCAAGN 1853-1871 1851
403 UCUUGAUCAGGGCAACGUN 822 NACGUUGCCCUGAUCAAGA 1853-1871 1851
404 NCUUGAUCAGGGCAACGUN 823 NACGUUGCCCUGAUCAAGN 1853-1871 1851
405 AGCUUGAUCAGGGCAACGU 824 ACGUUGCCCUGAUCAAGCU 1854-1872 1852
406 UGCUUGAUCAGGGCAACGU 825 ACGUUGCCCUGAUCAAGCA 1854-1872 1852
407 NGCUUGAUCAGGGCAACGU 826 ACGUUGCCCUGAUCAAGCN 1854-1872 1852
408 AGCUUGAUCAGGGCAACGN 827 NCGUUGCCCUGAUCAAGCU 1854-1872 1852
409 NGCUUGAUCAGGGCAACGN 828 NCGUUGCCCUGAUCAAGCN 1854-1872 1852
410 AGCUUGAUCAGGGCAACGU 829 ACGUUGCCCUGAUCAAICU 1854-1872 1852
411 UGCUUGAUCAGGGCAACGU 830 ACGUUGCCCUGAUCAAICA 1854-1872 1852
412 NGCUUGAUCAGGGCAACGU 831 ACGUUGCCCUGAUCAAICN 1854-1872 1852
413 AGCUUGAUCAGGGCAACGN 832 NCGUUGCCCUGAUCAAICU 1854-1872 1852
414 NGCUUGAUCAGGGCAACGN 833 NCGUUGCCCUGAUCAAICN 1854-1872 1852
415 UACACCAACUUGAAUGAAA 834 UUUCAUUCAAGUUGGUGUA 2257-2275 2255
416 NACACCAACUUGAAUGAAA 835 UUUCAUUCAAGUUGGUGUN 2257-2275 2255
417 UACACCAACUUGAAUGAAN 836 NUUCAUUCAAGUUGGUGUA 2257-2275 2255
418 NACACCAACUUGAAUGAAN 837 NUUCAUUCAAGUUGGUGUN 2257-2275 2255
419 UACACCAACUUGAAUGAAA 838 UUUCAUUCAAGUUGIUGUA 2257-2275 2255
420 NACACCAACUUGAAUGAAA 839 UUUCAUUCAAGUUGIUGUN 2257-2275 2255
421 UACACCAACUUGAAUGAAN 840 NUUCAUUCAAGUUGIUGUA 2257-2275 2255
422 NACACCAACUUGAAUGAAN 841 NUUCAUUCAAGUUGIUGUN 2257-2275 2255
423 CACUACUCCCCAGCUGAUU 842 AAUCAGCUGGGGAGUAGUG 2275-2293 2273
424 UACUACUCCCCAGCUGAUU 843 AAUCAGCUGGGGAGUAGUA 2275-2293 2273
425 NACUACUCCCCAGCUGAUU 844 AAUCAGCUGGGGAGUAGUN 2275-2293 2273
426 UACUACUCCCCAGCUGAUN 845 NAUCAGCUGGGGAGUAGUA 2275-2293 2273
427 NACUACUCCCCAGCUGAUN 846 NAUCAGCUGGGGAGUAGUN 2275-2293 2273
428 CACUACUCCCCAGCUGAUU 847 (A 2N)AUCAGCUGGGGAGUAGUG 2275-2293 2273
429 UACUACUCCCCAGCUGAUU 848 (A 2N)AUCAGCUGGGGAGUAGUA 2275-2293 2273
430 NACUACUCCCCAGCUGAUU 849 (A 2N)AUCAGCUGGGGAGUAGUN 2275-2293 2273
431 UCCACUACUCCCCAGCUGA 850 UCAGCUGGGGAGUAGUGGA 2277-2295 2275
432 NCCACUACUCCCCAGCUGA 851 UCAGCUGGGGAGUAGUGGN 2277-2295 2275
433 UCCACUACUCCCCAGCUGN 852 NCAGCUGGGGAGUAGUGGA 2277-2295 2275
434 NCCACUACUCCCCAGCUGN 853 NCAGCUGGGGAGUAGUGGN 2277-2295 2275
435 UCCACUACUCCCCAGCUGA 854 UCAGCUGGGGAGUAGUIGA 2277-2295 2275
436 NCCACUACUCCCCAGCUGA 855 UCAGCUGGGGAGUAGUIGN 2277-2295 2275
437 UCCACUACUCCCCAGCUGN 856 NCAGCUGGGGAGUAGUIGA 2277-2295 2275
438 NCCACUACUCCCCAGCUGN 857 NCAGCUGGGGAGUAGUIGN 2277-2295 2275
439 GACAUCCACUACUCCCCAG 858 CUGGGGAGUAGUGGAUGUC 2281-2299 2279
440 UACAUCCACUACUCCCCAG 859 CUGGGGAGUAGUGGAUGUA 2281-2299 2279
441 NACAUCCACUACUCCCCAG 860 CUGGGGAGUAGUGGAUGUN 2281-2299 2279
442 UACAUCCACUACUCCCCAN 861 NUGGGGAGUAGUGGAUGUA 2281-2299 2279
443 NACAUCCACUACUCCCCAN 862 NUGGGGAGUAGUGGAUGUN 2281-2299 2279
444 GACAUCCACUACUCCCCAG 863 CUGGGGAGUAGUGIAUGUC 2281-2299 2279
445 UACAUCCACUACUCCCCAG 864 CUGGGGAGUAGUGIAUGUA 2281-2299 2279
446 NACAUCCACUACUCCCCAG 865 CUGGGGAGUAGUGIAUGUN 2281-2299 2279
447 UACAUCCACUACUCCCCAN 866 NUGGGGAGUAGUGIAUGUA 2281-2299 2279
448 NACAUCCACUACUCCCCAN 867 NUGGGGAGUAGUGIAUGUN 2281-2299 2279
449 CAGACAUCCACUACUCCCC 868 GGGGAGUAGUGGAUGUCUG 2283-2301 2281
450 UAGACAUCCACUACUCCCC 869 GGGGAGUAGUGGAUGUCUA 2283-2301 2281
451 NAGACAUCCACUACUCCCC 870 GGGGAGUAGUGGAUGUCUN 2283-2301 2281
452 UAGACAUCCACUACUCCCN 871 NGGGAGUAGUGGAUGUCUA 2283-2301 2281
453 NAGACAUCCACUACUCCCN 872 NGGGAGUAGUGGAUGUCUN 2283-2301 2281
454 AACCCAAAUCCUCAUCUUG 873 CAAGAUGAGGAUUUGGGUU 2396-2414 2394
455 UACCCAAAUCCUCAUCUUG 874 CAAGAUGAGGAUUUGGGUA 2396-2414 2394
456 NACCCAAAUCCUCAUCUUG 875 CAAGAUGAGGAUUUGGGUN 2396-2414 2394
457 AACCCAAAUCCUCAUCUUN 876 NAAGAUGAGGAUUUGGGUU 2396-2414 2394
458 NACCCAAAUCCUCAUCUUN 877 NAAGAUGAGGAUUUGGGUN 2396-2414 2394
459 AACCCAAAUCCUCAUCUUG 878 CAAGAUGAGGAUUUGIGUU 2396-2414 2394
460 UACCCAAAUCCUCAUCUUG 879 CAAGAUGAGGAUUUGIGUA 2396-2414 2394
461 NACCCAAAUCCUCAUCUUG 880 CAAGAUGAGGAUUUGIGUN 2396-2414 2394
462 AACCCAAAUCCUCAUCUUN 881 NAAGAUGAGGAUUUGIGUU 2396-2414 2394
463 NACCCAAAUCCUCAUCUUN 882 NAAGAUGAGGAUUUGIGUN 2396-2414 2394
464 AAACCCAAAUCCUCAUCUU 883 AAGAUGAGGAUUUGGGUUU 2397-2415 2395
465 UAACCCAAAUCCUCAUCUU 884 AAGAUGAGGAUUUGGGUUA 2397-2415 2395
466 NAACCCAAAUCCUCAUCUU 885 AAGAUGAGGAUUUGGGUUN 2397-2415 2395
467 AAACCCAAAUCCUCAUCUN 886 NAGAUGAGGAUUUGGGUUU 2397-2415 2395
468 NAACCCAAAUCCUCAUCUN 887 NAGAUGAGGAUUUGGGUUN 2397-2415 2395
469 AAACCCAAAUCCUCAUCUU 888 AAGAUGAGGAUUUGIGUUU 2397-2415 2395
470 UAACCCAAAUCCUCAUCUU 889 AAGAUGAGGAUUUGIGUUA 2397-2415 2395
471 NAACCCAAAUCCUCAUCUU 890 AAGAUGAGGAUUUGIGUUN 2397-2415 2395
472 AAACCCAAAUCCUCAUCUN 891 NAGAUGAGGAUUUGIGUUU 2397-2415 2395
473 NAACCCAAAUCCUCAUCUN 892 NAGAUGAGGAUUUGIGUUN 2397-2415 2395
474 UAGAAAACCCAAAUCCUCA 893 UGAGGAUUUGGGUUUUCUA 2401-2419 2399
475 NAGAAAACCCAAAUCCUCA 894 UGAGGAUUUGGGUUUUCUN 2401-2419 2399
476 UAGAAAACCCAAAUCCUCN 895 NGAGGAUUUGGGUUUUCUA 2401-2419 2399
477 NAGAAAACCCAAAUCCUCN 896 NGAGGAUUUGGGUUUUCUN 2401-2419 2399
(A 2N) =含2-胺基腺嘌呤之核苷酸;I =次黃嘌呤(肌苷)核苷酸
包含表2中之序列或由其組成之CFB RNAi藥劑有義股及反義股可為經修飾之核苷酸或未經修飾之核苷酸。在一些實施例中,具有包含表2中之序列或由其組成之有義股及反義股序列的CFB RNAi藥劑全部或實質上全部為經修飾之核苷酸。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑的反義股與表2中之反義股序列中之任一者之差異為0、1、2或3個核苷酸。在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑的有義股與表2中之有義股序列中之任一者之差異為0、1、2或3個核苷酸。
依本文所用,表2中所揭示之序列中所列的各N可獨立地選自任何及所有核鹼基(包括經修飾之核苷酸及未經修飾之核苷酸上所存在的彼等核鹼基)。在一些實施例中,表2中所揭示之序列中所列的N核苷酸具有與另一股上對應位置處之N核苷酸互補的核鹼基。在一些實施例中,表2中所揭示之序列中所列的N核苷酸具有與另一股上對應位置處之N核苷酸不互補的核鹼基。在一些實施例中,表2中所揭示之序列中所列的N核苷酸具有與另一股上對應位置處之N核苷酸相同的核鹼基。在一些實施例中,表2中所揭示之序列中所列的N核苷酸具有與另一股上對應位置處之N核苷酸不同的核鹼基。
某些經修飾之CFB RNAi藥劑反義股以及其基礎(underlying)未經修飾之核鹼基序列提供於表3中。某些經修飾之CFB RNAi藥劑有義股以及其基礎未經修飾之核鹼基序列提供於表4A或表4B中。在形成CFB RNAi藥劑時,表3及表4A及表4B以及上文表2中所列的各基礎鹼基序列中之各核苷酸可為經修飾之核苷酸。
本文所描述之CFB RNAi藥劑由反義股與有義股黏接而形成。含有表2或表4A或表4B中所列序列之有義股可與含有表2或表3中所列序列之任何反義股雜交,其限制條件為兩個序列在連續15、16、17、18、19、20或21個核苷酸序列上具有至少85%互補之區域。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑反義股包含表2或表3中之序列中之任一者的核苷酸序列。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含以下或由以下組成:具有表2、表3或表4A或表4B中之序列中之任一者的有義股及反義股之核鹼基序列的雙螺旋體。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含以下或由以下組成:以鈉鹽、混合鹽或游離酸形式製備或提供之雙螺旋體序列。
含有經修飾之核苷酸之反義股的實例提供於表3及表5C中。含有經修飾之核苷酸之有義股的實例提供於表4A、表4B及表5C中。
依表3、表4A、表4B及表5C中所使用,使用以下記法指示經修飾之核苷酸及連接基團: A            =    腺苷-3'-磷酸酯; C            =    胞苷-3'-磷酸酯; G            =    鳥苷-3'-磷酸酯; U            =    尿苷-3'-磷酸酯 I             =    肌苷-3'-磷酸酯 a             =    2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸酯 as            =    2'-O-甲基腺苷-3'-硫代磷酸酯 ass         =    2′-O-甲基腺苷-3′-二硫代磷酸酯 c             =    2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸酯 cs            =    2'-O-甲基胞苷-3'-硫代磷酸酯 css         =    2′-O-甲基胞苷-3′-二硫代磷酸酯 g             =    2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸酯 gs           =    2'-O-甲基鳥苷-3'-硫代磷酸酯 gss         =    2′-O-甲基鳥苷-3′-二硫代磷酸酯 t             =    2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸酯 ts            =    2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-硫代磷酸酯 tss          =    2′-O-甲基-5-甲基尿苷-3′-二硫代磷酸酯 u            =    2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸酯 us          =    2'-O-甲基尿苷-3'-硫代磷酸酯 uss         =    2′-O-甲基尿苷-3′-二硫代磷酸酯 i             =    2'-O-甲基肌苷-3'-磷酸酯 is            =    2'-O-甲基肌苷-3'-硫代磷酸酯 iss          =    2′-O-甲基肌苷-3′-二硫代磷酸酯 Af          =    2'-氟腺苷-3'-磷酸酯 Afs         =    2'-氟腺苷-3'-硫代磷酸酯 Cf          =    2'-氟胞苷-3'-磷酸酯 Cfs         =    2'-氟胞苷-3'-硫代磷酸酯 Gf          =    2'-氟鳥苷-3'-磷酸酯 Gfs         =    2'-氟鳥苷-3'-硫代磷酸酯 Tf          =    2'-氟-5'-甲基尿苷-3'-磷酸酯 Tfs         =    2'-氟-5'-甲基尿苷-3'-硫代磷酸酯 Uf          =    2'-氟尿苷-3'-磷酸酯 Ufs         =    2'-氟尿苷-3'-硫代磷酸酯 dA         =    2'-去氧腺苷-3'-磷酸酯 dAs        =    2'-去氧腺苷-3'-硫代磷酸酯 dAss      =    2′-去氧腺苷-3′-二硫代磷酸酯 dC          =    2'-去氧胞苷-3'-磷酸酯 dCs        =    2'-去氧胞苷-3'-硫代磷酸酯 dCss       =    2′-去氧胞苷-3′-二硫代磷酸酯 dG          =    2'-去氧鳥苷-3'-磷酸酯 dGs        =    2'-去氧鳥苷-3'-硫代磷酸酯 dGss      =    2′-去氧鳥苷-3′-二硫代磷酸酯 dT          =    2′-去氧-5-甲基尿苷-3′-磷酸酯(或2′-O-去氧胸苷- 3′-磷酸酯) dTs        =    2′-去氧-5-甲基尿苷-3′-硫代磷酸酯(或2′-O- 去氧胸苷-3′-硫代磷酸酯) dTss       =    2′-去氧-5-甲基尿苷-3′-二硫代磷酸酯(或2′-O- 去氧胸苷-3′-二硫代磷酸酯) A UNA=    2′,3'-開環-腺苷-3'-磷酸酯(參見表6) A UNAs =    2',3'-開環-腺苷-3'-硫代磷酸酯(參見表6) C UNA=    2',3'-開環-胞苷-3'-磷酸酯(參見表6) C UNAs =    2',3'-開環-胞苷-3'-硫代磷酸酯(參見表6) G UNA=    2′,3'-開環-鳥苷-3'-磷酸酯(參見表6) G UNAs =    2′,3'-開環-鳥苷-3'-硫代磷酸酯(參見表6) U UNA=    2',3'-開環-尿苷-3'-磷酸酯(參見表6) U UNAs =    2',3'-開環-尿苷-3'-硫代磷酸酯(參見表6) a_2N      =    2′-O-甲基-2-胺基腺苷-3′-磷酸酯(參見表6) a_2Ns     =    2′-O-甲基-2-胺基腺苷-3′-硫代磷酸酯(參見表6) (invdA)  =    反向(3'-3'連接) 2′-去氧腺苷(參見表6) (invAb)  =    反向無鹼基去氧核糖核苷酸(參見表6) (invAb)s =    反向無鹼基去氧核糖核苷酸-5′- 硫代磷酸酯(參見表6) cPrpa      =    5'-膦酸環丙酯-2′-O-甲基腺苷-3′-磷酸酯(參見表6) cPrpas    =    5'-膦酸環丙酯-2′-O-甲基腺苷-3′- 硫代磷酸酯(參見表6) cPrpu      =    5'-膦酸環丙酯-2′-O-甲基尿苷-3′-磷酸酯(參見表6) cPrpus    =    5'-膦酸環丙酯-2′-O-甲基尿苷-3′- 硫代磷酸酯(參見表6) NAG37   =    參見表6 NAG37s =    參見表6
一般熟習此項技術者將容易地理解,除非藉由序列(諸如藉由硫代磷酸酯鍵聯「s」)另外指示,否則當存在於寡核苷酸中時,核苷酸單體係藉由5'-3'-磷酸二酯鍵相互連接。一般熟習此項技術者將清楚地理解,包括本文所揭示之經修飾之核苷酸序列中所示的硫代磷酸酯鍵聯替代寡核苷酸中通常存在之磷酸二酯鍵聯。此外,一般熟習此項技術者將容易地理解,給定寡核苷酸序列之3'端處的末端核苷酸通常係在給定單體之各別3'位置處具有羥基(-OH)而非離體磷酸酯部分。另外,對於本文所揭示之實施例,當觀察各別股5' 3'時,插入反向無鹼基殘基使得去氧核糖之3'位置連接在各別股上之前述單體的3'端處(參見例如表6)。此外,一般技術者將容易地理解及瞭解,雖然本文所描繪之硫代磷酸酯化學結構通常顯示硫原子上之陰離子,但本文所揭示之發明涵蓋所有硫代磷酸酯互變異構體及共振結構(例如其中硫原子具有雙鍵且陰離子位於氧原子上)。本文中除非另外明確指示,否則描述本文所揭示之CFB RNAi藥劑及CFB RNAi藥劑之組合物時,使用一般熟習此項技術者之此類理解。
與本文所揭示之CFB RNAi藥劑一起使用之靶向配位體、靶向基團及連接基團之某些實例提供於下表6中。更特定言之,靶向基團及連接基團(其共同可形成靶向配位體)包括(NAG37)及(NAG37)s,其化學結構提供於下表6中。有義股及/或反義股各具有本文所列之任何靶向配位體、靶向基團或連接基團,以及與序列之5'及/或3'端結合的其他基團。 3.CFB RNAi藥劑反義股序列
反義股 ID 經修飾之反義股 (5 ′ → 3′) SEQ ID NO. 基礎鹼基序列 (5 ′ → 3′) ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列 ) SEQ ID NO.
AM17115-AS usAfsusCfuAfgCfaCfcAfgGfuAfgAfuGfsc 897 UAUCUAGCACCAGGUAGAUGC 1267
AM17117-AS usCfsasUfcUfaGfcAfcCfaGfgUfaGfaUfsg 898 UCAUCUAGCACCAGGUAGAUG 1268
AM17119-AS usCfscsAfuCfuAfgCfaCfcAfgGfuAfgAfsu 899 UCCAUCUAGCACCAGGUAGAU 1269
AM17121-AS asUfscsCfaUfcUfaGfcAfcCfaGfgUfaGfsa 900 AUCCAUCUAGCACCAGGUAGA 1270
AM17123-AS usGfsasUfcCfaUfcUfaGfcAfcCfaGfgUfsa 901 UGAUCCAUCUAGCACCAGGUA 1271
AM17125-AS usGfsusCfuGfaUfcCfaUfcUfaGfcAfcCfsa 902 UGUCUGAUCCAUCUAGCACCA 1272
AM17127-AS asUfsgsCfuGfuCfuGfaUfcCfaUfcUfaGfsc 903 AUGCUGUCUGAUCCAUCUAGC 1273
AM17129-AS usAfsusGfcCfaCfaGfaGfaCfuCfaGfaGfsa 904 UAUGCCACAGAGACUCAGAGA 1274
AM17131-AS asAfsasGfuAfcUfcAfgAfcAfcCfaCfaGfsc 905 AAAGUACUCAGACACCACAGC 1275
AM17133-AS usAfscsAfcCfaAfcUfuGfaAfuGfaAfaCfsg 906 UACACCAACUUGAAUGAAACG 1276
AM17135-AS usAfscsUfaCfuCfcCfcAfgCfuGfaUfuAfsc 907 UACUACUCCCCAGCUGAUUAC 1277
AM17137-AS usCfscsAfcUfaCfuCfcCfcAfgCfuGfaUfsc 908 UCCACUACUCCCCAGCUGAUC 1278
AM17139-AS usAfscsAfuCfcAfcUfaCfuCfcCfcAfgCfsu 909 UACAUCCACUACUCCCCAGCU 1279
AM17141-AS usAfsgsAfcAfuCfcAfcUfaCfuCfcCfcAfsg 910 UAGACAUCCACUACUCCCCAG 1280
AM17143-AS asAfscsCfcAfaAfuCfcUfcAfuCfuUfgGfsa 911 AACCCAAAUCCUCAUCUUGGA 1281
AM17145-AS asAfsasCfcCfaAfaUfcCfuCfaUfcUfuGfsg 912 AAACCCAAAUCCUCAUCUUGG 1282
AM17147-AS usAfsgsAfaAfaCfcCfaAfaUfcCfuCfaUfsc 913 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM17667-AS usAfsgsAfaaacccaAfaUfcCfucausc 914 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM17668-AS usAfsgsaAfaacccaAfaUfcCfucausc 915 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM17669-AS usAfsgsaaaAfcccaAfaUfcCfucausc 916 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM17670-AS usAfsgsaaaacCfcaAfaUfcCfucausc 917 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM17671-AS usAfsgsAfaAfacccaaaUfcCfucausc 918 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM17672-AS usAfsgsaaAfacccaaaUfcCfucausc 919 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM17673-AS usAfsgsaaaacccaaaUfcCfucausc 920 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM17674-AS usAfsgsaaaacccaAfaUfccucausc 921 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM17675-AS usAfsgsaAfaacccaaaUfccucausc 922 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM17676-AS usAfsgAfaaacccaAfaUfcCfucausc 923 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM17677-AS usAfgAfaaacccaAfaUfcCfucaussc 1429 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM17681-AS cPrpusAfsgsAfaaacccaAfaUfcCfucausc 924 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM17683-AS asGfsusGfuAfaCfcGfuCfaUfaGfcAfgUfsg 925 AGUGUAACCGUCAUAGCAGUG 1284
AM17685-AS usUfsusGfaCfuAfgAfcAfcUfuUfuUfgGfsc 926 UUUGACUAGACACUUUUUGGC 1285
AM17687-AS asAfsgsUfuGfaCfuAfgAfcAfcUfuUfuUfsg 927 AAGUUGACUAGACACUUUUUG 1286
AM17689-AS usAfscsCfaUfaAfcUfuGfcCfaCfcUfuCfsu 928 UACCAUAACUUGCCACCUUCU 1287
AM17691-AS usCfsasUfgUfuGfuGfcAfaUfcCfaUfcAfsg 929 UCAUGUUGUGCAAUCCAUCAG 1288
AM17693-AS usCfsasUfcAfaUfgAfcAfgUfaAfuUfgGfsg 930 UCAUCAAUGACAGUAAUUGGG 1289
AM17695-AS usCfsasUfuGfaUfgUfuCfaCfuUfgGfuUfsc 931 UCAUUGAUGUUCACUUGGUUC 1290
AM17697-AS usUfsgsCfuUfgUfgGfuAfaUfcGfgUfaCfsc 932 UUGCUUGUGGUAAUCGGUACC 1291
AM17699-AS usGfsusUfgCfuUfgUfgGfuAfaUfcGfgUfsg 933 UGUUGCUUGUGGUAAUCGGUG 1292
AM17701-AS usUfsgsAfgAfuCfuUfgGfcCfuGfcCfaUfsg 934 UUGAGAUCUUGGCCUGCCAUG 1293
AM17703-AS usCfsusUfgAfuCfaGfgGfcAfaCfgUfcAfsc 935 UCUUGAUCAGGGCAACGUCAC 1294
AM17705-AS asGfscsUfuGfaUfcAfgGfgCfaAfcGfuCfsa 936 AGCUUGAUCAGGGCAACGUCA 1295
AM17707-AS usAfsasGfcCfaGfaAfgGfaCfaCfaCfgUfsa 937 UAAGCCAGAAGGACACACGUA 1296
AM17709-AS asAfsasGfaGfaUfcUfcAfuCfaCfuCfaCfsa 938 AAAGAGAUCUCAUCACUCACA 1297
AM17711-AS usGfsasAfaGfaGfaUfcUfcAfuCfaCfuCfsa 939 UGAAAGAGAUCUCAUCACUCA 1298
AM17713-AS usAfscsAfuGfaAfgGfaGfuCfuUfgGfcAfsg 940 UACAUGAAGGAGUCUUGGCAG 1299
AM17715-AS usCfsgsUfaCfaUfgAfaGfgAfgUfcUfuGfsg 941 UCGUACAUGAAGGAGUCUUGG 1300
AM17717-AS usUfsgsUfcGfuAfcAfuGfaAfgGfaGfuCfsu 942 UUGUCGUACAUGAAGGAGUCU 1301
AM17719-AS asUfscsGfaCfuCfcUfuCfuAfuGfgUfcUfsc 943 AUCGACUCCUUCUAUGGUCUC 1302
AM17721-AS usCfsasGfgUfaGfaUfgUfuCfaUfgGfaGfsc 944 UCAGGUAGAUGUUCAUGGAGC 1303
AM17723-AS usCfsusAfgCfaCfcAfgGfuAfgAfuGfuUfsc 945 UCUAGCACCAGGUAGAUGUUC 1304
AM17725-AS usCfscsCfaAfuGfcUfgUfcUfgAfuCfcAfsc 946 UCCCAAUGCUGUCUGAUCCAC 1305
AM17727-AS usGfsasCfuAfgAfcAfcUfuUfuUfgGfcUfsc 947 UGACUAGACACUUUUUGGCUC 1306
AM17729-AS asCfscsAfuAfaCfuUfgCfcAfcCfuUfcUfsc 948 ACCAUAACUUGCCACCUUCUC 1307
AM17731-AS usUfsusGfgCfuUfcAfcAfcCfaUfaAfcUfsc 949 UUUGGCUUCACACCAUAACUC 1308
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AM17745-AS usCfsasAfaCfaCfaUfaGfaCfaUfcCfaGfsa 956 UCAAACACAUAGACAUCCAGA 1315
AM17747-AS asAfsasGfcAfuUfgAfuGfuUfcAfcUfuGfsg 957 AAAGCAUUGAUGUUCACUUGG 1316
AM17749-AS asGfscsCfaAfaGfcAfuUfgAfuGfuUfcAfsc 958 AGCCAAAGCAUUGAUGUUCAC 1317
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AM17765-AS asAfsasguacuCfagAfcAfcCfacagsc 968 AAAGUACUCAGACACCACAGC 1275
AM17766-AS asAfsasGfuAfcucagacAfcCfacagsc 969 AAAGUACUCAGACACCACAGC 1275
AM17767-AS asAfsasguAfcucagacAfcCfacagsc 970 AAAGUACUCAGACACCACAGC 1275
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AM17769-AS asAfsasguacucagacAfcCfacagsc 972 AAAGUACUCAGACACCACAGC 1275
AM17770-AS asAfsasgUfacucagacAfccacagsc 973 AAAGUACUCAGACACCACAGC 1275
AM17771-AS asAfsaGfuacucagAfcAfcCfacagsc 974 AAAGUACUCAGACACCACAGC 1275
AM17772-AS asAfaGfuacucagAfcAfcCfacagssc 975 AAAGUACUCAGACACCACAGC 1275
AM17776-AS cPrpasAfsasGfuacucagAfcAfcCfacagsc 976 AAAGUACUCAGACACCACAGC 1275
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AM19118-AS asAfsaguaC UNAucagAfcAfcCfacagsc 1000 AAAGUACUCAGACACCACAGC 1275
AM19217-AS asGfsasAfaAfcCfcAfaAfuCfcUfcAfuCfsu 1001 AGAAAACCCAAAUCCUCAUCU 1327
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AM19274-AS cPrpasAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc 1003 AAAGUACUCAGACACCACAGC 1275
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AM19348-AS usdAsgsadAadAcccadAaUfccucausc 1005 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM19349-AS usdAsgsadAaacdCcadAaUfccucausc 1006 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
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AM19040-AS usdAsgsadAaacccadAadTcdCucausc 1008 UAGAAAACCCAAATCCUCAUC 1421
AM19543-AS usAfsgsaAfaacccaAfaUfcCfucsa 1009 UAGAAAACCCAAAUCCUCA 474
AM19667-AS usAfsaguaCfuuagAfcAfcCfacagsc 1010 UAAGUACUUAGACACCACAGC 1329
AM19668-AS usAfsaguaCfucagAfuAfcCfacagsc 1011 UAAGUACUCAGAUACCACAGC 1330
AM19669-AS usAfsaguaCfucagAfcAfuCfacagsc 1012 UAAGUACUCAGACAUCACAGC 1331
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AM19671-AS usAfsaguaCfucagAfcAfcCfauagsc 1014 UAAGUACUCAGACACCAUAGC 1333
AM19688-AS usCfsasaUfgacaguAfaUfuGfggucsc 1015 UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC 1310
AM19689-AS usCfsasaugAfcaguAfaUfuGfggucsc 1016 UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC 1310
AM19690-AS usCfsasaugacAfguAfaUfuGfggucsc 1017 UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC 1310
AM19691-AS usCfsasaugaCfaguaaUfuggguCfsc 1018 UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC 1310
AM19692-AS usCfsasaugAfcaguaaUfugggucsc 1019 UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC 1310
AM19693-AS usCfsasaugacAfguaaUfugggucsc 1020 UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC 1310
AM19694-AS usCfsasaUfgA UNAcaguAfaUfuGfggucsc 1021 UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC 1310
AM19695-AS usCfsaaugAfcaguAfaUfuGfggucsc 1022 UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC 1310
AM19696-AS usCfsaaugAfcaguAfaUfuGfggucssc 1023 UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC 1310
AM19700-AS dTssCfsasaugAfcaguAfaUfuGfggucsc 1024 TCAAUGACAGUAAUUGGGUCC 1422
AM19894-AS dTssAfsgaAfaacccaAfaUfcCfucausc 1025 TAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1420
AM19895-AS dTssAfsgaAfaacccaAfaUfcCfucaussc 1026 TAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1420
AM19896-AS UfssAfsgaAfaacccaAfaUfcCfucausc 1027 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM19897-AS UfssAfsgaAfaacccaAfaUfcCfucaussc 1028 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
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AM19928-AS isAfsgsaAfaacccaAfaUfcCfucausc 1030 IAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1334
AM20011-AS asAfsaguaCfucagAfcAfcCfacsa 1031 AAAGUACUCAGACACCACA 359
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AM20014-AS asAfsaguaCfucagAfcAfcCfacgsgsc 1033 AAAGUACUCAGACACCACGGC 1336
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AM20025-AS cPrpusAfsaguaCfucagAfcAfcCfauagsc 1039 UAAGUACUCAGACACCAUAGC 1333
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AM20063-AS usAfsgaAfaacccaAfaUfcCfucacsc 1041 UAGAAAACCCAAAUCCUCACC 1324
AM20064-AS usAfsgadAaacccaAfaUfcCfucausc 1042 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM20065-AS usAfsgaaaAfcccaAfaUfcCfucausc 1043 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM20066-AS usAfsgaaaAfcccaAfaUfcCfucacsc 1044 UAGAAAACCCAAAUCCUCACC 1324
AM20067-AS usAfsgaaadAcccaAfaUfcCfucausc 1045 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM20069-AS ussAfsgaAfaacccaAfaUfcCfucausc 1046 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM20070-AS ussAfsgaAfaacccaAfaUfcCfucacsc 1047 UAGAAAACCCAAAUCCUCACC 1324
AM20071-AS ussAfsgadAaacccaAfaUfcCfucausc 1048 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
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AM20074-AS ussAfsgadAaacccaAfaUfcCfucaussc 1051 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM20192-AS asAfsaguaCfucagAfcAfcCfacsc 1052 AAAGUACUCAGACACCACC 1338
AM20194-AS asAfsaguaCfucagAfcAfcCfacsg 1053 AAAGUACUCAGACACCACG 1339
AM20196-AS asAfsaguaCfucagAfcAfcCfacsa_2N 1054 AAAGUACUCAGACACCAC(A 2N) 1340
AM20197-AS cPrpasAfsaguaCfucagAfcAfcCfacsc 1055 AAAGUACUCAGACACCACC 1338
AM20199-AS usAfsaguaCfucagAfcAfcCfacsc 1056 UAAGUACUCAGACACCACC 1341
AM20200-AS asAfsaguaCfucagAfcAfcCfascsc 1057 AAAGUACUCAGACACCACC 1338
AM20201-AS asAfsaguaCfucagAfcAfcCfaccsgssc 1058 AAAGUACUCAGACACCACCGC 1337
AM20202-AS asAfsaguaCfucagAfcAfcCfaccgssc 1059 AAAGUACUCAGACACCACCGC 1337
AM20203-AS usAfsgaAfaacccaAfaUfcCfuscsa 1060 UAGAAAACCCAAAUCCUCA 474
AM20204-AS usAfsgaAfaacccaAfaUfcCfucasusc 1061 UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC 1283
AM20206-AS usAfsgaAfaacccaAfaUfcCfuccsusc 1062 UAGAAAACCCAAAUCCUCCUC 1342
AM20208-AS usAfsgaAfaacccaAfaUfcCfucgsusc 1063 UAGAAAACCCAAAUCCUCGUC 1343
AM20332-AS usAfsaguaCfucagAfcAfcdTacagsc 1064 UAAGUACUCAGACACTACAGC 1424
AM20333-AS usAfsaguaCfucagAfcAfcCfadTagsc 1065 UAAGUACUCAGACACCATAGC 1425
AM20425-AS isAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc 1066 IAAGUACUCAGACACCACAGC 1344
AM20494-AS usAfsaguaCfucacAfcAfcUfacagsc 1067 UAAGUACUCACACACUACAGC 1345
AM20496-AS usAfsagucCfucacAfcAfcAfacagsc 1068 UAAGUCCUCACACACAACAGC 1346
CA004415 asAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsu 1430 AAAGUACUCAGACACCACAGU 1437
CA915944 usAfsaguaCfucagAfcAfcCfacsc 1431 UAAGUACUCAGACACCACC 1341
(A 2N) =含2-胺基腺嘌呤之核苷酸;I =次黃嘌呤(肌苷)核苷酸 4A.CFB RNAi藥劑有義股序列
有義股 ID 經修飾之有義股(5 ′ → 3′) SEQ ID NO. 基礎鹼基序列 (5 ′ → 3′) ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列 ) SEQ ID NO.
AM17114-SS (NAG37)s(invAb)sgcaucuacCfUfGfgugcuagauas(invAb) 1069 GCAUCUACCUGGUGCUAGAUA 1347
AM17116-SS (NAG37)s(invAb)scaucuaccUfGfGfugcuagaugas(invAb) 1070 CAUCUACCUGGUGCUAGAUGA 1348
AM17118-SS (NAG37)s(invAb)saucuaccuGfGfUfgcuagauigas(invAb) 1071 AUCUACCUGGUGCUAGAUIGA 1349
AM17120-SS (NAG37)s(invAb)sucuaccugGfUfGfcuagauigaus(invAb) 1072 UCUACCUGGUGCUAGAUIGAU 1350
AM17122-SS (NAG37)s(invAb)suaccugguGfCfUfagaugiaucas(invAb) 1073 UACCUGGUGCUAGAUGIAUCA 1351
AM17124-SS (NAG37)s(invAb)suggugcuaGfAfUfggaucaiacas(invAb) 1074 UGGUGCUAGAUGGAUCAIACA 1352
AM17126-SS (NAG37)s(invAb)sgcuagaugGfAfUfcagacaicaus(invAb) 1075 GCUAGAUGGAUCAGACAICAU 1353
AM17128-SS (NAG37)s(invAb)sucucugagUfCfUfcugugicauas(invAb) 1076 UCUCUGAGUCUCUGUGICAUA 1354
AM17130-SS (NAG37)s(invAb)sgcugugguGfUfCfugaguacuuus(invAb) 1077 GCUGUGGUGUCUGAGUACUUU 1355
AM17132-SS (NAG37)s(invAb)scguuucauUfCfAfaguugiuguas(invAb) 1078 CGUUUCAUUCAAGUUGIUGUA 1356
AM17134-SS (NAG37)s(invAb)sgua_2NaucagCfUfGfgggaguaguas(invAb) 1079 GUA(A 2N)UCAGCUGGGGAGUAGUA 1357
AM17136-SS (NAG37)s(invAb)sgaucagcuGfGfGfgaguaguigas(invAb) 1080 GAUCAGCUGGGGAGUAGUIGA 1358
AM17138-SS (NAG37)s(invAb)sagcuggggAfGfUfagugiauguas(invAb) 1081 AGCUGGGGAGUAGUGIAUGUA 1359
AM17140-SS (NAG37)s(invAb)scuggggagUfAfGfuggaugucuas(invAb) 1082 CUGGGGAGUAGUGGAUGUCUA 1360
AM17142-SS (NAG37)s(invAb)succaagauGfAfGfgauuugiguus(invAb) 1083 UCCAAGAUGAGGAUUUGIGUU 1361
AM17144-SS (NAG37)s(invAb)sccaagaugAfGfGfauuugiguuus(invAb) 1084 CCAAGAUGAGGAUUUGIGUUU 1362
AM17146-SS (NAG37)s(invAb)sgaugaggaUfUfUfggguuuucuas(invAb) 1085 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM17678-SS (NAG37)s(invAb)sgaugaggaUfuUfGfgguuuucuas(invAb) 1086 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM17679-SS (NAG37)s(invAb)sgaugaggaUfuUfgGfguuuucuas(invAb) 1087 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM17680-SS (NAG37)s(invAb)sgaugagGfaUfuUfggguuuucuas(invAb) 1088 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM17682-SS (NAG37)s(invAb)scacugcuaUfGfAfcgguuacacus(invAb) 1089 CACUGCUAUGACGGUUACACU 1364
AM17684-SS (NAG37)s(invAb)sgccaaaaaGfUfGfucuagucaaas(invAb) 1090 GCCAAAAAGUGUCUAGUCAAA 1365
AM17686-SS (NAG37)s(invAb)sca_2NaaaaguGfUfCfuagucaacuus(invAb) 1091 C(A 2N)AAAAGUGUCUAGUCAACUU 1366
AM17688-SS (NAG37)s(invAb)sagaaggugGfCfAfaguuaugguas(invAb) 1092 AGAAGGUGGCAAGUUAUGGUA 1367
AM17690-SS (NAG37)s(invAb)scugauggaUfUfGfcacaacaugas(invAb) 1093 CUGAUGGAUUGCACAACAUGA 1368
AM17692-SS (NAG37)s(invAb)scccaauuaCfUfGfucauugaugas(invAb) 1094 CCCAAUUACUGUCAUUGAUGA 1369
AM17694-SS (NAG37)s(invAb)sgaaccaagUfGfAfacaucaaugas(invAb) 1095 GAACCAAGUGAACAUCAAUGA 1370
AM17696-SS (NAG37)s(invAb)sgguaccgaUfUfAfccacaaicaas(invAb) 1096 GGUACCGAUUACCACAAICAA 1371
AM17698-SS (NAG37)s(invAb)scaccgauuAfCfCfacaaicaacas(invAb) 1097 CACCGAUUACCACAAICAACA 1372
AM17700-SS (NAG37)s(invAb)scauggcagGfCfCfaagaucucaas(invAb) 1098 CAUGGCAGGCCAAGAUCUCAA 1373
AM17702-SS (NAG37)s(invAb)sgugacguuGfCfCfcugaucaagas(invAb) 1099 GUGACGUUGCCCUGAUCAAGA 1374
AM17704-SS (NAG37)s(invAb)sugacguugCfCfCfugaucaaicus(invAb) 1100 UGACGUUGCCCUGAUCAAICU 1375
AM17706-SS (NAG37)s(invAb)suacgugugUfCfCfuucugicuuas(invAb) 1101 UACGUGUGUCCUUCUGICUUA 1376
AM17708-SS (NAG37)s(invAb)sugugagugAfUfGfagaucucuuus(invAb) 1102 UGUGAGUGAUGAGAUCUCUUU 1377
AM17710-SS (NAG37)s(invAb)sugagugauGfAfGfaucucuuucas(invAb) 1103 UGAGUGAUGAGAUCUCUUUCA 1378
AM17712-SS (NAG37)s(invAb)scugccaagAfCfUfccuucauguas(invAb) 1104 CUGCCAAGACUCCUUCAUGUA 1379
AM17714-SS (NAG37)s(invAb)sccaagacuCfCfUfucauguacias(invAb) 1105 CCAAGACUCCUUCAUGUACIA 1380
AM17716-SS (NAG37)s(invAb)sagacuccuUfCfAfuguaciacaas(invAb) 1106 AGACUCCUUCAUGUACIACAA 1381
AM17718-SS (NAG37)s(invAb)sgagaccauAfGfAfaggaiucgaus(invAb) 1107 GAGACCAUAGAAGGAIUCGAU 1382
AM17720-SS (NAG37)s(invAb)sgcuccaugAfAfCfaucuaccuias(invAb) 1108 GCUCCAUGAACAUCUACCUIA 1383
AM17722-SS (NAG37)s(invAb)sgaacaucuAfCfCfugguicuagas(invAb) 1109 GAACAUCUACCUGGUICUAGA 1384
AM17724-SS (NAG37)s(invAb)sguggaucaGfAfCfagcauugigas(invAb) 1110 GUGGAUCAGACAGCAUUGIGA 1385
AM17726-SS (NAG37)s(invAb)sgagccaaaAfAfGfugucuaiucas(invAb) 1111 GAGCCAAAAAGUGUCUAIUCA 1386
AM17728-SS (NAG37)s(invAb)sgagaagguGfGfCfaaguuauggus(invAb) 1112 GAGAAGGUGGCAAGUUAUGGU 1387
AM17730-SS (NAG37)s(invAb)sgaguuaugGfUfGfugaaiccaaas(invAb) 1113 GAGUUAUGGUGUGAAICCAAA 1388
AM17732-SS (NAG37)s(invAb)saggcagugUfAfCfagcaugaugas(invAb) 1114 AGGCAGUGUACAGCAUGAUGA 1389
AM17734-SS (NAG37)s(invAb)sggacccaaUfUfAfcugucauugas(invAb) 1115 GGACCCAAUUACUGUCAUUGA 1390
AM17736-SS (NAG37)s(invAb)sgacccaauUfAfCfugucauugaus(invAb) 1116 GACCCAAUUACUGUCAUUGAU 1391
AM17738-SS (NAG37)s(invAb)scacugucaUfUfGfaugaiauccas(invAb) 1117 CACUGUCAUUGAUGAIAUCCA 1392
AM17740-SS (NAG37)s(invAb)sggaggauuAfUfCfuggaugucuas(invAb) 1118 GGAGGAUUAUCUGGAUGUCUA 1393
AM17742-SS (NAG37)s(invAb)scaucuggaUfGfUfcuauguguuus(invAb) 1119 CAUCUGGAUGUCUAUGUGUUU 1394
AM17744-SS (NAG37)s(invAb)sucuggaugUfCfUfauguguuugas(invAb) 1120 UCUGGAUGUCUAUGUGUUUGA 1395
AM17746-SS (NAG37)s(invAb)sccaagugaAfCfAfucaaugcuuus(invAb) 1121 CCAAGUGAACAUCAAUGCUUU 1396
AM17748-SS (NAG37)s(invAb)sgugaacauCfAfAfugcuuugicus(invAb) 1122 GUGAACAUCAAUGCUUUGICU 1397
AM17750-SS (NAG37)s(invAb)sgaacaucaAfUfGfcuuugicuuas(invAb) 1123 GAACAUCAAUGCUUUGICUUA 1398
AM17752-SS (NAG37)s(invAb)scaagaaagAfCfAfaugaicaacas(invAb) 1124 CAAGAAAGACAAUGAICAACA 1399
AM17754-SS (NAG37)s(invAb)sga_2NaagacaAfUfGfagcaacaugus(invAb) 1125 G(A 2N)AAGACAAUGAGCAACAUGU 1400
AM17756-SS (NAG37)s(invAb)sggugucugAfGfUfacuuuguicus(invAb) 1126 GGUGUCUGAGUACUUUGUICU 1401
AM17758-SS (NAG37)s(invAb)sgugucugaGfUfAfcuuuguicuas(invAb) 1127 GUGUCUGAGUACUUUGUICUA 1402
AM17760-SS (NAG37)s(invAb)sgcugacagCfAfGfcacauuguuus(invAb) 1128 GCUGACAGCAGCACAUUGUUU 1403
AM17773-SS (NAG37)s(invAb)sgcugugguGfuCfUfgaguacuuus(invAb) 1129 GCUGUGGUGUCUGAGUACUUU 1355
AM17774-SS (NAG37)s(invAb)sgcugugguGfuCfuGfaguacuuus(invAb) 1130 GCUGUGGUGUCUGAGUACUUU 1355
AM17775-SS (NAG37)s(invAb)sgcugugGfuGfuCfugaguacuuus(invAb) 1131 GCUGUGGUGUCUGAGUACUUU 1355
AM19042-SS (NAG37)s(invAb)sgaugaggaUfuuGfgguuuucuas(invAb) 1132 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM19043-SS (NAG37)s(invAb)sgaugaggadTuudGgguuuucuas(invAb) 1133 GAUGAGGATUUGGGUUUUCUA 1426
AM19044-SS (NAG37)s(invAb)sggugaggaUfuUfGfgguuuucuas(invAb) 1134 GGUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1404
AM19046-SS (NAG37)s(invAb)sgcugaggaUfuUfGfgguuuucuas(invAb) 1135 GCUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1405
AM19110-SS (NAG37)s(invAb)sgcugugguGfUfCfugaguacuuas(invAb) 1136 GCUGUGGUGUCUGAGUACUUA 1406
AM19117-SS (NAG37)s(invAb)sgcuguggudGudCugaguacuuus(invAb) 1137 GCUGUGGUGUCUGAGUACUUU 1355
AM19216-SS (NAG37)s(invAb)sagaugaggAfUfUfuggguuuucus(invAb) 1138 AGAUGAGGAUUUGGGUUUUCU 1407
AM19351-SS (NAG37)s(invAb)sgaugaggaUfuUfggguuuucuas(invAb) 1139 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM19352-SS (NAG37)s(invAb)sgaugaggaUuUfggguuuucuas(invAb) 1140 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM19353-SS (NAG37)s(invAb)sgaugaggaUfuUggguuuucuas(invAb) 1141 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM19354-SS (NAG37)s(invAb)sgaugaggadTuUfggguuuucuas(invAb) 1142 GAUGAGGATUUGGGUUUUCUA 1426
AM19355-SS (NAG37)s(invAb)sgaugaggaUfudTggguuuucuas(invAb) 1143 GAUGAGGAUUTGGGUUUUCUA 1427
AM19356-SS (NAG37)s(invAb)sgaugaggadTudTggguuuucuas(invAb) 1144 GAUGAGGATUTGGGUUUUCUA 1428
AM19357-SS (NAG37)s(invAb)sgaugaggaUudTggguuuucuas(invAb) 1145 GAUGAGGAUUTGGGUUUUCUA 1427
AM19358-SS (NAG37)s(invAb)sgaugaggadTuUggguuuucuas(invAb) 1146 GAUGAGGATUUGGGUUUUCUA 1426
AM19544-SS (NAG37)s(invAb)sugaggaUfuUfGfgguuuucuas(invAb) 1147 UGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1408
AM19545-SS (NAG37)susgaggaUfuUfGfgguuuucuas(invAb) 1148 UGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1408
AM19672-SS (NAG37)s(invAb)sgcugugguGfUfUfugaguacuuas(invAb) 1149 GCUGUGGUGUUUGAGUACUUA 1409
AM19697-SS (NAG37)s(invAb)sggacccaaUfuAfcugucauugas(invAb) 1150 GGACCCAAUUACUGUCAUUGA 1390
AM19698-SS (NAG37)s(invAb)sggacccaaUfuAfCfugucauugas(invAb) 1151 GGACCCAAUUACUGUCAUUGA 1390
AM19699-SS (NAG37)s(invAb)sggacccAfaUfuAfcugucauugas(invAb) 1152 GGACCCAAUUACUGUCAUUGA 1390
AM20010-SS (NAG37)s(invAb)sugugguGfUfCfugaguacuuus(invAb) 1153 UGUGGUGUCUGAGUACUUU 1410
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AM20198-SS (NAG37)sgsgugguGfUfCfugaguacuus(invdA) 1161 GGUGGUGUCUGAGUACUUA 1413
AM20205-SS (NAG37)s(invAb)sggaggaUfuUfGfgguuuucuas(invAb) 1162 GGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1414
AM20207-SS (NAG37)s(invAb)scgaggaUfuUfGfgguuuucuas(invAb) 1163 CGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1415
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AM20331-SS (NAG37)s(invAb)sgcuaugguGfUfCfugaguacuuas(invAb) 1165 GCUAUGGUGUCUGAGUACUUA 1417
AM20493-SS (NAG37)s(invAb)sgcugugguGfUfGfugaguacuuas(invAb) 1166 GCUGUGGUGUGUGAGUACUUA 1418
AM20495-SS (NAG37)s(invAb)sgcuguuguGfUfGfugaggacuuas(invAb) 1167 GCUGUUGUGUGUGAGGACUUA 1419
CS004414 (NAG37)s(invAb)sacugugguGfUfCfugaguacuuus(invAb) 1433 ACUGUGGUGUCUGAGUACUUU 1438
CS006373 (NAG37)s(invAb)sggugguGfUfCfugaguacuuas(invAb) 1434 GGUGGUGUCUGAGUACUUA 1413
(A 2N) =含2-胺基腺嘌呤之核苷酸;I =次黃嘌呤(肌苷)核苷酸 4B.CFB RNAi藥劑有義股序列(在無靶向配位體及反向無鹼基端帽之情況下顯示)
有義股 ID 經修飾之有義股(5 ′ → 3′) SEQ ID NO. 基礎鹼基序列 (5 ′ → 3′) ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列 ) SEQ ID NO.
AM17114-SS-NL gcaucuacCfUfGfgugcuagaua 1168 GCAUCUACCUGGUGCUAGAUA 1347
AM17116-SS-NL caucuaccUfGfGfugcuagauga 1169 CAUCUACCUGGUGCUAGAUGA 1348
AM17118-SS-NL aucuaccuGfGfUfgcuagauiga 1170 AUCUACCUGGUGCUAGAUIGA 1349
AM17120-SS-NL ucuaccugGfUfGfcuagauigau 1171 UCUACCUGGUGCUAGAUIGAU 1350
AM17122-SS-NL uaccugguGfCfUfagaugiauca 1172 UACCUGGUGCUAGAUGIAUCA 1351
AM17124-SS-NL uggugcuaGfAfUfggaucaiaca 1173 UGGUGCUAGAUGGAUCAIACA 1352
AM17126-SS-NL gcuagaugGfAfUfcagacaicau 1174 GCUAGAUGGAUCAGACAICAU 1353
AM17128-SS-NL ucucugagUfCfUfcugugicaua 1175 UCUCUGAGUCUCUGUGICAUA 1354
AM17130-SS-NL gcugugguGfUfCfugaguacuuu 1176 GCUGUGGUGUCUGAGUACUUU 1355
AM17132-SS-NL cguuucauUfCfAfaguugiugua 1177 CGUUUCAUUCAAGUUGIUGUA 1356
AM17134-SS-NL gua_2NaucagCfUfGfgggaguagua 1178 GUA(A 2N)UCAGCUGGGGAGUAGUA 1357
AM17136-SS-NL gaucagcuGfGfGfgaguaguiga 1179 GAUCAGCUGGGGAGUAGUIGA 1358
AM17138-SS-NL agcuggggAfGfUfagugiaugua 1180 AGCUGGGGAGUAGUGIAUGUA 1359
AM17140-SS-NL cuggggagUfAfGfuggaugucua 1181 CUGGGGAGUAGUGGAUGUCUA 1360
AM17142-SS-NL uccaagauGfAfGfgauuugiguu 1182 UCCAAGAUGAGGAUUUGIGUU 1361
AM17144-SS-NL ccaagaugAfGfGfauuugiguuu 1183 CCAAGAUGAGGAUUUGIGUUU 1362
AM17146-SS-NL gaugaggaUfUfUfggguuuucua 1184 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM17678-SS-NL gaugaggaUfuUfGfgguuuucua 1185 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM17679-SS-NL gaugaggaUfuUfgGfguuuucua 1186 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM17680-SS-NL gaugagGfaUfuUfggguuuucua 1187 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM17682-SS-NL cacugcuaUfGfAfcgguuacacu 1188 CACUGCUAUGACGGUUACACU 1364
AM17684-SS-NL gccaaaaaGfUfGfucuagucaaa 1189 GCCAAAAAGUGUCUAGUCAAA 1365
AM17686-SS-NL ca_2NaaaaguGfUfCfuagucaacuu 1190 C(A 2N)AAAAGUGUCUAGUCAACUU 1366
AM17688-SS-NL agaaggugGfCfAfaguuauggua 1191 AGAAGGUGGCAAGUUAUGGUA 1367
AM17690-SS-NL cugauggaUfUfGfcacaacauga 1192 CUGAUGGAUUGCACAACAUGA 1368
AM17692-SS-NL cccaauuaCfUfGfucauugauga 1193 CCCAAUUACUGUCAUUGAUGA 1369
AM17694-SS-NL gaaccaagUfGfAfacaucaauga 1194 GAACCAAGUGAACAUCAAUGA 1370
AM17696-SS-NL gguaccgaUfUfAfccacaaicaa 1195 GGUACCGAUUACCACAAICAA 1371
AM17698-SS-NL caccgauuAfCfCfacaaicaaca 1196 CACCGAUUACCACAAICAACA 1372
AM17700-SS-NL cauggcagGfCfCfaagaucucaa 1197 CAUGGCAGGCCAAGAUCUCAA 1373
AM17702-SS-NL gugacguuGfCfCfcugaucaaga 1198 GUGACGUUGCCCUGAUCAAGA 1374
AM17704-SS-NL ugacguugCfCfCfugaucaaicu 1199 UGACGUUGCCCUGAUCAAICU 1375
AM17706-SS-NL uacgugugUfCfCfuucugicuua 1200 UACGUGUGUCCUUCUGICUUA 1376
AM17708-SS-NL ugugagugAfUfGfagaucucuuu 1201 UGUGAGUGAUGAGAUCUCUUU 1377
AM17710-SS-NL ugagugauGfAfGfaucucuuuca 1202 UGAGUGAUGAGAUCUCUUUCA 1378
AM17712-SS-NL cugccaagAfCfUfccuucaugua 1203 CUGCCAAGACUCCUUCAUGUA 1379
AM17714-SS-NL ccaagacuCfCfUfucauguacia 1204 CCAAGACUCCUUCAUGUACIA 1380
AM17716-SS-NL agacuccuUfCfAfuguaciacaa 1205 AGACUCCUUCAUGUACIACAA 1381
AM17718-SS-NL gagaccauAfGfAfaggaiucgau 1206 GAGACCAUAGAAGGAIUCGAU 1382
AM17720-SS-NL gcuccaugAfAfCfaucuaccuia 1207 GCUCCAUGAACAUCUACCUIA 1383
AM17722-SS-NL gaacaucuAfCfCfugguicuaga 1208 GAACAUCUACCUGGUICUAGA 1384
AM17724-SS-NL guggaucaGfAfCfagcauugiga 1209 GUGGAUCAGACAGCAUUGIGA 1385
AM17726-SS-NL gagccaaaAfAfGfugucuaiuca 1210 GAGCCAAAAAGUGUCUAIUCA 1386
AM17728-SS-NL gagaagguGfGfCfaaguuauggu 1211 GAGAAGGUGGCAAGUUAUGGU 1387
AM17730-SS-NL gaguuaugGfUfGfugaaiccaaa 1212 GAGUUAUGGUGUGAAICCAAA 1388
AM17732-SS-NL aggcagugUfAfCfagcaugauga 1213 AGGCAGUGUACAGCAUGAUGA 1389
AM17734-SS-NL ggacccaaUfUfAfcugucauuga 1214 GGACCCAAUUACUGUCAUUGA 1390
AM17736-SS-NL gacccaauUfAfCfugucauugau 1215 GACCCAAUUACUGUCAUUGAU 1391
AM17738-SS-NL cacugucaUfUfGfaugaiaucca 1216 CACUGUCAUUGAUGAIAUCCA 1392
AM17740-SS-NL ggaggauuAfUfCfuggaugucua 1217 GGAGGAUUAUCUGGAUGUCUA 1393
AM17742-SS-NL caucuggaUfGfUfcuauguguuu 1218 CAUCUGGAUGUCUAUGUGUUU 1394
AM17744-SS-NL ucuggaugUfCfUfauguguuuga 1219 UCUGGAUGUCUAUGUGUUUGA 1395
AM17746-SS-NL ccaagugaAfCfAfucaaugcuuu 1220 CCAAGUGAACAUCAAUGCUUU 1396
AM17748-SS-NL gugaacauCfAfAfugcuuugicu 1221 GUGAACAUCAAUGCUUUGICU 1397
AM17750-SS-NL gaacaucaAfUfGfcuuugicuua 1222 GAACAUCAAUGCUUUGICUUA 1398
AM17752-SS-NL caagaaagAfCfAfaugaicaaca 1223 CAAGAAAGACAAUGAICAACA 1399
AM17754-SS-NL ga_2NaagacaAfUfGfagcaacaugu 1224 G(A 2N)AAGACAAUGAGCAACAUGU 1400
AM17756-SS-NL ggugucugAfGfUfacuuuguicu 1225 GGUGUCUGAGUACUUUGUICU 1401
AM17758-SS-NL gugucugaGfUfAfcuuuguicua 1226 GUGUCUGAGUACUUUGUICUA 1402
AM17760-SS-NL gcugacagCfAfGfcacauuguuu 1227 GCUGACAGCAGCACAUUGUUU 1403
AM17773-SS-NL gcugugguGfuCfUfgaguacuuu 1228 GCUGUGGUGUCUGAGUACUUU 1355
AM17774-SS-NL gcugugguGfuCfuGfaguacuuu 1229 GCUGUGGUGUCUGAGUACUUU 1355
AM17775-SS-NL gcugugGfuGfuCfugaguacuuu 1230 GCUGUGGUGUCUGAGUACUUU 1355
AM19042-SS-NL gaugaggaUfuuGfgguuuucua 1231 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM19043-SS-NL gaugaggadTuudGgguuuucua 1232 GAUGAGGATUUGGGUUUUCUA 1426
AM19044-SS-NL ggugaggaUfuUfGfgguuuucua 1233 GGUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1404
AM19046-SS-NL gcugaggaUfuUfGfgguuuucua 1234 GCUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1405
AM19110-SS-NL gcugugguGfUfCfugaguacuua 1235 GCUGUGGUGUCUGAGUACUUA 1406
AM19117-SS-NL gcuguggudGudCugaguacuuu 1236 GCUGUGGUGUCUGAGUACUUU 1355
AM19216-SS-NL agaugaggAfUfUfuggguuuucu 1237 AGAUGAGGAUUUGGGUUUUCU 1407
AM19351-SS-NL gaugaggaUfuUfggguuuucua 1238 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM19352-SS-NL gaugaggaUuUfggguuuucua 1239 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM19353-SS-NL gaugaggaUfuUggguuuucua 1240 GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1363
AM19354-SS-NL gaugaggadTuUfggguuuucua 1241 GAUGAGGATUUGGGUUUUCUA 1426
AM19355-SS-NL gaugaggaUfudTggguuuucua 1242 GAUGAGGAUUTGGGUUUUCUA 1427
AM19356-SS-NL gaugaggadTudTggguuuucua 1243 GAUGAGGATUTGGGUUUUCUA 1428
AM19357-SS-NL gaugaggaUudTggguuuucua 1244 GAUGAGGAUUTGGGUUUUCUA 1427
AM19358-SS-NL gaugaggadTuUggguuuucua 1245 GAUGAGGATUUGGGUUUUCUA 1426
AM19544-SS-NL ugaggaUfuUfGfgguuuucua 1246 UGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1408
AM19545-SS-NL usgaggaUfuUfGfgguuuucua 1247 UGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1408
AM19672-SS-NL gcugugguGfUfUfugaguacuua 1248 GCUGUGGUGUUUGAGUACUUA 1409
AM19697-SS-NL ggacccaaUfuAfcugucauuga 1249 GGACCCAAUUACUGUCAUUGA 1390
AM19698-SS-NL ggacccaaUfuAfCfugucauuga 1250 GGACCCAAUUACUGUCAUUGA 1390
AM19699-SS-NL ggacccAfaUfuAfcugucauuga 1251 GGACCCAAUUACUGUCAUUGA 1390
AM20010-SS-NL ugugguGfUfCfugaguacuuu 1252 UGUGGUGUCUGAGUACUUU 1410
AM20013-SS-NL cgugguGfUfCfugaguacuuu 1253 CGUGGUGUCUGAGUACUUU 1411
AM20015-SS-NL ggugguGfUfCfugaguacuuu 1254 GGUGGUGUCUGAGUACUUU 1412
AM20020-SS-NL gcugugguGfUfCfugaguacuua 1255 GCUGUGGUGUCUGAGUACUUA 1406
AM20068-SS-NL ggugagGfaUfuUfggguuuucua 1256 GGUGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1404
AM20191-SS-NL gsgugguGfUfCfugaguacuuu 1257 GGUGGUGUCUGAGUACUUU 1412
AM20193-SS-NL csgugguGfUfCfugaguacuuu 1258 CGUGGUGUCUGAGUACUUU 1411
AM20195-SS-NL usgugguGfUfCfugaguacuuu 1259 UGUGGUGUCUGAGUACUUU 1410
AM20198-SS-NL gsgugguGfUfCfugaguacuu 1260 GGUGGUGUCUGAGUACUUA 1413
AM20205-SS-NL ggaggaUfuUfGfgguuuucua 1261 GGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1414
AM20207-SS-NL cgaggaUfuUfGfgguuuucua 1262 CGAGGAUUUGGGUUUUCUA 1415
AM20330-SS-NL gcuguaguGfUfCfugaguacuua 1263 GCUGUAGUGUCUGAGUACUUA 1416
AM20331-SS-NL gcuaugguGfUfCfugaguacuua 1264 GCUAUGGUGUCUGAGUACUUA 1417
AM20493-SS-NL gcugugguGfUfGfugaguacuua 1265 GCUGUGGUGUGUGAGUACUUA 1418
AM20495-SS-NL gcuguuguGfUfGfugaggacuua 1266 GCUGUUGUGUGUGAGGACUUA 1419
CS004414-NL acugugguGfUfCfugaguacuuu 1435 ACUGUGGUGUCUGAGUACUUU 1438
CS006373-NL ggugguGfUfCfugaguacuua 1436 GGUGGUGUCUGAGUACUUA 1413
(A 2N) =含2-胺基腺嘌呤之核苷酸;I =次黃嘌呤(肌苷)核苷酸
本文所描述之CFB RNAi藥劑由反義股與有義股黏接而形成。含有表2、表4A、表4B或表5C中所列序列之有義股可與含有表2、表3或表5C中所列序列之任何反義股雜交,其限制條件為兩個序列在連續15、16、17、18、19、20或21個核苷酸序列上具有至少85%互補之區域。
在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑的反義股與表3或表5C中之反義股序列中之任一者之差異為0、1、2或3個核苷酸。在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑的有義股與表4A、表4B或表5C中之有義股序列中之任一者之差異為0、1、2或3個核苷酸。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑反義股包含表2、表3或表5C中之序列中之任一者的核苷酸序列。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑反義股包含表2、表3或表5C中之序列中之任一者的核苷酸(5'端 3'端) 1-17、2-17、1-18、2-18、1-19、2-19、1-20、2-20、1-21或2-21之序列。在某些實施例中,CFB RNAi藥劑反義股包含表3或表5C中之經修飾序列中之任一者的經修飾序列或由其組成。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑有義股包含表2、表4A、表4B或表5C中之序列中之任一者的核苷酸序列。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑有義股包含表2、表4A、表4B或表5C中之序列中之任一者的核苷酸(5'端 3'端) 1-17、2-17、3-17、4-17、1-18、2-18、3-18、4-18、1-19、2-19、3-19、4-19、1-20、2-20、3-20、4-20、1-21、2-21、3-21或4-21之序列。在某些實施例中,CFB RNAi藥劑有義股包含表4A、表4B或表5C中之經修飾序列中之任一者的經修飾序列或由其組成。
對於本文所揭示之CFB RNAi藥劑,反義股之位置1 (5'端 3'端)處的核苷酸可與CFB基因完全互補,或可與CFB基因不互補。在一些實施例中,反義股之位置1 (5'端 3'端)處的核苷酸為U、A或dT (或其經修飾之型式)。在一些實施例中,反義股之位置1 (5'端 3'端)處的核苷酸與有義股形成A:U或U:A鹼基對。
含有表2、表4A、表4B或表5C中所列序列之有義股可與含有表2、表3或表5C中所列序列之任何反義股雜交,其限制條件為兩個序列在連續15、16、17、18、19、20或21個核苷酸序列上具有至少85%互補之區域。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑具有有義股,其由表4A、表4B或表5C中之經修飾序列中之任一者的經修飾序列組成;及反義股,其由表3或表5C中之經修飾序列中之任一者的經修飾序列組成。某些代表性序列對由表5A、表5B及表5C中所示之雙螺旋體ID編號例示。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含以下、由以下組成或基本上由以下組成:由本文所呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者表示的雙螺旋體。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含由本文呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者表示的任何雙螺旋體之有義股及反義股核苷酸序列。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含由本文呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者表示的任何雙螺旋體之有義股及反義股核苷酸序列以及靶向基團及/或連接基團,其中該靶向基團及/或連接基團共價連接(亦即,結合)至有義股或反義股。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包括本文呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者的有義股及反義股經修飾之核苷酸序列。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含本文呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者的有義股及反義股經修飾之核苷酸序列以及靶向基團及/或連接基團,其中該靶向基團及/或連接基團共價連接至有義股或反義股。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含具有表2或表5A、表5B及表5C之反義股/有義股雙螺旋體中之任一者的核苷酸序列之反義股及有義股,且進一步包含靶向基團或靶向配位體。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含具有表2或表5A、表5B及表5C之反義股/有義股雙螺旋體之任一者的核苷酸序列之反義股及有義股,且進一步包含去唾液酸糖蛋白受體配位體靶向基團。
具有或不具有連接子之靶向基團可連接至表2、表3、表4或表5C中所揭示之有義股及/或反義股中之任一者的5'或3'端。具有或不具有靶向基團之連接子可連接至表2、表3、表4及表5C中所揭示之有義股及/或反義股中之任一者的5'或3'端。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含具有表2或表5A、表5B及表5C之反義股/有義股雙螺旋體中之任一者的核苷酸序列之反義股及有義股,且進一步包含選自由以下組成之群的靶向配位體:(NAG37)及(NAG37)s,其各自依表6中所定義。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含具有表3或表4A或表4B中之反義股及/或有義股核苷酸序列中之任一者的經修飾之核苷酸序列的反義股及有義股。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含具有表5A、表5B及表5C之雙螺旋體中之任一者的反義股及/或有義股核苷酸序列中之任一者的經修飾之核苷酸序列的反義股及有義股,且進一步包含去唾液酸糖蛋白受體配位體靶向基團。
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑包含以下、由以下組成或基本上由以下組成:表5A、表5B及表5C之雙螺旋體中之任一者。 5A.具有對應有義股及反義股ID編號以及經修飾及未經修飾之核苷酸序列之序列ID編號的CFB RNAi藥劑雙螺旋體。
雙螺旋體 AS ID 經AS 修飾之SEQ ID NO: 未經AS 修飾之SEQ ID NO: SS ID 經SS 修飾之SEQ ID NO: 未經SS 修飾之SEQ ID NO:
AD12080 AM17115-AS 897 1267 AM17114-SS 1069 1347
AD12081 AM17117-AS 898 1268 AM17116-SS 1070 1348
AD12082 AM17119-AS 899 1269 AM17118-SS 1071 1349
AD12083 AM17121-AS 900 1270 AM17120-SS 1072 1350
AD12084 AM17123-AS 901 1271 AM17122-SS 1073 1351
AD12085 AM17125-AS 902 1272 AM17124-SS 1074 1352
AD12086 AM17127-AS 903 1273 AM17126-SS 1075 1353
AD12087 AM17129-AS 904 1274 AM17128-SS 1076 1354
AD12088 AM17131-AS 905 1275 AM17130-SS 1077 1355
AD12089 AM17133-AS 906 1276 AM17132-SS 1078 1356
AD12090 AM17135-AS 907 1277 AM17134-SS 1079 1357
AD12091 AM17137-AS 908 1278 AM17136-SS 1080 1358
AD12092 AM17139-AS 909 1279 AM17138-SS 1081 1359
AD12093 AM17141-AS 910 1280 AM17140-SS 1083 1360
AD12094 AM17143-AS 911 1281 AM17142-SS 1083 1361
AD12095 AM17145-AS 912 1282 AM17144-SS 1084 1362
AD12096 AM17147-AS 913 1283 AM17146-SS 1085 1363
AD12495 AM17667-AS 914 1283 AM17146-SS 1085 1363
AD12496 AM17668-AS 915 1283 AM17146-SS 1085 1363
AD12497 AM17669-AS 916 1283 AM17146-SS 1085 1363
AD12498 AM17670-AS 917 1283 AM17146-SS 1085 1363
AD12499 AM17671-AS 918 1283 AM17146-SS 1085 1363
AD12500 AM17672-AS 919 1283 AM17146-SS 1085 1363
AD12501 AM17673-AS 920 1283 AM17146-SS 1085 1363
AD12502 AM17674-AS 921 1283 AM17146-SS 1085 1363
AD12503 AM17675-AS 922 1283 AM17146-SS 1085 1363
AD12504 AM17676-AS 923 1283 AM17146-SS 1085 1363
AD12505 AM17677-AS 1429 1283 AM17146-SS 1085 1363
AD12506 AM17667-AS 914 1283 AM17678-SS 1086 1363
AD12507 AM17667-AS 914 1283 AM17679-SS 1087 1363
AD12508 AM17667-AS 914 1283 AM17680-SS 1088 1363
AD12509 AM17681-AS 924 1283 AM17146-SS 1085 1363
AD12510 AM17683-AS 925 1284 AM17682-SS 1089 1364
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AD14518 AM20333-AS 1065 1425 AM19110-SS 1136 1406
AD14570 AM19111-AS 994 1326 AM17130-SS 1077 1355
AD14571 AM20425-AS 1066 1344 AM17130-SS 1077 1355
AD14637 AM20494-AS 1067 1345 AM20493-SS 1166 1418
AD14638 AM20496-AS 1068 1346 AM20495-SS 1167 1419
AC003560 CA004415 1430 1437 CS004414 1433 1438
AC005224 CA915944 1431 1341 CS006373 1434 1413
5B.具有靶向於CFB基因上之對應有義股及反義股ID編號參考位置(SEQ ID NO:1)之CFB RNAi藥劑雙螺旋體
雙螺旋體 ID 反義股ID 有義股ID 靶向CFB 基因位置 (SEQ ID NO:1 )
AD12080 AM17115-AS AM17114-SS 936
AD12081 AM17117-AS AM17116-SS 937
AD12082 AM17119-AS AM17118-SS 938
AD12083 AM17121-AS AM17120-SS 939
AD12084 AM17123-AS AM17122-SS 941
AD12085 AM17125-AS AM17124-SS 945
AD12086 AM17127-AS AM17126-SS 949
AD12087 AM17129-AS AM17128-SS 1547
AD12088 AM17131-AS AM17130-SS 1667
AD12089 AM17133-AS AM17132-SS 2255
AD12090 AM17135-AS AM17134-SS 2273
AD12091 AM17137-AS AM17136-SS 2275
AD12092 AM17139-AS AM17138-SS 2279
AD12093 AM17141-AS AM17140-SS 2281
AD12094 AM17143-AS AM17142-SS 2394
AD12095 AM17145-AS AM17144-SS 2395
AD12096 AM17147-AS AM17146-SS 2399
AD12495 AM17667-AS AM17146-SS 2399
AD12496 AM17668-AS AM17146-SS 2399
AD12497 AM17669-AS AM17146-SS 2399
AD12498 AM17670-AS AM17146-SS 2399
AD12499 AM17671-AS AM17146-SS 2399
AD12500 AM17672-AS AM17146-SS 2399
AD12501 AM17673-AS AM17146-SS 2399
AD12502 AM17674-AS AM17146-SS 2399
AD12503 AM17675-AS AM17146-SS 2399
AD12504 AM17676-AS AM17146-SS 2399
AD12505 AM17677-AS AM17146-SS 2399
AD12506 AM17667-AS AM17678-SS 2399
AD12507 AM17667-AS AM17679-SS 2399
AD12508 AM17667-AS AM17680-SS 2399
AD12509 AM17681-AS AM17146-SS 2399
AD12510 AM17683-AS AM17682-SS 515
AD12511 AM17685-AS AM17684-SS 992
AD12512 AM17687-AS AM17686-SS 994
AD12513 AM17689-AS AM17688-SS 1020
AD12514 AM17691-AS AM17690-SS 1290
AD12515 AM17693-AS AM17692-SS 1318
AD12516 AM17695-AS AM17694-SS 1429
AD12517 AM17697-AS AM17696-SS 1586
AD12518 AM17699-AS AM17698-SS 1588
AD12519 AM17701-AS AM17700-SS 1608
AD12520 AM17703-AS AM17702-SS 1851
AD12521 AM17705-AS AM17704-SS 1852
AD12522 AM17707-AS AM17706-SS 305
AD12523 AM17709-AS AM17708-SS 493
AD12524 AM17711-AS AM17710-SS 495
AD12525 AM17713-AS AM17712-SS 778
AD12526 AM17715-AS AM17714-SS 781
AD12527 AM17717-AS AM17716-SS 784
AD12528 AM17719-AS AM17718-SS 845
AD12529 AM17721-AS AM17720-SS 927
AD12530 AM17723-AS AM17722-SS 934
AD12531 AM17725-AS AM17724-SS 954
AD12532 AM17727-AS AM17726-SS 990
AD12533 AM17729-AS AM17728-SS 1019
AD12534 AM17731-AS AM17730-SS 1030
AD12535 AM17733-AS AM17732-SS 1206
AD12536 AM17735-AS AM17734-SS 1315
AD12537 AM17737-AS AM17736-SS 1316
AD12538 AM17739-AS AM17738-SS 1324
AD12539 AM17741-AS AM17740-SS 1384
AD12540 AM17743-AS AM17742-SS 1391
AD12541 AM17745-AS AM17744-SS 1393
AD12542 AM17747-AS AM17746-SS 1432
AD12543 AM17749-AS AM17748-SS 1436
AD12544 AM17751-AS AM17750-SS 1438
AD12545 AM17753-AS AM17752-SS 1459
AD12546 AM17755-AS AM17754-SS 1462
AD12547 AM17757-AS AM17756-SS 1672
AD12548 AM17759-AS AM17758-SS 1673
AD12549 AM17761-AS AM17760-SS 1690
AD12550 AM17762-AS AM17130-SS 1667
AD12551 AM17763-AS AM17130-SS 1667
AD12552 AM17764-AS AM17130-SS 1667
AD12553 AM17765-AS AM17130-SS 1667
AD12554 AM17766-AS AM17130-SS 1667
AD12555 AM17767-AS AM17130-SS 1667
AD12556 AM17768-AS AM17130-SS 1667
AD12557 AM17769-AS AM17130-SS 1667
AD12558 AM17770-AS AM17130-SS 1667
AD12559 AM17771-AS AM17130-SS 1667
AD12560 AM17772-AS AM17130-SS 1667
AD12561 AM17762-AS AM17773-SS 1667
AD12562 AM17762-AS AM17774-SS 1667
AD12563 AM17762-AS AM17775-SS 1667
AD12564 AM17776-AS AM17130-SS 1667
AD12964 AM17668-AS AM17678-SS 2399
AD12965 AM17674-AS AM17678-SS 2399
AD12966 AM17668-AS AM17680-SS 2399
AD12967 AM17674-AS AM17680-SS 2399
AD12968 AM18396-AS AM17678-SS 2399
AD12969 AM18397-AS AM17678-SS 2399
AD12970 AM18396-AS AM17680-SS 2399
AD12971 AM18397-AS AM17680-SS 2399
AD13036 AM17765-AS AM17775-SS 1667
AD13037 AM17770-AS AM17775-SS 1667
AD13038 AM18482-AS AM17775-SS 1667
AD13039 AM18483-AS AM17775-SS 1667
AD13040 AM18484-AS AM17775-SS 1667
AD13041 AM18485-AS AM17775-SS 1667
AD13123 AM17764-AS AM17775-SS 1667
AD13124 AM17771-AS AM17775-SS 1667
AD13125 AM18618-AS AM17775-SS 1667
AD13126 AM18618-AS AM17130-SS 1667
AD13127 AM18619-AS AM17130-SS 1667
AD13128 AM18619-AS AM17775-SS 1667
AD13382 AM19035-AS AM17678-SS 2399
AD13383 AM19036-AS AM17678-SS 2399
AD13384 AM19037-AS AM17678-SS 2399
AD13385 AM19038-AS AM17678-SS 2399
AD13386 AM19039-AS AM17678-SS 2399
AD13387 AM19040-AS AM17678-SS 2399
AD13388 AM19041-AS AM17678-SS 2399
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AD13390 AM19039-AS AM19043-SS 2399
AD13391 AM19045-AS AM19044-SS 2399
AD13392 AM19047-AS AM19046-SS 2399
AD13435 AM18484-AS AM17130-SS 1667
AD13436 AM19111-AS AM19110-SS 1667
AD13437 AM19112-AS AM17130-SS 1667
AD13438 AM19113-AS AM17130-SS 1667
AD13439 AM19114-AS AM17130-SS 1667
AD13440 AM19115-AS AM17130-SS 1667
AD13441 AM19116-AS AM17130-SS 1667
AD13442 AM18618-AS AM19117-SS 1667
AD13443 AM19118-AS AM17130-SS 1667
AD13534 AM19217-AS AM19216-SS 2398
AD13585 AM19273-AS AM17678-SS 2399
AD13586 AM19274-AS AM17130-SS 1667
AD13616 AM19316-AS AM17678-SS 2399
AD13647 AM19348-AS AM17678-SS 2399
AD13648 AM19349-AS AM17678-SS 2399
AD13649 AM19350-AS AM17678-SS 2399
AD13650 AM19040-AS AM19351-SS 2399
AD13651 AM19040-AS AM19352-SS 2399
AD13652 AM19040-AS AM19353-SS 2399
AD13653 AM19040-AS AM19354-SS 2399
AD13654 AM19040-AS AM19355-SS 2399
AD13655 AM19040-AS AM19356-SS 2399
AD13656 AM19040-AS AM19357-SS 2399
AD13657 AM19040-AS AM19358-SS 2399
AD13816 AM19543-AS AM17678-SS 2399
AD13817 AM19543-AS AM19544-SS 2399
AD13818 AM17668-AS AM19544-SS 2399
AD13819 AM19543-AS AM19545-SS 2399
AD13930 AM19667-AS AM19110-SS 1667
AD13931 AM19668-AS AM19110-SS 1667
AD13932 AM19669-AS AM19110-SS 1667
AD13933 AM19670-AS AM19110-SS 1667
AD13934 AM19671-AS AM19110-SS 1667
AD13935 AM19111-AS AM19672-SS 1667
AD13946 AM19688-AS AM17734-SS 1315
AD13947 AM19689-AS AM17734-SS 1315
AD13948 AM19690-AS AM17734-SS 1315
AD13949 AM19691-AS AM17734-SS 1315
AD13950 AM19692-AS AM17734-SS 1315
AD13951 AM19693-AS AM17734-SS 1315
AD13952 AM19694-AS AM17734-SS 1315
AD13953 AM19695-AS AM17734-SS 1315
AD13954 AM19696-AS AM17734-SS 1315
AD13955 AM19695-AS AM19697-SS 1315
AD13956 AM19695-AS AM19698-SS 1315
AD13957 AM19695-AS AM19699-SS 1315
AD13958 AM19700-AS AM17734-SS 1315
AD14126 AM19894-AS AM17678-SS 2399
AD14127 AM19895-AS AM17678-SS 2399
AD14128 AM19896-AS AM17678-SS 2399
AD14129 AM19897-AS AM17678-SS 2399
AD14130 AM19898-AS AM17678-SS 2399
AD14160 AM19928-AS AM17678-SS 2399
AD14221 AM20011-AS AM20010-SS 1667
AD14222 AM18618-AS AM20010-SS 1667
AD14223 AM20012-AS AM20010-SS 1667
AD14224 AM20014-AS AM20013-SS 1667
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AD14226 AM19670-AS AM19672-SS 1667
AD14227 AM19671-AS AM19672-SS 1667
AD14230 AM19671-AS AM20020-SS 1667
AD14231 AM20021-AS AM19110-SS 1667
AD14232 AM20022-AS AM19110-SS 1667
AD14233 AM20023-AS AM19110-SS 1667
AD14234 AM20024-AS AM19110-SS 1667
AD14235 AM20025-AS AM19110-SS 1667
AD14270 AM20062-AS AM17678-SS 2399
AD14271 AM20063-AS AM19044-SS 2399
AD14272 AM20064-AS AM17678-SS 2399
AD14273 AM20065-AS AM17678-SS 2399
AD14274 AM20066-AS AM19044-SS 2399
AD14275 AM20067-AS AM17678-SS 2399
AD14276 AM20062-AS AM17680-SS 2399
AD14277 AM20063-AS AM20068-SS 2399
AD14278 AM20064-AS AM17680-SS 2399
AD14279 AM20069-AS AM17678-SS 2399
AD14280 AM20070-AS AM19044-SS 2399
AD14281 AM20071-AS AM17678-SS 2399
AD14282 AM20072-AS AM17678-SS 2399
AD14283 AM20073-AS AM19044-SS 2399
AD14284 AM20074-AS AM17678-SS 2399
AD14386 AM20192-AS AM20191-SS 1667
AD14387 AM20194-AS AM20193-SS 1667
AD14388 AM20196-AS AM20195-SS 1667
AD14389 AM20192-AS AM20015-SS 1667
AD14390 AM20197-AS AM20191-SS 1667
AD14391 AM20199-AS AM20198-SS 1667
AD14392 AM20016-AS AM20191-SS 1667
AD14393 AM20200-AS AM20015-SS 1667
AD14394 AM20200-AS AM20191-SS 1667
AD14395 AM20201-AS AM20015-SS 1667
AD14396 AM20202-AS AM20015-SS 1667
AD14397 AM20203-AS AM17678-SS 2399
AD14398 AM20204-AS AM19544-SS 2399
AD14399 AM20206-AS AM20205-SS 2399
AD14400 AM20208-AS AM20207-SS 2399
AD14515 AM19670-AS AM20330-SS 1667
AD14516 AM19671-AS AM20331-SS 1667
AD14517 AM20332-AS AM19110-SS 1667
AD14518 AM20333-AS AM19110-SS 1667
AD14570 AM19111-AS AM17130-SS 1667
AD14571 AM20425-AS AM17130-SS 1667
AD14637 AM20494-AS AM20493-SS 1667
AD14638 AM20496-AS AM20495-SS 1667
AC003560 CA004415 CS004414 1667
AC005224 CA915944 CS006373 1667
5C.顯示經化學修飾之反義股及有義股序列的CFB RNAi藥劑雙螺旋體
雙螺旋體 ID 經修飾之反義股(5 ′ → 3′) SEQ ID NO. 經修飾之有義股(5 ′ → 3′) SEQ ID NO.
AD12080 usAfsusCfuAfgCfaCfcAfgGfuAfgAfuGfsc 897 (NAG37)s(invAb)sgcaucuacCfUfGfgugcuagauas(invAb) 1069
AD12081 usCfsasUfcUfaGfcAfcCfaGfgUfaGfaUfsg 898 (NAG37)s(invAb)scaucuaccUfGfGfugcuagaugas(invAb) 1070
AD12082 usCfscsAfuCfuAfgCfaCfcAfgGfuAfgAfsu 899 (NAG37)s(invAb)saucuaccuGfGfUfgcuagauigas(invAb) 1071
AD12083 asUfscsCfaUfcUfaGfcAfcCfaGfgUfaGfsa 900 (NAG37)s(invAb)sucuaccugGfUfGfcuagauigaus(invAb) 1072
AD12084 usGfsasUfcCfaUfcUfaGfcAfcCfaGfgUfsa 901 (NAG37)s(invAb)suaccugguGfCfUfagaugiaucas(invAb) 1073
AD12085 usGfsusCfuGfaUfcCfaUfcUfaGfcAfcCfsa 902 (NAG37)s(invAb)suggugcuaGfAfUfggaucaiacas(invAb) 1074
AD12086 asUfsgsCfuGfuCfuGfaUfcCfaUfcUfaGfsc 903 (NAG37)s(invAb)sgcuagaugGfAfUfcagacaicaus(invAb) 1075
AD12087 usAfsusGfcCfaCfaGfaGfaCfuCfaGfaGfsa 904 (NAG37)s(invAb)sucucugagUfCfUfcugugicauas(invAb) 1076
AD12088 asAfsasGfuAfcUfcAfgAfcAfcCfaCfaGfsc 905 (NAG37)s(invAb)sgcugugguGfUfCfugaguacuuus(invAb) 1077
AD12089 usAfscsAfcCfaAfcUfuGfaAfuGfaAfaCfsg 906 (NAG37)s(invAb)scguuucauUfCfAfaguugiuguas(invAb) 1078
AD12090 usAfscsUfaCfuCfcCfcAfgCfuGfaUfuAfsc 907 (NAG37)s(invAb)sgua_2NaucagCfUfGfgggaguaguas(invAb) 1079
AD12091 usCfscsAfcUfaCfuCfcCfcAfgCfuGfaUfsc 908 (NAG37)s(invAb)sgaucagcuGfGfGfgaguaguigas(invAb) 1080
AD12092 usAfscsAfuCfcAfcUfaCfuCfcCfcAfgCfsu 909 (NAG37)s(invAb)sagcuggggAfGfUfagugiauguas(invAb) 1081
AD12093 usAfsgsAfcAfuCfcAfcUfaCfuCfcCfcAfsg 910 (NAG37)s(invAb)scuggggagUfAfGfuggaugucuas(invAb) 1083
AD12094 asAfscsCfcAfaAfuCfcUfcAfuCfuUfgGfsa 911 (NAG37)s(invAb)succaagauGfAfGfgauuugiguus(invAb) 1083
AD12095 asAfsasCfcCfaAfaUfcCfuCfaUfcUfuGfsg 912 (NAG37)s(invAb)sccaagaugAfGfGfauuugiguuus(invAb) 1084
AD12096 usAfsgsAfaAfaCfcCfaAfaUfcCfuCfaUfsc 913 (NAG37)s(invAb)sgaugaggaUfUfUfggguuuucuas(invAb) 1085
AD12495 usAfsgsAfaaacccaAfaUfcCfucausc 914 (NAG37)s(invAb)sgaugaggaUfUfUfggguuuucuas(invAb) 1085
AD12496 usAfsgsaAfaacccaAfaUfcCfucausc 915 (NAG37)s(invAb)sgaugaggaUfUfUfggguuuucuas(invAb) 1085
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AC005224 usAfsaguaCfucagAfcAfcCfacsc 1431 (NAG37)s(invAb)sggugguGfUfCfugaguacuuas(invAb) 1434
(A 2N) =含2-胺基腺嘌呤之核苷酸;I =次黃嘌呤(肌苷)核苷酸
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑以鹽、混合鹽或游離酸形式製備或提供。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑以醫藥學上可接受之鹽(諸如鈉鹽或鉀鹽)形式製備或提供。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑以鈉鹽形式製備或提供。本文所描述之RNAi藥劑在遞送至表現CFB基因之細胞後,在活體內及/或活體外抑制或減弱一或多個CFB基因之表現。 靶向配位體或基團、連接基團及遞送媒劑
在一些實施例中,CFB RNAi藥劑與一或多種非核苷酸基團結合,該一或多種非核苷酸基團包括但不限於靶向基團、連接基團、靶向配位體、遞送聚合物或遞送媒劑。非核苷酸基團可增強RNAi藥劑之靶向、遞送或連接。靶向基團及連接基團之實例提供於表6中。非核苷酸基團可共價連接至有義股及/或反義股之3'及/或5'端。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑含有連接至有義股之3'及/或5'端的非核苷酸基團。在一些實施例中,非核苷酸基團連接至CFB RNAi藥劑有義股之5'端。非核苷酸基團可經由連接子/連接基團直接地或間接地連接至RNAi藥劑。在一些實施例中,非核苷酸基團經由不穩定、可裂解或可逆的鍵或連接子連接至RNAi藥劑。
在一些實施例中,非核苷酸基團增強RNAi藥劑或與其連接之結合物之藥物動力學或生物分佈特性,以改善RNAi藥劑或結合物之細胞特異性或組織特異性分佈及細胞特異性吸收。在一些實施例中,非核苷酸基團增強RNAi藥劑之內飲作用。
靶向基團或靶向部分增強結合物或與其連接之RNAi藥劑的藥物動力學或生物分佈特性,以改善結合物或RNAi藥劑之細胞特異性(在一些情況下包括器官特異性)分佈及細胞特異性(或器官特異性)吸收。靶向基團可為單價、二價、三價、四價或具有更高價數,以用於其所針對之目標。代表性靶向基團包括但不限於對細胞表面分子具有親和力之化合物、細胞受體配位體、半抗原、抗體、單株抗體、抗體片段及對細胞表面分子具有親和力之抗體模擬物。
在一些實施例中,靶向基團使用連接子連接至RNAi藥劑,該連接子諸如PEG連接子或一個、兩個或三個無鹼基及/或核糖醇(無鹼基核糖)殘基,該等殘基在一些情況下可充當連接子。在一些實施例中,靶向配位體包含半乳糖衍生物簇。
可在5'端及/或3'端處合成本文所描述之CFB RNAi藥劑,其具有反應性基團,諸如胺基(在本文中亦稱為胺)。反應性基團隨後可用於使用此項技術中典型之方法連接靶向部分。
在一些實施例中,靶向基團包含去唾液酸糖蛋白受體配位體。依本文所用,去唾液酸糖蛋白受體配位體為含有對去唾液酸糖蛋白受體具有親和力之部分的配位體。依本文提及,去唾液酸糖蛋白受體在肝細胞上高度表現。在一些實施例中,去唾液酸糖蛋白受體配位體包括一或多種半乳糖衍生物或由其組成。依本文所用,術語半乳糖衍生物包括半乳糖及對去唾液酸糖蛋白受體之親和力等於或大於半乳糖的半乳糖衍生物。半乳糖衍生物包括但不限於:半乳糖、半乳糖胺、N-甲醯基半乳糖胺、N-乙醯基-半乳糖胺、N-丙醯基-半乳糖胺、N-正丁醯基-半乳糖胺及N-異丁醯基半乳糖-胺(參見例如:S.T. Iobst及K. Drickamer, J.B.C., 1996, 271, 6686)。適用於將寡核苷酸及其他分子活體內靶向肝臟之半乳糖衍生物及半乳糖衍生物簇為此項技術中已知的(參見例如Baenziger及Fiete,1980,Cell, 22, 611-620;Connolly等人,1982, J. Biol. Chem., 257, 939-945)。
半乳糖衍生物已透過其結合於肝細胞表面上所表現之去唾液酸糖蛋白受體而用於將分子活體內靶向肝細胞。去唾液酸糖蛋白受體配位體與去唾液酸糖蛋白受體之結合促進細胞特異性靶向肝細胞及分子至肝細胞中之內飲作用。去唾液酸糖蛋白受體配位體可為單體(例如具有單個半乳糖衍生物,亦稱為單價或單齒)或多聚體(例如具有多個半乳糖衍生物)。半乳糖衍生物或半乳糖衍生物簇可使用此項技術中已知之方法連接至RNAi藥劑之有義股或反義股的3'或5'端。
諸如半乳糖衍生物簇之靶向配位體的製備描述於例如Arrowhead Pharmaceuticals, Inc.之國際專利申請公開案第WO 2018/044350號及Arrowhead Pharmaceuticals, Inc.之國際專利申請公開案第WO 2017/156012號中,該等國際專利申請公開案之內容以全文引用之方式併入本文中。
依本文所用,半乳糖衍生物簇包含具有二至四個末端半乳糖衍生物的分子。末端半乳糖衍生物透過其C-1碳連接至分子。在一些實施例中,半乳糖衍生物簇為半乳糖衍生物三聚體(亦稱為三觸角型半乳糖衍生物或三價半乳糖衍生物)。在一些實施例中,半乳糖衍生物簇包含N-乙醯基-半乳糖胺部分。在一些實施例中,半乳糖衍生物簇包含三個N-乙醯基-半乳糖胺部分。在一些實施例中,半乳糖衍生物簇為半乳糖衍生物四聚體(亦稱為四觸角型半乳糖衍生物或四價半乳糖衍生物)。在一些實施例中,半乳糖衍生物簇包含四個N-乙醯基-半乳糖胺部分。
依本文所用,半乳糖衍生物三聚體含有三種半乳糖衍生物,其各自連接至中央分支點。依本文所用,半乳糖衍生物四聚體含有四種半乳糖衍生物,其各自連接至中央分支點。半乳糖衍生物可透過醣之C-1碳連接至中央分支點。在一些實施例中,半乳糖衍生物經由連接子或間隔子連接至分支點。在一些實施例中,連接子或間隔子為可撓性親水性間隔子,諸如PEG基團(參見例如美國專利案第5,885,968號;Biessen等人,J. Med. Chem. 1995.第39卷.第1538-1546頁)。在一些實施例中,PEG間隔子為PEG 3間隔子。分支點可為允許三種半乳糖衍生物連接且進一步允許分支點連接至RNAi藥劑的任何小分子。分支點基團之實例為二-離胺酸或二-麩胺酸。分支點連接至RNAi藥劑可透過連接子或間隔子進行。在一些實施例中,連接子或間隔子包含可撓性親水性間隔子,諸如但不限於PEG間隔子。在一些實施例中,連接子包含剛性連接子,諸如環狀基團。在一些實施例中,半乳糖衍生物包含N-乙醯基-半乳糖胺或由其組成。在一些實施例中,半乳糖衍生物簇包含半乳糖衍生物四聚體,其可為例如N-乙醯基-半乳糖胺四聚體。
本發明之實施例包括用於將CFB RNAi藥劑活體內遞送至肝細胞之醫藥組合物。此類醫藥組合物可包括例如與半乳糖衍生物簇結合之CFB RNAi藥劑。在一些實施例中,半乳糖衍生物簇包含半乳糖衍生物三聚體,其可為例如N-乙醯基-半乳糖胺三聚體,或半乳糖衍生物四聚體,其可為例如N-乙醯基-半乳糖胺四聚體。
靶向配位體或靶向基團可連接至本文所揭示之CFB RNAi藥劑之有義股或反義股的3'或5'端。
靶向配位體包括但不限於表6中所定義之(NAG37)及(NAG37)s。其他靶向基團及靶向配位體(包括半乳糖簇靶向配位體)為此項技術中已知的。
在一些實施例中,連接基團與RNAi藥劑結合。連接基團促進藥劑與靶向基團、遞送聚合物或遞送媒劑之共價連接。連接基團可連接至RNAi藥劑有義股或反義股之3'及/或5'端。在一些實施例中,連接基團連接至RNAi藥劑有義股。在一些實施例中,連接基團結合至RNAi藥劑有義股之5'或3'端。在一些實施例中,連接基團結合至RNAi藥劑有義股之5'端。連接基團之實例可包括但不限於:反應性基團,諸如一級胺及炔烴、烷基、無鹼基核苷酸、核糖醇(無鹼基核糖),及/或PEG基團。
在一些實施例中,靶向基團內部連接至RNAi藥劑之有義股及/或反義股上之核苷酸。在一些實施例中,靶向基團經由連接子連接至RNAi藥劑。
連接子或連接基團為兩個原子之間的連接,其使一個相關化學基團(諸如RNAi藥劑)或區段經由一或多個共價鍵連接至另一個相關化學基團(諸如靶向基團或遞送聚合物)或區段。不穩定鍵聯含有不穩定鍵。鍵聯可視情況包括使兩個接合原子之間的距離增加之間隔子。間隔子可進一步增加鍵聯之可撓性及/或長度。間隔子包括但不限於烷基、烯基、炔基、芳基、芳烷基、芳烯基及芳炔基;其中之各者可含有一或多個雜原子、雜環、胺基酸、核苷酸及醣類。間隔子基團在此項技術中已熟知且前述清單不意欲限制本說明書之範疇。
在一些實施例中,當在單一組合物中包括兩種或更多種RNAi藥劑時,該等RNAi藥劑中之各者可連接至同一靶向基團或兩個不同的靶向基團(亦即,具有不同化學結構之靶向基團)。在一些實施例中,靶向基團在未使用額外連接子之情況下,可連接至本文所揭示之CFB RNAi藥劑。在一些實施例中,靶向基團本身被設計成具有連接子或其他位點,以輕而易舉地促進所呈現的結合。在一些實施例中,當在單個分子中包括兩種或更多種CFB RNAi藥劑時,該等RNAi藥劑中之各者可利用同一連接子或不同的連接子(亦即,具有不同化學結構之連接子)。
表2、表3、表4A、表4B或表5C中所列之CFB RNAi藥劑核苷酸序列中之任一者(無論經修飾或未經修飾)均可含有一或多個3'及/或5'靶向基團或連接基團。表3或表4中所列或在本文其他地方描述之含有3'或5'靶向基團或連接基團的CFB RNAi藥劑序列中之任一者可替代地不含3'或5'靶向基團或連接基團,或可含有不同的3'或5'靶向基團或連接基團,包括但不限於表6中所描繪之彼等靶向基團或連接基團。表5A、表5B及表5C中所列之CFB RNAi藥劑雙螺旋體中之任一者(無論經修飾或未經修飾)可進一步包含靶向基團或連接基團,包括但不限於表6中描繪之彼等靶向基團或連接基團,且靶向基團或連接基團可連接至CFB RNAi藥劑雙螺旋體之有義股或反義股之3'或5'端。靶向基團及連接基團(其在組合時可形成靶向配位體)之實例提供於表6中。表4A、表4B及表5C提供具有連接至5'或3'端之靶向基團或連接基團的CFB RNAi藥劑有義股之某些實施例。 6.表示各種經修飾之核苷酸、靶向配位體或靶向基團、加帽殘基及連接基團之結構
當位於內部時:
當位於3'末端時:
當位於3'末端時: (invdA)
在表6中之以上結構中之各者中,NAG包含N-乙醯基-半乳糖胺。在一些實施例中,上表6中所描繪之NAG可包含對肝細胞上存在之去唾液酸糖蛋白受體具有親和力的另一半乳糖衍生物,一般熟習此項技術者將理解為鑒於以上結構及本文所提供之描述而連接。可使用此項技術中已知的其他連接基團。
在一些實施例中,遞送媒劑可用於將RNAi藥劑遞送至細胞或組織中。遞送媒劑為使RNAi藥劑遞送至細胞或組織得到改善之化合物。遞送媒劑可包括但不限於以下或由其組成:聚合物,諸如兩性聚合物、膜活性聚合物、肽、蜂毒素肽、蜂毒素樣肽(MLP)、脂質、經可逆修飾之聚合物或肽或經可逆修飾之膜活性多元胺。在一些實施例中,RNAi藥劑可與脂質、奈米粒子、聚合物、脂質體、微胞、DPC或此項技術中可用之其他遞送系統組合。RNAi藥劑亦可化學結合至靶向基團、脂質(包括但不限於膽固醇及膽固醇基衍生物)、奈米粒子、聚合物、脂質體、微胞、DPC (參見例如WO 2000/053722、WO 2008/0022309、WO 2011/104169及WO 2012/083185、WO 2013/032829、WO 2013/158141,其各自以引用之方式併入本文中)、水凝膠、環糊精、可生物降解奈米膠囊及生物黏附微球、蛋白質載體或此項技術中已知及可用的適用於核酸或寡核苷酸遞送的其他遞送系統。 醫藥組合物
本文所揭示之CFB RNAi藥劑可製備為醫藥組合物或調配物(在本文中亦稱為「藥物」)。在一些實施例中,醫藥組合物包括至少一種CFB RNAi藥劑。此等醫藥組合物尤其適用於抑制目標細胞、細胞群、組織或生物體中之目標mRNA之表現。
醫藥組合物可用於治療患有可因降低目標CFB mRNA含量或抑制目標基因表現而受益之疾病、病症或病狀的個體。醫藥組合物可用於治療處於患有可因降低目標mRNA含量或抑制目標基因表現而受益之疾病、病症、症狀或病狀之風險下的個體。在一個實施例中,該方法包括向所治療之個體投與連接至本文所描述之靶向配位體的CFB RNAi藥劑。在一些實施例中,將一或多種醫藥學上可接受之賦形劑(包括媒劑、載劑、稀釋劑及/或遞送聚合物)添加至包括CFB RNAi藥劑之醫藥組合物中,由此形成適用於活體內遞送至個體(包括人類)之醫藥調配物或藥物。
包括CFB RNAi藥劑之醫藥組合物及本文所揭示之方法降低細胞、細胞群、組織、器官或個體中之目標mRNA之含量,包括藉由向個體投與治療有效量的本文所描述之CFB RNAi藥劑,由此抑制個體中之CFB mRNA之表現或轉譯。在一些實施例中,個體先前已經鑑別或診斷為患有IgA腎病變(IgAN)、C3腎絲球病變(C3G)、免疫複合體介導之膜增生性絲球體腎炎(IC-MPGN)、狼瘡性腎炎(LN)、抗腎絲球基底膜病(抗GBM)、腎移植中之缺血再灌注損傷及T細胞介導之排斥反應(TCMR)、抗嗜中性白血球細胞質抗體(ANCA)相關血管炎、包括早期及/或中期年齡相關黃斑退化(AMD)之AMD、地圖樣萎縮(GA)、青光眼、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮、陣發性夜間血紅素尿症(PNH)、非典型溶血性尿毒性症候群(aHUS)、子癇前症、類風濕性關節炎(RA)及/或其他補體介導之疾病。在一些實施例中,個體將受益於個體之肝臟中CFB基因表現之降低。
在一些實施例中,所描述之包括CFB RNAi藥劑的醫藥組合物用於治療或控制與IgA腎病變、C3腎絲球病變及/或陣發性夜間血紅素尿症(PNH)相關之臨床表現。CFB RNAi藥劑可適用之其他疾病或病狀包括免疫複合體介導之膜增生性絲球體腎炎(IC-MPGN)、狼瘡性腎炎(LN)、抗腎絲球基底膜病(抗GBM)、腎移植中之缺血再灌注損傷及T細胞介導之排斥反應(TCMR)、抗嗜中性白血球細胞質抗體(ANCA)相關血管炎、包括早期及/或中期年齡相關黃斑退化(AMD)之AMD、地圖樣萎縮(GA)、青光眼、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮、非典型溶血性尿毒性症候群(aHUS)、子癇前症、類風濕性關節炎(RA)及/或其他補體介導之疾病。在一些實施例中,向需要此治療之個體投與治療(包括預防)有效量的一或多種醫藥組合物。在一些實施例中,投與所揭示之CFB RNAi藥劑中之任一者可用於降低個體之疾病症狀之數目、嚴重程度及/或頻率。
所描述之包括CFB RNAi藥劑之醫藥組合物可用於治療個體中之至少一種症狀,該個體患有可因降低或抑制CFB mRNA表現及/或降低CFB蛋白含量及/或降低替代補體路徑活性而受益之疾病或病症。量測CFB含量及替代補體路徑活性可根據此項技術中已知之現有方法進行,包括根據本文所闡述之實例中所描述之方法。
在一些實施例中,向個體投與治療有效量的一或多種包括CFB RNAi藥劑之醫藥組合物,由此治療症狀。在其他實施例中,向個體投與預防有效量的一或多種CFB RNAi藥劑,由此預防或抑制至少一種症狀。
投與途徑為藉以使CFB RNAi藥劑與身體接觸之路徑。一般而言,投與藥物及寡核苷酸及核酸來治療哺乳動物之方法為此項技術中所熟知的,且可應用該等方法來投與本文所描述之組合物。本文所揭示之CFB RNAi藥劑可以根據特定途徑適當定製的製劑形式經由任何適合的途徑投與。因此,本文所描述之醫藥組合物可藉由注射(例如靜脈內、肌肉內、皮內、皮下、關節內或腹膜內)投與。在一些實施例中,本文所描述之醫藥組合物經由皮下注射投與。
可使用此項技術中已知之寡核苷酸遞送技術,將包括本文所描述之CFB RNAi藥劑的醫藥組合物遞送至細胞、細胞群、組織或個體。一般而言,此項技術中公認用於遞送核酸分子(活體外或活體內)之任何適合方法皆適合與本文所描述之組合物一起使用。舉例而言,遞送可藉由以下實現:局部投與(例如直接注射、植入或表面投與)、全身性投與或皮下、靜脈內、腹膜內或非經腸途徑,包括顱內(例如室內、腦實質內及鞘內)、肌肉內、經皮、呼吸道(氣溶膠)、經鼻、經口、經直腸或表面(包括經頰及舌下)投與。在某些實施例中,組合物係藉由皮下或靜脈內輸注或注射投與。
在一些實施例中,本文所描述之醫藥組合物包含一或多種醫藥學上可接受之賦形劑。本文所描述之醫藥組合物經調配以用於向個體投與。
依本文所用,醫藥組合物或藥物包括藥理學有效量的所描述治療性化合物中之至少一者及一或多種醫藥學上可接受之賦形劑。醫藥學上可接受之賦形劑(賦形劑)為有意包括於藥物遞送系統中之除活性醫藥成分(API,治療性產品,例如CFB RNAi藥劑)外之物質。賦形劑在預定劑量下不發揮或不意欲發揮治療作用。賦形劑可用於a)在製造期間輔助加工藥物遞送系統,b)保護、支持或增強API之穩定性、生物可用性或患者接受性,c)輔助產物鑑別,及/或d)在儲存或使用期間增強API遞送之整體安全性、有效性之任何其他屬性。醫藥學上可接受之賦形劑可為或可不為惰性物質。
賦形劑包括但不限於:吸收增強劑、抗黏劑、抗起泡劑、抗氧化劑、黏合劑、緩衝劑、載劑、包衣劑、顏料、遞送增強劑、遞送聚合物、清潔劑、聚葡萄糖、右旋糖、稀釋劑、崩解劑、乳化劑、增量劑、填充劑、調味劑、滑動劑、保濕劑、潤滑劑、油狀物、聚合物、防腐劑、鹽水、鹽、溶劑、糖、界面活性劑、懸浮劑、持續釋放型基質、甜味劑、增稠劑、張力劑、媒劑、憎水劑及潤濕劑。
適用於可注射用途之醫藥組合物包括無菌水溶液(在可溶於水之情況下)或分散液及用於臨時製備無菌可注射溶液或分散液之無菌散劑。對於靜脈內投與,適合之載劑包括生理鹽水、抑菌水、Cremophor® ELTM (BASF, Parsippany, NJ)或磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)。適合載劑在製造及儲存條件下應為穩定的,且應針對微生物(諸如細菌及真菌)之污染作用加以保存。載劑可為含有例如水、乙醇、多元醇(例如甘油、丙二醇及液態聚乙二醇)及其適合混合物的溶劑或分散介質。舉例而言,可藉由使用包衣(諸如卵磷脂)、藉由維持就分散液而言所需粒徑及藉由使用界面活性劑來維持適當之流動性。在許多情況下,組合物中將較佳包括等張劑,例如糖、多元醇(諸如甘露糖醇、山梨糖醇)及氯化鈉。可藉由使組合物中包括延遲吸收之藥劑(例如單硬脂酸鋁及明膠)來實現可注射組合物之延長吸收。
無菌可注射溶液可藉由以下方法來製備:將所需量之活性化合物與上文所列舉之成分中之一者或組合併入適當溶劑中,接著視需要進行過濾滅菌。一般而言,藉由將活性化合物併入至含有鹼性分散介質及上文所列舉之彼等成分之所需其他成分的無菌媒劑中來製備分散液。在用於製備無菌可注射溶液之無菌散劑之情況下,製備方法包括真空乾燥及冷凍乾燥,其產生活性成分加來自其先前無菌過濾溶液之任何額外所需成分的散劑。
在一些實施例中,可在水性磷酸鈉緩衝液中製備包括本文所揭示之適用於皮下投與之CFB RNAi藥劑的醫藥調配物(例如在含0.5 mM磷酸二氫鈉、0.5 mM磷酸氫二鈉之水中調配的CFB RNAi藥劑)。在一些實施例中,可在注射用水(無菌水)中製備包括本文所揭示之適用於皮下投與之CFB RNAi藥劑的醫藥調配物。可在等張鹽水(0.9%)中製備本文所揭示之適用於皮下投與之CFB RNAi藥劑。
適用於關節內投與之調配物可呈藥物之無菌水性製劑形式,其可呈微晶形式,例如呈水性微晶懸浮液形式。脂質調配物或生物可降解聚合物系統亦可用於使藥物用於關節內及經眼投與。
亦可製備適用於經口投與本文所揭示之CFB RNAi藥劑的調配物。在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑係經口投與。在一些實施例中,本文所揭示之CFB RNAi藥劑調配於膠囊中以供經口投與。
活性化合物可用將防止化合物自體內快速排除之載劑製備,諸如控制釋放型調配物,包括植入物及微囊封遞送系統。可使用可生物降解的生物相容性聚合物,諸如乙烯乙酸乙烯酯、聚酸酐、聚乙醇酸、膠原蛋白、聚原酸酯及聚乳酸。用於製備此類調配物之方法對於熟習此項技術者將為顯而易見的。脂質體懸浮液亦可用作醫藥學上可接受之載劑。此等可根據熟習此項技術者已知之方法製備,例如依美國專利第4,522,811號中所描述。
就投與之容易性及劑量之均勻性而言,CFB RNAi藥劑可在組合物中以單位劑型形式調配。單位劑型係指適合作為單位劑量用於所治療之個體的物理離散單位;各單位含有經計算以與所需醫藥載劑結合產生所需治療效應的預定量之活性化合物。本發明之單位劑型之規格由以下因素規定且直接視以下因素而定:活性化合物之獨特特徵及欲達成之治療效應,及混配此類活性化合物用於治療個體之此項技術中固有的限制。
醫藥組合物可含有常見於醫藥組合物中之其他額外組分。此類額外組分包括但不限於:止癢劑、收斂劑、局部麻醉劑、鎮痛劑、抗組織胺或抗炎劑(例如乙醯胺苯酚、NSAID、苯海拉明(diphenhydramine)等)。亦設想表現或包含本文所定義之RNAi藥劑的細胞、組織或經分離之器官可用作「醫藥組合物」。依本文所用,「藥理學有效量」、「治療有效量」或簡稱「有效量」係指產生藥理學、治療性或預防性結果之RNAi藥劑之量。
在一些實施例中,除了投與本文所揭示之RNAi藥劑以外,本文所揭示之方法進一步包含投與第二治療劑或治療之步驟。在一些實施例中,第二治療劑為另一CFB RNAi藥劑(例如靶向CFB目標內之不同序列的CFB RNAi藥劑)。在其他實施例中,第二治療劑可為小分子藥物、抗體、抗體片段或適體。
在一些實施例中,所描述之一或多種CFB RNAi藥劑視情況與一或多種額外治療劑組合。CFB RNAi藥劑及一或多種額外治療劑可依單一組合物形式投與或其可分開投與。在一些實施例中,一或多種額外治療劑以單獨劑型形式與RNAi藥劑分開投與(例如CFB RNAi藥劑係藉由皮下注射投與,而治療給藥方案之方法中所涉及的額外治療劑係經口投與)。在一些實施例中,所描述之一或多種CFB RNAi藥劑經由皮下注射投與有需要之個體,且一或多種視情況選用之額外治療劑係經口投與,其一起提供用於與補體系統之失調相關之疾病及病狀的治療方案,該等疾病及病狀包括IgA腎病變(IgAN)、C3腎絲球病變(C3G)、免疫複合體介導之膜增生性絲球體腎炎(IC-MPGN)、狼瘡性腎炎(LN)、抗腎絲球基底膜病(抗GBM)、腎移植中之缺血再灌注損傷及T細胞介導之排斥反應(TCMR)、抗嗜中性白血球細胞質抗體(ANCA)相關血管炎、包括早期及/或中期年齡相關黃斑退化(AMD)之AMD、地圖樣萎縮(GA)、青光眼、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮、陣發性夜間血紅素尿症(PNH)、非典型溶血性尿毒性症候群(aHUS)、子癇前症、類風濕性關節炎(RA)及/或其他補體介導之疾病。在一些實施例中,所描述之一或多種CFB RNAi藥劑經由皮下注射投與有需要之個體,且一或多種視情況選用之額外治療劑經由分開的皮下注射投與。在一些實施例中,將CFB RNAi藥劑及一或多種額外治療劑合併為單一劑型(例如經調配為用於皮下注射之單一組合物的「混合物」)。CFB RNAi藥劑在具有或不具有一或多種額外治療劑之情況下可與一或多種賦形劑組合以形成醫藥組合物。
一般而言,CFB RNAi藥劑之有效量將在約0.1至約100 mg/kg體重/劑量之範圍內,例如約1.0至約50 mg/kg體重/劑量。在一些實施例中,活性化合物之有效量將在約0.25至約6 mg/kg體重/劑量之範圍內。在一些實施例中,活性成分之有效量將在約0.5至約5 mg/kg體重/劑量之範圍內。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑之有效量可為固定劑量。在一些實施例中,固定劑量在約5 mg至約1,000 mg CFB RNAi藥劑之範圍內。在一些實施例中,固定劑量在25至400 mg CFB RNAi藥劑之範圍內。視所投與之CFB RNAi藥劑之劑量、特定CFB RNAi藥劑之活性水平及特定個體之所需抑製程度而定,可每週、每兩週、每月、每季或以任何其他時間間隔進行給藥。本文中之實例顯示在某些動物物種中之適合的抑製程度。所投與之量將視諸如患者或個體之整體健康狀況、所遞送之化合物之相關生物學功效、藥物之調配物、調配物中賦形劑之存在及類型以及投與途徑的變數而定。此外,應理解,可提高所投與之初始劑量以超出以上上限含量而快速獲得所需血液含量或組織含量,或初始劑量可小於最佳值。
為了治療疾病或形成用於治療疾病的藥物或組合物,本文所描述之包括CFB RNAi藥劑的醫藥組合物可與賦形劑或第二治療劑或治療組合,包括但不限於:第二或其他RNAi藥劑、小分子藥物、抗體、抗體片段、肽及/或適體。
在添加至醫藥學上可接受之賦形劑或佐劑中時,所描述之CFB RNAi藥劑可封裝於套組、容器、包裝或分配器中。本文所描述之醫藥組合物可封裝於預填注射筒、筆式注射器、自動注射器、輸注袋/裝置或小瓶中。
在一些實施例中,CFB RNAi藥物物質以鹽、混合鹽或游離酸形式製備或提供。在一些實施例中,形式為鈉鹽。
在一些實施例中,用一或多種醫藥學上可接受之賦形劑調配CFB RNAi藥劑以形成適用於向人類個體投與之醫藥組合物。在一些實施例中,本文所描述之CFB RNAi藥劑以200 mg/mL調配於水性磷酸鈉緩衝液(0.5 mM磷酸二氫鈉、0.5 mM磷酸氫二鈉)中,其適用於在人類中皮下投與。 治療及抑制表現的方法
本文所揭示之CFB RNAi藥劑可用於治療患有可因投與RNAi藥劑而受益之疾病或病症的個體(例如人類或其他哺乳動物)。在一些實施例中,本文揭示之RNAi藥劑可用於治療可因降低及/或抑制CFB mRNA表現及/或CFB蛋白含量而受益之個體(例如人類),例如個體已診斷患有或罹患關於以下之症狀:IgA腎病變(IgAN)、C3腎絲球病變(C3G)、免疫複合體介導之膜增生性絲球體腎炎(IC-MPGN)、狼瘡性腎炎(LN)、抗腎絲球基底膜病(抗GBM)、腎移植中之缺血再灌注損傷及T細胞介導之排斥反應(TCMR)、抗嗜中性白血球細胞質抗體(ANCA)相關血管炎、包括早期及/或中期年齡相關黃斑退化(AMD)之AMD、地圖樣萎縮(GA)、青光眼、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮、陣發性夜間血紅素尿症(PNH)、非典型溶血性尿毒性症候群(aHUS)、子癇前症、類風濕性關節炎(RA)及/或其他補體介導之疾病。
在一些實施例中,向個體投與治療有效量的任一或多種CFB RNAi藥劑。個體之治療可包括治療性及/或預防性治療。向個體投與治療有效量的本文所描述之任一或多種CFB RNAi藥劑。個體可為成人、青年、兒童或嬰兒。可向人類或動物投與本文所描述之醫藥組合物。
本文所描述之CFB RNAi藥劑可用於治療患有CFB相關疾病或病症或患有至少部分由CFB基因表現介導之疾病或病症的個體之至少一種症狀。在一些實施例中,CFB RNAi藥劑用於治療或控制個體之臨床表現,該個體患有可因降低CFB mRNA或CFB蛋白含量及/或降低替代路徑補體活性而受益或至少部分由其介導之疾病或病症。向個體投與治療有效量的本文所描述之CFB RNAi藥劑或含CFB RNAi藥劑之組合物中之一或多者。在一些實施例中,本文所揭示之方法包含向所治療之個體投與包含本文所描述之CFB RNAi藥劑的組合物。在一些實施例中,向個體投與預防有效量的所描述之CFB RNAi藥劑中之任一或多者,由此藉由預防或抑制至少一種症狀來治療個體。
在某些實施例中,本發明提供治療有需要之患者之至少部分由CFB基因表現介導之疾病、病症、病狀或病理狀態的方法,其中該等方法包括向患者投與本文所描述之CFB RNAi藥劑中之任一者。
在一些實施例中,相對於投與CFB RNAi藥劑之前的個體或未接受CFB RNAi藥劑的個體,投與所描述之CFB RNAi藥劑的個體中之CFB基因的基因表現量及/或mRNA含量降低至少約30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、95%、96%、97%、98%、99%或大於99%。在個體之細胞、細胞群及/或組織中,個體之CFB mRNA含量可降低。在一些實施例中,相對於投與CFB RNAi藥劑之前的個體或未接受CFB RNAi藥劑的個體,CFB基因表現在肝細胞中被抑制至少約30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%或大於65%。
在一些實施例中,相對於投與CFB RNAi藥劑之前的個體或未接受CFB RNAi藥劑的個體,已投與所描述之CFB RNAi藥劑的個體中之CFB蛋白含量降低至少約30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或大於99%。在個體之細胞、細胞群、組織、血液及/或其他體液中,個體之蛋白質含量可降低。
CFB mRNA含量及CFB蛋白含量之降低可藉由此項技術中已知之任何方法評估。依本文所用,CFB mRNA含量及/或蛋白質含量之降低或減少在本文中統稱為CFB之降低或減少,或抑制或降低CFB之基因表現。本文所闡述之實例說明用於評估CFB基因表現之抑制的已知方法。一般熟習此項技術者將進一步知曉用於評估活體內及/或活體外CFB基因表現之抑制的適合方法。
在一些實施例中,相對於投與CFB RNAi藥劑之前的個體或未接受CFB RNAi藥劑的個體,已投與所描述之CFB RNAi藥劑之個體中的替代路徑補體活性降低至少約30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或大於99%。在個體之細胞、細胞群、組織、血液及/或其他體液中,個體之蛋白質含量可降低。
在一些實施例中,本文揭示治療(包括防治性或預防性治療)與補體系統之失調相關之疾病、病症或症狀的方法,該等疾病、病症或症狀包括IgA腎病變(IgAN)、C3腎絲球病變(C3G)、免疫複合體介導之膜增生性絲球體腎炎(IC-MPGN)、狼瘡性腎炎(LN)、抗腎絲球基底膜病(抗GBM)、腎移植中之缺血再灌注損傷及T細胞介導之排斥反應(TCMR)、抗嗜中性白血球細胞質抗體(ANCA)相關血管炎、包括早期及/或中期年齡相關黃斑退化(AMD)之AMD、地圖樣萎縮(GA)、青光眼、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮、陣發性夜間血紅素尿症(PNH)、非典型溶血性尿毒性症候群(aHUS)、子癇前症、類風濕性關節炎(RA)及/或其他補體介導之疾病(van Lookeren等人, 2016,Casiraghi等人, 2017,Wong及Kavanaugh 2018,Holers及Banda 2018,Poppelaars及Thurman 2020,Crowley等人, 2023,Blakey等人, 2023,Hoppe及Gregory-Ksander 2024),其中該等方法包括向有需要之個體投與治療有效量的CFB RNAi藥劑,其包括與具有表1中之序列的CFB mRNA部分至少部分互補的反義股。在一些實施例中,本文揭示治療(包括防治性或預防性治療)與補體系統之失調相關之疾病或症狀的方法,該等疾病或症狀包括IgA腎病變(IgAN)、C3腎絲球病變(C3G)、免疫複合體介導之膜增生性絲球體腎炎(IC-MPGN)、狼瘡性腎炎(LN)、抗腎絲球基底膜病(抗GBM)、腎移植中之缺血再灌注損傷及T細胞介導之排斥反應(TCMR)、抗嗜中性白血球細胞質抗體(ANCA)相關血管炎、包括早期及/或中期年齡相關黃斑退化(AMD)之AMD、地圖樣萎縮(GA)、青光眼、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮、陣發性夜間血紅素尿症(PNH)、非典型溶血性尿毒性症候群(aHUS)、子癇前症、類風濕性關節炎(RA)及/或其他補體介導之疾病(van Lookeren等人, 2016,Casiraghi等人, 2017,Wong及Kavanaugh 2018,Holers及Banda 2018,Poppelaars及Thurman 2020,Crowley等人, 2023,Blakey等人, 2023,Hoppe及Gregory-Ksander 2024),其中該等方法包括向有需要之個體投與治療有效量的CFB RNAi藥劑,該CFB RNAi藥劑包括反義股,其包含表2、表3或表5C中之序列中之任一者之序列,以及有義股,其包含表2、表4或表5C中之序列中之任一者,該有義股與該反義股至少部分互補。在一些實施例中,本文揭示治療(包括防治性或預防性治療)與補體系統之失調相關之疾病或症狀的方法,該等疾病或症狀包括IgA腎病變(IgAN)、C3腎絲球病變(C3G)、免疫複合體介導之膜增生性絲球體腎炎(IC-MPGN)、狼瘡性腎炎(LN)、抗腎絲球基底膜病(抗GBM)、腎移植中之缺血再灌注損傷及T細胞介導之排斥反應(TCMR)、抗嗜中性白血球細胞質抗體(ANCA)相關血管炎、包括早期及/或中期年齡相關黃斑退化(AMD)之AMD、地圖樣萎縮(GA)、青光眼、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮、陣發性夜間血紅素尿症(PNH)、非典型溶血性尿毒性症候群(aHUS)、子癇前症、類風濕性關節炎(RA)及/或其他補體介導之疾病(van Lookeren等人, 2016,Casiraghi等人, 2017,Wong及Kavanaugh 2018,Holers及Banda 2018,Poppelaars及Thurman 2020,Crowley等人, 2023,Blakey等人, 2023,Hoppe及Gregory-Ksander 2024),其中該等方法包括向有需要之個體投與治療有效量的CFB RNAi藥劑,該CFB RNAi藥劑包括有義股,其包含表2、表4A、表4B或表5C中之序列中之任一者,以及反義股,其包含表2、表3或表5C中之序列中之任一者之序列,該反義股與該有義股至少部分互補。
在一些實施例中,本文揭示用於抑制細胞中之CFB基因之表現的方法,其中該等方法包括向細胞投與包括反義股之CFB RNAi藥劑,該反義股與具有表1中之序列的CFB mRNA部分至少部分互補。在一些實施例中,本文揭示抑制細胞中之CFB基因之表現的方法,其中該等方法包括向細胞投與CFB RNAi藥劑,該CFB RNAi藥劑包括反義股,其包含表2、表3或表5C中之序列中之任一者之序列,以及有義股,其包含表2、表4A、表4B或表5C中之序列中之任一者,該有義股與該反義股至少部分互補。在一些實施例中,本文揭示抑制細胞中之CFB基因之表現的方法,其中該等方法包括投與CFB RNAi藥劑,該CFB RNAi藥劑包括有義股,其包含表2、表4A、表4B或表5C中之序列中之任一者,以及反義股,其包括表2、表3或表5C中之序列中之任一者之序列,該反義股與該有義股至少部分互補。
使用CFB RNAi藥劑提供治療性(包括防治性)治療與補體系統之失調相關之疾病/病症的方法,該等疾病/病症包括IgA腎病變(IgAN)、C3腎絲球病變(C3G)、免疫複合體介導之膜增生性絲球體腎炎(IC-MPGN)、狼瘡性腎炎(LN)、抗腎絲球基底膜病(抗GBM)、腎移植中之缺血再灌注損傷及T細胞介導之排斥反應(TCMR)、抗嗜中性白血球細胞質抗體(ANCA)相關血管炎、包括早期及/或中期年齡相關黃斑退化(AMD)之AMD、地圖樣萎縮(GA)、青光眼、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮、陣發性夜間血紅素尿症(PNH)、非典型溶血性尿毒性症候群(aHUS)、子癇前症、類風濕性關節炎(RA)及/或其他補體介導之疾病(van Lookeren等人, 2016,Casiraghi等人, 2017,Wong及Kavanaugh 2018,Holers及Banda 2018,Poppelaars及Thurman 2020,Crowley等人, 2023,Blakey等人, 2023,Hoppe及Gregory-Ksander 2024)。所描述之CFB RNAi藥劑介導RNA干擾以抑制產生CFB蛋白所需之一或多種基因之表現。CFB RNAi藥劑亦可用於治療或預防各種疾病、病症或病狀,包括IgA腎病變(IgAN)、C3腎絲球病變(C3G)、免疫複合體介導之膜增生性絲球體腎炎(IC-MPGN)、狼瘡性腎炎(LN)、抗腎絲球基底膜病(抗GBM)、腎移植中之缺血再灌注損傷及T細胞介導之排斥反應(TCMR)、抗嗜中性白血球細胞質抗體(ANCA)相關血管炎、包括早期及/或中期年齡相關黃斑退化(AMD)之AMD、地圖樣萎縮(GA)、青光眼、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮、陣發性夜間血紅素尿症(PNH)、非典型溶血性尿毒性症候群(aHUS)、子癇前症、類風濕性關節炎(RA)及/或其他補體介導之疾病(van Lookeren等人, 2016,Casiraghi等人, 2017,Wong及Kavanaugh 2018,Holers及Banda 2018,Poppelaars及Thurman 2020,Crowley等人, 2023,Blakey等人, 2023,Hoppe及Gregory-Ksander 2024)。此外,描述用於活體內將CFB RNAi藥劑遞送至肝臟細胞,且尤其遞送至肝細胞的組合物。 細胞、組織、器官及非人類生物體
涵蓋包括至少一種本文所描述之CFB RNAi藥劑的細胞、組織、器官及非人類生物體。該細胞、組織、器官或非人類生物體係藉由將該RNAi藥劑遞送至該細胞、組織、器官或非人類生物體而製得。
上文所提供的實施例及項目現藉由以下非限制性實例說明。 實例 實例 1. 合成 CFB RNAi 藥劑
根據以下通用程序合成表5A、表5B及表5C中所示之CFB RNAi藥劑雙螺旋體: A. 合成
根據寡核苷酸合成中所用之固相亞磷醯胺技術合成RNAi藥劑之有義股及反義股。此標準合成一般為此項技術中已知的。視規模而定,使用MerMade96E® (Bioautomation)、MerMade12® (Bioautomation)或OP Pilot 100 (GE Healthcare)。在由受控微孔玻璃(CPG,500 Å或600 Å,獲自Prime Synthesis, Aston, PA, USA)製成之固體載體上進行合成。將位於各別股之3'端處的單體連接至固體載體作為合成起點。所有RNA及2'-修飾之RNA亞磷醯胺均購自Thermo Fisher Scientific (Milwaukee, WI, USA)或Hongene Biotech (Shanghai, PRC)。2′-O-甲基亞磷醯胺包括以下:(5′-O-二甲氧基三苯甲基-N 6-(苯甲醯基)-2′-O-甲基-腺苷-3′-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙胺基)亞磷醯胺、5′-O-二甲氧基-三苯甲基-N 4-(乙醯基)-2′-O-甲基-胞苷-3′-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙基-胺基)亞磷醯胺、(5′-O-二甲氧基三苯甲基-N 2-(異丁醯基)-2′-O-甲基-鳥苷-3′-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙胺基)亞磷醯胺及5′-O-二甲氧基三苯甲基-2′-O-甲基-尿苷-3′-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙胺基)亞磷醯胺。2'-去氧-2'-氟-亞磷醯胺帶有與2'-O-甲基胺基酸酯相同之保護基。5′-(4,4′-二甲氧基三苯甲基)-2′,3′-開環-尿苷、2′-苯甲醯基-3′-[(2-氰基乙基)-(N,N-二異丙基)]-亞磷醯胺亦購自Thermo Fisher Scientific或Hongene Biotech。5′-二甲氧基三苯甲基-2′-O-甲基-肌苷-3′-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙胺基)亞磷醯胺係購自Glen Research (Virginia)或Hongene Biotech。根據國際專利申請公開案第WO 2017/214112號合成膦酸環丙酯亞磷醯胺(亦參見Altenhofer等人, Chem. Communications (Royal Soc. Chem.), 57(55):6808-6811 (2021年7月))。反向無鹼基(3'-O-二甲氧基三苯甲基-2'-去氧核糖-5'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙基胺基)亞磷醯胺係購自ChemGenes (Wilmington, MA, USA)或SAFC (St Louis, MO, USA)。5'-O-二甲氧基三苯甲基-N 2,N 6-(苯氧基乙酸酯)-2'-O-甲基-二胺基嘌呤-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙基胺基)亞磷醯胺係獲自ChemGenes或Hongene Biotech。
將含靶向配位體之亞磷醯胺溶解於無水二氯甲烷或無水乙腈(50 mM)中,同時將所有其他胺基酸酯溶解於無水乙腈(50 mM)中,或添加無水二甲基甲醯胺及分子篩(3Å)。使用5-苯甲硫基-1H-四唑(BTT,乙腈中之250 mM)或5-乙硫基-1H-四唑(ETT,乙腈中之250 mM)作為活化劑溶液。偶合時間為12分鐘(RNA)、15分鐘(靶向配位體)、90秒(2'OMe)及60秒(2'F)。為引入硫代磷酸酯鍵聯,使用100 mM 3-苯基1,2,4-二噻唑啉-5-酮(POS,獲自PolyOrg, Inc., Leominster, MA, USA)於無水乙腈中之溶液。以下實例中合成且測試之CFB RNAi藥劑雙螺旋體中之各者使用N-乙醯基-半乳糖胺作為表6中所表示之靶向配位體化學結構中之「NAG」。通常可根據Arrowhead Pharmaceuticals, Inc.之國際專利申請公開案第WO 2018/044350號合成(NAG37)及(NAG37)s靶向配位體亞磷醯胺化合物。 B. 載體結合之寡聚物之裂解及脫保護
在完成固相合成之後,在30℃下用40 wt.%甲胺水溶液與28%氫氧化銨溶液(Aldrich)之1:1體積溶液處理經乾燥之固體載體1.5小時。將溶液蒸發且固體殘餘物於水中復原(參見下文)。 C. 純化
使用TSKgel SuperQ-5PW 13 µm管柱及Shimadzu LC-8系統,藉由陰離子交換HPLC純化粗寡聚物。緩衝液A為20 mM Tris、5 mM EDTA,pH 9.0且含有20%乙腈,且緩衝液B與緩衝液A相同,其中添加有1.5 M氯化鈉。在260 nm下記錄UV痕量。匯集適當溶離份,隨後用經過濾之DI水或100 mM碳酸氫銨,pH 6.7及20%乙腈之操作緩衝液,使用由Sephadex G-25細粒封裝之GE Healthcare XK 26/40管柱藉由尺寸排阻HPLC來操作。 D. 黏接
藉由在1×磷酸鹽緩衝鹽水(Corning, Cellgro)中合併等莫耳RNA溶液(有義及反義)來混合互補股,以形成RNAi藥劑。將一些RNAi藥劑凍乾且儲存於-15℃至-25℃下。藉由在UV-Vis光譜儀上量測1×磷酸鹽緩衝鹽水中之溶液吸光度來測定雙螺旋體濃度。隨後將260 nm溶液吸光度乘以換算因數及稀釋因數以測定雙螺旋體濃度。所使用之換算因數為0.050 mg/(mL∙cm)或根據以實驗方式測定之消光係數計算。 實例 2. hCFB-SEAP 小鼠模型
為了評估某些RNAi藥劑之效能,使用hCFB-SEAP小鼠模型。藉由流體動力尾部靜脈注射,用質體對六至八週齡雌性C57BL/6白化小鼠進行活體內短暫轉染,在投與CFB RNAi藥劑或對照物之前至少15天投與質體。質體含有插入分泌型人類胎盤鹼性磷酸酶(SEAP)報導基因之3' UTR中之人類CFB序列(GenBank NM_001710.6 (SEQ ID NO: 1))。將含10 µg至50 µg含有CFB基因序列之質體的林格氏溶液(Ringer's Solution)以動物體重之10%的總體積經由尾部靜脈注射至小鼠中,以產生CFB-SEAP模型小鼠。依先前所描述(Zhang G等人「High levels of foreign gene expression in hepatocytes after tail vein injection of naked plasmid DNA.」Human Gene Therapy 1999 第10卷, 第1735-1737頁),將溶液透過27規格的針頭在5-7秒內注射。CFB RNAi藥劑對CFB序列之表現的抑制同時亦抑制了SEAP表現,此係藉由Phospha-Light™ SEAP報導基因分析系統(Invitrogen)量測。在處理之前,量測血清中之SEAP表現量且根據平均SEAP含量將小鼠分組。 分析:可在投與CFB RNAi藥劑之前及之後的不同時間量測SEAP含量。 i) 血清收集:用2-3%異氟醚麻醉小鼠且將血液樣品自頜下區域收集至血清分離管(Sarstedt AG & Co., Nümbrecht, Germany)中。使血液在環境溫度下凝固20分鐘。將管以8,000 ×g離心3分鐘以分離血清且儲存於4℃下。 ii) 血清 SEAP 含量:收集血清,且根據製造商說明書藉由Phospha-Light™ SEAP報導基因分析系統(Invitrogen)來進行量測。將各動物之血清SEAP含量相對於注射鹽水之小鼠對照組標準化,以考慮此模型中與處理不相關的CFB序列表現之降低。首先,將各動物在一時間點之SEAP含量除以該動物之處理前表現量(「處理前」),以測定「相對於處理前標準化」之表現比率。可藉由將個別動物「相對於處理前標準化」之比率除以標準鹽水對照組中所有小鼠「相對於處理前標準化」之平均比率而使在特定時間點之表現相對於對照組標準化。替代地,可僅藉由相對於處理前含量標準化來評估各動物之血清SEAP含量。 實例 3. CFB RNAi 藥劑在 hCFB-SEAP 小鼠中之活體內測試
使用以上實例2中所描述之hCFB-SEAP小鼠模型。根據下表7,在第1天,給與四隻(n=4)雌性C57bl/6白化小鼠每20 g體重200 μl之單次皮下(SQ)注射,其中含有3.0 mg/kg (mpk)之CFB RNAi藥劑或無CFB RNAi藥劑之鹽水以用作對照物。
7.實例3之CFB RNAi藥劑及給藥
組ID 給藥方案
1 (等張鹽水) 在第1天單次SQ注射
第2 (3.0 mg/kg AD12511) 在第1天單次SQ注射
第3 (3.0 mg/kg AD12524) 在第1天單次SQ注射
第4 (3.0 mg/kg AD12525) 在第1天單次SQ注射
第5 (3.0 mg/kg AD12526) 在第1天單次SQ注射
第6 (3.0 mg/kg AD12527) 在第1天單次SQ注射
第7 (3.0 mg/kg AD12528) 在第1天單次SQ注射
第8 (3.0 mg/kg AD12529) 在第1天單次SQ注射
第9 (3.0 mg/kg AD12530) 在第1天單次SQ注射
第10 (3.0 mg/kg AD12531) 在第1天單次SQ注射
第11 (3.0 mg/kg AD12532) 在第1天單次SQ注射
第12 (3.0 mg/kg AD12533) 在第1天單次SQ注射
第13 (3.0 mg/kg AD12534) 在第1天單次SQ注射
第14 (3.0 mg/kg AD12535) 在第1天單次SQ注射
第15 (3.0 mg/kg AD12536) 在第1天單次SQ注射
CFB RNAi藥劑中之各者包括表5A、表5B、表5C及表6中所示之與有義股之5´末端結合的N-乙醯基-半乳糖胺靶向配位體((NAG37)s),且在上文實例1中所描述之寡核苷酸合成製程期間作為亞磷醯胺化合物添加。
第2-15組中之CFB RNAi藥劑各自包括設計成藉由靶向上表5B中所闡述之CFB mRNA之特定位置而抑制CFB基因之表現的核苷酸序列。(關於所參考之CFB mRNA序列,參見例如SEQ ID NO:1及表2)。特定言之,第2組(AD12521)包括設計成用於抑制CFB基因轉錄物之位置992處表現的核苷酸序列;第3組(AD12524)包括設計成用於抑制CFB基因轉錄物之位置495處表現的核苷酸序列;第4組(AD12525)包括設計成用於抑制CFB基因轉錄物之位置778處表現的核苷酸序列;第5組(AD12526)包括設計成用於抑制CFB基因轉錄物之位置781處表現的核苷酸序列;第6組(AD12527)包括設計成用於抑制CFB基因轉錄物之位置784處表現的核苷酸序列;第7組(AD12528)包括設計成用於抑制CFB基因轉錄物之位置845處表現的核苷酸序列;第8組(AD12529)包括設計成用於抑制CFB基因轉錄物之位置927處表現的核苷酸序列;第9組(AD12530)包括設計成用於抑制CFB基因轉錄物之位置934處表現的核苷酸序列;第10組(AD12531)包括設計成用於抑制CFB基因轉錄物之位置954處表現的核苷酸序列;第11組(AD12532)包括設計成用於抑制CFB基因轉錄物之位置990處表現的核苷酸序列;第12組(AD12533)包括設計成用於抑制CFB基因轉錄物之位置1019處表現的核苷酸序列;第13組(AD12534)包括設計成用於抑制CFB基因轉錄物之位置1030處表現的核苷酸序列;第14組(AD12535)包括設計成用於抑制CFB基因轉錄物之位置1206處表現的核苷酸序列;及第15組(AD12536)包括設計成用於抑制CFB基因轉錄物之位置1315處表現的核苷酸序列。
在皮膚與肌肉之間進行注射(亦即,皮下注射),注射至頸部及肩部區域上之鬆弛皮膚中。各組測試四(4)隻小鼠(n=4)。在第8天、第15天及第22天收集血清,且根據以上實例2中所闡述之程序測定SEAP表現量。來自實驗之資料示於下表8中,其中平均SEAP反映SEAP之標準化平均值。
8.實例3之CFB-SEAP小鼠中相對於處理前及鹽水對照標準化之平均SEAP。
8 15
ID 平均 SEAP 標準差 (+/-) 平均 SEAP 標準差 (+/-)
1 (等張鹽水) 1.000 0.101 1.000 0.155
2 (3.0 mg/kg AD12511) 0.823 0.244 0.952 0.333
3 (3.0 mg/kg AD12524) 0.778 0.150 0.845 0.156
4 (3.0 mg/kg AD12525) 1.013 0.206 1.098 0.105
5 (3.0 mg/kg AD12526) 0.847 0.131 0.740 0.228
6 (3.0 mg/kg AD12527) 1.117 0.406 0.679 0.215
7 (3.0 mg/kg AD12528) 0.868 0.312 1.260 0.360
8 (3.0 mg/kg AD12529) 0.589 0.283 0.896 0.186
9 (3.0 mg/kg AD12530) 1.023 0.137 1.428 0.242
10 (3.0 mg/kg AD12531) 0.894 0.159 0.881 0.103
11 (3.0 mg/kg AD12532) 0.895 0.205 0.616 0.163
12 (3.0 mg/kg AD12533) 1.072 0.081 1.169 0.103
13 (3.0 mg/kg AD12534) 0.936 0.146 1.153 0.204
14 (3.0 mg/kg AD12535) 0.885 0.057 1.059 0.105
15 (3.0 mg/kg AD12536) 0.778 0.150 0.632 0.088
22
ID 平均 SEAP 標準差 (+/-)
1 (等張鹽水) 1.000 0.155
2 (3.0 mg/kg AD12511) 0.853 0.376
3 (3.0 mg/kg AD12524) 1.191 0.251
4 (3.0 mg/kg AD12525) 0.758 0.140
5 (3.0 mg/kg AD12526) 0.960 0.405
6 (3.0 mg/kg AD12527) 0.656 0.290
7 (3.0 mg/kg AD12528) 1.056 0.375
8 (3.0 mg/kg AD12529) 0.713 0.275
9 (3.0 mg/kg AD12530) 1.044 0.108
10 (3.0 mg/kg AD12531) 0.829 0.184
11 (3.0 mg/kg AD12532) 0.486 0.155
12 (3.0 mg/kg AD12533) 1.097 0.154
13 (3.0 mg/kg AD12534) 1.003 0.209
14 (3.0 mg/kg AD12535) 0.860 0.201
15 (3.0 mg/kg AD12536) 0.526 0.110
依上文所示,若干所測試之CFB RNAi藥劑組顯示極少、甚至無抑制。在第8天,相比於鹽水對照組(第1組),第8組(AD12529,CFB基因之靶向位置927)顯示SEAP之最大降低,約41%降低(0.589)。在第22天,在此hCFB-SEAP小鼠模型中,第11組(AD12532,CFB基因之靶向位置990)及第15組(AD12536,CFB基因之靶向位置1315)分別顯示約51% (0.486)及43% (0.526)之降低。 實例 4. CFB RNAi 藥劑在 hCFB-SEAP 小鼠中之活體內測試
使用以上實例2中所描述之hCFB-SEAP小鼠模型。根據下表9,在第1天,給與四隻(n=4)雌性C57bl/6白化小鼠每20 g體重200 μl之單次皮下(SQ)注射,其中含有3.0 mg/kg (mpk)之CFB RNAi藥劑或無CFB RNAi藥劑之鹽水以用作對照物。
9.實例3之CFB RNAi藥劑及給藥
組ID 給藥方案
1 (等張鹽水) 在第1天單次SQ注射
第2 (3.0 mg/kg AD12536) 在第1天單次SQ注射
第3 (3.0 mg/kg AD13946) 在第1天單次SQ注射
第4 (3.0 mg/kg AD13947) 在第1天單次SQ注射
第5 (3.0 mg/kg AD13948) 在第1天單次SQ注射
第6 (3.0 mg/kg AD13949) 在第1天單次SQ注射
第7 (3.0 mg/kg AD13950) 在第1天單次SQ注射
第8 (3.0 mg/kg AD13953) 在第1天單次SQ注射
第9 (3.0 mg/kg AD13954) 在第1天單次SQ注射
第10 (3.0 mg/kg AD13955) 在第1天單次SQ注射
第11 (3.0 mg/kg AD13956) 在第1天單次SQ注射
第12 (3.0 mg/kg AD13957) 在第1天單次SQ注射
第13 (3.0 mg/kg AD13958) 在第1天單次SQ注射
CFB RNAi藥劑中之各者包括表5A、表5B、表5C及表6中所示之與有義股之5´末端結合的N-乙醯基-半乳糖胺靶向配位體((NAG37)s),且在上文實例1中所描述之寡核苷酸合成製程期間作為亞磷醯胺化合物添加。
第2-13組中之CFB RNAi藥劑中之各者包括設計成藉由靶向上表5B中所闡述之CFB mRNA之位置1315而抑制CFB基因之表現,但應用不同化學修飾的核苷酸序列。(關於所參考之CFB mRNA序列,參見例如SEQ ID NO:1及表2)。
在皮膚與肌肉之間進行注射(亦即,皮下注射),注射至頸部及肩部區域上之鬆弛皮膚中。各組測試四(4)隻小鼠(n=4)。在第8天及第15天收集血清,且根據以上實例2中所闡述之程序測定SEAP表現量。來自實驗之資料示於下表10中,其中平均SEAP反映SEAP之標準化平均值。
10.實例3之CFB-SEAP小鼠中相對於處理前及鹽水對照標準化之平均SEAP。
8 15
ID 平均 SEAP 標準差 (+/-) 平均 SEAP 標準差 (+/-)
1 (等張鹽水) 1.000 0.176 1.000 0.378
2 (3.0 mg/kg AD12536) 0.432 0.117 0.531 0.078
3 (3.0 mg/kg AD13946) 0.557 0.107 0.421 0.066
4 (3.0 mg/kg AD13947) 0.458 0.074 0.540 0.083
5 (3.0 mg/kg AD13948) 0.677 0.097 0.804 0.426
6 (3.0 mg/kg AD13949) 0.600 0.038 0.548 0.217
7 (3.0 mg/kg AD13950) 0.623 0.103 0.588 0.157
8 (3.0 mg/kg AD13953) 0.622 0.081 0.655 0.066
9 (3.0 mg/kg AD13954) 0.574 0.093 0.462 0.100
10 (3.0 mg/kg AD13955) 0.562 0.075 0.468 0.112
11 (3.0 mg/kg AD13956) 0.495 0.062 0.645 0.409
12 (3.0 mg/kg AD13957) 0.560 0.076 0.511 0.109
13 (3.0 mg/kg AD13958) 0.506 0.060 0.539 0.127
依上所示,所測試之CFB RNAi藥劑中之各者在hCFB-SEAP小鼠模型中呈活性,具有約30%至約58%緘默活性。 實例 5. CFB RNAi 藥劑在野生型小鼠中之活體內測試
某些CFB RNAi藥劑與小鼠CFB基因轉錄物具有足夠同源性,使其適合於檢查野生型小鼠中之CFB基因表現抑制活性。根據下表11,在第1天,給與六至八週齡雄性C57bl/6小鼠200 μl/20 g動物重量之單次皮下投與,其中含有2.0 mg/kg (mpk)之在等張鹽水中調配之CFB RNAi藥劑或媒劑對照物(無RNAi藥劑之等張鹽水)。
11.實例5之靶向位置及給藥組
群組 靶向基因位置 ( SEQ ID NO: 1 ) RNAi 藥劑及劑量 給藥方案
1 N/A 鹽水(無RNAi藥劑) 在第1天單次SQ注射
2 936 2.0 mg/kg AD12080 在第1天單次SQ注射
3 937 2.0 mg/kg AD12081 在第1天單次SQ注射
4 938 2.0 mg/kg AD12082 在第1天單次SQ注射
5 939 2.0 mg/kg AD12083 在第1天單次SQ注射
6 941 2.0 mg/kg AD12084 在第1天單次SQ注射
7 945 2.0 mg/kg AD12085 在第1天單次SQ注射
8 949 2.0 mg/kg AD12086 在第1天單次SQ注射
9 1547 2.0 mg/kg AD12087 在第1天單次SQ注射
10 1667 2.0 mg/kg AD12088 在第1天單次SQ注射
11 2255 2.0 mg/kg AD12089 在第1天單次SQ注射
12 2394 2.0 mg/kg AD12094 在第1天單次SQ注射
13 2395 2.0 mg/kg AD12095 在第1天單次SQ注射
14 2399 2.0 mg/kg AD12099 在第1天單次SQ注射
CFB RNAi藥劑中之各者包括在有義股之5'末端處結合至靶向配位體的經修飾之核苷酸,該靶向配位體包括具有本文雙螺旋體結構中所闡述之經修飾之序列的三個N-乙醯基-半乳糖胺基團(三齒配位體)。(關於與包括(NAG37)s配位體之CFB RNAi藥劑相關的特定修飾及結構資訊,參見表3、表4、表5A、表5B、表5C及表6)。第2-14組中之CFB RNAi藥劑各自包括核苷酸序列,儘管亦與小鼠CFB基因轉錄物同源,但該等核苷酸序列被設計成用於抑制人類CFB基因在上表11中所指出之特定位置處的表現。(關於所參考之CFB基因,亦參見SEQ ID NO:1及表2)。
在皮膚與肌肉之間進行注射(亦即,皮下注射),注射至頸部及肩部區域上之鬆弛皮膚中。各組測試四(4)隻小鼠(n=4)。在研究第8天將小鼠安樂死,且在收集及均質化之後自兩個肝及兩隻眼睛分離總RNA。小鼠CFB mRNA表現係藉由基於探針之定量PCR進行定量,相對於小鼠β-肌動蛋白表現標準化,且表示為媒劑對照組之分數(幾何平均值,+/- 95%信賴區間)。
12.實例5中在處死時(第8天)小鼠肝臟中之平均相對小鼠CFB mRNA
組ID 平均相對 mCFB mRNA ( 誤差 ) ( 誤差 )
1 (等張鹽水) 1.000 0.102 0.113
第2 (2.0 mg/kg AD12080) 1.297 0.160 0.182
第3 (2.0 mg/kg AD12081) 0.870 0.103 0.116
第4 (2.0 mg/kg AD12082) 1.064 0.071 0.076
第5 (2.0 mg/kg AD12083) 1.069 0.099 0.109
第6 (2.0 mg/kg AD12084) 0.707 0.097 0.113
第7 (2.0 mg/kg AD12085) 0.681 0.041 0.044
第8 (2.0 mg/kg AD12086) 0.632 0.107 0.129
第9 (2.0 mg/kg AD12087) 0.355 0.010 0.010
第10 (2.0 mg/kg AD12088) 0.305 0.027 0.030
第11 (2.0 mg/kg AD12089) 0.812 0.100 0.114
第12 (2.0 mg/kg AD12094) 0.434 0.066 0.077
第13 (2.0 mg/kg AD12095) 0.698 0.119 0.143
第14 (2.0 mg/kg AD12096) 0.213 0.021 0.023
相對於等張鹽水處理之組(第1組)標準化資料。依上表12中所示,CFB RNAi藥劑(第2-14組)中之各者顯示mCFB mRNA在肝臟中降低。特定言之,第10組(AD12088,CFB基因之靶向位置1667)及第14組(AD12096,CFB基因之靶向位置2399)顯示mCFB mRNA在第8天得到尤其穩定的抑制,其中兩者均在肝臟(分別為約70% (0.305)及約79% (0.213))及眼睛(分別為約73% (0.268)及約77% (0.227))中達成約70%或更高的緘默活性。
為了證實減弱資料之一致性,再分析某些測試之CFB RNAi藥劑的肝臟樣品,依下表14中所示:
14.實例5中在處死時(第8天)小鼠肝臟中之平均相對小鼠CFB mRNA (第2輪)
組ID 平均相對 mCFB mRNA ( 誤差 ) ( 誤差 )
1 (等張鹽水) 1.000 0.051 0.053
第4 (2.0 mg/kg AD12082) 1.041 0.077 0.084
第8 (2.0 mg/kg AD12086) 0.685 0.101 0.118
第10 (2.0 mg/kg AD12088) 0.341 0.041 0.046
第14 (2.0 mg/kg AD12096) 0.242 0.018 0.019
表14中之資料與表12中之資料一致,其中第10組(AD12088,CFB基因之靶向位置1667)及第14組(AD012096,CFB基因之靶向位置2399)之CFB RNAi藥劑顯示CFB基因表現之尤其穩定的抑制活性,而第4組(AD12082,靶向CFB基因之位置938)之RNAi藥劑相比於鹽水對照未顯示抑制。 實例 6. CFB RNAi 藥劑在野生型小鼠中之活體內測試
根據下表15,在第1天,給與六至八週齡雄性C57bl/6小鼠200 μl/20 g動物重量之單次皮下投與,其中含有1.0 mg/kg (mpk)之在等張鹽水中調配之CFB RNAi藥劑或媒劑對照物(無RNAi藥劑之等張鹽水)。
15.實例6之靶向位置及給藥組
群組 靶向基因位置 ( SEQ ID NO: 1 ) RNAi 藥劑及劑量 給藥方案
1 N/A 鹽水(無RNAi藥劑) 在第1天單次SQ注射
2 2399 1.0 mg/kg AD12096 在第1天單次SQ注射
3 2399 1.0 mg/kg AD12495 在第1天單次SQ注射
4 2399 1.0 mg/kg AD12496 在第1天單次SQ注射
5 2399 1.0 mg/kg AD12497 在第1天單次SQ注射
6 2399 1.0 mg/kg AD12498 在第1天單次SQ注射
7 2399 1.0 mg/kg AD12499 在第1天單次SQ注射
8 2399 1.0 mg/kg AD12500 在第1天單次SQ注射
9 2399 1.0 mg/kg AD12501 在第1天單次SQ注射
10 2399 1.0 mg/kg AD12502 在第1天單次SQ注射
11 2399 1.0 mg/kg AD12503 在第1天單次SQ注射
12 2399 1.0 mg/kg AD12504 在第1天單次SQ注射
13 2399 1.0 mg/kg AD12505 在第1天單次SQ注射
14 2399 1.0 mg/kg AD12506 在第1天單次SQ注射
15 2399 1.0 mg/kg AD12507 在第1天單次SQ注射
16 2399 1.0 mg/kg AD12508 在第1天單次SQ注射
17 2399 1.0 mg/kg AD12509 在第1天單次SQ注射
CFB RNAi藥劑中之各者包括在有義股之5'末端處結合至靶向配位體的經修飾之核苷酸,該靶向配位體包括具有本文雙螺旋體結構中所闡述之經修飾之序列的三個N-乙醯基-半乳糖胺基團(三齒配位體)。(關於與包括(NAG37)s配位體之CFB RNAi藥劑相關的特定修飾及結構資訊,參見表3、表4、表5A、表5B、表5C及表6)。第2-17組中之CFB RNAi藥劑各自包括核苷酸序列,儘管亦與小鼠CFB基因轉錄物同源,但該等核苷酸序列被設計成用於抑制人類CFB基因在上表15中所指出之CFB基因之位置2399處的表現,但具有不同化學修飾。(關於所參考之CFB基因,亦參見SEQ ID NO:1及表2)。
在皮膚與肌肉之間進行注射(亦即,皮下注射),注射至頸部及肩部區域上之鬆弛皮膚中。各組測試四(4)隻小鼠(n=4)。在研究第15天將小鼠安樂死,且在收集及均質化之後自兩個肝分離總RNA。小鼠CFB mRNA表現係藉由基於探針之定量PCR進行定量,相對於小鼠β-肌動蛋白表現標準化,且表示為媒劑對照組之分數(幾何平均值,+/- 95%信賴區間)。 16.實例6中在處死時(第15天)小鼠肝臟中之平均相對小鼠CFB mRNA
組ID 平均相對 mCFB mRNA ( 誤差) ( 誤差)
1 (等張鹽水) 1.000 0.152 0.180
第2 (1.0 mg/kg AD12096) 0.404 0.072 0.087
第3 (1.0 mg/kg AD12495) 0.400 0.038 0.042
第4 (1.0 mg/kg AD12496) 0.253 0.062 0.082
第5 (1.0 mg/kg AD12497) 0.420 0.025 0.027
第6 (1.0 mg/kg AD12498) 0.285 0.054 0.066
第7 (1.0 mg/kg AD12499) 0.410 0.031 0.033
第8 (1.0 mg/kg AD12500) 0.371 0.124 0.186
第9 (1.0 mg/kg AD12501) 0.472 0.039 0.042
第10 (1.0 mg/kg AD12502) 0.268 0.097 0.153
第11 (1.0 mg/kg AD12503) 0.506 0.034 0.036
第12 (1.0 mg/kg AD12504) 0.320 0.095 0.135
第13 (1.0 mg/kg AD12505) 0.260 0.037 0.043
第14 (1.0 mg/kg AD12506) 0.243 0.025 0.028
第15 (1.0 mg/kg AD12507) 0.285 0.009 0.009
第16 (1.0 mg/kg AD12508) 0.274 0.030 0.034
第17 (1.0 mg/kg AD12509) 0.257 0.037 0.044
相對於鹽水處理組(第1組)標準化資料。依上表16中所示,全部靶向CFB基因之位置2399的CFB RNAi藥劑(第2-17組)中之各者顯示在肝臟中之實質性mCFB mRNA降低,其中所有CFB RNAi藥劑顯示約50%減弱或更大,其中最強效CFB RNAi藥劑在第15天顯示約75% mCFB mRNA減弱。 實例 7. CFB RNAi 藥劑在野生型小鼠中之活體內測試
根據下表17,在第1天,給與六至八週齡雄性C57bl/6小鼠200 μl/20 g動物重量之單次皮下投與,其中含有1.0 mg/kg (mpk)之在等張鹽水中調配之CFB RNAi藥劑或媒劑對照物(無RNAi藥劑之等張鹽水)。 17.實例7之靶向位置及給藥組
群組 靶向基因位置 ( SEQ ID NO: 1 ) RNAi 藥劑及劑量 給藥方案
1 N/A 鹽水(無RNAi藥劑) 在第1天單次SQ注射
2 1667 1.0 mg/kg AD12088 在第1天單次SQ注射
3 1667 1.0 mg/kg AD12550 在第1天單次SQ注射
4 1667 1.0 mg/kg AD12551 在第1天單次SQ注射
5 1667 1.0 mg/kg AD12552 在第1天單次SQ注射
6 1667 1.0 mg/kg AD12553 在第1天單次SQ注射
7 1667 1.0 mg/kg AD12554 在第1天單次SQ注射
8 1667 1.0 mg/kg AD12555 在第1天單次SQ注射
9 1667 1.0 mg/kg AD12556 在第1天單次SQ注射
10 1667 1.0 mg/kg AD12557 在第1天單次SQ注射
11 1667 1.0 mg/kg AD12558 在第1天單次SQ注射
12 1667 1.0 mg/kg AD12559 在第1天單次SQ注射
13 1667 1.0 mg/kg AD12560 在第1天單次SQ注射
14 1667 1.0 mg/kg AD12561 在第1天單次SQ注射
15 1667 1.0 mg/kg AD12562 在第1天單次SQ注射
16 1667 1.0 mg/kg AD12563 在第1天單次SQ注射
17 1667 1.0 mg/kg AD12564 在第1天單次SQ注射
CFB RNAi藥劑中之各者包括在有義股之5'末端處結合至靶向配位體的經修飾之核苷酸,該靶向配位體包括具有本文雙螺旋體結構中所闡述之經修飾之序列的三個N-乙醯基-半乳糖胺基團(三齒配位體)。(關於與包括(NAG37)s配位體之CFB RNAi藥劑相關的特定修飾及結構資訊,參見表3、表4、表5A、表5B、表5C及表6)。第2-17組中之CFB RNAi藥劑各自包括核苷酸序列,儘管亦與小鼠CFB基因轉錄物同源,但該等核苷酸序列被設計成用於抑制人類CFB基因在上表17中所指出之CFB基因之位置1667處的表現,但具有不同化學修飾。(關於所參考之CFB基因,亦參見SEQ ID NO:1及表2)。
在皮膚與肌肉之間進行注射(亦即,皮下注射),注射至頸部及肩部區域上之鬆弛皮膚中。每組測試四(4)隻小鼠(n=4),除了僅測試三隻小鼠(n=3)之第8組(AD12555)及第15組(AD12562)。在研究第15天將小鼠安樂死,且在收集及均質化之後自兩個肝分離總RNA。小鼠CFB mRNA表現係藉由基於探針之定量PCR進行定量,相對於小鼠β-肌動蛋白表現標準化,且表示為媒劑對照組之分數(幾何平均值,+/- 95%信賴區間)。 18.實例7中在處死時(第15天)小鼠肝臟中之平均相對小鼠CFB mRNA
組ID 平均相對 mCFB mRNA ( 誤差) ( 誤差)
1 (等張鹽水) 1.000 0.220 0.282
第2 (1.0 mg/kg AD12088) 0.404 0.335 0.602
第3 (1.0 mg/kg AD12550) 0.358 0.049 0.055
第4 (1.0 mg/kg AD12551) 0.274 0.057 0.071
第5 (1.0 mg/kg AD12552) 0.206 0.128 0.211
第6 (1.0 mg/kg AD12553) 0.350 0.081 0.111
第7 (1.0 mg/kg AD12554) 0.341 0.215 0.378
第8 (1.0 mg/kg AD12555) 0.415 0.114 0.153
第9 (1.0 mg/kg AD12556) 0.597 0.055 0.062
第10 (1.0 mg/kg AD12557) 1.881 0.207 0.373
第11 (1.0 mg/kg AD12558) 0.626 0.034 0.039
第12 (1.0 mg/kg AD12559) 0.266 0.017 0.020
第13 (1.0 mg/kg AD12560) 0.1408 0.046 0.068
第14 (1.0 mg/kg AD12561) 0.395 0.028 0.033
第15 (1.0 mg/kg AD12562) 0.577 0.048 0.063
第16 (1.0 mg/kg AD12563) 0.2394 0.030 0.035
第17 (1.0 mg/kg AD12564) 0.315 0.026 0.032
相對於鹽水處理組(第1組)標準化資料。依上表18中所示,除第2組(AD12088)以外之全部靶向CFB基因之位置1667的CFB RNAi藥劑中之各者顯示在肝臟中之實質性mCFB mRNA降低,第10組除外,其中第3-17組中之所有CFB RNAi藥劑顯示約50%減弱或更大,其中最強效CFB RNAi藥劑在第15天顯示接近80% mCFB mRNA減弱(參見例如第4組(AD12551,顯示約72%減弱(0.274))、第5組(AD12552,顯示約80%減弱(0.206));第12組(AD12559,顯示約73%減弱(0.266))等)。 實例 8. CFB RNAi 藥劑在野生型小鼠中之活體內測試
根據下表19,在第1天,給與六至八週齡雄性C57bl/6小鼠200 μl/20 g動物重量之單次皮下投與,其中含有0.5 mg/kg (mpk)之在等張鹽水中調配之CFB RNAi藥劑或媒劑對照物(無RNAi藥劑之等張鹽水)。 19.實例8之靶向位置及給藥組
群組 靶向基因位置 ( SEQ ID NO: 1 ) RNAi 藥劑及劑量 給藥方案
1 N/A 鹽水(無RNAi藥劑) 在第1天單次SQ注射
2 2399 0.5 mg/kg AD12496 在第1天單次SQ注射
3 2399 0.5 mg/kg AD12502 在第1天單次SQ注射
4 2399 0.5 mg/kg AD12505 在第1天單次SQ注射
5 2399 0.5 mg/kg AD12506 在第1天單次SQ注射
6 2399 0.5 mg/kg AD12508 在第1天單次SQ注射
7 2399 0.5 mg/kg AD12964 在第1天單次SQ注射
8 2399 0.5 mg/kg AD12965 在第1天單次SQ注射
9 2399 0.5 mg/kg AD12966 在第1天單次SQ注射
10 2399 0.5 mg/kg AD12967 在第1天單次SQ注射
11 2399 0.5 mg/kg AD12968 在第1天單次SQ注射
12 2399 0.5 mg/kg AD12969 在第1天單次SQ注射
13 2399 0.5 mg/kg AD12970 在第1天單次SQ注射
14 2399 0.5 mg/kg AD12971 在第1天單次SQ注射
15 2399 0.5 mg/kg AD12096 在第1天單次SQ注射
CFB RNAi藥劑中之各者包括在有義股之5'末端處結合至靶向配位體的經修飾之核苷酸,該靶向配位體包括具有本文雙螺旋體結構中所闡述之經修飾之序列的三個N-乙醯基-半乳糖胺基團(三齒配位體)。(關於與包括(NAG37)s配位體之CFB RNAi藥劑相關的特定修飾及結構資訊,參見表3、表4、表5A、表5B、表5C及表6)。第2-15組中之CFB RNAi藥劑各自包括核苷酸序列,儘管亦與小鼠CFB基因轉錄物同源,但該等核苷酸序列被設計成用於抑制人類CFB基因在上表19中所指出之CFB基因之位置2399處的表現,但具有不同化學修飾。(關於所參考之CFB基因,亦參見SEQ ID NO:1及表2)。
在皮膚與肌肉之間進行注射(亦即,皮下注射),注射至頸部及肩部區域上之鬆弛皮膚中。各組測試四(4)隻小鼠(n=4)。在研究第15天將小鼠安樂死,且在收集及均質化之後自兩個肝分離總RNA。小鼠CFB mRNA表現係藉由基於探針之定量PCR進行定量,相對於小鼠β-肌動蛋白表現標準化,且表示為媒劑對照組之分數(幾何平均值,+/- 95%信賴區間)。 20.實例8中在處死時(第15天)小鼠肝臟中之平均相對小鼠CFB mRNA
組ID 平均相對 mCFB mRNA ( 誤差) ( 誤差)
1 (等張鹽水) 1.000 0.148 0.174
第2 (0.5 mg/kg AD12496) 0.453 0.050 0.056
第3 (0.5 mg/kg AD12502) 0.539 0.091 0.110
第4 (0.5 mg/kg AD12505) 0.540 0.057 0.063
第5 (0.5 mg/kg AD12506) 0.487 0.043 0.047
第6 (0.5 mg/kg AD12508) 0.507 0.084 0.100
第7 (0.5 mg/kg AD12964) 0.387 0.044 0.049
第8 (0.5 mg/kg AD12965) 0.596 0.054 0.059
第9 (0.5 mg/kg AD12966) 0.445 0.032 0.035
第10 (0.5 mg/kg AD12967) 0.684 0.083 0.094
第11 (0.5 mg/kg AD12968) 0.436 0.043 0.048
第12 (0.5 mg/kg AD12969) 0.692 0.131 0.162
第13 (0.5 mg/kg AD12970) 0.551 0.054 0.059
第14 (0.5 mg/kg AD12971) 0.762 0.074 0.082
第15 (0.5 mg/kg AD12096) 0.688 0.174 0.233
相對於鹽水處理組(第1組)標準化資料。依上表20中所示,全部靶向CFB基因之位置2399的CFB RNAi藥劑中之各者顯示肝臟中之mCFB mRNA降低。 實例 9. CFB RNAi 藥劑在野生型小鼠中之活體內測試
根據下表21,在第1天,給與六至八週齡雄性C57bl/6小鼠200 μl/20 g動物重量之單次皮下投與,其中含有0.5 mg/kg (mpk)之在等張鹽水中調配之CFB RNAi藥劑或媒劑對照物(無RNAi藥劑之等張鹽水)。 21.實例9之靶向位置及給藥組
群組 靶向基因位置 ( SEQ ID NO: 1 ) RNAi 藥劑及劑量 給藥方案
1 N/A 鹽水(無RNAi藥劑) 在第1天單次SQ注射
2 1667 0.5 mg/kg AD12088 在第1天單次SQ注射
3 1667 0.5 mg/kg AD12552 在第1天單次SQ注射
4 1667 0.5 mg/kg AD12559 在第1天單次SQ注射
5 1667 0.5 mg/kg AD12563 在第1天單次SQ注射
6 1667 0.5 mg/kg AD13123 在第1天單次SQ注射
7 1667 0.5 mg/kg AD13124 在第1天單次SQ注射
8 1667 0.5 mg/kg AD13125 在第1天單次SQ注射
9 1667 0.5 mg/kg AD13126 在第1天單次SQ注射
10 1667 0.5 mg/kg AD13127 在第1天單次SQ注射
11 1667 0.5 mg/kg AD13128 在第1天單次SQ注射
12 1667 0.5 mg/kg AD13036 在第1天單次SQ注射
13 1667 0.5 mg/kg AD13037 在第1天單次SQ注射
14 1667 0.5 mg/kg AD13038 在第1天單次SQ注射
15 1667 0.5 mg/kg AD13039 在第1天單次SQ注射
16 1667 0.5 mg/kg AD13040 在第1天單次SQ注射
17 1667 0.5 mg/kg AD13041 在第1天單次SQ注射
CFB RNAi藥劑中之各者包括在有義股之5'末端處結合至靶向配位體的經修飾之核苷酸,該靶向配位體包括具有本文雙螺旋體結構中所闡述之經修飾之序列的三個N-乙醯基-半乳糖胺基團(三齒配位體)。(關於與包括(NAG37)s配位體之CFB RNAi藥劑相關的特定修飾及結構資訊,參見表3、表4、表5A、表5B、表5C及表6)。第2-17組中之CFB RNAi藥劑各自包括核苷酸序列,儘管亦與小鼠CFB基因轉錄物同源,但該等核苷酸序列被設計成用於抑制人類CFB基因在上表21中所指出之CFB基因之位置1667處的表現,但具有不同化學修飾。(關於所參考之CFB基因,亦參見SEQ ID NO:1及表2)。
在皮膚與肌肉之間進行注射(亦即,皮下注射),注射至頸部及肩部區域上之鬆弛皮膚中。各組測試四(4)隻小鼠(n=4)。在研究第15天將小鼠安樂死,且在收集及均質化之後自兩個肝分離總RNA。小鼠CFB mRNA表現係藉由基於探針之定量PCR進行定量,相對於小鼠β-肌動蛋白表現標準化,且表示為媒劑對照組之分數(幾何平均值,+/- 95%信賴區間)。 22.實例9中在處死時(第15天)小鼠肝臟中之平均相對小鼠CFB mRNA
組ID 平均相對 mCFB mRNA ( 誤差) ( 誤差)
1 (等張鹽水) 1.000 0.061 0.064
第2 (0.5 mg/kg AD12088) 0.763 0.058 0.063
第3 (0.5 mg/kg AD12552) 0.545 0.036 0.039
第4 (0.5 mg/kg AD12559) 0.462 0.039 0.043
第5 (0.5 mg/kg AD12563) 0.560 0.065 0.074
第6 (0.5 mg/kg AD13123) 0.701 0.078 0.088
第7 (0.5 mg/kg AD13124) 0.473 0.044 0.049
第8 (0.5 mg/kg AD13125) 0.458 0.029 0.030
第9 (0.5 mg/kg AD13126) 0.409 0.091 0.117
第10 (0.5 mg/kg AD13127) 0.877 0.091 0.102
第11 (0.5 mg/kg AD13128) 0.896 0.113 0.129
第12 (0.5 mg/kg AD13036) 0.712 0.051 0.055
第13 (0.5 mg/kg AD13037) 0.681 0.088 0.101
第14 (0.5 mg/kg AD13038) 0.416 0.043 0.048
第15 (0.5 mg/kg AD13039) 0.568 0.028 0.030
第16 (0.5 mg/kg AD13040) 0.383 0.038 0.042
第17 (0.5 mg/kg AD13041) 0.575 0.047 0.052
相對於鹽水處理組(第1組)標準化資料。依上表22中所示,全部靶向CFB基因之位置1667的CFB RNAi藥劑中之各者顯示肝臟中之至少數值上的mCFB mRNA降低,其中數者實現顯著抑制。 實例 10. CFB RNAi 藥劑在野生型小鼠中之活體內測試
在第1天,給與六至八週齡雄性C57bl/6小鼠200 μl/20 g動物重量之單次皮下投與,其中含有0.5 mg/kg (mpk)之在等張鹽水中調配之CFB RNAi藥劑或媒劑對照物(無RNAi藥劑之等張鹽水),其包括下表23中之群組: 23.實例10之靶向位置及給藥組
群組 靶向基因位置 ( SEQ ID NO: 1 ) RNAi 藥劑及劑量 給藥方案
1 N/A 鹽水(無RNAi藥劑) 在第1天單次SQ注射
2 2399 0.5 mg/kg AD12964 在第1天單次SQ注射
3 2399 0.5 mg/kg AD13816 在第1天單次SQ注射
4 2399 0.5 mg/kg AD13817 在第1天單次SQ注射
5 2399 0.5 mg/kg AD13818 在第1天單次SQ注射
6 2399 0.5 mg/kg AD13819 在第1天單次SQ注射
7 1667 0.5 mg/kg AD13126 在第1天單次SQ注射
8 1667 0.5 mg/kg AD13436 在第1天單次SQ注射
9 1667 0.5 mg/kg AD13930 在第1天單次SQ注射
10 1667 0.5 mg/kg AD13931 在第1天單次SQ注射
11 1667 0.5 mg/kg AD13932 在第1天單次SQ注射
12 1667 0.5 mg/kg AD13933 在第1天單次SQ注射
13 1667 0.5 mg/kg AD13934 在第1天單次SQ注射
14 1667 0.5 mg/kg AD13935 在第1天單次SQ注射
CFB RNAi藥劑中之各者包括在有義股之5'末端處結合至靶向配位體的經修飾之核苷酸,該靶向配位體包括具有本文雙螺旋體結構中所闡述之經修飾之序列的三個N-乙醯基-半乳糖胺基團(三齒配位體)。(關於與包括(NAG37)s配位體之CFB RNAi藥劑相關的特定修飾及結構資訊,參見表3、表4、表5A、表5B、表5C及表6)。CFB RNAi藥劑各自包括核苷酸序列,儘管亦與小鼠CFB基因轉錄物同源,但該等核苷酸序列被設計成用於抑制人類CFB基因在CFB基因之位置1667或位置2399處的表現,依上表23中所指出。(關於所參考之CFB基因,亦參見SEQ ID NO:1及表2)。
在皮膚與肌肉之間進行注射(亦即,皮下注射),注射至頸部及肩部區域上之鬆弛皮膚中。各組測試四(4)隻小鼠(n=4)。在研究第15天將小鼠安樂死,且在收集及均質化之後自兩個肝分離總RNA。小鼠CFB mRNA表現係藉由基於探針之定量PCR進行定量,相對於小鼠β-肌動蛋白表現標準化,且表示為媒劑對照組之分數(幾何平均值,+/- 95%信賴區間)。 24.實例10中在處死時(第15天)小鼠肝臟中之平均相對小鼠CFB mRNA
組ID 平均相對 mCFB mRNA ( 誤差) ( 誤差)
1 (等張鹽水) 1.000 0.189 0.233
第2 (0.5 mg/kg AD12964) 0.403 0.048 0.054
第3 (0.5 mg/kg AD13816) 0.646 0.074 0.084
第4 (0.5 mg/kg AD13817) 0.635 0.097 0.114
第5 (0.5 mg/kg AD13818) 0.592 0.080 0.092
第6 (0.5 mg/kg AD13819) 0.678 0.109 0.129
第7 (0.5 mg/kg AD13126) 0.506 0.090 0.109
第8 (0.5 mg/kg AD13436) 0.516 0.076 0.089
第9 (0.5 mg/kg AD13930) 0.597 0.157 0.214
第10 (0.5 mg/kg AD13931) 0.939 0.157 0.189
第11 (0.5 mg/kg AD13932) 0.547 0.108 0.135
第12 (0.5 mg/kg AD13933) 0.410 0.047 0.053
第13 (0.5 mg/kg AD13934) 0.459 0.087 0.107
第14 (0.5 mg/kg AD13935) 0.437 0.116 0.159
相對於鹽水處理組(第1組)標準化資料。依表24中所示,第10組(AD13931)取代反義股(5' 3')之位置13處之U核苷酸,由此與CFB基因形成U:G擺動,且顯示出僅mCFB mRNA的極小減弱會使CFB RNAi藥劑基本上無活性(比較AD13931 (第10組)與AD13436 (第8組))。同時,第11組之CFB RNAi藥劑包括與反義股(5' 3')之位置15處之目標mRNA的錯配,亦用C取代U核苷酸,且因此與CFB mRNA (及有義股)形成U:G擺動,此比第10組耐更具耐受性,但其活性之效力仍不如與CFB基因目標更完全互補之型式(比較AD13932 (第11組) (約43%減弱(0.547))與AD13436 (第8組) (約49%減弱(0.516)))。
相反,第12組之CFB RNAi藥劑亦包括與其中U核苷酸經C核苷酸取代之目標CFB mRNA的錯配,但此次在反義股(5' 3)之位置16處,且儘管此反義股序列變化使得其不再與在此位置報導之CFB mRNA (SEQ ID NO:1) (以及與此特定CFB RNAi藥劑之有義股)形成沃森-克里克鹼基對,但實際上形成U:G擺動,出人意料地且意外地使得CFB基因緘默活性提高約10%,使其成為此特定研究中之最強效CFB RNAi藥劑。(比較AD13933 (第12組) (在此研究中顯示單次0.5 mg/kg皮下(SQ)劑量之59% (0.410)之最高減弱量)與AD13436 (第8組) (顯示僅49%減弱(0.516));亦參見表1 (位置1667 mRNA目標序列:UGU G GUGUCUGAGUACUUU (SEQ ID NO:45) (下劃線表示此前論述之位置16,其中AD13933與CFB基因轉錄物形成G:U擺動鹼基對而非C:G鹼基對))。類似地,第13組(AD13934,藉由修飾反義股而在位置18處插入G:U擺動對)雖不如第12組有效,但相比於第8組(AD13436)之完全互補序列,具有改善之抑制活性。儘管第12組(AD13933)及第13組(AD13934)相比於具有與CFB基因目標更完全互補之反義股序列的RNAi藥劑(AD13436)所發現之意外改善的確切原因僅可為假設,且不受任何理論束縛,但咸信,藉由修飾此等特定位置處之核苷酸序列而改變CFB RNAi藥劑之熱動力學會改善反義股之RISC負載及/或改善內體逃脫特性,以允許更多RNAi藥劑進入所需細胞,而不會導致因缺乏與CFB基因之完全互補性(且因此缺乏結合之潛力)所預期的抑制活性的下降(例如在對第10組中之序列進行改變的情況下可見)。 實例 11. CFB RNAi 藥劑在野生型小鼠中之活體內測試
在第1天,給與六至八週齡雄性C57bl/6小鼠200 μl/20 g動物重量之單次皮下投與,其中含有0.3 mg/kg、1.0 mg/kg或3.0 mg/kg之在等張鹽水中調配之CFB RNAi藥劑或媒劑對照物(無RNAi藥劑之等張鹽水),其包括下表25中之群組: 25.實例11之靶向位置及給藥組
群組 靶向基因位置 ( SEQ ID NO: 1 ) RNAi 藥劑及劑量 給藥方案
1 N/A 鹽水(無RNAi藥劑) 在第1天單次SQ注射
2 1667 0.3 mg/kg AD13126 在第1天單次SQ注射
3 1667 1.0 mg/kg AD13126 在第1天單次SQ注射
4 1667 3.0 mg/kg AD13126 在第1天單次SQ注射
5 1667 0.3 mg/kg AD13933 在第1天單次SQ注射
6 1667 1.0 mg/kg AD13933 在第1天單次SQ注射
7 1667 3.0 mg/kg AD13933 在第1天單次SQ注射
8 1667 0.3 mg/kg AD13934 在第1天單次SQ注射
9 1667 1.0 mg/kg AD13934 在第1天單次SQ注射
10 1667 3.0 mg/kg AD13934 在第1天單次SQ注射
11 1667 0.3 mg/kg AD13935 在第1天單次SQ注射
12 1667 1.0 mg/kg AD13935 在第1天單次SQ注射
13 1667 3.0 mg/kg AD13935 在第1天單次SQ注射
CFB RNAi藥劑中之各者包括在有義股之5'末端處結合至靶向配位體的經修飾之核苷酸,該靶向配位體包括具有本文雙螺旋體結構中所闡述之經修飾之序列的三個N-乙醯基-半乳糖胺基團(三齒配位體)。(關於與包括(NAG37)s配位體之CFB RNAi藥劑相關的特定修飾及結構資訊,參見表3、表4、表5A、表5B、表5C及表6)。CFB RNAi藥劑各自包括核苷酸序列,儘管亦與小鼠CFB基因轉錄物同源,但該等核苷酸序列被設計成用於抑制人類CFB基因在CFB基因之位置1667處的表現,依上表25中所指出。(關於所參考之CFB基因,亦參見SEQ ID NO:1及表2)。
在皮膚與肌肉之間進行注射(亦即,皮下注射),注射至頸部及肩部區域上之鬆弛皮膚中。各組測試四(4)隻小鼠(n=4)。在研究第15天將小鼠安樂死,且在收集及均質化之後自兩個肝分離總RNA。小鼠CFB mRNA表現係藉由基於探針之定量PCR進行定量,相對於小鼠β-肌動蛋白表現標準化,且表示為媒劑對照組之分數(幾何平均值,+/- 95%信賴區間)。 26.實例11中在處死時(第15天)小鼠肝臟中之平均相對小鼠CFB mRNA
組ID 平均相對 mCFB mRNA ( 誤差) ( 誤差)
1 (等張鹽水) 1.000 0.137 0.158
第2 (0.3 mg/kg AD13126) 0.509 0.077 0.091
第3 (1.0 mg/kg AD13126) 0.220 0.029 0.033
第4 (3.0 mg/kg AD13126) 0.074 0.012 0.015
第5 (0.3 mg/kg AD13933) 0.571 0.096 0.115
第6 (1.0 mg/kg AD13933) 0.354 0.080 0.104
第7 (3.0 mg/kg AD13933) 0.111 0.016 0.019
第8 (0.3 mg/kg AD13934) 0.753 0.230 0.331
第9 (1.0 mg/kg AD13934) 0.335 0.065 0.080
第10 (3.0 mg/kg AD13934) 0.082 0.014 0.017
第11 (0.3 mg/kg AD13935) 0.645 0.140 0.179
第12 (1.0 mg/kg AD13935) 0.246 0.036 0.042
第13 (3.0 mg/kg AD13935) 0.096 0.011 0.013
相對於鹽水處理組(第1組)標準化資料。依上表26中所示,CFB RNAi藥劑中之各者顯示穩定基因抑制,且所有四種所測試之CFB RNAi藥劑均展現明確的劑量反應。 實例 12. CFB RNAi 藥劑在食蟹獼猴中之活體內測試
在食蟹獼猴(cyno)中評估CFB RNAi藥劑AD12964、AD13126、AD13933及AD13934。在第1天及第29天,向四個三隻雄性食蟹獼猴之組(n=3/組)分別投與0.3 mL/kg (約1.5 mL體積,視動物質量而定)之皮下注射,其含有在等張鹽水中調配之3.0 mg/kg (mpk)之CFB RNAi藥劑(一種CFB RNAi藥劑/組)。
CFB RNAi藥劑包括在有義股之5'末端處結合至靶向配位體的經修飾之核苷酸,該靶向配位體包括具有本文雙螺旋體結構中所闡述之經修飾之序列的三個N-乙醯基-半乳糖胺基團(三齒配位體)。(關於與包括(NAG37)s配位體之CFB RNAi藥劑相關的特定修飾及結構資訊,參見表3、表4、表5A、表5B、表5C及表6)。
在第-7天(給藥前)、第1天(給藥前)、第8天及第15天,收集血清樣品。圖1顯示相對於第1天給藥前含量標準化之血清食蟹獼猴CFB (cCFB)蛋白含量,其藉由第2週的各血清收集日期量測結果來繪製(例如在圖1中,第0週為第1天;第4週為第29天)。
CFB之降低亦與補體(AP)之替代路徑受損相關。Wieslab ®AP分析為偵測補體攻膜複合物(MAC)之基於ELISA之分析,其為補體級聯之最終步驟之具有免疫性的細胞溶解效應物。(參見下文實例13,進一步論述所使用之Wieslab ®AP分析)。由於盤塗佈有替代路徑之特定活化劑,所以套組具有替代路徑特異性。圖2顯示藉由相對於D1給藥前含量標準化之Wieslab ®AP分析來量測的相對活性,其藉由第2週的各血清收集日期量測結果來繪製(例如在圖1中,第0週為第1天;第4週為第29天)
依圖1中所示,所評估之各測試之CFB RNAi藥劑引起血清CFB蛋白含量顯著降低,但程度不同。類似地,依圖2中所示,評估補體替代路徑活性之Wieslab ®AP分析支援與CFB蛋白含量降低相關之功能損失。截至第15天,四種所測試之CFB RNAi藥劑分別產生70% (AD12964)、92% (AD13933)、87% (AD13934)及73% (AD13126)之血清CFB蛋白降低(圖1)。對應地,此等血清CFB含量降低分別伴有藉由Wieslab ®AP分析量測之47% (AD12964)、81% (AD13933)、75% (AD13934)及49% (AD13126)之補體替代路徑活性的顯著損失(圖2)。 實例 13. CFB RNAi 藥劑在 85 天持續時間內在食蟹獼猴中之活體內測試
對於實例12中所描述之研究,相對於CFB RNAi藥劑AD13933處理(而非其他)之觀測及評估維持至第一次注射(第1天)後的第85天,以便進一步表徵藥效學作用。分析在第1次注射後每隔一週(亦即,第0週、第2週、第4週、第6週、第8週、第10週及第12週)收集之血清樣品。
藉由西方墨點法(Western blot),使用Jess (ProteinSimple, MN, USA)進行食蟹獼猴之血清CFB含量的半定量量測。使用Thermo Scientific™ Pierce™ BCA蛋白質分析套組(目錄號23227,Thermo Scientific™)量測血清樣品之蛋白質濃度。偵測血清CFB之初級抗體係購自Sigma (目錄號HPA001817),且偵測運鐵蛋白之初級抗體係購自R&D Systems (目錄號AF3987SP)。血清CFB蛋白含量經運鐵蛋白含量標準化,且隨後與各動物之對應第1天含量進行比較。西方墨點法分析所需之所有供應品均購自ProteinSimple。
另外,評估CFB RNAi藥劑AD13933之溶血活性。溶血活性對補體系統之關鍵組分的降低、缺失及/或失活敏感。依所指出,存在三種補體活化之路徑:替代路徑、經典路徑及凝集素路徑。由於補體系統之所有三種活化路徑需要CFB之參與才能在活體內引起組織損傷(參見例如Thurman, J.及Holers, V.M., J. Immunol. 2006年2月1日, 176(3) 1305-1310),因此量測補體之替代路徑(AP)之活化以評估CFB減弱對補體系統之影響。AP僅需要Mg 2+離子,而經典路徑及凝集素路徑需要Ca2+及Mg2+兩者。此差異用於在經典路徑蛋白及凝集素路徑蛋白存在下僅分析AP。已知兔紅血球在大部分哺乳動物物種中會自發活化AP,因此將該等兔紅血球用於進行該分析。
方法
溶血分析 ( 替代路徑 )
根據由Complement Technology, Inc. (https://www.complementtech.com)提供之經修改方案,經由量測致敏兔紅血球之溶血來進行替代路徑之溶血分析。簡言之,對於96孔盤中總體積為100 μL之各反應,將8-30 μL 2×稀釋之血清樣品與50 μL GVB0、5 μL 0.1M MgEGTA及25 μL兔紅血球(5×10 8/mL)一起培育。在37℃下培育混合物30分鐘,接著添加100 μL GVBE以停止反應。離心之後,將100 μL上清液轉移至新盤中。藉由分析412 nM之上清液的光學密度來測定溶血。在37℃培育持續60分鐘之情況下,獲得最大血球溶解物。所有試劑均購自Complement Technology, Inc (Texas, USA)。
一個AP50單元定義為引起50% RBC溶解所需之血清的量。此藉由自所有樣品減去本底OD且隨後將其除以最大溶解對照來計算。曲線繪製為ln(稀釋)相對於ln(溶解)。選擇50%最大溶解周圍之三個點來創建一條用於計算一個AP50單元之線。基於稀釋度,可計算各樣品之AP50 U/ml。
溶血分析 ( 經典路徑 )
根據由Complement Technology, Inc. (https://www.complementtech.com)提供之經修改方案來進行典型路徑之溶血分析。簡言之,對於具有GVB++之總體積為120 μL之各反應,最初將血清樣品稀釋20×,隨後以1:2.5稀釋且以1:1.5再稀釋三次。將15 μL GVB++稀釋之血清樣品與塗佈有兔抗體之10 μL綿羊紅血球(EA細胞,5×10 8/mL)一起培育。在37℃下培育混合物30分鐘,接著添加100 μL冷GVBE以停止反應。以1000 g離心5分鐘之後,將100 μL上清液轉移至新盤中。藉由分析412 nM之上清液的光學密度來測定溶血。所有試劑均購自Complement Technology, Inc (Texas, USA)。
一個CH50單元定義為引起50% RBC溶解所需之血清的量。此藉由自所有樣品減去本底OD且隨後將其除以最大溶解對照來計算。曲線繪製為ln(稀釋)相對於ln(溶解)。選擇50%最大溶解周圍之三個點來創建一條用於計算一個CH50單元之線。基於稀釋度,可計算各樣品之CH50 U/ml。
Wieslab ® 分析 ( 替代路徑及經典路徑 )
使用活體外競爭性ELISA套組(目錄號COMPLAP330,COMPLCP310,Svar Life Science AB)進行食蟹獼猴之補體替代路徑及典型路徑活性的定量量測。根據製造商說明書分析血清樣品。
結果
AD13933之處理使血清CFB含量在第一次注射之後快速減少。截至第15天,CFB RNAi藥劑AD13933顯示95%血清CFB蛋白降低。藉由在第29天投與第二次注射來進一步增強降低。直至第85天(第12週),血清CFB蛋白之低含量維持在不超過基線含量之5% (參見圖3)。個別食蟹獼猴之資料提供於下表中:
30.血清cCFB蛋白含量(相對於第1天標準化),個別動物在第1天及第29天投與兩劑AD13933:
組ID 1 第15 第29 第43 57 第71 85
食蟹獼猴 1 1.000 0.0494 0.0114 0.0081 0.0073 0.0072 0.0243
食蟹獼猴2 1.000 0.0413 0.0684 0.0241 0.0221 0.0659 0.1148
食蟹獼猴3 1.000 0.0537 0.0431 0.0082 0.0093 0.0126 0.0235
(亦參見繪製平均值之圖3)。自本文所呈現之資料所示,AD13933早在第15天就產生大於約95%降低且直至第85天展現出強抑制(其中三隻食蟹獼猴中之兩隻仍具有約98%之cCFB蛋白含量降低(0.0243-食蟹獼猴1;0.0235-食蟹獼猴3)。
亦評估Bb蛋白,亦即C3轉化酶之組分的血清含量。在補體活化之替代路徑中,CFB結合於C3b且裂解C3以產生C3b。然而,CFB本身僅在其結合於C3b時裂解。Bb片段表現絲胺酸蛋白酶活性,但僅可在其保持結合於C3b時裂解C3及C5。CFB及C3因此產生擴增循環(amplification loop),其中Bb為反映替代路徑活化之適當標記物。使用MicroVue Bb Plus EIA (Quidel, San Diego, CA, USA)經由ELISA定量血清Bb含量。血清Bb含量顯示與CFB蛋白含量類似之降低模式,且自第15天至第85天保持低於基線含量之30% (參見圖4)。
對應地,血清CFB及Bb含量之所見降低伴有分別藉由溶血AP50及Wieslab ®AP分析量測之補體替代路徑活性的顯著損失。3 mpk之兩劑AD13933處理使得AP溶血分析減少大於75% (第43天,圖5)且Wieslab ®AP分析降低約90% (第43天,圖6)。另外,確定CFB僅參與補體級聯中之替代路徑。依所預期,藉由溶血CH分析(CH50,圖7)及Wieslab ®CP分析(經典路徑) (圖8)量測,未偵測到經典路徑活性之顯著變化。 實例 14. CFB RNAi 藥劑在野生型小鼠中之活體內測試
在第1天,給與六至八週齡雄性C57bl/6小鼠200 μl/20 g動物重量之單次皮下投與,其中含有0.5 mg/kg之在等張鹽水中調配之CFB RNAi藥劑或媒劑對照物(無RNAi藥劑之等張鹽水),其包括下表28中之群組:
28.實例14之靶向位置及給藥組
群組 靶向基因位置 ( SEQ ID NO: 1 ) RNAi 藥劑及劑量 給藥方案
1 N/A 鹽水(無RNAi藥劑) 在第1天單次SQ注射
2 1667 0.5 mg/kg AD13126 在第1天單次SQ注射
3 2399 0.5 mg/kg AD12964 在第1天單次SQ注射
4 2399 0.5 mg/kg AD13391 在第1天單次SQ注射
5 2399 0.5 mg/kg AD13383 在第1天單次SQ注射
6 2399 0.5 mg/kg AD14270 在第1天單次SQ注射
7 2399 0.5 mg/kg AD14271 在第1天單次SQ注射
8 2399 0.5 mg/kg AD14272 在第1天單次SQ注射
9 2399 0.5 mg/kg AD14273 在第1天單次SQ注射
10 2399 0.5 mg/kg AD14274 在第1天單次SQ注射
11 2399 0.5 mg/kg AD14275 在第1天單次SQ注射
12 2399 0.5 mg/kg AD14276 在第1天單次SQ注射
13 2399 0.5 mg/kg AD14277 在第1天單次SQ注射
14 2399 0.5 mg/kg AD14278 在第1天單次SQ注射
15 2399 0.5 mg/kg AD14279 在第1天單次SQ注射
16 2399 0.5 mg/kg AD14280 在第1天單次SQ注射
17 2399 0.5 mg/kg AD14281 在第1天單次SQ注射
18 2399 0.5 mg/kg AD14282 在第1天單次SQ注射
19 2399 0.5 mg/kg AD14283 在第1天單次SQ注射
20 2399 0.5 mg/kg AD14284 在第1天單次SQ注射
CFB RNAi藥劑中之各者包括在有義股之5'末端處結合至靶向配位體的經修飾之核苷酸,該靶向配位體包括具有本文雙螺旋體結構中所闡述之經修飾之序列的三個N-乙醯基-半乳糖胺基團(三齒配位體)。(關於與包括(NAG37)s配位體之CFB RNAi藥劑相關的特定修飾及結構資訊,參見表3、表4、表5A、表5B、表5C及表6)。CFB RNAi藥劑各自包括核苷酸序列,儘管亦與小鼠CFB基因轉錄物同源,但該等核苷酸序列被設計成用於抑制人類CFB基因在CFB基因(第2組)之位置1667或CFB基因(第3-20組)之位置2399處的表現,依上表25中所指出。(關於所參考之CFB基因,亦參見SEQ ID NO:1及表2)。
在皮膚與肌肉之間進行注射(亦即,皮下注射),注射至頸部及肩部區域上之鬆弛皮膚中。各組測試四(4)隻小鼠(n=4)。在研究第15天將小鼠安樂死,且在收集及均質化之後自兩個肝分離總RNA。小鼠CFB mRNA表現係藉由基於探針之定量PCR進行定量,相對於小鼠β-肌動蛋白表現標準化,且表示為媒劑對照組之分數(幾何平均值,+/- 95%信賴區間)。
29.實例13中在處死時(第15天)小鼠肝臟中之平均相對小鼠CFB mRNA
組ID 平均相對 mCFB mRNA ( 誤差) ( 誤差)
1 (無處理) 1.000 0.123 0.140
第2 (0.5 mg/kg AD13126) 0.501 0.072 0.083
第3 (0.5 mg/kg AD12964) 0.389 0.092 0.120
第4 (0.5 mg/kg AD13391) 0.475 0.074 0.087
第5 (0.5 mg/kg AD13383) 0.399 0.071 0.087
第6 (0.5 mg/kg AD14270) 0.433 0.064 0.075
第7 (0.5 mg/kg AD14271) 0.435 0.095 0.121
第8 (0.5 mg/kg AD14272) 0.424 0.058 0.067
第9 (0.5 mg/kg AD14273) 0.621 0.097 0.115
第10 (0.5 mg/kg AD14274) 0.600 0.058 0.064
第11 (0.5 mg/kg AD14275) 0.616 0.097 0.116
第12 (0.5 mg/kg AD14276) 0.409 0.056 0.065
第13 (0.5 mg/kg AD14277) 0.500 0.143 0.201
第14 (0.5 mg/kg AD14278) 0.462 0.066 0.077
第15 (0.5 mg/kg AD14279) 0.579 0.139 0.184
第16 (0.5 mg/kg AD14280) 0.706 0.040 0.043
第17 (0.5 mg/kg AD14281) 0.525 0.060 0.067
第18 (0.5 mg/kg AD14282) 0.678 0.150 0.193
第19 (0.5 mg/kg AD14283) 0.677 0.128 0.158
第20 (0.5 mg/kg AD14284) 0.552 0.096 0.116
相對於鹽水處理組(第1組)標準化資料。依上表26中所示,CFB RNAi藥劑中之各者顯示CFB基因表現之抑制,其中數者實現mCFB mRNA大約或大於50%之降低。 實例 15. 用於評估健康人類志願者及患有補體介導之腎病之成年個體中單次及多次劑量之 CFB RNAi 藥劑的安全性、耐受性、藥物動力學及藥效學的 I/IIa 期臨床試驗。
啟動了一項1/2a期、單次及多次劑量遞增研究,以評估在磷酸鈉緩衝液中調配之CFB RNAi藥劑AD13933在成年健康志願者中以及在患有補體介導之腎病之個體中的安全性、耐受性、藥物動力學及藥效學作用。CFB RNAi藥劑AD13933在注射用水中以200 mg/mL (無鹽或游離酸基底)調配於含有0.5 mM磷酸二氫鈉及0.5 mM磷酸氫二鈉之緩衝水溶液中(「經調配CFB RNAi藥物物質」)。
五個單次遞增劑量(SAD)組各自預期選入6名正常健康志願者(NHV)個體(2:1隨機分組藥物:安慰劑)以接受25 mg、50 mg、100 mg、200 mg或400 mg之劑量的經調配CFB RNAi藥物物質或安慰劑(亦即,各組中4名個體接受CFB RNAi藥劑,且2名個體接受安慰劑),且在第15天進行安全性檢查。另外,三個多次劑量遞增(MAD)組各自預期選入6名NHV個體(2:1隨機分組藥物:安慰劑)以在第1天及第29天按兩次給藥接受100 mg、200 mg或400 mg之劑量的經調配CFB RNAi藥物物質或安慰劑。亦將啟動一組選入患有補體介導之腎病的個體,選入多達18名患有IgAN之患者,以在第1天、第29天及第113天接受總計三次給藥之經調配CFB RNAi藥物物質,其劑量(dose level)將基於SAD及MAD組之資料確定。 實例 16. CFB RNAi 藥劑在食蟹獼猴中之活體內測試
在食蟹獼猴(cyno)中評估CFB RNAi藥劑AD13933。在第1天及第29天,向三隻雄性食蟹獼猴(n=3)投與0.3 mL/kg (約1.5 mL體積,視動物質量而定)之皮下注射,其含有在等張鹽水中調配之0.5 mg/kg (mpk)、1.5 mg/kg或4.5 mg/kg之CFB RNAi藥劑AD13933。
CFB RNAi藥劑AD13933包括在有義股之5'末端處結合至靶向配位體的經修飾之核苷酸,該靶向配位體包括具有本文雙螺旋體結構中所闡述之經修飾之序列的三個N-乙醯基-半乳糖胺基團(三齒配位體)。(關於與包括(NAG37)s配位體之CFB RNAi藥劑相關的特定修飾及結構資訊,參見表3、表4、表5A、表5B、表5C及表6)。
在第-7天(給藥前)、第1天(給藥前)、第8天、第15天、第22天、第29天(第二次給藥前)、第36天、第43天、第50天、第57天、第64天、第71天、第78天及第85天,收集血清樣品。
投與CFB RNAi藥劑AD13933會在第一次給藥的兩週後使血清CFB顯著減少且此類降低顯示劑量依賴性反應。在第43天出現血清CFB蛋白含量之最低點,其中與其對應基線含量相比,偵測到超過90% (0.5 mg/kg組)及95% (4.5 mg/kg組)之降低(圖9)。替代路徑活化中CFB之功能片段Bb類似地藉由CFB RNAi藥劑AD13933處理顯著降低,且在所有處理組中之最低點處顯示出超過95%減少(圖10)。
亦藉由溶血分析及Wieslab ®分析來量測受CFB RNAi藥劑AD13933之處理影響的補體活性(分析資訊參見實例12及實例13)。CFB RNAi藥劑AD13933導致補體替代路徑活性之劑量依賴性降低。在最低點處,4.5 mg/kg之CFB RNAi藥劑AD13933產生超過70% (溶血之AP50,圖11)及90% (Wieslab ®AP分析,圖12)之替代路徑活性損失。另一方面,藉由溶血之CH50 (圖13)及Wieslab ®CP (經典路徑)分析(圖14)量測之經典路徑活性未發生改變,再次證實由CFB RNAi藥劑AD13933引起之CFB抑制並不影響經典路徑。
此研究結果表明,CFB RNAi藥劑AD13933有效地緘默CFB基因表現。重複給藥產生額外的藥效學作用。不僅血清中之CFB蛋白藉由劑量相關方式之CFB RNAi藥劑AD13933處理而顯著減少,而且補體替代路徑活性之CFB相關功能亦受CFB降低影響而明顯受損。 實例 17. CFB RNAi 藥劑之毒理學評估。
透過一系列標準活體外及活體內研究來評估CFB RNAi藥劑AD13933之非臨床安全概況。非GLP活體外研究之結果表明,誘發先天性免疫系統(細胞介素及補體活化)、粒線體毒性/細胞毒性或自發性血小板凝集之可能性極小。亦顯示CFB RNAi藥劑AD13933對中樞神經、呼吸道或心血管系統無不良反應,依安全性藥理學評估之結果所表明。
進行每四週以一次劑量使用皮下投與的重複劑量毒理學研究來評估AD13933之一般毒性潛力。NOAEL研究之概述提供於表中。
31 未觀測到不良反應水平之研究的概述
研究類型 NOAEL
大鼠
通用毒理學,三次Q4W劑量-短期 30 mg/kg 300 mg/kg
縮寫:NOAEL=未觀測到不良反應之水平(no-observed-adverse-effect level);Q4W=每4週。
大鼠肝臟及腎臟及猴注射部位及淋巴結中之微觀發現推測,CFB RNAi藥劑AD13933之吸收及清除與關於其他皮下投與之N-乙醯基-半乳糖胺siRNA藥物的描述類似。儘管在大鼠之腎上腺及胰臟中亦注意到微觀發現,但其並不被認為是不利的。在投與≥100 mg/kg ADS-020之大鼠中注意到,肝細胞之細胞核及細胞肥大(karyocytomegaly)之發病率及嚴重程度確定為30 mg/kg之NOAEL,然而,此等發現與臨床病理學無關,且與對動物之器官功能或一般健康狀況的明顯不良反應並不相關。
此外,對CFB RNAi藥劑AD13933之核苷酸序列進行脫靶分析,且指示CFB RNAi藥劑AD13933為對人類中之CFB mRNA具有高度特異性的RNAi藥劑,且尤其在臨床相關劑量下引起脫靶基因緘默的可能性極低。
總體而言,所進行之活體外及活體內非臨床安全性研究的結果支持,CFB RNAi藥劑AD13933適合安全用於人類臨床開發。在動物研究中觀測到之毒理學作用不視為對人類安全造成實質性風險,此係因為該等毒理學作用發生的劑量實質上大於臨床研究中所欲使用之劑量。 其他實施例
應瞭解,雖然本發明已結合其實施方式描述,但前述描述意欲說明且不限制本發明之範疇,本發明之範疇係由隨附申請專利範圍之範疇界定。其他態樣、優勢及修改屬於以下申請專利範圍之範疇內。
1.繪製食蟹獼猴中相對於給藥前標準化之相對血清cCFB蛋白含量的圖。注射器指示注射之時序。(參見實例12)。
2.繪製食蟹獼猴中相對於給藥前標準化之相對Wieslab ®替代路徑(AP)分析結果的圖。注射器指示注射之時序。(參見實例12)。
3.繪製食蟹獼猴中相對於給藥前標準化之相對血清cCFB蛋白含量的圖。注射器指示注射之時序。(參見實例13)。
4.繪製食蟹獼猴中相對於給藥前標準化之相對血清cBb含量的圖。注射器指示注射之時序。(參見實例13)。
5.繪製食蟹獼猴中相對於給藥前標準化之相對AP50溶血分析(替代路徑)結果的圖。注射器指示注射之時序。(參見實例13)。
6.繪製食蟹獼猴中相對於給藥前標準化之相對Wieslab ®替代路徑(AP)分析結果的圖。注射器指示注射之時序。(參見實例13)。
7.繪製食蟹獼猴中相對於給藥前標準化之相對CH50溶血分析(經典路徑)結果的圖。注射器指示注射之時序。(參見實例13)。
8.繪製食蟹獼猴中相對於給藥前標準化之相對Wieslab ®經典路徑(CP)分析結果的圖。注射器指示注射之時序。(參見實例13)。
9.繪製食蟹獼猴中藉由相對於給藥前標準化之CFB RNAi藥劑達成之相對血清cCFB蛋白含量的圖。注射器指示CFB RNAi藥劑AD13933之注射時序。(參見實例16)。
10.繪製食蟹獼猴中藉由相對於給藥前標準化之CFB RNAi藥劑AD13933達成之相對血清cBb含量的圖。注射器指示CFB RNAi藥劑AD13933之注射時序。(參見實例16)。
11.繪製食蟹獼猴中藉由相對於給藥前標準化之CFB RNAi藥劑AD13933達成之相對AP50溶血分析(替代路徑)結果的圖。注射器指示CFB RNAi藥劑AD13933之注射時序。(參見實例16)。
12.繪製食蟹獼猴中藉由相對於給藥前標準化之CFB RNAi藥劑AD13933達成之相對Wieslab ®替代路徑(AP)分析結果的圖。注射器指示CFB RNAi藥劑AD13933之注射時序。(參見實例16)。
13.繪製食蟹獼猴中相對於給藥前標準化之相對CH50溶血分析(經典路徑)結果的圖。注射器指示CFB RNAi藥劑AD13933之注射時序。(參見實例16)。
14.繪製食蟹獼猴中相對於給藥前標準化之相對Wieslab ®經典路徑(CP)分析結果的圖。注射器指示CFB RNAi藥劑AD13933之注射時序。(參見實例16)。
15A 至圖 15D.CFB RNAi藥劑AD12096之化學結構圖示,其中靶向配位體(NAG37)s連接至有義股(SEQ ID NO:913/1085)之5'端,顯示為游離酸。
16A 至圖 16D.CFB RNAi藥劑AD12096之化學結構圖示,其中靶向配位體(NAG37)s連接至有義股(SEQ ID NO:913/1085)之5'端,顯示為鈉鹽。
17A 至圖 17D.CFB RNAi藥劑AD13126之化學結構圖示,其中靶向配位體(NAG37)s連接至有義股(SEQ ID NO:983/1077)之5'端,顯示為游離酸。
18A 至圖 18D.CFB RNAi藥劑AD13126之化學結構圖示,其中靶向配位體(NAG37)s連接至有義股(SEQ ID NO:983/1077)之5'端,顯示為鈉鹽。
19A 至圖 19D.CFB RNAi藥劑AD13933之化學結構圖示,其中靶向配位體(NAG37)s連接至有義股(SEQ ID NO:1013/1136)之5'端,顯示為游離酸。
20A 至圖 20D.CFB RNAi藥劑AD13933之化學結構圖示,其中靶向配位體(NAG37)s連接至有義股(SEQ ID NO:1013/1136)之5'端,顯示為鈉鹽。
21A 至圖 21D.CFB RNAi藥劑AD13935之化學結構圖示,其中靶向配位體(NAG37)s連接至有義股(SEQ ID NO:994/1149)之5'端,顯示為游離酸。
22A 至圖 22D.CFB RNAi藥劑AD13935之化學結構圖示,其中靶向配位體(NAG37)s連接至有義股(SEQ ID NO:994/1149)之5'端,顯示為鈉鹽。
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Claims (55)

  1. 一種用於抑制補體因子B (complement factor B;CFB)基因表現之RNAi藥劑,其包含: 反義股,其包含與表2、表3或表5C之反義股序列中任一者的17個連續核苷酸之差異為0或1個核苷酸的至少15個連續核苷酸之核苷酸序列;及 有義股,其包含與該反義股至少部分互補之核苷酸序列。
  2. 如請求項1之RNAi藥劑,其中該反義股包含表2、表3或表5C中所提供序列中任一者之核苷酸2-18。
  3. 如請求項1或請求項2之RNAi藥劑,其中該有義股包含與表2、表4或表5之有義股序列中任一者的17個連續核苷酸之差異為0或1個核苷酸的至少17個連續核苷酸之核苷酸序列,且其中該有義股在至少17個連續核苷酸上具有與該反義股至少85%互補的區域。
  4. 如請求項1至2中任一項之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑之至少一個核苷酸包括經修飾之核苷間鍵聯。
  5. 如請求項1至3中任一項之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑包含一或多種獨立地選自由以下組成之群的經修飾之核苷酸:2′-O-甲基核苷酸、2′-氟核苷酸、2′-去氧核苷酸、2′,3′-斷核苷酸模擬物、鎖定核苷酸、2'-F-阿拉伯糖核苷酸、2′-甲氧基乙基核苷酸、無鹼基核苷酸、核糖醇、反向核苷酸、反向2′-O-甲基核苷酸、反向2′-去氧核苷酸、2′-胺基修飾之核苷酸、2′-烷基修飾之核苷酸、嗎啉核苷酸、含膦酸乙烯酯核苷酸、含膦酸環丙酯核苷酸及3′-O-甲基核苷酸。
  6. 如請求項1至5中任一項之RNAi藥劑,其中所有或實質上所有該等核苷酸為經修飾之核苷酸,且其中該等經修飾之核苷酸為2′-O-甲基核苷酸、2′-氟核苷酸或其組合。
  7. 如請求項1至6中任一項之RNAi藥劑,其中該反義股由表3或表5C之經修飾之反義股序列中任一者的核苷酸序列組成或基本上由該核苷酸序列組成。
  8. 如請求項1至7中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股由表4A、表4B或表5C之經修飾之有義股序列中任一者的核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列。
  9. 如請求項1之RNAi藥劑,其中該反義股包含表3或表5C之經修飾序列中任一者的核苷酸序列,且該有義股包含表4A、表4B或表5C之經修飾序列中任一者的核苷酸序列。
  10. 如請求項1至9中任一項之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑連接至靶向配位體。
  11. 如請求項10之RNAi藥劑,其中該靶向配位體對去唾液酸糖蛋白(asialoglycoprotein)受體具有親和力。
  12. 如請求項10或請求項11之RNAi藥劑,其中該靶向配位體包含N-乙醯基-半乳糖胺。
  13. 如請求項10至12中任一項之RNAi藥劑,其中該靶向配位體連接至該有義股。
  14. 如請求項13之RNAi藥劑,其中該靶向配位體連接至該有義股之5'末端。
  15. 如請求項10至14中任一項之RNAi藥劑,其中該靶向配位體包含:
  16. 如請求項1至15中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股長度介於15與30個核苷酸之間,且該反義股長度介於19與30個核苷酸之間。
  17. 如請求項16之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自介於19與26個核苷酸之間。
  18. 如請求項17之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自介於21與24個核苷酸之間。
  19. 如請求項18之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自為21個核苷酸。
  20. 如請求項1至19中任一項之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑具有兩個鈍端。
  21. 如請求項1至20中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股包含一或兩個端帽。
  22. 如請求項1至21中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股包含一或兩個反向無鹼基殘基。
  23. 如請求項1之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑包含有義股及反義股,其形成表5A、表5B或表5C中所闡述之雙螺旋體中任一者的雙螺旋體序列。
  24. 如請求項1至23中任一項之RNAi藥劑,該RNAi藥劑包含反義股,該反義股由與以下核苷酸序列(5′ 3′)中一者之差異為0或1個核苷酸的核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列: AAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1275); UAGAAAACCCAAAUCCUCAUC (SEQ ID NO:1283); UAAGUACUCAGACACUACAGC (SEQ ID NO:1332); UAAGUACUCAGACACCAUAGC (SEQ ID NO:1333); UAAGUACUCAGACACCACAGC (SEQ ID NO:1326); UCAAUGACAGUAAUUGGGUCC (SEQ ID NO:1310); AAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:359); UAGAAAACCCAAAUCCUCA (SEQ ID NO:474); UAAGUACUCAGACACUACA (SEQ ID NO:367); UAAGUACUCAGACACCAUA (SEQ ID NO:361); UAAGUACUCAGACACCACA (SEQ ID NO:360);或 UCAAUGACAGUAAUUGGGU (SEQ ID NO:246)。
  25. 如請求項1至24中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股由與以下核苷酸序列(5′ 3′)中一者之差異為0或1個核苷酸的核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列: GCUGUGGUGUCUGAGUACUUU (SEQ ID NO:1355); GAUGAGGAUUUGGGUUUUCUA (SEQ ID NO:1363); GCUGUGGUGUCUGAGUACUUA (SEQ ID NO:1406); GCUGUGGUGUUUGAGUACUUA (SEQ ID NO:1409); GGACCCAAUUACUGUCAUUGA (SEQ ID NO:1390); UGUGGUGUCUGAGUACUUU (SEQ ID NO:1410); UGAGGAUUUGGGUUUUCUA (SEQ ID NO:1408); UGUGGUGUCUGAGUACUUA (SEQ ID NO:779); UGUGGUGUUUGAGUACUUA (SEQ ID NO: 1439);或 ACCCAAUUACUGUCAUUGA (SEQ ID NO:665)。
  26. 如請求項23至25中任一項之RNAi藥劑,其中所有或實質上所有該等核苷酸均為經修飾之核苷酸。
  27. 如請求項1之RNAi藥劑,該RNAi藥劑包含反義股,該反義股包含與以下核苷酸序列(5′ 3′)中一者之差異為0或1個核苷酸的經修飾之核苷酸序列、由該經修飾之核苷酸序列組成或基本上由該經修飾之核苷酸序列組成: asAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc (SEQ ID NO:983); usAfsgsAfaAfaCfcCfaAfaUfcCfuCfaUfsc (SEQ ID NO:913); usAfsgsaAfaacccaAfaUfcCfucausc (SEQ ID NO:915); usAfsaguaCfucagAfcAfcUfacagsc (SEQ ID NO:1013); usAfsaguaCfucagAfcAfcCfauagsc (SEQ ID NO:1014); usAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc (SEQ ID NO:994);或 usCfsaaugAfcaguAfaUfuGfggucsc (SEQ ID NO:1022); 其中a表示2′-O-甲基腺苷,c表示2′-O-甲基胞苷,g表示2′-O-甲基鳥苷,且u表示2′-O-甲基尿苷;Af表示2′-氟腺苷,Cf表示2′-氟胞苷,Gf表示2′-氟鳥苷,且Uf表示2′-氟尿苷;s表示硫代磷酸酯鍵聯;且其中該有義股上之所有或實質上所有該等核苷酸均為經修飾之核苷酸。
  28. 如請求項1之RNAi藥劑,其中該有義股包含與以下核苷酸序列(5′ 3′)中一者之差異為0或1個核苷酸的經修飾之核苷酸序列、由該經修飾之核苷酸序列組成或基本上由該經修飾之核苷酸序列組成: gcugugguGfUfCfugaguacuuu (SEQ ID NO:1176); gaugaggaUfUfUfggguuuucua (SEQ ID NO:1184); gaugaggaUfuUfGfgguuuucua (SEQ ID NO:1185); gcugugguGfUfCfugaguacuua (SEQ ID NO:1235); gcugugguGfUfUfugaguacuua (SEQ ID NO:1248);或 ggacccAfaUfuAfcugucauuga (SEQ ID NO:1251), 其中a表示2′-O-甲基腺苷,c表示2′-O-甲基胞苷,g表示2′-O-甲基鳥苷,u表示2′-O-甲基尿苷;Af表示2′-氟腺苷,Cf表示2′-氟胞苷,Gf表示2′-氟鳥苷,且Uf表示2′-氟尿苷;s表示硫代磷酸酯鍵聯;且其中該反義股上之所有或實質上所有該等核苷酸均為經修飾之核苷酸。
  29. 如請求項23至28中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股在該核苷酸序列之3'末端處、該核苷酸序列之5'端處或兩者處進一步包括反向無鹼基殘基。
  30. 如請求項1至29中任一項之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑連接至靶向配位體。
  31. 如請求項1至30中任一項之RNAi藥劑,其中該靶向配位體包含:
  32. 如請求項1至31中任一項之RNAi藥劑,其中該靶向配位體連接至該有義股。
  33. 如請求項32之RNAi藥劑,其中該靶向配位體連接至該有義股之5'末端。
  34. 如請求項1至33中任一項之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑為醫藥學上可接受之鹽。
  35. 如請求項34之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑為鈉鹽。
  36. 如請求項1至35中任一項之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑包括反義股及有義股,該反義股及有義股由與以下序列對(5′ 3′)中一者之差異為0或1個核苷酸的經修飾之核苷酸序列組成、基本上由該等經修飾之核苷酸序列組成或包含該等經修飾之核苷酸序列: asAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc (SEQ ID NO:983)及(NAG37)s(invAb)sgcugugguGfUfCfugaguacuuus(invAb) (SEQ ID NO:1077); usAfsgsAfaAfaCfcCfaAfaUfcCfuCfaUfsc (SEQ ID NO:913)及(NAG37)s(invAb)sgaugaggaUfUfUfggguuuucuas(invAb) (SEQ ID NO:1085); usAfsgsaAfaacccaAfaUfcCfucausc (SEQ ID NO:915)及(NAG37)s(invAb)sgaugaggaUfuUfGfgguuuucuas(invAb) (SEQ ID NO:1086); usAfsaguaCfucagAfcAfcUfacagsc (SEQ ID NO:1013)及(NAG37)s(invAb)sgcugugguGfUfCfugaguacuuas(invAb) (SEQ ID NO:1136); usAfsaguaCfucagAfcAfcCfauagsc (SEQ ID NO:1014)及(NAG37)s(invAb)sgcugugguGfUfCfugaguacuuas(invAb) (SEQ ID NO:1136); usAfsaguaCfucagAfcAfcCfacagsc (SEQ ID NO:994)及(NAG37)s(invAb)sgcugugguGfUfUfugaguacuuas(invAb) (SEQ ID NO:1149);或 usCfsaaugAfcaguAfaUfuGfggucsc (SEQ ID NO:1022)及(NAG37)s(invAb)sggacccAfaUfuAfcugucauugas(invAb) (SEQ ID NO:1152); 其中a表示2′-O-甲基腺苷,c表示2′-O-甲基胞苷,g表示2′-O-甲基鳥苷,u表示2′-O-甲基尿苷;Af表示2′-氟腺苷,Cf表示2′-氟胞苷,Gf表示2′-氟鳥苷,且Uf表示2′-氟尿苷;s表示硫代磷酸酯鍵聯;(invAb)表示反向無鹼基去氧核糖核苷酸;且(NAG37)s具有以下化學結構:
  37. 一種組合物,其包含如請求項1至36中任一項之RNAi藥劑,其中該組合物包含醫藥學上可接受之賦形劑。
  38. 如請求項37之組合物,其中該醫藥學上可接受之賦形劑為磷酸鈉緩衝液。
  39. 如請求項38之組合物,其中該醫藥學上可接受之賦形劑為等張鹽水或注射用水。
  40. 一種用於抑制肝細胞中CFB基因表現之方法,該方法包含向個體之細胞中引入有效量的如請求項1至36中任一項之RNAi藥劑或如請求項37至39中任一項之組合物。
  41. 如請求項40之方法,其中該個體為人類個體。
  42. 如請求項40至41中任一項之方法,其中肝細胞或該個體中CFB mRNA含量降低至少約50%。
  43. 如請求項40至42中任一項之方法,其中肝細胞或該個體中CFB蛋白含量降低至少約50%。
  44. 如請求項40至43中任一項之方法,其中藉由Wieslab ®AP分析量測,該人類個體的補體活性之替代路徑被抑制至少50%。
  45. 如請求項40至44中任一項之方法,其中藉由Wieslab ®AP分析量測,該人類個體的補體活性之替代路徑被抑制至少90%。
  46. 如請求項40至45中任一項之方法,其中藉由AP50溶血分析量測,該人類個體的補體活性之替代路徑被抑制至少50%。
  47. 如請求項40至46中任一項之方法,其中藉由AP50溶血分析量測,該人類個體的補體活性之替代路徑被抑制至少70%。
  48. 一種治療CFB相關疾病、病症或症狀之方法,該方法包含向有需要人類個體投與治療有效量的如請求項37至39中任一項之組合物。
  49. 如請求項48之方法,其中該疾病為IgA腎病變(IgAN)、C3腎絲球病變(C3G)、免疫複合體介導之膜增生性絲球體腎炎(IC-MPGN)、狼瘡性腎炎(LN)、抗腎絲球基底膜病(抗GBM)、腎移植中之缺血再灌注損傷及T細胞介導之排斥反應(TCMR)、抗嗜中性白血球細胞質抗體(ANCA)相關血管炎、包括早期及/或中期年齡相關黃斑退化(AMD)之AMD、地圖樣萎縮(geographic atrophy,GA)、青光眼、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮(Doyne honeycomb retinal dystrophy)、陣發性夜間血紅素尿症(PNH)、非典型溶血性尿毒性症候群(aHUS)、子癇前症、類風濕性關節炎(RA)及/或其他補體介導之疾病。
  50. 如請求項40至49中任一項之方法,其中該RNAi藥劑以每公斤人類個體體重約0.05 mg至約6.0 mg之劑量向該人類個體投與。
  51. 如請求項40至50中任一項之方法,其中該RNAi藥劑以介於約25 mg與約400 mg之間的固定劑量向人類個體投與。
  52. 一種如請求項1至36中任一項之RNAi藥劑或如請求項37至39中任一項之組合物的用途,其用於治療至少部分藉由降低CFB基因表現所介導之疾病、病症或症狀。
  53. 如請求項52之用途,其中該疾病為IgA腎病變(IgAN)、C3腎絲球病變(C3G)、免疫複合體介導之膜增生性絲球體腎炎(IC-MPGN)、狼瘡性腎炎(LN)、抗腎絲球基底膜病(抗GBM)、腎移植中之缺血再灌注損傷及T細胞介導之排斥反應(TCMR)、抗嗜中性白血球細胞質抗體(ANCA)相關血管炎、包括早期及/或中期年齡相關黃斑退化(AMD)之AMD、地圖樣萎縮(GA)、青光眼、多恩蜂巢狀視網膜營養性萎縮、陣發性夜間血紅素尿症(PNH)、非典型溶血性尿毒性症候群(aHUS)、子癇前症、類風濕性關節炎(RA)及/或其他補體介導之疾病。
  54. 一種如請求項1至36中任一項之RNAi藥劑或如請求項37至39中任一項之組合物的用途,其用於製備用以治療至少部分藉由降低CFB基因表現所介導之疾病、病症或症狀的醫藥組合物。
  55. 如請求項52至54中任一項之用途,其中該RNAi藥劑以每公斤人類個體體重約0.05 mg至約6.0 mg之劑量向該人類個體投與或以介於約10 mg與約400 mg之間的固定劑量向人類個體投與。
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