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TW202030204A - 靶向腫瘤之超促效cd28抗原結合分子 - Google Patents

靶向腫瘤之超促效cd28抗原結合分子 Download PDF

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TW202030204A
TW202030204A TW108146669A TW108146669A TW202030204A TW 202030204 A TW202030204 A TW 202030204A TW 108146669 A TW108146669 A TW 108146669A TW 108146669 A TW108146669 A TW 108146669A TW 202030204 A TW202030204 A TW 202030204A
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湯瑪士 哈福
克里斯俊 克雷恩
珍妮 托斯卡 湯姆
帕伯羅 優瑪那
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Abstract

本發明係關於能多價結合至CD28之靶向腫瘤之超促效抗原結合分子、其製備方法、含有此等抗體之醫藥組合物，及使用其之方法。

Description

靶向腫瘤之超促效CD28抗原結合分子
本發明係關於靶向腫瘤之超促效CD28抗原結合分子，其製備方法，含有此等分子之醫藥組合物，及其於治療癌症中用作免疫調節劑之用途。
癌症免疫療法正在變成越來越有效的治療選項，其可導致癌症類型(諸如黑色素瘤、非小細胞肺癌及腎細胞癌)中之急劇且持久反應。此主要由若干免疫檢查點阻斷，包括抗PD-1 (例如Keytruda，Merck；Opdivo，BMS)、抗CTLA-4 (例如Yervoy，BMS)及抗PD-L1 (例如Tecentriq，Roche)之成功驅動。此等藥劑可用作許多癌症類型之護理標準，或作為組合療法之骨架，然而僅一小部分患者(＜25%)自此等療法受益。此外，各種癌症(前列腺癌、結腸直腸癌、胰臟癌、肉瘤、非三陰性乳癌等)主要呈現對此等免疫調節劑之耐藥性。許多報導指示，先已存在之抗腫瘤T細胞之不存在會造成一些患者無反應或差的反應。總之，儘管現有免疫療法之印象深刻的抗癌效果，對於解決大量癌症患者群體及對於開發旨在誘導及增強新穎腫瘤特異性T細胞反應之療法存在明確醫療需求。
CD28為共刺激分子之亞家族之創始成員，其特徵在於配對之連接至單跨膜域之V-組免疫球蛋白超家族(IgSF)域及含有關鍵信號基序之細胞質域(Carreno及Collins，2002)。亞家族之其他成員包括ICOS、CTLA-4、PD1、PD1H、TIGIT及BTLA (Chen及Flies，2013)。CD28表現受限於T細胞並且在所有初始及大多數有抗原經驗之子集(包括表現PD-1或CTLA-4之彼等)上流行。CD28及CTLA-4係高度同源及競爭結合至相同B7分子CD80及CD86，該等分子在樹突狀細胞、B細胞、巨噬細胞及腫瘤細胞上表現(Linsley等人，1990)。CTLA-4對配位體之B7家族之更高親和力允許CTLA-4對配位體結合勝過CD28且抑制效應T細胞反應(Engelhardt等人，2006)。相比之下，顯示PD-1藉由將CD28之細胞質域部分去磷酸化來抑制CD28信號傳導(Hui等人，2017)。CD28藉由專門抗原呈遞細胞表面上之CD80或CD86之接合嚴格要求初始T細胞之功能重新啟動、隨後純系擴增、細胞激素產生、靶細胞裂解及長壽記憶之形成。CD28配位體之結合亦促進可誘導共刺激受體(諸如OX-40、ICOS及4-1BB)之表現(於Acuto及Michel，2003中評論)。
在接合CD28後，已顯示經二硫鍵連接之同二聚體(膜近側YMNM基序及遠側PYAP基序)與若干激酶及適體蛋白複合(Boomer及Green，2010)。此等基序對於誘導IL2轉錄而言係重要的，該轉錄藉由NFAT、AP-1及NFκB家族轉錄因子之CD28依賴性活化介導(Fraser等人，1991) (June等人，1987) (Thompson等人，1989)。然而，於CD28之細胞質域中發現另外較差表徵之磷酸化及泛素化之位點。
如由(Esensten等人，2016)所評論，CD28引發之路徑於促進習知T細胞之增殖及效應功能中具有關鍵作用。CD28接合亦促進調節性T細胞之消炎功能。CD28藉由部分增強來自T細胞受體之信號共刺激T細胞，而且顯示其介導獨特信號傳導事件(Acuto及Michel，2003；Boomer及Green，2010；June等人，1987)。藉由CD28特異性觸發之信號控制T細胞功能之許多重要態樣，包括下游蛋白之磷酸化及其他轉譯後修飾(例如，PI3K介導之磷酸化)、轉錄變化(例如Bcl-xL表現)、表觀遺傳變化(例如IL-2啟動子)、細胞骨架重塑(例如微管組織中心之定位)及糖酵解速率(例如糖酵解通量)之變化。
CD28缺乏小鼠具有減少之對感染性病原體、同種異體移植抗原、移植物抗宿主病、接觸超敏性及哮喘之反應(Acuto及Michel，2003)。缺少CD28介導之共刺激導致減少之活體外及活體內T細胞增殖，嚴重抑制生發中心形成及免疫球蛋白同型類別切換，減少T輔助(Th)細胞分化及Th2型細胞激素之表現。CD4依賴性細胞毒性CD8+ T-細胞反應亦受影響。重要的是，CD28缺乏之初始T細胞顯示減少之增殖反應，特別在較低抗原濃度下。
越來越多的文獻支持接合T細胞上之CD28具有抗腫瘤潛力的觀點。最近證據證實，PD-L1/PD-1及CTLA-4檢查點抑制劑之抗癌效應依賴於CD28 (Kamphorst等人，2017；Tai等人，2007)。研究CTLA-4及PD-1阻斷之治療效果之臨床研究已顯示於患有晚期黑色素瘤及其他癌症之患者中之異常有前景的結果。此外，包含融合至細胞內TCR信號域(CD3z)及細胞內共刺激域(CD28及/或4-1BB域)之細胞外抗原識別域之表現人工嵌合T細胞受體之經遺傳工程改造之T細胞的融合已顯示B細胞癌症及其他癌症之反應之高速率及持久性。
可將CD28促效抗體分成兩類：(i) CD28超促效抗體及(ii) CD28習知促效抗體。正常地，針對初始T細胞之活化，需要T細胞抗原受體之接合(TCR，信號1)及藉由CD28之共刺激信號傳導(信號2)二者。CD28超促效劑(CD28SA)為CD28特異性單株單抗，其能自主活化T細胞而無明顯T細胞受體接合(Hunig，2012)。於齧齒動物中，CD28SA活化習知及調節性T細胞。CD28SA抗體於自體免疫、發炎及移植之多種模型中治療上有效。然而，2006年人類CD28SA抗體TGN1412之I期研究導致威脅生命之細胞激素風暴。隨訪研究已表明毒性係由給藥誤差引起，該等誤差係由於人類T細胞與臨床前動物模型之T細胞之CD28反應性差異。目前於RA患者及患有惡性腫瘤或不可切除之晚期實體惡性腫瘤之患者的開放標籤多中心劑量遞增研究中重新評價TGN1412。CD28習知促效抗體(諸如純系9.3)模擬CD28天然配位體且僅能在T細胞受體信號之存在下增強T細胞活化。公開之見解表明，抗體之結合抗原決定基對該促效抗體是否為超促效劑或習知促效劑具有主要影響(Beyersdorf等人，2005)。超促效TGN1412結合至CD28之側基序，而習知促效分子9.3結合接近於配位體結合抗原決定基。由於不同結合抗原決定基，超促效抗體及習知促效抗體在T細胞表面上形成CD28分子之線性複合體之能力不同。確切而言，TGN1412能有效形成CD28之線性陣列，其可能導致聚集之信號組分，該等組分足以超過T細胞活化之臨限值。另一方面，習知促效劑9.3導致結構上非線性之複合體。先前已公開基於9.3純系轉變習知促效結合劑之嘗試(Otz等人，2009)，其使用針對黑色素瘤相關蛋白多醣及CD28之重組雙特異性單鏈抗體。報導之雙特異性單鏈抗體發揮「超促效」活性而不管使用習知CD28促效結合劑9.3，基於雙特異性單鏈抗體形成多聚構築體之內在傾向。然而，此等構築體依賴於穩定且一致的多聚化。
本發明描述靶向腫瘤之超促效CD28抗原結合分子，其達成腫瘤依賴性自主T細胞活化及腫瘤細胞殺滅而不必形成多聚體。此等CD28抗原結合分子之特徵在於，其能多價結合至CD28且其包含能特異性結合至腫瘤相關抗原(諸如纖維母細胞活化蛋白(FAP)或癌胚抗原(CEA))之至少一個抗原結合域。此外，其具有由能穩定締合之第一亞單元及第二亞單元組成之包含一或多個胺基酸取代的Fc域，該取代降低抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能。從而廢除Fc受體介導之交聯且腫瘤特異性活化藉由經由能特異性結合至腫瘤相關抗原之至少一個抗原結合域與其抗原結合之交聯達成。
因此，本發明提供超促效CD28抗原結合分子，其能多價結合至CD28且包含 (a)能特異性結合至CD28之兩個或更多個抗原結合域， (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之至少一個抗原結合域，及 (c)由能穩定締合之第一亞單元及第二亞單元組成之包含一或多個胺基酸取代的Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能。
因此本發明係關於能在無先前T細胞活化下誘導T細胞增殖及細胞激素分泌之CD28抗原結合分子。然而，當其結合至腫瘤相關抗原時，其將在無先前T細胞活化下僅誘導T細胞增殖及細胞激素分泌，因為經由能特異性結合至腫瘤相關抗原之至少一個抗原結合域與其抗原結合之交聯係必需，因為CD28抗原結合分子缺少Fc受體及/或效應功能。
於一個態樣中，提供如下所定義之超促效CD28抗原結合分子，其中該Fc域為IgG，特定言之IgG1 Fc域或IgG4 Fc域。於一個特定態樣中，由能穩定締合之第一亞單元及第二亞單元組成之Fc域為IgG1 Fc域。於一個態樣中，該Fc域包含胺基酸取代L234A及L235A (根據Kabat EU索引編號)。於一個態樣中，該Fc域為人類IgG1子類且包含胺基酸突變L234A、L235A及P329G (根據Kabat EU索引編號)。
於一個態樣中，提供如上文中所定義之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含 (i)重鏈可變區(VH CD28)，其包含SEQ ID NO: 20之重鏈互補決定區CDR-H1、SEQ ID NO: 21之CDR-H2及SEQ ID NO: 22之CDR-H3，及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含SEQ ID NO: 23之輕鏈互補決定區CDR-L1、SEQ ID NO: 24之CDR-L2及SEQ ID NO: 25之CDR-L3；或 (ii)重鏈可變區(VH CD28)，其包含SEQ ID NO: 36之CDR-H1、SEQ ID NO: 37之CDR-H2及SEQ ID NO: 38之CDR-H3，及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含SEQ ID NO: 39之CDR-L1，SEQ ID NO: 40之CDR-L2及SEQ ID NO: 41之CDR-L3。
於一個態樣中，該超促效CD28抗原結合分子之該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含重鏈可變區(VH CD28)，其包含SEQ ID NO: 36之CDR-H1、SEQ ID NO: 37之CDR-H2及SEQ ID NO: 38之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含SEQ ID NO: 39之CDR-L1、SEQ ID NO: 40之CDR-L2及SEQ ID NO: 41之CDR-L3。
於另一態樣中，該超促效CD28抗原結合分子之該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含重鏈可變區(VH CD28)，其包含SEQ ID NO: 20之CDR-H1、SEQ ID NO: 21之CDR-H2及SEQ ID NO: 22之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含SEQ ID NO: 23之CDR-L1、SEQ ID NO: 24之CDR-L2及SEQ ID NO: 25之CDR-L3。
此外，提供如上文中所定義之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域者包含重鏈可變區(VH CD28)，其包含與SEQ ID NO: 26之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含與SEQ ID NO: 27之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列。
於另一態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含重鏈可變區(VH CD28)，其包含選自由SEQ ID NO: 42、SEQ ID NO: 43、SEQ ID NO: 44、SEQ ID NO: 45、SEQ ID NO: 46、SEQ ID NO: 47、SEQ ID NO: 48、SEQ ID NO: 49、SEQ ID NO: 50及SEQ ID NO: 51組成之群之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含選自由SEQ ID NO: 27、SEQ ID NO: 52、SEQ ID NO: 53、SEQ ID NO: 54、SEQ ID NO: 55、SEQ ID NO: 56、SEQ ID NO: 57、SEQ ID NO: 58、SEQ ID NO: 59、SEQ ID NO: 60及SEQ ID NO: 61組成之群之胺基酸序列。
於另一態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含 (a)包含SEQ ID NO: 47之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 54之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (b)包含SEQ ID NO: 47之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (c)包含SEQ ID NO: 51之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 61之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (d)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 53之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (e)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 54之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (f)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 59之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (g)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (h)包含SEQ ID NO: 43之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (i)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 53之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (j)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 59之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (k)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)。
於一個特定態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含：包含SEQ ID NO: 47之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 54之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)。
於另一特定態樣中，提供超超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含：包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 53之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)。
於另一特定態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含：包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)。
於另一態樣中，提供如上文中所定義之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各為Fab片段。
於一個態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至腫瘤相關抗原之抗原結合域為能特異性結合至癌胚抗原(CEA)之抗原結合域。
於一個態樣中，提供如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至CEA之抗原結合域包含重鏈可變區(VH CEA)，其包含(i)包含SEQ ID NO: 127之胺基酸序列之CDR-H1，(ii)包含SEQ ID NO: 128之胺基酸序列之CDR-H2，及(iii)包含SEQ ID NO: 129之胺基酸序列之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CEA)，其包含(iv)包含SEQ ID NO: 130之胺基酸序列之CDR-L1，(v)包含SEQ ID NO: 131之胺基酸序列之CDR-L2，及(vi)包含SEQ ID NO: 132之胺基酸序列之CDR-L3。特定言之，該能特異性結合至CEA之抗原結合域包含重鏈可變區(VH CEA)，其包含與SEQ ID NO: 133之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL CEA)，其包含與SEQ ID NO: 134之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列。
於另一態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至腫瘤相關抗原之抗原結合域為能特異性結合至纖維母細胞活化蛋白(FAP)之抗原結合域。
於一個態樣中，提供如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至FAP之抗原結合域包含 (a)重鏈可變區(VH FAP)，其包含(i)包含SEQ ID NO: 12之胺基酸序列之CDR-H1，(ii)包含SEQ ID NO: 13之胺基酸序列之CDR-H2，及(iii)包含SEQ ID NO: 14之胺基酸序列之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL FAP)，其包含(iv)包含SEQ ID NO: 15之胺基酸序列之CDR-L1，(v)包含SEQ ID NO: 16之胺基酸序列之CDR-L2，及(vi)包含SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之CDR-L3，或 (b)重鏈可變區(VH FAP)，其包含(i)包含SEQ ID NO: 4之胺基酸序列之CDR-H1，(ii)包含SEQ ID NO: 5之胺基酸序列之CDR-H2，及(iii)包含SEQ ID NO: 6之胺基酸序列之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL FAP)，其包含(iv)包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列之CDR-L1，(v)包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列之CDR-L2，及(vi)包含SEQ ID NO: 9之胺基酸序列之CDR-L3。特定言之，該能特異性結合至FAP之抗原結合域包含重鏈可變區(VH FAP)，其包含(i)包含SEQ ID NO: 12之胺基酸序列之CDR-H1，(ii)包含SEQ ID NO: 13之胺基酸序列之CDR-H2，及(iii)包含SEQ ID NO: 14之胺基酸序列之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL FAP)，其包含(iv)包含SEQ ID NO: 15之胺基酸序列之CDR-L1，(v)包含SEQ ID NO: 16之胺基酸序列之CDR-L2，及(vi)包含SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之CDR-L3。
於一個態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至FAP之抗原結合域包含(a)包含與SEQ ID NO: 18之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列的重鏈可變區(VH FAP)，及包含與SEQ ID NO: 19之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列的輕鏈可變區(VL FAP)，或(b)包含與SEQ ID NO: 10之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列的重鏈可變區(VH FAP)，及包含與SEQ ID NO: 11之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列的輕鏈可變區(VL FAP)。特定言之，該能特異性結合至FAP之抗原結合域包含：包含SEQ ID NO: 18之胺基酸序列之重鏈可變區(VH FAP)及包含SEQ ID NO: 19之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL FAP)。
於另一態樣中，提供如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子，其包含 (a)抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之VH及VL域，其中該VH域經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端且其中該VL域經由肽連接子連接至該第二重鏈之C端。
於另一態樣中，提供如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子，其包含 (a) 抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之crossFab片段，其經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端。
於另一態樣中，提供如本文中所揭示之超促效CD28抗原結合分子，其包含 (a)抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之兩個crossFab片段，其中一個crossFab片段經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端且其中另一crossFab片段經由肽連接子連接至該第二重鏈之C端。
根據本發明之另一態樣，提供一或多種編碼本發明之抗體或雙特異性抗原結合分子之經分離多核苷酸。本發明進一步提供一或多種包含本發明之經分離多核苷酸之表現載體，及包含本發明之經分離多核苷酸或表現載體之宿主細胞。於一些態樣中，該宿主細胞為真核細胞，特定言之哺乳動物細胞。於另一態樣中，提供一種製備如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子之方法，其包括在適於該超促效CD28抗原結合分子表現之條件下培養本發明之宿主細胞。視情況，該方法亦包括回收該超促效CD28抗原結合分子。本發明亦包括藉由本發明方法製備之超促效CD28抗原結合分子。
本發明進一步提供醫藥組合物，其包含本發明之超促效CD28抗原結合分子及至少一種醫藥上可接受之賦形劑。於一個態樣中，該醫藥組合物係用於治療癌症。
本發明亦包括使用超促效CD28抗原結合分子及本發明之醫藥組合物之方法。於一個態樣中，本發明提供根據本發明之超促效CD28抗原結合分子或醫藥組合物，其用作藥劑。於一個態樣中，提供根據本發明之超促效CD28抗原結合分子或醫藥組合物，其用於治療疾病。於特定態樣中，該疾病為癌症。於另一態樣中，提供根據本發明之超促效CD28抗原結合分子或醫藥組合物，其用於治療癌症，其中該超促效CD28抗原結合分子與化療劑、放射療法及/或用於癌症免疫療法之其他藥劑組合投與。
亦提供根據本發明之超促效CD28抗原結合分子於製造用於治療疾病之藥劑中的用途；以及一種治療個體之疾病之方法，其包括向該個體投與治療上有效量之根據本發明之超促效CD28抗原結合分子或呈醫藥上可接受形式之包含根據本發明之超促效CD28抗原結合分子之組合物。於特定態樣中，該疾病為癌症。於另一態樣中，提供根據本發明之超促效CD28抗原結合分子於製造用於治療疾病之藥劑中的用途，其中該治療包括與化療劑、放射療法及/或用於癌症免疫療法之其他藥劑共同投與。於另一態樣中，提供一種治療個體之疾病之方法，其包括向該個體投與治療上有效量之根據本發明之超促效CD28抗原結合分子或呈醫藥上可接受形式之包含根據本發明之超促效CD28抗原結合分子之組合物，其中該方法包括與化療劑、放射療法及/或用於癌症免疫療法之其他藥劑共同投與。亦提供一種抑制個體之腫瘤細胞生長之方法，其包括向該個體投與有效量之根據本發明之超促效CD28抗原結合分子，或呈醫藥上可接受形式之包含根據本發明之超促效CD28抗原結合分子之組合物以抑制腫瘤細胞之生長。於以上態樣中之任一者中，較佳地該個體為哺乳動物，特定言之人類。
定義 除非另有指定，否則本文中所用之技術及科學術語具有與本發明所屬之技術領域中一般所用相同的含義。出於解釋本說明書之目的，下列定義將適用及在適宜時，以單數使用之術語亦將包含複數及反之亦然。
如本文中所用，術語「抗原結合分子 」廣義上係指特異性結合抗原決定基之分子。抗原結合分子之實例為抗體、多特異性抗體(例如，雙特異性抗體)、抗體片段及支架抗原結合蛋白。
如本文中所用，術語「結合至腫瘤相關抗原之抗原結合域 」或「能特異性結合至腫瘤相關抗原之部分」係指特異性結合至抗原決定基之多肽分子。於一個態樣中，該抗原結合域能活化通過其靶細胞抗原之信號傳導。於特定態樣中，該抗原結合域能引導其所連接之實體(例如CD28超促效劑)至靶位點，例如，至含有該抗原決定基之特定類型之腫瘤細胞或腫瘤基質。能特異性結合至靶細胞抗原之抗原結合域包含如本文中進一步定義之抗體及其片段。此外，能特異性結合至靶細胞抗原之抗原結合域包含如本文中進一步定義之支架抗原結合蛋白，例如，基於經設計之重複蛋白或經設計之重複域之結合域(參見例如WO 2002/020565)。
與抗原結合分子(即，抗體或其片段)相關，術語「結合至靶細胞抗原之抗原結合域」係指包含特異性結合至抗原之部分或所有且與抗原之部分或所有互補之區域之分子的部分。可例如藉由一或多個抗體可變域(亦稱作抗體可變區)提供能特異性抗原結合之抗原結合域。特定言之，能特異性抗原結合之抗原結合域包含抗體輕鏈可變區(VL)及抗體重鏈可變區(VH)。於另一態樣中，「能特異性結合至靶細胞抗原之抗原結合域」亦可為Fab片段或crossFab片段。
本文中術語「抗體 」係以廣義使用且包含各種抗體結構，包括(但不限於)單株抗體、多株抗體、單特異性及多特異性抗體(例如雙特異性抗體)及抗體片段，只要其展示所需抗原結合活性。
如本文中所用，術語「單株抗體 」係指獲自實質上同源抗體之群體之抗體，即，該群體包含之個別抗體係相同及/或結合相同抗原決定基，除了可能變異體抗體(例如，含有天然產生之突變或在單株抗體製劑之製備期間產生)，此等變異體一般以最小量存在。與通常包含針對不同決定基(抗原決定基)之不同抗體之多株抗體製劑相反，單株抗體製劑之各單株抗體係針對抗原上之單個決定基。
如本文中所用，術語「單特異性 」抗體表示具有一或多個結合位點之抗體，該等結合位點各結合至相同抗原之相同抗原決定基。術語「雙特異性 」意指抗原結合分子能特異性結合至至少兩個獨特抗原決定基。通常，雙特異性抗原結合分子包含兩個抗原結合位點，該等結合位點各針對不同抗原決定基具特異性。於某些實施例中，該雙特異性抗原結合分子能同時結合兩個抗原決定基，特定言之在兩個獨特細胞上或在相同細胞上表現之兩個抗原決定基。
如本申請案中所用，術語「價 」表示針對一個獨特抗原決定基具特異性之抗原結合分子中之針對一個獨特抗原決定基具特異性之特定數目之結合位點的存在。因而，術語「二價」、「四價」及「六價」各自表示抗原結合分子中之針對某個抗原決定基特異性之兩個結合位點、四個結合位點及六個結合位點。於本發明之特定態樣中，根據本發明之雙特異性抗原結合分子可針對某個抗原決定基係一價，意指其針對該抗原決定基僅具有一個結合位點，或針對某個抗原決定基係二價或四價，意指其針對該抗原決定基具有兩個結合位點或四個結合位點。
本文中可交換使用術語「全長抗體」、「完整抗體」及「全抗體」係指具有實質上類似於初始抗體結構之結構之抗體。「初始抗體 」係指具有變化結構之天然產生之免疫球蛋白分子。例如，初始IgG類抗體為由二硫鍵鍵結之兩條輕鏈及兩條重鏈組成之約150,000道爾頓之異四聚醣蛋白。自N端至C端，各重鏈具有可變區(VH)，亦稱作可變重域或重鏈可變域，接著三個恆定域(CH1、CH2及CH3)，亦稱作重鏈恆定區。類似地，自N端至C端，各輕鏈具有可變區(VL)，亦稱作可變輕域或輕鏈可變域，接著輕鏈恆定域(CL)，亦稱作輕鏈恆定區。可將抗體之重鏈分配為五種類型(稱作α (IgA)、δ (IgD)、ε (IgE)、γ (IgG)或μ (IgM))中之一者，可將其中之一些進一步分成子類型，例如γ1 (IgG1)、γ2 (IgG2)、γ3 (IgG3)、γ4 (IgG4)、α1 (IgA1)及α2 (IgA2)。可將抗體之輕鏈分配成兩種類型(稱作κ及λ)中之一者，基於其恆定域之胺基酸序列。
「抗體片段 」係指除了完整抗體外之分子，其包含完整抗體之會結合完整抗體所結合之抗原的一部分。抗體片段之實例包括(但不限於) Fv、Fab、Fab'、Fab’-SH、F(ab')2 ；二抗體、三抗體、四抗體、crossFab片段；直鏈抗體；單鏈抗體分子(例如scFv)；及單域抗體。針對某些抗體片段之評論，參見Hudson等人，Nat Med 9, 129-134 (2003)。針對scFv片段之評論，參見例如Plückthun, The Pharmacology of Monoclonal Antibodies，第113卷，Rosenburg及Moore編輯，Springer-Verlag, New York，第269至315頁(1994)；亦參見WO 93/16185；及美國專利第5,571,894號及第5,587,458號。針對包含營救受體結合抗原決定基殘基且具有增加之活體內半衰期之Fab及F(ab')2片段之討論，參見美國專利第5,869,046號。二抗體為具有可係二價或雙特異性之兩個抗原結合位點之抗體片段，參見，例如，EP 404,097；WO 1993/01161；Hudson等人，Nat Med 9, 129-134 (2003)；及Hollinger等人，Proc Natl Acad Sci USA 90, 6444-6448 (1993)。三抗體及四抗體亦述於Hudson等人，Nat Med 9, 129-134 (2003)中。單域抗體為包含抗體之重鏈可變域之所有或一部分或輕鏈可變域之所有或一部分之抗體片段。於某些實施例中，單域抗體為人類單域抗體(Domantis, Inc., Waltham, MA；參見例如美國專利第6,248,516 B1號)。抗體片段可藉由各種技術製備，該等技術包括(但不限於)完整抗體之蛋白水解消化以及藉由重組宿主細胞(例如，大腸桿菌(E. coli)或噬菌體)製備，如本文中所述。
完整抗體之木瓜蛋白酶消化產生兩個相同抗原結合片段，稱作「Fab」片段，各含有重鏈及輕鏈可變域及亦輕鏈之恆定域及重鏈之第一恆定域(CH1)。因此，如本文中所用，術語「Fab 片段 」係指抗體片段，其包含輕鏈片段，該輕鏈片段包含輕鏈之可變輕鏈(VL)域及恆定域(CL)；及重鏈之可變重鏈(VH)域及第一恆定域(CH1)。Fab’片段與Fab片段不同之處在於在包含來自抗體鉸鏈區之一或多個半胱胺酸之重鏈CH1域之羧基端處添加少量殘基。Fab’-SH為Fab’片段，其中該等恆定域之該(該等)半胱胺酸殘基具有游離硫醇基。胃蛋白酶處理產生具有兩個抗原組合位點(兩個Fab片段)之F(ab')2 片段及Fc區之一部分。
術語「crossFab 片段 」或「xFab片段」或「交叉Fab片段」係指Fab片段，其中重鏈及輕鏈之可變區或恆定區經交換。交叉Fab分子之兩種不同鏈組成係可能且包含於本發明之雙特異性抗體中：一方面，Fab重鏈及輕鏈之可變區經交換，即，該交叉Fab分子包含由輕鏈可變(VL)域及重鏈恆定域(CH1)組成之肽鏈，及由重鏈可變域(VH)及輕鏈恆定域(CL)組成之肽鏈。亦將此交叉Fab分子稱作CrossFab(VLVH) 。另一方面，當Fab重鏈及輕鏈之恆定區經交換時，該交叉Fab分子包含由重鏈可變域(VH)及輕鏈恆定域(CL)組成之肽鏈，及由輕鏈可變域(VL)及重鏈恆定域(CH1)組成之肽鏈。亦將此交叉Fab分子稱作CrossFab(CLCH1) 。
「單鏈Fab片段」或「scFab 」為由抗體重鏈可變域(VH)、抗體恆定域1 (CH1)、抗體輕鏈可變域(VL)、抗體輕鏈恆定域(CL)及連接子組成之多肽，其中該等抗體域及該連接子具有以N端至C端方向之下列順序中之一者：a) VH-CH1-連接子-VL-CL，b) VL-CL-連接子-VH-CH1，c) VH-CL-連接子-VL-CH1或d) VL-CH1-連接子-VH-CL；且其中該連接子為至少30個胺基酸，較佳地32與50之間個胺基酸之多肽。該等單鏈Fab片段經由CL域與CH1域之間之天然二硫鍵穩定。此外，此等單鏈Fab分子可進一步藉由經由插入半胱胺酸殘基(例如可變重鏈之位置44及可變輕鏈之位置100，根據Kabat編號)產生鏈間二硫鍵來穩定。
「交叉單鏈Fab片段」或「x-scFab 」為由抗體重鏈可變域(VH)、抗體恆定域1 (CH1)、抗體輕鏈可變域(VL)、抗體輕鏈恆定域(CL)及連接子組成之多肽，其中該等抗體域及該連接子具有以N端至C端方向之下列順序中之一者：a) VH-CL-連接子-VL-CH1及b) VL-CH1-連接子-VH-CL；其中VH及VL一起形成特異性結合至抗原之抗原結合位點且其中該連接子為至少30個胺基酸之多肽。此外，此等x-scFab分子可進一步藉由經由插入半胱胺酸殘基(例如可變重鏈之位置44及可變輕鏈之位置100，根據Kabat編號)產生鏈間二硫鍵來穩定。
「單鏈可變片段(scFv )」為與10至約25個胺基酸之短連接子肽連接之抗體之重鏈(VH )及輕鏈(VL )之可變區的融合蛋白。該連接子通常富含甘胺酸用於可撓性，以及絲胺酸或蘇胺酸用於溶解性，且可將VH 之N端與VL 之C端連接或反之亦然。此蛋白質保留原始抗體之特異性，儘管移除恆定區及引入連接子。scFv抗體述於例如Houston, J.S., Methods in Enzymol. 203 (1991) 46-96中。此外，抗體片段包含單鏈多肽，該等單鏈多肽具有VH域之特徵，即，能與VL域一起組裝，或VL域之特徵，即，能與VH域一起組裝至功能抗原結合位點及從而提供全長抗體之抗原結合性質。
「支架抗原結合蛋白 」係此項技術中已知，例如，纖維連接蛋白(fibronectin)及經設計之錨蛋白(ankyrin)重複蛋白(DARPin)已經用作抗原結合域之替代支架，參見，例如，Gebauer及Skerra, Engineered protein scaffolds as next-generation antibody therapeutics. Curr Opin Chem Biol 13:245-255 (2009)及Stumpp等人，Darpins: A new generation of protein therapeutics. Drug Discovery Today 13: 695-701 (2008)。於本發明之一個態樣中，支架抗原結合蛋白係選自由以下組成之群：CTLA-4 (Evibody)、脂質運載蛋白(Lipocalin) (抗運載蛋白(Anticalin))、蛋白A衍化分子(諸如蛋白A之Z域(阿菲抗體(Affibody)))、A域(艾菲爾親和聚體(Avimer)/Maxibody)、血清轉鐵蛋白(反式體)；經設計之錨蛋白重複蛋白(DARPin)、抗體輕鏈或重鏈之可變域(單域抗體，sdAb)、抗體重鏈之可變域(奈米抗體，VH)、VNAR 片段、纖維連接蛋白(AdNectin)、C型凝集素域(四連接素(Tetranectin))；新穎抗原受體β-內醯胺酶之可變域(VNAR 片段)、人類γ-晶狀體蛋白(crystallin)或泛素(阿菲林(Affilin)分子)；人類蛋白酶抑制劑之kunitz型域、微抗體(諸如來自扭結菌素(knottin)家族之蛋白質)、肽適體及纖維連接蛋白(adnectin)。CTLA-4 (細胞毒性T淋巴細胞相關之抗原4)為主要在CD4+ T-細胞上表現之CD28家族受體。其細胞外域具有類可變域Ig折疊。對應於抗體之CDR之環可經異源序列取代以賦予不同結合性質。經工程改造以具有不同結合特異性之CTLA-4分子亦被稱作Evibody (例如US7166697B1)。Evibody係與抗體(例如域抗體)之分離可變區約相同大小。關於進一步細節，參見Journal of Immunological Methods 248 (1-2), 31-45 (2001)。脂質運載蛋白為轉運小疏水分子(諸如類固醇、後色膽素、類視色素及脂質)之細胞外蛋白質之家族。其具有在圓錐結構之開口端具有許多環之剛性β-片二級結構，其可經工程改造以結合至不同靶抗原。抗運載蛋白大小介於160至180個胺基酸之間，且衍生自脂質運載蛋白。關於進一步細節，參見Biochim Biophys Acta 1482: 337-350 (2000)、US7250297B1及US20070224633。Affibody為衍生自金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)之蛋白A之支架，其可經工程改造以結合至抗原。該域由約58個胺基酸之三螺旋束組成。庫已藉由表面殘基之隨機化產生。關於進一步細節，參見Protein Eng. Des. Sel. 2004, 17, 455-462及EP 1641818A1。艾菲爾親和聚體為衍生自A-域支架家族之多域蛋白。約35個胺基酸之初始域採取所定義之二硫鍵結構。多樣性藉由攪亂由A-域家族展示之天然變化產生。關於進一步細節，參見Nature Biotechnology 23(12), 1556 - 1561 (2005)及Expert Opinion on Investigational Drugs 16(6), 909-917 (2007年6月)。轉鐵蛋白為單體血清轉運醣蛋白。轉鐵蛋白可藉由於容許表面環中插入肽序列工程改造以結合不同靶抗原。經工程改造之轉鐵蛋白支架之實例包括反式體。針對進一步細節，參見J. Biol. Chem 274, 24066-24073 (1999)。經設計之錨蛋白重複蛋白(DARPin)係衍生自錨蛋白，該錨蛋白為介導整體膜蛋白連接至細胞骨架之蛋白質家族。單個錨蛋白重複為由兩個α-螺旋及一個β-回轉組成之33個殘基基序。其可藉由將各重複之第一α-螺旋及β-回轉中之殘基隨機化工程改造以結合不同靶抗原。其結合介面可藉由增加模組之數目(親和力成熟之方法)而增加。針對進一步細節，參見J. Mol. Biol. 332, 489-503 (2003), PNAS 100(4), 1700-1705 (2003)及J. Mol. Biol. 369, 1015-1028 (2007)及US20040132028A1。單域抗體為由單個單體可變抗體域組成之抗體片段。第一單域係衍生自駱駝科之抗體重鏈之可變域(奈米抗體或VH H片段)。此外，術語單域抗體包含自主人類重鏈可變域(aVH)或源自鯊魚之VNAR 片段。纖維連接蛋白為可經工程改造以結合至抗原之支架。Adnectin由人類纖維連接蛋白III型(FN3)之15個重複單元之第10域之天然胺基酸序列的骨架組成。β-夾層之一端處之三個環可經工程改造以使Adnectin能特異性識別所關注治療靶。關於進一步細節，參見Protein Eng. Des. Sel. 18, 435-444 (2005)；US 20080139791；WO 2005056764及US 6818418B1。肽適體為由恆定支架蛋白，通常硫氧還蛋白(thioredoxin) (TrxA)組成之組合識別分子，該恆定支架蛋白含有在活性位點處插入之受限可變肽環。關於進一步細節，參見Expert Opin. Biol. Ther. 5, 783-797 (2005)。微抗體係衍生自長度25至50個胺基酸之天然產生之微蛋白，其含有3至4個半胱胺酸橋-微蛋白之實例包括KalataBI及芋螺毒素(conotoxin)及扭結菌素。該等微蛋白具有環，該環可經工程改造以包含至多25個胺基酸而不影響微蛋白之整體折疊。關於經工程改造之扭結菌素域之進一步細節，參見WO2008098796。
與參考分子「結合至相同之抗原決定基之抗原結合分子 」係指於競爭分析中阻斷參考分子結合至其抗原50%或更多之抗原結合分子，及反之，該參考分子於競爭分析中阻斷該抗原結合分子結合至其抗原50%或更多。
術語「抗原結合域 」係指抗原結合分子之部分，其包含特異性結合至抗原之部分或全部且與之互補之區域。在抗原係大型的情況下，抗原結合分子僅可結合至抗原之特定部分，該部分被稱作抗原決定基。抗原結合域可藉由例如一或多個可變域(亦稱作可變區)提供。較佳地，抗原結合域包含抗體輕鏈可變域(VL)及抗體重鏈可變域(VH)。
如本文中所用，術語「抗原決定基 」係與「抗原」及「抗原決定基」同義且係指抗原結合部分結合之多肽大分子上之位點(例如胺基酸之鄰近延伸或由非鄰近胺基酸之不同區組成之構象排列)，形成抗原結合部分-抗原複合體。可例如在腫瘤細胞表面，在病毒感染細胞表面，在其他患病細胞表面，在不含血清之免疫細胞表面，及/或在細胞外基質(ECM)中發現有用抗原決定基。除非另有指定，否則本文中可用作抗原之蛋白質可為來自任何脊椎動物來源(包括哺乳動物，諸如靈長類動物(例如人類)及齧齒動物(例如小鼠及大鼠))之蛋白質之任何初始形式。於特定實施例中，該抗原為人類蛋白質。在參考本文中特定蛋白質之情況下，該術語包含「全長」未經處理之蛋白質以及由細胞中處理產生之蛋白質之任何形式。該術語亦包含蛋白質之天然產生之變異體，例如剪接變異體或對偶基因變異體。
「特異性結合 」意指該結合針對抗原係選擇性且可區別於非所需或非特異性相互作用。抗原結合分子結合至特定抗原之能力可通過酶聯免疫吸附分析 (ELISA)或為熟習此項技術者熟悉的其他技術，例如表面電漿子共振(SPR)技術(在BIAcore儀器上分析) (Liljeblad等人，Glyco J 17, 323-329 (2000))及傳統結合分析(Heeley, Endocr Res 28, 217-229 (2002))量測。於一個實施例中，抗原結合分子與不相關蛋白質之結合程度係小於該抗原結合分子與抗原之結合之約10%，如例如藉由SPR所量測。於某些實施例中，結合至抗原之分子具有≤ 1 μM、≤ 100 nM、≤ 10 nM、≤ 1 nM、≤ 0.1 nM、≤ 0.01 nM或≤ 0.001 nM (例如10-8 M或更少，例如10-8 M至10-13 M，例如10-9 M至10-13 M)之解離常數(Kd)。
「親和力 」或「結合親和力」係指分子(例如抗體)之單一結合位點與其結合搭檔(例如抗原)之間之非共價相互作用之加總的強度。如本文中所用，除非另有指定，否則「結合親和力」係指內在結合親和力，其反映結合對(例如抗體及抗原)之成員之間的1:1相互作用。一般可將分子X對其搭檔Y之親和力表示為解離常數(Kd)，其為解離及締合速率常數(各自為koff及kon)之比率。因此，相等親和力可包括不同速率常數，只要速率常數之比率保持相同。親和力可藉由此項技術中已知之常見方法(包括本文中所述彼等)量測。用於量測親和力之特定方法為表面電漿子共振(SPR)。
如本文中所用，「腫瘤相關抗原 」或TAA係指在靶細胞(例如，腫瘤細胞，諸如癌細胞或腫瘤基質細胞)表面上呈遞之抗原決定基。於某些態樣中，該靶細胞抗原為腫瘤細胞表面上之抗原。於一個態樣中，TAA係選自由以下組成之群：纖維母細胞活化蛋白(FAP)、癌胚抗原(CEA)、葉酸受體α (FolR1)、黑色素瘤相關之硫酸軟骨素蛋白多醣(MCSP)、表皮生長因子受體(EGFR)、人類表皮生長因子受體2 (HER2)及p95HER2。特定言之，該腫瘤相關抗原為纖維母細胞活化蛋白(FAP)或癌胚抗原(CEA)。另外TAA包括HER3、EpCAM、TPBG (5T4)、間皮素、MUC1及PSMA。TAA亦包括B細胞表面抗原，諸如CD19、CD20及CD79b。此外，亦可包含與多發性骨髓瘤相關之TAA GPRC5D、BCMA及CD38。
除非另有指定，否則術語「纖維母細胞活化蛋白 (FAP) 」亦稱作脯胺醯基內肽酶FAP或Seprase (EC 3.4.21)係指來自任何脊椎動物來源(包括哺乳動物，諸如靈長類動物(例如人類)、非人類靈長類動物(例如食蟹獼猴)及齧齒動物(例如小鼠及大鼠))之任何初始FAP。該術語包含「全長」未經處理之FAP以及由細胞中處理產生之FAP之任何形式。該術語亦包含FAP之天然產生之變異體，例如剪接變異體或對偶基因變異體。於一個實施例中，本發明之抗原結合分子能特異性結合至人類、小鼠及/或食蟹獼猴FAP。人類FAP之胺基酸序列示於UniProt (www.uniprot.org)寄存編號Q12884 (版本149，SEQ ID NO: 2)或NCBI (www.ncbi.nlm.nih.gov/) RefSeq NP_004451.2中。人類FAP之細胞外域(ECD)自胺基酸位置26延伸至760。His標記之人類FAP ECD之胺基酸序列示於SEQ ID NO: 135中。小鼠FAP之胺基酸序列示於UniProt寄存編號P97321 (版本126，SEQ ID NO: 136)或NCBI RefSeq NP_032012.1中。小鼠FAP之細胞外域(ECD)自胺基酸位置26延伸至761。SEQ ID NO: 137顯示His標記之小鼠FAP ECD之胺基酸序列。SEQ ID NO 138顯示His標記之食蟹獼猴FAP ECD之胺基酸序列。較佳地，本發明之抗FAP結合分子結合至FAP之細胞外域。
除非另有指定，否則術語「癌胚抗原 (CEA) 」亦稱作癌胚抗原相關之細胞黏著分子5 (CEACAM5)係指來自任何脊椎動物來源(包括哺乳動物，諸如靈長類動物(例如人類)、非人類靈長類動物(例如食蟹獼猴)及齧齒動物(例如小鼠及大鼠))之任何初始CEA。人類CEA之胺基酸序列示於UniProt寄存編號P06731 (版本151，SEQ ID NO: 3)中。CEA早已經識別為腫瘤相關抗原(Gold及Freedman, J Exp Med., 121:439-462, 1965；Berinstein N. L.、J Clin Oncol.，20:2197-2207, 2002)。最初被歸類為僅於胎兒組織中表現之蛋白質，CEA現已於若干正常成人組織中經識別。此等組織主要起源於上皮，包括胃腸道、呼吸道及泌尿生殖道之細胞，及結腸、子宮頸、汗腺及前列腺之細胞(Nap等人，Tumour Biol., 9(2-3):145-53, 1988；Nap等人，Cancer Res., 52(8):2329-23339, 1992)。上皮源之腫瘤以及其轉移酶含有作為腫瘤相關抗原之CEA。雖然CEA自身之存在不指示轉形至癌細胞，但是CEA之分佈係指示性。於正常組織中，CEA一般在細胞之頂端表面上表現(Hammarström S., Semin Cancer Biol. 9(2):67-81 (1999))，使其不可接近血流中之抗體。與正常組織相反，CEA傾向於在癌細胞之整個表面上表現(Hammarström S., Semin Cancer Biol. 9(2):67-81 (1999))。表現模式之此變化使CEA可接近癌細胞中之抗體結合。此外，CEA表現於癌細胞中增加。此外，增加之CEA表現促進增加之細胞間黏著，其可導致轉移(Marshall J., Semin Oncol., 30(增刊8):30-6, 2003)。各種腫瘤實體中之CEA表現之盛行率一般係極高的。根據公開之資料，於組織樣品中進行之自己的分析證實其高的盛行率，其中於結腸直腸癌(CRC)中約95%，於胰臟癌中90%，於胃癌中80%，於非小細胞肺癌(NSCLC，其中其與HER3共同表現)中60%，及於乳癌中40%；於小細胞肺癌及膠質母細胞瘤中發現低的表現。
CEA容易自細胞表面裂解及自腫瘤直接或經由淋巴系統流入血流中。因為此性質，已將血清CEA之含量用作診斷癌症及篩選癌症(特定言之結腸直腸癌)復發之臨床標誌(Goldenberg D M., The International Journal of Biological Markers, 7:183-188, 1992；Chau I.等人，J Clin Oncol., 22:1420-1429, 2004；Flamini等人，Clin Cancer Res; 12(23):6985-6988, 2006)。
術語「FolR1 」係指葉酸受體α及已經識別為許多癌症之潛在預後及治療靶。除非另有指定，否則其係指來自任何脊椎動物來源(包括哺乳動物，諸如靈長類動物(例如人類)、非人類靈長類動物(例如食蟹獼猴)及齧齒動物(例如小鼠及大鼠))之任何初始FolR1。人類FolR1之胺基酸序列示於UniProt寄存編號P15328 (SEQ ID NO: 139)中，鼠科FolR1具有UniProt寄存編號P35846 (SEQ ID NO: 140)之胺基酸序列及食蟹獼猴FolR1具有如UniProt寄存編號G7PR14 (SEQ ID NO: 141)中所示之胺基酸序列。FolR1為在細胞之質膜上表現之N-糖基化蛋白。FolR1具有對葉酸及對若干減少之葉酸衍生物之高的親和力且介導生理葉酸5-甲基四氫葉酸至細胞內部的遞送。FOLR1為指向FOLR1之癌症療法之所需靶，因為其在絕大多數卵巢癌中，以及於許多子宮癌、子宮內膜癌、胰臟癌、腎癌、肺癌及乳癌中過度表現，而FOLR1在正常組織上之表現受限於腎近端小管、肺之肺泡細胞、膀胱、睾丸、脈絡叢及甲狀腺中之上皮細胞之頂膜。最近研究已識別，FolR1表現於三陰性乳癌中係特別高(Necela等人，PloS One 2015, 10(3), e0127133)。
除非另有指定，否則術語「黑色素瘤相關之硫酸軟骨素蛋白多醣 (MCSP) 」亦稱作硫酸軟骨素蛋白多醣4 (CSPG4)係指來自任何脊椎動物來源(包括哺乳動物，諸如靈長類動物(例如人類)、非人類靈長類動物(例如食蟹獼猴)及齧齒動物(例如小鼠及大鼠))之任何初始MCSP。人類MCSP之胺基酸序列示於UniProt寄存編號Q6UVK1 (版本103，SEQ ID NO: 142)中。MCSP為高度糖基化之整合膜硫酸軟骨素蛋白多醣，其由N-連接之280 kDa醣蛋白組分及在細胞膜上表現之450-kDa硫酸軟骨素蛋白多醣組分組成(Ross等人，Arch. Biochem. Biophys. 1983, 225:370-38)。MCSP於許多正常及轉形細胞中更廣泛分佈。特定言之，MCSP見於表皮之幾乎所有基底細胞中。MCSP於黑色素瘤細胞中差別表現，且發現其於超過90%之所分析之良性痣及黑色素瘤病變中表現。亦已發現MCSP於非黑色素細胞源之腫瘤(包括基底細胞癌)、神經脊源之各種腫瘤及於乳癌中表現。
除非另有指定，否則術語「表皮生長因子受體 (EGFR) 」亦稱作原癌基因c-ErbB-1或受體酪胺酸-蛋白激酶erbB-1係指來自任何脊椎動物來源(包括哺乳動物，諸如靈長類動物(例如人類)、非人類靈長類動物(例如食蟹獼猴)及齧齒動物(例如小鼠及大鼠))之任何初始EGFR。人類EGFR之胺基酸序列示於UniProt寄存編號P00533 (版本211，SEQ ID NO: 143)中。原癌基因「HER2 」 (人類表皮生長因子受體2)編碼與人類表皮生長因子受體相關及稍微同源之蛋白酪胺酸激酶(p185HER2)。HER2於該領域中亦被稱作c-erbB-2，有時被稱作大鼠同源物neu。HER2之擴增及/或過度表現係與多發性人類惡性腫瘤相關且似乎完整涉及25至30%之人類乳癌及卵巢癌之進展。此外，擴增程度係與觀察到之患者生存時間中值逆相關(Slamon, D. J.等人，Science 244:707-712 (1989))。人類HER2之胺基酸序列示於UniProt寄存編號P04626 (版本230，SEQ ID NO: 144)中。如本文中所用，術語「p95HER2 」係指HER2受體蛋白之羧基端片段(CTF)，其亦被稱作「611-CTF」或「100-115 kDa p95HER2」。p95HER2片段於細胞中通過啟動全長HER2分子之密碼子位置611處之HER2 mRNA之轉譯而產生(Anido等人，EMBO J 25; 3234-44 (2006))。其具有100至115 kDa之分子量且在細胞膜上表現，其中其可形成藉由分子間二硫鍵維持之同二聚體(Pedersen等人，Mol Cell Biol 29, 3319-31 (2009))。於SEQ ID NO: 145中提供人類p95HER2之示例性序列。
除非另有指定，否則術語「CD28 」 (分化簇28，Tp44)係指來自任何脊椎動物來源(包括哺乳動物，諸如靈長類動物(例如人類)、非人類靈長類動物(例如食蟹獼猴)及齧齒動物(例如小鼠及大鼠))之任何CD28蛋白。CD28在T細胞上表現且提供T細胞活化及生存所需之共刺激信號。除了T-細胞受體(TCR)外通過CD28之T細胞刺激可提供用於產生各種介白素之強效信號。CD28為CD80 (B7.1)及CD86 (B7.2)蛋白之受體且為在初始T細胞上構成表現之唯一B7受體。人類CD28之胺基酸序列示於UniProt (www.uniprot.org)寄存編號P10747 (SEQ ID NO: 1)中。
「促效抗體 」係指包含針對給定受體之促效功能之抗體。一般而言，當促效配位體(因子)結合至受體時，該受體蛋白之三級結構改變，及該受體經活化(當該受體為膜蛋白時，通常轉導細胞生長信號或此類)。若該受體為二聚體形成型，則促效抗體可將該受體以適宜距離及角度二聚化，因此類似作用於配位體。適宜抗受體抗體可模擬藉由配位體進行之受體之二聚化，及因此可變成促效抗體。
「CD28 促效抗原結合分子」 或「CD28習知促效抗原結合分子」為模擬CD28天然配位體(CD80或CD86)之抗原結合分子，其作用為在T細胞受體信號(「信號2」)之存在下增強T細胞活化。T細胞需要兩個信號以被完全活化。在生理條件下，「信號1」產生於T細胞受體(TCR)分子與抗原呈遞細胞(APC)上之肽/主要組織相容性複合體(MHC)之相互作用及「信號2」藉由接合共刺激受體(例如CD28)提供。CD28促效抗原結合分子能共刺激T細胞(信號2)。其與具有對TCR複合體特異性之分子組合亦可誘導T細胞增殖及細胞激素分泌，然而CD28促效抗原結合分子在無TCR之另外刺激下不能完全活化T細胞。然而，存在CD28特異性抗原結合分子之子類，所謂CD28超促效抗原結合分子。「CD28 超促效抗原結合分子 」為CD28抗原結合分子，其在無TCR之另外刺激下能完全活化T細胞。通常將超促效劑定義為能產生大於內源促效劑(配位體)對靶受體之最大反應，及因此具有超過100%之功效的促效劑，然而與CD28相關，CD28超促效抗原結合分子意指在無先前T細胞活化(信號1)下能誘導T細胞增殖及細胞激素分泌之CD28抗原結合分子。
術語「可變域 」或「可變區」係指涉及抗原結合分子結合至抗原之抗體重鏈或輕鏈之域。初始抗體之重鏈及輕鏈之可變域(各自為VH及VL)一般具有相似結構，其中各域包含四個保守框架區(FR)及三個高可變區(HVR)。參見，例如，Kindt等人，Kuby Immunology，第6版，W.H. Freeman and Co.，第91頁(2007)。單個VH或VL域可足以賦予抗原結合特異性。
如本文中所用，術語「高可變區」或「HVR」係指抗原結合可變域之區各者，該等區序列係高度可變且其決定抗原結合特異性，例如「互補決定區」 (「CDR」)。一般而言，抗原結合域包含六個CDR：於VH中三個(CDR-H1、CDR-H2、CDR-H3)，及於VL中三個(CDR-L1、CDR-L2、CDR-L3)。本文中示例性CDR包含： (a)在胺基酸殘基26-32 (L1)、50-52 (L2)、91-96 (L3)、26-32 (H1)、53-55 (H2)及96-101 (H3)處出現之高可變環(Chothia及Lesk，J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987))； (b)在胺基酸殘基24-34 (L1)、50-56 (L2)、89-97 (L3)、31-35b (H1)、50-65 (H2)及95-102 (H3)處出現之CDR (Kabat等人，Sequences of Proteins of Immunological Interest ，第5版，Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991))；及 (c)在胺基酸殘基27c-36 (L1), 46-55 (L2), 89-96 (L3), 30-35b (H1), 47-58 (H2)及93-101 (H3)處出現之抗原接觸(MacCallum等人，J. Mol. Biol. 262: 732-745 (1996))。
除非另有指定，否則根據Kabat等人，見上確定CDR。熟習此項技術者將瞭解，CDR指定亦可根據Chothia，見上，McCallum，見上或其他科學上接受之命名法確定。Kabat等人亦定義可適用於任何抗體之可變區序列之編號系統。一般技術者可將此「Kabat編號」系統明確地分配給任何可變區序列，而不依賴於超出序列本身之任何實驗數據。如本文中所用，「Kabat編號」係指藉由Kabat等人，U.S. Dept. of Health and Human Services, 「Sequence of Proteins of Immunological Interest」 (1983)闡述之編號系統。除非另有指定，否則抗體可變區之特定胺基酸殘基位置之編號的參考係根據Kabat編號系統。
如本文中所用，於抗原結合分子(例如抗體)之情況下，術語「親和力成熟 」係指例如藉由突變衍生自參考抗原結合分子之抗原結合分子，結合至與參考抗體相同抗原，較佳地結合至相同抗原決定基；且具有較參考抗原結合分子更高對抗原之親和力。親和力成熟一般涉及抗原結合分子之一或多個CDR中之一或多個胺基酸殘基的修飾。通常，親和力成熟抗原結合分子結合至與初始參考抗原結合分子相同的抗原決定基。
「框架 」或「FR」係指除了高可變區(HVR)殘基外之可變域殘基。可變域之FR一般由四個FR域：FR1、FR2、FR3及FR4組成。因此，HVR及FR序列一般出現於VH (或VL)之下列序列中：FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4。
出於本文之目的，「受體人類框架 」為衍生自人類免疫球蛋白框架或人類共有框架之包含輕鏈可變域(VL)框架或重鏈可變域(VH)框架之胺基酸序列的框架，如下所定義。「衍生自」人類免疫球蛋白框架或人類共有框架之受體人類框架可包含其相同胺基酸序列，或其可含有胺基酸序列變化。於一些實施例中，胺基酸變化之數目為10或更少、9或更少、8或更少、7或更少、6或更少、5或更少、4或更少、3或更少、或2或更少。於一些實施例中，該VL受體人類框架序列係與VL人類免疫球蛋白框架序列或人類共有框架序列相同。
術語「嵌合 」抗體係指抗體，其中該重鏈及/或輕鏈之一部分係源自特定來源或物種，而該重鏈及/或輕鏈之其餘部分係源自不同來源或物種。
抗體之「類別 」係指其重鏈所具有之恆定域或恆定區之類型。存在五種主要類別之抗體：IgA、IgD、IgE、IgG及IgM，及可將此等中之若干進一步分成子類(同型)，例如 IgG1 、IgG2 、gG3 、IgG4 、IgA1 及IgA2 。將對應於不同類別之免疫球蛋白之重鏈恆定域各自稱作α、δ、ε、γ及μ。
「人源化 」抗體係指包含來自非人類HVR之胺基酸殘基及來自人類FR之胺基酸殘基之嵌合抗體。於某些實施例中，人源化抗體將包含至少一個，及通常兩個可變域之實質上所有，其中該等HVR (例如CDR)之所有或實質上所有對應於非人類抗體之彼等，及該等FR之所有或實質上所有對應於人類抗體之彼等。人源化抗體視情況可包含源自人類抗體之抗體恆定區之至少一部分。抗體(例如非人類抗體)之「人源化形式 」係指經歷人源化之抗體。本發明包含之「人源化抗體 」之其他形式為其中恆定區已自原始抗體另外修飾或改變以產生根據本發明之性質，尤其關於C1q結合及/或Fc受體(FcR)結合之彼等。
「人類 」抗體為具有對應於藉由人類或人類細胞產生或源自非人類來源之抗體之胺基酸序列者，該非人類來源利用人類抗體庫或其他人類抗體編碼序列。人類抗體之此定義明確排除包含非人類抗原結合殘基之人源化抗體。
本文中術語「Fc 域 」或「Fc區」係用於定義含有恆定區之至少一部分之抗體重鏈之C端區。該術語包含初始序列Fc區及變異體Fc區。IgG Fc區包含IgG CH2及IgG CH3域。人類IgG Fc區之「CH2域」通常自約位置231處之胺基酸殘基延伸至約位置340處之胺基酸殘基。於一個實施例中，碳水化合物鏈係連接至CH2域。本文中CH2域可為初始序列CH2域或變異體CH2域。「CH3域」包含Fc區中之殘基C端至CH2域之延伸(即，自約IgG之位置341處之胺基酸殘基至約位置447處之胺基酸殘基)。本文中CH3區可為初始序列CH3域或變異體CH3域(例如，具有於其一條鏈中引入之「隆凸」(「隆突」)及於其另一條鏈中對應引入之「腔」 (「穴」)之CH3域；參見美國專利第5,821,333號，其係以引用的方式明確地併入本文中)。此等變異體CH3域可用於促進兩個非相同抗體重鏈之異二聚化，如本文中所述。於一個實施例中，人類IgG重鏈Fc區自Cys226或自Pro230延伸至該重鏈之羧基端。然而，Fc區之C端離胺酸(Lys447)可存在或可不存在。除非本文中另有指定，否則Fc區或恆定區中之胺基酸殘基之編號係根據EU編號系統，亦稱作EU索引，如Kabat等人，Sequences of Proteins of Immunological Interest，第5版，Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1991中所述。
「隆突入穴 」技術係述於例如US 5,731,168；US 7,695,936；Ridgway等人，Prot Eng 9, 617-621 (1996)及Carter, J Immunol Meth 248, 7-15 (2001)中。一般而言，該方法涉及在第一多肽之介面處引入隆凸(「隆突」)及在第二多肽之介面中引入對應腔(「穴」)，使得該隆凸可位於該腔中以便促進異二聚體形成及阻止同二聚體形成。隆凸係藉由用更大側鏈(例如酪胺酸或色胺酸)取代來自第一多肽之介面之小的胺基酸側鏈來構築。與隆凸相同或相似大小之互補腔係於第二多肽之介面中藉由用更小者(例如丙胺酸或蘇胺酸)取代大的胺基酸側鏈來創建。該等隆凸及腔可藉由改變編碼多肽之核酸，例如藉由位點特異性誘變或藉由肽合成來製備。於特定實施例中，隆突修飾包含Fc域之兩個亞單元中之一者的胺基酸取代T366W，及穴修飾包含Fc域之兩個亞單元中之另一者的胺基酸取代T366S、L368A及Y407V。於另一特定實施例中，包含隆突修飾之Fc域之亞單元另外包含胺基酸取代S354C，及包含穴修飾之Fc域之亞單元另外包含胺基酸取代Y349C。此等兩個半胱胺酸殘基之引入導致Fc區之兩個亞單元之間之二硫鍵橋的形成，因此進一步使二聚體穩定(Carter, J Immunol Methods 248, 7-15 (2001))。
「等效於免疫球蛋白之Fc區之區」意欲包含免疫球蛋白之Fc區之天然產生之對偶基因變異體以及具有改變之變異體，該等改變產生取代、新增或缺失，但是不實質上減少免疫球蛋白介導效應功能(諸如抗體依賴性細胞毒性)之能力。例如，一或多個胺基酸可自免疫球蛋白之Fc區之N端或C端缺失而不實質上喪失生物功能。可根據此項技術中已知通則選擇此等變異體以便對活性具有最小影響(參見，例如，Bowie, J. U.等人，Science 247:1306-10 (1990))。
術語「效應功能 」係指可歸因於抗體之Fc區之彼等生物活性，其隨抗體同型變化。抗體效應功能之實例包括：C1q結合及補體依賴性細胞毒性(CDC)、Fc受體結合、抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)、抗體依賴性細胞吞噬作用(ADCP)、細胞激素分泌、免疫複合體介導之由抗原呈遞細胞之抗原攝取、細胞表面受體(例如B細胞受體)之下調及B細胞活化。
Fc受體結合依賴性效應功能可藉由抗體之Fc區與Fc受體(FcR)之相互作用介導，該等Fc受體為造血細胞上之專門細胞表面受體。Fc受體屬於免疫球蛋白超家族，且已顯示其介導抗體包被之病原體藉由免疫複合體之吞噬作用移除及用對應抗體包被之紅細胞及各種其他細胞靶(例如腫瘤細胞)經由抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)裂解二者(參見例如Van de Winkel, J.G.及Anderson, C.L., J. Leukoc. Biol. 49 (1991) 511-524)。FcR藉由其針對免疫球蛋白同型之特異性定義：將針對IgG抗體之Fc受體稱作FcγR。Fc受體結合述於例如Ravetch, J. V.及Kinet, J. P., Annu. Rev. Immunol. 9 (1991) 457-492；Capel, P.J.等人，Immunomethods 4 (1994) 25-34；de Haas, M.等人，J. Lab. Clin. Med. 126 (1995) 330-341；及Gessner, J.E.等人，Ann. Hematol. 76 (1998) 231-248中。
IgG抗體之Fc區受體(FcγR)之交聯觸發廣泛各種效應功能，包括吞噬作用、抗體依賴性細胞毒性、及發炎性介體之釋放，以及免疫複合體清除及抗體產生之調節。於人類中，已表徵三類FcγR，其為： - FcγRI (CD64)結合單體IgG，具有高親和力且在巨噬細胞、單核細胞、嗜中性白血球及嗜酸性白血球上表現。Fc區IgG至少在胺基酸殘基E233-G236、P238、D265、N297、A327及P329(根據Kabat之EU索引編號)中之一者處之修飾減少結合至FcγRI。位置233至236處之IgG2殘基取代成IgG1及IgG4，使結合至FcγRI減少了10³倍及消除對抗體敏感性紅血球之人類單核細胞反應(Armour, K.L.等人，Eur. J. Immunol. 29 (1999) 2613-2624)。 -FcγRII (CD32)結合複合之IgG，具有中度至低的親和力且廣泛表現。可將此受體分成兩種亞型，FcγRIIA及FcγRIIB。FcγRIIA見於涉及殺滅之許多細胞(例如巨噬細胞、單核細胞、嗜中性白血球)上且似乎能激活該殺滅過程。FcγRIIB似乎於抑制過程中起作用且見於B細胞、巨噬細胞及肥大細胞及嗜酸性白血球上。在B細胞上，其似乎功能為抑制另外免疫球蛋白產生及同型轉換成例如IgE類別。在巨噬細胞上，FcγRIIB作用為抑制如通過FcγRIIA介導之吞噬作用。在嗜酸性白血球及肥大細胞上，B-形式可幫助通過IgE結合至其分離受體抑制此等細胞之活化。例如針對包含具有至少在胺基酸殘基E233-G236、P238、D265、N297、A327、P329、D270、Q295、R292及K414 (根據Kabat之EU索引編號)中之一者處之突變之IgG Fc區之抗體，發現對FcγRIIA之減少之結合。 - FcγRIII (CD16)結合IgG，具有中度至低的親和力且存在為兩種類型。FcγRIIIA見於NK細胞、巨噬細胞、嗜酸性白血球及一些單核細胞及T細胞上且介導ADCC。FcγRIIIB係在嗜中性白血球上高度表現。例如針對包含具有至少在胺基酸殘基E233-G236、P238、D265、N297、A327、P329、D270、Q295、A327、S239、E269、E293、Y296、V303、K338及D376 (根據Kabat之EU索引編號)中之一者處之突變之IgG Fc區之抗體，發現對FcγRIIIA之減少之結合。
針對Fc受體之人類IgG1上之結合位點之定位(mapping)、上述突變位點及用於量測結合至FcγRI及FcγRIIA之方法述於Shields, R.L.等人，J. Biol. Chem. 276 (2001) 6591-6604中。
術語「ADCC 」或「抗體依賴性細胞毒性」為藉由免疫效應細胞導致抗體包被之靶細胞之溶解的免疫機制。該等靶細胞為包含Fc區之抗體或其衍生物特異性結合之細胞，一般經由為該Fc區之N端之蛋白質部分。如本文中所用，將術語「減少之ADCC」定義為藉由以上所定義之ADCC機制，於靶細胞周圍之介質中在給定抗體濃度下於給定時間中溶解之靶細胞之數目的減少，及/或達成藉由ADCC機制於給定時間中給定數目靶細胞之裂解所需之靶細胞周圍介質中之抗體濃度的增加。ADCC之減少係相對於藉由相同類型之宿主細胞使用相同標準製備、純化、調配及儲存方法(其為熟習此項技術者已知)產生之相同抗體介導之ADCC，但是該相同抗體未經工程改造。例如，藉由於其Fc域中包含減少ADCC之胺基酸取代之抗體介導之ADCC的減少係相對於藉由於該Fc域中無此胺基酸取代之相同抗體介導之ADCC。量測ADCC之適宜分析係此項技術中熟知(參見例如PCT公開案號WO 2006/082515或PCT公開案號WO 2012/130831)。例如，抗體誘導介導ADCC之初始步驟之能力係藉由量測其結合至Fcγ受體表現細胞，諸如重組表現FcγRI及/或FcγRIIA之細胞或NK細胞(基本上表現FcγRIIIA)來研究。特定言之，量測結合至NK細胞上之FcγR。
「活化 Fc 受體 」為Fc受體，其藉由抗體之Fc區之接合後引發刺激具有受體之細胞進行效應功能之信號傳導事件。活化Fc受體包括FcγRIIIa (CD16a)、FcγRI (CD64)、FcγRIIa (CD32)及FcαRI (CD89)。特定活化Fc受體為人類FcγRIIIa (參見UniProt寄存編號P08637，版本141)。
「外域 」為延伸至細胞外空間(即，靶細胞外部之空間)之膜蛋白之域。外域通常為開始與表面接觸之蛋白質之部分，其導致信號轉導。
術語「肽連接子 」係指包含一或多個胺基酸，通常約2至20個胺基酸之肽。肽連接子係此項技術中已知或本文中描述。適宜非免疫原性連接子肽為例如(G4 S)n 、(SG4 )n 或G4 (SG4 )n 肽連接子，其中「n」一般為1與5之間，通常2與4之間之數字，特定言之2，即，選自由以下組成之群之肽：GGGGS (SEQ ID NO: 146) GGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 147)、SGGGGSGGGG (SEQ ID NO: 148)及GGGGSGGGGSGGGG (SEQ ID NO: 149)，而且包含序列GSPGSSSSGS (SEQ ID NO: 150)、(G4S)3 (SEQ ID NO: 151)、(G4S)4 (SEQ ID NO: 152)、GSGSGSGS (SEQ ID NO: 153)、GSGSGNGS (SEQ ID NO: 154)、GGSGSGSG (SEQ ID NO: 155)、GGSGSG (SEQ ID NO: 156)、GGSG (SEQ ID NO: 157)、GGSGNGSG (SEQ ID NO: 158)、GGNGSGSG (SEQ ID NO: 159)及GGNGSG (SEQ ID NO: 160)。特別關注之肽連接子為(G4S) (SEQ ID NO: 146)、(G4 S)2 或GGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 147)、(G4S)3 (SEQ ID NO: 151)及(G4S)4 (SEQ ID NO: 152)。
如本申請案中所用，術語「胺基酸 」表示天然產生之羧基α-胺基酸之群，其包含丙胺酸(三字母代碼：ala，一字母代碼：A)、精胺酸(arg，R)、天冬醯胺(asn，N)、天冬胺酸(asp，D)、半胱胺酸(cys，C)、麩胺醯胺(gln，Q)、麩胺酸(glu，E)、甘胺酸 (gly，G)、組胺酸(his，H)、異白胺酸(ile，I)、白胺酸(leu，L)、離胺酸(lys，K)、甲硫胺酸(met，M)、苯丙胺酸(phe，F)、脯胺酸(pro，P)、絲胺酸(ser，S)、蘇胺酸(thr，T)、色胺酸(trp，W)、酪胺酸(tyr，Y)及纈胺酸(val，V)。
「融合」或「連接」意指組分(例如多肽及該TNF配位體家族成員之外域)藉由肽鍵直接連接或經由一或多個肽連接子連接。
將相對於參考多肽(蛋白質)序列之「胺基酸序列同一性百分比 (%) 」定義為於比對序列及引入空隙(若必要)以達成最大序列同一性百分比後，與參考多肽序列中之胺基酸殘基相同之候選序列中之胺基酸殘基的百分比，且不認為任何保守取代為序列同一性之部分。出於測定胺基酸序列同一性百分比之目的之比對可以此項技術中熟習的各種方式達成，例如，使用公共可得電腦軟體，諸如BLAST、BLAST-2、ALIGN. SAWI或Megalign (DNASTAR)軟體。熟習此項技術者可確定用於比對序列之適宜參數，包括達成對正在比較之序列之全長最大比對所需的任何演算法。然而，出於本文中之目的，使用序列比較電腦程式ALIGN-2產生胺基酸序列同一性%值。該ALIGN-2序列比較電腦程式由Genentech, Inc.編寫，且已於U.S. Copyright Office, Washington D.C., 20559中利用使用者文檔提交原始程式碼，其中將其在美國版權註冊編號TXU510087下註冊。該ALIGN-2程式自Genentech, Inc., South San Francisco, California公共可得，或可自原始程式碼編譯。應編譯該ALIGN-2程式用於在UNIX作業系統(包括數位UNIX V4.0D)上使用。所有序列比較參數藉由該ALIGN-2程式建立且不改變。於採用ALIGN-2用於胺基酸序列比較之情況下，給定胺基酸序列A與或針對給定胺基酸序列B之胺基酸序列同一性% (或者可將其敘述為給定胺基酸序列A，其具有或包含與或針對給定胺基酸序列B之某個胺基酸序列同一性%)係如下計算： 100乘以比率X/Y 其中X為於A及B之序列比對程式ALIGN-2之比對中，藉由該程式評分為相同配對之胺基酸殘基的數目，且其中Y為B中之胺基酸殘基之總數目。應瞭解，在胺基酸序列A之長度與胺基酸序列B之長度不相等之情況下，A對B之胺基酸序列同一性%將不等於B對A之胺基酸序列同一性%。除非另有明確指定，否則如先前段落中所述使用ALIGN-2電腦程式獲得本文中所用之所有胺基酸序列同一性%值。
於某些實施例中，涵蓋本文中所提供之CD28抗原結合分子之胺基酸序列變異體 。例如，可期望改善CD28抗原結合分子之結合親和力及/或其他生物性質。CD28抗原結合分子之胺基酸序列變異體可藉由引入適宜修飾至編碼該等分子之核苷酸序列中，或藉由肽合成來製備。此等修飾包括例如缺失及/或插入及/或取代抗體之胺基酸序列內之殘基。可作出缺失、插入及取代之任何組合以達成最終構築體，只要該最終構築體具有所需特性，例如抗原結合。針對取代誘變之所關注位點包括HVR及框架(FR)。在標題「較佳取代」下之表B中提供保守取代及以下參考胺基酸側鏈類別(1)至(6)進一步描述。可將胺基酸取代引入所關注分子及針對所需活性(例如，保留/改善之抗原結合、減少之免疫原性或改善之ADCC或CDC)篩選產物。表 A
原始殘基 示例性取代 較佳取代
Ala (A) Val、Leu、Ile Val
Arg (R) Lys、Gln、Asn Lys
Asn (N) Gln、His、Asp、Lys、Arg Gln
Asp (D) Glu、Asn Glu
Cys (C) Ser、Ala Ser
Gln (Q) Asn、Glu Asn
Glu (E) Asp、Gln Asp
Gly (G) Ala Ala
His (H) Asn、Gln、Lys、Arg Arg
Ile (I) Leu、Val、Met、Ala、Phe、正白胺酸 Leu
Leu (L) 正白胺酸、Ile、Val、Met、Ala、Phe Ile
Lys (K) Arg、Gln、Asn Arg
Met (M) Leu、Phe、Ile Leu
Phe (F) Trp、Leu、Val、Ile、Ala、Tyr Tyr
Pro (P) Ala Ala
Ser (S) Thr Thr
Thr (T) Val、Ser Ser
Trp (W) Tyr、Phe Tyr
Tyr (Y) Trp、Phe、Thr、Ser Phe
Val (V) Ile、Leu、Met、Phe、Ala、正白胺酸 Leu
可根據常見側鏈性質將胺基酸分組： (1)疏水性：正白胺酸、Met、Ala、Val、Leu、Ile； (2)中性親水性：Cys、Ser、Thr、Asn、Gln； (3)酸性：Asp、Glu； (4)鹼性：His、Lys、Arg； (5)影響鏈定向之殘基：Gly、Pro； (6)芳香性：Trp、Tyr、Phe。
非保守取代將包含將此等類別中之一者之成員交換為另一類別。
術語「胺基酸序列變異體 」包括實質變異體，其中於親本抗原結合分子(例如人源化或人類抗體)之一或多個高可變區殘基中存在胺基酸取代。一般而言，針對進一步研究所選之所得變異體將相對於親本抗原結合分子具有某些生物性質之修改(例如改善) (例如，增加之親和力、減少之免疫原性)及/或將實質上保留親本抗原結合分子之某些生物性質。示例性取代變異體為親和力成熟抗體，其可例如使用基於噬菌體呈現之親和力成熟技術(諸如本文中所述之彼等)方便地產生。簡言之，一或多個HVR殘基經突變及變異體抗原結合分子在噬菌體上呈現及針對特定生物活性(例如結合親和力)篩選。於某些實施例中，取代、插入或缺失可出現於一或多個HVR中，只要此等改變不實質上降低抗原結合分子結合抗原之能力。例如，可於HVR中作出不實質上減少結合親和力之保守改變(例如，如本文中所提供之保守取代)。用於識別可靶向用於誘變之抗體之殘基或區之有用方法稱作「丙胺酸掃描誘變」，如由Cunningham及Wells (1989)Science , 244:1081-1085所述。於此方法中，靶殘基(例如，帶電殘基，諸如Arg、Asp、His、Lys及Glu)之殘基或基團經識別及藉由中性或帶負電荷胺基酸(例如，丙胺酸或聚丙胺酸)取代以確定抗體與抗原之相互作用是否受影響。可在證實對初始取代功能敏感性之胺基酸位置處引入另外取代。或者或此外，抗原結合分子複合體之晶體結構識別抗體與抗原之間之接觸點。可作為取代之候選靶向或消除此等接觸殘基及相鄰殘基。可篩選變異體以確定其是否含有所需性質。
胺基酸序列插入包含長度範圍自一個殘基至含有上百或更多個殘基之多肽之胺基及/或羧基端融合，以及單個或多個胺基酸殘基之序列內插入。插入之實例包含CD28抗原結合分子融合至多肽之N端或C端，其增加該CD28抗原結合分子之血清半衰期。
於某些實施例中，改變本文中所提供之CD28抗原結合分子以增加或減少抗體經糖基化之程度。分子之糖基化變異體可藉由改變胺基酸序列使得一或多個糖基化位點經創建或移除而方便地獲得。在促效ICOS結合分子包含Fc域之情況下，可改變其上連接之碳水化合物。藉由哺乳動物細胞產生之初始抗體通常包含分支鏈雙觸角寡糖，其一般藉由N-鍵聯連接至Fc區之CH2域之Asn297。參見，例如，Wright等人，TIBTECH 15:26-32 (1997)。寡糖可包括各種碳水化合物，例如，甘露糖、N-乙醯基葡糖胺(GlcNAc)、半乳糖及矽鋁酸，以及連接至雙觸角寡糖結構之「幹」中之GlcNAc之海藻糖。於一些實施例中，可作出促效ICOS結合分子中之寡糖之修飾以創建具有某些改良性質之變異體。於一個態樣中，提供促效ICOS結合分子之變異體，其具有缺少連接(直接或間接)至Fc區之海藻糖之碳水化合物結構。此等海藻糖基化變異體可具有改善之ADCC功能，例如參見美國專利公開案號US 2003/0157108 (Presta, L.)或US 2004/0093621 (Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd)。本發明之CD28抗原結合分子之另外變異體包括具有等分寡糖之彼等，例如，其中連接至Fc區之二元寡糖藉由GlcNAc等分。此等變異體可具有減少之海藻糖基化及/或改善之ADCC功能，參見例如WO 2003/011878 (Jean-Mairet等人)；美國專利第6,602,684號(Umana等人)；及US 2005/0123546 (Umana等人)。亦提供於連接至Fc區之寡糖中具有至少一個半乳糖殘基之變異體。此等抗體變異體可具有改善之CDC功能及述於例如WO 1997/30087 (Patel等人)、WO 1998/58964 (Raju, S.)及WO 1999/22764 (Raju, S.)中。
於某些實施例中，可期望產生本發明之CD28抗原結合分子之經半胱胺酸工程改造之變異體 ，例如「硫代MAbs」，其中該分子之一或多個殘基經半胱胺酸殘基取代。於特定實施例中，該等經取代之殘基發生在分子之可接近位點。藉由用半胱胺酸取代該等殘基，反應性硫醇基團因此位於抗體之可接近位點及可用於使抗體結合至其他部分(諸如藥物部分或連接子-藥物部分)以產生免疫結合物。於某些實施例中，下列殘基中之任一者或多者可經半胱胺酸取代：輕鏈之V205 (Kabat編號)；重鏈之A118 (EU編號)；及重鏈Fc區之S400 (EU編號)。經半胱胺酸工程改造之抗原結合分子可如美國專利第7,521,541號中所述產生。
於某些態樣中，本文中所提供之CD28抗原結合分子可經進一步修飾以含有此項技術中已知及輕易可得之另外非蛋白質部分。適用於抗體衍化之部分包括(但不限於)水溶性聚合物。水溶性聚合物之非限制性實例包括(但不限於)聚乙二醇(PEG)、乙二醇/丙二醇共聚物、羧甲基纖維素、葡聚糖、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯啶酮、聚-1,3-二氧雜環戊烷、聚-1,3,6-三噁烷、乙烯/馬來酸酐共聚物、聚胺基酸(均聚物或無規共聚物)、及葡聚糖或聚(n-乙烯基吡咯啶酮)聚乙二醇、丙二醇均聚物、聚環氧丙烷/環氧乙烷共聚物、聚氧乙基化多元醇(例如甘油)、聚乙烯醇及其混合物。聚乙二醇丙醛可於製造中具有優點，由於其於水中之穩定性。該聚合物可係任何分子量，且可係分支或未分支。連接至抗體之聚合物之數目可變化，及若連接超過一種聚合物，則其可為相同或不同分子。一般而言，用於衍化之聚合物之數目及/或類型可基於考量包括(但不限於)欲改善之抗體之特定性質或功能、雙特異性抗體衍生物是否將用於限定條件下之療法中等決定。於另一態樣中，提供抗體及可藉由暴露於輻射選擇性加熱之非蛋白質部分之結合物。於一個實施例中，該非蛋白質部分為碳奈米管(Kam, N.W.等人，Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102 (2005) 11600-11605)。該輻射可係任何波長，且包括(但不限於)不損害普通細胞，但是將該非蛋白質部分加熱至殺滅接近該抗體-非蛋白質部分之細胞之溫度的波長。於另一態樣中，可獲得本文中所提供之CD28抗原結合分子之免疫結合物。「免疫結合物 」為抗體結合至一或多種異源分子，包括(但不限於)細胞毒性劑。
術語「多核苷酸」係指經分離之核酸分子或構築體，例如信使RNA (mRNA)、病毒衍生之RNA或質粒DNA (pDNA)。多核苷酸可包含習知磷酸二酯鍵或非習知鍵(例如醯胺鍵，諸如見於肽核酸(PNA)中)。術語「核酸分子」係指存在於多核苷酸中之任一或多個核酸片段，例如DNA或RNA片段。
意欲「經分離 」之核酸分子或多核苷酸為已自其初始環境移除之核酸分子、DNA或RNA。例如，出於本發明之目的，認為含於載體中之編碼多肽之重組多核苷酸經分離。經分離多核苷酸之另外實例包括維持於異源宿主細胞中之重組多核苷酸或溶液中之經純化(部分或實質上)多核苷酸。經分離多核苷酸包括含於細胞中之多核苷酸分子，該等細胞一般含有該多核苷酸分子，但是該多核苷酸分子染色體外或在不同於其天然染色體位置處之染色體位置處存在。經分離RNA分子包含本發明之活體內或活體外RNA轉錄子，以及正及負股形式，及雙股形式。根據本發明之經分離多核苷酸或核酸進一步包括合成產生之此等分子。此外，多核苷酸或核酸可為或可包含調控元件，諸如啟動子、核糖體結合位點或轉錄終止子。
具有與本發明之參考核苷酸序列至少例如95%「相同」之核苷酸序列之核酸或多核苷酸，意欲該多核苷酸之核苷酸序列與參考序列相同，除了該多核苷酸序列可包含至多5個點突變/該參考核苷酸序列之各100個核苷酸。換言之，為獲得具有與參考核苷酸序列至少95%相同之核苷酸序列之多核苷酸，參考序列之核苷酸之至多5%可缺失或經另一核苷酸取代，或可將參考序列之總核苷酸之至多5%數目核苷酸插入參考序列中。參考序列之此等改變可在參考核苷酸序列之5’或3’末端位置處或彼等末端位置之間之任何地方發生，該等位置個別散佈在參考序列之殘基中或參考序列內之一或多個鄰近基團中。作為實際情形，可使用已知電腦程式，諸如以上針對多肽討論者(例如ALIGN-2)按慣例來確定任何特定多核苷酸序列是否與本發明之核苷酸序列至少80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%或99%相同。
術語「表現盒 」係指具有一系列指定核酸元件之重組或合成產生之多核苷酸，該等核酸元件允許特定核酸於靶細胞中轉錄。可將該重組表現盒併入質粒、染色體、粒線體DNA、質體DNA、病毒或核酸片段。通常，表現載體之重組表現盒部分在其他序列中包含待轉錄之核酸序列及啟動子。於某些實施例中，本發明之表現盒包含編碼本發明之雙特異性抗原結合分子或其片段之多核苷酸序列。
術語「載體 」或「表現載體」係與「表現構築體」同義且係指用於引入及引導特定基因表現之DNA分子，該DNA分子於靶細胞中以可操作方式締合至該特定基因。該術語包含呈自我複製核酸結構之載體以及併入宿主細胞之基因組之載體，該載體已經引入該宿主細胞中。本發明之表現載體包含表現盒。表現載體允許大量穩定mRNA之轉錄。一旦表現載體係於靶細胞內部，藉由基因編碼之核糖核酸分子或蛋白質藉由細胞轉錄及/或轉譯機制產生。於一個實施例中，本發明之表現載體包含表現盒，該表現盒包含編碼本發明之雙特異性抗原結合分子或其片段之多核苷酸序列。
術語「宿主細胞 」、「宿主細胞系」及「宿主細胞培養物」可交換使用且係指已引入外源核酸之細胞，包括此等細胞之後代。宿主細胞包括「轉化株」及「轉形細胞」，其包括原發性轉形細胞及由此衍生之後代而不考慮代之數目。後代在核酸含量方面可與親本細胞不完全相同，但是可含有突變。本文中包含如於原始轉形細胞中篩選或選擇之具有相同功能或生物活性之突變後代。宿主細胞為細胞體系之任何類型，該細胞體系可用於產生本發明之雙特異性抗原結合分子。宿主細胞包括經培養細胞(例如哺乳動物經培養細胞，諸如CHO細胞、BHK細胞、NS0細胞、SP2/0細胞、YO骨髓瘤細胞、P3X63小鼠骨髓瘤細胞、PER細胞、PER.C6細胞或雜交瘤細胞)、酵母細胞、昆蟲細胞及植物細胞，略舉幾例，而且轉殖基因動物、轉殖基因植物或經培養之植物或動物組織內包含之細胞。
藥劑之「有效量 」係指導致細胞或組織中之生理變化所需之量，該藥劑經投與該細胞或組織。
藥劑(例如醫藥組合物)之「治療上有效量 」係指達成所需治療或預防結果所需之劑量及時間段的有效量。藥劑之治療上有效量例如消除、減少、延遲、最小化或防止疾病之不利作用。
「個體 」或「受試者」為哺乳動物。哺乳動物包括(但不限於)家養動物(例如牛、綿羊、貓、狗及馬)、靈長類動物(例如人類及非人類靈長類動物，諸如猴)、兔及齧齒動物(例如小鼠及大鼠)。特定言之，該個體或受試者為人類。
術語「醫藥組合物 」係指製劑，其呈以便允許其中含有之活性成分之生物活性有效之形式，且其不含有對受試者具有不可接受毒性之另外組分，該調配物經投與給該受試者。
「醫藥上可接受之賦形劑」係指醫藥組合物中除了活性成分外之成分，其對受試者無毒。醫藥上可接受之賦形劑包括(但不限於)緩衝劑、穩定劑或防腐劑。
使用術語「包裝插入物 」係指習慣包含於治療產品之商業包裝中之說明，其含有關於適應症、用途、劑量、投與、組合療法、禁忌及/或關於此等治療產品之使用之警告的資訊。
如本文中所用，「治療 (treatment) 」(及其語法變型，諸如治療(treat/treating))係指試圖改變正在治療之個體之自然過程之臨床干預，且可用於預防或在臨床病理之過程期間進行。治療之所需效果包括(但不限於)防止疾病發生或復發、減輕症狀、減少疾病之任何直接或間接病理結果、防止轉移、減少疾病進展率、改善或緩和疾病狀態及減輕或改善預後。於一些實施例中，本發明之分子係用於延遲疾病之發展或減慢疾病之進展。
術語「癌症 」係指或描述哺乳動物之生理狀況，其通常特徵為未經調控之細胞生長/增殖。因此，如本文中所用，術語癌症係指增生性疾病，諸如癌、淋巴瘤(例如霍奇金氏(Hodgkin’s)及非霍奇金氏淋巴瘤)、母細胞瘤、肉瘤及白血病。特定言之，該術語癌症包括淋巴細胞性白血病、肺癌、非小細胞肺(NSCL)癌、支氣管肺泡細胞肺癌、骨癌、胰臟癌、皮膚癌、頭頸癌、皮膚或眼內黑色素瘤、子宮癌、卵巢癌、直腸癌、肛門區癌、胃癌(stomach cancer/gastric cancer)、結腸癌、乳癌、子宮癌、輸卵管癌、子宮內膜癌、子宮頸癌、陰道癌、外陰癌、霍奇金氏病、食道癌、小腸癌、內分泌系統癌、甲狀腺癌、甲狀旁腺癌、腎上腺癌、軟組織肉瘤、尿道癌、陰莖癌、前列腺癌、膀胱癌、腎或尿管癌、腎細胞癌、腎盂癌、間皮瘤、肝細胞癌、膽道癌、中樞神經系統贅生物(CNS)、脊柱軸腫瘤、腦幹神經膠質瘤、多形性膠質母細胞瘤、星形細胞瘤、神經鞘瘤(schwanoma)、室管膜瘤(ependymoma)、神經管母細胞瘤、腦膜瘤、鱗狀細胞癌、垂體腺瘤及尤因氏(Ewings)肉瘤，包括以上癌症中之任一者之難治療版本或以上癌症中之一或多者之組合。於一個態樣中，該癌症為實體腫瘤。於另一態樣中，該癌症為血液癌，特定言之白血病，最特定言之急性淋巴母細胞性白血病(ALL)或急性骨髓性白血病(AML)。
應瞭解，於所述本發明之所有態樣及實施例中，術語「包括」態樣及實施例亦可經「由態樣及實施例組成」及「基本上由態樣及實施例組成」替換。
本發明之超促效 CD28 抗原結合分子 本發明提供新穎超促效CD28抗原結合分子，其具有特別有利性質，諸如生產率、穩定性、結合親和力、生物活性、靶向效率、降低之毒性、可提供給患者之擴大之劑量範圍及因此可能增強之功效。該等新穎超促效CD28抗原結合分子包含由能穩定締合之第一亞單元及第二亞單元組成之包含一或多個胺基酸取代的Fc域，該取代降低抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能(Fc沉默)及因此避免經由Fc受體之非特異性交聯。相反，其包含能特異性結合至腫瘤相關抗原(諸如纖維母細胞活化蛋白(FAP)或癌胚抗原(CEA))之至少一個抗原結合域，其引起在腫瘤位點處之交聯。因此，達成腫瘤特異性T細胞活化。
本文中提供超促效CD28抗原結合分子，其能多價結合至CD28且包含 (a)能特異性結合至CD28之兩個或更多個抗原結合域， (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之至少一個抗原結合域，及 (c)由能穩定締合之第一亞單元及第二亞單元組成之包含一或多個胺基酸取代的Fc域，該取代降低抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能。
於一個特定態樣中，該超促效CD28抗原結合分子能二價結合至CD28且包含能特異性結合至CD28之兩個抗原結合域。
於一個態樣中，提供如上文中所定義之超促效CD28抗原結合分子，其中該Fc域為IgG，特定言之IgG1 Fc域或IgG4 Fc域。於一個特定態樣中，該由能穩定締合之第一亞單元及第二亞單元組成之Fc域為IgG1 Fc域。該Fc域包含降低抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或減少或廢除效應功能之一或多個胺基酸取代。於一個態樣中，該Fc域包含胺基酸取代L234A及L235A (根據Kabat EU索引編號)。於一個態樣中，該Fc域為人類IgG1子類且包含胺基酸突變L234A、L235A及P329G (根據Kabat EU索引編號)。
於一個態樣中，提供如上文中所定義之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含 (i)重鏈可變區(VH CD28)，其包含SEQ ID NO: 20之重鏈互補決定區CDR-H1、SEQ ID NO: 21之CDR-H2及SEQ ID NO: 22之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含SEQ ID NO: 23之輕鏈互補決定區CDR-L1、SEQ ID NO: 24之CDR-L2及SEQ ID NO: 25之CDR-L3；或 (ii)重鏈可變區(VH CD28)，其包含SEQ ID NO: 36之CDR-H1、SEQ ID NO: 37之CDR-H2及SEQ ID NO: 38之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含SEQ ID NO: 39之CDR-L1，SEQ ID NO: 40之CDR-L2及SEQ ID NO: 41之CDR-L3。
於一個態樣中，該等能特異性結合至超促效CD28抗原結合分子之CD28之抗原結合域各包含重鏈可變區(VH CD28)，其包含SEQ ID NO: 36之CDR-H1、SEQ ID NO: 37之CDR-H2及SEQ ID NO: 38之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含SEQ ID NO: 39之CDR-L1、SEQ ID NO: 40之CDR-L2及SEQ ID NO: 41之CDR-L3。
於另一態樣中，該等能特異性結合至超促效CD28抗原結合分子之CD28之抗原結合域各包含重鏈可變區(VH CD28)，其包含SEQ ID NO: 20之CDR-H1、SEQ ID NO: 21之CDR-H2及SEQ ID NO: 22之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含SEQ ID NO: 23之CDR-L1、SEQ ID NO: 24之CDR-L2及SEQ ID NO: 25之CDR-L3。
此外，提供如上文中所定義之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含重鏈可變區(VH CD28)，包含與SEQ ID NO: 26之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含與SEQ ID NO: 27之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列。
於另一態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含重鏈可變區(VH CD28)，其包含選自由SEQ ID NO: 42、SEQ ID NO: 43、SEQ ID NO: 44、SEQ ID NO: 45、SEQ ID NO: 46、SEQ ID NO: 47、SEQ ID NO: 48、SEQ ID NO: 49、SEQ ID NO: 50及SEQ ID NO: 51組成之群之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含選自由SEQ ID NO: 27、SEQ ID NO: 52、SEQ ID NO: 53、SEQ ID NO: 54、SEQ ID NO: 55、SEQ ID NO: 56、SEQ ID NO: 57、SEQ ID NO: 58、SEQ ID NO: 59、SEQ ID NO: 60及SEQ ID NO: 61組成之群之胺基酸序列。
於另一態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含 (a)包含SEQ ID NO: 47之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 54之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (b)包含SEQ ID NO: 47之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (c)包含SEQ ID NO: 51之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 61之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (d)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 53之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (e)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 54之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (f)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 59之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (g)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (h)包含SEQ ID NO: 43之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (i)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 53之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (j)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 59之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (k)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)。
於一個特定態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含：包含SEQ ID NO: 47之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 54之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)。
於另一特定態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含：包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 53之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)。
於另一特定態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含：包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)。
於另一態樣中，提供如上文中所定義之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各為Fab片段。
於一個態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至腫瘤相關抗原之抗原結合域為能特異性結合至癌胚抗原(CEA)之抗原結合域。
於一個態樣中，提供如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至CEA之抗原結合域包含重鏈可變區(VH CEA)，其包含(i)包含SEQ ID NO: 127之胺基酸序列之CDR-H1，(ii)包含SEQ ID NO: 128之胺基酸序列之CDR-H2，及(iii)包含SEQ ID NO: 129之胺基酸序列之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CEA)，其包含(iv)包含SEQ ID NO: 130之胺基酸序列之CDR-L1，(v)包含SEQ ID NO: 131之胺基酸序列之CDR-L2，及(vi)包含SEQ ID NO: 132之胺基酸序列之CDR-L3。特定言之，該能特異性結合至CEA之抗原結合域包含重鏈可變區(VH CEA)，其包含與SEQ ID NO: 133之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL CEA)，其包含與SEQ ID NO: 134之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列。
於另一態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至腫瘤相關抗原之抗原結合域為能特異性結合至纖維母細胞活化蛋白(FAP)之抗原結合域。
於一個態樣中，提供如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至FAP之抗原結合域包含 (a)重鏈可變區(VH FAP)，其包含(i)包含SEQ ID NO: 12之胺基酸序列之CDR-H1，(ii)包含SEQ ID NO: 13之胺基酸序列之CDR-H2，及(iii)包含SEQ ID NO: 14之胺基酸序列之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL FAP)，其包含(iv)包含SEQ ID NO: 15之胺基酸序列之CDR-L1，(v)包含SEQ ID NO: 16之胺基酸序列之CDR-L2，及(vi)包含SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之CDR-L3，或 (b)重鏈可變區(VH FAP)，其包含(i)包含SEQ ID NO: 4之胺基酸序列之CDR-H1，(ii)包含SEQ ID NO: 5之胺基酸序列之CDR-H2，及(iii)包含SEQ ID NO: 6之胺基酸序列之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL FAP)，其包含(iv)包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列之CDR-L1，(v)包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列之CDR-L2，及(vi)包含SEQ ID NO: 9之胺基酸序列之CDR-L3。特定言之，該能特異性結合至FAP之抗原結合域包含重鏈可變區(VH FAP)，其包含(i)包含SEQ ID NO: 12之胺基酸序列之CDR-H1，(ii)包含SEQ ID NO: 13之胺基酸序列之CDR-H2，及(iii)包含SEQ ID NO: 14之胺基酸序列之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL FAP)，其包含(iv)包含SEQ ID NO: 15之胺基酸序列之CDR-L1，(v)包含SEQ ID NO: 16之胺基酸序列之CDR-L2，及(vi)包含SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之CDR-L3。
於一個態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至FAP之抗原結合域包含(a)包含與SEQ ID NO: 18之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列的重鏈可變區(VH FAP)，及包含與SEQ ID NO: 19之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列的輕鏈可變區(VL FAP)，或(b)包含與SEQ ID NO: 10之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列的重鏈可變區(VH FAP)，及包含與SEQ ID NO: 11之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列的輕鏈可變區(VL FAP)。特定言之，該能特異性結合至FAP之抗原結合域包含：包含SEQ ID NO: 18之胺基酸序列之重鏈可變區(VH FAP)及包含SEQ ID NO: 19之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL FAP)。
二價結合至 CD28 且一價結合至腫瘤相關抗原之超促效 CD28 抗原結合分子 (1+2 形式 ) 於另一態樣中，提供如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子，其包含 (a)抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之VH及VL域，其中該VH域經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端且其中該VL域經由肽連接子連接至該第二重鏈之C端。
於一個態樣中，該肽連接子包含選自SEQ ID NO: 146、SEQ ID NO: 147、SEQ ID NO: 151及SEQ ID NO: 152之胺基酸序列。更特定言之，該肽連接子包含SEQ ID NO: 152。
於另一態樣中，該超促效CD28抗原結合分子包含 (a)抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之VH及VL域，其中該VH域經由肽連接子連接至Fc隆突重鏈之C端且其中該VL域經由肽連接子連接至Fc穴重鏈之C端。
於特定態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其包含各包含SEQ ID NO: 62之胺基酸序列之兩條輕鏈、包含SEQ ID NO: 71之胺基酸序列之第一重鏈及包含SEQ ID NO: 72之胺基酸序列之第二重鏈。
於另一特定態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其包含各包含SEQ ID NO: 62之胺基酸序列之兩條輕鏈、包含SEQ ID NO: 83之胺基酸序列之第一重鏈及包含SEQ ID NO: 84之胺基酸序列之第二重鏈。
於另一態樣中，該超促效CD28抗原結合分子包含 (a) 抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之VH及VL域，其中該VH域經由肽連接子連接至Fc穴重鏈之C端且其中該VL域經由肽連接子連接至Fc隆突重鏈之C端。
於另一態樣中，提供如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子，其包含 (a) 抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之crossFab片段，其經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端。
二價結合至 CD28 且二價結合至腫瘤相關抗原之超促效 CD28 抗原結合分子 (2+2 形式 ) 於另一態樣中，提供如本文中所揭示之超促效CD28抗原結合分子，其包含 (a) 抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之兩個crossFab片段，其中一個crossFab片段經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端且其中另一crossFab片段經由肽連接子連接至該第二重鏈之C端。
於一個態樣中，如上文中所述之超促效CD28抗原結合分子包含能特異性結合至腫瘤相關抗原之兩個crossFab片段，其中一個crossFab片段經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端且其中另一crossFab片段經由肽連接子連接至該第二重鏈之C端，且其中於該等crossFab片段中交換該CH1及CL域。於另一態樣中，該等crossFab片段各在VH域之N端融合至Fc域之C端。
於特定態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其包含各包含SEQ ID NO: 65之胺基酸序列之兩條輕鏈、各包含SEQ ID NO: 74之胺基酸序列之兩條輕鏈及各包含SEQ ID NO: 73之胺基酸序列之兩條重鏈。
於另一特定態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其包含各包含SEQ ID NO: 65之胺基酸序列之兩條輕鏈、各包含SEQ ID NO: 82之胺基酸序列之兩條輕鏈及各包含SEQ ID NO: 81之胺基酸序列之兩條重鏈。
二價結合至 CD28 、一價結合至 FAP 及一價結合至 CEA 之三特異性超促效 CD28 抗原結合分子 於另一態樣中，提供如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子，其包含 (a)抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至FAP之VH及VL域，其中該VH域經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端且其中該VL域經由肽連接子連接至該第二重鏈之C端，及 (c)能特異性結合至CEA之crossFab片段，其經由肽連接子連接至能特異性結合至FAP之VH域之C端。
於特定態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其包含各包含SEQ ID NO: 62之胺基酸序列之兩條輕鏈、包含SEQ ID NO: 109之胺基酸序列之輕鏈、包含SEQ ID NO: 107之胺基酸序列之第一重鏈及包含SEQ ID NO: 108之胺基酸序列之第二重鏈。
於另一態樣中，提供如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子，其包含 (a)抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至FAP之VH及VL域，其中該VH域經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端且其中該VL域經由肽連接子連接至該第二重鏈之C端，及 (c)能特異性結合至CEA之VH及VL域，其中該VH域經由肽連接子連接至能特異性結合至FAP之VH域之C端且其中該VL域經由肽連接子連接至能特異性結合至FAP之VL域之C端。
於特定態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其包含各包含SEQ ID NO: 62之胺基酸序列之兩條輕鏈、包含SEQ ID NO: 110之胺基酸序列之第一重鏈及包含SEQ ID NO: 111之胺基酸序列之第二重鏈。
減少 Fc 受體結合及 / 或效應功能之 Fc 域修飾 本發明之超促效CD28抗原結合分子之Fc域由一對包含免疫球蛋白分子之重鏈域之多肽鏈組成。例如，免疫球蛋白G (IgG)分子之Fc域為二聚體，其各亞單元包含CH2及CH3 IgG重鏈恆定域。該Fc域之兩個亞單元能彼此穩定締合。該Fc域對本發明之抗原結合分子賦予有利藥物動力學性質，包括長的血清半衰期，其有助於靶組織中之良好累積及有利組織-血液分佈比率。然而，另一方面，其可導致本發明之雙特異性抗體非所需靶向表現Fc受體之細胞而非較佳攜帶抗原細胞。
因此，本發明之超促效CD28抗原結合分子之Fc域展示與初始IgG1 Fc域相比降低之與Fc受體之結合親和力及/或降低之效應功能。於一個態樣中，該Fc實質上不結合至Fc受體及/或不誘導效應功能。於特定態樣中，該Fc受體為Fcγ受體。於一個態樣中，該Fc受體為人類Fc受體。於特定態樣中，該Fc受體為活化人類Fcγ受體，更具體而言人類FcγRIIIa、FcγRI或FcγRIIa，最具體而言人類FcγRIIIa。於一個態樣中，該Fc域不誘導效應功能。降低之效應功能可包括(但不限於)下列中之一或多者：降低之補體依賴性細胞毒性(CDC)、降低之抗體依賴性細胞介導之細胞毒性(ADCC)、降低之抗體依賴性細胞吞噬作用(ADCP)、減少之細胞激素分泌、減少之免疫複合體介導之藉由抗原呈遞細胞之抗原攝取、減少之與NK細胞之結合、減少之與巨噬細胞之結合、減少之與單核細胞之結合、減少之與多形核細胞之結合、減少之誘導細胞凋亡之直接信號傳導、減少之樹突狀細胞成熟或減少之T細胞啟動(priming)。
於某些態樣中，可將一或多個胺基酸修飾引入本文中所提供抗體之Fc區，從而產生Fc區變異體。該Fc區變異體可包含人類Fc區序列(例如，人類IgG1、IgG2、IgG3或IgG4 Fc區)，該序列包含在一或多個胺基酸位置處之胺基酸修飾(例如取代)。
於一個特定態樣中，本發明提供抗體，其中該Fc區包含減少結合至Fc受體(特定言之朝向Fcγ受體)之一或多個胺基酸取代。於一個態樣中，本發明提供抗體，其中該Fc區包含一或多個胺基酸取代且其中藉由該抗體誘導之ADCC減少至藉由包含野生型人類IgG1 Fc區之抗體誘導之ADCC之0至20%。
於一個態樣中，本發明之抗體之Fc域包含一或多個胺基酸突變，該突變降低Fc域與Fc受體之結合親和力及/或效應功能。通常，一或多個相同胺基酸突變存在於Fc域之兩個亞單元各者中。特定言之，該Fc域包含E233、L234、L235、N297、P331及P329 (EU編號)之位置處之胺基酸取代。特定言之，該Fc域包含IgG重鏈之位置234及235 (EU編號)及/或329 (EU編號)處之胺基酸取代。更特定言之，提供根據本發明之抗體，其包含具有IgG重鏈之胺基酸取代L234A、L235A及P329G (「P329G LALA」，EU編號)之Fc域。該等胺基酸取代L234A及L235A係指所謂LALA突變。胺基酸取代之「P329G LALA」組合幾乎完全廢除人類IgG1 Fc域之Fcγ受體結合且述於國際專利申請公開案號WO 2012/130831 A1中，該案亦描述製備此等突變Fc域之方法及測定其性質(諸如Fc受體結合或效應功能)之方法。
具有減少之Fc受體結合及/或效應功能之Fc域亦包含具有Fc域殘基238、265、269、270、297、327及329中之一或多者之取代之彼等(美國專利第6,737,056號)。此等Fc突變體包括具有在胺基酸位置265、269、270、297及327中之兩者或更多者處之取代的Fc突變體，包括所謂「DANA」Fc突變體，其中將殘基265及297取代為丙胺酸(美國專利第7,332,581號)。
於另一態樣中，該Fc域為IgG4 Fc域。IgG4抗體與IgG1抗體相比展示降低之與Fc受體之結合親和力及降低之效應功能。於更特定態樣中，該Fc域為IgG4 Fc域，其包含位置S228 (Kabat編號)處之胺基酸取代，特定言之胺基酸取代S228P。於更特定態樣中，該Fc域為IgG4 Fc域，其包含胺基酸取代L235E及S228P及P329G (EU編號)。此等IgG4 Fc域突變體及其Fcγ受體結合性質亦述於WO 2012/130831中。
突變體Fc域可使用此項技術中熟知之遺傳或化學方法藉由胺基酸缺失、取代、插入或修飾製備。遺傳方法可包括編碼DNA序列之位點特異性誘變、PCR、基因合成及類似者。正確核苷酸變化可例如藉由定序來驗證。
與Fc受體之結合可例如藉由ELISA或藉由表面電漿子共振(SPR)使用標準儀器諸如BIAcore儀器(GE Healthcare)容易測定，及Fc受體諸如可藉由重組表現獲得。或者，可使用已知表現特定Fc受體之細胞系，諸如表現FcγIIIa受體之人類NK細胞評價Fc域或包含Fc域之細胞活化抗體對Fc受體之結合親和力。
Fc域或包含Fc域之本發明之抗原結合分子之效應功能可藉由此項技術中已知方法量測。本文中描述用於量測ADCC之適宜分析。評估所關注分子之ADCC活性之活體外分析之其他實例述於美國專利第5,500,362號；Hellstrom等人，Proc Natl Acad Sci USA 83, 7059-7063 (1986)及Hellstrom等人，Proc Natl Acad Sci USA 82, 1499-1502 (1985)；美國專利第5,821,337號；Bruggemann等人，J Exp Med 166, 1351-1361 (1987)中。或者，可採用非放射性分析方法(參見，例如，針對流動式細胞測量術之ACTI™非放射性細胞毒性分析(CellTechnology, Inc. Mountain View, CA)；及CytoTox 96®非放射性細胞毒性分析(Promega, Madison, WI))。用於此等分析之有用效應細胞包括外周血單核細胞(PBMC)及自然殺手(NK)細胞。或者或此外，可於活體內，例如於動物模型中評估所關注分子之ADCC活性，諸如於Clynes等人，Proc Natl Acad Sci USA 95, 652-656 (1998)中所揭示。
於一些態樣中，減少Fc域與補體組分，具體而言與C1q之結合。因此，於一些態樣中，其中Fc域經工程改造以具有降低之效應功能，該降低之效應功能包括降低之CDC。可進行C1q結合分析以測定本發明之雙特異性抗體是否能結合C1q及因此具有CDC活性。參見例如，WO 2006/029879及WO 2005/100402中之C1q及C3c結合ELISA。為評估補體活化，可進行CDC分析(參見，例如，Gazzano-Santoro等人，J Immunol Methods 202, 163 (1996)；Cragg等人，Blood 101, 1045-1052 (2003)；及Cragg及Glennie，Blood 103, 2738-2743 (2004))。
於一個特定態樣中，與初始IgG1 Fc域相比展示降低之與Fc受體之結合親和力及/或降低之效應功能之Fc域為包含胺基酸取代L234A、L235A及視情況P329G之人類IgG1 Fc域，或包含胺基酸取代S228P、L235E及視情況P329G之人類IgG4 Fc域(根據Kabat EU索引編號)。更特定言之，其為包含胺基酸取代L234A、L235A及P329G (根據Kabat EU索引編號)之人類IgG1 Fc域。
促進異二聚化之 Fc 域修飾 本發明之超促效CD28抗原結合分子包含融合至Fc域之兩個亞單元中一者或另一者之不同抗原結合位點，因此，該等Fc域之兩個亞單元可包含於兩條不同多肽鏈中。此等多肽之重組共同表現及隨後二聚化導致兩種多肽之若干可能組合。為提高本發明之雙特異性抗原結合分子於重組製備中之產率及純度，因此將促進所需多肽之締合之修飾引入本發明之雙特異性抗原結合分子之Fc域係有利的。
因此，於特定態樣中，本發明係關於超促效CD28抗原結合分子，其包含(a)能特異性結合至CD28之兩個或更多個抗原結合域，(b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之至少一個抗原結合域，及(c)由能穩定締合之第一亞單元及第二亞單元組成之Fc域，其包含會降低抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能之一或多個胺基酸取代，其中該Fc域包含促進該Fc域之第一亞單元及第二亞單元之締合的修飾。人類IgG Fc域之兩個亞單元之間之最廣泛蛋白質-蛋白質相互作用的位點係於Fc域之CH3域中。因此，於一個態樣中，該修飾係於Fc域之CH3域中。
於特定態樣中，該修飾為所謂「隆突入穴」修飾，其包含Fc域之兩個亞單元中之一者之「隆突」修飾及Fc域之兩個亞單元中之另一者之「穴」修飾。因此，本發明係關於超促效CD28抗原結合分子，其包含(a)能特異性結合至CD28之兩個或更多個抗原結合域，(b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之至少一個抗原結合域，及(c)由能穩定締合之第一亞單元及第二亞單元組成之Fc域，其包含會降低抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能之一或多個胺基酸取代，其中根據隆突入穴方法該Fc域之第一亞單元包含隆突及該Fc域之第二亞單元包含穴。於特定態樣中，該Fc域之第一亞單元包含胺基酸取代S354C及T366W (EU編號)及該Fc域之第二亞單元包含胺基酸取代Y349C、T366S及Y407V (根據Kabat EU索引編號)。
隆突入穴技術係述於例如US 5,731,168；US 7,695,936；Ridgway等人，Prot Eng 9, 617-621 (1996)及Carter, J Immunol Meth 248, 7-15 (2001)中。一般而言，該方法涉及在第一多肽之介面處引入隆凸(「隆突」)及在第二多肽之介面中引入對應腔(「穴」)，使得該隆凸可位於該腔中以便促進異二聚體形成及阻止同二聚體形成。隆凸係藉由用更大側鏈(例如酪胺酸或色胺酸)取代來自第一多肽之介面之小的胺基酸側鏈來構築。與隆凸相同或相似大小之互補腔係於第二多肽之介面中藉由用更小者(例如丙胺酸或蘇胺酸)取代大的胺基酸側鏈來產生。
因此，於一個態樣中，於本發明之雙特異性抗原結合分子之Fc域之第一亞單元的CH3域中，胺基酸殘基經具有更大側鏈體積之胺基酸殘基取代，從而產生第一亞單元之CH3域內之隆凸，其可位於第二亞單元之CH3域內之腔中，及於該Fc域之第二亞單元之CH3域中，胺基酸殘基經具有更小側鏈體積之胺基酸殘基取代，從而產生該第二亞單元之CH3域內之腔，其中該第一亞單元之CH3域內之隆凸係可定位。該隆凸及腔可藉由改變編碼多肽之核酸，例如，藉由位點特異性誘變或藉由肽合成製備。於特定態樣中，於Fc域之第一亞單元之CH3域中，位置366處之蘇胺酸殘基經色胺酸殘基取代(T366W)，及於Fc域之第二亞單元之CH3域中，位置407處之酪胺酸殘基經纈胺酸殘基取代(Y407V)。於一個態樣中，於Fc域之第二亞單元中，位置366處之蘇胺酸殘基另外經絲胺酸殘基取代(T366S)及位置368處之白胺酸殘基經丙胺酸殘基取代(L368A)。
於又一態樣中，於Fc域之第一亞單元中，位置354處之絲胺酸殘基另外經半胱胺酸殘基取代(S354C)，及於Fc域之第二亞單元中，位置349處之酪胺酸殘基另外經半胱胺酸殘基取代(Y349C)。此等兩種半胱胺酸殘基之引入導致Fc域之兩個亞單元之間之二硫鍵橋之形成，其進一步使二聚體穩定(Carter (2001), J Immunol Methods 248, 7-15)。於特定態樣中，該Fc域之第一亞單元包含胺基酸取代S354C及T366W (EU編號)及該Fc域之第二亞單元包含胺基酸取代Y349C、T366S及Y407V (根據Kabat EU索引編號)。
於替代態樣中，促進Fc域之第一亞單元及第二亞單元之締合之修飾包括介導靜電轉向效應之修飾，例如，如PCT公開案WO 2009/089004中所述。一般而言，此方法涉及藉由帶電胺基酸殘基取代兩個Fc域亞單元之介面處之一或多個胺基酸殘基使得同二聚體形成變得靜電不利，但是異二聚化靜電上有利。
如本文中所報導之超促效CD28抗原結合分子之重鏈之C端可為以胺基酸殘基PGK結束之完全C端。該重鏈之C端可為縮短之C端，其中該等C端胺基酸殘基中之一或兩者已經移除。於一個較佳態樣中，該重鏈之C端為以PG結束之縮短之C端。於如本文中所報導之所有態樣中之一個態樣中，包含如本文中所指定之C端CH3域之重鏈之CD28抗原結合分子包含C端甘胺酸-離胺酸二肽(G446及K447，根據Kabat EU索引編號)。於如本文中所報導之所有態樣中之一個態樣中，包含如本文中所指定之C端CH3域之重鏈之CD28抗原結合分子包含C端甘胺酸殘基(G446，根據Kabat EU索引編號)。
Fab 域中之修飾 於一個態樣中，本發明係關於超促效CD28抗原結合分子，其包含(a)能特異性結合至CD28之兩個或更多個抗原結合域，(b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之至少一個抗原結合域，及(c)由能穩定締合之第一亞單元及第二亞單元組成之Fc域，其包含會降低抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能之一或多個胺基酸取代，其中該能特異性結合至腫瘤相關抗原之至少一個抗原結合域為Fab片段且於該Fab片段中，可變域VH及VL或恆定域CH1及CL根據Crossmab技術經交換。
於一個結合臂中具有域取代/交換之多特異性抗體(CrossMabVH-VL或CrossMabCH-CL)詳細述於WO2009/080252及Schaefer, W.等人，PNAS, 108 (2011) 11187-1191中。其明確減少由對抗第一抗原之輕鏈與對抗第二抗原之錯誤重鏈之錯配造成之副產物(相較於無此域交換之方法)。
於一個態樣中，本發明係關於超促效CD28抗原結合分子，其包含(a)能特異性結合至CD28之兩個或更多個抗原結合域，(b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之兩個抗原結合域，及(c)由能穩定締合之第一亞單元及第二亞單元組成之Fc域，其包含會降低抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能之一或多個胺基酸取代，其中於該等能特異性結合至腫瘤相關抗原之Fab片段中，恆定域CL及CH1經彼此取代使得該CH1域為輕鏈之部分及該CL域為重鏈之部分。
於另一態樣中，及為進一步提高正確配對，包含(a)能特異性結合至CD28之兩個或更多個抗原結合域，(b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之兩個抗原結合域，及(c)由能穩定締合之第一亞單元及第二亞單元組成之Fc域(其包含會降低抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能之一或多個胺基酸取代)之超促效CD28抗原結合分子可含有不同帶電胺基酸取代(所謂「帶電殘基」)。於交聯或非交聯CH1及CL域中引入此等修飾。於特定態樣中，本發明係關於超促效CD28抗原結合分子，其中於CL域中之一者中，位置123 (EU編號)處之胺基酸已經精胺酸(R)取代及位置124 (EU編號)處之胺基酸已經離胺酸(K)取代且其中於CH1域中之一者中，位置147 (EU編號)處及位置213 (EU編號)處之胺基酸已經麩胺酸(E)取代。於一個特定態樣中，於該能特異性結合至CD28之Fab片段之CL域中，位置123 (EU編號)處之胺基酸已經精胺酸(R)取代及位置124 (EU編號)處之胺基酸已經離胺酸(K)取代且於該能特異性結合至CD28之Fab片段之CH1域中，位置147 (EU編號)處及位置213 (EU編號)處之胺基酸已經麩胺酸(E)取代。
多核苷酸 本發明進一步提供編碼如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子之經分離多核苷酸或其片段。
編碼本發明之超促效CD28抗原結合分子之經分離多核苷酸可表示為編碼整個抗原結合分子之單個多核苷酸或共同表現之多個(例如兩個或更多個)多核苷酸。藉由共同表現之多核苷酸編碼之多肽可通過例如二硫鍵或其他方法締合以形成功能抗原結合分子。例如，免疫球蛋白之輕鏈部分可藉由來自免疫球蛋白之重鏈部分之分離多核苷酸編碼。當共同表現時，重鏈多肽將與輕鏈多肽締合以形成免疫球蛋白。
於一些態樣中，該經分離之多核苷酸編碼根據本發明之如本文中所述之整個超促效CD28抗原結合分子。於其他態樣中，該經分離之多核苷酸編碼含於根據本發明之如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子中的多肽。
於某些態樣中，該多核苷酸或核酸為DNA。於其他態樣中，本發明之多核苷酸為RNA，例如，以信使RNA (mRNA)之形式。本發明之RNA可係單股或雙股。
重組方法 本發明之超促效CD28抗原結合分子可例如藉由固態肽合成(例如Merrifield固相合成)或重組製備獲得。針對重組製備，將編碼該超促效CD28抗原結合分子之一或多種多核苷酸或其多肽片段(例如，如上所述)分離及插入一或多種載體中用於進一步於宿主細胞中選殖及/或表現。此多核苷酸可使用習知程序容易分離及定序。於本發明之一個態樣中，提供載體，較佳地包含本發明之多核苷酸中之一或多者之表現載體。為熟習此項技術者熟知之方法可用於構築含有抗體(片段)之編碼序列之表現載體，連同適宜轉錄/轉譯控制信號。此等方法包括活體外重組DNA技術、合成技術及活體內重組/遺傳重組。參見，例如，Maniatis等人，MOLECULAR CLONING: A LABORATORY MANUAL, Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y. (1989)；及Ausubel等人，CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY, Greene Publishing Associates and Wiley Interscience, N.Y. (1989)中所述之技術。該表現載體可為質粒之部分、病毒或可為核酸片段。該表現載體包含表現盒，編碼抗體或其多肽片段之多核苷酸(即，編碼區)經選殖至該表現盒與啟動子及/或其他轉錄或轉譯控制元件可操作締合。如本文中所用，「編碼區」為由轉譯至胺基酸之密碼子組成之核酸的一部分。雖然「終止密碼子」 (TAG、TGA或TAA)未經轉譯至胺基酸，但是若存在，則可將其視為編碼區之部分，但是任何側翼序列，例如啟動子、核糖體結合位點、轉錄終止子、內含子、5'及3'未轉譯區及類似者非編碼區之部分。兩個或更多個編碼區可存在於單個多核苷酸構築體中(例如，在單個載體上)，或於分離多核苷酸構築體中(例如，在分離(不同)載體上)。此外，任何載體可含有單個編碼區，或可包含兩個或更多個編碼區，例如，本發明之載體可編碼一或多種多肽，該一或多種多肽經由蛋白質水解裂解後轉譯或共同轉譯分離至最終蛋白質。此外，本發明之載體、多核苷酸或核酸可編碼融合或未融合至編碼本發明之抗體或其多肽片段之多核苷酸或其變異體或衍生物的異源編碼區。異源編碼區包含(不限於)特定元件或基序，諸如分泌性信號肽或異源功能域。可操作締合為當基因產品(例如多肽)之編碼區以使該基因產品之表現在調節序列之影響或控制下之方式與一或多個調節序列締合時之締合。若啟動子功能之誘導導致編碼所需基因產品之mRNA之轉錄及若兩個DNA片段之間之鍵聯之性質不干預表現調節序列引導基因產品表現之能力或不干預DNA模板被轉錄之能力，則該等兩個DNA片段(諸如多肽編碼區及與之相關之啟動子)係「可操作締合」。因此，若啟動子能影響編碼多肽之核酸之轉錄，則啟動子區將與該核酸可操作締合。該啟動子可為僅於預定細胞中引導DNA之實質轉錄之細胞特異性啟動子。除了啟動子外之其他轉錄控制元件，例如增強子、操作子、抑制子及轉錄終止信號可與多核苷酸可操作締合以引導細胞特異性轉錄。
本文中揭示適宜啟動子及其他轉錄控制區。各種轉錄控制區為熟習此項技術者已知。此等包括(不限於)於脊椎動物細胞中起作用之轉錄控制區，諸如但不限於來自巨細胞病毒(例如與內含子-A結合之立即早期啟動子)、猿腎病毒40 (例如早期啟動子)及逆轉錄病毒(諸如例如Rous肉瘤病毒)之啟動子及增強子片段。其他轉錄控制區包含衍生自脊椎動物基因之彼等，諸如肌動蛋白、熱激蛋白、牛生長激素及兔â-球蛋白，以及能控制真核細胞中之基因表現之其他序列。另外適宜轉錄控制區包含組織特異性啟動子及增強子以及可誘導啟動子(例如啟動子可誘導四環素)。類似地，各種轉譯控制元件為一般技術者已知。此等包括(但不限於)核糖體結合位點、轉譯起始及終止密碼子、及源自病毒系統之元件(特定言之內部核糖體進入位點或IRES，亦稱作CITE序列)。表現盒亦可包含其他特徵，諸如複製之起源及/或染色體整合元件，諸如逆轉錄病毒長末端重複(LTR)或腺相關病毒(AAV)反向末端重複(ITR)。
本發明之多核苷酸及核酸編碼區可與編碼分泌肽或信號肽之另外編碼區締合，該等肽引導藉由本發明之多核苷酸編碼之多肽之分泌。例如，若抗體或其多肽片段之分泌係所需，則可將編碼信號序列之DNA放置於編碼本發明之抗體或其多肽片段之核酸之上游。根據信號假說，藉由哺乳動物細胞分泌之蛋白質具有信號肽或分泌前導序列，一旦開始跨粗糙內質網之生長蛋白質鏈之輸出，該前導序列自成熟蛋白質裂解。一般技術者意識到藉由脊椎動物細胞分泌之多肽一般具有融合至該多肽之N端之信號肽，其自經轉譯多肽裂解以產生多肽之分泌或「成熟」形式。於某些實施例中，使用初始信號肽，例如免疫球蛋白重鏈或輕鏈信號肽或保留引導與其可操作締合之多肽之分泌之能力之序列的功能衍生物。或者，可使用異源哺乳動物信號肽或其功能衍生物。例如，野生型前導序列可經人類組織纖維蛋白溶酶原活化子(TPA)或小鼠β-葡糖苷酸酶之前導序列取代。
可用於幫助後期純化(例如組胺酸標籤)或説明標記超促效CD28抗原結合分子之編碼短蛋白質序列之DNA可包含於編碼本發明之抗體或其多肽片段之多核苷酸內或在該多核苷酸末端。
於本發明之另一態樣中，提供包含本發明之一或多種多核苷酸之宿主細胞。於某些實施例中，提供包含本發明之一或多種載體之宿主細胞。該等多核苷酸及載體可單獨或組合併入本文中各自與多核苷酸及載體相關所述之特徵中之任一者。於一個態樣中，宿主細胞包含載體(例如已經載體轉形或轉染)，該載體包含編碼本發明之抗體(之部分)之多核苷酸。如本文中所用，術語「宿主細胞」係指任何類型之細胞體系，其可經工程改造以產生本發明之融合蛋白或其片段。適用於複製及適用於支援抗原結合分子表現之宿主細胞係此項技術中熟知。此等細胞可視情況經特定表現載體轉染或轉導及可生長大量含載體之細胞用於接種大量發酵物以獲得足夠數量之抗原結合分子用於臨床應用。適宜宿主細胞包括原核微生物，諸如大腸桿菌，或各種真核細胞，諸如中國倉鼠卵巢細胞(Chinese hamster ovary cells/CHO)、昆蟲細胞或類似者。例如，多肽可於細菌中產生，特定言之當不需要糖基化時。於表現後，多肽可溶部分可自細菌細胞團分離且可經進一步純化。除了原核生物外，真核微生物(諸如絲狀真菌或酵母)為用於多肽編碼載體之適宜選殖或表現宿主，其包含真菌及酵母株，該等真菌及酵母株之糖基化路徑經「人源化」，導致具有部分或完全人類糖基化模式之多肽之產生。參見Gerngross, Nat Biotech 22, 1409-1414 (2004)及Li等人，Nat Biotech 24, 210-215 (2006)。
用於表現(糖基化)多肽之適宜宿主細胞亦源自多細胞生物體(無脊椎動物及脊椎動物)。無脊椎動物細胞之實例包括植物及昆蟲細胞。已識別許多桿狀病毒株，其可與昆蟲細胞結合使用，特定言之用於轉染草地夜蛾(Spodoptera frugiperda)細胞。植物細胞培養物亦可用作宿主。參見例如美國專利第5,959,177號、第6,040,498號、第6,420,548號、第7,125,978號及第6,417,429號(描述用於於轉殖基因植物中產生抗體的PLANTIBODIESTM 技術)。脊椎動物細胞亦可用作宿主。例如，適於在懸浮液中生長之哺乳動物細胞系可係有用。有用哺乳動物宿主細胞系之其他實例為藉由SV40轉形之猴腎CV1系(COS-7)、人類胚腎系(293或293T細胞，如例如於Graham等人，J Gen Virol 36, 59 (1977)中所述)、小倉鼠腎細胞(BHK)、小鼠支援細胞(TM4細胞，如例如於Mather, Biol Reprod 23, 243-251 (1980)中所述)、猴腎細胞(CV1)、非洲綠猴腎細胞(VERO-76)、人類子宮頸癌細胞(HELA)、犬腎細胞(MDCK)、水牛大鼠肝細胞(BRL 3A)、人類肺細胞(W138)、人類肝細胞(Hep G2)、小鼠乳房腫瘤細胞(MMT 060562)、TRI細胞(如例如於Mather等人，Annals N.Y. Acad Sci 383, 44-68 (1982)中所述)、MRC 5細胞及FS4細胞。其他有用哺乳動物宿主細胞系包括中國倉鼠卵巢(CHO)細胞，包括dhfr-CHO細胞(Urlaub等人，Proc Natl Acad Sci USA 77, 4216 (1980))；及骨髓瘤細胞系，諸如YO、NS0、P3X63及Sp2/0。針對適用於蛋白質製備之某些哺乳動物宿主細胞系之評論，參見例如Yazaki及Wu，Methods in Molecular Biology，第248卷(B.K.C. Lo編輯，Humana Press, Totowa, NJ)，第255至268頁(2003)。宿主細胞包括經培養之細胞，例如經培養之哺乳動物細胞、酵母細胞、昆蟲細胞、細菌細胞及植物細胞，略舉幾例，而且包含於轉殖基因動物、轉殖基因植物或經培養之植物或動物組織內之細胞。於一個實施例中，該宿主細胞為真核細胞，較佳地哺乳動物細胞，諸如中國倉鼠卵巢(CHO)細胞、人類胚腎(HEK)細胞或淋巴樣細胞(例如Y0、NS0、Sp20細胞)。於此等系統中表現外來基因之標準技術係此項技術中已知。可將表現包含免疫球蛋白之重鏈或輕鏈之多肽之細胞工程改造以便亦表現免疫球蛋白鏈中之另一者使得該表現產品為具有重鏈及輕鏈二者之免疫球蛋白。
於一個態樣中，提供一種製備本發明之超促效CD28抗原結合分子或其多肽片段之方法，其中該方法包括在適於本發明之抗體或其多肽片段表現之條件下培養如本文中所提供之包含編碼本發明之抗體或其多肽片段之多核苷酸之宿主細胞，及自該宿主細胞(或宿主細胞培養基)恢復本發明之抗體或其多肽片段。
於某些實施例中，能特異性結合至抗原結合分子之靶細胞抗原(例如Fab片段)形成部分之部分包含能結合至抗原之至少一個免疫球蛋白可變區。可變區可形成天然或非天然產生之抗體及其片段之部分且自該等抗體及其片段衍生。製備多株抗體及單株抗體之方法係此項技術中熟知(參見例如Harlow及Lane，「Antibodies, a laboratory manual」, Cold Spring Harbor Laboratory, 1988)。非天然產生之抗體可使用固相肽合成構築，可重組產生(例如如美國專利第4,186,567號中所述)或可例如藉由篩選包含可變重鏈及可變輕鏈之組合庫獲得(參見例如頒與McCafferty之美國專利第5,969,108號)。
本發明可使用免疫球蛋白之任何動物物種。可用於本發明之非限制性免疫球蛋白可係鼠科、靈長類動物或人類起源。若意欲融合蛋白用於人類用途，則可使用免疫球蛋白之嵌合形式，其中該免疫球蛋白之恆定區係來自人類。人源化免疫球蛋白或免疫球蛋白之全人類形式亦可根據此項技術中熟知方法製備(參見例如頒與Winter之美國專利第5,565,332號)。人源化可藉由各種方法達成，該等方法包括(但不限於) (a)將非人類(例如供體抗體) CDR移植至保留或不保留關鍵框架殘基之人類(例如受體抗體)框架及恆定區(例如對保留良好抗原結合親和力或抗體功能重要之彼等)，(b)僅將非人類特異性決定區(SDR或a-CDR；對抗體-抗原相互作用關鍵之殘基)移植至人類框架及恆定區，或(c)移植整個非人類可變域，但是藉由取代表面殘基將其用類人類部分「遮蓋」。人源化抗體及製備其之方法例如於Almagro及Fransson, Front Biosci 13, 1619-1633 (2008)中評論，及進一步述於例如Riechmann等人，Nature 332, 323-329 (1988)；Queen等人，Proc Natl Acad Sci USA 86, 10029-10033 (1989)；美國專利第5,821,337號、第7,527,791號、第6,982,321號及第7,087,409號；Jones等人，Nature 321, 522-525 (1986)；Morrison等人，Proc Natl Acad Sci 81, 6851-6855 (1984)；Morrison及Oi, Adv Immunol 44, 65-92 (1988)；Verhoeyen等人，Science 239, 1534-1536 (1988)；Padlan, Molec Immun 31(3), 169-217 (1994)；Kashmiri等人，Methods 36, 25-34 (2005) (描述SDR (a-CDR)移植)；Padlan, Mol Immunol 28, 489-498 (1991) (描述「重新表面化」)；Dall’Acqua等人，Methods 36, 43-60 (2005) (描述「FR混合」)；及Osbourn等人，Methods 36, 61-68 (2005)及Klimka等人，Br J Cancer 83, 252-260 (2000) (描述FR混合之「引導選擇」方法)中。根據本發明之特定免疫球蛋白為人類免疫球蛋白。可使用此項技術中已知之各種技術製備人類抗體及人類可變區。人類抗體一般述於van Dijk及van de Winkel, Curr Opin Pharmacol 5, 368-74 (2001)及Lonberg, Curr Opin Immunol 20, 450-459 (2008)中。人類可變區可形成藉由雜交瘤方法製備之人類單株抗體之部分且自該等人類單株抗體衍生(參見例如Monoclonal Antibody Production Techniques and Application，第51至63頁(Marcel Dekker, Inc., New York, 1987))。人類抗體及人類可變區亦可藉由向轉殖基因動物投與免疫原來製備，該轉殖基因動物已經修飾以產生對抗原攻擊反應之完整人類抗體或具有人類可變區之完整抗體(參見例如Lonberg, Nat Biotech 23, 1117-1125 (2005)。人類抗體及人類可變區亦可藉由分離選自人類衍生之噬菌體呈現庫之Fv純系可變區序列產生(參見例如，Hoogenboom等人，Methods in Molecular Biology 178, 1-37 (O’Brien等人編輯，Human Press, Totowa, NJ, 2001)；及McCafferty等人，Nature 348, 552-554；Clackson等人，Nature 352, 624-628 (1991))。噬菌體通常呈現抗體片段，如單鏈Fv (scFv)片段或如Fab片段。
於某些態樣中，根據例如PCT公開案WO 2012/020006 (參見與親和力成熟相關之實例)或美國專利申請公開案第2004/0132066號中所揭示之方法將超促效CD28抗原結合分子工程改造以具有增強之結合親和力。本發明之抗原結合分子結合至特定抗原決定區之能力可通過酶聯免疫吸附分析(ELISA)或熟習此項技術者熟習之其他技術，例如，表面電漿子共振技術(Liljeblad等人，Glyco J 17, 323-329 (2000))及傳統結合分析(Heeley, Endocr Res 28, 217-229 (2002))量測。競爭分析可用於識別與參考抗體競爭結合至特定抗原之抗原結合分子。於某些實施例中，此競爭抗原結合分子結合至藉由參考抗原結合分子結合之相同抗原決定基(例如線性或構象抗原決定基)。用於比對抗原結合分子結合之抗原決定基之詳細示例性方法提供於Morris (1996) 「Epitope Mapping Protocols」, in Methods in Molecular Biology第66卷(Humana Press, Totowa, NJ)中。於示例性競爭分析中，將經固定抗原於包含結合至該抗原之第一標記抗原結合分子及第二未標記抗原結合分子的溶液中培育，正測試該第二未標記抗原結合分子與第一抗原結合分子競爭結合至該抗原之能力。第二抗原結合分子可存在於雜交瘤上清液中。作為對照，將經固定抗原於包含第一標記抗原結合分子但是無第二未標記抗原結合分子之溶液中培育。在允許第一抗體與抗原結合之條件下培育後，移除過量未結合抗體，及量測與固定抗原締合之標籤之量。若與固定抗原締合之標籤之量於測試樣品中相對於對照樣品實質上減少，則其指示該第二抗原結合分子與該第一抗原結合分子競爭結合至該抗原。參見Harlow及Lane (1988) Antibodies: A Laboratory Manual第14章(Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY)。
如本文中所述製備之本發明之超促效CD28抗原結合分子可藉由技術已知之技術，諸如高效液相層析法、離子交換層析法、凝膠電泳、親和層析法、尺寸排阻層析法及類似者純化。用於純化特定蛋白質之實際條件將部分取決於諸如淨電荷、疏水性、親水性等之因素，且將對熟習此項技術者明顯。針對親和層析法純化，可使用抗原結合分子結合之抗體、配位體、受體或抗原。例如，針對本發明之抗原結合分子之親和層析法純化，可使用具有蛋白A或蛋白G之基質。依序蛋白A或G親和層析法及尺寸排阻層析法可用於基本上分離抗原結合分子，如實例中所述。CD28抗原結合分子或其片段之純度可藉由各種熟知分析方法測定，該等方法包括凝膠電泳、高壓液相層析法及類似者。例如，如實例中所述表現之CD28抗原結合分子顯示係完整且經適當組裝，如由還原及非還原SDS-PAGE所證實。
分析 可藉由此項技術中已知之各種分析識別、篩選或表徵本文中所提供之超促效CD28抗原結合分子之物理/化學性質及/或生物活性。
1.親和力分析 本文中所提供之抗原結合分子對對應靶之親和力可根據實例中闡述之方法藉由表面電漿子共振(SPR)，使用標準儀器，諸如Proteon儀器(Bio-rad)測定，及受體或靶蛋白諸如可藉由重組表現獲得。含TNF家族配位體三聚體之抗原結合分子對靶細胞抗原之親和力亦可藉由表面電漿子共振(SPR)，使用標準儀器，諸如Proteon儀器(Bio-rad)測定，及受體或靶蛋白諸如可藉由重組表現獲得。用於量測結合親和力之特定說明性及示例性實施例述於實例4中。根據一個態樣中，KD 係藉由表面電漿子共振使用Proteon ®機器(Bio-Rad)在25℃下量測。
2.結合分析及其他分析 本文中所提供之雙特異性抗原結合分子與對應受體表現細胞之結合可使用表現特定受體或靶抗原之細胞系，例如藉由流動式細胞測量術(FACS)或藉由表面電漿子共振(SPR)來評價。於一個態樣中，表現人類CD28之CHO細胞(親本細胞系CHO-k1 ATCC #CCL-61，經修飾以穩定過度表現人類CD28)係用於結合分析中。
於另一態樣中，表現靶細胞抗原之癌細胞系(例如FAP或CEA)係用於證實雙特異性抗原結合分子與靶細胞抗原之結合。
3.活性分析 於一個態樣中，提供用於識別具有生物活性之CD28抗原結合分子之分析。生物活性可包括例如如利用如實例5中所述之方法量測之T細胞增殖及細胞激素分泌或如實例6中所量測之腫瘤細胞殺滅。亦提供活體內及/或活體外具有此生物活性之抗體。
醫藥組合物、調配物及投與途徑 於另一態樣中，本發明提供包含本文中所提供之超促效CD28抗原結合分子中之任一者之醫藥組合物，例如，用於下列治療方法中之任一者。於一個實施例中，醫藥組合物包含本文中所提供之超促效CD28抗原結合分子及至少一種醫藥上可接受之賦形劑。於另一實施例中，醫藥組合物包含本文中所提供之超促效CD28抗原結合分子及至少一種另外治療劑(例如，如下所述)。
本發明之醫藥組合物包含治療上有效量之溶解或分散於醫藥上可接受之賦形劑中之一或多種抗原結合分子。短語「醫藥或藥理上可接受」係指在所採用之劑量及濃度下對接受者大體上無毒，即，當向動物(諸如例如人類，視情況)投與時不產生不利、過敏或其他不良反應之分子實體及組合物。含有至少一種超促效CD28抗原結合分子及視情況另外活性成分之醫藥組合物之製備將為熟習此項技術者根據本發明已知，如由Remington's Pharmaceutical Sciences，第18版，Mack Printing Company, 1990 (其以引用的方式併入本文中)所例示。特定言之，該等組合物為凍乾調配物或水溶液。如本文中所用，「醫藥上可接受之賦形劑」包括任何及所有溶劑、緩衝劑、分散介質、塗料、表面活性劑、抗氧化劑、防腐劑(例如抗細菌劑、抗真菌劑)、等滲劑、鹽、穩定劑及其組合，正如為一般技術者已知。
非經腸組合物包括針對藉由注射(例如皮下、皮內、病灶內、靜脈內、動脈內、肌肉內、鞘內或腹膜內注射)投與設計之彼等。針對注射，本發明之含TNF家族配位體三聚體之抗原結合分子可於水溶液中，較佳地於生理上相容緩衝液，諸如漢克斯(Hanks')溶液、林格氏(Ringer's)溶液或生理鹽水緩衝液中調配。該溶液可含有調配劑，諸如懸浮劑、穩定劑及/或分散劑。或者，該超促效CD28抗原結合分子可呈粉末形式用於在使用之前與適宜媒劑(例如無菌無熱原水)組成。無菌可注射溶液藉由將所需量之本發明之融合蛋白併入視需要含有以下列舉之各種其他成分之適宜溶劑中來製備。無菌可容易實現，例如，藉由通過無菌過濾膜過濾。一般而言，分散液藉由將各種無菌活性成分併入含有基本分散介質及/或其他成分之無菌媒劑中來製備。於用於製備無菌可注射溶液、懸浮液或乳液之無菌粉末之情況下，較佳製備方法為真空乾燥或冷凍乾燥技術，其產生活性成分之粉末加上來自其先前經無菌過濾之液體介質之任何另外所需成分。若需要，則應將液體介質適宜緩衝及液體稀釋劑首先致使在注射之前與足夠鹽水或葡萄糖等滲。該組合物必須在製造及儲存條件下穩定，及保存避免微生物(諸如細菌及真菌)之污染行為。應瞭解，內毒素污染應最少保持在安全水平下，例如，少於0.5 ng/mg蛋白質。適宜醫藥上可接受之賦形劑包括(但不限於)：緩衝劑，諸如磷酸鹽、檸檬酸鹽及其他有機酸；抗氧化劑，包括抗壞血酸及甲硫胺酸；防腐劑(諸如十八基二甲基苄基氯化銨、氯化六甲銨；苯紮氯銨、氯化苄乙氧銨、苯酚、丁基或苄基醇、對羥基苯甲酸烷酯(諸如對羥基苯甲酸甲酯或對羥基苯甲酸丙酯)、兒茶酚、雷瑣酚、環己醇、3-戊醇及間苯酚)；低分子量(小於約10個殘基)多肽；蛋白質，諸如血清白蛋白、明膠或免疫球蛋白；親水性聚合物，諸如聚乙烯吡咯啶酮；胺基酸，諸如甘胺酸、麩胺醯胺、天冬醯胺、組胺酸、精胺酸或離胺酸；單糖、二糖及其他碳水化合物，包括葡萄糖、甘露糖或糊精；螯合劑，諸如EDTA；糖，諸如蔗糖、甘露醇、海藻糖或山梨醇；成鹽抗衡離子，諸如鈉；金屬錯合物(例如Zn-蛋白質錯合物)；及/或非離子表面活性劑，諸如聚乙二醇(PEG)。水性注射懸浮液可含有增加該懸浮液之黏度之化合物，諸如羧甲基纖維素鈉、山梨醇、葡聚糖或類似者。視情況，該懸浮液亦可含有適宜穩定劑或增加化合物之溶解度以允許製備高度濃縮溶液之劑。此外，活性化合物之懸浮液可呈適宜油性注射懸浮液製備。適宜親脂性溶劑或媒劑包括脂肪油(諸如芝麻油)或合成脂肪酸酯(諸如油酸乙酯或三甘油酯)或脂質體。
可例如藉由凝聚技術或藉由介面聚合將活性成分陷留於製備之微膠囊中，例如，羥甲基纖維素或明膠微膠囊及聚-(甲基丙烯酸甲酯)微膠囊各自於膠狀藥物遞送系統(例如，脂質體、白蛋白微球、微乳液、奈米粒子及奈米膠囊)或於粗乳液中。此等技術揭示於Remington之Pharmaceutical Sciences (第18版Mack Printing Company, 1990)中。可製備持續釋放製劑。持續釋放製劑之適宜實例包括含有多肽之固體疏水性聚合物之半滲透基質，該等基質係呈定型物品之形式，例如，薄膜或微膠囊。於特定實施例中，可注射組合物之延長之吸收可藉由於該等組合物中使用延遲吸收之劑，諸如例如，單硬脂酸鋁、明膠或其組合實現。
本文中示例性醫藥上可接受之賦形劑進一步包括間質藥物分散劑，諸如可溶性中性活性透明質酸酶醣蛋白(sHASEGP)，例如，人類可溶性PH-20透明質酸酶醣蛋白，諸如rHuPH20 (HYLENEX®，Baxter International, Inc.)。某些示例性sHASEGP及使用方法(包括rHuPH20)述於美國專利公開案第2005/0260186號及第2006/0104968號中。於一個態樣中，將sHASEGP與一或多種另外糖胺聚糖酶(諸如軟骨素酶)組合。
示例性凍乾抗體調配物述於美國專利第6,267,958號中。水性抗體調配物包括美國專利第6,171,586號及第WO2006/044908號中所述之彼等，後者調配物包含組胺酸-乙酸鹽緩衝液。
除了上述組合物外，該超促效CD28抗原結合分子亦可經調配成儲積製劑。此等長效調配物可藉由植入(例如經皮下或經肌肉內)或藉由肌肉內注射投與。因此，例如，該超促效CD28抗原結合分子可利用適宜聚合或疏水性材料(例如呈含於可接受油中之乳液)或離子交換樹脂調配或呈難溶衍生物，例如，呈難溶鹽調配。
包含本發明之超促效CD28抗原結合分子之醫藥組合物可藉助習知混合、溶解、乳化、封裝、陷留或凍乾方法製造。醫藥組合物可以習知方式使用一或多種生理上可接受之載劑、稀釋劑、賦形劑或助劑調配，該等劑促進蛋白質加工成可醫藥上使用之製劑。適宜調配物係取決於所選之投與途徑。
本發明之超促效CD28抗原結合分子可經調配成呈游離酸或鹼、中性或鹽形式之組合物。醫藥上可接受之鹽為實質上保留游離酸或鹼之生物活性之鹽。此等包括酸加成鹽，例如與類蛋白質組合物之游離胺基形成或與無機酸(諸如例如鹽酸或磷酸)或諸如乙酸、草酸、酒石酸或扁桃酸之有機酸形成之彼等。與游離羧基形成之鹽亦可衍生自無機鹼，諸如例如氫氧化鈉、氫氧化鉀、氫氧化銨、氫氧化鈣或氫氧化鐵；或諸如異丙胺、三甲胺、組胺酸或普魯卡因(procaine)之有機鹼。醫藥鹽傾向於較對應游離鹼形式於水性及其他質子溶劑中更可溶。
本文中組合物亦可視需要針對正在治療之特定適應症含有超過一種活性成分，較佳地具有不會不利影響彼此之互補活性之彼等。此等活性成分適宜地以針對期望目的有效之量組合存在。
用於活體內投與之調配物一般係無菌。無菌可容易實現，例如，藉由通過無菌過濾膜過濾。
治療方法及組合物 本文中所提供之超促效CD28抗原結合分子中之任一者可單獨或組合用於治療方法中。
於一個態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其用作藥劑。於另外態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其用於治療癌症。於某些態樣中，提供超促效CD28抗原結合分子，其用於治療方法中。於某些態樣中，本文中提供超促效CD28抗原結合分子，其用於治療患有癌症之個體之方法中，該方法包括向該個體投與有效量之超促效CD28抗原結合分子。於一個此實施例中，該方法進一步包括向該個體投與有效量之至少一種另外治療劑。
於另外態樣中，提供如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子，其用於癌症免疫療法。於某些實施例中，提供超促效CD28抗原結合分子，其用於癌症免疫療法之方法中。根據以上態樣中之任一者之「個體」較佳地為人類。
於另一態樣中，本文中提供如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子於製造或製備藥劑中之用途。於一個實施例中，該藥劑係用於治療癌症。於另一態樣中，該藥劑係用於治療癌症之方法中，該方法包括向患有癌症之個體投與有效量之藥劑。於一個此態樣中，該方法進一步包括向該個體投與有效量之至少一種另外治療劑(例如，如下所述)。根據以上態樣中之任一者之「個體」可為人類。
於另一態樣中，本文中提供一種治療癌症之方法。於一個態樣中，該方法包括向患有癌症之個體投與有效量之超促效CD28抗原結合分子。於一個此態樣中，該方法進一步包括向該個體投與有效量之至少一種另外治療劑(如下所述)。根據以上態樣中之任一者之「個體」可為人類。
於另一態樣中，本文中提供醫藥調配物，其包含如本文中所報導之超促效CD28抗原結合分子中之任一者，例如，用於以上治療方法中之任一者。於一個態樣中，醫藥調配物包含如本文中所報導之超促效CD28抗原結合分子中之任一者及醫藥上可接受之載劑。於另一態樣中，醫藥調配物包含如本文中所報導之超促效CD28抗原結合分子中之任一者及至少一種另外治療劑。
如本文中所報導之抗體可單獨或與其他藥劑組合用於療法中。例如，如本文中所報導之抗體可與至少一種另外治療劑共同投與。
以上指出之此等組合療法包含組合投與(其中兩種或更多種治療劑包含於相同或分開調配物中)及分開投與，於分開投與之情況下，如本文中所報導之抗體之投與可在投與另外治療劑之前、同時及/或之後發生。於一個態樣中，超促效CD28抗原結合分子之投與及另外治療劑之投與於彼此之約一個月內，或於約一週、兩週或三週內，或於約一天、兩天、三天、四天、五天或六天內發生。
如本文中所報導之抗原結合分子(及任何另外治療劑)可藉由任何適宜方法，包括非經腸、肺內及鼻內投與，及若針對局部治療所需，則病灶內投與。非經腸輸注包括肌肉內、靜脈內、動脈內、腹膜內或皮下投與。給藥可係藉由任何適宜途徑，例如藉由注射，諸如靜脈內或皮下注射，部分取決於投與是否短暫或長期。包括(但不限於)歷時各種時間點之單次或多次投與、團式投與及脈衝輸注之各種給藥時程表涵蓋於本文中。
如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子以與良好醫療實務一致之方式調配、給藥及投與。此情況下考慮之因素包括正在治療之特定病症、正在治療之特定哺乳動物、個別患者之臨床病狀、病症之原因、藥劑之遞送位點、投與方法、投與時程表及執業醫師已知之其他因素。超促效CD28抗原結合分子不必但是視情況與目前用於預防或治療所討論病症之一或多種藥劑調配。此等其他藥劑之有效量取決於存在於調配物中之抗體之量、病症之類型或治療，及以上所討論之其他因素。此等一般用於相同劑量中及利用如本文中所述之投與途徑，或本文中所述劑量之約1至99%，或以任何劑量及藉由經驗上/臨床上確定適宜之任何途徑。
為了預防或治療疾病，如本文中所述之超促效CD28抗原結合分子(當單獨或與一或多種其他另外治療劑組合使用時)之適宜劑量將取決於待治療之疾病之類型、抗體之類型、疾病之嚴重度及過程、無論是否出於預防或治療目的投與抗體、先前療法、患者之臨床史及對抗體之反應及主治醫師之裁量。一次性或歷時一系列治療向患者適宜投與該超促效CD28抗原結合分子。取決於疾病之類型及嚴重度，約1 µg/kg至15 mg/kg (例如0.5 mg/kg至10 mg/kg)之超促效CD28抗原結合分子可為向患者投與之初始候選劑量，無論是否例如藉由一或多個分開投與或藉由連續輸注。一個典型每日劑量範圍可自約1 µg/kg至100 mg/kg或更多，取決於上述因素。針對歷時若干天或更長之重複投與，取決於病狀，一般將持續治療直至疾病症狀之所需抑制出現。抗體之一個示例性劑量將於約0.05 mg/kg至約10 mg/kg之範圍內。因此，可向患者投與約0.5 mg/kg、2.0 mg/kg、4.0 mg/kg或10 mg/kg (或其任何組合)之一或多個劑量。可間歇投與此等劑量，例如每週或每三週(例如使得患者接受抗體之約2至約20個劑量，或例如約6個劑量)。可投與初始較高速效劑量，接著一或多個較低劑量。然而，其他劑量方案可係有用。藉由習知技術及分析容易監測此療法之過程。
其他藥劑及治療 本發明之超促效CD28抗原結合分子可與療法中之一或多種其他藥劑組合投與。例如，本發明之抗原結合分子可與至少一種另外治療劑共同投與。術語「治療劑」包括可投與用於治療需要此治療個體之症狀或疾病之任何藥劑。此另外治療劑可包括適用於正治療之特定適應症之任何活性成分，較佳為具有不會不利地影響彼此之互補活性者。於某些實施例中，另外治療劑為另一種抗癌劑。
此等其他藥劑適合於組合中以對所欲目的有效之量存在。此等其他藥劑之有效量取決於所用抗原結合分子之量、病症或治療之類型，及以上所討論之其他因素。該等超促效CD28抗原結合分子一般以本文中所述之相同劑量及投與途徑，或本文中所述劑量之約1至99%，或以經驗上/臨床上確定適宜之任何劑量及任何途徑使用。
以上指出之此等組合療法包含組合投與(其中兩種或更多種治療劑包含於相同或分開組合物中)及分開投與，於分開投與之情況下，本發明之超促效CD28抗原結合分子之投與可在投與另外治療劑及/或佐劑之前、同時及/或之後發生。
製品 於本發明之另一態樣中，提供含有可用於治療、預防及/或診斷上述病症之物質之製品。該製品包含容器及在該容器上或與該容器相關之標籤或包裝插入物。適宜容器包括例如瓶、小瓶、注射器、IV溶液袋等。該等容器可自各種材料(諸如玻璃或塑膠)形成。該容器容納組合物，該組合物自身或與另一種組合物組合有效治療、預防及/或診斷病狀且可具有無菌出入孔(例如該容器可為靜脈內溶液袋或具有可藉由皮下注射針刺穿之瓶塞之小瓶)。該組合物中之至少一種活性劑為本發明之超促效CD28抗原結合分子。
該標籤或包裝插入物指示該組合物係用於治療選擇之病狀。此外，該製品可包含(a)具有組合物含於其中之第一容器，其中該組合物包含本發明之超促效CD28抗原結合分子；及(b)具有組合物含於其中之第二容器，其中該組合物包含另外細胞毒性劑或另外治療劑。於本發明之此實施例中，該製品可進一步包含指示該等組合物可用於治療特定病狀之包裝插入物。
或者，或此外，該製品可進一步包含第二(或第三)容器，該容器包含醫藥上可接受之緩衝劑，諸如抑菌注射用水(BWFI)、磷酸鹽緩衝鹽水、林格氏溶液及葡萄糖溶液。其可進一步包含自商業及使用者立場所需之其他材料，包括其他緩衝劑、稀釋劑、填料、針及注射器。表 B ( 序列 ) ：
SEQ ID NO: 名稱 序列
1 hu CD28 UniProt編號P10747，版本1 MLRLLLALNL FPSIQVTGNK ILVKQSPMLV AYDNAVNLSC KYSYNLFSRE FRASLHKGLD SAVEVCVVYG NYSQQLQVYS KTGFNCDGKL GNESVTFYLQ NLYVNQTDIY FCKIEVMYPP PYLDNEKSNG TIIHVKGKHL CPSPLFPGPS KPFWVLVVVG GVLACYSLLV TVAFIIFWVR SKRSRLLHSD YMNMTPRRPG PTRKHYQPYA PPRDFAAYRS
2 hu FAP UniProt編號Q12884，版本168 MKTWVKIVFG VATSAVLALL VMCIVLRPSR VHNSEENTMR ALTLKDILNG TFSYKTFFPN WISGQEYLHQ SADNNIVLYN IETGQSYTIL SNRTMKSVNA SNYGLSPDRQ FVYLESDYSK LWRYSYTATY YIYDLSNGEF VRGNELPRPI QYLCWSPVGS KLAYVYQNNI YLKQRPGDPP FQITFNGREN KIFNGIPDWV YEEEMLATKY ALWWSPNGKF LAYAEFNDTD IPVIAYSYYG DEQYPRTINI PYPKAGAKNP VVRIFIIDTT YPAYVGPQEV PVPAMIASSD YYFSWLTWVT DERVCLQWLK RVQNVSVLSI CDFREDWQTW DCPKTQEHIE ESRTGWAGGF FVSTPVFSYD AISYYKIFSD KDGYKHIHYI KDTVENAIQI TSGKWEAINI FRVTQDSLFY SSNEFEEYPG RRNIYRISIG SYPPSKKCVT CHLRKERCQY YTASFSDYAK YYALVCYGPG IPISTLHDGR TDQEIKILEE NKELENALKN IQLPKEEIKK LEVDEITLWY KMILPPQFDR SKKYPLLIQV YGGPCSQSVR SVFAVNWISY LASKEGMVIA LVDGRGTAFQ GDKLLYAVYR KLGVYEVEDQ ITAVRKFIEM GFIDEKRIAI WGWSYGGYVS SLALASGTGL FKCGIAVAPV SSWEYYASVY TERFMGLPTK DDNLEHYKNS TVMARAEYFR NVDYLLIHGT ADDNVHFQNS AQIAKALVNA QVDFQAMWYS DQNHGLSGLS TNHLYTHMTH FLKQCFSLSD
3 hu CEA UniProt寄存編號P06731 MESPSAPPHR WCIPWQRLLL TASLLTFWNP PTTAKLTIES TPFNVAEGKE VLLLVHNLPQ HLFGYSWYKG ERVDGNRQII GYVIGTQQAT PGPAYSGREI IYPNASLLIQ NIIQNDTGFY TLHVIKSDLV NEEATGQFRV YPELPKPSIS SNNSKPVEDK DAVAFTCEPE TQDATYLWWV NNQSLPVSPR LQLSNGNRTL TLFNVTRNDT ASYKCETQNP VSARRSDSVI LNVLYGPDAP TISPLNTSYR SGENLNLSCH AASNPPAQYS WFVNGTFQQS TQELFIPNIT VNNSGSYTCQ AHNSDTGLNR TTVTTITVYA EPPKPFITSN NSNPVEDEDA VALTCEPEIQ NTTYLWWVNN QSLPVSPRLQ LSNDNRTLTL LSVTRNDVGP YECGIQNKLS VDHSDPVILN VLYGPDDPTI SPSYTYYRPG VNLSLSCHAA SNPPAQYSWL IDGNIQQHTQ ELFISNITEK NSGLYTCQAN NSASGHSRTT VKTITVSAEL PKPSISSNNS KPVEDKDAVA FTCEPEAQNT TYLWWVNGQS LPVSPRLQLS NGNRTLTLFN VTRNDARAYV CGIQNSVSAN RSDPVTLDVL YGPDTPIISP PDSSYLSGAN LNLSCHSASN PSPQYSWRIN GIPQQHTQVL FIAKITPNNN GTYACFVSNL ATGRNNSIVK SITVSASGTS PGLSAGATVG IMIGVLVGVA LI
4 FAP (28H1) CDR-H1 SHAMS
5 FAP (28H1) CDR-H2 AIWASGEQYYADSVKG
6 FAP (28H1) CDR-H3 GWLGNFDY
7 FAP (28H1) CDR-L1 RASQSVSRSYLA
8 FAP (28H1) CDR-L2 GASTRAT
9 FAP (28H1) CDR-L3 QQGQVIPPT
10 FAP(28H1) VH EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSHAMSWVRQAPGKGLEWVSAIWASGEQYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWLGNFDYWGQGTLVTVSS
11 FAP(28H1) VL EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVSRSYLAWYQQKPGQAPRLLIIGASTRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQGQVIPPTFGQGTKVEIK
12 FAP(4B9) CDR-H1 SYAMS
13 FAP(4B9) CDR-H2 AIIGSGASTYYADSVKG
14 FAP(4B9) CDR-H3 GWFGGFNY
15 FAP(4B9) CDR-L1 RASQSVTSSYLA
16 FAP(4B9) CDR-L2 VGSRRAT
17 FAP(4B9) CDR-L3 QQGIMLPPT
18 FAP(4B9) VH EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIIGSGASTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWFGGFNYWGQGTLVTVSS
19 FAP(4B9) VL EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVTSSYLAWYQQKPGQAPRLLINVGSRRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQGIMLPPTFGQGTKVEIK
20 CD28(SA) CDR-H1 SYYIH
21 CD28(SA) CDR-H2 CIYPGNVNTNYNEKFKD
22 CD28(SA) CDR-H3 SHYGLDWNFDV
23 CD28(SA) CDR-L1 HASQNIYVWLN
24 CD28(SA) CDR-L2 KASNLHT
25 CD28(SA) CDR-L3 QQGQTYPYT
26 CD28(SA) VH QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSS
27 CD28(SA) VL DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIK
28 CD28(mAb 9.3) CDR-H1 DYGVH
29 CD28(mAb 9.3) CDR-H2 VIWAGGGTNYNSALMS
30 CD28(mAb 9.3) CDR-H3 DKGYSYYYSMDY
31 CD28(mAb 9.3) CDR-L1 RASESVEYYVTSLMQ
32 CD28(mAb 9.3) CDR-L2 AASNVES
33 CD28(mAb 9.3) CDR-L3 QQSRKVPYT
34 CD28(mAb 9.3) VH EVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSS
35 CD28(mAb 9.3) VL DIELTQSPASLAVSLGQRATISCRASESVEYYVTSLMQWYQQKPGQPPKLLIFAASNVESGVPARFSGSGSGTNFSLNIHPVDEDDVAMYFCQQSRKVPYTFGGGTKLEIK
36 CD28 CDR-H1共有 SYYIH
37 CD28 CDR-H2共有 SIYPX1 X2 X3 X4 TNYNEKFKD，其中 X1 為G或R X2 為N或D X3 為V或G X4 為N或Q或A
38 CD28 CDR-H3共有 SHYGX5 DX6 NFDV，其中 X5 為L或A X6 為W或H或Y或F
39 CD28 CDR-L1共有 X7 ASQX8 IX9 X10 X11 LN，其中 X7 為H或R X8 為N或G X9 為Y或S X10 為V或N X11 為W或H或F或Y
40 CD28 CDR-L2共有 X12 X13 SX14 LX15 X16 ，其中 X12 為K或Y X13 為A或T X14 為N或S X15 為H或Y X16 為T或S
41 CD28 CDR-L3共有 QQX17 QTYPYT，其中 X17 為G或A
42 CD28 VH變異體a QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSS
43 CD28 VH變異體b QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPGNVQTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDHNFDVWGQGTTVTVSS
44 CD28 VH變異體c QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPGNVQTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGADHNFDVWGQGTTVTVSS
45 CD28 VH變異體d QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPRDGQTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDYNFDVWGQGTTVTVSS
46 CD28 VH變異體e QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPGNVQTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSS
47 CD28 VH變異體f QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPGNVQTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDFNFDVWGQGTTVTVSS
48 CD28 VH變異體g QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPRNVQTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDHNFDVWGQGTTVTVSS
49 CD28 VH變異體h QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPRDVQTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDHNFDVWGQGTTVTVSS
50 CD28 VH變異體i EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTSYYIHWVRQAPGKGLEWVASIYPGNVNTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSS
51 CD28 VH變異體j EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTSYYIHWVRQAPGKGLEWVASIYPGNVATRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSS
52 CD28 VL變異體k DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVHLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQAQTYPYTFGGGTKVEIK
53 CD28 VL變異體l DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVFLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIK
54 CD28 VL變異體m DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVYLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIK
55 CD28 VL變異體n DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQGISNYLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIK
56 CD28 VL變異體o DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSSLHSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIK
57 CD28 VL變異體p DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQGISNYLNWYQQKPGKAPKLLIYYTSSLHSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIK
58 CD28 VL變異體q DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQGISNHLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIK
59 CD28 VL變異體r DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQGIYVYLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIK
60 CD28 VL變異體s DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQGISVYLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIK
61 CD28 VL變異體t DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGQGTKLEIK
62 CD28(SA)輕鏈 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
63 CD28(SA) hu IgG4重鏈 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPSCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK
64 CD28(SA) hu IgG1 PGLALA重鏈 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
65 CD28(SA) hu IgG1輕鏈「RK」 DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDRKLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
66 CD28(SA) hu IgG1 PGLALA Fc隆突 QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
67 FAP(4B9) VL-CH hu IgG1 PGLALA Fc穴 EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVTSSYLAWYQQKPGQAPRLLINVGSRRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQGIMLPPTFGQGTKVEIKSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
68 FAP(4B9) VH-Cκ EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIIGSGASTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWFGGFNYWGQGTLVTVSSASVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
69 CD28(SA) VHCH-VHCH hu IgG1 Fc隆突FAP(4B9) VH PGLALA QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDGGGGSGGGGSQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIIGSGASTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWFGGFNYWGQGTLVTVSS
70 CD28(SA) VHCH-VHCH hu IgG1 Fc穴FAP(4B9) VL PGLALA QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDGGGGSGGGGSQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVTSSYLAWYQQKPGQAPRLLINVGSRRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQGIMLPPTFGQGTKVEIK
71 CD28(SA) VHCH- hu IgG1 Fc隆突FAP(4B9) VH QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIIGSGASTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWFGGFNYWGQGTLVTVSS
72 CD28(SA) VHCH- hu IgG1 Fc穴FAP(4B9) VL QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVTSSYLAWYQQKPGQAPRLLINVGSRRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQGIMLPPTFGQGTKVEIK
73 CD28(SA) VHCH 「EE」- hu IgG1 Fc PGLALA FAP(4B9) VHCL QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIIGSGASTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWFGGFNYWGQGTLVTVSSASVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
74 FAP(4B9) VLCH1 EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVTSSYLAWYQQKPGQAPRLLINVGSRRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQGIMLPPTFGQGTKVEIKSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCD
75 CD28(SA) VLCH1- FAP(4B9) VHCH1 「EE」- hu IgG1 Fc隆突PGLALA DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIKSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDGGGGSGGGGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIIGSGASTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWFGGFNYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
76 FAP(4B9) VHCH1 「EE」- hu IgG1 Fc穴PGLALA EVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIIGSGASTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWFGGFNYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
77 CD28(SA) VHCL QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
78 FAP(4B9) VLCL 「RK」 EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVTSSYLAWYQQKPGQAPRLLINVGSRRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQGIMLPPTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDRKLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
79 hu IgG1 Fc穴PGLALA DKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
80 hu IgG1 Fc隆突–FAP(4B9) VH DKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIIGSGASTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWFGGFNYWGQGTLVTVSS
81 CD28(SA) VHCH1 「EE」- hu IgG1 Fc PGLALA CEA(Medi-565) VHCL QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTVSSYWMHWVRQAPGKGLEWVGFIRNKANGGTTEYAASVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRGLRFYFDYWGQGTTVTVSSASVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
82 CEA VLCH1 QAVLTQPASLSASPGASASLTCTLRRGINVGAYSIYWYQQKPGSPPQYLLRYKSDSDKQQGSGVSSRFSASKDASANAGILLISGLQSEDEADYYCMIWHSGASAVFGGGTKLTVLSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC
83 CD28(SA) VHCH1- hu IgG1 Fc隆突CEA VH QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTVSSYWMHWVRQAPGKGLEWVGFIRNKANGGTTEYAASVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRGLRFYFDYWGQGTTVTVSS
84 CD28(SA) VHCH1- hu IgG1 Fc穴CEA VL QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQAVLTQPASLSASPGASASLTCTLRRGINVGAYSIYWYQQKPGSPPQYLLRYKSDSDKQQGSGVSSRFSASKDASANAGILLISGLQSEDEADYYCMIWHSGASAVFGGGTKLTVL
85 CD28(SA) VHCH1 「EE」- hu IgG1 Fc穴PGLALA HYRF QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNRFTQKSLSLSP
86 hu IgG1 Fc隆突PGLALA DKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
87 CEA VL-CH hu IgG1 PGLALA Fc穴 QAVLTQPASLSASPGASASLTCTLRRGINVGAYSIYWYQQKPGSPPQYLLRYKSDSDKQQGSGVSSRFSASKDASANAGILLISGLQSEDEADYYCMIWHSGASAVFGGGTKLTVLSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
88 CEA VH-CL EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTVSSYWMHWVRQAPGKGLEWVGFIRNKANGGTTEYAASVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRGLRFYFDYWGQGTTVTVSSASVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
89 CD28(mAb 9.3)輕鏈 DIELTQSPASLAVSLGQRATISCRASESVEYYVTSLMQWYQQKPGQPPKLLIFAASNVESGVPARFSGSGSGTNFSLNIHPVDEDDVAMYFCQQSRKVPYTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
90 CD28(mAb 9.3) hu IgG1 PGLALA重鏈 EVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
91 CD28(mAb 9.3) hu IgG1 PGLALA Fc隆突「EE」 EVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
92 CD28(mAb 9.3) hu IgG1輕鏈「RK」 DIELTQSPASLAVSLGQRATISCRASESVEYYVTSLMQWYQQKPGQPPKLLIFAASNVESGVPARFSGSGSGTNFSLNIHPVDEDDVAMYFCQQSRKVPYTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDRKLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
93 CD28(mAb 9.3) VHCH-VHCH hu IgG1 Fc隆突FAP(4B9) VH PGLALA EVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDGGGGSGGGGSEVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIIGSGASTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWFGGFNYWGQGTLVTVSS
94 CD28(mAb 9.3) VHCH-VHCH hu IgG1 Fc穴FAP(4B9) VL PGLALA EVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDGGGGSGGGGSEVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVTSSYLAWYQQKPGQAPRLLINVGSRRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQGIMLPPTFGQGTKVEIK
95 CD28(mAb 9.3) VHCH- hu IgG1 Fc隆突FAP(4B9) VH EVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIIGSGASTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWFGGFNYWGQGTLVTVSS
96 CD28(mAb 9.3) VHCH- hu IgG1 Fc穴FAP(4B9) VL EVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVTSSYLAWYQQKPGQAPRLLINVGSRRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQGIMLPPTFGQGTKVEIK
97 CD28(mAb 9.3) VHCH 「EE」- hu IgG1 Fc PGLALA FAP(4B9) VHCL EVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIIGSGASTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWFGGFNYWGQGTLVTVSSASVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
98 CD28(mAb 9.3) VLCL 「RK」 DIELTQSPASLAVSLGQRATISCRASESVEYYVTSLMQWYQQKPGQPPKLLIFAASNVESGVPARFSGSGSGTNFSLNIHPVDEDDVAMYFCQQSRKVPYTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDRKLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
99 FAP(4B9) VLCH1 EIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVTSSYLAWYQQKPGQAPRLLINVGSRRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQGIMLPPTFGQGTKVEIKSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC
100 CD28(mAb 9.3) VLCH1- FAP(4B9) VHCH1 「EE」- hu IgG1 Fc隆突PGLALA DIELTQSPASLAVSLGQRATISCRASESVEYYVTSLMQWYQQKPGQPPKLLIFAASNVESGVPARFSGSGSGTNFSLNIHPVDEDDVAMYFCQQSRKVPYTFGGGTKLEIKSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDGGGGSGGGGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIIGSGASTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWFGGFNYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
101 CD28(mAb 9.3) VHCL EVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSSASVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
102 CD28(mAb 9.3) VHCH1 「EE」- hu IgG1 Fc PGLALA CEA VHCL EVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTVSSYWMHWVRQAPGKGLEWVGFIRNKANGGTTEYAASVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRGLRFYFDYWGQGTTVTVSSASVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
103 CD28(mAb 9.3) VHCH1- hu IgG1 Fc隆突CEA VH EVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTVSSYWMHWVRQAPGKGLEWVGFIRNKANGGTTEYAASVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRGLRFYFDYWGQGTTVTVSS
104 CD28(mAb 9.3) VHCH1- hu IgG1 Fc穴CEA VL EVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQAVLTQPASLSASPGASASLTCTLRRGINVGAYSIYWYQQKPGSPPQYLLRYKSDSDKQQGSGVSSRFSASKDASANAGILLISGLQSEDEADYYCMIWHSGASAVFGGGTKLTVL
105 CD28(mAb 9.3) VHCH1 「EE」- hu IgG1 Fc穴PGLALA HYRF EVKLQQSGPGLVTPSQSLSITCTVSGFSLSDYGVHWVRQSPGQGLEWLGVIWAGGGTNYNSALMSRKSISKDNSKSQVFLKMNSLQADDTAVYYCARDKGYSYYYSMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
106 CD28(mAb 9.3) VLCL 「RK」 DIELTQSPASLAVSLGQRATISCRASESVEYYVTSLMQWYQQKPGQPPKLLIFAASNVESGVPARFSGSGSGTNFSLNIHPVDEDDVAMYFCQQSRKVPYTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDRKLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
107 CD28(SA) VHCH1 「EE」 hu IgG1 Fc穴PGLALA FAP(4B9) VH – CEA(Medi-565) VHCL QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIIGSGASTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWFGGFNYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTVSSYWMHWVRQAPGKGLEWVGFIRNKANGGTTEYAASVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRGLRFYFDYWGQGTTVTVSSASVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
108 CD28(SA) VHCH1 「EE」 hu IgG1 Fc隆突 PGLALA FAP(4B9) VL QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVTSSYLAWYQQKPGQAPRLLINVGSRRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQGIMLPPTFGQGTKVEIK
109 CEA VLCH1 QAVLTQPASLSASPGASASLTCTLRRGINVGAYSIYWYQQKPGSPPQYLLRYKSDSDKQQGSGVSSRFSASKDASANAGILLISGLQSEDEADYYCMIWHSGASAVFGGGTKLTVLSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC
110 CD28(SA) VHCH1 hu IgG1 Fc穴PGLALA FAP(4B9) VH – CEA VH QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLLESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWVRQAPGKGLEWVSAIIGSGASTYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCAKGWFGGFNYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTVSSYWMHWVRQAPGKGLEWVGFIRNKANGGTTEYAASVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRGLRFYFDYWGQGTTVTVSS
111 CD28(SA) VHCH1 Fc隆突 PGLALA FAP(4B9) VL – CEA VL QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEIVLTQSPGTLSLSPGERATLSCRASQSVTSSYLAWYQQKPGQAPRLLINVGSRRATGIPDRFSGSGSGTDFTLTISRLEPEDFAVYYCQQGIMLPPTFGQGTKVEIKGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQAVLTQPASLSASPGASASLTCTLRRGINVGAYSIYWYQQKPGSPPQYLLRYKSDSDKQQGSGVSSRFSASKDASANAGILLISGLQSEDEADYYCMIWHSGASAVFGGGTKLTVL
112 VH (CD28親本) CH1- hu IgG1 Fc隆突PGLALA QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGCIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
113 VH (CD28變異體g) CH1- hu IgG1 Fc隆突PGLALA QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPRNVQTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDHNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
114 VH (CD28變異體f) CH1- hu IgG1 Fc隆突PGLALA QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPGNVQTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDFNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
115 VH (CD28變異體j) CH1- hu IgG1 Fc隆突PGLALA EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTSYYIHWVRQAPGKGLEWVASIYPGNVATRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
116 VH (CD28變異體e) CH1- hu IgG1 Fc隆突PGLALA QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPGNVQTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
117 VH (CD28變異體b) CH1- hu IgG1 Fc隆突PGLALA QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPGNVQTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDHNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
118 VH (CD28變異體a) CH1- hu IgG1 Fc隆突PGLALA QVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGYTFTSYYIHWVRQAPGQGLEWIGSIYPGNVNTNYNEKFKDRATLTVDTSISTAYMELSRLRSDDTAVYFCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
119 VH (CD28變異體i) CH1- hu IgG1 Fc隆突PGLALA EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTSYYIHWVRQAPGKGLEWVASIYPGNVNTRYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCTRSHYGLDWNFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVEDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDEKVEPKSCDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPCRDELTKNQVSLWCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSP
120 VL (CD28變異體k)-CL DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVHLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQAQTYPYTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDRKLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
121 VL (CD28變異體l)-CL DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVFLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDRKLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
122 VL (CD28變異體m)-CL DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQNIYVYLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDRKLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
123 VL (CD28變異體r)-CL DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQGIYVYLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDRKLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
124 VL (CD28變異體s)-CL DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCHASQGISVYLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLHTGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDRKLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
125 VL (CD28變異體t)-CL DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQNIYVWLNWYQQKPGKAPKLLIYKASNLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQGQTYPYTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDRKLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
126 hu IgG1 Fc穴PGLALA, HYRF DKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVCTLPPSRDELTKNQVSLSCAVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLVSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNRFTQKSLSLSP
127 CEA CDR-H1 SYWMH
128 CEA CDR-H2 FIRNKANGGTTEYAASVKG
129 CEA CDR-H3 DRGLRFYFDY
130 CEA CDR-L1 TLRRGINVGAYSIY
131 CEA CDR-L2 YKSDSDKQQGSGV
132 CEA CDR-L3 MIWHSGASAV
133 CEA VH EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTVSSYWMHWVRQAPGKGLEWVGFIRNKANGGTTEYAASVKGRFTISRDDSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDRGLRFYFDYWGQGTTVTVSS
134 CEA VL QAVLTQPASLSASPGASASLTCTLRRGINVGAYSIYWYQQKPGSPPQYLLRYKSDSDKQQGSGVSSRFSASKDASANAGILLISGLQSEDEADYYCMIWHSGASAVFGGGTKLTVL
135 His標記之人類FAP ECD RPSRVHNSEENTMRALTLKDILNGTFSYKTFFPNWISGQEYLHQSADNNIVLYNIETGQSYTILSNRTMKSVNASNYGLSPDRQFVYLESDYSKLWRYSYTATYYIYDLSNGEFVRGNELPRPIQYLCWSPVGSKLAYVYQNNIYLKQRPGDPPFQITFNGRENKIFNGIPDWVYEEEMLATKYALWWSPNGKFLAYAEFNDTDIPVIAYSYYGDEQYPRTINIPYPKAGAKNPVVRIFIIDTTYPAYVGPQEVPVPAMIASSDYYFSWLTWVTDERVCLQWLKRVQNVSVLSICDFREDWQTWDCPKTQEHIEESRTGWAGGFFVSTPVFSYDAISYYKIFSDKDGYKHIHYIKDTVENAIQITSGKWEAINIFRVTQDSLFYSSNEFEEYPGRRNIYRISIGSYPPSKKCVTCHLRKERCQYYTASFSDYAKYYALVCYGPGIPISTLHDGRTDQEIKILEENKELENALKNIQLPKEEIKKLEVDEITLWYKMILPPQFDRSKKYPLLIQVYGGPCSQSVRSVFAVNWISYLASKEGMVIALVDGRGTAFQGDKLLYAVYRKLGVYEVEDQITAVRKFIEMGFIDEKRIAIWGWSYGGYVSSLALASGTGLFKCGIAVAPVSSWEYYASVYTERFMGLPTKDDNLEHYKNSTVMARAEYFRNVDYLLIHGTADDNVHFQNSAQIAKALVNAQVDFQAMWYSDQNHGLSGLSTNHLYTHMTHFLKQCFSLSDGKKKKKKGHHHHHH
136 小鼠FAP UniProt accession no. P97321
137 His標記之小鼠FAP ECD RPSRVYKPEGNTKRALTLKDILNGTFSYKTYFPNWISEQEYLHQSEDDNIVFYNIETRESYIILSNSTMKSVNATDYGLSPDRQFVYLESDYSKLWRYSYTATYYIYDLQNGEFVRGYELPRPIQYLCWSPVGSKLAYVYQNNIYLKQRPGDPPFQITYTGRENRIFNGIPDWVYEEEMLATKYALWWSPDGKFLAYVEFNDSDIPIIAYSYYGDGQYPRTINIPYPKAGAKNPVVRVFIVDTTYPHHVGPMEVPVPEMIASSDYYFSWLTWVSSERVCLQWLKRVQNVSVLSICDFREDWHAWECPKNQEHVEESRTGWAGGFFVSTPAFSQDATSYYKIFSDKDGYKHIHYIKDTVENAIQITSGKWEAIYIFRVTQDSLFYSSNEFEGYPGRRNIYRISIGNSPPSKKCVTCHLRKERCQYYTASFSYKAKYYALVCYGPGLPISTLHDGRTDQEIQVLEENKELENSLRNIQLPKVEIKKLKDGGLTFWYKMILPPQFDRSKKYPLLIQVYGGPCSQSVKSVFAVNWITYLASKEGIVIALVDGRGTAFQGDKFLHAVYRKLGVYEVEDQLTAVRKFIEMGFIDEERIAIWGWSYGGYVSSLALASGTGLFKCGIAVAPVSSWEYYASIYSERFMGLPTKDDNLEHYKNSTVMARAEYFRNVDYLLIHGTADDNVHFQNSAQIAKALVNAQVDFQAMWYSDQNHGILSGRSQNHLYTHMTHFLKQCFSLSDGKKKKKKGHHHHHH
138 His標記之食蟹獼猴FAP ECD RPPRVHNSEENTMRALTLKDILNGTFSYKTFFPNWISGQEYLHQSADNNIVLYNIETGQSYTILSNRTMKSVNASNYGLSPDRQFVYLESDYSKLWRYSYTATYYIYDLSNGEFVRGNELPRPIQYLCWSPVGSKLAYVYQNNIYLKQRPGDPPFQITFNGRENKIFNGIPDWVYEEEMLATKYALWWSPNGKFLAYAEFNDTDIPVIAYSYYGDEQYPRTINIPYPKAGAKNPFVRIFIIDTTYPAYVGPQEVPVPAMIASSDYYFSWLTWVTDERVCLQWLKRVQNVSVLSICDFREDWQTWDCPKTQEHIEESRTGWAGGFFVSTPVFSYDAISYYKIFSDKDGYKHIHYIKDTVENAIQITSGKWEAINIFRVTQDSLFYSSNEFEDYPGRRNIYRISIGSYPPSKKCVTCHLRKERCQYYTASFSDYAKYYALVCYGPGIPISTLHDGRTDQEIKILEENKELENALKNIQLPKEEIKKLEVDEITLWYKMILPPQFDRSKKYPLLIQVYGGPCSQSVRSVFAVNWISYLASKEGMVIALVDGRGTAFQGDKLLYAVYRKLGVYEVEDQITAVRKFIEMGFIDEKRIAIWGWSYGGYVSSLALASGTGLFKCGIAVAPVSSWEYYASVYTERFMGLPTKDDNLEHYKNSTVMARAEYFRNVDYLLIHGTADDNVHFQNSAQIAKALVNAQVDFQAMWYSDQNHGLSGLSTNHLYTHMTHFLKQCFSLSDGKKKKKKGHHHHHH
139 人類FolR1 UniProt寄存編號P15328
140 鼠科FolR1 UniProt寄存編號P35846
141 食蟹獼猴FolR1 UniProt寄存編號G7PR14
142 人類MCSP UniProt寄存編號Q6UVK1
143 人類EGFR UniProt寄存編號P00533
144 人類HER2 Uniprot寄存編號P04626
145 p95 HER2 MPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSIISAVVGILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAMPNQAQMRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCMQIAKGMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMALESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQNEDLGPASPLDSTFYRSLLEDDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRSGGGDLTLGLEPSEEEAPRSPLAPSEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVPLPSETDGYVAPLTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAARPAGATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEYLTPQGGAAPQPHPPPAFSPAFDNLYYWDQDPPERGAPPSTFKGTPTAENPEYLGLDVPV
146 肽連接子(G4S) GGGGS
147 肽連接子(G4S)2 GGGGSGGGGS
148 肽連接子(SG4)2 SGGGGSGGGG
149 肽連接子G4(SG4)2 GGGGSGGGGSGGGG
150 肽連接子 GSPGSSSSGS
151 (G4S)3肽連接子 GGGGSGGGGSGGGGS3
152 (G4S)4肽連接子 GGGGSGGGGSGGGGSGGGGS
153 肽連接子 GSGSGSGS
154 肽連接子 GSGSGNGS
155 肽連接子 GGSGSGSG
156 肽連接子 GGSGSG
157 肽連接子 GGSG
158 肽連接子 GGSGNGSG
159 肽連接子 GGNGSGSG
160 肽連接子 GGNGSG
161 基於CEACAM5之抗原Hu N(A2-B2)A-avi-His QLTTESMPFNVAEGKEVLLLVHNLPQQLFGYSWYKGERVDGNRQIVGYAIGTQQATPGPANSGRETIYPNASLLIQNVTQNDTGFYTLQVIKSDLVNEEATGQFHVYPELPKPFITSNNSNPVEDEDAVALTCEPEIQNTTYLWWVNNQSLPVSPRLQLSNDNRTLTLLSVTRNDVGPYECGIQNKLSVDHSDPVILNVLYGPDDPTISPSYTYYRPGVNLSLSCHAASNPPAQYSWLIDGNIQQHTQELFISNITEKNSGLYTCQANNSASGHSRTTVKTITVSALSPVVAKPQIKASKTTVTGDKDSVNLTCSTNDTGISIRWFFKNQSLPSSERMKLSQGNITLSINPVKREDAGTYWCEVFNPISKNQSDPIMLNVNYNALPQENLINVDGSGLNDIFEAQKIEWHEARAHHHHHH
162 Avi標籤 GLNDIFEAQKIEWHE
關於人類免疫球蛋白輕鏈及重鏈之核苷酸序列之一般資訊提供於Kabat, E.A.等人，Sequences of Proteins of Immunological Interest，第5版，Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)中。抗體鏈之胺基酸係根據Kabat之編號系統(Kabat, E.A.等人，Sequences of Proteins of Immunological Interest，第5版，Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991))編號及提及，如上所定義。
下列編號段落描述本發明之態樣： 1.一種超促效CD28抗原結合分子，其能二價結合至CD28且包含 (a)能特異性結合至CD28之兩個或更多個抗原結合域， (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之至少一個抗原結合域，及 (c)由能穩定締合之第一亞單元及第二亞單元組成之包含一或多個胺基酸取代的Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能。 2.如段落1之超促效CD28抗原結合分子，其包含能特異性結合至CD28之兩個抗原結合域。 3.如段落1或2之超促效CD28抗原結合分子，其中該Fc域為IgG，特定言之IgG1 Fc域或IgG4 Fc域。 4.如段落1至3中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其中該Fc域係人類IgG1子類且包含該等胺基酸突變L234A、L235A及P329G (根據Kabat EU索引編號)。 5.如段落1至4中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含 (i)重鏈可變區(VH CD28)，其包含SEQ ID NO: 20之重鏈互補決定區CDR-H1、SEQ ID NO: 21之CDR-H2及SEQ ID NO: 22之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含SEQ ID NO: 23之輕鏈互補決定區CDR-L1、SEQ ID NO: 24之CDR-L2及SEQ ID NO: 25之CDR-L3；或 (ii)重鏈可變區(VH CD28)，其包含SEQ ID NO: 36之CDR-H1、SEQ ID NO: 37之CDR-H2及SEQ ID NO: 38之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含SEQ ID NO: 39之CDR-L1，SEQ ID NO: 40之CDR-L2及SEQ ID NO: 41之CDR-L3。 6.如段落1至5中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含重鏈可變區(VH CD28)，其包含SEQ ID NO: 20之CDR-H1、SEQ ID NO: 21之CDR-H2及SEQ ID NO: 22之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含SEQ ID NO: 23之CDR-L1、SEQ ID NO: 24之CDR-L2及SEQ ID NO: 25之CDR-L3。 7.如段落1至5中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含重鏈可變區(VH CD28)，其包含與SEQ ID NO: 26之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含與SEQ ID NO: 27之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列。 8.如段落1至5中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含重鏈可變區(VH CD28)，其包含選自由SEQ ID NO: 42、SEQ ID NO: 43、SEQ ID NO: 44、SEQ ID NO: 45、SEQ ID NO: 46、SEQ ID NO: 47、SEQ ID NO: 48、SEQ ID NO: 49、SEQ ID NO: 50及SEQ ID NO: 51組成之群之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含選自由SEQ ID NO: 27、SEQ ID NO: 52、SEQ ID NO: 53、SEQ ID NO: 54、SEQ ID NO: 55、SEQ ID NO: 56、SEQ ID NO: 57、SEQ ID NO: 58、SEQ ID NO: 59、SEQ ID NO: 60及SEQ ID NO: 61組成之群之胺基酸序列。 9.如段落1至5或8中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含 (a)包含SEQ ID NO: 47之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 54之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (b)包含SEQ ID NO: 47之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (c)包含SEQ ID NO: 51之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 61之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (d)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 53之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (e)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 54之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (f)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 59之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (g)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (h)包含SEQ ID NO: 43之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (i)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 53之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (j)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 59之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (k)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)。 10.如段落1至9中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各為Fab片段。 11.如段落1至10中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至腫瘤相關抗原之抗原結合域為能特異性結合至癌胚抗原(CEA)之抗原結合域。 12.如段落1至11中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至CEA之抗原結合域包含重鏈可變區(VH CEA)，其包含(i)包含SEQ ID NO: 127之胺基酸序列之CDR-H1，(ii)包含SEQ ID NO: 128之胺基酸序列之CDR-H2，及(iii)包含SEQ ID NO: 129之胺基酸序列之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CEA)，其包含(iv)包含SEQ ID NO: 130之胺基酸序列之CDR-L1，(v)包含SEQ ID NO: 131之胺基酸序列之CDR-L2，及(vi)包含SEQ ID NO: 132之胺基酸序列之CDR-L3。 13.如段落1至12中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至CEA之抗原結合域包含重鏈可變區(VH CEA)，其包含與SEQ ID NO: 133之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL CEA)，其包含與SEQ ID NO: 134之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列。 14.如段落1至10中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至腫瘤相關抗原之抗原結合域為能特異性結合至纖維母細胞活化蛋白(FAP)之抗原結合域。 15.如段落1至10或14中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至FAP之抗原結合域包含 (a)重鏈可變區(VH FAP)，其包含(i)包含SEQ ID NO: 12之胺基酸序列之CDR-H1，(ii)包含SEQ ID NO: 13之胺基酸序列之CDR-H2，及(iii)包含SEQ ID NO: 14之胺基酸序列之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL FAP)，其包含(iv)包含SEQ ID NO: 15之胺基酸序列之CDR-L1，(v)包含SEQ ID NO: 16之胺基酸序列之CDR-L2，及(vi)包含SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之CDR-L3，或 (b)重鏈可變區(VH FAP)，其包含(i)包含SEQ ID NO: 4之胺基酸序列之CDR-H1，(ii)包含SEQ ID NO: 5之胺基酸序列之CDR-H2，及(iii)包含SEQ ID NO: 6之胺基酸序列之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL FAP)，其包含(iv)包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列之CDR-L1，(v)包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列之CDR-L2，及(vi)包含SEQ ID NO: 9之胺基酸序列之CDR-L3。 16.如段落1至10或14或15中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至FAP之抗原結合域包含 (a)重鏈可變區(VH FAP)，其包含與SEQ ID NO: 18之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL FAP)，其包含與SEQ ID NO: 19之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列，或 (b)重鏈可變區(VH FAP)，其包含與SEQ ID NO: 10之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL FAP，其包含與SEQ ID NO: 11之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列)。 17. 如段落1至10或14中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至FAP之抗原結合域包含：包含SEQ ID NO: 18之胺基酸序列之重鏈可變區(VH FAP)及包含SEQ ID NO: 19之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL FAP)。 18. 如段落1至17中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其包含 (a) 抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之VH及VL域，其中該VH域經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端且其中該VL域經由肽連接子連接至該第二重鏈之C端。 19.如段落1至17中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其包含 (a) 抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之crossFab片段，其經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端。 20.如段落1至17中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其包含 (a) 抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之兩個crossFab片段，其中一個crossFab片段經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端且其中另一crossFab片段經由肽連接子連接至該第二重鏈之C端。 21.一種多核苷酸，其編碼如段落1至20中任一項之雙特異性抗原結合分子。 22.一種宿主細胞，其包含如段落21之多核苷酸。 23.一種製備如段落1至20中任一項之超促效CD28抗原結合分子之方法，其包括如段落22之宿主細胞在適於該雙特異性抗原結合分子表現之條件下培養。 24.一種醫藥組合物，其包含如段落1至20中任一項之超促效CD28抗原結合分子及至少一種醫藥上可接受之賦形劑。 25.如段落24之醫藥組合物，其用於治療癌症。 26. 如段落1至20中任一項之超促效CD28抗原結合分子或如段落24之醫藥組合物，其用作藥劑。 27. 如段落1至20中任一項之超促效CD28抗原結合分子或如段落24之醫藥組合物，其用於治療癌症。 28. 如段落1至20中任一項之超促效CD28抗原結合分子，其用於治療癌症，其中該超促效CD28抗原結合分子與化療劑、放射療法及/或用於癌症免疫療法之其他藥劑組合投與。 29.一種如段落1至20中任一項之超促效CD28抗原結合分子或如段落24之醫藥組合物之用途，其用於製造用於治療癌症之藥劑。 30.一種抑制個體之腫瘤細胞生長之方法，其包括向該個體投與有效量之如段落1至20中任一項之超促效CD28抗原結合分子或如段落24之醫藥組合物以抑制該等腫瘤細胞之生長。 31.一種治療癌症之方法，其包括向該個體投與治療上有效量之如段落1至20中任一項之超促效CD28抗原結合分子或如段落24之醫藥組合物。***
實例 下列為本發明之方法及組合物之實例。應瞭解，可鑑於以上所提供之一般描述實踐各種其他實施例。
重組DNA技術 使用標準方法操作DNA，如Sambrook等人，Molecular cloning: A laboratory manual; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, New York, 1989中所述。根據製造商之說明使用分子生物試劑。關於人類免疫球蛋白輕鏈及重鏈之核苷酸序列之一般資訊提供於Kabat, E.A.等人，(1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest，第5版，NIH出版第91-3242號中。
DNA定序 藉由雙股定序測定DNA序列。
基因合成 在需要時，所需基因片段藉由PCR使用適宜模板產生或藉由自動基因合成在Geneart AG (Regensburg, Germany)或Genscript (New Jersey, USA)下自合成寡核苷酸及PCR產物合成。將位於單個限制核酸內切酶裂解位點側面之基因片段選殖至標準選殖/定序載體中。將質粒DNA自轉形細菌純化及藉由UV光譜法測定濃度。藉由DNA定序證實經次選殖之基因片段之DNA序列。利用適宜限制位點設計基因片段以允許次選殖至各自表現載體。利用編碼前導肽之5’端DNA序列設計所有構築體，該前導肽靶向於真核細胞中分泌之蛋白質。
細胞培養技術 使用標準細胞培養技術，如Current Protocols in Cell Biology (2000), Bonifacino, J.S., Dasso, M., Harford, J.B., Lippincott-Schwartz, J.及Yamada, K.M. (編輯), John Wiley & Sons, Inc.中所述。
蛋白質純化 參考標準方案將蛋白質自經過濾之細胞培養物上清液純化。簡言之，將抗體施覆於蛋白A瓊脂糖管柱(GE healthcare)及用PBS洗滌。在pH 2.8下達成抗體之溶離，接著立即中和樣品。藉由尺寸排阻層析法(Superdex 200, GE Healthcare)於PBS中或於20 mM組胺酸、150 mM NaCl pH 6.0中將聚集之蛋白質自單體抗體分離。彙集單體抗體片段，使用例如MILLIPORE Amicon Ultra (30 MWCO)離心濃縮機濃縮(若需要)，冷凍及儲存在-20℃或-80℃下。提供部分樣品用於隨後蛋白質分析及分析表徵，例如藉由SDS-PAGE、尺寸排阻層析法(SEC)或質譜法。
SDS-PAGE 根據製造商之說明，使用NuPAGE®預製凝膠系統(Invitrogen)。特定言之，使用10%或4至12% NuPAGE® Novex® Bis-TRIS預製凝膠(pH 6.4)及NuPAGE® MES (還原凝膠，具有NuPAGE®抗氧化劑運行緩衝液添加劑)或MOPS (非還原凝膠)運行緩衝液。
分析型尺寸排阻層析法 藉由HPLC層析法進行尺寸排阻層析法(SEC)以測定抗體之聚集及低聚狀態。簡言之，將蛋白A純化抗體施覆於Agilent HPLC 1100系統上之300 mM NaCl，50 mM KH2 PO4 /K2 HPO4 ，pH 7.5中之Tosoh TSKgel G3000SW管柱或Dionex HPLC-系統上之2 x PBS中之Superdex 200管柱(GE Healthcare)。將經溶離蛋白質藉由UV吸光度量化及將峰面積積分。BioRad凝膠過濾標準151-1901用作標準。
質譜法 此節描述具有強調其正確組裝之VH/VL交換(VH/VL CrossMab)之多特異性抗體之表徵。藉由經去糖基化之完整CrossMab及經去糖基化/纖維蛋白溶酶消化之或經去糖基化/受限LysC消化之CrossMab之電噴霧粒子質譜法(ESI-MS)分析預期初級結構。
在1 mg/ml之蛋白質濃度下，將VH/VL CrossMab於磷酸鹽或Tris緩衝液中在37℃下用N-糖苷酶F去糖基化持續至多17個小時。於Tris緩衝液pH 8中用100 µg經去糖基化之VH/VL CrossMab進行纖維蛋白溶酶或受限LysC (Roche)消化，各自在室溫下持續120小時及在37℃下持續40分鐘。在質譜法之前，將樣品在Sephadex G25管柱(GE Healthcare)上經由HPLC脫鹽。在配備有TriVersa NanoMate源(Advion)之maXis 4G UHR-QTOF MS系統(Bruker Daltonik)上經由ESI-MS測定總質量。
使用表面電漿子共振 (SPR) (BIACORE) 測定多特異性抗體與各自抗原之結合及結合親和力 藉由表面電漿子共振，使用BIACORE儀器(GE Healthcare Biosciences AB, Uppsala, Sweden)研究所產生之抗體與各自抗原之結合。簡言之，針對親和力量測，將山羊抗人類IgG，JIR 109-005-098抗體經由胺偶合固定在CM5晶片上以呈現抗體對抗各自抗原。於HBS緩衝液(HBS-P (10 mM HEPES，150 mM NaCl，0.005% Tween 20，pH 7.4)中，25℃下(或37℃下)量測結合。將抗原(R&D Systems或室內經純化)以各種濃度添加至溶液中。藉由80秒至3分鐘之抗原注射量測締合；藉由用HBS緩衝液洗滌晶片表面3至10分鐘量測締合及使用1:1朗格繆爾(Langmuir)結合模型評估KD值。自樣品曲線減去陰性對照數據(例如緩衝曲線)以校正系統固有基線漂移及減少噪音信號。使用相應Biacore評價軟體分析感測圖及計算親和力數據。
實例 1 靶向 CD28 及纖維母細胞活化蛋白 (FAP) 或癌胚抗原 (CEA) 之雙特異性或三特異性抗體之產生及製備 1.1 靶向 CD28 及纖維母細胞活化蛋白 (FAP) 或癌胚抗原 (CEA) 之雙特異性或三特異性抗體之選殖 抗原之選殖： 將編碼人類CD28 (Uniprot: P10747)之細胞外域(成熟蛋白質之胺基酸1至134)之DNA片段以框架插入編碼hum IgG1 Fc片段之片段上游之兩個不同哺乳動物受體載體中，該Fc片段用作溶解度及純化標籤。該等表現載體中之一者含有Fc區中之「穴」突變，另一者含有「隆突」突變以及C端avi標籤(GLNDIFEAQKIEWHE, SEQ ID NO: 162)，其允許在與Bir A生物素連接酶共同表現期間特異性生物素化。此外，兩個Fc片段均含有PG-LALA突變。兩個載體均與編碼BirA生物素連接酶之質粒組合共轉染，以得到在Fc-隆突鏈之C端處具有一價經生物素化之avi-標籤之二聚體CD28-Fc構築體。
FAP純系4B9、CEA結合劑及CD28純系SA及mAb 9.3之可變域係用於產生各種靶向腫瘤之CD28構築體。FAP純系4B9之產生及製備揭示於WO 2012/020006 A2中，其係以引用的方式併入本文中。本文中稱作MEDI-565之CEA純系述於WO 2007/071422中及該CD28超促效抗體(SA)述於WO 2006/050949中。抗體mAb 9.3之描述可見於Tan等人，J. Immunology 2002, 169, 1119-1125中。用於產生各自表現質粒，使用各自可變域之序列及於具有各自恆定區之框架中次選殖，該等恆定區經預先插入各自受體哺乳動物表現載體中。所得分子之示意性描述示於圖 1A 至 1L 中。在指示之情況下，已將Pro329Gly、Leu234Ala及Leu235Ala突變(PG-LALA)引入人類IgG1重鏈之恆定區以廢除與Fcγ受體之結合。用於產生不對稱雙特異性抗體，Fc-片段含有「隆突」或「穴」突變以避免重鏈之錯配。為避免雙特異性及多特異性抗體構築體之輕鏈之錯配，將VH/VL或CH1/Cκ域之交換引入一個結合部分中(CrossFab技術)。於另一結合部分中，將電荷引入CH1及Cκ域中。
將下列分子選殖，圖 1A 至 1L 中顯示特異性分子之示意性說明： 分子A：CD28(SA) (hu IgG4)、TGN1412、人類IgG4同型之CD28 (SA)抗體( 圖 1A) 包含SEQ ID NO: 62及SEQ ID NO: 63 (P1AE1975)之胺基酸序列。 分子B：CD28(SA) (PG-LALA)，huIgG1 PG-LALA同型之CD28 (SA)抗體( 圖 1B) 包含SEQ ID NO: 62及SEQ ID NO: 64 (P1AD9289)之胺基酸序列。 分子C：FAP(4B9)-CD28(SA) 1+1形式，具有CD28(SA) Fab片段(隆突)中之帶電荷修飾及FAP(4B9) Fab片段(穴)中之VH/VL交換之雙特異性huIgG1 PG-LALA CrossFab分子( 圖 1C) ，其包含SEQ ID NO: 65、66、67及68 (P1AD4492)之胺基酸序列。 分子D：FAP(4B9)-CD28(SA) 1+4形式，雙特異性四價抗CD28 (SA)及一價抗FAP huIgG1 PG-LALA構築體。FAP純系4B9之VH及VL域經融合至Fc域之各自鏈之C端(VH：隆突鏈，VL：穴鏈)( 圖 1F )。該分子包含SEQ ID NO: 62、69及70 (P1AD9018)之胺基酸序列。 分子E：FAP(4B9)-CD28(SA) 1+2形式，雙特異性二價抗CD28 (SA)及一價抗FAP huIgG1 PG-LALA構築體。FAP純系4B9之VH及VL域經融合至Fc域之各自鏈之C端(VH：隆突鏈，VL：穴鏈)( 圖 1D) 。該分子包含SEQ ID NO: 62、71及72 (P1AD9011)之胺基酸序列。 分子F：FAP(4B9)-CD28(SA) 2+2，雙特異性二價抗CD28 (SA)及二價抗FAP huIgG1 PG-LALA CrossFab構築體，於抗CD28 Fab片段中帶電荷修飾，具有CH1/Cκ交換之抗FAP CrossFab片段VH融合至Fc片段之C端( 圖 1E) 。該分子包含SEQ ID NO: 65、73及74 (P1AD4493)之胺基酸序列。 分子G：FAP (4B9)-CD28 (SA) 2+1，雙特異性一價抗CD28 (SA)及二價抗FAP huIgG1 PG-LALA CrossFab構築體，「經典定向」，於抗CD28 CrossFab片段中VH/VL交換，於抗FAP Fab片段中帶電荷修飾。該分子包含SEQ ID NO: 75、76、77及78 (P1AD5231)之胺基酸序列。 分子H：FAP(4B9) - CD28(SA) C-01，1+1雙特異性一價抗CD28 (SA)及一價抗FAP huIgG1 PG-LALA CrossFab分子，「頭至尾」，於抗CD28 CrossFab片段中VH/VL交換，於抗FAP結合劑中帶電荷修飾。該分子包含SEQ ID NO: 75、77、78及79 (P1AE2021)之胺基酸序列。 分子I：FAP(4B9) - CD28(SA) C-04，1+1雙特異性一價抗CD28 (SA)及一價抗FAP huIgG1 PG-LALA構築體。FAP結合劑4B9之VH及VL域經融合至Fc片段之各自鏈之C端(VH：隆突鏈，VL：穴鏈)。該分子包含SEQ ID NO: SEQ ID NO: 62、72及80 (P1AE2236)之胺基酸序列。 分子J：CEA(Medi565)-CD28SA) 2+2，雙特異性二價抗CD28 (SA)及二價抗CEA huIgG1 PG-LALA CrossFab構築體，於抗CD28 Fab片段中帶電荷修飾，具有CH1/Cκ交換之抗CEA CrossFab片段VH融合至Fc片段之C端( 圖 1H) 。該分子包含SEQ ID NO: 65、81及82 (P1AE1195)之胺基酸序列。 分子K：CEA(Medi565)-CD28(SA) 1+2，雙特異性二價抗CD28 (SA)及一價抗CEA huIgG1 PG-LALA構築體。CEA結合劑之VH及VL域經融合至Fc片段之各自鏈之C端(VH：隆突鏈，VL：穴鏈)( 圖 1G) 。該分子包含SEQ ID NO: 62、83及84 (P1AE1194)之胺基酸序列。 分子L：一價IgG CD28 (SA)，一價抗CD28 (SA) huIgG1 PG-LALA構築體，其中該CD28重鏈經表示為與Fc (隆突)片段組合之「穴」Fc鏈( 圖 1I) 。該分子包含SEQ ID NO: 65、85及86 (P1AD8944)之胺基酸序列。 分子M：CEA-CD28(SA) 1+1形式，具有CD28(SA) Fab片段(隆突)中之帶電荷修飾及CEA crossFab片段(穴)中之VH/VL交換之雙特異性huIgG1 PG-LALA CrossFab分子( 圖 1J) ，其包含SEQ ID NO: 65、66、87及88 (P1AE3127)之胺基酸序列。 分子N：mab 9.3 (PG-LALA)，人類IgG1 PG-LALA同型中之mAb9.3純系( 如圖 1B 中 ) 。該分子包含SEQ ID NO: 89及90 (P1AD5142)之胺基酸序列。 分子O：FAP(4B9) - CD28(mAb9.3) C-03，具有mAb9.3 Fab片段(隆突)中之帶電荷修飾及抗FAP片段(穴)中之VH/VL交換之雙特異性huIgG1 PG-LALA CrossFab構築體( 如圖 1C 中 ) 。該分子包含SEQ ID NO: 67、68、91及92 (P1AE2238)之胺基酸序列。 分子P：FAP(4B9)-CD28(mAb9.3) 1+4，雙特異性四價抗CD28 mAb9.3及一價抗FAP huIgG1 PG-LALA構築體。FAP結合劑之VH及VL域經融合至Fc片段之各自鏈之C端(VH：隆突鏈，VL：穴鏈)( 如圖 1F 中 ) 。該分子包含SEQ ID NO: 89、93及94 (P1AD8969)之胺基酸序列。 分子Q：FAP(4B9)-CD28(mAb9.3) 1+2，雙特異性二價抗CD28 mAb9.3及一價抗FAP huIgG1 PG-LALA構築體。FAP結合劑之VH及VL域經融合至Fc片段之各自鏈之C端(VH：隆突鏈，VL：穴鏈)( 如圖 1D 中 ) 。該分子包含SEQ ID No: 89、95及96 (P1AD8962)之胺基酸序列。 分子R：FAP(4B9)-CD28(mAb9.3) 2+2，雙特異性二價抗CD28 mAb9.3及二價抗FAP huIgG1 PG-LALA CrossFab構築體，於mAb9.3 FAP片段中帶電荷修飾，具有CH1/Cκ CrossFab交換之抗FAP Fab片段VH融合至Fc片段之C端( 如圖 1E 中 ) 。該分子包含SEQ ID No: 97、98及99 (P1AD8968)之胺基酸序列。 分子S：FAP (4B9)-CD28(mAb9.3) 2+1，雙特異性一價抗CD28 (mAb9.3)及二價抗FAP huIgG1 PG-LALA CrossFab構築體，「經典定向」，於抗CD28 (mAb9.3) CrossFab片段中VH/VL交換，於抗FAP Fab片段中帶電荷修飾。該分子包含SEQ ID No: 76、77、100及101 (P1AD5560)之胺基酸序列。 分子T：FAP(4B9) - CD28(mAb9.3) C-02，雙特異性一價抗CD28 (mAb9.3)及一價抗FAP huIgG1 PG-LALA CrossFab構築體，「頭至尾」，於抗CD28 (mAb9.3) CrossFab片段中VH/VL交換，於抗FAP Fab片段中帶電荷修飾。該分子包含SEQ ID No: 78、79、100及101 (P1AE2022)之胺基酸序列。 分子U：FAP(4B9) - CD28(mAb9.3) C-05，雙特異性一價抗CD28 (mAb9.3)及一價抗FAP huIgG1 PG-LALA構築體。FAP結合劑4B9之VH及VL域經融合至Fc片段之各自鏈之C端(VH：Fc隆突鏈，VL：Fc穴鏈)。該分子包含SEQ ID No: 80、89及96 (P1AE2237)之胺基酸序列。 分子V：CEA-CD28(mAb9.3) 2+2，雙特異性二價抗CD28 (mAb9.3)及二價抗CEA huIgG1 PG-LALA CrossFab構築體，於mAb9.3 Fab片段中帶電荷修飾，具有CH1/Cκ交換之抗CEA CrossFab片段VH融合至Fc片段之C端( 如圖 1H 中 ) 。該分子包含SEQ ID No: 82、89及102 (P1AE1193)之胺基酸序列。 分子W：CEA-CD28(mAb9.3) 1+2，雙特異性二價抗CD28 (mAb9.3)及一價抗CEA huIgG1 PG-LALA構築體。CEA結合劑之VH及VL域經融合至Fc片段之各自鏈之C端(VH：隆突鏈，VL：穴鏈)( 如圖 1G 中 ) 。該分子包含SEQ ID No: 89、103及104 (P1AE1192)之胺基酸序列。 分子X：一價IgG CD28 (mAb9.3)，其中該CD28重鏈表示為與Fc (隆突)片段組合之「穴」Fc鏈( 如圖 1I 中 ) 。該分子包含SEQ ID No: 86、105及106 (P1AD8938)之胺基酸序列。 分子Y：FAP(4B9)-CEA-CD28(SA) 1+1+2，三特異性二價抗CD28、一價抗FAP及一價抗CEA huIgG1 PG-LALA構築體。FAP結合劑之VH及VL域經融合至Fc片段之各自鏈之C端(FAP之VH域：隆突鏈，FAP之VL域：穴鏈)。抗CEA Fab片段VH融合至具有CH1/Cκ CrossFab交換之FAP VH之C端( 圖 1K) 。該分子包含SEQ ID No: 65、107、108及109 (P1AE0487)之胺基酸序列。 分子Z：FAP(4B9)-CEA-CD28(SA) 1+1+2，三特異性二價抗CD28、一價抗FAP及一價抗CEA huIgG1 PG-LALA構築體。FAP及CEA結合劑之VH及VL域經融合至Fc片段之各自鏈之C端(FAP及CEA之VH域：隆突鏈，FAP及CEA之VL域：穴鏈)( 圖 1L) 。該分子包含SEQ ID No: 62、110及111 (P1AE0486)之胺基酸序列。
1.2靶向CD28及纖維母細胞活化蛋白(FAP)或癌胚抗原(CEA)之雙特異性或三特異性抗體之製備 上述分子之表現藉由嵌合MPSV啟動子或CMV啟動子驅動。聚腺苷酸化藉由位於CDS之3’端之合成polyA信號序列驅動。此外，各載體含有用於常染色體複製之EBV OriP序列。
用於製備構築體C至W，使用聚乙烯亞胺作為轉染劑，將於懸浮液中生長之HEK293-EBNA細胞與各自表現載體共轉染。藉由短暫轉染HEK293 EBNA細胞產生抗體及雙特異性抗體。將細胞離心及藉由預升溫之CD CHO培養基更換培養基。將表現載體於CD CHO培養基中混合，添加PEI，將溶液渦旋及在室溫下培育10分鐘。之後，將細胞與該DNA/PEI溶液混合，轉移至藥瓶中及在37℃下於具有5% CO2 氛圍之培育箱中培育3小時。於培育後，添加含有補充物之埃克塞爾(Excell)培養基(Mammalian Cell Cultures for Biologics Manufacturing，編輯：Weichang Zhou、Anne Kantardjieff)。於轉染一天後，添加補充物(進料) (Mammalian Cell Cultures for Biologics Manufacturing，編輯：Weichang Zhou、Anne Kantardjieff)。於7天後藉由離心及隨後過濾(0.2 μm過濾器)收穫細胞上清液及藉由標準方法純化。
藉由Evitria，使用其專有載體系統，利用習知(基於非PCR)選殖技術及使用懸浮液適應之CHO K1細胞(最初接收自ATCC及適應於於Evitria之懸浮培養中無血清生長)製備構築體A、B、X及Y。用於製備，Evitria使用其專有無動物組分及無血清培養基(eviGrow及eviMake2)及其專有轉染劑(eviFect)。藉由離心及隨後過濾(0.2 μm過濾器)收穫上清液及藉由標準方法純化。
1.3靶向CD28及纖維母細胞活化蛋白(FAP)或癌胚抗原(CEA)之雙特異性或三特異性抗體之純化 參考標準方案，將蛋白質自經過濾之細胞培養物上清液純化。簡言之，藉由親和層析法使用蛋白A將含Fc之蛋白質自細胞培養物上清液純化。在pH 3.0下達成溶離，接著立即中和樣品。將蛋白質濃縮及於20 mM組胺酸、140 mM氯化鈉，pH 6.0中藉由尺寸排阻層析法將聚集之蛋白質自單體蛋白分離。
1.4靶向CD28及纖維母細胞活化蛋白(FAP)或癌胚抗原(CEA)之雙特異性或三特異性抗體之分析資料 藉由量測280 nm下之光密度(OD)，使用根據Pace等人，Protein Science, 1995, 4, 2411-1423之基於胺基酸序列計算之質量消光係數來測定經純化構築體之蛋白質濃度。在還原劑之存在及不存在下使用LabChipGXII (Perkin Elmer)藉由CE-SDS分析蛋白質之純度及分子量。在25℃下使用於運行緩衝液(各自為25 mM K2 HPO4 ，125 mM NaCl，200mM L-精胺酸單鹽酸鹽，pH 6.7或200 mM KH2 PO4 ，250 mM KCl pH 6.2)中平衡之分析型尺寸排阻管柱(TSKgel G3000 SW XL或UP-SW3000)藉由HPLC層析法進行聚集內容物之測定。表 1 中提供所有分子之純化參數之概述。表 1 ：雙特異性或三特異性 CD28 抗原結合分子之製備及純化之概述
分子 描述 產率[mg/l] 分析型SEC (HMW/單體/LMW) [%] 藉由CE-SDS量測之純度[%]
A CD28(SA) (hu IgG4) 257 0 / 100 / 0 84.25
B CD28(SA) hu IgG1 (PG-LALA) 390 0 / 97.3 / 2.7 84
C FAP(4B9)-CD28(SA) 1+1 19.5 0.64 / 97.28 / 2.07 98.75
D FAP(4B9)-CD28(TGN1412) 1+4 1.75 3.53 / 96.48 / 0 n.d.
E FAP(4B9)-CD28(SA) 1+2 0.38 0.8 / 95.48 / 3.72 93.58
F FAP(4B9)-CD28(SA) 2+2 18.2 1.4 / 98.6 / 0 91.42
G FAP (4B9)-CD28 (SA) 2+1 2.66 3.79 / 94. 02 / 2.19 64
H FAP(4B9) - CD28(SA) C-01 10.6 0 / 100 / 0 99.38
I FAP(4B9) - CD28(SA) C-04 5.55 4.12 / 81.17 / 14.71 96.5
J CEA-CD28(SA) 2+2 6.25 1 / 99 / 0 n.d.
K CEA-CD28(SA) 1+2 5.8 0.5 / 99.5 / 0 64
L 一價IgG1 CD28 (SA) 38.5 0.2 / 99.6 / 0.2 99.3
M CEA-CD28(SA) 1+1 14.3 0 / 100 / 0 99.18
N CD28 (mAb 9.3) hu IgG1 (PG-LALA) 22.06 0 /100 / 0 88
O FAP(4B9) - CD28(mAb9.3) C-03 2.14 0 / 100 / 0 97.4
P FAP(4B9)-CD28(mAb9.3) 1+4 7.6 1.2 / 98.8 / 0 97.6
Q FAP(4B9)-CD28(mAb9.3) 1+2 16. 1 / 98.5 / 0.5 97.16
R FAP(4B9)-CD28(mAb9.3) 2+2 3.9 0 / 95.5 / 4.5 87
S FAP (4B9)-CD28 (mAb9.3) 2+1 2.63 2.1 / 96.3 / 1.6 90.55
T FAP(4B9) - CD28(mAb9.3) C-02 2.3 0 / 100 / 0 100
U FAP(4B9) - CD28(mAb9.3) C-05 23.78 0.68 / 97.82 / 1.5 96.1
V CEA-CD28(mAb9.3) 2+2 3.1 0 / 100 / 0 100
W CEA-CD28(mAb9.3) 1+2 2.25 0 / 100 / 0 92.8
X 一價IgG1 CD28 (mAb9.3) 20.2 1.4 / 98.6 / 0 97.7
Y FAP(4B9)-CEA-CD28(SA) 1+1+2 11.3 10.7 / 85 / 4.3 85
Z FAP(4B9)-CEA-CD28(SA) 1+1+2 11.8 4.6 / 95.4 / 0 73.6
實例 2 靶向 CD28 及纖維母細胞活化蛋白 (FAP) 或癌胚抗原 (CEA) 之雙特異性或三特異性抗體之結合及動力學分析 2.1 靶向 CD28 及纖維母細胞活化蛋白 (FAP) 之雙特異性抗體與表現 FAP- 及 CD28- 之細胞之結合 使用表現人類纖維母細胞活化蛋白(huFAP)之3T3-huFAP細胞(純系19)測試雙特異性FAP-CD28分子之結合。藉由用表現載體pETR4921轉染小鼠胚胎纖維母細胞NIH/3T3細胞系(ATCC CRL-1658)以在1.5 μg/mL嘌呤黴素(Puromycin)選擇下表現huFAP來產生此細胞系。利用表現人類CD28之CHO細胞(親本細胞系CHO-k1 ATCC #CCL-61，經修飾以穩定過度表現人類CD28)測試與人類CD28之結合。
為評估結合，收穫細胞，計數，檢查活力及以2.5E5/ml再懸浮於FACS緩衝液(eBioscience，目錄號00-4222-26)中。在4℃下，將5x104 個細胞於具有漸增濃度之靶向FAP之CD28構築體(1 pM至100 nM)之圓底96孔板中培育2小時。然後，將細胞用冷FACS緩衝液洗滌三次，在4℃下用PE結合之山羊抗人類PE (Jackson ImmunoReserach，目錄號109-116-098)再培育60分鐘，用冷FACS緩衝液洗滌一次，離心及再懸浮於100 μl FACS緩衝液中。為監測構築體與細胞之間之非特異性結合相互作用，包含抗DP47 IgG作為陰性對照。藉由流動式細胞測量術，利用FACS Fortessa (BD，軟體FACS Diva)，評估結合。使用GraphPadPrism6獲得結合曲線。
該等FAP-CD28分子能以濃度依賴性方式結合至細胞上之人類FAP以及人類CD28二者(圖 2B 及2C 針對某些實例)。如所預期，未檢測到與抗-DP47 IgG之結合，指示該結合檢測係由於藉由各自靶向部分之特異性CD28及FAP結合。
2.2 靶向 CD28 及 CEA 之雙特異性或三特異性抗體之動力學分析 在25℃下，使用ProteOn XPR36儀器(Biorad)，利用藉由中性親和素捕獲之在NLC晶片上固定之經生物素化之huCD28-Fc抗原及經生物素化之Hu N(A2-B2)A-avi-His，藉由SPR量測包含抗CEA (Medi-565)及抗CD28之雙特異性或三特異性抗體之結合部分二者之親和力(KD )。
用於產生含有CEA(Medi-565)之抗原決定基之基於CEACAM5之抗原，產生由兩個CEACAM1及兩個CEACAM5 Ig域組成之嵌合蛋白。基於CEACAM1之序列，將CEACAM1之第二域及第三域經CEACAM5域A2及B2取代。融合C端avi標籤及His標籤用於位點特異性生物素化及純化。將所得蛋白質命名為Hu N(A2-B2)A-avi-His (SEQ ID NO: 161)。
重組抗原(配位體)之固定：將抗原用PBST (10 mM磷酸鹽，150 mM氯化鈉pH 7.4，0.005% Tween 20)稀釋至10 μg/ml，然後在變化之接觸時間下以30 μl/分鐘注射以達成在垂直方向約400、800及1600個反應單位(RU)之固定含量。分析物之注射：針對一次性動力學量測，將注射方向改為水平方向，沿著分開通道1至5以50 μl/min同時注射經純化雙特異性靶向CEA之抗CD28雙特異性抗體之兩倍稀釋系列(在50與3.125 nM之間之變化之濃度範圍)，其中締合時間150秒，及解離時間450秒。沿著第六通道注射緩衝液(PBST)以提供「內線」空白用於參照。使用ProteOn Manager v3.1軟體中之簡易一對一朗格繆爾結合模型藉由同時擬合締合及解離感測圖來計算締合速率常數(kon)及解離速率常數(koff)。以比率koff/kon計算平衡解離常數(KD )。包含一個抗CD28抗原結合域及一個抗CEA抗原結合域之雙特異性抗體(分子M)之經計算之KD 值與各自單特異性構築體之經量測之值一致。下表2中概述動力學及熱力學數據。表 2 ： CEA-CD28(SA) 1+1 ( 分子 M) 之動力學及熱力學分析
結合部分 kon (1/(s*M) koff  (1/s) KD (nM)
抗CEA (Medi-565) 4.13 exp5 1.2 exp-4 0.29
抗CD28 (TGN1412) 3.13 exp5 3.76 exp-4 1.2
實例 3 缺乏熱點及親和力降低之 CD28 (SA) 變異體之產生及表徵 3.1 移除未配對之半胱胺酸殘基、色胺酸殘基、脫醯胺化位點及產生親和力降低之 CD28 (SA) 變異體 作為吾人詳細結合劑表徵之一部分，進行CD28(SA)可變域序列之電腦分析。此分析揭示VH之CDR2區之未配對半胱胺酸(位置50，Kabat編號)，VH之CDR3之色胺酸殘基(位置100a，Kabat編號)及VL之CDR1之色胺酸殘基(位置32，Kabat編號)，及VH之CDR2之潛在天冬醯胺脫醯胺化位點(位置56，Kabat編號)。雖然色胺酸之氧化為相當緩慢過程且可藉由添加還原化合物阻止，但是抗體可變域中之未配對半胱胺酸之存在可係關鍵的。游離半胱胺酸係反應性且可與細胞或培養基之其他蛋白質或組分之其他未配對半胱胺酸形成穩定鍵。結果，此可導致具有未知修飾(其係潛在免疫原)之異源且不穩定產物及因此可對患者帶來風險。此外，天冬醯胺之脫醯胺化及異天冬胺酸鹽及琥珀醯亞胺之由此形成可影響活體外穩定性及活體內生物功能二者。親本鼠科結合劑5.11A之晶體結構分析揭示C50不涉及結合至人類CD28及因此可經相似胺基酸(諸如絲胺酸)取代而不影響與CD28之親和力(表 5 ，變異體29)。然而，兩種色胺酸殘基以及位置50處之天冬醯胺接近於或涉及結合介面及因此藉由相似胺基酸取代可導致結合親和力之降低。於此實例中，吾人特別旨在降低CD28(SA)與人類CD28之親和力，因為下列原因：CD28(SA)之親和力係於1至2 nM之範圍內，具有約32分鐘之結合半衰期。當靜脈內注射至患者時，此強親和力可導致含有大量CD28表現細胞之組織(諸如血液及淋巴組織)中之下沉效應。因此，可減少化合物經由靶向組分FAP及/或CEA之位點特異性靶向及可減少構築體之功效。為最小化此效應，產生若干VH及VL變異體以降低親和力至不同程度(圖 3A 及 3C )。除了先前提及之表示潛在穩定熱點之位置外，直接或間接涉及結合至人類CD28之另外殘基經原始鼠科生殖系胺基酸或藉由相似胺基酸取代。此外，亦將CD28(SA) VL及VH二者之CDR移植至曲妥珠單抗之各自框架序列中(圖 3B 及 3D )。然後將VH及VL變異體之若干組合表示為一價一臂抗CD28 IgG樣構築體及藉由SPR表徵結合。
3.2 藉由 SPR 分析 減少 之一臂抗 CD28 變異體之解離速率常數 (koff ) 為於第一步驟中表徵抗CD28結合劑變異體，將所有結合劑表示為一價一臂IgG樣構築體(圖 4A )。選擇此形式以表徵於1:1模型中與CD28之結合。於轉染至HEK細胞中5天後，收穫上清液及測定經表現構築體之效價。
在25℃下，使用ProteOn XPR36儀器(Biorad)，利用藉由中性親和素捕獲之在NLC晶片上固定之經生物素化之huCD28-Fc抗原，藉由表面電漿子共振(SPR)測定抗CD28結合劑變異體之解離速率。用於固定重組抗原(配位體)，將huCD28-Fc用PBST (具有Tween 20之磷酸鹽緩衝鹽水，其由10 mM磷酸鹽、150 mM氯化鈉pH 7.4、0.005% Tween 20組成)稀釋至100至500 nM範圍之濃度，然後在變化之接觸時間下以25 μl/分鐘注射。此導致在垂直方向之1000至3000個反應單位(RU)之固定含量。
針對一次性動力學量測，將注射方向改為水平方向。基於所產生之上清液之效價，將一價一臂IgG用PBST稀釋以得到100 nM至6.25 nM範圍之兩倍稀釋系列。沿著分開通道1至5以50 μl/min同時進行注射，具有120秒之締合時間，及300秒之解離時間。沿著第六通道注射緩衝液(PBST)以提供「內線」空白用於參照。因為利用來自上清液之未純化及生物化學表徵之一價一臂IgG量測結合相互作用，僅將蛋白質：蛋白質相互作用之解離速率用於進一步結論。使用ProteOn Manager v3.1軟體中之簡易一對一朗格繆爾結合模型，藉由擬合解離感測圖，來計算解離速率。表 2A 中概述所有純系之解離速率常數(koff )值。所產生之變異體之比較揭示相較於親本序列具有至多30倍減少之koff 值。表 2A ：所有表 示 之一價抗 CD28 變異體 與 解離速率常數 (koff ) 值之概述
結合劑變異體 Tapir ID SEQ ID NO: SEQ ID NO: SEQ ID NO: koff (10-4 /M)
CD28(SA)_變異體_1 (親本CD28) P1AE4441 112 65 126 3.0
CD28(SA)_變異體_2 P1AE3058 113 120 126 N/A
CD28(SA)_變異體_3 P1AE3059 113 121 126 N/A
CD28(SA)_變異體_4 P1AE3060 113 122 126 N/A
CD28(SA)_變異體_5 P1AE3061 113 65 126 N/A
CD28(SA)_變異體_6 P1AE3062 114 120 126 N/A
CD28(SA)_變異體_7 P1AE3063 114 121 126 100
CD28(SA)_變異體_8 P1AE3064 114 122 126 68
CD28(SA)_變異體_9 P1AE3065 114 123 126 78
CD28(SA)_變異體_10 P1AE3066 114 124 126 N/A
CD28(SA)_變異體_11 P1AE3067 114 65 126 37
CD28(SA)_變異體_12 P1AE3068 115 125 126 2.4
CD28(SA)_變異體_13 P1AE3069 115 65 126 1.9
CD28(SA)_變異體_14 P1AE3070 116 120 126 100
CD28(SA)_變異體_15 P1AE3071 116 121 126 24
CD28(SA)_變異體_16 P1AE3072 116 122 126 10
CD28(SA)_變異體_17 P1AE3073 116 123 126 14
CD28(SA)_變異體_18 P1AE3074 116 124 126 82
CD28(SA)_變異體_19 P1AE3075 116 65 126 2.9
CD28(SA)_變異體_20 P1AE3076 117 120 126 N/A
CD28(SA)_變異體_21 P1AE3077 117 121 126 N/A
CD28(SA)_變異體_22 P1AE3078 117 122 126 61
CD28(SA)_變異體_23 P1AE3079 117 65 126 43
CD28(SA)_變異體_24 P1AE3080 118 120 126 80
CD28(SA)_變異體_25 P1AE3081 118 121 126 3.51
CD28(SA)_變異體_26 P1AE3082 118 122 126 9.7
CD28(SA)_變異體_27 P1AE3083 118 123 126 14
CD28(SA)_變異體_28 P1AE3084 118 124 126 69
CD28(SA)_變異體_29 P1AE3085 118 65 126 2.5
CD28(SA)_變異體_30 P1AE3086 119 125 126 3.22
CD28(SA)_變異體_31 P1AE3087 119 65 126 2.5
3.3雙特異性靶向FAP之抗CD28親和力變異體之製備及動力學分析 基於對表現CD28之細胞之解離速率分析及結合研究，選擇具有不同結合強度之抗CD28 VH及VL變異體之若干組合並表示為靶向FAP之雙特異性huIgG1 PG-LALA CrossFab分子(針對SEQ ID NO:之組合，參見表 3 )。將呈1+1形式之所得構築體(圖 1C )純化及進行生物化學分析(表 4 )。 表3：所有表示之1+1雙特異性靶向FAP之抗CD28變異體之概述
結合劑變異體 Tapir ID SEQ ID NO: SEQ ID NO: SEQ ID NO: SEQ ID NO:
FAP (4B9)-CD28 (CD28(SA)_變異體8) 1+1 P1AE3131 67 68 114 122
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體11) 1+1 P1AE3132 67 68 114 65
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體12) 1+1 P1AE3133 67 68 115 125
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體15) 1+1 P1AE3134 67 68 116 121
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體16) 1+1 P1AE3135 67 68 116 122
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體17) 1+1 P1AE3136 67 68 116 123
 FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體19) 1+1 P1AE3137 67 68 116 65
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體23) 1+1 P1AE3138 67 68 117 65
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體25) 1+1 P1AE3139 67 68 118 121
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體27) 1+1 P1AE3140 67 68 118 123
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體29) 1+1 P1AE3141 67 68 118 65
表 4 ： 靶向 FAP 之抗 CD28 變異體之製備及純化之概述
TaPIR ID 雙特異性分子 產率[mg/l] 分析型SEC (HMW/單體/LMW) [%] 藉由CE-SDS量測之純度[%]
P1AE3131 FAP (4B9)-CD28 (CD28(SA)_變異體8) 1+1 11.8 0.1 / 98.5 / 1.4 100
P1AE3132 FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體11) 1+1 8.1 0.5 / 97.4 / 2.1 100
P1AE3133 FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體12) 1+1 6.1 0 / 100 / 0’ 100
P1AE3134 FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體15) 1+1 9.2 0 / 100 / 0 100
P1AE3135 FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體16) 1+1 0.4 0 / 100 / 0 97
P1AE3136 FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體17) 1+1 1.35 0 / 78.7 / 21.3 87
P1AE3137  FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體19) 1+1 2.6 0 / 100 / 0 100
P1AE3138 FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體23) 1+1 15.5 0 / 97.5 / 2.5 98
P1AE3139 FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體25) 1+1 5.4 0 / 88.7 / 11.3 100
P1AE3140 FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體27) 1+1 9.7 0 / 98.3 / 1.7 96
P1AE3141 FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體29) 1+1 1.76 1 / 99 / 0 96.3
在25℃下，使用ProteOn XPR36儀器(Biorad)，利用藉由中性親和素捕獲之在NLC晶片上固定之經生物素化之huCD28-Fc抗原，藉由SPR量測所產生之雙特異性抗原結合分子與CD28之親和力(KD )。重組抗原(配位體)之固定：將抗原用PBST (10 mM磷酸鹽、150 mM氯化鈉pH 7.4、0.005% Tween 20)稀釋至10 μg/ml，然後在變化之接觸時間下以30 μl/分鐘注射以達成在垂直方向之約200、400或800個反應單位(RU)之固定含量。分析物之注射：針對一次性動力學量測，將注射方向改為水平方向，沿著分開通道1至5以50 μl/min同時注射經純化之雙特異性靶向FAP之抗CD28親和變異體之兩倍稀釋系列(變化濃度範圍在50與3.125 nM之間)，具有150秒之締合時間，及450秒之解離時間。沿著第六通道注射緩衝液(PBST)以提供「內線」空白用於參照。使用ProteOn Manager v3.1軟體中之簡易一對一朗格繆爾結合模型，藉由同時擬合締合及解離感測圖，來計算締合速率常數(kon )及解離速率常數(koff )。以比率koff /kon 計算平衡解離常數(KD )。所分析之純系揭示寬範圍(1與25 nM之間)之KD 值。表 5 中概述動力學及熱力學數據。 表5：所表示之靶向FAP之抗CD28變異體之動力學及熱力學分析
雙特異性分子 kon (1/(s*M) koff  (1/s) KD (nM)
親本 3.79 exp5 3.6 exp-4 1
FAP (4B9)-CD28 (CD28(SA)_變異體8) 1+1 2.19 exp5 5.21 exp-3 23.8
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體11) 1+1 2.3 exp5 2.87 exp-3 12.5
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體12) 1+1 2.6 1exp5 2.67 exp-4 1
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體15) 1+1 2.59 exp5 1.84 exp-3 7.1
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體16) 1+1 1.87 exp5 9.94 exp-4 5.3
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體17) 1+1 3.38 exp5 1.25 exp-3 3.7
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體19) 1+1 2.8 exp5 3.04 exp-4 1.1
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體23) 1+1 2.11 exp5 3.42 exp-3 16.3
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體25) 1+1 2.38 exp5 3.96 exp-4 1.7
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體27) 1+1 2.27 exp5 1.21 exp-3 5.4
FAP (4B9) - CD28 (CD28(SA)_變異體29) 1+1 2.72 exp5 3.07 exp-4 1.1
實例4 一價CD28促效IgG及靶向FAP之CD28促效抗體與表現CD28之細胞之結合 利用表現人類CD28之CHO細胞(親本細胞系CHO-k1 ATCC #CCL-61，經修飾以穩定過度表現人類CD28)測試與人類CD28之結合。為評估結合，收穫細胞，計數，檢查活力及以2.5x105 /ml再懸浮於FACS緩衝液(eBioscience，目錄號00-4222-26)中。在4℃下，將5x104 個細胞於具有漸增濃度之CD28結合劑(1 pM至100 nM)之圓底96孔板中培育2小時。然後，將細胞用冷FACS緩衝液洗滌三次，在4℃下用PE結合之山羊抗人類PE (Jackson ImmunoReserach，目錄號109-116-098)再培育60分鐘，用冷FACS緩衝液洗滌一次，離心及再懸浮於100 μl FACS緩衝液中。為監測構築體與細胞之間之非特異性結合相互作用，包含抗DP47 IgG作為陰性對照。藉由流動式細胞測量術利用FACS Fortessa (BD，軟體FACS Diva)評估結合。使用GraphPadPrism6獲得結合曲線。
一價一臂IgG CD28樣變異體構築體顯示結合差異，如可自圖 4A 至 4C 看出。此外，測定呈1+1形式之雙特異性靶向FAP之抗CD28抗體與表現人類CD28之CHO細胞之結合。具有所選CD28變異體之不同1+1構築體之KD 值示於下表6中或圖 4D 及4E 之對應圖中。表 6 ：靶向 FAP 之抗 CD28 1+1 構築體與表現人類 CD28 之 CHO 細胞之結合
結合劑 TAPIR KD (nM)
TGN1412 P1AD4492 1
變異體8 P1AE3131 23.8
變異體11 P1AE3132 12.5
變異體12 P1AE3133 1
變異體15 P1AE3134 7.1
變異體16 P1AE3135 5.3
變異體17 P1AE3136 3.7
變異體19 P1AE3137 1.1
變異體23 P1AE3138 16.3
變異體25 P1AE3139 1.7
變異體27 P1AE3140 5.4
變異體29 P1AE3141 1.1
實例 5 靶向 CD28 及纖維母細胞活化蛋白 (FAP) 之雙特異性抗體對表現 FAP- 及 CD28- 之 細胞之活體外功能表徵 利用原發性人類PBMC進行若干基於細胞之活體外分析以評價CD28(SA)及雙特異性靶向FAP之CD28抗原結合分子在藉由T細胞雙特異性(TCB)抗體提供之TCR信號之存在及不存在下之活性。獲得如藉由流動式細胞測量術、細胞激素ELISA及活細胞成像所測定之T細胞增殖、細胞激素分泌及腫瘤細胞殺滅作為讀出。 1.使用上述高密度預培養系統評估原始超促效CD28(SA) IgG4之活性以恢復源自外周血之T細胞對CD28介導之超促效之反應性(Römer等人，2011)。 2.於原發性人類PBMC共培養分析中評估雙特異性靶向FAP之CD28分子在TCR信號不存在下之功能性，其中雙特異性靶向FAP之CD28分子藉由同時結合至T細胞上之人類CD28及在3T3-huFAP細胞(親本細胞系ATCC #CCL-92，經修飾以穩定過度表現人類FAP)或表現MCSP及FAP之MV3黑色素瘤細胞上表現之人類FAP而交聯。 3.如上所述評估雙特異性靶向FAP之CD28分子在TCR信號存在下之功能性，其中另外存在TCB分子，藉由同時結合至T細胞上之CD3及MKN45胃癌細胞(DSMZ #ACC 409)上之人類CEA或在MV3黑色素瘤細胞上表現之MCSP而交聯。
PBMC 分離 藉由密度梯度離心自獲自Buffy Coat (Blutspende Zürich)之肝素化血液之經濃化之淋巴細胞製劑製備外周血單核細胞(PBMC)。將25 ml血液(於PBS中1:2稀釋)在15 ml淋巴細胞製劑(STEMCELL技術，目錄號07851)上分層及在室溫下在845xg下不制動離心25分鐘。利用10 ml吸量管將含PBMC之介面收集於50 ml管中。將細胞用PBS洗滌及在611xg下離心5分鐘。遺棄上清液，將集結塊再懸浮於50 ml PBS中及在304xg下離心5分鐘。重複洗滌步驟，在171xg下離心。將細胞再懸浮於RPMI 1640 Glutamax (含5%人類血清、丙酮酸鈉、NEAA、50 μM 2-巰基乙醇、盤尼西林(Penicillin)/鏈黴素(Streptomycin))中及根據各自分析方案處理用於進一步功能分析。
PBMC 之高密度預培養及藉由 CD28 超促效劑 CD28(SA) 之 T 細胞活化之活體外評估 為恢復人類T細胞對TGN1412介導之CD28超促效之反應性，在評估CD28超促效抗體之效應之前將PBMC在高密度(HD)下預培養(Römer等人，2011)。簡言之，將PBMC於完全培養基(RPMI 1640 Glutamax，5%人類血清，丙酮酸鈉，NEAA，50 μM 2-巰基乙醇，盤尼西林/鏈黴素)中調整至1E7個細胞/ml及在37℃，5% CO2 下於24孔板中以1.5 ml/孔培養48小時。然後再收穫細胞，於完全培養基中洗滌，在550xg下離心5分鐘及調整至針對功能表徵所需之所需細胞密度。為評估T細胞增殖，將PBMC用CFSE標記及於刺激5天後量測CFSE稀釋作為T細胞增殖之代表。簡言之，將細胞於PBS中調整至2x107 個/ml及在37℃，5% CO2 下用2.5 μM CFSE增殖染料(LifeTechnologies，目錄號65-0850-84)標記6分鐘。將細胞於完全培養基中洗滌一次，接著於PBS中之2個洗滌步驟。針對用TGN1412刺激，將PBMC於完全培養基中調整至2x106 個/ml及將1x105 個細胞分配於平底96孔板之各孔及用漸增濃度之TGN1412 (0.0002 nM至10 nM，一式三份)刺激。藉由流動式細胞測量術評估CFSE稀釋。簡言之，將細胞在550xg下離心5分鐘及用PBS洗滌。根據供應商之指示進行CD8 (BV711抗人類CD8a，BioLegend #301044)、CD4 (PE-Cy7抗人類CD4，BioLegend # 344612)之表面染色。然後將細胞用150 µl/孔PBS洗滌兩次及再懸浮於200 µl/孔FACS緩衝液中及使用BD FACS Fortessa分析。在活化後第5天經由細胞激素ELISA (huTNFα，DuoSet #DY210-05及huIFNγ，DuoSet #DY285-05)或細胞激素多工 (人類細胞激素17-複合分析，Bio-Rad #M5000031YV)分析自培養物上清液量測細胞激素分泌。
CD28(SA) 之超促效需要 FcγRIIb 交聯 PBMC 之高密度預培養恢復 CD28(SA) 超促效 為理解CD28(SA)之作用機理，吾人驗證PBMC如上述方案之高密度(HD)預培養恢復源自PBMC之T細胞對TGN1412介導之CD28超促效之反應的能力(Romer等人，2011)。如圖 5A 及5B 中所述，CD28(SA) IgG4 (P1AE1975 )在刺激後5天僅於經歷HD預培養之PBMC中以濃度依賴性方式誘導PBMC T細胞增殖(圖 5A )及細胞激素產生(圖 5B )，而新鮮PBMC保持無反應。吾人得出結論，先前公開之恢復活體外T細胞對CD28(SA)之反應性之方案(Romer等人，2011)可於吾人手中重現。
CD28(SA) 超促效活性需要經由 Fc γ RIIb 之交聯 —— Fc γ RIIb 之阻斷廢除 CD28(SA) 功能性 先前公開之文獻指示，TGN1412潛在依賴於FcγRIIb交聯。為理解PBMC之HD預培養與CD28(SA)功能性之Fc依賴性之間之聯繫，在HD預培養之前及之後藉由流動式細胞測量術評估PBMC上之FcγRIIb之表現水平。如圖 5C 中所述，FcγRIIb表現於新鮮PBMC單核細胞中不存在，而於HD預培養2天後96.8%之單核細胞表現FcγRIIb。於隨後T細胞增殖分析中抗體介導之FcγRIIb之阻斷完全廢除在用CD28(SA)刺激後之T細胞增殖，於培養5天後量測得(圖 5D )。於替代方法中，攜帶P329G-LALA突變之CD28(SA)之Fc沉默變異體(CD28(SA) IgG1 PG-LALA: P1AD9289 )不顯示超促效功能(圖 6A )。此等資料證實CD28(SA)介導之CD28超促效依賴於經由FcγRIIb之交聯。
添加靶向 FAP 之腫瘤靶向部分至 Fc 沉默 CD28(SA) 恢復超促效，其然後依賴於腫瘤靶之存在 鑑於藉由CD28(SA)之CD28超促效依賴於FcγRIIb交聯，吾人假設可藉由引入(i) Fc沉默P329G-LALA突變及(ii)與表現腫瘤之表面抗原交聯之靶向部分將FcR依賴性重新定向至腫瘤。為測試此假設，添加FAP靶向部分作為Fc沉默CD28(SA)之C端融合(FAP-CD28(SA) 1+2: P1AD9011 )。因為此方法不需要FcR交聯，PBMC不經歷HD預培養。相反，在漸增濃度之FAP-CD28 (P1AD9011 )之存在下，將新鮮PBMC與3T3-huFAP或3T3-WT共培養5天及藉由CFSE稀釋經由流動式細胞測量術評估T細胞增殖。如圖 6B 中所示，FAP結合部分之引入使僅在FAP之存在下能T細胞增殖。吾人推斷超促效可藉由Fc沉默及添加腫瘤靶向部分選擇性靶向腫瘤抗原。
在 TCB 信號之不存在及存在下藉由雙特異性靶向 FAP 之 CD28 抗原結合分子之 T 細胞增殖及細胞激素分泌之活體外評估 泛T細胞係用作效應細胞及根據製造商之說明使用泛T細胞分離套組(Miltenyi Biotec)藉由MACS自PBMC分離。
為量測在TCB之不存在下藉由雙特異性FAP-CD28抗原結合分子之T細胞活化，將CFSE標記之泛T細胞與每孔3x104 個3T3-huFAP或缺少FAP表現之親本3T3細胞(3T3-WT)共培養，在前一天接種於平底96孔板中。以增加之濃度(0.0002 nM至10 nM，一式三份)添加雙特異性FAP-CD28抗原結合分子。
為量測在TCB信號之存在下之T細胞增殖，將CFSE標記之泛T細胞與3x104 個表現FAP及MCSP之MV3細胞/孔共培養，在前一天接種於平底96孔板中，漸增濃度之雙特異性FAP-CD28抗原結合分子(0.0002 nM至10 nM，一式三份)，及固定濃度之MCSP-TCB (5 pM，P1AD2189)。作為對照，僅含TCB之孔包括在內。
藉由流動式細胞測量術評估CFSE稀釋及在活化後5天經由細胞激素ELISA (huTNFα，DuoSet #DY210-05及huIFNγ，DuoSet #DY285-05)或細胞激素多工(人類細胞激素17-複合分析，Bio-Rad #M5000031YV)分析自培養物上清液量測細胞激素分泌。
習知 CD28 促效抗體 ( 純系 9.3) 不會以靶向腫瘤之雙特異性形式超促效地表現 已於文獻中報導兩種CD28促效抗體：超促效CD28抗體(諸如TGN1412)能自主活化T細胞而不需要藉由TCR提供之另外信號。此等抗體係稱作超促效劑，因為其超過天然CD28促效配位體CD80及CD86之功能性，該等配位體嚴格依賴於TCR信號之存在以增強T細胞功能。與超促效抗體(諸如TGN1412)相比，習知促效抗體(諸如純系mab 9.3)不能自主活化T細胞，而是正如天然CD28配位體需要另外TCR信號以增強T細胞活性。為更詳細評估CD28促效劑靶向腫瘤抗原之效應，吾人產生另外FAP-CD28分子：(i)具有2個CD28結合部分(TGN1412)及2個FAP結合部分之超促效(SA)分子= 2+2 SA形式(P1AD4493 )，(ii)具有2個CD28結合部分(純系9.3)及1或2個FAP結合部分之習知促效劑(CA)，各自為：2+2 CA (P1AD8968 )，1+2 CA (P1AD8962 )。在漸增濃度之FAP靶向分子之存在下，將新鮮PBMC與3T3-huFAP或3T3-WT共培養5天及藉由CFSE稀釋經由流動式細胞測量術評估T細胞增殖。如圖 7A 至7D 中所述，僅超促效結合劑能活化T細胞。此外，經由所述超促效構築體之T細胞活化嚴格依賴於FAP之存在(圖 7B )，如由在FAP不存在下不存在T細胞活化所證實(圖 7D )。與此等資料一致，同樣僅針對利用超促效CD28(SA)抗體但是非習知促效9.3抗體之構築體觀察到細胞激素分泌(圖 7E )。吾人推斷僅超促效CD28抗體以雙特異性靶向腫瘤之抗體形式引起自主T細胞活化，而與習知9.3結合劑相同之形式非超促效。
實例 6 在 TCB 之不存在或存在下藉由靶向腫瘤之 CD28 分子之腫瘤細胞殺滅之活體外評估 為評估雙特異性FAP-CD28或CEA-CD28抗原結合分子達成腫瘤細胞殺滅或支持TCB介導之腫瘤細胞殺滅之能力，將經純化之泛T細胞用作效應細胞及表現RFP之MV3細胞及MKN45細胞各自用作腫瘤靶。
為評估MV3腫瘤細胞之殺滅，將在前一天接種之5000個MV3靶細胞於平底96孔板中與1x105 個泛T細胞/孔共培養(E:T 20:1)，在單獨或與10 nM雙特異性FAP-CD28抗原結合分子組合之5 pM MCSP-TCB (P1AD2189)之存在下。為評估MV3腫瘤細胞之殺滅，將在前一天接種之5000個MV3靶細胞於平底96孔板中與1x105 個泛T細胞/孔共培養(E:T 20:1)，在2 nM FAP-CD28之存在下。為評估MKN45腫瘤細胞之殺滅，將在前一天接種之5000個MKN45於平底96孔板中與1x105 個泛T細胞/孔共培養，在2 nM CEA-CD28之存在下。使用IncuCyte活細胞成像系統(Essen Biosciences)歷時90小時之過程監測靶細胞之殺滅，每3小時捕獲4個影像/孔。隨時間之RFP+目標計數/影像(經由IncuCyte ZOOM軟體，Essen Biosciences評估)用作靶細胞死亡之代表。藉由監測靶細胞在單獨效應T細胞之存在下隨時間之計數(=基線對照)將抗體介導之靶細胞殺滅與自發靶細胞死亡加以區別。將殺滅計算為100 – x，x為相對於基線對照之靶%。使用student氏t-檢定進行統計分析，比較隨時間之殺滅%之曲線下面積(AUC)。
FAP-CD28 以 2+1 形式誘導靶細胞殺滅，但是僅 在 超促效 CD28 結合劑下， 而 不在習知 CD28 促效結合劑下 評估FAP-CD28分子誘導腫瘤細胞殺滅之能力。如圖 8A 至8D 中所述，在FAP-CD28之存在下源自PBMC之T細胞與表現FAP之MV3黑色素瘤細胞歷時90小時之共培養導致MV3細胞僅藉由呈1+2形式之FAP CD28(SA) (P1AD9011)之殺滅且可比得上藉由靶向FAP之TCB (P1AD4645)達成之殺滅之誘導。呈2+2形式之FAP-CD28(SA) (P1AD4493)以及具有習知CD28促效9.3抗體之FAP-CD28 (P1AD8968及P1AD8962)未觀察到殺滅。吾人推斷除了T細胞增殖及細胞激素分泌外，利用超促效結合劑之呈1+2形式之FAP-CD28亦可引起靶細胞殺滅，且與TCB可相當。
CEA-CD28 以 1+2 及 2+2 形式誘導靶細胞殺滅，但是僅 在 超促效抗體下， 而 不在習知 CD28 促效抗體下 於替代方法中，吾人使用呈2+2 SA (P1AE1195 )、1+2 SA (P1AE1194 )、2+2 CA (P1AE1193 )及2+1 CA (P1AE1192 )形式之靶向CEA之CD28促效分子評估其誘導靶細胞殺滅之能力。在呈上述形式之CEA-CD28之存在下，將PBMC T細胞與表現CEA之MKN45細胞共培養90小時。含有超促效CD28結合劑之兩種形式能誘導表現CEA之MKN45細胞之殺滅(圖 9A 及9B )。吾人推測FAP-CD28(SA) 2+2與CEA-CD28 (SA) 2+2殺滅其各自靶細胞之能力之間之差異位於MKN45相對於MV3細胞中之靶表現水平之差異內。精確地，內部資料證實，MV3細胞之FAP表現水平低於MKN45細胞之CEA表現水平10倍。因此，於MV3細胞中，腫瘤靶結合位點可受限及MV3細胞之殺滅需要FAP相對於CD28之有效占位，其呈1+2形式(即，1個FAP結合位點交聯2個CD28結合位點)相較於2+2 (即，2個FAP結合位點需要交聯2個CD28結合位點)係有利的。
藉由 TGN1412 結合劑之 CD28 超促效依賴於 CD28 結合劑多價 —— 一價結合劑非超促效 為進一步研究CD28超促效之性質，吾人評估一價CD28 TGN1412結合劑是否以靶向腫瘤之雙特異性形式顯示超促效行為。將PBMC T細胞與3T3-huFAP細胞共培養及利用漸增濃度之具有CD28二價之FAP-CD28 1+2 SA (P1AD9011 )及具有CD28一價之FAP-CD28 1+1 SA (P1AD4492 )培育。如圖 10A 中所示，具有一價CD28結合之FAP-CD28 (P1AD4492 )不能誘導T細胞增殖，與CD28二價構築體(P1AD9011 )相反。一致地，僅利用CD28二價觀察到T細胞活化標記物CD69及CD25之上調(各為圖 10B 及10C )。總之，TGN1412介導之超促效不僅依賴於經由Fc受體之交聯而且需要CD28結合劑多價。
總之，可確定CD28超促效可藉由Fc沉默及引入能特異性結合至腫瘤相關抗原之抗原結合域特異性靶向腫瘤抗原。另外，僅當靶向腫瘤之雙特異性抗體包含基於CD28(SA)之結合劑時，其係超促效，及當其包含習知促效結合劑(純系9.3)時，其非超促效。另外，超促效需要CD28(SA)結合劑之多價及雙特異性構築體之一價CD28(SA)結合廢除超促效T細胞活化。 ***參考文獻： Acuto, O.及Michel, F. (2003). CD28-mediated co-stimulation: a quantitative support for TCR signalling. Nat Rev Immunol 3, 939-951。 Boomer, J.S.及Green, J.M. (2010). An enigmatic tail of CD28 signaling. Cold Spring Harb Perspect Biol 2, a002436。 Carreno, B.M.及Collins, M. (2002). The B7 family of ligands and its receptors: new pathways for costimulation and inhibition of immune responses. Annu Rev Immunol 20, 29-53。 Chen, L.及Flies, D.B. (2013). Molecular mechanisms of T cell co-stimulation and co-inhibition. Nat Rev Immunol 13, 227-242。 Engelhardt, J.J.、Sullivan, T.J.及Allison, J.P. (2006). CTLA-4 overexpression inhibits T cell responses through a CD28-B7-dependent mechanism. J Immunol 177, 1052-1061。 Esensten, J.H.、Helou, Y.A.、Chopra, G.、Weiss, A.及Bluestone, J.A. (2016). CD28 Costimulation: From Mechanism to Therapy. Immunity 44, 973-988。 Fraser, J.D.、Irving, B.A.、Crabtree, G.R.及Weiss, A. (1991). Regulation of interleukin-2 gene enhancer activity by the T cell accessory molecule CD28. Science 251, 313-316。 Hui, E.、Cheung, J.、Zhu, J.、Su, X.、Taylor, M.J.、Wallweber, H.A.、Sasmal, D.K.、Huang, J.、Kim, J.M.、Mellman, I.及Vale, R.D. (2017). T cell costimulatory receptor CD28 is a primary target for PD-1-mediated inhibition. Science 355, 1428-1433。 Hunig, T. (2012). The storm has cleared: lessons from the CD28 superagonist TGN1412 trial. Nat Rev Immunol 12, 317-318。 June, C.H.、Ledbetter, J.A.、Gillespie, M.M.、Lindsten, T.及Thompson, C.B. (1987). T-cell proliferation involving the CD28 pathway is associated with cyclosporine-resistant interleukin 2 gene expression. Mol Cell Biol 7, 4472-4481。 Kamphorst, A.O.、Wieland, A.、Nasti, T.、Yang, S.、Zhang, R.、Barber, D.L.、Konieczny, B.T.、Daugherty, C.Z.、Koenig, L.、Yu, K.等人，(2017). Rescue of exhausted CD8 T cells by PD-1-targeted therapies is CD28-dependent. Science 355, 1423-1427。 Lavin, Y.、Kobayashi, S.、Leader, A.、Amir, E.D.、Elefant, N.、Bigenwald, C.、Remark, R.、Sweeney, R.、Becker, C.D.、Levine, J.H.等人，(2017). Innate Immune Landscape in Early Lung Adenocarcinoma by Paired Single-Cell Analyses. Cell 169, 750-765及717。 Linsley, P.S.、Clark, E.A.及Ledbetter, J.A. (1990). T-cell antigen CD28 mediates adhesion with B cells by interacting with activation antigen B7/BB-1. Proc Natl Acad Sci U S A 87, 5031-5035。 Romer, P.S.、Berr, S.、Avota, E.、Na, S.Y.、Battaglia, M.、ten Berge, I.、Einsele, H.及Hunig, T. (2011). Preculture of PBMCs at high cell density increases sensitivity of T-cell responses, revealing cytokine release by CD28 superagonist TGN1412. Blood 118, 6772-6782。 Tai, X.、Van Laethem, F.、Sharpe, A.H.及Singer, A. (2007). Induction of autoimmune disease in CTLA-4-/- mice depends on a specific CD28 motif that is required for in vivo costimulation. Proc Natl Acad Sci U S A 104, 13756-13761。 Thompson, C.B.、Lindsten, T.、Ledbetter, J.A.、Kunkel, S.L.、Young, H.A.、Emerson, S.G.、Leiden, J.M.及June, C.H. (1989). CD28 activation pathway regulates the production of multiple T-cell-derived lymphokines/cytokines. Proc Natl Acad Sci U S A 86, 1333-1337。 Tirosh, I.、Izar, B.、Prakadan, S.M.、Wadsworth, M.H.(第二作者)、Treacy, D.、Trombetta, J.J.、Rotem, A.、Rodman, C.、Lian, C.、Murphy, G.等人，(2016). Dissecting the multicellular ecosystem of metastatic melanoma by single-cell RNA-seq. Science 352, 189-196。 Zheng, C.、Zheng, L.、Yoo, J.K.、Guo, H.、Zhang, Y.、Guo, X.、Kang, B.、Hu, R.、Huang, J.Y.、Zhang, Q.等人，(2017). Landscape of Infiltrating T Cells in Liver Cancer Revealed by Single-Cell Sequencing. Cell 169, 1342-1356及1316。
於圖 1A 至 1L 中，顯示所述分子之示意圖。圖 1A 顯示呈其huIgG4同功異型物(TGN1412)之CD28促效抗體CD28(SA)。
圖 1B 說明呈hu IgG1 PGLALA同功異型物(「Fc沉默」)之CD28(SA)促效抗體。
於圖 1C 、 1D 、 1E 及1F 中各自顯示呈1+1形式、1+2形式、2+2形式及1+4形式之雙特異性FAP-CD28抗原結合分子。
於圖 1G 、 1H 及1J 中各自顯示呈1+2形式、2+2形式及1+1形式之雙特異性CEA-CD28抗原結合分子。
圖1I 顯示呈一價hu IgG1 PGLALA同功異型物(「Fc沉默」)之CD28促效抗體變異體之示意圖。
於圖 1K 及1L 中各自以替代形式顯示呈1+1+2形式之三特異性CEA-FAP-CD28抗原結合分子。
圖 2A 、 2B 、 2C 、 2D 及2E 係關於CD28促效抗體及FAP-CD28抗原結合分子與細胞上之人類CD28或人類FAP之結合。圖 2A 中顯示呈其IgG4同功異型物之CD28(SA)相對於hu IgG1 PGLALA同型ti人類CD28之結合及不同FAP-CD28分子與細胞上之人類CD28 (圖 2B )及人類FAP (圖 2C )之結合。藉由流動式細胞測量術評估不同CD28促效抗體或靶向抗DP47之分子與表現人類CD28之CHO細胞(親本細胞系CHO-k1 ATCC #CCL-61，經修飾以穩定過度表現人類CD28)或表現人類FAP之3T3細胞(NIH/3T3細胞系(ATCC CRL-1658))之結合的螢光強度中值。描繪的是技術複本與SEM。圖 2D (結合至人類CD28)及圖 2E (結合至人類FAP)中顯示FAP(4B9)-CD28(SA)抗原結合分子(如實例1中所述之分子D、E及F)之比較。
圖 3A 至3D 中顯示CD28(SA)之可變域及其變異體之比對。圖 3A 及3B 中顯示CD28(SA) VH域及其變異體之比對以移除半胱胺酸50及降低所得抗CD28結合劑之親和力至不同程度。值得注意的是，於VH變異體i及j中，CD28(SA)之CDR係自IGHV1-2框架移植至IGHV3-23框架(圖 3B )。於圖 3C 及3D 中，顯示CD28(SA) VL域及其變異體之比對以降低所得抗CD28結合劑之親和力至不同程度。於變異體t中，該等CDR經移植至曲妥珠單抗(trastuzumab) (赫賽汀(Herceptin)) VL序列之框架序列中。
於圖 4A 至4C 中，顯示來自上清液之呈一價IgG形式之親和力降低之CD28促效抗體與細胞上之人類CD28的親和力。藉由流動式細胞測量術評估與陰性對照(抗DP47)及原始TGN1412相比，與表現人類CD28之CHO細胞(親本細胞系CHO-k1 ATCC #CCL-61，經修飾以穩定過度表現人類CD28)結合之螢光強度中值。圖 4A 中顯示變異體1至10之結合曲線，圖 4B 中顯示變異體11至22之結合曲線及圖 4C 中顯示變異體23至31之結合曲線。描繪的是技術複本與SD。
於圖 4D 及4E 中，顯示具有選定親和力降低之CD28促效抗體變異體之呈huIgG1 PG-LALA 1+1形式之靶向FAP之雙特異性CD28促效抗體變異體與細胞上之人類CD28的結合。圖 4D 中顯示利用變異體8、11、12、15、16及17之雙特異性1+1構築體之結合曲線，然而圖 4E 中顯示利用變異體19、23、25、27及29之雙特異性1+1構築體之結合曲線。基於親和力選擇選定結合劑用於呈1+1雙特異性FAP靶向形式製備。顯示藉由流動式細胞測量術評估之與陰性對照(抗DP47)及原始TGN1412 (分子A)相比，與表現人類CD28之CHO細胞(親本細胞系CHO-k1 ATCC #CCL-61，經修飾以穩定過度表現人類CD28)結合之螢光強度中值。
圖 4F 及4G 中說明呈huIgG1 PG-LALA 1+1形式之選定靶向FAP之雙特異性CD28促效抗體變異體的活體外效力。在極限濃度之MCSP-TCB (5 pM，P1AD2189)及漸增濃度之FAP-CD28構築體之存在下，將T細胞用表現MCSP及FAP之MV3黑色素瘤細胞培育5天。圖 4F 中顯示作為CD8 T細胞之T細胞增殖之量度之CFSE稀釋，其藉由流動式細胞測量術評估。誤差條顯示SEM，圖描繪來自2個供體之代表性結果之技術一式三份。圖 4G 中顯示CD28結合劑變異體之KD (nM)關於藉由親本TGN1412純系(CD28(SA))之單位為%之曲線下面積(a)之效力的相關性。
圖 5A 至5D 係指高密度(HD)預培養及CD28(SA)之作用模式之建立。將PBMC T細胞在高密度(HD)下預培養2天或自PBMC分離新鮮使用及用漸增濃度之CD28(SA)刺激。描繪的是代表於用CD28(SA) (分子A，P1AE1975)刺激5天後T細胞增殖之CFSE稀釋(圖 5A )及於刺激2天後之細胞激素分泌之CFSE稀釋(圖 5B )。圖 5C 顯示在HD PBMC預培養2天前及2天後藉由流動式細胞測量術評估之PBMC單核細胞及B細胞中之FcγRIIb表現之百分比。圖 5D ：在FcγRIIb阻斷抗體或同型對照之存在或不存在下，將經HD預培養之PBMC與CD28(SA)共培養5天及藉由流動式細胞測量術評估CD4 T細胞之CFSE稀釋之百分比。圖代表至少6個供體(圖 5A 、 5B )及2個供體(圖 5C 、 5D )，各於獨立實驗中評估。該等圖顯示技術一式三份。誤差條指示SEM。藉由student氏t-檢定進行統計分析。***：p＜0.001。CD28(SA) IgG4之超促效取決於與FcγRIIb之交聯。
於圖 6A 及6B 中，顯示於用原始Fc野生型IgG4 CD28(SA) (P1AE1975 )或承載P329G-LALA突變之CD28(SA) (P1AD9289 )刺激5天後T細胞增殖，即，CD4 T細胞之CFSE稀釋。將T細胞在高密度下預培養2天。圖代表至少3個獨立實驗。顯示技術一式三份。Fc沉默廢除TGN1412之超促效。添加靶向腫瘤之部分至Fc沉默之TGN1412恢復超促效，然後該超促效取決於腫瘤靶之存在。
於圖 7A 、 7B 、 7C 及7D 中，顯示呈不同形式(2+2及1+2)及利用超促效(CD28(SA))結合劑及習知促效結合劑(9.3，CD28(CA))之靶向FAP之CD28促效劑的比較。利用習知CD28促效結合劑之靶向FAP之CD28促效劑不作為超促效劑起作用。在漸增濃度之利用超促效結合劑(SA，圖 7A )或習知促效結合劑(9.3，圖 7B )之FAP-CD28形式之存在下，將PBMC T細胞與3T3-huFAP細胞(FAP存在)共培養5天。顯示T細胞增殖。然後亦在漸增濃度之利用超促效結合劑(SA，圖 7C )或習知促效結合劑(9.3，圖 7D )之FAP-CD28形式之存在下，將PBMC T細胞與3T3 WT細胞(FAP不存在)共培養5天。描繪的是作為CD8 T細胞之T細胞增殖之量度之CFSE稀釋，其在刺激後第5天藉由流動式細胞測量術評估。圖顯示來自3個獨立實驗之3個供體之累積數據。誤差條顯示SEM。於相同實驗設置中，亦於共培養2天後自上清液量測細胞激素。圖 7E 中提供該等值。
在90小時之過程中藉由活細胞成像使用IncuCyte技術評估呈各種形式之利用超促效CD28(SA)結合劑或習知促效結合劑(CD28(CA))之FAP-CD28誘導表現FAP之RFP-MV3黑色素瘤細胞之殺滅的能力。在10 nM下使用包含FAP-TCB (P1AD4645)之所有分子。圖 8A 、 8B 及8C 各自顯示利用技術一式三份之來自三個供體之代表性結果。圖 8D 顯示表示為來自3個獨立實驗之3個供體之t=90小時下之曲線下面積(AUC)的累積結果。盒顯示第25至第75百分位數，鬚顯示最小值至最大值。藉由配對1因子ANOVA進行統計分析。***：p＜0.001，ns：不顯著。
圖 9A 及9B 中顯示呈不同形式之利用超促效及習知促效結合劑之靶向CEA之CD28促效劑的比較。在90小時之過程中藉由活細胞成像使用IncuCyte技術評估呈各種形式之利用超促效CD28(SA)結合劑或習知促效結合劑(CD28(CA))之CEA-CD28誘導表現CEA之RFP+ MKN45胃癌細胞之殺滅的能力。在10 nM下使用包含CEACAM5-TCB (P1AD5299)之所有分子。圖 9A 顯示利用技術一式三份之來自一個供體之代表性結果。圖 9B 顯示表示為1個實驗之1個供體之t=90小時下之曲線下面積(AUC)之技術一式三份的統計分析。盒顯示第25至第75百分位數，鬚顯示最小值至最大值。藉由配對1因子ANOVA進行統計分析。***：p＜0.001。其顯示利用習知CD28促效結合劑之靶向CEA之CD28促效劑不會超促效表現。
於圖 10A 、 10B 及10C 中，顯示利用一價超促效結合劑之靶向CD28促效劑功能上係非超促效。在漸增濃度之利用二價CD28結合劑之FAP-CD28 (P1AD9011，閉圓)或具有針對CD28結合一價之FAP-CD28 (P1AD4492，開圓)的存在下，將PBMC T細胞與3T3-huFAP細胞共培養5天。圖 10A 中顯示CD8 T細胞之CFSE稀釋。此外，T細胞之活化藉由檢測活化標記物CD69 (圖10B)及CD25 (圖10C)藉由流動式細胞測量術評估。在刺激後第5天時顯示CD69及CD25染色之平均螢光強度(MFI)。顯示來自1個供體之技術一式三份，誤差條指示SEM。其顯示類TGN1412超促效需要多價CD28結合。
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Claims (24)

  1. 一種超促效CD28抗原結合分子，其能二價結合至CD28且包含 (a)能特異性結合至CD28之兩個或更多個抗原結合域， (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之至少一個抗原結合域，及 (c)由能穩定締合之第一亞單元及第二亞單元組成之Fc域，其包含一或多個胺基酸取代，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能。
  2. 如請求項1之超促效CD28抗原結合分子，其中該Fc域係人類IgG1子類且包含胺基酸突變L234A、L235A及P329G (根據Kabat EU索引編號)。
  3. 如請求項1或2之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含 (i)重鏈可變區(VH CD28)，其包含SEQ ID NO: 20之重鏈互補決定區CDR-H1、SEQ ID NO: 21之CDR-H2及SEQ ID NO: 22之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含SEQ ID NO: 23之輕鏈互補決定區CDR-L1、SEQ ID NO: 24之CDR-L2及SEQ ID NO: 25之CDR-L3；或 (ii)重鏈可變區(VH CD28)，其包含SEQ ID NO: 36之CDR-H1、SEQ ID NO: 37之CDR-H2及SEQ ID NO: 38之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含SEQ ID NO: 39之CDR-L1，SEQ ID NO: 40之CDR-L2及SEQ ID NO: 41之CDR-L3。
  4. 如請求項1或2之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含重鏈可變區(VH CD28)，其包含SEQ ID NO: 20之CDR-H1、SEQ ID NO: 21之CDR-H2及SEQ ID NO: 22之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含SEQ ID NO: 23之CDR-L1、SEQ ID NO: 24之CDR-L2及SEQ ID NO: 25之CDR-L3。
  5. 如請求項1或2之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含重鏈可變區(VH CD28)，其包含與SEQ ID NO: 26之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含與SEQ ID NO: 27之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列。
  6. 如請求項1或2之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含重鏈可變區(VH CD28)，其包含選自由SEQ ID NO: 42、SEQ ID NO: 43、SEQ ID NO: 44、SEQ ID NO: 45、SEQ ID NO: 46、SEQ ID NO: 47、SEQ ID NO: 48、SEQ ID NO: 49、SEQ ID NO: 50及SEQ ID NO: 51組成之群之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL CD28)，其包含選自由SEQ ID NO: 27、SEQ ID NO: 52、SEQ ID NO: 53、SEQ ID NO: 54、SEQ ID NO: 55、SEQ ID NO: 56、SEQ ID NO: 57、SEQ ID NO: 58、SEQ ID NO: 59、SEQ ID NO: 60及SEQ ID NO: 61組成之群之胺基酸序列。
  7. 如請求項1或2之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各包含 (a)包含SEQ ID NO: 47之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 54之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (b)包含SEQ ID NO: 47之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (c)包含SEQ ID NO: 51之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 61之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (d)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 53之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (e)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 54之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (f)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 59之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (g)包含SEQ ID NO: 46之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (h)包含SEQ ID NO: 43之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (i)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 53之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (j)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 59之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)，或 (k)包含SEQ ID NO: 42之胺基酸序列之重鏈可變區(VH CD28)及包含SEQ ID NO: 27之胺基酸序列之輕鏈可變區(VL CD28)。
  8. 如請求項1或2之超促效CD28抗原結合分子，其中該等能特異性結合至CD28之抗原結合域各為Fab片段。
  9. 如請求項1或2之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至腫瘤相關抗原之抗原結合域為能特異性結合至癌胚抗原(CEA)之抗原結合域。
  10. 如請求項9之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至CEA之抗原結合域包含重鏈可變區(VH CEA)，其包含(i)包含SEQ ID NO: 127之胺基酸序列之CDR-H1，(ii)包含SEQ ID NO: 128之胺基酸序列之CDR-H2，及(iii)包含SEQ ID NO: 129之胺基酸序列之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL CEA)，其包含(iv)包含SEQ ID NO: 130之胺基酸序列之CDR-L1，(v)包含SEQ ID NO: 131之胺基酸序列之CDR-L2，及(vi)包含SEQ ID NO: 132之胺基酸序列之CDR-L3。
  11. 如請求項9之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至CEA之抗原結合域包含重鏈可變區(VH CEA)，其包含與SEQ ID NO: 133之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL CEA)，其包含與SEQ ID NO: 134之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列。
  12. 如請求項1或2之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至腫瘤相關抗原之抗原結合域為能特異性結合至纖維母細胞活化蛋白(FAP)之抗原結合域。
  13. 如請求項12之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至FAP之抗原結合域包含 (a)重鏈可變區(VH FAP)，其包含(i)包含SEQ ID NO: 12之胺基酸序列之CDR-H1，(ii)包含SEQ ID NO: 13之胺基酸序列之CDR-H2，及(iii)包含SEQ ID NO: 14之胺基酸序列之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL FAP)，其包含(iv)包含SEQ ID NO: 15之胺基酸序列之CDR-L1，(v)包含SEQ ID NO: 16之胺基酸序列之CDR-L2，及(vi)包含SEQ ID NO: 17之胺基酸序列之CDR-L3，或 (b)重鏈可變區(VH FAP)，其包含(i)包含SEQ ID NO: 4之胺基酸序列之CDR-H1，(ii)包含SEQ ID NO: 5之胺基酸序列之CDR-H2，及(iii)包含SEQ ID NO: 6之胺基酸序列之CDR-H3；及輕鏈可變區(VL FAP)，其包含(iv)包含SEQ ID NO: 7之胺基酸序列之CDR-L1，(v)包含SEQ ID NO: 8之胺基酸序列之CDR-L2，及(vi)包含SEQ ID NO: 9之胺基酸序列之CDR-L3。
  14. 如請求項12之超促效CD28抗原結合分子，其中該能特異性結合至FAP之抗原結合域包含 (a)重鏈可變區(VH FAP)，其包含與SEQ ID NO: 18之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL FAP)，其包含與SEQ ID NO: 19之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列，或 (b)重鏈可變區(VH FAP)，其包含與SEQ ID NO: 10之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列；及輕鏈可變區(VL FAP)，其包含與SEQ ID NO: 11之胺基酸序列至少約95%、96%、97%、98%、99%或100%相同之胺基酸序列。
  15. 如請求項1或2之超促效CD28抗原結合分子，其包含 (a)抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之VH及VL域，其中該VH域經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端且其中該VL域經由肽連接子連接至該第二重鏈之C端。
  16. 如請求項1或2之超促效CD28抗原結合分子，其包含 (a)抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之crossFab片段，其經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端。
  17. 如請求項1或2之超促效CD28抗原結合分子，其包含 (a)抗體之兩條輕鏈及兩條重鏈，其包含能特異性結合至CD28之兩個Fab片段及包含一或多個胺基酸取代之Fc域，該取代降低該抗原結合分子與Fc受體之結合親和力及/或效應功能，及 (b)能特異性結合至腫瘤相關抗原之兩個crossFab片段，其中一個crossFab片段經由肽連接子連接至該等兩條重鏈中之一者之C端且其中另一crossFab片段經由肽連接子連接至該第二重鏈之C端。
  18. 一種多核苷酸，其編碼如請求項1至17中任一項之超促效CD28抗原結合分子。
  19. 一種宿主細胞，其包含如請求項18之多核苷酸。
  20. 一種製備如請求項1至17中任一項之超促效CD28抗原結合分子之方法，其包含在適於該雙特異性抗原結合分子表現之條件下培養如請求項19之宿主細胞。
  21. 一種醫藥組合物，其包含如請求項1至17中任一項之超促效CD28抗原結合分子及至少一種醫藥上可接受之賦形劑。
  22. 一種如請求項1至17中任一項之超促效CD28抗原結合分子或如請求項21之醫藥組合物之用途，其用於製造用於治療癌症之藥劑。
  23. 如請求項22之用途，其中該藥劑進一步包含化療劑、放射療法及/或用於癌症免疫療法之其他藥劑，或與其組合使用。
  24. 一種如請求項1至17中任一項之超促效CD28抗原結合分子或如請求項21之醫藥組合物之用途，其用於製造用於抑制個體之腫瘤細胞生長之藥劑。
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