KR20030032940A

KR20030032940A - 신규 화합물

Info

Publication number: KR20030032940A
Application number: KR1020027014463A
Authority: KR
Inventors: 판카 아가왈; 폴 알. 머독; 사피아 케이. 리즈비; 란달 에프. 스미쓰; 자오잉 시앙; 카렌 에스. 카브닉; 잉-타 라이; 칭 시에
Original assignee: 스미스클라인 비참 코포레이션; 스미스클라인비이참피이엘시이
Priority date: 2000-04-27
Filing date: 2001-04-26
Publication date: 2003-04-26
Also published as: EP1276755A4; CA2407449A1; NO20025151L; AU2001257265A1; CZ20023548A3; HUP0300595A3; NO20025151D0; EP1276755A1; BR0110402A; CN1439017A; MXPA02010692A; HUP0300595A2; WO2001081363A1; IL152416A0; PL358580A1; JP2003530869A; HK1053840A1

Abstract

본 발명에는 표 1에 기재된 유전자의 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드, 및 재조합 기술에 의해 그러한 폴리펩티드를 생산하는 방법이 개시되어 있다. 또한, 표 1에 기재된 유전자들의 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드를 진단 분석법에 이용하는 방법도 개시되어 있다.

Description

신규 화합물 {Novel Compounds}

약물 개발 과정은 현재 "기능 유전체학 (functional genomics)", 즉 대용량 처리가 가능한 게놈 또는 유전자를 주축으로 한 생물학 (genome- and gene-based biology)을 받아들이면서 근본적인 진화를 거치고 있다. 치료 표적인 유전자 및 유전자 산물을 확인하기 위한 수단으로서의 이러한 접근법은 "위치 클로닝 (positional cloning)"을 토대로 한 초기의 접근법을 빠르게 대체해 가고 있다. 표현형, 즉 생물학적 기능 또는 유전자 질환이 확인되면, 유전자 맵의 위치를 토대로 관련 유전자를 역으로 추적할 수 있다.

기능 유전체학은 현재 입수 가능한 다수의 분자생물학 데이타베이스로부터잠재적으로 흥미있는 유전자 서열을 확인하기 위해, 주로 대용량 DNA 서열분석 기술 및 생물정보학 (bioinformatics)의 다양한 도구에 의존하고 있다. 약물 개발을 위한 표적으로서 또다른 유전자 및 이들의 관련 폴리펩티드/단백질을 확인하고 특성화할 필요성이 지속적으로 존재하고 있다.

자연적으로 혈액, 림프 및 기타 체액에 분비되거나, 또는 세포막에 분비되는 단백질 및 폴리펩티드는 제약적 연구 및 개발에 1차적으로 흥미있는 것이다. 그 이유는 단백질 치료제를 그의 작용 부위 (체액 또는 세포막)를 향해 전달하기가 비교적 용이하기 때문이다. 단백질을 세포외 공간으로 분비하는 천연 경로는 진핵생물의 소포체 및 원핵생물의 내막이다 (Palade, 1975, Science 189, 347; Milstein, Brownlee, Harrison, and Mathews, 1972, Nature New Biol., 239, 117; Blobel, and Dobberstein, 1975, J. Cell, Biol., 67, 835). 한편, 세포의 외부에서 사이토졸 (cytosol) 내로 단백질을 수송하는 천연 경로는 (음세포 작용, 뱀의 독을 세포 내로 침입시키는 메카니즘을 제외하고는) 알려져 있지 않다. 따라서, 세포 내로 단백질 치료제를 표적화하는 것은 매우 어렵다.

분비 및 막결합 단백질에는 모든 펩티드 호르몬 및 이들의 수용체 (인슐린, 성장 호르몬, 케모카인, 사이토카인, 신경펩티드, 인테그린, 칼리크레인, 라민, 멜라닌, 나트륨뇨 호르몬, 뉴롭신, 뉴로트롭신, 뇌하수체 호르몬, 플레이오트로핀, 프로스타글란딘, 세크레토그라닌, 셀렉틴, 트롬보글로불린, 티모신 등이 포함됨), 유방암 및 결장암 유전자 산물, 렙틴, 비만 유전자 단백질 및 그의 수용체, 혈청 알부민, 수퍼옥사이드 디스뮤타아제, 스플라이세오좀 단백질, 7TM (막횡단) 단백질(또한, G-단백질 결합 수용체라고도 불리움), 면역글로불린, 여러 족의 세린 단백질 분해효소 (혈액 응고 연쇄과정의 단백질들, 소화 효소 등이 포함됨), 데오시리보뉴클레아제 Ⅰ 등이 포함되지만, 이에 한정되지는 않는다.

분비 또는 막결합 단백질에 기초한 치료제는 FDA 또는 외국 기관에 의해 승인되었으며, 그 예로는 인슐린, 글루카곤, 성장 호르몬, 융모성 성선자극 호르몬, 여포 자극 호르몬, 황체 호르몬, 칼시토닌, 부신피질 자극 호르몬 (ACTH), 바소프레신, 인터루킨, 인터페론, 면역글로불린, 락토페린 (여러 회사에서 시판하는 다양한 제품), 조직형 플라즈미노겐 활성 인자 (Genentech에 의한 알테플라스 (Alteplase)), 히알루로니다제 (Wyeth-Ayerst에 의한 와이다제 (Wydase)), 도르나제 알파 (Genentech에 의한 풀모자임 (Pulmozyme)), 키모디악틴 (Chymodiactin; Knoll에 의한 키모파파인), 알글루세라제 (alglucerase; Genzyme에 의한 세레다제 (Ceredase)), 스트렙토키나아제 (Pharmacia에 의한 카비키나아제 (Kabikinase)) (Astra에 의한 스트렙타제 (Streptase)) 등이 포함되지만, 이에 한정되는 것은 아니다. 이는 분비 및 막결합 단백질들이 치료 표적으로서 확립되고 증명된 역사를 갖는다는 것을 나타낸다. 분명히, 당뇨병, 유방암, 전립선암, 결장암 및 기타 악성 종양, 고혈압 및 저혈압, 비만, 대식증, 거식증, 성장 이상, 천식, 조울증, 치매, 망상증, 정신 지체, 헌팅톤 질환, 뚜렛 (Tourette) 증후군, 정신분열증, 성장 장애, 정신 장애, 성발달 장애, 혈액 연쇄과정 시스템 기능장애 (뇌졸중을 유발하는 것 포함) 등을 비롯한 기능부전 또는 질환을 예방하고 경감시키며 교정하는 작용을 할 수 있는 또다른 분비 및 막결합 단백질을 확인하고 특성화할 필요가 있다.또한, 신호 서열을 포함하는 본 발명의 단백질은 현재 완전히 이해되지 않은 단백질 수송 메카니즘을 추가로 밝혀내는데 유용할 수 있으며, 따라서 연구 도구로서 사용될 수도 있다.

<발명의 개요>

본 발명은 재조합 물질을 비롯하여 표 1에 기재된 유전자들의 특정 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드에 관한 것이며, 또한 그들의 제조 방법에 관한 것이다. 그러한 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드는 표 3 및 5에 기재된 질환들 (이하 "본 발명의 질환"으로 언급함)을 포함하나 이에 한정되지는 않는 특정 질환의 치료 방법과 관련하여 흥미있는 것이다. 다른 측면에서, 본 발명은 본 발명에 의해 제공된 물질을 이용하여 작용제 및 길항제 (예를 들어, 억제제)를 확인하는 방법, 및 표 1에 기재된 유전자들의 폴리펩티드 및(또는) 폴리뉴클레오티드의 불균형과 관련된 증상을 상기 확인된 화합물로 치료하는 것에 관한 것이다. 또다른 측면에서, 본 발명은 표 1에 기재된 유전자들의 부적절한 활성 또는 농도와 관련된 질환들을 검출하는 진단 분석법에 관한 것이다. 본 발명의 다른 측면은 서열목록에 기재된 임의의 뉴클레오티드 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드, 및 상기 뉴클레오티드 서열에 의해 코딩되는 폴리펩티드를 포함하는 폴리펩티드에 관한 것이다. 다른 측면에서, 본 발명은 서열목록에 기재된 임의의 폴리펩티드 서열을 포함하는 폴리펩티드, 및 그의 재조합 물질 및 재조합 생산 방법에 관한 것이다. 본 발명의 다른 측면은 그러한 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드의 이용 방법에 관한 것이다. 그러한 용도에는 본 발명 유전자들의 비정상적인 발현, 생산, 기능 및(또는) 대사에서 기인한 질환, 이상 및 장애 (이하 질환으로 약칭함)의 치료가 포함되며, 그러한 질환은 첨부된 서열 각각에 대해 개시된 다른 단백질과의 상동성으로부터 당업자들에 의해 쉽게 분명해질 것이다. 또다른 측면에서, 본 발명은 본 발명에 의해 제공된 재료를 이용하여 작용제 및 길항제를 확인하는 방법, 및 상기 확인된 화합물을 사용한 불균형과 관련된 증상의 치료에 관한 것이다. 본 발명이 또다른 측면은 본 발명 분비 단백질의 부적절한 활성 또는 농도와 관련된 질환들을 검출하는 진단 분석법에 관한 것이다.

본 발명은 새로이 확인된 폴리펩티드 및 이 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드에 관한 것이며, 또한 진단에 있어서 및 치료상 잠재적으로 유용한 작용제 또는 길항제일 수 있는 화합물을 확인함에 있어서 이들의 용도, 및 그러한 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드의 제조에 관한 것이다. 또한, 본 발명의 폴리뉴클레오티드 및 폴리펩티드는, 이들이 세포 외부로 분비되거나 막에 결합되도록 하는 신호 서열을 갖는 단백질 (이하, 대체로 분비 단백질 또는 분비 폴리펩티드로 총칭함)과 관련성이 있다.

제1 측면에서, 본 발명은 표 1에 기재된 유전자들의 폴리펩티드에 관한 것이다. 그러한 폴리펩티드에는

(a) 서열목록에 기재된 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드에 의해 코딩되는 단리된 폴리펩티드 (여기서, 서열목록의 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드를 언급하는 경우, 서열목록에 언급된 서열의 목록 참조),

(b) 서열목록에 기재된 폴리펩티드 서열과 95％ 이상, 96％ 이상, 97％ 이상, 98％ 이상 또는 99％ 이상의 동일성을 갖는 폴리펩티드 서열을 포함하는 단리된 폴리펩티드,

(c) 서열목록에 기재된 폴리펩티드 서열을 포함하는 단리된 폴리펩티드,

(d) 서열목록에 기재된 폴리펩티드 서열과 95％ 이상, 96％ 이상, 97％ 이상, 98％ 이상 또는 99％ 이상의 동일성을 갖는 단리된 폴리펩티드,

(e) 서열목록에 기재된 폴리펩티드 서열,

(f) 서열목록에 기재된 폴리펩티드 서열과 비교시 0.95, 0.96, 0.97, 0.98 또는 0.99의 동일성 지수를 갖는 폴리펩티드 서열을 갖거나 포함하는 단리된 폴리펩티드, 및

(g) 상기 (a) 내지 (f)에 기재된 폴리펩티드의 단편 및 변이체가 포함된다.

본 발명의 폴리펩티드는 표 2에 기재된 유전자 족의 구성원일 것으로 생각된다. 따라서, 이들은 표 3 및 5에 기재된 이유로 치료 및 진단상 흥미있다. 표 1에 기재된 유전자들의 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드의 생물학적 특징은 이하에 표 1에 기재된 유전자들의 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드의 "생물학적 특징"으로 언급된다. 바람직하게는, 본 발명의 폴리펩티드가 표 1에 기재된 유전자들의 생물학적 특징 중 하나 이상을 나타낸다.

또한, 본 발명의 폴리펩티드는 대립유전자 형태 및 스플라이스 (splice) 변이체를 비롯한 상기 언급한 폴리펩티드의 변이체를 포함한다. 그러한 폴리펩티드는 삽입, 결실, 및 보존적이거나 비보존적일 수 있는 치환에 의해, 또는 상기의 임의 조합에 의해 기준 폴리펩티드와 다르다. 특히 바람직한 변이체는 몇몇 아미노산, 예를 들어 50 내지 30개, 30 내지 20개, 20 내지 10개, 10 내지 5개, 5 내지 3개, 3 내지 2개, 2 내지 1개 또는 1개의 아미노산이 임의 조합으로 삽입, 치환 또는 결실된 것이다.

본 발명 펩티드의 바람직한 단편에는 서열목록에 기재된 아미노산 서열로부터의 인접 아미노산 30개 이상, 50개 이상 또는 100개 이상을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 폴리펩티드, 또는 서열목록에 기재된 아미노산 서열로부터 말단이 잘리거나 결실된 인접 아미노산 30개 이상, 50개 이상 또는 100개 이상을 갖는 아미노산 서열을 포함하는 단리된 폴리펩티드가 포함된다. 바람직한 단편은 유사한 활성 또는 개선된 활성을 지닌 단편, 또는 원치않는 활성이 감소된 단편을 비롯하여 표 1에 기재된 유전자들의 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드의 생물학적 활성을 매개하는 생물학적 활성 단편이다. 또한, 동물, 특히 인간에 있어서 항원성 또는 면역원성인 단편이 바람직하다.

본 발명 폴리펩티드의 단편은 펩티드 합성에 의해 상응하는 전장 폴리펩티드를 생성하는 데 사용될 수 있다. 따라서, 이들 변이체는 본 발명의 전장 폴리펩티드를 생성하기 위한 중간체로서 사용될 수 있다. 본 발명의 폴리펩티드는 "성숙" 단백질의 형태일 수도 있고, 또는 전구체 또는 융합 단백질과 같이 보다 큰 단백질의 일부일 수도 있다. 대체로, 분비 또는 리더 서열, 프로-서열, 정제를 보조하는 서열 (예들 들어, 다수의 히스티딘 잔기), 또는 재조합 생산시 안정성을 위한 부가 서열을 함유하는 부가의 아미노산 서열을 포함하는 것이 유리하다.

본 발명의 폴리펩티드는 임의의 적합한 방법, 예를 들어 자연발생 공급원으로부터의 단리에 의해, 발현 시스템 (하기 참조)을 포함하는 유전공학적 숙주 세포로부터의 단리에 의해, 또는 자동화 펩티드 합성기 등을 이용한 화학 합성에 의해, 또는 그러한 방법들의 조합에 의해 제조될 수 있다. 그러한 폴리펩티드의 제조 방법은 당업계에 잘 알려져 있다.

다른 측면에서, 본 발명은 표 1에 기재된 유전자들의 폴리뉴클레오티드에 관한 것이다. 그러한 폴리뉴클레오티드에는

(a) 서열목록에 기재된 폴리뉴클레오티드 서열과 95％ 이상, 96％ 이상, 97％ 이상, 98％ 이상 또는 99％ 이상의 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리된 폴리뉴클레오티드,

(b) 서열목록에 기재된 폴리뉴클레오티드를 포함하는 단리된 폴리뉴클레오티드,

(c) 서열목록에 기재된 폴리뉴클레오티드와 95％ 이상, 96％ 이상, 97％ 이상, 98％ 이상 또는 99％ 이상의 동일성을 갖는 단리된 폴리뉴클레오티드,

(d) 서열목록에 기재된 단리된 폴리뉴클레오티드,

(e) 서열목록에 기재된 폴리펩티드 서열과 95％ 이상, 96％ 이상, 97％ 이상, 98％ 이상 또는 99％ 이상의 동일성을 갖는 폴리펩티드 서열을 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리된 폴리뉴클레오티드,

(f) 서열목록에 기재된 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리된 폴리뉴클레오티드,

(g) 서열목록에 기재된 폴리펩티드 서열과 95％ 이상, 96％ 이상, 97％ 이상, 98％ 이상 또는 99％ 이상의 동일성을 갖는 폴리펩티드 서열을 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열을 갖는 단리된 폴리뉴클레오티드,

(h) 서열목록에 기재된 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오티드,

(i) 서열목록에 기재된 폴리뉴클레오티드 서열과 비교시 0.95, 0.96, 0.97, 0.98 또는 0.99의 동일성 지수를 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 갖거나 포함하는 단리된 폴리뉴클레오티드,

(j) 서열목록에 기재된 폴리펩티드 서열과 비교시 0.95, 0.96, 0.97, 0.98 또는 0.99의 동일성 지수를 갖는 폴리펩티드 서열을 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열을 갖거나 포함하는 단리된 폴리뉴클레오티드, 및

상기 언급한 폴리뉴클레오티드의 단편 및 변이체인 폴리뉴클레오티드, 또는 전체 길이에 걸쳐 상기 언급한 폴리뉴클레오티드와 상보적인 폴리뉴클레오티드가 포함된다.

본 발명 폴리뉴클레오티드의 바람직한 단편에는 서열목록에 기재된 서열로부터의 인접 뉴클레오티드 15개 이상, 30개 이상, 50개 이상 또는 100개 이상을 갖는 뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리된 폴리뉴클레오티드, 또는 서열목록에 기재된 서열로부터 말단이 잘리거나 결실된 인접 뉴클레오티드 30개 이상, 50개 이상 또는 100개 이상을 갖는 서열을 포함하는 단리된 폴리뉴클레오티드가 포함된다.

본 발명 폴리뉴클레오티드의 바람직한 변이체에는 스플라이스 변이체, 대립유전자 변이체 및 다형성 (1개 이상의 단일 뉴클레오티드 다형성 (SNP)을 갖는 폴리뉴클레오티드 포함)이 포함된다.

또한 본 발명의 폴리뉴클레오티드에는, 서열목록에 기재된 아미노산 서열을 포함하며, 몇몇 아미노산 잔기, 예를 들어 50 내지 30개, 30 내지 20개, 20 내지 10개, 10 내지 5개, 5 내지 3개, 3 내지 2개, 2 내지 1개 또는 1개의 아미노산 잔기가 임의 조합으로 치환, 결실 또는 부가된 폴리펩티드 변이체를 코딩하는 폴리뉴클레오티드가 포함된다.

다른 측면에서, 본 발명은 본 발명 DNA 서열의 RNA 전사체인 폴리뉴클레오티드를 제공한다. 따라서, 본 발명에서는

(a) 서열목록에 기재된 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 서열의 RNA 전사체를 포함하거나,

(b) 서열목록에 기재된 폴리펩티드를 코딩하는 DNA 서열의 RNA 전사체이거나,

(c) 서열목록에 기재된 DNA 서열의 RNA 전사체를 포함하거나, 또는

(d) 서열목록에 기재된 DNA 서열의 RNA 전사체인

RNA 폴리뉴클레오티드, 및 상기 RNA 폴리뉴클레오티드에 상보적인 RNA 폴리뉴클레오티드가 제공된다.

서열목록에 기재된 폴리뉴클레오티드 서열은 표 2에 기재된 폴리뉴클레오티드 서열과 상동성을 나타낸다. 서열목록에 기재된 폴리뉴클레오티드 서열은 서열목록에 기재된 폴리펩티드를 코딩하는 cDNA 서열이다. 서열목록에 기재된 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열은 서열목록에 기재된 폴리펩티드 코딩 서열과 동일할 수도 있고, 또는 서열목록에 기재된 폴리펩티드를 코딩하나 유전자 코드의 중복성 (축퇴성 (degeneracy))의 결과로 서열목록에 기재된 서열과는 다른 서열일 수도 있다. 서열목록에 기재된 서열의 폴리펩티드는, 표 2에 기재된 폴리펩티드와 상동성 및(또는) 구조적 유사성을 갖는, 표 2에 기재된 유전자 족의 다른 단백질과 관련성이 있는 것일 수도 있다. 본 발명의 바람직한 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드는 특히 자신과 상동성인 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드와 유사한 생물학적 기능/특징을 가질 것으로 기대된다. 더욱이, 본 발명의 바람직한 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드는 표 1에 기재된 유전자들의 활성 중 하나 이상을 갖는다.

본 발명의 폴리뉴클레오티드는 표 4에 기재된 조직으로부터의 mRNA에서 유래한 cDNA로부터 표준 클로닝 및 스크리닝 기술을 이용하여 얻을 수 있다 (예를 들어, 문헌 [Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y. (1989)] 참조). 또한, 본 발명의 폴리뉴클레오티드는 게놈 DNA 라이브러리와 같은 천연 공급원으로부터 얻을 수도 있고, 또는 잘 알려져 있고 상업적으로 입수가능한 기술을 이용하여 합성할 수도 있다.

본 발명의 폴리뉴클레오티드가 본 발명 폴리펩티드의 재조합 생산에 사용되는 경우, 폴리뉴클레오티드는 그 자체로 성숙 폴리펩티드에 대한 코딩 서열을 포함할 수도 있고, 또는 리더 또는 분비 서열, 프리-단백질 서열, 프로-단백질 서열, 프리프로-단백질 서열, 또는 다른 융합 펩티드 부분을 코딩하는 것과 같은 다른 코딩 서열과 함께 리딩 프레임 내에 성숙 폴리펩티드에 대한 코딩 서열을 포함할 수도 있다. 예를 들어, 융합 폴리펩티드의 정제를 용이하게 해주는 마커 서열이 코딩될 수 있다. 본 발명의 이러한 측면에 대한 특정 바람직한 실시양태에서, 마커 서열은 pQE 벡터 (Qiagen, Inc.) 내에 제공되며 문헌 [Gentz et al., Proc Natl Acad Sci USA (1989) 86:821-824]에 기재된 헥사-히스티딘 펩티드이거나, 또는 HA 태그이다. 또한, 폴리뉴클레오티드는 비코딩 5' 및 3' 서열들, 예를 들어 전사되나 번역되지 않는 서열들, 스플라이싱 및 폴리아데닐화 신호, 리보솜 결합 부위,및 mRNA를 안정화시키는 서열들을 함유할 수 있다.

서열목록에 기재된 폴리뉴클레오티드 서열과 동일하거나 충분한 동일성을 갖는 폴리뉴클레오티드는 cDNA나 게놈 DNA에 대한 혼성화 프로브로서, 또는 핵산 증폭 반응 (예를 들어, PCR)을 위한 프라이머로서 사용될 수 있다. 그러한 프로브 및 프라이머는 본 발명의 폴리펩티드를 코딩하는 전장 cDNA 및 게놈 클론을 단리하기 위해, 및 서열목록에 기재된 서열들과 높은 서열 유사성을 갖는 다른 유전자들 (인간 공급원으로부터의 파라로그 (paralog) 및 다른 종으로부터의 오르토로그 (ortholog) 및 파라로그를 코딩하는 유전자들 포함), 통상 95％ 이상의 동일성을 갖는 유전자들의 cDNA 및 게놈 클론을 단리하기 위해 사용될 수 있다. 바람직한 프로브 및 프라이머는 일반적으로 15개 이상의 뉴클레오티드, 바람직하게는 30개 이상의 뉴클레오티드를 포함할 것이며, 50개 이상, 그렇지 않으면 100개 이상의 뉴클레오티드를 가질 수 있다. 특히 바람직한 프로브는 30 내지 50개의 뉴클레오티드를 가질 것이다. 특히 바람직한 프라이머는 20 내지 25개의 뉴클레오티드를 가질 것이다.

본 발명의 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드 (다른 종으로부터의 동족체 포함)는 엄격한 혼성화 조건하에서, 서열목록에 기재된 서열 또는 그의 단편 (바람직하게는 15개 이상의 뉴클레오티드)을 갖는 표지 프로브로 라이브러리를 스크리닝하는 단계; 및 서열목록에 기재된 폴리뉴클레오티드 서열을 함유하는 전장 cDNA 및 게놈 클론을 단리하는 단계를 포함하는 방법에 의해 얻을 수 있다. 그러한 혼성화 기술은 당업자에게 잘 알려져 있다. 바람직한 엄격 혼성화 조건에는,50％ 포름아미드, 5x SSC (150 mM NaCl, 15 mM 시트르산삼나트륨), 50 mM 인산나트륨 (pH 7.6), 5x 덴하르트 용액, 10％ 덱스트란 술페이트 및 20 ㎍/㎖의 변성 절단된 연어 정자 DNA를 포함하는 용액 중에서 42℃로 밤새 인큐베이션시킨 후, 필터를 0.1x SSC에서 65℃로 세척하는 것이 포함된다. 따라서, 본 발명은 또한 엄격한 혼성화 조건하에서 서열목록에 기재된 서열 또는 그의 단편 (바람직하게는 15개 이상의 뉴클레오티드)을 갖는 표지 프로브로 라이브러리를 스크리닝하여 얻은 단리된 폴리뉴클레오티드 (바람직하게는 100개 이상의 뉴클레오티드 서열을 가짐)를 포함한다.

많은 경우, 당업자는 단리된 cDNA 서열이 폴리펩티드를 코딩하는 영역이 5' 말단까지 확장되지 않는다는 점에서 불완전할 것임을 이해할 것이다. 이는 본래 "진행성 (processivity)" (중합 반응 동안 주형에 부착된 채로 남아있는 효소의 능력에 대한 측정치)이 낮은 효소인 역전사 효소로 인해 제1 가닥 cDNA 합성시 mRNA 주형의 완전한 DNA 카피를 생성하지 못하기 때문이다.

전장 cDNA를 얻거나 짧은 cDNA를 연장시키기 위해 입수 가능하고 당업자에게 잘 알려진 몇몇 방법이 있는데, 그 예로는 cDNA 말단의 속성 증폭 (Rapid Amplification of cDNA ends; RACE) (예를 들어, 문헌 [Frohman et al., Proc Nat Acad Sci USA 85, 8998-9002, 1998] 참조) 방법에 기초한 것들이 있다. 예를 들어 마라톤 (상표명, Marathon) 기술 (Clontech Laboratories Inc.)과 같은 상기 기술의 최근 변형법은 보다 긴 cDNA를 찾아내는 것을 매우 단순화시켰다. 마라톤 (상표명) 기술에서, cDNA는 선택된 조직으로부터 추출된 mRNA에서 제조되며, "어댑터(adaptor)" 서열이 각 말단에 라이게이션된다. 그 후, 유전자 특이적 및 어댑터 특이적 올리고뉴클레오티드 프라이머의 조합을 사용하여 핵산 증폭 (PCR)을 수행함으로써 cDNA의 "손실된 (missing)" 5' 말단을 증폭한다. 그 후, "네스티드 (nested)" 프라이머, 즉 증폭된 생성물 내에 어닐링되도록 디자인된 프라이머 (통상, 어댑터 프라이머 서열 중 보다 3'에 어닐링되는 어댑터 특이적 프라이머 및 공지의 유전자 서열 중 보다 5'에 어닐링되는 유전자 특이적 프라이머)를 사용하여 PCR 반응을 반복한다. 이 반응의 생성물은 이후에 DNA 서열분석에 의해 분석될 수 있으며, 이 생성물을 기존의 cDNA에 직접 결합시켜 완전한 서열을 수득하거나, 또는 5' 프라이머의 디자인을 위한 새로운 서열 정보를 이용하여 별도의 전장 PCR을 수행함으로써 전장 cDNA를 제작한다.

본 발명의 재조합 폴리펩티드는 발현 시스템을 포함하는, 유전공학적으로 조작된 숙주 세포로부터 당업계에 잘 알려진 방법에 의해 제조할 수 있다. 따라서, 다른 측면에서, 본 발명은 본 발명의 폴리펩티드 또는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현 시스템; 그러한 발현 시스템을 이용하여 유전공학적으로 조작된 숙주 세포; 및 재조합 기술에 의한 본 발명 펩티드의 생산과 관련성이 있다. 무세포 번역 시스템도, 본 발명의 DNA 작제물로부터 유래한 RNA를 이용하여 그러한 단백질을 생산하는 데 이용될 수 있다.

재조합 생산을 위해, 숙주 세포는 본 발명의 폴리펩티드에 대한 발현 시스템 또는 그의 일부를 포함하도록 유전공학적으로 조작될 수 있다. 폴리뉴클레오티드는 많은 표준 실험실 메뉴얼, 예를 들어 문헌 [Davis et al., Basic Methods inMolecular Biology (1986)] 및 [Sambrook et al.(상게서)]에 기재된 방법에 의해 숙주 세포 내로 도입될 수 있다. 폴리뉴클레오티드를 숙주 세포 내로 도입시키는 바람직한 방법에는, 예를 들어 인산칼슘 형질감염, DEAE-덱스트란 매개 형질감염, 트랜스벡션 (transvection), 미세 주입 (micro-injection), 양이온성 지질 매개 형질감염, 전기천공법, 형질도입, 스크랩 로딩 (scrape loading), 탄환형 도입 (ballistic introduction) 또는 감염이 포함된다.

적당한 숙주의 대표예로는 박테리아 세포, 예를 들어 스트렙토코커스 (Streptococci), 스타필로코커스 (Staphylococci), 이. 콜라이 (E, coli), 스트렙토마이세스 (Streptomyces) 및 바실러스 서브틸리스 (Bacillus subtilis) 세포; 진균류 세포, 예를 들어 효모 세포 및 아스퍼질러스 (Aspergillus) 세포; 곤충 세포, 예를 들어 드로소필라 (Drosophila) S2 및 스포도프테라 (Spodoptera) Sf9 세포; 동물 세포, 예를 들어, CHO, COS, HeLa, C127, 3T3, BHK, HEK 293 및 보우스 (Bowes) 흑색종 세포; 및 식물 세포가 있다.

매우 다양한 발현 시스템, 예를 들어 염색체, 에피좀 및 바이러스-유래 시스템이 사용될 수 있는데, 그 예로는 박테리아 플라스미드로부터 유래한 벡터, 박테리오파지로부터 유래한 벡터, 트랜스포손으로부터 유래한 벡터, 효소 에피좀으로부터 유래한 벡터, 삽입 인자로부터 유래한 벡터, 효모 염색체 인자로부터 유래한 벡터, 배큘로바이러스, 파포바 바이러스 (예를 들어, SV40), 백시니아 바이러스, 아데노바이러스, 포울 폭스 바이러스, 슈도래이비즈 바이러스 및 레트로바이러스 등의 바이러스로부터 유래한 벡터, 및 이들의 조합으로부터 유래한 벡터 (예를 들어,코스미드 및 파지미드와 같이 플라스미드 및 박테리오파지 유전자 요소로부터 유래한 벡터)가 있다. 발현 시스템은 발현을 유도하는 영역 뿐만 아니라, 발현을 조절하는 영역도 함유할 수 있다. 일반적으로, 숙주에서 폴리펩티드를 생산하도록 폴리뉴클레오티드를 유지, 증식 및 발현시킬 수 있는 임의의 시스템 또는 벡터가 사용될 수 있다. 적당한 폴리뉴클레오티드 서열은 임의의 공지 기술 및 통상 기술, 예를 들어 문헌 [Sambrook et al.,(상게서)]에 기재된 기술에 의해 발현 시스템 내로 삽입될 수 있다. 적당한 분비 신호가 원하는 폴리펩티드 내에 혼입되어, 번역된 단백질이 소포체의 루멘 (lumen), 세포질 주변 또는 세포외 환경으로 분비되게끔 할 수 있다. 이들 신호는 폴리펩티드에 대해 내인적이거나, 또는 이종 신호일 수 있다.

본 발명의 폴리펩티드가 스크리닝 분석법에 사용하기 위해 발현되는 경우, 폴리펩티드가 세포의 표면에 생성되는 것이 일반적으로 바람직하다. 이 경우, 스크리닝 분석법에 사용하기 전에 세포를 수확할 수 있다. 폴리펩티드가 배지로 분비되는 경우, 배지를 수거하여 폴리펩티드를 수거 및 정제할 수 있다. 폴리펩티드가 세포내에서 생성되는 경우에는 폴리펩티드를 수거하기 전에 우선 세포를 용해시켜야 한다.

본 발명의 폴리펩티드는 황산암모늄 또는 에탄올 침전, 산 추출, 음이온 또는 양이온 교환 크로마토그래피, 포스포셀룰로스 크로마토그래피, 소수성 상호작용 크로마토그래피, 친화 크로마토그래피, 히드록실아파타이트 크로마토그래피 및 렉틴 (lectin) 크로마토그래피를 비롯한 공지의 방법에 의해 세포 배양액으로부터 수거 및 정제할 수 있다. 보다 구체적으로, 고성능 액체 크로마토그래피가 정제에 이용된다. 펩티드가 세포내 합성, 단리 및(또는) 정제 동안 변성되는 경우에는 단백질의 재폴딩 (refolding)을 위해 잘 알려진 기술을 이용하여 활성 형태로 재생시킬 수 있다.

본 발명의 폴리펩티드는 관련 유전자의 돌연변이 검출을 통해 진단 시약으로서 사용될 수 있다. 특정 유전자의 돌연변이 형태 검출은 서열목록에 cDNA 또는 게놈 서열로 기재되어 있으며 기능장애와 관련된 폴리뉴클레오티드에 의해 특성화된다. 유전자의 저발현, 과다발현, 또는 변화된 공간 또는 시간적 발현에서 기인한, 질환이나 질환에 대한 감수성을 부가 또는 규정할 수 있는 진단 도구가 제공될 것이다. 유전자에 돌연변이를 포함하는 개체는 당업계에 공지된 다양한 기술에 의해 DNA 수준에서 검출될 수 있다.

진단을 위한 핵산은 대상체의 세포로부터, 예를 들어 혈액, 소변, 타액, 조직 생검체 또는 검시(檢視) 재료로부터 얻을 수 있다. 게놈 DNA가 검출을 위해 직접 사용될 수도 있고, 또는 PCR (바람직하게는 RT-PCR)이나 다른 증폭 기술을 이용하여 효소에 의해 증폭시킨 후에 분석법을 수행할 수도 있다. 또한, RNA 또는 cDNA도 유사한 방식으로 사용될 수 있다. 결실 또는 삽입은 정상 유전자형과 비교시 증폭 생성물의 크기 변화에 의해 검출할 수 있다. 점 돌연변이는 표 1에 기재된 유전자의 표지 뉴클레오티드 서열에 증폭된 DNA를 혼성화시킴으로써 확인할 수 있다. 바람직하게는 매치된 서열을, RNase 분해에 의해 또는 용융 온도의 차이에 의해 미스매치된 이중체와 구별할 수 있다. 또한, DNA 서열 차이는 변성제의 존재또는 부재하에 겔에서 DNA 단편의 전기영동시 나타나는 이동성의 변화에 의해, 또는 직접 DNA 서열분석에 의해 (예를 들어, 문헌 [Myers et al., Science (1985) 230:1242] 참조) 검출할 수 있다. 또한, 특정 위치에서의 서열 변화는 뉴클레아제 보호 분석법, 예를 들어 RNase 및 S1 뉴클레아제 보호에 의해 밝혀지거나, 또는 화학적 절단 방법 (문헌 [Cotton et al., Proc Natl Acad Sci USA (1985) 85:4397-4401] 참조)에 의해 밝혀질 수 있다.

표 1에 기재된 유전자들의 폴리뉴클레오티드 서열 또는 그의 단편을 포함하는 올리고뉴클레오티드 프로브의 어레이 (array)를 제작하여 유전자 돌연변이 등의 스크리닝을 효율적으로 수행할 수 있다. 그러한 어레이는 바람직하게는 고밀도 어레이 또는 그리드 (grid)이다. 어레이 기술은 잘 알려져 있고 전반적으로 이용가능하며, 유전자 발현, 유전자 연관 및 유전자 변이성을 비롯하여 분자 유전학 분야의 다양한 질문에 대해 설명하는 데 사용될 수 있다 (예를 들어, 문헌 [M. Chee et al., Science, 274, 610-613] 및 거기에 인용된 다른 참고문헌 참조).

비정상적으로 감소 또는 증가된 폴리펩티드 또는 mRNA 발현 수준의 검출은 본 발명의 질환에 대한 대상체의 진단 또는 그 감수성 결정을 위해 이용될 수 있다. 감소 또는 증가된 발현은 폴리뉴클레오티드의 정량을 위해 당업계에 공지된 임의의 방법, 예를 들어 핵산 증폭 (예, PCR, RT-PCR), RNase 보호, 노던 블롯팅 및 다른 혼성화 방법을 이용하여 RNA 수준에서 측정할 수 있다. 숙주로부터 유래한 샘플 중에서 단백질, 예를 들어 본 발명 폴리펩티드의 양을 측정하기 위해 이용되는 분석 기술은 당업계에 공지되어 있다. 그러한 분석 방법에는 방사성 면역분석법, 경쟁 결합 분석법, 웨스턴 블롯 분석법 및 ELISA 분석법이 포함된다.

따라서, 다른 측면에서 본 발명은

(a) 본 발명의 폴리뉴클레오티드, 바람직하게는 서열목록에 기재된 뉴클레오티드 서열, 또는 그의 단편이나 RNA 전사체;

(b) 상기 (a)에 상보적인 뉴클레오티드 서열;

(c) 본 발명의 폴리펩티드, 바람직하게는 서열목록에 기재된 폴리펩티드, 또는 그의 단편; 또는

(d) 본 발명의 폴리펩티드, 바람직하게는 서열목록에 기재된 폴리펩티드에 대한 항체

를 포함하는 진단 킷트에 관한 것이다.

임의의 그러한 킷트에서 (a), (b), (c) 또는 (d)가 실질적인 성분을 차지함을 이해할 수 있을 것이다. 그러한 킷트는 무엇보다도 질환 또는 질환에 대한 감수성 (특히, 본 발명의 질환)의 진단에 사용될 것이다.

본 발명의 폴리뉴클레오티드 서열은 염색체 위치결정 (localisation) 연구에 가치가 있다. 서열목록에 기재된 서열들은 개개의 인간 염색체 상에서 특정 위치에 특이적으로 표적화되거나 이와 혼성화될 수 있다. 본 발명에 따라 관련 서열을 염색체로 맵핑 (mapping)하는 것은, 이들 서열과 유전자 관련 질환과의 관계를 밝히는 데 있어서 중요한 제1 단계이다. 일단 특정 서열이 염색체의 정확한 위치에 매핑되면, 염색체 상에서 서열의 물리적 위치는 유전자 맵 데이타와 연관될 수 있다. 그러한 데이타는, 예를 들어 브이. 맥쿠식 (V. McKusick)의 '사람에서의 멘델유전 (Mendelian Inheritance in Man; Johns Hopkins University Welch Medical Library를 통해 온라인으로 입수가능)'에서 찾을 수 있다. 동일한 염색체 영역에 맵핑된 유전자와 질환과의 관계는 그 후에 연관 분석법 (물리적으로 인접한 유전자들의 공동 유전 (co-inheritance))을 통해 확인한다. 게놈 서열 (유전자 단편 등)에 대한 정확한 인간 염색체상의 위치는 방사선 하이브리드 (Radiation Hybird; RH) 맵핑 (Walter, M. Spillett, D., Thomas, P., Weissenbach, J., and Goodfellow, P., (1994) A method for constructing radiation hybrid maps of whole genomes, Nature Genetics 7, 22-28)을 이용하여 결정할 수 있다. 다수의 RH 패널이 리서치 제네틱스 (Research Genetics; Huntsville, AL, USA)로부터 입수 가능하며, 그 예로는 GeneBridge4 RH 패널 (Hum Mol Genet 1996 Mar;5(3):339-46 A radiation hybird map of the human genome. Gyapay G, Schmitt K, Fizames C, Jones H, Vega-Czarny N, Spillett D, Muselet D, Prud'Homme JF, Dib C, Auffray C, Morissette J, Weissenbach J, Goodfellow PN)이 있다. 이 패널을 사용하여 특정 유전자의 염색체상의 위치를 결정하기 위해, 목적 유전자로부터 디자인된 프라이머를 사용하여 RH DNA상에서 PCR을 93회 수행한다. 이들 각각의 DNA는 햄스터의 배경에서 유지된 (인간/햄스터 하이브리드 세포주) 무작위적인 인간 게놈 단편을 함유한다. 이 PCR 결과, 목적 유전자의 PCR 생성물의 존재 또는 부재를 나타내는 93 스코어가 나온다. 이 스코어를, 알려진 위치의 게놈 서열로부터의 PCR 생성물을 이용하여 생성된 스코어와 비교한다. 비교는 웹사이트 (http://www.genome.wi.mit.edu/)에서 수행한다.

또한, 본 발명의 폴리뉴클레오티드 서열은 조직 발현 연구를 위한 도구로서 가치가 있다. 그러한 연구는 본 발명 폴리뉴클레오티드의 발현 패턴을 결정할 수 있게 해주는데, 이는 본 발명의 폴리뉴클레오티드에 의해 코딩되는 mRNA를 검출함으로써 조직에서의 코딩된 폴리펩티드의 발현 패턴을 암시한다. 이 기술은 당업계에 공지되어 있으며, 여기에는 그리드상에 배열된 클론에 대한 원래 위치에서의 (in situ) 혼성화, 예를 들어 cDNA 마이크로어레이 (microarray) 혼성화 (문헌 [Schena et al, Science, 270, 467-470, 1995] 및 [Shalon et al, Genome Res, 6, 639-645, 1996]) 및 뉴클레오티드 증폭 기술 (예, PCR)이 포함된다. 바람직한 방법은 퍼킨 엘머 (Perkin Elmer)로부터 입수가능한 TAQMAN (상표명) 기술을 이용한다. 이 연구의 결과는 생물체에서 폴리펩티드의 정상적인 기능을 암시할 수 있다. 또한, mRNA의 정상 발현 패턴을 동일 유전자의 다른 형태에 의해 코딩된 mRNA의 발현 패턴 (예를 들어, 잠재적 또는 조절성 돌연변이를 코딩하는 폴리펩티드에서의 변화를 갖는 것)과 비교하는 연구는 본 발명 폴리펩티드의 역할, 또는 질환에서 그의 부적절한 발현의 역할에 대한 가치있는 전망을 제공할 수 있다. 그러한 부적절한 발현은 시간적, 공간적, 또는 단순히 정량적인 특성일 수 있다.

본 발명의 다른 측면은 항체에 관한 것이다. 본 발명의 폴리펩티드 또는 그의 단편, 또는 이들을 발현하는 세포를 면역원으로 사용하여, 본 발명의 폴리펩티드에 대해 면역특이적인 항체를 생성할 수 있다. 용어 "면역특이적인"이란 항체가 선행 기술의 다른 관련 폴리펩티드에 비해 본 발명의 폴리펩티드에 훨씬 큰 친화도를 가짐을 의미한다.

본 발명의 폴리펩티드에 대해 생성된 항체는, 상기 폴리펩티드 또는 에피토프 함유 단편, 또는 세포를 통상적인 방법으로 동물 (바람직하게는 비인간 포유동물)에 투여함으로써 얻을 수 있다. 모노클로날 항체의 제조를 위해, 연속적인 세포주 배양에 의해 생성된 항체를 제공하는 임의의 기술을 이용할 수 있다. 그 예로는 하이브리도마 (hybridoma) 기술 (Kohler, G., and Milstein, C., Nature (1975) 256:495-497), 트리오마 (trioma) 기술, 인간 B 세포 하이브리도마 기술 (Kozbor et al., Immunology Today (1983) 4:72) 및 EBV-하이브리도마 기술 (Cole et al., Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, 77-96, Alan R. Liss, Inc., 1985)이 포함된다.

또한, 단일쇄 항체를 제조하는 기술, 예를 들어 미국 특허 제4,946,778호에 기재된 기술을 채택하여 본 발명의 폴리펩티드에 대한 단일쇄 항체를 생성할 수 있다. 또한, 트랜스제닉 (transgenic) 마우스 또는 다른 생물체 (다른 포유동물 포함)도 인간화 항체의 발현에 이용될 수 있다.

상기 언급한 항체는 폴리펩티드를 발현하는 클론을 단리 또는 확인하는 데 사용될 수도 있고, 또는 친화 크로마토그래피에 의해 폴리펩티드를 정제하는 데 사용될 수도 있다. 또한, 본 발명의 폴리펩티드에 대한 항체는 무엇보다도 본 발명의 질환을 치료하는 데 사용될 수 있다.

또한, 본 발명의 폴리펩티드 및 폴리뉴클레오티드는 백신으로서 사용될 수도 있다. 따라서 다른 측면에서, 본 발명은 포유동물에서 면역 반응을 유도하는 방법에 관한 것이며, 이 방법은 개체가 이미 질환에 걸렸는지 아닌지 무관하게 상기 질환으로부터 포유동물을 보호하기 위해 항체 및(또는) T 세포 면역 반응 (예, 사이토카인 생성 T 세포 또는 세포독성 T 세포)을 생성하기에 적절하도록 상기 포유동물에 본 발명의 폴리펩티드를 접종하는 단계를 포함한다. 포유동물에서의 면역 반응은 또한, 본 발명의 질환으로부터 상기 동물을 보호하기 위한 항체를 생성하는 면역 반응을 유도하기 위해, 생체 내에서 본 발명 폴리펩티드의 발현을 유도하며 이 폴리펩티드를 코딩하는 벡터를 통해 상기 폴리펩티드를 전달하는 것을 포함하는 방법에 의해 유도될 수도 있다. 이 벡터를 투여하는 한 방법은 입자 상의 코팅으로서 또는 다른 것으로서 원하는 세포 내로 벡터를 가속화시키는 것이다. 그러한 핵산 벡터는 DNA, RNA, 변형된 핵산, 또는 DNA/RNA 하이브리드를 포함할 수 있다. 백신으로 사용하기 위해, 폴리펩티드 또는 핵산 벡터는 통상 백신 제제 (조성물)로서 제공될 것이다. 백신 제제는 적합한 담체를 더 포함할 수 있다. 폴리펩티드는 위에서 분해되기 때문에, 비경구적으로 (예를 들어, 피하 주사, 근육내 주사, 정맥내 주사 또는 피부내 주사) 투여하는 것이 바람직하다. 비경구 투여에 적합한 제제에는, 산화방지제, 완충액, 살균제 및 용질 (제제가 수용자의 혈액과 등장성이 되게 함)을 함유할 수 있는 수성 및 비수성 멸균 주사액; 및 현탁화제 또는 증점제를 포함할 수 있는 수성 및 비수성 멸균 현탁액이 포함된다. 이 제제는 단일 투여 또는 다중 투여 용기, 예를 들어 밀봉된 앰플 및 바이알 내에 존재할 수 있으며, 동결 건조 조건에서 보관되어 사용 직전에 멸균 액형 담체를 첨가하여 사용할 수 있다. 또한, 이 백신 제제는 제제의 면역원성을 증진시키기 위한 보조제 시스템, 예를 들어 수중유 시스템 및 당업계 공지의 다른 시스템을 포함할 수도 있다. 투여량은 백신의 비활성에 따라 달라질 것이며, 이는 통상적인 실험에 의해 용이하게 결정할 수 있다.

본 발명의 폴리펩티드는 1종 이상의 질환 상태, 특히 상기 언급한 본 발명의 질환과 관련된 하나 이상의 생물학적 기능을 갖는다. 따라서, 본 발명의 폴리펩티드는 자신의 기능 또는 양을 자극 또는 억제하는 화합물을 확인하는 데 유용하다. 따라서 다른 측면에서, 본 발명은 폴리펩티드의 기능 또는 양을 자극 또는 억제하는 화합물을 확인하기 위한 스크리닝 방법을 제공한다. 그러한 방법으로 상기 언급한 본 발명의 질환 등의 질환에 대해 치료 및 예방 목적으로 사용될 수 있는 작용제 또는 길항제를 확인할 수 있다. 화합물은 다양한 공급원, 예를 들어 세포, 무세포 제제, 화합물 라이브러리, 화합물의 집합체, 및 천연 생성물 혼합체로부터 확인할 수 있다. 이렇게 확인된 작용제 또는 길항제는 아마도, 폴리펩티드의 천연 또는 변형된 기질, 리간드, 수용체, 효소 등이거나, 그의 구조적 또는 기능적 유사체 (문헌 [Coligan et al., Current Protocols in Immunology 1(2):Chapter 5 (1991)] 참조) 또는 소분자일 수 있다. 그러한 소분자는 바람직하게는 분자량이 2,000 달톤 미만이고, 보다 바람직하게는 300 내지 1,000 달톤, 가장 바람직하게는 400 내지 700 달톤이다. 이들 소분자는 유기 분자인 것이 바람직하다.

스크리닝 방법은 후보 화합물과 직접 또는 간접적으로 관련된 표지에 의해 단순히 폴리펩티드에 대한 후보 화합물의 결합을 측정하는 것일 수도 있고, 또는 폴리펩티드 또는 그의 융합 단백질를 포함하는 세포 또는 막에 대한 결합을 측정하는 것일 수도 있다. 별법으로, 스크리닝 방법은 표지된 경쟁자 (예, 작용제 또는길항제)에 대한 후보 화합물과 폴리펩티드의 경쟁 결합을 측정 또는 검출 (정성적으로 또는 정량적으로)하는 것을 포함할 수 있다. 또한, 이 스크리닝 방법은 폴리펩티드를 포함하는 세포에 적합한 검출 시스템을 이용하여 후보 화합물이 폴리펩티드의 활성화 또는 억제에 의해 생성된 신호를 나타내는지의 여부를 시험하는 것일 수 있다. 활성화의 억제제는 일반적으로 공지 작용제의 존재하에 분석하고, 후보 화합물의 존재에 의한 상기 작용제의 활성화에 대한 효과를 관찰한다. 또한, 스크리닝 방법은 단순히 후보 화합물을 본 발명의 폴리펩티드 함유 용액과 혼합하여 혼합물을 형성하고, 이 혼합물에서 표 1에 기재된 유전자들의 활성을 측정한 후, 후보 화합물을 함유하지 않는 대조구 혼합물과 표 1에 기재된 유전자들의 혼합물의 활성을 비교하는 것을 포함할 수 있다.

본 발명의 폴리펩티드는 통상적인 저용량 스크리닝 방법에 사용될 수 있으며, 또한 대용량 스크리닝 (HTS) 형태에 사용될 수도 있다. 그러한 HTS 형태는 잘 확립된 96-웰 마이크로타이터 플레이트, 및 보다 최근에는 384-웰 마이크로타이터 플레이트의 사용을 포함할 뿐만 아니라, 문헌 [Schullek et al, Anal Biochem., 246, 20-29 (1997)]에 기재된 나노웰 (nanowel) 방법과 같이 최근 생겨난 방법도 포함한다.

Fc 영역, 및 상기 언급한 표 1에 기재된 유전자들의 폴리펩티드로부터 만들어진 단백질과 같은 융합 단백질도 본 발명의 폴리펩티드에 대한 길항제를 확인하기 위해 대용량 스크리닝 분석법에 사용할 수 있다 (문헌 [D. Bennett et al., J Mol Recognition, 8:52-58 (1995)] 및 [K. Johanson et al., J Biol Chem,270(16):9459-9471 (1995)] 참조).

본 발명의 폴리뉴클레오티드, 폴리펩티드 및 항체는 또한 세포에서 mRNA 및 폴리펩티드 생성에 대한 첨가 화합물의 효과를 검출하는 스크리닝 방법을 구성하는 데 사용될 수도 있다. 예를 들어, 모노클로날 및 폴리클로날 항체를 사용하여 당업계에 공지된 표준 기술에 의해 분비 또는 세포 결합 폴리펩티드의 양을 측정하는 ELISA 분석법이 구성될 수 있다. 이 방법은 적합하게 조작된 세포 또는 조직에서 폴리펩티드의 생산을 억제 또는 증진시킬 수 있는 물질 (소위 길항제 또는 작용제로 각각 불리움)을 찾아내는 데 사용될 수 있다.

본 발명의 폴리펩티드는 당업계에 공지된 표준 수용체 결합 기술을 통해 막결합 또는 가용성 수용체 (존재하는 경우)를 찾아내는 데 사용될 수 있다. 여기에는 폴리펩티드를 방사성 동위원소 (예,¹²⁵I)로 표지하거나, 화학적으로 변형 (예, 바이오티닐화)시키거나, 또는 검출 또는 정제에 적합한 펩티드 서열과 융합시키고, 이를 추정 수용체의 공급원 (세포, 세포막, 세포 상층액, 조직 추출액, 체액)과 함께 인큐베이션시키는 리간드 결합 및 가교결합 분석법이 포함되지만, 이에 한정되는 것은 아니다. 다른 방법에는 표면 플라즈마 공명 및 분광분석법과 같은 생물물리학적 기술이 포함된다. 또한, 이 스크리닝 방법은 수용체에 대한 폴리펩티드의 결합과 경쟁하는 폴리펩티드의 작용제 및 길항제 (존재하는 경우)를 확인하는 데 이용될 수 있다. 그러한 분석법을 수행하기 위한 표준 방법은 당업계에 확립되어 있다.

본 발명의 폴리펩티드에 대한 길항제의 예로는 항체, 또는 일부 경우에 폴리펩티드의 리간드, 기질, 수용체, 효소 등과 밀접하게 관련된 올리고뉴클레오티드 또는 단백질 (예, 리간드, 기질, 수용체, 효소 등의 단편); 또는 본 발명의 폴리펩티드에 결합하기는 하지만 반응을 일으키지 않아 폴리펩티드의 활성을 방해하는 소분자가 포함된다.

또한, 스크리닝 방법은 트랜스제닉 기술 및 표 1에 기재된 유전자들의 사용도 포함한다. 트랜스제닉 동물을 제작하는 기술은 확립되어 있다. 예를 들어, 표 1에 기재된 유전자를 미세 주입을 통해 수정된 난세포의 수컷 전핵 내로 도입시키거나, 이식 전 또는 후의 배 내로 레트로바이러스를 통해 전달하거나, 또는 전기천공법 등에 의해 유전적으로 변형된 배 간세포를 숙주의 배반포에 주입한다. 특히 유용한 트랜스제닉 동물은 자신의 게놈 내에서 동물 유전자가 인간 등가물로 대체된, 소위 "낙-인 (knock-in)" 동물이다. 낙-인 트랜스제닉 동물은 화합물이 인간 표적에 특이적인 경우에 약물 개발 과정에서 표적의 타당성 평가에 유용하다. 다른 유용한 트랜스제닉 동물은, 세포에서 내인성 DNA 서열에 의해 코딩된 본 발명 폴리펩티드의 동물 오르토로그의 발현이 부분적으로 또는 완전히 소멸된, 소위 "낙-아웃 (knock-out)" 동물이다. 유전자 낙-아웃은 특정 세포 또는 조직을 표적으로 할 수도 있고, 기술의 제약으로 인해 특정 세포 또는 조직에서만 발생할 수도 있으며, 또는 동물의 모든 세포 또는 실질적으로 모든 세포에서 발생할 수도 있다. 또한, 트랜스제닉 동물 기술은 도입된 유전자가 발현되어 본 발명의 폴리펩티드를 다량으로 제공하는 전동물 발현-클로닝 시스템을 제공할 수도 있다.

상기 언급한 방법에 사용하는 스크리닝 킷트는 본 발명의 다른 측면을 형성한다. 그러한 스크리닝 킷트는

(a) 본 발명의 폴리펩티드,

(b) 본 발명의 폴리펩티드를 발현하는 재조합 세포,

(c) 본 발명의 폴리펩티드를 발현하는 세포막, 또는

(d) 본 발명의 폴리펩티드에 대한 항체

를 포함하며, 상기 폴리펩티드는 바람직하게는 서열목록에 기재된 것이다.

임의의 그러한 킷트에서 (a), (b), (c) 또는 (d)가 실질적인 성분을 차지함을 이해할 수 있을 것이다.

<용어 해설>

하기 정의는 상기 빈번하게 사용된 특정 용어에 대한 이해를 돕기위해 제공된다.

본원에 사용된 "항체"는 폴리클로날 및 모노클로날 항체, 키메라 항체, 단일쇄 항체, 및 인간화 항체 뿐만 아니라, Fab 또는 다른 면역글로불린 발현 라이브러리의 생성물을 비롯한 Fab 단편을 포함한다.

"단리된"은 자연 상태로부터 "사람의 손에 의해" 변화된 것, 즉 자연에서 발생할 경우에 원래 환경으로부터 변화 또는 제거되거나, 또는 변화 및 제거된 것을 의미한다. 예를 들어, 본원에서 사용된 이 용어에 있어서, 생물체 내에서 자연적으로 존재하는 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드는 "단리된" 것이 아니지만, 자연 상태에서 함께 존재하는 물질들로부터 분리된 동일 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드는 "단리된" 것이다. 더욱이, 형질전환, 유전자 조작 또는 임의의 다른 재조합 방법에 의해 생물체 내로 도입된 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드는, 비록 이것이 살아있거나 죽어있을 수 있는 상기 생물체 내에 존재하더라도 "단리된" 것이다.

"분비 단백질 활성 또는 분비 폴리펩티드 활성" 또는 "분비 단백질 또는 분비 폴리펩티드의 생물학적 활성"은 유사한 활성이나 개선된 활성 또는 원치않는 부작용이 감소된 활성을 비롯한, 상기 분비 단백질의 대사적 또는 생리적 기능을 나타낸다. 또한, 상기 분비 단백질의 항원성 및 면역원성 활성도 포함된다.

"분비 단백질 유전자"는 임의의 첨부된 뉴클레오티드 서열 또는 그의 대립유전자 변이체 및(또는) 이들의 상보체를 포함하는 폴리뉴클레오티드를 나타낸다.

"폴리뉴클레오티드"는 임의의 폴리리보뉴클레오티드 (RNA) 또는 폴리데옥시리보뉴클레오티드 (DNA)를 통칭하는 것으로, 변형되지 않거나 변형된 RNA 또는 DNA일 수 있다. "폴리뉴클레오티드"에는 단일- 및 이중-가닥 DNA, 단일- 및 이중-가닥 영역이 혼합된 DNA, 단일- 및 이중-가닥 RNA, 및 단일- 및 이중-가닥 영역이 혼합된 RNA, 단일-가닥 또는 통상적으로 이중-가닥, 또는 단일- 및 이중-가닥 영역이 혼합된 것일 수 있는 DNA 및 RNA를 포함하는 하이브리드 분자가 포함되지만, 이에 한정되는 것은 아니다. 또한, "폴리뉴클레오티드"는 RNA 또는 DNA, 또는 RNA와 DNA 둘 다를 포함하는 삼중-가닥 영역을 나타낸다. 용어 "폴리뉴클레오티드"에는 또한 1개 이상의 변형된 염기를 함유하는 DNA 또는 RNA, 및 안정성 또는 다른 이유로 골격이 변형된 DNA 또는 RNA가 포함된다. "변형된" 염기에는, 예를 들어 트리틸화된 (tritylated) 염기, 및 이노신과 같은 독특한 염기가 포함된다. DNA 또는 RNA는 다양하게 변형될 수 있기 때문에, "폴리뉴클레오티드"는 자연에서 통상 발견되는 폴리뉴클레오티드에 비해 화학적으로, 효소적으로 또는 대사적으로 변형된 형태 뿐만 아니라, 바이러스 및 세포의 특징인 DNA 및 RNA의 화학적 형태도 포함한다. 또한, "폴리뉴클레오티드"는 대체로 올리고뉴클레오티드로 언급되는 비교적 짧은 폴리뉴클레오티드를 포함한다.

"폴리펩티드"는 펩티드 결합 또는 변형된 펩티드 결합에 의해 서로 결합된 2개 이상의 아미노산을 포함하는 임의의 폴리펩티드, 즉 펩티드 동배체 (isostere)를 나타낸다. "폴리펩티드"는 단쇄 (통상, 펩티드, 올리고펩티드 또는 올리고머로 언급) 및 장쇄 (통상, 단백질로 언급) 둘 다를 나타낸다. 폴리펩티드는 유전자에 의해 코딩되는 20종의 아미노산 이외의 아미노산을 함유할 수 있다. "폴리펩티드"에는 자연적인 과정, 예를 들어 번역 후 프로세싱에 의해 변형된 아미노산 서열, 또는 당업계 공지의 화학적 변형 기술에 의해 변형된 아미노산 서열이 포함된다. 그러한 변형은 기본적인 교과서에 잘 설명되어 있으며, 보다 상세하게는 전공 논문 및 큰 부피의 연구 문헌에 설명되어 있다. 변형은 펩티드 골격, 아미노산 측쇄, 및 아미노 또는 카르복실 말단을 비롯하여 폴리펩티드 내의 어느 곳에서든 발생할 수 있다. 주어진 폴리펩티드 내의 여러 부위에서 동일하거나 다른 정도로 동일한 유형의 변형이 존재할 수 있음은 명백할 것이다. 또한, 주어진 폴리펩티드는 많은 유형의 변형을 함유할 수 있다. 폴리펩티드는 유비퀴틴화 (ubiquitination)의 결과 분지될 수 있으며, 분지 또는 비분지 상태의 고리형이 될 수도 있다. 고리형,분지형 및 분지된 고리형의 폴리펩티드는 번역 후의 자연적인 과정으로부터 생성되거나, 또는 합성 방법에 의해 만들어질 수 있다. 변형에는 아세틸화, 아실화, ADP-리보실화, 아미드화, 바이오티닐화, 플라빈의 공유결합, 헴 (heme) 잔기의 공유결합, 뉴클레오티드 또는 뉴클레오티드 유도체의 공유결합, 지질 또는 지질 유도체의 공유결합, 포스포티딜이노시톨의 공유결합, 가교결합, 고리화, 이황결합 형성, 탈메틸화, 공유 가교결합의 형성, 시스틴 (cystine)의 형성, 피로글루타메이트의 형성, 포르밀화, 감마-카르복실화, 글리코실화, GPI 앵커 (anchor) 형성, 히드록실화, 요오드화, 메틸화, 미리스토일화, 산화, 단백질 분해성 과정, 인산화, 프레닐화 (prenylation), 라세미화, 셀레노일화, 술페이트화, 단백질에 전이-RNA 매개의 아미노산 첨가 (예, 아르기닐화), 및 유비퀴틴화가 포함된다 (예를 들어 문헌 [Proteins - Structure and Molecular Properties, 2nd Ed., T.E. Creighton, W. H. Freeman and Company, New York, 1993], [Wold, F., Post-translational Protein Modification: Prespectives and Prospects, 1-12, in Post-translational Covlaent Modification of Proteins, B. C. Johnson, Ed., Academic Press, New York, 1983], [Seifter et al., "Analysis for protein modifications and nonprotein cofactors", Meth Enzymol, 182, 626-646, 1990] 및 [Rattan et al., "Protein Synthesis: Post-translational Modifications and Aging", Ann NY Acad Sci, 663, 48-62, 1992] 참조).

폴리펩티드 서열의 "단편"은 기준 서열보다는 짧지만 기준 폴리펩티드와 본질적으로 동일한 생물학적 기능 또는 활성을 보유하는 폴리펩티드를 나타낸다. 폴리뉴클레오티드 서열의 "단편"은 서열목록에 기재된 기준 서열보다는 짧은 폴리뉴클레오티드 서열을 나타낸다.

"변이체"는 기준 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드와는 다르지만, 본질적으로 그의 특성을 보유한 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드를 나타낸다. 폴리뉴클레오티드의 통상적인 변이체는 기준 폴리뉴클레오티드와 뉴클레오티드 서열이 다르다. 변이체의 뉴클레오티드 서열 변화는 기준 폴리뉴클레오티드에 의해 코딩되는 폴리펩티드의 아미노산을 변화시킬 수도 있고, 변화시키지 않을 수도 있다. 뉴클레오티드 변화는 하기 논의되는 바와 같이 기준 서열에 의해 코딩되는 폴리펩티드 내에서 아미노산의 치환, 부가, 결실, 융합 및 말단절단 (truncation)을 초래할 수 있다. 폴리펩티드의 통상적인 변이체는 기준 폴리펩티드와 아미노산 서열이 다르다. 일반적으로, 변화는 기준 폴리펩티드의 서열과 변이체의 서열이 전체적으로 매우 유사하고, 많은 영역에서 동일한 것으로 한정된다. 변이체 및 기준 폴리펩티드는 임의 조합으로 1가지 이상의 치환, 삽입, 결실에 의해 아미노산 서열이 다를 수 있다. 치환 또는 삽입된 아미노산 잔기는 유전자 코드에 의해 코딩된 것이거나 코딩된 것이 아닐 수 있다. 통상적으로 보존적인 치환에는 Gly, Ala; Val, Ile, Leu; Asp, Glu; Asn, Gln; Ser, Thr; Lys, Arg; 및 Phe, Tyr이 포함된다. 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드의 변이체는 대립유전자와 같이 자연 발생적인 것이거나, 또는 자연적으로 발생하는 것으로 알려진 것이 아닌 변이체일 수 있다. 자연적으로 발생하지 않는 폴리뉴클레오티드 및 폴리펩티드는 돌연변이 유발 기술에 의해 또는 직접 합성에 의해 만들어질 수 있다. 또한, 변이체에는 글리코실화, 인산화, 메틸화, ADP 리보실화 등을 비롯하여 1가지 이상 번역 후 변형된 폴리펩티드가 포함된다. 구체적 실시양태에는 N-말단 아미노산의 메틸화, 세린과 트레오닌의 인산화, 및 C-말단 글리신의 변형이 포함된다.

"대립유전자"는 게놈의 주어진 좌위 (locus)에 나타나는 유전자의 2종 이상의 다른 형태를 의미한다.

"다형성"은 특정 개체군 내에서 게놈의 주어진 위치에 발생하는 뉴클레오티드 서열 (및 적절하다면 코딩된 폴리펩티드 서열)의 변이체를 나타낸다.

"단일 뉴클레오티드 다형성 (SNP)"은 특정 개체군 내에서 게놈의 단일 뉴클레오티드 위치에서 뉴클레오티드가 변이 가능한 것을 나타낸다. SNP는 유전자 내에서 또는 게놈의 세대간 영역 내에서 발생할 수 있다. SNP는 대립유전자 특이적 증폭 (Allele Specific Amplification; ASA)을 이용하여 분석할 수 있다. 이 방법을 위해서는 적어도 3개의 프라이머가 필요하다. 공통 프라이머가 분석될 다형성에 대한 역 상보체 (reverse complement)에 사용된다. 이 공통 프라이머는 다형성 염기로부터 50 내지 1500 bp 사이에 위치할 수 있다. 다른 2개 (이상)의 프라이머는, 다형성을 구성하는 2개 (이상)의 대립유전자 중 하나에 매치되는 마지막 3번째 염기의 워블 (wobble)을 제외하고는 서로 동일하다. 그 후, 2회 (이상)의 PCR 반응을 샘플 DNA상에서 수행하되, 여기서 공통 프라이머와 대립유전자 특이적 프라이머들 중 하나를 각각 사용한다.

본원에서 사용된 "스플라이스 변이체"는 최초에는 동일한 게놈 DNA로부터 전사되지만 다른 RNA 스플라이싱을 거친 RNA 분자에서 생성된 cDNA 분자를 나타낸다.다른 RNA 스플라이싱은 1차 RNA 전사체가 스플라이싱 (일반적으로는 인트론을 제거하기 위함)을 거치는 경우에 나타나며, 그 결과 각각 상이한 아미노산을 코딩할 수 있는 1종 이상의 mRNA를 생성한다. 또한, 용어 "스플라이스 변이체"는 상기 cDNA 분자에 의해 코딩되는 단백질을 나타낸다.

"동일성"은 서열들을 비교함으로써 결정된 2개 이상의 폴리펩티드 서열 또는 2개 이상의 폴리뉴클레오티드 서열 사이의 관계를 나타낸다. 일반적으로, 동일성은 2개의 폴리뉴클레오티드 또는 2개의 폴리펩티드 서열에서, 비교할 서열들의 전체 길이를 통해 정확하게 일치하는 뉴클레오티드 대 뉴클레오티드 또는 아미노산 대 아미노산을 각각 나타낸다.

"동일성 ％"는 정확하게 일치하지 않는 서열에 대해 측정할 수 있다. 일반적으로, 비교할 2개의 서열을 이들 서열 사이의 최대 상관성이 주어지도록 정렬한다. 여기에는 이들 서열 중 1개 또는 2개에 "갭 (gap)"을 삽입하는 것이 포함될 수 있다. 동일성 ％는 비교할 서열들 각각의 전체 길이를 통해 (소위 전체적 정렬 (global alignment)) 결정 (동일하거나 매우 유사한 길이의 서열에 특히 적합함)하거나, 또는 보다 짧거나 한정된 길이를 통해 (소위 부분적 정렬 (local alignment)) 결정 (동일하지 않은 길이의 서열에 보다 적합함)한다.

"유사성"은 2개의 폴리펩티드 서열에 대한 보다 더 변형된 측정치이다. 일반적으로 "유사성"은 비교할 서열들의 각 잔기들 쌍 사이의 정확한 일치 뿐만 아니라 (동일성에 대한 것과 같음), 정확히 일치하지 않을 경우에 진화를 토대로 어느 잔기가 다른 잔기로 치환될 가능성이 있는지의 여부까지 고려한, 2개의 폴리펩티드사슬의 아미노산에 대한 잔기 대 잔기의 비교를 의미한다. 이 가능성은 "스코어"와 관련되며, 이 스코어로부터 두 서열들 사이의 "유사성 ％"를 결정할 수 있다.

2개 이상의 서열들 사이의 동일성 및 유사성을 비교하는 방법은 당업계에 공지되어 있다. 예를 들어, 위스콘신 서열 분석 패키지 (Wisconsin Sequence Analysis Package) 버전 9.1 (Devereux J et al, Nucleic Acids Res, 12, 387-395, 1984; 제네틱스 컴류터 그룹 (Genetics Computer Group, Madison, Wisconsin, USA)에서 입수가능)에서 입수가능한 프로그램, 예컨대 BESTFIT 및 GAP 프로그램을 이용하여 2개의 폴리뉴클레오티드 사이의 동일성 ％ 및 2개의 폴리펩티드 서열 사이의 유사성 ％를 결정할 수 있다. BESTFIT은 스미쓰 및 워터맨 (Smith and Waterman)의 문헌 [J Mol Biol, 147, 195-197, 1981] 및 [Advances in Applied Mathematics, 2, 482-489, 1981]에 기재된 "부분적 (local) 상동성" 연산법을 이용하여 두 서열들 사이에서 가장 유사성이 높은 단일 영역을 찾아낸다. BESTFIT은 길이가 유사하지 않은 2개의 폴리뉴클레오티드 또는 2개의 폴리펩티드 서열을 비교하기에 보다 적합하며, 이 프로그램은 보다 짧은 서열이 보다 긴 서열의 일부라고 가정한다. 비교시, GAP으로 두 서열을 정렬함으로써, 니들만 및 운쉬 (Neddleman and Wunsch)의 문헌 [J Mol Biol, 48, 443-453, 1970]에 기재된 연산법에 따른 "최대 유사성"을 찾아낼 수 있다. GAP은 길이가 거의 동일한 서열들을 비교하기에 보다 적합하며, 전체 길이를 통한 정렬이 기대된다. 각각의 프로그램에서 사용된 "갭 가중치 (Gap Weight)" 및 "길이 가중치 (Length Weight)" 파라미터는 폴리뉴클레오티드 서열의 경우 각각 50 및 3이고, 폴리펩티드 서열의 경우 각각 12 및 4이다. 동일성％ 및 유사성 ％는 바람직하게는 비교할 2개의 서열이 최적으로 정렬될 때 결정한다.

서열들 사이의 동일성 및(또는) 유사성을 결정하기 위한 다른 프로그램들이 당업계에 공지되어 있으며, 그 예로는 BLAST 프로그램 패밀리 (Altschul S F et al, J Mol Biol 215, 403-410, Altschul S F et al, Nucleic Acids Res., 25:389-3402, 1997; 국립 생명공학 정보 센터 (National Center for Biotechnology Information; NCBI, Bethesda, Maryland, USA)에서 입수가능하며 NCBI 홈페이지 (www.ncbi.nlm.nih.gov)를 통해 접근가능) 및 FASTA (Pearson W R, Methods in Enzymology, 183, 63-99, 1990; Pearson W R and Lipman D J, Proc Nat Acad Sci USA, 85, 2444-2448, 1988; 위스콘신 서열 분석 패키지의 일부로서 입수가능)가 있다.

바람직하게는, 비교 전에 먼저 뉴클레오티드 서열을 아미노산 서열로 번역하는 경우를 포함하여 폴리펩티드 서열을 비교하는 데 BLOSUM62 아미노산 치환 매트릭스 (Henikoff S and Henikoff J G, Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 89, 10915-10919, 1992)를 이용한다.

바람직하게는, 문제의 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드 서열의 기준 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드 서열에 대한 동일성 ％를 결정하기 위해 BESTFIT 프로그램을 이용하며, 이 경우에 문제의 서열과 기준 서열은 최적으로 정렬되고 프로그램의 파라미터는 상기 설명한 바와 같이 디폴트값으로 설정되어 있다.

"동일성 지수"는 후보 서열 (폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드)과 기준 서열을 비교하기 위해 사용할 수 있는 서열 관련성의 측정치이다. 따라서, 예를 들어 기준 폴리뉴클레오티드 서열과 비교시 0.95의 동일성 지수를 갖는 후보 폴리뉴클레오티드 서열은, 후보 폴리뉴클레오티드가 기준 서열 100개 뉴클레오티드당 상이한 뉴클레오티드를 평균 5개 이하로 포함할 수 있음을 제외하고는 기준 서열과 동일하다. 그러한 상이함은 1개 이상의 뉴클레오티드의 결실, 치환 (전위 (transition) 및 전환 (transversion) 포함) 또는 삽입으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 이들 상이함은 기준 폴리뉴클레오티드 서열의 5' 또는 3' 말단 위치에서 나타나거나 이들 말단 위치 사이의 어느 곳에서도 나타날 수 있으며, 기준 서열의 각 뉴클레오티드들 사이에 산재하거나 기준 서열 내의 하나 이상의 인접한 군으로 존재할 수 있다. 다시 말해, 기준 폴리뉴클레오티드 서열과 비교시 0.95의 동일성 지수를 갖는 폴리뉴클레오티드 서열을 얻기 위해서는 기준 폴리뉴클레오티드 서열 중 100개의 뉴클레오티드마다 평균 5개 이하의 뉴클레오티드가 상기 설명한 바와 같이 결실, 치환 또는 삽입된 것이거나, 또는 이들의 임의 조합으로 변형된 것일 수 있다. 다른 동일성 지수값, 예를 들어 0.96, 0.97, 0.98 및 0.99에 대해서도 필요한 변경을 가하여 동일하게 적용된다.

이와 유사하게 폴리펩티드에 있어서, 예를 들어 기준 폴리펩티드 서열과 비교시 0.95의 동일성 지수를 갖는 후보 폴리펩티드는 기준 서열의 아미노산 100개마다 상이한 아미노산을 평균 5개 이하로 포함할 수 있음을 제외하고는 기준 서열과 동일하다. 그러한 상이함은 아미노산 1개 이상의 결실, 치환 (보존적 및 비보존적 치환 포함) 또는 삽입으로 이루어진 군으로부터 선택된다. 이들 상이함은 기준 폴리펩티드 서열의 아미노- 또는 카르복실-말단 위치에서 나타나거나 이들 말단 위치 사이의 어느 곳에서도 나타날 수 있으며, 기준 서열의 각 아미노산들 사이에 산재하거나 기준 서열 내의 하나 이상의 인접한 군으로 존재할 수 있다. 다시 말해, 기준 폴리펩티드 서열과 비교시 0.95의 동일성 지수를 갖는 폴리펩티드 서열을 얻기 위해서는 기준 서열 중 100개의 아미노산마다 평균 5개 이하의 아미노산이 상기 설명한 바와 같이 결실, 치환 또는 삽입된 것이거나, 또는 이들의 임의 조합으로 변형된 것일 수 있다. 다른 동일성 지수값, 예를 들어 0.96, 0.97, 0.98 및 0.99에 대해서도 필요한 변경을 가하여 동일하게 적용된다.

뉴클레오티드 또는 아미노산의 상이함과 동일성 지수 사이의 관계는 하기 식으로 표현할 수 있다:

상기 식에서,

n_a는 상이한 뉴클레오티드 또는 아미노산의 수이고,

x_a는 서열목록에 기재된 서열의 뉴클레오티드 또는 아미노산의 총 수이고,

I는 동일성 지수이고,

ㆍ는 곱셈을 나타내는 기호이며,

여기서, x_a와 I의 계산값이 정수가 아닌 경우에는 x_a로부터 이 값을 감하기 전에 가장 가까운 정수로 소수점 이하 버림한다.

"상동체"는 기준 서열에 대해 높은 서열 관련성을 지닌 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드 서열을 나타내기 위해 당업계에서 사용되는 포괄적인 용어이다. 그러한 관련성은 상기 정의한 바와 같이 2개의 서열 사이의 동일성 및(또는) 유사성 정도를 결정함으로써 정량할 수 있다. 이 포괄적인 용어에 "오르토로그" 및 "파라로그"가 포함된다. "오르토로그"는 다른 종의 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드에 대한 기능적 등가물인 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드를 나타낸다. "파라로그"는 동일한 종 내에서 기능적으로 유사한 폴리뉴클레오티드 또는 폴리펩티드를 나타낸다.

"융합 단백질"은 대체로 무관한 2개의 융합 유전자 또는 그의 단편에 의해 코딩된 단백질을 나타낸다. 예를 들어, EP-A-0 464 533-A에는 다른 인간 단백질 또는 그의 일부와 함께 면역글로불린 분자의 불변 영역의 다양한 부분을 포함하는 융합 단백질이 개시되어 있다. 많은 경우, 융합 단백질의 일부로서 면역글로불린 Fc 영역을 사용하는 것이, 예를 들어 개선된 약물동력학적 특징을 초래하는 치료 및 진단에 있어서 유리하다 (예를 들어, EP-A 0 232 262 참조). 한편, 일부 경우에는 융합 단백질의 발현, 검출 및 정제 후에 Fc 부분을 제거하여 사용할 수 있는 것이 바람직하다.

본 명세서에 인용된 특허 및 특허 출원 등을 비롯한 모든 간행물 및 참고문헌은, 각 간행물 또는 참고문헌이 본원에 전체적으로 기재된 상태로 참고문헌으로 혼입된 것처럼 간주되어 그 전문이 본원에 참고문헌으로 포함된다. 본 출원이 우선권을 주장하는 특허 출원도 상기 간행물 및 참고문헌에 대해 설명한 방식으로 그 전문이 본원에 참고문헌으로 포함된다.

유전자 명칭	GSK 유전자 ID	핵산 서열 번호	상응하는 단백질서열 번호
sbg318680DNase	318680	서열 1	서열 40
sbg237038SA	237038	서열 2서열 3	서열 41서열 42
sbg340871GPV	340871	서열 4	서열 43
sbg293416HNKS	293416	서열 5서열 6	서열 44서열 45
sbg257418ZP	257418	서열 7	서열 46
sbg319185CDa	319185	서열 8서열 9	서열 47서열 48
sbg323307KIAAa	323307	서열 10	서열 49
sbg315953GPPa	315953	서열 11서열 12	서열 50서열 51
sbg318486ONC	318486	서열 13	서열 52
sbg299359LIPO	299359	서열 14	서열 53
sbg230022NGa	230022	서열 15서열 16	서열 54서열 55
sbg297169BGP	297169	서열 17서열 18	서열 56서열 57
sbg253919HSCCAa	253919	서열 19서열 20	서열 58서열 59
sbg228137OLF	228137	서열 21서열 22	서열 60서열 61
sbg378514네트린	378514	서열 23서열 24	서열 62서열 63
sbg253227. 점액성 매트릭스 당단백질	253227	서열 25서열 26	서열 64서열 65
sbg262831SIAa	262831	서열 27서열 28	서열 66서열 67
sbg233728LIPASE	233728	서열 29	서열 68
sbg400455.CRF	400455	서열 30	서열 69
sbg400612KINASEa	400612	서열 31	서열 70
sbg381373ACRP	381373	서열 32	서열 71
sbg401294MEX-3	401294	서열 33서열 34	서열 72서열 73
sbg247722카드헤린	247722	서열 35서열 36	서열 74서열 75
sbg391057THIPa	391057	서열 37서열 38	서열 76서열 77
sbg378067TGFc	378067	서열 39	서열 78

유전자 명칭	용도	관련 질환
sbg318680-DNase	본 발명의 한 실시양태는 호흡기 질환의 치료 및 염색체 분해제로서 기생체나 암세포의 표적화를 통해 상기 세포들의 사멸을 초래하기 위한 sbg318680-DNase의 용도이다. sbg318680-DNase의 밀접한 상동체는 DNase이다. DNase는 기관지폐 분비물의 점도를 감소시킴으로써 폐렴, 낭포성 섬유증 및 천식과 같은 호흡기 질환의 치료에 사용될 수 있다 (MacConnachie AM; 1999; Intensive Crit Care Nurs 14:101-2).	암, 감염, 자가면역성 질환, 조혈 질환, 상처 치유 질환, 염증 및 호흡기 질환
sbg237038-SA	본 발명의 한 실시양태는 혈압 조절에 있어서 sbg237038SA의 용도이다. sbg237038SA의 밀접한 상동체는 래트 SA 유전자이다. SA 유전자는 유전적으로 고혈압인 래트의 신장에서 높은 수준으로 발현된다 (Yang T, Hassan SA, Singh I, Smart A, Brosius FC, Holzman LB, Schnermann JB, Briggs JP; 1996; Hypertension 27:541-51).	암, 감염, 자가면역성 질환, 조혈 질환, 상처 치유 질환, 염증 및 호흡기 질환
sbg340871-GPV	본 발명의 한 실시양태는 조혈작용 및 혈소판 응집에 있어서 sbg340871-GPV의 용도이다. sbg34087-GPV의 밀접한 상동체는 혈소판 당단백질 (GP) V이다. 혈소판 당단백질 (GP)는 혈소판 활성화시 트롬빈에 의해 절단되며 GPIb-IX 복합체와 결합하여 GPIb-V-IX (폰 빌레브란트 인자 및 트롬빈에 대한 수용체)를 형성하는 주요 표면 단백질이다. 조혈작용에서 그의 기능은 아마도 트롬빈 유도 혈소판 응집과 관련될 것이다 (Ravanat C, Morales M, Azorsa DO, Moog S, Schuhler S, Grunert P, Loew D, Van Dorsselaer A, Cazenave JP, Lanza F; 1997; Blood 89:3253-62).	암, 감염, 자가면역성 질환, 조혈 질환, 상처 치유 질환, 염증 및 베르나드-소울리어 질환
sbg293416-HNKS	본 발명의 한 실시양태는 세포 상호작용 및 신경계 발생에 있어서 sbg293416-HNKS의 용도이다. sbg293416-HNKS와 밀접한 상동체는 술포트랜스퍼라제이다. 술포트랜스퍼라제는 HNK-1 탄수화물 에피토프의 생합성에서 중요한 효소로 여겨지며, 이는 몇몇 신경 부착 당단백질 상에 발현되고 세포 상호작용에 관여한다 (Bakker, H., Friedmann, I., Oka, S., Kawasaki, T., Nifant'ev, N., Schachner, M. and Mantei, N., 1997, J. Biol. Chem. 272:29942-29946). HNK-1 에피토프는 신경계의 발생 동안 공간적 및 시간적으로 조절된다. HNK-1 술포트랜스퍼라제의 생물학적 기능은 신경계의 발생과 관련되며, 또한 손상 후 운동 액손에 의한 근육 신경의 우선적 신경재지배 (reinervation)에 관여한다 (Jungalwala FB, 1994, Neurochem Res 19:945-57).	암, 감염, 자가면역성 질환, 조혈 질환, 상처 치유 질환, 염증 및 말초 신경병증

유전자 명칭	용도	관련 질환
sbg257418-ZP	본 발명의 한 실시양태는 수정에 있어서 sbg257418ZP의 용도이다. sbg257418ZP와 밀접한 상동체는 투명대이다. 투명대 단백질은 성장중인 난세포, 배란된 난자 및 초기 배를 둘러싸는 세포외 매트릭스이며, 수정에 중요하게 관여한다 (Epifano, O., Liang, L.F., Familari, M., Moos, M.C. Jr. and Dean, J.; 1995; Development 121:1947-1956). 또한, 투명대는 다수정에 대한 수정후 블록을 제공하며 수란관을 통해 내려갈 때 성장중인 배를 보호한다 (Rankin T., and Dean J; 1996; Mol Hum Reprod 2:889-94).	불임
sbg319185-CDa	본 발명의 한 실시양태는 암 및 자가면역성 질환의 진단 및 치료에 있어서 분비 단백질인 sbg319185CDa의 용도이다. sbg319185CDa의 밀접한 상동체는 백혈구 분화 항체 CD84 이소형이다.CD84는 면역글로불린 거대족의 구성원으로, 분화 항원의 CD2 족에 속하는 몇몇 분자들과 높은 상동성을 나타내며, 암 및 자가면역성 질환의 진단 및 치료에 유용한 것으로 제안된 바 있다 (Palou E, Pirotto F, Sole J. Freed JH, Peral B, Vilardell C, Vilella R. Vives J, Gaya A. Genomic characterization of CD84 reveals the existence of five isoforms differing in their cytoplasmic domains. Tissue Antigens 2000 Feb; 55(2):118-27).	암, 자가면역성 질환, 상처 치유 질환, 감염 및 조혈 질환
sbg323307-KIAAa	본 발명의 한 실시양태는 세포 신호전달, 이동 및 핵산 관리를 조절함에 있어서 분비 단백질인 sbg323307-KIAAa의 용도이다. sbg323307-KIAAa의 밀접한 상동체는 인간 KIAA0918 단백질이다. 슬릿 (slit) 유사 단백질인 인간 KIAA0918 단백질은 기능적으로 세포 신호전달/연락, 세포 구조/이동 및 핵산 관리에 관여한다 (Nagase, T., Ishikawa, K., Suyama, M., Kikuno, R., Hirosawa, M., Miyajima, N., Tanaka, A., Kotani, H., Nomura, N. and Ohara, O., KIAA0918 protein [Homo sapiens], DNA Res. 5(6), 355-364 (1998)).	암, 자가면역성 질환, 감염, 상처 치유 질환 및 조혈 질환

유전자 명칭	용도	관련 질환
sbg315953-GPPa	본 발명의 한 실시양태는 리포폴리사카라이드와 관련된 질환을 치료함에 있어서 sbg315953GPPa의 용도이다. sbg315953GPPa와 밀접한 상동체는 소의 과립구 펩티드 A 전구체이다. 소의 과립구 펩티드 A 전구체는 의학 및 수의학에, 특히 리포폴리사카라이드와 관련된 질환, 예를 들어 패혈증 및 내독소혈증의 치료에 사용된다 (1. Selsted ME, Bovine granulocyte peptide A precursor (antimicrobial BGP-A). 허가 번호 W23722, 공개일 1997년 8월 21일; 2. Yount NY, Yuan J, Tarver A, Castro T, Diamond G, Tran PA, Levy JN, McCullough C, Cullor JS, Bevins CL, Selsted ME. Cloning and expression of bovine neutrophil beta-defensins. Biosynthetic profile during neutrophilic maturation and localization of mature peptide to novel cytoplasmic dense granules. J Biol Chem 1999 Sep 10, 274(37):26249-58).	감염, 암, 자가면역성 질환, 상처 치유 질환 및 조혈 질환
sbg318486-ONC	본 발명의 한 실시양태는 영양배엽 및 종양 세포의 증식 및 인배신 사건에 있어서 sbg348486ONC의 용도이다. sbg348486ONC의 밀접한 상동체는 종양영양배엽 (oncotrophoblast) 당단백질이다. 종양영양배엽 단백질은 전이성 유포되는 종양 세포에 의해 발현되며, 이는 암에서 인배신의 역할을 시사한다 (King, K.W., Sheppard, F.C., Westwater, C., Stern, P.L. and Myers, K.A.; 1999; Biochim. Biophys. Acta 1445, 257-270).	암, 감염, 자가면역성 질환, 조혈 질환, 상처 치유 질환 및 염증
sbg299359-LIPO	본 발명의 한 실시양태는 정자 성숙, 미각 인식, 및 혈뇌 장벽을 통한 일부 분자들의 수송에 있어서 sbg299359LIPO의 용도이다. sbg299359LIPO의 밀접한 상동체는 리포칼린 (Lipocalin)이다. 리포칼린은 소수성 소분자, 예를 들어 스테로이드, 빌린 (bilin), 레티노이드 및 지질을 수송하며, 다수의 조직에 다양한 영향을 미친다. 리포칼린은 정자 성숙, 미각 인식, 및 혈뇌 장벽을 통한 일부 분자들의 수송에 관여하는 것으로 알려져 있다 (Newcomer M.E.; 1993; Structure 1:7-18; Achen M.G., Harms P.J., Thomas T., Richardson S.J., Wettenhall R.E.H., Schreiber G.; 1992; J. Biol. Chem. 267:23170-23174).	암, 감염, 자가면역성 질환, 조혈 질환, 상처 치유 질환 및 염증

유전자 명칭	용도	관련 질환
sbg230022-NGa	본 발명의 한 실시양태는 뇌에서 뉴런 유형 특이적 네트워크를 형성 및 유지함에 있어서 sbg230022Nga의 용도이다. sbg230022Nga와 밀접한 상동체는 마우스 형질세포종 관련 신경 당단백질은 쥐의 형질세포종에서 뇌조내 (intracisternal) A형 입자 장쇄 말단 반복서열에 의해 이소성으로 (ectopically) 활성화된다. 래트 BIG-1 단백질은 신경돌기 돌출 촉진 활성을 지닌 면역글로불린 거대족의 TAG-1/F3 관련 구성원이며, 내에서 뉴런 유형 특이적 네트워크의 형성 및 유지에 관여한다 (1. Connelly MA, Grady RC, Mushinski JF, Marcu KB. PANG, a gene encoding a neuronal glycoprotein, is ectopically acitivated by intracisternal A-type particle long terminal repeats in murine plasmacytomas. Proc Natl Acad Sci USA 1994 Feb 15; 91(4):1337-41 2. Yoshihara Y, Kawasaki M, Tani A, Tamada A, Nagata S, Kangamiyama H, Mori K. BIG-1: a new TAG-1/F3-related member of the immunoglobulin superfamily with nurite outgrowth-promoting activity. Neuron 1994 Aug; 13(2):415-26).	암, 감염, 자가면역성 질환, 상처 치유 질환 및 조혈 질환
sbg297169-BGP	본 발명의 한 실시양태는 상피 세포의 재생 및(또는) 분화에 있어서 sbg297169BGP의 용도이다. sbg297169BGP의 밀접한 상동체는 BGP 단백질이다. BGP 단백질은 세포 표면에서 발현되며, 시험관내에서 세포 부착 분자로서 기능한다. 결장과 같은 상피 세포에서 다수의 BGP 이소형의 발현은 이들 단백질이 상피의 재생 및(또는) 분화에 중요한 작용을 한다는 것을 시사한다 (McCuaig K, Rosenberg M, Nedellec P, Turbide C, and Beauchemin N; 1993; Gene 127:173-83).	암, 감염, 자가면역성 질환, 조혈 질환, 상처 치유 질환 및 염증

유전자 명칭	용도	관련 질환
sbg253919-HSCCAa	본 발명의 한 실시양태는 암 또는 건선의 치료, 또는 보다 공격적인 편평세포 암종의 발달에 있어서 sbg253919-HSCCAa의 용도이다. sbg253919-HSCCAa와 밀접한 상동체는 소리아스타틴 (Psoriastatin) Ⅱ형 및 인간 루이핀 (leupin) 전구체이다. 소리아스타틴 Ⅱ형은, 예를 들어 암 또는 건선의 치료에 유용한 길항제(작용제)를 사용하여 소리아스타틴 Ⅰ형 및 Ⅱ형 유전자의 활성을 조절하는 것으로 주장되고 있다. 다른 단백질인 인간 루이핀 전구체는 보다 공격적인 편평세포 암종의 발달에 보통의 작용을 하는 인간 편평세포 암종 항원 유전자의 탠덤 복제물을 함유한다 (1. Goetinck PF, Hibino T, Takahashi T and Baciu PC. Modulating cell proliferation or apoptosis - by modulating activity of psoriastatin type Ⅰ and Ⅱ genes, e.g. using (ant)agonists, useful for treatment of cancer of Psoriasis. 허가 번호 W15242, 공개일 1997년 4월 24일; 2. Schneider SS, Schick C, Fish KE, Miller E, Pena JC, Treter SD, Hui SM, Silverman GA. A serine proteinase inhibitor locus at 18q21.3 contains a tandem duplication of the human squamous cell carcinoma antigen gene. Proc Natl Acad Sci USA 1995 Apr 11; 92(8):3147-51; 3. Barnes RC, Worrall DM. Identification of a novel human serpin gene; cloning sequencing and expression of leupin. FEBS Lett 1995 Oct 2; 373(1):61-5).	암, 예를 들어 편평세포 암종
sbg228137-OLF	본 발명의 한 실시양태는 화학수용 및 중추신경계에서 sbg228137OLF의 기능적 용도이다. sbg228137OLF의 밀접한 상동체는 올팍토메딘 (olfactomedin)이다. 올팍토메딘은 당단백질이며, 후각 섬모의 단백질과 반응한다. 이는 원래 양서류 후각 신경상피의 점액섬모에서 발견되었으며, 이후에 포유류 뇌에서 발견되었다 (Danielson, P.E., Forss-Petter, S., Battenberg, E.L., deLecea, L., Bloom, F.E., and Sutcliffe, J.G., 1994, J. Neurosci. Res. 38:468-478). 후각 신경상피에 올팍토메틴이 눈에띠게 축적되는 것은 화학수용에 있어서 이 단백질의 작용을 암시한다 (Snyder DA, Rivers AM, Yokoe H, Menco BP, and Anholt RR, 1991, Biochemistry 30:9143-53). 또한, 포유류 뇌에서 올팍토메딘의 광범위한 출현은 중추신경계에서 그의 새로운 기능을 암시한다 (Karavanich CA, and Anholt RR, 1998, Mol Biol Evol 15:718-26).	암, 감염, 자가면역성 질환, 조혈 질환, 상처 치유 질환, 염증 및 신경계 질환

유전자 명칭	용도	관련 질환
sbg378514-네트린	본 발명의 한 실시양태는 중추신경계의 역할에 있어서 sbg378514-네트린의 용도이다. sbg378514-네트린과 밀접한 상동체는 네트린이다. 네트린은 접합면의 액손 돌출 촉진 활성을 지니며, CNS 접합면 액손 및 말초 운동 액손의 안내를 제어한다 (Serafini T, Kennedy TE, Galko MJ, Mirzayan C, Jessell TM, and Tessier-Lavigne M; 1994; Cell 78:409-24). 네트린 및 그의 수용체를 비롯한 융합가능한 기질 결합 신호는 인력 및 반발 신호를 통해 액손의 경로를 안내할 수 있다 (Tear G; 1998; Essays Biochem 33:1-13).	암, 감염, 자가면역성 질환, 조혈 질환, 상처 치유 질환, 염증 및 신경계 질환
sbg253227.점액성 매트릭스 당단백질	본 발명의 한 실시양태는 위장 질환 및 암의 치료에 있어서 sbg253227.점액성 매트릭스 당단백질의 용도이다. sbg253227.점액성 매트릭스 당단백질의 밀접한 상동체들은 EMMG와 관련된 감염의 치료를 위해 병용되어 왔다. EMMG는 위장 질환 및 암, 예를 들어, 연하 장애, 허혈성 복통, 췌장염, 결장암, 크론병 및 말로리-웨이스 증후군의 치료에 유용하다 (US5929033-A, CORLEY NC, TANG YT; INCYTE PHARM INC.에 의해 제출, 참조 번호 WPI; 99-429518/36, 1999).	조혈 질환, 상처 치유 질환, 바이러스 및 박테리아 감염, 암, 자가면역성 질환, 신경 질환, 위장 질환, 연하 장애, 허혈성 복통, 췌장염, 결장암, 크론병, 및 말로리-웨이스 증후군
sbg262831-SIAa	본 발명의 한 실시양태는 시알산 의존성 리간드 인식을 매개하고 인간 천연 킬러 세포에서 억제성 수용체로서 기능하는 sbg262831SIAa의 용도이다. sbg262831SIAa와 밀접한 상동체는 인간 QA79 막 단백질이다. QA79는 시알로어드헤신 (sialoadhesin) 족에 속하며, 시알산 의존성 리간드 인식을 매개하고 인간 천연 킬러 세포에서 억제성 수용체로서 기능하는 것으로 제안되었다 (Falco, M., Biassoni, R., Bottino, C., Vitale, M., Sivori, S., Augugliaro, R., Motrtta, L. and Moretta, A. Identification and molecular cloning of p75/AIRM1, a novel membrane of the sialoadhesin family that functions as an inhibitory receptor in human natural killer cells. J Exp Med 1999 Sep 20; 190(6):793-802).	암, 자가면역성 질환, 감염, 상처 치유 질환 및 조혈 질환

유전자 명칭	용도	관련 질환
sbg233728-LIPASE	본 발명의 한 실시양태는 대체 요법을 통해 췌장염을 치료하는 sbg233728LIPASE의 용도이다. sbg233728-LIPASE와 밀접한 상동체는 췌장 리파아제이다. 췌장 리파아제는 소장의 루멘에서 음식의 장쇄 트리아실글리세롤을 유리 지방산 및 모노아실글리세롤로 가수분해한다(Lowe ME, Rosenblum JL, and Strauss AW; 1989; J Biol Chem 264:20042-8). 췌장 지방변증 및 췌장 당뇨병은 만성 췌장염의 특정 단계에 있는 환자의 주요 증상이다. 이 단계에서는, 영양 단계가 주로 방해받고, 저혈당 및 불안정한 감염이 수반된다. 췌장 효소 대체 요법이 췌장 지방변증의 주요 치료 방법이다 (Nakamura T, Takeuchi T, and Tando Y; 1998; Pancreas 16:329-36).	암, 감염, 자가면역성 질환, 조혈 질환, 상처 치유 질환, 염증 및 췌장염
sbg400455.-CRF	본 발명의 한 실시양태는 소뇌의 푸르키니에 세포, 부속 올리브핵, 뇌교 및 적색핵과 같은 운동 기능과 관련된 신경계 영역에 있어서 sbg400455.CRF의 용도이다. sbg400455.CRF의 밀접한 상동체에는 CRF 전사체가 포함된다. CRF 전사체는 신경계의 영역에 가장 풍부하며, 동물에서 에너지 균형 또는 인슐린 생산의 조절을 위한 생성물 개발에 사용되어 왔다 ((WO9639429-A2) Schere, P.E.; Whitehead Institute of Biomedical Research에 의해 제출; Berube NG, Swanson XH, Bertram MJ, Kittle JD, Didenko B, Baskin DS, Smith JR and Pereira-Smith OM., Brain Res. Mol. Brain Res. 63 (2), 233-240 (1999)).	조혈 질환, 상처 치유 질환, 바이러스 및 박테리아 감염, 암, 자가면역성 질환, 에너지 항상성 질환 및 비만
sbg400612-KINASEa	본 발명의 한 실시양태는 염증, 암, 신경 질환, 성장 및 발생 결함, 피부 상처, 및 모낭 질환의 치료에 있어서 sbg400612-KINASEa의 용도이다. sbg400612-KINASEa와 밀접한 상동체는 쥐의 단백질 키나아제/안키린 (ankyrin) 상동체이다. 쥐의 단백질 키나아제/안키린 상동체는 각질 세포의 성장 및 이동을 자극하고, 암세포의 증식을 억제하고, 신생혈관형성 및 종양 혈관형성을 조절하고, 피부 염증 및 상피 세포 성장을 조절하며, HIV-1의 백혈구와의 결합을 억제할 수 있다. 쥐의 단백질 키나아제/안키린 상동체는 또한 염증, 암, 신경 질환, 성장 및 발생 결함, 피부 상처, 및 모낭 질환의 치료에 사용될 수도 있다 (Kumble A, Murison JG, Onrust R, Sleeman M, Strachan L and Watson JD. Novel polynucleotides useful for the treatment of various conditions including wounds and cancer. 허가 번호: Y76079 공개일:1999년 11월 4일).	암, 상처 치유 질환, 자가면역성 질환, 조혈 질환 및 감염

유전자 명칭	용도	관련 질환
sbg381373-ACRP	본 발명의 한 실시양태는 음식 섭취, 탄수화물 이화 및 지질 이화와 관련된 에너지 항상성의 복합체 균형 시스템에 있어서 sbg381373-ACRP의 용도이다. sbg381373-ACRP와 밀접한 상동체는 ACRP30 단백질이다. ACRP30 단백질은 음식 섭취, 탄수화물 이화 및 지질 이화와 관련된 에너지 항상성의 복합체 균형 시스템에 관여하는 인자일 수 있다. ACRP30은 구조적으로 보체 인자 C1q와 유사하며, 일련의 번역후 변화를 수행하는 거대한 호모-올리고머를 형성한다 (Scherer PE, Williams S, Fogliano M, Baldini G, Lodish HF; 1995; J Biol Chem 270:26746-9).	암, 감염, 자가면역성 질환, 조혈 질환, 상처 치유 질환, 염증, 비만 및 당뇨병
sbg401294-MEX-3	본 발명의 한 실시양태는 종양 형성, 세포에서 아팝토시스를 감소 또는 증가시키기 위한 아팝토시스 조절과 같은 질환 상태의 진단 및 치료를 위한 제품, 및 제약적 스크리닝을 위한 제품을 개발함에 있어서 sbg401294-MEX-3의 용도이다.	조혈 질환, 상처 치유 질환, 바이러스 및 박테리아 감염, 암, 종양 형성, 자가면역성 질환, 아팝토시스 억제
sbg247722-카드헤린(Cadherin)	본 발명의 한 실시양태는 골 대사 질환의 치료 및 진단에 있어서 sbg247722-카드헤린의 용도이다. sbg247722-카드헤린의 밀접한 상동체는 Ca2+ 의존성 세포 부착 단백질인 카드헤린이다.	조혈 질환, 상처 치유 질환, 바이러스 및 박테리아 감염, 암, 자가면역성 질환, 에너지 항상성 질환 및 골 대사 질환
sbg391057-THIPa	본 발명의 한 실시양태는 갑상선 호르몬 합성을 제어함에 있어서 sbg391057-THIPa의 용도이다. sbg391057-THIPa의 밀접한 상동체는 제노푸스 래비스 (Xenopus laevis) 갑상선 호르몬 유도 단백질이다. 제노푸스 래비스 갑상선 호르몬 유도 단백질은 제노푸스의 올챙이에서 갑상선 호르몬 합성을 제어하는 데 영향을 미치며, 변태의 생물학에 대한 식견을 제공한다 (Brown, D.D., Wang, Z., Furlow, J.D., Kanamori, A., Schwartzman, R.A., Remo, B.F. and Pinder, A. The thyroid hormone-induced tail resorption program during Xenopus laevis metamorphosis. Proc Natl Acad Sci USA 1996 Mar 5; 93(5):1924-9).	자가면역성 질환, 상처 치유 질환, 암, 감염 및 조혈 질환

유전자 명칭	용도	관련 질환
sbg378067-TGFc	본 발명의 한 실시양태는 암의 병인학, 및 세포 분화 및 발생 중 세포의 성장 제어에 있어서 sbg378067-TGFc의 용도이다. sbg378067-TGFc 단백질은 TGF-베타 족의 구성원에 대한 프로사이트 (prosite) 컨센서프 패턴 (PDOC00223)과 매우 유사한 패턴을 함유한다. TGF-베타 단백질은 성장 제어에 관여하는 것으로 알려져 있으며, 따라서 암의 병인학 (Anticancer Res 1999 Nov-Dec; 19(6A):4791-807), 세포 분화 및 발생에 관여한다. TGF-베타 신호전달 경로는 종양 억제 경로를 구성한다 (Cytokine Growth Factor Rev 2000 Apr 1; 11(1-2):159-168). sbg378067-TGFc의 밀접한 상동체는 TGF-베타 단백질이다.	암, 감염, 자가면역성 질환, 상처 치유 질환, 염증, 세포 퇴화 또는 부전, 예를 들어 말초 신경병증에서 기인한 신경 퇴화, 근위축성 측삭 경화증, 알츠하이머 질환, 파킨슨 질환, 헌팅톤 질환, 허혈성 뇌졸중, 급성 뇌손상, 급성 척수손상, 신경계 종양, 다발성 경화증 또는 감염 (바이러스, 박테리아, 진균, 기생충)의 예방 또는 치료, 호산구 결핍증, 빈혈, 혈소판 감소증 또는 간세포 부전으로 인한 조혈 세포 퇴화 또는 부전, 심근병증 또는 울혈성 심부전으로 인한 심근 퇴화 또는 부전, 말초 신경 외상 또는 손상, 신경독소에의 노출, 대사 질환, 예를 들어 당뇨병 또는 신부전, 및 감염제에 의한 손상

특정 조직에서 mRNA 발현에 기초한 부가의 질환

조직 발현	부가의 질환
뇌	알츠하이머, 주변핵상마비, 헌팅톤 질환, 근긴장성 이영양증, 식욕 부진, 우울증, 정신분열증, 투통, 건망증, 불안 장애, 수면 장애, 다발성 경화증을 비롯한 신경 및 정신 질환
심장	울혈성 심부전, 확장성 심근병증, 심부정맥, 호지슨 (Hodgson) 질환, 심근경색을 비롯한 심혈관계 질환
폐	천식, 만성 폐색성 폐질환, 낭포성 섬유증, 급성 기관지염, 성인성 호흡곤란 증후군을 비롯한 호흡기 질환
간	지질대사 이상, 고콜레스테롤 혈증, 경화증, 간성 뇌병증, 지방 간경변, 바이러스성 및 비바이러스성 간염, Ⅱ형 진성 당뇨병, 글루코스 허용도 손상
신장	급성 및 만성 신부전, 급성 세뇨관 괴사, 시스틴뇨증, 판코니 (Fanconi) 증후군, 사구체 신염, 신세포 암종, 신혈관 고혈압을 비롯한 신장병
골격근	율렌버그 (Eulenburg) 질환, 저혈당증, 비만, 건염, 주기성 마비, 악성 고열증, 선천성 이상근긴장증, 선천성 근긴장증
소장	선천성 근긴장증, 장폐색, 장폐쇄, 열대성 스프루우 (Sprue), 위막성 장결장염을 비롯한 위장 질환
비장/림프	림프관 확장증, 비기능 항진증, 혈관종, 강직성 척추염, 호지킨 질환, 마크로글로불린혈증, 악성 림프종, 류마티스성 관절염
태반	융모암, 포상기태, 전치태반
정소	고환암, 남성 생식 질환 (낮은 농도의 테스토스테론 및 남성 불임증 포함)
췌장	당뇨성 케토산혈증, 1형 및 2형 당뇨병, 비만, 글루코스 허용도 손상

Claims

(a) 표 1에 기재된 서열을 포함하는 폴리뉴클레오티드에 의해 코딩되는 단리된 폴리펩티드,

(b) 표 1에 기재된 폴리펩티드 서열을 포함하는 단리된 폴리펩티드, 및

(c) 표 1에 기재된 유전자의 폴리펩티드 서열

로 이루어진 군으로부터 선택되는 단리된 폴리펩티드.
(a) 표 1에 기재된 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리된 폴리뉴클레오티드,

(b) 표 1에 기재된 유전자의 단리된 폴리뉴클레오티드,

(c) 표 1에 기재된 폴리펩티드를 코딩하는 폴리뉴클레오티드 서열을 포함하는 단리된 폴리뉴클레오티드,

(d) 표 1에 기재된 폴리펩티드를 코딩하는 단리된 폴리뉴클레오티드,

(e) 상기 폴리뉴클레오티드 (a) 내지 (d)의 RNA 등가물인 폴리뉴클레오티드,

또는 상기 단리된 폴리뉴클레오티드에 상보적인 폴리뉴클레오티드 서열

로 이루어진 군으로부터 선택되는 단리된 폴리뉴클레오티드.
적합 숙주 세포 내에 존재하게 될 때 제1항의 폴리펩티드를 생산할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현 벡터.
제1항의 폴리펩티드를 생산할 수 있는 폴리뉴클레오티드를 포함하는 발현 벡터를, 적당한 배양 조건하에서 숙주 세포가 상기 폴리펩티드를 생산하도록 세포에 도입하는 단계를 포함하는, 재조합 숙주 세포의 제조 방법.
제4항의 방법에 의해 제조된 재조합 숙주 세포.
상기항의 폴리펩티드를 발현하는, 제5항에 따른 재조합 숙주 세포의 세포막.
상기항의 폴리펩티드를 생산하기에 충분한 조건하에서 제5항의 숙주 세포를 배양하는 단계, 및 배양액으로부터 상기 폴리펩티드를 수거하는 단계를 포함하는 폴리펩티드의 생산 방법.