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JP2026500282A - インフルエンザウイルス様粒子をコードするmRNA - Google Patents

インフルエンザウイルス様粒子をコードするmRNA

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JP2026500282A
JP2026500282A JP2025534604A JP2025534604A JP2026500282A JP 2026500282 A JP2026500282 A JP 2026500282A JP 2025534604 A JP2025534604 A JP 2025534604A JP 2025534604 A JP2025534604 A JP 2025534604A JP 2026500282 A JP2026500282 A JP 2026500282A
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influenza
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mrna
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ソフィー・ビュファン
イザベル・ルゲストロワ
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サノフィ パスツール インコーポレイテッド
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Abstract

本発明は、哺乳動物細胞を誘導してインフルエンザウイルス様粒子(VLP)を産生することができるメッセンジャーRNA(mRNA)ベースの免疫原性組成物に関する。免疫原性組成物は、インフルエンザウイルスマトリックス1(M1)タンパク質と、1つ以上のインフルエンザウイルスヘマグルチニン(HA)タンパク質及び/又は1つ以上のインフルエンザウイルスノイラミニダーゼ(NA)タンパク質とをコードする1つ以上のmRNAを含む。

Description

本発明は、哺乳動物細胞を誘導してウイルス様粒子(VLP)を産生させることができるメッセンジャーRNA(mRNA)ベースのインフルエンザワクチンに関する。VLPは、その表面上に様々なエピトープのクラスターを発現することができるが、ウイルス遺伝物質を欠くため、ワクチンは、複数のインフルエンザ亜型/系統に対して有効であり、長期にわたって持続する免疫応答を誘発し、代替的なワクチン接種戦略よりも高い安全性プロファイルを確保することが期待される。
インフルエンザウイルスは、オルトミクソウイルス科(Orthomyxoviridae)のエンベロープを有するマイナス鎖RNAウイルスである。インフルエンザウイルスには、A型、B型、C型、及びD型の4つの型があり、これらのうち、A型、B型、及びC型のみがヒトに感染することが知られている。A型及びB型は、最も一般的に循環する型である。インフルエンザA型の亜型は、2つの表面糖タンパク質であるヘマグルチニン(HA)及びノイラミニダーゼ(NA)の存在に基づいて分類される。B型インフルエンザウイルスは、インフルエンザB型/山形系統及びインフルエンザB型/ビクトリア系統の2つの異なる系統によって分類される。A型インフルエンザウイルスは、18個のHA及び11個のNAの亜型(subtype)に更に細分される。多数の潜在的な亜型が、インフルエンザウイルスで観察される高い抗原変異の主な原因となる。
HA及びNAは、産生的感染及び宿主免疫応答の確立のための重要な決定因子と考えられる。HAは、ウイルス侵入を促進するために、宿主細胞受容体上のウイルスとシアル酸との間の初期相互作用に関与する。シアル酸残基へのHA媒介性結合後、NAは生物学的シザーとして作用し、シアル酸を切断してウイルス放出を促進する(Buffin et al.,Vaccine.2019:37(46):6857-6867;Cohen et al,Virology Journal 2013 10:321)。マトリックス1(M1)タンパク質は、ウイルスリボヌクレオタンパク質と相互作用して、ウイルス膜の内面と密接に関連している(Peukes et al.,Nature.2020;587:495-498)。マトリックス2(M2)タンパク質は、ウイルスエンベロープ内にプロトンチャネルを形成する構造的膜貫通タンパク質である(Pielak & Chou,Biochim Biophys Acta.2011;1808(2):522-529。
インフルエンザウイルス感染に関連する最も一般的に報告されている症状としては、発熱、倦怠感、及び筋肉痛とともに気管気管支炎及び咽頭炎の上気道徴候が挙げられる。高リスク患者集団は、肺炎及び急性呼吸窮迫症候群などの重度の疾病表現型を呈する可能性が高く、これは入院及び死亡の可能性につながり得る(Flerlage et al.,Nat Rev Microbiol.2021;19(7):425-441)。毎年300万人~500万人を超えるインフルエンザの重症症例が発生すると推定されており、これらの症例のうち何十万人も死に至る(Ali & Cowling,Annu Rev Public Health.2021;42:43-57)。
ワクチン接種は、インフルエンザを予防し、疾病負荷を軽減するための最も成功した方法であり続けている。現在、不活化ワクチン、生弱毒化ワクチン、及びサブユニットワクチンを含む、いくつかのワクチンアプローチが免疫化プログラムに採用されている。現在入手可能なインフルエンザワクチンは、どれも特に有効ではない。これは、少なくとも部分的には、不適切なワクチン株の選択及び株の選択とワクチンの提供との間の遅延時間によって説明され得る。例えば、現在のインフルエンザワクチンの多くは、孵化前の鶏卵中でインフルエンザウイルスを増殖させることによって作製されており、その長い製造時間により、新たに出現した株に効率的に対応することが困難になる。
したがって、季節的に循環する株に対してより迅速に展開することができ、感染の予防又は低減に有効であるインフルエンザワクチンの開発が依然として必要とされている。
mRNAベースのワクチンは、SARS-CoV-2ウイルスによって引き起こされた最近のCOVID-19パンデミック中に実証されたように、迅速に展開することができる。実際に、ウイルスは、ヒト集団に広がるにつれて急速に変化していたが、mRNAベースのワクチンは、感染の重症度を低下させるのに有効なままであった。加えて、mRNA技術は、更新されたワクチンを短期間で提供することを可能にした。更新されたワクチンは、主に循環しているウイルスによって獲得された変異を含むSARS-CoV-2スパイク糖タンパク質をコードするmRNA配列を含む。
mRNAベースのワクチン戦略は、インフルエンザ感染を予防するか又はこれらの感染の重症度を低下させるのに非常に魅力的である。
ウイルス様粒子(VLP)は、免疫応答を誘発させるのに有効であるため、何十年もの間ワクチン研究者の注目を集めてきた。しかしながら、VLPベースのワクチンの製造は、一部には商業規模でVLPを産生することが困難であるため、ほとんどのウイルス、特にエンベロープウイルスに対しては依然として困難なままである。
本開示は、mRNAベースのワクチン技術を使用して、哺乳動物細胞におけるインフルエンザVLPの発現を誘導することができることを実証する。具体的には、(i)インフルエンザウイルスマトリックス1(M1)タンパク質と、(ii)1つ以上のインフルエンザウイルスヘマグルチニン(HA)タンパク質及び/又は1つ以上のインフルエンザウイルスノイラミニダーゼ(NA)タンパク質と、をコードする1つ以上のメッセンジャーRNA(mRNA)で哺乳動物細胞をトランスフェクトすることにより、本発明者らは、野生型インフルエンザウイルスと形態及びサイズが非常に類似したこれらの細胞におけるVLPの産生を誘導することができた。このmRNAベースのアプローチを使用して、本発明者らは、哺乳動物細胞を誘導して、異なるインフルエンザウイルス由来のHAタンパク質及びNAタンパク質を含むVLPを産生することができた。
注目すべきことに、HAタンパク質のうちの少なくとも1つ及び/又はNAタンパク質のうちの少なくとも1つは、M1タンパク質が由来するインフルエンザウイルスとは異なるインフルエンザウイルスからのものであった。これは、単一のM1タンパク質コード配列が、それらの表面上に異なるインフルエンザウイルス由来の複数のHA及びNAタンパク質を有するVLAの形成を誘導するのに十分であり得ることを示した。
本明細書に記載の組成物は、複数のインフルエンザ亜型/系統に対して有効な免疫応答を誘発するように設計することができる。VLPは、その表面上にエピトープのクラスターを発現することができるが、完全なウイルス遺伝物質を欠くため、本明細書に記載の組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、高い免疫原性である一方で、良好な安全性プロファイルを維持することが期待される。
特に、本発明は、(i)インフルエンザウイルスマトリックス1(M1)タンパク質と、(ii)1つ以上のインフルエンザウイルスヘマグルチニン(HA)タンパク質及び/又は1つ以上のインフルエンザウイルスノイラミニダーゼ(NA)タンパク質と、をコードする1つ以上のメッセンジャーRNA(mRNA)を含む組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)であって、M1タンパク質と1つ以上のHAタンパク質及び/又は1つ以上のNAタンパク質は、哺乳動物細胞を誘導して、ウイルス様粒子(VLP)を産生することができる、組成物に関する。
いくつかの実施形態では、VLPは、約50nm~約200nmのサイズである。いくつかの実施形態では、VLPは、約100nmのサイズである。
いくつかの実施形態では、哺乳動物細胞は、ヒト細胞である。
いくつかの実施形態では、1つ以上のmRNAは、2つ以上のHAタンパク質及び/又は2つ以上のNAタンパク質をコードし、2つ以上のHAタンパク質の各々及び2つ以上のNAタンパク質の各々は、異なるインフルエンザウイルスからのものである。
いくつかの実施形態では、2つ以上のHAタンパク質のうちの少なくとも1つ及び/又は2つ以上のNAタンパク質のうちの少なくとも1つは、M1タンパク質が由来するインフルエンザウイルスとは異なるインフルエンザウイルスからのものである。いくつかの実施形態では、2つ以上のHAタンパク質及び/又は2つ以上のNAタンパク質は、異なるインフルエンザA型の亜型からのものである。いくつかの実施形態では、2つ以上のHAタンパク質のうちの少なくとも1つ及び/又は2つ以上のNAタンパク質のうちの少なくとも1つは、B型インフルエンザウイルスからのものである。
いくつかの実施形態では、M1タンパク質は、パンデミックインフルエンザウイルス(例えば、A/カリフォルニア/07/2009)からのものである。いくつかの実施形態では、M1タンパク質は、H1N1 A型インフルエンザウイルスからのものである。いくつかの実施形態では、M1タンパク質は、30位にセリン、142位にアラニン、207位にアスパラギン、及び209位にスレオニンを有する。いくつかの実施形態では、M1タンパク質は、別個のmRNAによってコードされる。
いくつかの実施形態では、2つ以上のNAタンパク質のうちの少なくとも1つは、ノイラミニダーゼ活性アッセイによって決定されるように、2000マイクロモル/時間(μM/時)以上の活性を有する。いくつかの実施形態では、2つ以上のNAタンパク質は、異なるインフルエンザA型の亜型からの2つのNAタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、異なるインフルエンザA型の亜型は、N1及びN2である。いくつかの実施形態では、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、哺乳動物細胞におけるVLPの発現を誘導することができ、VLPは、異なるインフルエンザA型の亜型からの2つのNAタンパク質を含む。
いくつかの実施形態では、2つ以上のHAタンパク質は、異なるインフルエンザA型の亜型からの2つのHAタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、異なるインフルエンザA型の亜型は、H1及びH3である。いくつかの実施形態では、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、哺乳動物細胞におけるVLPの発現を誘導することができ、VLPは、異なるインフルエンザA型の亜型からの2つのHAタンパク質を含む。
いくつかの実施形態では、1つ以上のmRNAは、1つ以上の脂質ナノ粒子(LNP)内に封入される。
いくつかの実施形態では、各HAタンパク質及び各NAタンパク質は、別個のmRNAによってコードされる。いくつかの実施形態では、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、3、4、5、6、7、8、又は9個の、M1タンパク質をコードするmRNA分子、及び(i)2、3、4、5、6、7、若しくは8個のHAタンパク質、(ii)2、3、4、5、6、7、若しくは8個のNAタンパク質、又は(iii)1、2、3、若しくは4個のHAタンパク質及び1、2、3、若しくは4個のNAタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、3、4、5、6、7、8、又は9個のmRNAは、同じLNPに封入される。
いくつかの実施形態では、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、M1タンパク質をコードする1つのmRNAと、1つのHAタンパク質及び1つのNAタンパク質をコードする少なくとも1つのmRNAとを含む。いくつかの実施形態では、mRNAは、同じLNPに封入される。
いくつかの実施形態では、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、第1のHAタンパク質及び第1のNAタンパク質をコードする第1のmRNAと、第2のHAタンパク質及び第2のNAタンパク質をコードする第2のmRNAと、M1タンパク質をコードする第3のmRNAとを含み、第1のHAタンパク質及び第1のNAタンパク質は第1のインフルエンザウイルスからのものであり、第2のHAタンパク質及び第2のNAタンパク質は第2のインフルエンザウイルスからのものである。
いくつかの実施形態では、第1及び第2のインフルエンザウイルスは、異なる亜型のA型インフルエンザウイルスである。いくつかの実施形態では、異なる亜型は、H1N1及びH3N2である。
いくつかの実施形態では、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、第3のHAタンパク質及び第3のNAタンパク質をコードする第4のmRNAを更に含み、第3のHAタンパク質及び第3のNAタンパク質は第3のインフルエンザウイルスからのものである。いくつかの実施形態では、第3のインフルエンザウイルスは、B型インフルエンザウイルスである。
いくつかの実施形態では、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、第4のHAタンパク質及び第4のNAタンパク質をコードする第5のmRNAを更に含み、第4のHAタンパク質及び第4のNAタンパク質は第4のインフルエンザウイルスからのものである。いくつかの実施形態では、第3及び第4のインフルエンザウイルスは、それぞれインフルエンザB型/山形系統及びインフルエンザB型/ビクトリア系統のものである。
いくつかの実施形態では、適用可能な場合、1つの第1、第2、第4及び第5のmRNAは、5’から3’の順序で、(i)HAタンパク質のコード配列、(ii)内部リボソーム進入部位(IRES)又は2Aペプチドをコードするヌクレオチド配列、及び(iii)NAタンパク質のコード配列を含む。
いくつかの実施形態では、適用可能な場合、第1、第2、第3、第4及び第5のmRNAは、同じLNPに封入される。
いくつかの実施形態では、第1、第2及び第3のmRNAは第1のLNPに封入され、第4及び第5のmRNAは第2のLNPに封入される。いくつかの実施形態では、第2のLNPは、M1タンパク質をコードする第6のmRNAを更に含む。いくつかの実施形態では、第6のmRNAによってコードされるM1タンパク質は、B型インフルエンザウイルスからのものである。いくつかの実施形態では、第1のLNP及び第2のLNPは、同じ脂質成分を含む。
いくつかの実施形態では、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、インフルエンザウイルスマトリックス2(M2)タンパク質を更にコードするmRNAを更に含む。
いくつかの実施形態では、1つ以上のmRNAは、配列最適化されている。
いくつかの実施形態では、mRNAは、約100ヌクレオチド~約500ヌクレオチドを含むポリアデニル化(ポリA)配列を含む。いくつかの実施形態では、ポリA配列は、約200ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、ポリA配列は、約500ヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態では、LNPの脂質成分は、カチオン性脂質、非カチオン性脂質、PEG修飾脂質、及び任意選択的にステロール系脂質を含むか、又はそれからなる。
いくつかの実施形態では、カチオン性脂質は、cKK-E12、cKK-E10、HGT5000、HGT5001、ICE、HGT4001、HGT4002、HGT4003、TL1-01D-DMA、TL1-04D-DMA、TL1-08D-DMA、TL1-10D-DMA、OF-Deg-Lin、OF-02、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10、GL-TES-SA-DMP-E18-2、GL-TES-SA-DME-E18-2、SY-3-E14-DMAPr、TL1-10D-DMA、HEP-E3-E10、HEP-E4-E10、RL3-DMA-07D、RL2-DMP-07D、cHse-E-3-E10、cHse-E-3-E12、cDD-TE-4-E12、SI-4-E14-DMAPr、TL-1-12D-DMA、SY-010、SY-011、及び4-ヒドロキシブチル)アザンジイル)ビス(ヘキサン-6,1-ジイル)ビス(2-ヘキシルデカノエート(ALC-0315)から選択される。
いくつかの実施形態では、非カチオン性脂質は、DSPC(1,2-ジステアロイル-sn-グリセロ-3-ホスホコリン)、DPPC(1,2-ジパルミトイル-sn-グリセロ-3-ホスホコリン)、DOPE(1,2-ジオレイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン)、DEPE 1,2-ジエルコイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン、DOPC(1,2-ジオレイル-sn-グリセロ-3-ホスホチジルコリン)、DPPE(1,2-ジパルミトイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン)、DMPE(1,2-ジミリストイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン)、及びDOPG(1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスホ-(1’-rac-グリセロール))から選択される。
いくつかの実施形態では、PEG修飾脂質は、DMG-PEG-2K及び2-[(ポリエチレングリコール)-2000]-N,N-ジテトラデシルアセトアミド(ALC-0159)から選択される。
いくつかの実施形態では、ステロール系脂質は、コレステロールである。
いくつかの実施形態では、カチオン性脂質は、cKK-E10、OF-02、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10、及びALC-0315から選択される。いくつかの実施形態では、PEG修飾脂質は、DMG-PEG2K又はALC-0159から選択される。いくつかの実施形態では、非カチオン性脂質は、DOPE又はDSPCから選択される。
いくつかの実施形態では、LNPは、約70nm~約150nmのサイズである。
本発明はまた、本明細書に開示される組成物(例えば、免疫原性組成物)及び1つ以上の薬学的に許容される賦形剤を含む医薬組成物に関する。いくつかの実施形態では、1つ以上の薬学的に許容される賦形剤は、塩、糖、緩衝試薬及びそれらの組み合わせから選択される。いくつかの実施形態では、塩は、塩化ナトリウム、塩化カリウム又はその両方の組み合わせである。いくつかの実施形態では、糖は、二糖である。いくつかの実施形態では、二糖は、スクロース又はトレハロースである。いくつかの実施形態では、緩衝試薬は、リン酸、トリス、イミダゾール及びヒスチジンから選択される。いくつかの実施形態では、緩衝試薬は、リン酸又はトリスである。
本発明はまた、対象における1つ以上のインフルエンザウイルスに対する免疫応答を誘発させる方法であって、本方法は、本明細書に開示される組成物(例えば、免疫原性組成物、ワクチン、又は医薬組成物)を対象に投与することを含む方法に関する。いくつかの実施形態では、免疫応答は、対象における1つ以上のインフルエンザウイルスによる感染の1つ以上の症状の重症度を低下させるのに有効である。いくつかの実施形態では、免疫応答は、対象における1つ以上のインフルエンザウイルスによる感染を予防するのに有効である。
いくつかの実施形態では、対象は、ヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、妊娠している。いくつかの実施形態では、対象は、65歳以上である。いくつかの実施形態では、対象は、70歳以上である。
以下の図面を参照しながら、本発明の実施形態を例として説明する。
棒グラフに示されるように、亜型N1又はN2のNAタンパク質をコードする単一のmRNAでトランスフェクトされた、又はHA、NA及びM1タンパク質をコードする複数のmRNAでトランスフェクトされたHEK293T細胞の上清におけるNA活性を示す。NAの酵素活性は、μM/時として報告され、平均値(N=3)はバーの上に示される。模擬トランスフェクトされたHEK293T細胞(mRNAなし)の上清では、NA活性は検出されなかった。PBSは、陰性対照として機能した。 示されるように、H3亜型HAタンパク質(H3)をコードするmRNA及びH1亜型HAタンパク質(H1)、M1タンパク質(M1)、又は1つ以上のNAタンパク質(N1、N2)をコードする1つ以上の追加のmRNAでトランスフェクトされたHEK293T細胞の溶解物におけるH3亜型HAタンパク質のタンパク質発現を示す。溶解物をゲル上で分離させた。ポリクローナル抗H3抗体を用いてウェスタンブロットを行った。模擬トランスフェクトされた細胞(mRNAなし)は、陰性対照(NC)として機能した。H1、N1、H3、N2、及びM1タンパク質をコードする発現プラスミドで一次的にトランスフェクトされたHEK293T細胞から得られた精製VLPは、陽性対照(PC)として機能した。ゲルのレーンを、以下のように左から右に装填した:分子量マーカー(M);H3;H3/M1;H3/N2/M1、H1N1/H3N2/M1;H1/H3/M1;陰性対照(NC);陽性対照(PC);分子量マーカー(M)。 模擬トランスフェクトされたHEK293T細胞及びmRNAがトランスフェクトされたHEK293T細胞の上清からのVLPの代表的な低温透過型電子顕微鏡法(Cryo-TEM)画像を示す。トランスフェクトされた細胞の上清を、100kDaの孔径を有するAmicon(登録商標)超遠心分離フィルターに濃縮して、細胞破片及び小さなタンパク質を除去した。濃縮VLPを、更なる検査のために-80℃で維持した。パネルAは、模擬トランスフェクトされた細胞(mRNAなし)を示す。この条件では、VLPは視認できなかった。対照的に、パネルBは、インフルエンザウイルスHA、NA及びM1タンパク質(H3/N2/M1)をコードする別個のmRNAでトランスフェクトされた細胞の表面上の球状小胞の存在を示す。同様に、パネルCは、2つの異なるインフルエンザウイルス(それぞれH1、H3、N1及びN2)のHA及びNAタンパク質をコードする別個のmRNA、並びにM1タンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされた細胞の表面上に球状小胞が存在することを示す。VLPは、インフルエンザウイルスのサイズと同様の約100nmのサイズを有する。注目すべきことに、異なるインフルエンザウイルスからのHA及びNAタンパク質の発現は、VLP形成を妨害しなかった。 NAタンパク質をコードするmRNA、HAタンパク質をコードするmRNA、及びM1タンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされたExpi293F細胞の上清におけるNA活性を示す。NA及びHAタンパク質は、それぞれダーウィン(A型)、ウィスコンシン(A型)、プーケット(B型)及びオーストリア(B型)インフルエンザ株に適合させ、それらに由来した。M1タンパク質は、HA及びNAタンパク質配列が由来したものとは異なる株からのものであった(更なる詳細については、実施例6を参照されたい)。NAの酵素活性は、μM/時として報告される。模擬トランスフェクトされたExpi293F細胞(リポフェクタントのみ、陰性対照)の上清では、NA活性は検出されなかった。精製された組換えVLPは、陽性対照として機能した。 NAタンパク質をコードするmRNA、HAタンパク質をコードするmRNA、及びM1タンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされたExpi293F細胞の溶解物及び上清(SN;濃縮及び非濃縮)におけるインフルエンザA型(パネルA)及びB型(パネルB)HAタンパク質の発現を示す。NA及びHAタンパク質は、それぞれダーウィン(A型)、ウィスコンシン(A型)、プーケット(B型)及びオーストリア(B型)株に適合させ、それらに由来した。M1タンパク質は、HA及びNAタンパク質配列が由来したものとは異なる株からのものであった(更なる詳細については、実施例6を参照されたい)。ゲル上での分離後、A型(パネルA)又はB型(パネルB)に対するモノクローナル抗HA抗体を用いてウェスタンブロットを行った。模擬トランスフェクトされた細胞(リポフェクタントのみ)は、陰性対照として機能した。組換えインフルエンザB型HA(rHA_B)は、陽性対照として機能した。分子量マーカー(MW)も別のレーンに含まれた。完全長HA及びHA2サブユニットに対応するバンドは、破線で囲まれている。 NAタンパク質をコードするmRNA、HAタンパク質をコードするmRNA、及びM1タンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされたExpi293F細胞の溶解物及び濃縮上清(パネルA)並びに非濃縮上清(パネルB)におけるM1タンパク質の発現を示す。NA及びHAタンパク質は、それぞれダーウィン(A型)、ウィスコンシン(A型)、プーケット(B型)及びオーストリア(B型)株に適合させ、それらに由来した。M1タンパク質は、HA及びNAタンパク質配列が由来したものとは異なる株からのものであった(更なる詳細については、実施例6を参照されたい)。ゲル上での分離後、ポリクローナル抗M1抗体を用いてウェスタンブロットを行った。模擬トランスフェクトされた細胞(リポフェクタントのみ)は、陰性対照として機能した。精製されたVLPは、陽性対照として機能した。分子量マーカー(MW)も別のレーンに含まれた。M1は、トランスフェクトされた細胞の細胞溶解物及び濃縮上清中で検出されたが(パネルA)、非濃縮上清試料(パネルB)では検出されなかった。 模擬トランスフェクトされたExpi293F細胞及びmRNAでトランスフェクトされたExpi293F細胞の濃縮上清からの代表的な低温透過型電子顕微鏡法(Cryo-TEM)画像を示す。パネルAは、模擬トランスフェクトされた細胞(リポフェクタントのみ)を示す。この条件では、VLPは視認できなかった。パネルB~Eは、NAタンパク質をコードするmRNA、HAタンパク質をコードするmRNA、及びM1タンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされたExpi293F細胞の上清の代表的な画像を示す。NA及びHAタンパク質は、上記各パネルに示すように、それぞれインフルエンザ株のダーウィン(A型;パネルB)、ウィスコンシン(A型;パネルC)、プーケット(B型;パネルD)及びオーストリア(B型;パネルE)に適合させ、それらに由来した。M1タンパク質は、HA及びNAタンパク質配列が由来したものとは異なる株からのものであった(更なる詳細については、実施例6を参照されたい)。模擬トランスフェクトされた細胞の上清では、不均一な平滑小胞(白色の矢印)(トランスフェクションプロセスからのアーチファクトと考えられる)、及びタンパク質破片(黒色の輪郭の矢印)のみが観察された(パネルAの例示的な画像を参照されたい)。mRNAでトランスフェクトされた細胞の上清の各々において、VLPが検出された(パネルB~E;塗りつぶした黒色矢印を参照されたい)。VLPは、タンパク質破片(黒色の輪郭の矢印;パネルB~Dを参照されたい)及び平滑な小胞(白色の矢印;パネルEを参照されたい)と明確に区別することができる。VLPは、約50~150nmのサイズを有していた。 図7-1の続き。
定義
本発明の理解が容易になるように、初めに以下に特定の用語を定義する。以下の用語及び他の用語についての更なる定義は、本明細書全体を通して示される。
本明細書及び添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「1つの(a)」、「1つの(an)」及び「その(the)」は、別途文脈が明らかに指示しない限り、複数の指示物を含む。
具体的に記載されるか又は文脈から明らかである場合を除き、本明細書で使用される場合、用語「又は」は包含的であると理解され、「又は」及び「及び」の両方が含まれる。
本明細書で使用される場合、用語「およそ」又は「約」は、注目する1つ以上の値に使用される場合、記述される参照値に類似する値を指す。ある特定の実施形態では、この用語は、別段記述されない限り又は文脈から別段明らかではない限り、記述される参照値のいずれかの方向(より大きいか又はより小さい)の10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、又はそれ未満内に入る値の範囲を指す。
例示的な方法及び材料を以下に記載するが、本発明の実施又は試験には、本明細書に記載されるものと同様の又は均等な方法及び材料も用いられ得る。概して、本明細書に記載される細胞及び組織培養、分子生物学、ウイルス学、免疫学、微生物学、遺伝学、分析化学、合成有機化学、医薬品及び製薬化学並びにタンパク質及び核酸化学及びハイブリダイゼーションとの関連で使用される命名法及びその技法は、当該技術分野で周知の一般的に使用されるものである。酵素反応及び精製技法は、製造者の仕様書に従い、当該技術分野において一般的に達成されるとおり又は本明細書に記載されるとおり実施される。
本明細書で使用される場合、用語「mRNA」は、少なくとも1つのポリペプチドをコードするポリリボヌクレオチドを指す。本明細書で使用されるmRNAは、修飾RNA及び非修飾RNAの両方を包含する。mRNAは、1つ以上のコード領域及び非コード領域を含み得る。mRNAは、天然源から精製され、組換え発現系を使用して産生され、任意選択的に精製され、インビトロで転写され、又は化学的に合成され得る。適切な場合には、例えば、化学的に合成された分子の場合、mRNAは、化学的に修飾された塩基又は糖、骨格修飾などを有する類似体などのヌクレオシド類似体を含み得る。mRNA配列は、別段の指示がない限り、5’~3’方向に提示される。典型的なmRNAは、5’キャップ、5’非翻訳領域(5’UTR)、タンパク質-コード領域、3’非翻訳領域(3’UTR)及び3’テールを含む。いくつかの実施形態では、テール構造は、ポリ(C)テールである。より典型的には、テール構造は、ポリ(A)テールである。
本明細書で使用される場合、用語「配列最適化されている」は、ヌクレオチド配列が天然に存在する又は野生型の核酸と比べて修飾されていることを表して使用される。かかる修飾には、例えば、コドン最適化並びに通常その天然に存在する又は野生型の核酸と結び付かない5’UTR及び3’UTRの使用が含まれ得る。本明細書で使用される場合、用語「コドン最適化」及び「コドン最適化されている」は、ペプチド、ポリペプチド又はタンパク質をコードする天然に存在する又は野生型の核酸のコドン組成についてのそのアミノ酸配列を変化させない修飾であって、それにより前記核酸のタンパク質発現が向上するような修飾を指す。本発明に関連して、「コドン最適化」は、ヌクレオチド配列のリストから、グアニン-シトシン含量、コドン適応指標、不安定化要因となる核酸配列若しくはモチーフの存在並びに/又は休止部位及び/若しくは終結シグナルの存在によるフィルタリングなど、最適に満たないヌクレオチド配列をフィルターで取り除くことにより、1つ以上の最適化されたヌクレオチド配列に至らしめる過程も指し得る。
本明細書で使用される場合、用語「鋳型DNA」(又は「DNA鋳型」)は、インビトロ転写(IVT)によって合成しようとするmRNA転写物をコードする核酸配列を含むDNA分子に関する。鋳型DNAは、鋳型DNAによってコードされるmRNA転写物を産生するためのIVTの鋳型として使用される。鋳型DNAは、IVTに必要な全ての要素、特に例えばT3、T7及びSP6 RNAポリメラーゼなど、DNA依存性RNAポリメラーゼの結合のための、所望のmRNA転写物をコードするDNA配列に作動可能に連結されているプロモーターエレメントを含む。更に、鋳型DNAは、RNA転写物をコードするDNA配列のアイデンティティを、例えばPCR又はDNAシーケンシングによって決定することができるように、mRNA転写物をコードするDNA配列の5’側及び/又は3’側にプライマー結合部位を含み得る。「鋳型DNA」は、本発明に関連して、線状又は環状DNA分子であり得る。本明細書で使用される場合、用語「鋳型DNA」は、プラスミドDNAなど、所望のmRNA転写物をコードする核酸配列を含むDNAベクターを指し得る。
本明細書で使用される場合、用語「対象」は、ヒト又は他の動物などの哺乳動物を指す。典型的には、対象は、ヒトである。対象は、男性又は女性であり得、乳児、若年者、青年、成人、及び高齢者対象を含む任意の好適な年齢であり得る。
本明細書で使用される場合、用語「ワクチン組成物」又は「ワクチン」は、対象において防御免疫応答を生じさせることができる組成物を指す。本明細書で使用される場合、「防御免疫応答」は、感染から対象を保護する(感染を予防するか、又は感染に関連する疾患の発症を予防する)か、又は感染(例えば、インフルエンザウイルスによる感染)の症状を軽減する免疫応答を指す。ワクチンは、予防(防止)反応及び治療反応の両方を誘発し得る。
本明細書で使用される全ての技術及び科学用語は、本願が属する当業者が一般に理解するのと同じであり、且つ本願が属する当該技術分野で一般的に使用されるのと同じ意味を有する。本発明の背景を記載し、その実施に関して追加的な詳細を提供するため本明細書において言及される刊行物及び他の参考資料は、本明細書によって参照により援用される。
本発明は、(i)インフルエンザウイルスマトリックス1(M1)タンパク質と、(ii)1つ以上のインフルエンザウイルスヘマグルチニン(HA)タンパク質及び/又は1つ以上のインフルエンザウイルスノイラミニダーゼ(NA)タンパク質とをコードする1つ以上のmRNAを含む組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)であって、M1タンパク質と、1つ以上のHAタンパク質及び/又は1つ以上のNAタンパク質は、哺乳動物細胞を誘導してウイルス様粒子(VLP)を産生させることができる、組成物を提供する。
ウイルス様粒子
ウイルス様粒子(VLP)は、ウイルスタンパク質の発現時に集合する構造であり、天然のビリオン構造を模倣することができる。それらは、天然ウイルスと同様の構造及び形状を有するが、ウイルスゲノムを欠く。エンベロープウイルスのVLPは、典型的には、それらが発現された細胞に由来する脂質膜を含む。1つ以上のウイルス糖タンパク質は、典型的には、脂質膜に組み込まれ、免疫細胞によって認識されて中和抗体を産生することができる標的抗原として機能する。
細胞からのインフルエンザVLPの出芽は、HA及びNAの発現、特にHA及びNAの細胞質テールに依存する。細胞表面からのVLPの効率的な放出は、HA及びNAによって提供されるシアリダーゼ活性の存在を必要とする。加えて、哺乳動物細胞、特にヒト細胞におけるVLPの有効な産生は、M1タンパク質の存在に依存する。M1タンパク質の存在下で産生されるVLPは、完全VLPと非常に類似している。
したがって、特定の実施形態では、本発明は、(i)インフルエンザウイルスマトリックス1(M1)タンパク質と、(ii)1つ以上のインフルエンザウイルスヘマグルチニン(HA)タンパク質と、(iii)1つ以上のインフルエンザウイルスノイラミニダーゼ(NA)タンパク質とをコードする1つ以上のmRNAを含む組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)を提供する。そのような組成物は、哺乳動物、特にヒト細胞を誘導してウイルス様粒子(VLP)を産生させるのに特に有効である。VLP産生は、本明細書、例えば実施例4及び5に記載されるように、電子顕微鏡(EM)法を使用して可視化することができる。例えば、M1タンパク質、1つ以上のHAタンパク質、及び1つ以上のNAタンパク質をコードする1つ以上のmRNAを使用して、HEK293細胞又は他の哺乳動物細胞をトランスフェクトすることができ、VLP産生は、本明細書に記載されるような低温EM法を使用して観察することができる。
いくつかの実施形態では、VLPは、約50nm~約200nmのサイズである。具体的な実施形態では、VLPは、約100nmのサイズである。
M1タンパク質
マトリックス1(M1)タンパク質は、ウイルス粒子の脂質二重層の下にコートを形成する252残基の構造タンパク質である。結果として、それは、表面タンパク質のヘマグルチニン(HA)及びノイラミニダーゼ(NA)と同じ進化圧を経験しない。実際、M1タンパク質は、インフルエンザウイルスゲノムによってコードされる最も遅い進化タンパク質の1つである。これは、インフルエンザウイルスゲノムのM遺伝子によってコードされる。M遺伝子は、HA遺伝子よりも5~10倍遅い進化をすることが分かった。
M1タンパク質は、MHCクラスI及びMHCクラスII T細胞エピトープの両方を含む。特に一般的なMHCクラスII T細胞エピトープは、核輸送配列と重複する。
そのアミノ酸配列の高い保存性とT細胞エピトープの存在は、M1タンパク質をコードするmRNAを含めることがインフルエンザウイルスの複数の株に対する免疫応答を誘発させるのに有効であり得ることを示唆している。
いくつかの実施形態では、M1タンパク質は、パンデミックインフルエンザウイルスからのものである。いくつかの実施形態では、M1タンパク質は、H1N1 A型インフルエンザウイルス(例えば、A/カリフォルニア/07/2009又はA/プエルトリコ/8/1934)からのものである。いくつかの実施形態では、M1タンパク質は、30位のアミノ酸セリン(S)、142位のアミノ酸アラニン(A)、207位のアミノ酸アスパラギン(N)及び209位のアミノ酸スレオニン(T)を含むM1タンパク質である。いくつかの実施形態では、M1タンパク質は、任意のインフルエンザA型株からのNA及びHAタンパク質を含むVLPを形成することができる。いくつかの実施形態では、M1タンパク質は、任意のインフルエンザB型株からのNA及びHAタンパク質を含むVLPを形成することができる。
哺乳動物細胞を、HAタンパク質をコードする1つ以上のmRNA、NAタンパク質をコードする1つ以上のmRNA及びH1N1 A型インフルエンザウイルス(A/カリフォルニア/07/2009)に由来するM1タンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトする場合、本発明者らは、HA及びNAタンパク質がA/カリフォルニア/07/2009以外のインフルエンザウイルスに由来した場合でも、形質膜においてVLPの効率的な出芽を観察した。
ヘマグルチニン
ヘマグルチニン(HA)タンパク質は、ウイルスのエンベロープに関連する内在膜タンパク質である。HAは、インフルエンザウイルスの主要な抗原であり、ビリオン表面ではNAを5~10倍上回る。グループ1(H1、H2、H5、H6、H8、H9、H11、H12、H13、H16、H17、及びH18)並びにグループ2(H3、H4、H7、H10、H14、及びH15)に細分される18個の既知のHA亜型が存在する。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、亜型H1、H2、H3、H4、H5、H6、H7、H8、H9、H10、H11、H12、H13、H14、H15、H16、H17、又はH18の少なくとも1つのHAタンパク質をコードする少なくとも1つのmRNAを含む。一般的な季節性インフルエンザA型の亜型としては、H1及びH3が挙げられる。したがって、いくつかの実施形態では、少なくとも1つのmRNAは、亜型H1又はH3の少なくとも1つのHAタンパク質をコードする。パンデミックの可能性を有するインフルエンザA型株は、H5、H7、H9又はH10亜型を含み得る。したがって、いくつかの実施形態では、少なくとも1つのmRNAは、亜型H5、H7、H9又はH10の少なくとも1つのHAタンパク質をコードする。
より典型的には、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、HAタンパク質をコードする複数の(例えば、2つ以上の)mRNAを含み、各HAタンパク質は、異なる亜型から選択される。HAタンパク質は、亜型H1、H2、H3、H4、H5、H6、H7、H8、H9、H10、H11、H12、H13、H14、H15、H16、H17、及びH18のいずれかから選択され得る。より一般的には、複数のmRNAは、グループ1及び2の各々の少なくとも1つのHAタンパク質をコードする。例えば、複数のmRNAは、亜型H1のHAタンパク質及び亜型H3のHAタンパク質をコードし得る。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、B型インフルエンザウイルスの少なくとも1つのHAタンパク質をコードする少なくとも1つのmRNAを含む。いくつかの実施形態では、B型インフルエンザウイルスは、山形系統のものである。いくつかの実施形態では、B型インフルエンザウイルスは、ビクトリア系統のものである。いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、インフルエンザB/山形系統のHAタンパク質及びインフルエンザB/ビクトリア系統のHAタンパク質をコードする1つ以上のmRNAを含む。
ノイラミニダーゼ
ノイラミニダーゼ(NA)タンパク質は、ウイルスのエンベロープに関連する別の内在膜タンパク質である。NAは、細胞質テール、膜貫通領域、ストーク(stalk)、及び触媒頭部を含む別個の構造ドメインに折り畳まれた4つの同一ポリペプチドの四量体として集合する。細胞質テールのN末端領域の高い配列保存性が観察されている。NAには11個の既知の亜型がある(N1~N11)。NAは、細胞受容体からのシアル酸の除去、並びに新生ビリオン上で新たに合成されたHA及びNAの除去に関与している。この酵素活性は、ウイルス凝集を防止し、瀕死の宿主細胞へのウイルス結合を回避し、新しい細胞標的のウイルス放出及び感染を促進する。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、亜型N1、N2、N3、N4、N5、N6、N7、N8、N9、N10、又はN11の少なくとも1つのNAタンパク質をコードする少なくとも1つのmRNAを含む。例えば、一般的な季節性インフルエンザA型の亜型は、N1及びN2を含む。したがって、いくつかの実施形態では、少なくとも1つのmRNAは、亜型N1又はN3の少なくとも1つのNAタンパク質をコードする。パンデミック可能性を有するインフルエンザA型株は、N1、N2、N3、N9又はN7を含み得る。したがって、いくつかの実施形態では、少なくとも1つのmRNAは、亜型N1、N2、N3、N9又はN7の少なくとも1つのNAタンパク質をコードする。
より典型的には、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、NAタンパク質をコードする複数の(例えば、2つ以上の)mRNAを含み、各NAタンパク質は、異なる亜型から選択される。NAタンパク質は、亜型N1、N2、N3、N4、N5、N6、N7、N8、N9、N10、及びN11のいずれかから選択され得る。より一般的には、複数のmRNAは、N1亜型の少なくとも1つのNAタンパク質及びN2亜型の少なくとも1つのNAタンパク質をコードする。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、B型インフルエンザウイルスの少なくとも1つのNAタンパク質をコードする少なくとも1つのmRNAを含む。いくつかの実施形態では、B型インフルエンザウイルスは、山形系統のものである。いくつかの実施形態では、B型インフルエンザウイルスは、ビクトリア系統のものである。いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、インフルエンザB/山形系統のNAタンパク質及びインフルエンザB/ビクトリア系統のNAタンパク質をコードする1つ以上のmRNAを含む。
本発明者らは、インフルエンザA型の亜型N2株のNAタンパク質が、インフルエンザA型の亜型N1のNAタンパク質よりも2.5~3倍活性であり得ることを観察した。したがって、2000μM/時間以上の高活性のNAタンパク質をコードするmRNAを、mRNAでトランスフェクトされた細胞からのVLPの効率的な出芽を確実にするために、より低い活性(例えば、1000μM/時間未満)のNAタンパク質をコードするmRNAと組み合わせて含むことが望ましい場合がある。したがって、いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、高活性のNAタンパク質(例えば、N2亜型のNAタンパク質)をコードする少なくとも1つのmRNAと、低活性のNAタンパク質(例えば、N1亜型のNAタンパク質)をコードする少なくとも1つのmRNAとを含む。NAタンパク質の酵素活性は、本明細書に記載されるように、例えば、実施例2に記載されるように決定することができる。具体的には、4-メチルウンベリフェロン-N-アセチルノイラミン酸(MUNANA)を基質として用いる蛍光ベースのアッセイを使用して、NAタンパク質の活性を決定することができる。
M2タンパク質
インフルエンザウイルスマトリックス2(M2)タンパク質とのHAタンパク質及びNAタンパク質の共発現は、宿主細胞からのこれらのタンパク質の放出を更に増強し得る。
VLP形成組成物
本発明のVLP形成組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、典型的には、M1タンパク質、1つ以上のHAタンパク質及び1つ以上のNAタンパク質をコードする複数のmRNAを含む。1つ以上のHAタンパク質及び1つ以上のNAタンパク質は、同じmRNAによって、又は別個のmRNAによってコードされ得る。いくつかの実施形態では、各HAタンパク質及び各NAタンパク質は、別個のmRNAによってコードされる。
典型的には、M1タンパク質は、別個のmRNAによってコードされる。いくつかの実施形態では、M1タンパク質は、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)中の1つ以上の他のmRNAによってコードされる少なくとも1つのHAタンパク質及び/又は少なくとも1つのNAタンパク質が由来するインフルエンザウイルスとは異なるインフルエンザウイルスからのものである。いくつかの実施形態では、M1タンパク質は、H1N1 A型インフルエンザウイルス(例えば、A/カリフォルニア/07/2009)からのものであり、及び/又は30位でアミノ酸セリン(S)、142位でアミノ酸アラニン(A)、207位でアミノ酸アスパラギン(N)及び209位でアミノ酸スレオニン(T)を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、M1タンパク質と、(i)1つ以上のHAタンパク質、(ii)1つ以上のNAタンパク質、又は(iii)1つ以上のHAタンパク質とNAタンパク質との組み合わせと、をコードする2、3、4、5、6、7、8、9個、又はそれ以上のmRNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、M1タンパク質と、(i)2つ以上のHAタンパク質、(ii)2つ以上のNAタンパク質、又は(iii)少なくとも1つのHAタンパク質及び少なくとも1つのNAタンパク質と、をコードする3、4、5、6、7、8、9個、又はそれ以上のmRNA分子を含む。
いくつかの実施形態では、HA及びNAタンパク質は、A型インフルエンザウイルスからのものである。いくつかの実施形態では、1つ以上のHAタンパク質は、H1亜型を含み、1つ以上のNAタンパク質は、N1亜型を含む。いくつかの実施形態では、1つ以上のHAタンパク質は、H2亜型を含み、1つ以上のNAタンパク質は、N2亜型を含む。いくつかの実施形態では、1つ以上のHAタンパク質は、H5亜型を含み、1つ以上のNAタンパク質は、N1亜型を含む。いくつかの実施形態では、1つ以上のHAタンパク質は、H3亜型を含み、1つ以上のNAタンパク質は、N2亜型を含む。いくつかの実施形態では、1つ以上のHAタンパク質は、H7亜型を含み、1つ以上のNAタンパク質は、N3、N7又はN9亜型を含む。いくつかの実施形態では、1つ以上のHAタンパク質は、H9亜型を含み、1つ以上のNAタンパク質は、N2亜型を含む。いくつかの実施形態では、1つ以上のHAタンパク質は、H10亜型を含み、1つ以上のNAタンパク質は、N7亜型を含む。
いくつかの実施形態では、1つ以上のHAタンパク質は、亜型H1及びH3を含み、1つ以上のNAタンパク質は、亜型N1及びN2を含む。いくつかの実施形態では、1つ以上のHAタンパク質は、インフルエンザB/山形系統又はインフルエンザB/ビクトリア系統のHAタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、1つ以上のNAタンパク質は、インフルエンザB/山形系統又はインフルエンザB/ビクトリア系統のNAタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、1つ以上のHAタンパク質は、亜型H1及びH3のHAタンパク質、並びにインフルエンザB/山形系統若しくはインフルエンザB/ビクトリア系統の1つ又は両方のHAタンパク質を含み、1つ以上のNAタンパク質は、亜型N1及びN2のHAタンパク質並びにインフルエンザB/山形系統若しくはインフルエンザB/ビクトリア系統の1つ又は両方のNAタンパク質を含む。
一実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、H3 HAタンパク質をコードする1つのmRNA、H1 HAタンパク質をコードする1つのmRNA分子、インフルエンザB/山形系統のHAタンパク質をコードする1つのmRNA、インフルエンザB/ビクトリア系統のHAタンパク質をコードする1つのmRNA、及びM1タンパク質をコードする1つのmRNAを含む。
一実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、H3 HAタンパク質をコードする1つのmRNA、N2 NAタンパク質をコードする1つのmRNA、H1 HAタンパク質をコードする1つのmRNA、N1 NAタンパク質をコードする1つのmRNA、インフルエンザB/山形系統からのHAタンパク質をコードする1つのmRNA、インフルエンザB/山形系統からのNAタンパク質をコードする1つのmRNA、インフルエンザB/ビクトリア系統からのHAタンパク質をコードする1つのmRNA、インフルエンザB/ビクトリア系統からのNAタンパク質をコードする1つのmRNA、及びM1タンパク質をコードする1つのmRNAを含む。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、第1のHAタンパク質及び第1のNAタンパク質をコードする第1のmRNAと、第2のHAタンパク質及び第2のNAタンパク質をコードする第2のmRNAと、M1タンパク質をコードする第3のmRNAとを含む。典型的には、第1のHAタンパク質及び第1のNAタンパク質は、第1のインフルエンザウイルスからのものであり(例えば、インフルエンザA型からのH1及びN1)、第2のHAタンパク質及び第2のNAタンパク質は、第2のインフルエンザウイルスからのものである(例えば、インフルエンザA型からのH3及びN2)。
いくつかの実施形態では、第1のインフルエンザウイルスは、H1N1 A型インフルエンザウイルスであり、第2のインフルエンザウイルスは、H3N2 A型インフルエンザウイルスである。いくつかの実施形態では、第1のインフルエンザウイルスは、A型インフルエンザウイルス(例えば、H1N1又はH3N2)であり、第2のインフルエンザウイルスは、B型インフルエンザウイルス(例えば、インフルエンザB/山形又はインフルエンザB/ビクトリア)である。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、第3のインフルエンザウイルスからの第3のHAタンパク質及び第3のNAタンパク質をコードする第4のmRNAを含む。いくつかの実施形態では、第1のインフルエンザウイルスは、H1N1 A型インフルエンザウイルスであり、第2のインフルエンザウイルスは、H3N2インフルエンザウイルスであり、第3のインフルエンザウイルスは、B型インフルエンザウイルス(例えば、インフルエンザB/山形又はインフルエンザB/ビクトリア)である。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、第3のインフルエンザウイルスからの第3のHAタンパク質及び第3のNAタンパク質をコードする第4のmRNAと、第4のインフルエンザウイルスからの第4のHAタンパク質及び第4のNAタンパク質をコードする第5のmRNAとを含む。いくつかの実施形態では、第1のインフルエンザウイルスは、H1N1 A型インフルエンザウイルスであり、第2のインフルエンザウイルスは、H3N2 A型インフルエンザウイルスであり、第3のインフルエンザウイルスは、山形系統のB型インフルエンザウイルスであり、第4のインフルエンザウイルスは、ビクトリア系統のものである。
いくつかの実施形態では、バイシストロニック(bicistronic)な第1、第2、第4及び第5のmRNAは、HA及びNAタンパク質をコードする2つのコード配列間の内部リボソーム進入部位(IRES)を含む。IRESは、第2のリボソーム動員部位として機能し、mRNAの内部領域で翻訳開始が追加的に起こることを可能にする。
いくつかの実施形態では、IRESは、ウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスは、リボウイルス(ribovirus)である。いくつかの実施形態では、リボウイルスは、ピコルナウイルス、ヘパシウイルス、ペスチウイルス、肝炎ウイルス、フラビウイルス、又はレトロウイルスである。いくつかの実施形態では、リボウイルスは、ピコルナウイルスである。いくつかの実施形態では、ピコルナウイルスは、ジシストロウイルス又は脳心筋炎ウイルス(EMCV)である。
いくつかの実施形態では、バイシストロニックな第1、第2、第4及び第5のmRNAは、HA及びNAタンパク質をコードする2つのコード配列間の自己切断ペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、自己切断ペプチドは、2Aペプチドである。いくつかの実施形態では、自己切断ペプチドは、2Aペプチドである。2Aペプチドは、典型的には、およそ18~25アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、2Aペプチドは、ウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、2Aペプチドは、P2A、T2A、E2A又はF2Aである。
上流コード配列の翻訳中に、2Aペプチドは、リボソームが2AペプチドのC末端でのグリシン及びプロリンペプチド結合の合成をスキップさせ、2Aペプチドと下流コード配列によってコードされるタンパク質との間の分離を引き起こす。結果として、上流タンパク質は、そのC末端に2Aペプチドに由来する残基を含む。下流コード配列によってコードされるタンパク質は、そのN末端にも2Aペプチドに由来するプロリンを含む。
バイシストロニックなmRNA中のHAタンパク質及びNAタンパク質のコード配列は、いずれかの順序で配置され得る(HAの後にNAが続くか、又はNAの後にHAが続く)。HAタンパク質は、典型的には、天然ウイルス粒子の表面上でNAを5~10倍上回るので、HAタンパク質がNAタンパク質よりも高いレベルで発現されるように、HAを最初に配置する(すなわち、ポリシストロニックなmRNAの5’位置に)ことが有利であり得る。
例えば、IRESの下流のコード配列は、典型的には、バイシストロンにおける上流コード配列と比較して、はるかに低いレベル(典型的には、10~20%)で発現される。したがって、HAタンパク質のコード配列、IRES及びNAタンパク質のコード配列を5’~3’の順序で含むバイシストロニックなmRNAは、天然ウイルス粒子のものと同様の比で、HAタンパク質及びNAタンパク質を含むVLPの形成をもたらし得る。
同様に、自己切断ペプチドをコードするヌクレオチド配列の下流のコード配列は、典型的には、バイシストロンにおける上流コード配列と比較してより低いレベルで発現される。例えば、2Aペプチドの翻訳産物のN末端は、2AペプチドのC末端のものを超える2~5倍のモル過剰に通常的に蓄積する。したがって、5’~3’の順序でHAタンパク質のコード配列、自己切断ペプチド(例えば、2Aペプチド)をコードするヌクレオチド配列、及びNAタンパク質のコード配列を含むバイシストロニックなmRNAは、同様に、天然ウイルス粒子のものと同様の比で、HAタンパク質及びNAタンパク質を含むVLPの形成をもたらし得る。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、少なくとも第1のHAタンパク質及び第2のHAタンパク質をコードする第2のmRNAと、少なくとも第1のNAタンパク質及び第2のNAタンパク質をコードする第2のmRNAと、M1タンパク質をコードする第3のmRNAとを含む。典型的には、第1のHAタンパク質及び第2のHAタンパク質(並びに任意の更なるHAタンパク質)は、異なる亜型(例えば、インフルエンザA型からのH1及びH3)及び/又は異なる系統(例えば、ビクトリア及び山形)からのものであり、第1のNAタンパク質及び第2のNAタンパク質(並びに任意の更なるNAタンパク質)は、異なる亜型(例えば、インフルエンザA型からのN1及びN2)及び/又は異なる系統からのものである。
いくつかの実施形態では、第1及び第2のHAタンパク質(並びに任意の更なるHAタンパク質)のコード配列及び/又は第1及び第2のNAタンパク質(並びに任意の更なるNAタンパク質)のコード配列は、自己切断ペプチドをコードするヌクレオチド配列によって分離されている。いくつかの実施形態では、自己切断ペプチドは、2Aペプチドである。2Aペプチドは、典型的には、約18~25アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、2Aペプチドは、ウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、2Aペプチドは、P2A、T2A、E2A又はF2Aである。
いくつかの実施形態では、第1及び第2のHAタンパク質(並びに任意の更なるHAタンパク質)をコードする第1のmRNAと第1及び第2のNAタンパク質(並びに任意の更なるNAタンパク質)をコードする第2のmRNAとは、同じ5’UTR配列を含む。いくつかの実施形態では、第1及び第2のHAタンパク質をコードする第1のmRNAと第1及び第2のNAタンパク質をコードする第2のmRNAとは、異なる5’UTR配列を含む。例えば、異なる5’UTR配列を使用することは、天然ウイルス粒子に見られるものと同様のHA対NA比を達成するのに有利であり得る。
1つ以上のHAタンパク質及び1つ以上のNAタンパク質とM2タンパク質との共発現は、細胞からのVLPの放出を更に増強し得る。したがって、本発明による組成物(例えば、本発明による免疫原性組成物又はワクチン)は、マトリックス2(M2)タンパク質をコードするmRNAを更に含み得る。インフルエンザウイルスゲノムでは、M1タンパク質及びM2タンパク質は、異なるが部分的に重複するリーディングフレームにコードされる。したがって、いくつかの実施形態では、M2タンパク質は、M1タンパク質と同じmRNAによってコードされ、例えば、野生型インフルエンザウイルスゲノム中のM1及びM2タンパク質のコード配列の配置を複製する。或いは、M2タンパク質は、別個のmRNAによってコードされ得る。
株選択
インフルエンザウイルスは絶えず進化しており、したがって、季節性インフルエンザワクチンに含まれるウイルス株の頻繁な更新が必要である。世界保健機関(WHO)は、インフルエンザなどの循環性呼吸器ウイルスを監視し、監視データを分析して、インフルエンザワクチン組成物の年間推奨を提供する。いくつかの実施形態では、1つ以上のHA及びNAタンパク質は、インフルエンザワクチン組成物のためのそれらの年間推奨においてWHOによって推奨されるインフルエンザウイルス株からのものである。
ある特定の実施形態では、1つ以上のインフルエンザウイルスタンパク質のうちの少なくとも1つは、機械学習モデルから同定されるか又は設計される分子配列を有するインフルエンザウイルスHAタンパク質及び/又はインフルエンザウイルスNAタンパク質を含み、ある特定の実施形態では、1つ以上のリボ核酸分子のうちの少なくとも1つは、機械学習モデルから同定されるか又は設計される分子配列を有する1つ以上のインフルエンザウイルスタンパク質をコードする。
ある実施形態では、組成物は、機械学習モデルから同定又は設計された分子配列を有する機械学習インフルエンザウイルスHAをコードする1つ以上のmRNA分子を更に含み、1つ以上の機械学習インフルエンザウイルスHAは、H1HA、H3HA、インフルエンザB/ビクトリア系統からのHA、インフルエンザB/山形系統からのHA、又はそれらの組み合わせから選択され得る。
1つ以上の機械学習インフルエンザウイルスHAを選択する場合には、任意の機械学習アルゴリズムを使用し得る。例えば、本明細書で想定されているのは、PCT出願の国際公開第2021/080990A1号パンフレット(発明の名称:Systems and Methods for Designing Vaccines)、及び国際公開第2021/080999A1号パンフレット(発明の名称:Systems and Methods for Predicting Biological Responses)(これらは両方とも、その全体が参照により本明細書に組み込まれる)で開示されている機械学習アルゴリズム及び方法のうちのいずれかである。
mRNA
mRNAの構造要素
本発明による典型的なmRNAは、5’キャップ、5’非翻訳領域(5’UTR)、タンパク質-コード領域、3’非翻訳領域(3’UTR)、及び3’テールを含む。キャップの存在は、ほとんどの真核細胞に見出されるヌクレアーゼへの抵抗性を提供するのに重要である。「テール」の存在は、mRNAをエキソヌクレアーゼ分解から保護するのに役立つ。いくつかの実施形態では、5’キャップ及び/又は3’テールは、mRNA合成後に付加され得る。他の実施形態では、5’キャップ及び/又は3’テール配列は、インビトロ転写(IVT)反応で使用されるDNA鋳型配列に含まれる。
5’キャップ
具体的な実施形態では、本発明のmRNAは、以下の構造を有する5’キャップを含む:
5’キャップは、以下のように付加され得る:まず、RNA末端ホスファターゼが、5’ヌクレオチドから末端ホスフェート基の1つを除去し、2つの末端ホスフェートを残し;続いて、グアノシントリホスフェート(GTP)が、グアニリルトランスフェラーゼによって末端ホスフェートに付加され、5’5’5トリホスフェート結合を生成し;続いて、グアニンの7-窒素がメチルトランスフェラーゼによってメチル化される。キャップ構造の例としては、m7G(5’)ppp(5’(A,G(5’)ppp(5’)A及びG(5’)ppp(5’)Gが挙げられるが、これらに限定されない。追加のキャップ構造は、参照により本明細書に組み込まれる、公開された米国特許出願公開第2016/0032356号明細書及び公開された米国特許出願公開第2018/0125989号明細書に記載されている。
3’テール
典型的な実施形態では、mRNAのテール構造は、ポリ(A)テールを含む。いくつかの実施形態では、mRNAのテール構造は、ポリ(C)テールを含む。いくつかの実施形態では、テール構造は、少なくとも50個のアデノシン又はシトシンヌクレオチドを含む。典型的な実施形態では、テール構造は、およそ100~500ヌクレオチド長である。例えば、100~250ヌクレオチド長のテール構造(例えば、ポリ(A)テール)は、mRNAの治療的使用に特に有用であり得る。
mRNAの3’末端上のポリ(A)又はポリ(C)テールは、典型的には、それぞれ少なくとも50個のアデノシン又はシトシンヌクレオチド、少なくとも150個のアデノシン又はシトシンヌクレオチド、少なくとも200個のアデノシン又はシトシンヌクレオチド、少なくとも250個のアデノシン又はシトシンヌクレオチド、少なくとも300個のアデノシン又はシトシンヌクレオチド、少なくとも350個のアデノシン又はシトシンヌクレオチド、少なくとも400個のアデノシン又はシトシンヌクレオチド、少なくとも450個のアデノシン又はシトシンヌクレオチド、少なくとも500個のアデノシン又はシトシンヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、テール構造は、本明細書に記載の様々な長さのポリ(A)及びポリ(C)テールの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、mRNAは、100ヌクレオチド~約500ヌクレオチドを含むポリA配列を含む。一実施形態では、mRNAは、約200ヌクレオチドのポリA配列を含む。別の実施形態では、mRNAは、約500ヌクレオチドのポリA配列を含む。
いくつかの実施形態では、テール構造は、少なくとも50%、55%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、92%、94%、95%、96%、97%、98%、又は99%のアデノシンヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、テール構造は、少なくとも50%、55%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、92%、94%、95%、96%、97%、98%、又は99%のシトシンヌクレオチドを含む。
5’UTR及び3’UTR
いくつかの実施形態では、本明細書に開示されるmRNAは、mRNA転写産物によってコードされる遺伝子と区別される遺伝子に由来する5’又は3’UTRを含み得る(すなわち、UTRは異種UTRである)。
ある特定の実施形態では、5’及び/又は3’UTR配列は、mRNAの安定性を高めるために安定である(例えば、グロビン、アクチン、GAPDH、チューブリン、ヒストン又はクエン酸サイクル酵素)mRNAからのものであり得る。例えば、5’UTR配列は、ヌクレアーゼ耐性を改善し、且つ/又はmRNAの半減期を改善するために、CMV前初期1(IE1)遺伝子の部分配列又はその断片を含み得る。ヒト成長ホルモン(hGH)をコードする配列又はその断片をmRNAの3’末端又は非翻訳領域に含めることも企図される。一般に、これらの修飾は、修飾されていない対応物と比較してmRNAの安定性及び/又は薬物動態特性(例えば、半減期)を改善し、例えば、インビボヌクレアーゼ消化に対するそのようなmRNA耐性を改善するために行われる修飾を含む。
例示的な5’UTRには、CMV前初期1(IE1)遺伝子(米国特許出願公開第2014/0206753号明細書及び同第2015/0157565号明細書(それらの各々は、参照により本明細書に組み込まれる))からの配列、又は米国特許出願公開第2016/0151409号明細書(参照により本明細書に組み込まれる)において開示される配列番号4の配列が含まれる。
様々な実施形態では、5’UTRは、TOP遺伝子の5’UTRからのものであり得る。TOP遺伝子は、典型的には、5’末端オリゴピリミジン(TOP)トラクトの存在によって特徴付けられる。更に、ほとんどのTOP遺伝子は、成長関連翻訳調節によって特徴付けられる。しかしながら、組織特異的翻訳調節を有するTOP遺伝子も公知である。ある特定の実施形態では、TOP遺伝子の5’UTRからの5’UTRは、5’TOPモチーフ(オリゴピリミジントラクト)を欠く(例えば、米国特許出願公開第2017/0029847号明細書、同第2016/0304883号明細書、同第2016/0235864号明細書、及び同第2016/0166710号明細書(それらの各々は、参照により本明細書に組み込まれる))。
ある特定の実施形態では、5’UTRは、リボソームタンパク質ラージ32(L32)遺伝子からのものである(上記の米国特許出願公開第2017/0029847号明細書)。
ある特定の実施形態では、5’UTRは、ヒドロキシステロイド(17-b)デヒドロゲナーゼ4遺伝子(HSD17B4)の5’UTRからのものである(上記の米国特許出願公開第2016/0166710号明細書)。
ある特定の実施形態では、5’UTRは、ATP5A1遺伝子の5’UTRからのものである(上記の米国特許出願公開第2016/0166710号明細書)。
いくつかの実施形態では、内部リボソーム進入部位(IRES)は、5’UTRの代わりに使用される。
本発明で使用するために好適な5’UTR及び3’UTR配列は、参照により本明細書に組み込まれる国際公開第2012/075040号パンフレットに記載されている。いくつかの実施形態では、5’UTRは、国際公開第2012/075040号パンフレットの配列番号1に記載される核酸配列を含む。いくつかの実施形態では、3’UTRは、国際公開第2012/075040号パンフレットの配列番号3に記載される核酸配列を含む。
典型的には、5’から3’まで、mRNA構築物は、段落[111]エラー!参照先が見つかりません、に記載される5’キャップ、段落[0124]に記載される5’UTR、本発明による1つ以上のコード配列、段落[0124]に記載される3’UTR、及び100~500ヌクレオチドのポリ(A)テールを含む。
ヌクレオチド
いくつかの実施形態では、mRNAは、天然に存在するヌクレオシド(又は非修飾ヌクレオチド;すなわち、アデノシン、グアノシン、シチジン、及びウリジン)を含む。いくつかの実施形態では、mRNAは、ヌクレオチド類似体(例えば、アデノシン類似体、グアノシン類似体、シチジン類似体、又はウリジン類似体)などの1つ以上の修飾ヌクレオシドを含む。1つ以上のヌクレオシド類似体の存在は、mRNAを、同じ配列を有するが天然に存在するヌクレオシドのみを含有する対照mRNAより安定にし、且つ/又は免疫原性をより少なくし得る。
いくつかの実施形態では、mRNAは、非修飾ヌクレオシド及び修飾ヌクレオシドの両方を含む。いくつかの実施形態では、1つ以上の修飾ヌクレオシドは、ヌクレオシド類似体である。いくつかの実施形態では、1つ以上の修飾ヌクレオシドは、修飾糖、及び修飾ヌクレオ塩基から選択される少なくとも1つの修飾を含む。いくつかの実施形態では、mRNAは、1つ以上の修飾ヌクレオシド間結合を含む。
いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオシドは、修飾糖、及び対応する天然に存在するリボヌクレオチドに対する修飾ヌクレオ塩基から選択される少なくとも1つの修飾を含む。
修飾ヌクレオシドは、修飾ウリジン、シチジン、アデニン、又はグアニンであり得る。mRNA分子ちゅうのヌクレオシドのいくつかの例示的な化学修飾としては、例えば、ピリジン-4-オンリボヌクレオシド、5-アザ-ウリジン、2-チオ-5-アザ-ウリジン、2-チオウリジン、4-チオシュードウリジン、2-チオ-シュードウリジン、5-ヒドロキシウリジン、3-メチルウリジン、5-カルボキシメチルウリジン、1-カルボキシメチル-シュードウリジン、5-プロピニル-ウリジン、1-プロピニル-シュードウリジン、5-タウリノメチルウリジン、1-タウリノメチル-シュードウリジン、5-タウリノメチル-2-チオ-ウリジン、1-タウリノメチル-4-チオ-ウリジン、5-メチル-ウリジン、1-メチル-シュードウリジン、4-チオ-1-メチル-シュードウリジン、2-チオ-1-メチル-シュードウリジン、1-メチル-1-デアザ-シュードウリジン、2-チオ-1-メチル-1-デアザ-シュードウリジン、ジヒドロウリジン、ジヒドロシュードウリジン、2-チオジヒドロウリジン、2-チオ-ジヒドロシュードウリジン、2-メトキシウリジン、2-メトキシ-4-チオ-ウリジン、4-メトキシ-シュードウリジン、4-メトキシ-2-チオ-シュードウリジン、5-アザ-シチジン、シュードイソシチジン、3-メチル-シチジン、N4-アセチルシチジン、5-ホルミルシチジン、N4-メチルシチジン、5-ヒドロキシメチルシチジン、1-メチル-シュードイソシチジン、ピロロ-シチジン、ピロロ-シュードイソシチジン、2-チオ-シチジン、2-チオ-5-メチル-シチジン、4-チオ-シュードイソシチジン、4-チオ-1-メチル-シュードイソシチジン、4-チオ-1-メチル-1-デアザ-シュードイソシチジン、1-メチル-1-デアザシュードイソシチジン、ゼブラリン、5-アザ-ゼブラリン、5-メチル-ゼブラリン、5-アザ-2-チオ-ゼブラリン、2-チオ-ゼブラリン、2-メトキシ-シチジン、2-メトキシ-5-メチル-シチジン、4-メトキシ-シュードイソシチジン、4-メトキシ-1-メチル-シュードイソシチジン、2-アミノプリン、2,6-ジアミノプリン、7-デアザアデニン、7-デアザ-8-アザ-アデニン、7-デアザ-2-アミノプリン、7-デアザ-8-アザ-2-アミノプリン、7-デアザ-2,6-ジアミノプリン、7-デアザ-8-アザ-2,6-ジアミノプリン、1-メチルアデノシン、N-メチルアデノシン、N-イソペンテニルアデノシン、N-(シス-ヒドロキシイソペンテニル)アデノシン、2-メチルチオ-N-(シス-ヒドロキシイソペンテニル)アデノシン、N-グリシニルカルバモイルアデノシン、N-スレオニルカルバモイルアデノシン、2-メチルチオ-N-スレオニルカルバモイルアデノシン、N,N-ジメチルアデノシン、7-メチルアデニン、2-メチルチオアデニン、2-メトキシアデニン、イノシン、1-メチル-イノシン、ウイオシン、ウイブトシン、7-デアザグアノシン、7-デアザ-8-アザ-グアノシン、6-チオグアノシン、6-チオ-7-デアザグアノシン、6-チオ-7-デアザ-8-アザ-グアノシン、7-メチル-グアノシン、6-チオ-7-メチルグアノシン、7-メチルイノシン、6-メトキシグアノシン、1-メチルグアノシン、N-メチルグアノシン、N,N-ジメチルグアノシン、8-オキソ-グアノシン、7-メチル-8-オキソ-グアノシン、1-メチル-6-チオ-グアノシン、N-メチル-6-チオ-グアノシン、及びN,N-ジメチル-6-チオ-グアノシンが挙げられる。
いくつかの実施形態では、mRNA分子中の修飾ヌクレオシドは、シュードウリジン、ピリジン-4-オンリボヌクレオシド、5-アザ-ウリジン、6-アザ-ウリジン、2-チオ-5-アザ-ウリジン、2-チオ-ウリジン、4-チオ-ウリジン、4-チオ-シュードウリジン、2-チオ-シュードウリジン、5-ヒドロキシウリジン、5-アミノアリル-ウリジン、5-ハロ-ウリジン(例えば、5-ヨードウリジン又は5-ブロモウリジン)、3-メチルウリジン、5-メトキシ-ウリジン、ウリジン-5-オキシ酢酸、ウリジン-5-オキシ酢酸メチルエステル、5-カルボキシメチル-ウリジン、1-カルボキシメチル-シュードウリジン、5-カルボキシヒドロキシメチルウリジン、5-カルボキシヒドロキシメチル-ウリジンメチルエステル、5-メトキシカルボニルメチルウリジン、5-メトキシカルボニルメチル-2-チオ-ウリジン、5-アミノメチル-2-チオウリジン、5-メチルアミノメチルウリジン、5-メチルアミノメチル-2-チオ-ウリジン、5-メチルアミノメチル-2-セレノウリジン、5-カルバモイルメチル-ウリジン、5-カルボキシメチルアミノメチル-ウリジン、5-カルボキシメチルアミノメチル-2-チオ-ウリジン、5-プロピニル-ウリジン、1-プロピニル-シュードウリジン、5-タウリノメチル-ウリジン、1-タウリノメチルシュードウリジン、5-タウリノメチル-2-チオ-ウリジン、1-タウリノメチル-4-チオ-シュードウリジン、5-メチル-ウリジン(mU、例えば、ヌクレオ塩基デオキシチミジンを有するもの)、1-メチル-シュードウリジン、5-メチル-2-チオ-ウリジン、1-メチル-4-チオ-シュードウリジン、4-チオ-1-メチル-シュードウリジン、3-メチル-シュードウリジン)、2-チオ-1-メチル-シュードウリジン、1-メチル-1-デアザ-シュードウリジン、2-チオ-1-メチル-1-デアザ-シュードウリジン、ジヒドロウリジン、ジヒドロシュードウリジン、5,6-ジヒドロウリジン、5-メチル-ジヒドロウリジン、2-チオ-ジヒドロウリジン、2-チオ-ジヒドロシュードウリジン、2-メトキシ-ウリジン、2-メトキシ-4-チオ-ウリジン、4-メトキシ-シュードウリジン、4-メトキシ-2-チオ-シュードウリジン、N1-メチル-シュードウリジン、3-(3-アミノ-3-カルボキシプロピル)ウリジン、1-メチル-3-(3-アミノ-3-カルボキシプロピル)シュードウリジン、5-(イソペンテニルアミノメチル)ウリジン、5-(イソペンテニルアミノメチル)-2-チオ-ウリジン、アルファ-チオ-ウリジン、2’-O-メチルウリジン、5,2’-O-ジメチルウリジン、2’-O-メチル-シュードウリジン、2-チオ-2’-O-メチルウリジン、5-メトキシカルボニルメチル-2’-O-メチルウリジン、5-カルバモイルメチル-2’-O-メチルウリジン、5-カルボキシメチルアミノメチル-2’-O-メチルウリジン、3,2’-O-ジメチルウリジン、5-(イソペンテニルアミノメチル)-2’-O-メチルウリジン、1-チオ-ウリジン、デオキシチミジン、2’-F-アラ-ウリジン、2’-F-ウリジン、2’-OH-アラ-ウリジン、5-(2-カルボメトキシビニル)ウリジン、及び5-[3-(1-E-プロペニルアミノ)ウリジンから選択される修飾ウリジンである。
いくつかの実施形態では、修飾ウリジンは、N1-メチルシュードウリジン、シュードウリジン、2-チオウリジン、4’-チオウリジン、2-チオ-1-メチル-1-デアザ-シュードウリジン、2-チオ-1-メチル-シュードウリジン、2-チオ-5-アザ-ウリジン、2-チオ-ジヒドロシュードウリジン、2-チオ-ジヒドロウリジン、2-チオ-シュードウリジン、4-メトキシ-2-チオ-シュードウリジン、4-メトキシ-シュードウリジン、4-チオ-1-メチル-シュードウリジン、4-チオ-シュードウリジン、5-アザ-ウリジン、ジヒドロシュードウリジン、5-メチルウリジン、5-メチルウリジン、5-メトキシウリジン、及び2’-O-メチルウリジンから選択される。
いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオシドは、5-アザ-シチジン、6-アザ-シチジン、シュードイソシチジン、3-メチルシチジン、N-アセチルシチジン、5-ホルミル-シチジン、N-メチルシチジン、5-メチルシチジン、5-ハロシチジン(例えば、5-ヨードシチジン)、5-ヒドロキシメチルシチジン、1-メチル-シュードイソシチジン、ピロロ-シチジン、ピロロ-シュードイソシチジン、2-チオ-シチジン、2-チオ-5-メチルシチジン、4-チオ-シュードイソシチジン、4-チオ-1-メチル-シュードイソシチジン、4-チオ-1-メチル-1-デアザ-シュードイソシチジン、1-メチル-1-デアザ-シュードイソシチジン、ゼブラリン、5-アザ-ゼブラリン、5-メチル-ゼブラリン、5-アザ-2-チオゼブラリン、2-チオ-ゼブラリン、2-メトキシシチジン、2-メトキシ-5-メチルシチジン、4-メトキシシュードイソシチジン、4-メトキシ-1-メチル-シュードイソシチジン、リシジン、アルファ-チオ-シチジン、2’-O-メチルシチジン、5,2’-O-ジメチルシチジン、N-アセチル-2’-O-メチルシチジン、N,2’-O-ジメチルシチジン、5-ホルミル-2’-O-メチルシチジン、N,N,2’-O-トリメチルシチジン、1-チオ-シチジン、2’-F-アラ-シチジン、2’-Fシチジン、及び2’-OH-アラ-シチジンから選択される修飾シトシンである。
いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオシドは、修飾ピリミジンヌクレオシドである。いくつかの実施形態では、修飾リボヌクレオシドは、シュードウリジン、N1-メチルシュードウリジン、5-メチルシチジン、5-メトキシウリジン、及びこれらの任意の組み合わせから選択される。いくつかの実施形態では、シトシン及びウラシルの両方が、修飾ヌクレオシド(例えば、N1-メチルシュードウリジン及び5-メチルシチジン)で置き換えられる。
いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2-アミノプリン、2,6-ジアミノプリン、2-アミノ-6-ハロプリン(例えば、2-アミノ-6-クロロプリン)、6-ハロプリン(例えば、6-クロロプリン)、2-アミノ-6-メチルプリン、8-アジドアデノシン、7-デアザ-アデニン、7-デアザ-8-アザアデニン、7-デアザ-2-アミノプリン、7-デアザ-8-アザ-2-アミノプリン、7-デアザ-2,6-ジアミノプリン、7-デアザ-8-アザ-2,6-ジアミノプリン、1-メチルアデノシン、2-メチルアデニン、N-メチルアデノシン、2-メチルチオ-N-メチルアデノシン、N-イソペンテニルアデノシン、2-メチルチオ-N-イソペンテニルアデノシン、N-(シス-ヒドロキシイソペンテニル)アデノシン、2-メチルチオ-N-(シス-ヒドロキシイソペンテニル)アデノシン、N-グリシニルカルバモイルアデノシン、N-スレオニルカルバモイルアデノシン、N-メチル-N-スレオニルカルバモイルアデノシン、2-メチルチオ-N-スレオニルカルバモイルアデノシン、N,N-ジメチルアデノシン、N-ヒドロキシノルバリルカルバモイルアデノシン、2-メチルチオ-N-ヒドロキシノルバリルカルバモイルアデノシン、N-アセチルアデノシン、7-メチルアデニン、2-メチルチオ-アデニン、2-メトキシアデニン、アルファ-チオ-アデノシン、2’-O-メチルアデノシン、N,2’-O-ジメチルアデノシン、N,N,2’-O-トリメチルアデノシン、1,2’-O-ジメチルアデノシン、2’-O-リボシルアデノシン(ホスフェート)、2-アミノ-N-メチルプリン、1-チオ-アデノシン、8-アジド-アデノシン、2’-F-アラ-アデノシン、2’-Fアデノシン、2’-OH-アラ-アデノシン、及びN-(19-アミノ-ペンタオキサノナデシル)アデノシンから選択される修飾アデニンである。
いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオシドは、イノシン、1-メチルイノシン、ウイオシン、メチルウイオシン、4-デメチルウイオシン、イソウイオシン、ウイブトシン、ペルオキシウイブトシン、ヒドロキシウイブトシン、中間体(undermodified)ヒドロキシウイブトシン、7-デアザ-グアノシン、キューオシン、エポキシキューオシン、ガラクトシルキューオシン、マンノシルキューオシン、7-シアノ-7-デアザ-グアノシン、7-アミノメチル-7-デアザ-グアノシン、アルカエオシン、7-デアザ-8-アザ-グアノシン、6-チオ-グアノシン、6-チオ-7-デアザ-グアノシン、6-チオ-7-デアザ-8-アザ-グアノシン、7-メチルグアノシン、6-チオ-7-メチルグアノシン、7-メチルイノシン、6-メトキシグアノシン、1-メチルグアノシン、N-メチル-グアノシン、N,N-ジメチルグアノシン、N2,7-ジメチルグアノシン、N,N2,7-ジメチルグアノシン、8-オキソ-グアノシン、7-メチル-8-オキソ-グアノシン、1-メチルグアノシン、N-メチル-6-チオ-グアノシン、N,N-ジメチル-6-チオ-グアノシン、アルファ-チオ-グアノシン、2’-O-メチルグアノシン、N-メチル-2’-O-メチルグアノシン、N,N-ジメチル-2’-O-メチルグアノシン、1-メチル-2’-O-メチルグアノシン、N2,7-ジメチル-2’-O-メチルグアノシン、2’-O-メチルイノシン、1,2’-O-ジメチルイノシン、2’-O-リボシルグアノシン(ホスフェート)、1-チオ-グアノシン、O-メチルグアノシン、2’-F-アラグアノシン、及び2’-Fグアノシンから選択される修飾グアニンである。
いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオシドは、2-アミノアデノシン、イノシン、ピロロ-ピリミジン、3-メチルアデノシン、5-メチルシチジン、C-5プロピニル-シチジン、C-5プロピニル-ウリジン、2-アミノアデノシン、C5-ブロモウリジン、C5-フルオロウリジン、C5-ヨードウリジン、C5-プロピニル-ウリジン、C5-プロピニル-シチジン、C5-メチルシチジン、2-アミノアデノシン、7-デアザアデノシン、7-デアザグアノシン、8-オキソアデノシン、8-オキソグアノシン、O(6)-メチルグアニン、シュードウリジン(例えば、N1-メチルシュードウリジン)、2-チオウリジン、及び2-チオシチジンから選択されるヌクレオシド類似体である。例えば、5-メチルシチジン、シュードウリジン、及び2-チオ-ウリジン並びにそれらのmRNAへの組み込みの議論については、米国特許第8,278,036号明細書又は国際公開第2011/012316号パンフレットを参照されたい。
いくつかの実施形態では、修飾ヌクレオシドは、シュードウリジン、N1-メチルシュードウリジン、2-チオウリジン、4’-チオウリジン、5-メチルシトシン、2-チオ-1-メチル-1-デアザ-シュードウリジン、2-チオ-1-メチル-シュードウリジン、2-チオ-5-アザ-ウリジン、2-チオ-ジヒドロシュードウリジン、2-チオ-ジヒドロウリジン、2-チオ-シュードウリジン、4-メトキシ-2-チオ-シュードウリジン、4-メトキシ-シュードウリジン、4-チオ-1-メチル-シュードウリジン、4-チオ-シュードウリジン、5-アザ-ウリジン、ジヒドロシュードウリジン、5-メチルウリジン、5-メトキシウリジン、及び2’-O-メチルウリジンから選択される。
本発明で使用するためのmRNAにおいて、修飾ヌクレオチドは、典型的には、天然に存在するヌクレオチドに取って代わる。したがって、本発明の1つ以上のmRNAは、非修飾ヌクレオチド及び修飾ヌクレオチドの両方を含み得る。そのようなmRNAは、典型的には、天然に存在するヌクレオチドの代わりにIVT反応混合物中に修飾ヌクレオチドを含めることによって調製することができる(例えば、ウリジンの代わりにN1-メチルシュードウリジン)。これにより、天然に存在するヌクレオチドの100%が対応する修飾ヌクレオチドに置き換えられる(例えば、ウリジンの100%がN1-メチルシュードウリジンに置き換えられる)mRNAがもたらされる。いくつかの実施形態では、天然に存在するヌクレオシドの一部のみ(例えば、天然に存在するヌクレオシドの少なくとも1%、5%、10%、15%、20%又は25%)が、修飾ヌクレオシドで置き換えられる。いくつかの実施形態では、1つ以上の天然に存在するヌクレオシドが、修飾リボヌクレオシドで置き換えられる。例えば、2つ以上のリボヌクレオシドは、修飾リボヌクレオシドであり得る(例えば、ウリジンは2-チオ-ウリジンで置き換えられてもよく、シチジンは5-メチルシチジンで置き換えられてもよい)。例えば、ウリジンの25%が2-チオ-ウリジンで置き換えられてもよく、及び/又はシチジン残基の25%が5-メチルシチジンで置き換えられてもよい。
最適化されたヌクレオチド配列の生成
いくつかの実施形態では、本発明で使用するための1つ以上のmRNAは、配列最適化されている。例えば、1つ以上のmRNAのコード配列は、(a)インビトロ合成中の完全長mRNAの収率を改善するために、及び(b)インビボでのmRNAの標的細胞への送達後のコードされたタンパク質の発現を最大化するために、それらの天然に存在する対応物に対して修飾され得る。標的細胞におけるmRNAの迅速な分解を促進する配列モチーフも除去されている。
最適化されたヌクレオチド配列を生成するプロセスは、最初にコドン最適化配列のリストを生成し、次いで3つのフィルターをリストに適用することを含み得る。具体的には、それは、モチーフ選別フィルター、グアニン-シトシン(GC)含量分析フィルター、及びコドン適応指数(CAI)分析フィルターにかけられて、最適化されたヌクレオチド配列のリストの更新をもたらす。更新されたリストはもはや、効率的な転写及び/又はコードされたポリペプチドの翻訳に支障をきたすことが期待される特徴を含有するヌクレオチド配列を含む。
コドン最適化
遺伝子コードは、64の可能なコドンを有する。各コドンは、3つのヌクレオチドの配列を含む。ゲノムのタンパク質コード領域における各コドンの使用頻度は、ゲノムのタンパク質コード領域内に特定のコドンが現れる事例の数を決定し、その後、得られた値をゲノムのタンパク質コード領域内で同じアミノ酸をコードするコドンの総数で除算することによって計算することができる。
コドン使用頻度表は、表が生成された特定の生物学的供給源について、各コドンがある特定のアミノ酸をコードするために使用される頻度に関する実験的に導出されたデータを含む。この情報は、コドンがそのアミノ酸をコードする総回数と比較して、そのコドンがある特定のアミノ酸をコードするために使用される頻度のパーセンテージ(0~100%)又は分数(0~1)として、各コドンについて表される。
コドン使用頻度表は、コドン使用頻度データベース(Codon Usage Database)(Nakamura et al(2000)Nucleic Acids Research 28(1),292;https://www.kazusa.or.jp/codon/にてオンラインで利用可能)、及びHigh-performance Integrated Virtual Environment-Codon Usage Tables(HIVE-CUTs)データベース(Athey et al.,(2017),BMC Bioinformatics 18(1),391;http://hive.biochemistry.gwu.edu/review/codonにてオンラインで利用可能)などの公的に利用可能なデータベースに格納されている。
コドン最適化の第1の工程中に、コドンが閾値使用頻度(例えば、10%)未満のコドン使用頻度に関連付けられる場合、所与の生物(例えば、哺乳動物又はヒト)における各コドンの頻度を反映する第1のコドン使用頻度表からコドンが除去される。第1の工程で除去されなかったコドンのコドン使用頻度を正規化して、正規化されたコドン使用頻度表を生成する。目的のアミノ酸配列をコードする最適化されたヌクレオチド配列は、正規化されたコドン使用頻度表における所与のアミノ酸に関連付けられた1つ以上のコドンの使用頻度に基づいて、アミノ酸配列中の各アミノ酸についてコドンを選択することによって生成される。所与のアミノ酸についてある特定のコドンを選択する確率は、正規化されたコドン使用頻度表におけるこのアミノ酸に関連付けられたコドンに関連する使用頻度に等しい。
本発明のコドン最適化配列は、最適化されたヌクレオチド配列を生成するためのコンピュータ実装方法によって生成される。本方法は、(i)アミノ酸配列がペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質をコードする、アミノ酸配列を受信することと、(ii)第1のコドン使用頻度表を受信することであって、第1のコドン使用頻度表がアミノ酸のリストを含み、表中の各アミノ酸が少なくとも1つのコドンに関連付けられ、各コドンが使用頻度に関連付けられる、第1のコドン使用頻度表を受信することと、(iii)コドン使用頻度表から閾値使用頻度未満である使用頻度に関連付けられた任意のコドンを除去することと、(iv)工程(iii)で除去されなかったコドンの使用頻度を正規化することによって、正規化されたコドン使用頻度表を生成することと、(v)正規化されたコドン使用頻度表中のアミノ酸に関連付けられた1つ以上のコドンの使用頻度に基づいて、アミノ酸配列中の各アミノ酸についてコドンを選択することによって、アミノ酸配列をコードする最適化されたヌクレオチド配列を生成することと、を含む。閾値使用頻度は、5%~30%の範囲であり得、特に5%、10%、15%、20%、25%、又30%であり得る。本発明に関連して、閾値使用頻度は、典型的には10%である。
正規化されたコドン使用頻度表を生成する工程は、(a)第1のアミノ酸に関連付けられ、且つ工程(iii)で除去された各コドンの使用頻度を、第1のアミノ酸に関連付けられた残りのコドンに分配することと、(b)各アミノ酸について工程(a)を繰り返して、正規化されたコドン使用頻度表を生成することと、を含む。いくつかの実施形態では、除去されたコドンの使用頻度は、残りのコドン間で均等に分配される。いくつかの実施形態では、除去されたコドンの使用頻度は、残りの各コドンの使用頻度に基づいて、比例して残りのコドン間で分配される。この文脈における「分配される」は、ある特定のアミノ酸に関連付けられた除去されたコドンの使用頻度の合計のサイズを取り、この組み合わされた頻度の一部を、ある特定のアミノ酸をコードする残りのコドンのそれぞれに割り当てることとして定義され得る。
各アミノ酸についてコドンを選択する工程は、(a)正規化されたコドン使用頻度表において、アミノ酸配列の第1のアミノ酸に関連付けられた1つ以上のコドンを識別することと、(b)第1のアミノ酸に関連付けられたコドンを選択することであって、ある特定のコドンを選択する確率が、正規化されたコドン使用頻度表中の第1のアミノ酸に関連付けられたコドンに関連する使用頻度に等しい、選択することと、(c)工程(a)及び(b)を、アミノ酸配列中の各アミノ酸についてコドンが選択されるまで繰り返すことと、を含む。
アミノ酸配列中の各アミノ酸についてコドンを選択することによって最適化されたヌクレオチド配列を生成する工程(上記方法における工程(v))をn回実行して、最適化されたヌクレオチド配列のリストを生成する。
モチーフスクリーニング
モチーフスクリーニングフィルターは、最適化されたヌクレオチド配列のリストに適用される。任意の既知のマイナスシス調節エレメント及びマイナス反復エレメントをコードする最適化されたヌクレオチド配列をリストから除去して、更新されたリストを生成する。
リスト中の各最適化されたヌクレオチド配列について、それが終止シグナルを含有するかどうかも決定される。1つ以上の終止シグナルを含有する任意のヌクレオチド配列は、更新されたリストを生成するリストから除去される。いくつかの実施形態では、終止シグナルは、以下のヌクレオチド配列を有する:5’-XATCTXTX-3’(式中、X、X及びXは、A、C、T又はGから独立して選択される)。いくつかの実施形態では、終止シグナルは、以下のヌクレオチド配列のうちの1つを有する:TATCTGTT;及び/又はTTTTTT;及び/又はAAGCTT;及び/又はGAAGAGC;及び/又はTCTAGA。典型的な実施形態では、終止シグナルは、以下のヌクレオチド配列を有する:5’-XAUCUXUX-3’(式中、X、X及びXは、A、C、U又はGから独立して選択される)。具体的な実施形態では、終止シグナルは、以下のヌクレオチド配列のうちの1つを有する:UAUCUGUU;及び/又はUUUUUU;及び/又はAAGCUU;及び/又はGAAGAGC;及び/又はUCUAGA。
グアニン-シトシン(GC)含量
本方法は、最適化されたヌクレオチド配列の更新されたリスト中の最適化されたヌクレオチド配列の各々のグアニン-シトシン(GC)含量を決定することを更に含む。配列のGC含量は、ヌクレオチド配列中のグアニン又はシトシンである塩基のパーセンテージである。最適化されたヌクレオチド配列のリストは、そのGC含量が所定のGC含量範囲外である場合、リストから任意のヌクレオチド配列を除去することによって更に更新される。
最適化されたヌクレオチド配列の各々のGC含量を決定することは、各ヌクレオチド配列について、ヌクレオチド配列の1つ以上の追加部分のGC含量を決定することを含み、追加部分が互いに第1の部分と重複しておらず、最適化された配列のリストを更新することが、任意の部分のGC含量が所定のGC含量範囲外にある場合、ヌクレオチド配列を除去することを含み、任意選択的に、任意の部分のGC含量が所定のGC含量の範囲外であると決定されると、ヌクレオチド配列のGC含量の決定は停止される。いくつかの実施形態では、ヌクレオチド配列の第1の部分及び/又は1つ以上の追加部分は、所定の数のヌクレオチドを含み、任意選択的に、所定の数のヌクレオチドは、5~300ヌクレオチド、又は10~200ヌクレオチド、又は15~100ヌクレオチド、又は20~50ヌクレオチドの範囲である。本発明に関連して、所定の数のヌクレオチドは、典型的には30ヌクレオチドである。所定のGC含量範囲は、15%~75%、又は40%~60%、又は30%~70%であり得る。本発明に関連して、所定のGC含量範囲は、典型的には30%~70%である。
本発明に関連する公的なGC含量フィルターは、最初に、最適化されたヌクレオチド配列の最初の30ヌクレオチド、すなわち、最適化されたヌクレオチド配列のヌクレオチド1~30個を分析し得る。分析は、G又はCのいずれかである部分中のヌクレオチドの数を決定することを含み得、部分のGC含量を決定することは、部分のG又はCヌクレオチドの数を部分のヌクレオチドの総数で除算することを含み得る。この分析結果は、G又はCである部分におけるヌクレオチドの割合を表す値を提供し、パーセンテージ、例えば50%、又は少数、例えば0.5であり得る。第1の部分のGC含量が所定のGC含量範囲外である場合、最適化されたヌクレオチド配列は、最適化されたヌクレオチド配列のリストから除去され得る。
第1の部分のGC含量が所定のGC含量範囲内にある場合、GC含量フィルターは、次いで、最適化されたヌクレオチド配列の第2の部分を分析し得る。この例では、これは、最適化されたヌクレオチド配列の第2の30ヌクレオチド、すなわち31~60個のヌクレオチドであり得る。部分分析は、以下のいずれかまで、各部分について繰り返され得る:所定のGC含量範囲外にあるGC含量を有する部分が見出される場合には、最適化されたヌクレオチド配列がリストから除外され得るか、又は最適化されたヌクレオチド配列全体が分析されており、そのような部分が見出されない場合には、GC含量フィルターが、最適化されたヌクレオチド配列をリストにそのまま残し、リスト中の次の最適化されたヌクレオチド配列まで移動し得る。
コドン適応指数(CAI)
本方法は、最適化されたヌクレオチド配列の最新の更新されたリスト中の最適化されたヌクレオチド配列の各々のコドン適応指数(CAI)を決定することを更に含む。配列のCAIは、コドン使用頻度バイアスの尺度であり、0~1の値であり得る。最適化されたヌクレオチド配列の最新の更新されたリストは、そのCAIが所定のコドン適応指数閾値以下である場合、任意のヌクレオチド配列を除去することによって更に更新される。CAI閾値は、0.7、又は0.75、又は0.8、又は0.85、又は0.9であり得る。本発明者らは、0.8以上のCAIを有する最適化されたヌクレオチド配列が、非常に高いタンパク質収率をもたらすことを見出した。したがって、本発明に関連して、CAI閾値は、典型的には0.8である。
コドン適応指数(CAI)は、最適化されたヌクレオチド配列ごとに、例えば“The codon adaptation index--a measure of directional synonymous codon usage bias,and its potential applications”(Sharp and Li,1987.Nucleic Acids Research 15(3),p.1281-1295)(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC340524/にてオンラインで利用可能)に記載されているように、当業者に明らかであろう任意の方法で計算され得る。
コドン適応指数(CAI)計算の実行は、以下によるか、又はそれに類似する方法を含み得る。配列中の各アミノ酸について、配列中の各コドンの重量は、相対的適応性(w)と呼ばれるパラメータによって表され得る。相対的適応性は、コドンfの観察された頻度とそのアミノ酸についての最も頻繁な同義コドンfの頻度との間の比として、参照配列セットから計算され得る。次いで、配列のCAIは、配列の長さにわたる各コドンに関連付けられた重量の幾何平均として計算され得る(コドンで測定される)。CAIを算出するために使用される参照配列セットは、本発明の方法で使用されるコドン使用頻度表が導出されるのと同じ参照配列セットであり得る。
インビトロ転写
本発明のmRNAは、種々の公知の方法のいずれかに従って合成され得る。様々な方法が、公開されている米国特許出願公開第2018/0258423号明細書及び国際公開第2018/157153号パンフレット(参照により本明細書に組み込まれる)に記載されており、本発明を実施するために使用することができる。例えば、本発明によるmRNAは、インビトロ転写(IVT)によって合成され得る。手短に言えば、IVTは、典型的には、プロモーター、リボヌクレオチドトリホスフェートのプール、DTT及びマグネシウムイオンを含み得る緩衝液システム、並びに適切なRNAポリメラーゼ(例えば、T3、T7又はSP6 RNAポリメラーゼ)、DNase I、ピロホスファターゼ及び/又はRNase阻害剤を含有する直鎖の若しくは環状DNA鋳型又はDNAベクターで行われる。正確な条件は、具体的な適用に応じて変わるであろう。
IVTによるmRNAの調製については、DNA鋳型又はDNAベクターがインビトロで転写され得る。公的なDNA鋳型又はDNAベクターは、通常、インビトロ転写(IVT)のためのプロモーター、例えば、T3、T7又はSP6プロモーターに続いて、所望のmRNA及び末端シグナル(ターミネーター)のための所望のヌクレオチド配列を有する。
一態様では、本発明は、本明細書に記載の最適化されたヌクレオチド配列を含むmRNAをコードするDNAベクターを提供する。いくつかの実施形態では、DNAベクターは、プロモーター及び/又はターミネーターを更に含む。一実施形態では、プロモーターは、SP6 RNAポリメラーゼプロモーターである。別の実施形態では、プロモーターは、T7 RNAポリメラーゼプロモーターである。
合成後精製
合成後にmRNAを精製するために、様々な方法が使用され得る。いくつかの実施形態では、mRNAは、タンジェンシャルフロー濾過(TFF)を使用して精製される。好適な精製方法としては、全てが参照により本明細書に組み込まれ、本発明を実践するために使用され得る米国特許出願公開第2016/0040154号明細書、米国特許出願公開第2015/0376220号明細書、米国特許出願公開第2018/0251755号明細書、米国特許出願公開第2018/0251754号明細書、2018年11月8日に出願された米国仮特許出願第62/757,612号明細書、及び2019年8月26日に出願された米国仮特許出願第62/891,781号明細書に記載されるものが挙げられる。mRNA製品の純度要件は、治療用途にはより厳格であるため、本発明のいくつかの実施形態で医薬組成物に含まれ得る本発明のmRNAを精製することが有利である。
いくつかの実施形態では、mRNAは、キャップ付加及びテール付加の前に精製される。いくつかの実施形態では、mRNAは、キャップ付加及びテール付加の後に精製される。いくつかの実施形態では、mRNAは、キャップ付加及びテール付加の前及び後の両方で精製される。いくつかの実施形態では、mRNAは、遠心分離によって、キャップ付加及びテール付加の前若しくは後のいずれか又は前及び後の両方で精製される。いくつかの実施形態では、mRNAは、濾過によって、キャップ付加及びテール付加の前若しくは後のいずれか又は前及び後の両方で精製される。いくつかの実施形態では、mRNAは、TFFによって、キャップ付加及びテール付加の前若しくは後のいずれか又は前及び後の両方で精製される。
脂質ナノ粒子(LNP)
本発明はまた、本発明で使用するための1つ以上のmRNAを封入する脂質ナノ粒子(LNP)を提供する。典型的には、本発明で使用するために好適な脂質ナノ粒子は、1つ以上のカチオン性脂質、1つ以上の非カチオン性脂質(例えば、DOPE並びに/又はコレステロール)、及び1つ以上のPEG修飾脂質(例えば、DMG-PEG2K)を含む。
本発明で使用するための典型的な脂質ナノ粒子は、4つの脂質成分:カチオン性脂質(例えば、cKKE10、OF-02又はALC-0315)、非カチオン性脂質(例えば、DOPE又はDSPC)、コレステロール系脂質(例えば、コレステロール)及びPEG修飾脂質(例えば、DMG-PEG-2K又は2-[(ポリエチレングリコール)-2000]-N,N-ジテトラデシルアセトアミド(ALC-0159))から構成される。カチオン性脂質と非カチオン性脂質とコレステロールとPEG修飾脂質のモル比は、典型的には、それぞれ約30~60:25~35:20~30:1~15である。本発明による例示的なLNPは、cKK-E10、OF-02及びALC-0315から選択されるカチオン性脂質;DOPE及びDSPCから選択される非カチオン性脂質;コレステロールなどのコレステロール系脂質;並びにDMG-PEG-2K及びALC-0159などのPEG修飾脂質から構成され得る。
いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、3つ以下の別個の脂質成分を含む。例示的な脂質ナノ粒子は、3つの脂質成分:カチオン性脂質(例えば、ステロール系カチオン性脂質)、非カチオン性脂質(例えば、DOPE又はDEPE)及びPEG修飾脂質(例えば、DMG-PEG2K)から構成される。具体的な実施形態では、3つの別個の脂質成分は、HGT4002、DOPE及びDMG-PEG2Kである。例示的な実施形態では、HGT4002、DOPE及びDMG-PEG2Kは、それぞれおよそ60:35:5のモル比で存在する。そのようなLNPは、本発明のmRNAのエアロゾル送達に特に好適であり得る。
本発明において使用するための脂質ナノ粒子は、当該技術分野において現在知られている様々な技術によって調製され得る。そのような方法は、例えば、全てが参照により本明細書に組み込まれる、公開されている米国特許出願公開第2011/0244026号明細書、公開されている米国特許出願公開第2016/0038432号明細書、公開されている米国特許出願公開第2018/0153822号明細書、公開されている米国特許出願公開第2018/0125989号明細書及び2019年7月23日に出願された米国仮特許出願第62/877,597号明細書に記載されている。
カチオン性脂質
カチオン性脂質は、低pHで正に帯電した環境を与えて、負に帯電したmRNA原薬の効率的なカプセル封入を促進する。LNPにおける使用に好適な様々なカチオン性脂質が当該技術分野において公知である。これらには、例えば、DOTAP(1,2-ジオレイル-3-トリメチルアンモニウムプロパン)、DODAP(1,2-ジオレイル-3-ジメチルアンモニウムプロパン)、DOTMA(N-[l-(2,3-ジオレイルオキシ)プロピル]-N,N,N-トリメチルアンモニウムクロリド)、DLinKC2DMA、DLin-KC2-DM、及びC12-200が挙げられる。本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法において使用するために好適な例示的なカチオン性脂質が本明細書に記載されており、例えば、参照により本明細書に組み込まれる、国際特許公開第2010/144740号パンフレットに記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質、(6Z,9Z,28Z,31Z)-ヘプタトリアコンタ-6,9,28,31-テトラエン-19-イル4-(ジメチルアミノ)ブタノエート:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法において使用するための他の好適なカチオン性脂質には、参照により本明細書に組み込まれる、国際特許公開第2013/149140号パンフレットに記載されるとおりのイオン化できるカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の式:
又はその薬学的に許容される塩(式中、R及びRは、各々独立して、水素、任意選択により置換された、不定の飽和若しくは不飽和C~C20アルキル及び任意選択により置換された、不定の飽和若しくは不飽和C~C20アシルからなる群から選択され;L及びLは、各々独立して、水素、任意選択により置換されたC~C30アルキル、任意選択により置換された、不定の不飽和C~C30アルケニル、及び任意選択により置換されたC~C30アルキニルからなる群から選択され;m及びoは、各々独立して、ゼロ及び任意の正の整数(例えば、mは3である)からなる群から選択され;且つnはゼロ又は任意の正の整数(例えば、nは1である)である)のうちの1つのカチオン性脂質を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質(15Z,18Z)-N,N-ジメチル-6-(9Z,12Z)-オクタデカ-9,12-ジエン-l-イル)テトラコサ-15,18-ジエン-1-アミン(「HGT5000」):
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質(15Z,18Z)-N,N-ジメチル-6-((9Z,12Z)-オクタデカ-9,12-ジエン-1-イル)テトラコサ-4,15,18-トリエン-l-アミン(「HGT5001」):
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質及び(15Z,18Z)-N,N-ジメチル-6-((9Z,12Z)-オクタデカ-9,12-ジエン-1-イル)テトラコサ-5,15,18-トリエン-1-アミン(「HGT5002」):
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法において使用するための他の好適なカチオン性脂質には、参照により本明細書に組み込まれる、国際特許公開第2010/053572号パンフレットにおいてアミノアルコールリピドイドとして記載されているカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法において使用するための他の好適なカチオン性脂質には、参照により本明細書に組み込まれる、国際特許公開第2016/118725号パンフレットに記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法において使用するための他の好適なカチオン性脂質には、参照により本明細書に組み込まれる、国際特許公開第2016/118724号パンフレットに記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法において使用のための他の好適なカチオン性脂質としては、14,25-ジトリデシル15,18,21,24-テトラアザ-オクタトリアコンタンの式を有するカチオン性脂質、及びその薬学的に許容される塩が挙げられる。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質には、各々が参照により本明細書に組み込まれる国際特許公開第2013/063468号パンフレット及び国際特許公開第2016/205691号パンフレットに記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の式のカチオン性脂質:
又はその薬学的に許容される塩(式中、Rのそれぞれの例は、独立して、任意選択により置換されたC~C40アルケニルである)を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質には、参照により本明細書に組み込まれる国際特許公開第2015/184256号パンフレットに記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の式のカチオン性脂質:
又はその薬学的に許容される塩(式中、各Xは、独立して、O又はSであり;各Yは、独立して、O又はSであり;各mは、独立して、0~20であり;各nは、独立して、1~6であり;各Rは、独立して、水素、任意選択により置換されたC1~50アルキル、任意選択により置換されたC2~50アルケニル、任意選択により置換されたC2~50アルキニル、任意選択により置換されたC3~10カルボシクリル、任意選択により置換された3~14員ヘテロシクリル、任意選択により置換されたC6~14アリール、任意選択により置換された5~14員ヘテロアリール又はハロゲンであり;且つ各Rは、独立して、水素、任意選択により置換されたC1~50アルキル、任意選択により置換されたC2~50アルケニル、任意選択により置換されたC2~50アルキニル、任意選択により置換されたC3~10カルボシクリル、任意選択により置換された3~14員ヘテロシクリル、任意選択により置換されたC6~14アリール、任意選択により置換された5~14員ヘテロアリール又はハロゲンである)を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質、「標的23」:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質には、参照により本明細書に組み込まれる国際特許公開第2016/004202号パンフレットに記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
又はその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
又はその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
又はその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質には、参照により本明細書に組み込まれる国際特許公開第2020/097384号パンフレットに記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の式のカチオン性脂質:
、又はその薬学的に許容される塩(式中、各R及びRは、独立して、H又はC~C脂肪族であり;各mは、独立して、1~4の値を有する整数であり;各Aは、独立して、共有結合又はアリーレンであり;各Lは、独立して、エステル、チオエステル、ジスルフィド、又は無水物基であり;各Lは、独立して、C~C10脂肪族であり;各Xは、独立して、H又はOHであり;且つ各Rは、独立して、C~C20脂肪族である)を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の式のカチオン性脂質:
又はその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の式のカチオン性脂質:
又はその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の式のカチオン性脂質:
又はその薬学的に許容される塩を含む。
本発明の医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質としては、参照により本明細書に組み込まれるJ.McClellan,M.C.King,Cell 2010,141,210-217及びWhitehead et al.,Nature Communications(2014)5:4277に記載されるとおりのカチオン性脂質を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質としては、参照により本明細書に組み込まれる国際特許公開第2015/199952号パンフレットに記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩より選択されてもよい。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩より選択されてもよい。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質としては、参照により本明細書に組み込まれる国際特許公開第2017/004143号パンフレットに記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質としては、参照により本明細書に組み込まれる国際特許公開第2017/075531号パンフレットに記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の式のカチオン性脂質:
又はその薬学的に許容される塩(式中、L又はLのうちの1つは、-O(C=O)-、-(C=O)O-、-C(=O)-、-O-、-S(O)、-S-S-、-C(=O)S-、-SC(=O)-、-NRC(=O)-、-C(=O)NR-、NRC(=O)NR-、-OC(=O)NR-、又は-NRC(=O)O-であり;L又はLのうちの他のものは、-O(C=O)-、-(C=O)O-、-C(=O)-、-O-、-S(O)、-S-S-、-C(=O)S-、SC(=O)-、-NRC(=O)-、-C(=O)NR-、NRC(=O)NR-、-OC(=O)NR-若しくは-NRC(=O)O-、又は直接結合であり;G及びGは、各々独立して非置換C~C12アルキレン又はC~C12アルケニレンであり;Gは、C~C24アルキレン、C~C24アルケニレン、C~Cシクロアルキレン、C~Cシクロアルケニレンであり;Rは、H又はC~C12アルキルであり;R及びRは、各々独立して、C~C24アルキル又はC~C24アルケニルであり;Rは、H、OR、CN、-C(=O)OR、-OC(=O)R又は-NRC(=O)Rであり;Rは、C~C12アルキルであり;Rは、H又はC~Cアルキルであり;且つxは、0、1又は2である)を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質としては、参照により本明細書に組み込まれる国際特許公開第2017/117528号パンフレットに記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質としては、参照により本明細書に組み込まれる国際特許公開第2017/049245号パンフレットに記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の式のうちの1つの化合物:
、及びその薬学的に許容される塩を含む。これらの4つの式のいずれか1つに関して、Rは、独立して、-(CHQ及び-(CHCHQRから選択され;Qは、-OR、-OH、-O(CHN(R)、-OC(O)R、-CX、-CN、-N(R)C(O)R、-N(H)C(O)R、-N(R)S(O)R、-N(H)S(O)R、-N(R)C(O)N(R)、-N(H)C(O)N(R)、-N(H)C(O)N(H)(R)、-N(R)C(S)N(R)、-N(H)C(S)N(R)、-N(H)C(S)N(H)(R)、及び複素環からなる群から選択され;且つnは、1、2、又は3である。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質としては、各々が参照により本明細書に組み込まれる国際特許公開第2017/173054号パンフレット及び国際特許公開第2015/095340号パンフレットに記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質としては、参照により本明細書に組み込まれる、2020年9月23日に出願された米国仮特許出願第63/082,090号明細書に記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明の組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質としては、参照により本明細書に組み込まれる、2020年4月1日に出願された米国仮特許出願第63/003,698号明細書に記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質としては、参照により本明細書に組み込まれる、2020年9月23日に出願された米国仮特許出願第63/082,101号明細書に記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質としては、参照により本明細書に組み込まれる、2019年6月21日に出願された米国仮特許出願第62/864,818号明細書に記載されるとおりのカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の式に従う化合物構造を有するカチオン性脂質:
又はその薬学的に許容される塩(式中、R、R3、及びRの各々は、独立してC~C30アルキル、C~C30アルケニル、又はC~C30アルキニルであり;Lは、C~C30アルキレン、C~C30アルケニレン、又はC~C30アルキニレンであり;且つBは、イオン化可能な窒素含有基である)を含む。実施形態では、LはC~C10アルキレンである。実施形態では、Lは、非置換C~C10アルキレンである。実施形態では、Lは、(CH、(CH、(CH4、又は(CHである。実施形態では、Lは、(CH)、(CH、(CH、(CH、(CH、又は(CH10である。実施形態では、Bは、独立して、NH、グアニジン、アミジン、モノ若しくはジアルキルアミン、5~6員窒素含有ヘテロシクロアルキル、又は5~6員窒素含有ヘテロアリールである。実施形態では、B
である。実施形態では、B
である。実施形態では、B
である。実施形態では、R、R、及びRの各々は、独立して、非置換直鎖C~C22アルキル、非置換直鎖C~C22アルケニル、非置換直鎖C~C22アルキニル、非置換分岐C~C22アルキル、非置換分岐C~C22アルケニル、又は非置換分岐C~C22アルキニルである。実施形態では、R、R、及びRの各々は、非置換C~C22アルキルである。実施形態では、R、R、及びRの各々は、-C13、-C15、-C17、-C19、-C1021、-C1123、-C1225、-C1327、-C1429、-C1531、-C1633、-C1735、-C1837、-C19H3、-C2041、-C2143、-C2245、-C2347、-C2449、又は-C2551である。実施形態では、R、R、及びRの各々は、独立して、-O(CO)R又は-C(O)ORで置換されたC~C12アルキルである(式中、Rは、非置換C~C14アルキルである)。実施形態では、R、R、及びRの各々は、非置換C~C22アルケニルである。実施形態では、R、R、及びRの各々は、-(CHCH=CH、-(CHCH=CH、-(CHCH=CH、-(CHCH=CH、-(CHCH=CH、-(CHCH=CH、-(CH10CH=CH、-(CH11CH=CH、-(CH12CH=CH、-(CH13CH=CH、-(CH14CH=CH、-(CH15CH=CH、-(CH16CH=CH、-(CH17CH=CH、-(CH18CH=CH、-(CHCH=CH(CHCH、-(CHCH=CH(CHCH、-(CHCH=CH(CHCH、-(CHCH=CH(CHCH、-(CHCH=CHCHCH=CH(CHCH、-(CHCH=CHCHCH=CH(CHCH、-(CHCH=CHCHCH=CHCHCH=CHCHCH、-(CHCH=CHCHCH=CHCHCH=CHCHCH=CH(CHCH、-(CHCH=CHCHCH=CHCHCH=CHCHCH=CHCHCH=CHCHCH、-(CH11CH=CH(CHCH、又は-(CHCH=CHCHCH=CHCHCH=CHCHCH=CHCHCH=CHCHCH=CHCHCHである。実施形態では、前記C~C22アルケニルは、モノアルケニル、ジエニル、又はトリエニルである。実施形態では、R、R、及びRの各々は、
である。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質としては、参照により本明細書に組み込まれる国際特許公開第2012/170889号パンフレットに記載されるとおりの切断可能なカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の式のカチオン性脂質:
を含み、式中、Rは、イミダゾール、グアニジウム、アミノ、イミン、エナミン、任意選択により置換されたアルキルアミノ(例えば、ジメチルアミノなどのアルキルアミノ)及びピリジルからなる群から選択され;Rは、以下の2つの式:
のうちの1つからなる群から選択され、式中、R及びRは、各々独立して、任意選択により置換された不定の飽和又は不飽和C~C20アルキル及び任意選択的に置換された、不定の飽和又は不飽和C~C20アシルからなる群から選択され;且つnは、0又は任意の正の整数(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20又はそれ以上)である。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質、「HGT4001」:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質、「HGT4002」:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質、「HGT4003」:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質、「HGT4004」:
及びその薬学的に許容される塩を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質、「HGT4005」:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法における使用のための他の好適なカチオン性脂質には、参照により本明細書に組み込まれる、国際特許公開第2019/222424号パンフレットに記載されるとおりの切断可能なカチオン性脂質が挙げられる。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、一般式のいずれか又は国際特許公開第2019/222424号パンフレットに記載される構造(1a)~(21a)及び(1b)~(21b)及び(22)~(237)のいずれかであるカチオン性脂質を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、式(I’)による構造を有するカチオン性脂質を含み、
式中、
は、独立して、-H、-L-R、又は-L5A-L5B-B’であり;
、L、及びLの各々は、独立して、共有結合、-C(O)-、-C(O)O-、-C(O)S-、又は-C(O)NR-であり;
各L4A及びL5Aは、独立して、-C(O)-、-C(O)O-、又は-C(O)NR-であり;
各L4B及びL5Bは、独立して、C~C20アルキレン、C~C20アルケニレン、又はC~C20アルキニレンであり;
各B及びB’は、NR又は5員~10員窒素含有ヘテロアリールであり;
各R、R及びRは、独立して、C~C30アルキル、C~C30アルケニル、又はC~C30アルキニルであり;
各R及びRは、独立して、水素、C~C10アルキル、C~C10アルケニル、又はC~C10アルキニルであり;且つ
各Rは、独立して、水素、C~C20アルキル、C~C20アルケニル、又はC~C20アルキニルである。
いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有する、国際特許公開第2019/222424号パンフレットの化合物(139)であるカチオン性脂質を含む:
いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するRL3-DMA-07Dであるカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するRL2-DMP-07Dであるカチオン性脂質:
及びその薬学的に許容される塩を含む。
いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有する、カチオン性脂質GL-HEPES-E3-E10-DS-3-E18-1(2-(4-(2-((3-(ビス((Z)-2-ヒドロキシオクタデカ-9-エン-1-イル)アミノ)プロピル)ジスルファネイル(disulfaneyl))エチル)ピペラジン-1-イル)エチル4-(ビス(2-ヒドロキシデシル)アミノ)ブタノエート)を含む:
いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有する、カチオン性脂質GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10(2-(4-(2-((3-(ビス(2-ヒドロキシデシル)アミノ)ブチル)ジスルファネイル)エチル)ピペラジン-1-イル)エチル4-(ビス(2-ヒドロキシドデシル)アミノ)ブタノエート)を含む:
いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法は、以下の化合物構造を有するカチオン性脂質GL-HEPES-E3-E12-DS-3-E14(2-(4-(2-((3-(ビス(2-ヒドロキシテトラデシル)アミノ)プロピル)ジスルファネイル)エチル)ピペラジン-1-イル)エチル4-(ビス(2-ヒドロキシドデシル)アミノ)ブタノエート)を含む:
いくつかの実施形態では、LNPは、カチオン性脂質、N-[l-(2,3-ジオレイルオキシ)プロピル]-N,N,N-トリメチルアンモニウムクロリド(「DOTMA」)を含む(参照により本明細書に組み込まれる、Feigner et al.(Proc.Nat’l Acad.Sci.84,7413(1987);米国特許第4,897,355号明細書)。本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法に好適な他のカチオン性脂質には、例えば、5-カルボキシスペルミルグリシンジオクタデシルアミド(「DOGS」);2,3-ジオレイルオキシ-N-[2(スペルミン-カルボキサミド)エチル]-N,N-ジメチル-l-プロパンアミニウム(「DOSPA」)(Behr et al.Proc.Nat.’l Acad.Sci.86,6982(1989)、米国特許第5,171,678号明細書;米国特許第5,334,761号明細書);1,2-ジオレオイル-3-ジメチルアンモニウム-プロパン(「DODAP」);1,2-ジオレオイル-3-トリメチルアンモニウム-プロパン(「DOTAP」)が挙げられる。
いくつかの実施形態では、LNPは、以下の構造を有するカチオン性脂質IM-001を含む:
いくつかの実施形態では、LNPは、カチオン性脂質、N-[l-(2,3-ジオレイルオキシ)プロピル]-N,N,N-トリメチルアンモニウムクロリド(「DOTMA」)を含む(参照により本明細書に組み込まれる、Feigner et al. (Proc.Nat’l Acad.Sci.84,7413(1987);米国特許第4,897,355号明細書)。本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法に好適な他のカチオン性脂質には、例えば、5-カルボキシスペルミルグリシンジオクタデシルアミド(「DOGS」);2,3-ジオレイルオキシ-N-[2(スペルミン-カルボキサミド)エチル]-N,N-ジメチル-l-プロパンアミニウム(「DOSPA」)(Behr et al.Proc.Nat.’l Acad.Sci.86,6982(1989)、米国特許第5,171,678号明細書;米国特許第5,334,761号明細書);1,2-ジオレオイル-3-ジメチルアンモニウム-プロパン(「DODAP」);1,2-ジオレオイル-3-トリメチルアンモニウム-プロパン(「DOTAP」)が挙げられる。
N-[l-(2,3-ジオレイルオキシ)プロピル]-N,N,N-トリメチルアンモニウムクロリド(「DOTMA」)(参照により本明細書に組み込まれる、Feigner et al.(Proc.Nat’l Acad.Sci.84,7413(1987);米国特許第4,897,355号明細書)。本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法に好適な他のカチオン性脂質には、例えば、5-カルボキシスペルミルグリシンジオクタデシルアミド(「DOGS」);2,3-ジオレイルオキシ-N-[2(スペルミン-カルボキサミド)エチル]-N,N-ジメチル-l-プロパンアミニウム(「DOSPA」)(Behr et al.Proc.Nat.’l Acad.Sci.86,6982(1989)、米国特許第5,171,678号明細書;米国特許第5,334,761号明細書);1,2-ジオレオイル-3-ジメチルアンモニウム-プロパン(「DODAP」);1,2-ジオレオイル-3-トリメチルアンモニウム-プロパン(「DOTAP」)が挙げられる。
本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法に好適な追加の例示的なカチオン性脂質にはまた、1,2-ジステアリルオキシ-N,N-ジメチル-3-アミノプロパン(「DSDMA」)1,2-ジオレイルオキシ-N,N-ジメチル-3-アミノプロパン(「DODMA」);1,2-ジリノレイルオキシ-N,N-ジメチル-3-アミノプロパン(「DLinDMA」);1,2-ジリノレニルオキシ-N,N-ジメチル-3-アミノプロパン(「DLenDMA」);N-ジオレイル-N,N-ジメチルアンモニウムクロリド(「DODAC」);N,N-ジステアリル-N,N-ジメチルアンモニウムブロミド(「DDAB」);N-(1,2-ジミリスチルオキシプロパ-3-イル)-N,N-ジメチル-N-ヒドロキシエチルアンモニウムブロミド(「DMRIE」);3-ジメチルアミノ-2-(コレスト-5-エン-3-ベータ-オキシブタン-4-オキシ)-l-(シス,シス-9,12-オクタデカジエンオキシ)プロパン(「CLinDMA」);2-[5’-(コレスト-5-エン-3-ベータ-オキシ)-3’-オキサペントキシ)-3-ジメチル-l-(シス,シス-9’,l-2’-オクタデカジエンオキシ)プロパン(「CpLinDMA」);N,N-ジメチル-3,4-ジオレイルオキシベンジルアミン(「DMOBA」);1,2-N,N’-ジオレイルカルバミル-3-ジメチルアミノプロパン(「DOcarbDAP」);2,3-ジリノレオイルオキシ-Ν,Ν-ジメチルプロピルアミン(「DLinDAP」);1,2-N,N’-ジリノレイルカルバミル-3-ジメチルアミノプロパン(「DLincarbDAP」);1,2-ジリノレオイルカルバミル-3-ジメチルアミノプロパン(「DLinCDAP」);2,2-ジリノレイル-4-ジメチルアミノメチル-[1,3]-ジオキソラン(「DLin-K-DMA」);2-((8-[(3P)-コレスト-5-エン-3-イルオキシ]オクチル)オキシ)-N,N-ジメチル-3-[(9Z,12Z)-オクタデカ-9,12-ジエン-1-イルオキシ]プロパン-1-アミン(「オクチル-CLinDMA」);(2R)-2-((8-[(3ベータ)-コレスト-5-エン-3-イルオキシ]オクチル)オキシ)-N,N-ジメチル-3-[(9Z,12Z)-オクタデカ-9,12-ジエン-1-イルオキシ]プロパン-1-アミン(「オクチル-CLinDMA(2R)」);(2S)-2-((8-[(3P)-コレスト-5-エン-3-イルオキシ]オクチル)オキシ)-N,fsl-dimethyh3-[(9Z,12Z)-オクタデカ-9,12-ジエン-1-イルオキシ]プロパン-1-アミン(「オクチル-CLinDMA(2S)」);2,2-ジリノレイル-4-ジメチルアミノエチル-[l,3]-ジオキソラン(「DLin-K-XTC2-DMA」);及び2-(2,2-ジ((9Z,12Z)-オクタデカ-9,l2-ジエン-1-イル)-l,3-ジオキソラン-4-イル)-N,N-ジメチルエタンアミン(「DLin-KC2-DMA」)が挙げられる(参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2010/042877号パンフレット;Sempleetal.,Nature Biotech.28:172-176(2010)を参照されたい)。(Heyes,J.,et al.,J Controlled Release 107:276-287(2005);Morrissey,DV.,et al.,Nat.Biotechnol.23(8):1003-1007(2005);国際特許公開第2005/121348号パンフレット)。いくつかの実施形態では、カチオン性脂質の1つ以上は、イミダゾール、ジアルキルアミノ、又はグアニジウム部分の少なくとも1つを含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物及び方法に好適な1つ以上のカチオン性脂質には、2,2-ジリノレイル-4-ジメチルアミノエチル-[1,3]-ジオキソラン(「XTC」);(3aR,5s,6aS)-N,N-ジメチル-2,2-ジ((9Z,12Z)-オクタデカ-9,12-ジエニル)テトラヒドロ-3aH-シクロペンタ[d][1,3]ジオキソール-5-アミン(「ALNY-100」)及び/又は4,7,13-トリス(3-オキソ-3-(ウンデシルアミノ)プロピル)-N1,N16-ジウンデシル-4,7,10,13-テトラアザヘキサデカン-1,16-ジアミド(「NC98-5」)が挙げられる。
特定の実施形態では、カチオン性脂質は、cKK-E12、cKK-E10、HGT5000、HGT5001、ICE、HGT4001、HGT4002、HGT4003、TL1-01D-DMA、TL1-04D-DMA、TL1-08D-DMA、TL1-10D-DMA、OF-Deg-Lin、OF-02、GL-TES-SA-DMP-E18-2、GL-TES-SA-DME-E18-2、SY-3-E14-DMAPr、TL1-10D-DMA、HEP-E3-E10、HEP-E4-E10、RL3-DMA-07D、RL2-DMP-07D、cHse-E-3-E10、cHse-E-3-E12、cDD-TE-4-E12、SI-4-E14-DMAPr、TL-1-12D-DMA、SY-010、SY-011、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10、及び4-ヒドロキシブチル)アザンジイル)ビス(ヘキサン-6,1-ジイル)ビス(2-ヘキシルデカノエート(ALC-0315)から選択される。
具体的な実施形態では、カチオン性脂質は、cKKE10、OF-02、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10、及びALC-0315から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物は、LNP、組成物、医薬組成物中の総脂質内容物、例えば、脂質ナノ粒子の重量によって測定される少なくとも約5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、又は70%を占める1つ以上のカチオン性脂質を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物は、LNP、組成物、医薬組成物中の総脂質内容物、例えば、脂質ナノ粒子のmol%として測定される少なくとも約5%、10%、20%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、又は70%を占める1つ以上のカチオン性脂質を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物は、LNP、組成物、医薬組成物中の総脂質内容物、例えば、脂質ナノ粒子の重量によって測定される約30~70%(例えば、約30~65%、約30~60%、約30~55%、約30~50%、約30~45%、約30~40%、約35~50%、約35~45%、又は約35~40%)を占める1つ以上のカチオン性脂質を含む。いくつかの実施形態では、本発明のLNP、組成物、医薬組成物は、LNP、組成物、医薬組成物中の総脂質内容物、例えば、脂質ナノ粒子のmol%として測定される約30~70%(例えば、約30~65%、約30~60%、約30~55%、約30~50%、約30~45%、約30~40%、約35~50%、約35~45%、又は約35~40%)を占める1つ以上のカチオン性脂質を含む。
非カチオン性脂質
いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、1つ以上の非カチオン性脂質を含有する。本明細書で使用される場合、語句「非カチオン性脂質」は、任意の中性、双性イオン又はアニオン性脂質を指す。本明細書で使用される場合、語句「アニオン性脂質」は、生理学的pHなどの選択されたpHで正味の負電荷を有するいくつかの脂質種のいずれかを指す。非カチオン性は、LNPの構造的安定性を増強し、mRNAペイロードの取り込み及び放出を改善し得る。いくつかの実施形態では、非カチオン性脂質は、mRNAペイロードの取り込み及び放出を増強させるための融合特性を有する双性イオン脂質である。非カチオン性脂質としては、ジステアロイルホスファチジルコリン(DSPC)、ジオレオイルホスファチジルコリン(DOPC)、ジパルミトイルホスファチジルコリン(DPPC)、1,2-ジラウロイル-sn-グリセロ-3-ホスホコリン(DLPC)、ジオレオイルホスファチジルグリセロール(DOPG)、ジパルミトイルホスファチジルグリセロール(DPPG)、ジオレオイルホスファチジルエタノールアミン(DOPE)、1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスホ-L-セリン(DOPS)、パルミトイルオレオイルホスファチジルコリン(POPC)、パルミトイルオレオイル-ホスファチジルエタノールアミン(POPE)、ジオレオイル-ホスファチジルエタノールアミン4-(N-マレイミドメチル)-シクロヘキサン-l-カルボキシレート(DOPE-mal)、ジパルミトイルホスファチジルエタノールアミン(DPPE)、ジミリストイルホスホエタノールアミン(DMPE)、ジステアロイル-ホスファチジル-エタノールアミン(DSPE)、1,2-ジラウロイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン(DLPE)、1,2-ジエルコイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン(DEPE)、1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスホコリン(DPOC)、ホスファチジルセリン、スフィンゴ脂質、セレブロシド、ガングリオシド、16-O-モノメチルPE、16-O-ジメチルPE、18-1-トランスPE、l-ステアロイル-2-オレオイル-ホスファチジルエタノールアミン(SOPE)、又はこれらの混合物が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、本発明で使用するのに好適な脂質ナノ粒子は、DOPEを非カチオン性脂質成分として含む。他の実施形態では、本発明で使用するのに好適な脂質ナノ粒子は、DEPEを非カチオン性脂質成分として含む。
特定の実施形態では、非カチオン性脂質は、DSPC(1,2-ジステアロイル-sn-グリセロ-3-ホスホコリン)、DPPC(1,2-ジパルミトイル-sn-グリセロ-3-ホスホコリン)、DOPE(1,2-ジオレイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン)、DEPE 1,2-ジエルコイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン、DOPC(1,2-ジオレイル-sn-グリセロ-3-ホスホチジルコリン)、DPPE(1,2-ジパルミトイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン)、DMPE(1,2-ジミリストイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン)、及びDOPG(1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスホ-(1’-rac-グリセロール))から選択される。具体的な実施形態では、非カチオン性脂質は、DOPE及び/又はDSPCから選択される。
いくつかの実施形態では、非カチオン性脂質は、中性脂質、すなわち、LNP、組成物、医薬組成物が製剤化され、及び/又は投与される条件において正味の電荷を有さない脂質である。
コレステロール系脂質
いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、1つ以上のコレステロール系脂質を含む。コレステロール系脂質は、ナノ粒子内の脂質二重層構造に安定性を提供し得る。例えば、好適なコレステロール系カチオン性脂質には、例えば、DC-Chol(N,N-ジメチル-N-エチルカルボキサミドコレステロール)、l,4-ビス(3-N-オレイルアミノ-プロピル)ピペラジン(Gao,et al. Biochem.Biophys.Res.Comm.179,280(1991);Wolf et al. BioTechniques 23,139(1997);米国特許第5,744,335号明細書)、又は以下の構造を有する国際特許公開第2011/068810号パンフレットに開示されているとおりのイミダゾールコレステロールエステル(ICE)が挙げられる:
実施形態では、コレステロール系脂質は、コレステロールである。
PEG修飾脂質
いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、1つ以上のPEG化脂質を含む。PEG化脂質は、LNPの粒径及び安定性に対する制御を提供し得る。そのような成分を添加することにより、複雑な凝集が防止され、循環寿命を延ばし、標的組織への脂質-核酸医薬組成物の送達を増大させるための手段を提供し得る(Klibanov et al.,FEBS Letters(1990)268 (1):235-7)。これらの成分は、インビボで医薬組成物から迅速に交換されるように選択され得る(例えば、米国特許第5,885,613号明細書を参照されたい)。
例えば、単独で又は好ましくは移送媒体(例えば、脂質ナノ粒子)を含む他の脂質医薬組成物とともに組み合わされた、ポリエチレングリコール(PEG)修飾リン脂質及びN-オクタノイル-スフィンゴシン-1-[スクシニル(メトキシポリエチレングリコール)-2000](C8 PEG-2000セラミド)を含む誘導体化されたセラミド(PEG-CER)などの誘導体化された脂質の使用もまた本発明によって企図される。
企図されるPEG修飾脂質には、C~C20(例えば、C、C10、C12、C14、C16、又はC18)の長さのアルキル鎖を有する脂質に共有結合した長さが最大5kDaのポリエチレングリコール鎖が挙げられるが、それらに限定されない。いくつかの実施形態では、PEG修飾脂質又はPEG化脂質は、PEG化コレステロール又はPEG-2Kである。そのような成分の添加は、複雑な凝集を妨げる可能性があり、循環寿命を増大させ且つ脂質-核酸医薬組成物の標的組織への送達を増加させるための手段も提供し得るか(Klibanov et al.(1990)FEBS Letters,268(1):235-237)、又はそれらは、インビボで医薬組成物から迅速に交換されるように選択され得る(米国特許第5,885,613号明細書を参照されたい)。特に有用な交換し得る脂質は、より短いアシル鎖(例えば、C14又はC18)を有するPEG-セラミドである。
いくつかの実施形態では、PEG化脂質は、1,2-ジミリストイル-rac-グリセロ-3-メトキシポリエチレングリコール(DMG-PEG);1,2-ジステアロイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-ポリエチレングリコール(DSPE-PEG);1,2-ジラウロイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン-ポリエチレングリコール(DLPE-PEG);又は1,2-ジステアロイル-rac-グリセロ-ポリエチレングリコール(DSG-PEG)である。
PEGは、典型的には高分子量、例えば、2000~2400g/molを有する。いくつかの実施形態では、PEGは、PEG2000(又はPEG-2K)である。特定の実施形態では、PEG化脂質は、DMG-PEG2000、DSPE-PEG2000、DLPE-PEG2000、DSG-PEG2000、又はC8 PEG2000である。
本発明で使用するために好適なLNPには、典型的には、1,2-ジミリストイル-rac-グリセロ-3-メトキシポリエチレングリコール-2000(DMG-PEG2K)又は2-[(ポリエチレングリコール)-2000]-N,N-ジテトラデシルアセトアミド(ALC-0159)などのPEG修飾脂質が挙げられる。
いくつかの実施形態では、1つ以上のPEG修飾脂質は、モル比で総脂質の約4%を占める。いくつかの実施形態では、1つ以上のPEG修飾脂質は、モル比で総脂質の約5%を占める。いくつかの実施形態では、1種以上のPEG修飾脂質は、モル比によって総脂質の約6%を占める。肺送達などの特定の用途では、PEG修飾脂質成分がモル比で総脂質の約5%を占める脂質ナノ粒子が特に好適であることが分かった。
例示的な脂質製剤
本発明で使用するための典型的なLNPは、次の組み合わせ:カチオン性脂質、非カチオン性脂質、PEG修飾脂質及び任意選択によるコレステロール:cKK-E12、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;cKK-E10、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;OF-Deg-Lin、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;OF-02、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;C12-200、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;HGT4003、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;ICE、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;HGT4001、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;HGT4002、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;TL1-01D-DMA、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;TL1-04D-DMA、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;TL1-08D-DMA、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;TL1-10D-DMA、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;ICE、DOPE及びDMG-PEG2K;HGT4001、DOPE及びDMG-PEG2K;HGT4002、DOPE及びDMG-PEG2K;SY-3-E14-DMAPr、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;RL3-DMA-07D、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;RL2-DMP-07D、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;cHse-E-3-E10、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;cHse-E-3-E12、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2K;又はcDD-TE-4-E12、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2Kのうちの1つから構成され得る。具体的な実施形態では、LNPは、SY-3-E14-DMAPr、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2Kから選択され得る。他の具体的な実施形態では、LNPは、RL3-DMA-07D、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2Kから構成され得る。更に他の具体的な実施形態では、LNPは、RL2-DMP-07D、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2Kから構成され得る。更に他の具体的な実施形態では、LNPは、cHse-E-3-E10、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2Kから構成され得る。更に他の具体的な実施形態では、LNPは、cHse-E-3-E12、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2Kから構成され得る。更に他の具体的な実施形態では、LNPは、cDD-TE-4-E12、DOPE、コレステロール及びDMG-PEG2Kから構成され得る。
カチオン性脂質、PEG化脂質、コレステロール系脂質、及び非カチオン性脂質のモル比は、A:B:C:D(ここで、A+B+C+D=100%)である。いくつかの実施形態では、総脂質に対するLNP中のカチオン性脂質のモル比(すなわち、A)は、35~45%(例えば、38~42%、例えば、40%)である。いくつかの実施形態では、総脂質に対するPEG化脂質成分のモル比(すなわち、B)は、0.25~2.75%(例えば、1~2%、例えば、1.5%)である。いくつかの実施形態では、総脂質に対するコレステロール系脂質のモル比(すなわち、C)は、20~35%(例えば、27~30%、例えば、28.5%)である。いくつかの実施形態では、総脂質に対する非カチオン性脂質のモル比(すなわち、D)は、25~35%(例えば、28~32%、例えば、30%)である。いくつかの実施形態では、(PEG化脂質+コレステロール)成分は、ヘルパー脂質と同じモル量を有する。いくつかの実施形態では、LNPは、1超である、カチオン性脂質とヘルパー脂質とのモル比を含有する。
いくつかの実施形態では、カチオン性脂質(例えば、cKK-E12、cKK-E10、OF-Deg-Lin、OF-02、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10、TL1-01D-DMA、TL1-04D-DMA、TL1-08D-DMA、TL1-10D-DMA、ICE、HGT4001、及び/又はHGT4002)は、モル比で脂質ナノ粒子の約30~60%(例えば、約30~55%、約30~50%、約30~45%、約30~40%、約35~50%、約35~45%、又は約35~40%)を占める。いくつかの実施形態では、カチオン性脂質(例えば、cKK-E12、cKK-E10、OF-Deg-Lin、OF-02、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10、TL1-01D-DMA、TL1-04D-DMA、TL1-08D-DMA、TL1-10D-DMA、ICE、HGT4001、及び/又はHGT4002)のパーセンテージは、モル比で脂質ナノ粒子の約30%超、約35%超、約40%超、約45%、約50%超、約55%超、又は約60%超である。
いくつかの実施形態では、カチオン性脂質と非カチオン性脂質とコレステロール系脂質とPEG修飾脂質との比は、モル比で約30~60:25~35:20~30:1~15であり得る。いくつかの実施形態では、カチオン性脂質と非カチオン性脂質とコレステロール系脂質とPEG修飾脂質との比は、モル比でおよそ40:30:20:10である。いくつかの実施形態では、カチオン性脂質と非カチオン性脂質とコレステロール系脂質とPEG修飾脂質との比は、モル比でおよそ40:30:25:5である。いくつかの実施形態では、カチオン性脂質と非カチオン性脂質とコレステロール系脂質とPEG修飾脂質との比は、モル比でおよそ40:32:25:3である。いくつかの実施形態では、カチオン性脂質と非カチオン性脂質とコレステロール系脂質とPEG修飾脂質との比は、モル比でおよそ50:25:20:5である。
ある特定の実施形態では、LNPは、35%~55%のモル比のカチオン性脂質(例えば、OF-02、cKK-E10、又はGL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10);5%~40%のモル比の非カチオン性脂質(例えば、DOPE);20%~45%のモル比のコレステロール系脂質(例えば、コレステロール);及び1%~2%のモル比のPEG修飾脂質(例えば、DMG-PEG2K)を含む。
いくつかの実施形態では、カチオン性脂質と非カチオン性脂質とコレステロール系脂質とPEG修飾脂質のモル比は、40:30:28.5:1.5である。いくつかの実施形態では、カチオン性脂質と非カチオン性脂質とコレステロール系脂質とPEG修飾脂質のモル比は、46.3:9.4:42.7:1.6である。いくつかの実施形態では、カチオン性脂質と非カチオン性脂質とコレステロール系脂質とPEG修飾脂質のモル比は、50:10:38.5:1.5である。
いくつかの実施形態では、LNPは、40%のモル比のOF-02、c-KK-E10、又はGL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10;30%のモル比のDOPE;28.5%のモル比のコレステロール;及び1.5%のモル比のDMG-PEG2Kを含む。いくつかの実施形態では、LNPは、46.3%のモル比のALC-0315;9.4%のモル比のDSPC;42.7%のモル比のコレステロール;及び1.6%のモル比のALC-0159を含む。いくつかの実施形態では、LNPは、50%のモル比のSM-102;10%のモル比のDSPC;38.5%のモル比のコレステロール;及び1.5%のモル比のDMG-PEG2Kを含む。そのような脂質ナノ粒子は、筋肉内投与によるmRNAの送達に特に好適である。
本発明での使用に好適な典型的な三成分脂質ナノ粒子において、カチオン性脂質と非カチオン性脂質とPEG修飾脂質とのモル比は、それぞれ約55~65:30~40:1~15であり得る。いくつかの実施形態では、カチオン性脂質(例えば、ステロール系脂質)と非カチオン性脂質(例えば、DOPE又はDEPE)とPEG修飾脂質(例えば、DMG-PEG2K)の60:35:5のモル比が、例えば、噴霧による脂質ナノ粒子の肺送達に特に好適である。
1つ以上のLNP
いくつかの実施形態では、LNPは、複数のタンパク質、例えば2、3、4、5、6、7、8、9、10個、又はそれ以上のタンパク質をコードするmRNAを担持し得る。例えば、LNPは、複数のインフルエンザウイルスタンパク質に翻訳され得るポリシストロニックなmRNA(例えば、バイシストロニックなmRNA)を担持し得る(例えば、各タンパク質コード配列は、IRESをコードするヌクレオチド配列又は2Aペプチドなどの自己切断ペプチドによって分離される)。典型的には、ポリシストロニックなmRNAは、3つ以下又は4つ以下のタンパク質をコードする。
いくつかの実施形態では、1つのmRNAは、HAタンパク質及びNAタンパク質をコードする。例えば、1つ以上のHAタンパク質及び1つ以上のNAタンパク質が、同じmRNAによってコードされてもよい。具体的な実施形態では、HA及びNAタンパク質の両方をコードするmRNAは、M1タンパク質をコードするmRNAとは別個である。
いくつかの実施形態では、1つのmRNAは、A型インフルエンザ株からの1つ以上のHAタンパク質及び1つ以上のNAタンパク質をコードする。いくつかの実施形態では、A型インフルエンザのコードされたHA及びNAタンパク質は、同じmRNAによってコードされる。いくつかの実施形態では、mRNAは、B型インフルエンザ株からの1つ以上のHAタンパク質及び1つ以上のNAタンパク質をコードする。いくつかの実施形態では、B型インフルエンザのコードされたHA及びNAタンパク質は、同じmRNAによってコードされる。一実施形態では、1つ以上のHAタンパク質及び1つ以上のNAタンパク質は、A型インフルエンザ株とB型インフルエンザ株との組み合わせからのものであり、同じmRNAからコードされる。
いくつかの実施形態では、LNPは、第1のHAタンパク質及び第1のNAタンパク質をコードする第1のmRNAと、第2のHAタンパク質及び第2のNAタンパク質をコードする第2のmRNAと、M1タンパク質をコードする第3のmRNAとを含む。典型的には、第1のHAタンパク質及び第1のNAタンパク質は、第1のインフルエンザウイルスからのものであり(例えば、インフルエンザA型からのH1及びN1)、第2のHAタンパク質及び第2のNAタンパク質は、第2のインフルエンザウイルスからのものである(例えば、インフルエンザA型からのH3及びN2)。いくつかの実施形態では、第1及び第2のインフルエンザウイルスは、異なる亜型のA型インフルエンザウイルスである。いくつかの実施形態では、第1及び第2のウイルスは、異なる系統のB型インフルエンザウイルスである。
いくつかの実施形態では、LNPは、第3のインフルエンザウイルスからの第3のHAタンパク質及び第3のNAタンパク質をコードする第4のmRNAと、第4のインフルエンザウイルスからの第4のHAタンパク質及び第4のNAタンパク質をコードする第5のmRNAとを更に含む。第3のインフルエンザウイルスは、典型的には、山形系統のウイルスのB型インフルエンザウイルスであり、第4のインフルエンザウイルスはビクトリア系統からのものである。
いくつかの実施形態では、LNPは、少なくとも第1のHAタンパク質及び第2のHAタンパク質をコードする第1のmRNAと、少なくとも第1のNAタンパク質及び第2のNAタンパク質をコードする第2のmRNAと、M1タンパク質をコードする第3のmRNAとを含む。典型的には、第1のHAタンパク質及び第2のHAタンパク質(並びに任意の更なるHAタンパク質)は、異なる亜型(例えば、A型インフルエンザからのH1及びH3)並びに/又は系統からのものであり、第1のNAタンパク質及び第2のNAタンパク質(並びに任意の更なるNAタンパク質)は、異なる亜型(例えば、A型インフルエンザからのN1及びN2)並びに/又は系統からのものである。
いくつかの実施形態では、LNPは、第3のインフルエンザウイルスからの第3のHAタンパク質及び第3のNAタンパク質をコードする第4のmRNAを含む。いくつかの実施形態では、第1のインフルエンザウイルスはH1N1 A型インフルエンザウイルスであり、第2のインフルエンザウイルスはH3N2インフルエンザウイルスであり、第3のインフルエンザウイルスはB型インフルエンザウイルス(例えば、インフルエンザB/山形又はインフルエンザB/ビクトリア)である。
いくつかの実施形態では、LNPは、第4のインフルエンザウイルスからの第4のHAタンパク質及び第4のNAタンパク質をコードする第5のmRNAを含む。いくつかの実施形態では、第4のインフルエンザウイルスは、第3のインフルエンザウイルスのものとは異なる系統からのB型インフルエンザウイルスである。
いくつかの実施形態では、第1、第2、及び第3のmRNAは第1のLNP中に封入され、第4及び第5のmRNAは第2のLNP中に封入される。第2のLNPは、第6のmRNAを追加的に含み得る。いくつかの実施形態では、第6のmRNAは、M1タンパク質をコードする。いくつかの実施形態では、第6のmRNAによってコードされるM1タンパク質は、B型インフルエンザウイルスからのものである。
いくつかの実施形態では、M1、HA、及びNAタンパク質は、各々別個のmRNAによってコードされ、全てのmRNAが単一のLNP中に封入される。例えば、LNPは、(i)2つ以上のHAタンパク質、及び/又は(ii)2つ以上のNAタンパク質、又は(iii)少なくとも1つのHAタンパク質及び少なくとも1つのNAタンパク質をコードする3、4、5、6、7、8、9個、又はそれ以上のmRNA分子を含んでもよい。いくつかの実施形態では、LNPは、HAタンパク質(例えば、H1及びH3)をコードする2つのmRNAと、NAタンパク質(例えば、N1及びN2)をコードする2つのmRNAと、M1タンパク質をコードする1つのmRNAとを含む。いくつかの実施形態では、LNPは、HAタンパク質(例えば、H1、H3、及びB型インフルエンザのHA)をコードする3つのmRNAと、NAタンパク質(例えば、(N1、N2、及びB型インフルエンザのHA)をコードする3つのmRNAと、M1タンパク質をコードする1つのmRNAとを含む。いくつかの実施形態では、LNPは、HAタンパク質(例えば、2つのA型インフルエンザのHA及び2つのB型インフルエンザのHA)をコードする4つのmRNAと、NAタンパク質(例えば、2つのA型インフルエンザのHA及び2つのB型インフルエンザのHA)をコードする4つのmRNAと、M1タンパク質をコードする1つのmRNAとを含む。
いくつかの実施形態では、LNPは、A型インフルエンザのHAタンパク質(例えば、H1又はH3)をコードする少なくとも1つのmRNAと、A型インフルエンザのNAタンパク質(例えば、N1又はN2)をコードする少なくとも1つのmRNAと、M1タンパク質をコードする1つのmRAとを含み、HA mRNA、NA mRNA及びM1 mRNAは、40~50:10~50:30~50(例えば、40:10:50、40:40:50、又は50:10:30)のモル比で存在する。いくつかの実施形態では、LNPは、B型インフルエンザのHAタンパク質(例えば、山形又はビクトリア)をコードする少なくとも1つのmRNAと、B型インフルエンザのNAタンパク質(例えば、山形又はビクトリア)をコードする少なくとも1つのmRNAと、M1タンパク質をコードする1つのmRNAとを含み、A mRNA、NA mRNA及びM1 mRNAは、40~50:10~50:30~50(例えば、40:10:50。40:40:50、又は50:10:30)のモル比で存在する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組成物は、A型インフルエンザのHAタンパク質(例えば、H1又はH3)をコードする少なくとも1つのmRNAと、A型インフルエンザのNAタンパク質(例えば、N1又はN2)をコードする少なくとも1つのmRNAと、M1タンパク質をコードする1つのmRNAとを含む第1のLNPであって、HA mRNA、NA mRNA及びM1 mRNAが、40~50:10~50:30~50(例えば、40:10:50。40:40:50、又は50:10:30)のモル比で存在する、第1のLNPと、B型インフルエンザのHAタンパク質(例えば、山形又はビクトリア)をコードする少なくとも1つのmRNAと、B型インフルエンザのNAタンパク質(例えば、山形又はビクトリア)をコードする少なくとも1つのmRNAと、M1タンパク質をコードする1つのmRNAとを含む第2のLNPであって、HA mRNA、NA mRNA及びM1 mRNAが、40~50:10~50:30~50(例えば、40:10:50、40:40:50、又は50:10:30)のモル比で存在する、第2のLNPとを含む。
いくつかの実施形態では、LNPは、A型インフルエンザのHAタンパク質(例えば、H1及びH3)をコードする2つのmRNAと、A型インフルエンザのNAタンパク質(例えば、(N1及びN2)をコードする2つのmRNAと、M1タンパク質をコードする1つのmRNAとを含み、HA mRNA及びNA mRNAが、40:10若しくは50:10のモル比で、又は等しいモル比で存在する。いくつかの実施形態では、LNPは、B型インフルエンザのHAタンパク質(例えば、H1及びH3)をコードする2つのmRNAと、B型インフルエンザのNAタンパク質(例えば、(N1及びN2)をコードする2つのmRNAと、M1タンパク質をコードする1つのmRNAとを含み、HA mRNA及びNA mRNAが、40:10若しくは50:10のモル比で、又は等しいモル比で存在する。
いくつかの実施形態では、M1、HA、及びNAタンパク質は、各々別個のmRNAによってコードされ、各mRNAはLNP中に別個に封入される。
いくつかの実施形態では、同じインフルエンザウイルスに由来するmRNAのセットは、単一のLNP中で製剤化され得る。例えば、第1のA型インフルエンザウイルスからのHA及びNAタンパク質をコードするmRNAの第1のセットは、第1のLNP中に封入され得る。第2のA型インフルエンザウイルスからのHA及びNAタンパク質をコードするmRNAの第2のセットは、第2のLNP中に封入され得る。B型インフルエンザウイルスからのHA及びNAタンパク質をコードするmRNAの第3のセットは、第3のLNP中に封入される。mRNAの各セットは、HAタンパク質をコードするmRNAと、NAタンパク質をコードするmRNAと、M1タンパク質をコードするmRNAとを含み得る。M1タンパク質は、各セットについて同じであってもよい。いくつかの実施形態では、HA及びNAタンパク質は、同じmRNAによってコードされ得る。第1、第2及び第3のLNPは、各々同じ脂質組成を有し得る。いくつかの実施形態では、第1、第2及び第3のLNPは、異なる脂質組成を有する。
いくつかの実施形態では、第3のセットにおけるmRNAによってコードされるHA及びNAタンパク質のものとは異なる系統のB型インフルエンザからのHA及びNAタンパク質をコードするmRNAの第4のセットは、第4のLNP中に封入される。第1、第2、第3及び第4のLNPは、各々同じ脂質組成を有し得る。いくつかの実施形態では、第1、第2、第3及び第4のLNPは、異なる脂質組成を有する。
いくつかの状況では、第1及び第2のA型インフルエンザからのHA及びNAタンパク質をコードするmRNAを第1のLNP中に封入し、且つ1つ以上のB型インフルエンザからのHA及びNAタンパク質をコードするmRNAを第2のLNP中に封入することが便利であり得る。したがって、いくつかの実施形態では、mRNAの第1及び第2のセットが第1のLNP中に封入され、mRNAの第3のセット及び任意選択的に第4のセットが第2のLNP中に封入される。第1及び第2のLNPは、同じ脂質組成を有し得る。いくつかの実施形態では、第1及び第2のLNPは、異なる脂質組成を有する。
ポリマー
いくつかの実施形態では、好適なLNP送達ビヒクルは、単独で又は本明細書に記載の様々な脂質を含む他の担体と組み合わせて、担体としてポリマーを使用して製剤化される。したがって、いくつかの実施形態では、LNPは、本明細書で使用される場合、ポリマーを含むナノ粒子も包含する。好適なポリマーとしては、例えば、ポリアクリレート、ポリアルキシアノアクリレート、ポリラクチド、ポリラクチド-ポリグリコリドコポリマー、ポリカプロラクトン、デキストラン、アルブミン、ゼラチン、アルギネート、コラーゲン、キトサン、シクロデキストリン、プロタミン、PEG化プロタミン、PLL、PEG化PLL及びポリエチレンイミン(PEI)が挙げられ得る。PEIが存在するとき、それは、10~40kDaの範囲の分子量の分岐PEI、例えば、25kDa分岐PEI(Sigma #408727)であり得る。
組成物
いくつかの実施形態では、本発明による組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、約0.5mg/mL~約1.0mg/mLの範囲の濃度のmRNAを含む。いくつかの実施形態では、mRNAは、少なくとも0.5mg/mLの濃度である。いくつかの実施形態では、mRNAは、少なくとも0.6mg/mLの濃度である。いくつかの実施形態では、mRNAは、少なくとも0.7mg/mLの濃度である。いくつかの実施形態では、mRNAは、少なくとも0.8mg/mLの濃度である。いくつかの実施形態では、mRNAは、少なくとも0.9mg/mLの濃度である。いくつかの実施形態では、mRNAは、少なくとも1.0mg/mLの濃度である。典型的な実施形態では、mRNAは、約0.6mg/mL~約0.8mg/mLの濃度である。
典型的には、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)中のmRNAは、LNP中に封入される。mRNA又はそれを封入するLNPを安定化させるため、又はmRNAのインビボ発現を増強させるために、本発明の組成物は、1つ以上の担体、安定化試薬又は他の賦形剤とともに製剤化され得る。そのような組成物は、医薬組成物であり得、したがって、それらは、1つ以上の薬学的に許容される賦形剤を含み得る。1つ以上の薬学的に許容される賦形剤は、緩衝液、糖、塩、界面活性剤又はそれらの組み合わせから選択され得る。
薬学的に許容される賦形剤
いくつかの実施形態では、医薬組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、希釈剤とともに製剤化され得る。いくつかの実施形態では、希釈剤は、エチレングリコール、グリセロール、プロピレングリコール、スクロース、トレハロース、又はそれらの組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、希釈剤は、二糖(例えば、トレハロース又はスクロース)である。いくつかの実施形態では、製剤は、1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%又は20%の希釈剤を含む。
いくつかの実施形態では、LNPは、二糖を含む水溶液中に懸濁される。本明細書で使用するために好適な二糖には、トレハロース及びスクロースが挙げられる。例えば、いくつかの実施形態では、LNPは、トレハロース、例えば、水中10%(w/v)のトレハロースを含む水溶液中に懸濁される。他の実施形態では、LNPは、スクロース、例えば、水中10%(w/v)のスクロースを含む水溶液中に懸濁される。
いくつかの実施形態では、水溶液は、緩衝液、塩、界面活性剤、又はそれらの組み合わせを更に含む。
いくつかの実施形態では、塩は、NaCl、KCl、及びCaClからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、塩は、NaClである。いくつかの実施形態では、塩は、KClである。いくつかの実施形態では、塩は、CaClである。いくつかの実施形態では、塩は、KClとNaClとの組み合わせである。
いくつかの実施形態では、緩衝液は、リン酸緩衝液、クエン酸緩衝液、イミダゾール緩衝液、ヒスチジン緩衝液、及びグッド緩衝液からなる群から選択される。したがって、いくつかの実施形態では、緩衝液は、リン酸緩衝液である。いくつかの実施形態では、緩衝液は、クエン酸緩衝液である。いくつかの実施形態では、緩衝液は、イミダゾール緩衝液である。いくつかの実施形態では、緩衝液は、ヒスチジン緩衝液である。いくつかの実施形態では、緩衝液は、グッド緩衝液である。いくつかの実施形態では、グッド緩衝液は、トリス緩衝液又はHEPES緩衝液である。
特定の実施形態では、緩衝液は、リン酸緩衝液(例えば、クエン酸-リン酸緩衝液)、トリス緩衝液(例えば、TrisHCl)、又はイミダゾール緩衝液である。いくつかの実施形態では、緩衝液は、酢酸緩衝液であるか、又はそれを含む。
いくつかの実施形態では、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、緩衝液及び塩(典型的には、二糖又は任意選択的にプロピレングリコールなどの好適な希釈剤に加えて)を含む。いくつかの実施形態では、緩衝液及び塩の総濃度は、約40mMのトリス緩衝液及び75~125mMのNaCl、約50mMのトリス緩衝液及び50mM~100mMのNaCl、約100mMのトリス緩衝液及び約100mM~200mMのNaCl、約40mMのイミダゾール及び約100mM~125mMのNaCl、並びに約50mMのイミダゾール及び約75mM~100mMのNaClから選択される。
いくつかの実施形態では、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、緩衝液(例えば、リン酸又はトリス)、塩(例えば、KCl若しくはNaCl、又はその両方)、及び糖(例えば、スクロース又はトレハロースなどの二糖)を含む。特定の実施形態では、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、緩衝液、塩及び糖を含む水溶液(例えば、注射用水を含む)である。追加の賦形剤には、(例えば、組成物のpHを調製するための)NaOH又はHClが含まれ得る。
脂質ナノ粒子製剤
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)中のLNPの大部分、すなわちLNPの約50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、又は99%超は、約150nm(例えば、約145nm、約140nm、約135nm、約130nm、約125nm、約120nm、約115nm、約110nm、約105nm、約100nm、約95nm、約90nm、約85nm、又は約80nm)のサイズを有する。いくつかの実施形態では、本発明の組成物中のLNPは、約150nm以下(例えば、約145nm以下、約140nm以下、約135nm以下、約130nm以下、約125nm以下、約120nm以下、約115nm以下、約110nm以下、約105nm以下、約100nm以下、約95nm以下、約90nm以下、約85nm以下、又は約80nm以下)のサイズを有する。具体的な実施形態では、LNPは、70nm~約150nmのサイズである。
いくつかの実施形態では、本発明により提供される組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)中のLNPの約70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%超は、約40~90nm(例えば、約45~85nm、約50~80nm、約55~75nm、約60~70nm)の範囲のサイズを有する。いくつかの実施形態では、LNPは、約40~90nm(例えば、約45~85nm、約50~80nm、約55~75nm、約60~70nm)の範囲のサイズを有する。約50~70nm(例えば、55~65nm)の平均サイズを有するLNPを有する組成物は、噴霧又は吸入による送達に特に好適であり得る。
いくつかの実施形態では、本発明によって提供される医薬組成物中の脂質ナノ粒子の分散度、又は分子のサイズの不均一性の尺度(多分散指数;PDI)は、約0.5未満である。いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、約0.5未満のPDIを有する。いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、約0.4未満のPDIを有する。いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、約0.3未満のPDIを有する。いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、約0.28未満のPDIを有する。いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、約0.25未満のPDIを有する。いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、約0.23未満のPDIを有する。いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、約0.20未満のPDIを有する。いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、約0.18未満のPDIを有する。いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、約0.16未満のPDIを有する。いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、約0.14未満のPDIを有する。いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、約0.12未満のPDIを有する。いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、約0.10未満のPDIを有する。いくつかの実施形態では、脂質ナノ粒子は、約0.08未満のPDIを有する。
いくつかの実施形態では、LNPは、約80%を超えるmRNAカプセル封入効率を有する。いくつかの実施形態では、LNPは、約85%を超えるmRNAカプセル封入効率を有する。いくつかの実施形態では、LNPは、約90%を超えるmRNAカプセル封入効率を有する。いくつかの実施形態では、LNPは、約92%を超えるmRNAカプセル封入効率を有する。いくつかの実施形態では、LNPは、約95%を超えるmRNAカプセル封入効率を有する。いくつかの実施形態では、LNPは、約98%を超えるmRNAカプセル封入効率を有する。いくつかの実施形態では、LNPは、約99%を超えるmRNAカプセル封入効率を有する。典型的には、本発明で使用するためのLNPは、少なくとも90%~95%のmRNAカプセル封入効率を有する。
治療有効量
本発明によるmRNAは、本明細書に提供される医薬組成物、免疫原性組成物又はワクチンにおいて治療有効量で提供される。本明細書で使用される場合、用語「治療有効量」は主として、本発明の医薬組成物中に含有される治療剤の総量に基づいて決定される。一般に、治療有効量は、対象に意味のある利益を達成するのに十分なものである。
いくつかの実施形態では、単一バイアル用量は、1~50μgのmRNA(例えば、一価又は多価)を含有する。例えば、単回用量バイアル又はシリンジは、典型的には、筋肉内注射により、又は粘膜送達により投与される、約2.5μg、約5μg、約7.5μg、約10μg、約12.5μg、又は約15μgのmRNAを含有し得る。
パッケージング
本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、非経口(例えば、筋肉内、皮内若しくは皮下)投与又は粘膜(例えば、鼻咽頭、肺若しくは鼻腔内)投与のために包装され得る。ワクチン組成物は、即時製剤の形態、例えば、使用直前に生理学的緩衝液(例えば、PBS)で再構成する必要がある凍結乾燥形態であり得る。いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、水溶液又は冷凍水溶液の形態で提供することができ、再構成なしで対象に直接投与することができる(予め冷凍されている場合には解凍後)。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物は、別個のmRNA、例えば、HAタンパク質をコードする1つのmRNA、NAタンパク質をコードする1つのmRNA、及びM1タンパク質をコードする1つのmRNAを含む。いくつかの実施形態では、HA mRNA、NA mRNA及びM1 mRNAは、1:1:2の重量比で提供される。いくつかの実施形態では、HA mRNA、NA mRNA及びM1 mRNAは、同じ脂質ナノ粒子中に封入される。
いくつかの実施形態では、組成物は多価であり、例えば、各々が異なるインフルエンザウイルスからのHA mRNA、NA mRNA、及びM1 mRNAを含む複数のセットを含む。例えば、四価組成物は、mRNAの4つのセット、例えばA型インフルエンザウイルス(H1N1)からのmRNAの第1のセット、A型インフルエンザウイルス(H3N2)からのmRNAの第2のセット、B型インフルエンザウイルス(B/山形)からのmRNAの第3のセット、及びB型インフルエンザウイルス(B/ビクトリア)からの第4のセットを含み得る。mRNAの各セットは、同じ脂質ナノ粒子中に封入され得る。いくつかの実施形態では、各セット中のHA mRNA、NA mRNA及びM1 mRNAは、1:1:2の重量比で提供される。
したがって、本開示は、単一容器中で本発明の組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)を提供するか、又はある容器中で組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)を提供し、別の容器中で再構成用の生理学的緩衝液を提供する製造品、例えばキットを提供する。容器は、単回使用投与量又は複数回使用投与量を含有し得る。容器は、前処理されたガラスバイアル又はアンプルであり得る。製造品は、使用説明書も含み得る。
特定の実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、筋肉内注射での使用のために提供される。組成物は対象に、例えば、対象の上腕の三角筋で注射することができる。いくつかの実施形態では、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、充填済みシリンジ又は注射器(例えば、シングルチャンバー型又はマルチチャンバー型)中で提供される。いくつかの実施形態では、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、粘膜投与による(例えば、鼻腔内スプレーとして、又は舌下で)使用のために提供される。いくつかの実施形態では、組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、吸入による(例えば、肺送達のための)使用のために提供され、充填済みポンプ、エアロゾル発生器、又は吸入器で提供される。
ある特定の実施形態では、本発明の組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)は、皮膚注射、例えば、皮膚の表皮、真皮、又は皮下における使用のために提供される。いくつかの実施形態では、組成物は、針(例えば、表皮針、真皮針又は皮下針)、無針デバイス、マイクロニードルデバイス、又はマイクロプロジェクションアレイデバイスなどの皮膚注射に好適なデバイス内に提供される。皮膚注射に適したマイクロニードル又はマイクロプロジェクションアレイデバイスの例は、米国特許出願公開第20230270842A1号明細書、米国特許出願公開第20220339416A1号明細書、米国特許出願公開第20210085598A1号明細書、米国特許出願公開第20200246450A1号明細書、米国特許出願公開第20220143376A1号明細書、米国特許出願公開第20180264244A1号明細書、米国特許出願公開第20180263641A1号明細書、米国特許出願公開第20110245776A1号明細書に記載されている。
治療的使用
いくつかの実施形態では、本発明は、対象において免疫応答を誘発させる方法であって、有効量の本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)を対象に投与することを含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、対象において免疫応答を誘発させるための本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、医薬品を製造する方法における本発明の組成物の使用であって、組成物が、対象において免疫応答を誘発させるための(例えば、誘発させるために製剤化される)ものである。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、対象における1つ以上のインフルエンザウイルスに対する免疫応答を誘発させる。いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、A型インフルエンザウイルスに対する免疫応答を誘発させる。いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、B型インフルエンザウイルスに対する免疫応答を誘発させる。いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、A型インフルエンザウイルス及びB型インフルエンザウイルスに対する免疫応答を誘発させる。いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、異なる亜型及び/又は系統のインフルエンザウイルスに対する免疫応答を誘発させる。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、予防的に投与される。いくつかの実施形態では、本発明は、対象におけるインフルエンザ感染の重症度を低下させる方法であって、有効量の本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)を対象に投与することを含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、対象におけるインフルエンザ感染の1つ以上の症状の重症度を低下させるのに使用するための、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、医薬品を製造する方法における本発明の組成物の使用であって、組成物が、対象におけるインフルエンザ感染の1つ以上の症状の重症度を低下させるための(例えば、そのために製剤化される)ものである、使用を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、A型インフルエンザウイルス及び/又はB型インフルエンザウイルスによる感染の1つ以上の症状の重症度を低下させる方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、異なる亜型及び/又は系統のインフルエンザウイルスによる感染の1つ以上の症状の重症度を低下させる方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象におけるインフルエンザ感染を予防する方法であって、有効量の本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)を対象に投与することを含む方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、対象におけるインフルエンザ感染の予防に使用するための本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、医薬品を製造する方法における本発明の組成物の使用であって、組成物が、対象におけるインフルエンザ感染を予防するための(例えば、そのために製剤化される)ものである、使用を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、A型インフルエンザウイルス及び/又はB型インフルエンザウイルスによる感染を予防する方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、異なる亜型及び/又は系統のインフルエンザウイルスによる感染を予防する方法を提供する。
様々な実施形態では、本明細書に提供される免疫化の方法は、1つ以上のインフルエンザウイルスに対する広範な中和免疫応答を誘発させる。いくつかの実施形態では、免疫応答は、抗体応答を含む。したがって、様々な実施形態では、本明細書に記載の組成物は、様々な型のインフルエンザウイルスに対して広範な交差防御を提供し得る。いくつかの実施形態では、本組成物は、鳥、ブタ、季節性及び/又はパンデミックインフルエンザウイルスに対する交差防御を提供する。
いくつかの実施形態では、組成物は、1つ以上のA型インフルエンザ若しくはB型インフルエンザ及び/又はA型インフルエンザの1つ以上の亜型若しくはB型インフルエンザの系統、特に季節性株に対する交差防御を提供する。いくつかの実施形態では、本組成物は、季節性インフルエンザウイルスの複数の株に対する交差防御を提供する。例えば、いくつかの実施形態では、本組成物は、季節性A型インフルエンザH1亜型ウイルス(例えば、H1N1)、季節性A型インフルエンザH3亜型ウイルス(例えば、H3N2)、及び1つ又は両方の循環B型インフルエンザウイルス(例えば、インフルエンザB/山形及び/又はインフルエンザB/ビクトリア)に対する交差防御を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明の方法は、1つ以上のパンデミックインフルエンザ株に対して改善された免疫応答を誘発させることができる。パンデミック亜型としては、特に、H1N1、H5N1、H2N2、H3N2、H9N2、H7N7、H7N3、H7N9及びH10N7亜型が挙げられる。
いくつかの実施形態では、本発明の方法は、1つ以上のブタインフルエンザ株に対する改善された免疫応答を誘発させることができる。
いくつかの実施形態では、本発明の方法は、1つ以上の鳥インフルエンザ株に対する改善された免疫応答を誘発させることができる。例示的な鳥株としては、H5N1、H7N3、H7N7、H7N9、及びH9N2が挙げられるが、これらに限定されない。追加のインフルエンザパンデミック、季節性、鳥及び/又はブタ株が、当該技術分野において公知である。
本発明のいくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、免疫原性組成物又はワクチン)の投与は、A型株及び/又はB型株によって引き起こされるインフルエンザ感染に対する免疫を提供する。いくつかの実施形態では、投与は、同じ型のインフルエンザ(例えば、A型又はB型)の複数の亜型(例えば、H1N1及びH3N2)又は系統(ビクトリア及び山形)によって引き起こされる感染に対する免疫を提供する。例えば、いくつかの実施形態では、2つ以上のA型インフルエンザの亜型に対する免疫が提供される。いくつかの実施形態では、1つ以上の(例えば、2つの)A型インフルエンザの亜型(例えば、H1N1及びH3N2)並びにB型インフルエンザの1つ以上の系統(例えば、ビクトリア及び/又は山形)に対して免疫が提供される。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、季節性及び/若しくはパンデミックインフルエンザワクチンとして、又は長期的な(複数季節)防御を付与することを意図したインフルエンザワクチン接種レジメンの一部として使用される。
本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、それを必要とする対象に、治療有効量、すなわち、十分な時間(例えば、1年、2年、5年、10年、又は生涯)にわたって標的病原体に対する十分な免疫防御を提供する量で投与され得る。十分な免疫防御は、例えば、病原体による感染に伴う症状の予防又は緩和であり得る。いくつかの実施形態では、所望の治療効果を達成するためにワクチンの複数回用量(例えば、2回用量)が、それを必要とする対象に注射される。用量(例えば、初回用量及び追加用量)は、例えば、1週間、2週間、3週間、4週間、1ヶ月、2ヶ月、3ヶ月、4ヶ月、5ヶ月、6ヶ月、1年、2年、5年、又は10年の間隔で分けられ得る。
代替的な実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、インフルエンザ症状及び/又は対象がインフルエンザ感染を有することが確認された後に投与される。いくつかの実施形態では、対象は、インフルエンザ感染に罹患しているか、又は罹患しやすい。いくつかの実施形態では、対象が、インフルエンザ感染に一般的に関連する1つ以上の症状を示している場合に、対象はインフルエンザ感染に罹患していると見なされる。
いくつかの実施形態では、対象は、インフルエンザウイルスに曝露されていると分かっているか、又は曝露されていると考えられている。いくつかの実施形態では、対象が、インフルエンザウイルスに曝露されていると分かっているか又は曝露されていると考えられている場合、対象は、インフルエンザ感染に罹患しやすいと見なされる。いくつかの実施形態では、対象が、インフルエンザウイルスに感染していると分かっているか又は疑われる他の個体と接触している場合、及び/又は対象がインフルエンザ感染が流行していることが知られているか又はそのように考えられる地域に対象が存在するか若しくは存在したことがある場合、対象はインフルエンザウイルスに曝露されていることが分かっているか又は曝露されていると考えられる。
いくつかの実施形態では、本発明の組成物(例えば、本発明の免疫原性組成物又はワクチン)は、単回用量として、例えば、筋肉内投与又は粘膜送達によって投与される。いくつかの実施形態では、追加用量は、初回投与後約1年以上後に投与される。いくつかの実施形態では、追加用量は、5年後に投与される。
対象
いくつかの実施形態では、対象は、ヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、健康である。ある特定の実施形態では、対象は、成人、青年又は乳児である。
いくつかの実施形態では、対象は、インフルエンザウイルスによる感染から重篤な合併症を発症するリスクが高い年齢を有する。いくつかの実施形態では、ヒト対象は、生後6ヶ月未満である。いくつかの実施形態では、ヒト対象は、2歳未満である。いくつかの実施形態では、ヒト対象は、5歳未満である。いくつかの実施形態では、ヒト対象は、55歳以上、例えば60歳以上、65歳以上、又は70歳以上である。いくつかの実施形態では、対象は、少なくとも65歳である。
いくつかの実施形態では、対象は、インフルエンザウイルスによる感染から重篤な合併症を発症するリスクがより高い状態を有する。いくつかの実施形態では、対象は、妊婦である。いくつかの実施形態では、対象は、肺の病態(例えば、慢性肺疾患)に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、喘息に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、COPDに罹患している。
いくつかの実施形態では、対象は、老人ホーム又は長期介護施設に住んでいる。
いくつかの実施形態では、対象は、非ヒト哺乳動物である。いくつかの実施形態では、対象は、家畜又はペット(例えば、イヌ、ネコ、ヒツジ、ウシ、及び/又はブタ)である。いくつかの実施形態では、対象は、非ヒト霊長類である。いくつかの実施形態では、対象は、鳥類(例えば、ニワトリ)である。
以下の実施例は、あくまでも例示目的で含めるものであり、本発明の範囲を限定することは意図されない。
実施例1:mRNAのインビトロ転写
この実施例は、インフルエンザA/H1N1及びA/H3N2ウイルスからのヘマグルチニン(HA)、ノイラミニダーゼ(NA)及びマトリックス1(M1)タンパク質をコードするメッセンジャーRNA(mRNA)の合成を示す。
A/カリフォルニア/07/2009からのM1タンパク質、A/カリフォルニア/07/2009(H1N1)からのHA-H1タンパク質、A/ミシガン/45/2015(H1N1)からのNA-N1タンパク質、A/ミネソタ/07/2008(H3N2)からのHA-H3タンパク質、及びA/Minnesota/07/2008(H3N2)からのNA-N2をコードする配列最適化ヌクレオチド配列を調製した。コドン最適化配列を、好適な5’及び3’UTR配列並びにRNAポリメラーゼプロモーターを含むプラスミドに別々に挿入した。インビトロ転写(IVT)の前に、プラスミドを制限エンドヌクレアーゼで線状化した。
DTT、ピロリン酸及びRNase阻害剤を補充した好適なIVT反応緩衝液中で、線状化DNA鋳型プラスミド、NTP(ATP、GTP、CTP、UTP)及びRNAポリメラーゼを使用してIVT反応を実施した。IVT反応を、37℃で90分にわたり行った。反応をDNase Iによる処理によって終結させ、鋳型プラスミドを除去した。得られたIVT mRNAを、グアニジンチオシアネートによる沈殿によって精製した。
精製されたIVT mRNAを、好適なキャッピング反応緩衝液中、S-アデノシルメチオニン、RNase阻害剤、2’-O-メチルトランスフェラーゼ及びグアニリルトランスフェラーゼとともに37℃で90分間インキュベートすることによってキャッピングした。キャッピング後に、テーリング反応を、好適なテーリング反応緩衝液中でATP及びポリAポリメラーゼを用いて37℃で30分間実施した。反応をEDTAの添加によって停止させ、続いて37℃で5分間のインキュベーション及び上述のmRNA精製を行った。
実施例2:ノイラミニダーゼ(NA)活性の評価
この実施例は、インフルエンザウイルスのNAタンパク質をコードするmRNAによる哺乳動物細胞のトランスフェクション後に、NA活性が上清で観察されることを示す。この活性は、細胞が、NAタンパク質をコードする複数のmRNAでトランスフェクトされる場合、又はM1タンパク質及び1つ以上のHAタンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされる場合にも観察される。
HA、NA及びM1タンパク質をコードするmRNAを、実施例1に記載されるように調製した。HEK293T細胞を、インフルエンザウイルスのタンパク質N1若しくはN2をコードする単一のmRNA、インフルエンザウイルスのタンパク質H1、N1及びM1若しくはH3、N2及びM1をコードする3つのmRNA、又はインフルエンザウイルスのタンパク質H1、N1、H3、N2、及びM1をそれぞれコードする5つのmRNAのいずれかでトランスフェクトした。トランスフェクションは、TransIT-mRNAトランスフェクションキットを使用して実施した。トランスフェクトされていない細胞及びeGFPをコードするmRNAでトランスフェクトされた細胞を、それぞれ陰性対照及び陽性対照として含めた。トランスフェクションの48時間後に細胞をカウントし、細胞生存率を評価した。
NA活性を、トランスフェクトされたHEK293Tから採取した上清を使用して決定した。酵素活性を、NA-Fluor(商標)インフルエンザノイラミニダーゼアッセイキットを使用して測定した。4-メチルインベリフェロン(methylimbelliferone)ナトリウム塩を使用して標準曲線を生成し、37℃で1時間インキュベートした後、Varioskanリーダーを使用して蛍光を検出した。NA活性の力価をμM/時で測定した。各試料につき3回の独立した測定を実施した。
結果を図1にまとめる。NAタンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされた全ての細胞の上清中にNA活性を検出した。細胞を、M1タンパク質をコードするmRNA、NAタンパク質(N1及び/又はN2)をコードする1つ又は2つのmRNA並びにHAタンパク質(H1及び/又はH3)をコードする1つ又は2つのmRNAで追加的にトランスフェクトした場合にもNA活性が観察された。興味深いことに、NA活性は、N1をコードするmRNAでトランスフェクトされた細胞と比較して、N2をコードするmRNAでトランスフェクトされた細胞では約2.5~3倍高かった。N1及びN2の両方を有するトランスフェクト細胞は、測定されたNA活性を更に増加させなかった。
この実施例のデータは、M1、HA及びNAタンパク質をコードするmRNAを同じ細胞内で一緒に発現させて、活性NAタンパク質を有するVLPを産生させることができることを示している。
実施例3:ヘマグルチニン(HA)活性の評価
この実施例は、インフルエンザウイルスのHAタンパク質をコードするmRNAが、哺乳動物細胞を誘導して機能的なヘマグルチニン(HA)活性を発現させることができることを示す。
HA、NA及びM1タンパク質をコードするmRNAを、実施例1に記載されるように調製した。HEK293T細胞を、H1若しくはH3のいずれかをコードする単一のmRNA、H1若しくはH3のタンパク質のいずれか及びM1タンパク質をコードする2つのmRNA、H1、N1及びM1タンパク質、H3、N2及びM1タンパク質若しくはH1、H3及びM1タンパク質のいずれかをコードする3つのmRNA、又はインフルエンザタンパク質のH1、N1、H3、N2及びM1をそれぞれコードする5つのmRNAでトランスフェクトした。トランスフェクションは、実施例2に記載されているものと同じ方法で実施した。
mRNAでトランスフェクトされたHEK293T細胞からの上清を使用してヘマグルチニン単位(HAU)力価を計算することによって、HAの機能性を決定した。前記上清の連続希釈物を、50μLの0.5%(v/v)七面鳥赤血球とともに、4℃で45~60分間インキュベートした。懸濁液のHAU力価は、完全な赤血球凝集を示す最も高い希釈の逆数であると定義される。非濃縮及び濃縮(5倍)上清の両方についての赤血球凝集値を表1に示す。それぞれインフルエンザウイルスA/ミシガン/45/2015のH1及びN1タンパク質、並びにA/香港/4801/2014のH3及びN2タンパク質を用いて調製された以前に精製及び濃縮したVLPを陽性対照として機能させた。mRNAなしでトランスフェクトされた細胞からの上清を陰性対照として使用した。
赤血球凝集は、H1亜型HAタンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされた細胞から得られた全ての濃縮上清について観察され、細胞がタンパク質をその活性形態で発現したことを示している。この観察は、細胞が、別のHAタンパク質(H3)、1つ以上のNAタンパク質(N1、若しくはN1及びN2)をコードする1つ以上のmRNA、及び/又はM1タンパク質をコードするmRNAで追加的にトランスフェクトされた細胞では無関係であった。
H1亜型HAタンパク質が存在しない場合、H3亜型HAタンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされた細胞について赤血球凝集は観察されなかった。赤血球凝集は、H3亜型HAタンパク質では検出が困難であり得るため、これはそれほど驚くべきことではない。H3亜型HAタンパク質が発現されたことを確認するために、ポリクローナル抗H3抗体(ウサギ、SIGMA)を用いて、ウェスタンブロットを実施した。簡単に述べると、細胞溶解物をNuPAGEゲル(Invitrogen)上で分離させた。分離したタンパク質をニトロセルロース膜(BioRAD)にブロッティングし、抗H3抗体でプローブした。抗ウサギ抗体(Rockland、DyLight)を、Odysseyイメージングシステム(LICOR)を使用する検出のために用いた。
図2から分かるように、H3タンパク質は、(i)H3及びM1タンパク質、(ii)H3、N2及びM1タンパク質、(iii)H1、N1、H3、N2及びM1タンパク質、並びに)(iv)H1及びH3タンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされた細胞において容易に検出された。理由は不明であるが、細胞をH3タンパク質をコードする単一のmRNAでトランスフェクトした場合に、非常に弱いH3バンドのみが検出された。
この実施例のデータは、M1、HA及びNAタンパク質をコードするmRNAを同じ細胞内で一緒に発現させて、機能的HAタンパク質を有するVLPを産生させることができることを示している。
実施例4:陰性染色透過型電子顕微鏡法(NS-TEM)によるインフルエンザVLPの可視化
この実施例は、M1、HA及びNAタンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされた哺乳動物細胞がVLPを産生することができることを示す。この実施例はまた、哺乳動物細胞がM1及びHAタンパク質をコードするmRNAのみでトランスフェクトされる場合、VLPの出芽が大幅に低減することを示している。
M1、HA及びNAタンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされた哺乳動物細胞におけるVLPの生成を可視化するために、陰性染色透過型電子顕微鏡法(NS-TEM)を実施した。HEK293T細胞を、mRNAの3つの異なる組み合わせでトランスフェクトした。HA、NA及びM1タンパク質をコードするmRNAを、実施例1に記載されるように調製した。いくつかの細胞を、M1タンパク質及び2つのHAタンパク質(H1及びH3)のいずれか、又は1つのHAタンパク質(それぞれH1又はH3)及び1つのNAタンパク質(それぞれN1又はN2)をコードする3つのmRNAの組み合わせでトランスフェクトした。他の細胞を、M1タンパク質、2つのHAタンパク質(H1及びH3)並びに2つのNAタンパク質(N1及びN2)をコードする5つのmRNAでトランスフェクトした。
トランスフェクト細胞の細胞上清を、プラズマクリーナー中の以前にイオン化された連続炭素フィルムTEMグリッド上でインキュベートした。濾紙を使用して過剰な物質を吸収し、吸着した粒子を2%酢酸ウラニルで陰性染色し、画像化した。
(i)H1、N1、H3、N2及びM1、(ii)H1、N1及びM1、(iii)H3、N2、及びM1、並びに(iv)H1、H3、及びM1をコードするmRNAでトランスフェクトされたHEK293T細胞の上清は、小胞を含有し、トランスフェクト細胞によるVLPの産生及び放出を示した。模擬トランスフェクト細胞の上清では、小胞は観察されなかった。重要なことに、H1、H3、及びM1をコードするmRNAでトランスフェクトされた細胞の上清では、非常に少量のみの小胞が観察された。
この実施例は、M1、HA及びNAタンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされた哺乳動物細胞がVLPを産生することができることを示している。この実施例はまた、哺乳動物細胞が、M1及びHAタンパク質のみをコードするmRNAでトランスフェクトされた場合にも、VLP形成が依然として起こり得ることを示している。しかしながら、VLP形成は非常に減少し、細胞表面からのVLPの効率的な出芽がNAタンパク質の発現に結び付いていることを示している。
実施例5:低温透過型電子顕微鏡法(Cryo-TEM)によるインフルエンザVLPの可視化
この実施例は、M1タンパク質をコードするmRNA、並びに複数のHAタンパク質及び複数のNAタンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされた哺乳動物細胞が、コード配列が異なるインフルエンザウイルスに由来する場合であっても、VLPを産生することができることを示す。
mRNAトランスフェクト哺乳動物細胞によって産生されるVLPのサイズを決定するために、細胞膜からのVLPの出芽を観察するために低温透過型電子顕微鏡法(Cryo-TEM)を実施した。HA、NA及びM1タンパク質をコードするmRNAを、実施1に記載されるように調製した。HEK293T細胞を、M1タンパク質、1つのHAタンパク質(H3)及び1つのNAタンパク質(N2)をコードする3つのmRNA、又はM1タンパク質、2つのHAタンパク質(H1及びH3)並びに2つのNAタンパク質(N1及びN2)をコードする5つのmRNAのいずれかでトランスフェクトした。模擬トランスフェクト細胞(mRNAなし)を対照として含めた。ELMOイオン化装置でのグロー放電後、試料をQuantifoil R2/2銅200メッシュグリッドに堆積させた。グリッドをブロッティングし、凍結させ、Cryo-TEMによる可視化のために移した。
例示的な画像を図3に示す。パネルAは、模擬トランスフェクト細胞を示す。VLPは視認できなかった。パネルB及びCは、3つのmRNA(H3/N2/M1;パネルB)又は5つのmRNA(H1/N1/H3/N2/M1;パネルC)のいずれかでトランスフェクトされた細胞からのVLPの代表的な画像を示す。VLPは、インフルエンザウイルスの糖タンパク質に類似した糖タンパク質の不均一なスパイクで観察することができた。観察されたVLPは、およそ100nmのサイズであり、したがってインフルエンザウイルスのサイズと同様であった。注目すべきことに、これは、細胞を異なるインフルエンザウイルスからのHAタンパク質及びNAタンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトした場合(それぞれ、A/カリフォルニア/07/2009[H1]、及びA/ミシガン/45/2015[N1]並びにA/ミネソタ/07/2008[H3及びN2])、又はM1タンパク質並びにHA及びNAタンパク質が、異なるインフルエンザウイルス(それぞれ、A/カリフォルニア/07/2009[H1N1]及びA/ミネソタ/07/2008[H3N2])からのものであった場合でもそうであった。
この実施例は、M1タンパク質をコードするmRNA並びに異なるインフルエンザウイルスからの2つのHAタンパク質及び2つのNAタンパク質をコードするmRNAでトランスフェクトされた哺乳動物細胞が、VLPを産生することができることを実証している。同様に、M1タンパク質をコードするmRNAのコード配列は、HA及びNAタンパク質をコードするmRNAのコード配列とは異なるウイルスに由来し得る。
実施例6:A型インフルエンザ及びB型インフルエンザのタンパク質によるトランスフェクションにより、VLP形成が可能になる
この実施例は、A型又はB型のいずれかに由来するM1及びインフルエンザ糖タンパク質の両方をコードするmRNAが、VLPを産生することができることを示す。
A型インフルエンザウイルス及びB型インフルエンザウイルスの両方からVLPが産生され得るかどうかを決定するために、4つの異なる株を調査した。A/ダーウィン/6/2021からのHA及びNAタンパク質(H3N2)、A/ウィスコンシン/588/2019からのHA及びNAタンパク質(H1N1)、B/プーケット/3073/2013(B/山形系統)からのHA及びNAタンパク質、並びにB/オーストリア/1359417/2021(B/ビクトリア系統)からのHA及びNAタンパク質をコードする配列最適化されたヌクレオチド配列を調製した。前の実施例と同様に、A/カリフォルニア/07/2009からのM1タンパク質をコードする同じ配列最適化ヌクレオチド配列を使用した。コドン最適化配列を、好適な5’及び3’UTR配列並びにRNAポリメラーゼプロモーターを含むプラスミドに別々に挿入した。IVTの前に、プラスミドを制限エンドヌクレアーゼで線状化した。IVT反応を、実施例1に記載されるように実施した。
Expi293F細胞を、実施例2に記載される方法を使用して、インフルエンザウイルスのタンパク質をコードする3つのmRNAでトランスフェクトした。表2に示すように、4つの組み合わせ(ダーウィン、ウィスコンシン、プーケット及びオーストリア)を試験した。各トランスフェクションについて、HA、NA、及びM1をコードするmRNAを、それぞれ40:10:50のモル比でトランスフェクトした。
トランスフェクトされたExpi293F細胞から採取された上清を使用する酵素的NA活性アッセイを、実施例2に記載されている方法によって実施した。結果を図4にまとめる。NA活性は、オーストリア株を除いて、トランスフェクトされたExpi293F細胞から採取された全ての上清で検出可能であった。精製されたVLP(陽性対照)と比べて、NA活性は、この実験では低かった。ウェスタンブロットにより、弱いNAタンパク質発現が確認された(データは示されていない)。
トランスフェクトされたExpi293F細胞からの細胞溶解物及び上清抽出物におけるM1及びHA発現を、ウェスタンブロットによって評価した。検出に使用される試薬を表3に示す。
濃縮(25倍)及び非濃縮上清抽出物の両方を分析した。HA発現を、モノクローナルA型インフルエンザ株又はB型インフルエンザ株の抗HA抗体を使用して決定した。結果を、それぞれ図5A(A型インフルエンザ)及び図5B(B型インフルエンザ)に示す。HA発現は、全ての実験条件の細胞溶解物、濃縮上清抽出物及び非濃縮上清抽出物で検出された。模擬トランスフェクト細胞(陰性対照)の溶解物及び上清では、シグナルは検出されなかった。HAは、各プロトマーが、単一のジスルフィド架橋を介して接続されたHA1鎖及びHA2鎖からなるホモトリマーである。HA2サブユニットは、細胞溶解物の各々で検出され得るが、細胞上清では検出されない。
M1発現を、ポリクローナル抗M1抗体を使用して決定した。図6に示すように、M1は、トランスフェクト細胞の細胞溶解物及び濃縮上清中で検出されたが(パネルA)、非濃縮上清試料では検出されなかった(パネルB)。濃縮上清中では、微量のみを検出することができた。バンド強度は、細胞溶解物試料で最大であった。陰性対照試料を含む細胞溶解物及び濃縮上清を含む試料において、非特異的結合が観察された。しかしながら、M1特異的バンドは、明らかに区別可能であった。模擬トランスフェクト細胞(リポフェクタントのみ、陰性対照)の細胞溶解物及び上清では、M1は観察されなかった。
実施例5に記載されるように、mRNAトランスフェクト哺乳動物細胞によって産生されたVLPを、Cryo-TEMを使用して可視化した。例示的な画像を図7に示す。パネルAは、模擬トランスフェクト細胞の代表的な画像を示す。この状態では、VLPは見出されなかった。不均一な平滑な小胞(白色の矢印)(トランスフェクションプロセスからのアーチファクトの可能性が高い)及びタンパク質の破片(黒色の輪郭の矢印)のみが観察された。
A型インフルエンザ株のダーウィン及びウィスコンシンからのM1プラスHA及びNAでトランスフェクトされた細胞からのVLPの代表的な画像を、それぞれパネルB及びCに示す。パネルD及びEは、それぞれ、B型インフルエンザ株のプーケット及びオーストリアからのM1プラスHA及びNAでトランスフェクトされた細胞からのVLPの代表的な画像を示す。糖タンパク質が密に施されたVLP(黒く塗りつぶされた矢印)は、4つの条件全てで観察された。VLPのサイズは約50~300nmの範囲であり、大部分は100nmを超えるサイズであった。
この実施例は、M1タンパク質をコードするmRNA及びA型インフルエンザ又はB型インフルエンザのいずれかからのHA及びNAをコードするmRNAでトランスフェクトされた哺乳動物細胞が、VLPを産生することができることを実証している。データは、HA及びNAタンパク質が由来するインフルエンザの型及び株に関係なく、M1タンパク質の同じコード配列の使用を更に裏付けている。
実施例7:マウス免疫化
この実施例は、実施例6に記載されるHA、NA及びM1タンパク質をコードするmRNAを含む組成物の免疫原性を試験するためのマウス研究を概説する。
インフルエンザ株B/プーケット/3073/2013(山形)のHA及びNAタンパク質並びにA/カリフォルニア/07/2009のM1タンパク質をコードする3つの配列最適化mRNAを含む一価mRNA組成物を調製する。mRNAを、40:30:28.5:1.5のモル比で、カチオン性脂質GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10、非カチオン性脂質DOPE、コレステロール、及びPEG修飾脂質DMG-PEG-2Kを含む脂質ナノ粒子(LNP)中に封入する。最終的なmRNA-LNP製剤を、水性懸濁液で提供する。HA、NA、及びM1をコードするmRNAを、免疫化に使用される最終組成物中でそれぞれ1:1:2の重量比で提供する。
並行して、mRNAの4つのセットを含む四価mRNA組成物を調製する。セット1は、インフルエンザ株B/プーケット/3073/2013(山形)のHA及びNAタンパク質並びにA/カリフォルニア/07/2009のM1タンパク質をコードする3つの配列最適化mRNAを含む。セット2は、インフルエンザ株A/ダーウィン/6/2021及びA/タスマニア/503/2020(H3N2)のそれぞれのHA及びNAタンパク質、並びにA/カリフォルニア/07/2009のM1タンパク質をコードする3つの配列最適化mRNAを含む。セット3は、インフルエンザ株A/ウィスコンシン/588/2019(H1N1)のHA及びNAタンパク質並びにA/カリフォルニア/07/2009のM1タンパク質をコードする3つの配列最適化mRNAを含む。セット4は、インフルエンザ株B/オーストリア/1359417/2021及びB/ワシントン/02/2019(ビクトリア)のそれぞれのHA及びNAタンパク質、並びにA/カリフォルニア/07/2009のM1タンパク質をコードする3つの配列最適化mRNAを含む。mRNAのセットの各々は、一価組成物と同じLNP中に別々に封入される。各セットについて、HA、NA、及びM1をコードするmRNAは、免疫化に使用される最終組成物中でそれぞれ1:1:2の重量比で提供される。
対照として、M1タンパク質をコードするmRNAが、エプスタイン・バール・ウイルス(EBV)からのTエピトープをコードするmRNAで置き換えられている一価及び四価組成物に対応するmRNA組成物が提供される。四価組換えインフルエンザワクチンFlublok及び四価不活化スプリットビリオンワクチンVaxigrip Tetraは、免疫化対照として提供される。Flublok及びVaxigrip Tetra中のHA及びNAタンパク質は、四価mRNA組成物中のそれぞれのHA及びNA mRNAによってコードされるものと一致する。リン酸緩衝生理食塩水(PBS)は、陰性対照として機能する。
組成物の各々を、0日目及び21日目に筋肉内(IM)注射によってマウスに投与する。BALB/cマウスの9群を免疫化する(n=8)。群1は、一価mRNA組成物の注射ごとに合計2μgのmRNAを受ける。群2は、一価mRNA組成物の注射ごとに合計8μgのmRNAを受ける。群3及び4は、それぞれ、注射ごとに合計2μg及び8μgの一価の対照mRNA組成物を受ける。群5は、四価mRNA組成物の注射ごとに合計8μgのmRNAを受ける。群6は、対照四価mRNA組成物の注射ごとに合計8μgのmRNAを受ける。群7は、注射ごとにヒトの用量の1/10のFlublokを受ける。群8は、注射ごとにヒトの用量の1/10のVaxigrip Tetraを受ける。群9は、PBSを受ける。
42日目に、マウスを殺処分する。血液を採取して、ELISA、赤血球凝集阻害(HAI)アッセイ、及びノイラミニダーゼ活性阻害(NAI)アッセイをそれぞれ使用して、IgG産生(総IgG)及び抗HA/抗NA機能抗体を評価する。

Claims (63)

  1. (i)インフルエンザウイルスマトリックス1(M1)タンパク質と、(ii)1つ以上のインフルエンザウイルスヘマグルチニン(HA)タンパク質及び/又は1つ以上のインフルエンザウイルスノイラミニダーゼ(NA)タンパク質とをコードする1つ以上のメッセンジャーRNA(mRNA)を含む組成物であって、前記M1タンパク質と前記1つ以上のHAタンパク質及び/又は前記1つ以上のNAタンパク質とが、哺乳動物を誘導して、ウイルス様粒子(VLP)を産生することができる、組成物。
  2. 前記1つ以上のmRNAが、2つ以上のHAタンパク質及び/又は2つ以上のNAタンパク質をコードし、前記2つ以上のHAタンパク質の各々及び前記2つ以上のNAタンパク質の各々が、異なるインフルエンザウイルスからのものである、請求項1に記載の組成物。
  3. 前記2つ以上のHAタンパク質の少なくとも1つ及び/又は前記2つ以上のNAタンパク質の少なくとも1つが、前記M1タンパク質が由来する前記インフルエンザウイルスとは異なるインフルエンザウイルスからのものである、請求項2に記載の組成物。
  4. 前記2つ以上のHAタンパク質及び/又は前記2つ以上のNAタンパク質が、異なるA型インフルエンザ亜型からのものである、請求項3に記載の組成物。
  5. 前記2つ以上のHAタンパク質の少なくとも1つ及び/又は前記2つ以上のNAタンパク質の少なくとも1つが、B型インフルエンザウイルスからのものである、請求項3又は4に記載の組成物。
  6. 前記M1タンパク質が、パンデミックインフルエンザウイルスからのものである、請求項1~5のいずれか一項に記載の組成物。
  7. 前記M1タンパク質が、H1N1 A型インフルエンザウイルスからのものである、請求項1~5のいずれか一項に記載の組成物。
  8. 前記M1タンパク質が、30位にセリン、142位にアラニン、207位にアスパラギン、及び209位にスレオニンを有する、請求項1~7のいずれか一項に記載の組成物。
  9. 前記M1タンパク質が、別個のmRNAによってコードされる、請求項1~5のいずれか一項に記載の組成物。
  10. 前記2つ以上のNAタンパク質の少なくとも1つが、ノイラミニダーゼ活性アッセイによって決定されるように、2000μM/時以上の活性を有する、請求項2~9のいずれか一項に記載の組成物。
  11. 前記2つ以上のNAタンパク質が、異なるA型インフルエンザ亜型からの2つのNAタンパク質を含む、請求項4~10のいずれか一項に記載の組成物。
  12. 前記異なるA型インフルエンザ亜型が、N1及びN2である、請求項11に記載の組成物。
  13. 前記組成物が、前記哺乳動物細胞におけるVLPの発現を誘導することができ、前記VLPが、異なるA型インフルエンザ亜型からの前記2つのNAタンパク質を含む、請求項11又は12に記載の組成物。
  14. 前記2つ以上のHAタンパク質が、異なるA型インフルエンザ亜型からの2つのHAタンパク質を含む、請求項4~13のいずれか一項に記載の組成物。
  15. 前記異なるA型インフルエンザ亜型が、H1及びH3である、請求項14に記載の組成物。
  16. 前記組成物が、前記哺乳動物細胞におけるVLPの発現を誘導することができ、前記VLPが、異なるA型インフルエンザ亜型からの前記2つのHAタンパク質を含む、請求項14又は15に記載の組成物。
  17. 前記1つ以上のmRNAが、1つ以上の脂質ナノ粒子(LNP)中に封入される、請求項1~16のいずれか一項に記載の組成物。
  18. 各HAタンパク質及び各NAタンパク質が、別個のmRNAによってコードされる、請求項1~17のいずれか一項に記載の組成物。
  19. 前記組成物が、M1タンパク質と、(i)2、3、4、5、6、7、若しくは8個のHAタンパク質、(ii)2、3、4、5、6、7、若しくは8個のNAタンパク質、又は(iii)1、2、3、若しくは4個のHAタンパク質及び1、2、3、若しくは4個のNAタンパク質と、をコードする3、4、5、6、7、8、若しくは9個のmRNA分子を含む、請求項18に記載の組成物。
  20. 前記3、4、5、6、7、8、若しくは9個のmRNAが、同じLNP中に封入される、請求項19に記載の組成物。
  21. 前記組成物が、前記M1タンパク質をコードする1つのmRNAと、1つのHAタンパク質及び1つのNAタンパク質をコードする少なくとも1つのmRNAと、を含む、請求項1~17のいずれか一項に記載の組成物。
  22. 前記組成物が、第1のHAタンパク質及び第1のNAタンパク質をコードする第1のmRNAと、第2のHAタンパク質及び第2のNAタンパク質をコードする第2のmRNAと、前記M1タンパク質をコードする第3のmRNAと、を含み、前記第1のHAタンパク質及び前記第1のNAタンパク質が、第1のインフルエンザウイルスからのものであり、前記第2のHAタンパク質及び前記第2のNAタンパク質が、第2のインフルエンザウイルスからのものである、請求項21に記載の組成物。
  23. 前記第1及び第2のインフルエンザウイルスが、異なる亜型のA型インフルエンザウイルスである、請求項22に記載の組成物。
  24. 前記異なる亜型が、H1N1及びH3N2である、請求項23に記載の組成物。
  25. 前記組成物が、第3のHAタンパク質及び第3のNAタンパク質をコードする第4のmRNAを更に含み、前記第3のHAタンパク質及び前記第3のNAタンパク質が、第3のインフルエンザウイルスからのものである、請求項22~24のいずれか一項に記載の組成物。
  26. 前記第3のインフルエンザウイルスが、B型インフルエンザウイルスである、請求項25に記載の組成物。
  27. 前記組成物が、第4のHAタンパク質及び第4のNAタンパク質をコードする第5のmRNAを更に含み、前記第4のHAタンパク質及び前記第4のNAタンパク質が、第4のインフルエンザウイルスからのものである、請求項25又は26に記載の組成物。
  28. 前記第3及び第4のインフルエンザウイルスが、それぞれ山形系統及びビクトリア系統からのものである、請求項27に記載の組成物。
  29. 前記第1、第2、第4及び第5のmRNAが、適用可能な場合、5’から3’の順序で、(i)前記HAタンパク質のコード配列、(ii)内部リボソーム進入部位(IRES)又は2Aペプチドをコードするヌクレオチド配列、及び(iii)前記NAタンパク質のコード配列を含む、請求項21~28のいずれか一項に記載の組成物。
  30. 前記mRNAが、同じLNP中に封入される、請求項21~29のいずれか一項に記載の組成物。
  31. 前記第1、第2及び第3のmRNAが、第1のLNP中に封入され、前記第4及び第5のmRNAが、第2のLNP中に封入される、請求項27又は28に記載の組成物。
  32. 前記第2のLNPが、M1タンパク質をコードする第6のmRNAを更に含む、請求項31に記載の組成物。
  33. 前記第6のmRNAによってコードされる前記M1タンパク質が、B型インフルエンザウイルスからのものである、請求項32に記載の組成物。
  34. 前記第1のLNP及び前記第2のLNPが、同じ脂質成分を含む、請求項31~33のいずれか一項に記載の組成物。
  35. 前記組成物が、インフルエンザウイルスマトリックス2(M2)タンパク質を更にコードするmRNAを更に含む、請求項1~34のいずれか一項に記載の組成物。
  36. 前記VLPが、約50nm~約200nmのサイズである、請求項1~35のいずれか一項に記載の組成物。
  37. 前記VLPが、約100nmのサイズである、請求項36に記載の組成物。
  38. 前記哺乳動物細胞が、ヒト細胞である、請求項1~37のいずれか一項に記載の組成物。
  39. 前記1つ以上のmRNAが、配列最適化されている、請求項1~38のいずれか一項に記載の組成物。
  40. 前記mRNAが、約100ヌクレオチド~約500ヌクレオチドを含むポリアデニル化(ポリA)配列を含む、請求項1~39のいずれか一項に記載の組成物。
  41. 前記ポリA配列が、約200ヌクレオチドを含む、請求項40に記載の組成物。
  42. 前記ポリA配列が、約500ヌクレオチドを含む、請求項40に記載の組成物。
  43. 前記LNPの前記脂質成分が、カチオン性脂質、非カチオン性脂質、PEG修飾脂質、及び任意選択的にステロール系脂質を含むか、又はそれからなる、請求項17~42のいずれか一項に記載の組成物。
  44. (a)前記カチオン性脂質が、cKK-E12、cKK-E10、HGT5000、HGT5001、ICE、HGT4001、HGT4002、HGT4003、TL1-01D-DMA、TL1-04D-DMA、TL1-08D-DMA、TL1-10D-DMA、OF-Deg-Lin、OF-02、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10、GL-TES-SA-DMP-E18-2、GL-TES-SA-DME-E18-2、SY-3-E14-DMAPr、TL1-10D-DMA、HEP-E3-E10、HEP-E4-E10、RL3-DMA-07D、RL2-DMP-07D、cHse-E-3-E10、cHse-E-3-E12、cDD-TE-4-E12、SI-4-E14-DMAPr、TL-1-12D-DMA、SY-010、SY-011、IM-001、及び4-ヒドロキシブチル)アザンジイル)ビス(ヘキサン-6,1-ジイル)ビス(2-ヘキシルデカノエート(ALC-0315)から選択され;
    (b)前記非カチオン性脂質が、DSPC(1,2-ジステアロイル-sn-グリセロ-3-ホスホコリン)、DPPC(1,2-ジパルミトイル-sn-グリセロ-3-ホスホコリン)、DOPE(1,2-ジオレイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン)、DEPE 1,2-ジエルコイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン、DOPC(1,2-ジオレイル-sn-グリセロ-3-ホスホチジルコリン)、DPPE(1,2-ジパルミトイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン)、DMPE(1,2-ジミリストイル-sn-グリセロ-3-ホスホエタノールアミン)、及びDOPG(1,2-ジオレオイル-sn-グリセロ-3-ホスホ-(1’-rac-グリセロール))から選択され;
    (c)前記PEG修飾脂質が、DMG-PEG-2K及び2-[(ポリエチレングリコール)-2000]-N,N-ジテトラデシルアセトアミド(ALC-0159)から選択され;並びに/又は
    (d)前記ステロール系が、コレステロールである、
    請求項43に記載の組成物。
  45. 前記カチオン性脂質が、cKK-E10、OF-02、GL-HEPES-E3-E12-DS-4-E10、IM-001及びALC-0315から選択される、請求項43又は44に記載の組成物。
  46. 前記PEG修飾脂質が、DMG-PEG2K又はALC-0159から選択される、請求項43~45のいずれか一項に記載の組成物。
  47. 前記非カチオン性脂質が、DOPE又はDSPCから選択される、請求項43~46のいずれか一項に記載の組成物。
  48. 前記LNPが、約70nm~約150nmのサイズである、請求項17~47のいずれか一項に記載の組成物。
  49. その組成物が、ワクチン組成物である、請求項1~48のいずれか一項に記載の組成物。
  50. 請求項1~49のいずれか一項に記載の組成物と、1つ以上の薬学的に許容される賦形剤とを含む、医薬組成物。
  51. 前記1つ以上の薬学的に許容される賦形剤が、塩、糖、緩衝試薬及びそれらの組み合わせから選択される、請求項50に記載の医薬組成物。
  52. 前記塩が、塩化ナトリウム、塩化カリウム又はその両方の組み合わせである、請求項51に記載の医薬組成物。
  53. 前記糖が、二糖である、請求項51又は52に記載の医薬組成物。
  54. 前記二糖が、スクロース又はトレハロースである、請求項53に記載の医薬組成物。
  55. 前記緩衝試薬が、リン酸、トリス、イミダゾール及びヒスチジンから選択される、請求項51~54のいずれか一項に記載の医薬組成物。
  56. 前記緩衝試薬が、リン酸又はトリスである、請求項55に記載の医薬組成物。
  57. 対象における1つ以上のインフルエンザウイルスに対する免疫応答を誘発させる方法における使用のための、請求項1~48のいずれか一項に記載の組成物、請求項49に記載のワクチン組成物又は請求項50~56のいずれか一項に記載の医薬組成物。
  58. 前記免疫応答が、前記対象における前記1つ以上のインフルエンザウイルスによる感染に関連する1つ以上の症状の重症度を低下させるのに有効である、請求項57に記載の使用のためのワクチン又は医薬組成物。
  59. 前記免疫応答が、前記対象における前記1つ以上のインフルエンザウイルスによる感染の予防に有効である、請求項57に記載の使用のためのワクチン又は医薬組成物。
  60. 前記対象が、ヒトである、請求項57~59のいずれか一項に記載の使用のためのワクチン又は医薬組成物。
  61. 前記対象が、妊娠している、請求項60に記載の使用のためのワクチン又は医薬組成物。
  62. 前記対象が、65歳以上である、請求項60に記載の使用のためのワクチン又は医薬組成物。
  63. 前記対象が、70歳以上である、請求項62に記載の使用のためのワクチン又は医薬組成物。
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