[go: up one dir, main page]

KR102889470B1 - 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰 - Google Patents

폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰

Info

Publication number
KR102889470B1
KR102889470B1 KR1020247004947A KR20247004947A KR102889470B1 KR 102889470 B1 KR102889470 B1 KR 102889470B1 KR 1020247004947 A KR1020247004947 A KR 1020247004947A KR 20247004947 A KR20247004947 A KR 20247004947A KR 102889470 B1 KR102889470 B1 KR 102889470B1
Authority
KR
South Korea
Prior art keywords
cases
solvent
delete delete
polynucleotide
synthesis
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
KR1020247004947A
Other languages
English (en)
Other versions
KR20240024357A (ko
Inventor
유진 피 마쉬
피에르 에프 인더뮐레
빌 제임스 펙
Original Assignee
트위스트 바이오사이언스 코포레이션
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 filed Critical 트위스트 바이오사이언스 코포레이션
Priority to KR1020257038617A priority Critical patent/KR20250165699A/ko
Publication of KR20240024357A publication Critical patent/KR20240024357A/ko
Application granted granted Critical
Publication of KR102889470B1 publication Critical patent/KR102889470B1/ko
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Classifications

    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J19/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J19/0046—Sequential or parallel reactions, e.g. for the synthesis of polypeptides or polynucleotides; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making molecular arrays
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00277—Apparatus
    • B01J2219/00279—Features relating to reactor vessels
    • B01J2219/00306—Reactor vessels in a multiple arrangement
    • B01J2219/00313—Reactor vessels in a multiple arrangement the reactor vessels being formed by arrays of wells in blocks
    • B01J2219/00315—Microtiter plates
    • B01J2219/00317—Microwell devices, i.e. having large numbers of wells
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00277—Apparatus
    • B01J2219/00351—Means for dispensing and evacuation of reagents
    • B01J2219/00378—Piezoelectric or ink jet dispensers
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00277—Apparatus
    • B01J2219/00497—Features relating to the solid phase supports
    • B01J2219/00504—Pins
    • B01J2219/00509—Microcolumns
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00277—Apparatus
    • B01J2219/00497—Features relating to the solid phase supports
    • B01J2219/00527—Sheets
    • B01J2219/00533—Sheets essentially rectangular
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
    • B01J2219/00596—Solid-phase processes
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
    • B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
    • B01J2219/00605—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being directly bound or immobilised to solid supports
    • B01J2219/00632—Introduction of reactive groups to the surface
    • B01J2219/00637—Introduction of reactive groups to the surface by coating it with another layer
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
    • B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
    • B01J2219/00653—Making arrays on substantially continuous surfaces the compounds being bound to electrodes embedded in or on the solid supports
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
    • B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
    • B01J2219/00659—Two-dimensional arrays
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00583—Features relative to the processes being carried out
    • B01J2219/00603—Making arrays on substantially continuous surfaces
    • B01J2219/00659—Two-dimensional arrays
    • B01J2219/00662—Two-dimensional arrays within two-dimensional arrays
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00709—Type of synthesis
    • B01J2219/00716—Heat activated synthesis
    • B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
    • B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
    • B01J—CHEMICAL OR PHYSICAL PROCESSES, e.g. CATALYSIS OR COLLOID CHEMISTRY; THEIR RELEVANT APPARATUS
    • B01J2219/00—Chemical, physical or physico-chemical processes in general; Their relevant apparatus
    • B01J2219/00274—Sequential or parallel reactions; Apparatus and devices for combinatorial chemistry or for making arrays; Chemical library technology
    • B01J2219/00718—Type of compounds synthesised
    • B01J2219/0072—Organic compounds
    • B01J2219/00722—Nucleotides

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
  • Physical Or Chemical Processes And Apparatus (AREA)

Abstract

올리고뉴클레오타이드와 같은 고품질 빌딩 블록의 제조를 위한 장치가 본원에 기재된다. 나노 크기 장치는 반응 조건의 선택적 제어를 허용한다. 또한, 본원에 기재된 방법 및 장치는 매우 정확한 핵산의 큰 라이브러리의 신속한 제작을 허용한다.

Description

폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰{HEATED NANOWELLS FOR POLYNUCLEOTIDE SYNTHESIS}
상호 참조
본 출원은 2017년 10월 20일에 출원된 미국 가출원 제62/575,287호의 이익을 주장하며, 이는 그 전체가 참조로 본원에 포함되어 있다.
서열 목록
본 출원은 ASCII 형식으로 전자적으로 제출된 서열 목록을 포함하며, 이는 그 전체가 참조로 본원에 포함되어 있다. 2018년 10월 16일에 생성된 상기 ASCII 사본의 이름은 44854-744_601_SL.txt이며, 크기는 685 바이트이다.
드 노보 유전자 합성은 기본적인 생물학적 연구 및 생명공학 응용을 위한 강력한 도구이다. 소규모로 비교적 짧은 단편을 설계 및 합성하기 위한 다양한 방법이 알려져 있지만, 이러한 기술들은 종종 예측성, 확장성, 자동화, 속도, 정확성, 및 비용으로 고통받고 있다.
표면을 포함하는 고체 지지체; 상기 표면 상에 위치한 폴리뉴클레오타이드 연장을 위한 복수의 구조물로서, 각각의 구조물은 약 10 nm 내지 약 1000 nm의 폭을 갖고, 각각의 구조물은 가열 유닛과 접촉하며, 가열 유닛은 적어도 하나의 전극을 포함하는 것인 구조물; 및 상기 표면에 걸쳐 분포된 용매로서, 극성 용매인 용매를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 장치가 본원에 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 30,000개의 좌위(loci)를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 50,000개의 좌위를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 100,000개의 좌위를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 200,000개의 좌위를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 1,000,000개의 좌위를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 하나 이상의 전극이 하나 이상의 개별 좌위를 가열하는 어드레서블 전극(addressable electrode)인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 고체 지지체가 냉각 유닛을 추가로 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 10 nm 내지 약 1000 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 100 nm 내지 약 500 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 20 nm 내지 약 300 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 100 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 200 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 500 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 각각의 구조물은 3차원 구조물을 포함하고, 3차원 구조물은 나노웰(nanowell), 나노와이어(nanowire), 나노포스트(nanopost), 또는 나노로드(nanorod)인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 약 0.5 내지 약 1.5 g/mL의 밀도를 갖는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 니트릴기를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 트리메틸아세토니트릴인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 5℃ 내지 18℃의 용융 온도를 갖는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 10℃ 내지 18℃의 용융 온도를 갖는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 15℃ 내지 18℃의 용융 온도를 갖는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 장치가 폴리뉴클레오타이드 합성에 사용되고, 폴리뉴클레오타이드 합성이 복수의 신장(elongation) 단계를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 신장 단계 동안 제거되지 않는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 본원에 기재된 장치를 사용한 폴리뉴클레오타이드 합성 방법이 본원에 추가로 제공된다.
표면을 포함하는 고체 지지체; 상기 표면 상에 위치한 폴리뉴클레오타이드 연장을 위한 복수의 구조물로서, 각각의 구조물은 약 10 nm 내지 약 1000 nm의 폭을 갖고, 각각의 구조물은 가열 유닛과 접촉하며, 가열 유닛은 적어도 하나의 전극을 포함하는 것인 구조물; 및 상기 표면에 걸쳐 분포된 용매로서, 약 18℃ 이하의 용융 온도를 갖는 것인 용매를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 장치가 본원에 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 30,000개의 좌위를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 50,000개의 좌위를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 100,000개의 좌위를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 200,000개의 좌위를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 1,000,000개의 좌위를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 하나 이상의 전극이 하나 이상의 개별 좌위를 가열하는 어드레서블 전극인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 고체 지지체가 냉각 유닛을 추가로 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 10 nm 내지 약 1000 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 100 nm 내지 약 500 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 20 nm 내지 약 300 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 100 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 200 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 500 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 각각의 구조물은 3차원 구조물을 포함하고, 3차원 구조물은 나노웰, 나노와이어, 나노포스트, 또는 나노로드인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 약 0.5 내지 약 1.5 g/mL의 밀도를 갖는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 극성 용매인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 니트릴기를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 트리메틸아세토니트릴인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 5℃ 내지 18℃의 용융 온도를 갖는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 10℃ 내지 18℃의 용융 온도를 갖는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 15℃ 내지 18℃의 용융 온도를 갖는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 장치가 폴리뉴클레오타이드 합성에 사용되고, 폴리뉴클레오타이드 합성이 복수의 신장 단계를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 신장 단계 동안 제거되지 않는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 본원에 기재된 장치를 사용한 폴리뉴클레오타이드 합성 방법이 본원에 추가로 제공된다.
표면을 포함하는 고체 지지체; 상기 표면 상에 위치한 폴리뉴클레오타이드 연장을 위한 복수의 구조물로서, 각각의 구조물은 약 10 nm 내지 약 1000 nm의 폭을 갖고, 각각의 구조물은 가열 유닛과 접촉하며, 가열 유닛은 적어도 하나의 전극을 포함하는 것인 구조물; 및 상기 표면에 걸쳐 분포된 용매로서, 약 82℃ 이하의 비등 온도를 갖는 것인 용매를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 장치가 본원에 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 30,000개의 좌위를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 50,000개의 좌위를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 100,000개의 좌위를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 200,000개의 좌위를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 1,000,000개의 좌위를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 하나 이상의 전극이 하나 이상의 개별 좌위를 가열하는 어드레서블 전극인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 고체 지지체가 냉각 유닛을 추가로 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 10 nm 내지 약 1000 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 100 nm 내지 약 500 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 20 nm 내지 약 300 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 100 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 200 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 임의의 2개의 구조물의 중심 사이의 거리가 약 500 nm인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 각각의 구조물은 3차원 구조물을 포함하고, 3차원 구조물은 나노웰, 나노와이어, 나노포스트, 또는 나노로드인 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 약 0.5 내지 약 1.5 g/mL의 밀도를 갖는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 0℃ 내지 82℃의 비등 온도를 갖는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 30℃ 내지 82℃의 비등 온도를 갖는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 55℃ 내지 82℃의 비등 온도를 갖는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 장치가 폴리뉴클레오타이드 합성에 사용되고, 폴리뉴클레오타이드 합성이 복수의 신장 단계를 포함하는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 용매가 신장 단계 동안 제거되지 않는 장치가 본원에 추가로 제공된다. 본원에 기재된 장치를 사용한 폴리뉴클레오타이드 합성 방법이 본원에 추가로 제공된다.
폴리뉴클레오타이드의 라이브러리를 위한 미리 결정된 서열을 제공하는 단계; 표면을 포함하는 기판을 제공하는 단계; 및 상기 표면으로부터 연장되는 폴리뉴클레오타이드의 라이브러리를 합성하는 단계로서, 탈블로킹(deblocking) 단계가 발생하기 전에 상이한 뉴클레오타이드가 순차적으로 첨가되는 것인 단계를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 합성 방법이 본원에 제공된다. 합성이 용매를 추가로 포함하고, 용매가 적어도 하나의 상 변화를 겪는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 극성 용매인 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 트리메틸아세토니트릴인 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 15℃ 내지 18℃의 용융 온도를 갖는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 0.5 내지 1.5 g/mL의 밀도를 갖는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 폴리뉴클레오타이드 합성이 복수의 신장 단계를 추가로 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 신장 단계 동안 제거되지 않는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 탈블로킹 단계가 발생하기 전에 적어도 2개의 상이한 뉴클레오타이드가 순차적으로 첨가되는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 탈블로킹 단계가 발생하기 전에 적어도 3개의 상이한 뉴클레오타이드가 순차적으로 첨가되는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 탈블로킹 단계가 발생하기 전에 적어도 4개의 상이한 뉴클레오타이드가 순차적으로 첨가되는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 모든 표면이 신장 단계 동안 동일한 뉴클레오타이드와 접촉되는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 적어도 하나의 상 변화가 용융 또는 동결인 방법이 본원에 추가로 제공된다. 적어도 하나의 상 변화가 비등 또는 응축인 방법이 본원에 추가로 제공된다.
본원에 기재된 장치를 사용한 폴리뉴클레오타이드 합성 방법이 본원에 제공된다.
폴리뉴클레오타이드의 라이브러리를 위한 미리 결정된 서열을 제공하는 단계; 표면을 포함하는 기판을 제공하는 단계; 상기 표면으로부터 연장되는 폴리뉴클레오타이드의 라이브러리를 합성하는 단계로서, 고체상의 용매가 표면의 적어도 하나의 영역으로부터 연장되는 적어도 하나의 폴리뉴클레오타이드의 탈블로킹을 방지하고, 상기 용매는 약 18℃ 이하의 용융 온도를 갖는 것인 단계를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 합성 방법이 본원에 제공된다. 표면으로부터 연장되는 폴리뉴클레오타이드의 라이브러리를 합성하는 단계가 표면을 제1 뉴클레오타이드 포스포르아미다이트와 접촉시키는 단계를 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 표면으로부터 연장되는 폴리뉴클레오타이드의 라이브러리를 합성하는 단계가 표면을 제2 뉴클레오타이드 포스포르아미다이트와 접촉시키는 단계로서, 용매는 제1 뉴클레오타이드 포스포르아미다이트와의 접촉과 제2 뉴클레오타이드 포스포르아미다이트와의 접촉 사이에서 제거되지 않는 것인 단계를 추가로 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 표면으로부터 연장되는 폴리뉴클레오타이드의 라이브러리를 합성하는 단계가 표면의 적어도 하나의 영역에 존재하는 용매를 용융시키는 단계, 및 적어도 하나의 영역에서의 표면으로부터 연장되는 적어도 하나의 연장된 폴리뉴클레오타이드를 탈블로킹하는 단계를 추가로 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 약 15℃ 이하의 용융 온도를 갖는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 약 10℃ 이하의 용융 온도를 갖는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 5℃ 내지 18℃의 용융 온도를 갖는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 10℃ 내지 18℃의 용융 온도를 갖는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 15℃ 내지 18℃의 용융 온도를 갖는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 30,000개의 좌위를 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 50,000개의 좌위를 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 100,000개의 좌위를 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 200,000개의 좌위를 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 1,000,000개의 좌위를 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다.
폴리뉴클레오타이드의 라이브러리를 위한 미리 결정된 서열을 제공하는 단계; 표면을 포함하는 기판을 제공하는 단계; 상기 표면으로부터 연장되는 폴리뉴클레오타이드의 라이브러리를 합성하는 단계로서, 기체상의 용매가 표면의 적어도 하나의 영역으로부터 연장되는 적어도 하나의 폴리뉴클레오타이드의 탈블로킹을 방지하고, 상기 용매는 약 82℃ 이하의 비등 온도를 갖는 것인 단계를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 합성 방법이 본원에 제공된다. 표면으로부터 연장되는 폴리뉴클레오타이드의 라이브러리를 합성하는 단계가 표면을 제1 뉴클레오타이드 포스포르아미다이트와 접촉시키는 단계를 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 표면으로부터 연장되는 폴리뉴클레오타이드의 라이브러리를 합성하는 단계가 표면을 제2 뉴클레오타이드 포스포르아미다이트와 접촉시키는 단계로서, 용매는 제1 뉴클레오타이드 포스포르아미다이트와의 접촉과 제2 뉴클레오타이드 포스포르아미다이트와의 접촉 사이에서 제거되지 않는 것인 단계를 추가로 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 표면으로부터 연장되는 폴리뉴클레오타이드의 라이브러리를 합성하는 단계가 표면의 적어도 하나의 영역에 존재하는 용매를 응축시키는 단계, 및 적어도 하나의 영역에서의 표면으로부터 연장되는 적어도 하나의 연장된 폴리뉴클레오타이드를 탈블로킹하는 단계를 추가로 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 약 75℃ 이하의 비등 온도를 갖는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 약 65℃ 이하의 비등 온도를 갖는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 0℃ 내지 82℃의 비등 온도를 갖는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 30℃ 내지 82℃의 비등 온도를 갖는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 용매가 55℃ 내지 82℃의 비등 온도를 갖는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 30,000개의 좌위를 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 50,000개의 좌위를 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 100,000개의 좌위를 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 200,000개의 좌위를 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다. 표면이 핵산 합성을 위한 적어도 1,000,000개의 좌위를 포함하는 방법이 본원에 추가로 제공된다.
참조에 의한 포함
본 명세서에 언급된 모든 간행물, 특허, 및 특허 출원은 각각의 개별 간행물, 특허, 또는 특허 출원이 구체적으로 그리고 개별적으로 참조로 포함되는 것으로 표시되는 것과 동일한 정도로 본원에 참조로 포함된다.
본 발명의 신규한 특징은 첨부된 청구범위에 구체적으로 제시되어 있다. 본 발명의 특징 및 이점은 본 발명의 원리가 이용되는 예시적인 구현예를 제시하는 다음의 상세한 설명 및 첨부 도면을 참조하여 더 잘 이해될 것이다:
도 1은 각각 평평한 특징부(좌위), 채널, 또는 웰을 갖는 강성 구조물을 도시한다.
도 2는 클러스터 증폭으로부터 폴리뉴클레오타이드 라이브러리를 생성하는 개략도를 도시한다.
도 3a는 어드레서블 웰을 갖는 가열된 나노웰 구조물의 정면 단면을 도시한다.
도 3b는 어드레서블 웰을 갖는 가열된 나노웰 구조물의 우측 단면을 도시한다.
도 4a는 어드레서블 웰을 갖는 가열된 나노웰 구조물의 정면 단면을 도시한다.
도 4b는 어드레서블 나노포스트를 갖는 가열된 나노포스트 구조물의 정면 단면을 도시한다.
도 5는 어드레서블 나노로드를 갖는 가열된 나노로드 구조물의 정면 단면을 도시한다.
도 6은 어드레서블 하부 접촉에 부착된 나노와이어 구조물의 정면 단면을 도시한다.
도 7은 폴리뉴클레오타이드 합성 물질 증착 장치를 도시한다.
도 8은 폴리뉴클레오타이드 합성 워크플로우를 도시한다.
도 9는 컴퓨터 시스템을 도시한다.
도 10은 컴퓨터 시스템의 아키텍처를 예시하는 블록도를 도시한다.
도 11은 복수의 컴퓨터 시스템, 복수의 휴대폰 및 개인 데이터 단말기, 및 네트워크 연결 저장장치(Network Attached Storage, NAS)를 통합하도록 구성된 네트워크를 도시한다.
도 12는 공유 가상 주소 메모리 공간을 사용하는 멀티프로세서 컴퓨터 시스템을 도시한다.
정의
달리 정의하지 않는 한, 본원에 사용된 모든 기술 및 과학 용어는 이들 발명의 속하는 기술 분야에서 통상의 기술을 가진 자에 의해 일반적으로 이해되는 것과 동일한 의미를 갖는다.
본 개시내용 전반에 걸쳐, 수치 특징은 범위 형식으로 제시된다. 범위 형식의 기재는 단지 편의성 및 간결성을 위한 것으로 이해되어야 하며 어떤 구현예의 범위에 대한 융통성 없는 제한으로 해석되지 않아야 한다. 따라서, 범위의 기재는 문맥이 달리 명백히 나타내지 않는 한 모든 가능한 하위범위뿐만 아니라 상기 범위 내의 개별 수치를 하한의 10분의 1까지 구체적으로 개시한 것으로 간주되어야 한다. 예를 들어, 1 내지 6과 같은 범위의 기재는 1 내지 3, 1 내지 4, 1 내지 5, 2 내지 4, 2 내지 6, 3 내지 6 등과 같은 하위범위뿐만 아니라 상기 범위 내의 개별 값, 예를 들어, 1.1, 2, 2.3, 5, 및 5.9를 구체적으로 개시한 것으로 간주되어야 한다. 이것은 범위의 폭에 관계없이 적용된다. 이들 개재 범위의 상한 및 하한은 독립적으로 더 작은 범위에 포함될 수 있고, 또한 언급된 범위에서 임의의 명시적으로 배제된 한계에 따라 본 발명에 포함된다. 언급된 범위가 한계 중 하나 또는 둘 모두를 포함하는 경우, 문맥이 달리 명확하게 나타내지 않는 한 상기 포함된 범위 중 하나 또는 둘 모두를 제외하는 범위가 또한 본 발명에 포함된다.
본원에 사용된 용어는 단지 특정 구현예를 설명하기 위한 것이며 임의의 구현예를 제한하고자 하는 것이 아니다. 본원에 사용된 바와 같이, 단수형 "a," "an" 및 "the"는 문맥이 달리 명확히 나타내지 않는 한 복수형도 포함하는 것으로 의도된다. 용어 "포함하다" 및/또는 "포함하는"은 본 명세서에서 사용될 때 언급된 특징, 물품, 단계, 동작, 요소, 및/또는 구성요소의 존재를 명시하지만, 하나 이상의 다른 특징, 물품, 단계, 동작, 요소, 구성요소, 및/또는 이의 그룹의 존재 또는 추가를 배제하지 않는다는 것이 추가적으로 이해될 것이다. 본원에 사용된 바와 같이, 용어 "및/또는"은 하나 이상의 관련된 열거된 항목의 임의의 및 모든 조합을 포함한다.
문맥으로부터 명시적으로 언급되지 않거나 명백하지 않는 한, 본원에 사용된 바와 같이, 숫자 또는 숫자의 범위와 관련하여 용어 "약"은 언급된 숫자 및 숫자들의 +/- 10%, 또는 범위에 대해 열거된 값에 대한 열거된 하한보다 10% 낮고 열거된 상한보다 10% 높은 것을 의미하는 것으로 이해된다.
본원에 사용된 바와 같이, 용어 "미리 선택된 서열", "미리 정의된 서열" 또는 "미리 결정된 서열"은 상호교환적으로 사용된다. 상기 용어는 중합체의 합성 또는 어셈블리 전에 중합체의 서열이 공지되고 선택되는 것을 의미한다. 특히, 본 발명의 다양한 양태는 핵산 분자의 제조와 관련하여 본원에 주로 기재되며, 올리고뉴클레오타이드 또는 폴리뉴클레오타이드의 서열은 핵산 분자의 합성 또는 어셈블리 전에 공지되고 선택된다.
합성(즉, 드 노보 합성되거나 화학적으로 합성된) 폴리뉴클레오타이드의 생산을 위한 방법 및 조성물이 본원에 제공된다. 용어 올리고뉴클레오타이드, 올리고, 및 폴리뉴클레오타이드는 전반에 걸쳐 동의어인 것으로 정의된다.　본원에 기재된 합성된 폴리뉴클레오타이드의 라이브러리는 하나 이상의 유전자 또는 유전자 단편을 총괄적으로 코딩하는 복수의 폴리뉴클레오타이드를 포함할 수 있다. 일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드 라이브러리는 코딩 또는 비코딩 서열을 포함한다. 일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드 라이브러리는 복수의 cDNA 서열을 코딩한다.　cDNA 서열이 기반으로 하는 참조 유전자 서열은 인트론을 함유할 수 있는 반면, cDNA 서열은 인트론을 배제한다. 본원에 기재된 폴리뉴클레오타이드는 유기체로부터의 유전자 또는 유전자 단편을 코딩할 수 있다.　예시적인 유기체는, 비제한적으로, 원핵생물(예컨대, 박테리아) 및 진핵생물(예컨대, 마우스, 토끼, 인간, 및 비인간 영장류)을 포함한다. 일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드 라이브러리는 하나 이상의 폴리뉴클레오타이드를 포함하고, 하나 이상의 폴리뉴클레오타이드 각각은 다수의 엑손에 대한 서열을 코딩한다. 본원에 기재된 라이브러리 내의 각각의 폴리뉴클레오타이드는 상이한 서열, 즉, 동일하지 않은 서열을 코딩할 수 있다.　일부 경우에, 본원에 기재된 라이브러리 내의 각각의 폴리뉴클레오타이드는 라이브러리 내의 또 다른 폴리뉴클레오타이드의 서열에 상보적인 적어도 하나의 부분을 포함한다. 본원에 기재된 폴리뉴클레오타이드 서열은 달리 언급되지 않는 한 DNA 또는 RNA를 포함한다. 합성(즉, 드 노보 합성된) 유전자의 생산을 위한 방법 및 조성물이 본원에 제공된다. 합성 유전자를 포함하는 라이브러리는, 2개 이상의 이중 가닥 폴리뉴클레오타이드를 조합("스티칭(stitching)")하여 더 큰 DNA 단위(즉, 샤시(chassis))를 생성하는, PCA, 비-PCA 유전자 어셈블리 방법 또는 계층적 유전자 어셈블리와 같은 본원의 다른 곳에 더 상세히 기재된 다양한 방법에 의해 구축될 수 있다. 큰 작제물의 라이브러리는 적어도 1, 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 15, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 125, 150, 175, 200, 250, 300, 400, 500 kb 이상의 길이인 폴리뉴클레오타이드를 포함할 수 있다. 큰 작제물은 약 5000, 10000, 20000 또는 50000개의 염기쌍의 독립적으로 선택된 상한에 의해 제한될 수 있다. 많은 폴리펩타이드-세그먼트 코딩 뉴클레오타이드 서열, 예컨대 비리보솜 펩타이드(NRP)를 코딩하는 서열, 비리보솜 펩타이드-합성효소(NRPS) 모듈 및 합성 변이체, 항체와 같은 다른 모듈 단백질의 폴리펩타이드 세그먼트, 비코딩 DNA 또는 RNA를 포함하는 다른 단백질 패밀리로부터의 폴리펩타이드 세그먼트를 코딩하는 서열, 예컨대 조절 서열, 예컨대 프로모터, 전사 인자, 인핸서, siRNA, shRNA, RNAi, miRNA, 마이크로RNA로부터 유래된 작은 핵소체(small nucleolar) RNA, 또는 관심있는 임의의 기능적 또는 구조적 DNA 또는 RNA 단위의 합성. 다음은 폴리뉴클레오타이드의 비제한적인 예이다: 유전자 또는 유전자 단편의 코딩 또는 비코딩 영역, 유전자간(intergenic) DNA, 연결 분석으로부터 정의된 좌위, 엑손, 인트론, 메신저 RNA(mRNA), 전달 RNA, 리보솜 RNA, 짧은 간섭 RNA(siRNA), 짧은 헤어핀 RNA(shRNA), 마이크로-RNA(miRNA), 작은 핵소체 RNA, 리보자임, 일반적으로 메신저 RNA(mRNA)의 역전사에 의해 또는 증폭에 의해 수득된, mRNA의 DNA의 표현인 상보적 DNA(cDNA); 합성적으로 또는 증폭에 의해 생산된 DNA 분자, 게놈 DNA, 재조합 폴리뉴클레오타이드, 분지된 폴리뉴클레오타이드, 플라스미드, 벡터, 임의의 서열의 단리된 DNA, 임의의 서열의 단리된 RNA, 핵산 프로브, 및 프라이머. 본원에 지칭된 유전자 또는 유전자 단편을 코딩하는 cDNA는 상응하는 게놈 서열에서 발견된 개재 인트론 서열이 없는 엑손 서열(들)을 코딩하는 적어도 하나의 영역을 포함할 수 있다. 대안적으로, cDNA에 대한 상응하는 게놈 서열은 처음에 인트론 서열이 결여될 수 있다.
폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 장치
상 변화(phase change) 과정에 기초하여 어드레서블 위치에서 폴리뉴클레오타이드를 선택적으로 합성하기 위한 공정 및 장치가 본원에 제공된다. 선택성은 활성 폴리뉴클레오타이드 합성 표면 상에서의 합성을 블로킹함으로써, 반응 웰에서 액체 용매와 같은 반응 용매 상을 주변 용매에서의 시약에의 노출을 제한하는 고체 또는 기체와 같은 비반응성 상으로 전환시킴으로써 달성된다. 반응 웰에서의 가열 또는 냉각은 폴리뉴클레오타이드 합성 표면에 노출된 용매의 물리적 상태의 변화를 제공한다. 반복적인 합성 프로토콜 동안, 로컬 어드레서블 히터(예를 들어, 하나 이상의 전극 또는 가열 요소를 포함하는 가열 유닛)를 포함하는 나노구조물과 같은 구조물은 용매를 용융 또는 비등시켜, 뉴클레오사이드 커플링 및 연장 반응과 같은 하류 상호작용을 위해 합성 표면 상의 정의된 위치에서 접근성을 제공하는데 사용된다.
폴리뉴클레오타이드 합성 또는 연장을 위한 복수의 특징부(좌위)를 갖는 표면을 갖는 구조물이 본원에 제공된다. 일부 경우에 구조물 상의 각각의 특징부는 특징부의 영역에서 주변 용매의 상을 제어하기 위한 나노구조물과 같은 하나 이상의 더 작은 구조물을 포함한다. 구조물(101)의 일부에서의 각각의 특징부는 실질적으로 평면인 특징부(103), 웰(105), 또는 채널을 포함할 수 있다. 도 1을 참고한다. 하나의 경우에서, 구조물의 각각의 특징부는 약 10 nm 내지 약 10 μm의 폭 및 약 10 nm 내지 약 10 μm의 각각의 특징부의 중심 사이의 거리를 갖는다. 특징부의 단면 형상은, 비제한적으로, 원형, 직사각형, 삼각형 또는 다각형을 포함할 수 있다. 특징부의 형상은 테이퍼형(tapered), 원형, 웰, 채널, 와이어, 로드, 폴(pole), 원뿔, 또는 이의 임의의 조합일 수 있다.
일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드는 폴리뉴클레오타이드 연장을 위해 좌위의 클러스터 상에서 합성되고, 방출된 후, 증폭 반응, 예컨대, PCR에 적용된다. 클러스터로부터 폴리뉴클레오타이드를 합성하는 예시적인 워크플로우가 도 2에 도시되어 있다. 규소 플레이트(201)는 다수의 클러스터(203)를 포함한다. 각각의 클러스터 내에는 다수의 좌위(221)가 있다. 폴리뉴클레오타이드는 클러스터(203)로부터 플레이트(201) 상에서 드 노보 합성된다(207). 폴리뉴클레오타이드는 절단되고(211) 플레이트로부터 제거되어(213) 방출된 폴리뉴클레오타이드의 집단(215)을 형성한다. 이후, 방출된 폴리뉴클레오타이드의 집단(215)은 증폭되어(217) 증폭된 폴리뉴클레오타이드의 라이브러리(219)를 형성한다.
제1 구조물에서, 고체-액체 상 제어를 위한 가열된 나노웰은 폴리뉴클레오타이드 합성을 제공한다. 도 3a 및 도 3b, 장치(300)를 참고한다. 구조물(301)의 일부에서의 각각의 특징부는 실질적으로 평면인 특징부(303)(예컨대, 평평한), 웰(305), 또는 채널일 수 있다. 일부 경우에, 실질적으로 평면인 특징부(303)는 제1 물질(307), 제2 물질(309), 제3 물질(311) 및 제4 물질(313)을 포함하고, 제3 물질(311)은 제1 물질(307) 및 제2 물질(309)의 제1 부분을 덮으며, 제4 물질(313)은 제1 물질(307) 및 제2 물질(309)의 제2 부분을 덮는다. 제1(307), 제2(309), 제3(311), 및 제4(313) 물질은 도체, 반도체, 또는 절연체를 포함한다. 일부 경우에, 제1 물질(307)은 규소와 같은 반도체 물질을 포함한다. 일부 경우에, 제2 물질(309)은 하부 어드레서블 전극의 2개 이상의 열(column)을 형성한다. 일부 경우에, 제2 물질(309)은 금속과 같은 도체를 포함한다. 일부 경우에, 제2 물질(309)은 텅스텐을 포함한다. 일부 경우에, 제3 물질(311)은 이산화규소와 같은 절연체를 포함한다. 일부 경우에, 제4 물질(313)은 상부 어드레서블 전극의 2개의 이상의 행(row)을 형성한다. 일부 경우에, 제4 물질(313)은 금속과 같은 도체를 포함한다. 일부 경우에, 제3 물질(311)은 질화티타늄을 포함한다. 사양과 일관되게 다른 금속, 반도체, 및 절연체가 사용된다.
일부 경우에, 하부 어드레서블 전극(309)의 하나 이상의 열, 및 상부 어드레서블 전극(313)의 하나 이상의 행에 전류를 동시에 인가하는 것은 하나 이상의 하부 전극(309)의 상응하는 열, 및 하나 이상의 상부 전극(313)의 상응하는 행의 교차점과 관련된 하나 이상의 웰(305)을 가열한다. 일부 양태에서, 제1 물질(307) 및 하부 전극(309)은 합성 표면(302)으로부터 냉각 요소(또는 냉각 유닛, 또는 콜드 척(cold chuck))로 열을 전도하는 역할을 한다. 일부 경우에, 늘어선 웰(305)은 히터로서 작용하고 뉴클레오타이드 결합 화학의 증착에 대해 선택적이다. 일부 경우에, SiO2와 같은 절연체는 웰(305) 및 장치(300)의 상부 표면을 열적으로 분리하는데 사용된다. 일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드의 선택적 합성을 위한 장치는 하나 이상의 어드레서블 전극으로 구성된 하나 이상의 가열 요소를 포함한다.
제2 구조물에서, 액체-기체 상 제어를 위한 가열된 나노웰은 폴리뉴클레오타이드 합성을 제공한다. 도 4a를 참고한다. 장치(400)의 일부에서의 각각의 특징부는 웰(401), 또는 채널일 수 있다. 일부 경우에, 웰은 실린더 형상이다. 일부 경우에, 장치(400)는 상부 접촉(403), 제1 가열 요소(404), 제1 물질(405), 제2 가열 요소(406), 하부 접촉(408), 및 제2 물질(409)을 포함하고, 상부 접촉(403)은 제1 물질(405)의 제1 부분 및 제1 가열 요소(404)의 제1 부분을 덮으며, 제1 가열 요소(404)는 제2 가열 요소(406)의 제1 부분, 및 제1 물질(405)의 제2 부분을 덮고, 제1 물질(405)은 제2 물질(409)의 제1 부분을 덮으며, 하부 접촉(408)은 제2 가열 요소(406) 및 제2 물질(409) 모두와 접촉한다. 일부 경우에, 상부 접촉(403) 및 하부 접촉은 각각 상부(403) 및 하부(408) 어드레서블 접촉을 형성한다. 일부 경우에, 상부 접촉(403) 및 하부 접촉(408)은 금속과 같은 도체를 포함한다. 일부 경우에, 제1 물질(405) 및 제2 물질(409)은 이산화규소와 같은 절연 물질을 포함한다. 일부 경우에, 제1 가열 요소(404) 및 제2 가열 요소(406)는 규소와 같은 반도체 물질을 포함한다. 일부 경우에, 반도체 물질은 하나 이상의 도펀트, 예컨대 비제한적으로 인, 안티몬, 비소, 붕소, 알루미늄, 또는 인듐을 포함한다. 대안적으로 또는 조합하여, 제1 가열 요소(404) 및 제2 가열 요소(406)는 도체이다.
일부 경우에, 하나 이상의 하부 어드레서블 접촉(408), 및 하나 이상의 상부 어드레서블 접촉(403)에 전류를 동시에 인가하여 전기 경로를 형성하는 것은 각각 제1 가열 요소(404) 및 제2 가열 요소(406)에서와 같이, 상응하는 하나 이상의 하부 접촉(408), 및 상응하는 하나 이상의 상부 접촉(403)의 교차점과 연관된 하나 이상의 웰(401)을 가열한다. 일부 경우에, 장치를 통해 전류를 인가하여 용매(402)를 가열하는 것은 용매 기화를 유발하여 합성 표면(407)과의 용매 접촉을 방지하는 증기 나노버블(417)을 형성하고, 이는 전류 흐름 또는 가열이 중단될 때 붕괴된다. 일부 경우에, 전기 경로는 p-n 접합과 같은 적어도 하나의 반도체 접합을 포함한다. 일부 경우에, 이러한 접합은 전류 세기를 결정하고, 가열 요소 안정성을 개선한다. 일부 경우에, 제4 물질(406)은 가열 요소를 형성하고, 도핑된 반도체 저항기를 포함한다.
제3 구조물에서, 액체-기체 상 제어를 위한 가열된 나노포스트는 폴리뉴클레오타이드 합성을 제공한다. 도 4b, 장치(410)를 참고한다. 장치(410)의 일부에서의 각각의 특징부는 나노포스트일 수 있다. 일부 경우에, 특징부(410)는 코어 접촉 (412), 제1 물질(413), 표면 접촉(414), 가열 요소(415), 및 제2 물질(416)을 포함하고, 표면 접촉(414)은 제1 물질(413)의 제1 부분을 덮으며, 가열 요소(415)는 제1 물질(413)의 제1 부분 및 표면 접촉(414)의 제1 부분을 덮고, 제2 물질(416)은 코어 접촉(412)의 제1 부분 및 표면 접촉(414)의 제2 부분을 덮는다. 일부 경우에, 장치를 통해 전류를 인가하여 용매(402)를 가열하는 것은 용매 기화를 유발하여 합성 표면(407)과의 용매 접촉을 방지하고 전류 흐름 또는 가열이 중단될 때 붕괴되는 기체 버블(417)을 형성한다. 일부 경우에, 코어 접촉(412), 표면 접촉(414), 및 가열 요소(415)는 금속과 같은 도체를 포함한다. 일부 경우에, 제1 물질(413) 및 제2 물질(416)은 절연 물질을 포함한다. 일부 경우에, 가열 요소(415)는 반도체 물질을 포함한다.
일부 경우에, 하나 이상의 상부 표면 접촉(414) 및 하나 이상의 전도성 코어 접촉(412)에 전류를 동시에 인가하는 것은 하나 이상의 전기 저항기 측벽(가열 요소)(415)을 가열한다. 일부 경우에, 장치를 통해 전류를 인가하여 용매(402)를 가열하는 것은 용매 기화를 유발하여 합성 표면(407)과의 용매 접촉을 방지하고 전류 흐름 또는 가열이 중단될 때 붕괴되는 증기 나노버블(417)을 형성한다.
제4 구조물에서, 액체-기체 상 제어를 위한 가열된 나노로드는 폴리뉴클레오타이드 합성을 제공한다. 도 5, 장치(500)를 참고한다. 장치(500)의 일부에서의 각각의 특징부는, 비제한적으로 나노와이어 또는 탄소 나노튜브를 포함하는 하나 이상의 나노로드(502)를 포함할 수 있다. 도 5에서 폴리뉴클레오타이드 합성 또는 연장의 위치(507)는 단지 예시를 위해 나타나 있으며; 합성 또는 연장은 나노로드(502) 상의 어느 곳에서 일어날 수 있다. 일부 경우에, 장치(500)는 가열 요소(501), 나노로드(502), 상부 접촉(503), 제1 물질(504), 및 하부 접촉(505)으로 구성되고, 상부 접촉(503)은 제1 물질(504)의 제1 부분을 덮으며, 가열 요소(501)는 제1 물질(504)의 제2 부분 및 하부 접촉(505)의 제1 부분을 덮고, 나노로드(502)는 제1 물질(504)의 제3 부분을 덮는다.
일부 경우에, 상부 접촉(503) 및 하부 접촉(505)은 각각 상부(503) 및 하부(505) 어드레서블 접촉을 형성한다. 일부 경우에, 상부 접촉(503) 및 하부 접촉(505)은 금속과 같은 도체를 포함한다. 일부 경우에, 제1 물질(504)은 절연 물질을 포함한다. 일부 경우에, 가열 요소(501)는 규소와 같은 반도체 물질을 포함한다. 일부 경우에, 반도체 물질은 하나 이상의 도펀트, 예컨대 비제한적으로 인, 안티몬, 비소, 붕소, 알루미늄, 또는 인듐을 포함한다. 일부 경우에, 가열 요소(501)는 금속과 같은 도체를 포함한다.
일부 경우에, 하나 이상의 하부 어드레서블 접촉(505), 및 하나 이상의 상부 어드레서블 접촉(503)에 전류를 동시에 인가하여 가열 요소(501) 및 용매(506)를 통해 전기 경로를 형성하는 것은 하나 이상의 나노로드(502) 또는 나노로드 클러스터를 둘러싸는 영역을 가열한다. 일부 경우에, 장치를 통해 전류를 인가하여 용매(506)를 가열하는 것은 용매 기화를 유발하여 전류 흐름 또는 가열이 중단될 때 붕괴되는 증기 나노버블(517)을 형성한다. 증기 버블(517)은 합성 표면(507)을 용매(506)로부터 분리한다. 일부 경우에, 전기 경로는 가열 요소(501)에서의 p-n 접합과 같은 적어도 하나의 반도체 접합을 포함한다. 일부 경우에, 이러한 접합은 전류 세기를 결정하고, 가열 요소 안정성을 개선한다. 일부 경우에, 가열 요소(501)는 도핑된 반도체 저항기를 포함한다. 일부 경우에, 나노로드(502)는 뉴클레오타이드 커플링을 위한 증가된 표면적을 제공하여, 더 높은 폴리뉴클레오타이드 수율을 초래한다. 일부 경우에, 나노로드(502) 및 전극의 수 및 규모는 감소될 수 있다.
제5 구조물에서, 접촉 상의 나노로드는 폴리뉴클레오타이드 합성을 제공한다. 도 6, 장치(600)를 참고한다. 장치(600)의 일부에서의 각각의 특징부는, 비제한적으로 나노와이어 또는 탄소 나노튜브를 포함하는 하나 이상의 나노로드(603)일 수 있다. 일부 경우에, 나노로드(603)는 용매(604)와 접촉한다. 도 6에서 폴리뉴클레오타이드 합성 또는 연장의 위치(607)는 단지 예시를 위해 나타나 있으며; 합성 또는 연장은 나노로드(603) 상의 어느 곳에서 일어날 수 있다. 일부 경우에, 실질적으로 평면인 특징부(600)는 하부 접촉(601), 하나 이상의 나노로드(603), 및 제1 물질(602)을 포함하고, 제1 물질(602)은 하부 접촉(601)의 제1 부분을 덮는다. 일부 경우에, 하부 접촉(601)은 하부 어드레서블 접촉을 형성한다. 일부 경우에, 하부 접촉(601)은 금속과 같은 도체를 포함한다. 일부 경우에, 나노로드(603)는 도체 또는 반도체를 포함한다. 일부 경우에, 제1 물질(602)은 절연 물질을 포함한다.
일부 경우에, 나노로드(603)는 전도성 물질을 포함한다. 일부 경우에, 나노로드 특징부(607)는 뉴클레오타이드 커플링을 위한 증가된 표면적을 제공하여, 더 높은 폴리뉴클레오타이드 수율을 초래한다. 일부 경우에, 나노로드 및 접촉의 수 및 크기는, 예를 들어, 하나의 접촉을 갖는 하나의 나노로드로 감소될 수 있다. 일부 경우에, 하부 접촉(601)은 열 접촉이다. 일부 경우에, 하부 접촉(601)의 냉각은 하나 이상의 나노로드(607)를 냉각시키고, 하나 이상의 나노로드(603)를 동결된 용매의 층으로 코팅하여, 합성 표면(607)과의 용매 접촉을 방지한다.
폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 구조물
일부 경우에, 본원에 기재된 웰은 20 내지 0.01의 폭 대 깊이(또는 높이) 비율을 가지며, 폭은 웰의 가장 좁은 세그먼트에서의 폭의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 웰은 20 내지 0.05의 폭 대 깊이(또는 높이) 비율을 가지며, 폭은 웰의 가장 좁은 세그먼트에서의 폭의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 웰은 1 내지 0.01의 폭 대 깊이(또는 높이) 비율을 가지며, 폭은 웰의 가장 좁은 세그먼트에서의 폭의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 웰은 0.5 내지 0.01의 폭 대 깊이(또는 높이) 비율을 가지며, 폭은 웰의 가장 좁은 세그먼트에서의 폭의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 웰은 약 0.01, 0.05, 0.1, 0.15, 0.16, 0.2, 0.5, 1, 2, 5, 10 또는 20의 폭 대 깊이(또는 높이) 비율을 갖는다.
일부 경우에, 본원에 기재된 웰은 20 내지 0.01의 직경 대 깊이(또는 높이) 비율을 가지며, 직경은 웰의 가장 좁은 세그먼트에서의 직경의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 웰은 20 내지 0.05의 직경 대 깊이(또는 높이) 비율을 가지며, 직경은 웰의 가장 좁은 세그먼트에서의 직경의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 웰은 1 내지 0.01의 직경 대 깊이(또는 높이) 비율을 가지며, 직경은 웰의 가장 좁은 세그먼트에서의 직경의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 웰은 0.5 내지 0.01의 직경 대 깊이(또는 높이) 비율을 가지며, 직경은 웰의 가장 좁은 세그먼트에서의 직경의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 웰은 약 0.01, 0.05, 0.1, 0.15, 0.16, 0.2, 0.5, 1, 2, 5, 10, 또는 20의 직경 대 깊이(또는 높이) 비율을 갖는다.
일부 경우에, 본원에 기재된 구조물은 복수의 웰을 포함하고, 웰의 높이 또는 깊이는 약 10 nm 내지 약 10 μm, 약 10 nm 내지 약 1 μm, 약 10 nm 내지 약 500 nm, 약 10 nm 내지 약 100 nm, 약 50 nm 내지 약 700 nm, 약 50 nm 내지 약 600 nm, 약 50 nm 내지 약 500 nm, 약 50 nm 내지 약 400 nm, 약 50 nm 내지 약 300 nm, 약 50 nm 내지 약 200 nm, 또는 약 50 nm 내지 약 100 nm이다. 일부 경우에, 웰의 높이는 10 μm, 5 μm, 2 μm, 1 μm, 500 nm, 200 nm, 100 nm, 50 nm, 20 nm 이하, 또는 10 nm 이하이다. 일부 경우에, 웰 높이는 약 10 nm, 20 nm, 30 nm, 40 nm, 50 nm, 60 nm, 70 nm, 80 nm, 90 nm, 100 nm, 200 nm, 300 nm, 400 nm, 500 nm, 1 μm, 2 μm, 5 μm, 10 μm, 또는 10 μm 초과이다.
일부 경우에, 본원에 기재된 구조물은 복수의 웰을 포함하고, 웰의 폭은 약 10 nm 내지 약 10 μm, 약 10 nm 내지 약 1 μm, 약 10 nm 내지 약 500 nm, 약 10 nm 내지 약 100 nm, 약 50 nm 내지 약 700 nm, 약 50 nm 내지 약 600 nm, 약 50 nm 내지 약 500 nm, 약 50 nm 내지 약 400 nm, 약 50 nm 내지 약 300 nm, 약 50 nm 내지 약 200 nm, 또는 약 50 nm 내지 약 100 nm이다. 일부 경우에, 웰의 폭은 10 μm, 5 μm, 2 μm, 1 μm, 500 nm, 200 nm, 100 nm, 50 nm, 20 nm 이하, 또는 10 nm 이하이다. 일부 경우에, 웰 폭은 약 10 nm, 20 nm, 30 nm, 40 nm, 50 nm, 60 nm, 70 nm, 80 nm, 90 nm, 100 nm, 200 nm, 300 nm, 400 nm, 500 nm, 1 μm, 2 μm, 5 μm, 10 μm, 또는 10 μm 초과이다.
일부 경우에, 본원에 기재된 구조물은 복수의 웰을 포함하고, 웰의 직경은 약 10 nm 내지 약 10 μm, 약 10 nm 내지 약 1 μm, 약 10 nm 내지 약 500 nm, 약 10 nm 내지 약 100 nm, 약 50 nm 내지 약 700 nm, 약 50 nm 내지 약 600 nm, 약 50 nm 내지 약 500 nm, 약 50 nm 내지 약 400 nm, 약 50 nm 내지 약 300 nm, 약 50 nm 내지 약 200 nm, 또는 약 50 nm 내지 약 100 nm이다. 일부 경우에, 웰의 직경은 10 μm, 5 μm, 2 μm, 1 μm, 500 nm, 200 nm, 100 nm, 50 nm, 20 nm 이하, 또는 10 nm 이하이다. 일부 경우에, 웰 직경은 약 10 nm, 20 nm, 30 nm, 40 nm, 50 nm, 60 nm, 70 nm, 80 nm, 90 nm, 100 nm, 200 nm, 300 nm, 400 nm, 500 nm, 1 μm, 2 μm, 5 μm, 10 μm, 또는 10 μm 초과이다.
일부 경우에, 본원에 기재된 스팟 또는 실질적으로 평면인 특징부는 약 50 nm 내지 약 1000 nm, 약 50 nm 내지 약 900 nm, 약 50 nm 내지 약 800 nm, 약 50 nm 내지 약 700 nm, 약 50 nm 내지 약 600 nm, 약 50 nm 내지 약 500 nm, 약 50 nm 내지 약 400 nm, 약 50 nm 내지 약 300 nm, 약 50 nm 내지 약 200 nm, 또는 약 50 nm 내지 약 100 nm의 직경을 갖는다.
일부 경우에, 본원에 기재된 채널은 20 내지 0.01의 폭 대 깊이(또는 높이) 비율을 갖고, 채널은 채널의 가장 좁은 세그먼트에서의 폭의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 채널은 20 내지 0.05의 폭 대 깊이(또는 높이) 비율을 갖고, 폭은 채널의 가장 좁은 세그먼트에서의 폭의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 채널은 1 내지 0.01의 폭 대 깊이(또는 높이) 비율을 갖고, 폭은 채널의 가장 좁은 세그먼트에서의 폭의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 채널은 0.5 내지 0.01의 폭 대 깊이(또는 높이) 비율을 갖고, 폭은 웰의 가장 좁은 세그먼트에서의 폭의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 채널은 약 0.01, 0.05, 0.1, 0.15, 0.16, 0.2, 0.5, 1, 2, 5, 10 또는 20의 폭 대 깊이(또는 높이) 비율을 갖는다.
일부 경우에, 본원에 기재된 채널은 20 내지 0.01의 직경 대 깊이(또는 높이) 비율을 갖고, 직경은 채널의 가장 좁은 세그먼트에서의 직경의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 채널은 20 내지 0.05의 직경 대 깊이(또는 높이) 비율을 갖고, 직경은 채널의 가장 좁은 세그먼트에서의 직경의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 채널은 1 내지 0.01의 직경 대 깊이(또는 높이) 비율을 갖고, 직경은 채널의 가장 좁은 세그먼트에서의 직경의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 채널은 0.5 내지 0.01의 직경 대 깊이(또는 높이) 비율을 갖고, 직경은 채널의 가장 좁은 세그먼트에서의 직경의 측정치이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 채널은 약 0.01, 0.05, 0.1, 0.15, 0.16, 0.2, 0.5, 1, 2, 5, 10, 또는 20의 직경 대 깊이(또는 높이) 비율을 갖는다.
일부 경우에, 본원에 기재된 구조물은 복수의 채널을 포함하고, 채널의 높이 또는 깊이는 약 10 nm 내지 약 10 μm, 약 10 nm 내지 약 1 μm, 약 10 nm 내지 약 500 nm, 약 10 nm 내지 약 100 nm, 약 50 nm 내지 약 700 nm, 약 50 nm 내지 약 600 nm, 약 50 nm 내지 약 500 nm, 약 50 nm 내지 약 400 nm, 약 50 nm 내지 약 300 nm, 약 50 nm 내지 약 200 nm, 또는 약 50 nm 내지 약 100 nm이다. 일부 경우에, 채널의 높이는 10 μm, 5 μm, 2 μm, 1 μm, 500 nm, 200 nm, 100 nm, 50 nm, 20 nm 이하, 또는 10 nm 이하이다. 일부 경우에, 채널 높이는 약 10 nm, 20 nm, 30 nm, 40 nm, 50 nm, 60 nm, 70 nm, 80 nm, 90 nm, 100 nm, 200 nm, 300 nm, 400 nm, 500 nm, 1 μm, 2 μm, 5 μm, 10 μm, 또는 10 μm 초과이다.
일부 경우에, 본원에 기재된 구조물은 복수의 채널을 포함하고, 채널의 폭은 약 10 nm 내지 약 10 μm, 약 10 nm 내지 약 1 μm, 약 10 nm 내지 약 500 nm, 약 10 nm 내지 약 100 nm, 약 50 nm 내지 약 700 nm, 약 50 nm 내지 약 600 nm, 약 50 nm 내지 약 500 nm, 약 50 nm 내지 약 400 nm, 약 50 nm 내지 약 300 nm, 약 50 nm 내지 약 200 nm, 또는 약 50 nm 내지 약 100 nm이다. 일부 경우에, 채널의 폭은 10 μm, 5 μm, 2 μm, 1 μm, 500 nm, 200 nm, 100 nm, 50 nm, 20 nm 이하, 또는 10 nm 이하이다. 일부 경우에, 채널 폭은 약 10 nm, 20 nm, 30 nm, 40 nm, 50 nm, 60 nm, 70 nm, 80 nm, 90 nm, 100 nm, 200 nm, 300 nm, 400 nm, 500 nm, 1 μm, 2 μm, 5 μm, 10 μm, 또는 10 μm 초과이다.
일부 경우에, 본원에 기재된 구조물은 복수의 채널을 포함하고, 채널의 직경은 약 10 nm 내지 약 10 μm, 약 10 nm 내지 약 1 μm, 약 10 nm 내지 약 500 nm, 약 10 nm 내지 약 100 nm, 약 50 nm 내지 약 700 nm, 약 50 nm 내지 약 600 nm, 약 50 nm 내지 약 500 nm, 약 50 nm 내지 약 400 nm, 약 50 nm 내지 약 300 nm, 약 50 nm 내지 약 200 nm, 또는 약 50 nm 내지 약 100 nm이다. 일부 경우에, 채널의 직경은 10 μm, 5 μm, 2 μm, 1 μm, 500 nm, 200 nm, 100 nm, 50 nm, 20 nm 이하, 또는 10 nm 이하이다. 일부 경우에, 웰 직경은 약 10 nm, 20 nm, 30 nm, 40 nm, 50 nm, 60 nm, 70 nm, 80 nm, 90 nm, 100 nm, 200 nm, 300 nm, 400 nm, 500 nm, 1 μm, 2 μm, 5 μm, 10 μm, 또는 10 μm 초과이다.
일부 경우에, 특징부(예컨대, 실질적으로 평면인 특징부, 웰, 채널, 또는 폴리뉴클레오타이드 합성을 지지하는 다른 특징부)의 폭은 약 10 nm 내지 약 10 μm, 약 100 nm 내지 약 10 μm, 약 200 nm 내지 약 1 μm, 약 50 nm 내지 약 500 nm, 약 50 nm 내지 약 200 μm, 또는 약 10 nm 내지 약 100 nm, 예를 들어, 약 10 μm, 5 μm, 2 μm, 1 μm, 500 nm, 200 nm, 100 nm, 50 nm, 20 nm, 또는 10 nm이다. 일부 경우에, 특징부의 폭은 약 10 μm, 5 μm, 2 μm, 1 μm, 500 nm, 200 nm, 100 nm, 50 nm 또는 10 nm 이하이다. 일부 경우에, 2개의 인접한 특징부의 중심 사이의 거리는 약 10 nm 내지 약 10 μm, 20 nm 내지 약 5 μm, 약 50 nm 내지 약 2 nm, 약 100 nm 내지 약 1 μm, 약 200 nm 내지 약 500 nm, 약 200 nm 내지 약 1 μm, 약 200 nm 내지 약 750 nm, 또는 약 300 nm 내지 약 600 nm, 예를 들어, 약 500 nm이다. 일부 경우에, 특징부의 총 폭은 약 10 nm, 20 nm, 50 nm, 100 nm, 200 nm, 500 nm, 1 μm, 5 μm, 10 μm, 20 μm, 30 μm, 40 μm, 50 μm, 60 μm, 70 μm, 80 μm, 90 μm, 또는 100 μm이다. 일부 경우에, 특징부의 총 폭은 약 10 nm 내지 1 μm, 20 nm 내지 500 nm, 또는 50 nm 내지 100 nm이다.
일부 경우에, 구조물(예컨대, 실질적으로 평면인 구조물, 웰, 채널, 나노웰, 나노로드, 나노포스트, 또는 폴리뉴클레오타이드 합성을 지지하는 다른 나노구조물)의 폭은 약 10 nm 내지 약 10 μm, 약 100 nm 내지 약 10 μm, 약 200 nm 내지 약 1 μm, 약 50 nm 내지 약 500 nm, 약 50 nm 내지 약 200 μm, 또는 약 10 nm 내지 약 100 nm, 예를 들어, 약 10 μm, 5 μm, 2 μm, 1 μm, 500 nm, 200 nm, 100 nm, 50 nm, 20 nm, 또는 10 nm이다. 일부 경우에, 구조물의 폭은 약 10 μm, 5 μm, 2 μm, 1 μm, 500 nm, 200 nm, 100 nm, 50 nm 또는 10 nm 이하이다. 일부 경우에, 2개의 인접한 구조물의 중심 사이의 거리는 약 10 nm 내지 약 10 μm, 20 nm 내지 약 5 μm, 약 50 nm 내지 약 2 nm, 약 100 nm 내지 약 1 μm, 약 200 nm 내지 약 500 nm, 약 200 nm 내지 약 1 μm, 약 200 nm 내지 약 750 nm, 또는 약 300 nm 내지 약 600 nm, 예를 들어, 약 500 nm이다. 일부 경우에, 구조물의 총 폭은 약 10 nm, 20 nm, 50 nm, 100 nm, 200 nm, 500 nm, 1 μm, 5 μm, 10 μm, 20 μm, 30 μm, 40 μm, 50 μm, 60 μm, 70 μm, 80 μm, 90 μm, 또는 100 μm이다. 일부 경우에, 구조물의 총 폭은 약 10 nm 내지 1 μm, 20 nm 내지 500 nm, 또는 50 nm 내지 100 nm이다.
폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 표면
일부 경우에, 각각의 특징부는 또 다른 특징부 상에서 성장된 폴리뉴클레오타이드의 집단과 상이한 서열을 갖는 폴리뉴클레오타이드의 집단의 합성을 지지한다. 적어도 10, 100, 256, 500, 1,000, 2,000, 3,000, 4,000, 5,000, 6,000, 7,000, 8,000, 9,000, 10,000, 11,000, 12,000, 13,000, 14,000, 15,000, 20,000, 30,000, 40,000, 50,000개 이상의 클러스터를 포함하는 표면이 본원에 제공된다. 2,000개 초과; 5,000; 10,000; 20,000; 30,000; 50,000; 100,000; 200,000; 300,000; 400,000; 500,000; 600,000; 700,000; 800,000; 900,000; 1,000,000; 5,000,000; 또는 10,000,000개 이상의 구별되는 특징부를 포함하는 표면이 본원에 제공된다. 일부 경우에, 각각의 클러스터는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 120, 130, 150, 200, 500개 이상의 특징부를 포함한다. 일부 경우에, 각각의 클러스터는 50 내지 500, 50 내지 200, 50 내지 150, 또는 100 내지 150개의 특징부를 포함한다. 일부 경우에, 각각의 클러스터는 100 내지 150개의 특징부를 포함한다. 예시적인 배열에서, 각각의 클러스터는 109, 121, 130 또는 137개의 특징부를 포함한다. 일부 경우에, 특징부 내의 각각의 구조물(예컨대, 나노구조물)은 동일한 특징부 내에서, 또 다른 구조물 상에서 성장된 폴리뉴클레오타이드의 집단과 상이한 서열을 갖는 폴리뉴클레오타이드의 집단의 합성을 지지한다. 일부 경우에 각각 적어도 1; 2; 5; 10; 20; 50; 100; 200, 500, 1,000, 2,000, 5,000, 10,000, 20,000 또는 200,000개 초과의 구별되는 나노구조물을 포함하는 특징부가 본원에 제공된다. 일부 경우에, 각각의 특징부는 약 10 내지 약 500, 약 50 내지 약 250, 약 10 내지 약 1000, 또는 약 1 내지 약 50개의 나노구조물을 포함한다.
10 nm 내지 1 μm의 가장 긴 세그먼트에서의 폭을 갖는 특징부가 본원에 제공된다. 일부 경우에, 특징부는 약 10, 20, 30, 35, 40, 45, 50, 55 또는 60 nm의 가장 긴 세그먼트에서의 폭을 갖는다. 일부 경우에, 특징부는 다수의 세그먼트를 갖는 채널이고, 각각의 세그먼트는 5 내지 50 nm 떨어진 중심간 거리를 갖는다. 일부 경우에, 각각의 세그먼트에 대해 떨어진 중심간 거리는 약 5, 10, 15, 20 또는 25 nm이다.
일부 경우에, 본원에 기재된 구조물의 표면 상에 합성된 구별되는 폴리뉴클레오타이드의 수는 기판에서 이용가능한 구별되는 특징부의 수에 좌우된다. 일부 경우에, 기판의 클러스터 내의 특징부의 밀도는 mm2 당 적어도 또는 약 1개의 특징부, mm2 당 10개의 특징부, mm2 당 25개의 특징부, mm2 당 50개의 특징부, mm2 당 65개의 특징부, mm2 당 75개의 특징부, mm2 당 100개의 특징부, mm2 당 130개의 특징부, mm2 당 150개의 특징부, mm2 당 175개의 특징부, mm2 당 200개의 특징부, mm2 당 300개의 특징부, mm2 당 400개의 특징부, mm2 당 500개의 특징부, mm2 당 1,000개의 특징부, mm2 당 2,000개의 특징부, mm2 당 5,000개의 특징부, mm2 당 10,000개의 특징부, mm2 당 100,000개의 특징부, mm2 당 1,000,000개의 특징부 또는 mm2 당 1,000,000개 초과의 특징부이다. 일부 경우에, 기판은 mm2 당 약 10개의 특징부 내지 mm2 당 약 500개의 특징부, mm2 당 약 25개의 특징부 내지 mm2 당 약 400개의 특징부, mm2 당 약 50개의 특징부 내지 mm2 당 약 500개의 특징부, mm2 당 약 100개의 특징부 내지 mm2 당 약 500개의 특징부, mm2 당 약 150개의 특징부 내지 mm2 당 약 500개의 특징부, mm2 당 약 10개의 특징부 내지 mm2 당 약 250개의 특징부, mm2 당 약 50개의 특징부 내지 mm2 당 약 250개의 특징부, mm2 당 약 10개의 특징부 내지 mm2 당 약 200개의 특징부, 또는 mm2 당 약 50개의 특징부 내지 mm2 당 약 200개의 특징부를 포함한다. 일부 경우에, 기판의 클러스터 내의 특징부의 밀도는 μm2 당 적어도 또는 약 1개의 특징부, μm2 당 10개의 특징부, μm2 당 25개의 특징부, μm2 당 50개의 특징부, μm2 당 65개의 특징부, μm2 당 75개의 특징부, μm2 당 100개의 특징부, μm2 당 130개의 특징부, μm2 당 150개의 특징부, μm2 당 175개의 특징부, μm2 당 200개의 특징부, μm2 당 300개의 특징부, μm2 당 400개의 특징부, μm2 당 500개의 특징부, μm2 당 1,000개의 특징부, μm2 당 2,000개의 특징부, μm2 당 5,000개의 특징부, μm2 당 10,000개의 특징부, μm2 당 100,000개의 특징부, μm2 당 1,000,000개의 특징부 또는 μm2 당 1,000,000개 초과의 특징부이다. 일부 경우에, 기판은 μm2 당 약 10개의 특징부 내지 μm2 당 약 500개의 특징부, μm2 당 약 25개의 특징부 내지 μm2 당 약 400개의 특징부, μm2 당 약 50개의 특징부 내지 μm2 당 약 500개의 특징부, μm2 당 약 100개의 특징부 내지 μm2 당 약 500개의 특징부, μm2 당 약 150개의 특징부 내지 μm2 당 약 500개의 특징부, μm2 당 약 10개의 특징부 내지 μm2 당 약 250개의 특징부, μm2 당 약 50개의 특징부 내지 μm2 당 약 250개의 특징부, μm2 당 약 10개의 특징부 내지 μm2 당 약 200개의 특징부, 또는 μm2 당 약 50개의 특징부 내지 μm2 당 약 200개의 특징부를 포함한다. 일부 경우에, 클러스터 내의 2개의 인접한 특징부의 중심 사이의 거리는 약 10 μm 내지 약 500 μm, 약 10 μm 내지 약 200 μm, 또는 약 10 μm 내지 약 100 μm이다. 일부 경우에, 인접한 특징부의 2개의 중심 사이의 거리는 약 10 μm, 20 μm, 30 μm, 40 μm, 50 μm, 60 μm, 70 μm, 80 μm, 90 μm 또는 100 μm 초과이다. 일부 경우에, 2개의 인접한 특징부의 중심 사이의 거리는 약 200 μm, 150 μm, 100 μm, 80 μm, 70 μm, 60 μm, 50 μm, 40 μm, 30 μm, 20 μm 또는 10 μm 미만이다. 일부 경우에, 클러스터 내의 2개의 인접한 특징부의 중심 사이의 거리는 약 10 nm 내지 약 1000 nm, 약 10 nm 내지 약 500 nm, 10 nm 내지 약 200 nm, 또는 약 10 nm 내지 약 100 nm이다. 일부 경우에, 인접한 특징부의 2개의 중심 사이의 거리는 약 10 nm, 20 nm, 30 nm, 40 nm, 50 nm, 60 nm, 70 nm, 80 nm, 90 nm 또는 100 nm 초과이다. 일부 경우에, 2개의 인접한 특징부의 중심 사이의 거리는 약 500 nm, 200 nm, 150 nm, 100 nm, 80 nm, 70 nm, 60 nm, 50 nm, 40 nm, 30 nm, 20 nm 또는 10 nm 미만이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 구조물의 각각의 제곱 미터는 적어도 약 107, 108, 109, 1010, 1011 , 또는 적어도 약 1012개의 특징부를 허용하며, 각각의 특징부는 하나의 폴리뉴클레오타이드를 지지한다. 일부 경우에, 본원에 기재된 구조물의 각각의 제곱 미터는 적어도 약 107, 108, 109, 1010, 1011 , 또는 적어도 약 1012개의 특징부를 허용하며, 각각의 특징부는 복수의 상이한 폴리뉴클레오타이드를 지지한다. 일부 경우에, 본원에 기재된 구조물의 약 6, 5, 4, 3, 2 또는 1 m2 미만 상에 109개의 폴리뉴클레오타이드가 지지된다.
일부 경우에, 본원에 기재된 구조물은 2,000개 초과; 5,000; 10,000; 20,000; 30,000; 50,000; 100,000; 200,000; 300,000; 400,000; 500,000; 600,000; 700,000; 800,000; 900,000; 1,000,000; 1,200,000; 1,400,000; 1,600,000; 1,800,000; 2,000,000; 2,500,000; 3,000,000; 3,500,000; 4,000,000; 4,500,000; 5,000,000; 10,000,000; 100,000,000개 이상의 동일하지 않은 폴리뉴클레오타이드의 합성을 위한 지지체를 제공한다. 일부 경우에, 구조물은 구별되는 서열을 코딩하는 2,000개 초과; 5,000; 10,000; 20,000; 50,000; 100,000; 200,000; 300,000; 400,000; 500,000; 600,000; 700,000; 800,000; 900,000; 1,000,000; 1,200,000; 1,400,000; 1,600,000; 1,800,000; 2,000,000; 2,500,000; 3,000,000; 3,500,000; 4,000,000; 4,500,000; 5,000,000; 10,000,000; 100,000,000개 이상의 폴리뉴클레오타이드의 합성을 위한 지지체를 제공한다. 일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드의 적어도 일부는 동일한 서열을 갖거나 동일한 서열을 이용하여 합성되도록 구성된다. 일부 경우에, 구조물은 적어도 약 50, 60, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 100, 110, 120, 130, 140, 150, 160, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 1,000, 2,000개의 염기 또는 2,000개 초과의 염기를 갖는 폴리뉴클레오타이드의 성장을 위한 표면 환경을 제공한다. 일부 경우에, 구조물은 50 내지 2,000개의 염기, 50 내지 1,000, 50 내지 500, 50 내지 250, 또는 100 내지 1,000, 100 내지 500, 또는 100 내지 300개의 염기를 갖는 폴리뉴클레오타이드의 성장을 위한 표면 환경을 제공한다.
일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드는 구조물의 구별되는 특징부 상에서 합성되고, 각각의 특징부는 폴리뉴클레오타이드의 집단의 합성을 지지한다. 일부 경우에, 각각의 특징부는 또 다른 좌위 상에서 성장된 폴리뉴클레오타이드의 집단과 상이한 서열을 갖는 폴리뉴클레오타이드의 집단의 합성을 지지한다. 일부 경우에, 구조물의 특징부는 복수의 클러스터 내에 위치한다. 일부 경우에, 구조물은 적어도 10, 500, 1,000, 2,000, 3,000, 4,000, 5,000, 6,000, 7,000, 8,000, 9,000, 10,000, 11,000, 12,000, 13,000, 14,000, 15,000, 20,000, 30,000, 40,000, 50,000개 이상의 클러스터를 포함한다. 일부 경우에, 구조물은 2,000개 초과; 5,000; 10,000; 100,000; 200,000; 300,000; 400,000; 500,000; 600,000; 700,000; 800,000; 900,000; 1,000,000; 1,100,000; 1,200,000; 1,300,000; 1,400,000; 1,500,000; 1,600,000; 1,700,000; 1,800,000; 1,900,000; 2,000,000; 300,000; 400,000; 500,000; 600,000; 700,000; 800,000; 900,000; 1,000,000; 1,200,000; 1,400,000; 1,600,000; 1,800,000; 2,000,000; 2,500,000; 3,000,000; 3,500,000; 4,000,000; 4,500,000; 5,000,000; 또는 10,000,000개 이상의 구별되는 특징부를 포함한다. 일부 경우에, 각각의 클러스터는 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 120, 130, 150개 이상의 특징부(좌위)를 포함한다. 일부 경우에, 각각의 클러스터는 50 내지 500, 100 내지 150, 또는 100 내지 200개의 특징부를 포함한다. 일부 경우에, 각각의 클러스터는 109, 121, 130 또는 137개의 특징부를 포함한다. 일부 경우에, 각각의 클러스터는 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11 또는 12개의 특징부를 포함한다. 일부 경우에, 하나의 클러스터 내의 구별되는 특징부로부터의 폴리뉴클레오타이드는 조립될 때 미리 결정된 서열의 인접한 더 긴 폴리뉴클레오타이드를 코딩하는 서열을 갖는다.
구조물 크기
일부 경우에, 본원에 기재된 구조물은 약 표준 96 웰 플레이트의 크기, 예를 들어 약 100 내지 200 mm 대 약 50 내지 150 mm이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 구조물은 약 1000 mm, 500 mm, 450 mm, 400 mm, 300 mm, 250 nm, 200 mm, 150 mm, 100 mm 또는 50 mm 이하의 직경을 갖는다. 일부 경우에, 기판의 직경은 약 25 mm 내지 1000 mm, 약 25 mm 내지 약 800 mm, 약 25 mm 내지 약 600 mm, 약 25 mm 내지 약 500 mm, 약 25 mm 내지 약 400 mm, 약 25 mm 내지 약 300 mm, 또는 약 25 mm 내지 약 200이다. 기판 크기의 비제한적인 예는 약 300 mm, 200 mm, 150 mm, 130 mm, 100 mm, 76 mm, 51 mm 및 25 mm를 포함한다. 일부 경우에, 기판은 적어도 약 100 mm2; 200 mm2; 500 mm2; 1,000 mm2; 2,000 mm2; 5,000 mm2; 10,000 mm2; 12,000 mm2; 15,000 mm2; 20,000 mm2; 30,000 mm2; 40,000 mm2; 50,000 mm2 이상의 평면 표면적을 갖는다. 일부 경우에, 기판은 약 50 mm 내지 약 2000 mm, 약 50 mm 내지 약 1000 mm, 약 100 mm 내지 약 1000 mm, 약 200 mm 내지 약 1000 mm, 또는 약 250 mm 내지 약 1000 mm의 두께를 갖는다. 두께의 비제한적인 예는 275 mm, 375 mm, 525 mm, 625 mm, 675 mm, 725 mm, 775 mm 및 925 mm를 포함한다. 일부 경우에, 기판의 두께는 직경에 따라 달라지며 기판의 조성에 좌우된다. 예를 들어, 규소 이외의 물질을 포함하는 구조물은 동일한 직경의 규소 구조물과 상이한 두께를 가질 수 있다. 구조물 두께는 사용된 물질의 기계적 강도에 의해 결정될 수 있으며, 구조물은 취급 동안 균열 없이 자체 중량을 지지할 수 있을 정도로 두꺼워야 한다. 일부 경우에, 구조물은 임의의 한 치수가 약 1, 2, 3, 4, 5, 10, 15, 30, 40, 50 피트 초과이다.
일부 경우에, 본원에 기재된 구조물은, 예를 들어 약 10 내지 200 nm 대 약 10 내지 150 nm의 나노구조물을 포함한다. 일부 경우에, 본원에 기재된 구조물은 약 1000 nm, 500 nm, 450 nm, 400 nm, 300 nm, 250 nm, 200 nm, 150 nm, 100 nm 또는 50 nm 이하의 직경을 갖는다. 일부 경우에, 구조물의 직경은 약 10 nm 내지 1000 nm, 약 10 nm 내지 약 800 nm, 약 10 nm 내지 약 600 nm, 약 10 nm 내지 약 500 nm, 약 10 nm 내지 약 400 nm, 약 10 nm 내지 약 300 nm, 또는 약 10 mm 내지 약 200 nm이다. 구조물 크기의 비제한적인 예는 약 300 nm, 200 nm, 150 nm, 130 nm, 100 nm, 76 nm, 51 nm 25 nm, 및 10 nm를 포함한다. 일부 경우에, 구조물은 적어도 약 100 nm2; 200 nm2; 500 nm2; 1,000 nm2; 2,000 nm2; 5,000 nm2; 10,000 nm2; 12,000 nm2; 15,000 nm2; 20,000 nm2; 30,000 nm2; 40,000 nm2; 50,000 nm2 이상의 평면 표면적을 갖는다. 일부 경우에, 구조물은 약 10 nm 내지 약 2000 nm, 약 50 nm 내지 약 1000 mm, 약 100 nm 내지 약 1000 nm, 약 200 nm 내지 약 1000 nm, 또는 약 250 nm 내지 약 1000 nm의 두께를 갖는다. 두께의 비제한적인 예는 50 nm, 100 nm, 275 nm, 375 nm 525 nm, 625 nm, 675 nm, 725 nm, 775 nm 및 925 nm를 포함한다.
물질
표면을 포함하는 장치로서, 표면은 미리 결정된 위치에서 그리고 결과적인 낮은 오류율, 낮은 탈락률(dropout rate), 높은 수율, 및 높은 올리고 표현으로 폴리뉴클레오타이드 합성을 지지하도록 변형된 것인 장치가 본원에 제공된다. 일부 경우에, 본원에 제공된 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 장치의 표면은 드 노보 폴리뉴클레오타이드 합성 반응을 지지하기 위해 변형될 수 있는 다양한 물질로부터 제조된다. 일부 경우에, 장치는 충분히 전도성이며, 예컨대 장치의 전체 또는 일부에 걸쳐 균일한 전기장을 형성할 수 있다. 본원에 기재된 장치는 가요성 물질을 포함할 수 있다. 예시적인 가요성 물질은, 비제한적으로, 변형된 나일론, 비변형된 나일론, 니트로셀룰로오스, 및 폴리프로필렌을 포함한다. 본원에 기재된 장치는 강성 물질을 포함할 수 있다. 예시적인 강성 물질은, 비제한적으로, 유리, 퓨즈 실리카(fuse silica), 규소, 이산화규소, 질화규소, 질화금속, 규화금속(metal silicide), 탄화금속(metal carbide), 산화금속, 플라스틱(예를 들어, 폴리테트라플루오로에틸렌, 폴리프로필렌, 폴리스티렌, 폴리카르보네이트, 및 이의 블렌드), 및 금속(예를 들어, 금, 백금)을 포함한다. 일부 경우에, 금속 산화물은 TiO2, Ta2O5, Nb2O5, Al2O3, BaO, Y2O3, HfO2,　SrO 또는 당업계에 공지된 다른 산화금속을 포함한다. 일부 경우에, 탄화금속은 TiC, WC, ThC2, ThC, VC, W2C, ZrC, HfC, NbC, TaC, Ta2C, 또는 당업계에 공지된 다른 탄화금속을 포함한다. 일부 경우에, 질화금속은 GaN, InN, BN, Be3N2, Cr2N, MoN, Si3N4, TaN, Th2N2, VN, ZrN, TiN, HfN, NbC, WN, TaN, 또는 당업계에 공지된 다른 질화금속을 포함한다. 일부 경우에, 본원에 개시된 장치는 규소, 폴리스티렌, 아가로스, 덱스트란, 셀룰로오스 중합체, 폴리아크릴아미드, 폴리디메틸실록산(PDMS), 유리, 또는 이의 임의의 조합을 포함하는 물질로부터 제조된다. 일부 경우에, 본원에 개시된 장치는 본원에 열거된 물질 또는 당업계에 공지된 임의의 다른 적합한 물질의 조합으로 제조된다.
본원에 기재된 예시적인 물질의 인장 강도의 목록은 다음과 같이 제공된다: 나일론(70 MPa), 니트로셀룰로오스(1.5 MPa), 폴리프로필렌(40 MPa), 규소(268 MPa), 폴리스티렌(40 MPa), 아가로스(1-10 MPa), 폴리아크릴아미드(1-10 MPa), 폴리디메틸실록산(PDMS)(3.9-10.8 MPa). 본원에 기재된 고체 지지체는 1 내지 300, 1 내지 40, 1 내지 10, 1 내지 5, 또는 3 내지 11 MPa의 인장 강도를 가질 수 있다. 본원에 기재된 고체 지지체는 약 1, 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 20, 25, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250, 270 MPa 이상의 인장 강도를 가질 수 있다. 일부 경우에, 본원에 기재된 장치는 연속 루프 또는 릴, 예컨대 테이프 또는 가요성 시트에 저장될 수 있는 가요성 물질의 형태인 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 고체 지지체를 포함한다.
영률(Young's modulus)은 하중 하의 탄성(복구가능한) 변형에 대한 물질의 내성을 측정한다. 본원에 기재된 예시적인 물질의 강성에 대한 영률의 목록은 다음과 같이 제공된다: 나일론(3 GPa), 니트로셀룰로오스(1.5 GPa), 폴리프로필렌(2 GPa), 규소(150 GPa), 폴리스티렌(3 GPa), 아가로스(1-10 GPa), 폴리아크릴아미드(1-10 GPa), 폴리디메틸실록산(PDMS)(1-10 GPa). 본원에 기재된 고체 지지체는 1 내지 500, 1 내지 40, 1 내지 10, 1 내지 5, 또는 3 내지 11 GPa의 영률을 가질 수 있다. 본원에 기재된 고체 지지체는 약 1, 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 20, 25, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 150, 200, 250, 400, 500 GPa 이상의 영률을 가질 수 있다. 가요성 및 강성 사이의 관계는 서로 반비례하기 때문에, 가요성 물질은 낮은 영률을 갖고 하중 하에 그의 형상을 크게 변화시킨다.
일부 경우에, 본원에 개시된 장치는 이산화규소 베이스 및 산화규소의 표면층을 포함한다. 대안적으로, 장치는 산화규소의 베이스를 가질 수 있다. 본원에 제공된 장치의 표면은 질감이 있어, 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 전체 표면적을 증가시킬 수 있다. 본원에 기재된 장치는 적어도 5%, 10%, 25%, 50%, 80%, 90%, 95%, 또는 99% 규소를 포함할 수 있다. 본원에 개시된 장치는 절연체상 규소(SOI) 웨이퍼로부터 제조될 수 있다.
임의의 하나 이상의 다양한 물질로부터 제조된 구조물을 포함하는 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 장치가 본원에 제공된다. 특정 경우에, 기판/ 고체 지지체가 포함하는 물질은 낮은 수준의 폴리뉴클레오타이드 결합을 나타내도록 제조된다. 일부 경우에, 가시광선 및/또는 UV 광에 투명한 물질이 사용될 수 있다. 충분히 전도성인 물질(도체), 예컨대 본원에 기재된 기판/고체 지지체의 전체 또는 일부에 균일한 전기장을 형성할 수 있는 물질이 이용될 수 있다. 일부 경우에, 이러한 물질은 전기 접지에 연결될 수 있다. 일부 경우에, 기판 또는 고체 지지체는 열 전도성이거나 절연성일 수 있다. 물질은 일련의 폴리뉴클레오타이드 합성 반응과 같은 화학적 또는 생화학적 반응을 지지하기 위해 화학적 내성이고 열 내성일 수 있다.
일부 경우에, 전도성 또는 반전도성 물질(반도체)은 비제한적으로 티타늄 질화규소, 질화티타늄, 질화텅스텐, 질화탄탈륨, 탄탈륨 질화규소, 티타늄, 규화백금, 또는 다른 전도성 물질 중 하나 이상을 포함한다. 예에서, 물질은 비제한적으로 알루미늄 탄화물, 탄화물, 질화물, 산화물, 규화물, 규소 질화물, 인화물, 또는 전도성 물질의 구성요소로서 사용되는 다른 비금속 또는 메탈로이드 중 하나 이상을 포함한다. 일부 경우에, 예시적인 물질은 (비제한적으로) 텅스텐, 코발트, 이리듐, 몰리브덴, 니켈, 백금, 레늄, 루테늄, 탄탈륨, 티타늄, 또는 전도성 물질의 구성요소로서 사용되는 다른 금속의 요소 중 하나 이상을 포함한다. 일부 경우에, 물질은 금속, 비금속, 또는 메탈로이드의 혼합물을 포함한다. 일부 경우에, 도펀트가 반전도체 물질에 첨가된다. 도펀트는 비제한적으로 인, 안티몬, 비소, 붕소, 알루미늄, 인듐, 또는 사양과 일관되는 다른 요소를 포함한다. 나노로드, 나노와이어, 또는 나노튜브와 같은 나노구조물의 경우, 관심있는 물질은 도체, 반도체, 또는 절연체를 포함한다. 이것은 비제한적으로 금속성 요소(예를 들어, 니켈, 구리, 은, 금, 백금), 반도체 물질(예를 들어, 규소, 산화아연, 게르마늄, 인화갈륨, 질화인듐), 또는 절연 물질(예를 들어, 이산화규소, 또는 이산화티타늄)을 포함한다. 도체, 반도체, 또는 절연체는 본원에 열거된 물질의 조합 또는 당업계에 공지된 임의의 다른 적합한 물질을 이용하여 제조될 수 있다.
강성 물질의 경우, 관심있는 특정 물질은 유리; 퓨즈드 실리카; 규소, 플라스틱(예를 들어, 폴리테트라플루오로에틸렌, 폴리프로필렌, 폴리스티렌, 폴리카르보네이트, 및 이의 블렌드 등); 금속(예를 들어, 금, 백금 등)을 포함한다. 구조물은 규소, 폴리스티렌, 아가로스, 덱스트란, 셀룰로오스 중합체, 폴리아크릴아미드, 폴리디메틸실록산(PDMS), 및 유리로 이루어진 군으로부터 선택된 물질로부터 제조될 수 있다. 기판/고체 지지체, 마이크로구조물, 반응기, 또는 그 안의 다른 폴리뉴클레오타이드 합성 구조물은 본원에 열거된 물질 또는 당업계에 공지된 임의의 다른 적합한 물질의 조합으로 제조될 수 있다.
본원에 기재된 구조물을 위한 예시적인 가요성 물질은, 비제한적으로, 나일론(비변형된 나일론, 변형된 나일론, 투명 나일론), 니트로셀룰로오스, 폴리프로필렌, 폴리카르보네이트, 폴리에틸렌, 폴리우레탄, 폴리스티렌, 아세탈, 아크릴, 아크릴로니트릴, 부타디엔 스티렌(ABS), 폴리에스테르 필름, 예컨대 폴리에틸렌 테레프탈레이트, 폴리메틸 메타크릴레이트 또는 다른 아크릴, 폴리염화비닐 또는 다른 비닐 수지, 투명 PVC 호일, 프린터용 투명 호일, 폴리(메틸 메타크릴레이트)(PMMA), 메타크릴레이트 공중합체, 스티렌 중합체, 고굴절률 중합체, 불소 함유 중합체, 폴리에테르설폰, 지환족 구조물을 함유하는 폴리이미드, 고무, 직물, 금속 호일, 및 이의 임의의 조합을 포함한다. 선택된 가요성 특징을 달성하기 위해 다양한 가소제 및 변형제가 중합체성 기판 물질과 함께 사용될 수 있다.
본원에 기재된 가요성 구조물은 플라스틱 물질을 포함할 수 있다. 일부 경우에, 구조물은 열가소성 물질을 포함한다. 열가소성 물질의 비제한적인 예는 아크릴, 아크릴로니트릴 부타디엔 스티렌, 나일론, 폴리락트산, 폴리벤즈이미다졸, 폴리카르보네이트, 폴리에테르 설폰, 폴리에테르에테르 케톤, 폴리에테르이미드, 폴리에틸렌, 산화 폴리페닐렌, 황화 폴리페닐렌, 폴리프로필렌, 폴리스티렌, 폴리염화비닐, 및 폴리테트라플루오로에틸렌을 포함한다. 일부 경우에, 기판은 폴리아릴에테르케톤(PEAK) 패밀리 내의 열가소성 물질을 포함한다. PEAK 열가소성 물질의 비제한적인 예는 폴리에테르케톤(PEK), 폴리에테르케톤케톤(PEKK), 폴리(에테르 에테르 케톤　케톤)(PEEKK), 폴리에테르 에테르 케톤(PEEK), 및 폴리에테르케톤에테르케톤케톤(PEKEKK)을 포함한다. 일부 경우에, 구조물은 톨루엔과 호환성인 열가소성 물질을 포함한다. 일부 경우에, 플라스틱 물질의 가요성은 가소제의 첨가에 의해 증가된다. 가소제의 예는 에스테르계 가소제, 예컨대 프탈레이트이다. 프탈레이트 가소제는 비스(2-에틸헥실) 프탈레이트(DEHP), 디이소노닐 프탈레이트(DINP), 디-n-부틸 프탈레이트(DnBP, DBP), 부틸 벤질 프탈레이트(BBzP), 디이소데실 프탈레이트(DIDP), 디옥틸 프탈레이트(DOP, DnOP), 디이소옥틸 프탈레이트(DIOP), 디에틸 프탈레이트(DEP), 디이소부틸 프탈레이트(DIBP), 및 디-n-헥실 프탈레이트를 포함한다. 일부 경우에, 공중합을 통한 열가소성 중합체의 변형 또는 중합 전에 단량체에 비반응성 측쇄를 첨가하는 것을 통한 열가소성 중합체의 변형은 또한 가요성을 증가시킨다.
플루오로엘라스토머를 추가로 포함할 수 있는 가요성 구조물이 본원에 제공된다. 약 80% 플루오로엘라스토머를 갖는 물질은 FKM으로 지정된다. 플루오로엘라스토머는 퍼플루오로-엘라스토머(FFKM) 및 테트라플루오로에틸렌/프로필렌 고무(FEPM)를 포함한다. 플루오로엘라스토머는 5개의 공지된 유형을 갖는다. 유형 1 FKM은 비닐리덴 플루오라이드(VDF) 및 헥사플루오로프로필렌(HFP)으로 구성되고, 이들의 불소 함량은 전형적으로 약 66 중량%이다. 유형 2 FKM은 VDF, HFP, 및 테트라플루오로에틸렌(TFE)으로 구성되고, 전형적으로 약 68% 내지 69%의 불소를 갖는다. 유형 3 FKM은 VDF, TFE, 및 퍼플루오로메틸비닐에테르(PMVE)으로 구성되고, 전형적으로 약 62% 내지 68%의 불소를 갖는다. 유형 4 FKM은 프로필렌, TFE, 및 VDF로 구성되고, 전형적으로 약 67%의 불소를 갖는다. 유형 5 FKM은 VDF, HFP, TFE, PMVE, 및 에틸렌으로 구성된다.
일부 경우에, 본원에 개시된 기판은 컴퓨터 판독가능한 물질을 포함한다. 컴퓨터 판독가능한 물질은, 비제한적으로, 자기 매체, 릴-투-릴 테이프, 카트리지 테이프, 카세트 테이프, 가요성 디스크, 종이 매체, 필름, 마이크로피시(microfiche), 연속 테이프(예컨대, 벨트) 및 전자 설명서를 저장하기에 적합한 임의의 매체를 포함한다. 일부 경우에, 기판은 자기 릴-투-릴 테이프 또는 자기 벨트를 포함한다. 일부 경우에, 기판은 가요성 인쇄 회로 보드를 포함한다.
본원에 기재된 구조물은 가시광선 및/또는 UV 광에 투명할 수 있다. 일부 경우에, 본원에 기재된 구조물은 구조물의 전부 또는 일부에 균일한 전기장을 형성하기 위해 충분히 전도성이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 구조물은 열 전도성이거나 절연성이다. 일부 경우에, 구조물은 폴리뉴클레오타이드 합성 반응과 같은 화학적 반응을 지지하기 위해 화학적 내성 및 열 내성이다. 일부 경우에, 기판은 자성이다. 일부 경우에, 구조물은 금속 또는 금속 합금을 포함한다.
폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 구조물은 임의의 치수가 1, 2, 5, 10, 30, 50 피트 이상의 길이일 수 있다. 가요성 구조물의 경우, 가요성 구조물은 선택적으로 권취된 상태, 예컨대, 릴로 저장된다. 예컨대 1 피트 길이를 초과하는 큰 구조물의 경우, 구조물은 수직 또는 수평으로 저장될 수 있다.
물질 증착 시스템
본원에 기재된 구조물 상에 생체분자를 증착 및 저장하기 위한 시스템 및 장치가 본원에 제공된다. 일부 경우에, 생체분자는 코딩된 정보를 그들의 서열에 저장하는 폴리뉴클레오타이드이다. 일부 경우에, 시스템은 생체분자 부착을 지지하기 위한 구조물의 표면 및/또는 기판의 표면에 생체분자 적용하기 위한 장치를 포함한다. 일 예에서, 생체분자 적용을 위한 장치는 폴리뉴클레오타이드 합성 장치이다. 일부 경우에, 시스템은 기판을 유체, 예를 들어, 플로우 셀(flow cell)로 처리하기 위한 장치를 포함한다. 일부 경우에, 시스템은 적용 장치 및 처리 장치 사이에서 기판을 이동시키기 위한 장치를 포함한다. 기판이 릴-투-릴 테이프인 경우, 시스템은 상이한 시간에 적용 및 선택적인 처리 장치에 기판의 상이한 부분의 액세스를 허용하는 2개 이상의 릴을 포함할 수 있다.
폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 폴리뉴클레오타이드 물질 증착 시스템의 첫 번째 예가 도 7에 나타나 있다. 시스템은 기판의 위치와 정렬되도록 X-Y 방향으로 이동하는 물질 증착 장치를 포함한다. 물질 증착 장치는 또한 Z 방향으로 이동하여 기판으로 밀봉하여 분해된 반응기를 형성할 수 있다. 분해된 반응기는 폴리뉴클레오타이드 및/또는 시약을 포함하는 유체를 기판으로부터 캡핑 요소로 및/또는 그 반대로 전달하도록 구성된다. 도 7에 나타낸 바와 같이, 유체는 기판 및 캡핑 요소 중 하나 또는 둘 모두를 통과할 수 있으며, 비제한적으로, 커플링 시약, 캡핑 시약, 산화제, 탈블로킹제, 아세토니트릴 및 질소 기체를 포함한다. 고해상도 액적 증착이 가능한 장치의 예는 잉크젯 프린터 및 레이저 프린터의 프린트헤드를 포함한다. 본원에 기재된 시스템 및 방법에 유용한 장치는 약 100 도트 퍼 인치(DPI) 내지 약 50,000 DPI; 약 100 DPI 내지 약 20,000 DPI; 약 100 DPI 내지 약 10,000 DPI; 약 100 DPI 내지 약 5,000 DPI; 약 1,000 DPI 내지 약 20,000 DPI; 또는 약 1,000 DPI 내지 약 10,000 DPI의 해상도를 달성한다. 일부 경우에, 장치는 적어도 약 1,000; 2,000; 3,000; 4,000; 5,000; 10,000; 12,000 DPI, 또는 20,000 DPI의 해상도를 갖는다. 장치에 의해 수행되는 고해상도 증착은 기판의 특징부에 상응하는 각 노즐의 수 및 밀도와 관련된다.
폴리뉴클레오타이드 합성 장치를 사용하여 기판 상에 폴리뉴클레오타이드를 드 노보 합성하기 위한 예시적인 공정 워크플로우가 도 8에 나타나 있다. 폴리뉴클레오타이드 합성 시약을 포함하는 액적은 단계적인 방식으로 물질 증착 장치로부터 기판으로 방출되며, 물질 증착 장치는 액적을 방출하기 위해 전기적 신호를 기계적 신호로 변환하는 피에조(piezo) 세라믹 물질 및 전극을 갖는다. 액적은 데이터를 코딩하는 미리 결정된 서열을 갖는 복수의 합성된 폴리뉴클레오타이드를 생성하기 위해 한 번에 하나의 핵염기로 기판의 표면 상의 특정 위치에 방출된다. 일부 경우에, 합성된 폴리뉴클레오타이드는 기판 상에 저장된다. 핵산 시약은 비연속적, 또는 드롭 온 디맨드(drop-on-demand) 방법으로 기판 표면에 증착될 수 있다. 이러한 방법의 예는 전기기계적 전달 방법, 전기 열적 전달 방법, 및 정전기적 인력 방법을 포함한다. 전기기계적 전달 방법에서는, 전기 펄스에 의해 변형된 압전(piezoelectric) 요소가 액적을 방출시킨다. 전기 열적 전달 방법에서는, 장치의 챔버에서 버블이 생성되고, 버블의 팽창력이 액적을 방출시킨다. 정전기적 인력 방법에서는, 정전기적 인력이 액적을 기판 상에 방출하는데 사용된다. 일부 경우에, 드롭 주파수(drop frequency)는 약 5 KHz 내지 약 500 KHz; 약 5 KHz 내지 약 100 KHz; 약 10 KHz 내지 약 500 KHz; 약 10 KHz 내지 약 100 KHz; 또는 약 50 KHz 내지 약 500 KHz이다. 일부 경우에, 주파수는 약 500 KHz, 200 KHz, 100 KHz, 또는 50 KHz 미만이다.
분배된 액적의 크기는 장치의 해상도와 상관관계가 있다. 일부 경우에, 장치는 시약의 액적을 약 0.01 pl 내지 약 20 pl, 약 0.01 pl 내지 약 10 pl, 약 0.01 pl 내지 약 1 pl, 약 0.01 pl 내지 약 0.5 pl, 약 0.01 pl 내지 약 0.01 pl, 또는 약 0.05 pl 내지 약 1 pl의 크기로 증착시킨다. 일부 경우에, 액적 크기는 약 1 pl, 0.5 pl, 0.2 pl, 0.1 pl, 또는 0.05 pl 미만이다. 장치에 의해 분배된 액적의 크기는 증착 노즐의 직경과 상관관계가 있으며, 각각의 노즐은 시약을 기판의 특징부 상에 증착시킬 수 있다. 일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드 합성 장치의 증착 장치는 약 100 내지 약 10,000개의 노즐; 약 100 내지 약 5,000개의 노즐; 약 100 내지 약 3,000개의 노즐; 약 500 내지 약 10,000개의 노즐; 또는 약 100 내지 약 5,000개의 노즐을 포함한다. 일부 경우에, 증착 장치는 1,000; 2,000; 3,000; 4,000; 5,000; 또는 10,000개 초과의 노즐을 포함한다. 일부 경우에, 각각의 물질 증착 장치는 복수의 노즐을 포함하고, 각각의 노즐은 선택적으로 기판 상의 특징부에 상응하도록 구성된다. 각각의 노즐은 또 다른 노즐과 상이한 시약 구성요소를 증착시킬 수 있다. 일부 경우에, 각각의 노즐은 기판의 하나 이상의 특징부를 덮는 액적을 증착시킨다. 일부 경우에, 하나 이상의 노즐은 각져있다. 일부 경우에, 다수의 증착 장치가 처리량의 배수 증가를 달성하기 위해 나란히 적층된다. 일부 경우에, 게인(gain)은 2x, 4x, 8x 이상이다. 증착 장치의 예는 삼바 프린트헤드(Samba Printhead(Fujifilm))이다. 삼바 프린트헤드는 삼바 웹 관리 도구(Samba Web Administration Tool, SWAT)와 함께 사용될 수 있다.
증착 부위의 수는 동일한 증착 장치를 사용하고 특정 각도 또는 세이버 각도(saber angle)로 회전시킴으로써 증가될 수 있다. 증착 장치를 회전시킴으로써, 각각의 노즐은 세이버 각도에 대응하는 특정 양의 지연 시간으로 분사된다. 이러한 비동기화된 분사는 노즐 사이에 크로스토크(cross talk)를 생성한다. 따라서, 액적이 0도와는 다른 특정한 세이버 각도로 분사되는 경우, 노즐로부터의 액적 부피는 상이할 수 있다.
일부 배열에서, 폴리뉴클레오타이드 합성 시스템의 구성은 릴-투-릴 유형 공정에서 이동하기 위해 기판의 가요성을 이용하는 연속적인 폴리뉴클레오타이드 합성 공정을 허용한다. 이 합성 공정은 기판의 위치를 회전시키는 하나 이상의 릴을 사용하여 기판이 다양한 단계의 폴리뉴클레오타이드 합성을 통과하여 이동하는 연속적인 생산 라인 방식으로 작동한다. 예시적인 구현예에서, 폴리뉴클레오타이드 합성 반응은 용매 배쓰(bath)를 통해, 포스포르아미다이트 증착을 위한 증착 장치 아래에, 산화제의 배쓰를 통해, 아세토니트릴 세척 배쓰를 통해, 및 탈블록 배쓰를 통해 기판을 롤링하는 단계를 포함한다. 선택적으로, 테이프는 또한 캡핑 배쓰를 통해 이동한다. 릴-투-릴　유형 공정은 합성된 폴리뉴클레오타이드를 포함하는 기판의 완성된 제품이 테이크업 릴(take-up reel) 상에 쉽게 모이게 하고, 여기서 추가 가공 및 저장을 위해 운반될 수 있다.
일부 배열에서, 폴리뉴클레오타이드 합성은 연속적인 가요성 테이프가 컨베이어 벨트 시스템을 따라 운반됨에 따라 연속적인 공정으로 진행된다. 릴-투-릴 유형 공정과 유사하게, 연속적인 테이프 상에서의 폴리뉴클레오타이드 합성은 생산 라인 방식으로 작동하며, 기판은 운반 동안 폴리뉴클레오타이드 합성의 다양한 단계를 통해 이동한다. 그러나, 컨베이어 벨트 공정에서, 연속적인 테이프는 릴-투-릴 공정에서와 같이 테이프의 롤링 및 언롤링 없이 폴리뉴클레오타이드 합성을 재개한다. 일부 배열에서, 폴리뉴클레오타이드 합성 단계는 구역으로 분할되고, 연속적인 테이프는 한 사이클에서 1회 이상 각각의 구역을 통해 운반된다. 예를 들어, 폴리뉴클레오타이드 합성 반응은 (1) 사이클에서 용매 배쓰를 통해, 포스포르아미다이트 증착을 위한 증착 장치 아래에, 산화제의 배쓰를 통해, 아세토니트릴 세척 배쓰를 통해, 및 블록 배쓰를 통해 기판을 운반하는 단계, 및 이후 (2) 사이클을 반복하여 미리 결정된 길이의 합성된 폴리뉴클레오타이드를 달성하는 단계를 포함한다. 폴리뉴클레오타이드 합성 후, 가요성 기판은 컨베이어 벨트 시스템으로부터 제거되고, 선택적으로, 저장을 위해 롤링된다. 롤링은 저장을 위해 릴 주위에서 이루어질 수 있다.
예시적인 배열에서, 열가소성 물질을 포함하는 가요성 기판은 뉴클레오사이드 커플링 시약으로 코딩된다. 코팅은 각각의 특징부가 약 10 μm의 직경을 갖고 약 21 μm의 2개의 인접한 특징부 사이의 중심간 거리를 갖도록 특징부로 패턴화된다. 이 경우, 특징부 크기는 폴리뉴클레오타이드 합성 증착 단계 동안 0.2 pl의 세실 드롭 부피(sessile drop volume)를 수용하기에 충분하다. 일부 경우에, 특징부 밀도는 m2당 약 22억 개의 특징부(1개의 특징부 / 441 x 10-12 m2)이다. 일부 경우에, 4.5 m2 기판은 각각 10 μm 직경을 갖는 약 100억 개의 특징부를 포함한다.
또 다른 예시적인 배열에서, 나노구조물을 포함하는 기판은 뉴클레오사이드 커플링 시약으로 코팅된다. 코팅은 각각의 특징부가 약 10 nm 내지 약 200 nm의 직경을 갖고 약 10 nm 내지 약 200 nm의 2개의 인접한 특징부 사이의 중심간 거리를 갖도록 특징부로 패턴화된다. 이 경우, 복수의 특징부는 폴리뉴클레오타이드 합성 증착 단계 동안 0.2 pl의 세실 드롭 부피를 수용한다. 일부 경우에, 약 50 nm의 특징부 직경 및 약 100 nm의 2개의 인접한 특징부 사이의 중심간 거리는 m2당 약 100억 개의 특징부(1개의 특징부 / 100 x 10-12 m2)의 특징부 밀도를 초래한다.
본원에 기재된 물질 증착 장치는 각각 액적당 1개의 핵염기로 초당 약 100,000개의 액적을 증착시키는 약 2,048개의 노즐을 포함할 수 있다. 각각의 증착 장치의 경우, 하루에 적어도 약 1.75 x 1013개의 핵염기가 기판 상에 증착된다. 일부 경우에, 100 내지 500개의 핵염기 폴리뉴클레오타이드가 합성된다. 일부 경우에, 200개의 핵염기 폴리뉴클레오타이드가 합성된다. 선택적으로, 3일 동안, 하루에 약 1.75 x 1013개의 염기의 속도로, 적어도 약 262.5 x 109개의 폴리뉴클레오타이드가 합성된다.
일부 배열에서, 합성 반응 동안 기판에 하나 이상의 시약을 적용하기 위한 장치는 뉴클레오사이드 포스포르아미다이트 기반 합성을 위한 시약 및/또는 뉴클레오타이드 단량체를 증착시키도록 구성된다. 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 시약은 폴리뉴클레오타이드 연장을 위한 시약 및 세척 완충제를 포함한다. 비제한적인 예로서, 장치는 세정 시약, 커플링 시약, 캡핑 시약, 산화제, 탈블로킹제, 아세토니트릴, 상 변화 용매, 질소 기체와 같은 기체, 및 이의 임의의 조합을 증착시킨다. 또한, 장치는 선택적으로 기판 무결성의 준비 및/또는 유지를 위한 시약을 증착시킨다. 일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드 합성 장치는 약 1000, 500, 100, 50, 또는 20 pl 미만의 부피에 약 200 μm, 100 μm, 또는 50 μm 미만의 직경을 갖는 방울을 증착시킨다. 일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드 합성 장치는 초당 약 1 내지 10,000, 1 내지 5,000, 100 내지 5,000, 또는 1,000 내지 5,000개의 액적을 증착시킨다.
일부 배열에서, 폴리뉴클레오타이드 합성 동안, 기판은 플로우 셀 내에 위치하고/거나 밀봉된다. 플로우 셀은 기판 내에서 반응하는데 필요한 시약, 예를 들어, 산화제 및/또는 용매를 포함하는 액체와 같은 액체의 연속적 또는 비연속적 흐름을 제공할 수 있다. 플로우 셀은 전형적으로 휘발성 기판의 향상된 증발을 통해 기판을 건조시키기 위해, 질소와 같은 기체의 연속적 또는 비연속적 흐름을 제공할 수 있다. 다양한 보조 장치는 건조를 개선하고 기판의 표면 상의 잔류 수분을 감소시키는데 유용하다. 이러한 보조 건조 장치의 예는, 비제한적으로, 진공 공급원, 감압 펌프 및 진공 탱크를 포함한다. 일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드 합성 시스템은 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 또는 20개와 같은 하나 이상의 플로우 셀 및 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10 또는 20개와 같은 하나 이상의 기판을 포함한다. 일부 경우에, 플로우 셀은 합성 반응에서의 하나 이상의 단계 동안 시약을 유지하고 기판에 제공하도록 구성된다. 일부 경우에, 플로우 셀은 기판의 위로 미끄러지는 뚜껑을 포함하고, 기판의 모서리 주위에 압착 밀봉을 형성하기 위해 제자리에 고정될 수 있다. 적절한 밀봉은, 비제한적으로, 약 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 또는 10 기압의 압력을 허용하는 밀봉을 포함한다. 일부 경우에, 플로우 셀의 뚜껑은 폴리뉴클레오타이드 합성 장치와 같은 적용 장치에의 액세스를 허용하기 위해 개방된다. 일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드 합성 방법의 하나 이상의 단계는 기판의 수송 없이, 플로우 셀 내의 기판 상에서 수행된다.
일부 배열에서, 기판을 유체로 처리하기 위한 장치는 스프레이 바(spray bar)를 포함한다. 뉴클레오타이드 단량체는 기판 표면에 적용될 수 있고, 이어서 스프레이 바는 스프레이 바의 스프레이 노즐을 사용하여 하나 이상의 처리 시약으로 기판 표면을 스프레이한다. 일부 배열에서, 스프레이 노즐은 폴리뉴클레오타이드 합성 동안 상이한 처리 단계와 상관되도록 순차적으로 정렬된다. 상이한 공정 단계에서 사용되는 화학 물질은 합성 방법 또는 합성 방법의 단계 사이의 변화를 쉽게 수용하도록 스프레이 바에서 변경될 수 있다. 일부 경우에, 스프레이 바는 기판이 스프레이 바를 지나 이동할 때 기판의 표면 상에 주어진 화학물질을 연속적으로 스프레이한다. 일부 경우에, 스프레이 바는 잔디 스프링클러에 사용되는 스프레이 바와 매우 유사하게, 기판의 광범위한 영역에 증착된다. 일부 경우에, 스프레이 바 노즐은 기판의 주어진 영역에 처리 물질의 균일한 코팅을 제공하도록 위치한다.
일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드 합성 시스템은 합성된 폴리뉴클레오타이드의 하류 처리에 유용한 하나 이상의 요소를 포함한다. 일 예로서, 시스템은 열 사이클링 장치와 같은 온도 제어 요소를 포함한다. 일부 경우에, 온도 제어 요소는 PCA와 같은 핵산 어셈블리 및/또는 PCR과 같은 핵산 증폭을 수행하기 위해 복수의 분해된 반응기와 함께 사용된다.
온도 제어가능 장치를 사용한 드 노보 폴리뉴클레오타이드 합성
온도 특이적 방식으로 폴리뉴클레오타이드 합성 동안 시약의 액세스를 조절하기 위한 상 변화 적용 방법이 본원에 제공된다(표 1 참고). 본원에 기재된 용매에 대한 예시적인 용융 온도는 약 10℃ 내지 약 30℃, 약 10℃ 내지 약 18℃, 약 -30℃ 내지 약 40℃, 또는 약 5℃ 내지 약 40℃를 포함한다. 일부 양태에서, 상 변화 용매는 약 15-16℃의 용융 온도를 갖는다. 일부 양태에서, 상 변화 용매는 약 10-25℃의 용융 온도를 갖는다. 일부 양태에서, 상 변화 용매는 약 15-25℃의 용융 온도를 갖는다. 일부 양태에서, 상 변화 용매는 약 15-18℃의 용융 온도를 갖는다. 일부 경우에, 상 변화 용매는 적어도 -20℃, 또는 적어도 -15, -10, -5, 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35, 40, 또는 40℃ 초과의 용융 온도를 갖는다. 일부 경우에, 상 변화 용매는 -20℃ 이하, 또는 -15, -10, -5, 0, 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 35 이하, 또는 40℃ 이하의 용융 온도를 갖는다. 일부 경우에, 상 변화 용매는 약 5 내지 약 10개의 탄소 원자를 함유하는 용매를 포함한다. 일부 경우에, 상 변화 용매는 극성 용매이다. 일부 경우에, 상 변화 용매는 이온성 액체이다. 일부 경우에, 상 변화 용매는 초임계 유체이다. 일부 경우에, 상 변화 용매는 용매 특성에 영향을 미치는 하나 이상의 첨가제, 예컨대 염, 다른 고체, 액체, 또는 용해된 기체를 포함한다. 본원에 기재된 상 변화 용매의 예시적인 밀도는 약 0.5 g/mL 내지 약 1.5 g/mL, 또는 약 0.6 g/mL 내지 약 1.4 g/mL, 또는 약 0.7 g/mL 내지 약 1.3 g/mL을 포함한다. 일부 경우에, 상 변화 용매는 82℃ 이상의 비등점을 갖는 용매이다. 일부 경우에, 상 변화 용매는 아세토니트릴 또는 아세토니트릴 혼합물이다.
일부 경우에, 상 변화 용매는 트리메틸아세토니트릴(TMACN)이다. 다른 예시적인 상 변화 용매는 비제한적으로 트리메틸아세토니트릴(TMACN), 디메틸설폭사이드(DMSO), p-자일렌, 사이클로헥실시아니드, 2,5-디메틸-2,4-헥사디엔, 사이클로옥탄, o-톨루니트릴, 아세토페논, 사이클로노난, p-메틸벤질 시아니드, 프로피오페논, m-니트로톨루엔, o-디메톡시벤젠, m-클로로벤즈알데히드, o-클로로벤즈알데히드, 사이클로데칸, 디메틸 석시네이트, 부티로페논, 4-에톡시벤즈알데히드, m-톨릴 아세테이트, 페닐 프로피오네이트, 또는 이의 혼합물을 포함한다.
일부 경우에, 본원에 사용된 폴리뉴클레오타이드 합성 방법은 1, 2, 3개 이상의 순차적인 커플링 단계를 포함한다. 커플링 전에, 여러 경우에, 기판에 결합된 뉴클레오사이드는 보호기의 제거에 의해 탈보호되고, 여기서 보호기는 중합을 방지하는 기능을 한다. 일반적인 보호기는 4,4'-디메톡시트리틸(DMT)이다. 일부 경우에, 커플링 단계는 보호기를 제거하지 않고 2회 이상 반복된다.
커플링 후, 포스포르아미다이트 폴리뉴클레오타이드 합성 방법은 선택적으로 캡핑 단계를 포함한다. 캡핑 단계에서, 성장하는 폴리뉴클레오타이드는 캡핑제로 처리된다. 캡핑 단계는 일반적으로 추가의 사슬 신장으로부터 커플링 후 미반응된 기판 결합된 5'-OH 기를 차단하여, 내부 염기 결실을 갖는 폴리뉴클레오타이드의 형성을 방지하는 역할을 한다. 또한, 1H-테트라졸로 활성화된 포스포르아미다이트는 종종 구아노신의 O6 위치와 작은 정도로 반응한다. 이론에 구속되지 않고, I2/물로 산화시, 이 부산물은, 아마도 O6-N7 이동을 통해, 탈퓨린화(depurination)를 겪는다. 퓨린결여(apurinic) 부위는 결국 폴리뉴클레오타이드의 최종 탈보호 과정에서 절단되어 전장 생성물의 수율을 감소시킬 수 있다. O6 변형은 I2/물로 산화시키기 전에 캡핑 시약으로 처리함으로써 제거될 수 있다. 일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드 합성 동안 캡핑 단계를 포함시키는 것은 캡핑이 없는 합성과 비교하여 오류율을 감소시킨다. 일 예로서, 캡핑 단계는 기판 결합된 폴리뉴클레오타이드를 아세트산 무수물 및 1-메틸이미다졸의 혼합물로 처리하는 단계를 포함한다. 캡핑 단계 후, 기판은 선택적으로 세척된다.
뉴클레오사이드 포스포르아미다이트의 첨가 후와 선택적으로 캡핑 및 하나 이상의 세척 단계 후, 기판 결합된 성장하는 핵산은 산화될 수 있다. 산화 단계는 포스파이트 트리에스테르를 자연발생 포스페이트 디에스테르 뉴클레오사이드간 연결의 보호된 전구체인 4배위(tetracoordinated) 포스페이트 트리에스테르로 산화시키는 단계를 포함한다. 일부 경우에, 성장하는 폴리뉴클레오타이드의 산화는, 선택적으로 피리딘, 루티딘, 또는 콜리딘과 같은 약염기의 존재하에, 요오드 및 물로 처리함으로써 달성된다. 산화는 때때로 tert-부틸 하이드로퍼옥사이드 또는 (1S)-(+)-(10-캄포르설포닐)-옥사지리딘(CSO)을 사용하여 무수 조건 하에서 수행된다. 일부 방법에서, 캡핑 단계는 산화 후에 수행된다. 지속될 수 있는 산화로부터의 잔류수가 후속 커플링을 억제할 수 있기 때문에, 제2 캡핑 단계는 기판 건조를 허용한다. 산화 후, 기판 및 성장하는 폴리뉴클레오타이드는 선택적으로 세척된다. 일부 경우에, 산화 단계는 폴리뉴클레오타이드 포스포로티오에이트를 수득하기 위해 황화 단계로 치환되고, 임의의 캡핑 단계는 황화 후에 수행될 수 있다. 비제한적으로, 3-(디메틸아미노메틸렌)아미노)-3H-1,2,4-디티아졸-3-티온, DDTT, 보카주(Beaucage) 시약으로도 알려진 3H-1,2-벤조디티올-3-온 1,1-디옥사이드, 및 N,N,N'N'-테트라에틸티우람 디설파이드(TETD)를 포함하는 많은 시약은 효율적인 황 전달을 할 수 있다.
커플링을 통해 발생하는 뉴클레오사이드 혼입의 후속 사이클을 위해, 기판 결합된 성장하는 폴리뉴클레오타이드의 보호된 5' 말단은 1차 하이드록실기가 다음 뉴클레오사이드 포스포르아미다이트와 반응할 수 있도록 제거되어야 한다. 일부 경우에, 보호기는 DMT이고, 탈블로킹은 디클로로메탄 중의 트리클로로아세트산을 이용하여 발생한다. 연장된 시간 동안 또는 권장된 산 용액보다 더 강한 산 용액으로 탈트리틸화(detritylation)를 수행하는 것은 고체 지지체 결합된 폴리뉴클레오타이드의 탈퓨린화를 증가시켜 원하는 전장 생성물의 수율을 감소시킬 수 있다. 본원에 기재된 방법 및 조성물은 원하지 않는 탈퓨린화 반응을 제한하는 제어된 탈블로킹조건을 제공한다. 일부 경우에, 기판 결합된 폴리뉴클레오타이드는 탈블로킹 후 세척된다. 일부 경우에, 탈블로킹 후 효율적인 세척은 낮은 오류율을 갖는 합성된 폴리뉴클레오타이드에 기여한다.
본원에 기재된 기판 상에서 폴리뉴클레오타이드를 합성하는 방법은 전형적으로 하기 단계의 반복 순서를 포함한다: 표면, 링커 또는 이전에 탈보호된 단량체와 연결하기 위해 기판 특징부의 표면에 보호된 단량체의 적용; 적용된 단량체가 후속적으로 적용된 보호된 단량체와 반응할 수 있도록 적용된 단량체의 탈보호; 연결을 위한 또 다른 보호된 단량체의 적용. 하나 이상의 중간 단계는 산화 및/또는 황화를 포함한다. 일부 경우에, 하나 이상의 세척 단계는 하나 또는 모든 단계보다 선행하거나 후행한다. 일부 경우에, 마지막 세척 단계는 적합한 상 변화 용매의 첨가를 포함한다. 일부 경우에, 커플링 단계는 상 변화 용매를 제거하지 않고 발생한다. 일부 경우에, 반응 용매는 상 변화 용매이다.
본원에 기재된 방법의 일부 양태에서, 반응 용매의 상은 장치의 표면 상의 특정 부위를 블로킹하거나 탈블로킹하는데 사용된다. 일 예에서, 부위에서의 반응 용매의 상은 하나 이상의 어드레서블 가열 요소에 의해 제어되고, 폴리뉴클레오타이드의 합성 방법은 하나 이상의 다음 단계의 순서의 반복을 포함한다: 표면 상의 적용된 단량체 또는 반응성기가 후속 적용된 보호된 단량체와 반응할 수 있도록 표면 상의 적용된 단량체 또는 반응성기의 탈보호; 장치 표면의 선택적 냉각; 표면 상의 모든 히터 요소의 활성화; 상 변화 용매의 첨가, 블로킹될 장치 부위에서 모든 가열 요소의 불활성화 및 표면, 링커 또는 이전에 탈보호된 단량체와 연결하기 위해 기판 특징부의 표면에 보호된 단량체의 적용. 하나 이상의 중간 단계는 모든 히터 요소의 활성화 후, 산화 및/또는 황화를 포함한다. 일부 경우에, 하나 이상의 세척 단계는 하나 또는 모든 단계보다 선행하거나 후행한다. 일부 경우에, 모든 가열 요소의 활성화는 하나 이상의 세척 단계보다 선행하거나 후행한다. 일부 경우에, 가열 요소는 블로킹될 부위에서 활성화된다.
폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 하나 이상의 표면 영역에서의 하나 이상의 히터 요소의 불활성화가 이들 영역 내의 용매를 동결시켜 고체를 형성하는 방법이 본원에 추가로 기재된다. 일부 경우에, 고체 용매 용매는 합성 표면 영역과 탈트리틸화 시약과 같은 추가적인 시약과의 접촉을 방지하여, 탈보호를 방지한다. 일부 경우에, 가열 요소의 활성화 또는 냉각 요소의 불활성화는 고체를 용융시켜, 시약을 합성 표면에 접촉시킨다.
폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 하나 이상의 표면 영역에서의 하나 이상의 히터 요소의 활성화가 이들 영역 내의 용매를 비등시켜 기체 버블을 형성하는 방법이 본원에 추가로 기재된다. 일부 경우에, 기체 용매의 버블은 합성 표면 영역과 탈트리틸화 시약과 같은 추가적인 시약과의 접촉을 방지하여, 탈보호를 방지한다. 일부 경우에, 냉각 요소의 활성화 또는 가열 요소의 불활성화는 버블을 붕괴시켜, 시약을 합성 표면에 접촉시킨다.
일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드는 광불안정성 보호기를 이용하여 합성되며, 여기서 표면 상에 생성된 하이드록실기는 광불안정성 보호기에 의해 블로킹된다. 표면이 포토리소그래픽 마스크를 통해서와 같이 UV 광에 노출될 때, 표면 상에 유리 하이드록실기의 패턴이 생성될 수 있다. 이들 하이드록실기는 포스포르아미다이트 화학에 따라 광보호된 뉴클레오사이드 포스포르아미다이트와 반응할 수 있다. 제2 포토리소그래픽 마스크가 적용될 수 있고 표면은 UV 광에 노출되어 하이드록실기의 제2 패턴을 생성한 후, 5'-광보호된 뉴클레오사이드 포스포르아미다이트와 커플링될 수 있다. 마찬가지로, 패턴이 생성될 수 있고 올리고머 사슬이 연장될 수 있다. 이론에 구속되지 않으면서, 광절단가능한 기의 불안정성은 사용된 용매의 파장 및 극성에 의존하고, 광절단 속도는 노출 지속시간 및 광의 강도에 의해 영향을 받을 수 있다. 이 방법은 마스크의 정렬 정확성, 광보호기의 제거 효율, 및 포스포르아미다이트 커플링 단계의 수율과 같은 많은 인자를 활용할 수 있다. 또한, 주변 부위로의 의도하지 않은 광 노출이 최소화될 수 있다. 스팟당 합성된 올리고머의 밀도는 합성 표면 상에서 리더 뉴클레오사이드의 로딩을 조절함으로써 모니터링될 수 있다.
폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 지지체를 제공하는 기판의 표면은 합성된 폴리뉴클레오타이드 사슬이 표면으로부터 절단되도록 화학적으로 변형될 수 있다. 일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드 사슬은 폴리뉴클레오타이드가 탈보호되는 것과 동시에 절단된다. 일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드 사슬은 폴리뉴클레오타이드가 탈보호된 후에 절단된다. 예시적인 방식에서, (CH3CH2O)3Si-(CH2)2-NH2와 같은 트리알콕시실릴 아민은 기판의 표면 SiOH 기와 반응한 후, 아민을 갖는 석시닉 무수물과 반응하여 핵산 사슬 성장이 지지된 아미드 연결 및 유리 OH를 생성한다. 절단은 암모니아 또는 메틸아민을 이용한 기체 절단을 포함한다. 일부 경우에, 일단 표면으로부터 방출되면, 폴리뉴클레오타이드는 더 큰 핵산으로 조립되고, 이는 저장된 정보를 추출하기 위해 시퀀싱되고 디코딩된다.
짧은 시간 내에 기판 상에 고밀도의 폴리뉴클레오타이드를 합성하기 위한 시스템 및 방법이 본원에 제공된다. 일부 경우에, 기판은 가요성 기판이다. 일부 경우에, 하루에 적어도 약 1010, 1011, 1012, 1013, 1014, 또는 1015개의 염기가 합성된다. 일부 경우에, 하루에 적어도 약 10 x 108, 10 x 109, 10 x 1010, 10 x 1011, 또는 10 x 1012개의 폴리뉴클레오타이드가 합성된다. 일부 경우에, 합성된 각각의 폴리뉴클레오타이드는 적어도 약 20, 50, 100, 200, 300, 400 또는 500개의 핵염기를 포함한다. 일부 경우에, 이들 염기는 100; 200; 300; 400; 500; 1000; 2000; 5000; 10000; 15000; 20000개 염기 중 약 1개 미만의 총 평균 오류율로 합성된다. 일부 경우에, 이들 오류율은 합성된 폴리뉴클레오타이드의 적어도 50%, 60%, 70%, 80%, 90%, 95%, 98%, 99%, 99.5% 이상에 대한 것이다. 일부 경우에, 합성된 폴리뉴클레오타이드의 이러한 적어도 90%, 95%, 98%, 99%, 99.5% 이상은 이들이 코딩하는 미리 결정된 서열과 상이하지 않다. 일부 경우에, 본원에 기재된 방법 및 시스템을 사용하여 기판 상에 합성된 폴리뉴클레오타이드에 대한 오류율은 200개 중 약 1개 미만이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 방법 및 시스템을 사용하여 기판 상에 합성된 폴리뉴클레오타이드에 대한 오류율은 1,000개 중 약 1개 미만이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 방법 및 시스템을 사용하여 기판 상에 합성된 폴리뉴클레오타이드에 대한 오류율은 2,000개 중 약 1개 미만이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 방법 및 시스템을 사용하여 기판 상에 합성된 폴리뉴클레오타이드에 대한 오류율은 3,000개 중 약 1개 미만이다. 일부 경우에, 본원에 기재된 방법 및 시스템을 사용하여 기판 상에 합성된 폴리뉴클레오타이드에 대한 오류율은 5,000개 중 약 1개 미만이다. 오류율의 개별 유형은 기판 상에 합성된 폴리뉴클레오타이드에 대한 미스매치, 결실, 삽입, 및/또는 치환을 포함한다. 용어 "오류율"은 합성된 폴리뉴클레오타이드의 총량을 미리 결정된 폴리뉴클레오타이드 서열의 합계와 비교하는 것을 지칭한다. 일부 경우에, 본원에 개시된 합성된 폴리뉴클레오타이드는 12 내지 25개의 염기의 테더(tether)를 포함한다. 일부 경우에, 테더는 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50개 이상의 염기를 포함한다.
본 개시내용의 기판 상에서 폴리뉴클레오타이드를 합성하기 위한 적합한 방법은 포스포르아미다이트 빌딩 블록과 기판에 결합된 뉴클레오사이드 사이에 포스파이트 트리에스테르 연결을 형성하는 커플링 단계(예를 들어, 신장 단계)에서 성장하는 폴리뉴클레오타이드 사슬에 포스포르아미다이트 빌딩 블록, 즉 뉴클레오사이드 포스포르아미다이트를 제어 첨가하는 것을 포함하는 포스포르아미다이트 방법이다. 일부 경우에, 뉴클레오사이드 포스포르아미다이트는 활성화된 기판에 제공된다. 일부 경우에, 뉴클레오사이드 포스포르아미다이트는 활성제와 함께 기판에 제공된다. 일부 경우에, 뉴클레오사이드 포스포르아미다이트는 기판 결합된 뉴클레오사이드보다 1.5, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 25, 30, 35, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100-배수 과량 이상으로 기판에 제공된다. 일부 경우에, 뉴클레오사이드 포스포르아미다이트의 첨가는 무수 환경, 예를 들어, 무수 아세토니트릴에서 수행된다. 커플링 단계에서 뉴클레오사이드 포스포르아미다이트의 첨가 및 연결 후, 기판은 선택적으로 세척된다. 일부 경우에, 커플링 단계는 선택적으로 기판에 대한 뉴클레오사이드 포스포르아미다이트 첨가 사이에 세척 단계와 함께, 추가 1회 이상 반복된다.
핵산 어셈블리
폴리뉴클레오타이드는 정보를 코딩하는 미리 결정된 서열의 큰 영역을 집합적으로 포괄하도록 설계될 수 있다. 일부 경우에, 합성된 폴리뉴클레오타이드를 연결하는 결찰 반응을 통해 더 큰 폴리뉴클레오타이드가 생성된다. 결찰 반응의 하나의 예는 중합효소 연쇄 어셈블리(PCA)이다. 일부 경우에, 폴리뉴클레오타이드의 적어도 일부는 유니버설 프라이머 결합을 위한 기질인 부가 영역을 포함하도록 설계된다. PCA 반응의 경우, 미리 합성된 폴리뉴클레오타이드는 서로 중첩(예컨대, 중첩 서열을 갖는 4, 20, 40개 이상의 염기)을 포함한다. 중합효소 사이클 동안, 폴리뉴클레오타이드는 상보적 단편에 어닐링된 다음 중합효소에 의해 채워진다. 따라서, 각각의 사이클은 어떤 폴리뉴클레오타이드가 서로를 발견하느냐에 따라 다양한 단편의 길이를 무작위로 증가시킨다. 단편들 사이의 상보성은 완전한 큰 범위의 이중 가닥 DNA를 형성할 수 있게 한다. 일부 경우에, PCA 반응이 완료된 후, 서열 내의 미스매치를 제거하기 위해 미스매치 복구 검출 효소를 사용하여 오류 교정 단계가 수행된다. 표적 서열의 더 큰 단편이 생성되면, 이들은 증폭될 수 있다. 예를 들어, 일부 경우에, 5' 및 3' 말단 어댑터 서열을 포함하는 표적 서열은 어댑터 서열에 혼성화하는 변형된 프라이머를 포함하는 중합효소 연쇄 반응(PCR)에서 증폭된다. 일부 경우에, 변형된 프라이머는 하나 이상의 우라실 염기를 포함한다. 변형된 프라이머의 사용은 단편으로부터 변형된 염기쌍을 절단하는 효소에 의해 남겨진 변형된 염기 및/또는 갭을 표적화하는 것에 중점을 둔 효소 반응을 통해 프라이머를 제거할 수 있게 한다. 남아 있는 것은 어댑터 서열의 잔존물이 없는 이중 가닥 증폭 생성물이다. 이러한 방식으로, 다수의 증폭 생성물이 동일한 프라이머 세트를 이용하여 동시에 생성되어 이중 가닥 DNA의 상이한 단편을 생성할 수 있다.
오류 교정은 합성된 폴리뉴클레오타이드 및/또는 조립된 생성물 상에서 수행될 수 있다. 오류 교정을 위한 예시적인 전략은 오류를 교정하기 위한 오버랩 PCR에 의한 부위 지정 돌연변이유발을 포함하며, 이는 선택적으로 2회 이상의 클로닝 및 시퀀싱과 결합된다. 특정 경우, 미스매치, 돌출부(bulge) 및 작은 루프를 갖는 이중 가닥 핵산, 화학적으로 변경된 염기 및/또는 다른 이종이합체는 정확하게 합성된 핵산의 집단으로부터 선택적으로 제거된다. 일부 경우에, 오류 교정은 단일 또는 이중 가닥 절단(break)을 생성하거나 가닥 전달 전위(strand transfer transposition) 사건을 개시하기 위해 이중 가닥 핵산 내의 미스매치되거나 쌍을 형성하지 않은 염기를 인식하고 이에 결합하거나 이의 옆에 있는 단백질/효소를 사용하여 수행된다. 오류 교정을 위한 단백질/효소의 비제한적인 예는 엔도뉴클레아제(T7 엔도뉴클레아제 I, E. coli 엔도뉴클레아제 V, T4 엔도뉴클레아제 VII, 녹두 뉴클레아제(mung bean nuclease), CelI, E. coli 엔도뉴클레아제 IV, UVDE), 제한 효소, 글리코실라제, 리보뉴클레아제, 미스매치 복구 효소, 레솔바제(resolvase), 헬리카제, 리가제, 미스매치에 특이적인 항체, 및 이들의 변이체를 포함한다. 특정 오류 교정 효소의 예는 T4 엔도뉴클레아제 7, T7 엔도뉴클레아제 1, S1, 녹두 엔도뉴클레아제, MutY, MutS, MutH, MutL, 클리바제(cleavase), CELI, 및 HINF1을 포함한다. 일부 경우에, DNA 미스매치 결합 단백질 MutS(Thermus aquaticus)가 합성된 생성물의 집단으로부터 실패 생성물을 제거하는데 사용된다. 일부 경우에, 오류 교정은 효소 코렉타제(Correctase)를 사용하여 수행된다. 일부 경우에, 오류 교정은 이종이합체 DNA에 대해 공지 및 비공지 돌연변이 및 다형성을 스캔하는 미스매치 특이적 DNA 엔도뉴클레아제인 SURVEYOR 엔도뉴클레아제(Transgenomic)를 사용하여 수행된다.
컴퓨터 시스템
다양한 양태에서, 본원에 기재된 임의의 시스템은 컴퓨터에 작동가능하게 연결되며, 선택적으로 컴퓨터를 통해 로컬 또는 원격으로 자동화된다. 다양한 경우에, 본 발명의 방법 및 시스템은 컴퓨터 시스템 상의 소프트웨어 프로그램 및 이의 사용을 추가로 포함한다. 따라서, 물질 증착 장치 이동, 분배 작용 및 진공 작동을 조정 및 동기화하는 것과 같은 분배/진공/충전 기능의 동기화를 위한 컴퓨터 제어는 본 발명의 범위에 속한다. 일부 경우에, 컴퓨터 시스템은 정확한 시약을 기판의 특정 영역으로 전달하기 위해 사용자 지정 염기 서열과 물질 증착 장치의 위치 사이를 연결하도록 프로그램된다.
도 9에 예시된 컴퓨터 시스템(900)은 매체(911) 및/또는 네트워크 포트(905)로부터의 명령을 읽을 수 있는 논리 장치로서 이해될 수 있으며, 이는 선택적으로 서버(909)에 연결될 수 있다. 도 9에 나타낸 바와 같은 시스템은 CPU(901), 디스크 드라이브(903), 키보드(915) 및/또는 마우스(916)와 같은 선택적인 입력 장치 및 선택적인 모니터(907)를 포함할 수 있다. 데이터 통신은 표시된 통신 매체를 통해 로컬 또는 원격 위치에 있는 서버로 달성될 수 있다. 통신 매체는 데이터를 전송 및/또는 수신하는 임의의 수단을 포함할 수 있다. 예를 들어, 통신 매체는 네트워크 연결, 무선 연결 또는 인터넷 연결일 수 있다. 이러한 연결은 월드 와이드 웹을 통한 통신을 제공할 수 있다. 본 개시내용과 관련된 데이터는 제3자(922)에 의한 수신 및/또는 검토를 위해 이러한 네트워크 또는 연결을 통해 전송될 수 있는 것으로 예상된다.
도 10은 본 발명의 예시적인 경우와 관련하여 사용될 수 있는 컴퓨터 시스템(1000)의 첫 번째 예시적인 아키텍처를 도시하는 블록도이다. 도 10에 도시된 바와 같이, 예시적인 컴퓨터 시스템은 명령을 처리하기 위한 프로세서(1002)를 포함할 수 있다. 프로세서의 비제한적인 예는 인텔 XeonTM 프로세서, AMD OpteronTM 프로세서, 삼성 32-비트 RISC ARM 1176JZ(F)-S v1.0TM 프로세서, ARM Cortex-A8 삼성 S5PC100TM 프로세서, ARM Cortex-A8 애플 A4TM 프로세서,　Marvell PXA 930TM 프로세서, 또는 기능적으로 동등한 프로세서를 포함한다. 병렬 처리를 위해 다수의 실행 스레드(thread)가 사용될 수 있다. 일부 경우에, 단일 컴퓨터 시스템에서든, 클러스터에서든, 또는 복수의 컴퓨터, 휴대폰, 및/또는 개인 데이터 단말기 장치를 포함하는 네트워크를 통해 시스템에 분산되어 있든지 간에, 다수의 프로세서 또는 다수의 코어를 갖는 프로세서가 또한 사용될 수 있다.
도 10에 도시된 바와 같이, 고속 캐시(cache)(1004)는 프로세서(1002)에 연결되거나 프로세서(1002)에 통합되어 프로세서(1002)에 의해 최근에 사용되었거나 자주 사용되는 명령 또는 데이터를 위한 고속 메모리를 제공할 수 있다. 프로세서(1002)는 프로세서 버스(1008)에 의해 노스 브릿지(1006)에 연결된다. 노스 브릿지(1006)는 메모리 버스(1012)에 의해 랜덤 액세스 메모리(RAM)(1010)에 연결되고, 프로세서(1002)에 의해 RAM(1010)에 대한 액세스를 관리한다. 노스 브릿지(1006)는 또한 칩셋 버스(1016)에 의해 사우스 브릿지(1014)에 연결된다. 사우스 브릿지(1014)는 결국 주변장치 버스(1018)에 연결된다. 주변장치 버스는, 예를 들어, PCI, PCI-X, PCI Express, 또는 다른 주변장치 버스일 수 있다. 노스 브릿지 및 사우스 브릿지는 종종 프로세서 칩셋으로 지칭되며, 프로세서, RAM, 및 주변장치 버스(1018) 상의 주변장치 구성요소 사이의 데이터 전달을 관리한다. 일부 대안적인 아키텍처에서, 노스 브릿지의 기능은 별도의 노스 브릿지 칩을 사용하는 대신에 프로세서에 통합될 수 있다.
일부 경우에, 시스템(1000)은 주변장치 버스(1018)에 부착된 가속기 카드(1022)를 포함할 수 있다. 가속기는 필드 프로그래머블 게이트 어레이(FPGA) 또는 특정 처리를 가속하기 위한 다른 하드웨어를 포함할 수 있다. 예를 들어, 가속기는 적응형 데이터 재구성을 위해 또는 확장된 세트 처리에 사용되는 대수식(algebraic expression)을 평가하는데 사용될 수 있다.
소프트웨어 및 데이터는 외부 저장장치(1024)에 저장되고, 프로세서에 의해 사용되도록 RAM(1010) 및/또는 캐시(1004)에 로딩될 수 있다. 시스템(1000)은 시스템 자원을 관리하기 위한 운영 체제를 포함하고; 운영 체제의 비제한적인 예는 Linux, WindowsTM,　MACOSTM, BlackBerry OSTM, iOSTM, 및 다른 기능적으로 동등한 운영 체제뿐만 아니라 본 발명의 예시적인 경우에 따라 데이터 저장 및 최적화를 관리하기 위한 운영 체제에서 실행되는 응용 소프트웨어를 포함한다.
이 예에서, 시스템(1000)은 또한 네트워크 연결 저장장치(NAS)와 같은 외부 저장장치에 네트워크 인터페이스를 제공하기 위하여 주변장치 버스에 연결된 네트워크 인터페이스 카드(NIC)(1020 및 1021) 및 분산 병렬 처리에 사용될 수 있는 다른 컴퓨터 시스템을 포함한다.
도 11은 복수의 컴퓨터 시스템(1102a, 및 1102b), 복수의 휴대폰 및 개인 데이터 단말기(1102c), 및 네트워크 연결 저장장치(NAS)(1104a, 및 1104b)를 갖는 네트워크(1100)를 나타내는 도표이다. 예시적인 경우에서, 시스템(1102a, 1102b, 및 1102c)은 데이터 저장을 관리하고 네트워크 연결 저장장치(NAS)(1104a 및 1104b)에 저장된 데이터에 대한 데이터 액세스를 최적화할 수 있다. 수학적 모델이 데이터에 사용될 수 있고, 컴퓨터 시스템(1102a, 및 1102b), 및 휴대폰 및 개인 데이터 단말기 시스템(1102c)에 걸쳐 분산 병렬 처리를 사용하여 평가될 수 있다. 컴퓨터 시스템(1102a, 및 1102b), 및 휴대폰 및 개인 데이터 단말기 시스템(1102c)은 또한 네트워크 연결 저장장치(NAS)(1104a 및 1104b)에 저장된 데이터의 적응형 데이터 재구성을 위한 병렬 처리를 제공할 수 있다. 도 11은 단지 예를 예시하고, 다양한 다른 컴퓨터 아키텍처 및 시스템이 본 발명의 다양한 예와 함께 사용될 수 있다. 예를 들어, 블레이드 서버(blade server)가 병렬 처리를 제공하는데 사용될 수 있다. 프로세서 블레이드는 병렬 처리를 제공하기 위해 후면을 통해 연결될 수 있다. 저장장치는 또한 후면에 연결될 수 있거나 별도의 네트워크 인터페이스를 통해 네트워크 연결 저장장치(NAS)로서 연결될 수 있다.
일부 예시적인 경우에, 프로세서는 별도의 메모리 공간을 유지하고 다른 프로세서에 의한 병렬 처리를 위해 네트워크 인터페이스, 후면 또는 다른 커넥터를 통해 데이터를 전송할 수 있다. 다른 경우에, 프로세서의 일부 또는 모두는 공유 가상 주소 메모리 공간을 사용할 수 있다.
도 12는 예시적인 구현예에 따른 공유 가상 주소 메모리 공간을 사용하는 멀티프로세서 컴퓨터 시스템(1200)의 블록도이다. 시스템은 공유 메모리 서브시스템(1204)에 액세스할 수 있는 복수의 프로세서(1202a-f)를 포함한다. 시스템은 메모리 서브시스템(1204) 내에 복수의 프로그래머블 하드웨어 메모리 알고리즘 프로세서(MAP)(1206a-f)를 포함한다. 각각의　MAP(1206a-f)는 메모리(1208a-f) 및 하나 이상의 필드 프로그래머블 게이트 어레이(FPGA)(1210a-f)를 포함할 수 있다.　MAP는 구성가능한 기능 유닛을 제공하고, 특정 알고리즘 또는 알고리즘의 일부는 각각의 프로세서와 밀접히 협력하여 처리하기 위해 FPGA(1210a-f)에 제공될 수 있다. 예를 들어, MAP는 데이터 모델에 관한 대수식을 평가하고 예시적인 경우에 적응형 데이터 재구성을 수행하는데 사용될 수 있다. 이 예에서, 각각의　MAP는 이러한 목적을 위해 모든 프로세서에 의해 전역에서 액세스될 수 있다. 일 구성에서, 각각의　MAP는 직접　메모리 액세스(DMA)를 사용하여 관련 메모리(1208a-f)에 액세스할 수 있고, 이는 그것이 각각의 마이크로프로세서(1202a-f)와 독립적으로 그리고 비동기적으로 작업을 실행할 수 있게 한다. 이 구성에서, MAP는 파이프라이닝(pipelining) 및 알고리즘의 병렬 실행을 위해 결과를 또 다른　MAP에 직접 공급할 수 있다.
상기 컴퓨터 아키텍처 및 시스템은 단지 예이며, 범용 프로세서, 보조 프로세서, FPGA 및 다른 프로그래머블 논리 장치, 시스템 온 칩(SOC), 주문형 반도체(application specific integrated circuits, ASIC), 및 다른 처리 및 논리 요소의 임의의 조합을 사용하는 시스템을 포함하는, 다양한 다른 컴퓨터, 휴대폰, 및 개인 데이터 단말기 아키텍처 및 시스템이 예시적인 경우와 관련하여 사용될 수 있다. 일부 경우에, 컴퓨터 시스템의 전부 또는 일부는 소프트웨어 또는 하드웨어로 구현될 수 있다. 랜덤 액세스 메모리, 하드 드라이브, 플래시 메모리, 테이프 드라이브, 디스크 어레이, 네트워크 연결 저장장치(NAS) 및 다른 로컬 또는 분산 데이터 저장 장치 및 시스템을 포함하는, 임의의 광범위한 데이터 저장 매체가 예시적인 경우와 관련하여 사용될 수 있다.
하기 실시예는 본원에 개시된 예의 원리 및 실행을 당업자에게 보다 명확하게 예시하기 위해 제시되며, 임의의 청구된 예의 범위를 제한하는 것으로 해석되지 않아야 한다. 달리 언급되지 않는 한, 모든 부분 및 백분율은 중량 기준이다.
실시예
실시예 1: 상 변화 용매를 사용하여 온도 제어가능한 표면 상에서 50-머 서열 폴리뉴클레오타이드의 합성
폴리뉴클레오타이드 합성 장치(101)(도 1 참고)는 온도 제어가능한 플로우 셀(도 3a 및 도 3b)로 조립되며, 이는 도 7에 나타낸 바와 같이 플로우 셀(Applied Biosystems(ABI394 DNA 합성 장치"))에 연결된다. SiO2로 코팅된 웰(305)(도 3a 및 도 3b)의 하부 표면은 N-(3-트리에톡시실릴프로필)-4-하이드록시부티르아미드(Gelest, CAS No. 156214-80-1)로 균일하게 작용화되고, 본원에 기재된 폴리뉴클레오타이드 합성 방법을 사용하여 50 bp의 예시적인 폴리뉴클레오타이드("50-머 폴리뉴클레오타이드")를 합성하는데 사용된다. 50-머의 서열은 서열번호: 1에 기재된 바와 같다: 5'AGACAATCAACCATTTGGGGTGGACAGCCTTGACCTCTAGACTTCGGCAT##TTTTTTTTTT3' (서열번호: 1), 여기서 #는 티미딘-석시닐 헥스아미드 CED 포스포르아미다이트(ChemGenes로부터의 CLP-2244)를 나타내며, 이는 탈보호 동안 표면으로부터 폴리뉴클레오타이드의 방출을 가능하게 하는 절단가능한 링커이다.
합성은 각 셀에서의 화학적 커플링 반응이 온도 제어가능한 표면을 통해 제어되는 변형으로, 표 2의 프로토콜에 따른 표준 DNA 합성 화학(커플링, 캡핑, 산화, 및 탈블로킹) 및 ABI 합성 장치를 변형하여 사용하여 수행된다(도 8 참고). 장치 온도는 콜드 척을 사용하여 상 변화 용매의 동결 온도보다 약 5℃ 낮아진다. 커플링 단계 동안, 상 변화 용매는 커플링 시약의 첨가 직전에 첨가되고, 상 변화 용매는 동결된다. 웰은 어드레서블 가열 요소를 통해 가열함으로써 커플링을 위해 활성화되고, 이는 개별 웰에서의 용매를 용융시킨다. 동결된 용매를 갖는 나머지 웰은 액체 커플링 시약과 반응하지 않으며 비활성이다. 각각의 커플링 반복에 대해 활성 웰을 변경하면서, 각각 상이한 DNA 염기, 예를 들어 A, T, G, 및 C를 사용하여 커플링 단계를 반복한다. 모든 원하는 부위가 작용화된 후, 모든 웰은 가열에 의해 활성화되고; 이후 전역 캡핑, 산화, 및 탈블로킹이 수행된다. 이 전체 과정은 원하는 길이의 폴리뉴클레오타이드가 합성될 때까지 반복된다.
장치 온도는 콜드 척을 사용하여 상 변화 용매의 동결 온도보다 약 5℃ 낮아진다. 커플링 단계 동안, 상 변화 용매는 커플링 시약의 첨가 직전에 첨가되고, 상 변화 용매는 동결된다. 웰은 어드레서블 가열 요소를 통해 가열함으로써 커플링을 위해 활성화되고, 이는 개별 웰에서의 용매를 용융시킨다. 동결된 용매를 갖는 나머지 웰은 액체 커플링 시약과 반응하지 않으며, 커플링 시약에 대해 비활성이다. 각각의 커플링 반복에 대해 활성 웰을 변경하면서, 상이한 DNA 염기, 예를 들어 A, T, G, 및 C를 사용하여 커플링 단계를 반복한다. 모든 원하는 부위가 작용화된 후, 모든 웰은 가열에 의해 활성화되고; 이후 전역 캡핑, 산화, 및 탈블로킹이 수행된다. 이 전체 과정은 원하는 길이의 폴리뉴클레오타이드가 합성될 때까지 반복된다.
실시예 2: 용매 증기 버블을 사용하여 온도 제어가능한 표면 상에서 50-머 서열 폴리뉴클레오타이드의 합성
폴리뉴클레오타이드 합성 장치(101)(도 1 참고)는 온도 제어가능한 플로우 셀(도 4a)로 조립되며, 이는 도 7에 나타낸 바와 같이 플로우 셀(Applied Biosystems(ABI394 DNA 합성 장치")에 연결된다. 웰(401)(도 4a)의 하부 표면은 실시예 1의 일반적인 방법을 사용하여 작용화된다.
합성은 각 셀에서의 화학적 커플링 반응이 온도 제어가능한 표면을 통해 제어되는 변형으로, 표 3의 프로토콜에 따른 표준 DNA 합성 화학(커플링, 캡핑, 산화, 및 탈블로킹) 및 ABI 합성 장치를 변형하여 사용하여 수행된다(도 8 참고).
웰은 어드레서블 가열 요소를 통해 가열함으로써 커플링에 대해 블로킹되며, 이는 개별 웰에서의 용매를 기화시켜 버블(417)을 생성한다. 연장 또는 합성을 위해 폴리뉴클레오타이드 표면(407)과 접촉하는 액체 용매를 갖는 나머지 웰은 액체 커플링 시약과 반응하고 활성이다. 각각의 커플링 반복에 대해 활성 웰을 변경하면서, 상이한 DNA 염기, 예를 들어 A, T, G, 및 C를 사용하여 커플링 단계를 반복한다. 불활성 웰은 상기 웰에서 가열 요소를 끔으로써 활성화되며, 이는 증기 버블을 붕괴시킨다. 모든 원하는 부위가 작용화된 후, 모든 웰은 가열 요소를 끔으로써 활성화되고; 이후 전역 캡핑, 산화, 및 탈블로킹이 수행된다. 이 전체 과정은 원하는 길이의 폴리뉴클레오타이드가 합성될 때까지 반복된다.
실시예 3: 나노포스트를 사용하여 온도 제어가능한 표면 상에서 50-머 서열 폴리뉴클레오타이드의 합성
폴리뉴클레오타이드 합성 장치(101)(도 1 참고)는 온도 제어가능한 플로우 셀(도 4a)로 조립되며, 이는 도 7에 나타낸 바와 같이 플로우 셀(Applied Biosystems(ABI394 DNA 합성 장치")에 연결된다. 나노포스트(407)(도 4b)의 상부 표면은 실시예 1의 일반적인 방법을 사용하여 작용화된다.
합성은 실시예 2의 일반적인 방법을 사용하여, 각 셀에서의 화학적 커플링 반응이 온도 제어가능한 표면을 통해 제어되는 변형으로, 표 3의 프로토콜에 따른 표준 DNA 합성 화학(커플링, 캡핑, 산화, 및 탈블로킹) 및 ABI 합성 장치를 사용하여 수행된다(도 8 참고).
실시예 4: 나노와이어를 사용하여 온도 제어가능한 표면 상에서 50-머 서열 폴리뉴클레오타이드의 합성
폴리뉴클레오타이드 합성 장치(101)(도 1 참고)는 온도 제어가능한 플로우 셀(도 5)로 조립되며, 이는 도 7에 나타낸 바와 같이 플로우 셀(Applied Biosystems(ABI394 DNA 합성 장치")에 연결된다. 나노로드(502)(도 5)의 표면은 실시예 1의 일반적인 방법을 사용하여 작용화된다.
합성은 실시예 2의 일반적인 방법을 사용하여, 각 셀에서의 화학적 커플링 반응이 온도 제어가능한 표면을 통해 제어되는 변형으로, 표 3의 프로토콜에 따른 표준 DNA 합성 화학(커플링, 캡핑, 산화, 및 탈블로킹) 및 ABI 합성 장치를 사용하여 수행된다(도 8 참고).
실시예 5: 나노로드를 함유하는 표면 상에서 그리고 상 변화 용매를 이용하여 50-머 서열 폴리뉴클레오타이드의 합성
폴리뉴클레오타이드 합성 장치(101)(도 1 참고)는 온도 제어가능한 플로우 셀(도 5)로 조립되며, 이는 도 7에 나타낸 바와 같이 플로우 셀(Applied Biosystems(ABI394 DNA 합성 장치")에 연결된다. 나노로드(603)(도 6)의 표면은 실시예 1의 일반적인 방법을 사용하여 작용화된다.
합성은 각 셀에서의 화학적 커플링 반응이 온도 제어가능한 표면을 통해 제어되는 변형으로, 표 4의 프로토콜에 따른 표준 DNA 합성 화학(커플링, 캡핑, 산화, 및 탈블로킹) 및 ABI 합성 장치를 사용하여 수행된다(도 8 참고). 커플링 단계 동안, 상 변화 용매는 커플링 시약의 첨가 직전에 첨가된다. 웰은 하나 이상의 나노로드에 연결된 어드레서블 하부 접촉(601)을 통해 냉각함으로써 커플링을 위해 비활성화되고, 이는 나노로드 주위의 용매 층을 동결시킨다. 액체 용매를 갖는 나머지 나노로드는 액체 커플링 시약과 반응하고 활성이다. 각각의 커플링 반복에 대해 활성 웰을 변경하면서, 상이한 DNA 염기, 예를 들어 A, T, G, 및 C를 사용하여 커플링 단계를 반복한다. 모든 원하는 부위가 작용화된 후, 모든 나노로드는 냉각을 중단함으로써 활성화되고; 이후 전역 캡핑, 산화, 및 탈블로킹이 수행된다. 이 전체 과정은 원하는 길이의 폴리뉴클레오타이드가 합성될 때까지 반복된다.
본 발명의 바람직한 구현예가 본원에 나타나고 설명되었지만, 이러한 구현예는 단지 예로서 제공된다는 것이 당업자에게 명백할 것이다. 많은 변경, 변화, 및 치환이 본 발명을 벗어나지 않으면서 당업자에게 일어날 것이다. 본원에 기재된 본 발명의 구현예에 대한 다양한 대안이 본 발명을 실시하는데 사용될 수 있음이 이해되어야 한다. 하기 청구범위는 본 발명의 범위를 정의하고, 이들 청구범위의 범위 내의 방법 및 구조물 및 이들의 등가물이 이에 의해 포함된다는 것이 의도된다.
SEQUENCE LISTING <110> TWIST BIOSCIENCE CORPORATION <120> HEATED NANOWELLS FOR POLYNUCLEOTIDE SYNTHESIS <130> 44854-744.601 <140> <141> <150> 62/575,287 <151> 2017-10-20 <160> 1 <170> PatentIn version 3.5 <210> 1 <211> 62 <212> DNA <213> Artificial Sequence <220> <223> Description of Artificial Sequence: Synthetic oligonucleotide <220> <221> modified_base <222> (51)..(52) <223> Thymidine-succinyl hexamide CED phosphoramidite <400> 1 agacaatcaa ccatttgggg tggacagcct tgacctctag acttcggcat tttttttttt 60 tt 62

Claims (55)

  1. 표면을 포함하는 고체 지지체;
    상기 표면 상에 위치한, 폴리뉴클레오타이드 연장을 위한 복수의 구조물로서, 각각의 구조물은 10 nm 내지 1000 nm의 폭을 갖고, 각각의 구조물은 전극을 포함하는 가열 유닛과 접촉하는 것인 복수의 구조물; 및
    상기 표면에 걸쳐 분포된 용매로서, 용매는 18℃ 이하의 용융 온도를 갖거나, 용매는 82℃ 이하의 비등 온도를 갖는 것인 용매
    를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 장치.
  2. 제1항에 있어서, 용매는 극성 용매인 장치.
  3. 제1항에 있어서, 표면은 핵산 합성을 위한 적어도 30,000개의 좌위(loci)를 포함하는 것인 장치.
  4. 제1항에 있어서, 전극은 제1 전극이고, 가열 유닛은 제2 전극을 포함하고, 제1 전극은 제1 좌위를 가열하도록 구성되고, 제2 전극은 제2 좌위를 가열하도록 구성되는 것인 장치.
  5. 제1항에 있어서, 용매는 트리메틸아세토니트릴인 장치.
  6. 제1항에 있어서, 장치는 용매의 존재 하에서 수행되는 복수의 신장(elongation) 단계를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 합성을 위해 구성되는 것인 장치.
  7. 제1항에 있어서, 용매는 0.5 내지 1.5 g/mL의 밀도를 갖는 것인 장치.
  8. 표면을 포함하는 고체 지지체;
    상기 표면 상에 위치한, 폴리뉴클레오타이드 연장을 위한 복수의 구조물로서, 각각의 구조물은 전극을 포함하는 가열 유닛과 접촉하고, 각각의 구조물은 나노와이어(nanowire), 나노포스트(nanopost), 또는 나노로드(nanorod)를 포함하는 것인 복수의 구조물; 및
    상기 표면에 걸쳐 분포된 용매
    를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 장치.
  9. 제8항에 있어서, 표면은 핵산 합성을 위한 적어도 30,000개의 좌위를 포함하는 것인 장치.
  10. 제9항에 있어서, 전극은 제1 전극이고, 가열 유닛은 제2 전극을 포함하고, 제1 전극은 적어도 30,000개의 좌위 중 제1 부위(portion)를 가열하도록 구성되고, 제2 전극은 적어도 30,000개의 좌위 중 제2 부위를 가열하도록 구성되는 것인 장치.
  11. 제8항에 있어서, 고체 지지체는 냉각 유닛을 추가로 포함하는 것인 장치.
  12. 제8항에 있어서, 제1 구조물의 중심과 인접한 제2 구조물의 중심 사이의 거리는 10 nm 내지 1000 nm인 장치.
  13. 제8항에 있어서, 용매는 극성 용매인 장치.
  14. 제8항에 있어서, 용매는 0℃ 내지 82℃의 비등 온도, 5℃ 내지 30℃의 용융 온도, 및/또는 0.5 g/mL 내지 1.5 g/mL의 밀도를 갖는 것인 장치.
  15. 표면을 포함하는 고체 지지체;
    상기 표면 상에 위치한, 폴리뉴클레오타이드 연장을 위한 복수의 구조물로서, 각각의 구조물은 10 nm 내지 1000 nm의 폭을 갖고, 각각의 구조물은 전극을 포함하는 가열 유닛과 접촉하는 것인 복수의 구조물; 및
    상기 표면에 걸쳐 분포된 극성 용매
    를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 장치.
  16. 제15항에 있어서, 극성 용매는 니트릴기를 포함하는 것인 장치.
  17. 제15항에 있어서, 장치는 극성 용매의 존재 하에서 수행되는 복수의 신장 단계를 포함하는 폴리뉴클레오타이드 합성을 위해 구성되는 것인 장치.
  18. 제15항에 있어서, 전극은 제1 전극이고, 가열 유닛은 제2 전극을 포함하고, 제1 전극은 복수의 구조물 중 제1 부위를 가열하도록 구성되고, 제2 전극은 복수의 구조물 중 제2 부위를 가열하도록 구성되는 것인 장치.
  19. 제15항에 있어서, 극성 용매는 0℃ 내지 82℃의 비등 온도, 5℃ 내지 30℃의 용융 온도, 및/또는 0.5 g/mL 내지 1.5 g/mL의 밀도를 갖는 것인 장치.
  20. 삭제
  21. 삭제
  22. 삭제
  23. 삭제
  24. 삭제
  25. 삭제
  26. 삭제
  27. 삭제
  28. 삭제
  29. 삭제
  30. 삭제
  31. 삭제
  32. 삭제
  33. 삭제
  34. 삭제
  35. 삭제
  36. 삭제
  37. 삭제
  38. 삭제
  39. 삭제
  40. 삭제
  41. 삭제
  42. 삭제
  43. 삭제
  44. 삭제
  45. 삭제
  46. 삭제
  47. 삭제
  48. 삭제
  49. 삭제
  50. 삭제
  51. 삭제
  52. 삭제
  53. 삭제
  54. 삭제
  55. 삭제
KR1020247004947A 2017-10-20 2018-10-19 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰 Active KR102889470B1 (ko)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
KR1020257038617A KR20250165699A (ko) 2017-10-20 2018-10-19 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201762575287P 2017-10-20 2017-10-20
US62/575,287 2017-10-20
PCT/US2018/056783 WO2019079769A1 (en) 2017-10-20 2018-10-19 HEATED NANOWELLS FOR THE SYNTHESIS OF POLYNUCLEOTIDES
KR1020207014418A KR102637566B1 (ko) 2017-10-20 2018-10-19 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰

Related Parent Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020207014418A Division KR102637566B1 (ko) 2017-10-20 2018-10-19 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰

Related Child Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020257038617A Division KR20250165699A (ko) 2017-10-20 2018-10-19 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰

Publications (2)

Publication Number Publication Date
KR20240024357A KR20240024357A (ko) 2024-02-23
KR102889470B1 true KR102889470B1 (ko) 2025-11-21

Family

ID=66169694

Family Applications (3)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020247004947A Active KR102889470B1 (ko) 2017-10-20 2018-10-19 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰
KR1020207014418A Active KR102637566B1 (ko) 2017-10-20 2018-10-19 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰
KR1020257038617A Pending KR20250165699A (ko) 2017-10-20 2018-10-19 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰

Family Applications After (2)

Application Number Title Priority Date Filing Date
KR1020207014418A Active KR102637566B1 (ko) 2017-10-20 2018-10-19 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰
KR1020257038617A Pending KR20250165699A (ko) 2017-10-20 2018-10-19 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰

Country Status (9)

Country Link
US (3) US10894242B2 (ko)
EP (1) EP3697529B1 (ko)
JP (1) JP7066840B2 (ko)
KR (3) KR102889470B1 (ko)
CN (1) CN111565834B (ko)
CA (1) CA3079613A1 (ko)
GB (1) GB2583590A (ko)
SG (1) SG11202003574TA (ko)
WO (1) WO2019079769A1 (ko)

Families Citing this family (35)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
KR102122632B1 (ko) 2013-08-05 2020-06-16 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 드 노보 합성된 유전자 라이브러리
US10669304B2 (en) 2015-02-04 2020-06-02 Twist Bioscience Corporation Methods and devices for de novo oligonucleic acid assembly
US9981239B2 (en) 2015-04-21 2018-05-29 Twist Bioscience Corporation Devices and methods for oligonucleic acid library synthesis
KR20180050411A (ko) 2015-09-18 2018-05-14 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 올리고핵산 변이체 라이브러리 및 그의 합성
KR102794025B1 (ko) 2015-09-22 2025-04-09 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 핵산 합성을 위한 가요성 기판
CN115920796A (zh) 2015-12-01 2023-04-07 特韦斯特生物科学公司 功能化表面及其制备
EP3500672A4 (en) 2016-08-22 2020-05-20 Twist Bioscience Corporation NOVO SYNTHESIZED NUCLEIC ACID BANKS
KR102217487B1 (ko) 2016-09-21 2021-02-23 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 핵산 기반 데이터 저장
KR102514213B1 (ko) 2016-12-16 2023-03-27 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 면역 시냅스의 변이체 라이브러리 및 그의 합성
EP4556433A3 (en) 2017-02-22 2025-08-06 Twist Bioscience Corporation Nucleic acid based data storage
AU2018234629A1 (en) 2017-03-15 2019-10-17 Twist Bioscience Corporation Variant libraries of the immunological synapse and synthesis thereof
WO2018231864A1 (en) 2017-06-12 2018-12-20 Twist Bioscience Corporation Methods for seamless nucleic acid assembly
SG11201912057RA (en) 2017-06-12 2020-01-30 Twist Bioscience Corp Methods for seamless nucleic acid assembly
GB2581620A (en) 2017-09-11 2020-08-26 Twist Bioscience Corp GPCR binding proteins and synthesis thereof
KR102889470B1 (ko) 2017-10-20 2025-11-21 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰
CN112041438B (zh) 2018-01-04 2025-05-23 特韦斯特生物科学公司 基于dna的数字信息存储
CN112639130B (zh) 2018-05-18 2024-08-09 特韦斯特生物科学公司 用于核酸杂交的多核苷酸、试剂和方法
CN119708086A (zh) 2018-12-26 2025-03-28 特韦斯特生物科学公司 高度准确的从头多核苷酸合成
SG11202109322TA (en) 2019-02-26 2021-09-29 Twist Bioscience Corp Variant nucleic acid libraries for glp1 receptor
KR20210144698A (ko) 2019-02-26 2021-11-30 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 항체 최적화를 위한 변이 핵산 라이브러리
EP3976752A4 (en) 2019-05-31 2023-03-01 Illumina, Inc. FLOW CELL WITH SELECTIVE NUCLEOTIDE DEPOSITION OR ACTIVATION
CA3144644A1 (en) 2019-06-21 2020-12-24 Twist Bioscience Corporation Barcode-based nucleic acid sequence assembly
US12173282B2 (en) 2019-09-23 2024-12-24 Twist Bioscience, Inc. Antibodies that bind CD3 epsilon
US12091777B2 (en) 2019-09-23 2024-09-17 Twist Bioscience Corporation Variant nucleic acid libraries for CRTH2
JP2023523335A (ja) 2020-04-27 2023-06-02 ツイスト バイオサイエンス コーポレーション コロナウイルス用の変異体核酸ライブラリー相互参照
KR20230074151A (ko) 2020-08-26 2023-05-26 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 Glp1r 변이체에 관한 방법 및 조성물
CA3190917A1 (en) 2020-08-28 2022-03-03 Andres Fernandez Devices and methods for synthesis
US11970697B2 (en) 2020-10-19 2024-04-30 Twist Bioscience Corporation Methods of synthesizing oligonucleotides using tethered nucleotides
US12202905B2 (en) 2021-01-21 2025-01-21 Twist Bioscience Corporation Methods and compositions relating to adenosine receptors
WO2022183121A1 (en) 2021-02-26 2022-09-01 Avery Digital Data, Inc. Semiconductor chip devices and methods for polynucleotide synthesis
EP4314075A4 (en) 2021-03-24 2025-04-09 Twist Bioscience Corporation VARIANT NUCLEIC ACID BANKS FOR CD3
US12201857B2 (en) 2021-06-22 2025-01-21 Twist Bioscience Corporation Methods and compositions relating to covid antibody epitopes
CA3238160A1 (en) 2021-11-18 2023-05-25 Aaron Sato Dickkopf-1 variant antibodies and methods of use
WO2023130123A2 (en) 2022-01-03 2023-07-06 Twist Bioscience Corporation Bispecific sars-cov-2 antibodies and methods of use
KR20240138412A (ko) 2023-03-10 2024-09-20 고려대학교 산학협력단 아토리터 방울 기반 전기화학 병렬 dna 합성기 및 이를 이용한 dna 합성 방법

Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2015021080A2 (en) 2013-08-05 2015-02-12 Twist Bioscience Corporation De novo synthesized gene libraries
US20150099870A1 (en) 2013-10-04 2015-04-09 Trustees Of Tufts College Glycosylation Reactions Using Phenyl(trifluoroethyl)iodonium Salts

Family Cites Families (941)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US3549368A (en) 1968-07-02 1970-12-22 Ibm Process for improving photoresist adhesion
US3920714A (en) 1972-11-16 1975-11-18 Weber Heinrich Process for the production of polymeric hydrocarbons with reactive silyl side groups
GB1550867A (en) 1975-08-04 1979-08-22 Hughes Aircraft Co Positioning method and apparatus for fabricating microcircuit devices
US4415732A (en) 1981-03-27 1983-11-15 University Patents, Inc. Phosphoramidite compounds and processes
EP0090789A1 (en) 1982-03-26 1983-10-05 Monsanto Company Chemical DNA synthesis
US4994373A (en) 1983-01-27 1991-02-19 Enzo Biochem, Inc. Method and structures employing chemically-labelled polynucleotide probes
JPS59224123A (ja) 1983-05-20 1984-12-17 Oki Electric Ind Co Ltd ウエハアライメントマ−ク
US5118605A (en) 1984-10-16 1992-06-02 Chiron Corporation Polynucleotide determination with selectable cleavage sites
JPS61141761A (ja) 1984-12-12 1986-06-28 Kanegafuchi Chem Ind Co Ltd 硬化性組成物
US5242794A (en) 1984-12-13 1993-09-07 Applied Biosystems, Inc. Detection of specific sequences in nucleic acids
US6492107B1 (en) 1986-11-20 2002-12-10 Stuart Kauffman Process for obtaining DNA, RNA, peptides, polypeptides, or protein, by recombinant DNA technique
US4613398A (en) 1985-06-06 1986-09-23 International Business Machines Corporation Formation of etch-resistant resists through preferential permeation
US4981797A (en) 1985-08-08 1991-01-01 Life Technologies, Inc. Process of producing highly transformable cells and cells produced thereby
US4726877A (en) 1986-01-22 1988-02-23 E. I. Du Pont De Nemours And Company Methods of using photosensitive compositions containing microgels
US4808511A (en) 1987-05-19 1989-02-28 International Business Machines Corporation Vapor phase photoresist silylation process
JPH07113774B2 (ja) 1987-05-29 1995-12-06 株式会社日立製作所 パタ−ンの形成方法
US4988617A (en) 1988-03-25 1991-01-29 California Institute Of Technology Method of detecting a nucleotide change in nucleic acids
US5700637A (en) 1988-05-03 1997-12-23 Isis Innovation Limited Apparatus and method for analyzing polynucleotide sequences and method of generating oligonucleotide arrays
EP0385410B1 (en) 1989-02-28 1996-10-02 Canon Kabushiki Kaisha Partially double-stranded oligonucleotide and method for forming oligonucleotide
US6008031A (en) 1989-05-12 1999-12-28 Duke University Method of analysis and manipulation of DNA utilizing mismatch repair systems
US5459039A (en) 1989-05-12 1995-10-17 Duke University Methods for mapping genetic mutations
US5556750A (en) 1989-05-12 1996-09-17 Duke University Methods and kits for fractionating a population of DNA molecules based on the presence or absence of a base-pair mismatch utilizing mismatch repair systems
US5102797A (en) 1989-05-26 1992-04-07 Dna Plant Technology Corporation Introduction of heterologous genes into bacteria using transposon flanked expression cassette and a binary vector system
US5527681A (en) 1989-06-07 1996-06-18 Affymax Technologies N.V. Immobilized molecular synthesis of systematically substituted compounds
US6040138A (en) 1995-09-15 2000-03-21 Affymetrix, Inc. Expression monitoring by hybridization to high density oligonucleotide arrays
US6309822B1 (en) 1989-06-07 2001-10-30 Affymetrix, Inc. Method for comparing copy number of nucleic acid sequences
US5242974A (en) 1991-11-22 1993-09-07 Affymax Technologies N.V. Polymer reversal on solid surfaces
US5143854A (en) 1989-06-07 1992-09-01 Affymax Technologies N.V. Large scale photolithographic solid phase synthesis of polypeptides and receptor binding screening thereof
US6919211B1 (en) 1989-06-07 2005-07-19 Affymetrix, Inc. Polypeptide arrays
US5744101A (en) 1989-06-07 1998-04-28 Affymax Technologies N.V. Photolabile nucleoside protecting groups
CA2036946C (en) 1990-04-06 2001-10-16 Kenneth V. Deugau Indexing linkers
US5494810A (en) 1990-05-03 1996-02-27 Cornell Research Foundation, Inc. Thermostable ligase-mediated DNA amplifications system for the detection of genetic disease
US6087482A (en) 1990-07-27 2000-07-11 Isis Pharmaceuticals, Inc. Heteroatomic oligonucleoside linkages
FI87886C (fi) 1990-09-06 1993-03-10 Instrumentarium Oy Faestorgan
EP0550693B1 (en) 1990-09-27 1996-04-24 Invitrogen Corporation Direct cloning of pcr amplified nucleic acids
GB9025236D0 (en) 1990-11-20 1991-01-02 Secr Defence Silicon-on porous-silicon;method of production
US6582908B2 (en) 1990-12-06 2003-06-24 Affymetrix, Inc. Oligonucleotides
WO1992010588A1 (en) 1990-12-06 1992-06-25 Affymax Technologies N.V. Sequencing by hybridization of a target nucleic acid to a matrix of defined oligonucleotides
CA2097708A1 (en) 1990-12-06 1992-06-07 Stephen P. A. Fodor Very large scale immobilized polymer synthesis
US5455166A (en) 1991-01-31 1995-10-03 Becton, Dickinson And Company Strand displacement amplification
US5137814A (en) 1991-06-14 1992-08-11 Life Technologies, Inc. Use of exo-sample nucleotides in gene cloning
US5449754A (en) 1991-08-07 1995-09-12 H & N Instruments, Inc. Generation of combinatorial libraries
US5474796A (en) 1991-09-04 1995-12-12 Protogene Laboratories, Inc. Method and apparatus for conducting an array of chemical reactions on a support surface
US7150982B2 (en) 1991-09-09 2006-12-19 Third Wave Technologies, Inc. RNA detection assays
US5994069A (en) 1996-01-24 1999-11-30 Third Wave Technologies, Inc. Detection of nucleic acids by multiple sequential invasive cleavages
US6759226B1 (en) 2000-05-24 2004-07-06 Third Wave Technologies, Inc. Enzymes for the detection of specific nucleic acid sequences
US5846717A (en) 1996-01-24 1998-12-08 Third Wave Technologies, Inc. Detection of nucleic acid sequences by invader-directed cleavage
US7045289B2 (en) 1991-09-09 2006-05-16 Third Wave Technologies, Inc. Detection of RNA Sequences
US5384261A (en) 1991-11-22 1995-01-24 Affymax Technologies N.V. Very large scale immobilized polymer synthesis using mechanically directed flow paths
EP0916396B1 (en) 1991-11-22 2005-04-13 Affymetrix, Inc. (a Delaware Corporation) Combinatorial strategies for polymer synthesis
US5573905A (en) 1992-03-30 1996-11-12 The Scripps Research Institute Encoded combinatorial chemical libraries
EP0636186B1 (en) 1992-04-03 1998-11-25 The Perkin-Elmer Corporation Probe composition and method
JP2553322Y2 (ja) 1992-05-11 1997-11-05 サンデン株式会社 飲料抽出装置のフィルタ送り機構
ES2104160T3 (es) 1992-07-31 1997-10-01 Behringwerke Ag Metodo para introducir secuencias definidas en el extremo 3' de polinucleotidos.
US5288514A (en) 1992-09-14 1994-02-22 The Regents Of The University Of California Solid phase and combinatorial synthesis of benzodiazepine compounds on a solid support
JP3176444B2 (ja) 1992-10-01 2001-06-18 株式会社リコー 水性インク及びこれを用いた記録方法
DE4241045C1 (de) 1992-12-05 1994-05-26 Bosch Gmbh Robert Verfahren zum anisotropen Ätzen von Silicium
US5368823A (en) 1993-02-11 1994-11-29 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Automated synthesis of oligonucleotides
US5395753A (en) 1993-02-19 1995-03-07 Theratech, Inc. Method for diagnosing rheumatoid arthritis
AU684279B2 (en) 1993-04-12 1997-12-11 Northwestern University Method of forming oligonucleotides
US7135312B2 (en) 1993-04-15 2006-11-14 University Of Rochester Circular DNA vectors for synthesis of RNA and DNA
US5455239A (en) 1993-08-05 1995-10-03 Merck & Co. Inc. 3-aryl of heteroaryl-7-heteroaralkylamido cephalosporin compounds, compositions and methods of use
US5482845A (en) 1993-09-24 1996-01-09 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Method for construction of normalized cDNA libraries
CN1039623C (zh) 1993-10-22 1998-09-02 中国人民解放军军事医学科学院毒物药物研究所 一种防治运动病综合征的药物组合物及其制备方法
DE69435196D1 (de) 1993-10-28 2009-04-23 Houston Advanced Res Ct Mikrofabriziertes poröses Durchflussgerät zur diskreten Bestimmung von Bindungsreaktionen
US6893816B1 (en) 1993-10-28 2005-05-17 Houston Advanced Research Center Microfabricated, flowthrough porous apparatus for discrete detection of binding reactions
US6027877A (en) 1993-11-04 2000-02-22 Gene Check, Inc. Use of immobilized mismatch binding protein for detection of mutations and polymorphisms, purification of amplified DNA samples and allele identification
US5834252A (en) 1995-04-18 1998-11-10 Glaxo Group Limited End-complementary polymerase reaction
US6015880A (en) 1994-03-16 2000-01-18 California Institute Of Technology Method and substrate for performing multiple sequential reactions on a matrix
DE69534464T2 (de) 1994-03-29 2006-09-28 Novozymes A/S Alkalische amylase aus bacellus
US5514789A (en) 1994-04-21 1996-05-07 Barrskogen, Inc. Recovery of oligonucleotides by gas phase cleavage
SE512382C2 (sv) 1994-04-26 2000-03-06 Ericsson Telefon Ab L M Anordning och förfarande för att placera långsträckta element mot eller invid en yta
JP2909216B2 (ja) 1994-04-29 1999-06-23 パーキン‐エルマー コーポレイション 核酸増幅生成物のリアルタイム検出装置
US6287850B1 (en) 1995-06-07 2001-09-11 Affymetrix, Inc. Bioarray chip reaction apparatus and its manufacture
EP0776330B1 (en) 1994-06-23 2003-08-20 Affymax Technologies N.V. Photolabile compounds and methods for their use
US5641658A (en) 1994-08-03 1997-06-24 Mosaic Technologies, Inc. Method for performing amplification of nucleic acid with two primers bound to a single solid support
US5530516A (en) 1994-10-04 1996-06-25 Tamarack Scientific Co., Inc. Large-area projection exposure system
US6635226B1 (en) 1994-10-19 2003-10-21 Agilent Technologies, Inc. Microanalytical device and use thereof for conducting chemical processes
US6613560B1 (en) 1994-10-19 2003-09-02 Agilent Technologies, Inc. PCR microreactor for amplifying DNA using microquantities of sample fluid
US5556752A (en) 1994-10-24 1996-09-17 Affymetrix, Inc. Surface-bound, unimolecular, double-stranded DNA
KR100253893B1 (ko) 1994-11-22 2000-04-15 크래이그 엠. 스타우퍼 마이크로전자공학 응용분야용 비아민 감광제 접착 촉진제
US5688642A (en) 1994-12-01 1997-11-18 The United States Of America As Represented By The Secretary Of The Navy Selective attachment of nucleic acid molecules to patterned self-assembled surfaces
US6017434A (en) 1995-05-09 2000-01-25 Curagen Corporation Apparatus and method for the generation, separation, detection, and recognition of biopolymer fragments
US5830655A (en) 1995-05-22 1998-11-03 Sri International Oligonucleotide sizing using cleavable primers
US5700642A (en) 1995-05-22 1997-12-23 Sri International Oligonucleotide sizing using immobilized cleavable primers
US6446682B1 (en) 1995-06-06 2002-09-10 James P. Viken Auto-loading fluid exchanger and method of use
US5877280A (en) 1995-06-06 1999-03-02 The Mount Sinai School Of Medicine Of The City University Of New York Thermostable muts proteins
US5707806A (en) 1995-06-07 1998-01-13 Genzyme Corporation Direct sequence identification of mutations by cleavage- and ligation-associated mutation-specific sequencing
US5712126A (en) 1995-08-01 1998-01-27 Yale University Analysis of gene expression by display of 3-end restriction fragments of CDNA
US5780613A (en) 1995-08-01 1998-07-14 Northwestern University Covalent lock for self-assembled oligonucleotide constructs
US5854033A (en) 1995-11-21 1998-12-29 Yale University Rolling circle replication reporter systems
US6352842B1 (en) 1995-12-07 2002-03-05 Diversa Corporation Exonucease-mediated gene assembly in directed evolution
US6537776B1 (en) 1999-06-14 2003-03-25 Diversa Corporation Synthetic ligation reassembly in directed evolution
DE69627189T2 (de) 1995-12-15 2004-02-05 Duke University Verfahren zum nachweis und zur entfernung von mutantsequenzen, die während enzymatischer amplifikation entstehen
US5962271A (en) 1996-01-03 1999-10-05 Cloutech Laboratories, Inc. Methods and compositions for generating full-length cDNA having arbitrary nucleotide sequence at the 3'-end
US5976846A (en) 1996-01-13 1999-11-02 Passmore; Steven E. Method for multifragment in vivo cloning and mutation mapping
US6090606A (en) 1996-01-24 2000-07-18 Third Wave Technologies, Inc. Cleavage agents
US5985557A (en) 1996-01-24 1999-11-16 Third Wave Technologies, Inc. Invasive cleavage of nucleic acids
US6706471B1 (en) 1996-01-24 2004-03-16 Third Wave Technologies, Inc. Detection of nucleic acid sequences by invader-directed cleavage
US7122364B1 (en) 1998-03-24 2006-10-17 Third Wave Technologies, Inc. FEN endonucleases
US7432048B2 (en) 1996-11-29 2008-10-07 Third Wave Technologies, Inc. Reactions on a solid surface
US7527928B2 (en) 1996-11-29 2009-05-05 Third Wave Technologies, Inc. Reactions on a solid surface
US6274369B1 (en) 1996-02-02 2001-08-14 Invitrogen Corporation Method capable of increasing competency of bacterial cell transformation
US6013440A (en) 1996-03-11 2000-01-11 Affymetrix, Inc. Nucleic acid affinity columns
US6020481A (en) 1996-04-01 2000-02-01 The Perkin-Elmer Corporation Asymmetric benzoxanthene dyes
US6706875B1 (en) 1996-04-17 2004-03-16 Affyemtrix, Inc. Substrate preparation process
US5869245A (en) 1996-06-05 1999-02-09 Fox Chase Cancer Center Mismatch endonuclease and its use in identifying mutations in targeted polynucleotide strands
US5863801A (en) 1996-06-14 1999-01-26 Sarnoff Corporation Automated nucleic acid isolation
US6780982B2 (en) 1996-07-12 2004-08-24 Third Wave Technologies, Inc. Charge tags and the separation of nucleic acid molecules
US5853993A (en) 1996-10-21 1998-12-29 Hewlett-Packard Company Signal enhancement method and kit
WO1998022541A2 (en) 1996-11-08 1998-05-28 Ikonos Corporation Method for coating substrates
US5750672A (en) 1996-11-22 1998-05-12 Barrskogen, Inc. Anhydrous amine cleavage of oligonucleotides
ES2317658T3 (es) 1996-11-29 2009-04-16 Third Wave Technologies, Inc. Endonucleasas fen - 1, mezclas y procedimientos de escision.
CA2389358C (en) 1996-12-31 2008-07-15 Genometrix Incorporated Multiplexed molecular analysis apparatus and method
DE69829976T2 (de) 1997-02-12 2006-04-27 Invitrogen Corp., Carlsbad Verfahren zur herstellung von zellen
US5882496A (en) 1997-02-27 1999-03-16 The Regents Of The University Of California Porous silicon structures with high surface area/specific pore size
US6770748B2 (en) 1997-03-07 2004-08-03 Takeshi Imanishi Bicyclonucleoside and oligonucleotide analogue
US6419883B1 (en) 1998-01-16 2002-07-16 University Of Washington Chemical synthesis using solvent microdroplets
WO1998041531A2 (en) 1997-03-20 1998-09-24 University Of Washington Solvent for biopolymer synthesis, solvent microdroplets and methods of use
US6028189A (en) 1997-03-20 2000-02-22 University Of Washington Solvent for oligonucleotide synthesis and methods of use
DE69838724T2 (de) 1997-03-21 2008-10-30 Stratagene California, La Jolla Polymerase-verbessernder faktor (pef)-enthaltende extrakte, pef proteinkomplexe, isoliertes pef protein und verfahren zur reinigung und identifizierung
US5922593A (en) 1997-05-23 1999-07-13 Becton, Dickinson And Company Microbiological test panel and method therefor
US6969488B2 (en) 1998-05-22 2005-11-29 Solexa, Inc. System and apparatus for sequential processing of analytes
WO1999000657A1 (en) 1997-06-26 1999-01-07 Perseptive Biosystems, Inc. High density sample holder for analysis of biological samples
GB9714716D0 (en) 1997-07-11 1997-09-17 Brax Genomics Ltd Characterising nucleic acids
US5989872A (en) 1997-08-12 1999-11-23 Clontech Laboratories, Inc. Methods and compositions for transferring DNA sequence information among vectors
US6027898A (en) 1997-08-18 2000-02-22 Transgenomic, Inc. Chromatographic method for mutation detection using mutation site specifically acting enzymes and chemicals
US6794499B2 (en) 1997-09-12 2004-09-21 Exiqon A/S Oligonucleotide analogues
US6136568A (en) 1997-09-15 2000-10-24 Hiatt; Andrew C. De novo polynucleotide synthesis using rolling templates
US6670127B2 (en) 1997-09-16 2003-12-30 Egea Biosciences, Inc. Method for assembly of a polynucleotide encoding a target polypeptide
ATE294860T1 (de) 1997-09-16 2005-05-15 Egea Biosciences Llc Methoden zur kompletten chemischen synthese und zusammensetzung von genen und genomen
US5976842A (en) 1997-10-30 1999-11-02 Clontech Laboratories, Inc. Methods and compositions for use in high fidelity polymerase chain reaction
US8182991B1 (en) 1997-11-26 2012-05-22 Third Wave Technologies, Inc. FEN-1 endonucleases, mixtures and cleavage methods
US6408308B1 (en) 1998-01-29 2002-06-18 Incyte Pharmaceuticals, Inc. System and method for generating, analyzing and storing normalized expression datasets from raw expression datasets derived from microarray includes nucleic acid probe sequences
US6287776B1 (en) 1998-02-02 2001-09-11 Signature Bioscience, Inc. Method for detecting and classifying nucleic acid hybridization
US6251588B1 (en) 1998-02-10 2001-06-26 Agilent Technologies, Inc. Method for evaluating oligonucleotide probe sequences
WO1999041007A2 (en) 1998-02-11 1999-08-19 University Of Houston Method and apparatus for chemical and biochemical reactions using photo-generated reagents
WO1999042813A1 (en) 1998-02-23 1999-08-26 Wisconsin Alumni Research Foundation Method and apparatus for synthesis of arrays of dna probes
JP4493844B2 (ja) 1998-03-25 2010-06-30 ランデグレン、ウルフ 錠型（ｐａｄｌｏｃｋ）プローブのローリングサークル複製
US6284497B1 (en) 1998-04-09 2001-09-04 Trustees Of Boston University Nucleic acid arrays and methods of synthesis
US7321828B2 (en) 1998-04-13 2008-01-22 Isis Pharmaceuticals, Inc. System of components for preparing oligonucleotides
EP1071826B1 (en) 1998-04-13 2006-09-13 Isis Pharmaceuticals, Inc. Identification of genetic targets for modulation by oligonucleotides and generation of oligonucleotides for gene modulation
US6376285B1 (en) 1998-05-28 2002-04-23 Texas Instruments Incorporated Annealed porous silicon with epitaxial layer for SOI
US6274725B1 (en) 1998-06-02 2001-08-14 Isis Pharmaceuticals, Inc. Activators for oligonucleotide synthesis
US6130045A (en) 1998-06-11 2000-10-10 Clontech Laboratories, Inc. Thermostable polymerase
US6251595B1 (en) 1998-06-18 2001-06-26 Agilent Technologies, Inc. Methods and devices for carrying out chemical reactions
ATE313548T1 (de) 1998-06-22 2006-01-15 Affymetrix Inc Reagenz und verfahren zu fester phase synthese
US7399844B2 (en) 1998-07-09 2008-07-15 Agilent Technologies, Inc. Method and reagents for analyzing the nucleotide sequence of nucleic acids
US6218118B1 (en) 1998-07-09 2001-04-17 Agilent Technologies, Inc. Method and mixture reagents for analyzing the nucleotide sequence of nucleic acids by mass spectrometry
US20030022207A1 (en) 1998-10-16 2003-01-30 Solexa, Ltd. Arrayed polynucleotides and their use in genome analysis
US6787308B2 (en) 1998-07-30 2004-09-07 Solexa Ltd. Arrayed biomolecules and their use in sequencing
US6222030B1 (en) 1998-08-03 2001-04-24 Agilent Technologies, Inc. Solid phase synthesis of oligonucleotides using carbonate protecting groups and alpha-effect nucleophile deprotection
US6991922B2 (en) 1998-08-12 2006-01-31 Proteus S.A. Process for in vitro creation of recombinant polynucleotide sequences by oriented ligation
US6951719B1 (en) 1999-08-11 2005-10-04 Proteus S.A. Process for obtaining recombined nucleotide sequences in vitro, libraries of sequences and sequences thus obtained
US6107038A (en) 1998-08-14 2000-08-22 Agilent Technologies Inc. Method of binding a plurality of chemicals on a substrate by electrophoretic self-assembly
EP2273270A1 (de) 1998-08-28 2011-01-12 febit holding GmbH Verfahren und Vorrichtung zur Herstellung und/oder Analyse von biochemischen Reaktionsträgern
US6258454B1 (en) 1998-09-01 2001-07-10 Agilent Technologies Inc. Functionalization of substrate surfaces with silane mixtures
US6458583B1 (en) 1998-09-09 2002-10-01 Agilent Technologies, Inc. Method and apparatus for making nucleic acid arrays
US6461812B2 (en) 1998-09-09 2002-10-08 Agilent Technologies, Inc. Method and multiple reservoir apparatus for fabrication of biomolecular arrays
CA2342838A1 (en) 1998-09-15 2000-03-23 Yale University Molecular cloning using rolling circle amplification
AR021833A1 (es) 1998-09-30 2002-08-07 Applied Research Systems Metodos de amplificacion y secuenciacion de acido nucleico
US6399516B1 (en) 1998-10-30 2002-06-04 Massachusetts Institute Of Technology Plasma etch techniques for fabricating silicon structures from a substrate
US6309828B1 (en) 1998-11-18 2001-10-30 Agilent Technologies, Inc. Method and apparatus for fabricating replicate arrays of nucleic acid molecules
GB9900298D0 (en) 1999-01-07 1999-02-24 Medical Res Council Optical sorting method
WO2000042559A1 (en) 1999-01-18 2000-07-20 Maxygen, Inc. Methods of populating data structures for use in evolutionary simulations
US6376246B1 (en) 1999-02-05 2002-04-23 Maxygen, Inc. Oligonucleotide mediated nucleic acid recombination
WO2000042561A2 (en) 1999-01-19 2000-07-20 Maxygen, Inc. Oligonucleotide mediated nucleic acid recombination
US20070065838A1 (en) 1999-01-19 2007-03-22 Maxygen, Inc. Oligonucleotide mediated nucleic acid recombination
US6251685B1 (en) 1999-02-18 2001-06-26 Agilent Technologies, Inc. Readout method for molecular biological electronically addressable arrays
EP2175021B1 (de) 1999-02-19 2013-06-19 Synthetic Genomics, Inc. Verfahren zur Herstellung von Polymeren
ATE556149T1 (de) 1999-02-23 2012-05-15 Caliper Life Sciences Inc Manipulation von mikropartikeln in mikrofluidischen systemen
EP1159285B1 (en) 1999-03-08 2005-05-25 Metrigen, Inc. Methods and compositions for economically synthesizing and assembling long dna sequences
US6824866B1 (en) 1999-04-08 2004-11-30 Affymetrix, Inc. Porous silica substrates for polymer synthesis and assays
US6284465B1 (en) 1999-04-15 2001-09-04 Agilent Technologies, Inc. Apparatus, systems and method for locating nucleic acids bound to surfaces
US6469156B1 (en) 1999-04-20 2002-10-22 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Rapid and sensitive method for detecting histoplasma capsulatum
US6773676B2 (en) 1999-04-27 2004-08-10 Agilent Technologies, Inc. Devices for performing array hybridization assays and methods of using the same
US6518056B2 (en) 1999-04-27 2003-02-11 Agilent Technologies Inc. Apparatus, systems and method for assaying biological materials using an annular format
US6221653B1 (en) 1999-04-27 2001-04-24 Agilent Technologies, Inc. Method of performing array-based hybridization assays using thermal inkjet deposition of sample fluids
US6300137B1 (en) 1999-04-28 2001-10-09 Agilent Technologies Inc. Method for synthesizing a specific, surface-bound polymer uniformly over an element of a molecular array
US6323043B1 (en) 1999-04-30 2001-11-27 Agilent Technologies, Inc. Fabricating biopolymer arrays
US7276336B1 (en) 1999-07-22 2007-10-02 Agilent Technologies, Inc. Methods of fabricating an addressable array of biopolymer probes
US6242266B1 (en) 1999-04-30 2001-06-05 Agilent Technologies Inc. Preparation of biopolymer arrays
NZ515189A (en) 1999-05-01 2004-05-28 Psimedica Ltd Derivatized porous silicon as a biomaterial to use as a material for componets in or on the surface of the human body
ATE347617T1 (de) 1999-05-06 2006-12-15 Sinai School Medicine Steganographie auf dna basis
US7056661B2 (en) 1999-05-19 2006-06-06 Cornell Research Foundation, Inc. Method for sequencing nucleic acid molecules
US6593464B1 (en) * 1999-05-24 2003-07-15 Invitrogen Corporation Method for deblocking of labeled oligonucleotides
US6472147B1 (en) 1999-05-25 2002-10-29 The Scripps Research Institute Methods for display of heterodimeric proteins on filamentous phage using pVII and pIX, compositions, vectors and combinatorial libraries
US6132997A (en) 1999-05-28 2000-10-17 Agilent Technologies Method for linear mRNA amplification
US6815218B1 (en) 1999-06-09 2004-11-09 Massachusetts Institute Of Technology Methods for manufacturing bioelectronic devices
US6709852B1 (en) 1999-06-22 2004-03-23 Invitrogen Corporation Rapid growing microorganisms for biotechnology applications
DE19928410C2 (de) 1999-06-22 2002-11-28 Agilent Technologies Inc Gerätegehäuse mit einer Einrichtung zum Betrieb eines Labor-Mikrochips
NZ528967A (en) 1999-06-22 2005-03-24 Invitrogen Corp Improved primers and methods for the amplification and discrimination of nucleic acids
US6399394B1 (en) 1999-06-30 2002-06-04 Agilent Technologies, Inc. Testing multiple fluid samples with multiple biopolymer arrays
US6465183B2 (en) 1999-07-01 2002-10-15 Agilent Technologies, Inc. Multidentate arrays
US7504213B2 (en) 1999-07-09 2009-03-17 Agilent Technologies, Inc. Methods and apparatus for preparing arrays comprising features having degenerate biopolymers
US6461816B1 (en) 1999-07-09 2002-10-08 Agilent Technologies, Inc. Methods for controlling cross-hybridization in analysis of nucleic acid sequences
US6346423B1 (en) 1999-07-16 2002-02-12 Agilent Technologies, Inc. Methods and compositions for producing biopolymeric arrays
US6306599B1 (en) 1999-07-16 2001-10-23 Agilent Technologies Inc. Biopolymer arrays and their fabrication
US6201112B1 (en) 1999-07-22 2001-03-13 Agilent Technologies Inc. Method for 3′ end-labeling ribonucleic acids
US6180351B1 (en) 1999-07-22 2001-01-30 Agilent Technologies Inc. Chemical array fabrication with identifier
US7604996B1 (en) 1999-08-18 2009-10-20 Illumina, Inc. Compositions and methods for preparing oligonucleotide solutions
US6262490B1 (en) 1999-11-05 2001-07-17 Advanced Semiconductor Engineering, Inc. Substrate strip for use in packaging semiconductor chips
US7244559B2 (en) 1999-09-16 2007-07-17 454 Life Sciences Corporation Method of sequencing a nucleic acid
US7211390B2 (en) 1999-09-16 2007-05-01 454 Life Sciences Corporation Method of sequencing a nucleic acid
US6319674B1 (en) 1999-09-16 2001-11-20 Agilent Technologies, Inc. Methods for attaching substances to surfaces
US6743585B2 (en) 1999-09-16 2004-06-01 Agilent Technologies, Inc. Methods for preparing conjugates
US7122303B2 (en) 1999-09-17 2006-10-17 Agilent Technologies, Inc. Arrays comprising background features that provide for a measure of a non-specific binding and methods for using the same
US7078167B2 (en) 1999-09-17 2006-07-18 Agilent Technologies, Inc. Arrays having background features and methods for using the same
EP1218543A2 (en) 1999-09-29 2002-07-03 Solexa Ltd. Polynucleotide sequencing
DE19964337B4 (de) 1999-10-01 2004-09-16 Agilent Technologies, Inc. (n.d.Ges.d.Staates Delaware), Palo Alto Mikrofluidischer Mikrochip mit abbiegbarem Ansaugrohr
CA2386791A1 (en) 1999-10-08 2001-04-19 Protogene Laboratories, Inc. Method and apparatus for performing large numbers of reactions using array assembly
US6232072B1 (en) 1999-10-15 2001-05-15 Agilent Technologies, Inc. Biopolymer array inspection
US6451998B1 (en) 1999-10-18 2002-09-17 Agilent Technologies, Inc. Capping and de-capping during oligonucleotide synthesis
US6171797B1 (en) 1999-10-20 2001-01-09 Agilent Technologies Inc. Methods of making polymeric arrays
US7115423B1 (en) 1999-10-22 2006-10-03 Agilent Technologies, Inc. Fluidic structures within an array package
US6387636B1 (en) 1999-10-22 2002-05-14 Agilent Technologies, Inc. Method of shielding biosynthesis reactions from the ambient environment on an array
US6077674A (en) 1999-10-27 2000-06-20 Agilent Technologies Inc. Method of producing oligonucleotide arrays with features of high purity
US8268605B2 (en) 1999-10-29 2012-09-18 Agilent Technologies, Inc. Compositions and methods utilizing DNA polymerases
US6689319B1 (en) 1999-10-29 2004-02-10 Agilent Technologies, Ind. Apparatus for deposition and inspection of chemical and biological fluids
US6329210B1 (en) 1999-10-29 2001-12-11 Agilent Technologies, Inc. Method and apparatus for high volume polymer synthesis
US20010055761A1 (en) 1999-10-29 2001-12-27 Agilent Technologies Small scale dna synthesis using polymeric solid support with functionalized regions
US6406849B1 (en) 1999-10-29 2002-06-18 Agilent Technologies, Inc. Interrogating multi-featured arrays
US6428957B1 (en) 1999-11-08 2002-08-06 Agilent Technologies, Inc. Systems tools and methods of assaying biological materials using spatially-addressable arrays
US6440669B1 (en) 1999-11-10 2002-08-27 Agilent Technologies, Inc. Methods for applying small volumes of reagents
US7041445B2 (en) 1999-11-15 2006-05-09 Clontech Laboratories, Inc. Long oligonucleotide arrays
US6446642B1 (en) 1999-11-22 2002-09-10 Agilent Technologies, Inc. Method and apparatus to clean an inkjet reagent deposition device
US6582938B1 (en) 2001-05-11 2003-06-24 Affymetrix, Inc. Amplification of nucleic acids
US6800439B1 (en) 2000-01-06 2004-10-05 Affymetrix, Inc. Methods for improved array preparation
EP1276900A2 (en) 2000-01-11 2003-01-22 Maxygen, Inc. Integrated systems and methods for diversity generation and screening
EP1118661A1 (en) 2000-01-13 2001-07-25 Het Nederlands Kanker Instituut T cell receptor libraries
WO2001056216A2 (en) 2000-01-25 2001-08-02 Affymetrix, Inc. Method, system and computer software for providing a genomic web portal
US6587579B1 (en) 2000-01-26 2003-07-01 Agilent Technologies Inc. Feature quality in array fabrication
US7198939B2 (en) 2000-01-28 2007-04-03 Agilent Technologies, Inc. Apparatus for interrogating an addressable array
US6406851B1 (en) 2000-01-28 2002-06-18 Agilent Technologies, Inc. Method for coating a substrate quickly and uniformly with a small volume of fluid
US6458526B1 (en) 2000-01-28 2002-10-01 Agilent Technologies, Inc. Method and apparatus to inhibit bubble formation in a fluid
US6235483B1 (en) 2000-01-31 2001-05-22 Agilent Technologies, Inc. Methods and kits for indirect labeling of nucleic acids
GB0002389D0 (en) 2000-02-02 2000-03-22 Solexa Ltd Molecular arrays
US6403314B1 (en) 2000-02-04 2002-06-11 Agilent Technologies, Inc. Computational method and system for predicting fragmented hybridization and for identifying potential cross-hybridization
US6833450B1 (en) 2000-03-17 2004-12-21 Affymetrix, Inc. Phosphite ester oxidation in nucleic acid array preparation
US6365355B1 (en) 2000-03-28 2002-04-02 The Regents Of The University Of California Chimeric proteins for detection and quantitation of DNA mutations, DNA sequence variations, DNA damage and DNA mismatches
US20020025561A1 (en) 2000-04-17 2002-02-28 Hodgson Clague Pitman Vectors for gene-self-assembly
US7776021B2 (en) 2000-04-28 2010-08-17 The Charles Stark Draper Laboratory Micromachined bilayer unit for filtration of small molecules
US6716634B1 (en) 2000-05-31 2004-04-06 Agilent Technologies, Inc. Increasing ionization efficiency in mass spectrometry
US7163660B2 (en) 2000-05-31 2007-01-16 Infineon Technologies Ag Arrangement for taking up liquid analytes
EP1287010A1 (en) 2000-06-02 2003-03-05 Blue Heron Biotechnology, Inc. Methods for improving the sequence fidelity of synthetic double-stranded oligonucleotides
US6969449B2 (en) 2000-07-10 2005-11-29 Vertex Pharmaceuticals (San Diego) Llc Multi-well plate and electrode assemblies for ion channel assays
CA2416952A1 (en) 2000-07-27 2002-02-07 The Australian National University Combinatorial probes and uses therefor
EP1176151B1 (en) 2000-07-28 2014-08-20 Agilent Technologies, Inc. Synthesis of polynucleotides using combined oxidation/deprotection chemistry
US7205400B2 (en) 2000-07-31 2007-04-17 Agilent Technologies, Inc. Array fabrication
US6890760B1 (en) 2000-07-31 2005-05-10 Agilent Technologies, Inc. Array fabrication
EP1598432A3 (en) 2000-07-31 2006-06-07 Agilent Technologies, Inc. Array based methods for sythesizing nucleic acid mixtures
US6613893B1 (en) 2000-07-31 2003-09-02 Agilent Technologies Inc. Array fabrication
US6599693B1 (en) 2000-07-31 2003-07-29 Agilent Technologies Inc. Array fabrication
GB0018876D0 (en) 2000-08-01 2000-09-20 Applied Research Systems Method of producing polypeptides
WO2002016583A2 (en) 2000-08-24 2002-02-28 Maxygen, Inc. Constructs and their use in metabolic pathway engineering
WO2002020537A2 (en) 2000-09-08 2002-03-14 University Technologies International Inc. Linker phosphoramidites for oligonucleotide synthesis
US6966945B1 (en) 2000-09-20 2005-11-22 Goodrich Corporation Inorganic matrix compositions, composites and process of making the same
WO2002027029A2 (en) 2000-09-27 2002-04-04 Lynx Therapeutics, Inc. Method for determining relative abundance of nucleic acid sequences
NO20004869D0 (no) 2000-09-28 2000-09-28 Torbjoern Rognes Metode for hurtig optimal lokal sekvensjustering ved bruk av parallell prosessering
US7097809B2 (en) 2000-10-03 2006-08-29 California Institute Of Technology Combinatorial synthesis system
EP1330306A2 (en) 2000-10-10 2003-07-30 BioTrove, Inc. Apparatus for assay, synthesis and storage, and methods of manufacture, use, and manipulation thereof
DE10051396A1 (de) 2000-10-17 2002-04-18 Febit Ferrarius Biotech Gmbh Verfahren und Vorrichtung zur integrierten Synthese und Analytbestimmung an einem Träger
US6693187B1 (en) 2000-10-17 2004-02-17 Lievre Cornu Llc Phosphinoamidite carboxlates and analogs thereof in the synthesis of oligonucleotides having reduced internucleotide charge
SK287998B6 (sk) 2000-10-18 2012-09-03 Ultra Proizvodnja Elektronskih Naprav D. O. O. System for payment data exchange and payment terminal device used therein
DE60125312T2 (de) 2000-10-26 2007-06-06 Agilent Technologies, Inc. (n.d. Ges. d. Staates Delaware), Santa Clara Mikroarray
US6905816B2 (en) 2000-11-27 2005-06-14 Intelligent Medical Devices, Inc. Clinically intelligent diagnostic devices and methods
US20020155439A1 (en) 2000-12-04 2002-10-24 Ana Rodriguez Method for generating a library of mutant oligonucleotides using the linear cyclic amplification reaction
US20040253242A1 (en) 2000-12-05 2004-12-16 Bowdish Katherine S. Rationally designed antibodies
DE10060433B4 (de) 2000-12-05 2006-05-11 Hahn-Schickard-Gesellschaft für angewandte Forschung e.V. Verfahren zur Herstellung eines Fluidbauelements, Fluidbauelement und Analysevorrichtung
US6768005B2 (en) 2000-12-20 2004-07-27 Avecia Limited Process
CA2714353A1 (en) 2000-12-05 2002-06-13 Avecia Biotechnology Inc Process for the preparation of phosphorothioate oligonucleotides
US6660475B2 (en) 2000-12-15 2003-12-09 New England Biolabs, Inc. Use of site-specific nicking endonucleases to create single-stranded regions and applications thereof
AUPR259301A0 (en) 2001-01-18 2001-02-15 Polymerat Pty Ltd Polymers having co-continuous architecture
EP1385950B1 (en) 2001-01-19 2008-07-02 Centocor, Inc. Computer-directed assembly of a polynucleotide encoding a target polypeptide
US6958217B2 (en) 2001-01-24 2005-10-25 Genomic Expression Aps Single-stranded polynucleotide tags
US7027930B2 (en) 2001-01-31 2006-04-11 Agilent Technologies, Inc. Reading chemical arrays
US7166258B2 (en) 2001-01-31 2007-01-23 Agilent Technologies, Inc. Automation-optimized microarray package
US6879915B2 (en) 2001-01-31 2005-04-12 Agilent Technologies, Inc. Chemical array fabrication and use
US20020164824A1 (en) 2001-02-16 2002-11-07 Jianming Xiao Method and apparatus based on bundled capillaries for high throughput screening
US6660338B1 (en) 2001-03-08 2003-12-09 Agilent Technologies, Inc. Functionalization of substrate surfaces with silane mixtures
CA2468425A1 (en) * 2001-03-08 2003-09-19 Applera Corporation Reagents for oligonucleotide cleavage and deprotection
US7211654B2 (en) 2001-03-14 2007-05-01 Regents Of The University Of Michigan Linkers and co-coupling agents for optimization of oligonucleotide synthesis and purification on solid supports
DK1370690T3 (da) 2001-03-16 2012-07-09 Kalim Mir Arrays og fremgangsmåder til anvendelse heraf
US6610978B2 (en) 2001-03-27 2003-08-26 Agilent Technologies, Inc. Integrated sample preparation, separation and introduction microdevice for inductively coupled plasma mass spectrometry
WO2002078947A1 (en) 2001-04-02 2002-10-10 Prolinx Incorporated Sensor surfaces for detecting analytes
US20030022240A1 (en) 2001-04-17 2003-01-30 Peizhi Luo Generation and affinity maturation of antibody library in silico
US6943036B2 (en) 2001-04-30 2005-09-13 Agilent Technologies, Inc. Error detection in chemical array fabrication
EP1393073A4 (en) 2001-05-03 2007-03-28 Sigma Genosys Ltd PROCESS FOR ASSEMBLING MICROARRAYAL PROTEINS
CA2447240C (en) 2001-05-18 2013-02-19 Wisconsin Alumni Research Foundation Method for the synthesis of dna sequences
US20040175710A1 (en) 2001-05-22 2004-09-09 Haushalter Robert C. Method for in situ, on-chip chemical synthesis
US6880576B2 (en) 2001-06-07 2005-04-19 Nanostream, Inc. Microfluidic devices for methods development
US6649348B2 (en) 2001-06-29 2003-11-18 Agilent Technologies Inc. Methods for manufacturing arrays
US6613523B2 (en) 2001-06-29 2003-09-02 Agilent Technologies, Inc. Method of DNA sequencing using cleavable tags
US20040161741A1 (en) 2001-06-30 2004-08-19 Elazar Rabani Novel compositions and processes for analyte detection, quantification and amplification
US6989267B2 (en) 2001-07-02 2006-01-24 Agilent Technologies, Inc. Methods of making microarrays with substrate surfaces having covalently bound polyelectrolyte films
US6753145B2 (en) 2001-07-05 2004-06-22 Agilent Technologies, Inc. Buffer composition and method for hybridization of microarrays on adsorbed polymer siliceous surfaces
US7205399B1 (en) 2001-07-06 2007-04-17 Sirna Therapeutics, Inc. Methods and reagents for oligonucleotide synthesis
US7314599B2 (en) 2001-07-17 2008-01-01 Agilent Technologies, Inc. Paek embossing and adhesion for microfluidic devices
US6702256B2 (en) 2001-07-17 2004-03-09 Agilent Technologies, Inc. Flow-switching microdevice
US7128876B2 (en) 2001-07-17 2006-10-31 Agilent Technologies, Inc. Microdevice and method for component separation in a fluid
US20030108903A1 (en) 2001-07-19 2003-06-12 Liman Wang Multiple word DNA computing on surfaces
DE60232523D1 (de) 2001-07-26 2009-07-16 Stratagene California Multi-stellen-mutagenese
WO2003014325A2 (en) 2001-08-10 2003-02-20 Xencor Protein design automation for protein libraries
US6682702B2 (en) 2001-08-24 2004-01-27 Agilent Technologies, Inc. Apparatus and method for simultaneously conducting multiple chemical reactions
US7371580B2 (en) 2001-08-24 2008-05-13 Agilent Technologies, Inc. Use of unstructured nucleic acids in assaying nucleic acid molecules
JP2003101204A (ja) 2001-09-25 2003-04-04 Nec Kansai Ltd 配線基板及び配線基板の製造方法並びに電子部品
US20030082618A1 (en) 2001-10-15 2003-05-01 Guangshan Li Methods for detecting genetic aberrations
US20050124022A1 (en) 2001-10-30 2005-06-09 Maithreyan Srinivasan Novel sulfurylase-luciferase fusion proteins and thermostable sulfurylase
US6902921B2 (en) 2001-10-30 2005-06-07 454 Corporation Sulfurylase-luciferase fusion proteins and thermostable sulfurylase
US6852850B2 (en) 2001-10-31 2005-02-08 Agilent Technologies, Inc. Use of ionic liquids for fabrication of polynucleotide arrays
US7524950B2 (en) 2001-10-31 2009-04-28 Agilent Technologies, Inc. Uses of cationic salts for polynucleotide synthesis
US6858720B2 (en) 2001-10-31 2005-02-22 Agilent Technologies, Inc. Method of synthesizing polynucleotides using ionic liquids
WO2003040410A1 (en) 2001-11-02 2003-05-15 Nimblegen Systems, Inc. Detection of hybridization oligonucleotide microarray through covalently labeling microarray probe
WO2003046508A2 (en) 2001-11-09 2003-06-05 Biomicroarrays, Inc. High surface area substrates for microarrays and methods to make same
US7482118B2 (en) 2001-11-15 2009-01-27 Third Wave Technologies, Inc. Endonuclease-substrate complexes
DE50114507D1 (de) 2001-11-22 2009-01-02 Sloning Biotechnology Gmbh Nukleinsäure-Linker und deren Verwendung in der Gensynthese
US20030099952A1 (en) 2001-11-26 2003-05-29 Roland Green Microarrays with visible pattern detection
US6927029B2 (en) 2001-12-03 2005-08-09 Agilent Technologies, Inc. Surface with tethered polymeric species for binding biomolecules
US20030143605A1 (en) 2001-12-03 2003-07-31 Si Lok Methods for the selection and cloning of nucleic acid molecules free of unwanted nucleotide sequence alterations
US6838888B2 (en) 2001-12-13 2005-01-04 Agilent Technologies, Inc. Flow cell humidity sensor system
WO2003054232A2 (en) 2001-12-13 2003-07-03 Blue Heron Biotechnology, Inc. Methods for removal of double-stranded oligonucleotides containing sequence errors using mismatch recognition proteins
US7932070B2 (en) 2001-12-21 2011-04-26 Agilent Technologies, Inc. High fidelity DNA polymerase compositions and uses therefor
US6790620B2 (en) 2001-12-24 2004-09-14 Agilent Technologies, Inc. Small volume chambers
US6846454B2 (en) 2001-12-24 2005-01-25 Agilent Technologies, Inc. Fluid exit in reaction chambers
US7282183B2 (en) 2001-12-24 2007-10-16 Agilent Technologies, Inc. Atmospheric control in reaction chambers
US20030171325A1 (en) 2002-01-04 2003-09-11 Board Of Regents, The University Of Texas System Proofreading, error deletion, and ligation method for synthesis of high-fidelity polynucleotide sequences
US7025324B1 (en) 2002-01-04 2006-04-11 Massachusetts Institute Of Technology Gating apparatus and method of manufacture
EP1472373A4 (en) 2002-01-14 2005-07-27 Diversa Corp PROCESSES FOR THE PRODUCTION AND PURIFICATION OF DOUBLE STRANDED POLYNUCLEOTIDES
US6673552B2 (en) 2002-01-14 2004-01-06 Diversa Corporation Methods for purifying annealed double-stranded oligonucleotides lacking base pair mismatches or nucleotide gaps
US20040009498A1 (en) 2002-01-14 2004-01-15 Diversa Corporation Chimeric antigen binding molecules and methods for making and using them
US7141368B2 (en) 2002-01-30 2006-11-28 Agilent Technologies, Inc. Multi-directional deposition in array fabrication
US7157229B2 (en) 2002-01-31 2007-01-02 Nimblegen Systems, Inc. Prepatterned substrate for optical synthesis of DNA probes
US7037659B2 (en) 2002-01-31 2006-05-02 Nimblegen Systems Inc. Apparatus for constructing DNA probes having a prismatic and kaleidoscopic light homogenizer
US7422851B2 (en) 2002-01-31 2008-09-09 Nimblegen Systems, Inc. Correction for illumination non-uniformity during the synthesis of arrays of oligomers
US20040126757A1 (en) 2002-01-31 2004-07-01 Francesco Cerrina Method and apparatus for synthesis of arrays of DNA probes
US7083975B2 (en) 2002-02-01 2006-08-01 Roland Green Microarray synthesis instrument and method
US20030148291A1 (en) 2002-02-05 2003-08-07 Karla Robotti Method of immobilizing biologically active molecules for assay purposes in a microfluidic format
US6728129B2 (en) 2002-02-19 2004-04-27 The Regents Of The University Of California Multistate triple-decker dyads in three distinct architectures for information storage applications
US6958119B2 (en) 2002-02-26 2005-10-25 Agilent Technologies, Inc. Mobile phase gradient generation microfluidic device
US6770892B2 (en) 2002-02-28 2004-08-03 Agilent Technologies, Inc. Method and system for automated focus-distance determination for molecular array scanners
US6929951B2 (en) 2002-02-28 2005-08-16 Agilent Technologies, Inc. Method and system for molecular array scanner calibration
US6914229B2 (en) 2002-02-28 2005-07-05 Agilent Technologies, Inc. Signal offset for prevention of data clipping in a molecular array scanner
US20050084907A1 (en) 2002-03-01 2005-04-21 Maxygen, Inc. Methods, systems, and software for identifying functional biomolecules
US6919181B2 (en) 2002-03-25 2005-07-19 Agilent Technologies, Inc. Methods for generating ligand arrays
US20030228602A1 (en) 2002-04-01 2003-12-11 Blue Heron Biotechnology, Inc. Solid phase methods for polynucleotide production
EP1350853A1 (en) 2002-04-05 2003-10-08 ID-Lelystad, Instituut voor Dierhouderij en Diergezondheid B.V. Detection of polymorphisms
US6773888B2 (en) 2002-04-08 2004-08-10 Affymetrix, Inc. Photoactivatable silane compounds and methods for their synthesis and use
WO2003089605A2 (en) 2002-04-22 2003-10-30 Genencor International, Inc. Method of creating a library of bacterial clones with varying levels of gene expression
GB0209539D0 (en) 2002-04-26 2002-06-05 Avecia Ltd Monomer Polymer and process
US7125523B2 (en) 2002-04-29 2006-10-24 Agilent Technologies, Inc. Holders for arrays
US6946285B2 (en) 2002-04-29 2005-09-20 Agilent Technologies, Inc. Arrays with elongated features
US6621076B1 (en) 2002-04-30 2003-09-16 Agilent Technologies, Inc. Flexible assembly for transporting sample fluids into a mass spectrometer
US7094537B2 (en) 2002-04-30 2006-08-22 Agilent Technologies, Inc. Micro arrays with structured and unstructured probes
WO2003093504A1 (de) 2002-05-06 2003-11-13 Noxxon Pharma Ag Verfahren zur amplifikation von nukleinsäuren
US20030211478A1 (en) 2002-05-08 2003-11-13 Gentel Corporation Transcription factor profiling on a solid surface
US7221785B2 (en) 2002-05-21 2007-05-22 Agilent Technologies, Inc. Method and system for measuring a molecular array background signal from a continuous background region of specified size
EP1546378B1 (en) 2002-05-24 2011-06-22 Roche NimbleGen, Inc. Microarrays and method for running hybridization reaction for multiple samples on a single microarray
US7273730B2 (en) 2002-05-24 2007-09-25 Invitrogen Corporation Nested PCR employing degradable primers
US7537936B2 (en) 2002-05-31 2009-05-26 Agilent Technologies, Inc. Method of testing multiple fluid samples with multiple biopolymer arrays
US6789965B2 (en) 2002-05-31 2004-09-14 Agilent Technologies, Inc. Dot printer with off-axis loading
US7078505B2 (en) 2002-06-06 2006-07-18 Agilent Technologies, Inc. Manufacture of arrays with varying deposition parameters
US7351379B2 (en) 2002-06-14 2008-04-01 Agilent Technologies, Inc. Fluid containment structure
US7371348B2 (en) 2002-06-14 2008-05-13 Agilent Technologies Multiple array format
US7919308B2 (en) 2002-06-14 2011-04-05 Agilent Technologies, Inc. Form in place gaskets for assays
US6939673B2 (en) 2002-06-14 2005-09-06 Agilent Technologies, Inc. Manufacture of arrays with reduced error impact
US20070275411A1 (en) 2006-05-25 2007-11-29 Mcgall Glenn H Silane mixtures
US7220573B2 (en) 2002-06-21 2007-05-22 Agilent Technologies, Inc. Array assay devices and methods of using the same
US6713262B2 (en) 2002-06-25 2004-03-30 Agilent Technologies, Inc. Methods and compositions for high throughput identification of protein/nucleic acid binding pairs
US7894998B2 (en) 2002-06-26 2011-02-22 Agilent Technologies, Inc. Method for identifying suitable nucleic acid probe sequences for use in nucleic acid arrays
US7202358B2 (en) 2002-07-25 2007-04-10 Agilent Technologies, Inc. Methods for producing ligand arrays
US7452712B2 (en) 2002-07-30 2008-11-18 Applied Biosystems Inc. Sample block apparatus and method of maintaining a microcard on a sample block
US6835938B2 (en) 2002-07-31 2004-12-28 Agilent Technologies, Inc. Biopolymer array substrate thickness dependent automated focus-distance determination method for biopolymer array scanners
US7101508B2 (en) 2002-07-31 2006-09-05 Agilent Technologies, Inc. Chemical array fabrication errors
US7153689B2 (en) 2002-08-01 2006-12-26 Agilent Technologies, Inc. Apparatus and methods for cleaning and priming droplet dispensing devices
US8946387B2 (en) 2002-08-14 2015-02-03 Macrogenics, Inc. FcγRIIB specific antibodies and methods of use thereof
US7205128B2 (en) 2002-08-16 2007-04-17 Agilent Technologies, Inc. Method for synthesis of the second strand of cDNA
US7563600B2 (en) 2002-09-12 2009-07-21 Combimatrix Corporation Microarray synthesis and assembly of gene-length polynucleotides
WO2004029220A2 (en) 2002-09-26 2004-04-08 Kosan Biosciences, Inc. Synthetic genes
US7498176B2 (en) 2002-09-27 2009-03-03 Roche Nimblegen, Inc. Microarray with hydrophobic barriers
AU2003282885A1 (en) 2002-09-30 2004-04-23 Nimblegen Systems, Inc. Parallel loading of arrays
DE10393431T5 (de) 2002-10-01 2005-11-17 Nimblegen Systems, Inc., Madison Mikroarrays mit mehreren Oligonukleotiden in einzelnen Array Features
US7129075B2 (en) 2002-10-18 2006-10-31 Transgenomic, Inc. Isolated CEL II endonuclease
US20040076964A1 (en) * 2002-10-22 2004-04-22 Leproust Eric M. Methods for in situ generation of nucleic acid arrays
US8283148B2 (en) 2002-10-25 2012-10-09 Agilent Technologies, Inc. DNA polymerase compositions for quantitative PCR and methods thereof
EP1581654A4 (en) 2002-10-28 2007-01-03 Invitrogen Corp ARRAY OLIGOMER SYNTHESIS AND USE
US7364896B2 (en) 2002-10-31 2008-04-29 Agilent Technologies, Inc. Test strips including flexible array substrates and method of hybridization
US7629120B2 (en) 2002-10-31 2009-12-08 Rice University Method for assembling PCR fragments of DNA
US7402279B2 (en) 2002-10-31 2008-07-22 Agilent Technologies, Inc. Device with integrated microfluidic and electronic components
US7422911B2 (en) 2002-10-31 2008-09-09 Agilent Technologies, Inc. Composite flexible array substrate having flexible support
AU2003287449A1 (en) 2002-10-31 2004-05-25 Nanostream, Inc. Parallel detection chromatography systems
US7390457B2 (en) 2002-10-31 2008-06-24 Agilent Technologies, Inc. Integrated microfluidic array device
US20040086892A1 (en) 2002-11-06 2004-05-06 Crothers Donald M. Universal tag assay
US7029854B2 (en) 2002-11-22 2006-04-18 Agilent Technologies, Inc. Methods designing multiple mRNA transcript nucleic acid probe sequences for use in nucleic acid arrays
US7062385B2 (en) 2002-11-25 2006-06-13 Tufts University Intelligent electro-optical nucleic acid-based sensor array and method for detecting volatile compounds in ambient air
EP1578799B8 (en) 2002-12-02 2011-03-23 Amgen Fremont Inc. Antibodies directed to tumor necrosis factor and uses thereof
US20040110133A1 (en) 2002-12-06 2004-06-10 Affymetrix, Inc. Functionated photoacid generator for biological microarray synthesis
US7879580B2 (en) 2002-12-10 2011-02-01 Massachusetts Institute Of Technology Methods for high fidelity production of long nucleic acid molecules
US7932025B2 (en) 2002-12-10 2011-04-26 Massachusetts Institute Of Technology Methods for high fidelity production of long nucleic acid molecules with error control
US6987263B2 (en) 2002-12-13 2006-01-17 Nanostream, Inc. High throughput systems and methods for parallel sample analysis
US20060076482A1 (en) 2002-12-13 2006-04-13 Hobbs Steven E High throughput systems and methods for parallel sample analysis
US7247337B1 (en) 2002-12-16 2007-07-24 Agilent Technologies, Inc. Method and apparatus for microarray fabrication
US20040191810A1 (en) 2002-12-17 2004-09-30 Affymetrix, Inc. Immersed microarrays in conical wells
GB0229443D0 (en) 2002-12-18 2003-01-22 Avecia Ltd Process
US7960157B2 (en) 2002-12-20 2011-06-14 Agilent Technologies, Inc. DNA polymerase blends and uses thereof
WO2004058391A2 (de) 2002-12-23 2004-07-15 Febit Biotech Gmbh Photoaktivierbare zweistufige schutzgruppen für die synthese von biopolymeren
JP4511943B2 (ja) 2002-12-23 2010-07-28 ワイス エルエルシー Ｐｄ−１に対する抗体およびその使用
JP2006511225A (ja) 2002-12-23 2006-04-06 アジレント・テクノロジーズ・インク 固定化オリゴヌクレオチドフィーチャーを用いた比較ゲノムハイブリダイゼーションアッセイ及びその実施に用いるための組成物
DE10260805A1 (de) 2002-12-23 2004-07-22 Geneart Gmbh Verfahren und Vorrichtung zum Optimieren einer Nucleotidsequenz zur Expression eines Proteins
US7372982B2 (en) 2003-01-14 2008-05-13 Agilent Technologies, Inc. User interface for molecular array feature analysis
US6809277B2 (en) 2003-01-22 2004-10-26 Agilent Technologies, Inc. Method for registering a deposited material with channel plate channels, and switch produced using same
CA2513535C (en) 2003-01-29 2012-06-12 454 Corporation Bead emulsion nucleic acid amplification
US7202264B2 (en) 2003-01-31 2007-04-10 Isis Pharmaceuticals, Inc. Supports for oligomer synthesis
US8073626B2 (en) 2003-01-31 2011-12-06 Agilent Technologies, Inc. Biopolymer array reading
US6950756B2 (en) 2003-02-05 2005-09-27 Agilent Technologies, Inc. Rearrangement of microarray scan images to form virtual arrays
GB2398383B (en) 2003-02-12 2005-03-09 Global Genomics Ab Method and means for nucleic acid sequencing
US7413709B2 (en) 2003-02-12 2008-08-19 Agilent Technologies, Inc. PAEK-based microfluidic device with integrated electrospray emitter
US7244513B2 (en) 2003-02-21 2007-07-17 Nano-Proprietary, Inc. Stain-etched silicon powder
US7070932B2 (en) 2003-02-25 2006-07-04 Agilent Technologies, Inc. Methods and devices for detecting printhead misalignment of an in situ polymeric array synthesis device
US7252938B2 (en) 2003-02-25 2007-08-07 Agilent Technologies, Inc. Methods and devices for producing a polymer at a location of a substrate
JP2004268394A (ja) 2003-03-07 2004-09-30 Canon Inc インクジェット記録装置及びその制御方法
WO2004080887A1 (en) 2003-03-07 2004-09-23 Massachusetts Institute Of Technology Three dimensional mecrofabrication
US20050053968A1 (en) 2003-03-31 2005-03-10 Council Of Scientific And Industrial Research Method for storing information in DNA
US20060134638A1 (en) 2003-04-02 2006-06-22 Blue Heron Biotechnology, Inc. Error reduction in automated gene synthesis
US7534561B2 (en) 2003-04-02 2009-05-19 Agilent Technologies, Inc. Nucleic acid array in situ fabrication methods and arrays produced using the same
US20040219663A1 (en) 2003-04-30 2004-11-04 Page Robert D. Biopolymer array fabrication using different drop deposition heads
US7206439B2 (en) 2003-04-30 2007-04-17 Agilent Technologies, Inc. Feature locations in array reading
US7269518B2 (en) 2003-04-30 2007-09-11 Agilent Technologies, Inc. Chemical array reading
US6916113B2 (en) 2003-05-16 2005-07-12 Agilent Technologies, Inc. Devices and methods for fluid mixing
AU2004240944A1 (en) 2003-05-20 2004-12-02 Fluidigm Corporation Method and system for microfluidic device and imaging thereof
ATE479777T1 (de) 2003-05-30 2010-09-15 Univ Illinois Genexpressionsprofile zur identifizierung von genetisch bevorzugten huftieren
CA2540692C (en) 2003-06-02 2013-05-28 Isis Pharmaceuticals, Inc. Oligonucleotide synthesis with alternative solvents
US8133670B2 (en) 2003-06-13 2012-03-13 Cold Spring Harbor Laboratory Method for making populations of defined nucleic acid molecules
US6938476B2 (en) 2003-06-25 2005-09-06 Agilent Technologies, Inc. Apparatus and methods for sensing fluid levels
US7534563B2 (en) 2003-06-30 2009-05-19 Agilent Technologies, Inc. Methods for producing ligand arrays
US20050016851A1 (en) 2003-07-24 2005-01-27 Jensen Klavs F. Microchemical method and apparatus for synthesis and coating of colloidal nanoparticles
US6843281B1 (en) 2003-07-30 2005-01-18 Agilent Techinologies, Inc. Methods and apparatus for introducing liquids into microfluidic chambers
US7353116B2 (en) 2003-07-31 2008-04-01 Agilent Technologies, Inc. Chemical array with test dependent signal reading or processing
WO2005014850A2 (en) 2003-08-06 2005-02-17 University Of Massachusetts Systems and methods for analyzing nucleic acid sequences
US7028536B2 (en) 2004-06-29 2006-04-18 Nanostream, Inc. Sealing interface for microfluidic device
US7348144B2 (en) 2003-08-13 2008-03-25 Agilent Technologies, Inc. Methods and system for multi-drug treatment discovery
US7229497B2 (en) 2003-08-26 2007-06-12 Massachusetts Institute Of Technology Method of preparing nanocrystals
US7417139B2 (en) 2003-08-30 2008-08-26 Agilent Technologies, Inc. Method for polynucleotide synthesis
US7193077B2 (en) 2003-08-30 2007-03-20 Agilent Technologies, Inc. Exocyclic amine triaryl methyl protecting groups in two-step polynucleotide synthesis
US7385050B2 (en) 2003-08-30 2008-06-10 Agilent Technologies, Inc. Cleavable linker for polynucleotide synthesis
US7585970B2 (en) 2003-08-30 2009-09-08 Agilent Technologies, Inc. Method of polynucleotide synthesis using modified support
US7427679B2 (en) 2003-08-30 2008-09-23 Agilent Technologies, Inc. Precursors for two-step polynucleotide synthesis
US20050049796A1 (en) 2003-09-03 2005-03-03 Webb Peter G. Methods for encoding non-biological information on microarrays
WO2005023993A2 (en) 2003-09-09 2005-03-17 Integrigen, Inc. Methods and compositions for generation of germline human antibody genes
WO2005030929A2 (en) 2003-09-23 2005-04-07 Atom Sciences, Inc. Polymeric nucleic acid hybridization probes
US7488607B2 (en) 2003-09-30 2009-02-10 Agilent Technologies, Inc. Electronically readable microarray with electronic addressing function
US7147362B2 (en) 2003-10-15 2006-12-12 Agilent Technologies, Inc. Method of mixing by intermittent centrifugal force
US7075161B2 (en) 2003-10-23 2006-07-11 Agilent Technologies, Inc. Apparatus and method for making a low capacitance artificial nanopore
US20050277125A1 (en) 2003-10-27 2005-12-15 Massachusetts Institute Of Technology High-density reaction chambers and methods of use
US7169560B2 (en) 2003-11-12 2007-01-30 Helicos Biosciences Corporation Short cycle methods for sequencing polynucleotides
US7276338B2 (en) 2003-11-17 2007-10-02 Jacobson Joseph M Nucleotide sequencing via repetitive single molecule hybridization
DE10353887A1 (de) 2003-11-18 2005-06-16 Febit Ag Hochparalleler DNA-Synthesizer auf Matrizenbasis
US7851192B2 (en) 2004-11-22 2010-12-14 New England Biolabs, Inc. Modified DNA cleavage enzymes and methods for use
US7282705B2 (en) 2003-12-19 2007-10-16 Agilent Technologies, Inc. Microdevice having an annular lining for producing an electrospray emitter
JP2007525571A (ja) 2004-01-07 2007-09-06 ソレクサ リミテッド 修飾分子アレイ
CA2553833C (en) 2004-01-28 2012-10-02 454 Corporation Nucleic acid amplification with continuous flow emulsion
US7084180B2 (en) 2004-01-28 2006-08-01 Velocys, Inc. Fischer-tropsch synthesis using microchannel technology and novel catalyst and microchannel reactor
CA2555377A1 (en) 2004-02-12 2005-09-01 Compass Genetics, Llc Genetic analysis by sequence-specific sorting
US7125488B2 (en) 2004-02-12 2006-10-24 Varian, Inc. Polar-modified bonded phase materials for chromatographic separations
WO2005089110A2 (en) 2004-02-27 2005-09-29 President And Fellows Of Harvard College Polynucleotide synthesis
WO2005093092A2 (en) 2004-03-26 2005-10-06 Bayer Healthcare Ag Diagnostics and therapeutics for diseases associated with g-protein coupled receptor 44 (gpr44)
US7875463B2 (en) 2004-03-26 2011-01-25 Agilent Technologies, Inc. Generalized pulse jet ejection head control model
US20050214779A1 (en) 2004-03-29 2005-09-29 Peck Bill J Methods for in situ generation of nucleic acid arrays
US20050214778A1 (en) 2004-03-29 2005-09-29 Peck Bill J Methods for in situ generation of nucleic acid arrays
US8825411B2 (en) 2004-05-04 2014-09-02 Dna Twopointo, Inc. Design, synthesis and assembly of synthetic nucleic acids
CA2566866A1 (en) 2004-05-11 2006-03-09 Wyeth Novel polynucleotides related to oligonucleotide arrays to monitor gene expression
DK1773978T3 (da) 2004-05-19 2014-05-26 Univ Pittsburgh Perfunderede, tredimensionelle celle/vævssygdomsmodeller
US7302348B2 (en) 2004-06-02 2007-11-27 Agilent Technologies, Inc. Method and system for quantifying and removing spatial-intensity trends in microarray data
US20060024711A1 (en) 2004-07-02 2006-02-02 Helicos Biosciences Corporation Methods for nucleic acid amplification and sequence determination
ES2372503T3 (es) 2004-07-06 2012-01-20 Bioren, Inc. Mutagénesis revisada para desarrollar polipéptidos alterados con propiedades potenciadas.
WO2006014533A2 (en) 2004-07-07 2006-02-09 Home Guardian Llc Instrumented mobility assistance device
US7811753B2 (en) 2004-07-14 2010-10-12 Ibis Biosciences, Inc. Methods for repairing degraded DNA
US20060012793A1 (en) 2004-07-19 2006-01-19 Helicos Biosciences Corporation Apparatus and methods for analyzing samples
US7276720B2 (en) 2004-07-19 2007-10-02 Helicos Biosciences Corporation Apparatus and methods for analyzing samples
US20060019084A1 (en) 2004-07-23 2006-01-26 Pearson Laurence T Monolithic composition and method
US20060024678A1 (en) 2004-07-28 2006-02-02 Helicos Biosciences Corporation Use of single-stranded nucleic acid binding proteins in sequencing
WO2006015789A2 (de) 2004-08-03 2006-02-16 Geneart Ag Verfahren zur modulation der genexpression durch änderung des cpg gehalts
WO2006073504A2 (en) 2004-08-04 2006-07-13 President And Fellows Of Harvard College Wobble sequencing
WO2006018044A1 (en) 2004-08-18 2006-02-23 Agilent Technologies, Inc. Microfluidic assembly with coupled microfluidic devices
US7034290B2 (en) 2004-09-24 2006-04-25 Agilent Technologies, Inc. Target support with pattern recognition sites
US7943046B2 (en) 2004-10-01 2011-05-17 Agilent Technologies, Inc Methods and systems for on-column protein delipidation
US20070122817A1 (en) 2005-02-28 2007-05-31 George Church Methods for assembly of high fidelity synthetic polynucleotides
CA2584984A1 (en) 2004-10-18 2006-04-27 Codon Devices, Inc. Methods for assembly of high fidelity synthetic polynucleotides
US7141807B2 (en) 2004-10-22 2006-11-28 Agilent Technologies, Inc. Nanowire capillaries for mass spectrometry
US20060110744A1 (en) 2004-11-23 2006-05-25 Sampas Nicolas M Probe design methods and microarrays for comparative genomic hybridization and location analysis
US8380441B2 (en) 2004-11-30 2013-02-19 Agilent Technologies, Inc. Systems for producing chemical array layouts
US11268149B2 (en) 2004-12-08 2022-03-08 Cedars-Sinai Medical Center Diagnosis and treatment of inflammatory bowel disease
US7977119B2 (en) 2004-12-08 2011-07-12 Agilent Technologies, Inc. Chemical arrays and methods of using the same
US7439272B2 (en) 2004-12-20 2008-10-21 Varian, Inc. Ultraporous sol gel monoliths
US20090285825A1 (en) 2004-12-22 2009-11-19 National University Of Singapore Novel snake toxin
US20070099196A1 (en) 2004-12-29 2007-05-03 Sakari Kauppinen Novel oligonucleotide compositions and probe sequences useful for detection and analysis of micrornas and their target mRNAs
CA2594832A1 (en) 2005-01-13 2006-07-20 Codon Devices, Inc. Compositions and methods for protein design
US20060171855A1 (en) 2005-02-03 2006-08-03 Hongfeng Yin Devices,systems and methods for multi-dimensional separation
WO2006086391A2 (en) 2005-02-07 2006-08-17 Massachusetts Institute Of Technology Electrochemically-degradable layer-by-layer thin films
US7393665B2 (en) 2005-02-10 2008-07-01 Population Genetics Technologies Ltd Methods and compositions for tagging and identifying polynucleotides
JP4641199B2 (ja) 2005-02-28 2011-03-02 国立感染症研究所長 Ｒｎａ干渉ポリヌクレオチド混合物の設計装置、ｒｎａ干渉ポリヌクレオチド混合物の作製方法、及びｒｎａ干渉ポリヌクレオチド混合物の設計プログラム
US20060203236A1 (en) 2005-03-08 2006-09-14 Zhenghua Ji Sample cell
WO2007086890A2 (en) 2005-03-10 2007-08-02 Genemark Inc. Method, apparatus, and system for authentication using labels containing nucleotide seouences
EP1623763A1 (en) 2005-03-11 2006-02-08 Agilent Technologies, Inc. Chip with cleaning cavity
US7618777B2 (en) 2005-03-16 2009-11-17 Agilent Technologies, Inc. Composition and method for array hybridization
US20060219637A1 (en) 2005-03-29 2006-10-05 Killeen Kevin P Devices, systems and methods for liquid chromatography
WO2006116476A1 (en) 2005-04-27 2006-11-02 Sigma-Aldrich Co. Activators for oligonucleotide and phosphoramidite synthesis
ATE474937T1 (de) 2005-04-29 2010-08-15 Synthetic Genomics Inc Amplifikation und klonierung einzelner dna- moleküle mittels rolling-circle-amplifikation
US7572907B2 (en) 2005-04-29 2009-08-11 Agilent Technologies, Inc. Methods and compounds for polynucleotide synthesis
DE602006010360D1 (de) 2005-05-12 2009-12-24 Hempel As Verfahren zur herstellung einer rissfesten epoxidlackschicht und dafür geeignete lacke
US7396676B2 (en) 2005-05-31 2008-07-08 Agilent Technologies, Inc. Evanescent wave sensor with attached ligand
CN101466847B (zh) 2005-06-15 2014-02-19 考利达基因组股份有限公司 用于遗传和化学分析的单分子阵列
US7919239B2 (en) 2005-07-01 2011-04-05 Agilent Technologies, Inc. Increasing hybridization efficiencies
US8076064B2 (en) 2005-07-09 2011-12-13 Agilent Technologies, Inc. Method of treatment of RNA sample
US7718365B2 (en) 2005-07-09 2010-05-18 Agilent Technologies, Inc. Microarray analysis of RNA
WO2007018601A1 (en) 2005-08-02 2007-02-15 Rubicon Genomics, Inc. Compositions and methods for processing and amplification of dna, including using multiple enzymes in a single reaction
DE102005037351B3 (de) 2005-08-08 2007-01-11 Geneart Ag Verfahren für die kontinuierliche zielgerichtete Evolution von Proteinen in vitro
CA2618699C (en) 2005-08-11 2012-10-02 J. Craig Venter Institute, Inc. In vitro recombination method
US9404882B2 (en) 2005-08-11 2016-08-02 New Mexico Tech Research Foundation Method of producing a multi-microchannel, flow-through element and device using same
EP1929012B1 (en) 2005-08-11 2010-10-06 Synthetic Genomics, Inc. Method for in vitro recombination
US7749701B2 (en) 2005-08-11 2010-07-06 Agilent Technologies, Inc. Controlling use of oligonucleotide sequences released from arrays
US7805252B2 (en) 2005-08-16 2010-09-28 Dna Twopointo, Inc. Systems and methods for designing and ordering polynucleotides
US20070054127A1 (en) 2005-08-26 2007-03-08 Hergenrother Robert W Silane coating compositions, coating systems, and methods
US20070196834A1 (en) 2005-09-09 2007-08-23 Francesco Cerrina Method and system for the generation of large double stranded DNA fragments
JP5055282B2 (ja) 2005-09-14 2012-10-24 イルミナ インコーポレイテッド 連続的なポリマー合成器
US20100233429A1 (en) 2005-09-16 2010-09-16 Yamatake Corporation Substrate for Biochip, Biochip, Method for Manufacturing Substrate for Biochip and Method for Manufacturing Biochip
US20080308884A1 (en) 2005-10-13 2008-12-18 Silex Microsystems Ab Fabrication of Inlet and Outlet Connections for Microfluidic Chips
US8552174B2 (en) 2005-10-31 2013-10-08 Agilent Technologies, Inc. Solutions, methods, and processes for deprotection of polynucleotides
US7759471B2 (en) 2005-10-31 2010-07-20 Agilent Technologies, Inc. Monomer compositions for the synthesis of RNA, methods of synthesis, and methods of deprotection
US7368550B2 (en) 2005-10-31 2008-05-06 Agilent Technologies, Inc. Phosphorus protecting groups
US8202985B2 (en) 2005-10-31 2012-06-19 Agilent Technologies, Inc. Monomer compositions for the synthesis of polynucleotides, methods of synthesis, and methods of deprotection
GB0522310D0 (en) 2005-11-01 2005-12-07 Solexa Ltd Methods of preparing libraries of template polynucleotides
US7291471B2 (en) 2005-11-21 2007-11-06 Agilent Technologies, Inc. Cleavable oligonucleotide arrays
GB0524069D0 (en) 2005-11-25 2006-01-04 Solexa Ltd Preparation of templates for solid phase amplification
US8137936B2 (en) 2005-11-29 2012-03-20 Macevicz Stephen C Selected amplification of polynucleotides
CN101365803B (zh) 2005-12-22 2013-03-20 关键基因股份有限公司 采用高通量测序技术的改进的转录谱描述策略
US7939645B2 (en) 2006-01-06 2011-05-10 Agilent Technologies, Inc Reaction buffer composition for nucleic acid replication with packed DNA polymerases
WO2007081386A2 (en) 2006-01-11 2007-07-19 Raindance Technologies, Inc. Microfluidic devices and methods of use
EP1987162A4 (en) 2006-01-23 2009-11-25 Population Genetics Technologi NUCLEIC ACID ANALYSIS ABOUT SEQUENCE TOKENS
WO2007087377A2 (en) 2006-01-25 2007-08-02 Massachusetts Institute Of Technology Photoelectrochemical synthesis of high density combinatorial polymer arrays
WO2008057127A2 (en) 2006-02-06 2008-05-15 Massachusetts Institute Of Technology Self-assembly of macromolecules on multilayered polymer surfaces
US8809876B2 (en) 2006-02-14 2014-08-19 Massachusetts Institute Of Technology Absorbing film
US7807356B2 (en) 2006-03-09 2010-10-05 Agilent Technologies, Inc. Labeled nucleotide composition
TW200806317A (en) 2006-03-20 2008-02-01 Wyeth Corp Methods for reducing protein aggregation
US7572908B2 (en) 2006-03-23 2009-08-11 Agilent Technologies, Inc. Cleavable linkers for polynucleotides
US7855281B2 (en) 2006-03-23 2010-12-21 Agilent Technologies, Inc. Cleavable thiocarbonate linkers for polynucleotide synthesis
US20070231800A1 (en) 2006-03-28 2007-10-04 Agilent Technologies, Inc. Determination of methylated DNA
EP3722409A1 (en) 2006-03-31 2020-10-14 Illumina, Inc. Systems and devices for sequence by synthesis analysis
US20070238106A1 (en) 2006-04-07 2007-10-11 Agilent Technologies, Inc. Systems and methods of determining alleles and/or copy numbers
US20070238104A1 (en) 2006-04-07 2007-10-11 Agilent Technologies, Inc. Competitive oligonucleotides
JP2009533028A (ja) 2006-04-07 2009-09-17 ザ ガバメント オブ ザ ユナイテッド ステイツ オブ アメリカ アズ リプレゼンティッド バイ ザ セクレタリー デパートメント オブ ヘルス アンド ヒューマン サービシーズ 新生物疾患の治療のための抗体組成物および方法
US20070238108A1 (en) 2006-04-07 2007-10-11 Agilent Technologies, Inc. Validation of comparative genomic hybridization
US8058055B2 (en) 2006-04-07 2011-11-15 Agilent Technologies, Inc. High resolution chromosomal mapping
EP2010678A2 (en) 2006-04-11 2009-01-07 New England Biolabs, Inc. Repair of nucleic acids for improved amplification
JP2009538123A (ja) 2006-04-19 2009-11-05 アプライド バイオシステムズ， エルエルシー ゲル非含有ビーズベースの配列決定のための試薬、方法およびライブラリー
US8383338B2 (en) 2006-04-24 2013-02-26 Roche Nimblegen, Inc. Methods and systems for uniform enrichment of genomic regions
US20070259344A1 (en) 2006-05-03 2007-11-08 Agilent Technologies, Inc. Compound probes and methods of increasing the effective probe densities of arrays
US20070259346A1 (en) 2006-05-03 2007-11-08 Agilent Technologies, Inc. Analysis of arrays
US20070259347A1 (en) 2006-05-03 2007-11-08 Agilent Technologies, Inc. Methods of increasing the effective probe densities of arrays
US20070259345A1 (en) 2006-05-03 2007-11-08 Agilent Technologies, Inc. Target determination using compound probes
WO2007137242A2 (en) 2006-05-19 2007-11-29 Massachusetts Institute Of Technology Microfluidic-based gene synthesis
US20090087840A1 (en) 2006-05-19 2009-04-02 Codon Devices, Inc. Combined extension and ligation for nucleic acid assembly
WO2008054543A2 (en) 2006-05-20 2008-05-08 Codon Devices, Inc. Oligonucleotides for multiplex nucleic acid assembly
ES2551577T3 (es) 2006-06-19 2015-11-20 Yeda Research And Development Company Limited Alargamiento Iterado Programable: Un método para elaborar genes sintéticos y ADN combinatorio y librerías de proteína
AT503861B1 (de) 2006-07-05 2008-06-15 F Star Biotech Forsch & Entw Verfahren zur manipulation von t-zell-rezeptoren
AT503902B1 (de) 2006-07-05 2008-06-15 F Star Biotech Forsch & Entw Verfahren zur manipulation von immunglobulinen
US20080193772A1 (en) 2006-07-07 2008-08-14 Bio-Rad Laboratories, Inc Mass spectrometry probes having hydrophobic coatiings
US7572585B2 (en) 2006-07-31 2009-08-11 Agilent Technologies, Inc. Enzymatic labeling of RNA
US7524942B2 (en) 2006-07-31 2009-04-28 Agilent Technologies, Inc. Labeled nucleotide composition
US9328378B2 (en) 2006-07-31 2016-05-03 Illumina Cambridge Limited Method of library preparation avoiding the formation of adaptor dimers
EP3342415B1 (en) 2006-08-08 2022-01-26 Rheinische Friedrich-Wilhelms-Universität Bonn Structure and use of 5' phosphate oligonucleotides
DE102006039479A1 (de) 2006-08-23 2008-03-06 Febit Biotech Gmbh Programmierbare Oligonukleotidsynthese
EP2061909A2 (en) 2006-08-24 2009-05-27 Illumina Cambridge Limited Method for retaining even coverage of short insert libraries
US8053191B2 (en) 2006-08-31 2011-11-08 Westend Asset Clearinghouse Company, Llc Iterative nucleic acid assembly using activation of vector-encoded traits
US8415138B2 (en) 2006-08-31 2013-04-09 Agilent Technologies, Inc. Apparatuses and methods for oligonucleotide preparation
US8097711B2 (en) 2006-09-02 2012-01-17 Agilent Technologies, Inc. Thioether substituted aryl carbonate protecting groups
US20080311628A1 (en) 2006-10-03 2008-12-18 Ghc Technologies, Inc. Methods and compositions for rapid amplification and capture of nucleic acid sequences
US20080287320A1 (en) 2006-10-04 2008-11-20 Codon Devices Libraries and their design and assembly
US20080085511A1 (en) 2006-10-05 2008-04-10 Peck Bill J Preparation of biopolymer arrays
JP2008097189A (ja) 2006-10-10 2008-04-24 National Institute Of Advanced Industrial & Technology 塩基配列断片の転写物特異性又は遺伝子特異性を判定する方法
US20080085514A1 (en) 2006-10-10 2008-04-10 Peck Bill J Methods and devices for array synthesis
US7867782B2 (en) 2006-10-19 2011-01-11 Agilent Technologies, Inc. Nanoscale moiety placement methods
US7999087B2 (en) 2006-11-15 2011-08-16 Agilent Technologies, Inc. 2′-silyl containing thiocarbonate protecting groups for RNA synthesis
WO2008063134A1 (en) 2006-11-24 2008-05-29 Agency For Science, Technology And Research Method of producing a pattern of discriminative wettability
WO2008063135A1 (en) 2006-11-24 2008-05-29 Agency For Science, Technology And Research Apparatus for processing a sample in a liquid droplet and method of using the same
US8242258B2 (en) 2006-12-03 2012-08-14 Agilent Technologies, Inc. Protecting groups for RNA synthesis
JP2010511397A (ja) 2006-12-05 2010-04-15 アブリンクス エン．ヴェー． 血清タンパク質と結合可能なペプチド
US7989396B2 (en) 2006-12-05 2011-08-02 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Biomolecule immobilization on biosensors
US7862999B2 (en) 2007-01-17 2011-01-04 Affymetrix, Inc. Multiplex targeted amplification using flap nuclease
US8314220B2 (en) 2007-01-26 2012-11-20 Agilent Technologies, Inc. Methods compositions, and kits for detection of microRNA
US20080182296A1 (en) 2007-01-31 2008-07-31 Chanda Pranab K Pcr-directed gene synthesis from large number of overlapping oligodeoxyribonucleotides
KR100827449B1 (ko) 2007-02-07 2008-05-07 삼성전자주식회사 광분해성 화합물과 상기 화합물이 커플링된 올리고머프로브 어레이용 기판, 올리고머 프로브 어레이 및 이의제조 방법
US20100323404A1 (en) 2007-02-09 2010-12-23 Richard Lathrop Method for recombining dna sequences and compositions related thereto
EP2126105A4 (en) 2007-02-20 2010-11-03 Anaptysbio Inc SOMATIC HYPERPERMUTATION SYSTEMS
US9029085B2 (en) 2007-03-07 2015-05-12 President And Fellows Of Harvard College Assays and other reactions involving droplets
US7651762B2 (en) 2007-03-13 2010-01-26 Varian, Inc. Methods and devices using a shrinkable support for porous monolithic materials
CA2684801C (en) 2007-04-04 2017-10-10 The Regents Of The University Of California Compositions, devices, systems, and methods for using a nanopore
EP2476689B1 (en) 2007-05-10 2015-10-21 Agilent Technologies, Inc. Thiocarbon-protecting groups for RNA synthesis
WO2008148392A1 (en) 2007-06-04 2008-12-11 In Situ Rcp A/S Enzyme activity assay using rolling circle amplification
US20090023190A1 (en) 2007-06-20 2009-01-22 Kai Qin Lao Sequence amplification with loopable primers
US20080318334A1 (en) 2007-06-20 2008-12-25 Robotti Karla M Microfluidic devices comprising fluid flow paths having a monolithic chromatographic material
US8194244B2 (en) 2007-06-29 2012-06-05 Intel Corporation Solution sample plate with wells designed for improved Raman scattering signal detection efficiency
US7659069B2 (en) 2007-08-31 2010-02-09 Agilent Technologies, Inc. Binary signaling assay using a split-polymerase
US8685642B2 (en) 2007-07-30 2014-04-01 Agilent Technologies, Inc. Allele-specific copy number measurement using single nucleotide polymorphism and DNA arrays
US7979215B2 (en) 2007-07-30 2011-07-12 Agilent Technologies, Inc. Methods and systems for evaluating CGH candidate probe nucleic acid sequences
US20090036664A1 (en) 2007-07-31 2009-02-05 Brian Jon Peter Complex oligonucleotide primer mix
WO2009020435A1 (en) 2007-08-07 2009-02-12 Agency For Science, Technology And Research Integrated microfluidic device for gene synthesis
US9440231B2 (en) 2007-08-14 2016-09-13 Fluidigm Corporation Polymer microfluidic biochip fabrication
US20110126929A1 (en) 2007-08-15 2011-06-02 Massachusetts Institute Of Technology Microstructures For Fluidic Ballasting and Flow Control
US9598737B2 (en) 2012-05-09 2017-03-21 Longhorn Vaccines And Diagnostics, Llc Next generation genomic sequencing methods
US20090053704A1 (en) 2007-08-24 2009-02-26 Natalia Novoradovskaya Stabilization of nucleic acids on solid supports
US8877688B2 (en) 2007-09-14 2014-11-04 Adimab, Llc Rationally designed, synthetic antibody libraries and uses therefor
CA2699518A1 (en) 2007-09-17 2009-03-26 Twof, Inc. Supramolecular nanostamping printing device
US7790387B2 (en) 2007-09-24 2010-09-07 Agilent Technologies, Inc. Thiocarbonate linkers for polynucleotides
US8003330B2 (en) 2007-09-28 2011-08-23 Pacific Biosciences Of California, Inc. Error-free amplification of DNA for clonal sequencing
EP2053132A1 (en) 2007-10-23 2009-04-29 Roche Diagnostics GmbH Enrichment and sequence analysis of geomic regions
WO2009070665A1 (en) 2007-11-27 2009-06-04 Massachusetts Institute Of Technology Near field detector for integrated surface plasmon resonance biosensor applications
WO2009076580A2 (en) 2007-12-12 2009-06-18 Thomas Jefferson University Compositions and methods for the treatment and prevention of cardiovascular diseases
WO2009078016A2 (en) 2007-12-17 2009-06-25 Yeda Research And Develompment Co. Ltd. System and method for editing and manipulating dna
US8530197B2 (en) 2008-01-09 2013-09-10 Applied Biosystems, Llc Method of making a paired tag library for nucleic acid sequencing
WO2012044847A1 (en) 2010-10-01 2012-04-05 Life Technologies Corporation Nucleic acid adaptors and uses thereof
US7682809B2 (en) 2008-01-11 2010-03-23 Agilent Technologies, Inc. Direct ATP release sequencing
EP2238459B1 (en) 2008-01-23 2019-05-08 Roche Diagnostics GmbH Integrated instrument performing synthesis and amplification
US8304273B2 (en) 2008-01-24 2012-11-06 Massachusetts Institute Of Technology Insulated nanogap devices and methods of use thereof
WO2009097368A2 (en) 2008-01-28 2009-08-06 Complete Genomics, Inc. Methods and compositions for efficient base calling in sequencing reactions
US20090194483A1 (en) 2008-01-31 2009-08-06 Robotti Karla M Microfluidic device having monolithic separation medium and method of use
DK3064599T3 (en) 2008-02-15 2019-04-08 Synthetic Genomics Inc METHODS IN VITRO FOR COMBINING AND COMBINATORY CONSTRUCTION OF NUCLEIC ACID MOLECULES
EP2270142A4 (en) 2008-03-11 2011-06-01 Univ Tokyo METHOD FOR PRODUCING A DNA FRAGMENT WITH STICKY END
US20090230044A1 (en) 2008-03-13 2009-09-17 Agilent Technologies, Inc. Microfluid Chip Cleaning
US20090238722A1 (en) 2008-03-18 2009-09-24 Agilent Technologies, Inc. Pressure-Reinforced Fluidic Chip
WO2009145818A1 (en) 2008-03-31 2009-12-03 Pacific Biosciences Of California, Inc Single molecule loading methods and compositions
US20090246788A1 (en) 2008-04-01 2009-10-01 Roche Nimblegen, Inc. Methods and Assays for Capture of Nucleic Acids
US8853185B2 (en) 2008-04-09 2014-10-07 Cornell University Coferons and methods of making and using them
US8911948B2 (en) 2008-04-30 2014-12-16 Integrated Dna Technologies, Inc. RNase H-based assays utilizing modified RNA monomers
EP2113255A1 (en) 2008-05-02 2009-11-04 f-star Biotechnologische Forschungs- und Entwicklungsges.m.b.H. Cytotoxic immunoglobulin
JP4582224B2 (ja) 2008-05-02 2010-11-17 ソニー株式会社 マイクロビーズ作製方法及びマイクロビーズ
EP3219812B1 (en) 2008-05-27 2020-09-02 Agilent Technologies, Inc. Hybridization compositions and methods
MX2010014364A (es) 2008-06-30 2011-08-12 Morphotek Inc Anticuerpos anti-gd2 y metodos y usos relacionados con los mismos.
GB2461546B (en) 2008-07-02 2010-07-07 Argen X Bv Antigen binding polypeptides
JP4667490B2 (ja) 2008-07-09 2011-04-13 三菱電機株式会社 加熱調理器
WO2010014903A1 (en) 2008-07-31 2010-02-04 Massachusetts Institute Of Technology Multiplexed olfactory receptor-based microsurface plasmon polariton detector
WO2010021936A1 (en) 2008-08-16 2010-02-25 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Digital pcr calibration for high throughput sequencing
US8703489B2 (en) 2008-08-22 2014-04-22 Sangamo Biosciences, Inc. Methods and compositions for targeted single-stranded cleavage and targeted integration
US8808986B2 (en) 2008-08-27 2014-08-19 Gen9, Inc. Methods and devices for high fidelity polynucleotide synthesis
US8034917B2 (en) 2008-08-28 2011-10-11 Agilent Technologies, Inc. Primer-directed chromosome painting
EP2334692B1 (en) 2008-09-05 2016-04-13 The Royal Institution for the Advancement of Learning/McGill University Rna monomers containing o-acetal levulinyl ester groups and their use in rna microarrays
WO2010028366A2 (en) 2008-09-05 2010-03-11 Life Technologies Corporation Methods and systems for nucleic acid sequencing validation, calibration and normalization
US8586310B2 (en) 2008-09-05 2013-11-19 Washington University Method for multiplexed nucleic acid patch polymerase chain reaction
US8541569B2 (en) 2008-09-06 2013-09-24 Chemgenes Corporation Phosphoramidites for synthetic RNA in the reverse direction, efficient RNA synthesis and convenient introduction of 3'-end ligands, chromophores and modifications of synthetic RNA
JP5714490B2 (ja) 2008-09-06 2015-05-07 ケムジーンズ コーポレーション Ｒｎａ合成、リバース方向での合成ｒｎａためのホスホラミダイト、及びｒｎａオリゴマーの合成のための５’から３’方向に対する結合形成によるオリゴヌクレオチドを調製する方法
US20100062495A1 (en) 2008-09-10 2010-03-11 Genscript Corporation Homologous recombination-based DNA cloning methods and compositions
US20100076183A1 (en) 2008-09-22 2010-03-25 Dellinger Douglas J Protected monomer and method of final deprotection for rna synthesis
US8213015B2 (en) 2008-09-25 2012-07-03 Agilent Technologies, Inc. Integrated flow cell with semiconductor oxide tubing
US8404445B2 (en) 2008-09-30 2013-03-26 Abbvie Inc. Antibody libraries
US20100090341A1 (en) 2008-10-14 2010-04-15 Molecular Imprints, Inc. Nano-patterned active layers formed by nano-imprint lithography
US20100301398A1 (en) 2009-05-29 2010-12-02 Ion Torrent Systems Incorporated Methods and apparatus for measuring analytes
US9080211B2 (en) 2008-10-24 2015-07-14 Epicentre Technologies Corporation Transposon end compositions and methods for modifying nucleic acids
EP2344687A4 (en) 2008-11-06 2013-11-13 Agency Science Tech & Res DEVICE FOR THE SYNTHESIS OF BIOPOLYMERS
US8357489B2 (en) 2008-11-13 2013-01-22 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Methods for detecting hepatocellular carcinoma
US20110229471A1 (en) 2008-11-26 2011-09-22 Cedars-Sinai Medical Center Methods of determining responsiveness to anti-tnf alpha therapy in inflammatory bowel disease
EP2370451B1 (en) 2008-12-02 2016-11-16 Wave Life Sciences Japan, Inc. Method for the synthesis of phosphorus atom modified nucleic acids
US8963262B2 (en) 2009-08-07 2015-02-24 Massachusettes Institute Of Technology Method and apparatus for forming MEMS device
JO3382B1 (ar) 2008-12-23 2019-03-13 Amgen Inc أجسام مضادة ترتبط مع مستقبل cgrp بشري
TW201104253A (en) 2008-12-31 2011-02-01 Nat Health Research Institutes Microarray chip and method of fabricating for the same
WO2010089412A1 (en) 2009-02-09 2010-08-12 Helmholtz Zentrum Muenchen Deutsches Forschungszentrum Fuer Gesundheit Und Umwelt (Gmbh) Repertoire of allo-restricted peptide-specific t cell receptor sequences and use thereof
EP2398915B1 (en) 2009-02-20 2016-08-24 Synthetic Genomics, Inc. Synthesis of sequence-verified nucleic acids
US8569046B2 (en) 2009-02-20 2013-10-29 Massachusetts Institute Of Technology Microarray with microchannels
US20100260739A1 (en) 2009-03-09 2010-10-14 Bioatla, Llc Mirac Proteins
WO2010115122A2 (en) 2009-04-03 2010-10-07 Illumina, Inc. Generation of uniform fragments of nucleic acids using patterned substrates
JP2010248084A (ja) 2009-04-10 2010-11-04 Invitrogen Japan Kk 新規洗浄溶媒を用いるオリゴヌクレオチド合成法
US7862716B2 (en) 2009-04-13 2011-01-04 Sielc Technologies Corporation HPLC schematic with integrated sample cleaning system
JP5597844B2 (ja) 2009-04-29 2014-10-01 テレコム・イタリア・エッセ・ピー・アー 基板上へ生物流体を付着させるための方法及び装置
WO2010127186A1 (en) 2009-04-30 2010-11-04 Prognosys Biosciences, Inc. Nucleic acid constructs and methods of use
EP2248914A1 (en) 2009-05-05 2010-11-10 Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. The use of class IIB restriction endonucleases in 2nd generation sequencing applications
US9309557B2 (en) 2010-12-17 2016-04-12 Life Technologies Corporation Nucleic acid amplification
US20100292102A1 (en) 2009-05-14 2010-11-18 Ali Nouri System and Method For Preventing Synthesis of Dangerous Biological Sequences
US20100300882A1 (en) 2009-05-26 2010-12-02 General Electric Company Devices and methods for in-line sample preparation of materials
EP2438195B1 (en) 2009-06-02 2014-12-17 The Regents of The University of California Virus discovery by sequencing and assembly of virus-derived sirnas, mirnas, pirnas
WO2010141249A2 (en) 2009-06-02 2010-12-09 Merck Sharp & Dohme Corp. Generation, characterization and uses thereof of anti-notch3 antibodies
US8309710B2 (en) 2009-06-29 2012-11-13 Agilent Technologies, Inc. Use of N-alkyl imidazole for sulfurization of oligonucleotides with an acetyl disulfide
US8642755B2 (en) 2009-06-30 2014-02-04 Agilent Technologies, Inc. Use of thioacetic acid derivatives in the sulfurization of oligonucleotides with phenylacetyl disulfide
GB0912909D0 (en) 2009-07-23 2009-08-26 Olink Genomics Ab Probes for specific analysis of nucleic acids
US8329208B2 (en) 2009-07-28 2012-12-11 Methylation Sciences International Srl Pharmacokinetics of S-adenosylmethionine formulations
CA2769302C (en) 2009-07-30 2018-10-16 F. Hoffmann-La Roche Ag A set of oligonucleotide probes as well as methods and uses related thereto
KR101606236B1 (ko) 2009-08-19 2016-03-24 메르크 파텐트 게엠베하 Ｆｆｐｅ 물질 내의 인테그린 복합체의 검출용 항체
ES2562159T3 (es) 2009-08-20 2016-03-02 Population Genetics Technologies Ltd. Composiciones y métodos para el reordenamiento de ácido nucleico molecular
US8476598B1 (en) 2009-08-31 2013-07-02 Sionyx, Inc. Electromagnetic radiation imaging devices and associated methods
US20110082055A1 (en) 2009-09-18 2011-04-07 Codexis, Inc. Reduced codon mutagenesis
US20120184724A1 (en) 2009-09-22 2012-07-19 Agilent Technologies, Inc. Protected monomers and methods of deprotection for rna synthesis
WO2011038241A1 (en) 2009-09-25 2011-03-31 President And Fellows Of Harvard College Nucleic acid amplification and sequencing by synthesis with fluorogenic nucleotides
US8975019B2 (en) 2009-10-19 2015-03-10 University Of Massachusetts Deducing exon connectivity by RNA-templated DNA ligation/sequencing
US8389689B2 (en) 2009-10-28 2013-03-05 Janssen Biotech, Inc. Anti-GLP-1R antibodies and their uses
WO2011053957A2 (en) 2009-11-02 2011-05-05 Gen9, Inc. Compositions and methods for the regulation of multiple genes of interest in a cell
WO2011056872A2 (en) 2009-11-03 2011-05-12 Gen9, Inc. Methods and microfluidic devices for the manipulation of droplets in high fidelity polynucleotide assembly
US20110114549A1 (en) 2009-11-13 2011-05-19 Agilent Technolgies, Inc. Microfluidic device comprising separation columns
ES2574055T3 (es) 2009-11-25 2016-06-14 Gen9, Inc. Métodos y aparatos para la reducción de errores en el ADN basada en un chip
WO2011066185A1 (en) 2009-11-25 2011-06-03 Gen9, Inc. Microfluidic devices and methods for gene synthesis
US8500979B2 (en) 2009-12-31 2013-08-06 Intel Corporation Nanogap chemical and biochemical sensors
WO2011085075A2 (en) 2010-01-07 2011-07-14 Gen9, Inc. Assembly of high fidelity polynucleotides
US9758817B2 (en) 2010-01-13 2017-09-12 Agilent Technologies, Inc. Method for identifying a nucleic acid in a sample
KR101230350B1 (ko) 2010-01-27 2013-02-06 주식회사 엘지화학 구조적 안정성이 우수한 전지팩
KR20110094878A (ko) 2010-02-18 2011-08-24 삼성전자주식회사 올리고머 어레이 제조용 조성물 및 올리고머 어레이 제조 방법
GB201003036D0 (en) 2010-02-23 2010-04-07 Fermentas Uab Restriction endonucleases and their applications
US20120027786A1 (en) 2010-02-23 2012-02-02 Massachusetts Institute Of Technology Genetically programmable pathogen sense and destroy
US8716467B2 (en) 2010-03-03 2014-05-06 Gen9, Inc. Methods and devices for nucleic acid synthesis
WO2011109031A1 (en) 2010-03-05 2011-09-09 Synthetic Genomics, Inc. Methods for cloning and manipulating genomes
EP2542681B1 (en) 2010-04-09 2019-02-27 The Catholic University Of America Protein and nucleic acid delivery vehicles, components and mechanisms thereof
WO2011130223A1 (en) 2010-04-12 2011-10-20 Mayo Foundation For Medical Education And Research System and method for alleviating freezing gait and gait hypokinesia in users with extrapyramidal disorders
WO2011143556A1 (en) 2010-05-13 2011-11-17 Gen9, Inc. Methods for nucleotide sequencing and high fidelity polynucleotide synthesis
WO2011150168A1 (en) 2010-05-28 2011-12-01 Gen9, Inc. Methods and devices for in situ nucleic acid synthesis
KR101339064B1 (ko) 2010-05-28 2014-01-06 한양대학교 에리카산학협력단 바이오칩을 이용하여 암호를 해독하는 방법 및 이를 이용하여 바코드의 위조 여부를 확인하는 방법
GB2481425A (en) 2010-06-23 2011-12-28 Iti Scotland Ltd Method and device for assembling polynucleic acid sequences
CA2805320A1 (en) 2010-07-28 2012-02-02 Immunocore Ltd T cell receptors
PT2623613T (pt) 2010-09-21 2016-10-11 Population Genetics Tech Ltd Aumento da confiança da designação de alelos por contagem molecular
US8715933B2 (en) 2010-09-27 2014-05-06 Nabsys, Inc. Assay methods using nicking endonucleases
WO2012045001A2 (en) 2010-09-30 2012-04-05 Vanderbilt University Influenza virus antibodies and immunogens and uses therefor
US9689012B2 (en) 2010-10-12 2017-06-27 Cornell University Method of dual-adapter recombination for efficient concatenation of multiple DNA fragments in shuffled or specified arrangements
EP2630264A4 (en) 2010-10-22 2014-04-02 Harvard College Orthogonal amplification and assembly of nucleic acid sequences
EP2635679B1 (en) 2010-11-05 2017-04-19 Illumina, Inc. Linking sequence reads using paired code tags
JP6118725B2 (ja) 2010-11-12 2017-04-19 ジェン９・インコーポレイテッドＧｅｎ９，ＩＮＣ． 核酸合成のための方法およびデバイス
US10457935B2 (en) 2010-11-12 2019-10-29 Gen9, Inc. Protein arrays and methods of using and making the same
CN110079588B (zh) 2010-12-17 2024-03-15 生命技术公司 用于核酸扩增的方法、组合物、系统、仪器和试剂盒
US9487807B2 (en) 2010-12-27 2016-11-08 Ibis Biosciences, Inc. Compositions and methods for producing single-stranded circular DNA
US20120164633A1 (en) 2010-12-27 2012-06-28 Ibis Biosciences, Inc. Digital droplet sequencing
US9683054B2 (en) 2010-12-31 2017-06-20 BioAlta, LLC Express humanization of antibodies
US20140178992A1 (en) 2011-03-30 2014-06-26 National Center For Geriatrics And Gerontology Membrane-separation-type culture device, membrane-separation-type culture kit, stem cell separation method using same, and separation membrane
US10131903B2 (en) 2011-04-01 2018-11-20 The Regents Of The University Of California Microfluidic platform for synthetic biology applications
US9384920B1 (en) 2011-04-04 2016-07-05 Eric J. Bakulich Locking knob
US20140357497A1 (en) 2011-04-27 2014-12-04 Kun Zhang Designing padlock probes for targeted genomic sequencing
US8722585B2 (en) 2011-05-08 2014-05-13 Yan Wang Methods of making di-tagged DNA libraries from DNA or RNA using double-tagged oligonucleotides
EP2710172B1 (en) 2011-05-20 2017-03-29 Fluidigm Corporation Nucleic acid encoding reactions
AU2012267220B2 (en) 2011-06-10 2016-04-21 Bright Devices Group Pty Ltd Freezing of gait cue apparatus
US9752176B2 (en) 2011-06-15 2017-09-05 Ginkgo Bioworks, Inc. Methods for preparative in vitro cloning
CN107857810A (zh) 2011-06-21 2018-03-30 非营利性组织佛兰芒综合大学生物技术研究所 针对gpcr:g蛋白复合物的结合结构域及来自其的用途
US9487824B2 (en) 2011-06-28 2016-11-08 Igor Kutyavin Methods and compositions for enrichment of nucleic acids in mixtures of highly homologous sequences
US20130045483A1 (en) 2011-07-01 2013-02-21 Whitehead Institute For Biomedical Research Yeast cells expressing amyloid beta and uses therefor
US9139874B2 (en) 2011-07-07 2015-09-22 Life Technologies Corporation Bi-directional sequencing compositions and methods
US20130017978A1 (en) 2011-07-11 2013-01-17 Finnzymes Oy Methods and transposon nucleic acids for generating a dna library
WO2013010062A2 (en) 2011-07-14 2013-01-17 Life Technologies Corporation Nucleic acid complexity reduction
LT2944693T (lt) 2011-08-26 2019-08-26 Gen9, Inc. Kompozicijos ir būdai, skirti nukleorūgščių didelio tikslumo sąrankai
US20150203839A1 (en) 2011-08-26 2015-07-23 Gen9, Inc. Compositions and Methods for High Fidelity Assembly of Nucleic Acids
EP2751729B1 (en) 2011-09-01 2020-10-21 Genome Compiler Corporation System for polynucleotide construct design, visualization and transactions to manufacture the same
EP2753714B1 (en) 2011-09-06 2017-04-12 Gen-Probe Incorporated Circularized templates for sequencing
US8840981B2 (en) 2011-09-09 2014-09-23 Eastman Kodak Company Microfluidic device with multilayer coating
EP3964285A1 (en) 2011-09-26 2022-03-09 Thermo Fisher Scientific Geneart GmbH High efficiency, small volume nucleic acid synthesis
WO2013055822A2 (en) 2011-10-11 2013-04-18 Life Technologies Corporation Systems and methods for analysis and interpretation of nucleic acid sequence data
WO2013059746A1 (en) 2011-10-19 2013-04-25 Nugen Technologies, Inc. Compositions and methods for directional nucleic acid amplification and sequencing
US8987174B2 (en) 2011-10-28 2015-03-24 Prognosys Biosciences, Inc. Methods for manufacturing molecular arrays
US8815782B2 (en) 2011-11-11 2014-08-26 Agilent Technologies, Inc. Use of DNAzymes for analysis of an RNA sample
US8450107B1 (en) 2011-11-30 2013-05-28 The Broad Institute Inc. Nucleotide-specific recognition sequences for designer TAL effectors
US20130137173A1 (en) 2011-11-30 2013-05-30 Feng Zhang Nucleotide-specific recognition sequences for designer tal effectors
EP2599785A1 (en) 2011-11-30 2013-06-05 Agilent Technologies, Inc. Novel methods for the synthesis and purification of oligomers
US9279154B2 (en) 2011-12-21 2016-03-08 Illumina, Inc. Apparatus and methods for kinetic analysis and determination of nucleic acid sequences
WO2013093693A1 (en) 2011-12-22 2013-06-27 Rinat Neuroscience Corp. Staphylococcus aureus specific antibodies and uses thereof
WO2013101783A2 (en) 2011-12-30 2013-07-04 Bio-Rad Laboratories, Inc. Methods and compositions for performing nucleic acid amplification reactions
WO2013101896A1 (en) 2011-12-30 2013-07-04 Quest Diagnostics Investments Incorporated Nucleic acid analysis using emulsion pcr
WO2013116771A1 (en) 2012-02-01 2013-08-08 Synthetic Genomics, Inc. Materials and methods for the synthesis of error-minimized nucleic acid molecules
EP2820174B1 (en) 2012-02-27 2019-12-25 The University of North Carolina at Chapel Hill Methods and uses for molecular tags
EP2820155B1 (en) 2012-02-28 2017-07-26 Population Genetics Technologies Ltd. Method for attaching a counter sequence to a nucleic acid sample
WO2013134881A1 (en) 2012-03-14 2013-09-19 Innovative Targeting Solutions Inc. Generating targeted sequence diversity in fusion proteins
US9150853B2 (en) 2012-03-21 2015-10-06 Gen9, Inc. Methods for screening proteins using DNA encoded chemical libraries as templates for enzyme catalysis
US10286129B2 (en) 2012-03-28 2019-05-14 Kci Licensing, Inc. Reduced-pressure systems, dressings, and methods facilitating separation of electronic and clinical component parts
US9732384B2 (en) 2012-04-02 2017-08-15 Lux Bio Group, Inc. Apparatus and method for molecular separation, purification, and sensing
EP2836821B1 (en) 2012-04-10 2018-09-26 The Trustees of Princeton University Ultra-sensitive sensor
US20150353921A9 (en) 2012-04-16 2015-12-10 Jingdong Tian Method of on-chip nucleic acid molecule synthesis
US20130281308A1 (en) 2012-04-24 2013-10-24 Gen9, Inc. Methods for sorting nucleic acids and preparative in vitro cloning
EP4001427A1 (en) 2012-04-24 2022-05-25 Gen9, Inc. Methods for sorting nucleic acids and multiplexed preparative in vitro cloning
MX2019001355A (es) 2012-05-10 2023-01-17 Bioatla Llc Anticuerpos monoclonales multiespecíficos.
CN104736722B (zh) 2012-05-21 2018-08-07 斯克利普斯研究所 样品制备方法
KR20150016572A (ko) 2012-06-01 2015-02-12 유럽피안 몰레큘러 바이올로지 래보러토리 Dna 디지털 정보의 고-용량 저장
US10308979B2 (en) 2012-06-01 2019-06-04 Agilent Technologies, Inc. Target enrichment and labeling for multi-kilobase DNA
WO2013188037A2 (en) 2012-06-11 2013-12-19 Agilent Technologies, Inc Method of adaptor-dimer subtraction using a crispr cas6 protein
CN104350161A (zh) 2012-06-14 2015-02-11 弗莱德哈钦森癌症研究中心 用于核酸分子中的敏感突变检测的组合物和方法
EP2864531B2 (en) 2012-06-25 2022-08-03 Gen9, Inc. Methods for nucleic acid assembly and high throughput sequencing
US9255245B2 (en) 2012-07-03 2016-02-09 Agilent Technologies, Inc. Sample probes and methods for sampling intracellular material
SG10201610861XA (en) 2012-07-03 2017-02-27 Integrated Dna Tech Inc Tm-enhanced blocking oligonucleotides and baits for improved target enrichment and reduced off-target selection
WO2014011800A1 (en) 2012-07-10 2014-01-16 Pivot Bio, Inc. Methods for multipart, modular and scarless assembly of dna molecules
WO2014012071A1 (en) 2012-07-12 2014-01-16 Massachusetts Institute Of Technology Methods and apparatus for assembly
JP6239813B2 (ja) 2012-07-18 2017-11-29 株式会社Ｓｃｒｅｅｎセミコンダクターソリューションズ 基板処理装置および基板処理方法
KR101743846B1 (ko) 2012-07-19 2017-06-05 프레지던트 앤드 펠로우즈 오브 하바드 칼리지 핵산을 이용하여 정보를 저장하는 방법
US20150191524A1 (en) 2012-07-27 2015-07-09 The Board Of Trustees Of The University Of Illinoi Engineering t cell receptors
WO2014021938A1 (en) 2012-08-02 2014-02-06 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Methods and apparatus for nucleic acid synthesis using oligo-templated polymerization
SG10201701022VA (en) 2012-08-16 2017-04-27 Synthetic Genomics Inc Digital to biological converter
CA2883454C (en) 2012-08-31 2022-10-18 The Scripps Research Institute Methods and compositions related to modulators of eukaryotic cells
US9328376B2 (en) 2012-09-05 2016-05-03 Bio-Rad Laboratories, Inc. Systems and methods for stabilizing droplets
US9133510B2 (en) 2012-10-15 2015-09-15 Life Technologies Corporation Compositions, methods, systems and kits for target nucleic acid enrichment
KR20140048733A (ko) 2012-10-16 2014-04-24 삼성전자주식회사 다중 웰 플레이트 및 상기 다중 웰 플레이트를 이용한 표적 물질 분석 방법
US9410173B2 (en) 2012-10-24 2016-08-09 Clontech Laboratories, Inc. Template switch-based methods for producing a product nucleic acid
EP2928500B1 (en) 2012-12-04 2019-03-06 Phosphorex Inc. Microparticles and nanoparticles having negative surface charges
US10072260B2 (en) 2012-12-06 2018-09-11 Agilent Technologies, Inc. Target enrichment of randomly sheared genomic DNA fragments
JP6745599B2 (ja) 2012-12-06 2020-08-26 アジレント・テクノロジーズ・インクＡｇｉｌｅｎｔ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ， Ｉｎｃ． 分子の作製
SG10202009015SA (en) 2012-12-10 2020-10-29 Resolution Bioscience Inc Methods for targeted genomic analysis
US9976162B2 (en) 2012-12-10 2018-05-22 Agilent Technologies, Inc. Pairing code directed assembly
WO2014093694A1 (en) 2012-12-12 2014-06-19 The Broad Institute, Inc. Crispr-cas nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation in eukaryotes
SG10201707011PA (en) 2013-02-28 2017-10-30 Univ Nanyang Tech Method of manufacturing a device for supporting biological material growth and device therefrom
US10017820B2 (en) 2013-03-05 2018-07-10 Agilent Technologies, Inc. Detection of genomic rearrangements by sequence capture
US9580746B2 (en) 2013-03-05 2017-02-28 Agilent Technologies, Inc. Synthesis of long fish probes
US10053719B2 (en) 2013-03-13 2018-08-21 Gen9, Inc. Compositions and methods for synthesis of high fidelity oligonucleotides
WO2014160004A1 (en) 2013-03-13 2014-10-02 Gen9, Inc. Compositions, methods and apparatus for oligonucleotides synthesis
US20140274741A1 (en) 2013-03-15 2014-09-18 The Translational Genomics Research Institute Methods to capture and sequence large fragments of dna and diagnostic methods for neuromuscular disease
JP2016517441A (ja) 2013-03-15 2016-06-16 ジェネンテック， インコーポレイテッド 抗ＣＲＴｈ２抗体及び使用方法
CN105209475B (zh) 2013-03-15 2018-06-12 Gen9股份有限公司 多重核酸合成的组合物和方法
US20140274729A1 (en) 2013-03-15 2014-09-18 Nugen Technologies, Inc. Methods, compositions and kits for generation of stranded rna or dna libraries
EP3795696B1 (en) 2013-03-15 2023-04-26 The Board of Trustees of the Leland Stanford Junior University Identification and use of circulating nucleic acid tumor markers
US10683536B2 (en) 2013-04-02 2020-06-16 Molecular Assemblies, Inc. Reusable initiators for synthesizing nucleic acids
US9279149B2 (en) 2013-04-02 2016-03-08 Molecular Assemblies, Inc. Methods and apparatus for synthesizing nucleic acids
US9771613B2 (en) 2013-04-02 2017-09-26 Molecular Assemblies, Inc. Methods and apparatus for synthesizing nucleic acid
US20150293102A1 (en) 2013-04-13 2015-10-15 Jung-Uk Shim Detecting low-abundant analyte in microfluidic droplets
ITRM20130278A1 (it) 2013-05-10 2014-11-11 Consiglio Nazionale Ricerche Procedimento di fabbricazione di film autoassemblati di copolimeri a blocchi
US10654906B2 (en) 2013-06-26 2020-05-19 Guangdong Xiangxue Life Sciences, Ltd. High-stability T-cell receptor and preparation method and application thereof
US20150010953A1 (en) 2013-07-03 2015-01-08 Agilent Technologies, Inc. Method for producing a population of oligonucleotides that has reduced synthesis errors
KR20150005062A (ko) 2013-07-04 2015-01-14 삼성전자주식회사 미니-코어를 사용하는 프로세서
US10421957B2 (en) 2013-07-29 2019-09-24 Agilent Technologies, Inc. DNA assembly using an RNA-programmable nickase
EP3027771B1 (en) 2013-07-30 2019-01-16 Gen9, Inc. Methods for the production of long length clonal sequence verified nucleic acid constructs
CN204356318U (zh) * 2014-08-05 2015-05-27 特韦斯特生物科学公司 三维微流体装置
US9589445B2 (en) 2013-08-07 2017-03-07 Nike, Inc. Activity recognition with activity reminders
CN104371019B (zh) 2013-08-13 2019-09-10 鸿运华宁（杭州）生物医药有限公司 一种能与glp-1r特异性结合的抗体及其与glp-1的融合蛋白质
GB201314721D0 (en) 2013-08-16 2013-10-02 Almagen Ltd A method of selectively masking one or more sites on a surface and a method of synthesising an array of molecules
EP3965111B8 (en) 2013-08-30 2025-06-11 Personalis, Inc. Methods for genomic analysis
KR102362030B1 (ko) 2013-09-14 2022-02-10 켐진스 코포레이션 역방향 접근법을 사용한 긴 rna의 고효율 합성
WO2015040075A1 (en) 2013-09-18 2015-03-26 Genome Research Limited Genomic screening methods using rna-guided endonucleases
EP3055676A1 (en) 2013-10-07 2016-08-17 Cellular Research, Inc. Methods and systems for digitally counting features on arrays
CA2929108A1 (en) 2013-10-29 2015-05-07 Longhorn Vaccines And Diagnostics, Llc Next generation genomic sequencing methods
CA2963072A1 (en) 2013-10-29 2015-05-07 Milbat - Giving Quality To Life Walker-assist device
WO2015081142A1 (en) 2013-11-26 2015-06-04 Xenco Medical, Llc Lock and release implant delivery system
US20170175110A1 (en) 2013-11-27 2017-06-22 Gen9, Inc. Libraries of Nucleic Acids and Methods for Making the Same
TWI664331B (zh) 2013-12-04 2019-07-01 日商中外製藥股份有限公司 因應化合物濃度使抗原結合能力變化的抗原結合分子及其資料庫
WO2015081440A1 (en) 2013-12-04 2015-06-11 Innovative Targeting Solutions Inc. G-protein coupled receptor agonists and methods
WO2015089053A1 (en) 2013-12-09 2015-06-18 Integrated Dna Technologies, Inc. Long nucleic acid sequences containing variable regions
KR20240017102A (ko) 2013-12-17 2024-02-06 제넨테크, 인크. Pd-1 축 결합 길항제 및 탁산을 이용한 암 치료 방법
GB2521387B (en) 2013-12-18 2020-05-27 Ge Healthcare Uk Ltd Oligonucleotide data storage on solid supports
WO2015103225A1 (en) 2013-12-31 2015-07-09 Illumina, Inc. Addressable flow cell using patterned electrodes
US9587268B2 (en) 2014-01-29 2017-03-07 Agilent Technologies Inc. Fast hybridization for next generation sequencing target enrichment
US10287627B2 (en) 2014-02-08 2019-05-14 The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate Multiplexed linking PCR
EP3114231B1 (en) 2014-03-03 2019-01-02 Swift Biosciences, Inc. Enhanced adaptor ligation
KR102290829B1 (ko) 2014-03-14 2021-08-18 이뮤노코어 리미티드 Tcr 라이브러리
US10675618B2 (en) 2014-03-27 2020-06-09 University Of Maryland, College Park Integration of ex situ fabricated porous polymer monoliths into fluidic chips
US10190161B2 (en) 2014-04-03 2019-01-29 Stmicroelectronics S.R.L. Apparatus and method for nucleic acid sequencing based on nanowire detectors
US20170037790A1 (en) 2014-04-15 2017-02-09 Volvo Construction Equipment Ab Device for controlling engine and hydraulic pump of construction equipment and control method therefor
GB201407852D0 (en) 2014-05-02 2014-06-18 Iontas Ltd Preparation of libraries od protein variants expressed in eukaryotic cells and use for selecting binding molecules
WO2015175832A1 (en) 2014-05-16 2015-11-19 Illumina, Inc. Nucleic acid synthesis techniques
US20150361423A1 (en) 2014-06-16 2015-12-17 Agilent Technologies, Inc. High throughput gene assembly in droplets
US20150361422A1 (en) 2014-06-16 2015-12-17 Agilent Technologies, Inc. High throughput gene assembly in droplets
US10870845B2 (en) 2014-07-01 2020-12-22 Global Life Sciences Solutions Operations UK Ltd Methods for capturing nucleic acids
US10472620B2 (en) 2014-07-01 2019-11-12 General Electric Company Method, substrate and device for separating nucleic acids
US20170198268A1 (en) 2014-07-09 2017-07-13 Gen9, Inc. Compositions and Methods for Site-Directed DNA Nicking and Cleaving
ES3047792T3 (en) 2014-07-14 2025-12-04 Univ California Crispr/cas transcriptional modulation
WO2016011174A1 (en) * 2014-07-15 2016-01-21 Life Technologies Corporation Compositions and methods for nucleic acid assembly
WO2016022557A1 (en) 2014-08-05 2016-02-11 Twist Bioscience Corporation Cell free cloning of nucleic acids
ES2880335T3 (es) 2014-09-09 2021-11-24 Igenomx Int Genomics Corporation Métodos y composiciones para la preparación rápida de bibliotecas de ácidos nucleicos
WO2016053883A1 (en) 2014-10-03 2016-04-07 Life Technologies Corporation Detection, identification, validation and enrichment of target nucleic acids
CN113930455A (zh) 2014-10-09 2022-01-14 生命技术公司 Crispr寡核苷酸和基因剪辑
JP6722179B2 (ja) 2014-10-10 2020-07-15 インヴァイティ コーポレイションＩｎｖｉｔａｅ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ 多重キャプチャー反応のためのユニバーサルブロッキングオリゴシステム及び改良されたハイブリダイゼーションキャプチャー方法
CA2964985A1 (en) 2014-10-18 2016-04-21 Girik MALIK A biomolecule based data storage system
WO2016065056A1 (en) 2014-10-22 2016-04-28 The Regents Of The University Of California High definition microdroplet printer
US9890417B2 (en) 2014-11-03 2018-02-13 Agilent Technologies, Inc. Signal amplification of fluorescence in situ hybridization
US10233490B2 (en) 2014-11-21 2019-03-19 Metabiotech Corporation Methods for assembling and reading nucleic acid sequences from mixed populations
CN104562213A (zh) 2014-12-26 2015-04-29 北京诺禾致源生物信息科技有限公司 扩增子文库及其构建方法
US10669304B2 (en) 2015-02-04 2020-06-02 Twist Bioscience Corporation Methods and devices for de novo oligonucleic acid assembly
CA3253836A1 (en) 2015-02-04 2025-12-01 Twist Bioscience Corporation Compositions and methods for synthetic gene assembly
US9834774B2 (en) 2015-02-11 2017-12-05 Agilent Technologies, Inc. Methods and compositions for rapid seamless DNA assembly
WO2016130868A2 (en) 2015-02-13 2016-08-18 Vaccine Research Institute Of San Diego Materials and methods to analyze rna isoforms in transcriptomes
CN104734848A (zh) 2015-03-02 2015-06-24 郑州轻工业学院 基于重组dna技术对信息进行加密与隐藏的方法及应用
EA201792084A8 (ru) 2015-04-01 2019-06-28 Зе Скриппс Рисёрч Инститьют Способы и композиции, связанные с полипептидами - агонистами gpcr
EP3280723B1 (en) 2015-04-08 2021-01-06 Polyphor AG Backbone-cyclized peptidomimetics
WO2016164779A1 (en) 2015-04-10 2016-10-13 University Of Washington Integrated system for nucleic acid-based storage of digital data
US10125198B2 (en) 2015-04-17 2018-11-13 Distributed Bio, Inc. Method for mass humanization of non-human antibodies
US9981239B2 (en) 2015-04-21 2018-05-29 Twist Bioscience Corporation Devices and methods for oligonucleic acid library synthesis
EP3288973B1 (en) 2015-04-30 2021-10-20 AbCheck s.r.o. Method for mass humanization of rabbit antibodies
WO2016183100A1 (en) 2015-05-11 2016-11-17 Twist Bioscience Corporation Compositions and methods for nucleic acid amplification
KR20180030092A (ko) 2015-07-13 2018-03-21 프레지던트 앤드 펠로우즈 오브 하바드 칼리지 핵산을 사용하여 검색 가능한 정보를 저장하는 방법
US10793851B2 (en) 2015-08-04 2020-10-06 The Regents Of The University Of Colorado, A Body Corporate Multiplexed binary assembly and quantitative tracking of bacterial populations
KR20180050411A (ko) 2015-09-18 2018-05-14 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 올리고핵산 변이체 라이브러리 및 그의 합성
KR102794025B1 (ko) 2015-09-22 2025-04-09 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 핵산 합성을 위한 가요성 기판
US20180320166A1 (en) 2015-10-01 2018-11-08 University Of Washington Multiplex pairwise assembly of dna oligonucleotides
US20170141793A1 (en) 2015-11-13 2017-05-18 Microsoft Technology Licensing, Llc Error correction for nucleotide data stores
CN115920796A (zh) 2015-12-01 2023-04-07 特韦斯特生物科学公司 功能化表面及其制备
PT3387152T (pt) 2015-12-08 2022-04-19 Twinstrand Biosciences Inc Adaptadores, métodos e composições melhorados para sequenciamento duplex
JP7308505B2 (ja) 2016-01-08 2023-07-14 マキシオン セラピューティクス リミテッド 多様性を変化させた足場ドメインを有する結合メンバー
GB201604492D0 (en) 2016-03-16 2016-04-27 Immatics Biotechnologies Gmbh Transfected t-cells and t-cell receptors for use in immunotherapy against cancers
SG11201811025VA (en) 2016-06-10 2019-01-30 Twist Bioscience Corp Systems and methods for automated annotation and screening of biological sequences
US11708574B2 (en) 2016-06-10 2023-07-25 Myriad Women's Health, Inc. Nucleic acid sequencing adapters and uses thereof
WO2018026920A1 (en) 2016-08-03 2018-02-08 Twist Bioscience Corporation Textured surfaces for polynucleotide synthesis
EP3500672A4 (en) 2016-08-22 2020-05-20 Twist Bioscience Corporation NOVO SYNTHESIZED NUCLEIC ACID BANKS
JP7160482B2 (ja) 2016-09-02 2022-10-25 レンティジェン・テクノロジー・インコーポレイテッド Ｄｕｏｃａｒを用いてがんを処置するための組成物および方法
KR102217487B1 (ko) 2016-09-21 2021-02-23 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 핵산 기반 데이터 저장
KR102569164B1 (ko) 2016-11-18 2023-08-21 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 조절된 화학량론을 갖는 폴리뉴클레오티드 라이브러리 및 이의 합성
KR102514213B1 (ko) 2016-12-16 2023-03-27 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 면역 시냅스의 변이체 라이브러리 및 그의 합성
KR102706743B1 (ko) 2016-12-21 2024-09-19 세파론 엘엘씨 인간 il-15에 특이적으로 결합하는 항체 및 이의 용도
EP4556433A3 (en) 2017-02-22 2025-08-06 Twist Bioscience Corporation Nucleic acid based data storage
AU2018234629A1 (en) 2017-03-15 2019-10-17 Twist Bioscience Corporation Variant libraries of the immunological synapse and synthesis thereof
WO2018170164A1 (en) 2017-03-15 2018-09-20 Twist Bioscience Corporation De novo synthesized combinatorial nucleic acid libraries
KR102228055B1 (ko) 2017-03-23 2021-03-16 큐바이오틱스 피티와이 리미티드 종양의 치료 또는 예방을 위한 병용 요법
US11274344B2 (en) 2017-03-30 2022-03-15 Grail, Inc. Enhanced ligation in sequencing library preparation
DK3872187T3 (da) 2017-04-23 2022-12-05 Illumina Cambridge Ltd Sammensætninger og fremgangsmåder til forbedring af prøveidentificering i indekserede nukleinsyrebiblioteker
CN110832087B (zh) 2017-05-08 2025-03-18 伊鲁米那股份有限公司 用于多核苷酸样品的索引的通用短衔接子
WO2018231864A1 (en) 2017-06-12 2018-12-20 Twist Bioscience Corporation Methods for seamless nucleic acid assembly
SG11201912057RA (en) 2017-06-12 2020-01-30 Twist Bioscience Corp Methods for seamless nucleic acid assembly
JP7015388B2 (ja) 2017-07-18 2022-02-02 インベスティガシオネス・フォレスタレス・ビオフォレスト・エス・アー 電気膜プロセスにおける非対称極性反転のための方法とデバイス
GB2581620A (en) 2017-09-11 2020-08-26 Twist Bioscience Corp GPCR binding proteins and synthesis thereof
KR102889470B1 (ko) 2017-10-20 2025-11-21 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰
US20200299684A1 (en) 2017-10-27 2020-09-24 Twist Bioscience Corporation Systems and methods for polynucleotide scoring
US11427867B2 (en) 2017-11-29 2022-08-30 Xgenomes Corp. Sequencing by emergence
CN112041438B (zh) * 2018-01-04 2025-05-23 特韦斯特生物科学公司 基于dna的数字信息存储
US10722916B2 (en) 2018-01-19 2020-07-28 Caulk Garbage Can LLC Caulk gun attachment for wiping excess caulk
CN112639130B (zh) 2018-05-18 2024-08-09 特韦斯特生物科学公司 用于核酸杂交的多核苷酸、试剂和方法
EP3814494B1 (en) 2018-06-29 2023-11-01 Thermo Fisher Scientific GENEART GmbH High throughput assembly of nucleic acid molecules
US10963953B2 (en) 2018-10-10 2021-03-30 Alliance Inspection Management, LLC Reserve management for continuous bidding portal
US10969965B2 (en) 2018-12-24 2021-04-06 Western Digital Technologies, Inc. Dynamic performance density tuning for data storage device
CN119708086A (zh) 2018-12-26 2025-03-28 特韦斯特生物科学公司 高度准确的从头多核苷酸合成
KR20210148122A (ko) 2019-02-25 2021-12-07 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 차세대 시퀀싱을 위한 조성물 및 방법
KR20210144698A (ko) 2019-02-26 2021-11-30 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 항체 최적화를 위한 변이 핵산 라이브러리
SG11202109322TA (en) 2019-02-26 2021-09-29 Twist Bioscience Corp Variant nucleic acid libraries for glp1 receptor
US20220243195A1 (en) 2019-06-21 2022-08-04 Twist Bioscience Corporation Barcode-based nucleic acid sequence assembly
CA3144644A1 (en) 2019-06-21 2020-12-24 Twist Bioscience Corporation Barcode-based nucleic acid sequence assembly
WO2021016395A1 (en) 2019-07-22 2021-01-28 Igenomx International Genomics Corporation Methods and compositions for high throughput sample preparation using double unique dual indexing
WO2021046655A1 (en) 2019-09-13 2021-03-18 University Health Network Detection of circulating tumor dna using double stranded hybrid capture
US12173282B2 (en) 2019-09-23 2024-12-24 Twist Bioscience, Inc. Antibodies that bind CD3 epsilon
US12091777B2 (en) 2019-09-23 2024-09-17 Twist Bioscience Corporation Variant nucleic acid libraries for CRTH2
WO2021119193A2 (en) 2019-12-09 2021-06-17 Twist Bioscience Corporation Variant nucleic acid libraries for adenosine receptors
JP2023523335A (ja) 2020-04-27 2023-06-02 ツイスト バイオサイエンス コーポレーション コロナウイルス用の変異体核酸ライブラリー相互参照
US20220032256A1 (en) 2020-07-07 2022-02-03 Twist Bioscience Corporation Devices and methods for light-directed polymer synthesis
WO2022046797A1 (en) 2020-08-25 2022-03-03 Twist Bioscience Corporation Compositions and methods for library sequencing
KR20230074151A (ko) 2020-08-26 2023-05-26 트위스트 바이오사이언스 코포레이션 Glp1r 변이체에 관한 방법 및 조성물
CA3190917A1 (en) 2020-08-28 2022-03-03 Andres Fernandez Devices and methods for synthesis
EP4225912A1 (en) 2020-10-05 2023-08-16 Twist Bioscience Corporation Hybridization methods and reagents
US11970697B2 (en) 2020-10-19 2024-04-30 Twist Bioscience Corporation Methods of synthesizing oligonucleotides using tethered nucleotides
US20220206001A1 (en) 2020-10-22 2022-06-30 Twist Bioscience Corporation Methods and systems for detecting coronavirus
US20220135965A1 (en) 2020-10-26 2022-05-05 Twist Bioscience Corporation Libraries for next generation sequencing
WO2022098662A2 (en) 2020-11-03 2022-05-12 Twist Bioscience Corporation Methods and compositions relating to chemokine receptor variants
US12202905B2 (en) 2021-01-21 2025-01-21 Twist Bioscience Corporation Methods and compositions relating to adenosine receptors
WO2022178137A1 (en) 2021-02-19 2022-08-25 Twist Bioscience Corporation Libraries for identification of genomic variants
EP4314075A4 (en) 2021-03-24 2025-04-09 Twist Bioscience Corporation VARIANT NUCLEIC ACID BANKS FOR CD3
US20220323924A1 (en) 2021-03-24 2022-10-13 Twist Bioscience Corporation Electrochemical polynucleotide synthesis
EP4314074A4 (en) 2021-03-24 2025-09-03 Twist Bioscience Corp NUCLEIC ACID VARIANT BANKS FOR TIGIT
CA3214947A1 (en) 2021-04-09 2022-10-13 Twist Bioscience Corporation Libraries for mutational analysis
EP4334515A1 (en) 2021-05-03 2024-03-13 Twist Bioscience Corporation Variant nucleic acid libraries for glycans
US20220356468A1 (en) 2021-05-03 2022-11-10 Twist Bioscience Corporation Variant nucleic acid libraries for ion channels
US12201857B2 (en) 2021-06-22 2025-01-21 Twist Bioscience Corporation Methods and compositions relating to covid antibody epitopes
WO2023023183A2 (en) 2021-08-17 2023-02-23 Twist Bioscience Corporation Sars-cov-2 antibodies and related compositions and methods of use
US20230192819A1 (en) 2021-08-17 2023-06-22 Twist Bioscience Corporation Single domain antibodies for sars-cov-2
US20230115861A1 (en) 2021-08-19 2023-04-13 Twist Bioscience Corporation Methods and compositions relating to covalently closed nucleic acids

Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2015021080A2 (en) 2013-08-05 2015-02-12 Twist Bioscience Corporation De novo synthesized gene libraries
US20150099870A1 (en) 2013-10-04 2015-04-09 Trustees Of Tufts College Glycosylation Reactions Using Phenyl(trifluoroethyl)iodonium Salts

Non-Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Acid binding and detritylation during oligonucleotide Synthesis, Nucleic Acids Research, 1996, Vol. 24, No. 15, 3048-3052

Also Published As

Publication number Publication date
JP7066840B2 (ja) 2022-05-13
US11745159B2 (en) 2023-09-05
EP3697529A4 (en) 2021-08-04
EP3697529A1 (en) 2020-08-26
WO2019079769A1 (en) 2019-04-25
SG11202003574TA (en) 2020-05-28
CN111565834B (zh) 2022-08-26
US20190118154A1 (en) 2019-04-25
US10894242B2 (en) 2021-01-19
US20210129108A1 (en) 2021-05-06
US20240001325A1 (en) 2024-01-04
KR20240024357A (ko) 2024-02-23
KR102637566B1 (ko) 2024-02-16
KR20200078554A (ko) 2020-07-01
KR20250165699A (ko) 2025-11-26
GB202007444D0 (en) 2020-07-01
EP3697529B1 (en) 2023-05-24
CA3079613A1 (en) 2019-04-25
JP2021502803A (ja) 2021-02-04
CN111565834A (zh) 2020-08-21
GB2583590A (en) 2020-11-04

Similar Documents

Publication Publication Date Title
KR102889470B1 (ko) 폴리뉴클레오타이드 합성을 위한 가열된 나노웰
US20250352972A1 (en) Highly accurate de novo polynucleotide synthesis
US20250154589A1 (en) Flexible substrates for nucleic acid synthesis
US12534494B2 (en) Devices and methods for synthesis
EP3516528B1 (en) Nucleic acid based data storage
HK40121633A (zh) 高度准确的从头多核苷酸合成
HK40056622B (zh) 高度准确的从头多核苷酸合成
HK40056622A (en) Highly accurate de novo polynucleotide synthesis
HK1262677A1 (en) Flexible substrates for nucleic acid synthesis

Legal Events

Date Code Title Description
A107 Divisional application of patent
E13-X000 Pre-grant limitation requested

St.27 status event code: A-2-3-E10-E13-lim-X000

P11-X000 Amendment of application requested

St.27 status event code: A-2-2-P10-P11-nap-X000

P13-X000 Application amended

St.27 status event code: A-2-2-P10-P13-nap-X000

PA0104 Divisional application for international application

St.27 status event code: A-0-1-A10-A18-div-PA0104

St.27 status event code: A-0-1-A10-A16-div-PA0104

PG1501 Laying open of application

St.27 status event code: A-1-1-Q10-Q12-nap-PG1501

A201 Request for examination
PA0201 Request for examination

St.27 status event code: A-1-2-D10-D11-exm-PA0201

E902 Notification of reason for refusal
PE0902 Notice of grounds for rejection

St.27 status event code: A-1-2-D10-D21-exm-PE0902

P11-X000 Amendment of application requested

St.27 status event code: A-2-2-P10-P11-nap-X000

P13-X000 Application amended

St.27 status event code: A-2-2-P10-P13-nap-X000

D22 Grant of ip right intended

Free format text: ST27 STATUS EVENT CODE: A-1-2-D10-D22-EXM-PE0701 (AS PROVIDED BY THE NATIONAL OFFICE)

PE0701 Decision of registration

St.27 status event code: A-1-2-D10-D22-exm-PE0701

A16 Divisional, continuation or continuation in part application filed

Free format text: ST27 STATUS EVENT CODE: A-0-1-A10-A16-DIV-PA0104 (AS PROVIDED BY THE NATIONAL OFFICE)

A18 Application divided or continuation or continuation in part accepted

Free format text: ST27 STATUS EVENT CODE: A-0-1-A10-A18-DIV-PA0104 (AS PROVIDED BY THE NATIONAL OFFICE)

F11 Ip right granted following substantive examination

Free format text: ST27 STATUS EVENT CODE: A-2-4-F10-F11-EXM-PR0701 (AS PROVIDED BY THE NATIONAL OFFICE)

PA0104 Divisional application for international application

St.27 status event code: A-0-1-A10-A18-div-PA0104

St.27 status event code: A-0-1-A10-A16-div-PA0104

PR0701 Registration of establishment

St.27 status event code: A-2-4-F10-F11-exm-PR0701

PR1002 Payment of registration fee

St.27 status event code: A-2-2-U10-U12-oth-PR1002

Fee payment year number: 1

U12 Designation fee paid

Free format text: ST27 STATUS EVENT CODE: A-2-2-U10-U12-OTH-PR1002 (AS PROVIDED BY THE NATIONAL OFFICE)

Year of fee payment: 1

PG1601 Publication of registration

St.27 status event code: A-4-4-Q10-Q13-nap-PG1601

Q13 Ip right document published

Free format text: ST27 STATUS EVENT CODE: A-4-4-Q10-Q13-NAP-PG1601 (AS PROVIDED BY THE NATIONAL OFFICE)