JP5818793B2 - 腸内共生細菌由来細胞外ベシクル、並びにこれを用いた疾病モデル、ワクチン、候補薬物探索方法及び診断方法 - Google Patents
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Description
また、本発明は、腸内共生細菌由来細胞外ベシクルにより発生する疾患を予防又は治療することが可能な候補薬物を効率よく探索する方法を提供しようとする。
また、本発明は、腸内共生細菌由来細胞外ベシクルによる疾患を予防又は治療することが可能なワクチンを提供しようとする。
また、本発明は、腸内共生細菌による感染を予防又は治療することが可能なワクチンを提供しようとする。
また、本発明は、前記ワクチンを用いて腸内共生細菌由来細胞外ベシクルによる疾患及び/又は腸内共生細菌による感染を予防又は治療する方法を提供しようとする。
また、本発明は、腸内共生細菌由来細胞外ベシクルによる疾患の原因因子を診断する方法を提供しようとする。
本発明が解決しようとする技術的課題は上述した課題に制限されず、上述していない別の課題は以降の記載から当業者に明らかに理解できるであろう。
前記本発明の一具現例によれば、前記腸内共生細菌は、腸内に共生するグラム陰性細菌でありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の他の具現例によれば、前記腸内共生グラム陰性細菌は、大腸菌(Escherichia coli)、肺炎桿菌(Klebsiella pneumoniae)、シュードモナス属(Pseudomonas)細菌、バクテロイデス属(Bacteroides)細菌でありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の別の具現例によれば、前記細胞外ベシクルは、腸内共生細菌培養液から分離したものでありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の別の具現例によれば、前記細胞外ベシクルは自然的に分泌されるもの、及び人工的に分泌されるものを含む。
前記本発明の別の具現例によれば、前記細胞外ベシクルは、哺乳動物の大便、腸内、胃液、小腸液又は口腔液などから分離したものでありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の腸内共生細菌及び細胞外ベシクルは前述と同じである。
前記本発明の一具現例によれば、前記動物は、マウスでありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の投与は腹腔投与、静脈投与、口腔投与、肛門投与、鼻腔投与、気道投与などを含む。
前記本発明の疾病は敗血症、動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、脳卒中、肺気腫、急性呼吸不全症候群、骨粗しょう症、高血圧、肥満、糖尿、関節炎、及び脳疾患などを含む。
前記本発明の他の具現例によれば、前記疾病は口腔炎、口腔癌、食道炎、食道癌、胃炎、消化性潰瘍、胃癌、炎症性腸炎、過敏性腸症候群、大腸癌、胆道炎、胆嚢炎、膵臓炎、胆道癌、及び膵臓癌などを含む。
前記本発明の腸内共生細菌、細胞外ベシクル及び疾病は前述と同じである。
前記本発明の一具現例によれば、前記探索方法は腸内共生細菌由来細胞外ベシクルを細胞に処理する段階を含むことができる。前記細胞は炎症細胞、上皮細胞、血管内皮細胞、幹細胞などを含む。また、前記炎症細胞は単核球、好中球、好酸球、好塩球、単核球が組織から分化した細胞などを含み、前記幹細胞は骨髄組織又は脂肪組織に由来する細胞でありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の他の具現例によれば、前記探索方法は、腸内共生細菌由来細胞外ベシクルと共に候補物質を投与した後、炎症関連媒介体の水準を測定する段階を含むことができる。前記炎症関連媒介体はインターロイキン(Interleukin,IL)−6を含む。
前記本発明の別の具現例によれば、前記探索方法は、腸内共生細菌由来細胞外ベシクルと共に候補物質を投与した後、炎症関連シグナル伝達過程を評価する段階を含むことができる。
前記本発明の一具現例によれば、前記ワクチンは効能を増加させ或いは副作用を減少させる目的で変形して使用することができる。前記変形は細菌を形質転換すること、細菌に化合物を処理することなどを含み、前記化合物は薬物を含む。
前記本発明の他の具現例によれば、前記細胞外ベシクルは効能を増加させ或いは副作用を減少させる目的で変形して使用することができ、前記変形は細胞外ベシクルに化合物を処理することを含み、前記化合物は薬物を含む。
前記本発明の別の具現例によれば、前記ワクチンは、効能を増加させ或いは副作用を減少させる目的で、薬物を併用投与して使用し或いは免疫補強剤を併用投与して使用することができるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の一具現例によれば、前記腸内共生細菌による感染は腹膜炎、敗血症、肺炎、尿路感染、骨関節及び中枢神経系感染などでありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の腸内共生細菌は前述と同じである。
前記本発明の別の具現例によれば、前記ワクチンは効能を増加させ或いは副作用を減少させる目的で変形して使用することができる。前記変形は細菌を形質転換すること、細菌に化合物を処理することなどを含み、前記化合物は薬物を含む。
前記本発明の別の具現例によれば、前記細胞外ベシクルは効能を増加させ或いは副作用を減少させる目的で変形して使用することができ、前記変形は細胞外ベシクルに化合物を処理することを含み、前記化合物は薬物を含む。
前記本発明の別の具現例によれば、前記ワクチンは、効能を増加させ或いは副作用を減少させる目的で、薬物を併用投与して使用し或いは免疫補強剤を併用投与して使用することができるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の腸内共生細菌及び細胞外ベシクルは前述と同じである。
前記本発明の一具現例によれば、前記疾病は腸内共生細菌由来細胞外ベシクルにより発生又は悪化する疾病を含む。
前記本発明の別の具現例によれば、前記疾病は、敗血症、動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、脳卒中、肺気腫、急性呼吸不全症候群、骨粗しょう症、高血圧、肥満、糖尿、関節炎、脳疾患などでありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の別の具現例によれば、前記疾病は、口腔炎、口腔癌、食道炎、食道癌、胃炎、消化性潰瘍、胃癌、炎症性腸炎、過敏性腸症候群、大腸癌、胆道炎、胆嚢炎、膵臓炎、胆道癌、膵臓癌でありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の別の具現例によれば、前記疾病は、腹膜炎、敗血症、肺炎、尿路感染、骨関節及び中枢神経系感染でありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の別の具現例によれば、前記投与は皮下注射、静脈注射、鼻腔投与、舌下投与、気道吸入、経口服用、肛門投与、皮膚投与、粘膜投与などを含む。
前記本発明の別の具現例によれば、前記細胞外ベシクルは効能を増加させ或いは副作用を減少させる目的で変形して使用することができる。前記変形は細菌を形質転換すること、細菌に化合物を処理すること、細胞外ベシクルに化合物を処理することなどを含み、前記化合物は薬物を含む。
前記本発明の別の具現例によれば、前記投与は、効能を増加させ或いは副作用を減少させる目的で、薬物を併用投与し或いは免疫補強剤を併用投与することができるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の一具現例によれば、前記物質はキナーゼ阻害剤(kinase inhibitor)でありうる。前記キナーゼ阻害剤は、ダムナカンタール(Damnacanthal;3-hydroxy-1-methoxy-9,10-dioxoanthracene-2-carbaldehyde)、H−7(5-(2-methylpiperazin-1-yl)sulfonylisoquinoline dihydrochloride)、LY294002(2-morpholin-4-yl-8-phenylchromen-4-one)、GF109203X(3-[1-[3-(dimethylamino)propyl]indol-3-yl]-4-(1H-indol-3-yl)pyrrole-2, 5-dione)、 ML−7(1-(5-iodonaphthalen-1-yl)sulfonyl-1,4-diazepane hydrochloride)、ML−9(1-(5-chloronaphthalen-1-yl)sulfonyl-1,4-diazepane hydrochloride)、ZM449829(1-(2-Naphthalenyl)-2-propen-1-one)、DRB((2S,3S,4R,5R)-2-(5,6-dichlorobenzimidazol-1-yl)-5-(hydroxymethyl)oxolane-3,4-diol)、インジルビン−3’−モノオキシム(Indirubin-3’-monoxime;3-[3-(hydroxyamino)-1H-indol-2-yl]indol-2-one)、ケンパウロン(Kenpaullone;9-bromo-7,12-dihydro-5H-indolo[3,2-d][1]benzazepin-6-one)、BML−259(N-(5-Isopropylthiazol-2-yl)phenylacetamide)、及びアピゲニン(Apigenin;5,7-dihydroxy-2-(4-hydroxyphenyl)chromen-4-one)などを含む。
前記本発明の他の具現例によれば、前記物質はホスファターゼ阻害剤(phosphatase inhibitor)でありうる。前記ホスファターゼ阻害剤はPD−144795(5-methoxy-3-(1-methylethoxy)benzo(b)thiophene-2-carboxamide-1-oxide)を含む。
前記本発明の別の具現例によれば、前記物質はプロドラッグ(prodrug)でありうる。前記プロドラッグはアミトリプチリン(Amitriptyline)、シクロベンザプリン(Cyclobenzaprine)、デシプラミン(Desipramine)、ドキセピン(Doxepin)、二塩化フルフェナジン(Fluphenazine dichloride)、ハロペリドール(Haloperidol)、イミプラミン(Imipramine)、マプロチリン(Maprotiline)、オルフェナドリン(Orphenadrine)、テルフェナジン(Terfenadine)、トルフェナム酸(Tolfenamic acid)、塩酸トラゾドン(Trazodone HCl)、トリクロルメチアジド(Trichlormethiazide)、ベラパミル(Verapamil)などを含む。
前記本発明の別の具現例によれば、前記疾病は腸内共生細菌由来細胞外ベシクルにより発生又は悪化する疾病を含む。
前記本発明の別の具現例によれば、前記疾病は、敗血症、動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、脳卒中、肺気腫、急性呼吸不全症候群、骨粗しょう症、高血圧、肥満、糖尿、関節炎、脳疾患でありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の別の具現例によれば、前記疾病は、口腔炎、口腔癌、食道炎、食道癌、胃炎、消化性潰瘍、胃癌、炎症性腸炎、過敏性腸症候群、大腸癌、胆道炎、胆嚢炎、膵臓炎、胆道癌、膵臓癌でありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の腸内共生細菌は前述と同じである。
前記本発明の一具現例によれば、前記疾病は、敗血症、動脈硬化症、急性冠状動脈症候群、脳卒中、肺気腫、急性呼吸不全症候群、骨粗しょう症、高血圧、肥満、糖尿、関節炎、脳疾患でありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の別の具現例によれば、前記疾病は、口腔炎、口腔癌、食道炎、食道癌、胃炎、消化性潰瘍、胃癌、炎症性腸炎、過敏性腸症候群、大腸癌、胆道炎、胆嚢炎、膵臓炎、胆道癌、膵臓癌でありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の別の具現例によれば、前記応用は腸内共生細菌由来細胞外ベシクルに含まれた遺伝物質の塩基配列を分析することであり、前記遺伝物質は16S rRNAでありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の別の具現例によれば、前記応用は、腸内共生細菌由来細胞外ベシクルに含まれたタンパク質を測定し、或いは腸内共生細菌由来細胞外ベシクルに対する免疫反応を測定することでありうるが、これに限定されるものではない。前記免疫反応測定は、腸内共生細菌由来細胞外ベシクルに対する抗体を測定することでありうるが、これに限定されるものではない。
前記本発明の別の具現例によれば、前記診断は、血液、大便、小便、脳脊髄液、関節液、胸水又は腹水などに由来する試料を用いることができるが、これに限定されるものではない。
本発明者らは、腸内共生細菌由来細胞外ベシクルが粘膜に炎症を誘導し、特に癌の病因に重要な好中球性炎症を特徴とするTh17免疫反応を誘導するという事実を初めて解明して、腸内共生細菌由来細胞外ベシクルを局所的に投与して前記の局所疾患に対する疾病モデルを開発した。
マウス大便由来細胞外ベシクルを分離するために、5週齢の雄C57BL/6マウスから得た大便25gを生理食塩水(phosphate buffered saline、PBS)2Lに入れ、4℃で16時間懸濁(resuspension)した。この懸濁液を4℃で10,000×gで20分間遠心分離した後、上澄液を取って孔径0.45mmのフィルターに通過させた。このようにバクテリアが除去された通過液は、分子量100kDa以下のタンパク質を除去することが可能な膜(membrane)を装着したQuixStand Benchtop Systemを用いて70mLに約30倍濃縮した。濃縮液を再び4℃、10,000×gで20分間遠心分離して上澄液を得た。この上澄液を、0.5mLの2.5Mスクロース溶液(2.5Mスクロース(sucrose)/20mM HEPES/150mM NaCl、pH7.4)と1mLの0.8Mスクロース溶液(0.8Mスクロース(sucrose)/20mM HEPES/150mM NaCl、pH7.4)が入っている超遠心分離チューブ(ultracentrifuge tube)に仕込み、4℃、100,000×gで4時間超遠心分離した後、2.5Mスクロース溶液と0.8Mスクロース溶液との間に位置した細胞外ベシクル含有層を取った。これをPBSで10倍希釈した後、0.15mLの2.5Mスクロース溶液と0.35mLの0.8Mスクロース溶液が入っている超遠心分離チューブに仕込み、4℃、200,000×gで2時間超遠心分離した。2.5Mスクロース溶液と0.8Mスクロース溶液との間に位置した細胞外ベシクル含有層をPBSで10倍希釈した後、4℃、150,000×gで3時間超遠心分離して沈殿させた。沈殿物を2.2mLの50%Optiprep溶液に懸濁し、超遠心分離チューブに入れた後、その上に2mLの40%Optiprep溶液と0.8mLの10%Optiprep溶液を順次入れた。その後、4℃、200,000×gで2時間超遠心分離し、40%Optiprep溶液と10%Optiprep溶液との間に位置した層から細胞外ベシクルを得た。
図1は前述の方法による、マウスの大便に存在する細胞外ベシクルのプロテオーム分析結果であって、合計295個のタンパク質のうち222個がバクテリア由来タンパク質であった。これらのうち、グラム陰性細菌由来タンパク質が77個、グラム陽性バクテリア由来タンパク質が145個同定された。グラム陰性細菌の場合は主にバクテロイデス・シータイオタオミクロン(Bacteroides thetaiotaomicron)、大腸菌K−12(Escherichia coli K-12)、肺炎桿菌(Klebsiella pneumonia)由来タンパク質であり、グラム陽性細菌の場合は主にウェルシュ菌(Clostridium perfringens)、ラクトバチルス・ロイテリ(Lactobacillus reuteri)由来タンパク質であった。
正常及びDSSによって誘導された炎症性腸炎マウスの小腸液から細胞外ベシクルを分離するために、マウスを解剖して小腸を摘出した。摘出された小腸からパイエル板(P eyer's patch)と脂質(lipid)を除去した後、小腸を約5cmの長さに切り取り、横に切開して生理食塩水で洗浄して小腸内の不純物を除去した。不純物の除去された小腸は1cm角に切り取り、30mLの生理食塩水に入れてvortexで5秒間5回ボルテックス(vortexing)した。小腸組織及び不純物は遠心分離して除去し、上澄液から超遠心分離によって細胞外ベシクルを分離した。
C57BL/6(雄、6週)マウス1匹の盲腸の端部に18ゲージ(gauge)注射針を2回刺してCLP(ceacal ligation puncture)手術を行った。40時間の後、PBS3mLを5mLの注射器を用いてマウスの腹腔に注射し、よく攪拌した後、さらに腹腔から1mLを回収し、その10μLをLB(Luria Bertani)溶液90μLと混ぜた後、10,000倍希釈してLB寒天プレート(Agar plate)に塗抹して37℃のインキュベータ(incubator)で8時間培養した。多数のコロニー(colonoy)の中から1つを選んで、5mLのLB溶液が入っている試験管に仕込み、37℃のインキュベータで8時間培養し、しかる後に、その10μLをLB溶液90μLと混ぜた後、10,000倍希釈してLB寒天プレートに塗抹して37℃のインキュベータで8時間培養した。前述のコロニーピッキング(picking)過程をもう1回同様に行い、一つのコロニーを得て腸内大腸菌を抽出した。
1×105個のマウスマクロファージ(RAW 264.7)をそれぞれ24ウェルプレートにシード(seeding)し、24時間後に細胞外ベシクル(0.1、1、10、100、1000ng/mL)又はフェノール(phenol)を用いて腸内大腸菌から抽出したLPS(100、200、500、1000、2000ng/mL)を細胞に処理して37℃のインキュベータで培養した。15時間の後に上澄液を取った後、4℃、500×gで10分間遠心分離し、しかる後に、4℃、3000×gで20分間遠心分離を行った。分離された上澄液に入っているサイトカインの量をELISA法によって測定した。
C57BL/6(雌、6週)マウス実験群と対照群各5匹を用意し、実験群に属したマウスに大腸菌由来細胞外ベシクル1、10、100ngを鼻腔投与した。投与後6時間、12時間に気道粘膜の炎症を測定した。ケタミン(ketamine)とキシラジン(xylazine)を混合した麻酔液をマウス腹腔に投与して麻酔した後、胸部を切開し、気管を露出させてカテーテルを気道に挿入し、結紮させた。PBSを1mLずつ2回注入し、気道を洗浄して気管支肺胞洗浄液(bronchoalveolar lavage、BAL fluid)を得た。気管支肺胞洗浄液を4℃で3000rpmにて10分間遠心分離した後、細胞ペレット(cell pellet)をPBS溶液に溶解させた。前記細胞ペレットを光学顕微鏡で観察して細胞の数を数えた。また、気管支肺胞洗浄液でTh17免疫反応を誘導する炎症性媒介体としてのIL−6をELISA法で測定した。
実施例3の方法で分離した細胞外ベシクルをC57BL/6(雄、6週)マウス20匹にそれぞれ15、25、50μgを1回腹腔注射して12時間ごとに死んだマウスの数を確認した。
図21は細胞外ベシクル(5μg)を注射してから24時間ごとに血圧を測定した結果である。マウスをプラットフォーム(platform)にのせた後、尾の血圧をセンサー(sensor)が認識してコンピュータ画面に出力された血圧数値を分析した。その結果、細胞外ベシクルによって血圧が著しく減少することを観察した。
重症敗血症の状況で観察される血液凝固現象が細胞外ベシクルによって誘導されるかを分析した。播種性血管内血液凝固が発生すると、血小板が減少し、D−dimerの量が増加する。
腸内共生大腸菌由来細胞外ベシクルによる血管内皮細胞の活性化を評価するために、5×105細胞数を有する血管内皮細胞(HUVEC:Human Umbilical Vein Endothelial Cell)を6ウェルプレートにシード(seeding)した後、24時間後に細胞外ベシクル(0.1、1、5、10、20ng/mL)を細胞に処理して37℃のインキュベータで培養した。8時間後に培養液を除去し、PBSで1回洗浄した後、細胞溶解(lysis)溶液を処理して10分間培養(incubation)し、しかる後に4℃、13,000×rpmで10分間遠心分離を行って細胞全体タンパク質を得た。これを5×ローディング染色剤(loading dye、250mM Tris−HCl、10% SDS、0.5%ブロモフェノールブルー(bromophenol blue)、50%グリセロール(glycerol))を最終的に1×となるように仕込み、100℃で10分間処理した。10%ポリアクリルアミドゲル(polyacrylamide gel)を用意し、サンプルをロードした。100Vで2時間電気泳動した後、300mAで2時間タンパク質をPVDF(polyvinylidene fluoride)メンブレインでトランスファー(transfer)した。スキムミルク(skim milk)をPBSに3%となるように溶かした後、メンブレインをこの溶液で2時間ブロッキング(blocking)した。ICAM−1とβ−アクチン抗体を4℃で12時間処理した。0.05%Tween20/PBSで3回洗浄した後、それぞれペロキシダーゼ(peroxidase)が付いている二次抗体を室温で1時間処理した。0.05%Tween20/PBSで30分間洗浄した後、ECL(enhanced chemiluminescence、Amersham Co.No.RPN2106)基質(substrate)で確認して細胞外ベシクルを処理した場合、濃度依存的に細胞全体タンパク質の水準でβ−アクチンに比べてICAM−1が増加することを確認した。ICAM−1は、免疫細胞接着タンパク質であって、各種免疫反応の発生及び冠状動脈疾患などの血管内皮細胞の活性化の際に血管内皮細胞で増加して免疫細胞の組織内への浸潤を誘導することがよく知られている。
腸内大腸菌由来細胞外ベシクル(10μg)をシアニン−7(cyanin-7,cy7)で染色した後、マウスの腹腔に注射した。6時間の後、マウスの全身を分析することが可能なコダックイメージステーション(Kodak image station)を用いて腸内大腸菌由来細胞外ベシクルの位置を確認した。
図27はこの血液と肺からRBC(red blood cell)溶解バッファ(lysis buffer)を用いて赤血球を除去した後、フローサイトメーター(FACS)によって、細胞外ベシクルを含む血液細胞と肺組織細胞の比率を分析した結果である。その結果、蛍光を帯びた細胞の比率が増加した。これは、図26の結果のように細胞外ベシクルが肺を含む全身に広がるにあたり、細胞外ベシクルが細胞に吸収されたボディの周囲に広がることを意味する。
低用量の腸内大腸菌由来細胞外ベシクルに繰り返し露出したときに慢性疾患が誘導されるかを評価するために、細胞外ベシクル(0.1、1μg)を週2回18週間腹腔に注入した。
実施例3の方法で分離したマウス腸内大腸菌由来細胞外ベシクル(25μg)をそれぞれ正常マウス(C57BL/6、雄、6週)とIL−6欠乏(ノックアウト、knock out)マウス(C57BL/6、雄、6週)に1回腹腔注射して12時間ごとに死んだマウスの数を確認し、生存率を図33に示した。IL−6欠乏マウスでは、正常マウスとは異なり、25μgの細胞外ベシクルによって死亡が誘導されなかった。
前記実施例らに基づいて、マウス腸内共生細菌由来細胞外ベシクルにより誘導される炎症性サイトカインが各種疾病に大きく関与することを確認した。これは、炎症性媒介体、特にIL−6の分泌を抑制することが可能な物質を発掘することが腸内共生細菌由来細胞外ベシクルによる疾病に対する予防又は治療候補薬物の選別において重要であることを意味する。
実施例12の方法によってマウスマクロファージ(RAW 264.7)に培養液のみを処理した群(陰性対照群)、腸内大腸菌由来細胞外ベシクル(0.1μg/mL)のみを培養液に混ぜて処理した群(陽性対照群)、及び80種のキナーゼ阻害剤[キナーゼ阻害剤ライブラリー(kinase inhibitor library)、BIOMOL No.2832: PD−98059、U−0126、SB−203580、H−7、H−9、AG−494、AG−825、ラベンダスチンA(Lavendustin A)、RG−14620、チルホスチン23(Tyrphostin 23)、チルホスチン25(Tyrphostin 25)、チルホスチン46(Tyrphostin 46)、チルホスチン47(Tyrphostin 47)、チルホスチン51(Tyrphostin 51)、チルホスチン1(Tyrphostin 1)、チルホスチン9(Tyrphostin 9)、チルホスチンAG1288(Tyrphostin AG 1288)、チルホスチンAG1478(Tyrphostin AG 1478)、チルホスチンAG1295(Tyrphostin AG 1295)、HNMPA、ダムナカンタール(Damnacanthal)、ピセタノール(Piceatannol)、AG−490、AG−126、AG−370、AG−879、LY294002、ウォルトマンニン(Wortmannin)、GF109203X、ヒペリシン(Hypericin)、スフィンゴシン(Sphingosine)、H−89、H−8、HA−1004、HA−1077、HDBA、KN−62、KN−93、ML−7、ML−9、2−アミノプリン(2-Aminopurine)、N9−イソプロピル−オロモウシン(N9-Isopropyl-olomoucine)、オロモウシン(Olomoucine)、イソ−オロモウシン(iso-olomoucine)、ロスコビチン(Roscovitine)、LFM−A13、SB−202190、ZM336372、SU4312、AG−1296、ロットレリン(Rottlerin)、ゲニステイン(Genistein)、ダイアゼイン(Daiazein)、エルブスタチンアナログ(Erbstatin analog)、クエルセチン二水和物(Quercetin dihydrate)、SU1498、ZM449829、DRB(5,6-Dichloro-1-b-D-ribofuranosylbenzimidazole)、HBDDE (2,2',3,3',4,4'-Hexahydroxy-1,1'-biphenyl-6,6'-dimethanol dimethyl ether)、インジルビン(Indirubin)、インジルビン−3’−モノオキシム(Indirubin-3'-monoxime)、Y−27632、ケンパウロン(Kenpaullone)、テレイン酸(Terreic acid)、BML−257、BML−259、アピゲニン(Apigenin)、BML−265(Erlotinib analog)、ラパマイシン(Rapamycin)]それぞれを10μM濃度で前述と同量の細胞外ベシクルと共に培養液に混ぜて処理した群を用いて実験を行った。処理15時間後に培養液におけるIL−6の量をサンドイッチELISA法で測定した。
その結果、80余種のキナーゼ阻害剤のうち、11種の物質(4; H−7、29;LY294002、31;GF109203X、42;ML−7、43; ML−9、64;ZM449829、66;DRB(5,6-Dichloro-1-b-D-ribofuranosylbenzimidazole)、70;インジルビン−3’−モノオキシム(Indirubin-3'monoxime)、72;ケンパウロン(Kenpaullone)、77;BML−259、78;アピゲニン(Apigenin))がIL−6の量を陽性対照群の50%未満に減少させることを確認することができる。
図38は実施例13の方法で30種のホスファターゼ阻害剤[phosphatase inhibitor、ホスファターゼ阻害剤ライブラリー(phosphatase inhibitor library) 、BIOMOL No.2834:カンタリジン酸(Cantharidic acid)、カンダリジン(Cantharidin)、エンドサル(Endothall)、ベンジルホスホン酸(Benzylphosphonic acid)、シュウ酸L−p−ブロモテトラミゾール(L-p-Bromotetramisole oxalate)、RK−682、RWJ−60475、RWJ−60475(AM)3、塩酸レバミゾール(Levamisole HCl)、塩酸テトラミゾール(Tetramisole HCl)、シペルメトリン(Cypermethrin)、デルタメトリン(Deltamethrin)、フェンバレラート(Fenvalerate)、チルホスチン8(Tyrphostin 8)、CinnGEL、CinnGEL 2 Me、BN−82002、シコニン(Shikonin)、NSC−663284、シクロスポリンA(Cyclosporin A)、ペンタミジン(Pentamidine)、BVT−948、B4−ロダニン(B4-Rhodanine)、BML−268、ジオキソフェナントレン(Dioxophenanthrene)、BML−260、PD−144795、BML−267、BML−267 Ester、OBA、OBA Ester、ゴシポール(Gossypol)、アレンドロネート(Alendronate)]を処理してIL−6の量を陽性対照群の50%未満に減少させる薬物候補物質を検索してPD−144795を発掘した結果である。
図40は実施例13の方法で100種のプロドラッグ[プロドラッグ:アセトアミノフェン(acetaminophen)、アセチルシステイン(acetylcysteine)、アロプリノール(allopurinol)、塩酸アルプレノロール(alprenolol HCl)、塩酸アミトリプチリン(amitriptyline HCl)、アトロピン(atropine)、ブレチリウムトシレート(bretylium tosylate)、ブロモフェニラミン(bromopheniramine)、ブデソニド(budesonide)、塩酸ブスピロン(buspirone HCl)、セフロキシム(cefuroxime)、 抱水クロラール(chloral hydrate)、塩酸クロルプロマジン(chlorpromazine HCl)、シメチジン(cimetidine)、塩酸クロミプラミン(clomipramine HCl)、 クロトリマゾール(clotrimazole)、シクロベンザプリン(cyclobenzaprine)、塩酸デシプラミン(desipramine HCl)、ジクロフェナク(diclofenac)、ジフルニサル(diflunisal)、ジルチアゼム(diltiazem)、塩酸ジフェンヒドラミン(diphenhydramine HCl)、ジソピラミン(disopyramine)、ジスルフィラム(disulfiram)、D−マンニトール(D-mannitol)、ドキセピン(doxepin)、ドキシサイクリン水和物(doxycycline hydrate)、コハク酸ドキシラミン(doxylamine succinate)、塩化エドロホニウム(edrophonium chloride)、マレイン酸エナラプリル(enalapril maleate)、ファモチジン(famotidine)、フェンブフェン(fenbufen)、フェノフィブラート(fenofibrate)、フェノプロフェンカルシウム塩水和物(fenoprofen calcium salt hydrate)、フルナリジン二塩酸塩(flunarizine dihydrochloride)、フルフェナジン二塩化物(fluphenazine dichloride)、フルルビプロフェン(flurbiprofen)、フロセミド(furosemide)、ゲムフィブロジル(gemfibrozil)、グリクラジド(gliclazide)、グリピジド(glipizide)、ハロペリドール(haloperidol)、ヒドロクロロチアジド(hydrochlorothiazide)、ヒドロフルメチアジド(hydroflumethiazide)、塩酸ヒドロキシジン(hydroxyzine HCl)、イブプロフェン(ibuprofen)、塩酸イミプラミン(imipramine HCl)、インダパミド(indapamide)、インドール−2カルボン酸(indole-2-carboxylic acid)、 インドメタジン(indomethacin)、イプラトロピウム(ipratropium)、ケトプロフェン(ketoprofen)、ケトロラックトリス塩(ketorolac tris salt)、塩酸マプロチリン(maprotiline HCl)、メクロフェナム酸(meclofenamic acid)、メラトニン(melatonin)、メトホルミン(metformin)、塩酸メタピリレン(methapyrilene HCl)、メチマゾール(methimazole)、メトカルバモール(methocarbamol)、塩酸メトクロプラミド(metoclopramide HCl)、メトロニダゾール(metronidazole)、ナブメトン(nabumetone)、ナプロキセン(naproxen)、臭化ネオスチグミン(neostigmine Br)、ナイアシン(niacin)、塩酸ニカルジピン(nicardipine HCl)、ニフェジピン(nifedipine)、ニトロフラントイン (nitrofurantoin)、ニザチジン(nizatidine)、ノルエチンドロン(norethindrone)、ノルトリプチリン(nortriptyline)、塩酸オルフェナドリン(orphenadrine HCl)、オキシプチニン(oxybutynin)、塩酸フェンフォルミン(phenformin HCl)、フェニルブダゾン(phenylbutazone)、フェニトイン(phenytoin)、ピロキシカム(piroxicam)、プレドニゾン(prednisone)、プロベネシド(probenecid)、塩酸プロプラノロール(propranolol HCl)、臭化ピリドスチグミン(pyridostigmine Br)、塩酸ラニチジン(ranitidine HCl)、スピロノラクトン(spironolactone)、スルファメト(sulfameth)、スルピリド( sulpiride)、テノキシカム(tenoxicam)、テルフェナジン(terfenadine)、テオフィリン(theophylline)、塩酸チクロピジン(ticlopidine HCl)、トラザミド(tolazamide)、トラゾリン(tolazoline)、トルブタミド(tolbutamide)、トルフェナム酸(tolfenamic acid)、塩酸トラマドール(tramadol HCl)、トラニルシプロミン(tranylcypromine)、塩酸トラゾドン(trazodone HCl)、トリアムテレン(triamterene)、トリクロルメチアジド(trichlormethiazide)、塩酸トリペレナミン(tripelennamine HCl)、ベラパミル(verapamil)、ワルファリン(warfarin)]を処理してIL−6の量を陽性対照群の80%未満に減少させる候補物質14種(10;アミトリプチリン(Amitriptyline)、39;シクロベンザプリン(Cyclobenzaprine)、41;デシプラミン(Desipramine)、54;ドキセピン(Doxepin)、72;二塩化フルフェナジン(Fluphenazine dichloride)、82;ハロペリドール(Haloperidol)、89;イミプラミン(Imipramine)、101;マプロチリン(Maprotiline)、132;オルフェナドリン(Orphenadrine)、165;テルフェナジン(Terfenadine)、173;トルフェナム酸(Tolfenamic acid)、179;ドラゾドン(Trazodone)、187;トリクロルメチアジド(Trichlormethiazide)、188;ベラパミル(Verapamil))を発掘した結果である。
実施例15で発掘したプロドラッグが体内で抗炎症効果を示すかを評価した。このために、実施例6のように腸内大腸菌由来細胞外ベシクルをC57BL/マウス(雄、6週、グループ当たり4匹)に5μg腹腔注射して敗血症を誘導したマウスモデルから、前記発掘したプロドラッグのうちハロペリドール(Haloperidol)とドキセピン(Doxepin)をそれぞれ10mg/kgの用量で腹腔注射して6時間後に血清を得た。
実施例3の方法によって分離した大腸菌由来細胞外ベシクル1mgを1週間隔で3週間3回C57BL/6(雄、6週、グループ当たり10匹)の腹腔に注入した。毎注入6時間、24時間、7日後にマウス血液を得て、血液内に存在する細胞外ベシクル特異的な抗体を測定した。大腸菌由来ベシクル200ngがコートされた黒色の96ウェルプレートに、1% BSA/PBSで1:500希釈されたマウス血清を入れ、常温で2時間培養した後、ペロキシダーゼ(peroxidase)が結合されたマウス抗体を用いて観察した。
大腸菌由来細胞外ベシクルワクチンの効能を評価するために、大腸菌感染による敗血症動物モデルを確立した。大腸菌1×106、1×108、1×1010CFUをC57BL/6(雄、6週、グループ当たり10匹)の腹腔に注入して5日間8時間の間隔でマウスの生存率を観察した。
実施例17の方法によって大腸菌由来細胞外ベシクル1μgを1週間隔で3回C57BL/6(雄、6週、グループ当たり5匹)の腹腔に注入した後、実施例6の方法によって確立された大腸菌由来細胞外ベシクルによる敗血症の発生に対する大腸菌由来細胞外ベシクルワクチンの効能を観察した。大腸菌由来細胞外ベシクルの予防接種が完了してから7日後、大腸菌由来細胞外ベシクル5μgを12時間間隔で3回腹腔に注入して敗血症関連指標を分析した。
実施例3の方法で分離した肺炎桿菌由来細胞外ベシクル100ng、1mgを5日間隔で3回C57BL/6(雄、グループ当たり5匹)の腹腔に注入した。最後接種3日後にマウスの血液を採取し、血液内に存在する肺炎桿菌由来細胞外ベシクル特異的な抗体を確認して図55に示したとともに、脾臓を採取した後、脾臓内T細胞を分離してサイトカインとしてのIFN−γ、IL−17を測定した結果を図56に示した。
肺炎桿菌由来細胞外ベシクルワクチンの効能を評価するために、肺炎桿菌感染による敗血症動物モデルを確立した。肺炎桿菌1×106、1×107、1×108CFUをC57BL/6(雄、6週、グループ当たり5匹)の腹腔に注入して5日間8時間の間隔でマウスの生存率を観察した。
実施例3の方法によって分離した大腸菌由来細胞外ベシクル、肺炎桿菌由来細胞外ベシクル1mg、大腸菌及び肺炎桿菌由来細胞外ベシクル各1mgを5日間隔で2回C57BL/6(雄、6週、グループ当たり5匹)の腹腔に注入した。細胞外ベシクル接種3日後に血液を採取した後、細胞外ベシクルがコートされた黒色の96ウェルプレートに、1:500で希釈された血清を入れ、常温で2時間培養した。
C57BL/6(6週、雄)マウス及びBALB/c(6週、雄)マウスの大便を採取して細胞外ベシクルを分離した後、それぞれ10μgの細胞外ベシクルに全体8μLの体積となるように3次蒸留水を追加した。各ベシクルに2μLのランダムデカマー(random decamer、Ambion、5722G)を添加し、95℃で10分、75℃で10分培養した後、4℃で保管した。ランダムデカマーを処理した各サンプルにAMV逆転写酵素(Promega、M510F)3μL、AMV逆転写酵素バッファ(Progema、M515A)4μL、10mM dNTP 2μL、RNase抑制剤(Promega、N211B)1μLを処理し、10分間25℃で反応させた後、2時間37℃で反応させた。AMV逆転写酵素を処理した各20μLのサンプルのうち1μLを用いて16S rRNA遺伝子をPCRで確認した。PCRのために、サンプル1μLにTaq酵素(NEB、M0273S)0.5μL、Taq酵素バッファ(NEB、B9014S)2μL、10mM dNTP1μL、10pM バクテリアのユニバーサルフォワードプライマー(bacterial universal forward primer)1μL(5’aaggcgacgatccctagctg−3’)、10pM バクテリアのユニバーサルリバースプライマー(bacterial universal reverse primer)1μL(5’ttgagcccggggatttcaca−3’)、3次蒸留水13.5μLを入れて混合した。混合物を95℃で2分反応させた後、95℃で30秒、55℃で30秒、72℃で45秒間反応させる過程を45回繰り返し行った。最後に72℃で5分間反応させた後、ソルゼント(株)(大田広域市儒城区花岩洞63−10)に依頼してPCR結果物をシークエンシングし、C57BL/6を対象とした図62の結果及びBALB/cを対象とした図63の結果を得た。
腸内共生細菌由来細胞外ベシクルをC57BL/6(6週、雄、グループ当たり3匹)マウスに25μg腹腔注射し、6時間後にマウスの臓器及び体液を摘出して細胞外ベシクルタンパク質の存否を細胞外ベシクルに対する抗体を用いてELISA法で確認した。マウスの摘出臓器を液体窒素の存在下に乳鉢で擂った後、RIPA溶液(50mM Tris(pH7.5)、1% NP−40、0.25% Na−デオキシコール酸塩(Na-Deoxycholate)、100mM NaCl、1mM EDTA、プロテアーゼ阻害剤(protease inhibitor))を入れて溶解(lysis)させて4℃で13,000rpmにて10分間遠心分離することによりタンパク質を得た。体液は前記実施例5及び6と同様の方法で得た。
Claims (3)
- Klebsiella属細菌由来細胞外ベシクル及び大腸菌由来細胞外ベシクルを共に含む、Klebsiella属細菌及び大腸菌による感染を治療するための薬学的組成物であって、
該細胞外ベシクルは哺乳動物の大便、大腸液、胃液、及び小腸液よりなる群から選ばれることから分離したものである、薬学的組成物。 - 前記細胞外ベシクルは自然的または人工的に分泌される細胞外ベシクルを分離したものである、請求項1に記載の薬学的組成物。
- Klebsiella属細菌由来細胞外ベシクル及び大腸菌由来細胞外ベシクルを共に含む、Klebsiella属細菌及び大腸菌による感染予防用ワクチンであって、
該細胞外ベシクルは哺乳動物の大便、大腸液、胃液、及び小腸液よりなる群から選ばれることから分離したものである、ワクチン。
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