JP5289491B2 - Nicotiana nucleic acid molecule and use thereof - Google Patents
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Description
本発明は、Nicotiana(ニコチアナ)植物におけるNicotiana核酸配列、例えば構成的またはエチレンもしくは老化(senescence)誘導性ポリペプチドをコードする配列、特にシトクロムp450酵素(以下、p450およびp450酵素と称する)をコードする配列、ならびに植物の表現型を改変するための、これらの核酸配列の使用方法に関する。 The present invention encodes Nicotiana nucleic acid sequences in Nicotiana plants, such as sequences encoding constitutive or ethylene or senescence inducible polypeptides, particularly cytochrome p450 enzymes (hereinafter referred to as p450 and p450 enzymes). The invention relates to the use of these nucleic acid sequences for modifying the sequences as well as the phenotype of plants.
タバコの熟成または乾燥(キュアリング)中、種々の遺伝子の発現が改変される。そのような遺伝子は、最終産物の特性形質に影響を及ぼすテルペノイド、ポリフェノールおよびアルカロイドを含む多数の二次代謝産物の形成に関与する代謝経路に影響を及ぼしうる。例えば、多数のNicotiana種においては、植物の老化過程および収穫後または葉乾燥段階に、ノルニコチンを生成するニコチンの生物変換が生じる。ニコチンは主たるノルニコチン源である。ノルニコチンアルカロイドは、葉乾燥またはそれに続く葉貯蔵および加工中にタバコ特異的ニトロソアミン(TSNA)N'-ニトロノルニコチン(NNN)を生成する微生物媒介ニトロソ化のための基質である。 During tobacco ripening or drying (curing), the expression of various genes is altered. Such genes can affect metabolic pathways involved in the formation of a number of secondary metabolites including terpenoids, polyphenols and alkaloids that affect the end product's characteristic traits. For example, in many Nicotiana species, biotransformation of nicotine that produces nornicotine occurs during plant senescence and post-harvest or leaf drying stages. Nicotine is the main source of nornicotine. Nornicotine alkaloids are substrates for microorganism-mediated nitrosation that produce tobacco-specific nitrosamine (TSNA) N′-nitronornicotine (NNN) during leaf drying or subsequent leaf storage and processing.
タバコの熟成または乾燥中に発現される遺伝子は、エチレン誘導性または老化関連遺伝子、例えば、シトクロムp450をコードする遺伝子でありうる。シトクロムp450は、例えば、内因性および生体異物物質の酸化的、過酸化的および還元的代謝を含む広範な化学的に様々な物質の酵素反応を触媒する。植物においては、p450は、研究されているフェニルプロパノイド、アルカロイド、テルペノイド、脂質、青酸グリコシドおよびグルコシノラートのような植物産物の合成を含む生化学的経路に関与する(Chappell, Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 46:521-547, 1995(非特許文献1))。シトクロムp450は、p450ヘム-チオラートタンパク質としても公知であり、通常、p450含有モノオキシゲナーゼ系と称される多成分電子伝達鎖における末端オキシダーゼとして作用する。これらの酵素系により触媒される特異的反応には、脱メチル化、ヒドロキシル化、エポキシ化、N-酸化、スルホ酸化、N-、S-およびO-脱アルキル化、脱硫酸化、脱アミノ化ならびにアゾ、ニトロおよびN-オキシド基の還元が含まれる。 A gene expressed during ripening or drying of tobacco can be an ethylene-inducible or aging-related gene, such as a gene encoding cytochrome p450. Cytochrome p450 catalyzes the enzymatic reactions of a wide variety of chemically diverse substances including, for example, oxidative, peroxidative and reductive metabolism of endogenous and xenobiotic substances. In plants, p450 is involved in biochemical pathways involving the synthesis of plant products such as phenylpropanoids, alkaloids, terpenoids, lipids, hydrocyanic acid glycosides and glucosinolates being studied (Chappell, Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 46: 521-547, 1995 (Non-Patent Document 1)). Cytochrome p450 is also known as p450 heme-thiolate protein and normally acts as a terminal oxidase in a multicomponent electron transport chain called p450-containing monooxygenase system. Specific reactions catalyzed by these enzyme systems include demethylation, hydroxylation, epoxidation, N-oxidation, sulfooxidation, N-, S- and O-dealkylation, desulfation, deamination and Includes reduction of azo, nitro and N-oxide groups.
Nicotiana植物のp450酵素の多様な役割が、種々の植物代謝産物、例えばフェニルプロパノイド、アルカロイド、テルペノイド、脂質、青酸グリコシドおよび多数の他の化合物の生成に関連づけられている。いくつかのp450酵素は植物代謝産物の組成に影響を及ぼしうる。例えば、選択された脂肪酸の植物プロフィールを育種により改変することにより、ある植物の香味および芳香を改良することが長い間望まれているが、これらの葉成分のレベルの制御に関与するメカニズムに関してはほとんど知られていない。脂肪酸の修飾に関連したp450酵素のダウンレギュレーションまたはアップレギュレーションは、より好ましい葉の表現型特性を与える所望の脂肪酸の蓄積を促進しうる。 The diverse roles of p450 enzymes in Nicotiana plants have been linked to the production of various plant metabolites such as phenylpropanoids, alkaloids, terpenoids, lipids, hydrocyanic acid glycosides and many other compounds. Some p450 enzymes can affect the composition of plant metabolites. For example, it has long been desired to improve the flavor and aroma of certain plants by modifying the plant profile of selected fatty acids by breeding, but with regard to the mechanisms involved in controlling the levels of these leaf components Little is known. Down-regulation or up-regulation of p450 enzymes associated with fatty acid modification may promote the accumulation of desired fatty acids that confer more favorable leaf phenotypic characteristics.
p450酵素の機能および植物成分におけるそれらの広範な役割は尚も発見し続けられている。例えば、特別なクラスのp450酵素は、果物および野菜の「新鮮青野菜・果実(fresh green)」の主要寄与物質である揮発性C6-およびC9-アルデヒドならびにβ-アルコールへの脂肪酸の分解を触媒することが見出された。Nicotiana葉における脂質組成および関連分解代謝産物を修飾することにより葉成分の質を改良するために、他の新規標的化p450のレベルが改変されうる。葉におけるこれらの成分のいくつかは、葉品質特性の熟成を促す老化により影響される。更に他の報告は、p450酵素が、植物病原体相互作用および耐病性に関与する脂肪酸の改変において機能的役割を果たすことを示している。 The functions of p450 enzymes and their broad role in plant components are still being discovered. For example, a special class of p450 enzymes catalyzes the degradation of fatty acids to volatile C6- and C9-aldehydes and β-alcohols, which are the main contributors to the “fresh green” of fruits and vegetables. It was found to be. To improve the quality of leaf components by modifying the lipid composition and related degradation metabolites in Nicotiana leaves, the level of other novel targeted p450s can be altered. Some of these components in leaves are affected by aging that promotes ripening of leaf quality characteristics. Still other reports indicate that the p450 enzyme plays a functional role in the modification of fatty acids involved in plant pathogen interactions and disease resistance.
p450酵素の形態は非常に多種多様であり、それらの構造および機能も様々であるため、本発明以前においては、Nicotiana p450酵素に関するそれらの研究は非常に困難であった。また、少なくとも1つの理由として、p450酵素の膜局在化タンパク質は典型的には非常に少量しか存在せず、精製中にしばしば不安定となるため、p450酵素のクローニングは困難である。したがって、植物におけるp450酵素およびそれらのp450酵素に関連した核酸配列の特定が必要とされている。特に、Nicotianaにおいては、非常に少数のシトクロムp450タンパク質しか報告されていない。本明細書に記載の本発明は、配列同一性に基づけばp450種のいくつかの群に相当するシトクロム450およびシトクロムp450断片の発見を含む。
Prior to the present invention, their studies on Nicotiana p450 enzymes were very difficult because the forms of p450 enzymes are very diverse and their structures and functions are also varied. Also, for at least one reason, cloning of the p450 enzyme is difficult because the membrane-localized protein of the p450 enzyme is typically present in very small amounts and often becomes unstable during purification. Therefore, there is a need to identify p450 enzymes in plants and the nucleic acid sequences associated with those p450 enzymes. In particular, only a very small number of cytochrome p450 proteins have been reported in Nicotiana. The invention described herein includes the discovery of
p450配列に加えて、本発明は、タバコ製品の品質に影響を及ぼす二次代謝産物の形成に関与する代謝経路の調節の要求に対応する他の成分およびエチレンまたは老化誘導性配列の発見を含む。これらの配列も、より望ましい生殖質および特に非GMO(遺伝子操作生物)型生殖質を開発するための育種計画における使用のための望ましい形質を有する植物生殖質の開発において有用である。 In addition to the p450 sequence, the present invention includes the discovery of other components and ethylene or aging-inducible sequences that correspond to the regulatory requirements of metabolic pathways involved in the formation of secondary metabolites that affect tobacco product quality. . These sequences are also useful in developing plant germplasm with desirable traits for use in breeding programs to develop more desirable germplasm and in particular non-GMO (genetically engineered organism) type germplasm.
本発明は、タバコ由来の構成的およびエチレンまたは老化誘導性配列(ニコチンデメチラーゼのゲノムクローンを含む)を特定し、特徴づけした。また、育種方法における、および所望の形質(例えば、ノルニコチンまたはN'-ニトロソノルニコチン(「NNN」)または両方のレベルの、対照植物に対する改変)を有する植物(例えば、トランスジェニック植物)を作製するための方法における、これらの配列の使用も、本明細書に記載する。 The present invention has identified and characterized constitutive and ethylene or senescence-inducing sequences from tobacco (including genomic clones of nicotine demethylase). It also creates plants (eg, transgenic plants) that have the desired trait (eg, nornicotine or N′-nitrosonornicotine (“NNN”) or modifications at both levels relative to the control plant) in the breeding method. The use of these sequences in a method for is also described herein.
1つの態様においては、本発明は、ニコチンデメチラーゼ遺伝子の発現の低下を伴うタバコ植物を生産するための育種方法に関する。該方法は、(a)変異体ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現を有する第1タバコ植物を準備し、(b)少なくとも1つの表現型形質を含有する第2タバコ植物を準備し、(c)第1タバコ植物と第2タバコ植物とを交配させてF1後代植物を得、(d)変異体ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現のために該F1後代の種子を集め、(e)該種子を発芽させて、ニコチンデメチラーゼ遺伝子の発現の低下を伴うタバコ植物を得る工程を含む。 In one embodiment, the present invention relates to a breeding method for producing tobacco plants with reduced expression of a nicotine demethylase gene. The method comprises (a) providing a first tobacco plant having mutant nicotine demethylase gene expression, (b) providing a second tobacco plant containing at least one phenotypic trait, and (c) first tobacco. A plant and a second tobacco plant are crossed to obtain an F1 progeny plant, (d) the F1 progeny seed is collected for mutant nicotine demethylase gene expression, (e) the seed is germinated, Obtaining a tobacco plant with reduced expression of the methylase gene.
1つの実施形態においては、本明細書に記載の配列および当技術分野で公知の標準的な方法を用いて、ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現(例えば、転写、転写後もしくは翻訳のレベルまたは酵素活性のレベルにおけるもの)に関する変異体としてタバコ植物を特定する。 In one embodiment, using the sequences described herein and standard methods known in the art, nicotine demethylase gene expression (eg, level of transcription, post-transcription or translation or level of enzyme activity). Tobacco plants are identified as variants for
この育種方法のもう1つの実施形態においては、第1タバコ植物は、変異(例えば、欠失、置換、点変異、転座、逆位、重複または挿入)を有する内因性ニコチンデメチラーゼ遺伝子を含む。もう1つの実施形態においては、第1タバコ植物は、ヌル変異を有するニコチンデメチラーゼ遺伝子を含み、内因性ニコチンデメチラーゼ遺伝子をサイレンシングする組換え遺伝子を含み、あるいは、酵素活性の低下または改変を伴うニコチンデメチラーゼを含む。更にもう1つの実施形態においては、第1タバコ植物のニコチンデメチラーゼ遺伝子は存在しない。更にもう1つの実施形態においては、第1タバコ植物はトランスジェニック植物である。 In another embodiment of this method of breeding, the first tobacco plant comprises an endogenous nicotine demethylase gene having a mutation (eg, deletion, substitution, point mutation, translocation, inversion, duplication or insertion). . In another embodiment, the first tobacco plant includes a nicotine demethylase gene having a null mutation, includes a recombinant gene that silences an endogenous nicotine demethylase gene, or reduces or modifies enzyme activity. With accompanying nicotine demethylase. In yet another embodiment, the first tobacco plant nicotine demethylase gene is absent. In yet another embodiment, the first tobacco plant is a transgenic plant.
本明細書に開示する育種方法において有用な典型的な第1タバコ植物には以下のものが含まれる:Nicotiana africana, Nicotiana amplexicaulis, Nicotiana arentsii, Nicotiana benthamiana, Nicotiana bigelovii, Nicotiana corymbosa, Nicotiana debneyi, Nicotiana excelsior, Nicotiana exigua, Nicotiana glutinosa, Nicotiana goodspeedii, Nicotiana gossei, Nicotiana hesperis, Nicotiana ingulba, Nicotiana knightiana, Nicotiana maritima, Nicotiana megalosiphon, Nicotiana miersii, Nicotiana nesophila, Nicotiana noctiflora, Nicotiana nudicaulis, Nicotiana otophora, Nicotiana palmeri, Nicotiana paniculata, Nicotiana petunioides, Nicotiana plumbaginifolia, Nicotiana repanda, Nicotiana rosulata, Nicotiana rotundifolia, Nicotiana rustica, Nicotiana setchelli, Nicotiana stocktonii, Nicotiana eastii, Nicotiana suaveolensまたはNicotiana trigonophylla。望ましくは、第1タバコ植物は、Nicotiana amplexicaulis, Nicotiana benthamiana, Nicotiana bigelovii, Nicotiana debneyi, Nicotiana excelsior, Nicotiana glutinosa, Nicotiana goodspeedii, Nicotiana gossei, Nicotiana hesperis, Nicotiana knightiana, Nicotiana maritima, Nicotiana megalosiphon, Nicotiana nudicaulis, Nicotiana paniculata, Nicotiana plumbaginifolia, Nicotiana repanda, Nicotiana rustica, Nicotiana suaveolensまたはNicotiana trigonophyllaである。他の第1タバコ植物には、ニコチンエメチラーゼのレベルが低下するよう操作された、Nicotiana tabacum(またはNicotiana rustica)の品種またはそれに関連したトランスジェニック系統が含まれる。他の典型的な第1タバコ植物には、オリエンタル、いぶし(dark)タバコ、火力乾燥(フルーキュアリング)もしくは空気乾燥(エアキュアリング)タバコ、バージニア、またはバーレータバコ植物が含まれる。 Typical first tobacco plants useful in the breeding methods disclosed herein include: Nicotiana africana, Nicotiana amplexicaulis, Nicotiana arentsii, Nicotiana benthamiana, Nicotiana bigelovii, Nicotiana corymbosa, Nicotiana debneyi, Nicotiana excelsior , Nicotiana exigua, Nicotiana glutinosa, Nicotiana goodspeedii, Nicotiana gossei, Nicotiana hesperis, Nicotiana ingulba, Nicotiana knightiana, Nicotiana maritima, Nicotiana megalosiphon, Nicotiana miersii, Nicotiana nesophila, Nicotiana noctiflora, Nicotiana noctiflora, Nicosiana noctiflora, Nicotiana petunioides, Nicotiana plumbaginifolia, Nicotiana repanda, Nicotiana rosulata, Nicotiana rotundifolia, Nicotiana rustica, Nicotiana setchelli, Nicotiana stocktonii, Nicotiana eastii, Nicotiana suaveolens or Nicotiana trigonophylla. Desirably, the first tobacco plant is Nicotiana amplexicaulis, Nicotiana benthamiana, Nicotiana bigelovii, Nicotiana debneyi, Nicotiana excelsior, Nicotiana glutinosa, Nicotiana goodspeedii, Nicotiana gossei, Nicotiana hesperis, Nicotiana knightiana, Nicotiana maritima, phonic Nicotiana plumbaginifolia, Nicotiana repanda, Nicotiana rustica, Nicotiana suaveolens or Nicotiana trigonophylla. Other first tobacco plants include Nicotiana tabacum (or Nicotiana rustica) varieties or related transgenic lines that have been engineered to reduce levels of nicotine emethylase. Other typical first tobacco plants include oriental, dark tobacco, fire-cured or air-cured tobacco, Virginia, or Burley tobacco plants.
前記の育種方法のもう1つの実施形態においては、第2タバコ植物はNicotiana tabacumである。Nicotiana tabacumの典型的な品種には例えば以下のような商業用品種が含まれる:BU 64, CC 101, CC 200, CC 27, CC 301, CC 400, CC 500, CC 600, CC 700, CC 800, CC 900, Coker 176, Coker 319, Coker 371 Gold, Coker 48, CU 263, DF911, Galpaoタバコ, GL 26H, GL 350, GL 737, GL 939, GL 973, HB 04P, K 149, K 326, K 346, K 358, K 394, K 399, K 730, KT 200, KY 10, KY 14, KY 160, KY 17, KY 171, KY 907, KY 160, Little Crittenden, McNair 373, McNair 944, msKY 14 x L8, Narrow Leaf Madole, NC 100, NC 102, NC 2000, NC 291, NC 297, NC 299, NC 3, NC 4, NC 5, NC 6, NC 606, NC 71, NC 72, NC 810, NC BH 129, OXFORD 207, 'Perique'タバコ, PVH03, PVH09, PVH19, PVH50, PVH51, R 610, R 630, R 7-11, R 7-12, RG 17, RG 81, RG H4, RG H51, RGH 4, RGH 51, RS 1410, SP 168, SP 172, SP 179, SP 210, SP 220, SP G-28, SP G-70, SP H20, SP NF3, TN 86, TN 90, TN 97, TN D94, TN D950, TR (Tom Rosson) Madole, VA 309, VA 309またはVA 359。 In another embodiment of said breeding method, the second tobacco plant is Nicotiana tabacum. Typical varieties of Nicotiana tabacum include commercial varieties such as: BU 64, CC 101, CC 200, CC 27, CC 301, CC 400, CC 500, CC 600, CC 700, CC 800 , CC 900, Coker 176, Coker 319, Coker 371 Gold, Coker 48, CU 263, DF911, Galpao tobacco, GL 26H, GL 350, GL 737, GL 939, GL 973, HB 04P, K 149, K 326, K 346, K 358, K 394, K 399, K 730, KT 200, KY 10, KY 14, KY 160, KY 17, KY 171, KY 907, KY 160, Little Crittenden, McNair 373, McNair 944, msKY 14 x L8, Narrow Leaf Madole, NC 100, NC 102, NC 2000, NC 291, NC 297, NC 299, NC 3, NC 4, NC 5, NC 6, NC 606, NC 71, NC 72, NC 810, NC BH 129, OXFORD 207, 'Perique' tobacco, PVH03, PVH09, PVH19, PVH50, PVH51, R 610, R 630, R 7-11, R 7-12, RG 17, RG 81, RG H4, RG H51, RGH 4 , RGH 51, RS 1410, SP 168, SP 172, SP 179, SP 210, SP 220, SP G-28, SP G-70, SP H20, SP NF3, TN 86, TN 90, TN 97, TN D94, TN D950, TR (Tom Rosson) Madole, VA 309, VA 309 or VA 359.
更に他の実施形態においては、第2タバコ植物の表現型形質には、耐病性;高い収量;高い等級指標;乾燥性;乾燥の質;機械的収穫性;保持能(holding ability);葉の質;丈、植物成熟度(例えば、早熟、早熟ないし中生、中生、中生ないし晩熟または晩熟);柄のサイズ(例えば、小さい、中等度または大きい柄);または植物当たりの葉数(例えば、少ない(例えば、5〜10枚の葉)、中等度(例えば、11〜15枚の葉)または多い(例えば、16〜21枚)の葉数)が含まれる。更に他の実施形態においては、該方法は更に、雄性不稔花粉受容体(acceptor)、雑種の生産に使用されうる花粉供与体もしくは工程(b)の植物との雄性不稔雑種を自家受粉もしくは受粉(授粉)させること、または工程(e)の発芽種子から得た植物を戻し交配または自家受粉させることを含む。 In yet another embodiment, the phenotypic trait of the second tobacco plant includes disease resistance; high yield; high grade index; desiccation; quality of desiccation; mechanical harvestability; holding ability; Quality; height, plant maturity (eg, early ripening, premature to medium, medium, medium to late ripening or late ripening); pattern size (eg, small, moderate or large pattern); or number of leaves per plant ( For example, low (eg, 5-10 leaves), moderate (eg, 11-15 leaves) or high (eg, 16-21 leaves). In yet another embodiment, the method further comprises self-pollination of a male sterile hybrid with a male sterile pollen acceptor, a pollen donor that can be used to produce the hybrid or the plant of step (b) or Including pollination (pollination), or backcrossing or self-pollination of the plant obtained from the germinated seed of step (e).
もう1つの態様においては、本発明は、タバコ植物内へニコチンデメチラーゼ欠損形質を育種するための方法に関する。該方法は、a)変異体ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現を有する第1タバコ植物を第2タバコ植物と交配させ、b)該交配の後代タバコ植物を得、c)後代タバコ植物からDNAサンプルを抽出し、d)該DNAサンプルを、ニコチンデメチラーゼ遺伝子またはその断片にハイブリダイズするマーカー核酸分子と接触させ、e)該変異体ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現形質に関するマーカー補助育種法(marker assisted breeding method)を行う工程を含む。例えば、植物を、ニコチンデメチラーゼの変異体遺伝子発現を有するものとして特定し、所望により、ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現に関して更に試験し、あるいは標準的なアルカロイドプロファイリングまたは免疫ブロット分析を用いて試験する。典型的には、そのようなマーカー補助育種法は、増幅断片長多型、制限断片長多型、ランダム増幅多型提示、一塩基多型、マイクロサテライトマーカー、またはタバコゲノムにおける標的化誘導性局所損傷(targetted induced local lesion)の利用を含む。 In another aspect, the invention relates to a method for breeding a nicotine demethylase deficient trait into a tobacco plant. The method comprises: a) crossing a first tobacco plant having a mutant nicotine demethylase gene expression with a second tobacco plant, b) obtaining a progeny tobacco plant of the cross, and c) extracting a DNA sample from the progeny tobacco plant D) contacting the DNA sample with a marker nucleic acid molecule that hybridizes to a nicotine demethylase gene or fragment thereof, e) performing a marker assisted breeding method for the mutant nicotine demethylase gene expression trait Process. For example, plants are identified as having mutant gene expression of nicotine demethylase, optionally further tested for nicotine demethylase gene expression, or using standard alkaloid profiling or immunoblot analysis. Typically, such marker-assisted breeding methods include amplified fragment length polymorphisms, restriction fragment length polymorphisms, random amplified polymorphism presentations, single nucleotide polymorphisms, microsatellite markers, or targeted inducible localities in the tobacco genome. Includes the use of targeted induced local lesions.
更にもう1つの態様においては、本発明は、Nicotiana africana, Nicotiana amplexicaulis, Nicotiana arentsii, Nicotiana benthamiana, Nicotiana bigelovii, Nicotiana corymbosa, Nicotiana debneyi, Nicotiana excelsior, Nicotiana exigua, Nicotiana glutinosa, Nicotiana goodspeedii, Nicotiana gossei, Nicotiana hesperis, Nicotiana ingulba, Nicotiana knightiana, Nicotiana maritima, Nicotiana megalosiphon, Nicotiana miersii, Nicotiana nesophila, Nicotiana noctiflora, Nicotiana nudicaulis, Nicotiana otophora, Nicotiana palmeri, Nicotiana paniculata, Nicotiana petunioides, Nicotiana plumbaginifolia, Nicotiana repanda, Nicotiana rosulata, Nicotiana rotundifolia, Nicotiana rustica, Nicotiana setchelli, Nicotiana stocktonii, Nicotiana eastii, Nicotiana suaveolensおよびNicotiana trigonophyllaよりなる群から選ばれるタバコ植物のいずれかをそれ自身と交配させることを含む、タバコ種子の生産方法に関する。1つの実施形態においては、該方法は更に、変異体ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現を有するタバコ植物を第2の異なるタバコ植物と交配させることを含む、雑種タバコ種子の生産方法を含む。本発明の更にもう1つの実施形態においては、該交配は、(a)変異体ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現を有するタバコ植物と第2の異なるタバコ植物との交配から得られた種子を植え、(b)該種子からのタバコ植物を成長させて、該植物を開花させ、(c)変異体ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現を有するタバコ植物の花を第2のタバコ植物からの花粉で受粉させ、あるいは第2のタバコ植物の花を、変異体ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現を有するタバコ植物の花からの花粉で受粉させ、(d)該受粉から得られた種子を収穫する工程を含む。 In yet another aspect, the present invention relates to Nicotiana africana, Nicotiana amplexicaulis, Nicotiana arentsii, Nicotiana benthamiana, Nicotiana bigelovii, Nicotiana corymbosa, Nicotiana debneyi, Nicotiana excelsior, Nicotiana exigua, Nicotiana glutinosa, Nicotiana glutinosa, Nicotiana , Nicotiana ingulba, Nicotiana knightiana, Nicotiana maritima, Nicotiana megalosiphon, Nicotiana miersii, Nicotiana nesophila, Nicotiana noctiflora, Nicotiana nudicaulis, Nicotiana otophora, Nicotiana palmeri, Nicotiana palmitiana, foliobag The present invention relates to a method for producing tobacco seeds comprising crossing with a tobacco plant selected from the group consisting of rustica, Nicotiana setchelli, Nicotiana stocktonii, Nicotiana eastii, Nicotiana suaveolens and Nicotiana trigonophylla with itself. In one embodiment, the method further comprises a method for producing hybrid tobacco seed comprising crossing a tobacco plant having a mutant nicotine demethylase gene expression with a second different tobacco plant. In yet another embodiment of the invention, the crossing comprises (a) planting seed obtained from crossing a tobacco plant having mutant nicotine demethylase gene expression with a second different tobacco plant, (b) ) Growing a tobacco plant from the seed and flowering the plant; (c) pollinating a tobacco plant having mutant nicotine demethylase gene expression with pollen from a second tobacco plant; And (d) harvesting seeds obtained from the pollination. The method comprises: pollinating the tobacco plant flower with pollen from a tobacco plant flower having a mutant nicotine demethylase gene expression.
更にもう1つの態様においては、本発明は、(a)変異体ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現を有するタバコ植物またはその成分を準備し、(b)タバコ植物育種技術を用いて育種材料源として該植物または植物成分を使用することを含む、タバコ育種計画においてタバコ植物を開発するための方法に関する。この方法の実施に有用な典型的な植物育種技術には、集団選抜(bulk selection)、戻し交配、自家受粉、移入交雑、系統選抜、純系選抜、半数体/倍加半数体育種または単粒系統法が含まれる。 In yet another aspect, the present invention provides (a) preparing a tobacco plant having mutant nicotine demethylase gene expression or a component thereof, and (b) using the tobacco plant breeding technique as a source of breeding material for the plant or The present invention relates to a method for developing tobacco plants in a tobacco breeding program comprising using plant components. Typical plant breeding techniques useful for carrying out this method include bulk selection, backcrossing, self-pollination, introgression crossing, line selection, pure line selection, haploid / doubled haploid breeding or single grain line methods Is included.
もう1つの態様においては、本発明は、(a)図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列よりなる群から選ばれる核酸分子の変異体遺伝子発現を含む修飾された属性を有する第1タバコ植物を準備し、(b)少なくとも1つの表現型形質を含有する第2タバコ植物を準備し、(c)第1タバコ植物を第2タバコ植物と交配させてF1後代植物を得、(d)前記の修飾された属性の該F1後代の種子を集め、(e)該種子を発芽させて、修飾された属性を有するタバコ植物を得る工程を含む、修飾された属性を有するタバコ植物を生産するための育種方法に関する。1つの実施形態においては、第1タバコ植物は、変異を含む、図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列よりなる群から選ばれる内因性核酸分子を含む。典型的な変異には、欠失、置換、点変異、転座、逆位、重複または挿入が含まれる。 In another embodiment, the invention relates to (a) FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and FIGS. 173-1 to 173-294 Providing a first tobacco plant having a modified attribute comprising a mutant gene expression of a nucleic acid molecule selected from the group consisting of the nucleic acid sequences shown, and (b) providing a second tobacco plant containing at least one phenotypic trait And (c) crossing the first tobacco plant with the second tobacco plant to obtain an F1 progeny plant, (d) collecting the seeds of the F1 progeny having the modified attributes, and (e) germinating the seeds. And a breeding method for producing a tobacco plant having a modified attribute, comprising the step of obtaining a tobacco plant having a modified attribute. In one embodiment, the first tobacco plant comprises the mutations of FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and FIGS. 173-1 to 173. -Endogenous nucleic acid molecules selected from the group consisting of the nucleic acid sequence shown in -294. Typical mutations include deletions, substitutions, point mutations, translocations, inversions, duplications or insertions.
更にもう1つの実施形態においては、前記方法の第1タバコ植物は、ヌル変異を含む、図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列よりなる群から選ばれる内因性核酸分子を含む。更にもう1つの実施形態においては、第1タバコ植物は、図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列よりなる群から選ばれる内因性核酸分子の発現をサイレンシングする組換え遺伝子を含む。 In yet another embodiment, the first tobacco plant of the method comprises a null mutation, wherein FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and An endogenous nucleic acid molecule selected from the group consisting of the nucleic acid sequences shown in FIGS. 173-1 to 173-294 is included. In yet another embodiment, the first tobacco plant is Figure 1, Figures 3-7, Figures 10-158, Figures 162-170, Figures 172-1 to 172-19 and Figures 173-1 to 173-294. A recombinant gene that silences the expression of an endogenous nucleic acid molecule selected from the group consisting of the nucleic acid sequences shown below.
所望により、第1タバコ植物は、低下または変化した酵素活性を有するポリペプチドをコードする、図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列よりなる群から選ばれる内因性核酸分子を含む。更に他の実施形態においては、第1タバコ植物はトランスジェニック植物である。 Optionally, the first tobacco plant encodes a polypeptide having reduced or altered enzymatic activity, as shown in FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and An endogenous nucleic acid molecule selected from the group consisting of the nucleic acid sequences shown in FIGS. 173-1 to 173-294 is included. In yet other embodiments, the first tobacco plant is a transgenic plant.
本明細書に開示する育種方法において有用な典型的な第1タバコ植物には以下のものが含まれる:Nicotiana africana, Nicotiana amplexicaulis, Nicotiana arentsii, Nicotiana benthamiana, Nicotiana bigelovii, Nicotiana corymbosa, Nicotiana debneyi, Nicotiana excelsior, Nicotiana exigua, Nicotiana glutinosa, Nicotiana goodspeedii, Nicotiana gossei, Nicotiana hesperis, Nicotiana ingulba, Nicotiana knightiana, Nicotiana maritima, Nicotiana megalosiphon, Nicotiana miersii, Nicotiana nesophila, Nicotiana noctiflora, Nicotiana nudicaulis, Nicotiana otophora, Nicotiana palmeri, Nicotiana paniculata, Nicotiana petunioides, Nicotiana plumbaginifolia, Nicotiana repanda, Nicotiana rosulata, Nicotiana rotundifolia, Nicotiana rustica, Nicotiana setchelli, Nicotiana stocktonii, Nicotiana eastii, Nicotiana suaveolensまたはNicotiana trigonophylla。他の第1タバコ植物には、Nicotiana tabacumまたはNicotiana rusticaの品種が含まれる。更に他の第1タバコ植物としては、オリエンタル、いぶし(dark)タバコ、火力乾燥(フルーキュアリング)もしくは空気乾燥(エアキュアリング)タバコ、バージニア、またはバーレータバコ植物が挙げられる。 Typical first tobacco plants useful in the breeding methods disclosed herein include: Nicotiana africana, Nicotiana amplexicaulis, Nicotiana arentsii, Nicotiana benthamiana, Nicotiana bigelovii, Nicotiana corymbosa, Nicotiana debneyi, Nicotiana excelsior , Nicotiana exigua, Nicotiana glutinosa, Nicotiana goodspeedii, Nicotiana gossei, Nicotiana hesperis, Nicotiana ingulba, Nicotiana knightiana, Nicotiana maritima, Nicotiana megalosiphon, Nicotiana miersii, Nicotiana nesophila, Nicotiana noctiflora, Nicotiana noctiflora, Nicosiana noctiflora, Nicotiana petunioides, Nicotiana plumbaginifolia, Nicotiana repanda, Nicotiana rosulata, Nicotiana rotundifolia, Nicotiana rustica, Nicotiana setchelli, Nicotiana stocktonii, Nicotiana eastii, Nicotiana suaveolens or Nicotiana trigonophylla. Other first tobacco plants include Nicotiana tabacum or Nicotiana rustica varieties. Still other first tobacco plants include oriental, dark tobacco, fire-cured or air-cured tobacco, Virginia, or Burley tobacco plants.
前記の育種方法のもう1つの実施形態においては、第2タバコ植物はNicotiana tabacumである。Nicotiana tabacumの典型的な品種には例えば以下のような商業用品種が含まれる:BU 64, CC 101, CC 200, CC 27, CC 301, CC 400, CC 500, CC 600, CC 700, CC 800, CC 900, Coker 176, Coker 319, Coker 371 Gold, Coker 48, CU 263, DF911, Galpaoタバコ, GL 26H, GL 350, GL 737, GL 939, GL 973, HB 04P, K 149, K 326, K 346, K 358, K 394, K 399, K 730, KT 200, KY 10, KY 14, KY 160, KY 17, KY 171, KY 907, KY 160, Little Crittenden, McNair 373, McNair 944, msKY 14 x L8, Narrow Leaf Madole, NC 100, NC 102, NC 2000, NC 291, NC 297, NC 299, NC 3, NC 4, NC 5, NC 6, NC 606, NC 71, NC 72, NC 810, NC BH 129, OXFORD 207, 'Perique'タバコ, PVH03, PVH09, PVH19, PVH50, PVH51, R 610, R 630, R 7-11, R 7-12, RG 17, RG 81, RG H4, RG H51, RGH 4, RGH 51, RS 1410, SP 168, SP 172, SP 179, SP 210, SP 220, SP G-28, SP G-70, SP H20, SP NF3, TN 86, TN 90, TN 97, TN D94, TN D950, TR (Tom Rosson) Madole, VA 309, VA 309またはVA 359。 In another embodiment of said breeding method, the second tobacco plant is Nicotiana tabacum. Typical varieties of Nicotiana tabacum include commercial varieties such as: BU 64, CC 101, CC 200, CC 27, CC 301, CC 400, CC 500, CC 600, CC 700, CC 800 , CC 900, Coker 176, Coker 319, Coker 371 Gold, Coker 48, CU 263, DF911, Galpao tobacco, GL 26H, GL 350, GL 737, GL 939, GL 973, HB 04P, K 149, K 326, K 346, K 358, K 394, K 399, K 730, KT 200, KY 10, KY 14, KY 160, KY 17, KY 171, KY 907, KY 160, Little Crittenden, McNair 373, McNair 944, msKY 14 x L8, Narrow Leaf Madole, NC 100, NC 102, NC 2000, NC 291, NC 297, NC 299, NC 3, NC 4, NC 5, NC 6, NC 606, NC 71, NC 72, NC 810, NC BH 129, OXFORD 207, 'Perique' tobacco, PVH03, PVH09, PVH19, PVH50, PVH51, R 610, R 630, R 7-11, R 7-12, RG 17, RG 81, RG H4, RG H51, RGH 4 , RGH 51, RS 1410, SP 168, SP 172, SP 179, SP 210, SP 220, SP G-28, SP G-70, SP H20, SP NF3, TN 86, TN 90, TN 97, TN D94, TN D950, TR (Tom Rosson) Madole, VA 309, VA 309 or VA 359.
更に他の実施形態においては、第2タバコ植物の表現型形質には、耐病性;高い収量;高い等級指標;乾燥性;乾燥の質;機械的収穫性;保持能(holding ability);葉の質;丈、植物成熟度(例えば、早熟、早熟ないし中生、中生、中生ないし晩熟または晩熟);柄のサイズ(例えば、小さい、中等度または大きい柄);または植物当たりの葉数(例えば、少ない(例えば、5〜10枚の葉)、中等度(例えば、11〜15枚の葉)または多い(例えば、16〜21枚)の葉数)が含まれる。 In yet another embodiment, the phenotypic trait of the second tobacco plant includes disease resistance; high yield; high grade index; desiccation; quality of desiccation; mechanical harvestability; holding ability; Quality; height, plant maturity (eg, early ripening, premature to medium, medium, medium to late ripening or late ripening); pattern size (eg, small, moderate or large pattern); or number of leaves per plant ( For example, low (eg, 5-10 leaves), moderate (eg, 11-15 leaves) or high (eg, 16-21 leaves).
更に他の実施形態においては、該方法は、雄性不稔もしくは雄性不稔雑種を工程(b)の植物で受粉させること、または工程(e)の発芽種子から得た植物を戻し交配または受粉させることを含む。もう1つの態様においては、本発明は、タバコ植物内へ属性を育種するための方法に関する。該方法は、a)図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列よりなる群から選ばれる核酸分子の変異体遺伝子発現を含む修飾された属性を有する第1タバコ植物を、第2タバコ植物と交配させ、b)該交配の後代タバコ植物を得、c)後代タバコ植物からDNAサンプルを抽出し、d)該DNAサンプルを、図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列またはそれらの断片よりなる群から選ばれる核酸分子にハイブリダイズするマーカー核酸分子と接触させ、e)修飾された属性に関するマーカー補助育種法を行う工程を含む。典型的には、そのようなマーカー補助育種法は、増幅断片長多型、制限断片長多型、ランダム増幅多型提示、一塩基多型、マイクロサテライトマーカー、またはタバコゲノムにおける標的化誘導性局所損傷(targetted induced local lesion)の利用を含む。 In yet another embodiment, the method comprises pollinating a male sterile or male sterile hybrid with the plant of step (b), or backcrossing or pollinating a plant obtained from the germinated seed of step (e) Including that. In another aspect, the present invention relates to a method for breeding attributes into tobacco plants. The method is a) selected from the group consisting of the nucleic acid sequences shown in FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and FIGS. 173-1 to 173-294 A first tobacco plant having a modified attribute comprising a variant gene expression of the nucleic acid molecule to be crossed with a second tobacco plant, b) obtaining a progeny tobacco plant of the cross, and c) obtaining a DNA sample from the progeny tobacco plant D) extracting the DNA sample from the nucleic acid sequence shown in FIG. 1, FIGS. 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and FIGS. 173-1 to 173-294 or Contacting with a marker nucleic acid molecule that hybridizes to a nucleic acid molecule selected from the group consisting of those fragments, and e) performing a marker-assisted breeding method for the modified attribute. Typically, such marker-assisted breeding methods include amplified fragment length polymorphisms, restriction fragment length polymorphisms, random amplified polymorphism presentations, single nucleotide polymorphisms, microsatellite markers, or targeted inducible localities in the tobacco genome. Includes the use of targeted induced local lesions.
更にもう1つの態様においては、本発明は、Nicotiana africana, Nicotiana amplexicaulis, Nicotiana arentsii, Nicotiana benthamiana, Nicotiana bigelovii, Nicotiana corymbosa, Nicotiana debneyi, Nicotiana excelsior, Nicotiana exigua, Nicotiana glutinosa, Nicotiana goodspeedii, Nicotiana gossei, Nicotiana hesperis, Nicotiana ingulba, Nicotiana knightiana, Nicotiana maritima, Nicotiana megalosiphon, Nicotiana miersii, Nicotiana nesophila, Nicotiana noctiflora, Nicotiana nudicaulis, Nicotiana otophora, Nicotiana palmeri, Nicotiana paniculata, Nicotiana petunioides, Nicotiana plumbaginifolia, Nicotiana repanda, Nicotiana rosulata, Nicotiana rotundifolia, Nicotiana rustica, Nicotiana setchelli, Nicotiana stocktonii, Nicotiana eastii, Nicotiana suaveolensおよびNicotiana trigonophyllaよりなる群から選ばれるタバコ植物のいずれかを、図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列よりなる群から選ばれる核酸分子の変異体遺伝子発現を含む修飾された属性を有するタバコ植物ないし第2の異なるタバコ植物と交配させることを含む、タバコ種子の生産方法に関する。 In yet another aspect, the present invention relates to Nicotiana africana, Nicotiana amplexicaulis, Nicotiana arentsii, Nicotiana benthamiana, Nicotiana bigelovii, Nicotiana corymbosa, Nicotiana debneyi, Nicotiana excelsior, Nicotiana exigua, Nicotiana glutinosa, Nicotiana glutinosa, Nicotiana , Nicotiana ingulba, Nicotiana knightiana, Nicotiana maritima, Nicotiana megalosiphon, Nicotiana miersii, Nicotiana nesophila, Nicotiana noctiflora, Nicotiana nudicaulis, Nicotiana otophora, Nicotiana palmeri, Nicotiana palmitiana, foliobag Any one of tobacco plants selected from the group consisting of rustica, Nicotiana setchelli, Nicotiana stocktonii, Nicotiana eastii, Nicotiana suaveolens and Nicotiana trigonophylla is shown in FIG. 1, FIG. 3-7, FIG. 10-158, FIG. 162-170, FIG. 1 to 172-19 and the group consisting of the nucleic acid sequences shown in FIGS. 173-1 to 173-294 Comprising causing crossed with tobacco plant or a second, different tobacco plants with modified attributes include variants gene expression of a nucleic acid molecule selected et al., It relates to a method of producing the tobacco seeds.
更にもう1つの実施形態においては、交配は、(a)修飾された属性を有するタバコ植物と第2の異なるタバコ植物との交配から得られた種子を植え、(b)該種子からのタバコ植物を成長させて、該植物を開花させ、(c)修飾された属性を有するタバコ植物の花を第2のタバコ植物からの花粉で受粉させ、あるいは第2のタバコ植物の花を、修飾された属性を有するタバコ植物の植物からの花粉で受粉させ、(d)該受粉から得られた種子を収穫する工程を含む。 In yet another embodiment, the crossing comprises (a) planting a seed obtained from crossing a tobacco plant having a modified attribute with a second different tobacco plant, and (b) a tobacco plant from the seed And (c) pollinating tobacco plant flowers with modified attributes with pollen from a second tobacco plant, or modifying flowers of a second tobacco plant And (d) harvesting seeds obtained from the pollination from pollens from tobacco plants having attributes.
更にもう1つの態様においては、本発明は、(a)図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列よりなる群から選ばれる核酸分子の変異体遺伝子発現を含む修飾された属性を有するタバコ植物またはその成分を準備し、(b)タバコ植物育種技術を用いて育種材料源として該植物または植物成分を使用することを含む、タバコ育種計画においてタバコ植物を開発するための方法に関する。この方法の実施に有用な典型的な植物育種技術には、集団選抜(bulk selection)、戻し交配、自家受粉、移入交雑、系統選抜、純系選抜、半数体/倍加半数体育種または単粒系統法が含まれる。 In yet another aspect, the present invention provides (a) FIG. 1, FIGS. 3-7, FIGS. 10-158, FIGS. 162-170, FIGS. 172-1 to 172-19 and FIGS. 173-1 to 173-294 A tobacco plant having a modified attribute including expression of a mutant gene of a nucleic acid molecule selected from the group consisting of the nucleic acid sequences shown in the above or a component thereof, and (b) the plant as a breeding material source using tobacco plant breeding technology Or relates to a method for developing tobacco plants in a tobacco breeding program comprising using plant components. Typical plant breeding techniques useful for carrying out this method include bulk selection, backcrossing, self-pollination, introgression crossing, line selection, pure line selection, haploid / doubled haploid breeding or single grain line methods Is included.
関連態様において、本発明は、前記育種方法のいずれかにより生産されたタバコ植物またはその成分に関する。更にもう1つの関連態様においては、本発明は、本明細書に記載の方法に従い育種または生産された植物のいずれかから得られた再生可能なタバコ細胞の組織培養に関する。そのような組織培養は、変異体ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現または修飾された属性を有するタバコ植物の生理学的および形態学的特徴のすべてを発現しうるタバコ植物を再生する。典型的な再生可能な細胞は胚、分裂細胞、種子、花粉、葉、根、根端または花であり、あるいはそれらに由来するプロトプラストまたはカルスである。 In a related aspect, the invention relates to a tobacco plant or component thereof produced by any of the above breeding methods. In yet another related aspect, the present invention relates to tissue culture of renewable tobacco cells obtained from any plant that has been bred or produced according to the methods described herein. Such tissue culture regenerates tobacco plants that can express all of the physiological and morphological characteristics of tobacco plants with mutant nicotine demethylase gene expression or modified attributes. Typical renewable cells are embryos, dividing cells, seeds, pollen, leaves, roots, root tips or flowers, or protoplasts or callus derived therefrom.
他の関連態様においては、本発明は、(a)前記育種方法のいずれかにより得られたタバコ植物を準備し、(b)該タバコ植物からタバコ製品を製造することを含む、タバコ製品の製造方法に関する。典型的なタバコ製品には、葉または茎またはそれらの両方;無煙タバコ製品;湿性もしくは乾燥かぎタバコ;噛みタバコ;巻きタバコ製品;葉巻製品;シガリーロ;パイプタバコ;またはビーディ(bidi)が含まれる。 In another related aspect, the present invention provides the production of a tobacco product comprising: (a) providing a tobacco plant obtained by any of the above breeding methods; and (b) producing a tobacco product from the tobacco plant. Regarding the method. Typical tobacco products include leaves or stems or both; smokeless tobacco products; wet or dry hookah tobacco; chewing tobacco; cigarette products; cigar products; cigarillos;
本発明の1つの態様は、図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列に対して実質的に同一、望ましくは少なくとも70%同一である核酸配列を含む単離された遺伝的マーカーに関する。本発明のこの態様の望ましい実施形態においては、該核酸配列は、図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列の相補体にストリンジェントな条件下でハイブリダイズする配列を含む。他の望ましい実施形態においては、該核酸配列は構成的またはエチレンもしくは老化誘導性である。また、該核酸配列は、望ましくは、図1、図3および4、図10〜158、図160A〜160E、図162〜170ならびに図172-1〜172-19に示すアミノ酸配列と実質的に同一であるポリペプチドをコードする。 One embodiment of the present invention is directed to the nucleic acid sequences shown in FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and FIGS. 173-1 to 173-294. It relates to an isolated genetic marker comprising a nucleic acid sequence that is substantially identical, desirably at least 70% identical. In a preferred embodiment of this aspect of the invention, the nucleic acid sequence comprises: FIG. 1, FIGS. 3-7, FIGS. 10-158, FIGS. 162-170, FIGS. 172-1 to 172-19 and FIGS. 173-1 to 173 -294 contains a sequence that hybridizes under stringent conditions to the complement of the nucleic acid sequence shown in -294. In other desirable embodiments, the nucleic acid sequence is constitutive or ethylene or senescence-inducible. In addition, the nucleic acid sequence is desirably substantially the same as the amino acid sequence shown in FIGS. 1, 3 and 4, FIGS. 10 to 158, FIGS. 160A to 160E, FIGS. 162 to 170 and FIGS. 172-1 to 172-19. Which encodes a polypeptide which is
本発明の他の望ましい実施形態においては、該核酸配列は異種遺伝子に機能しうる形で連結されている。あるいは、該核酸配列は、誘導性、構成的、病原体もしくは創傷誘導性、環境もしくは発生調節性または細胞もしくは組織特異的プロモーターに機能しうる形で連結されている。 In other desirable embodiments of the invention, the nucleic acid sequence is operably linked to a heterologous gene. Alternatively, the nucleic acid sequence is operably linked to an inducible, constitutive, pathogen or wound-inducible, environmental or developmental regulatory or cell or tissue specific promoter.
もう1つの態様においては、本発明は、図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列を含有し、該核酸配列によりコードされるポリペプチドの発現を導きうる発現ベクターに関する。 In another embodiment, the invention provides the nucleic acid sequences shown in FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and FIGS. 173-1 to 173-294. And an expression vector capable of directing the expression of the polypeptide encoded by the nucleic acid sequence.
本発明の他の態様は、図1、図3および4、図10〜158、図160A〜160E、図162〜170または図172-1〜172-19に示すポリペプチドのアミノ酸配列を含有する実質的に純粋なポリペプチド、ならびに該ポリペプチドを特異的に認識する抗体に関する。 Other embodiments of the invention include a substance containing the amino acid sequence of the polypeptide shown in FIGS. 1, 3 and 4, FIGS. 10-158, FIGS. 160A-160E, FIGS. 162-170 or FIGS. 172-1 to 172-19. Purely polypeptides as well as antibodies that specifically recognize the polypeptides.
本発明のもう1つの態様は、植物または植物成分において発現される図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す単離された核酸配列を含有する該植物または該植物成分、または図1、図3および4、図10〜158、図160A〜160E、図162〜170ならびに図172-1〜172-19に示すアミノ酸配列と実質的に同一であるポリペプチドをコードし植物または植物成分において発現される核酸配列を含有する該植物または該植物成分に関する。望ましくは、該植物または植物成分は、Nicotiana種、例えば、表8に示すNicotiana種である。他の望ましい実施形態においては、該植物成分は葉、例えば乾燥したタバコ葉、茎または種子である。望ましい実施形態は、発芽種子からの植物に関する。 Another embodiment of the invention is shown in FIG. 1, FIGS. 3-7, FIGS. 10-158, FIGS. 162-170, FIGS. 172-1 to 172-19 and FIGS. 173-1 to 173 expressed in plants or plant components. The plant or plant component containing the isolated nucleic acid sequence shown in -294, or FIGS. 1, 3 and 4, FIGS. 10-158, FIGS. 160A-160E, FIGS. 162-170 and FIGS. 172-1-172 Relates to the plant or plant component containing a nucleic acid sequence encoding a polypeptide substantially identical to the amino acid sequence shown in -19 and expressed in the plant or plant component. Desirably, the plant or plant component is a Nicotiana species, such as the Nicotiana species shown in Table 8. In other desirable embodiments, the plant component is leaves, such as dried tobacco leaves, stems or seeds. A desirable embodiment relates to plants from germinated seeds.
もう1つの態様においては、本発明は、植物または植物成分において発現される図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す単離された核酸配列を含有する該植物または該植物成分を含有するタバコ製品に関する。望ましくは、該乾燥タバコ植物または植物成分における内因性遺伝子の発現はサイレンシングされている。他の望ましい実施形態においては、該タバコ製品は無煙タバコ製品、湿性もしくは乾燥かぎタバコ、噛みタバコ、巻きタバコ製品、葉巻製品、シガリーロ、パイプタバコまたはビーディ(bidi)が含まれる。特に、本発明のこの態様のタバコ製品は、いぶし(dark)タバコ、粉砕タバコを含有することが可能であり、あるいは香味成分を含みうる。 In another embodiment, the present invention relates to FIG. 1, FIGS. 3-7, FIGS. 10-158, FIGS. 162-170, FIGS. 172-1 to 172-19 and FIGS. 173-1 expressed in plants or plant components. It relates to a tobacco product containing the plant or the plant component containing the isolated nucleic acid sequence shown at ~ 173-294. Desirably, expression of an endogenous gene in the dried tobacco plant or plant component is silenced. In other desirable embodiments, the tobacco products include smokeless tobacco products, wet or dry hookah tobacco, chewing tobacco, cigarette products, cigar products, cigarillos, pipe tobacco or bidi. In particular, the tobacco product of this aspect of the invention can contain dark tobacco, ground tobacco, or can include a flavor component.
本発明のもう1つの態様は、植物細胞における構成的またはエチレン誘導性もしくは老化誘導性タバコポリペプチドの発現または酵素活性を低下させるための方法に関する。この方法は、植物細胞における内因性構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドのレベルまたは酵素活性を低下させることを含む。望ましい実施形態においては、該タバコポリペプチドはp450である。他の望ましい実施形態においては、該植物細胞は、Nicotiana種、例えば、表8に示すNicotiana種の1つに由来するものである。 Another aspect of the invention relates to a method for reducing constitutive or ethylene-induced or senescence-induced tobacco polypeptide expression or enzyme activity in plant cells. This method involves reducing the level of endogenous constitutive or ethylene or senescence-induced tobacco polypeptides or enzymatic activity in plant cells. In desirable embodiments, the tobacco polypeptide is p450. In other desirable embodiments, the plant cell is derived from a Nicotiana species, eg, one of the Nicotiana species shown in Table 8.
もう1つの望ましい実施形態においては、内因性構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドのレベルを低下させることは、図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列または図1、図3および4、図10〜158、図160A〜160E、図162〜170ならびに図172-1〜172-19に示すアミノ酸配列を含有するポリペプチドをコードする核酸配列のアンチセンス核酸分子をコードするトランスジーンを該植物細胞において発現させることを含む。もう1つの望ましい実施形態においては、該トランスジーンは、該植物細胞において構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコ核酸またはアミノ酸配列の二本鎖RNA分子をコードする。他の望ましい実施形態においては、該トランスジーンは、例えば、組織特異的、細胞特異的または器官特異的に発現される。また、内因性構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドのレベルを低下させることは、望ましくは、該植物細胞における該構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドの共抑制(co-suppression)を含む。もう1つの望ましい実施形態においては、内因性構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドのレベルを低下させることは、該植物細胞においてドミナントネガティブ遺伝子産物を発現させることを含む。望ましくは、内因性構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドは、図1、図3および4、図10〜158、図160A〜160E、図162〜170ならびに図172-1〜172-19に示すアミノ酸配列をコードする遺伝子内に変異を含む。他の望ましい実施形態においては、発現の低下は、転写レベル、翻訳レベルまたは翻訳後レベルにおいて生じる。 In another desirable embodiment, reducing the level of endogenous constitutive or ethylene or aging-inducing tobacco polypeptide is shown in FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172. -1 to 172-19 and the nucleic acid sequences shown in FIGS. 173-1 to 173-294 or FIG. 1, FIGS. 3 and 4, FIGS. 10 to 158, FIGS. 160A to 160E, FIGS. 162 to 170, and FIGS. Expressing in the plant cell a transgene encoding an antisense nucleic acid molecule of a nucleic acid sequence encoding a polypeptide comprising the amino acid sequence shown in 19. In another desirable embodiment, the transgene encodes a double-stranded RNA molecule of constitutive or ethylene or senescence-induced tobacco nucleic acid or amino acid sequence in the plant cell. In other desirable embodiments, the transgene is expressed, for example, tissue-specific, cell-specific or organ-specific. Also, reducing the level of endogenous constitutive or ethylene or senescence-inducing tobacco polypeptide desirably co-suppresses the constitutive or ethylene or senescence-inducing tobacco polypeptide in the plant cell. including. In another desirable embodiment, reducing the level of endogenous constitutive or ethylene or senescence-inducible tobacco polypeptide comprises expressing a dominant negative gene product in the plant cell. Desirably, endogenous constitutive or ethylene or senescence-inducing tobacco polypeptides are shown in FIGS. 1, 3 and 4, FIGS. 10-158, FIGS. 160A-160E, FIGS. 162-170 and FIGS. Mutations are included in the gene encoding the amino acid sequence shown. In other desirable embodiments, the decrease in expression occurs at the transcriptional, translational or post-translational level.
本発明のもう1つの態様は、植物細胞における構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドの発現または酵素活性を上昇させるための方法に関する。この方法は、該植物細胞における内因性構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドのレベルまたは酵素活性を上昇させることを含む。本発明のこの態様の望ましい実施形態においては、該植物細胞は、Nicotiana種、例えば、表8に示すNicotiana種に由来する。もう1つの望ましい実施形態においては、構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドのレベルを上昇させることは、図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列または図1、図3および4、図10〜158、図160A〜160E、図162〜170ならびに図172-1〜172-19に示すアミノ酸配列を含有するポリペプチドをコードする核酸配列を含むトランスジーンを該植物細胞において発現させることを含む。望ましくは、発現の上昇は、転写レベル、翻訳レベルまたは翻訳後レベルで生じる。 Another aspect of the invention relates to a method for increasing constitutive or ethylene or senescence-induced tobacco polypeptide expression or enzyme activity in plant cells. The method includes increasing endogenous constitutive or ethylene or senescence-induced tobacco polypeptide levels or enzyme activity in the plant cell. In desirable embodiments of this aspect of the invention, the plant cell is derived from a Nicotiana species, such as the Nicotiana species shown in Table 8. In another desirable embodiment, increasing the level of a constitutive or ethylene or senescence-inducing tobacco polypeptide is shown in FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1. ~ 172-19 and the nucleic acid sequences shown in Figures 173-1 to 173-294 or in Figures 1, 3 and 4, Figures 10 to 158, Figures 160A to 160E, Figures 162 to 170 and Figures 172-1 to 172-19 Expressing in the plant cell a transgene comprising a nucleic acid sequence encoding a polypeptide containing the amino acid sequence shown. Desirably, increased expression occurs at the transcriptional, translational or post-translational level.
本発明のもう1つの態様は、構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドの製造方法に関する。この方法は、(a)図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列を含有する単離された核酸分子で形質転換された細胞を準備し、(b)その単離された核酸分子の発現のための条件下、形質転換細胞を培養し、(c)該構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドを回収する工程を含む。望ましくは、該構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドはp450である。もう1つの望ましい実施形態においては、本発明は、本発明のこの態様の方法に従い製造された組換え構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドに関する。 Another aspect of the invention relates to a method for producing a constitutive or ethylene or aging-inducing tobacco polypeptide. This method comprises (a) a single nucleic acid sequence comprising the nucleic acid sequences shown in FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and FIGS. 173-1 to 173-294. Preparing a cell transformed with the released nucleic acid molecule, (b) culturing the transformed cell under conditions for expression of the isolated nucleic acid molecule, and (c) the constitutive or ethylene or senescence Recovering the inducible tobacco polypeptide. Desirably, the constitutive or ethylene or aging-inducing tobacco polypeptide is p450. In another desirable embodiment, the present invention relates to a recombinant constitutive or ethylene or senescence-inducing tobacco polypeptide produced according to the method of this aspect of the invention.
もう1つの態様においては、本発明は、構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドまたはその断片を単離するための方法に関する。この方法は、図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列またはその一部を、図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す核酸配列に対して少なくとも70%以上の配列同一性を有する核酸配列の検出をもたらすハイブリダイゼーション条件下、植物細胞からの核酸調製物と接触させ、(b)ハイブリダイズする核酸配列を単離する工程を含む。望ましくは、該構成的またはエチレンもしくは老化誘導性タバコポリペプチドはp450である。 In another aspect, the invention relates to a method for isolating a constitutive or ethylene or senescence-inducing tobacco polypeptide or fragment thereof. In this method, the nucleic acid sequence shown in FIG. 1, FIGS. 3 to 7, FIGS. 10 to 158, FIGS. 162 to 170, FIGS. 172-1 to 172-19 and FIGS. 1, at least 70% sequence identity to the nucleic acid sequences shown in FIGS. 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and FIGS. 173-1 to 173-294 Contacting with a nucleic acid preparation from a plant cell under hybridization conditions that result in the detection of the nucleic acid sequence having (b) isolating the hybridizing nucleic acid sequence. Desirably, the constitutive or ethylene or aging-inducing tobacco polypeptide is p450.
本発明のもう1つの態様は、ニコチンデメチラーゼをコードするヌクレオチド配列を含有する単離された核酸分子、例えばDNA配列に関する。望ましい実施形態においては、第1の態様のヌクレオチド配列は、例えば、配列番号4もしくは配列番号5のヌクレオチド配列に対して少なくとも70%同一である又は配列番号4のヌクレオチド2010-2949および/もしくは3947-4562を含有する又は配列番号4もしくは配列番号5の配列を含有するヌクレオチド配列を含有するタバコニコチンデメチラーゼのように、タバコニコチンデメチラーゼをコードするヌクレオチド配列と実質的に同一である。本発明の第1の態様の単離された核酸分子は、例えば、植物細胞内で機能的なプロモーターに機能しうる形で連結されており、望ましくは、発現ベクター内に含有されている。他の望ましい実施形態においては、該発現ベクターは細胞、例えば植物細胞内に含有されている。望ましくは、該植物細胞、例えばタバコ植物細胞が植物内に含まれている。もう1つの望ましい実施形態においては、本発明は、異種プロモーター配列に機能しうる形で連結された配列番号4の配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズする単離された核酸分子を含む、発現ベクターを含有する植物からの種子、例えばタバコ種子に関する。さらに、本発明は、該発現ベクターを含有する発芽種子に由来する植物、該植物に由来する葉(緑葉または乾燥葉)、および該葉に由来する製造品に関する。 Another aspect of the invention relates to an isolated nucleic acid molecule, such as a DNA sequence, containing a nucleotide sequence encoding nicotine demethylase. In desirable embodiments, the nucleotide sequence of the first aspect is, for example, at least 70% identical to the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 5 or nucleotides 2010-2949 and / or 3947- of SEQ ID NO: 4 The nucleotide sequence encoding tobacco nicotine demethylase is substantially identical, such as tobacco nicotine demethylase containing 4562 or containing a nucleotide sequence containing the sequence of SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 5. The isolated nucleic acid molecule of the first aspect of the present invention is operably linked to a promoter that is functional in, for example, a plant cell, and is desirably contained in an expression vector. In other desirable embodiments, the expression vector is contained within a cell, eg, a plant cell. Desirably, the plant cells, such as tobacco plant cells, are contained within the plant. In another desirable embodiment, the present invention comprises an isolated nucleic acid molecule that hybridizes under stringent conditions to the sequence of SEQ ID NO: 4 operably linked to a heterologous promoter sequence. It relates to seeds from plants containing the vector, for example tobacco seeds. Furthermore, the present invention relates to a plant derived from a germinated seed containing the expression vector, a leaf (green leaf or dried leaf) derived from the plant, and a product derived from the leaf.
もう1つの望ましい実施形態においては、該ヌクレオチド配列は、配列番号4および/もしくは配列番号5のヌクレオチド配列の相補体または配列番号4もしくは配列番号5の断片にストリンジェントな条件下でハイブリダイズする配列を含有する。望ましくは、該ヌクレオチド配列は、配列番号3のアミノ酸配列と実質的に同一であるニコチンデメチラーゼをコードする。本発明の第1の態様のもう1つの望ましい実施形態においては、ニコチンデメチラーゼは、配列番号3のニコチンデメチラーゼアミノ酸配列に対して、または該完全長ポリペプチドと比べて変化(例えば低下)した酵素活性を有するニコチンデメチラーゼの断片に対して、少なくとも70%のアミノ酸配列同一性を有する。望ましくは、ニコチンデメチラーゼは配列番号3のアミノ酸配列を含む。 In another desirable embodiment, the nucleotide sequence is a sequence that hybridizes under stringent conditions to the complement of the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 4 and / or SEQ ID NO: 5 or a fragment of SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 5 Containing. Desirably, the nucleotide sequence encodes a nicotine demethylase that is substantially identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3. In another desirable embodiment of the first aspect of the invention, the nicotine demethylase is altered (eg, reduced) relative to the nicotine demethylase amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 or relative to the full-length polypeptide. It has at least 70% amino acid sequence identity to a fragment of nicotine demethylase having enzymatic activity. Desirably, the nicotine demethylase comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3.
もう1つの態様においては、本発明は、配列番号8の配列またはその断片にストリンジェントな条件下でハイブリダイズし転写を駆動するプロモーターを含有する単離された核酸分子に関する。望ましくは、該プロモーターは、(i)エチレンでの処理後または老化過程で誘導され、(ii)(a)配列番号4の塩基対1-2009、または(b)配列番号4の塩基対1-2009により定められる配列の200個の連続的塩基対と同一の少なくとも200個の連続的塩基対、または(c)配列番号4の塩基対1-2009に記載されている配列の連続的な20塩基対部分と配列において同一である20塩基対ヌクレオチド部分を含む。 In another embodiment, the present invention relates to an isolated nucleic acid molecule containing a promoter that hybridizes under stringent conditions to the sequence of SEQ ID NO: 8 or a fragment thereof and drives transcription. Desirably, the promoter is (i) induced after treatment with ethylene or during senescence, (ii) (a) base pair 1-2009 of SEQ ID NO: 4, or (b) base pair 1- 1 of SEQ ID NO: 4. At least 200 contiguous base pairs identical to 200 contiguous base pairs of the sequence defined by 2009, or (c) 20 contiguous bases of the sequence set forth in base pair 1-2009 of SEQ ID NO: 4 Contains a 20 base pair nucleotide portion that is identical in sequence to the paired portion.
本発明のもう1つの態様は、配列番号8の配列に対して50%以上の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含有する単離された核酸プロモーターに関する。望ましくは、この単離された核酸プロモーターはエチレンでの処理後または老化過程で誘導され、例えば、配列番号8の配列を含む。あるいは、プロモーターは、異種遺伝子の転写を駆動する又はニコチンデメチラーゼ酵素活性を低下もしくは変化させる(例えば、遺伝子発現をサイレンシングする)、配列番号8から入手可能な断片を含みうる。望ましい実施形態においては、該プロモーター配列は、異種核酸配列に機能しうる形で連結されており、あるいは例えば発現ベクター内に含有されうる。他の望ましい実施形態においては、該発現ベクターは細胞、例えば植物細胞内に含有されている。望ましくは、該植物細胞、例えばタバコ植物細胞が植物内に含まれている。もう1つの望ましい実施形態においては、本発明は、異種核酸配列に機能しうる形で連結された配列番号8の配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズする単離された核酸分子を含む、発現ベクターを含有する植物からの種子、例えばタバコ種子に関する。さらに、本発明は、本発明のこの態様のプロモーターを含有する発芽種子に由来する植物、該植物に由来する葉(緑葉または乾燥葉)、および該葉に由来する製造品に関する。 Another aspect of the invention relates to an isolated nucleic acid promoter containing a nucleotide sequence having 50% or more sequence identity to the sequence of SEQ ID NO: 8. Desirably, the isolated nucleic acid promoter is derived after treatment with ethylene or during senescence and comprises, for example, the sequence of SEQ ID NO: 8. Alternatively, the promoter can comprise a fragment obtainable from SEQ ID NO: 8 that drives transcription of a heterologous gene or reduces or alters nicotine demethylase enzyme activity (eg, silences gene expression). In desirable embodiments, the promoter sequence is operably linked to a heterologous nucleic acid sequence, or may be contained, for example, in an expression vector. In other desirable embodiments, the expression vector is contained within a cell, eg, a plant cell. Desirably, the plant cells, such as tobacco plant cells, are contained within the plant. In another desirable embodiment, the invention comprises an isolated nucleic acid molecule that hybridizes under stringent conditions to the sequence of SEQ ID NO: 8 operably linked to a heterologous nucleic acid sequence. It relates to seeds from plants containing the vector, for example tobacco seeds. Furthermore, the present invention relates to a plant derived from a germinated seed containing the promoter of this aspect of the present invention, a leaf (green leaf or dried leaf) derived from the plant, and a product derived from the leaf.
本発明のもう1つの態様は、植物において異種遺伝子を発現させるための方法に関する。これは、(i)異種核酸配列に機能しうる形で連結された配列番号8の配列に対して50%以上の配列同一性を有するプロモーター配列を含有するベクターを植物細胞内に導入し、(ii)該細胞から植物を再生させることを含む。また、この方法は、該ベクターを後代へ性的に伝達させることを含むことが可能であり、更に、該後代により産生された種子を集める工程を含むことが可能である。 Another aspect of the invention relates to a method for expressing a heterologous gene in a plant. This comprises (i) introducing into a plant cell a vector containing a promoter sequence having 50% or more sequence identity to the sequence of SEQ ID NO: 8 operably linked to a heterologous nucleic acid sequence; ii) including regenerating plants from the cells. The method can also include sexually transmitting the vector to progeny, and can further include collecting seed produced by the progeny.
更にもう1つの態様においては、本発明は、タバコ植物におけるニコチンデメチラーゼの発現を低下させるための方法に関する。この方法は、(i)異種核酸配列に機能しうる形で連結された配列番号8の配列または配列番号8から入手可能な断片を含有するベクターをタバコ植物内に導入し、(ii)該タバコ植物において該ベクターを発現させる工程を含む。この方法の望ましい実施形態においては、ニコチンデメチラーゼの発現がサイレンシングされる。他の望ましい実施形態においては、該ベクターはRNA、例えばアンチセンスRNA、またはRNA干渉(RNAi)を誘導しうるRNA分子を発現する。 In yet another aspect, the present invention relates to a method for reducing the expression of nicotine demethylase in tobacco plants. This method comprises (i) introducing into a tobacco plant a vector containing a sequence of SEQ ID NO: 8 or a fragment obtainable from SEQ ID NO: 8 operably linked to a heterologous nucleic acid sequence; Expressing the vector in a plant. In a preferred embodiment of this method, the expression of nicotine demethylase is silenced. In other desirable embodiments, the vector expresses RNA, such as antisense RNA, or RNA molecules that can induce RNA interference (RNAi).
もう1つの望ましい態様においては、本発明は、ニコチンデメチラーゼ酵素活性を低下もしくは変化させる(例えば遺伝子発現をサイレンシングする)またはニコチンデメチラーゼ核酸配列の特定のための分子マーカーとして働きうる、配列番号7の配列またはその断片にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするイントロンを含有する単離された核酸分子に関する。望ましい実施形態においては、該イントロンは、(a)配列番号4の塩基対2950-3946、または(b)配列番号4の塩基対2950-3946により定められる配列の200個の連続的塩基対と同一の少なくとも200個の連続的塩基対、または(c)配列番号4の塩基対2950-3946に記載されている配列の連続的な20塩基対部分と配列において同一である20塩基対ヌクレオチド部分を含む。 In another desirable embodiment, the present invention provides SEQ ID NO: which can reduce or alter nicotine demethylase enzyme activity (eg, silence gene expression) or serve as a molecular marker for identification of nicotine demethylase nucleic acid sequences. It relates to an isolated nucleic acid molecule containing an intron that hybridizes under stringent conditions to a sequence of 7 or a fragment thereof. In a preferred embodiment, the intron is identical to 200 consecutive base pairs of the sequence defined by (a) base pairs 2950-3946 of SEQ ID NO: 4, or (b) base pairs 2950-3946 of SEQ ID NO: 4 At least 200 contiguous base pairs, or (c) a 20 base pair nucleotide portion that is identical in sequence to the contiguous 20 base pair portion of the sequence set forth in base pair 2950-3946 of SEQ ID NO: 4 .
本発明のもう1つの望ましい態様は、ニコチンデメチラーゼ酵素活性を低下もしくは変化させる(例えば遺伝子発現をサイレンシングする)またはニコチンデメチラーゼ核酸配列の特定のための分子マーカーとして働きうる、配列番号7の配列またはその断片に対して50%以上の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含む単離された核酸イントロンに関する。遺伝子発現をサイレンシングすることは、例えば、相同組換え(例えば、配列番号188の配列またはその断片を使用するもの)、またはニコチンデメチラーゼ活性を有さない遺伝子産物を与える変異を含みうる。特に、該イントロンは配列番号7の配列または配列番号7から入手可能な断片を含みうる。望ましくは、イントロンを含む単離された核酸分子は異種核酸配列に機能しうる形で連結されており、この配列は、望ましくは、発現ベクター内に含有されうる。もう1つの実施形態においては、該発現ベクターは細胞、例えば植物細胞内に含有されている。特に、該細胞はタバコ細胞でありうる。発現ベクター内で異種核酸配列に機能しうる形で連結された配列番号7の配列または配列番号7から入手可能な断片を含有する植物細胞植物などの植物、例えばタバコ植物は、本発明のもう1つの望ましい実施形態である。更に、異種核酸配列に機能しうる形で連結された配列番号7にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするイントロンを含有する、植物からの種子、例えばタバコ種子も望ましい。更に、本発明は、本発明のこの態様のイントロンを含有する発芽種子に由来する植物、該植物に由来する葉(緑葉または乾燥葉)、および該緑葉または乾燥葉から製造された製造品に関する。 Another desirable embodiment of the invention is that of SEQ ID NO: 7 that can serve as a molecular marker for reducing or altering nicotine demethylase enzyme activity (eg, silencing gene expression) or for identifying nicotine demethylase nucleic acid sequences. It relates to an isolated nucleic acid intron comprising a nucleotide sequence having 50% or more sequence identity to the sequence or a fragment thereof. Silencing gene expression can include, for example, homologous recombination (eg, using the sequence of SEQ ID NO: 188 or a fragment thereof), or a mutation that results in a gene product that does not have nicotine demethylase activity. In particular, the intron may comprise the sequence of SEQ ID NO: 7 or a fragment obtainable from SEQ ID NO: 7. Desirably, the isolated nucleic acid molecule containing the intron is operably linked to a heterologous nucleic acid sequence, which sequence can desirably be contained within an expression vector. In another embodiment, the expression vector is contained within a cell, eg, a plant cell. In particular, the cell can be a tobacco cell. A plant, such as a plant plant, containing a sequence of SEQ ID NO: 7 or a fragment obtainable from SEQ ID NO: 7 operably linked to a heterologous nucleic acid sequence in an expression vector, such as a tobacco plant, is another aspect of the invention. One preferred embodiment. In addition, seeds from plants, such as tobacco seeds, containing introns that hybridize under stringent conditions to SEQ ID NO: 7 operably linked to heterologous nucleic acid sequences are also desirable. Furthermore, the present invention relates to a plant derived from the germinated seed containing the intron of this aspect of the present invention, a leaf (green leaf or dried leaf) derived from the plant, and a product manufactured from the green leaf or dried leaf.
本発明のもう1つの態様は、植物においてイントロンを発現させるための方法に関する。この方法は、(i)異種核酸配列に機能しうる形で連結された配列番号7の配列または配列番号7から入手可能な断片を含有するベクターを植物細胞内に導入し、(ii)該細胞から植物を再生させることを含む。望ましい実施形態においては、この方法は、(iii)該ベクターを後代へ性的に伝達させることを含むことが可能であり、該後代により産生された種子を集める工程を含むことが可能である。該方法は、望ましくは、例えば、発芽種子から植物を再生させること、該植物に由来する葉(緑葉または乾燥葉)、および該葉に由来する製造品の製造方法を含む。 Another aspect of the invention relates to a method for expressing an intron in a plant. This method comprises (i) introducing a vector containing a sequence of SEQ ID NO: 7 or a fragment obtainable from SEQ ID NO: 7 operably linked to a heterologous nucleic acid sequence into a plant cell; Including regenerating plants from. In desirable embodiments, the method can include (iii) sexually transferring the vector to progeny and collecting seed produced by the progeny. The method desirably includes, for example, regenerating a plant from germinated seeds, a leaf (green leaf or dried leaf) derived from the plant, and a method for producing a product derived from the leaf.
更にもう1つの態様においては、本発明は、タバコ植物におけるニコチンデメチラーゼの発現を低下させるための方法に関する。この方法は、(i)異種核酸配列に機能しうる形で連結された配列番号7の配列または配列番号7から入手可能な断片を含有するベクターをタバコ植物内に導入し、(ii)該タバコ植物において該ベクターを発現させる工程を含む。この方法の望ましい実施形態においては、ニコチンデメチラーゼの発現がサイレンシングされる。他の望ましい実施形態においては、該ベクターはRNA、例えばアンチセンスRNA、またはRNA干渉(RNAi)を誘導しうるRNA分子を発現する。 In yet another aspect, the present invention relates to a method for reducing the expression of nicotine demethylase in tobacco plants. This method comprises (i) introducing into a tobacco plant a vector containing a sequence of SEQ ID NO: 7 or a fragment obtainable from SEQ ID NO: 7 operably linked to a heterologous nucleic acid sequence; Expressing the vector in a plant. In a preferred embodiment of this method, the expression of nicotine demethylase is silenced. In other desirable embodiments, the vector expresses RNA, such as antisense RNA, or RNA molecules that can induce RNA interference (RNAi).
もう1つの望ましい態様においては、本発明は、遺伝子の発現パターンを変化させニコチンデメチラーゼ酵素活性を低下もしくは変化させうる(例えば遺伝子発現をサイレンシングする)またはニコチンデメチラーゼ核酸配列の特定のためのマーカーとして使用されうる、配列番号9の配列またはその断片にストリンジェントな条件下でハイブリダイズする非翻訳領域を含有する単離された核酸分子に関する。本発明のこの態様の望ましい実施形態においては、該非翻訳領域は、(a)配列番号4の塩基対4563-6347、または(b)配列番号4の塩基対4563-6347により定められる配列の200個の連続的塩基対と同一の少なくとも200個の連続的塩基対、または(c)配列番号4の塩基対4563-6347に記載されている配列の連続的な20塩基対部分と配列において同一である20塩基対ヌクレオチド部分を含む。 In another desirable embodiment, the present invention can alter the expression pattern of a gene to reduce or alter nicotine demethylase enzyme activity (eg, silence gene expression) or for identification of a nicotine demethylase nucleic acid sequence. It relates to an isolated nucleic acid molecule containing an untranslated region that hybridizes under stringent conditions to the sequence of SEQ ID NO: 9 or a fragment thereof that can be used as a marker. In a preferred embodiment of this aspect of the invention, the untranslated region comprises 200 of the sequence defined by (a) base pairs 4563-6347 of SEQ ID NO: 4, or (b) base pairs 4563-6347 of SEQ ID NO: 4 At least 200 contiguous base pairs identical to the contiguous base pairs of (c), or (c) identical in sequence to a contiguous 20 base pair portion of the sequence set forth in base pairs 4563-6347 of SEQ ID NO: 4 Contains a 20 base pair nucleotide moiety.
本発明のもう1つの望ましい態様は、配列番号9の配列またはその断片に対して50%以上の配列同一性を有するヌクレオチド配列を含有する単離された核酸非翻訳領域に関する。望ましくは、該非翻訳領域は配列番号9の配列を含み、該非翻訳領域は、遺伝子の発現パターンを変化させニコチンデメチラーゼ酵素活性を低下もしくは変化させる(例えば遺伝子発現をサイレンシングする)またはニコチンデメチラーゼ核酸配列の特定のためのマーカーとして使用されうる、配列番号9から入手可能な断片を含む。該非翻訳領域は、望ましくは、異種核酸配列に機能しうる形で連結されており、発現ベクター内に含有されうる。更に、この発現ベクターは、望ましくは、細胞、例えば植物細胞、例えばタバコ細胞内に含有されている。本発明のもう1つの望ましい実施形態は、配列番号9の配列に対して50%以上の配列同一性を有し異種核酸配列に機能しうる形で連結された単離された核酸配列を含むベクターを含有する植物細胞植物などの植物、例えばタバコ植物に関する。 Another desirable embodiment of the present invention relates to an isolated nucleic acid untranslated region containing a nucleotide sequence having 50% or more sequence identity to the sequence of SEQ ID NO: 9 or a fragment thereof. Desirably, the untranslated region comprises the sequence of SEQ ID NO: 9, and the untranslated region alters the expression pattern of the gene to reduce or alter nicotine demethylase enzyme activity (eg, silence gene expression) or nicotine demethylase Includes fragments available from SEQ ID NO: 9 that can be used as markers for identification of nucleic acid sequences. The untranslated region is desirably operably linked to a heterologous nucleic acid sequence and can be contained within an expression vector. Furthermore, the expression vector is desirably contained within a cell, such as a plant cell, such as a tobacco cell. Another desirable embodiment of the present invention is a vector comprising an isolated nucleic acid sequence operably linked to a heterologous nucleic acid sequence having at least 50% sequence identity to the sequence of SEQ ID NO: 9 Plants such as plant cell plants containing, for example, tobacco plants.
本発明はまた、異種核酸配列に機能しうる形で連結された配列番号9にストリンジェントな条件下でハイブリダイズする非翻訳領域を含む、植物からの種子、例えばタバコ種子に関する。更に、本発明は、本発明のこの態様の非翻訳領域を含有する発芽種子に由来する植物、該植物に由来する葉(緑葉または乾燥葉)、および該緑葉または乾燥葉から製造された製造品に関する。 The invention also relates to seeds from plants, such as tobacco seeds, comprising untranslated regions that hybridize under stringent conditions to SEQ ID NO: 9 operably linked to heterologous nucleic acid sequences. Furthermore, the present invention relates to a plant derived from germinated seeds containing the untranslated region of this aspect of the present invention, a leaf (green leaf or dried leaf) derived from the plant, and a product manufactured from the green leaf or dried leaf. About.
もう1つの態様においては、本発明は、植物において非翻訳領域を発現させるための方法に関する。この方法は、(i)配列番号9の配列に対して50%以上の配列同一性を有し異種核酸配列に機能しうる形で連結された単離された核酸配列を含有するベクターを植物細胞内に導入し、(ii)該細胞から植物を再生させることを含む。また、この方法は、(iii)該ベクターを後代へ性的に伝達させることを含むことが可能であり、望ましくは、該後代により産生された種子を集める追加的工程を含むことが可能である。該方法は、望ましくは、例えば、発芽種子から植物を再生させること、該植物に由来する葉(緑葉または乾燥葉)、および該緑葉または乾燥葉から製造される製造品の製造方法を含む。 In another aspect, the present invention relates to a method for expressing an untranslated region in a plant. This method comprises: (i) a vector containing an isolated nucleic acid sequence having a sequence identity of 50% or more to the sequence of SEQ ID NO: 9 and operably linked to a heterologous nucleic acid sequence. And (ii) regenerating a plant from the cell. The method can also include (iii) sexually transmitting the vector to progeny, and desirably including an additional step of collecting seed produced by the progeny. . The method desirably includes, for example, regenerating a plant from a germinated seed, a leaf (green leaf or dried leaf) derived from the plant, and a method for producing a product manufactured from the green leaf or dried leaf.
更に、本発明は、タバコ植物におけるニコチンデメチラーゼの発現を低下または変化させるための方法に関する。この方法は、(i)配列番号9の配列に対して50%以上の配列同一性を有し異種核酸配列に機能しうる形で連結された単離された核酸配列を含有するベクターをタバコ植物内に導入し、(ii)該タバコ植物において該ベクターを発現させる工程を含む。望ましくは、ニコチンデメチラーゼの発現がサイレンシングされる。他の望ましい実施形態においては、該ベクターはRNA、例えばアンチセンスRNA、またはRNA干渉(RNAi)を誘導しうるRNA分子を発現する。 Furthermore, the present invention relates to a method for reducing or altering the expression of nicotine demethylase in tobacco plants. This method comprises (i) a vector comprising an isolated nucleic acid sequence operably linked to a heterologous nucleic acid sequence having a sequence identity of 50% or more to the sequence of SEQ ID NO: 9 in tobacco plants. And (ii) expressing the vector in the tobacco plant. Desirably, the expression of nicotine demethylase is silenced. In other desirable embodiments, the vector expresses RNA, such as antisense RNA, or RNA molecules that can induce RNA interference (RNAi).
本発明のもう1つの態様は、該単離核酸分子によりコードされるニコチンデメチラーゼの発現を導きうる、ニコチンデメチラーゼをコードするヌクレオチド配列を含有する核酸分子を含む発現ベクターに関する。望ましくは、該ベクターは配列番号4または配列番号5の配列を含む。他の望ましい実施形態においては、本発明は、ニコチンを脱メチル化するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含有する核酸分子を含む、植物または植物成分、例えばタバコ植物または植物成分(例えば、タバコ葉または茎)に関する。 Another aspect of the invention relates to an expression vector comprising a nucleic acid molecule comprising a nucleotide sequence encoding nicotine demethylase that can direct expression of the nicotine demethylase encoded by the isolated nucleic acid molecule. Desirably, the vector comprises the sequence of SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 5. In other desirable embodiments, the present invention provides a plant or plant component, such as a tobacco plant or plant component (e.g., tobacco leaf or plant) comprising a nucleic acid molecule that contains a nucleotide sequence encoding a polypeptide that demethylates nicotine. Stem).
本発明のもう1つの態様は、ニコチンデメチラーゼをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子を含有する細胞に関する。望ましくは、この細胞は植物細胞または細菌細胞、例えばAgrobacteriumである。 Another aspect of the present invention relates to a cell containing an isolated nucleic acid molecule comprising a nucleotide sequence encoding nicotine demethylase. Desirably, the cell is a plant cell or a bacterial cell, such as Agrobacterium.
本発明のもう1つの態様は、植物または植物成分において発現される、ニコチンデメチラーゼをコードする単離された核酸分子を含有する該植物または該植物成分(例えば、タバコ葉または茎)に関する。望ましくは、該植物または植物成分は被子植物、双子葉植物、ナス科植物、またはNicotiana種である。この態様の他の望ましい実施形態は、種子または該植物または植物成分からの細胞、ならびに該植物に由来する葉(緑葉または乾燥葉)、およびそれらから製造された製造品である。 Another aspect of the invention relates to the plant or plant component (eg, tobacco leaf or stem) containing an isolated nucleic acid molecule encoding nicotine demethylase expressed in the plant or plant component. Desirably, the plant or plant component is an angiosperm, a dicotyledonous plant, a solanaceous plant, or a Nicotiana species. Other desirable embodiments of this aspect are seeds or cells from the plant or plant component, as well as leaves (green leaves or dry leaves) derived from the plants, and articles made therefrom.
もう1つの態様においては、本発明は、例えば、配列番号3の配列を含みニコチンを脱メチル化するようなポリペプチドをコードする核酸配列の発現の低下を伴うタバコ植物に関する。ここで、該発現低下(または酵素活性の低下)は該植物内のノルニコチンのレベルを低下させる。望ましい実施形態においては、該タバコ植物はトランスジェニック植物、例えば、該トランスジェニック植物において発現されると内因性タバコニコチンデメチラーゼの遺伝子発現をサイレンシングするトランスジーンを含むものである。 In another embodiment, the present invention relates to a tobacco plant with reduced expression of a nucleic acid sequence encoding a polypeptide that includes, for example, the sequence of SEQ ID NO: 3 and demethylates nicotine. Here, the decreased expression (or decreased enzyme activity) decreases the level of nornicotine in the plant. In desirable embodiments, the tobacco plant comprises a transgenic plant, eg, a transgene that silences gene expression of endogenous tobacco nicotine demethylase when expressed in the transgenic plant.
特に、該トランスジェニック植物は、望ましくは、以下のうちの1以上を含む:タバコニコチンデメチラーゼのアンチセンス分子またはRNA干渉(RNAi)を誘導しうるRNA分子を発現するトランスジーン;トランスジェニック植物において発現されるとタバコニコチンデメチラーゼの発現を共抑制するトランスジーン;ドミナントネガティブ遺伝子産物、例えば、配列番号3のアミノ酸配列の変異形態をコードするトランスジーン;配列番号3のアミノ酸配列をコードする遺伝子内の点変異;タバコニコチンデメチラーゼをコードする遺伝子内の欠失;およびタバコニコチンデメチラーゼをコードする遺伝子内の挿入。 In particular, the transgenic plant desirably comprises one or more of the following: a tobacco nicotine demethylase antisense molecule or a transgene expressing an RNA molecule capable of inducing RNA interference (RNAi); A transgene that, when expressed, co-suppresses tobacco nicotine demethylase expression; a dominant negative gene product, eg, a transgene that encodes a variant form of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3; within a gene that encodes the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 Point mutations; deletions in the gene encoding tobacco nicotine demethylase; and insertions in the gene encoding tobacco nicotine demethylase.
他の望ましい実施形態においては、ポリペプチドをコードする核酸配列の発現の低下は転写レベル、翻訳レベルまたは翻訳後レベルで生じる。 In other desirable embodiments, the reduction in expression of the nucleic acid sequence encoding the polypeptide occurs at the transcriptional, translational or post-translational level.
本発明のもう1つの態様は、自身のゲノム内に安定に組込まれた組換え発現カセットを含有するタバコ植物に関する。ここで、該カセットは、ニコチンデメチラーゼ活性の低下をもたらしうる。このタバコ植物の種子は、望ましい実施形態における主題である。他の望ましい実施形態は、この植物に由来する葉(緑葉または乾燥葉)およびそれらに由来する製造品を含む。 Another aspect of the invention relates to tobacco plants containing a recombinant expression cassette that is stably integrated into its genome. Here, the cassette may result in a decrease in nicotine demethylase activity. This tobacco plant seed is the subject in a preferred embodiment. Other desirable embodiments include leaves derived from this plant (green leaves or dry leaves) and articles derived therefrom.
本発明のもう1つの態様は、植物においてタバコニコチンデメチラーゼを発現させるための方法に関する。この方法は、(i)ニコチンデメチラーゼをコードするヌクレオチド配列を含有する核酸分子を含む発現ベクターを植物細胞内に導入し、(ii)該細胞から植物を再生させることを含む。望ましい実施形態においては、この方法は、該ベクターを後代へ性的に伝達させることを含み、望ましくは、該後代により産生された種子を集める追加的工程をも含む。更なる望ましい実施携帯は、該発芽種子に由来する植物、該植物に由来する葉(緑葉または乾燥葉)、および該緑葉または乾燥葉から製造される製造品を含む。 Another aspect of the invention relates to a method for expressing tobacco nicotine demethylase in a plant. The method includes (i) introducing an expression vector containing a nucleic acid molecule containing a nucleotide sequence encoding nicotine demethylase into a plant cell, and (ii) regenerating the plant from the cell. In desirable embodiments, the method includes sexually transferring the vector to progeny, and desirably also includes an additional step of collecting seed produced by the progeny. Further desirable implementations include plants derived from the germinated seeds, leaves derived from the plants (green leaves or dried leaves), and manufactured articles made from the green leaves or dried leaves.
本発明のもう1つの態様は、実質的に純粋なタバコニコチンデメチラーゼに関する。望ましくは、このタバコニコチンデメチラーゼは、配列番号3のアミノ酸配列に対して少なくとも70%の同一性を有するアミノ酸配列を含み、または配列番号3のアミノ酸配列を含む。望ましい実施形態においては、該タバコニコチンデメチラーゼは、植物細胞内で発現されると、ニコチンをノルニコチンへ変換する。他の望ましい実施形態においては、該タバコニコチンデメチラーゼは、植物細胞内で発現されると、主として葉に局在化し、あるいは該タバコニコチンデメチラーゼはエチレンにより誘導され、または植物の老化過程で発現される。 Another aspect of the invention relates to substantially pure tobacco nicotine demethylase. Desirably, the tobacco nicotine demethylase comprises an amino acid sequence having at least 70% identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3, or comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3. In desirable embodiments, the tobacco nicotine demethylase converts nicotine to nornicotine when expressed in plant cells. In other desirable embodiments, the tobacco nicotine demethylase is primarily localized to the leaf when expressed in plant cells, or the tobacco nicotine demethylase is induced by ethylene or expressed during plant senescence. Is done.
もう1つの態様においては、本発明は、タバコニコチンデメチラーゼを特異的に認識しそれに結合する実質的に純粋な抗体に関する。望ましくは、該抗体は組換えタバコニコチンデメチラーゼ(例えば、配列番号3の配列またはその断片を含有するもの)を認識し、それに結合する。 In another embodiment, the present invention relates to a substantially pure antibody that specifically recognizes and binds to tobacco nicotine demethylase. Desirably, the antibody recognizes and binds to a recombinant tobacco nicotine demethylase (eg, one containing the sequence of SEQ ID NO: 3 or a fragment thereof).
本発明のもう1つの態様はタバコニコチンデメチラーゼの製造方法に関する。この方法は、(a)ニコチンを脱メチル化するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含有する単離された核酸分子で形質転換された細胞を準備し、(b)その単離された核酸分子を発現させるための条件下、該形質転換細胞を培養し、(c)タバコニコチンデメチラーゼを回収する工程を含む。本発明はまた、この方法により製造された組換えタバコニコチンデメチラーゼに関する。 Another embodiment of the present invention relates to a method for producing tobacco nicotine demethylase. This method comprises (a) preparing a cell transformed with an isolated nucleic acid molecule containing a nucleotide sequence encoding a polypeptide that demethylates nicotine, and (b) preparing the isolated nucleic acid molecule Culturing the transformed cell under conditions for expression and (c) recovering tobacco nicotine demethylase. The invention also relates to a recombinant tobacco nicotine demethylase produced by this method.
もう1つの態様においては、本発明は、タバコニコチンデメチラーゼまたはその断片を単離するための方法に関する。この方法は、(a)配列番号4、5、7、8または9の核酸配列に対して少なくとも70%またはそれ以上の配列同一性を有する核酸配列に示す核酸配列に対して少なくとも70%以上の配列同一性を有する核酸配列の検出をもたらすハイブリダイゼーション条件下、配列番号4、5、7、8もしくは9またはそれらの一部の核酸分子を植物細胞からの核酸調製物と接触させ、(b)ハイブリダイズする核酸配列を単離する工程を含む。 In another embodiment, the present invention relates to a method for isolating tobacco nicotine demethylase or a fragment thereof. This method comprises: (a) at least 70% or more of the nucleic acid sequence shown in the nucleic acid sequence having at least 70% or more sequence identity to the nucleic acid sequence of SEQ ID NO: 4, 5, 7, 8 or 9 Contacting a nucleic acid molecule of SEQ ID NO: 4, 5, 7, 8 or 9 or a portion thereof with a nucleic acid preparation from a plant cell under hybridization conditions that result in the detection of a nucleic acid sequence having sequence identity; (b) Isolating the hybridizing nucleic acid sequence.
もう1つの態様においては、本発明は、タバコニコチンデメチラーゼまたはその断片を単離するためのもう1つの方法に関する。この方法は、(a)植物細胞DNAのサンプル準備し、(b)配列番号4、5、7、8または9の配列を有する核酸分子の領域に対して配列同一性を有するオリゴヌクレオチドのペアを準備し、(c)ポリメラーゼ連鎖反応によるDNA増幅に適した条件下、オリゴヌクレオチドのペアを該植物細胞DNAと接触させ、(d)増幅されたタバコニコチンデメチラーゼまたはその断片を単離する工程を含む。この態様の望ましい実施形態においては、植物細胞から調製されたcDNAのサンプルを使用して、該増幅工程を行う。もう1つの望ましい実施形態においては、タバコニコチンデメチラーゼは、配列番号3のアミノ酸配列に対して少なくとも70%同一であるポリペプチドをコードする。 In another embodiment, the present invention relates to another method for isolating tobacco nicotine demethylase or a fragment thereof. This method comprises (a) preparing a sample of plant cell DNA, and (b) preparing a pair of oligonucleotides having sequence identity to a region of a nucleic acid molecule having a sequence of SEQ ID NO: 4, 5, 7, 8 or 9. (C) contacting the oligonucleotide pair with the plant cell DNA under conditions suitable for DNA amplification by polymerase chain reaction, and (d) isolating the amplified tobacco nicotine demethylase or fragment thereof. Including. In a desirable embodiment of this aspect, the amplification step is performed using a cDNA sample prepared from plant cells. In another desirable embodiment, the tobacco nicotine demethylase encodes a polypeptide that is at least 70% identical to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3.
本発明のもう1つの態様は、植物または植物成分におけるタバコニコチンデメチラーゼの発現を低下させるための方法に関する。この方法は、(a)植物細胞内で機能的なプロモーターに機能しうる形で連結されたタバコニコチンデメチラーゼをコードするトランスジーンを該植物細胞内に導入して、形質転換植物細胞を得、(b)該形質転換植物細胞から植物または植物成分を再生させる工程を含み、ここで、該タバコニコチンデメチラーゼは該植物または植物成分の細胞において発現され、それにより植物または植物成分におけるタバコニコチンデメチラーゼの発現が低下する。本発明のこの態様の特定の実施形態においては、タバコニコチンデメチラーゼをコードするトランスジーンは組織特異的、細胞特異的または器官特異的に誘導的に発現され又は構成的に発現される。本発明のこの態様のもう1つの実施形態においては、該トランスジーンの発現は内因性タバコニコチンデメチラーゼまたは本明細書に記載の任意の他のポリペプチドの発現を共抑制する。 Another aspect of the invention relates to a method for reducing the expression of tobacco nicotine demethylase in a plant or plant component. In this method, (a) a transgene encoding tobacco nicotine demethylase operably linked to a functional promoter in a plant cell is introduced into the plant cell to obtain a transformed plant cell; (B) regenerating a plant or plant component from the transformed plant cell, wherein the tobacco nicotine demethylase is expressed in the plant or plant component cell, thereby causing tobacco nicotine depletion in the plant or plant component. Methylase expression is reduced. In particular embodiments of this aspect of the invention, the transgene encoding tobacco nicotine demethylase is inducibly or constitutively expressed in a tissue-specific, cell-specific or organ-specific manner. In another embodiment of this aspect of the invention, the expression of the transgene co-suppresses the expression of endogenous tobacco nicotine demethylase or any other polypeptide described herein.
本発明のもう1つの態様は、植物または植物成分におけるタバコニコチンデメチラーゼまたは本明細書に記載の他の任意のポリペプチドの発現を低下させるためのもう1つの方法に関する。この方法は、(a)植物細胞内で機能的なプロモーターに機能しうる形で連結された、タバコニコチンデメチラーゼのアンチセンスコード配列またはRNA干渉(RNAi)を誘導しうるRNA分子をコードするトランスジーンを、該植物細胞内に導入して、形質転換植物細胞を得、(b)該形質転換植物細胞から植物または植物成分を再生させる工程を含み、ここで、タバコニコチンデメチラーゼのコード配列のアンチセンスまたはRNA干渉(RNAi)を誘導しうるRNA分子は該植物または植物成分の細胞において発現され、それにより、植物または植物成分におけるタバコニコチンデメチラーゼの発現が低下する。望ましくは、タバコニコチンデメチラーゼのアンチセンス配列またはRNA干渉(RNAi)を誘導しうるRNA分子をコードするトランスジーンは、例えば組織特異的、細胞特異的または器官特異的に誘導的に発現され、あるいは構成的に発現される。他の望ましい実施形態においては、タバコニコチンデメチラーゼのコード配列のアンチセンスまたはRNAiを誘導しうるRNA分子は、配列番号1、配列番号4、配列番号5、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号62、配列番号188またはそれらの断片の相補体を含有する。
Another aspect of the invention relates to another method for reducing the expression of tobacco nicotine demethylase or any other polypeptide described herein in a plant or plant component. This method comprises: (a) a transcoding encoding an antisense coding sequence of tobacco nicotine demethylase or an RNA molecule capable of inducing RNA interference (RNAi) operably linked to a functional promoter in plant cells. A gene is introduced into the plant cell to obtain a transformed plant cell, and (b) regenerates a plant or plant component from the transformed plant cell, wherein the coding sequence of tobacco nicotine demethylase RNA molecules capable of inducing antisense or RNA interference (RNAi) are expressed in cells of the plant or plant component, thereby reducing the expression of tobacco nicotine demethylase in the plant or plant component. Desirably, the antisense sequence of tobacco nicotine demethylase or a transgene encoding an RNA molecule capable of inducing RNA interference (RNAi) is inducibly expressed, eg, tissue-specific, cell-specific or organ-specific, or Expressed constitutively. In other desirable embodiments, RNA molecules capable of inducing antisense or RNAi of the coding sequence of tobacco nicotine demethylase are SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9. Contains the complement of SEQ ID NO: 62 , SEQ ID NO: 188 or fragments thereof.
本発明のもう1つの態様は、植物または植物成分におけるタバコニコチンデメチラーゼの発現を低下させるための更にもう1つの方法に関する。この方法は、(a)植物細胞内で機能的なプロモーターに機能しうる形で連結されたタバコニコチンデメチラーゼのドミナントネガティブ遺伝子産物をコードするトランスジーンを該植物細胞内に導入して、形質転換植物細胞を得、(b)該形質転換植物細胞から植物または植物成分を再生させることを含み、ここで、該タバコニコチンデメチラーゼのドミナントネガティブ遺伝子産物は該植物または植物成分の細胞において発現され、それにより、植物または植物成分におけるタバコニコチンデメチラーゼの発現が低下する。本発明のこの態様の特定の実施形態においては、該ドミナントネガティブ遺伝子産物をコードするトランスジーンは、例えば組織特異的、細胞特異的または器官特異的に誘導的に発現され、あるいは構成的に発現される。 Another aspect of the invention relates to yet another method for reducing the expression of tobacco nicotine demethylase in a plant or plant component. In this method, (a) a transgene encoding a dominant negative gene product of tobacco nicotine demethylase operably linked to a functional promoter in a plant cell is introduced into the plant cell and transformed. Obtaining a plant cell and (b) regenerating the plant or plant component from the transformed plant cell, wherein the tobacco nicotine demethylase dominant negative gene product is expressed in the plant or plant component cell; Thereby, the expression of tobacco nicotine demethylase in the plant or plant component is reduced. In certain embodiments of this aspect of the invention, the transgene encoding the dominant negative gene product is inducibly expressed, eg, constitutively expressed, eg, tissue specific, cell specific, or organ specific. The
本発明のもう1つの態様は、植物細胞におけるタバコニコチンデメチラーゼの発現または酵素活性を低下させるためのもう1つの方法に関する。この方法は、該植物細胞における内因性タバコニコチンデメチラーゼのレベルを低下させることを含む。望ましくは、該植物細胞は双子葉植物、ナス科植物、またはNicotiana種に由来する。この態様の望ましい実施形態においては、内因性タバコニコチンデメチラーゼのレベルを低下させることは、タバコニコチンデメチラーゼのアンチセンス核酸分子またはRNA干渉(RNAi)を誘導しうるRNA分子をコードするトランスジーンを植物細胞において発現させることを含み、あるいはタバコニコチンデメチラーゼの二本鎖RNA分子をコードするトランスジーンを植物細胞において発現させることを含む。望ましくは、二本鎖RNAは、配列番号1、配列番号4、配列番号5、配列番号7、配列番号8、配列番号9、配列番号62、配列番号188の配列またはそれらの断片に対応するRNA配列である。もう1つの実施形態においては、内因性タバコニコチンデメチラーゼのレベルを低下させることは、該植物細胞における内因性タバコニコチンデメチラーゼの共抑制を含み、あるいは該植物細胞においてドミナントネガティブ遺伝子産物を発現させることを含む。特に、該ドミナントネガティブ遺伝子産物は、配列番号3のアミノ酸配列または本明細書に記載の任意の他のアミノ酸配列の変異型をコードする遺伝子を含みうる。
Another aspect of the invention relates to another method for reducing tobacco nicotine demethylase expression or enzyme activity in plant cells. The method includes reducing the level of endogenous tobacco nicotine demethylase in the plant cell. Desirably, the plant cell is derived from a dicotyledonous plant, a solanaceous plant, or a Nicotiana species. In desirable embodiments of this aspect, reducing the level of endogenous tobacco nicotine demethylase comprises transgene encoding an antisense nucleic acid molecule of tobacco nicotine demethylase or an RNA molecule capable of inducing RNA interference (RNAi). Or expressing in a plant cell a transgene encoding a double-stranded RNA molecule of tobacco nicotine demethylase. Desirably, the double-stranded RNA is an RNA corresponding to the sequence of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 62 , SEQ ID NO: 188 or a fragment thereof. Is an array. In another embodiment, reducing the level of endogenous tobacco nicotine demethylase comprises co-suppression of endogenous tobacco nicotine demethylase in the plant cell, or expresses a dominant negative gene product in the plant cell. Including that. In particular, the dominant negative gene product may comprise a gene encoding a variant of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 or any other amino acid sequence described herein.
本発明のこの態様の他の望ましい実施形態においては、内因性タバコニコチンデメチラーゼは、配列番号3のアミノ酸配列をコードする遺伝子内に点変異を含む。他の望ましい実施形態においては、内因性タバコニコチンデメチラーゼの発現のレベルを低下させることは、タバコニコチンデメチラーゼをコードする遺伝子内の欠失を伴い、またはタバコニコチンデメチラーゼをコードする遺伝子内の挿入を伴う。発現の低下は転写レベル、翻訳レベルまたは翻訳後レベルで生じうる。 In other desirable embodiments of this aspect of the invention, the endogenous tobacco nicotine demethylase comprises a point mutation in the gene encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3. In other desirable embodiments, reducing the level of expression of endogenous tobacco nicotine demethylase involves a deletion in the gene encoding tobacco nicotine demethylase, or within the gene encoding tobacco nicotine demethylase. With insertion. Decreased expression can occur at the transcriptional, translational or post-translational level.
本発明のもう1つの態様は、細胞におけるタバコニコチンデメチラーゼの発現を変化させる化合物を特定するための方法に関する。この方法は、(a)タバコニコチンデメチラーゼをコードする遺伝子を含有する細胞を準備し、(b)該細胞に候補化合物を適用し、(c)該タバコニコチンデメチラーゼをコードする遺伝子の発現を測定する工程を含み、ここで、未処理対照サンプルに対する発現における上昇または低下は、該化合物が該タバコニコチンデメチラーゼの発現を変化させることを示す。 Another aspect of the invention relates to a method for identifying a compound that alters the expression of tobacco nicotine demethylase in a cell. This method comprises (a) preparing a cell containing a gene encoding tobacco nicotine demethylase, (b) applying a candidate compound to the cell, and (c) expressing the gene encoding the tobacco nicotine demethylase. An increase or decrease in expression relative to an untreated control sample indicates that the compound alters expression of the tobacco nicotine demethylase.
この方法の望ましい実施形態においては、項目(a)の遺伝子は、配列番号3のアミノ酸配列に対して少なくとも70%の同一性を有するタバコニコチンデメチラーゼをコードする。望ましくは、該化合物は、該タバコニコチンデメチラーゼをコードする遺伝子の発現を低下または上昇させる。 In a preferred embodiment of this method, the gene of item (a) encodes a tobacco nicotine demethylase having at least 70% identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3. Desirably, the compound decreases or increases the expression of the gene encoding the tobacco nicotine demethylase.
もう1つの態様においては、本発明は、細胞におけるタバコニコチンデメチラーゼの活性を変化させる化合物を特定するためのもう1つの方法に関する。この方法は、(a)タバコニコチンデメチラーゼをコードする遺伝子を発現する細胞を準備し、(b)該細胞に候補化合物を適用し、(c)該タバコニコチンデメチラーゼの活性を測定する工程を含み、ここで、未処理対照サンプルに対する活性における上昇または低下は、該化合物が該タバコニコチンデメチラーゼの活性を変化させることを示す。本発明のこの態様の望ましい実施形態においては、項目(a)の遺伝子は、配列番号3のアミノ酸配列に対して少なくとも70%の同一性を有するタバコニコチンデメチラーゼをコードする。望ましくは、該化合物は、該タバコニコチンデメチラーゼの活性を低下または上昇させる。 In another embodiment, the present invention relates to another method for identifying a compound that alters the activity of tobacco nicotine demethylase in a cell. This method comprises the steps of (a) preparing a cell expressing a gene encoding tobacco nicotine demethylase, (b) applying a candidate compound to the cell, and (c) measuring the activity of the tobacco nicotine demethylase. Including, where an increase or decrease in activity relative to an untreated control sample indicates that the compound alters the activity of the tobacco nicotine demethylase. In a preferred embodiment of this aspect of the invention, the gene of item (a) encodes a tobacco nicotine demethylase having at least 70% identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3. Desirably, the compound reduces or increases the activity of the tobacco nicotine demethylase.
本発明のもう1つの態様は、(i)低下したレベルのニコチンデメチラーゼまたは(ii)変化した酵素活性を有するニコチンデメチラーゼおよび低下した量のニトロソアミンを含有する乾燥タバコ植物または植物成分に関する。望ましくは、該植物成分はタバコ葉またはタバコ茎である。望ましい実施形態においては、該ニトロソアミンはノルニコチンであり、ノルニコチンの含量は、望ましくは5 mg/g未満、4.5 mg/g未満、4.0 mg/g未満、3.5 mg/g未満、3.0 mg/g未満、より望ましくは2.5 mg/g未満、2.0 mg/g未満、1.5 mg/g未満、1.0 mg/g未満、より望ましくは750 μg/g未満、500 μg/g未満、250 μg/g未満、100 μg/g未満、より一層望ましくは75 μg/g未満、50 μg/g未満、25 μg/g未満、10 μg/g未満、7.0 μg/g未満、5.0 μg/g未満、4.0 μg/g未満、より一層望ましくは2.0 μg/g未満、1.0 μg/g未満、0.5 μg/g未満、0.4 μg/g未満、0.2 μg/g未満、0.1 μg/g未満、0.05 μg/g未満または0.01 μg/g未満であり、あるいは、ここで、それに含有される全アルカロイド含量に対する二次アルカロイドの比率(%)は90%未満、70%未満、50%未満、30%未満、10%未満、望ましくは5%未満、4%未満、3%未満、2%未満、1.5%未満、1%未満、より望ましくは0.75%未満、0.5%未満、0.25%未満または0.1%未満である。もう1つの望ましい実施形態においては、ニトロソアミンはN'-ニトロソノルニコチン(NNN)であり、N'-NNNの含量は、望ましくは5 mg/g未満、4.5 mg/g未満、4.0 mg/g未満、3.5 mg/g未満、3.0 mg/g未満、より望ましくは2.5 mg/g未満、2.0 mg/g未満、1.5 mg/g未満、1.0 mg/g未満、より望ましくは750 μg/g未満、500 μg/g未満、250 μg/g未満、100 μg/g未満、より一層望ましくは75 μg/g未満、50 μg/g未満、25 μg/g未満、10 μg/g未満、7.0 μg/g未満、5.0 μg/g未満、4.0 μg/g未満、より一層望ましくは2.0 μg/g未満、1.0 μg/g未満、0.5 μg/g未満、0.4 μg/g未満、0.2 μg/g未満、0.1 μg/g未満、0.05 μg/g未満または0.01 μg/g未満であり、あるいは、ここで、それに含有される全アルカロイド含量に対する二次アルカロイドの比率(%)は90%未満、70%未満、50%未満、30%未満、10%未満、望ましくは5%未満、4%未満、3%未満、2%未満、1.5%未満、1%未満、より望ましくは0.75%未満、0.5%未満、0.25%未満または0.1%未満である。本発明のこの態様の更なる望ましい実施形態においては、乾燥タバコ植物または植物成分は、いぶし(dark)タバコ、バーレータバコ。火力乾燥(フルーキュアリング)タバコ、バージニア、空気乾燥(エアキュアリング)タバコまたはオリエンタルタバコが挙げられる。 Another aspect of the invention relates to a dried tobacco plant or plant component containing (i) a reduced level of nicotine demethylase or (ii) a nicotine demethylase having altered enzyme activity and a reduced amount of nitrosamine. Desirably, the plant component is tobacco leaf or tobacco stem. In desirable embodiments, the nitrosamine is nornicotine and the content of nornicotine is desirably less than 5 mg / g, less than 4.5 mg / g, less than 4.0 mg / g, less than 3.5 mg / g, less than 3.0 mg / g, More desirably less than 2.5 mg / g, less than 2.0 mg / g, less than 1.5 mg / g, less than 1.0 mg / g, more desirably less than 750 μg / g, less than 500 μg / g, less than 250 μg / g, 100 μg less than 75 μg / g, more preferably less than 50 μg / g, less than 25 μg / g, less than 10 μg / g, less than 7.0 μg / g, less than 5.0 μg / g, less than 4.0 μg / g, Even more desirably, less than 2.0 μg / g, less than 1.0 μg / g, less than 0.5 μg / g, less than 0.4 μg / g, less than 0.2 μg / g, less than 0.1 μg / g, less than 0.05 μg / g or 0.01 μg / g Or the ratio of secondary alkaloids (%) to the total alkaloid content contained therein is less than 90%, less than 70%, less than 50%, less than 30%, less than 10%, desirably 5% Less than 4% 3% Mitsuru, less than 2%, less than 1.5%, less than 1%, more preferably less than 0.75%, less than 0.5%, less than less than 0.25% or 0.1%. In another desirable embodiment, the nitrosamine is N'-nitrosonornicotine (NNN) and the content of N'-NNN is desirably less than 5 mg / g, less than 4.5 mg / g, less than 4.0 mg / g Less than 3.5 mg / g, less than 3.0 mg / g, more preferably less than 2.5 mg / g, less than 2.0 mg / g, less than 1.5 mg / g, less than 1.0 mg / g, more preferably less than 750 μg / g, 500 <μg / g, <250 μg / g, <100 μg / g, even more preferably <75 μg / g, <50 μg / g, <25 μg / g, <10 μg / g, <7.0 μg / g Less than 5.0 μg / g, less than 4.0 μg / g, even more preferably less than 2.0 μg / g, less than 1.0 μg / g, less than 0.5 μg / g, less than 0.4 μg / g, less than 0.2 μg / g, 0.1 μg / g less than g, less than 0.05 μg / g or less than 0.01 μg / g, or where the ratio of secondary alkaloids to the total alkaloid content contained therein is less than 90%, less than 70%, less than 50% Less than 30%, less than 10%, preferably less than 5% , Less than 4%, less than 3%, less than 2%, less than 1.5%, less than 1%, more preferably less than 0.75%, less than 0.5%, less than less than 0.25% or 0.1%. In a further desirable embodiment of this aspect of the invention, the dried tobacco plant or plant component is dark tobacco, burley tobacco. Examples include fire-cured tobacco, Virginia, air-cured tobacco, oriental tobacco.
更に、本発明の乾燥タバコ植物または植物成分は、望ましくは、組換えニコチンデメチラーゼ遺伝子、例えば、配列番号4もしくは配列番号5の配列またはその断片を含有するものを含む。望ましくは、乾燥タバコ植物または植物成分における内因性ニコチンデメチラーゼ遺伝子または本明細書に記載の任意の他の核酸配列の発現がサイレンシングされる。 Further, the dried tobacco plant or plant component of the present invention desirably includes a recombinant nicotine demethylase gene, such as one containing the sequence of SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 5, or a fragment thereof. Desirably, expression of an endogenous nicotine demethylase gene or any other nucleic acid sequence described herein in a dried tobacco plant or plant component is silenced.
本発明のもう1つの態様は、(i)発現が低下したニコチンデメチラーゼもしくは本明細書に記載の任意の他のポリペプチドまたは(ii)変化した活性を有するニコチンデメチラーゼもしくは本明細書に記載の別のポリペプチドおよび低下した量のニトロソアミンを含む乾燥タバコ植物または植物成分を含有するタバコ製品に関する。望ましくは、該タバコ製品は無煙タバコ製品、湿性もしくは乾燥かぎタバコ、噛みタバコ、巻きタバコ製品、葉巻製品、シガリーロ、パイプタバコまたはビーディ(bidi)が含まれる。特に、本発明のこの態様のタバコ製品は、いぶし(dark)タバコ、粉砕タバコを含有することが可能であり、あるいは香味成分を含みうる。 Another aspect of the invention is (i) a nicotine demethylase with reduced expression or any other polypeptide described herein or (ii) a nicotine demethylase with altered activity or described herein. To a tobacco product containing a dried tobacco plant or plant component comprising a reduced polypeptide and a reduced amount of nitrosamine. Desirably, the tobacco products include smokeless tobacco products, wet or dry hookah tobacco, chewing tobacco, cigarette products, cigar products, cigarillos, pipe tobacco or bidi. In particular, the tobacco product of this aspect of the invention can contain dark tobacco, ground tobacco, or can include a flavor component.
本発明はまた、(i)発現が低下したニコチンデメチラーゼまたは(ii)変化(例えば低下)した酵素活性を有するニコチンデメチラーゼおよび低下した量のニトロソアミンを含有するタバコ製品、例えば無煙タバコ製品の製造方法に関する。この方法は、(i)低下したレベルのニコチンデメチラーゼまたは(ii)変化した酵素活性を有するニコチンデメチラーゼおよび低下した量のニトロソアミンを含有する乾燥タバコ植物または植物成分を準備し、該乾燥タバコ植物または植物成分から該タバコ製品を製造することを含む。 The invention also provides for the manufacture of tobacco products, eg, smokeless tobacco products, containing (i) nicotine demethylase with reduced expression or (ii) nicotine demethylase with altered (eg, reduced) enzyme activity and a reduced amount of nitrosamine. Regarding the method. The method comprises preparing a dried tobacco plant or plant component comprising (i) a reduced level of nicotine demethylase or (ii) a nicotine demethylase having altered enzyme activity and a reduced amount of nitrosamine, wherein the dried tobacco plant Or producing the tobacco product from plant components.
定義
「酵素活性」は、脱メチル化、ヒドロキシル化、エポキシ化、N-酸化、スルホ酸化、N-、S-およびO-脱アルキル化、脱硫酸化、脱アミノ化ならびにアゾ、ニトロ、N-オキシドおよび他のそのような酵素反応性化学基の還元を包含する(これらに限定されるものではない)と意図される。変化した酵素活性(酵素活性の変化)は、対照酵素(例えば、野生型タバコ植物タバコニコチンデメチラーゼ)の活性に対して少なくとも10〜20%、好ましくは少なくとも25〜50%、より好ましくは少なくとも55〜95%またはそれ以上の(例えば、タバコニコチンデメチラーゼの)酵素活性の低下を意味する。酵素(例えば、ニコチンデメチラーゼ)の活性は、当技術分野における標準的な方法を用いて、例えば本明細書に記載の酵母ミクロソームアッセイを用いてアッセイされうる。
The definition “enzymatic activity” is demethylation, hydroxylation, epoxidation, N-oxidation, sulfooxidation, N-, S- and O-dealkylation, desulfation, deamination and azo, nitro, N-oxide. And other such enzyme reactive chemical group reductions are intended to include (but are not limited to). The altered enzyme activity (change in enzyme activity) is at least 10-20%, preferably at least 25-50%, more preferably at least 55% relative to the activity of a control enzyme (eg, wild-type tobacco plant tobacco nicotine demethylase). Means a decrease in enzyme activity (eg, of tobacco nicotine demethylase) of ~ 95% or more. The activity of an enzyme (eg, nicotine demethylase) can be assayed using standard methods in the art, for example, using the yeast microsome assay described herein.
「核酸」なる語は、一本鎖もしくは二本鎖形態またはセンスもしくはアンチセンスのデオキシリボヌクレオチドまたはリボヌクレオチド重合体を意味し、特に限定されない限り、天然に存在するヌクレオチドに類似した様態で核酸にハイブリダイズする天然ヌクレオチドの公知類似体を含む。特に示さない限り、特定の核酸配列はその相補的配列を含む。「機能しうる形で連結された」、「機能的組合せ」および「機能的順序」なる語は、核酸発現制御配列(例えば、プロモーター、シグナル配列または一連の転写因子結合部位)と第2の核酸配列との間の機能的連結を意味し、この場合、該発現制御配列は、該第2配列に対応する核酸の転写および/または翻訳に影響を及ぼす。望ましくは、機能しうる形で連結された核酸配列は、完全長遺伝子を形成するよう同一遺伝子の他の配列に連結された遺伝子の断片を意味する。 The term “nucleic acid” refers to deoxyribonucleotides or ribonucleotide polymers in single-stranded or double-stranded form or sense or antisense, and unless otherwise limited, hybridizes to nucleic acids in a manner similar to naturally occurring nucleotides. Contains known analogs of natural nucleotides that soy. Unless otherwise indicated, a particular nucleic acid sequence includes its complementary sequence. The terms “operably linked”, “functional combination” and “functional order” refer to a nucleic acid expression control sequence (eg, promoter, signal sequence or series of transcription factor binding sites) and a second nucleic acid. By means of a functional linkage between sequences, the expression control sequence affects the transcription and / or translation of the nucleic acid corresponding to the second sequence. Desirably, a functionally linked nucleic acid sequence refers to a fragment of a gene linked to other sequences of the same gene to form a full-length gene.
細胞に関して用いられている場合の「組換え」なる語は、細胞が異種核酸を複製し、該核酸を発現し、または異種核酸によりコードされるペプチド、異種ペプチドもしくはタンパク質を発現することを示す。組換え細胞は、遺伝子または遺伝子断片を、センスもしくはアンチセンス形態で、または該細胞の天然(非組換え)形態においては見出されないRNA干渉(RNAi)を誘導するRNA分子として発現しうる。組換え細胞は、該細胞の天然形態で見出されるが人工的手段により修飾され該細胞内に再導入された遺伝子をも発現しうる。 The term “recombinant” when used with respect to a cell indicates that the cell replicates a heterologous nucleic acid, expresses the nucleic acid, or expresses a peptide, heterologous peptide or protein encoded by the heterologous nucleic acid. Recombinant cells can express a gene or gene fragment in sense or antisense form, or as an RNA molecule that induces RNA interference (RNAi) not found in the natural (non-recombinant) form of the cell. Recombinant cells can also express genes found in the natural form of the cells but modified by artificial means and reintroduced into the cells.
「構造遺伝子」は、タンパク質、ポリペプチドまたはその一部をコードするDNAセグメントを含む遺伝子の部分であり、これは、例えば、転写の開始を駆動する5'配列または3'UTRを含まない。あるいは、構造遺伝子は非翻訳可能産物をコードしうる。構造遺伝子は、該細胞内に通常見出されるもの、または該細胞もしくは細胞位置には通常見いだされないもの(それが導入される場合には、それは「異種遺伝子」と称される)でありうる。異種遺伝子は、全体的または部分的に、当技術分野で公知の任意の起源(細菌ゲノムもしくはエピソーム、真核、核もしくはプラスミドDNA、cDNA、ウイルスDNAまたは化学合成DNAを含む)に由来しうる。構造遺伝子は、生物活性もしくはその特性、発現産物の生物活性もしくは化学構造、発現の速度または発現制御の様態に影響を及ぼしうる1以上の修飾を含有しうる。そのような修飾には、1以上のヌクレオチドの変異、挿入、欠失および置換が含まれるが、これらに限定されるものではない。 A “structural gene” is a portion of a gene that includes a DNA segment that encodes a protein, polypeptide, or portion thereof, which does not include, for example, a 5 ′ sequence or 3 ′ UTR that drives transcription initiation. Alternatively, the structural gene can encode a non-translatable product. A structural gene can be one that is normally found in the cell, or one that is not normally found in the cell or cell location (when it is introduced, it is referred to as a “heterologous gene”). A heterologous gene can be derived, in whole or in part, from any source known in the art, including bacterial genomes or episomes, eukaryotic, nuclear or plasmid DNA, cDNA, viral DNA or chemically synthesized DNA. A structural gene may contain one or more modifications that may affect the biological activity or its characteristics, the biological activity or chemical structure of the expression product, the rate of expression or the manner of expression control. Such modifications include, but are not limited to, one or more nucleotide mutations, insertions, deletions and substitutions.
構造遺伝子は非分断コード配列を構成することが可能であり、あるいはそれは、適当なスプライス部位に隣接した1以上のイントロンを含みうる。構造遺伝子は翻訳可能または非翻訳可能であることが可能であり、アンチセンス、またはRNA干渉(RNAi)を誘導しうるRNA分子を含みうる。構造遺伝子は、複数の起源および複数の遺伝子配列(天然物または合成物であり、ここで、合成物は、化学合成されたDNAを意味する)に由来するセグメントの複合物でありうる。 A structural gene can constitute an unbroken coding sequence, or it can contain one or more introns flanked by appropriate splice sites. Structural genes can be translatable or non-translatable and can include antisense or RNA molecules that can induce RNA interference (RNAi). A structural gene can be a composite of segments derived from multiple sources and multiple gene sequences (natural or synthetic, where synthetic refers to chemically synthesized DNA).
核酸配列に関して本明細書中で用いる「エキソン」は遺伝子の核酸配列の一部を意味し、ここで、エキソンの核酸配列は遺伝子産物のアミノ酸の少なくとも1つをコードしている。エキソンは、典型的には、イントロンのような非コードDNAセグメントに隣接している。 An “exon” as used herein with respect to a nucleic acid sequence refers to a portion of a nucleic acid sequence of a gene, where the exon nucleic acid sequence encodes at least one amino acid of the gene product. Exons are typically adjacent to non-coding DNA segments such as introns.
核酸配列に関して本明細書中で用いる「イントロン」は、コード領域に隣接する遺伝子の非コード領域を意味する。イントロンは、典型的には、RNA分子には転写されるが次いでメッセンジャーRNAまたは他の機能的構造RNAの産生中にRNAスプライシングにより切除される遺伝子の非コード領域である。 An “intron” as used herein with respect to a nucleic acid sequence refers to a non-coding region of a gene that flank the coding region. Introns are typically non-coding regions of genes that are transcribed into RNA molecules but then excised by RNA splicing during the production of messenger RNA or other functional structural RNA.
核酸配列に関して本明細書中で用いる「3'UTR」は、エキソンの終止コドンに近い非コード核酸配列を意味する。 “3′UTR” as used herein with respect to a nucleic acid sequence means a non-coding nucleic acid sequence close to the stop codon of an exon.
「由来する」は、起源体(化学的および/または生物学的)から採取、入手、受領、追跡、複製または伝達されることを意味する。誘導体は、起源体の化学的または生物学的操作(置換、付加、挿入、欠失、抽出、単離、変異および複製を含むが、これらに限定されるものではない)により製造されうる。 “Derived” means taken, obtained, received, traced, replicated or transmitted from a source (chemical and / or biological). Derivatives can be made by chemical or biological manipulation of the source, including but not limited to substitution, addition, insertion, deletion, extraction, isolation, mutation and replication.
DNAの配列に関する「化学合成」は、成分ヌクレオチドの一部がin vitroで構築されたことを意味する。DNAの手動化学合成は、十分に確立された方法(Caruthers, Methodology of DNA and RNA Sequencing, (1983), Weissman (編), Praeger Publishers, New York, Chapter 1)を用いて達成されうる。自動化学合成は、多数の商業的に入手可能な装置の1つを使用して行われうる。 “Chemical synthesis” with respect to the sequence of DNA means that some of the component nucleotides were constructed in vitro. Manual chemical synthesis of DNA can be accomplished using well-established methods (Caruthers, Methodology of DNA and RNA Sequencing , (1983), Weissman (ed.), Praeger Publishers, New York, Chapter 1). Automated chemical synthesis can be performed using one of a number of commercially available equipment.
比較のための配列の最適なアライメントは、例えば、SmithおよびWaterman, Adv. Appl. Math. 2:482 (1981)の局所相同性アルゴリズム、NeedlemanおよびWunsch, J. Mol. Biol. 48:443 (1970)の相同性アライメントアルゴリズム、PearsonおよびLipman Proc. Natl. Acad. Sci. (U.S.A.) 85: 2444 (1988)の類似性検索法、これらのアルゴリズム(GAP、BESTFIT、FASTAおよびTFASTA(Wisconsin Genetics Software Package, Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Madison, Wis.におけるもの))のコンピューター化実行、または精査により行われうる。 Optimal alignment of sequences for comparison is described, for example, by the local homology algorithm of Smith and Waterman, Adv. Appl. Math. 2: 482 (1981), Needleman and Wunsch, J. Mol. Biol. 48: 443 (1970 ) Homology alignment algorithms, Pearson and Lipman Proc. Natl. Acad. Sci. (USA) 85: 2444 (1988) similarity search methods, these algorithms (GAP, BESTFIT, FASTA and TFASTA (Wisconsin Genetics Software Package, This can be done by computerized implementation or scrutiny by Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Madison, Wis.
NCBI Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) (Altschulら, 1990)は、配列分析プログラムblastp、blastn、blastx、tblastnおよびtblastxに関する使用のために、National Center for Biological Information (NCBI, Bethesda, Md.)を含むいくつかの入手源から、あるいはインターネット上で入手可能である。それはhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLASTでアクセスされうる。このプログラムを使用する配列同一性の決定方法はhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/blast help.htmlにおいて入手可能である。 NCBI Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) (Altschul et al., 1990) includes National Center for Biological Information (NCBI, Bethesda, Md.) For use with the sequence analysis programs blastp, blastn, blastx, tblastn and tblastx. Available from several sources or on the Internet. It can be accessed at http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST. Methods for determining sequence identity using this program are available at http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/blast help.html.
本明細書中でアミノ酸配列に関して用いる「実質的なアミノ酸同一性」または「実質的なアミノ酸配列同一性」なる語は、図10〜159、160A〜160E、162〜170および172-1〜172-19に示すタンパク質配列と比較して少なくとも70%の配列同一性、好ましくは80%のアミノ酸配列同一性、より好ましくは90%のアミノ酸配列同一性、最も好ましくは少なくとも99〜100%の配列同一性を有する配列をペプチドが含むという、ポリペプチドの特性を示す。望ましくは、ニコチンデメチラーゼの場合には、配列比較は、翻訳されたペプチドのシトクロムp450モチーフGXRXCX(G/A)(配列番号2265)の後から終止コドン領域までに関して行われる。 The terms “substantial amino acid identity” or “substantial amino acid sequence identity” as used herein with respect to amino acid sequences refer to FIGS. 10-159, 160A-160E, 162-170 and 172-1-172- At least 70% sequence identity, preferably 80% amino acid sequence identity, more preferably 90% amino acid sequence identity, most preferably at least 99-100% sequence identity compared to the protein sequence shown in 19. The polypeptide has the property that the peptide contains a sequence having Desirably, in the case of nicotine demethylase, the sequence comparison is performed after the cytochrome p450 motif GXRXCX (G / A) (SEQ ID NO: 2265) of the translated peptide to the stop codon region.
本明細書中でアミノ酸配列に関して用いる「実質的な核酸同一性」または「実質的な核酸配列同一性」なる語は、翻訳されたペプチドのシトクロムp450モチーフGXRXCX(G/A)(2265)をコードする領域の後から終止コドンまでの第1核酸に対応する領域にわたって参照グループと比較して少なくとも50%、好ましくは60、65、70または75%の配列同一性、より好ましくは81または91%の核酸配列同一性、最も好ましくは少なくとも95、99または更には100%の配列同一性を有する配列をポリヌクレオチドが含むという、該ポリヌクレオチド配列の特性を示す。 The terms “substantial nucleic acid identity” or “substantial nucleic acid sequence identity” as used herein with respect to amino acid sequence encode the translated peptide cytochrome p450 motif GXRXCX (G / A) (2265) At least 50%, preferably 60, 65, 70 or 75% sequence identity over the region corresponding to the first nucleic acid after the region to the stop codon, more preferably 81 or 91% A characteristic of the polynucleotide sequence is that the polynucleotide comprises a sequence having nucleic acid sequence identity, most preferably at least 95, 99 or even 100% sequence identity.
ヌクレオチド配列が実質的に同一であるというもう1つの指標は、2つの分子がストリンジェントな条件下で互いにハイブリダイズするかどうかである。ストリンジェントな条件は配列によって様々であり、状況によって異なるであろう。一般には、ストリンジェントな条件は、一定のイオン強度およびpHにおいて、特定の配列の熱融解点(Tm)より約5℃〜約22℃、通常は約10℃〜約15℃低い温度となるよう選ばれる。Tmは、標的配列の50%がマッチプローブにハイブリダイズする(一定のイオン強度およびpHにおける)温度である。典型的には、ストリンジェントな条件は、塩濃度がpH7で約0.02モル濃度であり温度が少なくとも約60℃であるものである。例えば標準的なサザンハイブリダイゼーション法においては、ストリンジェントな条件は、6×SSC中、42℃での初期洗浄、およびそれに続く0.2×SSC中、少なくとも約55℃、典型的には約60℃、しばしば約65℃の温度での1回以上の追加的洗浄を含むであろう。
Another indication that the nucleotide sequences are substantially identical is whether the two molecules hybridize to each other under stringent conditions. Stringent conditions vary from sequence to sequence and will vary from situation to situation. Generally, stringent conditions are such that at a constant ionic strength and pH, the temperature is about 5 ° C. to about 22 ° C., usually about 10 ° C. to about 15 ° C. below the thermal melting point (Tm) of the specific sequence. To be elected. Tm is the temperature (at constant ionic strength and pH) at which 50% of the target sequence hybridizes to the match probe. Typically, stringent conditions are those where the salt concentration is about 0.02 molar at
また、本発明の目的においては、ヌクレオチド配列が、実質的に同一のポリペプチドおよび/タンパク質をコードしている場合には、それらのヌクレオチド配列は実質的に同一である。したがって、1つの核酸配列が、第2の核酸配列と実質的に同じポリペプチドをコードしている場合には、それらの核酸配列は、遺伝暗号により許容される縮重(コドンの縮重および遺伝暗号の説明は、Darnellら (1990) Molecular Cell Biology, Second Edition Scientific American Books W. H. Freeman and Company New Yorkを参照されたい)が原因でストリンジェントな条件下でハイブリダイズしない場合であっても、実質的に同一である。タンパク質の純度または均一性は、当技術分野でよく知られた多数の手段、例えばタンパク質サンプルのポリアクリルアミドゲル電気泳動およびそれに続く染色後の可視化により示されうる。ある目的には、高い分離能が要求されることがあり、HPLCまたは同様の精製手段が用いられうる。 Also, for purposes of the present invention, if the nucleotide sequence encodes substantially the same polypeptide and / or protein, the nucleotide sequence is substantially the same. Thus, if one nucleic acid sequence encodes a polypeptide that is substantially the same as a second nucleic acid sequence, the nucleic acid sequences are degenerate (codon degeneracy and genetic) allowed by the genetic code. The description of the cipher is practical even if it does not hybridize under stringent conditions due to Darnell et al. (1990) Molecular Cell Biology, Second Edition Scientific American Books WH Freeman and Company New York) Are identical. Protein purity or homogeneity can be demonstrated by a number of means well known in the art, such as polyacrylamide gel electrophoresis of protein samples followed by visualization after staining. For some purposes, high resolution may be required and HPLC or similar purification means may be used.
タバコニコチンデメチラーゼのような特定のポリペプチドに「特異的に結合」または該ポリペプチドを「特異的に認識」する抗体は、等量の任意の他のタンパク質に対してよりも該ポリペプチドに対して高いアフィニティを有する抗体を意味する。望ましい抗体は、図1、図3および4、図10〜158、図160A〜160E、図162〜170ならびに図172-1〜172-19に示すアミノ酸配列を有するポリペプチドに特異的に結合する抗体である。例えば、配列番号3のアミノ酸配列を含有するタバコニコチンデメチラーゼに特異的に結合する抗体は、望ましくは、関連抗原を含む等量の任意の他の抗原より少なくとも2倍、5倍、10倍、30倍または100倍大きい、その抗原に対するアフィニティを有する。抗原(例えば、タバコニコチンデメチラーゼ)に対する抗体の結合は、多数の標準的な方法、例えばウエスタン分析、ELISAまたは共沈法により測定されうる。ポリペプチド(例えば、ニコチンデメチラーゼ)に特異的に結合する抗体も、該ポリペプチドの精製に有用である。 An antibody that “specifically binds” or “specifically recognizes” a particular polypeptide, such as tobacco nicotine demethylase, binds the polypeptide more than an equal amount of any other protein. It means an antibody having a high affinity for it. Desirable antibodies are antibodies that specifically bind to a polypeptide having the amino acid sequence shown in FIGS. 1, 3 and 4, FIGS. 10 to 158, FIGS. 160A to 160E, FIGS. 162 to 170 and FIGS. 172-1 to 172-19. It is. For example, an antibody that specifically binds tobacco nicotine demethylase containing the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 desirably is at least 2-fold, 5-fold, 10-fold, greater than any other equivalent amount of antigen, including related antigens, Has an affinity for that antigen that is 30 or 100 times greater. Antibody binding to an antigen (eg, tobacco nicotine demethylase) can be measured by a number of standard methods, such as Western analysis, ELISA or coprecipitation. Antibodies that specifically bind to a polypeptide (eg, nicotine demethylase) are also useful for purification of the polypeptide.
本明細書中で用いる「ベクター」なる語は、DNAセグメントを細胞内に移入する核酸分子に関して用いられる。ベクターは、DNAを複製するよう作用することが可能であり、宿主細胞内で独立して再生しうる。「ビヒクル」なる語は「ベクター」と互換的に用いられることがある。本明細書中で用いる「発現ベクター」なる語は、特定の宿主生物における機能しうる形で連結されたコード配列の発現に必要な適当な核酸配列および所望のコード配列を含有する組換えDNA分子を意味する。原核生物における発現に必要な核酸配列は、通常、プロモーター、オペレーター(随意的)およびリボソーム結合部位を、しばしば他の配列と共に含む。望ましくは、該プロモーターは、配列番号8の配列または転写を駆動するその断片を含む。配列番号8の配列に対して少なくとも50%、60%、75%、80%、90%、95%または更には99%の配列同一性を有し転写を駆動するプロモーター配列も望ましい。真核細胞はプロモーター、エンハンサーならびに終結およびポリアデニル化シグナル、例えば配列番号9の3'UTR配列を利用することが知られている。いくつかの場合には、植物発現ベクターは、安定な発現のためには、植物由来のイントロン(例えば、配列番号7の配列を有するイントロン)の存在を要することが認められている。したがって、本明細書中で更に詳しく説明するとおり、配列番号7の配列または適当なRNAスプライス部位を有する任意の他のイントロンが使用されうる。望ましいベクターには、図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19または図173-1〜173-294に示す核酸配列が含まれる。 As used herein, the term “vector” is used in reference to nucleic acid molecules that transfer DNA segments into cells. Vectors can act to replicate DNA and can be independently regenerated in host cells. The term “vehicle” is sometimes used interchangeably with “vector”. As used herein, the term “expression vector” refers to a recombinant DNA molecule containing the appropriate nucleic acid sequence and the desired coding sequence necessary for the expression of a operably linked coding sequence in a particular host organism. Means. The nucleic acid sequences necessary for expression in prokaryotes usually contain a promoter, an operator (optional) and a ribosome binding site, often along with other sequences. Desirably, the promoter comprises the sequence of SEQ ID NO: 8, or a fragment thereof that drives transcription. Also desirable are promoter sequences that drive transcription with at least 50%, 60%, 75%, 80%, 90%, 95% or even 99% sequence identity to the sequence of SEQ ID NO: 8. Eukaryotic cells are known to utilize promoters, enhancers and termination and polyadenylation signals such as the 3 ′ UTR sequence of SEQ ID NO: 9. In some cases, plant expression vectors have been found to require the presence of a plant-derived intron (eg, an intron having the sequence of SEQ ID NO: 7) for stable expression. Thus, as described in more detail herein, the sequence of SEQ ID NO: 7 or any other intron with an appropriate RNA splice site can be used. Desirable vectors include the nucleic acid sequences shown in FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 or FIGS. 173-1 to 173-294.
根を有する完全な遺伝子操作植物を再生させるためには、例えばin vitro接種のような任意の技術により、あるいは完全な植物に再生されうる形質転換植物細胞を得るための任意の公知のin vitro組織培養技術により、核酸を植物細胞内に挿入することが可能である。したがって、例えば、植物細胞内への挿入は、病原性または非病原性A tumefaciensによるin vitro接種によるものでありうる。他のそのような組織培養技術も用いられうる。 In order to regenerate fully engineered plants with roots, any known in vitro tissue can be obtained by any technique such as in vitro inoculation or to obtain transformed plant cells that can be regenerated into complete plants. Nucleic acids can be inserted into plant cells by culture techniques. Thus, for example, insertion into plant cells can be by in vitro inoculation with pathogenic or non-pathogenic Atumefaciens. Other such tissue culture techniques can also be used.
「植物組織」、「植物成分」または「植物細胞」には、植物の分化および未分化組織が含まれ、限定的なものではないが根、苗条、葉、花粉、種子、腫瘍組織および培養内の種々の形態の細胞、例えば単細胞、プロトプラスト、胚およびカルス組織が含まれる。植物組織はイン・プランタ(in planta)または器官、組織または細胞培養内のものでありうる。 "Plant tissue", "plant component" or "plant cell" includes plant differentiated and undifferentiated tissue, including but not limited to roots, shoots, leaves, pollen, seeds, tumor tissue and in culture Various forms of cells, such as single cells, protoplasts, embryos and callus tissues. Plant tissue can be in planta or in organ, tissue or cell culture.
本明細書中で用いる「植物細胞」は、イン・プランタ(in planta)の植物細胞、ならびに培養内の植物細胞およびプロトプラストを含む。「cDNA」または「相補的DNA」は、一般には、イントロンを含有するプロセシングされていないRNA分子に相補的な又はイントロンを欠くプロセシングされたmRNAに相補的なヌクレオチド配列を有する一本鎖DNA分子を意味する。cDNAはRNA鋳型に対する逆転写酵素の作用により形成される。 As used herein, “plant cells” includes plant cells of in planta, as well as plant cells and protoplasts in culture. “CDNA” or “complementary DNA” generally refers to a single-stranded DNA molecule having a nucleotide sequence that is complementary to an unprocessed RNA molecule containing an intron or complementary to a processed mRNA that lacks an intron. means. cDNA is formed by the action of reverse transcriptase on the RNA template.
本明細書中で用いる「タバコ」は、火力乾燥(フルーキュアリング)、バージニア、バーレー、いぶし(dark)タバコ、オリエンタル、およびNicotiana属の植物の他のタイプの植物を含む。Nicotiana属の種子はNicotiana tabacumの形態で商業的に容易に入手可能である。 As used herein, “tobacco” includes fire-cured, virginia, burley, dark tobacco, oriental, and other types of plants of the genus Nicotiana. Nicotiana seeds are readily available commercially in the form of Nicotiana tabacum.
「製造品」または「タバコ製品」は、湿性もしくは乾燥かぎタバコ、噛みタバコ、巻きタバコ製品、葉巻製品、シガリーロ、パイプタバコ、ビーディ(bidi)および同様のタバコ由来製品のような製品を含む。 “Manufactured product” or “tobacco product” includes products such as wet or dry hookah, chewing tobacco, cigarette products, cigar products, cigarillos, pipe tobacco, bidi and similar tobacco-derived products.
「遺伝子サイレンシング」は、対照植物(例えば、野生型タバコ植物)におけるレベルに対して少なくとも30〜50%、好ましくは少なくとも50〜80%、より好ましくは少なくとも80〜95%またはそれ以上の遺伝子発現(例えば、タバコニコチンデメチラーゼをコードする遺伝子の発現)のレベルの低下を意味する。そのような発現レベルの低下は、当技術分野で公知の標準的な方法、例えばRNA干渉、三本鎖干渉、リボザイム、相同組換え、ウイルス誘導性遺伝子サイレンシング、アンチセンスおよび共抑制技術、ドミナントネガティブ遺伝子産物の発現、標準的な変異誘発技術を用いる変異遺伝子の生成(例えば、本明細書に記載されているもの)を用いることにより達成されうる。タバコニコチンデメチラーゼポリペプチドまたは転写産物またはそれらの両方のレベルは、限定的なものではないがノーザンブロット法、RNアーゼプロテクションまたは免疫ブロット法を含む任意の標準的な技術によりモニターされる。 “Gene silencing” is a gene expression of at least 30-50%, preferably at least 50-80%, more preferably at least 80-95% or more relative to the level in a control plant (eg, a wild-type tobacco plant). It means a reduction in the level of (eg the expression of a gene encoding tobacco nicotine demethylase). Such reduction in expression level is achieved by standard methods known in the art, such as RNA interference, triple-stranded interference, ribozyme, homologous recombination, virus-induced gene silencing, antisense and cosuppression techniques, dominant It can be achieved by expression of negative gene products, generation of mutant genes using standard mutagenesis techniques (eg, those described herein). The level of tobacco nicotine demethylase polypeptide or transcript or both is monitored by any standard technique including, but not limited to, Northern blotting, RNase protection or immunoblotting.
アミノ酸配列の「断片」または「一部(部分)」は、図1、3、4、10〜158、160A〜160E、162〜170および172-1〜172-19に示すアミノ酸配列のいずれかの少なくとも例えば20、15、30、50、75、100、250、300、400または500個の連続的アミノ酸を意味する。典型的な望ましい断片は配列番号3の配列のアミノ酸1-313および配列番号3の配列のアミノ酸314-517ならびに配列番号2および63の配列である。また、核酸配列の断片または一部に関しては、望ましい断片は、1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す核酸配列のいずれかの少なくとも100、250、500、750、1000または1500個の連続的アミノ酸を含む。典型的な望ましい断片は配列番号4の配列の核酸1-2009、2010-2949、2950-3946、3947-4562、4563-6347および4731-6347である。 The “fragment” or “part” of the amino acid sequence is any of the amino acid sequences shown in FIGS. 1, 3, 4, 10 to 158, 160A to 160E, 162 to 170, and 172-1 to 172-19. By means of at least 20, 15, 30, 50, 75, 100, 250, 300, 400 or 500 consecutive amino acids. Exemplary desirable fragments are amino acids 1-313 of the sequence of SEQ ID NO: 3, amino acids 314-517 of the sequence of SEQ ID NO: 3, and sequences of SEQ ID NOs: 2 and 63. Also, with respect to fragments or parts of nucleic acid sequences, desirable fragments are those of the nucleic acid sequences shown in 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to 173-294. Any of at least 100, 250, 500, 750, 1000 or 1500 consecutive amino acids. Exemplary desirable fragments are nucleic acids 1-2009, 2010-2949, 2950-3946, 3947-4562, 4563-6347 and 4731-6347 of the sequence of SEQ ID NO: 4.
「実質的に純粋なポリペプチド」は、天然でそれに付随するほとんどの成分から分離されたポリペプチドを意味する。しかし、少なくとも8.3pKa/mgタンパク質の酵素活性を有する調製物に伴うミクロソーム画分において見出される他のタンパク質も、実質的に純粋なポリペプチドであるとみなされる。典型的には、該ポリペプチドは、それに天然で付随するタンパク質および天然に存在する有機分子からそれが少なくとも60重量%フリーである場合に実質的に純粋である。好ましくは、該調製物は少なくとも75重量%、より好ましくは少なくとも90重量%、最も好ましくは少なくとも99重量%の所望のポリペプチドを含有する。実質的に純粋なポリペプチドは、例えば、天然源(例えば、タバコ植物細胞)からの抽出、該ポリペプチドをコードする組換え核酸の発現、または該タンパク質の化学合成により得られうる。純度は、任意の適当な方法、例えばカラムクロマトグラフィー、ポリアクリルアミドゲル電気泳動またはHPLC分析により測定されうる。 By “substantially pure polypeptide” is meant a polypeptide that has been separated from most components that naturally accompany it. However, other proteins found in the microsomal fraction associated with preparations having an enzymatic activity of at least 8.3 pKa / mg protein are also considered to be substantially pure polypeptides. Typically, the polypeptide is substantially pure when it is at least 60% by weight free from the proteins and naturally occurring organic molecules that naturally accompany it. Preferably, the preparation contains at least 75%, more preferably at least 90%, most preferably at least 99% by weight of the desired polypeptide. A substantially pure polypeptide can be obtained, for example, by extraction from a natural source (eg, tobacco plant cells), expression of a recombinant nucleic acid encoding the polypeptide, or chemical synthesis of the protein. Purity can be measured by any appropriate method, such as column chromatography, polyacrylamide gel electrophoresis, or HPLC analysis.
「単離された核酸分子」は、生物のゲノム内の核酸分子の配列に天然で隣接している核酸配列を含有しない核酸配列を意味する。 By “isolated nucleic acid molecule” is meant a nucleic acid sequence that does not contain a nucleic acid sequence that is naturally adjacent to the sequence of the nucleic acid molecule in the genome of an organism.
「形質転換細胞」は、組換えDNA技術によりDNA分子[例えば、タバコニコチンデメチラーゼをコードするDNA分子または本明細書に開示する核酸配列(例えば、1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す核酸配列)のいずれか]が導入された細胞(またはその祖先)を意味する。 A “transformed cell” is a DNA molecule [eg, a DNA molecule encoding tobacco nicotine demethylase or a nucleic acid sequence disclosed herein (eg, 1, 3-7, 10-158, 162- 170, 172-1 to 172-19 and nucleic acid sequences shown in 173-1 to 173-294)] or the ancestor thereof.
本明細書中で用いる「タバコニコチンデメチラーゼ」または「ニコチンデメチラーゼ」は、配列番号3の配列に実質的と同一であるポリペプチドを意味する。望ましくは、タバコニコチンデメチラーゼは、ニコチン(C10H14N2、3-(1-メチル-2-ピロリジニル)ピリジンとも称される)をノルニコチン(C9H12N2)へ変換しうる。タバコニコチンデメチラーゼの活性は、当技術分野において標準的な方法を用いて、例えば、本明細書に記載されているとおり、酵母発現ミクロソームによる放射性ニコチンの脱メチル化を測定することによりアッセイされうる。 As used herein, “tobacco nicotine demethylase” or “nicotine demethylase” refers to a polypeptide that is substantially identical to the sequence of SEQ ID NO: 3. Desirably, tobacco nicotine demethylase can convert nicotine (also referred to as C 10 H 14 N 2 , 3- (1-methyl-2-pyrrolidinyl) pyridine) to nornicotine (C 9 H 12 N 2 ). The activity of tobacco nicotine demethylase can be assayed using standard methods in the art, for example, by measuring the demethylation of radioactive nicotine by yeast-expressing microsomes as described herein. .
本明細書中で用いる「シトクロムp450」および「p450」は互換的に用いられる。 As used herein, “cytochrome p450” and “p450” are used interchangeably.
本発明の他の特徴および利点は以下の詳細な説明、図面および特許請求の範囲から明らかであろう。 Other features and advantages of the invention will be apparent from the following detailed description, drawings, and claims.
図面の簡潔な説明
図1は、D35-BG11 (配列番号1)の核酸配列およびその翻訳産物 (配列番号2)である。
図2は、タバコニコチンデメチラーゼ遺伝子のゲノム構造の概要図である。
図3は、ゲノムタバコニコチンデメチラーゼ核酸配列 (配列番号4)およびその翻訳産物 (配列番号3)である。
図4は、タバコニコチンデメチラーゼ遺伝子のコード領域の核酸配列 (配列番号5)およびその翻訳産物 (配列番号6)である。
図5は、タバコニコチンデメチラーゼゲノム配列内に存在するイントロンの核酸配列 (配列番号7)である。
図6は、タバコデメチラーゼ遺伝子プロモーターの核酸配列 (配列番号8)である。
図7は、タバコニコチンデメチラーゼ遺伝子の3’UTRの核酸配列 (配列番号9)である。
図8は、Geno完全長(“FL”)プライマーセットでのタバコ系統のPCR産物を示す電気泳動イメージである。
図9は、実施例17に記載のプライマーセット(1), (2), (3)および(4)でのタバコ系統のPCR産物を示す電気泳動イメージである。該バンドのおおよそのサイズは、FLに関しては3,500ヌクレオチド(nt)、(1)に関しては2,600 nt、(2)に関しては1,400 nt、(3)に関しては600 ntおよび(4)に関しては1,400 ntである。
図10は、D58-BG7の核酸配列(配列番号10)およびD58-BG7のアミノ酸配列(配列番号11) (これはD58-BG7(配列番号10)の翻訳体である)である。
BRIEF DESCRIPTION OF THE FIGURES FIG. 1 shows the nucleic acid sequence of D35-BG11 (SEQ ID NO: 1) and its translation product (SEQ ID NO: 2).
FIG. 2 is a schematic diagram of the genomic structure of the tobacco nicotine demethylase gene.
FIG. 3 is the genomic tobacco nicotine demethylase nucleic acid sequence (SEQ ID NO: 4) and its translation product (SEQ ID NO: 3).
FIG. 4 shows the nucleic acid sequence (SEQ ID NO: 5) of the coding region of the tobacco nicotine demethylase gene and its translation product (SEQ ID NO: 6).
FIG. 5 is the nucleic acid sequence of an intron (SEQ ID NO: 7) present within the tobacco nicotine demethylase genomic sequence.
FIG. 6 is the nucleic acid sequence (SEQ ID NO: 8) of the tobacco demethylase gene promoter.
FIG. 7 is the nucleic acid sequence of the 3′UTR of the tobacco nicotine demethylase gene (SEQ ID NO: 9).
FIG. 8 is an electrophoresis image showing tobacco line PCR products with Geno full length (“FL”) primer set.
FIG. 9 is an electrophoretic image showing the PCR product of the tobacco line with the primer sets (1), (2), (3) and (4) described in Example 17. The approximate size of the band is 3,500 nucleotides (nt) for FL, 2,600 nt for (1), 1,400 nt for (2), 600 nt for (3) and 1,400 nt for (4) .
FIG. 10 shows the nucleic acid sequence of D58-BG7 (SEQ ID NO: 10) and the amino acid sequence of D58-BG7 (SEQ ID NO: 11) (this is a translation of D58-BG7 (SEQ ID NO: 10)).
図11は、D58-AB1の核酸配列(配列番号12)およびD58-AB1のアミノ酸配列(配列番号13) (これはD58-AB1(配列番号12)の翻訳体である)である。
図12は、D186-AH4の核酸配列(配列番号14)およびD186-AH4のアミノ酸配列(配列番号15) (これはD186-AH4(配列番号14)の翻訳体である)である。
図13は、D58-BE4の核酸配列(配列番号16)およびD58-BE4のアミノ酸配列(配列番号17) (これはD58-BE4(配列番号16)の翻訳体である)である。
図14は、D56-AH7の核酸配列(配列番号18)およびD56-AH7のアミノ酸配列(配列番号19) (これはD56-AH7(配列番号18)の翻訳体である)である。
図15は、D13a-5の核酸配列(配列番号20)およびD13a-5のアミノ酸配列(配列番号21) (これはD13a-5(配列番号20)の翻訳体である)である。
図16は、D56-AG10の核酸配列(配列番号22)およびD56-AG10のアミノ酸配列(配列番号23) (これはD56-AG10(配列番号22)の翻訳体である)である。
図17は、D35-33の核酸配列(配列番号24)およびD35-33のアミノ酸配列(配列番号25) (これはD35-33(配列番号24)の翻訳体である)である。
図18は、D34-62の核酸配列(配列番号26)およびD34-62のアミノ酸配列(配列番号27) (これはD34-62(配列番号26)の翻訳体である)である。
図19は、D56-AA7の核酸配列(配列番号28)およびD56-AA7のアミノ酸配列(配列番号29) (これはD56-AA7(配列番号28)の翻訳体である)である。
図20は、D56-AE1の核酸配列(配列番号30)およびD56-AE1のアミノ酸配列(配列番号31) (これはD56-AE1(配列番号30)の翻訳体である)である。
FIG. 11 shows the nucleic acid sequence of D58-AB1 (SEQ ID NO: 12) and the amino acid sequence of D58-AB1 (SEQ ID NO: 13) (this is a translation of D58-AB1 (SEQ ID NO: 12)).
FIG. 12 shows the nucleic acid sequence of D186-AH4 (SEQ ID NO: 14) and the amino acid sequence of D186-AH4 (SEQ ID NO: 15) (this is a translation of D186-AH4 (SEQ ID NO: 14)).
FIG. 13 shows the nucleic acid sequence of D58-BE4 (SEQ ID NO: 16) and the amino acid sequence of D58-BE4 (SEQ ID NO: 17) (this is a translation of D58-BE4 (SEQ ID NO: 16)).
FIG. 14 shows the nucleic acid sequence of D56-AH7 (SEQ ID NO: 18) and the amino acid sequence of D56-AH7 (SEQ ID NO: 19) (which is a translation of D56-AH7 (SEQ ID NO: 18)).
FIG. 15 shows the nucleic acid sequence of D13a-5 (SEQ ID NO: 20) and the amino acid sequence of D13a-5 (SEQ ID NO: 21) (this is a translation of D13a-5 (SEQ ID NO: 20)).
FIG. 16 shows the nucleic acid sequence of D56-AG10 (SEQ ID NO: 22) and the amino acid sequence of D56-AG10 (SEQ ID NO: 23) (this is a translation of D56-AG10 (SEQ ID NO: 22)).
FIG. 17 shows the nucleic acid sequence of D35-33 (SEQ ID NO: 24) and the amino acid sequence of D35-33 (SEQ ID NO: 25) (this is a translation of D35-33 (SEQ ID NO: 24)).
FIG. 18 shows the nucleic acid sequence of D34-62 (SEQ ID NO: 26) and the amino acid sequence of D34-62 (SEQ ID NO: 27) (this is a translation of D34-62 (SEQ ID NO: 26)).
FIG. 19 shows the nucleic acid sequence of D56-AA7 (SEQ ID NO: 28) and the amino acid sequence of D56-AA7 (SEQ ID NO: 29) (this is a translation of D56-AA7 (SEQ ID NO: 28)).
FIG. 20 shows the nucleic acid sequence of D56-AE1 (SEQ ID NO: 30) and the amino acid sequence of D56-AE1 (SEQ ID NO: 31) (this is a translation of D56-AE1 (SEQ ID NO: 30)).
図21は、D35-BB7の核酸配列(配列番号32)およびD35-BB7のアミノ酸配列(配列番号33) (これはD35-BB7(配列番号32)の翻訳体である)である。
図22は、D177-BA7の核酸配列(配列番号34)およびD177-BA7のアミノ酸配列(配列番号35) (これはD177-BA7(配列番号34)の翻訳体である)である。
図23は、D56A-AB6の核酸配列(配列番号36)およびD56A-AB6のアミノ酸配列(配列番号37) (これはD56A-AB6(配列番号36)の翻訳体である)である。
図24は、D144-AE2の核酸配列(配列番号38)およびD144-AE2のアミノ酸配列(配列番号39) (これはD144-AE2(配列番号38)の翻訳体である)である。
図25は、D56-AG11の核酸配列(配列番号40)およびD56-AG11のアミノ酸配列(配列番号41) (これはD56-AG11(配列番号40)の翻訳体である)である。
図26は、D179-AA1の核酸配列(配列番号42)およびD179-AA1のアミノ酸配列(配列番号43) (これはD179-AA1(配列番号42)の翻訳体である)である。
図27は、D56-AC7の核酸配列(配列番号44)およびD56-AC7のアミノ酸配列(配列番号45) (これはD56-AC7(配列番号44)の翻訳体である)である。
図28は、D144-AD1の核酸配列(配列番号46)およびD144-AD1のアミノ酸配列(配列番号47) (これはD144-AD1(配列番号46)の翻訳体である)である。
図29は、D144-AB5の核酸配列(配列番号48)およびD144-AB5のアミノ酸配列(配列番号49) (これはD144-AB5(配列番号48)の翻訳体である)である。
図30は、D181-AB5の核酸配列(配列番号50)およびD181-AB5のアミノ酸配列(配列番号51) (これはD181-AB5(配列番号50)の翻訳体である)である。
FIG. 21 shows the nucleic acid sequence of D35-BB7 (SEQ ID NO: 32) and the amino acid sequence of D35-BB7 (SEQ ID NO: 33) (this is a translation of D35-BB7 (SEQ ID NO: 32)).
FIG. 22 shows the nucleic acid sequence of D177-BA7 (SEQ ID NO: 34) and the amino acid sequence of D177-BA7 (SEQ ID NO: 35) (this is a translation of D177-BA7 (SEQ ID NO: 34)).
FIG. 23 shows the nucleic acid sequence of D56A-AB6 (SEQ ID NO: 36) and the amino acid sequence of D56A-AB6 (SEQ ID NO: 37) (this is a translation of D56A-AB6 (SEQ ID NO: 36)).
FIG. 24 shows the nucleic acid sequence of D144-AE2 (SEQ ID NO: 38) and the amino acid sequence of D144-AE2 (SEQ ID NO: 39) (this is a translation of D144-AE2 (SEQ ID NO: 38)).
FIG. 25 shows the nucleic acid sequence of D56-AG11 (SEQ ID NO: 40) and the amino acid sequence of D56-AG11 (SEQ ID NO: 41) (this is a translation of D56-AG11 (SEQ ID NO: 40)).
FIG. 26 shows the nucleic acid sequence of D179-AA1 (SEQ ID NO: 42) and the amino acid sequence of D179-AA1 (SEQ ID NO: 43) (this is a translation of D179-AA1 (SEQ ID NO: 42)).
FIG. 27 shows the nucleic acid sequence of D56-AC7 (SEQ ID NO: 44) and the amino acid sequence of D56-AC7 (SEQ ID NO: 45) (which is a translation of D56-AC7 (SEQ ID NO: 44)).
FIG. 28 shows the nucleic acid sequence of D144-AD1 (SEQ ID NO: 46) and the amino acid sequence of D144-AD1 (SEQ ID NO: 47) (this is a translation of D144-AD1 (SEQ ID NO: 46)).
FIG. 29 shows the nucleic acid sequence of D144-AB5 (SEQ ID NO: 48) and the amino acid sequence of D144-AB5 (SEQ ID NO: 49) (this is a translation of D144-AB5 (SEQ ID NO: 48)).
FIG. 30 shows the nucleic acid sequence of D181-AB5 (SEQ ID NO: 50) and the amino acid sequence of D181-AB5 (SEQ ID NO: 51) (this is a translation of D181-AB5 (SEQ ID NO: 50)).
図31は、D73-AC9の核酸配列(配列番号52)およびD73-AC9のアミノ酸配列(配列番号53) (これはD73-AC9(配列番号52)の翻訳体である)である。
図32は、D56-AC12の核酸配列(配列番号54)およびD56-AC12のアミノ酸配列(配列番号55) (これはD56-AC12(配列番号54)の翻訳体である)である。
図33は、D58-AB9の核酸配列(配列番号56)およびD58-AB9のアミノ酸配列(配列番号57) (これはD58-AB9(配列番号56)の翻訳体である)である。
図34は、D56-AG9の核酸配列(配列番号58)およびD56-AG9のアミノ酸配列(配列番号59) (これはD56-AG9(配列番号58)の翻訳体である)である。
図35は、D56-AG6の核酸配列(配列番号60)およびD56-AG6のアミノ酸配列(配列番号61) (これはD56-AG6(配列番号60)の翻訳体である)である。
図36は、D35-BG11の核酸配列(配列番号62)およびD35-BG11のアミノ酸配列(配列番号63) (これはD35-BG11(配列番号62)の翻訳体である)である。
図37は、D35-42の核酸配列(配列番号64)およびD35-42のアミノ酸配列(配列番号65) (これはD35-42(配列番号64)の翻訳体である)である。
図38は、D35-BA3の核酸配列(配列番号66)およびD35-BA3のアミノ酸配列(配列番号67) (これはD35-BA3(配列番号66)の翻訳体である)である。
図39は、D34-57の核酸配列 (配列番号68)およびD34-57のアミノ酸配列(配列番号69) (これはD34-57(配列番号68)の翻訳体である)である。
図40は、D34-52の核酸配列(配列番号70)およびD34-52のアミノ酸配列(配列番号71) (これはD34-52(配列番号70)の翻訳体である)である。
FIG. 31 shows the nucleic acid sequence of D73-AC9 (SEQ ID NO: 52) and the amino acid sequence of D73-AC9 (SEQ ID NO: 53) (this is a translation of D73-AC9 (SEQ ID NO: 52)).
FIG. 32 shows the nucleic acid sequence of D56-AC12 (SEQ ID NO: 54) and the amino acid sequence of D56-AC12 (SEQ ID NO: 55) (this is a translation of D56-AC12 (SEQ ID NO: 54)).
FIG. 33 shows the nucleic acid sequence of D58-AB9 (SEQ ID NO: 56) and the amino acid sequence of D58-AB9 (SEQ ID NO: 57) (this is a translation of D58-AB9 (SEQ ID NO: 56)).
FIG. 34 shows the nucleic acid sequence of D56-AG9 (SEQ ID NO: 58) and the amino acid sequence of D56-AG9 (SEQ ID NO: 59) (this is a translation of D56-AG9 (SEQ ID NO: 58)).
FIG. 35 shows the nucleic acid sequence of D56-AG6 (SEQ ID NO: 60) and the amino acid sequence of D56-AG6 (SEQ ID NO: 61) (this is a translation of D56-AG6 (SEQ ID NO: 60)).
FIG. 36 shows the nucleic acid sequence of D35-BG11 (SEQ ID NO: 62) and the amino acid sequence of D35-BG11 (SEQ ID NO: 63) (this is a translation of D35-BG11 (SEQ ID NO: 62)).
FIG. 37 shows the nucleic acid sequence of D35-42 (SEQ ID NO: 64) and the amino acid sequence of D35-42 (SEQ ID NO: 65) (which is a translation of D35-42 (SEQ ID NO: 64)).
FIG. 38 shows the nucleic acid sequence of D35-BA3 (SEQ ID NO: 66) and the amino acid sequence of D35-BA3 (SEQ ID NO: 67) (this is a translation of D35-BA3 (SEQ ID NO: 66)).
FIG. 39 shows the nucleic acid sequence of D34-57 (SEQ ID NO: 68) and the amino acid sequence of D34-57 (SEQ ID NO: 69), which is a translation of D34-57 (SEQ ID NO: 68).
FIG. 40 is the nucleic acid sequence of D34-52 (SEQ ID NO: 70) and the amino acid sequence of D34-52 (SEQ ID NO: 71) (this is a translation of D34-52 (SEQ ID NO: 70)).
図41は、D34-25の核酸配列(配列番号72)およびD34-25のアミノ酸配列(配列番号73) (これはD34-25(配列番号72)の翻訳体である)である。
図42は、D56AD10の核酸配列(配列番号74)およびD56AD10のアミノ酸配列(配列番号75) (これはD56AD10(配列番号74)の翻訳体である)である。
図43は、D56-AA11の核酸配列(配列番号76)およびD56-AA11のアミノ酸配列(配列番号77) (これはD56-AA11(配列番号76)の翻訳体である)である。
図44は、D177-BD5の核酸配列(配列番号78)およびD177-BD5のアミノ酸配列(配列番号79) (これはD177-BD5(配列番号78)の翻訳体である)である。
図45は、D56A-AG10の核酸配列(配列番号80)およびD56A-AG10のアミノ酸配列(配列番号81) (これはD56A-AG10(配列番号80)の翻訳体である)である。
図46は、D58-BC5の核酸配列(配列番号82)およびD58-BC5のアミノ酸配列(配列番号83) (これはD58-BC5(配列番号82)の翻訳体である)である。
図47は、D58-AD12の核酸配列(配列番号84)およびD58-AD12のアミノ酸配列(配列番号85) (これはD58-AD12(配列番号84)の翻訳体である)である。
図48は、D56-AC11の核酸配列(配列番号86)およびD56-AC11のアミノ酸配列(配列番号87) (これはD56-AC11(配列番号86)の翻訳体である)である。
図49は、D35-39の核酸配列(配列番号88)およびD35-39のアミノ酸配列(配列番号89) (これはD35-39(配列番号88)の翻訳体である)である。
図50は、D58-BH4の核酸配列(配列番号90)およびD58-BH4のアミノ酸配列(配列番号91) (これはD58-BH4(配列番号90)の翻訳体である)である。
FIG. 41 shows the nucleic acid sequence of D34-25 (SEQ ID NO: 72) and the amino acid sequence of D34-25 (SEQ ID NO: 73) (which is a translation of D34-25 (SEQ ID NO: 72)).
FIG. 42 shows the nucleic acid sequence of D56AD10 (SEQ ID NO: 74) and the amino acid sequence of D56AD10 (SEQ ID NO: 75) (which is a translation of D56AD10 (SEQ ID NO: 74)).
FIG. 43 shows the nucleic acid sequence of D56-AA11 (SEQ ID NO: 76) and the amino acid sequence of D56-AA11 (SEQ ID NO: 77) (which is a translation of D56-AA11 (SEQ ID NO: 76)).
FIG. 44 shows the nucleic acid sequence of D177-BD5 (SEQ ID NO: 78) and the amino acid sequence of D177-BD5 (SEQ ID NO: 79) (this is a translation of D177-BD5 (SEQ ID NO: 78)).
FIG. 45 shows the nucleic acid sequence of D56A-AG10 (SEQ ID NO: 80) and the amino acid sequence of D56A-AG10 (SEQ ID NO: 81) (this is a translation of D56A-AG10 (SEQ ID NO: 80)).
FIG. 46 shows the nucleic acid sequence of D58-BC5 (SEQ ID NO: 82) and the amino acid sequence of D58-BC5 (SEQ ID NO: 83) (this is a translation of D58-BC5 (SEQ ID NO: 82)).
FIG. 47 shows the nucleic acid sequence of D58-AD12 (SEQ ID NO: 84) and the amino acid sequence of D58-AD12 (SEQ ID NO: 85) (this is a translation of D58-AD12 (SEQ ID NO: 84)).
FIG. 48 shows the nucleic acid sequence of D56-AC11 (SEQ ID NO: 86) and the amino acid sequence of D56-AC11 (SEQ ID NO: 87) (which is a translation of D56-AC11 (SEQ ID NO: 86)).
FIG. 49 shows the nucleic acid sequence of D35-39 (SEQ ID NO: 88) and the amino acid sequence of D35-39 (SEQ ID NO: 89) (which is a translation of D35-39 (SEQ ID NO: 88)).
FIG. 50 is the nucleic acid sequence of D58-BH4 (SEQ ID NO: 90) and the amino acid sequence of D58-BH4 (SEQ ID NO: 91), which is a translation of D58-BH4 (SEQ ID NO: 90).
図51は、D177-BD7の核酸配列(配列番号92)およびD177-BD7のアミノ酸配列(配列番号93) (これはD177-BD7(配列番号92)の翻訳体である)である。
図52は、D176-BF2の核酸配列(配列番号94)およびD176-BF2のアミノ酸配列(配列番号95) (これはD176-BF2(配列番号94)の翻訳体である)である。
図53は、D56-AD6の核酸配列(配列番号96)およびD56-AD6のアミノ酸配列(配列番号97) (これはD56-AD6(配列番号96)の翻訳体である)である。
図54は、D73A-AD6の核酸配列(配列番号98)およびD73A-AD6のアミノ酸配列(配列番号99) (これはD73A-AD6(配列番号98)の翻訳体である)である。
図55は、D70A-BA11の核酸配列(配列番号100)およびD70A-BA11のアミノ酸配列(配列番号101) (これはD70A-BA11(配列番号100)の翻訳体である)である。
図56は、D70A-BB5の核酸配列(配列番号102)およびD70A-BB5のアミノ酸配列(配列番号103) (これはD70A-BB5(配列番号102)の翻訳体である)である。
図57は、D70A-AB5の核酸配列(配列番号104)およびD70A-AB5のアミノ酸配列(配列番号105) (これはD70A-AB5(配列番号104)の翻訳体である)である。
図58は、D70A-AA8の核酸配列(配列番号106)およびD70A-AA8のアミノ酸配列(配列番号107) (これはD70A-AA8(配列番号106)の翻訳体である)である。
図59は、D70A-AB8の核酸配列(配列番号108)およびD70A-AB8のアミノ酸配列(配列番号109) (これはD70A-AB8(配列番号108)の翻訳体である)である。
図60は、D70A-BH2の核酸配列(配列番号110)およびD70A-BH2のアミノ酸配列(配列番号111) (これはD70A-BH2(配列番号110)の翻訳体である)である。
FIG. 51 shows the nucleic acid sequence of D177-BD7 (SEQ ID NO: 92) and the amino acid sequence of D177-BD7 (SEQ ID NO: 93) (this is a translation of D177-BD7 (SEQ ID NO: 92)).
FIG. 52 shows the nucleic acid sequence of D176-BF2 (SEQ ID NO: 94) and the amino acid sequence of D176-BF2 (SEQ ID NO: 95) (this is a translation of D176-BF2 (SEQ ID NO: 94)).
FIG. 53 shows the nucleic acid sequence of D56-AD6 (SEQ ID NO: 96) and the amino acid sequence of D56-AD6 (SEQ ID NO: 97) (this is a translation of D56-AD6 (SEQ ID NO: 96)).
FIG. 54 shows the nucleic acid sequence of D73A-AD6 (SEQ ID NO: 98) and the amino acid sequence of D73A-AD6 (SEQ ID NO: 99) (this is a translation of D73A-AD6 (SEQ ID NO: 98)).
FIG. 55 shows the nucleic acid sequence of D70A-BA11 (SEQ ID NO: 100) and the amino acid sequence of D70A-BA11 (SEQ ID NO: 101) (this is a translation of D70A-BA11 (SEQ ID NO: 100)).
FIG. 56 shows the nucleic acid sequence of D70A-BB5 (SEQ ID NO: 102) and the amino acid sequence of D70A-BB5 (SEQ ID NO: 103) (this is a translation of D70A-BB5 (SEQ ID NO: 102)).
FIG. 57 shows the nucleic acid sequence of D70A-AB5 (SEQ ID NO: 104) and the amino acid sequence of D70A-AB5 (SEQ ID NO: 105) (this is a translation of D70A-AB5 (SEQ ID NO: 104)).
FIG. 58 shows the nucleic acid sequence of D70A-AA8 (SEQ ID NO: 106) and the amino acid sequence of D70A-AA8 (SEQ ID NO: 107) (which is a translation of D70A-AA8 (SEQ ID NO: 106)).
FIG. 59 shows the nucleic acid sequence of D70A-AB8 (SEQ ID NO: 108) and the amino acid sequence of D70A-AB8 (SEQ ID NO: 109) (this is a translation of D70A-AB8 (SEQ ID NO: 108)).
FIG. 60 shows the nucleic acid sequence of D70A-BH2 (SEQ ID NO: 110) and the amino acid sequence of D70A-BH2 (SEQ ID NO: 111) (this is a translation of D70A-BH2 (SEQ ID NO: 110)).
図61は、D70A-AA4の核酸配列(配列番号112)およびD70A-AA4のアミノ酸配列(配列番号113) (これはD70A-AA4(配列番号112)の翻訳体である)である。
図62は、D70A-BA1の核酸配列(配列番号114)およびD70A-BA1のアミノ酸配列(配列番号115) (これはD70A-BA1(配列番号114)の翻訳体である)である。
図63は、D70A-BA9の核酸配列(配列番号116)およびD70A-BA9のアミノ酸配列(配列番号117) (これはD70A-BA9(配列番号116)の翻訳体である)である。
図64は、D70A-BD4の核酸配列(配列番号118)およびD70A-BD4のアミノ酸配列(配列番号119) (これはD70A-BD4(配列番号118)の翻訳体である)である。
図65は、D181-AC5の核酸配列(配列番号120)およびD181-AC5のアミノ酸配列(配列番号121) (これはD181-AC5(配列番号120)の翻訳体である)である。
図66は、D144-AH1の核酸配列(配列番号122)およびD144-AH1のアミノ酸配列(配列番号123) (これはD144-AH1(配列番号122)の翻訳体である)である。
図67は、D34-65の核酸配列(配列番号124)およびD34-65のアミノ酸配列(配列番号125) (これはD34-65(配列番号124)の翻訳体である)である。
図68は、D35-BG2の核酸配列(配列番号126)およびD35-BG2のアミノ酸配列(配列番号127) (これはD35-BG2(配列番号126)の翻訳体である)である。
図69は、D73A-AH7の核酸配列(配列番号128)およびD73A-AH7のアミノ酸配列(配列番号129) (これはD73A-AH7(配列番号128)の翻訳体である)である。
図70は、D58-AA1の核酸配列(配列番号130)およびD58-AA1のアミノ酸配列(配列番号131) (これはD58-AA1(配列番号130)の翻訳体である)である。
FIG. 61 shows the nucleic acid sequence of D70A-AA4 (SEQ ID NO: 112) and the amino acid sequence of D70A-AA4 (SEQ ID NO: 113) (which is a translation of D70A-AA4 (SEQ ID NO: 112)).
FIG. 62 shows the nucleic acid sequence of D70A-BA1 (SEQ ID NO: 114) and the amino acid sequence of D70A-BA1 (SEQ ID NO: 115) (this is a translation of D70A-BA1 (SEQ ID NO: 114)).
FIG. 63 shows the nucleic acid sequence of D70A-BA9 (SEQ ID NO: 116) and the amino acid sequence of D70A-BA9 (SEQ ID NO: 117) (this is a translation of D70A-BA9 (SEQ ID NO: 116)).
FIG. 64 shows the nucleic acid sequence of D70A-BD4 (SEQ ID NO: 118) and the amino acid sequence of D70A-BD4 (SEQ ID NO: 119) (this is a translation of D70A-BD4 (SEQ ID NO: 118)).
FIG. 65 shows the nucleic acid sequence of D181-AC5 (SEQ ID NO: 120) and the amino acid sequence of D181-AC5 (SEQ ID NO: 121) (this is a translation of D181-AC5 (SEQ ID NO: 120)).
FIG. 66 shows the nucleic acid sequence of D144-AH1 (SEQ ID NO: 122) and the amino acid sequence of D144-AH1 (SEQ ID NO: 123) (this is a translation of D144-AH1 (SEQ ID NO: 122)).
FIG. 67 shows the nucleic acid sequence of D34-65 (SEQ ID NO: 124) and the amino acid sequence of D34-65 (SEQ ID NO: 125) (which is a translation of D34-65 (SEQ ID NO: 124)).
FIG. 68 shows the nucleic acid sequence of D35-BG2 (SEQ ID NO: 126) and the amino acid sequence of D35-BG2 (SEQ ID NO: 127) (this is a translation of D35-BG2 (SEQ ID NO: 126)).
FIG. 69 shows the nucleic acid sequence of D73A-AH7 (SEQ ID NO: 128) and the amino acid sequence of D73A-AH7 (SEQ ID NO: 129) (this is a translation of D73A-AH7 (SEQ ID NO: 128)).
FIG. 70 shows the nucleic acid sequence of D58-AA1 (SEQ ID NO: 130) and the amino acid sequence of D58-AA1 (SEQ ID NO: 131) (this is a translation of D58-AA1 (SEQ ID NO: 130)).
図71は、D73A-AE10の核酸配列(配列番号132)およびD73A-AE10のアミノ酸配列(配列番号133) (これはD73A-AE10(配列番号132)の翻訳体である)である。
図72は、D56A-AC12の核酸配列(配列番号134)およびD56A-AC12のアミノ酸配列(配列番号135) (これはD56A-AC12(配列番号134)の翻訳体である)である。
図73は、D177-BF7の核酸配列(配列番号136)およびD177-BF7のアミノ酸配列(配列番号137) (これはD177-BF7(配列番号136)の翻訳体である)である。
図74は、D73A-AG3の核酸配列(配列番号138)およびD73A-AG3のアミノ酸配列(配列番号139) (これはD73A-AG3(配列番号138)の翻訳体である)である。
図75は、D70A-AA12の核酸配列(配列番号140)およびD70A-AA12のアミノ酸配列(配列番号141) (これはD70A-AA12(配列番号140)の翻訳体である)である。
図76は、D185-BC1の核酸配列(配列番号142)およびD185-BC1のアミノ酸配列(配列番号143) (これはD185-BC1(配列番号142)の翻訳体である)である。
図77は、D185-BG2の核酸配列(配列番号144)およびD185-BG2のアミノ酸配列(配列番号145) (これはD185-BG2(配列番号144)の翻訳体である)である。
図78は、D185-BE1の核酸配列(配列番号146)およびD185-BE1のアミノ酸配列(配列番号147) (これはD185-BE1(配列番号146)の翻訳体である)である。
図79は、D185-BD2の核酸配列(配列番号148)およびD185-BD2のアミノ酸配列(配列番号149) (これはD185-BD2(配列番号148)の翻訳体である)である。
図80は、D176-BG2の核酸配列(配列番号150)およびD176-BG2のアミノ酸配列(配列番号151) (これはD176-BG2(配列番号150)の翻訳体である)である。
FIG. 71 shows the nucleic acid sequence of D73A-AE10 (SEQ ID NO: 132) and the amino acid sequence of D73A-AE10 (SEQ ID NO: 133) (this is a translation of D73A-AE10 (SEQ ID NO: 132)).
FIG. 72 is the nucleic acid sequence of D56A-AC12 (SEQ ID NO: 134) and the amino acid sequence of D56A-AC12 (SEQ ID NO: 135) (this is a translation of D56A-AC12 (SEQ ID NO: 134)).
FIG. 73 shows the nucleic acid sequence of D177-BF7 (SEQ ID NO: 136) and the amino acid sequence of D177-BF7 (SEQ ID NO: 137) (this is a translation of D177-BF7 (SEQ ID NO: 136)).
FIG. 74 shows the nucleic acid sequence of D73A-AG3 (SEQ ID NO: 138) and the amino acid sequence of D73A-AG3 (SEQ ID NO: 139) (which is a translation of D73A-AG3 (SEQ ID NO: 138)).
FIG. 75 shows the nucleic acid sequence of D70A-AA12 (SEQ ID NO: 140) and the amino acid sequence of D70A-AA12 (SEQ ID NO: 141) (this is a translation of D70A-AA12 (SEQ ID NO: 140)).
FIG. 76 shows the nucleic acid sequence of D185-BC1 (SEQ ID NO: 142) and the amino acid sequence of D185-BC1 (SEQ ID NO: 143) (this is a translation of D185-BC1 (SEQ ID NO: 142)).
FIG. 77 shows the nucleic acid sequence of D185-BG2 (SEQ ID NO: 144) and the amino acid sequence of D185-BG2 (SEQ ID NO: 145) (this is a translation of D185-BG2 (SEQ ID NO: 144)).
FIG. 78 shows the nucleic acid sequence of D185-BE1 (SEQ ID NO: 146) and the amino acid sequence of D185-BE1 (SEQ ID NO: 147) (which is a translation of D185-BE1 (SEQ ID NO: 146)).
FIG. 79 shows the nucleic acid sequence of D185-BD2 (SEQ ID NO: 148) and the amino acid sequence of D185-BD2 (SEQ ID NO: 149) (this is a translation of D185-BD2 (SEQ ID NO: 148)).
FIG. 80 shows the nucleic acid sequence of D176-BG2 (SEQ ID NO: 150) and the amino acid sequence of D176-BG2 (SEQ ID NO: 151) (this is a translation of D176-BG2 (SEQ ID NO: 150)).
図81は、D185-BD3の核酸配列(配列番号152)およびD185-BD3のアミノ酸配列(配列番号153) (これはD185-BD3(配列番号152)の翻訳体である)である。
図82は、D176-BC3の核酸配列(配列番号154)およびD176-BC3のアミノ酸配列(配列番号155) (これはD176-BC3(配列番号154)の翻訳体である)である。
図83は、D176-BB3の核酸配列(配列番号156)およびD176-BB3のアミノ酸配列(配列番号157) (これはD176-BB3(配列番号156)の翻訳体である)である。
図84は、D89-AB1の核酸配列(配列番号158)およびD89-AB1のアミノ酸配列(配列番号159) (これはD89-AB1(配列番号158)の翻訳体である)である。
図85は、D89-AD2の核酸配列(配列番号160)およびD89-AD2のアミノ酸配列(配列番号161) (これはD89-AD2(配列番号160)の翻訳体である)である。
図86は、D90A-BB3の核酸配列(配列番号162)およびD90A-BB3のアミノ酸配列(配列番号163) (これはD90A-BB3(配列番号162)の翻訳体である)である。
図87は、D95-AG1の核酸配列(配列番号164)およびD95-AG1のアミノ酸配列(配列番号165) (これはD95-AG1(配列番号164)の翻訳体である)である。
図88は、D96-AB6の核酸配列(配列番号166)およびD96-AB6のアミノ酸配列(配列番号167) (これはD96-AB6(配列番号166)の翻訳体である)である。
図89は、D96-AC2の核酸配列(配列番号168)およびD96-AC2のアミノ酸配列(配列番号169) (これはD96-AC2(配列番号168)の翻訳体である)である。
図90は、D98-AA1の核酸配列(配列番号170)およびD98-AA1のアミノ酸配列(配列番号171) (これはD98-AA1(配列番号170)の翻訳体である)である。
FIG. 81 shows the nucleic acid sequence of D185-BD3 (SEQ ID NO: 152) and the amino acid sequence of D185-BD3 (SEQ ID NO: 153) (this is a translation of D185-BD3 (SEQ ID NO: 152)).
FIG. 82 is the nucleic acid sequence of D176-BC3 (SEQ ID NO: 154) and the amino acid sequence of D176-BC3 (SEQ ID NO: 155), which is a translation of D176-BC3 (SEQ ID NO: 154).
FIG. 83 shows the nucleic acid sequence of D176-BB3 (SEQ ID NO: 156) and the amino acid sequence of D176-BB3 (SEQ ID NO: 157) (this is a translation of D176-BB3 (SEQ ID NO: 156)).
FIG. 84 shows the nucleic acid sequence of D89-AB1 (SEQ ID NO: 158) and the amino acid sequence of D89-AB1 (SEQ ID NO: 159) (this is a translation of D89-AB1 (SEQ ID NO: 158)).
FIG. 85 shows the nucleic acid sequence of D89-AD2 (SEQ ID NO: 160) and the amino acid sequence of D89-AD2 (SEQ ID NO: 161) (this is a translation of D89-AD2 (SEQ ID NO: 160)).
FIG. 86 shows the nucleic acid sequence of D90A-BB3 (SEQ ID NO: 162) and the amino acid sequence of D90A-BB3 (SEQ ID NO: 163) (which is a translation of D90A-BB3 (SEQ ID NO: 162)).
FIG. 87 shows the nucleic acid sequence of D95-AG1 (SEQ ID NO: 164) and the amino acid sequence of D95-AG1 (SEQ ID NO: 165) (which is a translation of D95-AG1 (SEQ ID NO: 164)).
FIG. 88 is the nucleic acid sequence of D96-AB6 (SEQ ID NO: 166) and the amino acid sequence of D96-AB6 (SEQ ID NO: 167) (this is a translation of D96-AB6 (SEQ ID NO: 166)).
FIG. 89 is the nucleic acid sequence of D96-AC2 (SEQ ID NO: 168) and the amino acid sequence of D96-AC2 (SEQ ID NO: 169) (this is a translation of D96-AC2 (SEQ ID NO: 168)).
FIG. 90 shows the nucleic acid sequence of D98-AA1 (SEQ ID NO: 170) and the amino acid sequence of D98-AA1 (SEQ ID NO: 171) (this is a translation of D98-AA1 (SEQ ID NO: 170)).
図91は、D98-AG1の核酸配列(配列番号172)およびD98-AG1のアミノ酸配列(配列番号173) (これはD98-AG1(配列番号172)の翻訳体である)である。
図92は、D100-BE2の核酸配列(配列番号174)およびD100-BE2のアミノ酸配列(配列番号175) (これはD100-BE2(配列番号174)の翻訳体である)である。
図93は、D100A-AC3の核酸配列(配列番号176)およびD100A-AC3のアミノ酸配列(配列番号177) (これはD100A-AC3(配列番号176)の翻訳体である)である。
図94は、D104A-AE8(69,1755)の核酸配列(配列番号178)およびD104A-AE8(69,1755)のアミノ酸配列(配列番号179) (これはD104A-AE8(69,1755)(配列番号178)の翻訳体である)である。
図95は、D105-AD6の核酸配列(配列番号180)およびD105-AD6のアミノ酸配列(配列番号181) (これはD105-AD6(配列番号180)の翻訳体である)である。
図96は、D109-AH8(14,1697)の核酸配列(配列番号182)およびD109-AH8(14,1697)のアミノ酸配列(配列番号183) (これはD109-AH8(14,1697)(配列番号182)の翻訳体である)である。
図97は、D110-AF12(166,1631)の核酸配列(配列番号184)およびD110-AF12(166,1631)のアミノ酸配列(配列番号185) (これはD110-AF12(166,1631)(配列番号184)の翻訳体である)である。
図98は、D112-AA5の核酸配列(配列番号186)およびD112-AA5のアミノ酸配列(配列番号187) (これはD112-AA5(配列番号186)の翻訳体である)である。
図99は、D120-AH4の核酸配列(配列番号188)およびD120-AH4のアミノ酸配列(配列番号189) (これはD120-AH4(配列番号188)の翻訳体である)である。
図100は、D121-AA8の核酸配列(配列番号190)およびD121-AA8のアミノ酸配列(配列番号191) (これはD121-AA8(配列番号190)の翻訳体である)である。
FIG. 91 shows the nucleic acid sequence of D98-AG1 (SEQ ID NO: 172) and the amino acid sequence of D98-AG1 (SEQ ID NO: 173) (this is a translation of D98-AG1 (SEQ ID NO: 172)).
FIG. 92 shows the nucleic acid sequence of D100-BE2 (SEQ ID NO: 174) and the amino acid sequence of D100-BE2 (SEQ ID NO: 175) (this is a translation of D100-BE2 (SEQ ID NO: 174)).
FIG. 93 shows the nucleic acid sequence of D100A-AC3 (SEQ ID NO: 176) and the amino acid sequence of D100A-AC3 (SEQ ID NO: 177) (this is a translation of D100A-AC3 (SEQ ID NO: 176)).
FIG. 94 shows the nucleic acid sequence of D104A-AE8 (69,1755) (SEQ ID NO: 178) and the amino acid sequence of D104A-AE8 (69,1755) (SEQ ID NO: 179) (this is D104A-AE8 (69,1755) (sequence No. 178).
FIG. 95 shows the nucleic acid sequence of D105-AD6 (SEQ ID NO: 180) and the amino acid sequence of D105-AD6 (SEQ ID NO: 181) (this is a translation of D105-AD6 (SEQ ID NO: 180)).
FIG. 96 shows the nucleic acid sequence of D109-AH8 (14, 1697) (SEQ ID NO: 182) and the amino acid sequence of D109-AH8 (14, 1697) (SEQ ID NO: 183) (this is D109-AH8 (14, 1697) (sequence No. 182).
FIG. 97 shows the nucleic acid sequence of D110-AF12 (166, 1631) (SEQ ID NO: 184) and the amino acid sequence of D110-AF12 (166, 1631) (SEQ ID NO: 185) (this is D110-AF12 (166, 1631) (sequence No. 184).
FIG. 98 shows the nucleic acid sequence of D112-AA5 (SEQ ID NO: 186) and the amino acid sequence of D112-AA5 (SEQ ID NO: 187) (this is a translation of D112-AA5 (SEQ ID NO: 186)).
FIG. 99 shows the nucleic acid sequence of D120-AH4 (SEQ ID NO: 188) and the amino acid sequence of D120-AH4 (SEQ ID NO: 189), which is a translation of D120-AH4 (SEQ ID NO: 188).
FIG. 100 shows the nucleic acid sequence of D121-AA8 (SEQ ID NO: 190) and the amino acid sequence of D121-AA8 (SEQ ID NO: 191) (this is a translation of D121-AA8 (SEQ ID NO: 190)).
図101は、D122-AF10の核酸配列(配列番号192)およびD122-AF10のアミノ酸配列(配列番号193) (これはD122-AF10(配列番号192)の翻訳体である)である。
図102は、D128-AB7の核酸配列(配列番号194)およびD128-AB7のアミノ酸配列(配列番号195) (これはD128-AB7(配列番号194)の翻訳体である)である。
図103は、D129-AD10の核酸配列(配列番号196)およびD129-AD10のアミノ酸配列(配列番号197) (これはD129-AD10(配列番号196)の翻訳体である)である。
図104は、D135-AE1の核酸配列(配列番号198)およびD135-AE1のアミノ酸配列(配列番号199) (これはD135-AE1(配列番号198)の翻訳体である)である。
図105は、D141-AD7の核酸配列(配列番号200)およびD141-AD7のアミノ酸配列(配列番号201) (これはD141-AD7(配列番号200)の翻訳体である)である。
図106は、D147-AD3の核酸配列(配列番号202)およびD147-AD3のアミノ酸配列(配列番号203) (これはD147-AD3(配列番号202)の翻訳体である)である。
図107は、D163-AF12の核酸配列(配列番号204)およびD163-AF12のアミノ酸配列(配列番号205) (これはD163-AF12(配列番号204)の翻訳体である)である。
図108は、D163-AG11の核酸配列(配列番号206)およびD163-AG11のアミノ酸配列(配列番号207) (これはD163-AG11(配列番号206)の翻訳体である)である。
図109は、D163-AG12の核酸配列(配列番号208)およびD163-AG12のアミノ酸配列(配列番号209) (これはD163-AG12(配列番号208)の翻訳体である)である。
図110は、D205-BG9の核酸配列(配列番号210)およびD205-BG9のアミノ酸配列(配列番号211) (これはD205-BG9(配列番号210)の翻訳体である)である。
FIG. 101 shows the nucleic acid sequence of D122-AF10 (SEQ ID NO: 192) and the amino acid sequence of D122-AF10 (SEQ ID NO: 193) (this is a translation of D122-AF10 (SEQ ID NO: 192)).
FIG. 102 shows the nucleic acid sequence of D128-AB7 (SEQ ID NO: 194) and the amino acid sequence of D128-AB7 (SEQ ID NO: 195) (this is a translation of D128-AB7 (SEQ ID NO: 194)).
FIG. 103 shows the nucleic acid sequence of D129-AD10 (SEQ ID NO: 196) and the amino acid sequence of D129-AD10 (SEQ ID NO: 197) (this is a translation of D129-AD10 (SEQ ID NO: 196)).
FIG. 104 shows the nucleic acid sequence of D135-AE1 (SEQ ID NO: 198) and the amino acid sequence of D135-AE1 (SEQ ID NO: 199) (this is a translation of D135-AE1 (SEQ ID NO: 198)).
FIG. 105 shows the nucleic acid sequence of D141-AD7 (SEQ ID NO: 200) and the amino acid sequence of D141-AD7 (SEQ ID NO: 201) (this is a translation of D141-AD7 (SEQ ID NO: 200)).
FIG. 106 shows the nucleic acid sequence of D147-AD3 (SEQ ID NO: 202) and the amino acid sequence of D147-AD3 (SEQ ID NO: 203) (this is a translation of D147-AD3 (SEQ ID NO: 202)).
FIG. 107 shows the nucleic acid sequence of D163-AF12 (SEQ ID NO: 204) and the amino acid sequence of D163-AF12 (SEQ ID NO: 205) (this is a translation of D163-AF12 (SEQ ID NO: 204)).
FIG. 108 shows the nucleic acid sequence of D163-AG11 (SEQ ID NO: 206) and the amino acid sequence of D163-AG11 (SEQ ID NO: 207) (this is a translation of D163-AG11 (SEQ ID NO: 206)).
FIG. 109 shows the nucleic acid sequence of D163-AG12 (SEQ ID NO: 208) and the amino acid sequence of D163-AG12 (SEQ ID NO: 209) (this is a translation of D163-AG12 (SEQ ID NO: 208)).
FIG. 110 shows the nucleic acid sequence of D205-BG9 (SEQ ID NO: 210) and the amino acid sequence of D205-BG9 (SEQ ID NO: 211) (this is a translation of D205-BG9 (SEQ ID NO: 210)).
図111は、D207-AA5の核酸配列(配列番号212)およびD207-AA5のアミノ酸配列(配列番号213) (これはD207-AA5(配列番号212)の翻訳体である)である。
図112は、D207-AB4の核酸配列(配列番号214)およびD207-AB4のアミノ酸配列(配列番号215) (これはD207-AB4(配列番号214)の翻訳体である)である。
図113は、D207-AC4の核酸配列(配列番号216)およびD207-AC4のアミノ酸配列(配列番号217) (これはD207-AC4(配列番号216)の翻訳体である)である。
図114は、D209-AA10の核酸配列(配列番号218)およびD209-AA10のアミノ酸配列(配列番号219) (これはD209-AA10(配列番号218)の翻訳体である)である。
図115は、D209-AA12の核酸配列(配列番号220)およびD209-AA12のアミノ酸配列(配列番号221) (これはD209-AA12(配列番号220)の翻訳体である)である。
図116は、D209-AH10の核酸配列(配列番号222)およびD209-AH10のアミノ酸配列(配列番号223) (これはD209-AH10(配列番号222)の翻訳体である)である。
図117は、D87A-AF3の核酸配列(配列番号224)およびD87A-AF3のアミノ酸配列(配列番号225) (これはD87A-AF3(配列番号224)の翻訳体である)である。
図118は、D208-AC8の核酸配列(配列番号226)およびD208-AC8のアミノ酸配列(配列番号227) (これはD208-AC8(配列番号226)の翻訳体である)である。
図119は、D215-AB5の核酸配列(配列番号228)およびD215-AB5のアミノ酸配列(配列番号229) (これはD215-AB5(配列番号228)の翻訳体である)である。
図120は、D103-AH3の核酸配列(配列番号230)およびD103-AH3のアミノ酸配列(配列番号231) (これはD103-AH3(配列番号230)の翻訳体である)である。
FIG. 111 shows the nucleic acid sequence of D207-AA5 (SEQ ID NO: 212) and the amino acid sequence of D207-AA5 (SEQ ID NO: 213) (this is a translation of D207-AA5 (SEQ ID NO: 212)).
FIG. 112 shows the nucleic acid sequence of D207-AB4 (SEQ ID NO: 214) and the amino acid sequence of D207-AB4 (SEQ ID NO: 215) (this is a translation of D207-AB4 (SEQ ID NO: 214)).
FIG. 113 shows the nucleic acid sequence of D207-AC4 (SEQ ID NO: 216) and the amino acid sequence of D207-AC4 (SEQ ID NO: 217) (this is a translation of D207-AC4 (SEQ ID NO: 216)).
FIG. 114 shows the nucleic acid sequence of D209-AA10 (SEQ ID NO: 218) and the amino acid sequence of D209-AA10 (SEQ ID NO: 219), which is a translation of D209-AA10 (SEQ ID NO: 218).
FIG. 115 shows the nucleic acid sequence of D209-AA12 (SEQ ID NO: 220) and the amino acid sequence of D209-AA12 (SEQ ID NO: 221) (which is a translation of D209-AA12 (SEQ ID NO: 220)).
FIG. 116 shows the nucleic acid sequence of D209-AH10 (SEQ ID NO: 222) and the amino acid sequence of D209-AH10 (SEQ ID NO: 223) (which is a translation of D209-AH10 (SEQ ID NO: 222)).
FIG. 117 shows the nucleic acid sequence of D87A-AF3 (SEQ ID NO: 224) and the amino acid sequence of D87A-AF3 (SEQ ID NO: 225) (which is a translation of D87A-AF3 (SEQ ID NO: 224)).
FIG. 118 is the nucleic acid sequence of D208-AC8 (SEQ ID NO: 226) and the amino acid sequence of D208-AC8 (SEQ ID NO: 227) (this is a translation of D208-AC8 (SEQ ID NO: 226)).
FIG. 119 shows the nucleic acid sequence of D215-AB5 (SEQ ID NO: 228) and the amino acid sequence of D215-AB5 (SEQ ID NO: 229) (this is a translation of D215-AB5 (SEQ ID NO: 228)).
FIG. 120 shows the nucleic acid sequence of D103-AH3 (SEQ ID NO: 230) and the amino acid sequence of D103-AH3 (SEQ ID NO: 231) (which is a translation of D103-AH3 (SEQ ID NO: 230)).
図121は、D208-AD9の核酸配列(配列番号232)およびD208-AD9のアミノ酸配列(配列番号233) (これはD208-AD9(配列番号232)の翻訳体である)である。
図122は、D237-AD1の核酸配列(配列番号234)およびD237-AD1のアミノ酸配列(配列番号235) (これはD237-AD1(配列番号234)の翻訳体である)である。
図123は、D125-AF11の核酸配列(配列番号236)およびD125-AF11のアミノ酸配列(配列番号237) (これはD125-AF11(配列番号236)の翻訳体である)である。
図124は、D134-AE11の核酸配列(配列番号238)およびD134-AE11のアミノ酸配列(配列番号239) (これはD134-AE11(配列番号238)の翻訳体である)である。
図125は、D209-AH12の核酸配列(配列番号240)およびD209-AH12のアミノ酸配列(配列番号241) (これはD209-AH12(配列番号240)の翻訳体である)である。
図126は、D221-BB8の核酸配列(配列番号242)およびD221-BB8のアミノ酸配列(配列番号243) (これはD221-BB8(配列番号242)の翻訳体である)である。
図127は、D222-BH4の核酸配列(配列番号244)およびD222-BH4のアミノ酸配列(配列番号245) (これはD222-BH4(配列番号244)の翻訳体である)である。
図128は、D224-AF10の核酸配列(配列番号246)およびD224-AF10のアミノ酸配列(配列番号247) (これはD224-AF10(配列番号246)の翻訳体である)である。
図129は、D224-BD11の核酸配列(配列番号248)およびD224-BD11のアミノ酸配列(配列番号249) (これはD224-BD11(配列番号248)の翻訳体である)である。
図130は、D228-AD7の核酸配列(配列番号250)およびD228-AD7のアミノ酸配列(配列番号251) (これはD228-AD7(配列番号250)の翻訳体である)である。
FIG. 121 shows the nucleic acid sequence of D208-AD9 (SEQ ID NO: 232) and the amino acid sequence of D208-AD9 (SEQ ID NO: 233) (which is a translation of D208-AD9 (SEQ ID NO: 232)).
FIG. 122 shows the nucleic acid sequence of D237-AD1 (SEQ ID NO: 234) and the amino acid sequence of D237-AD1 (SEQ ID NO: 235) (this is a translation of D237-AD1 (SEQ ID NO: 234)).
FIG. 123 shows the nucleic acid sequence of D125-AF11 (SEQ ID NO: 236) and the amino acid sequence of D125-AF11 (SEQ ID NO: 237) (this is a translation of D125-AF11 (SEQ ID NO: 236)).
FIG. 124 shows the nucleic acid sequence of D134-AE11 (SEQ ID NO: 238) and the amino acid sequence of D134-AE11 (SEQ ID NO: 239) (this is a translation of D134-AE11 (SEQ ID NO: 238)).
FIG. 125 shows the nucleic acid sequence of D209-AH12 (SEQ ID NO: 240) and the amino acid sequence of D209-AH12 (SEQ ID NO: 241), which is a translation of D209-AH12 (SEQ ID NO: 240).
FIG. 126 shows the nucleic acid sequence of D221-BB8 (SEQ ID NO: 242) and the amino acid sequence of D221-BB8 (SEQ ID NO: 243) (which is a translation of D221-BB8 (SEQ ID NO: 242)).
FIG. 127 shows the nucleic acid sequence of D222-BH4 (SEQ ID NO: 244) and the amino acid sequence of D222-BH4 (SEQ ID NO: 245) (this is a translation of D222-BH4 (SEQ ID NO: 244)).
FIG. 128 shows the nucleic acid sequence of D224-AF10 (SEQ ID NO: 246) and the amino acid sequence of D224-AF10 (SEQ ID NO: 247) (this is a translation of D224-AF10 (SEQ ID NO: 246)).
FIG. 129 shows the nucleic acid sequence of D224-BD11 (SEQ ID NO: 248) and the amino acid sequence of D224-BD11 (SEQ ID NO: 249) (this is a translation of D224-BD11 (SEQ ID NO: 248)).
FIG. 130 shows the nucleic acid sequence of D228-AD7 (SEQ ID NO: 250) and the amino acid sequence of D228-AD7 (SEQ ID NO: 251) (this is a translation of D228-AD7 (SEQ ID NO: 250)).
図131は、D228-AH8の核酸配列(配列番号252)およびD228-AH8のアミノ酸配列(配列番号253) (これはD228-AH8(配列番号252)の翻訳体である)である。
図132は、D235-AB1の核酸配列(配列番号254)およびD235-AB1のアミノ酸配列(配列番号255) (これはD235-AB1(配列番号254)の翻訳体である)である。
図133は、D243-AA2の核酸配列(配列番号256)およびD243-AA2のアミノ酸配列(配列番号257) (これはD243-AA2(配列番号256)の翻訳体である)である。
図134は、D244-AD4の核酸配列(配列番号258)およびD244-AD4のアミノ酸配列(配列番号259) (これはD244-AD4(配列番号258)の翻訳体である)である。
図135は、D247-AH1の核酸配列(配列番号260)およびD247-AH1のアミノ酸配列(配列番号261) (これはD247-AH1(配列番号260)の翻訳体である)である。
図136は、D248-AA6の核酸配列(配列番号262)およびD248-AA6のアミノ酸配列(配列番号263) (これはD248-AA6(配列番号262)の翻訳体である)である。
図137は、D249-AE8の核酸配列(配列番号264)およびD249-AE8のアミノ酸配列(配列番号265) (これはD249-AE8(配列番号264)の翻訳体である)である。
図138は、D250-AC11の核酸配列(配列番号266)およびD250-AC11のアミノ酸配列(配列番号267および2298) (これらはD250-AC11(配列番号266)の翻訳体である)である。
図139は、D259-AB9の核酸配列(配列番号268)およびD259-AB9のアミノ酸配列(配列番号269) (これはD259-AB9(配列番号268)の翻訳体である)である。
図140は、D218A-AC2の核酸配列(配列番号270)およびD218A-AC2のアミノ酸配列(配列番号271) (これはD218A-AC2(配列番号270)の翻訳体である)である。
FIG. 131 shows the nucleic acid sequence of D228-AH8 (SEQ ID NO: 252) and the amino acid sequence of D228-AH8 (SEQ ID NO: 253) (which is a translation of D228-AH8 (SEQ ID NO: 252)).
FIG. 132 shows the nucleic acid sequence of D235-AB1 (SEQ ID NO: 254) and the amino acid sequence of D235-AB1 (SEQ ID NO: 255) (this is a translation of D235-AB1 (SEQ ID NO: 254)).
FIG. 133 shows the nucleic acid sequence of D243-AA2 (SEQ ID NO: 256) and the amino acid sequence of D243-AA2 (SEQ ID NO: 257) (this is a translation of D243-AA2 (SEQ ID NO: 256)).
FIG. 134 shows the nucleic acid sequence of D244-AD4 (SEQ ID NO: 258) and the amino acid sequence of D244-AD4 (SEQ ID NO: 259) (this is a translation of D244-AD4 (SEQ ID NO: 258)).
FIG. 135 shows the nucleic acid sequence of D247-AH1 (SEQ ID NO: 260) and the amino acid sequence of D247-AH1 (SEQ ID NO: 261) (which is a translation of D247-AH1 (SEQ ID NO: 260)).
FIG. 136 shows the nucleic acid sequence of D248-AA6 (SEQ ID NO: 262) and the amino acid sequence of D248-AA6 (SEQ ID NO: 263) (this is a translation of D248-AA6 (SEQ ID NO: 262)).
FIG. 137 shows the nucleic acid sequence of D249-AE8 (SEQ ID NO: 264) and the amino acid sequence of D249-AE8 (SEQ ID NO: 265) (which is a translation of D249-AE8 (SEQ ID NO: 264)).
Figure 138 is the nucleic acid sequence of D250-AC11 (SEQ ID NO: 266) and amino acid sequence of D250-AC11 (SEQ ID NO: 267 and 2298) (These are the translation of D250-AC11 (SEQ ID NO: 266)).
FIG. 139 shows the nucleic acid sequence of D259-AB9 (SEQ ID NO: 268) and the amino acid sequence of D259-AB9 (SEQ ID NO: 269) (this is a translation of D259-AB9 (SEQ ID NO: 268)).
FIG. 140 shows the nucleic acid sequence of D218A-AC2 (SEQ ID NO: 270) and the amino acid sequence of D218A-AC2 (SEQ ID NO: 271) (which is a translation of D218A-AC2 (SEQ ID NO: 270)).
図141は、D210-BD4の核酸配列(配列番号272)およびD210-BD4のアミノ酸配列(配列番号273) (これはD210-BD4(配列番号272)の翻訳体である)である。
図142は、D233-AG7の核酸配列(配列番号274)およびD233-AG7のアミノ酸配列(配列番号275) (これはD233-AG7(配列番号274)の翻訳体である)である。
図143は、D257-AE4の核酸配列(配列番号276)およびD257-AE4のアミノ酸配列(配列番号277) (これはD257-AE4(配列番号276)の翻訳体である)である。
図144は、D268-AE2の核酸配列(配列番号278)およびD268-AE2のアミノ酸配列(配列番号279) (これはD268-AE2(配列番号278)の翻訳体である)である。
図145は、D283-AC1の核酸配列(配列番号280)およびD283-AC1のアミノ酸配列(配列番号281) (これはD283-AC1(配列番号280)の翻訳体である)である。
図146は、D244-AB6の核酸配列(配列番号282)およびD244-AB6のアミノ酸配列(配列番号283) (これはD244-AB6(配列番号282)の翻訳体である)である。
図147は、D205-BE9の核酸配列(配列番号284)およびD205-BE9のアミノ酸配列(配列番号285) (これはD205-BE9(配列番号284)の翻訳体である)である。
図148は、D136-AF4の核酸配列(配列番号286)およびD136-AF4のアミノ酸配列(配列番号287) (これはD136-AF4(配列番号286)の翻訳体である)である。
図149は、D101-BA2の核酸配列(配列番号288)およびD101-BA2のアミノ酸配列(配列番号289) (これはD101-BA2(配列番号288)の翻訳体である)である。
図150は、D130-AA1の核酸配列(配列番号290)およびD130-AA1のアミノ酸配列(配列番号291) (これはD130-AA1(配列番号290)の翻訳体である)である。
FIG. 141 shows the nucleic acid sequence of D210-BD4 (SEQ ID NO: 272) and the amino acid sequence of D210-BD4 (SEQ ID NO: 273) (this is a translation of D210-BD4 (SEQ ID NO: 272)).
FIG. 142 shows the nucleic acid sequence of D233-AG7 (SEQ ID NO: 274) and the amino acid sequence of D233-AG7 (SEQ ID NO: 275) (this is a translation of D233-AG7 (SEQ ID NO: 274)).
FIG. 143 shows the nucleic acid sequence of D257-AE4 (SEQ ID NO: 276) and the amino acid sequence of D257-AE4 (SEQ ID NO: 277) (which is a translation of D257-AE4 (SEQ ID NO: 276)).
FIG. 144 shows the nucleic acid sequence of D268-AE2 (SEQ ID NO: 278) and the amino acid sequence of D268-AE2 (SEQ ID NO: 279) (which is a translation of D268-AE2 (SEQ ID NO: 278)).
FIG. 145 shows the nucleic acid sequence of D283-AC1 (SEQ ID NO: 280) and the amino acid sequence of D283-AC1 (SEQ ID NO: 281) (which is a translation of D283-AC1 (SEQ ID NO: 280)).
FIG. 146 shows the nucleic acid sequence of D244-AB6 (SEQ ID NO: 282) and the amino acid sequence of D244-AB6 (SEQ ID NO: 283) (which is a translation of D244-AB6 (SEQ ID NO: 282)).
FIG. 147 shows the nucleic acid sequence of D205-BE9 (SEQ ID NO: 284) and the amino acid sequence of D205-BE9 (SEQ ID NO: 285) (this is a translation of D205-BE9 (SEQ ID NO: 284)).
FIG. 148 shows the nucleic acid sequence of D136-AF4 (SEQ ID NO: 286) and the amino acid sequence of D136-AF4 (SEQ ID NO: 287) (this is a translation of D136-AF4 (SEQ ID NO: 286)).
FIG. 149 shows the nucleic acid sequence of D101-BA2 (SEQ ID NO: 288) and the amino acid sequence of D101-BA2 (SEQ ID NO: 289) (this is a translation of D101-BA2 (SEQ ID NO: 288)).
FIG. 150 shows the nucleic acid sequence of D130-AA1 (SEQ ID NO: 290) and the amino acid sequence of D130-AA1 (SEQ ID NO: 291) (this is a translation of D130-AA1 (SEQ ID NO: 290)).
図151は、D136-AD5の核酸配列(配列番号292)およびD136-AD5のアミノ酸配列(配列番号293) (これはD136-AD5(配列番号292)の翻訳体である)である。
図152は、D138-AD12の核酸配列(配列番号294)およびD138-AD12のアミノ酸配列(配列番号295) (これはD138-AD12(配列番号294)の翻訳体である)である。
図153は、D216-AG8の核酸配列(配列番号296)およびD216-AG8のアミノ酸配列(配列番号297) (これはD216-AG8(配列番号296)の翻訳体である)である。
図154は、D243-AB3の核酸配列(配列番号298)およびD243-AB3のアミノ酸配列(配列番号299) (これはD243-AB3(配列番号298)の翻訳体である)である。
図155は、D250-AC11の核酸配列(配列番号300)およびD250-AC11のアミノ酸配列(配列番号301および2298) (これらはD250-AC11(配列番号300)の翻訳体である)である。
図156は、D205-AH4の核酸配列(配列番号302)およびD205-AH4のアミノ酸配列(配列番号303) (これはD205-AH4(配列番号302)の翻訳体である)である。
図157は、D267-AF10の核酸配列(配列番号304)およびD267-AF10のアミノ酸配列(配列番号305) (これはD267-AF10(配列番号304)の翻訳体である)である。
図158は、D284-AH5の核酸配列(配列番号306)およびD284-AH5のアミノ酸配列(配列番号307) (これはD284-AH5(配列番号306)の翻訳体である)である。
図159Aは、D58-BG7 (配列番号10), D58-AB1 (配列番号12)およびD58-BE4 (配列番号16)のアライメントならびにD56-AH7 (配列番号18)およびD13a-5 (配列番号20)のアライメントよりなる核酸配列アライメントのセットである。各アライメントの配列間の同一性 (%)がそれぞれのアライメントの下に示されている。
図159Bは、D56-AG10 (配列番号22), D35-33 (配列番号24)およびD34-62 (配列番号26)のアライメントならびにD56-AA7 (配列番号28), D56-AE1 (配列番号30)およびD185-BD3 (配列番号152)のアライメントよりなる核酸配列アライメントのセットである。各アライメントの配列間の同一性 (%)がそれぞれのアライメントの下に示されている。
図159Cは、D56A-AB6 (配列番号36), D35-BB7 (配列番号32), D177-BA7 (配列番号34)およびD144-AE2 (配列番号38)のアライメントならびにD56-AG11 (配列番号40)およびD179-AA1 (配列番号42)のアライメントよりなる核酸配列アライメントのセットである。各アライメントの配列間の同一性 (%)がそれぞれのアライメントの下に示されている。
図159Dは、D56-AC7 (配列番号44)およびD144-AD1 (配列番号46)のアライメントならびにD181-AB5 (配列番号50)およびD73-AC9 (配列番号52)のアライメントよりなる核酸配列アライメントのセットである。各アライメントの配列間の同一性 (%)がそれぞれのアライメントの下に示されている。
図159Eは、核酸配列D58-AB9 (配列番号56), D56-AG9 (配列番号58), D35-BG11 (配列番号62), D34-25 (配列番号72), D35-BA3 (配列番号66), D34-52 (配列番号70), D56-AG6 (配列番号60), D35-42 (配列番号64)およびD34-57 (配列番号68)のアライメントである。該アライメントの配列間の同一性 (%)が該アライメントの下に示されている。
図159Fは、D177-BD7 (配列番号92)およびD177-BD5 (配列番号78)のアライメントならびにD56A-AG10 (配列番号80), D58-AD12 (配列番号84)およびD58-BC5 (配列番号82)のアライメントよりなる核酸配列アライメントのセットである。各アライメントの配列間の同一性 (%)がそれぞれのアライメントの下に示されている。
図159Gは、D56-AD6 (配列番号96), D56-AC11 (配列番号86), D35-39 (配列番号88)およびD58-BH4 (配列番号90)のアライメントならびにD73A-AD6 (配列番号98)およびD70A-BA11 (配列番号100)のアライメントよりなる核酸配列アライメントのセットである。各アライメントの配列間の同一性 (%)がそれぞれのアライメントの下に示されている。
図159Hは、D70A-AB5 (配列番号104)およびD70A-AA8 (配列番号106)のアライメントならびにD70A-AB8 (配列番号108), D70A-BH2 (配列番号110), D70A-AA4 (配列番号112)のアライメントよりなる核酸配列アライメントのセットである。各アライメントの配列間の同一性 (%)がそれぞれのアライメントの下に示されている。
図159Iは、D70A-BA1 (配列番号114)およびD70A-BA9 (配列番号116)のアライメントならびにD144-AH1 (配列番号122), D34-65 (配列番号124)およびD181-AC5 (配列番号120)のアライメントよりなる核酸配列アライメントのセットである。各アライメントの配列間の同一性 (%)がそれぞれのアライメントの下に示されている。
図159Jは、D58-AA1 (配列番号130), D185-BC1 (配列番号142)およびD185-BG2 (配列番号144)のアライメントならびにD177-BF7 (配列番号136), D185-BD2 (配列番号148)およびD185-BE1 (配列番号146)のアライメントよりなる核酸配列アライメントのセットである。各アライメントの配列間の同一性 (%)がそれぞれのアライメントの下に示されている。
図159Kは、核酸配列D70-AA12 (配列番号140)およびD176-BF2 (配列番号94)のアライメントである。該アライメントの配列間の同一性 (%)が該アライメントの下に示されている。
図160Aは、D208-AD9 (配列番号2196), D120-AH4 (配列番号2197), D121-AA8 (配列番号2198), D122-AF10 (配列番号2199), D103-AH3 (配列番号2200), D208-AC8 (配列番号2201)およびD235-AB1 (配列番号2202)の配列アライメント; D244-AD4 (配列番号2203), D244-AB6 (配列番号2204), D285-AA8 (配列番号2205), D285-AB9 (配列番号2206)およびD268-AE2 (配列番号2207)の配列アライメント;ならびにD100A-AC3 (配列番号2208)およびD100A-BE2 (配列番号2209)の配列アライメントよりなるアミノ酸配列アライメントのセットである。
図160Bは、D205-BG9 (配列番号2210), D205-BE9 (配列番号2211)およびD205-AH4 (配列番号2212) の配列アライメント; D259-AB9 (配列番号2213), D257-AE4 (配列番号2214)およびD147-AD3 (配列番号2215) の配列アライメント; D249-AEB (配列番号2216)およびD248-AA6 (配列番号2217) の配列アライメント; D233-AG7 (配列番号2218), D224-BD11 (配列番号2219)およびD224-AF10 (配列番号2220) の配列アライメント;ならびにD105-AD6 (配列番号2221), D215-AB5 (配列番号2222)およびD135-AE1 (配列番号2223)の配列アライメントよりなるアミノ酸配列アライメントのセットである。
図160Cは、D87A-AF3 (配列番号2224)およびD210-BD4 (配列番号2225)の配列アライメント; D89-AB1 (配列番号2226), D89-AD2 (配列番号2227), D163-AG12 (配列番号2228), D163-AG11 (配列番号2229)およびD163-AF12 (配列番号2230) の配列アライメント; D267-AF10 (配列番号2231), D96-AC2 (配列番号2232), D96-AB6 (配列番号2233), D207-AA5 (配列番号2234), D207-AB4 (配列番号2235)およびD207-AC4 (配列番号2236);ならびにD98-AG1 (配列番号2237)およびD98-AA1 (配列番号2238)の配列アライメントよりなるアミノ酸配列アライメントのセットである。
図160Dは、D209-AA10 (配列番号2239), D209-AA12 (配列番号2240), D209-AH10 (配列番号2241), D209-AH12 (配列番号2242)およびD90a-BB3 (配列番号2243) の配列アライメント; D129-AD10 (配列番号2244)およびD104A-AE8 (配列番号2245) の配列アライメント; D228-AH8 (配列番号2246), D228-AD7 (配列番号2247), D250-AC11 (配列番号2248)およびD247-AH1 (配列番号2249)の配列アライメント;ならびにD128-AB7 (配列番号2250), D243-AA2 (配列番号2251)およびD125-AF11 (配列番号2252)の配列アライメントよりなるアミノ酸配列アライメントのセットである。
図160Eは、D284-AH5 (配列番号2253)およびD110-AF12 (配列番号2254)のアミノ酸配列アライメントである。
FIG. 151 shows the nucleic acid sequence of D136-AD5 (SEQ ID NO: 292) and the amino acid sequence of D136-AD5 (SEQ ID NO: 293) (this is a translation of D136-AD5 (SEQ ID NO: 292)).
FIG. 152 shows the nucleic acid sequence of D138-AD12 (SEQ ID NO: 294) and the amino acid sequence of D138-AD12 (SEQ ID NO: 295) (this is a translation of D138-AD12 (SEQ ID NO: 294)).
FIG. 153 shows the nucleic acid sequence of D216-AG8 (SEQ ID NO: 296) and the amino acid sequence of D216-AG8 (SEQ ID NO: 297) (which is a translation of D216-AG8 (SEQ ID NO: 296)).
FIG. 154 shows the nucleic acid sequence of D243-AB3 (SEQ ID NO: 298) and the amino acid sequence of D243-AB3 (SEQ ID NO: 299) (which is a translation of D243-AB3 (SEQ ID NO: 298)).
Figure 155 is the nucleic acid sequence of D250-AC11 (SEQ ID NO: 300) and D250-AC11 (SEQ ID NO: 301 and 2298) (These are the translation of D250-AC11 (SEQ ID NO: 300)).
FIG. 156 shows the nucleic acid sequence of D205-AH4 (SEQ ID NO: 302) and the amino acid sequence of D205-AH4 (SEQ ID NO: 303) (this is a translation of D205-AH4 (SEQ ID NO: 302)).
FIG. 157 shows the nucleic acid sequence of D267-AF10 (SEQ ID NO: 304) and the amino acid sequence of D267-AF10 (SEQ ID NO: 305) (this is a translation of D267-AF10 (SEQ ID NO: 304)).
FIG. 158 shows the nucleic acid sequence of D284-AH5 (SEQ ID NO: 306) and the amino acid sequence of D284-AH5 (SEQ ID NO: 307) (which is a translation of D284-AH5 (SEQ ID NO: 306)).
Figure 159A shows the alignment of D58-BG7 (SEQ ID NO: 10), D58-AB1 (SEQ ID NO: 12) and D58-BE4 (SEQ ID NO: 16) and D56-AH7 (SEQ ID NO: 18) and D13a-5 (SEQ ID NO: 20). A set of nucleic acid sequence alignments consisting of the above alignments. The percent identity between the sequences in each alignment is shown under each alignment.
Figure 159B shows the alignment of D56-AG10 (SEQ ID NO: 22), D35-33 (SEQ ID NO: 24) and D34-62 (SEQ ID NO: 26) and D56-AA7 (SEQ ID NO: 28), D56-AE1 (SEQ ID NO: 30). And a nucleic acid sequence alignment set consisting of an alignment of D185-BD3 (SEQ ID NO: 152). The percent identity between the sequences in each alignment is shown under each alignment.
Figure 159C shows alignment of D56A-AB6 (SEQ ID NO: 36), D35-BB7 (SEQ ID NO: 32), D177-BA7 (SEQ ID NO: 34) and D144-AE2 (SEQ ID NO: 38) and D56-AG11 (SEQ ID NO: 40). And a nucleic acid sequence alignment set consisting of an alignment of D179-AA1 (SEQ ID NO: 42). The percent identity between the sequences in each alignment is shown under each alignment.
FIG. 159D shows a set of nucleic acid sequence alignments consisting of an alignment of D56-AC7 (SEQ ID NO: 44) and D144-AD1 (SEQ ID NO: 46) and an alignment of D181-AB5 (SEQ ID NO: 50) and D73-AC9 (SEQ ID NO: 52). It is. The percent identity between the sequences in each alignment is shown under each alignment.
Figure 159E shows the nucleic acid sequences D58-AB9 (SEQ ID NO: 56), D56-AG9 (SEQ ID NO: 58), D35-BG11 (SEQ ID NO: 62), D34-25 (SEQ ID NO: 72), D35-BA3 (SEQ ID NO: 66) , D34-52 (SEQ ID NO: 70), D56-AG6 (SEQ ID NO: 60), D35-42 (SEQ ID NO: 64) and D34-57 (SEQ ID NO: 68). The identity (%) between the sequences of the alignment is shown below the alignment.
FIG. 159F shows an alignment of D177-BD7 (SEQ ID NO: 92) and D177-BD5 (SEQ ID NO: 78) and D56A-AG10 (SEQ ID NO: 80), D58-AD12 (SEQ ID NO: 84) and D58-BC5 (SEQ ID NO: 82). A set of nucleic acid sequence alignments consisting of the above alignments. The percent identity between the sequences in each alignment is shown under each alignment.
FIG.159G shows alignment of D56-AD6 (SEQ ID NO: 96), D56-AC11 (SEQ ID NO: 86), D35-39 (SEQ ID NO: 88) and D58-BH4 (SEQ ID NO: 90) and D73A-AD6 (SEQ ID NO: 98) And a set of nucleic acid sequence alignments consisting of an alignment of D70A-BA11 (SEQ ID NO: 100). The percent identity between the sequences in each alignment is shown under each alignment.
FIG.159H shows alignment of D70A-AB5 (SEQ ID NO: 104) and D70A-AA8 (SEQ ID NO: 106) and D70A-AB8 (SEQ ID NO: 108), D70A-BH2 (SEQ ID NO: 110), D70A-AA4 (SEQ ID NO: 112) A set of nucleic acid sequence alignments consisting of the above alignments. The percent identity between the sequences in each alignment is shown under each alignment.
FIG.159I shows an alignment of D70A-BA1 (SEQ ID NO: 114) and D70A-BA9 (SEQ ID NO: 116) and D144-AH1 (SEQ ID NO: 122), D34-65 (SEQ ID NO: 124) and D181-AC5 (SEQ ID NO: 120) A set of nucleic acid sequence alignments consisting of the above alignments. The percent identity between the sequences in each alignment is shown under each alignment.
FIG. 159J shows the alignment of D58-AA1 (SEQ ID NO: 130), D185-BC1 (SEQ ID NO: 142) and D185-BG2 (SEQ ID NO: 144) and D177-BF7 (SEQ ID NO: 136), D185-BD2 (SEQ ID NO: 148). And a nucleic acid sequence alignment set consisting of an alignment of D185-BE1 (SEQ ID NO: 146). The percent identity between the sequences in each alignment is shown under each alignment.
FIG. 159K is an alignment of nucleic acid sequences D70-AA12 (SEQ ID NO: 140) and D176-BF2 (SEQ ID NO: 94). The identity (%) between the sequences of the alignment is shown below the alignment.
Figure 160A shows D208-AD9 (SEQ ID NO: 2196), D120-AH4 (SEQ ID NO: 2197), D121-AA8 (SEQ ID NO: 2198), D122-AF10 (SEQ ID NO: 2199), D103-AH3 (SEQ ID NO: 2200), D208 -Sequence alignment of AC8 (SEQ ID NO: 2201) and D235-AB1 (SEQ ID NO: 2202); D244-AD4 (SEQ ID NO: 2203), D244-AB6 (SEQ ID NO: 2204), D285-AA8 (SEQ ID NO: 2205), D285-AB9 A set of amino acid sequence alignments consisting of a sequence alignment of (SEQ ID NO: 2206) and D268-AE2 (SEQ ID NO: 2207); and a sequence alignment of D100A-AC3 (SEQ ID NO: 2208) and D100A-BE2 (SEQ ID NO: 2209).
Figure 160B shows the sequence alignment of D205-BG9 (SEQ ID NO: 2210), D205-BE9 (SEQ ID NO: 2211) and D205-AH4 (SEQ ID NO: 2212); D259-AB9 (SEQ ID NO: 2213), D257-AE4 (SEQ ID NO: 2214) ) And D147-AD3 (SEQ ID NO: 2215); D249-AEB (SEQ ID NO: 2216) and D248-AA6 (SEQ ID NO: 2217); D233-AG7 (SEQ ID NO: 2218), D224-BD11 (SEQ ID NO: 2219) and D224-AF10 (SEQ ID NO: 2220); and amino acid sequence alignment consisting of D105-AD6 (SEQ ID NO: 2221), D215-AB5 (SEQ ID NO: 2222) and D135-AE1 (SEQ ID NO: 2223) It is a set of.
Figure 160C shows the sequence alignment of D87A-AF3 (SEQ ID NO: 2224) and D210-BD4 (SEQ ID NO: 2225); D89-AB1 (SEQ ID NO: 2226), D89-AD2 (SEQ ID NO: 2227), D163-AG12 (SEQ ID NO: 2228) ), D163-AG11 (SEQ ID NO: 2229) and D163-AF12 (SEQ ID NO: 2230) sequence alignment; D267-AF10 (SEQ ID NO: 2231), D96-AC2 (SEQ ID NO: 2232), D96-AB6 (SEQ ID NO: 2233), D207-AA5 (SEQ ID NO: 2234), D207-AB4 (SEQ ID NO: 2235) and D207-AC4 (SEQ ID NO: 2236); and D98-AG1 (SEQ ID NO: 2237) and D98-AA1 (SEQ ID NO: 2238) A set of amino acid sequence alignments.
Figure 160D shows the sequence of D209-AA10 (SEQ ID NO: 2239), D209-AA12 (SEQ ID NO: 2240), D209-AH10 (SEQ ID NO: 2241), D209-AH12 (SEQ ID NO: 2242) and D90a-BB3 (SEQ ID NO: 2243). Alignment; Sequence alignment of D129-AD10 (SEQ ID NO: 2244) and D104A-AE8 (SEQ ID NO: 2245); D228-AH8 (SEQ ID NO: 2246), D228-AD7 (SEQ ID NO: 2247), D250-AC11 (SEQ ID NO: 2248) and A set of amino acid sequence alignments consisting of sequence alignment of D247-AH1 (SEQ ID NO: 2249); and D128-AB7 (SEQ ID NO: 2250), D243-AA2 (SEQ ID NO: 2251) and D125-AF11 (SEQ ID NO: 2252) is there.
FIG. 160E is an amino acid sequence alignment of D284-AH5 (SEQ ID NO: 2253) and D110-AF12 (SEQ ID NO: 2254).
図161は、PCRによるシトクロムp450 cDNA断片のクローニングを示す概要図である。該クローニングに使用するプライマーは以下のとおりである:DM (配列番号2255), DM4 (配列番号2256), DM12 (配列番号2257), DM13 (配列番号2258), DM17 (配列番号2259), OLIGO d(T) (配列番号2260), T7 (配列番号2261)およびSP6 (配列番号2262)。
図162は、D425-AB10の核酸配列(配列番号367)およびD425-AB10のアミノ酸配列(配列番号368) (これはD425-AB10(配列番号367)の翻訳体である)である。
図163は、D425-AB11の核酸配列(配列番号369)およびD425-AB11のアミノ酸配列(配列番号370) (これはD425-AB11(配列番号369)の翻訳体である)である。
図164は、D425-AC9の核酸配列(配列番号371)およびD425-AC9のアミノ酸配列(配列番号372) (これはD425-AC9(配列番号371)の翻訳体である)である。
図165は、D425-AC10の核酸配列(配列番号373)およびD425-AC10のアミノ酸配列(配列番号374) (これはD425-AC10(配列番号373)の翻訳体である)である。
図166は、D425-AC11の核酸配列(配列番号375)およびD425-AC11のアミノ酸配列(配列番号376) (これはD425-AC11(配列番号375)の翻訳体である)である。
図167は、D425-AG11の核酸配列(配列番号377)およびD425-AG11のアミノ酸配列(配列番号378) (これはD425-AG11(配列番号377)の翻訳体である)である。
図168は、D425-AH7の核酸配列(配列番号379)およびD425-AH7のアミノ酸配列(配列番号380) (これはD425-AH7(配列番号379)の翻訳体である)である。
図169は、D425-AH11の核酸配列(配列番号381)およびD425-AH11のアミノ酸配列(配列番号382) (これはD425-AH11(配列番号381)の翻訳体である)である。
図170は、D427-AA5の核酸配列(配列番号383)およびD427-AA5のアミノ酸配列(配列番号384) (これはD427-AA5(配列番号383)の翻訳体である)である。
FIG. 161 is a schematic diagram showing cloning of a cytochrome p450 cDNA fragment by PCR. The primers used for the cloning are as follows: DM (SEQ ID NO: 2255), DM4 (SEQ ID NO: 2256), DM12 (SEQ ID NO: 2257), DM13 (SEQ ID NO: 2258), DM17 (SEQ ID NO: 2259), OLIGO d (T) (SEQ ID NO: 2260), T7 (SEQ ID NO: 2261) and SP6 (SEQ ID NO: 2262).
FIG. 162 shows the nucleic acid sequence of D425-AB10 (SEQ ID NO: 367) and the amino acid sequence of D425-AB10 (SEQ ID NO: 368) (this is a translation of D425-AB10 (SEQ ID NO: 367)).
FIG. 163 shows the nucleic acid sequence of D425-AB11 (SEQ ID NO: 369) and the amino acid sequence of D425-AB11 (SEQ ID NO: 370) (this is a translation of D425-AB11 (SEQ ID NO: 369)).
FIG. 164 shows the nucleic acid sequence of D425-AC9 (SEQ ID NO: 371) and the amino acid sequence of D425-AC9 (SEQ ID NO: 372) (this is a translation of D425-AC9 (SEQ ID NO: 371)).
FIG. 165 shows the nucleic acid sequence of D425-AC10 (SEQ ID NO: 373) and the amino acid sequence of D425-AC10 (SEQ ID NO: 374) (this is a translation of D425-AC10 (SEQ ID NO: 373)).
FIG. 166 shows the nucleic acid sequence of D425-AC11 (SEQ ID NO: 375) and the amino acid sequence of D425-AC11 (SEQ ID NO: 376), which is a translation of D425-AC11 (SEQ ID NO: 375).
FIG. 167 shows the nucleic acid sequence of D425-AG11 (SEQ ID NO: 377) and the amino acid sequence of D425-AG11 (SEQ ID NO: 378) (this is a translation of D425-AG11 (SEQ ID NO: 377)).
FIG. 168 shows the nucleic acid sequence of D425-AH7 (SEQ ID NO: 379) and the amino acid sequence of D425-AH7 (SEQ ID NO: 380) (this is a translation of D425-AH7 (SEQ ID NO: 379)).
FIG. 169 shows the nucleic acid sequence of D425-AH11 (SEQ ID NO: 381) and the amino acid sequence of D425-AH11 (SEQ ID NO: 382), which is a translation of D425-AH11 (SEQ ID NO: 381).
FIG. 170 shows the nucleic acid sequence of D427-AA5 (SEQ ID NO: 383) and the amino acid sequence of D427-AA5 (SEQ ID NO: 384) (this is a translation of D427-AA5 (SEQ ID NO: 383)).
図171は、GeneChip (登録商標) マイクロアレイ上のクローンのプローブセット配列 (配列番号385〜配列番号445)である。
図172-1は、D424-AA4 (配列番号446)の核酸配列; D424-AF5 (配列番号447) の核酸配列およびD424-AF5 (配列番号448)のアミノ酸配列(これはD424-AF5 (配列番号447)の翻訳体である); D425-AA11 (配列番号449)の核酸配列およびD425-AA11 (配列番号450および2299)のアミノ酸配列(これらはD425-AA11 (配列番号449)の翻訳体である);ならびにD425-AF11 (配列番号451)の核酸配列よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-2は、D425-AF11 (配列番号452)のアミノ酸配列(これはD425-AF11 (配列番号451)の翻訳体である); D425-AH10 (配列番号453)の核酸配列およびD425-AH10 (配列番号454)のアミノ酸配列(これはD425-AH10 (配列番号453)の翻訳体である); D426-AA3 (配列番号455)の核酸配列およびD426-AA3 (配列番号456)のアミノ酸配列(これはD426-AA3 (配列番号455)の翻訳体である);ならびにD426-AG1 (配列番号457)の核酸配列およびD426-AG1 (配列番号458)のアミノ酸配列(これはD426-AG1 (配列番号457)の翻訳体である)よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-3は、D427-AA6 (配列番号459)の核酸配列およびD427-AA6 (配列番号460)のアミノ酸配列(これはD427-AA6 (配列番号459)の翻訳体である); D427-AB6 (配列番号461)の核酸配列およびD427-AB6 (配列番号462)のアミノ酸配列(これはD427-AB6 (配列番号461)の翻訳体である); D428-AC9 (配列番号463)の核酸配列およびのD428-AC9 (配列番号464)アミノ酸配列(これはD428-AC9 (配列番号463)の翻訳体である);ならびにD428-AH10 (配列番号465)の核酸配列よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-4は、D428-AH10 (配列番号466)のアミノ酸配列(これはD428-AH10 (配列番号465)の翻訳体である); D429-AA1 (配列番号467)の核酸配列およびD429-AA1 (配列番号468)のアミノ酸配列(これはD429-AA1 (配列番号467)の翻訳体である); D430-AA3 (配列番号469)の核酸配列およびD430-AA3 (配列番号470)のアミノ酸配列(これはD430-AA3 (配列番号469)の翻訳体である);ならびにD431-AE6 (配列番号471)の核酸配列およびD431-AE6 (配列番号472)のアミノ酸配列(これはD431-AE6 (配列番号471)の翻訳体である)よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-5は、D113-AE9 (配列番号473)の核酸配列およびD113-AE9 (配列番号474)のアミノ酸配列(これはD113-AE9 (配列番号473)の翻訳体である);ならびにD114-AE12 (配列番号475)の核酸配列よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-6は、D114-AE12 (配列番号476)のアミノ酸配列(これはD114-AE12 (配列番号475)の翻訳体である); D119-AC3 (配列番号477)の核酸配列およびD119-AC3 (配列番号478)のアミノ酸配列(これはD119-AC3 (配列番号477)の翻訳体である);ならびにD132-AA5 (配列番号479)の核酸配列よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-7は、D132-AA5 (配列番号480)のアミノ酸配列(これはD132-AA5 (配列番号479)の翻訳体である); D223-BB10 (配列番号481)の核酸配列およびD223-BB10 (配列番号482)のアミノ酸配列(これはD223-BB10 (配列番号481)の翻訳体である);ならびにD245-AA8 (配列番号483)の核酸配列およびD245-AA8 (配列番号484)のアミノ酸配列(これはD245-AA8 (配列番号483)の翻訳体である)よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-8は、D246-AE12 (配列番号485)の核酸配列およびD246-AE12 (配列番号486)のアミノ酸配列(これはD246-AE12 (配列番号485)の翻訳体である);ならびにD279-AD1 (配列番号487)の核酸配列およびD279-AD1 (配列番号488)のアミノ酸配列(これはD279-AD1 (配列番号487)の翻訳体である)よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-9は、D282-AA10 (配列番号489)の核酸配列およびD282-AA10 (配列番号490)のアミノ酸配列(これはD282-AA10 (配列番号489)の翻訳体である);ならびにD295-AA1 (配列番号491)の核酸配列よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-10は、D295-AA1 (配列番号492)のアミノ酸配列(これはD295-AA1 (配列番号491)の翻訳体である); D101A-AE2 (配列番号493)の核酸配列およびD101A-AE2 (配列番号494)のアミノ酸配列(これはD101A-AE2 (配列番号493)の翻訳体である);ならびにD108-AA4 (配列番号495)の核酸配列よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-11は、D108-AA4 (配列番号496)のアミノ酸配列(これはD108-AA4 (配列番号495)の翻訳体である); D124-AC5(5’) (配列番号497)の核酸配列およびD124-AC5(5’) (配列番号498)のアミノ酸配列(これはD124-AC5(5’) (配列番号497)の翻訳体である); D124-AC5(3’) (配列番号499)の核酸配列およびD124-AC5(3’) (配列番号500)のアミノ酸配列(これはD124-AC5(3’) (配列番号499)の翻訳体である);ならびにD141-AD7 (配列番号501)の核酸配列よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-12は、D141-AD7 (配列番号502)のアミノ酸配列, (これはD141-AD7 (配列番号501)の翻訳体である);ならびにD148-AD1 (配列番号503)の核酸配列およびD148-AD1 (配列番号504)のアミノ酸配列(これはD148-AD1 (配列番号503)の翻訳体である)よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-13は、D212-BC11 (配列番号505)の核酸配列およびD212-BC11 (配列番号506)のアミノ酸配列(これはD212-BC11 (配列番号505)の翻訳体である);ならびにD217-AB10 (配列番号507)の核酸配列およびD217-AB10 (配列番号508)のアミノ酸配列(これはD217-AB10 (配列番号507)の翻訳体である)よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-14は、D220-BC6 (配列番号509)の核酸配列およびD220-BC6 (配列番号510)のアミノ酸配列(これはD220-BC6 (配列番号509)の翻訳体である); D225-AG9 (配列番号511)の核酸配列およびD225-AG9 (配列番号512)のアミノ酸配列(これはD225-AG9 (配列番号511)の翻訳体である); D231-AF1 (配列番号513)の核酸配列およびD231-AF1 (配列番号514)のアミノ酸配列(これはD231-AF1 (配列番号513)の翻訳体である);ならびにD232-AH5 (配列番号515)の核酸配列よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-15は、D232-AH5 (配列番号516)のアミノ酸配列(これはD232-AH5 (配列番号515)の翻訳体である); D240-BB8 (配列番号517)の核酸配列およびD240-BB8 (配列番号518)のアミノ酸配列(これはD240-BB8 (配列番号517)の翻訳体である); D280-AA6 (配列番号519)の核酸配列およびD280-AA6 (配列番号520)のアミノ酸配列(これはD280-AA6 (配列番号519)の翻訳体である);ならびにD285-AD7 (配列番号521)の核酸配列およびD285-AD7 (配列番号522)のアミノ酸配列(これはD285-AD7 (配列番号521)での翻訳体である)よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-16は、D285-AH9 (配列番号523)の核酸配列およびD285-AH9 (配列番号524)のアミノ酸配列(これはD285-AH9 (配列番号523)の翻訳体である); D99-AB3 (配列番号525)の核酸配列およびD99-AB3 (配列番号526)のアミノ酸配列(これはD99-AB3 (配列番号525)の翻訳体である);ならびにD99-AC2 (配列番号527)の核酸配列およびD99-AC2 (配列番号528)のアミノ酸配列(これはD99-AC2 (配列番号527)の翻訳体である)よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-17は、D99-AF11 (配列番号529)の核酸配列およびD99-AF11 (配列番号530)のアミノ酸配列(これはD99-AF11 (配列番号529)の翻訳体である); D99-AH4 (配列番号531)の核酸配列およびD99-AH4 (配列番号532)のアミノ酸配列(これはD99-AH4 (配列番号531)の翻訳体である); D99-AH7 (配列番号533)の核酸配列およびD99-AH7 (配列番号534)のアミノ酸配列(これはD99-AH7 (配列番号533)の翻訳体である); D99-DB4 (配列番号535)の核酸配列およびD99-DB4 (配列番号536)のアミノ酸配列(これはD99-DB4 (配列番号535)の翻訳体である)よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-18は、D99-DG4 (配列番号537)の核酸配列およびD99-DG4 (配列番号538)のアミノ酸配列(これはD99-DG4 (配列番号537)の翻訳体である); D40-2 (配列番号539)の核酸配列およびD40-2 (配列番号540)のアミノ酸配列(これはD40-2 (配列番号539)の翻訳体である); D301-EE11 (配列番号541)の核酸配列およびD301-EE11 (配列番号542)のアミノ酸配列(これはD301-EE11 (配列番号541)の翻訳体である);ならびにD302-AE10 (配列番号543)の核酸配列よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図172-19は、D302-AE10 (配列番号544)のアミノ酸配列(これはD302-AE10 (配列番号543)の翻訳体である); D303-AC6 (配列番号545)の核酸配列およびD303-AC6 (配列番号546)のアミノ酸配列(これはD303-AC6 (配列番号545)の翻訳体である);ならびにD303-AC11 (配列番号547)の核酸配列およびD303-AC11 (配列番号548)のアミノ酸配列(これはD303-AC11 (配列番号547)の翻訳体である)よりなる核酸およびアミノ酸配列群である。
図173-1は、40-17 (配列番号549), 40-20 (配列番号550), 40-23 (配列番号551), 40-26 (配列番号552), D40-27 (配列番号553), 40-28 (配列番号554)および40-78 (配列番号555)の核酸配列である。
図173-2は、40-83 (配列番号556), D40-86 (配列番号557), D40-97 (配列番号558), 40-100 (配列番号559), 40-107 (配列番号560), D41-41 (配列番号561)およびD41-60 (配列番号562)の核酸配列である。
図173-3は、D41-65 (配列番号563), D41-67 (配列番号564), D41-69 (配列番号565), D41-99 (配列番号566), D42-AA3 (配列番号567), D42-AA7 (配列番号568)およびD42-AC3 (配列番号569)の核酸配列である。
図173-4は、D42-AC7 (配列番号570), D42-AC8 (配列番号571), D42-AD3 (配列番号572), D42-AD12 (配列番号573), D42-AF3 (配列番号574)およびD42-AH3 (配列番号575)の核酸配列である。
図173-5は、D42-BA2 (配列番号576), D42-BB11 (配列番号577), D42-KC9 (配列番号578), D42-KC10 (配列番号579), D42-LB2 (配列番号580), D42-LC7 (配列番号581), D42-TG7 (配列番号582)およびD42-UG8 (配列番号583)の核酸配列である。
図173-6は、D42-ZB1 (配列番号584), D300-AA7 (配列番号585), D300-AB3 (配列番号586), D300-AB7 (配列番号587), D300-AB10 (配列番号588), D300-AB11 (配列番号589)およびD300-AC2 (配列番号590)の核酸配列である。
図173-7は、D300-AC6 (配列番号591), D300-AC7 (配列番号592), D300-AD4 (配列番号593), D300-AD6 (配列番号594), D300-AD10 (配列番号595), D300-AE3 (配列番号596)およびD300-AE9 (配列番号597)の核酸配列である。
図173-8は、D300-AE11 (配列番号598), D300-AF4 (配列番号599), D300-AF5 (配列番号600), D300-AF7 (配列番号601), D300-AF8 (配列番号602), D300-AF9 (配列番号603)およびD300-AF11 (配列番号604)の核酸配列である。
図173-9は、D300-AG1 (配列番号605), D300-AG2 (配列番号606), D300-AG3 (配列番号607), D300-AG10 (配列番号608), D300-AH6 (配列番号609), D300-AH9 (配列番号610), D300-AH10 (配列番号611)およびD300-AH11 (配列番号612)の核酸配列である。
図173-10は、D300-BA5 (配列番号613), D300-BA6 (配列番号614), D300-BA7 (配列番号615), D300-BA12 (配列番号616), D300-BB6 (配列番号617), D300-BB7 (配列番号618)およびD300-BC1 (配列番号619)の核酸配列である。
図173-11は、D300-BC4 (配列番号620), D300-BC7 (配列番号621), D300-BC8 (配列番号622), D300-BC9 (配列番号623), D300-BD2 (配列番号624), D300-BD7 (配列番号625)およびD300-BE1 (配列番号626)の核酸配列である。
図173-12は、D300-BE2 (配列番号627), D300-BE7 (配列番号628), D300-BE8 (配列番号629), D300-BE9 (配列番号630), D300-BE12 (配列番号631), D300-BF7 (配列番号632), D300-BF11 (配列番号633)およびD300-BG1 (配列番号634)の核酸配列である。
図173-13は、D300-BG2 (配列番号635), D300-BG5 (配列番号636), D300-BH6 (配列番号637), D300-BH9 (配列番号638), D300-CA1 (配列番号639), D300-CA6 (配列番号640)およびD300-CB1 (配列番号641)の核酸配列である。
図173-14は、D300-CB12 (配列番号642), D300-CC2 (配列番号643), D300-CD2 (配列番号644), D300-CD3 (配列番号645), D300-CD4 (配列番号646), D300-CD5 (配列番号647)およびD300-CE3 (配列番号648)の核酸配列である。
図173-15は、D300-CE7 (配列番号649), D300-CF1 (配列番号650), D300-CF2 (配列番号651), D300-CF11 (配列番号652), D300-CG2 (配列番号653), D300-CG7 (配列番号654), D300-CH1 (配列番号655)およびD300-CH3 (配列番号656)の核酸配列である。
図173-16は、D300-CH5 (配列番号657), D300-CH7 (配列番号658), D300-DA1 (配列番号659), D300-DA4 (配列番号660), D300-DB2 (配列番号661), D300-DB4 (配列番号662), D300-DB6 (配列番号663)およびD300-DB7-c (配列番号664)の核酸配列である。
図173-17は、D300-DB8 (配列番号665), D300-DC2 (配列番号666), D300-DC4 (配列番号667), D300-DC7 (配列番号668), D300-DC10 (配列番号669), D300-DC11 (配列番号670)およびD300-DD5 (配列番号671)の核酸配列である。
図173-18は、D300-DD6 (配列番号672), D300-DE2 (配列番号673), D300-DE9 (配列番号674), D300-DE10 (配列番号675), D300-DF5 (配列番号676), D300-DF6 (配列番号677), D300-DF8 (配列番号678)およびD300-DF12 (配列番号679)の核酸配列である。
図173-19は、D300-DG1 (配列番号680), D300-DG3 (配列番号681), D300-DG9 (配列番号682), D300-DG11 (配列番号683), D300-DH10 (配列番号684), D301-AB10 (配列番号685)およびD301-AC5 (配列番号686)の核酸配列である。
図173-20は、D301-AC7 (配列番号687), D301-AC9 (配列番号688), D301-AD1 (配列番号689), D301-AD2 (配列番号690), D301-AE4c (配列番号691), D301-AF12 (配列番号692), D301-AH6 (配列番号693)およびD301-AH12 (配列番号694)の核酸配列である。
図173-21は、D301-BB8 (配列番号695), D301-BB9 (配列番号696), D301-BC1 (配列番号697), D301-BC8 (配列番号698), D301-BD1 (配列番号699), D301-BD2 (配列番号700)およびD301-BF3 (配列番号701)の核酸配列である。
図173-22は、D301-DA4 (配列番号702), D301-DA8 (配列番号703), D301-DB5 (配列番号704), D301-DC6 (配列番号705), D301-DD4 (配列番号706), D301-DG1 (配列番号707), D301-DG4c (配列番号708)およびD301-EA5 (配列番号709)の核酸配列である。
図173-23は、D301-EA6 (配列番号710), D301-EA7 (配列番号711), D301-EC9 (配列番号712), D301-EC10 (配列番号713), D301-ED5 (配列番号714), D301-ED7 (配列番号715)およびD301-EE7 (配列番号716)の核酸配列である。
図173-24は、D301-EF2 (配列番号717), D301-EF5 (配列番号718), D301-EF10 (配列番号719), D301-EG12 (配列番号720), D302-AB8 (配列番号721), D302-AB9 (配列番号722), D302-AB12 (配列番号723)およびD302-AC1 (配列番号724)の核酸配列である。
図173-25は、D302-AC5 (配列番号725), D302-AC6 (配列番号726), D302-AC7 (配列番号727), D302-AC12 (配列番号728), D302-AD4 (配列番号729), D302-AD7 (配列番号730)およびD302-AE7 (配列番号731)の核酸配列である。
図173-26は、D302-AF6 (配列番号732), D302-AF8 (配列番号733), D302-AG2 (配列番号734), D302-AH10 (配列番号735), D302-BA2 (配列番号736), D302-BA6 (配列番号737), D302-BC3 (配列番号738)およびD302-BC6 (配列番号739)の核酸配列である。
図173-27は、D302-BC9 (配列番号740), D302-BD3 (配列番号741), D302-BD7 (配列番号742), D302-BD9 (配列番号743), D302-BE1 (配列番号744)およびD302-BE2 (配列番号745)の核酸配列である。
図173-28は、D302-BE6 (配列番号746), D302-BE7 (配列番号747), D302-BF1 (配列番号748), D302-BF5 (配列番号749), D302-BG1 (配列番号750), D302-bg3 (配列番号751)およびD302-BG7 (配列番号752)の核酸配列である。
図173-29は、D302-Bg9 (配列番号753), D302-BH1 (配列番号754), D302-bh9 (配列番号755), D302-CA5 (配列番号756), D302-CB7 (配列番号757), D302-CC1 (配列番号758), D302-CC3 (配列番号759)およびD302-CD2 (配列番号760)の核酸配列である。
図173-30は、D302-CE3 (配列番号761), D302-CE9 (配列番号762), D302-CF2 (配列番号763), D302-CF5 (配列番号764), D302-CF6 (配列番号765), D302-CH1 (配列番号766)およびD302-CH4 (配列番号767)の核酸配列である。
図173-31は、D302-CH5 (配列番号768), D302-CH6 (配列番号769), D302-DA2 (配列番号770), D302-DA5 (配列番号771), D302-DA9 (配列番号772), D302-DC4 (配列番号773)およびD302-DC7 (配列番号774)の核酸配列である。
図173-32は、D302-DC8 (配列番号775), D302-DC11 (配列番号776), D302-DD3 (配列番号777), D302-DF5 (配列番号778), D302-DF7 (配列番号779), D302-DG9 (配列番号780)およびD302-DH8 (配列番号781)の核酸配列である。
図173-33は、D303-AA9 (配列番号782), D303-AA10 (配列番号783), D303-AB11 (配列番号784), D303-AC4 (配列番号785), D303-AD3 (配列番号786), D303-AD11 (配列番号787), D303-AE1 (配列番号788)およびD303-ae2 (配列番号789)の核酸配列である。
図173-34は、D303-ae6 (配列番号790), D303-AF5 (配列番号791), D303-AF12 (配列番号792), D303-AG1 (配列番号793), D303-AG8 (配列番号794), D303-AG9 (配列番号795), D303-AH5 (配列番号796)およびD303-BA1 (配列番号797)の核酸配列である。
図173-35は、D303-BA5 (配列番号798), D303-BB6 (配列番号799), D303-BC1 (配列番号800), D303-BC2 (配列番号801), D303-BC8 (配列番号802), D303-BC11 (配列番号803), D303-bd2 (配列番号804)およびD303-BD6 (配列番号805)の核酸配列である。
図173-36は、D303-BD9 (配列番号806), D303-BE3 (配列番号807), D303-BE4 (配列番号808), D303-BE7 (配列番号809), D303-BF1 (配列番号810), D303-BF6 (配列番号811), D303-BG2 (配列番号812)およびD303-BG11 (配列番号813)の核酸配列である。
図173-37は、D303-BH1 (配列番号814), D303-BH6 (配列番号815), D414-AG2 (配列番号816), D35-33 (配列番号817), D35-34 (配列番号818)およびD35-35 (配列番号819)の核酸配列である。
図173-38は、D35-41 (配列番号820), D35-43 (配列番号821), D35-51 (配列番号822)およびD35-AC4 (配列番号823)の核酸配列である。
図173-39は、D35-AC12 (配列番号824), D35-AE2 (配列番号825), D35-AE6 (配列番号826), D35-AF1 (配列番号827), D35-AF3 (配列番号828)およびD35-AG3 (配列番号829)の核酸配列である。
図173-40は、D35-BA5 (配列番号830), D35-BA12 (配列番号831), D35-BB1 (配列番号832), D35-BB3 (配列番号833)およびD35-BB10 (配列番号834)の核酸配列である。
図173-41は、D35-BB12 (配列番号835), D55-AA8 (配列番号836), D55-AB1 (配列番号837), D55-AB5 (配列番号838)およびD55-AB6 (配列番号839)の核酸配列である。
図173-42は、D55-AB7 (配列番号840), D55-AB10 (配列番号841), D55-AA2 (配列番号842), D55-AC2 (配列番号843)およびD55-AC5 (配列番号844)の核酸配列である。
図173-43は、D55-AC7 (配列番号845), D55-BA7 (配列番号846), D55-BA8 (配列番号847), D55-BA10 (配列番号848), D55-BA11 (配列番号849)およびD55-BB9 (配列番号850)の核酸配列である。
図173-44は、D55-BB10 (配列番号851), D55-BB12 (配列番号852), D55-BC4 (配列番号853), D55-BC5 (配列番号854), D55-AA6 (配列番号855)およびD56-AE5 (配列番号856)の核酸配列である。
図173-45は、D56-AA2 (配列番号857), D56-AA4 (配列番号858), D56-AA8 (配列番号859), D56-AA9 (配列番号860), D56-AB1 (配列番号861)およびD56-AB7 (配列番号862)の核酸配列である。
図173-46は、D56-AB9 (配列番号863), D56-AC9 (配列番号864), D56-AD3 (配列番号865), D56-AG8 (配列番号866)およびD56-AH1 (配列番号867)の核酸配列である。
図173-47は、D56-AH10 (配列番号868), D56-AE2 (配列番号869), D57-AB2 (配列番号870), D57-AB5 (配列番号871)およびD57-AB6 (配列番号872)の核酸配列である。
図173-48は、D57-AB8 (配列番号873), D57-AB11 (配列番号874), D57-AB12 (配列番号875), D57-AC1 (配列番号876), D57-AC4 (配列番号877)およびD57-AC12 (配列番号878)の核酸配列である。
図173-49は、D57-AD5 (配列番号879), D57-AD8 (配列番号880), D57-AD9 (配列番号881), D57-AE1 (配列番号882), D57-AE2 (配列番号883)およびD57-AE7 (配列番号884)の核酸配列である。
図173-50は、D57-AF2 (配列番号885), D57-AE12 (配列番号886), D57-AF3 (配列番号887), D57-AF5 (配列番号888)およびD57-AF9 (配列番号889)の核酸配列である。
図173-51は、D57-AG5 (配列番号890), D57-AG7 (配列番号891), D57-AG11 (配列番号892)およびD57-AH10 (配列番号893)の核酸配列である。
図173-52は、D58-AA3 (配列番号894), D58-AA5 (配列番号895), D58-AB3 (配列番号896), D58-AB5 (配列番号897)およびD58-AC1 (配列番号898)の核酸配列である。
図173-53は、D58-AC9 (配列番号899), D58-AC11 (配列番号900), D58-AD2 (配列番号901)およびD58-AD5 (配列番号902)の核酸配列である。
図173-54は、D58-AD7 (配列番号903), D58-AD8 (配列番号904), D58-AD10 (配列番号905), D58-AE1 (配列番号906)およびD58-AE2 (配列番号907)の核酸配列である。
図173-55は、D58-AE5 (配列番号908), D58-AE9 (配列番号909), D58-AE10 (配列番号910), D58-AE11 (配列番号911)およびD58-AF3 (配列番号912)の核酸配列である。
図173-56は、D58-AF6 (配列番号913), D58-AH4 (配列番号914), D58-AH7 (配列番号915), D58-AH9 (配列番号916)およびD58-AH10 (配列番号917)の核酸配列である。
図173-57は、D58-BA5 (配列番号918), D58-BA7 (配列番号919), D58-BB7 (配列番号920), D58-BC5 (配列番号921), D58-BD3 (配列番号922)およびD58-BD7 (配列番号923)の核酸配列である。
図173-58は、D58-BD8 (配列番号924), D58-BD10 (配列番号925), D58-BE2 (配列番号926), D58-BE11 (配列番号927)およびD58-BF1 (配列番号928)の核酸配列である。
図173-59は、D58-BF2 (配列番号929), D58-BG3 (配列番号930), D58-BG5 (配列番号931), D58-BG8 (配列番号932), D58-BG10 (配列番号933)およびD58-BG12 (配列番号934)の核酸配列である。
図173-60は、D58-BH10 (配列番号935), D58-BH8 (配列番号936), D58-BH2 (配列番号937), D60-AA1 (配列番号938), D60-AA2 (配列番号939)およびD60-AA3 (配列番号940)の核酸配列である。
図173-61は、D60-AA5 (配列番号941), D60-AA6 (配列番号942), D60-AA7 (配列番号943), D60-AA8 (配列番号944), D60-AA10 (配列番号945)およびD60-AA11 (配列番号946)の核酸配列である。
図173-62は、D60-AA12 (配列番号947), D60-AB3 (配列番号948), D60-AB5 (配列番号949), D60-AB6 (配列番号950), D60-AB7 (配列番号951)およびD60-AB8 (配列番号952)の核酸配列である。
図173-63は、D60-AB11 (配列番号953), D60-AC3 (配列番号954), D60-AC5 (配列番号955), D60-AC7 (配列番号956), D60-AC8 (配列番号957)およびD60-AC11 (配列番号958)の核酸配列である。
図173-64は、D60-AC12 (配列番号959), D60-AD3 (配列番号960), D60-AD4 (配列番号961), D60-AD5 (配列番号962), D60-AD7 (配列番号963)およびD60-AE1 (配列番号964)の核酸配列である。
図173-65は、D60-AE4 (配列番号965), D60-AE6 (配列番号966), D60-AE8 (配列番号967), D60-AE12 (配列番号968), D60-AF5 (配列番号969)およびD60-AF8 (配列番号970)の核酸配列である。
図173-66は、D60-AF11 (配列番号971), D60-AG1 (配列番号972), D60-AG10 (配列番号973), D60-AG12 (配列番号974), D60-AH1 (配列番号975)およびD60-AH5 (配列番号976)の核酸配列である。
図173-67は、D60-AH6 (配列番号977), D60-AH9 (配列番号978), D60-AH10 (配列番号979), D60-AH11 (配列番号980)およびD63-AA12 (配列番号981)の核酸配列である。
図173-68は、D64-4 (配列番号982), D64-AB4 (配列番号983), D64-AB10 (配列番号984), D65-AA6 (配列番号985)およびD65-AA7 (配列番号986)の核酸配列である。
図173-69は、D65-AA9 (配列番号987), D65-AB4 (配列番号988), D65-AB5 (配列番号989), D65-AB8 (配列番号990), D65-AB9 (配列番号991)およびD65-AB11 (配列番号992)の核酸配列である。
図173-70は、D65-AC1 (配列番号993), D65-AC6 (配列番号994), D65-AC10 (配列番号995), D65-AC11 (配列番号996), D65-AD3 (配列番号997)およびD65-AE1 (配列番号998)の核酸配列である。
図173-71は、D65-AE2 (配列番号999), D65-AE10 (配列番号1000), D65-AE11 (配列番号1001), D65-AE12 (配列番号1002), D65-AF1 (配列番号1003)およびD65-AF5 (配列番号1004)の核酸配列である。
図173-72は、D65-AF7 (配列番号1005), D65-AG11 (配列番号1006), D65-CE1 (配列番号1007), D65-CE2 (配列番号1008), D65-CE7 (配列番号1009)およびD65-CE9 (配列番号1010)の核酸配列である。
図173-73は、D65-CE12 (配列番号1011), D65-CF3 (配列番号1012), D65-CF10 (配列番号1013), D65-CF12 (配列番号1014), D65-CG2 (配列番号1015), D65-CG5 (配列番号1016)およびD65-CH3 (配列番号1017)の核酸配列である。
図173-74は、D65-CH4 (配列番号1018), D65-CH6 (配列番号1019), D65-CH8 (配列番号1020), D65-CH9 (配列番号1021), D65-CH11 (配列番号1022)およびD65-CH12 (配列番号1023)の核酸配列である。
図173-75は、D66-AA4 (配列番号1024), D66-AA5 (配列番号1025), D66-AA6 (配列番号1026), D66-AA9 (配列番号1027)およびD66-AB5 (配列番号1028)の核酸配列である。
図173-76は、D66-AB1 (配列番号1029), D66-AB7 (配列番号1030), D66-AC1 (配列番号1031), D66-AC2 (配列番号1032)およびD66-AC4 (配列番号1033)の核酸配列である。
図173-77は、D66-AC7 (配列番号1034), D66-AD1 (配列番号1035), D66-AD3 (配列番号1036)およびD66-AD6 (配列番号1037)の核酸配列である。
図173-78は、D66-AD8 (配列番号1038), D66-AE1 (配列番号1039), D66-AE3 (配列番号1040), D66-AE6 (配列番号1041), D66-AE8 (配列番号1042)およびD66-AF3 (配列番号2263)の核酸配列である。
図173-79は、D66-AF5 (配列番号1043), D66-AF8 (配列番号1044), D66-AF9 (配列番号1045)およびD66-AG1 (配列番号1046)の核酸配列である。
図173-80は、D66-AG4 (配列番号1047), D66-AG5 (配列番号1048), D66-AH4 (配列番号1049), D66-AH5 (配列番号1050), D66-AH7 (配列番号1051)およびD66-AH8 (配列番号1052)の核酸配列である。
図173-81は、D66-AH9 (配列番号1053), D66-BA3 (配列番号1054), D66-BA8 (配列番号1055)およびD66-BB1 (配列番号1056)の核酸配列である。
図173-82は、D66-BB2 (配列番号1057), D66-BB3 (配列番号1058), D66-BB5 (配列番号1059)およびD66-BB7 (配列番号1060)の核酸配列である。
図173-83は、D66-BB9 (配列番号1061), D66-BB10 (配列番号1062), D66-BC6 (配列番号1063), D66-BD1 (配列番号1064)およびD66-BD2 (配列番号1065)の核酸配列である。
図173-84は、D66-BD9 (配列番号1066), D67-AA2 (配列番号1067), D67-AA3 (配列番号1068), D67-AB1 (配列番号1069)およびD67-AC5 (配列番号1070)の核酸配列である。
図173-85は、D67-AD1 (配列番号1071), D67-AD4 (配列番号1072), D67-AD6 (配列番号1073), D67-AE2 (配列番号1074)およびD67-AE6 (配列番号1075)の核酸配列である。
図173-86は、D67-AF6 (配列番号1076), D67-AG1 (配列番号1077), D67-AG3 (配列番号1078), D67-AG5 (配列番号1079)およびD67-AG6 (配列番号1080)の核酸配列である。
図173-87は、D69-AA5 (配列番号1081), D69-AB1 (配列番号1082), D69-AB8 (配列番号1083), D69-AB9 (配列番号1084)およびD69-AC4 (配列番号1085)の核酸配列である。
図173-88は、D70A-AB10 (配列番号1086), D70A-AC2 (配列番号1087), D70A-AC3 (配列番号1088), D70A-AD3 (配列番号1089), D70A-AD5 (配列番号1090)およびD70A-AD6 (配列番号1091)の核酸配列である。
図173-89は、D70A-AD11 (配列番号1092), D70A-AE10 (配列番号1093), D70A-AF6 (配列番号1094), D70A-AF8 (配列番号1095), D70A-AF10 (配列番号1096), D70A-AH5 (配列番号1097)およびD70A-AH8 (配列番号1098)の核酸配列である。
図173-90は、D70A-BA3 (配列番号1099), D70A-BA6 (配列番号1100), D70A-BA10 (配列番号1101), D70A-BB8 (配列番号1102)およびD70A-BB11 (配列番号1103)の核酸配列である。
図173-91は、D70A-BC7 (配列番号1104), D70A-BD8 (配列番号1105), D70A-BE1 (配列番号1106), D70A-BE5 (配列番号1107), D70A-BE6 (配列番号1108)およびD70A-BE8 (配列番号1109)の核酸配列である。
図173-92は、D70A-BF2 (配列番号1110), D70A-BF3 (配列番号1111), D70A-BF10 (配列番号1112), D70A-BG9 (配列番号1113), D70A-BH8 (配列番号1114)およびD70-AE2 (配列番号1115)の核酸配列である。
図173-93は、D70-AE6 (配列番号1116), D70-AF3 (配列番号1117), D70-AG10 (配列番号1118), D70-AH7 (配列番号1119), D70-BE6 (配列番号1120)およびD70-BE7 (配列番号1121)の核酸配列である。
図173-94は、D70A-BC12 (配列番号1122), D72-AB2 (配列番号1123), D72-AB6 (配列番号1124), D73A-AA12 (配列番号1125)およびD73A-AB4 (配列番号1126)の核酸配列である。
図173-95は、D73A-AB9 (配列番号1127), D73A-AB11 (配列番号1128), D73A-AC1 (配列番号1129), D73A-AC3 (配列番号1130)およびD73A-AC8 (配列番号1131)の核酸配列である。
図173-96は、D73A-AD3 (配列番号1132), D73A-AE1 (配列番号1133), D73A-AE3 (配列番号1134), D73A-AE4 (配列番号1135), D73A-AE5 (配列番号1136)およびD73A-AE9 (配列番号1137)の核酸配列である。
図173-97は、D73A-AE10 (配列番号1138), D73A-AF3 (配列番号1139), D73A-AF4 (配列番号1140), D73A-AF7 (配列番号1141), D73A-AF8 (配列番号1142)およびD73A-AG11 (配列番号1143)の核酸配列である。
図173-98は、D73A-AH1 (配列番号1144), D73A-AH5 (配列番号1145), D73A-AH9 (配列番号1146), D73A-AH12 (配列番号1147), D73A-BA9 (配列番号1148)およびD73A-BB3 (配列番号1149)の核酸配列である。
図173-99は、D73A-BB9 (配列番号1150), D73A-BE1 (配列番号1151), D73A-BF3 (配列番号1152), D73A-BG1 (配列番号1153)およびD73A-BG3 (配列番号1154)の核酸配列である。
図173-100は、D73A-BG5 (配列番号1155), D73A-BH1 (配列番号1156), D73-AC1 (配列番号1157), D73-AD8 (配列番号1158)およびD73-AD12 (配列番号1159)の核酸配列である。
図173-101は、D80-AB2 (配列番号1160), D81-AA5 (配列番号1161), D81-AB4 (配列番号1162), D81-AB6 (配列番号1163)およびD81-AC5 (配列番号1164)の核酸配列である。
図173-102は、D82-AA8 (配列番号1165), D82-AC9 (配列番号1166), D82-AH9 (配列番号1167)およびD83-AD10 (配列番号1168)の核酸配列である。
図173-103は、D83-AG10 (配列番号1169), D84-AD3 (配列番号1170), D84-AE1 (配列番号1171), D84-AF4 (配列番号1172), D84-AG1 (配列番号1173)およびD87-AA1 (配列番号1174)の核酸配列である。
図173-104は、D87-AA3 (配列番号1175), D87A-AA1 (配列番号1176), D87A-AB1 (配列番号1177), D87A-AB3 (配列番号1178), D87A-AC1 (配列番号1179)およびD87A-AC3 (配列番号1180)の核酸配列である。
図173-105は、D87A-AF2 (配列番号1181), D87A-AG1 (配列番号1182), D87A-AH1 (配列番号1183), D87A-AH3 (配列番号1184), D87-AB2 (配列番号1185)およびD88-AA10 (配列番号1186)の核酸配列である。
図173-106は、D88-AB3 (配列番号1187), D88-AB6 (配列番号1188), D88-AB7 (配列番号1189), D88-AB8 (配列番号1190), D88-AC5 (配列番号1191)およびD88-AC9 (配列番号1192)の核酸配列である。
図173-107は、D88-AD8 (配列番号1193), D88-AE5 (配列番号1194), D88-AE6 (配列番号1195), D88-AE8 (配列番号1196)およびD91-AA4 (配列番号1197)の核酸配列である。
図173-108は、D92-AD9 (配列番号1198), D92-AE9 (配列番号1199), D92-AF8 (配列番号1200), D92-AG10 (配列番号1201), D92-AH9 (配列番号1202)およびD93-AA1 (配列番号1203)の核酸配列である。
図173-109は、D93-AA2 (配列番号1204), D93-AB1 (配列番号1205), D93-AC3 (配列番号1206), D93-AC4 (配列番号1207)およびD93-AD1 (配列番号1208)の核酸配列である。
図173-110は、D93-AE3 (配列番号1209), D93-AE4 (配列番号1210), D93-AF3 (配列番号1211), D93-AG1 (配列番号1212), D93-AH2 (配列番号1213)およびD93-AH3 (配列番号1214)の核酸配列である。
図173-111は、D93-AH4 (配列番号1215), D93-BA10 (配列番号1216), D93-BA12 (配列番号1217), D93-BD11 (配列番号1218), D93-BE11 (配列番号1219)およびD93-BF12 (配列番号1220)の核酸配列である。
図173-112は、D94-AA2 (配列番号1221), D94-AA3 (配列番号1222), D94-AB1 (配列番号1223), D94-AB2 (配列番号1224)およびD94-AC3 (配列番号1225)の核酸配列である。
図173-113は、D94-AD1 (配列番号1226), D94-AE1 (配列番号1227), D94-AE3 (配列番号1228), D94-AG2 (配列番号1229)およびD94-AH1 (配列番号1230)の核酸配列である。
図173-114は、D94-AH2 (配列番号1231), D94-AH3 (配列番号1232), D95-AC1 (配列番号1233), D95-AD2 (配列番号1234), D96-AA3 (配列番号1235)およびD96-AA4 (配列番号1236)の核酸配列である。
図173-115は、D96-AA7 (配列番号1237), D96-AB7 (配列番号2264), D96-AC5 (配列番号1238), D96-AC6 (配列番号1239)およびD96-AD6 (配列番号1240)の核酸配列である。
図173-116は、D96-AE6 (配列番号1241), D96-AG3 (配列番号1242), D96-AH8 (配列番号1243), D97-AA1 (配列番号1244), D97-AB1 (配列番号1245)およびD97-AB3 (配列番号1246)の核酸配列である。
図173-117は、D97-AD1 (配列番号1247), D97-AD2 (配列番号1248), D97-AD4 (配列番号1249), D97-AE1 (配列番号1250)およびD97-AE2 (配列番号1251)の核酸配列である。
図173-118は、D97-AE4 (配列番号1252), D97-AF3 (配列番号1253), D97-AG2 (配列番号1254), D97-AG3 (配列番号1255)およびD97-AH1 (配列番号1256)の核酸配列である。
図173-119は、D97-AH2 (配列番号1257), D97-AH4 (配列番号1258), D98-AB2 (配列番号1259), D98-AE3 (配列番号1260)およびD98-AF1 (配列番号1261の核酸配列)である。
図173-120は、D98-AH2 (配列番号1262), D99-AC5 (配列番号1263), D99-AC8 (配列番号1264), D99-AD2 (配列番号1265), D99-AD3 (配列番号1266)およびD99-AD4 (配列番号1267)の核酸配列である。
図173-121は、D99-AD6 (配列番号1268), D99-AE1 (配列番号1269), D99-AE5 (配列番号1270), D99-AE6 (配列番号1271), D99-AE7 (配列番号1272)およびD99-AE8 (配列番号1273)の核酸配列である。
図173-122は、D99-AF1 (配列番号1274), D99-AF5 (配列番号1275), D99-AF7 (配列番号1276), D99-AG2 (配列番号1277), D99-AG4 (配列番号1278), D99-AG7 (配列番号1279)およびD99-AH2 (配列番号1280)の核酸配列である。
図173-123は、D99-AH10 (配列番号1281), D99-DA3 (配列番号1282), D99-DB5 (配列番号1283), D99-DC2 (配列番号1284)およびD99-DC3 (配列番号1285)の核酸配列である。
図173-124は、D99-DD5 (配列番号1286), D99-DG4 (配列番号1287), D100A-AA4 (配列番号1288)およびD101-BG2 (配列番号1289)の核酸配列である。
図173-125は、D101A-AC2 (配列番号1290), D101A-AD1 (配列番号1291), D101A-AD2 (配列番号1292), D101A-AE1 (配列番号1293)およびD101A-AF1 (配列番号1294)の核酸配列である。
図173-126は、D101C-AA1 (配列番号1295), D101C-AB1 (配列番号1296), D101C-AC1 (配列番号1297), D101C-AD3 (配列番号1298)およびD101C-BD12 (配列番号1299)の核酸配列である。
図173-127は、D101C-BE12 (配列番号1300), D101C-BF12 (配列番号1301), D101C-BG12 (配列番号1302)およびD101D-AB6 (配列番号1303)の核酸配列である。
図173-128は、D101D-AC5 (配列番号1304), D101D-AG5 (配列番号1305), D101D-AG6 (配列番号1306), D101D-AH4 (配列番号1307)およびD101D-AH6 (配列番号1308)の核酸配列である。
図173-129は、D101D-BB11 (配列番号1309), D101D-BD11 (配列番号1310), D107-AA3 (配列番号1311), D107-AB2 (配列番号1312), D107-AC2 (配列番号1313)およびD107-AC3 (配列番号1314)の核酸配列である。
図173-130は、D107-AD2 (配列番号1315), D107-AD3 (配列番号1316), D107-AF1 (配列番号1317), D107-AH1 (配列番号1318), D108-AA6 (配列番号1319)およびD108-AB4 (配列番号1320)の核酸配列である。
図173-131は、D108-AB5 (配列番号1321), D108-AC6 (配列番号1322), D108-AD6 (配列番号1323), D108-AF6 (配列番号1324), D109-AA7 (配列番号1325)およびD109-AA8 (配列番号1326)の核酸配列である。
図173-132は、D109-AA9 (配列番号1327), D109-AB8 (配列番号1328), D109-AC7 (配列番号1329), D109-AC8 (配列番号1330), D109-AC9 (配列番号1331)およびD109-AE7 (配列番号1332)の核酸配列である。
図173-133は、D109-AF9 (配列番号1333), D109-AH7 (配列番号1334), D110-AB11 (配列番号1335), D110-AF10 (配列番号1336), D111-AA2 (配列番号1337)およびD111-AB1 (配列番号1338)の核酸配列である。
図173-134は、D111-AB3 (配列番号1339), D111-AC3 (配列番号1340), D111-AD1 (配列番号1341), D111-AF1 (配列番号1342)およびD111-AG3 (配列番号1343)の核酸配列である。
図173-135は、D111-AH1 (配列番号1344), D111-AH2 (配列番号1345), D112-AD6 (配列番号1346), D112-AE6 (配列番号1347)およびD112-AF5 (配列番号1348)の核酸配列である。
図173-136は、D112-AG5 (配列番号1349), D112-AH4 (配列番号1350), D113-AA9 (配列番号1351), D113A-AC3 (配列番号1352)およびD113A-AD1 (配列番号1353)の核酸配列である。
図173-137は、D113A-AD3 (配列番号1354), D113A-AF3 (配列番号1355), D113A-AG2 (配列番号1356), D113A-AH2 (配列番号1357), D113-AB9 (配列番号1358)およびD113-AC7 (配列番号1359)の核酸配列である。
図173-138は、D113-AD8 (配列番号1360), D113-AD9 (配列番号1361), D113-AE7 (配列番号1362), D113-AF8 (配列番号1363)およびD113-AF9 (配列番号1364)の核酸配列である。
図173-139は、D113-AG7 (配列番号1365), D113-AG9 (配列番号1366), D114-AE10 (配列番号1367), D114-AF11 (配列番号1368)およびD115-AA6 (配列番号1369)の核酸配列である。
図173-140は、D133-AA7 (配列番号1370), D133-AE8 (配列番号1371), D133-AF9 (配列番号1372), D133-AG8 (配列番号1373), D138-AD10 (配列番号1374)およびD139-AD1 (配列番号1375)の核酸配列である。
図173-141は、D140-AA4 (配列番号1376), D140-AD4 (配列番号1377), D140-AF4 (配列番号1378), D141-AA7 (配列番号1379), D141-AB7 (配列番号1380)およびD142-AB11 (配列番号1381)の核酸配列である。
図173-142は、D142-AC10 (配列番号1382), D142-AE10 (配列番号1383), D142-AE11 (配列番号1384), D142-AF10 (配列番号1385), D144-AA1 (配列番号1386)およびD144A-AA9 (配列番号1387)の核酸配列である。
図173-143は、D144A-AB12 (配列番号1388), D144A-AC9 (配列番号1389), D144A-AC10 (配列番号1390), D144A-AD12 (配列番号1391), D144A-AE12 (配列番号1392)およびD144A-AF11 (配列番号1393)の核酸配列である。
図173-144は、D144A-AF12 (配列番号1394), D144A-AG11 (配列番号1395), D144A-AH9 (配列番号1396), D144A-AH11 (配列番号1397)およびD144-AE4 (配列番号1398)の核酸配列である。
図173-145は、D144-AH3 (配列番号1399), D145-AA8 (配列番号1400), D145-AC10 (配列番号1401), D145-AD7 (配列番号1402), D145-AD9 (配列番号1403)およびD145-AD10 (配列番号1404)の核酸配列である。
図173-146は、D145-AE7 (配列番号1405), D145-AF7 (配列番号1406), D145-AF8 (配列番号1407), D145-AG8 (配列番号1408), D145-AG9 (配列番号1409)およびD145-AG10 (配列番号1410)の核酸配列である。
図173-147は、D145-AH9 (配列番号1411), D146-BB2 (配列番号1412), D146-BC1 (配列番号1413), D146-BD1 (配列番号1414)およびD146-BD2 (配列番号1415)の核酸配列である。
図173-148は、配列D146-BF2 (配列番号1416), D147-AE2 (配列番号1417), D150-AA2 (配列番号1418), D150-AC2 (配列番号1419)およびD150-AD1 (配列番号1420)の核酸である。
図173-149は、D151-AA1 (配列番号1421), D152-AA2 (配列番号1422), D152-AB2 (配列番号1423), D152-AC1 (配列番号1424), D152-AD2 (配列番号1425)およびD152-AG2 (配列番号1426)の核酸配列である。
図173-150は、D152-AH2 (配列番号1427), D153-AA7 (配列番号1428), D153-AB2 (配列番号1429), D153-AF2 (配列番号1430), D153-AF7 (配列番号1431)およびD153-AF9 (配列番号1432)の核酸配列である。
図173-151は、の核酸配列D153-AG6 (配列番号1433), D153-AG7 (配列番号1434), D153-AG9 (配列番号1435), D153-AH6 (配列番号1436)およびD153-AH9 (配列番号1437)である。
図173-152は、D154-AC2 (配列番号1438), D154-AE9 (配列番号1439), D155-AB1 (配列番号1440), D155-AC1 (配列番号1441)およびD155-AC2 (配列番号1442)の核酸配列である。
図173-153は、D155-AE1 (配列番号1443), D155-AE2 (配列番号1444), D155-AF1 (配列番号1445), D155-AF2 (配列番号1446)およびD155-AH2 (配列番号1447)の核酸配列である。
図173-154は、D156-AB1 (配列番号1448), D156-AC3 (配列番号1449), D156-AC4 (配列番号1450), D156-AD3 (配列番号1451)およびD156-AF2 (配列番号1452)の核酸配列である。
図173-155は、D156-AF4 (配列番号1453), D156-AG1 (配列番号1454), D156-AG2 (配列番号1455), D156-AG4 (配列番号1456)およびD156-AH1 (配列番号1457)の核酸配列である。
図173-156は、D157-AG4 (配列番号1458), D158-AB8 (配列番号1459), D158-AD5 (配列番号1460), D158-AD6 (配列番号1461)およびD158-AD8 (配列番号1462)の核酸配列である。
図173-157は、D158-AE8 (配列番号1463), D159-AD2 (配列番号1464), D160-AB4 (配列番号1465), D160-AC4 (配列番号1466)およびD160-AE4 (配列番号1467)の核酸配列である。
図173-158は、D160-AF4 (配列番号1468), D160-AH4 (配列番号1469), D161-AE5 (配列番号1470), D161-AH5 (配列番号1471), D164-AB1 (配列番号1472)およびD164-AB3 (配列番号1473)の核酸配列である。
図173-159は、D164-AC1 (配列番号1474), D164-AC2 (配列番号1475), D164-AC5 (配列番号1476), D164-AE1 (配列番号1477)およびD164-AF1 (配列番号1478)の核酸配列である。
図173-160は、D165-AH8 (配列番号1479), D177-BB7 (配列番号1480), D178-AA6 (配列番号1481), D178-AD5 (配列番号1482)およびD180-AA9 (配列番号1483)の核酸配列である。
図173-161は、D181-AB6 (配列番号1484), D181-AC6 (配列番号1485), D181-AD7 (配列番号1486), D181-AG7 (配列番号1487)およびD181-AH6 (配列番号1488)の核酸配列である。
図173-162は、D182-AA1 (配列番号1489), D182-AA2 (配列番号1490), D182-AA4 (配列番号1491), D182-AB2 (配列番号1492)およびD182-AC2 (配列番号1493)の核酸配列である。
図173-163は、D182-AC4 (配列番号1494), D182-AD1 (配列番号1495), D182-AD3 (配列番号1496), D182-AF1 (配列番号1497)およびD182-AF4 (配列番号1498)の核酸配列である。
図173-164は、D182-AG1 (配列番号1499), D183-AC8 (配列番号1500), D185-AB10 (配列番号1501), D185-AC10 (配列番号1502), D185-AF10 (配列番号1503)およびD185-BA1 (配列番号1504)の核酸配列である。
図173-165は、D185-BB3 (配列番号1505), D186-AA3 (配列番号1506), D186-AB4 (配列番号1507), D186-AC2 (配列番号1508), D186-AC3 (配列番号1509)およびD186-AD2 (配列番号1510)の核酸配列である。
図173-166は、D186-AD3 (配列番号1511), D186-AE3 (配列番号1512), D187-AB2 (配列番号1513), D187-AB3 (配列番号1514), D187-AC4 (配列番号1515), D187-AE4 (配列番号1516)およびD187-AF4 (配列番号1517)の核酸配列である。
図173-167は、D187-AG1 (配列番号1518), D187-AG2 (配列番号1519), D187-AG3 (配列番号1520), D187-AH2 (配列番号1521), D184-AA1 (配列番号1522)およびD188-AC7 (配列番号1523)の核酸配列である。
図173-168は、D188-AC8 (配列番号1524), D188-AD8 (配列番号1525), D188-AE8 (配列番号1526), D188-AF6 (配列番号1527), D188-AG5 (配列番号1528)およびD188-AG7 (配列番号1529)の核酸配列である。
図173-169は、D188-AH7 (配列番号1530), D189-AA12 (配列番号1531), D189-AB10 (配列番号1532), D189-AE9 (配列番号1533), D189-AE12 (配列番号1534)およびD189-AF12 (配列番号1535)の核酸配列である。
図173-170は、D189-AG10 (配列番号1536), D190-BA6 (配列番号1537), D190-BD6 (配列番号1538), D190-BF6 (配列番号1539), D190-BG6 (配列番号1540)およびD190-BH6 (配列番号1541)の核酸配列である。
図173-171は、D191-BC5 (配列番号1542), D191-BD5 (配列番号1543), D191-BF5 (配列番号1544), D191-BG5 (配列番号1545)およびD194-AA1 (配列番号1546)の核酸配列である。
図173-172は、D194-AA2 (配列番号1547), D194-AB1 (配列番号1548), D194-AB2 (配列番号1549), D194-AC1 (配列番号1550)およびD194-AC2 (配列番号1551)の核酸配列である。
図173-173は、D194-AD1 (配列番号1552), D194-AD2 (配列番号1553), D194-AD3 (配列番号1554), D194-AE1 (配列番号1555)およびD194-AE2 (配列番号1556)の核酸配列である。
図173-174は、D194-AE3 (配列番号1557), D194-AF1 (配列番号1558), D194-AF2 (配列番号1559), D194-AG2 (配列番号1560)およびD194-AG3 (配列番号1561)の核酸配列である。
図173-175は、D194-AH1 (配列番号1562), D194-AH2 (配列番号1563), D194-AH3 (配列番号1564), D195-AB6 (配列番号1565), D195-AD5 (配列番号1566)およびD195-AE4 (配列番号1567)の核酸配列である。
図173-176は、D195-AE5 (配列番号1568), D195-AG5 (配列番号1569), D195-AH5 (配列番号1570), D196-AD7 (配列番号1571)およびD196-AF7 (配列番号1572)の核酸配列である。
図173-177は、D196-AG7 (配列番号1573), D197-AE8 (配列番号1574), D198-AB9 (配列番号1575), D198-AC9 (配列番号1576)およびD198-AF9 (配列番号1577)の核酸配列である。
図173-178は、D199-AA10 (配列番号1578), D199-AB10 (配列番号1579), D199-AD10 (配列番号1580), D199-AF10 (配列番号1581)およびD199-AG10 (配列番号1582)の核酸配列である。
図173-179は、D200-AB11 (配列番号1583), D200-AC11 (配列番号1584), D200-AD11 (配列番号1585), D200-AE11 (配列番号1586)およびD200-AG11 (配列番号1587)の核酸配列である。
図173-180は、D200-AH11 (配列番号1588), D201-AD12 (配列番号1589), D201-AE12 (配列番号1590), D201-AF12 (配列番号1591), D201-AG12 (配列番号1592)およびD203-BE11 (配列番号1593)の核酸配列である。
図173-181は、D203-BF11 (配列番号1594), D204-AA1 (配列番号1595), D204-AA2 (配列番号1596), D204-AA4 (配列番号1597)およびD204-AB1 (配列番号1598)の核酸配列である。
図173-182は、D204-AB3 (配列番号1599), D204-AC1 (配列番号1600), D204-AC2 (配列番号1601), D204-AC4 (配列番号1602)およびD204-AD1 (配列番号1603)の核酸配列である。
図173-183は、D204-AD2 (配列番号1604), D204-AD3 (配列番号1605), D204-AD4 (配列番号1606), D204-AE3 (配列番号1607)およびD204-AE4 (配列番号1608)の核酸配列である。
図173-184は、D204-AF1 (配列番号1609), D204-AF3 (配列番号1610), D204-AF4 (配列番号1611), D204-AG1 (配列番号1612)およびD204-AG2 (配列番号1613)の核酸配列である。
図173-185は、D204-AG3 (配列番号1614), D203-BA11 (配列番号1615), D204-AG4 (配列番号1616), D204-AH2 (配列番号1617)およびD204-AH1 (配列番号1618)の核酸配列である。
図173-186は、D204-AH3 (配列番号1619), D205-BC9 (配列番号1620), D205-BD9 (配列番号1621), D206-CB3 (配列番号1622), D206-CE3 (配列番号1623)およびD206-CF3 (配列番号1624)の核酸配列である。
図173-187は、D206-CG1 (配列番号1625), D206-CH1 (配列番号1626), D210-BF4 (配列番号1627)およびD210-BF6 (配列番号1628)の核酸配列である。
図173-188は、D210-BH6 (配列番号1629), D211-BA9 (配列番号1630), D211-BB8 (配列番号1631), D211-BB9 (配列番号1632), D211-BC9 (配列番号1633)およびD211-BD8 (配列番号1634)の核酸配列である。
図173-189は、D211-BD9 (配列番号1635), D211-BE7 (配列番号1636), D211-BE8 (配列番号1637)およびD211-BF8 (配列番号1638)の核酸配列である。
図173-190は、D211-BF9 (配列番号1639), D211-BG8 (配列番号1640), D211-BH7 (配列番号1641), D212-BB11 (配列番号1642)およびD212-BB12 (配列番号1643)の核酸配列である。
図173-191は、D212-BD10 (配列番号1644), D212-BD11 (配列番号1645), D212-BE10 (配列番号1646), D212-BE11 (配列番号1647), D212-BF10 (配列番号1648)およびD212-BF11 (配列番号1649)の核酸配列である。
図173-192は、D213-BD1 (配列番号1650), D213-BF2 (配列番号1651), D214-AA1 (配列番号1652), D214-AA3 (配列番号1653)およびD214-AC1 (配列番号1654)の核酸配列である。
図173-193は、D214-AE1 (配列番号1655), D214-AE3 (配列番号1656), D214-AG1 (配列番号1657), D214-AH2 (配列番号1658)およびD214-AH3 (配列番号1659)の核酸配列である。
図173-194は、D216-AB7 (配列番号1660), D216-AC8 (配列番号1661), D216-AH9 (配列番号1662), D219-BA1 (配列番号1663), D219-BB1 (配列番号1664)およびD219-BB2 (配列番号1665)の核酸配列である。
図173-195は、D219-BC1 (配列番号1666), D219-BD1 (配列番号1667), D219-BD2 (配列番号1668), D219-BE1 (配列番号1669), D219-BE2 (配列番号1670)およびD219-BF2 (配列番号1671)の核酸配列である。
図173-196は、D219-BH1 (配列番号1672), D220-BF6 (配列番号1673), D220-BD6 (配列番号1674), D223-BC11 (配列番号1675)およびD221-BC7 (配列番号1676)の核酸配列である。
図173-197は、D227-AE3 (配列番号1677), D223-BB10 (配列番号1678), D221-BF9 (配列番号1679), D229-AD2 (配列番号1680), D229-AE2 (配列番号1681), D229-AF2 (配列番号1682)およびD229-AG1 (配列番号1683)の核酸配列である。
図173-198は、D229-AH1 (配列番号1684), D230-AB1 (配列番号1685), D230-AC1 (配列番号1686), D230-AC2 (配列番号1687), D230-AF2 (配列番号1688)およびD230-AG1 (配列番号1689)の核酸配列である。
図173-199は、D230-AG2 (配列番号1690), D231-AA1 (配列番号1691), D231-AA2 (配列番号1692), D231-AA3 (配列番号1693), D231-AC1 (配列番号1694)およびD231-AC2 (配列番号1695)の核酸配列である。
図173-200は、D231-AD2 (配列番号1696), D231-AE1 (配列番号1697), D231-AG2 (配列番号1698), D231-AH1 (配列番号1699), D231-AH2 (配列番号1700)およびD231-AH3 (配列番号1701)の核酸配列である。
図173-201は、D232-AD4 (配列番号1702), D232-AE5 (配列番号1703), D232-AE6 (配列番号1704)およびD232-AF5 (配列番号1705)の核酸配列である。
図173-202は、D233-AA7 (配列番号1706), D233-AA8 (配列番号1707), D233-AB7 (配列番号1708), D233-AC7 (配列番号1709)およびD233-AC8 (配列番号1710)の核酸配列である。
図173-203は、D233-AH9 (配列番号1711), D234-AA11 (配列番号1712), D234-AC11 (配列番号1713), D234-AD11 (配列番号1714), D238-AA2 (配列番号1715)およびD239-BC3 (配列番号1716)の核酸配列である。
図173-204は、D239-BD4 (配列番号1717), D239-BD6 (配列番号1718), D239-BE4 (配列番号1719), D240-BB7 (配列番号1720)およびD241-BC9 (配列番号1721)の核酸配列である。
図173-205は、D241-BE9 (配列番号1722), D242-BA11 (配列番号1723), D242-BB11 (配列番号1724), D242-BB12 (配列番号1725), D242-BC12 (配列番号1726)およびD242-BF12 (配列番号1727)の核酸配列である。
図173-206は、D242-BG12 (配列番号1728), D242-BH11 (配列番号1729), D244-AA5 (配列番号1730), D244-AA6 (配列番号1731), D244-AF6 (配列番号1732)およびD245-AE7 (配列番号1733)の核酸配列である。
図173-207は、D245-AE8 (配列番号1734), D245-AF7 (配列番号1735), D246-AA12 (配列番号1736), D248-AG4 (配列番号1737)およびD249-AG9 (配列番号1738)の核酸配列である。
図173-208は、D250-AE10 (配列番号1739), D251-AF2 (配列番号1740), D251-AG2 (配列番号1741), D252-AA5 (配列番号1742)およびD252-AB5 (配列番号1743)の核酸配列である。
図173-209は、D252-AC5 (配列番号1744), D252-AD5 (配列番号1745), D252-AF4 (配列番号1746), D252-AF5 (配列番号1747), D252-AG5 (配列番号1748)およびD254-AE2 (配列番号1749)の核酸配列である。
図173-210は、D254-AG2 (配列番号1750), D255-AA5 (配列番号1751), D255-AA6 (配列番号1752), D255-AD5 (配列番号1753)およびD255-AD6 (配列番号1754)の核酸配列である。
図173-211は、D255-AF5 (配列番号1755), D255-AG5 (配列番号1756), D256-AA10 (配列番号1757)およびD256-AB10 (配列番号1758)の核酸配列である。
図173-212は、D256-AC10 (配列番号1759), D256-AE10 (配列番号1760), D256-AF9 (配列番号1761), D256-AF10 (配列番号1762)およびD256-AG10 (配列番号1763)の核酸配列である。
図173-213は、D256-AH10 (配列番号1764), D258-AC5 (配列番号1765), D263-AE12 (配列番号1766), D263-AF12 (配列番号1767)およびD263-AH12 (配列番号1768)の核酸配列である。
図173-214は、D264-AA1 (配列番号1769), D264-AA2 (配列番号1770), D264-AA3 (配列番号1771), D264-AB2 (配列番号1772)およびD264-AC3 (配列番号1773)の核酸配列である。
図173-215は、D264-AD3 (配列番号1774), D264-AE1 (配列番号1775), D264-AE2 (配列番号1776)およびD264-AE3 (配列番号1777)の核酸配列である。
図173-216は、D264-AF2 (配列番号1778), D264-AG2 (配列番号1779), D264-AH2 (配列番号1780)およびD265-AA4 (配列番号1781)の核酸配列である。
図173-217は、D265-AA6 (配列番号1782), D265-AC5 (配列番号1783), D265-AC6 (配列番号1784)およびD265-AD4 (配列番号1785)の核酸配列である。
図173-218は、D265-AD5 (配列番号1786), D266-AB7 (配列番号1787), D266-AB8 (配列番号1788), D266-AC9 (配列番号1789)およびD266-AD7 (配列番号1790)の核酸配列である。
図173-219は、D267-AD10 (配列番号1791), D268-AA2 (配列番号1792), D268-AC3 (配列番号1793), D268-AD1 (配列番号1794)およびD268-AD2 (配列番号1795)の核酸配列である。
図173-220は、D268-AD3 (配列番号1796), D268-AE3 (配列番号1797), D268-AG2 (配列番号1798)およびD268-AG3 (配列番号1799)の核酸配列である。
図173-221は、D269-AA5 (配列番号1800), D269-AD4 (配列番号1801), D269-AE4 (配列番号1802), D269-AF5 (配列番号1803), D269-AF6 (配列番号1804)およびD270-AA8 (配列番号1805)の核酸配列である。
図173-222は、D270-AB9 (配列番号1806), D270-AD8 (配列番号1807), D270-AD9 (配列番号1808), D270-AE9 (配列番号1809)およびD270-AF8 (配列番号1810)の核酸配列である。
図173-223は、D271-AG11 (配列番号1811), D271-AH11 (配列番号1812), D276-AD5 (配列番号1813)およびD276-AG6 (配列番号1814)の核酸配列である。
図173-224は、D276-AH4 (配列番号1815), D276-AH6 (配列番号1816), D277-AE8 (配列番号1817), D277-AF9 (配列番号1818)およびD277-AH9 (配列番号1819)の核酸配列である。
図173-225は、D278-AF10 (配列番号1820), D279-AA3 (配列番号1821), D279-AB2 (配列番号1822), D279-AC1 (配列番号1823)およびD279-AD2 (配列番号1824)の核酸配列である。
図173-226は、D279-AE1 (配列番号1825), D279-AE3 (配列番号1826), D279-AG3 (配列番号1827), D279-BA1 (配列番号1828)およびD279-BA2 (配列番号1829)の核酸配列である。
図173-227は、D279-BB3 (配列番号1830), D279-BC2 (配列番号1831), D279-BD2 (配列番号1832), D279-BE2 (配列番号1833)およびD279-BF3 (配列番号1834)の核酸配列である。
図173-228は、D279-BG1 (配列番号1835), D279-BH3 (配列番号1836), D280-AB5 (配列番号1837), D280-AB6 (配列番号1838)およびD280-AC4 (配列番号1839)の核酸配列である。
図173-229は、D280-AC6 (配列番号1840), D280-AD4 (配列番号1841), D280-AD5 (配列番号1842), D280-AD6 (配列番号1843)およびD280-AE4 (配列番号1844)の核酸配列である。
図173-230は、D280-AE5 (配列番号1845), D280-AE6 (配列番号1846), D280-AF5 (配列番号1847), D280-AF6 (配列番号1848)およびD280-AG4 (配列番号1849)の核酸配列である。
図173-231は、D280-AG5 (配列番号1850), D280-AG6 (配列番号1851), D280-AH4 (配列番号1852), D280-AH5 (配列番号1853)およびD280-BC4 (配列番号1854)の核酸配列である。
図173-232は、D280-BD4 (配列番号1855), D280-BE4 (配列番号1856), D280-BE6 (配列番号1857)およびD280-BF4 (配列番号1858)の核酸配列である。
図173-233は、D280-BG4 (配列番号1859), D280-BH4 (配列番号1860), D280-BH6 (配列番号1861), D281-AA8 (配列番号1862)およびD281-AD7 (配列番号1863)の核酸配列である。
図173-234は、D281-AD8 (配列番号1864), D281-AE7 (配列番号1865), D281-AE8 (配列番号1866), D281-AE9 (配列番号1867), D281-AG7 (配列番号1868)およびD282-AB10 (配列番号1869)の核酸配列である。
図173-235はD282-AB11 (配列番号1870), D282-AD10 (配列番号1871), D282-AH11 (配列番号1872), D282-BA10 (配列番号1873), D282-BB10 (配列番号1874)およびD282-BD10 (配列番号1875)、の核酸配列である。
図173-236は、D288-AB3 (配列番号1876), D289-AA4 (配列番号1877), D289-AA6 (配列番号1878), D289-AB4 (配列番号1879)およびD289-AB6 (配列番号1880)の核酸配列である。
図173-237は、D289-AD4 (配列番号1881), D289-AE4 (配列番号1882), D289-AE6 (配列番号1883), D289-AF4 (配列番号1884)およびD289-AF6 (配列番号1885)の核酸配列である。
図173-238は、D289-AG4 (配列番号1886), D289-AG6 (配列番号1887), D289-AH4 (配列番号1888), D289-AH6 (配列番号1889)およびD290-AA7 (配列番号1890)の核酸配列である。
図173-239は、D290-AA8 (配列番号1891), D290-AA9 (配列番号1892), D290-AB7 (配列番号1893), D290-AB9 (配列番号1894)およびD290-AC8 (配列番号1895)の核酸配列である。
図173-240は、D290-AC9 (配列番号1896), D290-AD7 (配列番号1897), D290-AD8 (配列番号1898), D290-AD9 (配列番号1899)およびD291-AA12 (配列番号1900)の核酸配列である。
図173-241は、D291-AB10 (配列番号1901), D291-AB11 (配列番号1902), D291-AC12 (配列番号1903), D291-AD11 (配列番号1904)およびD291-AD12 (配列番号1905)の核酸配列である。
図173-242は、D291-AE10 (配列番号1906), D291-AE12 (配列番号1907), D291-AF10 (配列番号1908), D291-AF12 (配列番号1909)およびD291-AG11 (配列番号1910)の核酸配列である。
図173-243は、D291-AG12 (配列番号1911), D291-AH11 (配列番号1912), D292-AA2 (配列番号1913), D292-AA3 (配列番号1914), D292-AB2 (配列番号1915)およびD292-AC2 (配列番号1916)の核酸配列である。
図173-244は、D292-AD1 (配列番号1917), D292-AD2 (配列番号1918), D292-AE1 (配列番号1919), D292-AE2 (配列番号1920), D292-AF1 (配列番号1921), D292-AF3 (配列番号1922)およびD292-AH3 (配列番号1923)の核酸配列である。
図173-245は、D291-AA10 (配列番号1924), D294-AB7 (配列番号1925), D294-AB8 (配列番号1926), D294-AB9 (配列番号1927)およびD294-AC7 (配列番号1928)の核酸配列である。
図173-246は、D294-AC8 (配列番号1929), D294-AE9 (配列番号1930), D294-AG8 (配列番号1931), D294-AH7 (配列番号1932)およびD295-AA3 (配列番号1933)の核酸配列である。
図173-247は、D295-AB1 (配列番号1934), D295-AB2 (配列番号1935), D295-AC2 (配列番号1936), D295-AC3 (配列番号1937)およびD295-AD1 (配列番号1938)の核酸配列である。
図173-248は、D295-AD2 (配列番号1939), D295-AE3 (配列番号1940), D295-AF1 (配列番号1941), D295-AF2 (配列番号1942)およびD295-AG3 (配列番号1943)の核酸配列である。
図173-249は、D295-AH1 (配列番号1944), D296-AA6 (配列番号1945), D296-AE5 (配列番号1946), D296-AF5 (配列番号1947)およびD296-AG4 (配列番号1948)の核酸配列である。
図173-250は、D296-AG5 (配列番号1949), D297-AA7 (配列番号1950), D297-AA8 (配列番号1951), D297-AB7 (配列番号1952)およびD297-AE7 (配列番号1953)の核酸配列である。
図173-251は、D297-AF7 (配列番号1954), D298-AA10 (配列番号1955), D298-AB11 (配列番号1956), D298-AF11 (配列番号1957)およびD298-AG12 (配列番号1958)の核酸配列である。
図173-252は、D35-40 (配列番号1959), D35-AC6 (配列番号1960), D35-BB2 (配列番号1961), D55-AB9 (配列番号1962)およびD55-BB1 (配列番号1963)の核酸配列である。
図173-253は、D55-BB2 (配列番号1964), D55-BB3 (配列番号1965), D55-BB7 (配列番号1966), D56-AA1 (配列番号1967), D56-AE4 (配列番号1968)およびD56-AE9 (配列番号1969)の核酸配列である。
図173-254は、D56-AD1 (配列番号1970), D56-AG12 (配列番号1971), D56-AH11 (配列番号1972), D57-AA5 (配列番号1973)およびD57-AA7 (配列番号1974)の核酸配列である。
図173-255は、D57-AB10 (配列番号1975), D57-AC2 (配列番号1976), D57-AC3 (配列番号1977), D57-AC6 (配列番号1978), D57-AC9 (配列番号1979)およびD57-AC11 (配列番号1980)の核酸配列である。
図173-256は、D57-AD3 (配列番号1981), D57-AE4 (配列番号1982), D57-AE6 (配列番号1983), D57-AE9 (配列番号1984)およびD57-AF4 (配列番号1985)の核酸配列である。
図173-257は、D57-AF11 (配列番号1986), D57-AG3 (配列番号1987), D57-AH11 (配列番号1988), D58-AB2 (配列番号1989), D58-AC8 (配列番号1990)およびD58-AG9 (配列番号1991)の核酸配列である。
図173-258は、D58-BA9 (配列番号1992), D58-BB9 (配列番号1993), D58-BC1 (配列番号1994), D58-BC10 (配列番号1995), D58-BC11 (配列番号1996)およびD58-BD4 (配列番号1997)の核酸配列である。
図173-259は、D58-BE8 (配列番号1998), D58-BF4 (配列番号1999), D60-AB4 (配列番号2000), D60-AC4 (配列番号2001), D60-AD11 (配列番号2002)およびD60-AF9 (配列番号2003)の核酸配列である。
図173-260は、D65-AB6 (配列番号2004), D65-AC3 (配列番号2005), D65-AC9 (配列番号2006), D65-AC12 (配列番号2007), D65-AE3 (配列番号2008)およびD65-AG1 (配列番号2009)の核酸配列である。
図173-261は、D65-CE10 (配列番号2010), D65-CE11 (配列番号2011), D65-CF11 (配列番号2012), D65-CH5 (配列番号2013), D66-AA1 (配列番号2014)およびD66-AA3 (配列番号2015)の核酸配列である。
図173-262は、D66-AE5 (配列番号2016), D66-AF1 (配列番号2017), D66-AG2 (配列番号2018), D66-AG6 (配列番号2019)およびD66-AH3 (配列番号2020)の核酸配列である。
図173-263は、D66-BA11 (配列番号2021), D66-BD6 (配列番号2022), D66-BD8 (配列番号2023), D67-AA5 (配列番号2024), D67-AD3 (配列番号2025)およびD67-AE1 (配列番号2026)の核酸配列である。
図173-264は、D67-AE4 (配列番号2027), D67-AG4 (配列番号2028), D68-AF3 (配列番号2029), D70A-AE1 (配列番号2030), D70A-AG7 (配列番号2031)およびD70A-BC6 (配列番号2032)の核酸配列である。
図173-265は、D70A-BF7 (配列番号2033), D70A-BF8 (配列番号2034), D70A-BH1 (配列番号2035), D70A-BH3 (配列番号2036)およびD73A-AA1 (配列番号2037)の核酸配列である。
図173-266は、D73A-AA3 (配列番号2038), D73A-AA5 (配列番号2039), D73A-AA6 (配列番号2040), D73A-AA8 (配列番号2041), D73A-AA9 (配列番号2042)およびD73A-AB1 (配列番号2043)の核酸配列である。
図173-267は、D73A-AB3 (配列番号2044), D73A-AB5 (配列番号2045), D73A-AB10 (配列番号2046), D73A-AC2 (配列番号2047)およびD73A-AC5 (配列番号2048)の核酸配列である。
図173-268は、D73A-AC11 (配列番号2049), D73A-AC12 (配列番号2050), D73A-AD7 (配列番号2051), D73A-AD10 (配列番号2052), D73A-AE6 (配列番号2053)およびD73A-AE7 (配列番号2054)の核酸配列である。
図173-269は、D73A-AE8 (配列番号2055), D73A-AE12 (配列番号2056), D73A-AF5 (配列番号2057), D73A-AF6 (配列番号2058), D73A-AF12 (配列番号2059)およびD73A-AG4 (配列番号2060)の核酸配列である。
図173-270は、D73A-AG6 (配列番号2061), D73A-AG10 (配列番号2062), D73A-AH2 (配列番号2063), D73A-AH3 (配列番号2064)およびD73A-AH10 (配列番号2065)の核酸配列である。
図173-271は、D93-AD3 (配列番号2066), D97-AD3 (配列番号2067), D97-AE3 (配列番号2068), D97-AF1 (配列番号2069)およびD113-AH8 (配列番号2070)の核酸配列である。
図173-272は、D114-AA10 (配列番号2071), D114-AC11 (配列番号2072), D131-AD1 (配列番号2073), D133-AD7 (配列番号2074)およびD139-AD2 (配列番号2075)の核酸配列である。
図173-273は、D139-AF2 (配列番号2076), D144A-AB10 (配列番号2077), D144A-AE9 (配列番号2078), D144A-AG12 (配列番号2079), D145-AC7 (配列番号2080)およびD145-AH7 (配列番号2081)の核酸配列である。
図173-274は、D150-AA3 (配列番号2082), D150-AG3 (配列番号2083), D151-AG3 (配列番号2084), D153-AA8 (配列番号2085), D153-AB7 (配列番号2086)およびD153-AC9 (配列番号2087)の核酸配列である。
図173-275は、D153-AF8 (配列番号2088), D155-AA2 (配列番号2089), D155-AG2 (配列番号2090), D156-AH3 (配列番号2091), D159-AA2 (配列番号2092)およびD164-AD1 (配列番号2093)の核酸配列である。
図173-276は、D181-AG6 (配列番号2094), D182-AB1 (配列番号2095), D182-AF2 (配列番号2096), D185-AE10 (配列番号2097), D186-AH3 (配列番号2098)およびD188-AC6 (配列番号2099)の核酸配列である。
図173-277は、D188-AF5 (配列番号2100), D189-AD12 (配列番号2101), D258-AG6 (配列番号2102), D194-AA3 (配列番号2103), D194-AB3 (配列番号2104), D198-AD9 (配列番号2105)およびD198-AE9 (配列番号2106)の核酸配列である。
図173-278は、D203-BB11 (配列番号2107), D203-BC11 (配列番号2108), D204-AA3 (配列番号2109), D204-AF2 (配列番号2110), D206-CB1 (配列番号2111)およびD214-AB1 (配列番号2112)の核酸配列である。
図173-279は、D214-AF2 (配列番号2113), D216-AA7 (配列番号2114), D216-AD7 (配列番号2115), D219-BA2 (配列番号2116), D219-BF1 (配列番号2117)およびD229-AB2 (配列番号2118)の核酸配列である。
図173-280は、D230-AD2 (配列番号2119), D230-AE2 (配列番号2120), D234-AE12 (配列番号2121), D241-BG10 (配列番号2122), D249-AA9 (配列番号2123)およびD255-AC5 (配列番号2124)の核酸配列である。
図173-281は、D270-AE7 (配列番号2125), D270-AE8 (配列番号2126), D276-AH5 (配列番号2127), D279-AA2 (配列番号2128)およびD279-AB3 (配列番号2129)の核酸配列である。
図173-282は、D279-AC2 (配列番号2130), D279-AC3 (配列番号2131), D279-AD3 (配列番号2132)およびD279-AE2 (配列番号2133)の核酸配列である。
図173-283は、D279-AG2 (配列番号2134), D279-AH3 (配列番号2135), D280-BF6 (配列番号2136), D281-AB8 (配列番号2137)およびD281-AC7 (配列番号2138)の核酸配列である。
図173-284は、D282-AG10 (配列番号2139), D288-AC2 (配列番号2140), D289-AC6 (配列番号2141), D290-AB8 (配列番号2142)およびD291-AD10 (配列番号2143)の核酸配列である。
図173-285は、D291-AE11 (配列番号2144), D291-AH12 (配列番号2145), D292-AB3 (配列番号2146), D292-AD3 (配列番号2147), D292-AE3 (配列番号2148)およびD294-AE7 (配列番号2149)の核酸配列である。
図173-286は、D419-AH11 (配列番号2150), D295-AE2 (配列番号2151), D295-AG2 (配列番号2152), D295-AH2 (配列番号2153), D295-AH3 (配列番号2154)およびD296-AD4 (配列番号2155)の核酸配列である。
図173-287は、D296-AF4 (配列番号2156), D296-AG6 (配列番号2157), D297-AD7 (配列番号2158), D297-AG7 (配列番号2159)およびD298-AD11 (配列番号2160)の核酸配列である。
図173-288は、D418-AH9 (配列番号2161), D418-AG10 (配列番号2162), D416-AA6 (配列番号2163), D414-AA2 (配列番号2164)およびD269-AD5 (配列番号2165)の核酸配列である。
図173-289は、D268-AE1 (配列番号2166), D258-AF6 (配列番号2167), D256-AG9 (配列番号2168), D255-AH6 (配列番号2169)およびD255-AE5 (配列番号2170)の核酸配列である。
図173-290は、D419-AE11 (配列番号2171), D142-AA10 (配列番号2172), D140-AH4 (配列番号2173), D66-AF7 (配列番号2174)およびD66-AA7 (配列番号2175)の核酸配列である。
図173-291は、D65-AF9 (配列番号2176), D65-AB3 (配列番号2177), D65-AB2 (配列番号2178), D144A-AA12 (配列番号2179)およびD64-7 (配列番号2180)の核酸配列である。
図173-292は、D109-BF9 (配列番号2181), D109-BG9 (配列番号2182), D118-AA11 (配列番号2183), D142-AB11(5’) (配列番号2184)およびD142-AE10(5’) (配列番号2185)の核酸配列である。
図173-293は、D207-AH5 (配列番号2186), D231-AA1(5’) (配列番号2187), D232-AD4(5’) (配列番号2188), D232-AE6(5’) (配列番号2189)およびD288-AA3 (配列番号2190)の核酸配列である。
図173-294は、D289-AE6 (配列番号2191), D290-AC7 (配列番号2192), D58-AA2 (配列番号2193)の核酸配列である。
FIG. 171 shows the probe set sequences (SEQ ID NO: 385 to SEQ ID NO: 445) of the clones on the GeneChip® microarray.
Figure 172-1 shows the nucleic acid sequence of D424-AA4 (SEQ ID NO: 446); the nucleic acid sequence of D424-AF5 (SEQ ID NO: 447) and the amino acid sequence of D424-AF5 (SEQ ID NO: 448) (this is D424-AF5 (SEQ ID NO: 448) 447)); D425-AA11 (SEQ ID NO: 449) nucleic acid sequence and D425-AA11 (SEQ ID NO: 450) And 2299 ) Amino acid sequence (this Et Is a translation of D425-AA11 (SEQ ID NO: 449)); and a nucleic acid and amino acid sequence group consisting of the nucleic acid sequence of D425-AF11 (SEQ ID NO: 451).
FIG. 172-2 shows the amino acid sequence of D425-AF11 (SEQ ID NO: 452) (which is a translation of D425-AF11 (SEQ ID NO: 451)); the nucleic acid sequence of D425-AH10 (SEQ ID NO: 453) and D425-AH10 (SEQ ID NO: 454) amino acid sequence (this is a translation of D425-AH10 (SEQ ID NO: 453)); D426-AA3 (SEQ ID NO: 455) nucleic acid sequence and D426-AA3 (SEQ ID NO: 456) amino acid sequence ( This is a translation of D426-AA3 (SEQ ID NO: 455)); and the nucleic acid sequence of D426-AG1 (SEQ ID NO: 457) and the amino acid sequence of D426-AG1 (SEQ ID NO: 458) (this is D426-AG1 (SEQ ID NO: 458) 457) is a nucleic acid and amino acid sequence group.
Figure 172-3 shows the nucleic acid sequence of D427-AA6 (SEQ ID NO: 459) and the amino acid sequence of D427-AA6 (SEQ ID NO: 460) (this is a translation of D427-AA6 (SEQ ID NO: 459)); D427-AB6 (SEQ ID NO: 461) and D427-AB6 (SEQ ID NO: 462) amino acid sequence (which is a translation of D427-AB6 (SEQ ID NO: 461)); D428-AC9 (SEQ ID NO: 463) nucleic acid sequence and A D428-AC9 (SEQ ID NO: 464) amino acid sequence (which is a translation of D428-AC9 (SEQ ID NO: 463)); and a D428-AH10 (SEQ ID NO: 465) nucleic acid and amino acid sequence group. .
Figure 172-4 shows the amino acid sequence of D428-AH10 (SEQ ID NO: 466) (which is a translation of D428-AH10 (SEQ ID NO: 465)); the nucleic acid sequence of D429-AA1 (SEQ ID NO: 467) and D429-AA1 (SEQ ID NO: 468) amino acid sequence (this is a translation of D429-AA1 (SEQ ID NO: 467)); D430-AA3 (SEQ ID NO: 469) nucleic acid sequence and D430-AA3 (SEQ ID NO: 470) amino acid sequence ( This is a translation of D430-AA3 (SEQ ID NO: 469)); and the nucleic acid sequence of D431-AE6 (SEQ ID NO: 471) and the amino acid sequence of D431-AE6 (SEQ ID NO: 472) (this is D431-AE6 (SEQ ID NO: 472)) 471) is a nucleic acid and amino acid sequence group.
FIG. 172-5 shows the nucleic acid sequence of D113-AE9 (SEQ ID NO: 473) and the amino acid sequence of D113-AE9 (SEQ ID NO: 474) (this is a translation of D113-AE9 (SEQ ID NO: 473)); and D114- A nucleic acid and amino acid sequence group consisting of the nucleic acid sequence of AE12 (SEQ ID NO: 475).
Figure 172-6 shows the amino acid sequence of D114-AE12 (SEQ ID NO: 476) (which is a translation of D114-AE12 (SEQ ID NO: 475)); the nucleic acid sequence of D119-AC3 (SEQ ID NO: 477) and D119-AC3 A nucleic acid and amino acid sequence group consisting of the amino acid sequence of (SEQ ID NO: 478) (this is a translation of D119-AC3 (SEQ ID NO: 477)); and the nucleic acid sequence of D132-AA5 (SEQ ID NO: 479).
Figure 172-7 shows the amino acid sequence of D132-AA5 (SEQ ID NO: 480) (which is a translation of D132-AA5 (SEQ ID NO: 479)); the nucleic acid sequence of D223-BB10 (SEQ ID NO: 481) and D223-BB10 (SEQ ID NO: 482) amino acid sequence (which is a translation of D223-BB10 (SEQ ID NO: 481)); and D245-AA8 (SEQ ID NO: 483) nucleic acid sequence and D245-AA8 (SEQ ID NO: 484) amino acid sequence (This is a nucleic acid and amino acid sequence group consisting of D245-AA8 (SEQ ID NO: 483)).
FIG. 172-8 shows the nucleic acid sequence of D246-AE12 (SEQ ID NO: 485) and the amino acid sequence of D246-AE12 (SEQ ID NO: 486) (which is a translation of D246-AE12 (SEQ ID NO: 485)); and D279- A nucleic acid and amino acid sequence group consisting of a nucleic acid sequence of AD1 (SEQ ID NO: 487) and an amino acid sequence of D279-AD1 (SEQ ID NO: 488) (which is a translation of D279-AD1 (SEQ ID NO: 487)).
Figure 172-9 shows the nucleic acid sequence of D282-AA10 (SEQ ID NO: 489) and the amino acid sequence of D282-AA10 (SEQ ID NO: 490), which is a translation of D282-AA10 (SEQ ID NO: 489); and D295- A nucleic acid and amino acid sequence group consisting of the nucleic acid sequence of AA1 (SEQ ID NO: 491).
FIG. 172-10 shows the amino acid sequence of D295-AA1 (SEQ ID NO: 492), which is a translation of D295-AA1 (SEQ ID NO: 491); the nucleic acid sequence of D101A-AE2 (SEQ ID NO: 493) and D101A-AE2 A nucleic acid and amino acid sequence group consisting of the amino acid sequence of (SEQ ID NO: 494) (this is a translation of D101A-AE2 (SEQ ID NO: 493)); and the nucleic acid sequence of D108-AA4 (SEQ ID NO: 495).
Figure 172-11 shows the amino acid sequence of D108-AA4 (SEQ ID NO: 496) (this is a translation of D108-AA4 (SEQ ID NO: 495)); the nucleic acid sequence of D124-AC5 (5 ') (SEQ ID NO: 497) And the amino acid sequence of D124-AC5 (5 ′) (SEQ ID NO: 498), which is a translation of D124-AC5 (5 ′) (SEQ ID NO: 497); D124-AC5 (3 ′) (SEQ ID NO: 499) And the amino acid sequence of D124-AC5 (3 ′) (SEQ ID NO: 500), which is a translation of D124-AC5 (3 ′) (SEQ ID NO: 499); and D141-AD7 (SEQ ID NO: 501) A nucleic acid and amino acid sequence group consisting of the nucleic acid sequences.
FIG. 172-12 shows the amino acid sequence of D141-AD7 (SEQ ID NO: 502), which is a translation of D141-AD7 (SEQ ID NO: 501); and the nucleic acid sequence of D148-AD1 (SEQ ID NO: 503) and D148 A nucleic acid and amino acid sequence group consisting of the amino acid sequence of -AD1 (SEQ ID NO: 504) (this is a translation of D148-AD1 (SEQ ID NO: 503)).
FIG. 172-13 shows the nucleic acid sequence of D212-BC11 (SEQ ID NO: 505) and the amino acid sequence of D212-BC11 (SEQ ID NO: 506) (which is a translation of D212-BC11 (SEQ ID NO: 505)); and D217- A nucleic acid and amino acid sequence group consisting of the nucleic acid sequence of AB10 (SEQ ID NO: 507) and the amino acid sequence of D217-AB10 (SEQ ID NO: 508) (which is a translation of D217-AB10 (SEQ ID NO: 507)).
Figure 172-14 shows the nucleic acid sequence of D220-BC6 (SEQ ID NO: 509) and the amino acid sequence of D220-BC6 (SEQ ID NO: 510) (this is a translation of D220-BC6 (SEQ ID NO: 509)); D225-AG9 (SEQ ID NO: 511) and D225-AG9 (SEQ ID NO: 512) amino acid sequence (which is a translation of D225-AG9 (SEQ ID NO: 511)); D231-AF1 (SEQ ID NO: 513) nucleic acid sequence and A nucleic acid and amino acid sequence group consisting of the amino acid sequence of D231-AF1 (SEQ ID NO: 514) (this is a translation of D231-AF1 (SEQ ID NO: 513)); and the nucleic acid sequence of D232-AH5 (SEQ ID NO: 515) .
Figure 172-15 shows the amino acid sequence of D232-AH5 (SEQ ID NO: 516) (which is a translation of D232-AH5 (SEQ ID NO: 515)); the nucleic acid sequence of D240-BB8 (SEQ ID NO: 517) and D240-BB8 (SEQ ID NO: 518) amino acid sequence (this is a translation of D240-BB8 (SEQ ID NO: 517)); D280-AA6 (SEQ ID NO: 519) nucleic acid sequence and D280-AA6 (SEQ ID NO: 520) amino acid sequence ( This is a translation of D280-AA6 (SEQ ID NO: 519)); and the nucleic acid sequence of D285-AD7 (SEQ ID NO: 521) and the amino acid sequence of D285-AD7 (SEQ ID NO: 522) (this is D285-AD7 (SEQ ID NO: 521)) 521) is a nucleic acid and amino acid sequence group.
Figure 172-16 shows the nucleic acid sequence of D285-AH9 (SEQ ID NO: 523) and the amino acid sequence of D285-AH9 (SEQ ID NO: 524) (this is a translation of D285-AH9 (SEQ ID NO: 523)); D99-AB3 (SEQ ID NO: 525) and D99-AB3 (SEQ ID NO: 526) amino acid sequence (which is a translation of D99-AB3 (SEQ ID NO: 525)); and D99-AC2 (SEQ ID NO: 527) nucleic acid sequence And a group of nucleic acid and amino acid sequences consisting of the amino acid sequence of D99-AC2 (SEQ ID NO: 528) (which is a translation of D99-AC2 (SEQ ID NO: 527)).
Figure 172-17 shows the nucleic acid sequence of D99-AF11 (SEQ ID NO: 529) and the amino acid sequence of D99-AF11 (SEQ ID NO: 530) (this is a translation of D99-AF11 (SEQ ID NO: 529)); D99-AH4 (SEQ ID NO: 531) and D99-AH4 (SEQ ID NO: 532) amino acid sequence (which is a translation of D99-AH4 (SEQ ID NO: 531)); D99-AH7 (SEQ ID NO: 533) nucleic acid sequence and D99-AH7 (SEQ ID NO: 534) amino acid sequence (this is a translation of D99-AH7 (SEQ ID NO: 533)); D99-DB4 (SEQ ID NO: 535) nucleic acid sequence and D99-DB4 (SEQ ID NO: 536) A nucleic acid and amino acid sequence group consisting of an amino acid sequence (which is a translation of D99-DB4 (SEQ ID NO: 535)).
Figure 172-18 shows the nucleic acid sequence of D99-DG4 (SEQ ID NO: 537) and the amino acid sequence of D99-DG4 (SEQ ID NO: 538) (this is a translation of D99-DG4 (SEQ ID NO: 537)); D40-2 (SEQ ID NO: 539) and D40-2 (SEQ ID NO: 540) amino acid sequence (which is a translation of D40-2 (SEQ ID NO: 539)); D301-EE11 (SEQ ID NO: 541) nucleic acid sequence and A nucleic acid and amino acid sequence group consisting of the amino acid sequence of D301-EE11 (SEQ ID NO: 542) (this is a translation of D301-EE11 (SEQ ID NO: 541)); and the nucleic acid sequence of D302-AE10 (SEQ ID NO: 543) .
Figure 172-19 shows the amino acid sequence of D302-AE10 (SEQ ID NO: 544) (which is a translation of D302-AE10 (SEQ ID NO: 543)); the nucleic acid sequence of D303-AC6 (SEQ ID NO: 545) and D303-AC6 (SEQ ID NO: 546) amino acid sequence (this is a translation of D303-AC6 (SEQ ID NO: 545)); and D303-AC11 (SEQ ID NO: 547) nucleic acid sequence and D303-AC11 (SEQ ID NO: 548) amino acid sequence This is a nucleic acid and amino acid sequence group consisting of (which is a translation of D303-AC11 (SEQ ID NO: 547)).
Figure 173-1 shows 40-17 (SEQ ID NO: 549), 40-20 (SEQ ID NO: 550), 40-23 (SEQ ID NO: 551), 40-26 (SEQ ID NO: 552), D40-27 (SEQ ID NO: 553) , 40-28 (SEQ ID NO: 554) and 40-78 (SEQ ID NO: 555).
Figure 173-2 shows 40-83 (SEQ ID NO: 556), D40-86 (SEQ ID NO: 557), D40-97 (SEQ ID NO: 558), 40-100 (SEQ ID NO: 559), 40-107 (SEQ ID NO: 560) , D41-41 (SEQ ID NO: 561) and D41-60 (SEQ ID NO: 562).
Figure 173-3 shows D41-65 (SEQ ID NO: 563), D41-67 (SEQ ID NO: 564), D41-69 (SEQ ID NO: 565), D41-99 (SEQ ID NO: 566), D42-AA3 (SEQ ID NO: 567) , D42-AA7 (SEQ ID NO: 568) and D42-AC3 (SEQ ID NO: 569).
Figure 173-4 shows D42-AC7 (SEQ ID NO: 570), D42-AC8 (SEQ ID NO: 571), D42-AD3 (SEQ ID NO: 572), D42-AD12 (SEQ ID NO: 573), D42-AF3 (SEQ ID NO: 574) And the nucleic acid sequence of D42-AH3 (SEQ ID NO: 575).
Figure 173-5 shows D42-BA2 (SEQ ID NO: 576), D42-BB11 (SEQ ID NO: 577), D42-KC9 (SEQ ID NO: 578), D42-KC10 (SEQ ID NO: 579), D42-LB2 (SEQ ID NO: 580) , D42-LC7 (SEQ ID NO: 581), D42-TG7 (SEQ ID NO: 582) and D42-UG8 (SEQ ID NO: 583).
Figure 173-6 shows D42-ZB1 (SEQ ID NO: 584), D300-AA7 (SEQ ID NO: 585), D300-AB3 (SEQ ID NO: 586), D300-AB7 (SEQ ID NO: 587), D300-AB10 (SEQ ID NO: 588) , D300-AB11 (SEQ ID NO: 589) and D300-AC2 (SEQ ID NO: 590).
Figure 173-7 shows D300-AC6 (SEQ ID NO: 591), D300-AC7 (SEQ ID NO: 592), D300-AD4 (SEQ ID NO: 593), D300-AD6 (SEQ ID NO: 594), D300-AD10 (SEQ ID NO: 595) , D300-AE3 (SEQ ID NO: 596) and D300-AE9 (SEQ ID NO: 597).
Figure 173-8 shows D300-AE11 (SEQ ID NO: 598), D300-AF4 (SEQ ID NO: 599), D300-AF5 (SEQ ID NO: 600), D300-AF7 (SEQ ID NO: 601), D300-AF8 (SEQ ID NO: 602) , D300-AF9 (SEQ ID NO: 603) and D300-AF11 (SEQ ID NO: 604) nucleic acid sequences.
Figure 173-9 shows D300-AG1 (SEQ ID NO: 605), D300-AG2 (SEQ ID NO: 606), D300-AG3 (SEQ ID NO: 607), D300-AG10 (SEQ ID NO: 608), D300-AH6 (SEQ ID NO: 609) , D300-AH9 (SEQ ID NO: 610), D300-AH10 (SEQ ID NO: 611) and D300-AH11 (SEQ ID NO: 612).
Figure 173-10 shows D300-BA5 (SEQ ID NO: 613), D300-BA6 (SEQ ID NO: 614), D300-BA7 (SEQ ID NO: 615), D300-BA12 (SEQ ID NO: 616), D300-BB6 (SEQ ID NO: 617) , D300-BB7 (SEQ ID NO: 618) and D300-BC1 (SEQ ID NO: 619).
Figure 173-11 shows D300-BC4 (SEQ ID NO: 620), D300-BC7 (SEQ ID NO: 621), D300-BC8 (SEQ ID NO: 622), D300-BC9 (SEQ ID NO: 623), D300-BD2 (SEQ ID NO: 624) , D300-BD7 (SEQ ID NO: 625) and D300-BE1 (SEQ ID NO: 626).
Figure 173-12 shows D300-BE2 (SEQ ID NO: 627), D300-BE7 (SEQ ID NO: 628), D300-BE8 (SEQ ID NO: 629), D300-BE9 (SEQ ID NO: 630), D300-BE12 (SEQ ID NO: 631) , D300-BF7 (SEQ ID NO: 632), D300-BF11 (SEQ ID NO: 633) and D300-BG1 (SEQ ID NO: 634).
Figure 173-13 shows D300-BG2 (SEQ ID NO: 635), D300-BG5 (SEQ ID NO: 636), D300-BH6 (SEQ ID NO: 637), D300-BH9 (SEQ ID NO: 638), D300-CA1 (SEQ ID NO: 639) , D300-CA6 (SEQ ID NO: 640) and D300-CB1 (SEQ ID NO: 641) nucleic acid sequences.
Figure 173-14 shows D300-CB12 (SEQ ID NO: 642), D300-CC2 (SEQ ID NO: 643), D300-CD2 (SEQ ID NO: 644), D300-CD3 (SEQ ID NO: 645), D300-CD4 (SEQ ID NO: 646) , D300-CD5 (SEQ ID NO: 647) and D300-CE3 (SEQ ID NO: 648).
Figure 173-15 shows D300-CE7 (SEQ ID NO: 649), D300-CF1 (SEQ ID NO: 650), D300-CF2 (SEQ ID NO: 651), D300-CF11 (SEQ ID NO: 652), D300-CG2 (SEQ ID NO: 653) , D300-CG7 (SEQ ID NO: 654), D300-CH1 (SEQ ID NO: 655) and D300-CH3 (SEQ ID NO: 656).
Figure 173-16 shows D300-CH5 (SEQ ID NO: 657), D300-CH7 (SEQ ID NO: 658), D300-DA1 (SEQ ID NO: 659), D300-DA4 (SEQ ID NO: 660), D300-DB2 (SEQ ID NO: 661) , D300-DB4 (SEQ ID NO: 662), D300-DB6 (SEQ ID NO: 663) and D300-DB7-c (SEQ ID NO: 664).
Figure 173-17 shows D300-DB8 (SEQ ID NO: 665), D300-DC2 (SEQ ID NO: 666), D300-DC4 (SEQ ID NO: 667), D300-DC7 (SEQ ID NO: 668), D300-DC10 (SEQ ID NO: 669) , D300-DC11 (SEQ ID NO: 670) and D300-DD5 (SEQ ID NO: 671).
Figure 173-18 shows D300-DD6 (SEQ ID NO: 672), D300-DE2 (SEQ ID NO: 673), D300-DE9 (SEQ ID NO: 674), D300-DE10 (SEQ ID NO: 675), D300-DF5 (SEQ ID NO: 676) , D300-DF6 (SEQ ID NO: 677), D300-DF8 (SEQ ID NO: 678) and D300-DF12 (SEQ ID NO: 679).
Figure 173-19 shows D300-DG1 (SEQ ID NO: 680), D300-DG3 (SEQ ID NO: 681), D300-DG9 (SEQ ID NO: 682), D300-DG11 (SEQ ID NO: 683), D300-DH10 (SEQ ID NO: 684) , D301-AB10 (SEQ ID NO: 685) and D301-AC5 (SEQ ID NO: 686).
Figure 173-20 shows D301-AC7 (SEQ ID NO: 687), D301-AC9 (SEQ ID NO: 688), D301-AD1 (SEQ ID NO: 689), D301-AD2 (SEQ ID NO: 690), D301-AE4c (SEQ ID NO: 691) , D301-AF12 (SEQ ID NO: 692), D301-AH6 (SEQ ID NO: 693) and D301-AH12 (SEQ ID NO: 694).
Figure 173-21 shows D301-BB8 (SEQ ID NO: 695), D301-BB9 (SEQ ID NO: 696), D301-BC1 (SEQ ID NO: 697), D301-BC8 (SEQ ID NO: 698), D301-BD1 (SEQ ID NO: 699) , D301-BD2 (SEQ ID NO: 700) and D301-BF3 (SEQ ID NO: 701).
Figure 173-22 shows D301-DA4 (SEQ ID NO: 702), D301-DA8 (SEQ ID NO: 703), D301-DB5 (SEQ ID NO: 704), D301-DC6 (SEQ ID NO: 705), D301-DD4 (SEQ ID NO: 706) , D301-DG1 (SEQ ID NO: 707), D301-DG4c (SEQ ID NO: 708) and D301-EA5 (SEQ ID NO: 709).
Figure 173-23 shows D301-EA6 (SEQ ID NO: 710), D301-EA7 (SEQ ID NO: 711), D301-EC9 (SEQ ID NO: 712), D301-EC10 (SEQ ID NO: 713), D301-ED5 (SEQ ID NO: 714) , D301-ED7 (SEQ ID NO: 715) and D301-EE7 (SEQ ID NO: 716).
Figure 173-24 shows D301-EF2 (SEQ ID NO: 717), D301-EF5 (SEQ ID NO: 718), D301-EF10 (SEQ ID NO: 719), D301-EG12 (SEQ ID NO: 720), D302-AB8 (SEQ ID NO: 721) , D302-AB9 (SEQ ID NO: 722), D302-AB12 (SEQ ID NO: 723) and D302-AC1 (SEQ ID NO: 724).
Figure 173-25 shows D302-AC5 (SEQ ID NO: 725), D302-AC6 (SEQ ID NO: 726), D302-AC7 (SEQ ID NO: 727), D302-AC12 (SEQ ID NO: 728), D302-AD4 (SEQ ID NO: 729) , D302-AD7 (SEQ ID NO: 730) and D302-AE7 (SEQ ID NO: 731) nucleic acid sequences.
Figure 173-26 shows D302-AF6 (SEQ ID NO: 732), D302-AF8 (SEQ ID NO: 733), D302-AG2 (SEQ ID NO: 734), D302-AH10 (SEQ ID NO: 735), D302-BA2 (SEQ ID NO: 736) , D302-BA6 (SEQ ID NO: 737), D302-BC3 (SEQ ID NO: 738) and D302-BC6 (SEQ ID NO: 739).
Figure 173-27 shows D302-BC9 (SEQ ID NO: 740), D302-BD3 (SEQ ID NO: 741), D302-BD7 (SEQ ID NO: 742), D302-BD9 (SEQ ID NO: 743), D302-BE1 (SEQ ID NO: 744) And the nucleic acid sequence of D302-BE2 (SEQ ID NO: 745).
Figure 173-28 shows D302-BE6 (SEQ ID NO: 746), D302-BE7 (SEQ ID NO: 747), D302-BF1 (SEQ ID NO: 748), D302-BF5 (SEQ ID NO: 749), D302-BG1 (SEQ ID NO: 750) , D302-bg3 (SEQ ID NO: 751) and D302-BG7 (SEQ ID NO: 752).
Figure 173-29 shows D302-Bg9 (SEQ ID NO: 753), D302-BH1 (SEQ ID NO: 754), D302-bh9 (SEQ ID NO: 755), D302-CA5 (SEQ ID NO: 756), D302-CB7 (SEQ ID NO: 757) , D302-CC1 (SEQ ID NO: 758), D302-CC3 (SEQ ID NO: 759) and D302-CD2 (SEQ ID NO: 760).
Figure 173-30 shows D302-CE3 (SEQ ID NO: 761), D302-CE9 (SEQ ID NO: 762), D302-CF2 (SEQ ID NO: 763), D302-CF5 (SEQ ID NO: 764), D302-CF6 (SEQ ID NO: 765) , D302-CH1 (SEQ ID NO: 766) and D302-CH4 (SEQ ID NO: 767).
Figure 173-31 shows D302-CH5 (SEQ ID NO: 768), D302-CH6 (SEQ ID NO: 769), D302-DA2 (SEQ ID NO: 770), D302-DA5 (SEQ ID NO: 771), D302-DA9 (SEQ ID NO: 772) , D302-DC4 (SEQ ID NO: 773) and D302-DC7 (SEQ ID NO: 774).
Figure 173-32 shows D302-DC8 (SEQ ID NO: 775), D302-DC11 (SEQ ID NO: 776), D302-DD3 (SEQ ID NO: 777), D302-DF5 (SEQ ID NO: 778), D302-DF7 (SEQ ID NO: 779) , D302-DG9 (SEQ ID NO: 780) and D302-DH8 (SEQ ID NO: 781).
Figures 173-33 show D303-AA9 (SEQ ID NO: 782), D303-AA10 (SEQ ID NO: 783), D303-AB11 (SEQ ID NO: 784), D303-AC4 (SEQ ID NO: 785), D303-AD3 (SEQ ID NO: 786) , D303-AD11 (SEQ ID NO: 787), D303-AE1 (SEQ ID NO: 788) and D303-ae2 (SEQ ID NO: 789).
Figure 173-34 shows D303-ae6 (SEQ ID NO: 790), D303-AF5 (SEQ ID NO: 791), D303-AF12 (SEQ ID NO: 792), D303-AG1 (SEQ ID NO: 793), D303-AG8 (SEQ ID NO: 794) , D303-AG9 (SEQ ID NO: 795), D303-AH5 (SEQ ID NO: 796) and D303-BA1 (SEQ ID NO: 797).
Figure 173-35 shows D303-BA5 (SEQ ID NO: 798), D303-BB6 (SEQ ID NO: 799), D303-BC1 (SEQ ID NO: 800), D303-BC2 (SEQ ID NO: 801), D303-BC8 (SEQ ID NO: 802) , D303-BC11 (SEQ ID NO: 803), D303-bd2 (SEQ ID NO: 804) and D303-BD6 (SEQ ID NO: 805).
Figure 173-36 shows D303-BD9 (SEQ ID NO: 806), D303-BE3 (SEQ ID NO: 807), D303-BE4 (SEQ ID NO: 808), D303-BE7 (SEQ ID NO: 809), D303-BF1 (SEQ ID NO: 810) , D303-BF6 (SEQ ID NO: 811), D303-BG2 (SEQ ID NO: 812) and D303-BG11 (SEQ ID NO: 813).
Figures 173-37 show D303-BH1 (SEQ ID NO: 814), D303-BH6 (SEQ ID NO: 815), D414-AG2 (SEQ ID NO: 816), D35-33 (SEQ ID NO: 817), D35-34 (SEQ ID NO: 818) And the nucleic acid sequence of D35-35 (SEQ ID NO: 819).
FIGS. 173-38 are the nucleic acid sequences of D35-41 (SEQ ID NO: 820), D35-43 (SEQ ID NO: 821), D35-51 (SEQ ID NO: 822) and D35-AC4 (SEQ ID NO: 823).
Figure 173-39 shows D35-AC12 (SEQ ID NO: 824), D35-AE2 (SEQ ID NO: 825), D35-AE6 (SEQ ID NO: 826), D35-AF1 (SEQ ID NO: 827), D35-AF3 (SEQ ID NO: 828) And the nucleic acid sequence of D35-AG3 (SEQ ID NO: 829).
Figure 173-40 shows D35-BA5 (SEQ ID NO: 830), D35-BA12 (SEQ ID NO: 831), D35-BB1 (SEQ ID NO: 832), D35-BB3 (SEQ ID NO: 833) and D35-BB10 (SEQ ID NO: 834) The nucleic acid sequence of
Figures 173-41 shows D35-BB12 (SEQ ID NO: 835), D55-AA8 (SEQ ID NO: 836), D55-AB1 (SEQ ID NO: 837), D55-AB5 (SEQ ID NO: 838) and D55-AB6 (SEQ ID NO: 839) The nucleic acid sequence of
Figures 173-42 show D55-AB7 (SEQ ID NO: 840), D55-AB10 (SEQ ID NO: 841), D55-AA2 (SEQ ID NO: 842), D55-AC2 (SEQ ID NO: 843) and D55-AC5 (SEQ ID NO: 844) The nucleic acid sequence of
Figure 173-43 shows D55-AC7 (SEQ ID NO: 845), D55-BA7 (SEQ ID NO: 846), D55-BA8 (SEQ ID NO: 847), D55-BA10 (SEQ ID NO: 848), D55-BA11 (SEQ ID NO: 849) And the nucleic acid sequence of D55-BB9 (SEQ ID NO: 850).
Figure 173-44 shows D55-BB10 (SEQ ID NO: 851), D55-BB12 (SEQ ID NO: 852), D55-BC4 (SEQ ID NO: 853), D55-BC5 (SEQ ID NO: 854), D55-AA6 (SEQ ID NO: 855) And the nucleic acid sequence of D56-AE5 (SEQ ID NO: 856).
Figure 173-45 shows D56-AA2 (SEQ ID NO: 857), D56-AA4 (SEQ ID NO: 858), D56-AA8 (SEQ ID NO: 859), D56-AA9 (SEQ ID NO: 860), D56-AB1 (SEQ ID NO: 861) And the nucleic acid sequence of D56-AB7 (SEQ ID NO: 862).
Figures 173-46 show D56-AB9 (SEQ ID NO: 863), D56-AC9 (SEQ ID NO: 864), D56-AD3 (SEQ ID NO: 865), D56-AG8 (SEQ ID NO: 866) and D56-AH1 (SEQ ID NO: 867) The nucleic acid sequence of
Figures 173-47 show D56-AH10 (SEQ ID NO: 868), D56-AE2 (SEQ ID NO: 869), D57-AB2 (SEQ ID NO: 870), D57-AB5 (SEQ ID NO: 871) and D57-AB6 (SEQ ID NO: 872) The nucleic acid sequence of
Figure 173-48 shows D57-AB8 (SEQ ID NO: 873), D57-AB11 (SEQ ID NO: 874), D57-AB12 (SEQ ID NO: 875), D57-AC1 (SEQ ID NO: 876), D57-AC4 (SEQ ID NO: 877) And the nucleic acid sequence of D57-AC12 (SEQ ID NO: 878).
Figure 173-49 shows D57-AD5 (SEQ ID NO: 879), D57-AD8 (SEQ ID NO: 880), D57-AD9 (SEQ ID NO: 881), D57-AE1 (SEQ ID NO: 882), D57-AE2 (SEQ ID NO: 883) And the nucleic acid sequence of D57-AE7 (SEQ ID NO: 884).
Figure 173-50 shows D57-AF2 (SEQ ID NO: 885), D57-AE12 (SEQ ID NO: 886), D57-AF3 (SEQ ID NO: 887), D57-AF5 (SEQ ID NO: 888) and D57-AF9 (SEQ ID NO: 889) The nucleic acid sequence of
FIGS. 173-51 are the nucleic acid sequences of D57-AG5 (SEQ ID NO: 890), D57-AG7 (SEQ ID NO: 891), D57-AG11 (SEQ ID NO: 892) and D57-AH10 (SEQ ID NO: 893).
Figures 173-52 show D58-AA3 (SEQ ID NO: 894), D58-AA5 (SEQ ID NO: 895), D58-AB3 (SEQ ID NO: 896), D58-AB5 (SEQ ID NO: 897) and D58-AC1 (SEQ ID NO: 898) The nucleic acid sequence of
FIGS. 173-53 are the nucleic acid sequences of D58-AC9 (SEQ ID NO: 899), D58-AC11 (SEQ ID NO: 900), D58-AD2 (SEQ ID NO: 901) and D58-AD5 (SEQ ID NO: 902).
Figures 173-54 show D58-AD7 (SEQ ID NO: 903), D58-AD8 (SEQ ID NO: 904), D58-AD10 (SEQ ID NO: 905), D58-AE1 (SEQ ID NO: 906) and D58-AE2 (SEQ ID NO: 907) The nucleic acid sequence of
Figures 173-55 show D58-AE5 (SEQ ID NO: 908), D58-AE9 (SEQ ID NO: 909), D58-AE10 (SEQ ID NO: 910), D58-AE11 (SEQ ID NO: 911) and D58-AF3 (SEQ ID NO: 912) The nucleic acid sequence of
Figures 173-56 show D58-AF6 (SEQ ID NO: 913), D58-AH4 (SEQ ID NO: 914), D58-AH7 (SEQ ID NO: 915), D58-AH9 (SEQ ID NO: 916) and D58-AH10 (SEQ ID NO: 917) The nucleic acid sequence of
Figure 173-57 shows D58-BA5 (SEQ ID NO: 918), D58-BA7 (SEQ ID NO: 919), D58-BB7 (SEQ ID NO: 920), D58-BC5 (SEQ ID NO: 921), D58-BD3 (SEQ ID NO: 922) And the nucleic acid sequence of D58-BD7 (SEQ ID NO: 923).
Figures 173-58 show D58-BD8 (SEQ ID NO: 924), D58-BD10 (SEQ ID NO: 925), D58-BE2 (SEQ ID NO: 926), D58-BE11 (SEQ ID NO: 927) and D58-BF1 (SEQ ID NO: 928) The nucleic acid sequence of
Figure 173-59 shows D58-BF2 (SEQ ID NO: 929), D58-BG3 (SEQ ID NO: 930), D58-BG5 (SEQ ID NO: 931), D58-BG8 (SEQ ID NO: 932), D58-BG10 (SEQ ID NO: 933) And the nucleic acid sequence of D58-BG12 (SEQ ID NO: 934).
Figure 173-60 shows D58-BH10 (SEQ ID NO: 935), D58-BH8 (SEQ ID NO: 936), D58-BH2 (SEQ ID NO: 937), D60-AA1 (SEQ ID NO: 938), D60-AA2 (SEQ ID NO: 939) And the nucleic acid sequence of D60-AA3 (SEQ ID NO: 940).
Figure 173-61 shows D60-AA5 (SEQ ID NO: 941), D60-AA6 (SEQ ID NO: 942), D60-AA7 (SEQ ID NO: 943), D60-AA8 (SEQ ID NO: 944), D60-AA10 (SEQ ID NO: 945) And the nucleic acid sequence of D60-AA11 (SEQ ID NO: 946).
Figure 173-62 shows D60-AA12 (SEQ ID NO: 947), D60-AB3 (SEQ ID NO: 948), D60-AB5 (SEQ ID NO: 949), D60-AB6 (SEQ ID NO: 950), D60-AB7 (SEQ ID NO: 951) And the nucleic acid sequence of D60-AB8 (SEQ ID NO: 952).
Figure 173-63 shows D60-AB11 (SEQ ID NO: 953), D60-AC3 (SEQ ID NO: 954), D60-AC5 (SEQ ID NO: 955), D60-AC7 (SEQ ID NO: 956), D60-AC8 (SEQ ID NO: 957) And the nucleic acid sequence of D60-AC11 (SEQ ID NO: 958).
Figure 173-64 shows D60-AC12 (SEQ ID NO: 959), D60-AD3 (SEQ ID NO: 960), D60-AD4 (SEQ ID NO: 961), D60-AD5 (SEQ ID NO: 962), D60-AD7 (SEQ ID NO: 963) And the nucleic acid sequence of D60-AE1 (SEQ ID NO: 964).
Figure 173-65 shows D60-AE4 (SEQ ID NO: 965), D60-AE6 (SEQ ID NO: 966), D60-AE8 (SEQ ID NO: 967), D60-AE12 (SEQ ID NO: 968), D60-AF5 (SEQ ID NO: 969) And the nucleic acid sequence of D60-AF8 (SEQ ID NO: 970).
Figure 173-66 shows D60-AF11 (SEQ ID NO: 971), D60-AG1 (SEQ ID NO: 972), D60-AG10 (SEQ ID NO: 973), D60-AG12 (SEQ ID NO: 974), D60-AH1 (SEQ ID NO: 975) And the nucleic acid sequence of D60-AH5 (SEQ ID NO: 976).
Figures 173-67 show D60-AH6 (SEQ ID NO: 977), D60-AH9 (SEQ ID NO: 978), D60-AH10 (SEQ ID NO: 979), D60-AH11 (SEQ ID NO: 980) and D63-AA12 (SEQ ID NO: 981) The nucleic acid sequence of
Figures 173-68 show D64-4 (SEQ ID NO: 982), D64-AB4 (SEQ ID NO: 983), D64-AB10 (SEQ ID NO: 984), D65-AA6 (SEQ ID NO: 985) and D65-AA7 (SEQ ID NO: 986). The nucleic acid sequence of
Figure 173-69 shows D65-AA9 (SEQ ID NO: 987), D65-AB4 (SEQ ID NO: 988), D65-AB5 (SEQ ID NO: 989), D65-AB8 (SEQ ID NO: 990), D65-AB9 (SEQ ID NO: 991) And the nucleic acid sequence of D65-AB11 (SEQ ID NO: 992).
Figure 173-70 shows D65-AC1 (SEQ ID NO: 993), D65-AC6 (SEQ ID NO: 994), D65-AC10 (SEQ ID NO: 995), D65-AC11 (SEQ ID NO: 996), D65-AD3 (SEQ ID NO: 997) And the nucleic acid sequence of D65-AE1 (SEQ ID NO: 998).
Figure 173-71 shows D65-AE2 (SEQ ID NO: 999), D65-AE10 (SEQ ID NO: 1000), D65-AE11 (SEQ ID NO: 1001), D65-AE12 (SEQ ID NO: 1002), D65-AF1 (SEQ ID NO: 1003) And the nucleic acid sequence of D65-AF5 (SEQ ID NO: 1004).
Figure 173-72 shows D65-AF7 (SEQ ID NO: 1005), D65-AG11 (SEQ ID NO: 1006), D65-CE1 (SEQ ID NO: 1007), D65-CE2 (SEQ ID NO: 1008), D65-CE7 (SEQ ID NO: 1009) And the nucleic acid sequence of D65-CE9 (SEQ ID NO: 1010).
Figure 173-73 shows D65-CE12 (SEQ ID NO: 1011), D65-CF3 (SEQ ID NO: 1012), D65-CF10 (SEQ ID NO: 1013), D65-CF12 (SEQ ID NO: 1014), D65-CG2 (SEQ ID NO: 1015) , D65-CG5 (SEQ ID NO: 1016) and D65-CH3 (SEQ ID NO: 1017).
Figure 173-74 shows D65-CH4 (SEQ ID NO: 1018), D65-CH6 (SEQ ID NO: 1019), D65-CH8 (SEQ ID NO: 1020), D65-CH9 (SEQ ID NO: 1021), D65-CH11 (SEQ ID NO: 1022) And the nucleic acid sequence of D65-CH12 (SEQ ID NO: 1023).
Figures 173-75 show D66-AA4 (SEQ ID NO: 1024), D66-AA5 (SEQ ID NO: 1025), D66-AA6 (SEQ ID NO: 1026), D66-AA9 (SEQ ID NO: 1027) and D66-AB5 (SEQ ID NO: 1028) The nucleic acid sequence of
Figures 173-76 show D66-AB1 (SEQ ID NO: 1029), D66-AB7 (SEQ ID NO: 1030), D66-AC1 (SEQ ID NO: 1031), D66-AC2 (SEQ ID NO: 1032) and D66-AC4 (SEQ ID NO: 1033) The nucleic acid sequence of
FIGS. 173-77 are the nucleic acid sequences of D66-AC7 (SEQ ID NO: 1034), D66-AD1 (SEQ ID NO: 1035), D66-AD3 (SEQ ID NO: 1036) and D66-AD6 (SEQ ID NO: 1037).
Figure 173-78 shows D66-AD8 (SEQ ID NO: 1038), D66-AE1 (SEQ ID NO: 1039), D66-AE3 (SEQ ID NO: 1040), D66-AE6 (SEQ ID NO: 1041), D66-AE8 (SEQ ID NO: 1042) And the nucleic acid sequence of D66-AF3 (SEQ ID NO: 2263).
FIGS. 173-79 are the nucleic acid sequences of D66-AF5 (SEQ ID NO: 1043), D66-AF8 (SEQ ID NO: 1044), D66-AF9 (SEQ ID NO: 1045) and D66-AG1 (SEQ ID NO: 1046).
Figure 173-80 shows D66-AG4 (SEQ ID NO: 1047), D66-AG5 (SEQ ID NO: 1048), D66-AH4 (SEQ ID NO: 1049), D66-AH5 (SEQ ID NO: 1050), D66-AH7 (SEQ ID NO: 1051) And the nucleic acid sequence of D66-AH8 (SEQ ID NO: 1052).
FIGS. 173-81 are the nucleic acid sequences of D66-AH9 (SEQ ID NO: 1053), D66-BA3 (SEQ ID NO: 1054), D66-BA8 (SEQ ID NO: 1055) and D66-BB1 (SEQ ID NO: 1056).
FIGS. 173-82 are the nucleic acid sequences of D66-BB2 (SEQ ID NO: 1057), D66-BB3 (SEQ ID NO: 1058), D66-BB5 (SEQ ID NO: 1059) and D66-BB7 (SEQ ID NO: 1060).
Figure 173-83 shows D66-BB9 (SEQ ID NO: 1061), D66-BB10 (SEQ ID NO: 1062), D66-BC6 (SEQ ID NO: 1063), D66-BD1 (SEQ ID NO: 1064) and D66-BD2 (SEQ ID NO: 1065) The nucleic acid sequence of
Figures 173-84 show D66-BD9 (SEQ ID NO: 1066), D67-AA2 (SEQ ID NO: 1067), D67-AA3 (SEQ ID NO: 1068), D67-AB1 (SEQ ID NO: 1069) and D67-AC5 (SEQ ID NO: 1070) The nucleic acid sequence of
Figures 173-85 show D67-AD1 (SEQ ID NO: 1071), D67-AD4 (SEQ ID NO: 1072), D67-AD6 (SEQ ID NO: 1073), D67-AE2 (SEQ ID NO: 1074) and D67-AE6 (SEQ ID NO: 1075) The nucleic acid sequence of
Figures 173-86 show D67-AF6 (SEQ ID NO: 1076), D67-AG1 (SEQ ID NO: 1077), D67-AG3 (SEQ ID NO: 1078), D67-AG5 (SEQ ID NO: 1079) and D67-AG6 (SEQ ID NO: 1080) The nucleic acid sequence of
Figures 173-87 show D69-AA5 (SEQ ID NO: 1081), D69-AB1 (SEQ ID NO: 1082), D69-AB8 (SEQ ID NO: 1083), D69-AB9 (SEQ ID NO: 1084) and D69-AC4 (SEQ ID NO: 1085) The nucleic acid sequence of
Figure 173-88 shows D70A-AB10 (SEQ ID NO: 1086), D70A-AC2 (SEQ ID NO: 1087), D70A-AC3 (SEQ ID NO: 1088), D70A-AD3 (SEQ ID NO: 1089), D70A-AD5 (SEQ ID NO: 1090) And the nucleic acid sequence of D70A-AD6 (SEQ ID NO: 1091).
Figure 173-89 shows D70A-AD11 (SEQ ID NO: 1092), D70A-AE10 (SEQ ID NO: 1093), D70A-AF6 (SEQ ID NO: 1094), D70A-AF8 (SEQ ID NO: 1095), D70A-AF10 (SEQ ID NO: 1096) , D70A-AH5 (SEQ ID NO: 1097) and D70A-AH8 (SEQ ID NO: 1098).
Figure 173-90 shows D70A-BA3 (SEQ ID NO: 1099), D70A-BA6 (SEQ ID NO: 1100), D70A-BA10 (SEQ ID NO: 1101), D70A-BB8 (SEQ ID NO: 1102) and D70A-BB11 (SEQ ID NO: 1103) The nucleic acid sequence of
Figure 173-91 shows D70A-BC7 (SEQ ID NO: 1104), D70A-BD8 (SEQ ID NO: 1105), D70A-BE1 (SEQ ID NO: 1106), D70A-BE5 (SEQ ID NO: 1107), D70A-BE6 (SEQ ID NO: 1108) And the nucleic acid sequence of D70A-BE8 (SEQ ID NO: 1109).
Figure 173-92 shows D70A-BF2 (SEQ ID NO: 1110), D70A-BF3 (SEQ ID NO: 1111), D70A-BF10 (SEQ ID NO: 1112), D70A-BG9 (SEQ ID NO: 1113), D70A-BH8 (SEQ ID NO: 1114) And the nucleic acid sequence of D70-AE2 (SEQ ID NO: 1115).
Figure 173-93 shows D70-AE6 (SEQ ID NO: 1116), D70-AF3 (SEQ ID NO: 1117), D70-AG10 (SEQ ID NO: 1118), D70-AH7 (SEQ ID NO: 1119), D70-BE6 (SEQ ID NO: 1120) And the nucleic acid sequence of D70-BE7 (SEQ ID NO: 1121).
Figure 173-94 shows D70A-BC12 (SEQ ID NO: 1122), D72-AB2 (SEQ ID NO: 1123), D72-AB6 (SEQ ID NO: 1124), D73A-AA12 (SEQ ID NO: 1125) and D73A-AB4 (SEQ ID NO: 1126) The nucleic acid sequence of
Figures 173-95 show D73A-AB9 (SEQ ID NO: 1127), D73A-AB11 (SEQ ID NO: 1128), D73A-AC1 (SEQ ID NO: 1129), D73A-AC3 (SEQ ID NO: 1130) and D73A-AC8 (SEQ ID NO: 1131) The nucleic acid sequence of
Figure 173-96 shows D73A-AD3 (SEQ ID NO: 1132), D73A-AE1 (SEQ ID NO: 1133), D73A-AE3 (SEQ ID NO: 1134), D73A-AE4 (SEQ ID NO: 1135), D73A-AE5 (SEQ ID NO: 1136) And the nucleic acid sequence of D73A-AE9 (SEQ ID NO: 1137).
Figure 173-97 shows D73A-AE10 (SEQ ID NO: 1138), D73A-AF3 (SEQ ID NO: 1139), D73A-AF4 (SEQ ID NO: 1140), D73A-AF7 (SEQ ID NO: 1141), D73A-AF8 (SEQ ID NO: 1142) And the nucleic acid sequence of D73A-AG11 (SEQ ID NO: 1143).
Figure 173-98 shows D73A-AH1 (SEQ ID NO: 1144), D73A-AH5 (SEQ ID NO: 1145), D73A-AH9 (SEQ ID NO: 1146), D73A-AH12 (SEQ ID NO: 1147), D73A-BA9 (SEQ ID NO: 1148) And the nucleic acid sequence of D73A-BB3 (SEQ ID NO: 1149).
Figures 173-99 show D73A-BB9 (SEQ ID NO: 1150), D73A-BE1 (SEQ ID NO: 1151), D73A-BF3 (SEQ ID NO: 1152), D73A-BG1 (SEQ ID NO: 1153) and D73A-BG3 (SEQ ID NO: 1154) The nucleic acid sequence of
Figure 173-100 shows D73A-BG5 (SEQ ID NO: 1155), D73A-BH1 (SEQ ID NO: 1156), D73-AC1 (SEQ ID NO: 1157), D73-AD8 (SEQ ID NO: 1158) and D73-AD12 (SEQ ID NO: 1159) The nucleic acid sequence of
Figure 173-101 shows D80-AB2 (SEQ ID NO: 1160), D81-AA5 (SEQ ID NO: 1161), D81-AB4 (SEQ ID NO: 1162), D81-AB6 (SEQ ID NO: 1163) and D81-AC5 (SEQ ID NO: 1164) The nucleic acid sequence of
FIGS. 173-102 are the nucleic acid sequences of D82-AA8 (SEQ ID NO: 1165), D82-AC9 (SEQ ID NO: 1166), D82-AH9 (SEQ ID NO: 1167) and D83-AD10 (SEQ ID NO: 1168).
Figure 173-103 shows D83-AG10 (SEQ ID NO: 1169), D84-AD3 (SEQ ID NO: 1170), D84-AE1 (SEQ ID NO: 1171), D84-AF4 (SEQ ID NO: 1172), D84-AG1 (SEQ ID NO: 1173) And the nucleic acid sequence of D87-AA1 (SEQ ID NO: 1174).
Figure 173-104 shows D87-AA3 (SEQ ID NO: 1175), D87A-AA1 (SEQ ID NO: 1176), D87A-AB1 (SEQ ID NO: 1177), D87A-AB3 (SEQ ID NO: 1178), D87A-AC1 (SEQ ID NO: 1179) And the nucleic acid sequence of D87A-AC3 (SEQ ID NO: 1180).
Figure 173-105 shows D87A-AF2 (SEQ ID NO: 1181), D87A-AG1 (SEQ ID NO: 1182), D87A-AH1 (SEQ ID NO: 1183), D87A-AH3 (SEQ ID NO: 1184), D87-AB2 (SEQ ID NO: 1185) And the nucleic acid sequence of D88-AA10 (SEQ ID NO: 1186).
Figures 173-106 show D88-AB3 (SEQ ID NO: 1187), D88-AB6 (SEQ ID NO: 1188), D88-AB7 (SEQ ID NO: 1189), D88-AB8 (SEQ ID NO: 1190), D88-AC5 (SEQ ID NO: 1191) And the nucleic acid sequence of D88-AC9 (SEQ ID NO: 1192).
Figures 173-107 show D88-AD8 (SEQ ID NO: 1193), D88-AE5 (SEQ ID NO: 1194), D88-AE6 (SEQ ID NO: 1195), D88-AE8 (SEQ ID NO: 1196) and D91-AA4 (SEQ ID NO: 1197) The nucleic acid sequence of
Figure 173-108 shows D92-AD9 (SEQ ID NO: 1198), D92-AE9 (SEQ ID NO: 1199), D92-AF8 (SEQ ID NO: 1200), D92-AG10 (SEQ ID NO: 1201), D92-AH9 (SEQ ID NO: 1202) And the nucleic acid sequence of D93-AA1 (SEQ ID NO: 1203).
Figures 173-109 show D93-AA2 (SEQ ID NO: 1204), D93-AB1 (SEQ ID NO: 1205), D93-AC3 (SEQ ID NO: 1206), D93-AC4 (SEQ ID NO: 1207) and D93-AD1 (SEQ ID NO: 1208) The nucleic acid sequence of
Figure 173-110 shows D93-AE3 (SEQ ID NO: 1209), D93-AE4 (SEQ ID NO: 1210), D93-AF3 (SEQ ID NO: 1211), D93-AG1 (SEQ ID NO: 1212), D93-AH2 (SEQ ID NO: 1213) And the nucleic acid sequence of D93-AH3 (SEQ ID NO: 1214).
Figure 173-111 shows D93-AH4 (SEQ ID NO: 1215), D93-BA10 (SEQ ID NO: 1216), D93-BA12 (SEQ ID NO: 1217), D93-BD11 (SEQ ID NO: 1218), D93-BE11 (SEQ ID NO: 1219) And the nucleic acid sequence of D93-BF12 (SEQ ID NO: 1220).
Figures 173-112 show D94-AA2 (SEQ ID NO: 1221), D94-AA3 (SEQ ID NO: 1222), D94-AB1 (SEQ ID NO: 1223), D94-AB2 (SEQ ID NO: 1224) and D94-AC3 (SEQ ID NO: 1225) The nucleic acid sequence of
Figures 173-113 show D94-AD1 (SEQ ID NO: 1226), D94-AE1 (SEQ ID NO: 1227), D94-AE3 (SEQ ID NO: 1228), D94-AG2 (SEQ ID NO: 1229) and D94-AH1 (SEQ ID NO: 1230) The nucleic acid sequence of
Figure 173-114 shows D94-AH2 (SEQ ID NO: 1231), D94-AH3 (SEQ ID NO: 1232), D95-AC1 (SEQ ID NO: 1233), D95-AD2 (SEQ ID NO: 1234), D96-AA3 (SEQ ID NO: 1235) And the nucleic acid sequence of D96-AA4 (SEQ ID NO: 1236).
Figures 173-115 show D96-AA7 (SEQ ID NO: 1237), D96-AB7 (SEQ ID NO: 2264), D96-AC5 (SEQ ID NO: 1238), D96-AC6 (SEQ ID NO: 1239) and D96-AD6 (SEQ ID NO: 1240) The nucleic acid sequence of
Figure 173-116 shows D96-AE6 (SEQ ID NO: 1241), D96-AG3 (SEQ ID NO: 1242), D96-AH8 (SEQ ID NO: 1243), D97-AA1 (SEQ ID NO: 1244), D97-AB1 (SEQ ID NO: 1245) And the nucleic acid sequence of D97-AB3 (SEQ ID NO: 1246).
Figures 173-117 show D97-AD1 (SEQ ID NO: 1247), D97-AD2 (SEQ ID NO: 1248), D97-AD4 (SEQ ID NO: 1249), D97-AE1 (SEQ ID NO: 1250) and D97-AE2 (SEQ ID NO: 1251) The nucleic acid sequence of
Figures 173-118 show D97-AE4 (SEQ ID NO: 1252), D97-AF3 (SEQ ID NO: 1253), D97-AG2 (SEQ ID NO: 1254), D97-AG3 (SEQ ID NO: 1255) and D97-AH1 (SEQ ID NO: 1256) The nucleic acid sequence of
Figure 173-119 shows D97-AH2 (SEQ ID NO: 1257), D97-AH4 (SEQ ID NO: 1258), D98-AB2 (SEQ ID NO: 1259), D98-AE3 (SEQ ID NO: 1260) and D98-AF1 (SEQ ID NO: 1261). Nucleic acid sequence).
Figure 173-120 shows D98-AH2 (SEQ ID NO: 1262), D99-AC5 (SEQ ID NO: 1263), D99-AC8 (SEQ ID NO: 1264), D99-AD2 (SEQ ID NO: 1265), D99-AD3 (SEQ ID NO: 1266) And the nucleic acid sequence of D99-AD4 (SEQ ID NO: 1267).
Figure 173-121 shows D99-AD6 (SEQ ID NO: 1268), D99-AE1 (SEQ ID NO: 1269), D99-AE5 (SEQ ID NO: 1270), D99-AE6 (SEQ ID NO: 1271), D99-AE7 (SEQ ID NO: 1272) And the nucleic acid sequence of D99-AE8 (SEQ ID NO: 1273).
Figure 173-122 shows D99-AF1 (SEQ ID NO: 1274), D99-AF5 (SEQ ID NO: 1275), D99-AF7 (SEQ ID NO: 1276), D99-AG2 (SEQ ID NO: 1277), D99-AG4 (SEQ ID NO: 1278) , D99-AG7 (SEQ ID NO: 1279) and D99-AH2 (SEQ ID NO: 1280).
Figure 173-123 shows D99-AH10 (SEQ ID NO: 1281), D99-DA3 (SEQ ID NO: 1282), D99-DB5 (SEQ ID NO: 1283), D99-DC2 (SEQ ID NO: 1284) and D99-DC3 (SEQ ID NO: 1285) The nucleic acid sequence of
FIGS. 173-124 are the nucleic acid sequences of D99-DD5 (SEQ ID NO: 1286), D99-DG4 (SEQ ID NO: 1287), D100A-AA4 (SEQ ID NO: 1288) and D101-BG2 (SEQ ID NO: 1289).
Figure 173-125 shows D101A-AC2 (SEQ ID NO: 1290), D101A-AD1 (SEQ ID NO: 1291), D101A-AD2 (SEQ ID NO: 1292), D101A-AE1 (SEQ ID NO: 1293) and D101A-AF1 (SEQ ID NO: 1294) The nucleic acid sequence of
Figures 173-126 show D101C-AA1 (SEQ ID NO: 1295), D101C-AB1 (SEQ ID NO: 1296), D101C-AC1 (SEQ ID NO: 1297), D101C-AD3 (SEQ ID NO: 1298) and D101C-BD12 (SEQ ID NO: 1299) The nucleic acid sequence of
FIGS. 173-127 are the nucleic acid sequences of D101C-BE12 (SEQ ID NO: 1300), D101C-BF12 (SEQ ID NO: 1301), D101C-BG12 (SEQ ID NO: 1302) and D101D-AB6 (SEQ ID NO: 1303).
Figures 173-128 show D101D-AC5 (SEQ ID NO: 1304), D101D-AG5 (SEQ ID NO: 1305), D101D-AG6 (SEQ ID NO: 1306), D101D-AH4 (SEQ ID NO: 1307) and D101D-AH6 (SEQ ID NO: 1308) The nucleic acid sequence of
Figure 173-129 shows D101D-BB11 (SEQ ID NO: 1309), D101D-BD11 (SEQ ID NO: 1310), D107-AA3 (SEQ ID NO: 1311), D107-AB2 (SEQ ID NO: 1312), D107-AC2 (SEQ ID NO: 1313) And the nucleic acid sequence of D107-AC3 (SEQ ID NO: 1314).
Figure 173-130 shows D107-AD2 (SEQ ID NO: 1315), D107-AD3 (SEQ ID NO: 1316), D107-AF1 (SEQ ID NO: 1317), D107-AH1 (SEQ ID NO: 1318), D108-AA6 (SEQ ID NO: 1319) And the nucleic acid sequence of D108-AB4 (SEQ ID NO: 1320).
Figure 173-131 shows D108-AB5 (SEQ ID NO: 1321), D108-AC6 (SEQ ID NO: 1322), D108-AD6 (SEQ ID NO: 1323), D108-AF6 (SEQ ID NO: 1324), D109-AA7 (SEQ ID NO: 1325) And the nucleic acid sequence of D109-AA8 (SEQ ID NO: 1326).
Figure 173-132 shows D109-AA9 (SEQ ID NO: 1327), D109-AB8 (SEQ ID NO: 1328), D109-AC7 (SEQ ID NO: 1329), D109-AC8 (SEQ ID NO: 1330), D109-AC9 (SEQ ID NO: 1331) And the nucleic acid sequence of D109-AE7 (SEQ ID NO: 1332).
Figures 173-133 show D109-AF9 (SEQ ID NO: 1333), D109-AH7 (SEQ ID NO: 1334), D110-AB11 (SEQ ID NO: 1335), D110-AF10 (SEQ ID NO: 1336), D111-AA2 (SEQ ID NO: 1337) And the nucleic acid sequence of D111-AB1 (SEQ ID NO: 1338).
Figures 173-134 show D111-AB3 (SEQ ID NO: 1339), D111-AC3 (SEQ ID NO: 1340), D111-AD1 (SEQ ID NO: 1341), D111-AF1 (SEQ ID NO: 1342) and D111-AG3 (SEQ ID NO: 1343) The nucleic acid sequence of
Figures 173-135 show D111-AH1 (SEQ ID NO: 1344), D111-AH2 (SEQ ID NO: 1345), D112-AD6 (SEQ ID NO: 1346), D112-AE6 (SEQ ID NO: 1347) and D112-AF5 (SEQ ID NO: 1348) The nucleic acid sequence of
Figures 173-136 show D112-AG5 (SEQ ID NO: 1349), D112-AH4 (SEQ ID NO: 1350), D113-AA9 (SEQ ID NO: 1351), D113A-AC3 (SEQ ID NO: 1352) and D113A-AD1 (SEQ ID NO: 1353) The nucleic acid sequence of
Figure 173-137 shows D113A-AD3 (SEQ ID NO: 1354), D113A-AF3 (SEQ ID NO: 1355), D113A-AG2 (SEQ ID NO: 1356), D113A-AH2 (SEQ ID NO: 1357), D113-AB9 (SEQ ID NO: 1358) And the nucleic acid sequence of D113-AC7 (SEQ ID NO: 1359).
Figures 173-138 show D113-AD8 (SEQ ID NO: 1360), D113-AD9 (SEQ ID NO: 1361), D113-AE7 (SEQ ID NO: 1362), D113-AF8 (SEQ ID NO: 1363) and D113-AF9 (SEQ ID NO: 1364). The nucleic acid sequence of
Figures 173-139 show D113-AG7 (SEQ ID NO: 1365), D113-AG9 (SEQ ID NO: 1366), D114-AE10 (SEQ ID NO: 1367), D114-AF11 (SEQ ID NO: 1368) and D115-AA6 (SEQ ID NO: 1369) The nucleic acid sequence of
Figure 173-140 shows D133-AA7 (SEQ ID NO: 1370), D133-AE8 (SEQ ID NO: 1371), D133-AF9 (SEQ ID NO: 1372), D133-AG8 (SEQ ID NO: 1373), D138-AD10 (SEQ ID NO: 1374) And the nucleic acid sequence of D139-AD1 (SEQ ID NO: 1375).
Figure 173-141 shows D140-AA4 (SEQ ID NO: 1376), D140-AD4 (SEQ ID NO: 1377), D140-AF4 (SEQ ID NO: 1378), D141-AA7 (SEQ ID NO: 1379), D141-AB7 (SEQ ID NO: 1380) And the nucleic acid sequence of D142-AB11 (SEQ ID NO: 1381).
Figure 173-142 shows D142-AC10 (SEQ ID NO: 1382), D142-AE10 (SEQ ID NO: 1383), D142-AE11 (SEQ ID NO: 1384), D142-AF10 (SEQ ID NO: 1385), D144-AA1 (SEQ ID NO: 1386) And the nucleic acid sequence of D144A-AA9 (SEQ ID NO: 1387).
Figure 173-143 shows D144A-AB12 (SEQ ID NO: 1388), D144A-AC9 (SEQ ID NO: 1389), D144A-AC10 (SEQ ID NO: 1390), D144A-AD12 (SEQ ID NO: 1391), D144A-AE12 (SEQ ID NO: 1392) And the nucleic acid sequence of D144A-AF11 (SEQ ID NO: 1393).
Figures 173-144 show D144A-AF12 (SEQ ID NO: 1394), D144A-AG11 (SEQ ID NO: 1395), D144A-AH9 (SEQ ID NO: 1396), D144A-AH11 (SEQ ID NO: 1397) and D144-AE4 (SEQ ID NO: 1398) The nucleic acid sequence of
Figure 173-145 shows D144-AH3 (SEQ ID NO: 1399), D145-AA8 (SEQ ID NO: 1400), D145-AC10 (SEQ ID NO: 1401), D145-AD7 (SEQ ID NO: 1402), D145-AD9 (SEQ ID NO: 1403) And the nucleic acid sequence of D145-AD10 (SEQ ID NO: 1404).
Figure 173-146 shows D145-AE7 (SEQ ID NO: 1405), D145-AF7 (SEQ ID NO: 1406), D145-AF8 (SEQ ID NO: 1407), D145-AG8 (SEQ ID NO: 1408), D145-AG9 (SEQ ID NO: 1409) And the nucleic acid sequence of D145-AG10 (SEQ ID NO: 1410).
Figures 173-147 show D145-AH9 (SEQ ID NO: 1411), D146-BB2 (SEQ ID NO: 1412), D146-BC1 (SEQ ID NO: 1413), D146-BD1 (SEQ ID NO: 1414) and D146-BD2 (SEQ ID NO: 1415) The nucleic acid sequence of
Figures 173-148 show the sequences D146-BF2 (SEQ ID NO: 1416), D147-AE2 (SEQ ID NO: 1417), D150-AA2 (SEQ ID NO: 1418), D150-AC2 (SEQ ID NO: 1419) and D150-AD1 (SEQ ID NO: 1420). ) Nucleic acid.
Figure 173-149 shows D151-AA1 (SEQ ID NO: 1421), D152-AA2 (SEQ ID NO: 1422), D152-AB2 (SEQ ID NO: 1423), D152-AC1 (SEQ ID NO: 1424), D152-AD2 (SEQ ID NO: 1425) And the nucleic acid sequence of D152-AG2 (SEQ ID NO: 1426).
Figure 173-150 shows D152-AH2 (SEQ ID NO: 1427), D153-AA7 (SEQ ID NO: 1428), D153-AB2 (SEQ ID NO: 1429), D153-AF2 (SEQ ID NO: 1430), D153-AF7 (SEQ ID NO: 1431) And the nucleic acid sequence of D153-AF9 (SEQ ID NO: 1432).
Figure 173-151 shows the nucleic acid sequences D153-AG6 (SEQ ID NO: 1433), D153-AG7 (SEQ ID NO: 1434), D153-AG9 (SEQ ID NO: 1435), D153-AH6 (SEQ ID NO: 1436) and D153-AH9 (SEQ ID NO: 1) No. 1437).
Figures 173-152 show D154-AC2 (SEQ ID NO: 1438), D154-AE9 (SEQ ID NO: 1439), D155-AB1 (SEQ ID NO: 1440), D155-AC1 (SEQ ID NO: 1441) and D155-AC2 (SEQ ID NO: 1442) The nucleic acid sequence of
Figure 173-153 shows D155-AE1 (SEQ ID NO: 1443), D155-AE2 (SEQ ID NO: 1444), D155-AF1 (SEQ ID NO: 1445), D155-AF2 (SEQ ID NO: 1446) and D155-AH2 (SEQ ID NO: 1447) The nucleic acid sequence of
Figures 173-154 show D156-AB1 (SEQ ID NO: 1448), D156-AC3 (SEQ ID NO: 1449), D156-AC4 (SEQ ID NO: 1450), D156-AD3 (SEQ ID NO: 1451) and D156-AF2 (SEQ ID NO: 1452) The nucleic acid sequence of
Figures 173-155 show D156-AF4 (SEQ ID NO: 1453), D156-AG1 (SEQ ID NO: 1454), D156-AG2 (SEQ ID NO: 1455), D156-AG4 (SEQ ID NO: 1456) and D156-AH1 (SEQ ID NO: 1457) The nucleic acid sequence of
Figures 173-156 show D157-AG4 (SEQ ID NO: 1458), D158-AB8 (SEQ ID NO: 1459), D158-AD5 (SEQ ID NO: 1460), D158-AD6 (SEQ ID NO: 1461) and D158-AD8 (SEQ ID NO: 1462) The nucleic acid sequence of
Figures 173-157 show D158-AE8 (SEQ ID NO: 1463), D159-AD2 (SEQ ID NO: 1464), D160-AB4 (SEQ ID NO: 1465), D160-AC4 (SEQ ID NO: 1466) and D160-AE4 (SEQ ID NO: 1467) The nucleic acid sequence of
Figure 173-158 shows D160-AF4 (SEQ ID NO: 1468), D160-AH4 (SEQ ID NO: 1469), D161-AE5 (SEQ ID NO: 1470), D161-AH5 (SEQ ID NO: 1471), D164-AB1 (SEQ ID NO: 1472) And the nucleic acid sequence of D164-AB3 (SEQ ID NO: 1473).
Figures 173-159 show D164-AC1 (SEQ ID NO: 1474), D164-AC2 (SEQ ID NO: 1475), D164-AC5 (SEQ ID NO: 1476), D164-AE1 (SEQ ID NO: 1477) and D164-AF1 (SEQ ID NO: 1478) The nucleic acid sequence of
Figures 173-160 show D165-AH8 (SEQ ID NO: 1479), D177-BB7 (SEQ ID NO: 1480), D178-AA6 (SEQ ID NO: 1481), D178-AD5 (SEQ ID NO: 1482) and D180-AA9 (SEQ ID NO: 1483). The nucleic acid sequence of
Figures 173-161 show D181-AB6 (SEQ ID NO: 1484), D181-AC6 (SEQ ID NO: 1485), D181-AD7 (SEQ ID NO: 1486), D181-AG7 (SEQ ID NO: 1487) and D181-AH6 (SEQ ID NO: 1488). The nucleic acid sequence of
Figures 173-162 show D182-AA1 (SEQ ID NO: 1489), D182-AA2 (SEQ ID NO: 1490), D182-AA4 (SEQ ID NO: 1491), D182-AB2 (SEQ ID NO: 1492) and D182-AC2 (SEQ ID NO: 1493) The nucleic acid sequence of
Figures 173-163 show D182-AC4 (SEQ ID NO: 1494), D182-AD1 (SEQ ID NO: 1495), D182-AD3 (SEQ ID NO: 1496), D182-AF1 (SEQ ID NO: 1497) and D182-AF4 (SEQ ID NO: 1498) The nucleic acid sequence of
Figure 173-164 shows D182-AG1 (SEQ ID NO: 1499), D183-AC8 (SEQ ID NO: 1500), D185-AB10 (SEQ ID NO: 1501), D185-AC10 (SEQ ID NO: 1502), D185-AF10 (SEQ ID NO: 1503) And the nucleic acid sequence of D185-BA1 (SEQ ID NO: 1504).
Figure 173-165 shows D185-BB3 (SEQ ID NO: 1505), D186-AA3 (SEQ ID NO: 1506), D186-AB4 (SEQ ID NO: 1507), D186-AC2 (SEQ ID NO: 1508), D186-AC3 (SEQ ID NO: 1509) And the nucleic acid sequence of D186-AD2 (SEQ ID NO: 1510).
Figure 173-166 shows D186-AD3 (SEQ ID NO: 1511), D186-AE3 (SEQ ID NO: 1512), D187-AB2 (SEQ ID NO: 1513), D187-AB3 (SEQ ID NO: 1514), D187-AC4 (SEQ ID NO: 1515) , D187-AE4 (SEQ ID NO: 1516) and D187-AF4 (SEQ ID NO: 1517).
Figure 173-167 shows D187-AG1 (SEQ ID NO: 1518), D187-AG2 (SEQ ID NO: 1519), D187-AG3 (SEQ ID NO: 1520), D187-AH2 (SEQ ID NO: 1521), D184-AA1 (SEQ ID NO: 1522) And the nucleic acid sequence of D188-AC7 (SEQ ID NO: 1523).
Figure 173-168 shows D188-AC8 (SEQ ID NO: 1524), D188-AD8 (SEQ ID NO: 1525), D188-AE8 (SEQ ID NO: 1526), D188-AF6 (SEQ ID NO: 1527), D188-AG5 (SEQ ID NO: 1528) And the nucleic acid sequence of D188-AG7 (SEQ ID NO: 1529).
Figure 173-169 shows D188-AH7 (SEQ ID NO: 1530), D189-AA12 (SEQ ID NO: 1531), D189-AB10 (SEQ ID NO: 1532), D189-AE9 (SEQ ID NO: 1533), D189-AE12 (SEQ ID NO: 1534) And the nucleic acid sequence of D189-AF12 (SEQ ID NO: 1535).
Figure 173-170 shows D189-AG10 (SEQ ID NO: 1536), D190-BA6 (SEQ ID NO: 1537), D190-BD6 (SEQ ID NO: 1538), D190-BF6 (SEQ ID NO: 1539), D190-BG6 (SEQ ID NO: 1540) And the nucleic acid sequence of D190-BH6 (SEQ ID NO: 1541).
Figures 173-171 show D191-BC5 (SEQ ID NO: 1542), D191-BD5 (SEQ ID NO: 1543), D191-BF5 (SEQ ID NO: 1544), D191-BG5 (SEQ ID NO: 1545) and D194-AA1 (SEQ ID NO: 1546). The nucleic acid sequence of
Figures 173-172 show D194-AA2 (SEQ ID NO: 1547), D194-AB1 (SEQ ID NO: 1548), D194-AB2 (SEQ ID NO: 1549), D194-AC1 (SEQ ID NO: 1550) and D194-AC2 (SEQ ID NO: 1551) The nucleic acid sequence of
Figures 173-173 show D194-AD1 (SEQ ID NO: 1552), D194-AD2 (SEQ ID NO: 1553), D194-AD3 (SEQ ID NO: 1554), D194-AE1 (SEQ ID NO: 1555) and D194-AE2 (SEQ ID NO: 1556) The nucleic acid sequence of
Figures 173-174 show D194-AE3 (SEQ ID NO: 1557), D194-AF1 (SEQ ID NO: 1558), D194-AF2 (SEQ ID NO: 1559), D194-AG2 (SEQ ID NO: 1560) and D194-AG3 (SEQ ID NO: 1561) The nucleic acid sequence of
Figure 173-175 shows D194-AH1 (SEQ ID NO: 1562), D194-AH2 (SEQ ID NO: 1563), D194-AH3 (SEQ ID NO: 1564), D195-AB6 (SEQ ID NO: 1565), D195-AD5 (SEQ ID NO: 1566) And the nucleic acid sequence of D195-AE4 (SEQ ID NO: 1567).
Figures 173-176 show D195-AE5 (SEQ ID NO: 1568), D195-AG5 (SEQ ID NO: 1569), D195-AH5 (SEQ ID NO: 1570), D196-AD7 (SEQ ID NO: 1571) and D196-AF7 (SEQ ID NO: 1572). The nucleic acid sequence of
Figures 173-177 show D196-AG7 (SEQ ID NO: 1573), D197-AE8 (SEQ ID NO: 1574), D198-AB9 (SEQ ID NO: 1575), D198-AC9 (SEQ ID NO: 1576) and D198-AF9 (SEQ ID NO: 1577). The nucleic acid sequence of
Figures 173-178 show D199-AA10 (SEQ ID NO: 1578), D199-AB10 (SEQ ID NO: 1579), D199-AD10 (SEQ ID NO: 1580), D199-AF10 (SEQ ID NO: 1581) and D199-AG10 (SEQ ID NO: 1582). The nucleic acid sequence of
Figures 173-179 show D200-AB11 (SEQ ID NO: 1583), D200-AC11 (SEQ ID NO: 1584), D200-AD11 (SEQ ID NO: 1585), D200-AE11 (SEQ ID NO: 1586) and D200-AG11 (SEQ ID NO: 1587) The nucleic acid sequence of
Figure 173-180 shows D200-AH11 (SEQ ID NO: 1588), D201-AD12 (SEQ ID NO: 1589), D201-AE12 (SEQ ID NO: 1590), D201-AF12 (SEQ ID NO: 1591), D201-AG12 (SEQ ID NO: 1592) And the nucleic acid sequence of D203-BE11 (SEQ ID NO: 1593).
Figures 173-181 show D203-BF11 (SEQ ID NO: 1594), D204-AA1 (SEQ ID NO: 1595), D204-AA2 (SEQ ID NO: 1596), D204-AA4 (SEQ ID NO: 1597) and D204-AB1 (SEQ ID NO: 1598). The nucleic acid sequence of
Figures 173-182 show D204-AB3 (SEQ ID NO: 1599), D204-AC1 (SEQ ID NO: 1600), D204-AC2 (SEQ ID NO: 1601), D204-AC4 (SEQ ID NO: 1602) and D204-AD1 (SEQ ID NO: 1603) The nucleic acid sequence of
Figures 173-183 show D204-AD2 (SEQ ID NO: 1604), D204-AD3 (SEQ ID NO: 1605), D204-AD4 (SEQ ID NO: 1606), D204-AE3 (SEQ ID NO: 1607) and D204-AE4 (SEQ ID NO: 1608) The nucleic acid sequence of
Figures 173-184 show D204-AF1 (SEQ ID NO: 1609), D204-AF3 (SEQ ID NO: 1610), D204-AF4 (SEQ ID NO: 1611), D204-AG1 (SEQ ID NO: 1612) and D204-AG2 (SEQ ID NO: 1613) The nucleic acid sequence of
Figures 173-185 show D204-AG3 (SEQ ID NO: 1614), D203-BA11 (SEQ ID NO: 1615), D204-AG4 (SEQ ID NO: 1616), D204-AH2 (SEQ ID NO: 1617) and D204-AH1 (SEQ ID NO: 1618) The nucleic acid sequence of
Figures 173-186 show D204-AH3 (SEQ ID NO: 1619), D205-BC9 (SEQ ID NO: 1620), D205-BD9 (SEQ ID NO: 1621), D206-CB3 (SEQ ID NO: 1622), D206-CE3 (SEQ ID NO: 1623) And the nucleic acid sequence of D206-CF3 (SEQ ID NO: 1624).
FIGS. 173-187 are the nucleic acid sequences of D206-CG1 (SEQ ID NO: 1625), D206-CH1 (SEQ ID NO: 1626), D210-BF4 (SEQ ID NO: 1627) and D210-BF6 (SEQ ID NO: 1628).
Figures 173-188 show D210-BH6 (SEQ ID NO: 1629), D211-BA9 (SEQ ID NO: 1630), D211-BB8 (SEQ ID NO: 1631), D211-BB9 (SEQ ID NO: 1632), D211-BC9 (SEQ ID NO: 1633) And the nucleic acid sequence of D211-BD8 (SEQ ID NO: 1634).
FIGS. 173-189 are the nucleic acid sequences of D211-BD9 (SEQ ID NO: 1635), D211-BE7 (SEQ ID NO: 1636), D211-BE8 (SEQ ID NO: 1637) and D211-BF8 (SEQ ID NO: 1638).
Figures 173-190 show D211-BF9 (SEQ ID NO: 1639), D211-BG8 (SEQ ID NO: 1640), D211-BH7 (SEQ ID NO: 1641), D212-BB11 (SEQ ID NO: 1642) and D212-BB12 (SEQ ID NO: 1643) The nucleic acid sequence of
Figure 173-191 shows D212-BD10 (SEQ ID NO: 1644), D212-BD11 (SEQ ID NO: 1645), D212-BE10 (SEQ ID NO: 1646), D212-BE11 (SEQ ID NO: 1647), D212-BF10 (SEQ ID NO: 1648) And the nucleic acid sequence of D212-BF11 (SEQ ID NO: 1649).
Figures 173-192 show D213-BD1 (SEQ ID NO: 1650), D213-BF2 (SEQ ID NO: 1651), D214-AA1 (SEQ ID NO: 1652), D214-AA3 (SEQ ID NO: 1653) and D214-AC1 (SEQ ID NO: 1654) The nucleic acid sequence of
Figures 173-193 show D214-AE1 (SEQ ID NO: 1655), D214-AE3 (SEQ ID NO: 1656), D214-AG1 (SEQ ID NO: 1657), D214-AH2 (SEQ ID NO: 1658) and D214-AH3 (SEQ ID NO: 1659) The nucleic acid sequence of
Figure 173-194 shows D216-AB7 (SEQ ID NO: 1660), D216-AC8 (SEQ ID NO: 1661), D216-AH9 (SEQ ID NO: 1662), D219-BA1 (SEQ ID NO: 1663), D219-BB1 (SEQ ID NO: 1664) And the nucleic acid sequence of D219-BB2 (SEQ ID NO: 1665).
Figure 173-195 shows D219-BC1 (SEQ ID NO: 1666), D219-BD1 (SEQ ID NO: 1667), D219-BD2 (SEQ ID NO: 1668), D219-BE1 (SEQ ID NO: 1669), D219-BE2 (SEQ ID NO: 1670) And the nucleic acid sequence of D219-BF2 (SEQ ID NO: 1671).
Figures 173-196 show D219-BH1 (SEQ ID NO: 1672), D220-BF6 (SEQ ID NO: 1673), D220-BD6 (SEQ ID NO: 1674), D223-BC11 (SEQ ID NO: 1675) and D221-BC7 (SEQ ID NO: 1676) The nucleic acid sequence of
Figure 173-197 shows D227-AE3 (SEQ ID NO: 1677), D223-BB10 (SEQ ID NO: 1678), D221-BF9 (SEQ ID NO: 1679), D229-AD2 (SEQ ID NO: 1680), D229-AE2 (SEQ ID NO: 1681) , D229-AF2 (SEQ ID NO: 1682) and D229-AG1 (SEQ ID NO: 1683).
Figure 173-198 shows D229-AH1 (SEQ ID NO: 1684), D230-AB1 (SEQ ID NO: 1685), D230-AC1 (SEQ ID NO: 1686), D230-AC2 (SEQ ID NO: 1687), D230-AF2 (SEQ ID NO: 1688) And the nucleic acid sequence of D230-AG1 (SEQ ID NO: 1689).
Figures 173-199 show D230-AG2 (SEQ ID NO: 1690), D231-AA1 (SEQ ID NO: 1691), D231-AA2 (SEQ ID NO: 1692), D231-AA3 (SEQ ID NO: 1693), D231-AC1 (SEQ ID NO: 1694) And the nucleic acid sequence of D231-AC2 (SEQ ID NO: 1695).
Figure 173-200 shows D231-AD2 (SEQ ID NO: 1696), D231-AE1 (SEQ ID NO: 1697), D231-AG2 (SEQ ID NO: 1698), D231-AH1 (SEQ ID NO: 1699), D231-AH2 (SEQ ID NO: 1700) And the nucleic acid sequence of D231-AH3 (SEQ ID NO: 1701).
FIGS. 173-201 are the nucleic acid sequences of D232-AD4 (SEQ ID NO: 1702), D232-AE5 (SEQ ID NO: 1703), D232-AE6 (SEQ ID NO: 1704) and D232-AF5 (SEQ ID NO: 1705).
Figure 173-202 shows D233-AA7 (SEQ ID NO: 1706), D233-AA8 (SEQ ID NO: 1707), D233-AB7 (SEQ ID NO: 1708), D233-AC7 (SEQ ID NO: 1709) and D233-AC8 (SEQ ID NO: 1710) The nucleic acid sequence of
Figure 173-203 shows D233-AH9 (SEQ ID NO: 1711), D234-AA11 (SEQ ID NO: 1712), D234-AC11 (SEQ ID NO: 1713), D234-AD11 (SEQ ID NO: 1714), D238-AA2 (SEQ ID NO: 1715) And the nucleic acid sequence of D239-BC3 (SEQ ID NO: 1716).
Figures 173-204 show D239-BD4 (SEQ ID NO: 1717), D239-BD6 (SEQ ID NO: 1718), D239-BE4 (SEQ ID NO: 1719), D240-BB7 (SEQ ID NO: 1720) and D241-BC9 (SEQ ID NO: 1721) The nucleic acid sequence of
Figure 173-205 shows D241-BE9 (SEQ ID NO: 1722), D242-BA11 (SEQ ID NO: 1723), D242-BB11 (SEQ ID NO: 1724), D242-BB12 (SEQ ID NO: 1725), D242-BC12 (SEQ ID NO: 1726) And the nucleic acid sequence of D242-BF12 (SEQ ID NO: 1727).
Figure 173-206 shows D242-BG12 (SEQ ID NO: 1728), D242-BH11 (SEQ ID NO: 1729), D244-AA5 (SEQ ID NO: 1730), D244-AA6 (SEQ ID NO: 1731), D244-AF6 (SEQ ID NO: 1732) And the nucleic acid sequence of D245-AE7 (SEQ ID NO: 1733).
Figures 173-207 show D245-AE8 (SEQ ID NO: 1734), D245-AF7 (SEQ ID NO: 1735), D246-AA12 (SEQ ID NO: 1736), D248-AG4 (SEQ ID NO: 1737) and D249-AG9 (SEQ ID NO: 1738) The nucleic acid sequence of
Figure 173-208 shows D250-AE10 (SEQ ID NO: 1739), D251-AF2 (SEQ ID NO: 1740), D251-AG2 (SEQ ID NO: 1741), D252-AA5 (SEQ ID NO: 1742) and D252-AB5 (SEQ ID NO: 1743) The nucleic acid sequence of
Figure 173-209 shows D252-AC5 (SEQ ID NO: 1744), D252-AD5 (SEQ ID NO: 1745), D252-AF4 (SEQ ID NO: 1746), D252-AF5 (SEQ ID NO: 1747), D252-AG5 (SEQ ID NO: 1748) And the nucleic acid sequence of D254-AE2 (SEQ ID NO: 1749).
Figure 173-210 shows D254-AG2 (SEQ ID NO: 1750), D255-AA5 (SEQ ID NO: 1751), D255-AA6 (SEQ ID NO: 1752), D255-AD5 (SEQ ID NO: 1753) and D255-AD6 (SEQ ID NO: 1754) The nucleic acid sequence of
FIGS. 173-211 are the nucleic acid sequences of D255-AF5 (SEQ ID NO: 1755), D255-AG5 (SEQ ID NO: 1756), D256-AA10 (SEQ ID NO: 1757) and D256-AB10 (SEQ ID NO: 1758).
Figures 173-212 show D256-AC10 (SEQ ID NO: 1759), D256-AE10 (SEQ ID NO: 1760), D256-AF9 (SEQ ID NO: 1761), D256-AF10 (SEQ ID NO: 1762) and D256-AG10 (SEQ ID NO: 1763) The nucleic acid sequence of
Figures 173-213 show D256-AH10 (SEQ ID NO: 1764), D258-AC5 (SEQ ID NO: 1765), D263-AE12 (SEQ ID NO: 1766), D263-AF12 (SEQ ID NO: 1767) and D263-AH12 (SEQ ID NO: 1768) The nucleic acid sequence of
Figures 173-214 show D264-AA1 (SEQ ID NO: 1769), D264-AA2 (SEQ ID NO: 1770), D264-AA3 (SEQ ID NO: 1771), D264-AB2 (SEQ ID NO: 1772) and D264-AC3 (SEQ ID NO: 1773) The nucleic acid sequence of
FIGS. 173-215 are the nucleic acid sequences of D264-AD3 (SEQ ID NO: 1774), D264-AE1 (SEQ ID NO: 1775), D264-AE2 (SEQ ID NO: 1776) and D264-AE3 (SEQ ID NO: 1777).
FIGS. 173-216 are the nucleic acid sequences of D264-AF2 (SEQ ID NO: 1778), D264-AG2 (SEQ ID NO: 1779), D264-AH2 (SEQ ID NO: 1780) and D265-AA4 (SEQ ID NO: 1781).
FIGS. 173-217 are the nucleic acid sequences of D265-AA6 (SEQ ID NO: 1782), D265-AC5 (SEQ ID NO: 1783), D265-AC6 (SEQ ID NO: 1784) and D265-AD4 (SEQ ID NO: 1785).
Figures 173-218 show D265-AD5 (SEQ ID NO: 1786), D266-AB7 (SEQ ID NO: 1787), D266-AB8 (SEQ ID NO: 1788), D266-AC9 (SEQ ID NO: 1789) and D266-AD7 (SEQ ID NO: 1790) The nucleic acid sequence of
Figures 173-219 show D267-AD10 (SEQ ID NO: 1791), D268-AA2 (SEQ ID NO: 1792), D268-AC3 (SEQ ID NO: 1793), D268-AD1 (SEQ ID NO: 1794) and D268-AD2 (SEQ ID NO: 1795) The nucleic acid sequence of
FIGS. 173-220 are the nucleic acid sequences of D268-AD3 (SEQ ID NO: 1796), D268-AE3 (SEQ ID NO: 1797), D268-AG2 (SEQ ID NO: 1798) and D268-AG3 (SEQ ID NO: 1799).
Figure 173-221 shows D269-AA5 (SEQ ID NO: 1800), D269-AD4 (SEQ ID NO: 1801), D269-AE4 (SEQ ID NO: 1802), D269-AF5 (SEQ ID NO: 1803), D269-AF6 (SEQ ID NO: 1804) And the nucleic acid sequence of D270-AA8 (SEQ ID NO: 1805).
Figures 173-222 show D270-AB9 (SEQ ID NO: 1806), D270-AD8 (SEQ ID NO: 1807), D270-AD9 (SEQ ID NO: 1808), D270-AE9 (SEQ ID NO: 1809) and D270-AF8 (SEQ ID NO: 1810) The nucleic acid sequence of
FIGS. 173-223 are the nucleic acid sequences of D271-AG11 (SEQ ID NO: 1811), D271-AH11 (SEQ ID NO: 1812), D276-AD5 (SEQ ID NO: 1813) and D276-AG6 (SEQ ID NO: 1814).
Figures 173-224 show D276-AH4 (SEQ ID NO: 1815), D276-AH6 (SEQ ID NO: 1816), D277-AE8 (SEQ ID NO: 1817), D277-AF9 (SEQ ID NO: 1818) and D277-AH9 (SEQ ID NO: 1819) The nucleic acid sequence of
Figures 173-225 show D278-AF10 (SEQ ID NO: 1820), D279-AA3 (SEQ ID NO: 1821), D279-AB2 (SEQ ID NO: 1822), D279-AC1 (SEQ ID NO: 1823) and D279-AD2 (SEQ ID NO: 1824) The nucleic acid sequence of
Figures 173-226 show D279-AE1 (SEQ ID NO: 1825), D279-AE3 (SEQ ID NO: 1826), D279-AG3 (SEQ ID NO: 1827), D279-BA1 (SEQ ID NO: 1828) and D279-BA2 (SEQ ID NO: 1829) The nucleic acid sequence of
Figures 173-227 show D279-BB3 (SEQ ID NO: 1830), D279-BC2 (SEQ ID NO: 1831), D279-BD2 (SEQ ID NO: 1832), D279-BE2 (SEQ ID NO: 1833) and D279-BF3 (SEQ ID NO: 1834) The nucleic acid sequence of
Figures 173-228 show D279-BG1 (SEQ ID NO: 1835), D279-BH3 (SEQ ID NO: 1836), D280-AB5 (SEQ ID NO: 1837), D280-AB6 (SEQ ID NO: 1838) and D280-AC4 (SEQ ID NO: 1839) The nucleic acid sequence of
Figure 173-229 shows D280-AC6 (SEQ ID NO: 1840), D280-AD4 (SEQ ID NO: 1841), D280-AD5 (SEQ ID NO: 1842), D280-AD6 (SEQ ID NO: 1843) and D280-AE4 (SEQ ID NO: 1844) The nucleic acid sequence of
Figures 173-230 shows D280-AE5 (SEQ ID NO: 1845), D280-AE6 (SEQ ID NO: 1846), D280-AF5 (SEQ ID NO: 1847), D280-AF6 (SEQ ID NO: 1848) and D280-AG4 (SEQ ID NO: 1849) The nucleic acid sequence of
Figures 173-231 show D280-AG5 (SEQ ID NO: 1850), D280-AG6 (SEQ ID NO: 1851), D280-AH4 (SEQ ID NO: 1852), D280-AH5 (SEQ ID NO: 1853) and D280-BC4 (SEQ ID NO: 1854) The nucleic acid sequence of
FIG. 173-232 shows the nucleic acid sequences of D280-BD4 (SEQ ID NO: 1855), D280-BE4 (SEQ ID NO: 1856), D280-BE6 (SEQ ID NO: 1857) and D280-BF4 (SEQ ID NO: 1858).
Figures 173-233 show D280-BG4 (SEQ ID NO: 1859), D280-BH4 (SEQ ID NO: 1860), D280-BH6 (SEQ ID NO: 1861), D281-AA8 (SEQ ID NO: 1862) and D281-AD7 (SEQ ID NO: 1863) The nucleic acid sequence of
Figure 173-234 shows D281-AD8 (SEQ ID NO: 1864), D281-AE7 (SEQ ID NO: 1865), D281-AE8 (SEQ ID NO: 1866), D281-AE9 (SEQ ID NO: 1867), D281-AG7 (SEQ ID NO: 1868) And the nucleic acid sequence of D282-AB10 (SEQ ID NO: 1869).
Figures 173-235 show D282-AB11 (SEQ ID NO: 1870), D282-AD10 (SEQ ID NO: 1871), D282-AH11 (SEQ ID NO: 1872), D282-BA10 (SEQ ID NO: 1873), D282-BB10 (SEQ ID NO: 1874) and D282-BD10 (SEQ ID NO: 1875).
Figures 173-236 show D288-AB3 (SEQ ID NO: 1876), D289-AA4 (SEQ ID NO: 1877), D289-AA6 (SEQ ID NO: 1878), D289-AB4 (SEQ ID NO: 1879) and D289-AB6 (SEQ ID NO: 1880) The nucleic acid sequence of
Figures 173-237 show D289-AD4 (SEQ ID NO: 1881), D289-AE4 (SEQ ID NO: 1882), D289-AE6 (SEQ ID NO: 1883), D289-AF4 (SEQ ID NO: 1884) and D289-AF6 (SEQ ID NO: 1885) The nucleic acid sequence of
Figures 173-238 show D289-AG4 (SEQ ID NO: 1886), D289-AG6 (SEQ ID NO: 1887), D289-AH4 (SEQ ID NO: 1888), D289-AH6 (SEQ ID NO: 1889) and D290-AA7 (SEQ ID NO: 1890). The nucleic acid sequence of
Figures 173-239 show D290-AA8 (SEQ ID NO: 1891), D290-AA9 (SEQ ID NO: 1892), D290-AB7 (SEQ ID NO: 1893), D290-AB9 (SEQ ID NO: 1894) and D290-AC8 (SEQ ID NO: 1895) The nucleic acid sequence of
Figures 173-240 show D290-AC9 (SEQ ID NO: 1896), D290-AD7 (SEQ ID NO: 1897), D290-AD8 (SEQ ID NO: 1898), D290-AD9 (SEQ ID NO: 1899) and D291-AA12 (SEQ ID NO: 1900) The nucleic acid sequence of
Figure 173-241 shows D291-AB10 (SEQ ID NO: 1901), D291-AB11 (SEQ ID NO: 1902), D291-AC12 (SEQ ID NO: 1903), D291-AD11 (SEQ ID NO: 1904) and D291-AD12 (SEQ ID NO: 1905) The nucleic acid sequence of
Figure 173-242 shows D291-AE10 (SEQ ID NO: 1906), D291-AE12 (SEQ ID NO: 1907), D291-AF10 (SEQ ID NO: 1908), D291-AF12 (SEQ ID NO: 1909) and D291-AG11 (SEQ ID NO: 1910) The nucleic acid sequence of
Figure 173-243 shows D291-AG12 (SEQ ID NO: 1911), D291-AH11 (SEQ ID NO: 1912), D292-AA2 (SEQ ID NO: 1913), D292-AA3 (SEQ ID NO: 1914), D292-AB2 (SEQ ID NO: 1915) And the nucleic acid sequence of D292-AC2 (SEQ ID NO: 1916).
Figure 173-244 shows D292-AD1 (SEQ ID NO: 1917), D292-AD2 (SEQ ID NO: 1918), D292-AE1 (SEQ ID NO: 1919), D292-AE2 (SEQ ID NO: 1920), D292-AF1 (SEQ ID NO: 1921) , D292-AF3 (SEQ ID NO: 1922) and D292-AH3 (SEQ ID NO: 1923).
Figures 173-245 show D291-AA10 (SEQ ID NO: 1924), D294-AB7 (SEQ ID NO: 1925), D294-AB8 (SEQ ID NO: 1926), D294-AB9 (SEQ ID NO: 1927) and D294-AC7 (SEQ ID NO: 1928) The nucleic acid sequence of
Figures 173-246 show D294-AC8 (SEQ ID NO: 1929), D294-AE9 (SEQ ID NO: 1930), D294-AG8 (SEQ ID NO: 1931), D294-AH7 (SEQ ID NO: 1932) and D295-AA3 (SEQ ID NO: 1933) The nucleic acid sequence of
Figures 173-247 show D295-AB1 (SEQ ID NO: 1934), D295-AB2 (SEQ ID NO: 1935), D295-AC2 (SEQ ID NO: 1936), D295-AC3 (SEQ ID NO: 1937) and D295-AD1 (SEQ ID NO: 1938) The nucleic acid sequence of
Figures 173-248 show D295-AD2 (SEQ ID NO: 1939), D295-AE3 (SEQ ID NO: 1940), D295-AF1 (SEQ ID NO: 1941), D295-AF2 (SEQ ID NO: 1942) and D295-AG3 (SEQ ID NO: 1943) The nucleic acid sequence of
Figures 173-249 show D295-AH1 (SEQ ID NO: 1944), D296-AA6 (SEQ ID NO: 1945), D296-AE5 (SEQ ID NO: 1946), D296-AF5 (SEQ ID NO: 1947) and D296-AG4 (SEQ ID NO: 1948) The nucleic acid sequence of
Figure 173-250 shows D296-AG5 (SEQ ID NO: 1949), D297-AA7 (SEQ ID NO: 1950), D297-AA8 (SEQ ID NO: 1951), D297-AB7 (SEQ ID NO: 1952) and D297-AE7 (SEQ ID NO: 1953) The nucleic acid sequence of
Figure 173-251 shows D297-AF7 (SEQ ID NO: 1954), D298-AA10 (SEQ ID NO: 1955), D298-AB11 (SEQ ID NO: 1956), D298-AF11 (SEQ ID NO: 1957) and D298-AG12 (SEQ ID NO: 1958) The nucleic acid sequence of
Figures 173-252 show D35-40 (SEQ ID NO: 1959), D35-AC6 (SEQ ID NO: 1960), D35-BB2 (SEQ ID NO: 1961), D55-AB9 (SEQ ID NO: 1962) and D55-BB1 (SEQ ID NO: 1963) The nucleic acid sequence of
Figure 173-253 shows D55-BB2 (SEQ ID NO: 1964), D55-BB3 (SEQ ID NO: 1965), D55-BB7 (SEQ ID NO: 1966), D56-AA1 (SEQ ID NO: 1967), D56-AE4 (SEQ ID NO: 1968) And the nucleic acid sequence of D56-AE9 (SEQ ID NO: 1969).
Figures 173-254 show D56-AD1 (SEQ ID NO: 1970), D56-AG12 (SEQ ID NO: 1971), D56-AH11 (SEQ ID NO: 1972), D57-AA5 (SEQ ID NO: 1973) and D57-AA7 (SEQ ID NO: 1974) The nucleic acid sequence of
Figure 173-255 shows D57-AB10 (SEQ ID NO: 1975), D57-AC2 (SEQ ID NO: 1976), D57-AC3 (SEQ ID NO: 1977), D57-AC6 (SEQ ID NO: 1978), D57-AC9 (SEQ ID NO: 1979) And the nucleic acid sequence of D57-AC11 (SEQ ID NO: 1980).
Figures 173-256 show D57-AD3 (SEQ ID NO: 1981), D57-AE4 (SEQ ID NO: 1982), D57-AE6 (SEQ ID NO: 1983), D57-AE9 (SEQ ID NO: 1984) and D57-AF4 (SEQ ID NO: 1985). The nucleic acid sequence of
Figure 173-257 shows D57-AF11 (SEQ ID NO: 1986), D57-AG3 (SEQ ID NO: 1987), D57-AH11 (SEQ ID NO: 1988), D58-AB2 (SEQ ID NO: 1989), D58-AC8 (SEQ ID NO: 1990) And the nucleic acid sequence of D58-AG9 (SEQ ID NO: 1991).
Figures 173-258 show D58-BA9 (SEQ ID NO: 1992), D58-BB9 (SEQ ID NO: 1993), D58-BC1 (SEQ ID NO: 1994), D58-BC10 (SEQ ID NO: 1995), D58-BC11 (SEQ ID NO: 1996) And the nucleic acid sequence of D58-BD4 (SEQ ID NO: 1997).
Figure 173-259 shows D58-BE8 (SEQ ID NO: 1998), D58-BF4 (SEQ ID NO: 1999), D60-AB4 (SEQ ID NO: 2000), D60-AC4 (SEQ ID NO: 2001), D60-AD11 (SEQ ID NO: 2002) And the nucleic acid sequence of D60-AF9 (SEQ ID NO: 2003).
Figure 173-260 shows D65-AB6 (SEQ ID NO: 2004), D65-AC3 (SEQ ID NO: 2005), D65-AC9 (SEQ ID NO: 2006), D65-AC12 (SEQ ID NO: 2007), D65-AE3 (SEQ ID NO: 2008) And the nucleic acid sequence of D65-AG1 (SEQ ID NO: 2009).
Figure 173-261 shows D65-CE10 (SEQ ID NO: 2010), D65-CE11 (SEQ ID NO: 2011), D65-CF11 (SEQ ID NO: 2012), D65-CH5 (SEQ ID NO: 2013), D66-AA1 (SEQ ID NO: 2014) And the nucleic acid sequence of D66-AA3 (SEQ ID NO: 2015).
Figures 173-262 show D66-AE5 (SEQ ID NO: 2016), D66-AF1 (SEQ ID NO: 2017), D66-AG2 (SEQ ID NO: 2018), D66-AG6 (SEQ ID NO: 2019) and D66-AH3 (SEQ ID NO: 2020) The nucleic acid sequence of
Figure 173-263 shows D66-BA11 (SEQ ID NO: 2021), D66-BD6 (SEQ ID NO: 2022), D66-BD8 (SEQ ID NO: 2023), D67-AA5 (SEQ ID NO: 2024), D67-AD3 (SEQ ID NO: 2025) And the nucleic acid sequence of D67-AE1 (SEQ ID NO: 2026).
Figure 173-264 shows D67-AE4 (SEQ ID NO: 2027), D67-AG4 (SEQ ID NO: 2028), D68-AF3 (SEQ ID NO: 2029), D70A-AE1 (SEQ ID NO: 2030), D70A-AG7 (SEQ ID NO: 2031) And the nucleic acid sequence of D70A-BC6 (SEQ ID NO: 2032).
Figures 173-265 show D70A-BF7 (SEQ ID NO: 2033), D70A-BF8 (SEQ ID NO: 2034), D70A-BH1 (SEQ ID NO: 2035), D70A-BH3 (SEQ ID NO: 2036) and D73A-AA1 (SEQ ID NO: 2037) The nucleic acid sequence of
Figure 173-266 shows D73A-AA3 (SEQ ID NO: 2038), D73A-AA5 (SEQ ID NO: 2039), D73A-AA6 (SEQ ID NO: 2040), D73A-AA8 (SEQ ID NO: 2041), D73A-AA9 (SEQ ID NO: 2042) And the nucleic acid sequence of D73A-AB1 (SEQ ID NO: 2043).
Figures 173-267 show D73A-AB3 (SEQ ID NO: 2044), D73A-AB5 (SEQ ID NO: 2045), D73A-AB10 (SEQ ID NO: 2046), D73A-AC2 (SEQ ID NO: 2047) and D73A-AC5 (SEQ ID NO: 2048) The nucleic acid sequence of
Figure 173-268 shows D73A-AC11 (SEQ ID NO: 2049), D73A-AC12 (SEQ ID NO: 2050), D73A-AD7 (SEQ ID NO: 2051), D73A-AD10 (SEQ ID NO: 2052), D73A-AE6 (SEQ ID NO: 2053) And the nucleic acid sequence of D73A-AE7 (SEQ ID NO: 2054).
Figure 173-269 shows D73A-AE8 (SEQ ID NO: 2055), D73A-AE12 (SEQ ID NO: 2056), D73A-AF5 (SEQ ID NO: 2057), D73A-AF6 (SEQ ID NO: 2058), D73A-AF12 (SEQ ID NO: 2059) And the nucleic acid sequence of D73A-AG4 (SEQ ID NO: 2060).
Figures 173-270 show D73A-AG6 (SEQ ID NO: 2061), D73A-AG10 (SEQ ID NO: 2062), D73A-AH2 (SEQ ID NO: 2063), D73A-AH3 (SEQ ID NO: 2064) and D73A-AH10 (SEQ ID NO: 2065) The nucleic acid sequence of
Figures 173-271 show D93-AD3 (SEQ ID NO: 2066), D97-AD3 (SEQ ID NO: 2067), D97-AE3 (SEQ ID NO: 2068), D97-AF1 (SEQ ID NO: 2069) and D113-AH8 (SEQ ID NO: 2070). The nucleic acid sequence of
Figures 173-272 show D114-AA10 (SEQ ID NO: 2071), D114-AC11 (SEQ ID NO: 2072), D131-AD1 (SEQ ID NO: 2073), D133-AD7 (SEQ ID NO: 2074) and D139-AD2 (SEQ ID NO: 2075) The nucleic acid sequence of
Figure 173-273 shows D139-AF2 (SEQ ID NO: 2076), D144A-AB10 (SEQ ID NO: 2077), D144A-AE9 (SEQ ID NO: 2078), D144A-AG12 (SEQ ID NO: 2079), D145-AC7 (SEQ ID NO: 2080) And the nucleic acid sequence of D145-AH7 (SEQ ID NO: 2081).
Figure 173-274 shows D150-AA3 (SEQ ID NO: 2082), D150-AG3 (SEQ ID NO: 2083), D151-AG3 (SEQ ID NO: 2084), D153-AA8 (SEQ ID NO: 2085), D153-AB7 (SEQ ID NO: 2086) And the nucleic acid sequence of D153-AC9 (SEQ ID NO: 2087).
Figure 173-275 shows D153-AF8 (SEQ ID NO: 2088), D155-AA2 (SEQ ID NO: 2089), D155-AG2 (SEQ ID NO: 2090), D156-AH3 (SEQ ID NO: 2091), D159-AA2 (SEQ ID NO: 2092) And the nucleic acid sequence of D164-AD1 (SEQ ID NO: 2093).
Figure 173-276 shows D181-AG6 (SEQ ID NO: 2094), D182-AB1 (SEQ ID NO: 2095), D182-AF2 (SEQ ID NO: 2096), D185-AE10 (SEQ ID NO: 2097), D186-AH3 (SEQ ID NO: 2098) And the nucleic acid sequence of D188-AC6 (SEQ ID NO: 2099).
Figure 173-277 shows D188-AF5 (SEQ ID NO: 2100), D189-AD12 (SEQ ID NO: 2101), D258-AG6 (SEQ ID NO: 2102), D194-AA3 (SEQ ID NO: 2103), D194-AB3 (SEQ ID NO: 2104) , D198-AD9 (SEQ ID NO: 2105) and D198-AE9 (SEQ ID NO: 2106).
Figures 173-278 show D203-BB11 (SEQ ID NO: 2107), D203-BC11 (SEQ ID NO: 2108), D204-AA3 (SEQ ID NO: 2109), D204-AF2 (SEQ ID NO: 2110), D206-CB1 (SEQ ID NO: 2111) And the nucleic acid sequence of D214-AB1 (SEQ ID NO: 2112).
Figures 173-279 show D214-AF2 (SEQ ID NO: 2113), D216-AA7 (SEQ ID NO: 2114), D216-AD7 (SEQ ID NO: 2115), D219-BA2 (SEQ ID NO: 2116), D219-BF1 (SEQ ID NO: 2117) And the nucleic acid sequence of D229-AB2 (SEQ ID NO: 2118).
Figure 173-280 shows D230-AD2 (SEQ ID NO: 2119), D230-AE2 (SEQ ID NO: 2120), D234-AE12 (SEQ ID NO: 2121), D241-BG10 (SEQ ID NO: 2122), D249-AA9 (SEQ ID NO: 2123) And the nucleic acid sequence of D255-AC5 (SEQ ID NO: 2124).
Figures 173-281 show D270-AE7 (SEQ ID NO: 2125), D270-AE8 (SEQ ID NO: 2126), D276-AH5 (SEQ ID NO: 2127), D279-AA2 (SEQ ID NO: 2128) and D279-AB3 (SEQ ID NO: 2129) The nucleic acid sequence of
FIGS. 173-282 are the nucleic acid sequences of D279-AC2 (SEQ ID NO: 2130), D279-AC3 (SEQ ID NO: 2131), D279-AD3 (SEQ ID NO: 2132) and D279-AE2 (SEQ ID NO: 2133).
Figures 173-283 show D279-AG2 (SEQ ID NO: 2134), D279-AH3 (SEQ ID NO: 2135), D280-BF6 (SEQ ID NO: 2136), D281-AB8 (SEQ ID NO: 2137) and D281-AC7 (SEQ ID NO: 2138) The nucleic acid sequence of
Figures 173-284 show D282-AG10 (SEQ ID NO: 2139), D288-AC2 (SEQ ID NO: 2140), D289-AC6 (SEQ ID NO: 2141), D290-AB8 (SEQ ID NO: 2142) and D291-AD10 (SEQ ID NO: 2143) The nucleic acid sequence of
Figure 173-285 shows D291-AE11 (SEQ ID NO: 2144), D291-AH12 (SEQ ID NO: 2145), D292-AB3 (SEQ ID NO: 2146), D292-AD3 (SEQ ID NO: 2147), D292-AE3 (SEQ ID NO: 2148) And the nucleic acid sequence of D294-AE7 (SEQ ID NO: 2149).
Figure 173-286 shows D419-AH11 (SEQ ID NO: 2150), D295-AE2 (SEQ ID NO: 2151), D295-AG2 (SEQ ID NO: 2152), D295-AH2 (SEQ ID NO: 2153), D295-AH3 (SEQ ID NO: 2154) And the nucleic acid sequence of D296-AD4 (SEQ ID NO: 2155).
Figures 173-287 show D296-AF4 (SEQ ID NO: 2156), D296-AG6 (SEQ ID NO: 2157), D297-AD7 (SEQ ID NO: 2158), D297-AG7 (SEQ ID NO: 2159) and D298-AD11 (SEQ ID NO: 2160) The nucleic acid sequence of
Figures 173-288 show D418-AH9 (SEQ ID NO: 2161), D418-AG10 (SEQ ID NO: 2162), D416-AA6 (SEQ ID NO: 2163), D414-AA2 (SEQ ID NO: 2164) and D269-AD5 (SEQ ID NO: 2165). The nucleic acid sequence of
Figures 173-289 show D268-AE1 (SEQ ID NO: 2166), D258-AF6 (SEQ ID NO: 2167), D256-AG9 (SEQ ID NO: 2168), D255-AH6 (SEQ ID NO: 2169) and D255-AE5 (SEQ ID NO: 2170) The nucleic acid sequence of
Figure 173-290 shows D419-AE11 (SEQ ID NO: 2171), D142-AA10 (SEQ ID NO: 2172), D140-AH4 (SEQ ID NO: 2173), D66-AF7 (SEQ ID NO: 2174) and D66-AA7 (SEQ ID NO: 2175) The nucleic acid sequence of
Figures 173-291 show D65-AF9 (SEQ ID NO: 2176), D65-AB3 (SEQ ID NO: 2177), D65-AB2 (SEQ ID NO: 2178), D144A-AA12 (SEQ ID NO: 2179) and D64-7 (SEQ ID NO: 2180) The nucleic acid sequence of
Figures 173-292 show D109-BF9 (SEQ ID NO: 2181), D109-BG9 (SEQ ID NO: 2182), D118-AA11 (SEQ ID NO: 2183), D142-AB11 (5 ') (SEQ ID NO: 2184) and D142-AE10 ( 5 ′) is the nucleic acid sequence of (SEQ ID NO: 2185).
Figure 173-293 shows D207-AH5 (SEQ ID NO: 2186), D231-AA1 (5 ') (SEQ ID NO: 2187), D232-AD4 (5') (SEQ ID NO: 2188), D232-AE6 (5 ') (sequence) Nos. 2189) and D288-AA3 (SEQ ID NO: 2190).
FIGS. 173-294 are the nucleic acid sequences of D289-AE6 (SEQ ID NO: 2191), D290-AC7 (SEQ ID NO: 2192), and D58-AA2 (SEQ ID NO: 2193).
詳細な説明
伝統的には、いずれかの新規の望ましい植物生殖質の開発は多数の段階を含むものであった。植物育種は、現在の生殖質の問題および弱点の分析および明確化、計画目標の確立ならびに特定の育種対象の明確化から開始される。次の段階は、計画目標に合致した形質を有する生殖質の選択である。該目標は、親生殖質からの望ましい形質の、改良された組合せを、単一の品種において組合せることである。望ましい形質には、例えば、より高い種収量、耐病性、耐虫性、干ばつおよび熱に対する耐性、ならびにより良好な農学的品質が含まれる。しかし、販売および流通の最終段階につながるこれらの過程には、最初の交配を行ってから6〜12年間を要しうる。したがって、新規品種の開発は、厳密な将来的計画、資源の効率的利用および最低限の方針変更を要する、時間のかかるプロセスである。
Detailed Description Traditionally, the development of any new desirable plant germplasm has involved multiple stages. Plant breeding begins with the analysis and clarification of current germplasm problems and weaknesses, the establishment of planning goals and the clarification of specific breeding targets. The next step is the selection of germplasm with traits that meet the planned goals. The goal is to combine improved combinations of desirable traits from the parent germplasm in a single variety. Desirable traits include, for example, higher seed yield, disease resistance, insect resistance, drought and heat resistance, and better agricultural quality. However, these processes leading to the final stage of sales and distribution can take 6-12 years after the initial mating. Thus, the development of new varieties is a time consuming process that requires strict future planning, efficient use of resources and minimal policy changes.
現代の植物育種には遺伝的形質転換による植物品種の改良が益々重要になっている。商業的な関心が持たれうる遺伝子、例えば、耐病性、耐虫性または品質改良の特定の望ましい植物形質を付与する遺伝子が、種々の遺伝子導入技術により作物種に組込まれうる。遺伝子発現を操作しうることは、形質転換植物における新規特性を得るための手段を提供する。いくつかの場合には、高い又は上昇したレベルの遺伝子発現が望ましいであろう。例えば、それ自体が耐病性、収量、香味または任意の他の商業的に望ましい植物属性を最大にするタンパク質の産生を増強することが望ましい。同様に、例えば遺伝子サイレンシングによる内因性遺伝子発現の調節は、より貴重な植物または植物製品を与えうる。 Improving plant varieties by genetic transformation is becoming increasingly important for modern plant breeding. Genes that may be of commercial interest, such as genes that confer certain desirable plant traits of disease resistance, insect resistance or quality improvement, can be incorporated into crop species by various gene transfer techniques. The ability to manipulate gene expression provides a means for obtaining novel properties in transformed plants. In some cases, high or elevated levels of gene expression may be desirable. For example, it is desirable to enhance the production of proteins that themselves maximize disease resistance, yield, flavor or any other commercially desirable plant attributes. Similarly, regulation of endogenous gene expression, for example by gene silencing, can give a more valuable plant or plant product.
タバコの熟成または乾燥(キュアリング)中に、エチレン誘導性または老化関連遺伝子であると特定された遺伝子(例えば、配列番号4、40、44、52、54、60、70、104、138、140、158、162、188、212、226、234および288の配列を有するもの)のいずれかの活性化、アップレギュレーションまたはダウンレギュレーションは、最終産物の品質特性(例えば、耐病性、耐虫性、品質の改良、香りの修飾、香味の修飾など)に影響を及ぼすテルペノイド、ポリフェノール、アルカロイドなどを含む多数の二次代謝産物の形成に関与するそれらの代謝経路に影響を及ぼしうる。本明細書中に特定されている遺伝子により同様に影響を受けるものとしては、老化過程で蓄積する乾物の率およびタイプまたは老化過程の植物内の乾物の分配に関連した代謝経路が挙げられうる。デンプン蓄積、リグニン形成、セルロース析出および糖輸送の率およびタイプにおける変化が示されうるであろう。本明細書中に特定されている遺伝子の制御は、老化速度、葉内および単一植物の葉間の老化の均一性ならびに人工的または自然手段による老化の誘導の決定に関与するそれらの代謝経路にも影響を及ぼしうる。本明細書中に特定されている遺伝子を刺激または活性化する老化誘導性物質または作用因子には、例えば、化学物質、例えば薄い過酸化物、殺虫剤、除草剤、成長調節物質、熱処理、創傷、またはガス、例えばオゾン、および二酸化炭素の濃度上昇が含まれる。 During tobacco ripening or drying (curing), genes identified as ethylene-induced or aging-related genes (eg, SEQ ID NOs: 4, 40, 44, 52, 54, 60, 70, 104, 138, 140 , 158, 162, 188, 212, 226, 234 and 288), activation, upregulation or downregulation of any of the final product quality characteristics (eg disease resistance, insect resistance, quality Can affect those metabolic pathways involved in the formation of a number of secondary metabolites, including terpenoids, polyphenols, alkaloids, and the like. Equally affected by the genes identified herein can include the rate and type of dry matter that accumulates during the aging process or metabolic pathways associated with the distribution of dry matter within the plant during the aging process. Changes in the rate and type of starch accumulation, lignin formation, cellulose precipitation and sugar transport could be shown. Control of the genes identified herein is their metabolic pathways involved in determining aging rate, uniformity of senescence within leaves and between leaves of single plants and induction of senescence by artificial or natural means Can also affect. Senescence-inducing substances or agents that stimulate or activate the genes specified herein include, for example, chemicals such as thin peroxides, insecticides, herbicides, growth regulators, heat treatments, wounds Or increased concentrations of gases such as ozone and carbon dioxide.
タバコの構成的に発現される又はエチレンもしくは老化により誘導される配列の特定
本発明においては、変換体(converter)および非変換体Nicotiana系統のNicotiana組織からRNAを抽出した。ついで、抽出されたRNAをcDNAの作製に使用した。ついで本発明の核酸配列を、2つの方法を用いて作製した。
Identification of sequences constitutively expressed in tobacco or induced by ethylene or aging In the present invention, RNA was extracted from Nicotiana tissues of converter and nonconverter Nicotiana lines. The extracted RNA was then used for cDNA preparation. The nucleic acid sequences of the present invention were then generated using two methods.
第1の方法においては、ポリA富化RNAを植物組織から抽出し、cDNAを逆転写PCRにより作製した。ついで該一本鎖cDNAを使用して、縮重プライマーおよびオリゴd(T)プライマーを用いてp450特異的PCR集団を得た。該プライマー設計は、他の植物のp450遺伝子配列の高度に保存されたモチーフに基づくものであった。特異的縮重プライマーの具体例は特許出願公開US 2004/0111759 A1、US 2004/0117869 A1およびUS 2004/0103449 A1の図1に記載されている(該特許出願公開を参照により本明細書に組み入れることとする)。適当なサイズのインサートを含有するプラスミドからの断片の配列を更に分析した。これらのインサートのサイズは、典型的には、使用するプライマーに応じて約300〜約800ヌクレオチドの範囲である。
In the first method, poly A enriched RNA was extracted from plant tissue, and cDNA was prepared by reverse transcription PCR. The single stranded cDNA was then used to obtain a p450-specific PCR population using degenerate primers and oligo d (T) primers. The primer design was based on highly conserved motifs of other plant p450 gene sequences. Specific examples of specific degenerate primers are described in FIG. 1 of patent
第2の方法においては、まず、cDNAライブラリーを構築した。該プラスミド内のcDNAを使用して、縮重プライマーおよびT7プライマーを用いてp450特異的PCR集団を得た。第1の方法の場合と同様に、適当なサイズのインサートを含有するプラスミドからの断片の配列を更に分析した。 In the second method, a cDNA library was first constructed. Using the cDNA in the plasmid, a p450-specific PCR population was obtained using degenerate primers and T7 primers. As with the first method, the sequence of the fragment from the plasmid containing the appropriate size insert was further analyzed.
高レベルのノルニコチンを産生することが知られているNicotiana植物系統(変換体(converter))および低レベルのノルニコチンを有する植物系統を出発材料として使用することが可能である。ついで葉を植物から摘出し、エチレンで処理して、本明細書で定義されているp450酵素活性を活性化することが可能である。当技術分野で公知の技術を用いて、全RNAを抽出する。ついで、図161に記載のとおりのオリゴd(T)プライマー(配列番号2260)と共にPCR(RT-PCR)を用いて、cDNA断片を作製することが可能である。ついで、本明細書中の実施例に更に詳しく記載されているとおり、cDNAライブラリーを構築することが可能である。 Nicotiana plant lines known to produce high levels of nornicotine (converters) and plant lines with low levels of nornicotine can be used as starting materials. The leaves can then be removed from the plant and treated with ethylene to activate the p450 enzyme activity as defined herein. Total RNA is extracted using techniques known in the art. Subsequently, a cDNA fragment can be prepared using PCR (RT-PCR) together with an oligo d (T) primer (SEQ ID NO: 2260) as shown in FIG. A cDNA library can then be constructed as described in more detail in the Examples herein.
p450型酵素の保存領域を縮重プライマーの鋳型として使用した。それらの具体例を図161に示す。縮重プライマーを使用して、p450特異的バンドをPCRにより増幅した。p450様酵素を示すバンドをDNA配列決定により特定した。BLAST検索、アライメントまたは適当な候補を特定するための他の手段を用いて、PCR断片を特徴づけした。 The conserved region of p450 type enzyme was used as a template for degenerate primers. Specific examples thereof are shown in FIG. A p450 specific band was amplified by PCR using degenerate primers. A band representing a p450-like enzyme was identified by DNA sequencing. PCR fragments were characterized using BLAST searches, alignments or other means to identify suitable candidates.
特定された断片からの配列情報を用いて、PCRプライマーを作製した。cDNAライブラリ−内のプラスミドプライマーと組合されたこれらのプライマーを使用して、完全長p450遺伝子をクローニングした。得られたすべての断片クローンおよびいくつかの場合には完全長クローンに関する示差的発現を調べるために、ラージスケールサザン逆分析を行った。本発明のこの態様においては、すべてのクローン化インサートをスクリーニングするために、クローン化DNA断片にハイブリダイズするプローブとして、種々の組織からの標識された全cDNAを使用して、これらのラージスケールリバースサザンアッセイを行うことが可能である。クローン化p450断片および完全長クローンを特徴づけるために、非放射性および放射性(P32)ノーザンブロットアッセイも用いた。 PCR primers were generated using sequence information from the identified fragments. These primers combined with the plasmid primers in the cDNA library were used to clone the full length p450 gene. Large scale Southern reverse analysis was performed to examine the differential expression for all fragment clones obtained and in some cases full length clones. In this aspect of the invention, these large scale reverses are used using total labeled cDNA from various tissues as probes that hybridize to the cloned DNA fragments to screen all cloned inserts. Southern assays can be performed. Non-radioactive and radioactive (P 32 ) Northern blot assays were also used to characterize cloned p450 fragments and full-length clones.
所望のレベルのp450酵素を発現する植物細胞が得られたら、当技術分野でよく知られた方法および技術を用いて該細胞から植物組織および全植物を再生させることが可能である。ついで該再生植物を通常の手段により再生させ、通常の植物育種技術を用いて該導入遺伝子を他の株および栽培品種に導入することが可能である。 Once a plant cell is obtained that expresses the desired level of p450 enzyme, plant tissue and whole plants can be regenerated from the cell using methods and techniques well known in the art. The regenerated plant can then be regenerated by conventional means and the transgene can be introduced into other strains and cultivars using conventional plant breeding techniques.
エチレン誘導性または老化関連遺伝子、例えば、配列番号4、40、44、52、54、60、70、104、138、140、158、162、188、212、226、234および288において特定されているものは、種々のタバコ製品にとって重要なタバコ葉の品質パラメーターの重要な決定因子である酵素をコードしうる。該タバコ製品には、湿性もしくは乾燥かぎタバコ、噛みタバコ、巻きタバコ製品、葉巻製品、シガリーロ、パイプタバコ、ビーディ(bidi)および同様の喫煙製品が含まれる。葉の品質パラメーターには、視覚的属性、例えば色、表面規則性、テクスチャーまたは斑入りにより示される構造的または物理的特性;葉身:中骨の比、油性度(oiliness)、巻きタバコ充填能、かさ密度、水分保持能および柔軟性;香味、芳香、発酵能、枯上がり(burn)速度、枯上がり(burn)温度、人工香味剤の吸収および放出に関連した化学的または生化学的形質;ならびにタールまたは粒状物、アルカロイドおよび他の属性を含むタバコ成分の生成が含まれうる。これらのエチレン誘導性または老化関連遺伝子から生じる酵素反応は、タバコ葉の収量および品質に影響を及ぼす病原体または昆虫相互作用に影響を及ぼす二次代謝産物をも産生しうる。例えば、Wagnerら(Nature Biotechnology, 19:371-374, 2001)は、p450ヒドロキシラーゼ遺伝子の抑制が、アブラムシ耐性に影響を及ぼす二次代謝産物であるセムブラチエン-オール(cembratiene-ol)の蓄積を著しく増強することを示した。 Identified in ethylene-inducible or senescence-related genes such as SEQ ID NOs: 4, 40, 44, 52, 54, 60, 70, 104, 138, 140, 158, 162, 188, 212, 226, 234 and 288 One can encode an enzyme that is an important determinant of tobacco leaf quality parameters important to various tobacco products. Such tobacco products include wet or dry hookah, chewing tobacco, cigarette products, cigar products, cigarillos, pipe tobacco, bidi and similar smoking products. Leaf quality parameters include structural or physical properties indicated by visual attributes such as color, surface regularity, texture or variegation; leaf blade: medium ratio, oiliness, cigarette filling ability, Bulk density, moisture retention and flexibility; flavor, aroma, fermentability, burn rate, burn temperature, chemical or biochemical traits related to absorption and release of artificial flavors; and Production of tobacco components including tar or particulates, alkaloids and other attributes can be included. Enzymatic reactions arising from these ethylene-induced or senescence-related genes can also produce secondary metabolites that affect pathogens or insect interactions that affect tobacco leaf yield and quality. For example, Wagner et al. (Nature Biotechnology, 19: 371-374, 2001) show that repression of the p450 hydroxylase gene significantly increases the accumulation of cembratiene-ol, a secondary metabolite that affects aphid resistance. It was shown to enhance.
抗体の生成
ペプチドのアミノ酸配列を誘導し、他のクローンとの対比において特有であり抗原性であるペプチド領域を選択することにより、ペプチド特異的抗体を製造した。担体タンパク質に結合した合成ペプチドに対して、ウサギ抗体を産生させた。これらの抗体を使用して、植物組織に関してウエスタンブロット分析または他の免疫学的方法を行った。また、ペプチドのアミノ酸配列を誘導し、他のクローンとの対比において特有であり潜在的に抗原性であるペプチド領域を選択することにより、いくつかの完全長クローンに関して、ペプチド特異的抗体を製造した。担体タンパク質に結合した合成ペプチドに対して、ウサギ抗体を産生させた。これらの抗体を使用して、ウエスタンブロット分析を行った。
Peptide-specific antibodies were produced by deriving the amino acid sequence of the antibody-generated peptide and selecting peptide regions that are unique and antigenic in comparison to other clones. Rabbit antibodies were raised against the synthetic peptide bound to the carrier protein. These antibodies were used for Western blot analysis or other immunological methods on plant tissues. Peptide-specific antibodies were also produced for some full-length clones by deriving the amino acid sequence of the peptides and selecting peptide regions that were unique and potentially antigenic in contrast to other clones. . Rabbit antibodies were raised against the synthetic peptide bound to the carrier protein. Western blot analysis was performed using these antibodies.
遺伝子発現のダウンレギュレーションおよび酵素活性の改変
ポリペプチドの発現の低下を伴う植物を、標準的な遺伝子サイレンシング法(総説としては、Arndt and Rank, Genome 40:785-797, 1997; TurnerおよびSchuch, Journal of Chemical Technology and Biotechnology 75:869-882, 2000; ならびにKlinkおよびWolniak, Journal of Plant Growth Regulation 19(4):371-384, 2000を参照されたい)により作製した。特に、タバコニコチンデメチラーゼ核酸配列(例えば、配列番号4、5、7、8および9、またはそれらの断片、例えば配列番号1および62の配列)および実質的に同一な核酸配列(例えば、配列番号188の配列)を使用して、任意のNicotiana種におけるタバコ表現型またはタバコ代謝産物、例えばノルニコチンを改変することが可能である。タバコニコチンデメチラーゼ遺伝子の発現の低下は、例えばRNA干渉(RNAi)(Smithら, Nature 407:319-320, 2000; Fireら, Nature 391:306-311, 1998; Waterhouseら, PNAS 95:13959-13964, 1998; Stalbergら, Plant Molecular Biology 23:671-683, 1993; Brignettiら, EMBO J. 17:6739-6746, 1998; Allenら, Nature Biotechnology 22: 1559-1566, 2004);ウイルス誘導性遺伝子サイレンシング(「VIGS」)(Baulcombe, Current Opinions in Plant Biology, 2:109-113, 1999; Cogoni and Macino, Genes Dev 10: 638-643, 2000; Ngelbrechtら, PNAS 91:10502-10506, 1994);センス配向で植物内因性遺伝子を導入することによる標的遺伝子のサイレンシング(Jorgensenら, Plant Mol Biol 31: 957-973, 1996);アンチセンス遺伝子の発現;相同組換え(Ohlら, Homologous Recombination and Gene Silencing in Plants. Kluwer, Dordrecht, The Netherlands, 1994);Cre /lox(Qinら, PNAS 91: 1706-1710, 1994; Koshinskyら, The Plant Journal 23: 715-722, 2000; Chouら, Plant and Animal Genome VII Conference Abstracts. San Diego, CA, 17-21 January, 1999);遺伝子トラップおよびT-DNAタギング(Burnsら, Genes Dev. 8: 1087-1105, 1994; Spradlingら, PNAS 92:10824-10830, 1995; Skarnesら, Bio/Technology 8, 827-831, 1990; Sundaresanら, Genes Dev. 9: 1797-1810, 1995);ならびにタバコポリペプチドの発現のダウンレギュレーションまたはその酵素活性の低下を引き起こす、科学分野において利用可能なその他の可能な遺伝子サイレンシング系のいずれかを用いて達成されうる。本明細書中で更に詳しく説明するとおり、本明細書中に記載の核酸配列のいずれかは、本明細書に記載の技術および当技術分野において見出される他の技術を用いてダウンレギュレーションまたはアップレギュレーションされうる。典型的な方法を以下に更に詳しく説明する。
Plants with downregulation of gene expression and decreased expression of modified polypeptides of enzyme activity can be transformed into standard gene silencing methods (for review, see Arndt and Rank, Genome 40: 785-797, 1997; Turner and Schuch, Journal of Chemical Technology and Biotechnology 75: 869-882, 2000; and Klink and Wolniak, Journal of Plant Growth Regulation 19 (4): 371-384, 2000). In particular, tobacco nicotine demethylase nucleic acid sequences (eg, SEQ ID NOs: 4, 5, 7, 8 and 9, or fragments thereof, eg, sequences of SEQ ID NOs: 1 and 62) and substantially identical nucleic acid sequences (eg, SEQ ID NO: 188 sequences) can be used to modify tobacco phenotypes or tobacco metabolites, such as nornicotine, in any Nicotiana species. Decreased expression of the tobacco nicotine demethylase gene is e.g. RNA interference (RNAi) (Smith et al., Nature 407: 319-320, 2000; Fire et al., Nature 391: 306-311, 1998; Waterhouse et al., PNAS 95: 13959- 13964, 1998; Stalberg et al., Plant Molecular Biology 23: 671-683, 1993; Brignetti et al., EMBO J. 17: 6739-6746, 1998; Allen et al., Nature Biotechnology 22: 1559-1566, 2004); virus-inducible genes Silencing ("VIGS") (Baulcombe, Current Opinions in Plant Biology, 2: 109-113, 1999; Cogoni and Macino, Genes Dev 10: 638-643, 2000; Ngelbrecht et al., PNAS 91: 10502-10506, 1994) Silencing target genes by introducing plant endogenous genes in sense orientation (Jorgensen et al., Plant Mol Biol 31: 957-973, 1996); antisense gene expression; homologous recombination (Ohl et al., Homologous Recombination and Gene Silencing in Plants. Kluwer, Dordrecht, The Netherlands, 1994); Cre / lox (Qin et al., PNAS 91: 1706-1710, 1994; Koshinsky et al., The Plant Journ al 23: 715-722, 2000; Chou et al., Plant and Animal Genome VII Conference Abstracts. San Diego, CA, 17-21 January, 1999); gene trapping and T-DNA tagging (Burns et al., Genes Dev. 8: 1087) -1105, 1994; Spradling et al., PNAS 92: 10824-10830, 1995; Skarnes et al., Bio /
RNA干渉
RNA干渉(「RNAi」)は、植物などの多数の生物における強力かつ特異的な翻訳後遺伝子サイレンシングを誘導するために一般に適用可能な方法である(例えば、Bosherら, Nat. Cell Biol. 2:E31-36, 2000; およびTavernarakisら, Nat. Genetics 24:180-183, 2000を参照されたい)。RNAiは、細胞内または細胞外環境内への、部分的または完全な二本鎖特性を伴うRNAの導入を含む。抑制性RNAを産生するよう標的遺伝子(例えば、タバコニコチンデメチラーゼ)の部分からのヌクレオチド配列が選択される点で、抑制は特異的である。選択された部分は一般には標的遺伝子のエキソンを含むが、選択された部分は非翻訳領域(UTR)およびイントロン(例えば、配列番号7の配列、または所望の植物遺伝子からの核酸配列、例えば、図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列)をも含みうる。
RNA interference
RNA interference (“RNAi”) is a generally applicable method for inducing strong and specific post-translational gene silencing in many organisms such as plants (eg, Bosher et al., Nat. Cell Biol. 2). : E31-36, 2000; and Tavernarakis et al., Nat. Genetics 24: 180-183, 2000). RNAi involves the introduction of RNA with partial or complete double-stranded properties into the intracellular or extracellular environment. Inhibition is specific in that the nucleotide sequence from the portion of the target gene (eg, tobacco nicotine demethylase) is selected to produce inhibitory RNA. The selected portion generally comprises an exon of the target gene, but the selected portion includes untranslated regions (UTRs) and introns (eg, the sequence of SEQ ID NO: 7, or nucleic acid sequences from the desired plant gene, 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to 173-294).
例えば、二本鎖形成能を有するRNAを産生する形質転換ベクターを構築するためには、2つの核酸配列(一方はセンス配向、もう一方はアンチセンス配向)を、機能しうる形で連結し、強力なウイルスプロモーター、例えばCaMV 35Sまたはキャッサバ・ブラウン・ストリーク・ウイルス(cassava brown streak virus)(CBSV)から単離されたプロモーターの制御下に配置することが可能である。しかし、内因性プロモーター、例えば配列番号8の配列を有するニコチンデメチラーゼプロモーター、または転写を駆動するその断片の使用も望ましいであろう。そのような構築物中に含まれるタバコニコチンデメチラーゼ核酸配列の長さは、望ましくは、少なくとも25ヌクレオチドであるが、完全長までのタバコニコチンデメチラーゼを含む配列を含みうる。 For example, to construct a transformation vector that produces RNA with the ability to form double strands, two nucleic acid sequences (one in sense orientation and the other in antisense orientation) are operably linked, It can be placed under the control of a strong viral promoter, such as a promoter isolated from CaMV 35S or cassava brown streak virus (CBSV). However, it may also be desirable to use an endogenous promoter, such as the nicotine demethylase promoter having the sequence of SEQ ID NO: 8, or a fragment thereof that drives transcription. The length of the tobacco nicotine demethylase nucleic acid sequence included in such a construct is desirably at least 25 nucleotides, but may include sequences comprising tobacco nicotine demethylase up to full length.
二本鎖形成能を有するRNAを産生する構築物は、アグロバクテリウムに媒介される形質転換(Chuangら, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97:4985-4990, 2000)により、植物(例えば、タバコ植物)のゲノム内に導入されて、タバコニコチンデメチラーゼにおける特異的かつ遺伝可能な遺伝的干渉を引き起こしうる。該二本鎖RNAは細胞の中へ(すなわち、細胞内に)直接的に導入されることも可能であり、あるいは細胞外において、例えば、該二本鎖RNAを含有する溶液に種子、実生または植物を浸けることにより導入されうる。 Constructs producing RNA with double-strand-forming ability can be obtained from plants (eg, by Agrobacterium-mediated transformation (Chuang et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97: 4985-4990, 2000). Can be introduced into the genome of a tobacco plant) to cause specific and inheritable genetic interference in tobacco nicotine demethylase. The double-stranded RNA can be introduced directly into the cell (ie, into the cell), or outside the cell, eg, in a solution containing the double-stranded RNA, seeds, seedlings or It can be introduced by soaking the plants.
運搬された二本鎖RNA物質の量に応じて、RNAiは、標的遺伝子に関する機能の部分的または完全な喪失をもたらしうる。標的細胞の少なくとも99%における遺伝子発現の低下または喪失が得られうる。一般には、より低い量の注入物質、およびdsRNAの投与後の、より長い時間が、細胞の、より小さな割合における抑制を引き起こす。 Depending on the amount of double-stranded RNA material delivered, RNAi can result in partial or complete loss of function for the target gene. A reduction or loss of gene expression in at least 99% of the target cells can be obtained. In general, lower amounts of infused material and longer times after administration of dsRNA cause inhibition of a smaller percentage of cells.
RNAiにおいて使用するRNAは重合リボヌクレオチドの1以上の鎖を含むことが可能であり、それは、リン酸-糖バックボーンまたはヌクレオシドに対する修飾を含みうる。該二本鎖構造は、単一の自己相補的RNA鎖により又は2つの相補的RNA鎖により形成されることが可能であり、RNA二本鎖形成は細胞の内部または外部で開始されうる。該RNAは、少なくとも1コピー/細胞の運搬を可能にする量で導入されうる。しかし、より多い量(例えば、少なくとも5、10、100、500または1000コピー/細胞)の二本鎖物質は、より効率的な抑制をもたらしうる。該RNAの二本鎖領域に対応するヌクレオチド配列が遺伝的抑制のために標的化される点で、抑制は配列特異的である。抑制のためには、標的遺伝子の部分と同一のヌクレオチド配列を含有するRNAが好ましい。標的配列と比較した場合に挿入、欠失および単点変異を有するRNA配列も抑制に有効でありうる。例えば、配列同一性は、当技術分野で公知のアライメントアルゴリズムおよび該ヌクレオチド配列間の差(%)の算出により最適化されうる。あるいは、該RNAの二本鎖領域は、標的遺伝子転写産物の一部にハイブリダイズしうるヌクレオチド配列として機能的に定められうる。 The RNA used in RNAi can include one or more strands of polymerized ribonucleotides, which can include modifications to the phosphate-sugar backbone or nucleoside. The double-stranded structure can be formed by a single self-complementary RNA strand or by two complementary RNA strands, and RNA duplex formation can be initiated inside or outside the cell. The RNA can be introduced in an amount that allows delivery of at least 1 copy / cell. However, higher amounts (eg, at least 5, 10, 100, 500 or 1000 copies / cell) of double-stranded material can result in more efficient suppression. Suppression is sequence specific in that the nucleotide sequence corresponding to the double stranded region of the RNA is targeted for genetic suppression. For suppression, RNA containing the same nucleotide sequence as the target gene portion is preferred. RNA sequences with insertions, deletions and single point mutations when compared to the target sequence may also be effective for suppression. For example, sequence identity can be optimized by alignment algorithms known in the art and calculating the percent difference between the nucleotide sequences. Alternatively, the double-stranded region of the RNA can be functionally defined as a nucleotide sequence that can hybridize to a portion of the target gene transcript.
また、RNAiに使用されるRNAはin vivoまたはin vitroで合成されうる。例えば、該細胞内の内因性RNAポリメラーゼはin vivoでの転写をもたらすことが可能であり、あるいはクローン化RNAポリメラーゼはin vivoまたはin vitroでの転写に使用されうる。in vivoでのトランスジーンまたは発現構築物からの転写のためには、RNA鎖を転写させるために調節領域が使用されうる。 Moreover, RNA used for RNAi can be synthesized in vivo or in vitro. For example, endogenous RNA polymerase in the cell can provide transcription in vivo, or cloned RNA polymerase can be used for transcription in vivo or in vitro. For transcription from a transgene or expression construct in vivo, a regulatory region can be used to transcribe the RNA strand.
三本鎖干渉
タバコ遺伝子の調節領域(例えば、プロモーターまたはエンハンサー領域)に相補的なデオキシリボヌクレオチド配列を標的化して、標的細胞内での該タバコ遺伝子の転写を妨げる三重らせん構造を形成させることによっても、内因性タバコニコチンデメチラーゼ遺伝子発現、または所望の植物遺伝子からの核酸断片(例えば、図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列)の発現がダウンレギュレーションされうる(全般的には、Helene, Anticancer Drug Des. 6:569-584, 1991; Heleneら, Ann. N.Y. Acad. Sci. 660:27-36, 1992; およびMaher, Bioassays 14:807-815, 1992)。
Triple stranded interference Also by targeting a deoxyribonucleotide sequence complementary to a regulatory region (eg, promoter or enhancer region) of a tobacco gene to form a triple helix structure that prevents transcription of the tobacco gene in the target cell. , Endogenous tobacco nicotine demethylase gene expression, or nucleic acid fragments from the desired plant gene (eg, FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to 173 -294 (any nucleic acid sequence shown) can be downregulated (generally Helene, Anticancer Drug Des. 6: 569-584, 1991; Helene et al., Ann. NY Acad. Sci. 660: 27- 36, 1992; and Maher, Bioassays 14: 807-815, 1992).
転写の抑制のための三重らせんの形成において使用される核酸分子は、好ましくは、一本鎖であり、デオキシリボヌクレオチドから構成される。これらのオリゴヌクレオチドの塩基組成は、一般には相当な大きさのプリンまたはピリミジン伸長が二重らせんの一方の鎖上に存在することを要するフーグスティーン型塩基対形成則による三重らせん形成の促進をもたらすはずである。ヌクレオチド配列はピリミジンに基づくものでありうる。これは、生じる三重らせんの3本の会合鎖を横切るTATおよびCGCトリプレットを与えるであろう。ピリミジンに富む(ピリミジンリッチ)分子は、二重らせんの一本鎖のプリンリッチ領域に対する塩基相補性を、その鎖に対して平行配向で与える。また、プリンリッチ(例えば、G残基の伸長を含有する)核酸分子が選択されうる。これらの分子は、GC対に富むDNA二重らせんと共に三重らせんを形成し、この場合、該プリン残基の大多数は標的二重らせんの一本鎖上に位置して、三重らせん内の三本鎖を横切るCGCトリプレットを与える。 The nucleic acid molecule used in the formation of a triple helix for transcriptional repression is preferably single-stranded and composed of deoxyribonucleotides. The base composition of these oligonucleotides generally promotes triple helix formation by Hoogsteen-type base-pairing rules, which require that a substantial amount of purine or pyrimidine extension be present on one strand of the double helix. Should bring. The nucleotide sequence can be based on pyrimidines. This will give TAT and CGC triplets across the three associated strands of the resulting triple helix. A pyrimidine-rich (pyrimidine-rich) molecule provides base complementarity to a single-stranded purine-rich region of a double helix in a parallel orientation to that strand. Also, purine-rich (eg, containing G residue extensions) nucleic acid molecules can be selected. These molecules form a triple helix with the GC pair-rich DNA double helix, in which the majority of the purine residues are located on one strand of the target double helix and the triple helix in the triple helix. Gives a CGC triplet across the chain.
あるいは、三重らせん形成のために標的化されうる潜在的配列を、「スイッチバック(switchback)」核酸分子を生成させることにより増加させることが可能である。スイッチバック分子は、交互の5'-3'、3'-5'様態で合成される。これにより、それらは、二重らせんの最初の1つの鎖と塩基対形成し、ついで他方と塩基対形成して、二重らせんの一方の鎖上の相当な大きさのプリンまたはピリミジン伸長の存在の必要性を排除する。 Alternatively, the potential sequences that can be targeted for triple helix formation can be increased by generating “switchback” nucleic acid molecules. Switchback molecules are synthesized in an alternating 5′-3 ′, 3′-5 ′ manner. This allows them to base pair with the first strand of the double helix, then base pair with the other, and the presence of a substantial size purine or pyrimidine extension on one strand of the double helix. Eliminate the need for
リボザイム
リボザイムは、酵素として作用するRNA分子であり、他のRNA分子を切断するよう設計されうる。リボザイムは、実質的に任意の標的RNAと特異的に対形成しホスホジエステルバックボーンを特定の位置で切断して標的RNAを機能的に不活性化するよう設計されうる。この過程においてはリボザイム自体は消費されず、複数のコピーのmRNA標的分子を切断するよう触媒的に作用しうる。したがって、リボザイムは、タバコニコチンデメチラーゼの発現をダウンレギュレーションするための手段としても使用されうる。標的RNA特異的リボザイムの設計および使用はHaseloffら(Nature 334:585-591, 1988)に記載されている。好ましくは、リボザイムは、該リボザイムの活性部位の両側に、標的配列(例えば、タバコニコチンデメチラーゼ、または所望の植物遺伝子からの核酸断片、例えば、図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列)に相補的な少なくとも20個の連続的ヌクレオチドを含む。
Ribozymes Ribozymes are RNA molecules that act as enzymes and can be designed to cleave other RNA molecules. Ribozymes can be designed to specifically pair with virtually any target RNA and cleave the phosphodiester backbone at specific positions to functionally inactivate the target RNA. In this process, the ribozyme itself is not consumed and can act catalytically to cleave multiple copies of the mRNA target molecule. Thus, ribozymes can also be used as a means to down regulate the expression of tobacco nicotine demethylase. The design and use of target RNA specific ribozymes is described in Haseloff et al. (Nature 334: 585-591, 1988). Preferably, the ribozyme is flanked on both sides of the ribozyme active site by a target sequence (eg, tobacco nicotine demethylase, or a nucleic acid fragment from the desired plant gene, eg, FIG. 1, 3-7, 10-158, 162- 170, 172-1 to 172-19 and any nucleic acid sequence shown in 173-1 to 173-294).
また、RNA切断活性をアンチセンスRNAに付与して該アンチセンス構築物の有効性を増強するために、リボザイム配列をアンチセンスRNA内に含有させることも可能である。 In addition, ribozyme sequences can be included in the antisense RNA in order to confer RNA cleavage activity to the antisense RNA and enhance the effectiveness of the antisense construct.
相同組換え
遺伝子置換技術は、与えられた遺伝子の発現をダウンレギュレーションするためのもう1つの望ましい方法である。遺伝子置換技術は相同組換えに基づくものである(Schnableら, Curr. Opinions Plant Biol. 1:123-129, 1998)。関心のある酵素(例えば、タバコニコチンデメチラーゼ、または図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列によりコードされるポリペプチド)の核酸配列を、酵素機能を低下させるために変異誘発(例えば、挿入、欠失、重複または置換)により操作することが可能である。ついで、改変された配列をゲノム内に導入して、相同組換えにより既存遺伝子(例えば、野生型遺伝子)を該配列で置換することが可能である(Puchtaら, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93:5055-5060, 1996; およびKempinら, Nature 389: 802-803, 1997)。あるいは、内因性タバコニコチンデメチラーゼ遺伝子は、デメチラーゼ活性を有さない遺伝子(例えば、配列番号188の配列)で置換されうる。
Homologous recombination Gene replacement technology is another desirable method for down-regulating expression of a given gene. Gene replacement technology is based on homologous recombination (Schnable et al., Curr. Opinions Plant Biol. 1: 123-129, 1998). Depending on the enzyme of interest (eg tobacco nicotine demethylase or any nucleic acid sequence shown in FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to 173-294 The nucleic acid sequence of the encoded polypeptide) can be manipulated by mutagenesis (eg, insertion, deletion, duplication or substitution) to reduce enzyme function. The modified sequence can then be introduced into the genome and the existing gene (eg, wild type gene) can be replaced with the sequence by homologous recombination (Puchta et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93: 5055-5060, 1996; and Kempin et al., Nature 389: 802-803, 1997). Alternatively, the endogenous tobacco nicotine demethylase gene can be replaced with a gene that does not have demethylase activity (eg, the sequence of SEQ ID NO: 188).
共抑制
遺伝子発現のサイレンシングのためのもう1つの望ましい方法は共抑制(co-suppression)(センス抑制とも称される)である。この技術は、センス配向で配置された核酸(例えば、所望の植物遺伝子からの核酸断片、例えば、図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列)の導入を含むものであり、標的遺伝子の転写を有効に阻止することが示されている(例えば、Napoliら, Plant Cell, 2:279-289, 1990およびJorgensenら, 米国特許第5,034,323号を参照されたい)。
Co-suppression Another desirable method for silencing gene expression is co-suppression (also called sense suppression). This technique involves nucleic acids arranged in a sense orientation (eg, nucleic acid fragments from a desired plant gene, eg, FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173- Any nucleic acid sequence shown in 1-173-294) and has been shown to effectively block transcription of target genes (eg, Napoli et al., Plant Cell, 2: 279-289, 1990 and Jorgensen et al., US Pat. No. 5,034,323).
一般には、センス抑制は、導入された配列の転写を含む。しかし、導入された配列がコード配列自体を含有しないが、イントロンもしくは非翻訳配列または他のそのような配列が、抑制すべき内因性遺伝子の一次転写産物中に存在する配列と実質的に同一である場合にも、共抑制が生じうる。導入される配列は、一般には、抑制のために標的化される内因性遺伝子と実質的に同一である。そのような同一性は典型的には約50%より大きいが、より高い同一性(例えば、80%または更には95%)が好ましい。なぜなら、それらはより有効な抑制を引き起こすからである。共抑制の効果は、相同性または実質的な相同性を示す類似遺伝子ファミリー内の他のタンパク質に対して適用されうる。1つの植物からの遺伝子からのセグメントは、例えば異なる植物種における相同遺伝子の発現を抑制するために直接的に使用されうる。 In general, sense suppression involves transcription of the introduced sequence. However, the introduced sequence does not contain the coding sequence itself, but the intron or untranslated sequence or other such sequence is substantially identical to the sequence present in the primary transcript of the endogenous gene to be repressed. In some cases, co-suppression can occur. The introduced sequence is generally substantially identical to the endogenous gene targeted for repression. Such identity is typically greater than about 50%, although higher identity (eg, 80% or even 95%) is preferred. Because they cause more effective suppression. The effect of co-suppression can be applied to other proteins within similar gene families that exhibit homology or substantial homology. Segments from genes from one plant can be used directly, for example, to suppress the expression of homologous genes in different plant species.
センス抑制においては、導入配列は、絶対的というほどの同一性は要求されず、一次転写産物または完全にプロセシングされたmRNAとの対比において完全長である必要はない。完全長より短い配列における、より高い配列同一性は、より低い同一性の、より長い配列を補償する。さらに、導入される配列は、同じイントロンまたはエキソンパターンを有する必要はなく、非コードセグメントの同一性は同様に有効でありうる。少なくとも50塩基対の配列が好ましく、より長い導入配列が好ましい(例えば、Jorgensenら, 米国特許第5,034,323号に記載されている方法を参照されたい)。 In sense suppression, the introduced sequence does not require absolute identity and need not be full length in comparison to the primary transcript or fully processed mRNA. Higher sequence identity in sequences shorter than full length compensates for longer sequences of lower identity. Furthermore, the introduced sequence need not have the same intron or exon pattern, and the identity of the non-coding segment can be equally effective. A sequence of at least 50 base pairs is preferred, with longer introduced sequences being preferred (see, eg, the method described in Jorgensen et al., US Pat. No. 5,034,323).
アンチセンス抑制
アンチセンス技術においては、所望の植物遺伝子からの核酸セグメント(例えば、図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列)をクローニングし、発現制御領域に機能しうる形で連結して、RNAのアンチセンス鎖が合成されるようにする。ついで該構築物を植物内に形質転換し、RNAのアンチセンス鎖を産生させる。植物細胞においては、アンチセンスRNAは遺伝子発現を抑制することが示されている。
Antisense suppression In antisense technology, nucleic acid segments from a desired plant gene (eg, FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to 173-294). Are cloned and operably linked to the expression control region so that the antisense strand of RNA is synthesized. The construct is then transformed into plants to produce the antisense strand of RNA. In plant cells, antisense RNA has been shown to suppress gene expression.
アンチセンス抑制において導入すべき核酸セグメントは、一般には、抑制すべき内因性遺伝子の少なくとも一部と実質的に同一であるが、同一である必要はない。本明細書に開示されているタバコニコチンデメチラーゼの核酸配列は、標的遺伝子に対して相同性または実質的な相同性を示す遺伝子ファミリー内の他のタンパク質に対して該抑制効果が適用されるように設計されたベクター内に含まれうる。1つの植物からの遺伝子からのセグメントは、例えば異なるタバコ品種における相同遺伝子の発現を抑制するために直接的に使用されうる。 The nucleic acid segment to be introduced in antisense suppression is generally substantially the same as at least a portion of the endogenous gene to be suppressed, but need not be the same. The nucleic acid sequence of tobacco nicotine demethylase disclosed herein is such that the inhibitory effect applies to other proteins in the gene family that show homology or substantial homology to the target gene. It can be contained in a vector designed in the above. Segments from genes from one plant can be used directly to suppress the expression of homologous genes, for example in different tobacco varieties.
導入される配列は、一次転写産物または完全にプロセシングされたmRNAとの対比において完全長である必要はない。一般には、より短い配列の使用を補償するために、より高い相同性が用いられうる。さらに、導入される配列は、同じイントロンまたはエキソンパターンを有する必要はなく、非コードセグメントの相同性は同様に有効であろう。一般には、そのようなアンチセンス配列は、通常、少なくとも15塩基対、好ましくは約15〜200塩基対、より好ましくは200〜2,000塩基対またはそれ以上の長さであろう。該アンチセンス配列は、抑制すべき遺伝子の全部または一部に対して相補的でありうる。当業者に理解されるとおり、アンチセンス配列が結合する個々の部位およびアンチセンス配列の長さは、所望の抑制の度合およびアンチセンス配列の特有性によって異なるであろう。植物の負調節性アンチセンスヌクレオチド配列を発現する転写構築物は、転写の方向に、プロモーター、センス鎖上でアンチセンスRNAをコードする配列、および転写終結領域を含む。アンチセンス配列は、例えばvan der Krolら (Gene 72: 45-50, 1988); Rodermelら (Cell 55: 673-681, 1988); Molら (FEBS Lett. 268: 427-430, 1990); WeigelおよびNilsson (Nature 377: 495-500, 1995); Cheungら, (Cell 82: 383-393, 1995); ならびにShewmakerら (米国特許第5,107,065号)に記載されているとおりに構築し発現させることが可能である。 The introduced sequence need not be full length relative to the primary transcript or fully processed mRNA. In general, higher homology can be used to compensate for the use of shorter sequences. Furthermore, the introduced sequence need not have the same intron or exon pattern, and homology of non-coding segments will be equally effective. In general, such antisense sequences will usually be at least 15 base pairs in length, preferably about 15-200 base pairs, more preferably 200-2,000 base pairs or longer. The antisense sequence can be complementary to all or part of the gene to be repressed. As will be appreciated by those skilled in the art, the individual sites to which the antisense sequence binds and the length of the antisense sequence will vary depending on the degree of suppression desired and the uniqueness of the antisense sequence. Transcription constructs that express plant negative regulatory antisense nucleotide sequences include, in the direction of transcription, a promoter, a sequence encoding antisense RNA on the sense strand, and a transcription termination region. Antisense sequences are described, for example, by van der Krol et al. (Gene 72: 45-50, 1988); Rodermel et al. (Cell 55: 673-681, 1988); Mol et al. (FEBS Lett. 268: 427-430, 1990); Weigel And Nilsson (Nature 377: 495-500, 1995); Cheung et al. (Cell 82: 383-393, 1995); and Shewmaker et al. (U.S. Pat.No. 5,107,065) can be constructed and expressed. Is possible.
ドミナントネガティブ体
タバコ遺伝子産物のドミナントネガティブ遺伝子産物をコードするトランスジーンを発現するトランスジェニック植物は、該トランスジーンが該トランスジェニック植物におけるタバコ遺伝子産物をダウンレギュレーションすることを示すために、人工的環境において又は圃場においてアッセイされうる。ドミナントネガティブトランスジーンは当技術分野で公知の方法に従い構築される。典型的には、ドミナントネガティブ遺伝子は、過剰発現されると野生型酵素の活性を損なうタバコ遺伝子産物の変異負調節性ポリペプチドをコードする。
Dominant negative body A transgenic plant expressing a transgene encoding a dominant negative gene product of a tobacco gene product is used in an artificial environment to show that the transgene down-regulates the tobacco gene product in the transgenic plant. Or it can be assayed in the field. The dominant negative transgene is constructed according to methods known in the art. Typically, a dominant negative gene encodes a mutant negative regulatory polypeptide of a tobacco gene product that, when overexpressed, impairs the activity of the wild type enzyme.
変異体
タバコ遺伝子産物の発現または酵素活性の低下を伴う植物は、標準的な変異法を用いることによっても作製されうる。そのような変異誘発法には、限定的なものではないが、エチルメチルスルファートでの種子の処理(HilderingおよびVerkerk, In, The use of induced mutations in plant breeding. Pergamon press, pp 317-320, 1965)またはUV照射、X線および高速中性子照射(例えば、Verkerk, Neth. J. Agric. Sci. 19:197-203, 1971; およびPoehlman, Breeding Field Crops, Van Nostrand Reinhold, New York (3.sup.rd ed), 1987を参照されたい)、トランスポゾンの使用(Fedoroffら, 1984; 米国特許第4,732,856および米国特許第5,013,658号)ならびにT-DNA挿入法(Hoekemaら, 1983; 米国特許第5,149,645号)が含まれる。タバコ遺伝子内に存在しうる変異のタイプには、例えば点変異、欠失、挿入、重複および逆位が含まれる。そのような変異は、望ましくは、タバコ遺伝子のコード領域内に存在するが、タバコ遺伝子のプロモーター領域およびイントロンまたは非翻訳領域内の変異も望ましいであろう。
Variants Plants with reduced tobacco gene product expression or reduced enzyme activity can also be generated using standard mutation methods. Such mutagenesis methods include, but are not limited to, treatment of seeds with ethyl methyl sulfate (Hildering and Verkerk, In, The use of induced mutations in plant breeding. Pergamon press, pp 317-320, 1965) or UV irradiation, X-ray and fast neutron irradiation (eg Verkerk, Neth. J. Agric. Sci. 19: 197-203, 1971; and Poehlman, Breeding Field Crops, Van Nostrand Reinhold, New York (3.sup rd), 1987), the use of transposons (Fedoroff et al., 1984; US Pat. No. 4,732,856 and US Pat. No. 5,013,658) and the T-DNA insertion method (Hoekema et al., 1983; US Pat. No. 5,149,645). Is included. Types of mutations that can be present in tobacco genes include, for example, point mutations, deletions, insertions, duplications and inversions. Such mutations are desirably present in the coding region of the tobacco gene, although mutations in the promoter region and intron or untranslated region of the tobacco gene may also be desirable.
例えば、T-DNA挿入変異誘発は、遺伝子の発現をダウンレギュレーションする、タバコ遺伝子内の挿入変異を作製するために用いられうる。理論的には、任意の与えられた遺伝子における挿入を95%の確率で得るためには、約100,000個の独立したT-DNA挿入が必要である(McKinnet, Plant J. 8: 613-622, 1995; およびForsthoefelら, Aust. J. Plant Physiol. 19:353-366, 1992)。植物のT-DNAタグ付き系統は、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)分析を用いてスクリーニングされうる。例えば、1つのプライマーをT-DNAの一方の末端に対して設計し、もう1つのプライマーを、目的の遺伝子に対して設計することが可能であり、両方のプライマーを該PCR分析に使用することが可能である。PCR産物が全く得られない場合には、関心のある遺伝子内に挿入は存在しない。これに対して、PCR産物が得らた場合には、関心のある遺伝子内に挿入が存在する。 For example, T-DNA insertion mutagenesis can be used to create insertion mutations in tobacco genes that down-regulate gene expression. Theoretically, approximately 100,000 independent T-DNA insertions are required to obtain 95% probability of insertion in any given gene (McKinnet, Plant J. 8: 613-622, 1995; and Forsthoefel et al., Aust. J. Plant Physiol. 19: 353-366, 1992). Plant T-DNA tagged lines can be screened using polymerase chain reaction (PCR) analysis. For example, one primer can be designed for one end of T-DNA and the other primer can be designed for the gene of interest, both primers used for the PCR analysis Is possible. If no PCR product is obtained, there is no insertion in the gene of interest. In contrast, when a PCR product is obtained, there is an insertion in the gene of interest.
変異タバコ遺伝子産物の発現は、標準的な方法(例えば、本明細書に記載されている方法)により評価することが可能であり、所望により、該非変異酵素の発現と比較することが可能である。非変異植物と比較した場合、タバコ遺伝子産物をコードする遺伝子の発現の低下を伴う変異植物は、本発明の望ましい実施形態である。本明細書に記載の任意の核酸配列内に変異を有する植物は、本明細書に記載の育種計画において使用されうる。 The expression of the mutant tobacco gene product can be assessed by standard methods (eg, the methods described herein) and, if desired, can be compared to the expression of the non-mutant enzyme. . Mutant plants with reduced expression of genes encoding tobacco gene products when compared to non-mutant plants are desirable embodiments of the present invention. Plants having mutations within any of the nucleic acid sequences described herein can be used in the breeding schemes described herein.
構成的またはエチレンもしくは老化誘導性配列の過剰発現
Nicotiana系統またはその系統の植物から製造されるタバコ製品における望ましい形質を増強するために、本発明の核酸配列(例えば、図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す核酸配列またはその断片)の過剰発現を用いることが可能である。特に、二次代謝産物から生じる望ましい香味および芳香産物の生合成を増強するために、本発明の核酸配列の過剰発現およびそれらの翻訳産物を使用することが可能である。タバコポリペプチドをコードする核酸配列の更なる過剰発現を用いて、Nicotiana系統内の該ポリペプチドの発現を増強することが可能である。
Overexpression of constitutive or ethylene or aging inducible sequences
In order to enhance desirable traits in tobacco products produced from Nicotiana lines or plants of that line, the nucleic acid sequences of the present invention (e.g., FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1-172). -19 and 173-1 to 173-294 nucleic acid sequences or fragments thereof) can be used. In particular, overexpression of the nucleic acid sequences of the present invention and their translation products can be used to enhance the biosynthesis of desirable flavor and aroma products resulting from secondary metabolites. Further overexpression of nucleic acid sequences encoding tobacco polypeptides can be used to enhance expression of the polypeptide in Nicotiana strains.
本発明の核酸を過剰発現させることによりNicotiana系統に付与されうる更なる望ましい形質には、青枯病、グランビレ枯病(Granville wilt)、立枯病、ジャガイモウイルスY、タバコモザイクウイルス、タバコ腐食(etch)ウイルス、タバコ葉脈斑紋(vein mottling)ウイルス、アルファルファモザイクウイルス、野火病、根こぶ線虫、南(Southern)根こぶ線虫、シスト線虫、黒根病、青かび病、レース0タバコ疫病菌およびレース1タバコ疫病菌に対する耐性が含まれる。本発明の核酸配列を発現させることによりNicotiana植物において増強されうる他の望ましい形質には、収量および/または等級の増加、乾燥性、収穫性、保持能、葉品質または乾燥特性の向上、丈の増加または減少、成熟時間の変化(例えば、早熟、早熟ないし中生、中生、中生ないし晩熟または晩熟)、柄のサイズの増加または減少、ならびに植物当たりの葉数の増加または減少が含まれる。
Further desirable traits that can be imparted to Nicotiana strains by overexpressing the nucleic acids of the present invention include bacterial wilt, Granville wilt, blight, potato virus Y, tobacco mosaic virus, tobacco corrosion ( etch) virus, tobacco mottling virus, alfalfa mosaic virus, wildfire, root-knot nematode, southern root-knot nematode, cyst nematode, black root disease, blue mold,
植物プロモーター
望ましいプロモーターは、カリモウイルスプロモーター、例えばカリフラワーモザイクウイルス(CaMV)プロモーターまたはキャッサバ葉脈モザイクウイルス(CsVMV)プロモーターである。これらのプロモーターはほとんどの植物組織において高レベルの発現をもたらし、これらのプロモーターの活性はウイルスコード化タンパク質に依存的ではない。CaMVは35Sおよび19Sの両方のプロモーターの入手源である。これらのプロモーターを使用する植物発現構築物の具体例は当技術分野において公知である。トランスジェニック植物のほとんどの組織においては、CaMV35Sプロモーターは強力なプロモーターである。CaMVプロモーターは単子葉植物においても非常に活性である。さらに、このプロモーターの活性はCaMV35Sプロモーターの重複により更に増強(すなわち、2〜10倍)されうる。
Plant promoters Desirable promoters are caulimovirus promoters, such as the cauliflower mosaic virus (CaMV) promoter or the cassava vein mosaic virus (CsVMV) promoter. These promoters provide high levels of expression in most plant tissues, and the activity of these promoters is not dependent on virus-encoded proteins. CaMV is a source of both 35S and 19S promoters. Specific examples of plant expression constructs that use these promoters are known in the art. In most tissues of transgenic plants, the CaMV35S promoter is a strong promoter. The CaMV promoter is also very active in monocotyledonous plants. Furthermore, the activity of this promoter can be further enhanced (ie 2-10 times) by duplication of the CaMV35S promoter.
他の有用な植物プロモーターには、限定的なものではないが、ノパリンシンターゼ(NOS)プロモーター、オクトピンシンターゼプロモーター、ゴマノハグサモザイクウイルス(FMV)プロモーター、コメアクチンプロモーターおよびユビキチンプロモーター系が含まれる。 Other useful plant promoters include, but are not limited to, the nopaline synthase (NOS) promoter, octopine synthase promoter, sesame mosaic virus (FMV) promoter, rice actin promoter, and ubiquitin promoter system.
典型的な単子葉植物プロモーターには、限定的なものではないが、イネリナイエローモットルウイルス、サトウキビバドナウイルスプロモーター、イネツングロバシリフォルム(tungro bacilliform)ウイルスプロモーター、トウモロコシストリーク(streak)ウイルス要素、およびコムギ萎縮病ウイルスプロモーターが含まれる。 Typical monocotyledonous promoters include, but are not limited to, rice yellow mottle virus, sugarcane badnavirus promoter, rice tungrobacilliform virus promoter, corn streak virus element , And wheat dwarf virus promoters.
ある用途には、タバコ遺伝子産物、例えばドミナントネガティブ変異遺伝子産物を、適当な組織において、適当な量で、または適当な生育時点で産生させることが望ましいかもしれない。この目的には、環境、ホルモンおよび/または発育刺激のような誘導性シグナルに応答して調節されることが示されている遺伝子プロモーター群(それぞれはその調節配列において具現化されるそれ自身の異なる特性を有する)が存在する。これらには、限定的なものではないが、熱調節性遺伝子発現、光調節性遺伝子発現(例えば、エンドウrbcS-3A;トウモロコシrbcSプロモーター;エンドウにおいて見出されるクロロフィルa/b結合性タンパク質遺伝子;またはArabssuプロモーター)、ホルモン調節性遺伝子発現(例えば、コムギのEm遺伝子からのアブシジン酸(ABA)応答配列;オオムギおよびArabidopsisのABA誘導性HVA1およびHVA22ならびにrd29Aプロモーター)ならびに創傷誘導性遺伝子発現(例えば、wunlのもの)、器官特異的遺伝子発現(例えば、塊茎特異的貯蔵タンパク質遺伝子;記載されているトウモロコシからの23kDaゼイン遺伝子;またはインゲンマメβ-ファセオリン遺伝子)をもたらす遺伝子プロモーター、または病原体誘導性プロモーター(例えば、PR-1、prp-1またはβ-1,3グルカナーゼプロモーター、コムギの真菌誘導性wirlaプロモーターおよび線虫誘導性プロモーター、タバコおよびパセリのそれぞれTobRB7-5AおよびHmg-1)が含まれる。 For some applications, it may be desirable to produce tobacco gene products, such as dominant negative mutant gene products, in appropriate tissues, in appropriate amounts, or at appropriate growth points. For this purpose, a group of gene promoters that have been shown to be regulated in response to inducible signals such as environment, hormones and / or developmental stimuli, each of which is its own distinct form embodied in its regulatory sequence. Has a characteristic). These include, but are not limited to, heat-regulated gene expression, light-regulated gene expression (eg, pea rbcS-3A; maize rbcS promoter; chlorophyll a / b binding protein gene found in pea; or Arabssu Promoter), hormone-regulated gene expression (eg, abscisic acid (ABA) responsive element from wheat Em gene; barley and Arabidopsis ABA-inducible HVA1 and HVA22 and rd29A promoters) and wound-inducible gene expression (eg, wunl ), Gene-specific gene expression (eg tuber-specific storage protein gene; 23 kDa zein gene from corn as described; or kidney bean β-phaseolin gene), or pathogen-inducible promoter (eg PR -1, prp-1 or β-1,3 gluca Over lactamase promoter, fungal inducible wirla promoter and nematode inducible promoter of wheat, tobacco and parsley, respectively TobRB7-5A and Hmg-1) are included.
植物発現ベクター
典型的には、植物発現ベクターは、(1)5'および3'調節配列の転写制御下のクローン化植物遺伝子ならびに(2)優性選択マーカーを含む。そのような植物発現ベクターは、所望により、プロモーター調節領域(例えば、誘導性もしくは構成的、病原体もしくは創傷誘導性、環境もしくは発生調節性、または細胞もしくは組織特異的発現を付与するもの)、転写開始出発部位、リボソーム結合部位、RNAプロセシングシグナル、転写終結部位および/またはポリアデニル化シグナルをも含有しうる。
Plant Expression Vectors Typically, plant expression vectors include (1) a cloned plant gene under transcriptional control of 5 ′ and 3 ′ regulatory sequences and (2) a dominant selectable marker. Such plant expression vectors optionally have a promoter regulatory region (eg, one that confers inducible or constitutive, pathogen or wound inducible, environmental or developmental regulatory, or cell or tissue specific expression), transcription initiation. It may also contain a start site, ribosome binding site, RNA processing signal, transcription termination site and / or polyadenylation signal.
植物発現ベクターは、所望により、RNAプロセシングシグナル、例えばイントロン(これは、効率的なRNA合成および蓄積に重要であることが示されている)をも含有しうる。RNAスプライス配列の位置は植物におけるトランスジーン発現のレベルに劇的な影響を及ぼしうる。この事実を考慮すると、遺伝子発現のレベルを改変するためには、トランスジーン内のタバコニコチンデメチラーゼコード配列の上流または下流にイントロンを配置することが可能である。 Plant expression vectors may also optionally contain RNA processing signals such as introns, which have been shown to be important for efficient RNA synthesis and accumulation. The location of the RNA splice sequence can dramatically affect the level of transgene expression in plants. In view of this fact, it is possible to place an intron upstream or downstream of the tobacco nicotine demethylase coding sequence in the transgene to modify the level of gene expression.
発現ベクターは、前記の5'調節制御配列に加えて、一般には植物遺伝子の3'領域内に存在する調節制御領域をも含みうる。例えば、mRNAの安定性を増加させるために、3'ターミネーター領域を発現ベクター内に含有させることが可能である。1つのそのようなターミネーター領域は、ジャガイモのPI-IIターミネーター領域に由来するものでありうる。また、他の一般に使用されるターミネーターはオクトピンまたはノパリンシンターゼシグナルに由来する。 In addition to the 5 ′ regulatory control sequences described above, the expression vector may also include regulatory control regions that are generally present in the 3 ′ region of plant genes. For example, a 3 ′ terminator region can be included in the expression vector to increase the stability of the mRNA. One such terminator region may be derived from the potato PI-II terminator region. Also other commonly used terminators are derived from octopine or nopaline synthase signals.
植物発現ベクターは、典型的には、形質転換された細胞を特定するための優性選択マーカー遺伝子をも含有する。植物系のための有用な選択遺伝子には、トランスポゾンTn5のアミノグリコシドホスホトランスフェラーゼ遺伝子(AphII)、抗生物質耐性遺伝子をコードする遺伝子、例えばハイグロマイシン、カナマイシン、ブレオマイシン、ネオマイシン、G418、ストレプトマイシンまたはスペクチノマイシンに対する耐性をコードする遺伝子が含まれる。光合成に必要な遺伝子も光合成欠損株における選択マーカーとして使用されうる。最後に、除草剤耐性をコードする遺伝子が選択マーカーとして使用されうる。有用な除草剤耐性遺伝子には、酵素ホスフィノトリシンアセチルトランスフェラーゼをコードし広域スペクトル除草剤Basta(登録商標)(Bayer Cropscience Deutschland GmbH, Langenfeld, Germany)に対する耐性を付与するbar遺伝子が含まれる。他の選択マーカーには、他のそのような除草剤、例えばグリホセートなど、およびイミダゾリノン、スルホニル尿素、トリアゾロピリミジン除草剤、クロロスルフロン、ブロモキシニル、ダラポンなどに対する耐性を付与する遺伝子が含まれる。さらに、メトトレキセートのような分子と共に、ジヒドロ葉酸レダクターゼをコードする遺伝子が使用されうる。 Plant expression vectors typically also contain a dominant selectable marker gene to identify transformed cells. Useful selection genes for plant systems include transposon Tn5 aminoglycoside phosphotransferase gene (AphII), genes encoding antibiotic resistance genes such as hygromycin, kanamycin, bleomycin, neomycin, G418, streptomycin or spectinomycin A gene encoding resistance is included. Genes required for photosynthesis can also be used as selection markers in photosynthesis deficient strains. Finally, a gene encoding herbicide resistance can be used as a selectable marker. Useful herbicide resistance genes include the bar gene that encodes the enzyme phosphinotricin acetyltransferase and confers resistance to the broad spectrum herbicide Basta® (Bayer Cropscience Deutschland GmbH, Langenfeld, Germany). Other selectable markers include genes that confer resistance to other such herbicides such as glyphosate, and imidazolinones, sulfonylureas, triazolopyrimidine herbicides, chlorosulfuron, bromoxynyl, dalapon, and the like. In addition, genes encoding dihydrofolate reductase can be used with molecules such as methotrexate.
選択マーカーの効率的な使用は、個々の選択因子に対する植物細胞の感受性の決定、および形質転換細胞の全てではなくともほとんどを有効に殺すこの因子の濃度の測定により促進される。タバコの形質転換に対する抗生物質の有用な濃度のいくつかには、例えば20〜100μg/ml(カナマイシン)、20〜50μg/ml(ハイグロマイシン)または5〜10μg/ml(ブレオマイシン)が含まれる。除草剤耐性に関する形質転換体の選択のための有用な方法は、例えばVasil (Cell Culture and Somatic Cell Genetics of Plants, Vol I, II, III Laboratory Procedures and Their Applications, Academic Press, New York, 1984)により記載されている。 Efficient use of a selectable marker is facilitated by determining the sensitivity of the plant cell to an individual selection factor and measuring the concentration of this factor that effectively kills most if not all of the transformed cells. Some useful concentrations of antibiotics for tobacco transformation include, for example, 20-100 μg / ml (kanamycin), 20-50 μg / ml (hygromycin) or 5-10 μg / ml (bleomycin). A useful method for selection of transformants for herbicide resistance is described, for example, by Vasil (Cell Culture and Somatic Cell Genetics of Plants, Vol I, II, III Laboratory Procedures and Their Applications, Academic Press, New York, 1984). Have been described.
選択マーカーに加えて、レポーター遺伝子を使用することが望ましいであろう。いくつかの場合には、レポーター遺伝子は選択マーカーの非存在下で使用される。レポーター遺伝子は、典型的には受容生物または組織内に存在せず発現もされない遺伝子である。レポーター遺伝子は、典型的には、いくつかの表現型変化または酵素特性をもたらすタンパク質をコードする。そのような遺伝子の具体例は、参照により本明細書に組み入れるWeisingら (Ann. Rev. Genetics 22:421, 1988)に記載されている。好ましいレポーター遺伝子には、限定的なものではないがグルクロニダーゼ(GUS)遺伝子およびGFP遺伝子が含まれる。 In addition to a selectable marker, it may be desirable to use a reporter gene. In some cases, the reporter gene is used in the absence of a selectable marker. Reporter genes are genes that are typically not present or expressed in the recipient organism or tissue. Reporter genes typically encode proteins that result in some phenotypic change or enzymatic property. Specific examples of such genes are described in Weising et al. (Ann. Rev. Genetics 22: 421, 1988), incorporated herein by reference. Preferred reporter genes include but are not limited to the glucuronidase (GUS) gene and the GFP gene.
植物発現ベクターの構築後、植物宿主内に該ベクターを導入してトランスジェニック植物を作製するためにいくつかの標準的な方法が利用可能である。これらの方法には、(1)Agrobacterium媒介形質転換(A. tumefaciensまたはA. rhizogenes)(例えば、LichtensteinおよびFuller In: Genetic Engineering, vol 6, PWJ Rigby編, London, Academic Press, 1987; ならびにLichtenstein, C.P.およびDraper, J., In: DNA Cloning, Vol II, D.M. Glover編, Oxford, IRI Press, 1985; 米国特許第4,693,976, 4,762,785, 4,940,838, 5,004,863, 5,104,310, 5,149,645, 5,159,135, 5,177,010, 5,231,019, 5,463,174, 5,469,976および5,464,763号; ならびに欧州特許第0131624, 0159418, 0120516, 0176112, 0116718, 0290799, 0292435, 0320500および0627752号、ならびに欧州特許出願番号0267159および0604622を参照されたい)、(2)粒子運搬系(例えば、米国特許第4,945,050および5,141,131号を参照されたい)、(3)マイクロインジェクション法、(4)ポリエチレングリコール(PEG)法、(5)リポソーム媒介DNA取り込み、(6)エレクトロポレーション法(例えば、WO 87/06614ならびに米国特許第5,384,253, 5,472,869, 5,641,664, 5,679,558, 5,712,135, 6,002,070および6,074,877号を参照されたい)、(7)ボルテックス法、または(8)いわゆるウイスカーズ(whiskers)法(例えば、Coffeeら, 米国特許第5,302,523および5,464,765号を参照されたい)が含まれる。発現ベクターで形質転換されうる植物組織のタイプには、胚組織、カルス組織IおよびII型、胚軸、分裂組織などが含まれる。
Following construction of a plant expression vector, several standard methods are available for introducing the vector into a plant host to create a transgenic plant. These methods include (1) Agrobacterium-mediated transformation (A. tumefaciens or A. rhizogenes) (eg, Lichtenstein and Fuller In: Genetic Engineering,
植物組織内への導入後、当技術分野で公知の任意の手段により構造遺伝子の発現をアッセイすることが可能であり、転写されたmRNAとして、または合成されたタンパク質として、またはタバコにおける二次アルカロイドの化学分析による代謝産物モニターにより測定される生じた遺伝子サイレンシングの量として、発現を測定することが可能である(本明細書中に記載のとおり;参照により本明細書に組み入れる米国特許第5,583,021号も参照されたい)。植物組織のin vitro培養のための、そして多くの場合には全植物への再生のための技術が公知である(例えば、米国特許第5,595,733および5,766,900号を参照されたい)。導入された発現複合体を商業的に有用な栽培品種へ移すための方法は当業者に公知である。 Following introduction into plant tissue, the expression of structural genes can be assayed by any means known in the art, as a transcribed mRNA, as a synthesized protein, or as a secondary alkaloid in tobacco Expression can be measured as the amount of gene silencing produced as measured by metabolite monitoring by chemical analysis of (as described herein; US Pat. No. 5,583,021 incorporated herein by reference) (See also issue). Techniques for in vitro culture of plant tissue and in many cases regeneration to whole plants are known (see, eg, US Pat. Nos. 5,595,733 and 5,766,900). Methods for transferring introduced expression complexes to commercially useful cultivars are known to those skilled in the art.
所望のレベルの望ましい遺伝子産物を発現する植物細胞が得られたら、当技術分野でよく知られた方法および技術を用いて、植物組織および全植物をそれから再生させることが可能である。ついで、再生された植物を通常の手段により生殖させ、導入された遺伝子を通常の植物育種技術により他の株および栽培品種へ移すことが可能である。 Once plant cells expressing the desired level of the desired gene product are obtained, plant tissues and whole plants can be regenerated therefrom using methods and techniques well known in the art. The regenerated plant can then be regenerated by conventional means and the introduced gene can be transferred to other strains and cultivars using conventional plant breeding techniques.
トランスジェニックタバコ植物はゲノム遺伝子の任意の部分の核酸をダウンレギュレーションまたは過剰発現のための異なる配向(例えば、それぞれアンチセンス配向またはセンス配向)で含みうる。Nicotiana系統内の遺伝子産物の発現を増強するためには、完全長タバコ遺伝子のアミノ酸配列の全体または機能的部分をコードする核酸配列の過剰発現が望ましい。 A transgenic tobacco plant may contain nucleic acids of any part of the genomic gene in different orientations for down-regulation or overexpression (eg, antisense orientation or sense orientation, respectively). In order to enhance the expression of the gene product in Nicotiana strains, overexpression of nucleic acid sequences encoding the entire amino acid sequence of a full-length tobacco gene or a functional part is desirable.
タバコ遺伝子の転写または翻訳レベルの測定
遺伝子発現は、例えば、タバコ遺伝子または遺伝子断片をハイブリダイゼーションプローブとして使用する標準的なノーザンブロット分析(Ausubelら, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, New York, NY, (2001),およびSambrookら, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y., (1989))により測定されうる。RNA発現レベルの測定は、定量的rtPCR(Kawasakiら, in PCR Technology: Principles and Applications of DNA Amplification (H. A. Erlich編) Stockton Press (1989); Wangら in PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications (M. A. Innisら編) Academic Press (1990); ならびにFreemanら, Biotechniques 26:112-122および124-125, 1999)を含む逆転写PCR(rtPCR)によっても補助されうる。タバコ遺伝子の発現を測定するための更なるよく知られた技術には、in situハイブリダイゼーションおよび蛍光in situハイブリダイゼーション(例えば、Ausubelら, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, New York, NY, (2001)を参照されたい)が含まれる。前記の標準的な技術は、植物間、例えば、タバコ遺伝子内に変異を有する植物と対照植物との間で発現レベルを比較するためにも有用でありうる。
Measurement of transcription or translation level of tobacco genes Gene expression can be performed, for example, by standard Northern blot analysis using tobacco genes or gene fragments as hybridization probes (Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, New York , NY, (2001), and Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, NY, (1989)). RNA expression levels are measured by quantitative rtPCR (Kawasaki et al., In PCR Technology: Principles and Applications of DNA Amplification (HA Erlich) Stockton Press (1989); Wang et al. In PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications (MA Innis Et al.) Academic Press (1990); and Freeman et al., Biotechniques 26: 112-122 and 124-125, 1999) can also be assisted by reverse transcription PCR (rtPCR). Further well-known techniques for measuring tobacco gene expression include in situ hybridization and fluorescence in situ hybridization (eg, Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, New York, NY). , (2001)). The standard techniques described above can also be useful for comparing expression levels between plants, for example, between plants having mutations in the tobacco gene and control plants.
所望により、同じ一般的アプローチおよび標準的なタンパク質分析技術、例えばブラッドフォードアッセイ、分光光度アッセイ、および免疫学的検出技術、例えば所望のポリペプチドに特異的な抗体でのウエスタンブロット法または免疫沈降を用いて、タバコ遺伝子の発現(例えば、図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す核酸配列またはそれらの断片)をタンパク質産生のレベルで測定することが可能である(Ausubelら, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, New York, NY, (2001), およびSambrookら, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y., (1989))。 If desired, use the same general approach and standard protein analysis techniques such as Bradford assay, spectrophotometric assay, and immunological detection techniques such as Western blotting or immunoprecipitation with antibodies specific for the desired polypeptide. Used for expression of tobacco genes (eg nucleic acid sequences shown in FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to 173-294 or fragments thereof) It can be measured at the level of protein production (Ausubel et al., Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, New York, NY, (2001), and Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, NY, (1989)).
本明細書に記載の任意のポリペプチドの活性は、当技術分野における標準的な方法を用いてアッセイされうる。例えば、p450の活性は、典型的には、蛍光に基づくアッセイ(例えば、Donatoら, Drug Metab Dispos. 32: 699-706, 2004を参照されたい)を用いてアッセイされる。特に、ニコチンデメチラーゼの活性は、酵母ミクロソームアッセイを用いて、本明細書に記載されているとおりにアッセイされうる。 The activity of any polypeptide described herein can be assayed using standard methods in the art. For example, the activity of p450 is typically assayed using a fluorescence-based assay (see, eg, Donato et al., Drug Metab Dispos. 32: 699-706, 2004). In particular, the activity of nicotine demethylase can be assayed as described herein using a yeast microsome assay.
タバコ遺伝子産物のモジュレーターの特定
また、cDNAの単離は、遺伝子産物の発現を上昇または低下させる分子の特定を促進する。1つのアプローチにおいては、タバコmRNAを発現する細胞(例えば、原核細胞、例えば大腸菌(E. coli)または真核細胞、例えば酵母、哺乳類細胞、昆虫細胞もしくは植物細胞)の培地に候補分子を種々の濃度で加える。ついで、例えば本明細書に記載されているような標準的な方法を用いて、遺伝子産物の発現を候補分子の存在下および非存在下で測定する。
Identification of Tobacco Gene Product Modulators Isolation of cDNA also facilitates identification of molecules that increase or decrease gene product expression. In one approach, various candidate molecules are placed in the medium of cells expressing tobacco mRNA (eg, prokaryotic cells, eg, E. coli or eukaryotic cells, eg, yeast, mammalian cells, insect cells or plant cells). Add by concentration. The expression of the gene product is then measured in the presence and absence of the candidate molecule using, for example, standard methods such as those described herein.
候補モジュレーターは、精製(または実質的に精製)された分子であることが可能であり、あるいは化合物混合物の1つの成分でありうる。混合化合物アッセイにおいては、単一の化合物または最小化合物混合物がタバコニコチンデメチラーゼ遺伝子発現を改変することが示されるまで、候補化合物プール(例えば、標準的な精製技術、例えばHPLCにより得られたもの)の次第に小さくなる亜群に対して遺伝子産物の発現を試験する。本発明の1つの実施形態においては、遺伝子産物の発現の低下を促進する分子が特に望ましいと考えられる。遺伝子産物の発現または活性のレベルで有効であることが見出されたモジュレーターは、イン・プランタ(in planta)において有用であると証明されうる。 Candidate modulators can be purified (or substantially purified) molecules, or can be a component of a compound mixture. In mixed compound assays, candidate compound pools (eg, those obtained by standard purification techniques, such as HPLC), until a single compound or minimal compound mixture is shown to modify tobacco nicotine demethylase gene expression. The expression of the gene product is tested against progressively smaller subgroups. In one embodiment of the invention, molecules that promote reduced expression of gene products may be particularly desirable. Modulators that have been found to be effective at the level of gene product expression or activity may prove useful in in planta.
農業用には、本明細書に開示されている方法を用いて特定された分子、化合物または物質は、植物の茎葉上への噴霧剤または粉剤として施用される化学物質として使用されうる。該分子、化合物または物質は、植物に何らかの利益をもたらす別の分子と共に植物に施用されうる。 For agriculture, molecules, compounds or substances identified using the methods disclosed herein can be used as chemicals applied as sprays or dusts on plant foliage. The molecule, compound or substance can be applied to a plant with another molecule that provides some benefit to the plant.
用途
本明細書に記載の任意の配列に対応する内因性遺伝子の調節、例えば遺伝子サイレンシングは、より貴重な植物または植物製品を与えうる。特に、エチレンにより誘導される又は老化に関連しているものとして本明細書中で特定されている配列(例えば、配列番号4、40、44、52、54、60、70、104、138、140、158、162、188、212、226、234および288の配列または図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す核酸配列もしくはそれらの断片を有するもの)を使用して、最終産物の品質特性に影響を及ぼすテルペノイド、ポリフェノール、アルカロイドなどを含む多数の二次代謝産物の形成に関与する代謝経路に影響を及ぼすことが可能である。同様に、本明細書中で特定されている遺伝子は、老化過程で蓄積する乾物の率およびタイプまたは老化過程の植物内の乾物の分配に関連した代謝経路を調節するために使用されうる。本明細書中で特定されている遺伝子の調節は、老化速度、葉内および単一植物の葉間の老化の均一性ならびに本明細書中で特定されている遺伝子を刺激または活性化して葉または他の植物成分を含む製品または製造品の質を制御する物質または活性による老化の誘導の決定に関与する代謝経路に影響を及ぼすためにも用いられうる。
Applications Regulation of endogenous genes corresponding to any of the sequences described herein, such as gene silencing, can give a more valuable plant or plant product. In particular, sequences identified herein as being induced by ethylene or associated with aging (eg, SEQ ID NOs: 4, 40, 44, 52, 54, 60, 70, 104, 138, 140 , 158, 162, 188, 212, 226, 234 and 288 or the nucleic acids shown in FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to 173-294 Can be used to influence the metabolic pathways involved in the formation of numerous secondary metabolites, including terpenoids, polyphenols, alkaloids, etc. that affect the quality characteristics of the final product. Is possible. Similarly, the genes identified herein can be used to regulate the rate and type of dry matter that accumulates during the aging process or the metabolic pathways associated with the distribution of dry matter within the plant during the aging process. The regulation of the genes identified herein can be achieved by stimulating or activating the genes identified herein by stimulating or activating the rate of senescence, uniformity of senescence within leaves and between leaves of a single plant. It can also be used to influence the metabolic pathways involved in determining the induction of aging by substances or activities that control the quality of products or manufactured goods that contain other plant components.
本明細書に記載の遺伝子のプロモーター領域は、作物の品質を改良し又は特定の形質を増強する任意の望ましい遺伝子産物の発現を駆動するために使用されうる。二次代謝産物から生じる香味および芳香産物の生合成に関与する特有の遺伝子を発現させるために、植物内への導入のための構築物において、植物の生活環の特定の期間中に発現される誘導性プロモーターが使用されうる。また、末端用途特性に影響を及ぼす構造的炭水化物またはタンパク質の発現を上昇または修飾するために、タバコ遺伝子プロモーターが使用されうる。更に、タバコ遺伝子プロモーターは、栄養製品、医薬物質または産業用物質の生合成に関与する遺伝子を含む異種遺伝子と組合されうるであろう。プロモーター配列の調節は、アルカロイド生合成および/または他の経路に関与する遺伝子を含む内因性タバコ遺伝子をダウンレギュレーションするために用いられうる。望ましくは、タバコ遺伝子プロモーター領域または他の転写調節領域は、植物内のノルニコチン含量およびニトロソアミンレベルのような化学的特性を改変するために用いられる。また、当技術分野における標準的な方法を用いてプロモーター配列内で容易に特定されうるプロモーターモチーフを用いて、タバコ遺伝子産物(例えば、p450)の発現に関連した又はそれを調節する因子を特定することが可能である。 The promoter regions of the genes described herein can be used to drive the expression of any desired gene product that improves crop quality or enhances a particular trait. Induction expressed during specific periods of the plant life cycle in constructs for introduction into plants to express unique genes involved in the biosynthesis of flavor and aroma products resulting from secondary metabolites Sex promoters can be used. Tobacco gene promoters can also be used to increase or modify the expression of structural carbohydrates or proteins that affect end-use properties. Furthermore, tobacco gene promoters could be combined with heterologous genes including genes involved in the biosynthesis of nutritional products, pharmaceutical substances or industrial substances. Regulation of promoter sequences can be used to down-regulate endogenous tobacco genes, including genes involved in alkaloid biosynthesis and / or other pathways. Desirably, tobacco gene promoter regions or other transcriptional regulatory regions are used to modify chemical properties such as nornicotine content and nitrosamine levels in plants. Also, a factor that is associated with or regulates expression of a tobacco gene product (eg, p450) is identified using a promoter motif that can be readily identified within the promoter sequence using standard methods in the art. It is possible.
更に、本発明の配列(例えば、図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す核酸配列もしくはそれらの断片)のいずれかは、本明細書に記載の標準的な方法を用いて遺伝子産物(例えば、p450)の遺伝子発現を低下させ又はその酵素活性を改変する方法において使用されうる。そのような技術には、限定的なものではないがRNA干渉、三本鎖干渉、リボザイム、相同組換え、ウイルス誘導性遺伝子サイレンシング、アンチセンスおよび共抑制技術、ドミナントネガティブ遺伝子産物の発現、標準的な変異誘発技術を用いる変異遺伝子の生成が含まれる。例えば、植物病原体相互作用および耐病性に関連した脂肪酸を改変するために、あるいは選択された脂肪酸の植物プロフィールを改変して該植物または植物成分の香味または芳香を改変するために、p450発現の低下またはp450酵素活性の改変が用いられうる。 Further, any of the sequences of the present invention (for example, the nucleic acid sequences shown in FIGS. 1, 3 to 7, 10 to 158, 162 to 170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to 173-294, or fragments thereof) It can be used in methods of reducing gene expression of a gene product (eg, p450) or modifying its enzymatic activity using standard methods described herein. Such techniques include, but are not limited to, RNA interference, triple strand interference, ribozyme, homologous recombination, virus-induced gene silencing, antisense and co-suppression techniques, expression of dominant negative gene products, standards Production of mutant genes using conventional mutagenesis techniques. For example, decreased p450 expression to modify fatty acids associated with phytopathogen interactions and disease resistance, or to modify the plant profile of selected fatty acids to modify the flavor or aroma of the plant or plant component Alternatively, modification of p450 enzyme activity can be used.
更に、他のタバコNicotiana種における関連遺伝子に関するスクリーニングのための又は植物が対応内因性遺伝子内に変異を有するかどうかを決定するための、関連遺伝子、プロモーターまたは調節領域を単離するための遺伝的マーカーとして、プロモーター、コード配列、イントロンまたは3'UTRまたはそれらの断片などのタバコ遺伝子の任意の部分が標準的な方法により使用されうる。また、特定の遺伝子の移入または喪失を追跡するために育種操作による遺伝子の流れをモニターするために、タバコ遺伝子の一部が使用されうる。 In addition, to screen for related genes in other tobacco Nicotiana species, or to determine whether a plant has a mutation in the corresponding endogenous gene, to isolate related genes, promoters or regulatory regions As a marker, any part of a tobacco gene such as a promoter, coding sequence, intron or 3′UTR or a fragment thereof can be used by standard methods. Also, a portion of the tobacco gene can be used to monitor gene flow through breeding operations to track the transfer or loss of a particular gene.
例えば、Nicotiana tabacumは、その他のNicotiana種のいくつかと同様に異質四倍体であり、元の遺伝子が存在するゲノムとは異なる親ゲノム内の相同遺伝子または関連遺伝子を特定するために使用されうるであろう。関連遺伝子に関するマーカーは、既存のタバコ生殖質、交雑により生じた分離または合成集団、変異誘発処理または種々の組織培養法により生じた集団をスクリーニングするためにも使用されうるであろう。したがって、本明細書に記載の核酸配列(例えば、図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す核酸配列またはそれらの断片)は、耐病性、耐虫性、香味および芳香特性、除草剤耐性、葉収量を増加させる又は葉に影響を及ぼす又は構造的形質もしくは繊維含量に関連した植物成分(例えば、リグニン、セルロースなど)に影響を及ぼす或いは望ましくない成分に関連した品質因子に関与する遺伝子を特定し又はそれに影響を及ぼすために使用されうる。 For example, Nicotiana tabacum, like some of the other Nicotiana species, is an allotetraploid and can be used to identify homologous genes or related genes in the parental genome that are different from the genome in which the original gene resides. I will. Markers for related genes could also be used to screen existing tobacco germplasm, segregated or synthetic populations generated by crossing, populations generated by mutagenesis or various tissue culture methods. Accordingly, the nucleic acid sequences described herein (e.g., the nucleic acid sequences shown in Figures 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to 173-294 or their Fragments) are plant components (eg, lignin, cellulose, etc.) that are disease resistant, insect resistant, flavor and fragrant, herbicide resistant, increase leaf yield or affect leaves or are associated with structural traits or fiber content Can be used to identify or affect genes involved in quality factors affecting or undesired components.
製品
ニトロソアミン含量の低下を伴うタバコ製品は、当技術分野で公知の標準的な方法により、本明細書に記載の任意のタバコ植物材料を使用して製造される。1つの実施形態においては、タバコ製品は、乾燥タバコ植物から得られたタバコ植物材料を使用して製造される。乾燥タバコ植物は、低下したニコチンデメチラーゼ活性を含有しうる。あるいは乾燥タバコ植物は、低下したニコチンデメチラーゼ活性を含有するよう育種されたものでありうる。例えば、乾燥タバコ植物は、ニコチンデメチラーゼの変異発現を伴うものとして特定されたタバコ植物を含む交配から得られたタバコ植物でありうる。望ましくは、タバコ製品は、約5 mg/g未満、約4.5 mg/g未満、約4.0 mg/g未満、約3.5 mg/g未満、約3.0 mg/g未満、約2.5 mg/g未満、約2.0 mg/g未満、約1.5 mg/g未満、約1.0 mg/g未満、約750 μg/g未満、約500 μg/g未満、約250 μg/g未満、約100 μg/g未満、約75 μg/g未満、約50 μg/g未満、約25 μg/g未満、約10 μg/g未満、約7.0 μg/g未満、約5.0 μg/g未満、約4.0 μg/g未満、約2.0 μg/g未満、約1.0 μg/g未満、約0.5 μg/g未満、約0.4 μg/g未満、約0.2 μg/g未満、約0.1 μg/g未満、約0.05 μg/g未満または約0.01 μg/g未満の、低下した量のノルニコチンまたはNNNを含有し、あるいは、ここで、それに含有される全アルカロイド含量に対する二次アルカロイドの比率(%)は90%未満、70%未満、50%未満、30%未満、10%未満、5%未満、4%未満、3%未満、2%未満、1.5%未満、1%未満、0.75%未満、0.5%未満、0.25%未満または0.1%未満である。「低下した量(量の低下)」なる表現は、ノルニコチンまたはNNNの低下のためにトランスジェニックにされていない同様に加工された同品種由来の野生型タバコ植物または植物成分またはタバコ製品において見出されるものより低い、タバコ植物または植物成分またはタバコ製品におけるノルニコチンまたはNNNまたはそれらの両方の量を意味する。1つの具体例においては、ノルニコチンまたはNNNまたはそれらの両方の減少が本明細書に記載の方法により得られたのか
どうかを判定するための対照として、同様に加工された同品種の野生型タバコ植物を使用する。もう1つの具体例においては、標準的な方法を用いて、例えば、遺伝子または遺伝子産物(例えば、ニコチンデメチラーゼ)または特定の遺伝子内変異の存在または非存在をモニターすることにより、ニトロソアミン含量の低下を伴う植物を評価する。更にもう1つの具体例においては、育種計画から得られた植物のニトロソアミン含量を、ニトロソアミン量の低下を伴う植物を育種するために使用した受容系統または供与系統またはそれらの両方のニトロソアミン含量と比較する。必要に応じて、当技術分野で公知の他の適当な対照も使用される。ノルニコチンおよびNNNまたはそれらの両方のレベルは、タバコ分野においてよく知られた方法に従い測定される。
Tobacco products with reduced product nitrosamine content are produced using any tobacco plant material described herein by standard methods known in the art. In one embodiment, the tobacco product is manufactured using tobacco plant material obtained from dried tobacco plants. Dried tobacco plants can contain reduced nicotine demethylase activity. Alternatively, the dried tobacco plant may have been bred to contain reduced nicotine demethylase activity. For example, a dry tobacco plant can be a tobacco plant obtained from a cross that includes a tobacco plant identified as having mutated expression of nicotine demethylase. Desirably, the tobacco product is less than about 5 mg / g, less than about 4.5 mg / g, less than about 4.0 mg / g, less than about 3.5 mg / g, less than about 3.0 mg / g, less than about 2.5 mg / g, about Less than 2.0 mg / g, less than about 1.5 mg / g, less than about 1.0 mg / g, less than about 750 μg / g, less than about 500 μg / g, less than about 250 μg / g, less than about 100 μg / g, about 75 <μg / g, <50 μg / g, <25 μg / g, <10 μg / g, <7.0 μg / g, <5.0 μg / g, <4.0 μg / g, <2.0 μg <g / g, <1.0 μg / g, <0.5 μg / g, <0.4 μg / g, <0.2 μg / g, <0.1 μg / g, <0.05 μg / g, or <0.01 μg / g containing a reduced amount of nornicotine or NNN less than g, or where the percentage of secondary alkaloids relative to the total alkaloid content contained therein is less than 90%, less than 70%, less than 50%, 30 <%, <10%, <5%, <4%, <3%, <2%, <1.5%, <1%, <0.75%, <0.5% Less than 0.25%, or less than 0.1%. The expression "reduced amount" (reduced amount) is found in wild-type tobacco plants or plant components or tobacco products from similarly processed varieties that have not been transgenic for nornicotine or NNN reduction Mean lower amounts of nornicotine or NNN or both in tobacco plants or plant components or tobacco products. In one embodiment, a similarly processed wild-type tobacco plant that has been similarly processed as a control to determine whether a decrease in nornicotine or NNN or both was obtained by the methods described herein. Is used. In another embodiment, reduced nitrosamine content using standard methods, for example, by monitoring the presence or absence of a gene or gene product (eg, nicotine demethylase) or a specific intragenic mutation. Evaluate plants with In yet another embodiment, the nitrosamine content of the plant obtained from the breeding program is compared to the nitrosamine content of the recipient line and / or donor line used to breed the plant with reduced nitrosamine levels. . Other suitable controls known in the art are also used as needed. Nornicotine and NNN or both levels are measured according to methods well known in the tobacco field.
以下の実施例は、本発明を実施するための方法を例示するものであり、添付の特許請求の範囲において定義される本発明の例示に過ぎないと理解されるべきであり、そのような本発明の範囲を限定するものと解釈されるべきではない。 The following examples are illustrative of methods for practicing the present invention, and are to be understood as merely exemplary of the invention as defined in the appended claims. It should not be construed as limiting the scope of the invention.
植物組織の開発およびエチレン処理
植物の成長
植物をポット内に播種し、温室内で4週間成長させた。該4週齢実生を個々のポットに移植し、該温室内で2ヶ月間成長させた。成長中に、150ppmのNPK肥料を含有する水で該植物に1日2回灌水した。大きくなった緑葉を植物から切断して、後記のとおりにエチレン処理を行った。
Plant tissue development and ethylene treatment
Plant growth Plants were sown in pots and grown in a greenhouse for 4 weeks. The 4 week old seedlings were transplanted into individual pots and grown for 2 months in the greenhouse. During growth, the plants were watered twice daily with water containing 150 ppm NPK fertilizer. The enlarged green leaves were cut from the plant and treated with ethylene as described below.
細胞系78379
タバコ系統78379は、University of Kentuckyにより公開されたバーレータバコ系統であり、それを植物材料源として使用した。100個の植物を、タバコの成長の分野における標準体として培養し、移植し、異なる番号(1〜100)で識別した。推奨されているとおりに施肥および圃場管理を行った。
Cell line 78379
Tobacco line 78379 is a Burley tobacco line published by the University of Kentucky, which was used as a source of plant material. 100 plants were cultivated as standard in the field of tobacco growth, transplanted and identified with different numbers (1-100). Fertilization and field management were performed as recommended.
それらの100個の植物の4分の3がニコチンの20〜100%をノルニコチンへと変換した。それらの100個の植物の4分の1はニコチンの5%未満をノルニコチンへと変換した。植物番号87は最低の変換率(2%)を示し、一方、植物番号21は100%の変換を示した。3%未満の変換率の植物は非変換体として分類された。遺伝的および表現型相違を調べるために、植物番号87および植物番号21の自己受粉種子ならびに交配(21×87および87×21)種子を得た。自殖した21からの植物は変換体であり、87からの自殖の99%は非変換体であった。87からの植物の残りの1%は低い変換率(5〜15%)を示した。正逆交雑からの植物はすべて変換体であった。
Three quarters of those 100 plants converted 20-100% of nicotine into nornicotine. A quarter of those 100 plants converted less than 5% of nicotine into nornicotine. Plant number 87 showed the lowest conversion rate (2%), while
細胞系4407
Nicotiana系統4407は、バーレー系統であり、それを植物材料源として使用した。均一かつ代表的な植物(100個)を選抜し、番号で識別した。それらの100個の植物のうちの97個は非変換体であり、3個は変換体であった。植物番号56は最低の変換率(1.2%)を示し、一方、植物番号58は最高レベルの変換率(96%)を示した。これらの2つの植物を使用して自己受粉種子ならびに交配種子を得た。
Cell line 4407
Nicotiana line 4407 is a Burley line, which was used as a source of plant material. Uniform and representative plants (100) were selected and identified by numbers. Of those 100 plants, 97 were non-converters and three were converters.
自殖した58からの植物は変換体:非変換体の比3:1で分離した。植物58-33および58-25は、それぞれホモ接合変換体およびホモ接合非変換変換体として特定された。58-33の安定な変換がその後代の分析により確認された。 The self-propagating plants from 58 were isolated with a converter: nonconverter ratio of 3: 1. Plants 58-33 and 58-25 were identified as homozygous transformants and homozygous non-transformed transformants, respectively. Stable conversion of 58-33 was confirmed by subsequent analysis.
細胞系PBLB01
PBLB01は、ProfiGen, Inc.により開発されたバーレー系統であり、それを植物材料源として使用した。PBLB01の原種から変換体植物を選抜した。
Cell line PBLB01
PBLB01 is a Burley line developed by ProfiGen, Inc., which was used as a plant material source. A converter plant was selected from the original species of PBLB01.
エチレン処理方法
緑葉を2〜3ヶ月の温室栽培植物から切断し、それに0.3% エチレン溶液(Prep brand Ethephon (Rhone-Poulenc))を噴霧した。各噴霧葉を、加湿器を備えた乾燥棚内に吊るし、プラスチックで覆った。該処理中に、該サンプル葉にエチレン溶液を定期的に噴霧した。エチレン処理の約24〜48時間後、RNA抽出のために葉を集めた。葉代謝産物およびより詳細な対象成分(例えば、種々のアルカロイド)の濃度を測定するための代謝成分分析のために、別の小サンプルを採取した。
Ethylene Treatment Method Green leaves were cut from 2-3 month greenhouse plants and sprayed with 0.3% ethylene solution (Prep brand Ethephon (Rhone-Poulenc)). Each spray leaf was hung in a drying shelf equipped with a humidifier and covered with plastic. During the treatment, the sample leaves were periodically sprayed with ethylene solution. Approximately 24-48 hours after ethylene treatment, leaves were collected for RNA extraction. Another small sample was taken for metabolic component analysis to determine the concentration of leaf metabolites and more detailed components of interest (eg, various alkaloids).
一例として、アルカロイド分析を以下のとおりに行うことが可能であった。0.5mlの2N NaOH、ならびに内部標準としてのキノリンおよびt-ブチルエーテルを含有する5mlの抽出溶液と共に、サンプル(0.1g)を150rpmで振とうした。サンプルを、FID検出器を備えたHP 6890 GC上で分析した。該検出器および注入器には250℃の温度を用いた。5% フェノールおよび95% メチルシリコンで架橋された溶融シリカよりなるHPカラム(30m-0.32nm-1mm)を、10℃/分(min)で110〜185℃の温度勾配で使用した。該カラムは、キャリヤーガスとしてヘリウムを使用して、100℃、1.7cm3min-1 の流速、40:1のスプリット比、2:1の注入容量で、該カラムを運転した。 As an example, alkaloid analysis could be performed as follows. Samples (0.1 g) were shaken at 150 rpm with 0.5 ml 2N NaOH and 5 ml extraction solution containing quinoline and t-butyl ether as internal standards. Samples were analyzed on an HP 6890 GC equipped with an FID detector. A temperature of 250 ° C. was used for the detector and injector. An HP column (30 m-0.32 nm-1 mm) consisting of fused silica crosslinked with 5% phenol and 95% methylsilicon was used at a temperature gradient of 110-185 ° C. at 10 ° C./min. The column was operated with helium as the carrier gas at 100 ° C., 1.7 cm 3 min −1 flow rate, 40: 1 split ratio, 2: 1 injection volume.
RNAの単離
RNA抽出のために、2月齢の温室栽培植物からの中葉を、前記のとおりにエチレンで処理した。その0および24〜48時間のサンプルをRNA抽出に使用した。いくつかの場合には、花の頭部の除去の10日後の植物から、老化過程中の葉サンプルを採取した。これらのサンプルも抽出に使用した。Rneasy Plant Mini Kit(登録商標)(Qiagen, Inc., Valencia, California)を該製造業者のプロトコールに従い使用して、全RNAを単離した。
RNA isolation
For RNA extraction, middle leaves from 2 month old greenhouse plants were treated with ethylene as described above. The 0 and 24-48 hour samples were used for RNA extraction. In some cases, leaf samples during the aging process were taken from
DEPCで処理された乳鉢および乳棒を使用して、組織サンプルを液体窒素下で粉砕して微粉末を得た。約100マイクログラムの粉砕組織を1.5mlの無菌エッペンドルフチューブに移した。すべてのサンプルが集まるまで、このサンプルチューブを液体窒素中に配置した。ついで、該キットとして提供されている450μlのバッファーRLTを(メルカプトエタノールの添加と共に)各チューブに加えた。該サンプルを激しくボルテックスし、56℃で3分間インキュベートした。ついでライセートを、2ml収集チューブ内に配置されたQIAshredder(登録商標)遠心カラムに適用し、最大速度で2分間遠心分離した。流出物を集め、0.5容量のエタノールを該清澄化ライセートに加えた。該サンプルを十分に混合し、2ml収集チューブ内に配置されたRneasy(登録商標)小型遠心カラムに移した。該サンプルを10,000rpmで1分間遠心分離した。つぎに700μlのバッファーRW1をRneasy(登録商標)カラム上にピペッティングし、10,000rpmで1分間遠心分離した。バッファーRPEを新しい収集チューブ内のRneasy(登録商標)カラム上にピペッティングし、10,000rpmで1分間遠心分離した。バッファーRPEを再びRneasy(登録商標)カラムに加え、最大速度で2分間遠心分離して、該膜を乾燥させた。エタノールキャリーオーバーを除去するために、該膜を別の収集チューブ内に配置し、最大速度で更に1分間遠心分離した。該Rneasy(登録商標)カラムを新たな1.5ml収集チューブ内に移し、40μlのRNアーゼ非含有水を該Rneasy(登録商標)膜上に直接的にピペッティングした。この最終溶出チューブを10,000rpmで1分間遠心分離した。変性ホルムアルデヒドゲルおよび分光光度計により全RNAの定性および定量分析を行った。 Using a mortar and pestle treated with DEPC, the tissue sample was ground under liquid nitrogen to obtain a fine powder. Approximately 100 micrograms of ground tissue was transferred to a 1.5 ml sterile Eppendorf tube. The sample tube was placed in liquid nitrogen until all samples were collected. Subsequently, 450 μl of buffer RLT provided with the kit was added to each tube (with the addition of mercaptoethanol). The sample was vortexed vigorously and incubated at 56 ° C. for 3 minutes. The lysate was then applied to a QIAshredder® centrifuge column placed in a 2 ml collection tube and centrifuged at maximum speed for 2 minutes. The effluent was collected and 0.5 volume of ethanol was added to the clarified lysate. The sample was mixed well and transferred to an Rneasy® mini centrifuge column placed in a 2 ml collection tube. The sample was centrifuged at 10,000 rpm for 1 minute. Next, 700 μl of buffer RW1 was pipetted onto an Rneasy® column and centrifuged at 10,000 rpm for 1 minute. Buffer RPE was pipetted onto an Rneasy® column in a new collection tube and centrifuged at 10,000 rpm for 1 minute. Buffer RPE was again added to the Rneasy® column and centrifuged at maximum speed for 2 minutes to dry the membrane. To remove ethanol carryover, the membrane was placed in a separate collection tube and centrifuged for an additional 1 minute at maximum speed. The Rneasy® column was transferred into a new 1.5 ml collection tube and 40 μl of RNase-free water was pipetted directly onto the Rneasy® membrane. The final elution tube was centrifuged at 10,000 rpm for 1 minute. Qualitative and quantitative analysis of total RNA was performed by denaturing formaldehyde gel and spectrophotometer.
Origotex(登録商標)ポリA+RNA精製キット(Qiagen Inc.)を該製造業者のプロトコールに従い使用して、ポリ(A)RNAを単離した。250μlの最大容量中の約200μgの全RNAを使用した。その250μlの全RNAに容量250μlのバッファーOBBおよび15μlのOligotex(登録商標)懸濁液を加えた。内容物をピペッティングにより十分に混合し、加熱ブロック上で70℃で3分間インキュベートした。ついで該サンプルを室温で20分間放置した。最大速度で2分間の遠心分離により、Oligotex(登録商標):mRNA複合体をペレット化した。50mlを除くすべての該懸濁液を該ミクロ遠心チューブから除去した。該サンプルをOBBバッファーで更に処理した。該Oligotex(登録商標):mRNAペレットを、ボルテックスすることにより400μlのバッファーOW2に再懸濁させた。この混合物を、新たなチューブ内に配置された小さな遠心カラム上に移し、最大速度で1分間遠心分離した。該遠心カラムを新たなチューブに移し、更に400μlのバッファーOW2を該カラムに加えた。ついで該チューブを最大速度で1分間遠心分離した。該遠心カラムを最終的な1.5mlのミクロ遠心チューブに移した。該サンプルを60μlの加温(70℃)バッファーOEBで溶出した。ポリA産物を変性ホルムアルデヒドゲルおよび分光光度計により分析した。 Poly (A) RNA was isolated using an Origotex® poly A + RNA purification kit (Qiagen Inc.) according to the manufacturer's protocol. Approximately 200 μg of total RNA in a maximum volume of 250 μl was used. A volume of 250 μl buffer OBB and 15 μl Oligotex® suspension was added to the 250 μl total RNA. The contents were mixed well by pipetting and incubated on a heating block at 70 ° C. for 3 minutes. The sample was then left at room temperature for 20 minutes. Oligotex®: mRNA complex was pelleted by centrifugation at maximum speed for 2 minutes. All the suspension except 50 ml was removed from the microcentrifuge tube. The sample was further processed with OBB buffer. The Oligotex®: mRNA pellet was resuspended in 400 μl buffer OW2 by vortexing. This mixture was transferred onto a small centrifuge column placed in a new tube and centrifuged at maximum speed for 1 minute. The centrifuge column was transferred to a new tube and an additional 400 μl of buffer OW2 was added to the column. The tube was then centrifuged for 1 minute at maximum speed. The centrifuge column was transferred to the final 1.5 ml microcentrifuge tube. The sample was eluted with 60 μl of warm (70 ° C.) buffer OEB. Poly A product was analyzed by denaturing formaldehyde gel and spectrophotometer.
逆転写PCR
SuperScript逆転写酵素を製造業者のプロトコール(Invitrogen, Carlsbad, California)に従い使用して、第1鎖cDNAを得た。ポリA+富化RNA/オリゴdTプライマー混合物は5μg未満の全RNA、1μlの10mM dNTP混合物、1μlのオリゴd(T) 12-18 (0.5μg/μl)および10μlまでのDEPC処理水よりなるものであった。各サンプルを65℃で5分間インキュベートし、ついで氷上で少なくとも1分間配置した。以下の成分のそれぞれを順番に加えることにより、反応混合物を調製した:2μl 10×RTバッファー, 4μlの25 mM MgCl2, 2μlの0.1 M DTTおよび1μlのRNアーゼOUT Recombinant RNase Inhibitor。9μlの反応混合物の添加物を各RNA/プライマー混合物にピペッティングし、穏やかに混合した。それを42℃で2分間インキュベートし、1μlのSuper Script II RTを各チューブに加えた。該チューブを42℃で50分間インキュベートした。該反応を70℃で15分間で終結させ、氷上で冷却した。該サンプルを遠心分離により集め、1μlのRNアーゼHを各チューブに加え、37℃で20分間インキュベートした。200pmolのフォワードプライマーおよび100pmolのリバースプライマー(18ntのオリゴd(T)およびそれに続く1個のランダムな塩基)を使用して、第2のPCRを行った。
Reverse transcription PCR
First strand cDNA was obtained using SuperScript reverse transcriptase according to the manufacturer's protocol (Invitrogen, Carlsbad, California). The poly A + enriched RNA / oligo dT primer mix consists of less than 5 μg total RNA, 1
反応条件は94℃で2分間、ついで94℃で1分間、45℃〜60℃で2分間、72℃で3分間の40サイクルのPCR、および72℃で更に10分間の伸長であった。1%アガロースゲルを使用する電気泳動により、10μlの該増幅サンプルを分析した。正しいサイズの断片をアガロースゲルから精製した。 The reaction conditions were 94 ° C. for 2 minutes, then 94 ° C. for 1 minute, 45 ° C.-60 ° C. for 2 minutes, 72 ° C. for 3 minutes, 40 cycles of PCR, and 72 ° C. for another 10 minutes of extension. Ten μl of the amplified sample was analyzed by electrophoresis using a 1% agarose gel. The correct size fragment was purified from an agarose gel.
PCR断片集団の作製
実施例3からのPCR断片をpGEM-T Easy Vector (Promega, Madison, Wisconsin)内に該製造業者の指示に従い連結した。連結産物をJM109コンピテント細胞内に形質転換し、青/白選択のためにLB培地プレート上でプレーティングした。コロニーを選択し、1.2mlのLB培地を含有する96ウェルプレート内で37℃で一晩成長させた。選択したすべてのコロニーの凍結ストックを作製した。Wizard SV Miniprepキット(Promega)と共にBeckman's Biomeck 2000ミニプレップ・ロボティックスを用いて、プレートからプラスミドDNAを精製した。プラスミドDNAを100μlの水で溶出し、96ウェルプレート内で保存した。プラスミドをEcoR1で消化し、1%アガロースゲルを使用して分析して、DNAの量およびインサートのサイズを確認した。CEQ 2000シークエンサー(Beckman, Fullerton, California)を使用して、400〜600bpのインサートを含有するプラスミドを配列決定した。BLAST検索により該配列をGenBankデータベースと整列させた(例えば、図159A〜159Kを参照されたい)。p450関連断片を特定し、更に分析した。あるいは、p450断片をサブトラクションライブラリーから単離した。これらの断片も、前記のとおりに分析した。
Preparation of PCR fragment population The PCR fragment from Example 3 was ligated into pGEM-T Easy Vector (Promega, Madison, Wisconsin) according to the manufacturer's instructions. Ligation products were transformed into JM109 competent cells and plated on LB media plates for blue / white selection. Colonies were selected and grown overnight at 37 ° C. in 96 well plates containing 1.2 ml LB medium. Frozen stocks of all selected colonies were made. Plasmid DNA was purified from the plates using a Beckman's
cDNAライブラリーの構築
以下のとおり、エチレンで処理された葉から全RNAを調製することにより、cDNAライブラリーを構築した。まず、修飾された酸フェノールおよびクロロホルム抽出プロトコールを用いて、タバコ系統58-33のエチレン処理葉から全RNAを抽出した。1グラムの組織を使用し、それを粉砕し、ついで、5mlのフェノール (pH 5.5) および5mlのクロロホルムが加えられた5mlの抽出バッファー(100 mM Tris-HCl, pH 8.5; 200 mM NaCl; 10mM EDTA; 0.5% SDS)中でボルテックスするよう、該プロトコールを修飾した。抽出されたサンプルを遠心分離し、上清を取っておいた。上清が透明になるまで、この抽出工程を2〜3回反復した。微量のフェノールを除去するために、約5mlのクロロホルムを加えた。3倍容量のエタノールおよび1/10容量の3M NaOAc (pH 5.2)を加え、-20℃で1時間保存することにより、合わせた上清画分からRNAを沈殿させた。Corexガラス容器に移した後、該RNA画分を9,000rpm、4℃で45分間遠心分離した。該ペレットを70%エタノールで洗浄し、9,000RPM、4℃で5分間遠心した。該ペレットの乾燥後、該ペレット化RNAを0.5mlのRNアーゼ非含有水に溶解した。変性ホルムアルデヒドゲルおよび分光光度計により全RNAをそれぞれ定性および定量分析した。
Construction of cDNA Library A cDNA library was constructed by preparing total RNA from leaves treated with ethylene as follows. First, total RNA was extracted from ethylene-treated leaves of tobacco line 58-33 using a modified acid phenol and chloroform extraction protocol.
得られた全RNAを使用し、以下のプロトコールによりオリゴ(dT)セルロースプロトコール (Invitrogen)およびミクロ遠心カラム (Invitrogen)を使用してポリA+RNAを単離した。約20mgの全RNAを2回精製に付して、高品質のポリA+RNAを得た。mRNAの高品質性を保証するために、既知完全長遺伝子の変性ホルムアルデヒドゲルおよびそれに続くRT-PCRを行うことにより、ポリA+RNA産物を分析した。 Using the resulting total RNA, poly A + RNA was isolated using an oligo (dT) cellulose protocol (Invitrogen) and a microcentrifuge column (Invitrogen) according to the following protocol. About 20 mg of total RNA was subjected to purification twice to obtain high quality poly A + RNA. In order to ensure high quality of mRNA, poly A + RNA products were analyzed by performing a denatured formaldehyde gel of known full-length gene followed by RT-PCR.
つぎに、ポリA+RNAを鋳型として使用し、cDNA合成キット、ZAP-cDNA合成キットおよびZAP-cDNA Gigapack IIIゴールドクローニングキット (Stratagene, La Jolla, California)を使用してcDNAライブラリーを得た。該方法は、示されているとおりの該製造業者のプロトコールに従い行った。約8μgのポリA+RNAを使用してcDNAライブラリーを構築した。該一次ライブラリーの分析は約2.5×106〜1×107 pfuを示した。IPTGおよびX-galを使用する相補性アッセイにより該ライブラリーの品質バックグラウンド試験を完了した。この場合、組換えプラークはバックグラウンド反応の100倍以上で発現された。 Next, using poly A + RNA as a template, a cDNA library was obtained using a cDNA synthesis kit, a ZAP-cDNA synthesis kit and a ZAP-cDNA Gigapack III gold cloning kit (Stratagene, La Jolla, California). The method was performed according to the manufacturer's protocol as indicated. A cDNA library was constructed using approximately 8 μg of poly A + RNA. Analysis of the primary library showed approximately 2.5 × 10 6 to 1 × 10 7 pfu. The library quality background test was completed by a complementation assay using IPTG and X-gal. In this case, recombinant plaques were expressed more than 100 times the background reaction.
ランダムPCRによる該ライブラリーの、より定量的な分析は、インサートcDNAの平均サイズが約1.2kbであることを示した。該方法は2工程のPCR法を用いるものであった。第1工程では、p450断片から得た予備配列情報に基づいてリバースプライマーを設計した。設計されたリバースプライマーおよびT3(フォワード)プライマーを使用して、cDNAライブラリーから対応遺伝子を増幅した。PCR反応をアガロース電気泳動に付し、高分子量の対応バンドを切り出し、精製し、クローニングし、配列決定した。第2工程においては、リバースプライマー(p450の3'UTRから設計したもの)と共に、フォワードプライマーとしてp450の5'UTRおよび開始コード領域から設計した新たなプライマーを、後続のPCRにおいて使用して、完全長p450クローンを得た。 A more quantitative analysis of the library by random PCR showed that the average size of the insert cDNA was approximately 1.2 kb. The method used a two-step PCR method. In the first step, a reverse primer was designed based on the preliminary sequence information obtained from the p450 fragment. The designed reverse primer and T3 (forward) primer were used to amplify the corresponding gene from the cDNA library. The PCR reaction was subjected to agarose electrophoresis and the corresponding high molecular weight band was excised, purified, cloned and sequenced. In the second step, the reverse primer (designed from the 3'UTR of p450) and a new primer designed from the 5'UTR of p450 and the start coding region as a forward primer were used in subsequent PCR to complete A long p450 clone was obtained.
該p450断片は、リバースプライマー以外は、実施例3に記載の構築されたcDNAライブラリーからのPCR増幅により得た。cDNAインサートの下流の該プラスミド上に位置するT7プライマーをリバースプライマーとして使用した。実施例4に記載のとおりに、PCR断片を単離し、クローニングし、配列決定した。 The p450 fragment was obtained by PCR amplification from the constructed cDNA library described in Example 3, except for the reverse primer. A T7 primer located on the plasmid downstream of the cDNA insert was used as a reverse primer. PCR fragments were isolated, cloned and sequenced as described in Example 4.
構築されたcDNAライブラリーから、このPCR法により完全長p450遺伝子を単離した。遺伝子特異的リバースプライマー(p450断片の下流配列から設計されたもの)およびフォワードプライマー(ライブラリープラスミド上のT3)を使用して完全長遺伝子を得た。PCR断片を単離し、クローニングし、配列決定した。必要に応じて、第2のPCR工程を行った。この第2の工程においては、p450クローンの3'UTRから設計したリバースプライマーと共に、クローン化p450の5'UTRから設計した新たなフォワードプライマーを、後続PCR反応において使用して、完全長p450クローンを得た。ついで該クローンを配列決定した。 The full-length p450 gene was isolated from the constructed cDNA library by this PCR method. A full length gene was obtained using a gene specific reverse primer (designed from the downstream sequence of the p450 fragment) and a forward primer (T3 on the library plasmid). PCR fragments were isolated, cloned and sequenced. A second PCR step was performed as needed. In this second step, a new primer designed from the 5′UTR of the cloned p450 along with a reverse primer designed from the 3′UTR of the p450 clone is used in subsequent PCR reactions to generate the full-length p450 clone. Obtained. The clone was then sequenced.
クローン化断片の特徴づけ - リバースサザンブロット分析
示差的発現を検出するために、前記実施例において特定されたすべてのp450クローン上で、非放射性ラージスケールリバースサザンブロットアッセイを行った。異なるp450クラスター間の発現のレベルは非常に異なることが観察された。更に、高い発現を示すクローン上でリアルタイム検出を行った。
Cloned Fragment Characterization-Reverse Southern Blot Analysis A non-radioactive large scale reverse Southern blot assay was performed on all p450 clones identified in the previous example to detect differential expression. It was observed that the level of expression between different p450 clusters was very different. Furthermore, real-time detection was performed on clones showing high expression.
非放射性サザンブロット法は以下のとおりに行った。
1)実施例2に記載のとおりに、Qiagen Rnaeasyキットを使用して、エチレンで処理された及び処理されていない変換体(58-33)および非変換体(58-25)葉から全RNAを抽出した。
Non-radioactive Southern blotting was performed as follows.
1) Total RNA from transformed (58-33) and untransformed (58-25) and untransformed leaves treated with ethylene using the Qiagen Rnaeasy kit as described in Example 2 Extracted.
2)前記工程で得たポリA+富化RNAに由来する一本鎖cDNAをビオチン尾部標識することにより、プローブを作製した。この標識一本鎖cDNAは、プライマー (Promega)としてビオチン化オリゴdTを使用すること以外は実施例3に記載のとおりの変換体および非変換体全RNA(Invitrogen)のRT-PCRにより作製した。これらを、クローン化DNAにハイブリダイズさせるためのプローブとして使用した。 2) A probe was prepared by labeling the single-stranded cDNA derived from the poly A + -enriched RNA obtained in the above step with a biotin tail. This labeled single-stranded cDNA was prepared by RT-PCR of converted and non-converted total RNA (Invitrogen) as described in Example 3 except that biotinylated oligo dT was used as a primer (Promega). These were used as probes for hybridizing to cloned DNA.
3)プラスミドDNAを制限酵素EcoR1で消化し、アガロースゲル上で泳動させた。ゲルを同時に乾燥させ、2つのナイロンメンブレン(Biodyne B)にトランスファーした。1つのメンブレンを変換体プローブでハイブリダイズさせ、もう1つを非変換体プローブでハイブリダイズさせた。ハイブリダイゼーション前にメンブレンをUV架橋(自動架橋セッティング, 254nm, Stratagene, Stratalinker)に付した。 3) Plasmid DNA was digested with the restriction enzyme EcoR1 and run on an agarose gel. The gel was simultaneously dried and transferred to two nylon membranes (Biodyne B). One membrane was hybridized with the converter probe and the other was hybridized with the non-converter probe. Prior to hybridization, the membrane was subjected to UV crosslinking (autocrosslinking setting, 254 nm, Stratagene, Stratalinker).
あるいは、p-GEMプラスミド、T3およびSP6の両アーム上に位置する配列をプライマーとして使用して、該インサートを各プラスミドからPCR増幅した。96ウェルReady-to-run アガロースゲル上で泳動させることにより、PCR産物を分析した。確認されたインサートを2つのナイロンメンブレン上にドット化(dot)した。1つのメンブレンを変換体プローブでハイブリダイズさせ、もう1つを非変換体プローブでハイブリダイズさせた。 Alternatively, the insert was PCR amplified from each plasmid using primers located on both arms of the p-GEM plasmid, T3 and SP6. PCR products were analyzed by running on a 96-well Ready-to-run agarose gel. The identified insert was doted onto two nylon membranes. One membrane was hybridized with the converter probe and the other was hybridized with the non-converter probe.
4)該膜をハイブリダイズさせ、洗浄ストリンジェンシーを変更すること以外は製造業者(Enzo MaxSence kit, Enzo Diagnostics, Inc, Farmingdale, NY)の指示に従い洗浄した。該膜をハイブリダイゼーションバッファー(界面活性剤およびハイブリダイゼーション増強剤を含有する2×SSC緩衝化ホルムアミド)で42℃で30分間、プレハイブリダイズさせ、10μlの変性プローブで42℃で一晩ハイブリダイズさせた。ついで該膜を1×ハイブリダイゼーション洗浄バッファー中、室温で10分間(1回)および68℃で15分間(4回)洗浄した。該検出法のための該膜の準備は整った。 4) The membrane was washed according to the manufacturer's instructions (Enzo MaxSence kit, Enzo Diagnostics, Inc, Farmingdale, NY) except that the washing stringency was changed. The membrane is prehybridized with hybridization buffer (2 × SSC buffered formamide containing surfactant and hybridization enhancer) for 30 minutes at 42 ° C. and hybridized overnight at 42 ° C. with 10 μl denaturing probe. It was. The membrane was then washed in 1 × hybridization wash buffer for 10 minutes at room temperature (1 time) and 15 minutes at 68 ° C. (4 times). The membrane was ready for the detection method.
5)それらの洗浄された膜を、製造業者の検出指示書(Enzo Diagnostics, Inc.)に記載されているとおりにアルカリホスファターゼ標識およびそれに続くNBT/BCIP比色検出により検出した。該膜を1×ブロッキング溶液で室温で1時間ブロッキングし、1×検出試薬で10分間(3回)洗浄し、1×前現像(predevelopment)反応バッファーで5分間(2回)洗浄し、ついで該ドットが出現するまで、現像溶液中、30〜45分間、該ブロットを現像した。すべての試薬は製造業者(Enzo Diagnostics, Inc)から入手した。また、KPLサザンハイブリダイゼーションおよび検出キットを製造業者の指示(KPL, Gaithersburg, Maryland)に従い使用して、ラージスケールリバースサザンアッセイを行った。 5) The washed membranes were detected by alkaline phosphatase labeling followed by NBT / BCIP colorimetric detection as described in the manufacturer's detection instructions (Enzo Diagnostics, Inc.). The membrane is blocked with 1 × blocking solution for 1 hour at room temperature, washed with 1 × detection reagent for 10 minutes (3 times), washed with 1 × predevelopment reaction buffer for 5 minutes (2 times), then the The blot was developed for 30-45 minutes in developer solution until dots appeared. All reagents were obtained from the manufacturer (Enzo Diagnostics, Inc). Large scale reverse Southern assays were also performed using the KPL Southern hybridization and detection kit according to the manufacturer's instructions (KPL, Gaithersburg, Maryland).
クローンのキャラクタライゼーション - ノーザンブロット分析
サザンブロット分析の代わりに、ノーザンブロットアッセイの実施例において記載されているとおりに、いくつかの膜をハイブリダイズさせ検出した。以下のとおりに、Nicotianaにおいて示差的に発現されたmRNAを検出するために、ノーザンハイブリダイゼーションを用いた。
Clone characterization-Northern blot analysis Instead of Southern blot analysis, several membranes were hybridized and detected as described in the Examples of Northern blot assays. Northern hybridization was used to detect differentially expressed mRNA in Nicotiana as follows.
クローン化p450(Megaprime DNA Labelling Systems, Amersham Biosciences)からプローブを調製するために、ランダムプライミング法を用いた。以下の成分を混合した:25ngの変性DNA鋳型;4ulの各未標識dTTP、dGTPおよびdCTP;5μlの反応バッファー;P32標識dATPおよび2ulのクレノウI;ならびにH2O(該反応液を50μlに調整する)。該混合物を37℃で1〜4時間インキュベートし、2μlの0.5M EDTAで停止させた。使用前に95℃で5分間のインキュベーションにより、該プローブを変性させた。 A random priming method was used to prepare probes from cloned p450 (Megaprime DNA Labeling Systems, Amersham Biosciences). The following components were mixed: 25 ng denatured DNA template; 4 ul of each unlabeled dTTP, dGTP and dCTP; 5 μl reaction buffer; P 32 labeled dATP and 2 ul Klenow I; and H 2 O (the reaction in 50 μl) adjust). The mixture was incubated at 37 ° C. for 1-4 hours and stopped with 2 μl 0.5 M EDTA. The probe was denatured by incubation at 95 ° C. for 5 minutes before use.
いくつかのペアのタバコ系統の、エチレンで処理された及び処理されていない新鮮な葉から、RNAサンプルを調製した。いくつかの場合には、ポリA+富化RNAを使用した。約15μgの全RNAまたは1.8μgのmRNA(実施例5に記載のとおりのRNAおよびmRNA抽出の方法)をDEPC H2O (5〜10μl)で等容量にした。同じ容量のローディングバッファー(1×MOPS; 18.5% ホルムアルデヒド; 50% ホルムアミド; 4 % Ficoll400; ブロモフェノールブルー)および0.5μlのEtBr (0.5 μg/μl)を加えた。ついで電気泳動による該RNAの分離のための準備において、該サンプルを変性させた。 RNA samples were prepared from fresh leaves treated and untreated with ethylene from several pairs of tobacco lines. In some cases, poly A + enriched RNA was used. Approximately 15 μg total RNA or 1.8 μg mRNA (RNA and mRNA extraction method as described in Example 5) was made up to volume with DEPC H 2 O (5-10 μl). The same volume of loading buffer (1 × MOPS; 18.5% formaldehyde; 50% formamide; 4% Ficoll400; bromophenol blue) and 0.5 μl EtBr (0.5 μg / μl) were added. The sample was then denatured in preparation for the separation of the RNA by electrophoresis.
サンプルを、1×MOPバッファー(0.4 M モルホリノプロパン硫酸; 0.1M 酢酸Na-3×H2O; 10mM EDTA; NaOHでpH 7.2に調節)を含有するホルムアルデヒドゲル(1% アガロース, 1×MOPS, 0.6M ホルムアルデヒド)上の電気泳動に付した。10×SSCバッファー(1.5M NaCl; 0.15M クエン酸Na)中、毛管法により、RNAを24時間にわたってHybond-N+メンブレン(Nylon, Amersham Pharmacia Biotech)トランスファーした。ハイブリダイゼーションの前に、RNAサンプルを含有するメンブレンをUV架橋させた(自動架橋セッティング, 254nm, Stratagene, Stratalinker)に付した。 Samples were formaldehyde gel (1% agarose, 1 × MOPS, 0.6M formaldehyde) containing 1 × MOP buffer (0.4 M morpholinopropane sulfate; 0.1 M Na-3 × H2O; 10 mM EDTA; adjusted to pH 7.2 with NaOH) ) Subjected to the above electrophoresis. RNA was transferred to Hybond-N + membrane (Nylon, Amersham Pharmacia Biotech) for 24 hours by capillary method in 10 × SSC buffer (1.5 M NaCl; 0.15 M Na citrate). Prior to hybridization, the membrane containing the RNA sample was subjected to UV crosslinking (autocrosslinking setting, 254 nm, Stratagene, Stratalinker).
該メンブレンを5〜10mlのプレハイブリダイゼーションバッファー(5×SSC; 50% ホルムアルミド; 5×デンハルト液; 1% SDS; 100μg/ml 熱変性せん断非相同DNA)で42℃で1〜4時間プレハイブリダイズさせた。古いプレハイブリダイゼーションバッファーを捨て、新たなプレハイブリダイゼーションバッファーおよびプローブを加えた。該ハイブリダイゼーションは42℃で一晩行った。該膜を2×SSCで室温で15分間洗浄し、ついで2×SSCで洗浄した。 Pre-hybridize the membrane with 5-10 ml prehybridization buffer (5x SSC; 50% formaluminide; 5x Denhardt's solution; 1% SDS; 100 μg / ml heat-denatured shear heterologous DNA) at 42 ° C for 1-4 hours Made soy. The old prehybridization buffer was discarded and new prehybridization buffer and probe were added. The hybridization was performed overnight at 42 ° C. The membrane was washed with 2 × SSC for 15 minutes at room temperature and then with 2 × SSC.
以下の表1に示すとおり、ノーザンブロットおよびリバースサザンブロットは、非誘導植物との対比においてどの遺伝子がエチレン処理により誘導されたかを決定するのに有用であった。興味深いことに、該変換体および非変換体において、必ずしもすべての断片が同様に影響を受けたわけではなかった。シトクロムp450断片のいくつかを部分的に配列決定して、それらの構造関連性を決定した。ついで、目的の完全長遺伝子クローンを単離し特徴づけるために、この情報を用いた。
エチレン処理により誘導された変換体および非変換体バーレー系統から得たタバコ組織上で完全長クローンを使用して、ノーザン分析を行った。この分析を用いて、エチレン誘導性非変換体バーレー系統との対比においてエチレン誘導性変換体系統における発現の上昇を示す完全長クローンを特定した。そのように行うことにより、変換体系統と非変換体系統との間の葉成分における生化学的相違を比較することにより、完全長クローンの機能関連性が決定されうる。 Northern analysis was performed using full-length clones on tobacco tissue from converter and non-converter Burley lines derived by ethylene treatment. This analysis was used to identify full-length clones that showed increased expression in ethylene-induced converter lines compared to ethylene-induced non-converter Burley lines. By doing so, the functional relevance of the full-length clone can be determined by comparing the biochemical differences in leaf components between converter and non-converter lines.
以下の表2に示すとおり、+により示される非変換体処理組織の発現と比較して、変換体エチレン処理組織においては、6個のクローンが、++および+++により示される有意に高い発現を示した。これらのクローンの全ては、エチレン処理されていない変換体および非変換体系統において、発現をほとんど又は全く示さなかった。
クローン化遺伝子によりコードされるポリペプチドの免疫検出
3個のp450クローンからの20〜22アミノ酸長に対応するペプチド領域を、(1)他のクローンに対して、より低い相同性を有する又は相同性を有さないこと、および(2)良好な親水性および抗原性を有することに関して選択した。それぞれのp450クローンから選択したペプチド領域のアミノ酸配列を以下に列挙する。該合成ペプチドをKHL(キーホールリンペットヘモシアニン)と共役させ、ついでウサギに注射した。4回目の注射(Alpha Diagnostic Intl. Inc. San Antonio, TX)の2週間後および4週間後に抗血清を集めた。
Immunodetection of polypeptides encoded by cloned genes.
Peptide regions corresponding to 20-22 amino acids in length from 3 p450 clones (1) have lower or no homology to other clones, and (2) good Selected for having hydrophilicity and antigenicity. The amino acid sequences of peptide regions selected from each p450 clone are listed below. The synthetic peptide was conjugated with KHL (keyhole limpet hemocyanin) and then injected into rabbits. Antisera were collected 2 and 4 weeks after the fourth injection (Alpha Diagnostic Intl. Inc. San Antonio, TX).
D234-AD1 DIDGSKSKLVKAHRKIDEILG (配列番号2266)
D90a-BB3 RDAFREKETFDENDVEELNY (配列番号163)
D89-AB1 FKNNGDEDRHFSQKLGDLADKY (配列番号2267)
ウエスタンブロット分析により、タバコ植物組織からの標的タンパク質に対する交差活性に関して抗血清を検査した。変換体および非変換体系統のエチレン処理(0〜40時間)中葉から粗タンパク質抽出物を得た。RC DC Protein Assay Kit (BIO-RAD)を該製造業者のプロトコールに従い使用して、該抽出物のタンパク質濃度を測定した。
D234-AD1 DIDGSKSKLVKAHRKIDEILG (SEQ ID NO: 2266)
D90a-BB3 RDAFREKETFDENDVEELNY (SEQ ID NO: 163)
D89-AB1 FKNNGDEDRHFSQKLGDLADKY (SEQ ID NO: 2267)
Antisera were tested for cross-activity against target proteins from tobacco plant tissue by Western blot analysis. Crude protein extracts were obtained from ethylene-treated (0-40 hours) middle leaves of converter and non-converter lines. The protein concentration of the extract was measured using RC DC Protein Assay Kit (BIO-RAD) according to the manufacturer's protocol.
2μgのタンパク質を各レーン上にローディングし、Laemmli SDS-PAGE系を使用して該タンパク質を10%〜20%勾配ゲル上で分離した。Trans-Blot Semi-Dry セル(BIO-RAD)を使用して該タンパク質をゲルからPROTRAN Nitrocellulose Transfer Membranes (Schleicher & Schuell)にトランスファーした。ECL Advance Western Blotting Detection Kit (Amersham Biosciences)を使用して、標的p450タンパク質を検出し可視化した。該合成KLHコンジュゲートに対する一次抗体をウサギにおいて調製した。ペルオキシダーゼに共役した、ウサギIgGに対する二次抗体を、Sigmaから購入した。一次抗体および二次抗体は共に1:1000の希釈度で使用した。抗体は、該ウエスタンブロット上の単一のバンドに対して強力な反応性を示した。このことは、該抗血清が、関心のある標的ペプチドに対して単一特異性であったことを示している。また、抗血清はKLH共役合成ペプチドに対して交差反応性であった。 2 μg of protein was loaded on each lane and the protein was separated on a 10% to 20% gradient gel using the Laemmli SDS-PAGE system. The protein was transferred from the gel to PROTRAN Nitrocellulose Transfer Membranes (Schleicher & Schuell) using a Trans-Blot Semi-Dry cell (BIO-RAD). The target p450 protein was detected and visualized using the ECL Advance Western Blotting Detection Kit (Amersham Biosciences). Primary antibodies against the synthetic KLH conjugate were prepared in rabbits. A secondary antibody against rabbit IgG conjugated to peroxidase was purchased from Sigma. Both primary and secondary antibodies were used at a dilution of 1: 1000. The antibody showed strong reactivity against a single band on the Western blot. This indicates that the antiserum was monospecific for the target peptide of interest. The antiserum was also cross-reactive with the KLH conjugated synthetic peptide.
核酸の同一性、単離された核酸断片の構造関連性およびGeneChip(登録商標)ハイブリダイゼーション
100個を超えるクローン化p450断片を、それらの構造関連性を決定するためのノーザンブロット分析と共に配列決定した。該アプローチは、p450遺伝子のカルボキシル末端付近に位置する2つの共通のp450モチーフのいずれかに基づくフォワードプライマーを使用するものであった。該フォワードプライマーはシトクロムp450モチーフFXPERF (配列番号2268)またはGRRXCP(A/G) (配列番号2269)に対応するものであった。リバースプライマーとしては、ポリA尾部またはpGEMプラスミドの両アーム上に位置するプラスミドSP6またはT7からの標準的なプライマーを使用した。用いたプロトコールを以下に説明する。
Nucleic acid identity, structural relevance of isolated nucleic acid fragments and GeneChip® hybridization
More than 100 cloned p450 fragments were sequenced with Northern blot analysis to determine their structural relevance. The approach used a forward primer based on one of two common p450 motifs located near the carboxyl terminus of the p450 gene. The forward primer corresponded to cytochrome p450 motif FXPERF (SEQ ID NO: 2268) or GRRXCP (A / G) (SEQ ID NO: 2269). As reverse primers, standard primers from the plasmid SP6 or T7 located on both arms of the poly A tail or pGEM plasmid were used. The protocol used is described below.
製造業者のプロトコール(Beckman Coulter)に従い出発二本鎖DNAの濃度を推定するために、分光光度法を用いた。該鋳型を適当な濃度まで水で希釈し、95℃で2分間の加熱により変性させ、ついで氷上に配置した。該配列決定反応は、0.5〜10μlの変性DNA鋳型、2μlの1.6pmolのフォワードプライマー、8μlのDTCS Quick Start Master Mixを使用して氷上で調製し、全容量を水で20μlにした。熱サイクルプログラムは以下のサイクルの30サイクルよりなるものであった:96℃で20秒間、50℃で20秒間および60℃で4分間ならびにそれに続く4℃での維持。 Spectrophotometry was used to estimate the concentration of starting double stranded DNA according to the manufacturer's protocol (Beckman Coulter). The template was diluted with water to an appropriate concentration, denatured by heating at 95 ° C. for 2 minutes, and then placed on ice. The sequencing reaction was prepared on ice using 0.5-10 μl denatured DNA template, 2 μl 1.6 pmol forward primer, 8 μl DTCS Quick Start Master Mix, bringing the total volume to 20 μl with water. The thermal cycle program consisted of 30 cycles of the following cycles: 96 ° C. for 20 seconds, 50 ° C. for 20 seconds and 60 ° C. for 4 minutes followed by 4 ° C. maintenance.
5μlの停止バッファー(等容量の3M NaOAcおよび100mM EDTAおよび1μlの20mg/ml グリコーゲン)を加えることにより、該配列決定反応を停止させた。該サンプルを60μlの冷95%エタノールで沈殿させ、6000×gで6分間遠心分離した。エタノールを捨てた。該ペレットを200μlの冷70%エタノールで2回洗浄した。該ペレットが乾燥した後、40μlのSLS溶液を加え、該ペレットを再懸濁させた。鉱油層を重層し、更なる分析のために該サンプルをCEQ 8000 Automated Sequencer上に配置した。 The sequencing reaction was stopped by adding 5 μl of stop buffer (equal volumes of 3M NaOAc and 100 mM EDTA and 1 μl of 20 mg / ml glycogen). The sample was precipitated with 60 μl cold 95% ethanol and centrifuged at 6000 × g for 6 minutes. Ethanol was discarded. The pellet was washed twice with 200 μl cold 70% ethanol. After the pellet dried, 40 μl of SLS solution was added and the pellet was resuspended. The mineral oil layer was overlaid and the sample was placed on a CEQ 8000 Automated Sequencer for further analysis.
核酸配列を確認するために、p450遺伝子のFXPERF (配列番号2268) またはGRRXCP(A/G)(配列番号2269)領域に対するフォワードプライマー、あるいはプラスミドまたはポリA尾部に対するリバースプライマーを使用して、該核酸配列を両方向に再び配列決定した。すべての配列決定は両方向に少なくとも2回行った。 To confirm the nucleic acid sequence, use a forward primer for the FXPERF (SEQ ID NO: 2268) or GRRXCP (A / G) (SEQ ID NO: 2269) region of the p450 gene, or a reverse primer for the plasmid or poly A tail. The sequence was resequenced in both directions. All sequencing was performed at least twice in both directions.
シトクロムp450断片の核酸配列を、GRRXCP(A/G) (配列番号2269)モチーフをコードする領域の後の第1核酸から終止コドンまでに対応するコード領域に関してお互いに比較した。p450タンパク質間の遺伝的多様性の指標として、この領域を選択した。他の植物種の場合と同様に、70遺伝子を超える多数の遺伝的に異なるp450遺伝子が観察された。核酸配列の比較に際して、該遺伝子は、配列同一性に基づいて、異なる配列群内に配置されうることが判明した。p450メンバーの最良の特有の群分けは、75%またはそれ以上の核酸同一性配列を有する配列であることが見出された(例えば、参照により本明細書に組み入れるUS 2004/0162420特許出願公開のTable 1を参照されたい)。同一性(%)の減少は有意に大きな群を与えた。好ましい群分けは、81%またはそれ以上の核酸同一性を有する配列で、より好ましい群分けは、91%またはそれ以上の核酸同一性を有する配列で、最も好ましい群分けは、99%またはそれ以上の核酸同一性を有する配列で認められた。それらの群のほとんどは少なくとも2個のメンバーを、そしてしばしば3個以上のメンバーを含有していた。他のものは反復的には見出されなかった。このことは、採用したアプローチが、使用した組織において低発現mRNAおよび高発現mRNAの両方を単離し得たことを示唆している。
The nucleic acid sequences of cytochrome p450 fragments were compared to each other with respect to the coding region corresponding to the first nucleic acid after the region encoding the GRRXCP (A / G) (SEQ ID NO: 2269) motif to the stop codon. This region was selected as an indicator of genetic diversity between p450 proteins. As with other plant species, a number of genetically distinct p450 genes over 70 genes were observed. Upon comparison of nucleic acid sequences, it has been found that the genes can be placed in different sequences based on sequence identity. The best unique groupings of p450 members have been found to be sequences having 75% or more nucleic acid identity sequences (eg, published in
75%またはそれ以上の核酸同一性に基づき、2つのシトクロムp450群が、該群該のものとは遺伝的に異なるかつてのタバコシトクロム遺伝子に対して核酸配列同一性を含有することが判明した。群23は、表3Aで用いるパラメーターにおいて、GenBank配列GI:1171579 (配列番号2270) (CAA64635)およびGI:14423327 (配列番号2271) (またはAAK62346)に対して核酸同一性を示した。GI:1171579 (配列番号2270)は群23のメンバーに対して96.9%〜99.5%の範囲の核酸同一性を有し、一方、GI:14423327 (配列番号2271)はこの群に対して95.4%〜96.9%の範囲の同一性を示した。群31のメンバーは、GI:14423319 (配列番号2272) (AAK62342)のGenBankに報告されている配列に対して76.7%〜97.8%の核酸同一性を有していた。表3Aのその他のp450同一性群はいずれも、既に報告されているNicotiana p450遺伝子に対して、表3Aにおいて用いるパラメーター同一性を含有していなかった。
Based on 75% or more nucleic acid identity, it was found that two cytochrome p450 groups contain nucleic acid sequence identity to a former tobacco cytochrome gene that is genetically different from that group.
Nicotiana植物からの各群の追加的なメンバーを優先的に同定し単離するためには、群に関して、適当な核酸縮重プローブでコンセンサス配列を誘導することが可能であろう。 In order to preferentially identify and isolate additional members of each group from Nicotiana plants, it would be possible to derive consensus sequences with appropriate nucleic acid degenerate probes for the group.
表3A:Nicotiana p450核酸配列同一性群
群 断片
1 D58-BG7 (配列番号10), D58-AB1 (配列番号12); D58-BE4 (配列番号16)
2 D56-AH7 (配列番号18); D13a-5 (配列番号20)
3 D56-AG10 (配列番号22); D35-33 (配列番号24); D34-62 (配列番号26)
4 D56-AA7 (配列番号28); D56-AE1 (配列番号30); 185-BD3 (配列番号152)
5 D35-BB7 (配列番号32); D177-BA7 (配列番号34); D56A-AB6 (配列番号36); D144-AE2 (配列番号38)
6 D56-AG11 (配列番号40); D179-AA1 (配列番号42)
7 D56-AC7 (配列番号44); D144-AD1 (配列番号46)
8 D144-AB5 (配列番号48)
9 D181-AB5 (配列番号50); D73-AC9 (配列番号52)
10 D56-AC12 (配列番号54)
11 D58-AB9 (配列番号56); D56-AG9 (配列番号58); D56-AG6 (配列番号60); D35-BG11 (配列番号62); D35-42 (配列番号64); D35-BA3 (配列番号66); D34-57 (配列番号68); D34-52 (配列番号70); D34-25 (配列番号72)
12 D56-AD10 (配列番号74)
13 56-AA11 (配列番号76)
14 D177-BD5 (配列番号78); D177-BD7 (配列番号92)
15 D56A-AG10 (配列番号80); D58-BC5 (配列番号82); D58-AD12 (配列番号84)
16 D56-AC11 (配列番号86); D35-39 (配列番号88); D58-BH4 (配列番号90); D56-AD6 (配列番号96)
17 D73A-AD6 (配列番号98); D70A-BA11 (配列番号100)
18 D70A-AB5 (配列番号104); D70A-AA8 (配列番号106)
19 D70A-AB8 (配列番号108); D70A-BH2 (配列番号110); D70A-AA4 (配列番号112)
20 D70A-BA1 (配列番号114); D70A-BA9 (配列番号116)
21 D70A-BD4 (配列番号118)
22 D181-AC5 (配列番号120); D144-AH1 (配列番号122); D34-65 (配列番号124)
23 D35-BG2 (配列番号126)
24 D73A-AH7 (配列番号128)
25 D58-AA1 (配列番号130); D185-BC1 (配列番号142); D185-BG2 (配列番号144)
26 D73-AE10 (配列番号132)
27 D56-AC12 (配列番号134)
28 D177-BF7 (配列番号136); D185-BE1 (配列番号146); D185-BD2 (配列番号148)
29 D73A-AG3 (配列番号138)
30 D70A-AA12 (配列番号140); D176-BF2 (配列番号94)
31 D176-BC3 (配列番号154)
32 D176-BB3 (配列番号 156)
33 D186-AH4 (配列番号14)
Table 3A : Nicotiana p450 nucleic acid sequence identity group
Group fragment
1 D58-BG7 (SEQ ID NO: 10), D58-AB1 (SEQ ID NO: 12); D58-BE4 (SEQ ID NO: 16)
2 D56-AH7 (SEQ ID NO: 18); D13a-5 (SEQ ID NO: 20)
3 D56-AG10 (SEQ ID NO: 22); D35-33 (SEQ ID NO: 24); D34-62 (SEQ ID NO: 26)
4 D56-AA7 (SEQ ID NO: 28); D56-AE1 (SEQ ID NO: 30); 185-BD3 (SEQ ID NO: 152)
5 D35-BB7 (SEQ ID NO: 32); D177-BA7 (SEQ ID NO: 34); D56A-AB6 (SEQ ID NO: 36); D144-AE2 (SEQ ID NO: 38)
6 D56-AG11 (SEQ ID NO: 40); D179-AA1 (SEQ ID NO: 42)
7 D56-AC7 (SEQ ID NO: 44); D144-AD1 (SEQ ID NO: 46)
8 D144-AB5 (SEQ ID NO: 48)
9 D181-AB5 (SEQ ID NO: 50); D73-AC9 (SEQ ID NO: 52)
10 D56-AC12 (SEQ ID NO: 54)
11 D58-AB9 (SEQ ID NO: 56); D56-AG9 (SEQ ID NO: 58); D56-AG6 (SEQ ID NO: 60); D35-BG11 (SEQ ID NO: 62); D35-42 (SEQ ID NO: 64); D35-BA3 ( SEQ ID NO: 66); D34-57 (SEQ ID NO: 68); D34-52 (SEQ ID NO: 70); D34-25 (SEQ ID NO: 72)
12 D56-AD10 (SEQ ID NO: 74)
13 56-AA11 (SEQ ID NO: 76)
14 D177-BD5 (SEQ ID NO: 78); D177-BD7 (SEQ ID NO: 92)
15 D56A-AG10 (SEQ ID NO: 80); D58-BC5 (SEQ ID NO: 82); D58-AD12 (SEQ ID NO: 84)
16 D56-AC11 (SEQ ID NO: 86); D35-39 (SEQ ID NO: 88); D58-BH4 (SEQ ID NO: 90); D56-AD6 (SEQ ID NO: 96)
17 D73A-AD6 (SEQ ID NO: 98); D70A-BA11 (SEQ ID NO: 100)
18 D70A-AB5 (SEQ ID NO: 104); D70A-AA8 (SEQ ID NO: 106)
19 D70A-AB8 (SEQ ID NO: 108); D70A-BH2 (SEQ ID NO: 110); D70A-AA4 (SEQ ID NO: 112)
20 D70A-BA1 (SEQ ID NO: 114); D70A-BA9 (SEQ ID NO: 116)
21 D70A-BD4 (SEQ ID NO: 118)
22 D181-AC5 (SEQ ID NO: 120); D144-AH1 (SEQ ID NO: 122); D34-65 (SEQ ID NO: 124)
23 D35-BG2 (SEQ ID NO: 126)
24 D73A-AH7 (SEQ ID NO: 128)
25 D58-AA1 (SEQ ID NO: 130); D185-BC1 (SEQ ID NO: 142); D185-BG2 (SEQ ID NO: 144)
26 D73-AE10 (SEQ ID NO: 132)
27 D56-AC12 (SEQ ID NO: 134)
28 D177-BF7 (SEQ ID NO: 136); D185-BE1 (SEQ ID NO: 146); D185-BD2 (SEQ ID NO: 148)
29 D73A-AG3 (SEQ ID NO: 138)
30 D70A-AA12 (SEQ ID NO: 140); D176-BF2 (SEQ ID NO: 94)
31 D176-BC3 (SEQ ID NO: 154)
32 D176-BB3 (SEQ ID NO: 156)
33 D186-AH4 (SEQ ID NO: 14)
エチレン活性化後に同質遺伝子系統に近い非変換体と変換体との間の示差的発現パターンを有する遺伝子を特定するために、GeneChip(登録商標)マイクロアレイハイブリダイゼーション(Affymetrix Inc.; Santa Clara, CA)を使用した。チップサイズは18ミクロンであり、アレイフォーマットは100〜2187であり、528個のプローブセット(11,628個のプローブ)を収容する。マイクロアレイの結果を、独立して証明するために、7個のペアのハイブリダイゼーションを用いた。これらは、4407-33/4407-25の未処理バーレータバコサンプルの1個のペア(変換体/非変換体)、エチレン処理された4407-33/4407-25サンプルの4個のペア、エチレン処理されたいぶし(dark)タバコNL Madole/181の1個のペア、ニコチン変換に関して同質に近い系統のもう1個のペア、および4407=33/25の天然で老化した葉の1個のペア(表3B)よりなるものであった。
Genome Explorations, Inc. (Memphis, TN)による検出装置を使用して作成したエクスプレッションレポートにより示されるとおり、全14セットのハイブリダイゼーションは成功した。メインレポートは、ノイズ、スケール因子、バックグラウンド、全プローブセット、存在する及び存在しないプローブセットの数および比率(%)、ハウスキーピング対照のシグナル強度の分析を含んでいた。ついで、ソフトウェアGCOSを他のソフトウェアと共に使用して、該データを分析し、表示した。処理ペア間のシグナル比較を行い、すべてのハイブリダーゼーションのすべてのそれぞれのプローブに関する全体のデータをまとめ、発現データも分析した。シグナル強度に基づく結果は、2つの遺伝子(D121-AA8およびD120-AH4)および1つの断片(D121-AA8の部分断片であるD35-BG11)だけが、エチレン処理変換体系統において、非変換体系統と比較した場合に、再現可能な誘導を受けることを示した。変換体系統、例えばバーレータバコ品種4407-33における遺伝子のシグナルは、関連非変換体同質遺伝子系統4407-25における遺伝子のシグナルに対する比として測定された。エチレン処理を行わなかった場合には、すべての遺伝子に関する非変換体シグナルに対する変換体シグナルの比は1.00に近かった。バックグラウンドの相違の影響を排除するために、正規化されたシグナル比も計算した。正規化シグナル比は、処理ペア比を対応非ペア比で割り算することにより得られる。エチレン処理および分析に際して、2つの遺伝子(D121-AA8およびD120-AH4)は、4つの異なる分析による測定では、非変換体系統との対比において変換体系統において誘導されることが確認された。これらの2つの遺伝子は99.8%の相対相同性を共有し、変換体品種におけるそれらの相対ハイブリダイゼーションシグナルはそれらの非変換体対応物におけるシグナルより約2〜22倍高かった。正規化された比に基づけば、2つのアクチン様内部対照クローンは変換体系統においては誘導されなかった。また、断片(D35-BG11)(そのコード領域の全体はD121-AA8およびD120-AH4遺伝子内に含有されている)は、ペアになった同質遺伝子変換体および非変換体系統の同じサンプルにおいて高度に誘導された。更に、D121-AA8およびD120-AH4遺伝子は同質遺伝子いぶし(dark)タバコペアNL Madoleおよび181の変換体系統において強力に誘導された(8〜28倍)。したがって、このことは、変換体系統におけるこれらの遺伝子のエチレン誘導がイン・プランタ(in planta)応答であったことを示している。4407-33/25の天然老化サンプルハイブリダイゼーションから行った比較においても、同じ遺伝子が特定された。D121-AA8に特異的なプライマーを使用するこれらの材料のRT-PCRアッセイは、この遺伝子に関するマイクロアレイの結果を証明した。 All 14 sets of hybridization were successful, as shown by an expression report generated using a detector by Genome Explorations, Inc. (Memphis, TN). The main report included analysis of noise, scale factor, background, total probe set, number and percentage of probe sets present and absent, and signal intensity of housekeeping controls. The software GCOS was then used with other software to analyze and display the data. Signal comparisons between treatment pairs were made, and overall data for all individual probes of all hybridizations was summarized and expression data was also analyzed. Results based on signal intensity indicated that only two genes (D121-AA8 and D120-AH4) and one fragment (D35-BG11, which is a partial fragment of D121-AA8), were found in non-converter lines in ethylene-treated converter lines. When compared with, it was shown to receive reproducible induction. The signal of the gene in a converter line, for example Burley tobacco variety 4407-33, was measured as a ratio to the signal of the gene in the related non-converter isogenic line 4407-25. In the absence of ethylene treatment, the ratio of converter signal to non-converter signal for all genes was close to 1.00. To eliminate the effect of background differences, normalized signal ratios were also calculated. The normalized signal ratio is obtained by dividing the treatment pair ratio by the corresponding non-pair ratio. Upon ethylene treatment and analysis, the two genes (D121-AA8 and D120-AH4) were confirmed to be induced in the converter line in contrast to the non-converter line, as measured by four different analyses. These two genes shared 99.8% relative homology and their relative hybridization signals in the transformant varieties were about 2-22 times higher than the signals in their non-transformant counterparts. Based on the normalized ratio, two actin-like internal control clones were not induced in the converter lines. In addition, the fragment (D35-BG11), whose entire coding region is contained within the D121-AA8 and D120-AH4 genes, is highly expressed in the same sample of paired isogenic and non-converter lines. Was guided to. Furthermore, the D121-AA8 and D120-AH4 genes were strongly induced (8-28 fold) in the transformant lines of the isogenic tobacco pair NL Madole and 181. This therefore indicates that ethylene induction of these genes in the converter lineage was an in planta response. The same gene was identified in a comparison made from 4407-33 / 25 natural aging sample hybridization. RT-PCR assays of these materials using primers specific for D121-AA8 demonstrated microarray results for this gene.
これらの結果に基づき、D121-AA8遺伝子(そのcDNA配列は配列暗号5の配列である; 図4)が、関心のあるタバコニコチンデメチラーゼ遺伝子として特定された。p450の命名法を考慮すると、D121-AA8はCYP82Eファミリー内のp450に最も類似していることが確認された(The Arabidopsis Genome Initiative (AGI) and The Arabidopsis Information Resource (TAIR); Frank, Plant Physiol. 110:1035-1046, 1996; Whitbredら, Plant Physiol. 124:47-58, 2000); SchopferおよびEbel, Mol. Gen. Genet. 258:315-322, 1998; ならびにTakemotoら, Plant Cell Physiol. 40:1232-1242, 1999)。 Based on these results, the D121-AA8 gene (its cDNA sequence is the sequence of sequence code 5; FIG. 4) was identified as the tobacco nicotine demethylase gene of interest. Considering the nomenclature of p450, D121-AA8 was confirmed to be most similar to p450 within the CYP82E family (The Arabidopsis Genome Initiative (AGI) and The Arabidopsis Information Resource (TAIR); Frank, Plant Physiol. 110: 1035-1046, 1996; Whitbred et al., Plant Physiol. 124: 47-58, 2000); Schopfer and Ebel, Mol. Gen. Genet. 258: 315-322, 1998; and Takemoto et al., Plant Cell Physiol. 40 : 1232-1242, 1999).
酵素活性の生化学的分析
生化学的分析(例えば、参照により本明細書に組み入れる既に出願されている出願に記載されているもの)は、配列番号5の配列がタバコニコチンデメチラーゼ(配列番号3;図3および4)をコードしていることを確認している。
Biochemical analysis of enzyme activity Biochemical analysis (eg, as described in previously filed applications incorporated herein by reference) is a sequence in which the sequence of SEQ ID NO: 5 is tobacco nicotine demethylase (SEQ ID NO: 3 Confirms that it encodes Figures 3 and 4).
特に、以下のとおり、酵母細胞内で異種発現されるp450の酵素活性をアッセイすることにより、候補クローンD121-AA8の機能をニコチンデメチラーゼのコード遺伝子として確認した。 In particular, the function of the candidate clone D121-AA8 was confirmed as a coding gene for nicotine demethylase by assaying the enzymatic activity of p450 heterologously expressed in yeast cells as follows.
1.酵母発現ベクターの構築
タバコニコチンデメチラーゼをコードするcDNA(D121-AA8)の推定タンパク質コード配列D120-AH4、D121-AA8、208-AC-8およびD208-AD9を酵母発現ベクターpYeDP60内にクローニングした。適当なBamHIおよびMfeI部位(以下の下線部)を、翻訳開始コドン(ATG)の上流または停止コドン(TAA)の下流にこれらの配列を含有するPCRプライマーにより導入した。増幅されたPCR産物上の該ベクター上のMfeIはEcoRI部位に適合性である。D121-AA8 cDNAを増幅するために使用したプライマーは5’-TAGCTACGCGGATCCATGCTTTCTCCCATAGAAGCC-3’ (配列番号2194)および5’-CTGGATCACAATTGTTAGTGATGGTGATGGTGATGCGATCCTCTATAAAGCTCAGGTGCCAGGC-3’ (配列番号2297)であった。6個のヒスチジンを含む該タンパク質のC末端の更に9個のアミノ酸をコードする配列のセグメントを、誘導された際の6-Hisタグ付きp450の発現を促進するためにリバースプライマー内に組込んだ。酵素消化の後、GAL10-CYC1プロモーターに対してセンス配向で、PCR産物をpYeDP60ベクター内に連結した。該酵母発現ベクターの適切な構築を制限酵素分析およびDNA配列決定により確認した。また、p450タンパク質の発現を酵母ミクロソームの界面活性剤相に関してSDS-PAGEゲル電気泳動上で可視化した。遺伝子配列に基づけば、p450タンパク質の予想サイズは59kDであり、結果をゲル分析により確認した。
1. Construction of Yeast Expression Vector The putative protein coding sequences D120-AH4, D121-AA8, 208-AC-8 and D208-AD9 of the cDNA encoding tobacco nicotine demethylase (D121-AA8) were cloned into the yeast expression vector pYeDP60. Appropriate BamHI and MfeI sites (underlined below) were introduced by PCR primers containing these sequences upstream of the translation start codon (ATG) or downstream of the stop codon (TAA). The MfeI on the vector on the amplified PCR product is compatible with the EcoRI site. The primers used to amplify D121-AA8 cDNA were 5'-TAGCTACGC GGATCC ATGCTTTCTCCCATAGAAGCC-3 '(SEQ ID NO: 2194) and 5'-CTGGATCA CAATTG TTAGTGATGGTGATGGTGATGCGATCCTCTATAAAGCTCAGGTGCCAGGC-3' (SEQ ID NO: 2297). A segment of the sequence encoding the 9 additional amino acids at the C-terminus of the protein containing 6 histidines was incorporated into the reverse primer to facilitate expression of 6-His tagged p450 when induced. . After enzymatic digestion, the PCR product was ligated into the pYeDP60 vector in sense orientation relative to the GAL10-CYC1 promoter. Proper construction of the yeast expression vector was confirmed by restriction enzyme analysis and DNA sequencing. In addition, the expression of p450 protein was visualized on SDS-PAGE gel electrophoresis for the surfactant phase of yeast microsomes. Based on the gene sequence, the expected size of the p450 protein is 59 kD and the results were confirmed by gel analysis.
2.酵母形質転換
Arabidopsis NADPH-シトクロムp450レダクターゼATR1を発現するよう修飾されたWAT11酵母系をpYeDP60-p450 cDNAプラスミドで形質転換した。50μlのWAT11酵母細胞浮遊液を、0.2cmの電極間隙を有するキュベット内で〜1μgのプラスミドDNAと混合した。Eppendorfエレクトロポレーター (Model 2510)により2.0kVの1パルスを加えた。細胞をSGIプレート(5g/L バクトカザミノ酸, アミノ酸を含有しない6.7 g/L 酵母窒素塩基, 20 g/L グルコース, 40 mg/L DL-トリプトファン, 20 g/L 寒天)上に広げた。ランダムに選択したコロニー上で直接的に行ったPCR分析により形質転換体を確認した。
2. Yeast transformation
A WAT11 yeast system modified to express Arabidopsis NADPH-cytochrome p450 reductase ATR1 was transformed with the pYeDP60-p450 cDNA plasmid. 50 μl of WAT11 yeast cell suspension was mixed with ˜1 μg of plasmid DNA in a cuvette with a 0.2 cm electrode gap. One pulse of 2.0 kV was applied by an Eppendorf electroporator (Model 2510). Cells were spread on SGI plates (5 g / L bactocasamino acid, 6.7 g / L yeast nitrogen base without amino acids, 20 g / L glucose, 40 mg / L DL-tryptophan, 20 g / L agar). Transformants were confirmed by PCR analysis performed directly on randomly selected colonies.
3.形質転換酵母細胞内でのp450発現
単一酵母コロニーを使用して、それを30ml SGI培地(5g/L バクトカザミノ酸, アミノ酸を含有しない6.7 g/L 酵母窒素塩基, 20 g/L グルコース, 40 mg/L DL-トリプトファン)に接種し、30℃で約24時間成長させた。この培養のアリコートを1000mLのYPGE培地(10 g/L 酵母エキス, 20 g/L バクトペプトン, 5 g/L グルコース, 30 ml/L エタノール)内に1:50希釈し、Diastix尿分析試薬片(Bayer, Elkhart, IN)の比色変化による表示でグルコースが完全に消費されるまで成長させた。DL-ガラクトースを2%の最終濃度まで加えることによりクローン化P450の誘導を開始した。in vivo活性アッセイまたはミクロソーム調製に使用する前に、該培養を更に20時間成長させた。
3. P450 expression in transformed yeast cells Using a single yeast colony, add 30ml SGI medium (5g / L bactocasamino acid, 6.7 g / L yeast nitrogen base without amino acids, 20 g / L glucose, 40 mg / L DL-tryptophan) and grown at 30 ° C. for about 24 hours. An aliquot of this culture is diluted 1:50 in 1000 mL of YPGE medium (10 g / L yeast extract, 20 g / L bactopeptone, 5 g / L glucose, 30 ml / L ethanol), and a Diastix urine analysis reagent strip ( Bayer, Elkhart, IN) were grown until glucose was completely consumed as indicated by colorimetric changes. Induction of cloned P450 was initiated by adding DL-galactose to a final concentration of 2%. The cultures were grown for an additional 20 hours before being used for in vivo activity assays or microsome preparation.
pYeDP60-CYP71D20(Nicotiana tabacumにおける5-エピ-アリストロケンおよび1-デオキシカプシジオールのヒドロキシル化を触媒するp450)を発現するWAT11酵母細胞を、p450発現および酵素活性アッセイのための対照として使用した。 WAT11 yeast cells expressing pYeDP60-CYP71D20 (p450 catalyzing the hydroxylation of 5-epi-Aristroken and 1-deoxycapsidiol in Nicotiana tabacum) were used as controls for p450 expression and enzyme activity assays.
p450の酵母発現の有効性を詳細に評価するために、還元CO差分光法(reduced CO difference spectroscopy)を行った。還元COスペクトルは、全4種のp450形質転換酵母系統から、450nmタンパク質においてピークを示した。対照の未形質転換酵母細胞またはブランクのベクター対照酵母細胞に由来する対照ミクロソームにおいては、類似したピークは観察されなかった。これらの結果は、pYeDP60-CYP 450を含有する酵母系においてp450タンパク質が有効に発現されたことを示した。酵母ミクロソームにおける発現p450タンパク質の濃度は45〜68 nmole/mg全タンパク質であった。 In order to evaluate in detail the effectiveness of p450 yeast expression, reduced CO difference spectroscopy was performed. The reduced CO spectrum showed a peak in 450 nm protein from all four p450 transformed yeast lines. Similar peaks were not observed in control microsomes derived from control untransformed yeast cells or blank vector control yeast cells. These results indicated that the p450 protein was effectively expressed in the yeast system containing pYeDP60-CYP 450. The concentration of expressed p450 protein in yeast microsomes was 45-68 nmole / mg total protein.
4.in vitro酵素アッセイ
酵母培養にDL-ニコチン(ピロリジン-2-14C)を供給することにより、形質転換された酵母細胞におけるニコチンデメチラーゼ活性をアッセイした。14C標識ニコチン(54 mCi/mmol)を55μMの最終濃度で75μlのガラクトース誘導培養に加えた。該アッセイ培養を、14mlのポリプロピレンチューブ中、振とうしながら6時間インキュベートし、900μlのメタノールで抽出した。遠心後、20μlの該メタノール抽出物をrp-HPLCで分離し、ノルニコチン画分をLSCにより定量した。
Four. In Vitro Enzyme Assay Nicotine demethylase activity in transformed yeast cells was assayed by feeding DL-nicotine (pyrrolidine-2- 14 C) to yeast cultures. 14 C-labeled nicotine (54 mCi / mmol) was added to 75 μl of galactose-induced culture at a final concentration of 55 μM. The assay culture was incubated for 6 hours with shaking in a 14 ml polypropylene tube and extracted with 900 μl of methanol. After centrifugation, 20 μl of the methanol extract was separated by rp-HPLC, and the nornicotine fraction was quantified by LSC.
WAT11(pYeDP60-CYP71D20)の対照培養はニコチンをノルニコチンへ変換しなかった。このことは、WAT11酵母株が、ニコチンからノルニコチンへの生物変換の過程を触媒する内因性酵素活性を含有していないことを示している。これとは対照的に、タバコニコチンデメチラーゼ遺伝子を発現する酵母は、検出可能な量のノルニコチンを産生した。これは配列番号4または配列番号5の翻訳産物のニコチンデメチラーゼ活性を示している。 Control cultures of WAT11 (pYeDP60-CYP71D20) did not convert nicotine to nornicotine. This indicates that the WAT11 yeast strain does not contain endogenous enzyme activity that catalyzes the process of bioconversion from nicotine to nornicotine. In contrast, yeast expressing the tobacco nicotine demethylase gene produced detectable amounts of nornicotine. This indicates the nicotine demethylase activity of the translation product of SEQ ID NO: 4 or SEQ ID NO: 5.
5.酵母ミクロソームの調製
ガラクトースによる20分間の誘導の後、酵母細胞を遠心分離により集め、TES-Mバッファー(50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 1 mM EDTA, 0.6 M ソルビトール, 10 mM 2-メルカプトエタノール)で2回洗浄した。該ペレットを抽出バッファー(50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 1 mM EDTA, 0.6 M ソルビトール, 2 mM 2-メルカプトエタノール, 1% ウシ血清アルブミン, プロテアーゼインヒビターカクテル (Roche) (錠剤1個/50 ml))に再懸濁させた。ついで細胞をガラスビーズ(直径0.5mm, Sigma)で破壊し、細胞抽出物を20,000×gで20分間遠心分離して細胞残渣を除去した。上清を100,000×gで60分間の超遠心分離に付した。得られたペレットはミクロソーム画分を含有していた。該ミクロソーム画分をTEG-Mバッファー (50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 1 mM EDTA, 20% グリセロールおよび1.5 mM 2-メルカプトエタノール)に1mg/mLのタンパク質濃度で懸濁させた。ミクロソーム調製物を、使用するまで液体窒素冷凍機内で保存した。
Five. Preparation of yeast microsomes After 20 minutes induction with galactose, yeast cells were collected by centrifugation and TES-M buffer (50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 1 mM EDTA, 0.6 M sorbitol, 10 mM 2-mercaptoethanol) And washed twice. Extract the pellet into extraction buffer (50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 1 mM EDTA, 0.6 M sorbitol, 2 mM 2-mercaptoethanol, 1% bovine serum albumin, protease inhibitor cocktail (Roche) (1 tablet / 50 ml) ). The cells were then disrupted with glass beads (diameter 0.5 mm, Sigma) and the cell extract was centrifuged at 20,000 × g for 20 minutes to remove cell debris. The supernatant was subjected to ultracentrifugation at 100,000 × g for 60 minutes. The resulting pellet contained the microsomal fraction. The microsomal fraction was suspended in TEG-M buffer (50 mM Tris-HCl, pH 7.5, 1 mM EDTA, 20% glycerol and 1.5 mM 2-mercaptoethanol) at a protein concentration of 1 mg / mL. Microsome preparations were stored in a liquid nitrogen refrigerator until use.
6.酵母ミクロソーム調製物における酵素活性アッセイ
酵母ミクロソーム調製物でのニコチンデメチラーゼ活性アッセイを行った。特に、DL-ニコチン(ピロリジン-2-14C)をMoravek Biochemicalsから得、それは54 mCi/mmolの比活性を有していた。クロルプロマジン(CPZ)および酸化型シトクロムc(cyt.C)(共にP450インヒビターである)をSigmaから購入した。還元型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドリン酸(NADPH)は、NADPH:シトクロムP450レダクターゼを介した、シトクロムP450に対する典型的な電子供与体である。対照インキュベーションにはNADPHを除いた。通常の酵素アッセイはミクロソームタンパク質(約1mg/ml)、6 mM NADPHおよび55 μM 14C標識ニコチンを含むものであった。CPZおよびCyt.Cの濃度は、それらを使用した場合には、それぞれ1mMおよび100μMであった。反応を25℃で1時間行い、それぞれ25μlの反応混合物への300μlのメタノールの添加により停止させた。遠心分離後、20μlの該メタノール抽出物を、VarianからのInertsil ODS-3 3 μ (150×4.6 mm)クロマトグラフィーカラムを使用する逆相高速液体クロマトグラフィー(HPLC)系(Agilent)で分離した。イソクラティック移動相はメタノールと50mMリン酸カリウムバッファー(pH6.25)との60:40(v/v)の比の混合物であり、流速は1ml/分であった。真正非標識ノルニコチンとの比較により決定されたノルニコチンのピークを集め、定量のために2900トリカーボ(tri-carb)Liquid Scintillation Counter (LSC) (Perkin Elmer)に付した。ニコチンデメチラーゼの活性は、1時間のインキュベーションにわたる14C標識ノルニコチンの産生に基づいて計算される。
6. Enzyme Activity Assay in Yeast Microsome Preparation A nicotine demethylase activity assay in a yeast microsome preparation was performed. In particular, DL-nicotine (pyrrolidine-2- 14 C) was obtained from Moravek Biochemicals and had a specific activity of 54 mCi / mmol. Chlorpromazine (CPZ) and oxidized cytochrome c (cyt.C) (both are P450 inhibitors) were purchased from Sigma. Reduced nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADPH) is a typical electron donor to cytochrome P450 via NADPH: cytochrome P450 reductase. NADPH was excluded from the control incubation. The usual enzyme assay included microsomal protein (approximately 1 mg / ml), 6 mM NADPH and 55 μM 14 C labeled nicotine. The concentrations of CPZ and Cyt.C were 1 mM and 100 μM, respectively, when they were used. The reaction was carried out for 1 hour at 25 ° C. and stopped by the addition of 300 μl methanol to 25 μl reaction mixture each time. After centrifugation, 20 μl of the methanol extract was separated on a reverse phase high performance liquid chromatography (HPLC) system (Agilent) using an Inertsil ODS-3 3 μ (150 × 4.6 mm) chromatography column from Varian. The isocratic mobile phase was a 60:40 (v / v) ratio mixture of methanol and 50 mM potassium phosphate buffer (pH 6.25) with a flow rate of 1 ml / min. Nornicotine peaks determined by comparison with authentic unlabeled nornicotine were collected and subjected to a 2900 tri-carb Liquid Scintillation Counter (LSC) (Perkin Elmer) for quantification. The activity of nicotine demethylase is calculated based on the production of 14 C-labeled nornicotine over a 1 hour incubation.
CYP71D20を発現する対照酵母細胞からのミクロソーム調製物、ならびに遺伝子D120-AH4、D208-AC8およびD208-AD9で形質転換された3つの試験p450酵母培養物において、p450様活性が観察された。しかし、該対照およびそれらの3つの試験p450はノルニコチン変換形成を全く示さなかった。このことは、それらが、ニコチンのデメチル化を触媒しうる内因性または誘導性酵素を含有していなかったことを示唆している。これとは対照的に、HPLCおよびLSC分析からの結果は、タバコニコチンデメチラーゼ遺伝子(D121-AA8)を発現する酵母細胞から得たミクロソームサンプルを使用した場合には、ニコチンのデメチル化から生じた検出可能な量のノルニコチンを示した。これらの結果は、ニコチンデメチラーゼ活性がD121-AA8遺伝子産物から生じることを示している。ニコチンデメチラーゼ活性はNADPHを要し、p450特異的インヒビターにより抑制されることが示され、これは、タバコニコチンデメチラーゼがp450であることに符合する。タバコニコチンデメチラーゼ(D121-AA8)に関する酵素活性は、放射能強度およびタンパク質濃度による計算では約10.8pKat/mgタンパク質であった。該酵母細胞に関して得られた一連の典型的な酵素アッセイの結果を以下の表(表4)に示す。
D121-AA8酵母細胞由来のミクロソームを使用するアッセイからNADPHを除いた場合には、ニコチンデメチラーゼ活性の阻止が生じた。したがって、ノルニコチンは形成しなかった(表4)。2つの公知P450インヒビターであるクロルプロマジン(CPZ, 1mM)および酸化型シトクロムc(cytC, 100μM)を別々に該酵素アッセイ混合物中に加え、1時間インキュベートした後でメタノール停止溶液を加えた場合には、ニコチンデメチラーゼ活性が有意に低下した(表4)。総合すると、これらの実験は、D121-AA8が、酵母内で発現されるとニコチンからノルニコチンへの変換を触媒するシトクロムp450タンパク質をコードしていることを示した。 When NADPH was removed from assays using microsomes from D121-AA8 yeast cells, inhibition of nicotine demethylase activity occurred. Therefore, nornicotine did not form (Table 4). If two known P450 inhibitors chlorpromazine (CPZ, 1 mM) and oxidized cytochrome c (cytC, 100 μM) were added separately into the enzyme assay mixture and incubated for 1 hour followed by methanol stop solution, Nicotine demethylase activity was significantly reduced (Table 4). Taken together, these experiments showed that D121-AA8 encodes a cytochrome p450 protein that catalyzes the conversion of nicotine to nornicotine when expressed in yeast.
単離された核酸断片の関連アミノ酸配列同一性
実施例8からシトクロムp450断片に関して得られた核酸配列のアミノ酸配列を演繹した。該演繹領域はGXRXCP(A/G) (配列番号2273)配列モチーフの直後のアミノ酸からカルボキシル末端または終止コドンまでに対応するものであった。該断片の配列同一性を比較したところ、70%またはそれ以上のアミノ酸同一性を有する配列に関して、特有の群分けが見られた。好ましい群分けは、80%またはそれ以上のアミノ酸同一性を有する配列で、より好ましい群分けは、90%またはそれ以上のアミノ酸同一性を有する配列で、最も好ましい群分けは、99%またはそれ以上のアミノ酸同一性を有する配列で認められた。それらの特有の核酸配列のいくつかは他の断片に対して完全なアミノ酸同一性を有することが見出されたため、同一アミノ酸を有する唯一のメンバーを報告した。
Related Amino Acid Sequence Identity of Isolated Nucleic Acid Fragments The amino acid sequence of the nucleic acid sequence obtained for the cytochrome p450 fragment from Example 8 was deduced. The deduced region corresponded to the amino acid immediately after the GXRXCP (A / G) (SEQ ID NO: 2273) sequence motif to the carboxyl terminus or stop codon. When comparing the sequence identity of the fragments, a unique grouping was found for sequences with 70% or more amino acid identity. A preferred grouping is a sequence having 80% or more amino acid identity, a more preferred grouping is a sequence having 90% or more amino acid identity, and the most preferred grouping is 99% or more. The sequence having the amino acid identity of Since some of their unique nucleic acid sequences were found to have complete amino acid identity to other fragments, the only member with the same amino acid was reported.
表5の群19に関するアミノ酸同一性は、それらの核酸配列に基づけば、3つの異なる群に対応した。群メンバーのアミノ酸配列およびそれらの同一性を図159Hに示す。アミノ酸の相違が示されている。 The amino acid identity for group 19 in Table 5 corresponded to three different groups based on their nucleic acid sequence. The amino acid sequences of group members and their identity are shown in Figure 159H. Amino acid differences are shown.
植物を使用する遺伝子クローニングおよび機能研究のために、各アミノ酸同一性群の少なくとも1つのメンバーを選択した。また、ノーザンおよびサザン分析により評価した場合にエチレン処理または他の生物学的相違により異なって影響される群メンバーを、遺伝子クローニングおよび機能研究のために選択した。遺伝子クローニング、発現研究および全植物評価を補助するために、配列同一性および特異な配列に基づき、ペプチド特異的抗体を調製することが可能である。
完全長クローンの関連アミノ酸配列同一性
実施例5においてクローニングされた完全長Nicotiana遺伝子の核酸配列をそれらの全アミノ酸配列に関して演繹した。カルボキシル末端におけるUXXRXXZ (配列番号2274)、PXRFXF (配列番号2275)またはGXRXC (配列番号2276)(ここで、UはEまたはKであり、Xは任意のアミノ酸であり、ZはP、T、SまたはMである)に対応する3つの保存されたp450ドメインモチーフの存在により、シトクロムp450遺伝子を特定した。お互いに対して及び公知タバコ遺伝子に対して完全長配列を比較するBLASTプログラムを使用して、アミノ酸同一性に関してすべてのp450遺伝子を特徴づけした。該プログラムはNCBIスペシャル(special)BLASTツール(tool)(Align two sequences (b12seq), http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/b12seq/b12.html)を使用するものであった。2つの配列を、核酸配列に関してはフィルター無しでBLASTNで、アミノ酸配列に関してはBLASTPで整列させた。それらのアミノ酸同一性(%)に基づき、各配列を同一性群に群分けした。この場合、該群分けは、別のメンバーに対して少なくとも85%の同一性を共有するメンバーを含有するものであった。好ましい群分けは、90%またはそれ以上のアミノ酸同一性を有する配列で、より好ましい群分けは、95%またはそれ以上のアミノ酸同一性を有する配列で、最も好ましい群分けは、99%またはそれ以上のアミノ酸同一性を有する配列で認められた。これらの基準を用いて、25個の特有の群を特定した。それらを表6に示す。完全長ニコチンデメチラーゼ遺伝子のアミノ酸配列は、配列番号5(図4)に記載の配列を有するように演繹された。
Related amino acid sequence identity of full-length clones The nucleic acid sequence of the full-length Nicotiana gene cloned in Example 5 was deduced with respect to their full amino acid sequence. UXXRXXZ (SEQ ID NO: 2274), PXRFXF (SEQ ID NO: 2275) or GXRXC (SEQ ID NO: 2276) at the carboxyl terminus (where U is E or K, X is any amino acid, Z is P, T, S) The cytochrome p450 gene was identified by the presence of three conserved p450 domain motifs corresponding to (or M). All p450 genes were characterized for amino acid identity using the BLAST program that compares full-length sequences against each other and against known tobacco genes. The program used NCBI special BLAST tool (Align two sequences (b12seq), http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/b12seq/b12.html) . The two sequences were aligned with BLASTN without filter for nucleic acid sequences and BLASTP for amino acid sequences. Based on their amino acid identity (%), each sequence was grouped into identity groups. In this case, the grouping contained members that shared at least 85% identity to another member. A preferred grouping is a sequence having 90% or more amino acid identity, a more preferred grouping is a sequence having 95% or more amino acid identity, and the most preferred grouping is 99% or more. The sequence having the amino acid identity of Using these criteria, 25 unique groups were identified. They are shown in Table 6. The amino acid sequence of the full-length nicotine demethylase gene was deduced to have the sequence set forth in SEQ ID NO: 5 (FIG. 4).
アミノ酸同一性に関して表6で用いたパラメーターにおいては、3つの群は、公知タバコ遺伝子に対して85%またはそれ以上の同一性を含有することが判明した。群5のメンバーはGeneBank配列GI:14423327 (配列番号2271) (またはAAK62346)に対して完全長配列に関して96%までのアミノ酸同一性を有していた。群23はGI:14423328 (配列番号2277) (またはAAK62347)に対して93%までのアミノ酸同一性を、群24はGI:14423318 (配列番号2278) (またはAAK62343;配列番号2300)に対して92%の同一性を有していた。
カルボキシル末端付近のGXRXC p450ドメイン (配列番号2276)とUXXRXXZ p450ドメイン (配列番号2274)との間の高度に保存されたアミノ酸相同性に基づき、完全長遺伝子を更に群分けした。図160A〜160Eに示すとおり、個々のクローンを保存ドメイン間の配列相同性に基づいて整列させ、種々の同一性群内に配置した。いくつかの場合には、該クローンの核酸配列は特有なものであったが、該領域に関するアミノ酸配列は同一であった。好ましい群分けは、90%またはそれ以上のアミノ酸同一性を有する配列で、より好ましい群分けは、95%またはそれ以上のアミノ酸同一性を有する配列で、最も好ましい群分けは、99%またはそれ以上のアミノ酸同一性を有する配列で認められた。この最終的な群分けは、2つの異なる群に分類された群17(表6)以外はクローンの全アミノ酸配列に関する同一性に基づくものに類似していた。 Full-length genes were further grouped based on the highly conserved amino acid homology between the GXRXC p450 domain near the carboxyl terminus (SEQ ID NO: 2276) and the UXXRXXZ p450 domain (SEQ ID NO: 2274). As shown in FIGS. 160A-160E, individual clones were aligned based on sequence homology between conserved domains and placed in various identity groups. In some cases, the nucleic acid sequence of the clone was unique, but the amino acid sequence for the region was identical. A preferred grouping is a sequence having 90% or more amino acid identity, a more preferred grouping is a sequence having 95% or more amino acid identity, and the most preferred grouping is 99% or more. The sequence having the amino acid identity of This final grouping was similar to that based on identity with respect to the entire amino acid sequence of the clones except group 17 (Table 6), which was classified into two different groups.
表7におけるアミノ酸同一性に関して用いたパラメーターにおいては、3つの群は、公知タバコ遺伝子に対して90%またはそれ以上の同一性を含有することが判明した。群5のメンバーはGeneBank配列GI:14423326 (配列番号2279) (またはAAK62346)に対して完全長配列に関して93.4%までのアミノ酸同一性を有していた。群23はGI:14423328 (配列番号2277) (またはAAK62347)に対して91.8%までのアミノ酸同一性を、群24はGI:14423318 (配列番号2278) (またはAAK62342)に対して92%の同一性を有していた。
タバコP450特異的ドメインの1以上を欠くNicotianaシトクロムP450クローン
4個のクローンは、表6に報告されている他のタバコシトクロム遺伝子に対して90%〜99%の範囲の高い核酸相同性を有していた。それらの4個のクローンには、D136-AD5 (配列番号292)、D138-AD12 (配列番号294)、D243-AB3 (配列番号298)およびD250-AC11 (配列番号300)が含まれた。しかし、ヌクレオチドフレームシフトにより、これらの遺伝子は3個のC末端シトクロームp450ドメインの1以上を含有しておらず、表6または表7に示す同一性群から除外された。
Nicotiana cytochrome P450 clone lacking one or more of tobacco P450 specific domains
Four clones had high nucleic acid homology ranging from 90% to 99% to the other tobacco cytochrome genes reported in Table 6. Those four clones included D136-AD5 (SEQ ID NO: 292), D138-AD12 (SEQ ID NO: 294), D243-AB3 (SEQ ID NO: 298) and D250-AC11 (SEQ ID NO: 300). However, due to nucleotide frameshifts, these genes did not contain one or more of the three C-terminal cytochrome p450 domains and were excluded from the identity groups shown in Table 6 or Table 7.
1つのクローンD95-AG1のアミノ酸同一性は、表6または表7においてp450タバコ遺伝子を群分けするのに用いた第3のドメインGXRXC (配列番号2276)を含有していなかった。このクローンの核酸配列は他のタバコシトクロム遺伝子に対して低い相同性を有し、したがって、このクローンはNicotianaのシトクロームp450遺伝子の新規群に相当する。 The amino acid identity of one clone D95-AG1 did not contain the third domain GXRXC (SEQ ID NO: 2276) that was used to group the p450 tobacco genes in Table 6 or Table 7. The nucleic acid sequence of this clone has low homology to other tobacco cytochrome genes, and therefore this clone represents a novel group of Nicotiana cytochrome p450 genes.
タバコの品質の調節の改変におけるNicotianaシトクロムP450断片およびクローンの使用
タバコp450核酸断片または全遺伝子の使用は、タバコ表現型またはタバコ成分の改変、そしてより重要なものとして代謝産物の改変を伴う植物の特定および選択において有用である。ダウンレギュレーション(例えば、アンチセンス配向)または過剰発現(例えば、センス配向)などのための配向で、本明細書に記載のものから選ばれる核酸断片または完全長遺伝子を組込む種々の形質転換系により、トランスジェニックタバコ植物を作製することが可能である。完全長遺伝子に対する過剰発現のためには、本発明に記載の完全長遺伝子の全体または機能的部分またはアミノ酸配列をコードする任意の核酸配列が望ましい。そのような核酸配列は、望ましくは、ある酵素の発現を増強してNicotianaにおける表現型効果をもたらすのに有効である。ホモ接合であるNicotiana系統は、一連の戻し交配により得られ、当業者に一般に利用可能な技術を用いて内因性p450 RNA、転写産物、p450発現ペプチドおよび植物代謝産物の濃度を分析することとなど(これらに限定されるものではない)により、表現型変化に関して評価される。タバコ植物において示される変化は、選択された関心のある遺伝子の機能的役割に関する情報を提供し、あるいは好ましいNicotiana植物種として有用である。
Use of Nicotiana Cytochrome P450 Fragments and Clones in Altering Control of Tobacco Quality The use of tobacco p450 nucleic acid fragments or whole genes can be used in plants with altered tobacco phenotypes or tobacco components, and more importantly, metabolite alterations. Useful in identification and selection. By various transformation systems that incorporate nucleic acid fragments or full-length genes selected from those described herein in an orientation such as for down-regulation (eg, antisense orientation) or overexpression (eg, sense orientation), It is possible to produce transgenic tobacco plants. For overexpression to the full-length gene, any nucleic acid sequence encoding the entire or functional part or amino acid sequence of the full-length gene according to the present invention is desirable. Such nucleic acid sequences are desirably effective to enhance the expression of certain enzymes and produce phenotypic effects in Nicotiana. Homozygous Nicotiana strains are obtained by a series of backcrosses, such as analyzing concentrations of endogenous p450 RNA, transcripts, p450-expressed peptides and plant metabolites using techniques generally available to those skilled in the art, etc. (But not limited to) are evaluated for phenotypic changes. The changes shown in tobacco plants provide information regarding the functional role of the selected gene of interest or are useful as a preferred Nicotiana plant species.
変換体バーレータバコからのゲノムタバコニコチンデメチラーゼのクローニング
Qiagen Plant Easyキットを前記実施例に記載のとおりに(該製造業者の説明も参照されたい)使用して、変換体バーレータバコ植物系統4407-33(Nicotiana tabacum品種4407系統)からゲノムDNAを抽出した。
Cloning of Genomic Tobacco Nicotine Demethylase from Transformer Burley Tobacco
Genomic DNA was extracted from the transformant burley tobacco plant line 4407-33 (Nicotiana tabacum variety 4407 line) using the Qiagen Plant Easy kit as described in the previous examples (see also the manufacturer's instructions) .
前記実施例においてクローニングした5'プロモーターおよび3'UTR領域に基づいて、プライマーを設計した。フォワードプライマーは5’-GGC TCT AGA TAA ATC TCT TAA GTT ACT AGG TTC TAA-3’ (配列番号2280) および5’- TCT CTA AAG TCC CCT TCC -3’ (配列番号2288)であり、リバースプライマーは5’-GGC TCT AGA AGT CAA TTA TCT TCT ACA AAC CTT TAT ATA TTA GC-3’ (配列番号2281)および5’- CCA GCA TTC CTC AAT TTC -3’ (配列番号2289)であった。100μlの反応混合物を使用して4407-33ゲノムDNAにPCRを適用した。Pfx高忠実度酵素をPCR増幅に使用した。電気泳動後に1%アガロースゲル上でPCR産物を可視化した。約3.5kbの分子量を有する単一のバンドが観察され、それを該ゲルから切り出した。ゲル精製キット(Qiagen; based on manufacturer’s procedure)を使用して、生じたバンドを精製した。精製されたDNAを酵素XbaI(NEB; 製造業者の指示に従い使用する)で消化した。同じ方法を用いてpBluescriptプラスミドをXbaIで消化した。該断片をゲル精製し、pBluescriptプラスミド内に連結した。該連結混合物をコンピテント細胞GMlO9内に形質転換し、青/白選択を伴う100mg/lのアンピシリンを含有するLBプレート上にプレーティングした。白色コロニーを拾い、アンピシリンを含有する10mlのLB液体培地内で成長させた。DNAをミニプレップにより抽出した。CEQ2000シークエンサー(Beckman, Fullerton, California)を製造業者の説明に従い使用して、該インサートを含有するプラスミドDNAを配列決定した。T3およびT7プライマーならびに8個の他の内部プライマーを配列決定に使用した。該配列を集合させ、分析して、ゲノム配列(配列番号4; 図3)を得た。該ゲノム配列に基づき、変換体および非変換体の両方のタバコ系統におけるニコチンデメチラーゼ遺伝子は転移因子を含有しないことが確認された。 Primers were designed based on the 5 ′ promoter and 3 ′ UTR region cloned in the previous example. The forward primer is 5'-GGC TCT AGA TAA ATC TCT TAA GTT ACT AGG TTC TAA-3 '(SEQ ID NO: 2280) and 5'-TCT CTA AAG TCC CCT TCC-3' (SEQ ID NO: 2288), the reverse primer is 5′-GGC TCT AGA AGT CAA TTA TCT TCT ACA AAC CTT TAT ATA TTA GC-3 ′ (SEQ ID NO: 2281) and 5′-CCA GCA TTC CTC AAT TTC-3 ′ (SEQ ID NO: 2289). PCR was applied to 4407-33 genomic DNA using 100 μl of reaction mixture. Pfx high fidelity enzyme was used for PCR amplification. PCR products were visualized on a 1% agarose gel after electrophoresis. A single band with a molecular weight of about 3.5 kb was observed and was excised from the gel. The resulting band was purified using a gel purification kit (Qiagen; based on manufacturer's procedure). The purified DNA was digested with the enzyme XbaI (NEB; used according to manufacturer's instructions). The pBluescript plasmid was digested with XbaI using the same method. The fragment was gel purified and ligated into the pBluescript plasmid. The ligation mixture was transformed into competent cells GMlO9 and plated on LB plates containing 100 mg / l ampicillin with blue / white selection. White colonies were picked and grown in 10 ml LB liquid medium containing ampicillin. DNA was extracted by miniprep. Plasmid DNA containing the insert was sequenced using a CEQ2000 sequencer (Beckman, Fullerton, California) according to the manufacturer's instructions. T3 and T7 primers and 8 other internal primers were used for sequencing. The sequences were assembled and analyzed to obtain the genomic sequence (SEQ ID NO: 4; FIG. 3). Based on the genomic sequence, it was confirmed that the nicotine demethylase gene in both transformed and non-transformed tobacco lines does not contain a transposable element.
配列番号5の配列と配列番号4との比較は該遺伝子のコード部分コードの単一のイントロン(配列番号7の配列として特定される; 図5)の決定を可能にした。図2に示すとおり、タバコニコチンデメチラーゼのゲノム構造は、単一のイントロンに隣接する2つのエキソンを含む。第1エキソンは配列番号4のヌクレオチド2010-2949に伸長し、これは配列番号3のアミノ酸1-313をコードし、第2エキソンは配列番号4のヌクレオチド3947-4562に伸長し、これは配列番号3のアミノ酸314-517をコードしている。したがって、イントロンは配列番号4のヌクレオチド2950-3946に伸長している。該イントロン配列を図5に示す。それは配列番号7の配列である。ゲノムDNA配列の翻訳産物を配列番号3の配列として図3に示す。タバコニコチンデメチラーゼアミノ酸配列は、小胞体膜アンカーモチーフを含有する。 Comparison of the sequence of SEQ ID NO: 5 with SEQ ID NO: 4 allowed the determination of a single intron (identified as the sequence of SEQ ID NO: 7; FIG. 5) of the coding part code of the gene. As shown in FIG. 2, the genomic structure of tobacco nicotine demethylase contains two exons flanking a single intron. The first exon extends to nucleotides 2010-2949 of SEQ ID NO: 4, which encodes amino acids 1-313 of SEQ ID NO: 3, and the second exon extends to nucleotides 3947-4562 of SEQ ID NO: 4, which are SEQ ID NO: 4 It encodes 3 amino acids 314-517. Thus, the intron extends to nucleotides 2950-3946 of SEQ ID NO: 4. The intron sequence is shown in FIG. It is the sequence of SEQ ID NO: 7. The translation product of the genomic DNA sequence is shown in FIG. The tobacco nicotine demethylase amino acid sequence contains an endoplasmic reticulum membrane anchor motif.
変換体タバコからの5'隣接配列(配列番号8)および3'UTR(配列番号9)のクローニング
A.変換体タバコ葉組織からの全DNAの単離
変換体タバコ4407-33の葉からゲノムDNAを単離した。Qiagen, Inc. (Valencia, Ca)社のDNeasy Plant Mini Kitを該製造業者のプロトコールに従い使用してDNAの単離を行った。その製造業者のマニュアルDneasy’ Plant Mini and DNeasy Plant Maxi Handbook, Qiagen January 2004を参照により本明細書に組み入れることとする。DNA調製の方法は以下の工程を含むものであった。タバコ葉組織(約20mgの乾燥重量)を、液体窒素下で1分間、微粉末に粉砕した。該組織粉末を1.5mlのチューブ内に移した。バッファーAP1(400μl)および4μlのRNアーゼストック溶液(100mg/ml)を最大100mgの粉砕葉組織に加え、激しくボルテックスした。該混合物を65℃で10分間インキュベートし、チューブを反転させることによりインキュベート中に2〜3回混合した。ついでバッファーAP2(130μl)をライセートに加えた。該混合物を混合し、氷上で5分間インキュベートした。該ライセートをQIAshredder Mini Spin Columnにアプライし、2分間(14,000rpm)遠心分離した。該細胞残渣ペレットを乱すことなく、流出画分を新たなチューブに移した。ついでバッファーAP3/E(1.5容量)を清澄化ライセートに加え、ピペッティングにより混合した。存在しうる沈殿物を含む前工程からの混合物(650μl)をDNeasy Mini Spin Columnにアプライした。該混合物を>6000×g(>8000rpm)で1分間遠心分離し、流出物を捨てた。残りのサンプルについて、これを繰返し、流出物および収集チューブを捨てた。DNeasy Mini Spin Columnを新たな2mlの収集チューブ内に配置した。ついでバッファーAW(500μl)をDNeasyカラムに加え、1分間(>8000rpm)遠心分離した。流出物を捨てた。収集チューブを次の工程で再利用した。ついでバッファーAW(500μl)をDNeasyカラムに加え、2分間(>14,000rpm)遠心分離して該メンブレン(膜)を乾燥させた。該DNeasyカラムを1.5mlのチューブに移した。ついでバッファーAE(100μl)をDNeasyメンブレン上にピペッティングした。該混合物を室温(15〜25℃)で5分間インキュベートし、ついで1分間(>8000rpm)遠心分離して溶出させた。
アガロースゲル上でサンプルを泳動させることにより、該DNAの質および量を評価した。
Cloning of 5 'flanking sequences (SEQ ID NO: 8) and 3' UTR (SEQ ID NO: 9) from transgenic tobacco
A. Isolation of total DNA from converter tobacco leaf tissue Genomic DNA was isolated from leaves of converter tobacco 4407-33. DNA isolation was performed using the DNeasy Plant Mini Kit from Qiagen, Inc. (Valencia, Ca) according to the manufacturer's protocol. The manufacturer's manual Dneasy 'Plant Mini and DNeasy Plant Maxi Handbook, Qiagen January 2004 is incorporated herein by reference. The method of DNA preparation included the following steps. Tobacco leaf tissue (about 20 mg dry weight) was ground to a fine powder under liquid nitrogen for 1 minute. The tissue powder was transferred into a 1.5 ml tube. Buffer AP1 (400 μl) and 4 μl RNase stock solution (100 mg / ml) were added to a maximum of 100 mg ground leaf tissue and vortexed vigorously. The mixture was incubated at 65 ° C. for 10 minutes and mixed 2-3 times during the incubation by inverting the tube. Buffer AP2 (130 μl) was then added to the lysate. The mixture was mixed and incubated on ice for 5 minutes. The lysate was applied to a QIAshredder Mini spin column and centrifuged for 2 minutes (14,000 rpm). The effluent fraction was transferred to a new tube without disturbing the cell debris pellet. Buffer AP3 / E (1.5 volumes) was then added to the clarified lysate and mixed by pipetting. The mixture from the previous step (650 μl) containing the possible precipitate was applied to the DNeasy Mini spin column. The mixture was centrifuged at> 6000 × g (> 8000 rpm) for 1 minute and the effluent was discarded. This was repeated for the remaining samples and the effluent and collection tube discarded. The DNeasy Mini spin column was placed in a new 2 ml collection tube. Buffer AW (500 μl) was then added to the DNeasy column and centrifuged for 1 minute (> 8000 rpm). The spill was discarded. The collection tube was reused in the next step. Buffer AW (500 μl) was then added to the DNeasy column and centrifuged for 2 minutes (> 14,000 rpm) to dry the membrane. The DNeasy column was transferred to a 1.5 ml tube. Buffer AE (100 μl) was then pipetted onto the DNeasy membrane. The mixture was incubated at room temperature (15-25 ° C.) for 5 minutes and then eluted by centrifugation for 1 minute (> 8000 rpm).
The quality and quantity of the DNA was assessed by running samples on an agarose gel.
B.構造遺伝子の5'隣接配列のクローニング
配列番号5からの構造遺伝子の5'隣接配列の750ヌクレオチドをクローニングするために、修飾された逆PCR法を用いた。まず、既知配列断片内の制限部位および5'隣接配列の下流の制限部位距離に基づき、適当な制限酵素を選択した。この既知断片に基づき、2つのプライマーを設計した。フォワードプライマーはリバースプライマーの下流に配置した。リバースプライマーは該既知断片の3'部分に配置した。
B. Cloning of the 5 ′ flanking sequence of the structural gene To clone 750 nucleotides of the 5 ′ flanking sequence of the structural gene from SEQ ID NO: 5, a modified inverse PCR method was used. First, an appropriate restriction enzyme was selected based on the restriction site in the known sequence fragment and the restriction site distance downstream of the 5 ′ flanking sequence. Two primers were designed based on this known fragment. The forward primer was placed downstream of the reverse primer. A reverse primer was placed in the 3 ′ portion of the known fragment.
クローニング操作は以下の工程を含むものであった。
精製されたゲノムDNA(5μg)を、50μlの制限混合物中、20〜40単位の適当な制限酵素(EcoRIおよびSpeI)で消化した。該DNAが完全に消化されたかどうかを確認するために、該反応混合物の1/10容量でのアガロースゲル電気泳動を行った。完全な消化の後に、4℃で一晩の連結により直接的な連結を行った。10μlの消化DNAおよび0.2μlのT4 DNAリガーゼ(NEB)を含有する200μlの反応混合物を4℃で一晩連結させた。人工的な小さな環状ゲノムが得られた後、該連結反応物に対してPCRを行った。50μlの反応混合物中、2つの異なる方向の既知断片からの2個のプライマーおよび10μlの連結反応物を使用して、PCRを行った。45〜56℃のアニーリング温度を用いるグラジエントPCRプログラムを適用した。
The cloning operation included the following steps.
Purified genomic DNA (5 μg) was digested with 20-40 units of the appropriate restriction enzymes (EcoRI and SpeI) in a 50 μl restriction mixture. To confirm whether the DNA was completely digested, agarose gel electrophoresis was performed with 1/10 volume of the reaction mixture. After complete digestion, direct ligation was performed by overnight ligation at 4 ° C. 200 μl of reaction mixture containing 10 μl of digested DNA and 0.2 μl of T4 DNA ligase (NEB) was ligated overnight at 4 ° C. After an artificial small circular genome was obtained, PCR was performed on the ligation reaction. PCR was performed using two primers from two different orientations of known fragments and 10 μl of ligation reaction in a 50 μl reaction mixture. A gradient PCR program using an annealing temperature of 45-56 ° C was applied.
PCR反応を調べるために、アガロースゲル電気泳動を行った。所望のバンドを該ゲルから切り出し、QIAGENのQIAquickゲル精製キットを使用して該バンドを精製した。pGEM-T Easy Vector (Promega, Madison, WI)内に、該製造業者の説明に従い、精製されたPCR断片を連結した。SV Miniprepキット (Promega, Madison, WI)を該製造業者の説明に従い使用して、該形質転換DNAプラスミドをミニプレップにより抽出した。CEQ 2000シークエンサー (Beckman, Fullerton, CA)を使用して、該インサートを含有するプラスミドDNAを配列決定した。5'隣接配列の約758nt(配列番号4のヌクレオチド1241-2009)を前記方法によりクローニングした。 To examine the PCR reaction, agarose gel electrophoresis was performed. The desired band was excised from the gel and the band was purified using QIAGEN's QIAquick gel purification kit. Purified PCR fragments were ligated into pGEM-T Easy Vector (Promega, Madison, Wis.) according to the manufacturer's instructions. The transformed DNA plasmid was extracted by miniprep using the SV Miniprep kit (Promega, Madison, Wis.) According to the manufacturer's instructions. Plasmid DNA containing the insert was sequenced using a CEQ 2000 sequencer (Beckman, Fullerton, CA). About 758 nt of the 5 ′ flanking sequence (nucleotides 1241-2009 of SEQ ID NO: 4) was cloned by the above method.
C.構造遺伝子の、より長い5'隣接配列(配列番号8; 図6)のクローニング
構造遺伝子D121-AA8の更なる5'隣接配列をクローニングするために、BD GenomeWalker Universal Kit (Clontech laboratories, Inc., PaloAlto, CA)を該製造業者のユーザーマニュアルに従い使用した。その製造業者のマニュアルBD GenomeWalker August, 2004を参照により本明細書に組み入れることとする。サンプルを0.5%アガロースゲル上で泳動させることにより、タバコゲノムDNAのサイズおよび純度を試験した。タバコ33ライブラリーゲノムウォーキング構築のために、合計4つの平滑末端反応(DRA I, STU I, ECOR V, PVU II)を準備した。消化されたDNAの精製の後、消化されたゲノムDNAをゲノムウォーカーアダプターに連結した。D121-AA8からの遺伝子特異的プライマー(CTCTATTGATACTAGCTGGTTTTGGAC; 配列番号2282)およびアダプタープライマーAP1を使用することにより、それらの4つの消化DNAに一次PCR反応を適用した。該一次PCR産物をネスティッドPCR用の鋳型として直接使用した。該キットにより供給されたアダプターネスティッドプライマーおよび公知クローンD121-AA8(配列番号5)からのネスティッドプライマー(GGAGGGAGAGTATAACTTACGGATTC; 配列番号2283)を該PCR反応において使用した。ゲル電気泳動を行うことにより、PCR産物を調べた。所望のバンドを該ゲルから切り出し、QIAGENのQIAquickゲル精製キットを使用して該バンドを精製した。pGEM-T Easy Vector (Promega, Madison, WI)内に、該製造業者の説明に従い、精製されたPCR断片を連結した。SV Miniprepキット (Promega, Madison, WI)を該製造業者の説明に従い使用して、該形質転換DNAプラスミドをミニプレップにより抽出した。CEQ 2000シークエンサー (Beckman, Fullerton, CA)を使用して、該インサートを含有するプラスミドDNAを配列決定した。配列番号4のヌクレオチド399-1240を含む5'隣接配列の更に約853ntを前記方法によりクローニングした。
C. Cloning of the longer 5 'flanking sequence of the structural gene (SEQ ID NO: 8; Figure 6) To clone additional 5' flanking sequences of the structural gene D121-AA8, the BD GenomeWalker Universal Kit (Clontech laboratories, Inc., PaloAlto , CA) was used according to the manufacturer's user manual. The manufacturer's manual BD GenomeWalker August, 2004 is incorporated herein by reference. Tobacco genomic DNA was tested for size and purity by running samples on a 0.5% agarose gel. A total of four blunt end reactions (DRA I, STU I, ECOR V, PVU II) were prepared for the construction of the tobacco 33 library genome walking. After purification of the digested DNA, the digested genomic DNA was ligated to a genomic walker adapter. The primary PCR reaction was applied to these four digested DNAs by using the gene specific primer from D121-AA8 (CTCTATTGATACTAGCTGGTTTTGGAC; SEQ ID NO: 2282) and the adapter primer AP1. The primary PCR product was used directly as a template for nested PCR. The adapter nested primer supplied with the kit and the nested primer (GGAGGGAGAGTATAACTTACGGATTC; SEQ ID NO: 2283) from the known clone D121-AA8 (SEQ ID NO: 5) were used in the PCR reaction. PCR products were examined by gel electrophoresis. The desired band was excised from the gel and the band was purified using QIAGEN's QIAquick gel purification kit. Purified PCR fragments were ligated into pGEM-T Easy Vector (Promega, Madison, Wis.) according to the manufacturer's instructions. The transformed DNA plasmid was extracted by miniprep using the SV Miniprep kit (Promega, Madison, Wis.) According to the manufacturer's instructions. Plasmid DNA containing the insert was sequenced using a CEQ 2000 sequencer (Beckman, Fullerton, CA). An additional approximately 853 nt of the 5 ′ flanking sequence containing nucleotides 399-1240 of SEQ ID NO: 4 was cloned by the above method.
以下のプライマーGWR1A (5’- AGTAACCGATTGCTCACGTTATCCTC -3’) (配列番号2284)およびGWR2A (5’- CTCTATTCAACCCCACACGTAACTG -3’) (配列番号2285)を使用する以外は同じ方法で、第2ラウンドのゲノムウォーキングを行った。配列番号4のヌクレオチド1-398を含む隣接配列の更に約398ntをこの方法によりクローニングした。 Perform a second round of genome walking in the same way except using the following primers GWR1A (5'-AGTAACCGATTGCTCACGTTATCCTC -3 ') (SEQ ID NO: 2284) and GWR2A (5'-CTCTATTCAACCCCACACGTAACTG -3') (SEQ ID NO: 2285). went. An additional approximately 398 nt of the flanking sequence containing nucleotides 1-398 of SEQ ID NO: 4 was cloned by this method.
調節要素に関する検索は、「TATA」ボックス、「CAAT」ボックスおよび「GAGA」ボックスに加えて、いくつかのMYB様認識部位および器官特異性要素がタバコニコチンデメチラーゼプロモーター領域内に存在することを示した。標準的な方法を用いて特定された推定エリシター応答要素および窒素調節要素も該プロモーター領域内に存在する。 A search for regulatory elements indicates that in addition to the “TATA”, “CAAT” and “GAGA” boxes, several MYB-like recognition sites and organ-specific elements are present in the tobacco nicotine demethylase promoter region. It was. Putative elicitor response elements and nitrogen regulatory elements identified using standard methods are also present in the promoter region.
D.構造遺伝子の3'隣接配列のクローニング
構造遺伝子D121-AA8の更なる3'隣接配列をクローニングするために、BD GenomeWalker Universal Kit (Clontech laboratories, Inc., PaloAlto, CA)を該製造業者のユーザーマニュアルに従い使用した。該クローニング手順は、遺伝子特異的プライマー以外は、この実施例の前記C節に記載されているのと同じである。第1プライマーはD121-AA8構造遺伝子の末端の近傍から設計した(5’- CTA AAC TCT GGT CTG ATC CTG ATA CTT -3’) (配列番号2286)。ネスティッドプライマーは、D121-AA8の構造遺伝子のプライマー1の更に下流から設計した(CTA TAC GTA AGG TAA ATC CTG TGG AAC) (配列番号2287)。ゲル電気泳動により、最終的なPCR産物を調べた。所望のバンドを該ゲルから切り出した。QIAGENのQIAquickゲル精製キットを使用して該PCR断片を精製した。pGEM-T Easy Vector (Promega, Madison, WI)内に、該製造業者の説明に従い、精製されたPCR断片を連結した。SV Miniprepキット (Promega, Madison, WI)を該製造業者の説明に従い使用して、該形質転換DNAプラスミドをミニプレップにより抽出した。CEQ 2000シークエンサー (Beckman, Fullerton, CA)を使用して、該インサートを含有するプラスミドDNAを配列決定した。更に3'隣接配列の約1617ヌクレオチド(配列番号4のヌクレオチド4731-6347)を前記方法によりクローニングした。3'UTR領域の核酸配列を図7に示す。
D. Cloning the 3 'flanking sequence of the structural gene To clone additional 3' flanking sequences of the structural gene D121-AA8, use the BD GenomeWalker Universal Kit (Clontech laboratories, Inc., PaloAlto, CA) according to the manufacturer's user manual. used. The cloning procedure is the same as described in section C of this example, except for gene specific primers. The first primer was designed from the vicinity of the end of the D121-AA8 structural gene (5′-CTA AAC TCT GGT CTG ATC CTG ATA CTT-3 ′) (SEQ ID NO: 2286). The nested primer was designed further downstream from primer 1 of the D121-AA8 structural gene (CTA TAC GTA AGG TAA ATC CTG TGG AAC) (SEQ ID NO: 2287). The final PCR product was examined by gel electrophoresis. The desired band was cut from the gel. The PCR fragment was purified using QIAGEN's QIAquick gel purification kit. Purified PCR fragments were ligated into pGEM-T Easy Vector (Promega, Madison, Wis.) according to the manufacturer's instructions. The transformed DNA plasmid was extracted by miniprep using the SV Miniprep kit (Promega, Madison, Wis.) According to the manufacturer's instructions. Plasmid DNA containing the insert was sequenced using a CEQ 2000 sequencer (Beckman, Fullerton, CA). Further, about 1617 nucleotides (nucleotides 4731-6347 of SEQ ID NO: 4) of the 3 ′ flanking sequence were cloned by the above method. The nucleic acid sequence of the 3 ′ UTR region is shown in FIG.
ニコチンデメチラーゼ遺伝子の存在または非存在に関するNicotiana属のスクリーニング
以下の表8に示すとおり、43種のNicotiana種、49種のNicotiana rustica系統および約600種のNicotiana tabacumをポット内に播種し、生じた植物を温室内で成長させた。
葉サンプルを6週齢の植物から採取した。DNeasy Plant Mini Kit (Qiagen, Inc., Valencia, CA)を該製造業者のプロトコールに従い使用して、葉からのDNA抽出を行った。 Leaf samples were taken from 6 week old plants. DNA extraction from leaves was performed using DNeasy Plant Mini Kit (Qiagen, Inc., Valencia, CA) according to the manufacturer's protocol.
プライマーは、本明細書に記載の5'プロモーターおよび3'UTR領域に基づいて設計した。フォワードプライマーは5’-GGC TCT AGA TAA ATC TCT TAA GTT ACT AGG TTC TAA-3’ (配列番号2290)であり、リバースプライマーは5’-GGC TCT AGA AGT CAA TTA TCT TCT ACA AAC CTT TAT ATA TTA GC-3’ (配列番号2291) (5'隣接領域の -750から180 nt 3’ UTRまで)であった。すべての前記Nicotiana系統から抽出したゲノムDNAをPCR分析に使用した。100μlの反応混合物およびPfx高忠実度酵素をPCR増幅に使用した。種間の相同性がより低かったため、用いたアニーリング温度は54℃であった(この温度は、前記の4407変換体タバコからのゲノム配列のクローニングに用いた温度より2℃低い)。電気泳動後、0.8%アガロースゲル上でPCR産物を可視化した。約3.5kbの分子量を有する単一のバンドが該ゲル上に存在した、または存在しなかった。陽性バンドを有するこの系統は標的遺伝子を有すると評価された。陽性バンドを欠く系統に関しては、更に4つのプライマーセットを使用して4つの追加的なPCR反応を行った。これらのプライマーセットは、該遺伝子の異なる領域から選択した。それらのプライマーセットは以下のとおりであった。 Primers were designed based on the 5 ′ promoter and 3 ′ UTR region described herein. The forward primer is 5'-GGC TCT AGA TAA ATC TCT TAA GTT ACT AGG TTC TAA-3 '(SEQ ID NO: 2290), and the reverse primer is 5'-GGC TCT AGA AGT CAA TTA TCT TCT ACA AAC CTT TAT ATA TTA GC -3 ′ (SEQ ID NO: 2291) (from −750 to 180 nt 3 ′ UTR of the 5 ′ flanking region). Genomic DNA extracted from all the Nicotiana strains was used for PCR analysis. 100 μl of reaction mixture and Pfx high fidelity enzyme were used for PCR amplification. Due to the lower homology between species, the annealing temperature used was 54 ° C. (this temperature is 2 ° C. lower than the temperature used for cloning the genomic sequence from the 4407 transformant tobacco). After electrophoresis, PCR products were visualized on a 0.8% agarose gel. A single band with a molecular weight of about 3.5 kb was present or absent on the gel. This line with a positive band was assessed to have the target gene. For lines lacking positive bands, four additional PCR reactions were performed using four additional primer sets. These primer sets were selected from different regions of the gene. Those primer sets were as follows.
(1)開始コドンから(5’- GCC CAT CCT ACA GTT ACC TAT AAA AAG GAA G -3’)終止コドンまで5’- ACC AAG ATG AAA GAT CTT AGG TTT TAA -3’) (配列番号2293)、
(2)開始コドンの570nt下流から(5’- CTG ATC GTG AAG ATG A -3’) (配列番号2294)イントロンの終わりまで(5’- TGC TGC ATC CAA GAC CA -3’) (配列番号2295)、
(3)イントロンの始まりの300nt下流から(5’- GGG CTA TAT GGA TTC GC -3’)(配列番号2296)イントロンの終わりまで(5’- TGC TGC ATC CAA GAC CA -3’) (配列番号2295)、および
(4)イントロンの始まりの300nt下流から(5’- GGG CTA TAT GGA TTC GC -3’) (配列番号2296)3'UTRまで(5’- AGT CAA TTA TCT TCT ACA AAC CTT TAT ATA TTA GC -3’) (配列番号2195)。
(1) From the start codon to (5'-GCC CAT CCT ACA GTT ACC TAT AAA AAG GAA G -3 ') to the stop codon 5'-ACC AAG ATG AAA GAT CTT AGG TTT TAA -3') (SEQ ID NO: 2293),
(2) From 570 nt downstream of the start codon to (5′-TCG ATC GTG AAG ATG A -3 ′) (SEQ ID NO: 2294) to the end of the intron (5′-TCC TGC ATC CAA GAC CA -3 ′) (SEQ ID NO: 2295 ),
(3) 300 nt downstream from the beginning of the intron (5'-GGG CTA TAT GGA TTC GC -3 ') (SEQ ID NO: 2296) to the end of the intron (5'-TGC TGC ATC CAA GAC CA -3') (SEQ ID NO: 2295), and (4) 300 nt downstream from the beginning of the intron (5'-GGG CTA TAT GGA TTC GC -3 ') (SEQ ID NO: 2296) up to 3'UTR (5'- AGT CAA TTA TCT TCT ACA AAC CTT TAT ATA TTA GC-3 ') (SEQ ID NO: 2195).
5つの前記PCR反応がすべて正しいバンドを示した場合には、該系統は標的遺伝子を欠いていると評価された。標的ニコチンデメチラーゼ遺伝子に関するゲノムDNA量およびPCR産物の具体例を図8および9に示す。 If all five of the PCR reactions showed the correct band, the line was assessed as lacking the target gene. Specific examples of the amount of genomic DNA and PCR products related to the target nicotine demethylase gene are shown in FIGS.
ニコチンデメチラーゼ遺伝子を欠くものとして特定された生殖質を、栽培タバコとの育種のための原材料として使用する。しかし、図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列またはそれらの断片が同様に使用されうる。異常な又は存在しないニコチンデメチラーゼ遺伝子または図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列もしくはそれらの断片をドナー源から栽培タバコへ移入するためには、戻し交配または系統育種法のような標準的な育種法と組合された種間または種内交雑法が用いられうる。ニコチンデメチラーゼに関するスクリーニング実験の結果を以下の表9に記載する。ニコチンデメチラーゼに関して陰性である系統をそれ自身または別の陰性系統と交配させることが可能である(例えば、Nicotiana africana × Nicotiana africana、またはNicotiana africana × Nicotiana amplexicaulis、または任意の適当な交配組合せ)。また、当技術分野で公知の標準的なタバコ育種技術により、陰性系統をタバコの任意の実用品種と交配させることも可能である。当技術分野における標準的な方法により、タバコ系統を任意の他の適合植物と交配させることが可能である。
変異の作製または生成およびニコチンデメチラーゼ遺伝子内の遺伝的変異に関するスクリーニング
ニコチンデメチラーゼをコードする配列または図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す核酸配列もしくはそれらの断片により表される任意の他の遺伝子における既存の遺伝的変異または変異を、ゲノム内標的化誘発性局所損傷(targeted induced local lesions in genomes (TILLING))、DNAフィンガープリンティング法、例えば増幅断片長多型(AFLP)および一塩基多型(SNP)を含む分子的技術を用いてスクリーニングする。実際には、既存の遺伝的変異を表す植物集団、例えばトランスジェニック植物(例えば、本明細書に記載の任意のトランスジェニック植物)または生殖組織または他の植物組織を化学的変異誘発、例えばアルキル化剤、例えばエタンメチルスルホナート(EMS)または放射線、例えばX線もしくはγ線に付すことにより作製された植物を使用する。変異誘発された集団を得るためには、変異誘発化合物または放射線の量は、致死または生殖不稔により特徴づけられる閾値レベルより低い変異頻度が得られるよう植物組織の各タイプごとに実験的に決定される。変異誘発処理から生じたM1世代種子の数またはM1植物集団のサイズは、変異の予想頻度に基づいて推定される。M1植物のの後代であるM2世代は、望ましくは遺伝子(例えば、ニコチンデメチラーゼ遺伝子)内の変異に関して評価される集団に相当する。
Screening for the creation or generation of mutations and genetic mutations within the nicotine demethylase gene Sequences encoding nicotine demethylase or FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1-172-19 and 173- Pre-existing genetic mutations or mutations in any other gene represented by the nucleic acid sequence shown in 1-173-294 or fragments thereof are targeted induced local lesions in genomes (TILLING) ), Screening using molecular fingerprinting techniques such as amplified fragment length polymorphism (AFLP) and single nucleotide polymorphism (SNP). In practice, chemical mutagenesis, eg, alkylation, of a plant population that represents an existing genetic variation, eg, a transgenic plant (eg, any transgenic plant described herein) or a reproductive tissue or other plant tissue. Plants made by exposure to agents such as ethane methyl sulfonate (EMS) or radiation such as X-rays or gamma rays are used. In order to obtain a mutagenized population, the amount of mutagenic compound or radiation is experimentally determined for each type of plant tissue so that a mutation frequency is obtained that is below the threshold level characterized by lethality or reproductive sterility. Is done. The number of M1 generation seeds or the size of the M1 plant population resulting from the mutagenesis treatment is estimated based on the expected frequency of mutation. The M2 generation, the progeny of M1 plants, desirably corresponds to a population that is evaluated for mutations in a gene (eg, nicotine demethylase gene).
誘発された又は天然で生じる遺伝的変異を望ましい遺伝子(例えば、ニコチンデメチラーゼ遺伝子)内で検出するためには、耕作(tilling)、DNAフィンガープリンティング、SNPまたは同様の技術が用いられうる。該変異は、欠失、置換、点変異、転座、逆位、重複、挿入または完全なヌル変異から生じうる。これらの技術は、ニコチンデメチラーゼ遺伝子または図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列もしくはそれらの断片のヌルまたは異類(dissimilar)対立遺伝子を他のタバコ内に移入または育種するためのマーカー補助選別(MA育種計画)において用いられうるであろう。育種家は、ヌルまたは異類対立遺伝子を含有する遺伝子型と農業に望ましい遺伝子型との交雑により分離集団を作製しうるであろう。既に挙げた技術の1つを用いて、ニコチンデメチラーゼ配列または図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す核酸配列もしくはそれらの断片から生じたマーカーを使用して、F2または戻し交配世代における植物をスクリーニングしうるであろう。ヌルまたは同類対立遺伝子を有すると特定された植物を戻し交配または自家受粉させて、スクリーニングされうる次の世代を作製することが可能であろう。予想される遺伝パターンまたは用いるMAS技術に応じて、所望の個々の植物の特定を補助するために、戻し交配の各サイクルの前に、選抜された植物を自家受粉させることが必要かもしれない。戻し交配または他の育種法は、反復親の所望の表現型が回復するまで反復されうる。 Tilling, DNA fingerprinting, SNP or similar techniques can be used to detect induced or naturally occurring genetic variations within the desired gene (eg, nicotine demethylase gene). The mutation can result from a deletion, substitution, point mutation, translocation, inversion, duplication, insertion or complete null mutation. These techniques involve the nicotine demethylase gene or any nucleic acid sequence shown in FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to 173-294 or fragments thereof. Could be used in a marker-assisted selection (MA breeding program) to transfer or breed other null or dissimilar alleles into other tobacco. Breeders could create a segregating population by crossing a genotype containing a null or heterologous allele with a genotype desirable for agriculture. Using one of the techniques already mentioned, the nicotine demethylase sequence or the nucleic acid sequence shown in Figures 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1-172-19 and 173-1-173-294 Alternatively, markers generated from these fragments could be used to screen plants in F2 or backcross generations. Plants identified as having null or conservative alleles could be backcrossed or self-pollinated to produce the next generation that could be screened. Depending on the expected genetic pattern or the MAS technique used, it may be necessary to self-pollinate the selected plants prior to each backcross cycle to help identify the desired individual plants. Backcrossing or other breeding methods can be repeated until the desired phenotype of the recurrent parent is restored.
栽培タバコ内への変異ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現の交配または移入
A.親系統の選択
変異ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現を有する供与タバコ系統(例えば、PCRに基づく方法を用いて、ニコチンデメチラーゼ遺伝子を欠く、またはニコチンデメチラーゼに関してヌルである、または酵素活性の改変を伴うニコチンデメチラーゼを発現するものとして特定されるタバコ系統、あるいは遺伝子発現を改変もしくはサイレンシングするトランスジーンを発現するタバコ系統も、ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現に関する変異体であるとみなされる)または図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列もしくはそれらの断片を特定し、供与親として用いるために選択する。そのような植物は、当技術分野で公知の標準的な方法(例えば、本明細書に記載のもの)により作製される。他の供与親には、変異誘発され次いで変異ニコチンデメチラーゼ遺伝子活性または図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列もしくはそれらの断片によりコードされる遺伝子産物の変異活性を有すると特定されたタバコ植物が含まれる。1つの典型的な供与親としては、neタバコ系統Nicotiana rusticaが挙げられる。
Mating or transferring mutant nicotine demethylase gene expression into cultivated tobacco
A. Selection of parental line A donor tobacco line with mutated nicotine demethylase gene expression (eg, using a PCR-based method, nicotine lacking the nicotine demethylase gene or null with respect to nicotine demethylase, or with altered enzyme activity Tobacco lines identified as expressing demethylase, or tobacco lines expressing a transgene that alters or silences gene expression are also considered variants for nicotine demethylase gene expression) or FIG. Any nucleic acid sequence shown in -7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to 173-294 or a fragment thereof is identified and selected for use as a donor parent. Such plants are produced by standard methods known in the art (eg, those described herein). Other donor parents are mutagenized and then mutated nicotine demethylase gene activity or shown in Figures 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1-172-19 and 173-1-173-294 Included are tobacco plants identified as having the mutating activity of the gene product encoded by any nucleic acid sequence or fragment thereof. One typical donor is the ne tobacco line Nicotiana rustica.
受容(レシピエント)タバコ系統は、典型的には、任意の商業用タバコ品種、例えばNicotiana tabacum TN 90である。他の有用なNicotiana tabacum品種には、BU 64, CC 101, CC 200, CC 27, CC 301, CC 400, CC 500, CC 600, CC 700, CC 800, CC 900, Coker 176, Coker 319, Coker 371 Gold, Coker 48, CU 263, DF911, Galpao tobacco, GL 26H, GL 350, GL 737, GL 939, GL 973, HB 04P, K 149, K 326, K 346, K 358, K 394, K 399, K 730, KT 200, KY 10, KY 14, KY 160, KY 17, KY 171, KY 907, KY 160, Little Crittenden, McNair 373, McNair 944, msKY 14 x L8, Narrow Leaf Madole, NC 100, NC 102, NC 2000, NC 291, NC 297, NC 299, NC 3, NC 4, NC 5, NC 6, NC 606, NC 71, NC 72, NC 810, NC BH 129, OXFORD 207, 'Perique' tobacco, PVH03, PVH09, PVH19, PVH50, PVH51, R 610, R 630, R 7-11, R 7-12, RG 17, RG 81, RG H4, RG H51, RGH 4, RGH 51, RS 1410, SP 168, SP 172, SP 179, SP 210, SP 220, SP G-28, SP G-70, SP H20, SP NF3, TN 86, TN 97, TN D94, TN D950, TR (Tom Rosson) Madole, VA 309, VA 309またはVA 359が含まれる。そのような品種からの種子も、標準的な化学的または分子的方法を用いてニコチン変換の欠如または存在に関してスクリーニングすることにより得られた起源に由来しうる。そのような商業用品種は、本明細書に記載の方法によりニコチンデメチラーゼ活性を改変するための材料をも提供しうる。当技術分野で公知の他のヌル系統および受容または供与系統も有用であり、本明細書に記載のニコチンデメチラーゼ遺伝子とは異類であると特定された系統も供与親として使用される。また、受容系統は、火力乾燥(フルーキュアリング)、バーレー、いぶし(dark)タバコ、バージニアまたはオリエンタルタバコのための任意のタバコ品種から選択されうる。表10は、Nicotiana tabacumに対して育種適合性を示す典型的なNicotiana種を示す(例えば、APSにより公開されているCompendium of Tobacco Diseasesまたは日本たばこ産業により公開されているThe Genus Nicotiana Illustratedも参照されたい)。
B.遺伝子導入
標準的な育種法により、供与親を反復的に供与親と交配または交雑させる。標準的な方法により特定される、交雑の成功は、稔性であるか又は所望により反復親と戻し交配されるF1植物を与える。F1植物に由来するF2世代における植物集団を、変異ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現に関して(例えば、標準的な方法により、例えば、本明細書に記載のニコチンデメチラーゼに関するヌクレオチド配列情報に基づくプライマーを使用するPCRにより、ニコチンデメチラーゼ遺伝子の非存在によりニコチンデメチラーゼを発現しない植物が特定される)または図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列もしくはそれらの断片の変異体発現に関してスクリーニングする。あるいは、植物アルカロイド含量を評価するための、当技術分野で公知の任意の標準的なスクリーニング法を用いて、ニコチンをノルニコチンへ変換しない植物を特定する。ついで、選択した植物を受容親と交雑させ、第1戻し交配(BC1)世代植物を自家受粉させてBC1F2集団を得、これを変異ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現(例えば、ニコチンでメチラーゼ遺伝子のヌル形態)に関して再びスクリーニングする。稔性であり受容親に合理的に類似した植物を最終スクリーニングが与えるまで、戻し交配、自家受粉およびスクリーニングの過程を例えば少なくとも4回繰返す。所望により、この植物を自家受粉させ、ついでその後代を再びスクリーニングして、該植物が変異ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現(例えば、ニコチンデメチラーゼに関してヌル状態を示す植物)または図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列もしくはそれらの断片の変異体発現を示すことを確認する。所望により、染色体相補および染色体対合関係を確認するするために、選択した植物の細胞遺伝学的分析を行う。標準的な方法、例えば、圃場試験、ニコチンデメチラーゼに関するヌル状態または図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列もしくはそれらの断片によりコードされるポリペプチドのヌルもしくは促進状態の確認、ならびに乾燥葉の化学的分析(アルカロイドのレベル、特にノルニコチンの含量およびノルニコチン/ニコチン + ノルニコチンの比、または図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列もしくはそれらの断片において見出されるそれらの遺伝子配列によりもたらされる他のそのような所望の特性を測定するためのもの)を用いて、選択した植物の育種用種子を得る。
B. Gene transfer The donor parent is repeatedly mated or hybridized with the donor parent using standard breeding methods. A successful cross, identified by standard methods, gives F1 plants that are fertile or optionally backcrossed with recurrent parents. Plant populations in the F2 generation derived from F1 plants can be mutated for mutant nicotine demethylase gene expression (eg, using standard methods, eg, primers using primers based on nucleotide sequence information for nicotine demethylase described herein) Identifies plants that do not express nicotine demethylase due to the absence of the nicotine demethylase gene) or FIGS. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to Screen for mutant expression of any of the nucleic acid sequences shown in 173-294 or fragments thereof. Alternatively, any standard screening method known in the art for assessing plant alkaloid content is used to identify plants that do not convert nicotine to nornicotine. The selected plant is then crossed with the recipient parent, and the first backcross (BC1) generation plant is self-pollinated to obtain the BC1F2 population, which is mutated nicotine demethylase gene expression (eg, nicotine with the null form of the methylase gene) Screen again for. The process of backcrossing, self-pollination and screening is repeated, for example, at least four times until the final screening gives fertile and reasonably similar plants to the recipient parent. If desired, the plant is self-pollinated and then its progeny are screened again so that the plant exhibits mutant nicotine demethylase gene expression (eg, a plant that exhibits a null state for nicotine demethylase) or FIG. 1, 3-7, 10 It is confirmed to show mutant expression of any of the nucleic acid sequences shown in 158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to 173-294 or fragments thereof. If desired, cytogenetic analysis of selected plants is performed to confirm chromosomal complementation and chromosome pairing relationships. Standard methods such as field tests, null status for nicotine demethylase or any of those shown in Figures 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to 173-294 Confirmation of the null or accelerated state of the polypeptide encoded by the nucleic acid sequences or fragments thereof, and chemical analysis of dried leaves (alkaloid levels, particularly nornicotine content and nornicotine / nicotine + nornicotine ratio, or FIG. Any of the nucleic acid sequences shown in 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 to 172-19 and 173-1 to 173-294 or other gene sequences thereof found in their fragments For measuring the desired characteristics as described above) to obtain seeds for breeding the selected plant.
受容植物(例えば、N. rustica)と供与親(例えば、TN90)との間の交配から得られた元のF1雑種を該供与植物(例えば、TN90)と交雑または戻し交配させる場合には、この戻し交配の後代を自家受粉させてBC1F2世代を得、これを、ニコチンデメチラーゼのヌルもしくは異類形態または図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列もしくはそれらの断片によりコードされるポリペプチドのヌルもしくは促進状態に関してスクリーニングする。育種操作のその他の点については、前段落で説明したとおりである。 If the original F1 hybrid obtained from a cross between a recipient plant (eg N. rustica) and a donor parent (eg TN90) is crossed or backcrossed to the donor plant (eg TN90), this The progeny of backcrossing is self-pollinated to obtain the BC1F2 generation, which is a null or atypical form of nicotine demethylase or Figure 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1-172-19 and 173 Screening for null or facilitating states of polypeptides encoded by any of the nucleic acid sequences shown in -1 to 173-294 or fragments thereof. Other aspects of the breeding operation are as described in the previous paragraph.
C.農業上の特性の試験および表現型の確認
該育種および変異体ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現(例えば、ニコチンデメチラーゼに関するヌル状態、または図1、3〜7、10〜158、162〜170、172-1〜172-19および173-1〜173-294に示す任意の核酸配列もしくはそれらの断片のヌル状態)に関するスクリーニングから得られた系統を、標準的な圃場法を用いて圃場において評価する。元の受容親(例えば、TN90)を含む対照遺伝子型を加え、登録体を、完全無作為ブロック設計または他の適当な圃場設計において圃場に配置する。タバコのための標準的な農業的実施を行い、例えば、該タバコを収穫し、秤量し、乾燥(キュアリング)の前および途中に化学的および他の一般的な試験のためにサンプル化する。選択された系統の、受容植物(例えば、親系統TN90)に対する類似性を確認するために、データの統計解析を行う。
C. Testing agricultural characteristics and confirming the phenotype The breeding and mutant nicotine demethylase gene expression (eg, null status for nicotine demethylase, or FIG. 1, 3-7, 10-158, 162-170, 172-1 Lines obtained from screening for any nucleic acid sequences shown in ˜172-19 and 173-1 to 173-294 or the null state thereof are evaluated in the field using standard field methods. A control genotype containing the original recipient parent (eg, TN90) is added and the registrant is placed in the field in a fully random block design or other suitable field design. Standard agricultural practices for tobacco are performed, for example, the tobacco is harvested, weighed, and sampled for chemical and other common tests before and during drying (curing). Statistical analysis of the data is performed to confirm the similarity of the selected line to the recipient plant (eg, parent line TN90).
栽培タバコへの修飾属性の交配(育種)または移入
本明細書に記載の任意の遺伝子、例えば図1、図3〜7、図10〜158、図162〜170、図172-1〜172-19および図173-1〜173-294に示す任意の核酸配列の発現を本明細書に記載の方法により修飾することも可能である。そのような遺伝子は、植物の表現型を修飾するための、例えば香味または芳香またはそれらの両方を改良するための、感覚刺激特性を改良するための、または乾燥性を改良するための基礎となる。ついで、修飾された表現型を有すると特定された植物を、当技術分野で公知の標準的な方法(例えば、本明細書に記載の方法)による育種プロトコールにおいて使用する。
Crossing (breeding) or transferring modified attributes to cultivated tobacco Any gene described herein, for example, FIG. 1, FIG. 3-7, FIG. 10-158, FIG. 162-170, FIG. And the expression of any of the nucleic acid sequences shown in FIGS. 173-1 to 173-294 can be modified by the methods described herein. Such genes are the basis for modifying the phenotype of plants, for example improving flavor or fragrance or both, improving sensory stimulating properties, or improving dryness . The plants identified as having a modified phenotype are then used in a breeding protocol by standard methods known in the art (eg, the methods described herein).
雑種植物の作製
プロトプラスト融合を用いる、雑種植物の生産のために開発された標準的なプロトプラスト培養法の適用も、変異体遺伝子発現(例えば、変異体ニコチンデメチラーゼ遺伝子発現)を有する植物を作製するために有用である。したがって、変異体遺伝子発現を有する第1および第2タバコ植物からプロトプラストを作製する。成功裏に得られたプロトプラスト融合体からカルスを培養し、ついで植物を再生させる。生じた後代雑種植物を特定し、標準的な方法により、変異体遺伝子発現に関して選択し、所望により、任意の標準的な育種プロトコールにおいて使用することが可能である。
Using the manufacturing protoplast fusion hybrid plants, standard protoplast culture methods developed for the production of hybrid plants also apply, mutant gene expression (e.g., mutant nicotine demethylase gene expression) to produce a plant having Useful for. Accordingly, protoplasts are produced from the first and second tobacco plants having mutant gene expression. Callus is cultured from the successfully obtained protoplast fusion, and then the plant is regenerated. The resulting progeny hybrid plants can be identified, selected for mutant gene expression by standard methods, and used in any standard breeding protocol if desired.
WO 03/078577、WO 2004/035745、PCT/US/2004/034218およびPCT/US/2004/034065ならびに本明細書中で言及されている全ての他の参考文献、特許、特許出願公開および特許出願を、これらの参考文献、特許、特許出願公開および特許出願のそれぞれが参照により本明細書中に個別に組み入れられている場合と同等に、参照により本明細書に組み入れることとする。 WO 03/078577, WO 2004/035745, PCT / US / 2004/034218 and PCT / US / 2004/034065 and all other references, patents, patent publications and patent applications mentioned in this specification Are hereby incorporated by reference as if each of these references, patents, patent application publications and patent applications were individually incorporated herein by reference.
本発明の前記の詳細な説明を考慮すれば、本発明の実施における多数の修飾および変更が当業者に見出されると予想される。したがって、そのような修飾および変更も特許請求の範囲の範囲内に含まれると意図される。 In view of the foregoing detailed description of the invention, many modifications and changes in the practice of the invention are expected to occur to those skilled in the art. Accordingly, such modifications and variations are intended to be included within the scope of the claims.
Claims (14)
a)複数のタバコ植物細胞を変異誘発する工程;
b)低下したニコチンデメチラーゼの発現について、変異誘発された細胞から作製された植物の後代をスクリーニングする工程;および
c) 配列番号4で表されるヌクレオチド配列に変異を含む内因性核酸を有し、ニコチンデメチラーゼの発現が低下している、一つまたは複数の後代を選択する工程。 A method of producing a tobacco plant with reduced expression of nicotine demethylase comprising the steps of:
a) mutagenizing a plurality of tobacco plant cells;
b) screening progeny of plants made from the mutagenized cells for reduced nicotine demethylase expression; and
c) a step of selecting one or more progeny having an endogenous nucleic acid containing a mutation in the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 4 and having reduced expression of nicotine demethylase.
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