JP7600165B2 - 多能性細胞を分化させるための方法 - Google Patents
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Description
本発明は、一般に、分子生物学及び医薬の分野に関する。より詳細には、本発明は、多能性細胞からドーパミン作動性ニューロンを生成する方法に関する。
多数の特殊化した細胞型に分化する能力を保持している細胞集団は、多数の系統特異的分化細胞集団を生成するのに有用である。これらの系統特異的分化細胞集団は、定義された細胞集団の機能喪失をもたらす疾患を有する患者の細胞補充療法において用途を見出すことが企図される。これらの直接的な治療的価値に加えて、系統特異的分化細胞はまた、細胞系統特異的疾患を処置するための治療用分子の機能の詳細又は試験送達について同定し、確認し、かつ試験するためのインビトロスクリーニングアッセイを含む様々な目的のための貴重な研究ツールである。
以下の図面は、本明細書の一部を構成し、本発明の特定の態様をさらに実証するために含められる。本発明は、本明細書に提示される特定の実施形態の詳細な説明と組み合わせてこれらの図面のうちの1つ又は複数を参照することによってよりよく理解することができる。
「多能性」又は「多能性の」は、1つ以上の組織又は器官を構成する全ての細胞、例えば、3つの胚葉:内胚葉(内胃内層、胃腸管、肺)、中胚葉(筋肉、骨、血液、尿生殖器)、又は外胚葉(表皮組織及び神経系)のいずれかに分化する可能性を有する幹細胞又は未分化細胞を指す。
いくつかの態様では、多能性細胞(例えば、iPS細胞、ES細胞)を中脳ドーパミン作動性細胞などのニューロン細胞に変換する方法において、単一のBMPシグナル伝達阻害剤又は単一のTGF-βシグナル伝達阻害剤のいずれかを用いてSMADシグナル伝達を阻害する。例えば、いくつかの態様では、多能性細胞は、中脳DAニューロンを含むニューロン細胞の集団に変換され、分化が、単一のBMPシグナル伝達阻害剤を含む培地中で起こる。いくつかの実施形態では、BMP阻害剤は、LDN-193189、ドルソモルフィン、又はDMH-1である。BMPシグナル伝達阻害剤の非限定的な例としては、ドルソモルフィン、ドミナントネガティブBMP、切断型BMP受容体、可溶性BMP受容体、BMP受容体-Fcキメラ、ノギン、LDN-193189、フォリスタチン、コーディン、グレムリン、ケルベロス/DANファミリータンパク質、ベントロピン(ventropin)、高用量アクチビン、及び無羊膜が挙げられる。いくつかの実施形態では、核酸、アンチセンス、RNAi、siRNA、又は他の遺伝的方法を、BMPシグナル伝達を阻害するために使用することができる。本明細書で使用される場合、BMPシグナル伝達阻害剤は、単に「BMP阻害剤」と呼ばれることもある。BMP阻害剤は、分化の1日目、2日目、3日目、4日目、5日目、6日目、7日目、8日目、9日目、10日目、11日目、12日目、13日目、14日目、15日目、16日目、及び/若しくは17日目に、又はこれらの中で導出可能な任意の範囲の日(例えば、1~17日目、1~16日目、1~15日目、2~15日目など)の分化培地に含めることができる。いくつかの実施形態では、BMP阻害剤は、分化の1~17日目の全ての日に分化培地に含められる。それにもかかわらず、特定の時期、例えば上記の日の1日、2日、又は3日に、BMP阻害剤を分化培地から排除することが可能であり得ることが予想される。いくつかの実施形態では、BMP阻害剤は、任意選択により11~17日目の分化培地には含められず、いくつかの好ましい実施形態では、BMP阻害剤は、1~10日目の分化培地に含められる。
いくつかの態様では、MEK阻害剤を、例えばBMP阻害剤又は単一SMAD阻害剤と組み合わせて分化培地に含めて、iPS細胞などの多能性細胞からの中脳ドーパミン作動性ニューロンを生成する。いくつかの実施形態では、MEK阻害剤はPD0325901である。実施形態に従って使用することができるMEK阻害剤の非限定的な例としては、PD0325901、トラメチニブ(GSK1120212)、セルメチニブ(AZD6244)、ピマセルチブ(pimasertib)(AS-703026)、MEK162、コビメチニブ(cobimetinib)、PD184352、PD173074、BIX02189、AZD8330、及びPD98059が挙げられる。例えば、いくつかの実施形態では、この方法は、約0.1~10μM(例えば、約0.1~5μM;約0.5~3μM、又は約0.5~1.5μM)のPD0325901などのMEK阻害剤の存在下で細胞を培養することを含む。いくつかの実施形態では、分化の3日目、4日目、5日目、又は3~5日目に細胞をMEK阻害剤(例えば、PD0325901)に接触させる。
いくつかの態様では、Wnt活性化因子(例えば、GSK3阻害剤)は、iPS細胞などの多能性細胞から中脳ドーパミン作動性ニューロンを生成するために、例えばBMP阻害剤又は単一SMAD阻害剤と組み合わせて分化培地に含められる。いくつかの実施形態では、多能性細胞を、中脳DAニューロンを含むニューロン細胞の集団に分化させ、この分化は、Wntシグナル伝達の少なくとも第1の活性化因子を含む培地中である。
一部の態様では、ソニックヘッジホッグ(SHH)シグナル伝達の活性化因子は、iPS細胞などの多能性細胞から中脳ドーパミン作動性ニューロンを生成するために、例えばBMP阻害剤又は単一SMAD阻害剤と組み合わせて分化培地に含められる。いくつかの実施形態では、ソニックヘッジホッグ活性化因子は、ソニックヘッジホッグ(Shh)又は変異体Shhである。Shhは、例えば、ヒト若しくはマウスタンパク質であってもよいし、又はヒト若しくはマウスShhに由来してもよい。例えば、いくつかの実施形態では、Shhは、マウスC25II Shh又はヒトC24II Shhなどの変異体マウスShhタンパク質である。いくつかの実施形態では、分化培地は、Shh(例えば、C25II Shh)及びSHHの小分子活性化因子、例えば、プルモルファミンの両方を含む。いかなる理論にも拘束されることを望むものではないが、Shh及び/又はソニックヘッジホッグの活性化因子の両方は、神経底板(neural floor plate)の分化を促進し得る。
多能性幹細胞は、多能性幹細胞の神経誘導のために本方法で使用することができる。例えば、培地成分の最適化及び/又は分化プロトコルによって生成される所望の中脳DAニューロンの選択によって神経分化効率を改善するために使用することができる方法及び組成物が本明細書に開示される。
胚性幹(ES)細胞は、胚盤胞の内部細胞塊に由来する多能性細胞である。ES細胞は、発生中の胚の外側栄養外胚葉層を除去し、次いで非増殖細胞の支持細胞層上で内部細胞塊を培養することによって単離することができる。適切な条件下で、増殖している未分化のES細胞のコロニーが形成される。コロニーを除去し、個々の細胞に解離させ、次いで新鮮な支持細胞層に再播種することができる。再播種した細胞は、増殖し続けることができ、未分化ES細胞の新しいコロニーを形成する。次いで、新しいコロニーを取り出し、解離させ、もう一度再播種して成長させることができる。未分化ES細胞を「継代培養する」又は「継代する」このプロセスを何度も繰り返して、未分化ES細胞を含む細胞株を生成することができる(例えば、米国特許第5,843,780号明細書;同第6,200,806号明細書;同第7,029,913号明細書に記載されている)。「初代細胞培養物」は、例えば胚盤胞の内部細胞塊などの組織から直接得られる細胞の培養物である。「継代培養物」は、初代細胞培養物に由来するあらゆる培養物である。
人工多能性幹(iPS)細胞は、ES細胞の特徴を有するが、分化した体細胞のリプログラミングによって得られる細胞である。人工多能性幹細胞は、様々な方法で得られてきた。一方法では、成人ヒト皮膚線維芽細胞に、レトロウイルス形質導入を用いて転写因子Oct4、Sox2、c-Myc、及びKlf4をトランスフェクトする(Takahashi et al.,2006,2007)。トランスフェクト細胞を、塩基性線維芽細胞増殖因子(bFGF)を添加した培地中のSNL支持細胞(LIFを産生するマウス細胞線維芽細胞株)上に播種する。約25日後、ヒトES細胞コロニーに似たコロニーが培養中に出現する。ES細胞様コロニーをピックアップし、そしてbFGFの存在下で支持細胞上で増殖させる。いくつかの好ましい態様では、iPS細胞はヒトiPS細胞である。
多能性幹細胞は、体細胞核移植によって作製することができ、この核移植では、ドナー核が紡錘体のない卵母細胞に導入される。核移植によって作製される幹細胞は、ドナー核と遺伝的に同一である。一方法では、皮膚線維芽細胞由来のドナー線維芽細胞核が、電気融合によって紡錘体のない成熟中期II卵母細胞の細胞質に導入される(Byrne et al,2007)。融合卵母細胞は、イオノマイシンへの曝露によって活性化され、次いで胚盤胞期までインキュベートされる。次いで、選択された胚盤胞の内部細胞塊が、胚性幹細胞株が作製されるように培養される。胚性幹細胞株は、正常なES細胞形態を示し、様々なES細胞マーカーを発現し、そしてインビトロ及びインビボの両方で複数の細胞型に分化し得る。本明細書で使用される用語「ES細胞」は、受精核を含む胚に由来する胚性幹細胞を指す。ES細胞は、「体細胞核移植によって誘導される胚性幹細胞」と呼ばれる、核移植によって作製される胚性幹細胞とは区別される。
本発明の特定の態様による分化培地は、その基本培地として動物細胞の培養に使用されるべき培地を使用して調製することができる。いくつかの実施形態では、分化培地を用いて、単一のBMP阻害剤又は単一のTGF-β阻害剤のみを使用して多能性細胞を中脳ドーパミン作動性ニューロンに分化させる。例えば、多能性細胞の分化(例えば、中脳ドーパミン作動性細胞への分化)を促進するために使用される分化培地は、単一のBMP阻害剤(LDN-193189又はドルソモルフィンなど;例えば、分化の1~17日目;ソニックヘッジホッグ(SHH)シグナル伝達の活性化因子(プルモルファミン、ヒトC25II SHH、又はマウスC24II SHHなど;例えば、1~6日目、2~7日目、又は1~7日目);Wntシグナル伝達の活性化因子(GSK阻害剤など、例えば、CHIR99021;例えば、2~17日目又は3~17日目)、及び/又はMEK阻害剤(PD0325901など;例えば、2~4日目又は3~5日目)を含み得る。いくつかの実施形態では、単一のTGFβ阻害剤(SB-431542など;例えば、1~4日目)を単一のBMP阻害剤の代わりに使用することができる;しかしながら、以下の実施例に示すように、単一のBMP阻害剤の使用は、単一のTGF-β阻害剤の使用と比較して、細胞のFOXA2+/LMX1A+細胞への優れた分化をもたらすことが観察された。いくつかの実施形態では、FGF-8(例えば、FGF-8b)は、初日又は1日目、2日目、3日目、4日目、5日目、6日目、7日目、8日目、9日目、若しくは10日目、又はこれらの任意の組み合わせの日(例えば、1~8日目)の分化培地に含められない;例えば、いくつかの実施形態では、FGF-8は、9日目、10日目、11日目、12日目、13日目、14日目、15日目、16日目、及び17日目、又はこれらの任意の組み合わせの日の分化培地に含められる。様々な実施形態では、分化培地は、TGFβ及びbFGFを含んでもよいし、あるいは、分化培地は、本質的にTGFβ及びbFGFを含まなくてもよい。
・単一のBMP阻害剤(又はTGFβ阻害剤);ソニックヘッジホッグ(SHH)シグナル伝達の活性化因子;及びWntシグナル伝達の活性化因子を含む培地での接着培養で;
・細胞凝集体を形成するための、単一のBMP阻害剤(又はTGFβ阻害剤);SHHシグナル伝達の活性化因子;及びWntシグナル伝達の活性化因子を含む培地に懸濁して;
・成熟のための、B27Supplement、L-グルタミン、BDNF、GDNF、TGFβ、アスコルビン酸、ジブチリルcAMP、及びDAPT、(及び任意選択による、外部から添加されるレチノール又はレチノイン酸を欠く)を含むNeurobasal培地中での接着培養で培養される。
細胞を培養するために使用される培養容器としては、特に限定されるものではないが、内部で細胞を培養できるのであれば、フラスコ、組織培養用フラスコ、スピナーフラスコ、皿、ペトリ皿、組織培養用皿、マルチディッシュ、マイクロプレート、マイクロウェルプレート、マルチプレート、マルチウェルプレート、マイクロスライド、チャンバースライド、チューブ、トレイ、CellSTACK(登録商標)チャンバー、培養バッグ、及びローラーボトルなどを挙げることができる。細胞は、培養の必要性に応じて、少なくとも又は約0.2mL、約0.5mL、約1mL、約2mL、約5mL、約10mL、約20mL、約30mL、約40mL、約50mL、約100mL、約150mL、約200mL、約250mL、約300mL、約350mL、約400mL、約450mL、約500mL、約550mL、約600mL、約800mL、約1000mL、約1500mL、又はこれらの中で導出可能な任意の範囲の体積で培養することができる。特定の実施形態では、培養容器は、バイオリアクターであり得、このバイオリアクターは、生物学的に活性な環境を支持する任意の装置又はシステムを指し得る。バイオリアクターは、少なくとも又は約2リットル、約4リットル、約5リットル、約6リットル、約8リットル、約10リットル、約15リットル、約20リットル、約25リットル、約50リットル、約75リットル、約100リットル、約150リットル、約200リットル、約500リットル、約1立方メートル、約2立方メートル、約4立方メートル、約6立方メートル、約8立方メートル、約10立方メートル、約15立方メートル、又はこれらの中で導出可能な任意の範囲の体積を有し得る。
ES細胞などの多能性幹細胞を調製及び培養するための方法は、細胞生物学、組織培養、並びに奇形癌腫及び胚性幹細胞を含む発生学の標準的な教科書及び概説で確認することができる:全て参照により本明細書に組み入れられる、Guide to Techniques in Mouse Development(1993);Embryonic Stem Cell Differentiation in vitro(1993);Properties and uses of Embryonic Stem Cells:Prospects for Application to Human Biology and Gene Therapy(1998)。組織培養で使用される標準的な方法は概ね、Animal Cell Culture(1987);Gene Transfer Vectors for Mammalian Cells(1987);及びCurrent Protocols in Molecular Biology and Short Protocols in Molecular Biology(1987 & 1995)に記載されている。
多能性幹細胞培養のいくつかの実施形態では、培養容器が満たされたら、コロニーが、解離に適した任意の方法によって凝集細胞又は単一細胞にさえも分割され、次いでこの細胞は、継代のために新しい培養容器に入れられる。細胞継代又は細胞分裂は、細胞が長期間にわたって培養条件下で生存して増殖することを可能にする技術である。細胞は、典型的には、これらが約70%~100%コンフルエントであるときに継代されることになる。
多能性幹細胞の神経分化効率(特に中脳DA分化効率)を改善する方法を提供することができる。多能性幹細胞の分化は、様々な方法で、例えば、付着コロニーで、又は、例えば低付着環境において胚様体(EB)と呼ばれる細胞凝集塊を形成することによって誘導することができる。EB内の分子及び細胞形態形成シグナル及び事象は、発生中の胚におけるこのような細胞の天然の個体発生の多くの状況を模倣する。細胞を神経分化に誘導するための方法は、例えば、参照により本明細書に組み入れられる米国特許出願公開第2012/0276063号明細書に示されている。DAニューロン分化のためのより詳細かつ明確なプロトコルは、参照により本明細書に組み入れられるPCT国際公開第2013/067362号パンフレットに示されている。
特定の態様では、非静置培養を、多能性幹細胞の培養及び分化に使用することができる。非静置培養は、例えば、振盪、回転、又は攪拌プラットフォーム又は培養容器、特に大容量回転バイオリアクターを使用することによって細胞を制御された移動速度に維持するあらゆる培養であり得る。いくつかの実施形態では、ロッカーテーブルを使用することができる。撹拌は、栄養素及び細胞老廃物の循環を改善することができ、また撹拌を行って、より均一な環境を提供することにより細胞凝集を制御することができる。例えば、回転速度は、少なくとも又は最大でも約10rpm、約15rpm、約20rpm、約25rpm、約30rpm、約35rpm、約40rpm、約45rpm、約50rpm、約75rpm、約100rpm、又はこれらの中で導出可能な任意の範囲に設定することができる。多能性幹細胞、細胞凝集体、分化幹細胞、又はこれらに由来する子孫細胞のための非静置培養のインキュベーション期間は、少なくとも又は約4時間、約8時間、約16時間、又は約1日、約2日、約3日、約4日、約5日、約6日、又は約1週間、約2週間、約3週間、約4週間、約5週間、約6週間、約7週間、又はこれらの中で導出可能な任意の範囲であり得る。
いくつかの実施形態では、多能性細胞(例えば、多能性細胞又はDAニューロン)は、遺伝子操作されている。ポリヌクレオチドが任意の適切な人工操作の手段によって細胞内に移入された場合、又は細胞がポリヌクレオチドの遺伝子を受け継いだ最初に改変された細胞の子孫である場合に、細胞は、「遺伝子改変」されている又は「トランスジェニック」であると言われる。いくつかの実施形態では、細胞は、例えば、MAP2プロモーターなどのニューロンプロモーターの制御下にある抗生物質耐性遺伝子を含み得る。例えば、いくつかの実施形態では、マーカー遺伝子は、抗生物質耐性遺伝子であり、そしてニューロン細胞は、細胞培養物を抗生物質に曝露することによって精製することができ、従ってニューロン細胞に分化しなかった細胞を殺す。例えば、MAP2プロモーターの制御下にあるネオマイシン遺伝子を発現する細胞をG418に曝露して、非ニューロン細胞を殺すことができる。本発明と共に使用することができるさらなる方法は、参照により排除されずにその全体が本明細書に組み入れられる米国特許出願第14/664,245号明細書に記載されている。
本発明の特定の態様の方法及び組成物によって提供されるDAニューロンは、様々な用途に使用することができる。これらには、ほんの数例を挙げると、限定されるものではないが、インビボでのDAニューロンの移植又は植え込み;インビトロでの細胞毒性化合物、発癌物質、変異原性増殖(mutagens growth)/調節因子、医薬化合物などのスクリーニング;神経変性のメカニズムの解明;薬物及び/又は増殖因子が作用する機序の研究、遺伝子治療;並びに生物学的に活性な産物の生産が含まれる。
本発明の中脳DAニューロンを使用して、本明細書で提供されるDAニューロンの特性に影響を与える因子(溶媒、小分子薬、ペプチド、及びポリヌクレオチドなど)又は環境条件(培養条件又は操作など)をスクリーニングすることができる。
1.中枢神経系の疾患
有糸分裂後中脳DAニューロンなどのドーパミン作動性ニューロンを、中枢神経系(CNS)の疾患を有する個体の神経細胞を再生するために移植することができる。いくつかの実施形態では、本発明の方法に従って生成される中脳DAニューロンを、CNS疾患を処置するために対象に投与することができる(例えば、パーキンソン病を処置するために脳又は中脳、例えば、尾状核、被殻、又は黒質に投与する)。このような疾患には、限定されるものではないが、パーキンソニズムなどの神経変性疾患が含まれ得る。
幹細胞又は分化細胞は、局所的又は全身的のいずれかで対象に投与することができる。対象にDAニューロンを投与するための方法は当技術分野で公知である。患者に自身の細胞由来の細胞が投与される場合、これは自家移植と呼ばれ;このような移植は、拒絶の可能性が殆どない。
一態様では、本明細書に記載の方法は、前駆細胞又はDAニューロンの対象での生着を高めるための方法を提供する。一実施形態では、対象は哺乳動物であり得る。別の実施形態では、哺乳動物はヒトであり得るが、本発明は、全ての哺乳動物に対して有効である。
DAニューロンの生着を高めるための所与の処置の有効性は、当業者によって決定することができる。しかしながら、例えば不十分なDAニューロンの生着の徴候又は症状のいずれか1つ又は全てが有益な方法で変更され、他の臨床的に許容されている症状が、例えば、本明細書に記載の細胞集団での処置後に少なくとも10%改善された、又はさらに寛解された場合に、処置は、本明細書で使用される用語である「有効な処置」と見なされる。有効性はまた、入院、医学的介入の必要性(すなわち、疾患の進行が停止している)、又は生着不全の発生率によって評価される、個体の悪化がなかったことによっても測定することができる。これらの指標を測定する方法は当業者に公知であり、かつ/又は本明細書に記載されている。処置には、個体又は動物(いくつかの非限定的な例にはヒト又は哺乳動物が含まれる)における疾患のあらゆる処置が含まれ、かつ以下を含む:(1)疾患を抑制すること、例えば生着不全を防止すること;又は(2)病気を緩和すること、例えば症状を緩解させること。疾患の処置に有効な量は、それを必要とする哺乳動物に投与したときに、その疾患の処置又は治療上の利益をもたらすのに十分な量を意味する。剤の有効性は、例えば、振戦、運動緩慢、屈曲姿勢、バランスと協調運動などのようなDAニューロン生着の物理的指標を評価することによって決定することができる。いくつかの実施形態では、生着又は神経機能を、代謝又は活性又はドーパミン作動系を測定するためにPETスキャンを使用して(例えば、ドーパミン作動系のイメージングのためのPETトレーサーを使用して)インビボ(例えば、ヒトの体内)で測定することができる。有効性は、パーキンソン病の動物モデルにおいて、例えば段階試験や円筒試験などの行動試験を行うことによって評価することができる。
生産、配布、及び使用の目的のために、本明細書に記載される中脳DAニューロンなどの神経細胞は、細胞培養物の形態で供給してもよいし、又は等張賦形剤若しくは培養培地に懸濁し、任意選択により輸送又は保存を容易にするために凍結してもよい。
以下の実施例は、本発明の好ましい実施形態を実証するために含められる。以下の実施例に開示される技術は、本発明の実施において十分に機能する、発明者によって発見された技術を表しており、従ってその実施での好ましい様式を構成すると見なすことができることが当業者には理解されよう。しかしながら、当業者であれば、本開示に照らして、開示された特定の実施形態に多くの変更を加えることができ、それでも本発明の精神及び範囲から逸脱することなく同様又は類似の結果を得ることができることが明らかであろう。
材料及び方法
Essential 8培地中のVTN-TN上で増殖させたヒト人工多能性幹細胞(iPS)細胞株の中脳神経分化を、表1~表5に詳述するように様々な分化培地の組成及びスケジュールを使用して小分子及び増殖因子誘導を用いて行った。一般に、iPS細胞は、1日目にD1 DAニューロン誘導培地で、2日目にD2ニューロン誘導培地で、そして3日目及び4日目にD3-D4 DA誘導培地で培養した。5日目に、細胞をTrypLEを用いて15分間解離させてDA Quench培地で収集してから、細胞をスピナーフラスコ懸濁培養に移して、D5 DAニューロン凝集体形成培地で凝集体を形成させた。
単一SMADiを用いた効率的なmDA前駆細胞のパターン形成
プロセスの17日目にFoxA2及びLmx1を共発現する細胞の割合によって測定される、mDA前駆細胞の効率的なパターン形成は、一般に、生産プロセスの終了時にmDAニューロンの高度に濃縮された集団を得るために必要である。17日目の細胞の大部分がmDA前駆細胞ではない場合、得られるニューロンは、非中脳表現型ニューロンの大集団を有するか、又は典型的にはニューロンの剥離若しくは障害又は有糸分裂後のニューロンの精製不能をもたらす増殖細胞の増殖を有することになる。
単一SMAD阻害のための阻害剤の決定
以下のように、様々な阻害剤を、単一SMADi法で機能について試験した。iCell DopaNeuronsプロセスは、BMPシグナル伝達の阻害剤であるLDN-193189(ALK 1/2/3/6を阻害し、SMAD 1/5/8をブロックする)、及びTGF-bシグナル伝達の阻害剤であるSB-431542(ALK 4/5/7を阻害し、SMAD 2/3をブロックする)を用いて神経化を誘導する。合わせて、これは、「二重SMAD阻害」又は「二重SMADi」と呼ばれる。mDAプロセスにおいて単一のSMAD阻害剤のみを使用する神経化のための最適条件を定義するために、LDN-193189及びSB-431542の様々な類似体を、上記の代替のパターン形成条件を使用して複数のiPS細胞株についてスクリーニングした。図3に示すように、LDN-193189は、異なるiPSC株について試験した場合に、最高の割合のmDA前駆細胞の誘導において全体的に最良の阻害剤であることが観察された。1つのSMAD阻害剤を用いて示されたデータでは、LDN-193189、ドルソモルフィン、及びDMH-1は、1~17日目に培地に添加し、SB431542は、1~4日目に培地に20μMで添加した。
単一SMADiにより生成されたドーパミン作動性ニューロンの精製及び特徴付け
mDAニューロンのインプロセス精製:たとえ効率的なmDA前駆細胞のパターン形成を用いても、成熟mDAニューロンが細胞周期を出た後(およそ25日目)でさえも増殖し続ける細胞の集団が存在する。これらの不要な細胞を除去するために、mDAニューロンが細胞周期を出た直後に、DNA架橋剤マイトマイシンC(MMC)を低用量(50~500ng/mL)で4日間(27~31日目)添加した。Sigma又はTocrisから得たMMCを実験に使用した。使用した用量及び期間は、有糸分裂後のmDAニューロンに殆ど又は全く悪影響を及ぼさないが、分裂中の細胞を殺す。このアプローチは、分裂中の細胞に毒性のある様々な化合物を試験し、そして用量、期間、及びMMC処置の開始日を変更することによって最適化した。はるかに短い時間に与えられたはるかに高いMMCの用量、例えば1時間に5μg/mLは、同じ効果(分裂細胞を殺す)を達成することができることにも留意されたい。中間の時間に与えられた中間用量を使用しても、同様の効果を達成することができる。しかしながら、約100ng/mLのより低い濃度を4日間にわたって使用し、そして有糸分裂後のニューロンに対する毒性は観察されずに分裂細胞が除去されることが観察された。
単一SMADi分化プロセスの交差iPSC株試験
健康なドナー(ドナーID 11378及び11379)由来の3つのiPSC株及びパーキンソン病患者由来の9つのiPSC株(ドナーID 11249、11250、及び11251)を、最適化単一SMADiプロセス(図2の「条件9」)を用いて分化させた。全てのiPSC株は、プロセスの17日目までにDA前駆細胞に効率的に変換され、12株のうちの11株で>80%のFoxA2/Lmx1が共発現された(図7A)。プロセスの完了(37日目)までに、全てのiPSC株由来の細胞は、高レベルのニューロン純度(>90%のMAP2+/ネスティン-)、中脳特異化(>80 %FoxA2+)、及び中脳ドーパミンニューロン成熟(>40%のTH+)を達成した(図7B)。これらの結果は、パーキンソン病患者由来のiPSC株を含む、iPSC株について最適化単一SMADi分化プロトコルのロバスト性を実証している。
FoxA2/Lmxl共発現についてのフローサイトメトリーアッセイ
FoxA2/Lmx1共発現は、成功したドーパミンニューロン前駆細胞のパターン形成の重要な読み出しであり、従って、免疫細胞化学画像で実行される細胞計数ソフトウェアを用いて得られる結果よりも主観的でなく変動が少ない細胞内フローサイトメトリーアッセイが開発された。このアッセイは、プロセスの17日目~24日目にFoxA2及びLmx1を共発現する細胞の割合を正確に定量することができ、結果は、分析したICC画像からのカウントに相関する。細胞が17日目に>80%のFoxA2+/Lmx1+である場合、前駆細胞のパターン形成は成功したと見なされる(図8の上)。準標以下の前駆細胞のパターン形成の例が示され(図8の下)、60%のFoxA2+/Lmx1+細胞及びFoxA2+/Lmx1陰性細胞の有意な集団を伴っている。
iPSC-mDAニューロンからのドーパミンの放出
iPSC株「K」を、最適化単一SMADiプロトコル(「条件9」)を使用してプロセスの完了(37日目)までに分化させ、そして凍結保存した。細胞を解凍し、高密度(8.8×105/cm2)で播種した。細胞に、DAPTを含まない成熟培地を3日ごとに合計14日間供給した。アッセイの日に、細胞を洗浄し、そしてHBSS(56mMのKClを含む又は含まない)と共に30分間インキュベートした。放出溶液中のドーパミン濃度は、競合ドーパミンELISAキット(Eagle Biosciences)を用いて決定した。ドーパミンの放出は、iPSC由来前脳ニューロン(iCell Neurons)からは検出されなかった。逆に、最適化単一SMADiプロセス(DA Therapyニューロン)を使用して誘導されたiPSC-mDA細胞は、最適化二重SMADプロセス(iCell DopaNeurons)を使用して誘導された細胞と少なくとも同量のドーパミンを分泌した。従って、細胞は、成熟ドーパミンニューロンの重要な機能的属性を果たすことができる。結果を図9に示す。
iPSC-mDAニューロンの電気的活動
凍結保存iPSC-mDAニューロンを解凍し、そしてPEI被覆48ウェル多電極アレイ(MEA)プレートに播種した。細胞を、米国特許出願第14/830,162号明細書のCellular Dynamics Intl適用プロトコル「Measuring synchronous neuronal activity on the Maestro multielectrode array」に従って培養した。最適化単一SMADiプロトコル「条件9」(DA Therapy)を用いて生成したニューロンは、平均発火率(mFR)、バースト(macro BPM)、及び接続性(図10の上のグラフ)を含む、最適化二重SMADiプロトコル(iCell Dopa G100)を用いて産生させた細胞と比較して同様の電気活性を示した。平均発火率(mFR)、頻度、及び接続性バースト強度は時間と共に増加し、解凍後約16日までに横ばいになった。Temporal Rasterプロットは、きれいなスパイク間の間隔、高いバースト強度、及びウェル内の全ての電極についてのバーストを示し、高度の電気的活動を実証した。結果を図10に示す。
iPSC-mDAニューロンの定量的遺伝子発現プロファイル
最適化単一SMADiプロセス(バッチ1~4)を使用して誘導された4つのバッチのiPSC-mDA細胞及びプロセスの37日目に最適化二重SMADiプロトコル(iCell DopaNeurons)を使用して誘導された1つのバッチのiPSC-mDA細胞からRNAを抽出した。RNAの単離後、リアルタイム定量的ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)を、TaqMan遺伝子発現アッセイ(Applied Biosy stems)を用いて行い、結果をGAPDH対照に対する相対発現として表した。<10-4の値はバックグラウンドと見なされる(影付きボックス)。中脳及びmDAニューロンマーカーの発現は、バッチ間及び異なるプロトコルを用いて産生させた細胞間で同様であった。非中脳領域又は非mDA細胞型のマーカーは低く、単一SMADi由来細胞と二重SMADi由来細胞との間でも同様であった。結果を図11に示す。
cGMP適合性試薬への変換
単一SMADi iPSC-mDA分化プロトコルを細胞療法のcGMP適合性プロセスに変換するためには、動物由来成分を含有する、許容できないレベルのエンドトキシンを含有する、又はそうでなければ治療用のcGMP細胞の産生に不適合である複数の試薬を交換することが好ましい又は必要であった。iPSC-mDA細胞を、最適化単一SMADiプロセス(「条件9」)を用いて分化させ、さらに次のゼノフリーcGMP適合性試薬を使用した:組換えヒトビトロネクチン、ラミニン、ソニックヘッジホッグ、FGF-8、GDNF、BDNF、及びTGF-b3;エンドトキシンフリーdbcAMP。B27及びB27(-Vit.A)が、動物成分を含むこのプロセスで使用される唯一の試薬である。標準試薬又はcGMP適合試薬を用いて、「条件9」プロセスにより分化させたK系統iPSC細胞は、同等の前駆細胞のパターン形成(17日目)及び37日目のmDAニューロン純度を有していた。結果を図12に示す。
非ヒト霊長類におけるiPSC-DAニューロンの生着
iPSC株「K」を、最適化プロトコル(「条件9」)を使用してプロセスの完了(37日目)までに分化させ、そして凍結保存した。細胞を解凍し、そしてMPTP処理及び免疫抑制したアフリカミドリザル(n=3)の尾状核及び被殻の両側に移植した(1.5×106細胞/注射)。3ヶ月後、ニューロンの生着及び神経支配を冠状切片の組織学によって評価した。ヒト細胞質の染色(STEM121)は、良好なヒト細胞の生着及び全ての動物における神経支配を明らかにする。ドーパミンニューロン(TH+)が移植片中に観察され、これらの細胞が、長期間生存し、そして脳内のmDAニューロン標的構造を神経支配する能力を実証している。これらの動物では、腫瘍、神経成長、又は他の有害作用は観察されなかった。結果を図13に示す。
ラットパーキンソン病モデル系におけるiPSC-DA前駆細胞及びニューロンの生着
iPSC株「K」を、最適化単一SMADiプロトコル(「条件9」)を用いて分化させ、そして分化プロセスの異なる段階(17日目、24日目、及び37日目)で凍結保存した。さらに、最適化二重SMADiプロトコル(iCell Dopa)を使用して誘導されたiPSC-mDA細胞をプロセスの37日目に凍結保存した。細胞を解凍し、そして6-OHDA処理したが無症状のヌード(RNU)ラットの(1群あたりn=3)の線条体(4.5×105の細胞/注射)の両側に移植した。3ヶ月後、細胞の生着及び神経支配を、冠状切片の組織学によって評価した。ニューロンの生着及び神経支配は4つの群全てで観察されたが(ヒトNCAM染色)、iPSC-DA前駆細胞(17日目)及び未成熟mDAニューロン(24日目)は、より成熟した単一SMADi及び二重SMADi由来mDAニューロン(それぞれ37日目及び37日目のiCell Dopa)と比較してはるかに大きい移植片及びより大きい神経支配を有していた。さらに、より多数のDAニューロン(TH+)が、前駆細胞及び未成熟DAニューロン移植片で観察された。Ki67染色では、37日目の細胞からの移植片では増殖細胞が殆ど示されず、そして17日目及び24日目の細胞からの移植片ではKi67+細胞が殆ど示されなかった。これらの動物のいずれでも、腫瘍、神経成長、又は他の有害作用が観察されなかった。これらの結果は、最適化単一SMADi分化プロセスの早期(17~24日目)に採取された細胞が、より成熟した細胞と比較して、よりよく生着して神経支配できることを示唆している。結果を図14に示す。
2μMのLDN-193189を使用した分化の改善
iPSC株「K」を、標準濃度のLDN-193189(200nM)、又は10倍高い濃度(2μMのLDN)のいずれかを用いて、単一SMADiプロトコル「条件7」又は「条件9」(上記の通り)により分化させた。複数の実験(n=5)において、2μMのLDNを使用したときに分化の質に改善が見られた。例えば、「条件7」プロトコルに対する2μMのLDNの改善には、17日目の前駆細胞におけるより高いFoxA2及びLmx1発現レベル(上部)、並びにプロセス37日目におけるより高い割合の底板由来ニューロン(FoxA2+)(底部)が含まれる。これは、恐らくは、高濃度(IC50>500nM、Yu et al.2008)でTGF-β1型(ALK4/5/7)受容体シグナル伝達を阻害するLDNの能力により、2μMのLDNが分化プロセスのロバスト性を改善することを示唆する。結果を図15に示す。
参考文献
以下の参考文献は、本明細書に記載の手順又は他の詳細を補足する例示的な手順又は他の詳細を提供する限りにおいて、参照により本明細書に具体的に組み入れられる。
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国際出願PCT/US2010/024487号明細書
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国際公開第2009/149233パンフレット
国際公開第2010/141801パンフレット
国際公開第2013/067362パンフレット
国際特許公開第1998/30679号明細書
国際特許公開第2001/088100号明細書
国際特許公開第2002/076976号明細書
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Claims (58)
- 以下の方法により得られた細胞の培養物を含み、前記細胞の少なくとも40%が分化し、FOXA2及びLMX1の両方を発現する、哺乳動物対象の中枢神経系(CNS)の疾患を処置するための組成物:
以下のシグナル伝達モジュレーター
(a)Small Mothers Against Decapentaplegic(SMAD)シグナル伝達の単一の阻害剤、
(b)ソニックヘッジホッグ(SHH)シグナル伝達の少なくとも1つの活性化因子、及び
(c)ウィングレス(Wnt)シグナル伝達の少なくとも1つの活性化因子、の存在下でヒト多能性細胞を培養すること;
FOXA2+/LMXl+細胞を含む細胞組成物を提供するのに十分な期間にわたって前記細胞を前記モジュレーターの存在下で培養すること;並びに
前記多能性細胞をMEK阻害剤に接触させることを含み、
前記SMADシグナル伝達の阻害剤がBMP阻害剤であり、
前記BMP阻害剤が、LDN-193189、ドルソモルフィン又はDMH-1であり、
前記SHHシグナル伝達の活性化因子が、プルモルファミン、C24II ShhまたはC25II Shhであり、
前記Wntシグナル伝達の活性化因子が、CHIR99021であり、
前記MEK阻害剤がPD0325901であり、
ただし、前記培養は、2以上のSmall Mothers Against Decapentaplegic(SMAD)シグナル伝達の阻害因子の存在下で培養することを含まず、
前記疾患がパーキンソン病(PD)又はパーキンソンプラス症候群(PPS)である、方法。 - 前記哺乳動物対象がヒトである、請求項1に記載の組成物。
- 前記培養物が、完全には分化していない、又は分化の16日目、17日目、18日目、
19日目、20日目、21日目、22日目、23日目、24日目、25日目、若しくは1
7~24日目であるドーパミン作動性ニューロンを含む、請求項1又は2に記載の組成物。 - 前記培養物が、分化の16日目、17日目又は18日目であるドーパミン作動性ニューロンを含む、請求項3に記載の組成物。
- 前記培養物が、分化の17日目であるドーパミン作動性ニューロンを含む、請求項4に記載の組成物。
- 前記培養物がヒアルロン酸マトリックスを含む、請求項3に記載の組成物。
- 前記BMP阻害剤がLDN-193189である、請求項1~6のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記LDN-193189が、約0.2μM~約4μMの濃度で存在する、請求項7に記載の組成物。
- 前記LDN-193189が、約1μM~約3μMの濃度で存在する、請求項8に記載の組成物。
- 前記多能性細胞を、培養の1~15日目、1~16日目、又は1~17日目に前記SM
ADの阻害剤と共に培養する、請求項1~9のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記前記多能性細胞を、培養の1~17日目に前記SMAD阻害剤と共に培養する、請求項10に記載の組成物。
- 前記多能性細胞を、15日間、16日間、又は17日間にわたって前記SMADの阻害
剤と共に実質的に連続的に又は毎日培養する、請求項1~11のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記多能性細胞を、17日間にわたって前記SMADの阻害剤と共に実質的に連続的に又は毎日培養する、請求項12に記載の組成物。
- 前記SMADの阻害剤が約50~2000nM又は50~500nMの濃度で存在する
、請求項1~8及び10~13のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記SMADの阻害剤が、約180~240nMの濃度で存在する、請求項14に記載の組成物。
- 前記PD0325901が、約0.25~2.5μMの濃度で存在する、請求項1~15のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記MEK阻害剤を、前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触開始後約1~3日間
、又は1~3日目、2~4日目、3~5日目、又は1日目、2日目、3日目、4日目、若
しくは5日目に前記多能性細胞に接触させる、請求項1~16のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記MEK阻害剤を、前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触開始後約24~約4
8時間、前記多能性細胞に接触させる、請求項1~17のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記MEK阻害剤を、前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触開始の約1~2日後
から約3~4日間にわたって毎日又は実質的に連続的に前記多能性細胞に接触させる、請求項1~18のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記MEK阻害剤を、1日目の前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触開始後2~5日目又は3~6日目に前記多能性細胞に接触させる、請求項19に記載の組成物。
- 前記CHIR99021が約0.5~3μMの濃度で存在する、請求項1~20のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記CHIR99021が約1.25μM超~約2μMの濃度で存在する、請求項1~21のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記CHIR99021が、前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触開始後9~1
7日目に約4~7μMの濃度で存在する、請求項1~20のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記Wntシグナル伝達の活性化因子を、前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触
開始後1~3日目に前記多能性細胞に接触させる、請求項1~23のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記Wntシグナル伝達の活性化因子を、前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触
開始後24~48時間以内に前記多能性細胞に接触させる、請求項1~23のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記多能性細胞を、14日間、15日間、又は約16日間にわたって実質的に連続的に又は毎日、前記Wntシグナル伝達の活性化因子と共に培養する、請求項1~23のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記Wntシグナル伝達の活性化因子を、前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触開始後2~17日目に前記多能性細胞に接触させる、請求項1~23のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記SHHシグナル伝達の活性化因子がプルモルファミン又はC25II Shhである、請求項1~27のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記多能性細胞を2つのSHHシグナル伝達の活性化因子に接触させることをさらに含む、請求項28に記載の組成物。
- 前記2つのSHHシグナル伝達の活性化因子がプルモルファミン及びC25II Shhである、請求項29に記載の組成物。
- 前記SHHシグナル伝達の少なくとも1つの活性化因子を、前記SMADシグナル伝達
の阻害剤との接触開始と同じ日に、又は前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触開始
後24~48時間以内に前記多能性細胞に接触させる、請求項1~30のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記SHHシグナル伝達の少なくとも1つの活性化因子を、前記SMADシグナル伝達
の阻害剤との接触開始と同時又は接触開始後1~7日目に前記多能性細胞に接触させる、請求項1~30のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記多能性細胞をFGF-8に接触させることをさらに含む、請求項1~32のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記FGF-8を、前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触開始と同じ日に前記多能性細胞に接触させない、請求項33に記載の組成物。
- 前記FGF-8を、前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触開始後9~17日目又は11~17日目に前記多能性細胞に接触させる、請求項33又は34に記載の組成物。
- 前記FGF-8が、約50~200ng/mLの濃度で存在する、請求項33~35のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記多能性細胞が、ニューロンプロモーターの制御下にある抗生物質耐性導入遺伝子を含む、請求項1~36のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記多能性細胞由来の神経細胞又は中脳DAニューロンを、細胞を抗生物質、化学療法剤、DNA架橋剤、DNA合成阻害剤、又は有糸分裂阻害剤に接触させることによって選択することをさらに含む、請求項1~37のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記多能性細胞を抗生物質又は化学療法剤に接触させることをさらに含む、請求項1~38のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記化学療法剤がマイトマイシンCである、請求項38又は39に記載の組成物。
- 前記マイトマイシンCを、前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触開始後27日目、28日目及び/又は29日目に前記多能性細胞に接触させる、請求項40に記載の組成物。
- 前記抗生物質がG418(ジェネティシン)である、請求項38又は39に記載の組成物。
- 前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触開始前に、前記多能性細胞を、ROCK阻
害剤を含む培地で培養又はインキュベートすることをさらに含む、請求項1~42のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記多能性細胞をブレビスタチンに接触させることをさらに含む、請求項1~43のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記ブレビスタチンを、分化の5日目及び17日目に前記細胞に接触させる、請求項44に記載の組成物。
- 細胞の少なくとも60%が分化し、FOXA2及びLMX1の両方を発現する、請求項1~45のいずれか1項に記載の組成物。
- 細胞の少なくとも80%が分化し、FOXA2及びLMX1の両方を発現する、請求項46に記載の組成物。
- 細胞の少なくとも85%が分化し、FOXA2及びLMX1の両方を発現する、請求項47に記載の組成物。
- 細胞の少なくとも50%が分化し、FOXA2及びチロシンヒドロキシラーゼ(TH)の両方を発現する、請求項1~48のいずれか一項に記載の組成物。
- 細胞の少なくとも70%が分化し、FOXA2及びチロシンヒドロキシラーゼ(TH)の両方を発現する、請求項49に記載の組成物。
- 前記多能性細胞がヒト人工多能性幹(iPS)細胞である、請求項1~50のいずれか1項に記載の組成物。
- 前記LMX1が、LIMホメオボックス転写因子1α(LMX1A)である、請求項1~51のいずれか1項に記載の組成物。
- FOXA2及びLMX1、又はFOXA2及びチロシンヒドロキシラーゼ(TH)を発現する前記分化細胞が、オルソデンティクルホメオボックス2(OTX2)、核内受容体関連1タンパク質(NURR1)、ニューロン特異的クラスIIIβ-チューブリン(Tuj1)、TTF3、対様ホメオドメイン3(PITX3)、achaete-scute複合体(ASCL)、初期B細胞因子1(EBF-1)、初期B細胞因子3(EBF-3)、トランスサイレチン(TTR)、シナプシン、ドーパミントランスポーター(DAT)、及びGタンパク質共役型の内向き整流カリウムチャネル(Kir3.2/GIRK2)、CD142、DCSM1、CD63、及びCD99からなる群から選択される少なくとも1つのマーカーをさらに発現する、請求項46~52のいずれか1項に記載の組成物。
- ヒト多能性細胞を、DNase又はエンドヌクレアーゼの存在下でインキュベートする
ことをさらに含む、請求項1~53のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記エンドヌクレアーゼがDNase I又はBenzonaseである、請求項54に記載の組成物。
- 前記DNase I又はBenzonaseが約100U/mLの濃度で存在する、請求項55に記載の組成物。
- 前記ヒト多能性細胞を、前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触開始後4~6日目
の少なくとも1日、エンドヌクレアーゼの存在下で培養する、請求項54~56のいずれか1項に記載の組成物。 - 前記ヒト多能性細胞を、前記SMADシグナル伝達の阻害剤との接触開始後5日目にエ
ンドヌクレアーゼの存在下で培養する、請求項54~56のいずれか1項に記載の組成物。
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