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KR20170080662A - 항-tim3 항체 및 사용 방법 - Google Patents

항-tim3 항체 및 사용 방법 Download PDF

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KR20170080662A
KR20170080662A KR1020177015113A KR20177015113A KR20170080662A KR 20170080662 A KR20170080662 A KR 20170080662A KR 1020177015113 A KR1020177015113 A KR 1020177015113A KR 20177015113 A KR20177015113 A KR 20177015113A KR 20170080662 A KR20170080662 A KR 20170080662A
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hvr
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acid sequence
antibody
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발레리아 리프케
가이 조지스
빅터 레비트스키
올리버 플뢰트너
스테판 시버
바르바라 바이저
일디코 뷘체
아드리안 즈빅
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에프. 호프만-라 로슈 아게
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    • C07K2317/50—Immunoglobulins specific features characterized by immunoglobulin fragments
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Abstract

본 명세는 항-TIM3 항체 및 그의 사용 방법을 제공한다.

Description

항-TIM3 항체 및 사용 방법{ANTI-TIM3 ANTIBODIES AND METHODS OF USE}
본 발명은 항-TIM3 항체 및 그의 사용 방법에 관한 것이다.
TIM3은 면역글로불린 상과, 및 단백질의 TIM 과에 속하는 인간 단백질이다. 인간에서, 마우스와 유사하게, TIM-3은 T 세포뿐만 아니라 식세포, 예를 들어 대식세포 및 수지상 세포상에서 발현된다. 단백질 리간드(예를 들어 갈렉틴-9)에의 TIM-3의 결합은 세포사멸 유도의 기전을 통해 Th1 응답을 억제할 수 있으며, 따라서 말초 면역관용의 유도를 이끌어낼 수 있다. siRNA에 의한 인간 TIM-3의 발현의 감소 또는 차단-항체에 의한 인간 TIM-3의 억제는 CD4 양성 T-세포로부터 인터페론 알파의 분비를 증가시켰으며, 이는 인간 T 세포에서 TIM-3의 억제 역할을 지지한다. 식세포에서, TIM-3은 또한 세포사멸 세포를 인식하기 위한 수용체로서 기능한다. 자가면역 질병 환자로부터의 임상 샘플의 분석은 CD4 양성 세포에서 TIM-3의 발현이 없음을 보였다. 특히, 다발성 경화증이 있는 환자의 뇌척수액으로부터 유래된 T 세포 클론에서, TIM-3의 발현 수준은 보통의 건강한 사람으로부터 유래된 클론의 경우보다 더 낮고 IFN-감마의 분비 수준은 더 높았다(문헌[Koguchi K et al., J Exp Med. 203 (2006) 1413-1418]).
TIM-3과 알러지성 질병 또는 천식과의 관계에 대한 보고서들이 존재한다(WO96/27603 및 WO2003/063792).
급성 골수성 백혈병(본 명세서에서 이후부터 "AML"이라 칭한다) 환자로부터의 조혈모세포 및 정상적인 조혈모세포의 미세배열 분석에 따르면, TIM-3은 AML 줄기 세포상에서 발현되며 따라서 상기 분석은 혈액암에서 TIM-3의 연루를 암시하였다(문헌[Majeti R et al., PNAS, 106 (2009) 3396-3401] 및 WO2009/091547).
상기 항-TIM-3 단클론 항체의 예는 항-인간 TIM-3 래트 단클론 항체(클론 344823, R&D 시스템스에 의해 제조됨) 및 항-인간 TIM-3 마우스 단클론 항체(클론 F38-2E2, R&D 시스템스에 의해 제조됨)를 포함한다. WO2013/06490은 암을 치료하고 염증을 감소시키기 위한, 빠른 내면화를 나타내는 항-TIM-3 항체 및 그의 면역접합체에 관한 것이다. US2012/189617은 인간 TIM-3 발현 세포와 관련된 질병에 대해 보다 높은 효과기 활성, 예를 들어 항체-의존적인 세포 세포독성(ADCC 활성)을 나타내는 항-TIM3 항체에 관한 것이다.
본 발명은 항-TIM3 항체 및 그의 사용 방법을 제공한다.
본 발명의 하나의 태양은 TIM3에 결합하는 단리된 항체이며, 여기에서 상기 항체는
·37 ℃에서 120분 후에 45% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다.
본 발명의 또 다른 태양은 상기와 같은 항-TIM3 항체이며, 여기에서 상기 항체는
·서열번호 7의 VH 및 서열번호 8의 VL을 포함하는 항-Tim3 항체와 TIM3에의 결합에 대해 경쟁하고
·인간 및 시노몰구스 TIM3에 결합하고
·면역접합체로서 TIM3 발현 세포상에서 세포독성 활성을 나타내고
·인터페론-감마 방출을 유도한다.
하나의 실시태양에서 본 발명에 따른 항-TIM3 항체는 단클론 항체이다.
하나의 실시태양에서 본 발명에 따른 항-TIM3 항체는 인간, 인간화된, 또는 키메릭 항체이다.
하나의 실시태양에서 본 발명에 따른 항-TIM3 항체는 TIM3에 결합하는 항체 단편이다.
하나의 실시태양에서 본 발명에 따른 항-TIM3 항체는 Fab 단편이다.
하나의 실시태양에서 본 발명에 따른 항-TIM3 항체는
A) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
B) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
C) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
D) (a) (i) 서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 15 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
E) (a) (i) 서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 23 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
F) (a) (i) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 31 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 34의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
G) (a) (i) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 39 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
H) (a) (i) 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 46의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 47 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 48의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 50의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
I) (a) (i) 서열번호 53의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 55 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
J) (a) (i) 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 63 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 64의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 65의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 66의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인
을 포함한다.
본 발명은 또한 인간 TIM3에 결합하는 단리된 항체를 제공하며, 여기에서 상기 항체는 (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
본 발명은 또한 인간 TIM3에 결합하는 단리된 항체를 제공하며, 여기에서 상기 항체는
i) 서열번호 79의 VH 서열 및 서열번호 80의 VL 서열, 또는
ii) 서열번호 81의 VH 서열 및 서열번호 82의 VL 서열
을 포함한다.
본 발명은 또한 인간 TIM3에 결합하는 단리된 항체를 제공하며, 여기에서 상기 항체는 (a) (i) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 39 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
본 발명은 또한 인간 TIM3에 결합하는 단리된 항체를 제공하며, 여기에서 상기 항체는
i) 서열번호 83의 VH 서열 및 서열번호 84의 VL 서열, 또는
ii) 서열번호 85의 VH 서열 및 서열번호 86의 VL 서열
을 포함한다.
하나의 실시태양에서 본 발명에 따른 항-TIM3 항체는 전장(full length) IgG1 항체이다.
하나의 실시태양에서 본 발명에 따른 항-TIM3 항체는 돌연변이 L234A, L235A 및 P329G(카밧의 EU 색인에 따른 넘버링)를 갖는 전장 IgG1 항체이다.
본 발명의 또 다른 태양은 본 발명에 따른 항체를 암호화하는 단리된 핵산이다.
본 발명의 또 다른 태양은 본 발명에 따른 항체 및 세포독성제를 포함하는 면역접합체이다.
하나의 바람직한 실시태양에서 본 발명은 세포독성제가 슈도모나스 외독소 A 또는 아마톡신인 면역접합체이다.
본 발명의 또 다른 태양은 본 발명에 따른 항체 또는 본 발명에 따른 면역접합체 및 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 약학 제형이다.
본 발명의 또 다른 태양은 약제로서 사용하기 위한 본 발명에 따른 항체 또는 본 발명에 따른 면역접합체이다.
본 발명의 또 다른 태양은 암 치료에 사용하기 위한 본 발명에 따른 항체 또는 본 발명에 따른 면역접합체이다.
본 발명의 또 다른 태양은 약제의 제조에 사용하기 위한 본 발명에 따른 항체 또는 본 발명에 따른 면역접합체의 용도이다.
본 발명의 또 다른 태양은 암 치료용 약제의 제조에 사용하기 위한 본 발명에 따른 항체 또는 본 발명에 따른 면역접합체의 용도이다.
본 발명의 또 다른 태양은 암에 걸린 개인에게 유효량의 본 발명에 따른 항체 또는 본 발명에 따른 면역접합체를 투여함을 포함하는 상기 개인의 치료 방법이다.
본 발명의 항-TIM3 항체는 TIM3-발현 암세포상에서 빠르고 강한 내면화, 면역접합체(예를 들어 슈도모나스 외독소 또는 아마톡신과 접합시)로서 강한 세포독성 활성과 같은 매우 귀중한 성질들을 나타낸다. 따라서 상기 항체는 상이한 암, 특히 백혈병 및 림프종과 같은 혈액 종양의 치료에 유용한 치료제이다. 더욱 또한 상기 항체는 혼합 림프구 반응(MLR)에서 강한 면역자극성 사이토킨 방출을 나타내며 따라서 면역자극성 암 치료법으로서 유용하다. 또한 인간화된 항체 버전은 모 항체에 비해 CD4 T 세포에 대한 개선된 결합 및 결합 특이성을 갖는다.
도 1a: 37 ℃에서 배양 후 huTIM-3을 발현하는 rec CHOK1 세포내에 내면화된 항-TIM3 항체 Tim3_0022(<TIM-3>Ab(022)로서 약기됨)의 시간 의존적인 FACS 기재 내면화.
도 1b: 항-TIM3 항체 Tim3_0022(<TIM-3>Ab(022)로서 약기됨)의 Fab 단편이 완전 IgG 포맷과 유사한 동역학으로 37 ℃에서 배양 후 huTIM-3을 발현하는 rec CHOK1 세포내에 내면화됨을 나타내는 FACS 기재 내면화 분석으로부터의 결과.
도 2a: RPMI-8226 세포에 대한 항-TIM3 항체의 결합(항체 지정 클론 0016은 항체 Tim3_0016을 지칭하고, 클론 0016은 항체 Tim3_0016 변이체(항체 Tim3_0018)를 지칭하고, 클론 0022는 항체 Tim3_00122 등을 지칭한다).
도 2b: 파이퍼(Pfeiffer) 세포에 대한 항-TIM3 항체의 결합(항체 지정 클론 0016은 항체 Tim3_0016을 지칭하고, 클론 0016은 항체 Tim3_0016 변이체(항체 Tim3_0018)를 지칭하고, 클론 0022는 항체 Tim3_00122 등을 지칭한다).
도 3: 항-TIM-3 mAb를 사용하는 FACS에 의한, 상이한 환자 AML 세포 샘플상에서의 TIM-3의 발현 수준.
도 4: 상이한 말초 혈액 단핵세포(단핵세포, NK 세포, T 세포, CD4 T 세포)에 대한 TIM3 항체의 결합의 직접적인 비교:
4a: Tim3_0016 변이체(항체 Tim3_0018) 및 인간화된 버전이 결합하는 양성 세포%.
4b: 평균 형광 강도 - 상이한 말초 혈액 단핵 세포에 대한 Tim3_0016 변이체(항체 Tim3_0018) 및 인간화된 버전의 결합.
4c: Tim3_0028 및 키메릭 및 인간화된 버전이 결합하는 양성 세포%.
4d: 평균 형광 강도 - 상이한 말초 혈액 단핵 세포에 대한 Tim3_0028 및 키메릭 및 인간화된 버전의 결합.
I. 정의
본 발명의 목적을 위한 "수용체 인간 프레임워크"는 하기에 정의되는 바와 같은, 인간 면역글로불린 프레임워크 또는 인간 공통 프레임워크로부터 유래된 경쇄 가변 도메인(VL) 프레임워크 또는 중쇄 가변 도메인(VH) 프레임워크의 아미노산 서열을 포함하는 프레임워크이다. 인간 면역글로불린 프레임워크 또는 인간 공통 프레임워크"로 부터 유래된" 수용체 인간 프레임워크는 동일한 아미노산 서열을 포함할 수 있거나, 또는 아미노산 서열 변화를 함유할 수 있다. 일부 실시태양에서, 상기 아미노산 변화의 수는 10 이하, 9 이하, 8 이하, 7 이하, 6 이하, 5 이하, 4 이하, 3 이하, 또는 2 이하이다. 일부 실시태양에서, 상기 VL 수용체 인간 프레임워크는 상기 VL 인간 면역글로불린 프레임워크 서열 또는 인간 공통 프레임워크 서열(적합한 경우 생식세포 계열을 한정한다)과 서열이 일치한다.
"항-TIM3 항체" 및 "TIM3에 결합하는 항체"란 용어는 상기 항체가 TIM3을 표적화하는 진단제 및/또는 치료제로서 유용하기에 충분한 친화성으로 TIM3에 결합할 수 있는 항체를 지칭한다. 하나의 실시태양에서, 관련되지 않은 비-TIM3 단백질에의 항-TIM3 항체의 결합 정도는 예를 들어 표면 플라스몬 공명 분석(예를 들어 비아코어)에 의해 측정된 바와 같은 TIM3에 대한 상기 항체의 결합의 약 10% 미만이다. 몇몇 실시태양에서, 인간 TIM3에 결합하는 항원 결합 단백질은 ≤1 μM, ≤ 100 nM, ≤ 10 nM, ≤ 1 nM, ≤ 0.1 nM, ≤ 0.01 nM, 또는 ≤ 0.001 nM(예를 들어 10-8 M 이하, 예를 들어 10-8 M 내지 10-13 M, 예를 들어 10-9 M 내지 10-13 M)의 인간 TIM3에의 결합에 대한 결합 친화성의 KD 값을 갖는다. 하나의 바람직한 실시태양에서 상기 결합 친화성의 각각의 KD 값을 TIM3 결합 친화성의 경우 인간 TIM3의 세포외 도메인(ECD)(TIM3-ECD)를 사용하여 표면 플라스몬 공명 분석에서 측정한다.
본 발명에서 "항체"란 용어는 가장 넓은 의미로 사용되며 다양한 항체 구조물들, 예를 들어 비제한적으로 단클론 항체, 다클론 항체, 다중특이성 항체(예를 들어 이중특이성 항체), 및 항체 단편(목적하는 항원-결합 활성을 나타내는 한)을 포함한다.
"항체 단편"은 완전 항체가 결합하는 항원에 결합하는 상기 완전 항체의 일부를 포함하는 상기 완전 항체 이외의 분자를 지칭한다. 항체 단편의 예는 비제한적으로 Fv, Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2; 다이아바디; 선형 항체; 단쇄 항체 분자(예를 들어 scFv); 및 항체 단편으로부터 형성되는 다중특이성 항체를 포함한다.
기준 항체로서 "동일한 에피토프에 결합하는 항체"는 경쟁 분석에서 항원에 대한 상기 기준 항체의 결합을 50% 이상까지 차단하는 항체를 지칭하며, 환언하면, 상기 기준 항체는 경쟁 분석에서 항원에 대한 상기 항체의 결합을 50% 이상까지 차단한다. 예시적인 경쟁 분석을 본 명세서에 제공한다.
"키메릭" 항체란 용어는 중쇄 및/또는 경쇄의 일부가 특정 출처 또는 종으로부터 유래하는 반면 상기 중쇄 및/또는 경쇄의 나머지는 상이한 출처 또는 종으로부터 유래하는 항체를 지칭한다.
항체의 "부류"는 상기 항체의 중쇄가 갖는 불변 도메인 또는 불변 영역의 유형을 지칭한다. 항체의 5개의 주요 부류, 즉 IgA, IgD, IgE, IgG 및 IgM이 존재하며, 이들 중 다수는 하위부류(아이소타입)들, 예를 들어 IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 및 IgA2로 추가로 세분될 수 있다. 면역글로불린의 상이한 부류들에 상응하는 중쇄 불변 도메인을 각각 α, δ, ε, γ 및 μ라 칭한다.
본 발명에 사용되는 바와 같은 "세포독성제"란 용어는 세포 기능을 억제하거나 방지하고/하거나 세포사 또는 파괴를 야기하는 물질을 지칭한다. 세포독성제는 비제한적으로 방사성 동위원소(예를 들어 At211, I131, I125, Y90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32, Pb212 및 Lu의 방사성 동위원소); 화학요법제 또는 약물(예를 들어 메토트렉세이트, 아드리아미신, 빈카 알칼로이드(빈크리스틴, 빈블라스틴, 에토포시드), 독소루비신, 멜팔란, 미토마이신 C, 클로람부실, 다우노루비신 또는 다른 삽입제); 성장 억제제; 효소 및 그의 단편, 예를 들어 핵산분해 효소; 항생제; 독소, 예를 들어 소분자 독소 또는 세균, 진균, 식물 또는 동물 기원의 효소 활성 독소, 및 이들의 단편 및/또는 변이체; 및 하기에 개시하는 다양한 항종양 또는 항암제를 포함한다.
하나의 바람직한 실시태양에서 "세포독성제"는 슈도모나스 외독소 A(또는 그의 변이체)이다(WO2005/052006, WO2007/016150, WO2007/014743, WO2007/031741, WO2009/32954, WO2011/32022, WO2012/154530, 및 WO　2012/170617, 문헌[Liu W, et al, PNAS 109 (2012) 11782-11787], 문헌[Mazor R, et al PNAS 111 (2014) 8571-8576] 및 문헌[Alewine C, et al, Mol Cancer Ther. (2014) 2653-61]). 하나의 바람직한 실시태양에서 상기 "슈도모나스 외독소 A"는 서열번호 69의 아미노산 서열을 포함하거나 서열번호 70의 아미노산 서열을 포함한다(이들의 제조는 또한 문헌[Mazor R, et al PNAS 111 (2014) 8571-8576] 및 문헌[Alewine C, et al, Mol Cancer Ther. (2014) 2653-61]에 기재되어 있다).
또 다른 바람직한 실시태양에서 상기 "세포독성제"는 예를 들어 WO2010/115630, WO2010/115629, WO2012/119787, WO2012/041504, 및 WO2014/135282에 기재된 바와 같은 아마톡신(또는 그의 변이체이며, 바람직한 변이체는 WO2012/041504(예를 들어 아마톡신 아미노산 4의 6' C-원자를 통해, 특히 아마톡신 아미노산의 6' C-원자에 결합된 산소 원자를 통해 접합되며, 여기에서 TIM3 항체는 유레아 부분을 통해 링커에 의해 연결된다) 및 WO2014/135282에 기재되어 있다.
작용제, 예를 들어 약학 제형의 "유효량"은 목적하는 치료학적 또는 예방학적 결과를 성취하기에 필요한 투여량에서 및 상기에 필요한 기간 동안 상기 성취에 유효한 양을 지칭한다.
본 발명에서 "Fc-영역"이란 용어는 불변 영역의 적어도 일부를 함유하는 면역글로불린 중쇄의 C-말단 영역을 한정하는데 사용된다. 상기 용어는 고유 서열 Fc-영역 및 변형 Fc-영역을 포함한다. 하나의 실시태양에서, 인간 IgG 중쇄 Fc-영역은 Cys226 또는 Pro230으로부터 상기 중쇄의 카복시-말단까지 연장된다. 그러나, 상기 Fc-영역의 C-말단 리신(Lys447)은 존재할 수도, 존재하지 않을 수도 있다. 본 발명에서 달리 명시되지 않는 한, 상기 Fc-영역 또는 불변 영역 중 아미노산 잔기들의 넘버링은 문헌[Kabat, E.A. et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991), NIH Publication 91-3242]에 개시된 바와 같은 EU 넘버링 시스템(또한 EU 색인이라 칭함)에 따른다.
"프레임워크" 또는 "FR"은 고가변 영역(HVR) 잔기 이외의 가변 도메인 잔기를 지칭한다. 가변 도메인의 FR은 일반적으로 4개의 FR 도메인, 즉 FR1, FR2, FR3 및 FR4로 이루어진다. 상응하게, 상기 HVR 및 FR 서열은 일반적으로 VH(또는 VL)에서 하기의 순서로 존재한다: FR1-H1(L1)-FR2-H2(L2)-FR3-H3(L3)-FR4.
"전장 항체", "완전 항체" 및 "전체 항체"란 용어들은 본 발명에서 본 발명에 정의된 바와 같은 Fc-영역을 함유하는 중쇄를 갖거나 또는 고유 항체 구조와 실질적으로 유사한 구조를 갖는 항체를 지칭하는데 호환적으로 사용된다.
"숙주 세포", "숙주 세포주" 및 "숙주 세포 배양물"이란 용어는 호환적으로 사용되며 상기와 같은 세포의 자손을 포함하여, 외인성 핵산이 도입된 세포를 지칭한다. 숙주 세포는 "형질전환체" 및 "형질전환된 세포"를 포함하며, 이들은 계대의 수와 상관 없이 1차 형질전환된 세포 및 그로부터 유래된 자손을 포함한다. 자손은 모 세포와 핵산 함량이 완전히 동일할 필요는 없으며, 돌연변이를 함유할 수도 있다. 원래 형질전환된 세포에 대해 선별되거나 선택된 바와 동일한 기능 또는 생물 활성을 갖는 돌연변이 자손은 본 발명에 포함된다.
"인간 항체"는 인간 또는 인간 세포에 의해 생산되거나 또는 인간 항체 레퍼토리 또는 다른 인간 항체-암호화 서열을 사용하는 비-인간 공급원으로부터 유래된 항체의 아미노산 서열에 상응하는 아미노산 서열을 갖는 것이다. 인간 항체의 이러한 정의는 비-인간 항원-결합 잔기를 포함하는 인간화된 항체를 특별히 제외시킨다.
"인간 공통 프레임워크"는 인간 면역글로불린 VL 또는 VH 프레임워크 서열의 선택시 가장 통상적으로 존재하는 아미노산 잔기를 나타내는 프레임워크이다. 일반적으로, 인간 면역글로불린 VL 또는 VH 서열의 선택은 가변 도메인 서열의 하위그룹으로부터이다. 일반적으로, 상기 서열의 하위그룹은 문헌[Kabat, E.A. et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed., Bethesda MD (1991), NIH Publication 91-3242, Vols. 1-3]에서와 같은 하위그룹이다. 하나의 실시태양에서, VL의 경우, 상기 하위 그룹은 상기 문헌[Kabat et al.,]에서와 같은 하위그룹 카파 I이다. 하나의 실시태양에서, VH의 경우, 상기 하위 그룹은 상기 문헌[Kabat et al.,]에서와 같은 하위그룹 III이다.
"인간화된" 항체는 비-인간 HVR로부터의 아미노산 잔기 및 인간 FR로부터의 아미노산 잔기를 포함하는 키메릭 항체를 지칭한다. 몇몇 실시태양에서, 인간화된 항체는 적어도 하나, 및 전형적으로는 2개의 가변 도메인을 실질적으로 모두 포함할 것이며, 여기에서 상기 HVR(예를 들어 CDR)의 모두 또는 실질적으로 모두는 비-인간 항체의 것들에 상응하며, 상기 FR의 모두 또는 실질적으로 모두는 인간 항체의 것들에 상응한다. 인간화된 항체는 임의로 인간 항체로부터 유래된 항체 불변 영역의 적어도 일부를 포함할 수 있다. 항체, 예를 들어 비-인간 항체의 "인간화된 형태"는 인간화를 겪은 항체를 지칭한다.
본 발명에 사용되는 바와 같은 "고가변 영역" 또는 "HVR"이란 용어는 서열이 고가변성이고/이거나("상보성 결정 영역" 또는 "CDR") 구조적으로 한정된 고리("고가변 고리")를 형성하고/하거나, 항원-접촉 잔기("항원 접촉부")를 함유하는 항체 가변 도메인의 각각의 영역들을 지칭한다. 일반적으로, 항체는 6개의 HVR; VH 중 3개(H1, H2, H3) 및 VL 중 3개(L1, L2, L3)를 포함한다. 본 발명에서 예시적인 HVR은 하기를 포함한다:
(a) 아미노산 잔기 26-32 (L1), 50-52 (L2), 91-96 (L3), 26-32 (H1), 53-55 (H2), 및 96-101 (H3)에 존재하는 고가변 고리들(문헌[Chothia and Lesk, J. Mol. Biol. 196 (1987) 901-917(1987)]);
(b) 아미노산 잔기 24-34 (L1), 50-56 (L2), 89-97 (L3), 31-35b (H1), 50-65 (H2), 및 95-102 (H3)에 존재하는 CDR(문헌[Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)]);
(c) 아미노산 잔기 27c-36 (L1), 46-55 (L2), 89-96 (L3), 30-35b (H1), 47-58 (H2), 및 93-101 (H3)에 존재하는 항원 접촉부(문헌[MacCallum et al. J. Mol. Biol. 262: 732-745 (1996)]); 및
(d) (a), (b) 및/또는 (c)의 조합, 예를 들어 HVR 아미노산 잔기 46-56 (L2), 47-56 (L2), 48-56 (L2), 49-56 (L2), 26-35 (H1), 26-35b (H1), 49-65 (H2), 93-102 (H3), 및 94-102 (H3).
달리 가리키지 않는 한, 가변 도메인 중의 HVR 잔기 및 다른 잔기(예를 들어 FR 잔기)를 본 발명에서 상기 카밧(Kabat) 등에 따라 넘버링한다.
"면역접합체"는 비제한적으로 세포독성제를 포함하여, 하나 이상의 이종 분자에 접합된 항체이다. 하나의 바람직한 실시태양에서 면역접합체는 하나 이상의 세포독성제(바람직하게는 슈도모나스 외독소 A 또는 아마톡신)에 접합된 본 명세서에 기재된 바와 같은 항-TIM3 항체이다.
"개인" 또는 "피실험자"는 포유동물이다. 포유동물은 비제한적으로 가축(예를 들어 소, 양, 개, 고양이 및 말), 영장류(예를 들어 인간 및 비-인간 영장류, 예를 들어 원숭이), 토끼 및 설치류(예를 들어 마우스 및 래트)를 포함한다. 몇몇 실시태양에서, 상기 개인 또는 피실험자는 인간이다.
"단리된" 항체는 그의 천연 환경의 성분으로부터 분리된 것이다. 일부 실시태양에서, 항체를 예를 들어 전기영동(예를 들어 SDS-PAGE, 등전점 전기영동(IEF), 모세관 전기영동) 또는 크로마토그래피(예를 들어 이온 교환 또는 역상 HPLC)에 의해 측정되는 바와 같이 95% 또는 99% 초과의 순도로 정제시킨다. 항체 순도의 평가 방법에 대한 리뷰를 위해서, 예를 들어 문헌[Flatman, S. et al., J. Chromatogr. B 848(2007) 79-87]을 참조하시오.
"단리된" 핵산은 그의 천연 환경의 성분으로부터 분리된 핵산 분자를 지칭한다. 단리된 핵산은, 통상적으로 핵산 분자를 함유하지만 상기 핵산 분자가 염색체외에 또는 그의 천연 염색체 위치와 상이한 염색체 위치에 존재하는 세포 중에 함유된 핵산 분자를 포함한다.
"항-TIM3 항체를 암호화하는 단리된 핵산"은 항체 중쇄 및 경쇄를 암호화하는 하나 이상의 핵산 분자(또는 그의 단편), 예를 들어 단일 벡터 또는 별도의 벡터 중의 상기와 같은 핵산 분자를 지칭하며, 상기와 같은 핵산 분자는 숙주 세포 중의 하나 이상의 위치에 존재한다.
본 발명에 사용되는 바와 같은 "단클론 항체"란 용어는 실질적으로 동종인 항체들의 집단으로부터 획득되는 항체를 지칭한다, 즉 상기 집단을 포함하는 개별적인 항체들은 동일하고/하거나, 상기 단클론 항체의 생성 중 발생할 수 있는 가능한 변이체(상기와 같은 변이체는 일반적으로 소량으로 존재한다)를 제외하고 동일한 에피토프에 결합한다. 전형적으로 상이한 결정인자(에피토프)에 대한 상이한 항체를 포함하는 다클론 항체 제제와 대조적으로, 단클론 항체 제제의 각각의 단클론 항체는 상기 항원상의 단일 결정인자에 대한 것이다. 따라서, "단클론"이라는 수식어구는 실질적으로 동종인 항체 집단으로부터 획득된다는 항체의 특징을 가리키며, 임의의 특정한 방법에 의한 상기 항체의 생성을 요구하는 것으로서 해석해서는 안 된다. 예를 들어, 본 발명에 따라 사용되는 단클론 항체를 다양한 기법들, 예를 들어 비제한적으로 하이브리도마 방법, 재조합 DNA 방법, 파지-디스플레이 방법, 및 상기 인간 면역글로불린 유전자좌의 전부 또는 부분을 함유하는 트랜스제닉 동물을 사용하는 방법에 의해 제조할 수 있으며, 상기와 같은 방법 및 단클론 항체의 다른 예시적인 제조 방법들은 본 발명에 개시되어 있다.
"네이키드 항체"는 이종 부분(예를 들어 세포독성 부분) 또는 방사성표지에 접합되지 않은 항체를 지칭한다. 상기 네이키드 항체는 약학 제형 중에 존재할 수 있다(종래 기술이 면역접합체를 갖는 경우 포함된다).
"고유 항체"는 다양한 구조를 갖는 천연 면역글로불린 분자를 지칭한다. 예를 들어 고유 IgG 항체는 다이설파이드-결합되는 2개의 동일한 경쇄 및 2개의 동일한 중쇄로 구성된, 약 150,000 달톤의 이종사량체성 당단백질이다. N-에서부터 C-말단까지, 각각의 중쇄는 가변 영역(VH)(또한 가변 중쇄 도메인 또는 중쇄 가변 도메인이라 칭한다)에 이어서 3개의 불변 도메인(CH1, CH2 및 CH3)을 갖는다. 유사하게, N-에서부터 C-말단까지, 각각의 경쇄는 가변 영역(VL)(또한 가변 경쇄 도메인 또는 경쇄 가변 도메인이라 칭한다)에 이어서 불변 경쇄(CL) 도메인을 갖는다. 항체의 경쇄를 그의 불변 도메인의 아미노산 서열을 근거로, 카파(κ) 및 람다(λ)라 칭하는 2가지 유형 중 하나로 지정할 수 있다.
"패키지 삽입물"이란 용어는 치료 제품의 사용에 관한 적응증, 용법, 용량, 투여, 복합 요법, 금기 및/또는 경고에 관한 정보를 함유하는 상기 치료 제품의 상업적인 패키지 중에 통상적으로 포함되는 설명서를 지칭하는데 사용된다.
기준 폴리펩타이드 서열에 관한 "아미노산 서열 일치성 퍼센트(%)"는, 필요한 경우 최대의 서열 일치성 퍼센트를 성취하기 위해서, 및 상기 서열 일치성의 부분으로서 어떠한 보존적인 치환도 고려하지 않고, 서열과 도입 틈을 정렬시킨 후에, 기준 폴리펩타이드 서열 중의 아미노산 잔기들과 일치하는 후보 서열 중의 아미노산 잔기들의 백분율로서 정의된다. 아미노산 서열 일치성 퍼센트를 측정하기 위한 정렬은 당해 분야의 기술 내에 있는 다양한 방식들로, 예를 들어 공개적으로 입수할 수 있는 컴퓨터 소프트웨어, 예를 들어 BLAST, BLAST-2, ALGN 또는 메그얼라인(Megalign)(DNASTAR) 소프트웨어를 사용하여 성취될 수 있다. 당해 분야의 숙련가들은 서열들을 정렬시키기에 적합한 매개변수들, 예를 들어 비교하는 서열들의 전체길이에 대해 최대의 정렬을 성취하기 위해 필요한 임의의 연산을 결정할 수 있다. 그러나, 본 발명의 목적을 위해서, 아미노산 서열 일치성%를 서열 비교 컴퓨터 프로그램 ALIGN-2를 사용하여 생성시킨다. 상기 ALIGN-2 서열 비교 컴퓨터 프로그램은 제넨테크 인코포레이티드(Genentech, Inc.)에 의해 저술되었으며, 소스 암호는 미국 저작권 관청(미국 워싱톤 D.C. 20559 소재)에 사용자 문서와 함께 제출되었다(이때 상기 코드는 미국 저작권 등록 번호 TXU510087로 등록되어 있다). 상기 ALIGN-2 프로그램은 미국 캘리포니아주 사우스 샌프란시스코 소재의 제넨테크 인코포레이티드로부터 공개적으로 입수할 수 있거나, 또는 상기 소스 암호로부터 편집될 수 있다. 상기 ALIGN-2 프로그램을, 디지털 UNIX V4.0D를 포함하여, UNIX 실행 시스템상에서 사용하기 위해 편집해야 한다. 모든 서열 비교 매개변수들은 상기 ALIGN-2 프로그램에 의해 설정되며 변하지 않는다.
ALIGN-2를 아미노산 서열 비교를 위해 사용하는 경우에, 주어진 아미노산 서열 A의 주어진 아미노산 서열 B에의, 상기 B와의, 또는 상기 B에 대한 아미노산 서열 일치성%(이는 한편으로 주어진 아미노산 서열 B에, 상기 B와, 또는 상기 B에 대해 일정한 아미노산 서열 일치성%를 갖거나 포함하는 주어진 아미노산 서열 A로서 표현될 수 있다)를 하기와 같이 계산한다:
100 x X/Y 분수
상기에서, X는 A 및 B의 서열 정렬 프로그램 ALIGN-2의 정렬에서 상기 프로그램에 의해 일치성 합치로서 채점되는 아미노산 잔기의 수이고, Y는 B 중 아미노산 잔기의 총수이다. 아미노산 서열 A의 길이가 아미노산 서열 B의 길이와 동일하지 않은 경우, A 대 B의 아미노산 서열 일치성%는 B 대 A의 아미노산 서열 일치성%와 동일하지 않음을 알 것이다. 달리 구체적으로 서술되지 않는 한, 본 발명에 사용된 모든 아미노산 서열 일치성% 값들은 상기 ALIGN-2 컴퓨터 프로그램을 사용하여 바로 앞의 단락에 개시된 바와 같이 획득된다.
"약학 제형"이란 용어는 제형 중에 함유된 활성 성분의 생물학적 활성이 유효하도록 하는 형태로 존재하고 상기 제형이 투여되는 환자에게 허용 가능하지 않게 독성인 추가적인 성분을 함유하지 않는 제제를 지칭한다.
"약학적으로 허용 가능한 담체"는 환자에게 무독성인, 활성 성분 이외의 약학 제형 중의 성분을 지칭한다. 약학적으로 허용 가능한 담체는 비제한적으로 완충제, 부형제, 안정제, 또는 보존제를 포함한다.
본 발명에 사용되는 바와 같은 "TIM3"이란 용어는 달리 나타내지 않는 한 영장류(예를 들어 인간) 및 설치류(예를 들어 마우스 및 래트)와 같은 포유동물을 포함한, 임의의 척추동물 공급원으로부터의 임의의 고유 T 세포 면역글로불린 뮤신 3(TIM3) 단백질(또한 A형 간염 바이러스 세포 수용체 2(HAVcr-2), 신장 손상 분자-3(KIM-3), TIM-3, Tim3, 또는 Tim-3으로서 공지됨)을 지칭한다. 상기 용어는 세포에서의 가공으로부터 생성되는 TIM3의 임의의 형태뿐만 아니라 "전장"의 가공되지 않은 TIM3을 포함한다. 상기 용어는 또한 TIM3의 천연 변이체, 예를 들어 이어맞추기 변이체 또는 대립유전자 변이체를 포함한다. 예시적인 인간 TIM3의 아미노산 서열을 서열번호 77에 나타낸다. TIM3의 세포외 도메인(ECD)의 아미노산 서열을 서열번호 78에 나타낸다.
TIM3은 면역글로불린 상과, 및 단백질의 TIM 과에 속하는 인간 단백질이다. 인간에서, 마우스와 유사하게, TIM-3은 T 세포뿐만 아니라 식세포, 예를 들어 대식세포 및 수지상 세포상에서 발현된다. 단백질 리간드(예를 들어 갈렉틴-9)에의 TIM-3의 결합은 세포사멸 유도의 기전을 통해 Th1 응답을 억제할 수 있으며, 따라서 말초 면역관용의 유도를 이끌어낼 수 있다. siRNA에 의한 인간 TIM-3의 발현의 감소 또는 차단-항체에 의한 인간 TIM-3의 억제는 CD4 양성 T-세포로부터 인터페론 알파의 분비를 증가시켰으며, 이는 인간 T 세포에서 TIM-3의 억제 역할을 지지한다. 식세포에서, TIM-3은 또한 세포사멸 세포를 인식하기 위한 수용체로서 기능한다. 자가면역 질병 환자로부터의 임상 샘플의 분석은 CD4 양성 세포에서 TIM-3의 발현이 없음을 보였다. 특히, 다발성 경화증이 있는 환자의 뇌척수액으로부터 유래된 T 세포 클론에서, TIM-3의 발현 수준은 보통의 건강한 사람으로부터 유래된 클론의 경우보다 더 낮고 IFN-감마의 분비 수준은 더 높았다(문헌[Koguchi K et al., J Exp Med. 203 (2006) 1413-1418]).
TIM-3과 알러지성 질병 또는 천식과의 관계에 대한 보고서들이 존재한다(WO96/27603 및 WO2003/063792).
급성 골수성 백혈병(본 명세서에서 이후부터 "AML"이라 칭한다) 환자로부터의 조혈모세포 및 정상적인 조혈모세포의 미세배열 분석에 따르면, TIM-3은 AML 줄기 세포상에서 발현되며 따라서 상기 분석은 혈액암에서 TIM-3의 연루를 암시하였다(문헌[Majeti R et al., PNAS, 106 (2009) 3396-3401] 및 WO2009/091547).
상기 항-TIM-3 단클론 항체의 예는 항-인간 TIM-3 래트 단클론 항체(클론 344823, R&D 시스템스에 의해 제조됨) 및 항-인간 TIM-3 마우스 단클론 항체(클론 F38-2E2, R&D 시스템스에 의해 제조됨)를 포함한다.
본 발명에 사용된 바와 같이, "치료"(및 "치료하다" 및 "치료하는"과 같은 그의 문법상 어미변화)는 치료 중인 개인의 자연적인 과정을 변경시키고자 하는 임상적 중재를 지칭하며, 예방을 위해서 또는 임상적 병리 과정 동안 수행될 수 있다. 치료의 바람직한 효과는 비제한적으로 질병의 발생 또는 재발 방지, 증상의 완화, 상기 질병의 임의의 직접적인 또는 간접적인 병리학적 결과의 감소, 전이 방지, 질병 진행속도의 감소, 질병 상태의 개선 또는 완화, 및 진정 또는 개선된 예후를 포함한다. 일부 실시태양에서, 본 발명의 항체를 사용하여 질병의 발생을 지연시키거나 또는 질병의 진행을 늦춘다.
"가변 영역" 또는 "가변 도메인"이란 용어는 항원에 대한 항체의 결합과 관련된 항체 중쇄 또는 경쇄의 도메인을 지칭한다. 고유 항체의 중쇄 및 경쇄의 가변 도메인(각각 VH 및 VL)은 일반적으로 유사한 구조들을 가지며, 이때 각 도메인은 4개의 보존된 프레임워크 영역(FR) 및 3개의 고가변 영역(HVR)을 포함한다(예를 들어 문헌[Kindt, T.J. et al. Kuby Immunology, 6th ed., W.H. Freeman and Co., N.Y. (2007), page 91]을 참조하시오). 단일의 VH 또는 VL 도메인이면 항원-결합 특이성을 부여하기에 충분할 수 있다. 더욱 또한, 특정 항원에 결합하는 항체를, 각각 상보성 VL 또는 VH 도메인의 라이브러리를 선별하기 위해 상기 항원에 결합하는 상기 항체로부터의 VH 또는 VL 도메인을 사용하여 단리시킬 수 있다(예를 들어 문헌[Portolano, S. et al., J. Immunol. 150 (1993) 880-887]; 문헌[Clackson, T. et al., Nature 352 (1991) 624-628]을 참조하시오).
본 발명에 사용된 바와 같은 "벡터"란 용어는 결합된 또 다른 핵산을 전파할 수 있는 핵산 분자를 지칭한다. 상기 용어는 자기-복제 핵산 구조물로서 벡터뿐만 아니라 상기 벡터가 도입된 숙주 세포의 게놈내에 통합된 벡터를 포함한다. 몇몇 벡터는 상기 벡터가 작동적으로 연결되는 핵산의 발현을 지시할 수 있다. 상기와 같은 벡터를 본 발명에서 "발현 벡터"라 칭한다.
II. 조성물 및 방법
하나의 태양에서, 본 발명은 부분적으로 본 발명의 상기 선택된 항-TIM3 항체가 TIM3의 몇몇 에피토프에 결합하여, 면역접합체로서 암세포에 대해 강하고 빠른 내면화 및/또는 높은 세포독성 활성을 보이고/보이거나 상한 면역자극성 사이토킨(예를 들어 인터페론 감마) 방출을 보인다는 발견을 기본으로 한다. 몇몇 실시태양에서, TIM3에 결합하는 항체를 제공한다. 본 발명의 항체는 예를 들어 암의 진단 또는 치료에 유용하다.
A. 예시적인 항-TIM3 항체
하나의 태양에서, 본 발명은 TIM3에 결합하는 단리된 항체를 제공한다. 몇몇 실시태양에서, 항-TIM3을 제공하며, 여기에서 상기 항체는
·37 ℃에서 120분 후에 45% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 50% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 55% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 60% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 65% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오).
몇몇 실시태양에서, 항-TIM3을 제공하며, 여기에서 상기 항체는
·Tim3_0016의 VH 및 VL을 포함하는 항-Tim3 항체와 TIM3에의 결합에 대해 경쟁하고
·인간 및 시노몰구스 TIM3에 결합하고
·면역접합체로서 TIM3 발현 세포상에서 세포독성 활성을 나타내고(하나의 실시태양에서 상기 면역접합체는 0.1 이하(실시예 11에서 측정된 바와 같이)의, RPMI-8226 세포상에서 슈도모나스 외독소 A 접합체로서 세포독성 활성의 상대적인 IC50 값을 갖는다)
·인터페론-감마 방출을 유도한다(MLR 분석에서 - 실시예 5를 참조하시오).
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; 또는 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 2, 3, 4, 5 또는 6개의 HVR을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; 또는 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; 또는 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VH HVR 서열 전부를 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; 또는 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; 또는 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VL HVR 서열 전부를 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; 또는 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; 또는 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
하나의 실시태양에서 상기와 같은 항-TIM3 항체는
i) 서열번호 7의 VH 서열 및 서열번호 8의 VL 서열;
ii) 서열번호 9의 VH 서열 및 서열번호 10의 VL 서열;
iii) 또는 i) 또는 ii) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체
를 포함한다.
하나의 바람직한 실시태양에서 상기와 같은 항-TIM3 항체는
i) 서열번호 79의 VH 서열 및 서열번호 80의 VL 서열, 또는
ii) 서열번호 81의 VH 서열 및 서열번호 82의 VL 서열
을 포함한다.
하나의 바람직한 실시태양은 인간 TIM3 항체에 결합하는 항체이며, 여기에서 상기 항체는 서열번호 79의 VH 서열 및 서열번호 80의 VL 서열을 포함한다.
하나의 바람직한 실시태양은 인간 TIM3 항체에 결합하는 항체이며, 여기에서 상기 항체는 서열번호 81의 VH 서열 및 서열번호 82의 VL 서열을 포함한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 15의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 2, 3, 4, 5 또는 6개의 HVR을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 15의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 15 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VH HVR 서열 전부를 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VL HVR 서열 전부를 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 15 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
하나의 실시태양에서 상기와 같은 항-TIM3 항체는
i) 서열번호 19의 VH 서열 및 서열번호 20의 VL 서열;
ii) 또는 i) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체
를 포함한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 23의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 2, 3, 4, 5 또는 6개의 HVR을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 23의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 23 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VH HVR 서열 전부를 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VL HVR 서열 전부를 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 23 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
하나의 실시태양에서 상기와 같은 항-TIM3 항체는
i) 서열번호 27의 VH 서열 및 서열번호 28의 VL 서열;
ii) 또는 i) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체
를 포함한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 31의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 34의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 2, 3, 4, 5 또는 6개의 HVR을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 31의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 34의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 31 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VH HVR 서열 전부를 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 34의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VL HVR 서열 전부를 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 31 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 34의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
하나의 실시태양에서 상기와 같은 항-TIM3 항체는
i) 서열번호 35의 VH 서열 및 서열번호 36의 VL 서열;
ii) 또는 i) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체
를 포함한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 39의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 2, 3, 4, 5 또는 6개의 HVR을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 39의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 39 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VH HVR 서열 전부를 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VL HVR 서열 전부를 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 39 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
하나의 실시태양에서 상기와 같은 항-TIM3 항체는
i) 서열번호 43의 VH 서열 및 서열번호 44의 VL 서열;
ii) 또는 i) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체
를 포함한다.
하나의 바람직한 실시태양에서 상기와 같은 항-TIM3 항체는
i) 서열번호 83의 VH 서열 및 서열번호 84의 VL 서열, 또는
ii) 서열번호 85의 VH 서열 및 서열번호 86의 VL 서열
을 포함한다.
하나의 바람직한 실시태양은 인간 TIM3 항체에 결합하는 항체이며, 여기에서 상기 항체는 서열번호 83의 VH 서열 및 서열번호 84의 VL 서열을 포함한다.
하나의 바람직한 실시태양은 인간 TIM3 항체에 결합하는 항체이며, 여기에서 상기 항체는 서열번호 85의 VH 서열 및 서열번호 86의 VL 서열을 포함한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 46의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 47의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 48의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 50의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 2, 3, 4, 5 또는 6개의 HVR을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 46의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 47의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 48의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 50의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 46의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 47 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VH HVR 서열 전부를 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 48의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 50의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VL HVR 서열 전부를 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 46의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 47 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 48의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 50의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
하나의 실시태양에서 상기와 같은 항-TIM3 항체는
i) 서열번호 51의 VH 서열 및 서열번호 52의 VL 서열;
ii) 또는 i) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체
를 포함한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 53의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 55의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 2, 3, 4, 5 또는 6개의 HVR을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 53의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 55의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 53의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 55 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VH HVR 서열 전부를 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VL HVR 서열 전부를 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 53의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 55 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
하나의 실시태양에서 상기와 같은 항-TIM3 항체는
i) 서열번호 59의 VH 서열 및 서열번호 60의 VL 서열;
ii) 또는 i) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체
를 포함한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 63의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 64의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 65의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 66의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 2, 3, 4, 5 또는 6개의 HVR을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
하나의 태양에서, 본 발명은 (a) 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 63의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 64의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 65의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 66의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 항-TIM3 항체를 제공한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 63 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VH HVR 서열 전부를 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 64의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 65의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 66의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3 중에서 선택된 적어도 1, 적어도 2 또는 3개의 VL HVR 서열 전부를 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
또 다른 태양에서, 본 발명의 항체는 (a) (i) 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 63 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 64의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 65의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 66의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
하나의 실시태양에서 상기와 같은 항-TIM3 항체는
i) 서열번호 67의 VH 서열 및 서열번호 68의 VL 서열;
ii) 또는 i) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체
를 포함한다.
상기 실시태양들 중 어느 하나에서, 항-TIM3 항체는 인간화된다. 하나의 실시태양에서, 항-TIM3 항체는 상기 실시태양들 중 어느 하나에서와 같은 HVR을 포함하며, 수용체 인간 프레임워크, 예를 들어 인간 면역글로불린 프레임워크 또는 인간 공통 프레임워크를 추가로 포함한다. 또 다른 실시태양에서, 항-TIM3항체는 상기 실시태양들 중 어느 하나에서와 같은 HVR을 포함하며, 상기와 같은 HVR을 포함하는 VH 및 VL을 추가로 포함한다.
추가의 태양에서, 본 발명은 본 명세서에 제공된 항-TIM3 항체와 동일한 에피토프에 결합하는 항체를 제공한다. 예를 들어, 몇몇 실시태양에서, 서열번호 7의 VH 서열 및 서열번호 8의 VL 서열을 포함하는 항-TIM3 항체와 동일한 에피토프에 결합하는 항체를 제공하거나, 또는 서열번호 9의 VH 서열 및 서열번호 10의 VL 서열을 포함하는 항-TIM3 항체와 동일한 에피토프에 결합하는 항체를 제공하거나, 또는 서열번호 19의 VH 서열 및 서열번호 20의 VL 서열을 포함하는 항-TIM3 항체와 동일한 에피토프에 결합하는 항체를 제공하거나, 또는 서열번호 27의 VH 서열 및 서열번호 28의 VL 서열을 포함하는 항-TIM3 항체와 동일한 에피토프에 결합하는 항체를 제공하거나, 또는 서열번호 35의 VH 서열 및 서열번호 36의 VL 서열을 포함하는 항-TIM3 항체와 동일한 에피토프에 결합하는 항체를 제공하거나, 또는 서열번호 43의 VH 서열 및 서열번호 44의 VL 서열을 포함하는 항-TIM3 항체와 동일한 에피토프에 결합하는 항체를 제공하거나, 또는 서열번호 51의 VH 서열 및 서열번호 52의 VL 서열을 포함하는 항-TIM3 항체와 동일한 에피토프에 결합하는 항체를 제공하거나, 또는 서열번호 59의 VH 서열 및 서열번호 60의 VL 서열을 포함하는 항-TIM3 항체와 동일한 에피토프에 결합하는 항체를 제공하거나, 또는 서열번호 67의 VH 서열 및 서열번호 68의 VL 서열을 포함하는 항-TIM3 항체와 동일한 에피토프에 결합하는 항체를 제공한다.
하나의 바람직한 실시태양에서 서열번호 7의 VH 서열 및 서열번호 8의 VL 서열을 포함하는 항-TIM3 항체와 동일한 에피토프에 결합하는 항체를 제공한다.
하나의 바람직한 실시태양에서 서열번호 7의 VH 서열 및 서열번호 8의 VL 서열을 포함하는 항-TIM3 항체와 인간 TIM3에의 결합에 대해 경쟁하는(RPMI-8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))상에서 실시예 4에 기재된 경쟁 분석에서 측정된 바와 같이) 항체를 제공한다.
하나의 태양에서, 본 발명은
A) (a) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
B) (a) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
C) (a) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
D) (a) 서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 15의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
E) (a) 서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 23의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
F) (a) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 31의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 34의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
G) (a) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 39 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
H) (a) 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 46의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 47의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 48의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 50의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
I) (a) 서열번호 53의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 55의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 57 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
J) (a) 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 63의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 64의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 65의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 66의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3
을 포함하는 항-TIM3 항체(예를 들어 인간 TIM3에 결합하는 항체)를 제공한다.
또 다른 태양에서 본 발명은
A) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
B) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
C) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
D) (a) (i) 서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 15 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
E) (a) (i) 서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 23 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
F) (a) (i) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 31 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 34의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
G) (a) (i) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 39 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
H) (a) (i) 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 46의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 47 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 48의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 50의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
I) (a) (i) 서열번호 53의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 55 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
J) (a) (i) 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 63 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 64의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 65의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 66의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인
을 포함하는 항-TIM3 항체(예를 들어 인간 TIM3에 결합하는 항체)를 제공한다.
하나의 태양에서, 본 발명은
A1) i) 서열번호 7의 VH 서열 및 서열번호 8의 VL 서열을 포함하거나;
ii) 서열번호 9의 VH 서열 및 서열번호 10의 VL 서열을 포함하거나;
iii) 또는 i) 또는 ii) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체를 포함하거나;
또는
A2) i) 서열번호 79의 VH 서열 및 서열번호 80의 VL 서열을 포함하거나; 또는
ii) 서열번호 81의 VH 서열 및 서열번호 82의 VL 서열을 포함하거나;
또는
B) i) 서열번호 19의 VH 서열 및 서열번호 20의 VL 서열을 포함하거나;
ii) 또는 i) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체를 포함하거나; 또는
C) i) 서열번호 27의 VH 서열 및 서열번호 28의 VL 서열을 포함하거나;
ii) 또는 i) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체를 포함하거나; 또는
D) i) 서열번호 35의 VH 서열 및 서열번호 36의 VL 서열을 포함하거나;
ii) 또는 i) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체를 포함하거나; 또는
E) i) 서열번호 43의 VH 서열 및 서열번호 44의 VL 서열을 포함하거나;
ii) 또는 i) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체를 포함하거나; 또는
F) i) 서열번호 51의 VH 서열 및 서열번호 52의 VL 서열을 포함하거나;
ii) 또는 i) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체를 포함하거나; 또는
G1) i) 서열번호 59의 VH 서열 및 서열번호 60의 VL 서열을 포함하거나;
ii) 또는 i) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체를 포함하거나; 또는
G2) i) 서열번호 83의 VH 서열 및 서열번호 84의 VL 서열을 포함하거나; 또는
ii) 서열번호 85의 VH 서열 및 서열번호 86의 VL 서열을 포함하거나; 또는
H) i) 서열번호 67의 VH 서열 및 서열번호 68의 VL 서열을 포함하거나;
ii) 또는 i) 하의 항체의 VH 및 VL의 인간화된 변이체를 포함하는
항-TIM3 항체(예를 들어 인간 TIM3에 결합하는 항체)를 제공한다.
또 다른 태양에서, 본 발명은
A) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
B) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
C) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
D) (a) (i) 서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 15 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
E) (a) (i) 서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 23 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
F) (a) (i) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 31 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 34의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
G) (a) (i) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 39 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
H) (a) (i) 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 46의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 47 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 48의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 50의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
I) (a) (i) 서열번호 53의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 55 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
J) (a) (i) 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 63 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 64의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 65의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 66의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인
을 포함하는 항-TIM3 항체(예를 들어 인간 TIM3에 결합하는 항체)를 제공하며, 여기에서 상기 항체는 하기의 성질들 중 하나 이상에 의해 독립적으로 특성화된다: 상기 TIM3 항체는
·37 ℃에서 120분 후에 45% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 50% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 55% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 60% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 65% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오).
또 다른 태양에서, 본 발명은
A) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
B) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
C) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
D) (a) (i) 서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 15 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
E) (a) (i) 서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 23 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
F) (a) (i) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 31 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 34의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
G) (a) (i) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 39 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
H) (a) (i) 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 46의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 47 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 48의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 50의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
I) (a) (i) 서열번호 53의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 55 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
J) (a) (i) 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 63 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 64의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 65의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 66의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인
을 포함하는 항-TIM3 항체(예를 들어 인간 TIM3에 결합하는 항체)를 제공하며, 여기에서 상기 항체는 하기의 성질들 중 하나 이상에 의해 독립적으로 특성화된다: 상기 항-TIM3 항체는
·37 ℃에서 120분 후에 45% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 50% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 55% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 60% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 65% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·서열번호 7의 VH 및 서열번호 8의 VL을 포함하는 항-Tim3 항체와 TIM3에의 결합에 대해 경쟁하고
·인간 및 시노몰구스 TIM3에 결합하고
·면역접합체로서 TIM3 발현 세포상에서 세포독성 활성을 나타내고(하나의 실시태양에서 상기 면역접합체는 0.1 이하(실시예 11에서 측정된 바와 같이)의, RPMI-8226 세포상에서 슈도모나스 외독소 A 접합체로서 세포독성 활성의 상대적인 IC50 값을 갖는다)
·인터페론-감마 방출을 유도한다(실시예 5에 기재된 바와 같은 혼합림프구반응(MLR) 분석에서).
본 발명의 추가의 태양에서, 상기 실시태양들 중 어느 하나에 따른 항-TIM3 항체는 키메릭, 인간화된 또는 인간 항체를 포함한 단클론 항체이다. 하나의 실시태양에서, 항-TIM3 항체는 항체 단편, 예를 들어 Fv, Fab, Fab', scFv, 다이아바디, 또는 F(ab')2 단편이다. 또 다른 실시태양에서, 상기 항체는 전장 항체, 예를 들어 완전한 IgG1 또는 IgG4 항체 또는 본 명세서에서 정의된 바와 같은 다른 항체 부류 또는 아이소타입이다.
추가의 태양에서, 상기 실시태양들 중 어느 하나에 따른 항-TIM3항체는 하기 섹션 1-7에 기재된 바와 같은 특징들 중 임의의 특징을 단독으로 또는 함께 포함할 수 있다:
1. 항체 친화성
몇몇 실시태양에서, 본 발명에 제공된 항체는 ≤ 1 μM, ≤ 100 nM, ≤ 10 nM, ≤ 1 nM, ≤ 0.1 nM, ≤ 0.01 nM, 또는 ≤ 0.001 nM(예를 들어 10-8 M 이하, 예를 들어 10-8 M 내지 10-13 M, 예를 들어 10-9 M 내지 10-13 M)의 해리상수 KD를 갖는다.
하나의 실시태양에서, KD를 약 10 응답 단위(RU)에서 고정화된 항원 CM5 칩으로 25 ℃에서 비아코어(등록상표)를 사용하는 표면 플라스몬 공명 분석을 사용하여 측정한다. 간단히, 카복시메틸화된 덱스트란 바이오센서 칩(CM5, 비아코어 인코포레이티드)을 공급자의 설명서에 따라 N-에틸-N'-(3-다이메틸아미노프로필)-카보다이이미드 하이드로클로라이드(ECD) 및 N-하이드록시숙신이미드(NHS)로 활성화시킨다. 항원을 10 mM 나트륨 아세테이트(pH 4.8)로 5 ㎍/㎖(약 0.2 μM)로 희석한 후에 5 ㎕/분의 유량으로 주입하여 대략 10 응답 단위(RU)의 결합된 단백질을 성취한다. 상기 항원의 주입에 이어서, 1 M 에탄올아민을 주입하여 반응되지 않은 그룹들을 차단한다. 동역학적 측정을 위해서, Fab의 2배 연속 희석물(0.78 nM 내지 500 nM)을 25 ℃에서 대략 25 ㎕/분의 유량으로 0.05% 폴리솔베이트 20(트윈-20(상표)) 계면활성제(PBST)와 함께 PBS 중에서 주입한다. 결합율(kon 또는 ka) 및 해리율(koff 또는 kd)을 결합 및 해리 센서그램을 동시에 정합시킴으로써 간단한 1 대 1 랭뮤어(Langmuir) 결합 모델(비아코어(등록상표) 평가 소프트웨어 버전 3.2)을 사용하여 계산한다. 평형 해리 상수 KD를 kd/ka(koff/kon) 비로서 계산한다(예를 들어 문헌[Chen, Y. et al., J. Mol. Biol. 293(1999) 865-881]을 참조하시오). 상기 온-율이 상기 표면 플라스몬 공명 분석에 의해 106 M-1s-1을 초과하는 경우, 상기 온-율을 분광계, 예를 들어 스탑-플로우(stop-flow) 구비된 분광광도계(아비브 인스트루먼츠(Aviv Instruments) 또는 교반식 큐벳을 갖는 8000-시리즈 SLM-AMINCO(상표) 분광광도계(써모스펙트로닉(ThermoSpectronic))에서 측정되는 바와 같이 증가하는 농도의 항원의 존재하에서 25 ℃에서 PBS(pH 7.2) 중의 20 nM 항-항원 항체(Fab 형태)의 형광 방출 강도(여기 = 295 ㎚; 방출 = 340 ㎚, 16 ㎚ 통과 대역)의 증가 또는 감소를 측정하는 형광 소광 기법을 사용하여 측정할 수 있다.
2. 항체 단편
몇몇 실시태양에서, 본 발명에 제공된 항체는 항체 단편이다. 항체 단편은 비제한적으로 Fab, Fab', Fab'-SH, F(ab')2, Fv, 및 scFv 단편, 및 하기에 개시되는 다른 단편들을 포함한다. 몇몇 항체 단편의 리뷰를 위해서, 문헌[Hudson, P.J. et al., Nat. Med. 9 (2003) 129-134]을 참조하시오. scFv 단편의 리뷰를 위해서 예를 들어 문헌[Plueckthun, A., In; The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, Vol. 113, Rosenburg and Moore (eds.), Springer-Verlag, New York (1994), pp. 269-315]; 또한 WO 93/16185; 미국특허 제 5,571,894 호 및 미국특허 제 5,587,458 호를 참조하시오. 구조 수용체 결합 에피토프 잔기를 포함하고 증가된 생체내 반감기를 갖는 Fab 및 F(ab')2 단편에 대한 논의에 대해서, 미국특허 제 5,869,046 호를 참조하시오.
다이아바디는 2가 또는 이중특이성일 수 있는 2개의 항원-결합 부위를 갖는 항체 단편이다. 예를 들어 EP 0 404 097; WO 1993/01161; 문헌[Hudson, P.J. et al., Nat. Med. 9 (2003) 129-134]; 및 문헌[Holliger, P. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90 (1993) 6444-6448]을 참조하시오. 트라이아바디 및 테트라바디가 또한 문헌[Hudson, P.J. et al., Nat. Med. 9 (20039 129-134)]에 개시되어 있다.
단일-도메인 항체는 항체의 중쇄 가변 도메인의 일부 또는 전부 또는 경쇄 가변 도메인의 일부 또는 전부를 포함하는 항체 단편이다. 몇몇 실시태양에서, 단일-도메인 항체는 인간 단일-도메인 항체이다(문헌[Domantis, Inc., Waltham, MA]; 예를 들어 미국특허 제 6,248,516 B1 호를 참조하시오).
항체 단편을 본 발명에 개시된 바와 같은 다양한 기법들, 예를 들어 비제한적으로 완전 항체의 단백질분해 절단뿐만 아니라 재조합 숙주 세포(예를 들어 에스케리키아 콜라이 또는 파지)에 의한 생산에 의해 제조할 수 있다.
3. 키메릭 및 인간화된 항체
몇몇 실시태양에서, 본 발명에 제공된 항체는 키메릭 항체이다. 몇몇 키메릭 항체들이 예를 들어 미국특허 제 4,816,567 호; 및 문헌[Morrison, S.L. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81 (1984) 6851-6855)]에 개시되어 있다. 일례로, 키메릭 항체는 비-인간 가변 영역(예를 들어 마우스, 래트, 햄스터, 토끼, 또는 비-인간 영장류, 예를 들어 원숭이로부터 유래된 가변 영역) 및 인간 불변 영역을 포함한다. 추가의 예에서, 키메릭 항체는 상기 부류 또는 하위부류가 모 항체의 부류 또는 하위부류로부터 변화된 "부류 변환된(switched)" 항체이다. 키메릭 항체는 그의 항원-결합 단편을 포함한다.
몇몇 실시태양에서, 키메릭 항체는 인간화된 항체이다. 전형적으로, 비-인간 항체는 모 비-인간 항체의 특이성 및 친화성은 유지하면서 인간에 대한 면역원성이 감소하도록 인간화된다. 일반적으로, 인간화된 항체는 HVR, 예를 들어 CDR(또는 그의 부분들)이 비-인간 항체로부터 유래되고 FR(또는 그의 부분들)이 인간 항체 서열로부터 유래되는 하나 이상의 가변 도메인을 포함한다. 인간화된 항체는 임의로 인간 불변 영역의 적어도 일부를 또한 포함할 것이다. 일부 실시태양에서, 인간화된 항체 중의 일부 FR 잔기는, 예를 들어 항체 특이성 또는 친화성을 복원하거나 개선시키기 위해서 비-인간 항체(예를 들어 HVR 잔기가 유래되는 항체)로부터의 상응하는 잔기로 치환된다.
인간화된 항체 및 그의 제조 방법들이 예를 들어 문헌[Almagro, J.C. and Fransson, J., Front. Biosci. 13 (2008) 1619-1633]에 리뷰되어 있으며, 예를 들어 문헌[Riechmann, I. et al., Nature 332 (1988) 323-329]; 문헌[Queen, C. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86 (1989) 10029-10033]; 미국특허 제 5,821,337 호, 미국특허 제 7,527,791 호, 미국특허 제 6,982,321 호 및 미국특허 제 7,087,409 호; 문헌[Kashmiri, S.V. et al., Methods 36 (2005) 25-34](SDR(a-CDR) 이식을 개시함); 문헌[Padlan, E.A., Mol. Immunol. 28 (1991) 489-498]("재표면화"를 개시함); 문헌[Dall'Acqua, W.F. et al., Methods 36 (2005) 43-60]("FR 셔플링"을 개시함); 및 문헌[Osbourn, J. et al., Methods 36 (2005) 61-68] 및 문헌[Klimka, A. et al., Br. J. Cancer 83 (2000) 252-260](FR 셔플링으로의 "유도된 선택" 접근을 개시함)에 추가로 개시되어 있다.
인간화에 사용될 수 있는 인간 프레임워크 영역은 비제한적으로 "최적합" 방법(예를 들어 문헌[Sims, M.J. et al., J. Immunol. 151 (1993) 2296-2308]을 참조하시오)을 사용하여 선택된 프레임워크 영역; 경쇄 또는 중쇄 가변 영역의 특정 하위그룹의 인간 항체의 공통 서열로부터 유래된 프레임워크 영역(예를 들어 문헌[Carter, P. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89 (1992) 4285-4289]; 및 문헌[Presta, L.G. et al., J. Immunol. 151 (1993) 2623-2632]을 참조하시오); 인간 성숙(체세포 돌연변이된) 프레임워크 영역 또는 인간 생식세포 계열 프레임워크 영역(예를 들어 문헌[Almagro, J.C. and Fransson, J., Front. Biosci. 13 (2008) 1619-1633]을 참조하시오); 및 FR 라이브러리의 선별로부터 유래된 프레임워크 영역(예를 들어 문헌[Baca, M. et al., J. Biol. Chem. 272 (1997) 10678-10684] 및 문헌[Rosok, M.J. et al., J. Biol. Chem. 271 (19969 22611-22618)]을 참조하시오)을 포함한다.
4. 인간 항체
몇몇 실시태양에서, 본 발명에 제공된 항체는 인간 항체이다. 인간 항체를 당해 분야에 공지된 다양한 기법을 사용하여 생성시킬 수 있다. 인간 항체는 문헌[van Dijk, M.A. and van de Winkel, J.G., Curr. Opin. Pharmacol. 5 (2001) 368-374] 및 문헌[Lonberg, N., Curr. Opin. Immunol. 20 (2008) 450-459]에 일반적으로 개시되어 있다.
인간 항체를, 항원 공격에 응답하여 완전한 인간 항체 또는 인간 가변 영역을 갖는 완전 항체를 생성하도록 변형시킨 트랜스제닉 동물에게 투여함으로써 제조할 수 있다. 상기와 같은 동물은 전형적으로는 인간 면역글로불린 유전자좌의 일부 또는 전부를 함유하며, 상기 자리는 내인성 면역글로불린 유전자좌로 대체되거나 또는 염색체외에 존재하거나 또는 상기 동물의 염색체내로 무작위로 삽입된다. 상기와 같은 트랜스제닉 마우스에서, 상기 내인성 면역글로불린 유전자좌는 일반적으로 불활성화되었다. 트랜스제닉 동물로부터 인간 항체를 수득하기 위한 방법의 리뷰에 대해서, 문헌[Lonberg, N., Nat. Biotech. 23 (2005) 1117-1125]을 참조하시오. 또한 예를 들어 제노마우스(XENOMOUSE)(상표) 기술을 개시하는 미국특허 제 6,075,181 호 및 미국특허 제 6,150,584 호; 휴맵(HUMAB)(등록상표) 기술을 개시하는 미국특허 제 5,770,429 호; 케이엠 마우스(K-M MOUSE)(등록상표) 기술을 개시하는 미국특허 제 7,041,870 호; 및 벨로시마우스(VELOCIMOUSE)(등록상표) 기술을 개시하는 미국 특허 출원 공보 US 2007/0061900을 참조하시오. 상기와 같은 동물들로부터 생성된 완전 항체로부터의 인간 가변 영역들을 예를 들어 상이한 인간 불변 영역과의 조합에 의해 추가로 변형시킬 수도 있다.
인간 항체를 또한 하이브리도마-기재 방법에 의해 제조할 수 있다. 인간 단클론 항체의 생성을 위한 인간 골수종 및 마우스-인간 이종골수종 세포주가 개시되었다(예를 들어 문헌[Kozbor, D., J. Immunol. 133 (1984) 3001-3005]; 문헌[Brodeur, B.R. et al., Monoclonal Antibody Production Techniques and Applications, Marcel Dekker, Inc., New York (1987), pp. 51-63]; 및 문헌[Boerner, P. et al., J. Immunol. 147 (1991) 86-95]을 참조하시오). 인간 B-세포 하이브리도마 기술을 통해 생성된 인간 항체가 또한 문헌[Li, J. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103 (2006) 3557-3562]에 개시되어 있다. 추가의 방법은 예를 들어 미국특허 제 7,189,826 호(하이브리도마 세포주로부터 단클론 인간 IgM 항체의 생성을 개시한다) 및 문헌[Ni, J., Xiandai Mianyixue 26 (2006) 265-268](인간-인간 하이브리도마를 개시한다)에 개시된 것들을 포함한다. 인간 하이브리도마 기술(트라이오마(Trioma) 기술)이 또한 문헌[Vollmers, H.P. and Brandlein, S., Histology and Histopathology 20 (2005) 927-937] 및 문헌[Vollmers, H.P. and Brandlein, S., Methods and Findings in Experimental and Clinical Pharmacology 27 (2005) 185-191]에 개시되어 있다.
인간 항체를 또한, 인간-유래된 파지 디스플레이 라이브러리로부터 선택된 Fv 클론 가변 도메인 서열을 단리함으로써 생성시킬 수 있다. 이어서 상기와 같은 가변 도메인 서열을 목적하는 인간 불변 도메인과 병용할 수 있다. 항체 라이브러리로부터 인간 항체를 선택하는 기법을 하기에 개시한다.
5. 라이브러리-유래된 항체
본 발명의 항체를 목적하는 활성 또는 활성들을 갖는 항체에 대해 조합 라이브러리를 선별함으로써 단리할 수 있다. 예를 들어, 파지 디스플레이 라이브러리를 생성시키고 상기와 같은 라이브러리를 목적하는 결합 특성을 갖는 항체들에 대해 선별하는 다양한 방법들이 당해 분야에 공지되어 있다. 상기와 같은 방법들은 예를 들어 문헌[Hoogenboom, H.R. et al., Methods in Molecular Biology 178 (2001) 1-37]에 리뷰되어 있으며 예를 들어 문헌[McCafferty, J. et al., Nature 348 (1990) 552-554]; 문헌[Clackson, T. et al., Nature 352 (1991) 624-628]; 문헌[Marks, J.D. et al., J. Mol. Biol. 222 (1992) 581-597]; 문헌[Marks, J.D. and Bradbury, A., Methods in Molecular Biology 248 (2003) 161-175]; 문헌[Sidhu, S.S. et al., J. Mol. Biol. 338 (2004) 299-310]; 문헌[Lee, C.V. et al., J. Mol. Biol. 340 (2004) 1073-1093]; 문헌[Fellouse, F.A., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101 (2004) 12467-12472]; 및 문헌[Lee, C.V. et al., J. Immunol. Methods 284 (2004) 119-132]에 추가로 개시되어 있다.
몇몇 파지 디스플레이 방법에서, VH 및 VL 유전자의 레퍼토리를 폴리머라제 쇄 반응(PCR)에 의해 별도로 클로닝하고 파지 라이브러리에 무작위로 재조합시키고, 이어서 상기 라이브러리를 문헌[Winter, G. et al., Ann. Rev. Immunol. 12 (1994) 433-455]에 개시된 바와 같이 항원-결합 파지에 대해 선별할 수 있다. 파지는 전형적으로 단쇄 Fv(scFv) 단편으로서 또는 Fab 단편으로서 항체 단편을 표시한다. 면역된 출처로부터의 라이브러리들은 하이브리도마 제작의 필요 없이 면역원에 대한 고-친화성 항체를 제공한다. 한편으로, 미경험 레퍼토리를 문헌[Griffiths, A.D. et al., EMBO J. 12 (1993) 725-734]에 개시된 바와 같이 클로닝하여(예를 들어 인간으로부터) 어떠한 면역화도 없이 광범위한 비-자기 및 또한 자기-항원에 대한 단일 출처의 항체를 제공할 수 있다. 최종적으로, 미경험 라이브러리를 또한, 줄기세포로부터 재배열되지 않은 V-유전자 분절을 클로닝하고 무작위 서열을 함유하는 PCR 프라이머를 사용하여 고도로 가변성인 CDR3 영역을 암호화하고 시험관내에서 재배열을 수행함으로써 합성적으로 제조할 수 있다(문헌[Hoogenboom, H.R. and Winter, G., J. Mol. Biol. 227 (1992) 381-388]에 개시되어 있다). 인간 항체 파지 라이브러리를 개시하는 특허 공보들은 예를 들어 미국특허 제 5,750,373 호, 및 미국특허 공보 US　2005/0079574, US　2005/0119455, US　2005/0266000, US　2007/0117126, US　2007/0160598, US　2007/0237764, US　2007/0292936, 및 US　2009/0002360을 포함한다.
인간 항체 라이브러리로부터 단리된 항체 또는 항체 단편은 본 발명에서 인간 항체 또는 인간 항체 단편으로 간주된다.
6. 다중특이성 항체
몇몇 실시태양에서, 본 발명에 제공된 항체는 다중특이성 항체, 예를 들어 이중특이성 항체이다. 다중특이성 항체는 적어도 2개의 상이한 부위에 대해 결합 특이성을 갖는 단클론 항체이다. 몇몇 실시태양에서, 상기 결합 특이성 중 하나는 TIM3에 대한 것이고 다른 하나는 임의의 다른 항원에 대한 것이다. 몇몇 실시태양에서, 이중특이성 항체는 TIM3의 2개의 상이한 에피토프에 결합할 수 있다. 이중특이성 항체를 또한 TIM3을 발현하는 세포에 세포독성제를 국소화시키기 위해 사용할 수 있다. 이중특이성 항체를 전장 항체 또는 항체 단편으로서 제조할 수 있다.
다중특이성 항체의 제조 기법은 비제한적으로 상이한 특이성을 갖는 2개의 면역글로불린 중쇄-경쇄 쌍의 재조합 동시-발현(문헌[Milstein, C. and Cuello, A.C., Nature 305 (1983) 537-540], WO 93/08829, 및 문헌[Traunecker, A. et al., EMBO J. 10 (1991) 3655-3659]을 참조하시오), 및 "구멍에 손잡이" 공학(예를 들어 미국특허 제 5,731,168 호를 참조하시오)을 포함한다. 다중특이성 항체를 또한, 항체 Fc-이종이량체성 분자의 제조를 위해 정전기적 조향(steering) 효과를 조작하고(WO 2009/089004); 2개 이상의 항체 또는 단편을 가교결합시키고(예를 들어 미국특허 제 4,676,980 호, 및 문헌[Brennan, M. et al., Science 229 (1985) 81-83]을 참조하시오); 류신 지퍼를 사용하여 이중특이성 항체를 생성시키고(예를 들어 문헌[Kostelny, S.A. et al., J. Immunol. 148 (1992) 1547-1553]을 참조하시오); 이중특이성 항체 단편을 제조하기 위한 "다이아바디" 기술을 사용하고(예를 들어 문헌[Holliger, P. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90 (1993) 6444-6448]을 참조하시오); 단쇄 Fv(scFv) 이량체를 사용하고(예를 들어 문헌[Gruber, M et al., J. Immunol. 152 (1994) 5368-5374]을 참조하시오); 예를 들어 문헌[Tutt, A. et al., J. Immunol. 147 (1991) 60-69]에 개시된 바와 같이 삼중특이성 항체를 제조함으로써 제조할 수 있다.
"옥토퍼스 항체"를 포함하여, 3개 이상의 기능성 항원 결합 부위를 갖는 조작된 항체가 또한 본 발명에 포함된다(예를 들어 US　2006/0025576을 참조하시오).
본 발명에서 항체 또는 단편은 또한 TIM3뿐만 아니라 또 다른 상이한 항원에 결합하는 항원 결합 부위를 포함하는 "이중 작용 Fab" 또는 "DAF"를 포함한다(예를 들어 US 2008/0069820을 참조하시오).
본 발명에서 항체 또는 단편은 또한 WO　2009/080251, WO　2009/080252, WO　2009/080253, WO　2009/080254, WO　2010/112193, WO　2010/115589, WO　2010/136172, WO　2010/145792, 및 WO 2010/145793, WO2011/117330, WO2012/025525, WO2012/025530, WO2013/026835, WO2013/026831, WO2013/164325, 또는 WO 2013/174873에 개시된 다중특이성 항체들을 포함한다.
7. 항체 변이체
몇몇 실시태양에서, 본 발명에 제공된 항체의 아미노산 서열 변이체를 고려한다. 예를 들어, 상기 항체의 결합 친화성 및/또는 다른 생물학적 성질들을 개선시키는 것이 바람직할 수 있다. 항체의 아미노산 서열 변이체를, 상기 항체를 암호화하는 뉴클레오타이드 서열에 적합한 변형을 도입시키거나, 또는 펩타이드 합성에 의해 제조할 수 있다. 상기와 같은 변형은 예를 들어 상기 항체의 아미노산 서열로부터의 잔기들의 결실, 및/또는 상기 서열내로의 잔기들의 삽입 및/또는 상기 서열내에서 잔기들의 치환을 포함한다. 결실, 삽입 및 치환의 임의의 조합을 최종 구조물에 도달하도록 수행할 수 있으나, 단 최종 구조물은 목적하는 특성, 예를 들어 항원-결합성을 가져야 한다.
a) 치환, 삽입 및 결실 변이체
몇몇 실시태양에서, 하나 이상의 아미노산 치환을 갖는 항체 변이체를 제공한다. 치환 돌연변이유발을 위한 관심 부위는 HVR 및 FR을 포함한다. 예시적인 변화를 표 1에 "예시적인 치환"의 제목하에, 및 하기에 추가로 개시하는 바와 같이 아미노산 측쇄 부류와 관련하여 제공한다. 보존적 치환을 표 1에 "바람직한 치환"이란 표제하에 나타낸다. 아미노산 치환을 관심 항체에 도입시키고 생성물을 목적하는 활성, 예를 들어 유지된/개선된 항원 결합, 감소된 면역원성, 또는 개선된 ADCC 또는 CDC에 대해 선별할 수 있다.
[표 1]
Figure pct00001
아미노산들을 공통 측쇄 성질에 따라 분류할 수도 있다:
(1) 소수성: 노르류신, Met, Ala, Val, Leu, Ile;
(2) 중성 친수성: Cys, Ser, Thr, Asn, Gln;
(3) 산성: Asp, Glu;
(4) 염기성: His, Lys, Arg;
(5) 쇄 배향에 영향을 미치는 잔기: Gly, Pro;
(6) 방향족: Trp, Tyr, Phe.
비-보존적인 치환은 이들 부류 중 하나의 구성원을 또 다른 부류에 대해 교환함을 수반할 것이다.
치환 변이체의 한 가지 유형은 모 항체(예를 들어 인간화된 또는 인간 항체)의 하나 이상의 고가변 영역 잔기를 치환시킴을 수반한다. 일반적으로, 추가의 연구를 위해 선택되는 상기 생성되는 변이체는 모 항체에 비해 몇몇 생물학적 성질들(예를 들어 증가된 친화성, 감소된 면역원성)의 변형(예를 들어 개선)을 갖고/갖거나, 상기 모 항체의 몇몇 생물학적 성질들을 실질적으로 유지할 것이다. 예시적인 치환 변이체는 친화성 성숙된 항체이며, 상기 항체를 편의상, 예를 들어 파지 디스플레이-기재 친화성 성숙 기법, 예를 들어 본 발명에 개시된 것들을 사용하여 생성시킬 수 있다. 간단히, 하나 이상의 HVR 잔기를 돌연변이시키고 변이체 항체를 파지상에 표시하고 특정한 생물학적 활성(예를 들어 결합 친화성)에 대해 선별한다.
변경(예를 들어 치환)을, 예를 들어 항체 친화성을 개선시키기 위해 HVR에서 수행할 수 있다. 상기와 같은 변경을 HVR "핫스폿", 즉 체세포 성숙 과정 동안 높은 빈도로 돌연변이를 겪는 코돈에 의해 암호화된 잔기(예를 들어 문헌[Chowdhury, P.S., Methods Mol. Biol. 207 (2008) 179-196]을 참조하시오), 및/또는 SDR(a-CDR)에서 수행할 수 있으며, 이때 생성되는 변형 VH 또는 VL을 결합 친화성에 대해 시험한다. 2차 라이브러리로부터의 제작 및 재선택에 의한 친화성 성숙이 예를 들어 문헌[Hoogenboom, H.R. et al. in Methods in Molecular Biology 178 (2002) 1-37]에 개시되었다. 친화성 성숙의 일부 실시태양에서, 다양한 방법들 중 임의의 방법(예를 들어 오류유발 PCR, 쇄 셔플링, 또는 올리고뉴클레오타이드-지시된 돌연변이유발)에 의해 성숙화용으로 선택된 가변 유전자내에 다양성을 도입시킨다. 이어서 2차 라이브러리를 생성시킨다. 이어서 상기 라이브러리를 목적하는 친화성을 갖는 임의의 항체 변이체를 확인하기 위해 선별한다. 다양성을 도입시키는 또 다른 방법은 HVR-지시된 접근법을 포함하며, 상기 접근법에서 다수의 HVR 잔기들(예를 들어 한 번에 4 내지 6개의 잔기)이 무작위화된다. 항원 결합에 관련된 HVR 잔기를 예를 들어 알라닌 주사 돌연변이유발 또는 모델링을 사용하여 특이적으로 확인할 수 있다. 특히 CDR-H3 및 CDR-L3를 종종 표적화한다.
몇몇 실시태양에서, 치환, 삽입 또는 결실이, 상기와 같은 변경이 항원에 결합하는 항체의 능력을 실질적으로 감소시키지 않는 한, 하나 이상의 HVR 내에서 발생할 수 있다. 예를 들어, 결합 친화성을 실질적으로 감소시키지 않는 보존적 변경(예를 들어 본 발명에 제공되는 바와 같은 보존적 치환)를 HVR에서 수행할 수 있다. 상기와 같은 변경은 HVR "핫스폿" 또는 SDR의 밖에서 있을 수 있다. 상기에 제공된 변형 VH 및 VL 서열의 몇몇 실시태양에서, 각각의 HVR은 변경되지 않거나, 또는 1, 2 또는 3개 이하의 아미노산 치환을 함유한다.
돌연변이유발을 위해 표적화될 수 있는 항체의 잔기 또는 영역의 확인에 유용한 방법을 문헌[Cunningham, B.C. and Wells, J.A., Science 244(1989) 1081-1085]에 개시된 바와 같이 "알라닌 주사 돌연변이유발"이라 칭한다. 상기 방법에서, 표적 잔기들(예를 들어 하전된 잔기, 예를 들어 arg, asp, his, lys 및 glu)의 잔기 또는 그룹이 확인되며 이들을, 상기 항원과 항체와의 상호작용이 영향을 받는지를 측정하기 위해 중성 또는 음으로 하전된 아미노산(예를 들어 알라닌 또는 폴리알라닌)에 의해 치환시킨다. 추가의 치환을 상기 아미노산 위치들에 도입시켜 초기 치환에 대한 기능적 민감성을 입증할 수 있다. 한편으로, 또는 추가로, 항체와 항원간의 접촉 지점들을 확인하기 위한 상기 항원-항체 복합체의 결정 구조. 상기와 같은 접촉 잔기 및 이웃하는 잔기들을 치환용 후보로서 표적화하거나 제거할 수 있다. 변이체를, 상기 변이체가 목적하는 성질을 함유하는지를 측정하기 위해서 선별할 수도 있다.
아미노산 서열 삽입은 하나의 잔기에서부터 100개 이상의 잔기를 함유하는 폴리펩타이드까지의 길이 범위에 이르는 아미노- 및/또는 카복시-말단 융합뿐만 아니라 단일 또는 다수 아미노산 잔기들의 서열내 삽입을 포함한다. 말단 삽입의 예는 N-말단 메티오닐 잔기를 갖는 항체를 포함한다. 항체 분자의 다른 삽입 변이체는 효소(예를 들어 ADEPT를 위한) 또는 항체의 혈청 반감기를 증가시키는 폴리펩타이드에의 항체의 N- 또는 C-말단에의 융합을 포함한다.
b) Fc-영역 변이체
몇몇 실시태양에서, 하나 이상의 아미노산 변형을 본 발명에 제공된 항체의 Fc 영역에 도입시켜 Fc 영역 변이체를 생성시킬 수 있다. 상기 Fc 영역 변이체는 하나 이상의 아미노산 위치에서 아미노산 변형(예를 들어 치환)을 포함하는 인간 Fc 영역 서열(예를 들어 인간 IgG1, IgG2, IgG3 또는 IgG4 Fc 영역)을 포함할 수 있다.
감소된 효과기 기능을 갖는 항체들은 Fc 영역 잔기 238, 265, 269, 270, 297, 327 및 329 중 하나 이상의 치환을 갖는 것들을 포함한다(미국특허 제 6,737,056 호). 상기와 같은 Fc 돌연변이체는 아미노산 위치 265, 269, 270, 297 및 327 중 2개 이상에서 치환을 갖는 Fc 돌연변이체(알라닌으로의 잔기 265 및 297의 치환을 갖는 소위 "DANA" Fc 돌연변이체 포함(미국특허 제 7,332,581 호))를 포함한다.
FcR에 대한 개선된 또는 감소된 결합을 갖는 몇몇 항체 변이체들이 개시되어 있다(예를 들어 미국특허 제 6,737,056 호; WO 2004/056312, 및 문헌[Shields, R.L. et al., J. Biol. Chem. 276: 6591-6604 (2001)]을 참조하시오).
본 발명의 하나의 실시태양에서 상기와 같은 항체는 돌연변이 L234A 및 L235A 또는 돌연변이 L234A, L235A 및 P329G를 갖는 IgG1이다. 또 다른 실시태양에서 돌연변이 S228P 및 L235E 또는 S228P, L235E 또는 및 P329G(카밧 등의 EU 색인에 따른 넘버링, 문헌[Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1991])를 갖는 IgG4.
증가된 반감기 및 신생아 Fc 수용체(RcRn)(모 IgG의 태아로의 전달을 맡고 있다)(문헌[Guyer, R.L. et al ., J. Immunol . 117:587-593 (1976)] 및 문헌[Kim J.K. et al ., J. Immunol . 24:2429-2434 (1994)])에의 개선된 결합을 갖는 항체들이 US2005/0014934에 개시되어 있다. 상기 항체들은 FcRn에 대한 Fc 영역의 결합을 개선시키는 하나 이상의 치환을 갖는 상기 Fc 영역을 포함한다. 상기와 같은 Fc 변이체들은 Fc 영역 잔기: 238, 256, 265, 272, 286, 303, 305, 307, 311, 312, 317, 340, 356, 360, 362, 376, 378, 380, 382, 413, 424 및 434 중 하나 이상에서의 치환, 예를 들어 Fc 영역 잔기 434에서의 치환(미국특허 제 7,371,826 호)을 갖는 것들을 포함한다.
또한 Fc 영역 변이체의 다른 예들에 관한 문헌[Duncan, A.R. and Winter, G., Nature 322:738-740 (1988)]; 미국특허 제 5,648,260 호; 미국특허 제 5,624,821 호; 및 WO 94/29351을 참조하시오.
c) 시스테인 조작된 항체 변이체
몇몇 실시태양에서, 시스테인 조작된 항체, 예를 들어 항체의 하나 이상의 잔기가 시스테인 잔기로 치환된 "티오MAb"를 생성시키는 것이 바람직할 수 있다. 특정한 실시태양에서, 상기 치환된 잔기는 상기 항체의 접근 가능한 부위에 존재한다. 상기 잔기를 시스테인으로 치환시킴으로써, 반응성 티올기가 상기 항체의 접근 가능한 부위에 위치되며 이를 사용하여 본 발명에 추가로 개시된 바와 같이 상기 항체를 다른 부분, 예를 들어 약물 부분 또는 링커-약물 부분에 접합시켜 면역접합체를 생성시킬 수 있다. 몇몇 실시태양에서, 하기의 잔기들 중 임의의 하나 이상을 시스테인으로 치환시킬 수도 있다: 경쇄의 V205(카밧 넘버링); 중쇄의 A118(EU 넘버링); 및 중쇄 Fc 영역의 S400(EU 넘버링). 시스테인 조작된 항체를 예를 들어 미국특허 제 7,521,541 호에 개시된 바와 같이 생성시킬 수 있다.
d) 항체 유도체
몇몇 실시태양에서, 본 발명에 제공된 항체를 당해 분야에 공지되고 쉽게 입수할 수 있는 추가적인 비단백질성 부분을 함유하도록 추가로 변형시킬 수 있다. 상기 항체의 유도체화에 적합한 부분은 비제한적으로 수용성 중합체를 포함한다. 수용성 중합체의 비제한적인 예는 비제한적으로 폴리에틸렌 글리콜(PEG), 에틸렌 글리콜/프로필렌 글리콜의 공중합체, 카복시메틸셀룰로스, 덱스트란, 폴리비닐 알콜, 폴리비닐 피롤리돈, 폴리-1,3-다이옥솔란, 폴리-1,3,6-트라이옥산, 에틸렌/말레산 무수물 공중합체, 폴리아미노산(단독중합체 또는 랜덤 공중합체), 및 덱스트란 또는 폴리(n-비닐 피롤리돈)폴리에틸렌 글리콜, 프로필렌 글리콜 단독중합체, 폴리프로필렌 옥사이드/에틸렌 옥사이드 공중합체, 폴리옥시에틸화된 폴리올(예를 들어 글리세롤), 폴리비닐 알콜, 및 이들의 혼합물을 포함한다. 폴리에틸렌 글리콜 프로피온알데하이드는 그의 수 중 안정성으로 인해 제조에 이점을 가질 수 있다. 상기 중합체는 임의의 분자량을 가질 수 있으며 분지되거나 분지되지 않을 수도 있다. 상기 항체에 부착된 중합체들의 수는 변할 수 있으며, 하나보다 많은 중합체가 부착되는 경우, 이들 중합체는 동일하거나 상이한 분자일 수 있다. 일반적으로, 상기 유도체화에 사용되는 중합체의 수 및/또는 유형을 비제한적으로, 개선시키고자 하는 상기 항체의 특정한 성질, 상기 항체 유도체를 한정된 조건하에서 치료법에 사용할 것인지의 여부 등을 포함한 고려사항을 기준으로 결정할 수 있다.
또 다른 실시태양에서, 방사선에의 노출에 의해 선택적으로 가열될 수 있는 항체 및 비단백질성 부분의 접합체를 제공한다. 하나의 실시태양에서, 상기 비단백질성 부분은 탄소 나노튜브이다(문헌[Kam, N.W. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 102: 11600-11605 (2005)]). 상기 방사선은 임의의 파장을 가질 수 있으며, 비제한적으로 통상적인 세포에는 해롭지 않지만 상기 비단백질성 부분을 상기 항체-비단백질성 부분에 근접한 세포를 죽이는 온도로 가열하는 파장을 포함한다.
B. 재조합 방법 및 조성물
항체를 예를 들어 미국특허 제 4,816,567 호에 개시된 바와 같이 재조합 방법 및 조성물을 사용하여 생성시킬 수 있다. 하나의 실시태양에서, 본 발명에 개시된 항-TIM3 항체를 암호화하는 단리된 핵산을 제공한다. 상기와 같은 핵산은 항체(예를 들어 상기 항체의 경쇄 및/또는 중쇄)의 VH을 포함하는 아미노산 서열 및/또는 VH를 포함하는 아미노산 서열을 암호화할 수 있다. 추가의 실시태양에서, 상기와 같은 핵산을 포함하는 하나 이상의 벡터(예를 들어 발현 벡터)를 제공한다. 추가의 실시태양에서, 상기와 같은 핵산을 포함하는 숙주 세포를 제공한다. 하나의 상기와 같은 실시태양에서, 숙주 세포는 (1) 항체의 VL을 포함하는 아미노산 서열 및 상기 항체의 VH를 포함하는 아미노산 서열을 암호화하는 핵산을 포함하는 벡터, 또는 (2) 상기 항체의 VL을 포함하는 아미노산 서열을 암호화하는 핵산을 포함하는 제1 벡터 및 상기 항체의 VH를 포함하는 아미노산 서열을 암호화하는 핵산을 포함하는 제2 벡터를 포함한다(예를 들어 이들 벡터로 형질전환되었다). 하나의 실시태양에서, 상기 숙주 세포는 진핵생물, 예를 들어 중국 햄스터 난소(CHO) 세포 또는 림프양 세포(예를 들어 Y0, NS0, Sp20 세포)이다. 하나의 실시태양에서, 항-TIM3 항체의 제조 방법을 제공하며, 여기에서 상기 방법은 항체의 발현에 적합한 조건하에서, 상기에 제공된 바와 같은, 상기 항체를 암호화하는 핵산을 포함하는 숙주 세포를 배양하고, 임의로 상기 숙주 세포(또는 숙주 세포 배양 배지)로부터 상기 항체를 회수함을 포함한다.
항-TIM3 항체의 재조합 생성을 위해서, 예를 들어 상술한 바와 같은, 항체를 암호화하는 핵산을 단리하고 추가의 클로닝 및/또는 숙주 세포에서의 발현을 위해 하나 이상의 벡터 내로 삽입한다. 상기와 같은 핵산을 통상적인 과정을 사용하여(예를 들어 상기 항체의 중쇄 및 경쇄를 암호화하는 유전자에 특이적으로 결합할 수 있는 올리고뉴클레오타이드 탐침을 사용함으로써) 쉽게 단리하고 서열분석할 수 있다.
항체-암호화 벡터의 클로닝 또는 발현에 적합한 숙주 세포는 본 발명에 개시된 원핵생물 또는 진핵생물 세포를 포함한다. 예를 들어, 항체를, 특히 글리코실화 및 Fc 효과기 기능이 필요하지 않은 경우, 세균에서 생성시킬 수 있다. 세균에서의 항체 단편 및 폴리펩타이드의 발현에 대해서, 예를 들어 미국특허 제 5,648,237 호, 미국특허 제 5,789,199 호 및 미국특허 제 5,840,523 호를 참조하시오. (또한 에스케리키아 콜라이에서의 항체 단편의 발현을 개시하는 문헌[Charlton, K.A., In: Methods in Molecular Biology, Vol. 248, Lo, B.K.C. (ed.), Humana Press, Totowa, NJ (2003), pp. 245-254]을 참조하시오). 발현 후에, 상기 항체를 용액 분획 중 세균 세포 페이스트로부터 단리하고 추가로 정제할 수 있다.
원핵생물 외에, 진핵 미생물, 예를 들어 섬유상 진균 또는 효모, 예를 들어 글리코실화 경로가 "인간화되어" 부분적인 또는 완전한 인간 글리코실화 패턴을 갖는 항체를 생산하는 진균 및 효모 균주가 항체-암호화 벡터에 적합한 클로닝 또는 발현 숙주이다. 문헌[Gerngross, T.U., Nat. Biotech. 22 (2004) 1409-1414]; 및 문헌[Li, H. et al., Nat. Biotech. 24 (2006) 210-215]을 참조하시오.
글리코실화된 항체의 발현에 적합한 숙주 세포는 또한 다세포 유기체(무척추동물 및 척추동물)로부터 유래된다. 무척추동물 세포의 예는 식물 및 곤충 세포이다. 특히 스포도프테라 프루기페르다(Spodoptera frugiperda) 세포의 형질감염을 위해, 곤충 세포와 함께 사용될 수 있는 다수의 바큘로바이러스 균주가 동정되었다.
식물 세포 배양물을 또한 숙주로서 사용할 수 있다. 예를 들어 미국특허 제 5,959,177 호, 미국특허 제　6,040,498 호, 미국특허 제 6,420,548 호, 미국특허 제 7,125,978 호 및 미국특허 제　6,417,429 호(트랜스제닉 식물에서 항체를 생성시키기 위한 플랜티바디스(PLANTIBODIES)(상표) 기술을 개시한다)를 참조하시오.
척추동물 세포를 또한 숙주로서 사용할 수 있다. 예를 들어 현탁액에서 증식시키기에 적합한 포유동물 세포주가 유용할 수 있다. 유용한 포유동물 숙주 세포주의 다른 예는 SV40(COS-7)에 의해 형질전환된 원숭이 신장 CV1 계통; 인간 배아 신장 계통(예를 들어 문헌[Graham, F.L. et al., J. Gen Virol. 36 (1977) 59-74]에 개시된 바와 같은 293 또는 293 세포); 아기 햄스터 신장 세포(BHK); 마우스 세르톨리 세포(예를 들어 문헌[Mather, J.P., Biol. Reprod. 23 (1980) 243-252]에 개시된 바와 같은 TM4 세포); 원숭이 신장 세포(CV1); 아프리카 녹색 원숭이 신장 세포(VERO-76); 인간 자궁경부 암종 세포(HELA); 개 신장 세포(MDCK; 버팔로 래트 간세포(BRL 3A); 인간 폐세포(W138); 인간 간세포(Hep G2); 마우스 유방 종양(MMT 060562); 예를 들어 문헌[Mather, J.P. et al., Annals N.Y. Acad. Sci. 383 (1982) 44-68]에 개시된 바와 같은 TRI 세포; MRC 5 세포; 및 FS4 세포이다. 다른 유용한 포유동물 숙주 세포주는 중국 햄스터 난소(CHO) 세포, 예를 들어 DHFR- CHO 세포(문헌[Urlaub, G. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77 (1980) 4216-4220]); 및 골수종 세포주, 예를 들어 Y0, NS0 및 Sp2/0를 포함한다. 항체 생산에 적합한 몇몇 포유동물 숙주 세포주에 대한 리뷰에 대해서, 예를 들어 문헌[Yazaki, P. and Wu, A.M., Methods in Molecular Biology, Vol. 248, Lo, B.K.C. (ed.), Humana Press, Totowa, NJ (2004), pp. 255-268]을 참조하시오.
C. 분석
본 발명에 제공된 항-TIM3 항체를 당해 분야에 공지된 다양한 분석에 의해 그의 물리/화학적 성질 및/또는 생물학적 활성에 대해 확인하거나, 선별하거나 특성화할 수 있다.
1. 결합 분석 및 다른 분석
하나의 태양에서, 본 발명의 항체를 예를 들어 공지된 방법, 예를 들어 ELISA, 웨스턴 블럿 등에 의해 그의 항원 결합 활성에 대해 시험한다.
또 다른 태양에서, 경쟁 분석을 사용하여 TIM3에의 결합에 대해 Tim3_0016(서열번호 7의 VH 서열 및 서열번호 8의 VL 서열을 포함한다)과 경쟁하는(또는 한편으로 동일한 6개 HVR을 갖는 Tim3_0016 변이체 항체 Tim3_0018과 경쟁하는) 항체를 식별할 수 있다. 따라서 본 발명의 하나의 실시태양은 서열번호 7의 VH 서열의 3개의 HVR 전부 및 서열번호 8의 VL 서열의 3개의 HVR 전부를 포함하는 항-TIM3 항체와 인간 TIM3에의 결합에 대해 경쟁하는 항체이다. 몇몇 실시태양에서, 상기와 같은 경쟁 항체는 항-TIM3 항체 Tim3_0016에 의해 결합되는 동일한 에피토프(예를 들어 선형 또는 입체구조 에피토프)에 결합한다. 항체가 결합하는 에피토프의 지도화에 대한 상세한 예시적인 방법들이 문헌[Morris, G.E. (ed.), Epitope Mapping Protocols, In: Methods in Molecular Biology, Vol. 66, Humana Press, Totowa, NJ (1996)]에 제공되어 있다.
예시적인 경쟁 분석에서, 고정화된 TIM3(-ECD)를, TIM3에 결합하는 제1 표지된 항체(예를 들어 항-TIM3 항체 aTim3_0016), 및 TIM3에의 결합에 대해 상기 제1 항체와 경쟁하는 능력에 대해 시험하고자 하는 표지되지 않은 제2 항체를 포함하는 용액 중에서 배양한다. 상기 제2 항체는 하이브리도마 상등액 중에 존재할 수 있다. 대조용으로서, 고정화된 TIM3을, 상기 표지된 제1 항체는 포함하지만 상기 표지되지 않은 제2 항체는 포함하지 않는 용액 중에서 배양한다. 상기 제1 항체의 TIM3에의 결합을 허용하는 조건하에서 배양 후에 과잉의 결합되지 않은 항체를 제거하고, 고정화된 TIM3과 결합된 표지의 양을 측정한다. 고정화된 TIM3과 결합된 표지의 양이 대조용 샘플에 비해 시험 샘플에서 실질적으로 감소하는 경우, 이는 상기 제2 항체가 TIM3에의 결합에 대해서 상기 제1 항체와 경쟁함을 암시한다(예를 들어 문헌[Harlow, E. and Lane, D., Antibodies: A Laboratory Manual, Chapter 14, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY (1988)]을 참조하시오). 또 다른 예시적인 경쟁 분석에 대해서 실시예 4를 참조하시오.
2. 활성 분석
하나의 태양에서, 생물학적 활성을 갖는 항-HER3 항체를 확인하기 위한 분석을 제공한다. 생물학적 활성은 예를 들어 TIM3 수용체 내면화, 또는 사이토킨 방출, 또는 세포독성 활성(독소에 접합된 면역접합체로서), 또는 시노몰구스 결합 교차반응성뿐만 아니라 상이한 세포 유형에의 결합을 포함할 수 있다. 생체내 및/또는 시험관내에서 상기와 같은 생물학적 활성을 갖는 항체들을 또한 제공한다.
몇몇 실시태양에서, 본 발명의 항체를 예를 들어 실시예 5 내지 15에 기재된 바와 같이 상기와 같은 생물학적 활성에 대해 시험한다.
D. 면역접합체(오직 암 또는 표적에 따라 변형됨)
본 발명은 또한 하나 이상의 세포독성제, 예를 들어 화학요법제 또는 약물, 성장 억제제, 독소(예를 들어 단백질 독소, 세균, 진균, 식물 또는 동물 기원의 효소 활성 독소, 또는 그의 단편), 또는 방사성 동위원소에 접합된 본 발명에 개시된 항-TIM3 항체를 포함하는 면역접합체를 제공한다.
하나의 실시태양에서, 면역접합체는, 항체가 하나 이상의 약물, 예를 들어 비제한적으로 메이탄시노이드(미국특허 제　5,208,020 호, 미국특허 제 5,416,064 호 및 EP 0 425 235 B1를 참조하시오); 아우리스타틴, 예를 들어 모노메틸 아우리스타틴 약물 부분 DE 및 DF(MMAE 및 MMAF)(미국특허 제 5,635,483 호, 미국특허 제 5,780,588 호, 및 미국특허 제 7,498,298 호); 돌라스타틴; 칼리케아미신 또는 그의 유도체(미국특허 제 5,712,374 호, 미국특허 제 5,714,586 호, 미국특허 제 5,739,116 호, 미국특허 제 5,767,285 호, 미국특허 제 5,770,701 호, 미국특허 제 5,770,710 호, 미국특허 제 5,773,001 호, 및 미국특허 제 5,877,296 호; 문헌[Hinman, L.M. et al., Cancer Res. 53 (1993) 3336-3342]; 및 문헌[Lode, H.N. et al., Cancer Res. 58 (1998) 2925-2928]을 참조하시오); 안트라사이클린, 예를 들어 다우노마이신 또는 독소루비신(문헌[Kratz, F. et al., Curr. Med. Chem. 13 (2006) 477-523]; 문헌[Jeffrey, S.C. et al., Bioorg. Med. Chem. Lett. 16 (2006) 358-362]; 문헌[Torgov, M.Y. et al., Bioconjug. Chem. 16 (2005) 717-721]; 문헌[Nagy, A. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97 (2000) 829-834]; 문헌[Dubowchik, G.M. et al., Bioorg. & Med. Chem. Letters 12 (2002) 1529-1532]; 문헌[King, H.D. et al., J. Med. Chem. 45 (2002) 4336-4343]; 및 미국특허 제 6,630,579 호를 참조하시오); 메토트렉세이트; 빈데신; 탁산, 예를 들어 도세탁셀, 패클리탁셀, 라로탁셀, 테세탁셀, 및 오르타탁셀; 트라이코테센; 및 CC1065를 포함하는 약물에 접합된 항체-약물 접합체(ADC)이다.
또 다른 실시태양에서, 면역접합체는 효소 활성 독소 또는 그의 단편, 예를 들어 비제한적으로 디프테리아-A 쇄, 디프테리아 독소의 비-결합 활성 단편, 외독소 A 쇄(슈도모나스 아에루기노사로부터), 리신 A 쇄, 아브린 A 쇄, 모데신 A 쇄, 알파-사르신, 알류라이테스 포르디이 단백질, 다이안틴 단백질, 피토라카 아메리카나 단백질(PAPI, PAPII 및 PAP-S), 모모르디카 카란티아 억제제, 쿠르신, 크로틴, 사파오나리아 오피시날리스 억제제, 젤로닌, 미토젤린, 레스트릭토신, 페노마이신, 에노마이신 및 트라이코테센에 접합된 본 발명에 개시된 바와 같은 항체를 포함한다.
또 다른 실시태양에서, 면역접합체는 슈도모나스 외독소 A(또는 그의 변이체)에 접합된 본 발명에 개시된 바와 같은 항체를 포함한다. 슈도모나스 외독소 A(PE)는 바람직하지 못한 세포, 예를 들어 암세포의 생육을 파괴하거나 억제하기에 유효할 수 있는 세포독성 활성을 갖는 세균 독소이다. 따라서, PE는 예를 들어 암과 같은 질병의 치료 또는 예방에 유용할 수 있다. 다수의 탈면역된 슈도모나스 외독소(PE)가 당해 분야에 공지되어 있다. 도메인 II 결실된 버전(예를 들어 PE24)은 도메인 II를 함유하는 PE38에 비해 덜 면역원성일 수 있으며 보다 적은 부작용(예를 들어 모세관 누출 증후군 및 간독성)을 일으킬 수 있다. 상이한 퓨린 절단성 링커를 PE24 변이체에 사용할 수 있다. 상기와 같은 탈면역된 슈도모나스 외독소(PE)는 예를 들어 국제 특허 출원 공보 WO2005/052006, WO2007/016150, WO2007/014743, WO2007/031741, WO2009/32954, WO2011/32022, WO2012/154530, 및 WO 2012/170617에 기재되어 있다. 본 명세서에 사용되는 바와 같은 "슈도모나스 외독소 A"란 용어는 야생형 및 탈면역된 슈도모나스 외독소(PE)를 포함한다. 하나의 바람직한 실시태양에서 "슈도모나스 외독소 A"는 예를 들어 비제한적으로 WO2009/32954, WO2011/32022, WO2012/154530, WO 2012/170617, 문헌[Liu W, et al, PNAS 109 (2012) 11782-11787, Mazor R, et al PNAS 111 (2014) 8571-8576] 및 문헌[Alewine C, et al, Mol Cancer Ther. (2014) 2653-61]에 기재된 바와 같은 탈면역된 PE24 변이체를 지칭한다. 하나의 바람직한 실시태양에서, 상기 "슈도모나스 외독소 A"는 서열번호 69의 아미노산 서열을 포함하거나 또는 서열번호 70의 아미노산 서열을 포함한다(이들의 제조가 또한 문헌[Mazor R, et al PNAS 111 (2014) 8571-8576] 및 문헌[Alewine C, et al, Mol Cancer Ther. (2014) 2653-61]에 기재되어 있다).
또 다른 실시태양에서, 면역접합체는 아마톡신 또는 그의 변이체에 접합된 본 명세서에 기재된 바와 같은 항체를 포함한다. 아마톡신(α-아마니틴, β-아마니틴, 아마닌)은 8개의 아미노산으로 구성된 환상 펩타이드이다. 상기를 알광대버섯으로부터 단리하거나 또는 합성에 의해 구성블록으로부터 제조할 수 있다. 아마톡신은 포유동물 세포의 DNA-의존적인 RNA 폴리머라제 II를 특이적으로 억제하며, 상기에 의해 상기 세포의 전사 및 단백질 생합성에 영향을 미친다. 세포에서의 전사의 억제는 생육 및 증식의 정지를 야기한다. 아마니틴과 RNA-폴리머라제 II간의 복합체는 공유 결합되지는 않았지만, 매우 단단하다(KD = 3 nM). 상기 효소로부터 아마니틴의 해리는 병든 세포를 예상 밖으로 회복시키는 매우 느린 과정이다. 세포에서 전사의 억제가 너무 오래 지속되면, 상기 세포는 α-아마니틴과 배양된 주르캣 세포의 배양물에서 나타나는 바와 같이, 또는 막-투과성 O-메틸-α-아마니틴 올리에이트와 배양된 주르캣 세포에서 훨씬 더 높은 효율로 프로그램화된 세포사(세포사멸)를 겪는다. 하나의 바람직한 실시태양에서 본 명세서에 사용되는 바와 같은 "아마톡신"이란 용어는 예를 들어 WO2010/115630, WO2010/115629, WO2012/119787, WO2012/041504, 및 WO2014/135282에 기재된 바와 같은 알파-아마니틴 또는 그의 변이체를 지칭하며, WO2012/041504(예를 들어 아마톡신 아미노산 4의 6' C-원자를 통해, 특히 아마톡신 아미노산의 6' C-원자에 결합된 산소 원자를 통해 접합되고, 여기에서 TIM3 항체가 유레아 부분을 통해 링커에 의해 연결된다) 및 WO2014/135282에 기재된 변이체가 바람직하다.
또 다른 실시태양에서, 면역접합체는 방사성 원자에 접합되어 방사성접합체를 형성하는 본 발명에 개시된 바와 같은 항체를 포함한다. 다양한 방사성 동위원소들을 방사성접합체의 생성에 이용할 수 있다. 예를 들어 At211, I131, I125, Y90, Re186, Re188, Sm153, Bi212, P32, Pb212, 및 Lu의 방사성 동위원소를 포함한다. 상기 방사성접합체가 검출에 사용되는 경우 상기 접합체는 섬광조영술 연구를 위한 방사성 원자, 예를 들어 TC99m 또는 I123, 또는 핵자기 공명(NMR) 영상화(또한 자기공명 영상화, MRI로서 공지됨)용 스핀 표지, 예를 들어 다시 요오드-123, 요오드-131, 인듐-111, 불소-19, 탄소-13, 질소-15, 산소-17, 가돌리늄, 망간 또는 철을 포함할 수 있다.
항체 및 세포독성제의 접합체를 다양한 이중기능성 단백질 커플링제, 예를 들어 N-숙신이미딜-3-(2-피리딜다이티오)프로피오네이트(SPDP), 숙신이미딜-4-(N-말레이미도메틸) 사이클로헥산-1-카복실레이트(SMCC), 이미노티올란(IT), 이미도에스터의 이중작용성 유도체(예를 들어 다이메틸 아디프이미데이트 HCl), 활성 에스터(예를 들어 다이숙신이미딜 수베레이트), 알데하이드(예를 들어 글루타르알데하이드), 비스-아지도 화합물(예를 들어 비스(p-아지도벤조일) 헥산다이아민), 비스-다이아조늄 유도체(예를 들어 비스-(p-다이아조늄벤조일)-에틸렌다이아민), 다이아이소시아네이트(예를 들어 톨루엔 2,6-다이아이소시아네이트), 및 비스-활성 불소 화합물(예를 들어 1,5-다이플루오로-2,4-다이나이트로벤젠)을 사용하여 제조할 수 있다. 예를 들어, 리신 면역독소를 문헌[Vitetta, E.S. et al., Science 238 (1987) 1098-1104]에 개시된 바와 같이 제조할 수 있다. 탄소-14-표지된 1-아이소티오시아네이토벤질-3-메틸다이에틸렌 트라이아민 펜타아세트산(MX-DTPA)은 상기 항체에의 방사성핵종의 접합을 위한 예시적인 킬레이트화제이다. WO 94/11026을 참조하시오. 상기 링커는 세포 중의 세포독성 약물의 방출을 촉진하는 "절단성 링커"일 수 있다. 예를 들어, 산-불안정성 링커, 펩티다제-민감성 링커, 광불안정성 링커, 다이메틸 링커 또는 다이설파이드-함유 링커(문헌[Chari, R.V. et al., Cancer Res. 52 (1992) 127-131]; 미국특허 제 5,208,020 호)를 사용할 수 있다.
상기 면역접합체 또는 ADC는 가교결합제 시약, 예를 들어 비제한적으로 BMPS, EMCS, GMBS, HBVS, LC-SMCC, MBS, MPBH, SBAP, SIA, SIAB, SMCC, SMPB, SMPH, 설포-EMCS, 설포-GMBS, 설포-KMUS, 설포-MBS, 설포-SIAB, 설포-SMCC, 및 설포-SMPB, 및 SVSB(숙신이미딜-4-(비닐설폰)벤조에이트)(이들은 예를 들어 피어스 바이오테크놀로지 인코포레이티드(Pierce Biotechnology, Inc.), 미국 일리노이주 록빌 소재)로부터 상업적으로 입수할 수 있다)로 제조된 상기와 같은 접합체가 본 발명에서 명백히 고려된다.
E. 진단 및 검출을 위한 방법 및 조성물
몇몇 실시태양에서, 본 발명에서 제공된 항-TIM3 항체 중 어느 하나는 생물학적 샘플 중의 TIM3의 존재를 검출하기에 유용하다. 본 발명에 사용되는 바와 같은 "검출하는"이란 용어는 정량적인 또는 정성적인 검출을 포함한다. 몇몇 실시태양에서, 생물학적 샘플은 세포 또는 조직, 예를 들어 AML 줄기 암세포를 포함한다.
하나의 실시태양에서, 진단 또는 검출 방법에 사용하기 위한 항-TIM3 항체를 제공한다. 추가의 태양에서, 생물학적 샘플 중의 TIM3 각각의 존재를 검출하는 방법을 제공한다. 몇몇 실시태양에서, 상기 방법은 상기 생물학적 샘플을 상기 항-TIM3 항체의 TIM3에의 결합을 허용하는 조건하에서 본 발명에 개시된 바와 같은 항-TIM3 항체와 접촉시키고, 상기 항-TIM3 항체와 TIM3 간에 복합체가 형성되는 지를 검출함을 포함한다. 상기와 같은 방법은 시험관내 또는 생체내 방법일 수 있다. 하나의 실시태양에서, 항-TIM3 항체를 사용하여, 예를 들어 TIM3이 환자의 선택을 위한 생물마커인 경우, 항-TIM3 항체에 의한 요법에 적격인 피실험자를 선택한다.
본 발명의 항체를 사용하여 진단될 수 있는 예시적인 질환은 AML 또는 다발성 골수종(MM)과 같은 상이한 형태의 혈액암을 포함한 암을 포함한다.
몇몇 실시태양에서, 표지된 항-TIM3 항체를 제공한다. 표지는 비제한적으로 직접 검출되는 표지 또는 부분(예를 들어 형광성, 발색성, 전자-밀집성, 화학발광성 및 방사성 표지)뿐만 아니라, 예를 들어 효소 반응 또는 분자 상호작용을 통해 간접적으로 검출되는 부분들, 예를 들어 효소 또는 리간드를 포함한다. 예시적인 표지는 비제한적으로 방사성동위원소 32P, 14C, 125I, 3H 및 131I, 형광단, 예를 들어 희토 킬레이트 또는 플루오레세인 및 그의 유도체, 로다민 및 그의 유도체, 단실, 움벨리페론, 루세리페라제, 예를 들어 개똥벌레 루시페라제 및 세균 루시페라제(미국특허 제 4,737,456 호), 루시페린, 2,3-다이하이드로프탈라진디온, 양고추냉이 퍼옥시다제(HRP), 알칼리성 포스파타제, β-갈락토시다제, 글루코아밀라제, 라이소자임, 사카라이드 옥시다제, 예를 들어 글루코스 옥시다제, 갈락토스 옥시다제, 및 글루코스-6-포스페이트 데하이드로게나제, 헤테로사이클릭 옥시다제, 예를 들어 유리카제 및 잔틴 옥시다제(과산화 수소를 사용하여 염료 전구체, 예를 들어 HRP를 산화시키는 효소와 결합된), 락토퍼옥시다제, 또는 미세퍼옥시다제, 비오틴/아비딘, 회전 표지, 박테리오파지 표지, 안정한 유리 라디칼 등을 포함한다.
F. 약학 제형
본 발명에 개시된 바와 같은 항-TIM3 항체의 약학 제형을, 목적하는 정도의 순도를 갖는 상기와 같은 항체를 하나 이상의 임의의 약학적으로 허용 가능한 담체(문헌[Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980)])와 혼합함으로써 동결건조된 제형 또는 수용액의 형태로 제조한다. 약학적으로 허용 가능한 담체는 사용되는 투여량 및 농도에서 수용자에게 일반적으로 무독성이며, 상기 담체는 비제한적으로 완충제, 예를 들어 포스페이트, 시트레이트 및 다른 유기산; 아스코르브산 및 메티오닌을 포함한 산화방지제; 보존제(예를 들어 옥타데실다이메틸벤질 암모늄 클로라이드; 헥사메토늄 클로라이드; 벤즈알코늄 클로라이드; 벤즈에토늄 클로라이드; 페놀, 부틸 또는 벤질 알콜; 알킬 파라벤, 예를 들어 메틸 또는 프로필 파라벤; 카테콜; 레소르시놀; 사이클로헥산올; 3-펜탄올; 및 m-크레졸); 저분자량(약 10 잔기 미만) 폴리펩타이드; 단백질, 예를 들어 혈청 알부민, 젤라틴, 또는 면역글로불린; 친수성 중합체, 예를 들어 폴리비닐피롤리돈; 아미노산, 예를 들어 글리신, 글루타민, 아스파라진, 히스티딘, 아르기닌, 또는 리신; 모노사카라이드, 다이사카라이드, 및 다른 탄수화물, 예를 들어 글루코스, 만노스, 또는 덱스트린; 킬레이트화제, 예를 들어 EDTA; 당, 예를 들어 슈크로스, 만니톨, 트레할로스 또는 솔비톨; 염-형성 대이온, 예를 들어 나트륨; 금속 착체(예를 들어 Zn-단백질 착체); 및/또는 비-이온성 계면활성제, 예를 들어 폴리에틸렌 글리콜(PEG)을 포함한다. 본 발명에서 예시적인 약학적으로 허용 가능한 담체는 간질성 약물 분산제, 예를 들어 용해성 중성-활성 히아루로니다제 당단백질(sHASEGP), 예를 들어 인간 용해성 PH-20 히아루로니다제 당단백질, 예를 들어 rHuPH20(하이레넥스(HYLENEX)(등록상표), 박스터 인터내셔널 인코포레이티드(Baxter International, Inc.))을 추가로 포함한다. rHuPH20을 포함한 몇몇 예시적인 sHASEGP 및 사용 방법이 미국특허 공보 2005/0260186 및 2006/0104968에 개시되어 있다. 하나의 태양에서, sHASEGP를 하나 이상의 추가적인 클리코스아미노글리카나제, 예를 들어 콘드로이티나제와 병용한다.
예시적인 동결건조된 제형들이 미국특허 제 6,267,958 호에 개시되어 있다. 수성 항체 제형은 미국특허 제 6,171,586 호 및 WO2006/044908에 개시된 것들을 포함하며, 후자의 제형은 히스티딘-아세테이트 완충제를 포함한다.
본 발명의 제형은 또한 치료하려는 특정 적응증에 필요한 하나 초과의 활성 성분들, 바람직하게는 서로 불리한 영향을 미치지 않는 상보적인 활성을 갖는 것들을 함유할 수 있다. 예를 들어 [[항-TIM3 항체와 병용될 수도 있는 약물 목록]]을 추가로 제공하는 것이 바람직할 수 있다. 상기와 같은 활성 성분들은 적합하게는 의도된 목적에 유효한 양으로 함께 존재한다.
활성 성분을 예를 들어 코아세르베이션 기법에 의해서 또는 계면 중합에 의해서 제조된 미세캡슐, 예를 들어 콜로이드 약물 전달 시스템(예를 들어 리포솜, 알부민 미소구, 미세유화액, 나노-입자 및 나노캡슐) 중의 또는 거대유화액 중의 각각의 하이드록시메틸셀룰로스 또는 젤라틴-미세캡슐 및 폴리-(메틸메트아크릴레이트) 미세캡슐 중에 포집할 수 있다. 상기와 같은 기법들은 문헌[Remington's Pharmaceutical Sciences, 16th edition, Osol, A. (ed.) (1980)]에 개시되어 있다.
서방성 제제를 제조할 수도 있다. 서방성 제제의 적합한 예는 상기 항체를 함유하는 고체 소수성 중합체의 반투과성 기질(상기 기질은 성형품, 예를 들어 필름 또는 미세캡슐의 형태이다)을 포함한다.
생체내 투여에 사용되는 제형은 일반적으로 멸균성이다. 멸균은 예를 들어 멸균 여과막을 통한 여과에 의해 쉽게 수행될 수 있다.
G. 치료 방법 및 조성물
본 발명에 제공된 항-TIM3 항체(또는 항원 결합 단백질) 중 어느 하나 또는 세포독성제에 접합된 상기 항-TIM3 항체(또는 항원 결합 단백질)의 면역접합체를 치료 방법에 사용할 수 있다.
하나의 태양에서, 약제로서 사용하기 위한 항-TIM3 항체 또는 세포독성제에 접합된 상기 항-TIM3 항체의 면역접합체를 제공한다. 추가의 태양에서, 암의 치료에 사용하기 위한 항-TIM3 항체 또는 세포독성제에 접합된 상기 항-TIM3 항체의 면역접합체를 제공한다. 몇몇 실시태양에서, 치료 방법에 사용하기 위한 항-TIM3 항체 또는 세포독성제에 접합된 상기 항-TIM3 항체의 면역접합체를 제공한다. 몇몇 실시태양에서, 본 발명은 암이 있는 개인에게 유효량의 항-TIM3 항체 또는 세포독성제에 접합된 상기 항-TIM3 항체의 면역접합체를 투여함을 포함하는, 상기 개인의 치료 방법에 사용하기 위한 항-TIM3 항체 또는 세포독성제에 접합된 상기 항-TIM3 항체의 면역접합체를 제공한다.
추가의 실시태양에서, 본 발명은 암세포의 세포사멸을 유도하고/하거나 암세포 증식을 억제하는데 사용하기 위한 항-TIM3 항체 또는 세포독성제에 접합된 상기 항-TIM3 항체의 면역접합체를 제공한다. 몇몇 실시태양에서, 본 발명은 개인에게 암세포의 세포사멸을 유도하고/하거나 암세포 증식을 억제하기에 유효한 항-TIM3 항체 또는 세포독성제에 접합된 상기 항-TIM3 항체의 면역접합체를 투여함을 포함하는, 상기 개인에서 암세포의 세포사멸을 유도하고/하거나 암세포 증식을 억제하는 방법에 사용하기 위한 상기 항-TIM3 항체 또는 세포독성제에 접합된 상기 항-TIM3 항체의 면역접합체를 제공한다.
추가의 실시태양에서, 본 발명은 면역자극제로서 사용하기 위한/또는 IFN 감마 분비를 자극하기 위한 항-TIM3 항체를 제공한다. 몇몇 실시태양에서, 본 발명은 개인에게 면역자극/또는 IFN 감마 분비의 자극에 유효한 항-TIM3 항체를 투여함을 포함하는, 상기 개인에서 상기 면역자극/또는 IFN 감마 분비의 자극에 사용하기 위한 항-TIM3 항체를 제공한다.
상기 실시태양들 중 어느 하나에 따른 "개인"은 바람직하게는 인간이다. 추가의 태양에서, 본 발명은 약제의 제작 또는 제조에서 항-TIM3 항체 또는 세포독성제에 접합된 상기 항-TIM3 항체의 면역접합체의 용도를 제공한다. 하나의 실시태양에서, 상기 약제는 암 치료용이다. 추가의 실시태양에서, 상기 약제는 암이 있는 개인에게 유효량의 상기 약제를 투여함을 포함하는 상기 암의 치료 방법에 사용하기 위한 것이다. 추가의 실시태양에서, 상기 약제는 암세포의 세포사멸을 유도하고/하거나 암세포 증식을 억제하기 위한 것이다. 추가의 실시태양에서, 상기 약제는 암을 앓고 있는 개인에게 암세포의 세포사멸을 유도하고/하거나 암세포 증식을 억제하기에 유효한 양의 상기 약제를 투여함을 포함하는 상기 개인에서 암세포의 세포사멸을 유도하고/하거나 암세포 증식을 억제하는 방법에 사용하기 위한 것이다. 상기 실시태양들 중 어느 하나에 따른 "개인"은 인간일 수 있다.
추가의 태양에서, 본 발명은 암의 치료 방법을 제공한다. 하나의 실시태양에서, 상기 방법은 암이 있는 개인에게 유효량의 항-TIM3 항체를 투여함을 포함한다. 상기 실시태양들 중 어느 하나에 따른 "개인"은 인간일 수 있다.
추가의 태양에서, 본 발명은 암을 앓고 있는 개인에서 암세포의 세포사멸을 유도하고/하거나 암세포 증식을 억제하기 위한 방법을 제공한다. 하나의 실시태양에서, 상기 방법은 암을 앓고 있는 개인에게 상기 개인에서 암세포의 세포사멸을 유도하고/하거나 암세포 증식을 억제하기에 유효한 양의 항-TIM3 항체 또는 세포독성제에 접합된 상기 항-TIM3 항체의 면역접합체를 투여함을 포함한다. 하나의 실시태양에서, "개인"은 인간이다.
추가의 태양에서, 본 발명은 예를 들어 상기 치료학적 방법들 중 어느 하나에 사용하기 위한, 본 발명에 제공된 항-TIM3 항체 중 어느 하나를 포함하는 약학 제형을 제공한다. 하나의 실시태양에서, 약학 제형은 본 발명에 제공된 항-TIM3 항체 중 어느 하나 및 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함한다.
본 발명의 항체(및 임의의 추가적인 치료제)를 임의의 적합한 수단, 예를 들어 비경구, 폐내 및 비내, 및 국소 치료를 원하는 경우, 병변내 투여에 의해 투여할 수 있다. 비경구 주입은 근육내, 정맥내, 동맥내, 복강내, 또는 피하 투여를 포함한다. 투여는 부분적으로 투여가 짧은지 또는 만성적인지에 따라, 임의의 적합한 경로, 예를 들어 주사, 예를 들어 정맥내 또는 피하 주사에 의할 수 있다. 본 발명에서는 비제한적으로 다양한 시점들에 걸친 단일 또는 수회 투여, 일시 투여, 및 펄스 주입을 포함한 다양한 투여 스케줄이 고려된다.
본 발명의 항체를 양호한 의학적 실행과 일관되는 방식으로 제형화하고, 복용시키고, 투여할 수 있다. 이와 관련하여 고려되는 인자들은 치료되는 특정 질환, 치료되는 특정 포유동물, 개인 환자의 임상적 조건, 질환의 원인, 작용제의 전달 부위, 투여 방법, 투여 스케줄, 및 의료 종사자에게 공지된 다른 인자들을 포함한다. 상기 항체는 문제의 질환을 예방하거나 치료하기 위해 현재 사용되는 하나 이상의 작용제와, 필요하지는 않지만, 임의로 제형화한다. 상기와 같은 다른 작용제의 유효량은 상기 제형 중에 존재하는 항체의 양, 질환 또는 치료제의 유형, 및 상기에 논의된 다른 인자들에 따라 변한다. 이들은 본 발명에 개시된 바와 동일한 투여량으로 및 투여 경로에 따라, 또는 본 발명에 개시된 투여량의 대략 1 내지 99%, 또는 실험적으로/임상적으로 적합한 것으로 결정된 임의의 투여량으로 및 임의의 경로에 의해 일반적으로 사용된다.
질병의 예방 또는 치료를 위해서, 본 발명의 항체의 적합한 투여량(단독으로 또는 하나 이상의 다른 추가적인 치료제와 함께 사용될 때)은 치료되는 질병의 유형, 항체의 유형, 상기 질병의 중증도 및 과정, 상기 항체가 예방 또는 치료 목적으로 사용되는지의 여부, 선행 치료법, 환자의 임상 병력 및 상기 항체에 대한 반응, 및 주치의의 판단에 따라 변할 것이다. 상기 항체를 한번에 또는 일련의 치료에 걸쳐 환자에게 적합하게 투여한다. 상기 질병의 유형 및 중증도에 따라, 약 1 ㎍/㎏ 내지 15 ㎎/㎏(예를 들어 0.5 ㎎/㎏ 내지 10 ㎎/㎏)의 항체가, 예를 들어 1회 이상의 분리 투여에 의한 것이든 또는 연속 주입에 의한 것이든 간에, 상기 환자에게 투여하기 위한 초기 후보 투여량일 수 있다. 임의의 전형적인 1일 투여량은 상기 언급한 인자들에 따라 약 1 ㎍/㎏ 내지 100 ㎎/㎏ 또는 그 이상의 범위일 수 있다. 수일 이상에 걸쳐 반복된 투여를 위해서, 상기 조건에 따라, 상기 치료를 일반적으로는 질병 증상의 목적하는 억제가 발생할 때까지 지속할 수 있다. 상기 항체의 하나의 예시적인 투여량은 약 0.05 ㎎/㎏ 내지 약 10 ㎎/㎏의 범위일 것이다. 따라서, 약 0.5 ㎎/㎏, 2.0 ㎎/㎏, 4.0 ㎎/㎏ 또는 10 ㎎/㎏(또는 이들의 임의의 조합)의 1회 이상의 용량을 상기 환자에게 투여할 수 있다. 상기와 같은 용량을 간헐적으로, 예를 들어 매주 또는 3주마다(예를 들어 상기 환자가 약 2 내지 약 20회, 또는 예를 들어 약 6회 용량의 상기 항체를 수령하도록) 투여할 수 있다. 초기의 보다 높은 부하 용량에 이어서 하나 이상의 보다 낮은 용량을 투여할 수도 있다. 예시적인 투여 섭생은 상기 항체의 약 4 ㎎/㎏의 초기 부하 용량을 투여한 다음, 약 2 ㎎/㎏의 매주 유지 용량을 투여함을 포함한다. 그러나, 다른 복용 섭생이 유용할 수도 있다. 상기 치료법의 진행을 통상적인 기법 및 분석에 의해 용이하게 모니터한다.
상기 제형들 및 치료 방법들 중 어느 하나를 항-TIM3 항체 대신에 또는 상기 항체 외에 본 발명의 면역접합체를 사용하여 수행할 수 있는 것으로 생각된다.
상기 제형 또는 치료 방법들 중 어느 하나를 항-TIM3 항체 대신에 또는 상기 항체 외에 본 발명의 면역접합체를 사용하여 수행할 수 있는 것으로 생각된다.
III. 제조 물품
본 발명의 또 다른 태양에서, 상술한 질환의 치료, 예방 및/또는 진단에 유용한 물질을 함유하는 제조 물품을 제공한다. 상기 제조 물품은 용기 및 상기 용기 상의 또는 상기 용기와 결합된 표지 또는 패키지 삽입물을 포함한다. 적합한 용기는 예를 들어 병, 바이알, 주사기, IV 용액 주머니 등을 포함한다. 상기 용기는 다양한 물질들, 예를 들어 유리 또는 플라스틱으로부터 형성될 수 있다. 상기 용기는 조성물을 단독으로, 또는 상태의 치료, 예방 및/또는 진단에 유효한 또 다른 조성물과 함께 유지하며 멸균 출입구를 가질 수 있다(예를 들어 상기 용기는 정맥내 용액 주머니 또는 피하주사 바늘에 의해 관통될 수 있는 마개를 갖는 바이알일 수 있다). 상기 조성물 중의 적어도 하나의 활성제는 본 발명의 항체이다. 상기 표지 또는 패키지 삽입물은 상기 조성물이 선택 상태의 치료에 사용됨을 가리킨다. 더욱이, 상기 제조 물품은 (a) 조성물이 함유된 제1 용기(여기에서 상기 조성물은 본 발명의 항체를 포함한다); 및 (b) 조성물이 함유된 제2 용기(여기에서 상기 조성물은 추가의 세포독성제 또는 다른 치료제를 포함한다)를 포함할 수 있다. 본 발명의 상기 실시태양에서 제조 물품은 상기 조성물을 사용하여 특정 상태를 치료할 수 있음을 가리키는 패키지 삽입물을 추가로 포함할 수 있다. 한편으로, 또는 추가로, 상기 제조 물품은 약학적으로 허용 가능한 완충제, 예를 들어 주사용 정균수(BWFI), 포스페이트-완충된 염수, 링거액 및 덱스트로스 용액을 포함하는 제2(또는 제3) 용기를 추가로 포함할 수 있다. 상기 물품은 상업적 및 사용자 관점에서 바람직할 수 있는 다른 물질, 예를 들어 다른 완충제, 희석제, 필터, 바늘 및 주사기를 추가로 포함할 수도 있다.
상기 제조 물품 중 임의의 물품이 항-TIM3 항체 대신에 또는 상기 항체 외에 본 발명의 면역접합체를 포함할 수 있는 것으로 생각된다.
아미노산 서열의 설명
서열번호 1 중쇄 HVR-H1, Tim3_0016
서열번호 2 중쇄 HVR-H2, Tim3_0016
서열번호 3 중쇄 HVR-H3, Tim3_0016
서열번호 4 경쇄 HVR-L1, Tim3_0016
서열번호 5 경쇄 HVR-L2, Tim3_0016
서열번호 6 경쇄 HVR-L3, Tim3_0016
서열번호 7 중쇄 가변 도메인 VH, Tim3_0016
서열번호 8 경쇄 가변 도메인 VL, Tim3_0016
서열번호 9 중쇄 가변 도메인 VH, Tim3_0016 변이체 (0018)
서열번호 10 경쇄 가변 도메인 VL, Tim3_0016 변이체 (0018)
서열번호 11 경쇄 HVR-L1, Tim3_0016_HVR-L1 변이체 1_NQ
(N에서 Q로의 돌연변이에 의한 글리코실화 부위의 제거)
서열번호 12 경쇄 HVR-L1, Tim3_0016_HVR-L1 변이체 2_NS
(N에서 S로의 돌연변이에 의한 글리코실화 부위의 제거)
서열번호 13 중쇄 HVR-H1, Tim3_0021
서열번호 14 중쇄 HVR-H2, Tim3_0021
서열번호 15 중쇄 HVR-H3, Tim3_0021
서열번호 16 경쇄 HVR-L1, Tim3_0021
서열번호 17 경쇄 HVR-L2, Tim3_0021
서열번호 18 경쇄 HVR-L3, Tim3_0021
서열번호 19 중쇄 가변 도메인 VH, Tim3_0021
서열번호 20 경쇄 가변 도메인 VL, Tim3_0021
서열번호 21 중쇄 HVR-H1, Tim3_0022
서열번호 22 중쇄 HVR-H2, Tim3_0022
서열번호 23 중쇄 HVR-H3, Tim3_0022
서열번호 24 경쇄 HVR-L1, Tim3_0022
서열번호 25 경쇄 HVR-L2, Tim3_0022
서열번호 26 경쇄 HVR-L3, Tim3_0022
서열번호 27 중쇄 가변 도메인 VH, Tim3_0022
서열번호 28 경쇄 가변 도메인 VL, Tim3_0022
서열번호 29 중쇄 HVR-H1, Tim3_0026
서열번호 30 중쇄 HVR-H2, Tim3_0026
서열번호 31 중쇄 HVR-H3, Tim3_0026
서열번호 32 경쇄 HVR-L1, Tim3_0026
서열번호 33 경쇄 HVR-L2, Tim3_0026
서열번호 34 경쇄 HVR-L3, Tim3_0026
서열번호 35 중쇄 가변 도메인 VH, Tim3_0026
서열번호 36 경쇄 가변 도메인 VL, Tim3_0026
서열번호 37 중쇄 HVR-H1, Tim3_0028
서열번호 38 중쇄 HVR-H2, Tim3_0028
서열번호 39 중쇄 HVR-H3, Tim3_0028
서열번호 40 경쇄 HVR-L1, Tim3_0028
서열번호 41 경쇄 HVR-L2, Tim3_0028
서열번호 42 경쇄 HVR-L3, Tim3_0028
서열번호 43 중쇄 가변 도메인 VH, Tim3_0028
서열번호 44 경쇄 가변 도메인 VL, Tim3_0028
서열번호 45 중쇄 HVR-H1, Tim3_0030
서열번호 46 중쇄 HVR-H2, Tim3_0030
서열번호 47 중쇄 HVR-H3, Tim3_0030
서열번호 48 경쇄 HVR-L1, Tim3_0030
서열번호 49 경쇄 HVR-L2, Tim3_0030
서열번호 50 경쇄 HVR-L3, Tim3_0030
서열번호 51 중쇄 가변 도메인 VH, Tim3_0030
서열번호 52 경쇄 가변 도메인 VL, Tim3_0030
서열번호 53 중쇄 HVR-H1, Tim3_0033
서열번호 54 중쇄 HVR-H2, Tim3_0033
서열번호 55 중쇄 HVR-H3, Tim3_0033
서열번호 56 경쇄 HVR-L1, Tim3_0033
서열번호 57 경쇄 HVR-L2, Tim3_0033
서열번호 58 경쇄 HVR-L3, Tim3_0033
서열번호 59 중쇄 가변 도메인 VH, Tim3_0033
서열번호 60 경쇄 가변 도메인 VL, Tim3_0033
서열번호 61 중쇄 HVR-H1, Tim3_0038
서열번호 62 중쇄 HVR-H2, Tim3_0038
서열번호 63 중쇄 HVR-H3, Tim3_0038
서열번호 64 경쇄 HVR-L1, Tim3_0038
서열번호 65 경쇄 HVR-L2, Tim3_0038
서열번호 66 경쇄 HVR-L3, Tim3_0038
서열번호 67 중쇄 가변 도메인 VH, Tim3_0038
서열번호 68 경쇄 가변 도메인 VL, Tim3_0038
서열번호 69 예시적인 슈도모나스 외독소 A 변이체 1(탈면역된 PE24 예)
서열번호 70 예시적인 슈도모나스 외독소 A 변이체 2(탈면역된 PE24 예)
서열번호 71 인간 카파 경쇄 불변 영역
서열번호 72 인간 람다 경쇄 불변 영역
서열번호 73 IgG1로부터 유래된 인간 중쇄 불변 영역
서열번호 74 돌연변이 L234A 및 L235A를 갖는 IgG1로부터 유래된 인간 중쇄 불변 영역
서열번호 75 돌연변이 L234A, L235A 및 P329G를 갖는 IgG1로부터 유래 된 인간 중쇄 불변 영역
서열번호 76 IgG4로부터 유래된 인간 중쇄 불변 영역
서열번호 77 예시적인 인간 TIM3 서열
서열번호 78 인간 TIM3 세포외 도메인 (ECD)
서열번호 79 Tim3_0016 변이체(0018)의 VH 인간화된 버전(= Tim3-0433)
서열번호 80 Tim3_0016 변이체(0018)의 VL 인간화된 버전(= Tim3-0433)
서열번호 81 Tim3_0016 변이체(0018의 VH 인간화된 버전)(= Tim3-0434)
서열번호 82 Tim3_0016 변이체(0018)의 VL 인간화된 버전(= Tim3-0434)
서열번호 83 Tim3-0028의 VH 인간화된 버전(= Tim3-0438)
서열번호 84 Tim3-0028의 VL 인간화된 버전(= Tim3-0438)
서열번호 85 Tim3-0028의 VH 인간화된 버전(= Tim3-0443)
서열번호 86 Tim3-0028의 VL 인간화된 버전(= Tim3-0443)
하기에서 항-TIM3 항체 Tim3-0016, Tim3-0016 변이체(0018) 및 그의 인간화된 버전 Tim3-0433 및 Tim3-0434, Tim3-0021, Tim3-0022, Tim3-0026, Tim3-0028 및 그의 인간화된 버전 Tim3-0438 및 Tim3-0443, Tim3-0030, 및 Tim3-0033, Tim3-0038의 표시된 HVR(굵게, 밑줄친 글씨의 HVR)을 포함하는 VH 및 VL 도메인의 아미노산 서열들을 나열한다:
Figure pct00002
Figure pct00003
Figure pct00004
Figure pct00005
Figure pct00006
Figure pct00007
Figure pct00008
하기에서 본 발명의 특정한 실시태양들을 나열한다:
1. TIM3에 결합하는 단리된 항체로, 여기에서 상기 항체는
·37 ℃에서 120분 후에 45% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 50% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 55% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 60% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 65% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오).
2. 실시태양 1에 따른 항-TIM3 항체로, 여기에서 상기 항체는
·Tim3_0016의 VH 및 VL을 포함하는 항-Tim3 항체와 TIM3에의 결합에 대해 경쟁하고
·인간 및 시노몰구스 TIM3에 결합하고
·면역접합체로서 TIM3 발현 세포상에서 세포독성 활성을 나타내고(하나의 실시태양에서 상기 면역접합체는 0.1 이하(실시예 11에서 측정된 바와 같이)의, RPMI-8226 세포상에서 슈도모나스 외독소 A 접합체로서 세포독성 활성의 상대적인 IC50 값을 갖는다)
·인터페론-감마 방출을 유도한다(MLR 분석에서).
3. 실시태양 1의 항체로, 인간, 인간화된 또는 키메릭 항체인 항체.
4. 실시태양 1의 항체로, TIM3에 결합하는 항체 단편인 항체.
5. 실시태양 4의 항체 단편으로, Fab 단편인 항체 단편.
6. A) (a) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
B) (a) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
C) (a) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
D) (a) 서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 15의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
E) (a) 서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 23의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
F) (a) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 31의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 34의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
G) (a) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 39 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
H) (a) 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 46의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 47의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 48의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 50의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
I) (a) 서열번호 53의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 55의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 57 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3; 또는
J) (a) 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 63의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 64의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 65의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 66의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3
을 포함하는 선행 실시태양들 중 어느 하나에 따른 항-TIM3 항체.
7. 인간 TIM3에 결합하는 단리된 항체로, 여기에서 상기 항체는 (a) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 3의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함한다.
8. 실시태양 7에 따른 항체로, 여기에서 상기 항체는
i) 서열번호 79의 VH 서열 및 서열번호 80의 VL 서열, 또는
ii) 서열번호 81의 VH 서열 및 서열번호 82의 VL 서열
을 포함한다.
9. 실시태양 7에 따른 항체로, 여기에서 상기 항체는 서열번호 79의 VH 서열 및 서열번호 80의 VL 서열을 포함한다.
10. 실시태양 7에 따른 항체로, 여기에서 상기 항체는 서열번호 81의 VH 서열 및 서열번호 82의 VL 서열을 포함한다.
11. 인간 TIM3에 결합하는 단리된 항체로, 여기에서 상기 항체는 (a) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1; (b) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2; (c) 서열번호 39의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3; (d) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (e) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2; 및 (f) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함한다.
12. 실시태양 11에 따른 항체로, 여기에서 상기 항체는
i) 서열번호 83의 VH 서열 및 서열번호 84의 VL 서열, 또는
ii) 서열번호 85의 VH 서열 및 서열번호 86의 VL 서열
을 포함한다.
13. 실시태양 11에 따른 항체로, 여기에서 상기 항체는 서열번호 83의 VH 서열 및 서열번호 84의 VL 서열을 포함한다.
14. 실시태양 11에 따른 항체로, 여기에서 상기 항체는 서열번호 85의 VH 서열 및 서열번호 86의 VL 서열을 포함한다.
15. A) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
B) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
C) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
D) (a) (i) 서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 15 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
E) (a) (i) 서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 23 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
F) (a) (i) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 31 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 34의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
G) (a) (i) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 39 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
H) (a) (i) 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 46의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 47 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 48의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 50의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
I) (a) (i) 서열번호 53의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 55 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
J) (a) (i) 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 63 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 64의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 65의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 66의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인
을 포함하는 선행 실시태양들 중 어느 하나에 따른 항-TIM3 항체.
16. 인간 TIM3에 결합하는 단리된 항체로, 여기에서 상기 항체는 (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
17. 실시태양 16에 따른 항체로, 여기에서 상기 항체는
i) 서열번호 79의 VH 서열 및 서열번호 80의 VL 서열, 또는
ii) 서열번호 81의 VH 서열 및 서열번호 82의 VL 서열
을 포함한다.
18. 실시태양 16에 따른 항체로, 여기에서 상기 항체는 서열번호 79의 VH 서열 및 서열번호 80의 VL 서열을 포함한다.
19. 실시태양 16에 따른 항체로, 여기에서 상기 항체는 서열번호 81의 VH 서열 및 서열번호 82의 VL 서열을 포함한다.
20. 인간 TIM3에 결합하는 단리된 항체로, 여기에서 상기 항체는 (a) (i) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 39 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함한다.
21. 실시태양 20에 따른 항체로, 여기에서 상기 항체는
i) 서열번호 83의 VH 서열 및 서열번호 84의 VL 서열, 또는
ii) 서열번호 85의 VH 서열 및 서열번호 86의 VL 서열
을 포함한다.
22. 실시태양 20에 따른 항체로, 여기에서 상기 항체는 서열번호 83의 VH 서열 및 서열번호 84의 VL 서열을 포함한다.
23. 실시태양 20에 따른 항체로, 여기에서 상기 항체는 서열번호 85의 VH 서열 및 서열번호 86의 VL 서열을 포함한다.
24. A) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
B) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
C) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
D) (a) (i) 서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 15 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
E) (a) (i) 서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 23 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
F) (a) (i) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 31 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 34의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
G) (a) (i) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 39 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
H) (a) (i) 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 46의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 47 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 48의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 50의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
I) (a) (i) 서열번호 53의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 55 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
J) (a) (i) 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 63 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 64의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 65의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 66의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인
을 포함하는 선행 실시태양들 중 어느 하나에 따른 항-TIM3 항체로, 여기에서 상기 항체는 하기의 성질들 중 하나 이상에 의해 독립적으로 특성화된다: 상기 항-TIM3 항체는
·37 ℃에서 120분 후에 45% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 50% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 55% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 60% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 65% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·서열번호 7의 VH 및 서열번호 8의 VL을 포함하는 항-Tim3 항체와 TIM3에의 결합에 대해 경쟁하고
·인간 및 시노몰구스 TIM3에 결합하고
·면역접합체로서 TIM3 발현 세포상에서 세포독성 활성을 나타내고(하나의 실시태양에서 상기 면역접합체는 0.1 이하(실시예 11에서 측정된 바와 같이)의, RPMI-8226 세포상에서 슈도모나스 외독소 A 접합체로서 세포독성 활성의 상대적인 IC50 값을 갖는다)
·인터페론-감마 방출을 유도한다(실시예 5에 기재된 바와 같은 혼합림프구반응(MLR) 분석에서).
25. 인간 TIM3에 결합하는 단리된 항체로, 여기에서 상기 항체는 (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함하며,
여기에서 상기 항체는 하기의 성질들 중 하나 이상에 의해 독립적으로 특성화된다: 상기 항-TIM3 항체는
·37 ℃에서 120분 후에 45% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 50% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 55% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 60% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 65% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·서열번호 7의 VH 및 서열번호 8의 VL을 포함하는 항-Tim3 항체와 TIM3에의 결합에 대해 경쟁하고
·인간 및 시노몰구스 TIM3에 결합하고
·면역접합체로서 TIM3 발현 세포상에서 세포독성 활성을 나타내고(하나의 실시태양에서 상기 면역접합체는 0.1 이하(실시예 11에서 측정된 바와 같이)의, RPMI-8226 세포상에서 슈도모나스 외독소 A 접합체로서 세포독성 활성의 상대적인 IC50 값을 갖는다)
·인터페론-감마 방출을 유도한다(실시예 5에 기재된 바와 같은 혼합림프구반응(MLR) 분석에서).
26. 인간 TIM3에 결합하는 단리된 항체로, 여기에서 상기 항체는 (a) (i) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 39 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함하며;
여기에서 상기 항체는 하기의 성질들 중 하나 이상에 의해 독립적으로 특성화된다: 상기 항-TIM3 항체는
·37 ℃에서 120분 후에 45% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 50% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 55% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 60% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·하나의 실시태양에서 상기 항체는 37 ℃에서 120분 후에 65% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도한다(실시예 6을 참조하시오)
·서열번호 7의 VH 및 서열번호 8의 VL을 포함하는 항-Tim3 항체와 TIM3에의 결합에 대해 경쟁하고
·인간 및 시노몰구스 TIM3에 결합하고
·면역접합체로서 TIM3 발현 세포상에서 세포독성 활성을 나타내고(하나의 실시태양에서 상기 면역접합체는 0.1 이하(실시예 11에서 측정된 바와 같이)의, RPMI-8226 세포상에서 슈도모나스 외독소 A 접합체로서 세포독성 활성의 상대적인 IC50 값을 갖는다)
·인터페론-감마 방출을 유도한다(실시예 5에 기재된 바와 같은 혼합림프구반응(MLR) 분석에서).
27. 선행 실시태양들 중 어느 하나에 따른 항체로, 전장 IgG1 항체인 항체.
28. 선행 실시태양들 중 어느 하나에 따른 항체로, 돌연변이 L234A, L235A 및 P329G(카밧의 EU 색인에 따른 넘버링)를 갖는 전장 IgG1 항체인 항체.
29. 선행 실시태양들 중 어느 하나에 따른 항체를 암호화하는 단리된 핵산.
30. 실시태양 29의 핵산을 포함하는 숙주 세포.
31. 항체의 생성 방법으로, 상기 항체가 생성되도록 실시태양 30의 숙주 세포를 배양시킴을 포함하는 방법.
32. 실시태양 31의 방법으로, 숙주 세포로부터 항체를 회수함을 또한 포함하는 방법.
33. 실시태양 1 내지 28 중 어느 하나에 따른 항체 및 세포독성제를 포함하는 면역접합체.
34. 실시태양 33에 따른 면역접합체로, 여기에서 세포독성제는 슈도모나스 외독소 A 또는 아마톡신이다.
35. 실시태양 1 내지 28 중 어느 하나에 따른 항체 및 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 약학 제형.
36. 약제로서 사용하기 위한 실시태양 1 내지 28 중 어느 하나에 따른 항체 또는 실시태양 33 및 34 중 어느 하나의 면역접합체.
37. 암 치료에 사용하기 위한 실시태양 1 내지 28 중 어느 하나에 따른 항체 또는 실시태양 33 및 34 중 어느 하나의 면역접합체.
38. 약제의 제조에 사용하기 위한 실시태양 1 내지 28 중 어느 하나에 따른 항체 또는 실시태양 33 및 34 중 어느 하나의 면역접합체의 용도.
39. 실시태양 38의 용도로, 상기 약제가 암 치료용인 용도.
40. 암에 걸린 개인에게 유효량의 실시태양 1의 항체 또는 실시태양 33의 면역접합체를 투여함을 포함하는 상기 개인의 치료 방법.
V. 실시예
하기는 본 발명의 방법 및 조성물의 실시예이다. 다양한 다른 실시태양들을 실행하여, 상기에 제공된 일반적인 설명을 제공할 수 있음을 알 것이다.
상기 발명을 이해의 명확성을 위해 예시 및 실시예에 의해 일부 상세히 기재하였지만, 상기 설명 및 실시예들이 본 발명의 범위를 제한하는 것으로서 해석해서는 안 된다. 본 명세서에 인용된 모든 특허 및 과학 문헌의 내용은 명백히 내용 전체가 참고로 인용된다.
실시예 1a: 항-TIM3 항체의 생성
마우스의 면역화
NMRI 마우스를, 100 ug 벡터 DNA의 피내 적용에 이어서 일렉트로포레이션(2 제곱 펄스의 1000 V/㎝, 지속시간 0.1 ms, 간격 0.125 s; 이어서 4 제곱 펄스의 287.5 V/㎝, 지속시간 10 ms, 간격 0.125 s. 마우스에게 0, 14, 28, 42, 56, 70 및 84일째에 6회 연속적인 면역화를 제공하였다. 36, 78 및 92일째에 채혈하고 혈청을 제조하였으며, 이를 ELISA에 의한 역가 측정(하기 참조)에 사용하였다)에 의해 전장 인간 Tim-3을 암호화하는 플라스미드 발현 벡터(플라스미드 15304_hTIM3-fl)를 사용하여 유전학적으로 면역시켰다. 가장 높은 역가를 갖는 동물을 96일째에 50 ug의 재조합 인간 Tim-3 인간 Fc 키메라의 정맥내 주사에 의한 추가접종을 위해 선택하고, 단클론 항체를 추가접종 후 3일째에 골수종 세포주에의 비장세포의 융합에 의한 하이브리도마 기술에 의해 단리하였다.
혈청 역가의 측정(ELISA)
인간 재조합 Tim-3 인간 Fc 키메라를 PBS 중의 0.3 ug/㎖, 100 ㎕/웰로 96-웰 NUNC 맥시솝(Maxisorp) 플레이트상에 고정화시킨 다음; 상기 플레이트를 PBS 중 2% 크로테인 C, 200 ㎕/웰로 차단시키고; PBS 중 0.5% 크로테인 C, 100 ㎕/웰에서 항혈청을 중복해서 연속 희석하고; HRP-접합된 염소 항-마우스 항체(잭슨 임뮤노리써치/다이아노바(Jackson Immunoresearch/Dianova) 115-036-071; 1/16 000)로 검출하였다. 모든 단계에 대해서, 플레이트를 37 ℃에서 1시간 동안 배양시켰다. 모든 단계들 사이에서, 플레이트를 PBS 중의 0.05% 트윈 20으로 3회 세척하였다. 용해성 BM 블루 POD 기질(로슈), 100 ul/웰의 첨가에 의해 신호를 발생시켰으며; 1M HCl, 100 ul/웰의 첨가에 의해 정지시켰다. 흡광도를, 참조로서 690 ㎚에 대해, 450 ㎚에서 판독하였다. 역가는 최대-절반 신호를 생성시키는 항혈청의 희석으로서 정의되었다.
실시예 1b: 항-Tim3 항체 특성화
Tim3에 대한 ELISA
Nunc-맥시솝 스트렙트아비딘 플레이트(마이크로코트(MicroCoat) #11974998/MC1099)를 Tim3-ECD-His-비오틴(BirA 리가제에 의해 비오틴화됨)이 있는 25 ㎕/웰에 의해 코팅하고 400 rpm 회전으로 진탕시키면서 RT에서 1시간 동안 배양시켰다. 세척(PBST-완충제에 의해 3x90 ㎕/웰) 후에 25 ㎕ aTim3 샘플 또는 희석된(1:2 단계) 참조 항체 aTim3 F38-2E2(바이오레전드(Biolegend))를 가하고 RT에서 1시간 배양하였다. 세척(PBST-완충제에 의해 3x90 ㎕/웰) 후에 25 ㎕/웰 양-항-마우스-POD(GE NA9310V)를 1:9000 희석으로 가하고 400 rpm 회전으로 진탕시키면서 RT에서 1시간 동안 배양시켰다. 세척(PBST-완충제에 의해 3x90 ㎕/웰) 후에 25 ㎕/웰 TMB 기질(칼바이오켐(Calbiochem), #CL07)을 가하고 OD 1.5-2.5까지 배양시켰다. 이어서 상기 반응을 25 ㎕/웰 1N HCL-용액의 첨가에 의해 정지시켰다. 측정을 370/492 ㎚에서 수행하였다.
ELISA 결과를 하기 요약 표 2에서 EC50-값[ng/㎖]으로서 나열한다.
Tim3 에 대한 세포 ELISA
전장 인간 Tim3을 암호화하는 플라스미드 15312_hTIM3-fl_pUC_Neo로 안정하게 형질감염되고 G418(플라스미드상의 네오마이신 내성 마커)로 선택된 부착성 CHO-K1 세포주를 384-웰 편평 바닥 플레이트에 1.2x10E6 세포/㎖의 농도로 시딩하고 밤새 증식시켰다.
다음날 25 ㎕/웰 Tim3 샘플 또는 aTim3 참조 항체 F38-2E2 무 아지드(바이오레전드, 354004)를 가하고 4 ℃에서 2시간 동안 배양시켰다(내면화를 피하기 위해서). 세척(3x90 ㎕/웰 PBST(BIOTEK 세척제: Prog. 29, 1x90) 후에 세포를, 잔류 완충제를 튀겨 날리고 50 ㎕/웰 0.05% 글루타르알데하이드: 1:500의 1xPBS-완충제 중의 25% 글루타르알데하이드(시그마 Cat.No: G5882)를 가하여 고정시키고 RT에서 1시간 동안 배양시켰다. 세척(3x90 ㎕/웰 PBST(BIOTEK 세척제: Prog. 21, 3x90 그레인리신(GreinLysin)) 후에 25 ㎕/웰 2차 항체를 검출(양-항-마우스-POD; 양고추냉이 PDO 결합된 F(ab')2 단편; GE NA9310)을 위해 가한 다음 400 rpm에서 진탕시키면서 RT에서 2시간 배양시켰다. 세척(3x90 ㎕/웰 PBST(BIOTEK 세척제: Prog. 21, 3x90 그레인리신) 후에 25 ㎕/웰 TMB 기질 용액(로슈 11835033001)을 가하고 OD 1.5-2.5까지 배양시켰다. 이어서 상기 반응을 25 ㎕/웰 1N HCL-용액의 첨가에 의해 정지시켰다. 측정을 370/492 ㎚에서 수행하였다.
세포 ELISA 결과를 하기 요약 표 2에서 "EC50 CHO-Tim3" 값[ng/㎖]으로서 나열한다.
[표 2]
Figure pct00009
Tim3 AB의 BIAcore 특성화
표면 플라스몬 공명(SPR) 기재 분석을 사용하여 다수의 쥐 Tim3 결합제들뿐만 아니라 상업적인 인간 Tim3 결합 참조들간의 결합의 동역학적 매개변수들을 측정하였다. 따라서, 항-마우스 IgG를 아민 커플링에 의해 (BIAcore) CM5 센서 칩의 표면에 고정화시켰다. 이어서 상기 샘플을 포획하고 단량체성 hu/cy Tim3-ECD뿐만 아니라 Fc-태그된 인간 Tim3-ECD 이량체를 상기에 결합시켰다. 상기 센서 칩 표면을 각 분석 주기 후에 재생시켰다. 상기 데이터를 1:1 랭뮤어 상호작용 모델에 적합시켜 최종적으로 평형 상수 KD를 획득하였다.
약 12000 응답 단위(RU)의 30 ㎍/㎖ 항-마우스 IgG(GE 헬쓰케어 #BR-1008-38)를, GE 헬쓰케어에 의해 공급된 아민 커플링 키트를 사용하여 pH 5.0에서 BIAcore B4000에서 CM5 센서 칩의 유동 셀 1-4의 1, 2, 4 및 5 스폿(스폿 1, 5는 활성이고 스폿 2, 4는 참조 스폿이다)상에 커플링시켰다.
상기 샘플 및 실행 완충제는 HBS-EP+(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 3 mM EDTA, 0.05% v/v 계면활성제 P20, pH 7.4)였다. 유동 셀 온도를 25 ℃로 설정하고 샘플 구획 온도를 12 ℃로 설정하였다. 상기 시스템을 실행 완충제로 초회 자극하였다.
상기 샘플을 30초 동안 200 ㎍/㎖의 농도로 주입하고 각 유동 셀의 스폿 1 및 5에 결합시켜, 8개의 샘플이 나란히 측정되게 하였다. 이어서 상이한(단량체성 시노, 단량체성 인간 및 huFc 융합된 이량체성 인간 Tim3-ECD) 농도(s, 표 X)의 완전한 세트를 각 샘플에 대해 240s에 이어서 30/1800s의 해리 시간(s. 표 1) 동안 주입하였다. 이어서 각 분석 주기(샘플 포획, 스폿 1 및 5 - Tim3 ECD 주입)를 글리신-HCl pH 1.7의 30초 길이 주입에 의해 재생시켰다. 유량은 전체 실행 동안 30 ㎕/분으로 설정하였다.
최종적으로 상기 이중 참조 데이터를 BIAcore B4000 평가 소프트웨어로 1:1 랭뮤어 상호작용 모델에 적합시켰다. 단량체성 인간, 시노 Tim3 및 huFc 융합된 이량체성 인간 Tim3에 대해 생성되는 친화성을 표 2 및 3에 나타낸다. 상기 hu Tim3 이량체에 대한 친화성은 가장 있음직하게는 결합활성에 의해 영향을 받는 듯하며 따라서 상기 친화성은 단량체성 huTim3에 대한 친화성보다 명백히 더 강하다.
[표 3a]
Figure pct00010
SPR을 통한 Tim3에 대한 친화성의 측정( 키메릭 TIM3 -0016 변이체 (0018) 및 인간화된 버전)
단백질 A를 (Biacore) CM5 센서 칩의 표면에 아민 커플링에 의해 고정화시켰다. 이어서 상기 샘플을 포획하고 hu Tim3-ECD를 상기에 결합시켰다. 상기 센서 칩 표면을 각 분석 주기 후에 재생시켰다. 평형 상수 및 동역학적 속도 상수를 최종적으로, 상기 데이터를 1:1 랭뮤어 상호작용 모델에 적합시킴으로써 획득하였다.
약 2000 응답 단위(RU)의 20 ㎍/㎖ 단백질 A를, GE 헬쓰케어에 의해 공급된 아민 커플링 키트를 사용하여 Biacore B4000 장비에서 CM5 센서 칩의 모든 유동 셀의 1, 2, 4 및 5 스폿상에 커플링시켰다.
상기 샘플 및 실행 완충제는 HBS-EP+(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 3 mM EDTA, 0.05% v/v 계면활성제 P20, pH 7.4)였다. 유동 셀 온도를 25 ℃로 설정하고 샘플 구획 온도를 12 ℃로 설정하였다. 상기 시스템을 실행 완충제로 초회 자극하였다.
상이한 샘플들을 30초 동안 10 nM의 농도로 주입하고 모든 유동 셀 중의 스폿 1 및 5에 연속적으로 결합시켰다. 이어서 단량체성 인간 Tim3-ECD 희석물의 완전한 세트(600 nM, 200 nM, 66.7 nM, 2x22.2 nM, 7.4 nM, 2.5 nM 및 2x0 nM)를 300s 동안 각 샘플 상에 연속적으로 주입하였다. 각 항원 주입에 이어서 12s/1000s의 해리 시간 및 2회의 30s 재생 단계(글리신-HCl pH 1.5 용액에 의해)를 수행하였으며, 이중 마지막 하나는 20초의 주입 후 안정화 기간을 함유하였다.
최종적으로 상기 이중 참조 데이터를 Biacore B4000 평가 소프트웨어를 사용하여 1:1 랭뮤어 상호작용 모델에 적합시켰다. 생성되는 KD 값을 표 3b에 나타낸다.
SPR을 통한 Tim3에 대한 친화성의 측정(( 키메릭 TIM3 -0028 및 인간화된 버전))
항-인간 Fc IgG를 (Biacore) CM5 센서 칩의 표면에 아민 커플링에 의해 고정화시켰다. 이어서 상기 샘플을 포획하고 hu Tim3-ECD를 상기에 결합시켰다. 상기 센서 칩 표면을 각 분석 주기 후에 재생시켰다. 평형 상수 및 동역학적 속도 상수를 최종적으로, 상기 데이터를 1:1 랭뮤어 상호작용 모델에 적합시킴으로써 획득하였다.
약 2500 응답 단위(RU)의 10 ㎍/㎖ 항-인간 Fc IgG(GE 헬쓰케어 #BR-1008-39)를, GE 헬쓰케어에 의해 공급된 아민 커플링 키트를 사용하여 Biacore B4000 장비에서 CM5 센서 칩의 모든 유동 셀의 1, 2, 4 및 5 스폿상에 커플링시켰다.
상기 샘플 및 실행 완충제는 HBS-EP+(0.01 M HEPES, 0.15 M NaCl, 3 mM EDTA, 0.05% v/v 계면활성제 P20, pH 7.4)였다. 유동 셀 온도를 25 ℃로 설정하고 샘플 구획 온도를 12 ℃로 설정하였다. 상기 시스템을 실행 완충제로 초회 자극하였다.
상이한 샘플들을 30초 동안 10 nM의 농도로 주입하고 모든 유동 셀의 스폿 1 및 5에 연속적으로 결합시켰다. 이어서 단량체성 인간 Tim3-ECD 희석물의 완전한 세트(600 nM, 200 nM, 66.7 nM, 2x22.2 nM, 7.4 nM, 2.5 nM 및 2x0 nM)를 300s 동안 각 샘플 상에 연속적으로 주입하였다. 각 항원 주입에 이어서 12s/700s의 해리 시간 및 2회의 30s 재생 단계(3 M MgCl2 용액에 의해)를 수행하였으며, 이중 마지막 하나는 실행 완충제에 의한 "주입 후 여분의 세척"을 함유하였다.
최종적으로 상기 이중 참조 데이터를 Biacore B4000 평가 소프트웨어를 사용하여 1:1 랭뮤어 상호작용 모델에 적합시켰다. 생성되는 KD 값을 표 3b에 나타낸다.
[표 3b]
Figure pct00011
실시예 2: 항-Tim3 항체 유도체의 생성
키메릭 항체 유도체
키메릭 Tim3 항체를, PCR을 통해 항-TIM3 마우스 항체 Tim3-0016, Tim3-0016 변이체(0018), Tim3-0021, Tim3-0022, Tim3-0026, Tim3-0028, Tim3-0030, 및 Tim3-0033, Tim3-0038의 가변 중쇄 및 경쇄 영역을 증폭시키고 이들을 효과기 기능을 없애는 LALA 및 PG 돌연변이(류신 234에서 알라닌으로, 류신 235에서 알라닌으로, 프롤린 329에서 글리신으로)를 갖는 인간 IgG1 주쇄/인간 CH1-힌지-CH2-CH3와의 융합 단백질로서 중쇄 발현 벡터내에 및 인간 C-카파에 대한 융합 단백질로서 경쇄 발현 벡터내에 클로닝시킴으로써 생성시켰다. 이어서 LC 및 HC 플라스미드를 HEK293내에 동시형질감염시키고 7일 후에 항체 정제에 대한 표준 방법에 의해 상등액으로부터 정제시켰다.
글리코실화 부위 NYT의 제거: Q 또는 S에 의한 N의 치환에 의한 Tim3 -0016, Tim3_0016 변이체(0018 또는 Tim _0018이라 명명함) 중의 1 HVR -L1 위치의 변형
Tim3_0016 및 Tim3_0016 변이체(0018)의 가변 경쇄 영역내 돌연변이를, 제조사의 설명에 따라 에이질런트(Agilent) "퀵 체인지 라이트닝(Quick Change Lightning) 부위-지향된 변이도입 키트"를 사용하여 시험관내 변이도입에 의해 생성시켰다. 상기 방법에 의해 경쇄 HVR-L1(서열번호 4) 중의 글리코실화 부위 동기 NYT의 아스파라진(N)을 글루타민(Q)에 의해 치환시키거나(서열번호 11 = Tim3_0016_HVR-L1 변이체 1_ NQ가 생성된다), 또는 한편으로 상기 아스파라진(N)을 세린(S)에 의해 치환시켰다(서열번호 12 = Tim3_0016_HVR-L1 변이체 2_ NS가 생성된다). 상기 둘 모두에서, 글리코실화 부위 동기 NYT가 성공적으로 변형되었다. 이어서 상기 변이체들을 암호화하는 LC 및 HC 플라스미드를 HEK293내로 동시형질감염시키고 7일 후에 항체 정제에 대한 표준 방법에 의해 상등액으로부터 정제시켰다.
상기 생성된 돌연변이체를, 인간 Tim3상에서 ELISA, 시노몰구스 Tim3상에서 ELISA 및 전장 인간 Tim3을 발현하는 부착성 CHO-K1 세포상에서 세포성 ELISA에 의해 시험하였다.
[표 4]
Figure pct00012
생성된 모든 돌연변이체는 각각 모 항체 Tim3_0016 또는 Tim3_0016 항체 변이체 Tim3_0018보다 인간 TIM3(인간), 시노 TIM3(시노) 또는 인간 TIMR에 훨씬 더 큰 기능적인 결합을 나타내는 것으로 밝혀졌다.
인간화된 항체 유도체: 쥐 항- Tim3 -0016 변이체 (0018) 및 항- Tim3 _0028의 VH 및 VL 도메인의 인간화
a) 항-Tim3 항체 Tim3_0016 변이체(0018)(6개 HVR의 아미노산 서열을 가지며, 여기에서 경쇄에서 HVR-L1 변이체 2_NS(N에서 S로의 돌연변이에 의한 글리코실화 부위의 제거)가 사용되었다(서열번호 1, 2, 3, 12, 5 및 6))의 VH 및 VL 도메인의 아미노산 서열을 기본으로 인간화된 항-Tim3 항체 변이체 Tim3-0433 및 Tim3-0434를 생성시키고 b) 항-Tim3 항체 Tim3_0028(6개 HVR의 아미노산 서열(서열번호 37, 38, 39, 40, 41 및 42)을 갖는다)의 VH 및 VL 도메인의 아미노산 서열을 기본으로 인간화된 항-Tim3 항체 변이체 Tim3-0438 및 Tim3-0443을 생성시켰다.
상기 중쇄 및 경쇄 가변 영역에 대한 인간화된 아미노산 서열을 DNA로 역번역하고 생성되는 cDNA를 합성하고(GenArt) 이어서 효과기 기능을 없애는 LALA 및 PG 돌연변이(류신 234에서 알라닌으로, 류신 235에서 알라닌으로, 프롤린 329에서 글리신으로)를 갖는 인간 IgG1 주쇄/인간 CH1-힌지-CH2-CH3와의 융합 단백질로서 중쇄 발현 벡터내에 또는 인간 C-카파에 대한 융합 단백질로서 경쇄 발현 벡터내에 클로닝시켰다. 이어서 LC 및 HC 플라스미드를 HEK293내에 동시형질감염시키고 7일 후에 항체 정제에 대한 표준 방법에 의해 상등액으로부터 정제시켰다. 상기 생성되는 인간화된 Tim3-항체를 하기와 같이 명명한다:
Figure pct00013
실시예 3: 정제된 단클론 항체의 형광 표지화
하이브리도마 유래된 단클론 항체의 형광 표지화를 제조사의 설명에 따라 알렉사 플루오르(Alexa Fluor) 488 단클론 항체 표지화 키트(인비트로젠에 의해 제조됨)를 사용하여 수행하였다. 상기 표지화 후에, 각 항체는 TIM-3 발현 RPMI-8226 및 파이퍼(Pfeiffer) 세포에 대한 FACSCalibur(BD 바이오사이언시즈(Biosciences)에 의해 제조됨) 분석에 의해 알렉사 플루오르 488(본 명세서에서 이후부터 "알렉사-488"이라 지칭함)로 양으로 표지된 것으로 확인되었다.
실시예 4: FACS 기재 경쟁 분석을 사용하는 결합 에피토프 그룹의 분류
생성된 항-TIM3 항체 및 6개의 항-TIM3 참조 항체간의 에피토프의 관계를 FACS 기재 결합 경쟁 분석에 의해 분석하였다. 상기 TIM3 참조 항체는 하기와 같았다: US2012/189617에 기재된 바와 같은 항체 4177 및 8213, WO2013/06490에 기재된 바와 같은 항체 1.7E10 및 27.12E12; 항체 344823(클론 344823, R&D 시스템스에 의해 제조됨) 및 항체 F38-2E2(클론 F38-2E2, 바이오레전드 및 R&D 시스템스에 의해 제조됨). 간단히, 상기 시험 항체는 상기 TIM-3 발현 RPMI-8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))와의 상호작용 및 결합이 허용되었으며, 이어서 상기를 유식 세포측정 방법에 의해 또 다른 항-TIM-3 항체가 또한 TIM-3 발현 세포에 결합할 수 있는지를 평가하였다.
간단히 인간 TIM3 발현 RPMI-8226 세포를 RT에서 10분 동안 BD 인간 Fc 블록과 함께 배양하고 2개의 상이한 실험 장치에서 염색하여, 하기와의 결합에 대한 상기 시험된 항체의 친화성의 변화의 영향을 배제하였다:
1) 항체당 평균 2.7 형광단을 갖는, 제조사의 설명(몰레큘라 프로브스(Molecular Probes A-20181)에 따라 알렉사*488과 접합된, 개시된 정제된 항-TIM3(4 ℃에서 0.5시간 동안 BD 염색 완충제 중의 10 ㎍/㎖). 이어서 a) 표지되지 않은(1-4) 참조 재조합 항-TIM3 항체 또는 아이소타입 대조용을 BD SB 중에서 4 ℃에서 0.5시간 동안 가하고(10 ㎍/㎖) BD SB로 세척 후에 PE-표지된 항-huFcγ Ab(JIR, 109-116-098, 1:200, BD SB 중에서 4 ℃에서 0.5시간)로 염색하거나 또는 b) PE 표지된(5-6) 입수 가능한 참조 항-TIM3 항체 또는 적합한 아이소타입 대조용을 BD SB 중에서 4 ℃에서 0.5시간 동안 가하였다(10 ㎍/㎖). 세척 및 원심분리 후에 염색된 RPMI-8226 세포의 MFI 신호를 BD 바이오사이언시즈 FACSCanto 유식 세포계에 의해 분석하였다.
[표 5]
Figure pct00014
FACS 기재 에피토프 그룹 지도화로부터의 결과는 Tim3_0016 및 Tim3_0016 변이체 Tim3_0018이 임의의 시험된 항-TIM-3 참조 항체와 결합 경쟁을 나타내지 않음을 보이며 이는 상기 Ab가 앞서 기재된 모든 TIM3 참조 항체들이 인식하는 에피토프와 상이한 새로운 에피토프를 인식한 반면 Tim3_0022, Tim3_0026, Tim3_0028 및 Tim3_0038은 다양한 경쟁자들과 JRPMI-8226상에서 표면 발현된 TIM3에의 결합에 대해 상이한 정도로 경쟁함을 암시하였다.
실시예 5: 혼합 림프구 반응(MLR)에서 사이토킨 생성에 대한 인간 항-TIM-3 항체의 효과
혼합 림프구 반응을 사용하여 림프구 효과기 세포에 대한 TIM-3 경로의 차단 효과를 설명하였다. 상기 분석에서 T 세포를 항-TIM-3 mAb의 존재 또는 부재하에서 활성화 및 IFN-감마 분비에 대해 시험하였다.
인간 림프구를 류코셉(Leukosep)(그라이너 바이오 원(Greiner Bio One, 227 288))을 사용하여 밀도 구배 원심분리에 의해 건강한 공여자의 말초 혈액으로부터 단리하였다. 간단히, 헤파린 처리된 혈액을 3배 부피의 PBS로 희석하고 상기 희석된 혈액 중 25 ㎖ 분액들을 50 ㎖ 류코셉 튜브 중에 층상화하였다. 실온에서 15분 동안 800xg에서 원심분리(중단 없이) 후에 상기 림프구 함유 분획들을 수확하고, PBS에서 세척하고, 기능 분석에 바로 사용하거나 1.0E+07 세포/㎖로 동결 매질(10% DMSO, 90% FCS)에 재현탁시키고 액체 질소에서 보관하였다. 1:1 표적/응답 세포 비를 MLR 분석에 사용하였다(즉 각각의 MLR 배양물은 각 공여자로부터 -2.0E+0.5 PBMC를 총 200 ㎕의 부피로 함유하였다. 항-TIM3 단클론 항체 Tim3_0016, Tim3_0016 변이체(Tim3_0018), Tim3_0021, Tim3_0022, Tim3_0026, Tim3_0028, Tim3_0030, Tim3_0033, Tim3_0038 및 F38-2E2(바이오레전드)를 상이한 항체 농도로 각 배양물에 가하였다. 항체가 없거나 또는 아이소타입 대조용 항체를 음성 대조용으로서 사용하였으며 rec hu IL-2(20 EU/㎖)를 양성 대조용으로서 사용하였다. 상기 세포를 37 ℃에서 6일 동안 배양하였다. 6일 후에 100 ㎕의 배지를 사이토킨 측정을 위해 각 배양물로부터 채취하였다. IFN-감마의 수준을 OptEIA ELISA 키트(BD 바이오사이언시즈)를 사용하여 측정하였다.
상기 결과를 표 6(IFN-g 분비/방출)에 나타낸다. 상기 항-TIM-3 단클론 항체는 T 세포 활성화 및 IFN-감마 분비를 농도 의존적인 방식으로 촉진하였다. 상기 항-TIM3 항체 Tim3_0021, Tim3_0022, Tim3_0028, 및 Tim3_0038은 상기 F38-2E2 항체보다 더 많이 염증성 사이토킨 IFN-감마)의 방출을 감소시킨다. Tim3_0016, Tim3_0016 변이체(Tim3_0018), Tim3_0033 및 Tim3_0038은 상기 F38-2E2 항체에 비해 유사한 방출을 나타내었다. 대조적으로, 상기 아이소타입 대조용 항체를 함유하는 배양물은 IFN-감마 분비에서 증가를 나타내지 않았다.
[표 6a]
Figure pct00015
추가의 실험에서 0.1 ㎍/㎖ 항-PD1 mAb와 함께 하기의 키메릭 및 인간화된 항체(상술한 바와 같이 생성됨)의 EC50 값을 측정하였다: 키메릭 chi_Tim3_018 항체 및 그의 인간화된 버전 Tim3-433 및 Tim3-434, 키메릭 chi_Tim3_028 항체 및 그의 인간화된 버전 Tim3-438 및 Tim3-443을 상이한 림프구 공여자 혼합물(각각 D2 및 D3, 또는 D1 및 D5)에 대해 측정하였다. 결과를 표 6b에 나타낸다.
[표 6b]
Figure pct00016
실시예 6: 항-TIM-3 항체의 TIM-3 발현 세포내로의 내면화
본 명세서에 기재된 TIM-3-특이성 항체를 TIM-3 발현 림프종, 다발성 골수종 및 AML 세포를 포함한 TIM-3-발현 세포내로 내면화시킬 수 있다. 예를 들어, 상기 개시된 TIM-3 특이성 항체 및 그의 단편은 세포 기재 ELISA, 유식 세포측정(FACS) 및 공초점 현미경검사에 의해 평가되는 바와 같이 인간 TIM-3을 안정하게 발현하는 rec TIM3 CHO 세포내로 내면화되는 것으로 나타났다.
예를 들어 안정한 Tim3-형질감염된 CHO-K1 세포(클론 8)(4x104 세포/웰/100 ㎕)를 신선한 배양 배지를 사용하여 98 웰-MTP에 시딩하였다. 밤새 세포 부착 후, 세포 배양 배지를 제거하고 시험 항체를 상기 세포에 가하고(세포 배양 배지 중 10 ㎍/㎖) 4 ℃에서 0.5시간 동안 배양하였다. 참조로서, 상업적인 마우스-항-인간 항체(TIM3 MAB 11E365(US 바이오로지컬(Biological), T5469-92P)를 사용하였다. 세척(세포 배양 배지로 2x) 및 원심분리 후에 세포를 a) 4 ℃ 또는 b) 37 ℃에서 200 ㎕ 세포 배양 배지에서 3시간 동안 배양하였다. 내면화는 전형적으로 37 ℃에서 발생하지만 4 ℃에서는 발생하지 않으며, 이는 상기 반응에 대한 또 다른 대조군을 제공한다. 이어서 세포를 실온(RT)에서 10분 동안 1xPBS 중에서 100 ㎕/웰 0.05% 글루타르알데하이드(시그마 Cat.No: G5882)로 고정시켰다. 이어서 200 ㎕ PBS-T로 3회의 세척 단계를 수행하고 2차 항체 양-항-마우스-POD(양고추냉이 POD 결합된 F(ab')2 단편; GE NA9310))를 RT에서 1시간 동안 가하였다. 최종 세척 단계(3xPBS-T) 후에, TMB 기질을 15분 동안 가하고(로슈 오더 번호 11835033001) 1N HCl을 사용하여 발색을 정지시켰다. 최종 OD를 ELISA 판독기에서 450/620 ㎚에서의 측정에 의해 측정하였다. 상기 세포 ELISA 과정을, 하이브리도마 상등액으로부터 정제된 시험 항체의 내면화 능력 평가 전체를 통해 배지에 대해 사용하였다.
내면화 비율을 하기와 같이 계산하였다:
내면화[%] = (1 - OD샘플 _ 37 ℃/OD샘플 _ 4 ℃) * 100
결과를 도 1a 및 1b(내면화)에 나타낸다. 거의 모든 시험된 항-TIM-3 단클론 항체는 37 ℃에서 3시간 배양 후 안정한 Tim3-형질감염된 CHO-K1 세포내로 유사하게 충분히 내면화되었다(모든 데이터가 도시되지는 않음).
EC50 내면화 값(시간 의존적인)의 측정뿐만 아니라 1가 대 2가에 따른 상기내면화의 동역학의 비교를, 선택된 후보에 대해 FACS에 의해 평가하였다.
간단히 인간 TIM3 안정 발현 CHO-K1 세포를 신선한 배양 배지를 사용하여 98 웰-v 바닥 MTP에 시딩하고(4x105 세포/웰/50 ㎕) RT에서 10분 동안 레디뮨(Redimune)(등록상표) NF 액체와 배양하여 비특이적인 결합을 차단하였다. 이어서 50 ㎕/웰의 선택된 정제된 항-TIM3(세포 배양 배지 중 10 ㎍/㎖)를 가하고 4 ℃에서 1시간 동안 배양하였다. 세척(세포 배양 배지에 의해) 및 원심분리 후에 세포를 a) 4 ℃ 또는 b) 37 ℃에서 200 ㎕ 세포 배양 배지 중에서 0.25, 0.5, 1, 2, 3, 4, 6 및 24 시간 동안 배양하였다. 이어서 세포를 PBS/1% BSA로 세척하고 2차 항체 알렉사 플루오르 488 염소-항-마우스 IgG, F(ab)2를 4 ℃에서 1시간 동안 가하였다. 세척 및 원심분리 후에 125 ㎕의 셀픽스(CellFix)(BD 바이오사이언스, 1:1000)를 가하고 염색된 세포의 MFI 신호를 BD 바이오사이언시즈 FACSCanto 유식 세포계에 의해 분석하였다.
내면화 비율을 하기와 같이 계산하였다:
내면화[%] = (1 - MFI샘플 _ 37 ℃/MFI샘플 _ 4 ℃) * 100
RPMI-8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))상에서 항-TIM3 항체 Tim3_0016, Tim3_0016 변이체(Tim3_0018), Tim3_0021, Tim3_0028, Tim3_0030, Tim3_0033, Tim3_0038의 시간 의존적인 내면화의 평가를 위한 실시예
현재 개시된 항-TIM3 항체는 TIM3 발현 RPMI-8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))내로 높은 수준으로 빠르게 내면화된다. 상기 실험을 huTIM-3을 발현하는 rec CHOK1 세포 대신에 TIM3 발현 RPMI-8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))로 상술한 바와 같이 수행하였다. 결과를 표 7에 나타낸다. TIM3 참조 항체로서 하기의 항체들을 사용하였다: US2012/189617에 기재된 바와 같은 항체 8213, WO2013/06490에 기재된 바와 같은 항체 27.12E12. Tim3_0016, Tim3_0016 변이체(Tim3_0018), Tim3_0038을 인간 IgG1 키메릭 버전으로서 사용하였다.
[표 7]
Figure pct00017
상기 결과로부터 본 발명의 항체는 RPMI-8226 세포(ATCC(등록상표) CCL-155(상표))상에서 참조 항체에 비해 높은 비율로 빠르게 내면화된다.
실시예 7: TIM-3을 발현하는 단리된 인간 단핵세포에 대한 항-TIM-3 항체의 결합
CD14+ 단핵세포를, 피콜-파크(Ficoll-Paque)(GE 헬쓰케어)(사용자 매뉴얼의 일반적인 프로토콜을 참조하거나 www.miltenyibiotec.com/protocols를 방문한다)를 사용하여 밀도 구배 원심분리에 의해 및 CD14 마이크로비즈(MicroBeads)를 통해 후속의 양성 선택에 의해 건강한 공여자의 응고방지된 말초 혈액으로부터 단리하였다. 먼저 상기 CD14+ 세포를 CD14 마이크로비즈로 자기에 의해 표지한다. 이어서 상기 세포 현탁액을 MACS(등록상표) 컬럼(MACS 분리기의 자기장에 놓인)상에 로딩한다. 상기 자기에 의해 표지된 CD14+ 세포를 상기 컬럼에서 유지시킨다. 표지되지 않은 세포는 그대로 통과하며, 상기 세포 분획은 CD14+ 세포가 고갈된다. 상기 자기장으로부터 상기 컬럼의 제거 후에, 상기 자기에 의해 유지된 CD14+ 세포는 상기 양으로 선택된 세포 분획으로서 용출될 수 있다. 실온에서 10분 동안 200xg에서 원심분리 후에, 상기 단핵세포를 수확하고 결합 분석에 직접 사용하거나 동결 배지(10% DMSO, 90% FCS) 중에 1.0E+07 세포/㎖로 재현탁시키고 액체 질소 중에서 보관하였다.
문헌에 나타낸 바와 같이 단핵세포는 그의 표면상에서 TIM3을 구성적으로 발현한다. 1x105 CD14+ 단리된 인간 단핵세포(50 ㎕/웰)를 신선한 배양 배지 중에서 98 웰-v 바닥 MTP에 놓고 레디뮨(등록상표) NF 액체와 RT에서 15분 동안 배양하여 비특이적인 결합을 차단하였다. 이어서 50 ㎕/웰의 개시된 항-TIM3 mAb 또는 참조 항-TIM-3 mAb 344823(R&D) 및 F38-2E2(바이오레전드)(세포 배양 배지에서 10 ㎍/㎖)를 가하고 4 ℃에서 1시간 동안 배양하였다. 이어서 세포를 PBS/1% BSA로 세척하고 2차 항체 PE-표지된 염소-항-마우스 F(ab')2(잭슨 랩 115-006-072)를 4 ℃에서 1시간 동안 가하였다. 세척 및 원심분리 후에 염색된 세포의 MFI 신호를 BD 바이오사이언시즈 FACSCanto 유식 세포계에 의해 분석하였다.
비 결합을 하기와 같이 계산하였다:
비 결합[MFI] = 기하평균 MFI샘플 - 기하평균 MFI아이소타입 대조용
상기 결과를 표 8에 나타낸다: (인간 단핵세포에 대한 결합). TIM3 클론 Tim3_0016, Tim3_0018, Tim3_0020, Tim3_0028 및 Tim3_0038은 상기 참조 항-TIM-3 Ab보다 훨씬 더 양호하게 상이한 공여자의 인간 단핵세포에 결합한다.
[표 8]
Figure pct00018
실시예 8: TIM-3을 발현하는 단리된 시노 단핵세포에 대한 항-TIM-3 항체의 결합
CD14+ 단핵세포를, 피콜-파크(GE 헬쓰케어)(사용자 매뉴얼의 일반적인 프로토콜을 참조하거나 www.miltenyibiotec.com/protocols를 방문한다)를 사용하여 밀도 구배 원심분리에 의해 및 NHP CD14 마이크로비즈를 통해 후속의 양성 선택에 의해 시노몰구스 원숭이의 응고방지된 말초 혈액(코밴스(Covance))으로부터 단리하였다. 먼저 상기 CD14+ 세포를 CD14 마이크로비즈로 자기에 의해 표지한다. 이어서 상기 세포 현탁액을 MACS(등록상표) 컬럼(MACS 분리기의 자기장에 놓인)상에 로딩한다. 상기 자기에 의해 표지된 CD14+ 세포를 상기 컬럼에서 유지시킨다. 표지되지 않은 세포는 그대로 통과하며, 상기 세포 분획은 CD14+ 세포가 고갈된다. 상기 자기장으로부터 상기 컬럼의 제거 후에, 상기 자기에 의해 유지된 CD14+ 세포는 상기 양으로 선택된 세포 분획으로서 용출될 수 있다. 실온에서 10분 동안 200xg에서 원심분리 후에, 상기 단핵세포를 수확하고 결합 분석에 직접 사용하거나 동결 배지(10% DMSO, 90% FCS) 중에 1.0E+07 세포/㎖로 재현탁시키고 액체 질소 중에서 보관하였다.
문헌에 나타낸 바와 같이 단핵세포는 그의 표면상에서 TIM3을 구성적으로 발현한다. 1x105 CD14+ 단리된 시노 단핵세포(50 ㎕/웰)를 신선한 배양 배지 중에서 98 웰-v 바닥 MTP에 놓고 레디뮨(등록상표) NF 액체와 RT에서 15분 동안 배양하여 비특이적인 결합을 차단하였다. 이어서 50 ㎕/웰의 알렉사488 표지된 항-TIM3(세포 배양 배지에서 10 ㎍/㎖)를 가하고 4 ℃에서 1시간 동안 배양하였다. 세척 및 원심분리 후에 염색된 세포의 MFI 신호를 BD 바이오사이언시즈 FACSCanto 유식 세포계에 의해 분석하였다.
비 결합을 하기와 같이 계산하였다:
비 결합[MFI] = 기하평균 MFI샘플 - 기하평균 MFI아이소타입 대조용
상기 결과를 표 9에 나타낸다: (시노 단핵세포에 대한 결합). TIM3 클론 Tim3_0016, Tim3_0018, Tim3_0026, Tim3_0028 및 Tim3_0038은 상이한 시노 공여자의 시노 단핵세포에 결합한다.
[표 9]
Figure pct00019
실시예 9: TIM-3을 발현하는 NHL 및 MM 세포주에 대한 항-TIM-3 항체의 결합
개시된 항-TIM3 항체 및 2개의 항-TIM3 참조 항체 클론 (1) 4177 및 (2) 8213(쿄와(Kyowa))의 결합 능력을 FACS에 의해 분석하였다. 간단히 인간 TIM3 발현 B 세포 림프종 세포(파이퍼 세포로서 예시됨) 및 다발성 골수종 세포(RPMI-8226 세포로서 예시됨)를 BD 인간 Fc 블록과 RT에서 10분 동안 배양하여 비특이적인 결합을 차단하였다. 이어서 2x105 세포(50 ㎕/웰)를 98 웰-v 바닥 MTP에 놓고 50 ㎕/웰의 알렉사488 표지된 항-TIM3(BD 염색 완충제에서 10 ㎍/㎖)를 가하고 4 ℃에서 1시간 동안 배양하였다. 세척 및 원심분리 후에 염색된 세포의 MFI 신호를 BD 바이오사이언시즈 FACSCanto 유식 세포계에 의해 분석하였다.
비 결합을 하기와 같이 계산하였다:
비 결합[MFI] = 기하평균 MFI샘플 - 기하평균 MFI아이소타입 대조용
상기 결과를 도 2a 및 2b에 나타낸다(RPMI-8226 및 파이퍼 세포에 대한 결합).
실시예 10: TIM-3 발현 NHL 및 MM 세포에 대한 항-TIM-3 항체의 세포독성 활성
슈도모나스 외독소(PE 24)와 접합된 TIM3-특이성 항체는 TIM3-발현 세포를 유효하게 살해한다.
개시된 항-TIM3 항체 및 하나의 상업적으로 입수할 수 있는 항-TIM3 참조 항체 클론 11E365(US 바이오로지컬로부터 입수할 수 있다)의 세포독성 활성을 프로메가 셀티터-글로(Promega CellTiter-Glo) 발광 세포 생육력 분석으로 분석하였다. 간단히 인간 TIM-3을 안정하게 발현하는 5x103(98 웰 MTP 중 50 ㎕/웰, 삼중으로)의 재조합 CHO K1 또는 2x104 세포(98 웰 MTP 중 50 ㎕/웰, 삼중으로)의 인간 TIM3 발현 B 세포 림프종 세포(파이퍼 세포로서 예시됨) 또는 다발성 골수종 세포(RPMI-8226 세포로서 예시됨)에, 25 ㎕/웰의 1:5 연속 희석된, 10 ㎍/㎖의 최고 농도를 갖는 개시된 항-TIM-3 항체 또는 처리되지 않은 세포 또는 표적화되지 않은 처리된 세포에 대한 아이소타입 대조용에 적합한 배지를 가하였다. 처리 범위는 삼중으로 10 ㎍/㎖ 내지 1 ng/㎖의 범위이다. 모든 항체를 전장 마우스 Fcγ 버전으로서 사용하였다. 상기 슈도모나스 외독소의 접합을 위해서 PE24와 접합된 마우스 Fcγ 단편 특이성 Fab 단편 10 ㎍/㎖을 가하고 37 ℃에서 3일 동안 배양하였다. 진핵생물에서 공지된 단백질 합성 억제제로서 사이클로헥스이미드를 양성 대조용으로서 사용하였다. 처리된 세포의 생육력을 프로메가 셀티터-글로 발광 세포 생육력 분석으로 측정하였다.
상기 세포독성 활성을 하기와 같이 계산하였다:
상대 억제[%] = (1 - (E샘플 - E음성 대조용)/(E양성 대조용 - E음성 대조용)) * 100
상기 결과를 표 10에 나타낸다(샌드위치 포맷으로 TIM-3 발현 재조합, NHL 및 MM 세포주에 대한 항-TIM3 mAb의 세포독성 활성).
[표 10]
Figure pct00020
모든 시험된 TIM3 클론은 그의 세포독성 활성에 있어서 인간 TIM-3을 안정하게 발현하는 재조합 CHO K1 및 높은 수준 및 보통 수준의 TIM-3을 발현하는 파이퍼 세포에 대해 매우 효능이 있으며(IC50 범위 0.01 - 0.2 nM) 강한 내면화 참조 항-TIM-3 Ab 클론 11E365(US 바이오로지컬)보다 훨씬 더 효능이 있다. TIM3 클론 0016, 0018, 0021, 0022, 0033 및 0038이 또한 재조합 CHO TIM-3 세포에 비해 5배 더 낮은 TIM-3 수준을 발현하는 RPMI-8226 세포에 대해 효능이 있다.
실시예 11: 개시된 항-TIM3 항체 대 2개의 항-TIM3 참조 항체 1.7.E10 및 27-12E12(WO2013/06490에 기재된 바와 같은)의 세포독성 활성의 비교
개시된 항-TIM3 항체 및 2개의 항-TIM3 참조 항체, TIM3 참조 항체 1.7E10 및 27.12E12(WO2013/06490에 기재된 바와 같은)의 세포독성 활성을 상술한 바와 같이 프로메가 셀티터-글로 발광 세포 생육력 분석으로 분석하였다. 모든 항체를 인간 Fc감마 부분을 포함하는 전장 인간 IgG1 포맷으로서 사용하였다. 상기 실험에서 슈도모나스 외독소의 접합을 PE24(10 ㎍/㎖)(첨가되고 37 ℃에서 5일 동안 배양되었다)와 접합된 인간 Fcγ 단편 특이성 Fab를 통해 성취하였다.
상기 결과를 표 11에 나타낸다 - TIM-3 발현 NHL 및 MM 세포주에 대한 항-TIM3 mAb의 세포독성 활성의 비교
[표 11]
Figure pct00021
모든 개시된 TIM3 클론은 그의 세포독성 활성에 있어서 TIM-3을 발현하는 파이퍼 및 RPMI-8226 세포에 대해 매우 활성이며(IC50 범위, 0.02-0.08 nM) 강한 내면화 참조 항-TIM-3 Ab 클론 27-12E12보다 훨씬 더 효능이 있다. 모든 항체를 동일한 조건하에서 동일한 슈도모나스 외독소를 사용하는 슈도모나스 외독소(PE24) 접합체로서 비교하였다.
실시예 12: MM, NHL 및 AML 세포주(TIM3을 발현하지만 PSMA는 발현하지 않는다)에 대한 개시된 항-TIM3 항체의 Fab-PE24 구조물의 세포독성 활성
세포독성 활성을 상술한 바와 같이 프로메가 셀티터-글로 발광 세포 생육력 분석으로 분석하였다. 50 ㎍/㎖의 최고 농도로 PE24에 직접 접합된 개시된 항-TIM-3 항체의 1:5 연속 희석된 Fab-단편 또는 처리되지 않은 세포 또는 표적화되지 않은 처리된 세포에 대한 비-결합 항-PSMA Fab-PE24 대조용에 적합한 배지를, 7.5x103 파이퍼 세포 또는 2x103 RPMI-8226 세포(98 웰 MTP 중의 50 ㎕/웰)와 37 ℃에서 4일 동안 배양하였다. 처리 범위는 삼중으로 50 ㎍/㎖ 내지 8 ng/㎖의 범위이다. 사이클로헥스이미드를 양성 대조용으로서 사용하였다.
상기 결과를 표 12에 나타낸다(MM, NHL 및 AML 세포주에 대한 개시된 항-TIM3 항체의 Fab-PE24 구조물의 세포독성 활성).
[표 12]
Figure pct00022
개시된 항-TIM3 항체의 모든 시험된 Fab-PE24 구조물은 보통 수준의 TIM-3을 발현하는 MM(RPMI-8226) 및 NHL(카르파스-299) 세포에 대해 매우 효능이 있으며(IC50 범위 1-10 nM) 매우 낮은 수준의 TIM-3을 발현하는 AML 세포주(CMK, TF-1, MOLM-13)에 대해 현저한 세포독성 활성을 나타낸다.
실시예 13: 재발된/난치성 환자로부터의 원발성 백혈병 줄기/선조 AML 세포에 대한 개시된 항-TIM3의 면역접합체(슈도모나스 외독소 A 접합체(Fab-PE24 구조물)의 세포독성 활성
재발된/난치성 환자의 말초 혈액으로부터 CD34+ 세포를 올셀즈(AllCells)(LLC, 미국 캘리포니아주 앨러미다 소재)로부터 수득하였다.
[표 13]
Figure pct00023
모든 샘플의 순도 및 생육력의 확인 후에(순도 범위 84-94% 및 생육력 범위 95-99%) TIM-3의 발현 수준을 항-TIM-3 mAb 344823(R&D)을 사용하여 실시예 7에 기재된 바와 같이 FACS에 의해 평가하였다(도 3 참조).
재발된/난치성 환자로부터의 모든 시험된(4/4) 원발성 백혈병 줄기/선조(CD34+) AML 샘플은 상이한 수준에서 TIM-3의 균일한 발현을 입증한다.
원발성 CD34+ AML 세포에 대한 개시된 항-TIM3 클론 0016 및 0022의 Fab-PE24 구조물의 세포독성 활성의 평가를 위해서 1x104 세포(98 웰 MTP 중의 50 ㎕/웰, 삼중으로)를, 50 ㎍/㎖의 최고 농도를 갖는 1:5 연속 희석된 Fab-단편, 또는 처리되지 않은 세포 또는 표적화되지 않은 처리된 세포에 대한 비-결합 항-PSMA Fab-PE24 대조용에 적합한 배지와 37 ℃에서 3일 동안 배양하였다. 사이클로헥스이미드를 양성 대조용으로서 사용하였다. 세포독성 활성을 실시예 12에서 상술한 바와 같이 프로메가 셀티터-글로 발광 세포 생육력 분석으로 분석하였다.
상기 결과를 표 14에 나타낸다(원발성 CD34+ AML 세포에 대한 개시된 항-TIM3 항체의 Fab-PE24 구조물의 세포독성 활성).
[표 14]
Figure pct00024
항-TIM3 항체 Tim3_0016 및 Tim3_0022의 Fab-PE24 구조물은 (2/4) 원발성 AML 샘플(PB0142 및 PB0135)(IC50 범위 30-116 nM)에 대해 매우 효능이 있으며 상이한 수준의 TIM-3을 발현하는 모든 (4/4) 원발성 백혈병 줄기/선조세포(CD34+) AML 세포에 대해 현저한 세포독성 활성을 나타낸다.
실시예 14: NHL 및 MM 세포주에 대한 선택된 항-TIM3 항체의 Fab-PE24 구조물의 효능의 비교
선택된 개시된 항-TIM3 항체의 소르타제 커플링된 Fab-PE24 구조물의 세포독성 활성의 평가를 실시예 12에서 상술한 바와 같이 프로메가 셀티터-글로 발광 세포 생육력 분석으로 분석하였다.
상기 결과를 표 15에 나타낸다(NHL 및 MM 세포에 대한 선택된 항-TIM3 항체의 Fab-PE24 구조물의 세포독성 활성).
[표 15]
Figure pct00025
보통 수준의 TIM-3을 발현하는 NHL(파이퍼) 및 MM(RPMI-8226) 세포에 대한 높은 세포독성 효능이 모든 선택된 개시된 항-TIM3 항체(IC50 범위 0.3-5 nM)의 Fab-PE24 구조물에 의해 입증되었다.
최고의 세포독성 활성이, 개시된 항-TIM3 항체 Tim3_0016 및 Tim3_0038의 Fab-PE24 구조물에 대해 관찰되었다.
실시예 15: 파이퍼 세포에 대한 개시된 항-TIM-3 항체의 동일한 클론의 Fab-PE24 구조물 대 전체-IgG-아마톡신 접합체의 세포독성 활성의 비교
개시된 항-TIM3 클론 0016의 접합된 Fab-PE24 구조물 대 아마톡신과 접합된(WO2012/041504에 기재된 과정에 따라(아마톡신 아미노산 4의 6' C-원자를 통해, 특히 아마톡신 아미노산의 6' C-원자에 결합된 산소 원자를 통해 접합되며, 여기에서 TIM3 항체는 유레아 부분을 통해 링커에 의해 연결된다)) 동일한 클론의 전체 IgG의 세포독성 활성의 평가를 실시예 12에 상술한 바와 같이 프로메가 셀티터-글로 발광 세포 생육력 분석으로 분석하였다.
상기 결과를 표 16에 나타낸다(NHL 세포에 대한 항-TIM3 클론 0016의 Fab-PE24 구조물 대 전체 IgG-아마톡신 접합체의 세포독성 활성).
[표 16]
Figure pct00026
아마니틴-접합된 항-TIM-3 클론 0016(IC50 0.8 nM)의 세포독성 활성은 보통 수준의 TIM-3을 발현하는 NHL(파이퍼) 세포에 대한 동일 클론(IC50 0.3 nM)의 Fab-PE24 구조물의 세포독성 활성에 필적한다.
실시예 16: 상이한 말초 혈액 단핵세포(PBMC)에 대한 TIM3 항체의 결합의 직접적인 비교
결합 분석
새로 단리된 PBMC 또는 3일 다클론 활성화된(플레이트 결합된 항-CD3 및 용해성 항-CD28 항체, 각각 1 ug/㎖, 모두 BD 파밍겐(Pharmingen)으로부터) CD4 T 세포를, 4 ℃에서 1시간 동안 알렉사 647-직접 접합된 항-TIM-항체 Tim3_0018, Tim3_0028 또는 그의 키메라화된 또는 인간화된 버전으로 염색하였다. 이어서 상기 세포들을 세척하여 결합되지 않은 항체를 제거하고 표면 마커를 4 ℃에서 30분 동안 염색하여, BD 셀 픽스(Cell Fix)로 고정시키기 전에 단핵세포(CD14+(BD 파밍겐)), NK 세포(CD16+(e바이오사이언스)), CD56+(바이오레전드) 및 CD3-) 및 T 세포(CD3+(e바이오사이언스))를 구별하였다.
결과를 도 4a 내지 4d에 나타낸다(도면에서 하기의 명칭들이 사용되었다: Tim3-0018의 경우: 0018(aTIM-3), 인간화된 Tim3-0018 버전 Tim3-0434의 경우: 0434(h0018), Tim3-0028의 경우: 0028 (aTIM-3), 키메릭 Tim3-0028의 경우: chi0028, 인간화된 Tim3-0028 버전 Tim3-0438의 경우: 0438(h0028)). 상기 데이터는 상기 인간화된 항체들이 모 항체들과 비교시 CD4 T 세포에 대해 개선된 결합 및 결합 특이성을 가짐을 나타낸다.
SEQUENCE LISTING <110> F. Hoffmann-La Roche AG <120> ANTI-TIM3 ANTIBODIES AND METHODS OF USE <130> 32411 <140> PCT/EP2015/075820 <141> 2015-11-05 <150> EP14192175.9 <151> 2014-11-06 <150> EP15188056.4 <151> 2015-10-02 <160> 86 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 9 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 1 Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser Gly Met 1 5 <210> 2 <211> 3 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 2 Leu Asn Asp 1 <210> 3 <211> 8 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 3 Asn Gly Tyr Leu Tyr Ala Leu Asp 1 5 <210> 4 <211> 6 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 4 Ser Ser Ser Val Asn Tyr 1 5 <210> 5 <211> 3 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 5 Asp Ala Phe 1 <210> 6 <211> 7 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 6 Trp Ser Ser Tyr Pro Trp Thr 1 5 <210> 7 <211> 120 <212> PRT <213> Mus musculus <400> 7 Gln Val Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Gly Ile Leu Gln Pro Ser Gln 1 5 10 15 Thr Leu Arg Leu Thr Cys Ser Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser 20 25 30 Gly Met Ser Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Ser Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His 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Glu 165 170 175 Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu 180 185 190 His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn 195 200 205 Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly 210 215 220 Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu 225 230 235 240 Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr 245 250 255 Pro Ser Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn 260 265 270 Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe 275 280 285 Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn 290 295 300 Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr 305 310 315 320 Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys 325 330 <210> 74 <211> 330 <212> PRT <213> homo sapiens <400> 74 Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys 1 5 10 15 Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr 20 25 30 Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser 35 40 45 Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser 50 55 60 Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr 65 70 75 80 Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys 85 90 95 Lys Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys 100 105 110 Pro Ala Pro Glu Ala Ala Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro 115 120 125 Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys 130 135 140 Val Val Val Asp Val Ser His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp 145 150 155 160 Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu 165 170 175 Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu 180 185 190 His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn 195 200 205 Lys Ala Leu Pro Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly 210 215 220 Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Asp Glu 225 230 235 240 Leu Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys 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330 <210> 76 <211> 327 <212> PRT <213> Homo Sapiens <400> 76 Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Cys Ser Arg 1 5 10 15 Ser Thr Ser Glu Ser Thr Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr 20 25 30 Phe Pro Glu Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser 35 40 45 Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser 50 55 60 Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Lys Thr 65 70 75 80 Tyr Thr Cys Asn Val Asp His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys 85 90 95 Arg Val Glu Ser Lys Tyr Gly Pro Pro Cys Pro Ser Cys Pro Ala Pro 100 105 110 Glu Phe Leu Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys 115 120 125 Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val 130 135 140 Asp Val Ser Gln Glu Asp Pro Glu Val Gln Phe Asn Trp Tyr Val Asp 145 150 155 160 Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Phe 165 170 175 Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp 180 185 190 Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Gly Leu 195 200 205 Pro Ser Ser Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg 210 215 220 Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Gln Glu Glu Met Thr Lys 225 230 235 240 Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Ser Asp 245 250 255 Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys 260 265 270 Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser 275 280 285 Arg Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Glu Gly Asn Val Phe Ser 290 295 300 Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser 305 310 315 320 Leu Ser Leu Ser Leu Gly Lys 325 <210> 77 <211> 280 <212> PRT <213> homo sapiens <400> 77 Ser Glu Val Glu Tyr Arg Ala Glu Val Gly Gln Asn Ala Tyr Leu Pro 1 5 10 15 Cys Phe Tyr Thr Pro Ala Ala Pro Gly Asn Leu Val Pro Val Cys Trp 20 25 30 Gly Lys Gly Ala Cys Pro Val Phe Glu Cys Gly Asn Val Val Leu Arg 35 40 45 Thr Asp Glu Arg Asp Val Asn Tyr Trp Thr Ser Arg Tyr Trp Leu Asn 50 55 60 Gly Asp Phe Arg Lys Gly Asp Val Ser Leu Thr Ile Glu Asn Val Thr 65 70 75 80 Leu Ala Asp Ser Gly Ile Tyr Cys Cys Arg Ile Gln Ile Pro Gly Ile 85 90 95 Met Asn Asp Glu Lys Phe Asn Leu Lys Leu Val Ile Lys Pro Ala Lys 100 105 110 Val Thr Pro Ala Pro Thr Arg Gln Arg Asp Phe Thr Ala Ala Phe Pro 115 120 125 Arg Met Leu Thr Thr Arg Gly His Gly Pro Ala Glu Thr Gln Thr Leu 130 135 140 Gly Ser Leu Pro Asp Ile Asn Leu Thr Gln Ile Ser Thr Leu Ala Asn 145 150 155 160 Glu Leu Arg Asp Ser Arg Leu Ala Asn Asp Leu Arg Asp Ser Gly Ala 165 170 175 Thr Ile Arg Ile Gly Ile Tyr Ile Gly Ala Gly Ile Cys Ala Gly Leu 180 185 190 Ala Leu Ala Leu Ile Phe Gly Ala Leu Ile Phe Lys Trp Tyr Ser His 195 200 205 Ser Lys Glu Lys Ile Gln Asn Leu Ser Leu Ile Ser Leu Ala Asn Leu 210 215 220 Pro Pro Ser Gly Leu Ala Asn Ala Val Ala Glu Gly Ile Arg Ser Glu 225 230 235 240 Glu Asn Ile Tyr Thr Ile Glu Glu Asn Val Tyr Glu Val Glu Glu Pro 245 250 255 Asn Glu Tyr Tyr Cys Tyr Val Ser Ser Arg Gln Gln Pro Ser Gln Pro 260 265 270 Leu Gly Cys Arg Phe Ala Met Pro 275 280 <210> 78 <211> 181 <212> PRT <213> homo sapiens <400> 78 Ser Glu Val Glu Tyr Arg Ala Glu Val Gly Gln Asn Ala Tyr Leu Pro 1 5 10 15 Cys Phe Tyr Thr Pro Ala Ala Pro Gly Asn Leu Val Pro Val Cys Trp 20 25 30 Gly Lys Gly Ala Cys Pro Val Phe Glu Cys Gly Asn Val Val Leu Arg 35 40 45 Thr Asp Glu Arg Asp Val Asn Tyr Trp Thr Ser Arg Tyr Trp Leu Asn 50 55 60 Gly Asp Phe Arg Lys Gly Asp Val Ser Leu Thr Ile Glu Asn Val Thr 65 70 75 80 Leu Ala Asp Ser Gly Ile Tyr Cys Cys Arg Ile Gln Ile Pro Gly Ile 85 90 95 Met Asn Asp Glu Lys Phe Asn Leu Lys Leu Val Ile Lys Pro Ala Lys 100 105 110 Val Thr Pro Ala Pro Thr Arg Gln Arg Asp Phe Thr Ala Ala Phe Pro 115 120 125 Arg Met Leu Thr Thr Arg Gly His Gly Pro Ala Glu Thr Gln Thr Leu 130 135 140 Gly Ser Leu Pro Asp Ile Asn Leu Thr Gln Ile Ser Thr Leu Ala Asn 145 150 155 160 Glu Leu Arg Asp Ser Arg Leu Ala Asn Asp Leu Arg Asp Ser Gly Ala 165 170 175 Thr Ile Arg Ile Gly 180 <210> 79 <211> 120 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> VH humanized version of Tim3_0016 variant (0018) (= Tim3-0433) <400> 79 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser 20 25 30 Gly Met Ser Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Leu Asn Asp Asp Val Phe Phe Asn Pro Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Thr Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 95 Cys Val Arg Ala Asn Gly Tyr Leu Tyr Ala Leu Asp Tyr Trp Gly Gln 100 105 110 Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 115 120 <210> 80 <211> 106 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> VL humanized version of Tim3_0016 variant (0018) (= Tim3-0433) <400> 80 Glu Thr Thr Leu Thr Gln Ser Pro Ala Phe Met Ser Ala Thr Pro Gly 1 5 10 15 Asp Lys Val Asn Ile Ala Cys Ser Ala Ser Ser Ser Val Ser Tyr Thr 20 25 30 Gln Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Glu Ala Pro Lys Leu Trp Ile Tyr 35 40 45 Asp Ala Phe Lys Leu Ala Pro Gly Ile Pro Pro Arg Phe Ser Gly Ser 50 55 60 Gly Tyr Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Asn Asn Ile Glu Ser Glu 65 70 75 80 Asp Ala Ala Tyr Tyr Phe Cys His Gln Trp Ser Ser Tyr Pro Trp Thr 85 90 95 Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys 100 105 <210> 81 <211> 120 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> VH humanized version of Tim3_0016 variant (0018) (= Tim3-0434) <400> 81 Gln Ile Thr Leu Lys Glu Ser Gly Pro Thr Leu Val Lys Pro Thr Gln 1 5 10 15 Thr Leu Thr Leu Thr Cys Thr Phe Ser Gly Phe Ser Leu Ser Thr Ser 20 25 30 Gly Met Ser Val Gly Trp Ile Arg Gln Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu 35 40 45 Trp Leu Ala His Ile Trp Leu Asn Asp Asp Val Phe Phe Asn Pro Ala 50 55 60 Leu Lys Ser Arg Leu Thr Ile Thr Lys Asp Thr Ser Lys Asn Gln Val 65 70 75 80 Val Leu Thr Met Thr Asn Met Asp Pro Val Asp Thr Ala Thr Tyr Tyr 85 90 95 Cys Val Arg Ala Asn Gly Tyr Leu Tyr Ala Leu Asp Tyr Trp Gly Gln 100 105 110 Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 115 120 <210> 82 <211> 106 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> VL humanized version of Tim3_0016 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65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Val Arg Asp Phe Gly Tyr Val Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly 100 105 110 Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 115 <210> 84 <211> 107 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> VL humanized version of Tim3-0028 (= Tim3-0438) <400> 84 Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly 1 5 10 15 Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Asp Asn Tyr 20 25 30 Val Ala Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Gln Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Ile Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala 65 70 75 80 Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Gln Gln His Tyr Ser Ser Pro Tyr 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105 <210> 85 <211> 119 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> VH humanized version of Tim3-0028 (= Tim3-0443) <400> 85 Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly 1 5 10 15 Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Asn Ile Lys Thr Thr 20 25 30 Tyr Met His Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45 Gly Arg Ile Asp Pro Ala Asp Asp Asn Thr Lys Tyr Ala Pro Lys Phe 50 55 60 Gln Gly Lys Ala Thr Ile Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr 65 70 75 80 Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95 Val Arg Asp Phe Gly Tyr Val Ala Trp Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly 100 105 110 Thr Leu Val Thr Phe Ser Ser 115 <210> 86 <211> 107 <212> PRT <213> Artificial <220> <223> VL humanized version of Tim3-0028 (= Tim3-0443) <400> 86 Asp Ile Val Met Thr Gln Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly 1 5 10 15 Glu Pro Ala Ser Ile Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Val Asp Asn Tyr 20 25 30 Val Ala Trp Tyr Leu Gln Lys Pro Gly Gln Ser Pro Gln Leu Leu Ile 35 40 45 Tyr Tyr Ala Ser Asn Arg Tyr Ile Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly 50 55 60 Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Lys Ile Ser Arg Val Glu Ala 65 70 75 80 Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys Gln Gln His Tyr Ser Ser Pro Tyr 85 90 95 Thr Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys 100 105

Claims (27)

  1. TIM3에 결합하는 단리된 항체로서,
    ·37 ℃에서 120분 후에 45% 이상의 TIM3의 내면화(RPMI8226 세포(ATCC CCL-155)를 발현하는 TIM3상에서의 FACS 분석에서)를 유도하는 항체.
  2. 제 1 항에 있어서,
    ·서열번호 7의 VH 및 서열번호 8의 VL을 포함하는 항-Tim3 항체와 TIM3에의 결합에 대해 경쟁하고
    ·인간 및 시노몰구스 TIM3에 결합하고
    ·면역접합체로서 TIM3 발현 세포상에서 세포독성 활성을 나타내고
    ·인터페론-감마 방출을 유도하는
    항-TIM3 항체.
  3. 제 1 항에 있어서,
    인간, 인간화된 또는 키메릭 항체인 항체.
  4. 제 1 항에 있어서,
    TIM3에 결합하는 항체 단편인 항체.
  5. 제 4 항에 있어서,
    Fab 단편인 항체 단편.
  6. 제 1 항 내지 제 5 항 중 어느 한 항에 있어서,
    A) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 4의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
    B) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 11의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
    C) (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
    D) (a) (i) 서열번호 13의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 14의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 15 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 16의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 17의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 18의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
    E) (a) (i) 서열번호 21의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 22의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 23 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 24의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 25의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 26의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
    F) (a) (i) 서열번호 29의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 30의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 31 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 32의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 33의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 34의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
    G) (a) (i) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 39 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
    H) (a) (i) 서열번호 45의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 46의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 47 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 48의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 49의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 50의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
    I) (a) (i) 서열번호 53의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 54의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 55 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 56의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 57의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 58의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인; 또는
    J) (a) (i) 서열번호 61의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 62의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 63 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 64의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 65의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 66의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인
    을 포함하는 항-TIM3 항체.
  7. 인간 TIM3에 결합하는 단리된 항체로서, (a) (i) 서열번호 1의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 2의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 3 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 12의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 5의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 6의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함하는 항체.
  8. 제 7 항에 있어서,
    i) 서열번호 79의 VH 서열 및 서열번호 80의 VL 서열, 또는
    ii) 서열번호 81의 VH 서열 및 서열번호 82의 VL 서열
    을 포함하는 항체.
  9. 제 7 항에 있어서,
    서열번호 79의 VH 서열 및 서열번호 80의 VL 서열을 포함하는 항체.
  10. 제 7 항에 있어서,
    서열번호 81의 VH 서열 및 서열번호 82의 VL 서열을 포함하는 항체.
  11. 인간 TIM3에 결합하는 단리된 항체로서, (a) (i) 서열번호 37의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H1, (ii) 서열번호 38의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H2, 및 (iii) 서열번호 39 중에서 선택된 아미노산 서열을 포함하는 HVR-H3을 포함하는 VH 도메인; 및 (b) (i) 서열번호 40의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L1; (ii) 서열번호 41의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L2 및 (iii) 서열번호 42의 아미노산 서열을 포함하는 HVR-L3을 포함하는 VL 도메인을 포함하는 항체.
  12. 제 11 항에 있어서,
    i) 서열번호 83의 VH 서열 및 서열번호 84의 VL 서열, 또는
    ii) 서열번호 85의 VH 서열 및 서열번호 86의 VL 서열
    을 포함하는 항체.
  13. 제 11 항에 있어서,
    서열번호 83의 VH 서열 및 서열번호 84의 VL 서열을 포함하는 항체.
  14. 제 11 항에 있어서,
    서열번호 85의 VH 서열 및 서열번호 86의 VL 서열을 포함하는 항체.
  15. 제 1 항 내지 제 14 항 중 어느 한 항에 있어서,
    전장 IgG1 항체인 항체.
  16. 제 1 항 내지 제 15 항 중 어느 한 항에 있어서,
    돌연변이 L234A, L235A 및 P329G(카밧의 EU 색인에 따른 넘버링)를 갖는 전장 IgG1 항체인 항체.
  17. 제 1 항 내지 제 16 항 중 어느 한 항에 따른 항체를 암호화하는 단리된 핵산.
  18. 제 17 항에 따른 핵산을 포함하는 숙주 세포.
  19. 항체가 생성되도록 제 18 항에 따른 숙주 세포를 배양시킴을 포함하는, 항체의 생성 방법.
  20. 제 31 항에 있어서,
    숙주 세포로부터 항체를 회수함을 또한 포함하는 방법.
  21. 제 1 항 내지 제 16 항 중 어느 한 항에 따른 항체 및 세포독성제를 포함하는 면역접합체.
  22. 제 1 항 내지 제 16 항 중 어느 한 항에 따른 항체 또는 제 21 항의 면역접합체 및 약학적으로 허용 가능한 담체를 포함하는 약학 제형.
  23. 약제로서 사용하기 위한 제 1 항 내지 제 16 항 중 어느 한 항에 따른 항체 또는 제 21 항에 따른 면역접합체.
  24. 암 치료에 사용하기 위한 제 1 항 내지 제 16 항 중 어느 한 항에 따른 항체 또는 제 21 항에 따른 면역접합체.
  25. 약제의 제조에 사용하기 위한 제 1 항 내지 제 16 항 중 어느 한 항에 따른 항체 또는 제 21 항에 따른 면역접합체의 용도.
  26. 제 25 항에 있어서,
    약제가 암 치료용인 용도.
  27. 암에 걸린 개인에게 유효량의 제 1 항에 따른 항체 또는 제 21 항에 따른 면역접합체를 투여함을 포함하는 상기 개인의 치료 방법.
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