JP6154895B2 - ヒト二重特異性EGFRvIII抗体結合分子 - Google Patents
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Description
本発明は、癌治療の分野に関係している。特に、本発明は、EGFRvIIIを発現する癌を治療することに関する。
最もよく見られる原発性の悪性脳腫瘍である多形性膠芽腫(glioblastoma multiforme: GBM)は、外科的切除、放射線療法、および化学療法にもかかわらず、一様に致命的なままである1。免疫療法は、集学的治療(multimodality therapy)にさらなる毒性を追加することなく、比類のない特異性で腫瘍細胞を排除する強力な腫瘍特異的免疫応答を誘導することを約束する。実質的証拠によって、癌の根絶におけるT細胞の役割は支持されている。最近、T細胞をリダイレクトするために特異的な抗体を使用するという概念は、組換え二重特異性T細胞動員分子、つまりCD3などのT細胞活性化リガンドに対する単鎖抗体に連結された腫瘍標的化単鎖抗体から成る二重特異性T細胞動員分子という形で最適化された。こうした二重特異性T細胞動員分子は、T細胞を腫瘍細胞につなぐことができ、結果的に、T細胞の非常に局部的かつ特異的な活性化をもたらし、同時に腫瘍細胞の溶解を起こす。最近、CD19×CD3二重特異性T細胞動員分子を用いたヒト試験では、たった0.06mg/m2の用量で非ホジキンリンパ腫の患者7人中7人において観察された、血液、骨髄、および肝臓からの腫瘍のクリアランスを伴う腫瘍退縮によって、これらの構築物の効力が確認された4。しかしながら、頻繁にかつ均一に発現される腫瘍特異的標的が欠如していることが、これらの有望な構築物の最も重要な制限となっている。
EGFRvIIIに結合しかつSEQ ID NO:2および3によりコードされるセグメントを含む、第1の単鎖ヒト可変領域と、
T細胞活性化リガンドCD3に結合しかつSEQ ID NO:5および6によりコードされるセグメントを含む、第2の単鎖ヒト可変領域と
を直列に含む、二重特異性ポリペプチド。
[本発明1002]
SEQ ID NO:2、3、4、5、および6によりコードされるセグメントを含む、本発明1001の二重特異性ポリペプチド。
[本発明1003]
SEQ ID NO:2、3、4、5、6、および7によりコードされるセグメントを含む、本発明1001の二重特異性ポリペプチド。
[本発明1004]
本発明1001の二重特異性ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
[本発明1005]
SEQ ID NO:8の配列を含む、本発明1004のポリヌクレオチド。
[本発明1006]
EGFRvIII発現腫瘍を有する患者を治療する方法であって、
本発明1001の二重特異性ポリペプチドを該患者に投与する段階であって、それにより該腫瘍に対する細胞溶解性T細胞応答が誘導される、段階
を含む、方法。
[本発明1007]
スペーサーポリペプチドセグメントが第1および第2の単鎖可変領域を連結する、本発明1001の二重特異性ポリペプチド。
[本発明1008]
スペーサーポリペプチドセグメントが(G 4 S) n であり、nが1〜5である、本発明1007の二重特異性ポリペプチド。
[本発明1009]
スペーサーポリペプチドセグメントが第1の単鎖可変領域内でV H ドメインとV L ドメインを連結する、本発明1001の二重特異性ポリペプチド。
[本発明1010]
スペーサーポリペプチドセグメントが第2の単鎖可変領域内でV H ドメインとV L ドメインを連結する、本発明1001の二重特異性ポリペプチド。
[本発明1011]
スペーサーポリペプチドセグメントが(G 4 S) n であり、nが1〜5である、本発明1009の二重特異性ポリペプチド。
[本発明1012]
スペーサーポリペプチドセグメントが(G 4 S) n であり、nが1〜5である、本発明1010の二重特異性ポリペプチド。
[本発明1013]
各単鎖可変領域がV H ドメインとV L ドメインの間にジスルフィド結合を含む、本発明1001の二重特異性ポリペプチド。
[本発明1014]
本発明1004のポリヌクレオチドを含む細胞を培養培地中で培養する段階、および
該細胞または培養培地から二重特異性ポリペプチドを回収する段階
を含む、二重特異性ポリペプチドを製造する方法。
これらの態様、および本明細書を読むことで当業者には明らかな他の態様は、当技術分野に以下を提供する。
本発明者らは、EGFRvIIIとT細胞活性化リガンドCD3の両方を標的とするヒト二重特異性T細胞動員分子を開発した。それらは、EGFRvIIIを発現する癌細胞に細胞傷害性T細胞を補充しかつ細胞傷害性T細胞を活性化し、それによってEGFRvIII分子を発現する癌細胞を死滅させることが見出された。二重特異性T細胞動員分子は、細胞外環境からの該抗体に接近可能な、哺乳動物細胞の表面上に提示されたEGFRvIIIおよびT細胞活性化リガンドCD3と選択的に反応する。
単位、接頭辞、および記号は、国際単位系(Systeme International de Unites: SI)に受け入れられた形態で表示される。数値範囲は、その範囲を既定している数値を含む。特に断らない限り、核酸は5'から3'の方向で左から右に向かって書かれる;アミノ酸配列はアミノからカルボキシの方向で左から右に向かって書かれる。本明細書に提供される見出しは、本明細書全体を参照することにより得られる本開示のさまざまな局面または態様を限定するものではない。したがって、以下に定義される用語は、本明細書全体を参照することによりさらに十分に定義される。
本発明者らは、マウス抗ヒトEGFRvIII単鎖FvであるMR1-1と、マウス抗ヒトCD3単鎖FvであるaCD3とから成る、分子MR1-1×aCD3を構築した。MR1-1×aCD3を細菌BL21(DE3)において発現させて、該細菌から精製した。この二重機能分子の活性は、EGFRvIIIを発現する細胞株ならびにヒトT細胞へのその特異的結合を示すFACSによって確認した。EGFRvIIIを発現するGBM D54MG.EGFRvIII細胞株に対するMR1-1×aCD3の細胞傷害性は、標準的なクロム放出アッセイによってインビトロで測定した。MR1-1×aCD3の有効性は、ヒトEGFRvIII発現細胞株を移植したNOD/SCIDγマウスにおいて評価した。本発明者らの結果は、MR1-1×aCD3構築物が高度に細胞傷害性および抗原特異性であって、野生型対照と比べてD54MG.EGFRvIIIに対して特異的溶解が8倍増加を有することを示した。皮下モデルでは、腫瘍増殖が用量依存的に抑制された。完全抑制は100mcg/マウス/日で達成されたが、低用量は最適化することで効果的に作用する可能性がある。まとめると、本発明者らの実験では、ヒトEGFRvIII特異性T細胞動員分子MR1-1×aCD3は、EGFRvIIIを発現する腫瘍に対して有効であることが示された。
これらのヒトEGFRvIII特異的scFvに基づく組換え二重特異性T細胞動員分子を構築するために、本発明者らは、MR1-1×CD3分子(図5)を作製するために以前に使用した既存のカセットに、MR1-1 scFv部分を置換することによって、ヒト抗EGFRvIII scFvをサブクローニングする。マウス抗ヒトCD3 scFvはハイブリドーマ株OKT3(ATCC, CRL 8001)からクローン化した。精製後のMR1-1二重特異性T細胞動員分子は、SDS-PAGEゲルで示され、55kDaの分子量を有していた(図5;挿入図)。MR1-1二重特異性T細胞動員分子は、EGFRvIIIに特異的に結合し、かつCD3への結合を介して付随的にT細胞を動員する(図6)。EGFRvIIIへの結合能および特異性は、NR6M(EGFRvIII)およびNR6W(EGFRwt)細胞株ならびにEGFRvIIIでトランスフェクトされたGBM細胞株(U87MG.ΔEGFR)を用いることによって確認した(図6)。同様に、CD3への結合はヒト末梢血単核細胞(PBMC)およびJurkat細胞を染色することによって確認し、これはヒトPBMCまたはJurkat細胞からの同じT細胞亜集団上での二重特異性T細胞動員分子と抗CD4または抗CD8の共結合を示していた(図7)。二重特異性T細胞動員分子を作製するためにヒトscFvを使用することは、中和抗体の生成を低減して、反復投与を可能にするが、既存のMR1-1二重特異性T細胞動員分子も使用することが可能である。
腫瘍細胞に対する潜在的な同種免疫反応を最小限に抑えるために、本発明者らは、既存の適合したヒト末梢血リンパ球(PBL)およびGBM細胞株の本発明者らのバンクをこれらのアッセイにおいて使用した。MR1-1二重特異性T細胞動員分子の細胞傷害性は、エフェクター細胞として非刺激PBLを、標的細胞として野生型EGFRを発現するヒトGBM細胞株U87MGおよびトランスフェクトされたU87MG-EGFRvIII細胞株を用いて、標準的なクロム放出アッセイにより測定した。結果は、MR1-1構築物が高度に細胞傷害性および抗原特異性であって、野生型対照のU87MGと比べてU87MG-EGFRvIIIに対して特異的溶解(%)のほぼ25倍増加を有することを示す(図8A、左)。これらの結果は、二重特異性構築物bscCD19×CD34についてインビトロで最初に報告された試験結果を、超えないまでも、反映している。二重特異性構築物bscCD19×CD34は、それ以来、ヒト臨床治験で試験されて、非ホジキンリンパ腫の患者において強力な腫瘍退縮を誘導することが見出されている。MR1-1二重特異性T細胞動員分子による特異的溶解は、18時間後に、対照細胞が約1%〜2%であることに比べて、U87MG-EGFRvIIIは30%であり(図8B、右)、MR1-1二重特異性T細胞動員分子がインビトロで用量依存的な特異的溶解を媒介したことを示している。
MR1-1二重特異性T細胞動員分子の有効性はNSGマウスで評価した。本発明者らは、NSGマウスの皮下でU87MG-EGFRvIIIに対するMR1-1二重特異性T細胞動員分子の有効性を確認した。簡単に説明すると、0.25%トリプシン-EDTAを用いてU87MG-EGFRIII細胞(集密度70%〜80%)を採取した。細胞を滅菌PBSで2回洗浄した。PBLは、AIM-V 2%HABS中での1時間のインキュベーション後に健康なドナーのPBMC白血球搬出から非接着性部分として回収した。3×105個のU87MG-EGFRvIII細胞を3×105個のヒトPBLと混合し(1:1のE:T)、1群8匹の雄NSGマウスの右脇腹に皮下注射した。腫瘍細胞の移植の1時間後に1μg、10μg、100μg、およびビヒクル対照を尾静脈に注射することによる治療を開始した。治療は4日連続して繰り返した。その結果により、MR1-1×CD3によるNSGマウスにおける皮下U87MG-EGFRvIII腫瘍の増殖抑制が28日間の観察後に用量依存的であることが示された(図9)。未治療の腫瘍は着実に増殖し続けた。1μg群には8匹のうち2匹に触知可能な腫瘍が認められた。10μg治療群には1匹に触知可能な腫瘍が存在した。100μg治療群には腫瘍が認められなかった。U87MG-EGFRvIIIの治療に対するMR1-1二重特異性T細胞動員分子の有効性は、効力および用量依存性の面で非常に顕著でありかつ有望であった。
EBV形質転換B細胞は、ヒトゲノムへのウイルス組み込みが非常に不安定であるため、多クローン性抗EGFRvIII抗体の一過性の貯蔵所を提供するにすぎない。抗体を分泌する安定した細胞株を作製するために、かつこれらの試料からEGFRvIII特異的scFvをクローン化するために、本発明者らは、以前に記載されたような13、ヒトハイブリドーマ技術と電気融合を用いる。簡単に説明すると、CytoPulse Hybrimune電気融合システム(Cytopulse社)を用いることによって、EBV形質転換PBMCをヘテロミエローマ細胞株HMMA2.5と融合させる。単一細胞クローンを、HAT(ヒポキサンチン、アミノプテリン、およびチミジン)選択によってスクリーニングして、組換えEGFRvIII ECDに対する上清のELISAによって、またはEGFRvIII発現細胞株および種々のB細胞マーカーに対するフローサイトメトリーによって確認する。代替として本発明者らは、EGFRvIII ECDでスクリーニングされ得る、ヒト免疫グロブリン遺伝子を発現するファージscFvディスプレイライブラリーを構築し、必要な場合には、以前に記載されたように、親和性成熟を行うであろう。別のアプローチは、記載されたように19、抗体可変領域(V)遺伝子レパートリーを形質細胞から取り出すために、ハイスループットDNA配列決定およびバイオインフォマティクス解析を用いることによって、スクリーニング段階を迂回する方法である。選択されたEGFRvIII特異的MAbを発現するハイブリドーマのVHおよびVL CDRを、アイソタイプ特異的プライマーを用いて増幅し、scFvを構築し、その際scFvタンパク質はそのカルボキシ末端で精製・検出用のヘキサヒスチジン配列でタグ付けされる。scFvの発現、産生および特性評価は、金属アフィニティーカラムを用いて、記載されたとおりに実施される。scFvの結合は、EGFRvIIIを発現する細胞に対するフローサイトメトリーにより確認される。少なくとも1つの完全ヒト抗EGFRvIII MAbが単離され、そのscFvはMR1-1(1.5nM)よりも高い親和性を有することが期待される。
完全なヒト抗EGFRvIII二重特異性T細胞動員分子を作製するために、本発明者らは、ヒトscFvファージディスプレイライブラリーからスクリーニングすることによって、CD3抗原と反応するマウスMAb OKT3のヒトscFvミモトープを生成する。Los Alamos国立研究所から入手される、ヒトscFvファージミドライブラリー21は、非常に大きいサイズ(7.1×1013pfu/mL)および多様性(3×1011)を有する。選択時に、ビオチン化標的抗原CD3(Sino Biological社)をscFvライブラリーとインキュベートし、形成された複合体を磁性ストレプトアビジン被覆ビーズ上に捕捉する。非特異的または低親和性結合ファージを除去するために、ビーズ+Ag/scFv複合体を洗浄する。ビーズ+Ag/scFv複合体を酸(0.1M HCl)で処理して、標的抗原に結合する全てのscFvを回収する。マウス抗体の模倣体を回収するには、ビーズ+Ag/scFv複合体を、結合するscFv抗体の競合/溶出のための対応するマウスOKT3 IgGとインキュベートする。最も高い親和性を有するscFv抗体を生成するには、3ラウンドの各ラウンドを通して選択圧を高める。CD3に結合するscFvが回収されたら、競合ELISAを実施して、それらがマウスOKT3の真の模倣体であるかどうかを判定し、必要ならば親和性成熟を行う。その後、(1)Tリンパ球増殖アッセイ、(2)サイトカイン放出アッセイ、および(3)初期のT細胞活性化マーカーの発現のFACSによる検出を、記載されたとおりに22、実施することによって、抗CD3 scFvのヒト型OKT3のT細胞活性化機能7を確認する。
本発明者らは、(Gly4Ser)3ペプチドリンカーでVHおよびVLフラグメントを連結することによって、ヒト抗EGFRvIII scFvおよびヒト抗CD3 scFvを構築する。検出と精製を容易にするために、ヒト抗CD3 scFvのC末端にヘキサヒスチジンタグを導入した。新しい完全ヒト抗EGFRvIII二重特異性T細胞動員分子の発現および精製は、本発明者らの以前のプロトコルに従って、MR1-1二重特異性T細胞動員分子について上述したのと同じプロトコルに従うものとする。
本発明者らのMR1-1二重特異性T細胞動員分子研究からのこれらの有望な予備的データを足場にして、本発明者らは、上記と同じプロトコルに従うことによって、新しい完全ヒトEGFRvIII標的化二重特異性T細胞動員分子の細胞傷害活性を評価する。陰性対照実験は、二重特異性T細胞動員分子またはエフェクター細胞の代わりに培地を用いて実施する。その後、特異的溶解を次のように計算する:[(cpm、実験的放出)−(cpm、自然放出)]/[(cpm、最大放出)−(cpm、自然放出)]。
新規な完全ヒトEGFRvIII二重特異性T細胞動員分子の有効性は、予備研究と同様に、前述の通りNSGマウスにおいて評価される。本発明者らのプログラムでは、いくつかのEGFRvIII発現ヒトGBM異種移植片および細胞株を、冷凍保存された適合自己リンパ球と共に自由に使用することができる。簡単に説明すると、二重特異性T細胞動員分子の投与に先立って、腫瘍細胞とリンパ球を1:1の比で混合し、本発明者らが以前に記載したように24、Kopf定位固定フレーム(stereotactic frame)を用いてNSGマウスの尾状核に移植する。このNSGマウスモデルは、CNSでEGFRvIIIを発現するGBMに対する「概念実証(proof-of-concept)」有効性試験を提供する。しかし、有効性実験を開始する前に、これらのマウスにおいて、各候補二重特異性T細胞動員分子の最大耐量(MTD)を確立する。それぞれ40匹の動物の個々のコホートに候補分子を投与し、MTDが確立されるまで、群間の用量を0.001μgから1μgまでlog10の2分の1ずつ増量する。以前の研究に基づいて、マウスに二重特異性T細胞動員分子の1日用量を5日間静脈内(i.v.)投与して治療する。生存期間中央値(median survival time)の約3分の1が経過した後に、これらの腫瘍を用いた本発明者らの以前の実験に従ってMTDでの治療を開始する。治療は、所定の用量の二重特異性T細胞動員分子構築物のi.v.投与から成る。
完全ヒトBiTE設計
本発明者らは、139×28F11と指定された完全ヒトEGFRvIII特異的BiTEをコードするcDNAを作製した(図11)。mAb139(US 2010/0111979 A1)および28F11(US 7728114 B2)は、それぞれ、EGFRvIII腫瘍抗原およびヒトCD3複合体に対する特異性を有する完全ヒト抗体である。28F11は、マウスOKT3クローンの完全ヒト類似体として記載されており、このアプローチではCD3に結合しかつOKT3と同様にこの受容体を介してT細胞活性化を誘導する能力について選択された。
Claims (6)
- EGFRvIIIに結合する第1の単鎖ヒト可変領域と、
T細胞活性化リガンドCD3に結合する第2の単鎖ヒト可変領域と
を直列に含む、二重特異性ポリペプチドであって、
SEQ ID NO:8によりコードされる、二重特異性ポリペプチド。 - 請求項1記載の二重特異性ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド。
- SEQ ID NO:8の配列を含む、請求項2記載のポリヌクレオチド。
- 請求項1に記載の二重特異性ポリペプチドを含む、EGFRvIII発現腫瘍を治療するための薬学的組成物。
- 各単鎖可変領域がVHドメインとVLドメインの間にジスルフィド結合を含む、請求項1記載の二重特異性ポリペプチド。
- 請求項2記載のポリヌクレオチドを含む細胞を培養培地中で培養する段階、および
該細胞または培養培地から二重特異性ポリペプチドを回収する段階
を含む、二重特異性ポリペプチドを製造する方法。
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