JP5539971B2 - ビーズに基づく親和性キャプチャおよび質量分析による抗体薬剤コンジュゲートの分析 - Google Patents
ビーズに基づく親和性キャプチャおよび質量分析による抗体薬剤コンジュゲートの分析 Download PDFInfo
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Description
（関連出願の説明）
米国特許法規則１.５３(ｂ)に基づき出願した非仮出願は、米国特許法１１９(ｅ)に基づき、２００８年５月１３日に出願の仮出願第６１／０５２７２７号の優先権を主張し、出典明記によりその内容全体を援用するものである。
米国特許法規則１.５３(ｂ)に基づき出願した非仮出願は、米国特許法１１９(ｅ)に基づき、２００８年５月１３日に出願の仮出願第６１／０５２７２７号の優先権を主張し、出典明記によりその内容全体を援用するものである。
（発明の分野）
本発明は概して、抗体−薬剤コンジュゲートやその断片および代謝産物を含む抗体コンジュゲート化合物を、質量分析によって、捕獲し、検出し、分析し、スクリーニングし、特徴付けし、定量化するための方法に関する。また、本発明は、薬物動態学研究および毒物動態学研究のために質量分析用試料を調製するための方法にも関する。
本発明は概して、抗体−薬剤コンジュゲートやその断片および代謝産物を含む抗体コンジュゲート化合物を、質量分析によって、捕獲し、検出し、分析し、スクリーニングし、特徴付けし、定量化するための方法に関する。また、本発明は、薬物動態学研究および毒物動態学研究のために質量分析用試料を調製するための方法にも関する。
抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)は、非特異的な毒性を低減し、従来の小分子および抗体癌化学療法と比較して有効性を増やすように設計された標的抗癌治療法である。抗体−薬剤コンジュゲートは、非常に強力なコンジュゲートした小分子治療法を癌細胞に特異的に供給するために、モノクローナル抗体の強力なターゲティング能力を利用する。これらの抗体−薬剤コンジュゲートの薬物動態および毒性といった性質を評価するために、血漿、尿および他の生物学的な試料からそれらを特徴付けし、定量化することが可能であることは、有用である。さらに、同じ試料および同じクロマトグラフィの注入物による方法における遊離薬剤(抗体にコンジュゲートされていない薬剤)を定量化する能力も、有用である。
様々な質量分析技術、例えば電子衝撃(ＥＩ)、化学イオン化(ＣＩ)、脱着化学イオン化(ＤＣＩ)、高速原子衝撃(ＦＡＢ)、エレクトロスプレーイオン化(ＥＳＩ)、マトリックス支援レーザー脱離／イオン化(ＭＡＬＤＩ)、及び逆重畳積分のためのイオン選別の単イオンモニタリング(ＳＩＭ)(Souppart et al (2002) Jour. of Chrom. B 774:195-203；Wong et al (2001) Jour. of Chrom. 765:55-62；Yao et al (1998) Jour. of Chrom. B 718:77-85；Abdel-Hamid et al (2001) Jour. of Chrom. B 753:401-408；Marques et al (2001) Jour. of Chrom. 762:87-95)を含むタンデム質量分析(ＭＳ／ＭＳ)(Yao et al (2001) Jour. of Chrom. B 752:9-16；Royer et al (1995) Rapid Comm. in Mass Spec. 9:495-502)は、薬物動態学研究における小分子療法の同定および定量化のために使用されている。これらの方法および測定器は、十分な感度を得るために生体液から様々な分析物を分離することが必要である。このような精製は大きな労力を要する上に遅く、細胞培養培地、ヒトの血漿、尿および胆汁といった試料における対象の分析物の濃度が低いために大量の試料体液を必要とする。
様々な質量分析技術、例えば電子衝撃(ＥＩ)、化学イオン化(ＣＩ)、脱着化学イオン化(ＤＣＩ)、高速原子衝撃(ＦＡＢ)、エレクトロスプレーイオン化(ＥＳＩ)、マトリックス支援レーザー脱離／イオン化(ＭＡＬＤＩ)、及び逆重畳積分のためのイオン選別の単イオンモニタリング(ＳＩＭ)(Souppart et al (2002) Jour. of Chrom. B 774:195-203；Wong et al (2001) Jour. of Chrom. 765:55-62；Yao et al (1998) Jour. of Chrom. B 718:77-85；Abdel-Hamid et al (2001) Jour. of Chrom. B 753:401-408；Marques et al (2001) Jour. of Chrom. 762:87-95)を含むタンデム質量分析(ＭＳ／ＭＳ)(Yao et al (2001) Jour. of Chrom. B 752:9-16；Royer et al (1995) Rapid Comm. in Mass Spec. 9:495-502)は、薬物動態学研究における小分子療法の同定および定量化のために使用されている。これらの方法および測定器は、十分な感度を得るために生体液から様々な分析物を分離することが必要である。このような精製は大きな労力を要する上に遅く、細胞培養培地、ヒトの血漿、尿および胆汁といった試料における対象の分析物の濃度が低いために大量の試料体液を必要とする。
質量分析による検出／特徴付け／定量化と分離／単離／精製の初期段階工程との直接の組合せは、複合体生体試料の代謝研究に有用である。一般的に、ＬＣ／ＭＳは抗体の特徴付けのために使われ(Martin et al (1997) Cancer Chemother. Pharmacol. 40:189-201；国際公開０３／０４６５７１；国際公開０３／０４６５７２)、ＥＬＩＳＡは生物学的基質の定量化のために使われる(Murray et al (2001) J. Imm. Methods 255:41-56；Kirchner et al (2004) Clin. Pharmacokinetics 43(2): 83-95)。ＥＬＩＳＡアッセイは一般的に、高処理のスクリーニングに感受性が高く、適している。
質量分析(ＭＳ)によるタンパク質分析の最近の進歩は、エレクトロスプレーイオン化(ＥＳＩ)、マトリックス支援レーザー脱離イオン化(ＭＡＬＤＩ、米国公開特許２００３／００２７２１６)および表面増強レーザー脱離イオン化(ＳＥＬＤＩ、米国特許第６０２０２０８号)といった初期段階の気相イオン化と導入技術、並びに、計測器感度、分解能、質量精度、バイオインフォマティックスおよびソフトウェアデータ逆重畳積分アルゴリズム("Electrospray Ionization Mass Spectrometry: Fundamentals, Instrumentation, and Applications", Cole, R.B., Ed. (1997) Wiley, New York; "Modern Protein Chemistry: Practical Aspects", Howard, G.C. and Brown, W.E., Eds. (2002) CRC Press, Boca Raton, FL, p. 71-102;)の改良に因るものである。タンパク質の一次(配列)、二次及び三次構造はプローブ化され、ＭＳにより解明されうる。エレクトロスプレーイオン化(ＥＳＩ)は、液体試料の大気圧イオン化(ＡＰＩ)を提供する。エレクトロスプレー法は、蒸発の下で、溶液中に含まれる種を表すイオンを作り出す高度に荷電したドロップレットを作り出す。質量分析機のイオン-試料採集用開口部は、質量分析のためのこれらの気相イオンの見本を取るために用いられる。質量分析検出器によって測定される分析物の応答は、体液の分析物の濃度に依存し、体液流速には依存していない。
免疫親和性メンブラン(ＩＡＭ)キャプチャおよび質量分析による抗体−薬剤コンジュゲートを検出及びスクリーニングするための方法は開示されている(米国公開特許２００５／０２３２９２９)。
質量分析(ＭＳ)によるタンパク質分析の最近の進歩は、エレクトロスプレーイオン化(ＥＳＩ)、マトリックス支援レーザー脱離イオン化(ＭＡＬＤＩ、米国公開特許２００３／００２７２１６)および表面増強レーザー脱離イオン化(ＳＥＬＤＩ、米国特許第６０２０２０８号)といった初期段階の気相イオン化と導入技術、並びに、計測器感度、分解能、質量精度、バイオインフォマティックスおよびソフトウェアデータ逆重畳積分アルゴリズム("Electrospray Ionization Mass Spectrometry: Fundamentals, Instrumentation, and Applications", Cole, R.B., Ed. (1997) Wiley, New York; "Modern Protein Chemistry: Practical Aspects", Howard, G.C. and Brown, W.E., Eds. (2002) CRC Press, Boca Raton, FL, p. 71-102;)の改良に因るものである。タンパク質の一次(配列)、二次及び三次構造はプローブ化され、ＭＳにより解明されうる。エレクトロスプレーイオン化(ＥＳＩ)は、液体試料の大気圧イオン化(ＡＰＩ)を提供する。エレクトロスプレー法は、蒸発の下で、溶液中に含まれる種を表すイオンを作り出す高度に荷電したドロップレットを作り出す。質量分析機のイオン-試料採集用開口部は、質量分析のためのこれらの気相イオンの見本を取るために用いられる。質量分析検出器によって測定される分析物の応答は、体液の分析物の濃度に依存し、体液流速には依存していない。
免疫親和性メンブラン(ＩＡＭ)キャプチャおよび質量分析による抗体−薬剤コンジュゲートを検出及びスクリーニングするための方法は開示されている(米国公開特許２００５／０２３２９２９)。
本発明の一態様は、抗体コンジュゲート化合物及び組成物、抗体、及びそれらの断片ないし代謝産物を、免疫親和性ビーズキャプチャ、分離、クロマトグラフィおよび質量分析によって検出、スクリーニング、及び定量化するための方法を含む。質量分析の例示的な方法には、エレクトロスプレーイオン化(ＥＳＩ)、及び全スキャン質量分析(ＭＳ)が含まれる。
免疫親和性ビーズキャプチャは、(i) 強いストレプトアビジン−ビオチン相互作用、(ii) 対象タンパク質の分析のために十分な物質を捕獲する高い結合能、(iii) 低い非特異的結合、(iv) 質量分析適合溶剤による試料成分溶出、(v) 良好な試料回復、及び(vi) 自動化への従順さ、を利用するストレプトアビジンコート常磁性ビーズによって実施してよい。
免疫親和性ビーズキャプチャは、(i) 強いストレプトアビジン−ビオチン相互作用、(ii) 対象タンパク質の分析のために十分な物質を捕獲する高い結合能、(iii) 低い非特異的結合、(iv) 質量分析適合溶剤による試料成分溶出、(v) 良好な試料回復、及び(vi) 自動化への従順さ、を利用するストレプトアビジンコート常磁性ビーズによって実施してよい。
以下の式Ｉを有し、
Ａｂ−（Ｌ−Ｄ）ｐ Ｉ
このとき、
Ａｂが抗体であり、
Ｄがメイタンシノイド又はモノメチルアウリスタチン薬剤部分であり、
Ｌが、共有結合的にＡｂに接着し、共有結合的にＤに接着したリンカーであり、そして、 ｐが１、２、３、４、５、６、７又は８である、本発明の抗体コンジュゲート化合物。
Ａｂ−（Ｌ−Ｄ）ｐ Ｉ
このとき、
Ａｂが抗体であり、
Ｄがメイタンシノイド又はモノメチルアウリスタチン薬剤部分であり、
Ｌが、共有結合的にＡｂに接着し、共有結合的にＤに接着したリンカーであり、そして、 ｐが１、２、３、４、５、６、７又は８である、本発明の抗体コンジュゲート化合物。
本発明の一態様には、以下の工程を含む抗体−薬剤コンジュゲート化合物の検出方法が含まれる：
(i) 式Ｉを有する抗体−薬剤コンジュゲート化合物を提供すること；
(ii) 抗体−薬剤コンジュゲート化合物と、場合によってｐが０である式Ｉの抗体又はその抗体断片ないし代謝産物を、哺乳動物、組織、細胞培養物、血漿又は血清から選択される生物学的な供給源と接触させること；
(iii) 生物学的な供給源から生体試料を採取すること；
(iv) 処方し、固定し、遠心し、単離し、消化し、血液細胞凝集を誘導ないし予防し、加水分解し、又は精製することによって分析試料を生成するために生物学的試料を処理し、処理済みの分析試料を生成すること；
(v) 処理済みの分析試料に特異的な抗原を含む親和性成熟ビーズにて処理した分析試料を捕獲すること；
(vi) 処理した分析試料を溶出すること；
(vii) 分離培地に溶出した分析試料を置き、１より多くの試料成分を分離すること、このとき分離した試料成分は式Ｉを有する抗体−薬剤コンジュゲート化合物又はその抗体断片ないし代謝物を含み、ｐは０、１、２、３、４、５、６、７又は８である；そして、 (viii) 一又は複数の分離した試料成分の質量電荷比を質量分析によって確認すること。
(i) 式Ｉを有する抗体−薬剤コンジュゲート化合物を提供すること；
(ii) 抗体−薬剤コンジュゲート化合物と、場合によってｐが０である式Ｉの抗体又はその抗体断片ないし代謝産物を、哺乳動物、組織、細胞培養物、血漿又は血清から選択される生物学的な供給源と接触させること；
(iii) 生物学的な供給源から生体試料を採取すること；
(iv) 処方し、固定し、遠心し、単離し、消化し、血液細胞凝集を誘導ないし予防し、加水分解し、又は精製することによって分析試料を生成するために生物学的試料を処理し、処理済みの分析試料を生成すること；
(v) 処理済みの分析試料に特異的な抗原を含む親和性成熟ビーズにて処理した分析試料を捕獲すること；
(vi) 処理した分析試料を溶出すること；
(vii) 分離培地に溶出した分析試料を置き、１より多くの試料成分を分離すること、このとき分離した試料成分は式Ｉを有する抗体−薬剤コンジュゲート化合物又はその抗体断片ないし代謝物を含み、ｐは０、１、２、３、４、５、６、７又は８である；そして、 (viii) 一又は複数の分離した試料成分の質量電荷比を質量分析によって確認すること。
本発明の他の態様には、以下の工程を含む、哺乳動物において、抗体−薬剤コンジュゲート化合物の混合物をスクリーニングして、化合物又はその断片ないし代謝物のクリアランスを決定する方法を含む：
(i) 式Ｉを有する抗体−薬剤コンジュゲート化合物の混合物を提供すること、このとき該混合物は場合によって、ｐが０である抗体又はその断片ないし代謝物を含み；
(ii) 哺乳動物に混合物を投与すること；
(iii) 混合物が投与された哺乳動物から血液試料又は排出物を採取すること；
(iv) 処方し、固定し、遠心し、単離し、消化し、血液細胞凝集を誘導ないし予防し、加水分解し、又は精製することによって分析試料を生成するために血液試料又は排出物を処理し、処理済みの分析試料を生成すること；
(v) 処理済みの分析試料に特異的な抗原を含む免疫親和性ビーズにて処理済みの分析試料を捕獲すること；
(vi) 処理済みの分析試料を溶出すること；
(vii) 分離培地に血液試料、排出物又は分析試料を置き、１より多くの試料成分を分離すること、このとき分離した試料成分は式Ｉを有する抗体−薬剤コンジュゲート化合物又はその抗体断片ないし代謝物を含み、ｐは０、１、２、３、４、５、６、７又は８であり；そして、
(viii) 一又は複数の分離した試料成分の質量電荷比を質量分析によって確認すること。
(i) 式Ｉを有する抗体−薬剤コンジュゲート化合物の混合物を提供すること、このとき該混合物は場合によって、ｐが０である抗体又はその断片ないし代謝物を含み；
(ii) 哺乳動物に混合物を投与すること；
(iii) 混合物が投与された哺乳動物から血液試料又は排出物を採取すること；
(iv) 処方し、固定し、遠心し、単離し、消化し、血液細胞凝集を誘導ないし予防し、加水分解し、又は精製することによって分析試料を生成するために血液試料又は排出物を処理し、処理済みの分析試料を生成すること；
(v) 処理済みの分析試料に特異的な抗原を含む免疫親和性ビーズにて処理済みの分析試料を捕獲すること；
(vi) 処理済みの分析試料を溶出すること；
(vii) 分離培地に血液試料、排出物又は分析試料を置き、１より多くの試料成分を分離すること、このとき分離した試料成分は式Ｉを有する抗体−薬剤コンジュゲート化合物又はその抗体断片ないし代謝物を含み、ｐは０、１、２、３、４、５、６、７又は８であり；そして、
(viii) 一又は複数の分離した試料成分の質量電荷比を質量分析によって確認すること。
本発明は、添付の図面、図および実施例と併せて、以下の例示的な実施態様の詳細な解説を参照することによって理解されるであろう。下記の考察は記載、図示そして例示であって、添付の特許請求の範囲のいずれかによって定義される範囲を限定するものとみなされるものではない。
例示的実施態様の詳細な説明
ここで、本発明のある実施態様を詳細に参照するが、その例を添付の構造及び式で例証する。本発明を列挙する実施態様と併せて説明するが、それらは本発明をその実施態様に限定することを意図するものではないことは理解されよう。それどころか、本発明は特許請求の範囲によって定まる本発明の範囲に含まれうるあらゆる代替例、変形例、及び均等物を包含することが意図される。当業者であれば、本発明の実施において使用されうるここに記載のものと同様な又は均等な多くの方法及び材料が分かるであろう。本発明は記載された方法及び材料に決して限定されるものではない。
特に定義のない限り、本明細書中で用いた技術及び科学用語は、本発明が属する分野の当業者が共通して理解するものと同じ意味を有し、以下と一致している：Singleton et al, (1994) "Dictionary of Microbiology and Molecular Biology", 2nd Ed., J. Wiley & Sons, New York, NY；及びJaneway, et al (2001) "Immunobiology", 5th Ed., Garland Publishing, New York。本明細書中で商標名が用いられる場合、出願人は、商品名生成物の商品名生成物製剤、後発品および活性な製薬成分(一又は複数)をそれぞれ含むことを意図する。
ここで、本発明のある実施態様を詳細に参照するが、その例を添付の構造及び式で例証する。本発明を列挙する実施態様と併せて説明するが、それらは本発明をその実施態様に限定することを意図するものではないことは理解されよう。それどころか、本発明は特許請求の範囲によって定まる本発明の範囲に含まれうるあらゆる代替例、変形例、及び均等物を包含することが意図される。当業者であれば、本発明の実施において使用されうるここに記載のものと同様な又は均等な多くの方法及び材料が分かるであろう。本発明は記載された方法及び材料に決して限定されるものではない。
特に定義のない限り、本明細書中で用いた技術及び科学用語は、本発明が属する分野の当業者が共通して理解するものと同じ意味を有し、以下と一致している：Singleton et al, (1994) "Dictionary of Microbiology and Molecular Biology", 2nd Ed., J. Wiley & Sons, New York, NY；及びJaneway, et al (2001) "Immunobiology", 5th Ed., Garland Publishing, New York。本明細書中で商標名が用いられる場合、出願人は、商品名生成物の商品名生成物製剤、後発品および活性な製薬成分(一又は複数)をそれぞれ含むことを意図する。
定義
特段の記載がない限り、本明細書中で用いる以下の用語及び表現は以下の意味を有することが意図される。
特段の記載がない限り、本明細書中で用いる以下の用語及び表現は以下の意味を有することが意図される。
「抗体」は最も広い意味で用いられ、特に、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体、多特異性抗体(例えば二重特異性抗体)および抗体断片を包含する。抗体は、マウス、ヒト、ヒト化、キメラ、または他の種由来のものであってよい。抗体は、特異的な抗原を認識して結合することができる免疫系によって生成されるタンパク質である。(Janeway, et al (2001) "Immunobiology", 5th Ed., Garland Publishing, New York)。標的抗原は一般に、エピトープとも呼ばれ、複数の抗体上のＣＤＲによって認識される多数の結合部位を有する。異なるエピトープに特異的に結合する各々の抗体は異なる構造を有する。よって、１つの抗原は１より多い対応する抗体を有しうる。また、抗体は、完全長免疫グロブリン分子又は完全長免疫グロブリン分子の免疫学的に活性な部分、すなわち限定するものではないが、癌細胞又は自己免疫性疾患と関連した自己免疫抗体を産生する細胞を含む標的などの対象の標的の抗原ないしその一部を免疫特異的に結合する抗原結合部位を含む分子を指す。本明細書において開示される免疫グロブリンは、免疫グロブリン分子のいずれかのタイプ(例えばＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤおよびＩｇＡ)、クラス(例えばＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３、ＩｇＧ４、ＩｇＡ１およびＩｇＡ２)又はサブクラスのものであってよい。免疫グロブリンは任意の種から得られてよい。一態様では、しかしながら、免疫グロブリンは、ヒト、マウス又はウサギ起源のものである。
「抗体断片」には、完全長抗体の一部、一般に抗原結合又はその可変領域が含まれる。抗体断片の例には、Ｆａｂ、Ｆａｂ'、Ｆ(ａｂ')２およびＦｖ断片；ダイアボディ；線状抗体；Ｆａｂ発現ライブラリーによって生産される断片、抗イディオタイプ(抗Ｉｄ)抗体、ＣＤＲ(相補性決定領域)、ＥＣＤ(細胞外ドメイン)、及び癌細胞抗原、ウイルス抗原又は微生物抗原、単鎖抗体分子に免疫特異的に結合する上記の何れかのエピトープ結合断片；及び抗体断片から形成される多重特異性抗体が含まれる。
本明細書における「インタクトな抗体」は、抗原結合性可変領域ＶＬおよびＶＨドメイン、並びに完全な軽鎖および重鎖定常ドメイン(ＣＬ)および重鎖定常ドメイン、ＣＨ１、ＣＨ２およびＣＨ３を含むものである。定常ドメインは、天然の配列定常ドメイン(例えばヒト天然配列定常ドメイン)又はそのアミノ酸配列変異体であってもよい。インタクトな抗体は、抗体のＦｃ領域(天然配列Ｆｃ領域又はアミノ酸配列変異体Ｆｃ領域)に起因する生物活性を意味する一又は複数の「エフェクター機能」を有してよい。抗体エフェクター機能の例には、Ｃ１ｑ結合；補体依存性細胞障害作用；Ｆｃレセプター結合；抗体依存性細胞媒介性細胞障害作用(ＡＤＣＣ)；食作用；細胞表面レセプターの下方制御(例えばＢ細胞レセプター；ＢＣＲ)などが含まれる。
本明細書における「インタクトな抗体」は、抗原結合性可変領域ＶＬおよびＶＨドメイン、並びに完全な軽鎖および重鎖定常ドメイン(ＣＬ)および重鎖定常ドメイン、ＣＨ１、ＣＨ２およびＣＨ３を含むものである。定常ドメインは、天然の配列定常ドメイン(例えばヒト天然配列定常ドメイン)又はそのアミノ酸配列変異体であってもよい。インタクトな抗体は、抗体のＦｃ領域(天然配列Ｆｃ領域又はアミノ酸配列変異体Ｆｃ領域)に起因する生物活性を意味する一又は複数の「エフェクター機能」を有してよい。抗体エフェクター機能の例には、Ｃ１ｑ結合；補体依存性細胞障害作用；Ｆｃレセプター結合；抗体依存性細胞媒介性細胞障害作用(ＡＤＣＣ)；食作用；細胞表面レセプターの下方制御(例えばＢ細胞レセプター；ＢＣＲ)などが含まれる。
「モノクローナル抗体」は、実質的に均一な抗体の集団から得られる抗体を意味する、すなわち、集団に含まれる個々の抗体が、少量で存在しうる自然に生じる可能性のある突然変異を除いて同一である。モノクローナル抗体は高度に特異的であり、一つの抗原部位に対している。さらに、異なる決定基(エピトープ)に対する異なる抗体を含むポリクローナル抗体調製物と比べて、各モノクローナル抗体は、抗原上の単一の決定基に対するものである。その特異性に加えて、モノクローナル抗体は、他の抗体によって汚染されずに合成される点で有利である。「モノクローナル」との修飾詞は、抗体の実質的に均一な集団から得られている抗体の性質を表すものであって、抗体を何か特定の方法で生成しなければならないことを意味するものではない。例えば、本発明において有用なモノクローナル抗体は、最初にKohler et al (1975) Nature 256:495により記載されたハイブリドーマ法によって作ることができ、あるいは組換えＤＮＡ法(米国特許第４８１６５６７号を参照)によって作られてもよい(例えば、米国特許第４８１６５６７号参照)。また「モノクローナル抗体」は、例えばClackson et al (1991) Nature, 352:624-628；Marks et al (1991) J. Mol. Biol., 222:581-597に記載された技術を用いてファージ抗体ライブラリーから単離してもよい。
本明細書中のモノクローナル抗体には特に、特定の種由来または特定の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体の対応する配列に同一または類似する重鎖および／または軽鎖の一部を含み、残りの鎖は、所望の生物学的活性を表す限り、他の種由来または他の抗体クラスもしくはサブクラスに属する抗体並びに該抗体の抗体断片の対応する配列に同一または類似する「キメラ」抗体が含まれる（米国特許第４８１６５６７号；およびMorrison et al (1984) Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81:6851-6855)。ここで対象とするキメラ抗体には、非ヒト霊長類(例えば旧世界ザル、サルなど)及びヒト定常領域配列由来の可変ドメイン抗原結合配列を含む「霊長類化」抗体が含まれる。
「生物学的試料(生体試料)」は、(i) 血液、胆汁、尿又は糞便；(ii) 組織抽出物；及び(iii) 細胞培養物、細胞溶解物又は細胞抽出物を意味する。
「生体起源」は、(i) 哺乳動物、例えばマウス、ラット、ウサギ、イヌ、サル又はヒト；(ii) 哺乳類の組織；及び(iii) 培養細胞を意味する。
「標識」は、抗体に共有結合的に接着し得、(i) 検出可能なシグナルを生じる；(ii) 第二標識と相互作用して、第一又は第二標識、例えばＦＲＥＴ(蛍光共鳴エネルギー転移)によって生じる検出可能なシグナルを修飾する；(iii) 抗原又はリガンドとの相互作用を安定させるかまたは結合の親和性を増やす；(iv) 電荷、疎水性、形状又は他の物理学的パラメータによって、移動度、例えば電気泳動移動度又は細胞透過性に作用する、又は(v) キャプチャ分子を生じさせ、リガンド親和性、抗体／抗原結合又はイオン複合体調節するために機能する、任意の部分を意味する。
「生体起源」は、(i) 哺乳動物、例えばマウス、ラット、ウサギ、イヌ、サル又はヒト；(ii) 哺乳類の組織；及び(iii) 培養細胞を意味する。
「標識」は、抗体に共有結合的に接着し得、(i) 検出可能なシグナルを生じる；(ii) 第二標識と相互作用して、第一又は第二標識、例えばＦＲＥＴ(蛍光共鳴エネルギー転移)によって生じる検出可能なシグナルを修飾する；(iii) 抗原又はリガンドとの相互作用を安定させるかまたは結合の親和性を増やす；(iv) 電荷、疎水性、形状又は他の物理学的パラメータによって、移動度、例えば電気泳動移動度又は細胞透過性に作用する、又は(v) キャプチャ分子を生じさせ、リガンド親和性、抗体／抗原結合又はイオン複合体調節するために機能する、任意の部分を意味する。
抗体
式Ｉの抗体ユニット(Ａｂ−)は、所定の標的細胞集団と関連するレセプター、抗原又は他の受容性部分と結合するか又は反応的に結合するか又は複合体化する抗体(Ａｂ)の任意のユニットをその範囲内に包含する。抗体は、治療上又は生物学上修飾される細胞集団の部分と結合する、複合体化する又は相互作用する任意のタンパク質ないしタンパク質様分子でありうる。一態様では、抗体ユニットは、抗体ユニットが反応する特定の標的細胞集団へ薬剤ユニットを運搬するように働く。このような抗体には、限定するものではないが、完全長抗体及び抗体断片といった大きな分子量タンパク質が含まれる。
式Ｉの抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)にＡｂを含み、癌の治療に有用となりうる抗体には、腫瘍関連抗原(ＴＡＡ)に対する抗体を含むが、これに限定されるものではない。このような腫瘍関連抗原は当分野で公知であり、当分野で周知である方法および情報を使用して抗体を生成するために調製されてよい。癌の診断及び治療のために有効な細胞標的を発見するために、研究者は、一又は複数の正常非癌性細胞と比較して、一又は複数の特定の種類の癌細胞の表面上に特異的に発現される膜貫通あるいは腫瘍関連のポリペプチドを同定することを目的としている。多くの場合、このような腫瘍関連ポリペプチドは、非癌性細胞の表面上と比較して癌細胞の表面上に多く発現される。このような腫瘍関連細胞表面抗原ポリペプチドの同定により、抗体ベースの治療法による破壊のために癌細胞を特異的に標的化する能力が生じる。
式Ｉの抗体ユニット(Ａｂ−)は、所定の標的細胞集団と関連するレセプター、抗原又は他の受容性部分と結合するか又は反応的に結合するか又は複合体化する抗体(Ａｂ)の任意のユニットをその範囲内に包含する。抗体は、治療上又は生物学上修飾される細胞集団の部分と結合する、複合体化する又は相互作用する任意のタンパク質ないしタンパク質様分子でありうる。一態様では、抗体ユニットは、抗体ユニットが反応する特定の標的細胞集団へ薬剤ユニットを運搬するように働く。このような抗体には、限定するものではないが、完全長抗体及び抗体断片といった大きな分子量タンパク質が含まれる。
式Ｉの抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)にＡｂを含み、癌の治療に有用となりうる抗体には、腫瘍関連抗原(ＴＡＡ)に対する抗体を含むが、これに限定されるものではない。このような腫瘍関連抗原は当分野で公知であり、当分野で周知である方法および情報を使用して抗体を生成するために調製されてよい。癌の診断及び治療のために有効な細胞標的を発見するために、研究者は、一又は複数の正常非癌性細胞と比較して、一又は複数の特定の種類の癌細胞の表面上に特異的に発現される膜貫通あるいは腫瘍関連のポリペプチドを同定することを目的としている。多くの場合、このような腫瘍関連ポリペプチドは、非癌性細胞の表面上と比較して癌細胞の表面上に多く発現される。このような腫瘍関連細胞表面抗原ポリペプチドの同定により、抗体ベースの治療法による破壊のために癌細胞を特異的に標的化する能力が生じる。
ＴＡＡの例には以下に列挙するＴＡＡ(１)−(３５)が含まれるが、これらに限定されるものではない。便宜上、これらの抗原に関する情報(その全ては当分野で公知である)を以下に列挙し、名前、別名、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号および基本的な参照(一又は複数)を含む。抗体の標的となる腫瘍関連抗原には、引例文献において同定された配列と比較して少なくともおよそ７０％、８０％、８５％、９０％又は９５％の配列同一性を有するか又は、引用文献に見られる配列を有するＴＡＡと実質的に同じ生物学的特性又は特徴を表すすべてのアミノ酸配列変異体及びアイソフォームが含まれる。例えば、変異配列を有するＴＡＡは一般に、列挙した対応する配列を有するＴＡＡに特異的に結合する抗体に結合することが可能である。本明細書において特別に引用される文献中の配列と開示内容は、出典明記によって特別に本明細書中に援用される。
腫瘍関連抗原(１)−(３６)：
(１) ＢＭＰＲ１Ｂ (骨形態形成タンパク質レセプタータイプＩＢ、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＭ_００１２０３) ten Dijke,P., et al Science 264 (5155): 101-104 (1994), Oncogene 14 (11): 1377-1382 (1997))；国際公開２００４０６３３６２(請求項２)；国際公開２００３０４２６６１(請求項１２)；米国公開特許２００３１３４７９０Ａ１(３８〜３９頁)；国際公開２００２１０２２３５(請求項１３；２９６頁)；国際公開２００３０５５４４３(９１〜９２頁)；国際公開２００２９９１２２(実施例２；５２８〜５３０頁)；国際公開２００３０２９４２１(請求項６)；国際公開２００３０２４３９２(請求項２；図１１２)；国際公開２００２９８３５８(請求項１；１８３頁)；国際公開２００２５４９４０(１００〜１０１頁)；国際公開２００２５９３７７(３４９〜３５０頁)；国際公開２００２３０２６８(請求項２７；３７６頁)；国際公開２００１４８２０４(実施例；図４)。ＮＰ＿００１１９４骨形態形成タンパク質レセプタータイプＩＢ／ｐｉｄ＝ＮＰ＿００１１９４.１-相互参照：ＭＩＭ：６０３２４８;ＮＰ＿００１１９４.１；ＮＭ_００１２０３_１
(１) ＢＭＰＲ１Ｂ (骨形態形成タンパク質レセプタータイプＩＢ、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＭ_００１２０３) ten Dijke,P., et al Science 264 (5155): 101-104 (1994), Oncogene 14 (11): 1377-1382 (1997))；国際公開２００４０６３３６２(請求項２)；国際公開２００３０４２６６１(請求項１２)；米国公開特許２００３１３４７９０Ａ１(３８〜３９頁)；国際公開２００２１０２２３５(請求項１３；２９６頁)；国際公開２００３０５５４４３(９１〜９２頁)；国際公開２００２９９１２２(実施例２；５２８〜５３０頁)；国際公開２００３０２９４２１(請求項６)；国際公開２００３０２４３９２(請求項２；図１１２)；国際公開２００２９８３５８(請求項１；１８３頁)；国際公開２００２５４９４０(１００〜１０１頁)；国際公開２００２５９３７７(３４９〜３５０頁)；国際公開２００２３０２６８(請求項２７；３７６頁)；国際公開２００１４８２０４(実施例；図４)。ＮＰ＿００１１９４骨形態形成タンパク質レセプタータイプＩＢ／ｐｉｄ＝ＮＰ＿００１１９４.１-相互参照：ＭＩＭ：６０３２４８;ＮＰ＿００１１９４.１；ＮＭ_００１２０３_１
(２) Ｅ１６ (ＬＡＴ１、ＳＬＣ７Ａ５、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＭ_００３４８６) Biochem. Biophys. Res. Commun. 255 (2), 283-288 (1999)、Nature 395 (6699): 288-291 (1998)、Gaugitsch, H.W., et al (1992) J. Biol. Chem. 267 (16): 11267-11273)；国際公開２００４０４８９３８(実施例２)；国際公開２００４０３２８４２(実施例ＩＶ)；国際公開２００３０４２６６１(請求項１２)；国際公開２００３０１６４７５(請求項１)；国際公開２００２７８５２４(実施例２)；国際公開２００２９９０７４(請求項１９；１２７〜１２９頁)；国際公開２００２８６４４３(請求項２７；２２２頁、３９３頁)；国際公開２００３００３９０６(請求項１０；２９３頁)；国際公開２００２６４７９８(請求項３３；９３〜９５頁)；国際公開２０００１４２２８(請求項５；１３３〜１３６頁)；米国公開特許２００３２２４４５４(図３)；国際公開２００３０２５１３８(請求項１２；１５０頁)；ＮＰ＿００３４７７溶質輸送体ファミリ７(カチオンアミノ酸輸送体、ｙ＋ｓｙｓｔｅｍ)、メンバー５／ｐｉｄ＝ＮＰ＿００３４７７.３ − ヒト。相互参照：ＭＩＭ：６００１８２;ＮＰ＿００３４７７.３；ＮＭ_０１５９２３；ＮＭ_００３４８６_１
(３) ＳＴＥＡＰ１ (前立腺の６回膜貫通上皮性抗原、Ｇｅｎｂａｎｋ 受託番号ＮＭ_０１２４４９) Cancer Res. 61 (15), 5857-5860 (2001)、Hubert, R.S., et al (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96 (25): 14523-14528)；国際公開２００４０６５５７７(請求項６)；国際公開２００４０２７０４９(図１Ｌ)；ＥＰ１３９４２７４(実施例１１)；国際公開２００４０１６２２５(請求項２)；国際公開２００３０４２６６１(請求項１２)；米国公開特許２００３１５７０８９(実施例５)；米国公開特許２００３１８５８３０(実施例５)；米国公開特許２００３０６４３９７(図２)；国際公開２００２８９７４７(実施例５；６１８〜６１９頁)；国際公開２００３０２２９９５(実施例９；図１３Ａ、実施例５３；１７３頁、実施例２；図２Ａ)；ＮＰ＿０３６５８１ 前立腺の６回膜貫通上皮性抗原。相互参照：ＭＩＭ：６０４４１５;ＮＰ＿０３６５８１.１；ＮＭ_０１２４４９_１
(４) ０７７２Ｐ (ＣＡ１２５、ＭＵＣ１６、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＡＦ３６１４８６) J. Biol. Chem. 276 (29): 27371-27375 (2001))；国際公開２００４０４５５５３(請求項１４)；国際公開２００２９２８３６(請求項６；図１２)；国際公開２００２８３８６６(請求項１５；１１６〜１２１頁)；米国公開特許２００３１２４１４０(実施例１６)；米国公開特許２００３０９１５８０(請求項６)；国際公開２００２０６３１７(請求項６；４００〜４０８頁)；相互参照：ＧＩ：３４５０１４６７;ＡＡＫ７４１２０.３；ＡＦ３６１４８６＿１
(５) ＭＰＦ (ＭＰＦ、ＭＳＬＮ、ＳＭＲ、拒核球増強因子、メソテリン、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＭ_００５８２３) Yamaguchi, N., et al Biol. Chem. 269 (2), 805-808 (1994)、Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96 (20): 11531-11536 (1999)、Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93 (1): 136-140 (1996)、J. Biol. Chem. 270 (37): 21984-21990 (1995))；国際公開２００３１０１２８３(請求項１４)；(国際公開２００２１０２２３５(請求項１３；２８７〜２８８頁)；国際公開２００２１０１０７５(請求項４；３０８〜３０９頁)；国際公開２００２７１９２８(３２０〜３２１頁)；国際公開９４１０３１２(５２〜５７頁)；相互参照：ＭＩＭ：６０１０５１;ＮＰ＿００５８１４.２；ＮＭ_００５８２３_１
(６) Ｎａｐｉ３ｂ (ＮＡＰＩ-３Ｂ、ＮＰＴＩＩｂ、ＳＬＣ３４Ａ２、溶質輸送体ファミリ３４(リン酸ナトリウム)、メンバー２、タイプＩＩナトリウム依存性リン酸輸送体３ｂ、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＭ_００６４２４) J. Biol. Chem. 277 (22): 19665-19672 (2002)、Genomics 62 (2): 281-284 (1999)、Feild, J.A., et al (1999) Biochem. Biophys. Res. Commun. 258 (3): 578-582)；国際公開２００４０２２７７８(請求項２)；ＥＰ１３９４２７４(実施例１１)；国際公開２００２１０２２３５(請求項１３；３２６頁)；欧州特許第８７５５６９号(請求項１；１７〜１９頁)；国際公開２００１５７１８８(請求項２０；３２９頁)；国際公開２００４０３２８４２(実施例ＩＶ)；国際公開２００１７５１７７(請求項２４；１３９〜１４０頁)；相互参照：ＭＩＭ：６０４２１７;ＮＰ＿００６４１５.１；ＮＭ_００６４２４_１
(７) Ｓｅｍａ ５ｂ (ＦＬＪ１０３７２、ＫＩＡＡ１４４５、Ｍｍ.４２０１５、ＳＥＭＡ５Ｂ、ＳＥＭＡＧ、セマフォリン５ｂ Ｈｌｏｇ、セマドメイン、７トロンボスポンジンリピート(タイプ１及びタイプ１様)、膜貫通ドメイン(ＴＭ)及び短い細胞質ドメイン、(セマフォリン)５Ｂ、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＡＢ０４０８７８) Nagase T., et al (2000) DNA Res. 7 (2): 143-150)；国際公開２００４０００９９７(請求項１)；国際公開２００３００３９８４(請求項１)；国際公開２００２０６３３９(請求項１；５０頁)；国際公開２００１８８１３３(請求項１；４１〜４３頁、４８〜５８頁)；国際公開２００３０５４１５２(請求項２０)；国際公開２００３１０１４００(請求項１１)；受託：Ｑ９Ｐ２８３；ＥＭＢＬ；ＡＢ０４０８７８；ＢＡＡ９５９６９.１。Ｇｅｎｅｗ；ＨＧＮＣ：１０７３７;
(８) ＰＳＣＡ ｈｌｇ(２７０００５０Ｃ１２Ｒｉｋ、Ｃ５３０００８Ｏ１６Ｒｉｋ、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ２７０００５０Ｃ１２、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ２７０００５０Ｃ１２遺伝子、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＡＹ３５８６２８)；米国公開特許２００３１２９１９２(請求項２)；米国公開特許２００４０４４１８０(請求項１２)；米国公開特許２００４０４４１７９(請求項１１)；米国公開特許２００３０９６９６１(請求項１１)；米国公開特許２００３２３２０５６(実施例５)；国際公開２００３１０５７５８(請求項１２)；米国公開特許２００３２０６９１８(実施例５)；ＥＰ１３４７０４６(請求項１)；国際公開２００３０２５１４８(請求項２０)；相互参照：ＧＩ：３７１８２３７８;ＡＡＱ８８９９１.１；ＡＹ３５８６２８＿１
(９) ＥＴＢＲ (エンドセリンタイプＢレセプター、Ｇｅｎｂａｎｋ 受託番号ＡＹ２７５４６３)；Nakamuta M., et al Biochem. Biophys. Res. Commun. 177, 34-39, 1991；Ogawa Y., et al Biochem. Biophys. Res. Commun. 178, 248-255, 1991；Arai H., et al Jpn. Circ. J. 56, 1303-1307, 1992；Arai H., et al J. Biol. Chem. 268, 3463-3470, 1993；Sakamoto A., Yanagisawa M., et al Biochem. Biophys. Res. Commun. 178, 656-663, 1991；Elshourbagy N.A., et al J. Biol. Chem. 268, 3873-3879, 1993；Haendler B., et al J. Cardiovasc. Pharmacol. 20, s1-S4, 1992；Tsutsumi M., et al Gene 228, 43-49, 1999；Strausberg R.L., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99, 16899-16903, 2002；Bourgeois C., et al J. Clin. Endocrinol. Metab. 82, 3116-3123, 1997；Okamoto Y., et al Biol. Chem. 272, 21589-21596, 1997；Verheij J.B., et al Am. J. Med. Genet. 108, 223-225, 2002；Hofstra R.M.W., et al Eur. J. Hum. Genet. 5, 180-185, 1997；Puffenberger E.G., et al Cell 79, 1257-1266, 1994；Attie T., et al, Hum. Mol. Genet. 4, 2407-2409, 1995；Auricchio A., et al Hum. Mol. Genet. 5:351-354, 1996；Amiel J., et al Hum. Mol. Genet. 5, 355-357, 1996；Hofstra R.M.W., et al Nat. Genet. 12, 445-447, 1996；Svensson P.J., et al Hum. Genet. 103, 145-148, 1998；Fuchs S., et al Mol. Med. 7, 115-124, 2001；Pingault V., et al (2002) Hum. Genet. 111, 198-206；国際公開２００４０４５５１６(請求項１)；国際公開２００４０４８９３８(実施例２)；国際公開２００４０４００００(請求項１５１)；国際公開２００３０８７７６８(請求項１)；国際公開２００３０１６４７５(請求項１)；国際公開２００３０１６４７５(請求項１)；国際公開２００２６１０８７(図１)；国際公開２００３０１６４９４(図６)；国際公開２００３０２５１３８(請求項１２；１４４頁)；国際公開２００１９８３５１(請求項１；１２４〜１２５頁)；欧州特許第５２２８６８号(請求項８；図２)；国際公開２００１７７１７２(請求項１；２９７〜２９９頁)；米国公開特許２００３１０９６７６；米国特許第６５１８４０４(図３)；米国特許第５７７３２２３(請求項１ａ；段落３１〜３４)；国際公開２００４００１００４；
(１０) ＭＳＧ７８３ (ＲＮＦ１２４、推定タンパク質ＦＬＪ２０３１５、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＭ_０１７７６３)；国際公開２００３１０４２７５(請求項１)；国際公開２００４０４６３４２(実施例２)；国際公開２００３０４２６６１(請求項１２)；国際公開２００３０８３０７４(請求項１４；６１頁)；国際公開２００３０１８６２１(請求項１)；国際公開２００３０２４３９２(請求項２；図９３)；国際公開２００１６６６８９(実施例６)；相互参照：ＬｏｃｕｓＩＤ：５４８９４;ＮＰ＿０６０２３３.２；ＮＭ_０１７７６３_１
(１１) ＳＴＥＡＰ２ (ＨＧＮＣ_８６３９、ＩＰＣＡ-１、ＰＣＡＮＡＰ１、ＳＴＡＭＰ１、ＳＴＥＡＰ２、ＳＴＭＰ、前立腺癌関連遺伝子１、前立腺癌関連タンパク質１、前立腺の６回膜貫通上皮性抗原２、６回膜貫通前立腺タンパク質、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＡＦ４５５１３８) Lab. Invest. 82 (11): 1573-1582 (2002))；国際公開２００３０８７３０６；米国公開特許２００３０６４３９７(請求項１；図１)；国際公開２００２７２５９６(請求項１３；５４〜５５頁)；国際公開２００１７２９６２(請求項１；図４Ｂ)；国際公開２００３１０４２７０(請求項１１)；国際公開２００３１０４２７０(請求項１６)；米国公開特許２００４００５５９８(請求項２２)；国際公開２００３０４２６６１(請求項１２)；米国公開特許２００３０６０６１２(請求項１２；図１０)；国際公開２００２２６８２２(請求項２３；図２)；国際公開２００２１６４２９(請求項１２；図１０)；相互参照：ＧＩ：２２６５５４８８;ＡＡＮ０４０８０.１；ＡＦ４５５１３８＿１
(１２) ＴｒｐＭ４ (ＢＲ２２４５０、ＦＬＪ２００４１、ＴＲＰＭ４、ＴＲＰＭ４Ｂ、一過性受容器電位カチオンチャネル、サブファミリＭ、メンバー４、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＭ_０１７６３６) Xu, X.Z., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98 (19): 10692-10697 (2001)、Cell 109 (3): 397-407 (2002)、J. Biol. Chem. 278 (33): 30813-30820 (2003))；米国公開特許２００３１４３５５７(請求項４)；国際公開２０００４０６１４(請求項１４；１００〜１０３頁)；国際公開２００２１０３８２(請求項１；図９Ａ)；国際公開２００３０４２６６１(請求項１２)；国際公開２００２３０２６８(請求項２７；３９１頁)；米国公開特許２００３２１９８０６(請求項４)；国際公開２００１６２７９４(請求項１４；図１Ａ−Ｄ)；相互参照：ＭＩＭ：６０６９３６;ＮＰ＿０６０１０６.２；ＮＭ_０１７６３６_１
(１３) ＣＲＩＰＴＯ (ＣＲ、ＣＲ１、ＣＲＧＦ、ＣＲＩＰＴＯ、ＴＤＧＦ１、テトラカルチノーマ由来の増殖因子、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＰ_００３２０３又はＮＭ_００３２１２) Ciccodicola, A., et al EMBO J. 8 (7): 1987-1991 (1989)、Am. J. Hum. Genet. 49 (3): 555-565 (1991))；米国公開特許２００３２２４４１１(請求項１)；国際公開２００３０８３０４１(実施例１)；国際公開２００３０３４９８４(請求項１２)；国際公開２００２８８１７０(請求項２；５２〜５３頁)；国際公開２００３０２４３９２(請求項２；図５８)；国際公開２００２１６４１３(請求項１；９４〜９５頁、１０５頁)；国際公開２００２２２８０８(請求項２；図１)；米国特許第５８５４３９９(実施例２；段落１７−１８)；米国特許第５７９２６１６(図２)；相互参照：ＭＩＭ：１８７３９５;ＮＰ＿００３２０３.１；ＮＭ_００３２１２_１
(１４) ＣＤ２１ (ＣＲ２ (補体レセプター２)又はＣ３ＤＲ (Ｃ３ｄ/エプスタインバーウイルスレセプター)又はＨｓ.７３７９２ Ｇｅｎｂａｎｋ 受託番号Ｍ２６００４) Fujisaku et al (1989) J. Biol. Chem. 264 (4): 2118-2125)；Weis J.J., et al J. Exp. Med. 167, 1047-1066, 1988；Moore M., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84, 9194-9198, 1987；Barel M., et al Mol. Immunol. 35, 1025-1031, 1998；Weis J.J., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 83, 5639-5643, 1986；Sinha S.K., et al (1993) J. Immunol. 150, 5311-5320；国際公開２００４０４５５２０(実施例４)；米国公開特許２００４００５５３８(実施例１)；国際公開２００３０６２４０１(請求項９)；国際公開２００４０４５５２０(実施例４)；国際公開９１０２５３６(図９．１−９．９)；国際公開２００４０２０５９５(請求項１)；受託：Ｐ２００２３；Ｑ１３８６６；Ｑ１４２１２；ＥＭＢＬ；Ｍ２６００４；ＡＡＡ３５７８６.１。
(１５) ＣＤ７９ｂ (ＣＤ７９Ｂ、ＣＤ７９、ＩＧｂ (免疫グロブリン関連β)、Ｂ２９、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＭ_０００６２６又は１１０３８６７４) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (2003) 100 (7): 4126-4131、Blood (2002) 100 (9): 3068-3076、Muller et al (1992) Eur. J. Immunol. 22 (6): 1621-1625)；国際公開２００４０１６２２５(請求項２、図１４０)；国際公開２００３０８７７６８、米国公開特許２００４１０１８７４(請求項１、１０２頁)；国際公開２００３０６２４０１(請求項９)；国際公開２００２７８５２４(実施例２)；米国公開特許２００２１５０５７３(請求項５、１５頁)；米国特許第５６４４０３３号；国際公開２００３０４８２０２(請求項１、３０６および３０９頁)；国際公開 ９９／５５８６５８、米国特許第６５３４４８２号(請求項１３、図１７Ａ／Ｂ)；国際公開２０００５５３５１(請求項１１、１１４５〜１１４６頁)；相互参照：ＭＩＭ：１４７２４５;ＮＰ＿０００６１７.１；ＮＭ_０００６２６_１
(１６) ＦｃＲＨ２ (ＩＦＧＰ４、ＩＲＴＡ４、ＳＰＡＰ１Ａ (ＳＨ２ドメイン含有ホスファターゼアンカータンパク質１ａ)、ＳＰＡＰ１Ｂ、ＳＰＡＰ１Ｃ、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＭ_０３０７６４) Genome Res. 13 (10): 2265-2270 (2003)、Immunogenetics 54 (2): 87-95 (2002)、Blood 99 (8): 2662-2669 (2002)、Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98 (17): 9772-9777 (2001)、Xu, M.J., et al (2001) Biochem. Biophys. Res. Commun. 280 (3): 768-775；国際公開２００４０１６２２５(請求項２)；国際公開２００３０７７８３６；国際公開２００１３８４９０(請求項５；図１８Ｄ−１〜１８Ｄ−２)；国際公開２００３０９７８０３(請求項１２)；国際公開２００３０８９６２４(請求項２５)；相互参照：ＭＩＭ：６０６５０９;ＮＰ＿１１０３９１.２；ＮＭ_０３０７６４_１
(１７) ＨＥＲ２ (ＥｒｂＢ２、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号Ｍ１１７３０) Coussens L., et al Science (1985) 230(4730): 1132-1139)；Yamamoto T., et al Nature 319, 230-234, 1986；Semba K., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 82, 6497-6501, 1985；Swiercz J.M., et al J. Cell Biol. 165, 869-880, 2004；Kuhns J.J., et al J. Biol. Chem. 274, 36422-36427, 1999；Cho H.-S., et al Nature 421, 756-760, 2003；Ehsani A., et al (1993) Genomics 15, 426-429；国際公開２００４０４８９３８(実施例２)；国際公開２００４０２７０４９(図１Ｉ)；国際公開２００４００９６２２；国際公開２００３０８１２１０；国際公開２００３０８９９０４(請求項９)；国際公開２００３０１６４７５(請求項１)；米国公開特許２００３１１８５９２；国際公開２００３００８５３７(請求項１)；国際公開２００３０５５４３９(請求項２９；図１Ａ−Ｂ)；国際公開２００３０２５２２８(請求項３７；図５Ｃ)；国際公開２００２２２６３６(実施例１３；９５〜１０７頁)；国際公開２００２１２３４１(請求項６８；図７)；国際公開２００２１３８４７(７１〜７４頁)；国際公開２００２１４５０３(１１４〜１１７頁)；国際公開２００１５３４６３(請求項２；４１〜４６頁)；国際公開２００１４１７８７(１５頁)；国際公開２０００４４８９９(請求項５２；図７)；国際公開２０００２０５７９(請求項３；図２)；米国特許第５８６９４４５号(請求項３；段落３１−３８)；国際公開９６３０５１４(請求項２；５６〜６１頁)；欧州特許第１４３９３９３号(請求項７)；国際公開２００４０４３３６１(請求項７)；国際公開２００４０２２７０９；国際公開２００１００２４４(実施例３；図４)；受託：Ｐ０４６２６；ＥＭＢＬ；Ｍ１１７６７；ＡＡＡ３５８０８.１。ＥＭＢＬ；Ｍ１１７６１；ＡＡＡ３５８０８.１。抗ＨＥＲ２抗体は以下を含む：ハーセプチン(登録商標)(トラスツズマブ、ｈｕＭＡｂ４Ｄ５-８)完全長ヒト化抗ＨＥＲ２(ＭＷ１４５１６７)、トラスツズマブＦ(ａｂ’)２＝抗ＨＥＲ２酵素処理由来(ＭＷ１０００００)、４Ｄ５＝完全長マウス抗ＨＥＲ２、ハイブリドーマ由来、ｒｈｕ４Ｄ５＝過渡的に発現される完全長ヒト化抗体、ｒｈｕＦａｂ４Ｄ５＝組換えヒト化Ｆａｂ(ＭＷ４７７３８)、４Ｄ５Ｆｃ８＝完全長マウス抗ＨＥＲ２、変異ＦｃＲｎ結合ドメインを有する、ｈｕＭＡｂ４Ｄ５-１、ｈｕＭＡｂ４Ｄ５-２、ｈｕＭＡｂ４Ｄ５-３、ｈｕＭＡｂ４Ｄ５-４、ｈｕＭＡｂ４Ｄ５-５、ｈｕＭＡｂ４Ｄ５-６、ｈｕＭＡｂ４Ｄ５-７及び(トラスツズマブ)。
(１８) ＮＣＡ (ＣＥＡＣＡＭ６、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号Ｍ１８７２８)；Barnett T., et al Genomics 3, 59-66, 1988；Tawaragi Y., et al Biochem. Biophys. Res. Commun. 150, 89-96, 1988；Strausberg R.L., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99:16899-16903, 2002；国際公開２００４０６３７０９；欧州特許第１４３９３９３号(請求項７)；国際公開２００４０４４１７８(実施例４)；国際公開２００４０３１２３８；国際公開２００３０４２６６１(請求項１２)；国際公開２００２７８５２４(実施例２)；国際公開２００２８６４４３(請求項２７；４２７頁)；国際公開２００２６０３１７(請求項２)；継承：Ｐ４０１９９；Ｑ１４９２０；ＥＭＢＬ；Ｍ２９５４１；ＡＡＡ５９９１５.１。ＥＭＢＬ；Ｍ１８７２８；
(１９) ＭＤＰ (ＤＰＥＰ１、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＢＣ０１７０２３) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99 (26): 16899-16903 (2002))；国際公開２００３０１６４７５(請求項１)；国際公開２００２６４７９８(請求項３３；８５〜８７頁)；日本特許第０５００３７９０号(図６−８)；国際公開９９４６２８４(図９)；相互参照：ＭＩＭ：１７９７８０;ＡＡＨ１７０２３.１；ＢＣ０１７０２３＿１
(２０) ＩＬ２０Ｒ (ＩＬ２０Ｒａ、ＺＣＹＴＯＲ７、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＡＦ１８４９７１)；Clark H.F., et al Genome Res. 13, 2265-2270, 2003；Mungall A.J., et al Nature 425, 805-811, 2003；Blumberg H., et al Cell 104, 9-19, 2001；Dumoutier L., et al J. Immunol. 167, 3545-3549, 2001；Parrish-Novak J., et al J. Biol. Chem. 277, 47517-47523, 2002；Pletnev S., et al (2003) Biochemistry 42:12617-12624；Sheikh F., et al (2004) J. Immunol. 172, 2006-2010；欧州特許１３９４２７４(実施例１１)；米国公開特許２００４００５３２０(実施例５)；国際公開２００３０２９２６２(７４〜７５頁)；国際公開２００３００２７１７(請求項２；６３頁)；国際公開２００２２２１５３(４５〜４７頁)；米国公開特許２００２０４２３６６(２０〜２１頁)；国際公開２００１４６２６１(５７〜５９頁)；国際公開２００１４６２３２(６３〜６５頁)；国際公開９８３７１９３(請求項１；５５〜５９頁)；受託：Ｑ９ＵＨＦ４；Ｑ６ＵＷＡ９；Ｑ９６ＳＨ８；ＥＭＢＬ；ＡＦ１８４９７１；ＡＡＦ０１３２０.１。
(２１) Ｂｒｅｖｉｃａｎ (ＢＣＡＮ、ＢＥＨＡＢ、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＡＦ２２９０５３) Gary S.C., et al Gene 256, 139-147, 2000；Clark H.F., et al Genome Res. 13, 2265-2270, 2003；Strausberg R.L., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99, 16899-16903, 2002；米国公開特許２００３１８６３７２(請求項１１)；米国公開特許２００３１８６３７３(請求項１１)；米国公開特許２００３１１９１３１(請求項１；図５２)；米国公開特許２００３１１９１２２(請求項１；図５２)；米国公開特許２００３１１９１２６(請求項１)；米国公開特許２００３１１９１２１(請求項１；図５２)；米国公開特許２００３１１９１２９(請求項１)；米国公開特許２００３１１９１３０(請求項１)；米国公開特許２００３１１９１２８(請求項１；図５２)；米国公開特許２００３１１９１２５(請求項１)；国際公開２００３０１６４７５(請求項１)；国際公開２００２０２６３４(請求項１)；
(２２) ＥｐｈＢ２Ｒ (ＤＲＴ、ＥＲＫ、Ｈｅｋ５、ＥＰＨＴ３、Ｔｙｒｏ５、Ｇｅｎｂａｎｋ 受託番号ＮＭ_００４４４２) Chan, J. and Watt, V.M., Oncogene 6 (6), 1057-1061 (1991) Oncogene 10 (5): 897-905 (1995)、Annu. Rev. Neurosci. 21:309-345 (1998)、Int. Rev. Cytol. 196:177-244 (2000))；国際公開２００３０４２６６１(請求項１２)；国際公開２０００５３２１６(請求項１；４１頁)；国際公開２００４０６５５７６(請求項１)；国際公開２００４０２０５８３(請求項９)；国際公開２００３００４５２９(１２８〜１３２頁)；国際公開２０００５３２１６(請求項１；４２頁)；相互参照：ＭＩＭ：６００９９７;ＮＰ＿００４４３３.２；ＮＭ_００４４４２_１
(２３) ＡＳＬＧ６５９ (Ｂ７ｈ、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＡＸ０９２３２８) 米国公開特許２００４０１０１８９９ (請求項２)；国際公開２００３１０４３９９(請求項１１)；国際公開２００４０００２２１(図３)；米国公開特許２００３１６５５０４(請求項１)；米国公開特許２００３１２４１４０(実施例２)；米国公開特許２００３０６５１４３(図６０)；国際公開２００２１０２２３５(請求項１３；２９９頁)；米国公開特許２００３０９１５８０(実施例２)；国際公開２００２１０１８７(請求項６；図１０)；国際公開２００１９４６４１(請求項１２；図７ｂ)；国際公開２００２０２６２４(請求項１３；図１Ａ−１Ｂ)；米国公開特許２００２０３４７４９(請求項５４；４５〜４６頁)；国際公開２００２０６３１７(実施例２；３２０〜３２１頁、請求項３４；３２１〜３２２頁)；国際公開２００２７１９２８(４６８〜４６９頁)；国際公開２００２０２５８７(実施例１；図１)；国際公開２００１４０２６９(実施例３；１９０〜１９２頁)；国際公開２０００３６１０７(実施例２；２０５〜２０７頁)；国際公開２００４０５３０７９(請求項１２)；国際公開２００３００４９８９(請求項１)；国際公開２００２７１９２８(２３３〜２３４頁、４５２〜４５３頁)；国際公開０１１６３１８；
(２４) ＰＳＣＡ (前立腺幹細胞抗原前駆体、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＡＪ２９７４３６) Reiter R.E., et al Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95, 1735-1740, 1998；Gu Z., et al Oncogene 19, 1288-1296, 2000；Biochem. Biophys. Res. Commun. (2000) 275(3): 783-788；国際公開２００４０２２７０９；欧州特許第１３９４２７４号(実施例１１)；米国公開特許２００４０１８５５３(請求項１７)；国際公開２００３００８５３７(請求項１)；国際公開２００２８１６４６(請求項１；１６４頁)；国際公開２００３００３９０６(請求項１０；２８８頁)；国際公開２００１４０３０９(実施例１；図１７)；米国公開特許２００１０５５７５１(実施例１；図１ｂ)；国際公開２０００３２７５２(請求項１８；図１)；国際公開９８５１８０５(請求項１７；９７頁)；国際公開９８５１８２４(請求項１０；９４頁)；国際公開９８４０４０３(請求項２；図１Ｂ)；受託：Ｏ４３６５３；ＥＭＢＬ；ＡＦ０４３４９８；ＡＡＣ３９６０７.１。
(２５) ＧＥＤＡ (Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＡＹ２６０７６３)；ＡＡＰ１４９５４脂肪腫ＨＭＧＩＣ融合−パートナー様タンパク質／ｐｉｄ＝ＡＡＰ１４９５４.１−ヒト種：ホモサピエンス(ヒト) 国際公開２００３０５４１５２(請求項２０)；国際公開２００３０００８４２(請求項１)；国際公開２００３０２３０１３(実施例３、請求項２０)；米国公開特許２００３１９４７０４(請求項４５)；相互参照：ＧＩ：３０１０２４４９;ＡＡＰ１４９５４.１；ＡＹ２６０７６３＿１
(２６) ＢＡＦＦ-Ｒ (Ｂ細胞活性化因子レセプター、ＢＬｙＳレセプター３、ＢＲ３、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＰ_４４３１７７.１)；ＮＰ＿４４３１７７ ＢＡＦＦレセプター／ｐｉｄ＝ＮＰ＿４４３１７７.１−ホモサピエンス；Thompson, J.S., et al Science 293 (5537), 2108-2111 (2001)；国際公開２００４０５８３０９；国際公開２００４０１１６１１；国際公開２００３０４５４２２(実施例；３２〜３３頁)；国際公開２００３０１４２９４(請求項３５；図６Ｂ)；国際公開２００３０３５８４６(請求項７０；６１５〜６１６頁)；国際公開２００２９４８５２(段落１３６−１３７)；国際公開２００２３８７６６(請求項３；１３３頁)；国際公開２００２２４９０９(実施例３；図３)；相互参照：ＭＩＭ：６０６２６９;ＮＰ＿４４３１７７.１；ＮＭ_０５２９４５_１
(２７) ＣＤ２２ (Ｂ細胞レセプターＣＤ２２-Ｂアイソフォーム、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＰ-００１７６２.１)；Stamenkovic, I. and Seed, B., Nature 345 (6270), 74-77 (1990)；米国公開特許２００３１５７１１３；米国公開特許２００３１１８５９２；国際公開２００３０６２４０１(請求項９)；国際公開２００３０７２０３６(請求項１；図１)；国際公開２００２７８５２４(実施例２)；相互参照：ＭＩＭ：１０７２６６;ＮＰ＿００１７６２.１；ＮＭ_００１７７１_１
(２８) ＣＤ７９ａ (ＣＤ７９Ａ、ＣＤ７９、免疫グロブリン関連α、Ｉｇβと共有結合的に相互作用し(ＣＤ７９Ｂ)、ＩｇＭ分子と表面上で複合体を形成し、Ｂ細胞分化に関与するシグナルを伝達するＢ細胞特異的タンパク質 ＰＲＯＴＥＩＮ ＳＥＱＵＥＮＣＥ Ｆｕｌｌ ｍｐｇｇｐｇｖ...ｄｖｑｌｅｋｐ (１..２２６; ２２６ａａ)、ｐＩ: ４.８４、ＭＷ: ２５０２８ ＴＭ: ２ [Ｐ] 遺伝子染色体: １９ｑ１３.２、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＰ_００１７７４.１０) 国際公開２００３０８８８０８、米国公開特許２００３０２２８３１９；国際公開２００３０６２４０１(請求項９)；米国公開特許２００２１５０５７３(請求項４、１３〜１４頁)；国際公開９９５８６５８(請求項１３、図１６)；国際公開９２０７５７４(図１)；米国特許第５６４４０３３号；Ha et al (1992) J. Immunol. 148(5): 1526-1531；Mueller et al (1992) Eur. J. Biochem. 22:1621-1625；Hashimoto et al (1994) Immunogenetics 40(4): 287-295；Preud'homme et al (1992) Clin. Exp. Immunol. 90(1): 141-146；Yu et al (1992) J. Immunol. 148(2) 633-637；Sakaguchi et al (1988) EMBO J. 7(11): 3457-3464；
(２９) ＣＸＣＲ５ (バーキットリンパ腫レセプター１、ＣＸＣＬ１３ケモカインによって活性化され、リンパ球移動及び体液性免疫において機能し、ＨＩＶ−２感染並びに、おそらくＡＩＤＳ、リンパ腫、メラノーマ及び白血病の発達において働くＧタンパク質結合レセプター) ＰＲＯＴＥＩＮ ＳＥＱＵＥＮＣＥ Ｆｕｌｌ ｍｎｙｐｌｔｌ...ａｔｓｌｔｔｆ (１..３７２; ３７２ａａ)、ｐＩ: ８.５４ ＭＷ: ４１９５９ ＴＭ: ７ [Ｐ] 遺伝子染色体: １１ｑ２３.３、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＰ_００１７０７.１) 国際公開２００４０４００００；国際公開２００４０１５４２６；米国公開特許２００３１０５２９２(実施例２)；米国特許第６５５５３３９(実施例２)；国際公開２００２６１０８７(図１)；国際公開２００１５７１８８(請求項２０、２６９頁)；国際公開２００１７２８３０(１２〜１３頁)；国際公開２０００２２１２９(実施例１、１５２〜１５３頁、実施例２、２５４〜２５６頁)；国際公開９９２８４６８(請求項１、３８頁)；米国特許第５４４００２１号(実施例２、段落４９−５２)；国際公開９４２８９３１(５６〜５８頁)；国際公開９２１７４９７(請求項７、図５)；Dobner et al (1992) Eur. J. Immunol. 22:2795-2799；Barella et al (1995) Biochem. J. 309:773-779；
(３０) ＨＬＡ-ＤＯＢ(ペプチドを結合し、ＣＤ４＋Ｔリンパ球に対してそれらを提示するＭＨＣクラスＩＩ分子(Ｉａ抗原)のβサブユニット) ＰＲＯＴＥＩＮ ＳＥＱＵＥＮＣＥ Ｆｕｌｌ ｍｇｓｇｗｖｐ...ｖｌｌｐｑｓｃ (１..２７３; ２７３ａａ, ｐＩ: ６.５６ ＭＷ: ３０８２０ ＴＭ: １ [Ｐ] 遺伝子染色体: ６ｐ２１.３、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＰ_００２１１１.１) Tonnelle et al (1985) EMBO J. 4(11): 2839-2847；Jonsson et al (1989) Immunogenetics 29(6): 411-413；Beck et al (1992) J. Mol. Biol. 228:433-441；Strausberg et al (2002) Proc. Natl. Acad. Sci USA 99:16899-16903；Servenius et al (1987) J. Biol. Chem. 262:8759-8766；Beck et al (1996) J. Mol. Biol. 255:1-13；Naruse et al (2002) Tissue Antigens 59:512-519；国際公開９９５８６５８(請求項１３、図１５)；米国特許第６１５３４０８号(段落３５−３８)；米国特許第５９７６５５１号(段落１６８−１７０)；米国特許第６０１１１４６号(段落１４５−１４６)；Kasahara et al (1989) Immunogenetics 30(1): 66-68；Larhammar et al (1985) J. Biol. Chem. 260(26): 14111-14119；
(３１) Ｐ２Ｘ５ (細胞外ＡＴＰによってゲートされるイオンチャネルであるプリンレセプターＰ２Ｘリガンドゲートイオンチャネル５はシナプス伝達及び神経発生に関与し得、欠損すると特発性の排尿筋不安定性の病態生理をもたらしうる) ＰＲＯＴＥＩＮ ＳＥＱＵＥＮＣＥ Ｆｕｌｌ ｍｇｑａｇｃｋ...ｌｅｐｈｒｓｔ (１..４２２; ４２２ａａ)、ｐＩ: ７.６３、ＭＷ: ４７２０６ ＴＭ: １ [Ｐ] 遺伝子染色体: １７ｐ１３.３、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＰ_００２５５２.２) Le et al (1997) FEBS Lett. 418(1-2): 195-199；国際公開２００４０４７７４９；国際公開２００３０７２０３５(請求項１０)；Touchman et al (2000) Genome Res. 10: 165-173；国際公開２００２２２６６０(請求項２０)；国際公開２００３０９３４４４(請求項１)；国際公開２００３０８７７６８(請求項１)；国際公開２００３０２９２７７(８２頁)；
(３２) ＣＤ７２ (Ｂ細胞分化抗原ＣＤ７２、Ｌｙｂ-２) ＰＲＯＴＥＩＮ ＳＥＱＵＥＮＣＥ Ｆｕｌｌ ｍａｅａｉｔｙ...ｔａｆｒｆｐｄ (１..３５９; ３５９ａａ)、ｐＩ: ８.６６、ＭＷ: ４０２２５ ＴＭ: １ [Ｐ] 遺伝子染色体: ９ｐ１３.３、Ｇｅｎｂａｎｋ 受託番号ＮＰ_００１７７３.１) ＷＯ２００４０４２３４６ (ｃｌａｉｍ ６５)；国際公開２００３０２６４９３(５１〜５２頁、５７〜５８頁)；国際公開２０００７５６５５(１０５〜１０６頁)；Von Hoegen et al (1990) J. Immunol. 144(12): 4870-4877；Strausberg et al (2002) Proc. Natl. Acad. Sci USA 99:16899-16903；
(３３) ＬＹ６４ (ロイシンリッチリピート(ＬＲＲ)ファミリのタイプＩ膜タンパク質であるリンパ球抗原６４ (ＲＰ１０５)はＢ細胞活性化及びアポトーシスを調節し、機能が欠損すると全身性エリテマトーデス患者における疾患活性の増加に関連する) ＰＲＯＴＥＩＮ ＳＥＱＵＥＮＣＥ Ｆｕｌｌ ｍａｆｄｖｓｃ...ｒｗｋｙｑｈｉ (１..６６１; ６６１ａａ)、ｐＩ: ６.２０、ＭＷ: ７４１４７ ＴＭ: １ [Ｐ] 遺伝子染色体: ５ｑ１２、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＰ_００５５７３.１) 米国公開特許２００２１９３５６７；国際公開９７０７１９８(請求項１１、３９〜４２頁)；Miura et al (1996) Genomics 38(3): 299-304；Miura et al (1998) Blood 92:2815-2822；国際公開２００３０８３０４７；国際公開９７４４４５２(請求項８、５７〜６１頁)；国際公開２０００１２１３０(２４〜２６頁)；
(３４) ＦＣＲＨ１ (Ｃ２タイプＩｇ様及びＩＴＡＭドメインを含む免疫グロブリンＦｃドメインの推定レセプターであるＦｃレセプター様タンパク質１はＢリンパ球分化において働きを有しうる) ＰＲＯＴＥＩＮ ＳＥＱＵＥＮＣＥ Ｆｕｌｌ ｍｌｐｒｌｌｌ...ｖｄｙｅｄａｍ (１..４２９; ４２９ａａ)、ｐＩ: ５.２８、ＭＷ: ４６９２５ ＴＭ: １ [Ｐ] 遺伝子染色体: １ｑ２１-１ｑ２２、Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＮＰ_４４３１７０.１) 国際公開２００３０７７８３６；国際公開２００１３８４９０(請求項６、図１８Ｅ−１−１８−Ｅ−２)；Davis et al (2001) Proc. Natl. Acad. Sci USA 98(17): 9772-9777；国際公開２００３０８９６２４(請求項８)；欧州特許第１３４７０４６号(請求項１)；国際公開２００３０８９６２４(請求項７)；
(３５) ＩＲＴＡ２ (Ｂ細胞発生及びリンパ球発生において役割を有しうる推定免疫レセプターである免疫グロブリンスーパーファミリレセプター転座関連２；いくつかのＢ細胞悪性腫瘍において転座による遺伝子の制御不能が生じる) ＰＲＯＴＥＩＮ ＳＥＱＵＥＮＣＥ Ｆｕｌｌ ｍｌｌｗｖｉｌ...ａｓｓａｐｈｒ (１..９７７; ９７７ａａ)、ｐＩ: ６.８８ ＭＷ: １０６４６８ ＴＭ: １ [Ｐ] 遺伝子染色体: １ｑ２１、Ｇｅｎｂａｎｋ 受託番号ＮＰ_１１２５７１.１) 国際公開２００３０２４３９２ (請求項２、図９７)；Nakayama et al (2000) Biochem. Biophys. Res. Commun. 277(1): 124-127；国際公開２００３０７７８３６；国際公開２００１３８４９０(請求項３、図１８Ｂ−１−１８Ｂ−２)
(３６) ＴＥＮＢ２(ＴＭＥＦＦ２、ｔｏｍｏｒｅｇｕｌｉｎ、ＴＰＥＦ、ＨＰＰ１、ＴＲ、推定膜貫通プロテオグリカン、増殖因子のＥＧＦ／ヘレグリンファミリおよびフォリスタチンに関連する)；３７４ａａ、ＮＣＢＩ受託：ＡＡＤ５５７７６、ＡＡＦ９１３９７、ＡＡＧ４９４５１、ＮＣＢＩ ＲｅｆＳｅｑ：ＮＰ＿０５７２７６；ＮＣＢＩ Ｇｅｎｅ：２３６７１;ＯＭＩＭ：６０５７３４;ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ Ｑ９ＵＩＫ５；Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号ＡＦ１７９２７４；ＡＹ３５８９０７、ＣＡＦ８５７２３、ＣＱ７８２４３６。国際公開２００４０７４３２０；日本公開特許２００４１１３１５１；国際公開２００３０４２６６１；国際公開２００３００９８１４；欧州特許第１２９５９４４号(６９〜７０頁)；国際公開２００２３０２６８(３２９頁)；国際公開２００１９０３０４；米国公開特許２００４２４９１３０；米国公開特許２００４０２２７２７；国際公開２００４０６３３５５；米国公開特許２００４１９７３２５；米国公開特許２００３２３２３５０；米国公開特許２００４００５５６３；米国公開特許２００３１２４５７９；Horie et al (2000) Genomics 67:146-152；Uchida et al (1999) Biochem. Biophys. Res. Commun. 266:593-602；Liang et al (2000) Cancer Res. 60: 4907-12；Glynne-Jones et al (2001) Int J Cancer. Oct 15;94(2): 178-84。
本発明の抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)の抗体は、ＥｒｂＢ遺伝子によってコード化されるレセプターに特異的に結合しうる。抗体は、ＥＧＦＲ、ＨＥＲ２、ＨＥＲ３およびＨＥＲ４から選択されるＥｒｂＢレセプターに特異的に結合してよい。ＡＤＣは、ＨＥＲ２レセプターの細胞外ドメインに特異的に結合しても、ＨＥＲ２レセプターを過剰発現する腫瘍細胞の増殖を阻害してもよい。ハーセプチン(登録商標)(トラスツズマブ)は、ヒト上皮細胞増殖因子レセプター２タンパク質、ＨＥＲ２(ＥｒｂＢ２)の細胞外ドメイン(ＥＣＤ)に選択的に結合する(米国特許第５８２１３３７号；米国特許第６０５４２９７号；米国特許第６４０７２１３号；米国特許第６６３９０５５号；Coussens et al (1985) Science 230:1132-9；Slamon, et al (1989) Science 244:707-12)。トラスツズマブは、ＨＥＲ２に結合するマウス抗体(４Ｄ５)の相補性決定領域(ＣＤＲ)を有するヒトフレームワーク領域を含むＩｇＧ１κ抗体である。トラスツズマブはＨＥＲ２抗原に結合し、それによってＨＥＲ２を過剰に発現するヒト腫瘍細胞の増殖を阻害する(Hudziak RM, et al (1989) Mol Cell Biol 9:1165-72；Lewis GD, et al (1993) Cancer Immunol Immunother; 37:255-63；Baselga J, et al (1998) Cancer Res. 58: 2825-2831)。
抗体は、様々な技術を用いて測定することができる発色性基質の化学的な変化を触媒する酵素によって標識されるか、コンジュゲートされてよい。例えば、酵素は、分光光度的に測定することができる基質に色彩変化を触媒してよい。あるいは、酵素は基質の発光又は化学発光を変化しうる。発光の変化を定量化するための技術は公知である。化学発光基質は、ジオキセタン基のＯ−Ｏ結合の切断といった化学反応によって電子的に励起されるようになり、その後(例えば化学発光測定器を使用して)測定することができ、又は蛍光アクセプターにエネルギーを供与する光を発しうる。酵素的標識の例は、ルシフェラーゼ(例えば、ホタルルシフェラーゼ及び細菌ルシフェラーゼ；米国特許第４７３７４５６号)、ルシフェリン、２，３−ジヒドロフタラジンジオン類、リンゴ酸デヒドロゲナーゼ、ウレアーゼ、ペルオキシダーゼ、例えば西洋わさびペルオキシダーゼ(ＨＲＰ)、アルカリホスファターゼ(ＡＰ)、β−ガラクトシダーゼ、グルコアミラーゼ、リゾチーム、サッカライドオキシダーゼ(例えば、グルコースオキシダーゼ、ガラクトースオキシダーゼ、及びグルコース−６−ホスフェートデヒドロゲナーゼ)、複素環式オキシダーゼ(例えばウリカーゼ及びキサンチンオキシダーゼ)、ラクトペルオキシダーゼ、マイクロペルオキシダーゼ等々を含む。抗体に酵素をコンジュゲートさせるための技術は、O'Sullivan et al., Methods for the Preparation of Enzyme-Antibody Conjugates for Use in Enzyme Immunoassay, Methods in Enzym. (J. Langone及びH. Van Vunakis編), Academic press, New York, 73: 147-166 (1981)に記載されている。
酵素−基質の組合せの例には、例えば以下のものが含まれる：(i) 基質として水素ペルオキシダーゼを有する西洋わさびペルオキシダーゼ(ＨＲＰ)、ここで水素ペルオキシダーゼが染料前駆体(例えば、オルソフェニレン(orthophenylene)ジアミン(ＯＰＤ)又は３,３',５,５'テトラメチルのベンジジン塩酸塩(ＴＭＢ))を酸化する；(ii) 色素生産性基質としてリン酸パラグラフ-ニトロフェニルを有するアルカリホスファターゼ(ＡＰ)；及び(iii) 色素生産性基質(例えばｐ-ニトロフェニル-β-Ｄ-ガラクトシダーゼ)又は蛍光発生基質４-メチルウンベリフェリル(methylumbelliferyl)-β-Ｄ-ガラクトシダーゼを有するβ-Ｄ-ガラクトシダーゼ(β-Ｄ-Ｇａｌ)。多数の他の酵素−基質の組合せは当業者にとって利用可能である(米国特許第４２７５１４９号；同第４３１８９８０号)。
標識は、抗体と直接又は非共有的にコンジュゲートされてよい。例えば、抗体は、ビオチンとコンジュゲートさせることができ、前述した分類のうちの何れかはストレプトアビジンなどのアビジンとコンジュゲートさせることができ、その逆もまた可能である。ビオチンは選択的にアビジンと結合し、したがって、標識はこの間接的な方法でポリペプチド変異体にコンジュゲートさせることができる。
標識は、抗体と直接又は非共有的にコンジュゲートされてよい。例えば、抗体は、ビオチンとコンジュゲートさせることができ、前述した分類のうちの何れかはストレプトアビジンなどのアビジンとコンジュゲートさせることができ、その逆もまた可能である。ビオチンは選択的にアビジンと結合し、したがって、標識はこの間接的な方法でポリペプチド変異体にコンジュゲートさせることができる。
薬剤部分
式Ｉの抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)の薬剤部分(Ｄ)は、細胞障害効果又は細胞分裂停止効果を有する任意の化合物、部分又は基を含む。薬剤部分は、マイクロチューブリンインヒビター、有糸分裂インヒビター、トポイソメラーゼインヒビター又はＤＮＡ干渉物質として機能しうる化学療法剤と、癌療法のために用いられる特別なものとを含む。式Ｉの抗体−薬剤コンジュゲートの薬剤部分は、他の作用機構を有してもよく、いずれかのメカニズムに限定されるものではない。
式Ｉの抗体薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)の薬剤部分(Ｄ)は以下の構造を有するメイタンシノイドを含む：
このとき、波線は抗体薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)のリンカー(Ｌ)へのＤの硫黄原子の共有結合を示す。ＲはそれぞれＨ又はＣ１−Ｃ６アルキルであってよい。硫黄原子にアミド基を付着しているアルキレン鎖はメチル、エチル又はプロピルであってよく、すなわち、ｍは１、２又は３である。
式Ｉの抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)の薬剤部分(Ｄ)は、細胞障害効果又は細胞分裂停止効果を有する任意の化合物、部分又は基を含む。薬剤部分は、マイクロチューブリンインヒビター、有糸分裂インヒビター、トポイソメラーゼインヒビター又はＤＮＡ干渉物質として機能しうる化学療法剤と、癌療法のために用いられる特別なものとを含む。式Ｉの抗体−薬剤コンジュゲートの薬剤部分は、他の作用機構を有してもよく、いずれかのメカニズムに限定されるものではない。
式Ｉの抗体薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)の薬剤部分(Ｄ)は以下の構造を有するメイタンシノイドを含む：
メイタンシン化合物は、マイクロチューブリンタンパク質であるチューブリンの重合阻害により有糸分裂中の微小管の形成を阻害することによって細胞増殖を阻害する(Remillard et al (1975) Science 189:1002-1005；米国特許第５２０８０２０号)。メイタンシンは、東アフリカの低木Ｍａｙｔｅｎｕｓ ｓｅｒｒａｔａから単離され、メトトレキセート、ダウノルビシンおよびビンクリスチンのような従来の癌化学療法剤の１００〜１０００倍もの細胞障害性があることが示された(米国特許第３８９６１１１号)。その後、いくつかの微生物もメイタンシノール及びメイタンシノールのＣ−３エステルといったメイタンシノイドを生成することが発見された(米国特許第４１５１０４２号)。また、メイタンシノールおよびメイタンシノールの類似体の合成Ｃ−３エステルも報告された(Kupchan et al., (1978) J. Med. Chem. 21:31-37；Higashide et al. (1977) Nature 270:721-722；Kawai et al., 32 Chem. Pharm. (1984) Bull. 3441-3451)。Ｃ−３エステルが調製されているメイタンシノールの類似体は、芳香族環(例えばデクロロ)上に、又は、Ｃ−９、Ｃ−１４(例えばヒドロキシル化したメチル基)、Ｃ−１５、Ｃ−１８、Ｃ−２０及びＣ-４,５に修飾を有するメイタンシノールを含む。天然に生じる及び合成のＣ−３エステルは２つのグループに分類されうる：(ａ) 単一のカルボン酸を有するＣ−３エステル(米国特許第４２４８８７０号；米国特許第４２６５８１４号；米国特許第４３０８２６８号；米国特許第４３０８２６９号；米国特許第４３０９４２８号；米国特許第４３１７８２１号；米国特許第４３２２３４８号；及び米国特許第４３３１５９８号)と、(ｂ) Ｎ-メチル-Ｌ-アラニンの誘導体を有するＣ-３エステル(米国特許第４１３７２３０号及び米国特許第４２６０６０８号；及びKawai et al., (1984) Chem. Pharm. Bull. 32:3441-3451)。グループ(ｂ)のエステルは、グループ(ａ)のエステルより非常に細胞障害作用があることが明らかとされた。
他の薬剤部分と同様に、メイタンシノイド薬剤部分のすべての立体異性体、Ｄのキラル炭素でのＲ及びＳ配位の組合せは、本発明の化合物のために考慮される。一実施態様では、メイタンシノイド薬剤部分(Ｄ)は以下の立体化学を有する：
メイタンシノイド薬剤部分の例示的な実施態様は、以下を含む：ＤＭ１、(ＣＲ２)ｍ＝ＣＨ２ＣＨ２；ＤＭ３、(ＣＲ２)ｍ＝ＣＨ２ＣＨ２ＣＨ(ＣＨ３)；及びＤＭ４、(ＣＲ２)ｍ＝ＣＨ２ＣＨ２Ｃ(ＣＨ３)２、以下の構造を有する：
また、抗体薬剤イムノコンジュゲート(ＡＤＣ)の薬剤部分(Ｄ)は、ドラスタチン及びそのペプチジル類似体及び誘導体、アウリスタチン(auristatin)を含む(米国特許第５６３５４８３号；同第５７８０５８８号)。ドラスタチン及びアウリスタチンは、微小管動態、ＧＴＰ加水分解及び核と細胞の分割を妨げ(Woyke et al (2001) Antimicrob. Agents and Chemother. 45(12): 3580-3584)、抗癌活性(米国特許第５６６３１４９号)及び抗真菌性活性(Pettit et al (1998) Antimicrob. Agents Chemother. 42:2961-2965)を有することが示されている。アウリスタチンペプチドである、アウリスタチンＥ(ＡＥ)とドラスタチンの合成類似体であるモノメチルアウリスタチン(ＭＭＡＥ)(国際公開０２／０８８１７２)は、(i) キメラモノクローナル抗体ｃＢＲ９６(カルチノーマ上のルイスＹに特異的)、(ii) 血液系悪性腫瘍上のＣＤ３０に特異的であるｃＡＣ１０(Klussman, et al (2004), Bioconjugate Chemistry 15(4): 765-773；Doronina et al (2003) Nature Biotechnology 21(7): 778-784；Francisco et al (2003) Blood 102(4): 1458-1465；米国公開特許２００４／００１８１９４)、(iii) ＣＤ２０発現癌及び免疫不全の治療のためのリツキサンなどの抗ＣＤ２０抗体、(iv) 結腸直腸癌の治療のための抗ＥｐｈＢ２Ｒ抗体２Ｈ９(Mao et al (2004) Cancer Research 64(3): 781-788)、(v) Ｅセレクチン抗体(Bhaskar et al (2003) Cancer Res. 63: 6387-6394)、(vi) トラスツズマブ(ハーセプチン(登録商標)、米国公開特許２００５／０２３８６４９)、及び(vi) 抗ＣＤ３０抗体(国際公開０３／０４３５８３)へ、薬剤成分としてコンジュゲートされていた。アウリスタチンＥの変異体は、米国特許第５７６７２３７号及び米国特許第６１２４４３１号において開示され、モノクローナル抗体にコンジュゲートされるモノメチルアウリスタチンＥが含まれる(２００４年３月２８日に発表されたSenter et al, Proceedings of the American Association for Cancer Research, Volume 45, Abstract Number 623)。アウリスタチン類似体ＭＭＡＥおよびＭＭＡＦは、様々な抗体にコンジュゲートされている(米国公開特許２００５／０２３８６４９)。
式Ｉの抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)のモノメチルアウリスタチン薬剤部分(Ｄ)は、アウリスタチン薬剤部分であるＭＭＡＥ(米国特許第７０９０８４３号)およびＭＭＡＦ(米国公開特許２００５／０２３８６４９)を含む。ＭＭＡＥ又はＭＭＡＦ薬剤部分のＮ末端は、抗体の設計されたシステインに、リンカーを介して共有結合的に付着される。
他の例示的なアウリスタチン薬剤部分には、ペンタペプチドアウリスタチン薬剤成分のＣ末端にフェニルアラニンカルボキシ修飾を有するモノメチルバリン化合物(国際公開２００７／００８８４８)及びペンタペプチドアウリスタチン薬剤成分のＣ末端にフェニルアラニン側鎖修飾を有するモノメチルバリン化合物(国際公開２００７／００８６０３)が含まれる。
リンカー
リンカーは、式Ｉの抗体−薬剤コンジュゲートに従って抗体(Ａｂ)を薬剤成分(Ｄ)に共有結合的に接着させる原子の鎖又は共有結合を含む、二官能性ないしは多機能性の化学部分である。抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)は、薬剤及び抗体への結合について反応性機能を有するリンカー(Ｌ)を用いて都合良く調製されうる。リンカーは、チオール又はアミノといった抗体上に存在する求核基と反応する求電子基を有してもよい。抗体のシステインチオールは、リンカー上の求電子基と反応することができ、リンカーとの共有結合を形成する。有用な求電子基には、マレイミドおよびハロアセトアミド基を含むが、これらに限定されるものではない。また、リンカーは、アルキルジイルといった二価のラジカル、アリーレン、ヘテロアリーレン、アルキルオキシ(例としてポリエチレンオキシ、ＰＥＧ、ポリメチレンオキシ)とアルキラミノ(例えばポリエチレンアミノ、JeffamineTM)の繰り返しユニットである−(ＣＲ２)ｎＯ(ＣＲ２)ｎ−などの部分、及び、スクシナート、スクシンアミド、ジグリコレート、マロネート及びカプロアミドを含む二酸エステル及びアミドが含まれる。抗体上の有用な求核基には、スルフヒドリル、ヒドロキシルおよびアミノ基が含まれるがこれらに限定されるものではない。
他の実施態様では、リンカー試薬又は薬剤-リンカー試薬は、抗体上に存在する求電子基と反応することができる反応性の求核官能基を有し、共有結合を形成する。抗体上の有用な求電子基には、アルデヒドおよびケトンカルボニル基が含まれるが、これらに限定されるものではない。リンカー上の有用な求核基には、ヒドラジド、オキシム、アミノ、ヒドラジン、チオセミカルバゾン、ヒドラジンカルボキシレートおよびアリールヒドラジドが含まれるが、これらに限定されるものではない。
リンカーは、式Ｉの抗体−薬剤コンジュゲートに従って抗体(Ａｂ)を薬剤成分(Ｄ)に共有結合的に接着させる原子の鎖又は共有結合を含む、二官能性ないしは多機能性の化学部分である。抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)は、薬剤及び抗体への結合について反応性機能を有するリンカー(Ｌ)を用いて都合良く調製されうる。リンカーは、チオール又はアミノといった抗体上に存在する求核基と反応する求電子基を有してもよい。抗体のシステインチオールは、リンカー上の求電子基と反応することができ、リンカーとの共有結合を形成する。有用な求電子基には、マレイミドおよびハロアセトアミド基を含むが、これらに限定されるものではない。また、リンカーは、アルキルジイルといった二価のラジカル、アリーレン、ヘテロアリーレン、アルキルオキシ(例としてポリエチレンオキシ、ＰＥＧ、ポリメチレンオキシ)とアルキラミノ(例えばポリエチレンアミノ、JeffamineTM)の繰り返しユニットである−(ＣＲ２)ｎＯ(ＣＲ２)ｎ−などの部分、及び、スクシナート、スクシンアミド、ジグリコレート、マロネート及びカプロアミドを含む二酸エステル及びアミドが含まれる。抗体上の有用な求核基には、スルフヒドリル、ヒドロキシルおよびアミノ基が含まれるがこれらに限定されるものではない。
他の実施態様では、リンカー試薬又は薬剤-リンカー試薬は、抗体上に存在する求電子基と反応することができる反応性の求核官能基を有し、共有結合を形成する。抗体上の有用な求電子基には、アルデヒドおよびケトンカルボニル基が含まれるが、これらに限定されるものではない。リンカー上の有用な求核基には、ヒドラジド、オキシム、アミノ、ヒドラジン、チオセミカルバゾン、ヒドラジンカルボキシレートおよびアリールヒドラジドが含まれるが、これらに限定されるものではない。
リンカーは一又は一又は複数のリンカー成分から成ってもよい。例示的なリンカー成分には、６-マレイミドカプロイル(「ＭＣ」)、マレイミドプロパノイル(「ＭＰ」)、バリン−シトルリン(「ｖａｌ−ｃｉｔ」又は「ｖｃ」)、アラニン−フェニルアラニン(「ａｌａ−ｐｈｅ」又は「ａｆ」)、ｐ-アミノベンジルオキシカルボニル(「ＰＡＢ」)、Ｎ-スクシンイミジル４-(２-ピリジルチオ)ペンタノエート(「ＳＰＰ」)、Ｎ-スクシンイミジル４-(Ｎ-マレイミドメチル)シクロヘキサン-１カルボキシレート(「ＳＭＣＣ」)、Ｎ-スクシンイミジル(４-イオド-アセチル)アミノ安息香酸エステル(「ＳＩＡＢ」)、一又は複数の繰り返しユニットとしてのエチレンオキシ−ＣＨ２ＣＨ２Ｏ−(「ＥＯ」又は「ＰＥＯ」)が含まれる。更なるリンカー成分は当分野において周知であり、そのいくつかを本明細書中に記載する。
他の実施態様では、抗体は、一又は複数のスルフヒドリル基を導入するために化学的に改変されうる一又は複数のリジン残基を有する。抗体ユニットは、スルフヒドリル基の硫黄原子を介してリンカーユニットに結合する。リジンを改変するために用いられうる試薬には、限定するものではないが、Ｎ-スクシンイミジル Ｓ-アセチルチオアセテート(ＳＡＴＡ)及び２-イミノチオラン ヒドロクロライド(トラウト試薬)が含まれる。
他の実施態様では、抗体は、一又は複数のスルフヒドリル基を導入するために化学的に改変されうる一又は複数のリジン残基を有する。抗体ユニットは、スルフヒドリル基の硫黄原子を介してリンカーユニットに結合する。リジンを改変するために用いられうる試薬には、限定するものではないが、Ｎ-スクシンイミジル Ｓ-アセチルチオアセテート(ＳＡＴＡ)及び２-イミノチオラン ヒドロクロライド(トラウト試薬)が含まれる。
他の実施態様では、抗体は、一又は複数のスルフヒドリル基を持つように化学的に改変されうる一又は複数の糖質基を持っていてもよい。抗体ユニットは、リンカー、例としてストレッチャーユニットに、スルフヒドリル基の硫黄原子を介して結合する。さらに他の実施態様では、抗体は、酸化されて、アルデヒド(-ＣＨＯ)基を提供しうる一又は複数の糖質基を持っていてもよい(例としてLaguzza, et al, J. Med. Chem. 1989, 32(3), 548-55を参照)。対応するアルデヒドはストレッチャー上の反応部位と結合しうる。抗体上のカルボニル基と反応しうるストレッチャー上の反応部位には、限定するものではないが、ヒドラジンおよびヒドロキシルアミンが含まれる。薬剤ユニットの接着又は会合のためにタンパク質を改変するための他のプロトコールは、Coligan et al., Current Protocols in Protein Science, vol. 2, John Wiley & Sons (2002)に記載されており、該文献は出典明記によって本明細書中に援用される。
他の実施態様では、リンカーは、溶解性又は反応性を調節した基と置換してもよい。例えば、ＡＤＣを調製するために用いる合成手段に応じて、スルホン酸(−ＳＯ３ −)又はアンモニウムなどの荷電性の置換基は、試薬の水溶性を増し、抗体又は薬剤成分とリンカー試薬とのカップリング反応を容易にしうるか、又はＤとＡｂ−Ｌ(抗体−リンカー)とのカップリング反応、又はＡｂとＤ−Ｌ(薬剤−リンカー試薬)とのカップリング反応を容易にしうる。
他の実施態様では、リンカーは、溶解性又は反応性を調節した基と置換してもよい。例えば、ＡＤＣを調製するために用いる合成手段に応じて、スルホン酸(−ＳＯ３ −)又はアンモニウムなどの荷電性の置換基は、試薬の水溶性を増し、抗体又は薬剤成分とリンカー試薬とのカップリング反応を容易にしうるか、又はＤとＡｂ−Ｌ(抗体−リンカー)とのカップリング反応、又はＡｂとＤ−Ｌ(薬剤−リンカー試薬)とのカップリング反応を容易にしうる。
本発明の化合物は、限定するものではないが、以下のクロスリンカー試薬：ＢＭＰＥＯ、ＢＭＰＳ、ＥＭＣＳ、ＧＭＢＳ、ＨＢＶＳ、ＬＣ−ＳＭＣＣ、ＭＢＳ、ＭＰＢＨ、ＳＢＡＰ、ＳＩＡ、ＳＩＡＢ、ＳＭＣＣ、ＳＭＰＢ、ＳＭＰＨ、スルホ−ＥＭＣＳ、スルホ−ＧＭＢＳ、スルホ−ＫＭＵＳ、スルホ−ＭＢＳ、スルホ−ＳＩＡＢ、スルホ−ＳＭＣＣ、及びスルホ−ＳＭＰＢ、及びＳＶＳＢ(スクシンイミジル-(４-ビニルスルホン)ベンゾアート)、例えばPierce Biotechnology, Inc.から市販されているビスマレイミド試薬：ＤＴＭＥ、ＢＭＢ、ＢＭＤＢ、ＢＭＨ、ＢＭＯＥ、ＢＭ(ＰＥＯ)２、及びＢＭ(ＰＥＯ)３にて調製されるＡＤＣを特別に意図する。ビスマレイミド試薬により、連続した様式又は同時の様式で、チオール含有薬剤成分、標識又はリンカー中間生成物に抗体のシステイン残基のチオール基が付着することができる。抗体、薬剤部分、標識又はリンカー中間生成物のチオール基と反応することができるマレイミド以外の他の官能基には、ヨードアセトアミド、ブロモアセトアミド、ビニルピリジン、ジスルフィド、ピリジルジスルフィド、イソシアネート及びイソチオシアネートが含まれる。また、有用なリンカー試薬は、Molecular Biosciences Inc.(Boulder, CO)などの他の商業的供給源により得ることができるし、Toki et al (2002) J. Org. Chem. 67:1866-1872；Firestone et alの米国特許第６２１４３４５号；国際公開０２／０８８１７２；米国特許公開２００３１３０１８９；米国公開特許２００３０９６７４３；国際公開０３／０２６５７７；国際公開０３／０４３５８３；及び国際公開０４／０３２８２８に記載の手段に従って合成してもよい。
Klussman, et al (2004), Bioconjugate Chemistry 15(4): 765-773の７６６頁のコンジュゲーション法に従って、システイン改変抗体の反応性チオール基(米国公開特許２００７／００９２９４０)は、リンカー試薬又は薬剤−リンカー中間体と、マレイミド又はα-ハロカルボニルといった求電子官能基と、反応する。
抗体薬剤コンジュゲート
式ＩのＡＤＣの実施態様には、米国公開特許２００５／０２３８６４９にて開示されるように、モノメチルアウリスタチン薬剤部分(Ｄ)であるＭＭＡＥおよびＭＭＡＦと、マレイミドカプロイル(ＭＣ)、バリン-シトルリン(ｖｃ)およびパラ-アミノベンジルカルバモイル(ＰＡＢ)サブユニットを含むリンカーとが含まれる。例示的なＡＤＣは以下を含む：
式ＩのＡＤＣの実施態様には、米国公開特許２００５／０２３８６４９にて開示されるように、モノメチルアウリスタチン薬剤部分(Ｄ)であるＭＭＡＥおよびＭＭＡＦと、マレイミドカプロイル(ＭＣ)、バリン-シトルリン(ｖｃ)およびパラ-アミノベンジルカルバモイル(ＰＡＢ)サブユニットを含むリンカーとが含まれる。例示的なＡＤＣは以下を含む：
上記の例示的なモノメチルアウリスタチンＡＤＣは、反応性のシステインチオール基を有する抗体、例えばシステイン改変抗体(米国公開特許２００７／００９２９４０)と、薬剤リンカー試薬ＭＣ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢ−ＭＭＡＦ、ＭＣ−ｖａｌ−ｃｉｔ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ、ＭＣ−ＭＭＡＦおよびＭＣ−ＭＭＡＥそれぞれから調製されてよい(Doronina et al (2003) Nature Biotechnology 21(7): 778-784；Francisco et al (2003) Blood 102:1458-1465；米国公開特許２００５／０２３８６４９)。
システイン改変抗体および対応するＡＤＣの特定の実施態様を図３に示し、上から下へ順に、軽鎖に位置する２つのＭＭＡＥ薬剤部分−Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＨＥＲ２ ４Ｄ５ ＬＣ Ｖ２０５Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ；重鎖に位置する２つのＭＭＡＥ薬剤部分−Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＨＥＲ２ ４Ｄ５ ＨＣ Ａ１１８Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ；重鎖のＦｃ領域に位置する２つのＭＭＡＥ薬剤部分−Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＨＥＲ２ ４Ｄ５ Ｆｃ Ｓ４００Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ；Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＨＥＲ２ ４Ｄ５ Ｆｃ Ｓ４００Ｃ；及び、コンジュゲートのためのシステイン改変抗体：Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＨＥＲ２ ４Ｄ５ Ｆｃ Ｓ４００Ｃ。システイン改変抗体は、米国公開特許２００７／００９２９４０に従って設計され、選択される。
システイン改変抗体および対応するＡＤＣの特定の実施態様を図３に示し、上から下へ順に、軽鎖に位置する２つのＭＭＡＥ薬剤部分−Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＨＥＲ２ ４Ｄ５ ＬＣ Ｖ２０５Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ；重鎖に位置する２つのＭＭＡＥ薬剤部分−Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＨＥＲ２ ４Ｄ５ ＨＣ Ａ１１８Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ；重鎖のＦｃ領域に位置する２つのＭＭＡＥ薬剤部分−Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＨＥＲ２ ４Ｄ５ Ｆｃ Ｓ４００Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ；Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＨＥＲ２ ４Ｄ５ Ｆｃ Ｓ４００Ｃ；及び、コンジュゲートのためのシステイン改変抗体：Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＨＥＲ２ ４Ｄ５ Ｆｃ Ｓ４００Ｃ。システイン改変抗体は、米国公開特許２００７／００９２９４０に従って設計され、選択される。
式ＩのＡＤＣの実施態様は、米国公開特許２００５／０２７６８１２に開示されるように、メイタンシノイド薬剤部分(Ｄ) ＤＭ１、ＤＭ３およびＤＭ４と、ＳＰＰ、ＳＰＤＢおよびＳＭＣＣといったリンカー試薬から形成されるリンカーとを含む。例示的な抗体−薬剤コンジュゲートは、以下の
を含む。
ＤＭ１がＢＭＰＥＯリンカーを介して抗体のチオール基に結合している例示的な抗体薬剤コンジュゲートは、以下の構造を有する：
ここで、ｎは０、１又は２であり、ｐは１、２、３又は４である。
薬剤ローディング(薬剤負荷、Drug Loading)
薬剤ローディング値は、式Ｉの分子において、抗体当たりの薬剤部分の数であるｐによって表される。式ＩのＡＤＣの組成物には、１からおよそ８の薬剤とコンジュゲートされた抗体の混合物が含まれる。抗体と薬剤−リンカー試薬とのコンジュゲート又は抗体−リンカーと薬剤試薬とのコンジュゲートから生じる抗体−薬剤コンジュゲートの混合物は、コンジュゲート条件に応じて、およそ１からおよそ８の平均薬剤ローディング値を有するものとして特徴付けられる。抗体を薬剤部分にコンジュゲートすることによるＡＤＣの調製により、一又は複数の抗体に結合した薬剤を持つ生成分子の分布が生じ得、この抗体は薬剤部分に結合されておらず、ｐ＝０である。コンジュゲート反応からのＡＤＣの調製において抗体当たりの薬剤の平均数は、本発明の方法、すなわち親和性質量分析及びＥＬＩＳＡアッセイによって特徴付けられうる。ＥＬＩＳＡによって、あるＡＤＣ調製でのｐの平均値が決定されうる(Hamblett et al (2004) Clinical Cancer Res. 10: 7063-7070；Sanderson et al (2005) Clinical Cancer Res. 11: 843-852)。しかしながら、ｐ(薬剤)値の分布は、ＥＬＩＳＡの抗体−抗原結合および検出限界によって識別可能でない。また、抗体−薬剤コンジュゲートの検出のためのＥＬＩＳＡアッセイは、薬剤部分が重鎖又は軽鎖断片又は特定のアミノ酸残基といった抗体に付着しているところを決定しない。この重要な分布パラメータは、ＡＤＣ組成物の個々の分子の分離およびそれらの特徴づけと定量化を有する本発明の方法によって決定されてよい。試料の成分の分離は、方法の分離培地工程時、そして、質量分析工程の間に起こる。本発明の方法の分離培地工程の高い選択性により、複合した異質な生物学的試料から、それぞれのＡＤＣ成分の分離と精製が達成される。本発明の方法の質量分析工程の解像度と精度が高いので、分離されるＡＤＣ成分の検出と定量化が達成される。
薬剤ローディング値は、式Ｉの分子において、抗体当たりの薬剤部分の数であるｐによって表される。式ＩのＡＤＣの組成物には、１からおよそ８の薬剤とコンジュゲートされた抗体の混合物が含まれる。抗体と薬剤−リンカー試薬とのコンジュゲート又は抗体−リンカーと薬剤試薬とのコンジュゲートから生じる抗体−薬剤コンジュゲートの混合物は、コンジュゲート条件に応じて、およそ１からおよそ８の平均薬剤ローディング値を有するものとして特徴付けられる。抗体を薬剤部分にコンジュゲートすることによるＡＤＣの調製により、一又は複数の抗体に結合した薬剤を持つ生成分子の分布が生じ得、この抗体は薬剤部分に結合されておらず、ｐ＝０である。コンジュゲート反応からのＡＤＣの調製において抗体当たりの薬剤の平均数は、本発明の方法、すなわち親和性質量分析及びＥＬＩＳＡアッセイによって特徴付けられうる。ＥＬＩＳＡによって、あるＡＤＣ調製でのｐの平均値が決定されうる(Hamblett et al (2004) Clinical Cancer Res. 10: 7063-7070；Sanderson et al (2005) Clinical Cancer Res. 11: 843-852)。しかしながら、ｐ(薬剤)値の分布は、ＥＬＩＳＡの抗体−抗原結合および検出限界によって識別可能でない。また、抗体−薬剤コンジュゲートの検出のためのＥＬＩＳＡアッセイは、薬剤部分が重鎖又は軽鎖断片又は特定のアミノ酸残基といった抗体に付着しているところを決定しない。この重要な分布パラメータは、ＡＤＣ組成物の個々の分子の分離およびそれらの特徴づけと定量化を有する本発明の方法によって決定されてよい。試料の成分の分離は、方法の分離培地工程時、そして、質量分析工程の間に起こる。本発明の方法の分離培地工程の高い選択性により、複合した異質な生物学的試料から、それぞれのＡＤＣ成分の分離と精製が達成される。本発明の方法の質量分析工程の解像度と精度が高いので、分離されるＡＤＣ成分の検出と定量化が達成される。
本発明の方法は、ＡＤＣの抗体当たりの結合した薬剤(ローディング)の量と、重鎖及び軽鎖といった断片上の薬剤部分の分布を決定し、さらに、抗体のサブ断片座又は特定のアミノ酸残基で共有的に付着した薬剤部分を位置づけることができる。
あるＡＤＣでは、ｐは抗体上の付着部位の数によって限定されうる。例えば、付着がシステインチオールである場合、上記の例示的な実施態様のように、抗体はたった１つ又は複数のシステインチオール基を有してもよいし、付着しうるリンカーによってたった１つ又は複数の十分に活性なチオール基を有してもよい。リジンといった反応性の低いアミノ酸残基は、コンジュゲートさせる抗体に多くあるが、反応せず、薬剤部分又は薬剤−リンカー試薬との反応に利用されない。薬剤ローディングが高い、例えばｐ＞５であると、特定の抗体−薬剤コンジュゲートの凝集、難溶性、毒性又は細胞透過性の喪失が起こりうる。
あるＡＤＣでは、ｐは抗体上の付着部位の数によって限定されうる。例えば、付着がシステインチオールである場合、上記の例示的な実施態様のように、抗体はたった１つ又は複数のシステインチオール基を有してもよいし、付着しうるリンカーによってたった１つ又は複数の十分に活性なチオール基を有してもよい。リジンといった反応性の低いアミノ酸残基は、コンジュゲートさせる抗体に多くあるが、反応せず、薬剤部分又は薬剤−リンカー試薬との反応に利用されない。薬剤ローディングが高い、例えばｐ＞５であると、特定の抗体−薬剤コンジュゲートの凝集、難溶性、毒性又は細胞透過性の喪失が起こりうる。
典型的に、理論的な最大よりも少ない薬剤部分がコンジュゲート反応の間に抗体にコンジュゲートされる。抗体は、例えば、薬剤−リンカー中間体又はリンカー試薬と反応しない多くのリジン残基を含みうる。最も反応性の高いリジン基のみがアミン−反応性リンカー試薬と反応しうる。また、最も反応性の高いシステインチオール基のみがチオール−反応性リンカー試薬と反応しうる。一般に、抗体は薬剤部分に結合しうる多くの遊離した反応性のシステインチオール基を含まない。抗体のほとんどのシステインチオール残基はジスルフィド架橋として存在し、部分的ないしは完全に還元な条件下で、ジチオトレイトール(ＤＴＴ)又はトリス(２-カルボキシエチル)ホスフィンヒドロクロライド(ＴＣＥＰ)などの還元剤により還元される。さらに、抗体は、変性又は部分的な変性条件下に曝されるとリジンやシステインなどの反応性の求核基を現しうる。ＡＤＣのローディング(薬剤／抗体比率)は、例えば、(i) 抗体に対して薬剤−リンカー中間体又はリンカー試薬のモル過剰量を限定する、(ii) コンジュゲートの反応時間又は温度を限定する、及び(iii) システインチオール修飾のための還元条件を部分的又は完全に限定することによるなどの、様々なパラメータによって制御されうる。
抗体の一又は複数の求核基が薬剤−リンカー中間体又はリンカー試薬の後に薬剤部分試薬と反応する場合、その結果生じる生成物は、抗体に付着した薬剤部分の分布、例えば１、２、３などとのＡＤＣ化合物の混合物である。ポリマー逆相(ＰＬＲＰ)及び疎水性相互作用(ＨＩＣ)といった液相クロマトグラフィ法は、薬剤ローディング値によって混合物中の化合物を分離しうる。単一の薬剤ローディング値(ｐ)を有するＡＤＣの調製物は単離されうる("Effect of drug loading on the pharmacology, pharmacokinetics, and toxicity of an anti-CD30 antibody-drug conjugate", Hamblett, K.J., et al, Abstract No. 624, American Association for Cancer Research;2004 Annual Meeting, March 27-31, 2004, Proceedings of the AACR, Volume 45, March 2004；"Controlling the Location of Drug Attachment in Antibody-Drug Conjugates", Alley, S.C., et al, Abstract No. 627, American Association for Cancer Research;2004 Annual Meeting, March 27-31, 2004, Proceedings of the AACR, Volume 45, March 2004)。しかしながら、薬剤部分は抗体上の異なる部位でリンカーにより付着されうるので、これら単一ローディング値のＡＤＣは依然として不均質な混合物であるかもしれない。
抗体の一又は複数の求核基が薬剤−リンカー中間体又はリンカー試薬の後に薬剤部分試薬と反応する場合、その結果生じる生成物は、抗体に付着した薬剤部分の分布、例えば１、２、３などとのＡＤＣ化合物の混合物である。ポリマー逆相(ＰＬＲＰ)及び疎水性相互作用(ＨＩＣ)といった液相クロマトグラフィ法は、薬剤ローディング値によって混合物中の化合物を分離しうる。単一の薬剤ローディング値(ｐ)を有するＡＤＣの調製物は単離されうる("Effect of drug loading on the pharmacology, pharmacokinetics, and toxicity of an anti-CD30 antibody-drug conjugate", Hamblett, K.J., et al, Abstract No. 624, American Association for Cancer Research;2004 Annual Meeting, March 27-31, 2004, Proceedings of the AACR, Volume 45, March 2004；"Controlling the Location of Drug Attachment in Antibody-Drug Conjugates", Alley, S.C., et al, Abstract No. 627, American Association for Cancer Research;2004 Annual Meeting, March 27-31, 2004, Proceedings of the AACR, Volume 45, March 2004)。しかしながら、薬剤部分は抗体上の異なる部位でリンカーにより付着されうるので、これら単一ローディング値のＡＤＣは依然として不均質な混合物であるかもしれない。
抗体薬剤コンジュゲートの投与
本発明の抗体薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)は、治療される状態に適切な任意の手段によって生物学上の供給源と接触させるか又は投与してよい。典型的に、ＡＤＣは、非経口的、すなわち注入、皮下、筋肉内、静脈内、皮内、髄腔内および硬膜外に哺乳動物に投与される。式ＩのＡＤＣと接触、すなわち投与されうる生物源は、(i) 哺乳動物、例えばマウス、ラット、ウサギ、イヌ、サル又はヒト；(ii) 哺乳類の組織；及び(iii) 培養細胞を含む。生物学的試料は、１回、または、時限であるか、間欠的であるか、ランダムな間隔で、生物源から採取される。生物学的試料は、(i) 血液、胆汁、尿又は糞便；(ii) 組織抽出物；及び(iii) 細胞培養物、細胞溶解物又は細胞抽出物を含む。
本発明の親和性キャプチャＬＣ−ＭＳ法は、抗体−薬剤コンジュゲート化合物の毒性のメカニズムを決定するために、組織分析法で使用されてよい。
本発明の抗体薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)は、治療される状態に適切な任意の手段によって生物学上の供給源と接触させるか又は投与してよい。典型的に、ＡＤＣは、非経口的、すなわち注入、皮下、筋肉内、静脈内、皮内、髄腔内および硬膜外に哺乳動物に投与される。式ＩのＡＤＣと接触、すなわち投与されうる生物源は、(i) 哺乳動物、例えばマウス、ラット、ウサギ、イヌ、サル又はヒト；(ii) 哺乳類の組織；及び(iii) 培養細胞を含む。生物学的試料は、１回、または、時限であるか、間欠的であるか、ランダムな間隔で、生物源から採取される。生物学的試料は、(i) 血液、胆汁、尿又は糞便；(ii) 組織抽出物；及び(iii) 細胞培養物、細胞溶解物又は細胞抽出物を含む。
本発明の親和性キャプチャＬＣ−ＭＳ法は、抗体−薬剤コンジュゲート化合物の毒性のメカニズムを決定するために、組織分析法で使用されてよい。
薬学的製剤
本発明の治療上の抗体薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)の薬学的製剤は、典型的に、薬学的に許容可能な非経口用ベヒクルと共に単位用量注入用形態で、非経口的投与、すなわちボーラス、静脈内、腫瘍内注入のために調製される。所望の純度を持つ抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)は、場合によって、薬学的に許容される希釈剤、担体、賦形剤又は安定化剤と、凍結乾燥又は水溶液の形態に混合される(Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980))。
許容される希釈剤、担体、賦形剤及び安定化剤は、用いられる用量と濃度で生物源レシピエントに非毒性であり、ホスフェート、シトレート及び他の有機酸等のバッファー；アスコルビン酸及びメチオニンを含む酸化防止剤；保存料(例えばオクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロリド；ヘキサメトニウムクロリド；ベンザルコニウムクロリド、ベンズエトニウムクロリド；フェノール、ブチル又はベンジルアルコール；メチル又はプロピルパラベン等のアルキルパラベン；カテコール；レゾルシノール；シクロヘキサノール；３-ペンタノール；及びｍ-クレゾール)；低分子量(約１０残基未満)のポリペプチド；血清アルブミン、ゼラチン、又は免疫グロブリン等のタンパク質；ポリビニルピロリドン等の親水性ポリマー；グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン又はリシン等のアミノ酸；グアールゴムおよびデキストリンを含む、単糖、二糖および他の炭水化物；グルコース、マンノース、スクロース、マンニトール、トレハロース又はソルビトールといった糖質；ＥＤＴＡ等のキレート化剤；ナトリウム等の塩形成対イオン；金属錯体(例えば、Ｚｎ-タンパク質複合体)；及び／又はＴＷＥＥＮＴＭ、ＰＬＵＲＯＮＩＣＳＴＭ又はポリエチレングリコール(ＰＥＧ)等の非イオン性界面活性剤を含む。例えば、凍結乾燥した抗ＥｒｂＢ２抗体製剤は国際公開９７／０４８０１に記載されており、出典明記によって本明細書中に特別に援用される。
本発明の治療上の抗体薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)の薬学的製剤は、典型的に、薬学的に許容可能な非経口用ベヒクルと共に単位用量注入用形態で、非経口的投与、すなわちボーラス、静脈内、腫瘍内注入のために調製される。所望の純度を持つ抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)は、場合によって、薬学的に許容される希釈剤、担体、賦形剤又は安定化剤と、凍結乾燥又は水溶液の形態に混合される(Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980))。
許容される希釈剤、担体、賦形剤及び安定化剤は、用いられる用量と濃度で生物源レシピエントに非毒性であり、ホスフェート、シトレート及び他の有機酸等のバッファー；アスコルビン酸及びメチオニンを含む酸化防止剤；保存料(例えばオクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロリド；ヘキサメトニウムクロリド；ベンザルコニウムクロリド、ベンズエトニウムクロリド；フェノール、ブチル又はベンジルアルコール；メチル又はプロピルパラベン等のアルキルパラベン；カテコール；レゾルシノール；シクロヘキサノール；３-ペンタノール；及びｍ-クレゾール)；低分子量(約１０残基未満)のポリペプチド；血清アルブミン、ゼラチン、又は免疫グロブリン等のタンパク質；ポリビニルピロリドン等の親水性ポリマー；グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン又はリシン等のアミノ酸；グアールゴムおよびデキストリンを含む、単糖、二糖および他の炭水化物；グルコース、マンノース、スクロース、マンニトール、トレハロース又はソルビトールといった糖質；ＥＤＴＡ等のキレート化剤；ナトリウム等の塩形成対イオン；金属錯体(例えば、Ｚｎ-タンパク質複合体)；及び／又はＴＷＥＥＮＴＭ、ＰＬＵＲＯＮＩＣＳＴＭ又はポリエチレングリコール(ＰＥＧ)等の非イオン性界面活性剤を含む。例えば、凍結乾燥した抗ＥｒｂＢ２抗体製剤は国際公開９７／０４８０１に記載されており、出典明記によって本明細書中に特別に援用される。
また活性成分は、例えばコアセルベーション技術あるいは界面重合により調製されたマイクロカプセル、例えばそれぞれヒドロキシメチルセルロース又はゼラチンマイクロカプセル及びポリ-(メタクリル酸メチル)マイクロカプセルに、コロイド状ドラッグデリバリーシステム(例えば、リポソーム、アルブミンミクロスフィア、マイクロエマルション、ナノ-粒子及びナノカプセル)に、あるいはマクロエマルションに捕捉させてもよい。このような技術は、Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980)に開示されている。
徐放性調製物を調製してもよい。徐放性調製物の好ましい例は、ＡＤＣを含む疎水性固体ポリマーの半透性マトリクスを含み、そのマトリクスは成形物、例えばフィルム又はマイクロカプセルの形態である。徐放性マトリクスの例には、ポリエステル、ヒドロゲル(例えば、ポリ(２-ヒドロキシエチルメタクリレート)、又はポリ(ビニルアルコール))、ポリラクチド(米国特許第３７７３９１９号)、Ｌ-グルタミン酸とγエチル-Ｌ-グルタメートのコポリマー、非分解性エチレン-酢酸ビニル、分解性乳酸-グリコール酸コポリマー、例えばＬＵＰＲＯＮ ＤＥＰＯＴＴＭ(乳酸-グリコール酸コポリマー及び酢酸ロイプロリドからなる注射可能なミクロスフィア)、及びポリ-Ｄ-(-)-３-ヒドロキシブチル酸が含まれる。
徐放性調製物を調製してもよい。徐放性調製物の好ましい例は、ＡＤＣを含む疎水性固体ポリマーの半透性マトリクスを含み、そのマトリクスは成形物、例えばフィルム又はマイクロカプセルの形態である。徐放性マトリクスの例には、ポリエステル、ヒドロゲル(例えば、ポリ(２-ヒドロキシエチルメタクリレート)、又はポリ(ビニルアルコール))、ポリラクチド(米国特許第３７７３９１９号)、Ｌ-グルタミン酸とγエチル-Ｌ-グルタメートのコポリマー、非分解性エチレン-酢酸ビニル、分解性乳酸-グリコール酸コポリマー、例えばＬＵＰＲＯＮ ＤＥＰＯＴＴＭ(乳酸-グリコール酸コポリマー及び酢酸ロイプロリドからなる注射可能なミクロスフィア)、及びポリ-Ｄ-(-)-３-ヒドロキシブチル酸が含まれる。
抗体薬剤コンジュゲートの代謝産物
代謝産物が先行技術に対して新規性及び非自明性を有する限りにおいて、本明細書中に記載のＡＤＣ化合物のインビボ代謝産物も、本発明の権利内である。このような生成物は、投与された化合物の、例えば酸化、還元、加水分解、アミド化、エステル化、酵素切断などから生じうる。したがって、本発明は、代謝産物が生じるために十分な時間、本発明の化合物を哺乳動物と接触させることを含む方法によって生成される新規の自明でない化合物を包含する。
典型的には、代謝産物は、ラット、マウス、モルモット、サルなどの動物又はヒトに検出可能な用量(例えば、およそ０．５ｍｇ／ｋｇ以上)で抗体−薬剤コンジュゲート混合物を投与し、代謝が生じるために十分な時間(典型的にはおよそ３０秒から３０時間)をおいて、尿、血液又は他の生体試料から代謝された生成物を単離することによって同定される。代謝産物の構造は本発明の質量分析法によって決定される。
代謝産物が先行技術に対して新規性及び非自明性を有する限りにおいて、本明細書中に記載のＡＤＣ化合物のインビボ代謝産物も、本発明の権利内である。このような生成物は、投与された化合物の、例えば酸化、還元、加水分解、アミド化、エステル化、酵素切断などから生じうる。したがって、本発明は、代謝産物が生じるために十分な時間、本発明の化合物を哺乳動物と接触させることを含む方法によって生成される新規の自明でない化合物を包含する。
典型的には、代謝産物は、ラット、マウス、モルモット、サルなどの動物又はヒトに検出可能な用量(例えば、およそ０．５ｍｇ／ｋｇ以上)で抗体−薬剤コンジュゲート混合物を投与し、代謝が生じるために十分な時間(典型的にはおよそ３０秒から３０時間)をおいて、尿、血液又は他の生体試料から代謝された生成物を単離することによって同定される。代謝産物の構造は本発明の質量分析法によって決定される。
薬物動態
半減期、クリアランス、曲線下面積（ＡＵＣ）、及び分布容積を含む哺乳動物における薬物動態（ＰＫ）定量のための治療剤の循環量のモニタリングは、安全性／毒性限界及び適切な投薬計画を樹立するために必要である（Welling, P. (1997) Pharmacokinetics Processes, Mathematics, and Applications, 2版, American Chemical Society, Washington, DC）。生物学的利用能は、投与された化合物が投与投薬形態から全身循環に達する度合いであり、通常は投与された用量のパーセントとして表される。ある化合物の半減期は、該化合物のピーク血漿中濃度の５０％が排出又は生体内分解（代謝）によって除去されるのに必要な時間である。該治療指数は、所望される治療活性と所望されない毒性副作用間の選択性を表す。本発明の方法による薬物動態測定値は、抗体及び抗体・薬剤コンジュゲート（ＡＤＣ）の吸収、分布、代謝、及び排出（ＡＤＭＥ）を明らかにするものである。
インビボ投与されると、抗体・薬剤コンジュゲートは、加水分解、薬剤部分切断、抗体変性、グルクロン酸抱合、酸化、又は他の代謝分解事象を被る場合がある。これらの事象を精確に特徴付け、その産物を測定するために、ビーズベースのアフィニティ捕獲及び質量分析法が開発される。
半減期、クリアランス、曲線下面積（ＡＵＣ）、及び分布容積を含む哺乳動物における薬物動態（ＰＫ）定量のための治療剤の循環量のモニタリングは、安全性／毒性限界及び適切な投薬計画を樹立するために必要である（Welling, P. (1997) Pharmacokinetics Processes, Mathematics, and Applications, 2版, American Chemical Society, Washington, DC）。生物学的利用能は、投与された化合物が投与投薬形態から全身循環に達する度合いであり、通常は投与された用量のパーセントとして表される。ある化合物の半減期は、該化合物のピーク血漿中濃度の５０％が排出又は生体内分解（代謝）によって除去されるのに必要な時間である。該治療指数は、所望される治療活性と所望されない毒性副作用間の選択性を表す。本発明の方法による薬物動態測定値は、抗体及び抗体・薬剤コンジュゲート（ＡＤＣ）の吸収、分布、代謝、及び排出（ＡＤＭＥ）を明らかにするものである。
インビボ投与されると、抗体・薬剤コンジュゲートは、加水分解、薬剤部分切断、抗体変性、グルクロン酸抱合、酸化、又は他の代謝分解事象を被る場合がある。これらの事象を精確に特徴付け、その産物を測定するために、ビーズベースのアフィニティ捕獲及び質量分析法が開発される。
生物学的試料の処理(プロセシング)
式Ｉの抗体・薬剤コンジュゲート（ＡＤＣ）化合物と場合によっては式Ｉの抗体（ここで、ｐは０である）、又は抗体断片又はその代謝産物を、哺乳動物、組織、細胞培養物、血漿又は血清から選択される生物学的供給源に投与し、又はこれと接触させる。血清及び血漿試料からの分析は、その高いプロテオミクスバックグラウンド、つまり多くのタンパク質及び他の分析物のために問題があることは知られている。分、時間、日にわたる所定の時間の後に、式Ｉを有する抗体・薬剤コンジュゲート化合物、又はその断片もしくは代謝産物を含有する生物学的試料を集める。該生物学的試料は、シリンジ又はカニューレで液を抜き出すことを含む任意の手段によって集めることができる。該生物学的試料は、血液又は血液生成物、例えば血清、血漿等、脳脊髄液又は他の体液、例えば唾液、尿、リンパ液、胆汁、糞便、汗、又は呼気でありうる。
処方、固定、遠心分離、単離、消化、血球凝固の誘導又は防止、加水分解、又は精製を含む一般的な手順によって生物学的試料を処理して分析試料を形成する。
生物学的試料の処理は、試料成分の分離を妨げ、又はデータ収集又は解析を不明瞭にしうる不純物を除去し、試料不均一性を低減させるものである。あるいは、又は加えて、プロセシングは、試料の取り扱いを単純化し、分解から保存し、試料容積を最小化し、又は質量分析解析において興味ある試料成分（分析物）を選択する。あるいは、又は加えて、プロセシングは、生物学的試料を、薬物代謝又は薬物動態効果の測定において興味深い代謝産物、断片、又は誘導体に転換する。
式Ｉの抗体・薬剤コンジュゲート（ＡＤＣ）化合物と場合によっては式Ｉの抗体（ここで、ｐは０である）、又は抗体断片又はその代謝産物を、哺乳動物、組織、細胞培養物、血漿又は血清から選択される生物学的供給源に投与し、又はこれと接触させる。血清及び血漿試料からの分析は、その高いプロテオミクスバックグラウンド、つまり多くのタンパク質及び他の分析物のために問題があることは知られている。分、時間、日にわたる所定の時間の後に、式Ｉを有する抗体・薬剤コンジュゲート化合物、又はその断片もしくは代謝産物を含有する生物学的試料を集める。該生物学的試料は、シリンジ又はカニューレで液を抜き出すことを含む任意の手段によって集めることができる。該生物学的試料は、血液又は血液生成物、例えば血清、血漿等、脳脊髄液又は他の体液、例えば唾液、尿、リンパ液、胆汁、糞便、汗、又は呼気でありうる。
処方、固定、遠心分離、単離、消化、血球凝固の誘導又は防止、加水分解、又は精製を含む一般的な手順によって生物学的試料を処理して分析試料を形成する。
生物学的試料の処理は、試料成分の分離を妨げ、又はデータ収集又は解析を不明瞭にしうる不純物を除去し、試料不均一性を低減させるものである。あるいは、又は加えて、プロセシングは、試料の取り扱いを単純化し、分解から保存し、試料容積を最小化し、又は質量分析解析において興味ある試料成分（分析物）を選択する。あるいは、又は加えて、プロセシングは、生物学的試料を、薬物代謝又は薬物動態効果の測定において興味深い代謝産物、断片、又は誘導体に転換する。
捕獲処理がなされた分析試料
式Ｉの抗体・薬剤コンジュゲート（ＡＤＣ）化合物と場合によっては式Ｉの抗体（ここで、ｐは０である）、又は抗体断片又はその代謝産物を、ビーズがＡＤＣの抗体又は薬剤に特異的な固定化抗原を有する免疫親和性ビーズに捕捉せしめる。投与された抗体・薬剤コンジュゲートの抗体に特異的な抗原をビオチン化し、強いビオチン-ストレプトアビジン相互作用（ＫＤ＝１０−１５Ｍ）によってストレプトアビジン被覆常磁性ビーズに結合させる。図１ａはＥＣＤ捕獲と称される一実施態様を例証している。抗体（ＭＡｂ）及び抗体・薬剤コンジュゲート（ＡＤＣ）は、磁石に接触したストレプトアビジンに結合しているビオチン化ＥＤＣタンパク質のＥＣＤ（細胞外ドメイン）に結合する。図１ｂは、抗体（ＭＡｂ）及び抗体・薬剤コンジュゲート（ＡＤＣ）が、ビーズに共有的に結合しているＥＣＤタンパク質のＥＣＤ（細胞外ドメイン）に結合するＥＣＤ捕獲の他の実施態様を例証する。ビーズはカラム形式に又はウェル中に緩く設けられうる。図２は、抗体・薬剤コンジュゲート（ＡＤＣ）が、磁石に接触したストレプトアビジン被覆常磁性ビーズに結合しているビオチン化抗薬剤モノクローナル抗体（ビオチン-抗薬剤ＭＡｂ）に結合する抗薬剤部分抗体捕獲の他の実施態様を例証する。
免疫親和性ビーズは、多孔性ポリマーモノリスを含み得、捕集リザーバと流体が流れるように連通しているフロースルーチャネルに設けられうる。ビーズは、生物学的供給源からの試料が一端又はオリフィスに導入され、試料が他端又はオリフィスから溶出されるカラム又は漏斗のようなフロースルー容器に収容されてもよい。免疫親和性ビーズは、それぞれが別個の捕集リザーバに連通させられた複数のフロースルー容器に分布せしめられてもよい。容器及びリザーバは、１２×８の行列の９６マイクロタイターウェル形式、又は自動化及び結果の再現性のために２４×１６の行列の３８４マイクロタイターウェル形式に構成されうる。
式Ｉの抗体・薬剤コンジュゲート（ＡＤＣ）化合物と場合によっては式Ｉの抗体（ここで、ｐは０である）、又は抗体断片又はその代謝産物を、ビーズがＡＤＣの抗体又は薬剤に特異的な固定化抗原を有する免疫親和性ビーズに捕捉せしめる。投与された抗体・薬剤コンジュゲートの抗体に特異的な抗原をビオチン化し、強いビオチン-ストレプトアビジン相互作用（ＫＤ＝１０−１５Ｍ）によってストレプトアビジン被覆常磁性ビーズに結合させる。図１ａはＥＣＤ捕獲と称される一実施態様を例証している。抗体（ＭＡｂ）及び抗体・薬剤コンジュゲート（ＡＤＣ）は、磁石に接触したストレプトアビジンに結合しているビオチン化ＥＤＣタンパク質のＥＣＤ（細胞外ドメイン）に結合する。図１ｂは、抗体（ＭＡｂ）及び抗体・薬剤コンジュゲート（ＡＤＣ）が、ビーズに共有的に結合しているＥＣＤタンパク質のＥＣＤ（細胞外ドメイン）に結合するＥＣＤ捕獲の他の実施態様を例証する。ビーズはカラム形式に又はウェル中に緩く設けられうる。図２は、抗体・薬剤コンジュゲート（ＡＤＣ）が、磁石に接触したストレプトアビジン被覆常磁性ビーズに結合しているビオチン化抗薬剤モノクローナル抗体（ビオチン-抗薬剤ＭＡｂ）に結合する抗薬剤部分抗体捕獲の他の実施態様を例証する。
免疫親和性ビーズは、多孔性ポリマーモノリスを含み得、捕集リザーバと流体が流れるように連通しているフロースルーチャネルに設けられうる。ビーズは、生物学的供給源からの試料が一端又はオリフィスに導入され、試料が他端又はオリフィスから溶出されるカラム又は漏斗のようなフロースルー容器に収容されてもよい。免疫親和性ビーズは、それぞれが別個の捕集リザーバに連通させられた複数のフロースルー容器に分布せしめられてもよい。容器及びリザーバは、１２×８の行列の９６マイクロタイターウェル形式、又は自動化及び結果の再現性のために２４×１６の行列の３８４マイクロタイターウェル形式に構成されうる。
抗体・薬剤コンジュゲート組成物を投与された哺乳動物（生物学的供給源）からの血漿又は血清試料を、手作業のピペット操作により又は自動化されたロボット分配によってビーズに塗布する。ビーズは、ウェル又は他の容器に設けられ、又は試料が一端又はオリフィスに導入され、洗浄溶出物又は溶出試料が他端又はオリフィスから溶出されるカラム又は他のフロースルー容器に収容されてもよい。ビーズ結合抗原に特異的な試料成分が結合せしめられる。ビーズを洗浄して非特異的タンパク質及び他の非特異的試料成分をすすぐ。結合した抗体はビーズ上で例えばＰＮＧａｓｅＦで脱グリコシル化されうる。結合した試料成分は試料プレート中に溶出され得、分離されたものは容器又はウェルに収容される。溶出した試料はついで手作業のピペット操作により又はロボット移送によって対処され、逆相クロマトグラフィーによって分離され得、分離された試料成分が質量分析計によって分析される。
ストレプトアビジン被覆常磁性ビーズを使用する理論的根拠は、(i)強いストレプトアビジン−ビオチン相互作用（ＫＤ＝１０−１５Ｍ）、(ii)固定化ストレプトアビジン／ビオチン化分析物が立証された方法であること、(iii)高い結合能（インタクトなタンパク質に対して十分な材料）、(iv)低い非特異的結合、(v)質量分析に適合した溶媒を用いた試料の溶出、(vi)ビーズからの良好な試料回収、及び(vii)使用の容易性及び自動化への受け入れ性である。
例示的な実施態様では、生物学的試料はトリプシン消化で消化されうる。トリプシン消化では、試料はＤＤＴで還元され、ヨード酢酸ナトリウムでＳ−カルボキシメチル化され、ついでトリプシンで消化されうる。消化された試料は、(i)逆相ＨＰＬＣ、例えばＮｕｃｌｅｏｓｉｌ Ｃ１８カラム；(ii)サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）、例えばＴＳＫ３０００ＳＷｘＬカラム；又は(iii)ＴＳＫボロン酸カラムを使用するボロン酸アフィニティクロマトグラフィーによって分析されうる。
ストレプトアビジン被覆常磁性ビーズを使用する理論的根拠は、(i)強いストレプトアビジン−ビオチン相互作用（ＫＤ＝１０−１５Ｍ）、(ii)固定化ストレプトアビジン／ビオチン化分析物が立証された方法であること、(iii)高い結合能（インタクトなタンパク質に対して十分な材料）、(iv)低い非特異的結合、(v)質量分析に適合した溶媒を用いた試料の溶出、(vi)ビーズからの良好な試料回収、及び(vii)使用の容易性及び自動化への受け入れ性である。
例示的な実施態様では、生物学的試料はトリプシン消化で消化されうる。トリプシン消化では、試料はＤＤＴで還元され、ヨード酢酸ナトリウムでＳ−カルボキシメチル化され、ついでトリプシンで消化されうる。消化された試料は、(i)逆相ＨＰＬＣ、例えばＮｕｃｌｅｏｓｉｌ Ｃ１８カラム；(ii)サイズ排除クロマトグラフィー（ＳＥＣ）、例えばＴＳＫ３０００ＳＷｘＬカラム；又は(iii)ＴＳＫボロン酸カラムを使用するボロン酸アフィニティクロマトグラフィーによって分析されうる。
試料成分の分離
分析試料を形成するために、生物学的試料を分離溶液に適用して、一を越える試料成分の分離をなさしめることができる。分離方法は、アフィニティ、クロマトグラフィー、及び電気泳動法を含む。アフィニティ法は、アフィニティクロマトグラフィー、吸着、及び固定化アフィニティマトリックスを含む。クロマトグラフィー法は、ＨＰＬＣ、疎水性相互作用（ＨＩＣ）、アニオン交換、カチオン交換、逆相、順相、イオン対逆相、薄層、キャピラリーフロー、及びサイズ排除を含む。電気泳動法は、単一次元、スラブゲル、キャピラリー、ポリアクリルアミド、変性、天然、自由溶液、紙、２次元、等電点電気泳動、及び勾配電位を含む。他の分離方法は、透析、遠心分離、遠心沈降、浮選、沈降、免疫沈降、及びゲル濾過を含む。
分離方法は、限定しないが、溶出時間、疎水性、親水性、泳動時間、割合、速度、クロマトグラフィー保持時間、溶解度、分子容積又はサイズ、正味荷電、荷電状態、イオン電荷、等電点、解離定数（ｐＫａ）、抗体親和性、電気泳動移動度、イオン化ポテンシャル、双極子モーメント、水素結合能、及び気相中におけるイオン移動度を含む一又は複数の物理化学的性質による生物学的試料の成分の分離を行うことができる。
質量分析計入口装置中へのキャピラリーフロー注入による低い流量により、質量検出の感度を高め、例えばインタクトなタンパク質及び抗体・薬剤コンジュゲートのような低濃度分析物及び高分子量種を検出し特徴付けることができる。
分析試料を形成するために、生物学的試料を分離溶液に適用して、一を越える試料成分の分離をなさしめることができる。分離方法は、アフィニティ、クロマトグラフィー、及び電気泳動法を含む。アフィニティ法は、アフィニティクロマトグラフィー、吸着、及び固定化アフィニティマトリックスを含む。クロマトグラフィー法は、ＨＰＬＣ、疎水性相互作用（ＨＩＣ）、アニオン交換、カチオン交換、逆相、順相、イオン対逆相、薄層、キャピラリーフロー、及びサイズ排除を含む。電気泳動法は、単一次元、スラブゲル、キャピラリー、ポリアクリルアミド、変性、天然、自由溶液、紙、２次元、等電点電気泳動、及び勾配電位を含む。他の分離方法は、透析、遠心分離、遠心沈降、浮選、沈降、免疫沈降、及びゲル濾過を含む。
分離方法は、限定しないが、溶出時間、疎水性、親水性、泳動時間、割合、速度、クロマトグラフィー保持時間、溶解度、分子容積又はサイズ、正味荷電、荷電状態、イオン電荷、等電点、解離定数（ｐＫａ）、抗体親和性、電気泳動移動度、イオン化ポテンシャル、双極子モーメント、水素結合能、及び気相中におけるイオン移動度を含む一又は複数の物理化学的性質による生物学的試料の成分の分離を行うことができる。
質量分析計入口装置中へのキャピラリーフロー注入による低い流量により、質量検出の感度を高め、例えばインタクトなタンパク質及び抗体・薬剤コンジュゲートのような低濃度分析物及び高分子量種を検出し特徴付けることができる。
分離された試料成分の質量分析
質量分光分析のための抗体・薬剤コンジュゲート試料の調製は、一般に、知られている技術に従って実施されうる。“Modern Protein Chemistry: Practical Aspects”, Howard, G.C.及びBrown, W.E.編(2002) CRC Press, Boca Raton, Flを参照のこと。
本発明の方法は生物学的試料から由来する抗体混合物の分析に適しており、成分を連続的に又はバッチ形式で溶出せしめ、又は質量分析計によって直接検出せしめるアフィニティ又はクロマトグラフィーを含む一又は複数のプロセスにより、混合物の異なった化学成分が、最初に単離され、分離され、又は部分的に分離される。断片化、脱アミド、グリケーション、酸化、部分的配列情報、例えばＮ末端及びＣ末端、二量体及び凝集状態を含む抗体の様々な構造的特徴及び性質を、質量分光分析から解明することができる。生物学的試料中の一又は複数の化学成分は、投与される抗体・薬剤コンジュゲートが既知の配列、構造、及び分子量のものであるので、その精確な質量の測定によって高度に特異的な形で特徴付けることができる。
質量分光分析のための抗体・薬剤コンジュゲート試料の調製は、一般に、知られている技術に従って実施されうる。“Modern Protein Chemistry: Practical Aspects”, Howard, G.C.及びBrown, W.E.編(2002) CRC Press, Boca Raton, Flを参照のこと。
本発明の方法は生物学的試料から由来する抗体混合物の分析に適しており、成分を連続的に又はバッチ形式で溶出せしめ、又は質量分析計によって直接検出せしめるアフィニティ又はクロマトグラフィーを含む一又は複数のプロセスにより、混合物の異なった化学成分が、最初に単離され、分離され、又は部分的に分離される。断片化、脱アミド、グリケーション、酸化、部分的配列情報、例えばＮ末端及びＣ末端、二量体及び凝集状態を含む抗体の様々な構造的特徴及び性質を、質量分光分析から解明することができる。生物学的試料中の一又は複数の化学成分は、投与される抗体・薬剤コンジュゲートが既知の配列、構造、及び分子量のものであるので、その精確な質量の測定によって高度に特異的な形で特徴付けることができる。
高質量精度、高感度、及び高解像度を可能にする様々な質量分析システムが当該分野で知られており、本発明の方法において用いることができる。かかる質量分析計の質量分析器（マスアナライザー）は、限定しないが、四重極型（Ｑ）、飛行時間型（ＴＯＦ）、イオントラップ、磁場型又はＦＴ−ＩＣＲ又はその組合せを含む。質量分析計のイオン源は、主として試料分子イオン、又は疑似分子イオン、及び所定の特徴付け可能なフラグメントイオンを生じなければならない。かかるイオン源の例は、大気圧イオン化源、例えばエレクトロスプレーイオン化（ＥＳＩ）及び大気圧化学イオン化（ＡＰＣＩ）及びマトリックス支援レーザー脱離イオン化（ＭＡＬＤＩ）を含む。ＥＳＩとＭＡＬＤＩは、質量分光分析に対してタンパク質をイオン化するための二種の最も一般的に用いられている方法である。ＥＳＩとＡＰＣＩは、ＬＣ／ＭＳによる小分子の分析のために最も一般的に使用されるイオン源技術である（Lee, M. “LC/MS Applications in Drug Development” (2002) J. Wiley & Sons, New York）。
表面増強レーザー脱離イオン化（ＳＥＬＤＩ）は高スループットの質量分析を可能にする表面ベースのイオン化技術の一例である（米国特許第６０２０２０８号）。典型的には、ＳＥＬＤＩはタンパク質と他の生体分子の複雑な混合物を分析するために使用される。ＳＥＬＤＩは、溶液中の例えばタンパク質のような分析物と相互作用する「プロテインチップ」のような化学的に反応性の表面を用いる。かかる表面は分析物と選択的に相互作用し、それらをその上に固定化する。よって、本発明の分析物はチップ上で部分的に精製され、ついで質量分析計で迅速に分析されうる。基体表面上の異なった部位に複数の反応性部分を設けることにより、スループットが増大されうる。
機能的システムでは、質量分析計は関心ある化学種の質量を、その正確な又は計算された質量の２０ｐｐｍ以内まで、典型的にはその正確な又は計算された質量の５ｐｐｍ以下まで精確に測定する。市販の質量分析計は、質量スペクトルシグナル強度又はピーク面積が定量的に代表することを担保するために混合物中の複数の成分について十分なスペクトルを獲得することを可能にする頻度で同時に全質量スペクトルをサンプリングし記録することができる。これはまた全ての質量に対して観察される溶出時間が質量分析器によって変更又は歪められないことを担保し、定量的測定値が大量の一過性シグナルを測定する必要性によって損なわれないことを担保するのに役立つであろう。
機能的システムでは、質量分析計は関心ある化学種の質量を、その正確な又は計算された質量の２０ｐｐｍ以内まで、典型的にはその正確な又は計算された質量の５ｐｐｍ以下まで精確に測定する。市販の質量分析計は、質量スペクトルシグナル強度又はピーク面積が定量的に代表することを担保するために混合物中の複数の成分について十分なスペクトルを獲得することを可能にする頻度で同時に全質量スペクトルをサンプリングし記録することができる。これはまた全ての質量に対して観察される溶出時間が質量分析器によって変更又は歪められないことを担保し、定量的測定値が大量の一過性シグナルを測定する必要性によって損なわれないことを担保するのに役立つであろう。
エレクトロスプレーイオン化質量分析（ＥＳＩ）
高感度が、増加した分析物イオン化効率のために低流量で達成される（Gale等(1993) Rapid Commun. Mass Spectrom. 7:1017）。よって、分レンジ当たりナノリットルの流量で試料含有液のエレクトロスプレー注入を実施することによって、適切な検量後に精確な定量がもたらされ、質量分析と併用される場合、液中に含まれる分析物に対して高感度がもたらされる。高選択性及び感度をもたらし、ＭＳに対する前工程としての精確な定量分析をもたらす小型化され統合されたマイクロカラム及びアフィニティクロマトグラフィー吸着剤を有するマイクロカラムアレイを含むシステム及び装置が報告されている（米国特許第６８１１６８９号；米国特許第６０２０２０８号；米国特許第６５７９７１９号）。
抗体のような比較的高分子量の化合物の質量は、殆どの質量分析計によって容易に決定される質量電荷比（ｍ／ｚ）（２０００までから３０００までの典型的なｍ／ｚ範囲）で検出されうる。エレクトロスプレーイオン化質量分析ＥＳＩ−ＭＳは、荷電、極性又は塩基性化合物に、また多重に荷電した化合物を優れた検出限界で分析するために特に適している。ＥＳＩはよって大きな生体分子、例えば１５００００又はそれ以上の分子量（ＭＷ）の抗体及び抗体・薬剤コンジュゲートの検出及び特徴付けを可能にする。高分子量イオンを用いると、一連の多重に荷電した分子イオンが典型的には観察される。陽イオンの分子量は、測定されたｍ／ｚ比に電荷数（ｎ）を掛け、カチオン質量（Ｃ＋）にイオン上の電荷数（ｎ）を掛けたものを引くことによって決定される。
高感度が、増加した分析物イオン化効率のために低流量で達成される（Gale等(1993) Rapid Commun. Mass Spectrom. 7:1017）。よって、分レンジ当たりナノリットルの流量で試料含有液のエレクトロスプレー注入を実施することによって、適切な検量後に精確な定量がもたらされ、質量分析と併用される場合、液中に含まれる分析物に対して高感度がもたらされる。高選択性及び感度をもたらし、ＭＳに対する前工程としての精確な定量分析をもたらす小型化され統合されたマイクロカラム及びアフィニティクロマトグラフィー吸着剤を有するマイクロカラムアレイを含むシステム及び装置が報告されている（米国特許第６８１１６８９号；米国特許第６０２０２０８号；米国特許第６５７９７１９号）。
抗体のような比較的高分子量の化合物の質量は、殆どの質量分析計によって容易に決定される質量電荷比（ｍ／ｚ）（２０００までから３０００までの典型的なｍ／ｚ範囲）で検出されうる。エレクトロスプレーイオン化質量分析ＥＳＩ−ＭＳは、荷電、極性又は塩基性化合物に、また多重に荷電した化合物を優れた検出限界で分析するために特に適している。ＥＳＩはよって大きな生体分子、例えば１５００００又はそれ以上の分子量（ＭＷ）の抗体及び抗体・薬剤コンジュゲートの検出及び特徴付けを可能にする。高分子量イオンを用いると、一連の多重に荷電した分子イオンが典型的には観察される。陽イオンの分子量は、測定されたｍ／ｚ比に電荷数（ｎ）を掛け、カチオン質量（Ｃ＋）にイオン上の電荷数（ｎ）を掛けたものを引くことによって決定される。
ＥＳＩ法は、インターフェースレンズ電位を制御することによってフラグメンテーションの有無を制御することを可能にする。エレクトロスプレーイオン化（ＥＳＩ）は、液体分離方法（前工程）並びに質量分光検出法（後工程）と適合性がある（“Electrospray Ionization Mass Spectrometry: Fundamentals, Instrumentation, and Applications”, Cole, R.B.編(1997) Wiley, New York）。
ＥＳＩ−ＭＳデータは、多数のスキャンを併せて平均化し、データを平滑化して良好なピーク強度及び形状をもたらすことによって獲得されうる。低分子量化合物では、観察される最も多いピークはしばしば陽イオンモードでは［Ｍ＋Ｈ］＋イオン、陰イオンモードでは［Ｍ−Ｈ］−である。二重及び三重に荷電したイオン並びに二量体がまた観察されうる。二重に荷電した陽イオンは質量（ＭＷ＋２Ｃ＋）÷２に観察され、ここで、ＭＷは分子量であり、Ｃ＋はイオン化陽イオン、例えばＨ＋、Ｎａ＋、又はＮＨ４＋である。非常に低分子量の化合物を除いて、検出されるイオンは多重に荷電される。ＥＳＩのソフトな（低イオン化電位）条件のため、典型的には分子イオンだけが観察される。ＥＳＩスペクトルは、イオンが有する様々な電荷数のために質量が異なる幾つかの分子イオンピークを有しうる。
ＥＳＩ−ＭＳデータは、多数のスキャンを併せて平均化し、データを平滑化して良好なピーク強度及び形状をもたらすことによって獲得されうる。低分子量化合物では、観察される最も多いピークはしばしば陽イオンモードでは［Ｍ＋Ｈ］＋イオン、陰イオンモードでは［Ｍ−Ｈ］−である。二重及び三重に荷電したイオン並びに二量体がまた観察されうる。二重に荷電した陽イオンは質量（ＭＷ＋２Ｃ＋）÷２に観察され、ここで、ＭＷは分子量であり、Ｃ＋はイオン化陽イオン、例えばＨ＋、Ｎａ＋、又はＮＨ４＋である。非常に低分子量の化合物を除いて、検出されるイオンは多重に荷電される。ＥＳＩのソフトな（低イオン化電位）条件のため、典型的には分子イオンだけが観察される。ＥＳＩスペクトルは、イオンが有する様々な電荷数のために質量が異なる幾つかの分子イオンピークを有しうる。
試料、例えばＡＤＣ又は他の生体分子の希釈溶液は、ＥＳＩ−ＭＳ分析のための皮下注射針を通してゆっくりとポンプ移送されうる。試料はフロー注入又はＬＣ／ＭＳを介して導入されうる。典型的には、流量は、毎分１マイクロリットル（μｌ）未満から毎分約１ミリリットル（ｍｌ）の範囲である。ＥＳＩは、さもないと蒸発又はイオン化が困難な大きな生体分子に特に適している。針は高電圧に保たれ、針端部の強電場が噴霧された溶液を荷電し、荷電した液滴を生じせしめる。荷電した液滴は水を蒸発させ、小オリフィスを通じて真空チャンバー中に移動する分子イオンを最終的に生じる。溶媒蒸発の過程中に、非共有的に結合した複合体が溶液から気相に移動される。（Hu等(1994)）。インタクトな気相複合体を維持するためには穏やかな脱溶媒和条件が一般的に必要とされる。イオンが完全に脱溶媒和されることを担保するためにオリフィスを加熱してもよい。あるＭＳシステムは向流の加熱ガスを用いる。荷電した液滴は、皮下注射針から放出され、真空チャンバーに入る前に溶媒を蒸発させるにつれて収縮する。熱及びガス流を使用して脱溶媒和を助けてもよい。ＥＳＩ測定に対して必要とされる試料の量は、小さなキャピラリーエレクトロスプレーエミッター、チップの使用により液の流れを減少させることによって低減させることができ、ナノエレクトロスプレーとして知られている方法である。ナノエレクトロスプレー法は１μｌの試料に対して約１０−３０分の間、一定のシグナルを生成しうる。低い流量はイオン効率を増加させ、イオン抑制を低減させることが示されている。ナノエレクトロスプレー法はＭＳ／ＭＳタンパク質研究に頻繁に使用される（Korner等(1996) J. Am. Soc. Mass Spectrom. 7:150-156；Mann, M.及びWilm, M. (1996) Anal. Chem. 68:1-8）。
タンパク質のＥＳＩは、分子量が増加するにつれて増加する傾向にある電荷数を有する多重に荷電したイオンを生成する。与えられたイオン種上の電荷数は、例えば(i)一電荷が異なる二つの荷電状態を比較し、連立方程式を解き；(ii)同じ電荷を有するが異なった付加質量を有する種を探し；(iii)分離された同位体クラスターに対して質量電荷比を調べるような方法によって決定することができる。ESI及びESI-MSの方法及びこれらの方法を実施するために必要とされるパラメータは当該分野でよく知られている。エレクトロスプレーイオン化法の穏やかさは、インタクトな抗体コンジュゲートを質量分析法によって直接検出することを可能にする。
一実施態様では、タンパク質、抗体、抗体断片又は抗体コンジュゲート（大きな分子）のＱ１質量スペクトルが、方法の一部として実施される。大きな分子の適切な質のＱ１質量スペクトルを得ることができる。タンパク質外被が移動する可能性があるので、クロマトグラフィーに使用される全ての溶媒が新鮮にされ、スペクトルエンベロープを観察された範囲に位置付けるために溶出溶媒に酸が加えられる。≧１０００００質量単位のタンパク質には、ギ酸のような酸を、溶出溶媒、例えば溶媒Ａ（水）と溶媒Ｂ（アセトニトリル）の双方に約０．１％（容量）で使用することができる。より強い酸、例えばトリフルオロ酢酸（ＴＦＡ）は、≦１０００００質量単位のタンパク質に対してＡ及びＢ双方の溶媒に対して、０．０５％（容量）ＴＦＡで使用することができる。ギ酸の量が減少すると、インタクトなグリコシル化抗体、トラスツズマブがより多くの電荷を拾い上げ、エンベロープを更に左に、そして観察された範囲のｍ／ｚ（１８００−３０００ｍ／ｚ）にシフトさせる。クラスター分離（ＤＰ）電位が約３０−１２０Ｖから約７０−１９０Ｖまで増加すると、抗体上の電荷が更に尚増加する。よって、印加される電圧、溶媒組成、及びイオン対形成剤は考慮し調節すべき因子である。クラスター分離電位（ＤＰ）を増加（勾配付け）させて最良の電荷イオン範囲を選択するのに十分な分解能を獲得することができる。線形性を、広範囲のｍ／ｚにわたって得ることができる。抗体の脱グリコシル化はインタクトな抗体又は重鎖、断片又はＡＤＣの定量を支援する。グリコシル化はイオン化効率を低下させるのに影響し、よって感度を減少させる。抗体又は抗体断片コンジュゲートを定量する場合、抗体の脱グリコシル化が質量スペクトルの不均一性を低減させ、感度を増大させ、よって分析を単純化しうる。
逆重畳積分表を使用して、定量される各種に対して正確な質量電荷比（ｍ／ｚ）を決定する。逆重畳積分ソフトウェアアプリケーション、例えばＡｎａｌｙｓｔＴＭＱＳ（Applied Biosystems, Foster City, CA）は市販されており、及び／又は質量分析器と共に提供される。逆重畳積分ソフトウェアは一般に使用者に逆重畳積分質量の表並びにこれらの質量の計算に使用されるｍ／ｚイオンの副表を提供する。
実施例１ 血漿および血清中の抗ＭＵＣ１６抗体−薬剤コンジュゲート化合物の分析
以下の構造を有する抗体ＭＵＣ１６抗体−薬剤コンジュゲートである３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ、「抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ」：
（ここで、ｐ(ＤＡＲ)は１、２、３又は４であり、Ｖａｌはバリンであり、Ｃｉｔはシトルリンであり、Ａｂは３Ａ５のシステイン改変したＡ１１８Ｃ重鎖変異体である抗ＭＵＣ１６モノクローナル抗体である）を、血漿および血清試料において分析した。３Ａ５抗体変異体は、正常ヒト組織と比較してヒト卵巣上皮癌(ＥＯＣ)において過剰に発現される細胞表面膜貫通タンパク質であるＭＵＣ１６の細胞外ドメイン(ＥＣＤ)上のエピトープを認識し、ＭＵＣ１６への結合により内部移行し、リソソームに輸送され、これによってアウリスタチン薬剤部分ＭＭＡＥのＭＵＣ１６陽性腫瘍細胞への標的輸送が達成される(国際公開２００７／００１８５１；２００７年５月８日に出願の米国特許出願６０／９１６６５７「CYSTEINE ENGINEERED ANTI-MUC16 ANTIBODIES AND ANTIBODY DRUG CONJUGATES」)。Ａ118Ｃ(ＥＵ番号付け)変異体は、米国公開特許２００７／００９２９４０に従って、薬剤−リンカー試薬によりその最適化されたチオール反応性について選択した。
以下の構造を有する抗体ＭＵＣ１６抗体−薬剤コンジュゲートである３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ、「抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ」：
抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)は、以下の免疫親和性ビーズキャプチャ及び質量分析法によって特付けし、血漿又は血清における異なる薬剤−抗体比率(ＤＡＲ)を有するＡＤＣ試料成分の相対量を測定した。この方法により試験した濃度範囲(５０μｌの試料容量中１．２５〜５０μｇ／ｍｌ)において期待するＡＤＣ試料成分が成功裏に同定されたことから、親和性キャプチャＭＳ特徴付けの間に選択的な損失はなかったことが示される。異なる種の血漿又は血清において有意なマトリックス効果は観察されなかった。ラット、カニクイザルおよびヒトの血漿からの結果は、５％ＢＳＡを含むＰＢＳバッファ中の添加した抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ混合物から得た結果と同等であった。また、ラットおよびカニクイザルのマトリックスにおける血漿および血清の試料から同様な結果が得られた。短期のマトリックス凍結／解凍の安定性は、ラット血漿(最高３サイクル)およびカニクイザル血清(最高６サイクル)での抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)混合物について確認した。２℃〜８℃に維持したオートサンプラー中におよそ１３時間維持した被処理試料は安定であった。
免疫親和性ビーズ／ＭＳ法のアッセイ実行は、異なる薬剤ローディング値、ｐ＝０(ネイキッド抗体)、１(抗体につき１の薬剤)および２(抗体につき２の薬剤)値を有する抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ混合物の相対量を測定することを特徴とする。ネイキッド抗体(ｐ＝０)とＡＤＣ(ｐ＝１および２)の標準物質を組み合わせて、既知組成物の混合物を得た。標準物質混合物は、血漿(ラット、カニクイザルおよびヒト)および血清(例えばラットおよびカニクイザル)に添加し、ストレプトアビジンコート常磁性ビーズに固定したビオチン化ｒｈｕ ＭＵＣ１６ ＥＣＤによる親和性キャプチャによって回収した。キャプチャした抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ成分を洗浄し、脱グリコシル化し、ビーズから溶出させ、四極子飛行時間型質量分析検出と組み合わせた毛細管流ＬＣによって分析した。抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ成分からのシグナルを含む全イオンクロマトグラム(ＴＩＣ)の代表的な時間ウインドウを選択し、抽出した質量スペクトルを得た。質量スペクトルの逆重畳積分後に、ｐ＝０、１又は２を有する抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ成分のピーク面積を用いて、血漿又は血清中の異なる薬剤ローディング(ｐ)をもつ抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣの相対量を算出した。
ビオチン化したヒトＭＵＣ１６ ＥＣＤをストレプトアビジンコートビーズ上へ固定し、それを用いて室温で試験血漿又は血清の試料と共にインキュベートすることによって抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣをキャプチャした。例えば、ビーズは、およそ１０−１００ミクロン直径のセファロース(登録商標)ビーズであってもよい。ビーズが常磁性である場合、試料成分の結合の後に、常磁性ビーズが磁石によって適当な状態に保たれ、ビーズに結合した試料成分の分離、単離および洗浄が可能となる。ビーズが常磁性でない場合、ビーズは移動相流量のための出入口を有するカラムで構成されてもよい。試料成分は、例えば高い酸及び有機濃度を有する溶出培地又はバッファにて被処理分析試料として溶出してよく、この溶出した試料は、分離培地に曝すために回収して試料成分を分離させた後に質量分析を行ってもよい。典型的な非特異的洗浄バッファは水溶性であり、およそｐＨ７．４で酢酸ナトリウム及び塩化ナトリウムを含んでいてよい。典型的な抗体試料溶出バッファは水溶性であり、２〜４のｐＨで、イソプロパノール、アセトニトリル又は他の有機溶媒のような低分子性アルコールと蟻酸のような酸を含有してよい。溶出の後、固定したＥＣＤビーズは、回収しても、再利用しても、処分してもよい。
ビオチン化したヒトＭＵＣ１６ ＥＣＤをストレプトアビジンコートビーズ上へ固定し、それを用いて室温で試験血漿又は血清の試料と共にインキュベートすることによって抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣをキャプチャした。例えば、ビーズは、およそ１０−１００ミクロン直径のセファロース(登録商標)ビーズであってもよい。ビーズが常磁性である場合、試料成分の結合の後に、常磁性ビーズが磁石によって適当な状態に保たれ、ビーズに結合した試料成分の分離、単離および洗浄が可能となる。ビーズが常磁性でない場合、ビーズは移動相流量のための出入口を有するカラムで構成されてもよい。試料成分は、例えば高い酸及び有機濃度を有する溶出培地又はバッファにて被処理分析試料として溶出してよく、この溶出した試料は、分離培地に曝すために回収して試料成分を分離させた後に質量分析を行ってもよい。典型的な非特異的洗浄バッファは水溶性であり、およそｐＨ７．４で酢酸ナトリウム及び塩化ナトリウムを含んでいてよい。典型的な抗体試料溶出バッファは水溶性であり、２〜４のｐＨで、イソプロパノール、アセトニトリル又は他の有機溶媒のような低分子性アルコールと蟻酸のような酸を含有してよい。溶出の後、固定したＥＣＤビーズは、回収しても、再利用しても、処分してもよい。
あるいは、セファロース(登録商標)ビーズはＮＨＳ(Ｎ-ヒドロキシスクシンイミド)エステルといったアミノ反応性官能基を持ち、ＥＣＤタンパク質と反応(結合)しうる。リジン側鎖といったＥＣＤタンパク質の反応性アミノ基はＮＨＳ基を置き換え、ＥＣＤとビーズとの間に安定なアミド結合を形成する。代表的なカップリングバッファは水溶性であり、中性又は中性に近いｐＨ、例えばｐＨ７〜９で、リン酸塩、重炭酸ナトリウムおよび塩化ナトリウムから選択される塩類を含んでもよい。過剰なカップリングしなかった反応性の官能基は、水溶性培地中のエタノールアミンといった低分子量の反応性アミンでおおわれてもよく、中性又は中性に近いｐＨ、例えばｐＨ７〜９で、重炭酸ナトリウムおよび塩化ナトリウムから選択される塩類を含んでもよい。
ビーズは、洗浄溶出溶液の出入口を有するカラム形式に構成されてよい。ＮＨＳ−活性化セファロース(登録商標)ビーズの市販される実施態様にはＮＨＳ ＨｉＴｒａｐ ＨＰ１．０ｍｌ親和性カラム(Amersham)がある。
ビーズは、洗浄溶出溶液の出入口を有するカラム形式に構成されてよい。ＮＨＳ−活性化セファロース(登録商標)ビーズの市販される実施態様にはＮＨＳ ＨｉＴｒａｐ ＨＰ１．０ｍｌ親和性カラム(Amersham)がある。
親和性キャプチャの後に、結合した抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)を単離し、脱グリコシル化した。後者の工程を用いて、試料の不均一性を低減し、質量スペクトルを単純化した。数回洗浄して非特異的に結合した血漿タンパク質を除去した後、抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分を、３０％アセトニトリルと１％蟻酸を含む水によって溶出し、逆相キャピラリーＬＣシステムに注入した。試料成分(分析物)は、ターボイオンスプレーによってイオン化し、陽性ＴＯＦ-ＭＳモードで作動する四極子飛行時間型Ｑ-Ｓｔａｒ ＸＬ質量分析機によって検出した。全イオンクロマトグラム(ＴＩＣ)の代表的な時間ウインドウを選択し、質量スペクトルを得た。質量スペクトルを逆重畳積分し、対象の各抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分についてピーク面積を得た。抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分ｐ＝０、１および２の相対比を算出した。
以下のアッセイパラメータを評価した：
イオン化効率： 特定のｐ＝０、１および２(それぞれＤＡＲ-０、ＤＡＲ-１およびＤＡＲ-２)を有する抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)標準物質を、異なる比率で混合した(例えば３３：３３：３３および３０：６０：１０)。次いで、脱グリコシル化のために混合物を３７℃で終夜インキュベートした。脱グリコシル化混合物をおよそ３０μｇ／ｍＬに希釈し、１０μｌの一定量を分析のためにＬＣ／ＭＳ上に直接注入した。
ＨＢＳ−ＥＰ中３０：６０：１０の比率の、ｐ＝０、１および２(ＤＡＲ-０、ＤＡＲ-１及びＤＡＲ-２)を有する抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)試料成分の全イオンクロマトグラムを得て、ＡＤＣシグナルを含む代表的な時間ウインドウを選択した。時間ウインドウはＬＣ条件の変動のために変化しうる。ＡＤＣ試料成分について特徴的な電荷エンベロープを表す対応する質量スペクトルを抽出した。質量スペクトルの逆重畳積分により、対応する逆重畳積分した質量スペクトルを有するピーク面積表を生成した。抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分の分子質量に基づいて、３つのメインピークは、それぞれおよそ１４４８３４Ｄａ、１４６０３３Ｄａおよび１４７２２３ＤａのＤＡＲ−０、ＤＡＲ−１およびＤＡＲ−２と同定した。内部較正なしで、機器の集団の精度はおよそ±５０Ｄａであった。他のマイナーピークは、主に標準物質のマトリックスバックグラウンド、添加物および／または不均一性によるものであった。それらは結果としてＡＤＣ試料成分の相対量の算出に大きな影響を与えなかったので、その後の比率算出に用いなかった。３つの個々のピーク面積は総ピーク面積として合計し、各々の抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分の相対的なパーセント比率を算出した。２つの添加混合物のそれぞれについて表１Ａと１Ｂ(下記)にデータをまとめた。各添加組成物について３回試験した。明らかなように、平均精度は７０％〜１３０％の範囲内であった。したがって、ＤＡＲ−０、ＤＡＲ−１およびＤＡＲ−２を有する抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分は、陽性ターボイオンスプレーモードにおけるイオン化効率に有意差がなかったことが結論づけられた。
表１ ＤＡＲ ０、ＤＡＲ １およびＤＡＲ ２の既知組成物について、ＬＣ／ＭＳによって直接測定したＨＢＳ ＥＰバッファ中の抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)試料成分の相対的な比率
イオン化効率： 特定のｐ＝０、１および２(それぞれＤＡＲ-０、ＤＡＲ-１およびＤＡＲ-２)を有する抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)標準物質を、異なる比率で混合した(例えば３３：３３：３３および３０：６０：１０)。次いで、脱グリコシル化のために混合物を３７℃で終夜インキュベートした。脱グリコシル化混合物をおよそ３０μｇ／ｍＬに希釈し、１０μｌの一定量を分析のためにＬＣ／ＭＳ上に直接注入した。
ＨＢＳ−ＥＰ中３０：６０：１０の比率の、ｐ＝０、１および２(ＤＡＲ-０、ＤＡＲ-１及びＤＡＲ-２)を有する抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)試料成分の全イオンクロマトグラムを得て、ＡＤＣシグナルを含む代表的な時間ウインドウを選択した。時間ウインドウはＬＣ条件の変動のために変化しうる。ＡＤＣ試料成分について特徴的な電荷エンベロープを表す対応する質量スペクトルを抽出した。質量スペクトルの逆重畳積分により、対応する逆重畳積分した質量スペクトルを有するピーク面積表を生成した。抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分の分子質量に基づいて、３つのメインピークは、それぞれおよそ１４４８３４Ｄａ、１４６０３３Ｄａおよび１４７２２３ＤａのＤＡＲ−０、ＤＡＲ−１およびＤＡＲ−２と同定した。内部較正なしで、機器の集団の精度はおよそ±５０Ｄａであった。他のマイナーピークは、主に標準物質のマトリックスバックグラウンド、添加物および／または不均一性によるものであった。それらは結果としてＡＤＣ試料成分の相対量の算出に大きな影響を与えなかったので、その後の比率算出に用いなかった。３つの個々のピーク面積は総ピーク面積として合計し、各々の抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分の相対的なパーセント比率を算出した。２つの添加混合物のそれぞれについて表１Ａと１Ｂ(下記)にデータをまとめた。各添加組成物について３回試験した。明らかなように、平均精度は７０％〜１３０％の範囲内であった。したがって、ＤＡＲ−０、ＤＡＲ−１およびＤＡＲ−２を有する抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分は、陽性ターボイオンスプレーモードにおけるイオン化効率に有意差がなかったことが結論づけられた。
表１ ＤＡＲ ０、ＤＡＲ １およびＤＡＲ ２の既知組成物について、ＬＣ／ＭＳによって直接測定したＨＢＳ ＥＰバッファ中の抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)試料成分の相対的な比率
選択性： ｒｈｕＭＵＣ１６ ＥＣＤによるＤＭＵＣ４０６４Ａ構成成分の親和性キャプチャの間に選択的な損失がなかったことを確認するために、異なるＤＡＲを有する既知のＤＭＵＣ４０６４Ａ標準物質を様々な濃度でラット血漿に添加し、親和性ＭＳによって分析した。表２に、それぞれ１０：３０：６０、３０：６０：１０および３３:３３：３３のＤＡＲ−０、ＤＡＲ−１およびＤＡＲ−２について測定比率と理論上の添加比率を示す。
表２ 親和性ＭＳによって測定したラット血漿における抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)試料成分についての測定比率と添加比率
平均精度が、異なる組成物でＤＡＲ−０、ＤＡＲ−１およびＤＡＲ−２の３つの抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分について７０％〜１３０％の範囲内であったことから、ＥＣＤ改変親和性ビーズは血漿からの選択的な損失がなくＡＤＣを回収することができ、許容範囲内の精度を示したことが示された。
表２ 親和性ＭＳによって測定したラット血漿における抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)試料成分についての測定比率と添加比率
異なる種全体のマトリックス効果： 特定のｐ＝０、１および２を有する抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)標準物質を、ラット、カニクイザルおよびヒトの血漿又は５％ＢＳＡを有するＰＢＳバッファにおいて３０：６０：１０の比率で添加した。３０μｇ／ｍｌの総ＡＤＣ濃度を用いた。各々の血漿種について３回、ＥＣＤ改変親和性ビーズによって回収し、コントロールとして用いた５％ＢＳＡを有するＰＢＳバッファからの結果と比較した。ＥＣＤ親和性キャプチャおよび抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分によって試験したブランクのラット、カニクイザルおよびヒトの血漿は、ＴＩＣ(総イオンクロマトグラフィ)によって分析した。典型的なＡＤＣ時間ウィンドウに有意な分析物ピークは観察されなかった。また、抽出したＴＯＦ ＭＳシグナルは逆重畳積分することができないほどに低かったことから、ヒトＭＵＣ１６ ＥＣＤによる親和性キャプチャは相対的にクリーンであり、血漿マトリックスの非特異的なタンパク質の影響をほとんど受けない。
ラット、カニクイザルおよびヒトの血漿に添加した抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分の代表的なＴＩＣクロマトグラムを、ＰＢＳバッファコントロールと比較した。ＥＣＤ免疫親和性ビーズによってキャプチャされるこれら４つのマトリックスにおける抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分のクロマトグラフィのパターンは非常に類似していた。代表的なクロマトグラフィの持続時間ウインドウから、３つの種の血漿マトリックスおよびＰＢＳ(バッファ)コントロール間で、同種のＤＡＲ分布パターンが観察された。試料成分は、ＤＡＲ ０(＋０、ネイキッド抗体)、ＤＡＲ−１(＋１ Ｄ、１のＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ薬剤リンカーユニット)およびＤＡＲ−２(＋２Ｄ、２のＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ薬剤リンカーユニット)とした。ＤＡＲ−０、ＤＡＲ−１およびＤＡＲ−２構成成分の相対量の詳細な比較を表３に示す。全体の相対的標準偏差(ＲＳＤ)は、試験した４つすべてのマトリックスについて３０％以下で十分であった。したがって、親和性ＭＳ法は、異なる種全体にわたって最小限のマトリックス効果を示した。全体の精度は７０〜１３０％の範囲内であった。
表３ 異なる種およびＰＢＳバッファ全体における、様々な血漿中に添加された抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)の正確さと精度
ラット、カニクイザルおよびヒトの血漿に添加した抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分の代表的なＴＩＣクロマトグラムを、ＰＢＳバッファコントロールと比較した。ＥＣＤ免疫親和性ビーズによってキャプチャされるこれら４つのマトリックスにおける抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分のクロマトグラフィのパターンは非常に類似していた。代表的なクロマトグラフィの持続時間ウインドウから、３つの種の血漿マトリックスおよびＰＢＳ(バッファ)コントロール間で、同種のＤＡＲ分布パターンが観察された。試料成分は、ＤＡＲ ０(＋０、ネイキッド抗体)、ＤＡＲ−１(＋１ Ｄ、１のＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ薬剤リンカーユニット)およびＤＡＲ−２(＋２Ｄ、２のＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ薬剤リンカーユニット)とした。ＤＡＲ−０、ＤＡＲ−１およびＤＡＲ−２構成成分の相対量の詳細な比較を表３に示す。全体の相対的標準偏差(ＲＳＤ)は、試験した４つすべてのマトリックスについて３０％以下で十分であった。したがって、親和性ＭＳ法は、異なる種全体にわたって最小限のマトリックス効果を示した。全体の精度は７０〜１３０％の範囲内であった。
表３ 異なる種およびＰＢＳバッファ全体における、様々な血漿中に添加された抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)の正確さと精度
血漿と血清の間のマトリックス効果： 特定のｐ＝０、１および２を有する抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)標準物質を、ラットとカニクイザルの血漿及び血清に３０：６０：１０の比率で添加した。各ケースにおいて、血漿と血清全体にわたって類似の逆重畳積分された質量スペクトルが観察された。血漿及び血清のマトリックスにおけるＤＡＲ ０、ＤＡＲ １及びＤＡＲ ２を有する既知の組成物のＤＭＵＣ４０６４Ａ混合物について得られた値を表４に示す。ラットマトリックスにおける全体のＲＳＤが３０％の許容範囲内であることから、ラットの血漿と血清の間でＥＣＤによる親和性キャプチャの間にバイアスがなかったことが示された。同様に、カニクイザルマトリックスにおける全体のＲＳＤは３０％未満であったことから、カニクイザルの血漿と血清の間にバイアスがないことが示された。
表４ ラットおよびカニクイザルの血漿及び血清における、抗ＭＵＣ16 ＡＤＣ(3Ａ5−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)試料成分の正確な測定
表４ ラットおよびカニクイザルの血漿及び血清における、抗ＭＵＣ16 ＡＤＣ(3Ａ5−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)試料成分の正確な測定
血漿と血清の間の潜在的なマトリックス効果をさらに評価するために、抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)を投与したカニクイザルのインビボ試料のサブセットを採取し、免疫親和性ビーズキャプチャと質量分析法を使用して分析した。単一の動物から投与後５分から２２日の間に採取した血漿と対応する血清試料を分析し、結果を比較した(表５)。結果から、カニクイザルの血漿又は対応する血清試料間において、回収した抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ試料成分の相対的なＤＡＲ分布に有意差がなかったことが示される。図９は、３８ｍｇ／ｋｇのＴｈｉｏ Ｈｕ 抗ＭＵＣ１６(３Ａ５) ＨＣ Ａ１１８Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥを投与したカニクイザルの血漿におけるインビボ安定性の逆重畳積分質量分析データの例を示す。平均薬剤ローディングは１．６のＭＭＡＥ／３Ａ５であった。投与したＡＤＣのおよそ３０％は、ＤＡＲ２の脱コンジュゲーションから生成されるものよりＤＡＲ＋１の異なる形態であった。血漿試料は、５分、６時間、２４時間、７２時間、６日、８日、１５日および２２日の時点に採取し、免疫親和性ＥＣＤビーズ法によってキャプチャした。試料成分は、＋０(ネイキッド抗体)、＋１Ｄ(１のＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ薬剤リンカーユニット)および＋２Ｄ(２のＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ薬剤リンカーユニット)のＤＡＲとした。およそ１４９０００及び１５００００ａｍｕの小さいピークは、不完全に脱グリコシル化された試料成分である。
表５ 毒物試験から採取したカニクイザルの血清及び血漿における、抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)試料成分の相対的なＤＡＲ分布
表５ 毒物試験から採取したカニクイザルの血清及び血漿における、抗ＭＵＣ１６ ＡＤＣ(３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ)試料成分の相対的なＤＡＲ分布
図６は、ＥＣＤ免疫親和性ビーズキャプチャの０、６、２４、４８および９６時間後の時点に採取したＴｈｉｏ Ｈｕ抗ＭＵＣ１６(３Ａ５) ＨＣ Ａ１１８Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ(３７℃でインキュベートしたラット血漿中１００μｇ／ｍｌ)の安定性の逆重畳積分質量分析データを示す。試料成分は、＋０(ネイキッド抗体)、＋１Ｄ(１のＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ薬剤リンカーユニット)および＋２Ｄ(２のＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ薬剤リンカーユニット)の薬剤／抗体比率(ＤＡＲ)とした。図７は、ラット血漿中の試料成分ＤＡＲ ＋０、＋１および＋２の経時的なＤＡＲ分布変化を示す。
ＥＣＤ免疫親和性ビーズキャプチャ効率を、ラット血漿中でインキュベートした後に、Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＭＵＣ１６(３Ａ５) ＨＣ Ａ１１８Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥの抗薬剤Ｍａｂ免疫親和性ビーズキャプチャと比較された。４つの異なる抗アウリスタチンモノクローナル抗体クローンをビオチン化し、ストレプトアビジンコート常磁性ビーズに固定した(図２)。これらの抗薬剤クローンは、１薬剤をロードしたＡＤＣ(ＤＡＲ＋１)の非効率的なキャプチャを示した。
ＥＣＤ免疫親和性ビーズキャプチャ効率を、ラット血漿中でインキュベートした後に、Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＭＵＣ１６(３Ａ５) ＨＣ Ａ１１８Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥの抗薬剤Ｍａｂ免疫親和性ビーズキャプチャと比較された。４つの異なる抗アウリスタチンモノクローナル抗体クローンをビオチン化し、ストレプトアビジンコート常磁性ビーズに固定した(図２)。これらの抗薬剤クローンは、１薬剤をロードしたＡＤＣ(ＤＡＲ＋１)の非効率的なキャプチャを示した。
実施例２ ＥＣＤ免疫親和性ビーズキャプチャプロトコール
抗ＭＵＣ１６ 抗体−薬剤コンジュゲートである３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥを投与したカニクイザルの血清および血漿試料を、以下の工程によって処理した。
１． 試料、コントロール及びブランクのプレート位置を決定する(９６深底ウェルプレート(２ｍｌの正方形上部)：Analytical Sales and Service Inc. カタログ番号59623-23、又は９６ウェルプレート(５００μｌの円形上部): VWRカタログ番号47743-828)。一般的に、２つのブランクと１つのシステムコントロールを実行の初めに試験し、その後２つのブランクと２つのシステムコントロールを実行の最後に試験する。必要に応じて実行の全体にわたって更なるブランクを試験してよい。試料、コントロール又はブランクに用いるウェルに、後述する添加を行った。
２． 試料、コントロール又はブランクに用いる９６深底ウェル正方形上部プレートの各ウェルに４００μｌのＨＢＳ−ＥＰバッファ(Biacoreカタログ番号BR-1001-88)をピペットで移す。
３． ストレプトアビジンコートのダイナビーズM-280 (Dynabeads、M280ストレプトアビジン、10mg/mL、カタログ番号110029、Lot番号G74050、BioVeris)を緩やかに撹拌することによって再懸濁する。使用中のＨＢＳ−ＥＰバッファプレートの各ウェルに１００μｌの懸濁したビーズ混合物をピペットで移す。およそ２０秒間、室温で、ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒ９６の磁気粒子プロセッサ(Thermo Electron Corp.)によって混合する。
４． ４００μＬのＨＢＳ−ＥＰバッファを含む新たな９６深底ウェル正方形上部プレートへビーズを移し、およそ２０秒間、室温で、ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒにより混合する。
５． 新たな９６深底ウェル正方形上部プレートのブランク、試料又はコントロールの各ウェルに、４００μｌのＨＢＳ−ＥＰバッファをピペットで移す。
６． ＨＢＳ−ＥＰバッファプレートのブランク、試料又はコントロールの各ウェルに、２５μｌのビオチン化抗ＭＵＣ１６-ＥＣＤ(図１ａ)をピペットで移す。
７． ＨＢＳ−ＥＰバッファとビオチン化した抗ＭＵＣ１６-ＥＣＤを含む９６深底ウェルプレートにビーズを移し、およそ２０秒間穏やかに混ぜる。プレートをアルミニウムシールで被う。
８． プレートを攪拌機(スピード７に設定)に載せ、およそ１２０分間、室温でインキュベートする。
９． ４００μｌのＨＢＳ−ＥＰバッファを含む９６深底ウェル正方形上部プレートにビーズを移し、ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いて２回洗浄する。
抗ＭＵＣ１６ 抗体−薬剤コンジュゲートである３Ａ５−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥを投与したカニクイザルの血清および血漿試料を、以下の工程によって処理した。
１． 試料、コントロール及びブランクのプレート位置を決定する(９６深底ウェルプレート(２ｍｌの正方形上部)：Analytical Sales and Service Inc. カタログ番号59623-23、又は９６ウェルプレート(５００μｌの円形上部): VWRカタログ番号47743-828)。一般的に、２つのブランクと１つのシステムコントロールを実行の初めに試験し、その後２つのブランクと２つのシステムコントロールを実行の最後に試験する。必要に応じて実行の全体にわたって更なるブランクを試験してよい。試料、コントロール又はブランクに用いるウェルに、後述する添加を行った。
２． 試料、コントロール又はブランクに用いる９６深底ウェル正方形上部プレートの各ウェルに４００μｌのＨＢＳ−ＥＰバッファ(Biacoreカタログ番号BR-1001-88)をピペットで移す。
３． ストレプトアビジンコートのダイナビーズM-280 (Dynabeads、M280ストレプトアビジン、10mg/mL、カタログ番号110029、Lot番号G74050、BioVeris)を緩やかに撹拌することによって再懸濁する。使用中のＨＢＳ−ＥＰバッファプレートの各ウェルに１００μｌの懸濁したビーズ混合物をピペットで移す。およそ２０秒間、室温で、ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒ９６の磁気粒子プロセッサ(Thermo Electron Corp.)によって混合する。
４． ４００μＬのＨＢＳ−ＥＰバッファを含む新たな９６深底ウェル正方形上部プレートへビーズを移し、およそ２０秒間、室温で、ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒにより混合する。
５． 新たな９６深底ウェル正方形上部プレートのブランク、試料又はコントロールの各ウェルに、４００μｌのＨＢＳ−ＥＰバッファをピペットで移す。
６． ＨＢＳ−ＥＰバッファプレートのブランク、試料又はコントロールの各ウェルに、２５μｌのビオチン化抗ＭＵＣ１６-ＥＣＤ(図１ａ)をピペットで移す。
７． ＨＢＳ−ＥＰバッファとビオチン化した抗ＭＵＣ１６-ＥＣＤを含む９６深底ウェルプレートにビーズを移し、およそ２０秒間穏やかに混ぜる。プレートをアルミニウムシールで被う。
８． プレートを攪拌機(スピード７に設定)に載せ、およそ１２０分間、室温でインキュベートする。
９． ４００μｌのＨＢＳ−ＥＰバッファを含む９６深底ウェル正方形上部プレートにビーズを移し、ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いて２回洗浄する。
１０． 陰性の血漿又は血清のプールを用いたアッセイの範囲に、血漿又は血清試料を希釈する。
１１． ９６深底ウェル正方形上部プレートへ４００μｌのＨＢＳ−ＥＰバッファをピペットで移し、次いで、各々希釈した５０μｌの血漿又は血清の試料、コントロール又は又はブランクを適切なウェルに添加する。
１２． 希釈した血漿又は血清の試料にＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いてビーズを移す。およそ２０秒間穏やかに混ぜる。プレートをアルミニウムシールテープで被う。
１３． プレートを攪拌機(速度７)に載せ、およそ１２０分間、室温でインキュベートする。
１４． ５００μｌのＨＢＳ−ＥＰバッファを含む９６深底ウェル正方形上部プレートにビーズを移し、ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いて２回洗浄する。
１５． ＨＢＳ−ＥＰバッファ、８０ｍＭリン酸塩及びグリコＮ-グリカナーゼ(Prozyme glyko N-glycanase, Cat. No. GKE-5006D)をそれぞれ３００パーツ：３２パーツ：４パーツの比率で混合することによってＨＢＳ−ＥＰ−グリカナーゼバッファを調製する。
１６． ３３６μｌのＨＢＳ−ＥＰ−グリカナーゼバッファを９６深底ウェル正方形上部プレートの各ウェルへピペットで移す。
１７． ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いてＨＢＳ−ＥＰ−グリカナーゼバッファにビーズを移す。およそ２０秒間穏やかに混合する。プレートをアルミニウムシールテープで被う。
１８． ３７℃及び３００ｒｐｍの撹拌速度に維持するように設定したインキュベーターにプレートを置き、終夜インキュベートする。
１９． ５００μｌのＨＢＳ−ＥＰバッファを含む９６深底ウェル正方形上部プレートにビーズを移し、ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いて２回洗浄する。
１１． ９６深底ウェル正方形上部プレートへ４００μｌのＨＢＳ−ＥＰバッファをピペットで移し、次いで、各々希釈した５０μｌの血漿又は血清の試料、コントロール又は又はブランクを適切なウェルに添加する。
１２． 希釈した血漿又は血清の試料にＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いてビーズを移す。およそ２０秒間穏やかに混ぜる。プレートをアルミニウムシールテープで被う。
１３． プレートを攪拌機(速度７)に載せ、およそ１２０分間、室温でインキュベートする。
１４． ５００μｌのＨＢＳ−ＥＰバッファを含む９６深底ウェル正方形上部プレートにビーズを移し、ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いて２回洗浄する。
１５． ＨＢＳ−ＥＰバッファ、８０ｍＭリン酸塩及びグリコＮ-グリカナーゼ(Prozyme glyko N-glycanase, Cat. No. GKE-5006D)をそれぞれ３００パーツ：３２パーツ：４パーツの比率で混合することによってＨＢＳ−ＥＰ−グリカナーゼバッファを調製する。
１６． ３３６μｌのＨＢＳ−ＥＰ−グリカナーゼバッファを９６深底ウェル正方形上部プレートの各ウェルへピペットで移す。
１７． ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いてＨＢＳ−ＥＰ−グリカナーゼバッファにビーズを移す。およそ２０秒間穏やかに混合する。プレートをアルミニウムシールテープで被う。
１８． ３７℃及び３００ｒｐｍの撹拌速度に維持するように設定したインキュベーターにプレートを置き、終夜インキュベートする。
１９． ５００μｌのＨＢＳ−ＥＰバッファを含む９６深底ウェル正方形上部プレートにビーズを移し、ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いて２回洗浄する。
２０． ５００μｌの水を含む９６深底ウェル正方形上部プレートにビーズを移し、ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いて２回洗浄する。
２１． 水中１０％アセトニトリルを５００μｌ含む９６深底ウェル正方形上部プレートにビーズを移し、ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いて１回洗浄する。
２２． 溶出溶媒として、１％の蟻酸を含む３０％アセトニトリル水、５０μｌを、９６深底ウェル正方形上部プレートにピペットで移す。
２３． ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いて溶出溶媒プレートにビーズを移す。プレートをアルミニウムシールテープで被う。
２４． 速度７に設定した攪拌機にプレートを置き、およそ１５分間振とうする。
２５． ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いて溶出プレートからビーズを取り除く。
２６． マルチチャネルピペットを用いて、９６ウェル注入プレート(ＶＷＲ、５００μｌ円形上部)に溶出プレートからの上清を移し、プレートをシリコン封入マットで被う。
２７． ２〜８℃に維持するように設定した遠心機にて、３０００ｒｐｍの設定でおよそ５分間遠心分離する。そうして、ＬＣ−ＭＳ上への注入用試料プレートとする。
２１． 水中１０％アセトニトリルを５００μｌ含む９６深底ウェル正方形上部プレートにビーズを移し、ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いて１回洗浄する。
２２． 溶出溶媒として、１％の蟻酸を含む３０％アセトニトリル水、５０μｌを、９６深底ウェル正方形上部プレートにピペットで移す。
２３． ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いて溶出溶媒プレートにビーズを移す。プレートをアルミニウムシールテープで被う。
２４． 速度７に設定した攪拌機にプレートを置き、およそ１５分間振とうする。
２５． ＫｉｎｇＦｉｓｈｅｒを用いて溶出プレートからビーズを取り除く。
２６． マルチチャネルピペットを用いて、９６ウェル注入プレート(ＶＷＲ、５００μｌ円形上部)に溶出プレートからの上清を移し、プレートをシリコン封入マットで被う。
２７． ２〜８℃に維持するように設定した遠心機にて、３０００ｒｐｍの設定でおよそ５分間遠心分離する。そうして、ＬＣ−ＭＳ上への注入用試料プレートとする。
実施例３ 血漿および血清における抗ＨＥＲ２抗体-薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)化合物の分析
以下の構造：
を有する、システイン改変抗ＨＥＲ２変異体Ｖ２０５ＣおよびＡ１１８Ｃのトラスツズマブ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ(ここで、ｐが１、２、３又は４であり、Ｖａｌはバリンであり、Ｃｉｔはシトルリンであり、Ａｂはトラスツズマブのシステイン改変の、Ａ１１８Ｃ重鎖変異体およびＶ２０５Ｃ軽鎖変異体、抗ＨＥＲ２モノクローナル抗体である)を血漿試料において分析した。
以下の構造：
図４は、０、８、２４、４８および９６時間の時点で採取したインビボ血漿試料の、免疫親和性ＥＣＤ改変ビーズキャプチャ(図１ａ)及び質量分析特徴付け後の、血漿における軽鎖(Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＨＥＲ２ ４Ｄ５ ＬＣ Ｖ２０５Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ、１.６４ ＭＭＡＥ／４Ｄ５ Ａｂ)(上)および重鎖(Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＨＥＲ２ ４Ｄ５ ＨＣ Ａ１１８Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ、１.９ ＭＭＡＥ／４Ｄ５ Ａｂ)(下)ＡＤＣ変異体についての、薬剤／抗体比(ＤＡＲ)分布の変化を示す。試料成分は、０(ネイキッド抗体)、１(１のＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ薬剤リンカーユニット)および２(２のＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ薬剤リンカーユニット)のＤＡＲとした。ＤＡＲ分布パターンは、これらＡＤＣについて、軽鎖変異体(ＬＣ Ｖ２０５Ｃ)が重鎖変異体(ＨＣ Ａ１１８Ｃ)より安定性が高いことを示す。
重鎖変異体(Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＨＥＲ２ ４Ｄ５ ＨＣ Ａ１１８Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ、１．９ＭＭＡＥ／４Ｄ５ Ａｂ)を、１００μｇ／ｍｌでラット血漿中でインキュベートした。特定の時点で試料を採取し、免疫親和性ＥＣＤビーズキャプチャにて処理した。図５は、０、８、２４、４８および９６時間の時点で採取した試料の逆重畳積分質量分析データを示す。試料成分を、＋０(ネイキッド抗体)、＋１Ｄ(１のＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ薬剤リンカーユニット)および＋２Ｄ(２のＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ薬剤リンカーユニット)のＤＡＲとした。およそ１５１０００ａｍｕの小さいピークは、不完全に脱グリコシル化された試料成分である。
重鎖変異体(Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＨＥＲ２ ４Ｄ５ ＨＣ Ａ１１８Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ、１．９ＭＭＡＥ／４Ｄ５ Ａｂ)を、１００μｇ／ｍｌでラット血漿中でインキュベートした。特定の時点で試料を採取し、免疫親和性ＥＣＤビーズキャプチャにて処理した。図５は、０、８、２４、４８および９６時間の時点で採取した試料の逆重畳積分質量分析データを示す。試料成分を、＋０(ネイキッド抗体)、＋１Ｄ(１のＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ薬剤リンカーユニット)および＋２Ｄ(２のＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ薬剤リンカーユニット)のＤＡＲとした。およそ１５１０００ａｍｕの小さいピークは、不完全に脱グリコシル化された試料成分である。
実施例４ ＥＬＩＳＡと免疫親和性ビーズキャプチャ法の比較
図１０ａは、ＥＣＤタンパク質が抗体又は抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)への結合のために固体担体上に固定されている総ＥＬＩＳＡアッセイフォーマットを示す。ＡＤＣは、化学発光検出のためにＦ(ａｂ')２ヤギ抗ヒトＦｃ−ＨＲＰに結合する。
図１０ｂは、抗薬剤ＭＡｂが抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)への結合のために固体担体上に固定されているコンジュゲートＥＬＩＳＡアッセイフォーマットを示す。ＡＤＣは、溶液中のビオチン化ＥＣＤタンパク質に結合する。次いで、複合体は、化学発光検出のためにストレプトアビジン−西洋ワサビペルオキシダーゼ(ＨＲＰ)に結合しうる。
図１１は、Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＭＵＣ１６ (３Ａ５) ＨＣ Ａ１１８Ｃ-ＭＣ-ｖｃ-ＰＡＢ-ＭＭＡＥと共にインキュベートし、９６時間まで経時的に分析したラット血漿試料中の、薬剤部分にコンジュゲートした残りの抗体をプロットすることによる、ＥＬＩＳＡ法、及び免疫親和性ビーズキャプチャ／質量分析(ＭＳ)法による試料成分の検出の比較を示す。
図１０ａは、ＥＣＤタンパク質が抗体又は抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)への結合のために固体担体上に固定されている総ＥＬＩＳＡアッセイフォーマットを示す。ＡＤＣは、化学発光検出のためにＦ(ａｂ')２ヤギ抗ヒトＦｃ−ＨＲＰに結合する。
図１０ｂは、抗薬剤ＭＡｂが抗体−薬剤コンジュゲート(ＡＤＣ)への結合のために固体担体上に固定されているコンジュゲートＥＬＩＳＡアッセイフォーマットを示す。ＡＤＣは、溶液中のビオチン化ＥＣＤタンパク質に結合する。次いで、複合体は、化学発光検出のためにストレプトアビジン−西洋ワサビペルオキシダーゼ(ＨＲＰ)に結合しうる。
図１１は、Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＭＵＣ１６ (３Ａ５) ＨＣ Ａ１１８Ｃ-ＭＣ-ｖｃ-ＰＡＢ-ＭＭＡＥと共にインキュベートし、９６時間まで経時的に分析したラット血漿試料中の、薬剤部分にコンジュゲートした残りの抗体をプロットすることによる、ＥＬＩＳＡ法、及び免疫親和性ビーズキャプチャ／質量分析(ＭＳ)法による試料成分の検出の比較を示す。
表６は、ＥＣＤ免疫親和性ビーズによってキャプチャし、質量分析によって分析した、０、６、２４、４８、９６の同じ時点の試料からの、Ｔｈｉｏ Ｈｕ 抗ＭＵＣ１６(３Ａ５) ＨＣ Ａ１１８Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ試料成分の相対量を蓄積する。親和性質量分析およびＥＬＩＳＡからの結果は、抗アウリスタチン抗体がコンジュゲートＴｈｉｏ Ｈｕ 抗ＭＵＣ１６(３Ａ５) ＨＣ Ａ１１８Ｃ−ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ−ＭＭＡＥ試料成分をすべて効率よくキャプチャしたわけではないことを示した。したがって、親和性ＭＳは、コンジュゲートＥＬＩＳＡアッセイを発達させるための最も適切な抗薬剤抗体を選別する補助として用いることができる。
表６ ＥＣＤ免疫親和性ビーズキャプチャ
表６ ＥＣＤ免疫親和性ビーズキャプチャ
Claims (31)
- (i) 以下の式Ｉを有する抗体−薬剤コンジュゲート化合物を提供すること：
Ａｂ−(Ｌ−Ｄ)ｐ Ｉ
このとき、
Ａｂが抗体であり、
Ｄはメイタンシノイド又はモノメチルアウリスタチン薬剤部分であり、
Ｌは、共有結合でＡｂに付着し、共有結合でＤに付着したリンカーであり、そして、
ｐは、１、２、３、４、５、６、７又は８であり；
(ii) 抗体−薬剤コンジュゲート化合物と、細胞培養物、血漿又は血清から選択される生物学的な供給源と接触させること；
(iii) 生物学的な供給源から、抗体−薬剤コンジュゲートと接触した生体試料を採取すること；
(iv) 処方し、固定し、遠心し、単離し、消化し、血液細胞凝集を誘導ないし予防し、加水分解し、又は精製することによって分析試料を生成するために生物学的試料を処理し、処理済みの分析試料を生成すること；
(v) 処理済みの分析試料を、抗体−薬剤コンジュゲートの抗体に特異的な抗原を含む免疫親和性ビーズに捕獲すること、このとき該抗原が標的レセプタータンパク質のビオチン化された細胞外ドメイン(ＥＣＤ)であり、該ビオチン化されたＥＣＤがストレプトアビジンコート常磁性免疫親和性ビーズに結合すること；
(vi) 処理済みの分析試料を溶出すること；
(vii) 分離培地に溶出した処理済みの分析試料を置き、１より多くの試料成分を分離すること、このとき分離した試料成分が抗体−薬剤コンジュゲート化合物を含み；そして、
(viii) 一又は複数の分離した試料成分の質量電荷比を質量分析によって確認すること、このときインタクトな抗体−薬剤コンジュゲート化合物が検出される、
という工程を含む、抗体−薬剤コンジュゲート化合物の検出方法。 - さらに、(iii)から(viii)の工程を１回又は複数回繰り返すことを含む、請求項１に記載の方法。
- 生物学的試料が血液であり、この血液が処理されて血漿又は血清を形成する、請求項１に記載の方法。
- 分析試料が変性している、請求項１に記載の方法。
- 分析試料がホルムアミド、ジメチルホルムアミドおよびアセトニトリルから選択される変性試薬によって変性される、請求項１に記載の方法。
- 分析試料が還元剤で処理される、請求項１に記載の方法。
- 還元剤がＤＴＴ又はＴＣＥＰである、請求項６に記載の方法。
- 抗原が抗薬剤抗体である、請求項１に記載の方法。
- 免疫親和性ビーズが磁気ビーズである、請求項１に記載の方法。
- 免疫親和性ビーズが多孔質ポリマーモノリスを含む、請求項１に記載の方法。
- 免疫親和性ビーズが、回収貯蔵部と流体連結する流入チャネルに設置される、請求項１に記載の方法。
- 免疫親和性ビーズが流入管に設置され、このとき、生物源からの試料が一端又は開口部に導入され、試料が他端又は開口部から溶出される、請求項１１に記載の方法。
- 免疫親和性ビーズが、それぞれ別々の回収貯蔵部に連結した複数の流入管に分配されている、請求項１２に記載の方法。
- 流入管および回収貯蔵部が１２×８の段と列の９６マイクロタイターウェル様式、又は２４×１６の段と列の３８４マイクロタイターウェル様式に設置されている、請求項１３に記載の方法。
- さらに、分析試料を脱グリコシル化試薬で処理する工程を含む、請求項１に記載の方法。
- 脱グリコシル化試薬がＰＮＧａｓｅＦである、請求項１に記載の方法。
- 分離培地がクロマトグラフィ支持体である、請求項１に記載の方法。
- クロマトグラフィ支持体が逆相吸着剤である、請求項１７に記載の方法。
- 逆相がポリスチレン、又はポリスチレンのグラフトないしコポリマーである、請求項１８に記載の方法。
- クロマトグラフィ支持体からの溶出物が質量分析によって間欠的に分析され、１より多くの質量電荷比の被分離清浄成分を得る、請求項１８に記載の方法。
- 試料成分が重鎖又は軽鎖の抗体断片を含む、請求項１に記載の方法。
- 重鎖又は軽鎖の抗体断片がさらに一又は複数の薬剤部分を含む、請求項１に記載の方法。
- 式Ｉを有する抗体−薬剤コンジュゲート化合物が、生物学的な供給源の腫瘍関連抗原又は細胞表面レセプターに結合する、請求項１に記載の方法。
- 抗体−薬剤コンジュゲート化合物の抗体が、以下の(1)から(36)から選択される一又は複数の腫瘍関連抗原又は細胞表面レセプターに結合する、請求項２３に記載の方法：
(1) ＢＭＰＲ１Ｂ(骨形成タンパク質レセプター−タイプＩＢ)；
(2) Ｅ１６(ＬＡＴ１、ＳＬＣ７Ａ５)；
(3) ＳＴＥＡＰ１(前立腺の６回膜貫通上皮抗原)；
(4) ０７７２Ｐ(ＣＡ１２５、ＭＵＣ１６)；
(5) ＭＰＦ(ＭＰＦ、ＭＳＬＮ、ＳＭＲ、巨核球増強因子、メソテリン)；
(6) Ｎａｐｉ３ｂ(ＮＡＰＩ-３Ｂ、ＮＰＴＩＩｂ、ＳＬＣ３４Ａ２、溶質担体ファミリ３４(リン酸ナトリウム)、メンバー２、タイプＩＩナトリウム依存性リン酸輸送体３ｂ)；
(7) Ｓｅｍａ５ｂ(ＦＬＪ１０３７２、ＫＩＡＡ１４４５、Ｍｍ.４２０１５、ＳＥＭＡ５Ｂ、ＳＥＭＡＧ、セマフォリン５ｂ Ｈｌｏｇ、ｓｅｍａドメイン、７回トロンボスポンジンリピート(タイプ１およびタイプ１様)、膜貫通ドメイン(ＴＭ)および短い細胞質ドメイン、(セマフォリン)５Ｂ)；
(8) ＰＳＣＡ ｈｌｇ(２７０００５０Ｃ１２Ｒｉｋ、Ｃ５３０００８Ｏ１６Ｒｉｋ、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ２７０００５０Ｃ１２、ＲＩＫＥＮ ｃＤＮＡ ２７０００５０Ｃ１２遺伝子)；
(9) ＥＴＢＲ(エンドセリンＢ型レセプター)；
(10) ＭＳＧ７８３(ＲＮＦ１２４、仮定タンパク質ＦＬＪ２０３１５)；
(11) ＳＴＥＡＰ２(ＨＧＮＣ＿８６３９、ＩＰＣＡ-１、ＰＣＡＮＡＰ１、ＳＴＡＭＰ１、ＳＴＥＡＰ２、ＳＴＭＰ、前立腺癌関連遺伝子１、前立腺癌関連タンパク質１、前立腺の６回膜貫通上皮抗原２、６回膜貫通前立腺タンパク質)；
(12) ＴｒｐＭ４(ＢＲ２２４５０、ＦＬＪ２００４１、ＴＲＰＭ４、ＴＲＰＭ４Ｂ、一過性レセプター電位陽イオンチャネル、サブファミリＭ、メンバー４)；
(13) ＣＲＩＰＴＯ(ＣＲ、ＣＲ１、ＣＲＧＦ、ＣＲＩＰＴＯ、ＴＤＧＦ１、テラトカルシノーマ由来の増殖因子)；
(14) ＣＤ２１(ＣＲ２(補体レセプター２)又はＣ３ＤＲ(Ｃ３ｄ／エプスタイン・バーウイルスレセプター)又はＨｓ.７３７９２ Ｇｅｎｂａｎｋ受託番号Ｍ２６００４)；
(15) ＣＤ７９ｂ(ＣＤ７９Ｂ、ＣＤ７９β、ＩＧｂ(免疫グロブリン関連β)、Ｂ２９)；
(16) ＦｃＲＨ２(ＩＦＧＰ４、ＩＲＴＡ４、ＳＰＡＰ１Ａ(ＳＨ２ドメイン含有ホスファターゼアンカータンパク質１ａ)、ＳＰＡＰ１Ｂ、ＳＰＡＰ１Ｃ)；
(17) ＨＥＲ２；
(18) ＮＣＡ；
(19) ＭＤＰ；
(20) ＩＬ２０Ｒα；
(21) ブレビカン；
(22) Ｅｐｈｂ２Ｒ；
(23) ＡＳＬＧ６５９；
(24) ＰＳＣＡ；
(25) ＧＥＤＡ；
(26) ＢＡＦＦ-Ｒ(Ｂ細胞活性化因子レセプター、ＢＬｙＳレセプター３、ＢＲ３)；
(27) ＣＤ２２(Ｂ細胞レセプターＣＤ２２-Ｂアイソフォーム)；
(28) ＣＤ７９ａ(ＣＤ７９Ａ、ＣＤ７９α、免疫グロブリン関連α)；
(29) ＣＸＣＲ５(バーキットリンパ腫レセプター１)；
(30) ＨＬＡ-ＤＯＢ(ＭＨＣクラスＩＩ分子(Ｉａ抗原)のβサブユニット)；
(31) Ｐ２Ｘ５(プリン作動性レセプターＰ２Ｘリガンドゲートイオンチャネル５)；
(32) ＣＤ７２(Ｂ細胞分化抗原ＣＤ７２、Ｌｙｂ-２)；
(33) ＬＹ６４(リンパ球抗原６４(ＲＰ１０５))；
(34) ＦＣＲＨ１(Ｆｃレセプター様タンパク質１)；
(35) ＩＲＴＡ２(免疫グロブリンスーパーファミリレセプター転座関連２)；及び、
(36) ＴＥＮＢ２(推定膜貫通プロテオグリカン、増殖因子のＥＧＦ／ヘレグリンファミリおよびフォリスタチンに関連）。 - ＬがＡｂのアミノ、カルボキシル又はチオールに共有結合的に付着している、請求項１に記載の方法。
- Ｌが、Ｎ-スクシンイミジル-４(２-ピリジルチオ)プロパノエート(ＳＰＤＰ)、スクシンイミジル-４-(Ｎ-マレイミドメチル)シクロヘキサン-１-カルボキシレート(ＳＭＣＣ)及びＮ-スクシンイミジル-４-(２-ピリジルチオ)ペンタノエート(ＳＰＰ)から選択されるリンカー試薬から形成される、請求項１に記載の方法。
- Ｌが、マレイミドカプロイル(ＭＣ)、マレイミドプロパノイル(ＭＰ)、およびマレイミドカプロイル−バリン−シトルリン−パラ−アミノベンジルオキシカルボニル(ＭＣ−ｖｃ−ＰＡＢ)から選択される、請求項１に記載の方法。
- Ｄが以下の構造を有するＤＭ１である、請求項１に記載の方法。
- Ｄがモノメチルアウリスタチンである、請求項１に記載の方法。
- Ｄが以下の構造を有するＭＭＡＥである、請求項２９に記載の方法。
- Ｄが以下の構造を有するＭＭＡＦである、請求項２９に記載の方法。
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