TW202444904A - 用於抑制粒線體醯胺肟還原組分1(MARC1)之表現之RNAi藥劑、其醫藥組合物及使用方法 - Google Patents
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Abstract
本發明係關於能夠抑制粒線體醯胺肟還原組分1 (MARC1)基因表現之RNAi藥劑,例如雙股RNAi藥劑。亦揭示包括MARC1 RNAi藥劑之醫藥組合物及其使用方法。本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑可與靶向配位體結合以促進向肝細胞遞送,該等靶向配位體包括包含N-乙醯基-半乳胺糖之配位體。活體內遞送該等MARC1 RNAi藥劑提供對MARC1基因表現之抑制。該等RNAi藥劑可用於治療部分地由MARC1基因表現介導之疾病、病症或症狀的方法,該等疾病、病症或症狀包括非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、酒精性脂肪肝病、自體免疫肝炎、肝纖維化、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病。
Description
本揭示係關於用於抑制粒線體醯胺肟還原組分1 (MARC1)之RNA干擾(RNAi)藥劑,例如雙股RNAi藥劑,諸如經化學修飾之小(或短)干擾RNA (siRNA);包括MARC1 RNAi藥劑之醫藥組合物;及其用於治療MARC1相關疾病及病症之使用方法。
粒線體醯胺肟還原組分(MARC)蛋白於2006年首次被發現,且被描述為粒線體苯甲醯胺肟前藥轉化系統中之含鉬輔因子組分。人類基因體含有兩種MARC基因:MTARC1及MTARC2 (通常分別已知為且簡稱為MARC1及MARC2),其編碼在序列及功能上具有顯著同源性之MARC1及MARC2蛋白。
研究人員在MARC1中鑑別出一種罕見的錯義變體(稱為p.A165T突變),該變體導致MARC1蛋白功能喪失,該突變與預防肝硬化、降低肝脂肪及減少其他各種肝病生物標記相關。(Emdin CA等人, A missense variant in Mitochondrial Amidoxime Reducing Component 1 gene and protection against liver disease, PLoS Genet. (2020年4月);16(4):e1008629)。MARC1中之此功能喪失型突變的同合子型個體展現較低肝脂肪含量,且醫師診斷為脂肪肝之可能性降低。MARC1中之功能喪失型突變亦與血液中丙胺酸轉胺酶、鹼性磷酸酶、總膽固醇及LDL膽固醇含量較低相關。
儘管MARC1在肝病進展方面之確切機制尚不完全清楚,但近期針對肝病及自體免疫肝炎之全基因體關聯研究進一步驗證了所報導之MARC1關聯,該等研究進一步證實了MARC1中之錯義突變及所引起之功能喪失能夠預防肝損傷及肝硬化(Janik等人, MARC1 p.A165T variant is associated with decreased markers of liver injury and enhanced antioxidant capacity in autoimmune hepatitis.
Sci Rep(2021);11:24407)。此等彙總資料表明,MARC1蛋白之減少可能能夠降低血液膽固醇含量且預防肝硬化,且MARC1之抑制為治療肝病之潛在治療靶點。
需要能夠選擇性且高效地抑制MARC1基因表現之新穎RNA干擾(RNAi)藥劑(稱為RNAi藥劑、RNAi觸發劑或觸發劑),例如雙股RNAi藥劑,諸如經化學修飾之siRNA。此外,需要新穎MARC1特異性RNAi藥劑之組合物,其用作治療劑或藥物,用於治療MARC1相關疾病或病症,諸如非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、酒精性脂肪肝病、自體免疫肝炎、肝纖維化、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病。
本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑的核苷酸序列及化學修飾不同於先前所揭示或此項技術中已知之彼等核苷酸序列及化學修飾。本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑提供對MARC1基因表現之高度特異性、強效且高效的活體內及/或活體外抑制。
在一些實施例中,有義股包含與表2、表4、表5或表6D之有義股序列中之任一者之15個連續核苷酸相差0或1個核苷酸的至少15個連續核苷酸之核苷酸序列,且其中有義股在15個連續核苷酸內具有與反義股至少85%互補性的區域。
在一些實施例中,本文揭示用於抑制MARC1基因表現之RNAi藥劑,其包含:
反義股,其中該反義股之核苷酸1至19包含表2、表3或表6D之反義股序列之核苷酸1至19,及
有義股,其包含與該反義股至少部分互補之核苷酸序列,
其中反義股及/或有義股之所有或實質上所有核苷酸為經修飾之核苷酸,且RNAi藥劑連接至包含N-乙醯基-半乳胺糖之靶向配位體。
在一些實施例中,本文揭示用於抑制MARC1基因表現之RNAi藥劑,其包含
有義股,其包含與表2、表4、表5或表6D之有義股序列中之任一者之15個連續核苷酸相差0或1個核苷酸的至少15個連續核苷酸之核苷酸序列,且其中該有義股在15個連續核苷酸內具有與該反義股至少85%互補性的區域。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑之至少一個核苷酸包括經修飾之核苷間鍵。
在一些實施例中,本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑的經修飾之核苷酸係選自由以下組成之群:2'-O-甲基核苷酸、2'-氟核苷酸、2'-去氧核苷酸、2',3'-開環核苷酸模擬物、鎖定核苷酸、2'-F-阿糖核苷酸、2'-甲氧基乙基核苷酸、無鹼基核苷酸、核糖醇、反向核苷酸、反向2'-O-甲基核苷酸、反向2'-去氧核苷酸、2'-胺基修飾之核苷酸、2'-烷基修飾之核苷酸、N-𠰌啉基核苷酸、含膦酸乙烯酯之核苷酸、含膦酸環丙酯之核苷酸及3'-O-甲基核苷酸。
在其他實施例中,本文所揭示之RNAi藥劑的所有或實質上所有經修飾之核苷酸為2'-O-甲基核苷酸、2'-氟核苷酸或其組合。
在一些實施例中,反義股由表3或表6D之經修飾之反義股序列中之任一者的核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列。
在一些實施例中,有義股由表4、表5或表6D之經修飾之有義股序列中之任一者的核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列。
在一些實施例中,反義股包含表3或表6D之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列,且有義股包含表4或表6D之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列。
本文所揭示之RNAi藥劑連接至包含N-乙醯基-半乳胺糖之靶向配位體。在其他實施例中,靶向配位體連接至有義股。在一些實施例中,靶向配位體連接至有義股之5'末端。
在一些實施例中,有義股之長度為15至30個核苷酸,且反義股之長度為19至30個核苷酸。在其他實施例中,有義股及反義股之長度各自為21至27個核苷酸。在其他實施例中,有義股及反義股之長度各自為21至24個核苷酸。在又其他實施例中,有義股及反義股之長度各自為21個核苷酸。
在一些實施例中,RNAi藥劑具有兩個鈍端。
在一些實施例中,有義股包含一或兩個端帽。在其他實施例中,有義股包含一或兩個反向無鹼基殘基。
在一些實施例中,RNAi藥劑包含有義股及反義股,該有義股及該反義股形成表6A、表6B、表6C或表6D中所顯示之雙螺旋體結構之雙螺旋體序列。
在一些實施例中,有義股在核苷酸序列之3'末端處、核苷酸序列之5'端處或此兩者處進一步包括反向無鹼基殘基。
在其他實施例中,靶向配位體包含以下或由以下組成:
(NAG37),或
(NAG37s)。
本文亦揭示包含所揭示之RNAi藥劑的組合物,其中該等組合物進一步包含醫藥學上可接受之賦形劑。
另外,本文提供用於活體內抑制人類個體之肝細胞中MARC1基因表現之方法,該方法包含向個體體內引入有效量的所揭示之MARC1 RNAi藥劑或所揭示之組合物。
本文進一步提供治療MARC1相關疾病、病症或症狀之方法,該方法包含向有需要之人類個體投與治療有效量的所揭示之組合物。
在一些實施例中,疾病為非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)、酒精性及非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、脂肪肝病、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病。
在一些實施例中,RNAi藥劑係以約0.05 mg/kg人類個體體重至約5.0 mg/kg人類個體體重之劑量投與。在一些實施例中,本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑係以固定劑量之單次注射投與,該單次注射含有約50 mg、約100 mg、約200 mg、約300 mg或約400 mg MARC1 RNAi藥劑。
本文亦提供所揭示之RNAi藥劑或所揭示之組合物的用途,其係用於治療至少部分地由MARC1基因表現介導之疾病、病症或症狀。
本文進一步提供所揭示之RNAi藥劑或所揭示之組合物的用途,其係用於製備用以治療至少部分地由MARC1基因表現介導之疾病、病症或症狀的醫藥組合物。
相關申請案之交叉參考
本申請案主張2023年3月16日申請之美國臨時專利申請案序列號63/490,694之優先權,該案之內容以全文引用之方式併入本文中。
序列表
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所揭示之RNAi藥劑、其組合物及使用方法可參考以下詳細描述更容易地理解,該詳細描述形成本揭示之一部分。應理解,本揭示不限於本文所具體描述及/或顯示之內容,且本文所使用之術語僅出於以舉例方式描述特定實施例之目的,且不意欲為限制性的。
應瞭解,儘管為清楚起見,本文所包括之揭示內容的某些特徵係在個別實施例之情形下在本文中予以描述,但該等特徵亦可在單一實施例中組合提供。相反,為簡潔起見,在單一實施例之情形下描述的所揭示之方法的各種特徵亦可分開地或以任何子組合形式提供。
定義
依本文所使用,「RNAi藥劑」意謂含有RNA或RNA樣(例如經化學修飾之RNA)寡核苷酸分子之化學組合物,該寡核苷酸分子能夠以序列特異性方式降低或抑制(例如在適當條件下降低或抑制)目標mRNA之信使RNA (mRNA)轉錄物的轉譯。依本文所使用,RNAi藥劑可透過RNA干擾機制(亦即透過與哺乳動物細胞之RNA干擾途徑機制(RNA誘導型緘默化複合體或RISC)之相互作用誘導RNA干擾)或藉由任何替代性機制或途徑來起作用。儘管咸信本文所使用之術語RNAi藥劑主要透過RNA干擾機制起作用,但所揭示之RNAi藥劑不藉由任何特定途徑或作用機制結合或受限於任何特定途徑或作用機制。本文所揭示之RNAi藥劑包含有義股及反義股,且包括但不限於:小(或短)干擾RNA (siRNA)、雙股RNA (dsRNA)、微小RNA (miRNA)、短髮夾RNA (shRNA)及切丁酶受質。本文所描述之RNAi藥劑之反義股與所靶向之mRNA (亦即MARC1 mRNA)至少部分互補。RNAi藥劑可包括一或多個經修飾之核苷酸及/或一或多個非磷酸二酯鍵。
依本文所使用,當提及給定基因之表現時,術語「緘默」、「降低」、「抑制」、「下調」或「減弱(knockdown)」意謂當用本文所描述之RNAi藥劑治療細胞、細胞群、組織、器官或個體時,與尚未經歷該治療之第二細胞、細胞群、組織、器官或個體相比,基因表現降低,經藉由其中基因經轉錄之細胞、細胞群、組織、器官或個體中自基因轉錄之RNA含量或自mRNA轉譯之多肽、蛋白質或蛋白質次單元之含量所量測。
依本文所使用,術語「序列」及「核苷酸序列」意謂使用標準命名法用一連串字母描述之一連串或一系列核鹼基或核苷酸。核酸分子可包含未經修飾及/或經修飾之核苷酸。核苷酸序列可包含未經修飾及/或經修飾之核苷酸。
依本文所使用,「鹼基」、「核苷酸鹼基」或「核鹼基」係作為核苷酸組分之雜環嘧啶或嘌呤化合物,且包括主要嘌呤鹼基腺嘌呤及鳥嘌呤以及主要嘧啶鹼基胞嘧啶、胸腺嘧啶及尿嘧啶。核鹼基可進一步經修飾以包括但不限於通用鹼基、疏水性鹼基、混雜鹼基、尺寸擴展鹼基及氟化鹼基。(參見例如Modified Nucleosides in Biochemistry, Biotechnology and Medicine, Herdewijn, P.編. Wiley-VCH, 2008)。此等經修飾之核鹼基(包括包含經修飾之核鹼基的胺基亞磷酸酯化合物)之合成為此項技術中已知的。
依本文所使用,術語「核苷酸」具有與此項技術中通常所理解相同的含義。因此,依本文所使用,術語「核苷酸」係指包含糖部分、鹼基部分及共價連接基團(鍵聯基團) (諸如磷酸酯或硫代磷酸酯核苷間鍵聯基團)的糖苷,且涵蓋天然存在之核苷酸(諸如DNA或RNA)以及包含經修飾之糖及/或鹼基部分的非天然存在之核苷酸,該等非天然存在之核苷酸在本文中亦稱為「核苷酸類似物」。本文中,單核苷酸可稱為單體或單元。
依本文所使用且除非另外指示,否則術語「互補」在用於相對於第二核鹼基或核苷酸序列(例如RNAi藥劑反義股或單股反義寡核苷酸)描述第一核鹼基或核苷酸序列(例如RNAi藥劑有義股或所靶向之mRNA)時,意謂包括第一核苷酸序列之寡核苷酸或聚核苷酸在某些標準條件下與包括第二核苷酸序列之寡核苷酸雜交(在哺乳動物生理條件(或其他適合之活體內或活體外條件)下形成鹼基對氫鍵)及形成雙螺旋體或雙螺旋結構的能力。一般熟習此項技術者將能夠選擇最適合於雜交測試之條件組。至少在滿足以上雜交要求之範圍內,互補序列包括沃森-克里克鹼基對(Watson-Crick base pair)或非沃森-克里克鹼基對且包括天然或經修飾之核苷酸或核苷酸模擬物。序列一致性或互補性與修飾無關。舉例而言,出於確定一致性或互補性之目的,本文所定義之a及Af與U (或T)互補,且與A一致。
依本文所使用,「完美互補」或「完全互補」意謂在核鹼基或核苷酸序列分子之雜交對中,第一寡核苷酸之連續序列中的所有(100%)鹼基將與第二寡核苷酸之連續序列中的相同數目個鹼基雜交。連續序列可包含第一或第二核苷酸序列之全部或一部分。
依本文所使用,「部分互補」意謂在核鹼基或核苷酸序列分子之雜交對中,第一寡核苷酸之連續序列中的至少70% (但並非所有)鹼基將與第二寡核苷酸之連續序列中的相同數目個鹼基雜交。連續序列可包含第一或第二核苷酸序列之全部或一部分。
依本文所使用,「實質上互補」意謂在核鹼基或核苷酸序列分子之雜交對中,第一寡核苷酸之連續序列中的至少85% (但並非所有)鹼基將與第二寡核苷酸之連續序列中的相同數目個鹼基雜交。連續序列可包含第一或第二核苷酸序列之全部或一部分。
依本文所使用,術語「互補」、「完全互補」、「部分互補」及「實質上互補」係關於RNAi藥劑之有義股與反義股之間或RNAi藥劑之反義股與MARC1 mRNA之序列之間的核鹼基或核苷酸匹配而使用。
依本文所使用,適用於核酸序列之術語「實質上一致」或「實質一致性」意謂與參考序列相比,核苷酸序列(或核苷酸序列之一部分)具有至少約85%序列一致性或更高,例如至少90%、至少95%或至少99%一致性。序列一致性之百分比係藉由在比較窗內比較兩個最佳比對序列而測定。藉由以下操作來計算該百分比:測定兩個序列中存在之相同類型的核酸鹼基的位置數,得到匹配位置數,將匹配位置數除以比較窗中之總位置數且將結果乘以100,得到序列一致性百分比。本文所揭示之發明涵蓋與本文所揭示之核苷酸序列實質上一致的核苷酸序列。
依本文所使用,術語「個體(individual)」、「患者」及「個體(subject)」可互換使用以指任何動物物種之成員,包括但不限於鳥類、人類及其他靈長類動物,及包括商業上相關之哺乳動物或動物模型(諸如小鼠、大鼠、猴、牛、豬、馬、綿羊、貓及狗)的其他哺乳動物。較佳地,個體為人類。
依本文所使用,術語「治療(treat)」、「治療(treatment)」及其類似者意謂用於減輕或緩解個體疾病之一或多個症狀之數目、嚴重程度及/或頻率的方法或步驟。依本文所使用,「治療(treat)」及「治療(treatment)」可包括個體疾病之一或多個症狀的數目、嚴重程度及/或頻率的預防、管理、防治性治療及/或抑制或減少。
依本文所使用,當提及RNAi藥劑時,片語「向細胞中引入」意謂將RNAi藥劑功能性遞送至細胞中。片語「功能性遞送」意謂以使RNAi藥劑能夠具有預期生物活性(例如基因表現之序列特異性抑制)的方式將RNAi藥劑遞送至細胞中。
除非另外說明,否則使用本文所使用之符號
意謂根據本文所描述之發明範疇,任何基團可與該符號連接。
依本文所使用,術語「異構物」係指具有相同分子式,但原子之鍵結性質或序列或原子空間排列不同的化合物。原子空間排列不同的異構物稱為「立體異構物」。彼此不為鏡像之立體異構物稱為「非鏡像異構物」,且為不可重疊鏡像之立體異構物稱為「鏡像異構物」或有時稱為光學異構物。鍵合至四個不相同的取代基之碳原子稱為「對掌性中心」。
依本文所使用,除非在結構中具體鑑別為具有特定構形,否則對於其中存在不對稱中心且因此產生鏡像異構物、非鏡像異構物或其他立體異構組態之各結構,本文所揭示之各結構意欲表示所有此類可能的異構物,包括其光學純及外消旋形式。舉例而言,本文所揭示之結構意欲涵蓋非鏡像異構物之混合物以及單一立體異構物。
依本文之申請專利範圍中所使用,片語「由……組成」不包括申請專利範圍中未指定之任何元素、步驟或成分。當用於本文之申請專利範圍中時,片語「基本上由……組成」將申請專利範圍之範疇限制於所指定之材料或步驟及實質上不影響所主張發明之基礎及新穎特徵的材料或步驟。
一般熟習此項技術者將容易理解及瞭解,視本文所揭示之化合物或組合物所處之環境而定,該化合物及組合物可具有某些呈質子化或去質子化狀態之原子(例如N、O或S原子)。因此,依本文所使用,本文所揭示之結構設想某些官能基,諸如OH、SH或NH可經質子化或去質子化。本文之揭示內容意欲涵蓋所揭示之化合物及組合物而與其基於環境(諸如pH)之質子化狀態無關,依一般熟習此項技術者將容易地理解。對應地,具有不穩定質子或鹼性原子的本文所描述之化合物亦應理解為表示對應化合物之鹽形式。本文所描述之化合物可呈游離酸、游離鹼或鹽形式。本文所描述之化合物的醫藥學上可接受之鹽應理解為在本發明之範疇內。
依本文所使用,當提及兩種化合物或分子之間的連接時,術語「連接」或「結合」意謂兩種化合物或分子藉由共價鍵接合。除非加以陳述,否則本文所使用之術語「連接」及「結合」可指第一化合物與第二化合物之間在存在或不存在任何插入原子或原子基團之情況下的連接。
依本文所使用,術語「包括」在本文中用於意謂片語「包括但不限於」且可與其互換使用。除非上下文另外明確指示,否則術語「或」在本文中用於意謂術語「及/或」且可與其互換使用。
除非另外定義,否則本文所使用之所有技術及科學術語均具有與一般熟習此項技術者通常所理解相同的含義。儘管類似或等效於本文所描述之彼等方法及材料可用於實踐或測試本發明,但適合的方法及材料描述如下。所有公開案、專利申請案、專利及本文所提及之其他參考案均以全文引用的方式併入。在有衝突之情況下,將以本說明書(包括定義)為準。另外,材料、方法及實例僅為說明性的,且不意欲為限制性的。
在明確敍述值之情況下,應理解,與所敍述值大約相同數量或量之值亦在本發明之範疇內。在揭示組合之情況下,彼組合之元素的各子組合亦經具體地揭示且在本發明之範疇內。相反,在個別地揭示不同元素或元素之群的情況下,亦揭示其組合。在將本揭示之任何元素揭示為具有複數個替代物之情況下,亦特此揭示其中各替代物被單獨排除或與其他替代物以任何組合排除的本揭示之實例;本揭示之超過一個元素可具有此類排除,且特此揭示具有此類排除之元素的所有組合。
本發明之其他目標、特徵、態樣及優點將自以下實施方式、附圖及申請專利範圍而變得顯而易見。
詳細描述 RNAi 藥劑
本文描述用於抑制MARC1基因表現之RNAi藥劑。各MARC1 RNAi藥劑包含有義股及反義股。有義股之長度可為15至49個核苷酸。反義股之長度可為19至49個核苷酸。有義股及反義股可為相同長度或其可為不同長度。在一些實施例中,有義股及反義股之長度各自獨立地為19至27個核苷酸。在一些實施例中,有義股及反義股之長度各自均為21至26個核苷酸。在一些實施例中,有義股及反義股之長度各自為21至24個核苷酸。在一些實施例中,有義股之長度為約19個核苷酸,而反義股之長度為約21個核苷酸。在一些實施例中,有義股之長度為約21個核苷酸,而反義股之長度為約23個核苷酸。在一些實施例中,有義股之長度為23個核苷酸且反義股之長度為21個核苷酸。在一些實施例中,有義股及反義股之長度各自均為21個核苷酸。在一些實施例中,RNAi藥劑反義股之長度各自獨立地為21、22、23、24、25、26、27、28、29或30個核苷酸。在一些實施例中,RNAi藥劑有義股之長度各自獨立地為15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48或49個核苷酸。有義股及反義股黏接形成雙螺旋體,且在一些實施例中,雙股RNAi藥劑具有約15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29或30個核苷酸之雙螺旋體長度。
表2、表3、表4及表5中提供用於形成MARC1 RNAi藥劑之核苷酸序列的實例。包括表2、表3、表4及表5中之有義股及反義股序列的RNAi藥劑雙螺旋體之實例顯示於表6A及表6B中。
在一些實施例中,有義股與反義股之間完美互補、實質上互補或部分互補的區域之長度為15至26 (例如15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25或26)個核苷酸,且存在於反義股之5'端或其附近(例如此區域可與反義股之5'端間隔0、1、2、3或4個並非完美互補、實質上互補或部分互補的核苷酸)。
本文所描述之MARC1 RNAi藥劑的有義股包括至少15個連續核苷酸,其與MARC1 mRNA中相同數目個核苷酸之核心伸長序列(core stretch sequence) (在本文中亦稱為「核心伸長段」或「核心序列」)具有至少85%一致性。在一些實施例中,有義股核心伸長序列與反義股中之核心伸長序列100% (完美)互補或至少約85% (實質上)互補,且因此,有義股核心伸長序列通常與MARC1 mRNA目標中存在的具有相同長度之核苷酸序列(有時例如稱為目標序列)完美一致或至少約85%一致。在一些實施例中,此有義股核心伸長段之長度為15、16、17、18、19、20、21、22或23個核苷酸。在一些實施例中,此有義股核心伸長段之長度為17個核苷酸。在一些實施例中,此有義股核心伸長段之長度為19個核苷酸。在一些實施例中,此有義股核心伸長段之長度為21個核苷酸。
本文所描述之MARC1 RNAi藥劑之反義股包括與MARC1 mRNA中具有相同數目個核苷酸之核心伸長段及對應有義股中具有相同數目個核苷酸之核心伸長段具有至少85%互補性的至少15個連續核苷酸。在一些實施例中,反義股核心伸長段與MARC1 mRNA目標中存在的具有相同長度之核苷酸序列(例如目標序列) 100% (完美)互補或至少約85% (實質上)互補。在一些實施例中,此反義股核心伸長段之長度為15、16、17、18、19、20、21、22或23個核苷酸。在一些實施例中,此反義股核心伸長段之長度為21個核苷酸。在一些實施例中,此反義股核心伸長段之長度為19個核苷酸。有義股核心伸長序列可具有與相應反義核心序列相同的長度或其可具有不同長度。
MARC1 RNAi藥劑有義股及反義股黏接形成雙螺旋體。MARC1 RNAi藥劑之有義股及反義股可彼此部分、實質上或完全互補。在互補雙螺旋體區域內,有義股核心伸長序列與反義核心伸長序列至少85%互補或100%互補。在一些實施例中,有義股核心伸長序列含有至少15、至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、至少24或至少25個核苷酸之序列,其與反義股核心伸長序列之對應15、16、17、18、19、20、21、22、23、24或25個核苷酸序列至少85%或100%互補(亦即MARC1 RNAi藥劑之有義及反義核心伸長序列具有至少85%鹼基配對或100%鹼基配對之至少15、至少16、至少17、至少18、至少19、至少20、至少21、至少22、至少23、至少24或至少25個核苷酸之區域)。
在一些實施例中,本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑之反義股與表2或表3中之反義股序列中的任一者相差0、1、2或3個核苷酸。在一些實施例中,本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑之有義股與表2、表4或表5中之有義股序列中的任一者相差0、1、2或3個核苷酸。
在一些實施例中,有義股及/或反義股可視情況且獨立地在核心伸長序列之3'端、5'端或3'及5'端兩者處含有額外1、2、3、4、5或6個核苷酸(延伸部分(extension))。反義股額外核苷酸(若存在)可能或可能不與MARC1 mRNA中之對應序列互補。有義股額外核苷酸(若存在)可能或可能不與MARC1 mRNA中之對應序列一致。反義股額外核苷酸(若存在)可能或可能不與對應有義股之額外核苷酸(若存在)互補。
依本文所使用,延伸部分包含有義股核心伸長序列及/或反義股核心伸長序列之5'及/或3'端處的1、2、3、4、5或6個核苷酸。有義股上之延伸部分核苷酸可或可不與對應反義股中之核苷酸(核心伸長序列核苷酸或延伸部分核苷酸)互補。相反,反義股上之延伸部分核苷酸可或可不與對應有義股中之核苷酸(核心伸長段核苷酸或延伸部分核苷酸)互補。在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股及反義股均含有3'及5'延伸部分。在一些實施例中,一個股之一或多個3'延伸部分核苷酸與另一股之一或多個5'延伸部分核苷酸鹼基配對。在其他實施例中,一個股之一或多個3'延伸部分核苷酸不與另一股之一或多個5'延伸部分核苷酸鹼基配對。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑具有含有3'延伸部分之反義股及含有5'延伸部分之有義股。在一些實施例中,延伸部分核苷酸為未配對的且形成突出物(overhang)。依本文及此項技術中所使用,「突出物」係指位於有義股或反義股之末端處的一或多個未配對核苷酸之伸長段的延伸部分,其不形成本文所揭示之RNAi藥劑之雜交或雙螺旋部分的一部分。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含具有長度為1、2、3、4、5或6個核苷酸之3'延伸部分的反義股。在其他實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含具有長度為1、2或3個核苷酸之3'延伸部分的反義股。在一些實施例中,一或多個反義股延伸部分核苷酸包含與對應MARC1 mRNA序列互補之核苷酸。在一些實施例中,一或多個反義股延伸部分核苷酸包含與對應MARC1 mRNA序列不互補之核苷酸。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含具有長度為1、2、3、4或5個核苷酸之3'延伸部分的有義股。在一些實施例中,一或多個有義股延伸部分核苷酸包含腺苷、尿嘧啶或胸苷核苷酸、AT二核苷酸或與MARC1 mRNA序列中之核苷酸對應或一致的核苷酸。在一些實施例中,3'有義股延伸部分包括以下序列中之一者或由其組成(但不限於):T、UT、TT、UU、UUT、TTT或TTTT (各自按5'至3'列出)。
有義股可具有3'延伸部分及/或5'延伸部分。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含具有長度為1、2、3、4、5或6個核苷酸之5'延伸部分的有義股。在一些實施例中,一或多個有義股延伸部分核苷酸包含與MARC1 mRNA序列中之核苷酸對應或一致的核苷酸。
表2、表3、表4、表5及表6D中提供用於形成MARC1 RNAi藥劑之序列的實例。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑反義股包括表2、表3或表6D中之序列中之任一者的序列。在某些實施例中,MARC1 RNAi藥劑反義股包含表3或表6D中之經修飾序列中的任一者或由其組成。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑反義股包括表2、表3或表6D中之序列中之任一者的核苷酸(自5'端
3'端) 1至17、2至15、2至17、1至18、2至18、1至19、2至19、1至20、2至20、1至21或2至21的序列。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑有義股包括表2、表4、表5或表6D中之序列中之任一者的序列。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑有義股包括表2、表4、表5或表6D中之序列中之任一者的核苷酸(自5'端
3'端) 1至18、1至19、1至20、1至21、2至19、2至20、2至21、3至20、3至21或4至21的序列。在某些實施例中,MARC1 RNAi藥劑有義股包含表4、表5或表6D中之經修飾序列中之任一者的經修飾序列或由其組成。
在一些實施例中,本文所描述之RNAi藥劑的有義股及反義股含有相同數目個核苷酸。在一些實施例中,本文所描述之RNAi藥劑的有義股及反義股含有不同數目個核苷酸。在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股5'端及反義股3'端形成鈍端。在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股3'端及反義股5'端形成鈍端。在一些實施例中,RNAi藥劑之兩端均形成鈍端。在一些實施例中,RNAi藥劑之兩端均非鈍端。依本文所使用,「鈍端」係指雙股RNAi藥劑中兩個黏接股之末端核苷酸互補(形成互補鹼基對)的一端。
在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股5'端及反義股3'端形成翻口端(frayed end)。在一些實施例中,RNAi藥劑之有義股3'端及反義股5'端形成翻口端。在一些實施例中,RNAi藥劑之兩端均形成翻口端。在一些實施例中,RNAi藥劑之兩端均非翻口端。依本文所使用,翻口端係指雙股RNAi藥劑中兩個黏接股之末端核苷酸形成一對(亦即不形成突出物)但不互補(亦即形成非互補對)的一端。在一些實施例中,雙股RNAi藥劑之一個股之端處的一或多個未配對核苷酸形成突出物。未配對核苷酸可在有義股或反義股上,產生3'或5'突出物。在一些實施例中,RNAi藥劑含有:鈍端及翻口端、鈍端及5'突出端、鈍端及3'突出端、翻口端及5'突出端、翻口端及3'突出端、兩個5'突出端、兩個3'突出端、5'突出端及3'突出端、兩個翻口端或兩個鈍端。通常,當存在突出物時,突出物位於有義股、反義股或有義股及反義股兩者之3'末端。
本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑亦可包含一或多個經修飾之核苷酸。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑之有義股之實質上所有核苷酸及反義股之實質上所有核苷酸為經修飾之核苷酸。本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑可進一步包含一或多個經修飾之核苷間鍵,例如一或多個硫代磷酸酯鍵。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑含有一或多個經修飾之核苷酸及一或多個經修飾之核苷間鍵。在一些實施例中,2'-修飾之核苷酸與經修飾之核苷間鍵組合。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑以鹽、混合鹽或游離酸形式製備或提供。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑以醫藥學上可接受之鹽形式製備。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑以醫藥學上可接受之鈉鹽形式製備。此項技術中眾所周知的此類形式在本文所揭示之發明之範疇內。
經修飾之核苷酸
當用於各種寡核苷酸構築體中時,經修飾之核苷酸可保存細胞中化合物之活性,同時增加此等化合物之血清穩定性,且亦可最小化在投與寡核苷酸構築體後活化人類干擾素活性之可能性。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑含有一或多個經修飾之核苷酸。依本文所使用,「經修飾之核苷酸」為除核糖核苷酸(2'-羥基核苷酸)以外的核苷酸。在一些實施例中,至少50% (例如至少60%、至少70%、至少80%、至少90%、至少95%、至少97%、至少98%、至少99%或100%)之核苷酸為經修飾之核苷酸。依本文所使用,經修飾之核苷酸可包括但不限於去氧核糖核苷酸、核苷酸模擬物、無鹼基核苷酸、2'-修飾之核苷酸、反向核苷酸、包含經修飾之核鹼基的核苷酸、橋聯核苷酸、肽核酸(PNA)、2',3'-開環核苷酸模擬物(解鎖核鹼基(unlocked nucleobase)類似物)、鎖定核苷酸(locked nucleotide)、3'-O-甲氧基(2'核苷間連接)核苷酸、2'-F-阿糖核苷酸、5'-Me、2'-氟核苷酸、N-𠰌啉基核苷酸、膦酸乙烯酯去氧核糖核苷酸、含膦酸乙烯酯之核苷酸及含膦酸環丙酯之核苷酸。2'-修飾之核苷酸(亦即在五員糖環之2'位置處具有除羥基以外之基團的核苷酸)包括但不限於2'-O-甲基核苷酸(在本文或此項技術中亦稱為2'-甲氧基核苷酸)、2'-氟核苷酸(在本文或此項技術中亦稱為2'-去氧-2'-氟核苷酸)、2'-去氧核苷酸、2'-甲氧基乙基(2'-O-2-甲氧基乙基)核苷酸(在本文或此項技術中亦稱為2'-MOE核苷酸)、2'-胺基核苷酸及2'-烷基核苷酸。給定化合物之所有位置無需經均一修飾。相反,可在單一MARC1 RNAi藥劑中或甚至在其單一核苷酸中併入超過一個修飾。MARC1 RNAi藥劑有義股及反義股可藉由此項技術中已知之方法合成及/或修飾。一個核苷酸處之修飾獨立於另一核苷酸處之修飾。
經修飾之核鹼基包括合成及天然核鹼基,諸如5-取代之嘧啶、6-氮雜嘧啶及N-2、N-6及O-6取代之嘌呤(例如2-胺基丙基腺嘌呤、5-丙炔基尿嘧啶或5-丙炔基胞嘧啶)、5-甲基胞嘧啶(5-me-C)、5-羥基甲基胞嘧啶、肌苷、黃嘌呤、次黃嘌呤、2-胺基腺嘌呤、腺嘌呤及鳥嘌呤之6-烷基(例如6-甲基、6-乙基、6-異丙基或6-正丁基)衍生物、腺嘌呤及鳥嘌呤之2-烷基(例如2-甲基、2-乙基、2-異丙基或2-正丁基)及其他烷基衍生物、2-硫代尿嘧啶、2-硫代胸腺嘧啶、2-硫代胞嘧啶、5-鹵基尿嘧啶、胞嘧啶、5-丙炔基尿嘧啶、5-丙炔基胞嘧啶、6-偶氮尿嘧啶、6-偶氮胞嘧啶、6-偶氮胸腺嘧啶、5-尿嘧啶(假尿嘧啶)、4-硫代尿嘧啶、8-鹵基、8-胺基、8-硫氫基、8-硫代烷基、8-羥基及其他8-取代之腺嘌呤及鳥嘌呤、5-鹵基(例如5-溴)、5-三氟甲基及其他5-取代之尿嘧啶及胞嘧啶、7-甲基鳥嘌呤及7-甲基腺嘌呤、8-氮雜鳥嘌呤及8-氮雜腺嘌呤、7-去氮鳥嘌呤、7-去氮腺嘌呤、3-去氮鳥嘌呤及3-去氮腺嘌呤。
在一些實施例中,反義股之5'及/或3'端可包括無鹼基殘基(Ab),其亦可稱為「無鹼基位點」或「無鹼基核苷酸」。無鹼基殘基(Ab)為在糖部分之1'位置處不具有核鹼基之核苷酸或核苷。在一些實施例中,無鹼基殘基可置於核苷酸序列內部。在一些實施例中,Ab或AbAb可添加至反義股之3'端。在一些實施例中,有義股之5'端可包括一或多個額外無鹼基殘基(例如(Ab)或(AbAb))。在一些實施例中,將UUAb、UAb或Ab添加至有義股之3'端。在一些實施例中,可用核糖醇(無鹼基核糖)殘基替代無鹼基(去氧核糖)殘基。
在一些實施例中,RNAi藥劑之所有或實質上所有核苷酸為經修飾之核苷酸。依本文所使用,其中所存在的實質上所有核苷酸為經修飾之核苷酸的RNAi藥劑為有義股及反義股兩者中之四個或更少(亦即0、1、2、3或4個)核苷酸為核糖核苷酸(亦即未經修飾)的RNAi藥劑。依本文所使用,其中所存在的實質上所有核苷酸為經修飾之核苷酸的有義股為有義股中有兩個或更少(亦即0、1或2個)核苷酸為未經修飾之核糖核苷酸的有義股。依本文所使用,其中所存在的實質上所有核苷酸為經修飾之核苷酸的反義股為反義股中有兩個或更少(亦即0、1或2個)核苷酸為未經修飾之核糖核苷酸的反義股。在一些實施例中,RNAi藥劑之一或多個核苷酸為未經修飾之核糖核苷酸。某些經修飾之核苷酸的化學結構闡述於本文之表7中。
經修飾之核苷間鍵
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑之一或多個核苷酸藉由非標準鍵或主鏈(亦即經修飾之核苷間鍵或經修飾之主鏈)連接。經修飾之核苷間鍵或主鏈包括但不限於硫代磷酸酯基(在本文中表示為小寫字母「s」)、對掌性硫代磷酸酯、硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯、磷酸三酯、胺基烷基-磷酸三酯、膦酸烷酯(例如膦酸甲酯或3'-伸烷基膦酸酯)、對掌性膦酸酯、亞膦酸酯、胺基磷酸酯(例如3'-胺基胺基磷酸酯、胺基烷基胺基磷酸酯或硫羰基胺基磷酸酯)、硫羰基烷基-膦酸酯、硫羰基烷基磷酸三酯、N-𠰌啉基鍵、具有正常3'-5'鍵之硼烷磷酸酯、硼烷磷酸酯之2'-5'連接之類似物或具有反向極性之硼烷磷酸酯,其中相鄰核苷單元對使3'-5'連接至5'-3'或使2'-5'連接至5'-2'。在一些實施例中,經修飾之核苷間鍵或主鏈不具有磷原子。不具有磷原子之經修飾之核苷間鍵包括但不限於短鏈烷基或環烷基糖間鍵、混合雜原子及烷基或環烷基糖間鍵,或一或多個短鏈雜原子或雜環糖間鍵。在一些實施例中,經修飾之核苷間主鏈包括但不限於矽氧烷主鏈、硫醚主鏈、亞碸主鏈、碸主鏈、甲醯基及硫甲醯基主鏈、亞甲基甲醯基及硫甲醯基主鏈、含有烯烴之主鏈、胺基磺酸酯主鏈、亞甲基亞胺基及亞甲基肼基主鏈、磺酸酯及磺醯胺主鏈、醯胺主鏈及其他具有混合N、O、S及CH
2組分之主鏈。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑之有義股可含有1、2、3、4、5或6個硫代磷酸酯鍵,MARC1 RNAi藥劑之反義股可含有1、2、3、4、5或6個硫代磷酸酯鍵,或有義股及反義股均可獨立地含有1、2、3、4、5或6個硫代磷酸酯鍵。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑之有義股可含有1、2、3或4個硫代磷酸酯鍵,MARC1 RNAi藥劑之反義股可含有1、2、3或4個硫代磷酸酯鍵,或有義股及反義股均可獨立地含有1、2、3或4個硫代磷酸酯鍵。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑有義股含有至少兩個硫代磷酸酯核苷間鍵。在一些實施例中,硫代磷酸酯核苷間鍵位於自有義股之3'端起之位置1至3處的核苷酸之間。在一些實施例中,一個硫代磷酸酯核苷間鍵位於有義股核苷酸序列之5'端處,且另一硫代磷酸酯鍵在有義股核苷酸序列之3'端處。在一些實施例中,兩個硫代磷酸酯核苷間鍵位於有義股之5'端處,且另一硫代磷酸酯鍵位於有義股之3'端處。在一些實施例中,有義股不包括核苷酸之間的任何硫代磷酸酯核苷間鍵,但含有5'及3'端兩者上之末端核苷酸之間的一個、兩個或三個硫代磷酸酯鍵及視情況存在之反向無鹼基殘基端帽。在一些實施例中,靶向配位體經由硫代磷酸酯鍵連接至有義股。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑反義股含有四個硫代磷酸酯核苷間鍵。在一些實施例中,四個硫代磷酸酯核苷間鍵位於自反義股之5'端起之位置1至3處的核苷酸之間及自5'端起之位置19至21、20至22、21至23、22至24、23至25或24至26處的核苷酸之間。在一些實施例中,三個硫代磷酸酯核苷間鍵位於自反義股之5'端起之位置1至4之間,且第四個硫代磷酸酯核苷間鍵位於自反義股之5'端起之位置20至21之間。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑在反義股中含有至少三個或四個硫代磷酸酯核苷間鍵。
加帽殘基 (capping residue) 或 部分
在一些實施例中,有義股可包括一或多個加帽殘基或部分,在此項技術中有時稱為「帽」、「端帽」或「加帽殘基」。依本文所使用,「加帽殘基」為非核苷酸化合物或可併入本文所揭示之RNAi藥劑之核苷酸序列的一或多個末端處之其他部分。在一些情況下,加帽殘基可為RNAi藥劑提供某些有益特性,諸如防止核酸外切酶降解。在一些實施例中,添加反向無鹼基殘基(invAb) (在此項技術中亦稱為「反向無鹼基位點」)作為加帽殘基。(參見例如F. Czauderna, Nucleic Acids Res., 2003, 31(11), 2705-16;美國專利第5,998,203號)。加帽殘基為此項技術中通常已知的,且包括例如反向無鹼基殘基以及碳鏈,諸如末端C
3H
7(丙基)、C
6H
13(己基)或C
12H
25(十二烷基)基團。在一些實施例中,在有義股之5'末端、3'末端或5'及3'末端兩者處存在加帽殘基。在一些實施例中,有義股之5'端及/或3'端可包括超過一個反向無鹼基去氧核糖部分作為加帽殘基。
在一些實施例中,將一或多個反向無鹼基殘基(invAb)添加至有義股之3'端。在一些實施例中,一或多個反向無鹼基殘基(invAb)添加至有義股之5'端。在一些實施例中,將一或多個反向無鹼基殘基或反向無鹼基位點插入靶向配位體與RNAi藥劑之有義股的核苷酸序列之間。在一些實施例中,在RNAi藥劑之有義股之一或多個末端或其附近包括一或多個反向無鹼基殘基或反向無鹼基位點允許增強RNAi藥劑之活性或其他所需特性。
在一些實施例中,一或多個反向無鹼基殘基(invAb)添加至有義股之5'端。在一些實施例中,可將一或多個反向無鹼基殘基插入於靶向配位體與RNAi藥劑之有義股的核苷酸序列之間。反向無鹼基殘基可經由磷酸酯鍵、硫代磷酸酯鍵(例如在本文中顯示為(invAb)s))或其他核苷間鍵連接。在一些實施例中,在RNAi藥劑之有義股之一或多個末端或其附近包括一或多個反向無鹼基殘基可允許增強RNAi藥劑之活性或其他所需特性。在一些實施例中,可用反向核糖醇(無鹼基核糖)殘基替代反向無鹼基(去氧核糖)殘基。在一些實施例中,反義股核心伸長序列之3'端或反義股序列之3'端可包括反向無鹼基殘基。反向無鹼基去氧核糖殘基之化學結構顯示於下表7中。
MARC1 RNAi 藥劑
本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑經設計以靶向MARC1基因上之特定位置(例如SEQ ID NO:1)。
智人(
homo sapiens),粒線體醯胺肟還原組分1 (MARC1),mRNA轉錄物(SEQ ID NO: 1) (7287個鹼基),NCBI參考序列:NM_022746.4:
依本文所定義,反義股序列經設計以當與MARC1基因鹼基配對時,當反義股之5'末端核鹼基與該基因上在給定位置下游(朝向3'端) 21個核苷酸處的位置對準時,在該基因上之該給定位置靶向該基因。舉例而言,依本文中表1及表2中所說明,經設計以在位置1275處靶向MARC1基因之反義股序列需要在與該基因鹼基配對時,該反義股之5'末端核鹼基與MARC1基因之位置1295對準。
依本文所提供,MARC1 RNAi藥劑不需要反義股之位置1 (5'
3')處的核鹼基與該基因互補,其限制條件為該反義股與該基因在至少15個連續核苷酸之核心伸長序列內存在至少85%互補性(例如至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%互補性)。舉例而言,對於本文所揭示之經設計以靶向MARC1基因之位置1275的MARC1 RNAi藥劑,MARC1 RNAi藥劑之反義股之5'末端核鹼基必須與該基因之位置1295對準;然而,反義股之5'末端核鹼基可與MARC1基因之位置1295互補,但並非必須如此,其限制條件為該反義股與該基因在至少15個連續核苷酸之核心伸長序列內存在至少85%互補性(例如至少85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%互補性)。尤其依本文所揭示且此項技術中眾所周知的實例所顯示,MARC1 RNAi藥劑之反義股與該基因結合之特定位點(例如不管MARC1 RNAi藥劑係經設計以在位置1275處、在位置1190處抑或在某一其他位置處靶向MARC1基因)對於藉由MARC1 RNAi藥劑達成之抑制程度以及藉由分子達成之毒性概況很重要。(參見例如Kamola等人,
The siRNA Non - seed Region and Its Target Sequences are Auxiliary Determinants of Off - Target Effects ,PLOS Computational Biology, 11(12), 圖1(2015))。
在一些實施例中,本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑靶向表1中所顯示之MARC1基因序列之位置處或其附近的MARC1基因。在一些實施例中,本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑的反義股包括與表1中所揭示之目標MARC1 19聚體(19-mer)序列完全、實質上或至少部分互補的核心伸長序列。
表 1.MARC1 19聚體mRNA目標序列(取自
智人MARC1,mRNA,GenBank NM_022746.4 (SEQ ID NO:1))
SEQ ID No. | MARC1 19 聚體 目標序列 (5' →3 ') | 序列在SEQ ID NO: 1 上之對應位置 | 靶向基因位置 ( 依本文所提及) |
2 | GGUUUUGGCUUGUGAUCAA | 307-325 | 305 |
3 | GUUUUGGCUUGUGAUCAAC | 308-326 | 306 |
4 | UUUUGGCUUGUGAUCAACC | 309-327 | 307 |
5 | CAGGAGGGAAACAUGGUUA | 327-345 | 325 |
6 | UCUCAGUGCAGCCUACACA | 407-425 | 405 |
7 | CUCAGUGCAGCCUACACAA | 408-426 | 406 |
8 | AGUGCAGCCUACACAAAGG | 411-429 | 409 |
9 | UGCAGCCUACACAAAGGAC | 413-431 | 411 |
10 | ACACAAAGGACCUACUACU | 421-439 | 419 |
11 | UAACCAGCUUCCUGAAGUC | 538-556 | 536 |
12 | CCGCCUGGUGCACUUCGAG | 566-584 | 564 |
13 | CGCCUGGUGCACUUCGAGC | 567-585 | 565 |
14 | GCCUGGUGCACUUCGAGCC | 568-586 | 566 |
15 | CCUGGUGCACUUCGAGCCU | 569-587 | 567 |
16 | CGUCCUCAUCAAAUAGCAG | 603-621 | 601 |
17 | UCAAAUAGCAGACUUGUUC | 611-629 | 609 |
18 | CAAAUAGCAGACUUGUUCC | 612-630 | 610 |
19 | AAAUAGCAGACUUGUUCCG | 613-631 | 611 |
20 | GGACCAGAUUGCUUACUCA | 638-656 | 636 |
21 | CAGAUUGCUUACUCAGACA | 642-660 | 640 |
22 | UUGCUUACUCAGACACCAG | 646-664 | 644 |
23 | GGCUAGAGAAGAAAGUUAA | 712-730 | 710 |
24 | AGAGAAGAAAGUUAAAGCA | 716-734 | 714 |
25 | AGAAGAAAGUUAAAGCAAC | 718-736 | 716 |
26 | GCCCAAUAUUGUAAUUUCA | 746-764 | 744 |
27 | CAGGAUGCGAUGUCUAUGC | 763-781 | 761 |
28 | UCCAGAUGCAUUUUAACCA | 843-861 | 841 |
29 | CUGGAAACACUGAAGAGUU | 903-921 | 901 |
30 | ACCCUUCAGAACGAAAGUU | 934-952 | 932 |
31 | CCCUUCAGAACGAAAGUUA | 935-953 | 933 |
32 | CAGAACGAAAGUUAUAUGG | 940-958 | 938 |
33 | GAACGAAAGUUAUAUGGAA | 942-960 | 940 |
34 | AAAGUUAUAUGGAAAAUCA | 947-965 | 945 |
35 | UGGAAAAUCACCACUCUUU | 956-974 | 954 |
36 | GAAAAUCACCACUCUUUGG | 958-976 | 956 |
37 | CAAAGUGGGAGACCCUGUG | 1010-1028 | 1008 |
38 | AAAGUGGGAGACCCUGUGU | 1011-1029 | 1009 |
39 | GUGGGAGACCCUGUGUACC | 1014-1032 | 1012 |
40 | UGGGAGACCCUGUGUACCU | 1015-1033 | 1013 |
41 | GGGAGACCCUGUGUACCUG | 1016-1034 | 1014 |
42 | GUCCUGGAAUAUUAGAUGC | 1059-1077 | 1057 |
43 | UCCUGGAAUAUUAGAUGCC | 1060-1078 | 1058 |
44 | CCUGGAAUAUUAGAUGCCU | 1061-1079 | 1059 |
45 | CUGGAAUAUUAGAUGCCUU | 1062-1080 | 1060 |
46 | UCUCAAAAAUGACAACACU | 1091-1109 | 1089 |
47 | UGACAACACUUGAAGCAUG | 1100-1118 | 1098 |
48 | AACACUUGAAGCAUGGUGU | 1104-1122 | 1102 |
49 | GAAGCAUGGUGUUUCAGAA | 1111-1129 | 1109 |
50 | AGCAUGGUGUUUCAGAACU | 1113-1131 | 1111 |
51 | AGAACUGAGACCUCUACAU | 1126-1144 | 1124 |
52 | AGACCUCUACAUUUUCUUU | 1133-1151 | 1131 |
53 | UGAUUUUCACAUUUUUCGU | 1159-1177 | 1157 |
54 | GUGUCUCAAUGCUUCAAUG | 1192-1210 | 1190 |
55 | UCUCAAUGCUUCAAUGUCC | 1195-1213 | 1193 |
56 | CUUAGUAGGACUUCAGUAA | 1248-1266 | 1246 |
57 | AUGACAAGACAGGAUUCUG | 1276-1294 | 1274 |
58 | UGACAAGACAGGAUUCUGA | 1277-1295 | 1275 |
59 | GACAAGACAGGAUUCUGAA | 1278-1296 | 1276 |
60 | ACAGGAUUCUGAAAACUCC | 1284-1302 | 1282 |
61 | CGUUUAACUGAUUAUGGAA | 1304-1322 | 1302 |
62 | UGAUUAUGGAAUAGUUCUU | 1312-1330 | 1310 |
63 | UUAUGGAAUAGUUCUUUCU | 1315-1333 | 1313 |
64 | UAUGGAAUAGUUCUUUCUC | 1316-1334 | 1314 |
65 | CCUGCUUCUCCGUUUAUCU | 1334-1352 | 1332 |
66 | GAAGAAUAUCCUAGAAUGU | 1434-1452 | 1432 |
67 | UUUCCAUAGAUCUGGAUCU | 1607-1625 | 1605 |
68 | GCUUCUCAGACAGCAUUGG | 1635-1653 | 1633 |
69 | UUCUCAGACAGCAUUGGAU | 1637-1655 | 1635 |
70 | ACAGCAUUGGAUUUCCUAA | 1644-1662 | 1642 |
71 | CAUUGGAUUUCCUAAAGGU | 1648-1666 | 1646 |
72 | UUGGAUUUCCUAAAGGUGC | 1650-1668 | 1648 |
73 | ACUGAAAACCUUUAAAGGG | 1819-1837 | 1817 |
74 | GGAAAGCAUAUGUCAGUUG | 1844-1862 | 1842 |
75 | UGUCAGUUGUUUAAAACCC | 1854-1872 | 1852 |
76 | AACUCUAAGAUCUGAUGAA | 1899-1917 | 1897 |
77 | ACUCUAAGAUCUGAUGAAG | 1900-1918 | 1898 |
78 | UCUAAGAUCUGAUGAAGUA | 1902-1920 | 1900 |
79 | AUUGCCAUUUUGUCCUUUG | 1929-1947 | 1927 |
80 | CCAUUUUGUCCUUUGAUUA | 1933-1951 | 1931 |
81 | GGGAAGUUGACUAAACUUG | 1956-1974 | 1954 |
82 | GGAAGUUGACUAAACUUGA | 1957-1975 | 1955 |
83 | UGUGAAUAAAUGGAAGCUA | 1992-2010 | 1990 |
84 | ACUAGUUUCAGAUCUUACU | 2016-2034 | 2014 |
85 | GUUUCAGAUCUUACUAACU | 2020-2038 | 2018 |
86 | UUCAGAUCUUACUAACUUC | 2022-2040 | 2020 |
87 | GCAUGUGCUUGUUUUAUGG | 2632-2650 | 2630 |
88 | GACAAAGCGAAGUGUUCAG | 2781-2799 | 2779 |
89 | CCAGUGACCUCUAGAAUCU | 3192-3210 | 3190 |
90 | GCAUUUGCACACUAUUCCA | 3334-3352 | 3332 |
91 | GACAGAUGUUUGAGAUCAG | 3414-3432 | 3412 |
92 | UGUGUGGCAACUUAUGCUG | 3466-3484 | 3464 |
93 | GACCAGACCUUGAUUGUGG | 3993-4011 | 3991 |
94 | GGAGAAGCACUCUCUUUCU | 4502-4520 | 4500 |
95 | AACCAAACUCUCUCUAACC | 4584-4602 | 4582 |
96 | CAAACUCUCUCUAACCUUG | 4587-4605 | 4585 |
97 | GAUGUAAGUUACAAAACCA | 4625-4643 | 4623 |
98 | CCACCUGUGAUGAAAGUGC | 4641-4659 | 4639 |
99 | ACUGGUGCAUUUAUAAUCC | 5257-5275 | 5255 |
100 | AGCUCUGACUAUAACUCUG | 5851-5869 | 5849 |
101 | CCUUUACAGAGCAUCCUAG | 6145-6163 | 6143 |
102 | AACUAAGUUAAGUCUAACU | 6296-6314 | 6294 |
103 | CAGAGAGAUUGAAUUUACU | 6410-6428 | 6408 |
104 | GCUCUGGUUAACAUCAACC | 6539-6557 | 6537 |
105 | UGACCUGACAUCAUAGUUU | 6835-6853 | 6833 |
106 | AUAAAAUGUAUUAAUGACA | 6959-6977 | 6957 |
107 | UCUUAAAGCUAUAUUCUGC | 7210-7228 | 7208 |
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包括反義股,其中該反義股之位置19 (5'
3')能夠與表1中所揭示之19聚體目標序列之位置1形成鹼基對。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包括反義股,其中該反義股之位置1 (5'
3')能夠與表1中所揭示之19聚體目標序列之位置19形成鹼基對。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包括反義股,其中該反義股之位置2 (5'
3')能夠與表1中所揭示之19聚體目標序列之位置18形成鹼基對。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包括反義股,其中該反義股之位置2至18 (5'
3')能夠與位於表1中所揭示之19聚體目標序列之位置18至2處的各別互補鹼基中之各者形成鹼基對。
對於本文所揭示之RNAi藥劑,在反義股(自5'端
3'端)之位置1處之核苷酸可與MARC1基因完美互補,或可與MARC1基因為非互補的。在一些實施例中,在反義股(自5'端
3'端)之位置1處之核苷酸為U、A或dT。在一些實施例中,在反義股(自5'端
3'端)之位置1處之核苷酸與有義股形成A:U或U:A鹼基對。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑反義股包含表2或表3中之反義股序列中之任一者的核苷酸(自5'端
3'端) 2至18、2至19、2至20或2至21之序列。在一些實施例中,MARC1 RNAi有義股包含表2、表4、表5或表6D中之有義股序列中之任一者的核苷酸(自5'端
3'端) 3至21、2至21、1至21、3至20、2至20、1至20、3至19、2至19、1至19、3至18、2至18或1至18之序列。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑反義股包含表2或表3之反義股序列中之任一者的核苷酸(自5'端
3'端) 2至18、2至19、2至20或2至21之序列。在一些實施例中,MARC1 RNAi有義股包含表2、表4、表5或表6D之有義股序列中之任一者的核苷酸(自5'端
3'端) 3至21、2至21、1至21、3至20、2至20、1至20、3至19、2至19、1至19、3至18、2至18或1至18之序列。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含(i)包含表2、表3或表6D中之反義股序列中之任一者的核苷酸(自5'端
3'端) 2至18或2至19之序列的反義股;及(ii)包含表2、表4、表5或表6D中之有義股序列中之任一者的核苷酸自(自5'端
3'端) 3至21、2至21、1至21、3至20、2至20、1至20、3至19、2至19、1至19、3至18、2至18或1至18之序列的有義股。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含(i)包含表2、表3或表6D之反義股序列中之任一者的核苷酸(自5'端
3'端) 2至18或2至19之序列的反義股;及(ii)包含表2、表4、表5或表6D之有義股序列中之任一者的核苷酸(自5'端
3'端) 3至21、2至21、1至21、3至20、2至20、1至20、3至19、2至19、1至19、3至18、2至18或1至18之序列的有義股。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包括下表2中所顯示之核心19聚體核苷酸序列。
表 2.MARC1 RNAi藥劑反義股及有義股核心伸長鹼基序列(N=任何核鹼基)
SEQ ID NO:. | 反義股鹼基序列 (5' →3' ) ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列) | SEQ ID NO:. | 有義股鹼基序列 (5' →3' ) ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列) | SEQ ID NO: 1 上經鑑別序列之對應位置 | 所靶向基因體位置 | ||
108 | UUGAUCACAAGCCAAAACC | 582 | GGUUUUGGCUUGUGAUCAA | 307-325 | 305 | ||
109 | AUGAUCACAAGCCAAAACC | 583 | GGUUUUGGCUUGUGAUCAU | 307-325 | 305 | ||
110 | NUGAUCACAAGCCAAAACC | 584 | GGUUUUGGCUUGUGAUCAN | 307-325 | 305 | ||
111 | NUGAUCACAAGCCAAAACN | 585 | NGUUUUGGCUUGUGAUCAN | 307-325 | 305 | ||
112 | GUUGAUCACAAGCCAAAAC | 586 | GUUUUGGCUUGUGAUCAAC | 308-326 | 306 | ||
113 | UUUGAUCACAAGCCAAAAC | 587 | GUUUUGGCUUGUGAUCAAA | 308-326 | 306 | ||
114 | AUUGAUCACAAGCCAAAAC | 588 | GUUUUGGCUUGUGAUCAAU | 308-326 | 306 | ||
115 | NUUGAUCACAAGCCAAAAC | 589 | GUUUUGGCUUGUGAUCAAN | 308-326 | 306 | ||
116 | NUUGAUCACAAGCCAAAAN | 590 | NUUUUGGCUUGUGAUCAAN | 308-326 | 306 | ||
117 | GGUUGAUCACAAGCCAAAA | 591 | UUUUGGCUUGUGAUCAACC | 309-327 | 307 | ||
118 | UGUUGAUCACAAGCCAAAA | 592 | UUUUGGCUUGUGAUCAACA | 309-327 | 307 | ||
119 | AGUUGAUCACAAGCCAAAA | 593 | UUUUGGCUUGUGAUCAACU | 309-327 | 307 | ||
120 | NGUUGAUCACAAGCCAAAA | 594 | UUUUGGCUUGUGAUCAACN | 309-327 | 307 | ||
121 | NGUUGAUCACAAGCCAAAN | 595 | NUUUGGCUUGUGAUCAACN | 309-327 | 307 | ||
122 | UAACCAUGUUUCCCUCCUG | 596 | CAGGAGGGAAACAUGGUUA | 327-345 | 325 | ||
123 | AAACCAUGUUUCCCUCCUG | 597 | CAGGAGGGAAACAUGGUUU | 327-345 | 325 | ||
124 | NAACCAUGUUUCCCUCCUG | 598 | CAGGAGGGAAACAUGGUUN | 327-345 | 325 | ||
125 | NAACCAUGUUUCCCUCCUN | 599 | NAGGAGGGAAACAUGGUUN | 327-345 | 325 | ||
126 | UGUGUAGGCUGCACUGAGA | 600 | UCUCAGUGCAGCCUACACA | 407-425 | 405 | ||
127 | AGUGUAGGCUGCACUGAGA | 601 | UCUCAGUGCAGCCUACACU | 407-425 | 405 | ||
128 | NGUGUAGGCUGCACUGAGA | 602 | UCUCAGUGCAGCCUACACN | 407-425 | 405 | ||
129 | NGUGUAGGCUGCACUGAGN | 603 | NCUCAGUGCAGCCUACACN | 407-425 | 405 | ||
130 | UUGUGUAGGCUGCACUGAG | 604 | CUCAGUGCAGCCUACACAA | 408-426 | 406 | ||
131 | AUGUGUAGGCUGCACUGAG | 605 | CUCAGUGCAGCCUACACAU | 408-426 | 406 | ||
132 | NUGUGUAGGCUGCACUGAG | 606 | CUCAGUGCAGCCUACACAN | 408-426 | 406 | ||
133 | NUGUGUAGGCUGCACUGAN | 607 | NUCAGUGCAGCCUACACAN | 408-426 | 406 | ||
134 | CCUUUGUGUAGGCUGCACU | 608 | AGUGCAGCCUACACAAAGG | 411-429 | 409 | ||
135 | UCUUUGUGUAGGCUGCACU | 609 | AGUGCAGCCUACACAAAGA | 411-429 | 409 | ||
136 | ACUUUGUGUAGGCUGCACU | 610 | AGUGCAGCCUACACAAAGU | 411-429 | 409 | ||
137 | NCUUUGUGUAGGCUGCACU | 611 | AGUGCAGCCUACACAAAGN | 411-429 | 409 | ||
138 | NCUUUGUGUAGGCUGCACN | 612 | NGUGCAGCCUACACAAAGN | 411-429 | 409 | ||
139 | GUCCUUUGUGUAGGCUGCA | 613 | UGCAGCCUACACAAAGGAC | 413-431 | 411 | ||
140 | UUCCUUUGUGUAGGCUGCA | 614 | UGCAGCCUACACAAAGGAA | 413-431 | 411 | ||
141 | AUCCUUUGUGUAGGCUGCA | 615 | UGCAGCCUACACAAAGGAU | 413-431 | 411 | ||
142 | NUCCUUUGUGUAGGCUGCA | 616 | UGCAGCCUACACAAAGGAN | 413-431 | 411 | ||
143 | NUCCUUUGUGUAGGCUGCN | 617 | NGCAGCCUACACAAAGGAN | 413-431 | 411 | ||
144 | AGUAGUAGGUCCUUUGUGU | 618 | ACACAAAGGACCUACUACU | 421-439 | 419 | ||
145 | UGUAGUAGGUCCUUUGUGU | 619 | ACACAAAGGACCUACUACA | 421-439 | 419 | ||
146 | NGUAGUAGGUCCUUUGUGU | 620 | ACACAAAGGACCUACUACN | 421-439 | 419 | ||
147 | NGUAGUAGGUCCUUUGUGN | 621 | NCACAAAGGACCUACUACN | 421-439 | 419 | ||
148 | GACUUCAGGAAGCUGGUUA | 622 | UAACCAGCUUCCUGAAGUC | 538-556 | 536 | ||
149 | UACUUCAGGAAGCUGGUUA | 623 | UAACCAGCUUCCUGAAGUA | 538-556 | 536 | ||
150 | AACUUCAGGAAGCUGGUUA | 624 | UAACCAGCUUCCUGAAGUU | 538-556 | 536 | ||
151 | NACUUCAGGAAGCUGGUUA | 625 | UAACCAGCUUCCUGAAGUN | 538-556 | 536 | ||
152 | NACUUCAGGAAGCUGGUUN | 626 | NAACCAGCUUCCUGAAGUN | 538-556 | 536 | ||
153 | CUCGAAGUGCACCAGGCGG | 627 | CCGCCUGGUGCACUUCGAG | 566-584 | 564 | ||
154 | UUCGAAGUGCACCAGGCGG | 628 | CCGCCUGGUGCACUUCGAA | 566-584 | 564 | ||
155 | AUCGAAGUGCACCAGGCGG | 629 | CCGCCUGGUGCACUUCGAU | 566-584 | 564 | ||
156 | NUCGAAGUGCACCAGGCGG | 630 | CCGCCUGGUGCACUUCGAN | 566-584 | 564 | ||
157 | NUCGAAGUGCACCAGGCGN | 631 | NCGCCUGGUGCACUUCGAN | 566-584 | 564 | ||
158 | GCUCGAAGUGCACCAGGCG | 632 | CGCCUGGUGCACUUCGAGC | 567-585 | 565 | ||
159 | UCUCGAAGUGCACCAGGCG | 633 | CGCCUGGUGCACUUCGAGA | 567-585 | 565 | ||
160 | ACUCGAAGUGCACCAGGCG | 634 | CGCCUGGUGCACUUCGAGU | 567-585 | 565 | ||
161 | NCUCGAAGUGCACCAGGCG | 635 | CGCCUGGUGCACUUCGAGN | 567-585 | 565 | ||
162 | NCUCGAAGUGCACCAGGCN | 636 | NGCCUGGUGCACUUCGAGN | 567-585 | 565 | ||
163 | GGCUCGAAGUGCACCAGGC | 637 | GCCUGGUGCACUUCGAGCC | 568-586 | 566 | ||
164 | UGCUCGAAGUGCACCAGGC | 638 | GCCUGGUGCACUUCGAGCA | 568-586 | 566 | ||
165 | AGCUCGAAGUGCACCAGGC | 639 | GCCUGGUGCACUUCGAGCU | 568-586 | 566 | ||
166 | NGCUCGAAGUGCACCAGGC | 640 | GCCUGGUGCACUUCGAGCN | 568-586 | 566 | ||
167 | NGCUCGAAGUGCACCAGGN | 641 | NCCUGGUGCACUUCGAGCN | 568-586 | 566 | ||
168 | AGGCUCGAAGUGCACCAGG | 642 | CCUGGUGCACUUCGAGCCU | 569-587 | 567 | ||
169 | UGGCUCGAAGUGCACCAGG | 643 | CCUGGUGCACUUCGAGCCA | 569-587 | 567 | ||
170 | NGGCUCGAAGUGCACCAGG | 644 | CCUGGUGCACUUCGAGCCN | 569-587 | 567 | ||
171 | NGGCUCGAAGUGCACCAGN | 645 | NCUGGUGCACUUCGAGCCN | 569-587 | 567 | ||
172 | CUGCUAUUUGAUGAGGACG | 646 | CGUCCUCAUCAAAUAGCAG | 603-621 | 601 | ||
173 | UUGCUAUUUGAUGAGGACG | 647 | CGUCCUCAUCAAAUAGCAA | 603-621 | 601 | ||
174 | AUGCUAUUUGAUGAGGACG | 648 | CGUCCUCAUCAAAUAGCAU | 603-621 | 601 | ||
175 | NUGCUAUUUGAUGAGGACG | 649 | CGUCCUCAUCAAAUAGCAN | 603-621 | 601 | ||
176 | NUGCUAUUUGAUGAGGACN | 650 | NGUCCUCAUCAAAUAGCAN | 603-621 | 601 | ||
177 | GAACAAGUCUGCUAUUUGA | 651 | UCAAAUAGCAGACUUGUUC | 611-629 | 609 | ||
178 | UAACAAGUCUGCUAUUUGA | 652 | UCAAAUAGCAGACUUGUUA | 611-629 | 609 | ||
179 | AAACAAGUCUGCUAUUUGA | 653 | UCAAAUAGCAGACUUGUUU | 611-629 | 609 | ||
180 | NAACAAGUCUGCUAUUUGA | 654 | UCAAAUAGCAGACUUGUUN | 611-629 | 609 | ||
181 | NAACAAGUCUGCUAUUUGN | 655 | NCAAAUAGCAGACUUGUUN | 611-629 | 609 | ||
182 | GGAACAAGUCUGCUAUUUG | 656 | CAAAUAGCAGACUUGUUCC | 612-630 | 610 | ||
183 | UGAACAAGUCUGCUAUUUG | 657 | CAAAUAGCAGACUUGUUCA | 612-630 | 610 | ||
184 | AGAACAAGUCUGCUAUUUG | 658 | CAAAUAGCAGACUUGUUCU | 612-630 | 610 | ||
185 | NGAACAAGUCUGCUAUUUG | 659 | CAAAUAGCAGACUUGUUCN | 612-630 | 610 | ||
186 | NGAACAAGUCUGCUAUUUN | 660 | NAAAUAGCAGACUUGUUCN | 612-630 | 610 | ||
187 | CGGAACAAGUCUGCUAUUU | 661 | AAAUAGCAGACUUGUUCCG | 613-631 | 611 | ||
188 | UGGAACAAGUCUGCUAUUU | 662 | AAAUAGCAGACUUGUUCCA | 613-631 | 611 | ||
189 | AGGAACAAGUCUGCUAUUU | 663 | AAAUAGCAGACUUGUUCCU | 613-631 | 611 | ||
190 | NGGAACAAGUCUGCUAUUU | 664 | AAAUAGCAGACUUGUUCCN | 613-631 | 611 | ||
191 | NGGAACAAGUCUGCUAUUN | 665 | NAAUAGCAGACUUGUUCCN | 613-631 | 611 | ||
192 | UGAGUAAGCAAUCUGGUCC | 666 | GGACCAGAUUGCUUACUCA | 638-656 | 636 | ||
193 | AGAGUAAGCAAUCUGGUCC | 667 | GGACCAGAUUGCUUACUCU | 638-656 | 636 | ||
194 | NGAGUAAGCAAUCUGGUCC | 668 | GGACCAGAUUGCUUACUCN | 638-656 | 636 | ||
195 | NGAGUAAGCAAUCUGGUCN | 669 | NGACCAGAUUGCUUACUCN | 638-656 | 636 | ||
196 | UGUCUGAGUAAGCAAUCUG | 670 | CAGAUUGCUUACUCAGACA | 642-660 | 640 | ||
197 | AGUCUGAGUAAGCAAUCUG | 671 | CAGAUUGCUUACUCAGACU | 642-660 | 640 | ||
198 | NGUCUGAGUAAGCAAUCUG | 672 | CAGAUUGCUUACUCAGACN | 642-660 | 640 | ||
199 | NGUCUGAGUAAGCAAUCUN | 673 | NAGAUUGCUUACUCAGACN | 642-660 | 640 | ||
200 | CUGGUGUCUGAGUAAGCAA | 674 | UUGCUUACUCAGACACCAG | 646-664 | 644 | ||
201 | UUGGUGUCUGAGUAAGCAA | 675 | UUGCUUACUCAGACACCAA | 646-664 | 644 | ||
202 | AUGGUGUCUGAGUAAGCAA | 676 | UUGCUUACUCAGACACCAU | 646-664 | 644 | ||
203 | NUGGUGUCUGAGUAAGCAA | 677 | UUGCUUACUCAGACACCAN | 646-664 | 644 | ||
204 | NUGGUGUCUGAGUAAGCAN | 678 | NUGCUUACUCAGACACCAN | 646-664 | 644 | ||
205 | UUAACUUUCUUCUCUAGCC | 679 | GGCUAGAGAAGAAAGUUAA | 712-730 | 710 | ||
206 | AUAACUUUCUUCUCUAGCC | 680 | GGCUAGAGAAGAAAGUUAU | 712-730 | 710 | ||
207 | NUAACUUUCUUCUCUAGCC | 681 | GGCUAGAGAAGAAAGUUAN | 712-730 | 710 | ||
208 | NUAACUUUCUUCUCUAGCN | 682 | NGCUAGAGAAGAAAGUUAN | 712-730 | 710 | ||
209 | UGCUUUAACUUUCUUCUCU | 683 | AGAGAAGAAAGUUAAAGCA | 716-734 | 714 | ||
210 | AGCUUUAACUUUCUUCUCU | 684 | AGAGAAGAAAGUUAAAGCU | 716-734 | 714 | ||
211 | NGCUUUAACUUUCUUCUCU | 685 | AGAGAAGAAAGUUAAAGCN | 716-734 | 714 | ||
212 | NGCUUUAACUUUCUUCUCN | 686 | NGAGAAGAAAGUUAAAGCN | 716-734 | 714 | ||
213 | GUUGCUUUAACUUUCUUCU | 687 | AGAAGAAAGUUAAAGCAAC | 718-736 | 716 | ||
214 | UUUGCUUUAACUUUCUUCU | 688 | AGAAGAAAGUUAAAGCAAA | 718-736 | 716 | ||
215 | AUUGCUUUAACUUUCUUCU | 689 | AGAAGAAAGUUAAAGCAAU | 718-736 | 716 | ||
216 | NUUGCUUUAACUUUCUUCU | 690 | AGAAGAAAGUUAAAGCAAN | 718-736 | 716 | ||
217 | NUUGCUUUAACUUUCUUCN | 691 | NGAAGAAAGUUAAAGCAAN | 718-736 | 716 | ||
218 | UGAAAUUACAAUAUUGGGC | 692 | GCCCAAUAUUGUAAUUUCA | 746-764 | 744 | ||
219 | AGAAAUUACAAUAUUGGGC | 693 | GCCCAAUAUUGUAAUUUCU | 746-764 | 744 | ||
220 | NGAAAUUACAAUAUUGGGC | 694 | GCCCAAUAUUGUAAUUUCN | 746-764 | 744 | ||
221 | NGAAAUUACAAUAUUGGGN | 695 | NCCCAAUAUUGUAAUUUCN | 746-764 | 744 | ||
222 | GCAUAGACAUCGCAUCCUG | 696 | CAGGAUGCGAUGUCUAUGC | 763-781 | 761 | ||
223 | UCAUAGACAUCGCAUCCUG | 697 | CAGGAUGCGAUGUCUAUGA | 763-781 | 761 | ||
224 | ACAUAGACAUCGCAUCCUG | 698 | CAGGAUGCGAUGUCUAUGU | 763-781 | 761 | ||
225 | NCAUAGACAUCGCAUCCUG | 699 | CAGGAUGCGAUGUCUAUGN | 763-781 | 761 | ||
226 | NCAUAGACAUCGCAUCCUN | 700 | NAGGAUGCGAUGUCUAUGN | 763-781 | 761 | ||
227 | UGGUUAAAAUGCAUCUGGA | 701 | UCCAGAUGCAUUUUAACCA | 843-861 | 841 | ||
228 | AGGUUAAAAUGCAUCUGGA | 702 | UCCAGAUGCAUUUUAACCU | 843-861 | 841 | ||
229 | NGGUUAAAAUGCAUCUGGA | 703 | UCCAGAUGCAUUUUAACCN | 843-861 | 841 | ||
230 | NGGUUAAAAUGCAUCUGGN | 704 | NCCAGAUGCAUUUUAACCN | 843-861 | 841 | ||
231 | AACUCUUCAGUGUUUCCAG | 705 | CUGGAAACACUGAAGAGUU | 903-921 | 901 | ||
232 | UACUCUUCAGUGUUUCCAG | 706 | CUGGAAACACUGAAGAGUA | 903-921 | 901 | ||
233 | NACUCUUCAGUGUUUCCAG | 707 | CUGGAAACACUGAAGAGUN | 903-921 | 901 | ||
234 | NACUCUUCAGUGUUUCCAN | 708 | NUGGAAACACUGAAGAGUN | 903-921 | 901 | ||
235 | AACUUUCGUUCUGAAGGGU | 709 | ACCCUUCAGAACGAAAGUU | 934-952 | 932 | ||
236 | UACUUUCGUUCUGAAGGGU | 710 | ACCCUUCAGAACGAAAGUA | 934-952 | 932 | ||
237 | NACUUUCGUUCUGAAGGGU | 711 | ACCCUUCAGAACGAAAGUN | 934-952 | 932 | ||
238 | NACUUUCGUUCUGAAGGGN | 712 | NCCCUUCAGAACGAAAGUN | 934-952 | 932 | ||
239 | UAACUUUCGUUCUGAAGGG | 713 | CCCUUCAGAACGAAAGUUA | 935-953 | 933 | ||
240 | AAACUUUCGUUCUGAAGGG | 714 | CCCUUCAGAACGAAAGUUU | 935-953 | 933 | ||
241 | NAACUUUCGUUCUGAAGGG | 715 | CCCUUCAGAACGAAAGUUN | 935-953 | 933 | ||
242 | NAACUUUCGUUCUGAAGGN | 716 | NCCUUCAGAACGAAAGUUN | 935-953 | 933 | ||
243 | CCAUAUAACUUUCGUUCUG | 717 | CAGAACGAAAGUUAUAUGG | 940-958 | 938 | ||
244 | UCAUAUAACUUUCGUUCUG | 718 | CAGAACGAAAGUUAUAUGA | 940-958 | 938 | ||
245 | ACAUAUAACUUUCGUUCUG | 719 | CAGAACGAAAGUUAUAUGU | 940-958 | 938 | ||
246 | NCAUAUAACUUUCGUUCUG | 720 | CAGAACGAAAGUUAUAUGN | 940-958 | 938 | ||
247 | NCAUAUAACUUUCGUUCUN | 721 | NAGAACGAAAGUUAUAUGN | 940-958 | 938 | ||
248 | UUCCAUAUAACUUUCGUUC | 722 | GAACGAAAGUUAUAUGGAA | 942-960 | 940 | ||
249 | AUCCAUAUAACUUUCGUUC | 723 | GAACGAAAGUUAUAUGGAU | 942-960 | 940 | ||
250 | NUCCAUAUAACUUUCGUUC | 724 | GAACGAAAGUUAUAUGGAN | 942-960 | 940 | ||
251 | NUCCAUAUAACUUUCGUUN | 725 | NAACGAAAGUUAUAUGGAN | 942-960 | 940 | ||
252 | UGAUUUUCCAUAUAACUUU | 726 | AAAGUUAUAUGGAAAAUCA | 947-965 | 945 | ||
253 | AGAUUUUCCAUAUAACUUU | 727 | AAAGUUAUAUGGAAAAUCU | 947-965 | 945 | ||
254 | NGAUUUUCCAUAUAACUUU | 728 | AAAGUUAUAUGGAAAAUCN | 947-965 | 945 | ||
255 | NGAUUUUCCAUAUAACUUN | 729 | NAAGUUAUAUGGAAAAUCN | 947-965 | 945 | ||
256 | AAAGAGUGGUGAUUUUCCA | 730 | UGGAAAAUCACCACUCUUU | 956-974 | 954 | ||
257 | UAAGAGUGGUGAUUUUCCA | 731 | UGGAAAAUCACCACUCUUA | 956-974 | 954 | ||
258 | NAAGAGUGGUGAUUUUCCA | 732 | UGGAAAAUCACCACUCUUN | 956-974 | 954 | ||
259 | NAAGAGUGGUGAUUUUCCN | 733 | NGGAAAAUCACCACUCUUN | 956-974 | 954 | ||
260 | CCAAAGAGUGGUGAUUUUC | 734 | GAAAAUCACCACUCUUUGG | 958-976 | 956 | ||
261 | UCAAAGAGUGGUGAUUUUC | 735 | GAAAAUCACCACUCUUUGA | 958-976 | 956 | ||
262 | ACAAAGAGUGGUGAUUUUC | 736 | GAAAAUCACCACUCUUUGU | 958-976 | 956 | ||
263 | NCAAAGAGUGGUGAUUUUC | 737 | GAAAAUCACCACUCUUUGN | 958-976 | 956 | ||
264 | NCAAAGAGUGGUGAUUUUN | 738 | NAAAAUCACCACUCUUUGN | 958-976 | 956 | ||
265 | CACAGGGUCUCCCACUUUG | 739 | CAAAGUGGGAGACCCUGUG | 1010-1028 | 1008 | ||
266 | UACAGGGUCUCCCACUUUG | 740 | CAAAGUGGGAGACCCUGUA | 1010-1028 | 1008 | ||
267 | AACAGGGUCUCCCACUUUG | 741 | CAAAGUGGGAGACCCUGUU | 1010-1028 | 1008 | ||
268 | NACAGGGUCUCCCACUUUG | 742 | CAAAGUGGGAGACCCUGUN | 1010-1028 | 1008 | ||
269 | NACAGGGUCUCCCACUUUN | 743 | NAAAGUGGGAGACCCUGUN | 1010-1028 | 1008 | ||
270 | ACACAGGGUCUCCCACUUU | 744 | AAAGUGGGAGACCCUGUGU | 1011-1029 | 1009 | ||
271 | UCACAGGGUCUCCCACUUU | 745 | AAAGUGGGAGACCCUGUGA | 1011-1029 | 1009 | ||
272 | NCACAGGGUCUCCCACUUU | 746 | AAAGUGGGAGACCCUGUGN | 1011-1029 | 1009 | ||
273 | NCACAGGGUCUCCCACUUN | 747 | NAAGUGGGAGACCCUGUGN | 1011-1029 | 1009 | ||
274 | GGUACACAGGGUCUCCCAC | 748 | GUGGGAGACCCUGUGUACC | 1014-1032 | 1012 | ||
275 | UGUACACAGGGUCUCCCAC | 749 | GUGGGAGACCCUGUGUACA | 1014-1032 | 1012 | ||
276 | AGUACACAGGGUCUCCCAC | 750 | GUGGGAGACCCUGUGUACU | 1014-1032 | 1012 | ||
277 | NGUACACAGGGUCUCCCAC | 751 | GUGGGAGACCCUGUGUACN | 1014-1032 | 1012 | ||
278 | NGUACACAGGGUCUCCCAN | 752 | NUGGGAGACCCUGUGUACN | 1014-1032 | 1012 | ||
279 | AGGUACACAGGGUCUCCCA | 753 | UGGGAGACCCUGUGUACCU | 1015-1033 | 1013 | ||
280 | UGGUACACAGGGUCUCCCA | 754 | UGGGAGACCCUGUGUACCA | 1015-1033 | 1013 | ||
281 | NGGUACACAGGGUCUCCCA | 755 | UGGGAGACCCUGUGUACCN | 1015-1033 | 1013 | ||
282 | NGGUACACAGGGUCUCCCN | 756 | NGGGAGACCCUGUGUACCN | 1015-1033 | 1013 | ||
283 | CAGGUACACAGGGUCUCCC | 757 | GGGAGACCCUGUGUACCUG | 1016-1034 | 1014 | ||
284 | UAGGUACACAGGGUCUCCC | 758 | GGGAGACCCUGUGUACCUA | 1016-1034 | 1014 | ||
285 | AAGGUACACAGGGUCUCCC | 759 | GGGAGACCCUGUGUACCUU | 1016-1034 | 1014 | ||
286 | NAGGUACACAGGGUCUCCC | 760 | GGGAGACCCUGUGUACCUN | 1016-1034 | 1014 | ||
287 | NAGGUACACAGGGUCUCCN | 761 | NGGAGACCCUGUGUACCUN | 1016-1034 | 1014 | ||
288 | GCAUCUAAUAUUCCAGGAC | 762 | GUCCUGGAAUAUUAGAUGC | 1059-1077 | 1057 | ||
289 | UCAUCUAAUAUUCCAGGAC | 763 | GUCCUGGAAUAUUAGAUGA | 1059-1077 | 1057 | ||
290 | ACAUCUAAUAUUCCAGGAC | 764 | GUCCUGGAAUAUUAGAUGU | 1059-1077 | 1057 | ||
291 | NCAUCUAAUAUUCCAGGAC | 765 | GUCCUGGAAUAUUAGAUGN | 1059-1077 | 1057 | ||
292 | NCAUCUAAUAUUCCAGGAN | 766 | NUCCUGGAAUAUUAGAUGN | 1059-1077 | 1057 | ||
293 | GGCAUCUAAUAUUCCAGGA | 767 | UCCUGGAAUAUUAGAUGCC | 1060-1078 | 1058 | ||
294 | AGCAUCUAAUAUUCCAGGA | 768 | UCCUGGAAUAUUAGAUGCU | 1060-1078 | 1058 | ||
295 | UGCAUCUAAUAUUCCAGGA | 769 | UCCUGGAAUAUUAGAUGCA | 1060-1078 | 1058 | ||
296 | NGCAUCUAAUAUUCCAGGA | 770 | UCCUGGAAUAUUAGAUGCN | 1060-1078 | 1058 | ||
297 | NGCAUCUAAUAUUCCAGGN | 771 | NCCUGGAAUAUUAGAUGCN | 1060-1078 | 1058 | ||
298 | AGGCAUCUAAUAUUCCAGG | 772 | CCUGGAAUAUUAGAUGCCU | 1061-1079 | 1059 | ||
299 | UGGCAUCUAAUAUUCCAGG | 773 | CCUGGAAUAUUAGAUGCCA | 1061-1079 | 1059 | ||
300 | NGGCAUCUAAUAUUCCAGG | 774 | CCUGGAAUAUUAGAUGCCN | 1061-1079 | 1059 | ||
301 | NGGCAUCUAAUAUUCCAGN | 775 | NCUGGAAUAUUAGAUGCCN | 1061-1079 | 1059 | ||
302 | AAGGCAUCUAAUAUUCCAG | 776 | CUGGAAUAUUAGAUGCCUU | 1062-1080 | 1060 | ||
303 | UAGGCAUCUAAUAUUCCAG | 777 | CUGGAAUAUUAGAUGCCUA | 1062-1080 | 1060 | ||
304 | NAGGCAUCUAAUAUUCCAG | 778 | CUGGAAUAUUAGAUGCCUN | 1062-1080 | 1060 | ||
305 | NAGGCAUCUAAUAUUCCAN | 779 | NUGGAAUAUUAGAUGCCUN | 1062-1080 | 1060 | ||
306 | AGUGUUGUCAUUUUUGAGA | 780 | UCUCAAAAAUGACAACACU | 1091-1109 | 1089 | ||
307 | UGUGUUGUCAUUUUUGAGA | 781 | UCUCAAAAAUGACAACACA | 1091-1109 | 1089 | ||
308 | NGUGUUGUCAUUUUUGAGA | 782 | UCUCAAAAAUGACAACACN | 1091-1109 | 1089 | ||
309 | NGUGUUGUCAUUUUUGAGN | 783 | NCUCAAAAAUGACAACACN | 1091-1109 | 1089 | ||
310 | CAUGCUUCAAGUGUUGUCA | 784 | UGACAACACUUGAAGCAUG | 1100-1118 | 1098 | ||
311 | UAUGCUUCAAGUGUUGUCA | 785 | UGACAACACUUGAAGCAUA | 1100-1118 | 1098 | ||
312 | AAUGCUUCAAGUGUUGUCA | 786 | UGACAACACUUGAAGCAUU | 1100-1118 | 1098 | ||
313 | NAUGCUUCAAGUGUUGUCA | 787 | UGACAACACUUGAAGCAUN | 1100-1118 | 1098 | ||
314 | NAUGCUUCAAGUGUUGUCN | 788 | NGACAACACUUGAAGCAUN | 1100-1118 | 1098 | ||
315 | ACACCAUGCUUCAAGUGUU | 789 | AACACUUGAAGCAUGGUGU | 1104-1122 | 1102 | ||
316 | UCACCAUGCUUCAAGUGUU | 790 | AACACUUGAAGCAUGGUGA | 1104-1122 | 1102 | ||
317 | NCACCAUGCUUCAAGUGUU | 791 | AACACUUGAAGCAUGGUGN | 1104-1122 | 1102 | ||
318 | NCACCAUGCUUCAAGUGUN | 792 | AACACUUGAAGCAUGGUGN | 1104-1122 | 1102 | ||
319 | UUCUGAAACACCAUGCUUC | 793 | GAAGCAUGGUGUUUCAGAA | 1111-1129 | 1109 | ||
320 | AUCUGAAACACCAUGCUUC | 794 | GAAGCAUGGUGUUUCAGAU | 1111-1129 | 1109 | ||
321 | NUCUGAAACACCAUGCUUC | 795 | GAAGCAUGGUGUUUCAGAN | 1111-1129 | 1109 | ||
322 | NUCUGAAACACCAUGCUUN | 796 | NAAGCAUGGUGUUUCAGAN | 1111-1129 | 1109 | ||
323 | AGUUCUGAAACACCAUGCU | 797 | AGCAUGGUGUUUCAGAACU | 1113-1131 | 1111 | ||
324 | UGUUCUGAAACACCAUGCU | 798 | AGCAUGGUGUUUCAGAACA | 1113-1131 | 1111 | ||
325 | NGUUCUGAAACACCAUGCU | 799 | AGCAUGGUGUUUCAGAACN | 1113-1131 | 1111 | ||
326 | NGUUCUGAAACACCAUGCN | 800 | NGCAUGGUGUUUCAGAACN | 1113-1131 | 1111 | ||
327 | AUGUAGAGGUCUCAGUUCU | 801 | AGAACUGAGACCUCUACAU | 1126-1144 | 1124 | ||
328 | UUGUAGAGGUCUCAGUUCU | 802 | AGAACUGAGACCUCUACAA | 1126-1144 | 1124 | ||
329 | NUGUAGAGGUCUCAGUUCU | 803 | AGAACUGAGACCUCUACAN | 1126-1144 | 1124 | ||
330 | NUGUAGAGGUCUCAGUUCN | 804 | NGAACUGAGACCUCUACAN | 1126-1144 | 1124 | ||
331 | AAAGAAAAUGUAGAGGUCU | 805 | AGACCUCUACAUUUUCUUU | 1133-1151 | 1131 | ||
332 | UAAGAAAAUGUAGAGGUCU | 806 | AGACCUCUACAUUUUCUUA | 1133-1151 | 1131 | ||
333 | NAAGAAAAUGUAGAGGUCU | 807 | AGACCUCUACAUUUUCUUN | 1133-1151 | 1131 | ||
334 | NAAGAAAAUGUAGAGGUCN | 808 | NGACCUCUACAUUUUCUUN | 1133-1151 | 1131 | ||
335 | ACGAAAAAUGUGAAAAUCA | 809 | UGAUUUUCACAUUUUUCGU | 1159-1177 | 1157 | ||
336 | UCGAAAAAUGUGAAAAUCA | 810 | UGAUUUUCACAUUUUUCGA | 1159-1177 | 1157 | ||
337 | NCGAAAAAUGUGAAAAUCA | 811 | UGAUUUUCACAUUUUUCGN | 1159-1177 | 1157 | ||
338 | NCGAAAAAUGUGAAAAUCN | 812 | NGAUUUUCACAUUUUUCGN | 1159-1177 | 1157 | ||
339 | CAUUGAAGCAUUGAGACAC | 813 | GUGUCUCAAUGCUUCAAUG | 1192-1210 | 1190 | ||
340 | UAUUGAAGCAUUGAGACAC | 814 | GUGUCUCAAUGCUUCAAUA | 1192-1210 | 1190 | ||
341 | AAUUGAAGCAUUGAGACAC | 815 | GUGUCUCAAUGCUUCAAUU | 1192-1210 | 1190 | ||
342 | NAUUGAAGCAUUGAGACAC | 816 | GUGUCUCAAUGCUUCAAUN | 1192-1210 | 1190 | ||
343 | NAUUGAAGCAUUGAGACAN | 817 | NUGUCUCAAUGCUUCAAUN | 1192-1210 | 1190 | ||
344 | GGACAUUGAAGCAUUGAGA | 818 | UCUCAAUGCUUCAAUGUCC | 1195-1213 | 1193 | ||
345 | UGACAUUGAAGCAUUGAGA | 819 | UCUCAAUGCUUCAAUGUCA | 1195-1213 | 1193 | ||
346 | AGACAUUGAAGCAUUGAGA | 820 | UCUCAAUGCUUCAAUGUCU | 1195-1213 | 1193 | ||
347 | NGACAUUGAAGCAUUGAGA | 821 | UCUCAAUGCUUCAAUGUCN | 1195-1213 | 1193 | ||
348 | NGACAUUGAAGCAUUGAGN | 822 | NCUCAAUGCUUCAAUGUCN | 1195-1213 | 1193 | ||
349 | UUACUGAAGUCCUACUAAG | 823 | CUUAGUAGGACUUCAGUAA | 1248-1266 | 1246 | ||
350 | AUACUGAAGUCCUACUAAG | 824 | CUUAGUAGGACUUCAGUAU | 1248-1266 | 1246 | ||
351 | NUACUGAAGUCCUACUAAG | 825 | CUUAGUAGGACUUCAGUAN | 1248-1266 | 1246 | ||
352 | NUACUGAAGUCCUACUAAN | 826 | NUUAGUAGGACUUCAGUAN | 1248-1266 | 1246 | ||
353 | CAGAAUCCUGUCUUGUCAU | 827 | AUGACAAGACAGGAUUCUG | 1276-1294 | 1274 | ||
354 | UAGAAUCCUGUCUUGUCAU | 828 | AUGACAAGACAGGAUUCUA | 1276-1294 | 1274 | ||
355 | AAGAAUCCUGUCUUGUCAU | 829 | AUGACAAGACAGGAUUCUU | 1276-1294 | 1274 | ||
356 | NAGAAUCCUGUCUUGUCAU | 830 | AUGACAAGACAGGAUUCUN | 1276-1294 | 1274 | ||
357 | NAGAAUCCUGUCUUGUCAN | 831 | NUGACAAGACAGGAUUCUN | 1276-1294 | 1274 | ||
358 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCA | 832 | UGACAAGACAGGAUUCUGA | 1277-1295 | 1275 | ||
359 | ACAGAAUCCUGUCUUGUCA | 833 | UGACAAGACAGGAUUCUGU | 1277-1295 | 1275 | ||
360 | NCAGAAUCCUGUCUUGUCA | 834 | UGACAAGACAGGAUUCUGN | 1277-1295 | 1275 | ||
361 | NCAGAAUCCUGUCUUGUCN | 835 | NGACAAGACAGGAUUCUGN | 1277-1295 | 1275 | ||
362 | UUCAGAAUCCUGUCUUGUC | 836 | GACAAGACAGGAUUCUGAA | 1278-1296 | 1276 | ||
363 | AUCAGAAUCCUGUCUUGUC | 837 | GACAAGACAGGAUUCUGAU | 1278-1296 | 1276 | ||
364 | NUCAGAAUCCUGUCUUGUC | 838 | GACAAGACAGGAUUCUGAN | 1278-1296 | 1276 | ||
365 | NUCAGAAUCCUGUCUUGUN | 839 | NACAAGACAGGAUUCUGAN | 1278-1296 | 1276 | ||
366 | GGAGUUUUCAGAAUCCUGU | 840 | ACAGGAUUCUGAAAACUCC | 1284-1302 | 1282 | ||
367 | UGAGUUUUCAGAAUCCUGU | 841 | ACAGGAUUCUGAAAACUCA | 1284-1302 | 1282 | ||
368 | AGAGUUUUCAGAAUCCUGU | 842 | ACAGGAUUCUGAAAACUCU | 1284-1302 | 1282 | ||
369 | NGAGUUUUCAGAAUCCUGU | 843 | ACAGGAUUCUGAAAACUCN | 1284-1302 | 1282 | ||
370 | NGAGUUUUCAGAAUCCUGN | 844 | NCAGGAUUCUGAAAACUCN | 1284-1302 | 1282 | ||
371 | UUCCAUAAUCAGUUAAACG | 845 | CGUUUAACUGAUUAUGGAA | 1304-1322 | 1302 | ||
372 | AUCCAUAAUCAGUUAAACG | 846 | CGUUUAACUGAUUAUGGAU | 1304-1322 | 1302 | ||
373 | NUCCAUAAUCAGUUAAACG | 847 | CGUUUAACUGAUUAUGGAN | 1304-1322 | 1302 | ||
374 | NUCCAUAAUCAGUUAAACN | 848 | NGUUUAACUGAUUAUGGAN | 1304-1322 | 1302 | ||
375 | AAGAACUAUUCCAUAAUCA | 849 | UGAUUAUGGAAUAGUUCUU | 1312-1330 | 1310 | ||
376 | UAGAACUAUUCCAUAAUCA | 850 | UGAUUAUGGAAUAGUUCUA | 1312-1330 | 1310 | ||
377 | NAGAACUAUUCCAUAAUCA | 851 | UGAUUAUGGAAUAGUUCUN | 1312-1330 | 1310 | ||
378 | NAGAACUAUUCCAUAAUCN | 852 | NGAUUAUGGAAUAGUUCUN | 1312-1330 | 1310 | ||
379 | AGAAAGAACUAUUCCAUAA | 853 | UUAUGGAAUAGUUCUUUCU | 1315-1333 | 1313 | ||
380 | UGAAAGAACUAUUCCAUAA | 854 | UUAUGGAAUAGUUCUUUCA | 1315-1333 | 1313 | ||
381 | NGAAAGAACUAUUCCAUAA | 855 | UUAUGGAAUAGUUCUUUCN | 1315-1333 | 1313 | ||
382 | NGAAAGAACUAUUCCAUAN | 856 | NUAUGGAAUAGUUCUUUCN | 1315-1333 | 1313 | ||
383 | GAGAAAGAACUAUUCCAUA | 857 | UAUGGAAUAGUUCUUUCUC | 1316-1334 | 1314 | ||
384 | UAGAAAGAACUAUUCCAUA | 858 | UAUGGAAUAGUUCUUUCUA | 1316-1334 | 1314 | ||
385 | AAGAAAGAACUAUUCCAUA | 859 | UAUGGAAUAGUUCUUUCUU | 1316-1334 | 1314 | ||
386 | NAGAAAGAACUAUUCCAUA | 860 | UAUGGAAUAGUUCUUUCUN | 1316-1334 | 1314 | ||
387 | NAGAAAGAACUAUUCCAUN | 861 | NAUGGAAUAGUUCUUUCUN | 1316-1334 | 1314 | ||
388 | AGAUAAACGGAGAAGCAGG | 862 | CCUGCUUCUCCGUUUAUCU | 1334-1352 | 1332 | ||
389 | UGAUAAACGGAGAAGCAGG | 863 | CCUGCUUCUCCGUUUAUCA | 1334-1352 | 1332 | ||
390 | NGAUAAACGGAGAAGCAGG | 864 | CCUGCUUCUCCGUUUAUCN | 1334-1352 | 1332 | ||
391 | NGAUAAACGGAGAAGCAGN | 865 | NCUGCUUCUCCGUUUAUCN | 1334-1352 | 1332 | ||
392 | ACAUUCUAGGAUAUUCUUC | 866 | GAAGAAUAUCCUAGAAUGU | 1434-1452 | 1432 | ||
393 | UCAUUCUAGGAUAUUCUUC | 867 | GAAGAAUAUCCUAGAAUGA | 1434-1452 | 1432 | ||
394 | NCAUUCUAGGAUAUUCUUC | 868 | GAAGAAUAUCCUAGAAUGN | 1434-1452 | 1432 | ||
395 | NCAUUCUAGGAUAUUCUUN | 869 | NAAGAAUAUCCUAGAAUGN | 1434-1452 | 1432 | ||
396 | AGAUCCAGAUCUAUGGAAA | 870 | UUUCCAUAGAUCUGGAUCU | 1607-1625 | 1605 | ||
397 | UGAUCCAGAUCUAUGGAAA | 871 | UUUCCAUAGAUCUGGAUCA | 1607-1625 | 1605 | ||
398 | NGAUCCAGAUCUAUGGAAA | 872 | UUUCCAUAGAUCUGGAUCN | 1607-1625 | 1605 | ||
399 | NGAUCCAGAUCUAUGGAAN | 873 | NUUCCAUAGAUCUGGAUCN | 1607-1625 | 1605 | ||
400 | CCAAUGCUGUCUGAGAAGC | 874 | GCUUCUCAGACAGCAUUGG | 1635-1653 | 1633 | ||
401 | UCAAUGCUGUCUGAGAAGC | 875 | GCUUCUCAGACAGCAUUGA | 1635-1653 | 1633 | ||
402 | ACAAUGCUGUCUGAGAAGC | 876 | GCUUCUCAGACAGCAUUGU | 1635-1653 | 1633 | ||
403 | NCAAUGCUGUCUGAGAAGC | 877 | GCUUCUCAGACAGCAUUGN | 1635-1653 | 1633 | ||
404 | NCAAUGCUGUCUGAGAAGN | 878 | NCUUCUCAGACAGCAUUGN | 1635-1653 | 1633 | ||
405 | AUCCAAUGCUGUCUGAGAA | 879 | UUCUCAGACAGCAUUGGAU | 1637-1655 | 1635 | ||
406 | UUCCAAUGCUGUCUGAGAA | 880 | UUCUCAGACAGCAUUGGAA | 1637-1655 | 1635 | ||
407 | NUCCAAUGCUGUCUGAGAA | 881 | UUCUCAGACAGCAUUGGAN | 1637-1655 | 1635 | ||
408 | NUCCAAUGCUGUCUGAGAN | 882 | NUCUCAGACAGCAUUGGAN | 1637-1655 | 1635 | ||
409 | UUAGGAAAUCCAAUGCUGU | 883 | ACAGCAUUGGAUUUCCUAA | 1644-1662 | 1642 | ||
410 | AUAGGAAAUCCAAUGCUGU | 884 | ACAGCAUUGGAUUUCCUAU | 1644-1662 | 1642 | ||
411 | NUAGGAAAUCCAAUGCUGU | 885 | ACAGCAUUGGAUUUCCUAN | 1644-1662 | 1642 | ||
412 | NUAGGAAAUCCAAUGCUGN | 886 | NCAGCAUUGGAUUUCCUAN | 1644-1662 | 1642 | ||
413 | ACCUUUAGGAAAUCCAAUG | 887 | CAUUGGAUUUCCUAAAGGU | 1648-1666 | 1646 | ||
414 | UCCUUUAGGAAAUCCAAUG | 888 | CAUUGGAUUUCCUAAAGGA | 1648-1666 | 1646 | ||
415 | NCCUUUAGGAAAUCCAAUG | 889 | CAUUGGAUUUCCUAAAGGN | 1648-1666 | 1646 | ||
416 | NCCUUUAGGAAAUCCAAUN | 890 | NAUUGGAUUUCCUAAAGGN | 1648-1666 | 1646 | ||
417 | GCACCUUUAGGAAAUCCAA | 891 | UUGGAUUUCCUAAAGGUGC | 1650-1668 | 1648 | ||
418 | UCACCUUUAGGAAAUCCAA | 892 | UUGGAUUUCCUAAAGGUGA | 1650-1668 | 1648 | ||
419 | ACACCUUUAGGAAAUCCAA | 893 | UUGGAUUUCCUAAAGGUGU | 1650-1668 | 1648 | ||
420 | NCACCUUUAGGAAAUCCAA | 894 | UUGGAUUUCCUAAAGGUGN | 1650-1668 | 1648 | ||
421 | NCACCUUUAGGAAAUCCAN | 895 | NUGGAUUUCCUAAAGGUGN | 1650-1668 | 1648 | ||
422 | CCCUUUAAAGGUUUUCAGU | 896 | ACUGAAAACCUUUAAAGGG | 1819-1837 | 1817 | ||
423 | UCCUUUAAAGGUUUUCAGU | 897 | ACUGAAAACCUUUAAAGGA | 1819-1837 | 1817 | ||
424 | ACCUUUAAAGGUUUUCAGU | 898 | ACUGAAAACCUUUAAAGGU | 1819-1837 | 1817 | ||
425 | NCCUUUAAAGGUUUUCAGU | 899 | ACUGAAAACCUUUAAAGGN | 1819-1837 | 1817 | ||
426 | NCCUUUAAAGGUUUUCAGN | 900 | NCUGAAAACCUUUAAAGGN | 1819-1837 | 1817 | ||
427 | CAACUGACAUAUGCUUUCC | 901 | GGAAAGCAUAUGUCAGUUG | 1844-1862 | 1842 | ||
428 | UAACUGACAUAUGCUUUCC | 902 | GGAAAGCAUAUGUCAGUUA | 1844-1862 | 1842 | ||
429 | AAACUGACAUAUGCUUUCC | 903 | GGAAAGCAUAUGUCAGUUU | 1844-1862 | 1842 | ||
430 | NAACUGACAUAUGCUUUCC | 904 | GGAAAGCAUAUGUCAGUUN | 1844-1862 | 1842 | ||
431 | NAACUGACAUAUGCUUUCN | 905 | NGAAAGCAUAUGUCAGUUN | 1844-1862 | 1842 | ||
432 | GGGUUUUAAACAACUGACA | 906 | UGUCAGUUGUUUAAAACCC | 1854-1872 | 1852 | ||
433 | UGGUUUUAAACAACUGACA | 907 | UGUCAGUUGUUUAAAACCA | 1854-1872 | 1852 | ||
434 | AGGUUUUAAACAACUGACA | 908 | UGUCAGUUGUUUAAAACCU | 1854-1872 | 1852 | ||
435 | NGGUUUUAAACAACUGACA | 909 | UGUCAGUUGUUUAAAACCN | 1854-1872 | 1852 | ||
436 | NGGUUUUAAACAACUGACN | 910 | NGUCAGUUGUUUAAAACCN | 1854-1872 | 1852 | ||
437 | UUCAUCAGAUCUUAGAGUU | 911 | AACUCUAAGAUCUGAUGAA | 1899-1917 | 1897 | ||
438 | AUCAUCAGAUCUUAGAGUU | 912 | AACUCUAAGAUCUGAUGAU | 1899-1917 | 1897 | ||
439 | NUCAUCAGAUCUUAGAGUU | 913 | AACUCUAAGAUCUGAUGAN | 1899-1917 | 1897 | ||
440 | NUCAUCAGAUCUUAGAGUN | 914 | NACUCUAAGAUCUGAUGAN | 1899-1917 | 1897 | ||
441 | CUUCAUCAGAUCUUAGAGU | 915 | ACUCUAAGAUCUGAUGAAG | 1900-1918 | 1898 | ||
442 | UUUCAUCAGAUCUUAGAGU | 916 | ACUCUAAGAUCUGAUGAAA | 1900-1918 | 1898 | ||
443 | AUUCAUCAGAUCUUAGAGU | 917 | ACUCUAAGAUCUGAUGAAU | 1900-1918 | 1898 | ||
444 | NUUCAUCAGAUCUUAGAGU | 918 | ACUCUAAGAUCUGAUGAAN | 1900-1918 | 1898 | ||
445 | NUUCAUCAGAUCUUAGAGN | 919 | NCUCUAAGAUCUGAUGAAN | 1900-1918 | 1898 | ||
446 | UACUUCAUCAGAUCUUAGA | 920 | UCUAAGAUCUGAUGAAGUA | 1902-1920 | 1900 | ||
447 | AACUUCAUCAGAUCUUAGA | 921 | UCUAAGAUCUGAUGAAGUU | 1902-1920 | 1900 | ||
448 | NACUUCAUCAGAUCUUAGA | 922 | UCUAAGAUCUGAUGAAGUN | 1902-1920 | 1900 | ||
449 | NACUUCAUCAGAUCUUAGN | 923 | NCUAAGAUCUGAUGAAGUN | 1902-1920 | 1900 | ||
450 | CAAAGGACAAAAUGGCAAU | 924 | AUUGCCAUUUUGUCCUUUG | 1929-1947 | 1927 | ||
451 | UAAAGGACAAAAUGGCAAU | 925 | AUUGCCAUUUUGUCCUUUA | 1929-1947 | 1927 | ||
452 | AAAAGGACAAAAUGGCAAU | 926 | AUUGCCAUUUUGUCCUUUU | 1929-1947 | 1927 | ||
453 | NAAAGGACAAAAUGGCAAU | 927 | AUUGCCAUUUUGUCCUUUN | 1929-1947 | 1927 | ||
454 | NAAAGGACAAAAUGGCAAN | 928 | NUUGCCAUUUUGUCCUUUN | 1929-1947 | 1927 | ||
455 | UAAUCAAAGGACAAAAUGG | 929 | CCAUUUUGUCCUUUGAUUA | 1933-1951 | 1931 | ||
456 | AAAUCAAAGGACAAAAUGG | 930 | CCAUUUUGUCCUUUGAUUU | 1933-1951 | 1931 | ||
457 | NAAUCAAAGGACAAAAUGG | 931 | CCAUUUUGUCCUUUGAUUN | 1933-1951 | 1931 | ||
458 | NAAUCAAAGGACAAAAUGN | 932 | NCAUUUUGUCCUUUGAUUN | 1933-1951 | 1931 | ||
459 | CAAGUUUAGUCAACUUCCC | 933 | GGGAAGUUGACUAAACUUG | 1956-1974 | 1954 | ||
460 | UAAGUUUAGUCAACUUCCC | 934 | GGGAAGUUGACUAAACUUA | 1956-1974 | 1954 | ||
461 | AAAGUUUAGUCAACUUCCC | 935 | GGGAAGUUGACUAAACUUU | 1956-1974 | 1954 | ||
462 | NAAGUUUAGUCAACUUCCC | 936 | GGGAAGUUGACUAAACUUN | 1956-1974 | 1954 | ||
463 | NAAGUUUAGUCAACUUCCN | 937 | NGGAAGUUGACUAAACUUN | 1956-1974 | 1954 | ||
464 | UCAAGUUUAGUCAACUUCC | 938 | GGAAGUUGACUAAACUUGA | 1957-1975 | 1955 | ||
465 | ACAAGUUUAGUCAACUUCC | 939 | GGAAGUUGACUAAACUUGU | 1957-1975 | 1955 | ||
466 | NCAAGUUUAGUCAACUUCC | 940 | GGAAGUUGACUAAACUUGN | 1957-1975 | 1955 | ||
467 | NCAAGUUUAGUCAACUUCN | 941 | NGAAGUUGACUAAACUUGN | 1957-1975 | 1955 | ||
468 | UAGCUUCCAUUUAUUCACA | 942 | UGUGAAUAAAUGGAAGCUA | 1992-2010 | 1990 | ||
469 | AAGCUUCCAUUUAUUCACA | 943 | UGUGAAUAAAUGGAAGCUU | 1992-2010 | 1990 | ||
470 | NAGCUUCCAUUUAUUCACA | 944 | UGUGAAUAAAUGGAAGCUN | 1992-2010 | 1990 | ||
471 | NAGCUUCCAUUUAUUCACN | 945 | NGUGAAUAAAUGGAAGCUN | 1992-2010 | 1990 | ||
472 | AGUAAGAUCUGAAACUAGU | 946 | ACUAGUUUCAGAUCUUACU | 2016-2034 | 2014 | ||
473 | UGUAAGAUCUGAAACUAGU | 947 | ACUAGUUUCAGAUCUUACA | 2016-2034 | 2014 | ||
474 | NGUAAGAUCUGAAACUAGU | 948 | ACUAGUUUCAGAUCUUACN | 2016-2034 | 2014 | ||
475 | NGUAAGAUCUGAAACUAGN | 949 | NCUAGUUUCAGAUCUUACN | 2016-2034 | 2014 | ||
476 | AGUUAGUAAGAUCUGAAAC | 950 | GUUUCAGAUCUUACUAACU | 2020-2038 | 2018 | ||
477 | UGUUAGUAAGAUCUGAAAC | 951 | GUUUCAGAUCUUACUAACA | 2020-2038 | 2018 | ||
478 | NGUUAGUAAGAUCUGAAAC | 952 | GUUUCAGAUCUUACUAACN | 2020-2038 | 2018 | ||
479 | NGUUAGUAAGAUCUGAAAN | 953 | NUUUCAGAUCUUACUAACN | 2020-2038 | 2018 | ||
480 | GAAGUUAGUAAGAUCUGAA | 954 | UUCAGAUCUUACUAACUUC | 2022-2040 | 2020 | ||
481 | UAAGUUAGUAAGAUCUGAA | 955 | UUCAGAUCUUACUAACUUA | 2022-2040 | 2020 | ||
482 | AAAGUUAGUAAGAUCUGAA | 956 | UUCAGAUCUUACUAACUUU | 2022-2040 | 2020 | ||
483 | NAAGUUAGUAAGAUCUGAA | 957 | UUCAGAUCUUACUAACUUN | 2022-2040 | 2020 | ||
484 | NAAGUUAGUAAGAUCUGAN | 958 | NUCAGAUCUUACUAACUUN | 2022-2040 | 2020 | ||
485 | CCAUAAAACAAGCACAUGC | 959 | GCAUGUGCUUGUUUUAUGG | 2632-2650 | 2630 | ||
486 | UCAUAAAACAAGCACAUGC | 960 | GCAUGUGCUUGUUUUAUGA | 2632-2650 | 2630 | ||
487 | ACAUAAAACAAGCACAUGC | 961 | GCAUGUGCUUGUUUUAUGU | 2632-2650 | 2630 | ||
488 | NCAUAAAACAAGCACAUGC | 962 | GCAUGUGCUUGUUUUAUGN | 2632-2650 | 2630 | ||
489 | NCAUAAAACAAGCACAUGN | 963 | NCAUGUGCUUGUUUUAUGN | 2632-2650 | 2630 | ||
490 | CUGAACACUUCGCUUUGUC | 964 | GACAAAGCGAAGUGUUCAG | 2781-2799 | 2779 | ||
491 | UUGAACACUUCGCUUUGUC | 965 | GACAAAGCGAAGUGUUCAA | 2781-2799 | 2779 | ||
492 | AUGAACACUUCGCUUUGUC | 966 | GACAAAGCGAAGUGUUCAU | 2781-2799 | 2779 | ||
493 | NUGAACACUUCGCUUUGUC | 967 | GACAAAGCGAAGUGUUCAN | 2781-2799 | 2779 | ||
494 | NUGAACACUUCGCUUUGUN | 968 | NACAAAGCGAAGUGUUCAN | 2781-2799 | 2779 | ||
495 | AGAUUCUAGAGGUCACUGG | 969 | CCAGUGACCUCUAGAAUCU | 3192-3210 | 3190 | ||
496 | UGAUUCUAGAGGUCACUGG | 970 | CCAGUGACCUCUAGAAUCA | 3192-3210 | 3190 | ||
497 | NGAUUCUAGAGGUCACUGG | 971 | CCAGUGACCUCUAGAAUCN | 3192-3210 | 3190 | ||
498 | NGAUUCUAGAGGUCACUGN | 972 | NCAGUGACCUCUAGAAUCN | 3192-3210 | 3190 | ||
499 | UGGAAUAGUGUGCAAAUGC | 973 | GCAUUUGCACACUAUUCCA | 3334-3352 | 3332 | ||
500 | AGGAAUAGUGUGCAAAUGC | 974 | GCAUUUGCACACUAUUCCU | 3334-3352 | 3332 | ||
501 | NGGAAUAGUGUGCAAAUGC | 975 | GCAUUUGCACACUAUUCCN | 3334-3352 | 3332 | ||
502 | NGGAAUAGUGUGCAAAUGN | 976 | NCAUUUGCACACUAUUCCN | 3334-3352 | 3332 | ||
503 | CUGAUCUCAAACAUCUGUC | 977 | GACAGAUGUUUGAGAUCAG | 3414-3432 | 3412 | ||
504 | UUGAUCUCAAACAUCUGUC | 978 | GACAGAUGUUUGAGAUCAA | 3414-3432 | 3412 | ||
505 | AUGAUCUCAAACAUCUGUC | 979 | GACAGAUGUUUGAGAUCAU | 3414-3432 | 3412 | ||
506 | NUGAUCUCAAACAUCUGUC | 980 | GACAGAUGUUUGAGAUCAN | 3414-3432 | 3412 | ||
507 | NUGAUCUCAAACAUCUGUN | 981 | NACAGAUGUUUGAGAUCAN | 3414-3432 | 3412 | ||
508 | CAGCAUAAGUUGCCACACA | 982 | UGUGUGGCAACUUAUGCUG | 3466-3484 | 3464 | ||
509 | UAGCAUAAGUUGCCACACA | 983 | UGUGUGGCAACUUAUGCUA | 3466-3484 | 3464 | ||
510 | AAGCAUAAGUUGCCACACA | 984 | UGUGUGGCAACUUAUGCUU | 3466-3484 | 3464 | ||
511 | NAGCAUAAGUUGCCACACA | 985 | UGUGUGGCAACUUAUGCUN | 3466-3484 | 3464 | ||
512 | NAGCAUAAGUUGCCACACN | 986 | NGUGUGGCAACUUAUGCUN | 3466-3484 | 3464 | ||
513 | CCACAAUCAAGGUCUGGUC | 987 | GACCAGACCUUGAUUGUGG | 3993-4011 | 3991 | ||
514 | UCACAAUCAAGGUCUGGUC | 988 | GACCAGACCUUGAUUGUGA | 3993-4011 | 3991 | ||
515 | ACACAAUCAAGGUCUGGUC | 989 | GACCAGACCUUGAUUGUGU | 3993-4011 | 3991 | ||
516 | NCACAAUCAAGGUCUGGUC | 990 | GACCAGACCUUGAUUGUGN | 3993-4011 | 3991 | ||
517 | NCACAAUCAAGGUCUGGUN | 991 | NACCAGACCUUGAUUGUGN | 3993-4011 | 3991 | ||
518 | AGAAAGAGAGUGCUUCUCC | 992 | GGAGAAGCACUCUCUUUCU | 4502-4520 | 4500 | ||
519 | UGAAAGAGAGUGCUUCUCC | 993 | GGAGAAGCACUCUCUUUCA | 4502-4520 | 4500 | ||
520 | NGAAAGAGAGUGCUUCUCC | 994 | GGAGAAGCACUCUCUUUCN | 4502-4520 | 4500 | ||
521 | NGAAAGAGAGUGCUUCUCN | 995 | NGAGAAGCACUCUCUUUCN | 4502-4520 | 4500 | ||
522 | GGUUAGAGAGAGUUUGGUU | 996 | AACCAAACUCUCUCUAACC | 4584-4602 | 4582 | ||
523 | UGUUAGAGAGAGUUUGGUU | 997 | AACCAAACUCUCUCUAACA | 4584-4602 | 4582 | ||
524 | AGUUAGAGAGAGUUUGGUU | 998 | AACCAAACUCUCUCUAACU | 4584-4602 | 4582 | ||
525 | NGUUAGAGAGAGUUUGGUU | 999 | AACCAAACUCUCUCUAACN | 4584-4602 | 4582 | ||
526 | NGUUAGAGAGAGUUUGGUN | 1000 | NACCAAACUCUCUCUAACN | 4584-4602 | 4582 | ||
527 | CAAGGUUAGAGAGAGUUUG | 1001 | CAAACUCUCUCUAACCUUG | 4587-4605 | 4585 | ||
528 | UAAGGUUAGAGAGAGUUUG | 1002 | CAAACUCUCUCUAACCUUA | 4587-4605 | 4585 | ||
529 | AAAGGUUAGAGAGAGUUUG | 1003 | CAAACUCUCUCUAACCUUU | 4587-4605 | 4585 | ||
530 | NAAGGUUAGAGAGAGUUUG | 1004 | CAAACUCUCUCUAACCUUN | 4587-4605 | 4585 | ||
531 | NAAGGUUAGAGAGAGUUUN | 1005 | NAAACUCUCUCUAACCUUN | 4587-4605 | 4585 | ||
532 | UGGUUUUGUAACUUACAUC | 1006 | GAUGUAAGUUACAAAACCA | 4625-4643 | 4623 | ||
533 | AGGUUUUGUAACUUACAUC | 1007 | GAUGUAAGUUACAAAACCU | 4625-4643 | 4623 | ||
534 | NGGUUUUGUAACUUACAUC | 1008 | GAUGUAAGUUACAAAACCN | 4625-4643 | 4623 | ||
535 | NGGUUUUGUAACUUACAUN | 1009 | NAUGUAAGUUACAAAACCN | 4625-4643 | 4623 | ||
536 | GCACUUUCAUCACAGGUGG | 1010 | CCACCUGUGAUGAAAGUGC | 4641-4659 | 4639 | ||
537 | UCACUUUCAUCACAGGUGG | 1011 | CCACCUGUGAUGAAAGUGA | 4641-4659 | 4639 | ||
538 | ACACUUUCAUCACAGGUGG | 1012 | CCACCUGUGAUGAAAGUGU | 4641-4659 | 4639 | ||
539 | NCACUUUCAUCACAGGUGG | 1013 | CCACCUGUGAUGAAAGUGN | 4641-4659 | 4639 | ||
540 | NCACUUUCAUCACAGGUGN | 1014 | NCACCUGUGAUGAAAGUGN | 4641-4659 | 4639 | ||
541 | GGAUUAUAAAUGCACCAGU | 1015 | ACUGGUGCAUUUAUAAUCC | 5257-5275 | 5255 | ||
542 | UGAUUAUAAAUGCACCAGU | 1016 | ACUGGUGCAUUUAUAAUCA | 5257-5275 | 5255 | ||
543 | AGAUUAUAAAUGCACCAGU | 1017 | ACUGGUGCAUUUAUAAUCU | 5257-5275 | 5255 | ||
544 | NGAUUAUAAAUGCACCAGU | 1018 | ACUGGUGCAUUUAUAAUCN | 5257-5275 | 5255 | ||
545 | NGAUUAUAAAUGCACCAGN | 1019 | ACUGGUGCAUUUAUAAUCN | 5257-5275 | 5255 | ||
546 | CAGAGUUAUAGUCAGAGCU | 1020 | AGCUCUGACUAUAACUCUG | 5851-5869 | 5849 | ||
547 | UAGAGUUAUAGUCAGAGCU | 1021 | AGCUCUGACUAUAACUCUA | 5851-5869 | 5849 | ||
548 | AAGAGUUAUAGUCAGAGCU | 1022 | AGCUCUGACUAUAACUCUU | 5851-5869 | 5849 | ||
549 | NAGAGUUAUAGUCAGAGCU | 1023 | AGCUCUGACUAUAACUCUN | 5851-5869 | 5849 | ||
550 | NAGAGUUAUAGUCAGAGCN | 1024 | NGCUCUGACUAUAACUCUN | 5851-5869 | 5849 | ||
551 | CUAGGAUGCUCUGUAAAGG | 1025 | CCUUUACAGAGCAUCCUAG | 6145-6163 | 6143 | ||
552 | UUAGGAUGCUCUGUAAAGG | 1026 | CCUUUACAGAGCAUCCUAA | 6145-6163 | 6143 | ||
553 | AUAGGAUGCUCUGUAAAGG | 1027 | CCUUUACAGAGCAUCCUAU | 6145-6163 | 6143 | ||
554 | NUAGGAUGCUCUGUAAAGG | 1028 | CCUUUACAGAGCAUCCUAN | 6145-6163 | 6143 | ||
555 | NUAGGAUGCUCUGUAAAGN | 1029 | NCUUUACAGAGCAUCCUAN | 6145-6163 | 6143 | ||
556 | AGUUAGACUUAACUUAGUU | 1030 | AACUAAGUUAAGUCUAACU | 6296-6314 | 6294 | ||
557 | UGUUAGACUUAACUUAGUU | 1031 | AACUAAGUUAAGUCUAACA | 6296-6314 | 6294 | ||
558 | NGUUAGACUUAACUUAGUU | 1032 | AACUAAGUUAAGUCUAACN | 6296-6314 | 6294 | ||
559 | NGUUAGACUUAACUUAGUN | 1033 | NACUAAGUUAAGUCUAACN | 6296-6314 | 6294 | ||
560 | AGUAAAUUCAAUCUCUCUG | 1034 | CAGAGAGAUUGAAUUUACU | 6410-6428 | 6408 | ||
561 | UGUAAAUUCAAUCUCUCUG | 1035 | CAGAGAGAUUGAAUUUACA | 6410-6428 | 6408 | ||
562 | NGUAAAUUCAAUCUCUCUG | 1036 | CAGAGAGAUUGAAUUUACN | 6410-6428 | 6408 | ||
563 | NGUAAAUUCAAUCUCUCUN | 1037 | NAGAGAGAUUGAAUUUACN | 6410-6428 | 6408 | ||
564 | GGUUGAUGUUAACCAGAGC | 1038 | GCUCUGGUUAACAUCAACC | 6539-6557 | 6537 | ||
565 | UGUUGAUGUUAACCAGAGC | 1039 | GCUCUGGUUAACAUCAACA | 6539-6557 | 6537 | ||
566 | AGUUGAUGUUAACCAGAGC | 1040 | GCUCUGGUUAACAUCAACU | 6539-6557 | 6537 | ||
567 | NGUUGAUGUUAACCAGAGC | 1041 | GCUCUGGUUAACAUCAACN | 6539-6557 | 6537 | ||
568 | NGUUGAUGUUAACCAGAGN | 1042 | NCUCUGGUUAACAUCAACN | 6539-6557 | 6537 | ||
569 | AAACUAUGAUGUCAGGUCA | 1043 | UGACCUGACAUCAUAGUUU | 6835-6853 | 6833 | ||
570 | UAACUAUGAUGUCAGGUCA | 1044 | UGACCUGACAUCAUAGUUA | 6835-6853 | 6833 | ||
571 | NAACUAUGAUGUCAGGUCA | 1045 | UGACCUGACAUCAUAGUUN | 6835-6853 | 6833 | ||
572 | NAACUAUGAUGUCAGGUCN | 1046 | NGACCUGACAUCAUAGUUN | 6835-6853 | 6833 | ||
573 | ACAUUAACGAGAUCUGUUU | 1047 | AAACAGAUCUCGUUAAUGU | 6959-6977 | 6957 | ||
574 | UCAUUAACGAGAUCUGUUU | 1048 | AAACAGAUCUCGUUAAUGA | 6959-6977 | 6957 | ||
575 | NCAUUAACGAGAUCUGUUU | 1049 | AAACAGAUCUCGUUAAUGN | 6959-6977 | 6957 | ||
576 | NCAUUAACGAGAUCUGUUN | 1050 | NAACAGAUCUCGUUAAUGN | 6959-6977 | 6957 | ||
577 | GCAGAAUAUAGCUUUAAGA | 1051 | UCUUAAAGCUAUAUUCUGC | 7210-7228 | 7208 | ||
578 | UCAGAAUAUAGCUUUAAGA | 1052 | UCUUAAAGCUAUAUUCUGA | 7210-7228 | 7208 | ||
579 | ACAGAAUAUAGCUUUAAGA | 1053 | UCUUAAAGCUAUAUUCUGU | 7210-7228 | 7208 | ||
580 | NCAGAAUAUAGCUUUAAGA | 1054 | UCUUAAAGCUAUAUUCUGN | 7210-7228 | 7208 | ||
581 | NCAGAAUAUAGCUUUAAGN | 1055 | NCUUAAAGCUAUAUUCUGN | 7210-7228 | 7208 | ||
包含表2中之序列或由其組成之MARC1 RNAi藥劑有義股及反義股可為經修飾之核苷酸或未經修飾之核苷酸。在一些實施例中,具有包含表2中之序列或由其組成之有義股及反義股序列的MARC1 RNAi藥劑全部或實質上全部為經修飾之核苷酸。
在一些實施例中,本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑之反義股與表2中之反義股序列中的任一者相差0、1、2或3個核苷酸。在一些實施例中,本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑之有義股與表2中之有義股序列中的任一者相差0、1、2或3個核苷酸。
依本文所使用,表2中所揭示之序列中所列的各N可獨立地選自任何及所有核鹼基(包括經修飾之核苷酸及未經修飾之核苷酸兩者上存在的彼等核鹼基)。在一些實施例中,表2中所揭示之序列中所列的N核苷酸具有與另一股上對應位置處之N核苷酸互補的核鹼基。在一些實施例中,表2中所揭示之序列中所列的N核苷酸具有與另一股上對應位置處之N核苷酸不互補的核鹼基。在一些實施例中,表2中所揭示之序列中所列的N核苷酸具有與另一股上對應位置處之N核苷酸相同的核鹼基。在一些實施例中,表2中所揭示之序列中所列的N核苷酸具有與另一股上對應位置處之N核苷酸不同的核鹼基。
某些經修飾之MARC1 RNAi藥劑反義股以及其基礎未經修飾之核鹼基序列提供於表3中。某些經修飾之MARC1 RNAi藥劑有義股以及其基礎未經修飾之核鹼基序列提供於表4中。在形成MARC1 RNAi藥劑時,表3及表4以及上表2中所列的基礎鹼基序列中之每一者的核苷酸中之任一者可為經修飾之核苷酸。
本文所描述之MARC1 RNAi藥劑藉由反義股與有義股黏接而形成。含有表2、表4或表6D中所列序列之有義股可與含有表2或表3或表6D中所列序列之任何反義股雜交,其限制條件為兩個序列在連續15、16、17、18、19、20或21個核苷酸序列內具有至少85%互補性的區域。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑反義股包含表2或表3或表6D中之序列中之任一者的核苷酸序列。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含以下或由以下組成:具有表2、表3、表4或表6D中之序列中之任一者的有義股及反義股之核鹼基序列的雙螺旋體。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含以下或由以下組成:以鈉鹽、混合鹽或游離酸形式製備或提供的雙螺旋體序列。
含有經修飾之核苷酸之反義股的實例提供於表3及表6D中。含有經修飾之核苷酸之有義股的實例提供於表4、表5及表6D中。
依表3、表4及表5中所使用,使用以下記號指示經修飾之核苷酸及連接基團:
A = 腺苷-3'-磷酸酯;
C = 胞苷-3'-磷酸酯;
G = 鳥苷-3'-磷酸酯;
U = 尿苷-3'-磷酸酯
I = 肌苷-3'-磷酸酯
a = 2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸酯
as = 2'-O-甲基腺苷-3'-硫代磷酸酯
c = 2'-O-甲基胞苷-3'-磷酸酯
cs = 2'-O-甲基胞苷-3'-硫代磷酸酯
g = 2'-O-甲基鳥苷-3'-磷酸酯
gs = 2'-O-甲基鳥苷-3'-硫代磷酸酯
t = 2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-磷酸酯
ts = 2'-O-甲基-5-甲基尿苷-3'-硫代磷酸酯
u = 2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸酯
us = 2'-O-甲基尿苷-3'-硫代磷酸酯
i = 2'-O-甲基肌苷-3'-磷酸酯
is = 2'-O-甲基肌苷-3'-硫代磷酸酯
Af = 2'-氟腺苷-3'-磷酸酯
Afs = 2'-氟腺苷-3'-硫代磷酸酯
Cf = 2'-氟胞苷-3'-磷酸酯
Cfs = 2'-氟胞苷-3'-硫代磷酸酯
Gf = 2'-氟鳥苷-3'-磷酸酯
Gfs = 2'-氟鳥苷-3'-硫代磷酸酯
Tf = 2'-氟-5'-甲基尿苷-3'-磷酸酯
Tfs = 2'-氟-5'-甲基尿苷-3'-硫代磷酸酯
Uf = 2'-氟尿苷-3'-磷酸酯
Ufs = 2'-氟尿苷-3'-硫代磷酸酯
A
UNA= 2',3'-開環-腺苷-3'-磷酸酯,參見表7
A
UNAs
= 2',3'-開環-腺苷-3'-硫代磷酸酯,參見表7
C
UNA= 2',3'-開環-胞苷-3'-磷酸酯,參見表7
C
UNAs
= 2',3'-開環-胞苷-3'-硫代磷酸酯,參見表7
G
UNA= 2',3'-開環-鳥苷-3'-磷酸酯,參見表7
G
UNAs
= 2',3'-開環-鳥苷-3'-硫代磷酸酯,參見表7
U
UNA= 2',3'-開環-尿苷-3'-磷酸酯,參見表7
U
UNAs
= 2',3'-開環-尿苷-3'-硫代磷酸酯,參見表7
a_2N = 2'-O-甲基-2-胺基腺苷-3'-磷酸酯,參見表7
a_2Ns = 2'-O-甲基-2-胺基腺苷-3'-硫代磷酸酯,參見表7
(invAb) = 反向無鹼基去氧核糖核苷酸,參見表7
(invAb)s = 反向無鹼基去氧核糖核苷酸-5'-硫代磷酸酯,參見表7
cPrpa = 5'-膦酸環丙酯-2'-O-甲基腺苷-3'-磷酸酯(參見表7)
cPrpas = 5'-膦酸環丙酯-2'-O-甲基腺苷-3'- 硫代磷酸酯(參見表7)
cPrpu = 5'-膦酸環丙酯-2'-O-甲基尿苷-3'-磷酸酯(參見表7)
cPrpus = 5'-膦酸環丙酯-2'-O-甲基尿苷-3'-硫代磷酸酯(參見表7)
一般熟習此項技術者將容易地理解,除非藉由序列(諸如藉由硫代磷酸酯鍵「s」)另外指示,否則當存在於寡核苷酸中時,核苷酸單體藉由5'-3'-磷酸二酯鍵相互連接。一般熟習此項技術者將清楚地理解,包括本文所揭示之經修飾之核苷酸序列中所顯示的硫代磷酸酯鍵替代寡核苷酸中通常存在之磷酸二酯鍵。此外,一般熟習此項技術者將容易地理解,給定寡核苷酸序列之3'端處的末端核苷酸通常將在給定單體之各別3'位置處具有羥基(-OH)而非離體磷酸酯部分。另外,對於本文所揭示之實施例,當檢視個別股5'
3'時,插入反相無鹼基殘基,使得去氧核糖之3'位置連接於各別股上之前一單體的3'端處(參見例如表7)。此外,一般技術者將容易地理解及瞭解,雖然本文所描繪之硫代磷酸酯化學結構通常顯示硫原子上之陰離子,但本文所揭示之發明涵蓋所有硫代磷酸酯互變異構物及共振結構(例如其中硫原子具有雙鍵且陰離子位於氧原子上)。本文中除非另外明確指示,否則在描述本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑及MARC1 RNAi藥劑之組合物時使用一般熟習此項技術者之此類理解。
與本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑一起使用的靶向配位體、靶向基團及連接基團之某些實例提供於下表7中。更具體言之,靶向基團及連接基團(其共同可形成靶向配位體)包括(NAG37)及(NAG37)s,其化學結構提供於下表7中。各有義股及/或反義股可具有本文所列之任何靶向配位體、靶向基團或連接基團,以及與序列之5'及/或3'端結合的其他基團。
表 3.MARC1 RNAi藥劑反義股序列
表 4.MARC1 RNAi藥劑有義股序列(顯示為不具有連接基團、結合物或加帽部分)。
(A
2N)=2-胺基腺苷核苷酸;I=次黃嘌呤(肌苷)核苷酸
表 5.MARC1 RNAi藥劑有義股序列(顯示為具有(NAG37)靶向配位體(結構資訊參見表7))。
(A
2N)=2-胺基腺苷核苷酸;I=次黃嘌呤(肌苷)核苷酸
AS 股ID | 經修飾之反義股 (5' →3') | SEQ ID NO. | 基礎鹼基序列(5' →3') ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列 ) | SEQ ID NO. |
AM16712-AS | usAfsasCfcAfuguuuCfcCfuCfcUfggsu | 1056 | UAACCAUGUUUCCCUCCUGGU | 1542 |
AM16714-AS | usAfscsUfuCfaggaaGfcUfgGfuUfausc | 1057 | UACUUCAGGAAGCUGGUUAUC | 1543 |
AM16716-AS | usAfsasCfaAfgucugCfuAfuUfuGfausg | 1058 | UAACAAGUCUGCUAUUUGAUG | 1544 |
AM16718-AS | usGfsgsAfaCfaagucUfgCfuAfuUfugsg | 1059 | UGGAACAAGUCUGCUAUUUGG | 1545 |
AM16720-AS | usGfsasGfuAfagcaaUfcUfgGfuCfcusc | 1060 | UGAGUAAGCAAUCUGGUCCUC | 1546 |
AM16722-AS | usGfsusCfuGfaguaaGfcAfaUfcUfggsu | 1061 | UGUCUGAGUAAGCAAUCUGGU | 1547 |
AM16724-AS | usUfsgsGfuGfU UNAcugaGfuAfaGfcAfausc | 1062 | UUGGUGUCUGAGUAAGCAAUC | 1548 |
AM16726-AS | usUfsasAfcUfuucuuCfuCfuAfgCfcusg | 1063 | UUAACUUUCUUCUCUAGCCUG | 1549 |
AM16728-AS | usGfsgsUfuAfaaaugCfaUfcUfgGfaasc | 1064 | UGGUUAAAAUGCAUCUGGAAC | 1550 |
AM16730-AS | asAfscsUfuUfcguucUfgAfaGfgGfucsa | 1065 | AACUUUCGUUCUGAAGGGUCA | 1551 |
AM16732-AS | usUfscsCfaUfauaacUfuUfcGfuUfcusg | 1066 | UUCCAUAUAACUUUCGUUCUG | 1552 |
AM16734-AS | usGfsasUfuUfuccauAfuAfaCfuUfucsg | 1067 | UGAUUUUCCAUAUAACUUUCG | 1553 |
AM16736-AS | asAfsasGfaGfuggugAfuUfuUfcCfausg | 1068 | AAAGAGUGGUGAUUUUCCAUG | 1554 |
AM16738-AS | usCfsasUfcUfaauauUfcCfaGfgAfcasc | 1069 | UCAUCUAAUAUUCCAGGACAC | 1555 |
AM16740-AS | asGfsusGfuUfgucauUfuUfuGfaGfaasc | 1070 | AGUGUUGUCAUUUUUGAGAAC | 1556 |
AM16742-AS | usAfsusGfcUfucaagUfgUfuGfuCfausc | 1071 | UAUGCUUCAAGUGUUGUCAUC | 1557 |
AM16744-AS | asCfsasCfcAfU UNAgcuuCfaAfgUfgUfugsc | 1072 | ACACCAUGCUUCAAGUGUUGC | 1558 |
AM16746-AS | asGfsusUfcUfgaaacAfcCfaUfgCfuusc | 1073 | AGUUCUGAAACACCAUGCUUC | 1559 |
AM16748-AS | usAfsusUfgAfagcauUfgAfgAfcAfccsa | 1074 | UAUUGAAGCAUUGAGACACCA | 1560 |
AM16750-AS | usGfsasCfaUfugaagCfaUfuGfaGfacsg | 1075 | UGACAUUGAAGCAUUGAGACG | 1561 |
AM16752-AS | usGfsasGfuUfuucagAfaUfcCfuGfucsc | 1076 | UGAGUUUUCAGAAUCCUGUCC | 1562 |
AM16754-AS | asAfsgsAfaCfuauucCfaUfaAfuCfagsc | 1077 | AAGAACUAUUCCAUAAUCAGC | 1563 |
AM16756-AS | asGfsasAfaGfaacuaUfuCfcAfuAfausc | 1078 | AGAAAGAACUAUUCCAUAAUC | 1564 |
AM16758-AS | asGfsasUfcCfagaucUfaUfgGfaAfaasc | 1079 | AGAUCCAGAUCUAUGGAAAAC | 1565 |
AM16760-AS | asUfscsCfaAfugcugUfcUfgAfgAfagsc | 1080 | AUCCAAUGCUGUCUGAGAAGC | 1566 |
AM16762-AS | asCfscsUfuUfaggaaAfuCfcAfaUfgcsc | 1081 | ACCUUUAGGAAAUCCAAUGCC | 1567 |
AM16764-AS | usCfsasCfcUfuuaggAfaAfuCfcAfausg | 1082 | UCACCUUUAGGAAAUCCAAUG | 1568 |
AM16766-AS | usGfsgsUfuUfuaaacAfaCfuGfaCfausg | 1083 | UGGUUUUAAACAACUGACAUG | 1569 |
AM16768-AS | usUfscsAfuCfagaucUfuAfgAfgUfuasc | 1084 | UUCAUCAGAUCUUAGAGUUAC | 1570 |
AM16770-AS | usUfsusCfaUfcagauCfuUfaGfaGfuusg | 1085 | UUUCAUCAGAUCUUAGAGUUG | 1571 |
AM16772-AS | usCfsasAfgUfuuaguCfaAfcUfuCfccsa | 1086 | UCAAGUUUAGUCAACUUCCCA | 1572 |
AM16774-AS | usAfsgsCfuUfccauuUfaUfuCfaCfagsc | 1087 | UAGCUUCCAUUUAUUCACAGC | 1573 |
AM17404-AS | asGfsusguugucauUfuUfuGfagaasc | 1088 | AGUGUUGUCAUUUUUGAGAAC | 1556 |
AM17405-AS | cPrpasGfsusguugucauUfuUfuGfagaasc | 1089 | AGUGUUGUCAUUUUUGAGAAC | 1556 |
AM17406-AS | usAfsusugaagcauUfgAfgAfcaccsa | 1090 | UAUUGAAGCAUUGAGACACCA | 1560 |
AM17407-AS | cPrpusAfsusugaagcauUfgAfgAfcaccsa | 1091 | UAUUGAAGCAUUGAGACACCA | 1560 |
AM17408-AS | asAfsgsaacuauucCfaUfaAfucagsc | 1092 | AAGAACUAUUCCAUAAUCAGC | 1563 |
AM17409-AS | cPrpasAfsgsaacuauucCfaUfaAfucagsc | 1093 | AAGAACUAUUCCAUAAUCAGC | 1563 |
AM17410-AS | asGfsasaagaacuaUfuCfcAfuaausc | 1094 | AGAAAGAACUAUUCCAUAAUC | 1564 |
AM17411-AS | cPrpasGfsasaagaacuaUfuCfcAfuaausc | 1095 | AGAAAGAACUAUUCCAUAAUC | 1564 |
AM17488-AS | usUfsgsAfuCfacaagCfcAfaAfaCfcusg | 1096 | UUGAUCACAAGCCAAAACCUG | 1574 |
AM17490-AS | usCfsasUfaGfacaucGfcAfuCfcUfgasa | 1097 | UCAUAGACAUCGCAUCCUGAA | 1575 |
AM17492-AS | usCfsasAfaGfaguggUfgAfuUfuUfccsa | 1098 | UCAAAGAGUGGUGAUUUUCCA | 1576 |
AM17494-AS | usUfscsUfgAfaacacCfaUfgCfuUfcasa | 1099 | UUCUGAAACACCAUGCUUCAA | 1577 |
AM17496-AS | usCfsasGfaAfuccugUfcUfuGfuCfausu | 1100 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCAUU | 1578 |
AM17498-AS | usCfsasAfuGfcugucUfgAfgAfaGfcasg | 1101 | UCAAUGCUGUCUGAGAAGCAG | 1579 |
AM17500-AS | usCfscsUfuUfaaaggUfuUfuCfaGfuasg | 1102 | UCCUUUAAAGGUUUUCAGUAG | 1580 |
AM17502-AS | usAfscsUfuCfaucagAfuCfuUfaGfagsu | 1103 | UACUUCAUCAGAUCUUAGAGU | 1581 |
AM17504-AS | usAfsasGfuUfuagucAfaCfuUfcCfcasa | 1104 | UAAGUUUAGUCAACUUCCCAA | 1582 |
AM17808-AS | usGfsusGfuAfggcugCfaCfuGfaGfagsu | 1105 | UGUGUAGGCUGCACUGAGAGU | 1583 |
AM17810-AS | usUfsgsUfgUfaggcuGfcAfcUfgAfgasg | 1106 | UUGUGUAGGCUGCACUGAGAG | 1584 |
AM17812-AS | usCfsusUfuGfuguagGfcUfgCfaCfugsa | 1107 | UCUUUGUGUAGGCUGCACUGA | 1585 |
AM17814-AS | usUfscsCfuUfuguguAfgGfcUfgCfacsu | 1108 | UUCCUUUGUGUAGGCUGCACU | 1586 |
AM17816-AS | usUfscsGfaAfgugcaCfcAfgGfcGfgusa | 1109 | UUCGAAGUGCACCAGGCGGUA | 1587 |
AM17818-AS | usCfsusCfgAfagugcAfcCfaGfgCfggsu | 1110 | UCUCGAAGUGCACCAGGCGGU | 1588 |
AM17820-AS | usGfscsUfcGfaagugCfaCfcAfgGfcgsg | 1111 | UGCUCGAAGUGCACCAGGCGG | 1589 |
AM17822-AS | asGfsgsCfuCfgaaguGfcAfcCfaGfgcsg | 1112 | AGGCUCGAAGUGCACCAGGCG | 1590 |
AM17824-AS | asAfscsUfcUfucaguGfuUfuCfcAfgcsg | 1113 | AACUCUUCAGUGUUUCCAGCG | 1591 |
AM17826-AS | usAfscsAfgGfgucucCfcAfcUfuUfgasu | 1114 | UACAGGGUCUCCCACUUUGAU | 1592 |
AM17828-AS | asCfsasCfaGfggucuCfcCfaCfuUfugsa | 1115 | ACACAGGGUCUCCCACUUUGA | 1593 |
AM17830-AS | usGfsusAfcAfcagggUfcUfcCfcAfcusu | 1116 | UGUACACAGGGUCUCCCACUU | 1594 |
AM17832-AS | asGfsgsUfaCfacaggGfuCfuCfcCfacsu | 1117 | AGGUACACAGGGUCUCCCACU | 1595 |
AM17834-AS | usAfsgsGfuAfcacagGfgUfcUfcCfcasc | 1118 | UAGGUACACAGGGUCUCCCAC | 1596 |
AM17864-AS | usGfsasAfcAfagucuGfcUfaUfuUfgasu | 1119 | UGAACAAGUCUGCUAUUUGAU | 1597 |
AM17866-AS | usGfscsUfuUfaacuuUfcUfuCfuCfuasg | 1120 | UGCUUUAACUUUCUUCUCUAG | 1598 |
AM17868-AS | usUfsusGfcUfuuaacUfuUfcUfuCfucsu | 1121 | UUUGCUUUAACUUUCUUCUCU | 1599 |
AM17870-AS | usGfsasAfaUfuacaaUfaUfuGfgGfccsu | 1122 | UGAAAUUACAAUAUUGGGCCU | 1600 |
AM17872-AS | usAfsasCfuUfucguuCfuGfaAfgGfgusc | 1123 | UAACUUUCGUUCUGAAGGGUC | 1601 |
AM17874-AS | usCfsasUfaUfaacuuUfcGfuUfcUfgasa | 1124 | UCAUAUAACUUUCGUUCUGAA | 1602 |
AM17876-AS | usUfscsCfaUfaaucaGfuUfaAfaCfggsg | 1125 | UUCCAUAAUCAGUUAAACGGG | 1603 |
AM17878-AS | usUfsasGfgAfaauccAfaUfgCfuGfucsu | 1126 | UUAGGAAAUCCAAUGCUGUCU | 1604 |
AM17880-AS | usAfsasAfgGfacaaaAfuGfgCfaAfuasa | 1127 | UAAAGGACAAAAUGGCAAUAA | 1605 |
AM17882-AS | usAfsasUfcAfaaggaCfaAfaAfuGfgcsa | 1128 | UAAUCAAAGGACAAAAUGGCA | 1606 |
AM18384-AS | usUfsgsauCfacaagCfcAfaAfaccusg | 1129 | UUGAUCACAAGCCAAAACCUG | 1574 |
AM18385-AS | cPrpusUfsgsauCfacaagCfcAfaAfaccusg | 1130 | UUGAUCACAAGCCAAAACCUG | 1574 |
AM18386-AS | usUfsgsaucacaagCfcAfaAfaccusg | 1131 | UUGAUCACAAGCCAAAACCUG | 1574 |
AM18387-AS | cPrpusUfsgsaucacaagCfcAfaAfaccusg | 1132 | UUGAUCACAAGCCAAAACCUG | 1574 |
AM18388-AS | usCfscsuuUfaaaggUfuUfuCfaguasg | 1133 | UCCUUUAAAGGUUUUCAGUAG | 1580 |
AM18389-AS | cPrpusCfscsuuUfaaaggUfuUfuCfaguasg | 1134 | UCCUUUAAAGGUUUUCAGUAG | 1580 |
AM18390-AS | usCfscsuuuaaaggUfuUfuCfaguasg | 1135 | UCCUUUAAAGGUUUUCAGUAG | 1580 |
AM18391-AS | cPrpusCfscsuuuaaaggUfuUfuCfaguasg | 1136 | UCCUUUAAAGGUUUUCAGUAG | 1580 |
AM18393-AS | usCfscsuuuaaaggUfuUfuCfagugsg | 1137 | UCCUUUAAAGGUUUUCAGUGG | 1607 |
AM18394-AS | cPrpusCfscsuuuaaaggUfuUfuCfagugsg | 1138 | UCCUUUAAAGGUUUUCAGUGG | 1607 |
AM18398-AS | asGfsasaaGfaacuaUfuCfcAfuaausc | 1139 | AGAAAGAACUAUUCCAUAAUC | 1564 |
AM18399-AS | cPrpasGfsasaaGfaacuaUfuCfcAfuaausc | 1140 | AGAAAGAACUAUUCCAUAAUC | 1564 |
AM18401-AS | usGfsasaaGfaacuaUfuCfcAfuaausc | 1141 | UGAAAGAACUAUUCCAUAAUC | 1608 |
AM18402-AS | cPrpusGfsasaaGfaacuaUfuCfcAfuaausc | 1142 | UGAAAGAACUAUUCCAUAAUC | 1608 |
AM18403-AS | cPrpusGfaaaGfaacuaUfuCfcAfuaausc | 1143 | UGAAAGAACUAUUCCAUAAUC | 1608 |
AM18404-AS | asGfsusguUfgucauUfuUfuGfagaasc | 1144 | AGUGUUGUCAUUUUUGAGAAC | 1556 |
AM18405-AS | cPrpasGfsusguUfgucauUfuUfuGfagaasc | 1145 | AGUGUUGUCAUUUUUGAGAAC | 1556 |
AM18407-AS | usGfsusguUfgucauUfuUfuGfagaasc | 1146 | UGUGUUGUCAUUUUUGAGAAC | 1609 |
AM18408-AS | cPrpusGfsusguUfgucauUfuUfuGfagaasc | 1147 | UGUGUUGUCAUUUUUGAGAAC | 1609 |
AM18409-AS | cPrpusGfsusguU UNAgucauUfuUfuGfagaasc | 1148 | UGUGUUGUCAUUUUUGAGAAC | 1609 |
AM18410-AS | cPrpusGfuguUfgucauUfuUfuGfagaasc | 1149 | UGUGUUGUCAUUUUUGAGAAC | 1609 |
AM18411-AS | usGfsusguugucauUfuUfuGfagaasc | 1150 | UGUGUUGUCAUUUUUGAGAAC | 1609 |
AM18412-AS | cPrpusGfsusguugucauUfuUfuGfagaasc | 1151 | UGUGUUGUCAUUUUUGAGAAC | 1609 |
AM18413-AS | cPrpusGfuguugucauUfuUfuGfagaasc | 1152 | UGUGUUGUCAUUUUUGAGAAC | 1609 |
AM18606-AS | usCfsasgaAfuccugUfcUfuGfucausu | 1153 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCAUU | 1578 |
AM18607-AS | cPrpusCfsasgaAfuccugUfcUfuGfucausu | 1154 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCAUU | 1578 |
AM18608-AS | usCfsasgaauccugUfcUfuGfucausu | 1155 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCAUU | 1578 |
AM18609-AS | cPrpusCfsasgaauccugUfcUfuGfucausu | 1156 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCAUU | 1578 |
AM18610-AS | cPrpusCfagaauccugUfcUfuGfucausu | 1157 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCAUU | 1578 |
AM18611-AS | usAfsasguuuagucAfaCfuUfcccasa | 1158 | UAAGUUUAGUCAACUUCCCAA | 1582 |
AM18612-AS | cPrpusAfsasguuuagucAfaCfuUfcccasa | 1159 | UAAGUUUAGUCAACUUCCCAA | 1582 |
AM18614-AS | usUfsusGfaUfcacaaGfcCfaAfaAfccsu | 1160 | UUUGAUCACAAGCCAAAACCU | 1610 |
AM18616-AS | usGfsusUfgAfucacaAfgCfcAfaAfacsc | 1161 | UGUUGAUCACAAGCCAAAACC | 1611 |
AM18629-AS | asGfsasaAfgaacuaUfuCfcAfuaausc | 1162 | AGAAAGAACUAUUCCAUAAUC | 1564 |
AM18632-AS | asGfsasaagAfacuaUfuCfcAfuaausc | 1163 | AGAAAGAACUAUUCCAUAAUC | 1564 |
AM18634-AS | usAfsgsaaAfgaacuAfuUfcCfauaasu | 1164 | UAGAAAGAACUAUUCCAUAAU | 1612 |
AM18636-AS | usAfsgsaaAfgaacuAfuUfcCfauagsu | 1165 | UAGAAAGAACUAUUCCAUAGU | 1613 |
AM18638-AS | usAfsgsaaAfgaacuAfuUfcCfauagsc | 1166 | UAGAAAGAACUAUUCCAUAGC | 1614 |
AM18878-AS | asGfsusAfaGfaucugAfaAfcUfaGfucsa | 1167 | AGUAAGAUCUGAAACUAGUCA | 1615 |
AM18880-AS | asGfsusUfaGfuaagaUfcUfgAfaAfcusa | 1168 | AGUUAGUAAGAUCUGAAACUA | 1616 |
AM18882-AS | usAfsasGfuUfaguaaGfaUfcUfgAfaasc | 1169 | UAAGUUAGUAAGAUCUGAAAC | 1617 |
AM18884-AS | usCfsasUfaAfaacaaGfcAfcAfuGfcasc | 1170 | UCAUAAAACAAGCACAUGCAC | 1618 |
AM18886-AS | usUfsgsAfaCfacuucGfcUfuUfgUfcusc | 1171 | UUGAACACUUCGCUUUGUCUC | 1619 |
AM18888-AS | asGfsasUfuCfuagagGfuCfaCfuGfgasa | 1172 | AGAUUCUAGAGGUCACUGGAA | 1620 |
AM18890-AS | usGfsgsAfaUfaguguGfcAfaAfuGfcusc | 1173 | UGGAAUAGUGUGCAAAUGCUC | 1621 |
AM18892-AS | usUfsgsAfuCfucaaaCfaUfcUfgUfcasu | 1174 | UUGAUCUCAAACAUCUGUCAU | 1622 |
AM18894-AS | usAfsgsCfaUfaaguuGfcCfaCfaCfagsa | 1175 | UAGCAUAAGUUGCCACACAGA | 1623 |
AM18896-AS | usCfsasCfaAfucaagGfuCfuGfgUfcusg | 1176 | UCACAAUCAAGGUCUGGUCUG | 1624 |
AM18898-AS | asGfsasAfaGfagaguGfcUfuCfuCfccsu | 1177 | AGAAAGAGAGUGCUUCUCCCU | 1625 |
AM18900-AS | usGfsusUfaGfagagaGfuUfuGfgUfuusc | 1178 | UGUUAGAGAGAGUUUGGUUUC | 1626 |
AM18902-AS | usAfsasGfgUfuagagAfgAfgUfuUfggsu | 1179 | UAAGGUUAGAGAGAGUUUGGU | 1627 |
AM18904-AS | usGfsgsUfuUfuguaaCfuUfaCfaUfcasc | 1180 | UGGUUUUGUAACUUACAUCAC | 1628 |
AM18906-AS | usCfsasCfuUfucaucAfcAfgGfuGfgusu | 1181 | UCACUUUCAUCACAGGUGGUU | 1629 |
AM18908-AS | usGfsasUfuAfuaaauGfcAfcCfaGfucsa | 1182 | UGAUUAUAAAUGCACCAGUCA | 1630 |
AM18910-AS | usAfsgsAfgUfuauagUfcAfgAfgCfugsu | 1183 | UAGAGUUAUAGUCAGAGCUGU | 1631 |
AM18912-AS | usUfsasGfgAfugcucUfgUfaAfaGfgusa | 1184 | UUAGGAUGCUCUGUAAAGGUA | 1632 |
AM18914-AS | asGfsusUfaGfacuuaAfcUfuAfgUfucsc | 1185 | AGUUAGACUUAACUUAGUUCC | 1633 |
AM18916-AS | asGfsusAfaAfuucaaUfcUfcUfcUfgasg | 1186 | AGUAAAUUCAAUCUCUCUGAG | 1634 |
AM18918-AS | usGfsusUfgAfuguuaAfcCfaGfaGfcusg | 1187 | UGUUGAUGUUAACCAGAGCUG | 1635 |
AM18920-AS | asAfsasCfuAfugaugUfcAfgGfuCfaasc | 1188 | AAACUAUGAUGUCAGGUCAAC | 1636 |
AM18922-AS | asCfsasUfuAfacgagAfuCfuGfuUfugsa | 1189 | ACAUUAACGAGAUCUGUUUGA | 1637 |
AM18924-AS | usCfsasGfaAfuauagCfuUfuAfaGfaasc | 1190 | UCAGAAUAUAGCUUUAAGAAC | 1638 |
AM18944-AS | asGfsusAfgUfaggucCfuUfuGfuGfuasg | 1191 | AGUAGUAGGUCCUUUGUGUAG | 1639 |
AM18946-AS | usUfsgsCfuAfuuugaUfgAfgGfaCfgusc | 1192 | UUGCUAUUUGAUGAGGACGUC | 1640 |
AM18948-AS | asUfsgsUfaGfaggucUfcAfgUfuCfugsa | 1193 | AUGUAGAGGUCUCAGUUCUGA | 1641 |
AM18950-AS | asAfsasGfaAfaauguAfgAfgGfuCfucsa | 1194 | AAAGAAAAUGUAGAGGUCUCA | 1642 |
AM18952-AS | asCfsgsAfaAfaauguGfaAfaAfuCfacsa | 1195 | ACGAAAAAUGUGAAAAUCACA | 1643 |
AM18954-AS | usUfsasCfuGfaagucCfuAfcUfaAfgusu | 1196 | UUACUGAAGUCCUACUAAGUU | 1644 |
AM18956-AS | asGfsasUfaAfacggaGfaAfgCfaGfgasg | 1197 | AGAUAAACGGAGAAGCAGGAG | 1645 |
AM18958-AS | asCfsasUfuCfuaggaUfaUfuCfuUfccsa | 1198 | ACAUUCUAGGAUAUUCUUCCA | 1646 |
AM18960-AS | usAfsasCfuGfacauaUfgCfuUfuCfcusu | 1199 | UAACUGACAUAUGCUUUCCUU | 1647 |
AM19120-AS | cPrpusCfscsUfuUfaaaggUfuUfuCfaGfuasg | 1200 | UCCUUUAAAGGUUUUCAGUAG | 1580 |
AM19121-AS | usCfscsUfuuaaaggUfuUfuCfaguasg | 1201 | UCCUUUAAAGGUUUUCAGUAG | 1580 |
AM19122-AS | cPrpusCfscsUfuuaaaggUfuUfuCfaguasg | 1202 | UCCUUUAAAGGUUUUCAGUAG | 1580 |
AM19123-AS | usCfscsuuuAfaaggUfuUfuCfaguasg | 1203 | UCCUUUAAAGGUUUUCAGUAG | 1580 |
AM19125-AS | usAfsgsGfuacacagGfgUfcUfcccasc | 1204 | UAGGUACACAGGGUCUCCCAC | 1596 |
AM19126-AS | usAfsgsguAfcacagGfgUfcUfcccasc | 1205 | UAGGUACACAGGGUCUCCCAC | 1596 |
AM19127-AS | usAfsgsguaCfacagGfgUfcUfcccasc | 1206 | UAGGUACACAGGGUCUCCCAC | 1596 |
AM19128-AS | cPrpusAfsgsguaCfacagGfgUfcUfcccasc | 1207 | UAGGUACACAGGGUCUCCCAC | 1596 |
AM19131-AS | usAfsgsguaCfacagGfgUfcUfcccasu | 1208 | UAGGUACACAGGGUCUCCCAU | 1648 |
AM19132-AS | usAfsgsguaCfacagGfgUfcUfccuasc | 1209 | UAGGUACACAGGGUCUCCUAC | 1649 |
AM19181-AS | cPrpusCfaGfaauccugUfcUfuGfucausu | 1210 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCAUU | 1578 |
AM19182-AS | cPrpusCfagAfauccugUfcUfuGfucausu | 1211 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCAUU | 1578 |
AM19183-AS | cPrpusCfagaaUfccugUfcUfuGfucausu | 1212 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCAUU | 1578 |
AM19185-AS | cPrpasCfagaauccugUfcUfuGfucausu | 1213 | ACAGAAUCCUGUCUUGUCAUU | 1650 |
AM19186-AS | asCfagaauccugUfcUfuGfucausu | 1214 | ACAGAAUCCUGUCUUGUCAUU | 1650 |
AM19189-AS | cPrpusCfagaauccugUfcUfuGfucgusu | 1215 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCGUU | 1651 |
AM19191-AS | cPrpusCfagaauccugUfcUfuGfucausc | 1216 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCAUC | 1652 |
AM19193-AS | cPrpasCfaGfaauccugUfcUfuGfucausc | 1217 | ACAGAAUCCUGUCUUGUCAUC | 1653 |
AM19219-AS | asGfsgsCfaUfcuaauAfuUfcCfaGfgasc | 1218 | AGGCAUCUAAUAUUCCAGGAC | 1654 |
AM19221-AS | asGfscsAfuCfuaauaUfuCfcAfgGfacsa | 1219 | AGCAUCUAAUAUUCCAGGACA | 1655 |
AM19223-AS | asAfsgsGfcAfucuaaUfaUfuCfcAfggsa | 1220 | AAGGCAUCUAAUAUUCCAGGA | 1656 |
AM19405-AS | cPrpusGfuguuGfucauUfuUfuGfagaasc | 1221 | UGUGUUGUCAUUUUUGAGAAC | 1609 |
AM19406-AS | cPrpusGfuGfuugucauUfuUfuGfagaasc | 1222 | UGUGUUGUCAUUUUUGAGAAC | 1609 |
AM19407-AS | usAfsasucaAfaggaCfaAfaAfuggcsa | 1223 | UAAUCAAAGGACAAAAUGGCA | 1606 |
AM19408-AS | cPrpusAfaucaAfaggaCfaAfaAfuggcsa | 1224 | UAAUCAAAGGACAAAAUGGCA | 1606 |
AM19410-AS | usAfsasUfcaaaggaCfaAfaAfuggcsa | 1225 | UAAUCAAAGGACAAAAUGGCA | 1606 |
AM19411-AS | cPrpusAfaUfcaaaggaCfaAfaAfuggcsa | 1226 | UAAUCAAAGGACAAAAUGGCA | 1606 |
AM19536-AS | asCfagAfauccugUfcUfuGfucausu | 1227 | ACAGAAUCCUGUCUUGUCAUU | 1650 |
AM19538-AS | asCfagAfauccugUfcUfuGfucgusu | 1228 | ACAGAAUCCUGUCUUGUCGUU | 1657 |
AM19538.1-AS | isCfagAfauccugUfcUfuGfucgusu | 1229 | ICAGAAUCCUGUCUUGUCGUU | 1658 |
AM19539-AS | asCfagAfauccugUfcUfuGfucausc | 1230 | ACAGAAUCCUGUCUUGUCAUC | 1653 |
AM19656-AS | usUfsasggaAfauccAfaUfgCfugucsu | 1231 | UUAGGAAAUCCAAUGCUGUCU | 1604 |
AM19657-AS | cPrpusUfsasggaAfauccAfaUfgCfugucsu | 1232 | UUAGGAAAUCCAAUGCUGUCU | 1604 |
AM19658-AS | usAfsusugaAfgcauUfgAfgAfcaccsa | 1233 | UAUUGAAGCAUUGAGACACCA | 1560 |
AM19659-AS | cPrpusAfuugaAfgcauUfgAfgAfcaccsa | 1234 | UAUUGAAGCAUUGAGACACCA | 1560 |
AM19661-AS | usAfsusugaAfgcauUfgAfgAfcaccsg | 1235 | UAUUGAAGCAUUGAGACACCG | 1659 |
AM19663-AS | usAfsusugaAfgcauUfgAfgAfcaucsg | 1236 | UAUUGAAGCAUUGAGACAUCG | 1660 |
CA004443 | cPrpusCfagAfauccugUfcUfuGfucgusu | 1237 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCGUU | 1651 |
CA004444 | cPrpusCfagAfauccugUfcUfuGfucausc | 1238 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCAUC | 1652 |
CA004446 | cPrpusCfagAfauccugUfcUfuGfucgusc | 1239 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCGUC | 1661 |
CA004447 | cPrpusCfagAfaU UNAccugUfcUfuGfucgusu | 1240 | UCAGAAUCCUGUCUUGUCGUU | 1651 |
CA004449 | usUfuaAfcuuucuUfcUfcUfagccsu | 1241 | UUUAACUUUCUUCUCUAGCCU | 1662 |
CA004481 | usAfsgsaAfuccuguCfuUfgUfcauusc | 1242 | UAGAAUCCUGUCUUGUCAUUC | 1663 |
CA004483 | usUfscsaGfaauccuGfuCfuUfgucasc | 1243 | UUCAGAAUCCUGUCUUGUCAC | 1664 |
CA004798 | isCfagAfauccugUfcUfuGfucgusu | 1244 | ICAGAAUCCUGUCUUGUCGUU | 1658 |
CA005198 | asGfsgcauCfuaauauUfcCfaggsusu | 1245 | AGGCAUCUAAUAUUCCAGGUU | 1665 |
CA008056 | usCfuuUfguguagGfcUfgCfacugsa | 1246 | UCUUUGUGUAGGCUGCACUGA | 1585 |
CA008057 | asAfcuCfuucaguGfuUfuCfcagcsg | 1247 | AACUCUUCAGUGUUUCCAGCG | 1591 |
CA008058 | usAfggUfacacagGfgUfcUfcccasc | 1248 | UAGGUACACAGGGUCUCCCAC | 1596 |
CA008429 | cPrpusGfaaagaacuaguCfcauaausc | 1249 | UGAAAGAACUAGUCCAUAAUC | 1666 |
CA008430 | cPrpusGfaaaGfaacuaUfuCfcAfuaasusc | 1250 | UGAAAGAACUAUUCCAUAAUC | 1608 |
CA915324 | asCfagAfauccugUfcUfuGfucgusu | 1251 | ACAGAAUCCUGUCUUGUCGUU | 1657 |
股ID | 經修飾之有義股(5' →3') | SEQ ID NO. | 基礎鹼基序列(5' →3') ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列 ) | SEQ ID NO. |
AM16711-SS-NL | accaggagGfGfAfaacaugguua | 1252 | ACCAGGAGGGAAACAUGGUUA | 1667 |
AM16713-SS-NL | gauaaccaGfCfUfuccugaagua | 1253 | GAUAACCAGCUUCCUGAAGUA | 1668 |
AM16715-SS-NL | caucaaauAfGfCfagacuuguua | 1254 | CAUCAAAUAGCAGACUUGUUA | 1669 |
AM16717-SS-NL | ccaaauagCfAfGfacuuiuucca | 1255 | CCAAAUAGCAGACUUIUUCCA | 1670 |
AM16719-SS-NL | gaggaccaGfAfUfugcuuacuca | 1256 | GAGGACCAGAUUGCUUACUCA | 1671 |
AM16721-SS-NL | accagauuGfCfUfuacucagaca | 1257 | ACCAGAUUGCUUACUCAGACA | 1672 |
AM16723-SS-NL | gauugcuuAfCfUfcagacaccaa | 1258 | GAUUGCUUACUCAGACACCAA | 1673 |
AM16725-SS-NL | caggcuagAfGfAfagaaaguuaa | 1259 | CAGGCUAGAGAAGAAAGUUAA | 1674 |
AM16727-SS-NL | guuccagaUfGfCfauuuuaacca | 1260 | GUUCCAGAUGCAUUUUAACCA | 1675 |
AM16729-SS-NL | ugacccuuCfAfGfaacgaaaguu | 1261 | UGACCCUUCAGAACGAAAGUU | 1676 |
AM16731-SS-NL | cagaacgaAfAfGfuuauauggaa | 1262 | CAGAACGAAAGUUAUAUGGAA | 1677 |
AM16733-SS-NL | cgaaaguuAfUfAfuggaaaauca | 1263 | CGAAAGUUAUAUGGAAAAUCA | 1678 |
AM16735-SS-NL | cauggaaaAfUfCfaccacucuuu | 1264 | CAUGGAAAAUCACCACUCUUU | 1679 |
AM16737-SS-NL | guguccugGfAfAfuauuagauga | 1265 | GUGUCCUGGAAUAUUAGAUGA | 1680 |
AM16739-SS-NL | guucucaaAfAfAfugacaacacu | 1266 | GUUCUCAAAAAUGACAACACU | 1681 |
AM16741-SS-NL | gaugacaaCfAfCfuugaagcaua | 1267 | GAUGACAACACUUGAAGCAUA | 1682 |
AM16743-SS-NL | gcaacacuUfGfAfagcauggugu | 1268 | GCAACACUUGAAGCAUGGUGU | 1683 |
AM16745-SS-NL | gaagcaugGfUfGfuuucagaacu | 1269 | GAAGCAUGGUGUUUCAGAACU | 1684 |
AM16747-SS-NL | uggugucuCfAfAfugcuucaaua | 1270 | UGGUGUCUCAAUGCUUCAAUA | 1685 |
AM16749-SS-NL | cgucucaaUfGfCfuucaauguca | 1271 | CGUCUCAAUGCUUCAAUGUCA | 1686 |
AM16751-SS-NL | ggacaggaUfUfCfugaaaacuca | 1272 | GGACAGGAUUCUGAAAACUCA | 1687 |
AM16753-SS-NL | gcugauuaUfGfGfaauaguucuu | 1273 | GCUGAUUAUGGAAUAGUUCUU | 1688 |
AM16755-SS-NL | gauuauggAfAfUfaguucuuucu | 1274 | GAUUAUGGAAUAGUUCUUUCU | 1689 |
AM16757-SS-NL | guuuuccaUfAfGfaucuigaucu | 1275 | GUUUUCCAUAGAUCUIGAUCU | 1690 |
AM16759-SS-NL | gcuucucaGfAfCfagcauuggau | 1276 | GCUUCUCAGACAGCAUUGGAU | 1691 |
AM16761-SS-NL | ggcauuggAfUfUfuccuaaaggu | 1277 | GGCAUUGGAUUUCCUAAAGGU | 1692 |
AM16763-SS-NL | cauuggauUfUfCfcuaaagguia | 1278 | CAUUGGAUUUCCUAAAGGUIA | 1693 |
AM16765-SS-NL | caugucagUfUfGfuuuaaaacca | 1279 | CAUGUCAGUUGUUUAAAACCA | 1694 |
AM16767-SS-NL | guaacucuAfAfGfaucugaugaa | 1280 | GUAACUCUAAGAUCUGAUGAA | 1695 |
AM16769-SS-NL | caacucuaAfGfAfucugaugaaa | 1281 | CAACUCUAAGAUCUGAUGAAA | 1696 |
AM16771-SS-NL | ugggaaguUfGfAfcuaaacuuga | 1282 | UGGGAAGUUGACUAAACUUGA | 1697 |
AM16773-SS-NL | gcugugaaUfAfAfauggaagcua | 1283 | GCUGUGAAUAAAUGGAAGCUA | 1698 |
AM17487-SS-NL | cagguuuuGfGfCfuugugaucaa | 1284 | CAGGUUUUGGCUUGUGAUCAA | 1699 |
AM17489-SS-NL | uucaggauGfCfGfaugucuauga | 1285 | UUCAGGAUGCGAUGUCUAUGA | 1700 |
AM17491-SS-NL | uggaaaauCfAfCfcacucuuuga | 1286 | UGGAAAAUCACCACUCUUUGA | 1701 |
AM17493-SS-NL | uugaagcaUfGfGfuguuucagaa | 1287 | UUGAAGCAUGGUGUUUCAGAA | 1702 |
AM17495-SS-NL | aaugacaaGfAfCfaggauucuga | 1288 | AAUGACAAGACAGGAUUCUGA | 1703 |
AM17497-SS-NL | cugcuucuCfAfGfacagcauuga | 1289 | CUGCUUCUCAGACAGCAUUGA | 1704 |
AM17499-SS-NL | cuacugaaAfAfCfcuuuaaagga | 1290 | CUACUGAAAACCUUUAAAGGA | 1705 |
AM17501-SS-NL | acucuaagAfUfCfugaugaagua | 1291 | ACUCUAAGAUCUGAUGAAGUA | 1706 |
AM17503-SS-NL | uugggaagUfUfGfacuaaacuua | 1292 | UUGGGAAGUUGACUAAACUUA | 1707 |
AM17505-SS-NL | cugcuucuCfAfGfacaguauuga | 1293 | CUGCUUCUCAGACAGUAUUGA | 1708 |
AM17807-SS-NL | acucucagUfGfCfagccuacaca | 1294 | ACUCUCAGUGCAGCCUACACA | 1709 |
AM17809-SS-NL | cucucaguGfCfAfgccuacacaa | 1295 | CUCUCAGUGCAGCCUACACAA | 1710 |
AM17811-SS-NL | ucagugcaGfCfCfuacacaaaga | 1296 | UCAGUGCAGCCUACACAAAGA | 1711 |
AM17813-SS-NL | agugcagcCfUfAfcacaaaggaa | 1297 | AGUGCAGCCUACACAAAGGAA | 1712 |
AM17815-SS-NL | uaccgccuGfGfUfgcacuucgaa | 1298 | UACCGCCUGGUGCACUUCGAA | 1713 |
AM17817-SS-NL | accgccugGfUfGfcacuucgaga | 1299 | ACCGCCUGGUGCACUUCGAGA | 1714 |
AM17819-SS-NL | ccgccuggUfGfCfacuucgagca | 1300 | CCGCCUGGUGCACUUCGAGCA | 1715 |
AM17821-SS-NL | cgccugguGfCfAfcuucgagccu | 1301 | CGCCUGGUGCACUUCGAGCCU | 1716 |
AM17823-SS-NL | cgcuggaaAfCfAfcugaagaguu | 1302 | CGCUGGAAACACUGAAGAGUU | 1717 |
AM17825-SS-NL | aucaaaguGfGfGfagacccugua | 1303 | AUCAAAGUGGGAGACCCUGUA | 1718 |
AM17827-SS-NL | ucaaagugGfGfAfgacccugugu | 1304 | UCAAAGUGGGAGACCCUGUGU | 1719 |
AM17829-SS-NL | aagugggaGfAfCfccuguguaca | 1305 | AAGUGGGAGACCCUGUGUACA | 1720 |
AM17831-SS-NL | agugggagAfCfCfcuguguaccu | 1306 | AGUGGGAGACCCUGUGUACCU | 1721 |
AM17833-SS-NL | gugggagaCfCfCfuguguaccua | 1307 | GUGGGAGACCCUGUGUACCUA | 1722 |
AM17863-SS-NL | aucaaauaGfCfAfgacuuguuca | 1308 | AUCAAAUAGCAGACUUGUUCA | 1723 |
AM17865-SS-NL | cuagagaaGfAfAfaguuaaagca | 1309 | CUAGAGAAGAAAGUUAAAGCA | 1724 |
AM17867-SS-NL | agagaagaAfAfGfuuaaagcaaa | 1310 | AGAGAAGAAAGUUAAAGCAAA | 1725 |
AM17869-SS-NL | aggcccaaUfAfUfuguaauuuca | 1311 | AGGCCCAAUAUUGUAAUUUCA | 1726 |
AM17871-SS-NL | gacccuucAfGfAfacgaaaguua | 1312 | GACCCUUCAGAACGAAAGUUA | 1727 |
AM17873-SS-NL | uucagaacGfAfAfaguuauauga | 1313 | UUCAGAACGAAAGUUAUAUGA | 1728 |
AM17875-SS-NL | cccguuuaAfCfUfgauuauggaa | 1314 | CCCGUUUAACUGAUUAUGGAA | 1729 |
AM17877-SS-NL | agacagcaUfUfGfgauuuccuaa | 1315 | AGACAGCAUUGGAUUUCCUAA | 1730 |
AM17879-SS-NL | uuauugccAfUfUfuuguccuuua | 1316 | UUAUUGCCAUUUUGUCCUUUA | 1731 |
AM17881-SS-NL | ugccauuuUfGfUfccuuugauua | 1317 | UGCCAUUUUGUCCUUUGAUUA | 1732 |
AM18392-SS-NL | ccacugaaAfAfCfcuuuaaagga | 1318 | CCACUGAAAACCUUUAAAGGA | 1733 |
AM18400-SS-NL | gauuauggAfAfUfaguucuuuca | 1319 | GAUUAUGGAAUAGUUCUUUCA | 1734 |
AM18406-SS-NL | guucucaaAfAfAfugacaacaca | 1320 | GUUCUCAAAAAUGACAACACA | 1735 |
AM18613-SS-NL | agguuuugGfCfUfugugaucaaa | 1321 | AGGUUUUGGCUUGUGAUCAAA | 1736 |
AM18615-SS-NL | gguuuuggCfUfUfgugaucaaca | 1322 | GGUUUUGGCUUGUGAUCAACA | 1737 |
AM18630-SS-NL | gauuauggAfaUfaGfuucuuucu | 1323 | GAUUAUGGAAUAGUUCUUUCU | 1689 |
AM18631-SS-NL | gauuauggAfaUfaguucuuucu | 1324 | GAUUAUGGAAUAGUUCUUUCU | 1689 |
AM18633-SS-NL | auuauggaAfUfAfguucuuucua | 1325 | AUUAUGGAAUAGUUCUUUCUA | 1738 |
AM18635-SS-NL | acuauggaAfUfAfguucuuucua | 1326 | ACUAUGGAAUAGUUCUUUCUA | 1739 |
AM18637-SS-NL | gcuauggaAfUfAfguucuuucua | 1327 | GCUAUGGAAUAGUUCUUUCUA | 1740 |
AM18877-SS-NL | ugacuaguUfUfCfagaucuuacu | 1328 | UGACUAGUUUCAGAUCUUACU | 1741 |
AM18879-SS-NL | uaguuucaGfAfUfcuuacuaacu | 1329 | UAGUUUCAGAUCUUACUAACU | 1742 |
AM18881-SS-NL | guuucagaUfCfUfuacuaacuua | 1330 | GUUUCAGAUCUUACUAACUUA | 1743 |
AM18883-SS-NL | gugcauguGfCfUfuguuuuauga | 1331 | GUGCAUGUGCUUGUUUUAUGA | 1744 |
AM18885-SS-NL | gagacaaaGfCfGfaaguguucaa | 1332 | GAGACAAAGCGAAGUGUUCAA | 1745 |
AM18887-SS-NL | uuccagugAfCfCfucuagaaucu | 1333 | UUCCAGUGACCUCUAGAAUCU | 1746 |
AM18889-SS-NL | gagcauuuGfCfAfcacuauucca | 1334 | GAGCAUUUGCACACUAUUCCA | 1747 |
AM18891-SS-NL | augacagaUfGfUfuugagaucaa | 1335 | AUGACAGAUGUUUGAGAUCAA | 1748 |
AM18893-SS-NL | ucugugugGfCfAfacuuaugcua | 1336 | UCUGUGUGGCAACUUAUGCUA | 1749 |
AM18895-SS-NL | cagaccagAfCfCfuugauuguga | 1337 | CAGACCAGACCUUGAUUGUGA | 1750 |
AM18897-SS-NL | agggagaaGfCfAfcucucuuucu | 1338 | AGGGAGAAGCACUCUCUUUCU | 1751 |
AM18899-SS-NL | gaaaccaaAfCfUfcucucuaaca | 1339 | GAAACCAAACUCUCUCUAACA | 1752 |
AM18901-SS-NL | accaaacuCfUfCfucuaaccuua | 1340 | ACCAAACUCUCUCUAACCUUA | 1753 |
AM18903-SS-NL | gugauguaAfGfUfuacaaaacca | 1341 | GUGAUGUAAGUUACAAAACCA | 1754 |
AM18905-SS-NL | aaccaccuGfUfGfaugaaaguga | 1342 | AACCACCUGUGAUGAAAGUGA | 1755 |
AM18907-SS-NL | ugacugguGfCfAfuuuauaauca | 1343 | UGACUGGUGCAUUUAUAAUCA | 1756 |
AM18909-SS-NL | acagcucuGfAfCfuauaacucua | 1344 | ACAGCUCUGACUAUAACUCUA | 1757 |
AM18911-SS-NL | uaccuuuaCfAfGfagcauccuaa | 1345 | UACCUUUACAGAGCAUCCUAA | 1758 |
AM18913-SS-NL | ggaacuaaGfUfUfaagucuaacu | 1346 | GGAACUAAGUUAAGUCUAACU | 1759 |
AM18915-SS-NL | cucagagaGfAfUfugaauuuacu | 1347 | CUCAGAGAGAUUGAAUUUACU | 1760 |
AM18917-SS-NL | cagcucugGfUfUfaacaucaaca | 1348 | CAGCUCUGGUUAACAUCAACA | 1761 |
AM18919-SS-NL | guugaccuGfAfCfaucauaguuu | 1349 | GUUGACCUGACAUCAUAGUUU | 1762 |
AM18921-SS-NL | ucaaacagAfUfCfucguuaaugu | 1350 | UCAAACAGAUCUCGUUAAUGU | 1763 |
AM18923-SS-NL | guucuuaaAfGfCfuauauucuga | 1351 | GUUCUUAAAGCUAUAUUCUGA | 1764 |
AM18943-SS-NL | cuacacaaAfGfGfaccuacuacu | 1352 | CUACACAAAGGACCUACUACU | 1765 |
AM18945-SS-NL | gacguccuCfAfUfcaaauagcaa | 1353 | GACGUCCUCAUCAAAUAGCAA | 1766 |
AM18947-SS-NL | ucagaacuGfAfGfaccucuacau | 1354 | UCAGAACUGAGACCUCUACAU | 1767 |
AM18949-SS-NL | ugagaccuCfUfAfcauuuucuuu | 1355 | UGAGACCUCUACAUUUUCUUU | 1768 |
AM18951-SS-NL | ugugauuuUfCfAfcauuuuucgu | 1356 | UGUGAUUUUCACAUUUUUCGU | 1769 |
AM18953-SS-NL | aacuuaguAfGfGfacuucaguaa | 1357 | AACUUAGUAGGACUUCAGUAA | 1770 |
AM18955-SS-NL | cuccugcuUfCfUfccguuuaucu | 1358 | CUCCUGCUUCUCCGUUUAUCU | 1771 |
AM18957-SS-NL | uggaagaaUfAfUfccuagaaugu | 1359 | UGGAAGAAUAUCCUAGAAUGU | 1772 |
AM18959-SS-NL | aaggaaagCfAfUfaugucaguua | 1360 | AAGGAAAGCAUAUGUCAGUUA | 1773 |
AM19119-SS-NL | cuacugaaAfAfCfcuuuaaaiga | 1361 | CUACUGAAAACCUUUAAAIGA | 1774 |
AM19124-SS-NL | cuacugaaAfaCfcUfuuaaagga | 1362 | CUACUGAAAACCUUUAAAGGA | 1705 |
AM19129-SS-NL | gugggagaCfcCfuGfuguaccua | 1363 | GUGGGAGACCCUGUGUACCUA | 1722 |
AM19130-SS-NL | gugggagaCfCfCfuguguaucua | 1364 | GUGGGAGACCCUGUGUAUCUA | 1775 |
AM19184-SS-NL | aaugacaaGfAfCfaggauucugu | 1365 | AAUGACAAGACAGGAUUCUGU | 1776 |
AM19187-SS-NL | aaugacaaGfaCfaGfgauucuga | 1366 | AAUGACAAGACAGGAUUCUGA | 1703 |
AM19188-SS-NL | aacgacaaGfAfCfaggauucuga | 1367 | AACGACAAGACAGGAUUCUGA | 1777 |
AM19190-SS-NL | gaugacaaGfAfCfaggauucuga | 1368 | GAUGACAAGACAGGAUUCUGA | 1778 |
AM19192-SS-NL | gaugacaaGfaCfaGfgauucugu | 1369 | GAUGACAAGACAGGAUUCUGU | 1779 |
AM19194-SS-NL | gaugacaaGfAfCfaggauucugu | 1370 | GAUGACAAGACAGGAUUCUGU | 1779 |
AM19218-SS-NL | guccuggaAfUfAfuuagaugccu | 1371 | GUCCUGGAAUAUUAGAUGCCU | 1780 |
AM19220-SS-NL | uguccuggAfAfUfauuagaugcu | 1372 | UGUCCUGGAAUAUUAGAUGCU | 1781 |
AM19222-SS-NL | uccuggaaUfAfUfuagaugccuu | 1373 | UCCUGGAAUAUUAGAUGCCUU | 1782 |
AM19404-SS-NL | guucucaaAfaAfuGfacaacaca | 1374 | GUUCUCAAAAAUGACAACACA | 1735 |
AM19409-SS-NL | ugccauuuUfgUfcCfuuugauua | 1375 | UGCCAUUUUGUCCUUUGAUUA | 1732 |
AM19537-SS-NL | aacgacaaGfAfCfaggauucugu | 1376 | AACGACAAGACAGGAUUCUGU | 1783 |
AM19660-SS-NL | cggugucuCfAfAfugcuucaaua | 1377 | CGGUGUCUCAAUGCUUCAAUA | 1784 |
AM19662-SS-NL | cgaugucuCfAfAfugcuucaaua | 1378 | CGAUGUCUCAAUGCUUCAAUA | 1785 |
CS004445-NL | gacgacaaGfAfCfaggauucuga | 1379 | GACGACAAGACAGGAUUCUGA | 1786 |
CS004448-NL | aggcuagaGfAfAfgaaaguuaaa | 1380 | AGGCUAGAGAAGAAAGUUAAA | 1787 |
CS004480-NL | gaaugacaAfGfAfcaggauucua | 1381 | GAAUGACAAGACAGGAUUCUA | 1788 |
CS004482-NL | gugacaagAfCfAfggauucugaa | 1382 | GUGACAAGACAGGAUUCUGAA | 1789 |
CS005197-NL | ccuggaAfuAfUfUfAfgaugccuu | 1383 | CCUGGAAUAUUAGAUGCCUU | 1790 |
CS008428-NL | gauuauggAfAfUfaggucuuuca | 1389 | GAUUAUGGAAUAGGUCUUUCA | 1791 |
CS913717-NL | ucagugcaGfCfCfuacacaaaga | 1390 | UCAGUGCAGCCUACACAAAGA | 1711 |
CS913729-NL | cgcuggaaAfCfAfcugaagaguu | 1391 | CGCUGGAAACACUGAAGAGUU | 1717 |
CS913739-NL | gugggagaCfCfCfuguguaccua | 1392 | GUGGGAGACCCUGUGUACCUA | 1722 |
CS914289-NL | gauuauggAfAfUfaguucuuuca | 1393 | GAUUAUGGAAUAGUUCUUUCA | 1734 |
CS914989-NL | aacgacaaGfAfCfaggauucuga | 1394 | AACGACAAGACAGGAUUCUGA | 1777 |
CS914991-NL | gaugacaaGfAfCfaggauucuga | 1395 | GAUGACAAGACAGGAUUCUGA | 1778 |
CS915323-NL | aacgacaaGfAfCfaggauucugu | 1396 | AACGACAAGACAGGAUUCUGU | 1783 |
股ID | 經修飾之有義股(5' →3') | SEQ ID NO. | 基礎鹼基序列(5' →3') ( 顯示為未經修飾之核苷酸序列 ) | SEQ ID NO. |
AM16711-SS | (NAG37)s(invAb)saccaggagGfGfAfaacaugguuas(invAb) | 1397 | ACCAGGAGGGAAACAUGGUUA | 1667 |
AM16713-SS | (NAG37)s(invAb)sgauaaccaGfCfUfuccugaaguas(invAb) | 1398 | GAUAACCAGCUUCCUGAAGUA | 1668 |
AM16715-SS | (NAG37)s(invAb)scaucaaauAfGfCfagacuuguuas(invAb) | 1399 | CAUCAAAUAGCAGACUUGUUA | 1669 |
AM16717-SS | (NAG37)s(invAb)sccaaauagCfAfGfacuuiuuccas(invAb) | 1400 | CCAAAUAGCAGACUUIUUCCA | 1670 |
AM16719-SS | (NAG37)s(invAb)sgaggaccaGfAfUfugcuuacucas(invAb) | 1401 | GAGGACCAGAUUGCUUACUCA | 1671 |
AM16721-SS | (NAG37)s(invAb)saccagauuGfCfUfuacucagacas(invAb) | 1402 | ACCAGAUUGCUUACUCAGACA | 1672 |
AM16723-SS | (NAG37)s(invAb)sgauugcuuAfCfUfcagacaccaas(invAb) | 1403 | GAUUGCUUACUCAGACACCAA | 1673 |
AM16725-SS | (NAG37)s(invAb)scaggcuagAfGfAfagaaaguuaas(invAb) | 1404 | CAGGCUAGAGAAGAAAGUUAA | 1674 |
AM16727-SS | (NAG37)s(invAb)sguuccagaUfGfCfauuuuaaccas(invAb) | 1405 | GUUCCAGAUGCAUUUUAACCA | 1675 |
AM16729-SS | (NAG37)s(invAb)sugacccuuCfAfGfaacgaaaguus(invAb) | 1406 | UGACCCUUCAGAACGAAAGUU | 1676 |
AM16731-SS | (NAG37)s(invAb)scagaacgaAfAfGfuuauauggaas(invAb) | 1407 | CAGAACGAAAGUUAUAUGGAA | 1677 |
AM16733-SS | (NAG37)s(invAb)scgaaaguuAfUfAfuggaaaaucas(invAb) | 1408 | CGAAAGUUAUAUGGAAAAUCA | 1678 |
AM16735-SS | (NAG37)s(invAb)scauggaaaAfUfCfaccacucuuus(invAb) | 1409 | CAUGGAAAAUCACCACUCUUU | 1679 |
AM16737-SS | (NAG37)s(invAb)sguguccugGfAfAfuauuagaugas(invAb) | 1410 | GUGUCCUGGAAUAUUAGAUGA | 1680 |
AM16739-SS | (NAG37)s(invAb)sguucucaaAfAfAfugacaacacus(invAb) | 1411 | GUUCUCAAAAAUGACAACACU | 1681 |
AM16741-SS | (NAG37)s(invAb)sgaugacaaCfAfCfuugaagcauas(invAb) | 1412 | GAUGACAACACUUGAAGCAUA | 1682 |
AM16743-SS | (NAG37)s(invAb)sgcaacacuUfGfAfagcauggugus(invAb) | 1413 | GCAACACUUGAAGCAUGGUGU | 1683 |
AM16745-SS | (NAG37)s(invAb)sgaagcaugGfUfGfuuucagaacus(invAb) | 1414 | GAAGCAUGGUGUUUCAGAACU | 1684 |
AM16747-SS | (NAG37)s(invAb)suggugucuCfAfAfugcuucaauas(invAb) | 1415 | UGGUGUCUCAAUGCUUCAAUA | 1685 |
AM16749-SS | (NAG37)s(invAb)scgucucaaUfGfCfuucaaugucas(invAb) | 1416 | CGUCUCAAUGCUUCAAUGUCA | 1686 |
AM16751-SS | (NAG37)s(invAb)sggacaggaUfUfCfugaaaacucas(invAb) | 1417 | GGACAGGAUUCUGAAAACUCA | 1687 |
AM16753-SS | (NAG37)s(invAb)sgcugauuaUfGfGfaauaguucuus(invAb) | 1418 | GCUGAUUAUGGAAUAGUUCUU | 1688 |
AM16755-SS | (NAG37)s(invAb)sgauuauggAfAfUfaguucuuucus(invAb) | 1419 | GAUUAUGGAAUAGUUCUUUCU | 1689 |
AM16757-SS | (NAG37)s(invAb)sguuuuccaUfAfGfaucuigaucus(invAb) | 1420 | GUUUUCCAUAGAUCUIGAUCU | 1690 |
AM16759-SS | (NAG37)s(invAb)sgcuucucaGfAfCfagcauuggaus(invAb) | 1421 | GCUUCUCAGACAGCAUUGGAU | 1691 |
AM16761-SS | (NAG37)s(invAb)sggcauuggAfUfUfuccuaaaggus(invAb) | 1422 | GGCAUUGGAUUUCCUAAAGGU | 1692 |
AM16763-SS | (NAG37)s(invAb)scauuggauUfUfCfcuaaagguias(invAb) | 1423 | CAUUGGAUUUCCUAAAGGUIA | 1693 |
AM16765-SS | (NAG37)s(invAb)scaugucagUfUfGfuuuaaaaccas(invAb) | 1424 | CAUGUCAGUUGUUUAAAACCA | 1694 |
AM16767-SS | (NAG37)s(invAb)sguaacucuAfAfGfaucugaugaas(invAb) | 1425 | GUAACUCUAAGAUCUGAUGAA | 1695 |
AM16769-SS | (NAG37)s(invAb)scaacucuaAfGfAfucugaugaaas(invAb) | 1426 | CAACUCUAAGAUCUGAUGAAA | 1696 |
AM16771-SS | (NAG37)s(invAb)sugggaaguUfGfAfcuaaacuugas(invAb) | 1427 | UGGGAAGUUGACUAAACUUGA | 1697 |
AM16773-SS | (NAG37)s(invAb)sgcugugaaUfAfAfauggaagcuas(invAb) | 1428 | GCUGUGAAUAAAUGGAAGCUA | 1698 |
AM17487-SS | (NAG37)s(invAb)scagguuuuGfGfCfuugugaucaas(invAb) | 1429 | CAGGUUUUGGCUUGUGAUCAA | 1699 |
AM17489-SS | (NAG37)s(invAb)suucaggauGfCfGfaugucuaugas(invAb) | 1430 | UUCAGGAUGCGAUGUCUAUGA | 1700 |
AM17491-SS | (NAG37)s(invAb)suggaaaauCfAfCfcacucuuugas(invAb) | 1431 | UGGAAAAUCACCACUCUUUGA | 1701 |
AM17493-SS | (NAG37)s(invAb)suugaagcaUfGfGfuguuucagaas(invAb) | 1432 | UUGAAGCAUGGUGUUUCAGAA | 1702 |
AM17495-SS | (NAG37)s(invAb)saaugacaaGfAfCfaggauucugas(invAb) | 1433 | AAUGACAAGACAGGAUUCUGA | 1703 |
AM17497-SS | (NAG37)s(invAb)scugcuucuCfAfGfacagcauugas(invAb) | 1434 | CUGCUUCUCAGACAGCAUUGA | 1704 |
AM17499-SS | (NAG37)s(invAb)scuacugaaAfAfCfcuuuaaaggas(invAb) | 1435 | CUACUGAAAACCUUUAAAGGA | 1705 |
AM17501-SS | (NAG37)s(invAb)sacucuaagAfUfCfugaugaaguas(invAb) | 1436 | ACUCUAAGAUCUGAUGAAGUA | 1706 |
AM17503-SS | (NAG37)s(invAb)suugggaagUfUfGfacuaaacuuas(invAb) | 1437 | UUGGGAAGUUGACUAAACUUA | 1707 |
AM17505-SS | (NAG37)s(invAb)scugcuucuCfAfGfacaguauugas(invAb) | 1438 | CUGCUUCUCAGACAGUAUUGA | 1708 |
AM17807-SS | (NAG37)s(invAb)sacucucagUfGfCfagccuacacas(invAb) | 1439 | ACUCUCAGUGCAGCCUACACA | 1709 |
AM17809-SS | (NAG37)s(invAb)scucucaguGfCfAfgccuacacaas(invAb) | 1440 | CUCUCAGUGCAGCCUACACAA | 1710 |
AM17811-SS | (NAG37)s(invAb)sucagugcaGfCfCfuacacaaagas(invAb) | 1441 | UCAGUGCAGCCUACACAAAGA | 1711 |
AM17813-SS | (NAG37)s(invAb)sagugcagcCfUfAfcacaaaggaas(invAb) | 1442 | AGUGCAGCCUACACAAAGGAA | 1712 |
AM17815-SS | (NAG37)s(invAb)suaccgccuGfGfUfgcacuucgaas(invAb) | 1443 | UACCGCCUGGUGCACUUCGAA | 1713 |
AM17817-SS | (NAG37)s(invAb)saccgccugGfUfGfcacuucgagas(invAb) | 1444 | ACCGCCUGGUGCACUUCGAGA | 1714 |
AM17819-SS | (NAG37)s(invAb)sccgccuggUfGfCfacuucgagcas(invAb) | 1445 | CCGCCUGGUGCACUUCGAGCA | 1715 |
AM17821-SS | (NAG37)s(invAb)scgccugguGfCfAfcuucgagccus(invAb) | 1446 | CGCCUGGUGCACUUCGAGCCU | 1716 |
AM17823-SS | (NAG37)s(invAb)scgcuggaaAfCfAfcugaagaguus(invAb) | 1447 | CGCUGGAAACACUGAAGAGUU | 1717 |
AM17825-SS | (NAG37)s(invAb)saucaaaguGfGfGfagacccuguas(invAb) | 1448 | AUCAAAGUGGGAGACCCUGUA | 1718 |
AM17827-SS | (NAG37)s(invAb)sucaaagugGfGfAfgacccugugus(invAb) | 1449 | UCAAAGUGGGAGACCCUGUGU | 1719 |
AM17829-SS | (NAG37)s(invAb)saagugggaGfAfCfccuguguacas(invAb) | 1450 | AAGUGGGAGACCCUGUGUACA | 1720 |
AM17831-SS | (NAG37)s(invAb)sagugggagAfCfCfcuguguaccus(invAb) | 1451 | AGUGGGAGACCCUGUGUACCU | 1721 |
AM17833-SS | (NAG37)s(invAb)sgugggagaCfCfCfuguguaccuas(invAb) | 1452 | GUGGGAGACCCUGUGUACCUA | 1722 |
AM17863-SS | (NAG37)s(invAb)saucaaauaGfCfAfgacuuguucas(invAb) | 1453 | AUCAAAUAGCAGACUUGUUCA | 1723 |
AM17865-SS | (NAG37)s(invAb)scuagagaaGfAfAfaguuaaagcas(invAb) | 1454 | CUAGAGAAGAAAGUUAAAGCA | 1724 |
AM17867-SS | (NAG37)s(invAb)sagagaagaAfAfGfuuaaagcaaas(invAb) | 1455 | AGAGAAGAAAGUUAAAGCAAA | 1725 |
AM17869-SS | (NAG37)s(invAb)saggcccaaUfAfUfuguaauuucas(invAb) | 1456 | AGGCCCAAUAUUGUAAUUUCA | 1726 |
AM17871-SS | (NAG37)s(invAb)sgacccuucAfGfAfacgaaaguuas(invAb) | 1457 | GACCCUUCAGAACGAAAGUUA | 1727 |
AM17873-SS | (NAG37)s(invAb)suucagaacGfAfAfaguuauaugas(invAb) | 1458 | UUCAGAACGAAAGUUAUAUGA | 1728 |
AM17875-SS | (NAG37)s(invAb)scccguuuaAfCfUfgauuauggaas(invAb) | 1459 | CCCGUUUAACUGAUUAUGGAA | 1729 |
AM17877-SS | (NAG37)s(invAb)sagacagcaUfUfGfgauuuccuaas(invAb) | 1460 | AGACAGCAUUGGAUUUCCUAA | 1730 |
AM17879-SS | (NAG37)s(invAb)suuauugccAfUfUfuuguccuuuas(invAb) | 1461 | UUAUUGCCAUUUUGUCCUUUA | 1731 |
AM17881-SS | (NAG37)s(invAb)sugccauuuUfGfUfccuuugauuas(invAb) | 1462 | UGCCAUUUUGUCCUUUGAUUA | 1732 |
AM18392-SS | (NAG37)s(invAb)sccacugaaAfAfCfcuuuaaaggas(invAb) | 1463 | CCACUGAAAACCUUUAAAGGA | 1733 |
AM18400-SS | (NAG37)s(invAb)sgauuauggAfAfUfaguucuuucas(invAb) | 1464 | GAUUAUGGAAUAGUUCUUUCA | 1734 |
AM18406-SS | (NAG37)s(invAb)sguucucaaAfAfAfugacaacacas(invAb) | 1465 | GUUCUCAAAAAUGACAACACA | 1735 |
AM18613-SS | (NAG37)s(invAb)sagguuuugGfCfUfugugaucaaas(invAb) | 1466 | AGGUUUUGGCUUGUGAUCAAA | 1736 |
AM18615-SS | (NAG37)s(invAb)sgguuuuggCfUfUfgugaucaacas(invAb) | 1467 | GGUUUUGGCUUGUGAUCAACA | 1737 |
AM18630-SS | (NAG37)s(invAb)sgauuauggAfaUfaGfuucuuucus(invAb) | 1468 | GAUUAUGGAAUAGUUCUUUCU | 1689 |
AM18631-SS | (NAG37)s(invAb)sgauuauggAfaUfaguucuuucus(invAb) | 1469 | GAUUAUGGAAUAGUUCUUUCU | 1689 |
AM18633-SS | (NAG37)s(invAb)sauuauggaAfUfAfguucuuucuas(invAb) | 1470 | AUUAUGGAAUAGUUCUUUCUA | 1738 |
AM18635-SS | (NAG37)s(invAb)sacuauggaAfUfAfguucuuucuas(invAb) | 1471 | ACUAUGGAAUAGUUCUUUCUA | 1739 |
AM18637-SS | (NAG37)s(invAb)sgcuauggaAfUfAfguucuuucuas(invAb) | 1472 | GCUAUGGAAUAGUUCUUUCUA | 1740 |
AM18877-SS | (NAG37)s(invAb)sugacuaguUfUfCfagaucuuacus(invAb) | 1473 | UGACUAGUUUCAGAUCUUACU | 1741 |
AM18879-SS | (NAG37)s(invAb)suaguuucaGfAfUfcuuacuaacus(invAb) | 1474 | UAGUUUCAGAUCUUACUAACU | 1742 |
AM18881-SS | (NAG37)s(invAb)sguuucagaUfCfUfuacuaacuuas(invAb) | 1475 | GUUUCAGAUCUUACUAACUUA | 1743 |
AM18883-SS | (NAG37)s(invAb)sgugcauguGfCfUfuguuuuaugas(invAb) | 1476 | GUGCAUGUGCUUGUUUUAUGA | 1744 |
AM18885-SS | (NAG37)s(invAb)sgagacaaaGfCfGfaaguguucaas(invAb) | 1477 | GAGACAAAGCGAAGUGUUCAA | 1745 |
AM18887-SS | (NAG37)s(invAb)suuccagugAfCfCfucuagaaucus(invAb) | 1478 | UUCCAGUGACCUCUAGAAUCU | 1746 |
AM18889-SS | (NAG37)s(invAb)sgagcauuuGfCfAfcacuauuccas(invAb) | 1479 | GAGCAUUUGCACACUAUUCCA | 1747 |
AM18891-SS | (NAG37)s(invAb)saugacagaUfGfUfuugagaucaas(invAb) | 1480 | AUGACAGAUGUUUGAGAUCAA | 1748 |
AM18893-SS | (NAG37)s(invAb)sucugugugGfCfAfacuuaugcuas(invAb) | 1481 | UCUGUGUGGCAACUUAUGCUA | 1749 |
AM18895-SS | (NAG37)s(invAb)scagaccagAfCfCfuugauugugas(invAb) | 1482 | CAGACCAGACCUUGAUUGUGA | 1750 |
AM18897-SS | (NAG37)s(invAb)sagggagaaGfCfAfcucucuuucus(invAb) | 1483 | AGGGAGAAGCACUCUCUUUCU | 1751 |
AM18899-SS | (NAG37)s(invAb)sgaaaccaaAfCfUfcucucuaacas(invAb) | 1484 | GAAACCAAACUCUCUCUAACA | 1752 |
AM18901-SS | (NAG37)s(invAb)saccaaacuCfUfCfucuaaccuuas(invAb) | 1485 | ACCAAACUCUCUCUAACCUUA | 1753 |
AM18903-SS | (NAG37)s(invAb)sgugauguaAfGfUfuacaaaaccas(invAb) | 1486 | GUGAUGUAAGUUACAAAACCA | 1754 |
AM18905-SS | (NAG37)s(invAb)saaccaccuGfUfGfaugaaagugas(invAb) | 1487 | AACCACCUGUGAUGAAAGUGA | 1755 |
AM18907-SS | (NAG37)s(invAb)sugacugguGfCfAfuuuauaaucas(invAb) | 1488 | UGACUGGUGCAUUUAUAAUCA | 1756 |
AM18909-SS | (NAG37)s(invAb)sacagcucuGfAfCfuauaacucuas(invAb) | 1489 | ACAGCUCUGACUAUAACUCUA | 1757 |
AM18911-SS | (NAG37)s(invAb)suaccuuuaCfAfGfagcauccuaas(invAb) | 1490 | UACCUUUACAGAGCAUCCUAA | 1758 |
AM18913-SS | (NAG37)s(invAb)sggaacuaaGfUfUfaagucuaacus(invAb) | 1491 | GGAACUAAGUUAAGUCUAACU | 1759 |
AM18915-SS | (NAG37)s(invAb)scucagagaGfAfUfugaauuuacus(invAb) | 1492 | CUCAGAGAGAUUGAAUUUACU | 1760 |
AM18917-SS | (NAG37)s(invAb)scagcucugGfUfUfaacaucaacas(invAb) | 1493 | CAGCUCUGGUUAACAUCAACA | 1761 |
AM18919-SS | (NAG37)s(invAb)sguugaccuGfAfCfaucauaguuus(invAb) | 1494 | GUUGACCUGACAUCAUAGUUU | 1762 |
AM18921-SS | (NAG37)s(invAb)sucaaacagAfUfCfucguuaaugus(invAb) | 1495 | UCAAACAGAUCUCGUUAAUGU | 1763 |
AM18923-SS | (NAG37)s(invAb)sguucuuaaAfGfCfuauauucugas(invAb) | 1496 | GUUCUUAAAGCUAUAUUCUGA | 1764 |
AM18943-SS | (NAG37)s(invAb)scuacacaaAfGfGfaccuacuacus(invAb) | 1497 | CUACACAAAGGACCUACUACU | 1765 |
AM18945-SS | (NAG37)s(invAb)sgacguccuCfAfUfcaaauagcaas(invAb) | 1498 | GACGUCCUCAUCAAAUAGCAA | 1766 |
AM18947-SS | (NAG37)s(invAb)sucagaacuGfAfGfaccucuacaus(invAb) | 1499 | UCAGAACUGAGACCUCUACAU | 1767 |
AM18949-SS | (NAG37)s(invAb)sugagaccuCfUfAfcauuuucuuus(invAb) | 1500 | UGAGACCUCUACAUUUUCUUU | 1768 |
AM18951-SS | (NAG37)s(invAb)sugugauuuUfCfAfcauuuuucgus(invAb) | 1501 | UGUGAUUUUCACAUUUUUCGU | 1769 |
AM18953-SS | (NAG37)s(invAb)saacuuaguAfGfGfacuucaguaas(invAb) | 1502 | AACUUAGUAGGACUUCAGUAA | 1770 |
AM18955-SS | (NAG37)s(invAb)scuccugcuUfCfUfccguuuaucus(invAb) | 1503 | CUCCUGCUUCUCCGUUUAUCU | 1771 |
AM18957-SS | (NAG37)s(invAb)suggaagaaUfAfUfccuagaaugus(invAb) | 1504 | UGGAAGAAUAUCCUAGAAUGU | 1772 |
AM18959-SS | (NAG37)s(invAb)saaggaaagCfAfUfaugucaguuas(invAb) | 1505 | AAGGAAAGCAUAUGUCAGUUA | 1773 |
AM19119-SS | (NAG37)s(invAb)scuacugaaAfAfCfcuuuaaaigas(invAb) | 1506 | CUACUGAAAACCUUUAAAIGA | 1774 |
AM19124-SS | (NAG37)s(invAb)scuacugaaAfaCfcUfuuaaaggas(invAb) | 1507 | CUACUGAAAACCUUUAAAGGA | 1705 |
AM19129-SS | (NAG37)s(invAb)sgugggagaCfcCfuGfuguaccuas(invAb) | 1508 | GUGGGAGACCCUGUGUACCUA | 1722 |
AM19130-SS | (NAG37)s(invAb)sgugggagaCfCfCfuguguaucuas(invAb) | 1509 | GUGGGAGACCCUGUGUAUCUA | 1775 |
AM19184-SS | (NAG37)s(invAb)saaugacaaGfAfCfaggauucugus(invAb) | 1510 | AAUGACAAGACAGGAUUCUGU | 1776 |
AM19187-SS | (NAG37)s(invAb)saaugacaaGfaCfaGfgauucugas(invAb) | 1511 | AAUGACAAGACAGGAUUCUGA | 1703 |
AM19188-SS | (NAG37)s(invAb)saacgacaaGfAfCfaggauucugas(invAb) | 1512 | AACGACAAGACAGGAUUCUGA | 1777 |
AM19190-SS | (NAG37)s(invAb)sgaugacaaGfAfCfaggauucugas(invAb) | 1513 | GAUGACAAGACAGGAUUCUGA | 1778 |
AM19192-SS | (NAG37)s(invAb)sgaugacaaGfaCfaGfgauucugus(invAb) | 1514 | GAUGACAAGACAGGAUUCUGU | 1779 |
AM19194-SS | (NAG37)s(invAb)sgaugacaaGfAfCfaggauucugus(invAb) | 1515 | GAUGACAAGACAGGAUUCUGU | 1779 |
AM19218-SS | (NAG37)s(invAb)sguccuggaAfUfAfuuagaugccus(invAb) | 1516 | GUCCUGGAAUAUUAGAUGCCU | 1780 |
AM19220-SS | (NAG37)s(invAb)suguccuggAfAfUfauuagaugcus(invAb) | 1517 | UGUCCUGGAAUAUUAGAUGCU | 1781 |
AM19222-SS | (NAG37)s(invAb)succuggaaUfAfUfuagaugccuus(invAb) | 1518 | UCCUGGAAUAUUAGAUGCCUU | 1782 |
AM19404-SS | (NAG37)s(invAb)sguucucaaAfaAfuGfacaacacas(invAb) | 1519 | GUUCUCAAAAAUGACAACACA | 1735 |
AM19409-SS | (NAG37)s(invAb)sugccauuuUfgUfcCfuuugauuas(invAb) | 1520 | UGCCAUUUUGUCCUUUGAUUA | 1732 |
AM19537-SS | (NAG37)s(invAb)saacgacaaGfAfCfaggauucugus(invAb) | 1521 | AACGACAAGACAGGAUUCUGU | 1783 |
AM19660-SS | (NAG37)s(invAb)scggugucuCfAfAfugcuucaauas(invAb) | 1522 | CGGUGUCUCAAUGCUUCAAUA | 1784 |
AM19662-SS | (NAG37)s(invAb)scgaugucuCfAfAfugcuucaauas(invAb) | 1523 | CGAUGUCUCAAUGCUUCAAUA | 1785 |
CS004445 | (NAG37)s(invAb)sgacgacaaGfAfCfaggauucugas(invAb) | 1524 | GACGACAAGACAGGAUUCUGA | 1786 |
CS004448 | (NAG37)s(invAb)saggcuagaGfAfAfgaaaguuaaas(invAb) | 1525 | AGGCUAGAGAAGAAAGUUAAA | 1787 |
CS004480 | (NAG37)s(invAb)sgaaugacaAfGfAfcaggauucuas(invAb) | 1526 | GAAUGACAAGACAGGAUUCUA | 1788 |
CS004482 | (NAG37)s(invAb)sgugacaagAfCfAfggauucugaas(invAb) | 1527 | GUGACAAGACAGGAUUCUGAA | 1789 |
CS005197 | (NAG37)sccuggaAfuAfUfUfAfgaugccuus(invAb) | 1528 | CCUGGAAUAUUAGAUGCCUU | 1790 |
CS008428 | (NAG37)s(invAb)sgauuauggAfAfUfaggucuuucas(invAb) | 1534 | GAUUAUGGAAUAGGUCUUUCA | 1791 |
CS913717 | (NAG37)s(invAb)sucagugcaGfCfCfuacacaaagas(invAb) | 1535 | UCAGUGCAGCCUACACAAAGA | 1711 |
CS913729 | (NAG37)s(invAb)scgcuggaaAfCfAfcugaagaguus(invAb) | 1536 | CGCUGGAAACACUGAAGAGUU | 1717 |
CS913739 | (NAG37)s(invAb)sgugggagaCfCfCfuguguaccuas(invAb) | 1537 | GUGGGAGACCCUGUGUACCUA | 1722 |
CS914289 | (NAG37)s(invAb)sgauuauggAfAfUfaguucuuucas(invAb) | 1538 | GAUUAUGGAAUAGUUCUUUCA | 1734 |
CS914989 | (NAG37)s(invAb)saacgacaaGfAfCfaggauucugas(invAb) | 1539 | AACGACAAGACAGGAUUCUGA | 1777 |
CS914991 | (NAG37)s(invAb)sgaugacaaGfAfCfaggauucugas(invAb) | 1540 | GAUGACAAGACAGGAUUCUGA | 1778 |
CS915323 | (NAG37)s(invAb)saacgacaaGfAfCfaggauucugus(invAb) | 1541 | AACGACAAGACAGGAUUCUGU | 1783 |
本文所描述之MARC1 RNAi藥劑藉由反義股與有義股黏接而形成。含有表2、表4或表5中所列序列之有義股可與含有表2或表3中所列序列之任何反義股雜交,其限制條件為兩個序列在連續15、16、17、18、19、20或21個核苷酸序列內具有至少85%互補性的區域。
在一些實施例中,本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑之反義股與表3中之反義股序列中的任一者相差0、1、2或3個核苷酸。在一些實施例中,本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑之有義股與表4或表5中之有義股序列中的任一者相差0、1、2或3個核苷酸。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑反義股包含表2或表3中之序列中之任一者的核苷酸序列。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑反義股包含表2或表3中序列中之任一者的核苷酸(自5'端
3'端) 1至17、2至17、1至18、2至18、1至19、2至19、1至20、2至20、1至21或2至21之序列。在某些實施例中,MARC1 RNAi藥劑反義股包含表3中之經修飾序列中之任一者的經修飾序列或由其組成。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑有義股包含表2、表4或表5中之序列中之任一者的核苷酸序列。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑有義股包含表2、表4或表5中之序列中之任一者的核苷酸(自5'端
3'端) 1至17、2至17、3至17、4至17、1至18、2至18、3至18、4至18、1至19、2至19、3至19、4至19、1至20、2至20、3至20、4至20、1至21、2至21、3至21或4至21之序列。在某些實施例中,MARC1 RNAi藥劑有義股包含表4或表5中之經修飾序列中之任一者的經修飾序列或由其組成。
對於本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑,在反義股(自5'端
3'端)之位置1處之核苷酸可與MARC1基因完美互補,或可與MARC1基因為非互補的。在一些實施例中,在反義股(自5'端
3'端)之位置1處之核苷酸為U、A或dT (或其經修飾之型式)。在一些實施例中,在反義股(自5'端
3'端)之位置1處之核苷酸與有義股形成A:U或U:A鹼基對。
含有表2、表4或表5中所列序列之有義股可與含有表2或表3中所列序列之任何反義股雜交,其限制條件為兩個序列在連續15、16、17、18、19、20或21個核苷酸序列內具有至少85%互補性的區域。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑具有由表4或表5中之經修飾序列中之任一者之經修飾序列組成的有義股,及由表3中之經修飾序列中之任一者之經修飾序列組成的反義股。某些代表性序列配對由表6A或表6B中所顯示之雙螺旋體ID編號舉例說明。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含由本文所呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者表示的雙螺旋體、由其組成或基本上由其組成。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含由本文所呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者表示的雙螺旋體中之任一者的有義股及反義股核苷酸序列。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含由本文所呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者表示的雙螺旋體中之任一者的有義股及反義股核苷酸序列以及靶向基團及/或連接基團,其中該靶向基團及/或連接基團共價連接(亦即結合)至有義股或反義股。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包括本文所呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者的有義股及反義股經修飾核苷酸序列。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含本文所呈現之雙螺旋體ID編號中之任一者的有義股及反義股經修飾核苷酸序列以及靶向基團及/或連接基團,其中該靶向基團及/或連接基團共價連接至有義股或反義股。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含具有表2或表6A及表6B之反義股/有義股雙螺旋體中之任一者的核苷酸序列之反義股及有義股,且進一步包含靶向基團或靶向配位體。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含具有表2或表6A及表6B之反義股/有義股雙螺旋體中之任一者的核苷酸序列之反義股及有義股,且進一步包含去唾液酸糖蛋白受體配位體靶向基團。
靶向基團在有或無連接子之情況下可連接至表2、表3、表4或表5中所揭示之有義股及/或反義股中之任一者的5'或3'端。連接子在有或無靶向基團之情況下可連接至表2、表3、表4及表5中所揭示之有義股及/或反義股中之任一者的5'或3'端。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含具有表2、表6A或表6B之反義股/有義股雙螺旋體中之任一者的核苷酸序列之反義股及有義股,且進一步包含選自由(NAG37)及(NAG37)s組成之群的靶向配位體,該(NAG37)及(NAG37)s各自依表7中所定義。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含具有表3或表4中之反義股及/或有義股核苷酸序列中之任一者之經修飾核苷酸序列的反義股及有義股。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含具有表6A及表6B之雙螺旋體中之任一者的反義股及/或有義股核苷酸序列中之任一者的經修飾核苷酸序列之反義股及有義股,且進一步包含去唾液酸糖蛋白受體配位體靶向基團。
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑包含表6A及表6B之雙螺旋體中之任一者、由其組成或基本上由其組成。
表 6A.具有對應有義股及反義股ID編號以及經修飾及未經修飾之核苷酸序列之序列ID編號的MARC1 RNAi藥劑雙螺旋體。
表 6B.具有對應有義股及反義股ID編號以及經修飾及未經修飾之核苷酸序列之序列ID編號的MARC1 RNAi藥劑雙螺旋體。
表 6C.具有靶向於MARC1基因上之對應有義股及反義股ID編號參考位置((SEQ ID NO:1)之MARC1 RNAi藥劑雙螺旋體
表 6D.顯示經化學修飾之反義股及有義股序列的MARC1 RNAi藥劑雙螺旋體
(A
2N)=含2-胺基腺嘌呤核苷酸;I=次黃嘌呤(肌苷)核苷酸
AS ID | AS 經修飾之SEQ ID NO: | AS 未經修飾之SEQ ID NO: | SS ID | SS 經修飾之SEQ ID NO: | SS 未經修飾之SEQ ID NO: |
AM16712-AS | 1056 | 1542 | AM16711-SS-NL | 1252 | 1667 |
AM16714-AS | 1057 | 1543 | AM16713-SS-NL | 1253 | 1668 |
AM16716-AS | 1058 | 1544 | AM16715-SS-NL | 1254 | 1669 |
AM16718-AS | 1059 | 1545 | AM16717-SS-NL | 1255 | 1670 |
AM16720-AS | 1060 | 1546 | AM16719-SS-NL | 1256 | 1671 |
AM16722-AS | 1061 | 1547 | AM16721-SS-NL | 1257 | 1672 |
AM16724-AS | 1062 | 1548 | AM16723-SS-NL | 1258 | 1673 |
AM16726-AS | 1063 | 1549 | AM16725-SS-NL | 1259 | 1674 |
AM16728-AS | 1064 | 1550 | AM16727-SS-NL | 1260 | 1675 |
AM16730-AS | 1065 | 1551 | AM16729-SS-NL | 1261 | 1676 |
AM16732-AS | 1066 | 1552 | AM16731-SS-NL | 1262 | 1677 |
AM16734-AS | 1067 | 1553 | AM16733-SS-NL | 1263 | 1678 |
AM16736-AS | 1068 | 1554 | AM16735-SS-NL | 1264 | 1679 |
AM16738-AS | 1069 | 1555 | AM16737-SS-NL | 1265 | 1680 |
AM16740-AS | 1070 | 1556 | AM16739-SS-NL | 1266 | 1681 |
AM16742-AS | 1071 | 1557 | AM16741-SS-NL | 1267 | 1682 |
AM16744-AS | 1072 | 1558 | AM16743-SS-NL | 1268 | 1683 |
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AM17404-AS | 1088 | 1556 | AM16739-SS-NL | 1266 | 1681 |
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AM17406-AS | 1090 | 1560 | AM16747-SS-NL | 1270 | 1685 |
AM17407-AS | 1091 | 1560 | AM16747-SS-NL | 1270 | 1685 |
AM17408-AS | 1092 | 1563 | AM16753-SS-NL | 1273 | 1688 |
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AM17504-AS | 1104 | 1582 | AM17503-SS-NL | 1292 | 1707 |
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AM17814-AS | 1108 | 1586 | AM17813-SS-NL | 1297 | 1712 |
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AM17870-AS | 1122 | 1600 | AM17869-SS-NL | 1311 | 1726 |
AM17872-AS | 1123 | 1601 | AM17871-SS-NL | 1312 | 1727 |
AM17874-AS | 1124 | 1602 | AM17873-SS-NL | 1313 | 1728 |
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AM17878-AS | 1126 | 1604 | AM17877-SS-NL | 1315 | 1730 |
AM17880-AS | 1127 | 1605 | AM17879-SS-NL | 1316 | 1731 |
AM17882-AS | 1128 | 1606 | AM17881-SS-NL | 1317 | 1732 |
AM18384-AS | 1129 | 1574 | AM17487-SS-NL | 1284 | 1699 |
AM18385-AS | 1130 | 1574 | AM17487-SS-NL | 1284 | 1699 |
AM18386-AS | 1131 | 1574 | AM17487-SS-NL | 1284 | 1699 |
AM18387-AS | 1132 | 1574 | AM17487-SS-NL | 1284 | 1699 |
AM18388-AS | 1133 | 1580 | AM17499-SS-NL | 1290 | 1705 |
AM18389-AS | 1134 | 1580 | AM17499-SS-NL | 1290 | 1705 |
AM18390-AS | 1135 | 1580 | AM17499-SS-NL | 1290 | 1705 |
AM18391-AS | 1136 | 1580 | AM17499-SS-NL | 1290 | 1705 |
AM18393-AS | 1137 | 1607 | AM18392-SS-NL | 1318 | 1733 |
AM18394-AS | 1138 | 1607 | AM18392-SS-NL | 1318 | 1733 |
AM18398-AS | 1139 | 1564 | AM16755-SS-NL | 1274 | 1689 |
AM18399-AS | 1140 | 1564 | AM16755-SS-NL | 1274 | 1689 |
AM18401-AS | 1141 | 1608 | AM18400-SS-NL | 1319 | 1734 |
AM18402-AS | 1142 | 1608 | AM18400-SS-NL | 1319 | 1734 |
AM18403-AS | 1143 | 1608 | AM18400-SS-NL | 1319 | 1734 |
AM18404-AS | 1144 | 1556 | AM16739-SS-NL | 1266 | 1681 |
AM18405-AS | 1145 | 1556 | AM16739-SS-NL | 1266 | 1681 |
AM18407-AS | 1146 | 1609 | AM18406-SS-NL | 1320 | 1735 |
AM18408-AS | 1147 | 1609 | AM18406-SS-NL | 1320 | 1735 |
AM18409-AS | 1148 | 1609 | AM18406-SS-NL | 1320 | 1735 |
AM18410-AS | 1149 | 1609 | AM18406-SS-NL | 1320 | 1735 |
AM18411-AS | 1150 | 1609 | AM18406-SS-NL | 1320 | 1735 |
AM18412-AS | 1151 | 1609 | AM18406-SS-NL | 1320 | 1735 |
AM18413-AS | 1152 | 1609 | AM18406-SS-NL | 1320 | 1735 |
AM18606-AS | 1153 | 1578 | AM17495-SS-NL | 1288 | 1703 |
AM18607-AS | 1154 | 1578 | AM17495-SS-NL | 1288 | 1703 |
AM18608-AS | 1155 | 1578 | AM17495-SS-NL | 1288 | 1703 |
AM18609-AS | 1156 | 1578 | AM17495-SS-NL | 1288 | 1703 |
AM18610-AS | 1157 | 1578 | AM17495-SS-NL | 1288 | 1703 |
AM18611-AS | 1158 | 1582 | AM17503-SS-NL | 1292 | 1707 |
AM18612-AS | 1159 | 1582 | AM17503-SS-NL | 1292 | 1707 |
AM18614-AS | 1160 | 1610 | AM18613-SS-NL | 1321 | 1736 |
AM18616-AS | 1161 | 1611 | AM18615-SS-NL | 1322 | 1737 |
AM18629-AS | 1162 | 1564 | AM16755-SS-NL | 1274 | 1689 |
AM18629-AS | 1162 | 1564 | AM18630-SS-NL | 1323 | 1689 |
AM18629-AS | 1162 | 1564 | AM18631-SS-NL | 1324 | 1689 |
AM18632-AS | 1163 | 1564 | AM16755-SS-NL | 1274 | 1689 |
AM18632-AS | 1163 | 1564 | AM18630-SS-NL | 1323 | 1689 |
AM18632-AS | 1163 | 1564 | AM18631-SS-NL | 1324 | 1689 |
AM18634-AS | 1164 | 1612 | AM18633-SS-NL | 1325 | 1738 |
AM18636-AS | 1165 | 1613 | AM18635-SS-NL | 1326 | 1739 |
AM18638-AS | 1166 | 1614 | AM18637-SS-NL | 1327 | 1740 |
AM18878-AS | 1167 | 1615 | AM18877-SS-NL | 1328 | 1741 |
AM18880-AS | 1168 | 1616 | AM18879-SS-NL | 1329 | 1742 |
AM18882-AS | 1169 | 1617 | AM18881-SS-NL | 1330 | 1743 |
AM18884-AS | 1170 | 1618 | AM18883-SS-NL | 1331 | 1744 |
AM18886-AS | 1171 | 1619 | AM18885-SS-NL | 1332 | 1745 |
AM18888-AS | 1172 | 1620 | AM18887-SS-NL | 1333 | 1746 |
AM18890-AS | 1173 | 1621 | AM18889-SS-NL | 1334 | 1747 |
AM18892-AS | 1174 | 1622 | AM18891-SS-NL | 1335 | 1748 |
AM18894-AS | 1175 | 1623 | AM18893-SS-NL | 1336 | 1749 |
AM18896-AS | 1176 | 1624 | AM18895-SS-NL | 1337 | 1750 |
AM18898-AS | 1177 | 1625 | AM18897-SS-NL | 1338 | 1751 |
AM18900-AS | 1178 | 1626 | AM18899-SS-NL | 1339 | 1752 |
AM18902-AS | 1179 | 1627 | AM18901-SS-NL | 1340 | 1753 |
AM18904-AS | 1180 | 1628 | AM18903-SS-NL | 1341 | 1754 |
AM18906-AS | 1181 | 1629 | AM18905-SS-NL | 1342 | 1755 |
AM18908-AS | 1182 | 1630 | AM18907-SS-NL | 1343 | 1756 |
AM18910-AS | 1183 | 1631 | AM18909-SS-NL | 1344 | 1757 |
AM18912-AS | 1184 | 1632 | AM18911-SS-NL | 1345 | 1758 |
AM18914-AS | 1185 | 1633 | AM18913-SS-NL | 1346 | 1759 |
AM18916-AS | 1186 | 1634 | AM18915-SS-NL | 1347 | 1760 |
AM18918-AS | 1187 | 1635 | AM18917-SS-NL | 1348 | 1761 |
AM18920-AS | 1188 | 1636 | AM18919-SS-NL | 1349 | 1762 |
AM18922-AS | 1189 | 1637 | AM18921-SS-NL | 1350 | 1763 |
AM18924-AS | 1190 | 1638 | AM18923-SS-NL | 1351 | 1764 |
AM18944-AS | 1191 | 1639 | AM18943-SS-NL | 1352 | 1765 |
AM18946-AS | 1192 | 1640 | AM18945-SS-NL | 1353 | 1766 |
AM18948-AS | 1193 | 1641 | AM18947-SS-NL | 1354 | 1767 |
AM18950-AS | 1194 | 1642 | AM18949-SS-NL | 1355 | 1768 |
AM18952-AS | 1195 | 1643 | AM18951-SS-NL | 1356 | 1769 |
AM18954-AS | 1196 | 1644 | AM18953-SS-NL | 1357 | 1770 |
AM18956-AS | 1197 | 1645 | AM18955-SS-NL | 1358 | 1771 |
AM18958-AS | 1198 | 1646 | AM18957-SS-NL | 1359 | 1772 |
AM18960-AS | 1199 | 1647 | AM18959-SS-NL | 1360 | 1773 |
AM17500-AS | 1102 | 1580 | AM19119-SS-NL | 1361 | 1774 |
AM19120-AS | 1200 | 1580 | AM19119-SS-NL | 1361 | 1774 |
AM19121-AS | 1201 | 1580 | AM19119-SS-NL | 1361 | 1774 |
AM19122-AS | 1202 | 1580 | AM19119-SS-NL | 1361 | 1774 |
AM19123-AS | 1203 | 1580 | AM17499-SS-NL | 1290 | 1705 |
AM19123-AS | 1203 | 1580 | AM19124-SS-NL | 1362 | 1705 |
AM19121-AS | 1201 | 1580 | AM17499-SS-NL | 1290 | 1705 |
AM19121-AS | 1201 | 1580 | AM19124-SS-NL | 1362 | 1705 |
AM19125-AS | 1204 | 1596 | AM17833-SS-NL | 1307 | 1722 |
AM19126-AS | 1205 | 1596 | AM17833-SS-NL | 1307 | 1722 |
AM19127-AS | 1206 | 1596 | AM17833-SS-NL | 1307 | 1722 |
AM19128-AS | 1207 | 1596 | AM17833-SS-NL | 1307 | 1722 |
AM19127-AS | 1206 | 1596 | AM19129-SS-NL | 1363 | 1722 |
AM19127-AS | 1206 | 1596 | AM19130-SS-NL | 1364 | 1775 |
AM19131-AS | 1208 | 1648 | AM17833-SS-NL | 1307 | 1722 |
AM19132-AS | 1209 | 1649 | AM17833-SS-NL | 1307 | 1722 |
AM19181-AS | 1210 | 1578 | AM17495-SS-NL | 1288 | 1703 |
AM19182-AS | 1211 | 1578 | AM17495-SS-NL | 1288 | 1703 |
AM19183-AS | 1212 | 1578 | AM17495-SS-NL | 1288 | 1703 |
AM19185-AS | 1213 | 1650 | AM19184-SS-NL | 1365 | 1776 |
AM19186-AS | 1214 | 1650 | AM19184-SS-NL | 1365 | 1776 |
AM18610-AS | 1157 | 1578 | AM19187-SS-NL | 1366 | 1703 |
AM19189-AS | 1215 | 1651 | AM19188-SS-NL | 1367 | 1777 |
AM19191-AS | 1216 | 1652 | AM19190-SS-NL | 1368 | 1778 |
AM19193-AS | 1217 | 1653 | AM19192-SS-NL | 1369 | 1779 |
AM19193-AS | 1217 | 1653 | AM19194-SS-NL | 1370 | 1779 |
AM19219-AS | 1218 | 1654 | AM19218-SS-NL | 1371 | 1780 |
AM19221-AS | 1219 | 1655 | AM19220-SS-NL | 1372 | 1781 |
AM19223-AS | 1220 | 1656 | AM19222-SS-NL | 1373 | 1782 |
AM18410-AS | 1149 | 1609 | AM19404-SS-NL | 1374 | 1735 |
AM19405-AS | 1221 | 1609 | AM18406-SS-NL | 1320 | 1735 |
AM19406-AS | 1222 | 1609 | AM18406-SS-NL | 1320 | 1735 |
AM19407-AS | 1223 | 1606 | AM17881-SS-NL | 1317 | 1732 |
AM19408-AS | 1224 | 1606 | AM17881-SS-NL | 1317 | 1732 |
AM19408-AS | 1224 | 1606 | AM19409-SS-NL | 1375 | 1732 |
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雙螺旋體 | AS ID | AS 經修飾之 SEQ ID NO: | AS 未 經修飾之 SEQ ID NO: | SS ID | SS 經修飾之 SEQ ID NO: | SS 未 經修飾之 SEQ ID NO: |
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AD13290 | AM18902-AS | AM18901-SS | 4585 |
AD13291 | AM18904-AS | AM18903-SS | 4623 |
AD13292 | AM18906-AS | AM18905-SS | 4639 |
AD13293 | AM18908-AS | AM18907-SS | 5255 |
AD13294 | AM18910-AS | AM18909-SS | 5849 |
AD13295 | AM18912-AS | AM18911-SS | 6143 |
AD13296 | AM18914-AS | AM18913-SS | 6294 |
AD13297 | AM18916-AS | AM18915-SS | 6408 |
AD13298 | AM18918-AS | AM18917-SS | 6537 |
AD13299 | AM18920-AS | AM18919-SS | 6833 |
AD13300 | AM18922-AS | AM18921-SS | 6957 |
AD13301 | AM18924-AS | AM18923-SS | 7208 |
AD13322 | AM18944-AS | AM18943-SS | 419 |
AD13323 | AM18946-AS | AM18945-SS | 601 |
AD13324 | AM18948-AS | AM18947-SS | 1124 |
AD13325 | AM18950-AS | AM18949-SS | 1131 |
AD13326 | AM18952-AS | AM18951-SS | 1157 |
AD13327 | AM18954-AS | AM18953-SS | 1246 |
AD13328 | AM18956-AS | AM18955-SS | 1332 |
AD13329 | AM18958-AS | AM18957-SS | 1432 |
AD13330 | AM18960-AS | AM18959-SS | 1842 |
AD13444 | AM17500-AS | AM19119-SS | 1817 |
AD13445 | AM19120-AS | AM19119-SS | 1817 |
AD13446 | AM19121-AS | AM19119-SS | 1817 |
AD13447 | AM19122-AS | AM19119-SS | 1817 |
AD13448 | AM19123-AS | AM17499-SS | 1817 |
AD13449 | AM19123-AS | AM19124-SS | 1817 |
AD13450 | AM19121-AS | AM17499-SS | 1817 |
AD13451 | AM19121-AS | AM19124-SS | 1817 |
AD13452 | AM19125-AS | AM17833-SS | 1014 |
AD13453 | AM19126-AS | AM17833-SS | 1014 |
AD13454 | AM19127-AS | AM17833-SS | 1014 |
AD13455 | AM19128-AS | AM17833-SS | 1014 |
AD13456 | AM19127-AS | AM19129-SS | 1014 |
AD13457 | AM19127-AS | AM19130-SS | 1014 |
AD13458 | AM19131-AS | AM17833-SS | 1014 |
AD13459 | AM19132-AS | AM17833-SS | 1014 |
AD13507 | AM19181-AS | AM17495-SS | 1275 |
AD13508 | AM19182-AS | AM17495-SS | 1275 |
AD13509 | AM19183-AS | AM17495-SS | 1275 |
AD13510 | AM19185-AS | AM19184-SS | 1275 |
AD13511 | AM19186-AS | AM19184-SS | 1275 |
AD13512 | AM18610-AS | AM19187-SS | 1275 |
AD13513 | AM19189-AS | AM19188-SS | 1275 |
AD13514 | AM19191-AS | AM19190-SS | 1275 |
AD13515 | AM19193-AS | AM19192-SS | 1275 |
AD13516 | AM19193-AS | AM19194-SS | 1275 |
AD13535 | AM19219-AS | AM19218-SS | 1059 |
AD13536 | AM19221-AS | AM19220-SS | 1058 |
AD13537 | AM19223-AS | AM19222-SS | 1060 |
AD13705 | AM18410-AS | AM19404-SS | 1089 |
AD13706 | AM19405-AS | AM18406-SS | 1089 |
AD13707 | AM19406-AS | AM18406-SS | 1089 |
AD13708 | AM19407-AS | AM17881-SS | 1931 |
AD13709 | AM19408-AS | AM17881-SS | 1931 |
AD13710 | AM19408-AS | AM19409-SS | 1931 |
AD13711 | AM19410-AS | AM17881-SS | 1931 |
AD13712 | AM19411-AS | AM17881-SS | 1931 |
AD13804 | AM19536-AS | AM19184-SS | 1275 |
AD13805 | AM19538-AS | AM19537-SS | 1275 |
AD13805.1 | AM19538.1-AS | AM19537-SS | 1275 |
AD13806 | AM19539-AS | AM19194-SS | 1275 |
AD13921 | AM19656-AS | AM17877-SS | 1642 |
AD13922 | AM19657-AS | AM17877-SS | 1642 |
AD13923 | AM19658-AS | AM16747-SS | 1190 |
AD13924 | AM19659-AS | AM16747-SS | 1190 |
AD13925 | AM19661-AS | AM19660-SS | 1190 |
AD13926 | AM19663-AS | AM19662-SS | 1190 |
AC003589 | CA004443 | CS914989 | 1275 |
AC003590 | CA004444 | CS914991 | 1275 |
AC003591 | CA004446 | CS004445 | 1275 |
AC003592 | CA004447 | CS914989 | 1275 |
AC003593 | CA004449 | CS004448 | 711 |
AC003625 | CA004481 | CS004480 | 1274 |
AC003626 | CA004483 | CS004482 | 1276 |
AC003891 | CA004798 | CS915323 | 1275 |
AC004186 | CA005198 | CS005197 | 1059 |
AC006749 | CA008056 | CS913717 | 409 |
AC006750 | CA008057 | CS913729 | 901 |
AC006751 | CA008058 | CS913739 | 1014 |
AC007084 | CA008429 | CS008428 | 1313 |
AC007085 | CA008430 | CS914289 | 1313 |
雙螺旋體 ID : | 經修飾之反義股 (5 ' → 3 ') | SEQ ID NO. | 經修飾之有義股 (5 ' → 3 ') | SEQ ID NO. |
AD11764 | usAfsasCfcAfuguuuCfcCfuCfcUfggsu | 1056 | (NAG37)s(invAb)saccaggagGfGfAfaacaugguuas(invAb) | 1397 |
AD11765 | usAfscsUfuCfaggaaGfcUfgGfuUfausc | 1057 | (NAG37)s(invAb)sgauaaccaGfCfUfuccugaaguas(invAb) | 1398 |
AD11766 | usAfsasCfaAfgucugCfuAfuUfuGfausg | 1058 | (NAG37)s(invAb)scaucaaauAfGfCfagacuuguuas(invAb) | 1399 |
AD11767 | usGfsgsAfaCfaagucUfgCfuAfuUfugsg | 1059 | (NAG37)s(invAb)sccaaauagCfAfGfacuuiuuccas(invAb) | 1400 |
AD11768 | usGfsasGfuAfagcaaUfcUfgGfuCfcusc | 1060 | (NAG37)s(invAb)sgaggaccaGfAfUfugcuuacucas(invAb) | 1401 |
AD11769 | usGfsusCfuGfaguaaGfcAfaUfcUfggsu | 1061 | (NAG37)s(invAb)saccagauuGfCfUfuacucagacas(invAb) | 1402 |
AD11770 | usUfsgsGfuGfU UNAcugaGfuAfaGfcAfausc | 1062 | (NAG37)s(invAb)sgauugcuuAfCfUfcagacaccaas(invAb) | 1403 |
AD11771 | usUfsasAfcUfuucuuCfuCfuAfgCfcusg | 1063 | (NAG37)s(invAb)scaggcuagAfGfAfagaaaguuaas(invAb) | 1404 |
AD11772 | usGfsgsUfuAfaaaugCfaUfcUfgGfaasc | 1064 | (NAG37)s(invAb)sguuccagaUfGfCfauuuuaaccas(invAb) | 1405 |
AD11773 | asAfscsUfuUfcguucUfgAfaGfgGfucsa | 1065 | (NAG37)s(invAb)sugacccuuCfAfGfaacgaaaguus(invAb) | 1406 |
AD11774 | usUfscsCfaUfauaacUfuUfcGfuUfcusg | 1066 | (NAG37)s(invAb)scagaacgaAfAfGfuuauauggaas(invAb) | 1407 |
AD11775 | usGfsasUfuUfuccauAfuAfaCfuUfucsg | 1067 | (NAG37)s(invAb)scgaaaguuAfUfAfuggaaaaucas(invAb) | 1408 |
AD11776 | asAfsasGfaGfuggugAfuUfuUfcCfausg | 1068 | (NAG37)s(invAb)scauggaaaAfUfCfaccacucuuus(invAb) | 1409 |
AD11777 | usCfsasUfcUfaauauUfcCfaGfgAfcasc | 1069 | (NAG37)s(invAb)sguguccugGfAfAfuauuagaugas(invAb) | 1410 |
AD11778 | asGfsusGfuUfgucauUfuUfuGfaGfaasc | 1070 | (NAG37)s(invAb)sguucucaaAfAfAfugacaacacus(invAb) | 1411 |
AD11779 | usAfsusGfcUfucaagUfgUfuGfuCfausc | 1071 | (NAG37)s(invAb)sgaugacaaCfAfCfuugaagcauas(invAb) | 1412 |
AD11780 | asCfsasCfcAfU UNAgcuuCfaAfgUfgUfugsc | 1072 | (NAG37)s(invAb)sgcaacacuUfGfAfagcauggugus(invAb) | 1413 |
AD11781 | asGfsusUfcUfgaaacAfcCfaUfgCfuusc | 1073 | (NAG37)s(invAb)sgaagcaugGfUfGfuuucagaacus(invAb) | 1414 |
AD11782 | usAfsusUfgAfagcauUfgAfgAfcAfccsa | 1074 | (NAG37)s(invAb)suggugucuCfAfAfugcuucaauas(invAb) | 1415 |
AD11783 | usGfsasCfaUfugaagCfaUfuGfaGfacsg | 1075 | (NAG37)s(invAb)scgucucaaUfGfCfuucaaugucas(invAb) | 1416 |
AD11784 | usGfsasGfuUfuucagAfaUfcCfuGfucsc | 1076 | (NAG37)s(invAb)sggacaggaUfUfCfugaaaacucas(invAb) | 1417 |
AD11785 | asAfsgsAfaCfuauucCfaUfaAfuCfagsc | 1077 | (NAG37)s(invAb)sgcugauuaUfGfGfaauaguucuus(invAb) | 1418 |
AD11786 | asGfsasAfaGfaacuaUfuCfcAfuAfausc | 1078 | (NAG37)s(invAb)sgauuauggAfAfUfaguucuuucus(invAb) | 1419 |
AD11787 | asGfsasUfcCfagaucUfaUfgGfaAfaasc | 1079 | (NAG37)s(invAb)sguuuuccaUfAfGfaucuigaucus(invAb) | 1420 |
AD11788 | asUfscsCfaAfugcugUfcUfgAfgAfagsc | 1080 | (NAG37)s(invAb)sgcuucucaGfAfCfagcauuggaus(invAb) | 1421 |
AD11789 | asCfscsUfuUfaggaaAfuCfcAfaUfgcsc | 1081 | (NAG37)s(invAb)sggcauuggAfUfUfuccuaaaggus(invAb) | 1422 |
AD11790 | usCfsasCfcUfuuaggAfaAfuCfcAfausg | 1082 | (NAG37)s(invAb)scauuggauUfUfCfcuaaagguias(invAb) | 1423 |
AD11791 | usGfsgsUfuUfuaaacAfaCfuGfaCfausg | 1083 | (NAG37)s(invAb)scaugucagUfUfGfuuuaaaaccas(invAb) | 1424 |
AD11792 | usUfscsAfuCfagaucUfuAfgAfgUfuasc | 1084 | (NAG37)s(invAb)sguaacucuAfAfGfaucugaugaas(invAb) | 1425 |
AD11793 | usUfsusCfaUfcagauCfuUfaGfaGfuusg | 1085 | (NAG37)s(invAb)scaacucuaAfGfAfucugaugaaas(invAb) | 1426 |
AD11794 | usCfsasAfgUfuuaguCfaAfcUfuCfccsa | 1086 | (NAG37)s(invAb)sugggaaguUfGfAfcuaaacuugas(invAb) | 1427 |
AD11795 | usAfsgsCfuUfccauuUfaUfuCfaCfagsc | 1087 | (NAG37)s(invAb)sgcugugaaUfAfAfauggaagcuas(invAb) | 1428 |
AD12285 | asGfsusguugucauUfuUfuGfagaasc | 1088 | (NAG37)s(invAb)sguucucaaAfAfAfugacaacacus(invAb) | 1411 |
AD12286 | cPrpasGfsusguugucauUfuUfuGfagaasc | 1089 | (NAG37)s(invAb)sguucucaaAfAfAfugacaacacus(invAb) | 1411 |
AD12287 | usAfsusugaagcauUfgAfgAfcaccsa | 1090 | (NAG37)s(invAb)suggugucuCfAfAfugcuucaauas(invAb) | 1415 |
AD12288 | cPrpusAfsusugaagcauUfgAfgAfcaccsa | 1091 | (NAG37)s(invAb)suggugucuCfAfAfugcuucaauas(invAb) | 1415 |
AD12289 | asAfsgsaacuauucCfaUfaAfucagsc | 1092 | (NAG37)s(invAb)sgcugauuaUfGfGfaauaguucuus(invAb) | 1418 |
AD12290 | cPrpasAfsgsaacuauucCfaUfaAfucagsc | 1093 | (NAG37)s(invAb)sgcugauuaUfGfGfaauaguucuus(invAb) | 1418 |
AD12291 | asGfsasaagaacuaUfuCfcAfuaausc | 1094 | (NAG37)s(invAb)sgauuauggAfAfUfaguucuuucus(invAb) | 1419 |
AD12292 | cPrpasGfsasaagaacuaUfuCfcAfuaausc | 1095 | (NAG37)s(invAb)sgauuauggAfAfUfaguucuuucus(invAb) | 1419 |
AD12363 | usUfsgsAfuCfacaagCfcAfaAfaCfcusg | 1096 | (NAG37)s(invAb)scagguuuuGfGfCfuugugaucaas(invAb) | 1429 |
AD12364 | usCfsasUfaGfacaucGfcAfuCfcUfgasa | 1097 | (NAG37)s(invAb)suucaggauGfCfGfaugucuaugas(invAb) | 1430 |
AD12365 | usCfsasAfaGfaguggUfgAfuUfuUfccsa | 1098 | (NAG37)s(invAb)suggaaaauCfAfCfcacucuuugas(invAb) | 1431 |
AD12366 | usUfscsUfgAfaacacCfaUfgCfuUfcasa | 1099 | (NAG37)s(invAb)suugaagcaUfGfGfuguuucagaas(invAb) | 1432 |
AD12367 | usCfsasGfaAfuccugUfcUfuGfuCfausu | 1100 | (NAG37)s(invAb)saaugacaaGfAfCfaggauucugas(invAb) | 1433 |
AD12368 | usCfsasAfuGfcugucUfgAfgAfaGfcasg | 1101 | (NAG37)s(invAb)scugcuucuCfAfGfacagcauugas(invAb) | 1434 |
AD12369 | usCfscsUfuUfaaaggUfuUfuCfaGfuasg | 1102 | (NAG37)s(invAb)scuacugaaAfAfCfcuuuaaaggas(invAb) | 1435 |
AD12370 | usAfscsUfuCfaucagAfuCfuUfaGfagsu | 1103 | (NAG37)s(invAb)sacucuaagAfUfCfugaugaaguas(invAb) | 1436 |
AD12371 | usAfsasGfuUfuagucAfaCfuUfcCfcasa | 1104 | (NAG37)s(invAb)suugggaagUfUfGfacuaaacuuas(invAb) | 1437 |
AD12372 | usCfsasAfuGfcugucUfgAfgAfaGfcasg | 1101 | (NAG37)s(invAb)scugcuucuCfAfGfacaguauugas(invAb) | 1438 |
AD12583 | usGfsusGfuAfggcugCfaCfuGfaGfagsu | 1105 | (NAG37)s(invAb)sacucucagUfGfCfagccuacacas(invAb) | 1439 |
AD12584 | usUfsgsUfgUfaggcuGfcAfcUfgAfgasg | 1106 | (NAG37)s(invAb)scucucaguGfCfAfgccuacacaas(invAb) | 1440 |
AD12585 | usCfsusUfuGfuguagGfcUfgCfaCfugsa | 1107 | (NAG37)s(invAb)sucagugcaGfCfCfuacacaaagas(invAb) | 1441 |
AD12586 | usUfscsCfuUfuguguAfgGfcUfgCfacsu | 1108 | (NAG37)s(invAb)sagugcagcCfUfAfcacaaaggaas(invAb) | 1442 |
AD12587 | usUfscsGfaAfgugcaCfcAfgGfcGfgusa | 1109 | (NAG37)s(invAb)suaccgccuGfGfUfgcacuucgaas(invAb) | 1443 |
AD12588 | usCfsusCfgAfagugcAfcCfaGfgCfggsu | 1110 | (NAG37)s(invAb)saccgccugGfUfGfcacuucgagas(invAb) | 1444 |
AD12589 | usGfscsUfcGfaagugCfaCfcAfgGfcgsg | 1111 | (NAG37)s(invAb)sccgccuggUfGfCfacuucgagcas(invAb) | 1445 |
AD12590 | asGfsgsCfuCfgaaguGfcAfcCfaGfgcsg | 1112 | (NAG37)s(invAb)scgccugguGfCfAfcuucgagccus(invAb) | 1446 |
AD12591 | asAfscsUfcUfucaguGfuUfuCfcAfgcsg | 1113 | (NAG37)s(invAb)scgcuggaaAfCfAfcugaagaguus(invAb) | 1447 |
AD12592 | usAfscsAfgGfgucucCfcAfcUfuUfgasu | 1114 | (NAG37)s(invAb)saucaaaguGfGfGfagacccuguas(invAb) | 1448 |
AD12593 | asCfsasCfaGfggucuCfcCfaCfuUfugsa | 1115 | (NAG37)s(invAb)sucaaagugGfGfAfgacccugugus(invAb) | 1449 |
AD12594 | usGfsusAfcAfcagggUfcUfcCfcAfcusu | 1116 | (NAG37)s(invAb)saagugggaGfAfCfccuguguacas(invAb) | 1450 |
AD12595 | asGfsgsUfaCfacaggGfuCfuCfcCfacsu | 1117 | (NAG37)s(invAb)sagugggagAfCfCfcuguguaccus(invAb) | 1451 |
AD12596 | usAfsgsGfuAfcacagGfgUfcUfcCfcasc | 1118 | (NAG37)s(invAb)sgugggagaCfCfCfuguguaccuas(invAb) | 1452 |
AD12625 | usGfsasAfcAfagucuGfcUfaUfuUfgasu | 1119 | (NAG37)s(invAb)saucaaauaGfCfAfgacuuguucas(invAb) | 1453 |
AD12626 | usGfscsUfuUfaacuuUfcUfuCfuCfuasg | 1120 | (NAG37)s(invAb)scuagagaaGfAfAfaguuaaagcas(invAb) | 1454 |
AD12627 | usUfsusGfcUfuuaacUfuUfcUfuCfucsu | 1121 | (NAG37)s(invAb)sagagaagaAfAfGfuuaaagcaaas(invAb) | 1455 |
AD12628 | usGfsasAfaUfuacaaUfaUfuGfgGfccsu | 1122 | (NAG37)s(invAb)saggcccaaUfAfUfuguaauuucas(invAb) | 1456 |
AD12629 | usAfsasCfuUfucguuCfuGfaAfgGfgusc | 1123 | (NAG37)s(invAb)sgacccuucAfGfAfacgaaaguuas(invAb) | 1457 |
AD12630 | usCfsasUfaUfaacuuUfcGfuUfcUfgasa | 1124 | (NAG37)s(invAb)suucagaacGfAfAfaguuauaugas(invAb) | 1458 |
AD12631 | usUfscsCfaUfaaucaGfuUfaAfaCfggsg | 1125 | (NAG37)s(invAb)scccguuuaAfCfUfgauuauggaas(invAb) | 1459 |
AD12632 | usUfsasGfgAfaauccAfaUfgCfuGfucsu | 1126 | (NAG37)s(invAb)sagacagcaUfUfGfgauuuccuaas(invAb) | 1460 |
AD12633 | usAfsasAfgGfacaaaAfuGfgCfaAfuasa | 1127 | (NAG37)s(invAb)suuauugccAfUfUfuuguccuuuas(invAb) | 1461 |
AD12634 | usAfsasUfcAfaaggaCfaAfaAfuGfgcsa | 1128 | (NAG37)s(invAb)sugccauuuUfGfUfccuuugauuas(invAb) | 1462 |
AD12953 | usUfsgsauCfacaagCfcAfaAfaccusg | 1129 | (NAG37)s(invAb)scagguuuuGfGfCfuugugaucaas(invAb) | 1429 |
AD12954 | cPrpusUfsgsauCfacaagCfcAfaAfaccusg | 1130 | (NAG37)s(invAb)scagguuuuGfGfCfuugugaucaas(invAb) | 1429 |
AD12955 | usUfsgsaucacaagCfcAfaAfaccusg | 1131 | (NAG37)s(invAb)scagguuuuGfGfCfuugugaucaas(invAb) | 1429 |
AD12956 | cPrpusUfsgsaucacaagCfcAfaAfaccusg | 1132 | (NAG37)s(invAb)scagguuuuGfGfCfuugugaucaas(invAb) | 1429 |
AD12957 | usCfscsuuUfaaaggUfuUfuCfaguasg | 1133 | (NAG37)s(invAb)scuacugaaAfAfCfcuuuaaaggas(invAb) | 1435 |
AD12958 | cPrpusCfscsuuUfaaaggUfuUfuCfaguasg | 1134 | (NAG37)s(invAb)scuacugaaAfAfCfcuuuaaaggas(invAb) | 1435 |
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AD13456 | usAfsgsguaCfacagGfgUfcUfcccasc | 1206 | (NAG37)s(invAb)sgugggagaCfcCfuGfuguaccuas(invAb) | 1508 |
AD13457 | usAfsgsguaCfacagGfgUfcUfcccasc | 1206 | (NAG37)s(invAb)sgugggagaCfCfCfuguguaucuas(invAb) | 1509 |
AD13458 | usAfsgsguaCfacagGfgUfcUfcccasu | 1208 | (NAG37)s(invAb)sgugggagaCfCfCfuguguaccuas(invAb) | 1452 |
AD13459 | usAfsgsguaCfacagGfgUfcUfccuasc | 1209 | (NAG37)s(invAb)sgugggagaCfCfCfuguguaccuas(invAb) | 1452 |
AD13507 | cPrpusCfaGfaauccugUfcUfuGfucausu | 1210 | (NAG37)s(invAb)saaugacaaGfAfCfaggauucugas(invAb) | 1433 |
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AD13514 | cPrpusCfagaauccugUfcUfuGfucausc | 1216 | (NAG37)s(invAb)sgaugacaaGfAfCfaggauucugas(invAb) | 1513 |
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AD13516 | cPrpasCfaGfaauccugUfcUfuGfucausc | 1217 | (NAG37)s(invAb)sgaugacaaGfAfCfaggauucugus(invAb) | 1515 |
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AD13710 | cPrpusAfaucaAfaggaCfaAfaAfuggcsa | 1224 | (NAG37)s(invAb)sugccauuuUfgUfcCfuuugauuas(invAb) | 1520 |
AD13711 | usAfsasUfcaaaggaCfaAfaAfuggcsa | 1225 | (NAG37)s(invAb)sugccauuuUfGfUfccuuugauuas(invAb) | 1462 |
AD13712 | cPrpusAfaUfcaaaggaCfaAfaAfuggcsa | 1226 | (NAG37)s(invAb)sugccauuuUfGfUfccuuugauuas(invAb) | 1462 |
AD13804 | asCfagAfauccugUfcUfuGfucausu | 1227 | (NAG37)s(invAb)saaugacaaGfAfCfaggauucugus(invAb) | 1510 |
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AD13806 | asCfagAfauccugUfcUfuGfucausc | 1230 | (NAG37)s(invAb)sgaugacaaGfAfCfaggauucugus(invAb) | 1515 |
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在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑以鹽、混合鹽或游離酸形式製備或提供。本文所描述之RNAi藥劑在遞送至表現MARC1基因之細胞中之後活體內及/或活體外抑制或減弱一或多個MARC1基因之表現。
靶向配位體或基團、連接基團及遞送媒劑
在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑與一或多個非核苷酸基團結合,該一或多個非核苷酸基團包括但不限於靶向基團、連接基團、靶向配位體、遞送聚合物或遞送媒劑。非核苷酸基團可增強RNAi藥劑之靶向、遞送或連接。靶向基團及連接基團之實例提供於表7中。非核苷酸基團可共價連接至有義股及/或反義股之3'及/或5'端。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑含有連接至有義股之3'及/或5'端之非核苷酸基團。在一些實施例中,非核苷酸基團連接至MARC1 RNAi藥劑有義股之5'端。非核苷酸基團可經由連接子/連接基團直接地或間接地連接至RNAi藥劑。在一些實施例中,非核苷酸基團經不穩定、可裂解或可逆鍵或連接子連接至RNAi藥劑。
在一些實施例中,非核苷酸基團增強RNAi藥劑或與其連接之結合物之藥物動力學特性或生物分佈特性,以改善RNAi藥劑或結合物之細胞特異性或組織特異性分佈及細胞特異性吸收。在一些實施例中,非核苷酸基團增強RNAi藥劑之胞吞作用。
靶向基團或靶向部分增強結合物或與其連接之RNAi藥劑的藥物動力學或生物分佈特性,以改善結合物或RNAi藥劑之細胞特異性(在一些情況下包括器官特異性)分佈及細胞特異性(或器官特異性)吸收。靶向基團可為單價、二價、三價、四價或具有更高價數,以用於其所針對之目標。代表性靶向基團包括但不限於對細胞表面分子具有親和力之化合物、細胞受體配位體、半抗原、抗體、單株抗體、抗體片段及對細胞表面分子具有親和力之抗體模擬物。
在一些實施例中,靶向基團使用連接子連接至RNAi藥劑,該連接子諸如PEG連接子或一個、兩個或三個無鹼基及/或核糖醇(無鹼基核糖)殘基,該等殘基在一些情況下可充當連接子。在一些實施例中,靶向配位體包含半乳糖衍生物簇。
本文所描述之MARC1 RNAi藥劑可合成為在5'末端及/或3'末端處具有反應性基團,諸如胺基(在本文中亦稱為胺)。反應性基團隨後可用於使用此項技術中典型之方法連接靶向部分。
在一些實施例中,靶向基團包含去唾液酸糖蛋白受體配位體。依本文所使用,去唾液酸糖蛋白受體配位體為含有對去唾液酸糖蛋白受體具有親和力之部分的配位體。依本文所提及,去唾液酸糖蛋白受體在肝細胞上高度表現。在一些實施例中,去唾液酸糖蛋白受體配位體包括一或多種半乳糖衍生物或由其組成。依本文所使用,術語半乳糖衍生物包括半乳糖及對去唾液酸糖蛋白受體之親和力等於或大於半乳糖所具有之親和力的半乳糖衍生物。半乳糖衍生物包括但不限於:半乳糖、半乳胺糖、N-甲醯基半乳胺糖、N-乙醯基-半乳胺糖、N-丙醯基-半乳胺糖、N-正丁醯基-半乳胺糖及N-異丁醯基半乳胺糖(參見例如:S.T. Iobst及K. Drickamer, J.B.C., 1996, 271, 6686)。適用於將寡核苷酸及其他分子活體內靶向肝之半乳糖衍生物及半乳糖衍生物簇為此項技術中已知的(參見例如Baenziger及Fiete,1980,Cell, 22, 611-620;Connolly等人,1982, J. Biol. Chem., 257, 939-945)。
半乳糖衍生物已被用於透過其與肝細胞表面上所表現之去唾液酸糖蛋白受體結合而將分子活體內靶向肝細胞。去唾液酸糖蛋白受體配位體與去唾液酸糖蛋白受體之結合促進細胞特異性靶向肝細胞及分子至肝細胞中之胞吞作用。去唾液酸糖蛋白受體配位體可為單體(例如具有單一半乳糖衍生物,亦稱為單價或單齒)或多聚體(例如具有多種半乳糖衍生物)。半乳糖衍生物或半乳糖衍生物簇可使用此項技術中已知之方法連接至RNAi藥劑之有義股或反義股的3'或5'端。
諸如半乳糖衍生物簇之靶向配位體的製備描述於例如Arrowhead Pharmaceuticals, Inc.之國際專利申請公開案第WO 2018/044350號及Arrowhead Pharmaceuticals, Inc.之國際專利申請公開案第WO 2017/156012號中,該等國際專利申請公開案之內容以全文引用之方式併入本文中。
依本文所使用,半乳糖衍生物簇包含具有兩個至四個末端半乳糖衍生物之分子。末端半乳糖衍生物透過其C-1碳連接至分子。在一些實施例中,半乳糖衍生物簇為半乳糖衍生物三聚體(亦稱為三觸角型半乳糖衍生物或三價半乳糖衍生物)。在一些實施例中,半乳糖衍生物簇包含N-乙醯基-半乳胺糖部分。在一些實施例中,半乳糖衍生物簇包含三個N-乙醯基-半乳胺糖部分。在一些實施例中,半乳糖衍生物簇為半乳糖衍生物四聚體(亦稱為四觸角型半乳糖衍生物或四價半乳糖衍生物)。在一些實施例中,半乳糖衍生物簇包含四個N-乙醯基-半乳胺糖部分。
依本文所使用,半乳糖衍生物三聚體含有三種半乳糖衍生物,其各自連接至中央分支點。依本文所使用,半乳糖衍生物四聚體含有四種半乳糖衍生物,其各自連接至中央分支點。半乳糖衍生物可透過醣之C-1碳連接至中央分支點。在一些實施例中,半乳糖衍生物經由連接子或間隔基連接至分支點。在一些實施例中,連接子或間隔基為可撓性親水性間隔基,諸如PEG基團(參見例如美國專利第5,885,968號;Biessen等人, J. Med. Chem. 1995, 第39卷, 第1538-1546頁)。在一些實施例中,PEG間隔基為PEG
3間隔基。分支點可為允許三種半乳糖衍生物連接且進一步允許分支點連接至RNAi藥劑的任何小分子。分支點基團之實例為二離胺酸或二麩胺酸。分支點至RNAi藥劑之連接可透過連接子或間隔基發生。在一些實施例中,連接子或間隔基包含可撓性親水性間隔基,諸如但不限於PEG間隔基。在一些實施例中,連接子包含剛性連接子,諸如環狀基團。在一些實施例中,半乳糖衍生物包含N-乙醯基-半乳胺糖或由其組成。在一些實施例中,半乳糖衍生物簇包含半乳糖衍生物四聚體,其可為例如N-乙醯基-半乳胺糖四聚體。
本揭示之實施例包括用於將MARC1 RNAi藥劑活體內遞送至肝臟細胞中之醫藥組合物。此類醫藥組合物可包括例如與半乳糖衍生物簇結合之MARC1 RNAi藥劑。在一些實施例中,半乳糖衍生物簇包含半乳糖衍生物三聚體,其可為例如N-乙醯基-半乳胺糖三聚體,或包含半乳糖衍生物四聚體,其可為例如N-乙醯基-半乳胺糖四聚體。
靶向配位體或靶向基團可連接至本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑之有義股或反義股的3'或5'端。
靶向配位體包括但不限於表7中所定義之(NAG37)及(NAG37)s。其他靶向基團及靶向配位體(包括半乳糖簇靶向配位體)為此項技術中已知的。
在一些實施例中,連接基團與RNAi藥劑結合。連接基團有助於藥劑與靶向基團、遞送聚合物或遞送媒劑之共價鍵聯。連接基團可連接至RNAi藥劑有義股或反義股之3'及/或5'端。在一些實施例中,連接基團連接至RNAi藥劑有義股。在一些實施例中,連接基團與RNAi藥劑有義股之5'或3'端結合。在一些實施例中,連接基團與RNAi藥劑有義股之5'端結合。連接基團之實例包括但不限於:反應性基團,諸如一級胺及炔烴、烷基、無鹼基核苷酸、核糖醇(無鹼基核糖),及/或PEG基團。
在一些實施例中,靶向基團內部連接至RNAi藥劑之有義股及/或反義股上之核苷酸。在一些實施例中,靶向基團經由連接子連接至RNAi藥劑。
連接子或連接基團為兩個原子之間的連接,其使所關注之一個化學基團(諸如RNAi藥劑)或區段經由一或多個共價鍵連接至所關注之另一化學基團(諸如靶向基團或遞送聚合物)或區段。不穩定鍵聯含有不穩定鍵。鍵聯可視情況包括使兩個接合之原子之間的距離增加的間隔基。間隔基可進一步增加鍵聯之可撓性及/或長度。間隔基包括但不限於烷基、烯基、炔基、芳基、芳烷基、芳烯基及芳炔基;其各自可含有一或多個雜原子、雜環、胺基酸、核苷酸及醣類。間隔子基團為此項技術中所熟知且前述清單並不意欲限制本說明書之範疇。
在一些實施例中,當在單一組合物中包括兩種或更多種RNAi藥劑時,該等RNAi藥劑中之各者可連接至同一靶向基團或兩個不同靶向基團(亦即具有不同化學結構之靶向基團)。在一些實施例中,在不使用額外連接子之情況下,將靶向基團連接至本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑。在一些實施例中,靶向基團本身經設計以具有連接子或其他位點以促進容易存在的結合。在一些實施例中,當在單一分子中包括兩種或更多種MARC1 RNAi藥劑時,該等RNAi藥劑中之各者可利用相同的連接子或不同的連接子(亦即具有不同化學結構之連接子)。
表2、表3、表4、表5或表6D中列出之MARC1 RNAi藥劑核苷酸序列中之任一者無論經修飾或未經修飾,均可含有3'及/或5'靶向基團或連接基團。表3、表4或表6D中所列或在本文其他地方所描述之含有3'或5'靶向基團或連接基團的MARC1 RNAi藥劑序列中之任一者或者可不含3'或5'靶向基團或連接基團,或可含有不同的3'或5'靶向基團或連接基團,包括但不限於表7中所描繪之靶向基團或連接基團。表6A、表6B、表6C或表6D中所列之MARC1 RNAi藥劑雙螺旋體中之任一者無論經修飾或未經修飾,均可進一步包含靶向基團或連接基團,包括但不限於表7中所描繪之靶向基團或連接基團,且靶向基團或連接基團可連接至MARC1 RNAi藥劑雙螺旋體之有義股或反義股之3'或5'末端。
靶向基團及連接基團(當該等靶向基團及連接基團組合時可形成靶向配位體)之實例提供於表7中。表5及表6D提供具有連接至5'或3'端之靶向基團或連接基團的MARC1 RNAi藥劑有義股之某些實施例。
表 7.表示各種經修飾之核苷酸、靶向配位體或靶向基團、加帽殘基及連接基團之結構
當位於內部時: | |
當位於3'末端時: | |
在表7中之以上結構中之各者中,NAG包含N-乙醯基-半乳胺糖。在一些實施例中,上表7中所描繪之NAG可包含對肝細胞上存在之去唾液酸糖蛋白受體具有親和力的另一半乳糖衍生物,依一般熟習此項技術者將理解,鑒於以上結構及本文所提供之描述而連接。可使用此項技術中已知的其他連接基團。
在一些實施例中,可使用遞送媒劑將RNAi藥劑遞送至細胞或組織中。遞送媒劑為改善RNAi藥劑至細胞或組織之遞送的化合物。遞送媒劑可包括但不限於以下或由以下組成:聚合物,諸如兩性聚合物、膜活性聚合物、肽、蜂毒素肽、蜂毒素樣肽(MLP)、脂質、經可逆修飾之聚合物或肽,或經可逆修飾之膜活性多元胺。在一些實施例中,RNAi藥劑可與脂質、奈米粒子、聚合物、脂質體、微胞、DPC或此項技術中可用之其他遞送系統組合。RNAi藥劑亦可化學結合至靶向基團、脂質(包括但不限於膽固醇及膽固醇基衍生物)、奈米粒子、聚合物、脂質體、微胞、DPC (參見例如WO 2000/053722、WO 2008/0022309、WO 2011/104169及WO 2012/083185、WO 2013/032829、WO 2013/158141,其各自以引用之方式併入本文中)、水凝膠、環糊精、可生物降解奈米膠囊及生物黏附微球、蛋白質載體或此項技術中已知及可用的適用於核酸或寡核苷酸遞送的其他遞送系統。
醫藥組合物
本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑可以醫藥組合物或調配物(在本文中亦稱為「藥物(medicament)」)之形式製備。在一些實施例中,醫藥組合物包括至少一種MARC1 RNAi藥劑。此等醫藥組合物尤其適用於抑制目標細胞、細胞群、組織或生物體中之目標mRNA之表現。
該等醫藥組合物可用於治療患有疾病、病症或病狀之個體,該疾病、病症或病狀將受益於目標MARC1 mRNA之含量降低或目標基因表現之抑制。該等醫藥組合物可用於治療處於罹患疾病、病症、症狀或病狀之風險下的個體,該疾病、病症、症狀或病狀將受益於目標mRNA之含量降低或目標基因表現之抑制。在一個實施例中,該方法包括向待治療之個體投與連接至本文所描述之靶向配位體的MARC1 RNAi藥劑。在一些實施例中,向包括MARC1 RNAi藥劑之醫藥組合物中添加一或多種醫藥學上可接受之賦形劑(包括媒劑、載劑、稀釋劑及/或遞送聚合物),藉此形成適用於向包括人類在內之個體活體內遞送的醫藥調配物或藥物。
本文所揭示之包括MARC1 RNAi藥劑之醫藥組合物及方法可降低細胞、細胞群、組織、器官或個體中目標mRNA之含量,包括藉由向個體投與治療有效量之本文所描述之MARC1 RNAi藥劑,藉此抑制個體體內MARC1 mRNA之表現或轉譯。在一些實施例中,個體先前已被鑑別為在肝細胞中具有目標基因之病原性上調。在一些實施例中,個體先前已被鑑別或診斷為患有非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、酒精性脂肪肝病、自體免疫肝炎、肝纖維化、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病。在一些實施例中,個體將受益於個體之肝臟中MARC1基因表現之降低。
在一些實施例中,所描述之包括MARC1 RNAi藥劑之醫藥組合物係用於治療或管理與以下相關之臨床表現:非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、酒精性脂肪肝病、自體免疫肝炎、肝纖維化、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病。在一些實施例中,向需要此類治療之個體投與治療(包括防治)有效量的醫藥組合物中之一或多者。在一些實施例中,投與所揭示之MARC1 RNAi藥劑中之任一者可用於降低個體之疾病症狀之數目、嚴重程度及/或頻率。
所描述之包括MARC1 RNAi藥劑之醫藥組合物可用於治療患有將受益於MARC1 mRNA表現之降低或抑制及/或MARC1蛋白含量之降低的疾病或病症之個體之至少一個症狀。量測MARC1含量可根據此項技術中已知之既定方法進行。
在一些實施例中,向個體投與治療有效量之一或多種包括MARC1 RNAi藥劑的醫藥組合物,藉此治療該症狀。在其他實施例中,向個體投與防治有效量之一或多種MARC1 RNAi藥劑,藉此預防或抑制至少一個症狀。
投與途徑為MARC1 RNAi藥劑藉以與身體接觸之路徑。一般而言,投與藥物及寡核苷酸及核酸以用於治療哺乳動物之方法為此項技術中所熟知的,且可應用該等方法來投與本文所描述之組合物。本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑可經由任何適合途徑以根據特定途徑適當調整的製劑形式投與。因此,本文所描述之醫藥組合物可藉由注射來投與,例如靜脈內、肌肉內、皮內、皮下、關節內或腹膜內注射投與。在一些實施例中,本文所描述之醫藥組合物經由皮下注射投與。
本文中所描述之包括MARC1 RNAi藥劑的醫藥組合物可使用此項技術中已知的寡核苷酸遞送技術遞送至細胞、細胞群、組織或個體中。一般而言,此項技術中公認用於遞送核酸分子(活體外或活體內)之任何適合方法均適合與本文所描述之組合物一起使用。舉例而言,可藉由以下方式進行遞送:局部投與(例如直接注射、植入或表面投與)、全身性投與或皮下、靜脈內、腹膜內或非經腸途徑,包括顱內(例如腦室內、腦實質內及鞘內)、肌肉內、經皮、呼吸道(氣溶膠)、經鼻、經口、經直腸或表面(包括經頰及舌下)投與。在某些實施例中,組合物係藉由皮下或靜脈內輸注或注射投與。
在一些實施例中,本文所描述之醫藥組合物包含一或多種醫藥學上可接受之賦形劑。本文所描述之醫藥組合物經調配以用於向個體進行投與。
依本文所使用,醫藥組合物或藥物包括藥理學有效量之所描述治療性化合物中之至少一者及一或多種醫藥學上可接受之賦形劑。醫藥學上可接受之賦形劑(賦形劑)為有意包括於藥物遞送系統中之除有效藥劑成分(API、治療產品,例如MARC1 RNAi藥劑)外之物質。賦形劑在預期劑量下不發揮或不意欲發揮治療作用。賦形劑可用於a)在製造期間輔助加工藥物遞送系統,b)保護、支持或增強API之穩定性、生物可用性或患者接受性,c)輔助產物鑑別,及/或d)在儲存或使用期間增強API遞送之總體安全性、有效性之任何其他屬性。醫藥學上可接受之賦形劑可為或可不為惰性物質。
賦形劑包括但不限於:吸收增強劑、抗黏劑、消泡劑、抗氧化劑、黏合劑、緩衝劑、載劑、塗佈劑、顏料、遞送增強劑、遞送聚合物、清潔劑、聚葡萄糖、右旋糖、稀釋劑、崩解劑、乳化劑、增量劑、填充劑、調味劑、滑動劑、保濕劑、潤滑劑、油狀物、聚合物、防腐劑、鹽水、鹽、溶劑、糖、界面活性劑、懸浮劑、持續釋放型基質、甜味劑、增稠劑、張力劑、媒劑、防水劑(water-repelling agent)及濕潤劑。
適用於可注射使用之醫藥組合物包括無菌水溶液(在可溶於水之情況下)或分散液及用於臨時製備無菌可注射溶液或分散液之無菌粉末。對於靜脈內投與,適合載劑包括生理鹽水、抑菌水、Cremophor® ELTM (BASF, Parsippany, NJ)或磷酸鹽緩衝鹽水(PBS)。適合載劑應該在製造及儲存條件下穩定,且應該能被保存而不會受到諸如細菌及真菌之微生物的污染作用。載劑可為含有例如水、乙醇、多元醇(例如甘油、丙二醇及液態聚乙二醇)及其適合混合物的溶劑或分散介質。適當流動性可例如藉由使用諸如卵磷脂之包衣、藉由在分散液之情況下維持所需粒度及藉由使用界面活性劑來維持。在許多情況下,組合物中將較佳包括等張劑,例如糖、多元醇(諸如甘露醇、山梨醇)及氯化鈉。可藉由在組合物中包括延遲吸收劑,例如單硬脂酸鋁及明膠來實現可注射組合物之延長吸收。
無菌可注射溶液可藉由以下方法來製備:將適當溶劑中之所需量之活性化合物與上文所列舉之成分中之一種或組合合併,且視需要接著進行過濾滅菌。通常,分散液係藉由將活性化合物併入無菌媒劑中來製備,該無菌媒劑含有鹼性分散介質及來自上文所列舉之成分的其他所需成分。在用於製備無菌可注射溶液之無菌散劑之情況下,製備方法包括真空乾燥及冷凍乾燥,其產生活性成分加來自其先前無菌過濾溶液之任何額外所需成分的散劑。
在一些實施例中,包括本文所揭示之適用於皮下投與之MARC1 RNAi藥劑的醫藥調配物可在磷酸鈉水性緩衝液中製備(例如在水中以0.5 mM磷酸二氫鈉、0.5 mM磷酸氫二鈉調配之MARC1 RNAi藥劑)。在一些實施例中,包括本文所揭示之適用於皮下投與之MARC1 RNAi藥劑的醫藥調配物可在注射用水(無菌水)中製備。本文所揭示之適用於皮下投與之MARC1 RNAi藥劑可在等張鹽水(0.9%)中製備。
適用於關節內投與之調配物可呈藥物之無菌水性製劑形式,其可呈微晶形式,例如呈水性微晶懸浮液形式。脂質調配物或生物可降解聚合物系統亦可用於呈遞藥物以用於關節內及經眼投與。
亦可製備適用於經口投與本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑的調配物。在一些實施例中,本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑係經口投與。在一些實施例中,本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑經調配於膠囊中以供經口投與。
活性化合物可用將防止化合物自體內快速排除之載劑來製備,該等載劑諸如控制釋放型調配物,包括植入物及微囊封遞送系統。可使用可生物降解的生物相容性聚合物,諸如乙烯乙酸乙烯酯、聚酸酐、聚乙醇酸、膠原蛋白、聚原酸酯及聚乳酸。用於製備此類調配物之方法將為熟習此項技術者顯而易見的。脂質體懸浮液亦可用作醫藥學上可接受之載劑。其可根據熟習此項技術者已知之方法製備,例如依美國專利第4,522,811號中所描述。
就投與之容易性及劑量之均勻性而言,MARC1 RNAi藥劑可在組合物中以單位劑型形式調配。單位劑型係指適合以單位劑量用於待治療之個體的物理離散單位;各單位含有預定量之活性化合物,其經計算以與所需醫藥載劑聯合產生所需治療效果。本揭示之單位劑型之規格由以下因素規定且直接視以下因素而定:活性化合物之獨特特徵及欲達成之治療效果,及用於治療個體之此活性化合物之混配技術中的固有限制。
醫藥組合物可含有常見於醫藥組合物中之其他額外組分。此類額外組分包括但不限於:止癢劑、收斂劑、局部麻醉劑、鎮痛劑、抗組織胺或抗炎劑(例如乙醯胺苯酚、NSAID、苯海拉明(diphenhydramine)等)。亦設想表現或包含本文所定義之RNAi藥劑的細胞、組織或經分離之器官可用作「醫藥組合物」。依本文所使用,「藥理學有效量」、「治療有效量」或簡稱「有效量」係指產生藥理學、治療性或預防性結果之RNAi藥劑的量。
在一些實施例中,本文所揭示之方法除了投與本文中所揭示之RNAi藥劑以外,進一步包含投與第二治療劑或第二治療之步驟。在一些實施例中,第二治療劑為另一MARC1 RNAi藥劑(例如靶向MARC1目標內之不同序列的MARC1 RNAi藥劑)。在其他實施例中,第二治療劑可為小分子藥物、抗體、抗體片段或適體。
在一些實施例中,所描述之MARC1 RNAi藥劑視情況與一或多種額外治療劑組合。MARC1 RNAi藥劑及額外治療劑可以單一組合物之形式投與或可分開投與。在一些實施例中,一或多種額外治療劑以各別劑型與RNAi藥劑分開投與(例如MARC1 RNAi藥劑係藉由皮下注射來投與,而治療給藥方案之方法中涉及的額外治療劑係經口投與)。在一些實施例中,所描述之MARC1 RNAi藥劑係經由皮下注射向有需要之個體投與,且一或多種視情況選用之額外治療劑係經口投與,其共同提供與以下相關之疾病及病狀的治療方案:非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、酒精性脂肪肝病、自體免疫肝炎、肝纖維化、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病。在一些實施例中,所描述之MARC1 RNAi藥劑係經由皮下注射向有需要之個體投與,且一或多種視情況選用之額外治療劑係經由單獨皮下注射投與。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑及一或多種額外治療劑組合成單一劑型(例如經調配成用於皮下注射之單一組合物的「雞尾酒(cocktail)」)。MARC1 RNAi藥劑在具有或不具有一或多種額外治療劑之情況下可與一或多種賦形劑組合以形成醫藥組合物。
一般而言,MARC1 RNAi藥劑之有效量將在約0.1 mg/kg體重/劑量至約100 mg/kg體重/劑量,例如約1.0 mg/kg體重/劑量至約50 mg/kg體重/劑量之範圍內。在一些實施例中,活性化合物之有效量將在每劑量約0.25 mg/kg體重至約5 mg/kg體重之範圍內。在一些實施例中,活性成分之有效量將在每劑量約0.5 mg/kg體重至約4 mg/kg體重之範圍內。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑之有效量可為固定劑量。在一些實施例中,固定劑量在約5 mg至約1,000 mg MARC1 RNAi藥劑之範圍內。在一些實施例中,固定劑量在10至400 mg MARC1 RNAi藥劑之範圍內。在一些實施例中,固定劑量在50至400 mg MARC1 RNAi藥劑之範圍內。視所投與之MARC1 RNAi藥劑之劑量、特定MARC1 RNAi藥劑之活性含量及特定個體之所需抑制程度而定,給藥可每週、每兩週、每月、每季或以任何其他時間間隔進行。本文中之實例顯示在某些動物物種中之適合的抑制程度。所投與之量將視諸如患者或個體之整體健康狀況、所遞送之化合物之相關生物學功效、藥物之調配物、調配物中賦形劑之存在及類型以及投與途徑的變數而定。此外,應理解,可將所投與之初始劑量增加至超出以上上限含量以快速達成所需血液含量或組織含量,或初始劑量可小於最佳值。
為了治療疾病或形成用於治療疾病之藥物或組合物,本文所描述之包括MARC1 RNAi藥劑的醫藥組合物可與賦形劑或第二治療劑或治療組合,該第二治療劑或治療包括但不限於:第二或其他RNAi藥劑、小分子藥物、抗體、抗體片段、肽及/或適體。
當添加至醫藥學上可接受之賦形劑或佐劑中時,所描述之MARC1 RNAi藥劑可封裝於套組、容器、封裝物或分配器中。本文所描述之醫藥組合物可封裝於預填注射筒、筆式注射器、自動注射器、輸注袋/裝置或小瓶中。
治療方法及表現抑制
本文所揭示之MARC1 RNAi藥劑可用於治療患有將受益於RNAi藥劑投與之疾病或病症的個體(例如人類或其他哺乳動物)。在一些實施例中,本文所揭示之RNAi藥劑可用於治療將受益於MARC1 mRNA表現及/或MARC1蛋白含量之降低及/或抑制的個體(例如人類),例如已診斷患有或患有與以下相關之症狀的個體:非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、酒精性脂肪肝病、自體免疫肝炎、肝纖維化、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病。
在一些實施例中,向個體投與治療有效量之任何一或多種MARC1 RNAi藥劑。個體之治療可包括治療性及/或防治性治療。向個體投與治療有效量之本文所描述之任何一或多種MARC1 RNAi藥劑。個體可為成年人、青少年、兒童或嬰兒。本文所描述之醫藥組合物可向人類或動物投與。
本文所描述之MARC1 RNAi藥劑可用於治療患有MARC1相關疾病或病症或患有至少部分地由MARC1基因表現介導之疾病或病症的個體之至少一個症狀。在一些實施例中,MARC1 RNAi藥劑用於治療或管理患有將受益於MARC1 mRNA降低或MARC1蛋白含量之降低或者至少部分地由其介導之疾病或病症的個體之臨床表現。向個體投與治療有效量的本文所描述之MARC1 RNAi藥劑或含有MARC1 RNAi藥劑之組合物中之一或多者。在一些實施例中,本文所揭示之方法包含向待治療之個體投與包含本文所描述之MARC1 RNAi藥劑的組合物。在一些實施例中,向個體投與防治有效量之所描述MARC1 RNAi藥劑中之任何一或多者,藉此藉由預防或抑制至少一個症狀來治療個體。
在某些實施例中,本揭示提供用於治療有需要之患者之至少部分地由MARC1基因表現介導之疾病、病症、病狀或病理學病況的方法,其中該等方法包括向患者投與本文所描述之MARC1 RNAi藥劑中之任一者。
在一些實施例中,相對於被投與MARC1 RNAi藥劑之前的個體或未接受MARC1 RNAi藥劑之個體,被投與所描述MARC1 RNAi藥劑之個體之MARC1基因的基因表現量及/或mRNA含量降低至少約30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、95%、96%、97%、98%、99%或大於99%。在個體之細胞、細胞組及/或組織中,個體之MARC1 mRNA含量可能降低。在一些實施例中,相對於被投與MARC1 RNAi藥劑之前的個體或未接受MARC1 RNAi藥劑之個體,肝細胞中MARC1基因表現被抑制至少約30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%或大於65%。
在一些實施例中,相對於被投與MARC1 RNAi藥劑之前的個體或未接受MARC1 RNAi藥劑之個體,已投與所描述MARC1 RNAi藥劑之個體中MARC1蛋白含量降低至少約30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%或大於99%。在個體之細胞、細胞群、組織、血液及/或其他體液中,個體之蛋白含量可降低。
MARC1 mRNA含量及MARC1蛋白含量之降低可藉由此項技術中已知之任何方法來評定。依本文所使用,MARC1 mRNA含量及/或蛋白含量之降低或減少在本文中統稱為MARC1之降低或減少或MARC1之基因表現之抑制或降低。本文所闡述之實例說明用於評定MARC1基因表現之抑制的已知方法。一般熟習此項技術者將進一步知曉用於評定活體內及/或活體外MARC1基因表現之抑制的適合方法。
在一些實施例中,本文揭示治療(包括防治性或預防性治療)由非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、酒精性脂肪肝病、自體免疫肝炎、肝纖維化、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病引起之疾病、病症或症狀的方法,其中該等方法包括向有需要之個體投與治療有效量之MARC1 RNAi藥劑,該MARC1 RNAi藥劑包括與MARC1 mRNA之具有表1中之序列的部分至少部分互補之反義股。在一些實施例中,本文揭示治療(包括防治性或預防性治療)由非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、酒精性脂肪肝病、自體免疫肝炎、肝纖維化、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病引起之疾病或症狀的方法,其中該等方法包括向有需要之個體投與治療有效量之MARC1 RNAi藥劑,該MARC1 RNAi藥劑包括包含表2、表3或表6D中之序列中之任一者之序列的反義股及包含表2、表4、表5或表6D之序列中之任一者的與反義股至少部分互補之有義股。在一些實施例中,本文揭示治療(包括防治性或預防性治療)由非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、酒精性脂肪肝病、自體免疫肝炎、肝纖維化、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病引起之疾病或症狀的方法,其中該等方法包括向有需要之個體投與治療有效量之MARC1 RNAi藥劑,該MARC1 RNAi藥劑包括包含表2、表4、表5或表6D之序列中之任一者的有義股及包含表2、表3或表6D中之序列中之任一者之序列的與有義股至少部分互補之反義股。
在一些實施例中,本文揭示用於抑制細胞中MARC1基因表現之方法,其中該等方法包括向細胞投與MARC1 RNAi藥劑,該MARC1 RNAi藥劑包括與MARC1 mRNA之具有表1中之序列的部分至少部分互補之反義股。在一些實施例中,本文揭示抑制細胞中MARC1基因表現之方法,其中該等方法包括向細胞投與MARC1 RNAi藥劑,該MARC1 RNAi藥劑包括包含表2、表3或表6D中之序列中之任一者之序列的反義股及包含表2、表4、表5或表6D之序列中之任一者的與反義股至少部分互補之有義股。在一些實施例中,本文揭示抑制細胞中MARC1基因表現之方法,其中該等方法包括投與MARC1 RNAi藥劑,該MARC1 RNAi藥劑包括包含表2、表4、表5或表6D之序列中之任一者的有義股及包括表2、表3或表6D中之序列中之任一者之序列的與有義股至少部分互補之反義股。
MARC1 RNAi藥劑之使用提供用於治療性(包括防治性)治療與以下相關之疾病/病症的方法:非酒精性脂肪性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、酒精性脂肪肝病、自體免疫肝炎、肝纖維化、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病。所描述之MARC1 RNAi藥劑介導RNA干擾以抑制產生MARC1蛋白所需的一或多種基因之表現。MARC1 RNAi藥劑亦可用於治療或預防各種疾病、病症或病狀,包括非酒精性脂肪性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、酒精性脂肪肝病、自體免疫肝炎、肝纖維化、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病。此外,描述用於活體內將MARC1 RNAi藥劑遞送至肝臟細胞,且尤其遞送至肝細胞的組合物。
細胞、組織、器官及非人類生物體
涵蓋包括本文所描述之MARC1 RNAi藥劑中之至少一者的細胞、組織、器官及非人類生物體。該細胞、組織、器官或非人類生物體係藉由將該RNAi藥劑遞送至該細胞、組織、器官或非人類生物體而製得。
額外說明性實施例
本文提供所揭示之發明之某些額外說明性實施例。此等實施例僅為說明性的且不限制本揭示或其所附申請專利範圍之範疇。
實施例1. 一種用於抑制MARC1基因表現之RNAi藥劑,其包含:
反義股,其包含與表2、表3或表6D之反義股序列中之任一者之15個連續核苷酸相差0或1個核苷酸的至少15個連續核苷酸之核苷酸序列;及
有義股,其包含與該反義股至少部分互補之核苷酸序列。
實施例2. 如實施例1之RNAi藥劑,其中該反義股包含表2、表3或表6D中所提供之序列中之任一者的核苷酸2至18。
實施例3. 如實施例1或實施例2之RNAi藥劑,其中該有義股包含與表2、表4、表5或表6D之有義股序列中之任一者之15個連續核苷酸相差0或1個核苷酸的至少15個連續核苷酸之核苷酸序列,且其中該有義股在至少15個連續核苷酸內具有與該反義股至少85%互補性的區域。
實施例4. 如實施例1至3中任一項之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑之至少一個核苷酸包括經修飾之核苷間鍵。
實施例5. 如實施例1至4中任一項之RNAi藥劑,其中所有或實質上所有該等核苷酸為經修飾之核苷酸。
實施例6. 如實施例4至5中任一項之RNAi藥劑,其中該等經修飾之核苷酸獨立地選自由以下組成之群:2'-O-甲基核苷酸、2'-氟核苷酸、2'-去氧核苷酸、2',3'-開環核苷酸模擬物、鎖定核苷酸、2'-F-阿糖核苷酸、2'-甲氧基乙基核苷酸、無鹼基核苷酸、核糖醇、反向核苷酸、反向2'-O-甲基核苷酸、反向2'-去氧核苷酸、2'-胺基修飾之核苷酸、2'-烷基修飾之核苷酸、N-𠰌啉基核苷酸、含膦酸乙烯酯之核苷酸、含膦酸環丙酯之核苷酸及3'-O-甲基核苷酸。
實施例7. 如實施例5之RNAi藥劑,其中所有或實質上所有該等經修飾之核苷酸為2'-O-甲基核苷酸、2'-氟核苷酸或其組合。
實施例8. 如實施例1至7中任一項之RNAi藥劑,其中該反義股由表3之經修飾之反義股序列中之任一者的核苷酸序列組成或基本上由該核苷酸序列組成。
實施例9. 如實施例1至8中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股由表4、表5或表6D之經修飾之有義股序列中之任一者的核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列。
實施例10. 如實施例1之RNAi藥劑,其中該反義股包含表3或表6D之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列,且該有義股包含表4、表5或表6D之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列。
實施例11. 如實施例1至10中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股之長度為18至30個核苷酸,且該反義股之長度為18至30個核苷酸。
實施例12. 如實施例11之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自為18至27個核苷酸。
實施例13. 如實施例12之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自為18至24個核苷酸。
實施例14. 如實施例13之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自為21個核苷酸。
實施例15. 如實施例14之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑具有兩個鈍端。
實施例16. 如實施例1至15中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股包含一或兩個端帽。
實施例17. 如實施例1至16中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股包含一或兩個反向無鹼基殘基。
實施例18. 如實施例1之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑包含有義股及反義股,該有義股及該反義股形成具有表6A及表6B中之雙螺旋體中之任一者之結構的雙螺旋體。
實施例19. 如實施例18之RNAi藥劑,其中所有或實質上所有該等核苷酸為經修飾之核苷酸。
實施例20. 如實施例1之RNAi藥劑,其包含反義股,該反義股由與以下核苷酸序列(5'
3')中之一者相差0或1個核苷酸的核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列:
UGAAAGAACUAUUCCAUAAUC (SEQ ID NO: 1608);
ACAGAAUCCUGUCUUGUCGUU (SEQ ID NO: 1657);
UCCUUUAAAGGUUUUCAGUAG (SEQ ID NO: 1580);或
UAUUGAAGCAUUGAGACACCG (SEQ ID NO: 1659)。
實施例21. 如實施例1至20中任一項之RNAi藥劑,其中該反義股之位於自5'端起之位置2及位置14處的核苷酸為2'-氟修飾之核苷酸。
實施例22. 如實施例21之RNAi藥劑,其中該反義股之在位置2處的核苷酸為2'-氟尿苷,且該反義股之在位置14處的核苷酸為2'-氟胞苷,且其中該反義股包含3或4個硫代磷酸酯核苷間鍵。
實施例23. 如實施例1至22中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股由與以下核苷酸序列(5'
3')中之一者相差0或1個核苷酸的核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列:
GAUUAUGGAAUAGUUCUUUCA (SEQ ID NO: 1734);
AACGACAAGACAGGAUUCUGU (SEQ ID NO: 1783);
CUACUGAAAACCUUUAAAIGA (SEQ ID NO: 1774);或
CGGUGUCUCAAUGCUUCAAUA (SEQ ID NO: 1784)。
實施例24. 如實施例20至23中任一項之RNAi藥劑,其中所有或實質上所有該等核苷酸為經修飾之核苷酸。
實施例25. 如實施例1之RNAi藥劑,其包含反義股,該反義股包含與以下核苷酸序列(5'
3')中之一者相差0或1個核苷酸的經修飾之核苷酸序列、由該經修飾之核苷酸序列組成,或基本上由該經修飾之核苷酸序列組成:
cPrpusGfaaaGfaacuaUfuCfcAfuaausc (SEQ ID NO: 1143);
asCfagAfauccugUfcUfuGfucgusu (SEQ ID NO: 1228);
isCfagAfauccugUfcUfuGfucgusu (SEQ ID NO: 1229);
cPrpusCfscsUfuUfaaaggUfuUfuCfaGfuasg (SEQ ID NO: 1200);或
usAfsusugaAfgcauUfgAfgAfcaccsg (SEQ ID NO: 1235),
其中a表示2'-O-甲基腺苷,c表示2'-O-甲基胞苷,g表示2'-O-甲基鳥苷,i表示2'-O-甲基肌苷;且u表示2'-O-甲基尿苷;Af表示2'-氟腺苷,Cf表示2'-氟胞苷,Gf表示2'-氟鳥苷,且Uf表示2'-氟尿苷;cPrpu表示5'-膦酸環丙酯-2'-O-甲基尿苷;s表示硫代磷酸酯鍵;且其中該有義股上之所有或實質上所有該等核苷酸為經修飾之核苷酸。
實施例26. 如實施例1之RNAi藥劑,其中該有義股包含與以下核苷酸序列(5'
3')中之一者相差0或1個核苷酸的經修飾之核苷酸序列、由該經修飾之核苷酸序列組成,或基本上由該經修飾之核苷酸序列組成:
gauuauggAfAfUfaguucuuuca (SEQ ID NO: 1319);
aacgacaaGfAfCfaggauucugu (SEQ ID NO: 1376);
cuacugaaAfAfCfcuuuaaaiga (SEQ ID NO: 1361);或
cggugucuCfAfAfugcuucaaua (SEQ ID NO: 1377),
其中a表示2'-O-甲基腺苷,c表示2'-O-甲基胞苷,g表示2'-O-甲基鳥苷,u表示2'-O-甲基尿苷,且i表示2'-O-甲基肌苷;Af表示2'-氟腺苷,Cf表示2'-氟胞苷,Gf表示2'-氟鳥苷,且Uf表示2'-氟尿苷;s表示硫代磷酸酯鍵;且其中該反義股上之所有或實質上所有該等核苷酸為經修飾之核苷酸。
實施例27. 如實施例20至26中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股在該核苷酸序列之3'末端處、在該核苷酸序列之5'端處或此兩者處進一步包括反向無鹼基殘基。
實施例28. 如實施例1至27中任一項之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑連接至靶向配位體。
實施例29. 如實施例1至28中任一項之RNAi藥劑,其中該靶向配位體包含:
。
實施例30. 如實施例1至29中任一項之RNAi藥劑,其中該靶向配位體連接至該有義股。
實施例31. 如實施例30之RNAi藥劑,其中該靶向配位體連接至該有義股之5'末端。
實施例32. 一種組合物,其包含如實施例1至31中任一項之RNAi藥劑,其中該組合物進一步包含醫藥學上可接受之賦形劑。
實施例33. 如實施例32之組合物,其進一步包含能夠抑制MARC1基因表現之第二RNAi藥劑。
實施例34. 如實施例32至33中任一項之組合物,其進一步包含一或多種額外治療劑。
實施例35. 如實施例32至34中任一項之組合物,其中該組合物經調配以用於投與。
實施例36. 如實施例35之組合物,其中該組合物係藉由皮下注射來遞送。
實施例37. 如實施例32至36中任一項之組合物,其中該醫藥學上可接受之賦形劑為磷酸鈉緩衝液。
實施例38. 如實施例32至36中任一項之組合物,其中該醫藥學上可接受之賦形劑為等張鹽水或注射用水。
實施例39. 一種用於抑制肝細胞中MARC1基因表現之方法,該方法包含向個體之細胞中引入有效量的如實施例1至31中任一項之RNAi藥劑或如實施例32至38中任一項之組合物。
實施例40. 如實施例39之方法,其中該個體為人類個體。
實施例41. 如實施例39至40中任一項之方法,其中該肝細胞或該個體中MARC1 mRNA含量降低至少約50%。
實施例42. 如實施例39至41中任一項之方法,其中該肝細胞或該個體中MARC1蛋白含量降低至少約50%。
實施例43. 一種治療MARC1相關疾病、病症或症狀之方法,該方法包含向有需要之人類個體投與治療有效量的如實施例32至38中任一項之組合物。
實施例44. 如實施例43之方法,其中該疾病為高三酸甘油酯血症、非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)、酒精性及非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、脂肪肝病、肝硬化、血液膽固醇含量升高、肝病、自體免疫肝炎及/或其他MARC1相關疾病。
實施例45. 如實施例39至44中任一項之方法,其中該個體中血清MARC1蛋白之含量降低。
實施例46. 如實施例39至45中任一項之方法,其中該RNAi藥劑係以約0.05 mg/kg人類個體體重至約5.0 mg/kg人類個體體重之劑量向該人類個體投與。
實施例47. 一種如實施例1至31中任一項之RNAi藥劑或如實施例32至38中任一項之組合物的用途,其係用於治療至少部分地由MARC1基因表現降低介導之疾病、病症或症狀。
實施例48. 如實施例47之用途,其中該疾病為非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、酒精性脂肪肝病、自體免疫肝炎、肝纖維化、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病。
實施例49. 一種如實施例1至31中任一項之RNAi藥劑或如實施例32至38中任一項之組合物的用途,其係用於製備用以治療至少部分地由MARC1基因表現降低介導之疾病、病症或症狀的醫藥組合物。
上文所提供之實施例及各項現利用以下非限制性實例加以說明。
實例 實例 1 . MARC1 RNAi 藥劑 之合成。
根據以下通用程序合成上表6A及表6B中所顯示之MARC1 RNAi藥劑雙螺旋體:
A.
合成。
根據寡核苷酸合成中使用之固相胺基亞磷酸酯技術合成RNAi藥劑之有義股及反義股。此類標準合成一般為此項技術中已知的。視規模而定,使用MerMade96E® (Bioautomation)、MerMade12® (Bioautomation)或OP Pilot 100 (GE Healthcare)。在由受控微孔玻璃(CPG,500 Å或600 Å,獲自Prime Synthesis, Aston, PA, USA)製成之固體支撐物上進行合成。將位於各別股之3'端處的單體連接至固體支撐物作為合成起點。所有RNA及2'-修飾之RNA胺基亞磷酸酯均購自Thermo Fisher Scientific (Milwaukee, WI, USA)或Hongene Biotech (Shanghai, PRC)。2'-O-甲基胺基亞磷酸酯包括以下:(5'-O-二甲氧基三苯甲基-N
6-(苯甲醯基)-2'-O-甲基-腺苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙胺基)胺基亞磷酸酯、5'-O-二甲氧基-三苯甲基-N
4-(乙醯基)-2'-O-甲基-胞苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙基-胺基)胺基亞磷酸酯、(5'-O-二甲氧基三苯甲基-N
2-(異丁醯基)-2'-O-甲基-鳥苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙胺基)胺基亞磷酸酯及5'-O-二甲氧基三苯甲基-2'-O-甲基-尿苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙胺基)胺基亞磷酸酯。2'-去氧-2'-氟-胺基亞磷酸酯帶有與2'-O-甲基胺基酸酯相同的保護基。5'-(4,4'-二甲氧基三苯甲基)-2',3'-開環-尿苷、2'-苯甲醯基-3'-[(2-氰基乙基)-(N,N-二異丙基)]-胺基亞磷酸酯亦購自Thermo Fisher Scientific或Hongene Biotech。5'-二甲氧基三苯甲基-2'-O-甲基-肌苷-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙胺基)胺基亞磷酸酯購自Glen Research (Virginia)或Hongene Biotech。根據國際專利申請公開案第WO 2017/214112號合成膦酸環丙酯胺基亞磷酸酯(亦參見Altenhofer等人, Chem. Communications (Royal Soc. Chem.), 57(55):6808-6811 (2021年7月))。反向無鹼基(3'-O-二甲氧基三苯甲基-2'-去氧核糖-5'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙基胺基)胺基亞磷酸酯購自ChemGenes (Wilmington, MA, USA)或SAFC (St Louis, MO, USA)。5'-O-二甲氧基三苯甲基-N
2,N
6-(苯氧基乙酸酯)-2'-O-甲基-二胺基嘌呤-3'-O-(2-氰基乙基-N,N-二異丙基胺基)胺基亞磷酸酯獲自ChemGenes或Hongene Biotech。
將含靶向配位體之胺基亞磷酸酯溶解於無水二氯甲烷或無水乙腈(50 mM)中,同時將所有其他胺基酸酯溶解於無水乙腈(50 mM)中,或添加無水二甲基甲醯胺及分子篩(3Å)。使用5-苯甲硫基-1H-四唑(BTT,250 mM於乙腈中)、5-乙硫基-1H-四唑(ETT,250 mM於乙腈中)或4,5-二氰基咪唑(DCI)作為活化劑溶液。偶合時間為12分鐘(RNA)、15分鐘(靶向配位體)、90秒(2'OMe)及60秒(2'F)。為了引入硫代磷酸酯鍵,使用100 mM 3-苯基1,2,4-二噻唑啉-5-酮(POS,獲自PolyOrg, Inc., Leominster, MA, USA)於無水乙腈中之溶液。以下實例中合成且測試之各MARC1 RNAi藥劑雙螺旋體利用N-乙醯基-半乳胺糖作為表7中所表示之靶向配位體化學結構中的「NAG」。可根據Arrowhead Pharmaceuticals, Inc.之國際專利申請公開案第WO 2018/044350號合成(NAG37)及(NAG37)s靶向配位體胺基亞磷酸酯化合物。
B. 支撐物結合之寡聚物的裂解及脫除保護基。
在完成固相合成之後,在30℃下用40重量%甲胺水溶液與28%氫氧化銨溶液(Aldrich)之1:1體積溶液處理經乾燥之固體支撐物1.5小時。將溶液蒸發且固體殘餘物於水中復原(參見下文)。
C. 純化。
使用TSKgel SuperQ-5PW 13µm管柱及Shimadzu LC-8系統,藉由陰離子交換HPLC純化粗寡聚物。緩衝液A為20 mM Tris、5 mM EDTA,pH 9.0且含有20%乙腈;且緩衝液B與緩衝液A相同,其中添加有1.5 M氯化鈉。記錄260 nm下之UV痕量。混合適當溶離份,接著用經過濾之DI水或100 mM碳酸氫銨,pH 6.7及20%乙腈之操作緩衝液,使用裝填有Sephadex G25細粒之GE Healthcare XK 26/40管柱藉由尺寸排阻HPLC來操作。
D. 黏接 。
藉由將等莫耳RNA溶液(有義及反義)合併於1×磷酸鹽緩衝鹽水(Corning, Cellgro)中來使互補股混合以形成RNAi藥劑。將一些RNAi藥劑凍乾且儲存於-15℃至-25℃下。藉由在UV-Vis光譜儀上量測1×磷酸鹽緩衝鹽水中之溶液吸光度來測定雙螺旋體濃度。隨後將260 nm下之溶液吸光度乘以換算因數及稀釋因數以測定雙螺旋體濃度。所使用之換算因數為0.050 mg/(mL∙cm)或根據以實驗方式測定之消光係數計算。
實例 2. hMARC1 SEAP 小鼠模型。
為了評估MARC1 RNAi藥劑,使用MARC1-SEAP小鼠模型。藉由流體動力尾部靜脈(HTV)注射,用質體對C57bl6/白化小鼠進行短暫活體內轉染。經由流體動力尾部靜脈(HTV)向小鼠注射質體pMIR1015,該質體含有插入至SEAP (分泌型人類胎盤鹼性磷酸酶)報導基因之3' UTR中的人類MARC1 cDNA序列(NCBI參考序列:NM_022746.4 (Seq ID No. 1))之33-2500區域。經由HTV,以10%動物體重之總體積注射50 µg含有hMARC1 cDNA之質體的林格氏溶液(Ringer's solution),以建立MARC1-SEAP模型小鼠。在用MARC1-SEAP轉染後,隨後向小鼠投與MARC1 RNAi藥劑。MARC1 RNAi藥劑對MARC1表現之抑制同時引起對SEAP表現之抑制。藉由Phospha-Light™ SEAP報導基因分析系統(ThermoFisher目錄號T1016)量測SEAP表現量。在治療之前,量測血清中之SEAP表現量且根據平均SEAP含量將小鼠分組。
分析:可在投與MARC1 RNAi藥劑之前及之後的不同時間量測SEAP含量。
i ) 血清收集:用2%至3%異氟醚麻醉小鼠且將血液樣品自頜下區域收集至血清分離管(Sarstedt AG & Co., Nümbrecht, Germany)中。使血液在環境溫度下凝固20分鐘。管在8,000×g下離心3分鐘以分離血清且儲存在4℃下。
ii ) 血清 SEAP 含量:收集血清且根據製造商說明書藉由Phospha-Light™ SEAP報導基因分析系統(ThermoFisher)來量測。將各動物之血清SEAP含量相對於被注射鹽水之小鼠對照組正規化,以考慮此模型中MARC1序列表現之非治療相關降低。首先,將各動物在一時間點之SEAP含量除以該動物之治療前表現量(「治療前」),以測定「相對於治療前正規化」之表現比率。接著藉由將個別動物的「相對於治療前正規化」之比率除以正常鹽水對照組中所有小鼠的「相對於治療前正規化」之平均比率而使在一特定時間點之表現相對於對照組正規化。替代地,在本文所闡述之一些實例中,藉由僅相對於治療前含量正規化來評定各動物之血清SEAP含量。
實例 3 . MARC1 RNAi 藥劑在 hMARC1 - SEAP 小鼠中之活體內投與。
使用以上實例2中描述之hMARC1-SEAP模型。在第1天,經由皮下(SQ)注射,向四隻(n=4)雌性C57bl/6白化小鼠給與鹽水或以鹽水調配之MARC1 RNAi藥劑(以2 mg/kg)。給藥方案係根據下表8。
表8. 實例3之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | MARC1 之所靶向位置(Seq ID No. 1) | 給藥途經 |
1 | 等張鹽水 | 不適用 | 第1天SQ注射 |
2 | 2 mg/kg AD11764 | 325 | 第1天SQ注射 |
3 | 2 mg/kg AD11765 | 536 | 第1天SQ注射 |
4 | 2 mg/kg AD11766 | 609 | 第1天SQ注射 |
5 | 2 mg/kg AD11767 | 611 | 第1天SQ注射 |
6 | 2 mg/kg AD11768 | 636 | 第1天SQ注射 |
7 | 2 mg/kg AD11769 | 640 | 第1天SQ注射 |
8 | 2 mg/kg AD11770 | 644 | 第1天SQ注射 |
9 | 2 mg/kg AD11771 | 710 | 第1天SQ注射 |
10 | 2 mg/kg AD11772 | 841 | 第1天SQ注射 |
11 | 2 mg/kg AD11773 | 932 | 第1天SQ注射 |
12 | 2 mg/kg AD11774 | 940 | 第1天SQ注射 |
13 | 2 mg/kg AD11775 | 945 | 第1天SQ注射 |
14 | 2 mg/kg AD11776 | 954 | 第1天SQ注射 |
15 | 2 mg/kg AD11777 | 1057 | 第1天SQ注射 |
16 | 2 mg/kg AD11778 | 1089 | 第1天SQ注射 |
17 | 2 mg/kg AD11779 | 1098 | 第1天SQ注射 |
18 | 2 mg/kg AD11780 | 1102 | 第1天SQ注射 |
19 | 2 mg/kg AD11781 | 1111 | 第1天SQ注射 |
20 | 2 mg/kg AD11782 | 1190 | 第1天SQ注射 |
21 | 2 mg/kg AD11783 | 1193 | 第1天SQ注射 |
22 | 2 mg/kg AD11784 | 1282 | 第1天SQ注射 |
23 | 2 mg/kg AD11785 | 1310 | 第1天SQ注射 |
24 | 2 mg/kg AD11786 | 1313 | 第1天SQ注射 |
25 | 2 mg/kg AD11787 | 1605 | 第1天SQ注射 |
26 | 2 mg/kg AD11788 | 1635 | 第1天SQ注射 |
27 | 2 mg/kg AD11789 | 1646 | 第1天SQ注射 |
28 | 2 mg/kg AD11790 | 1648 | 第1天SQ注射 |
29 | 2 mg/kg AD11791 | 1852 | 第1天SQ注射 |
30 | 2 mg/kg AD11792 | 1897 | 第1天SQ注射 |
31 | 2 mg/kg AD11793 | 1898 | 第1天SQ注射 |
32 | 2 mg/kg AD11794 | 1955 | 第1天SQ注射 |
33 | 2 mg/kg AD11795 | 1990 | 第1天SQ注射 |
在第-3天、第1天、第8天、第15天、第22天及第29天收集血清。依照以上實例2中所闡述之程序測定SEAP表現量。來自實驗之資料顯示於下表9中,其中平均SEAP反映SEAP之正規化平均值。
表9. 實例3之hMARC1-SEAP小鼠中相對於治療前及鹽水對照正規化之平均SEAP。
第 8 天 | 第 15 天 | 第 22 天 | ||||
組 ID | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 |
1. 等張鹽水 | 1.000 | 0.228 | 1.000 | 0.221 | 1.000 | 0.227 |
2. 2 mg/kg AD11764 | 1.417 | 0.470 | 1.331 | 0.425 | 1.557 | 0.467 |
3. 2 mg/kg AD11765 | 1.606 | 0.124 | 1.540 | 0.135 | 1.729 | 0.384 |
4. 2 mg/kg AD11766 | 1.007 | 0.134 | 1.098 | 0.186 | 1.389 | 0.087 |
5. 2 mg/kg AD11767 | 0.975 | 0.103 | 0.926 | 0.324 | 0.949 | 0.264 |
6. 2 mg/kg AD11768 | 1.091 | 0.310 | 1.007 | 0.302 | 1.168 | 0.314 |
7. 2 mg/kg AD11769 | 0.923 | 0.254 | 0.814 | 0.461 | 0.829 | 0.433 |
8. 2 mg/kg AD11770 | 0.992 | 0.022 | 0.984 | 0.158 | 0.989 | 0.085 |
9. 2 mg/kg AD11771 | 1.122 | 0.190 | 1.083 | 0.168 | 1.216 | 0.209 |
10. 2 mg/kg AD11772 | 1.047 | 0.152 | 0.881 | 0.333 | 0.785 | 0.357 |
11. 2 mg/kg AD11773 | 1.152 | 0.097 | 0.985 | 0.130 | 1.115 | 0.375 |
12. 2 mg/kg AD11774 | 0.824 | 0.241 | 0.815 | 0.374 | 0.844 | 0.526 |
13. 2 mg/kg AD11775 | 0.655 | 0.167 | 0.660 | 0.416 | 0.522 | 0.216 |
14. 2 mg/kg AD11776 | 0.959 | 0.247 | 0.862 | 0.273 | 1.087 | 0.408 |
15. 2 mg/kg AD11777 | 0.811 | 0.256 | 0.774 | 0.442 | 0.936 | 0.479 |
16. 2 mg/kg AD11778 | 0.542 | 0.122 | 0.474 | 0.261 | 0.354 | 0.243 |
17. 2 mg/kg AD11779 | 1.083 | 0.559 | 0.810 | 0.536 | 0.755 | 0.578 |
18. 2 mg/kg AD11780 | 0.998 | 0.310 | 0.910 | 0.465 | 0.973 | 0.511 |
19. 2 mg/kg AD11781 | 2.102 | 1.415 | 0.855 | 0.649 | 1.049 | 0.767 |
20. 2 mg/kg AD11782 | 1.156 | 0.379 | 0.464 | 0.215 | 0.486 | 0.222 |
21. 2 mg/kg AD11783 | 1.126 | 0.166 | 0.838 | 0.111 | 0.789 | 0.217 |
22. 2 mg/kg AD11784 | 0.973 | 0.209 | 0.774 | 0.306 | 0.696 | 0.379 |
23. 2 mg/kg AD11785 | 0.543 | 0.439 | 0.464 | 0.437 | 0.492 | 0.507 |
24. 2 mg/kg AD11786 | 0.730 | 0.369 | 0.458 | 0.308 | 0.433 | 0.253 |
25. 2 mg/kg AD11787 | 0.937 | 0.151 | 0.822 | 0.106 | 0.957 | 0.129 |
26. 2 mg/kg AD11788 | 1.015 | 0.215 | 0.683 | 0.168 | 0.721 | 0.149 |
27. 2 mg/kg AD11789 | 1.311 | 0.196 | 0.910 | 0.135 | 1.059 | 0.211 |
28. 2 mg/kg AD11790 | 1.100 | 0.207 | 0.825 | 0.210 | 1.073 | 0.366 |
29. 2 mg/kg AD11791 | 1.115 | 0.438 | 0.890 | 0.560 | 1.273 | 0.857 |
30. 2 mg/kg AD11792 | 0.946 | 0.201 | 0.876 | 0.120 | 1.020 | 0.252 |
31. 2 mg/kg AD11793 | 0.853 | 0.207 | 0.668 | 0.287 | 0.852 | 0.441 |
32. 2 mg/kg AD11794 | 1.095 | 0.357 | 0.785 | 0.323 | 0.997 | 0.513 |
33. 2 mg/kg AD11795 | 1.117 | 0.084 | 0.973 | 0.199 | 1.154 | 0.174 |
第5組、第7組、第8組、第12組至第16組、第18組、第22組至第25組、第30組及第31組在第8天顯示SEAP降低。第5組、第7組、第8組及第10組至第33組在第15天顯示SEAP降低。第5組、第7組、第8組、第10組、第12組、第13組、第15組至第18組、第20組至第26組、第31組及第32組在第22天顯示SEAP降低。
實例 4 . MARC1 RNAi 藥劑在 hMARC1 - SEAP 小鼠中之活體內投與。
使用以上實例2中描述之hMARC1-SEAP模型。在第1天,經由皮下(SQ)注射,向四隻(n=4)雌性C57bl/6白化小鼠給與鹽水或以鹽水調配之MARC1 RNAi藥劑(以2 mg/kg、4 mg/kg或6 mg/kg),注射體積為每20 g體重200 µL (10 mL/kg)。給藥方案係根據下表10。
表10. 實例4之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | MARC1 之所靶向位置(Seq ID No. 1) | 給藥途經 |
1 | 等張鹽水 | 不適用 | 第1天SQ注射 |
2 | 6 mg/kg AD11778 | 1089 | 第1天SQ注射 |
3 | 4 mg/kg AD11778 | 1089 | 第1天SQ注射 |
4 | 2 mg/kg AD11778 | 1089 | 第1天SQ注射 |
5 | 6 mg/kg AD11785 | 1310 | 第1天SQ注射 |
6 | 4 mg/kg AD11785 | 1310 | 第1天SQ注射 |
7 | 2 mg/kg AD11785 | 1310 | 第1天SQ注射 |
8 | 6 mg/kg AD11786 | 1313 | 第1天SQ注射 |
9 | 4 mg/kg AD11786 | 1313 | 第1天SQ注射 |
10 | 2 mg/kg AD11786 | 1313 | 第1天SQ注射 |
11 | 4 mg/kg AD11782 | 1190 | 第1天SQ注射 |
在第-5天、第1天、第8天、第15天、第22天及第29天收集血清。依照以上實例2中所闡述之程序測定SEAP表現量。來自實驗之資料顯示於下表11中,其中平均SEAP反映SEAP之正規化平均值。
表11. 實例4之MARC1-SEAP小鼠中相對於治療前及鹽水對照正規化之平均SEAP。
第 8 天 | 第 15 天 | 第 22 天 | ||||
組 ID | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 |
1. 等張鹽水 | 1.000 | 0.212 | 1.000 | 0.335 | 1.000 | 0.182 |
2. 6 mg/kg AD11778 | 0.241 | 0.054 | 0.107 | 0.018 | 0.075 | 0.025 |
3. 4 mg/kg AD11778 | 0.409 | 0.074 | 0.209 | 0.083 | 0.234 | 0.122 |
4. 2 mg/kg AD11778 | 0.425 | 0.084 | 0.207 | 0.058 | 0.228 | 0.089 |
5. 6 mg/kg AD11785 | 0.252 | 0.135 | 0.140 | 0.103 | 0.162 | 0.127 |
6. 4 mg/kg AD11785 | 0.418 | 0.098 | 0.214 | 0.115 | 0.249 | 0.219 |
7. 2 mg/kg AD11785 | 0.597 | 0.107 | 0.383 | 0.093 | 0.441 | 0.138 |
8. 6 mg/kg AD11786 | 0.272 | 0.109 | 0.164 | 0.152 | 0.187 | 0.220 |
9. 4 mg/kg AD11786 | 0.286 | 0.025 | 0.200 | 0.045 | 0.194 | 0.063 |
10. 2 mg/kg AD11786 | 0.433 | 0.118 | 0.371 | 0.139 | 0.377 | 0.164 |
11. 4 mg/kg AD11782 | 0.614 | 0.089 | 0.318 | 0.075 | 0.313 | 0.180 |
第29 天 | ||||||
組 ID | 平均 SEAP | 標準差 | ||||
1. 等張鹽水 | 1.000 | 0.250 | ||||
2. 6 mg/kg AD11778 | 0.134 | 0.078 | ||||
3. 4 mg/kg AD11778 | 0.419 | 0.345 | ||||
4. 2 mg/kg AD11778 | 0.238 | 0.099 | ||||
5. 6 mg/kg AD11785 | 0.218 | 0.113 | ||||
6. 4 mg/kg AD11785 | 0.342 | 0.322 | ||||
7. 2 mg/kg AD11785 | 0.505 | 0.131 | ||||
8. 6 mg/kg AD11786 | 0.247 | 0.271 | ||||
9. 4 mg/kg AD11786 | 0.273 | 0.082 | ||||
10. 2 mg/kg AD11786 | 0.485 | 0.231 | ||||
11. 4 mg/kg AD11782 | 0.369 | 0.128 |
第2組至第11組在所有時間點均顯示SEAP降低。
實例 5 . MARC1 RNAi 藥劑在 hMARC1 - SEAP 小鼠中之活體內投與。
使用以上實例2中描述之hMARC1-SEAP模型。在第1天,經由皮下(SQ)注射,向四隻(n=4)雌性C57bl/6白化小鼠給與鹽水或以鹽水調配之MARC1 RNAi藥劑(以2 mg/kg),注射體積為每20 g體重200 µl (10 mL/kg)。給藥方案係根據下表12。
表12. 實例5之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | MARC1 之所靶向位置(Seq ID No. 1) | 給藥途經 |
1 | 等張鹽水 | 不適用 | 第1天SQ注射 |
2 | 2 mg/kg AD12363 | 305 | 第1天SQ注射 |
3 | 2 mg/kg AD12364 | 761 | 第1天SQ注射 |
4 | 2 mg/kg AD12365 | 956 | 第1天SQ注射 |
5 | 2 mg/kg AD12366 | 1109 | 第1天SQ注射 |
6 | 2 mg/kg AD12367 | 1275 | 第1天SQ注射 |
7 | 2 mg/kg AD12368 | 1633 | 第1天SQ注射 |
8 | 2 mg/kg AD12369 | 1817 | 第1天SQ注射 |
9 | 2 mg/kg AD12370 | 1900 | 第1天SQ注射 |
10 | 2 mg/kg AD12371 | 1954 | 第1天SQ注射 |
11 | 2 mg/kg AD12372 | 1633 | 第1天SQ注射 |
12 | 2 mg/kg AD11786 | 1313 | 第1天SQ注射 |
在第-9天、第1天、第8天、第15天及第22天收集血清。依照以上實例2中所闡述之程序測定SEAP表現量。來自實驗之資料顯示於下表13中,其中平均SEAP反映SEAP之正規化平均值。
表13. 實例5之MARC1-SEAP小鼠中相對於治療前及鹽水對照正規化之平均SEAP。
第 8 天 | 第 15 天 | 第 22 天 | ||||
組 ID | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 |
1. 等張鹽水 | 1.000 | 0.087 | 1.000 | 0.302 | 1.000 | 0.299 |
2. 2 mg/kg AD12363 | 0.778 | 0.196 | 0.551 | 0.180 | 0.703 | 0.219 |
3. 2 mg/kg AD12364 | 0.887 | 0.032 | 0.661 | 0.191 | 0.878 | 0.402 |
4. 2 mg/kg AD12365 | 0.918 | 0.246 | 0.723 | 0.224 | 0.801 | 0.231 |
5. 2 mg/kg AD12366 | 0.732 | 0.198 | 0.598 | 0.258 | 0.601 | 0.142 |
6. 2 mg/kg AD12367 | 0.622 | 0.133 | 0.374 | 0.074 | 0.517 | 0.182 |
7. 2 mg/kg AD12368 | 0.800 | 0.096 | 0.529 | 0.047 | 0.713 | 0.185 |
8. 2 mg/kg AD12369 | 0.970 | 0.262 | 0.835 | 0.111 | 0.887 | 0.171 |
9. 2 mg/kg AD12370 | 0.747 | 0.215 | 0.508 | 0.251 | 0.634 | 0.225 |
10. 2 mg/kg AD12371 | 0.639 | 0.150 | 0.355 | 0.193 | 0.704 | 0.161 |
11. 2 mg/kg AD12372 | 0.813 | 0.209 | 0.704 | 0.184 | 0.764 | 0.249 |
12. 2 mg/kg AD11786 | 0.393 | 0.051 | 0.582 | 0.114 | 0.327 | 0.099 |
第2組至第12組在所有時間點均顯示SEAP降低。
實例 6 . MARC1 RNAi 藥劑在 hMARC1 - SEAP 小鼠中之活體內投與。
使用以上實例2中描述之hMARC1-SEAP模型。在第1天,經由皮下(SQ)注射,向四隻(n=4)雌性C57bl/6白化小鼠給與鹽水或以鹽水調配之MARC1 RNAi藥劑(以2 mg/kg),注射體積為每20 g體重200 µL (10 mL/kg)。給藥方案係根據下表14。
表14. 實例6之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | MARC1 之所靶向位置(Seq ID No. 1) | 給藥途經 |
1 | 等張鹽水 | 不適用 | 第1天SQ注射 |
2 | 2 mg/kg AD11786 | 1313 | 第1天SQ注射 |
3 | 2 mg/kg AD12291 | 1313 | 第1天SQ注射 |
4 | 2 mg/kg AD12292 | 1313 | 第1天SQ注射 |
5 | 2 mg/kg AD12972 | 1313 | 第1天SQ注射 |
6 | 2 mg/kg AD12973 | 1313 | 第1天SQ注射 |
7 | 2 mg/kg AD12974 | 1313 | 第1天SQ注射 |
8 | 2 mg/kg AD12975 | 1313 | 第1天SQ注射 |
9 | 2 mg/kg AD12976 | 1313 | 第1天SQ注射 |
10 | 2 mg/kg AD12591 | 901 | 第1天SQ注射 |
在第-14天、第-7天、第1天、第8天、第15天、第22天及第29天收集血清。依照以上實例2中所闡述之程序測定SEAP表現量。來自實驗之資料顯示於下表15中,其中平均SEAP反映SEAP之正規化平均值。
表15. 實例6之MARC1-SEAP小鼠中相對於治療前及鹽水對照正規化之平均SEAP。
第 8 天 | 第 15 天 | 第 22 天 | ||||
組 ID | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 |
1. 等張鹽水 | 1.000 | 0.152 | 1.000 | 0.188 | 1.000 | 0.334 |
2. 2 mg/kg AD11786 | 0.591 | 0.085 | 0.475 | 0.152 | 0.395 | 0.171 |
3. 2 mg/kg AD12291 | 0.625 | 0.041 | 0.392 | 0.094 | 0.387 | 0.231 |
4. 2 mg/kg AD12292 | 0.823 | 0.079 | 0.614 | 0.094 | 0.433 | 0.077 |
5. 2 mg/kg AD12972 | 0.703 | 0.140 | 0.584 | 0.220 | 0.548 | 0.229 |
6. 2 mg/kg AD12973 | 0.627 | 0.109 | 0.376 | 0.052 | 0.275 | 0.045 |
7. 2 mg/kg AD12974 | 0.633 | 0.037 | 0.493 | 0.145 | 0.446 | 0.152 |
8. 2 mg/kg AD12975 | 0.573 | 0.057 | 0.409 | 0.141 | 0.303 | 0.134 |
9. 2 mg/kg AD12976 | 0.493 | 0.095 | 0.341 | 0.100 | 0.283 | 0.121 |
10. 2 mg/kg AD12591 | 0.849 | 0.131 | 0.776 | 0.184 | 0.514 | 0.078 |
第29 天 | ||||||
組 ID | 平均 SEAP | 標準差 | ||||
1. 等張鹽水 | 1.000 | 0.214 | ||||
2. 2 mg/kg AD11786 | 0.508 | 0.160 | ||||
3. 2 mg/kg AD12291 | 0.444 | 0.333 | ||||
4. 2 mg/kg AD12292 | 0.657 | 0.135 | ||||
5. 2 mg/kg AD12972 | 0.567 | 0.258 | ||||
6. 2 mg/kg AD12973 | 0.337 | 0.065 | ||||
7. 2 mg/kg AD12974 | 0.525 | 0.185 | ||||
8. 2 mg/kg AD12975 | 0.382 | 0.210 | ||||
9. 2 mg/kg AD12976 | 0.351 | 0.152 | ||||
10. 2 mg/kg AD12591 | 0.658 | 0.163 |
第2組至第10組在所有時間點均顯示SEAP降低。
實例 7 . MARC1 RNAi 藥劑在 hMARC1 - SEAP 小鼠中之活體內投與。
使用以上實例2中描述之hMARC1-SEAP模型。在第1天,經由皮下(SQ)注射,向四隻(n=4)雌性C57bl/6白化小鼠給與鹽水或以鹽水調配之MARC1 RNAi藥劑(以2 mg/kg),注射體積為每20 g體重200 µL (10 mL/kg)。給藥方案係根據下表16。
表16. 實例7之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | MARC1 之所靶向位置(Seq ID No. 1) | 給藥途經 |
1 | 等張鹽水 | 不適用 | 第1天SQ注射 |
2 | 2 mg/kg AD11786 | 1313 | 第1天SQ注射 |
3 | 2 mg/kg AD12367 | 1275 | 第1天SQ注射 |
4 | 2 mg/kg AD13113 | 1275 | 第1天SQ注射 |
5 | 2 mg/kg AD13114 | 1275 | 第1天SQ注射 |
6 | 2 mg/kg AD13115 | 1275 | 第1天SQ注射 |
7 | 2 mg/kg AD13116 | 1275 | 第1天SQ注射 |
8 | 2 mg/kg AD13117 | 1275 | 第1天SQ注射 |
9 | 2 mg/kg AD12371 | 1954 | 第1天SQ注射 |
10 | 2 mg/kg AD13118 | 1954 | 第1天SQ注射 |
11 | 2 mg/kg AD13119 | 1954 | 第1天SQ注射 |
12 | 2 mg/kg AD12596 | 1014 | 第1天SQ注射 |
在第-14天、第-7天、第1天、第8天、第15天、第22天及第29天收集血清。依照以上實例2中所闡述之程序測定SEAP表現量。來自實驗之資料顯示於下表17中,其中平均SEAP反映SEAP之正規化平均值。
表17. 實例7之MARC1-SEAP小鼠中相對於治療前及鹽水對照正規化之平均SEAP。
第 8 天 | 第 15 天 | 第 22 天 | ||||
組 ID | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 |
1. 等張鹽水 | 1.000 | 0.182 | 1.000 | 0.322 | 1.000 | 0.373 |
2. 2 mg/kg AD11786 | 0.881 | 0.210 | 0.875 | 0.558 | 0.711 | 0.598 |
3. 2 mg/kg AD12367 | 1.103 | 0.095 | 1.260 | 0.308 | 1.241 | 0.481 |
4. 2 mg/kg AD13113 | 0.906 | 0.248 | 1.020 | 0.408 | 0.896 | 0.401 |
5. 2 mg/kg AD13114 | 0.936 | 0.138 | 0.947 | 0.447 | 0.714 | 0.307 |
6. 2 mg/kg AD13115 | 1.026 | 0.118 | 1.175 | 0.157 | 1.033 | 0.151 |
7. 2 mg/kg AD13116 | 0.890 | 0.032 | 0.886 | 0.214 | 0.767 | 0.170 |
8. 2 mg/kg AD13117 | 0.645 | 0.155 | 0.626 | 0.310 | 0.616 | 0.428 |
9. 2 mg/kg AD12371 | 1.381 | 0.131 | 1.744 | 0.574 | 1.492 | 0.524 |
10. 2 mg/kg AD13118 | 1.083 | 0.374 | 1.026 | 0.328 | 1.010 | 0.300 |
11. 2 mg/kg AD13119 | 1.311 | 0.128 | 1.592 | 0.111 | 1.469 | 0.141 |
12. 2 mg/kg AD12596 | 1.260 | 0.273 | 1.562 | 0.242 | 1.399 | 0.352 |
第2組、第4組、第5組、第7組及第8組在第8天顯示SEAP降低。第2組、第5組、第7組及第8組在第15天顯示SEAP降低。第2組、第4組、第5組、第7組及第8組在第22天顯示SEAP降低。
實例 8 . MARC1 RNAi 藥劑在 hMARC1 - SEAP 小鼠中之活體內投與。
使用以上實例2中描述之hMARC1-SEAP模型。在第1天,經由皮下(SQ)注射,向四隻(n=4)雌性C57bl/6白化小鼠給與鹽水或以鹽水調配之MARC1 RNAi藥劑(以2 mg/kg),注射體積為每20 g體重200 µL (10 mL/kg)。給藥方案係根據下表18。
表18. 實例8之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | MARC1 之所靶向位置(Seq ID No. 1) | 給藥途經 |
1 | 等張鹽水 | 不適用 | 第1天SQ注射 |
2 | 2 mg/kg AD11786 | 1313 | 第1天SQ注射 |
3 | 2 mg/kg AD12976 | 1313 | 第1天SQ注射 |
4 | 2 mg/kg AD13322 | 419 | 第1天SQ注射 |
5 | 2 mg/kg AD13323 | 601 | 第1天SQ注射 |
6 | 2 mg/kg AD13324 | 1124 | 第1天SQ注射 |
7 | 2 mg/kg AD13325 | 1131 | 第1天SQ注射 |
8 | 2 mg/kg AD13326 | 1157 | 第1天SQ注射 |
9 | 2 mg/kg AD13327 | 1246 | 第1天SQ注射 |
10 | 2 mg/kg AD13328 | 1332 | 第1天SQ注射 |
11 | 2 mg/kg AD13329 | 1432 | 第1天SQ注射 |
12 | 2 mg/kg AD13330 | 1842 | 第1天SQ注射 |
在第-14天、第-7天、第1天、第8天、第15天、第22天及第29天收集血清。依照以上實例2中所闡述之程序測定SEAP表現量。來自實驗之資料顯示於下表19中,其中平均SEAP反映SEAP之正規化平均值。
表19. 實例8之MARC1-SEAP小鼠中相對於治療前及鹽水對照正規化之平均SEAP。
第 8 天 | 第 15 天 | 第 22 天 | ||||
組 ID | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 |
1. 等張鹽水 | 1.000 | 0.221 | 1.000 | 0.421 | 1.000 | 0.323 |
2. 2 mg/kg AD11786 | 0.529 | 0.035 | 0.451 | 0.111 | 0.429 | 0.144 |
3. 2 mg/kg AD12976 | 0.334 | 0.107 | 0.231 | 0.129 | 0.246 | 0.193 |
4. 2 mg/kg AD13322 | 0.568 | 0.158 | 0.824 | 0.913 | 0.625 | 0.293 |
5. 2 mg/kg AD13323 | 0.918 | 0.141 | 0.722 | 0.189 | 0.758 | 0.237 |
6. 2 mg/kg AD13324 | 0.599 | 0.123 | 0.506 | 0.079 | 0.566 | 0.149 |
7. 2 mg/kg AD13325 | 0.488 | 0.110 | 0.510 | 0.212 | 0.598 | 0.200 |
8. 2 mg/kg AD13326 | 0.660 | 0.171 | 0.796 | 0.196 | 0.624 | 0.071 |
9. 2 mg/kg AD13327 | 0.701 | 0.092 | 0.592 | 0.271 | 0.948 | 0.568 |
10. 2 mg/kg AD13328 | 0.785 | 0.155 | 0.612 | 0.128 | 0.548 | 0.224 |
11. 2 mg/kg AD13329 | 0.570 | 0.066 | 0.542 | 0.138 | 0.584 | 0.180 |
12. 2 mg/kg AD13330 | 0.552 | 0.117 | 0.588 | 0.089 | 0.520 | 0.092 |
第2組至第12組在所有時間點均顯示SEAP降低。
實例 9 . MARC1 RNAi 藥劑在 hMARC1 - SEAP 小鼠中之活體內投與。
使用以上實例2中描述之hMARC1-SEAP模型。在第1天,經由皮下(SQ)注射,向四隻(n=4)雌性C57bl/6白化小鼠給與鹽水或以鹽水調配之MARC1 RNAi藥劑(以2 mg/kg),注射體積為每20 g體重200 µL (10 mL/kg)。給藥方案係根據下表20。
表20. 實例9之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | MARC1 之所靶向位置(Seq ID No. 1) | 給藥途經 |
1 | 等張鹽水 | 不適用 | 第1天SQ注射 |
2 | 2 mg/kg AD12976 | 1313 | 第1天SQ注射 |
3 | 2 mg/kg AD13535 | 1059 | 第1天SQ注射 |
4 | 2 mg/kg AD13536 | 1058 | 第1天SQ注射 |
5 | 2 mg/kg AD13537 | 1060 | 第1天SQ注射 |
6 | 2 mg/kg AD12982 | 1089 | 第1天SQ注射 |
7 | 2 mg/kg AD13117 | 1275 | 第1天SQ注射 |
8 | 2 mg/kg AD12960 | 1817 | 第1天SQ注射 |
9 | 2 mg/kg AD12287 | 1190 | 第1天SQ注射 |
10 | 2 mg/kg AD12289 | 1310 | 第1天SQ注射 |
在第-7天、第1天、第8天、第15天及第22天收集血清。依照以上實例2中所闡述之程序測定SEAP表現量。來自實驗之資料顯示於下表21中,其中平均SEAP反映SEAP之正規化平均值。
表21. 實例9之MARC1-SEAP小鼠中相對於治療前及鹽水對照正規化之平均SEAP。
第 8 天 | 第 15 天 | 第 22 天 | ||||
組 ID | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 |
1. 等張鹽水 | 1.000 | 0.134 | 1.000 | 0.296 | 1.000 | 0.476 |
2. 2 mg/kg AD12976 | 0.507 | 0.120 | 0.266 | 0.147 | 0.261 | 0.186 |
3. 2 mg/kg AD13535 | 0.976 | 0.234 | 0.790 | 0.311 | 0.797 | 0.396 |
4. 2 mg/kg AD13536 | 0.731 | 0.242 | 0.535 | 0.222 | 0.591 | 0.238 |
5. 2 mg/kg AD13537 | 0.372 | 0.104 | 0.229 | 0.092 | 0.208 | 0.062 |
6. 2 mg/kg AD12982 | 0.487 | 0.051 | 0.234 | 0.062 | 0.164 | 0.046 |
7. 2 mg/kg AD13117 | 0.482 | 0.198 | 0.290 | 0.178 | 0.349 | 0.290 |
8. 2 mg/kg AD12960 | 0.803 | 0.123 | 0.673 | 0.047 | 0.655 | 0.128 |
9. 2 mg/kg AD12287 | 0.535 | 0.096 | 0.307 | 0.095 | 0.256 | 0.108 |
10. 2 mg/kg AD12289 | 0.727 | 0.087 | 0.320 | 0.097 | 0.310 | 0.074 |
第2組至第10組在所有時間點均顯示SEAP降低。
實例 10 . MARC1 RNAi 藥劑在 hMARC1 - SEAP 小鼠中之活體內投與。
使用以上實例2中描述之hMARC1-SEAP模型。在第1天,經由皮下(SQ)注射,向四隻(n=4)雌性C57bl/6白化小鼠給與鹽水或以鹽水調配之MARC1 RNAi藥劑(以2 mg/kg),注射體積為每20 g體重200 µL (10 mL/kg)。給藥方案係根據下表22。
表22. 實例10之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | MARC1 之所靶向位置(Seq ID No. 1) | 給藥途經 |
1 | 等張鹽水 | 不適用 | 第1天SQ注射 |
2 | 2 mg/kg AD11778 | 1089 | 第1天SQ注射 |
3 | 2 mg/kg AD12982 | 1089 | 第1天SQ注射 |
4 | 2 mg/kg AD13705 | 1089 | 第1天SQ注射 |
5 | 2 mg/kg AD13706 | 1089 | 第1天SQ注射 |
6 | 2 mg/kg AD13707 | 1089 | 第1天SQ注射 |
7 | 2 mg/kg AD12634 | 1931 | 第1天SQ注射 |
8 | 2 mg/kg AD13708 | 1931 | 第1天SQ注射 |
9 | 2 mg/kg AD13709 | 1931 | 第1天SQ注射 |
10 | 2 mg/kg AD13710 | 1931 | 第1天SQ注射 |
11 | 2 mg/kg AD13711 | 1931 | 第1天SQ注射 |
12 | 2 mg/kg AD13712 | 1931 | 第1天SQ注射 |
在第-7天、第1天、第8天、第15天及第22天收集血清。依照以上實例2中所闡述之程序測定SEAP表現量。來自實驗之資料顯示於下表23中,其中平均SEAP反映SEAP之正規化平均值。
表23. 實例10之MARC1-SEAP小鼠中相對於治療前及鹽水對照正規化之平均SEAP。
第 8 天 | 第 15 天 | 第 22 天 | ||||
組 ID | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 |
1. 等張鹽水 | 1.000 | 0.312 | 1.000 | 0.306 | 1.000 | 0.169 |
2. 2 mg/kg AD11778 | 0.510 | 0.109 | 0.348 | 0.057 | 0.619 | 0.266 |
3. 2 mg/kg AD12982 | 0.407 | 0.090 | 0.237 | 0.068 | 0.272 | 0.162 |
4. 2 mg/kg AD13705 | 0.485 | 0.027 | 0.260 | 0.057 | 0.316 | 0.104 |
5. 2 mg/kg AD13706 | 0.457 | 0.159 | 0.219 | 0.141 | 0.299 | 0.221 |
6. 2 mg/kg AD13707 | 0.597 | 0.038 | 0.368 | 0.094 | 0.452 | 0.186 |
7. 2 mg/kg AD12634 | 0.632 | 0.069 | 0.665 | 0.277 | 0.772 | 0.438 |
8. 2 mg/kg AD13708 | 0.566 | 0.094 | 0.461 | 0.089 | 0.614 | 0.155 |
9. 2 mg/kg AD13709 | 0.562 | 0.044 | 0.306 | 0.131 | 0.373 | 0.226 |
10. 2 mg/kg AD13710 | 0.415 | 0.131 | 0.259 | 0.194 | 0.323 | 0.184 |
11. 2 mg/kg AD13711 | 0.556 | 0.112 | 0.506 | 0.155 | 0.467 | 0.128 |
12. 2 mg/kg AD13712 | 0.391 | 0.108 | 0.325 | 0.154 | 0.262 | 0.065 |
第2組至第12組在所有時間點均顯示SEAP降低。
實例 11 . MARC1 RNAi 藥劑在 hMARC1 - SEAP 小鼠中之活體內投與。
使用以上實例2中描述之hMARC1-SEAP模型。在第1天,經由皮下(SQ)注射,向四隻(n=4)雌性C57bl/6白化小鼠給與鹽水或以鹽水調配之RNAi藥劑(以2 mg/kg),注射體積為每20 g體重200 µL (10 mL/kg)。給藥方案係根據下表24。
表24. 實例11之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | MARC1 之所靶向位置(Seq ID No. 1) | 給藥途經 |
1 | 等張鹽水 | 不適用 | 第1天SQ注射 |
2 | 2 mg/kg AD11786 | 1313 | 第1天SQ注射 |
3 | 2 mg/kg AD12976 | 1313 | 第1天SQ注射 |
4 | 2 mg/kg AD12367 | 1275 | 第1天SQ注射 |
5 | 2 mg/kg AD13117 | 1275 | 第1天SQ注射 |
6 | 2 mg/kg AD13508 | 1275 | 第1天SQ注射 |
7 | 2 mg/kg AD13511 | 1275 | 第1天SQ注射 |
8 | 2 mg/kg AD13510 | 1275 | 第1天SQ注射 |
9 | 2 mg/kg AD13514 | 1275 | 第1天SQ注射 |
10 | 2 mg/kg AD13804 | 1275 | 第1天SQ注射 |
11 | 2 mg/kg AD13805 | 1275 | 第1天SQ注射 |
12 | 2 mg/kg AD13806 | 1275 | 第1天SQ注射 |
在第-7天、第1天、第8天、第15天及第22天收集血清。依照以上實例2中所闡述之程序測定SEAP表現量。來自實驗之資料顯示於下表25中,其中平均SEAP反映SEAP之正規化平均值。
表25. 實例11之MARC1-SEAP小鼠中相對於治療前及鹽水對照正規化之平均SEAP。
第 8 天 | 第 15 天 | 第 22 天 | ||||
組 ID | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 |
1. 等張鹽水 | 1.000 | 0.316 | 1.000 | 0.380 | 1.000 | 0.370 |
2. 2 mg/kg AD11786 | 0.911 | 0.235 | 0.635 | 0.357 | 0.691 | 0.471 |
3. 2 mg/kg AD12976 | 0.638 | 0.207 | 0.426 | 0.168 | 0.481 | 0.267 |
4. 2 mg/kg AD12367 | 0.844 | 0.239 | 0.714 | 0.297 | 0.799 | 0.349 |
5. 2 mg/kg AD13117 | 0.801 | 0.325 | 0.662 | 0.439 | 0.651 | 0.417 |
6. 2 mg/kg AD13508 | 0.829 | 0.232 | 0.551 | 0.145 | 0.595 | 0.161 |
7. 2 mg/kg AD13511 | 0.736 | 0.197 | 0.607 | 0.232 | 0.672 | 0.404 |
8. 2 mg/kg AD13510 | 0.750 | 0.040 | 0.558 | 0.100 | 0.477 | 0.067 |
9. 2 mg/kg AD13514 | 0.486 | 0.124 | 0.354 | 0.203 | 0.358 | 0.236 |
10. 2 mg/kg AD13804 | 0.596 | 0.052 | 0.472 | 0.051 | 0.414 | 0.290 |
11. 2 mg/kg AD13805 | 0.496 | 0.120 | 0.339 | 0.116 | 0.355 | 0.125 |
12. 2 mg/kg AD13806 | 0.670 | 0.126 | 0.465 | 0.124 | 0.472 | 0.079 |
第2組至第12組在所有時間點均顯示SEAP降低。
實例 12 . MARC1 RNAi 藥劑在 hMARC1 - SEAP 小鼠中之活體內投與。
使用以上實例2中描述之hMARC1-SEAP模型。在第1天,經由皮下(SQ)注射,向四隻(n=4)雌性C57bl/6白化小鼠給與鹽水或以鹽水調配之RNAi藥劑(以2 mg/kg),注射體積為每20 g體重200 µL (10 mL/kg)。給藥方案係根據下表26。
表26. 實例12之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | MARC1 之所靶向位置(Seq ID No. 1) | 給藥途經 |
1 | 等張鹽水 | 不適用 | 第1天SQ注射 |
2 | 2 mg/kg AD12976 | 1313 | 第1天SQ注射 |
3 | 2 mg/kg AD12960 | 1817 | 第1天SQ注射 |
4 | 2 mg/kg AD13447 | 1817 | 第1天SQ注射 |
5 | 2 mg/kg AD13117 | 1275 | 第1天SQ注射 |
6 | 2 mg/kg AD12287 | 1190 | 第1天SQ注射 |
7 | 2 mg/kg AD13923 | 1190 | 第1天SQ注射 |
8 | 2 mg/kg AD13924 | 1190 | 第1天SQ注射 |
9 | 2 mg/kg AD13925 | 1190 | 第1天SQ注射 |
10 | 2 mg/kg AD13926 | 1190 | 第1天SQ注射 |
在第-7天、第1天、第8天、第15天及第22天收集血清。依照以上實例2中所闡述之程序測定SEAP表現量。來自實驗之資料顯示於下表27中,其中平均SEAP反映SEAP之正規化平均值。
表27. 實例12之MARC1-SEAP小鼠中相對於治療前及鹽水對照正規化之平均SEAP。
第 8 天 | 第 15 天 | 第 22 天 | ||||
組 ID | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 |
1. 等張鹽水 | 1.000 | 0.296 | 1.000 | 0.225 | 1.000 | 0.163 |
2. 2 mg/kg AD12976 | 0.514 | 0.058 | 0.577 | 0.079 | 0.247 | 0.108 |
3. 2 mg/kg AD12960 | 0.560 | 0.049 | 0.645 | 0.122 | 0.269 | 0.108 |
4. 2 mg/kg AD13447 | 0.495 | 0.098 | 0.582 | 0.175 | 0.287 | 0.054 |
5. 2 mg/kg AD13117 | 0.442 | 0.068 | 0.530 | 0.094 | 0.191 | 0.080 |
6. 2 mg/kg AD12287 | 0.703 | 0.062 | 0.817 | 0.081 | 0.268 | 0.056 |
7. 2 mg/kg AD13923 | 0.641 | 0.210 | 0.780 | 0.229 | 0.360 | 0.283 |
8. 2 mg/kg AD13924 | 0.628 | 0.092 | 0.739 | 0.106 | 0.418 | 0.068 |
9. 2 mg/kg AD13925 | 0.566 | 0.282 | 0.555 | 0.142 | 0.243 | 0.077 |
10. 2 mg/kg AD13926 | 0.513 | 0.061 | 0.664 | 0.078 | 0.341 | 0.086 |
第2組至第10組在所有時間點均顯示SEAP降低。
實例 13 . MARC1 RNAi 藥劑在 hMARC1 - SEAP 小鼠中之活體內投與。
使用以上實例2中描述之hMARC1-SEAP模型。在第1天,經由皮下(SQ)注射,向四隻(n=4)雌性C57bl/6白化小鼠給與鹽水或以鹽水調配之RNAi藥劑(以2 mg/kg),注射體積為每25 g體重250 µL。給藥方案係根據下表28。
表28. 實例13之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | MARC1 之所靶向位置(Seq ID No. 1) | 給藥途經 |
1 | 等張鹽水 | 不適用 | 第1天SQ注射 |
2 | 2 mg/kg AD11786 | 1313 | 第1天SQ注射 |
3 | 2 mg/kg AD12976 | 1313 | 第1天SQ注射 |
4 | 2 mg/kg AD12369 | 1817 | 第1天SQ注射 |
5 | 2 mg/kg AD13447 | 1817 | 第1天SQ注射 |
6 | 2 mg/kg AD12367 | 1275 | 第1天SQ注射 |
7 | 2 mg/kg AD13805 | 1275 | 第1天SQ注射 |
8 | 2 mg/kg AD11782 | 1190 | 第1天SQ注射 |
9 | 2 mg/kg AD13925 | 1190 | 第1天SQ注射 |
在第-7天、第1天、第8天、第15天及第22天收集血清。依照以上實例2中所闡述之程序測定SEAP表現量。來自實驗之資料顯示於下表29中,其中平均SEAP反映SEAP之正規化平均值。
表29. 實例13之MARC1-SEAP小鼠中相對於治療前及鹽水對照正規化之平均SEAP。
第 8 天 | 第 15 天 | 第 22 天 | ||||
組 ID | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 | 平均 SEAP | 標準差 |
1. 等張鹽水 | 1.000 | 0.673 | 1.000 | 0.779 | 1.000 | 0.998 |
2. 2 mg/kg AD11786 | 0.745 | 0.349 | 0.433 | 0.195 | 0.405 | 0.122 |
3. 2 mg/kg AD12976 | 0.499 | 0.057 | 0.391 | 0.083 | 0.323 | 0.138 |
4. 2 mg/kg AD12369 | 0.837 | 0.105 | 0.704 | 0.127 | 0.906 | 0.175 |
5. 2 mg/kg AD13447 | 0.887 | 0.070 | 0.983 | 0.144 | 1.081 | 0.187 |
6. 2 mg/kg AD12367 | 0.825 | 0.148 | 0.565 | 0.145 | 0.659 | 0.113 |
7. 2 mg/kg AD13805 | 0.474 | 0.085 | 0.237 | 0.048 | 0.317 | 0.091 |
8. 2 mg/kg AD11782 | 0.666 | 0.111 | 0.571 | 0.022 | 0.618 | 0.228 |
9. 2 mg/kg AD13925 | 0.518 | 0.113 | 0.430 | 0.166 | 0.564 | 0.169 |
第2組至第9組在第8天及第15天顯示SEAP降低。第2組至第4組及第6組至第9組在第22天顯示SEAP降低。
實例 14 . MARC1 - GLuc AAV 小鼠模型。
為了評估某些MARC1 RNAi藥劑,使用MARC1-GLuc (高斯螢光素酶(Gaussia Luciferase)) AAV (腺相關病毒)小鼠模型。將六至八週齡的雄性C57BL/6小鼠用MARC1-GLuc AAV血清型8轉導,該血清型係在投與MARC1 RNAi藥劑或對照物之前至少14天投與。MARC1-GLuc AAV之基因體含有插入至GLuc報導基因序列之3'UTR中的人類MARC1 cDNA序列(GenBank NM_022746.4 (SEQ ID NO:1))之33-2500區域。經由尾部靜脈,以每25 g動物體重250 µL之總體積將含5E12至1E13 GC/kg各別病毒之PBS溶液注射至小鼠中,以建立MARC1-GLuc AAV模型小鼠。經量測,MARC1 RNAi藥劑對MARC1表現之抑制同時引起對GLuc表現之抑制。在投與治療之前(給藥前第-7天與第1天之間),藉由Pierce™高斯螢光素酶輝光分析套組(Gaussia Luciferase Glow Assay Kit) (Thermo Fisher Scientific,目錄號16161)量測血清中之GLuc表現量,且根據平均GLuc含量對小鼠分組。
用2%至3%異氟醚麻醉小鼠且將血液樣品自頜下區域收集至血清分離管(Sarstedt AG & Co., Nümbrecht, Germany)中。使血液在環境溫度下凝固20分鐘。管在8,000×g下離心3分鐘以分離血清且儲存在4℃下。收集血清且藉由Pierce™高斯螢光素酶輝光分析套組根據製造商說明書來量測。可將各動物之血清GLuc含量相對於被注射媒劑對照物之小鼠正規化,以考慮此模型之MARC1表現的非治療相關轉變。為此,首先,將各動物在一時間點之GLuc含量除以該動物之治療前表現量(第1天),以測定「相對於治療前正規化」之表現比率。接著藉由將個別動物的「相對於治療前正規化」之比率除以正常媒劑對照組中所有小鼠的「相對於治療前正規化」之平均比率而使在一特定時間點之表現相對於對照組正規化。替代地,僅藉由相對於治療前含量正規化來評估各動物之血清GLuc含量。
實例 15 . MARC1 RNAi 藥劑在 MARC1 - GLuc AAV 小鼠中之活體內測試。
使用以上實例14中所描述之MARC1-GLUC AAV小鼠模型,其使用含有人類MARC1 cDNA序列之33-2500區域的MARC1-GLuc AAV。在第1天,經由皮下(SQ)注射,向四隻(n=4)雄性C57bl/6小鼠給與鹽水或以鹽水調配之RNAi藥劑(以2 mg/kg),注射體積為每25 g體重250 µL。在皮膚與肌肉之間進行注射(亦即皮下注射)。給藥方案係根據下表30。
表30. 實例15之小鼠之給藥
組 | 劑量 (RNAi 藥劑 ) | 所靶向位置 (Seq ID No. 1) | 給藥方案 |
1 | 鹽水 | 不適用 | 在第1天單次SQ注射 |
2 | 2 mg/kg AD12363 | 305 | 在第1天單次SQ注射 |
3 | 2 mg/kg AD12364 | 761 | 在第1天單次SQ注射 |
4 | 2 mg/kg AD12365 | 956 | 在第1天單次SQ注射 |
5 | 2 mg/kg AD12366 | 1109 | 在第1天單次SQ注射 |
6 | 2 mg/kg AD12367 | 1275 | 在第1天單次SQ注射 |
7 | 2 mg/kg AD12368 | 1633 | 在第1天單次SQ注射 |
8 | 2 mg/kg AD12369 | 1817 | 在第1天單次SQ注射 |
9 | 2 mg/kg AD12370 | 1900 | 在第1天單次SQ注射 |
10 | 2 mg/kg AD12371 | 1954 | 在第1天單次SQ注射 |
11 | 2 mg/kg AD11786 | 1313 | 在第1天單次SQ注射 |
MARC1 RNAi藥劑中之各者包括在有義股之5'末端處結合至包括三個N-乙醯基-半乳胺糖基之靶向配位體(三牙配位體)的經修飾核苷酸,該等經修飾核苷酸具有本文之雙螺旋體結構中所闡述之經修飾序列。(關於與MARC1 RNAi藥劑相關之特定修飾及結構資訊參見表3、表4、表5A、表5B、表5C及表6,包括(NAG37)s配位體)。MARC1 RNAi藥劑AD12363 (第2組)包括經設計以抑制MARC1基因在該基因之位置305處表現的核苷酸序列;MARC1 RNAi藥劑AD12364 (第3組)包括經設計以抑制MARC1基因在該基因之位置761處表現的核苷酸序列;MARC1 RNAi藥劑AD12365 (第4組)包括經設計以抑制MARC1基因在該基因之位置956處表現的核苷酸序列;MARC1 RNAi藥劑AD12366 (第5組)包括經設計以抑制MARC1基因在該基因之位置1109處表現的核苷酸序列;MARC1 RNAi藥劑AD12367 (第6組)包括經設計以抑制MARC1基因在該基因之位置1275處表現的核苷酸序列;MARC1 RNAi藥劑AD12368 (第7組)包括經設計以抑制MARC1基因在該基因之位置1633處表現的核苷酸序列;MARC1 RNAi藥劑AD12369 (第8組)包括經設計以抑制MARC1基因在該基因之位置1817處表現的核苷酸序列;MARC1 RNAi藥劑AD12370 (第9組)包括經設計以抑制MARC1基因在該基因之位置1900處表現的核苷酸序列;MARC1 RNAi藥劑AD12371 (第10組)包括經設計以抑制MARC1基因在該基因之位置1954處表現的核苷酸序列;MARC1 RNAi藥劑AD11786 (第11組)包括經設計以抑制MARC1基因在該基因之位置1313處表現的核苷酸序列。(關於所提及之MARC1基因參見例如SEQ ID NO:1及表2)。
在第1天、第8天、第15天及第22天收集血清。依照以上實例14中所闡述之程序測定GLuc表現量。來自實驗之資料顯示於下表31中,其中平均GLuc反映GLuc之正規化平均值。
表31. 實例15之MARC1-GLuc-AAV小鼠中相對於治療前及鹽水對照正規化之平均GLuc。
第 8 天 | 第 15 天 | 第 22 天 | ||||
組 ID | 平均 GLuc | 標準差 | 平均 GLuc | 標準差 | 平均 GLuc | 標準差 |
1. 鹽水 | 1.000 | 0.576 | 1.000 | 0.170 | 1.000 | 0.273 |
2. 2 mg/kg AD12363 | 0.301 | 0.147 | 1.351 | 0.378 | 0.997 | 0.193 |
3. 2 mg/kg AD12364 | 0.348 | 0.065 | 1.297 | 0.100 | 1.395 | 0.191 |
4. 2 mg/kg AD12365 | 0.381 | 0.065 | 0.927 | 0.136 | 1.279 | 0.169 |
5. 2 mg/kg AD12366 | 0.425 | 0.112 | 1.066 | 0.240 | 1.205 | 0.173 |
6. 2 mg/kg AD12367 | 0.294 | 0.064 | 0.956 | 0.162 | 1.039 | 0.144 |
7. 2 mg/kg AD12368 | 0.483 | 0.231 | 1.355 | 0.334 | 1.405 | 0.663 |
8. 2 mg/kg AD12369 | 0.346 | 0.122 | 1.007 | 0.199 | 1.379 | 0.291 |
9. 2 mg/kg AD12370 | 0.344 | 0.056 | 0.938 | 0.126 | 1.190 | 0.190 |
10. 2 mg/kg AD12371 | 0.358 | 0.080 | 1.126 | 0.078 | 1.717 | 0.249 |
11. 2 mg/kg AD11786 | 0.300 | 0.031 | 0.930 | 0.260 | 1.023 | 0.194 |
第2組至第11組在第8天顯示GLuc降低。第4組、第6組、第9組及第11組在第15天顯示GLuc降低。第2組在第22天顯示GLuc降低。
實例 16 . MARC1 RNAi 藥劑在 大鼠中之活體內投與。
在史泊格多利大白鼠(Sprague Dawley rat)中測試MARC1 RNAi藥劑對MARC1之抑制。在第1天,經由皮下(SQ)注射,向四隻(n=4)雄性史泊格多利大白鼠動物給與鹽水或以鹽水調配之RNAi藥劑(以3 mg/kg),注射體積為每25 g體重1000 µL (4 mL/kg)。給藥方案係根據下表32。
表32. 實例16之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | MARC1 之所靶向位置(Seq ID No. 1) | 給藥途經 |
1 | 鹽水 | 不適用 | 第1天SQ注射 |
2 | 3 mg/kg AD12583 | 405 | 第1天SQ注射 |
3 | 3 mg/kg AD12584 | 406 | 第1天SQ注射 |
4 | 3 mg/kg AD12585 | 409 | 第1天SQ注射 |
5 | 3 mg/kg AD12586 | 411 | 第1天SQ注射 |
6 | 3 mg/kg AD12587 | 564 | 第1天SQ注射 |
7 | 3 mg/kg AD12588 | 565 | 第1天SQ注射 |
8 | 3 mg/kg AD12589 | 566 | 第1天SQ注射 |
9 | 3 mg/kg AD12590 | 567 | 第1天SQ注射 |
10 | 3 mg/kg AD12591 | 901 | 第1天SQ注射 |
11 | 3 mg/kg AD12592 | 1008 | 第1天SQ注射 |
12 | 3 mg/kg AD12593 | 1009 | 第1天SQ注射 |
13 | 3 mg/kg AD12594 | 1012 | 第1天SQ注射 |
14 | 3 mg/kg AD12595 | 1013 | 第1天SQ注射 |
15 | 3 mg/kg AD12596 | 1014 | 第1天SQ注射 |
第2組至第15組的MARC1 RNAi藥劑之所靶向基因位置與人類MARC1具有交叉反應性。
在給藥後第8天,將動物處死且收集肝臟組織。以大鼠β-肌動蛋白為對照,使用qPCR測定大鼠MARC1之表現。將各動物之肝臟組織中之平均MARC1表現相對於給藥前及對照組1(鹽水)正規化。來自實驗之資料顯示於下表33中。
表33. 實例16之第8天大鼠肝臟中MARC1之平均相對表現。
第 8 天 | |||
組 ID | rMARC1 相對表現 | 低 | 高 |
1. 鹽水 | 1.000 | 0.144 | 0.168 |
2. 3 mg/kg AD12583 | 1.031 | 0.278 | 0.380 |
3. 3 mg/kg AD12584 | 0.627 | 0.160 | 0.215 |
4. 3 mg/kg AD12585 | 0.436 | 0.071 | 0.084 |
5. 3 mg/kg AD12586 | 1.471 | 0.341 | 0.444 |
6. 3 mg/kg AD12587 | 1.158 | 0.297 | 0.400 |
7. 3 mg/kg AD12588 | 1.191 | 0.242 | 0.303 |
8. 3 mg/kg AD12589 | 0.874 | 0.152 | 0.184 |
9. 3 mg/kg AD12590 | 0.549 | 0.067 | 0.077 |
10. 3 mg/kg AD12591 | 0.369 | 0.104 | 0.144 |
11. 3 mg/kg AD12592 | 1.321 | 0.169 | 0.194 |
12. 3 mg/kg AD12593 | 1.051 | 0.162 | 0.191 |
13. 3 mg/kg AD12594 | 1.149 | 0.225 | 0.280 |
14. 3 mg/kg AD12595 | 0.561 | 0.145 | 0.195 |
15. 3 mg/kg AD12596 | 0.405 | 0.103 | 0.139 |
第3組、第4組、第8組至第10組、第14組及第15組在第8天顯示rMARC1降低。
實例 17 . MARC1 RNAi 藥劑在 大鼠中之活體內投與。
在史泊格多利大白鼠中測試MARC1 RNAi藥劑對MARC1之抑制。在第1天,經由皮下(SQ)注射,向四隻(n=4)雄性史泊格多利大白鼠動物給與鹽水或以鹽水調配之RNAi藥劑(以3 mg/kg),注射體積為每25 g體重1000 µL (4 mL/kg)。給藥方案係根據下表34。
表34. 實例17之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | MARC1 之所靶向位置(Seq ID No. 1) | 給藥途經 |
1 | 鹽水 | 不適用 | 第1天SQ注射 |
2 | 3 mg/kg AD12596 | 1014 | 第1天SQ注射 |
3 | 3 mg/kg AD13452 | 1014 | 第1天SQ注射 |
4 | 3 mg/kg AD13453 | 1014 | 第1天SQ注射 |
5 | 3 mg/kg AD13454 | 1014 | 第1天SQ注射 |
6 | 3 mg/kg AD13455 | 1014 | 第1天SQ注射 |
7 | 3 mg/kg AD13456 | 1014 | 第1天SQ注射 |
8 | 3 mg/kg AD13457 | 1014 | 第1天SQ注射 |
9 | 3 mg/kg AD13458 | 1014 | 第1天SQ注射 |
10 | 3 mg/kg AD13459 | 1014 | 第1天SQ注射 |
第2組至第10組的MARC1 RNAi藥劑之所靶向基因位置與人類MARC1具有交叉反應性。
在給藥後第8天,將動物處死且收集肝臟組織。以大鼠β-肌動蛋白為對照,使用qPCR測定大鼠MARC1之表現。將各動物之肝臟組織中之平均MARC1表現相對於給藥前及對照組1(鹽水)正規化。來自實驗之資料顯示於下表35中。
表35. 實例17第8天大鼠肝臟中MARC1之平均相對表現。
第 8 天 | |||
組 ID | rMARC1 相對表現 | 低 | 高 |
1. 鹽水 | 1.000 | 0.132 | 0.151 |
2. 3 mg/kg AD12596 | 0.559 | 0.246 | 0.439 |
3. 3 mg/kg AD13452 | 0.437 | 0.083 | 0.102 |
4. 3 mg/kg AD13453 | 0.469 | 0.113 | 0.149 |
5. 3 mg/kg AD13454 | 0.361 | 0.075 | 0.094 |
6. 3 mg/kg AD13455 | 0.486 | 0.138 | 0.192 |
7. 3 mg/kg AD13456 | 0.414 | 0.061 | 0.072 |
8. 3 mg/kg AD13457 | 0.394 | 0.136 | 0.208 |
9. 3 mg/kg AD13458 | 0.573 | 0.160 | 0.222 |
10. 3 mg/kg AD13459 | 0.368 | 0.056 | 0.066 |
第2組至第10組在第8天顯示rMARC1降低。
實例 18 . MARC1 RNAi 藥劑在 食蟹獼猴中之活體內投與。
在食蟹獼猴中測試MARC1 RNAi藥劑對MARC1之抑制。在第-7天自所有動物收集肝臟活檢體,且用作正規化目的之內部參考樣品。在第1天,經由皮下(SQ)注射,在肩胛中部區域用注射器及針頭向四組雌性食蟹獼猴(非幼猴)動物給與以鹽水調配之RNAi藥劑(以3 mg/kg),每組三隻(n=3)動物,注射體積為0.3 mL/kg體重。在第15天及第43天,收集額外肝臟活檢體。在鎮靜及收集肝臟活檢體之前,所有動物禁食至少12小時但不超過18小時。給藥方案係根據下表36。
表36. 實例18之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | MARC1 之所靶向位置(Seq ID No. 1) | 給藥途經 |
1 | 3 mg/kg AD11786 | 1313 | 第1天SQ注射 |
2 | 3 mg/kg AD11778 | 1089 | 第1天SQ注射 |
3 | 3 mg/kg AD12363 | 305 | 第1天SQ注射 |
4 | 3 mg/kg AD12369 | 1817 | 第1天SQ注射 |
在各次SQ注射之前,首先給測試動物服鎮靜劑。鎮靜係使用鹽酸氯胺酮(10 mg/kg)來完成,以肌肉內(IM)注射之形式投與(未注射至四頭肌中)。基於在各給藥日所記錄之體重計算MARC1 RNAi藥劑之個別劑量。
對於各動物,收集肝臟活檢樣品(各自約200 mg (160至240 mg;±10%))以用於探索性基因減弱分析。
在第-7天、第1天、第15天、第29天及第43天,在適用時進行肝臟活檢樣品收集或劑量投與之前,自發現處於瀕死狀態或以非預定間隔處死之任何動物收集血清血液。
以食蟹獼猴ARL1為對照,使用qPCR測定食蟹獼猴MARC1之表現。將各動物之肝臟組織中之平均MARC1表現相對於各個別測試動物之第-7日樣品含量正規化。隨後根據個別正規化值計算各組之平均相對表現。來自實驗之資料顯示於下表37中。
表37. 實例18之相對於治療前食蟹獼猴正規化之平均MARC1。
第 -7 天 ( 給藥前 ) | 第 15 天 | |||||
組 ID | MARC1 相對表現 | 低 | 高 | MARC1 相對表現 | 低 | 高 |
1. 3 mg/kg AD11786 | 1.000 | 0.446 | 0.805 | 0.446 | 0.137 | 0.199 |
2. 3 mg/kg AD11778 | 1.000 | 0.497 | 0.987 | 0.824 | 0.255 | 0.369 |
3. 3 mg/kg AD12363 | 1.000 | 0.601 | 1.504 | 0.836 | 0.515 | 1.339 |
4. 3 mg/kg AD12369 | 1.000 | 0.125 | 0.142 | 0.548 | 0.164 | 0.235 |
第43 天 | ||||||
組 ID | MARC1 相對表現 | 低 | 高 | |||
1. 3 mg/kg AD11786 | 0.355 | 0.159 | 0.289 | |||
2. 3 mg/kg AD11778 | 0.715 | 0.309 | .554 | |||
3. 3 mg/kg AD12363 | 0.926 | 0.510 | 1.133 | |||
4. 3 mg/kg AD12369 | 0.228 | 0.079 | 0.120 |
第1組至第4組在給藥後第15天及第43天顯示MARC1降低。
經由預定LCMS/MS分析對MARC1蛋白含量進行定量。為此,使用RIPA溶解及提取緩衝液(Thermo Scientific)對食蟹獼猴肝臟樣品進行均質化。使用磁珠方案提取蛋白質,且在內標存在下用胰蛋白酶消化20小時。進行基於LC-MS/MS之肽定量,且對兩種MARC1特異性肽(下文所列之序列)之回應曲線下面積、對應內標以及SLC25A3蛋白之特異性肽進行定量。SLC25A3為一種磷酸鹽載體蛋白,其因與粒線體膜中之MARC1蛋白並置而被選為正規化蛋白。食蟹獼猴測試動物之肝臟中經SLC25A3正規化之MARC1蛋白濃度顯示於下表38中。
表38. 實例18之食蟹獼猴肝臟中相對於給藥前及SLC25A3表現的MARC1蛋白含量。
第 -7 天 ( 給藥前 ) | ||||
組 ID | 肽序列 | 相對 MARC1 | 低 | 高 |
1. 3 mg/kg AD11786 | DLLLPIK | 1.00 | 0.87 | 1.13 |
SPLFGQYFVLENPGTIK | 1.00 | 0.81 | 1.19 | |
2. 3 mg/kg AD11778 | DLLLPIK | 1.00 | 0.83 | 1.17 |
SPLFGQYFVLENPGTIK | 1.00 | 0.66 | 1.34 | |
3. 3 mg/kg AD12363 | DLLLPIK | 1.00 | 0.83 | 1.17 |
SPLFGQYFVLENPGTIK | 1.00 | 0.54 | 1.46 | |
4. 3 mg/kg AD12369 | DLLLPIK | 1.00 | 0.89 | 1.11 |
SPLFGQYFVLENPGTIK | 1.00 | 0.79 | 1.21 | |
第15 天 | ||||
組 ID | 肽序列 | 相對MARC1 | 低 | 高 |
1. 3 mg/kg AD11786 | DLLLPIK | 0.63 | 0.49 | 0.90 |
SPLFGQYFVLENPGTIK | 0.61 | 0.29 | 1.07 | |
2. 3 mg/kg AD11778 | DLLLPIK | 0.89 | 0.77 | 1.00 |
SPLFGQYFVLENPGTIK | 1.15 | 0.47 | 1.72 | |
3. 3 mg/kg AD12363 | DLLLPIK | 0.97 | 0.70 | 1.17 |
SPLFGQYFVLENPGTIK | 1.06 | 0.50 | 1.81 | |
4. 3 mg/kg AD12369 | DLLLPIK | 0.64 | 0.57 | 0.71 |
SPLFGQYFVLENPGTIK | 0.68 | 0.56 | 0.76 | |
第43 天 | ||||
組 ID | 肽序列 | 相對MARC1 | 低 | 高 |
1. 3 mg/kg AD11786 | DLLLPIK | 0.42 | 0.32 | 0.62 |
SPLFGQYFVLENPGTIK | 0.68 | 0.47 | 1.03 | |
2. 3 mg/kg AD11778 | DLLLPIK | 0.65 | 0.58 | 0.72 |
SPLFGQYFVLENPGTIK | 1.17 | 0.67 | 1.63 | |
3. 3 mg/kg AD12363 | DLLLPIK | 1.14 | 0.81 | 1.46 |
SPLFGQYFVLENPGTIK | 2.12 | 0.86 | 2.87 | |
4. 3 mg/kg AD12369 | DLLLPIK | 0.37 | 0.34 | 0.42 |
SPLFGQYFVLENPGTIK | 0.42 | 0.27 | 0.66 |
第4組(3 mg/kg AD12369)顯示時間依賴性>50%的MARC1蛋白減弱。
實例 19 . MARC1 RNAi 藥劑在 食蟹獼猴中之活體內投與。
在食蟹獼猴中測試MARC1 RNAi藥劑對MARC1之抑制。在第1天及第29天,經由皮下(SQ)注射,向四組雄性食蟹獼猴(非幼猴)動物給與以鹽水調配之RNAi藥劑(以3 mg/kg),每組三隻(n=3)動物,注射體積為0.3 mL/kg體重。給藥方案係根據下表39。
表39. 實例19之小鼠之給藥
組 | 劑量(RNAi 藥劑) | 給藥途經 | 劑量體積 | 動物數目(n =) |
1 | 3.0 mg/kg AD12976 | 第1天及第29天SQ注射 | 0.3 ml/kg | n = 3 |
2 | 3.0 mg/kg AD13805 | 第1天及第29天SQ注射 | 0.3 ml/kg | n = 3 |
3 | 3.0 mg/kg AD13445 | 第1天及第29天SQ注射 | 0.3 ml/kg | n = 3 |
4 | 3.0 mg/kg AD13925 | 第1天及第29天SQ注射 | 0.3 ml/kg | n = 3 |
在第1天及第29天,對測試動物進行稱重,且經由皮下(SQ)投與在肩胛中部區域用注射器及針頭給藥。
在第-7天(給藥前)、第15天、第29天及第43天收集肝臟活檢體。在進行鎮靜程序時,收集肝臟活檢體。在各次肝臟活檢體收集之前使動物禁食隔夜(至少12小時但少於18小時)。對於各動物,收集肝臟活檢樣品(各自約40 mg,30至60 mg,+/-10%)以用於基因減弱分析。僅對於第2組動物,在第15天,收集額外肝臟活檢體(各自約40 mg,30至60 mg;±10%)。在適用時,亦自發現處於瀕死狀態或以非預定間隔處死之任何動物收集肝臟活檢體。
在第-7天(給藥前)、第1天、第15天、第29天及第43天,在適用時進行肝臟活檢樣品收集或RNAi藥劑劑量投與之前收集血液。在適用時,亦自發現處於瀕死狀態或以非預定間隔處死之任何動物收集血液。對於預定收集,使動物禁食隔夜(至少12小時但少於24小時)。收集之間的空腹持續時間一致(+/-1小時)。對於非預定收集,動物不禁食。血液收集部位為股靜脈,隱靜脈為替代收集部位。
鎮靜係使用鹽酸氯胺酮(10 mg/kg)來完成,以肌肉內(IM)注射之形式投與(未注射至四頭肌中)。
以獼猴ARL1為內源性對照,使用qPCR測定cMARC1之表現。將各動物之肝臟組織中之平均MARC1表現相對於各個別測試動物之第-7日樣品含量正規化。隨後根據個別正規化值計算各組之平均相對表現。來自實驗之資料顯示於下表40中。
表40. 實例19之相對於治療前食蟹獼猴正規化之平均MARC1。
第 -7 天 ( 給藥前 ) | 第 15 天 | |||||
組 ID | MARC1 相對表現 | 低 | 高 | MARC1 相對表現 | 低 | 高 |
1. 3.0 mg/kg AD12976 | 1.000 | 0.666 | 1.991 | 0.801 | 0.411 | 0.844 |
2. 3.0 mg/kg AD13805 | 1.000 | 0.600 | 1.499 | 0.712 | 0.352 | 0.696 |
3. 3.0 mg/kg AD13445 | 1.000 | 0.650 | 1.855 | 0.849 | 0.430 | 0.869 |
4. 3.0 mg/kg AD13925 | 1.000 | 0.644 | 1.805 | 0.553 | 0.378 | 1.188 |
第 29 天 | 第 43 天 | |||||
組 ID | MARC1 相對表現 | 低 | 高 | MARC1 相對表現 | 低 | 高 |
1. 3.0 mg/kg AD12976 | 0.920 | 0.420 | 0.771 | 0.495 | 0.279 | 0.638 |
2. 3.0 mg/kg AD13805 | 0.388 | 0.208 | 0.447 | 0.250 | 0.142 | 0.327 |
3. 3.0 mg/kg AD13445 | 1.024 | 0.601 | 1.453 | 0.886 | 0.529 | 1.312 |
4. 3.0 mg/kg AD13925 | 0.302 | 0.190 | 0.510 | 0.235 | 0.143 | 0.368 |
第1組至第4組在給藥後第15天及第43天顯示MARC1降低。
經由預定LCMS/MS分析對MARC1蛋白含量進行定量。為此,使用RIPA溶解及提取緩衝液(Thermo Scientific)對食蟹獼猴肝臟樣品進行均質化。使用磁珠方案提取蛋白質,且在內標存在下用胰蛋白酶消化20小時。進行基於LC-MS/MS之肽定量,且對兩種MARC1特異性肽(下文所列之序列)之回應曲線下面積、對應內標以及SLC25A3蛋白之特異性肽進行定量。SLC25A3為一種磷酸鹽載體蛋白,其因與粒線體膜中之MARC1蛋白並置而被選為正規化蛋白。食蟹獼猴測試動物之肝臟中經SLC25A3正規化之MARC1蛋白濃度顯示於下表41及表42中。表41及表42顯示MARC1蛋白含量,其係根據LC-MS/MS分析藉由該等蛋白含量之各別肽序列而定量。
表41. 實例19之食蟹獼猴肝臟中相對於給藥前及SLC25A3表現的MARC1蛋白含量(使用肽序列:DLLLPIK來定量)。
第 -7 天 | 第 15 天 | |||
組 ID | MARC1 相對表現 | 標準差 | MARC1 相對表現 | 標準差 |
1. 3.0 mg/kg AD12976 | 1.000 | 0.000 | 0.787 | 0.119 |
2. 3.0 mg/kg AD13805 | 1.000 | 0.000 | 0.536 | 0.232 |
3. 3.0 mg/kg AD13445 | 1.000 | 0.000 | 1.048 | 0.271 |
4. 3.0 mg/kg AD13925 | 1.000 | 0.000 | 0.475 | 0.030 |
第 29 天 | 第 43 天 | |||
組 ID | MARC1 相對表現 | 標準差 | MARC1 相對表現 | 標準差 |
1. 3.0 mg/kg AD12976 | 0.744 | 0.123 | 0.642 | 0.153 |
2. 3.0 mg/kg AD13805 | 0.449 | 0.147 | 0.281 | 0.101 |
3. 3.0 mg/kg AD13445 | 0.874 | 0.188 | 0.943 | 0.057 |
4. 3.0 mg/kg AD13925 | 0.400 | 0.109 | 0.323 | 0.057 |
MARC1 RNAi藥劑在給藥後至少43天顯示出MARC1蛋白抑制。第1組、第2組及第4組在所有時間點均顯示MARC1降低,而第3組在所有時間點均顯示可忽略不計的降低。更具體言之,在2×3.0 mg/kg劑量之後,AD13805在第43天達成約71%之MARC1抑制(0.281)。
表42. 實例19之食蟹獼猴肝臟中相對於給藥前及SLC25A3表現的MARC1蛋白含量(使用肽序列:SPLFGQYFVLENPGTIK來定量)。
第 -7 天 | 第 15 天 | |||
組 ID | MARC1 相對表現 | 標準差 | MARC1 相對表現 | 標準差 |
1. 3.0 mg/kg AD12976 | 1.000 | 0.000 | 0.820 | 0.056 |
2. 3.0 mg/kg AD13805 | 1.000 | 0.000 | 0.481 | 0.135 |
3. 3.0 mg/kg AD13445 | 1.000 | 0.000 | 0.969 | 0.083 |
4. 3.0 mg/kg AD13925 | 1.000 | 0.000 | 0.544 | 0.047 |
第 29 天 | 第 43 天 | |||
組 ID | MARC1 相對表現 | 標準差 | MARC1 相對表現 | 標準差 |
1. 3.0 mg/kg AD12976 | 0.719 | 0.142 | 0.642 | 0.191 |
2. 3.0 mg/kg AD13805 | 0.383 | 0.069 | 0.245 | 0.065 |
3. 3.0 mg/kg AD13445 | 0.875 | 0.143 | 0.740 | 0.107 |
4. 3.0 mg/kg AD13925 | 0.363 | 0.059 | 0.286 | 0.019 |
MARC1 RNAi藥劑在給藥後至少43天顯示出MARC1蛋白抑制。第1組、第2組及第4組在所有時間點均顯示MARC1降低,而第3組在所有時間點均顯示不太顯著的降低(第15天之降低可忽略不計)。更具體言之,在2×3.0 mg/kg劑量之後,AD13805在第43天達成約75%之MARC1抑制(0.245)。
其他實施例
應理解,儘管本發明已結合其實施方式加以描述,但前述描述意欲說明且不限制由所附申請專利範圍之範疇限定的本發明之範疇。其他態樣、優勢及修改在以下申請專利範圍之範疇內。
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Claims (50)
- 一種用於抑制MARC1基因表現之RNAi藥劑,其包含: 反義股,其包含與表2、表3或表6D之反義股序列中之任一者之15個連續核苷酸相差0或1個核苷酸的至少15個連續核苷酸之核苷酸序列;及 有義股,其包含與該反義股至少部分互補之核苷酸序列。
- 如請求項1之RNAi藥劑,其中該反義股包含表2、表3或表6D中所提供之序列中之任一者的核苷酸2至18。
- 如請求項1或請求項2之RNAi藥劑,其中該有義股包含與表2、表4、表5或表6D之有義股序列中之任一者之15個連續核苷酸相差0或1個核苷酸的至少15個連續核苷酸之核苷酸序列,且其中該有義股在至少15個連續核苷酸內具有與該反義股至少85%互補性的區域。
- 如請求項1至3中任一項之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑之至少一個核苷酸包括經修飾之核苷間鍵。
- 如請求項1至4中任一項之RNAi藥劑,其中所有或實質上所有該等核苷酸為經修飾之核苷酸。
- 如請求項4至5中任一項之RNAi藥劑,其中該等經修飾之核苷酸獨立地選自由以下組成之群:2'-O-甲基核苷酸、2'-氟核苷酸、2'-去氧核苷酸、2',3'-開環核苷酸模擬物、鎖定核苷酸、2'-F-阿糖核苷酸、2'-甲氧基乙基核苷酸、無鹼基核苷酸、核糖醇、反向核苷酸、反向2'-O-甲基核苷酸、反向2'-去氧核苷酸、2'-胺基修飾之核苷酸、2'-烷基修飾之核苷酸、N-𠰌啉基核苷酸、含膦酸乙烯酯之核苷酸、含膦酸環丙酯之核苷酸及3'-O-甲基核苷酸。
- 如請求項5之RNAi藥劑,其中所有或實質上所有該等經修飾之核苷酸為2'-O-甲基核苷酸、2'-氟核苷酸或其組合。
- 如請求項1至7中任一項之RNAi藥劑,其中該反義股由表3或表6D之經修飾之反義股序列中之任一者的核苷酸序列組成或基本上由該核苷酸序列組成。
- 如請求項1至8中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股由表4、表5或表6D之經修飾之有義股序列中之任一者的核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列。
- 如請求項1之RNAi藥劑,其中該反義股包含表3之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列,且該有義股包含表4、表5或表6D之經修飾之序列中之任一者的核苷酸序列。
- 如請求項1至10中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股之長度為18至30個核苷酸,且該反義股之長度為18至30個核苷酸。
- 如請求項11之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自為18至27個核苷酸。
- 如請求項12之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自為18至24個核苷酸。
- 如請求項13之RNAi藥劑,其中該有義股及該反義股之長度各自為21個核苷酸。
- 如請求項14之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑具有兩個鈍端。
- 如請求項1至15中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股包含一或兩個端帽。
- 如請求項1至16中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股包含一或兩個反向無鹼基殘基。
- 如請求項1之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑包含有義股及反義股,該有義股及該反義股形成具有表6A及表6B中之雙螺旋體中之任一者之結構的雙螺旋體。
- 如請求項18之RNAi藥劑,其中所有或實質上所有該等核苷酸為經修飾之核苷酸。
- 如請求項1之RNAi藥劑,其包含反義股,該反義股由與以下核苷酸序列(5' 3')中之一者相差0或1個核苷酸的核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列: UGAAAGAACUAUUCCAUAAUC (SEQ ID NO: 1608); ACAGAAUCCUGUCUUGUCGUU (SEQ ID NO: 1657); UCCUUUAAAGGUUUUCAGUAG (SEQ ID NO: 1580);或 UAUUGAAGCAUUGAGACACCG (SEQ ID NO: 1659)。
- 如請求項1至20中任一項之RNAi藥劑,其中該反義股之位於自5'端起之位置2及位置14處的核苷酸為2'-氟修飾之核苷酸。
- 如請求項21之RNAi藥劑,其中該反義股之在位置2處的核苷酸為2'-氟尿苷,且該反義股之在位置14處的核苷酸為2'-氟胞苷,且其中該反義股包含3或4個硫代磷酸酯核苷間鍵。
- 如請求項1至22中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股由與以下核苷酸序列(5' 3')中之一者相差0或1個核苷酸的核苷酸序列組成、基本上由該核苷酸序列組成或包含該核苷酸序列: GAUUAUGGAAUAGUUCUUUCA (SEQ ID NO: 1734); AACGACAAGACAGGAUUCUGU (SEQ ID NO: 1783); CUACUGAAAACCUUUAAAIGA (SEQ ID NO: 1774);或 CGGUGUCUCAAUGCUUCAAUA (SEQ ID NO: 1784)。
- 如請求項20至23中任一項之RNAi藥劑,其中所有或實質上所有該等核苷酸為經修飾之核苷酸。
- 如請求項1之RNAi藥劑,其包含反義股,該反義股包含與以下核苷酸序列(5' 3')中之一者相差0或1個核苷酸的經修飾之核苷酸序列、由該經修飾之核苷酸序列組成,或基本上由該經修飾之核苷酸序列組成: cPrpusGfaaaGfaacuaUfuCfcAfuaausc (SEQ ID NO: 1143); asCfagAfauccugUfcUfuGfucgusu (SEQ ID NO: 1228); isCfagAfauccugUfcUfuGfucgusu (SEQ ID NO: 1229); cPrpusCfscsUfuUfaaaggUfuUfuCfaGfuasg (SEQ ID NO: 1200);或 usAfsusugaAfgcauUfgAfgAfcaccsg (SEQ ID NO: 1235), 其中a表示2'-O-甲基腺苷,c表示2'-O-甲基胞苷,g表示2'-O-甲基鳥苷,i表示2'-O-甲基肌苷;且u表示2'-O-甲基尿苷;Af表示2'-氟腺苷,Cf表示2'-氟胞苷,Gf表示2'-氟鳥苷,且Uf表示2'-氟尿苷;cPrpu表示5'-膦酸環丙酯-2'-O-甲基尿苷;s表示硫代磷酸酯鍵;且其中該有義股上之所有或實質上所有該等核苷酸為經修飾之核苷酸。
- 如請求項1之RNAi藥劑,其中該有義股包含與以下核苷酸序列(5' 3')中之一者相差0或1個核苷酸的經修飾之核苷酸序列、由該經修飾之核苷酸序列組成,或基本上由該經修飾之核苷酸序列組成: gauuauggAfAfUfaguucuuuca (SEQ ID NO: 1319); aacgacaaGfAfCfaggauucugu (SEQ ID NO: 1376); cuacugaaAfAfCfcuuuaaaiga (SEQ ID NO: 1361);或 cggugucuCfAfAfugcuucaaua (SEQ ID NO: 1377), 其中a表示2'-O-甲基腺苷,c表示2'-O-甲基胞苷,g表示2'-O-甲基鳥苷,u表示2'-O-甲基尿苷,且i表示2'-O-甲基肌苷;Af表示2'-氟腺苷,Cf表示2'-氟胞苷,Gf表示2'-氟鳥苷,且Uf表示2'-氟尿苷;s表示硫代磷酸酯鍵;且其中該反義股上之所有或實質上所有該等核苷酸為經修飾之核苷酸。
- 如請求項20至26中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股在該核苷酸序列之3'末端處、該核苷酸序列之5'端處或此兩者處進一步包括反向無鹼基殘基。
- 如請求項1至27中任一項之RNAi藥劑,其中該RNAi藥劑連接至靶向配位體。
- 如請求項1至28中任一項之RNAi藥劑,其中該有義股包含: 。
- 如請求項1至29中任一項之RNAi藥劑,其中該靶向配位體連接至該有義股。
- 如請求項30之RNAi藥劑,其中該靶向配位體連接至該有義股之5'末端。
- 一種組合物,其包含如請求項1至31中任一項之RNAi藥劑,其中該組合物進一步包含醫藥學上可接受之賦形劑。
- 如請求項32之組合物,其進一步包含能夠抑制MARC1基因表現之第二RNAi藥劑。
- 如請求項32至33中任一項之組合物,其進一步包含一或多種額外治療劑。
- 如請求項32至34中任一項之組合物,其中該組合物經調配以用於投與。
- 如請求項35之組合物,其中該組合物係藉由皮下注射來遞送。
- 如請求項32至36中任一項之組合物,其中該醫藥學上可接受之賦形劑為磷酸鈉緩衝液。
- 如請求項32至36中任一項之組合物,其中該醫藥學上可接受之賦形劑為等張鹽水或注射用水。
- 一種用於抑制肝細胞中MARC1基因表現之方法,該方法包含向個體之細胞中引入有效量的如請求項1至31中任一項之RNAi藥劑或如請求項32至38中任一項之組合物。
- 如請求項39之方法,其中該個體為人類個體。
- 如請求項39至40中任一項之方法,其中該肝細胞或該個體中MARC1 mRNA含量降低至少約50%。
- 如請求項39至41中任一項之方法,其中該肝細胞或該個體中MARC1蛋白含量降低至少約50%。
- 一種治療MARC1相關疾病、病症或症狀之方法,該方法包含向有需要之人類個體投與治療有效量的如請求項32至38中任一項之組合物。
- 如請求項43之方法,其中該疾病為非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、酒精性脂肪肝病、自體免疫肝炎、肝纖維化、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病。
- 如請求項39至44中任一項之方法,其中該個體中血清MARC1蛋白之含量降低。
- 如請求項39至45中任一項之方法,其中該RNAi藥劑係以約0.05 mg/kg人類個體體重至約5.0 mg/kg人類個體體重之劑量向該人類個體投與。
- 一種如請求項1至31中任一項之RNAi藥劑或如請求項32至38中任一項之組合物的用途,其係用於治療至少部分地由MARC1基因表現降低介導之疾病、病症或症狀。
- 如請求項47之用途,其中該疾病為非酒精性脂肪變性肝炎(NASH)、非酒精性脂肪肝病(NAFLD)、酒精性脂肪肝病、自體免疫肝炎、肝纖維化、肝硬化、血液膽固醇含量升高、高三酸甘油酯血症、肝病及/或其他MARC1相關疾病。
- 一種如請求項1至31中任一項之RNAi藥劑或如請求項32至38中任一項之組合物的用途,其係用於製備用以治療至少部分地由MARC1基因表現降低介導之疾病、病症或症狀的醫藥組合物。
- 如請求項47至49中任一項之用途,其中該RNAi藥劑係以約0.05 mg/kg人類個體體重至約5.0 mg/kg人類個體體重之劑量向該人類個體投與。
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