[go: up one dir, main page]

JP2025512313A - 腫瘍浸潤リンパ球療法によるnsclc患者の治療 - Google Patents

腫瘍浸潤リンパ球療法によるnsclc患者の治療 Download PDF

Info

Publication number
JP2025512313A
JP2025512313A JP2024559177A JP2024559177A JP2025512313A JP 2025512313 A JP2025512313 A JP 2025512313A JP 2024559177 A JP2024559177 A JP 2024559177A JP 2024559177 A JP2024559177 A JP 2024559177A JP 2025512313 A JP2025512313 A JP 2025512313A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
expansion
day
til population
population
til
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2024559177A
Other languages
English (en)
Inventor
ファーディス,マリア
フィンケンシュタイン,フリードリヒ グラフ フィンク ヴォン
ジー. フォーグト,フレデリック
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Individual
Original Assignee
Individual
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Individual filed Critical Individual
Publication of JP2025512313A publication Critical patent/JP2025512313A/ja
Pending legal-status Critical Current

Links

Images

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K35/00Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
    • A61K35/12Materials from mammals; Compositions comprising non-specified tissues or cells; Compositions comprising non-embryonic stem cells; Genetically modified cells
    • A61K35/14Blood; Artificial blood
    • A61K35/17Lymphocytes; B-cells; T-cells; Natural killer cells; Interferon-activated or cytokine-activated lymphocytes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K40/00Cellular immunotherapy
    • A61K40/10Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K40/11T-cells, e.g. tumour infiltrating lymphocytes [TIL] or regulatory T [Treg] cells; Lymphokine-activated killer [LAK] cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N5/00Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
    • C12N5/06Animal cells or tissues; Human cells or tissues
    • C12N5/0602Vertebrate cells
    • C12N5/0634Cells from the blood or the immune system
    • C12N5/0636T lymphocytes
    • C12N5/0638Cytotoxic T lymphocytes [CTL] or lymphokine activated killer cells [LAK]
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2501/00Active agents used in cell culture processes, e.g. differentation
    • C12N2501/20Cytokines; Chemokines
    • C12N2501/23Interleukins [IL]
    • C12N2501/2302Interleukin-2 (IL-2)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2501/00Active agents used in cell culture processes, e.g. differentation
    • C12N2501/50Cell markers; Cell surface determinants
    • C12N2501/515CD3, T-cell receptor complex

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

(i)CD40アゴニストの有無にかかわらず、かつ抗CTLA-4抗体の有無にかかわらず、インターフェロンガンマ(IFNγ)及び抗PD-1抗体の組み合わせによるREP前刺激、(ii)低濃度IL-2の有無にかかわらず、AKT阻害剤(AKTi)の有無にかかわらず、REP拡張及び/またはREP前拡張中の様々な濃度のIL-15及びIL-21、(iii)REP拡張及び/またはREP前拡張中の低濃度のIL-2及びAKTi、(iv)(i)及び(ii)の組み合わせ、または(v)(i)及び(iii)の組み合わせを介してTILを産生する方法が、本明細書で提供される。
【選択図】なし

Description

関連出願の相互参照
本出願は、2022年9月9日に出願された米国仮出願第63/375,209号、及び2022年4月15日に出願された米国仮出願第63/331,757号の優先権を主張し、これらのすべては、参照によりそれら全体が本明細書に組み込まれる。
腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の養子自家移入を使用した巨大な不応性がんの治療は、予後不良の患者の治療に対する強力なアプローチを表す。Gattinoni,et al.,Nat.Rev.Immunol.2006,6,383-393。TILは、T細胞によって占有され、IL-2ベースのTIL拡張とそれに続く「急速拡張プロセス」(REP)は、その速度及び効率のためにTIL拡張の好ましい方法になっている。Dudley,et al.,Science 2002,298,850-54、Dudley,et al.,J.Clin.Oncol.2005,23,2346-57、Dudley,et al.,J.Clin.Oncol.2008,26,5233-39、Riddell,et al.,Science 1992,257,238-41、Dudley,et al.,J.Immunother.2003,26,332-42。黒色腫におけるTIL療法への応答を改善し、TIL療法を他の腫瘍タイプに拡張するための多くのアプローチが限られた成功を収めており、この分野は依然として困難である。Goff,et al.,J.Clin.Oncol.2016,34,2389-97、Dudley,et al.,J.Clin.Oncol.2008,26,5233-39、Rosenberg,et al.,Clin.Cancer Res.2011,17,4550-57。単一免疫チェックポイント阻害剤との併用研究も記載されているが、さらなる研究が進行中であり、追加の治療方法が必要である(Kverneland,et al.,Oncotarget,2020,11(22),2092-2105)。
さらに、現行のTILの製造及び治療プロセスは、長さ、コスト、無菌性の懸念、及び本明細書に記載される他の要因によって制限されているため、他のチェックポイント阻害剤療法に対して不応性である患者を治療する可能性は厳しく制限されている。実行可能な治療選択肢がほとんどまたはまったく残っていない患者を治療する際に使用するのに適したTIL製造プロセス及びかかるプロセスに基づく療法を提供することが緊急に必要である。本発明は、より堅牢なTILを生成する際に使用するための製造プロセスを提供することによって、この必要性を満たす。
本発明は、治療効果が増加し、エフェクター分化が減少し、記憶及び幹様属性が改善され、機能性が増加した治療的TIL集団を調製するために、サイトカイン及び他の細胞培養培地成分の特定の組み合わせを有するTILを調製するための改善されたプロセス及び方法を提供する。
(i)インターフェロンガンマ(IFNγ)、抗PD-1、CD40アゴニズム、及び/またはCTLA-4アゴニズムの組み合わせによるREP前刺激、(ii)REP拡張及び/またはREP前拡張中のIL-21、IL-15、低濃度IL-2、及びAKT阻害剤(AKTi)の様々な組み合わせ、(iii)REP拡張及び/またはREP前拡張中の低濃度IL-2及び/またはAKTi、(iv)(i)及び(ii)の組み合わせ、
または(v)(i)及び(iii)の組み合わせを介して、TIL集団を産生する方法が、本明細書で提供される。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から腫瘍を切除するステップであって、腫瘍が、第1のTIL集団を含む、切除するステップと、
(b)腫瘍を複数の腫瘍断片に処理するステップと、
(c)複数の腫瘍断片を閉鎖系に付加するステップと、
(d)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、D3、D4、D5、D6またはD7に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(e)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下のIL-2、及び/またはタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、D3、D4、D5、D6またはD7に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、
(f)ステップ(f)から取得された第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取するステップと、
(g)ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すステップと、
(h)任意選択で、凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を含む注入バッグを凍結保存するステップと、を含む、方法を提供する。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、腫瘍が、第1のTIL集団を含む、取得するステップと、
(b)腫瘍を腫瘍消化物に処理するステップと、
(c)腫瘍消化物を閉鎖系に付加するステップと、
(d)第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(e)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日
目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、
(f)ステップ(f)から取得された第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こる、採取するステップと、
(g)ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こる、移すステップと、を含む、方法を提供する。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、腫瘍が、第1のTIL集団を含む、取得するステップと、
(b)腫瘍を腫瘍断片または腫瘍消化物に処理するステップと、
(c)腫瘍断片または腫瘍消化物を閉鎖系に付加するステップと、
(d)第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(e)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、
(f)ステップ(f)から取得された第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こる、採取するステップと、
(g)ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こる、移すステップと、を含む、方法を提供する。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、腫瘍が、第1のTIL集団を含む、取得するステップと、
(b)腫瘍を腫瘍消化物に処理し、腫瘍消化物を凍結保存するステップと、
(c)凍結保存した腫瘍消化物を解凍し、腫瘍消化物を閉鎖系に付加するステップと、
(d)第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(e)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及
び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、
(f)ステップ(f)から取得された第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こる、採取するステップと、
(g)ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すステップと、を含む、方法を提供する。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から取得された腫瘍から取得された腫瘍断片を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(b)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、
(c)ステップ(b)から取得された第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こる、採取するステップと、
(d)ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、任意選択で、閉鎖系を開くことなく起こる、移すステップと、を含む、方法を提供する。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から取得された腫瘍から取得された腫瘍消化物を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(b)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及
び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、
(c)ステップ(b)から取得された第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こる、採取するステップと、
(d)ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、任意選択で、閉鎖系を開くことなく起こる、移すステップと、を含む、方法を提供する。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から取得された腫瘍から取得された腫瘍断片または腫瘍消化物を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(b)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、
(c)ステップ(b)から取得された第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こる、採取するステップと、
(d)ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、任意選択で、閉鎖系を開くことなく起こる、移すステップと、を含む、方法を提供する。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から取得された腫瘍から取得された凍結保存した腫瘍消化物を解凍し、腫瘍消化物を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(b)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及
び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、
(c)ステップ(b)から取得された第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こる、採取するステップと、
(d)ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、任意選択で、閉鎖系を開くことなく起こる、移すステップと、を含む、方法を提供する。
凍結保存プロセスを使用して、採取された第3のTIL集団を含む注入バッグを凍結保存するステップをさらに含む、請求項1~8のいずれか1項に記載の方法。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、腫瘍が、第1のTIL集団を含む、取得するステップと、
(b)腫瘍を複数の腫瘍断片に処理するステップと、
(c)複数の腫瘍断片を閉鎖系に付加するステップと、
(d)第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(e)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、を含む、方法を提供する。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、腫瘍が、第1のTIL集団を含む、取得するステップと、
(b)腫瘍を腫瘍消化物に処理するステップと、
(c)腫瘍消化物を閉鎖系に付加するステップと、
(d)第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日
目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(e)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、を含む、方法を提供する。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、腫瘍が、第1のTIL集団を含む、取得するステップと、
(b)腫瘍を腫瘍断片または腫瘍消化物に処理するステップと、
(c)腫瘍断片または腫瘍消化物を閉鎖系に付加するステップと、
(d)第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(e)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、を含む、方法を提供する。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、腫瘍が、第1のTIL集団を含む、取得するステップと、
(b)腫瘍を腫瘍消化物に処理し、腫瘍消化物を凍結保存するステップと、
(c)凍結保存した腫瘍消化物を解凍し、腫瘍消化物を閉鎖系に付加するステップと、
(d)第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(e)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第
2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、
(f)ステップ(f)から取得された第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こる、採取するステップと、
(g)ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こる、移すステップと、を含む、方法を提供する。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から取得された腫瘍から取得された腫瘍断片を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(b)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、を含む、方法を提供する。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から取得された腫瘍から取得された腫瘍消化物を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(b)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、を含む、方法を提供する。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から取得された腫瘍から取得された腫瘍断片または腫瘍消化物を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(b)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、を含む、方法を提供する。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から取得された腫瘍から取得された凍結保存した腫瘍消化物を解凍し、腫瘍消化物を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(b)第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、IL-2は、より低い用量のIL-2である。
いくつかの実施形態では、ステップ(d)の培養培地は、3000IU/mL以下のIL-2、及び/またはタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(e)の培養培地は、タンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(d)及び/またはステップ(e)の培養培地は、IL-15及び/またはIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、方法は、ステップ(d)のD0、D1またはD2中に、20
0ng/mlの濃度のIFNγ及び抗PD-1抗体を添加することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、方法は、ステップ(d)のD0、D1またはD2中に、CD40アゴニスト及び/またはCTLA-4の阻害剤を添加することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)の後かつステップ(b)の前に、方法は、複数の腫瘍断片を酵素的に消化して、第1のTIL集団を取得するステップを含む。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団は、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、またはがんからの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から取得される。
いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド(Tehranolide)、イソリキリゲニン、スクテラリン、及びホノキオールからなる群から選択される。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から腫瘍を切除するステップであって、腫瘍が、第1のTIL集団を含む、切除するステップと、
(b)腫瘍を複数の腫瘍断片に処理するステップと、
(c)複数の腫瘍断片を閉鎖系に付加するステップと、
(d)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、D3、D4、D5、D6またはD7に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(e)第2のTIL集団を、IL-15及び/またはIL-21、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、D3、D4、D5、D6またはD7に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、
(f)ステップ(f)から取得された第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取するステップと、
(g)ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すステップと、
(h)任意選択で、凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を含む注入バッグを凍結保存するステップと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、ステップ(d)における培養培地は、IL-15及び/またはIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、IL-2は、より低い用量のIL-2である。
いくつかの実施形態では、ステップ(d)及び/またはステップ(e)における培養培地は、3000IU/mL以下のIL-2、及び/またはタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む。
いくつかの実施形態では、方法は、ステップ(d)におけるD0、D1またはD2中に、200ng/mlの濃度のIFNγ及び抗PD-1抗体を添加することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、方法は、ステップ(d)におけるD0、D1またはD2中に、CD40アゴニスト及び/またはCTLA-4の阻害剤を添加することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)の後かつステップ(b)の前に、方法は、複数の腫瘍断片を酵素的に消化して、第1のTIL集団を取得するステップを含む。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団は、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、またはがんからの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から取得される。
いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、及びホノキオールからなる群から選択される。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から腫瘍を切除するステップであって、腫瘍が、第1のTIL集団を含む、切除するステップと、
(b)腫瘍を複数の腫瘍断片に処理するステップと、
(c)複数の腫瘍断片を閉鎖系に付加するステップと、
(d)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張は、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張は、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、IFNγ及び/またはPD-1の阻害剤は、ステップ(d)のD0、D1またはD2中に添加され、ステップ(c)からステップ(d)への移行は、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地は、D3、D4、D5、D6またはD7に置き換えられる、第2のTIL集団を産生するステップと、
(e)第2のTIL集団を、OKT-3及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張は、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団は、治療的TIL集団であり、第2の拡張は、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行は、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地は、D3、D4、D5、D6またはD7に置き換えられる、第3のTIL集団を産生するステップと、
(f)ステップ(f)から取得された第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取するステップと、
(g)ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すステップと、
(h)任意選択で、凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取された第3
のTIL集団を含む注入バッグを凍結保存するステップと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、ステップ(d)のD0、D1またはD2中に、CD40アゴニスト及び/またはCTLA-4の阻害剤を添加することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、IL-2は、より低い用量のIL-2である。
いくつかの実施形態では、ステップ(d)及び/またはステップ(e)の培養培地は、3000IU/mL以下のIL-2、及び/またはタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(d)及び/またはステップ(e)の培養培地は、IL-15及び/またはIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)の後かつステップ(b)の前に、方法は、複数の腫瘍断片を酵素的に消化して、第1のTIL集団を取得するステップを含む。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団は、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、またはがんからの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から取得される。
いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、及びホノキオールからなる群から選択される。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から腫瘍を切除するステップであって、腫瘍が、第1のTIL集団を含む、切除するステップと、
(b)第1のTIL集団を、IL-2、任意選択でOKT-3(抗CD3抗体)を含み、任意選択でIL-15及び/またはIL-21を含む細胞培養培地中で培養することによって初期拡張(またはプライミングによる第1の拡張)を行うステップであって、プライミングによる第1の拡張が、任意選択で、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、プライミングによる第1の拡張が、約1~8日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、D3、D4、D5、D6またはD7に置き換えられる、初期拡張を行うステップと、
(c)第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団の急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を取得するステップであって、第2の細胞培養培地が、3000IU/mL以下のIL-2、OKT-3(抗CD3抗体)、IL-15及び/またはIL-21、APC、及び/またはタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含み、急速拡張が、14日以内の期間にわたって行われ、任意選択で、急速な第2の拡張が、急速な第2の拡張の開始後1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日にわたって進行することができ、任意選択で、細胞培養培地が、D3、D4、D5、D6またはD7に置き換えられる、第3のTIL集団を取得するステップと、
(d)第3のTIL集団を採取するステップと、
(e)ステップ(d)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(d)から(e)への移行が、系を開くことなく起こる、移すステップと、
(f)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(e)からの採取された第3のTIL集団を含む注入バッグを凍結保存するステップと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、IL-2は、より低い用量のIL-2である。
いくつかの実施形態では、ステップ(b)の培養培地は、3000IU/mL以下のIL-2、及び/またはタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(b)及び/またはステップ(c)の培養培地は、IL-15及び/またはIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、方法は、ステップ(b)のD0、D1またはD2中に、200ng/mlの濃度のIFNγ及びPD-1の阻害剤を添加することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(b)のD0、D1またはD2中に、CD40アゴニスト及び/またはCTLA-4の阻害剤を添加することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団は、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、またはがんからの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から取得される。
いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、及びホノキオールからなる群から選択される。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から腫瘍を切除するステップであって、腫瘍が、第1のTIL集団を含む、切除するステップと、
(b)第1のTIL集団を、IL-2、任意選択でOKT-3(抗CD3抗体)を含み、任意選択でIL-15及び/またはIL-21を含む細胞培養培地中で培養することによって初期拡張(またはプライミングによる第1の拡張)を行うステップであって、プライミングによる第1の拡張が、任意選択で、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、プライミングによる第1の拡張が、約1~8日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、D3、D4、D5、D6またはD7に置き換えられる、初期拡張を行うステップと、
(c)第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団の急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を取得するステップであって、第2の細胞培養培地が、IL-2、OKT-3(抗CD3抗体)、IL-15及び/またはIL-21、APCを含み、急速拡張が、14日以内の期間にわたって行われ、任意選択で、急速な第2の拡張が、急速な第2の拡張の開始後1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日にわたって進行することができ、任意選択で、細胞培養培地が、D3、D4、D5、D6またはD7に置き換えられる、第3のTIL集団を取得するステップと、
(d)第3のTIL集団を採取するステップと、
(e)ステップ(d)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(d)から(e)への移行が、系を開くことなく起こる、移すステップと、
(f)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(e)からの採取された第3のTIL集
団を含む注入バッグを凍結保存するステップと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、IL-2は、より低い用量のIL-2である。
いくつかの実施形態では、ステップ(b)及び/またはステップ(c)の培養培地は、3000IU/mL以下のIL-2、及び/またはタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(b)及び/またはステップ(c)の培養培地は、IL-15及び/またはIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、方法は、ステップ(b)のD0、D1またはD2中に、200ng/mlの濃度のIFNg及びPD-1の阻害剤を添加することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(b)のD0、D1またはD2中に、CD40アゴニスト及び/またはCTLA-4の阻害剤を添加することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団は、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、またはがんからの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から取得される。
いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、及びホノキオールからなる群から選択される。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、この方法は、
(a)がん患者から腫瘍を切除するステップであって、腫瘍が、第1のTIL集団を含む、切除するステップと、
(b)第1のTIL集団を、IL-2、任意選択でOKT-3(抗CD3抗体)を含み、任意選択でIL-15またはIL-21を含む細胞培養培地中で培養することによって初期拡張(またはプライミングによる第1の拡張)を行うステップであって、プライミングによる第1の拡張が、任意選択で、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、プライミングによる第1の拡張が、約1~8日間行われて、第2のTIL集団を取得し、IFNγ及び/またはPD-1の阻害剤が、ステップ(b)のD0、D1またはD2中に添加され、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、任意選択で、細胞培養培地が、D3、D4、D5、D6またはD7に置き換えられる、初期拡張を行うステップと、
(c)第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団の急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を取得するステップであって、第2の細胞培養培地が、IL-2、OKT-3(抗CD3抗体)を含み、かつ任意選択で、IL-15及び/またはIL-21、APCを含み、急速拡張が、14日以内の期間にわたって行われ、任意選択で、急速な第2の拡張が、急速な第2の拡張の開始後1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日にわたって進行することができる、任意選択で、細胞培養培地が、D3、D4、D5、D6またはD7に置き換えられる、第3のTIL集団を取得するステップと、
(d)第3のTIL集団を採取するステップと、
(e)ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移
すステップと、
(h)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取された第3のTIL集団を含む注入バッグを凍結保存するステップと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、IL-2は、より低い用量のIL-2である。
いくつかの実施形態では、ステップ(b)及び/またはステップ(c)の培養培地は、3000IU/mL以下のIL-2、及び/またはタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(b)及び/またはステップ(c)の培養培地は、IL-15及び/またはIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、方法は、ステップ(d)のD0、D1またはD2中に、200ng/mlの濃度のIFNγ及びPD-1の阻害剤を添加することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、方法は、ステップ(d)におけるD0、D1またはD2中に、CD40アゴニスト及び/またはCTLA-4の阻害剤を添加することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)の後かつステップ(b)の前に、方法は、複数の腫瘍断片を酵素的に消化して、第1のTIL集団を取得するステップを含む。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団は、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、またはがんからの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から取得される。
いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、及びホノキオールからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、トリプルネガティブ乳癌、ヒトパピローマウイルスによって引き起こされたがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団は、IFNg(インターフェロンガンマ)、PD-1の阻害剤(例えば、抗PD-1抗体)、CD40アゴニスト(例えば、CD40L、抗CD40アゴニスト抗体)、及び/またはCTLA-4アゴニスト(例えば、抗CTLA-4アゴニスト抗体)で、第1の拡張前に最大約48時間、及び任意選択で、第1の拡張前に24時間または48時間刺激される。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張ステップでは、細胞培養培地は、抗原提示細胞(APC)をさらに含み、急速な第2の拡張ステップにおける培養培地中のAPCの数は、プライミングによる第1の拡張ステップにおける培養培地中のAPCの数より多い。
いくつかの実施形態では、抗原提示細胞(APC)は、第1のTIL集団、第2のTIL集団、または両方に添加される。
いくつかの実施形態では、CD40またはCD40Lは、刺激中、細胞培養培地中に約30ng/mLの初期濃度で存在する。
いくつかの実施形態では、IFNgは、刺激中、細胞培養培地中に約200ng/mLの初期濃度で存在する。
いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に1000IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在する。
いくつかの実施形態では、IL-2は、第2の拡張において、細胞培養培地中に1000IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在する。
いくつかの実施形態では、低用量のIL-2は、1000IU/mL以下を含む。
いくつかの実施形態では、第1の拡張の細胞培養培地は、IL-4、IL-7、IL-15、IL-21、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるサイトカインをさらに含む。
いくつかの実施形態では、第2の拡張の細胞培養培地は、IL-4、IL-7、IL-15、IL-21、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるサイトカインをさらに含む。
いくつかの実施形態では、刺激の細胞培養培地は、IL-4、IL-7、IL-15、IL-21、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるサイトカインをさらに含む。
いくつかの実施形態では、第1の拡張は、約11日の期間にわたって行われる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張は、ガス透過性容器を使用して行われる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張は、ガス透過性容器を使用して行われる。
いくつかの実施形態では、刺激は、ガス透過性容器を使用して行われる。
本発明はまた、本明細書に記載の方法を使用して製造されるTIL集団を提供する。
いくつかの実施形態では、TIL集団は、約2.3×1010~約13.7×1010のTILを含む。
本発明はまた、本明細書に記載のTIL集団を含む薬学的組成物を提供する。
本発明はまた、本明細書に記載のTIL集団またはその薬学的組成物を投与することを含む、がん患者を治療する方法を提供する。
いくつかの実施形態では、方法は、第3のTIL集団を患者に投与する前に、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンで患者を治療するステップをさらに含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日
の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で1日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、シクロホスファミドは、メスナとともに投与される。
いくつかの実施形態では、方法は、TILを患者に投与した翌日に開始するIL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含む。
いくつかの実施形態では、方法は、TILを患者に投与したのと同じ日に開始するIL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含む。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、許容範囲まで8時間毎に15分間のボーラス静脈内注入として投与される、600,000もしくは720,000IU/kgのアルデスロイキン、またはそのバイオシミラーもしくはバリアントを含む高用量IL-2レジメンである。
いくつかの実施形態では、治療上有効なTIL集団が投与され、約2.3×1010~約13.7×1010のTILを含む。
いくつかの実施形態では、TILは、遺伝子修飾されたTILを含み、任意選択で、第1のTIL集団及び/または第2のTIL集団は、CD39及びCD69の発現を減少させるように遺伝子修飾される。
いくつかの実施形態では、TILは、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、及びTOXを含む群から選択される免疫チェックポイント遺伝子のうちの1つ以上の発現を減少させる、遺伝子修飾をさらに含む。
いくつかの実施形態では、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子は、PD-1、CBL-B、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TIGIT、TET2、TGFβ、及びPKAを含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、遺伝子修飾されたTILは、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる遺伝子修飾を
さらに含み、免疫チェックポイント遺伝子(複数可)は、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-21、NOTCH 1/2細胞内ドメイン(ICD)、及び/またはNOTCHリガンドmDLL1を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、遺伝子修飾ステップは、当該1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼを使用して行われる。
いくつかの実施形態では、遺伝子修飾は、CRISPR法、TALE法、ジンクフィンガー法、及びそれらの組み合わせから選択される1つ以上の方法を使用して行われる。
いくつかの実施形態では、方法は、CRISPR法を含む。
いくつかの実施形態では、CRISPR法は、CRISPR/Cas9法である。
いくつかの実施形態では、遺伝子修飾は、TALE法を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子修飾は、ジンクフィンガー法を含む。
いくつかの実施形態では、対象から取得された腫瘍試料を腫瘍消化物に処理することは、腫瘍試料を酵素培地中でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、対象から取得された腫瘍試料を腫瘍消化物に処理することは、腫瘍試料を機械的に破壊して腫瘍試料を解離することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、対象から取得された腫瘍試料を腫瘍消化物に処理することは、密度勾配分離を使用して解離された腫瘍試料を精製することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、酵素培地は、DNaseを含む。
いくつかの実施形態では、酵素培地は、30単位/mLのDNaseを含む。
いくつかの実施形態では、酵素培地は、コラゲナーゼを含む。
いくつかの実施形態では、酵素培地は、1.0mg/mLのコラゲナーゼを含む。
いくつかの実施形態では、採取された治療的TIL集団は、治療上有効な投与量を対象に投与する際に使用するのに十分なTILを含む。
いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約1×10~約9×1010のTILを含む。
いくつかの実施形態では、APCは、末梢血単核細胞(PBMC)を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(e)で採取された治療的TIL集団は、第1及び/または第2のTIL集団と比較して増加したCD4+細胞の亜集団を示す。
いくつかの実施形態では、PBMCは、約1:25のTIL:PBMCの比で補充される。
いくつかの実施形態では、第1の拡張ステップは、約3~11日で行われる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張ステップは、約7~11日で行われる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張及び第2の拡張は、各々、11日の期間内で個別に行われる。
いくつかの実施形態では、ステップにおける第1の拡張及びステップにおける第2の拡張は、各々、11~12日の期間内で個別に行われる。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)~(e)、(f)、(g)、または(h)は、約10日~約24日で行われる。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)~(e)、(f)、(g)、(h)は、約15日~約24日で行われる。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)~(e)、(f)、(g)、または(h)は、約20日~約24日で行われる。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)~(e)、(f)、(g)、(h)は、約20日~約22日で行われる。
いくつかの実施形態では、拡張プロセス(ステップ(a)~(f))は、約22日以内で行われる。
いくつかの実施形態では、拡張プロセス(ステップ(a)~(f))は、約24日以内で行われる。
いくつかの実施形態では、拡張プロセス(ステップ(a)~(f))は、約26日以内で行われる。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張及び急速な第2の拡張は、21日以内の期間にわたって行われる。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張及び急速な第2の拡張は、16日または17日以内の期間にわたって行われる。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、7日または8日以内の期間にわたって行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、11日以内の期間にわたって行われる。
いくつかの実施形態では、第2のTIL集団は、第1のTIL集団よりも数が少なくとも50倍多い。
いくつかの実施形態では、低用量のIL-2は、100~3000IU/mL、任意選択で1000IU/mL未満である。
いくつかの実施形態では、IL-15の濃度は、約10ng/mLである。いくつかの実施形態では、IL-21は、約1ng/mL、約2ng/mL、約3ng/mL、約4ng/mL、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約45ng/mL、約50ng/mL、約55ng/mL、または約60ng/mL、任意選択で、約10ng/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、IL-21の濃度は、約1ng/mL、約2ng/mL、約3ng/mL、約4ng/mL、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約45ng/mL、約50ng/mL、約55ng/mL、または約60ng/mL、任意選択で、約10ng/mLである。
いくつかの実施形態では、AKT阻害剤の濃度は、約1uM、約2uM、約3uM、約4uM、約5uM、約10uM、約20uM、約30uM、約40uM、約50uM、または約100uM、任意選択で約5uMである。
いくつかの実施形態では、刺激のためのIFNg(インターフェロンガンマ)の濃度は、200ng/mlである。
いくつかの実施形態では、PD-1の阻害剤は、抗PD-1抗体である。
いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、ペムブロリズマブまたはニボルマブである。
いくつかの実施形態では、CTLA-4の阻害剤は、抗CTLA-4抗体である。
いくつかの実施形態では、CTLA-4アゴニストは、CTLA-4抗体である。
いくつかの実施形態では、CTLA-4抗体は、イピリムマブ、トレメリムマブ、またはザリフレリマブである。
本発明はまた、本明細書に記載の方法のうちのいずれかによるTIL集団を提供する。
本発明はまた、本明細書に記載の方法のうちのいずれかによる凍結保存されたTIL集団を提供する。
いくつかの実施形態では、IL-2は1000IU/mlであり、IL-21は、10ng/mlであり、AKTiは、5uMである。
本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、
(a)IL-2、任意選択でOKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地中で、がん患者からの腫瘍から取得された第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む容器内で行われ、プライミングによる第1の拡張が、約1~7/8日間の第1の期間行われて、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団の数が第1のTIL集団よりも多く、任意選択で、細胞培養培地が、第1の拡張の3日目、第1の拡張の4日目、第1の拡張の5日目、第1の拡張の6日目、または第1の拡張の7日目に置き換えられる、第2のTIL集団を産生することと、
(b)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及びAPCで補充することによって急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張に追加されるAPCの数が、ステップ(b)で追加されるAPCの数の少なくとも2倍であり、急速な第2の拡張が、約1~11日間の第2の期間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、急速な第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を含む容器内で行われ、任意選択で、細胞培養培地が、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、第2の拡張の5日目、第2の拡張の6日目、または第2の拡張の7日目に置き換えられる、第3のTIL集団を産生することと、
(c)ステップ(b)から取得された治療的TIL集団を採取することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、方法は、
(d)ステップ(c)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すことと、
(e)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(d)からの採取された第3のTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、をさらに含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)における培養培地は、3000IU/mL以下のIL-2、及び/またはタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)またはステップ(b)における培養培地は、タンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)またはステップ(b)における培養培地は、約0.1μM~約10μMの濃度のAKT阻害剤を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)またはステップ(b)における培養培地は、約1μMの濃度のAKT阻害剤を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)及び/またはステップ(b)の培養培地は、IL-15及び/またはIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)及び/またはステップ(b)の培養培地は、約1ng/mL~約100ng/mLの濃度のIL-15及び/またはIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)及び/またはステップ(b)の培養培地は、約10ng/mLの濃度のIL-15及び/またはIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、方法は、ステップ(a)及び/またはステップ(b)のD0、D1またはD2中に、200ng/mlの濃度のIFNγ及び抗PD-1抗体を添加することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(a)及び/またはステップ(b)のD0、D1またはD2中に、CD40アゴニスト及び/またはCTLA-4の阻害剤を添加することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、及びホ
ノキオールからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、AZD5363である。
いくつかの実施形態では、方法は、複数の腫瘍断片を酵素的に消化して、第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を取得するステップを含む。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団は、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、またはがんからの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から取得される。
いくつかの実施形態では、第2の拡張中に、第2のTIL集団を1つ以上の培養物に分割し、IL-2、OKT-3、及びAPCを含む追加の細胞培養培地で補充する。
第2のTIL集団が、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の培養物に分割される、請求項119に記載の方法。
いくつかの実施形態では、第2のTIL集団は、第2の拡張の2日目、第2の拡張の3日目、第2の拡張の4日目、または第2の拡張の5日目に分割される。
いくつかの実施形態では、閉鎖系が、任意選択である、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
いくつかの実施形態では、系が、閉鎖していない、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
本開示のいくつかの実施形態は、本明細書に開示される方法を使用して製造される治療的TIL集団を提供する。
いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、約2.3×1010~約13.7×1010のTILを含む。
いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、約1×10~約1×1011のTILを含む。
いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、増強された多官能性を示す。
いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、より幹様の表現型を示す。
いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、活性化及び/または分化の少ないTILの頻度の増加を示す。
いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、同種異系設定で改善された腫瘍細胞殺傷を示す。
いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、CD27、CD28、CD62L、及びIL-7Rから
なる群から選択されるメモリー関連マーカーの増加した発現を示す。
いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、CD38、CD39、及びCD69からなる群から選択される活性化マーカーの発現の低下を示す。
いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、LAG3、TIM3、TIGIT、及びTOXからなる群から選択される阻害/枯渇関連マーカーの発現の低下を示す。
いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、GZMB、CXCR3、IFNg、TNFa、及びIL-2からなる群から選択される機能的マーカーの発現の増加を示す。
ステップA~Fの概要を提供する例示的なGen2(プロセス2A)チャート。 TIL製造のためのGen2(プロセス2A)の実施形態のプロセスフローチャート。 TIL製造のためのGen2(プロセス2A)の実施形態のプロセスフローチャート。 TIL製造のためのGen2(プロセス2A)の実施形態のプロセスフローチャート。 凍結保存されたTILの例示的な製造プロセス(約22日)の実施形態の図を示す。 TIL製造のための22日プロセスである、Gen2(プロセス2A)の実施形態の図を示す。 TIL製造のためのプロセス1C及びGen2(プロセス2A)の例示的な実施形態からのステップA~Fの比較表。 TIL製造のためのプロセス1Cの実施形態とGen2(プロセス2A)の実施形態との詳細な比較。 例示的なGen3型TIL製造プロセス。 TIL製造のための2Aプロセス(およそ22日プロセス)とGen3プロセス(およそ14日~16日プロセス)の実施形態との比較を示す。 ステップA~Fの概要を提供する例示的なプロセスGen3チャート(およそ14日~16日プロセス)。 3つのプロセスバリエーションの各々について、ステップA~F(およそ14日~16日プロセス)の概要とともに3つの例示的なGen3プロセスを提供するチャート。 ステップA~Fの概要を提供する例示的な修正Gen2様プロセス(およそ22日プロセス)。 2Aプロセス(およそ22日プロセス)とTIL製造のためのGen3プロセス(およそ14日~22日プロセス)の実施形態との比較を示す。 例示的なプロセス(a)CD39/CD69二重陰性、(b)CD39/CD69LO/LO、またはステップA~F(およそ14日~22日プロセス)の概要を提供する(i)及び(ii)TIL拡張方法Gen3チャートの組み合わせ。 (a)CD39/CD69二重陰性、(b)CD39/CD69LO/LO、または本明細書に記載の事前選択を用いる(i)及び(ii)TIL拡張方法の組み合わせの例示的な実施形態。 ステップA~Fの概要を提供する例示的なTS-TILプロセス(およそ22日プロセス)。 ステップA~Fの概要を提供する例示的な修正I-TILプロセス(およそ22日プロセス)。 ステップA~Fの概要を提供する例示的な修正TS-TILプロセス(およそ22日プロセス)。 Gen2(プロセス2A)とGen3プロセスとの比較のための実験フローチャートを提供する。 様々なGen2(プロセス2A)とGen3.1プロセス実施形態との比較を示す。 Gen2、Gen2.1及びGen3.0プロセスの実施形態の様々な特徴を説明する表。 Gen3.1と称される、Gen3プロセスの実施形態のための培地条件の概要。 Gen2、Gen2.1及びGen3.0プロセスの実施形態の様々な特徴を説明する表。 Gen2及びGen3.0プロセスの実施形態の様々な特徴を比較する表。 記載された拡張プロセスの様々な実施形態における培地の使用を提供する表。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3拡張プラットフォームを使用して造血器悪性腫瘍からT細胞を拡張するための方法の例示的な実施形態の概略図。 構造I-A及びI-Bを提供する。円筒は、個々のポリペプチド結合ドメインを指す。構造I-A及びI-Bは、例えば、4-1BBLまたは4-1BBに結合する抗体から誘導される3つの線形に結合したTNFRSF結合ドメインを含み、これらを折り畳んで三価タンパク質を形成し、次いでこれをIgG1-Fc(CH3及びCH2ドメインを含む)によって第2の三価タンパク質に結合し、次いでこれを使用して、三価タンパク質のうちの2つをジスルフィド結合(小さい長楕円)によって一緒に結合し、構造を安定化し、6つの受容体及びシグナル伝達タンパク質の細胞内シグナル伝達ドメインを一緒にして、シグナル伝達複合体を形成することができるアゴニストを提供する。円筒として示されるTNFRSF結合ドメインは、例えば、親水性残基及び柔軟性のためのGly及びSer配列、ならびに溶解性のためのGlu及びLysを含み得るリンカーによって結合されたV鎖及びV鎖を含む、scFvドメインであり得る。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3.1プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態のプロセス概要を提供する。 Gen3.1試験プロセス(16~17日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 例示的なGen2プロセス及び例示的なGen3プロセスの比較表。 例示的なGen2プロセス及び例示的なGen3プロセスの比較表。 Gen3プロセス(16/17日プロセス)の調製タイムラインの例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(14~16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen2、Gen2.1、及びGen3プロセス(16日プロセス)の実施形態の比較。 Gen2、Gen2.1、及びGen3プロセス(16日プロセス)の実施形態の比較。 Gen3実施形態の構成要素。 Gen3実施形態のフローチャート比較(Gen3.0、Gen3.1対照、Gen3.1試験)。 Gen3プロセス(16~17日プロセス)の例示的な実施形態の構成要素が示される。 承認基準表 実施例15のワークフローの概略図。 実施例17のワークフローの概略図。 REP拡張プロセス中に1回または2回与えられるIL-2またはIL-15の異なる濃度を含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 REP拡張プロセス中に1回または2回与えられるIL-2またはIL-15の異なる濃度を含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 REP拡張プロセス中に1回または2回与えられる異なる濃度のIL-2またはIL-15を含む標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)、及び生TILの頻度。 REP拡張プロセス中に1回または2回与えられる異なる濃度のIL-2またはIL-15を含む標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)、及び生TILの頻度。 REP拡張プロセス中に1回または2回与えられる異なる濃度のIL-2またはIL-15を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 REP拡張プロセス中に1回または2回与えられる異なる濃度のIL-2またはIL-15を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 REP拡張プロセス中に1回または2回与えられる異なる濃度のIL-2またはIL-15を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 REP拡張プロセス中に1回または2回与えられる異なる濃度のIL-2またはIL-15を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 REP拡張プロセス中に1回または2回与えられる異なる濃度のIL-2またはIL-15を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 REP拡張プロセス中に1回または2回与えられる異なる濃度のIL-2またはIL-15を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 REP拡張プロセス中に1回または2回与えられる異なる濃度のIL-2またはIL-15を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くTIL拡張(A)及び生存率(B)。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くTIL拡張(A)及び生存率(B)。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くNK、NKT細胞及び生細胞の頻度。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25(B)CD38及び(C)NKG2Dの発現を測定した。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25(B)CD38及び(C)NKG2Dの発現を測定した。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25(B)CD38及び(C)NKG2Dの発現を測定した。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせた標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせた標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間培養後の、(A)CD8+(B)CD4+TIL上のCD40L発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間培養後の、(A)CD8+(B)CD4+TIL上のCD40L発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 I-TILプロセスの実施形態の培地条件の概要。 I-TILプロセスの実施形態の培地条件の概要。 IL-21(30ng/ml)単独、またはPanobinostatの有無にかかわらず異なる用量のIL-2もしくはIL-15と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-21(30ng/ml)単独、またはPanobinostatの有無にかかわらず異なる用量のIL-2もしくはIL-15と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-21(30ng/ml)単独、またはPanobinostatの有無にかかわらず異なる用量のIL-2もしくはIL-15と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのCD8+、CD4+及び生TILの頻度。 IL-21(30ng/ml)単独、またはPanobinostatの有無にかかわらず異なる用量のIL-2もしくはIL-15と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-21(30ng/ml)単独、またはPanobinostatの有無にかかわらず異なる用量のIL-2もしくはIL-15と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-21(30ng/ml)単独、またはPanobinostatの有無にかかわらず異なる用量のIL-2もしくはIL-15と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-21(30ng/ml)単独、またはPanobinostatの有無にかかわらず異なる用量のIL-2もしくはIL-15と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-21(30ng/ml)単独、またはPanobinostatの有無にかかわらず異なる用量のIL-2もしくはIL-15と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-21(30ng/ml)単独、またはPanobinostatの有無にかかわらず異なる用量のIL-2もしくはIL-15と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 IL-21(30ng/ml)単独、またはPanobinostatの有無にかかわらず異なる用量のIL-2もしくはIL-15と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 IL-21または2-HCと組み合わせて異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-21または2-HCと組み合わせて異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-21または2-HCと組み合わせて異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生TILの頻度。 IL-21または2-HCと組み合わせて異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生TILの頻度。 IL-21または2-HCと組み合わせて異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-21または2-HCと組み合わせて異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-21または2-HCと組み合わせて異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-21または2-HCと組み合わせて異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 IL-21または2-HCと組み合わせて異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3及び(E)TIM3の発現を測定した。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件下のTIL拡張(A)及び生存率(B)。 拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらず、IL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件下のTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-21または2-HCと組み合わせて異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 IL-21または2-HCと組み合わせて異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 IL-21または2-HCと組み合わせて異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらずIL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらずIL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらずIL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらずIL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらずIL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。拡張プロセス中に1回または2回添加した場合、1uMのGDC-0068もしくはIL-15単独で、またはIL-21との組み合わせの有無にかかわらずIL-21と組み合わせた異なる濃度のIL-2を含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)、NK、NKT細胞及び生細胞の頻度。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)、NK、NKT細胞及び生細胞の頻度。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)、NK、NKT細胞及び生細胞の頻度。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)、NK、NKT細胞及び生細胞の頻度。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)、NK、NKT細胞及び生細胞の頻度。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)、NK、NKT細胞及び生細胞の頻度。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD4+TIL上の(A)Ki-67(B)PD-1及び(C)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD4+TIL上の(A)Ki-67(B)PD-1及び(C)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、TransActによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD4+TIL上の(A)Ki-67(B)PD-1及び(C)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD4+TIL上の(A)Ki-67(B)PD-1及び(C)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD4+TIL上の(A)Ki-67(B)PD-1及び(C)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD4+TIL上の(A)Ki-67(B)PD-1及び(C)TOX発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間培養後の、(A)CD8+(B)CD4+TIL上のCD40L発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間培養後の、(A)CD8+(B)CD4+TIL上のCD40L発現の頻度。IL-2もしくはIL-15単独、または拡張プロセス中に2回添加された5uM AKTi(GDC-0068)の有無にかかわらず異なる濃度のIL-21と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 異なる濃度のIL-2単独、またはREP前拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のGDC-0068もしくはIL-21(10ng/ml)と組み合わせて含む、修正REP前条件下での倍率拡張(A)及び生存率(B)。 異なる濃度のIL-2単独、またはREP前拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のGDC-0068もしくはIL-21(10ng/ml)と組み合わせて含む、修正REP前条件下での倍率拡張(A)及び生存率(B)。 異なる濃度のIL-2単独、またはREP前拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のGDC-0068もしくはIL-21(10ng/ml)と組み合わせて含む、修正REP前条件下でのCD8 TIL上の(A)CD127及び(B)CD62Lの頻度。 異なる濃度のIL-2単独、またはREP前拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のGDC-0068もしくはIL-21(10ng/ml)と組み合わせて含む、修正REP前条件下でのCD8 TIL上の(A)CD127及び(B)CD62Lの頻度。 異なる濃度のIL-2単独、またはREP前拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のGDC-0068もしくはIL-21(10ng/ml)と組み合わせて含む、修正REP前条件下でのCD8 TIL上の(A)CD69-CD39-及び(B)CD69+CD39+CD8 TILの頻度。 異なる濃度のIL-2単独、またはREP前拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のGDC-0068もしくはIL-21(10ng/ml)と組み合わせて含む、修正REP前条件下でのCD8 TIL上の(A)CD69-CD39-及び(B)CD69+CD39+CD8 TILの頻度。 異なる濃度のIL-2単独、またはREP前拡張プロセス中に2回添加された異なる濃度のGDC-0068もしくはIL-21(10ng/ml)と組み合わせて含む、修正REP前条件下でのTcm様CD8 TILの頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを解凍し、染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD4+TIL上の(A)Ki-67(B)PD-1及び(C)TOX発現の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD4+TIL上の(A)Ki-67(B)PD-1及び(C)TOX発現の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD4+TIL上の(A)Ki-67(B)PD-1及び(C)TOX発現の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間培養後の、(A)CD8+(B)CD4+TIL上のCD40L発現の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間培養後の、(A)CD8+(B)CD4+TIL上のCD40L発現の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)単独、または拡張プロセス中に2回添加された以前に滴定した濃度の異なるAKT阻害剤と組み合わせて含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続くCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD8+TIL上の(A)IFNg(B)TNFa(C)IFNg+TNFa+(D)Ki-67(E)PD-1及び(F)TOX発現の頻度。様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD4+TIL上の(A)Ki-67(B)PD-1及び(C)TOX発現の頻度。様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD4+TIL上の(A)Ki-67(B)PD-1及び(C)TOX発現の頻度。様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間の培養後のCD4+TIL上の(A)Ki-67(B)PD-1及び(C)TOX発現の頻度。様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間培養後の、(A)CD8+(B)CD4+TIL上のCD40L発現の頻度。様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件下でTILを拡張した。 翌日のBrefeldinAの存在下での、aCD3/CD28ビーズによる一晩の刺激及び4時間培養後の、(A)CD8+(B)CD4+TIL上のCD40L発現の頻度。様々な用量のIL-21またはAKT阻害剤MK-2206の有無にかかわらず、より低用量のIL-2を含む、標準または修正REP前条件下でTILを拡張した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)CD8+TILを発現するIL-2の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)CD8+TILを発現するIL-2の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)CD8+TILを発現するIL-2の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)CD4+TILを発現するIL-2の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)CD4+TILを発現するIL-2の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)CD4+TILを発現するIL-2の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のCXCR3発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なるAKT阻害剤とともに含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のCXCR3発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)CD8+TILを発現するIFNg+TNFa+の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)CD8+TILを発現するIFNg+TNFa+の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)CD8+TILを発現するIFNg+TNFa+の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)CD4+TILを発現するIFNg+TNFa+の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)CD4+TILを発現するIFNg+TNFa+の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)CD4+TILを発現するIFNg+TNFa+の頻度。IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)を異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のGZMB発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のGZMB発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のCXCR3発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のCXCR3発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のTOX発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/mlを異なる濃度のAZD5363とともに含む、標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のTOX発現の頻度。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa+(D)CD8+TILを発現するIL-2の頻度。異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa+(D)CD8+TILを発現するIL-2の頻度。異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa+(D)CD8+TILを発現するIL-2の頻度。異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa+(D)CD8+TILを発現するIL-2の頻度。異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa(D)CD4+TILを発現するIL-2の頻度。異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa(D)CD4+TILを発現するIL-2の頻度。異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa(D)CD4+TILを発現するIL-2の頻度。異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa(D)CD4+TILを発現するIL-2の頻度。異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のGZMB発現の頻度。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のGZMB発現の頻度。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のCXCR3発現の頻度。 異なる濃度のIL-2またはIL-15の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のCXCR3発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28(B)CD127(C)PD-1(D)LAG3(E)TIM3及び(F)TIGITの発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25及び(B)CD38の発現を測定した。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa+(D)CD8+TILを発現するIL-2の頻度。TILは、IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件であった。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa+(D)CD8+TILを発現するIL-2の頻度。TILは、IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件であった。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa+(D)CD8+TILを発現するIL-2の頻度。TILは、IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件であった。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa+(D)CD8+TILを発現するIL-2の頻度。TILは、IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件であった。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa(D)CD4+TILを発現するIL-2の頻度。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa(D)CD4+TILを発現するIL-2の頻度。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa(D)CD4+TILを発現するIL-2の頻度。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa(D)CD4+TILを発現するIL-2の頻度。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でTILを拡張した。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のGZMB発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のGZMB発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のCXCR3発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のCXCR3発現の頻度。 Invigo-T拡張プロセスは、TILの収率及び生存率を増加させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 Invigo-T拡張プロセスは、TILの収率及び生存率を増加させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのTIL拡張(A)及び生存率(B)。 Invigo-T拡張プロセスは、Foxp3+細胞の数を減少させながら、CD4+(Foxp3-)細胞の数を増加させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 Invigo-T拡張プロセスは、Foxp3+細胞の数を減少させながら、CD4+(Foxp3-)細胞の数を増加させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 Invigo-T拡張プロセスは、Foxp3+細胞の数を減少させながら、CD4+(Foxp3-)細胞の数を増加させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 Invigo-T拡張プロセスは、Foxp3+細胞の数を減少させながら、CD4+(Foxp3-)細胞の数を増加させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件下でのCD8、CD4(Foxp3-)、CD4(Foxp3+)及び生細胞の頻度。 Invigo-T拡張プロセスは、メモリー関連マーカーの発現を増加させ、阻害性受容体の発現を減少させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28、(B)CD127、(C)PD-1、(D)LAG3、(E)TIM3、(F)TIGIT、(G)CD27、(H)CD62L、(I)IL-7R、及び(J)TOXの発現を測定した。 Invigo-T拡張プロセスは、メモリー関連マーカーの発現を増加させ、阻害性受容体の発現を減少させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28、(B)CD127、(C)PD-1、(D)LAG3、(E)TIM3、(F)TIGIT、(G)CD27、(H)CD62L、(I)IL-7R、及び(J)TOXの発現を測定した。 Invigo-T拡張プロセスは、メモリー関連マーカーの発現を増加させ、阻害性受容体の発現を減少させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28、(B)CD127、(C)PD-1、(D)LAG3、(E)TIM3、(F)TIGIT、(G)CD27、(H)CD62L、(I)IL-7R、及び(J)TOXの発現を測定した。 Invigo-T拡張プロセスは、メモリー関連マーカーの発現を増加させ、阻害性受容体の発現を減少させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28、(B)CD127、(C)PD-1、(D)LAG3、(E)TIM3、(F)TIGIT、(G)CD27、(H)CD62L、(I)IL-7R、及び(J)TOXの発現を測定した。 Invigo-T拡張プロセスは、メモリー関連マーカーの発現を増加させ、阻害性受容体の発現を減少させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28、(B)CD127、(C)PD-1、(D)LAG3、(E)TIM3、(F)TIGIT、(G)CD27、(H)CD62L、(I)IL-7R、及び(J)TOXの発現を測定した。 Invigo-T拡張プロセスは、メモリー関連マーカーの発現を増加させ、阻害性受容体の発現を減少させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28、(B)CD127、(C)PD-1、(D)LAG3、(E)TIM3、(F)TIGIT、(G)CD27、(H)CD62L、(I)IL-7R、及び(J)TOXの発現を測定した。 Invigo-T拡張プロセスは、メモリー関連マーカーの発現を増加させ、阻害性受容体の発現を減少させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28、(B)CD127、(C)PD-1、(D)LAG3、(E)TIM3、(F)TIGIT、(G)CD27、(H)CD62L、(I)IL-7R、及び(J)TOXの発現を測定した。 Invigo-T拡張プロセスは、メモリー関連マーカーの発現を増加させ、阻害性受容体の発現を減少させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28、(B)CD127、(C)PD-1、(D)LAG3、(E)TIM3、(F)TIGIT、(G)CD27、(H)CD62L、(I)IL-7R、及び(J)TOXの発現を測定した。 Invigo-T拡張プロセスは、メモリー関連マーカーの発現を増加させ、阻害性受容体の発現を減少させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28、(B)CD127、(C)PD-1、(D)LAG3、(E)TIM3、(F)TIGIT、(G)CD27、(H)CD62L、(I)IL-7R、及び(J)TOXの発現を測定した。 Invigo-T拡張プロセスは、メモリー関連マーカーの発現を増加させ、阻害性受容体の発現を減少させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD28、(B)CD127、(C)PD-1、(D)LAG3、(E)TIM3、(F)TIGIT、(G)CD27、(H)CD62L、(I)IL-7R、及び(J)TOXの発現を測定した。 Invigo-T拡張プロセスは、TILの活性化状態を低下させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25、(B)CD38、(C)CD39、及び(D)CD69の発現を測定した。 Invigo-T拡張プロセスは、TILの活性化状態を低下させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25、(B)CD38、(C)CD39、及び(D)CD69の発現を測定した。 Invigo-T拡張プロセスは、TILの活性化状態を低下させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25、(B)CD38、(C)CD39、及び(D)CD69の発現を測定した。 Invigo-T拡張プロセスは、TILの活性化状態を低下させる。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TIL上のマーカー発現。TILを染色して、フローサイトメトリーによって(A)CD25、(B)CD38、(C)CD39、及び(D)CD69の発現を測定した。 Invigo-T拡張プロセスは、刺激後のTILで活性化状態の低下を維持する。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。CD38(C)及びCD39(D)の発現は、Brefeldin Aの存在下で6時間1ug/mlでのOKT3刺激後のREP後FACSによって評価された。 Invigo-T拡張プロセスは、刺激後のTILで活性化状態の低下を維持する。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。CD38(C)及びCD39(D)の発現は、Brefeldin Aの存在下で6時間1ug/mlでのOKT3刺激後のREP後FACSによって評価された。 Invigo-T拡張プロセスは、刺激後のTILで活性化状態の低下を維持する。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。CD38(C)及びCD39(D)の発現は、Brefeldin Aの存在下で6時間1ug/mlでのOKT3刺激後のREP後FACSによって評価された。 Invigo-T拡張プロセスは、刺激後のTILで活性化状態の低下を維持する。IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD69+CD39+及び(B)CD69-CD39-CD8+TILの発現。CD38(C)及びCD39(D)の発現は、Brefeldin Aの存在下で6時間1ug/mlでのOKT3刺激後のREP後FACSによって評価された。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続くCD8+及びCD4+TILにおけるPD-1及びTIM3サブセットの頻度。(A)PD-1+TIM3+TILの頻度及び(B)PD-1-TIM3-TIL。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa+(D)IL-2及び(E)CD8+TILを発現するIFNg+TNFa+IL-2+の頻度。TILは、IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件であった。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa+(D)IL-2及び(E)CD8+TILを発現するIFNg+TNFa+IL-2+の頻度。TILは、IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件であった。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa+(D)IL-2及び(E)CD8+TILを発現するIFNg+TNFa+IL-2+の頻度。TILは、IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件であった。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa+(D)IL-2及び(E)CD8+TILを発現するIFNg+TNFa+IL-2+の頻度。TILは、IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件であった。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa+(D)IL-2及び(E)CD8+TILを発現するIFNg+TNFa+IL-2+の頻度。TILは、IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件であった。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa(D)IL-2及び(E)CD4+TILを発現するIFNg+TNFa+IL-2+の頻度。TILは、IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件であった。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa(D)IL-2及び(E)CD4+TILを発現するIFNg+TNFa+IL-2+の頻度。TILは、IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件であった。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa(D)IL-2及び(E)CD4+TILを発現するIFNg+TNFa+IL-2+の頻度。TILは、IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件であった。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa(D)IL-2及び(E)CD4+TILを発現するIFNg+TNFa+IL-2+の頻度。TILは、IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件であった。 Brefeldin A及びMonensinの存在下、プレート結合OKT3による6時間刺激後の(A)IFNg(B)TNFa及び(C)IFNg+TNFa(D)IL-2及び(E)CD4+TILを発現するIFNg+TNFa+IL-2+の頻度。TILは、IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件であった。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+及び(C)CD107a+TIL上のGZMB発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+及び(C)CD107a+TIL上のGZMB発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+及び(C)CD107a+TIL上のGZMB発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のCXCR3発現の頻度。 IL-2(1000IU/ml)またはIL-15(10ng/ml)の存在下、IL-21(10ng/ml)及びAZD5363を含む標準または修正REP条件に続く(A)CD8+及び(B)CD4+TIL上のCXCR3発現の頻度。 Invigo-T拡張プロセスは、TILの多機能性を増加させる。示される各プロセスによって拡張されたCD8+TILについて、Brefeldin Aの存在下で6時間、1ug/mlでのOKT3刺激後に、REP後FACSによってサイトカイン発現を評価した。CD4+TILについて同様の結果が観察された(図示せず)。 Invigo-T拡張プロセスは、TILの多機能性を増加させる。示される各プロセスによって拡張されたCD8+TILについて、Brefeldin Aの存在下で6時間、1ug/mlでのOKT3刺激後に、REP後FACSによってサイトカイン発現を評価した。CD4+TILについて同様の結果が観察された(図示せず)。 Invigo-T拡張プロセスは、TILの多機能性を増加させる。示される各プロセスによって拡張されたCD8+TILについて、Brefeldin Aの存在下で6時間、1ug/mlでのOKT3刺激後に、REP後FACSによってサイトカイン発現を評価した。CD4+TILについて同様の結果が観察された(図示せず)。 Invigo-T拡張プロセスは、同種異系設定においてTIL細胞傷害性を増加させる。示されたプロセスによって産生されたTILを(A)10:1のエフェクター対標的細胞の比でKILR(登録商標)THP-1細胞と24時間共培養して、同種異系設定における細胞傷害性を測定し、(B、C)を3日毎にTransActで刺激した後、KILR(登録商標)THP-1細胞と24時間共培養し、フローサイトメトリー染色した。対照及びInvigo-T処理したTILを、自己腫瘍細胞と24時間共培養した。IFNgレベルを、24時間後にELISAによって測定した(D、E)。 Invigo-T拡張プロセスは、同種異系設定においてTIL細胞傷害性を増加させる。示されたプロセスによって産生されたTILを(A)10:1のエフェクター対標的細胞の比でKILR(登録商標)THP-1細胞と24時間共培養して、同種異系設定における細胞傷害性を測定し、(B、C)を3日毎にTransActで刺激した後、KILR(登録商標)THP-1細胞と24時間共培養し、フローサイトメトリー染色した。対照及びInvigo-T処理したTILを、自己腫瘍細胞と24時間共培養した。IFNgレベルを、24時間後にELISAによって測定した(D、E)。 Invigo-T拡張プロセスは、同種異系設定においてTIL細胞傷害性を増加させる。示されたプロセスによって産生されたTILを(A)10:1のエフェクター対標的細胞の比でKILR(登録商標)THP-1細胞と24時間共培養して、同種異系設定における細胞傷害性を測定し、(B、C)を3日毎にTransActで刺激した後、KILR(登録商標)THP-1細胞と24時間共培養し、フローサイトメトリー染色した。対照及びInvigo-T処理したTILを、自己腫瘍細胞と24時間共培養した。IFNgレベルを、24時間後にELISAによって測定した(D、E)。 Invigo-T拡張プロセスは、同種異系設定においてTIL細胞傷害性を増加させる。示されたプロセスによって産生されたTILを(A)10:1のエフェクター対標的細胞の比でKILR(登録商標)THP-1細胞と24時間共培養して、同種異系設定における細胞傷害性を測定し、(B、C)を3日毎にTransActで刺激した後、KILR(登録商標)THP-1細胞と24時間共培養し、フローサイトメトリー染色した。対照及びInvigo-T処理したTILを、自己腫瘍細胞と24時間共培養した。IFNgレベルを、24時間後にELISAによって測定した(D、E)。 Invigo-T拡張プロセスは、同種異系設定においてTIL細胞傷害性を増加させる。示されたプロセスによって産生されたTILを(A)10:1のエフェクター対標的細胞の比でKILR(登録商標)THP-1細胞と24時間共培養して、同種異系設定における細胞傷害性を測定し、(B、C)を3日毎にTransActで刺激した後、KILR(登録商標)THP-1細胞と24時間共培養し、フローサイトメトリー染色した。対照及びInvigo-T処理したTILを、自己腫瘍細胞と24時間共培養した。IFNgレベルを、24時間後にELISAによって測定した(D、E)。 (A)CD8+TIL上及び(B)CD4+TIL上で、Invigo-Tで観察された全体的な表現型変化。 (A)CD8+TIL上及び(B)CD4+TIL上で、Invigo-Tで観察された全体的な表現型変化。 対照またはInvigo-T拡張したTILのバルクTCRseqからの結果。バルクTCRb配列決定は、対照またはInvigo-T処理したTIL上で行った。図示されるのは、(A)対照対Invigo-Tのシャノン多様性指数(B)及びシンプソンクローン性指数である。データは、群当たり平均±SD及びn=5として示される。 対照またはInvigo-T拡張したTILのバルクTCRseqからの結果。バルクTCRb配列決定は、対照またはInvigo-T処理したTIL上で行った。図示されるのは、(A)対照対Invigo-Tのシャノン多様性指数(B)及びシンプソンクローン性指数である。データは、群当たり平均±SD及びn=5として示される。 CTRL試料とInvigo-T scRNAseq試料との間の異なる予測細胞型分布。単一細胞RNA配列決定(scRNAseq)を、対照及びInvigo-T処理したTIL上で行った。(A)自動化参照アトラス予測細胞型アノテーションに基づいてラベル付けされたUMAP次元削減可視化。(B)対照(左)対Invigo-T(右)の参照マッピング結果のUMAP可視化。(C)対照群対Invigo-T群の平均クラスター頻度のバープロット可視化。 CTRL試料とInvigo-T scRNAseq試料との間の異なる予測細胞型分布。単一細胞RNA配列決定(scRNAseq)を、対照及びInvigo-T処理したTIL上で行った。(A)自動化参照アトラス予測細胞型アノテーションに基づいてラベル付けされたUMAP次元削減可視化。(B)対照(左)対Invigo-T(右)の参照マッピング結果のUMAP可視化。(C)対照群対Invigo-T群の平均クラスター頻度のバープロット可視化。 CTRL試料とInvigo-T scRNAseq試料との間の異なる予測細胞型分布。単一細胞RNA配列決定(scRNAseq)を、対照及びInvigo-T処理したTIL上で行った。(A)自動化参照アトラス予測細胞型アノテーションに基づいてラベル付けされたUMAP次元削減可視化。(B)対照(左)対Invigo-T(右)の参照マッピング結果のUMAP可視化。(C)対照群対Invigo-T群の平均クラスター頻度のバープロット可視化。 CTRLとInvigo-T拡張TILとの間の別個のCD8 T細胞クラスター分布。群(左)及びSeurat定義クラスター(右)に基づいて着色されたCD8 T細胞UMAP次元削減可視化。 Invigo-Tは、CD8+TIL上の疲弊関連遺伝子を低減しながら、幹様細胞に関連する遺伝子を濃縮する。(A)対照群とInvigo-T群とを比較した、CD8 T細胞サブセットにおける上位20個の差異的に発現された遺伝子のヒートマップ可視化。(B)対照群とInvigo-T群とを比較した、幹細胞性(左)疲弊(中)または代謝(右)に関連する特定の目的の遺伝子のCD8 T細胞サブセットヒートマップ可視化。(C)対照対InvigoTによってグループ化された各試料についてのUCellスコア平均の行zスコアを示す、幹または疲弊遺伝子シグネチャのCD8 T細胞サブセット遺伝子セットヒートマップ可視化。 Invigo-Tは、CD8+TIL上の疲弊関連遺伝子を低減しながら、幹様細胞に関連する遺伝子を濃縮する。(A)対照群とInvigo-T群とを比較した、CD8 T細胞サブセットにおける上位20個の差異的に発現された遺伝子のヒートマップ可視化。(B)対照群とInvigo-T群とを比較した、幹細胞性(左)疲弊(中)または代謝(右)に関連する特定の目的の遺伝子のCD8 T細胞サブセットヒートマップ可視化。(C)対照対InvigoTによってグループ化された各試料についてのUCellスコア平均の行zスコアを示す、幹または疲弊遺伝子シグネチャのCD8 T細胞サブセット遺伝子セットヒートマップ可視化。 Invigo-Tは、CD8+TIL上の疲弊関連遺伝子を低減しながら、幹様細胞に関連する遺伝子を濃縮する。(A)対照群とInvigo-T群とを比較した、CD8 T細胞サブセットにおける上位20個の差異的に発現された遺伝子のヒートマップ可視化。(B)対照群とInvigo-T群とを比較した、幹細胞性(左)疲弊(中)または代謝(右)に関連する特定の目的の遺伝子のCD8 T細胞サブセットヒートマップ可視化。(C)対照対InvigoTによってグループ化された各試料についてのUCellスコア平均の行zスコアを示す、幹または疲弊遺伝子シグネチャのCD8 T細胞サブセット遺伝子セットヒートマップ可視化。 Invigo-Tは、CD8+TIL上の疲弊関連遺伝子を低減しながら、幹様細胞に関連する遺伝子を濃縮する。(A)対照群とInvigo-T群とを比較した、CD8 T細胞サブセットにおける上位20個の差異的に発現された遺伝子のヒートマップ可視化。(B)対照群とInvigo-T群とを比較した、幹細胞性(左)疲弊(中)または代謝(右)に関連する特定の目的の遺伝子のCD8 T細胞サブセットヒートマップ可視化。(C)対照対InvigoTによってグループ化された各試料についてのUCellスコア平均の行zスコアを示す、幹または疲弊遺伝子シグネチャのCD8 T細胞サブセット遺伝子セットヒートマップ可視化。 Invigo-Tは、CD8+TIL上の疲弊関連遺伝子を低減しながら、幹様細胞に関連する遺伝子を濃縮する。(A)対照群とInvigo-T群とを比較した、CD8 T細胞サブセットにおける上位20個の差異的に発現された遺伝子のヒートマップ可視化。(B)対照群とInvigo-T群とを比較した、幹細胞性(左)疲弊(中)または代謝(右)に関連する特定の目的の遺伝子のCD8 T細胞サブセットヒートマップ可視化。(C)対照対InvigoTによってグループ化された各試料についてのUCellスコア平均の行zスコアを示す、幹または疲弊遺伝子シグネチャのCD8 T細胞サブセット遺伝子セットヒートマップ可視化。 Invigo-Tは、応答に関連するCD39-CD69-遺伝子クラスターを濃縮する。対照とInvigo-Tとを比較した、Krishna et al.,Science 2020 Dec 11;370(6522):1328-1334からの(A)CD39-CD69-及び(B)CD39+CD69+遺伝子シグネチャについてのCD8 T細胞サブセットUCellスコアのバイオリンプロット。(C)対照とInvigo-Tとを比較した、目的の他の遺伝子シグネチャについてのCD8 T細胞サブセットUCellスコアのバイオリンプロット。 Invigo-Tは、応答に関連するCD39-CD69-遺伝子クラスターを濃縮する。対照とInvigo-Tとを比較した、Krishna et al.,Science 2020 Dec 11;370(6522):1328-1334からの(A)CD39-CD69-及び(B)CD39+CD69+遺伝子シグネチャについてのCD8 T細胞サブセットUCellスコアのバイオリンプロット。(C)対照とInvigo-Tとを比較した、目的の他の遺伝子シグネチャについてのCD8 T細胞サブセットUCellスコアのバイオリンプロット。 Invigo-Tは、応答に関連するCD39-CD69-遺伝子クラスターを濃縮する。対照とInvigo-Tとを比較した、Krishna et al.,Science 2020 Dec 11;370(6522):1328-1334からの(A)CD39-CD69-及び(B)CD39+CD69+遺伝子シグネチャについてのCD8 T細胞サブセットUCellスコアのバイオリンプロット。(C)対照とInvigo-Tとを比較した、目的の他の遺伝子シグネチャについてのCD8 T細胞サブセットUCellスコアのバイオリンプロット。 Invigo-Tは、応答に関連するCD39-CD69-遺伝子クラスターを濃縮する。対照とInvigo-Tとを比較した、Krishna et al.,Science 2020 Dec 11;370(6522):1328-1334からの(A)CD39-CD69-及び(B)CD39+CD69+遺伝子シグネチャについてのCD8 T細胞サブセットUCellスコアのバイオリンプロット。(C)対照とInvigo-Tとを比較した、目的の他の遺伝子シグネチャについてのCD8 T細胞サブセットUCellスコアのバイオリンプロット。 Invigo-Tは、応答に関連するCD39-CD69-遺伝子クラスターを濃縮する。対照とInvigo-Tとを比較した、Krishna et al.,Science 2020 Dec 11;370(6522):1328-1334からの(A)CD39-CD69-及び(B)CD39+CD69+遺伝子シグネチャについてのCD8 T細胞サブセットUCellスコアのバイオリンプロット。(C)対照とInvigo-Tとを比較した、目的の他の遺伝子シグネチャについてのCD8 T細胞サブセットUCellスコアのバイオリンプロット。 Invigo-Tは、応答に関連するCD39-CD69-遺伝子クラスターを濃縮する。対照とInvigo-Tとを比較した、Krishna et al.,Science 2020 Dec 11;370(6522):1328-1334からの(A)CD39-CD69-及び(B)CD39+CD69+遺伝子シグネチャについてのCD8 T細胞サブセットUCellスコアのバイオリンプロット。(C)対照とInvigo-Tとを比較した、目的の他の遺伝子シグネチャについてのCD8 T細胞サブセットUCellスコアのバイオリンプロット。 Invigo-Tは、応答に関連するCD39-CD69-遺伝子クラスターを濃縮する。対照とInvigo-Tとを比較した、Krishna et al.,Science 2020 Dec 11;370(6522):1328-1334からの(A)CD39-CD69-及び(B)CD39+CD69+遺伝子シグネチャについてのCD8 T細胞サブセットUCellスコアのバイオリンプロット。(C)対照とInvigo-Tとを比較した、目的の他の遺伝子シグネチャについてのCD8 T細胞サブセットUCellスコアのバイオリンプロット。 Invigo-T処理したCD8TILは、メモリー関連遺伝子の発現の増加を示す。対照とInvigo-Tとを比較した、目的の特定の遺伝子のCD8 T細胞サブセットの正規化した発現のバイオリンプロット。 Invigo-T処理したCD8TILは、メモリー関連遺伝子の発現の増加を示す。対照とInvigo-Tとを比較した、目的の特定の遺伝子のCD8 T細胞サブセットの正規化した発現のバイオリンプロット。 Invigo-T処理したCD8TILは、メモリー関連遺伝子の発現の増加を示す。対照とInvigo-Tとを比較した、目的の特定の遺伝子のCD8 T細胞サブセットの正規化した発現のバイオリンプロット。 擬時間軌道分析は、より分化した細胞のサブセットを伴う、低分化状態でのInvigo-T処理したCD8 TILの大部分を示す。Invigo-Tは、CD8+TIL上のクラスター3対2を比較すると、改善された表現型を示す。(A)群(左)及びMonocle3定義の擬時間(右)に基づいて着色されたCD8 T細胞UMAP次元削減可視化。(B)対照とInvigo-Tとを比較した、CD8 T細胞サブセットMonocle3擬時間のバイオリンプロット。(C)赤色のボックスを介して強調表示された最も分化したクラスター(2及び3)のうちの2つを有する、群(左)及びSeurat定義されたクラスター(右)に基づいて着色された、CD8 T細胞UMAP次元削減可視化。(D)対照(クラスター2)とInvigo-T(クラスター3)とを比較した、強調表示されたクラスターにおける上位20個の差異的に発現された遺伝子のヒートマップ可視化。データは、他に言及されない限り、すべての値の分布として示され、群当たりn=5であり、p値は、マン-ホイットニーU検定に基づいている。 擬時間軌道分析は、より分化した細胞のサブセットを伴う、低分化状態でのInvigo-T処理したCD8 TILの大部分を示す。Invigo-Tは、CD8+TIL上のクラスター3対2を比較すると、改善された表現型を示す。(A)群(左)及びMonocle3定義の擬時間(右)に基づいて着色されたCD8 T細胞UMAP次元削減可視化。(B)対照とInvigo-Tとを比較した、CD8 T細胞サブセットMonocle3擬時間のバイオリンプロット。(C)赤色のボックスを介して強調表示された最も分化したクラスター(2及び3)のうちの2つを有する、群(左)及びSeurat定義されたクラスター(右)に基づいて着色された、CD8 T細胞UMAP次元削減可視化。(D)対照(クラスター2)とInvigo-T(クラスター3)とを比較した、強調表示されたクラスターにおける上位20個の差異的に発現された遺伝子のヒートマップ可視化。データは、他に言及されない限り、すべての値の分布として示され、群当たりn=5であり、p値は、マン-ホイットニーU検定に基づいている。 擬時間軌道分析は、より分化した細胞のサブセットを伴う、低分化状態でのInvigo-T処理したCD8 TILの大部分を示す。Invigo-Tは、CD8+TIL上のクラスター3対2を比較すると、改善された表現型を示す。(A)群(左)及びMonocle3定義の擬時間(右)に基づいて着色されたCD8 T細胞UMAP次元削減可視化。(B)対照とInvigo-Tとを比較した、CD8 T細胞サブセットMonocle3擬時間のバイオリンプロット。(C)赤色のボックスを介して強調表示された最も分化したクラスター(2及び3)のうちの2つを有する、群(左)及びSeurat定義されたクラスター(右)に基づいて着色された、CD8 T細胞UMAP次元削減可視化。(D)対照(クラスター2)とInvigo-T(クラスター3)とを比較した、強調表示されたクラスターにおける上位20個の差異的に発現された遺伝子のヒートマップ可視化。データは、他に言及されない限り、すべての値の分布として示され、群当たりn=5であり、p値は、マン-ホイットニーU検定に基づいている。 擬時間軌道分析は、より分化した細胞のサブセットを伴う、低分化状態でのInvigo-T処理したCD8 TILの大部分を示す。Invigo-Tは、CD8+TIL上のクラスター3対2を比較すると、改善された表現型を示す。(A)群(左)及びMonocle3定義の擬時間(右)に基づいて着色されたCD8 T細胞UMAP次元削減可視化。(B)対照とInvigo-Tとを比較した、CD8 T細胞サブセットMonocle3擬時間のバイオリンプロット。(C)赤色のボックスを介して強調表示された最も分化したクラスター(2及び3)のうちの2つを有する、群(左)及びSeurat定義されたクラスター(右)に基づいて着色された、CD8 T細胞UMAP次元削減可視化。(D)対照(クラスター2)とInvigo-T(クラスター3)とを比較した、強調表示されたクラスターにおける上位20個の差異的に発現された遺伝子のヒートマップ可視化。データは、他に言及されない限り、すべての値の分布として示され、群当たりn=5であり、p値は、マン-ホイットニーU検定に基づいている。 CD4 TIL上の差異的遺伝子発現分析。対照群とInvigo-T群とを比較した、CD4 T細胞サブセットにおける上位20個の差異的に発現された遺伝子のヒートマップ可視化。 擬時間軌道分析は、対照TILと比較して、低分化状態でのInvigo-T処理したCD4 TILの大部分を示す。(A)群(左)及びMonocle3定義の擬時間(右)に基づいて着色されたCD4 T細胞UMAP次元削減可視化。(B)対照とInvigo-Tとを比較した、CD4 T細胞サブセットMonocle3擬時間のバイオリンプロット。 擬時間軌道分析は、対照TILと比較して、低分化状態でのInvigo-T処理したCD4 TILの大部分を示す。(A)群(左)及びMonocle3定義の擬時間(右)に基づいて着色されたCD4 T細胞UMAP次元削減可視化。(B)対照とInvigo-Tとを比較した、CD4 T細胞サブセットMonocle3擬時間のバイオリンプロット。 Invigo-T処理したCD4 TILは、対照処理したTILと比較して、メモリー関連遺伝子の発現の増加及び疲弊関連遺伝子シグネチャの発現の低下を示す。(A)対照対Invigo-Tによってグループ化された各試料についてのUCellスコア平均の行zスコアを示す、幹または疲弊遺伝子シグネチャのCD4 T細胞サブセット遺伝子セットヒートマップ可視化。(B)対照とInvigo-Tとを比較した、目的の特定の遺伝子のCD4 T細胞サブセットの正規化発現のバイオリンプロット。データは、他に言及されない限り、すべての値の分布として示され、群当たりn=5である。 Invigo-T処理したCD4 TILは、対照処理したTILと比較して、メモリー関連遺伝子の発現の増加及び疲弊関連遺伝子シグネチャの発現の低下を示す。(A)対照対Invigo-Tによってグループ化された各試料についてのUCellスコア平均の行zスコアを示す、幹または疲弊遺伝子シグネチャのCD4 T細胞サブセット遺伝子セットヒートマップ可視化。(B)対照とInvigo-Tとを比較した、目的の特定の遺伝子のCD4 T細胞サブセットの正規化発現のバイオリンプロット。データは、他に言及されない限り、すべての値の分布として示され、群当たりn=5である。 Invigo-T処理したCD4 TILは、対照処理したTILと比較して、メモリー関連遺伝子の発現の増加及び疲弊関連遺伝子シグネチャの発現の低下を示す。(A)対照対Invigo-Tによってグループ化された各試料についてのUCellスコア平均の行zスコアを示す、幹または疲弊遺伝子シグネチャのCD4 T細胞サブセット遺伝子セットヒートマップ可視化。(B)対照とInvigo-Tとを比較した、目的の特定の遺伝子のCD4 T細胞サブセットの正規化発現のバイオリンプロット。データは、他に言及されない限り、すべての値の分布として示され、群当たりn=5である。 Invigo-T処理したCD4 TILは、対照処理したTILと比較して、メモリー関連遺伝子の発現の増加及び疲弊関連遺伝子シグネチャの発現の低下を示す。(A)対照対Invigo-Tによってグループ化された各試料についてのUCellスコア平均の行zスコアを示す、幹または疲弊遺伝子シグネチャのCD4 T細胞サブセット遺伝子セットヒートマップ可視化。(B)対照とInvigo-Tとを比較した、目的の特定の遺伝子のCD4 T細胞サブセットの正規化発現のバイオリンプロット。データは、他に言及されない限り、すべての値の分布として示され、群当たりn=5である。 Invigo-T処理したCD4 TILは、対照処理したTILと比較して、メモリー関連遺伝子の発現の増加及び疲弊関連遺伝子シグネチャの発現の低下を示す。(A)対照対Invigo-Tによってグループ化された各試料についてのUCellスコア平均の行zスコアを示す、幹または疲弊遺伝子シグネチャのCD4 T細胞サブセット遺伝子セットヒートマップ可視化。(B)対照とInvigo-Tとを比較した、目的の特定の遺伝子のCD4 T細胞サブセットの正規化発現のバイオリンプロット。データは、他に言及されない限り、すべての値の分布として示され、群当たりn=5である。 Invigo-T処理したCD4 TILは、対照処理したTILと比較して、メモリー関連遺伝子の発現の増加及び疲弊関連遺伝子シグネチャの発現の低下を示す。(A)対照対Invigo-Tによってグループ化された各試料についてのUCellスコア平均の行zスコアを示す、幹または疲弊遺伝子シグネチャのCD4 T細胞サブセット遺伝子セットヒートマップ可視化。(B)対照とInvigo-Tとを比較した、目的の特定の遺伝子のCD4 T細胞サブセットの正規化発現のバイオリンプロット。データは、他に言及されない限り、すべての値の分布として示され、群当たりn=5である。
配列表の簡単な説明
配列番号1は、ムロモナブの重鎖のアミノ酸配列である。
配列番号2は、ムロモナブの軽鎖のアミノ酸配列である。
配列番号3は、組換えヒトIL-2タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号4は、アルデスロイキンのアミノ酸配列である。
配列番号5は、IL-2形態である。
配列番号6は、ネムバロイキンアルファのアミノ酸配列である。
配列番号7は、IL-2形態である。
配列番号8は、ムチンドメインポリペプチドである。
配列番号9は、組換えヒトIL-4タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号10は、組換えヒトIL-7タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号11は、組換えヒトIL-15タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号12は、組換えヒトIL-21タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号13は、IL-2配列である。
配列番号14は、IL-2ムテイン配列である。
配列番号15は、IL-2ムテイン配列である。
配列番号16は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR1_IL-2である。
配列番号17は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR2である。
配列番号18は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR3である。
配列番号19は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR1_IL-2カバットである。
配列番号20は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR2カバットである。
配列番号21は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR3カバットである。
配列番号22は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR1_IL-2クロチアである。
配列番号23は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR2クロチアである。
配列番号24は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR3クロチアである。
配列番号25は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR1_IL-2 IMGTである。
配列番号26は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR2 IMGTである。
配列番号27は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR3 IMGTである。
配列番号28は、IgG.IL2R67A.H1のV鎖である。
配列番号29は、IgG.IL2R67A.H1の重鎖である。
配列番号30は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR1カバットである。
配列番号31は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR2カバットである。
配列番号32は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR3カバットである。
配列番号33は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR1 chothiaである。
配列番号34は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR2 chothiaである。
配列番号35は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR3 chothiaである。
配列番号36は、V鎖である。
配列番号37は、軽鎖である。
配列番号38は、軽鎖である。
配列番号39は、軽鎖である。
配列番号40は、ヒト4-1BBのアミノ酸配列である。
配列番号41は、マウス4-1BBのアミノ酸配列である。
配列番号42は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖である。
配列番号43は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖である。
配列番号44は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖可変領域(V)である。
配列番号45は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号46は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖CDR1である。
配列番号47は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖CDR2である。
配列番号48は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖CDR3である。
配列番号49は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖CDR1である。
配列番号50は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖CDR2である。
配列番号51は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖CDR3である。
配列番号52は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖である。
配列番号53は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖である。
配列番号54は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖可変領域(VH)である。
配列番号55は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖可変領域(VL)である。
配列番号56は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖CDR1である。
配列番号57は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖CDR2である。
配列番号58は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖CDR3である。
配列番号59は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖CDR1である。
配列番号60は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖CDR2である。
配列番号61は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖CDR3である。
配列番号62は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のFcドメインである。
配列番号63は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号64は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号65は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号66は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号67は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号68は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号69は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号70は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号71は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号72は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号73は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のFcドメインである。
配列番号74は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号75は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号76は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号77は、4-1BBリガンド(4-1BBL)アミノ酸配列である。
配列番号78は、4-1BBLポリペプチドの可溶性部分である。
配列番号79は、4-1BBアゴニスト抗体4B4-1-1バージョン1の重鎖可変領域(V)である。
配列番号80は、4-1BBアゴニスト抗体4B4-1-1バージョン1の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号81は、4-1BBアゴニスト抗体4B4-1-1バージョン2の重鎖可変領域(V)である。
配列番号82は、4-1BBアゴニスト抗体4B4-1-1バージョン2の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号83は、4-1BBアゴニスト抗体H39E3-2の重鎖可変領域(V)である。
配列番号84は、4-1BBアゴニスト抗体H39E3-2の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号85は、ヒトOX40のアミノ酸配列である。
配列番号86は、マウスOX40のアミノ酸配列である。
配列番号87は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖である。
配列番号88は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の軽鎖である。
配列番号89は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖可変領域(V)である。
配列番号90は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI
-0562)の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号91は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖CDR1である。
配列番号92は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖CDR2である。
配列番号93は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖CDR3である。
配列番号94は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の軽鎖CDR1である。
配列番号95は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の軽鎖CDR2である。
配列番号96は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の軽鎖CDR3である。
配列番号97は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖である。
配列番号98は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖である。
配列番号99は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖可変領域(V)である。
配列番号100は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号101は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖CDR1である。
配列番号102は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖CDR2である。
配列番号103は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖CDR3である。
配列番号104は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖CDR1である。
配列番号105は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖CDR2である。
配列番号106は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖CDR3である。
配列番号107は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖である。
配列番号108は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖である。
配列番号109は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖可変領域(V)である。
配列番号110は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号111は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖CDR1である。
配列番号112は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖CDR2である。
配列番号113は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖CDR3である。
配列番号114は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖CDR1である。
配列番号115は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖CDR2である。
配列番号116は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖CDR3である。
配列番号117は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の重鎖可変領域(V)である。
配列番号118は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号119は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の重鎖CDR1である。
配列番号120は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の重鎖CDR2である。
配列番号121は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の重鎖CDR3である。
配列番号122は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の軽鎖CDR1である。
配列番号123は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の軽鎖CDR2である。
配列番号124は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の軽鎖CDR3である。
配列番号125は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の重鎖可変領域(V)である。
配列番号126は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号127は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の重鎖CDR1である。
配列番号128は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の重鎖CDR2である。
配列番号129は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の重鎖CDR3である。
配列番号130は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の軽鎖CDR1である。
配列番号131は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の軽鎖CDR2である。
配列番号132は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の軽鎖CDR3である。
配列番号133は、OX40リガンド(OX40L)アミノ酸配列である。
配列番号134は、OX40Lポリペプチドの可溶性部分である。
配列番号135は、OX40Lポリペプチドの代替可溶性部分である。
配列番号136は、OX40アゴニストモノクローナル抗体008の重鎖可変領域(V)である。
配列番号137は、OX40アゴニストモノクローナル抗体008の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号138は、OX40アゴニストモノクローナル抗体011の重鎖可変領域(V)である。
配列番号139は、OX40アゴニストモノクローナル抗体011の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号140は、OX40アゴニストモノクローナル抗体021の重鎖可変領域(V)である。
配列番号141は、OX40アゴニストモノクローナル抗体021の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号142は、OX40アゴニストモノクローナル抗体023の重鎖可変領域(V)である。
配列番号143は、OX40アゴニストモノクローナル抗体023の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号144は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号145は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号146は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号147は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号148は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号149は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号150は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号151は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号152は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号153は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号154は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号155は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号156は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号157は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号158は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号159は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号160は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号161は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号162は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号163は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号164は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号165は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号166は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号167は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号168は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号169は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号170は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号171は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号172は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号173は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号174は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号175は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号176は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号177は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号178は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号179は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号180は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号181は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号182は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号183は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号184は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号185は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号186は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号187は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号188は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号189は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号190は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号191は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号192は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号193は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号194は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号195は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号196は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号197は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号198は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号199は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号200は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号201は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号202は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号203は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号204は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号205は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号206は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号207は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号208は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号209は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号210は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号211は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号212は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号213は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号214は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号215は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号216は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号217は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列であ
る。
配列番号218は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号219は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号220は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号221は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号222は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号223は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号224は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号225は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号226は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号227は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号228は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号229は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号230は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号231は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号232は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号233は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号234は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号235は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列で
ある。
配列番号236は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号237は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号238は、CD40アゴニストCD40Lである。
I.導入
(i)インターフェロンガンマ(IFN-γ)及び抗PD-1の組み合わせによる、CD40アゴニズムの有無にかかわらず、かつCTLA-4アゴニズムの有無にかかわらず、REP前刺激、(ii)REP拡張及び/またはREP前拡張中に、IL-15、IL-21、低濃度IL-2などの様々なサイトカイン組み合わせを、AKT阻害(AKTi)の有無にかかわらず添加すること、及び/または(iii)REP拡張及び/またはREP前拡張中に低濃度IL-2及びAKTiを添加することによる、TILを産生する方法が、本明細書で提供される。かかるTILを使用する治療方法もまた、本明細書で提供される。
定義
他に定義されない限り、本明細書で使用されるすべての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解される意味と同じである。本明細書で参照されるすべての特許及び刊行物は、参照によりそれらの全体が組み込まれる。
本明細書で使用される「同時投与」、「同時投与すること」、「組み合わせて投与される」、「組み合わせて投与すること」、「同時(simultaneous)」、及び「同時(concurrent)」という用語は、対象への2つ以上の医薬品有効成分(本発明のいくつかの実施形態では、例えば、複数のTIL)の投与を包含し、医薬品有効成分及び/またはそれらの代謝物の両方が、対象において同時に存在するようにする。同時投与には、別々の組成物での同時投与、別々の組成物での異なる時間での投与、または2つ以上の医薬品有効成分が存在する組成物での投与が含まれる。別々の組成物での同時投与及び両方の薬剤が存在する組成物での投与が好ましい。
「インビボ」という用語は、対象の体内で起こる事象を指す。
「インビトロ」という用語は、対象の体外で起こる事象を指す。インビトロアッセイには、生きている細胞または死んでいる細胞が用いられる細胞ベースのアッセイが包含され、無傷の細胞が用いられない無細胞アッセイも含み得る。
「エクスビボ」という用語は、対象の体から除去された細胞、組織、及び/または器官に対する治療または処置の実施を伴う事象を指す。適切には、細胞、組織、及び/または器官は、外科手術または治療の方法で対象の体に戻され得る。
「急速拡張」という用語は、1週間の期間にわたって少なくとも約3倍(または4、5、6、7、8、もしくは9倍)、より好ましくは1週間の期間にわたって少なくとも約10倍(または20、30、40、50、60、70、80、もしくは90倍)、あるいは最も好ましくは1週間の期間にわたって少なくとも約100倍の抗原特異的TILの数の増加を意味する。本明細書では、いくつかの急速拡張プロトコルが説明されている。
本明細書における「腫瘍浸潤リンパ球」または「TIL」とは、対象の血流を離れて腫瘍に移動した白血球として最初に取得された細胞の集団を意味する。TILには、CD8細胞傷害性T細胞(リンパ球)、Th1及びTh17 CD4T細胞、ナチュラルキラー細胞、樹状細胞、ならびにM1マクロファージが含まれるが、これらに限定されない。TILには、一次TIL及び二次TILの両方が含まれる。「一次TIL」は、本明細書に概説されるように患者組織試料から得られるもの(「新たに採取された」と称されることもある)であり、「二次TIL」は、本明細書で考察される拡張または増殖された任意のTIL細胞集団であり、バルクTIL及び拡張TIL(「REP TIL」または「post-REP TIL」)が含まれるが、これらに限定されない。TIL細胞集団には、遺伝子修飾TILが含まれ得る。
TILは、一般に、細胞表面マーカーを使用して生化学的に定義されるか、または腫瘍に浸潤して治療を達成するそれらの能力によって機能的に定義されるかのいずれかであり得る。TILは、一般に、CD4、CD8、TCRαβ、CD27、CD28、CD56、CCR7、CD45Ra、CD95、PD-1、及びCD25のうちの1つ以上のバイオマーカーの発現によって分類され得る。追加として及び代替的に、TILは、患者への再導入時に固形腫瘍に浸潤する能力により機能的に定義され得る。TILは、効力によってさらに特徴付けられ得、例えば、インターフェロン(IFN)放出が、約50pg/mLを超える、約100pg/mLを超える、約150pg/mLを超える、または約200pg/mLを超える場合、TILは強力であるとみなされ得る。例えば、インターフェロン(IFNγ)放出が、約50pg/mLを超える、約100pg/mLを超える、約150pg/mLを超える、または約200pg/mLを超える、約300pg/mLを超える、約400pg/mLを超える、約500pg/mLを超える、約600pg/mLを超える、約700pg/mLを超える、約800pg/mLを超える、約900pg/mL、約1000pg/mLを超える場合、TILは強力であるとみなされ得る。
「CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL」または「CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団」または前述のうちのいずれかの文法的変型は、参照されるTILまたはTIL集団が取得される任意のTIL/TIL集団と比較して、平均して検出不能な、低い、または低下したレベルの細胞表面タンパク質CD39及びCD69を示すTILまたはTIL集団を意味する。
「CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL」または「CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団」または前述のうちのいずれかの文法的変型は、参照されるTILまたはTIL集団が取得される任意のTIL/TIL集団と比較して、平均して検出不能な、低い、または低下したレベルの細胞表面タンパク質CD39及びCD69を有するTILについて濃縮されたTILまたはTIL集団を意味する。任意の濃縮手段を使用して、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TILを取得することができ、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILの選別または選択が含まれる。
本明細書における「細胞の集団」(TILを含む)とは、共通の形質を共有するいくつかの細胞を意味する。一般に、集団は、概して1×10~1×1010の数の範囲であり、異なるTIL集団は、異なる数を含む。例えば、IL-2の存在下での一次TILの初期成長は、およそ1×10細胞のバルクTIL集団をもたらす。REP拡張は、一般に、注入用の1.5×10~1.5×1010細胞の集団を提供するために行われる。
本明細書における「凍結保存されたTIL」とは、一次、バルク、または拡張(REP
TIL)のいずれかのTILが、約-150℃~-60℃の範囲で処理及び保管されることを意味する。凍結保存のための一般的な方法は、実施例を含む本明細書の他の場所にも記載されている。明確にするために、「凍結保存されたTIL」は、一次TILのソースとして使用される可能性のある凍結組織試料と区別することができる。
本明細書における「解凍された凍結保存TIL」とは、以前に凍結保存され、その後、細胞培養温度またはTILが患者に投与され得る温度を含むがこれらに限定されない、室温以上に戻るように処理されたTIL集団を意味する。
TILは、一般に、細胞表面マーカーを使用して生化学的に定義されるか、または腫瘍に浸潤して治療を達成するそれらの能力によって機能的に定義されるかのいずれかであり得る。TILは、一般に、CD4、CD8、TCRαβ、CD27、CD28、CD56、CCR7、CD45Ra、CD95、PD-1、及びCD25のうちの1つ以上のバイオマーカーの発現によって分類され得る。追加として及び代替的に、TILは、患者への再導入時に固形腫瘍に浸潤する能力により機能的に定義され得る。
「凍結保存培地(cryopreservation media)」または「凍結保存培地(cryopreservation medium)」という用語は、細胞の凍結保存に使用できる任意の培地を指す。かかる培地は、7%~10%のDMSOを含む培地を含むことができる。例示的な培地には、CryoStor CS10、Hyperthermasol、及びそれらの組み合わせが含まれる。「CS10」という用語は、Stemcell TechnologiesまたはBiolife Solutionsから入手した凍結保存培地を指す。CS10培地は、商品名「CryoStor(登録商標)CS10」と称され得る。CS10培地は、DMSOを含む無血清の動物成分を含まない培地である。
「セントラルメモリーT細胞」という用語は、ヒトではCD45R0+であり、CCR7(CCR7)及びCD62L(CD62)を構成的に発現するT細胞のサブセットを指す。セントラルメモリーT細胞の表面表現型には、TCR、CD3、CD127(IL-7R)、及びIL-15Rも含まれる。セントラルメモリーT細胞の転写因子には、BCL-6、BCL-6B、MBD2、及びBMI1が含まれる。セントラルメモリーT細胞は、TCRトリガー後、エフェクター分子としてIL-2及びCD40Lを主に分泌する。セントラルメモリーT細胞は、血液中のCD4コンパートメントで優勢であり、ヒトではリンパ節及び扁桃腺において比例して濃縮される。
「エフェクターメモリーT細胞」という用語は、セントラルメモリーT細胞と同様にCD45R0+であるが、CCR7の構成的発現を失い(CCR7)、CD62L発現が不均一であるかまたは低い(CD62L)、ヒトまたは哺乳動物T細胞のサブセットを指す。セントラルメモリーT細胞の表面表現型には、TCR、CD3、CD127(IL-7R)、及びIL-15Rも含まれる。セントラルメモリーT細胞の転写因子には、BLIMP1が含まれる。エフェクターメモリーT細胞は、インターフェロンガンマ、IL-4、及びIL-5を含む、抗原刺激後に高レベルの炎症性サイトカインを急速に分泌する。エフェクターメモリーT細胞は、血液中のCD8コンパートメントで優勢であり、ヒトでは肺、肝臓、及び腸において比例して濃縮される。CD8+エフェクターメモリーT細胞は、大量のパーフォリンを担持する。
「閉鎖系」という用語は、外部環境に対して閉鎖されている系を指す。細胞培養法に適した任意の閉鎖系を、本発明の方法で用いることができる。閉鎖系には、例えば、密閉G容器が含まれるが、これに限定されない。腫瘍セグメントが閉鎖系に付加されると、TI
Lを患者に投与する準備ができるまで、系は外部環境に開かれない。
腫瘍を破壊するためのプロセスを説明するために本明細書で使用される「断片化すること」、「断片」、及び「断片化された」という用語は、腫瘍組織を破砕、スライス、分割、及び細切するなどの機械的断片化法、ならびに腫瘍組織の物理的構造を破壊するための任意の他の方法を含む。
「末梢血単核細胞」及び「PBMC」という用語は、リンパ球(T細胞、B細胞、NK細胞)及び単球を含む、丸い核を有する末梢血細胞を指す。抗原提示細胞として使用される場合(PBMCは抗原提示細胞の一種である)、末梢血単核細胞は、好ましくは、放射線照射された同種異系末梢血単核細胞である。
「末梢血リンパ球」及び「PBL」という用語は、末梢血から拡張したT細胞を指す。いくつかの実施形態では、PBLは、ドナーからの全血またはアフェレーシス産物から分離される。いくつかの実施形態では、PBLは、CD3+CD45+のT細胞表現型などのT細胞表現型の正または負の選択によって、ドナー由来の全血またはアフェレーシス産物から分離される。
「抗CD3抗体」という用語は、成熟T細胞のT細胞抗原受容体におけるCD3受容体に対するヒト、ヒト化、キメラ、またはマウス抗体を含む、抗体またはそのバリアント、例えば、モノクローナル抗体を指す。抗CD3抗体には、ムロモナブとしても知られるOKT-3が含まれる。抗CD3抗体には、T3及びCD3εとしても知られるUHCT1クローンも含まれる。他の抗CD3抗体には、例えば、オテリキシズマブ、テプリズマブ、及びビシリズマブが含まれる。
「OKT-3」(本明細書では「OKT3」とも称される)という用語は、成熟T細胞のT細胞抗原受容体におけるCD3受容体に対するヒト、ヒト化、キメラ、またはマウス抗体を含む、モノクローナル抗体またはそのバイオシミラーもしくはバリアントを指し、市販の形態、例えば、OKT-3(30ng/mL、MACS GMP CD3 pure、Miltenyi Biotech,Inc.,San Diego,CA,USA)及びムロモナブ、またはそれらのバリアント、保存的アミノ酸置換物、グリコフォーム、またはバイオシミラーを含む。ムロモナブの重鎖及び軽鎖のアミノ酸配列を表1に示す(配列番号1及び配列番号2)。OKT-3を産生することができるハイブリドーマは、American Type Culture Collectionに寄託され、ATCC受託番号CRL8001が割り当てられている。OKT-3を産生することができるハイブリドーマは、European Collection of Authenticated Cell Cultures(ECACC)にも寄託され、カタログ番号86022706が割り当てられている。
「IL-2」(本明細書では「IL2」とも称される)という用語は、インターロイキン-2として知られるT細胞成長因子を指し、ヒト及び哺乳動物形態、保存的アミノ酸置換物、グリコフォーム、バイオシミラー、及びバリアントを含む、IL-2のすべての形態を含む。IL-2は、例えば、Nelson,J.Immunol.2004,172,3983-88及びMalek,Annu.Rev.Immunol.2008,26,453-79に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-2のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号3)。例えば、IL-2という用語は、アルデスロイキン(PROLEUKIN、単回使用バイアル当たり2200万IUで複数の供給業者から市販されている)などのヒト組換えIL-2形態、ならびにCellGenix,Inc.,Portsmouth,NH,USA(CELLGRO GMP)またはProSpec-Tany TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USAによって市販されている組換えIL-2形態(カタログ番号CYT-209-b)及び他のベンダーからの他の商用同等物を包含する。アルデスロイキン(デス-アラニル-1、セリン-125ヒトIL-2)は、およそ15kDaの分子量を有する非グリコシル化ヒト組換えIL-2形態である。本発明での使用に好適なアルデスロイキンのアミノ酸配列を表2に示す(配列番号4)。IL-2という用語はまた、ペグ化IL2プロドラッグベンペガルデスロイキン(NKTR-214、平均6個のリジン残基が[(2,7-ビス{[メチルポリ(オキシエチレン)]カルバモイル}-9H-フルオレン-9-イル)メトキシ]カルボニル)で置換されたNである、配列番号4のようなペグ化ヒト組換えIL-2)を含む、本明細書に記載のIL-2のペグ化形態も包含し、Nektar Therapeutics(South San Francisco,CA,USA)から入手可能であるか、または国際特許出願公開第WO2018/132496 A1号の実施例19に記載の方法、または米国特許出願公開第2019/0275133 A1号の実施例1に記載の方法など、当該技術分野で知られている方法によって調製することができ、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。本発明での使用に好適なベンペガルデスロイキン(NKTR-214)及び他のペグ化IL-2分子は、米国特許出願公開第2014/0328791 A1号及び国際特許出願公開第WO2012/065086 A1号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。本発明での使用に好適な複合化IL-2の代替形態は、米国特許第4,766,106号、同第5,206,344号、同第5,089,261号、及び同第4,902,502号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。本発明での使用に好適なIL-2の製剤は、米国特許第6,706,289号に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、Synthorx,Inc.から入手可能なTHOR-707である。本発明での使用に好適なTHOR-707及びIL-2の追加の代替形態の調製ならびに特性は、米国特許出願公開第2020/0181220 A1号及び同第2020/0330601 A1号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、単離及び精製IL-2ポリペプチドと、K35、T37、R38、T41、F42、K43、F44、Y45、E61、E62、E68、K64、P65、V69、L72、及びY107から選択されるアミノ酸位置で単離及び精製IL - 2ポリペプチドに結合する複合部分と、を含む、インターロイキン2(IL-2)複合体であり、アミノ酸残基の番号付けは配列番号5に対応する。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、T37、R38、T41、F42、F44、Y45、E61、E62、E68、K64、P65、V69、L72、及びY107から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、T37、R38、T41、F42、F44、Y45、E61、E62、E68、P65、V69、L72、及びY107から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、T37、T41、F42、F44、Y45、P65、V69、L72、及びY107から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、R38及びK64から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、E61、E62、及びE68から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、E62である。いくつかの実施形態では、K35、T37、R38、T41、F42、K43、F44、Y45、E61、E62、E68、K64、P65、V69、L72、及びY107から選択されるアミノ酸残基は、リジン、システイン、またはヒスチジンにさらに変異する。いくつかの実施形態では、アミノ酸残基は、システインに変異する。いくつかの実施形態では、アミノ酸残基は、リジンに変異する。いくつかの実施形態では、K35、T37、R38、T41、F42、K43、F44、Y45、E61、E62、E68、K64、P65、V69、L72、及びY107から選択されるアミノ酸残基は、非天然アミノ酸にさらに変異する。いくつかの実施形態では、非天然アミノ酸は、N6-アジドエトキシ-L-リジン(AzK)、N6-プロパルギルエトキシ-L-リジン(PraK)、BCN-L-リジン、ノルボルネンリジン、TCO-リジン、メチルテトラジンリジン、アリルオキシカルボニルリジン、2-アミノ-8-オキソノナン酸、2-アミノ-8-オキソオクタン酸、p-アセチル-L-フェニルアラニン、p-アジドメチル-L-フェニルアラニン(pAMF)、p-ヨード-L-フェニルアラニン、m-アセチルフェニルアラニン、2-アミノ-8-オキソノナン酸、p-プロパルギルオキシフェニルアラニン、p-プロパルギル-フェニルアラニン、3-メチル-フェニルアラニン、L-ドーパ、フッ素化フェニルアラニン、イソプロピル-L-フェニルアラニン、p-アジド-L-フェニルアラニン、p-アシル-L-フェニルアラニン、p-ベンゾイル-L-フェニルアラニン、p-ブロモフェニルアラニン、p-アミノ-L-フェニルアラニン、イソプロピル-L-フェニルアラニン、O-アリルチロシン、O-メチル-L-チロシン、O-4-アリル-L-チロシン、4-プロピル-L-チロシン、ホスホノチロシン、トリ-O-アセチル-GlcNAcp-セリン、L-ホスホセリン、ホスホノセリン、L-3-(2-ナフチル)アラニン、2-アミノ-3-((2-((3-(ベンジルオキシ)-3-オキソプロピル)アミノ)エチル)セラニル)プロパン酸、2-アミノ-3-(フェニルセラニル)プロパン酸、またはセレノシステインを含む。いくつかの実施形態では、IL-2複合体は、野生型IL-2ポリペプチドと比較して、IL-2受容体α(IL-2Rα)サブユニットに対する減少した親和性を有する。いくつかの実施形態では、減少した親和性は、野生型IL-2ポリペプチドと比較して、IL-2Rαに対する結合親和性の約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、99%、または99%を超える減少である。いくつかの実施形態では、減少した親和性は、野生型IL-2ポリペプチドと比較して、約1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、30倍、50倍、100倍、200倍、300倍、500倍、1000倍以上である。いくつかの実施形態では、複合部分は、IL-2
とIL-2Rαとの結合を損なうかまたは遮断する。いくつかの実施形態では、複合部分は、水溶性ポリマーを含む。いくつかの実施形態では、追加の複合部分は、水溶性ポリマーを含む。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、ポリエチレングリコール(PEG)、ポリ(プロピレングリコール)(PPG)、エチレングリコール及びプロピレングリコールのコポリマー、ポリ(オキシエチル化ポリオール)、ポリ(オレフィンアルコール)、ポリ(ビニルピロリドン)、ポリ(ヒドロキシアルキルメタクリルアミド)、ポリ(ヒドロキシアルキルメタクリレート)、ポリ(サッカライド)、ポリ(α-ヒドロキシ酸)、ポリ(ビニルアルコール)、ポリホスファゼン、ポリオキサゾリン(POZ)、ポリ(N-アクリロイルモルホリン)、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、PEGを含む。いくつかの実施形態では、PEGは、直鎖状PEGまたは分岐状PEGである。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、ポリサッカライドを含む。いくつかの実施形態では、ポリサッカライドは、デキストラン、ポリシアル酸(PSA)、ヒアルロン酸(HA)、アミロース、ヘパリン、ヘパランサルフェート(HS)、デキストリン、またはヒドロキシエチルデンプン(HES)を含む。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、グリカンを含む。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、ポリアミンを含む。いくつかの実施形態では、複合部分は、タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、追加の複合部分は、タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質の各々は、独立して、アルブミン、トランスフェリン、またはトランスサイレチンを含む。いくつかの実施形態では、タンパク質の各々は、独立して、Fc部分を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質の各々は、独立して、IgGのFc部分を含む。いくつかの実施形態では、複合部分は、ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、追加の複合部分は、ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、タンパク質の各々は、独立して、XTENペプチド、グリシンリッチホモアミノ酸ポリマー(HAP)、PASポリペプチド、エラスチン様ポリペプチド(ELP)、CTPペプチド、またはゼラチン様タンパク質(GLK)ポリマーを含む。いくつかの実施形態では、単離及び精製IL-2ポリペプチドは、グルタミル化によって修飾される。いくつかの実施形態では、複合部分は、単離及び精製IL-2ポリペプチドと直接的に結合される。いくつかの実施形態では、複合部分は、リンカーを介して単離及び精製されたIL-2ポリペプチドと間接的に結合される。いくつかの実施形態では、リンカーは、ホモ二官能性リンカーを含む。いくつかの実施形態では、ホモ二官能性リンカーは、ロマント試薬ジチオビス(スクシンイミジルプロピオネート)DSP、3′3′-ジチオビス(スルホスクシンイミジルプロピオネート)(DTSSP)、ジスクシンイミジルスベラート(DSS)、ビス(スルホスクシンイミジル)スベラート(BS)、ジスクシンイミジルタータラート(DST)、ジスルホスクシンイミジルタータラート(スルホDST)、エチレングリコビス(スクシンイミジルスクシネート)(EGS)、ジスクシンイミジルグルタラート(DSG)、N,N′-ジスクシンイミジルカーボナート(DSC)、ジメチルアジピミデート(DMA)、ジメチルピメリミデート(DMP)、ジメチルスベリミデート(DMS)、ジメチル-3,3′-ジチオビスプロピオンイミデート(DTBP)、1,4-ジ-(3′-(2′-ピリジルジチオ)プロピオンアミド)ブタン(DPDPB)、ビスマレイミドヘキサン(BMH)、ハロゲン化アリール含有化合物(DFDNB)、例えば、1,5-ジフルオロ-2,4-ジニトロベンゼンまたは1,3-ジフルオロ-4,6-ジニトロベンゼン、4,4′-ジフルオロ-3,3′-ジニトロフェニルスルホン(DFDNPS)、ビス-[β-(4-アジドサリチルアミド)エチル]ジスルフィド(BASED)、ホルムアルデヒド、グルタルアルデヒド、1,4-ブタンジオールジグリシジルエーテル、アジピン酸ジヒドラジド、カルボヒドラジド、o-トルイジン、3,3′-ジメチルベンジジン、ベンジジン、α,α′-p-ジアミノジフェニル、ジヨード-p-キシレンスルホン酸、N,N′-エチレン-ビス(ヨードアセトアミド)、またはN,N′-ヘキサメチレンビス(ヨードアセトアミド)を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、ヘテロ二官能性リンカーを含む。いくつかの実施形態では、ヘテロ二官能性リンカーは
、N-スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート(sPDP)、長鎖N-スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート(LC-sPDP)、水溶性長鎖N-スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート(スルホ-LC-sPDP)、スクシンイミジルオキシカルボニル-α-メチル-α-(2-ピリジルジチオ)トルエン(sMPT)、スルホスクシンイミジル-6-[α-メチル-α-(2-ピリジルジチオ)トルアミド]ヘキサノエート(スルホ-LC-sMPT)、スクシンイミジル-4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(sMCC)、スルホスクシンイミジル-4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(スルホ-sMCC)、m-マレイミドベンゾイル-N-ヒドロキシスクシンイミドエステル(MB)、m-マレイミドベンゾイル-N-ヒドロキシスルホスクシンイミドエステル(スルホ-MB)、N-スクシンイミジル(4-ヨードアセチル)アミノベンゾエート(sIAB)、スルホスクシンイミジル(4-ヨードアセチル)アミノベンゾエート(スルホ-sIAB)、スクシンイミジル-4-(p-マレイミドフェニル)ブチレート(sMPB)、スルホスクシンイミジル-4-(p-マレイミドフェニル)ブチレート(スルホ-sMPB)、N-(γ-マレイミドブチリルオキシ)スクシンイミドエステル(GMB)、N-(γ-マレイミドブチリルオキシ)スルホスクシンイミドエステル(スルホ-GMB)、スクシンイミジル6-((ヨードアセチル)アミノ)ヘキサノエート(sIAX)、スクシンイミジル6-[6-(((ヨードアセチル)アミノ)ヘキサノイル)アミノ]ヘキサノエート(slAXX)、スクシンイミジル4-(((ヨードアセチル)アミノ)メチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(sIAC)、スクシンイミジル6-(((((4-ヨードアセチル)アミノ)メチル)シクロヘキサン-1-カルボニル)アミノ)ヘキサノエート(sIACX)、p-ニトロフェニルヨードアセテート(NPIA)、カルボニル反応性及びスルフヒドリル反応性架橋剤、例えば、4-(4-N-マレイミドフェニル)酪酸ヒドラジド(MPBH)、4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシル-ヒドラジド-8(M2C2H)、3-(2-ピリジルジチオ)プロピオニルヒドラジド(PDPH)、N-ヒドロキシスクシンイミジル-4-アジドサリチル酸(NHs-AsA)、N-ヒドロキシスルホスクシンイミジル-4-アジドサリチル酸(スルホ-NHs-AsA)、スルホスクシンイミジル-(4-アジドサリチルアミド)ヘキサノエート(スルホ-NHs-LC-AsA)、スルホスクシンイミジル-2-(p-アジドサリチルアミド)エチル-1,3’-ジチオプロピオネート(sAsD)、N-ヒドロキシスクシンイミジル-4-アジドベンゾエート(HsAB)、N-ヒドロキシスルホスクシンイミジル-4-アジドベンゾエート(スルホ-HsAB)、N-スクシンイミジル-6-(4’-アジド-2’-ニトロフェニルアミノ)ヘキサノエート(sANPAH)、スルホスクシンイミジル-6-(4’-アジド-2’-ニトロフェニルアミノ)ヘキサノエート(スルホ-sANPAH)、N-5-アジド-2-ニトロベンゾイルオキシスクシンイミド(ANB-NO)、スルホスクシンイミジル-2-(m-アジド-o-ニトロベンズアミド)-エチル-1,3’-ジチオプロピオネート(sAND)、N-スクシンイミジル-4(4-アジドフェニル)1,3’-ジチオプロピオネート(sADP)、N-スルホスクシンイミジル(4-アジドフェニル)-1,3’-ジチオプロピオネート(スルホ-sADP)、スルホスクシンイミジル4-(ρ-アジドフェニル)ブチレート(スルホ-sAPB)、スルホスクシンイミジル2-(7-アジド-4-メチルクマリン-3-アセトアミド)エチル-1,3’-ジチオプロピオネート(sAED)、スルホスクシンイミジル7-アジド-4-メチルクマリン-3-アセテート(スルホ-sAMCA)、p-ニトロフェニルジアゾピルベート(pNPDP)、p-ニトロフェニル-2-ジアゾ-3,3,3-トリフルオロプロピオネート(PNP-DTP)、1-(ρ-アジドサリチルアミド)-4-(ヨードアセトアミド)ブタン(AsIB)、N-[4-(ρ-アジドサリチルアミド)ブチル]-3’-(2’-ピリジルジチオ)プロピオンアミド(APDP)、ベンゾフェノン-4-ヨードアセトアミド、p-アジドベンゾイルヒドラジド(ABH)、4-(ρ-アジドサリチルアミド)ブチルアミン(AsBA)、またはp-アジドフェニルグリオキサール(APG)を含む。い
くつかの実施形態では、リンカーは、任意選択でジペプチドリンカーを含む、切断可能なリンカーを含む。いくつかの実施形態では、ジペプチドリンカーは、Val-Cit、Phe-Lys、Val-Ala、またはVal-Lysを含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、切断不可能なリンカーを含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、任意選択で、マレイミドカプロイル(mc)、スクシンイミジル-4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(sMCC)、またはスルホスクシンイミジル-4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(スルホ-sMCC)を含むマレイミド基を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、スペーサーをさらに含む。いくつかの実施形態では、スペーサーは、p-アミノベンジルアルコール(PAB)、p-アミノベンジルオキシカルボニル(PABC)、その誘導体、または類似体を含む。いくつかの実施形態では、複合部分は、IL-2複合体の血清半減期を延長することができる。いくつかの実施形態では、追加の複合部分は、IL-2複合体の血清半減期を延長することができる。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、本明細書に記載のIL-2形態のうちのいずれかの断片である。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、米国特許出願公開第2020/0181220 A1号及び米国特許出願公開第2020/0330601 A1号に開示されているようにペグ化されている。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ポリエチレングリコール(PEG)を含む複合部分に共有結合したN6-アジドエトキシ-L-リジン(AzK)を含むIL-2ポリペプチドを含む、IL-2複合体であり、IL-2ポリペプチドは、配列番号5と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、AzKは、配列番号5内のアミノ酸位置に関して、K35位、F42位、F44位、K43位、E62位、P65位、R38位、T41位、E68位、Y45位、V69位、またはL72位でアミノ酸を置換する。いくつかの実施形態では、IL-2ポリペプチドは、配列番号5に対して1残基のN末端欠失を含む。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、IL-2Rアルファ鎖会合を欠いているが、中間親和性IL-2Rベータ-ガンマシグナル伝達複合体との正常な結合を保持している。
いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ポリエチレングリコール(PEG)を含む複合部分に共有結合したN6-アジドエトキシ-L-リジン(AzK)を含むIL-2ポリペプチドを含む、IL-2複合体であり、IL-2ポリペプチドは、配列番号5と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、AzKは、配列番号5内のアミノ酸位置に関して、K35位、F42位、F44位、K43位、E62位、P65位、R38位、T41位、E68位、Y45位、V69位、またはL72位でアミノ酸を置換する。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ポリエチレングリコール(PEG)を含む複合部分に共有結合したN6-アジドエトキシ-L-リジン(AzK)を含むIL-2ポリペプチドを含む、IL-2複合体であり、IL-2ポリペプチドは、配列番号5と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、AzKは、配列番号5内のアミノ酸位置に関して、K35位、F42位、F44位、K43位、E62位、P65位、R38位、T41位、E68位、Y45位、V69位、またはL72位でアミノ酸を置換する。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ポリエチレングリコール(PEG)を含む複合部分に共有結合したN6-アジドエトキシ-L-リジン(AzK)を含むIL-2ポリペプチドを含む、IL-2複合体であり、IL-2ポリペプチドは、配列番号5と少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、AzKは、配列番号5内のアミノ酸位置に関して、K35位、F42位、F44位、K43位、E62位、P65位、R38位、T41位、E68位、Y45位、V69位、またはL72位でアミノ酸を置換する。
いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ALKS-4230(配列番号6)としても知られるネムバロイキンアルファであり、Alkermes,
Inc.から入手可能である。ネムバロイキンアルファは、ペプチジルリンカー(60GG61)を介してヒトインターロイキン2断片(62-132)と融合し、ペプチジルリンカー(133GSGGGS138)を介してヒトインターロイキン2受容体α鎖断片(139-303)と融合し、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞で産生され、グリコシル化されている、ヒトインターロイキン2断片(1-59)、バリアント(Cys125>Ser51);Gペプチドリンカー(60-61)を介してヒトインターロイキン2(IL-2)(4-74)-ペプチド(62-132)と融合し、GSGSペプチドリンカー(133-138)を介してヒトインターロイキン2受容体α鎖(IL2Rサブユニットアルファ、IL2Rα、IL2RA)(1-165)-ペプチド(139-303)と融合し、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞で産生され、アルファグリコシル化されている、ヒトインターロイキン2(IL-2)(75-133)-ペプチド[Cys125(51)>Ser]-変異体(1-59)としても知られている。ネムバロイキンアルファのアミノ酸配列は、配列番号6に示されている。いくつかの実施形態では、ネムバロイキンアルファは、以下の翻訳後修飾を示す:以下の位置でのジスルフィド架橋:31-116、141-285、184-242、269-301、166-197、または166-199、168-199または168-197(配列番号6の番号付けを使用する)、及び以下の位置でのグリコシル化部位:配列番号6の番号付けを使用する、N187、N206、T212。ネムバルイキン アルファの調製及び特性、ならびに本発明での使用に好適な追加の代替形態のIL-2は、米国特許出願公開第2021/0038684 A1号及び米国特許第10,183,979号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、配列番号6と少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも90%の配列同一性を有するタンパク質である。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、配列番号6で示されるアミノ酸配列またはその保存的アミノ酸置換を有する。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、配列番号7のアミノ酸24~452、またはそのバリアント、断片、もしくは誘導体を含む融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、配列番号7のアミノ酸24~452と少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列、またはそのバリアント、断片、もしくは誘導体を含む融合タンパク質である。本発明での使用に好適な他のIL-2形態は、米国特許第10,183,979号に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。任意選択で、いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ムチンドメインポリペプチドリンカーによって第2の融合パートナーと連結された第1の融合パートナーを含む融合タンパク質であり、第1の融合パートナーは、IL-1Rα、またはIL-1Rαと少なくとも98%のアミノ酸配列同一性を有し、IL-Rαの受容体アンタゴニスト活性を有するタンパク質であり、第2の融合パートナーは、Fc領域を含む免疫グロブリンの全部または一部を含み、ムチンドメインポリペプチドリンカーは、配列番号8、または配列番号8と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、融合タンパク質の半減期は、ムチンドメインポリペプチドリンカーの非存在下での第2の融合パートナーとの第1の融合パートナーの融合と比較して改善される。

いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、相補性決定領域HCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、重鎖可変領域(V)と、LCDR1、LCDR2、LCDR3を含む軽鎖可変領域(V)と、VまたはVのCDRに移植されたIL-2分子またはその断片と、を含む抗体サイトカイン移植タンパク質を含み、抗体サイトカイン移植タンパク質は、制御性T細胞よりもTエフェクター細胞を優先的に拡張させる。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、相補性決定領域HCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、重鎖可変領域(V)と、LCDR1、LCDR2、LCDR3を含む軽鎖可変領域(V)と、VまたはVのCDRに移植されたIL-2分子またはその断片と、を含み、IL-2分子は、ムテインであり、抗体サイトカイン移植タンパク質は、制御性T細胞よりもTエフェクター細胞を優先的に拡張させる。いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、米国特許出願公開第2020/0270334 A1号に記載されている抗体の投与を含み、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、相補性決定領域HCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、重鎖可変領域(VH)と、LCDR1、LCDR2、LCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)と、VまたはVのCD
Rに移植されたIL-2分子またはその断片と、を含み、IL-2分子は、ムテインであり、抗体サイトカイン移植タンパク質は、制御性T細胞よりもTエフェクター細胞を優先的に拡張させ、抗体は、配列番号39を含むIgGクラス軽鎖及び配列番号38を含むIgGクラス重鎖、配列番号37を含むIgGクラスの軽鎖及び配列番号29を含むIgGクラスの重鎖、配列番号39を含むIgGクラス軽鎖及び配列番号29を含むIgGクラス重鎖、配列番号37を含むIgGクラス軽鎖及び配列番号38を含むIgGクラス重鎖からなる群から選択されるIgGクラスの重鎖及びIgGクラスの軽鎖をさらに含む。
いくつかの実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VのHCDR1に移植され、IL-2分子は、ムテインである。いくつかの実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VのHCDR2に移植され、IL-2分子は、ムテインである。いくつかの実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VのHCDR3に移植され、IL-2分子は、ムテインである。いくつかの実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VのLCDR1に移植され、IL-2分子は、ムテインである。いくつかの実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VのLCDR2に移植され、IL-2分子は、ムテインである。いくつかの実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VのLCDR3に移植され、IL-2分子は、ムテインである。
IL-2分子の挿入は、CDRのN末端領域もしくはその近く、CDRの中間領域、またはCDRのC末端領域もしくはその近くであり得る。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、CDRに組み込まれたIL-2分子を含み、IL2配列はCDR配列をフレームシフトしない。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、CDRに組み込まれたIL-2分子を含み、IL-2配列はCDR配列のすべてまたは一部を置き換える。IL-2分子による置き換えは、CDRのN末端領域、CDRの中間領域、またはCDRのC末端領域もしくはその近くであり得る。IL-2分子による置き換えは、CDR配列のわずか1個もしくは2個のアミノ酸、またはCDR配列全体であり得る。
いくつかの実施形態では、IL-2分子は、ペプチドリンカーなしで、CDR配列とIL-2配列との間に追加のアミノ酸なしで、CDRに直接的に移植される。いくつかの実施形態では、IL-2分子は、ペプチドリンカーを用いて、CDR配列とIL-2配列との間に1つ以上の追加のアミノ酸を伴って、CDRに間接的に移植される。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のIL-2分子は、IL-2ムテインである。いくつかの事例では、IL-2ムテインは、R67A置換を含む。いくつかの実施形態では、IL-2ムテインは、配列番号14または配列番号15のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、IL-2ムテインは、米国特許出願公開第2020/0270334 A1号の表1のアミノ酸配列を含み、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号16、配列番号19、配列番号22及び配列番号25からなる群から選択されるHCDR1を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号7、配列番号10、配列番号13及び配列番号16からなる群から選択されるHCDR1を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号17、配列番号20、配列番号23、及び配列番号26からなる群から選択されるHCDR2からなる群から選択されるHCDR1を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号18、配列番号21、配列番号24、及び配列番号27からなる群から選択されるHCDR3を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号28のアミノ酸配列を含むV領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイ
トカイン移植タンパク質は、配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号36のアミノ酸配列を含むV領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号37のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号28のアミノ酸配列を含むV領域及び配列番号36のアミノ酸配列を含むV領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖領域及び配列番号37のアミノ酸配列を含む軽鎖領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖領域及び配列番号39のアミノ酸配列を含む軽鎖領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖領域及び配列番号37のアミノ酸配列を含む軽鎖領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖領域及び配列番号39のアミノ酸配列を含む軽鎖領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、米国特許出願公開第2020/0270334 A1号のIgG.IL2F71A.H1もしくはIgG.IL2R67A.H1、またはそのバリアント、誘導体、もしくは断片、またはその保存的アミノ酸置換体、またはそれと少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも98%の配列同一性を有するタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の抗体サイトカイン移植タンパク質の抗体成分は、免疫グロブリン配列、フレームワーク配列、またはパリビズマブのCDR配列を含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の抗体サイトカイン移植タンパク質は、アルデスロイキンまたは同等の分子などであるがこれらに限定されない野生型IL-2分子よりも長い血清半減期を有する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の抗体サイトカイン移植タンパク質は、表3に記載される配列を有する。

「IL-4」(本明細書では「IL4」とも称される)という用語は、インターロイキン4として知られるサイトカインを指し、これは、Th2 T細胞、ならびに好酸球、好塩基球、及び肥満細胞によって産生される。IL-4は、ナイーブヘルパーT細胞(Th0細胞)からTh2 T細胞への分化を調節する。Steinke and Borish,Respir.Res.2001,2,66-70。IL-4によって活性化されると、Th2 T細胞は、その後、正のフィードバックループで追加のIL-4を産生する。IL-4は、B細胞増殖及びクラスII MHC発現も刺激し、B細胞からのIgE及びIgG発現へのクラス切り替えを誘導する。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-4は、ProSpec-Tany TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USA(カタログ番号CYT-211)及びThermoFisher Scientific,Inc.,Waltham,MA,USA(ヒトIL-15組換えタンパク質、カタログ番号Gibco CTP0043)を含む、複数の供給業者から市販されている。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-4のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号9)。
「IL-7」(本明細書では「IL7」とも称される)という用語は、インターロイキン7として知られるグリコシル化組織由来のサイトカインを指し、これは、間質細胞及び上皮細胞、ならびに樹状細胞から得ることができる。Fry and Mackall,Blood 2002,99,3892-904。IL-7は、T細胞の発達を刺激することができる。IL-7は、IL-7受容体アルファ及び共通ガンマ鎖受容体からなるヘテロ二量体であるIL-7受容体に結合し、これは、胸腺内でのT細胞発生及び末梢内での生存に重要な一連のシグナルである。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-7は、
ProSpec-Tany TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USA(カタログ番号CYT-254)及びThermoFisher Scientific,Inc.,Waltham,MA,USA(ヒトIL-15組換えタンパク質、カタログ番号Gibco PHC0071)を含む、複数の供給業者から市販されている。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-7のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号10)。
「IL-15」(本明細書では「IL15」とも称される)という用語は、インターロイキン-15として知られるT細胞成長因子を指し、ヒト及び哺乳動物形態、保存的アミノ酸置換物、グリコフォーム、バイオシミラー、及びバリアントを含む、IL-2のすべての形態を含む。IL-15は、例えば、Fehniger and Caligiuri,Blood 2001,97,14-32に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。IL-15は、β及びγシグナル伝達受容体サブユニットをIL-2と共有する。組換えヒトIL-15は、12.8kDaの分子量を有する114個のアミノ酸(及びN末端メチオニン)を含む単一の非グリコシル化ポリペプチド鎖である。組換えヒトIL-15は、ProSpec-Tany TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USA(カタログ番号CYT-230-b)及びThermoFisher Scientific,Inc.,Waltham,MA,USA(ヒトIL-15組換えタンパク質、カタログ番号34-8159-82)を含む、複数の供給業者から市販されている。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-15のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号11)。
「IL-21」(本明細書では「IL21」とも称される)という用語は、インターロイキン-21として知られる多面発現性サイトカインタンパク質を指し、ヒト及び哺乳動物形態、保存的アミノ酸置換物、グリコフォーム、バイオシミラー、及びバリアントを含む、IL-21のすべての形態を含む。IL-21は、例えば、Spolski and
Leonard,Nat.Rev.Drug.Disc.2014,13,379-95に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。IL-21は、主にナチュラルキラーT細胞及び活性化ヒトCD4T細胞によって産生される。組換えヒトIL-21は、15.4kDaの分子量を有する132個のアミノ酸を含む単一の非グリコシル化ポリペプチド鎖である。組換えヒトIL-21は、ProSpec-Tany
TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USA(カタログ番号CYT-408-b)及びThermoFisher Scientific,Inc.,Waltham,MA,USA(ヒトIL-21組換えタンパク質、カタログ番号14-8219-80)を含む、複数の供給業者から市販されている。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-21のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号21)。
「抗腫瘍有効量」、「腫瘍阻害有効量」、または「治療量」が示される場合、投与される本発明の組成物の正確な量は、患者(対象)の年齢、体重、腫瘍サイズ、感染または転移の程度、及び健康状態の個人差を考慮して、医師によって決定され得る。一般に、本明細書に記載される腫瘍浸潤リンパ球(例えば、二次TILまたは遺伝子改変された細胞傷害性リンパ球)は、体重1kg当たり10~1011細胞(例えば、体重1kg当たり10~10、10~1010、10~1011、10~1010、10~1011、10~1011、10~1010、10~1011、10~1010、10~1011、または10~1010細胞)(それらの範囲内のすべての整数値を含む)の投与量で投与され得る。TIL(場合によっては、遺伝子修飾細胞傷害性リンパ球を含む)組成物もまた、これらの投与量で複数回投与され得る。腫瘍TIL(場合によっては、遺伝子操作したTILを含む)は、免疫療法で一般的に知られている注入技法を使用することによって投与することができる(例えば、Rosenberg et al.,New Eng.J.of Med.1988,319,1676を参照されたい)
。特定の患者に最適な投薬量及び治療レジーム(regime)は、患者を疾患の兆候について監視し、適宜に治療を調整することによって、医学分野の技術者によって容易に決定され得る。
「血液学的悪性腫瘍」、「血液系悪性腫瘍」という用語または相関する意味の用語は、血液、骨髄、リンパ節、及びリンパ系の組織を含むが、これらに限定されない、哺乳動物の造血組織及びリンパ組織のがん及び腫瘍を指す。血液学的悪性腫瘍は、「液体腫瘍」とも称される。血液学的悪性腫瘍には、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、慢性リンパ性リンパ腫(CLL)、小リンパ球性リンパ腫(SLL)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性骨髄性白血病(CML)、多発性骨髄腫、急性単球性白血病(AMoL)、ホジキンリンパ腫、及び非ホジキンリンパ腫が含まれ得るが、これらに限定されない。「B細胞血液学的悪性腫瘍」という用語は、B細胞を冒す血液学的悪性腫瘍を指す。
「液体腫瘍」という用語は、本来流体である異常な細胞塊を指す。液体腫瘍癌には、白血病、骨髄腫、及びリンパ腫、ならびに他の血液学的悪性腫瘍が含まれるが、これらに限定されない。液体腫瘍から取得されたTILは、本明細書では骨髄浸潤リンパ球(MIL)とも称され得る。末梢血中で循環する液体腫瘍を含む液体腫瘍から得られるTILは、本明細書ではPBLとも称され得る。MIL、TIL、及びPBLという用語は、本明細書で互換的に使用され、細胞が由来する組織タイプに基づいてのみ異なる。
本明細書で使用される「微小環境」という用語は、全体としての固形もしくは血液学的腫瘍微小環境、または微小環境内の細胞の個々のサブセットを指し得る。本明細書で使用される腫瘍微小環境は、Swartz,et al.,Cancer Res.,2012,72,2473に記載されるように、「腫瘍性形質転換を促進し、腫瘍成長及び浸潤を支持し、腫瘍を宿主免疫から保護し、治療抵抗性を助長し、かつ優勢な転移を成功させるニッチを提供する、細胞、可溶性因子、シグナル伝達分子、細胞外マトリックス、及び機械的手がかり」の複合混合物を指す。腫瘍はT細胞によって認識されるべき抗原を発現するが、微小環境による免疫抑制のため、免疫系による腫瘍クリアランスはまれである。
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL集団でがんを治療する方法を含み、患者は、本発明によるTILの注入前に骨髄非破壊的化学療法で前治療される。いくつかの実施形態では、TIL集団が提供され得、患者は、本発明によるTILの注入前に骨髄非破壊的化学療法で前治療される。いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的化学療法は、シクロホスファミド60mg/kg/日で2日間(TIL注入の27日前及び26日前)、ならびにフルダラビン25mg/m2/日で5日間(TIL注入の27日前~23日前)である。いくつかの実施形態では、本発明による骨髄非破壊的化学療法及びTIL注入(0日目)後、患者は、生理学的許容範囲まで8時間毎に720,000IU/kgでIL-2の静脈内注入を受ける。
実験的発見は、腫瘍特異的Tリンパ球の養子移入前のリンパ球枯渇が、制御性T細胞及び免疫系の競合要素(「サイトカインシンク」)を排除することによって治療有効性を増強する上で重要な役割を果たすことを示す。したがって、本発明のいくつかの実施形態は、本発明のTILを導入する前に、患者に対してリンパ球枯渇ステップ(「免疫抑制コンディショニング」と称されることもある)を利用する。
「有効量」または「治療有効量」という用語は、疾患治療を含むが、これに限定されない、意図された用途を達成するのに十分である、本明細書に記載の化合物または化合物の組み合わせの量を指す。治療有効量は、意図される用途(インビトロもしくはインビボ)、または治療される対象及び病状(例えば、対象の体重、年齢、及び性別)、病状の重症度、または投与方法に応じて異なり得る。この用語は、標的細胞において特定の応答(例
えば、血小板粘着及び/または細胞遊走の低減)を誘導する用量にも適用される。特定の用量は、選択された特定の化合物、従うべき投薬レジメン、化合物が他の化合物と組み合わせて投与されるか、投与のタイミング、それが投与される組織、及び化合物が運ばれる物理的送達系に応じて異なる。
「治療」、「治療すること」、「治療する」などの用語は、所望の薬理学的及び/または生理学的効果を得ることを指す。その効果は、その疾患または症状を完全にまたは部分的に予防するという観点において予防的であり得、及び/または疾患及び/またはその疾患に起因する副作用の部分的または完全な治癒という観点において治療的であり得る。「治療」は、本明細書で使用される場合、哺乳動物、特にヒトにおける疾患の任意の治療を包含し、(a)疾患にかかりやすい可能性があるが、まだ疾患を有すると診断されていない対象に疾患が生じるのを予防すること、(b)疾患を抑制すること、すなわち、その発症または進行を抑止すること、及び(c)疾患を軽減すること、すなわち、疾患の退行を引き起こし、及び/または1つ以上の疾患症状を軽減することを含む。「治療」は、疾患または状態がない場合でさえも、薬理学的効果を提供するための薬剤の送達を包含するようにも意図されている。例えば、「治療」は、病状がない場合、例えば、ワクチンの場合に免疫応答を誘発するか、または免疫を与えることができる組成物の送達を包含する。
「異種」という用語は、核酸またはタンパク質の一部に関して使用される場合、核酸またはタンパク質が、自然界では互いに同じ関係では見出されない2つ以上の部分配列を含むことを示す。例えば、核酸は、典型的には、組換え的に産生され、新たな機能的核酸、例えば、ある供給源からのプロモーター及び別の供給源からのコード領域、または異なる供給源からのコード領域を作製するように配置された無関係の遺伝子由来の2つ以上の配列を有する。同様に、異種タンパク質は、そのタンパク質が、自然界では互いに同じ関係では見出されない2つ以上の部分配列を含むことを示す(例えば、融合タンパク質)。
2つ以上の核酸またはポリペプチドの文脈における「配列同一性」、「同一性パーセント」、及び「配列同一性パーセント」(もしくはそれらの同義語、例えば「99%同一」)という用語は、同じであるか、または配列同一性の一部としていかなる保存的アミノ酸置換も考慮せずに、最大一致のために比較し整列させた場合(必要に応じてギャップを導入する)、特定のパーセンテージの同じヌクレオチドもしくはアミノ酸残基を有する2つ以上の配列または部分配列を指す。同一性パーセントは、配列比較ソフトウェアもしくはアルゴリズムを使用して、または目視検査によって測定することができる。アミノ酸またはヌクレオチド配列のアラインメントを取得するために使用され得る様々なアルゴリズム及びソフトウェアが当該技術分野で知られている。配列同一性パーセントの決定に好適なプログラムには、例えば、米国政府の国立生物工学情報センターのBLASTウェブサイトから入手可能なBLASTプログラム一式が含まれる。2つの配列間の比較は、BLASTNまたはBLASTPアルゴリズムのいずれかを使用して実行することができる。BLASTNは、核酸配列を比較するために使用され、BLASTPは、アミノ酸配列を比較するために使用される。DNASTARから入手可能なALIGN、ALIGN-2(Genentech,South San Francisco,California)、またはMegAlignは、配列を整列させるために使用することができる追加の公的に入手可能なソフトウェアプログラムである。当業者であれば、特定のアラインメントソフトウェアによって最大アラインメントに適切なパラメータを決定することができる。ある特定の実施形態では、アラインメントソフトウェアのデフォルトパラメータが使用される。
本明細書で使用される場合、「バリアント」という用語は、参照抗体のアミノ酸配列内または隣接する特定の位置における1つ以上の置換、欠失、及び/または付加により参照抗体のアミノ酸配列とは異なるアミノ酸配列を含む抗体または融合タンパク質を包含する
が、これらに限定されない。バリアントは、参照抗体のアミノ酸配列と比較して、そのアミノ酸配列に1つ以上の保存的置換を含み得る。保存的置換は、例えば、同様に荷電したまたは非荷電のアミノ酸の置換を含み得る。バリアントは、参照抗体の抗原に特異的に結合する能力を保持している。バリアントという用語は、ペグ化抗体またはタンパク質も含む。
本明細書における「腫瘍浸潤リンパ球」または「TIL」とは、対象の血流を離れて腫瘍に移動した白血球として最初に取得された細胞の集団を意味する。TILには、CD8細胞傷害性T細胞(リンパ球)、Th1及びTh17 CD4T細胞、ナチュラルキラー細胞、樹状細胞、ならびにM1マクロファージが含まれるが、これらに限定されない。TILには、一次TIL及び二次TILの両方が含まれる。「一次TIL」は、本明細書に概説されるように患者組織試料から得られるもの(「新たに採取された」と称されることもある)であり、「二次TIL」は、本明細書で考察されるように拡張または増殖された任意のTIL細胞集団であり、本明細書で考察されるバルクTIL、拡張TIL(「REP TIL」)、ならびに「reREP TIL」が含まれるが、これらに限定されない。reREP TILは、例えば、第2の拡張TILまたは第2の追加の拡張TIL(例えば、reREP TILと称されるTILを含む、図8のステップDに記載されているものなど)を含み得る。
TILは、一般に、細胞表面マーカーを使用して生化学的に定義されるか、または腫瘍に浸潤して治療を達成するそれらの能力によって機能的に定義されるかのいずれかであり得る。TILは、一般に、CD4、CD8、TCRαβ、CD27、CD28、CD56、CCR7、CD45Ra、CD95、PD-1、及びCD25のうちの1つ以上のバイオマーカーの発現によって分類され得る。追加として及び代替的に、TILは、患者への再導入時に固形腫瘍に浸潤する能力により機能的に定義され得る。TILは、効力によってさらに特徴付けられ得、例えば、インターフェロン(IFN)放出が、約50pg/mLを超える、約100pg/mLを超える、約150pg/mLを超える、または約200pg/mLを超える場合、TILは強力であるとみなされ得る。例えば、インターフェロン(IFNγ)放出が、約50pg/mLを超える、約100pg/mLを超える、約150pg/mLを超える、または約200pg/mLを超える、約300pg/mLを超える、約400pg/mLを超える、約500pg/mLを超える、約600pg/mLを超える、約700pg/mLを超える、約800pg/mLを超える、約900pg/mL、約1000pg/mLを超える場合、TILは強力であるとみなされ得る。
「デオキシリボヌクレオチド」という用語は、天然及び合成の、未修飾及び修飾デオキシリボヌクレオチドを包含する。修飾には、糖部分、塩基部分、及び/またはオリゴヌクレオチド中のデオキシリボヌクレオチド間の連結への変更が含まれる。
「RNA」という用語は、少なくとも1つのリボヌクレオチド残基を含む分子を定義する。「リボヌクレオチド」という用語は、b-D-リボフラノース部分の2′位にヒドロキシル基を有するヌクレオチドを定義する。RNAという用語には、二本鎖RNA、一本鎖RNA、部分的に精製されたRNAなどの単離されたRNA、本質的に純粋なRNA、合成RNA、組換え的に産生されたRNA、ならびに1つ以上のヌクレオチドの付加、欠失、置換、及び/または変化によって天然に存在するRNAとは異なる変化したRNAが含まれる。本明細書に記載のRNA分子のヌクレオチドはまた、非天然に存在するヌクレオチドまたは化学的に合成されたヌクレオチドもしくはデオキシヌクレオチドなどの非標準ヌクレオチドを含み得る。これらの変化したRNAは、類似体または天然に存在するRNAの類似体と称され得る。
「薬学的に許容される担体」または「薬学的に許容される賦形剤」という用語は、あり
とあらゆる溶媒、分散媒、コーティング、抗細菌剤及び抗真菌剤、等張剤及び吸収遅延剤、ならびに不活性成分を含むよう意図されている。医薬品有効成分のためのかかる薬学的に許容される担体または薬学的に許容される賦形剤の使用は、当該技術分野で周知である。任意の従来の薬学的に許容される担体または薬学的に許容される賦形剤が医薬品有効成分と適合しない場合を除いて、本発明の治療用組成物におけるその使用が企図される。他の薬物などの追加の医薬品有効成分を、記載された組成物及び方法に組み込むこともできる。
「約」及び「およそ」という用語は、値の統計的に有意な範囲内を意味する。かかる範囲は、所与の値または範囲の1桁以内、好ましくは50%以内、より好ましくは20%以内、なおより好ましくは10%以内、さらにより好ましくは5%以内であり得る。「約」または「およそ」という用語によって包含される許容偏差は、研究中の特定の系に依存し、当業者によって容易に理解され得る。さらに、本明細書で使用される場合、「約」及び「およそ」という用語は、寸法、サイズ、配合、パラメータ、形状、ならびに他の量及び特徴が正確でなく、かつ正確である必要はないが、公差、変換係数、四捨五入、測定誤差など、及び当業者に知られている他の要因を反映して、必要に応じて、およそであってもよく、及び/またはそれよりも大きくても小さくてもよいことを意味する。一般に、寸法、サイズ、配合、パラメータ、形状、または他の量もしくは特徴は、そのように明示的に述べられているかにかかわらず、「約」または「およそ」である。非常に異なるサイズ、形状、及び寸法の実施形態が記載された配置を採用し得ることに留意されたい。
添付の特許請求の範囲で使用される場合、「含む」、「から本質的になる」、及び「からなる」という移行用語は、元の形式及び補正された形式で、存在する場合、列挙されていない追加のクレーム要素またはステップが特許請(複数可)求の範囲から除外されるかに関して特許請求の範囲を定義する。「含む」という用語は、包括的または自由形式であるよう意図されており、いずれの追加の列挙されていない要素、方法、ステップ、または材料も除外しない。「からなる」という用語は、特許請求の範囲で指定されたもの以外のいずれの要素、ステップ、または材料も除外し、後者の場合、指定された材料(複数可)に通常関連する不純物も除外する。「から本質的になる」という用語は、特許請求の範囲を、特定の要素、ステップ、または材料(複数可)、及び特許請求された本発明の基本的及び新規の特徴(複数可)に実質的に影響を及ぼさないに限定する。本発明を具体化する本明細書に記載のすべての組成物、方法、及びキットは、代替の実施形態では、「含む」、「から本質的になる」、及び「からなる」という移行用語のうちのいずれかによってより具体的に定義され得る。
「抗体」及びその複数形の「抗体」という用語は、免疫グロブリン全体及び任意の抗原結合断片(「抗原結合部分」)またはその一本鎖を指す。「抗体」はさらに、ジスルフィド結合によって相互接続された少なくとも2つの重鎖(H)鎖及び2つの軽(L)鎖を含む糖タンパク質、またはその抗原結合部分を指す。各重鎖は、重鎖可変領域(本明細書ではVと略される)及び重鎖定常領域で構成される。重鎖定常領域は、CH1、CH2、及びCH3の3つのドメインで構成される。各軽鎖は、軽鎖可変領域(本明細書ではVと略される)及び軽鎖定常領域で構成される。軽鎖定常領域は、1つのドメイン、Cで構成される。抗体のV及びV領域は、相補性決定領域(CDR)または超可変領域(HVR)と称され、フレームワーク領域(FR)と呼ばれる、より保存された領域が点在し得る、超可変性の領域にさらに細分化することができる。各V及びVは、アミノ末端からカルボキシ末端へと以下の順序で配列された3つのCDR及び4つのFRで構成される:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。重鎖及び軽鎖の可変領域は、1つまたは複数の抗原エピトープと相互作用する結合ドメインを含む。抗体の定常領域は、免疫系の様々な細胞(例えば、エフェクター細胞)及び古典的な補体系の第1の成分(Clq)を含む宿主組織または因子への免疫グロブリンの結合を媒介し得
る。
「抗原」という用語は、免疫応答を誘導する物質を指す。いくつかの実施形態では、抗原は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)分子によって提示される場合、抗体またはTCRによって結合されることができる分子である。本明細書で使用される「抗原」という用語はまた、T細胞エピトープを包含する。抗原は、追加として免疫系によって認識されることができる。いくつかの実施形態では、抗原は、体液性免疫応答または細胞性免疫応答を誘導することができ、Bリンパ球及び/またはTリンパ球の活性化につながる。場合によっては、これは、抗原がTh細胞エピトープを含むか、またはそれに結合されることを必要とし得る。抗原はまた、1つ以上のエピトープ(例えば、B-及びT-エピトープ)を有し得る。いくつかの実施形態では、抗原は、好ましくは、典型的には非常に特異的かつ選択的な方法で、対応する抗体またはTCRと反応し、他の抗原によって誘導され得る多数の他の抗体またはTCRとは反応しない。
「モノクローナル抗体」、「mAb」、「モノクローナル抗体組成物」という用語、またはそれらの複数形は、単一分子組成の抗体分子の調製物を指す。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープに対して単一の結合特異性及び親和性を示す。特定の受容体に特異的なモノクローナル抗体は、試験対象に好適な抗原を注入し、次いで、所望の配列または機能的特徴を有する抗体を発現するハイブリドーマを単離するという当該技術分野における知識及び技術を使用して作製することができる。モノクローナル抗体をコードするDNAは、従来の手順を使用して(例えば、モノクローナル抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを使用することによって)容易に単離され、配列決定される。ハイブリドーマ細胞は、かかるDNAの好ましい供給源として機能する。一旦単離されると、DNAは、発現ベクターに入れられ、次いで、E.coli細胞、サルCOS細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、または免疫グロブリンタンパク質を産生しない骨髄腫細胞などの宿主細胞にトランスフェクトされて、組換え宿主細胞におけるモノクローナル抗体の合成を取得することができる。抗体の組換え産生については、以下でより詳細に説明する。
本明細書で使用される、抗体の「抗原結合部分」または「抗原結合断片」(または単に「抗体部分」もしくは「断片」)という用語は、抗原に特異的に結合する能力を保持する抗体の1つ以上の断片を指す。抗体の抗原結合機能は、完全長抗体の断片によって行われ得ることが示されている。抗体の「抗原結合部分」という用語に包含される結合断片の例には、(i)V、V、C、及びCH1ドメインからなる一価断片である、Fab断片、(ii)ヒンジ領域でジスルフィド架橋によって結合された2つのFab断片を含む二価断片である、F(ab′)2断片、(iii)V及びCH1ドメインからなるFd断片、(iv)抗体の単一アームのV及びVドメインからなるFv断片、(v)VまたはVドメインからなり得るドメイン抗体(dAb)断片(Ward,et al.,Nature,1989,341,544-546)、ならびに(vi)単離した相補性決定領域(CDR)が含まれる。さらに、Fv断片の2つのドメイン、V及びVは、別々の遺伝子によってコードされるが、これらは、組換え方法を使用して、V及びV領域が対合して、一本鎖Fv(scFv)として知られる一価分子を形成する単一タンパク質鎖としてそれらを作製することを可能にする合成リンカーによって接合され得、例えば、Bird,et al.,Science 1988,242,423-426、及びHuston,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 1988,85,5879-5883)を参照されたい。かかるscFv抗体はまた、抗体の「抗原結合部分」または「抗原結合断片」という用語に包含されることを意図している。これらの抗体断片は、当業者に知られている従来の技法を使用して得られ、断片は、無傷の抗体と同じ方法で有用性についてスクリーニングされる。いくつかの実施形態では、scFvタンパク質ドメインは、V部分及びV部分を含む。scFv分子は、V
メインがscFv分子のN末端部分である場合、V-L-V、またはVドメインがscFv分子のN末端部分である場合、V-L-Vのいずれかとして示される。scFv分子を作製し、好適なペプチドリンカーを設計するための方法は、米国特許第4,704,692号、米国特許第4,946,778号、R.Raag and M.Whitlow,“Single Chain Fvs.”FASEB Vol 9:73-80(1995)及びR.E.Bird and B.W.Walker,Single Chain Antibody Variable Regions,TIBTECH,Vol 9:132-137(1991)に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書で使用される「ヒト抗体」という用語は、フレームワーク及びCDR領域の両方が、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する抗体を含むことを意図している。さらに、抗体が定常領域を含む場合、定常領域はまた、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する。本発明のヒト抗体は、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列によってコードされないアミノ酸残基を含み得る(例えば、インビトロでのランダムもしくは部位特異的変異誘発によって、またはインビボでの体細胞変異によって導入される変異)。本明細書で使用される「ヒト抗体」という用語は、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖細胞系に由来するCDR配列が、ヒトフレームワーク配列に移植されている抗体を含むことを意図しない。
「ヒトモノクローナル抗体」という用語は、フレームワーク領域及びCDR領域の両方がヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する単一の結合特異性を示す抗体を指す。いくつかの実施形態では、ヒトモノクローナル抗体は、不死化細胞に融合したヒト重鎖導入遺伝子及び軽鎖導入遺伝子を含むゲノムを有する、トランスジェニック非ヒト動物、例えばトランスジェニックマウスから取得されたB細胞を含むハイブリドーマによって産生される。
本明細書で使用される「組換えヒト抗体」という用語は、組換え手段によって調製、発現、作成、または単離されるすべてのヒト抗体、例えば(a)ヒト免疫グロブリン遺伝子またはそれから調製されたハイブリドーマ(以下でさらに説明される)についてトランスジェニックまたはトランス染色体である動物(マウスなど)から単離された抗体、(b)ヒト抗体を発現するように形質転換された宿主細胞から、例えば、トランスフェクトーマから単離された抗体、(c)組換えコンビナトリアルヒト抗体ライブラリーから単離された抗体、及び(d)ヒト免疫グロブリン遺伝子配列を他のDNA配列にスプライシングすることを含む、任意の他の手段によって調製、発現、作成、または単離された抗体を含む。かかる組換えヒト抗体は、フレームワーク及びCDR領域がヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する。しかしながら、ある特定の実施形態では、かかる組換えヒト抗体は、インビトロ変異誘発(または、ヒトIg配列についてトランスジェニックな動物が使用される場合、インビボ体細胞変異誘発)に供され得、したがって、組換え抗体のV及びV領域のアミノ酸配列は、ヒト生殖細胞系V及びV配列に由来し、関連しているが、インビボでヒト抗体生殖細胞系レパートリー内に自然に存在しない可能性がある配列である。
本明細書で使用される場合、「アイソタイプ」は、重鎖定常領域遺伝子によってコードされる抗体クラス(例えば、IgMまたはIgG1)を指す。
「抗原を認識する抗体」及び「抗原に特異的な抗体」という句は、本明細書では「抗原に特異的に結合する抗体」という用語と交換可能に使用される。
「ヒト抗体誘導体」という用語は、抗体と別の医薬品有効成分または抗体とのコンジュ
ゲートを含む、ヒト抗体の任意の修飾形態を指す。「コンジュゲート」、「抗体薬物コンジュゲート」、「ADC」、または「免疫コンジュゲート」という用語は、別の治療部分にコンジュゲートされた抗体またはその断片を指し、これは当該技術分野において使用可能な方法を使用して、本明細書に記載の抗体にコンジュゲートされ得る。
「ヒト化抗体」、「ヒト化抗体(複数)」、及び「ヒト化」という用語は、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖細胞系に由来するCDR配列が、ヒトフレームワーク配列に移植されている抗体を指すことを意図している。追加のフレームワーク領域の修飾は、ヒトフレームワーク配列内で行うことができる。非ヒト(例えば、マウス)抗体のヒト化形態は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小限の配列を含むキメラ抗体である。ほとんどの場合、ヒト化抗体は、ヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)であり、レシピエントの超可変領域からの残基が、所望の特異性、親和性、及び能力を有するマウス、ラット、ウサギなどの非ヒト種(ドナー抗体)または非ヒト霊長類の15超可変領域からの残基によって置き換えられる。場合によっては、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク(FR)残基は、対応する非ヒト残基によって置き換えられる。さらに、ヒト化抗体は、レシピエント抗体またはドナー抗体には見られない残基を含み得る。これらの修飾は、抗体の性能をさらに向上させるために行われる。一般に、ヒト化抗体は、超可変ループのすべてまたは実質的にすべてが非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、FR領域のすべてまたは実質的にすべてがヒト免疫グロブリン配列のものである、少なくとも1つ、典型的には2つの可変ドメインの実質的すべてを含むことになる。ヒト化抗体はまた、任意選択で、免疫グロブリン定常領域(Fc)、典型的にはヒト免疫グロブリンの定常領域の少なくとも一部を含むであろう。さらなる詳細については、Jones,et al.,Nature1986,321,522-525、Riechmann,et al.,Nature1988,332,323-329、及びPresta,Curr.Op.Struct.Biol.1992,2,593-596を参照されたい。本明細書に記載される抗体はまた、エフェクター機能及び/またはFcR結合の改善(例えば、低減)を与えることが知られている任意のFcバリアントを用いるように修飾され得る。Fcバリアントは、例えば、国際特許出願公開第WO1988/07089A1号、同第WO1996/14339A1号、同第WO1998/05787A1号、同第WO1998/23289A1号、同第WO1999/51642A1号、同第WO99/58572A1号、同第WO2000/09560A2号、同第WO2000/32767A1号、同第WO2000/42072A2号、同第WO2002/44215A2号、同第WO2002/060919A2号、同第WO2003/074569A2号、同第WO2004/016750A2号、同第WO2004/029207A2号、同第WO2004/035752A2号、同第WO2004/063351A2号、同第WO2004/074455A2号、同第WO2004/099249A2号、同第WO2005/040217A2号、同第WO2005/070963A1号、同第WO2005/077981A2号、同第WO2005/092925A2号、同第WO2005/123780A2号、同第WO2006/019447A1号、同第WO2006/047350A2号、及び同第WO2006/085967A2号、ならびに米国特許第5,648,260号、同第5,739,277号、同第5,834,250号、同第5,869,046号、同第6,096,871号、同第6,121,022号、同第6,194,551号、同第6,242,195号、同第6,277,375号、同第6,528,624号、同第6,538,124号、同第6,737,056号、同第6,821,505号、同第6,998,253号、及び同第7,083,784号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に開示されるアミノ酸置換のうちのいずれか1つを含み得る。
「キメラ抗体」という用語は、可変領域配列が1つの種に由来し、定常領域配列が別の種に由来する抗体、例えば、可変領域配列がマウス抗体に由来し、定常領域配列がヒト抗体に由来する抗体を指すことを意図している。
「二重特異性抗体(diabody)」は、2つの抗原結合部位を有する小さな抗体断片である。断片は、同じポリペプチド鎖(V-VまたはV-V)中に軽鎖可変ドメイン(V)に接続された重鎖可変ドメイン(V)を含む。同じ鎖上の2つのドメインをペアリングするには短すぎるリンカーを使用すると、ドメインは別のチェーンの相補ドメインとペアリングさせられ、2つの抗原結合部位が作成される。二重特異性抗体は、例えば、欧州特許第404,097号、国際特許公開第WO93/11161号、及びBolliger,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA1993,90,6444-6448においてより完全に記載されている。
「グリコシル化」という用語は、抗体の修飾誘導体を指す。非グリコシル化抗体は、グリコシル化を欠いている。グリコシル化は、例えば、抗原に対する抗体の親和性を増加させるように変化され得る。かかる炭水化物修飾は、例えば、抗体配列内の1つ以上のグリコシル化部位を変化させることによって達成され得る。例えば、1つ以上の可変領域フレームワークのグリコシル化部位の排除をもたらす、1つ以上のアミノ酸置換を行い、それによってその部位でのグリコシル化を排除することができる。米国特許第5,714,350号及び同第6,350,861号に記載されているように、非グリコシル化は、抗原に対する抗体の親和性を高める可能性がある。追加としてまたは代替的に、改変した種類のグリコシル化を有する抗体、例えば、フコシル残基の量が低減した低フコシル化抗体または二分GlcNac構造が増加した抗体が作製され得る。かかるグリコシル化パターンの変化は、抗体の能力を増加させることが実証されている。かかる炭水化物修飾は、例えば、抗体をグリコシル化機構が変化した宿主細胞で発現させることによって達成され得る。グリコシル化機構が変化した細胞については、当該技術分野で説明されており、本発明の組換え抗体を発現させ、それによりグリコシル化が変化した抗体を産生する宿主細胞として使用され得る。例えば、Ms704、Ms705、及びMs709細胞株で発現される抗体が、それらの炭水化物上のフコースを欠くように、細胞株Ms704、Ms705、及びMs709は、フコシルトランスフェラーゼ遺伝子FUT8(アルファ(1,6)フコシルトランスフェラーゼ)を欠く。Ms704、Ms705、及びMs709 FUT8-/-細胞株は、2つの置換ベクターを使用したCHO/DG44細胞中のFUT8遺伝子の標的破壊によって作成された(例えば、米国特許公開第2004/0110704号またはYamane-Ohnuki,et al.,Biotechnol.Bioeng.,2004,87,614-622を参照)。別の例として、欧州特許第1,176,195号は、フコシルトランスフェラーゼをコードし、それによりかかる細胞株で発現される抗体が、アルファ1,6結合関連酵素を低減または排除することによって低フコシル化を示す、機能的に破壊されたFUT8遺伝子を有する細胞株を説明しており、抗体のFc領域に結合するN-アセチルグルコサミンにフコースを付加するための酵素活性が低いか、または酵素活性を有しない細胞株、例えばラット骨髄腫細胞株YB2/0(ATCC CRL 1662)についても説明している。国際特許公開第WO03/035835号は、フコースをAsn(297)結合型炭水化物に付着させる能力が低減し、さらにその宿主細胞で発現される抗体の低フコシル化ももたらすバリアントCHO細胞株、Lec13細胞について説明している(Shields,et al.,J.Biol.Chem.2002,277,26733-26740も参照されたい。国際特許公開第WO99/54342号は、糖タンパク質修飾グリコシルトランスフェラーゼ(例えば、ベータ(1,4)-N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII(GnTIII))を発現するように操作され、それにより操作された細胞株で発現される抗体が、二分性GlcNac構造の増加を示し、抗体のADCC活性の増加をもたらす、細胞株について記載している(Umana,et al.,Nat.Biotech.1999,17,176-180も参照)。代替的に、フコシダーゼ酵素を使用して、抗体のフコース残基を切断でき得る。例えば、フコシダーゼアルファ-L-フコシダーゼは、Tarentino,et al.,Biochem.1975,14,5516-5523に記載
されているように、抗体からフコシル残基を除去する。
「ペグ化」は、1つ以上のPEG基が抗体または抗体断片に付着する条件下で、PEGの反応性エステルまたはアルデヒド誘導体などのポリエチレングリコール(PEG)と反応させる、修飾抗体またはその断片を指す。ペグ化は、例えば、抗体の生物学的(例えば、血清)半減期を増加させることができる。好ましくは、ペグ化は、反応性PEG分子(または類似の反応性水溶性ポリマー)とのアシル化反応またはアルキル化反応を介して実行される。本明細書で使用される場合、「ポリエチレングリコール」という用語は、モノ(C~C10)アルコキシ-もしくはアリールオキシ-ポリエチレングリコール、またはポリエチレングリコール-マレイミドなどの、他のタンパク質を誘導体化するために使用されているPEGの形態のうちのいずれかを包含することが意図される。ペグ化される抗体は、非グリコシル化抗体であり得る。ペグ化のための方法は、当該技術分野で知られており、例えば欧州特許第0154316号及び同第0401384号、ならびに米国特許第5,824,778号(各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように、本発明の抗体に適用することができる。
「バイオシミラー」という用語は、モノクローナル抗体またはタンパク質を含む、臨床的に不活性な成分にわずかな違いがあるにもかかわらず、米国で認可された参照バイオ製品と非常に類似しており、製品の安全性、純度、及び効力に関してバイオ製品と参照製品との間に臨床的に意味のある差異がない、バイオ製品を意味する。さらに、類似のバイオまたは「バイオシミラー」医薬品は、欧州医薬品庁によって既に使用が許可されている別のバイオ医薬品に類似したバイオ医薬品である。「バイオシミラー」という用語は、他の国及び地域の規制機関によっても同義的に使用されている。バイオ製品またはバイオ医薬品は、細菌または酵母などの生物源によって作製された、またはそれに由来する医薬品である。それらは、ヒトインスリンもしくはエリスロポエチンなどの比較的小さな分子、またはモノクローナル抗体などの複雑な分子からなり得る。例えば、参照IL-2タンパク質がアルデスロイキン(PROLEUKIN)である場合、アルデスロイキンに関して薬物規制当局によって承認されたタンパク質は、アルデスロイキンの「バイオシミラー」であるか、またはアルデスロイキンの「そのバイオシミラー」である。欧州では、類似のバイオまたは「バイオシミラー」医薬品は、欧州医薬品庁(EMA)によって既に使用が許可されている別のバイオ医薬品に類似したバイオ医薬品である。欧州における同様の生物学的用途に関連する法的根拠は、補正されたRegulation(EC)No 726/2004の第6条及びDirective 2001/83/ECの第10(4)条であり、したがって欧州では、バイオシミラーは、Regulation(EC)No 726/2004の第6条及びDirective 2001/83/ECの第10(4)条の下で、認可または認可申請の対象について認可、承認され得る。既に認可されているオリジナルのバイオ医薬品は、欧州では「参照医薬品」と称されることがある。バイオシミラーとみなされる製品に対する要件のうちのいくつかは、バイオシミラー医薬品に関するCHMPガイドラインに概説されている。さらに、モノクローナル抗体バイオシミラーに関連するガイドラインを含む製品固有のガイドラインは、EMAによって製品毎に提供され、そのウェブサイトで公開されている。本明細書に記載のバイオシミラーは、品質特徴、生物活性、作用機序、安全性プロファイル、及び/または有効性の点で、参照医薬品に類似している可能性がある。さらに、バイオシミラーは、参照医薬品と同じ状態を治療するために使用され得るか、または使用を意図され得る。したがって、本明細書に記載のバイオシミラーは、参照医薬品と類似または非常に類似した品質特徴を有するとみなされ得る。代替的に、またはさらに、本明細書に記載のバイオシミラーは、参照医薬品と類似または非常に類似した生物活性を有するとみなされ得る。代替的に、またはさらに、本明細書に記載のバイオシミラーは、参照医薬品と類似または非常に類似した安全性プロファイルを有するとみなされ得る。代替的に、またはさらに、本明細書に記載のバイオシミラーは、参照医薬品と類似または非常に類似した効力を有するとみなされ得る。本明細書に
記載されているように、欧州におけるバイオシミラーは、EMAによって認可された参照医薬品と比較される。しかしながら、場合によっては、バイオシミラーは、特定の研究で欧州経済領域外で認可されたバイオ医薬品(EEA認可されていない「コンパレーター」)と比較される場合がある。かかる研究には、例えば、特定の臨床研究及びインビボ非臨床研究が含まれる。本明細書で使用される場合、「バイオシミラー」という用語は、EEA認可されていないコンパレーターと比較された、または比較され得るバイオ医薬品にも関する。特定のバイオシミラーは、抗体、抗体断片(例えば、抗原結合部分)、及び融合タンパク質などのタンパク質である。タンパク質バイオシミラーは、ポリペプチドの機能に有意な影響を及ぼさない、アミノ酸構造にわずかな修飾(例えば、アミノ酸の欠失、付加、及び/または置換を含む)を有するアミノ酸配列を有し得る。バイオシミラーは、その参照医薬品のアミノ酸配列に対して97%以上、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。バイオシミラーは、その違いが医薬品の安全性及び/または有効性の変化をもたらさないならば、1つ以上の翻訳後修飾、例えば、限定されないが、参照医薬品の翻訳後修飾とは異なる、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び/または切断を含み得る。バイオシミラーは、参照医薬品と同一または異なるグリコシル化パターンを有し得る。特に、排他的ではないが、バイオシミラーは、その違いが参照医薬品に関連する安全性の懸念に対処するか、対処することを意図している場合、異なるグリコシル化パターンを有し得る。追加として、バイオシミラーは、医薬品の安全性及び有効性が損なわれないならば、例えば、その強度、剤形、製剤、賦形剤、及び/または提示において参照医薬品から逸脱する可能性がある。バイオシミラーは、参照医薬品と比較して、例えば薬物動態(PK)及び/または薬力学的(PD)プロファイルの違いを含み得るが、それでも、認可される、または認可に適しているとみなされるように、参照医薬品と十分に類似しているとみなされる。特定の状況において、バイオシミラーは、参照医薬品と比較して異なる結合特徴を示し、異なる結合特徴は、EMAなどの規制当局によって類似のバイオ製品としての認可の障壁ではないとみなされる。「バイオシミラー」という用語は、他の国及び地域の規制機関によっても同義的に使用されている。
II .遺伝子編集プロセス
A.概要:TIL拡張+遺伝子編集
TIL集団(例えば、CD39/CD69陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団)を拡張するための方法に関する本発明のいくつかの実施形態では、本方法は、それらの治療効果を増強するために、TILの少なくとも一部を遺伝子編集する1つ以上のステップを含む。本明細書で使用される場合、「遺伝子編集」、「遺伝子編集」、及び「ゲノム編集」は、DNAが細胞のゲノム内で永続的に修飾され、例えば、DNAが細胞のゲノム内で挿入、欠失、修飾、または置換される遺伝子修飾のタイプを指す。いくつかの実施形態では、遺伝子編集は、DNA配列の発現をサイレンシング(遺伝子ノックアウトと称されることもある)または阻害/低減(遺伝子ノックダウンと称されることもある)させる。他の実施形態では、遺伝子編集は、DNA配列の発現を増強させる(例えば、過剰発現を引き起こすことによって)。本発明の実施形態によれば、遺伝子編集技術は、TILの治療的集団の有効性を増強するために使用される。
いくつかの実施形態では、TIL集団は、1つ以上の細胞表面受容体の発現をサイレンシングまたは低減するように遺伝子修飾される。例示的な実施形態では、細胞表面受容体は、CD39及び/またはCD69である。本明細書で使用される場合、「CD39」、「ENTPD1」、「ATPDase」、「NTPDase-1」、「SPG64」、及び「エクトヌクレオシドトリホスホヒドロラーゼ1」はすべて、トリホスホ及びジホスホヌクレオシドのγ-及びβ-リン酸残基の、モノホスホヌクレオシド誘導体への加水分解を触媒する細胞表面酵素を指す。CD39の高い発現または活性は、免疫系ががんの進行を阻害するのを防ぐことができる。本明細書で使用される場合、「CD69」、「AIM
」、「BL-AC/P26」、「CLEC2C」、「EA1」、「GP32/28」、「MLR-3」はすべて、CD69遺伝子によってコードされるヒト膜貫通C型レクチンタンパク質を指す。CD69は、免疫系の多くの細胞型で発現する活性化マーカーであり、リンパ球増殖及びリンパ球におけるシグナル伝達に関与する。したがって、いかなる特定の操作理論にも縛られることなく、CD39及びCD69の発現をサイレンシングまたは減少させるように遺伝子修飾されたTILは、増加した抗腫瘍活性を示すと考えられる。TILは、本明細書に記載の遺伝子修飾方法を含む当該技術分野で知られている任意の好適な方法を使用して、CD39及びCD69の発現をサイレンシングまたは減少させるように修飾され得る。例示的な遺伝子修飾技法としては、例えば、本明細書に記載のCRISPR、TALE、及びジンクフィンガー法が挙げられる。
いくつかの実施形態では、遺伝子修飾されたTIL集団は、CD39/CD69二重陰性発現について最初に事前選択され、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団は、その後、CD39及びCD69の発現をサイレンシングまたは減少させるように遺伝子修飾される。いかなる特定の操作理論にも縛られることなく、かかるCD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団は、その後、CD39及びCD69の発現をサイレンシングまたは減少させるように遺伝子修飾され、対照TIL集団(例えば、CD39/CD69二重陰性発現について事前選択されていない及び/またはその後、CD39及びCD69の発現を減少させるように修飾されたTIL集団)と比較して、増強された抗腫瘍活性を示すと考えられる。TILは、例えば、本明細書で提供されるCD39/CD69二重陰性事前選択法を含む任意の好適な方法を使用して、CD39/CD69二重陰性発現のために事前選択される。
いくつかの実施形態では、その後、サイレンシングまたは減少したCD39及びCD69の発現を有する遺伝子修飾されたTIL集団を拡張して、CD39及びCD69の発現をサイレンシングまたは減少させるように遺伝子修飾された治療的TIL集団の集団を作成する。任意の好適な拡張方法を使用して、遺伝子修飾されたTIL集団を拡張することができる。
腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のうちのいずれかの実施形態に従って実行することができ、この方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。さらなる実施形態によれば、TILを治療的TIL集団に拡張するための方法は、PCT/US2017/058610、PCT/US2018/012605、またはPCT/US2018/012633(これらは参照によりそれら全体が本明細書に組み込まれる)に記載されている方法のいずれかの実施形態に従って実行され、この方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。したがって、本発明のある実施形態は、本明細書に記載される任意の実施形態に従って拡張された治療的TIL集団を提供し、治療的集団の少なくとも一部は遺伝子編集されており、例えば、注入バッグに移される治療的TIL集団の少なくとも一部は、永続的に遺伝子編集される。
B.TIL拡張中の遺伝子編集のタイミング
いくつかの実施形態では、TIL集団は、本明細書で提供される拡張方法の過程で遺伝子修飾される。拡張方法(例えば、本明細書に記載の2Aプロセス及びGen3プロセス、または図34に示されるプロセス)は、概して、第1の拡張及び第2の拡張を含む。ある特定の実施形態では、TILは、拡張方法の第1の拡張の前に、特定のマーカー(例えば、CD39/CD69二重陰性発現)について事前選択される。いくつかの実施形態では、この濃縮集団は、第1の拡張(例えば、本明細書に記載の2AまたはGen3プロセスの第1の拡張、または図34に示される第1の拡張)を受ける前に、CD39及びCD69の発現をサイレンシングまたは最小化するように遺伝子修飾される。いくつかの実施
形態では、濃縮された集団は、第1の拡張を受け、第1の拡張で産生された細胞は、第2の拡張(例えば、本明細書に記載の2AもしくはGen3プロセスの第2の拡張、または図34に示される第1の拡張)を受ける前に、CD39及びCD69の発現をサイレンシングまたは減少させるように遺伝子修飾される。いくつかの実施形態では、濃縮集団は、第1の拡張及び第2の拡張を受け、第2の拡張の結果として産生されたTILは、CD39及びCD69の発現をサイレンシングまたは減少させるように遺伝子修飾される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者または対象におけるがんからの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料である第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)(a)における第1のTIL集団からCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILを選択して、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団を取得することと、
(c)CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団を、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む第1の細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む容器内で行われ、プライミングによる第1の拡張が、約1~11日間の第1の期間行われ、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団の数が第1のTIL集団よりも多い、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及びAPCを含む第2の培養培地中で培養することによって急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、急速な第2の拡張が、約14日以下の第2の期間行われ、治療的TIL集団を取得することと、
(e)第3のTIL集団を採取することと、
(f)採取された第3のTIL集団が、CD39及びCD69の発現を減少させる遺伝子修飾を含む遺伝子修飾されたTILを含むように、方法中の任意の時点でCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団を遺伝子修飾することと、を含む。
上記の実施形態のステップ(f)に記載されるように、遺伝子修飾プロセスは、方法において任意のTIL集団で実行されてもよく、これは、遺伝子編集が、拡張方法におけるステップのうちのいずれかの前、最中、または後に、例えば、上記の方法で概説されたステップ(a)~(e)のうちのいずれかの間に、TIL上で実行されてもよいことを意味する。ある特定の実施形態によれば、TILは、拡張方法中に収集され、収集されたTILは、遺伝子編集プロセスに供され、場合によっては、その後、拡張プロセスを継続するために拡張方法に再導入され(例えば、培養培地に戻され)、それにより治療的TIL集団の少なくとも一部が永続的に遺伝子編集される。ある実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TILを活性化し、活性化されたTILに対して遺伝子編集ステップを行い、本明細書に記載のプロセスに従って遺伝子編集TILを拡張することによって、拡張の前に実行されてもよい。
拡張プロセスの代替実施形態は、上記に示される方法とは異なり得ることに留意されたく、例えば、代替実施形態は、同じステップ(a)~(g)を有し得ないか、または異なる数のステップを有し得る。特定の実施形態にかかわらず、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行されてもよい。例えば、代替実施形態は、2つを超える拡張を含み得、第3または第4の拡張中にTILに対して遺伝子修飾が実施され得ることなどが可能である。
いくつかの実施形態によれば、遺伝子修飾プロセスは、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団、第2の集団、及び第3の集団のうちの1つ以上からのTIL上で実行される。例えば、遺伝子修飾は、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団上で、またはCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO集団から収集されたTILの一部上で実行されてもよく、遺伝子編集プロセスに続いて、それらのTILをその後、拡張プロセスに戻してもよい(例えば、培養培地に戻してもよい)。代替的に、遺伝子修飾は、第2もしくは第3の集団からのTIL上で、または第2もしくは第3の集団から収集されたTILの一部上で、それぞれ、実行されてもよく、遺伝子修飾プロセスに続いて、それらのTILをその後、拡張プロセスに戻してもよい(例えば、培養培地に戻してもよい)。他の実施形態によれば、遺伝子修飾は、TILがまだ培養培地中にある間、及び拡張が実行されている間に行われ、すなわち、遺伝子編集を実施するために必ずしも拡張から「除去」されるわけではない。
他の実施形態によれば、遺伝子修飾プロセスは、第1の拡張からのTIL、または第2の拡張からのTIL、またはその両方で実行される。例えば、第1の拡張または第2の拡張中に、遺伝子修飾は、培養培地から収集されたTIL上で実行され得、遺伝子編集プロセスの後、それらのTILは、その後、例えば、それらを培養培地に再導入することによって、拡張方法に戻され得る。
他の実施形態によれば、遺伝子修飾プロセスは、第1の拡張後かつ第2の拡張前にTILの少なくとも一部上で実行される。例えば、第1の拡張後に、遺伝子編集は、培養培地から収集されたTIL上で実行され得、遺伝子修飾プロセスの後、それらのTILは、その後、例えば、それらを第2の拡張のための培養培地に再導入することによって、拡張方法に戻され得る。
代替実施形態によれば、遺伝子編集プロセスは、ステップ(c)の前(例えば、ステップ(a)~(b)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)、ステップ(d)の前(例えば、ステップ(a)~(c)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)、またはステップ(e)の前(例えば、ステップ(a)~(d)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)に実行される。
他の実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)(a)における第1のTIL集団からCD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得することと、
(d)IL-2及び任意選択でOKT-3(例えば、OKT-3は拡張プロセスの開始日に開始して培養培地中に存在し得る)を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過
性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(f)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、採取することと、
(g)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すことと、
(h)採取されたTIL集団が、CD39及びCD69の発現を減少させる遺伝子修飾を含む遺伝子修飾されたTILを含むように、ステップ(g)において注入バッグに移す前の任意の時点で、CD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を任意選択で遺伝子修飾することと、を含む。
上記の実施形態のステップ(g)に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、ステップ(f)における注入バッグへの移送前のTIL拡張方法中の任意の時点で実行されてもよく、これは、遺伝子編集が、拡張方法のステップのうちのいずれかの前、最中、または後に、例えば、上記の方法で概説されたステップ(a)~(f)のうちのいずれかの間、または上記の方法で概説されたステップ(a)~(e)のうちのいずれかの前もしくは後に、TIL上で実行されてもよいことを意味する。ある特定の実施形態によれば、TILは、拡張方法中に収集され(例えば、拡張方法は、TILの少なくとも一部について「一時停止」され)、収集されたTILは、遺伝子編集プロセスに供され、場合によっては、その後、拡張プロセスを継続するために拡張方法に戻され(例えば、培地に戻され)、それにより最終的に注入バッグに移される治療的TIL集団の少なくとも一部が永続的に遺伝子編集される。ある実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TILを活性化し、活性化されたTILに対して遺伝子編集ステップを行い、本明細書に記載のプロセスに従って遺伝子編集TILを拡張することによって、拡張の前に実行されてもよい。
拡張プロセスの代替実施形態は、上記に示される方法とは異なり得ることに留意されたく、例えば、代替実施形態は、同じステップ(a)~(g)を有し得ないか、または異なる数のステップを有し得る。特定の実施形態にかかわらず、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行されてもよい。例えば、代替実施形態は、2つを超える拡張を含み得、第3または第4の拡張中にTILに対して遺伝子編集が実施され得ることなどが可能である。
いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集プロセスは、第1の集団、第2の集団、及び第3の集団のうちの1つ以上からのTIL上で実行される。例えば、遺伝子編集は、第1のTIL集団上で、または第1の集団から収集されたTILの一部上で実行されてもよく、遺伝子編集プロセスに続いて、それらのTILをその後、拡張プロセスに戻してもよい(例えば、培養培地に戻してもよい)。代替的に、遺伝子編集は、第2もしくは第3の集団からのTIL上で、または第2もしくは第3の集団から収集されたTILの一部上で実行されてもよく、遺伝子編集プロセスに続いて、それらのTILをその後、拡張プロセスに戻してもよい(例えば、培養培地に戻してもよい)。他の実施形態によれば、遺伝子編集は、TILがまだ培養培地中にある間、及び拡張が実行されている間に行われ、すなわち、遺伝子編集を実施するために必ずしも拡張から「除去」されるわけではない。
他の実施形態によれば、遺伝子編集プロセスは、第1の拡張からのTIL、または第2の拡張からのTIL、またはその両方で実行される。例えば、第1の拡張または第2の拡張中に、遺伝子編集は、培養培地から収集されたTIL上で実行され得、遺伝子編集プロセスの後、それらのTILは、その後、例えば、それらを培養培地に再導入することによって、拡張方法に戻され得る。
他の実施形態によれば、遺伝子編集プロセスは、第1の拡張後及び第2の拡張前にTILの少なくとも一部上で実行される。例えば、第1の拡張後に、遺伝子編集は、培養培地から収集されたTIL上で実行され得、遺伝子編集プロセスの後、それらのTILは、その後、例えば、それらを第2の拡張のための培養培地に再導入することによって、拡張方法に戻され得る。
代替実施形態によれば、遺伝子編集プロセスは、ステップ(c)の前(例えば、ステップ(a)~(b)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)、ステップ(d)の前(例えば、ステップ(a)~(c)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)、ステップ(e)の前(例えば、ステップ(a)~(d)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)、またはステップ(f)の前(例えば、ステップ(a)~(e)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)に実行される。
OKT-3に関しては、ある特定の実施形態によれば、細胞培養培地は、開始日(0日目)、または第1の拡張の1日目に開始するOKT-3を含んでもよく、その結果、遺伝子編集は、0日目及び/または1日目に細胞培養培地中でOKT-3に曝露した後にTIL上で実行されることに留意されたい。他の実施形態によれば、細胞培養培地は、第1の拡張中及び/または第2の拡張中にOKT-3を含み、OKT-3が細胞培養培地に導入される前に、遺伝子編集が実行される。代替的に、細胞培養培地は、第1の拡張中及び/または第2の拡張中にOKT-3を含み、OKT-3が細胞培養培地中に導入された後に、遺伝子編集が実行される。
4-1BBアゴニストに関しては、ある特定の実施形態によれば、細胞培養培地は、開始日(0日目)、または第1の拡張の1日目に開始する4-1BBを含んでもよく、その結果、遺伝子編集は、0日目及び/または1日目に細胞培養培地中で4-1BBアゴニストに曝露した後にTIL上で実行されることにも留意されたい。他の実施形態によれば、細胞培養培地は、第1の拡張中及び/または第2の拡張中に4-1BBを含み、4-1BBが細胞培養培地に導入される前に、遺伝子編集が実行される。代替的に、細胞培養培地は、第1の拡張中及び/または第2の拡張中に4-1BBを含み得、4-1BBアゴニストが細胞培養培地中に導入された後に、遺伝子編集が実行される。
IL-2に関しては、ある特定の実施形態によれば、細胞培養培地は、開始日(0日目)、または第1の拡張の1日目に開始するIL-2を含んでもよく、その結果、遺伝子編集は、0日目及び/または1日目に細胞培養培地中でIL-2に曝露した後にTIL上で実行されることにも留意されたい。他の実施形態によれば、細胞培養培地は、第1の拡張中及び/または第2の拡張中にIL-2を含み、IL-2が細胞培養培地に導入される前に、遺伝子編集が実行される。代替的に、細胞培養培地は、第1の拡張中及び/または第2の拡張中にIL-2を含み得、IL-2が細胞培養培地中に導入された後に、遺伝子編集が実行される。
上述のように、OKT-3、4-1BBアゴニスト及びIL-2のうちの1つ以上は、第1の拡張の0日目または1日目に開始する細胞培地中に含まれてもよい。いくつかの実施形態によれば、OKT-3は、第1の拡張の0日目または1日目に開始する細胞培地中に含まれ、及び/または4-1BBアゴニストは、第1の拡張の0日目または1日目に開始する細胞培地中に含まれ、及び/またはIL-2は、第1の拡張の0日目または1日目に開始する細胞培地中に含まれる。実施例によれば、細胞培養培地は、第1の拡張の0日目または1日目に開始するOKT-3及び4-1BBアゴニストを含む。別の実施例によれば、細胞培養培地は、第1の拡張の0日目または1日目に開始するOKT-3、4-1BBアゴニスト、及びIL-2を含む。当然のことながら、本明細書に記載の様々な実施
形態に記載されるように、OKT-3、4-1BBアゴニスト及びIL-2のうちの1つ以上を、拡張プロセス中の1つ以上の追加の時点で細胞培地に添加してもよい。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)(a)における第1のTIL集団からCD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得することと、
(d)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(f)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の細胞の一部に移入させることと、
(g)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(h)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(i)ステップ(h)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(h)からステップ(i)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(j)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、第2のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの遺伝子エディターの無菌エレクトロポレーションが、その一部における複数の細胞を修飾して、CD39及びCD69の発現を減少させる、移すことと、を含む。
いくつかの実施形態によれば、前述の方法は、凍結保存培地を使用して採取されたTIL集団を凍結保存することをさらに含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地はジメチルスルホキシド系凍結保存培地である。他の実施形態では、凍結保存培地は、CS10である。
他の実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者または対象におけるがんからの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料である第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)(a)における第1のTIL集団からCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得することと、
(c)CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地中で培養することによってプライミングによる
第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む容器内で行われ、プライミングによる第1の拡張が、約1~11日間の第1の期間行われ、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団の数が第1のTIL集団よりも多い、第2のTIL集団を産生することと、
(d)任意選択で、第2のTIL集団をOKT-3で再刺激するステップと、
(e)第2のTIL集団を遺伝子修飾して、修飾された第2のTIL集団を産生することであって、修飾された第2のTIL集団が、CD39及びCD69の発現を減少させる遺伝子修飾を含む、修飾された第2のTIL集団を産生することと、
(f)修飾された第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及びAPCを含む第2の細胞培養培地中で培養することによって急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張が約14日以内の第2の期間行われて、治療的TIL集団を取得し、第3のTIL集団が、CD39及びCD69の発現を減少させる遺伝子修飾を含む治療的TIL集団である、第3のTIL集団を産生することと、
(g)第3のTIL集団を採取することと、を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子修飾ステップは、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)系、転写活性化因子様エフェクター(TALE)系、またはジンクフィンガー系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系のエレクトロポレーション及び送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディター系は、修飾された第2のTIL集団においてCD39及び/またはCD69の発現を減少させる。
いくつかの実施形態によれば、前述の方法を使用して、がんを有するヒト対象の治療のために自己採取されたTIL集団を提供することができる。
C.遺伝子編集法
上記で考察されたように、本発明の実施形態は、それらの治療効果(例えば、細胞表面上で免疫調節融合タンパク質の発現)を増強するために遺伝子編集を介して遺伝子修飾された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を提供する。本発明の実施形態は、1つ以上のタンパク質の発現の促進及び1つ以上のタンパク質の発現の阻害の両方、ならびにそれらの組み合わせのために、TIL集団へのヌクレオチド挿入(RNAまたはDNA)による遺伝子編集を包含する。本発明の実施形態は、TILを治療的集団に拡張するための方法も提供し、方法は、TILを遺伝子編集することを含む。TIL集団を遺伝子修飾するために使用され得るいくつかの遺伝子編集技術が存在し、それらは本発明による使用に好適である。
いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、1つ以上のタンパク質の産生のために遺伝子の安定した組み込みステップを含む。ある実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、レトロウイルス形質導入ステップを含む。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、レンチウイルス形質導入ステップを含む。レンチウイルス形質導入系は、当該技術分野で知られており、例えば、Levine,et al.,Proc.Nat′l Acad.Sci.2006,103,17372-77、Zufferey,et al.,Nat.Biotechnol.1997,15,871-75、Dull,et al.,J.Virology 1998,72,8463-71、及び米国特許第6,627,442号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、ガンマレトロウイルス形質導入ステップを含む。ガンマレトロウイルス形質導入系は、当該技術分野で知られており、例えば、Cepko and Pear,Cur.Prot.Mol.Biol.1996,9.9.1-9.9.16に記載されており、この開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、トランスポゾン媒介遺伝子導入ステップを含む。トランスポゾン媒介遺伝子導入系は、当該技術分野で知られており、トランスポザーゼが
、DNA発現ベクターとしてまたは発現可能なRNAもしくはタンパク質として提供される系を含み、これにより、トランスポザーゼ、例えば、mRNA(例えば、キャップ及びポリA尾部を含むmRNA)として提供されるトランスポザーゼの長期発現がトランスジェニック細胞で起こらないようになる。SB10、SB11、及びSB100xなどのサケ科型Tel様トランスポザーゼ(SBまたはSleeping Beautyトランスポザーゼ)を含む好適なトランスポゾン媒介遺伝子導入系、ならびに増加した酵素活性を有する操作された酵素は、例えば、Hackett,et al.,Mol.Therapy 2010,18,674-83及び米国特許第6,489,458号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、1つ以上のタンパク質の産生または阻害(例えば、サイレンシング)のために遺伝子の安定した組み込みステップを含む。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、エレクトロポレーションステップを含む。エレクトロポレーション法は、当該技術分野で知られており、例えば、Tsong,Biophys.J.1991,60,297-306及び米国特許出願公開第2014/0227237A1号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。米国特許第5,019,034号、同第5,128,257号、同第5,137,817号、同第5,173,158号、同第5,232,856号、同第5,273,525号、同第5,304,120号、同第5,318,514号、同第6,010,613号、及び同第6,078,490号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるものなどの当該技術分野で知られている他のエレクトロポレーション法が使用され得る。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、滅菌エレクトロポレーション法である。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、パルスエレクトロポレーション法である。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのDC電気パルス列は、以下の特徴のうちの1つ、2つ、または3つを有する:(1)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる、(2)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる、及び(3)少なくとも3つのパルスのうちの2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つの第1のセットの
第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILにおける細孔形成を誘導するステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つのDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのDC電気パルス列は、以下の特徴のうちの1つ、2つ、または3つを有する:(1)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる、(2)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる、及び(3)少なくとも3つのパルスのうちの2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なり、これにより、誘導された細孔が比較的長期間にわたって持続され、TILの生存率が維持される。
いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、リン酸カルシウムトランスフェクションステップを含む。リン酸カルシウムトランスフェクション法(リン酸カルシウムDNA沈殿、細胞表面コーティング、及びエンドサイトーシス)は、当該技術分野で知られており、Graham and van der Eb,Virology 1973,52,456-467、Wigler,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.1979,76,1373-1376、及びChen and Okayarea,Mol.Cell.Biol.1987,7,2745-2752、ならびに米国特許第5,593,875号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、リポソームトランスフェクションステップを含む。リポソームトランスフェクション法、例えば、カチオン性脂質N-[1-(2,3-ジオレイルオキシ)プロピル]-n,n,n-トリメチルアンモニウムクロリド(DOTMA)及びジオレオイルホスホチジルエタノールアミン(DOPE)の1:1(w/w)リポソーム製剤を用いる方法は、当該技術分野において既知であり、Rose,et al.,Biotechniques 1991,10,520-525及びFelgner,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1987,84,7413-7417、ならびに米国特許第5,279,833号、同第5,908,635号、同第6,056,938号、同第6,110,490号、同第6,534,484号、及び同第7,687,070号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、米国特許第5,766,902号、同第6,025,337号、同第6,410,517号、同第6,475,994号、及び同第7,189,705号に記載の方法を使用するトランスフェクションステップを含み、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
ある実施形態によれば、遺伝子編集プロセスは、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。かかるプログラム可能なヌクレアーゼは、特定のゲノム遺伝子座に切断を導入することによって正確なゲノム編集を可能にし、すなわち、ゲノム内の特定のDNA配列の認識に依存して、ヌクレアーゼドメインをこの位置に標的し、標的配列での二本鎖切断の生成を媒介する。DNAの二本鎖切断は、その後、内因性修復機構を切断部位に動員して、非相同末端結合(NHEJ)または相同指向修復(HDR)のいずれかによるゲノム編集を媒介する。したがって、切断の修復は、標的遺伝子産物を破壊する(例えば、サイレンス、抑制、または増強する)挿入/欠失変異の導入をもたらす可能性がある。
部位特異的ゲノム編集を可能にするために開発されたヌクレアーゼの主要なクラスには、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)、転写活性化因子様ヌクレアーゼ(TALEN)、及びCRISPR関連ヌクレアーゼ(例えば、CRISPR/Cas9)が含まれる。これらのヌクレアーゼ系は、DNA認識のモードに基づいて大きく2つのカテゴリー
に分類され得、ZFN及びTALENは、タンパク質-DNA相互作用を介して特定のDNA結合を達成するが、Cas9などのCRISPR系は、標的DNAと直接塩基対を形成する短いRNAガイド分子によって、かつタンパク質-DNA相互作用によって特定のDNA配列を標的とする。例えば、Cox et al.,Nature Medicine,2015,Vol.21,No.2を参照されたい。
本発明のTIL拡張方法に従って使用され得る遺伝子編集法の非限定的な例には、CRISPR法、TALE法、及びZFN法が含まれ、これらの実施形態は以下でより詳細に説明される。いくつかの実施形態によれば、TILを治療用集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A)に従って、またはPCT/US2017/058610、PCT/US2018/012605、もしくはPCT/US2018/012633に記載されるように実行することができ、方法は、増強された治療効果を提供することができるTILを生成するために、CRISPR法、TALE法、またはZFN法のうちの1つ以上によって、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集されたTILは、インビトロでそれらを修飾されていないTILと比較することによって、例えば、修飾されていないTILと比較してインビトロでのエフェクター機能、サイトカインプロファイルなどを評価することによって、治療効果の改善について評価され得る。
本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーションは、CRISPR系、TALEN系、及びZFN系などの遺伝子編集系の送達のために使用される。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーション系は、フローエレクトロポレーション系である。本発明のいくつかの実施形態との使用に好適な、好適なフローエレクトロポレーション系の例は、市販のMaxCyte STX系である。本発明との使用に好適であり得る、BTX-Harvard Apparatusから入手可能なAgilePulse系もしくはECM830、Cellaxess Elektra(Cellectricon)、Nucleofector(Lonza/Amaxa)、GenePulser MXcell(BIORAD)、iPorator-96(Primax)、またはsiPORTer96(Ambion)などのいくつかの代替の市販エレクトロポレーション機器が存在する。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーション系は、TIL拡張法の残りとともに、滅菌閉鎖系を形成する。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーション系は、本明細書に記載のパルスエレクトロポレーション系であり、TIL拡張法の残りとともに、滅菌閉鎖系を形成する。
a.CRISPR法
TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A)に従って、またはPCT/US2017/058610、PCT/US2018/012605、もしくはPCT/US2018/012633に記載されるように実行することができ、この方法は、CRISPR法(例えば、CRISPR/Cas9またはCRISPR/Cpf1)によって、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のCRISPR法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の細胞表面での少なくとも1つの免疫調節組成物の発現を引き起こし、任意選択で、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子を治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは減少させる。代替的に、TIL拡張プロセス中のCRISPR法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の細胞表面での少なくとも1つの免疫調節組成物の発現を引き起こし、任意選択で、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子を治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカーに融合したサイトカインを含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-12、IL-15、及びIL-21からなる群から選択される。
CRISPRは、「Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats(クラスター化された定期的に間隔をあけた短いパリンドロミックリピート)」の略語である。遺伝子編集のためにCRISPR系を使用する方法は、本明細書ではCRISPR法とも称される。CRISPR系は、クラス1及びクラス2の2つの主要なクラスに分類され得、これらは、異なるタイプ及びサブタイプにさらに分類される。CRISPR系の分類は、特定の核酸を切断することができるエフェクターCasタンパク質に基づいている。クラス1CRISPR系では、エフェクターモジュールは、マルチタンパク質複合体からなるが、クラス2の系は、1つのエフェクタータンパク質のみを使用する。クラス1CRISPRには、I型、III型、及びIV型が含まれ、クラス2 CRISPRには、II型、V型、及びVI型が含まれる。これらの型のCRISPR系のうちのいずれかは、本発明に従って使用され得るが、RNA及びCasタンパク質を組み込み、かつ本発明に従って使用されることが好ましいCRISPR系には、3つの型:I型(Cas3によって例示される)、II型(Cas9によって例示される)、及びIII型(Cas10によって例示される)がある。II型CRISPRは、最もよく特徴付けられている系のうちの1つである。
CRISPR技術は、細菌及び古細菌(単細胞微生物のドメイン)の自然防御機構から適合された。これらの生物は、CRISPR由来のRNA及びCas9を含む様々なCasタンパク質を使用して、外来侵入物のDNAを切り刻んで破壊することによって、ウイルス及び他の異物による攻撃を阻止する。CRISPRは、ヌクレオチド反復配列及びスペーサーの存在という2つの異なる特徴を有するDNAの特殊な領域である。ヌクレオチドの反復配列は、CRISPR領域全体に分布しており、外来DNA(スペーサー)の短いセグメントが反復配列の間に散在している。II型CRISPR/Cas系では、スペーサーは、CRISPRゲノム遺伝子座内に組み込まれ、転写され、短いCRISPR RNA(crRNA)に処理される。これらのcrRNAは、トランス活性化crRNA(tracrRNA)にアニーリングし、Casタンパク質による病原性DNAの配列特異的切断及びサイレンシングを指示する。Cas9タンパク質による標的認識には、crRNA内の「シード」配列、及びcrRNA結合領域の上流にある保存されたジヌクレオチドを含むプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列が必要である。これにより、CRISPR/Cas系が再標的されて、crRNAを再設計することにより、実質的にいずれのDNA配列も切断することができる。したがって、ある特定の実施形態によれば、Cas9は、crRNA-tracrRNA認識時にDNAを切断するRNA誘導DNAエンドヌクレアーゼとして機能する。天然系におけるcrRNA及びtracrRNAは、遺伝子操作で使用するために、およそ100ヌクレオチドの単一ガイドRNA(sgRNA)に簡略化され得る。sgRNAは、Cas結合に必要な足場配列と、修飾されるゲノム標的を定義するユーザ定義のおよそ17~20ヌクレオチドスペーサーとを含む合成RNAである。したがって、ユーザは、sgRNAに存在する標的配列を変更することによって、Casタンパク質のゲノム標的を変更することができる。CRISPR/Cas系は、Cas9エンドヌクレアーゼを発現するプラスミドとRNA成分(例えば、sgRNA)を同時送達することにより、ヒト細胞に直接運搬可能である。Casタンパク質の異なるバリアント(例えば、Cpf1などのCas9のオルソログ)を使用して、標的の制限を低減することができる。
いくつかの実施形態によれば、操作された、プログラム可能な、天然に存在しないII型CRISPR-Cas系は、Cas9タンパク質及びTILにおいてDNA分子の標的配列を標的とし、それにハイブリダイズする少なくとも1つのガイドRNAを含み、DNA分子が少なくとも1つの免疫チェックポイント分子をコードし、TILが少なくとも1つの免疫チェックポイント分子を発現し、Cas9タンパク質がDNA分子を切断し、それによって、少なくとも1つの免疫チェックポイント分子の発現が改変され、Cas9タ
ンパク質及びガイドRNAが、天然に一緒に存在しない。ある実施形態によれば、2つ以上の免疫チェックポイント分子の発現が改変される。ある実施形態によれば、ガイドRNA(複数可)は、tracr配列に融合したガイド配列を含む。例えば、ガイドRNAは、crRNA-tracrRNAまたはsgRNAを含み得る。本発明の態様によれば、「ガイドRNA」、「単一ガイドRNA」及び「合成ガイドRNA」という用語は、互換的に使用され得、ガイド配列を含むポリヌクレオチド配列を指し、これは、標的部位を特定するガイドRNA内の約17~20bpの配列である。
Cas9と比較して改善されたオンターゲット特異性を有するCas9のバリアントもまた、本発明の実施形態に従って使用され得る。そのようなバリアントは、高忠実度Cas-9と称され得る。ある実施形態によれば、デュアルニッカーゼアプローチを利用してもよく、反対のDNA鎖を標的とする2つのニッカーゼは、標的DNA内でDSBを生成する(多くの場合、ダブルニッカーゼまたはデュアルニッカーゼCRISPR系と称される)。例えば、このアプローチは、2つのCas9ヌクレアーゼドメインのうちの1つの変異を伴い、Cas9をヌクレアーゼからニッカーゼに変えることを伴い得る。高忠実度Cas9の非限定的な例としては、eSpCas9、SpCas9-HF1及びHypaCas9が挙げられる。そのようなバリアントは、非標的DNA部位における望ましくない変化を低減または排除し得る。例えば、Slaymaker IM,et al.Science.2015 Dec 1、Kleinstiver BP,et al.Nature.2016 Jan 6、及びRan et al.,Nat Protoc.2013 Nov;8(11):2281-2308(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)を参照されたい。
追加として、特定の実施形態によれば、参照により本明細書に組み込まれる、米国特許出願公開第2016/0102324号に開示されているものなどの、細胞へのCas9の遺伝子送達を改善し、標的特異性を改善する、Cas9足場を使用することができる。例えば、Cas9足場は、(D-[I/L]-G-X-X-S-X-G-W-A)によって定義されるRuvCモチーフ及び/または(Y-X-X-D-H-X-X-P-X-S-X-X-X-D-X-S)によって定義されるHNHモチーフを含んでよく、Xは、20個の天然に存在するアミノ酸のうちのいずれか1つを表し、[I/L]は、イソロイシンまたはロイシンを表す。HNHドメインは、標的dsDNAの一方の鎖をニッキングすることに関与し、RuvCドメインは、dsDNAの他方の鎖の切断に関与する。したがって、これらのドメインの各々は、PAMのすぐ近くのプロトスペーサー内の標的DNAの鎖をニックし、DNAの鈍い切断をもたらす。これらのモチーフを互いに組み合わせて、よりコンパクト及び/またはより特異的なCas9足場を作製してもよい。さらに、モチーフを使用して、分割されたCas9タンパク質(すなわち、RuvCドメインまたはHNHドメインのいずれかを含むCas9タンパク質またはCas9バリアントの還元型または切断型)を作製してもよく、分割されたCas9タンパク質は、2つの別個のRuvCドメイン及びHNHドメインに分割され、標的DNAを一緒にまたは別個に処理することができる。
特定の実施形態によれば、CRISPR法は、Cas9ヌクレアーゼ及び免疫チェックポイント遺伝子(複数可)の標的DNA配列に特異的なおよそ17~20ヌクレオチドの配列を含むガイドRNA(例えば、crRNA-tracrRNAまたはsgRNA)を導入することによって、TILにおける1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現をサイレンシングまたは減少させることを含む。ガイドRNAは、RNAとして、またはプロモーターの下でガイドRNAコード配列を有するプラスミドを形質転換することによって送達されてもよい。CRISPR/Cas酵素は、sgRNAにより定義された標的配列に基づいて、特定の位置に二本鎖切断(DSB)を導入する。DSBは、DNAの挿入または欠失(インデル)を頻繁に引き起こす機序である、非相同末端結合(NHEJ)に
よって細胞内で修復され得る。インデルは、多くの場合、フレームシフトをもたらし、例えば、標的遺伝子のオープンリーディングフレーム(ORF)内で早期停止コドンを引き起こすことによって、機能対立遺伝子の喪失を引き起こす。ある特定の実施形態によれば、結果は、標的免疫チェックポイント遺伝子内の機能喪失変異である。
代替的に、CRISPR/Cas酵素によって誘導されるDSBは、NHEJの代わりに相同性指向修復(HDR)によって修復されてもよい。NHEJ媒介DSB修復は、しばしば遺伝子のオープンリーディングフレームを破壊するが、相同指向修復(HDR)を使用して、単一ヌクレオチド変化から大きな挿入までの範囲の特異的なヌクレオチド変化を生成することができる。ある実施形態によれば、HDRは、sgRNA(複数可)及びCas9またはCas9ニッカーゼを有するTILに所望の配列を含むDNA修復テンプレートを送達することによって、免疫チェックポイント遺伝子を遺伝子編集するために使用される。修復テンプレートは、好ましくは、所望の編集、ならびに標的遺伝子のすぐ上流及び下流の追加の相同配列(多くの場合、左及び右の相同アームと称される)を含む。
特定の実施形態によれば、酵素的に不活性なバージョンのCas9(deadCas9またはdCas9)は、開始を遮断することによって転写を抑制するために、転写開始部位を標的とし得る。したがって、標的とされた免疫チェックポイント遺伝子は、DSBを使用せずに抑制され得る。dCas9分子は、sgRNA標的化配列に基づいて標的DNAに結合する能力を保持している。本発明のある実施形態によれば、CRISPR法は、標的遺伝子(複数可)の転写を阻害または防止することによって、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現をサイレンシングまたは減少させることを含む。例えば、CRISPR法は、Kruppel関連ボックス(KRAB)ドメインなどの転写リプレッサードメインをCas9の酵素不活性バージョンに融合させ、それによって、例えば、免疫チェックポイント遺伝子の転写開始部位を標的とするdCas9-KRABを形成し、遺伝子の転写の阻害または防止をもたらすことを含み得る。好ましくは、リプレッサードメインは、転写開始部位の下流、例えば、約500bp下流のウィンドウを標的とする。CRISPR干渉(CRISPRi)と称され得るこのアプローチは、標的RNAの転写還元を介して堅牢な遺伝子ノックダウンをもたらす。
特定の実施形態によれば、酵素的に不活性なバージョンのCas9(deadCas9またはdCas9)は、転写を活性化するために、転写開始部位を標的とし得る。このアプローチは、CRISPR活性化(CRISPRa)と称され得る。ある実施形態によれば、CRISPR法は、標的遺伝子(複数可)の転写を活性化することによって1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を増加させることを含む。そのような実施形態によれば、標的とされた免疫チェックポイント遺伝子は、DSBを使用せずに活性化され得る。CRISPR法は、例えば、VP64などの転写活性化因子をdCas9に融合させ、それによって例えば、免疫チェックポイント遺伝子の転写開始部位を標的とするdCas9-VP64を形成することによって、転写活性化ドメインを転写開始部位に標的化することを含み得、遺伝子の転写の活性化をもたらす。好ましくは、活性化因子ドメインは、転写開始部位から上流のウィンドウ、例えば、約50~400bp下流を標的とする。
本発明の追加の実施形態は、哺乳動物細胞における標的遺伝子の強力な活性化のために開発された活性化戦略を利用し得る。非限定的な例としては、エピトープタグ付きdCas9及び抗体活性化剤エフェクタータンパク質(例えば、SunTag系)の共発現、複数の異なる活性化ドメインに直列に融合したdCas9(例えば、dCas9-VPR)、またはdCas9-VP64と修飾された足場gRNA及び追加のRNA結合ヘルパー活性化因子(例えば、SAM活性化因子)との共発現が挙げられる。
他の実施形態によれば、参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第9,982,
278号に開示されるように、CRISPR支援合理的タンパク質操作(CARPE)と称されるCRISPR媒介ゲノム編集方法を、本発明の実施形態に従って使用してもよい。CARPEは、一本鎖DNA(ssDNA)または二本鎖DNA(dsDNA)編集カセットからの指向性変異をゲノムに直接組み込む「ドナー」及び「デスティネーション」ライブラリーの生成を伴う。ドナーライブラリーの構築は、標的DNA配列にハイブリダイズするガイドRNA(gRNA)を用いて、合理的に設計された編集オリゴヌクレオチドを細胞に同時形質転換することを伴う。編集オリゴヌクレオチドは、PAMの欠失または変異を、隣接遺伝子内の1つ以上の所望のコドンの変異とカップリングするように設計される。これにより、ドナーライブラリー全体を単一の形質転換で生成することができる。ドナーライブラリーは、編集オリゴヌクレオチドからの合成特徴、すなわち、遺伝子の3’末端に同時に組み込まれる第2のPAM欠失または変異を使用して、PCR反応などによる組換え染色体の増幅によって回収される。これは、PAM欠失に指向されたコドン標的変異を共有結合する。次いで、ドナーライブラリーを、デスティネーションgRNAベクターを有する細胞に同時形質転換して、合理的に設計されたタンパク質ライブラリーを発現する細胞の集団を作製する。
他の実施形態によれば、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第9,982,278号に開示されるように、追跡可能なCRISPR濃縮組換えによるゲノム操作(GEn-TraCER)と称されるCRISPR媒介系を使用する、追跡可能な精密ゲノム編集のための方法を、本発明の実施形態に従って使用してもよい。GEn-TraCER方法及びベクターは、編集カセットを、単一のベクター上のgRNAをコードする遺伝子と組み合わせる。カセットは、所望の変異及びPAM変異を含有する。Cas9もコードし得るベクターは、細胞または細胞集団に導入される。これは、細胞または細胞集団におけるCRISPR系の発現を活性化し、gRNAにCas9を標的領域に動員させ、dsDNA切断が発生し、PAM変異の組み込みを可能にする。
CRISPR法によりTILを永続的に遺伝子編集することによってサイレンシングまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例には、CD39、CD69、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、及びTOXが含まれる。
CRISPR法によりTILを永続的に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の非限定的な例には、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18、IL-21、NOTCH1/2細胞内ドメイン(ICD)、及び/またはNOTCHリガンドmDLL1が含まれる。
CRISPR法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得る系、方法、及び組成物の例は、米国特許第8,697,359号、同第8,993,233号、同第8,795,965号、同第8,771,945号、同第8,889,356号、同第8,865,406号、同第8,999,641号、同第8,945,839号、同第8,932,814号、同第8,871,445号、同第8,906,616号、及び同第8,895,308号に記載されており、これらは参照に
より本明細書に組み込まれる。CRISPR/Cas9及びCRISPR/Cpf1を発現するためのプラスミドなどのCRISPR法を行うための資源は、GenScriptなどの企業から市販されている。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のTIL集団の遺伝子修飾は、米国特許第9,790,490号に記載されているCRISPR/Cpf1系を使用して行うことができ、この開示は参照により本明細書に組み込まれる。CRISPR/Cpf1系は、Cpf1関連CRISPRアレイが追加のtracrRNAを必要とすることなく成熟したcrRNAに処理されるという点で、CRISPR-Cas9系とは機能的に異なる。CRISPR/Cpf1系で使用されるcrRNAは、スペーサーまたはガイド配列及び直接反復配列を有する。この方法を使用して形成されるCpf1p-crRNA複合体は、それ自体で標的DNAを切断するのに十分である。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)任意選択で、腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)(a)における第1のTIL集団からCD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得することと、
(d)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(f)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(g)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(h)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(i)ステップ(h)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(h)からステップ(i)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(j)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(i)から(j)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すことと、
(k)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップは、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)/Cas9系及びCRISPR/Cpf1系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系の送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディターは、CD39及びCD69の発現を減少させる。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)任意選択で、腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)(a)における第1のTIL集団からCD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得することと、
(d)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激して、第2のTIL集団を取得することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(f)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(g)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(h)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(i)ステップ(h)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(h)からステップ(i)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(j)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(i)から(j)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すことと、
(k)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップは、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)/Cas9系及びCRISPR/Cpf1系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系の送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディター系は、CD39及びCD69の発現を減少させる。
b.TALE法
TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A)に従って、またはPCT/US2017/058610、PCT/US2018/012605、もしくはPCT/US2018/012633に記載されるように実行することができ、この方法は、TALE法によって、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のTALE法の使用は、細胞表面での少なくとも1つの免疫調節組成物の発現を引き起こし、任意選択で、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは減少させる。代替的に、TIL拡張プロセス中のTALE法の使用は、細胞表面での少なくとも1つの免疫調節組成物の発現を引き起こし、任意選択で、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。
TALEは、TALEN(「転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ」)を含む、「Transcription Activator-Like Effector(転写活性化因子様エフェクター)」タンパク質の略語である。遺伝子編集のためにTALE系を使用する方法は、本明細書ではTALE法とも称され得る。TALEは、植物病原菌Xanthomonas属由来の天然に存在するタンパク質であり、各々単一の塩基対を認識する一連の33~35アミノ酸反復ドメインで構成されるDNA結合ドメインを含む。TALE特異性は、反復可変二残基(RVD)として知られる2つの超可変アミノ酸によって決定される。モジュラーTALE反復配列は、隣接するDNA配列を認識するために一緒に結合される。DNA結合ドメイン内の特定のRVDは、標的遺伝子座内の塩基を認識し、予測可能なDNA結合ドメインを組み立てるための構造的特徴を提供する。TALEのDNA結合ドメインは、IIS型FokIエンドヌクレアーゼの触媒ドメインに融合して、標的可能なTALEヌクレアーゼを作製する。部位特異的変異を誘導するために、14~20塩基対のスペーサー領域によって分離された2つの個々のTALENアームがFokIモノマーを密接に接近させて二量体化し、標的とされる二本鎖切断を産生する。
様々な組み立て方法を利用したいくつかの大規模な系統的研究により、TALE反復配列を組み合わせて、実質的にすべてのユーザ定義配列を認識することができることが示されている。カスタムTALEアレイの迅速な組み立てを可能にする戦略には、ゴールデンゲート分子クローニング、高スループット固相組み立て、及びライゲーション非依存性クローニング技術が含まれる。カスタム設計されたTALEアレイも、Cellectis
Bioresearch(Paris,France)、Transposagen Biopharmaceuticals(Lexington,KY,USA)、及びLife Technologies(Grand Island,NY,USA)から市販されている。追加として、所望の標的のためのカスタムTALエフェクター反復アレイの設計を可能にし、また、予測されるTALエフェクター結合部位を提供する、TALエフェクター-ヌクレオチドターゲット2.0などのウェブベースのツールが利用可能である。Doyle,et al.,Nucleic Acids Research,2012,Vol.40,W117-W122を参照されたい。本発明での使用に好適なTALE法及びTALEN法の例は、米国特許公開第2011/0201118A1号、同第2013/0117869A1号、同第2013/0315884A1号、同第2015/0203871A1号、同第2016/0120906A1号に記載されており、これらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
本発明のいくつかの実施形態によれば、TALE法は、標的遺伝子(複数可)の転写を阻害または防止することによって、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現をサイレンスまたは減少させることを含む。例えば、TALE法は、KRAB-TALEを利用することを含み得、この方法は、転写Kruppel関連ボックス(KRAB)ドメインを、遺伝子の転写開始部位を標的とするDNA結合ドメインに融合することを含み、遺伝子の転写の阻害または防止につながる。
他の実施形態によれば、TALE法は、標的遺伝子(複数可)に変異を導入することによって1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現をサイレンスまたは減少させることを含む。例えば、TALE法は、FoklなどのヌクレアーゼエフェクタードメインをTALE DNA結合ドメインに融合させ、TALENをもたらすことを含み得る。Foklは、二量体として活性であり、したがって、この方法は、FOKLヌクレアーゼドメインを隣接するゲノム標的部位に位置決めするためのTALEN対を構築することを含み、DNA二本鎖切断を導入する。Foklの正しい位置決め及び二量体化後、二本鎖切断が完了し得る。二本鎖切断が導入されると、DNA修復は、高忠実度相同組換え対(HRR
)(相同性指向修復またはHDRとしても知られる)またはエラーが発生しやすい非相同性末端結合(NHEJ)の2つの異なる機序を介して達成することができる。NHEJを介した二本鎖切断の修復は、好ましくは、DNA標的部位の欠失、挿入または置換をもたらす、すなわち、NHEJは、典型的には、切断部位での小さな挿入及び欠失の導入をもたらし、多くの場合、遺伝子機能をノックアウトするフレームシフトを誘導する。特定の実施形態によれば、TALEN対は、遺伝子の最5’エクソンを標的とし、早期フレームシフト変異または早期停止コドンを促進する。TALENによって導入される遺伝子変異(複数可)は、好ましくは永続的である。したがって、いくつかの実施形態によれば、この方法は、二量体化TALENを利用して、エラーが発生しやすいNHEJを介して修復される部位特異的二本鎖切断を誘導し、標的免疫チェックポイント遺伝子に1つ以上の変異をもたらすことによって、免疫チェックポイント遺伝子の発現をサイレンシングまたは減少させることを含む。
追加の実施形態によれば、TALENは、非ランダム点変異、標的欠失、またはDNA断片の付加などのHRRを介して遺伝子改変を導入するために利用される。DNA二本鎖切断の導入は、好適なドナーDNAの存在下での相同組換えを介した遺伝子編集を可能にする。いくつかの実施形態によれば、この方法は、部位特異的二本鎖切断を誘導し、1つ以上の導入遺伝子をDNAに組み込むために、二量体化TALEN及び遺伝子座特異的相同性アームを有するドナープラスミドを同時送達することを含む。
他の実施形態によれば、米国特許公開第2011/0201118号に開示されているように、FokI及びAvrXa7に由来するハイブリッドタンパク質であるTALENを、本発明の実施形態に従って使用してもよい。このTALENは、AvrXa7の標的ヌクレオチド及びFokIの二本鎖DNA切断活性に対する認識特異性を保持する。同じ方法を使用して、異なる認識特異性を有する他のTALENを調製することができる。例えば、コンパクトTALENは、DNA結合特異性を変化させ、特定の単一のdsDNA標的配列を標的とするために、RVDの異なるセットを有するコアTALE足場を操作することによって生成され得る。米国特許公開第2013/0117869号を参照されたい。触媒ドメインの選択は、DNA処理をもたらすために足場に付着させることができ、これは、触媒ドメインが、コアTALE足場に融合されたときに、単一のdsDNA標的配列の近くでDNAを処理することができることを確実にするように操作され得る。ペプチドリンカーはまた、触媒ドメインを足場に融合させて、特定の単一のdsDNA配列を標的とするために二量体化を必要としない単一のポリペプチド鎖からなるコンパクトなTALENを作製するように操作されてもよい。コアTALE足場はまた、TALモノマーであり得る触媒ドメインをそのN末端に融合させることによって修飾され得、この触媒ドメインが別のTALモノマーに融合された別の触媒ドメインと相互作用する可能性を可能にし、それによって標的配列の近傍でDNAを処理する可能性が高い触媒エンティティを作製する。米国特許公開第2015/0203871号を参照されたい。このアーキテクチャは、1つのDNA鎖のみを標的とすることを可能にするが、これは古典的なTALENアーキテクチャの選択肢ではない。
本発明のある実施形態によれば、従来のRVDを使用して、遺伝子発現を顕著に低減することができるTALENを作製してもよい。ある実施形態では、4つのRVD、NI、HD、NN、及びNGを使用して、それぞれ、アデニン、シトシン、グアニン、及びチミンを標的とする。これらの従来のRVDを使用して、例えば、PD-1遺伝子を標的とするTALENを作製することができる。従来のRVDを使用するTALENの例としては、Gautron et al.,Molecular Therapy:Nucleic Acids Dec.2017,Vol.9:312-321(Gautron)(これは参照により本明細書に組み込まれる)に開示されているT3v1及びT1 TALENが挙げられる。T3v1及びT1 TALENは、PD-L1結合部位が位置するP
DCD1遺伝子座の第2のエクソンを標的とし、PD-1産生を著しく低減することができる。ある実施形態では、T1 TALENは、標的配列番号238を使用することによってそれを行い、T3v1 TALENは、標的配列番号239を使用することによってそれを行う。
他の実施形態によれば、TALENは、Gautronに開示されるような、標的遺伝子に対するそれらの活性及び特異性を改善するために、非従来型RVDを使用して修飾される。天然に存在するRVDは、超可変アミノ酸位置の潜在的な多様性レパートリーのごく一部のみをカバーする。非従来のRVDは、天然のRVDの代替物を提供し、TALENによるオフサイト標的(標的配列に対していくつかのミスマッチを含むゲノム内の配列)の標的化を除外するために使用され得る、新規の固有の標的化特異性特徴を有する。非従来型RVDは、Juillerat,et al.,Scientific Reports 5,Article Number 8150(2015)(これは参照により本明細書に組み込まれる)に開示されるようなアレイの定義された位置における2つの超可変アミノ酸位置にアミノ酸の代替組み合わせを含むTALENの集合を生成及びスクリーニングすることによって同定され得る。次に、ミスマッチの位置に存在するヌクレオチドを区別する非従来型RVDを選択してもよく、これにより、標的位置の適切な処理を依然として可能にしながら、オフサイト配列でのTALEN活性を防止することができる。次いで、選択された非従来型RVDは、TALEN内の従来のRVDを置き換えるために使用され得る。従来のRVDが非従来型RVDに置き換えられたTALENの例としては、Gautronによって産生されたT3v2及びT3v3 PD-1 TALENが挙げられる。これらのTALENは、従来のRVDを使用したTALENと比較した場合、特異性が増加していた。
追加の実施形態によれば、TALENを利用して、2つの遺伝子の発現をサイレンシングまたは減少させるための遺伝子改変を導入してもよい。例えば、2つの異なる遺伝子を標的とするために2つの別個のTALENを生成し、次いで一緒に使用してもよい。2つのTALENによってそれぞれの遺伝子座及び潜在的なオフターゲット部位で生成される分子事象は、ハイスループットDNA配列決定によって特徴付けられ得る。これにより、オフターゲット部位の分析、及び両方のTALENの使用から生じる可能性のある部位の特定が可能になる。この情報に基づいて、一緒に使用されても特異性及び活性が増加したTALENを操作するために、適切な従来型及び非従来型のRVDが選択され得る。例えば、Gautronは、T3v4 PD-1及びTRAC TALENを併用して、強力なインビトロ抗腫瘍機能を維持したダブルノックアウトCAR T細胞を産生することを開示する。
いくつかの実施形態では、Gautronの方法または本明細書に記載の他の方法は、TILを遺伝子編集するために用いられてもよく、このTILは、次いで、本明細書に記載の手順のうちのいずれかによって拡張されてもよい。ある実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)CD3及びCD28活性化ビーズまたは抗体を使用して、患者から切除された腫瘍から取得されたTILの第1の集団を1~5日間活性化するステップと、
(b)(a)における第1のTIL集団からCD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得するステップと、
(c)転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼのエレクトロポレーションを使用して第1のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第2のTIL集団を取得するステップであって、遺伝子編集が、第2のTIL集団の細胞の一部においてCD39及びCD69を減少させる、第2のTIL集団を取得するステップと、
(d)任意選択で、第2のTIL集団をインキュベートするステップと、
(e)IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む細胞培養培地中で第2のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第3のTIL集団を取得する、第3のTIL集団を産生するステップと、
(f)第3のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第4のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第4のTIL集団を取得し、第4のTIL集団が、治療的TIL集団である、第4のTIL集団を産生するステップと、
(g)ステップ(f)から取得された治療的TIL集団を採取するステップと、
(h)ステップ(g)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すステップと、
(i)任意選択で、ステップ(a)~(h)のうちの1つ以上が、閉鎖した無菌系で行われるステップと、を含む。
いくつかの実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)CD3及びCD28活性化ビーズまたは抗体を使用して、患者から切除された腫瘍から取得されたTILの第1の集団を1~5日間活性化するステップと、
(b)(a)における第1のTIL集団からCD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得するステップと、
(c)転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼのエレクトロポレーションを使用して第1のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第2のTIL集団を取得するステップであって、遺伝子編集が、第2のTIL集団の細胞の一部において、CD39及びCD69の発現を減少させる、第2のTIL集団を取得するステップと、
(d)任意選択で、第2のTIL集団をインキュベートするステップと、
(e)IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む細胞培養培地中で第2のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第6のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~9日間行われて、第3のTIL集団を取得する、第3のTIL集団を産生するステップと、
(f)第3のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第4のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約9~11日間行われて、第4のTIL集団を取得し、第4のTIL集団が、治療的TIL集団である、第4のTIL集団を産生するステップと、
(g)ステップ(f)から取得された治療的TIL集団を採取するステップと、
(h)ステップ(f)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すステップと、
(i)任意選択で、ステップ(a)~(h)のうちの1つ以上が、閉鎖した無菌系で行われるステップと、を含む。
いくつかの実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)CD3及びCD28活性化ビーズまたは抗体を使用して、患者から切除された腫瘍から取得されたTILの第1の集団を1~5日間活性化するステップと、
(b)(a)における第1のTIL集団からCD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得するステップと、
(c)転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼのエレクトロポレーションを使用して第1のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第2のTIL集団を取得するステップであって、遺伝子編集が、第2のTIL集団の細胞の一部において、CD39及びCD69の発現を減少させる、第2のTIL集団を取得するステップと、
(d)任意選択で、第2のTIL集団をインキュベートするステップであって、インキュベーションが、約30~40℃で、約5%のCOで行われる、インキュベートするステップと、
(e)IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む細胞培養培地中で第2のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約6~9日間行われて、第3のTIL集団を取得する、第3のTIL集団を産生するステップと、
(f)第3のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第4のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約9~11日間行われて、第4のTIL集団を取得し、第4のTIL集団が、治療的TIL集団である、第4のTIL集団を産生するステップと、
(g)ステップ(f)から取得された治療的TIL集団を採取するステップと、
(h)ステップ(f)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すステップと、
(i)任意選択で、ステップ(a)~(h)のうちの1つ以上が、閉鎖した無菌系で行われるステップと、を含む。
他の実施形態によれば、TALENは特異的に設計されてもよく、これにより、遺伝子の特異的選択を標的とすることができる標的細胞(複数可)内の、より高い割合のDSB事象が可能になる。米国特許公開第2013/0315884号を参照されたい。そのようなまれな切断エンドヌクレアーゼの使用は、トランスフェクトされた細胞内で標的遺伝子の二重不活性化を得る可能性を高め、T細胞などの操作された細胞の産生を可能にする。さらに、変異誘発を増加させ、標的遺伝子不活性化を強化するために、追加の触媒ドメインをTALENで導入することができる。米国特許公開第2013/0315884号に記載されているTALENは、免疫療法に適するようにT細胞を操作するために首尾よく使用された。TALENを使用して、単一のT細胞内の少なくとも2つの遺伝子の不活性化を含む、T細胞内の様々な免疫チェックポイント遺伝子を不活性化することもできる。米国特許公開第2016/0120906号を参照されたい。追加として、TALENを使用して、参照により本明細書に組み込まれる米国特許公開第2018/0021379号に開示されるように、免疫抑制剤及びT細胞受容体の標的をコードする遺伝子を不活性化することができる。さらに、TALENは、米国特許公開第2019/0010514号(これは参照により本明細書に組み込まれる)に開示されるように、ベータ2-ミクログロブリン(B2M)及び/またはクラスII主要組織適合性複合体トランスアクチベーター(CIITA)の発現を阻害するために使用され得る。
TALE法によりTILを永続的に遺伝子編集することによってサイレンシングまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例には、CD39、CD69、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7
、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、及びGUCY1B3が含まれる。
PD-1遺伝子を標的とするTALEヌクレアーゼの非限定的な例を、以下の表に提供する。これらの実施例では、標的化ゲノム配列は、15bpのスペーサー(小文字で示される)によって分離された2つの17塩基対(bp)の長い配列(大文字で示される、半分の標的と称される)を含有する。各半分の標的は、表に列挙される半分のTALEヌクレアーゼの反復によって認識される。したがって、特定の実施形態によれば、本発明によるTALEヌクレアーゼは、配列番号238及び配列番号239からなる群から選択される標的配列を認識し、切断する。TALEN配列及び遺伝子編集方法はまた、上述のGautronに記載されている。




いくつかの実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)第1のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集するステップであって、遺伝子編集が、サイトポレーション培地中のCD39及びCD69を標的とする転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼのエレクトロポレーションを使用して、第2のTIL集団を取得することを含み、遺伝子編集が、第2のTIL集団の細胞の一部においてCD39及びCD69の発現を減少させる、遺伝子編集するステップと、
(b)任意選択で、第2のTIL集団をインキュベートするステップであって、インキュベーションが、約30~40℃で、約5%のCOで行われる、インキュベートするステップと、
(c)IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む細胞培養培地中で第2のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約6~9日間行われて、第3のTIL集団を産生するステップと、
(d)第3のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示
細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第4のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約9~11日間行われて、第4のTIL集団を取得し、第4のTIL集団が、治療的TIL集団である、第4のTIL集団を産生するステップと、
(e)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取するステップと、
(f)ステップ(f)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(d)から(e)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すステップと、
(g)任意選択で、ステップ(a)~(f)のうちの1つ以上が、閉鎖した無菌系で行われるステップと、をさらに含む。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカーに融合したサイトカインを含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-12、IL-15、IL-18、及びIL-21からなる群から選択される。
TALE法によりTILを永続的に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の他の非限定的な例には、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18、IL-21、NOTCH1/2細胞内ドメイン(ICD)、及び/またはNOTCHリガンドmDLL1が含まれる。
TALE法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得る系、方法、及び組成物の例は、米国特許第8,586,526号に記載されており、これは参照により本明細書に組み込まれる。これらの開示される例は、反復RVDを含有する2つ以上のTALE反復単位を有する天然に存在しないDNA結合ポリペプチド、TALEタンパク質の残基からなるN-キャップポリペプチド、及びTALEタンパク質の全長C末端領域の断片からなるC-キャップポリペプチドの使用を含む。
TALEN介在性遺伝子組み込み及び不活性化を効率的に行うために使用することができ、本発明の実施形態に従って使用することができるTALEN設計及び設計戦略、活性評価、スクリーニング戦略、ならびに方法の例は、Valton,et al.,Methods,2014,69,151-170(これは参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)IFN-γ及びPD-1(及び任意選択でCD40L及び/または抗CTLA-4)による拡張前刺激を行うことと、
(d)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(f)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(g)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(h)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(i)ステップ(h)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(h)からステップ(i)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(j)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(i)から(j)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すことと、
(k)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、CD39及びCD69の発現を減少させるTALEヌクレアーゼ系の送達を含む。
c.ジンクフィンガー法
TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A)に従って、またはPCT/US2017/058610、PCT/US2018/012605、もしくはPCT/US2018/012633に記載されるように実行することができ、この方法は、ジンクフィンガーまたはジンクフィンガーヌクレアーゼ法によって、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のジンクフィンガー法の使用は、細胞表面での少なくとも1つの免疫調節組成物の発現を引き起こし、任意選択で、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは減少させる。代替的に、TIL拡張プロセス中のジンクフィンガー法の使用は、細胞表面での少なくとも1つの免疫調節組成物の発現を引き起こし、任意選択で、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。
個々のジンクフィンガーは、保存されたββα立体配置でおよそ30個のアミノ酸を含む。αらせんの表面上のいくつかのアミノ酸は、典型的には、異なる選択性レベルでDNAの主溝の3bpと接触する。ジンクフィンガーは、2つのタンパク質ドメインを有する。第1のドメインは、DNA結合ドメインであり、真核生物転写因子を含み、ジンクフィンガーを含む。第2のドメインは、ヌクレアーゼドメインであり、FokI制限酵素を含み、DNAの触媒的切断を担っている。
個々のZFNのDNA結合ドメインは、典型的には、3~6個の個々のジンクフィンガー反復配列を含み、各々9~18塩基対を認識することができる。ジンクフィンガードメインが目的の標的部位に特異的である場合、合計18塩基対を認識する3フィンガーZFNの対でさえ、理論的には、哺乳動物ゲノムの単一遺伝子座を標的とすることができる。新たなジンクフィンガーアレイを生成するための1つの方法は、既知の特異性を有するより小さいジンクフィンガー「モジュール」を組み合わせることである。最も一般的なモジュラーアセンブリプロセスは、各々3塩基対のDNA配列を認識することができる3つの別個のジンクフィンガーを組み合わせて、9塩基対の標的部位を認識することができる3フィンガーアレイを生成することを含む。代替的に、オリゴマー化プールエンジニアリング(OPEN)などの選択ベースのアプローチを使用して、隣接するフィンガー間のコンテキスト依存的相互作用を考慮したランダム化ライブラリーから新たなジンクフィンガーアレイを選択することができる。設計されたジンクフィンガーは市販されており、San
gamo Biosciences(Richmond,CA,USA)は、Sigma-Aldrich(St.Louis,MO,USA)と協同して、ジンクフィンガー構築のための独自のプラットフォーム(CompoZr(登録商標))を開発した。
ジンクフィンガー法によりTILを永続的に遺伝子編集することによってサイレンシングまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例には、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、及びGUCY1B3が含まれる。
ジンクフィンガー法によりTILを永続的に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の非限定的な例には、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18、IL-21、NOTCH1/2細胞内ドメイン(ICD)、及び/またはNOTCHリガンドmDLL1が含まれる。
ジンクフィンガー法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得る系、方法、及び組成物の例は、米国特許第6,534,261号、同第6,607,882号、同第6,746,838号、同第6,794,136号、同第6,824,978号、同第6,866,997号、同第6,933,113号、同第6,979,539号、同第7,013,219号、同第7,030,215号、同第7,220,719号、同第7,241,573号、同第7,241,574号、同第7,585,849号、同第7,595,376号、同第6,903,185号、及び同第6,479,626号に記載されており、これらは参照により本明細書に組み込まれる。
ジンクフィンガー法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得る系、方法、及び組成物の他の例は、Beane,et al.,Mol.Therapy,2015,23 1380-1390に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)(a)における第1のTIL集団からCD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得することと、
(d)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を
刺激して、第2のTIL集団を取得することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(f)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(g)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(h)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(i)ステップ(h)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(h)からステップ(i)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(j)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(i)から(j)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すことと、
(k)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、CD39及びCD69の発現を減少させるジンクフィンガーヌクレアーゼ系の送達を含む。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)(a)における第1のTIL集団からCD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得することと、
(d)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(f)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(g)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(h)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(i)ステップ(h)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(h)からステップ(i)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供
することと、
(j)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(i)から(j)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すことと、
(k)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、CD39及びCD69の発現を低減するジンクフィンガーヌクレアーゼ系の送達を含む。
D.免疫チェックポイント
本発明の特定の実施形態によれば、TIL集団は、TIL集団におけるTIL細胞の細胞表面で1つ以上の免疫調節組成物を発現し、TIL集団における1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子を遺伝子修飾するように遺伝子編集される。別の言い方をすると、細胞表面で1つ以上の免疫調節組成物を発現させるようにTIL集団を改変することに加えて、TILの1つ以上の免疫チェックポイントをコードするTIL内のDNA配列が、TILのゲノム内で永続的に修飾される、例えば、挿入される、欠失される、もしくは置換される。免疫チェックポイントは、阻害経路または刺激経路を介して免疫応答を調節するリンパ球によって発現される分子である。がんの場合、免疫チェックポイント経路は、しばしば活性化されて抗腫瘍応答を阻害する、すなわち、悪性細胞によるある特定の免疫チェックポイントの発現は、抗腫瘍免疫を阻害し、がん細胞の成長を促進する。例えば、Marin-Acevedo et al.,Journal of Hematology&Oncology(2018)11:39を参照されたい。したがって、ある特定の阻害チェックポイント分子は、本発明の免疫療法の標的として機能する。特定の実施形態によれば、TILは、ある特定の免疫チェックポイント経路を遮断または刺激し、それによって腫瘍に対する体の免疫学的活性を増強するように遺伝子編集される。
本明細書で使用される場合、免疫チェックポイント遺伝子は、免疫チェックポイント分子をコードするDNA配列を含む。本発明の特定の実施形態によれば、TIL拡張法中の遺伝子編集TILは、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは減少させる。例えば、遺伝子編集は、免疫反応を増強するために、PD-1またはCTLA-4などの阻害性受容体の発現をサイレンスまたは減少させ得る。
最も広く研究されているチェックポイントには、プログラムされた細胞死受容体-1(PD-1)及び細胞傷害性Tリンパ球関連分子-4(CTLA-4)が含まれ、これらは、それらが阻害リガンドと相互作用するときに、主要なエフェクター機能(例えば、活性化、増殖、サイトカイン放出、細胞傷害性など)を阻害する免疫細胞上の阻害性受容体である。以下でさらに詳細に論じられるように、PD-1及びCTLA-4に加えて、多数のチェックポイント分子が免疫療法の潜在的な標的として浮上している。
本発明のTILを永続的に遺伝子編集することによってサイレンシングまたは阻害され得る免疫チェックポイント遺伝子の非限定的な例には、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、BAFF(BR3)、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、及びGUCY1B3が含まれる。例えば、本発明のTI
Lにおいてサイレンシングまたは阻害され得る免疫チェックポイント遺伝子は、PD-1、CTLA-4、LAG-3、TIM-3、Cish、TGFβ、及びPKAを含む群から選択されてもよい。BAFF(BR3)は、Bloom,et al.,J.Immunother.,2018,in pressに記載されている。別の実施例によれば、本発明のTILにおいてサイレンシングまたは阻害され得る免疫チェックポイント遺伝子は、PD-1、LAG-3、TIM-3、CTLA-4、TIGIT、CISH、TGFβR2、PRA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせを含む群から選択されてもよい。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)(a)における第1のTIL集団からCD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得することと、
(d)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(f)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(g)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(h)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われ、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(i)ステップ(h)から取得された第3のTIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(h)からステップ(i)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(j)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(i)から(j)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すことと、
(k)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップは、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)系、転写活性化因子様エフェクター(TALE)系、またはジンクフィンガー系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系の送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディター系は、CD39及びCD69の発現を減少させる。
1.PD-1
チェックポイント遮断の誘導のために最も研究されている標的のうちの1つは、T細胞調節因子のCD28スーパーファミリーのメンバーであるプログラム死受容体(PD1またはPD-1、PDCD1としても知られている)である。そのリガンドであるPD-L
1及びPD-L2は、メラノーマを含む様々な腫瘍細胞上で発現する。PD-1とPD-L1との相互作用は、T細胞エフェクター機能を阻害し、慢性刺激の設定においてT細胞疲弊をもたらし、腫瘍微小環境においてT細胞アポトーシスを誘導する。PD-1はまた、免疫監視からの腫瘍特異的エスケープにおいても役割を果たし得る。
特定の実施形態によれば、TIL中のPD-1の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは減少される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34に示される方法)に従って実行することができ、方法は、PD-1の発現をサイレンシングまたは抑制することによって、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、PD-1などの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のPD-1の発現をサイレンシングまたは減少させることができる。
2.CTLA-4
CTLA-4発現は、活性化T細胞上でのT細胞活性化時に誘導され、抗原提示細胞活性化抗原CD80及びCD86との結合について競合する。CTLA-4とCD80またはCD86との相互作用は、T細胞阻害を引き起こし、免疫応答のバランスを維持するのに役立つ。しかしながら、CD80またはCD86とのCTLA-4相互作用の阻害は、T細胞の活性化を延長し、したがって、がん抗原に対する免疫応答のレベルを増加させ得る。
特定の実施形態によれば、TIL中のCTLA-4の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは減少される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のCTLA-4の発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、CTLA-4などの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のCTLA-4の発現をサイレンシングまたは抑制することができる。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカーに融合したサイトカインを含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-12、IL-15、及びIL-21からなる群から選択される。
3.LAG-3
リンパ球活性化遺伝子-3(LAG-3、CD223)は、主要組織適合複合体(MHC)クラスIIのライゲーション後に、T細胞及びナチュラルキラー(NK)細胞によって発現される。その機序は不明なままであるが、その調節は、T細胞機能に対して負の調節効果を引き起こし、組織損傷及び自己免疫を防止する。LAG-3及びPD-1は、TIL上でしばしば共発現及び上方制御され、免疫疲弊及び腫瘍成長につながる。したがって、LAG-3遮断は、抗腫瘍応答を改善する。例えば、Marin-Acevedo et al.,Journal of Hematology&Oncology(2018)11:39を参照されたい。
特定の実施形態によれば、TIL中のLAG-3の発現は、本発明の組成物及び方法に
従ってサイレンシングまたは減少される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のLAG-3の発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、LAG-3などの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。特定の実施形態によれば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TILにおけるLAG-3の発現をサイレンシングまたは抑制することができる。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカーに融合したサイトカインを含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-12、IL-15、及びIL-21からなる群から選択される。
4.TIM-3
T細胞免疫グロブリン-3(TIM-3)は、T細胞の直接的な負の調節因子であり、NK細胞及びマクロファージ上で発現する。TIM-3は、骨髄由来サプレッサー細胞(MDSC)の増殖を誘導することにより、間接的に免疫抑制を促進する。そのレベルは、機能不全及び疲弊したT細胞で特に上昇することが見出されており、悪性腫瘍における重要な役割を示唆している。
特定の実施形態によれば、TIL中のTIM-3の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは減少される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のTIM-3の発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、TIM-3などの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のTIM-3の発現をサイレンシングまたは抑制することができる。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカーに融合したサイトカインを含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-12、IL-15、及びIL-21からなる群から選択される。
5.Cish
サイトカインシグナル伝達(SOCS)ファミリーのサプレッサーのメンバーであるCishは、CD8+T細胞におけるTCR刺激によって誘導され、腫瘍に対するそれらの機能的不活性を阻害する。CD8+T細胞におけるCishの遺伝的欠失は、それらの拡大、機能的親和性、及びサイトカイン多機能性を増強し得、確立された腫瘍の顕著で持続的な退縮をもたらす。例えば、Palmer et al.,Journal of Experimental Medicine,212(12):2095(2015)を参照されたい。
特定の実施形態によれば、TIL中のCishの発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは減少される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表
面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のCishの発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、Cishなどの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のCishの発現をサイレンシングまたは抑制することができる。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカーに融合したサイトカインを含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-12、IL-15、及びIL-21からなる群から選択される。
6.TGFβ
TGFβシグナル伝達経路は、細胞増殖、分化、アポトーシス、運動性及び侵入、細胞外マトリックス産生、血管新生、ならびに免疫応答を調節することにおいて複数の機能を有する。TGFβシグナル伝達の調節解除は、腫瘍において頻繁に行われ、腫瘍の開始、発達及び転移において重要な役割を有する。微小環境レベルでは、TGFβ経路は、発がん全体にわたる腫瘍成長及び転移のための好ましい微小環境を生成することに寄与する。例えば、Neuzillet et al.Pharmacology&Therapeutics,Vol.147,pp.22-31(2015)を参照されたい。
特定の実施形態によれば、TIL中のTGFβの発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは減少される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のTGFβの発現をサイレンシングまたは減少させることを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、TGFβなどの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のTGFβの発現をサイレンシングまたは抑制することができる。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカーに融合したサイトカインを含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-12、IL-15、及びIL-21からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、TGFβR2(TGFベータ受容体2)は、CRISPR/Cas9系を使用してTGFβR2をサイレンシングすることによって、または当該技術分野で知られている方法を使用してTGFβR2優性陰性細胞外トラップを使用することによって抑制され得る。
7.PKA
タンパク質キナーゼA(PKA)は、セリン-トレオニンタンパク質キナーゼスーパーファミリーの周知のメンバーである。cAMP依存性タンパク質キナーゼとしても知られるPKAは、cAMP結合時の活性化を介してGタンパク質結合受容体のシグナル伝達を媒介するマルチユニットプロテインキナーゼである。それは、代謝からイオンチャネル活性化、細胞成長及び分化、遺伝子発現及びアポトーシスまでの多種多様な細胞プロセスの制御に関与する。重要なことに、PKAは、多くの腫瘍の開始及び進行に関与している。例えば、Sapio et al.,EXCLI Journal;2014;13:843-855を参照されたい。
特定の実施形態によれば、TIL中のPKAの発現は、本発明の組成物及び方法に従っ
てサイレンシングまたは減少される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のPKAの発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、PKAなどの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のPKAの発現をサイレンシングまたは抑制することができる。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカーに融合したサイトカインを含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-12、IL-15、及びIL-21からなる群から選択される。
8.CBLB
CBLB(またはCBL-B)は、E3ユビキチン-タンパク質リガーゼであり、T細胞活性化の負の制御因子である。Bachmaier,et al.,Nature,2000,403,211-216、Wallner,et al.,Clin.Dev.Immunol.2012,692639。
特定の実施形態によれば、TIL中のCBLBの発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは減少される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のCBLBの発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、CBLBなどの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のPKAの発現をサイレンシングまたは抑制することができる。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカーに融合したサイトカインを含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-12、IL-15、及びIL-21からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、CBLBは、TALENノックアウトを使用してサイレンシングされる。いくつかの実施形態では、CBLBは、TALE-KRAB転写阻害剤ノックインを使用してサイレンシングされる。これらの方法のさらなる詳細は、Boettcher and McManus,Mol.Cell Review,2015,58,575-585に見出すことができる。
9.TIGIT
Ig及びITIM(免疫受容体チロシンベースの阻害モチーフ)ドメインまたはTIGITを有するT細胞免疫受容体は、Ig様V型ドメインを有し、その細胞質ドメイン内にITIMを有する膜貫通糖タンパク質受容体である。Khalil,et al.,Advances in Cancer Research,2015,128,1-68、Yu,et al.,Nature Immunology,2009,Vol.10,No.1,48-57。TIGITは、いくつかのT細胞及びナチュラルキラー細胞によって発現される。追加として、TIGITは、特にメラノーマを有する個体から、抗原特異的CD8+T細胞及びCD8+TIL上で過剰発現することが示されている。研究では、TIGIT経路が腫瘍免疫回避に寄与し、TIGIT阻害がポリクローナル及び抗原特異的刺激に応答して、T細胞の活性化及び増殖を増加させることが示されている。Khalil,et al.,Advances in Cancer Research,2
015,128,1-68.さらに、PD-1またはTIM3のいずれかとのTIGITの共遮断は、マウスモデルにおいて固形腫瘍に対する相乗効果を示している。Id.;Kurtulus,et al.,The Journal of Clinical Investigation,2015,Vol.125,No.11,4053-4062も参照されたい。
特定の実施形態によれば、TIL中のTIGITの発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは減少される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のTIGITの発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、TIGITなどの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のTIGITの発現をサイレンシングまたは抑制することができる。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカーに融合したサイトカインを含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-12、IL-15、及びIL-21からなる群から選択される。
10.TOX
胸腺細胞選択関連高移動度群(HMG)ボックス(TOX)は、HMGボックスDNA結合ドメインを含有する転写因子である。TOXは、配列非依存であるが構造依存的な方法でDNAに結合すると考えられるHMGボックススーパーファミリーのメンバーである。
TOXは、腫瘍特異的CD8T細胞機能障害またはT細胞枯渇の重要な調節因子として同定され、例えば、Scott,et al.,Nature,2019,571,270-274及びKhan,et al.,Nature,2019,571,211-218(これらの両方は、参照によりそれら全体が本明細書に組み込まれる)に記載されるように、CD8T細胞疲弊を転写的かつ後成的にプログラムすることが見出された。TOXはまた、Alfei,et al.,Nature,2019,571,265-269(これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に記載されるように、慢性感染中のT細胞機能不全の進行及び疲弊したT細胞の維持に対する重要な因子であることが見出された。TOXは、腫瘍及び慢性ウイルス感染からの機能不全または疲弊したT細胞において高度に発現される。インビトロでのエフェクターT細胞におけるTOXの異所発現は、T細胞疲弊に関連する転写プログラムを誘導したが、T細胞におけるTOXの欠失は、T疲弊プログラムを廃止した。
特定の実施形態によれば、TIL中のTOXの発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは減少される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TOXの発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、TOXなどの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のTOXの発現をサイレンシングまたは
抑制することができる。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカーに融合したサイトカインを含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-12、IL-15、及びIL-21からなる群から選択される。
E.共刺激受容体または接着分子の過剰発現
追加の実施形態によれば、TIL拡張法中の遺伝子編集TILは、細胞表面における少なくとも1つの免疫調節組成物の発現を引き起こし、1つ以上の共刺激受容体、接着分子及び/またはサイトカインの発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。例えば、遺伝子編集は、共刺激受容体、接着分子またはサイトカインの発現を増強させ得、これは、遺伝子修飾されていない共刺激受容体、接着分子またはサイトカインの発現と比較して、それが過剰発現されることを意味する。本発明のTILを永続的に遺伝子編集することによって増強された発現を示し得る共刺激性受容体、接着分子またはサイトカイン遺伝子の非限定的な例には、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18、IL-21、NOTCH1/2細胞内ドメイン(ICD)、及び/またはNOTCHリガンドmDLL1などのある特定のケモカイン受容体及びインターロイキンが含まれる。
1.CCR
養子T細胞免疫療法が有効であるためには、T細胞をケモカインによって腫瘍内に適切に輸送する必要がある。腫瘍細胞によって分泌されるケモカイン、末梢に存在するケモカイン、及びT細胞によって発現されるケモカイン受容体との間の一致は、T細胞の腫瘍床への輸送を成功させるために重要である。
特定の実施形態によれば、本発明の遺伝子編集方法を使用して、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3及びCX3CR1のうちの1つ以上などのTILにおけるある特定のケモカイン受容体の発現を増加させてもよい。CCRの過剰発現は、エフェクター機能及び養子移植後のTILの増殖を促進するのに役立ち得る。
特定の実施形態によれば、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3及びCX3CR1のうちの1つ以上のTILにおける発現は、本発明の組成物及び方法に従って増強される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGen3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TIL中のCCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3及びCX3CR1のうちの1つ以上の細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、発現を増強することを含む。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカーに融合したサイトカインを含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-12、IL-15、IL-18、及びIL-21からなる群から選択される。
以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、ケモカイン受容体遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TILにおけるある特定のケモカイン受容体の発現を増強することができる。
いくつかの実施形態では、CCR4及び/またはCCR5接着分子は、本明細書に記載のガンマ-レトロウイルスまたはレンチウイルス法を使用して、TIL集団に挿入される。ある実施形態では、CXCR2接着分子は、Forget,et al.,Frontiers Immunology 2017,8,908またはPeng,et al.
,Clin.Cancer Res.2010,16,5458(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるようなガンマレトロウイルスまたはレンチウイルス法を使用して、TIL集団に挿入される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)(a)における第1のTIL集団からCD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得することと、
(d)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激して、第2のTIL集団を取得することであって、第2のTIL集団が、第1のTIL集団よりも数が少なくとも50倍多く、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(f)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(g)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(h)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われ、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(i)ステップ(h)から取得された第3のTIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(h)からステップ(i)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(j)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(i)から(j)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すことと、
(k)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)系、転写活性化因子様エフェクター(TALE)系、またはジンクフィンガー系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系の送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディター系が、CD39及びCD69の発現を減少させ、さらに少なくとも1つの遺伝子エディター系が、第2のTIL集団の複数の細胞の細胞表面でCXCR2接着分子を発現させるか、またはCXCR2接着分子が、ガンマレトロウイルスまたはレンチウイルス法によって第1のTIL集団、第2のTIL集団、または採取されたTIL集団に挿入される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)(a)における第1のTIL集団からCD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得することと、
(d)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(f)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(g)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(h)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われ、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(i)ステップ(h)から取得された第3のTIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(h)からステップ(i)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(j)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(i)から(j)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すことと、
(k)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)系、転写活性化因子様エフェクター(TALE)系、またはジンクフィンガー系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系の送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディター系が、CD39及びCD69の発現を減少させ、さらに少なくとも1つの遺伝子エディター系が、第2のTIL集団の複数の細胞の細胞表面でCCR4及び/またはCCR5接着分子を発現させるか、またはCXCR2接着分子が、ガンマレトロウイルスまたはレンチウイルス法によって第1のTIL集団、第2のTIL集団、または採取されたTIL集団に挿入される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)(a)における第1のTIL集団からCD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得することと、
(d)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を
刺激して、第2のTIL集団を取得することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(f)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(g)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(h)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われ、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(i)ステップ(h)から取得された第3のTIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(h)からステップ(i)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(j)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(i)から(j)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すことと、
(k)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)系、転写活性化因子様エフェクター(TALE)系、またはジンクフィンガー系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系の送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディター系が、CD39及びCD69の発現を減少させ、さらに少なくとも1つの遺伝子エディター系が、第2のTIL集団の複数の細胞の細胞表面でCCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される接着分子を発現させるか、または接着分子が、ガンマレトロウイルスまたはレンチウイルス法によって第1のTIL集団、第2のTIL集団、または採取されたTIL集団に挿入される。
2.インターロイキン
追加の実施形態によれば、本発明の遺伝子編集方法を使用して、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18及びIL-21のうちの1つ以上などのある特定のインターロイキンの発現を増加させてもよい。ある特定のインターロイキンは、T細胞のエフェクター機能を増加させ、腫瘍制御を媒介することが実証されている。
特定の実施形態によれば、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18、及びIL-21のうちの1つ以上のTILにおける発現は、本発明の組成物及び方法に従って増強される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGen3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18及びIL-21のうちの1つ以上の発現を増強することによって遺伝子編集することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、インターロイキン遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TILにおけるある特定のインターロイキンの発現を増強することができる。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張
するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に付加することと、
(c)(a)における第1のTIL集団からCD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性TILを選択して、CD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得することと、
(d)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激して、第2のTIL集団を取得することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(f)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを移入させることと、
(g)第2のTIL集団を、第2のTIL集団内の複数の細胞内に約1日間静置することと、
(h)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われ、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(i)ステップ(h)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(h)からステップ(i)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(j)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(i)から(j)への移行が、任意選択で、系を開くことなく起こる、移すことと、
(k)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)系、転写活性化因子様エフェクター(TALE)系、またはジンクフィンガー系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系の送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディター系が、CD39及びCD69の発現を減少させ、さらに少なくとも1つの遺伝子エディター系が、第2のTIL集団の複数の細胞の細胞表面でIL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18、IL-21、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるインターロイキンを発現させるか、またはインターロイキンが、ガンマレトロウイルスまたはレンチウイルス法によって第1のTIL集団、第2のTIL集団、または採取されたTIL集団に挿入される。
D.タンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤
いくつかの実施形態によれば、第1の拡張ステップ、第2の拡張ステップ、または第1の拡張ステップ及び第2の拡張ステップの両方は、培養培地中にプロテインキナーゼB(AKT)阻害剤(AKTi)を添加することを含む。いくつかの実施形態によれば、プライミングによる第1の拡張ステップ、急速な第2の拡張ステップ、またはプライミングによる第1の拡張ステップ及び急速な第2の拡張ステップの両方は、培養培地中にプロテインキナーゼB(AKT)阻害剤(AKTi)を添加することを含む。
AKT阻害剤
SB-203580
ある実施形態では、AKT阻害剤は、SB-203580である。SB-203580は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。4-[4-(4-フルオロフェニル)-2-(4-メチルスルフィニルフェニル)-1H-イミダゾール-5-イル]ピリジン
MK-2206
ある実施形態では、AKT阻害剤は、MK-2206である。MK-2206は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。8-[4-(1-アミノシクロブチル)フェニル]-9-フェニル-2H-[1,2,4]トリアゾロ[3,4-f][1,6]ナフチリジン-3-オン
SC79
ある実施形態では、AKT阻害剤は、SC79である。SC79は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。2-アミノ-6-クロロ-4-(1-シアノ-2-エトキシ-2-オキソエチル)-4H-クロメン-3-カルボン酸エチル
カピバセルチブ(AZD5363)
ある実施形態では、AKT阻害剤は、カピバセルチブである。カピバセルチブは、以下
のように示される化学構造及び名称を有する。4-アミノ-N-[(1S)-1-(4-クロロフェニル)-3-ヒドロキシプロピル]-1-(7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-イル)ピペリジン-4-カルボキサミド
ミルテフォシン
ある実施形態では、AKT阻害剤は、ミルテフォシンである。ミルテフォシンは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。2-(トリメチルアザニウムイル)エチルリン酸ヘキサデシル
ペリフォシン
ある実施形態では、AKT阻害剤は、ペリフォシンである。ペリフォシンは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(1,1-ジメチルピペリジン-1-イウム-4-イル)オクタデシルホスフェート
PF-04691502
ある実施形態では、AKT阻害剤は、PF-04691502である。PF-04691502は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。2-アミノ-8-[4-(2-ヒドロキシエトキシ)シクロヘキシル]-6-(6-メトキシピリジン-3-イル)-4-メチルピリド[2,3-d]ピリミジン-7-オン
CCT128930
ある実施形態では、AKT阻害剤は、CCT128930である。CCT128930は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。4-[(4-クロロフェニル)メチル]-1-(7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-イル)ピペリジン-4-アミン
A-674563
ある実施形態では、AKT阻害剤は、A-674563である。A-674563は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(2S)-1-[5-(3-メチル-2H-インダゾール-5-イル)ピリジン-3-イル]オキシ-3-フェニルプロパン-2-アミン
アルケキシン(RX-0201)
ある実施形態では、AKT阻害剤は、アルケキシンである。ある実施形態では、AKT阻害剤は、5′ gctgcatgatctccttggcg 3′の配列を有するオリ
ゴデオキシヌクレオチドである。
オレアンドリン(PBI-05204)
ある実施形態では、AKT阻害剤は、オレアンドリンである。オレアンドリンは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。[(3S,5R,8R,9S,10S,13R,14S,16S,17R)-14-ヒドロキシ-3-[(2R,4S,5S,6S)-5-ヒドロキシ-4-メトキシ-6-メチルオキサン-2-イル]オキシ-10,13-ジメチル-17-(5-オキソ-2H-フラン-3-イル)-1,2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,15,16,17-テトラデカヒドロシクロペンタ[a]フェナントレン-16-イル]アセテート
AKT阻害剤VIII
ある実施形態では、AKT阻害剤は、AKT阻害剤VIIIである。AKT阻害剤VIIIは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。3-[1-[[4-(7-フェニル-3H-イミダゾ[4,5-g]キノキサリン-6-イル)フェニル]メチル]ピペリジン-4-イル]-1H-ベンズイミダゾール-2-オン
AT7867
ある実施形態では、AKT阻害剤は、AT7867である。AT7867は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。4-(4-クロロフェニル)-4-[4-(1H-ピラゾール-4-イル)フェニル]ピペリジン
AT13148
ある実施形態では、AKT阻害剤は、AT13148である。AT13148は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(1S)-2-アミノ-1-(4-クロロフェニル)-1-[4-(1H-ピラゾール-4-イル)フェニル]エタノール
イパタセルチブ(GDC-0068)
ある実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブである。イパタセルチブは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(S)-2-(4-クロロフェニル)-1-(4-((5R,7R)-7-ヒドロキシ-5-メチル-6,7-ジヒドロ-5H-シクロペンタ[d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル)-3-(イソプロピルアミノ)プロパン-1-オン
TIC10
ある実施形態では、AKT阻害剤は、TIC10である。TIC10は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。7-ベンジル-4-(2-メチルベンジル)-1,2,6,7,8,9-ヘキサヒドロイミダゾ[1,2-a]ピリド[3,4-e]ピリミジン-5(4H)-オン
SC79
ある実施形態では、AKT阻害剤は、SC79である。SC79は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。2-アミノ-6-クロロ-4-(1-シアノ-2-エトキシ-2-オキソエチル)-4H-クロメン-3-カルボン酸エチル
GSK690693
ある実施形態では、AKT阻害剤は、GSK690693である。GSK690693は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。4-[2-(4-アミノ-1,2,5-オキサジアゾール-3-イル)-1-エチル-7-[[(3S)-ピペリジン-3-イル]メトキシ]イミダゾ[4,5-c]ピリジン-4-イル]-2-メチルブタ-3-イン-2-オール
アフレセルチブ(GSK2110183)
ある実施形態では、AKT阻害剤は、アフレセルチブである。アフレセルチブは、次のように示される化学構造及び名前を有する。N-[(2S)-1-アミノ-3-(3,4-ジフルオロフェニル)プロパン-2-イル]-5-クロロ-4-(4-クロロ-2-メチルピラゾール-3-イル)チオフェン-2-カルボキサミド
ウプロセルチブ(GSK2141795)
ある実施形態では、AKT阻害剤は、ウプロセルチブである。ウプロセルチブは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。N-[(2S)-1-アミノ-3-(3,4-ジフルオロフェニル)プロパン-2-イル]-5-クロロ-4-(4-クロロ-2-メチルピラゾール-3-イル)フラン-2-カルボキサミド
トリシリビン
ある実施形態では、AKT阻害剤は、トリシリビンである。トリシリビンは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(2R,3R,4S,5R)-2-(5-アミノ-7-メチル-2,6,7,9,11-ペンタザトリシクロ[6.3.1.04,12]ドデカ-1(12),3,5,8,10-ペンタエン-2-イル)-5-(ヒドロキシメチル)オキソラン-3,4-ジオール
SR13668
ある実施形態では、AKT阻害剤は、SR13668である。SR13668は、次のように示される化学構造及び名称を有する。6-メトキシ-5,7-ジヒドロインドロ[2,3-b]カルバゾール-2,10-ジカルボン酸ジエチル
A-443654
ある実施形態では、AKT阻害剤は、A-443654である。A-443654は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(2S)-1-(1H-インドール-3-イル)-3-[5-(3-メチル-2H-インダゾール-5-イル)ピリジン-3-イル]オキシプロパン-2-アミン
デグエリン
ある実施形態では、AKT阻害剤は、デグエリンである。デグエリンは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(1S,14S)-17,18-ジメトキシ-7,7-ジメチル-2,8,21-トリオキサペンタシクロ[12.8.0.03,12.04,9.015,20]ドコサ-3(12),4(9),5,10,15,17,19-ヘプタエン-13-オン
PHT-427
ある実施形態では、AKT阻害剤は、PHT-427である。PHT-427は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。4-ドデシル-N-(1,3,4-チアジアゾール-2-イル)ベンゼンスルホンアミド
ミランセルチブ(ARQ-092)
ある実施形態では、AKT阻害剤は、ミランセルチブである。ミランセルチブは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。3-[3-[4-(1-アミノシクロブチル)フェニル]-5-フェニルイミダゾ[4,5-b]ピリジン-2-イル]ピリジン-2-アミン
BAY1125976
ある実施形態では、AKT阻害剤は、BAY1125976である。BAY1125976は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。2-[4-(1-アミノシクロブチル)フェニル]-3-フェニルイミダゾ[1,2-b]ピリダジン-6-カルボキサミド
TAS-117
ある実施形態では、AKT阻害剤は、TAS-117である。TAS-117は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。3-アミノ-1-メチル-3-[4-(5-フェニル-8-オキサ-3,6,12-トリアザトリシクロ[7.4.0.02,6]トリデカ-1(9),2,4,10,12-ペンタエン-4-イル)フェニル]シクロブタン-1-オール
MSC2363318A
ある実施形態では、AKT阻害剤は、MSC2363318Aである。MSC2363318Aは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。4-[[(1S)-2-(アゼチジン-1-イル)-1-[4-クロロ-3-(トリフルオロメチル)フェニル]エチル]アミノ]キナゾリン-8-カルボキサミド
トリシリビンホスフェート(VQD-002)
ある実施形態では、AKT阻害剤は、トリシリビンホスフェートである。トリシリビンホスフェートは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。[(2R,3S,4R,5R)-5-(5-アミノ-7-メチル-2,6,7,9,11-ペンタザトリシクロ[6.3.1.04,12]ドデカ-1(12),3,5,8,10-ペンタエン-2-イル)-3,4-ジヒドロキシオキソラン-2-イル]メチルリン酸二水素
XL418
ある実施形態では、AKT阻害剤は、XL418である。XL418は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。1-[3-[4-(3-ブロモ-2H-ピラゾロ[3,4-d]ピリミジン-4-イル)ピペラジン-1-イル]-4-メチル-5-(2-ピロリジン-1-イルエチルアミノ)フェニル]-4,4,4-トリフルオロブタン-1-オン
SC66
ある実施形態では、AKT阻害剤は、SC66である。SC66は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(2E,6E)-2,6-ビス(ピリジン-4-イルメチリデン)シクロヘキサン-1-オン
ホノキオール
ある実施形態では、AKT阻害剤は、ホノキオールである。ホノキオールは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。2-(4-ヒドロキシ-3-プロパ-2-エニルフェニル)-4-プロパ-2-エニルフェノール
ベボリセルチブ(ARQ751)
ある実施形態では、AKT阻害剤は、ベボリセルチブである。ベボリセルチブは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。N-[1-[3-[3-[4-(1-アミノシクロブチル)フェニル]-2-(2-アミノピリジン-3-イル)イミダゾ[4,5-b]ピリジン-5-イル]フェニル]ピペリジン-4-イル]-N-メチルアセトアミド
PX-316
ある実施形態では、AKT阻害剤は、PX-316である。PX-316は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。[(2R)-2-メトキシ-3-オクタデコキシプロピル][(1R,2R,3S,4R,6R)-2,3,4,6-テトラヒドロキシシクロヘキシル]リン酸水素
API-1
ある実施形態では、AKT阻害剤は、API-1である。API-1は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。4-アミノ-8-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-ジヒドロキシ-5-(ヒドロキシメチル)オキソラン-2-イル]-5-オキソピリド[2,3-d]ピリミジン-6-カルボキサミド
ALM301
ある実施形態では、AKT阻害剤は、ALM301である。ALM301は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。3-(3-(4-(1-アミノシクロブチル)フェニル)-5-フェニル-3H-イミダゾ[4,5-b]ピリジン-2-イル)ピリジン-2-アミン
COTI-2
ある実施形態では、AKT阻害剤は、COTI-2である。COTI-2は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。N-(6,7-ジヒドロ-5H-キノリン-8-イリデンアミノ)-4-ピリジン-2-イルピペラジン-1-カルボチオアミド
DC120
ある実施形態では、AKT阻害剤は、DC120である。DC120は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。N-[1-アミノ-3-(2,4-ジクロロフェニル)プロパン-2-イル]-2-[2-(メチルアミノ)ピリミジン-4-イル]-1,3-チアゾール-5-カルボキサミド
TD52
ある実施形態では、AKT阻害剤は、TD52である。TD52は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。2-N,3-N-ビス(3-エチニルフェニル)キノキサリン-2,3-ジアミン
アルテミシニン
ある実施形態では、AKT阻害剤は、アルテミシニンである。アルテミシニンは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(1R,4S,5R,8S,9R,12S,13R)-1,5,9-トリメチル-11,14,15,16-テトラオキサテトラシクロ[10.3.1.04,13.08,13]ヘキサデカン-10-オン
ググルステロン
ある実施形態では、AKT阻害剤は、ググルステロンである。ググルステロンは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(8R,9S,10R,13S,14S,17Z)-17-エチリデン-10,13-ジメチル-1,2,6,7,8,9,11,12,14,15-デカヒドロシクロペンタ[a]フェナントレン-3,16-ジオン
オリドニン(NSC-250682)
ある実施形態では、AKT阻害剤は、オリドニンである。オリドニンは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(1S,2S,5S,8R,9S,10S,11R,15S,18R)-9,10,15,18-テトラヒドロキシ-12,12-ジメチル-6-メチリデン-17-オキサペンタシクロ[7.6.2.15,8.01,11.02,8]オクタデカン-7-オン
セニセルチブ(AS-703569)
ある実施形態では、AKT阻害剤は、セニセルチブである。セニセルチブnは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(1S,2S,3R,4R)-3-[[5-フルオロ-2-[3-メチル-4-(4-メチルピペラジン-1-イル)アミノ]ピリミジン-4-イル]アミノ]ビシクロ[2.2.1]ヘプタ-5-エン-2-カルボキサミド
3CAI
ある実施形態では、AKT阻害剤は、3CAIである。3CAIは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。2-クロロ-1-(1H-インドール-3-イル)エタノン
ボルセルチブ(Borussertib)
ある実施形態では、AKT阻害剤は、ボルセルチブである。ボルセルチブは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。N-[2-オキソ-3-[1-[[4-(5-オキソ-3-フェニル-6H-1,6-ナフチリジン-2-イル)フェニル]メチル]ピペリジン-4-イル]-1H-ベンズイミダゾール-5-イル]プロパ-2-エンアミド
PF-AKT400
ある実施形態では、AKT阻害剤は、PF-AKT400である。PF-AKT400は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。N-[[(3S)-3-アミノ-1-(5-エチル-7H-ピロロ[2,3-d]ピリミジン-4-イル)ピロリジン-3-イル]メチル]-2,4-ジフルオロベンズアミド
Hu7691
ある実施形態では、AKT阻害剤は、Hu7691である。Hu7691は、以下のように示される化学構造及び名称を有する。N-((3S,4S)-4-(3,4-ジフルオロフェニル)ピペリジン-3-イル)-2-フルオロ-4-(1-メチル-1H-ピラゾール-5-イル)ベンズアミド
ヘルバセチン
ある実施形態では、AKT阻害剤は、ヘルバセチンである。ヘルバセチンは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。3,5,7,8-テトラヒドロキシ-2-(4-ヒドロキシフェニル)クロメン-4-オン
イソリキリチゲニン
ある実施形態では、AKT阻害剤は、イソリキリチゲニンである。イソリキリチゲニンは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(E)-1-(2,4-ジヒドロキシフェニル)-3-(4-ヒドロキシフェニル)プロパ-2-エン-1-オン
スクテラリン
ある実施形態では、AKT阻害剤は、スクテラリンである。スクテラリンは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(2S,3S,4S,5R,6S)-6-[5,6-ジヒドロキシ-2-(4-ヒドロキシフェニル)-4-オキソクロメン-7-イル]オキシ-3,4,5-トリヒドロキシオキサン-2-カルボン酸
テヘラノリド
ある実施形態では、AKT阻害剤は、テヘラノリドである。テヘラノリドは、以下のように示される化学構造及び名称を有する。(1R,4R,5S,12S,13S)-4,13-ジヒドロキシ-5,9-ジメチル-11,14,15-トリオキサテトラシクロ[11.2.1.01,5.08,12]ヘキサデカン-10-オン
いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、ホノキオール、及びそれらの薬学的に許容される塩からなる群から選択される。
III.TIL製造プロセス-2A
これらの特徴のうちのいくつかを含むプロセス2Aとして知られる例示的なTILプロセスが図2に示され、プロセス1Cに対する本発明のこの実施形態の利点のうちのいくつかが、国際特許公開第WO2018/081473号に記載されている。プロセス2Aの実施形態を図1に示す。
本明細書で考察されるように、本発明は、患者への移植前に凍結保存されたTILを再刺激して、それらの代謝活性、ひいては相対的健康を向上させることに関するステップ、及び当該代謝健康を試験する方法を含み得る。本明細書で一般に概説されるように、TILは、一般に、患者試料から採取され、患者への移植前にそれらの数を拡張するように操作される。いくつかの実施形態では、TILは、以下で考察されるように、任意で遺伝子操作され得る。
いくつかの実施形態では、TILは、凍結保存され得る。解凍した時点で、それらが再刺激されて、患者への注入前に代謝を高めることができる。
いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図で詳細に考察されるように、第1の拡張(REP前と称されるプロセス、ならびに図1にステップAとして示されるプロセスを含む)は、3~14日に短縮され、第2の拡張(REPと称されるプロセス、ならびに図1にステップBとして示されるプロセスを含む)は、7~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、第1の拡張(例えば、図1にステップBとして記載される拡張)は、11日に短縮され、第2の拡張(例えば、図1にステップDとして記載される拡張)は、11日に短縮される。いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図で詳細に考察されるように、第1の拡張と第2の拡張との組み合わせ(例えば、図1にステップB及びステップDとして記載される拡張)は、22日に短縮される。
以下の「ステップ」表記A、B、Cなどは、図1を参照し、本明細書に記載のある特定の実施形態を参照する。以下及び図1におけるステップの順序は例示であり、ステップの任意の組み合わせまたは順序、ならびに追加のステップ、ステップの繰り返し、及び/またはステップの省略は、本出願及び本明細書に開示される方法によって企図される。
A.ステップA:患者の腫瘍試料を取得する
一般に、TILは、最初に患者の腫瘍試料から取得され、その後、本明細書に記載されるさらなる操作のためにより大きい集団に拡張され、任意選択で凍結保存され、本明細書に概説されるように再刺激され、任意選択でTIL健康の指標として表現型及び代謝パラメータについて評価される。
患者の腫瘍試料は、一般に外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段を介して、当該技術分野で知られている方法を使用して取得することができる。いくつかの実施形態では、多病変サンプリングが使用される。いくつかの実施形態では、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段は、多病変サンプリングを含む(すなわち、患者の1つ以上の腫瘍部位及び/または場所、ならびに同じ場所または近接した1つ以上の腫瘍から試料を取得する)。一般に、腫
瘍試料は、原発腫瘍、浸潤性腫瘍、または転移性腫瘍を含む、任意の固形腫瘍に由来し得る。腫瘍試料は、血液系悪性腫瘍から取得された腫瘍などの液体腫瘍であり得る。固形腫瘍は、肺組織のものであり得る。いくつかの実施形態では、有用なTILは、非小細胞肺癌(NSCLC)から得られる。固形腫瘍は、皮膚組織のものであり得る。いくつかの実施形態では、有用なTILは、黒色腫から取得される。
取得された時点で、腫瘍試料は、一般に、鋭的解剖を使用して1~約8mmの小片に断片化され、約2~3mmが特に有用である。いくつかの実施形態では、TILは、酵素腫瘍消化物を使用してこれらの断片から培養される。かかる腫瘍消化物は、酵素培地(例えば、Roswell Park Memorial Institute(RPMI)1640緩衝液、2mMグルタミン酸、10mcg/mLゲンタマイシン、30単位/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(例えば、組織解離機を使用する)によって産生され得る。腫瘍消化物は、腫瘍を酵素培地に入れ、腫瘍をおよそ1分間機械的に解離させ、続いて5% CO中37℃で30分間インキュベートし、続いて小さな組織片のみが存在するまで、前述の条件下で機械的解離及びインキュベーションのサイクルを繰り返すことによって産生することができる。このプロセスの最後に、細胞懸濁液中に多数の赤血球または死細胞が含まれている場合、FICOLL分岐親水性多糖類を使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。米国特許出願公開第2012/0244133A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているものなどの当該技術分野で知られている代替の方法を使用することができる。前述の方法のうちのいずれかが、TILを拡張する方法またはがんを治療する方法について本明細書に記載される実施形態のうちのいずれかにおいて使用され得る。
腫瘍解離酵素混合物には、1つ以上の解離(消化)酵素、例えば、限定されないが、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはコラゲナーゼの種類を含む)、Accutase(商標)、Accumax(商標)、ヒアルロニダーゼ、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)、キモトリプシン、キモパパイン、トリプシン、カゼイナーゼ、エラスターゼ、パパイン、XIV型プロテアーゼ(プロナーゼ)、デオキシリボヌクレアーゼI(DNase)、トリプシン阻害剤、任意の他の解離酵素またはタンパク質分解酵素、及びそれらの任意の組み合わせが含まれ得る。
いくつかの実施形態では、解離酵素は、凍結乾燥酵素から再構成される。いくつかの実施形態では、凍結乾燥酵素は、HBSSなどの滅菌緩衝液の量で再構成される。
いくつかの事例では、コラゲナーゼ(アニマルフリー1型コラゲナーゼなど)を、10mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝液で再構成する。凍結乾燥ストック酵素は、2892PZ U/バイアルの濃度であり得る。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼは、5mL~15mLの緩衝液中で再構成される。いくつかの実施形態では、再構成後のコラゲナーゼストックは、約100PZ U/mL~約400PZ U/mLの範囲、例えば、約100PZ U/mL~約400PZ U/mL、約100PZ U/mL~約350PZ U/mL、約100PZ U/mL~約300PZ U/mL、約150PZ U/mL~約400PZ U/mL、約100PZ U/mL、約150PZ U/mL、約200PZ U/mL、約210PZ U/mL、約220PZ U/mL、約230PZ U/mL、約240PZ U/mL、約250PZ U/mL、約260PZ U/mL、約270PZ U/mL、約280PZ U/mL、約289.2PZ U/mL、約300PZ U/mL、約350PZ U/mL、または約400PZ U/mLである。
いくつかの実施形態では、中性プロテアーゼは、1mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝
液中で再構成される。凍結乾燥ストック酵素は、175DMCU/バイアルの濃度であり得る。いくつかの実施形態では、再構成後の中性プロテアーゼストックは、約100DMC/mL~約400DMC/mLの範囲、例えば、約100DMC/mL~約400DMC/mL、約100DMC/mL~約350DMC/mL、約100DMC/mL~約300DMC/mL、約150DMC/mL~約400DMC/mL、約100DMC/mL、約110DMC/mL、約120DMC/mL、約130DMC/mL、約140DMC/mL、約150DMC/mL、約160DMC/mL、約170DMC/mL、約175DMC/mL、約180DMC/mL、約190DMC/mL、約200DMC/mL、約250DMC/mL、約300DMC/mL、約350DMC/mL、または約400DMC/mLである。
いくつかの実施形態では、DNAse Iは、1mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝液中で再構成される。凍結乾燥したストック酵素は、4KU/バイアルの濃度であった。いくつかの実施形態では、再構成後のDNase Iストックは、約1KU/mL~10KU/mL、例えば、約1KU/mL、約2KU/mL、約3KU/mL、約4KU/mL、約5KU/mL、約6KU/mL、約7KU/mL、約8KU/mL、約9KU/mL、または約10KU/mLの範囲である。
いくつかの実施形態では、酵素のストックは可変であり、濃度を決定する必要があり得る。いくつかの実施形態では、凍結乾燥ストックの濃度を検証することができる。いくつかの実施形態では、消化カクテルに添加される酵素の最終量は、決定されたストック濃度に基づいて調整される。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、約4.7mLの無菌HBSS中に約10.2ulの中性プロテアーゼ(0.36DMC U/mL)、21.3μLのコラゲナーゼ(1.2PZ/mL)及び250ulのDNAse I(200U/mL)を含む。
上に示されるように、いくつかの実施形態では、TILは、固形腫瘍に由来する。いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、断片化されない。いくつかの実施形態では、固形腫瘍は断片化されず、全腫瘍として酵素消化に供される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間、37℃、5%COで消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間、37℃、5%COで回転を伴って消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、37℃、5%COで一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、全腫瘍が酵素と組み合わされて、腫瘍消化反応混合物が形成される。
いくつかの実施形態では、腫瘍は、滅菌緩衝液中の凍結乾燥酵素で再構成される。いくつかの実施形態では、緩衝液は、滅菌HBSSである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、コラゲナーゼを含む。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼは、コラゲナーゼIVである。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼの作業ストックは、100mg/mLの10倍作業ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、DNAseを含む。いくつかの実施形態では、DNAseの作業ストックは、10,000IU/mLの10倍作業ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、ヒアルロニダーゼを含む。いくつかの実施形態では、ヒアルロニダーゼの作業ストックは、10mg/mLの10倍作業ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、10mg/mLのコラゲナーゼ、1000IU/mLのDNAse、及び1mg/mLのヒアルロニダーゼを含む。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、10mg/mLのコラゲナーゼ、500IU/mLのDNAse、及び1mg/mLのヒアルロニダーゼを含む。
一般に、採取された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに採取された」細胞集団と呼ばれる。
いくつかの実施形態では、断片化は、例えば、解剖及び消化を含む物理的断片化を含む。いくつかの実施形態では、断片化は、物理的断片化である。いくつかの実施形態では、断片化は、解剖である。いくつかの実施形態では、断片化は、消化によるものである。いくつかの実施形態では、TILは、患者から取得された腫瘍試料を消化または断片化することから取得された酵素腫瘍消化物及び腫瘍断片から最初に培養され得る。
腫瘍が固形腫瘍であるいくつかの実施形態では、腫瘍試料が、例えば、ステップA(図1または図8に提供される)で取得された後、腫瘍は物理的断片化を受ける。いくつかの実施形態では、断片化は、凍結保存前に起こる。いくつかの実施形態では、断片化は、凍結保存後に起こる。いくつかの実施形態では、断片化は、腫瘍を得た後に、いずれの凍結保存もない場合に起こる。いくつかの実施形態では、腫瘍は断片化され、10、20、30、40個またはそれ以上の断片または小片が、第1の拡張のために各容器内に配置される。いくつかの実施形態では、腫瘍は断片化され、30または40個の断片または小片が、第1の拡張のために各容器内に配置される。いくつかの実施形態では、腫瘍は断片化され、40個の断片または小片が、第1の拡張のために各容器内に配置される。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約4~約50個の断片を含み、各断片は、約27mmの体積を有する。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1300mm~約1500mmの総体積を伴う約30~約60個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1350mmの総体積を伴う約50個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1グラム~約1.5グラムの総質量を伴う約50個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約4個の断片を含む。
いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍断片から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、鋭的解剖によって取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~10mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~8mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約2mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約3mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約4mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約5mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約6mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約7mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約8mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約9mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約10mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、1~4mm×1~4mm×1~4mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、1mm×1mm×1mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、2mm×2mm×2mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、3mm×3mm×3mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、4mm×4mm×4mmである。
いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の出血性、壊死性、及び/または脂肪性組織の量を最小化するために切除される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の出血性組織の量を最小化するために切除される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の壊死性組織の量を最小化するために切除される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の脂肪性組織の量を最小化するために切除される。
いくつかの実施形態では、腫瘍の断片化は、腫瘍の内部構造を維持するために行われる。いくつかの実施形態では、腫瘍の断片化は、メスでのこ引き動作を行うことなく行われる。いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍消化物から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、例えば、RPMI1640(2mM GlutaMAX、10mg/mLゲンタマイシン、30U/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)であるが、これに限定されない酵素培地中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(GentleMACS,Miltenyi Biotec,Auburn,CA)によって生成された。腫瘍を酵素培地に入れた後、腫瘍は、およそ1分間機械的に解離され得る。その後、溶液が5%CO中37℃で30分間インキュベートされ、その後、およそ1分間再び機械的に破壊され得る。5% CO中37℃で30分間再びインキュベートした後、腫瘍を、およそ1分間、3回目に機械的に破壊することができる。いくつかの実施形態では、大きい組織片が存在する場合、3回目の機械的破壊後、5%CO中37℃でさらに30分間インキュベートするかにかかわらず、1回または2回の追加の機械的解離が試料に適用された。いくつかの実施形態では、細胞懸濁液が多数の赤血球または死細胞を含む場合、最終インキュベーションの終わりに、Ficollを使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張ステップの前に採取された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに採取された」細胞集団と呼ばれる。
いくつかの実施形態では、細胞は、試料採取後に任意選択で凍結され、ステップBに記載される拡張に入る前に凍結保存され得、これは、以下でさらに詳細に説明され、図1及び図8にも例示される。
1.胸水T細胞及びTIL
いくつかの実施形態では、試料は、胸腔内液試料である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセスによる拡張のためのT細胞またはTILの供給源は、胸腔内液試料である。いくつかの実施形態では、試料は、胸水由来試料である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセスによる拡張のためのTILの供給源は、胸水由来試料である。例えば、米国特許公開第2014/0295426号に記載されている方法を参照されたく、これはすべての目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、TILと思われる、及び/またはTILを含む任意の胸腔内液または胸水を利用することができる。かかる試料は、NSCLCもしくはSCLCなどの原発性または転移性肺癌に由来し得る。いくつかの実施形態では、試料は、別の臓器、例えば、乳房、卵巣、結腸、または前立腺に由来する二次転移性がん細胞に由来し得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用する試料は、胸膜浸出液である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用する試料は、胸膜漏出液である。他の生体試料は、例えば、腹部からの腹水または膵嚢胞液を含む、TILを含有する他の漿液を含み得る。腹水及び胸腔内液は、非常に類似した化学系を伴い、腹部及び肺の両方が、悪性腫瘍における同じ物質の胸膜空間及び腹部空間に中皮線及び流体形態を有し、いくつかの実施形態では、かかる流体は、TILを含有する。開示される方法が胸水を利用するいくつかの実施形態では、同じ方法が、TILを含有する他の嚢胞液を使用
して同様の結果で行われてもよい。
いくつかの実施形態では、胸腔内液は、患者から直接除去された未処理の形態である。いくつかの実施形態では、未処理の胸腔内液は、さらなる処理ステップの前に、EDTAまたはヘパリンチューブなどの標準的な採血管に入れられる。いくつかの実施形態では、未処理の胸腔内液は、さらなる処理ステップの前に、標準的なCellSave(登録商標)チューブ(Veridex)に入れられる。いくつかの実施形態では、試料は、生存TILの数の減少を避けるために、患者から採取した直後にCellSaveチューブに入れられる。生存TILの数は、4℃であっても、未処理の胸腔内液中に放置されると、24時間以内に大幅に減少する可能性がある。いくつかの実施形態では、試料は、患者からの除去後1時間、5時間、10時間、15時間、または最大24時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。いくつかの実施形態では、試料は、4℃で、患者からの除去後1時間、5時間、10時間、15時間、または最大24時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。
いくつかの実施形態では、選択された対象からの胸腔内液試料は、希釈され得る。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:10である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:9である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:8である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:5である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:2である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:1である。いくつかの実施形態では、希釈剤には、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水、別の緩衝液、または生理学的に許容される希釈剤が含まれる。いくつかの実施形態では、試料は、患者からの収集及び希釈の直後にCellSaveチューブ内に入れられ、生存TILの減少を回避し、これは、4℃であっても、未処理の胸腔内液中に放置された場合、24~48時間以内に有意に生じ得る。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、患者からの除去及び希釈後1時間、5時間、10時間、15時間、24時間、36時間、最大48時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、4℃で、患者からの除去及び希釈後1時間、5時間、10時間、15時間、24時間、36時間、最大48時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。
さらに他の実施形態では、胸腔内液試料は、さらなる処理ステップの前に、従来の手段によって濃縮される。いくつかの実施形態では、胸腔内液のこの前処理は、方法を実施する実験室への輸送のために、またはその後の分析のために(例えば、採取後24~48時間より後に)胸水を凍結保存しなければならない状況において好ましい。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、それが対象から採取された後に胸腔内液試料を遠心分離し、遠心分離物またはペレットを緩衝液中に再懸濁することによって調製される。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、輸送または後の分析及び/または処理のために凍結保存される前に、複数の遠心分離及び再懸濁に供される。
いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、濾過法を使用することによって、さらなる処理ステップの前に濃縮される。いくつかの実施形態では、さらなる処理で使用される胸腔内液試料は、胸腔内液が膜を通過することを可能にするが腫瘍細胞を保持する、既知で本質的に均一な孔径を含むフィルターを通して流体を濾過することによって調製される。いくつかの実施形態では、膜の細孔の直径は、少なくとも4μMであり得る。他の実施形態では、細孔直径は、5μM以上であり得、他の実施形態では、6、7、8、9、または10μMのうちのいずれかであり得る。濾過後、膜によって保持されたTILを含む細胞を、膜から適切な生理学的に許容される緩衝液にすすいでもよい。次いで、このように濃縮されたTILを含む細胞は、方法のさらなる処理ステップで使用することができる。
いくつかの実施形態では、胸腔内液試料(例えば、未処理の胸腔内液を含む)、希釈胸腔内液、または再懸濁細胞ペレットは、試料中に存在する無核赤血球を特異的に溶解する溶解試薬と接触させる。いくつかの実施形態では、このステップは、胸腔内液がかなりの数のRBCを含む状況で、さらなる処理ステップの前に行われる。好適な溶解試薬には、単一の溶解試薬もしくは溶解試薬及びクエンチ試薬、または溶解剤、クエンチ試薬及び固定試薬が含まれる。好適な溶解系は市販されており、BD Pharm Lyse(商標)系(Becton Dickenson)が含まれる。他の溶解系には、Versalyse(商標)系、FACSlyse(商標)系(Becton Dickenson)、Immunoprep(商標)系、またはErythrolyse II系(Beckman Coulter,Inc.)、または塩化アンモニウム系が含まれる。いくつかの実施形態では、溶解試薬は、赤血球の効率的な溶解、ならびに胸水におけるTIL及びTILの表現型特性の保存のような主要な要件によって異なり得る。溶解のための単一の試薬を利用することに加えて、本明細書に記載の方法に有用な溶解系は、第2の試薬、例えば、方法の残りのステップ中に溶解試薬の効果をクエンチまたは遅延させるもの、例えばStabilyse(商標)試薬(Beckman Coulter,Inc.)を含むことができる。溶解試薬の選択または方法の好ましい実施に応じて、従来の固定試薬を使用することもできる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、未処理、希釈または多重遠心分離または処理された胸腔内液試料は、本明細書で提供されるようにさらに処理及び/または拡張される前に、約-140℃の温度で凍結保存される。
2.CD39/CD69二重陰性の事前選択選択
本発明のいくつかの方法によれば、TILは、例えば、第1の拡張前に(i)CD39/CD69二重陰性、(ii)CD39/CD69LO/LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせであるように事前選択される。いくつかの実施形態では、PD-1についての任意選択の事前選択ステップも存在する。
いくつかの実施形態では、最低3,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低3,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低4,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低4,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低5,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低5,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低6,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低6,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低7,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低7,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低8,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低8,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低9,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低9,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低10,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低10,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低20,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低20,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低30,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低30,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最
低40,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低40,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低50,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低50,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低60,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低60,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低70,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低70,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低80,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低80,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低90,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低90,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低100,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低100,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、細胞を、200,000個の密度まで成長または拡張させる。いくつかの実施形態では、細胞を、200,000個の密度まで成長または拡張させて、第2の拡張を開始するための約2e8個のTILを提供する。いくつかの実施形態では、細胞を、150,000個の密度まで成長または拡張させる。いくつかの実施形態では、細胞を、150,000個の密度まで成長または拡張させて、第2の拡張を開始するための約2e8個のTILを提供する。いくつかの実施形態では、細胞を、250,000個の密度まで成長または拡張させる。いくつかの実施形態では、細胞を、250,000個の密度まで成長または拡張させて、第2の拡張を開始するための約2e8個のTILを提供する。いくつかの実施形態では、最小細胞密度は、第2の拡張を開始するための10e6個を与えるために、10,000個の細胞である。いくつかの実施形態では、第2の拡張を開始するための10e6個の播種密度は、1e9個を超えるTILをもたらし得る。
いくつかの実施形態では、第1の拡張において使用するためのTILは、(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ(例えば、事前選択後、及び第1の拡張前)である。いくつかの実施形態では、第1の拡張で使用するためのTILは、少なくとも75%が(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ、少なくとも80%が(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ、少なくとも85%が(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ、少なくとも90%が(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ、少なくとも95%が(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ、少なくとも98%が(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ、または少なくとも99%が(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ(例えば、事前選択後及び第1の拡張前)である。
いくつかの実施形態では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILの事前選択は、一次細胞集団、全腫瘍消化物、及び/または全腫瘍細胞懸濁液TILを抗CD39抗体及び抗CD69抗体で染色することによって行われる。い
くつかの実施形態では、抗CD39及び抗CD69抗体は、ポリクローナル抗体、例えば、マウス抗ヒトCD39及びCD69ポリクローナル抗体、ヤギ抗ヒトCD39及びCD69ポリクローナル抗体などである。いくつかの実施形態では、抗CD39及び抗CD69抗体は、モノクローナル抗体である。
いくつかの実施形態では、事前選択で使用するための抗CD39抗体は、CD39を発現する細胞の少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、少なくとも99%、または少なくとも100%に結合する。いくつかの実施形態では、事前選択で使用するための抗CD69抗体は、CD69を発現する細胞の少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、少なくとも99%、または少なくとも100%に結合する。
いくつかの実施形態では、患者は、抗PD-1抗体で治療されている。いくつかの実施形態では、対象は、抗PD-1抗体治療未経験である。いくつかの実施形態では、対象は、抗PD-1抗体で治療されていない。いくつかの実施形態では、対象は、以前に化学療法剤で治療されている。いくつかの実施形態では、対象は、以前に化学療法剤で治療されているが、もはや化学療法剤で治療されていない。いくつかの実施形態では、対象は、化学療法治療後または抗PD-1抗体治療後である。いくつかの実施形態では、対象は、化学療法治療後及び抗PD-1抗体治療後である。いくつかの実施形態では、患者は、抗PD-1抗体治療未経験である。いくつかの実施形態では、対象は、治療未経験のがんを有するか、または化学療法治療後であるが、抗PD-1抗体未経験である。いくつかの実施形態では、対象は、治療未経験であり、かつ化学療法治療後であるが、抗PD-1抗体治療未経験である。
いくつかの実施形態では、事前選択は、細胞選別法を使用して行われる。いくつかの実施形態では、細胞選別法は、フローサイトメトリー法、例えば、フロー活性化細胞選別法(FACS)である。いくつかの実施形態では、陰性は、FMOに基づいてゲーティングされる。いくつかの実施形態では、FACSゲートは、対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することにより、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容するステップの後に設定される。いくつかの実施形態では、ゲーティングは、各選別に対して設定される。いくつかの実施形態では、ゲーティングは、PBMCの各試料に対して設定される。いくつかの実施形態では、ゲーティングは、PBMCの各試料に対して設定される。いくつかの実施形態では、ゲーティングテンプレートは、PBMCから10日、20日、30日、40日、50日、または60日毎に設定される。いくつかの実施形態では、ゲーティングテンプレートは、PBMCから60日毎に設定される。いくつかの実施形態では、ゲーティングテンプレートは、10日、20日、30日、40日、50日、または60日毎にPBMCの各試料に対して設定される。いくつかの実施形態では、ゲーティングテンプレートは、60日毎にPBMCの各試料に対して設定される。
いくつかの実施形態では、事前選択は、第1のTIL集団から(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせを選択して、TIL集団を取得することを伴い、少なくとも11.27%~74.4%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILであるTIL集団を第1のTIL集団から選択することを含む。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団は、少なくとも10%~80%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも20%~80%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも20%~80%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69
TIL、少なくとも30%~80%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも40%~80%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも50%~80%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも10%~70%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも20%~70%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも30%~70%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも40%~70%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILである。
いくつかの実施形態では、選択ステップ(例えば、CD39/CD69二重陰性細胞の事前選択及び/または選択)は、
(i)第1のTIL集団及びPBMC集団を、CD39及びCD69に結合する過剰のモノクローナル抗CD39 IgG及び抗CD69 IgG抗体に曝露するステップと、
(ii)フルオロフォアにコンジュゲートした過剰の抗IgG抗体を添加するステップと、
(iii)蛍光活性化細胞選別法(FACS)によって行われた場合のPBMC集団で検出されたフルオロフォアの強度と比較して、第1のTIL集団中のCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILで検出されたフルオロフォアの強度に基づいて、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を取得するステップと、を含む。
いくつかの実施形態では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の少なくとも70%が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILである。いくつかの実施形態では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団の少なくとも80%が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILである。いくつかの実施形態では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団の少なくとも90%が、PD-1陽性TILである。いくつかの実施形態では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団の少なくとも95%が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILである。いくつかの実施形態では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団の少なくとも99%が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILである。いくつかの実施形態では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団の100%が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILである。
いくつかの実施形態では、図8のステップA2として例示される選択ステップは、(i)第1のTIL集団を過剰のモノクローナル抗CD39及び抗CD69 IgG抗体に曝露するステップと、(ii)フルオロフォアにコンジュゲートした過剰の抗IgG抗体を追加するステップと、(iii)フルオロフォアに基づいてフローベースの細胞選別を実施して、(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)濃縮TIL集団の組み合わせを取得するステップと、を含む。
いくつかの実施形態では、実施例15のゲーティング法が用いられる。腫瘍試料に由来するTILがCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOであるかどうかを決定するために、当業者は、1人以上の健康なヒト対象由来の血液試料から取得された末梢T細胞におけるCD39及び/またはCD69の発現レベルに対応する参
照値を利用することができる。参照試料中のCD39/CD69陽性細胞は、蛍光から1つの対照を差し引いたものと、一致するアイソタイプ対照とを使用して定義することができる。いくつかの実施形態では、健康な対象由来のCD3+/CD39+/CD69+末梢T細胞(例えば、参照細胞)において測定されたCD39/CD69の発現レベルを使用して、腫瘍から取得されたTILにおけるCD39/CD69の免疫染色強度の閾値またはカットオフ値を確立する。閾値は、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILのCD39/CD69免疫染色の最大強度として定義することができる。そのため、CD39/CD69発現が閾値と同じかそれを下回るTILは、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO細胞であるとみなすことができる。いくつかの事例では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILは、全CD3+細胞の最大1%以下に相当するCD39/CD69免疫染色の最低強度を有するものを表す。他の事例では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILは、全CD3+細胞の最大0.75%以下に相当するCD39/CD69免疫染色の最低強度を有するものを表す。いくつかの事例では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILは、全CD3+細胞の最大0.50%以下に相当するCD39/CD69免疫染色の最低強度を有するものを表す。一事例では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILは、全CD3+細胞の最大0.25%以下に相当するCD39/CD69免疫染色の最低強度を有するものを表す。
いくつかの実施形態では、実施例16のタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤(AKTi)法が用いられる。いくつかの実施形態では、TIL集団は、AKT阻害剤を含む培地中で培養され、CD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得する。いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、ホノキオール、及びそれらの薬学的に許容される塩からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブである。いくつかの実施形態では、TIL集団を、約0.1μM、約0.2μM、約0.3μM、約0.4μM、約0.5μM、約0.6μM、約0.7μM、約0.8μM、約0.9μM、約1μM、約1.1μM、約1.2μM、約1.3μM、約1.4μM、約1.5μM、約1.6μM、約1.7μM、約1.8μM、約1.9μM、約2μM、約2.1μM、約2.2μM、約2.3μM、約2.4μM、約2.5μM、約2.6μM、約2.7μM、約2.8μM、約2.9μM、約3μM、約3.5μM、約4μM、約4.5μM、または約5μMのイパタセルチブを含む培地中で培養する。
a.フルオロフォア
いくつかの実施形態では、一次TIL細胞集団は、フルオロフォアに連結された抗CD39及び抗CD69抗体及びフルオロフォアに連結された抗CD3抗体を含むカクテルで染色される。いくつかの実施形態では、一次TIL細胞集団は、フルオロフォアに連結された抗CD39及び抗CD69抗体(例えば、PE、live/deadバイオレット)及び抗CD3-FITCを含むカクテルで染色される。いくつかの実施形態では、一次TIL細胞集団は、第1のフルオロフォアにコンジュゲートした抗CD39及び第2のフルオロフォアにコンジュゲートした抗CD69抗体、第3のフルオロフォアにコンジュゲートした抗CD3抗体、及びlive/dead青色染色(ThermoFisher,MA、カタログ番号L23105から市販されているものなど)を含むカクテルで染色され、第1、第2、及び第3の抗体は異なり、個別の検出が可能である。いくつかの実施形態では、抗CD39及び抗CD69抗体とのインキュベーション後、(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i
)及び(ii)細胞の組み合わせは、本明細書、例えば、図8E及び/または図8F及び/または図8Gに記載の第1の拡張による拡張のために選択される。
いくつかの実施形態では、一次TIL細胞集団は、フルオロフォアに連結された抗CD39及び抗CD69抗体及びフルオロフォアに連結された抗CD3抗体を含むカクテルで染色される。いくつかの実施形態では、一次TIL細胞集団は、フルオロフォアに連結された抗CD39及び抗CD69抗体(例えば、PE、live/deadバイオレット)及び抗CD3-PE-Cy7を含むカクテルで染色される。いくつかの実施形態では、一次TIL細胞集団は、抗CD39-FITC及び抗CD69-PE、抗CD3-PE-Cy7、及びlive/dead青色染色(ThermoFisher,MA、カタログ番号L23105)を含むカクテルで染色される。いくつかの実施形態では、抗CD39及び抗CD69抗体とのインキュベーション後、(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)細胞の組み合わせは、本明細書、例えば、図8E及び/または図8F及び/または図8GのプロセスCD39/CD69 GEN3のステップBに記載のプライミングによる第1の拡張による拡張のために選択される。
いくつかの実施形態では、フルオロフォアには、PE(フィコエリトリン)、APC(アロフィコシアニン)、PerCP(ペリジニンクロロフィルタンパク質)、DyLight 405、Alexa Fluor 405、Pacific Blue、Alexa Fluor 488、FITC(フルオレセインイソチオシアネート)、DyLight 550、Alexa Fluor 647、DyLight 650、及びAlexa Fluor 700が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、フルオロフォアには、PE-Alexa Fluor(登録商標)647、PE-Cy5、PerCP-Cy5.5、PE-Cy5.5、PE-Alexa Fluor(登録商標)750、PE-Cy7、及びAPC-Cy7が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、フルオロフォアには、フルオレセイン色素が含まれるが、これに限定されない。フルオレセイン色素の例には、5-カルボキシフルオレセイン、フルオレセイン-5-イソチオシアネート及び6-カルボキシフルオレセイン、5,6-ジカルボキシフルオレセイン、5-(及び6)-スルホフルオレセイン、スルホンフルオレセイン、スクシニルフルオレセイン、5-(及び6)-カルボキシSNARF-1、カルボキシフルオレセインスルホネート、カルボキシフルオレセイン双性イオン、カルボキシフルオレセイン四級アンモニウム、カルボキシフルオレセインホスホネート、カルボキシフルオレセインGABA、5’(6’)-カルボキシフルオレセイン、カルボキシフルオレセイン-cys-Cy5、ならびにフルオレセイングルタチオンが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、蛍光部分は、ローダミン色素である。ローダミン色素の例には、テトラメチルローダミン-6-イソチオシアネート、5-カルボキシテトラメチルローダミン、5-カルボキシロードール誘導体、カルボキシローダミン110、テトラメチル及びテトラエチルローダミン、ジフェニルジメチル及びジフェニルジエチルローダミン、ジナフチルローダミン、ローダミン101スルホニルクロリド(TEXAS RED(登録商標)の商品名で販売される)が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、蛍光部分は、シアニン色素である。シアニン色素の例には、Cy3、Cy3B、Cy3.5、Cy5、Cy5.5、及びCy7が含まれるが、これらに限定されない。
B.ステップB:第1の拡張
いくつかの実施形態では、本方法は、対象/患者への投与時に複製サイクルを増加させることができ、したがって、より古いTIL(すなわち、対象/患者への投与前により多くの複製ラウンドをさらに受けたTIL)よりも追加の治療的利益を提供し得る、若いTILを得ることを提供する。若いTILの特徴は、文献、例えば、Donia,et a
l.,Scand.J.Immunol.2012,75,157-167、Dudley,et al.,Clin.Cancer Res.2010,16,6122-6131、Huang,et al.,J.Immunother.2005,28,258-267、Besser,et al.,Clin.Cancer Res.2013,19,OF1-OF9、Besser,et al.,J.Immunother.2009,32:415-423、Robbins,et al.,J.Immunol.2004,173,7125-7130、Shen,et al.,J.Immunother.,2007,30,123-129、Zhou,et al.,J.Immunother.2005,28,53-62、及びTran,et al.,J.Immunother.,2008,31,742-751に記載されており、これらの各々は参照により本明細書に組み込まれる。
Tリンパ球及びBリンパ球の多様な抗原受容体は、限られた数であるが、多数の遺伝子セグメントの体細胞組換えによって産生される。これらの遺伝子セグメント:V(可変)、D(多様性)、J(接合)、及びC(一定)は、免疫グロブリン及びT細胞受容体(TCR)の結合特異性及び下流での適用を決定する。本発明は、T細胞レパートリー多様性を示し、かつ増加させるTILを生成するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、新たに採取されたTIL及び/または例えば、図1または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILと比較して、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、新たに採取されたTIL及び/または図5及び/または図6に例示されるようにプロセス1Cと称される方法を使用して調製されたTILと比較して、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、第1の拡張で取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、多様性の増加は、免疫グロブリン多様性及び/またはT細胞受容体多様性の増加である。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン重鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン軽鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、T細胞受容体にある。いくつかの実施形態では、多様性は、アルファ、ベータ、ガンマ、及びデルタ受容体からなる群から選択されるT細胞受容体のうちの1つにある。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファ及び/またはベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)ベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、TCRab(すなわち、TCRα/β)の発現が増加する。
例えば、図1または図8のステップAに記載されるものなどの腫瘍断片の解剖または消化後に、結果として得られた細胞は、腫瘍及び他の細胞よりもTILの成長を好む条件下で、IL-2を含む血清中で培養される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、6000IU/mLのIL-2を有する不活性化ヒトAB血清を含む培地中2mLのウェル中でインキュベートされる。他の実施形態では、腫瘍消化物は、1000IU/mLのIL-2を有する不活性化ヒトAB血清を含む培地中2mLのウェル中でインキュベートされる。この一次細胞集団は、数日間、一般に3~14日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10バルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、7~14日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10バルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、10~14日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10バルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、約11日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10バルクTIL細胞を生じる。
いくつかの実施形態では、TILの拡張は、第1の拡張の直前の追加の刺激ステップを含んでもよく、本明細書に記載の腫瘍試料からTILを調製し、少なくともインターフェロンガンマ((IFN-γ)200ng/mL、例えば、I17001、Sigma-Aldrich,Inc.,St.Louis,MO)及び抗PD-1(例えば、ニボルマブ)で第1の単離(または凍結保存試料の場合は凍結解凍)から培養する。いくつかの実施形態では、拡張前刺激培養物は、CD40アゴニスト、例えば、可溶性CD40Lまたは抗CD40抗体(例えば、セリクレルマブ)をさらに含む。いくつかの実施形態では、拡張前刺激培養物は、CTLA-4アゴニスト、例えば、抗CTLA-4(例えば、イピリムマブ)をさらに含む。いくつかの実施形態では、拡張前刺激は、48~72時間持続する。いくつかの実施形態では、拡張前刺激は、48時間、50時間、52時間、54時間、56時間、58時間、60時間、62時間、64時間、66時間、68時間、70時間、または72時間持続する。様々な実施形態では、拡張前刺激は、6、8、10、12、16、20、24、36または40時間持続する。
好ましい実施形態では、TILの拡張は、以下及び本明細書に記載の初期バルクTIL拡張ステップ(例えば、REP前と称されるプロセスを含み得る、図1または図8のステップBに記載のものなど)、続いて以下のステップD及び本明細書に記載の第2の拡張(ステップD、急速拡張プロトコル(REP)ステップと称されるプロセスを含む)、続いて任意の凍結保存、続いて以下及び本明細書に記載の第2のステップD(再刺激REPステップと称されるプロセスを含む)を使用して行われ得る。このプロセスから取得されたTILは、本明細書に記載の表現型特徴及び代謝パラメータについて任意で特徴付けられ得る。
TIL培養物が24ウェルプレートで開始される実施形態では、例えば、Costar
24ウェル細胞培養クラスター、平底(Corning Incorporated,Corning,NY)を使用して、IL-2(6000IU/mL、Chiron Corp.,Emeryville,CA)を含む2mLの完全培地(CM)中の1×10個の腫瘍消化細胞または1つの腫瘍断片を、各ウェルに播種することができる。他の実施形態では、各ウェルは、IL-2(1000IU/mL)を含む2mLの完全培地(CM)中の1×10個の腫瘍消化細胞または1つの腫瘍断片を播種することができる。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~10mmである。
いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、培養培地の略語である「CM」と称される。いくつかの実施形態では、ステップBのCMは、10%ヒトAB血清、25mM
Hepes、及び10mg/mLゲンタマイシンを補充した、GlutaMAXを含むRPMI 1640からなる。培養物が40mL容量及び10cmガス透過性シリコン底部(例えば、G-REX10、Wilson Wolf Manufacturing,New Brighton,MN)を有するガス透過性フラスコ内で開始される実施形態では、各フラスコに、IL-2を含む10~40mLのCM中の10~40×10個の生きた腫瘍消化細胞または5~30個の腫瘍断片を装填した。G-REXREX10及び24ウェルプレートの両方を、5% CO中37℃の加湿インキュベーター内でインキュベートし、培養開始から5日後、培地の半分を取り除き、新たなCM及びIL-2と交換し、5日後、培地の半分を2~3日毎に交換した。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される拡張プロセスで使用される培地は、無血清培地または合成培地である。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、血清含有培地のロット間の変動に部分的に起因する実験変動を防止及び/または減少させるために使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地には、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal
Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CTS(商標)AIM-V
SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、血清サプリメントまたは血清代替物には、CTS(商標)OpTmizer T-Cell Expansion Serum Supplement、CTS(商標)Immune Cell Serum Replacement、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代用物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代用物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代用物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の抗生物質、及び1つ以上の微量元素のうちの1つ以上が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/または2-メルカプトエタノールをさらに含む。
いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Immune Cell Serum Replacementは、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CST(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地を含むが、これらに限定されない、従来の成長培地とともに使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地中の総血清代替物濃度(vol%)は、総無血清または合成培地の約1体積%、2体積%、3体積%、4体積%、5体積%、6体積%、7体積%、8体積%、9体積%、10体積%、11体積%、12体積%、13体積%、14体積%、15体積%、16体積%、17体積%、18体積%、19体積%、または20体積%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約3%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約5%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約10%である。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、CTS(商標)OpTmizer
(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion
SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されており、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMに
は、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune
Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher
Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum
Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されており、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約0.1mM~約10mM、0.5mM~約9mM、1mM~約8mM、2mM~約7mM、3mM~約6mM、または4mM~約5mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約2mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約5mM~約150mM、10mM~約140mM、15mM~約130mM、20mM~約120mM、25mM~約110mM、30mM~約100mM、35mM~約95mM、40mM~約90mM、45mM~約85mM、50mM~約80mM、55mM~約75mM、60mM~約70mM、または約65mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約55mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、参照により本明細書に組み込まれる国際PCT公開第WO/1998/030679号に記載されている合成培地は、本発明において有用である。その刊行物には、無血清真核細胞培養培地が記載されている。無血清真核細胞培養培地には、無血清培養下で細胞の成長を支持することができる無血清サプリメントを補充した基礎
細胞培養培地が含まれる。無血清真核細胞培養培地サプリメントは、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代替物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の微量元素、及び1つ以上の抗生物質からなる群から選択される1つ以上の成分を含むか、またはそれらを組み合わせることによって取得される。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/またはベータ-メルカプトエタノールをさらに含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンまたはアルブミン代替物と、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、及び1つ以上の微量元素からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地は、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、合成培地中のグリシンの濃度は、約5~200mg/Lの範囲であり、L-ヒスチジンの濃度は、約5~250mg/Lであり、L-イソロイシンの濃度は、約5~300mg/Lであり、L-メチオニンの濃度は、約5~200mg/Lであり、L-フェニルアラニンの濃度は、約5~400mg/Lであり、L-プロリンの濃度は、約1~1000mg/Lであり、L-ヒドロキシプロリンの濃度は、約1~45mg/Lであり、L-セリンの濃度は、約1~250mg/Lであり、L-スレオニンの濃度は、約10~500mg/Lであり、L-トリプトファンの濃度は、約2~110mg/Lであり、L-チロシンの濃度は、約3~175mg/Lであり、L-バリンの濃度は、約5~500mg/Lであり、チアミンの濃度は、約1~20mg/Lであり、還元型グルタチオンの濃度は、約1~20mg/Lであり、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩の濃度は、約1~200mg/Lであり、鉄飽和トランスフェリンの濃度は、約1~50mg/Lであり、インスリンの濃度は、約1~100mg/Lであり、亜セレン酸ナトリウムの濃度は、約0.000001~0.0001mg/Lであり、アルブミン(例えば、AlbuMAX(登録商標)I)の濃度は、約5000~50,000mg/Lである。
いくつかの実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、以下の表4の「1×培地中の濃度範囲」という見出しの下の列にリストされた濃度範囲で存在する。他の実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされた最終濃度で存在する。他の実施形態では、合成培地は、無血清サプリメントを含む基礎細胞培地である。これらの実施形態のうちのいくつかでは、無血清サプリメントは、以下の表4の「サプリメント中の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされたタイプ及び濃度の非微量部分成分を含む。
いくつかの実施形態では、合成培地の浸透圧は、約260~350mOsmolである。いくつかの実施形態では、浸透圧は、約280~310mOsmolである。いくつかの実施形態では、合成培地には、最大約3.7g/L、または約2.2g/Lの重炭酸ナトリウムが補充されている。合成培地には、L-グルタミン(最終濃度約2mM)、1つ以上の抗生物質、非必須アミノ酸(NEAA、最終濃度約100μM)、2-メルカプトエタノール(最終濃度約100μM)がさらに補充されていてもよい。
いくつかの実施形態では、Smith,et al.,Clin.Transl Immunology,4(1)2015(doi:10.1038/cti.2014.31)に記載の合成培地が、本発明において有用である。簡潔には、RPMIまたはCTS(商標)OpTmizer(商標)を基礎細胞培地として使用し、0、2%、5%、または10%のいずれかのCTS(商標)Immune Cell Serum Replacementを補充した。
いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、濾過されていない。濾過されていない細胞培地の使用は、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化することができる。いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、ベータ-メルカプトエタノール(BMEまたはβME、2-メルカプトエタノールとしても知られる、CAS60-24-2)を欠いている。
腫瘍断片の調製(及び任意の拡張前刺激)後、結果として得られた細胞(すなわち、断片)は、腫瘍及び他の細胞よりもTILの成長を好む条件下で、IL-2を含む血清中で培養される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、6000IU/mLのIL-2を有する不活性化ヒトAB血清を含む培地中2mLのウェル中(または、いくつかの事例では、本明細書で概説されるように、APC細胞集団の存在下)でインキュベートされる。この一次細胞集団は、数日間、一般に10~14日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10個のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、第1の拡張中の成長培地は、IL-2またはそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ILは、組換えヒトIL-2(rhIL-2)である。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき20~30×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき20×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき25×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき30×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、4~8×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、5~7×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、6×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、実施例5に記載されるように調製される。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約10,000IU/mLのIL-2、約9,000IU/mLのIL-2、約8,000IU/mLのIL-2、約7,000IU/mLのIL-2、約6000IU/mLのIL-2、または約5,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約9,000IU/mLのIL-2~約5,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約8,000IU/mLのIL-2~約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約7,000IU/mLのIL-2~約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、約4000IU/mL、約4500IU/mL、約5000IU/mL、約5500IU/mL、約6000IU/mL、約6500IU/mL、約7000IU/mL、約7500IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、1000~2000IU/mL、2000~3000IU/mL、3000~4000IU/mL、4000~5000IU/mL、5000~6000IU/mL、6000~7000IU/mL、7000~8000IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、抗CD3アゴニスト抗体、例えば、OKT
-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約0.1ng/mL、約0.5ng/mL、約1ng/mL、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約200ng/mL、約500ng/mL、及び約1μg/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、0.1ng/mL~1ng/mL、1ng/mL~5ng/mL、5ng/mL~10ng/mL、10ng/mL~20ngの間、20ng/mL~30ng/mL、30ng/mL~40ng/mL、40ng/mL~50ng/mL、及び50ng/mL~100ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、OKT-3抗体を含まない。いくつかの実施形態では、OKT-3抗体は、ムロモナブである。例えば、表1を参照されたい。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、細胞培養培地中に1つ以上のTNFRSFアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは4-1BBアゴニストであり、4-1BBアゴニストは、ウレルマブ、ウトミルマブ、EU-101、融合タンパク質、ならびにそれらの断片、誘導体、バリアント、バイオシミラー、及び組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、0.1μg/mL~100μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、20μg/mL~40μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。
いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、細胞培養培地は、IL-2を約3000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、培養培地の略語である「CM」と称される。いくつかの実施形態では、それは、CM1(培養培地1)と称される。いくつかの実施形態では、CMは、10%ヒトAB血清、25mM Hepes、及び10mg/mLゲンタマイシンを補充した、GlutaMAXを含むRPMI1640からなる。培養物が40mL容量及び10cmガス透過性シリコン底部(例えば、G-REX10、Wilson Wolf Manufacturing,New Brighton,MN)を有するガス透過性フラスコ内で開始される実施形態では(図1)、IL-2を含む10~40mLのCM中の10~40×10個の生きた腫瘍消化細胞または5~30個の腫瘍断片を、各フラスコに入れた。G-REX10及び24ウェルプレートの両方を、5% CO中37℃の加湿インキュベーター内でインキュベートし、培養開始から5日後、培地の半分を取り除き、新たなCM及びIL-2と交換し、5日後、培地の半分を2~3日毎に交換した。いくつかの実施形態では、CMは、実施例に記載されるCM1であり、実施例1を参照されたい。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、初期細胞培養培地または第1の細胞培養培地中で起こる。いくつかの実施形態では、初期細胞培養培地または第1の細胞培養培地は、IL-2を含む。
いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、第1の拡張(例えば、REP前と称されることもあるものを含み得る、図1または図8のステップBに記載されるものなどのプロセスを含む)プロセスは、3~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、実施例で考察され、かつ図4及び図5に示されるように、例えば、図1または図8のステップBに記載される拡張も含む、第1の拡張(例えば、REP前と称されることも
あるものを含み得る、図1または図8のステップBに記載されるものなどのプロセスを含む)は、7~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、ステップBの第1の拡張は、10~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、例えば、図1または図8のステップBに記載される拡張において考察されるように、11日に短縮される。
いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、または14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、1日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、2日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、3日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、4日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、5日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、6日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、7日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、8日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、9日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、10日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、11日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、12日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、13日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、1日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、2日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、3日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、4日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、5日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、6日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、7日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、8日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、9日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、10日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、11日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21の組み合わせは、第1の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、例えば、図1または図8による、かつ本明細書に記載のステップBのプロセス中を含む、第1の拡張中に含まれ得る。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21の組み合わせは、第1の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、図1または図8による、かつ本明細書に記載のステップBのプロセス中に含まれ得る。
いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、第1の拡張(REP前と称されるプロセスを含む、例えば、図1または図8によるステップB)プロセスは、3~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、ステップBの第1の拡張は、7~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、ステップBの第1の拡張は、10~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、11日に短縮される。
いくつかの実施形態では、第1の拡張、例えば、図1または図8によるステップBは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、G-REX-10またはG-REX-100である。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。
1.サイトカイン及び他の添加物
いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張のためにサイトカインの組み合わせを使用することは、米国特許出願公開第2017/0107490A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように、IL-2、IL-15及びIL-21のうちの2つ以上の組み合わせを用いて可能である。したがって、可能な組み合わせには、IL-2及びIL-15、IL-2及びIL-21、IL-15及びIL-21及びIL-2、またはIL-15及びIL-21が含まれる。サイトカインの組み合わせの使用は、リンパ球、特にそこに記載されているようにT細胞の生成に特に有利に働く。いくつかの実施形態では、IL-2は、低濃度、例えば、約10IU/mL、約20IU/mL、約30IU/mL、約40IU/mL、約50IU/mL、約100IU/mL、約200IU/mL、約300IU/mL、約400IU/mL、約500IU/mL、約600IU/mL、約700IU/mL、約800IU/mL、約900IU/mL、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、または約4000IU/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-2は、約10~4000IU/mL、約100~3000IU/mL、約500~2000IU/ML、または約1000~1500IU/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-2は、約1000IU/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約1ng/mL、約2ng/mL、約3ng/mL、約4ng/mL、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約30ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、または約100ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約10ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-21は、約1ng/mL、約2ng/mL、約3ng/mL、約4ng/mL、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約30ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約150ng/mL、約200ng/mL、約250ng/mL、または約300ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約10ng/mLで添加され、IL-21は、約30ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15及びIL-21のうちの1つ以上は、ステップB中、例えば、ステップBのD0及びD3、D0及びD4、D0及びD5、D0及びD6、D0及びD7、D0及びD8に2回添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、OKT-3抗体またはムロモナブの、培養培地への添加を含み得る。いくつかの実施形態では、ステップBはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、4-1BBアゴニストの、培養培地への添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、ステップBはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、OX-40アゴニストの、培養培地への添加を含み得る。他の実施形態では、チアゾリジンジオン化合物などの増殖因子活性化受容体(PPAR)-ガンマアゴニストを含む、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体ガンマコアクチベーターI-アルファアゴニストなどの添加剤は、米国特許出願公開第2019/0307796 A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載され
るように、ステップB中に培養培地で使用されてもよい。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、培養培地中のタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤(AKTi)の添加を含み得る。いくつかの実施形態では、TIL集団は、AKT阻害剤を含む培地中で培養され、CD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得する。いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、ホノキオール、及びそれらの薬学的に許容される塩からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブである。いくつかの実施形態では、TIL集団を、約0.1μM、約0.2μM、約0.3μM、約0.4μM、約0.5μM、約0.6μM、約0.7μM、約0.8μM、約0.9μM、約1μM、約1.1μM、約1.2μM、約1.3μM、約1.4μM、約1.5μM、約1.6μM、約1.7μM、約1.8μM、約1.9μM、約2μM、約2.1μM、約2.2μM、約2.3μM、約2.4μM、約2.5μM、約2.6μM、約2.7μM、約2.8μM、約2.9μM、約3μM、約3.5μM、約4μM、約4.5μM、約5μM、約6μM、約7μM、約8μM、約9μM、約10μM、約20μM、約30μM、約40μM、約50μM、約60μM、約70μM、約80μM、約90μM、または約100μMのAKT阻害剤を含む培地中で培養する。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、CD40アゴニスト、例えば、CD40Lまたは抗CD40アゴニスト抗体の添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、CD40Lが添加される。いくつかの実施形態では、抗CD40アゴニスト抗体が添加される。いくつかの実施形態では、CD40アゴニストは、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約45ng/mL、約50ng/mL、約55ng/mL、または約60ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、CD40アゴニストは、約30ng/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、IFNγの添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、IFNγが添加される。いくつかの実施形態では、IFNγは、約50ng/mL、約55ng/mL、約60ng/mL、約65ng/mL、約70ng/mL、約75ng/mL、約80ng/mL、約85ng/mL、約90ng/mL、約95ng/mL、約100ng/mL、約105ng/mL、約110ng/mL、約115ng/mL、約120ng/mL、約125ng/mL、約130ng/mL、約135ng/mL、約140ng/mL、約145ng/mL、約150ng/mL、約155ng/mL、約160ng/mL、約165ng/mL、約170ng/mL、約175ng/mL、約180ng/mL、約185ng/mL、約190ng/mL、約195ng/mL、約200ng/mL、約205ng/mL、約210ng/mL、約215ng/mL、約220ng/mL、約225ng/mL、約230ng/mL、約235ng/mL、約240ng/mL、約245ng/mL、約250ng/mL、約255ng/mL、約260ng/mL、約265ng/mL、約270ng/mL、約275ng/mL、約280ng/mL、約285ng/mL、約290ng/mL、約295ng/mL、または約300ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IFNγは、約200ng/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、抗PD-1抗体の添加を含み得る。いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、約5μg/mL、約10μg/mL、約15μg/mL、約20μg/mL、約25μg/mL、約3
0μg/mL、約35μg/mL、約40μg/mL、約45μg/mL、約50μg/mL、約55μg/mL、または約60μg/mLで添加される。いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、約10μg/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、抗CTLA-4抗体の添加を含み得る。いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、約5μg/mL、約10μg/mL、約15μg/mL、約20μg/mL、約25μg/mL、約30μg/mL、約35μg/mL、約40μg/mL、約45μg/mL、約50μg/mL、約55μg/mL、または約60μg/mLで添加される。いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、約10μg/mLで添加される。
C.ステップC:第1の拡張から第2の拡張へと移行
いくつかの事例では、例えば、図1または図8に示されるステップBから取得されたTIL集団を含む、第1の拡張から取得されたバルクTIL集団は、以下で考察されるプロトコルを使用して、直ちに凍結保存され得る。代替的に、第2のTIL集団と称される第1の拡張から取得されたTIL集団は、以下で考察されるように、第2の拡張(REPと称されることもある拡張を含み得る)に供され、その後、凍結保存され得る。同様に、遺伝子修飾TILが治療に使用される場合、第1のTIL集団(バルクTIL集団と称されることもある)または第2のTIL集団(いくつかの実施形態では、REP TIL集団と称される集団を含み得る)は、拡張前または第1の拡張後及び第2の拡張前に、好適な治療のために遺伝子修飾に供され得る。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から(例えば、図1または図8に示されるステップBから)取得されたTILは、選択のために表現型決定されるまで保管される。いくつかの実施形態では、第1の拡張から(例えば、図1または図8に示されるステップBから)取得されたTILは保管されず、第2の拡張に直接進む。いくつかの実施形態では、第1の拡張から取得されたTILは、第1の拡張後及び第2の拡張前に凍結保存されない。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、または14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約3日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約4日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約4日~10日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約7日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約14日で起こる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、または14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから1日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、2日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから3日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから4日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから5日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから6日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから7日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから8日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行
は、断片化が起こってから9日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから10日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから11日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから12日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから13日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから1日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから3日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから4日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから5日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから6日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから7日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから8日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから9日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから10日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから11日で起こる。
いくつかの実施形態では、TILは、第1の拡張後及び第2の拡張前に保管されず、TILは、第2の拡張に直接進む(例えば、いくつかの実施形態では、図1及び/または図8に示されるステップBからステップDへの移行中に保管されない)。いくつかの実施形態では、移行は、本明細書に記載されるように、閉鎖系内で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張由来のTILである第2のTIL集団は、移行期間なしで第2の拡張に直接進む。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行、例えば、図1または図8によるステップCは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、G-REX-10またはG-REX-100バイオリアクターである。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。
D.ステップD:第2の拡張
いくつかの実施形態では、TIL細胞集団は、採取及び初期バルク処理後、例えば、図1または図8に示される、ステップA及びステップB、ならびにステップCと称される移行後に数が拡張される)。このさらなる拡張は、本明細書では第2の拡張と称され、これは、当該技術分野で一般に急速拡張プロセス(REP)と称される拡張プロセス、ならびに図1または図8のステップDに示されるプロセスを含み得る。第2の拡張は、一般に、フィーダー細胞、サイトカイン源、及び抗CD3抗体を含むいくつかの成分を含む培養培地を使用して、ガス透過性容器内で達成される。
いくつかの実施形態では、第2の拡張または第2のTIL拡張(REPと称されることもある拡張、ならびに図1のステップDに示されるプロセスを含み得る)は、当業者に知られている任意のTILフラスコまたは容器を使用して行われ得る。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、また
は14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約7日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約8日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約9日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約10日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約11日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約12日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約13日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約14日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張は、本開示の方法(例えば、REPと称される拡張、ならびに図1または図8のステップDに示されるプロセスを含む)を使用して、ガス透過性容器内で行われ得る。例えば、TILは、インターロイキン-2(IL-2)またはインターロイキン-15(IL-15)の存在下で非特異的T細胞受容体刺激を使用して、急速に拡張され得る。非特異的T細胞受容体刺激は、例えば、抗CD3抗体、例えば約30ng/mLのOKT3、マウスモノクローナル抗CD3抗体(Ortho-McNeil,Raritan,NJもしくはMiltenyi Biotech,Auburn,CAから市販)またはUHCT-1(BioLegend,San Diego,CA,USAから市販)を含み得る。TILは、がんのエピトープ(複数可)などの抗原性部分を含む、第2の拡張中に1つ以上の抗原を含むことによって、インビトロでTILのさらなる刺激を誘導するように拡張することができ、これは、ベクター、例えば、ヒト白血球抗原A2(HLA-A2)結合ペプチド、例えば、0.3μM MART-1:26-35(27L)またはgpl00:209-217(210M)から、任意選択で300IU/mLのIL-2またはIL-15などのT細胞成長因子の存在下で任意で発現され得る。他の好適な抗原には、例えば、NY-ESO-1、TRP-1、TRP-2、チロシナーゼがん抗原、MAGE-A3、SSX-2、及びVEGFR2、またはそれらの抗原性部分が含まれ得る。TILは、HLA-A2を発現する抗原提示細胞にパルスされたがんの同じ抗原(複数可)で再刺激することによっても急速に拡張され得る。代替的に、TILは、例えば、例として放射線照射された自己リンパ球または放射線照射されたHLA-A2+同種異系リンパ球及びIL-2でさらに再刺激され得る。いくつかの実施形態では、再刺激は、第2の拡張の一部として起こる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、放射線照射された自己リンパ球の存在下で、または放射線照射されたHLA-A2+同種異系リンパ球及びIL-2を用いて起こる。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約10IU/mL、約20IU/mL、約30IU/mL、約40IU/mL、約50IU/mL、約100IU/mL、約200IU/mL、約300IU/mL、約400IU/mL、約500IU/mL、約600IU/mL、約700IU/mL、約800IU/mL、約900IU/mL、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、約4000IU/mL、約4500IU/mL、約5000IU/mL、約5500IU/mL、約6000IU/mL、約6500IU/mL、約7000IU/mL、約7500IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、10~100IU/mL、100~200IU/mL、200~300IU/mL、300~400IU/mL、400~500IU/mL、500~1000IU/mL、1000~2000IU/mL、2000~3000IU/mL、3000~4000IU/mL、4000~5000IU/mL、5000~6000IU/mL、6000~7000IU/mL、または7000~8000IU/mLのIL-2を含む。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、OKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約0.1ng/mL、約0.5ng/mL、約1ng/mL、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約200ng/mL、約500ng/mL、及び約1μg/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、0.1ng/mL~1ng/mL、1ng/mL~5ng/mL、5ng/mL~10ng/mL、10ng/mL~20ngの間、20ng/mL~30ng/mL、30ng/mL~40ng/mL、40ng/mL~50ng/mL、及び50ng/mL~100ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、OKT-3抗体を含まない。いくつかの実施形態では、OKT-3抗体は、ムロモナブである。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、細胞培養培地中に1つ以上のTNFRSFアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは4-1BBアゴニストであり、4-1BBアゴニストは、ウレルマブ、ウトミルマブ、EU-101、融合タンパク質、ならびにそれらの断片、誘導体、バリアント、バイオシミラー、及び組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、0.1μg/mL~100μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、20μg/mL~40μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。
いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、細胞培養培地は、IL-2を約3000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21の組み合わせは、第2の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、例えば、図1または図8による、かつ本明細書に記載のステップDのプロセス中を含む、第2の拡張中に含まれ得る。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21の組み合わせは、第2の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、図1または図8による、かつ本明細書に記載のステップDのプロセス中に含まれ得る。
いくつかの実施形態では、第2の拡張は、IL-2、OKT-3、抗原提示フィーダー細胞、及び任意でTNFRSFアゴニストを含む補充された細胞培養培地において実施され得る。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、補充された細胞培養培地中で起こる。いくつかの実施形態では、補充された細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、第2の細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC、抗原提示フィーダー細胞とも称される)を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞(すなわち、抗原提示細胞)を含む細胞培養培地中で起こる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15、約400IU/mLのIL-15、約300IU/mLのIL-15、約200IU/mLのIL-15、約180IU/mLのIL-15、約160IU/mLのIL-15、約140IU/mLのIL-15、約120IU/mLのIL-15、または約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約400IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約300IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約200IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-15をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21、約15IU/mLのIL-21、約12IU/mLのIL-21、約10IU/mLのIL-21、約5IU/mLのIL-21、約4IU/mLのIL-21、約3IU/mLのIL-21、約2IU/mLのIL-21、約1IU/mLのIL-21、または約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約15IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約12IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約10IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約5IU/mLのIL-21~約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約2IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-21をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞(APC)は、PBMCである。いくつかの実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMC及び/または抗原提示細胞に対する比は、約1:25、約1:50、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。いくつかの実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMCに対する比は、1:50~1:300である。いくつかの実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMCに対する比は、1:100~1:200である。
いくつかの実施形態では、REP及び/または第2の拡張は、バルクTILが150mLの培地中の100倍または200倍過剰の不活性化フィーダー細胞、30mg/mLのOKT3抗CD3抗体、及び3000IU/mLのIL-2と混合されているフラスコ内で行われる。細胞が代替の成長チャンバに移されるまで、培地交換が行われる(一般に、新鮮な培地との呼吸による3分の2の培地交換)。代替の成長チャンバには、以下でより完全に考察されるように、G-REXフラスコ及びガス透過性容器が含まれる。
いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、第2の拡張(REPプロ
セスと称されるプロセスを含み得る)は、7~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、11日に短縮される。
いくつかの実施形態では、REP及び/または第2の拡張は、以前に記載されたT-175フラスコ及びガス透過性バッグ(Tran,et al.,J.Immunother.2008,31,742-51、Dudley,et al.,J.Immunother.2003,26,332-42)またはガス透過性培養器具(G-REXフラスコ)を使用して行われ得る。いくつかの実施形態では、第2の拡張(急速拡張と称される拡張を含む)は、T-175フラスコ内で行われ、150mLの培地に懸濁された約1×10個のTILが、各T-175フラスコに添加され得る。TILは、3000IU/mLのIL-2及び30ng/mLの抗CD3を補充した、1:1のCMとAIM-V培地との混合物中で培養され得る。T-175フラスコを、5% CO中37℃でインキュベートすることができる。培地の半分が、3000IU/mLのIL-2を含む50/50培地を使用して5日目に交換され得る。いくつかの実施形態では、7日目に、2つのT-175フラスコからの細胞が3Lバッグ内で組み合わせられ得、5%ヒトAB血清及び3000IU/mLのIL-2を含む300mLのAIM Vが、300mLのTIL懸濁液に添加された。各バッグ内の細胞の数を、毎日または隔日カウントし、新鮮な培地を添加して、0.5~2.0×10細胞/mLの間の細胞数を維持した。
いくつかの実施形態では、第2の拡張(REPと称される拡張、ならびに図1または図8のステップDで参照される拡張を含み得る)は、100cmのガス透過性シリコン底部(G-REX-100、Wilson Wolf Manufacturing Corporation,New Brighton,MN,USAから市販されている)を有する500mL容量のガス透過性フラスコ内で行われ得る。5×10または10×10TILは、5%ヒトAB血清、3000IU/mLのIL-2、及び30ng/mLの抗CD3(OKT3)を補充した400mLの50/50培地中、PBMCで培養され得る。G-REX-100フラスコを、5% CO中37℃でインキュベートすることができる。5日目に、250mLの上清が除去され、遠心分離ボトルに入れられ、1500rpm(491×g)で10分間遠心分離される。TILペレットが、5%ヒトAB血清、3000IU/mLのIL-2を含む150mLの新鮮な培地で再懸濁され、元のG-REX-100フラスコに戻し追加され得る。TILがG-REX-100フラスコ内で連続的に拡張される場合、7日目に、各G-REX-100内のTILが、各フラスコに存在する300mLの培地に懸濁され得、細胞懸濁液が3つの100mLアリコートに分割され得、それを使用して、3つのG-REX-100フラスコに播種することができる。その後、5%ヒトAB血清及び3000IU/mLのIL-2を含む150mLのAIM-Vが各フラスコに添加され得る。G-REX-100フラスコが5% CO中37℃でインキュベートされ得、4日後に、3000IU/mLのIL-2を含む150mLのAIM-Vが、各G-REX-100フラスコに添加され得る。培養14日目に、細胞が採取され得る。
いくつかの実施形態では、第2の拡張(REPと称される拡張を含む)は、バルクTILが150mLの培地中の100倍または200倍過剰の不活性化フィーダー細胞、30mg/mLのOKT3抗CD3抗体、及び3000IU/mLのIL-2と混合されているフラスコで行われる。いくつかの実施形態では、培地交換は、細胞が代替の成長チャンバに移されるまで行われる。いくつかの実施形態では、培地の3分の2が、新鮮な培地と呼吸によって交換される。いくつかの実施形態では、代替の成長チャンバには、以下でより完全に考察されるように、G-REXフラスコ及びガス透過性容器が含まれる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張(REPと称される増殖を含む)が行われ、優れた腫瘍反応性のためにTILが選択されるステップをさらに含む。当該技術分野で知られ
ている任意の選択方法が使用され得る。例えば、米国特許出願公開第2016/0010058A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている方法が、優れた腫瘍反応性のためのTILの選択に使用され得る。
任意選択で、細胞生存率アッセイは、当該技術分野で知られている標準的なアッセイを使用して、第2の拡張(REP拡張と称される拡張を含む)後に行われ得る。例えば、死細胞を選択的に標識し、生存率の評価を可能にするトリパンブルー排除アッセイが、バルクTILの試料上で行われ得る。いくつかの実施形態では、TIL試料は、Cellometer K2自動セルカウンター(Nexcelom Bioscience,Lawrence,MA)を使用して計数され、生存率が決定され得る。いくつかの実施形態では、生存率は、標準のCellometer K2 Image Cytometer Automatic Cell Counterプロトコルに従って決定される。
いくつかの実施形態では、TILの第2の拡張(REPと称される拡張を含む)は、以前に記載されているT-175フラスコ及びガス透過性バッグ(Tran,et al.,2008,J Immunother.,31:742-751及びDudley,et al.2003,J Immunother.,26:332-342)またはガス透過性G-REXフラスコを使用して行われ得る。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、フラスコを使用して行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、ガス透過性G-REXフラスコを使用して行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、T-175フラスコ内で行われ、約1×10個のTILが約150mLの培地に懸濁され、これが各T-175フラスコに添加される。TILは、「フィーダー」細胞として1対100の比で放射線照射された(50Gy)同種異系PBMCと培養され、細胞が、3000IU/mLのIL-2及び30ng/mLの抗CD3を補充した、1:1のCMとAIM-V培地との混合物(50/50培地)中で培養された。T-175フラスコを、5%
CO中37℃でインキュベートする。いくつかの実施形態では、培地の半分が、3000IU/mLのIL-2を含む50/50培地を使用して5日目に交換される。いくつかの実施形態では、7日目に、2つのT-175フラスコからの細胞が3Lバッグ内で組み合わせられ、5%ヒトAB血清及び3000IU/mLのIL-2を含む300mLのAIM-Vが、300mLのTIL懸濁液に添加される。各バッグ内の細胞の数が毎日または隔日計数され得、新鮮な培地が添加されて、約0.5~約2.0×10細胞/mLの細胞数を維持することができる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張(REPと称される拡張を含む)は、100cmのガス透過性シリコン底部(G-REX-100、Wilson Wolf)を有する500mL容量のフラスコ内で行われ、約5×10または10×10TILが、3000IU/mLのIL-2及び30ng/mLの抗CD3を補充した、400mLの50/50培地中、1対100の比で放射線照射された同種異系PBMCと培養される。G-REX-100フラスコを、5% CO中37℃でインキュベートする。いくつかの実施形態では、5日目に、250mLの上清を除去し、遠心分離ボトルに入れ、1500rpm(491g)で10分間遠心分離する。その後、TILペレットが、3000IU/mLのIL-2を含む150mLの新鮮な50/50培地に再懸濁され、元のG-REX-100フラスコに戻し追加され得る。TILがG-REX-100フラスコ内で連続的に拡張される実施形態では、7日目に、各G-REX-100内のTILを、各フラスコ内に存在する300mLの培地に懸濁し、細胞懸濁液を3つの100mLアリコートに分割し、それを使用して3つのG-REX-100フラスコに播種する。その後、5%ヒトAB血清及び3000IU/mLのIL-2を含む150mLのAIM-Vが各フラスコに添加される。G-REX-100フラスコが5% CO中37℃でインキュベートされ、4日後に、3000IU/mLのIL-2を含む150mLのAIM-Vが、各G-REX-100フラスコに添加される。培養14日目に、細胞が採取される。
Tリンパ球及びBリンパ球の多様な抗原受容体は、限られた数であるが、多数の遺伝子セグメントの体細胞組換えによって産生される。これらの遺伝子セグメント:V(可変)、D(多様性)、J(接合)、及びC(一定)は、免疫グロブリン及びT細胞受容体(TCR)の結合特異性及び下流での適用を決定する。本発明は、T細胞レパートリー多様性を示し、かつ増加させるTILを生成するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、第2の拡張において取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、多様性の増加は、免疫グロブリン多様性及び/またはT細胞受容体多様性の増加である。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン重鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン軽鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、T細胞受容体にある。いくつかの実施形態では、多様性は、アルファ、ベータ、ガンマ、及びデルタ受容体からなる群から選択されるT細胞受容体のうちの1つにある。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファ及び/またはベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)ベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、TCRab(すなわち、TCRα/β)の発現が増加する。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地と称されることもある)は、以下でさらに詳細に考察されるように、IL-2、OKT-3、ならびに抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される拡張プロセスで使用される培地は、無血清培地または合成培地である。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、血清含有培地のロット間の変動に部分的に起因する実験変動を防止及び/または減少させるために使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地には、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal
Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CTS(商標)AIM-V
SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、血清サプリメントまたは血清代替物には、CTS(商標)OpTmizer T-Cell Expansion Serum Supplement、CTS(商標)Immune Cell Serum Replacement、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代用物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代用物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代用物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の抗生物質、及び1つ以上の微量元素のうちの1つ以上が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-
バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/または2-メルカプトエタノールをさらに含む。
いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Immune Cell Serum Replacementは、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CST(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地を含むが、これらに限定されない、従来の成長培地とともに使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地中の総血清代替物濃度(vol%)は、総無血清または合成培地の約1体積%、2体積%、3体積%、4体積%、5体積%、6体積%、7体積%、8体積%、9体積%、10体積%、11体積%、12体積%、13体積%、14体積%、15体積%、16体積%、17体積%、18体積%、19体積%、または20体積%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約3%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約5%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約10%である。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion
SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されており、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientif
ic)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune
Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher
Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形
態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum
Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されており、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約0.1mM~約10mM、0.5mM~約9mM、1mM~約8mM、2mM~約7mM、3mM~約6mM、または4mM~約5mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約2mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約5mM~約150mM、10mM~約140mM、15mM~約130mM、20mM~約120mM、25mM~約110mM、30mM~約100mM、35mM~約95mM、40mM~約90mM、45mM~約85mM、50mM~約80mM、55mM~約75mM、60mM~約70mM、または約65mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約55mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、参照により本明細書に組み込まれる国際PCT公開第WO/1998/030679号に記載されている合成培地は、本発明において有用である。その刊行物には、無血清真核細胞培養培地が記載されている。無血清真核細胞培養培地には、無血清培養下で細胞の成長を支持することができる無血清サプリメントを補充した基礎細胞培養培地が含まれる。無血清真核細胞培養培地サプリメントは、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代替物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の微量元素、及び1つ以上の抗生物質からなる群から選択される1つ以上の成分を含むか、またはそれらを組み合わせることによって取得される。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/またはベータ-メルカプトエタノールをさらに含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンまたはアルブミン代替物と、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、及び1つ以上の微量元素からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地は、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αME
M)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、合成培地中のグリシンの濃度は、約5~200mg/Lの範囲であり、L-ヒスチジンの濃度は、約5~250mg/Lであり、L-イソロイシンの濃度は、約5~300mg/Lであり、L-メチオニンの濃度は、約5~200mg/Lであり、L-フェニルアラニンの濃度は、約5~400mg/Lであり、L-プロリンの濃度は、約1~1000mg/Lであり、L-ヒドロキシプロリンの濃度は、約1~45mg/Lであり、L-セリンの濃度は、約1~250mg/Lであり、L-スレオニンの濃度は、約10~500mg/Lであり、L-トリプトファンの濃度は、約2~110mg/Lであり、L-チロシンの濃度は、約3~175mg/Lであり、L-バリンの濃度は、約5~500mg/Lであり、チアミンの濃度は、約1~20mg/Lであり、還元型グルタチオンの濃度は、約1~20mg/Lであり、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩の濃度は、約1~200mg/Lであり、鉄飽和トランスフェリンの濃度は、約1~50mg/Lであり、インスリンの濃度は、約1~100mg/Lであり、亜セレン酸ナトリウムの濃度は、約0.000001~0.0001mg/Lであり、アルブミン(例えば、AlbuMAX(登録商標)I)の濃度は、約5000~50,000mg/Lである。
いくつかの実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地中の濃度範囲」という見出しの下の列にリストされた濃度範囲で存在する。他の実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされた最終濃度で存在する。他の実施形態では、合成培地は、無血清サプリメントを含む基礎細胞培地である。これらの実施形態のうちのいくつかでは、無血清サプリメントは、表4の「サプリメント中の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされたタイプ及び濃度の非微量部分成分を含む。
いくつかの実施形態では、合成培地の浸透圧は、約260~350mOsmolである。いくつかの実施形態では、浸透圧は、約280~310mOsmolである。いくつかの実施形態では、合成培地には、最大約3.7g/L、または約2.2g/Lの重炭酸ナトリウムが補充されている。合成培地には、L-グルタミン(最終濃度約2mM)、1つ以上の抗生物質、非必須アミノ酸(NEAA、最終濃度約100μM)、2-メルカプトエタノール(最終濃度約100μM)がさらに補充されていてもよい。
いくつかの実施形態では、Smith,et al.,Clin.Transl Immunology,4(1)2015(doi:10.1038/cti.2014.31)に記載の合成培地が、本発明において有用である。簡潔には、RPMIまたはCTS(商標)OpTmizer(商標)を基礎細胞培地として使用し、0、2%、5%、または10%のいずれかのCTS(商標)Immune Cell Serum Replacementを補充した。
いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、濾過されていない。濾過されていない細胞培地の使用は、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化することができる。いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、ベータ-メルカプトエタノール(BMEまたはβME、2-メルカプトエタノールとしても知られる、CAS60-24-2)を欠いている。
いくつかの実施形態では、第2の拡張、例えば、図1または図8によるステップDは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイ
オリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、G-REX-10またはG-REX-100である。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。
いくつかの実施形態では、急速なまたは第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX-100 MCS容器内での小規模培養で約3~7日間培養することによって急速なまたは第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養でのTILを、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX-500-MCS容器に移し、小規模培養由来のTILを、第2の容器内でのより大規模な培養で約4~7日間培養することとによって、培養のスケールアップを達成する。
いくつかの実施形態では、急速なまたは第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX100MCS容器内での第1の小規模培養で約3~7日間培養することによって急速なまたは第2の拡張を行うことと、その後、(b)第1の小規模培養由来のTILを、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたTILの一部が、第2の小規模培養で約4~7日間培養される。
いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、TILの複数の約2~5亜集団に配分される。
いくつかの実施形態では、急速なまたは第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX100MCS容器内での小規模培養で約3~7日間培養することによって急速なまたは第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来のTILを、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX-500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたTILの一部が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。
いくつかの実施形態では、急速なまたは第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX-100MCS容器内での小規模培養で約5日間培養することによって急速なまたは第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来のTILを、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX-500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたTILの一部が、より大規模な培養で約6日間培養される。
いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の分割時に、各第2の容器は、少なくとも10個のTILを含む。いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の分割時に、各第2の容器は、少なくとも10個のTIL、少なくとも10個のTIL、または少なくとも1010個のTILを含む。例示的な一実施形態では、各第2の容器は、少なくとも1010個のTILを含む。
いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の亜集団に配分される。
いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の約2~5亜集団に配分される。いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の約2、3、4、または5亜集団に配分される。
いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の完了後、複数の亜集団は、治療有効量のTILを含む。いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の完了後、1つ以上のTILの亜集団を一緒にプールして、治療有効量のTILを産生する。いくつかの実施形態では、急速拡張の完了後、TILの各亜集団は、治療有効量のTILを含む。
いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張は、複数のステップに分割される前に、約3~7日間行われる。いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の分裂は、急速または第2の拡張の開始後約3日目、4日目、5日目、6日目、または7日目に起こる。
いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の分裂は、第1の拡張(すなわち、REP前拡張)の開始後の約7日目、8日目、9日目、10日目、11日目、12日目、13日目、14日目、15日目、または16日目、17日目、または18日目に起こる。例示的な一実施形態では、急速または第2の拡張の分裂は、第1の拡張の開始後約16日目に起こる。
いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張は、分裂後約7~11日間、さらに行われる。いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張は、分裂後約5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日間、さらに行われる。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂後の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地と同じ成分を含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂後の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地とは異なる成分を含む。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、任意選択でOKT-3、及びさらに任意選択でAPCを含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及びさらに任意選択でAPCを含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、OKT-3及びAPCを含む。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、任意選択でOKT-3及びさらに任意選択でAPCを含む新鮮な培養培地で補充することによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、OKT-3及びAPCを含む新鮮な培養培地で補充することによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、任意選択でOKT-3及びさらに任意選択でAPCを含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、OKT-3及びAPCを含む新鮮な細胞培養培地で置き換えることによって生成される。
いくつかの実施形態では、分裂後の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、分裂後の急速
または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2及びOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、分裂後の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地を、IL-2及び任意選択でOKT-3を含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂後の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地を、IL-2及びOKT-3を含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。
いくつかの実施形態では、急速な膨張の分裂は、閉鎖系において起こる。
いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張中のTIL培養物のスケールアップは、新鮮な細胞培養培地をTIL培養物に添加すること(TILを供給することとも称される)を含む。いくつかの実施形態では、供給は、新鮮な細胞培養培地をTIL培養物に頻繁に添加することを含む。いくつかの実施形態では、供給は、新鮮な細胞培養培地をTIL培養物に一定の間隔で添加することを含む。いくつかの実施形態では、新鮮な細胞培養培地は、一定の流れを介してTILに供給される。いくつかの実施形態では、Xuri W25などの自動細胞拡張系は、急速な膨張及び供給のために使用される。
1.フィーダー細胞及び抗原提示細胞
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順(例えば、図1または図8のステップDに記載されるような拡張、ならびにREPと称されるものを含む)は、REP TIL拡張中及び/または第2の拡張中に過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、健康な献血者由来の標準の全血単位から得られる末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。
一般に、同種異系PBMCは、放射線照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、実施例に記載されるように、REP手順で使用され、これは、放射線照射された同種異系PBMCの複製無能力を評価するための例示的なプロトコルを提供する。
いくつかの実施形態では、14日目の生細胞の総数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数よりも少ない場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。
いくつかの実施形態では、7日目及び14日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された生細胞の総数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、7日目及び14日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された生細胞の総数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、5~60ng/mLのOKT3抗体及び1000~6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、10~50ng/mLのOKT3抗体及び2000~5000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、20~40ng/mL
のOKT3抗体及び2000~4000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、25~35ng/mLのOKT3抗体及び2500~3500IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、PBMCである。いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、人工抗原提示フィーダー細胞である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、約1:25、約1:50、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、1:50~1:300である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、1:100~1:200である。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約100×10TILの比を必要とする。他の実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約50×10TILの比を必要とする。さらに他の実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約25×10TILを必要とする。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、第2の拡張中に過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、健康な献血者由来の標準の全血単位から得られる末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。いくつかの実施形態では、人工抗原提示(aAPC)細胞がPBMCの代わりに使用される。
一般に、同種異系PBMCは、放射線照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、図及び実施例に記載される例示的な手順を含む、本明細書に記載のTIL拡張手順で使用される。
いくつかの実施形態では、人工抗原提示細胞は、PBMCの代替物として、またはPBMCと組み合わせて、第2の拡張において使用される。
2.サイトカイン及び他の添加物
本明細書に記載の拡張方法は、一般に、当該技術分野で知られているように、高用量のサイトカイン、特にIL-2を含む培養培地を使用する。
いくつかの実施形態では、TILの急速拡張及び/または第2の拡張のためにサイトカインの組み合わせを使用することは、米国特許出願公開第2017/0107490A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように、IL-2、IL-15及びIL-21のうちの2つ以上の組み合わせを用いて可能である。したがって、可能な組み合わせには、IL-2及びIL-15、IL-2及びIL-21、IL-15及びIL-21及びIL-2、またはIL-15及びIL-21が含まれる。サイトカインの組み合わせの使用は、リンパ球、特にそこに記載されているようにT細胞の生成に特に有利に働く。いくつかの実施形態では、IL-2は、低濃度、例えば、約10IU/mL、約20IU/mL、約30IU/mL、約40IU/mL、約50IU/mL、約100IU/mL、約200IU/mL、約300IU/mL、約400IU/mL、約500IU/mL、約600IU/mL、約700IU/mL、約800IU/mL、約900IU/mL、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、または
約4000IU/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-2は、約10~4000IU/mL、約100~3000IU/mL、約500~2000IU/ML、または約1000~1500IU/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-2は、約1000IU/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約1ng/mL、約2ng/mL、約3ng/mL、約4ng/mL、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約30ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、または約100ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約10ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-21は、約1ng/mL、約2ng/mL、約3ng/mL、約4ng/mL、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約30ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約150ng/mL、約200ng/mL、約250ng/mL、または約300ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約10ng/mLで添加され、IL-21は、約30ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15及びIL-21のうちの1つ以上は、ステップB中、例えば、ステップBのD0及びD3、D0及びD4、D0及びD5、D0及びD6、D0及びD7、D0及びD8に2回添加される。
いくつかの実施形態では、ステップDはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、OKT-3抗体またはムロモナブの、培養培地への添加を含み得る。いくつかの実施形態では、ステップDはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、4-1BBアゴニストの、培養培地への添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、ステップDはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、OX-40アゴニストの、培養培地への添加を含み得る。加えて、チアゾリジンジオン化合物などの増殖因子活性化受容体(PPAR)-ガンマアゴニストを含む、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体ガンマコアクチベーターI-アルファアゴニストなどの添加剤は、米国特許出願公開第2019/0307796 A1号(この開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるように、ステップD中の培養培地で使用されてもよい。
いくつかの実施形態では、ステップDはまた、培養培地中のタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤(AKTi)の添加を含み得る。いくつかの実施形態では、TIL集団は、AKT阻害剤を含む培地中で培養され、CD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得する。いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、ホノキオール、及びそれらの薬学的に許容される塩からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブである。いくつかの実施形態では、TIL集団を、約0.1μM、約0.2μM、約0.3μM、約0.4μM、約0.5μM、約0.6μM、約0.7μM、約0.8μM、約0.9μM、約1μM、約1.1μM、約1.2μM、約1.3μM、約1.4μM、約1.5μM、約1.6μM、約1.7μM、約1.8μM、約1.9μM、約2μM、約2.1μM、約2.2μM、約2.3μM、約2.4μM、約2.5μM、約2.6μM、約2.7μM、約2.8μM、約2.9μM、約3μM、約3.5μM、約4μM、約4.5μM、約5μM、約6μM、約7μM、約8μM、約9μM、約10μM、約20μM、約30μM、約40μM、約50μM、約60μM、約70μM、約80μM、約90μM、または約100μMのAKT阻害剤を含む培地中で培養する。
いくつかの実施形態では、IL-15は、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7
.5ng/mL、約10ng/mL、約12.5ng/mL、約15ng/mL、または約20ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約10ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-21は、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約45ng/mL、約50ng/mL、約55ng/mL、または約60ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-21は、約30ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約10ng/mLで添加され、IL-21は、約30ng/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、CD40アゴニスト、例えば、CD40Lまたは抗CD40アゴニスト抗体の添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、CD40Lが添加される。いくつかの実施形態では、抗CD40アゴニスト抗体が添加される。いくつかの実施形態では、CD40アゴニストは、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約45ng/mL、約50ng/mL、約55ng/mL、または約60ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、CD40アゴニストは、約30ng/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、IFNγの添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、IFNγが添加される。いくつかの実施形態では、IFNγは、約50ng/mL、約55ng/mL、約60ng/mL、約65ng/mL、約70ng/mL、約75ng/mL、約80ng/mL、約85ng/mL、約90ng/mL、約95ng/mL、約100ng/mL、約105ng/mL、約110ng/mL、約115ng/mL、約120ng/mL、約125ng/mL、約130ng/mL、約135ng/mL、約140ng/mL、約145ng/mL、約150ng/mL、約155ng/mL、約160ng/mL、約165ng/mL、約170ng/mL、約175ng/mL、約180ng/mL、約185ng/mL、約190ng/mL、約195ng/mL、約200ng/mL、約205ng/mL、約210ng/mL、約215ng/mL、約220ng/mL、約225ng/mL、約230ng/mL、約235ng/mL、約240ng/mL、約245ng/mL、約250ng/mL、約255ng/mL、約260ng/mL、約265ng/mL、約270ng/mL、約275ng/mL、約280ng/mL、約285ng/mL、約290ng/mL、約295ng/mL、または約300ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IFNγは、約200ng/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、抗PD-1抗体の添加を含み得る。いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、約5μg/mL、約10μg/mL、約15μg/mL、約20μg/mL、約25μg/mL、約30μg/mL、約35μg/mL、約40μg/mL、約45μg/mL、約50μg/mL、約55μg/mL、または約60μg/mLで添加される。いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、約10μg/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、抗CTLA-4抗体の添加を含み得る。いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、約5μg/mL、約10μg/mL、約15μg/mL、約20μg/mL、約25μg/mL、約30μg/mL、約35μg/mL、約40μg/mL、約45μg/mL、約50μg/mL、約55μg/mL、または約60μg/mLで添加される。いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、約10μg/mLで添加される。
E.ステップE:TILを採取する
第2の拡張ステップ後、細胞が採取され得る。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、図1または図8に提供されるように、1、2、3、4つ、またはそれ以上の拡張ステップ後に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、図1または図8に提供されるように、2つの拡張ステップ後に採取される。
TILは、例えば、遠心分離を含む、任意の適切な滅菌様式で採取され得る。TILを採取するための方法は、当該技術分野で周知であり、いずれかのかかる既知の方法が本プロセスで用いられ得る。いくつかの実施形態では、TILは、自動化系を使用して採取される。
細胞採取機及び/または細胞処理系は、例えば、Fresenius Kabi、Tomtec Life Science、Perkin Elmer、及びInotech
Biosystems International,Incを含む、様々な供給源から市販されている。任意の細胞ベースの採取機が本方法とともに用いられ得る。いくつかの実施形態では、細胞採取機及び/または細胞処理系は、膜ベースの細胞採取機である。いくつかの実施形態では、細胞採取は、LOVO系(Fresenius Kabiによって製造されたもの)などの細胞処理系によるものである。「LOVO細胞処理系」という用語は、細胞を含む溶液を、滅菌及び/または閉鎖系環境で回転膜または回転フィルターなどの膜またはフィルターをとおしてポンプ輸送し、連続フローを可能にし、細胞を処理して、ペレット化せずに上清または細胞培養培地を除去する、任意のベンダーによって製造された任意の機器または装置も指す。いくつかの実施形態では、細胞採取機及び/または細胞処理系は、滅菌閉鎖系内で、細胞分離、洗浄、流体交換、濃縮、及び/または他の細胞処理ステップを行うことができる。
いくつかの実施形態では、採取、例えば、図1または図8によるステップEは、閉鎖系バイオリアクターから行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、G-REX-10またはG-REX-100である。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。
いくつかの実施形態では、図1または図8によるステップEは、本明細書に記載のプロセスに従って行われる。いくつかの実施形態では、閉鎖系は、閉鎖系の無菌性及び閉鎖性を維持するために、滅菌条件下でシリンジを介してアクセスされる。いくつかの実施形態では、実施例に記載の閉鎖系が用いられる。
いくつかの実施形態では、TILは、実施例に記載の方法に従って採取される。いくつかの実施形態では、1日目~11日目の間のTILは、実施例における11日目のTIL採取のような、本明細書で言及されるステップにおいて記載される方法を使用して採取される。いくつかの実施形態では、12日目~24日目の間のTILは、実施例における22日目のTIL採取のような、本明細書で言及されるステップにおいて記載される方法を使用して採取される。いくつかの実施形態では、本発明は、(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)TILの組み合わせについて、本明細書に記載の採取ステップに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を評価または選別することを提供する。(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせであるTILを選別するための方法は、米国出願第2019/0212332号(これは参照により本明細書に組み込まれる)に見出すことができる。いくつかの実施形態では、細胞選別は、Zhang,X et.al.,Surface Free Energy Activated High-Throughput
Cell Sorting,Analytical Chemistry(2014),86:9350-9355(これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に記載される方法を使用して行われる。実施例15及び図35は、本発明の方法での使用に好適な選別プロトコルの追加の例示を提供する。
F.ステップF:最終製剤及び輸液容器への移行
図1または図8に例示的な順序で提供され、かつ上及び本明細書で詳細に概説されるステップA~Eが完了した後、細胞は、注入バッグまたは無菌バイアルなどの患者への投与に使用するために容器に移される。いくつかの実施形態では、治療的に十分な数のTILが上記の拡張方法を使用して得られると、それらは、患者への投与に使用するために容器に移される。
いくつかの実施形態では、本開示のAPCを使用して拡張されたTILは、薬学的組成物として患者に投与される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、滅菌緩衝液中のTIL懸濁液である。本開示のPBMCを使用して拡張されたTILは、当該技術分野で知られている任意の好適な経路によって投与され得る。いくつかの実施形態では、T細胞は、単回の動脈内または静脈内注入として投与され、これは、好ましくは、およそ30~60分続く。他の好適な投与経路には、腹腔内、髄腔内、及びリンパ内投与が含まれる。
いくつかの実施形態では、本発明は、(a)選別ステップ(i)の前に、腫瘍断片または試料中のバルクTIL、または第1のTIL集団が、IL-2及び任意選択で腫瘍断片または試料から出るTILを産生するための抗生物質の第1の組み合わせを含有する細胞培養培地中で培養され、(ii)腫瘍断片または試料から出る少なくとも複数のTILが、腫瘍断片または試料から分離して、腫瘍断片または試料、腫瘍断片または試料中に残存するTIL、及び腫瘍断片または試料から出て、分離後に残存する任意のTILの混合物を産生し、(iii)腫瘍断片または試料、腫瘍断片または試料中に残存するTIL、及び腫瘍断片または試料から出て、分離後に残存する任意のTILの混合物を消化して、かかる混合物の消化物を産生し、(b)混合物の消化物を選別して、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を産生し、(b)第1の拡張を、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を使用して行うように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載される方法を提供する。いくつかの実施形態では、腫瘍断片または試料から出るTILの少なくとも約1%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%以上が、腫瘍断片または試料から分離されて、混合物を産生する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1の拡張前の培養ステップが、約1日~約3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1の拡張前の培養ステップが、約1、2、3、4、5、6または7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、(a)消化、選別、刺激、及び第1の拡張ステップが、(i)腫瘍断片または試料中のバルクTIL、または第1のTIL集団を、IL-2を含有する細胞培養培地中で培養して、腫瘍断片または試料から出るTILを産生することと、(ii)腫瘍断片または試料から出る少なくとも複数のTILを腫瘍断片または試料から分離して、腫瘍断片または試料、腫瘍断片または試料中に残存するTIL、及び腫瘍断片または試料から出て、分離後に残存する任意のTILの混合物を産生することと
、(iii)腫瘍断片または試料、腫瘍断片または試料中に残存するTIL、及び腫瘍断片または試料から出て、分離後に残存する任意のTILの混合物を消化して、かかる混合物の消化物を産生することと、(任意選択で、(iv)混合物の消化物を選別して、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を産生する)を含み、(b)第2の拡張が、選別されたTIL集団で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載される方法を提供する。いくつかの実施形態では、腫瘍断片または試料から出るTILの少なくとも約1%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%以上が、腫瘍断片または試料から分離されて、混合物を産生する。
IV.Gen3 TIL製造プロセス
いかなる特定の理論にも限定されることなく、本発明の方法に記載される、T細胞の活性化をプライミングする、プライミングによる第1の拡張と、それに続くT細胞の活性化を促進する急速な第2の拡張により、「より若い」表現型を保持する拡張されたT細胞の調製が可能になると考えられ、したがって、本発明の拡張されたT細胞が、他の方法によって拡張されたT細胞よりも高いがん細胞に対する細胞傷害性を示すことが予想される。特に、本発明の方法によって教示される、抗CD3抗体(例えば、OKT-3)、IL-2、及び任意選択で抗原提示細胞(APC)への曝露によってプライミングされ、その後、追加の抗CD-3抗体(例えば、OKT-3)、IL-2、及びAPCへのその後の曝露によって促進されるT細胞の活性化が、培養下でT細胞の成熟を限定または回避し、成熟度の低い表現型を有するT細胞集団を産生し、これらのT細胞が、培養下での拡張によってあまり疲弊せず、より高いがん細胞に対する細胞傷害性を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)T細胞を、第1の容器、例えば、G-REX-100 MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養でのT細胞を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX-500 MCS容器に移し、小規模培養由来のT細胞を、第2の容器内でのより大規模な培養で約4~7日間培養することとによって、培養のスケールアップを達成する。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)T細胞を、第1の容器、例えば、G-REX-100 MCS容器内での第1の小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)第1の小規模培養由来のT細胞を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたT細胞の一部が、第2の小規模培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)T細胞を、第1の容器、例えば、G-REX-100
MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来のT細胞を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX-500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたT細胞の一部が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)T細胞を、第1の容器、例えば、G-REX-100 MCS容器内での小規模培養で約4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来のT細胞を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX-500 MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各
第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたT細胞の一部が、より大規模な培養で約5日間培養される。
いくつかの実施形態では、急速拡張の分割時に、各第2の容器は、少なくとも10個のTILを含む。いくつかの実施形態では、急速拡張の分割時に、各第2の容器は、少なくとも10個のTIL、少なくとも10個のTIL、または少なくとも1010個のTILを含む。例示的な一実施形態では、各第2の容器は、少なくとも1010個のTILを含む。
いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の亜集団に配分される。いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の約2~5亜集団に配分される。いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の約2、3、4、または5亜集団に配分される。
いくつかの実施形態では、急速拡張の完了後、複数の亜集団は、治療有効量のTILを含む。いくつかの実施形態では、急速拡張の完了後、1つ以上のTILの亜集団を一緒にプールして、治療有効量のTILを産生する。いくつかの実施形態では、急速拡張の完了後、TILの各亜集団は、治療有効量のTILを含む。
いくつかの実施形態では、急速拡張は、複数のステップに分割される前に、約1~5日間行われる。いくつかの実施形態では、急速拡張の分裂は、急速拡張の開始後約1日目、2日目、3日目、4日目、または5日目に起こる。
いくつかの実施形態では、急速拡張の分裂は、第1の拡張(すなわち、REP前拡張)の開始後約8日目、9日目、10日目、11日目、12日目、または13日目に起こる。例示的な一実施形態では、急速拡張の分裂は、プライミングによる第1の拡張の開始後約10日目に起こる。例示的な一実施形態では、急速拡張の分裂は、第1の拡張の開始後約11日目に起こる。
いくつかの実施形態では、急速拡張は、分裂後約4~11日間、さらに行われる。いくつかの実施形態では、急速拡張は、分裂後約3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日間、さらに行われる。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、分裂後の急速拡張に使用される細胞培養培地と同じ成分を含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、分裂後の急速拡張に使用される細胞培養培地とは異なる成分を含む。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、任意選択でOKT-3、及びさらに任意選択でAPCを含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及びさらに任意選択でAPCを含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、OKT-3及びAPCを含む。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、任意選択でOKT-3及びさらに任意選択でAPCを含む新鮮な培養培地で補充することによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、OKT-3及びAPCを含む新鮮な培養培地で補充することによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培
養培地を、IL-2、任意選択でOKT-3及びさらに任意選択でAPCを含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、OKT-3及びAPCを含む新鮮な細胞培養培地で置き換えることによって生成される。
いくつかの実施形態では、分裂後の急速拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、分裂後の急速拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2及びOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、分裂後の急速拡張に使用される細胞培養培地は、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地を、IL-2及び任意選択でOKT-3を含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂後の急速拡張に使用される細胞培養培地は、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地を、IL-2及びOKT-3を含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。
いくつかの実施形態では、急速な膨張の分裂は、閉鎖系において起こる。
いくつかの実施形態では、急速拡張中のTIL培養物のスケールアップは、新鮮な細胞培養培地をTIL培養物に添加すること(TILを供給することとも称される)を含む。いくつかの実施形態では、供給は、新鮮な細胞培養培地をTIL培養物に頻繁に添加することを含む。いくつかの実施形態では、供給は、新鮮な細胞培養培地をTIL培養物に一定の間隔で添加することを含む。いくつかの実施形態では、新鮮な細胞培養培地は、一定の流れを介してTILに供給される。いくつかの実施形態では、Xuri W25などの自動細胞拡張系は、急速な膨張及び供給のために使用される。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が減少、軽減、衰退、または沈静化し始めた後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が、正確にまたは約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が、正確にまたは約1%~100%の範囲のパーセンテージ減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が、正確にまたは約1%~10%、10%~20%、20%~30%、30%~40%、40%~50%、50%~60%、60%~70%、70%~80%、80%~90%、または90%~100%の範囲のパーセンテージ減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によっ
てもたらされるT細胞の活性化が、少なくとも正確にまたは約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99%減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が、最大で正確にまたは約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化の減少は、抗原による刺激に応答してT細胞によって放出されるインターフェロンガンマの量の減少によって決定される。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、最大で正確にまたは約7日または約8日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、最大で正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞の急速な第2の拡張は、最大で正確にまたは約11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞の急速な第2の拡張は、最大で正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞の急速な第2の拡張は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約7日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、最大で正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日の期間中に行われ、T細
胞の急速な第2の拡張は、最大で正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約8日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約9日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、8日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、9日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約7日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約9日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、7日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、9日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)である。
いくつかの実施形態では、T細胞は、骨髄浸潤リンパ球(MIL)である。
いくつかの実施形態では、T細胞は、末梢血リンパ球(PBL)である。
いくつかの実施形態では、T細胞は、がんに罹患しているドナーから取得される。
いくつかの実施形態では、T細胞は、がんに罹患している患者から切除された腫瘍から取得されたTILである。
いくつかの実施形態では、T細胞は、血液系悪性腫瘍に罹患している患者の骨髄から取得されたMILである。
いくつかの実施形態では、T細胞は、ドナー由来の末梢血単核細胞(PBMC)から取得されたPBLである。いくつかの実施形態では、ドナーは、がんに罹患している。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫、卵巣癌、子宮内膜癌、甲状腺癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭腫ウイルスによって引き起こされたがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択されるがんである。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭腫ウイルスによって引き起こされたがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、ドナーは、腫瘍に罹患している。いくつかの実施形態では、腫瘍は、液体腫瘍である。いくつかの実施形態では、腫瘍は、固形腫瘍である。いくつかの実施形態では、ドナーは、血液系悪性腫瘍に罹患している。
本開示の特定の態様では、免疫エフェクター細胞、例えば、T細胞は、FICOLL分離などの当業者に知られている任意の数の技法を使用して対象から収集された血液の単位から得ることができる。好ましい一態様では、個体の循環血液由来の細胞は、アフェレーシスによって取得される。アフェレーシス産物は、典型的には、リンパ球、例えば、T細胞、単球、顆粒球、B細胞、他の有核白血球、赤血球、血小板を含む。一態様では、アフ
ェレーシスによって収集された細胞が洗浄されて、血漿画分が除去され、任意選択で、その後の処理ステップのために細胞を適切な緩衝液または培地に入れられ得る。いくつかの実施形態では、細胞は、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で洗浄される。代替の実施形態では、洗浄溶液は、カルシウムを欠き、マグネシウムを欠き得るか、またはすべてではないが多くの二価カチオンを欠き得る。一態様では、T細胞は、赤血球を溶解し、かつ単球を枯渇させることによって、例えば、PERCOLL勾配による遠心分離によって、または対向流遠心溶出法によって末梢血リンパ球から単離される。
いくつかの実施形態では、T細胞は、ドナー由来のリンパ球が濃縮された全血またはアフェレーシス産物から分離されたPBLである。いくつかの実施形態では、ドナーは、がんに罹患している。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫、卵巣癌、子宮内膜癌、甲状腺癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭腫ウイルスによって引き起こされたがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択されるがんである。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭腫ウイルスによって引き起こされたがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、ドナーは、腫瘍に罹患している。いくつかの実施形態では、腫瘍は、液体腫瘍である。いくつかの実施形態では、腫瘍は、固形腫瘍である。いくつかの実施形態では、ドナーは、血液系悪性腫瘍に罹患している。いくつかの実施形態では、PBLは、正または負の選択法を使用することによって、すなわち、T細胞表現型について、マーカー(複数可)、例えば、CD3+CD45+を使用してPBLを除去することによって、または非T細胞表現型細胞を除去してPBLを残すことによって、リンパ球が濃縮された全血またはアフェレーシス産物から単離される。他の実施形態では、PBLは、勾配遠心分離によって単離される。ドナー組織からPBLを単離した時点で、PBLのプライミングによる第1の拡張は、本明細書に記載される方法のうちのいずれかのプライミングによる第1の拡張ステップに従って、プライミングによる第1の拡張培養下で好適な数の単離されたPBL(いくつかの実施形態では、およそ1×10PBL)を播種することによって開始され得る。
これらの特徴のうちのいくつかを含む、プロセス3として知られる(本明細書ではGen3とも称される)例示的なTILプロセスが、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C及び/または図8D及び図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示され、本発明のこの実施形態の、Gen2を超える利点のうちのいくつかが、図1、2、8、30、及び31(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に記載される。Gen3の実施形態は、図1、8、及び30(特に、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示される。プロセス2AまたはGen2またはGen2Aはまた、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる米国特許公開第2018/0280436号にも記載されている。Gen3プロセスはまた、国際特許公開第WO2020/096988号に記載されている。
本明細書で考察され、かつ一般に概説されるように、TILは、患者試料から採取され、本明細書に記載され、かつGen3と称されるTIL拡張プロセスを使用して患者に移植する前に、それらの数を拡張するように操作される。いくつかの実施形態では、TILは、以下で考察されるように、任意で遺伝子操作され得る。いくつかの実施形態では、TILは、拡張前または拡張後に凍結保存され得る。解凍した時点で、それらが再刺激されて、患者への注入前に代謝を高めることができる。
いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図において詳細に考察されるように、プライミングによる第1の拡張(本明細書において急速拡張前(REP前)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップBとして示されるプロセスを含む)は、1~8日に短縮され、急速な第2の拡張(本明細書において急速拡張プロトコル(REP)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップDとして示されるプロセスを含む)は、1~9日に短縮される。いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図において詳細に考察されるように、プライミングによる第1の拡張(本明細書において急速拡張前(REP前)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップBとして示されるプロセスを含む)は、1~8日に短縮され、急速な第2の拡張(本明細書において急速拡張プロトコル(REP)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップDとして示されるプロセスを含む)は、1~8日に短縮される。いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図において詳細に考察されるように、プライミングによる第1の拡張(本明細書において急速拡張前(REP前)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップBとして示されるプロセスを含む)は、1~7日に短縮され、急速な第2の拡張(本明細書において急速拡張プロトコル(REP)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップDとして示されるプロセスを含む)は、1~9日に短縮される。いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図において詳細に考察されるように、プライミングによる第1の拡張(本明細書において急速拡張前(REP前)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図1B及び/または図8C)においてステップBとして示されるプロセスを含む)は、1~7日に短縮され、急速な第2の拡張(本明細書において急速拡張プロトコル(REP)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップDとして示されるプロセスを含む)は、1~10日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップBとして記載される拡張)は、8日に短縮され、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップDに記載される拡張)は、7~9日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップBとして記載される拡張)は、8日間であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップDに記載される拡張)は、8~9日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップBとして記載される拡張)は、7日に短縮され、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及
び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップDに記載される拡張)は、7~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップBとして記載される拡張)は、8日に短縮され、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップDに記載される拡張)は、8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップBとして記載される拡張)は、8日間であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップDに記載される拡張)は、9日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップBとして記載される拡張)は、8日間であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップDに記載される拡張)は、10日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップBとして記載される拡張)は、7日間であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップDに記載される拡張)は、7~10日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップBとして記載される拡張)は、7日間であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップDに記載される拡張)は、8~10日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップBとして記載される拡張)は、7日間であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップDに記載される拡張)は、9~10日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップBとして記載される拡張)は、7日間であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)においてステップDに記載される拡張)は、7~9日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張と急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図1B及び/または図8C)においてステップB及びステップDとして記載される拡張)との組み合わせは、以下ならびに実施例及び図面において詳細に考察されるように、14~16日間である。特に、本発明のある特定の実施形態が、IL-2の存在下での抗CD3抗体、例えば、OKT-3への曝露、または少なくともIL-2及び抗CD3抗体、例えば、OKT-3の存在下での抗原への曝露によってTILが活性化される、プライミングによる第1の拡張ステップを含むと考えられる。ある特定の実施形態では
、上記のようにプライミングによる第1の拡張ステップで活性化されるTILは、第1のTIL集団であり、すなわち、一次細胞集団である。
以下の「ステップ」指定A、B、Cなどは、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)における非限定的な例を参照し、本明細書に記載のある特定の非限定的な実施形態を参照している。以下及び図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)におけるステップの順序は例示であり、ステップの任意の組み合わせまたは順序、ならびに追加のステップ、ステップの繰り返し、及び/またはステップの省略は、本出願及び本明細書に開示される方法によって企図される。
A.ステップA:患者の腫瘍試料を取得する
一般に、TILは、最初に患者の腫瘍試料(「一次TIL」)から、またはTIL様の特徴を有する末梢血リンパ球を含む末梢血リンパ球などの循環リンパ球から得られ、その後、本明細書に記載されるように、さらなる操作のためにより大きな集団に拡張され、任意選択で凍結保存され、任意選択でTILの健康の指標として表現型及び代謝パラメータについて評価される。
患者の腫瘍試料は、一般に、外科的切除、針生検、または腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を得るための他の手段により、当該技術分野で知られている方法を使用して得ることができる。一般に、腫瘍試料は、原発腫瘍、浸潤性腫瘍、または転移性腫瘍を含む、任意の固形腫瘍に由来し得る。腫瘍試料は、血液系悪性腫瘍から取得された腫瘍などの液体腫瘍であり得る。固形腫瘍は、乳癌、膵臓癌、前立腺癌、大腸癌、肺癌、脳癌、腎癌、胃癌、及び皮膚癌を含むが、これらに限定されない(扁平上皮癌、基底細胞癌、及び黒色腫を含むが、これらに限定されない)、任意の種類のがんであり得る。いくつかの実施形態では、がんは、子宮頸癌、頭頸部癌(例えば、頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBM)、胃腸癌、卵巣癌、肉腫、膵臓癌、膀胱癌、乳癌、トリプルネガティブ乳癌、及び非小細胞肺癌から選択される。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫である。いくつかの実施形態では、悪性黒色腫腫瘍が特に高レベルのTILを有することが報告されているため、有用なTILは、悪性黒色腫腫瘍から取得される。
取得された時点で、腫瘍試料は、一般に、鋭的解剖を使用して1~約8mmの小片に断片化され、約2~3mmが特に有用である。TILは、酵素腫瘍消化物を使用してこれらの断片から培養される。かかる腫瘍消化物は、酵素培地(例えば、Roswell Park Memorial Institute(RPMI)1640緩衝液、2mMグルタミン酸、10mcg/mLゲンタマイシン、30単位/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(例えば、組織解離機を使用する)によって産生され得る。腫瘍消化物は、腫瘍を酵素培地に入れ、腫瘍をおよそ1分間機械的に解離させ、続いて5% CO中37℃で30分間インキュベートし、続いて小さな組織片のみが存在するまで、前述の条件下で機械的解離及びインキュベーションのサイクルを繰り返すことによって産生することができる。このプロセスの最後に、細胞懸濁液中に多数の赤血球または死細胞が含まれている場合、FICOLL分岐親水性多糖類を使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。米国特許出願公開第2012/0244133A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているものなどの当該技術分野で知られている代替の方法を使用することができる。前述の方法のうちのいずれかが、TILを拡張する方法またはがんを治療する方法について本明細書に記載される実施形態のうちのいずれかにおいて使用され得る。
上に示されるように、いくつかの実施形態では、TILは、固形腫瘍に由来する。いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、断片化されない。いくつかの実施形態では、固形腫瘍は断片化されず、全腫瘍として酵素消化に供される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間、37℃、5%COで消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間、37℃、5%COで回転を伴って消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、37℃、5%COで一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、全腫瘍が酵素と組み合わされて、腫瘍消化反応混合物が形成される。
いくつかの実施形態では、腫瘍は、滅菌緩衝液中の凍結乾燥酵素で再構成される。いくつかの実施形態では、緩衝液は、滅菌HBSSである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、コラゲナーゼを含む。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼは、コラゲナーゼIVである。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼの作業ストックは、100mg/mLの10倍作業ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、DNAseを含む。いくつかの実施形態では、DNAseの作業ストックは、10,000IU/mLの10倍作業ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、ヒアルロニダーゼを含む。いくつかの実施形態では、ヒアルロニダーゼの作業ストックは、10mg/mLの10倍作業ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、10mg/mLのコラゲナーゼ、1000IU/mLのDNAse、及び1mg/mLのヒアルロニダーゼを含む。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、10mg/mLのコラゲナーゼ、500IU/mLのDNAse、及び1mg/mLのヒアルロニダーゼを含む。
一般に、腫瘍から取得された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに取得された」または「新たに単離された」細胞集団と呼ばれる。ある特定の実施形態では、新たに取得されたTIL細胞集団は、抗原提示細胞、IL-12、及びOKT-3を含む細胞培養培地に曝露される。
いくつかの実施形態では、断片化には、例えば、解剖及び消化を含む物理的断片化が含まれる。いくつかの実施形態では、断片化は、物理的断片化である。いくつかの実施形態では、断片化は、解剖である。いくつかの実施形態では、断片化は、消化によるものである。いくつかの実施形態では、TILは、最初に、患者から取得された酵素腫瘍消化物及び腫瘍断片から培養され得る。いくつかの実施形態では、TILは、最初に、患者から取得された酵素腫瘍消化物及び腫瘍断片から培養され得る。
腫瘍が固形腫瘍であるいくつかの実施形態では、腫瘍試料が、例えば、ステップA(図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に提供される)で取得された後
、腫瘍は物理的断片化を受ける。いくつかの実施形態では、断片化は、凍結保存前に起こる。いくつかの実施形態では、断片化は、凍結保存後に起こる。いくつかの実施形態では、断片化は、腫瘍を得た後に、いずれの凍結保存もない場合に起こる。いくつかの実施形態では、断片化ステップは、インビトロまたはエクスビボプロセスである。いくつかの実施形態では、腫瘍が断片化され、10、20、30、40個、またはそれ以上の断片または小片が、プライミングによる第1の拡張のために各容器に入れられる。いくつかの実施形態では、腫瘍が断片化され、30個または40個の断片または小片が、プライミングによる第1の拡張のために各容器に入れられる。いくつかの実施形態では、腫瘍が断片化され、40個の断片または小片が、プライミングによる第1の拡張のために各容器に入れられる。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約4~約50個の断片を含み、各断片は、約27mmの体積を有する。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1300mm~約1500mmの総体積を伴う約30~約60個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1350mmの総体積を伴う約50個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1グラム~約1.5グラムの総質量を伴う約50個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約4個の断片を含む。
いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍断片から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、鋭的解剖によって取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~10mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~8mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約2mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約3mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約4mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約5mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約6mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約7mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約8mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約9mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約10mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、1~4mm×1~4mm×1~4mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、1mm×1mm×1mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、2mm×2mm×2mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、3mm×3mm×3mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、4mm×4mm×4mmである。
いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の出血性、壊死性、及び/または脂肪性組織の量を最小限に抑えるために断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の出血性組織の量を最小限に抑えるために断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の壊死性組織の量を最小限に抑えるために断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の脂肪性組織の量を最小限に抑えるために断片化される。ある特定の実施形態では、腫瘍の断片化ステップは、インビトロまたはエクスビボ方法である。
いくつかの実施形態では、腫瘍の断片化は、腫瘍の内部構造を維持するために行われる。いくつかの実施形態では、腫瘍の断片化は、メスでのこ引き動作を行うことなく行われる。いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍消化物から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、例えば、RPMI1640(2mM GlutaMAX、10mg/mLゲンタマイシン、30U/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)であるが、これに限定されない酵素培地中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(GentleMACS,Miltenyi Biotec,Auburn,CA)によって生成された。腫瘍を酵素培地に入れた後、腫瘍は、およそ1分間機械的に解離され得る。その後、溶液が5%CO中37℃で30分間インキュベートされ、その後、およそ1分間再び機械的に破壊され得る。5% CO中37℃で30分間再びインキュベ
ートした後、腫瘍を、およそ1分間、3回目に機械的に破壊することができる。いくつかの実施形態では、大きい組織片が存在する場合、3回目の機械的破壊後、5%CO中37℃でさらに30分間インキュベートするかにかかわらず、1回または2回の追加の機械的解離が試料に適用された。いくつかの実施形態では、細胞懸濁液が多数の赤血球または死細胞を含む場合、最終インキュベーションの終わりに、Ficollを使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張ステップ前の細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに取得された」または「新たに単離された」細胞集団と呼ばれる。
いくつかの実施形態では、細胞は、試料単離後(例えば、腫瘍試料を得た後及び/または腫瘍試料から細胞懸濁液を得た後)、任意選択で凍結され得、ステップBに記載の拡張に入る前に凍結保存され得、これは以下でさらに詳細に説明されるとともに、図8(特に、例えば図8B)に例示される。
1.コア/小生検由来のTIL
いくつかの実施形態では、TILは、最初に、コア生検または同様の手順によって取得された患者腫瘍試料(「一次TIL」)から得られ、その後、本明細書に記載されるように、さらなる操作のためにより大きい集団に拡張され、任意で凍結保存され、任意で表現型及び代謝パラメータについて評価される。
いくつかの実施形態では、患者の腫瘍試料は、一般に、小生検、コア生検、針生検、または腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を得るための他の手段により、当該技術分野で知られている方法を使用して取得することができる。一般に、腫瘍試料は、原発腫瘍、浸潤性腫瘍、または転移性腫瘍を含む、任意の固形腫瘍に由来し得る。腫瘍試料は、血液系悪性腫瘍から取得された腫瘍などの液体腫瘍であり得る。いくつかの実施形態では、試料は、複数の小さい腫瘍試料または生検に由来し得る。いくつかの実施形態では、試料は、同じ患者由来の単一の腫瘍からの複数の腫瘍試料を含むことができる。いくつかの実施形態では、試料は、同じ患者由来の1、2、3、または4つの腫瘍からの複数の腫瘍試料を含むことができる。いくつかの実施形態では、試料は、同じ患者由来の複数の腫瘍からの複数の腫瘍試料を含むことができる。固形腫瘍は、肺癌及び/または非小細胞肺癌(NSCLC)であり得る。
一般に、腫瘍コアまたは断片から取得された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに取得された」または「新たに単離された」細胞集団と呼ばれる。ある特定の実施形態では、新たに取得されたTIL細胞集団は、抗原提示細胞、IL-2、及びOKT-3を含む細胞培養培地に曝露される。
いくつかの実施形態では、腫瘍が転移性であり、かつ原発性病変が過去に効率的に治療/除去された場合、転移性病変のうちの1つの除去が必要とされ得る。いくつかの実施形態では、最も侵襲性の低いアプローチは、皮膚病変、または利用可能な場合、首または腋窩領域のリンパ節を除去することである。いくつかの実施形態では、皮膚病変が除去されるか、またはその小生検が除去される。いくつかの実施形態では、リンパ節またはその小生検が除去される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、黒色腫である。いくつかの実施形態では、黒色腫の小生検は、ほくろまたはその一部を含む。
いくつかの実施形態では、小生検は、パンチ生検である。いくつかの実施形態では、パンチ生検は、皮膚に押し込まれた円形の刃で取得される。いくつかの実施形態では、パンチ生検は、疑わしいほくろの周りの皮膚に押し込まれた円形の刃で得られる。いくつかの
実施形態では、パンチ生検は、皮膚に押し込まれた円形の刃で得られ、丸い皮膚片が採取される。いくつかの実施形態では、小生検は、パンチ生検であり、腫瘍の丸い部分が採取される。
いくつかの実施形態では、小生検は、切除生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、切除生検であり、ほくろまたは増殖全体が除去される。いくつかの実施形態では、小生検は、切除生検であり、ほくろまたは増殖全体が、正常に見える皮膚の小縁とともに除去される。
いくつかの実施形態では、小生検は、切開生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、切開生検であり、ほくろまたは増殖の最も不規則な部分のみが採取される。いくつかの実施形態では、小生検は、切開生検であり、切開生検は、疑わしいほくろが非常に大きい場合など、他の技法を達成することができない場合に使用される。
いくつかの実施形態では、小生検は、肺生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、気管支鏡検査によって取得される。一般に、気管支鏡検査では、患者は麻酔をかけられ、小さい用具が鼻または口を通り、喉を下って気管支通路に入り、そこで小さい用具を使用していくらかの組織を採取する。気管支鏡検査によって腫瘍または成長に到達できないいくつかの実施形態では、経胸腔針生検が用いられ得る。一般に、経胸腔針生検の場合も、患者は麻酔をかけられ、針が皮膚をとおして疑わしい場所に直接挿入されて、小さい組織試料を採取する。いくつかの実施形態では、経胸壁針生検は、介入放射線医学(例えば、針をガイドするためのX線またはCT走査の使用)を必要とし得る。いくつかの実施形態では、小生検は、針生検によって取得される。いくつかの実施形態では、小生検は、超音波内視鏡検査によって得られる(例えば、照明を備えた内視鏡であり、口をとおして食道に配置される)。いくつかの実施形態では、小生検は、外科的に取得される。
いくつかの実施形態では、小生検は、頭頸部生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、切開生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、切開生検であり、小さい組織片が異常に見える領域から切り取られる。いくつかの実施形態では、異常な領域に容易にアクセスできる場合、試料は、入院することなく採取され得る。いくつかの実施形態では、腫瘍が口または喉のより深くにある場合、生検は、全身麻酔を用いて手術室で行われる必要があり得る。いくつかの実施形態では、小生検は、切除生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、全領域が除去される切除生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、細針吸引(FNA)である。いくつかの実施形態では、小生検は、細針吸引(FNA)であり、シリンジに取り付けられた非常に細い針を使用して、腫瘍または塊から細胞を抽出(吸引)する。いくつかの実施形態では、小生検は、パンチ生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、パンチ生検であり、パンチ鉗子を使用して、疑わしい領域の一片を採取する。
いくつかの実施形態では、小生検は、子宮頸部生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、膣鏡検査によって取得される。一般に、膣鏡検査は、拡大双眼鏡に取り付けられた照明付き拡大器具(膣鏡)の使用を採用し、その後、これを使用して、子宮頸部の表面の小さい切片を生検する。いくつかの実施形態では、小生検は、円錐切除/錐体生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、円錐切除/錐体生検であり、子宮頸部からより大きい組織片を採取するために外来手術が必要になる場合がある。いくつかの実施形態では、錐体生検は、診断の確認を助けることに加えて、錐体生検が初期治療となり得る。
「固形腫瘍」という用語は、通常、嚢胞または液体領域を含まない異常な組織塊を指す。固形腫瘍は、良性または悪性であり得る。「固形腫瘍癌」という用語は、悪性、腫瘍性、またはがん性の固形腫瘍を指す。固形腫瘍癌には、肺の癌が含まれる。いくつかの実施
形態では、がんは、黒色腫である。いくつかの実施形態では、がんは、非小細胞肺癌(NSCLC)である。固形腫瘍の組織構造には、実質(がん細胞)を含む相互依存的組織区画、及びがん細胞が分散しており、かつ支持微小環境を提供し得る支持間質細胞が含まれる。
いくつかの実施形態では、腫瘍由来の試料は、細針吸引物(FNA)、コア生検、小生検(例えば、パンチ生検を含む)として取得される。いくつかの実施形態では、試料は、最初にG-REX-10に入れられる。いくつかの実施形態では、1つまたは2つのコア生検及び/または小生検試料が存在する場合、試料は、最初にG-REX-10に入れられる。いくつかの実施形態では、3、4、5、6、8、9、または10個以上のコア生検及び/または小生検試料が存在する場合、試料は、最初にG-REX-100に入れられる。いくつかの実施形態では、3、4、5、6、8、9、または10個以上のコア生検及び/または小生検試料が存在する場合、試料は、最初にG-REX-500に入れられる。
FNAは、例えば、黒色腫を含む皮膚腫瘍から取得することができる。いくつかの実施形態では、FNAは、転移性黒色腫を有する患者からの皮膚腫瘍などの皮膚腫瘍から取得される。いくつかの事例では、黒色腫を有する患者は、外科的治療を以前に受けたことがある。
FNAは、例えば、NSCLCを含む肺腫瘍から得ることができる。いくつかの実施形態では、FNAは、非小細胞肺癌(NSCLC)を有する患者由来の肺腫瘍などの肺腫瘍から取得される。いくつかの事例では、NSCLCを有する患者は、外科的治療を以前に受けたことがある。
本明細書に記載のTILは、FNA試料から得られ得る。いくつかの事例では、FNA試料は、18ゲージ針~25ゲージ針の範囲の細いゲージ針を使用して、患者から得られるか、または単離される。細いゲージ針は、18ゲージ、19ゲージ、20ゲージ、21ゲージ、22ゲージ、23ゲージ、24ゲージ、または25ゲージであり得る。いくつかの実施形態では、患者由来のFNA試料は、少なくとも400,000個のTIL、例えば、400,000個のTIL、450,000個のTIL、500,000個のTIL、550,000個のTIL、600,000個のTIL、650,000個のTIL、700,000個のTIL、750,000個のTIL、800,000個のTIL、850,000個のTIL、900,000個のTIL、950,000個のTIL、またはそれ以上を含み得る。
いくつかの事例では、本明細書に記載のTILは、コア生検試料から取得される。いくつかの事例では、コア生検試料は、11ゲージ針~16ゲージ針の範囲の外科用または医療用針を使用して、患者から得られるか、または単離される。針は、11ゲージ、12ゲージ、13ゲージ、14ゲージ、15ゲージ、または16ゲージであり得る。いくつかの実施形態では、患者由来のコア生検試料は、少なくとも400,000個のTIL、例えば、400,000個のTIL、450,000個のTIL、500,000個のTIL、550,000個のTIL、600,000個のTIL、650,000個のTIL、700,000個のTIL、750,000個のTIL、800,000個のTIL、850,000個のTIL、900,000個のTIL、950,000個のTIL、またはそれ以上を含み得る。
一般に、採取された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに採取された」細胞集団と呼ばれる。
いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍消化物から得られない。いくつかの実施形態では、固形腫瘍コアは、断片化されない。
いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍消化物から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、例えば、RPMI1640(2mM GlutaMAX、10mg/mLゲンタマイシン、30U/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)であるが、これに限定されない酵素培地中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(GentleMACS,Miltenyi Biotec,Auburn,CA)によって生成された。腫瘍を酵素培地に入れた後、腫瘍は、およそ1分間機械的に解離され得る。その後、溶液が5%CO中37℃で30分間インキュベートされ、その後、およそ1分間再び機械的に破壊され得る。5% CO中37℃で30分間再びインキュベートした後、腫瘍を、およそ1分間、3回目に機械的に破壊することができる。いくつかの実施形態では、大きい組織片が存在する場合、3回目の機械的破壊後、5%CO中37℃でさらに30分間インキュベートするかにかかわらず、1回または2回の追加の機械的解離が試料に適用された。いくつかの実施形態では、細胞懸濁液が多数の赤血球または死細胞を含む場合、最終インキュベーションの終わりに、Ficollを使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を取得することは、多病変サンプリング法を含む。
腫瘍解離酵素混合物には、1つ以上の解離(消化)酵素、例えば、限定されないが、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはコラゲナーゼの種類を含む)、Accutase(商標)、Accumax(商標)、ヒアルロニダーゼ、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)、キモトリプシン、キモパパイン、トリプシン、カゼイナーゼ、エラスターゼ、パパイン、XIV型プロテアーゼ(プロナーゼ)、デオキシリボヌクレアーゼI(DNase)、トリプシン阻害剤、任意の他の解離酵素またはタンパク質分解酵素、及びそれらの任意の組み合わせが含まれ得る。
いくつかの実施形態では、解離酵素は、凍結乾燥酵素から再構成される。いくつかの実施形態では、凍結乾燥酵素は、ハンクス平衡塩溶液(HBSS)などの滅菌緩衝液の量で再構成される。
いくつかの事例では、コラゲナーゼ(アニマルフリー1型コラゲナーゼなど)を、10mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝液で再構成する。凍結乾燥ストック酵素は、2892PZ U/バイアルの濃度であり得る。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼは、5mL~15mLの緩衝液中で再構成される。いくつかの実施形態では、再構成後のコラゲナーゼストックは、約100PZ U/mL~約400PZ U/mLの範囲、例えば、約100PZ U/mL~約400PZ U/mL、約100PZ U/mL~約350PZ U/mL、約100PZ U/mL~約300PZ U/mL、約150PZ U/mL~約400PZ U/mL、約100PZ U/mL、約150PZ U/mL、約200PZ U/mL、約210PZ U/mL、約220PZ U/mL、約230PZ U/mL、約240PZ U/mL、約250PZ U/mL、約260PZ U/mL、約270PZ U/mL、約280PZ U/mL、約289.2PZ U/mL、約300PZ U/mL、約350PZ U/mL、または約400PZ U/mLである。
いくつかの実施形態では、中性プロテアーゼは、1mlの滅菌HBSSまたは別の緩衝液中で再構成される。凍結乾燥ストック酵素は、175DMCU/バイアルの濃度であり得る。いくつかの実施形態では、再構成後の中性プロテアーゼストックは、約100DM
C/mL~約400DMC/mLの範囲、例えば、約100DMC/mL~約400DMC/mL、約100DMC/mL~約350DMC/mL、約100DMC/mL~約300DMC/mL、約150DMC/mL~約400DMC/mL、約100DMC/mL、約110DMC/mL、約120DMC/mL、約130DMC/mL、約140DMC/mL、約150DMC/mL、約160DMC/mL、約170DMC/mL、約175DMC/mL、約180DMC/mL、約190DMC/mL、約200DMC/mL、約250DMC/mL、約300DMC/mL、約350DMC/mL、または約400DMC/mLである。
いくつかの実施形態では、DNAse Iは、1mlの滅菌HBSSまたは別の緩衝液中で再構成される。凍結乾燥したストック酵素は、4KU/バイアルの濃度であった。いくつかの実施形態では、再構成後のDNase Iストックは、約1KU/mL~10KU/mL、例えば、約1KU/mL、約2KU/mL、約3KU/mL、約4KU/mL、約5KU/mL、約6KU/mL、約7KU/mL、約8KU/mL、約9KU/mL、または約10KU/mLの範囲である。
いくつかの実施形態では、酵素のストックは変化する可能性があるため、凍結乾燥ストックの濃度を確認し、それに応じて消化カクテルに追加される酵素の最終量を修正する。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、約4.7mlの滅菌HBSS中に約10.2ulの中性プロテアーゼ(0.36DMC U/mL)、21.3ulのコラゲナーゼ(1.2PZ/mL)及び250ulのDNAse I(200U/mL)を含む。
2.胸水T細胞及びTIL
いくつかの実施形態では、試料は、胸腔内液試料である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセスによる拡張のためのT細胞またはTILの供給源は、胸腔内液試料である。いくつかの実施形態では、試料は、胸水由来試料である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセスによる拡張のためのTILの供給源は、胸水由来試料である。例えば、米国特許公開第2014/0295426号に記載されている方法を参照されたく、これはすべての目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、TILと思われる、及び/またはTILを含む任意の胸腔内液または胸水を利用することができる。かかる試料は、NSCLCもしくはSCLCなどの原発性または転移性肺癌に由来し得る。いくつかの実施形態では、試料は、別の臓器、例えば、乳房、卵巣、結腸、または前立腺に由来する二次転移性がん細胞であり得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用する試料は、胸膜浸出液である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用する試料は、胸膜漏出液である。他の生体試料は、例えば、腹部からの腹水または膵嚢胞液を含む、TILを含有する他の漿液を含み得る。腹水及び胸腔内液は、非常に類似した化学系を伴い、腹部及び肺の両方が、悪性腫瘍における同じ物質の胸膜空間及び腹部空間に中皮線及び流体形態を有し、いくつかの実施形態では、かかる流体は、TILを含有する。本開示が胸水を例示するいくつかの実施形態では、同じ方法が、胸腔内液またはTILを含有する他の嚢胞液を使用して同様の結果で実行されてもよい。
いくつかの実施形態では、胸腔内液は、患者から直接除去された未処理の形態である。いくつかの実施形態では、未処理の胸腔内液は、接触ステップの前に、EDTAまたはヘパリンチューブなどの標準的な採血管に入れられる。いくつかの実施形態では、未処理の胸腔内液は、接触ステップの前に、標準的なCellSave(登録商標)チューブ(Veridex)に入れられる。いくつかの実施形態では、試料は、生存TILの数の減少を避けるために、患者から採取した直後にCellSaveチューブに入れられる。生存
TILの数は、4℃であっても、未処理の胸腔内液中に放置されると、24時間以内に大幅に減少する可能性がある。いくつかの実施形態では、試料は、患者からの除去後1時間、5時間、10時間、15時間、または最大24時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。いくつかの実施形態では、試料は、4℃で、患者からの除去後1時間、5時間、10時間、15時間、または最大24時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。
いくつかの実施形態では、選択された対象からの胸腔内液試料は、希釈され得る。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:10である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:9である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:8である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:5である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:2である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:1である。いくつかの実施形態では、希釈剤には、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水、別の緩衝液、または生理学的に許容される希釈剤が含まれる。いくつかの実施形態では、試料は、患者からの収集及び希釈の直後にCellSaveチューブ内に入れられ、生存TILの減少を回避し、これは、4℃であっても、未処理の胸腔内液中に放置された場合、24~48時間以内に有意に生じ得る。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、患者からの除去及び希釈後1時間、5時間、10時間、15時間、24時間、36時間、最大48時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、4℃で、患者からの除去及び希釈後1時間、5時間、10時間、15時間、24時間、36時間、最大48時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。
さらに他の実施形態では、胸腔内液試料は、さらなる処理ステップの前に、従来の手段によって濃縮される。いくつかの実施形態では、胸腔内液のこの前処理は、方法を実施する実験室への輸送のために、またはその後の分析のために(例えば、採取後24~48時間より後に)胸水を凍結保存しなければならない状況において好ましい。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、それが対象から採取された後に胸腔内液試料を遠心分離し、遠心分離物またはペレットを緩衝液中に再懸濁することによって調製される。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、輸送または後の分析及び/または処理のために凍結保存される前に、複数の遠心分離及び再懸濁に供される。
いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、濾過法を使用することによって、さらなる処理ステップの前に濃縮される。いくつかの実施形態では、接触ステップで使用される胸腔内液試料は、胸腔内液が膜を通過することを可能にするが腫瘍細胞を保持する、既知で本質的に均一な孔径を含むフィルターをとおして流体を濾過することによって調製される。いくつかの実施形態では、膜の細孔の直径は、少なくとも4μMであり得る。他の実施形態では、細孔直径は、5μM以上であり得、他の実施形態では、6、7、8、9、または10μMのうちのいずれかであり得る。濾過後、膜によって保持されたTILを含む細胞を、膜から適切な生理学的に許容される緩衝液にすすいでもよい。次いで、このように濃縮されたTILを含む細胞は、方法の接触ステップで使用することができる。
いくつかの実施形態では、胸腔内液試料(例えば、未処理の胸腔内液を含む)、希釈胸腔内液、または再懸濁細胞ペレットは、試料中に存在する無核赤血球を特異的に溶解する溶解試薬と接触させる。いくつかの実施形態では、このステップは、胸腔内液がかなりの数のRBCを含む状況で、さらなる処理ステップの前に行われる。好適な溶解試薬には、単一の溶解試薬もしくは溶解試薬及びクエンチ試薬、または溶解剤、クエンチ試薬及び固定試薬が含まれる。好適な溶解系は市販されており、BD Pharm Lyse(商標)系(Becton Dickenson)が含まれる。他の溶解系には、Versalyse(商標)系、FACSlyse(商標)系(Becton Dickenson)、Immunoprep(商標)系、またはErythrolyse II系(Beck
man Coulter,Inc.)、または塩化アンモニウム系が含まれる。いくつかの実施形態では、溶解試薬は、赤血球の効率的な溶解、ならびに胸水におけるTIL及びTILの表現型特性の保存のような主要な要件によって異なり得る。溶解のための単一の試薬を利用することに加えて、本明細書に記載の方法に有用な溶解系は、第2の試薬、例えば、方法の残りのステップ中に溶解試薬の効果をクエンチまたは遅延させるもの、例えばStabilyse(商標)試薬(Beckman Coulter,Inc.)を含むことができる。溶解試薬の選択または方法の好ましい実施に応じて、従来の固定試薬を使用することもできる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、未処理、希釈または多重遠心分離または処理された胸腔内液試料は、本明細書で提供されるようにさらに処理及び/または拡張される前に、約-140℃の温度で凍結保存される。
3.CD39/CD69二重陰性の事前選択
本発明のいくつかの方法によれば、TILは、プライミングによる第1の拡張前に(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(ii)(i)及び(ii)の組み合わせであるように事前選択される。いくつかの実施形態では、PD-1についての任意選択の事前選択ステップも存在する。
いくつかの実施形態では、最低3,000個のTILが、プライミングによる第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低3,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低4,000個のTILが、プライミングによる第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低4,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低5,000個のTILが、プライミングによる第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低5,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低6,000個のTILが、プライミングによる第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低6,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低7,000個のTILが、プライミングによる第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低7,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低8,000個のTILが、プライミングによる第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低8,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低9,000個のTILが、プライミングによる第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低9,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低10,000個のTILが、プライミングによる第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低10,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低20,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低20,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低30,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低30,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低40,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低40,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低50,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低50,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低60,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低60,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低70,000個のTILが、第1の拡張に播種する
ために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低70,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低80,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低80,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低90,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低90,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、最低100,000個のTILが、第1の拡張に播種するために必要とされる。いくつかの実施形態では、事前選択ステップは、最低100,000個のTILをもたらす。いくつかの実施形態では、細胞を、200,000個の密度まで成長または拡張させる。いくつかの実施形態では、細胞を、200,000個の密度まで成長または拡張させて、急速な第2の拡張を開始するための約2e8個のTILを提供する。いくつかの実施形態では、細胞を、150,000個の密度まで成長または拡張させる。いくつかの実施形態では、細胞を、150,000個の密度まで成長または拡張させて、急速な第2の拡張を開始するための約2e8個のTILを提供する。いくつかの実施形態では、細胞を、250,000個の密度まで成長または拡張させる。いくつかの実施形態では、細胞を、250,000個の密度まで成長または拡張させて、急速な第2の拡張を開始するための約2e8個のTILを提供する。いくつかの実施形態では、最小細胞密度は、急速な第2の拡張を開始するための10e6個を与えるために、10,000個の細胞である。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張を開始するための10e6個の播種密度は、1e9個を超えるTILをもたらし得る。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張において使用するためのTILは、(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ(例えば、事前選択後、及びプライミングによる第1の拡張前)である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張で使用するためのTILは、少なくとも75%が(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ、少なくとも80%が(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ、少なくとも90%が(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ、少なくとも95%が(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ、少なくとも98%が(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ、または少なくとも99%が(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせ(例えば、事前選択後及びプライミングによる第1の拡張前)である。
いくつかの実施形態では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILの事前選択は、一次細胞集団、全腫瘍消化物、及び/または全腫瘍細胞懸濁液TILを抗CD39抗体及び抗CD69抗体で染色することによって行われる。いくつかの実施形態では、抗CD39及び抗CD69抗体は、ポリクローナル抗体、例えば、マウス抗ヒトCD39及びCD69ポリクローナル抗体、ヤギ抗ヒトCD39及びCD69ポリクローナル抗体などである。いくつかの実施形態では、抗CD39及び抗CD69抗体は、モノクローナル抗体である。
いくつかの実施形態では、事前選択で使用するための抗CD39抗体は、CD39を発現する細胞の少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、少なくとも99%、または少なくとも100
%に結合する。いくつかの実施形態では、事前選択で使用するための抗CD69抗体は、CD69を発現する細胞の少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも98%、少なくとも99%、または少なくとも100%に結合する。
いくつかの実施形態では、患者は、抗PD-1抗体で治療されている。いくつかの実施形態では、対象は、抗PD-1抗体治療未経験である。いくつかの実施形態では、対象は、抗PD-1抗体で治療されていない。いくつかの実施形態では、対象は、以前に化学療法剤で治療されている。いくつかの実施形態では、対象は、以前に化学療法剤で治療されているが、もはや化学療法剤で治療されていない。いくつかの実施形態では、対象は、化学療法治療後または抗PD-1抗体治療後である。いくつかの実施形態では、対象は、化学療法治療後及び抗PD-1抗体治療後である。いくつかの実施形態では、患者は、抗PD-1抗体治療未経験である。いくつかの実施形態では、対象は、治療未経験のがんを有するか、または化学療法治療後であるが、抗PD-1抗体未経験である。いくつかの実施形態では、対象は、治療未経験であり、かつ化学療法治療後であるが、抗PD-1抗体治療未経験である。
いくつかの実施形態では、陰性は、FMOに基づいてゲーティングされる。いくつかの実施形態では、FACSゲートは、対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することにより、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容するステップの後に設定される。いくつかの実施形態では、ゲーティングは、各選別に対して設定される。いくつかの実施形態では、ゲーティングは、PBMCの各試料に対して設定される。いくつかの実施形態では、ゲーティングは、PBMCの各試料に対して設定される。いくつかの実施形態では、ゲーティングテンプレートは、PBMCから10日、20日、30日、40日、50日、または60日毎に設定される。いくつかの実施形態では、ゲーティングテンプレートは、PBMCから60日毎に設定される。いくつかの実施形態では、ゲーティングテンプレートは、10日、20日、30日、40日、50日、または60日毎にPBMCの各試料に対して設定される。いくつかの実施形態では、ゲーティングテンプレートは、60日毎にPBMCの各試料に対して設定される。
いくつかの実施形態では、事前選択は、第1のTIL集団から(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせを選択して、TIL集団を取得することを伴い、少なくとも11.27%~74.4%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILであるTIL集団を第1のTIL集団から選択することを含む。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団は、少なくとも10%~80%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO、少なくとも20%~80%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも20%~80%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも30%~80%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも40%~80%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも50%~80%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも10%~70%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも20%~70%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも30%~70%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL、少なくとも40%~70%がCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILである。
いくつかの実施形態では、選択ステップ(例えば、CD39/CD69二重陰性細胞の
事前選択及び/または選択)は、
(i)第1のTIL集団及びPBMC集団を、CD39及びCD69に結合する過剰のモノクローナル抗CD39 IgG及び抗CD69 IgG抗体に曝露するステップと、
(ii)フルオロフォアにコンジュゲートした過剰の抗IgG抗体を添加するステップと、
(iii)蛍光活性化細胞選別法(FACS)によって行われた場合のPBMC集団で検出されたフルオロフォアの強度と比較して、第1のTIL集団中のCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILで検出されたフルオロフォアの強度に基づいて、CD39/CD69二重陰性集団を取得するステップと、を含む。
いくつかの実施形態では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団の少なくとも70%が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILである。いくつかの実施形態では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団の少なくとも80%が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILである。いくつかの実施形態では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団の少なくとも90%が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILである。いくつかの実施形態では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団の少なくとも95%が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILである。いくつかの実施形態では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団の少なくとも99%が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILである。いくつかの実施形態では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO濃縮TIL集団の100%が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILである。
いくつかの実施形態では、図8E及び/または図8F及び/または図8GにおけるプロセスCD39/CD69 GEN3のステップA3として例示される選択ステップは、(i)第1のTIL集団を過剰のモノクローナル抗CD39及び抗CD69 IgG抗体に曝露するステップと、(ii)フルオロフォアにコンジュゲートした過剰の抗IgG抗体を追加するステップと、(iii)フルオロフォアに基づいてフローベースの細胞選別を行って、(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)濃縮TIL集団の組み合わせを取得するステップと、を含む。
腫瘍試料に由来するTILがCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOであるかどうかを決定するために、当業者は、1人以上の健康なヒト対象由来の血液試料から取得された末梢T細胞におけるCD39及び/またはCD69の発現レベルに対応する参照値を利用することができる。参照試料中のCD39/CD69陽性細胞は、蛍光から1つの対照を差し引いたものと、一致するアイソタイプ対照とを使用して定義することができる。いくつかの実施形態では、健康な対象由来のCD3+/CD39+/CD69+末梢T細胞(例えば、参照細胞)において測定されたCD39/CD69の発現レベルを使用して、腫瘍から取得されたTILにおけるCD39/CD69の免疫染色強度の閾値またはカットオフ値を確立する。閾値は、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOT細胞のCD39/CD69免疫染色の最大強度として定義することができる。そのため、CD39/CD69発現が閾値と同じかそれを下回るTILは、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO細胞であるとみなすことができる。いくつかの事例では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILは、全CD3+細胞の最大1%以下に相当
するCD39/CD69免疫染色の最低強度を有するものを表す。他の事例では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILは、全CD3+細胞の最大0.75%以下に相当するCD39/CD69免疫染色の最低強度を有するものを表す。いくつかの事例では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILは、全CD3+細胞の最大0.50%以下に相当するCD39/CD69免疫染色の最低強度を有するものを表す。他の事例では、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTILは、全CD3+細胞の最大0.25%以下に相当するCD39/CD69免疫染色の最低強度を有するものを表す。
いくつかの実施形態では、実施例16のタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤(AKTi)法が用いられる。いくつかの実施形態では、TIL集団は、AKT阻害剤を含む培地中で培養され、CD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得する。いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、ホノキオール、及びそれらの薬学的に許容される塩からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブである。いくつかの実施形態では、TIL集団を、約0.1μM、約0.2μM、約0.3μM、約0.4μM、約0.5μM、約0.6μM、約0.7μM、約0.8μM、約0.9μM、約1μM、約1.1μM、約1.2μM、約1.3μM、約1.4μM、約1.5μM、約1.6μM、約1.7μM、約1.8μM、約1.9μM、約2μM、約2.1μM、約2.2μM、約2.3μM、約2.4μM、約2.5μM、約2.6μM、約2.7μM、約2.8μM、約2.9μM、約3μM、約3.5μM、約4μM、約4.5μM、または約5μMのイパタセルチブを含む培地中で培養する。
b.フルオロフォア
いくつかの実施形態では、一次TIL細胞集団は、フルオロフォアに連結された抗CD39及び抗CD69抗体及びフルオロフォアに連結された抗CD3抗体を含むカクテルで染色される。いくつかの実施形態では、一次TIL細胞集団は、フルオロフォアに連結された抗CD39及び抗CD69抗体(例えば、PE、live/deadバイオレット)及び抗CD3-FITCを含むカクテルで染色される。いくつかの実施形態では、一次TIL細胞集団は、第1のフルオロフォアにコンジュゲートした抗CD39及び第2のフルオロフォアにコンジュゲートした抗CD69抗体、第3のフルオロフォアにコンジュゲートした抗CD3抗体、及びlive/dead青色染色(ThermoFisher,MA、カタログ番号L23105から市販されているものなど)を含むカクテルで染色され、第1、第2、及び第3の抗体は異なり、個別の検出が可能である。いくつかの実施形態では、抗CD39及び抗CD69抗体とのインキュベーション後、(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)細胞の組み合わせは、本明細書、例えば、図8E及び/または図8F及び/または図8GのステップBに記載の第1の拡張による拡張のために選択される。
いくつかの実施形態では、一次TIL細胞集団は、フルオロフォアに連結された抗CD39及び抗CD69抗体及びフルオロフォアに連結された抗CD3抗体を含むカクテルで染色される。いくつかの実施形態では、一次TIL細胞集団は、フルオロフォアに連結された抗CD39及び抗CD69抗体(例えば、PE、live/deadバイオレット)及び抗CD3-PE-Cy7を含むカクテルで染色される。いくつかの実施形態では、一次TIL細胞集団は、抗CD39-FITC及び抗CD69-PE、抗CD3-PE-Cy7、及びlive/dead青色染色(ThermoFisher,MA、カタログ番号L23105)を含むカクテルで染色される。いくつかの実施形態では、抗CD39及
び抗CD69抗体とのインキュベーション後、(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)細胞の組み合わせは、本明細書、例えば、図8E及び/または図8F及び/または図8GのプロセスCD39/CD69 GEN3のステップBに記載のプライミングによる第1の拡張による拡張のために選択される。
いくつかの実施形態では、フルオロフォアには、PE(フィコエリトリン)、APC(アロフィコシアニン)、PerCP(ペリジニンクロロフィルタンパク質)、DyLight 405、Alexa Fluor 405、Pacific Blue、Alexa Fluor 488、FITC(フルオレセインイソチオシアネート)、DyLight 550、Alexa Fluor 647、DyLight 650、及びAlexa Fluor 700が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、フルオロフォアには、PE-Alexa Fluor(登録商標)647、PE-Cy5、PerCP-Cy5.5、PE-Cy5.5、PE-Alexa Fluor(登録商標)750、PE-Cy7、及びAPC-Cy7が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、フルオロフォアには、フルオレセイン色素が含まれるが、これに限定されない。フルオレセイン色素の例には、5-カルボキシフルオレセイン、フルオレセイン-5-イソチオシアネート及び6-カルボキシフルオレセイン、5,6-ジカルボキシフルオレセイン、5-(及び6)-スルホフルオレセイン、スルホンフルオレセイン、スクシニルフルオレセイン、5-(及び6)-カルボキシSNARF-1、カルボキシフルオレセインスルホネート、カルボキシフルオレセイン双性イオン、カルボキシフルオレセイン四級アンモニウム、カルボキシフルオレセインホスホネート、カルボキシフルオレセインGABA、5’(6’)-カルボキシフルオレセイン、カルボキシフルオレセイン-cys-Cy5、ならびにフルオレセイングルタチオンが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、蛍光部分は、ローダミン色素である。ローダミン色素の例には、テトラメチルローダミン-6-イソチオシアネート、5-カルボキシテトラメチルローダミン、5-カルボキシロードール誘導体、カルボキシローダミン110、テトラメチル及びテトラエチルローダミン、ジフェニルジメチル及びジフェニルジエチルローダミン、ジナフチルローダミン、ローダミン101スルホニルクロリド(TEXAS RED(登録商標)の商品名で販売される)が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、蛍光部分は、シアニン色素である。シアニン色素の例には、Cy3、Cy3B、Cy3.5、Cy5、Cy5.5、及びCy7が含まれるが、これらに限定されない。
4.末梢血から末梢血リンパ球(PBL)を拡張する方法
PBL法1。本発明のいくつかの実施形態では、PBLは、本明細書に記載のプロセスを使用して拡張される。本発明のいくつかの実施形態では、方法は、全血からPBMC試料を取得することを含む。いくつかの実施形態では、方法は、非CD19+画分の負の選択を使用して、PBMCから純粋なT細胞を単離することによってT細胞を濃縮することを含む。いくつかの実施形態では、方法は、非CD19+画分の磁気ビーズベースの負の選択を使用して、PBMCから純粋なT細胞を単離することによってT細胞を濃縮することを含む。
本発明のいくつかの実施形態では、PBL法1は、以下のように行われる:0日目に、凍結保存されたPBMC試料を解凍し、PBMCを計数する。T細胞を、ヒトPan T細胞単離キット及びLSカラム(Miltenyi Biotec)を使用して単離する。
PBL法2。本発明のいくつかの実施形態では、PBLは、全血からPBMC試料を得ることを含むPBL法2を使用して拡張される。PBMC由来のT細胞は、PBMCを3
7℃で少なくとも3時間インキュベートし、その後、非接着細胞を単離することによって濃縮される。
本発明のいくつかの実施形態では、PBL法2は、以下のように行われる:0日目に、凍結保存されたPMBC試料を解凍し、PBMC細胞を、CM-2培地中の6ウェルプレートに600万細胞/ウェルで播種し、37℃で3時間インキュベートする。3時間後、PBLである非接着細胞を取り出し、計数する。
PBL法3。本発明のいくつかの実施形態では、PBLは、末梢血からPBMC試料を得ることを含むPBL法3を使用して拡張される。B細胞は、CD19+選択を使用して単離され、T細胞は、PBMC試料の非CD19+画分の負の選択を使用して選択される。
本発明のいくつかの実施形態では、PBL法3は、以下のように行われる:0日目に、末梢血から取得された凍結保存されたPBMCを解凍し、計数する。CD19+B細胞を、CD19 Multisortキット、ヒト(Miltenyi Biotec)を使用して選別する。非CD19+細胞画分のうち、T細胞を、ヒトPan T細胞単離キット及びLSカラム(Miltenyi Biotec)を使用して精製する。
いくつかの実施形態では、PBMCは、全血試料から単離される。いくつかの実施形態では、PBMC試料は、PBLを拡張するための出発材料として使用される。いくつかの実施形態では、試料は、拡張プロセス前に凍結保存される。他の実施形態では、新鮮な試料が、PBLを拡張するための出発材料として使用される。本発明のいくつかの実施形態では、T細胞は、当該技術分野で知られている方法を使用してPBMCから単離される。いくつかの実施形態では、T細胞は、ヒトT汎細胞単離キット及びLSカラムを使用して単離される。本発明のいくつかの実施形態では、T細胞は、当該技術分野で知られている抗体選択方法、例えば、CD19の負の選択を使用して、PBMCから単離される。
本発明のいくつかの実施形態では、PBMC試料は、非接着細胞を特定するのに有効な所望の温度である期間インキュベートされる。本発明のいくつかの実施形態では、インキュベーション時間は、約3時間である。本発明のいくつかの実施形態では、温度は、約37℃である。その後、非接着細胞は、上記のプロセスを使用して拡張される。
いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで任意選択で前治療された対象または患者由来のものである。いくつかの実施形態では、腫瘍試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療された対象または患者由来のものである。いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療されており、少なくとも1ヶ月間、少なくとも2ヶ月間、少なくとも3ヶ月間、少なくとも4ヶ月間、少なくとも5ヶ月間、少なくとも6ヶ月間、または1年間、またはそれ以上治療を受けた対象または患者由来のものである。他の実施形態では、PBMCは、イブルチニブなどのITK阻害剤レジメンを現在受けている患者に由来する。
いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療されており、キナーゼ阻害剤またはイブルチニブなどのITK阻害剤での治療に不応性である対象または患者由来のものである。
いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療されたが、もはやキナーゼ阻害剤またはITK阻害剤での治療を受けていない対象または患者由来のものである。いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キ
ナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療されたが、もはやキナーゼ阻害剤またはITK阻害剤での治療を受けておらず、少なくとも1ヶ月間、少なくとも2ヶ月間、少なくとも3ヶ月間、少なくとも4ヶ月間、少なくとも5ヶ月間、少なくとも6ヶ月間、または少なくとも1年間、またはそれ以上治療を受けていない対象または患者由来のものである。他の実施形態では、PBMCは、ITK阻害剤に以前に曝露されたが、少なくとも3ヶ月、少なくとも6ヶ月、少なくとも9ヶ月、または少なくとも1年以内に治療されていない患者に由来する。
本発明のいくつかの実施形態では、0日目に、細胞がCD19+について選択され、それに応じて選別される。本発明のいくつかの実施形態では、選択は、抗体結合ビーズを使用して行われる。本発明のいくつかの実施形態では、純粋なT細胞が、0日目にPBMCから単離される。
本発明のいくつかの実施形態では、イブルチニブまたは他のITK阻害剤で前治療されていない患者の場合、10~15mLのバフィーコートは、約5×10のPBMCを産生し、これは、次いで、約5.5×10のPBLを産生する。
本発明のいくつかの実施形態では、イブルチニブまたは他のITK阻害剤で前治療された患者の場合、拡張プロセスは、約20×10のPBLを産生する。本発明のいくつかの実施形態では、40.3×10のPBMCは、約4.7×10のPBLを産生する。
前述の実施形態のうちのいずれにおいても、PBMCは、全血試料から、アフェレーシスによって、バフィーコートから、またはPBMCを得るための当該技術分野で知られている任意の他の方法から得られ得る。
いくつかの実施形態では、PBLは、米国特許出願公開第2020/0347350 A1号(この開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載される方法を使用して調製される。
5.骨髄由来のPBMCから骨髄浸潤リンパ球(MIL)を拡張する方法
MIL法3。本発明のいくつかの実施形態では、方法は、骨髄からPBMCを取得することを含む。0日目に、PBMCがCD3+/CD33+/CD20+/CD14+について選択され、選別され、非CD3+/CD33+/CD20+/CD14+細胞画分が超音波処理され、超音波処理された細胞画分の一部が選択された細胞画分に戻し追加される。
本発明のいくつかの実施形態では、MIL法3は、以下のように行われる:0日目に、凍結保存されたPBMC試料を解凍し、PBMCを計数する。細胞を、CD3、CD33、CD20、及びCD14抗体で染色し、選別されたS3e細胞(Bio-Rad)を使用して選別する。細胞を、免疫細胞画分(またはMIL画分)(CD3+CD33+CD20+CD14+)及びAML芽球画分(非CD3+CD33+CD20+CD14+)の2つの画分に選別する。
本発明のいくつかの実施形態では、PBMCは、骨髄から取得される。いくつかの実施形態では、PBMCは、アフェレーシス、吸引、針生検、または当該技術分野で知られている他の同様の手段により骨髄から取得される。いくつかの実施形態では、PBMCは、新鮮である。他の実施形態では、PBMCは、凍結保存される。
本発明のいくつかの実施形態では、MILは、10~50mLの骨髄穿刺液から拡張さ
れる。本発明のいくつかの実施形態では、10mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。他の実施形態では、20mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。他の実施形態では、30mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。他の実施形態では、40mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。他の実施形態では、50mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。
本発明のいくつかの実施形態では、約10~50mLの骨髄穿刺液から産生されたPBMCの数は、約5×10~約10×10PBMCである。他の実施形態では、産生されたPMBCの数は、約7×10PBMCである。
本発明のいくつかの実施形態では、約5×10~約10×10PBMCが、約0.5×10~約1.5×10MILを産生する。本発明のいくつかの実施形態では、約1×10MILが産生される。
本発明のいくつかの実施形態では、骨髄穿刺液から誘導された12×10PBMCは、およそ1.4×10MILを産生する。
前述の実施形態のうちのいずれにおいても、PBMCは、全血試料から、骨髄から、アフェレーシスによって、バフィーコートから、またはPBMCを得るための当該技術分野で知られている任意の他の方法から得られ得る。
いくつかの実施形態では、MILは、米国特許出願公開第2020/0347350 A1号(この開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載される方法を使用して調製される。
B.ステップB:プライミングによる第1の拡張
いくつかの実施形態では、本方法は、より古いTIL(すなわち、対象/患者への投与前により多くの複製ラウンドをさらに受けたTIL)よりも追加の治療的利益を提供し得る、より若いTILを提供する。若いTILの特徴は、文献、例えば、Donia,et
al.,Scand.J.Immunol.2012,75,157-167、Dudley,et al.,Clin.Cancer Res.2010,16,6122-6131、Huang,et al.,J.Immunother.2005,28,258-267、Besser,et al.,Clin.Cancer Res.2013,19,OF1-OF9、Besser,et al.,J.Immunother.2009,32:415-423、Robbins,et al.,J.Immunol.2004,173,7125-7130、Shen,et al.,J.Immunother.,2007,30,123-129、Zhou,et al.,J.Immunother.2005,28,53-62、及びTran,et al.,J.Immunother.,2008,31,742-751に記載されており、これらの各々は参照により本明細書に組み込まれる。
例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C)のステップAに記載されるものなどの腫瘍断片及び/または腫瘍断片の解剖または消化後に、結果として得られた細胞は、腫瘍及び他の細胞よりもTILの成長を好む条件下で、IL-2、OKT-3、及びフィーダー細胞(例えば、抗原提示フィーダー細胞)を含む血清中で培養される。いくつかの実施形態では、IL-2、OKT-3、及びフィーダー細胞は、腫瘍消化物及び/または腫瘍断片とともに培養開始時に(例えば、0日目に)追加される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物及び/または腫瘍断片は、1容器当たり最大60個の断片及び6000IU/mLのIL-2を含む容器内でインキュベートされる。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、数日間、一般に1~8日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの
実施形態では、この一次細胞集団は、数日間、一般に1~7日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、1~8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、1~7日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、5~8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、5~7日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約6~8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に、約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約6~7日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に、約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約7~8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に、約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約7日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞をもたらす。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞をもたらす。
いくつかの実施形態では、TILの拡張は、以下及び本明細書に記載されるプライミングによる第1の拡張ステップ(例えば、REP前またはプライミングREPと称されるプロセスを含み得、0日目及び/または培養開始からのフィーダー細胞を含有する、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに記載されるものなど)、続いて以下のステップD及び本明細書に記載される急速な第2の拡張(ステップD、急速拡張プロトコル(REP)ステップと称されるプロセスを含む)、続いて任意選択の凍結保存、続いて以下及び本明細書に記載される第2のステップD(再刺激REPステップと称されるプロセスを含む)を使用して行うことができる。このプロセスから取得されたTILは、本明細書に記載の表現型特徴及び代謝パラメータについて任意で特徴付けられ得る。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~10mmである。
いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、培養培地の略語である「CM」と称される。いくつかの実施形態では、ステップBのCMは、10%ヒトAB血清、25mM
Hepes、及び10mg/mLゲンタマイシンを補充した、GlutaMAXを含むRPMI 1640からなる。
いくつかの実施形態では、240個以下の腫瘍断片が存在する。いくつかの実施形態では、4つ以下の容器に入れられた240個以下の腫瘍断片が存在する。いくつかの実施形態では、容器は、GREX100 MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、60個以下の腫瘍断片が1つの容器に入れられる。いくつかの実施形態では、各容器は、1容器当たり500mL以下の培地を含む。いくつかの実施形態では、培地は、IL-2を含む。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、培地は、抗原提示フィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、OKT-3を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり30ng/mLのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、GREX100 MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2、30ngのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり
6000IU/mLのIL-2、30ng/mLのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。
腫瘍断片の調製後、結果として得られた細胞(すなわち、一次細胞集団である断片)は、腫瘍及び他の細胞よりもTILの成長を好み、かつ0日目の培養開始からTILプライミング及び加速された成長を可能にする条件下で、IL-2、抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む培地中で培養される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物及び/または腫瘍断片は、6000IU/mLのIL-2、ならびに抗原提示フィーダー細胞及びOKT-3とインキュベートされる。この一次細胞集団は、数日間、一般に1~8日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞をもたらす。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張中の成長培地は、IL-2またはそのバリアント、ならびに抗原提示フィーダー細胞及びOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、数日間、一般に1~7日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞をもたらす。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張中の成長培地は、IL-2またはそのバリアント、ならびに抗原提示フィーダー細胞及びOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、IL-2は、組換えヒトIL-2(rhIL-2)である。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき20~30×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき20×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき25×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき30×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、4~8×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、5~7×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、6×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、実施例Cに記載されるように調製される。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約10,000IU/mLのIL-2、約9,000IU/mLのIL-2、約8,000IU/mLのIL-2、約7,000IU/mLのIL-2、約6000IU/mLのIL-2、または約5,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約9,000IU/mLのIL-2~約5,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約8,000IU/mLのIL-2~約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約7,000IU/mLのIL-2~約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、約4000IU/mL、約4500IU/mL、約5000IU/mL、約5500IU/mL、約6000IU/mL、約6500IU/mL、約7000IU/mL、約7500IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、1000~2000IU/mL、2000~3000IU/mL、3000~4000IU/mL、4000~5000IU/mL、5000~6000IU/mL、6000~7000IU/mL、700
0~8000IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15、約400IU/mLのIL-15、約300IU/mLのIL-15、約200IU/mLのIL-15、約180IU/mLのIL-15、約160IU/mLのIL-15、約140IU/mLのIL-15、約120IU/mLのIL-15、または約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約400IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約300IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約200IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、IL-15をさらに含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21、約15IU/mLのIL-21、約12IU/mLのIL-21、約10IU/mLのIL-21、約5IU/mLのIL-21、約4IU/mLのIL-21、約3IU/mLのIL-21、約2IU/mLのIL-21、約1IU/mLのIL-21、または約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約15IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約12IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約10IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約5IU/mLのIL-21~約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約2IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-21をさらに含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、OKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約0.1ng/mL、約0.5ng/mL、約1ng/mL、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約200ng/mL、約500ng/mL、及び約1μg/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、0.1ng/mL~1ng/mL、1ng/mL~5ng/mL、5ng/mL~10ng/mL、10ng/mL~20ngの間、20ng/mL~30ng/mL、30ng/mL~40ng/mL、40ng/mL~50ng/mL、及び5
0ng/mL~100ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、15ng/mL~30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、OKT-3抗体は、ムロモナブである。例えば、表1を参照されたい。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、細胞培養培地中に1つ以上のTNFRSFアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは4-1BBアゴニストであり、4-1BBアゴニストは、ウレルマブ、ウトミルマブ、EU-101、融合タンパク質、ならびにそれらの断片、誘導体、バリアント、バイオシミラー、及び組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、0.1μg/mL~100μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、20μg/mL~40μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。
いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、IL-2を約3000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、IL-2を約6000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、培養培地の略語である「CM」と称される。いくつかの実施形態では、それは、CM1(培養培地1)と称される。いくつかの実施形態では、CMは、10%ヒトAB血清、25mM Hepes、及び10mg/mLゲンタマイシンを補充した、GlutaMAXを含むRPMI1640からなる。いくつかの実施形態では、CMは、実施例に記載されるCM1である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、初期細胞培養培地または第1の細胞培養培地中で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培地または初期細胞培養培地または第1の細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞(本明細書ではフィーダー細胞とも称される)を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される拡張プロセスで使用される培地は、無血清培地または合成培地である。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、血清含有培地のロット間の変動に部分的に起因する実験変動を防止及び/または減少させるために使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地には、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal
Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CTS(商標)AIM-V
SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、血清サプリメントまたは血清代替物には、CTS(商標)OpTmizer T-Cell Expansion Serum Supplement、CTS(商標)Immune Cell Serum Replacement、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代用物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代用物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代用物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の抗生物質、及び1つ以上の微量元素のうちの1つ以上が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/または2-メルカプトエタノールをさらに含む。
いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Immune Cell Serum Replacementは、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CST(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地を含むが、これらに限定されない、従来の成長培地とともに使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地中の総血清代替物濃度(vol%)は、総無血清または合成培地の約1体積%、2体積%、3体積%、4体積%、5体積%、6体積%、7体積%、8体積%、9体積%、10体積%、11体積%、12体積%、13体積%、14体積%、15体積%、16体積%、17体積%、18体積%、19体積%、または20体積%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約3%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約5%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約10%である。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。い
くつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion
SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されており、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(
SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune
Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher
Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum
Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されており、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約0.1mM~約10mM、0.5mM~約9mM、1mM~約8mM、2mM~約7mM、3mM~約6mM、または4mM~約5mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約2mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約5mM~約150mM、10mM~約140mM、15mM~約130mM、20mM~約120mM、25mM~約110mM、30mM~約100mM、35mM~約95mM、40mM~約90mM、45mM~約85mM、50mM~約80mM、55mM~約75mM、60mM~約70mM、または約65mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約55mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、参照により本明細書に組み込まれる国際PCT公開第WO/1998/030679号に記載されている合成培地は、本発明において有用である。その刊行物には、無血清真核細胞培養培地が記載されている。無血清真核細胞培養培地には、無血清培養下で細胞の成長を支持することができる無血清サプリメントを補充した基礎細胞培養培地が含まれる。無血清真核細胞培養培地サプリメントは、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代替物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の微量元素、及び1つ以上の抗生物質からなる群から選択される1つ以上の成分を含むか、またはそれらを組み合わせることによって取得される。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/またはベータ-メルカプトエタノールをさらに含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンまたはアルブミン代替物と、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上の
コラーゲン前駆体、及び1つ以上の微量元素からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地は、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、合成培地中のグリシンの濃度は、約5~200mg/Lの範囲であり、L-ヒスチジンの濃度は、約5~250mg/Lであり、L-イソロイシンの濃度は、約5~300mg/Lであり、L-メチオニンの濃度は、約5~200mg/Lであり、L-フェニルアラニンの濃度は、約5~400mg/Lであり、L-プロリンの濃度は、約1~1000mg/Lであり、L-ヒドロキシプロリンの濃度は、約1~45mg/Lであり、L-セリンの濃度は、約1~250mg/Lであり、L-スレオニンの濃度は、約10~500mg/Lであり、L-トリプトファンの濃度は、約2~110mg/Lであり、L-チロシンの濃度は、約3~175mg/Lであり、L-バリンの濃度は、約5~500mg/Lであり、チアミンの濃度は、約1~20mg/Lであり、還元型グルタチオンの濃度は、約1~20mg/Lであり、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩の濃度は、約1~200mg/Lであり、鉄飽和トランスフェリンの濃度は、約1~50mg/Lであり、インスリンの濃度は、約1~100mg/Lであり、亜セレン酸ナトリウムの濃度は、約0.000001~0.0001mg/Lであり、アルブミン(例えば、AlbuMAX(登録商標)I)の濃度は、約5000~50,000mg/Lである。
いくつかの実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地中の濃度範囲」という見出しの下の列にリストされた濃度範囲で存在する。他の実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされた最終濃度で存在する。他の実施形態では、合成培地は、無血清サプリメントを含む基礎細胞培地である。これらの実施形態のうちのいくつかでは、無血清サプリメントは、表4の「サプリメント中の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされたタイプ及び濃度の非微量部分成分を含む。
いくつかの実施形態では、合成培地の浸透圧は、約260~350mOsmolである。いくつかの実施形態では、浸透圧は、約280~310mOsmolである。いくつかの実施形態では、合成培地には、最大約3.7g/L、または約2.2g/Lの重炭酸ナトリウムが補充されている。合成培地には、L-グルタミン(最終濃度約2mM)、1つ以上の抗生物質、非必須アミノ酸(NEAA、最終濃度約100μM)、2-メルカプトエタノール(最終濃度約100μM)がさらに補充されていてもよい。
いくつかの実施形態では、Smith,et al.,ClinTransl.Immunology,4(1)2015(doi:10.1038/cti.2014.31)に記載の合成培地が、本発明において有用である。簡潔には、RPMIまたはCTS(商標)OpTmizer(商標)を基礎細胞培地として使用し、0、2%、5%、または10%のいずれかのCTS(商標)Immune Cell Serum Replac
ementを補充した。
いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、濾過されていない。濾過されていない細胞培地の使用は、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化することができる。いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、ベータ-メルカプトエタノール(BMEまたはβME、2-メルカプトエタノールとしても知られる、CAS60-24-2)を欠いている。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、1~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、2~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、3~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、4~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、5~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、6~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図1または図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに提供されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、7~8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに提供されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、8日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに記載されるものなどのプ
ロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、1~7日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、2~7日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、3~7日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、4~7日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、5~7日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、6~7日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップBに提供されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、7日間である。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから1日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから1日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから2日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから2日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから3日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから3日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから4日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから
4日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから5日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから5日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから6日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから6日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから7日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから7日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、TILのプライミングによる第1の拡張は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、1日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、1日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、2日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、2日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、3日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、3日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、4日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、4日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、5日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、5日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、6日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、6日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、7日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、7日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21の組み合わせは、プライミングによる第1の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)による、ならびに本明細書に記載のステップBプロセス中を含む、プライミングによる第1の拡張中に含まれ得る。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21の組み合わせは、プライミングによる第1の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)による、及び本明細書に記載のステップBプロセス中に含まれ得る。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張、例えば、図8によるステッ
プB(特に、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)は、閉鎖系バイオリアクターにおいて行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが容器として用いられる。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、例えば、G-REX-10またはG-REX-100である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-REX-100である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-REX-10である。
1.フィーダー細胞及び抗原提示細胞
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろプライミングによる第1の拡張中に追加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ4~8日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ4~7日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ5~8日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ5~7日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ6~8日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8
D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ6~7日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ7日目または8日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ7日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ8日目の間の任意の時点でプライミングによる第1の拡張中に追加される。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8B)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時及びプライミングによる第1の拡張中にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要する。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、同種異系の健康な献血者由来の標準の全血単位から取得される末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。いくつかの実施形態では、2.5×10のフィーダー細胞が、プライミングによる第1の拡張中に使用される。いくつかの実施形態では、容器当たり2.5×10のフィーダー細胞が、プライミングによる第1の拡張中に使用される。いくつかの実施形態では、GREX-10当たり2.5×10のフィーダー細胞が、プライミングによる第1の拡張中に使用される。いくつかの実施形態では、GREX-100当たり2.5×10のフィーダー細胞が、プライミングによる第1の拡張中に使用される。
一般に、同種異系PBMCは、放射線照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、実施例に記載されるように、REP手順で使用され、これは、放射線照射された同種異系PBMCの複製無能力を評価するための例示的なプロトコルを提供する。
いくつかの実施形態では、14日目の総生細胞数が、プライミングによる第1の拡張の0日目に培養された初期の生細胞数よりも少ない場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。
いくつかの実施形態では、7日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された総生細胞数が、プライミングによる第1の拡張の0日目に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOK
T3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、7日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された総生細胞数が、プライミングによる第1の拡張の0日目に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、5~60ng/mLのOKT3抗体及び1000~6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、10~50ng/mLのOKT3抗体及び2000~5000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、20~40ng/mLのOKT3抗体及び2000~4000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、25~35ng/mLのOKT3抗体及び2500~3500IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、15ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、15ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、PBMCである。いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、人工抗原提示フィーダー細胞である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、約1:25、約1:50、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、1:50~1:300である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、1:100~1:200である。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約100×10TILの比を必要とする。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約50×10TILの比を必要とする。さらに他の実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約25×10TILを必要とする。さらに他の実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張は、約2.5×10フィーダー細胞を必要とする。さらに他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、急速な第2の拡張で使用されるフィーダー細胞の数の4分の1、3分の1、12分の5、または半分を必要とする。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、IL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、6000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、容器当たり2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、OKT-3を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり30ngのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、GREX100 MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2、30ng/mLのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では
、培地は、容器当たり6000IU/mLのIL-2、30ng/mLのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞当たり15μgのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地及び15μgのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、GREX100 MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、培地は、500mLの培養培地、6000IU/mLのIL-2、30ng/mLのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地、6000IU/mLのIL-2、15μgのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞当たり15μgのOKT-3を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順は、第2の拡張中にTILを超える過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、同種異系の健康な献血者由来の標準の全血単位から取得される末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。いくつかの実施形態では、人工抗原提示(aAPC)細胞がPBMCの代わりに使用される。
一般に、同種異系PBMCは、放射線照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、図及び実施例に記載される例示的な手順を含む、本明細書に記載のTIL拡張手順で使用される。
いくつかの実施形態では、人工抗原提示細胞は、PBMCの代替物として、またはPBMCと組み合わせて、プライミングによる第1の拡張において使用される。
2.サイトカイン及び他の添加物
本明細書に記載の拡張方法は、一般に、当該技術分野で知られているように、高用量のサイトカイン、特にIL-2を含む培養培地を使用する。
代替
いくつかの実施形態では、TILのプライミングによる第1の拡張のためにサイトカインの組み合わせを使用することは、米国特許出願公開第2017/0107490 A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように、IL-2、IL-15及びIL-21のうちの2つ以上の組み合わせを用いて可能である。したがって、可能な組み合わせには、IL-2及びIL-15、IL-2及びIL-21、IL-15及びIL-21及びIL-2、またはIL-15及びIL-21が含まれる。サイトカインの組み合わせの使用は、リンパ球、特にそこに記載されているようにT細胞の生成に特に有利に働く。いくつかの実施形態では、IL-2は、低濃度、例えば、約10IU/mL、約20IU/mL、約30IU/mL、約40IU/mL、約50IU/mL、約100IU/mL、約200IU/mL、約300IU/mL、約400IU/mL、約500IU/mL、約600IU/mL、約700IU/mL、約800IU/mL、約900IU/mL、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、または約4000IU/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-2は、約10~4000IU/mL、約100~3000IU/mL、約500~2000IU/ML、または約1000~1500IU/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-2は、約1000IU/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約1ng/mL、約2ng/mL、約3ng/mL、約4ng/mL、約5ng/mL、約1
0ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約30ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、または約100ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約10ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-21は、約1ng/mL、約2ng/mL、約3ng/mL、約4ng/mL、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約30ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約150ng/mL、約200ng/mL、約250ng/mL、または約300ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約10ng/mLで添加され、IL-21は、約30ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15及びIL-21のうちの1つ以上は、ステップB中、例えば、ステップBのD0及びD3、D0及びD4、D0及びD5、D0及びD6、D0及びD7、D0及びD8に2回添加される。例えば、表2を参照されたい。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、OKT-3抗体またはムロモナブの、培養培地への添加を含み得る。いくつかの実施形態では、ステップBはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、4-1BBアゴニストの、培養培地への添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、ステップBはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、OX-40アゴニストの、培養培地への添加を含み得る。加えて、チアゾリジンジオン化合物などの増殖因子活性化受容体(PPAR)-ガンマアゴニストを含む、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体ガンマコアクチベーターI-アルファアゴニストなどの添加剤は、米国特許出願公開第2019/0307796 A1号(この開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるように、ステップB中の培養培地で使用されてもよい。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、培養培地中のタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤(AKTi)の添加を含み得る。いくつかの実施形態では、TIL集団は、AKT阻害剤を含む培地中で培養され、CD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得する。いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、ホノキオール、及びそれらの薬学的に許容される塩からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブである。いくつかの実施形態では、TIL集団を、約0.1μM、約0.2μM、約0.3μM、約0.4μM、約0.5μM、約0.6μM、約0.7μM、約0.8μM、約0.9μM、約1μM、約1.1μM、約1.2μM、約1.3μM、約1.4μM、約1.5μM、約1.6μM、約1.7μM、約1.8μM、約1.9μM、約2μM、約2.1μM、約2.2μM、約2.3μM、約2.4μM、約2.5μM、約2.6μM、約2.7μM、約2.8μM、約2.9μM、約3μM、約3.5μM、約4μM、約4.5μM、約5μM、約6μM、約7μM、約8μM、約9μM、約10μM、約20μM、約30μM、約40μM、約50μM、約60μM、約70μM、約80μM、約90μM、または約100μMのAKT阻害剤を含む培地中で培養する。
いくつかの実施形態では、IL-15は、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約12.5ng/mL、約15ng/mL、または約20ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約10ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-21は、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約45ng/mL、約50ng/mL、約55
ng/mL、または約60ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-21は、約30ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約10ng/mLで添加され、IL-21は、約30ng/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、CD40アゴニスト、例えば、CD40Lまたは抗CD40アゴニスト抗体の添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、CD40Lが添加される。いくつかの実施形態では、抗CD40アゴニスト抗体が添加される。いくつかの実施形態では、CD40アゴニストは、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約45ng/mL、約50ng/mL、約55ng/mL、または約60ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、CD40アゴニストは、約30ng/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、IFNγの添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、IFNγが添加される。いくつかの実施形態では、IFNγは、約50ng/mL、約55ng/mL、約60ng/mL、約65ng/mL、約70ng/mL、約75ng/mL、約80ng/mL、約85ng/mL、約90ng/mL、約95ng/mL、約100ng/mL、約105ng/mL、約110ng/mL、約115ng/mL、約120ng/mL、約125ng/mL、約130ng/mL、約135ng/mL、約140ng/mL、約145ng/mL、約150ng/mL、約155ng/mL、約160ng/mL、約165ng/mL、約170ng/mL、約175ng/mL、約180ng/mL、約185ng/mL、約190ng/mL、約195ng/mL、約200ng/mL、約205ng/mL、約210ng/mL、約215ng/mL、約220ng/mL、約225ng/mL、約230ng/mL、約235ng/mL、約240ng/mL、約245ng/mL、約250ng/mL、約255ng/mL、約260ng/mL、約265ng/mL、約270ng/mL、約275ng/mL、約280ng/mL、約285ng/mL、約290ng/mL、約295ng/mL、または約300ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IFNγは、約200ng/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、抗PD-1抗体の添加を含み得る。いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、約5μg/mL、約10μg/mL、約15μg/mL、約20μg/mL、約25μg/mL、約30μg/mL、約35μg/mL、約40μg/mL、約45μg/mL、約50μg/mL、約55μg/mL、または約60μg/mLで添加される。いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、約10μg/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、抗CTLA-4抗体の添加を含み得る。いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、約5μg/mL、約10μg/mL、約15μg/mL、約20μg/mL、約25μg/mL、約30μg/mL、約35μg/mL、約40μg/mL、約45μg/mL、約50μg/mL、約55μg/mL、または約60μg/mLで添加される。いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、約10μg/mLで添加される。
C.ステップC:プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行
場合によっては、例えば図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されるようにステップBから取得されるTIL集団を含む、プライミングによる第1の拡張から取得されたバルクTIL母集団(REP前と称されることもある拡張を含み得る)は、急速な第2の拡張(これは、急速拡張プロトコル(REP)と称されることもある
拡張を含み得る)に供され、次いで、以下で考察されるように凍結保存され得る。同様に、遺伝子修飾TILが療法に使用される場合、プライミングによる第1の拡張由来の拡張TIL集団または急速な第2の拡張由来の拡張TIL集団は、拡張ステップ前またはプライミングによる第1の拡張後及び急速な第2の拡張前に好適な治療のために遺伝子修飾に供され得る。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されるステップBから)取得されたTILは、選択のために表現型決定されるまで保管される。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されるステップBから)取得されたTILは保管されず、急速な第2の拡張に直接進む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から取得されたTILは、プライミングによる第1の拡張後及び急速な第2の拡張前に凍結保存されない。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、腫瘍の断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約3日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約3日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約4日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約4日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約5日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約5日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約6日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約6日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約7日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約8日で起こる。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始された
ときから1日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから1日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから2日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから2日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから3日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから3日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから4日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから4日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから5日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから5日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから6日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから6日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから7日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき、及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき、及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから8日で起こる。
いくつかの実施形態では、TILは、初期第1の拡張後、及び急速な第2の拡張前に保存されず、TILは、急速な第2の拡張に直接進行する(例えば、いくつかの実施形態では、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されるようにステップBからステップDへの移行中の保存がない)。いくつかの実施形態では、移行は、本明細書に記載されるように、閉鎖系内で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張由来のTILである第2のTIL集団は、移行期間なしで急速な第2の拡張に直接進む。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)によるステップCは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリ
アクターは、例えば、GREX-10またはGREX-100である。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、容器サイズのスケールアップを伴う。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、急速な第2の拡張よりも小さい容器内で行われる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、GREX-100内で行われ、急速な第2の拡張は、GREX-500内で行われる。
D.ステップD:急速な第2の拡張
いくつかの実施形態では、TIL細胞集団は、採取及びプライミングによる第1の拡張後、ステップA及びステップB、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されるように、ステップCと称される移行後に数がさらに拡張される。このさらなる拡張は、本明細書では急速な第2の拡張または急速拡張と称され、これは、当該技術分野で一般に急速拡張プロセス(急速拡張プロトコルまたはREP、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップDに示されるプロセス)と称される拡張プロセスを含み得る。急速な第2の拡張は、一般に、フィーダー細胞、サイトカイン源、及び抗CD3抗体を含む、いくつかの成分を含む培養培地を使用して、ガス透過性容器内で達成される。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張開始の1日、2日、3日、または4日後(すなわち、Gen3プロセス全体の8、9、10、または11日目)に、TILは、より大容量の容器に移される。
いくつかの実施形態では、TILの急速な第2の拡張(REPと称されることもある拡張、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップDに示されるプロセスを含み得る)は、当業者に知られている任意のTILフラスコまたは容器を使用して行うことができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、または10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約1日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約1日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約3日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約3日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約4日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約4日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約5日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約5日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約6日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約6日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約7日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約7日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約8日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形
態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約8日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約9日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約1日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約3日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約4日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約5日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約6日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約10日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、本開示の方法(例えば、REPと称される拡張、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップDに示されるプロセスを含む)を使用して、ガス透過性容器内で行うことができる。いくつかの実施形態では、TILは、IL-2、OKT-3、及びフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)の存在下での急速な第2の拡張において拡張される。いくつかの実施形態では、TILは、IL-2、OKT-3、及びフィーダー細胞の存在下での急速な第2の拡張において拡張され、フィーダー細胞は、プライミングによる第1の拡張において存在するフィーダー細胞の濃度の2倍、2.4倍、2.5倍、3倍、3.5倍、または4倍である最終濃度まで追加される。例えば、TILは、インターロイキン-2(IL-2)またはインターロイキン-15(IL-15)の存在下で非特異的T細胞受容体刺激を使用して、急速に拡張され得る。非特異的T細胞受容体刺激は、例えば、抗CD3抗体、例えば約30ng/mLのOKT3、マウスモノクローナル抗CD3抗体(Ortho-McNeil,Raritan,NJもしくはMiltenyi Biotech,Auburn,CAから市販)またはUHCT-1(BioLegend,San Diego,CA,USAから市販)を含み得る。TILは、がんのエピトープ(複数可)などの抗原性部分を含む、第2の拡張中に1つ以上の抗原を含むことによって、インビトロでTILのさらなる刺激を誘導するように拡張することができ、これは、ベクター、例えば、ヒト白血球抗原A2(HLA-A2)結合ペプチド、例えば、0.3μM MART-1:26-35(27L)またはgpl00:209-217(210M)から、任意選択で300IU/mLのIL-2またはIL-15などのT細胞成長因子の存在下で任意で発現され得る。他の好適な抗原には、例えば、NY-ESO-1、TRP-1、TRP-2、チロシナーゼがん抗原、MAGE-A3、SSX-2、及びVEGFR2、またはそれらの抗原性部分が含まれ得る。TILは、HLA-A2を発現する抗原提示細胞にパルスされたがんの同じ抗原(複数可)で再刺激することによっても急速に拡張され得る。代替的に、TILは、例えば、例として放射線照射された自己リンパ球または放射線照射されたHLA-A2+同種異系リンパ球及びIL-2でさらに再刺激され得る。いくつかの実施形態では、再刺激は、第2の拡張の一部として起こる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、放射線照射された自己リンパ球の存在下で、または放射線照射されたHLA-A2+同種異系リンパ球及びIL-2を用いて起こる。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態
では、細胞培養培地は、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、約4000IU/mL、約4500IU/mL、約5000IU/mL、約5500IU/mL、約6000IU/mL、約6500IU/mL、約7000IU/mL、約7500IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、1000~2000IU/mL、2000~3000IU/mL、3000~4000IU/mL、4000~5000IU/mL、5000~6000IU/mL、6000~7000IU/mL、7000~8000IU/mL、または8000IU/mLのIL-2を含む。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、OKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約0.1ng/mL、約0.5ng/mL、約1ng/mL、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約200ng/mL、約500ng/mL、及び約1μg/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、0.1ng/mL~1ng/mL、1ng/mL~5ng/mL、5ng/mL~10ng/mL、10ng/mL~20ngの間、20ng/mL~30ng/mL、30ng/mL~40ng/mL、40ng/mL~50ng/mL、及び50ng/mL~100ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、15ng/mL~30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約30ng/mL~60ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約60ng/mLのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、OKT-3抗体は、ムロモナブである。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、IL-2を含む。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、容器当たり7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、OKT-3を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培地中に、容器当たり500mLの培養培地及び30μgのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、G-REX-100 MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培地中に、6000IU/mLのIL-2、60ng/mLのOKT-3、及び7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地、6000IU/mLのIL-2、30μgのOKT-3、及び7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、IL-2を含む。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり5×10~7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、OKT-3を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、容器当たり500mLの培養培地及び30μgのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、G-REX-100 MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、6000IU/mLのIL-2、60ng/mLのOKT-3、及び5×10
~7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、容器当たり500mLの培養培地、ならびに6000IU/mLのIL-2、30μgのOKT-3、及び5×10~7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、細胞培養培地中に1つ以上のTNFRSFアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは4-1BBアゴニストであり、4-1BBアゴニストは、ウレルマブ、ウトミルマブ、EU-101、融合タンパク質、ならびにそれらの断片、誘導体、バリアント、バイオシミラー、及び組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、0.1μg/mL~100μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、20μg/mL~40μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。
いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、細胞培養培地は、IL-2を約3000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21の組み合わせは、第2の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)による、ならびに本明細書に記載のステップDプロセス中を含む、第2の拡張中に含まれ得る。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21の組み合わせは、第2の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)による、及び本明細書に記載のステップDプロセス中に含まれ得る。
いくつかの実施形態では、第2の拡張は、IL-2、OKT-3、抗原提示フィーダー細胞、及び任意でTNFRSFアゴニストを含む補充された細胞培養培地において実施され得る。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、補充された細胞培養培地中で起こる。いくつかの実施形態では、補充された細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、第2の細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC、抗原提示フィーダー細胞とも称される)を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞(すなわち、抗原提示細胞)を含む細胞培養培地中で起こる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15、約400IU/mLのIL-15、約300IU/mLのIL-15、約200IU/mLのIL-15、約180IU/mLのIL-15、約160IU/mLのIL-15、約140IU/mLのIL-15、約120IU/mLのIL-15、または約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約400IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約300IU/
mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約200IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-15をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21、約15IU/mLのIL-21、約12IU/mLのIL-21、約10IU/mLのIL-21、約5IU/mLのIL-21、約4IU/mLのIL-21、約3IU/mLのIL-21、約2IU/mLのIL-21、約1IU/mLのIL-21、または約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約15IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約12IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約10IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約5IU/mLのIL-21~約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約2IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-21をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞(APC)は、PBMCである。いくつかの実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMC及び/または抗原提示細胞に対する比は、約1:10、約1:15、約1:20、約1:25、約1:30、約1:35、約1:40、約1:45、約1:50、約1:75、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。いくつかの実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMCに対する比は、1:50~1:300である。いくつかの実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMCに対する比は、1:100~1:200である。
いくつかの実施形態では、REP及び/または急速な第2の拡張は、バルクTILを100倍または200倍過剰の不活性化フィーダー細胞と混合してフラスコ内で行われ、フィーダー細胞濃度は、150ml培地中のプライミングによる第1の拡張、30ng/mLのOKT3抗CD3抗体及び6000IU/mLのIL-2におけるフィーダー細胞濃度の少なくとも1.1倍(1.1倍)、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、1.6倍、1.7倍、1.8倍、1.8倍、2倍、2.1倍、2.2倍、2.3倍、2.4倍、2.5倍、2.6倍、2.7倍、2.8倍、2.9倍、3.0倍、3.1倍、3.2倍、3.3倍、3.4倍、3.5倍、3.6倍、3.7倍、3.8倍、3.9倍または4.0倍である。培地交換(一般に、使用済み培地の3分の2の吸引及び等量の新鮮な培地との交換による、3分の2培地交換)は、細胞が代替の成長チャンバに移されるまで行われる。代替の成長チャンバには、以下でより完全に考察されるように、G-REXフラスコ及びガス透過性容器が含まれる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張(REPプロセスと称されるプロセスを含み得る)は、実施例及び図で論じられるように、7~9日間である。いくつかの実施形態
では、第2の拡張は、7日間である。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、8日間である。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、9日間である。
いくつかの実施形態では、第2の拡張(REPと称される拡張、ならびに図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップDで参照される拡張を含み得る)は、100cmのガス透過性シリコン底部(G-REX-100、Wilson Wolf Manufacturing Corporation,New Brighton,MN,USAから市販)を有する500mL容量のガス透過性フラスコ内で行うことができる。5×10または10×10TILは、5%ヒトAB血清、3000IU/mLのIL-2、及び30ng/mLの抗CD3(OKT3)を補充された400mLの50/50培地中でPBMCとともに培養され得る。G-REX-100フラスコを、5% CO中37℃でインキュベートすることができる。5日目に、250mLの上清が除去され、遠心分離ボトルに入れられ、1500rpm(491×g)で10分間遠心分離される。TILペレットが、5%ヒトAB血清、6000IU/mLのIL-2を含む150mLの新鮮な培地で再懸濁され、元のGREX-100フラスコに戻し追加され得る。TILがGREX-100フラスコで連続して拡張される場合、10日目または11日目に、TILは、GREX-500などのより大きいフラスコに移され得る。培養14日目に、細胞が採取され得る。培養15日目に、細胞が採取され得る。培養16日目に、細胞が採取され得る。いくつかの実施形態では、培地交換は、細胞が代替の成長チャンバに移されるまで行われる。いくつかの実施形態では、培地の3分の2は、使用済み培地の吸引及び等体積の新鮮な培地との交換によって交換される。いくつかの実施形態では、代替の成長チャンバには、以下でより完全に考察されるように、GREXフラスコ及びガス透過性容器が含まれる。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される拡張プロセスで使用される培地は、無血清培地または合成培地である。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、血清含有培地のロット間の変動に部分的に起因する実験変動を防止及び/または減少させるために使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地には、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal
Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CTS(商標)AIM-V
SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、血清サプリメントまたは血清代替物には、CTS(商標)OpTmizer T-Cell Expansion Serum Supplement、CTS(商標)Immune Cell Serum Replacement、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代用物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代用物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代用物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の抗生物質、及び1つ以上の微量元素のうちの1つ以上が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、
L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/または2-メルカプトエタノールをさらに含む。
いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Immune Cell Serum Replacementは、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CST(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地を含むが、これらに限定されない、従来の成長培地とともに使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地中の総血清代替物濃度(vol%)は、総無血清または合成培地の約1体積%、2体積%、3体積%、4体積%、5体積%、6体積%、7体積%、8体積%、9体積%、10体積%、11体積%、12体積%、13体積%、14体積%、15体積%、16体積%、17体積%、18体積%、19体積%、または20体積%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約3%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約5%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約10%である。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。
CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion
Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。
いくつかの実施形態では、合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Ex
pansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune
Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher
Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2m
Mのグルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約0.1mM~約10mM、0.5mM~約9mM、1mM~約8mM、2mM~約7mM、3mM~約6mM、または4mM~約5mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約2mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約5mM~約150mM、10mM~約140mM、15mM~約130mM、20mM~約120mM、25mM~約110mM、30mM~約100mM、35mM~約95mM、40mM~約90mM、45mM~約85mM、50mM~約80mM、55mM~約75mM、60mM~約70mM、または約65mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約55mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。
いくつかの実施形態では、国際特許出願公開第WO1998/030679号及び米国特許出願公開第2002/0076747 A1号(参照により本明細書に組み込まれる)に記載される合成培地は、本発明において有用である。その刊行物には、無血清真核細胞培養培地が記載されている。無血清真核細胞培養培地には、無血清培養下で細胞の成長を支持することができる無血清サプリメントを補充した基礎細胞培養培地が含まれる。無血清真核細胞培養培地サプリメントは、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代替物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の微量元素、及び1つ以上の抗生物質からなる群から選択される1つ以上の成分を含むか、またはそれらを組み合わせることによって取得される。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/またはベータ-メルカプトエタノールをさらに含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンまたはアルブミン代替物と、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、及び1つ以上の微量元素からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地は、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、合成培地中のグリシンの濃度は、約5~200mg/Lの範囲であり、L-ヒスチジンの濃度は、約5~250mg/Lであり、L-イソロイシンの濃度は、約5~300mg/Lであり、L-メチオニンの濃度は、約5~200mg/Lであり、L-フェニルアラニンの濃度は、約5~400mg/Lであり、L-プロリンの濃度は、約1~1000mg/Lであり、L-ヒドロキシプロリンの濃度は、約1~45
mg/Lであり、L-セリンの濃度は、約1~250mg/Lであり、L-スレオニンの濃度は、約10~500mg/Lであり、L-トリプトファンの濃度は、約2~110mg/Lであり、L-チロシンの濃度は、約3~175mg/Lであり、L-バリンの濃度は、約5~500mg/Lであり、チアミンの濃度は、約1~20mg/Lであり、還元型グルタチオンの濃度は、約1~20mg/Lであり、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩の濃度は、約1~200mg/Lであり、鉄飽和トランスフェリンの濃度は、約1~50mg/Lであり、インスリンの濃度は、約1~100mg/Lであり、亜セレン酸ナトリウムの濃度は、約0.000001~0.0001mg/Lであり、アルブミン(例えば、AlbuMAX(登録商標)I)の濃度は、約5000~50,000mg/Lである。
いくつかの実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地中の濃度範囲」という見出しの下の列に列挙された濃度範囲で存在する。他の実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地の好ましい実施形態」という見出しの下の列に列挙された最終濃度で存在する。他の実施形態では、合成培地は、無血清サプリメントを含む基礎細胞培地である。これらの実施形態のうちのいくつかでは、無血清サプリメントは、表4の「サプリメント中の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされたタイプ及び濃度の非微量部分成分を含む。
いくつかの実施形態では、合成培地の浸透圧は、約260~350mOsmolである。いくつかの実施形態では、浸透圧は、約280~310mOsmolである。いくつかの実施形態では、合成培地には、最大約3.7g/L、または約2.2g/Lの重炭酸ナトリウムが補充されている。合成培地には、L-グルタミン(最終濃度約2mM)、1つ以上の抗生物質、非必須アミノ酸(NEAA、最終濃度約100μM)、2-メルカプトエタノール(最終濃度約100μM)がさらに補充されていてもよい。いくつかの実施形態では、Smith,et al.,Clin.Transl.Immunology,4(1)2015(doi:10.1038/cti.2014.31)に記載の合成培地が、本発明において有用である。簡潔には、RPMIまたはCTS(商標)OpTmizer(商標)を基礎細胞培地として使用し、0、2%、5%、または10%のいずれかのCTS(商標)Immune Cell Serum Replacementを補充した。
いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、濾過されていない。濾過されていない細胞培地の使用は、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化することができる。いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、ベータ-メルカプトエタノール(BMEまたはβME、2-メルカプトエタノールとしても知られる、CAS60-24-2)を欠いている。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張(REPと称される拡張を含む)が行われ、優れた腫瘍反応性のためにTILが選択されるステップをさらに含む。当該技術分野で知られている任意の選択方法が使用され得る。例えば、米国特許出願公開第2016/0010058A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている方法が、優れた腫瘍反応性のためのTILの選択に使用され得る。
任意選択で、細胞生存率アッセイは、当該技術分野で知られている標準のアッセイを使用して、急速な第2の拡張(REP拡張と称される拡張を含む)後に行われ得る。例えば、死細胞を選択的に標識し、生存率の評価を可能にするトリパンブルー排除アッセイが、バルクTILの試料上で行われ得る。いくつかの実施形態では、TIL試料は、Cellometer K2自動セルカウンター(Nexcelom Bioscience,Lawrence,MA)を使用して計数され、生存率が決定され得る。いくつかの実施形
態では、生存率は、標準のCellometer K2 Image Cytometer Automatic Cell Counterプロトコルに従って決定される。
Tリンパ球及びBリンパ球の多様な抗原受容体は、限られた数であるが、多数の遺伝子セグメントの体細胞組換えによって産生される。これらの遺伝子セグメント:V(可変)、D(多様性)、J(接合)、及びC(一定)は、免疫グロブリン及びT細胞受容体(TCR)の結合特異性及び下流での適用を決定する。本発明は、T細胞レパートリー多様性を示し、かつ増加させるTILを生成するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、第2の拡張において取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、多様性の増加は、免疫グロブリン多様性及び/またはT細胞受容体多様性の増加である。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン重鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン軽鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、T細胞受容体にある。いくつかの実施形態では、多様性は、アルファ、ベータ、ガンマ、及びデルタ受容体からなる群から選択されるT細胞受容体のうちの1つにある。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファ及び/またはベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)ベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、TCRab(すなわち、TCRα/β)の発現が増加する。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地と称されることもある)は、以下でさらに詳細に考察されるように、IL-2、OKT-3、ならびに抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地とも称される)は、以下でさらに詳細に論じられるように、6000IU/mLのIL-2、30ug/フラスコのOKT-3、ならびに7.5×10の抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地と称されることもある)は、以下でさらに詳細に考察されるように、IL-2、OKT-3、ならびに抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地とも称される)は、以下でさらに詳細に論じられるように、6000IU/mLのIL-2、30ug/フラスコのOKT-3、ならびに5×10の抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張、例えば、図8によるステップD(特に、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)は、閉鎖系バイオリアクターにおいて行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが容器として用いられる。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、例えば、G-REX-100またはG-REX-500である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-REX-100である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-REX-500である。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX-100 MCS容器内での小規模培養で約3~7日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養でのTILを、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX-500-MCS容器に移し、小規模培養由来のTILを、第2の容器内でのより大規模な
培養で約4~7日間培養することとによって、培養のスケールアップを達成する。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX-100MCS容器内での第1の小規模培養で約3~7日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)第1の小規模培養由来のTILを、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたTILの一部が、第2の小規模培養で約4~7日間培養される。
いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、TILの複数の約2~5亜集団に配分される。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX-100MCS容器内での小規模培養で約3~7日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来のTILを、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX-500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたTILの一部が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX-100MCS容器内での小規模培養で約5日間培養することによって急速なまたは第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来のTILを、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX-500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたTILの一部が、より大規模な培養で約6日間培養される。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張の分割時に、各第2の容器は、少なくとも10個のTILを含む。いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の分割時に、各第2の容器は、少なくとも10個のTIL、少なくとも10個のTIL、または少なくとも1010個のTILを含む。例示的な一実施形態では、各第2の容器は、少なくとも1010個のTILを含む。
いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の亜集団に配分される。いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の約2~5亜集団に配分される。いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の約2、3、4、または5亜集団に配分される。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張の完了後、複数の亜集団は、治療有効量のTILを含む。いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の完了後、1つ以上のTILの亜集団を一緒にプールして、治療有効量のTILを産生する。いくつかの実施形態では、急速拡張の完了後、TILの各亜集団は、治療有効量のTILを含む。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、複数のステップに分割される前に、約3~7日間行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張の分裂は、急速または
第2の拡張の開始後約3日目、4日目、5日目、6日目、または7日目に起こる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張の分裂は、第1の拡張(すなわち、REP前拡張)の開始後の約7日目、8日目、9日目、10日目、11日目、12日目、13日目、14日目、15日目、または16日目、17日目、または18日目に起こる。例示的な一実施形態では、急速または第2の拡張の分裂は、第1の拡張の開始後約16日目に起こる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、分裂後約7~11日間、さらに行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、分裂後約5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日間、さらに行われる。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂後の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地と同じ成分を含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂後の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地とは異なる成分を含む。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、任意選択でOKT-3、及びさらに任意選択でAPCを含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及びさらに任意選択でAPCを含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、OKT-3及びAPCを含む。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、任意選択でOKT-3及びさらに任意選択でAPCを含む新鮮な培養培地で補充することによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、OKT-3及びAPCを含む新鮮な培養培地で補充することによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、任意選択でOKT-3及びさらに任意選択でAPCを含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、OKT-3及びAPCを含む新鮮な細胞培養培地で置き換えることによって生成される。
いくつかの実施形態では、分裂後の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、分裂後の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2及びOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、分裂後の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地を、IL-2及び任意選択でOKT-3を含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂後の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地を、IL-2及びOKT-3を含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。
1.フィーダー細胞及び抗原提示細胞
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の急速な第2の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップDに記載されるような拡張、ならびにREPと称されるものを含む)は、REP TIL拡張中及び/または急速な
第2の拡張中に過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、健康な献血者由来の標準の全血単位から得られる末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。
一般に、同種異系PBMCは、放射線照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、実施例に記載されるように、REP手順で使用され、これは、放射線照射された同種異系PBMCの複製無能力を評価するための例示的なプロトコルを提供する。
いくつかの実施形態では、7日目または14日目の総生細胞数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数よりも少ない場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。
いくつかの実施形態では、7日目及び14日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された総生細胞数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、60ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、60ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、7日目及び14日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された総生細胞数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び1000~6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び2000~5000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び2000~4000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び2500~3500IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、PBMCである。いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、人工抗原提示フィーダー細胞である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、約1:10、約1:25、約1:50、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、1:50~1:300である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、1:100~1:200である。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約5×10フィーダ
ー細胞:約100×10TILの比を必要とする。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約7.5×10フィーダー細胞:約100×10TILの比を必要とする。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約5×10フィーダー細胞:約50×10TILの比を必要とする。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約7.5×10フィーダー細胞:約50×10TILの比を必要とする。さらに他の実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約5×10フィーダー細胞:約25×10TILを必要とする。さらに他の実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約7.5×10フィーダー細胞:約25×10TILを必要とする。さらに他の実施形態では、急速な第2の拡張は、急速な第2の拡張の2倍の数のフィーダー細胞を必要とする。さらに他の実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張が約2.5×10フィーダー細胞を必要とする場合、急速な第2の拡張は、約5×10フィーダー細胞を必要とする。さらに他の実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張が約2.5×10フィーダー細胞を必要とする場合、急速な第2の拡張は、約7.5×10フィーダー細胞を必要とする。さらに他の実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張の2倍(2.0×)、2.5倍、3.0倍、3.5倍または4.0倍の数のフィーダー細胞を必要とする。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の急速な第2の拡張手順は、急速な第2の拡張中に過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、同種異系の健康な献血者由来の標準の全血単位から取得される末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。いくつかの実施形態では、人工抗原提示(aAPC)細胞がPBMCの代わりに使用される。いくつかの実施形態では、PBMCは、プライミングによる第1の拡張に追加されたPBMCの2倍の濃度で、急速な第2の拡張に追加される。
一般に、同種異系PBMCは、放射線照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、図及び実施例に記載される例示的な手順を含む、本明細書に記載のTIL拡張手順で使用される。
いくつかの実施形態では、人工抗原提示細胞は、PBMCの代替物として、またはPBMCと組み合わせて、急速な第2の拡張において使用される。
2.サイトカイン及び他の添加物
本明細書に記載の急速な第2の拡張方法は、一般に、当該技術分野で知られているように、高用量のサイトカイン、特にIL-2を含む培養培地を使用する。
いくつかの実施形態では、急速なTIL拡張のためにサイトカインの組み合わせを使用することは、米国特許出願公開第2017/0107490A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように、IL-2、IL-15及びIL-21のうちの2つ以上の組み合わせを用いて可能である。したがって、可能な組み合わせには、IL-2及びIL-15、IL-2及びIL-21、IL-15及びIL-21及びIL-2、またはIL-15及びIL-21が含まれる。サイトカインの組み合わせの使用は、リンパ球、特にそこに記載されているようにT細胞の生成に特に有利に働く。いくつかの実施形態では、IL-2は、低濃度、例えば、約10IU/mL、約20IU/mL、約30IU/mL、約40IU/mL、約50IU/mL、約100IU/mL、約200IU/mL、約300IU/mL、約400IU/mL、約500IU/mL、約600IU/mL、約700IU/mL、約800IU/mL、約900IU/mL、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、または約4000IU/mLで
添加される。いくつかの実施形態では、IL-2は、約10~4000IU/mL、約100~3000IU/mL、約500~2000IU/ML、または約1000~1500IU/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-2は、約1000IU/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約1ng/mL、約2ng/mL、約3ng/mL、約4ng/mL、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約30ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、または約100ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約10ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-21は、約1ng/mL、約2ng/mL、約3ng/mL、約4ng/mL、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約30ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約150ng/mL、約200ng/mL、約250ng/mL、または約300ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約10ng/mLで添加され、IL-21は、約30ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15及びIL-21のうちの1つ以上は、ステップB中、例えば、ステップBのD0及びD3、D0及びD4、D0及びD5、D0及びD6、D0及びD7、D0及びD8に2回添加される。
いくつかの実施形態では、ステップD(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gから)はまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、OKT-3抗体またはムロモナブの、培養培地への添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、ステップDはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、4-1BBアゴニストの、培養培地への添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、ステップD(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gから)はまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、OX-40アゴニストの、培養培地への添加を含んでもよい。加えて、チアゾリジンジオン化合物などの増殖因子活性化受容体(PPAR)-ガンマアゴニストを含む、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体ガンマコアクチベーターI-アルファアゴニストなどの添加剤は、米国特許出願公開第2019/0307796 A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるように、ステップD(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gから)中の培養培地で使用されてもよい。
いくつかの実施形態では、ステップDはまた、培養培地中のタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤(AKTi)の添加を含み得る。いくつかの実施形態では、TIL集団は、AKT阻害剤を含む培地中で培養され、CD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性濃縮TIL集団を取得する。いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、ホノキオール、及びそれらの薬学的に許容される塩からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、AKT阻害剤は、イパタセルチブである。いくつかの実施形態では、TIL集団を、約0.1μM、約0.2μM、約0.3μM、約0.4μM、約0.5μM、約0.6μM、約0.7μM、約0.8μM、約0.9μM、約1μM、約1.1μM、約1.2μM、約1.3μM、約1.4μM、約1.5μM、約1.6μM、約1.7μM、約1.8μM、約1.9μM、約2μM、約2.1μM、約2.2μM、約2.3μM、約2.4μM、約2.5μM、約2.6μM、約2.7μM、約2.8μM、約2.9μM、約3μM、約3.5μM、約4μM
、約4.5μM、約5μM、約6μM、約7μM、約8μM、約9μM、約10μM、約20μM、約30μM、約40μM、約50μM、約60μM、約70μM、約80μM、約90μM、または約100μMのAKT阻害剤を含む培地中で培養する。
いくつかの実施形態では、IL-15は、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約12.5ng/mL、約15ng/mL、または約20ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約10ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-21は、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約45ng/mL、約50ng/mL、約55ng/mL、または約60ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-21は、約30ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IL-15は、約10ng/mLで添加され、IL-21は、約30ng/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、CD40アゴニスト、例えば、CD40Lまたは抗CD40アゴニスト抗体の添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、CD40Lが添加される。いくつかの実施形態では、抗CD40アゴニスト抗体が添加される。いくつかの実施形態では、CD40アゴニストは、約5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約45ng/mL、約50ng/mL、約55ng/mL、または約60ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、CD40アゴニストは、約30ng/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、IFNγの添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、IFNγが添加される。いくつかの実施形態では、IFNγは、約50ng/mL、約55ng/mL、約60ng/mL、約65ng/mL、約70ng/mL、約75ng/mL、約80ng/mL、約85ng/mL、約90ng/mL、約95ng/mL、約100ng/mL、約105ng/mL、約110ng/mL、約115ng/mL、約120ng/mL、約125ng/mL、約130ng/mL、約135ng/mL、約140ng/mL、約145ng/mL、約150ng/mL、約155ng/mL、約160ng/mL、約165ng/mL、約170ng/mL、約175ng/mL、約180ng/mL、約185ng/mL、約190ng/mL、約195ng/mL、約200ng/mL、約205ng/mL、約210ng/mL、約215ng/mL、約220ng/mL、約225ng/mL、約230ng/mL、約235ng/mL、約240ng/mL、約245ng/mL、約250ng/mL、約255ng/mL、約260ng/mL、約265ng/mL、約270ng/mL、約275ng/mL、約280ng/mL、約285ng/mL、約290ng/mL、約295ng/mL、または約300ng/mLで添加される。いくつかの実施形態では、IFNγは、約200ng/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、抗PD-1抗体の添加を含み得る。いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、約5μg/mL、約10μg/mL、約15μg/mL、約20μg/mL、約25μg/mL、約30μg/mL、約35μg/mL、約40μg/mL、約45μg/mL、約50μg/mL、約55μg/mL、または約60μg/mLで添加される。いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、約10μg/mLで添加される。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、D0、D1またはD2において、抗CTLA-4抗体の添加を含み得る。いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、約5μg/mL、約10μg/mL、約15μg/mL、約20μg/mL、約25μg/m
L、約30μg/mL、約35μg/mL、約40μg/mL、約45μg/mL、約50μg/mL、約55μg/mL、または約60μg/mLで添加される。いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、約10μg/mLで添加される。
E.ステップE:TILを採取する
急速な第2の拡張ステップ後、細胞が採取され得る。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に提供されるように、1、2、3、4、またはそれ以上の拡張ステップ後に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に提供されるように、2つの拡張ステップ後に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、2つの拡張ステップ、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に提供されるように、1回のプライミングによる第1の拡張及び1回の急速な第2の拡張の後に採取される。
TILは、任意の適切な滅菌様式で、例えば、遠心分離によって採取され得る。TILを採取するための方法は、当該技術分野で周知であり、任意のかかる既知の方法が本プロセスとともに用いられ得る。いくつかの実施形態では、TILは、自動化系を使用して採取される。
細胞採取機及び/または細胞処理系は、例えば、Fresenius Kabi、Tomtec Life Science、Perkin Elmer、及びInotech
Biosystems International,Incを含む、様々な供給源から市販されている。任意の細胞ベースの採取機が本方法とともに用いられ得る。いくつかの実施形態では、細胞採取機及び/または細胞処理系は、膜ベースの細胞採取機である。いくつかの実施形態では、細胞採取は、LOVO系(Fresenius Kabiによって製造されたもの)などの細胞処理系によるものである。「LOVO細胞処理系」という用語は、細胞を含む溶液を、滅菌及び/または閉鎖系環境で回転膜または回転フィルターなどの膜またはフィルターをとおしてポンプ輸送し、連続フローを可能にし、細胞を処理して、ペレット化せずに上清または細胞培養培地を除去する、任意のベンダーによって製造された任意の機器または装置も指す。いくつかの実施形態では、細胞採取機及び/または細胞処理系は、滅菌閉鎖系内で、細胞分離、洗浄、流体交換、濃縮、及び/または他の細胞処理ステップを行うことができる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張、例えば、図8によるステップD(特に、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)は、閉鎖系バイオリアクターにおいて行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが容器として用いられる。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、例えば、G-REX-100またはG-REX-500である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-REX-100である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-REX-500である。
いくつかの実施形態では、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)によるステップEは、本明細書に記載のプロセスに従って行われる。いくつかの実施形態では、閉鎖系は、閉鎖系の無菌性及び閉鎖性を維持するために、滅菌条件下でシリンジを
介してアクセスされる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるような閉鎖系が用いられる。
いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に記載の方法に従って採取される。いくつかの実施形態では、14~16日目のTILが本明細書に記載の方法を使用して採取される。いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に記載の方法を使用して14日目に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に記載の方法を使用して15日目に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に記載の方法を使用して16日目に採取される。
いくつかの実施形態では、本発明は、(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせについて、本明細書に記載の採取ステップに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を評価または選別することを提供する。(i)CD39/CD69二重陰性及び/または(ii)CD39LO/CD69LO、または(iii)(i)及び(ii)の組み合わせであるTILを選別するための方法は、米国出願第2019/0212332号(これは参照により本明細書に組み込まれる)に見出すことができる。いくつかの実施形態では、細胞選別は、Zhang,X et.al.,Surface Free Energy Activated High-Throughput Cell Sorting,Analytical Chemistry(2014),86:9350-9355(これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に記載される方法を使用して行われる。実施例15及び図41は、かかる方法を使用して選別するためのプロトコルの例を提供する。
F.ステップF:最終製剤及び輸液容器への移行
図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に例示的な順序で提供され、かつ上及び本明細書で詳細に概説されるステップA~Eが完了した後、細胞は、注入バッグまたは無菌バイアルなどの患者への投与に使用するために容器に移される。いくつかの実施形態では、治療的に十分な数のTILが上記の拡張方法を使用して得られると、それらは、患者への投与に使用するために容器に移される。
いくつかの実施形態では、本開示の方法を使用して拡張されたTILは、薬学的組成物として患者に投与される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、滅菌緩衝液中のTIL懸濁液である。本明細書に開示されるように拡張されたTILは、当該技術分野で知られている任意の好適な経路によって投与され得る。いくつかの実施形態では、TILは、単回の動脈内または静脈内注入として投与され、これは、好ましくは、およそ30~60分続く。他の好適な投与経路には、腹腔内、髄腔内、及びリンパ内投与が含まれる。
いくつかの実施形態では、本発明は、(a)プライミングによる第1の拡張の前に、(i)腫瘍断片または試料中のバルクTIL、または第1のTIL集団が、IL-2及び任意選択で腫瘍断片または試料から出るTILを産生するための抗生物質の第1の組み合わせを含有する細胞培養培地中で培養され、(ii)腫瘍断片または試料から出る少なくとも複数のTILが、腫瘍断片または試料から分離して、腫瘍断片または試料、腫瘍断片または試料中に残存するTIL、及び腫瘍断片または試料から出て、分離後に残存する任意のTILの混合物を産生し、(iii)任意選択で、腫瘍断片または試料、腫瘍断片または試料中に残存するTIL、及び腫瘍断片または試料から出て、分離後に残存する任意のTILの混合物を消化して、かかる混合物の消化物を産生し、(b)プライミングによる第1の拡張を、混合物または混合物の消化物を使用して行うように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載される方法を提供する。いくつかの実施形態では、
腫瘍断片または試料から出るTILの少なくとも約1%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%以上が、腫瘍断片または試料から分離されて、混合物を産生する。
いくつかの実施形態では、本発明は、プライミングによる第1の拡張前の培養ステップが、約1日~約3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、プライミングによる第1の拡張の前に、培養ステップが約1、2、3、4、5、6、または7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、(a)プライミングの第1の拡張に先立つCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO事前選択ステップの前に、(i)腫瘍断片または試料中のバルクTIL、または第1のTIL集団が、IL-2を含有する細胞培養培地中で培養されて、腫瘍断片または試料から出るTILを産生するように、(ii)腫瘍断片または試料から出る少なくとも複数のTILが、腫瘍断片または試料から分離されて、腫瘍断片または試料、腫瘍断片または試料に残るTIL、及び腫瘍断片または試料から出て、分離後に残る任意のTILの混合物を産生するように、(iii)腫瘍断片または試料、腫瘍断片または試料に残るTIL、及び腫瘍断片または試料から出て、分離後に残る任意のTILの混合物が消化されて、かかる混合物の消化物を産生するように、かつ(b)CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO予備選択ステップが、混合物の消化物を使用して行われて、TILのCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO集団を産生するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。いくつかの実施形態では、腫瘍断片または試料から出るTILの少なくとも約1%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%以上が、腫瘍断片または試料から分離されて、混合物を産生する。
いくつかの実施形態では、本発明は、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO事前選択ステップ前の培養ステップが、約1日~約3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LO事前選択ステップ前の培養ステップが、約1、2、3、4、5、6または7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
V.さらなるGen2、Gen3、及び他のTIL製造プロセスの実施形態
A.PBMCフィーダー細胞比
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用される培養培地(例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)を参照されたい)は、抗CD3抗体、例えばOKT-3を含む。IL-2と組み合わせた抗CD3抗体は、TIL集団におけるT細胞活性化及び細胞分裂を誘導する。この効果は、全長抗体、ならびにFab及びF(ab′)2断片で見ることができ、前者が一般に好まれ、例えば、Tsoukas et al.,J.Immunol.1985,135,1719(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)を参照されたい。
いくつかの実施形態では、PBMCフィーダー層の数は、以下のように計算される:
T細胞の体積(10μm直径):V = (4/3) πr =523.6 μm
40μm(4細胞)の高さを有するG-REX-100(M)のカラム:V = (4/3) πr = 4×1012 μm
カラムBを充填するために必要な細胞数:4×1012 μm / 523.6 μm = 7.6×10 μm * 0.64 = 4.86×10
四次元空間で最適に活性化され得る細胞の数:4.86×10 / 24 = 20.25×10
G-REX-500に外挿されるフィーダー及びTILの数:TIL: 100×10及びフィーダー:2.5×10
この計算では、100cmの底部を有するシリンジ中でのTILの活性化のために二十面体形状を提供するのに必要な単核細胞の数の近似値が使用される。この計算は、Jin,et.al.,J.Immunother.2012,35,283-292に記載されているように、NCI実験データを密接に反映するT細胞の閾値活性化について、約5×10の実験結果を導き出す。(C)では、乗数(0.64)は、Jaeger and Nagel,Science,1992,255,1523-3によって計算された等価球のランダム充填密度である。(D)では、除数24は、Musin,Russ.Math.Surv.,2003,58,794-795に記載される、四次元空間内の同様のオブジェクトと接触する可能性のある等価球の数または「ニュートン数」である。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給される抗原提示フィーダー細胞の数は、急速な第2の拡張中に外因的に供給される抗原提示フィーダー細胞の数のおよそ半分である。ある特定の実施形態では、この方法は、急速な第2の拡張の細胞培養培地と比較しておよそ50%少ない抗原提示細胞を含む細胞培養培地中でプライミングによる第1の拡張を行うことを含む。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給される抗原提示フィーダー細胞(APC)の数は、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数よりも多い。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約20:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約9:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約8:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約
1.1:1~正確にまたは約7:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約6:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2
:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1である。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数のプライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1、1.2:1、1.3:1、1.4:1、1.5:1、1.6:1、1.7:1、1.8:1、1.9:1、2:1、2.1:1、2.2:1、2.3:1、2.4:1、2.5:1、2.6:1、2.7:1、2.8:1、2.9:1、3:1、3.1:1、3.2:1、3.3:1、3.4:1、3.5:1、3.6:1、3.7:1、3.8:1、3.9:1、4:1、4.1:1、4.2:1、4.3:1、4.4:1、4.5:1、4.6:1、4.7:1、4.8:1、4.9:1、または5:1である。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約1×10、1.1×10、1.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、または3.5×10APCであり、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、7.5×10、7.6×10、7.7×10、7.8×10、7.9×10、8×10、8.1×10、8.2×10、8.3×10、8.4×10、8.5×10、8.6×10、8.7×10、8.8×10、8.9×10、9×10、9.1×10、9.2×10、9.3×10、9.4×10、9.5×10、9.6×10、9.7×10、9.8×10、9.9×10、または1×10APCである。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約1.5×10APC~正確にまたは約3×10APCの範囲から選択され、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約4×10APC~正確にまたは約7.5×10APCの範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約2×10APC~正確にまたは約2.5×10APCの範囲から選択され、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約4.5×10APC~正確にまたは約5.5×10APCの範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約2.5×10APCであり、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約5×10APCである。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に追加されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、プライミングによる第1の拡張の7日目(例えば、方法の7日目)に追加されるPBMCの数のおよそ半分である。ある特定の実施形態では、方法は、プライミングによる第1の拡張の0日目に抗原提示細胞を第1のTIL集団に追加することと、7日目に抗原提示細胞を第2のTIL集団に追加することとを含み、0日目に追加される抗原提示細胞の数は、プライミングによる第1の拡張の7日目(例えば、方法の7日目)に追加される抗原提示細胞の数のおよそ50%である。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるPBMCの数よりも多い。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.0×10APC/cm~正確にまたは約4.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.5×10APC/cm~正確にまたは約3.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2×10APC/cm~正確にまたは約3×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2×10APC/cmの密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.0×10、1.1×10、1.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、または4.5×10APC/cmの密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2.5×10APC/cm~正確にまたは約7.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約3.5×10APC/cm~正確にまたは約6.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約4.0×10APC/cm~正確にまたは約5.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約4.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2.5×10APC/cm、2.6×10APC/cm、2.7×10APC/cm、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、または7.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.0×10、1.1×10、1.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、または4.5×10APC/cmの密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2.5×10APC/cm、2.6×10APC/cm、2.7×10APC/cm、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、または7.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPC
は、正確にまたは約1.0×10APC/cm~正確にまたは約4.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2.5×10APC/cm~正確にまたは約7.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.5×10APC/cm~正確にまたは約3.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約3.5×10APC/cm~正確にまたは約6×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2×10APC/cm~正確にまたは約3×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約4×10APC/cm~正確にまたは約5.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2×10APC/cmの密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約4×10APC/cmの密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるPBMCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約20:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるPBMCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるPBMCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約9:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約8:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約7:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、
PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約6:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、
PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、
PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数のプライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1である。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数のプライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1、1.2:1、1.3:1、1.4:1、1.5:1、1.6:1、1.7:1、1.8:1、1.9:1、2:1、2.1:1、2.2:1、2.3:1、2.4:1、2.5:1、2.6:1、2.7:1、2.8:1、2.9:1、3:1、3.1:1、3.2:1、3.3:1、3.4:1、3.5:1、3.6:1、3.7:1、3.8:1、3.9:1、4:1、4.1:1、4.2:1、4.3:1、4.4:1、4.5:1、4.6:1、4.7:1、4.8:1、4.9:1、または5:1である。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約1×10、1.1×10、1
.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、または3.5×10APC(例えば、PBMCを含む)であり、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、7.5×10、7.6×10、7.7×10、7.8×10、7.9×10、8×10、8.1×10、8.2×10、8.3×10、8.4×10、8.5×10、8.6×10、8.7×10、8.8×10、8.9×10、9×10、9.1×10、9.2×10、9.3×10、9.4×10、9.5×10、9.6×10、9.7×10、9.8×10、9.9×10、または1x10APC(例えば、PBMCを含む)である。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約1×10APC(例えば、PBMCを含む)~正確にまたは約3.5×10APC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択され、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約3.5×10APC(例えば、PBMCを含む)~正確にまたは約1×10APC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約1.5×10APC~約3×10APC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択され、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、約4×10APC(例えば、PBMCを含む)~約7.5×10APC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約2×10APC(例えば、PBMCを含む)~正確にまたは約2.5×10APC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択され、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約4.5×10APC(例えば、PBMCを含む)~正確にまたは約5.5×10APC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約2.5×10APC(例えば、PBMCを含む)であり、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約5×10APC(例えば、PBMCを含む)である。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に追加されるAPC
(例えば、PBMCを含む)層の数は、急速な第2の拡張の7日目に追加されるAPC(例えば、PBMCを含む)層の数のおよそ半分である。ある特定の実施形態では、方法は、プライミングによる第1の拡張の0日目に抗原提示細胞層を第1のTIL集団に追加することと、7日目に抗原提示細胞を第2のTIL集団に追加することとを含み、0日目に追加される抗原提示細胞層の数は、7日目に追加される抗原提示細胞層の数のおよそ50%である。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)層の数は、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)層の数よりも多い。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約2細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約4細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第3の拡張の7日目は、正確にまたは約2細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1.5細胞層~正確にまたは約2.5細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約3細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約2細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、または3細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、または8細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1細胞層~正確にまたは約2細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約3細胞層~正確にまたは約10細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約2細胞
層~正確にまたは約3細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約2細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1、2、または3細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約3、4、5、6、7、8、9、または10細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:10の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:8の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:7の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:6の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PB
MCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:5の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:4の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:3の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:2の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.2~正確にまたは約1:8の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.3~正確にまたは約1:7の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBM
Cを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.4~正確にまたは約1:6の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.5~正確にまたは約1:5の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.6~正確にまたは約1:4の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.7~正確にまたは約1:3.5の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.8~正確にまたは約1:3の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数のAPC(例えば、PBMCを含む)の、第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.9~正確にまたは約1:2.5の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:2.
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、第1のAPC(例えば、PBMCを含む)層の数の第2のAPC(例えば、PBMCを含む)層の数に対する比は、約1:1.1、1:1.2、1:1.3、1:1.4、1:1.5、1:1.6、1:1.7、1:1.8、1:1.9、1:2、1:2.1、1:2.2、1:2.3、1:2.4、1:2.5、1:2.6、1:2.7、1:2.8、1:2.9、1:3、1:3.1、1:3.2、1:3.3、1:3.4、1:3.5、1:3.6、1:3.7、1:3.8、1:3.9、1:4、1:4.1、1:4.2、1:4.3、1:4.4、1:4.5、1:4.6、1:4.7、1:4.8、1:4.9、1:5、1:5.1、1:5.2、1:5.3、1:5.4、1:5.5、1:5.6、1:5.7、1:5.8、1:5.9、1:6、1:6.1、1:6.2、1:6.3、1:6.4、1:6.5、1:6.6、1:6.7、1:6.8、1:6.9、1:7、1:7.1、1:7.2、1:7.3、1:7.4、1:7.5、1:7.6、1:7.7、1:7.8、1:7.9、1:8、1:8.1、1:8.2、1:8.3、1:8.4、1:8.5、1:8.6、1:8.7、1:8.8、1:8.9、1:9、1:9.1、1:9.2、1:9.3、1:9.4、1:9.5、1:9.6、1:9.7、1:9.8、1:9.9、または1:10から選択される。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張におけるAPCの数は、約1.0×10APC/cm~約4.5×10APC/cmの範囲から選択され、急速な第2の拡張におけるAPCの数は、約2.5×10APC/cm~約7.5×10APC/cmの範囲から選択される。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張におけるAPCの数は、約1.5×10APC/cm~約3.5×10APC/cmの範囲から選択され、急速な第2の拡張におけるAPCの数は、約3.5×10APC/cm~約6.0×10APC/cmの範囲から選択される。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張におけるAPCの数は、約2.0×10APC/cm~約3.0×10APC/cmの範囲から選択され、急速な第2の拡張におけるAPCの数は、約4.0×10APC/cm~約5.5×10APC/cmの範囲から選択される。
B.任意選択の細胞培地成分
1.抗CD3抗体
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用される培養培地(例えば、図1及び8(特に、例えば図8B)を参照されたい)は、抗CD3抗体を含む。IL-2と組み合わせた抗CD3抗体は、TIL集団におけるT細胞活性化及び細胞分裂を誘導する。この効果は、全長抗体、ならびにFab及びF(ab′)2断片で見ることができ、前者が一般に好まれ、例えば、Tsoukas et al.,J.Immunol.1985,135,1719(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)を参照されたい。
当業者によって理解されるように、マウス、ヒト、霊長類、ラット、及びイヌ抗体を含むが、これらに限定されない、様々な哺乳動物由来の抗ヒトCD3ポリクローナル及びモノクローナル抗体を含む、本発明での使用が見出されるいくつかの好適な抗ヒトCD3抗体が存在する。いくつかの実施形態では、抗CD3抗体ムロモナブであるOKT3が使用
される(Ortho-McNeil,Raritan,NJまたはMiltenyi Biotech,Auburn,CAから市販されている)。表1を参照されたい。
当業者によって理解されるように、マウス、ヒト、霊長類、ラット、及びイヌ抗体を含むが、これらに限定されない、様々な哺乳動物由来の抗ヒトCD3ポリクローナル及びモノクローナル抗体を含む、本発明での使用が見出されるいくつかの好適な抗ヒトCD3抗体が存在する。いくつかの実施形態では、抗CD3抗体ムロモナブであるOKT3が使用される(Ortho-McNeil,Raritan,NJまたはMiltenyi Biotech,Auburn,CAから市販されている)。
2.4-1BB(CD137)アゴニスト
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張及び/または急速な第2の拡張の細胞培養培地は、TNFRSFアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BB(CD137)アゴニストである。4-1BBアゴニストは、当該技術分野で知られている任意の4-1BB結合分子であり得る。4-1BB結合分子は、ヒトまたは哺乳動物の4-1BBに結合することができるモノクローナル抗体または融合タンパク質であり得る。4-1BBアゴニストまたは4-1BB結合分子は、任意のアイソタイプ(例えば、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA、及びIgY)、クラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、及びIgA2)、またはサブクラスの免疫グロブリン分子の免疫グロブリン重鎖を含み得る。4-1BBアゴニストまたは4-1BB結合分子は、重鎖及び軽鎖の両方を有し得る。本明細書で使用される場合、結合分子という用語は、抗体(全長抗体を含む)、モノクローナル抗体(全長モノクローナル抗体を含む)、ポリクローナル抗体、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、ヒト、ヒト化またはキメラ抗体、及び抗体断片、例えば、Fab断片、F(ab′)断片、Fab発現ライブラリーによって産生された断片、上記のうちのいずれかのエピトープ結合断片、ならびに4-1BBに結合する抗体の操作された形態、例えば、scFv分子も含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、完全ヒト抗体である抗原結合タンパク質である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、ヒト化抗体である抗原結合タンパク質である。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法及び組成物に使用するための4-1BBアゴニストには、抗4-1BB抗体、ヒト抗4-1BB抗体、マウス抗4-1BB抗体、哺乳動物抗4-1BB抗体、モノクローナル抗4-1BB抗体、ポリクローナル抗4-1BB抗体、キメラ抗4-1BB抗体、抗4-1BBアドネクチン、抗4-1BBドメイン抗体、一本鎖抗4-1BB断片、重鎖抗4-1BB断片、軽鎖抗4-1BB断片、抗4-1BB融合タンパク質、及びそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、またはバイオシミラーが含まれる。アゴニスト抗4-1BB抗体は、強力な免疫応答を誘導することが知られている。Lee,et al.,PLOS One 2013,8,e69677。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、アゴニスト、抗4-1BBヒト化、または完全ヒトモノクローナル抗体(すなわち、単一の細胞株に由来する抗体)である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、EU-101(Eutilex Co.Ltd.)、ウトミルマブ、もしくはウレルマブ、またはそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、もしくはバイオシミラーである。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウトミルマブもしくはウレルマブ、またはそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、もしくはバイオシミラーである。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストまたは4-1BB結合分子は、融合タンパク質である場合もある。いくつかの実施形態では、三量体または六量体4-1BBアゴニスト(3つまたは6つのリガンド結合ドメインを有する)などの多量体4-1BBアゴニストは、典型的に2つのリガンド結合ドメインを有するアゴニストモノクローナル抗体と比較して、優れた受容体(4-1BBL)クラスター化及び内部細胞シグナル伝達複
合体形成を誘導し得る。3つのTNFRSF結合ドメイン及びIgG1-Fcを含み、かつ任意選択でこれらの融合タンパク質のうちの2つ以上をさらに結合する三量体(三価)または六量体(もしくは六価)またはそれ以上の融合タンパク質は、例えば、Gieffers,et al.,Mol.Cancer Therapeutics 2013,12,2735-47に記載されている。
アゴニスト4-1BB抗体及び融合タンパク質は、強い免疫応答を誘導することが知られている。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、毒性を低減するのに十分な様式で4-1BB抗原に特異的に結合するモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、抗体依存性細胞毒性(cellular toxicity)(ADCC)、例えば、NK細胞細胞傷害性(cytotoxicity)を抑制するアゴニスト4-1BBモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、抗体依存性細胞食作用(ADCP)を無効にするアゴニスト4-1BBモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、補体依存性細胞傷害性(CDC)を抑制するアゴニスト4-1BBモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、Fc領域機能性を無効にするアゴニスト4-1BBモノクローナル抗体または融合タンパク質である。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、高い親和性及びアゴニスト活性でヒト4-1BB(配列番号40)に結合することを特徴とする。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、ヒト4-1BBに結合する結合分子である(配列番号40)。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、マウス4-1BBに結合する結合分子である(配列番号41)。4-1BBアゴニストまたは結合分子が結合する4-1BB抗原のアミノ酸配列を表5に要約する。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウス4-1BBに約100pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約90pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約80pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約70pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約60pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約50pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約40pM以下のKで結合する、またはヒトもしくはマウス4-1BBに約30pM以下のKで結合する、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウス4-1BBに約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約8×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約8.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約9×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約9.5×101/M・s以上のkassocで結合する、またはヒトもしくはマウス4-1BBに約1×101/M・s以上のkassocで結合する4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.1×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.3×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.4×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.5×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.6×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.7×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.8×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.9×10-51/s以下のkdissocで結合する、またはヒトもしくはマウス4-1BBに約3×10-51/s以下のkdissocで結合する、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス及び方法は、ヒトもしくはマウス4-1BBに約10nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約9nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約8nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約7nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約6nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約5nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約4nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約3nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約1nM以下のIC50で結合する、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、PF-05082566もしくはMOR-7480としても知られるウトミルマブ、またはその断片、誘導体、バリアント、もしくはバイオシミラーである。ウトミルマブは、Pfizer,Inc.から入手可能である。ウトミルマブは、免疫グロブリンG2-ガンマ、抗[ホモサピエンスTNFRSF9(腫瘍壊死因子受容体(TNFR)スーパーファミリーメンバー9、4-1BB、T細胞抗原ILA、CD137)]、ホモサピエンス(完全ヒト)モノクローナル抗体である。ウトミルマブのアミノ酸配列を表6に示す。ウトミルマブは、Asn59及びAsn292にグリコシル化部位、22-96位(V-V)、143-199位(C1-C)、256-316位(C2)、及び362-420位(C3)に重鎖鎖内ジスルフィド架橋、22′-87′位(V-V)及び136′-195′位(C1-C)に軽鎖鎖内ジスルフィド架橋、IgG2Aアイソフォーム218-218、219-219、222-222、及び225-225位、IgG2A/Bアイソフォーム218-130、219-219、222-222、及び225-225位、ならびにIgG2Bアイソフォーム219-130(2)、222-222、及び225-225位に鎖
間重鎖-重鎖ジスルフィド架橋、ならびにIgG2Aアイソフォーム130-213′(2)位、IgG2A/Bアイソフォーム218-213′位、及び130-213′位、ならびにIgG2Bアイソフォーム218-213′(2)位に鎖間重鎖-軽鎖ジスルフィド架橋を含む。ウトミルマブならびにそのバリアント及び断片の調製及び特性は、米国特許第8,821,867号、同第8,337,850号、及び同第9,468,678号、ならびに国際特許出願公開第WO2012/032433A1号(これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。ウトミルマブの前臨床特徴は、Fisher,et al.,Cancer Immunolog.&Immunother.2012,61,1721-33に記載されている。様々な血液学的及び固形腫瘍適応症におけるウトミルマブの現在の臨床試験には、米国国立衛生研究所のclinicaltrials.gov識別子NCT02444793、NCT01307267、NCT02315066、及びNCT02554812が含まれる。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、配列番号42によって示される重鎖及び配列番号43によって示される軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウトミルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号44に示される配列を含み、4-1BBアゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号45に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含むscFv抗体を含む。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、それぞれ、配列番号46、配列番号47、及び配列番号48に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号49、配列番号
50、及び配列番号51に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウトミルマブに関して薬物規制当局によって承認された4-1BBアゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照バイオ製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含む4-1BB抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウトミルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出された4-1BBアゴニスト抗体であり、4-1BBアゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウトミルマブである。4-1BBアゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウトミルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウトミルマブである。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、BMS-663513及び20H4.9.h4aとしても知られるモノクローナル抗体ウレルマブ、またはそれらの断片、誘導体、バリアント、もしくはバイオシミラーである。ウレルマブは、Bristol-Myers Squibb,Inc.及びCreative Biolabs,Inc.から入手可能である。ウレルマブは、免疫グロブリンG4-カッパ、抗[ホモサピエンスTNFRSF9(腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー9、4-1BB、T細胞抗原ILA、CD137)]、ホモサピエンス(完全ヒト)モノクローナル抗体である。ウレルマブのアミノ酸配列を表7に示す。ウレルマブは、298位(及び298′′)にN-グリコシル化部位、22-95位(V-V)、148-204位(C1-C)、262-322位(C2)、及び368-426位(C3)(22′′-95′′、148′′-204′′、262′′-322′′、及び368′′-426′′位)に重鎖鎖内ジスルフィド架橋、23′-88′位(V-V)及び136′-196′位(C1-C)(23′′′-88′′′及び136′′′-196′′′位)に軽鎖鎖内ジスルフィド架橋、227-227′′位及び230-230′′位に鎖間重鎖-重鎖ジスルフィド架橋ならびに135-216′及び135′′-216′′′に鎖間重鎖-軽鎖ジスルフィド架橋を含む。ウレルマブならびにそのバリアント及び断片の調製及び特性は、米国特許第7,288,638号及び同第8,962,804号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。ウレルマブの前臨床及び臨床特徴は、Segal,et al.,Clin.Cancer Res.2016に記載されており、http:/dx.doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-16-1272で入手可能である。様々な血液学的及び固形腫瘍適応症におけるウレルマブの現在の臨床試験には、米国国立衛生研究所のclinicaltrials.gov識別子NCT01775631、NCT02110082、NCT02253992、及びNCT01471210が含まれる。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、配列番号52によって示される重鎖及び配列番号53によって示される軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウレルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号54に示される配列を含み、4-1BBアゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号55に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54
及び配列番号55に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含むscFv抗体を含む。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、それぞれ、配列番号56、配列番号57、及び配列番号58に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号59、配列番号60、及び配列番号61に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウレルマブに関して薬物規制当局によって承認された4-1BBアゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照バイオ製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含む4-1BB抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウレルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出された4-1BBアゴニスト抗体であり、4-1BBアゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウレルマブである。4-1BBアゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウレルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウレルマブである。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、1D8、3Elor、4B4(BioLegend 309809)、H4-1BB-M127(BD Pharmingen 552532)、BBK2(Thermo Fisher MS621PABX)、145501(Leinco Technologies B591)、ATCC番号HB-11248として寄託された細胞株によって産生され、米国特許第6,974,863号に開示される抗体、5F4(BioLegend 31 1503)、C65-485(BD Pharmingen 559446)、米国特許出願公開第2005/0095244号に開示される抗体、米国特許第7,288,638号に開示される抗体(例えば、20H4.9-IgGl(BMS-663031))、米国特許第6,887,673号に開示される抗体(例えば、4E9もしくはBMS-554271)、米国特許第7,214,493号に開示される抗体、米国特許第6,303,121号に開示される抗体、米国特許第6,569,997号に開示される抗体、米国特許第6,905,685号に開示される抗体(例えば、4E9もしくはBMS-554271)、米国特許第6,362,325号に開示される抗体(例えば、1D8もしくはBMS-469492、3H3もしくはBMS-469497、または3El)、米国特許第6,974,863号に開示される抗体(例えば、53A2)、米国特許第6,210,669号に開示される抗体(例えば、1D8、3B8、もしくは3El)、米国特許第5,928,893号に開示される抗体、米国特許第6,303,121号に開示される抗体、米国特許第6,569,997号に開示される抗体、国際特許出願公開第WO2012/177788号、同第WO2015/119923号、及び同第WO2010/042433号に開示される抗体、ならびにそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、またはバイオシミラ
ーからなる群から選択され、前述の特許または特許出願公開の各々の開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、国際特許出願公開第WO2008/025516A1号、同第WO2009/007120A1号、同第WO2010/003766A1号、同第WO2010/010051A1号、及び同第WO2010/078966A1号、米国特許出願公開第2011/0027218A1号、同第2015/0126709A1号、同第2011/0111494A1号、同第2015/0110734A1号、及び同第2015/0126710A1号、ならびに米国特許第9,359,420号、同第9,340,599号、同第8,921,519号、及び同第8,450,460号に記載される4-1BBアゴニスト融合タンパク質であり、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、構造I-A(C末端Fc抗体断片融合タンパク質)もしくは構造I-B(N末端Fc抗体断片融合タンパク質)に示されるような4-1BBアゴニスト融合タンパク質、またはそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、もしくはバイオシミラーである(図18を参照されたい)。構造I-A及びI-Bにおいて、円筒は、個々のポリペプチド結合ドメインを指す。構造I-A及びI-Bは、例えば、4-1BBL(4-1BBリガンド、CD137リガンド(CD137L)、もしくは腫瘍壊死因子スーパーファミリーメンバー9(TNFSF9))または4-1BBに結合する抗体に由来する3つの直線的に連結されたTNFRSF結合ドメインを含み、これらが折り重なって三価タンパク質を形成し、その後、これがIgG1-Fc(C3及びC2ドメインを含む)によって第2の三価タンパク質に連結され、その後、これを使用して、三価タンパク質のうちの2つをジスルフィド結合(小さく長細い楕円)によって一緒に連結し、構造を安定化し、6つの受容体及びシグナル伝達タンパク質の細胞内シグナル伝達ドメインを一緒にして、シグナル伝達複合体を形成することができるアゴニストを提供する。円筒として示されるTNFRSF結合ドメインは、例えば、親水性残基及び柔軟性のためのGly及びSer配列、ならびに溶解性のためのGlu及びLysを含み得るリンカーによって結合されたV鎖及びV鎖を含む、scFvドメインであり得る。de Marco,Microbial Cell Factories,2011,10,44、Ahmad,et al.,Clin.&Dev.Immunol.2012,980250、Monnier,et al.,Antibodies,2013,2,193-208、または本明細書の他の場所に組み込まれている参照文献に記載されるものなどの任意のscFvドメイン設計が使用され得る。この形態の融合タンパク質構造は、米国特許第9,359,420号、同第9,340,599号、同第8,921,519号、及び同第8,450,460号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
図18に示される構造I-Aの他のポリペプチドドメインのアミノ酸配列は、表8に見出される。Fcドメインは、好ましくは、完全な定常ドメイン(配列番号62のアミノ酸17~230)、完全なヒンジドメイン(配列番号62のアミノ酸1~16)、またはヒンジドメインの一部(例えば、配列番号62のアミノ酸4~16)を含む。C末端Fc抗体を結合するための好ましいリンカーは、追加のポリペプチドの融合に好適なリンカーを含む、配列番号63~配列番号72に示される実施形態から選択され得る。
図18に示される構造I-Bの他のポリペプチドドメインのアミノ酸配列は、表9に見出される。Fc抗体断片が構造I-BにあるようなTNRFSF融合タンパク質のN末端に融合される場合、Fcモジュールの配列は、好ましくは、配列番号73に示されるものであり、リンカー配列は、好ましくは、配列番号74~配列番号76に示される実施形態から選択される。
いくつかの複合体実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、ウトミルマブの可変重鎖及び可変軽鎖、ウレルマブの可変重鎖及び可変軽鎖、ウトミルマブの可変重鎖及び可変軽鎖、表10に記載の可変重鎖及び可変軽鎖から選択される可変重鎖及び可変軽鎖、前述の可変重鎖及び可変軽鎖の任意の組み合わせ、
ならびにそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、及びバイオシミラーからなる群から選択される1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。
いくつかの複合体実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、4-1BBL配列を含む1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、配列番号77による配列を含む1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、可溶性4-1BBL配列を含む1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、配列番号78による配列を含む1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号43及び配列番号44に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上の4-1BB結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインは、リンカーによって結合されている。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上の4-1BB結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインは、リンカーによって結合されている。いくつか実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、各々が、表10に示されるV配列及びV配列と少なくとも95%同一であるV配列及びV配列を含むscFvドメインである1つ以上の4-1BB結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインはリンカーによって結合されている。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、(i)第1の可溶性4-1BB結合ドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性4-1BB結合ドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性4-1BB結合ドメインを含む4-1BBアゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、N末端及び/またはC末端に追加のドメインをさらに含み、追加のドメインは、FabまたはFc断片ドメインである。いくつか実施形態では、4-1BBアゴニストは、(i)第1の可溶性4-1BB結合ドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性4-1BB結合ドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性4-1BB結合ドメインを含む4-1BBアゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、N末端及び/またはC末端に追加のドメインをさらに含み、追加のドメインは、FabまたはFc断片ドメインであり、可溶性4-1BBドメインは各々、茎領域(三量体化に寄与し、細胞膜まである特定の距離を提供するが、4-1BB結合ドメインの一部分ではない)を欠き、第1及び第2のペプチドリンカーは独立して、3~8アミノ酸長を有する。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、(i)第1の可溶性腫瘍壊死因子(TNF)スーパーファミリーサイトカインドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメインを含む4-1BBアゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメインは各々、茎領域を欠き、第1及び第2のペプチドリンカーは独立して、3~8アミノ酸長であり、各TNFスーパーファミリーサイトカインドメインは、4-1BB結合ドメインである。
いくつか実施形態では、4-1BBアゴニストは、前述のVドメインのうちのいずれかに連結された前述のVドメインのうちのいずれかを含む4-1BBアゴニストscFv抗体である。
いくつか実施形態では、4-1BBアゴニストは、BPS Bioscience(San Diego,CA,USA)から市販されているBPS Bioscience 4-1BBアゴニスト抗体カタログ番号79097-2である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、Creative Biolabs(Shirley,NY,USA)から市販されているCreative Biolabs 4-1BBアゴニスト抗体カタログ番号MOM-18179である。
3.OX40(CD134)アゴニスト
いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、OX40(CD134)アゴニストである。OX40アゴニストは、当該技術分野で知られている任意のOX40結合分子であり得る。OX40結合分子は、ヒトまたは哺乳動物のOX40に結合することができるモノクローナル抗体または融合タンパク質であり得る。OX40アゴニストまたはOX40結合分子は、任意のアイソタイプ(例えば、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA、及びIgY)、クラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、及びIgA2)、またはサブクラスの免疫グロブリン分子の免疫グロブリン重鎖を含み得る。OX40アゴニストまたはOX40結合分子は、重鎖及び軽鎖の両方を有し得る。本明細書で使用される場合、結合分子という用語は、抗体(全長抗体を含む)、モノクローナル抗体(全長モノクローナル抗体を含む)、ポリクローナル抗体、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、ヒト、ヒト化またはキメラ抗体、及び抗体断片、例えば、Fab断片、F(ab′)断片、Fab発現ライブラリーによって産生された断片、上記のうちのいずれかのエピトープ結合断片、ならびにOX40に結合する抗体の操作された形態、例えば、scFv分子も含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、完全ヒト抗体である抗原結合タンパク質である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、ヒト化抗体である抗原結合タンパク質である。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法及び組成物に使用するためのOX40アゴニストには、抗OX40抗体、ヒト抗OX40抗体、マウス抗OX40抗体、哺乳動物抗OX40抗体、モノクローナル抗OX40抗体、ポリクローナル抗OX40抗体、キメラ抗OX40抗体、抗OX40アドネクチン、抗OX40ドメイン抗体、一本鎖抗OX40断片、重鎖抗OX40断片、軽鎖抗OX40断片、抗OX40融合タンパク質、及びそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、またはバイオシミラーが含まれる。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、アゴニスト、抗OX40ヒト化、または完全ヒトモノクローナル抗体(すなわち、単一の細胞株に由来する抗体)である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストまたはOX40結合分子は、融合タンパク質である場合もある。OX40Lに融合されたFcドメインを含むOX40融合タンパク質は、例えば、Sadun,et al.,J.Immunother.2009,182,1481-89に記載されている。いくつかの実施形態では、三量体または六量体OX40アゴニスト(3つまたは6つのリガンド結合ドメインを有する)などの多量体OX40アゴニストは、典型的に2つのリガンド結合ドメインを有するアゴニストモノクローナル抗体と比較して、優れた受容体(OX40L)クラスター化及び内部細胞シグナル伝達複合体形成を誘導し得る。3つのTNFRSF結合ドメイン及びIgG1-Fcを含み、かつ任意選択でこれらの融合タンパク質のうちの2つ以上をさらに結合する三量体(三価)または六量体(もしくは六価)またはそれ以上の融合タンパク質は、例えば、Gieffers,et al.,Mol.Cancer Therapeutics 2013,12,2735-47に記載されている。
アゴニストOX40抗体及び融合タンパク質は、強い免疫応答を誘導することが知られている。Curti,et al.,Cancer Res.2013,73,7189-98。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、毒性を低減するのに十分な様式でOX40抗原に特異的に結合するモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体依存性細胞毒性(cellular toxicity)(ADCC)、例えば、NK細胞細胞傷害性(cytotoxicity)を抑制するアゴニストOX40モノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体依存性細胞食作用(ADCP)を無効にするアゴニストOX40モノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、補体依存性細胞傷害(CDC)を無効にするアゴニストOX40モノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Fc領域機能性を無効にするアゴニストOX40モノクローナル抗体または融合タンパク質である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、ヒトOX40(配列番号85)に高い親和性及びアゴニスト活性で結合することを特徴とする。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、ヒトOX40に結合する結合分子である(配列番号85)。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、マウスOX40に結合する結合分子である(配列番号86)。OX40アゴニストまたは結合分子が結合するOX40抗原のアミノ酸配列を表11に要約する。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウスOX40に約100pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約90pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約80pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約70pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約60pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約50pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約40pM以下のKで結合する、またはヒトもしくはマウスOX40に約30pM以下のKで結合するOX40アゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウスOX40に約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約8×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約8.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約9×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒ
トもしくはマウスOX40に約9.5×101/M・s以上のkassocで結合する、またはヒトもしくはマウスOX40に約1×101/M・s以上のkassocで結合するOX40アゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウスOX40に約2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.1×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.3×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.4×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.5×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.6×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.7×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.8×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.9×10-51/s以下のkdissocで結合する、またはヒトもしくはマウスOX40に約3×10-51/s以下のkdissocで結合する、OX40アゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウスOX40に約10nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約9nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約8nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約7nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約6nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約5nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約4nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約3nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約1nM以下のIC50で結合する、OX40アゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、MEDI0562またはMEDI-0562としても知られるタボリキシズマブである。タボリキシズマブは、AstraZeneca,Inc.の子会社であるMedImmuneから入手可能である。タボリキシズマブは、免疫グロブリンG1-カッパ、抗[ホモサピエンスTNFRSF4(腫瘍壊死因子受容体(TNFR)スーパーファミリーメンバー4、OX40、CD134)]、ヒト化及びキメラモノクローナル抗体である。タボリキシズマブのアミノ酸配列を表12に示す。タボリキシズマブは、301及び301′′位にN-グリコシル化部位(フコシル化複合二分岐CHO型グリカンを有する)、22-95位(V-V)、148-204位(C1-C)、265-325位(C2)、及び371-429位(C3)(及び22′′-95′′、148′′-204′′、265′′-325′′、及び371′′-429′′位)に重鎖鎖内ジスルフィド架橋、23′-88′位(V-V)及び134′-194′位(C1-C)(及び23′′′-88′′′及び134′′′-194′′′位)に軽鎖鎖内ジスルフィド架橋、230-230”及び233-233”位に重鎖鎖内ジスルフィド架橋、ならびに224-214′及び224′′-214′′′に鎖間重鎖-軽鎖ジスルフィド架橋を含む。様々な固形腫瘍適応症におけるタボリキシズマブの現在の臨床試験には、米国国立衛生研究所のclinicaltrials.gov識別子NCT02318394及びNCT02705482が含まれる。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、配列番号87によって示される重鎖及び配列番号88によって示される軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアン
ト、もしくはコンジュゲートを含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、タボリキシズマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号89に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号90に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含むscFv抗体を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号91、配列番号92、及び配列番号93に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号94、配列番号95、及び配列番号96に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、タボリキシズマブに関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照バイオ製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、タボリキシズマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、タボリキシズマブである。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって承認され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は
、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、タボリキシズマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、タボリキシズマブである。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Pfizer,Inc.から入手可能な完全ヒト抗体である11D4である。11D4の調製及び特性は、米国特許第7,960,515号、同第8,236,930号、及び同第9,028,824号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。11D4のアミノ酸配列を表13に示す。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、配列番号97によって示される重鎖及び配列番号98によって示される軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列を有する重鎖及び軽
鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくはコンジュゲートを含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、11D4の重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号99に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号100に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号101、配列番号102、及び配列番号103に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号104、配列番号105、及び配列番号106に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、11D4に関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照バイオ製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、11D4である。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、11D4である。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可されている場合がある。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品ま
たは参照バイオ製品は、11D4である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、11D4である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Pfizer,Inc.から入手可能な完全ヒト抗体である18D8である。18D8の調製及び特性は、米国特許第7,960,515号、同第8,236,930号、及び同第9,028,824号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。18D8のアミノ酸配列を表14に示す。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、配列番号107によって示される重鎖及び配列番号108によって示される軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくはコンジュゲートを含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニス
トは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、18D8の重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号109に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号110に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号111、配列番号112、及び配列番号113に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号114、配列番号115、及び配列番号116に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、18D8に関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照バイオ製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、18D8である。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、18D8である。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可されている場合がある。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、18D8である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、18D8である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、GlaxoSmithKline plc.から入手可能なヒト化抗体であるHu119-122である。Hu119-122の調製及び特性は、米国特許第9,006,399号及び同第9,163,085号、ならびに国際特許公開第WO2012/027328号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。Hu119-122のアミノ酸配列を表15に示す。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Hu119-122の重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号117に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号118に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも96%同一である
領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号119、配列番号120、及び配列番号121に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号122、配列番号123、及び配列番号124に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Hu119-122に関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照バイオ製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu119-122である。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu119-122である。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可されている場合がある。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu119-122である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu119-122である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、GlaxoSmithKline plc.から入手可能なヒト化抗体であるHu106-222である。Hu106-222の調製及び特性は、米国特許第9,006,399号及び同第9,163,085号、ならびに国際特許公開第WO2012/027328号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。Hu106-222のアミノ酸配列を表16に示す。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Hu106-222の重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号125に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号126に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号127、配列番号128、及び配列番号129に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号130、配
列番号131、及び配列番号132に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Hu106-222に関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照バイオ製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu106-222である。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu106-222である。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可されている場合がある。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu106-222である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu106-222である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニスト抗体は、MEDI6469(9B12とも称される)である。MEDI6469は、マウスモノクローナル抗体である。Wein
berg,et al.,J.Immunother.2006,29,575-585。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Weinberg,et al.,J.Immunother.2006,29,575-585(その開示は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に記載されているように、Biovest Inc.(Malvern,MA,USA)に寄託された9B12ハイブリドーマによって産生された抗体である。いくつかの実施形態では、抗体は、MEDI6469のCDR配列を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、MEDI6469の重鎖可変領域配列及び/または軽鎖可変領域配列を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、L106 BD(Pharmingen製品番号340420)である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体L106(BD Pharmingen製品番号340420)のCDRを含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体L106(BD Pharmingen製品番号340420)の重鎖可変領域配列及び/または軽鎖可変領域配列を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、ACT35(Santa Cruz Biotechnology、カタログ番号20073)である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体ACT35(Santa Cruz Biotechnology、カタログ番号20073)のCDRを含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体ACT35(Santa Cruz Biotechnology、カタログ番号20073)の重鎖可変領域配列及び/または軽鎖可変領域配列を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、InVivoMAb、BioXcell Inc(West Lebanon,NH)から市販されているマウスモノクローナル抗体抗mCD134/mOX40(クローンOX86)である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、国際特許出願公開第WO95/12673号、同第WO95/21925号、同第WO2006/121810号、同第WO2012/027328号、同第WO2013/028231号、同第WO2013/038191号、及び同第WO2014/148895号、欧州特許出願第0672141号、米国特許出願公開第2010/136030号、同第2014/377284号、同第2015/190506号、及び同第2015/132288号(クローン20E5及び12H3を含む)、ならびに米国特許第7,504,101号、同第7,550,140号、同第7,622,444号、同第7,696,175号、同第7,960,515号、同第7,961,515号、同第8,133,983号、同第9,006,399号、及び同第9,163,085号に記載されるOX40アゴニストから選択され、その各々の開示は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、構造I-A(C末端Fc抗体断片融合タンパク質)もしくは構造I-B(N末端Fc抗体断片融合タンパク質)に示されるOX40アゴニスト融合タンパク質、またはそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、もしくはバイオシミラーである。構造I-A及びI-Bの特性は、上記及び米国特許第9,359,420号、同第9,340,599号、同第8,921,519号、及び同第8,450,460号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。図18に示される構造I-Aのポリペプチドドメインのアミノ酸配列は、表9に見出される。Fcドメインは、好ましくは、完全な定常ドメイン(配列番号62のアミノ酸17~230)、完全なヒンジドメイン(配列番号62のアミノ酸1~16)、またはヒンジドメインの一部(例えば、配列番号62のアミノ酸4~16)を含む。C末端Fc抗体を結合するための好ましいリンカーは、追加のポリペプチドの融合に好適なリンカーを含む、配列番号63~配列番号72に示される実施形態から選択され得る。同様に、図18に示される構造I-Bのポリペプチドドメインのアミノ酸配列は、表10に見出される。Fc抗体断片が構造I-BにあるようなTNRFSF融合タンパク質のN末端に融合さ
れる場合、Fcモジュールの配列は、好ましくは、配列番号73に示されるものであり、リンカー配列は、好ましくは、配列番号74~配列番号76に示される実施形態から選択される。
いくつかの複合体実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、タボリキシズマブの可変重鎖及び可変軽鎖、11D4の可変重鎖及び可変軽鎖、18D8の可変重鎖及び可変軽鎖、Hu119-122の可変重鎖及び可変軽鎖、Hu106-222の可変重鎖及び可変軽鎖、表17に記載の可変重鎖及び可変軽鎖から選択される可変重鎖及び可変軽鎖、前述の可変重鎖及び可変軽鎖の任意の組み合わせ、ならびにそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、及びバイオシミラーからなる群から選択される1つ以上のOX40結合ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、OX40L配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、配列番号133による配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、可溶性OX40L配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、配列番号134による配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、配列番号135による配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインは、リンカーによって結合されている。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインは、リンカーによって結合されている。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインは、リンカーによって結合されている。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号127及び配列番号128に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインは、リンカーによって結合されている。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインは、リンカーによって結合されている。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、表17に示されるV配列及びV配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインはリンカーによって結合されている。

いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、(i)第1の可溶性OX40結合ドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性OX40結合ドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性OX40結合ドメインを含むOX40アゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、N末端及び/またはC末端に追加のドメインをさらに含み、追加のドメインは、FabまたはFc断片ドメインである。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、(i)第1の可溶性OX40結合ドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性OX40結合ドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性OX40結合ドメインを含むOX40アゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、N末端及び/またはC末端に追加のドメインをさらに含み、追加のドメインは、FabまたはFc断片ドメインであり、可溶性OX40ドメインは各々、茎領域(三量体化に寄与し、細胞膜まである特定の距離を提供するが、OX40結合ドメインの一部分ではない)を欠き、第1及び第2のペプチドリンカーは独立して、3~8アミノ酸長を有する。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、(i)第1の可溶性腫瘍壊死因子(TNF)スーパーファミリーサイトカインドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインド
メインを含むOX40アゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメインは各々、茎領域を欠き、第1及び第2のペプチドリンカーは独立して、3~8アミノ酸長であり、TNFスーパーファミリーサイトカインドメインは、OX40結合ドメインである。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、MEDI6383である。MEDI6383は、OX40アゴニスト融合タンパク質であり、米国特許第6,312,700号に記載されているように調製することができ、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつか実施形態では、OX40アゴニストは、前述のVドメインのうちのいずれかに連結された前述のVドメインのうちのいずれかを含むOX40アゴニストscFv抗体である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Creative Biolabs,Inc.,Shirley,NY,USAから市販されているCreative Biolabs OX40アゴニストモノクローナル抗体MOM-18455である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、BioLegend,Inc.,San Diego,CA,USAから市販されているOX40アゴニスト抗体クローンBer-ACT35である。
C.任意選択の細胞生存率分析
任意選択で、細胞生存率アッセイは、当該技術分野で知られている標準のアッセイを使用して、プライミングによる第1の拡張(初期バルク拡張と称されることもある)後に行われ得る。したがって、ある特定の実施形態では、方法は、プライミングによる第1の拡張後に細胞生存率アッセイを行うことを含む。例えば、死細胞を選択的に標識し、生存率の評価を可能にするトリパンブルー排除アッセイが、バルクTILの試料上で行われ得る。生存率の試験に使用する他のアッセイには、アラマーブルーアッセイ及びMTTアッセイが含まれるが、これらに限定されない。
1.細胞計数、生存率、フローサイトメトリー
いくつかの実施形態では、細胞数及び/または生存率が測定される。CD3、CD4、CD8、及びCD56などであるが、これらに限定されないマーカー、ならびに本明細書に開示または記載される任意の他のマーカーの発現は、FACSCanto(商標)フローサイトメーター(BD Biosciences)を使用して、例えば、BD Bio-sciences(BD Biosciences,San Jose,CA)から市販されているものであるが、これに限定されない抗体を用いたフローサイトメトリーによって測定され得る。細胞は、使い捨てのcチップ血球計数器(VWR,Batavia,IL)を使用して手動で計数することができ、生存率は、トリパンブルー染色を含むが、これに限定されない、当該技術分野で知られている任意の方法を使用して評価することができる。細胞生存率は、米国特許出願公開第2018/0282694号(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に基づいてアッセイされ得る。細胞生存率は、米国特許公開第2018/0280436号または国際特許公開第WO/2018/081473号(いずれもあらゆる目的のためにそれらの全体が本明細書に組み込まれる)に基づいてアッセイすることもできる。
いくつかの事例では、バルクTIL集団は、以下で考察されるプロトコルを使用して直ちに凍結保存され得る。代替的に、以下で論じられるように、バルクTIL集団がREPに供されて、凍結保存され得る。同様に、遺伝子修飾TILが療法に使用される場合、バ
ルクまたはREP TIL集団が好適な治療のために遺伝子修飾に供され得る。
2.細胞培養
いくつかの実施形態では、上で考察され、図1及び8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に例示されたものを含む、TILを拡張するための方法は、約5,000mL~約25,000mLの細胞培地、約5,000mL~約10,000mLの細胞培地、または約5,800mL~約8,700mLの細胞培地を使用することを含み得る。いくつかの実施形態では、培地は、無血清培地である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、無血清である。いくつかの実施形態では、第2の拡張における培地は、無血清である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張及び第2の拡張(急速な第2の拡張とも称される)における培地は、両方とも無血清である。いくつかの実施形態では、TILの数を拡張することは、わずか1種類の細胞培養培地を使用する。任意の好適な細胞培養培地、例えば、AIM-V細胞培地(L-グルタミン、50μMの硫酸ストレプトマイシン、及び10μMの硫酸ゲンタマイシン)細胞培養培地(Invitrogen,Carlsbad CA)が使用され得る。これに関して、本発明の方法は、TILの数を拡張するために必要な培地の量及び培地の種類の数を有利に減少させる。いくつかの実施形態では、TILの数を拡張することは、3日または4日に1回以下の頻度で細胞にフィードすることを含み得る。ガス透過性容器内で細胞の数を拡張することは、細胞を拡張するために必要なフィード頻度を減少させることによって、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化する。
いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培養培地は、濾過されていない。濾過されていない細胞培地の使用は、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化することができる。いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、ベータ-メルカプトエタノール(BME)を欠いている。
いくつかの実施形態では、方法の期間は、哺乳動物から腫瘍組織試料を取得することと、プライミングによる第1の拡張として約1~8日間、例えば約7日間、またはプライミングによる第1の拡張として約8日間にわたってIL-2、1X抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第1のガス透過性容器内で腫瘍組織試料を培養することと、TILを第2のガス透過性容器に移し、IL-2、2X抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第2のガス透過性容器内でTILの数を約7~9日間、例えば約7日間、約8日間、または約9日間にわたって拡張することと、を含む。
いくつかの実施形態では、方法の期間は、哺乳動物から腫瘍組織試料を取得することと、プライミングによる第1の拡張として、IL-2、1X抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第1のガス透過性容器内で腫瘍組織試料を約1~7日間、例えば、約7日間にわたって培養することと、TILを第2のガス透過性容器に移し、IL-2、2X抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第2のガス透過性容器内でTILの数を約7~14日間、または約7~9日間、例えば、約7日間、約8日間、または約9日間、約10日間、または約11日間にわたって拡張することと、を含む。
いくつかの実施形態では、方法の期間は、哺乳動物から腫瘍組織試料を取得することと、プライミングによる第1の拡張として、IL-2、1×抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第1のガス透過性容器内で腫瘍組織試料を、 約1~7日、例えば、約7日の期間培養することと、TILを第2のガス透過性容器に移し、
IL-2、2×抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第の2ガス透過性容器内でTILの数を、約7~11日、例えば、約7日、約8日、約9日、約10日、または約11日の期間拡張することと、を含む。
いくつかの実施形態では、TILは、ガス透過性容器内で拡張される。ガス透過性容器は、米国特許出願公開第2005/0106717A1号に記載されるものを含む、当該技術分野で知られている方法、組成物、及びデバイスを使用して、PBMCを使用してTILを拡張するために使用されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TILは、ガス透過性バッグ内で拡張される。いくつかの実施形態では、TILは、Xuri Cell Expansion System W25(GE Healthcare)などのガス透過性バッグ内のTILを拡張する細胞拡張系を使用して拡張される。いくつかの実施形態では、TILは、Xuri Cell Expansion System W5(GE Healthcare)としても知られるWAVE Bioreactor Systemなどのガス透過性バッグ内でTILを拡張する細胞拡張系を使用して拡張される。いくつかの実施形態では、細胞拡張系は、約100mL、約200mL、約300mL、約400mL、約500mL、約600mL、約700mL、約800mL、約900mL、約1L、約2L、約3L、約4L、約5L、約6L、約7L、約8L、約9L、及び約10Lからなる群から選択される体積を有するガス透過性細胞バッグを含む。
いくつかの実施形態では、TILは、G-REXフラスコ(Wilson Wolf Manufacturingから市販されている)内で拡張され得る。かかる実施形態は、細胞集団が約5×10細胞/cmから10×10~30×10細胞/cmまで拡張するのを可能にする。いくつかの実施形態では、これは、フィードなしである。いくつかの実施形態では、これは、培地がG-REXフラスコ内の約10cmの高さに存在する限り、フィードなしである。いくつかの実施形態では、これは、フィードなしであるが、1つ以上のサイトカインの追加を伴う。いくつかの実施形態では、サイトカインを培地と混合する必要なしに、サイトカインがボーラスとして追加され得る。かかる容器、装置、及び方法は、当該技術分野で知られており、TILを拡張するために使用されており、米国特許出願公開第2014/0377739A1号、国際公開第WO2014/210036A1号、米国特許出願公開第2013/0115617A1号、国際公開第WO2013/188427A1号、米国特許出願公開第2011/0136228A1、米国特許第8,809,050B2号、国際公開第WO2011/072088A2号、米国特許出願公開第2016/0208216A1号、米国特許出願公開第2012/0244133A1号、国際公開第WO2012/129201A1号、米国特許出願公開第2013/0102075A1号、米国特許第8,956,860B2号、国際公開第WO2013/173835A1号、米国特許出願公開第2015/0175966A1号に記載されるものを含み、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。かかるプロセスはまた、Jin et al.,J.Immunotherapy,2012,35:283-292に記載されている。
D.TILにおける遺伝子の任意選択のノックダウンまたはノックアウト
いくつかの実施形態では、本発明の拡張TILは、タンパク質発現を一過的に変化させるために、各々本明細書で提供されるように、閉鎖滅菌製造プロセス中を含む、拡張ステップ前、拡張ステップ中、または拡張ステップ後にさらに操作される。いくつかの実施形態では、一過的に変化したタンパク質発現は、一過性の遺伝子編集によるものである。いくつかの実施形態では、本発明の拡張TILは、TILにおけるタンパク質発現を一過的に変化させることができる転写因子(TF)及び/または他の分子で処理される。いくつかの実施形態では、タンパク質発現を一過的に変化させることができるTF及び/または他の分子は、腫瘍抗原の発現の変化及び/またはTIL集団における腫瘍抗原特異的T細
胞の数の変化を提供する。
ある特定の実施形態では、方法は、TIL集団を遺伝子編集することを含む。ある特定の実施形態では、この方法は、第1のTIL集団、第2のTIL集団、及び/または第3のTIL集団を遺伝子編集することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、1つ以上のタンパク質の発現の促進または1つ以上のタンパク質の発現の阻害、ならびに一組のタンパク質の促進及び別の組のタンパク質の阻害の両方の組み合わせの同時発生のために、リボ核酸(RNA)挿入、例えば、メッセンジャーRNA(mRNA)または低分子(もしくは短)干渉RNA(siRNA)のTIL集団への挿入などのヌクレオチド挿入による遺伝子編集を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の拡張TILは、タンパク質発現の一過性の変化を受ける。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8(特に図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されるようなステップAから取得されたTIL集団を含む、第1の拡張前のバルクTIL集団において起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8(例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されるように、例えば、ステップBで拡張されたTIL集団におけるものを含む、第1の拡張中に起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8に示されるように、ステップBから取得され、ステップCに含まれるTIL集団である、例えば、第1の拡張と第2の拡張との間の移行中のTIL集団(例えば、本明細書に記載の第2のTIL集団)におけるものを含む、第1の拡張後に起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8に示されるように、例えば、ステップCから取得され、ステップDでのその拡張前のTIL集団を含む、第2の拡張前のバルクTIL集団において起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8に示されるように、例えば、ステップDで拡張されたTIL集団(例えば、第3のTIL集団)を含む、第2の拡張中に起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8に示されるように、例えば、ステップDでの拡張から取得されたTIL集団を含む、第2の拡張後に起こる。
いくつかの実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、エレクトロポレーションステップを含む。エレクトロポレーション法は、当該技術分野で知られており、例えば、Tsong,Biophys.J.1991,60,297-306及び米国特許出願公開第2014/0227237A1号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、リン酸カルシウムトランスフェクションステップを含む。リン酸カルシウムトランスフェクション法(リン酸カルシウムDNA沈殿、細胞表面コーティング、及びエンドサイトーシス)は、当該技術分野で知られており、Graham and van der Eb,Virology 1973,52,456-467、Wigler,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.1979,76,1373-1376、及びChen and Okayarea,Mol.Cell.Biol.1987,7,2745-2752、ならびに米国特許第5,593,875号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、リポソームトランスフェクションステップを含む。リポソームトランスフェクション法、例えば、カチオン性脂質N-[1-(2,3-ジオレイルオキシ)プロピル]-n,n,n-トリメチルアンモニウムクロリド(DOTMA)及びジオレオイルホスホチジルエタノールアミン(DOPE)の1:1(w/w)リポソーム
製剤を用いる方法は、当該技術分野において既知であり、Rose,et al.,Biotechniques 1991,10,520-525及びFelgner,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1987,84,7413-7417、ならびに米国特許第5,279,833号、同第5,908,635号、同第6,056,938号、同第6,110,490号、同第6,534,484号、及び同第7,687,070号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、米国特許第5,766,902号、同第6,025,337号、同第6,410,517号、同第6,475,994号、及び同第7,189,705号に記載されている方法を使用するトランスフェクションステップを含み、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、幹細胞メモリーT細胞(TSCM)の増加をもたらす。TSCMは、抗原を経験したセントラルメモリーT細胞の初期前駆細胞である。TSCMは、一般に、幹細胞を定義する長期生存、自己再生、及び多分化能を示し、一般に、効果的なTIL製品の生成に望ましいものである。TSCMは、養子細胞移植のマウスモデルにおいて他のT細胞サブセットと比較して増強された抗腫瘍活性を示している。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、高い割合のTSCMを含む組成を有するTIL集団をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TSCMパーセンテージの少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%の増加をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIL集団中のTSCMの少なくとも1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、または10倍の増加をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%のTSCMを有するTIL集団をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%のTSCMを有する治療的TIL集団をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、抗原を経験したT細胞の幼若化をもたらす。いくつかの実施形態では、幼若化には、例えば、増加した増殖、増加したT細胞活性化、及び/または増加した抗原認識が含まれる。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、腫瘍由来のTCRレパートリーを保存するために、T細胞の大部分における発現を変化させる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、腫瘍由来のTCRレパートリーを変化させない。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、腫瘍由来のTCRレパートリーを維持する。
いくつかの実施形態では、タンパク質の一過性の変化は、特定の遺伝子の発現の変化を
もたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD39、CD69、PD-1(PDCD1またはCC279とも称される)、TGFBR2、CCR4/5、CBLB(CBL-B)、CISH、CCR(キメラ共刺激受容体)、IL-2、IL-12、IL-15、IL-21、NOTCH 1/2 ICD、CTLA-4、TIM3、LAG3、TIGIT、TET2、TGFβ、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR1、CXCR2、CSCR3、CCL2(MCP-1)、CCL3(MIP-1α)、CCL4(MIP1-β)、CCL5(RANTES)、CXCL1/CXCL8、CCL22、CCL17、CXCL1/CXCL8、VHL、CD44、PIK3CD、SOCS1、胸腺細胞選択関連高移動度群(HMG)ボックス(TOX)、アンキリンリピートドメイン11(ANKRD11)、BCL6コリプレッサー(BCOR)、及び/またはcAMPタンパク質キナーゼA(PKA)を含むが、これらに限定されない遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、TGFBR2、CCR4/5、CTLA-4、CBLB(CBL-B)、CISH、CCR(キメラ共刺激受容体)、IL-2、IL-12、IL-15、IL-21、NOTCH1/2 ICD、TIM3、LAG3、TIGIT、TET2、TGFβ、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR1、CXCR2、CSCR3、CCL2(MCP-1)、CCL3(MIP-1α)、CCL4(MIP1-β)、CCL5(RANTES)、CXCL1/CXCL8、CCL22、CCL17、CXCL1/CXCL8、VHL、CD44、PIK3CD、SOCS1、胸腺細胞選択関連高移動度群(HMG)ボックス(TOX)、アンキリンリピートドメイン11(ANKRD11)、BCL6コリプレッサー(BCOR)、及び/またはcAMPタンパク質キナーゼA(PKA)からなる群から選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD39を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD69を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TGFBR2を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR4/5を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CTLA-4を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性変化は、CBLBを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性変化は、CISHを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR(キメラ共刺激受容体)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-2を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-12を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-15を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-21を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、NOTCH1/2 ICDを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TET2を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TGFβを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR2を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR4を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR5を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CXCR1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CXCR2を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CSCR3を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL2(MCP-1)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL3(MIP-1α)を標的とする。いくつかの実施形
態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL4(MIP1-β)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL5(RANTES)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CXCL1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CXCL8を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL22を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL17を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、VHLを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD44を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PIK3CDを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、SOCS1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性変化は、胸腺細胞選択関連高移動度群(HMG)ボックス(TOX)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、アンキリンリピートドメイン11(ANKRD11)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性変化は、BCL6コリプレッサー(BCOR)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、cAMPタンパク質キナーゼA(PKA)を標的とする。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、ケモカイン受容体の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、一過性タンパク質発現によって過剰発現されるケモカイン受容体は、CCL2(MCP-1)、CCL3(MIP-1α)、CCL4(MIP1-β)、CCL5(RANTES)、CXCL1、CXCL8、CCL22、及び/またはCCL17を含むが、これらに限定されないリガンドを有する受容体を含む。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD39、CD69、PD-1、CTLA-4、CBLB、CISH、TIM-3、LAG-3、TIGIT、TET2、TGFβR2、及び/またはTGFβの発現の低下及び/または減少をもたらす(例えば、TGFβ経路の遮断をもたらすことを含む)。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CBLB(CBL-B)の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CISHの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM-3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG-3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIGITの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TET2の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TGFβR2の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TGFβの発現の低下及び/または減少をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、腫瘍部位へのTILの輸送または移動を改善するために、ケモカイン受容体の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR(キメラ共刺激受容体)の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR1、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR1、CXCR2、及び/またはCSCR3からなる群から選択されるケモカイン受容体の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、インターロイキンの発現
の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-2、IL-12、IL-15、及び/またはIL-21からなる群から選択されるインターロイキンの発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、NOTCH1/2 ICDの発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、VHLの発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD44の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PIK3CDの発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、SOCS1の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、cAMPタンパク質キナーゼA(PKA)の発現の低下及び/または減少をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD39、CD69、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される分子の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD39、CD69、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される2つの分子の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、ならびにLAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される1つの分子の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、CTLA-4、LAG-3、CISH、CBLB、TIM3、TIGIT、TET2、及びそれらの組み合わせの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、ならびにCTLA-4、LAG3、CISH、CBLB、TIM3、TIGIT、TET2、及びそれらの組み合わせのうちの1つの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びCTLA-4の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びLAG3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びCISHの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びCBLBの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD39及びCD69の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びTIM3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びTIGITの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びTET2の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CTLA-4及びLAG3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CTLA-4及びCISHの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CTLA-4及びCBLBの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CTLA-4及びTIM3の発現の低下及び/または減少をも
たらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CTLA-4及びTIGITの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CTLA-4及びTET2の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3及びCISHの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3及びCBLBの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3及びTIM3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3及びTIGITの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3及びTET2の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CISH及びCBLBの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CISH及びTIM3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CISH及びTIGITの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CISH及びTET2の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CBLB及びTIM3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CBLB及びTIGITの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CBLB及びTET2の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びPD-1の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びLAG3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びCISHの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びCBLBの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びTIGITの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びTET2の発現の低下及び/または減少をもたらす。
いくつかの実施形態では、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される接着分子は、ガンマレトロウイルスまたはレンチウイルス法によって、第1のTIL集団、第2のTIL集団、または採取されたTIL集団に挿入される(例えば、接着分子の発現が増加する)。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD39、CD69、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される分子の発現の低下及び/または減少、ならびにCCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、及びそれらの組み合わせの発現の増加及び/または増強をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD39、CD69、PD-1、CTLA-4、LAG3、TIM3、CISH、CBLB、TIGIT、TET2、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される分子の発現の低下及び/または減少、ならびにCCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、及びそれらの組み合わせの発現の増加及び/または増強をもたらす。
いくつかの実施形態では、発現が約5%、約10%、約10%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、
約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約90%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約99%減少する。
いくつかの実施形態では、発現が約5%、約10%、約10%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%、約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約90%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約99%増加する。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TILにおけるタンパク質発現を一過的に変化させることができる転写因子(TF)及び/または他の分子でのTILの処理によって誘導される。いくつかの実施形態では、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームが、タンパク質発現を一過的に変化させることができる転写因子(TF)及び/または他の分子の細胞内送達のために用いられる。かかる方法は、転写因子を含むタンパク質を、T細胞を含む様々な初代ヒト細胞に送達する能力を示す(これらは、米国特許出願公開第2019/0093073 A1号、同第2018/0201889 A1号、及び同第2019/0017072 A1号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)。かかる方法は、TIL集団を、転写因子(TF)及び/または一過性タンパク質発現を誘導することができる他の分子に曝露するために本発明で用いることができ、一過性タンパク質発現を誘導することができる当該TF及び/または他の分子は、腫瘍抗原の発現の増加及び/またはTIL集団における腫瘍抗原特異的T細胞の数の増加をもたらし、それ故に、TIL集団の再プログラミング及び再プログラミングされていないTIL集団と比較して再プログラミングされたTIL集団の治療的有効性の増加をもたらす。いくつかの実施形態では、再プログラミングは、本明細書に記載されるように、TIL開始集団またはTIL前集団(すなわち、再プログラミング前の)集団と比較して、エフェクターT細胞及び/またはセントラルメモリーT細胞の亜集団の増加をもたらす。
いくつかの実施形態では、転写因子(TF)には、TCF-1、NOTCH1/2 ICD、及び/またはMYBが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、TCF-1である。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、NOTCH1/2 ICDである。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、MYBである。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、さらなるTIL再プログラミングを誘導するために、市販のKNOCKOUT Serum Replacement(Gibco/ThermoFisher)などの誘導多能性幹細胞培養物(iP
SC)とともに投与される。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、さらなるTIL再プログラミングを誘導するために、iPSCカクテルとともに投与される。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、iPSCカクテルなしで投与される。いくつかの実施形態では、再プログラミングは、TSCMのパーセンテージの増加をもたらす。いくつかの実施形態では、再プログラミングは、TSCMのパーセンテージの約5%、約10%、約10%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%TSCMの増加をもたらす。
いくつかの実施形態では、上記のようにタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、TIL集団を遺伝子修飾する方法と組み合わせられてもよく、1つ以上のタンパク質の産生のための遺伝子の安定した組み込みステップを含む。ある特定の実施形態では、この方法は、TIL集団を遺伝子修飾するステップを含む。ある特定の実施形態では、この方法は、第1のTIL集団、第2のTIL集団、及び/または第3のTIL集団を遺伝子修飾することを含む。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、レトロウイルス形質導入ステップを含む。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、レンチウイルス形質導入ステップを含む。レンチウイルス形質導入系は、当該技術分野で知られており、例えば、Levine,et al.,Proc.Nat′l
Acad.Sci.2006,103,17372-77、Zufferey,et al.,Nat.Biotechnol.1997,15,871-75、Dull,et al.,J.Virology 1998,72,8463-71、及び米国特許第6,627,442号に記載されており、それらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、ガンマレトロウイルス形質導入ステップを含む。ガンマレトロウイルス形質導入系は、当該技術分野で知られており、例えば、Cepko and Pear,Cur.Prot.Mol.Biol.1996,9.9.1-9.9.16に記載されており、この開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、トランスポゾン媒介遺伝子導入ステップを含む。トランスポゾン媒介遺伝子導入系は、当該技術分野で知られており、トランスポザーゼが、DNA発現ベクターとしてまたは発現可能なRNAもしくはタンパク質として提供される系を含み、これにより、トランスポザーゼ、例えば、mRNA(例えば、キャップ及びポリA尾部を含むmRNA)として提供されるトランスポザーゼの長期発現がトランスジェニック細胞で起こらないようになる。SB10、SB11、及びSB100xなどのサケ科型Tel様トランスポザーゼ(SBまたはSleeping Beautyトランスポザーゼ)を含む好適なトランスポゾン媒介遺伝子導入系、ならびに増加した酵素活性を有する操作された酵素は、例えば、Hackett,et al.,Mol.Therapy 2010,18,674-83及び米国特許第6,489,458号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、TIL中のタンパク質発現の一過性変化は、短干渉RNAまたはサイレンシングRNAとして知られることもある、低分子干渉RNA(siRNA)は、一般に19~25塩基対長の二本鎖RNA分子である。siRNAは、RNA干渉(RNAi)において使用され、相補的なヌクレオチド配列を有する特定の遺伝子の発現に干渉する。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性変化は、発現の低下である。いくつかの実施形態では、TILにおけるタンパク質発現の一過性の変化は、高パーセンテージの2′-OH置換(典型的にはフッ素または-OCH)を有する化学的に合成された非対称siRNA二重鎖である自己送達RNA干渉(sdRNA)によって誘導され、これはテトラエチレングリコール(TEG)リンカーを使用してその3′末端でコレステロー
ルに複合された、20ヌクレオチドアンチセンス(ガイド)鎖及び13~15塩基センス(パッセンジャー)鎖を含む。短干渉RNAまたはサイレンシングRNAとして知られることもある、低分子干渉RNA(siRNA)は、一般に19~25塩基対長の二本鎖RNA分子である。siRNAは、RNA干渉(RNAi)において使用され、相補的なヌクレオチド配列を有する特定の遺伝子の発現に干渉する。sdRNAは、共有結合及び疎水的に修飾されたRNAi化合物であり、細胞に侵入するために送達媒体を必要としない。sdRNAは、一般に、最小限の二本鎖領域を有する非対称の化学修飾された核酸分子である。sdRNA分子は、典型的に一本鎖領域及び二本鎖領域を含み、分子の一本鎖領域及び二本鎖領域の両方に様々な化学修飾を含み得る。追加として、sdRNA分子は、本明細書に記載されているように、従来の高度なステロール型分子などの疎水性複合体に結合することができる。sdRNA及びかかるsdRNAを作製するための関連方法は、例えば、米国特許出願公開第2016/0304873 A1号、同第2019/0211337 A1号、同第2009/0131360 A1号、及び同第2019/0048341 A1号、ならびに米国特許第10,633,654号及び同第10,913,948 B2号(それらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)にも広く記載されている。sdRNA構造、化学、標的化位置、配列の好みなどを最適化するために、sdRNA力価予測用のアルゴリズムが開発及び利用されている。これらの分析に基づいて、機能的なsdRNA配列は、一般に、1μMの濃度で70%を超える発現の減少を有すると定義されており、確率は40%を超える。
二本鎖DNA(dsRNA)は、一般に、RNAの相補鎖の対、一般にセンス(パッセンジャー)鎖及びアンチセンス(ガイド)鎖を含む任意の分子を定義するために使用することができ、一本鎖オーバーハング領域を含み得る。siRNAとは対照的に、dsRNAという用語は、一般に、ダイサーを含む切断酵素系の作用によりより大きいdsRNA分子から放出されるsiRNA分子の配列を含む前駆体分子を指す。
いくつかの実施形態では、方法は、CCRを発現するように修飾されたTILを含むTIL集団におけるタンパク質発現の一過性変化を含み、例えば、テトラエチレングリコール(TEG)リンカーを使用して20ヌクレオチドアンチセンス(ガイド)鎖及び3’末端でコレステロールにコンジュゲートされた13~15塩基センス(パッセンジャー)鎖を含む、高いパーセンテージの2’-OH置換(典型的にはフッ素または-OCH)を有する化学的に合成された非対称siRNA二本鎖である、自己送達RNA干渉(sdRNA)の使用を含む。siRNA及びsdRNAを使用する方法は、Khvorova and Watts,Nat.Biotechnol.2017,35,238-248、Byrne,et al.,J.Ocul.Pharmacol.Ther.2013,29,855-864、及びLigtenberg,et al.,Mol.Therapy,2018,26,1482-93(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。いくつかの実施形態では、siRNAの送達は、エレクトロポレーションまたは細胞膜破壊(スクイーズまたはSQZ法など)を使用して達成される。いくつかの実施形態では、TIL集団へのsdRNAの送達は、エレクトロポレーション、SQZ、または他の方法を使用せず、代わりに、TIL集団が培地中1μM/10,000TILの濃度でsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成される。ある特定の実施形態では、方法は、TIL集団を培地中1μM/10,000TILの濃度のsdRNAに1~3日間曝露することを含む、TIL集団へのsiRNAまたはsdRNAの送達を含む。いくつかの実施形態では、TIL集団へのsdRNAの送達は、TIL集団が培地中10μM/10,000TILの濃度でsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成される。いくつかの実施形態では、TIL集団へのsdRNAの送達は、TIL集団が培地中50μM/10,000TILの濃度でsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成される。いくつかの実施形態では、TIL集団へのsdRNAの送達は、TIL集団が培地中0.1μM/10,000TIL~50μM/10
,000TILの濃度でsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成される。いくつかの実施形態では、TIL集団へのsdRNAの送達は、TIL集団が培地中0.1μM/10,000TIL~50μM/10,000TILの濃度でsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成され、sdRNAへの曝露は、培地に新鮮なsdRNAを添加することによって2、3、4、または5回行われる。他の好適なプロセスは、例えば、米国特許出願公開第US2011/0039914A1号、同第US2013/0131141A1号、及び同第US2013/0131142A1号、ならびに米国特許第9,080,171号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、製造中にTIL集団に挿入される。いくつかの実施形態では、sdRNAは、NOTCH1/2 ICD、PD-1、CTLA-4 TIM-3、LAG-3、TIGIT、TGFβ、TGFBR2、cAMPプロテインキナーゼA(PKA)、BAFF BR3、CISH、及び/またはCBLBに干渉するRNAをコードする。いくつかの実施形態では、発現の減少は、例えば、フローサイトメトリー及び/またはqPCRによって評価される、遺伝子サイレンシングのパーセンテージに基づいて決定される。いくつかの実施形態では、発現が約5%、約10%、約10%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約90%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約99%減少する。
siRNAの化学修飾に基づく自己送達可能なRNAi技術を本発明の方法とともに用いて、本明細書に記載されるように、sdRNAをTILに首尾よく送達することができる。非対称siRNA構造及び疎水性リガンドとの骨格修飾の組み合わせ(例えば、Ligtenberg,et al.Mol.Therapy,2018,26,1482-93及び米国特許出願公開第2016/0304873 A1号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)を参照されたい)は、sdRNAのヌクレアーゼ安定性を利用して、培養培地に単純に添加することによって、追加の製剤及び方法なしに、sdRNAが培養された哺乳動物細胞に浸透することを可能にする。この安定性により、単に培地中のsdRNAの活性濃度を維持することによって、標的遺伝子活性の一定レベルのRNAiを介した減少を支援することができる。理論に拘束されることはないが、sdRNAの骨格安定化は、非分裂細胞で数ヶ月間続く可能性のある遺伝子発現効果の延長された低減を提供する。
いくつかの実施形態では、TILの95%を超えるトランスフェクション効率及び様々な特定のsiRNAまたはsdRNAによる標的の発現の減少が起こる。いくつかの実施形態では、いくつかの未修飾リボース残基を含むsiRNAまたはsdRNAは、RNAi効果の効力及び/または寿命を増加させるために、完全に修飾された配列で置き換えられた。いくつかの実施形態では、発現効果の減少は、12時間、24時間、36時間、48時間、5日間、6日間、7日間、または8日間以上維持される。いくつかの実施形態では、発現効果の減少は、TILのsiRNAまたはsdRNA処理後10日以上で低下す
る。いくつかの実施形態では、標的発現の発現の70%を超える減少が維持される。いくつかの実施形態では、標的発現の発現の70%を超える減少が維持されるTIL。いくつかの実施形態では、PD-1/PD-L1経路における発現の減少により、TILがより強力なインビボ効果を示すことが可能になり、これは、いくつかの実施形態では、PD-1/PD-L1経路の抑制効果の回避に起因する。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAによるPD-1の発現の減少は、TIL増殖の増加をもたらす。
いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の70%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の75%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の80%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の85%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の90%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の95%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の99%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約0.25μM~約4μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約0.25μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約0.5μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約0.75μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約1.0μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約1.25μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約1.5μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約1.75μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約2.0μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約2.25μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約2.5μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約2.75μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約3.0μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約3.25μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約3.5μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約3.75μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約4.0μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチド剤は、治療剤の安定性及び/または有効性を増加させ、かつ治療される細胞または組織へのオリゴヌクレオチドの効率的な送達をもたらすための1つ以上の修飾を含む。かかる修飾には、2′-O-メチル修飾、2′-O-フルロ修飾、ジホスホロチオエート修飾、2′F修飾ヌクレオチド、2′-O-メチル修飾、及び/または2′デオキシヌクレオチドが含まれ得る。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、例えば、ステロール、コレステロ
ール、ビタミンD、ナフチル、イソブチル、ベンジル、インドール、トリプトファン、及び/またはフェニルを含む1つ以上の疎水性修飾を含むように修飾される。いくつかの実施形態では、化学修飾ヌクレオチドは、ホスホロチオエート、2’-O-メチル、2’デオキシ、疎水性修飾及びホスホロチオエートの組み合わせである。いくつかの実施形態では、糖が修飾され得、修飾された糖には、D-リボース、2′-O-アルキル(2′-O-メチル及び2′-0-エチルを含む)、すなわち、2′-アルコキシ、2′-アミノ、2′-S-アルキル、2′-ハロ(2′-フルオロを含む)、T-メトキシエトキシ、2′-アリルオキシ(-OCHCH=CH)、2′-プロパルギル、2′-プロピル、エチニル、エテニル、プロペニル、及びシアノなどが含まれ得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、糖部分は、ヘキソースであり得、Augustyns,et al.,Nucl.Acids.Res.1992,18,4711(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているようにオリゴヌクレオチドに組み込まれ得る。
いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、その全長にわたって二本鎖であり、すなわち、分子のいずれかの末端にも一本鎖配列が突出しておらず、すなわち、平滑末端である。いくつかの実施形態では、個々の核酸分子は、異なる長さであり得る。言い換えれば、本発明の二本鎖siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、その全長にわたって二本鎖ではない。例えば、2つの別個の核酸分子が使用される場合、アンチセンス配列を含むそれらの分子の一方、例えば、第1の分子は、それにハイブリダイズする(分子の一部を一本鎖のままにする)第2の分子よりも長い可能性がある。いくつかの実施形態では、単一の核酸分子が使用される場合、いずれかの末端の分子の一部は、一本鎖のままであり得る。
いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、ミスマッチ及び/またはループもしくはバルジを含むが、オリゴヌクレオチドの長さの少なくとも約70%にわたって二本鎖である。いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの長さの少なくとも約80%にわたって二本鎖である。他の実施形態では、本発明の二本鎖siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの長さの少なくとも約90%~95%にわたって二本鎖である。いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの長さの少なくとも約96%~98%にわたって二本鎖である。いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖オリゴヌクレオチドは、少なくともまたは最大1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、または15のミスマッチを含む。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、例えば、米国特許第5,849,902号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように3’または5’結合を修飾することによって、ヌクレアーゼから実質的に保護され得る。例えば、オリゴヌクレオチドは、「ブロッキング基」を含めることによって耐性にすることができる。本明細書で使用される場合、「ブロッキング基」という用語は、合成のための保護基またはカップリング基のいずれかとして(例えば、FITC、プロピル(CH-CH-CH)、グリコール(-0-CH-CH-O-)ホスフェート(PO 2’’)、リン酸水素、もしくはホスホロアミダイト)、オリゴヌクレオチドまたはヌクレオモノマーに結合され得る置換基(例えば、OH基以外)を指す。「ブロッキング基」は、修飾ヌクレオチド及び非ヌクレオチドエキソヌクレアーゼ耐性構造を含む、オリゴヌクレオチドの5′及び3′末端を保護する「末端ブロッキング基」または「エキソヌクレアーゼブロッキング基」も含み得る。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNA内の隣接するポリヌクレオチド
の少なくとも一部は、代替の連結、例えば、ホスホロチオエート連結によって結合されている。
いくつかの実施形態では、化学修飾は、siRNAまたはsdRNAの細胞取り込みの少なくとも1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、225、250、275、300、325、350、375、400、425、450、475、または500パーセントの増強をもたらし得る。いくつかの実施形態では、C残基またはU残基の少なくとも一方が疎水性修飾を含む。いくつかの実施形態では、複数のC及びUが疎水性修飾を含む。いくつかの実施形態では、C及びUの少なくとも10%、15%、20%、30%、40%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、または少なくとも95%が疎水性修飾を含み得る。いくつかの実施形態では、C及びUのすべてが疎水性修飾を含む。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNA分子は、プロトン化可能なアミンの組み込みにより増強されたエンドソーム放出を示す。いくつかの実施形態では、プロトン化可能なアミンは、センス鎖(RISC負荷後に廃棄される分子の一部分)に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本発明のsiRNAまたはsdRNA化合物は、二重鎖領域(10~15塩基長の効率的なRISC侵入に必要)及び4~12ヌクレオチド長の一本鎖領域を13ヌクレオチド二重鎖とともに含む非対称化合物を含む。いくつかの実施形態では、6ヌクレオチドの一本鎖領域が用いられる。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAの一本鎖領域は、2~12個のホスホロチオエートヌクレオチド間連結(ホスホロチオエート修飾と称される)を含む。いくつかの実施形態では、6~8個のホスホロチオエートヌクレオチド間連結が用いられる。いくつかの実施形態では、本発明のsiRNAまたはsdRNA化合物は、安定性を提供し、かつRISC侵入と互換性がある固有の化学修飾パターンを含む。ガイド鎖は、例えば、RISC侵入に干渉することなく安定性を確証する任意の化学修飾によって修飾することもできる。いくつかの実施形態では、ガイド鎖における化学修飾パターンは、2′Fが修飾され、かつ5′末端がリン酸化されたC及びUヌクレオチドの大部分を含む。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAのヌクレオチドの少なくとも30%が修飾されている。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAのヌクレオチドの少なくとも30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%が修飾されている。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAのヌクレオチドの100%が修飾されている。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNA分子は、最小の二本鎖領域を有する。いくつかの実施形態では、二本鎖である分子の領域は、8~15ヌクレオチド長の範囲である。いくつかの実施形態では、二本鎖である分子の領域は、8、9、10、11、12、13、14、または15ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、二本鎖領域は、13ヌクレオチド長である。ガイド鎖とパッセンジャー鎖との間に100%の相補性が存在する場合もあれば、ガイド鎖とパッセンジャー鎖との間に1つ以上の不一致
が存在する場合もある。いくつかの実施形態では、二本鎖分子の一端で、分子は、平滑末端であるか、または1ヌクレオチドのオーバーハングを有するかのいずれかである。分子の一本鎖領域は、いくつかの実施形態では、4~12ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、一本鎖領域は、4、5、6、7、8、9、10、11または12ヌクレオチド長であり得る。いくつかの実施形態では、一本鎖領域は、4ヌクレオチド長未満または12ヌクレオチド長超であることもできる。ある特定の実施形態では、一本鎖領域は、6または7ヌクレオチド長である。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNA分子は、増加した安定性を有する。いくつかの事例では、化学修飾されたsiRNAまたはsdRNA分子は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24時間以上、または24時間超(任意の中間値を含む)の培地中での半減期を有する。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsd-RNAは、12時間以上の培地中での半減期を有する。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、効力の増加及び/または毒性の低減のために最適化されている。いくつかの実施形態では、ガイド鎖及び/またはパッセンジャー鎖のヌクレオチド長、及び/またはガイド鎖及び/またはパッセンジャー鎖におけるホスホロチオエート修飾の数が、いくつかの態様では、RNA分子の効力に影響を与え得る一方で、2′-フルオロ(2′F)修飾の2′-0-メチル(2′OMe)修飾での置き換えは、いくつかの態様では、分子の毒性に影響を与え得る。いくつかの実施形態では、分子の2′F含有量の減少は、分子の毒性を低減すると予測される。いくつかの実施形態では、RNA分子におけるホスホロチオエート修飾の数は、細胞への分子の取り込み、例えば、細胞への分子の受動的取り込みの効率に影響を及ぼし得る。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、2′F修飾を有しないが、それにもかかわらず、細胞取り込み及び組織浸透における同等の有効性を特徴とする。
いくつかの実施形態では、ガイド鎖は、およそ18~19ヌクレオチド長であり、およそ2~14個のリン酸修飾を有する。例えば、ガイド鎖は、リン酸修飾された2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14個、または14個超のヌクレオチドを含み得る。ガイド鎖は、RISCの侵入に干渉することなく増加した安定性を付与する1つ以上の修飾を含み得る。ホスホロチオエート修飾ヌクレオチドなどのリン酸修飾ヌクレオチドは、3′末端にあるか、5′末端にあるか、またはガイド鎖全体に広がっている可能性がある。いくつかの実施形態では、ガイド鎖の3′末端10ヌクレオチドは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のホスホロチオエート修飾ヌクレオチドを含む。ガイド鎖は、分子全体に位置し得る2′F及び/または2′OMe修飾も含み得る。いくつかの実施形態では、ガイド鎖の1位のヌクレオチド(ガイド鎖の最も5′側のヌクレオチド)は、2′OMe修飾及び/またはリン酸化されている。ガイド鎖内のC及びUヌクレオチドは、2′F修飾されていてもよい。例えば、19ntガイド鎖の2~10位(または異なる長さのガイド鎖における対応する位置)のC及びUヌクレオチドは、2′F修飾されていてもよい。ガイド鎖内のC及びUヌクレオチドは、2′OMe修飾されている場合もある。例えば、19ntガイド鎖の11~18位(または異なる長さのガイド鎖における対応する位置)のC及びUヌクレオチドは、2′OMe修飾されていてもよい。いくつかの実施形態では、ガイド鎖の最も3′側の末端のヌクレオチドは修飾されていない。ある特定の実施形態では、ガイド鎖内のC及びUの大部分は2′F修飾されており、ガイド鎖の5′末端はリン酸化されている。他の実施形態では、1位及び11~18位のCまたはUは2′OMe修飾されており、ガイド鎖の5′末端はリン酸化されている。他の実施形態では、位置1及び位置11~18のCsまたはUsは2′OMe修飾されており、ガイド鎖の5′末端はリン酸化されており、2~10位のCまたはUは2′F修飾されている。
自己送達可能なRNAi技術は、追加の製剤または技法を必要とすることなくRNAi剤(siRNA、sdRNA、または他のRNAi剤のいずれか)で細胞を直接トランスフェクトする方法を提供する。トランスフェクションが困難な細胞株をトランスフェクトする能力、高いインビボ活性、及び使用の単純さは、従来のsiRNAベースの技法に優る重大な機能的利点を提示する組成物及び方法の特徴であり、したがって、sdRNA法は、本発明のTILにおける標的遺伝子の発現を減少させる方法に関連するいくつかの実施形態で用いられる。sdRNA法により、化学合成された化合物をエクスビボ及びインビボの両方で広範囲の一次細胞及び組織に直接送達することが可能になる。本明細書における本発明のいくつかの実施形態に記載のsdRNAは、Advirna LLC(Worcester,MA,USA)から市販されている。
siRNA及びsdRNAは、疎水的に修飾されたsiRNA-アンチセンスオリゴヌクレオチドハイブリッド構造として形成され得、例えば、Byrne,et al.,J.Ocular Pharmacol.Therapeut.,2013,29,855-864(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、滅菌エレクトロポレーションを使用して本明細書に記載のTILに送達され得る。ある特定の実施形態では、方法は、siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドを送達するためにTIL集団の滅菌エレクトロポレーションを含む。
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、膜貫通送達系と組み合わせて細胞に送達され得る。いくつかの実施形態では、この膜貫通送達系は、脂質、ウイルスベクターなどを含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド剤は、自己送達RNAi剤であり、いかなる送達剤も必要としない。特定の実施形態では、方法は、TIL集団にsiRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドを送達するための膜貫通送達系の使用を含む。
オリゴヌクレオチド及びオリゴヌクレオチド組成物は、本明細書に記載のTILと接触し(例えば、接触させられ、本明細書では投与または送達されるとも称される)、TILによって取り込まれる(TILによる受動的取り込みを含む)。sdRNAは、第1の拡張中(例えば、ステップB)、第1の拡張後(例えば、ステップC中)、第2の拡張前または拡張中(例えば、ステップDの前またはステップD中)、ステップD後及びステップEにおける採取前、ステップFにおける採取中または採取後、ステップFにおける最終製剤化及び/または注入バッグへの移行前または移行中、ならびにステップFにおける任意選択の凍結保存ステップ前に、本明細書に記載のTILに添加され得る。さらに、sdRNAは、ステップFにおける任意の凍結保存ステップから解凍した後に添加され得る。いくつかの実施形態では、CD39、CD69、PD-1、LAG-3、TIM-3、CISH、CTLA-4、TIGIT、TET2及びCBLBを含む、本明細書に記載の1つ以上のsdRNA標的遺伝子が、100nM~20mM、200nM~10mM、500nm~1mM、1μM~100μM、及び1μM~100μMからなる群から選択される濃度でTIL及び他の薬剤を含む細胞培養培地に添加され得る。いくつかの実施形態では、CD39、CD69、PD-1、LAG-3、TIM-3、CISH、CTLA-4、TIGIT、TET2及びCBLBを含む、本明細書に記載の1つ以上のsdRNA標的遺伝子は、0.1μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、0.5μM
sdRNA/10,000TIL/100μL培地、0.75μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、1μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、1.25μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、1.5μM
sdRNA/10,000TIL/100μL培地、2μM sdRNA/10,00
0TIL/100μL培地、5μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、または10μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地からなる群から選択される量でTIL及び他の薬剤を含む細胞培養培地に添加され得る。いくつかの実施形態では、CD39、CD69、PD-1、LAG-3、TIM-3、CISH、CTLA-4、TIGIT、TET2及びCBLBを含む、本明細書に記載の1つ以上のsdRNA標的遺伝子は、REP前段階またはREP段階中に1日2回、1日1回、2日毎、3日毎、4日毎、5日毎、6日毎、または7日毎にTIL培養物に添加され得る。
sdRNAを含む本発明のオリゴヌクレオチド組成物は、例えば、細胞培養培地にsdRNAを高濃度で溶解し、かつ受動的取り込みが起こるのに十分な時間を許容することによって、拡張プロセス中に本明細書に記載のTILと接触することができる。ある特定の実施形態では、本発明の方法は、TIL集団を、本明細書に記載のオリゴヌクレオチド組成物と接触させることを含む。ある特定の実施形態では、この方法は、オリゴヌクレオチド、例えば、sdRNAを細胞培養培地に溶解することと、細胞培養培地をTIL集団と接触させることとを含む。TILは、本明細書に記載の第1の集団、第2の集団、及び/または第3の集団であり得る。
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの細胞への送達は、リン酸カルシウム、DMSO、グリセロールもしくはデキストラン、エレクトロポレーションを含む好適な技術分野で認識される方法によって、またはトランスフェクションによって、例えば、当該技術分野で知られている方法、例えば、米国特許第4,897,355号、同第5,459,127号、同第5,631,237号、同第5,955,365号、同第5,976,567号、同第10,087,464号、及び同第10,155,945号、ならびにBergan,et al.,Nucl.Acids Res.1993,21,3567(それらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載される方法を使用して、カチオン性、アニオン性、もしくは中性脂質組成物またはリポソームを使用して増強され得る。
いくつかの実施形態では、1つを超えるsiRNAまたはsdRNAが、標的遺伝子の発現を減少させるために使用されるいくつかの実施形態では、CD39、CD69、PD-1、TIM-3、CBLB、LAG3、CTLA-4、TIGIT、TET2及び/またはCISHを標的とするsiRNAまたはsdRNAのうちの1つ以上が一緒に使用される。いくつかの実施形態では、PD-1 siRNAまたはsdRNAは、1つを超える遺伝子標的の発現を減少させるために、TIM-3、CBLB、LAG3、CTLA-4、TIGIT、TET2及び/またはCISHのうちの1つ以上とともに使用される。いくつかの実施形態では、LAG3 siRNAまたはsdRNAは、両方の標的の遺伝子発現を減少させるために、CISHを標的とするsiRNAまたはsdRNAと組み合わせて使用される。いくつかの実施形態では、本明細書におけるCD39、CD69、PD-1、TIM-3、CBLB、LAG3、CTLA-4、TIGIT、TET2及び/またはCISHのうちの1つ以上を標的とするsiRNAまたはsdRNAは、Advirna LLC(Worcester,MA,USA)または複数の他のベンダーから市販されている。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、CD39、CD69、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、CD39、CD69、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では
、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、別のsiRNAまたはsdRNAは、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、CD39、CD69、PD-1、LAG-3、CISH、CBLB、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、及びそれらの組み合わせから選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、PD-1、ならびにLAG3、CISH、CBLB、TIM3のうちの1つ、及びそれらの組み合わせから選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CTLA-4を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TET2を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CTLA-4を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TET2を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CTLA-4を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TET2を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsdRNAは、CD39を標的とし、1つのsdRNAは、CD69を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CTLA-4を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TET2を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とする。いくつかの実施形態では
、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CTLA-4を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TET2を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CTLA-4を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CTLA-4を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TET2を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIGITを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TET2を標的とする。
本明細書で考察されたように、本発明の実施形態は、それらの治療効果を増強するために遺伝子編集を介して遺伝子修飾された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を提供する。本発明の実施形態は、1つ以上のタンパク質の発現の促進及び1つ以上のタンパク質の発現の阻害の両方、ならびにそれらの組み合わせのために、TIL集団へのヌクレオチド挿入(RNAまたはDNA)による遺伝子編集を包含する。本発明の実施形態は、TILを治療的集団に拡張するための方法も提供し、方法は、TILを遺伝子編集することを含む。TIL集団を遺伝子修飾するために使用され得るいくつかの遺伝子編集技術が存在し、それらは本発明による使用に好適である。かかる方法は、以下に記載の方法、ならびに本明細書の他の場所に記載のウイルス及びトランスポゾン方法を含む。いくつかの実施形態では、TIL、MIL、またはPBLを遺伝子修飾してCCRを発現させる方法はまた、かかる遺伝子の安定したノックアウトまたはかかる遺伝子の一過性ノックダウンのいずれかを介して遺伝子の発現を抑制する修飾を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、この方法は、本明細書に記載の第1の集団、第2の集団、及び/または第3の集団におけるTIL集団を遺伝子修飾する方法を含む。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、1つ以上のタンパク質の産生または阻害(例えば、サイレンシング)のために遺伝子の安定した組み込みステップを含む。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、エレクトロポレーションステップを含む。エレクトロポレーション法は、当該技術分野で知られており、例えば、Tsong,Biophys.J.1991,60,297-306及び米国特許出願公開第2014/0227237A1号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。米国特許第5,019,034号、同第5,128,257号、同第5,137,817号、同第5,173,158号、同第5,232,856号、同第5,273,525号、同第5,304,120号、同第5,318,514号、同第6,010,613号、及び同第6,078,490号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるものなどの当該技術分野で知られている他のエレクトロポレーション法が使用され得る。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、滅菌エレクトロポレーション法である。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、パルスエレクトロポレーション法である。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適
用するステップを含み、少なくとも3つのDC電気パルス列は、以下の特徴のうちの1つ、2つ、または3つを有する:(1)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる、(2)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる、及び(3)少なくとも3つのパルスのうちの2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILにおける細孔形成を誘導するステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つのDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのDC電気パルス列は、以下の特徴のうちの1つ、2つ、または3つを有する:(1)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる、(2)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる、及び(3)少なくとも3つのパルスのうちの2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なり、これにより、誘導された細孔が比較的長期間にわたって持続され、TILの生存率が維持される。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、リン酸カルシウムトランスフェクションステップを含む。リン酸カルシウムトランスフェクション法(リン酸カルシウムDNA沈殿、細胞表面コーティング、及びエンドサイトーシス)は、当該技術分野で知られており、Graham and van der Eb,Virology 1973,52,456-467、Wigler,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.1979,76,1373-1376、及びChen and Okayarea,Mol.Cell.Biol.1987,7,2745-2752、ならびに米国特許第5,593,875号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、リポソームトランスフェクションステップを含む。リポソームトランスフェクション法、例えば、カチオン性脂質N-[1-(2,3-ジオレイルオキシ)プロピル]-n,n,n-トリメチルアンモニウムクロリド(DOTMA)及びジオレオイルホスホチジルエタノールアミン(DOPE)の1:1(w/w)リポソーム製剤を用いる方法は、当該技術分野において既知であり、Rose,et al.,Biotechniques 1991,10,520-525及びFelgner,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1987,84,7413-7417、ならびに米国特許第5,279,833号、同第5,908,635号、同第6,056,938号、同第6,110,490号、同第6,534,48
4号、及び同第7,687,070号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、米国特許第5,766,902号、同第6,025,337号、同第6,410,517号、同第6,475,994号、及び同第7,189,705号に記載の方法を使用するトランスフェクションステップを含み、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。TILは、本明細書に記載のTILの第1の集団、第2の集団、及び/または第3の集団であり得る。
ある実施形態によれば、遺伝子編集プロセスは、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。かかるプログラム可能なヌクレアーゼは、特定のゲノム遺伝子座に切断を導入することによって正確なゲノム編集を可能にし、すなわち、ゲノム内の特定のDNA配列の認識に依存して、ヌクレアーゼドメインをこの位置に標的し、標的配列での二本鎖切断の生成を媒介する。DNAの二本鎖切断は、その後、内因性修復機構を切断部位に動員して、非相同末端結合(NHEJ)または相同指向修復(HDR)のいずれかによるゲノム編集を媒介する。したがって、切断の修復は、標的遺伝子産物を破壊する(例えば、サイレンス、抑制、または増強する)挿入/欠失変異の導入をもたらす可能性がある。
部位特異的ゲノム編集を可能にするために開発されたヌクレアーゼの主要なクラスには、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)、転写活性化因子様ヌクレアーゼ(TALEN)、及びCRISPR関連ヌクレアーゼ(例えば、CRISPR/Cas9)が含まれる。これらのヌクレアーゼ系は、DNA認識のモードに基づいて大きく2つのカテゴリーに分類され得、ZFN及びTALENは、タンパク質-DNA相互作用を介して特定のDNA結合を達成するが、Cas9などのCRISPR系は、標的DNAと直接塩基対を形成する短いRNAガイド分子によって、かつタンパク質-DNA相互作用によって特定のDNA配列を標的とする。例えば、Cox et al.,Nature Medicine,2015,Vol.21,No.2を参照されたい。
本発明のTIL拡張法に従って使用され得る遺伝子編集法の非限定的な例には、CRISPR法、TALE法、及びZFN法が含まれ、これらは以下でより詳細に説明される。ある実施形態によれば、TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、Gen2)に従って、または米国特許出願公開第2020/0299644 A1号及び同第2020/0121719 A1号、ならびに米国特許第10,925,900号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるように実行することができ、方法は、増強された治療効果を提供することができるTILを生成するために、CRISPR法、TALE法、またはZFN法のうちの1つ以上によって、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。ある実施形態によれば、遺伝子編集されたTILは、インビトロでそれらを修飾されていないTILと比較することによって、例えば、修飾されていないTILと比較してインビトロでのエフェクター機能、サイトカインプロファイルなどを評価することによって、治療効果の改善について評価され得る。ある特定の実施形態では、この方法は、CRISPR法、TALE法、及び/またはZFN法を使用してTIL集団を遺伝子編集することを含む。
本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーションは、CRISPR系、TALEN系、及びZFN系などの遺伝子編集系の送達のために使用される。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーション系は、フローエレクトロポレーション系である。本発明のいくつかの実施形態との使用に好適な、好適なフローエレクトロポレーション系の例は、市販のMaxCyte STX系である。本発明との使用に好適であり得る、BTX-Harvard Apparatusから入手可能なAgilePulse系
もしくはECM830、Cellaxess Elektra(Cellectricon)、Nucleofector(Lonza/Amaxa)、GenePulser MXcell(BIORAD)、iPorator-96(Primax)、またはsiPORTer96(Ambion)などのいくつかの代替の市販エレクトロポレーション機器が存在する。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーション系は、TIL拡張法の残りとともに、滅菌閉鎖系を形成する。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーション系は、本明細書に記載のパルスエレクトロポレーション系であり、TIL拡張法の残りとともに、滅菌閉鎖系を形成する。
TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、Gen2)に従って、または米国特許出願公開第2020/0299644 A1号及び同第2020/0121719 A1号、ならびに米国特許第10,925,900号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように実行することができ、方法は、CRISPR法(例えば、CRISPR/Cas9またはCRISPR/Cpf1)によってTILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のCRISPR法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは減少させる。代替的に、TIL拡張プロセス中のCRISPR法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。
CRISPRは、clustered regularly interspaced
short palindromic repeats(クラスター化された定期的に間隔をあけた短いパリンドロミックリピート)の略語である。遺伝子編集のためにCRISPR系を使用する方法は、本明細書ではCRISPR法とも称される。RNA及びCasタンパク質を組み込み、かつ本発明に従って使用され得るCRISPR系には、3つの型:I型、II型、及びIII型がある。II型CRISPR(Cas9によって例示される)は、最もよく特徴付けられている系のうちの1つである。
CRISPR技術は、細菌及び古細菌(単細胞微生物のドメイン)の自然防御機構から適合された。これらの生物は、CRISPR由来のRNA及びCas9を含む様々なCasタンパク質を使用して、外来侵入物のDNAを切り刻んで破壊することによって、ウイルス及び他の異物による攻撃を阻止する。CRISPRは、ヌクレオチド反復配列及びスペーサーの存在という2つの異なる特徴を有するDNAの特殊な領域である。ヌクレオチドの反復配列は、CRISPR領域全体に分布しており、外来DNA(スペーサー)の短いセグメントが反復配列の間に散在している。II型CRISPR/Cas系では、スペーサーは、CRISPRゲノム遺伝子座内に組み込まれ、転写され、短いCRISPR RNA(crRNA)に処理される。これらのcrRNAは、トランス活性化crRNA(tracrRNA)にアニーリングし、Casタンパク質による病原性DNAの配列特異的切断及びサイレンシングを指示する。Cas9タンパク質による標的認識には、crRNA内の「シード」配列、及びcrRNA結合領域の上流にある保存されたジヌクレオチドを含むプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列が必要である。これにより、CRISPR/Cas系が再標的されて、crRNAを再設計することにより、実質的にいずれのDNA配列も切断することができる。天然系におけるcrRNA及びtracrRNAは、遺伝子操作で使用するために、およそ100ヌクレオチドの単一ガイドRNA(sgRNA)に簡略化され得る。CRISPR/Cas系は、Cas9エンドヌクレアーゼを発現するプラスミドと必要なcrRNA成分を同時送達することにより、ヒト細胞に直接運搬可能である。Casタンパク質の異なるバリアント(例えば、Cpf1などのCas9のオルソログ)を使用して、標的の制限を低減することができる。
CRISPR法によりTILを永続的に遺伝子編集することによってサイレンスまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例には、CD39、CD69、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、TOX、SOCS1、ANKRD11、及びBCORが含まれる。
CRISPR法によりTILを永続的に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の非限定的な例には、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL12、IL-15、及びIL-21が含まれる。
CRISPR法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得る系、方法、及び組成物の例は、米国特許第8,697,359号、同第8,993,233号、同第8,795,965号、同第8,771,945号、同第8,889,356号、同第8,865,406号、同第8,999,641号、同第8,945,839号、同第8,932,814号、同第8,871,445号、同第8,906,616号、及び同第8,895,308号に記載されており、それらの各々の開示は、参照により本明細書に組み込まれる。CRISPR/Cas9及びCRISPR/Cpf1を発現するためのプラスミドなどのCRISPR法を行うための資源は、GenScriptなどの企業から市販されている。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のTIL集団の遺伝子修飾は、米国特許第9790490号に記載されているCRISPR/Cpf1系を使用して行うことができ、この開示は参照により本明細書に組み込まれる。
TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、Gen2)に従って、または米国特許出願公開第2020/0299644 A1号及び同第2020/0121719 A1号、ならびに米国特許第10,925,900号に記載されているように実行することができ、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれ、方法は、TALE法によってTILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のTALE法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは減少させる。あるいは、TIL拡張プロセス中のTALE法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。
TALEは、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)を含む、転写活性化因子様エフェクタータンパク質を表す。遺伝子編集のためにTALE系を使用する方法は、本明細書ではTALE法とも称され得る。TALEは、植物病原菌Xanthomonas属由来の天然に存在するタンパク質であり、各々単一の塩基対を認識する一連の33~35アミノ酸反復ドメインで構成されるDNA結合ドメインを含む。TALE特異性は、反復可変二残基(RVD)として知られる2つの超可変アミノ酸によって決定される。モジュラーTALE反復配列は、隣接するDNA配列を認識するために一緒に結合される。DNA結合ドメイン内の特定のRVDは、標的遺伝子座内の塩基を認識し、予測
可能なDNA結合ドメインを組み立てるための構造的特徴を提供する。TALEのDNA結合ドメインは、IIS型FokIエンドヌクレアーゼの触媒ドメインに融合して、標的可能なTALEヌクレアーゼを作製する。部位特異的変異を誘導するために、14~20塩基対のスペーサー領域によって分離された2つの個々のTALENアームがFokIモノマーを密接に接近させて二量体化し、標的とされる二本鎖切断を産生する。
様々な組み立て方法を利用したいくつかの大規模な系統的研究により、TALE反復配列を組み合わせて、実質的にすべてのユーザ定義配列を認識することができることが示されている。カスタム設計されたTALEアレイも、Cellectis Bioresearch(Paris,France)、Transposagen Biopharmaceuticals(Lexington,KY,USA)、及びLife Technologies(Grand Island,NY,USA)から市販されている。本発明での使用に好適なTALE法及びTALEN法は、米国特許公開第2011/0201118 A1号、同第2013/0117869 A1号、同第2013/0315884 A1号、同第2015/0203871 A1号、及び同第2016/0120906 A1号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
TALE法によりTILを永続的に遺伝子編集することによってサイレンスまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例には、CD39、CD69、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、TOX、SOCS1、ANKRD11、及びBCORが含まれる。
TALE法によりTILを永続的に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の非限定的な例には、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL12、IL-15、及びIL-21が含まれる。
TALE法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得る系、方法、及び組成物の例は、米国特許第8,586,526号に記載されており、これは参照により本明細書に組み込まれる。
TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態に従って、または米国特許出願公開第2020/0299644 A1号及び同第2020/0121719 A1号、ならびに米国特許第10,925,900号に記載されているように実行することができ、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれ、方法は、ジンクフィンガーまたはジンクフィンガーヌクレアーゼ法によってTILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のジンクフィンガー法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは減少させる。代替的に、TIL拡張プロセス中のジンクフィンガー法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。
個々のジンクフィンガーは、保存されたββα立体配置でおよそ30個のアミノ酸を含む。αらせんの表面上のいくつかのアミノ酸は、典型的には、異なる選択性レベルでDNAの主溝の3bpと接触する。ジンクフィンガーは、2つのタンパク質ドメインを有する。第1のドメインは、DNA結合ドメインであり、真核生物転写因子を含み、ジンクフィンガーを含む。第2のドメインは、ヌクレアーゼドメインであり、FokI制限酵素を含み、DNAの触媒的切断を担っている。
個々のZFNのDNA結合ドメインは、典型的には、3~6個の個々のジンクフィンガー反復配列を含み、各々9~18塩基対を認識することができる。ジンクフィンガードメインが目的の標的部位に特異的である場合、合計18塩基対を認識する3フィンガーZFNの対でさえ、理論的には、哺乳動物ゲノムの単一遺伝子座を標的とすることができる。新たなジンクフィンガーアレイを生成するための1つの方法は、既知の特異性を有するより小さいジンクフィンガー「モジュール」を組み合わせることである。最も一般的なモジュラーアセンブリプロセスは、各々3塩基対のDNA配列を認識することができる3つの別個のジンクフィンガーを組み合わせて、9塩基対の標的部位を認識することができる3フィンガーアレイを生成することを含む。代替的に、オリゴマー化プールエンジニアリング(OPEN)などの選択ベースのアプローチを使用して、隣接するフィンガー間のコンテキスト依存的相互作用を考慮したランダム化ライブラリーから新たなジンクフィンガーアレイを選択することができる。操作されたジンクフィンガーは、Sangamo Biosciences(Richmond,CA,USA)及びSigma-Aldrich(St.Louis,MO,USA)から市販されている。
ジンクフィンガー法によりTILを永続的に遺伝子編集することによってサイレンスまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例には、CD39、CD69、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、TOX、SOCS1、ANKRD11、及びBCORが含まれる。
ジンクフィンガー法によりTILを永続的に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の非限定的な例には、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL12、IL-15、及びIL-21が含まれる。
ジンクフィンガー法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得る系、方法、及び組成物の例は、米国特許第6,534,261号、同第6,607,882号、同第6,746,838号、同第6,794,136号、同第6,824,978号、同第6,866,997号、同第6,933,113号、同第6,979,539号、同第7,013,219号、同第7,030,215号、同第7,220,719号、同第7,241,573号、同第7,241,574号、同第7,585,849号、同第7,595,376号、同第6,903,185号、及び同第6,479,626号に記載されており、これらの各々は参照により本明細書に組み込まれる。
ジンクフィンガー法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施
形態に従って使用され得る系、方法、及び組成物の他の例は、Beane,et al.,Mol.Therapy,2015,23 1380-1390に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、TILは、高親和性TCR、例えば、MAGE-1、HER2、もしくはNY-ESO-1などの腫瘍関連抗原で標的とされるTCR、または腫瘍関連細胞表面分子(例えば、メソセリン)もしくは系統制限細胞表面分子(例えば、CD19)に結合するキメラ抗原受容体(CAR)を含むが、これらに限定されない追加の機能を含むように任意選択で遺伝子操作される。いくつかの実施形態では、遺伝子操作を用いて、PD-1及びCTLA-4またはCD39及びCD69をコードする遺伝子などの特定の標的遺伝子のノックアウトを含む、TILを遺伝子編集することができる。ある特定の実施形態では、この方法は、高親和性TCR、例えば、MAGE-1、HER2、もしくはNY-ESO-1などの腫瘍関連抗原で標的とされるTCR、または腫瘍関連細胞表面分子(例えば、メソセリン)もしくは系統制限細胞表面分子(例えば、CD19)に結合するキメラ抗原受容体(CAR)を含むようにTIL集団を遺伝子操作することを含む。適切には、TIL集団は、本明細書に記載の第1の集団、第2の集団及び/または第3の集団であり得る。
E.TIL製造のための閉鎖系
本発明は、TIL培養プロセス中に閉鎖系の使用を提供する。かかる閉鎖系は、微生物汚染の防止及び/または低減を可能にし、より少数のフラスコの使用を可能にし、コスト削減を可能にする。いくつかの実施形態では、閉鎖系は、2つの容器を使用する。
かかる閉鎖系は当該技術分野でよく知られており、例えば、http://www.fda.gov/cber/guidelines.htm及びhttps://www.fda.gov/BiologicsBloodVaccines/GuidanceComplianceRegulatoryInformation/Guidances/Blood/ucm076779.htmで見つけることができる。
滅菌接続装置(STCD)は、互換性のある2本の管間の滅菌溶接をもたらす。この手順により、様々な容器と管径との滅菌接続が可能になる。いくつかの実施形態では、閉鎖系には、実施例に記載のルアーロック系及びヒートシール系が含まれる。いくつかの実施形態では、閉鎖系は、閉鎖系の無菌性及び閉鎖性を維持するために、滅菌条件下でシリンジを介してアクセスされる。いくつかの実施形態では、実施例に記載の閉鎖系が用いられる。いくつかの実施形態では、TILは、実施例において本明細書に記載される方法に従って、最終製品製剤容器に製剤化される。
いくつかの実施形態では、閉鎖系は、腫瘍断片が得られてから、TILを患者に投与するかまたは凍結保存する準備が整うまで、1つの容器を使用する。いくつかの実施形態では、2つの容器が使用される場合、第1の容器は密閉G容器であり、TIL集団が遠心分離され、第1の密閉G容器を開かずに注入バッグに移される。いくつかの実施形態では、2つの容器が使用される場合、注入バッグは、HypoThermosolを含有する注入バッグである。閉鎖系または閉鎖TIL細胞培養系は、腫瘍試料及び/または腫瘍断片が追加されると、系が外部からしっかりと密閉され、細菌、真菌、及び/またはいずれの他の微生物汚染も侵入しない閉鎖環境を形成することを特徴とする。
いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約5%~約100%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約5%~約95%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約5%~約90%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約10%~約90%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は
、約15%~約85%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約5%、約10%、約15%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、約95%、約97%、約98%、約99%、または約100%である。
閉鎖系は、微生物汚染の不在下で及び/または微生物汚染が大幅に低減された状態で、TILの成長を可能にする。
さらに、TIL細胞培養環境のpH、二酸化炭素分圧、及び酸素分圧は各々、細胞が培養されるにつれて変化する。したがって、細胞培養に適切な培地を循環させても、TIL増殖に最適な環境として閉鎖環境を常に一定に維持する必要がある。この目的のために、閉鎖環境の培養液中のpH、二酸化炭素分圧、及び酸素分圧の物理的要因がセンサーによって監視されること、そのシグナルが培養環境の入口に設置されたガス交換器を制御するために使用されること、及び閉鎖環境のガス分圧が細胞培養環境を最適化するように培養液の変化に応じてリアルタイムで調整されることが望ましい。いくつかの実施形態では、本発明は、閉鎖環境のpH、二酸化炭素分圧、及び酸素分圧を測定する監視装置を備えたガス交換器を閉鎖環境の入口に組み込み、かつ監視装置からのシグナルに基づいてガス濃度を自動的に調整することによって細胞培養環境を最適化する閉鎖細胞培養系を提供する。
いくつかの実施形態では、閉鎖環境内の圧力は、連続的または断続的に制御される。すなわち、閉鎖環境内の圧力を、例えば、圧力維持装置によって変化させることができ、それ故に、空間が正圧状態でTILの成長に好適であることを確実にするか、または負圧状態で流体の浸出を促進し、ひいては細胞増殖を促進する。さらに、負圧を断続的に加えることにより、閉鎖環境内の体積の一時的な収縮によって、閉鎖環境内の循環液体を均一かつ効率的に置き換えることが可能である。
いくつかの実施形態では、TILの増殖に最適な培養成分を置換または追加することができ、IL-2及び/またはOKT3などの因子、ならびに組み合わせを追加することができる。
F.TILの任意選択の凍結保存
バルクTIL集団(例えば、第2のTIL集団)または拡張されたTIL集団(例えば、第3のTIL集団)のいずれかを、任意選択で凍結保存することができる。いくつかの実施形態では、凍結保存は、治療的TIL集団に起こる。いくつかの実施形態では、凍結保存は、第2の拡張後に採取されたTILに起こる。いくつかの実施形態では、凍結保存は、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)の例示的なステップFにおいてTILに起こる。いくつかの実施形態では、TILは、注入バッグ内で凍結保存される。いくつかの実施形態では、TILは、注入バッグに入れる前に凍結保存される。いくつかの実施形態では、TILは、凍結保存され、注入バッグに入っていない。いくつかの実施形態では、凍結保存は、凍結保存培地を使用して行われる。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、ジメチルスルホキシド(DMSO)を含有する。これは、一般に、TIL集団を凍結溶液、例えば、85%補体不活性化AB血清及び15%ジメチルスルホキシド(DMSO)に入れることによって達成される。溶液中の細胞が極低温バイアルに入れられ、-80℃で24時間保存され、任意選択で凍結保存のためにガス状窒素冷凍庫に移される。Sadeghi,et al.,Acta Oncologica 2013,52,978-986を参照されたい。
適切な場合、細胞が冷凍庫から取り出され、溶液のおよそ5分の4が解凍されるまで3
7℃の水浴中で解凍される。細胞は、一般に、完全培地中に再懸濁され、任意で1回以上洗浄される。いくつかの実施形態では、解凍されたTILは、当該技術分野で知られているように計数され、生存率について評価され得る。
いくつかの実施形態では、TIL集団は、CS10凍結保存培地(CryoStor 10、BioLife Solutions)を使用して凍結保存される。いくつかの実施形態では、TIL集団は、ジメチルスルホキシド(DMSO)を含有する凍結保存培地を使用して凍結保存される。いくつかの実施形態では、TIL集団は、1:1(体積:体積)比のCS10及び細胞培養培地を使用して凍結保存される。いくつかの実施形態では、TIL集団は、約1:1(体積:体積)比のCS10及び細胞培養培地を使用して凍結保存され、追加のIL-2をさらに含む。
上で考察されたように、また図1及び/または8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されるステップA~Eで例示されるように、凍結保存は、TIL拡張プロセス全体の様々な時点で起こり得る。いくつかの実施形態では、第1の拡張後の拡張されたTIL集団(例えば、ステップBに従って提供される、または図1もしくは8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)のステップDによる1回以上の第2の拡張後の拡張されたTIL集団を凍結保存することができる。凍結保存は、一般に、TIL集団を凍結溶液、例えば、85%補体不活性化AB血清及び15%ジメチルスルホキシド(DMSO)に入れることによって達成され得る。溶液中の細胞が極低温バイアルに入れられ、-80℃で24時間保存され、任意選択で凍結保存のためにガス状窒素冷凍庫に移される。Sadeghi,et al.,Acta Oncologica 2013,52,978-986を参照されたい。いくつかの実施形態では、TILは、5% DMSO中で凍結保存される。いくつかの実施形態では、TILは、5% DMSOを加えた細胞培養培地中で凍結保存される。いくつかの実施形態では、TILは、実施例6に提供される方法に従って凍結保存される。
適切な場合、細胞が冷凍庫から取り出され、溶液のおよそ5分の4が解凍されるまで37℃の水浴中で解凍される。細胞は、一般に、完全培地中に再懸濁され、任意で1回以上洗浄される。いくつかの実施形態では、解凍されたTILは、当該技術分野で知られているように計数され、生存率について評価され得る。
場合によっては、図1または8からのステップB(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)TIL集団は、以下に考察されるプロトコルを使用して、直ちに凍結保存され得る。代替的に、バルクTIL集団を、図1または8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップC及びステップDに供し、その後、図1または8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップDの後に凍結保存することができる。同様に、遺伝子修飾されたTILが治療法に使用される場合、図1または8からのステップBまたはステップD(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)を、好適な治療のために遺伝子修飾に供することができる。
G.拡張TILの表現型特徴
いくつかの実施形態では、TILは、本明細書及び実施例に記載されているものを含む、拡張後の多数の表現型マーカーの発現について分析される。いくつかの実施形態では、
1つ以上の表現型マーカーの発現が調べられる。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、図1または8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップBにおける第1の拡張後に分析される。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、図1または8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップCにおける遷移中に分析される。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、図1または8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップCによる移行中及び凍結保存後に分析される。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、図1または8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップDによる第2の拡張後に分析される。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、図1または8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)からのステップDによる2つ以上の拡張後に分析される。
いくつかの実施形態では、マーカーは、CD8及びCD28からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、CD8の発現が調べられる。いくつかの実施形態では、CD28の発現が調べられる。いくつかの実施形態では、CD8及び/またはCD28の発現は、他のプロセス(例えば、例えば図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に提供されるGen3プロセス)と比較して、例えば図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に提供される2Aプロセスと比較して、現行の本発明のプロセスに従って産生されたTIL上でより高い。いくつかの実施形態では、CD8の発現は、他のプロセス(例えば、例えば図8(特に、例えば図8B)に提供されるGen3プロセス)と比較して、例えば図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に提供される2Aプロセスと比較して、本発明のプロセスに従って産生されたTIL上でより高い。いくつかの実施形態では、CD28の発現は、他のプロセス(例えば、例えば図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に提供されるGen3プロセス)と比較して、例えば図8(特に、例えば図8A)に提供される2Aプロセスと比較して、本発明のプロセスに従って産生されたTIL上でより高い。いくつかの実施形態では、高いCD28発現は、より若く、より持続的なTIL表現型を示す。いくつかの実施形態では、1つ以上の調節マーカーの発現が測定される。
いくつかの実施形態では、CD8及び/またはCD28に基づく第1のTIL集団、第2のTIL集団、第3のTIL集団、または採取されたTIL集団の選択は、本明細書に記載の腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を拡張するための方法のいずれのステップ中にも行われない。
いくつかの実施形態では、セントラルメモリー細胞のパーセンテージは、他のプロセス(例えば、例えば図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に提供されるGen3プロセス)と比較して、例えば図8(特に、例えば図8A)に提供される2Aプロセスと比較して、本発明のプロセスに従って産生されたTIL上でより高い。いくつかの実施形態では、セントラルメモリー細胞のメモリーマーカーは、CCR7及びCD62Lからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILメモリーサブセットは、異なるメモリーサブセットに分類され得る。いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILは、ナイーブ(CD45RA+CD62L+)TILを含む。いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILは、セントラルメモリー(CM、CD45RA-CD62L+)TILを含む。いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILは、エフェクターメモリー(EM、CD45RA-CD62L-)TILを含む。いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILは、RA+エフェクターメモリー/エフェクター(TEMRA/TEFF、CD45RA+CD62L+)TILを含む。
いくつかの実施形態では、TILは、グランザイムB、パーフォリン、及びグラニュライシンからなる群から選択されるもう1つのマーカーを発現する。いくつかの実施形態では、TILは、グランザイムBを発現する。いくつかの実施形態では、TILは、パーフォリンを発現する。いくつかの実施形態では、TILは、グラニュライシンを発現する。
いくつかの実施形態では、再刺激されたTILは、サイトカイン放出アッセイを使用して、サイトカイン放出についても評価され得る。いくつかの実施形態では、TILは、インターフェロンガンマ(IFN-γ)分泌について評価され得る。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、ELISAアッセイによって測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に提供されるように、ステップDの後の急速な第2の拡張ステップの後のELISAアッセイによって測定される。いくつかの実施形態では、TILの健康は、IFN-ガンマ(IFN-γ)分泌によって測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、活性なTILを示す。いくつかの実施形態では、IFN-γ産生の効力アッセイが用いられる。IFN-γ産生は、細胞傷害能の別の尺度である。IFN-γ産生は、CD3、CD28、及びCD137/4-1BBに対する抗体で刺激されたTILの培地中のサイトカインIFN-γのレベルを決定することによって測定され得る。これらの刺激されたTILからの培地中のIFN-γレベルは、IFN-γ放出を測定することによって決定され得る。いくつかの実施形態では、例えば図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)TILに提供されるようなGen3プロセスのステップDにおけるIFN-γ産生の増加は、例えば図8(特に、例えば図8A)に提供される2AプロセスのステップDと比較して、ステップD TILの細胞傷害能の増加を示している。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、1倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、2倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、3倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、4倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、5倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γは、Quantikine ELISAキットを使用して測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、エクスビボでのTIL中で測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、例えば図8Bの方法を含む、本発明の方法によって産生されたTILを含む、TILにおいてエクスビボで測定される。
いくつかの実施形態では、少なくとも1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも1倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B
及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも2倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも3倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも4倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも5倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、少なくとも100pg/mL~約1000pg/mL以上のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL、少なくとも250pg/mL、少なくとも300pg/mL、少なくとも350pg/mL、少なくとも400pg/mL、 少なくとも450pg/mL、少なくとも500pg/mL、少なくとも550pg/mL、少なくとも600pg/mL、少なくとも650pg/mL、少なくとも700pg/mL、少なくとも750pg/mL、少なくとも800pg/mL、 少なくとも850pg/mL、少なくとも900pg/mL、少なくとも950pg/mL、または少なくとも1000pg/mL以上のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも300pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも400pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも500pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも600pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも700pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、
例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも800pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも900pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも1000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも2000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも3000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも4000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも5000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも6000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも7000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも8000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも9000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも10,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも15,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも20,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少な
くとも25,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも30,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも35,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも40,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも45,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも50,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、少なくとも100pg/mL/5e5細胞~約1000pg/mL/5e5細胞以上のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL/5e5細胞、少なくとも250pg/mL/5e5細胞、少なくとも300pg/mL/5e5細胞、少なくとも350pg/mL/5e5細胞、少なくとも400pg/mL/5e5細胞、少なくとも450pg/mL/5e5細胞、少なくとも500pg/mL/5e5細胞、少なくとも550pg/mL/5e5細胞、少なくとも600pg/mL/5e5細胞、少なくとも650pg/mL/5e5細胞、少なくとも700pg/mL/5e5細胞、少なくとも750pg/mL/5e5細胞、少なくとも800pg/mL/5e5細胞、少なくとも850pg/mL/5e5細胞、少なくとも900pg/mL/5e5細胞、少なくとも950pg/mL/5e5細胞、または少なくとも1000pg/mL/5e5細胞以上のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも300pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも400pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及
び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも500pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも600pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも700pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも800pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも900pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも1000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも2000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも3000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも4000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも5000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも6000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも7000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも8000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも9000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/また
は図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも10,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも15,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも20,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも25,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも30,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも35,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも40,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも45,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも50,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
Tリンパ球及びBリンパ球の多様な抗原受容体は、限られた数であるが、多数の遺伝子セグメントの体細胞組換えによって産生される。これらの遺伝子セグメント:V(可変)、D(多様性)、J(接合)、及びC(一定)は、免疫グロブリン及びT細胞受容体(TCR)の結合特異性及び下流での適用を決定する。本発明は、T細胞レパートリー多様性を示し、かつ増加させるTILを生成するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、本方法によって得られたTILは、新たに採取されたTIL及び/または例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILと比較して、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、新たに採取されたTIL及び/または図8(特に、例えば図8A)に例示されるようにGen2と称される方法を使用して調製されたTILと比較して、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、第1の拡張で取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態
では、多様性の増加は、免疫グロブリン多様性及び/またはT細胞受容体多様性の増加である。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン重鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン軽鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、T細胞受容体にある。いくつかの実施形態では、多様性は、アルファ、ベータ、ガンマ、及びデルタ受容体からなる群から選択されるT細胞受容体のうちの1つにある。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファ及び/またはベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)ベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、TCRab(すなわち、TCRα/β)の発現が増加する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセス(例えば、Gen3プロセス)は、他のプロセス、例えば、試料中の固有のペプチドCDRの数に基づくGen2と称されるプロセスと比較して、より高いクローン多様性を示す。
いくつかの実施形態では、TILの活性化及び疲弊は、1つ以上のマーカーを調べることによって決定され得る。いくつかの実施形態では、活性化及び疲弊は、多色フローサイトメトリーを使用して決定され得る。いくつかの実施形態では、活性化及び疲弊のマーカーには、CD39、CD69、CD3、PD-1、2B4/CD244、CD8、CD25、BTLA、KLRG、TIM-3、CD194/CCR4、CD4、TIGIT、CD183、CD69、CD95、CD127、CD103、及び/またはLAG-3)からなる群から選択される1つ以上のマーカーが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、活性化及び疲弊のマーカーには、CD39、CD69、BTLA、CTLA-4、ICOS、Ki67、LAG-3、PD-1、TIGIT、及び/またはTIM-3からなる群から選択される1つ以上のマーカーが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、活性化及び疲弊のマーカーには、CD39、CD69、BTLA、CTLA-4、ICOS、Ki67、LAG-3、CD103+/CD69+、CD103+/CD69-、PD-1、TIGIT、及び/またはTIM-3からなる群から選択される1つ以上のマーカーが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、T細胞マーカー(活性化及び疲弊マーカーを含む)は、T細胞の活性化、阻害、または機能を調べるために決定及び/または分析され得る。いくつかの実施形態では、T細胞マーカーには、CD39、CD69、TIGIT、CD3、FoxP3、Tim-3、PD-1、CD103、CTLA-4、LAG-3、BTLA-4、ICOS、Ki67、CD8、CD25、CD45、CD4、及び/またはCD59からなる群から選択される1つ以上のマーカーが含まれ得るが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、3000pg/10超のTIL~300000pg/10以上のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10超のTIL、5000pg/10超のTIL、7000pg/10超のTIL、9000pg/10超のTIL、11000pg/10超のTIL、13000pg/10超のTIL、15000pg/10超のTIL、17000pg/10超のTIL、19000pg/10超のTIL、20000pg/10超のTIL、40000pg/10超のTIL、60000pg/10超のTIL、80000pg/10超のTIL、100000pg/10超のTIL、120000pg/10超のTIL、140000pg/10超のTIL、160000pg/10超のTIL、180000pg/10超のTIL、200000pg/10超のTIL、220000pg/10超のTIL、240000pg/10超のTIL、260000pg/10超のTIL、280000pg/10超のTIL、300000pg/10以上のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E
及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、5000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、7000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、9000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、11000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、13000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、15000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、17000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、19000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、20000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、40000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、60000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、80000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、100000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、120000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及
び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、140000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、160000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、180000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、200000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、220000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、240000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、260000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、280000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、300000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10超のTIL~300000pg/10以上のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10超のTIL、5000pg/10超のTIL、7000pg/10超のTIL、9000pg/10超のTIL、11000pg/10超のTIL、13000pg/10超のTIL、15000pg/10超のTIL、17000pg/10超のTIL、19000pg/10超のTIL、20000pg/10超のTIL、40000pg/10超のTIL、60000pg/10超のTIL、80000pg/10超のTIL、100000pg/10超のTIL、120000pg/10超のTIL、140000pg/10超のTIL、160000pg/10超のTIL、180000pg/10超のTIL、200000pg/10超のTIL、220000pg/10超のTIL、240000pg/10超のTIL、260000pg/10超のTIL、280000pg/10超のTIL、300000pg/10以上のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例え
ば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、5000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、7000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、9000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、11000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、13000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、15000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、17000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、19000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、20000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、40000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、60000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、80000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、100000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、120000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、140000pg/10超のTILグランザイムB分泌
を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、160000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、180000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、200000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、220000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、240000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、260000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、280000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、300000pg/10超のTILグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、1000pg/mL超~300000pg/mL以上のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、1000pg/mL超、2000pg/mL超、3000pg/mL超、4000pg/mL超、5000pg/mL超、6000pg/mL超、7000pg/mL超、8000pg/mL超、9000pg/mL超、10000pg/mL超、20000pg/mL超、30000pg/mL超、40000pg/mL超、50000pg/mL超、60000pg/mL超、70000pg/mL超、80000pg/mL超、90000pg/mL超、100000pg/mL以上のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、1000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、2000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/mL超の
グランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、4000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、5000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、6000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、7000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、8000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、9000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、10000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、20000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、30000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、40000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、50000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、60000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、70000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、80000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、90000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張
方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、100000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、120000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、140000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、160000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、180000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、200000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、220000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、240000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、260000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、280000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、300000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、本発明の拡張方法は、拡張されていないTIL集団と比較して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gに提供されるようなTILを含む、インビトロで増加したグランザイムB分泌を示す拡張されたTIL集団を産生する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも1倍~50倍以上増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、1倍、少なくとも2倍、少なくとも3倍、少なくとも4倍、少なくとも5倍、少なくとも6倍、少なくとも7倍、少なくとも8倍、少なくとも9倍、少なくとも10倍、少なくとも20倍、少なくとも30倍、少なくとも40倍、少なくとも50倍以上増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも1倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張された
TIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも2倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも3倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも4倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも5倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも6倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも7倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも8倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも9倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも10倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも20倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも30倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも40倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも50倍増加する。
いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上低いレベルのTNF-α(すなわち、TNF-アルファ)分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも1倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも2倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも3倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも4倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも5倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α(すなわち、TNF-アルファ)分泌が可能な
TILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも500pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも1000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも2000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも3000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも4000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも5000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも6000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも7000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも8000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも9000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、IFN-γ及びグランザイムBのレベルを測定して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILの表現型特徴を決定する。いくつかの実施形態では、IFN-γ及びTNF-αのレベルを測定して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本
発明の拡張方法によって産生されたTILの表現型特徴を決定する。いくつかの実施形態では、グランザイムB及びTNF-αのレベルを測定して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILの表現型特徴を決定する。いくつかの実施形態では、IFN-γ、グランザイムB及びTNF-αのレベルを測定して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8Gの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILの表現型特徴を決定する。
いくつかの実施形態では、表現型特徴付けは、凍結保存後に調べられる。
H.追加のプロセスの実施形態
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得し、第1のTIL集団からCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を分離することと、(b)IL-2及びOKT-3を含む細胞培養培地中でCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行うことであって、プライミングによる第1の拡張を約1~7日間または約1~8日間行って第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団の数が第1のTILよりも多い、プライミングによる第1の拡張を行うことと、(c)第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及び外因性抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地と接触させることによって急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張が約1~11日間または約1~10日間行われて第3のTIL集団が取得され、第3のTIL集団が、治療的TIL集団である、第3のTIL集団を産生することと、(d)ステップ(c)から取得された治療的TIL集団を採取することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間、または約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX
500MCS容器に移すこととによって、培養のスケールアップを達成し、第2の容器内で、小規模培養由来の第2のTIL集団が、より大規模な培養で約4~7日間、または約4~8日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での第1の小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、第2の小規模培養で約4~7日間、または約4~8日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間、または約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で
約4~7日間、または約4~8日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約5~7日間培養される。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得し、第1のTIL集団からCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を分離することと、(b)IL-2及びOKT-3を含む細胞培養培地中でCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行うことであって、プライミングによる第1の拡張が約1~8日間行われて第2のTIL集団が取得され、第2のTIL集団の数が第1のTIL集団よりも多い、プライミングによる第1の拡張を行うことと、(c)第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3及び外因性抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地と接触させることによって急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張が約1~8日間行われて第3のTIL集団が取得され、第3のTIL集団が治療的TIL集団である、第3のTIL集団を産生することと、(d)ステップ(c)から取得された治療的TIL集団を採取することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移すこととによって、培養のスケールアップを達成し、第2の容器内で、小規模培養由来の第2のTIL集団が、より大規模な培養で約4~8日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での第1の小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、第2の小規模培養で約4~6日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約4~6日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模
培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約4~5日間培養される。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得し、第1のTIL集団からCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を分離することと、(b)IL-2及びOKT-3を含む細胞培養培地中でCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行うことであって、プライミングによる第1の拡張が約1~7日間行われて第2のTIL集団が取得され、第2のTIL集団の数が第1のTIL集団よりも多い、プライミングによる第1の拡張を行うことと、(c)第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3及び外因性抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地と接触させることによって急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張が約1~11日間行われて第3のTIL集団が取得され、第3のTIL集団が治療的TIL集団である、第3のTIL集団を産生することと、(d)ステップ(c)から取得された治療的TIL集団を採取することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移すこととによって、培養のスケールアップを達成し、第2の容器内で、小規模培養由来の第2のTIL集団が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での第1の小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、第2の小規模培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX g500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養
で約5日間培養される。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、一次の第1の拡張が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を、外因性抗原提示細胞(APC)をさらに含む培養培地と接触させることによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)における培養培地中のAPCの数が、ステップ(b)における培養培地中のAPCの数よりも多い、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において培養培地に追加の外因性APCが補充されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約20:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約9:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約8:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約7:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約6:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~
正確にまたは約4:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~
正確にまたは約2.1:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確
にまたは約2.5:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1になるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1、1.2:1、1.3:1、1.4:1、1.5:1、1.6:1、1.7:1、1.8:1、1.9:1、2:1、2.1:1、2.2:1、2.3:1、2.4:1、2.5:1、2.6:1、2.7:1、2.8:1、2.9:1、3:1、3.1:1、3.2:1、3.3:1、3.4:1、3.5:1、3.6:1、3.7:1、3.8:1、3.9:1、4:1、4.1:1、4.2:1、4.3:1、4.4:1、4.5:1、4.6:1、4.7:1、4.8:1、4.9:1、または5:1になるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、一次の第1の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約1×10、1.1×10、1.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、または3.5×10APCになるように、かつ急速な第2の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6
.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、7.5×10、7.6×10、7.7×10、7.8×10、7.9×10、8×10、8.1×10、8.2×10、8.3×10、8.4×10、8.5×10、8.6×10、8.7×10、8.8×10、8.9×10、9×10、9.1×10、9.2×10、9.3×10、9.4×10、9.5×10、9.6×10、9.7×10、9.8×10、9.9×10、または1×10APCになるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、一次の第1の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約1×10APC~正確にまたは約3.5×10APCの範囲から選択され、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約3.5×10APC~正確にまたは約1×10APCの範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、一次の第1の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約1.5×10APC~正確にまたは約3×10APCの範囲から選択され、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約4×10APC~正確にまたは約7.5×10APCの範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、一次の第1の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約2×10APC~正確にまたは約2.5×10APCの範囲から選択され、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約4.5×10APC~正確にまたは約5.5×10APCの範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、正確にまたは約2.5×10APCが一次の第1の拡張に追加され、かつ正確にまたは約5×10APCが急速な第2の増殖に追加されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、抗原提示細胞が末梢血単核細胞(PBMC)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の腫瘍断片が複数の別個の容器に分配され、それらの別個の容器の各々内で、第1のTIL集団がステップ(a)において取得され、第2のTIL集団がステップ(b)において取得され、第3のTIL集団がステップ(c)において取得され、ステップ(c)における複数の容器からの治療的TIL集団が組み合わせられて、ステップ(d)からの採取されたTIL集団を産生するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の腫瘍が複数の別個の容器に均一に分配されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が少なくとも2個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2~20個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2~15個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2~10個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2~5個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、プライミングによる第1の拡張がステップ(b)において第1のTIL集団で行われる各容器の場合、ステップ(c)における急速な第2の拡張が、同じ容器内でかかる第1のTIL集団から産生された第2のTIL集団で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、別個の容器の各々が第1のガス透過性表面積を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の腫瘍断片が単一の容器に分配されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、単一の容器が第1のガス透過性表面積を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、プライミングによる第1の拡張が、ステップ(b)において、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団上で行われる各容器について、ステップ(c)における急速な第2の拡張が、同じ容器内でかかるCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団から産生される第2のTIL集団上で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、ステップ(b)において、一次の第1の拡張が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地に追加の抗原提示細胞(APC)を補充することによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1細胞層~正確にまたは約3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1.5細胞層~正確にまたは約2.5細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約2細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、または3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3細胞層~正確にまたは約10細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3、4、5、6、7、8、9、または10細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、または8細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む第1の容器内で行われ、ステップ(c)において、急速な第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を含む第2の容器内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第2の容器が第1の容器よりも大きいように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、ステップ(b)において、一次の第1の拡張が、第1のTIL集団の細胞培養培地に追加の抗原提示細胞(APC)を補充することによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1細胞層~正確にまたは約3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1.5細胞層~正確にまたは約2.5細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約2細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、または3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3細胞層~正確にまたは約10細胞層の平均厚さで第2のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さで第2のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3、4、5、6、7、8、9、または10細胞層の平均厚さで第2のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、または8細胞層の平均厚さで第2のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む第1の容器内で行われ、ステップ(c)において、急速な第2の拡張が、第1の容器内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、ステップ(b)において、一次の第1の拡張が、第1のTIL集団の細胞培養培地に追加の抗原提示細胞(APC)を補充することによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1細胞層~正確にまたは約3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1.5細胞層~正確にまたは約2.5細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約2
細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、または3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3細胞層~正確にまたは約10細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3、4、5、6、7、8、9、または10細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、または8細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:10の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:9の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPC
の数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:8の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:7の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:6の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:5の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:4の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:3の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.
1~正確にまたは約1:2の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.2~正確にまたは約1:8の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.3~正確にまたは約1:7の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.4~正確にまたは約1:6の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.5~正確にまたは約1:5の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.6~正確にまたは約1:4の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.7~正確にまたは約1:3.5の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.8~正確にまたは約1:3の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.9~正確にまたは約1:2.5の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:2の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、一次の第1の拡張が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地に追加の抗原提示細胞(APC)を補充することによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1、1:1.2、1:1.3、1:1.4、1:1.5、1:1.6、1:1.7、1:1.8、1:1.9、1:2、1:2.1、1:2.2、1:2.3、1:2.4、1:2.5、1:2.6、1:2.7、1:2.8、1:2.9、1:3、1:3.1、1:3.2、1:3.3、1:3.4、1:3.5、1:3.6、1:3.7、1:3.8、1:3.9、1:4、1:4.1、1:4.2、1:4.3、1:4.4、1:4.5、1:4.6、1:4.7、1:4.8、1:4.9、1:5、1:5.1、1:5.2、1:5.3、1:5.4、1:5.5、1:5.6、1:5.7、1:5.8、1:5.9、1:6、1:6.1、1:6.2、1:6.3、1:6.4、1:6.5、1:6.6、1:6.7、1:6.8、1:6.9、1:7、1:7.1、1:7.2、1:7.3、1:7.4、1:7.5、1:7.6、1:7.7、1:7.8、1:7.9、1:8、1:8.1、1:8.2、1:8.3、1:8.4、1:8.5、1:8.6、1:8.7、1:8.8、1:8.9、1:9、1:9.1、1:9.2、1:9.3、1:9.4、1:9.5、1:9.6、1:9.7、1:9.8、1:9.9、または1:10から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、TIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(
c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:10の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、TIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:9の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、TIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:8の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、TIL集団を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:7の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、TIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:6の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、TIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:5の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、TIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)
において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:4の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:3の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:2の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.2~正確にまたは約1:8の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.3~正確にまたは約1:7の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.4~正確にまたは約1:6の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細
胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.5~正確にまたは約1:5の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.6~正確にまたは約1:4の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.7~正確にまたは約1:3.5の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.8~正確にまたは約1:3の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.9~正確にまたは約1:2.5の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:2の範囲から選択される、方
法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、一次の第1の拡張が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団の細胞培養培地に追加の抗原提示細胞(APC)を補充することによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1、1:1.2、1:1.3、1:1.4、1:1.5、1:1.6、1:1.7、1:1.8、1:1.9、1:2、1:2.1、1:2.2、1:2.3、1:2.4、1:2.5、1:2.6、1:2.7、1:2.8、1:2.9、1:3、1:3.1、1:3.2、1:3.3、1:3.4、1:3.5、1:3.6、1:3.7、1:3.8、1:3.9、1:4、1:4.1、1:4.2、1:4.3、1:4.4、1:4.5、1:4.6、1:4.7、1:4.8、1:4.9、1:5、1:5.1、1:5.2、1:5.3、1:5.4、1:5.5、1:5.6、1:5.7、1:5.8、1:5.9、1:6、1:6.1、1:6.2、1:6.3、1:6.4、1:6.5、1:6.6、1:6.7、1:6.8、1:6.9、1:7、1:7.1、1:7.2、1:7.3、1:7.4、1:7.5、1:7.6、1:7.7、1:7.8、1:7.9、1:8、1:8.1、1:8.2、1:8.3、1:8.4、1:8.5、1:8.6、1:8.7、1:8.8、1:8.9、1:9、1:9.1、1:9.2、1:9.3、1:9.4、1:9.5、1:9.6、1:9.7、1:9.8、1:9.9、または1:10から選択される、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団中のTILの数の、第1のTIL集団中のTILの数に対する比が、正確にまたは約50:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団中のTILの数の、第1のTIL集団中のTILの数に対する比が、正確にまたは約25:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団中のTILの数の、第1のTIL集団中のTILの数に対する比が、正確にまたは約20:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団中のTILの数の、第1のTIL集団中のTILの数に対する比が、正確にまたは約10:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第2のTIL集団の数が、第1のTIL集団よりも少なくとも正確にまたは約50倍多いように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第2のTIL集団の数が、第1のTIL集団よりも少なくとも正確にまたは約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、または50倍多いように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第2の期間の開始の正確にまたは約2日または正確にまたは約3日後に、細胞培養培地に追加のIL-2が補充されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、凍結保存プロセスを使用して、ステップ(d)において採取されたTIL集団を凍結保存するステップをさらに含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(d)の後に、(e)ステップ(d)から採取したTIL集団を、任意選択でHypoThermosolを含有する注入バッグに移す追加のステップを行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、凍結保存プロセスを使用して、ステップ(e)において採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存するステップを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、凍結保存プロセスが、1:1の採取されたTIL集団の凍結保存培地に対する比を使用して行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、抗原提示細胞が末梢血単核細胞(PBMC)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、PBMCが放射線照射され、かつ同種異系であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において細胞培養に追加されるAPCの総数が2.5×10であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において細胞培養に追加されるAPCの総数が5×10であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、APCがPBMCであるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、PBMCが放射線照射され、かつ同種異系であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、抗原提示細胞が人工抗原提示細胞であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(d)での採取が膜ベースの細胞処理系を使用して行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(d)での採取がLOVO細胞処理系を使用し
て行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約5~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約10~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約15~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約20~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約25~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約30~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約35~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約40~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約45~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約50~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、または60個の断片(複数可)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約27mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約20mm~正確にまたは約50mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約21mm~正確にまたは約30mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約22mm~正確にまたは約29.5mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約23mm~正確にまたは約29mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約24mm~正確にまたは約28.5mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約25mm~正確にまたは約28mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約26.5mm~正確にまたは約27.5mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、または50mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の断片が正確にまたは約30~正確にまたは約60個の断片を含み、正確にまたは約1300mm~正確にまたは約1500mmの総体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の断片が正確にまたは約50個の断片を含み、正確にまたは約1350mmの総体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の断片が正確にまたは約50個の断片を含み、正確にまたは約1グラム~正確にまたは約1.5グラムの総質量を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、細胞培養培地がG容器またはXuriセルバッグである容器内に提供されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、細胞培養培地中のIL-2濃度が約10,000IU/mL~約5000IU/mLであるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、細胞培養培地中のIL-2濃度が約6,000IU/mLであるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、凍結保存培地がジメチルスルホキシド(DMSO)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、凍結保存培地が7%~10%DMSOを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)における第1の期間が正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日の期間内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第2の期間が正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日の期間内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)における第1の期間及びステップ(c)における第2の期間が各々、正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日の期間内に個別に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)における第1の期間及びステップ(c)における第2の期間が各々、正確にまたは約5日、6日、または7日の期間内に個別に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)における第1の期間及びステップ(c)における第2の期間が各々、正確にまたは約7日の期間内に個別に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日~正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日~正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約16日~正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約17日~正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日~正確にまたは約17日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日~正確にまたは約17日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約16日~正確にまたは約17日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日~正確にまたは約16日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日~正確にまたは約16日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約16日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約17日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日以内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法
を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日以内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約16日以内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約18日以内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(d)で採取された治療的TIL集団が、TILの治療上有効な投与量に十分なTILを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量に十分なTILの数が、正確にまたは約2.3×1010~正確にまたは約13.7×1010であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第3のTIL集団が、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第3のTIL集団が、16日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍~5倍以上のインターフェロンガンマ産生を提供するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第3のTIL集団が、17日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍~5倍以上のインターフェロンガンマ産生を提供するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第3のTIL集団が、18日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍~5倍以上のインターフェロンガンマ産生を提供するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)の第3のTIL集団から取得されたエフェクターT細胞及び/またはセントラルメモリーT細胞が、ステップ(b)の第2の細胞集団から取得されたエフェクターT細胞及び/またはセントラルメモリーT細胞と比較して増加したCD8及びCD28発現を示すように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器が密閉容器であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器がG容器であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器がGREX-10であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器がGREX-100であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器がGREX-500であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法によって作製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供する。
他の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、抗原提示細胞(APC)またはOKT3を添加せずに第1のTIL拡張が行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
他の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、抗原提示細胞(APC)を添加せずに第1のTIL拡張が行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
他の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、OKT3を添加せずに第1のTIL拡張が行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
他の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、抗原提示細胞(APC)を添加せず、かつOKT3を添加せずに第1のTIL拡張が行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
他の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、16日より長いプロセスによってプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
他の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、17日より長いプロセスによってプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
他の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TI
L)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、18日より長いプロセスによってプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
他の実施形態では、本発明は、増加したインターフェロンガンマ産生を提供する、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。
他の実施形態では、本発明は、増加したポリクローン性を提供する、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載された治療的TIL集団を提供する。
他の実施形態では、本発明は、増加した有効性を提供する、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、16日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、17日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、18日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されているように)、本明細書に記載の拡張プロセスに起因する少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、16日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、17日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、18日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されているように)、本明細書に記載の拡張プロセスに起因する少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、16日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、17日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンガンマ
産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、18日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されているように)、本明細書に記載の拡張プロセスに起因する少なくとも3倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、抗原提示細胞(APC)を添加せずに第1のTIL拡張が行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能である腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されているように)、本明細書に記載の拡張プロセスに起因する少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、OKT3を添加せずに第1のTIL拡張が行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能である腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されているように)、本明細書に記載の拡張プロセスに起因する少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、APCを添加せずに第1のTIL拡張が行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能である治療的TIL集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されているように)、本明細書に記載の拡張プロセスに起因する少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、OKT3を添加せずに第1のTIL拡張が行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能である治療的TIL集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されているように)、本明細書に記載の拡張プロセスに起因する少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、APCを添加せずに第1のTIL拡張が行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンガンマ産生が可能である治療的TIL集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例え
ば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されているように)、本明細書に記載の拡張プロセスに起因する少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、OKT3を添加せずに第1のTIL拡張が行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンガンマ産生が可能である治療的TIL集団を提供する。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また、例えば、図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に示されているように)、本明細書に記載の拡張プロセスに起因する少なくとも3倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、腫瘍断片が、小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物であるように修正された、上記の該当する前の段落のいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、腫瘍断片がコア生検であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、腫瘍断片が細針吸引物であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、腫瘍断片が小生検(例えば、パンチ生検を含む)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、腫瘍断片がコア針生検であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1つ以上の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から第1のTIL集団を得ることを含み、(ii)方法が、プライミングによる第1の拡張ステップを行う前に、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、約8日間にわたってプライミングによる第1の拡張を行うことを含み、かつ(iv)方法が、約11日間にわたって急速な第2の拡張を行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
他の実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1つ以上の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から第1のTIL集団を得ることを含み、(ii)方法が、プライミングによる第1の拡張ステップを行う前に、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、約8日間にわたってプライミングによる第1の拡張を行うことを含み、かつ(iv)方法が、第2のTIL集団の培養物を約5日間培養し、培養物を最大5つの継代培養物に分割し、かつ継代培養物を約6日間培養することによって、急速な第2の拡張を行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、最大5
つの継代培養物が各々、第2のTIL集団の培養が急速な第2の拡張で開始される容器と同じサイズのまたはそれよりも大きい容器内で培養される。前述の実施形態のうちのいくつかでは、第2のTIL集団の培養物は、最大5つの継代培養物間で均等に分けられる。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個のコア生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のコア生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のコア生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個の細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個の細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれか
に記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個のコア針生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア針生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のコア針生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のコア針生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア生検から第1のTIL集団を得ることを含み、(ii)方法が、第1のTIL集団からCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を分離するステップを行う前に、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間
培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む培養培地中で約8日間培養することによってプライミングによる第1の拡張ステップを行い、第2のTIL集団を得ることを含み、かつ(iv)方法が、第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及びAPCを含む培養培地中で約11日間培養することによって急速な第2の拡張ステップを行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
他の実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア生検から第1のTIL集団を取得することを含み、(ii)方法が、第1のTIL集団からCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を分離するステップを行う前に、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む培養培地中で約8日間培養することによってプライミングによる第1の拡張ステップを行い、第2のTIL集団を取得することを含み、かつ(iv)方法が、第2のTIL集団の培養物を、IL-2、OKT-3、及びAPCを含む培養培地中で約5日間培養し、培養物を最大5つの継代培養物に分割し、かつ継代培養物の各々を、IL-2を含む培養培地中で約6日間培養することによって、急速な第2の拡張を行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、最大5つの継代培養物が各々、第2のTIL集団の培養が急速な第2の拡張で開始される容器と同じサイズのまたはそれよりも大きい容器内で培養される。前述の実施形態のうちのいくつかでは、第2のTIL集団の培養物は、最大5つの継代培養物間で均等に分けられる。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
他の実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア生検から第1のTIL集団を取得することを含み、(ii)方法が、第1のTIL集団からCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を分離するステップを行う前に、G-REX-100Mフラスコ内の0.5LのCM1培養培地中6000IU IL-2/mLを含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、6000IU/mL IL-2、30ng/mL OKT-3、及び約10個のフィーダー細胞を含む0.5LのCM1培養培地を、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団に添加し、約8日間培養することによって、プライミングによる第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することを含み、かつ(iv)方法が、(a)第2のTIL集団を、3000IU/mL IL-2、30ng/mL OKT-3、及び5×10個のフィーダー細胞を有する5LのCM培養培地を含むG-REX 500MCSフラスコに移し、約5日間培養し、(b)10個のTILを、3000IU/mL IL-2を有する5LのAIM-V培地を含む最大5つのG-REX 500MCSフラスコの各々に移すことによって培養物を最大5つの継代培養物に分割し、継代培養物を約6日間培養することによって、急速な第2の拡張を行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
いくつかの実施形態では、本発明は、(a)対象から腫瘍試料を取得するステップの後で、(i)腫瘍試料中のバルクTIL、または第1のTIL集団が、IL-2を含有する細胞培養培地中で培養されて、腫瘍断片または試料から出るTILを産生する、(ii)腫瘍断片または試料から出る少なくとも複数のTILが、/腫瘍断片または試料から分離
して、腫瘍断片または試料、腫瘍断片または試料中に残存するTIL、及び腫瘍断片または試料から出て、分離後に残存する任意のTILの混合物を産生する、(iii)腫瘍断片または試料、腫瘍断片または試料中に残存するTIL、及び腫瘍断片または試料から出て、分離後に残存する任意のTILの混合物を消化して、かかる混合物の消化物を産生する、及び(iv)TILのCD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団が、かかる混合物の消化物から分離されるように、(b)プライミングの第1の拡張が、CD39/CD69二重陰性及び/またはCD39LO/CD69LOTIL集団を培養することによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。いくつかの実施形態では、腫瘍断片または試料から出るTILの少なくとも約1%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、99%以上が、腫瘍断片または試料から分離されて、混合物を産生する。
いくつかの実施形態では、本発明は、プライミングによる第1の拡張前の培養ステップが、約1日~約3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、プライミングによる第1の拡張前の培養ステップが、約1、2、3、4、5、6または7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、PD-1事前選択ステップ前の培養ステップが、約1日~約3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、PD-1事前選択ステップ前の培養ステップが、約1、2、3、4、5、6または7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、CD39及びCD69事前選択前の培養ステップが、約1日~約3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、CD39及びCD69事前選択ステップ前の培養ステップが、約1、2、3、4、5、6または7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、T細胞を拡張する方法であって、(a)第1のT細胞集団を培養することによってドナーから取得された第1のT細胞集団のプライミングによる第1の拡張を行って成長をもたらし、第1のT細胞集団の活性化をプライミングすることと、(b)ステップ(a)においてプライミングされた第1のT細胞集団の活性化が減衰し始めた後、第1のT細胞集団を培養することによって第1のT細胞集団の急速な第2の拡張を行って成長をもたらし、第1のT細胞集団の活性化を促進して第2のT細胞集団を取得することと、(c)第2のT細胞集団を採取することと、を含む、T細胞を拡張する方法を提供する。他の実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX-100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養での第1のT細胞集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX-500MCS容器に移し、小規模培養由来の第1のT細胞集
団を、第2の容器内でのより大規模な培養で約4~7日間培養することとによって、培養のスケールアップを達成する。他の実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX-100MCS容器内での第1の小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)第1の小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、第2の小規模培養で約4~7日間培養される。他の実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX-100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX-500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。他の実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX-100MCS容器内での小規模培養で約4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX-500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約5日間培養される。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養での第1のT細胞集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移し、小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第2の容器内でのより大規模な培養で約5~7日間培養することとによって、培養のスケールアップを達成するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での第1の小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)第1の小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、第2の小規模培養で約5~7日間培養される。
他の実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、1
7、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約5~7日間培養される。
他の実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約5~6日間培養される。
他の実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約5日間培養される。
他の実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約6日間培養される。
他の実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約7日間培養される。
他の実施形態では、本発明は、プライミングによる第1の拡張ステップが最大7日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張ステップが最大8日の期間中に行われ
るように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)の急速な第2の拡張が最大9日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)の急速な第2の拡張が最大10日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)の急速な第2の拡張が最大11日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が7日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大9日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が7日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大10日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が7日または8日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大9日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が7日または8日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大10日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が8日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大9日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が8日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大8日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団がOKT-3及びIL-2を含む第1の培養培地中で培養されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1の培養培地が4-1BBアゴニスト、OKT-3及びIL-2を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方
法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1の培養培地がOKT-3、IL-2及び抗原提示細胞(APC)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1の培養培地が4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2及び抗原提示細胞(APC)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のT細胞集団がOKT-3、IL-2及び抗原提示細胞(APC)を含む第2の培養培地中で培養されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第2の培養培地が4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2及び抗原提示細胞(APC)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団が、第1のガス透過性表面を含む容器内の第1の培養培地中で培養され(ここで、第1の培養培地が、OKT-3、IL-2及び第1の抗原提示細胞(APC)集団を含み、第1のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第1のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化される)、ステップ(b)において、第1のT細胞集団が、容器内の第2の培養培地中で培養される(ここで、第2の培養培地が、OKT-3、IL-2及び第2のAPC集団を含み、第2のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第2のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化され、第2のAPC集団が、第1のAPC集団よりも多い)ように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団が、第1のガス透過性表面を含む容器内の第1の培養培地中で培養され(ここで、第1の培養培地が、4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2及び第1の抗原提示細胞(APC)集団を含み、第1のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第1のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化される)、ステップ(b)において、第1のT細胞集団が、容器内の第2の培養培地中で培養される(ここで、第2の培養培地が、OKT-3、IL-2及び第2のAPC集団を含み、第2のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第2のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化され、第2のAPC集団が、第1のAPC集団よりも多い)ように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団が、第1のガス透過性表面を含む容器内の第1の培養培地中で培養され(ここで、第1の培養培地が、OKT-3、IL-2及び第1の抗原提示細胞(APC)集団を含み、第1のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第1のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化される)、ステップ(b)において、第1のT細胞集団が、容器内の第2の培養培地中で培養される(ここで、第2の培養培地が、4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2及び第2のAPC集団を含み、第2のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第2のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化され、第2のAPC集団が、第1のAPC集団よりも多い)ように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団が、第1のガス透過性表面を含む容器内の第1の培養培地中で培養され(ここで、第1の培養培地が、4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2及び第1の抗原提示細胞(APC)集団を含み、第1のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第1のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化される)、ステップ(b)において、第1のT細胞集団が、容器内の第2の培養培地中で培養される(ここで、第2の培養培地が、4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2及び第2のAPC集団を含み、第2のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第2のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化され、第2のAPC集団が、第1のAPC集団よりも多い)ように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第2のAPC集団中のAPCの数の、第1のAPC集団中のAPCの数に対する比が約2:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のAPC集団中のAPCの数が約2.5×10であり、第2のAPC集団中のAPCの数が約5×10であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が、2層のAPCの平均厚さで第1のガス透過性表面上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が、4~8層のAPCから選択される平均厚さで第1のガス透過性表面上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において第1のガス透過性表面上に層状化されたAPCの平均層数の、ステップ(a)において第1のガス透過性表面上に層状化されたAPCの平均層数に対する比が、2:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が約1.0×10APC/cm~約4.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が約1.5×10APC/cm~約3.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が約2.0×10APC/cm~約3.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約2.0×10APC/cmの密度で第1のガス透過性表面に播種されるように
修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約2.5×10APC/cm~正確にまたは約7.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約3.5×10APC/cm~正確にまたは約6.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約4.0×10APC/cm~正確にまたは約5.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約4.0×10APC/cmの密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約1.0×10APC/cm~正確にまたは約4.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種され、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約2.5×10APC/cm~正確にまたは約7.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約1.5×10APC/cm~正確にまたは約3.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種され、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約3.5×10APC/cm~正確にまたは約6.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約2.0×10APC/cm~正確にまたは約3.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種され、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約4.0×10APC/cm~正確にまたは約5.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約2.0×10APC/cmの密度で第1のガス透過性表面に播種され、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約4.0×10APC/cmの密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、APCが末梢血単核細胞(PBMC)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、PBMCが放射線照射され、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、T細胞が腫瘍浸潤リンパ球(TIL)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、T細胞が骨髄浸潤リンパ球(MIL)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、T細胞が末梢血リンパ球(PBL)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団がドナーの全血からの分離によって取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団がドナーのアフェレーシス産物からの分離によって取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、T細胞表現型の正または負の選択によってドナーの全血またはアフェレーシス産物から分離されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、T細胞表現型がCD3+及びCD45+であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団のプライミングによる第1の拡張を行う前に、T細胞がNK細胞から分離されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。他の実施形態では、T細胞は、第1のT細胞集団からのCD3-CD56+細胞の除去によって、第1のT細胞集団中のNK細胞から分離される。他の実施形態では、CD3-CD56+細胞は、CD3-CD56+細胞画分を除去し、かつ陰性画分を回収するゲーティング戦略を使用して、第1のT細胞集団を細胞選別に供することによって、第1のT細胞集団から除去される。他の実施形態では、前述の方法は、高いNK細胞パーセンテージを特徴とする第1のT細胞集団におけるT細胞の拡張のために利用される。他の実施形態では、前述の方法は、高いCD3-CD56+細胞パーセンテージを特徴とする第1のT細胞集団におけるT細胞の拡張のために利用される。他の実施形態では、前述の方法は、多数のNK細胞の存在を特徴とする腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。他の実施形態では、前述の方法は、多数のCD3-CD56+細胞を特徴とする腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。他の実施形態では、前述の方法は、多数のNK細胞の存在を特徴とする腫瘍に罹患している患者から取得された腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。他の実施形態では、前述の方法は、多数のCD3-CD56+細胞の存在を特徴とする腫瘍に罹患している患者から取得された腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。他の実施形態では、前述の方法は、卵巣癌に罹患している患者から取得された腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団由来の正確にまたは約1×10T細
胞が容器内に播種されて、かかる容器内で一次の第1の拡張を開始するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が複数の容器に分配され、各容器内で、第1のT細胞集団由来の正確にまたは約1×10T細胞が播種されて、かかる容器内で一次の第1の拡張を開始するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において採取された第2のT細胞集団が治療的TIL集団であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上のコア生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個のコア生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個のコア生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のコア生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のコア生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上の細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個の細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個の細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提
供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上のコア針生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個のコア針生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個のコア針生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のコア針生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のコア針生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、(i)IFN-γ及び抗PD-1を含む第1の細胞培養倍地中で腫瘍試料を約2~3日間培養することによって対象における腫瘍の1つ以上の小生検、コア生検、または針生検から取得された腫瘍試料から第1のTIL集団を取得及び/または受容して、AKTiの有無にかかわらず、少なくともIL-2及び任意選択で、IL-21を含む培地中で腫瘍反応性TILの刺激を増強することと、(ii)AKTiの有無にかかわらず、少なくともIL-2、及び任意選択で、IL-21を含む第2の細胞培養倍地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が約2~3日間の第1の期間行われて、第2のTIL集団が取得され、第2のTIL集団の数が第1のTIL集団よりも多い、第2のTIL集団を産生することと、(iii)第2のTIL集団を、AKTiの有無にかかわらず、少なくともIL-2、及び任意選択で、IL-15及び/またはIL-21を含む第3の細胞培養培地と接触させることによって急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張が約11日間の第2の期間行われて、第3のTIL集団が取得され、第3のTIL集団が治療的TIL集団である、第3のTIL集団を産生することと、(iv)ステップ(iii)から取得された治療的TIL集団を採取することと、を含む、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第2の期間の5日目の後に、培養物が2つ以上の継代培養物に分割され、各継代培養物に追加量の第3の培養培地が補充され、約6日間培養されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第2の期間の5日目の後に、培養物が2つ以上の継代培養物に分割され、各継代培養物にIL-2を含む第4の培養培地が補充され、約6日間培養されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第2の期間の5日目の後に、培養物が最大5つの継代培養物に分割されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、方法におけるすべてのステップが約22日で完了するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、T細胞を拡張する方法であって、(i)最大約48~72時間を含む、IFNg(インターフェロンガンマ)、PD-1(抗PD-1抗体)、CD40L、CD40(抗CD40抗体)、及び/またはCTLA-4アゴニストからなる群のうちのいずれかで第1のTIL集団を刺激することと、(ii)第1のTIL集団のプライミングによる第1の拡張を行って、腫瘍反応性TILの割合を増加させ、第1のT細胞集団の活性化をプライミングすることと、(iii)ステップ(b)でプライミングされた第1のTIL集団の活性化後、第1のTIL集団を培養することによって第1のTIL集団の第2の拡張を行って、成長をもたらし、第1のT細胞集団の活性化を促進して第2のT細胞集団を取得することと、(iv)第2のT細胞集団を採取することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、腫瘍試料は、複数のコア生検から得られる。いくつかの実施形態では、複数のコア生検は、2、3、4、5、6、7、8、9及び10個のコア生検からなる群から選択される。
他の実施形態では、本発明は、B細胞を拡張する方法であって、(i)最大約48~72時間を含む、IFNg(インターフェロンガンマ)、PD-1(抗PD-1抗体)、CD40L、CD40(抗CD40抗体)、及び/またはCTLA-4アゴニストからなる群のうちのいずれかで第1のTIL集団を刺激することと、(ii)細胞を培養することによって第1のB細胞集団の第1の拡張を行って、第2のB細胞集団を産生することと、(iii)第2のB細胞集団の細胞培養培地を補充することによって第2の拡張を行って、第3のB細胞集団を産生することであって、第3のB細胞集団が、治療的B細胞集団である、第3のB細胞集団を産生することと、(iv)第3のB細胞集団を採取することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、腫瘍試料は、複数のコア生検から得られる。いくつかの実施形態では、複数のコア生検は、2、3、4、5、6、7、8、9及び10個のコア生検からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1、第2及び/または第3のTIL集団が、(a)CD39/CD69二重陰性及び/または(b)CD39LO/CD69LO、または(c)(a)及び(b)TILの組み合わせについて選別されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。(a)CD39/CD69二重陰性及び/または(b)CD39LO/CD69LO、または本発明の方法による(i)及び(ii)の組み合わせであるTILを選別するのに好適な細胞選別システムは、米国出願第2019/0212332号に見出すことができ、これは参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、細胞選別は、Zhang,X et.al.,Surface Free Energy Activated High-Throughput Cell Sorting,Analytical Chemistry(2014),86:9350-9355(これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に記載される方法を使用して行われる。いくつかの実施形態では、細胞選別技術は、1秒当たりの5e7細胞の容量を有する。いくつかの実施形態では、1秒当たりの5e7細胞の容量は、22日目(例えば、TILの拡張後)での選別に有用である。いくつかの実施形態では、本発明は、治療的TIL集団またはTIL組成物が、1-REPまたは2-REPプロトコルのいずれかを使用して拡張されることを提供する(実施例15及び図41を参照されたい)。いくつかの実施形態では、TIL集団は、成長、生存率、表現型、機能、自己腫瘍死滅、及びTCRvβレパートリーについて評価される。いく
つかの実施形態では、上記の細胞選別方法を使用して試験するために、治療的TIL集団またはTIL組成物の一部をサンプリングしてもよい。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞またはTILが腫瘍消化物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載される方法。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、例えば、RPMI1640、2mM GlutaMAX、10mg/mLゲンタマイシン、30U/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼであるが、これらに限定されない酵素培地中で腫瘍をインキュベートすること、続いて、機械的解離(GentleMACS,Miltenyi Biotec,Auburn,CA)によって生成される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはタイプのコラゲナーゼを含む)、Accutase(商標)、Accumax(商標)、ヒアルロニダーゼ、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)、キモトリプシン、キモパパイン、トリプシン、カゼイナーゼ、エラスターゼ、パパイン、プロテアーゼタイプXIV(プロナーゼ)、デオキシリボヌクレアーゼI(DNase)、トリプシン阻害剤、任意の他の解離酵素またはタンパク質分解酵素、及びこれらの任意の組み合わせ等の1つ以上の解離(消化)酵素を含むが、これらに限定されない腫瘍解離酵素混合物の中に配置される。他の実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはタイプのコラゲナーゼを含む)、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)及びデオキシリボヌクレアーゼI(DNase)を含む腫瘍解離酵素混合物中に配置される。
VI.薬学的組成物、投与量、及び投薬レジメン
いくつかの実施形態では、本開示の方法を使用して拡張及び/または遺伝子修飾された(CCRを発現するように遺伝子修飾されたTIL、MIL、またはPBLを含む)TIL、MIL、またはPBLは、薬学的組成物として患者に投与される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、滅菌緩衝液中のTIL懸濁液である。本開示のPBMCを使用して拡張されたTILは、当該技術分野で知られている任意の好適な経路によって投与され得る。いくつかの実施形態では、T細胞は、単回の動脈内または静脈内注入として投与され、これは、好ましくは、およそ30~60分続く。他の好適な投与経路には、腹腔内、髄腔内、及びリンパ内投与が含まれる。
したがって、本開示のいくつかの実施形態は、本明細書に開示される方法を使用して製造される治療的TIL集団を提供する。いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、約2.3×1010~約13.7×1010のTILを含む。いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、約1×10~約1×1011のTILを含む。いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、増強された多官能性を示す。いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、より幹様の表現型を示す。いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、活性化及び/または分化の少ないTILの頻度の増加を示す。いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、同種異系設定で改善された腫瘍細胞殺傷を示す。いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、CD27、CD28、CD62L、及びIL-7Rからなる群から選択されるメモリー関連マーカーの増加した発現を示す。いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、CD38、CD39、及びCD69からなる群から選択される活性化マーカーの発現の低下を示す。いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、LAG3、TIM3、TIGIT、及びTOXからなる群から選択される阻害/枯渇関連マーカーの発現の低下を示す。いくつかの実施形態では、治療的TIL集団は、参照TIL製造プロセスを使用して製造
されたTIL集団と比較して、GZMB、CXCR3、IFNg、TNFa、及びIL-2からなる群から選択される機能的マーカーの発現の増加を示す。いくつかの実施形態では、参照TIL製造プロセスは、例えば、図1及び/または8に概説されるプロセスを含む、Gen2プロセスまたはプロセス2Aなどの、本明細書に開示されるTIL製造プロセスである。
任意の好適な用量のTILが投与され得る。いくつかの実施形態では、特にがんがNSCLCまたは黒色腫である場合、約2.3×1010~約13.7×1010のTILが投与され、平均約7.8×1010のTILである。いくつかの実施形態では、約1.2×1010~約4.3×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約3×1010~約12×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約4×1010~約10×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約5×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約6×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約7×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約2.3×1010~約13.7×1010である。いくつかの実施形態では、特にがんが黒色腫である場合、治療上有効な投与量は、約7.8×1010のTILである。いくつかの実施形態では、特にがんがNSCLCである場合、治療上有効な投与量は、約7.8×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約1.2×1010~約4.3×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約3×1010~約12×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約4×1010~約10×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約5×1010~約8×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約6×1010~約8×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約7×1010~約8×1010のTILである。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物で提供されるTILの数は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、及び9×1013である。いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物で提供されるTILの数は、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×1010、1×1010~5×1010、5×1010~1×1011、5×1011~1×1012、1×1012~5×1012、及び5×1012~1×1013の範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、例えば、薬学的組成物の100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11
%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%、0.1%、0.09%、0.08%、0.07%、0.06%、0.05%、0.04%、0.03%、0.02%、0.01%、0.009%、0.008%、0.007%、0.006%、0.005%、0.004%、0.003%、0.002%、0.001%、0.0009%、0.0008%、0.0007%、0.0006%、0.0005%、0.0004%、0.0003%、0.0002%、または0.0001%w/w、w/v、またはv/v未満である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、19.75%、19.50%、19.25%、19%、18.75%、18.50%、18.25%、18%、17.75%、17.50%、17.25%、17%、16.75%、16.50%、16.25%、16%、15.75%、15.50%、15.25%、15%、14.75%、14.50%、14.25%、14%、13.75%、13.50%、13.25%、13%、12.75%、12.50%、12.25%、12%、11.75%、11.50%、11.25%、11%、10.75%、10.50%、10.25%、10%、9.75%、9.50%、9.25%、9%、8.75%、8.50%、8.25%、8%、7.75%、7.50%、7.25%、7%、6.75%、6.50%、6.25%、6%、5.75%、5.50%、5.25%、5%、4.75%、4.50%、4.25%、4%、3.75%、3.50%、3.25%、3%、2.75%、2.50%、2.25%、2%、1.75%、1.50%、125%、1%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%、0.1%、0.09%、0.08%、0.07%、0.06%、0.05%、0.04%、0.03%、0.02%、0.01%、0.009%、0.008%、0.007%、0.006%、0.005%、0.004%、0.003%、0.002%、0.001%、0.0009%、0.0008%、0.0007%、0.0006%、0.0005%、0.0004%、0.0003%、0.0002%、または0.0001%w/w、w/v、またはv/v超である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の約0.0001%~約50%、約0.001%~約40%、約0.01%~約30%、約0.02%~約29%、約0.03%~約28%、約0.04%~約27%、約0.05%~約26%、約0.06%~約25%、約0.07%~約24%、約0.08%~約23%、約0.09%~約22%、約0.1%~約21%、約0.2%~約20%、約0.3%~約19%、約0.4%~約18%、約0.5%~約17%、約0.6%~約16%、約0.7%~約15%、約0.8%~約14%、約0.9%~約12%、または約1%~約10%w/w、w/v、またはv/vの範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の約0.001%~約10%、約0.01%~約5%、約0.02%~約4.5%、約0.03%~約4%、約0.04%~約3.5%、約0.05%~約3%、約0.06%~約2.5%、約0.07%~約2%、約0.08%~約1.5%、約0.09%~約1%、約0.1%~約0.9%w/w、w/v、またはv/vの範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの量は、10g、9.5g、9.0g、8.5g、8.0g、7.5g、7.0g、6.5g、6.0g、5.5g、5.0g、4.5g、4.0g、3.5g、3.0g、2.5g、2.0g、1.5g、1.0g、0.95g、0.9g、0.85g、0.8g、0.75g、0.7g、0.65g、0.6g、0.55g、0.5g、0.45g、0.4g、0.35g、0.3g、0.25g、0.2g、0.15g、0.1g、0.09g、0.08g、0.07g、0.06g、0.05g、0.04g、0.03g、0.02g、0.
01g、0.009g、0.008g、0.007g、0.006g、0.005g、0.004g、0.003g、0.002g、0.001g、0.0009g、0.0008g、0.0007g、0.0006g、0.0005g、0.0004g、0.0003g、0.0002g、または0.0001g以下である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの量は、0.0001g、0.0002g、0.0003g、0.0004g、0.0005g、0.0006g、0.0007g、0.0008g、0.0009g、0.001g、0.0015g、0.002g、0.0025g、0.003g、0.0035g、0.004g、0.0045g、0.005g、0.0055g、0.006g、0.0065g、0.007g、0.0075g、0.008g、0.0085g、0.009g、0.0095g、0.01g、0.015g、0.02g、0.025g、0.03g、0.035g、0.04g、0.045g、0.05g、0.055g、0.06g、0.065g、0.07g、0.075g、0.08g、0.085g、0.09g、0.095g、0.1g、0.15g、0.2g、0.25g、0.3g、0.35g、0.4g、0.45g、0.5g、0.55g、0.6g、0.65g、0.7g、0.75g、0.8g、0.85g、0.9g、0.95g、1g、1.5g、2g、2.5、3g、3.5、4g、4.5g、5g、5.5g、6g、6.5g、7g、7.5g、8g、8.5g、9g、9.5g、または10g超である。
本発明の薬学的組成物中に提供されるTILは、広い投与量範囲にわたって有効である。正確な投与量は、投与経路、化合物が投与される形態、治療される対象の性別及び年齢、治療される対象の体重、ならびに主治医の選好及び経験に依存するであろう。適切な場合、TILの臨床的に確立された投与量が使用される場合もある。TILの投与量などの本明細書の方法を使用して投与される薬学的組成物の量は、治療されるヒトまたは哺乳動物、障害または状態の重症度、投与速度、医薬品有効成分の性質、及び処方医師の裁量に依存するであろう。
いくつかの実施形態では、TILは、単回用量で投与され得る。かかる投与は、注射、例えば、静脈内注射に従うものであり得る。いくつかの実施形態では、TILは、複数回用量で投与され得る。投薬は、1年に1回、2回、3回、4回、5回、6回、または6回超であり得る。投薬は、月1回、2週間に1回、週1回、または隔日に1回であり得る。TILの投与は、必要な限り継続することができる。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、及び9×1013である。いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×1010、1×1010~5×1010、5×1010
~1×1011、5×1011~1×1012、1×1012~5×1012、及び5×1012~1×1013の範囲内である。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約0.01mg/kg~約4.3mg/kg、約0.15mg/kg~約3.6mg/kg、約0.3mg/kg~約3.2mg/kg、約0.35mg/kg~約2.85mg/kg、約0.15mg/kg~約2.85mg/kg、約0.3mg~約2.15mg/kg、約0.45mg/kg~約1.7mg/kg、約0.15mg/kg~約1.3mg/kg、約0.3mg/kg~約1.15mg/kg、約0.45mg/kg~約1mg/kg、約0.55mg/kg~約0.85mg/kg、約0.65mg/kg~約0.8mg/kg、約0.7mg/kg~約0.75mg/kg、約0.7mg/kg~約2.15mg/kg、約0.85mg/kg~約2mg/kg、約1mg/kg~約1.85mg/kg、約1.15mg/kg~約1.7mg/kg、約1.3mg/kg~約1.6mg/kg、約1.35mg/kg~約1.5mg/kg、約2.15mg/kg~約3.6mg/kg、約2.3mg/kg~約3.4mg/kg、約2.4mg/kg~約3.3mg/kg、約2.6mg/kg~約3.15mg/kg、約2.7mg/kg~約3mg/kg、約2.8mg/kg~約3mg/kg、または約2.85mg/kg~約2.95mg/kgの範囲内である。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約1mg~約500mg、約10mg~約300mg、約20mg~約250mg、約25mg~約200mg、約1mg~約50mg、約5mg~約45mg、約10mg~約40mg、約15mg~約35mg、約20mg~約30mg、約23mg~約28mg、約50mg~約150mg、約60mg~約140mg、約70mg~約130mg、約80mg~約120mg、約90mg~約110mg、または約95mg~約105mg、約98mg~約102mg、約150mg~約250mg、約160mg~約240mg、約170mg~約230mg、約180mg~約220mg、約190mg~約210mg、約195mg~約205mg、または約198~約207mgの範囲内である。
TILの有効量は、鼻腔内経路及び経皮経路を含む、同様の有用性を有する薬剤の認められた投与様式のうちのいずれかによって、動脈内注射によって、静脈内、腹腔内、非経口、筋肉内、皮下、局所、移植によって、または吸入によって、単回用量または複数回用量のいずれかで投与され得る。
他の実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を含む注入バッグを提供する。
他の実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団及び薬学的に許容される担体を含む腫瘍浸潤リンパ球(TIL)組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を含む注入バッグを提供する。
他の実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団の凍結保存された調製物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団及び凍結保存された培地を含む腫瘍浸潤リンパ球(TIL)組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、凍結保存培地がDMSOを含むように修正された、上記
の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、凍結保存培地が7~10%のDMSOを含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物の凍結保存された調製物を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示の方法を使用して拡張されたTILは、薬学的組成物として患者に投与される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、滅菌緩衝液中のTIL懸濁液である。本開示のPBMCを使用して拡張されたTILは、当該技術分野で知られている任意の好適な経路によって投与され得る。いくつかの実施形態では、T細胞は、単回の動脈内または静脈内注入として投与され、これは、好ましくは、およそ30~60分続く。他の好適な投与経路には、腹腔内、髄腔内、及びリンパ内投与が含まれる。
任意の好適な用量のTILが投与され得る。いくつかの実施形態では、特にがんがNSCLCである場合、約2.3×1010~約13.7×1010のTILが投与され、平均は約7.8×1010のTILである。いくつかの実施形態では、約1.2×1010~約4.3×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約3×1010~約12×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約4×1010~約10×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約5×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約6×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約7×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約2.3×1010~約13.7×1010である。いくつかの実施形態では、特にがんがNSCLCである場合、治療上有効な投与量は、約7.8×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約1.2×1010~約4.3×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約3×1010~約12×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約4×1010~約10×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約5×1010~約8×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約6×1010~約8×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約7×1010~約8×1010TILである。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物で提供されるTILの数は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、及び9×1013である。いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物で提供されるTILの数は、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10
、1×1010~5×1010、5×1010~1×1011、5×1011~1×1012、1×1012~5×1012、及び5×1012~1×1013の範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、例えば、薬学的組成物の100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%、0.1%、0.09%、0.08%、0.07%、0.06%、0.05%、0.04%、0.03%、0.02%、0.01%、0.009%、0.008%、0.007%、0.006%、0.005%、0.004%、0.003%、0.002%、0.001%、0.0009%、0.0008%、0.0007%、0.0006%、0.0005%、0.0004%、0.0003%、0.0002%、または0.0001%w/w、w/v、またはv/v未満である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、19.75%、19.50%、19.25%、19%、18.75%、18.50%、18.25%、18%、17.75%、17.50%、17.25%、17%、16.75%、16.50%、16.25%、16%、15.75%、15.50%、15.25%、15%、14.75%、14.50%、14.25%、14%、13.75%、13.50%、13.25%、13%、12.75%、12.50%、12.25%、12%、11.75%、11.50%、11.25%、11%、10.75%、10.50%、10.25%、10%、9.75%、9.50%、9.25%、9%、8.75%、8.50%、8.25%、8%、7.75%、7.50%、7.25%、7%、6.75%、6.50%、6.25%、6%、5.75%、5.50%、5.25%、5%、4.75%、4.50%、4.25%、4%、3.75%、3.50%、3.25%、3%、2.75%、2.50%、2.25%、2%、1.75%、1.50%、125%、1%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%、0.1%、0.09%、0.08%、0.07%、0.06%、0.05%、0.04%、0.03%、0.02%、0.01%、0.009%、0.008%、0.007%、0.006%、0.005%、0.004%、0.003%、0.002%、0.001%、0.0009%、0.0008%、0.0007%、0.0006%、0.0005%、0.0004%、0.0003%、0.0002%、または0.0001%w/w、w/v、またはv/v超である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の約0.0001%~約50%、約0.001%~約40%、約0.01%~約30%、約0.02%~約29%、約0.03%~約28%、約0.04%~約27%、約0.05%~約26%、約0.06%~約25%、約0.07%~約24%、約0.08%~約23%、約0.09%~約22%、約0.1%~約21%、約0.2%~約20%、約0.3%~約19%、約0.4%~約18%、約0.5%~約17%、約0.6%~約16%、約0.7%~約15%、約0.8%~約14%、約0.9%~約12%、または約1%~約10%w/w、w/v、またはv/vの範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の約0.001%~約10%、約0.01%~約5%、約0.02%~約4.5%、約0.03%~約4%、約0.04%~約3.5%、約0.05%~約3%、約0.06%~約2.5%、約0.07%~約2%、約0.08%~約1.5%、約0.09%~約1%、約0.1%~約0.9%w/w、w/v、またはv/vの範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの量は、10g、9.5g、9.0g、8.5g、8.0g、7.5g、7.0g、6.5g、6.0g、5.5g、5.0g、4.5g、4.0g、3.5g、3.0g、2.5g、2.0g、1.5g、1.0g、0.95g、0.9g、0.85g、0.8g、0.75g、0.7g、0.65g、0.6g、0.55g、0.5g、0.45g、0.4g、0.35g、0.3g、0.25g、0.2g、0.15g、0.1g、0.09g、0.08g、0.07g、0.06g、0.05g、0.04g、0.03g、0.02g、0.01g、0.009g、0.008g、0.007g、0.006g、0.005g、0.004g、0.003g、0.002g、0.001g、0.0009g、0.0008g、0.0007g、0.0006g、0.0005g、0.0004g、0.0003g、0.0002g、または0.0001g以下である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの量は、0.0001g、0.0002g、0.0003g、0.0004g、0.0005g、0.0006g、0.0007g、0.0008g、0.0009g、0.001g、0.0015g、0.002g、0.0025g、0.003g、0.0035g、0.004g、0.0045g、0.005g、0.0055g、0.006g、0.0065g、0.007g、0.0075g、0.008g、0.0085g、0.009g、0.0095g、0.01g、0.015g、0.02g、0.025g、0.03g、0.035g、0.04g、0.045g、0.05g、0.055g、0.06g、0.065g、0.07g、0.075g、0.08g、0.085g、0.09g、0.095g、0.1g、0.15g、0.2g、0.25g、0.3g、0.35g、0.4g、0.45g、0.5g、0.55g、0.6g、0.65g、0.7g、0.75g、0.8g、0.85g、0.9g、0.95g、1g、1.5g、2g、2.5、3g、3.5、4g、4.5g、5g、5.5g、6g、6.5g、7g、7.5g、8g、8.5g、9g、9.5g、または10g超である。
本発明の薬学的組成物中に提供されるTILは、広い投与量範囲にわたって有効である。正確な投与量は、投与経路、化合物が投与される形態、治療される対象の性別及び年齢、治療される対象の体重、ならびに主治医の選好及び経験に依存するであろう。適切な場合、TILの臨床的に確立された投与量が使用される場合もある。TILの投与量などの本明細書の方法を使用して投与される薬学的組成物の量は、治療されるヒトまたは哺乳動物、障害または状態の重症度、投与速度、医薬品有効成分の性質、及び処方医師の裁量に依存するであろう。
いくつかの実施形態では、TILは、単回用量で投与され得る。かかる投与は、注射、例えば、静脈内注射に従うものであり得る。いくつかの実施形態では、TILは、複数回用量で投与され得る。投薬は、1年に1回、2回、3回、4回、5回、6回、または6回超であり得る。投薬は、月1回、2週間に1回、週1回、または隔日に1回であり得る。TILの投与は、必要な限り継続することができる。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011
、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、及び9×1013である。いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×1010、1×1010~5×1010、5×1010~1×1011、5×1011~1×1012、1×1012~5×1012、及び5×1012~1×1013の範囲内である。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約0.01mg/kg~約4.3mg/kg、約0.15mg/kg~約3.6mg/kg、約0.3mg/kg~約3.2mg/kg、約0.35mg/kg~約2.85mg/kg、約0.15mg/kg~約2.85mg/kg、約0.3mg~約2.15mg/kg、約0.45mg/kg~約1.7mg/kg、約0.15mg/kg~約1.3mg/kg、約0.3mg/kg~約1.15mg/kg、約0.45mg/kg~約1mg/kg、約0.55mg/kg~約0.85mg/kg、約0.65mg/kg~約0.8mg/kg、約0.7mg/kg~約0.75mg/kg、約0.7mg/kg~約2.15mg/kg、約0.85mg/kg~約2mg/kg、約1mg/kg~約1.85mg/kg、約1.15mg/kg~約1.7mg/kg、約1.3mg/kg~約1.6mg/kg、約1.35mg/kg~約1.5mg/kg、約2.15mg/kg~約3.6mg/kg、約2.3mg/kg~約3.4mg/kg、約2.4mg/kg~約3.3mg/kg、約2.6mg/kg~約3.15mg/kg、約2.7mg/kg~約3mg/kg、約2.8mg/kg~約3mg/kg、または約2.85mg/kg~約2.95mg/kgの範囲内である。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約1mg~約500mg、約10mg~約300mg、約20mg~約250mg、約25mg~約200mg、約1mg~約50mg、約5mg~約45mg、約10mg~約40mg、約15mg~約35mg、約20mg~約30mg、約23mg~約28mg、約50mg~約150mg、約60mg~約140mg、約70mg~約130mg、約80mg~約120mg、約90mg~約110mg、または約95mg~約105mg、約98mg~約102mg、約150mg~約250mg、約160mg~約240mg、約170mg~約230mg、約180mg~約220mg、約190mg~約210mg、約195mg~約205mg、または約198~約207mgの範囲内である。
TILの有効量は、鼻腔内経路及び経皮経路を含む、同様の有用性を有する薬剤の認められた投与様式のうちのいずれかによって、動脈内注射によって、静脈内、腹腔内、非経口、筋肉内、皮下、局所、移植によって、または吸入によって、単回用量または複数回用量のいずれかで投与され得る。
VII.患者を治療する方法
治療方法は、最初のTIL収集及びTILの培養から始まる。かかる方法は両方とも、例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Jin et al.,J.Immunotherapy,2012,35(3):283-292によって当該技術分野で説明されている。治療方法の実施形態は、実施例を含む以下の節全体に記載されている。
本明細書に記載の方法に従って、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また例えば、図1及び/または図8に示されるよ
うに)産生される拡張TILは、がんを有する患者の治療における特定の用途を見出す(例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Goff,et al.,J.Clinical Oncology,2016,34(20):2389-239、及び補足内容に記載される)。いくつかの実施形態では、TILは、以前に記載されたように、転移性黒色腫の切除された沈着物から増殖された(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Dudley,et al.,J Immunother.,2003,26:332-342を参照されたい)。新鮮な腫瘍は、滅菌条件下で解剖され得る。代表的な試料は、正式な病理学的分析のために収集され得る。2mm~3mmの単一断片が使用され得る。いくつかの実施形態では、患者当たり5、10、15、20、25、または30個の試料が取得される。いくつかの実施形態では、患者当たり20、25、または30個の試料が取得される。いくつかの実施形態では、患者当たり20、22、24、26、または28個の試料が取得される。いくつかの実施形態では、患者当たり24個の試料が取得される。試料は、24ウェルプレートの個々のウェル内に配置され、高用量IL-2(6,000IU/mL)を含む成長培地中で維持され、腫瘍の破壊及び/またはTILの増殖について監視され得る。処理後に生細胞が残っている腫瘍は、本明細書に記載されるように、単一細胞懸濁液中に酵素的に消化され、凍結保存され得る。
いくつかの実施形態では、成功裏に成長したTILは、表現型分析(CD3、CD4、CD8、及びCD56)のためにサンプリングされ、利用可能な場合、自己腫瘍に対して試験され得る。一晩の共培養によりインターフェロンガンマ(IFN-γ)レベルが200pg/mLを超え、バックグラウンドの2倍になった場合、TILは反応性があるとみなされ得る。(Goff,et al.,J Immunother.,2010,33:840-847、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態では、自己反応性または十分な成長パターンの証拠を有する培養物は、急速拡張(REP)と称されることもある第2の拡張を含む、第2の拡張(例えば、図1及び/または図8のステップDに従って提供される第2の拡張)のために選択され得る。いくつかの実施形態では、高い自己反応性(例えば、第2の拡張中の高い増殖)を有する拡張TILが、追加の第2の拡張のために選択される。いくつかの実施形態では、高い自己反応性(例えば、図1及び/または図8のステップDで提供されるような第2の拡張中の高い増殖)を有するTILが、図1及び/または図8のステップDに従って、追加の第2の拡張のために選択される。
注入バッグTILの凍結保存試料の細胞表現型は、表面マーカーCD3、CD4、CD8、CCR7、及びCD45RA(BD BioSciences)のフローサイトメトリー(例えば、FlowJo)、ならびに本明細書に記載の方法のうちのいずれかによって分析され得る。血清サイトカインは、標準的な酵素結合免疫吸着アッセイ技術を使用することにより測定された。血清IFN-gの上昇は、100pg/mL超及び4 3ベースラインレベルを超えると定義された。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法、例えば図1及び/または図8に例示される方法によって産生されるTILは、TILの臨床効果の驚くべき改善を提供する。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法、例えば図1及び/または図8に例示される方法によって産生されるTILは、例えば、図1及び/または図8に例示されるもの以外の方法を含む、本明細書に記載されるもの以外の方法によって産生されるTILと比較して、増加した臨床効果を示す。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるもの以外の方法は、プロセス1C及び/または第1世代(Gen1)と称される方法を含む。いくつかの実施形態では、増加した有効性は、DCR、ORR、及び/または他の臨床応答によって測定される。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法、例えば図1または図8に例示される方法によって産生されるTILは、例えば、図1及び/または図8に例示されるもの以外の方法を含む、本明細書に記載されるもの以外の方法
によって産生されるTILと比較して、同様の応答時間及び安全性プロファイルを示す。
いくつかの実施形態では、IFN-ガンマ(IFN-γ)は、治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。いくつかの実施形態では、TILで治療された対象の血液中のIFN-γは、活性なTILを示す。いくつかの実施形態では、IFN-γ産生の効力アッセイが用いられる。IFN-γ産生は、細胞傷害能の別の尺度である。IFN-γ産生は、例えば、図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象のエクスビボでの血液、血清、またはTIL中のサイトカインIFN-γのレベルを決定することによって測定することができる。いくつかの実施形態では、IFN-γの増加は、本発明の方法によって産生されたTILで治療された患者における治療有効性を示す。いくつかの実施形態では、IFN-γは、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、IFN-γが1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、2倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、3倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、4倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、5倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γは、Quantikine ELISAキットを使用して測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、例えば、図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象のエクスビボでのTILにおいて測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、例えば図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象の血液において測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、例えば、図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象のTIL血清において測定される。いくつかの実施形態では、IFN-ガンマ(IFN-γ)は、がんの治療における治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。
いくつかの実施形態では、本発明の方法によって調製されたTILで治例えば、図1または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTIL。いくつかの実施形態では、IFN-ガンマ(IFN-γ)は、治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。いくつかの実施形態では、TILで治療された対象の血液中のIFN-γは、活性なTILを示す。いくつかの実施形態では、IFN-γ産生の効力アッセイが用いられる。IFN-γ産生は、細胞傷害能の別の尺度である。IFN-γ産生は、例えば、図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象のエクスビボでの血液、血清、またはTIL中のサイトカインIFN-γのレベルを決定することによって測定することができる。いくつかの実施形態では、IFN-γの増加は、本発明の方法によって産生されたTILで治療された患者におけ
る治療有効性を示す。いくつかの実施形態では、IFN-γは、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、IFN-γが1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上増加する。
いくつかの実施形態では、例えば図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されるTILは、例えばプロセス1C法と称される方法を含む、図1及び/または図8に例示されていないものを含む他の方法によって産生されるTILと比較して、増加したポリクローン性を示す。いくつかの実施形態では、有意に改善されたポリクローン性及び/または増加したポリクローン性は、治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、T細胞レパートリーの多様性を指す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性の増加は、本発明の方法によって産生されたTILの投与に関する治療有効性を示すことができる。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILと比較して、1倍、2倍、10倍、100倍、500倍、または1000倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、2倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、10倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、100倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、500倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1000倍増加する。
有効性の尺度には、当該技術分野で知られており、本明細書にも記載されている、疾患制御率(DCR)ならびに全応答率(ORR)が含まれ得る。
A.がんを治療する方法
本明細書に記載の組成物及び方法は、疾患を治療するための方法で使用され得る。いくつかの実施形態では、それらは、成人患者または小児患者における、がんなどの過剰増殖性障害の治療に使用するためのものである。それらは、本明細書及び以下の段落に記載される他の障害の治療にも使用され得る。
いくつかの実施形態では、過剰増殖性障害は、がんである。いくつかの実施形態では、過剰増殖性障害は、固形腫瘍がんである。いくつかの実施形態では、固形腫瘍癌は、肛門癌、膀胱癌、乳癌(トリプルネガティブ乳癌を含む)、骨癌、ヒトパピローマウイルス(HPV)によって引き起こされるたん、中枢神経系関連癌(上衣腫、髄芽腫、神経芽腫、松果体芽腫、及び未分化神経外胚葉性腫瘍を含む)、子宮頸癌(扁平上皮癌、腺扁平上皮
癌、及び子宮頸部腺癌)、結腸癌、大腸癌、子宮内膜癌、食道癌、食道胃接合癌、胃癌、消火器癌、消化管間質腫瘍、神経膠芽細胞腫、神経膠腫、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、下咽頭癌、喉頭癌、鼻咽頭癌、中咽頭癌、及び咽頭癌)、腎臓癌、肝臓癌、肺癌(非小細胞肺癌(NSCLC)及び小細胞肺癌)、黒色腫(ブドウ膜黒色腫、脈絡膜黒色腫、毛様体黒色腫、または虹彩黒色腫を含む)、中皮腫(悪性胸膜中皮腫を含む)、卵巣癌、膵臓癌(膵管腺癌を含む)、陰茎癌、直腸癌、腎癌、腎細胞癌、肉腫(ユーイング肉腫、骨肉腫、横紋筋肉腫、ならびに他の骨及び軟部組織肉腫を含む)、甲状腺癌(未分化甲状腺癌を含む)、子宮癌、ならびに膣癌からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、過剰増殖性障害は、血液学的悪性腫瘍である。いくつかの実施形態では、血液学的悪性腫瘍は、慢性リンパ性白血病、急性リンパ芽球性白血病、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、濾胞性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、及び多発性骨髄腫からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、本発明は、がん患者を治療する方法を含み、がんは、血液学的悪性腫瘍である。いくつかの実施形態では、本発明は、1つ以上のCCRを発現するように修飾されたTIL、MIL、またはPBLを使用して、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、血液学的悪性腫瘍である。いくつかの実施形態では、本発明は、1つ以上のCCRを発現するように修飾されたMILまたはPBLを使用して、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、血液学的悪性腫瘍である。
いくつかの実施形態では、がんは、化学療法、放射線療法、または免疫療法を含む少なくとも1つの前療法による治療に対して再発するか、または不応性である、固形腫瘍がん及び血液学的悪性腫瘍を含む、前述のがんのうちの1つである。いくつかの実施形態では、がんは、化学療法、放射線療法、及び/または免疫療法を含む少なくとも2つの以前の療法による治療に対して再発するか、または不応性である、前述のがんのうちの1つである。いくつかの実施形態では、がんは、化学療法、放射線療法、及び/または免疫療法を含む少なくとも3つの以前の療法による治療に対して再発するか、または不応性である前述のがんのうちの1つである。
いくつかの実施形態では、がんは、高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)癌である。したがって、MSI-H及びdMMR癌ならびに試験は、Kawakami,et al.,Curr.Treat.Options Oncol.2015,16,30(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。
いくつかの実施形態では、本発明は、1つ以上のCCRを発現するように修飾されたTIL、MIL、またはPBLを使用してがんを有する患者を治療する方法を含み、患者は、ヒトである。いくつかの実施形態では、本発明は、1つ以上のCCRを発現するように修飾されたTIL、MIL、またはPBLを使用してがんを有する患者を治療する方法を含み、患者は、非ヒトである。いくつかの実施形態では、本発明は、1つ以上のCCRを発現するように修飾されたTIL、MIL、またはPBLを使用してがんを有する患者を治療する方法を含み、患者は、伴侶動物である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、BRAF阻害剤及び/またはMEK阻害剤による治療に対して不応性である。いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、及びそれらの薬学的に許容される塩または溶媒和物からなる群から選択されるBRAF阻害剤による治療に対して不応性である。いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、ピマセルチニ
ブ、レファメチニブ、及びそれらの薬学的に許容される塩または溶媒和物からなる群から選択されるMEK阻害剤による治療に対して不応性である。いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、及びそれらの薬学的に許容される塩または溶媒和物からなる群から選択されるBRAF阻害剤、ならびにトラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、ピマセルチニブ、レファメチニブ、及びそれらの薬学的に許容される塩または溶媒和物からなる群から選択されるMEK阻害剤による治療に対して不応性である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がん患者を治療する方法を含み、がんは、小児癌である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、ブドウ膜黒色腫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、ブドウ膜黒色腫は、脈絡膜黒色腫、毛様体黒色腫、または虹彩黒色腫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、小児癌は、神経芽腫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、小児がんは、肉腫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、肉腫は、骨肉腫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、肉腫は、軟部組織肉腫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、軟部組織肉腫は、横紋筋肉腫、ユーイング肉腫、または未分化神経外胚葉性腫瘍(PNET)である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、小児癌は、中枢神経系(CNS)関連癌である。いくつかの実施形態では、小児癌は、化学療法による治療に対して不応性である。いくつかの実施形態では、小児癌は、放射線療法による治療に対して不応性である。いくつかの実施形態では、小児癌は、ジヌツキシマブによる治療に対して不応性である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、CNS関連がんは、髄芽腫、松果芽腫、神経膠腫、上衣腫、または神経膠芽細胞腫である。
本明細書に記載の組成物及び方法は、がんを治療するための方法において使用することができ、がんは、抗PD-1または抗PD-L1抗体による治療に対して不応性または耐性である。いくつかの実施形態では、患者は、抗PD-1または抗PD-L1抗体に対する一次不応性患者である。いくつかの実施形態では、患者は、抗PD-1または抗PD-L1抗体に対する事前の応答を示さない。いくつかの実施形態では、患者は、患者のがんの進行に続く、抗PD-1または抗PD-L1抗体に対する事前の応答を示す。いくつかの実施形態では、がんは、少なくとも1つの化学療法剤と組み合わせた抗CTLA-4抗
体及び/または抗PD-1もしくは抗PD-L1抗体に対して不応性である。いくつかの実施形態では、以前の化学療法剤は、カルボプラチン、パクリタキセル、ペメトレキセド、及び/またはシスプラチンである。いくつかの実施形態では、化学療法剤(複数可)は、白金ダブレット化学療法剤である。いくつかの実施形態では、白金ダブレット療法は、シスプラチン及びカルボプラチンからなる群から選択される第1の化学療法剤と、ビノレルビン、ゲムシタビン、及びタキサン(例えば、パクリタキセル、ドセタキセル、またはナブ-パクリタキセルを含む)からなる群から選択される第2の化学療法剤と、を含む。いくつかの実施形態では、白金ダブレット化学療法剤は、ペメトレキセドと組み合わされている。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、PD-L1陰性であり、及び/または本明細書の他の場所に記載されるように、腫瘍割合スコア(TPS)が1%未満でPD-L1を発現するがんを有する患者に由来する。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1または抗PD-L1抗体及び白金ダブレット療法を含む併用療法に対して不応性であり、白金ダブレット療法は、
i)シスプラチン及びカルボプラチンからなる群から選択される第1の化学療法剤と、
ii)ビノレルビン、ゲムシタビン、及びタキサン(例えば、パクリタキセル、ドセタキセル、またはnab-パクリタキセルを含む)からなる群から選択される第2の化学療法剤と、を含む。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1または抗PD-L1抗体、ペメトレキセド、及び白金ダブレット療法を含む併用療法に対して不応性であり、白金ダブレット療法は、
i)シスプラチン及びカルボプラチンからなる群から選択される第1の化学療法剤と、
ii)ビノレルビン、ゲムシタビン、及びタキサン(例えば、パクリタキセル、ドセタキセル、またはnab-パクリタキセルを含む)からなる群から選択される第2の化学療法剤と、を含む。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1抗体で処理されている。いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-L1抗体で処理されている。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、治療未経験である。いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1抗体で治療されていない。いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-L1抗体で治療されていない。いくつかの実施形態では、NSCLCは、以前に化学療法剤で治療されている。いくつかの実施形態では、NSCLCは、以前に化学療法剤で治療されているが、もはや化学療法剤で治療されていない。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、抗PD-1/PD-L1未経験である。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、低いPD-L1の発現を有する。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、治療未経験のNSCLCを有するか、または化学療法治療後であるが、抗PD-1/PD-L1未経験である。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、治療未経験または化学療法治療後であるが、抗PD-1/PD-L1未経験であり、低いPD-L1の発現を有する。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、ベースラインで巨大腫瘤病変を有する。いくつかの実施形態では、対象は、ベースラインで巨大腫瘤病変を有し、低いPD-L1の発現を有する。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、検出可能なPD-L1の発現を有しない。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、治療未経験または化学療法治療後であるが、抗PD-1/PD-L1未経験であり、検出可能なPD-L1の発現を有しない。いくつかの実施形態では、患者は、ベースラインで巨大腫瘤病変を有し、検出可能なPD-L1の発現を有しない。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、治療未経験のNSCLCまたは化学療法後(例えば、化学療法剤後)であるが、PD-L1の発現が低く、及び/またはベースラインで巨大腫瘤病変を有する抗PD-1
/PD-L1未経験である。いくつかの実施形態では、最大腫瘍直径が横方向または冠状面のいずれかで測定された7cmより大きい場合、巨大腫瘤病変が示される。いくつかの実施形態では、巨大腫瘤病変は、20mm以上の短軸直径を有する腫れたリンパ節がある場合に示される。いくつかの実施形態では、化学療法剤は、NSCLCの標準治療の治療薬を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1発現は、腫瘍割合スコアによって決定される。いくつかの実施形態では、不応性NSCLC腫瘍を有する対象は、<1%の腫瘍割合スコア(TPS)を有する。いくつかの実施形態では、不応性NSCLC腫瘍を有する対象は、≧1% TPSを有する。いくつかの実施形態では、不応性NSCLCを有する対象は、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、該抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体治療の前に決定された。いくつかの実施形態では、不応性NSCLCを有する対象は、抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、該抗PD-L1抗体治療の前に決定された。
いくつかの実施形態では、例えば、図1または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されるTILは、例えば、プロセス1C法と称される方法などの、図1または図8に例示されていないものを含む他の方法によって産生されるTILと比較して、増加したポリクローン性を示す。いくつかの実施形態では、有意に改善されたポリクローン性及び/または増加したポリクローン性は、がん治療に対する治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、T細胞レパートリーの多様性を指す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性の増加は、本発明の方法によって産生されたTILの投与に関する治療有効性を示すことができる。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、例えば、図1または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILと比較して、1倍、2倍、10倍、100倍、500倍、または1000倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、2倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、10倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、100倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、500倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1000倍増加する。
いくつかの実施形態では、PD-L1発現は、本明細書に記載の1つのさらなる試験方法を使用して、腫瘍割合スコアによって決定される。いくつかの実施形態では、NSCLC腫瘍を有する対象または患者は、<1%の腫瘍割合スコア(TPS)を有する。いくつかの実施形態では、NSCLC腫瘍は、≧1% TPSを有する。いくつかの実施形態では、NSCLCを有する対象または患者は、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で
以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体治療の前に決定された。いくつかの実施形態では、NSCLCを有する対象または患者は、抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-L1抗体治療の前に決定された。いくつかの実施形態では、不応性または耐性NSCLC腫瘍を有する対象または患者は、<1%の腫瘍割合スコア(TPS)を有する。いくつかの実施形態では、不応性または耐性NSCLC腫瘍を有する対象または患者は、≧1% TPSを有する。いくつかの実施形態では、不応性または耐性NSCLCを有する対象または患者は、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体治療の前に決定された。いくつかの実施形態では、不応性または耐性NSCLCを有する対象または患者は、抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-L1抗体治療の前に決定された。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、1%未満(TPS<1%)のPD-L1タンパク質についての任意の強度での部分的または完全な膜染色を示す、抗PD-1または抗PD-L1療法の前に採取された患者からの腫瘍割合スコア(TPS)または生存腫瘍細胞のパーセンテージを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、<50%、<45%、<40%、<35%、<30%、<25%、<20%、<15%、<10%、<9%、<8%、<7%、<6%、<5%、<4%、<3%、<2%、<1%、<0.9%、<0.8%、<0.7%、<0.6%、<0.5%、<0.4%、<0.3%、<0.2%、<0.1%、<0.09%、<0.08%、<0.07%、<0.06%、<0.05%、<0.04%、<0.03%、<0.02%、及び<0.01%からなる群から選択されるTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、約50%、約45%、約40%、約35%、約30%、約25%、約20%、約15%、約10%、約9%、約8%、約7%、約6%、約5%、約4%、約3%、約2%、約1%、約0.9%、約0.8%、約0.7%、約0.6%、約0.5%、約0.4%、約0.3%、約0.2%、約0.1%、約0.09%、約0.08%、約0.07%、約0.06%、約0.05%、約0.04%、約0.03%、約0.02%,及び約0.01%からなる群から選択されるTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~1%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.9%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.8%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.7%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.6%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.5%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.4%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.3%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.2%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.1%のTPSを示すNSCLCである。TPSは、当該技術分野で知られている方法、例えば、Hirsch,et al.J.Thorac.Oncol.2017,12,208-222に記載される方法、あるいはペムブロリズマブまたは他の抗PD-1もしくは抗PD-L1療法による治療前のTPSの決定に使用される方法によって測定され得る。米国食品医薬品局(U.S.Food and Drug Administration)によって承認されたTPSの測定のための方法を使用することもできる。いくつかの実施形態では、PD-L1は、エクソソームPD-L1である。いくつかの実施形態では、PD-L1は、循環腫瘍細胞上に見出される。
いくつかの実施形態では、部分的な膜染色は、1%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、99%、またはそれ以上を含む。い
くつかの実施形態では、完了した膜染色は、およそ100%の膜染色を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1の試験は、患者の血清中のPD-L1のレベルを測定することを伴い得る。これらの実施形態では、患者の血清中のPD-L1の測定は、腫瘍の不均一性の不確実性及び連続生検の患者の不快感を除去する。
いくつかの実施形態では、ベースラインまたは標準レベルと比較して、可溶性PD-L1の上昇は、NSCLCにおける予後の悪化と相関する。例えば、Okuma,et al.,Clinical Lung Cancer,2018,19,410-417、Vecchiarelli,et al.,Oncotarget,2018,9,17554-17563を参照されたい。いくつかの実施形態では、PD-L1は、エクソソームPD-L1である。いくつかの実施形態では、PD-L1は、循環腫瘍細胞上に発現される。
いくつかの実施形態では、本発明は、非小細胞肺癌(NSCLC)の治療を必要とする対象または患者に腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を投与することによって、NSCLCを治療する方法を提供し、対象または患者は、
<1%のPD-L1の所定の腫瘍割合スコア(TPS)、
1%~49%のPD-L1のTPSスコア、または
1つ以上のドライバー変異の所定の非存在のうちの少なくとも1つを有し、
ドライバー変異は、EGFR変異、EGFR挿入、EGFRエクソン20、KRAS変異、BRAF変異、ALK変異、c-ROS変異(ROS1変異)、ROS1融合、RET変異、RET融合、ERBB2変異、ERBB2増幅、BRCA変異、MAP2K1変異、PIK3CA、CDKN2A、PTEN変異、UMD変異、NRAS変異、KRAS変異、NF1変異、MET変異、METスプライス及び/または変化したMETシグナル伝達、TP53変異、CREBBP変異、KMT2C変異、KMT2D変異、ARID1A変異、RB1変異、ATM変異、SETD2変異、FLT3変異、PTPN11変異、FGFR1変異、EP300変異、MYC変異、EZH2変異、JAK2変異、FBXW7変異、CCND3変異、及びGNA11変異からなる群から選択され、この方法は、
(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)第1のTIL集団を閉鎖系に付加することと、
(c)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(e)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(f)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(g)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(h)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(g)の注入バッグから対
象または患者に投与することと、を含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、非小細胞肺癌(NSCLC)の治療を必要とする対象または患者に腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を投与することによって、NSCLCを治療する方法を提供し、この方法は、
(a)PD-L1のPD-L1発現及び腫瘍割合スコア(TPS)について患者の腫瘍を試験することと、
(b)1つ以上のドライバー変異の所定の非存在について患者を試験することであって、ドライバー変異が、EGFR変異、EGFR挿入、EGFRエクソン20、KRAS変異、BRAF変異、ALK変異、c-ROS変異(ROS1変異)、ROS1融合、RET変異、RET融合、ERBB2変異、ERBB2増幅、BRCA変異、MAP2K1変異、PIK3CA、CDKN2A、PTEN変異、UMD変異、NRAS変異、KRAS変異、NF1変異、MET変異、METスプライス及び/または変化したMETシグナル伝達、TP53変異、CREBBP変異、KMT2C変異、KMT2D変異、ARID1A変異、RB1変異、ATM変異、SETD2変異、FLT3変異、PTPN11変異、FGFR1変異、EP300変異、MYC変異、EZH2変異、JAK2変異、FBXW7変異、CCND3変異、及びGNA11変異からなる群から選択される、試験することと、
(c)患者が、約1%~約49%のPD-L1のTPSスコアを有していることを判定し、また患者がドライバー変異を有しないことを判定することと、
(d)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(e)第1のTIL集団を閉鎖系に付加することと、
(f)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(i)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(k)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(g)の注入バッグから対象または患者に投与することと、を含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、非小細胞肺癌(NSCLC)の治療を必要とする対象または患者に腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を投与することによって、NSCLCを治療する方法を提供し、この方法は、
(a)PD-L1のPD-L1発現及び腫瘍割合スコア(TPS)について患者の腫瘍を試験することと、
(b)1つ以上のドライバー変異の所定の非存在について患者を試験することであって、ドライバー変異が、EGFR変異、EGFR挿入、EGFRエクソン20、KRAS変
異、BRAF変異、ALK変異、c-ROS変異(ROS1変異)、ROS1融合、RET変異、RET融合、ERBB2変異、ERBB2増幅、BRCA変異、MAP2K1変異、PIK3CA、CDKN2A、PTEN変異、UMD変異、NRAS変異、KRAS変異、NF1変異、MET変異、METスプライス及び/または変化したMETシグナル伝達、TP53変異、CREBBP変異、KMT2C変異、KMT2D変異、ARID1A変異、RB1変異、ATM変異、SETD2変異、FLT3変異、PTPN11変異、FGFR1変異、EP300変異、MYC変異、EZH2変異、JAK2変異、FBXW7変異、CCND3変異、及びGNA11変異からなる群から選択される、試験することと、
(c)患者が、約1%未満のPD-L1のTPSスコアを有していることを判定し、また患者がドライバー変異を有しないことを判定することと、
(d)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(e)第1のTIL集団を閉鎖系に付加することと、
(f)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(i)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(k)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(g)の注入バッグから対象または患者に投与することと、を含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、非小細胞肺癌(NSCLC)の治療を必要とする対象または患者に腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を投与することによって、NSCLCを治療する方法を提供し、この方法は、
(a)PD-L1のPD-L1発現及び腫瘍割合スコア(TPS)について患者の腫瘍を試験することと、
(b)1つ以上のドライバー変異の非存在について患者を試験することであって、ドライバー変異が、EGFR変異、EGFR挿入、KRAS変異、BRAF変異、ALK変異、c-ROS変異(ROS1変異)、ROS1融合、RET変異、またはRET融合からなる群から選択される、試験することと、
(c)患者が、約1%~約49%のPD-L1のTPSスコアを有していることを判定し、また患者がドライバー変異を有しないことを判定することと、
(d)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(e)第1のTIL集団を閉鎖系に付加することと、
(f)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透
過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(i)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(k)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(g)の注入バッグから対象または患者に投与することと、を含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、非小細胞肺癌(NSCLC)の治療を必要とする対象または患者に腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を投与することによって、NSCLCを治療する方法を提供し、この方法は、
(a)PD-L1のPD-L1発現及び腫瘍割合スコア(TPS)について患者の腫瘍を試験することと、
(b)1つ以上のドライバー変異の非存在について患者を試験することであって、ドライバー変異が、EGFR変異、EGFR挿入、KRAS変異、BRAF変異、ALK変異、c-ROS変異(ROS1変異)、ROS1融合、RET変異、またはRET融合からなる群から選択される、試験することと、
(c)患者が、約1%未満のPD-L1のTPSスコアを有していることを判定し、また患者がドライバー変異を有しないことを判定することと、
(d)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(e)第1のTIL集団を閉鎖系に付加することと、
(f)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(i)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(k)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(g)の注入バッグから対
象または患者に投与することと、を含む。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の、本明細書に記載の治療的TIL集団を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の、本明細書に記載のTIL組成物を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、それぞれ、治療上有効な投与量の治療的TIL集団及び本明細書に記載のTIL組成物を投与する前に、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが対象に投与されるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、60mg/m/日の用量で2日間のシクロホスファミドの投与に続いて、25mg/m/日の用量で5日間のフルダラビンを投与するステップを含むように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、対象にTIL細胞を投与した翌日に開始する、高用量のIL-2レジメンで対象を治療するステップをさらに含むように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、高用量IL-2レジメンが、許容範囲まで8時間毎に15分間のボーラス静脈内注入として投与される600,000または720,000IU/kgを含むように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが固形腫瘍であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、トリプルネガティブ乳癌、ヒト乳頭癌ウイルスによって引き起こされたがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、または腎細胞癌であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫、HNSCC、子宮頸癌、NSCLC、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、及び胃腸癌であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんがHNSCCであるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが子宮頸癌であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんがNSCLCであるように修正された、本明細書に
記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが神経膠芽細胞腫(GBMを含む)であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが胃腸癌であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが高頻度変異癌であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが小児の高頻度変異癌であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の治療的TIL集団を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法で使用するための、本明細書に記載の治療的TIL集団を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量のTIL組成物を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法で使用するための、本明細書に記載のTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の、本明細書に記載の治療的TIL集団または本明細書に記載のTIL組成物を対象に投与する前に、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが対象に投与されるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団または本明細書に記載のTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、60mg/m/日の用量で2日間のシクロホスファミドの投与に続いて、25mg/m/日の用量で5日間のフルダラビンを投与するステップを含むように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、TIL細胞を患者に投与した翌日から開始する、高用量IL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含むように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、高用量IL-2レジメンが、許容範囲まで8時間毎に15分間のボーラス静脈内注入として投与される600,000または720,000IU/kgを含むように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが固形腫瘍であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭癌ウイルスによって引き起こされたがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、または腎細胞癌であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫、HNSCC、子宮頸癌、NSCLC、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、及び胃腸癌であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんがHNSCCであるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが子宮頸癌であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんがNSCLCであるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが、神経膠芽細胞腫であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが胃腸癌であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが高頻度変異癌であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが小児の高頻度変異癌であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の治療的TIL集団を対象に投与することを含む、対象におけるがんを治療する方法における本明細書に記載の治療的TIL集団の使用を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量のTIL組成物を対象に投与することを含む、対象におけるがんを治療する方法における前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物の使用を提供する。
他の実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンを対象に投与することと、次いで治療上有効な投与量の、本明細書に記載の治療的TIL集団または本明細書に記載のTIL組成物を対象に投与することと、を含む、患者におけるがんを治療する方法における、本明細書に記載の治療的TIL集団または本明細書に記載のTIL組成物の使用を提供する。
B.PD-1及びPD-L1阻害剤との併用
いくつかの実施形態では、がんを有する患者に提供されるTIL療法は、治療的TIL集合単独による治療を含んでもよく、またはTILならびに1つ以上のPD-1及び/またはPD-L1阻害剤を含む併用治療を含んでもよい。
プログラム死1(PD-1)は、T細胞、B細胞、ナチュラルキラー(NK)T細胞、活性化単球、及び樹状細胞によって発現される288アミノ酸の膜貫通免疫チェックポイント受容体タンパク質である。CD279としても知られるPD-1は、CD28ファミ
リーに属し、ヒトでは第2染色体上のPdcd1遺伝子によってコードされる。PD-1は、1つの免疫グロブリン(Ig)スーパーファミリードメイン、膜貫通領域、ならびに免疫受容体チロシンベースの阻害モチーフ(ITIM)及び免疫受容体チロシンベースのスイッチモチーフ(ITSM)を含む細胞内ドメインからなる。PD-1とそのリガンド(PD-L1及びPD-L2)は、Keir,et al.,Annu.Rev.Immunol.2008,26,677-704に記載されるように、免疫耐性において重要な役割を果たすことが知られている。PD-1は、T細胞の免疫応答を負に調節する阻害シグナルを提供する。PD-L1(B7-H1またはCD274としても知られる)及びPD-L2(B7-DCまたはCD273としても知られる)は、腫瘍細胞及び間質細胞上に発現され、PD-1を発現する活性化T細胞が遭遇する可能性があり、T細胞の免疫抑制につながる。PD-L1は、ヒト第9染色体上のCd274遺伝子によってコードされる290アミノ酸の膜貫通タンパク質である。例えば、Topalian,et al.,N.Eng.J.Med.2012,366,2443-54に記載される最近の臨床研究で実証されているように、PD-1阻害剤、PD-L1阻害剤、及び/またはPD-L2阻害剤の使用による、PD-1とそのリガンドPD-L1及びPD-L2との間の相互作用をブロックすることで、免疫抵抗を克服することができる。PD-L1は、多くの腫瘍細胞株上で発現されるが、PD-L2は、主に樹状細胞及びいくつかの腫瘍株上で発現される発現される。T細胞(活性化後にPD-1を誘導的に発現する)に加えて、PD-1は、B細胞、ナチュラルキラー細胞、マクロファージ、活性化単球、樹状細胞上でも発現される。
いくつかの実施形態では、TIL及びPD-1阻害剤は、NSCLCの治療のための併用療法または共療法として投与される。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、前療法を受けていない。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、フロントライン療法または初期療法として投与される。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、本明細書に記載のTILと併用して、フロントライン療法または初期療法として投与される。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、当該技術分野で知られている任意のPD-1阻害剤またはPD-1遮断剤であり得る。特に、次の段落でより詳細に記載されるPD-1阻害剤または遮断剤のうちの1つである。「阻害剤」、「アンタゴニスト」、及び「遮断剤」という用語は、本明細書では、PD-1阻害剤に関して互換的に使用される。誤解を避けるために、抗体であるPD-1阻害剤への本明細書での言及は、化合物またはその抗原結合断片、バリアント、複合体、もしくはバイオシミラーを指し得る。誤解を避けるために、PD-1阻害剤への本明細書での言及はまた、小分子化合物またはその薬学的に許容される塩、エステル、溶媒和物、水和物、共結晶、もしくはプロドラッグを指し得る。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、抗体(すなわち、抗PD-1抗体)、Fab断片を含むその断片、またはその一本鎖可変断片(scFv)である。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ポリクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、モノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、PD-1との結合について競合し、及び/またはPD-1上のエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、抗体は、PD-1との結合について競合し、及び/またはPD-1上のエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ヒトPD-1に約100pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約90pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約80pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約70pM以下のKDで結合する、ヒトPD-
1に約60pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約50pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約40pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約30pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約20pM以下のKDで結合する、ヒトPD-1に約10pM以下のKDで結合する、またはヒトPD-1に約1pM以下のKDで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ヒトPD-1に約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約8×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約8.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約9×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約9.5×101/M・s以上のkassocで結合する、またはヒトPD-1に約1×101/M・s以上のkassocで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ヒトPD-1に約2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.1×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.3×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.4×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.5×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.6×10-51/s以下のkdissocで結合する、またはヒトPD-1に約2.7×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.8×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.9×10-51/s以下のkdissocで結合する、またはヒトPD-1に約3×10-51/s以下のkdissocで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、約10nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約9nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約8nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約7nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約6nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約5nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約4nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約3nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約2nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、または約1nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害するものである。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブ(Bristol-Myers Squibb Co.からOPDIVOとして市販されている)、またはそれらのバイオシミラー、抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。ニボルマブは、PD-1受容体を遮断する完全ヒトIgG4抗体である。いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、免疫グロブリンG4カッパ、抗(ヒトCD274)抗体である。ニボルマブには、Chemical Abstracts Service(CAS)登録番号946414-94-4が割り当てられており、5C4、BMS-936558、MDX-1106、及びONO-4538としても知られている。ニボルマブの調製及び特性は、米国
特許第8,008,449号及び国際特許公開第WO2006/121168号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。様々な形態のがんにおけるニボルマブの臨床的安全性及び有効性は、Wang,et al.,Cancer Immunol.Res.2014,2,846-56、Page,et al.,Ann.Rev.Med.,2014,65,185-202、及びWeber,et al.,J.Clin.Oncology,2013,31,4311-4318に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。ニボルマブのアミノ酸配列を表18に示す。ニボルマブは、22-96、140-196、254-314、360-418、22′′-96′′、140′′-196′′、254′′-314′′、及び360′′-418′′における重鎖内ジスルフィド連結;23′-88′、134′-194′、23′′′-88′′′、及び134′′′-194′′′における軽鎖内ジスルフィド連結;127-214′、127′′-214′′′における重鎖-軽鎖間ジスルフィド連結;219-219′′及び222-222′′における重鎖-重鎖間ジスルフィド連結;ならびに290、290′′におけるN-グリコシル化部位(H CH2
84.4)を有する。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、配列番号158によって与えられる重鎖及び配列番号159によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号160に示される配列を含み、PD-1阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号161に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも99%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも98%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも97%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも96%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも95%同一であるV及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、それぞれ、配列番号162、配列番号163、及び配列番号164に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号165、配列番号166、及び配列番号167に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR
3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはPD-1上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-1バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ニボルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-1抗体であり、抗PD-1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ニボルマブである。抗PD-1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ニボルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ニボルマブである。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約0.5mg/kg~約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約1.5mg/kg、約2mg/kg、約2.5mg/kg、約3mg/kg、約3.5mg/kg、約4mg/kg、約4.5mg/kg、約5mg/kg、約5.5mg/kg、約6mg/kg、約6.5mg/kg、約7mg/kg、約7.5mg/kg、約8mg/kg、約8.5mg/kg、約9mg/kg、約9.5mg/kg、または約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約200mg~約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約200mg、約220mg、約240mg、約260mg、約280mg、約300mg、約320mg、約340mg、約360mg、約380mg、約400mg、約420mg、約440mg、約460mg、約480mg、または約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、2週間毎、3週間毎、4週間毎、5週間毎、または6週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、切除不能または転移性黒色腫を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、切除不能または転移性黒色腫を治療するために投与され、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、切除不能または転移性黒色腫を治療するために投与され、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、切除不能または転移性黒色腫を治療するために、約1mg/kgで投与され、続いて同じ日にイピリムマブ3mg/kgを3週間毎に4用量、次いで240mgを2週間毎、または480mgを4週間毎に投与される。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、黒色腫のアジュバント治療のために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、黒色腫のアジュバント治療のために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、黒色腫のアジュバント治療のために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、2週間毎に約3mg/kgで、6週間毎に1mg/kgのイピリムマブとともに投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、3週間毎に約360mgで、6週間毎に1mg/kgのイピリムマブ及び2サイクルのプラ
チナダブレット化学療法とともに投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、2週間毎に約240mgまたは4週間毎に480mg投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、小細胞肺癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、小細胞肺癌を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、悪性胸膜中皮腫を治療するために、3週間毎に約360mg/kg、6週間毎に1mg/kgのイピリムマブとともに投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、進行性腎細胞癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、進行性腎細胞癌を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、進行性腎細胞癌を治療するために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、進行性腎細胞癌を治療するために、約3mg/kgで投与され、続いて同じ日にイピリムマブ約1mg/kgを3週間毎に4用量、次いで240mgを2週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、進行性腎細胞癌を治療するために、約3mg/kgで投与され、続いて同じ日にイピリムマブ約1mg/kgを3週間毎に4用量、次いで240mgを2週間毎、480mgを4週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、古典的ホジキンリンパ腫を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、古典的ホジキンリンパ腫を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは
、古典的ホジキンリンパ腫を治療するために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、頭頸部の再発性または転移性扁平上皮癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、頭頸部の再発性または転移性扁平上皮癌を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、頭頸部の再発性または転移性扁平上皮癌を治療するために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、局所進行性または転移性尿路上皮癌を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、局所進行性または転移性尿路上皮癌を治療するために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性大腸癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、成人及び小児患者における高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性大腸癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、40kg以上の成人及び小児患者における高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性大腸癌を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、40kg以上の成人及び小児患者における高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性大腸癌を治療するために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、<40kgの小児患者における高頻度マイク
ロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性大腸癌を治療するために、2週間毎に約3mg/kgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、40kg以上の成人及び小児患者における高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性大腸癌を治療するために、約3mg/kgで投与され、続いて同じ日にイピリムマブ1mg/kgを3週間毎に4用量、次いで240mgを2週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、40kg以上の成人及び小児患者における高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性大腸癌を治療するために、約3mg/kgで投与され、続いて同じ日にイピリムマブ1mg/kgを3週間毎に4用量、次いで480mgを4週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、肝細胞癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、肝細胞癌を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、肝細胞癌を治療するために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、肝細胞癌を治療するために、約1mg/kgで投与され、続いて同じ日にイピリムマブ3mg/kgを3週間毎に4用量、次いで240mgを2週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、肝細胞癌を治療するために、約1mg/kgで投与され、続いて同じ日にイピリムマブ3mg/kgを3週間毎に4用量、次いで480mgを4週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、食道扁平上皮癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、食道扁平上皮癌を治療するために、2週間毎に約240mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、食道扁平上皮癌を治療するために、4週間毎に約480mgで投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
他の実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブ(Merck&Co.,Inc(Kenilworth,NJ,USA)からKEYTRUDAとして市販されている)、またはそれらの抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントを含む。ペムブロリズマブには、CAS登録番号1374853-91-4が割り当てられており、ラムブロリズマブ、MK-3475、及びSCH-900475としても知られている。ペムブロリズマブは、免疫グロブリンG4、抗(ヒトタンパク質PDCD1(プログラム細胞死1))
(ヒト-ハツカネズミモノクローナル重鎖)、ヒト-ハツカネズミモノクローナル軽鎖、二量体構造を有するジスルフィドを有する。ペムブロリズマブの構造は、免疫グロブリンG4、抗(ヒトプログラム細胞死1);ヒト化マウスモノクローナルκ軽鎖二量体(226-226′′:229-229′′)-ビスジスルフィドを有するヒト化マウスモノクローナル[228-L-プロリン(H10-S>P)]γ4重鎖(134-218′)-ジスルフィドとしても記載され得る。ペムブロリズマブの特性、使用、及び調製は、国際特許公開第WO2008/156712A1号、米国特許第8,354,509号、ならびに米国特許出願公開第2010/0266617A1号、同第2013/0108651A1号、及び同第2013/0109843A2号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。様々な形態のがんにおけるペムブロリズマブの臨床的安全性及び有効性は、Fuerst,Oncology Times,2014,36,35-36、Robert,et al.,Lancet,2014,384,1109-17、及びThomas,et al.,Exp.Opin.Biol.Ther.,2014,14,1061-1064に記載されている。ペムブロリズマブのアミノ酸配列を表19に示す。ペムブロリズマブは、ジスルフィド架橋:22-96、22′′-96′′、23′-92′、23′′′-92′′′、134-218′、134′′-218′′′、138′-198′、138′′′-198′′′、147-203、147′′-203′′、226-226′′、229-229′′、261-321、261′′-321′′、367-425、及び367′′-425′′、ならびにグリコシル化部位(N):Asn-297及びAsn-297′′を含む。ペムブロリズマブは、Fc領域に安定化S228P変異を有するIgG4/カッパアイソタイプであり、この変異をIgG4ヒンジ領域に挿入すると、IgG4抗体で典型的に観察される半分子の形成が防止される。ペムブロリズマブは、各重鎖のFcドメイン内のAsn297で不均一にグリコシル化されており、無傷の抗体の分子量はおよそ149kDaになる。ペムブロリズマブの優性グリコフォームは、フコシル化アガラクト二分性グリカンフォーム(G0F)である。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、配列番号168によって与えられる重鎖及び配列番号169によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号170に示される配列を含み、PD-1阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号171に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも99%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも98%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実
施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも97%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも96%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも95%同一であるV及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、それぞれ、配列番号172、配列番号173、及び配列番号174に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号175、配列番号176、及び配列番号177に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはPD-1上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-1バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ペムブロリズマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-1抗体であり、抗PD-1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ペムブロリズマブである。抗PD-1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ペムブロリズマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ペムブロリズマブである。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ペムブロリズマブは、約0.5mg/kg~約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ペムブロリズマブは、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約1.5mg/kg、約2mg/kg、約2.5mg/kg、約3mg/kg、約3.5mg/kg、約4mg/kg、約4.5mg/kg、約5mg/kg、約5.5mg/kg、約6mg/kg、約6.5mg/kg、約7mg/kg、約7.5mg/kg、約8mg/kg、約8.5mg/kg、約9mg/kg、約9.5mg/kg、または約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患
者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ペムブロリズマブは、約200mg~約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約200mg、約220mg、約240mg、約260mg、約280mg、約300mg、約320mg、約340mg、約360mg、約380mg、約400mg、約420mg、約440mg、約460mg、約480mg、または約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ペムブロリズマブは、2週間毎、3週間毎、4週間毎、5週間毎、または6週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、黒色腫を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、黒色腫を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、黒色腫を治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、NSCLCを治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、NSCLCを治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、NSCLCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、小細胞肺癌(SCLC)を治療するた
めに投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、SCLCを治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、SCLCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、HNSCCを治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、HNSCCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、古典的ホジキンリンパ腫(cHL)または原発性縦隔大細胞型B細胞リンパ腫(PMBCL)を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、古典的ホジキンリンパ腫(cHL)または原発性縦隔大細胞型B細胞リンパ腫(PMBCL)を治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。ペムブロリズマブは、古典的ホジキンリンパ腫(cHL)または原発性縦隔大細胞型B細胞リンパ腫(PMBCL)を治療するために、小児の場合、3週間毎に約2mg/kg(最大200mg)で投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、尿路上皮癌を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、尿路上皮癌を治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、高頻度マイクロサテライト不安定性(
MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)癌を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、MSI-HまたはdMMR癌を治療するために、成人の場合、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、MSI-HまたはdMMR癌を治療するために、小児の場合、3週間毎に約2mg/kg(最大200mg)で投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損大腸癌(dMMR CRCを治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、MSI-HまたはdMMR CRCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、胃癌を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、胃癌を治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、食道癌を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、食道癌を治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、子宮頸癌を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、子宮頸癌を治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、肝細胞癌(HCC)を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、HCCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、メルケル細胞癌(MCC)を治療するために、成人の場合、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、MCCを治療するために、成人の場合、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、MCCを治療するために、小児の場合、3週間毎に約2mg/kg(最大200mg)で投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、腎細胞癌(RCC)を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、RCCを治療するために、6週間毎に約400mgで、経口で1日2回のアキシチニブ5mgとともに投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態
では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、子宮内膜癌を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、子宮内膜癌を治療するために、MSI-HまたはdMMRではない腫瘍に対して、6週間毎に約400mgで、経口で1日1回のレンバチニブ20mgとともに投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、高遺伝子変異量(TMB-H)癌を治療するために、成人の場合、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、TMB-H癌を治療するために、成人の場合、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、TMB-H癌を治療するために、小児の場合、3週間毎に約2mg/kg(最大200mg)で投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、皮膚扁平上皮癌(cSCC)を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、cSCCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、トリプルネガティブ乳癌(TNBC)を治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、TNBCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、患者または対象が成人である場合、すなわち、成人適応症の治療、及び6週間毎の400mgの追加の投薬レジメンが用いられ得る。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、抗m-PD-1クローンJ43(カタログ番号BE0033-2)及びRMP1-14(カタログ番号BE0146)(Bio X Cell,Inc.,West Lebanon,NH USA)などの市販の抗PD-1モノクローナル抗体である。いくつかの市販の抗PD-1抗体が、当業者に知られている。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、米国特許第8,354,509号または米国特許出願公開第2010/0266617 A1号、同第2013/0108651A1号、同第2013/0109843 A2号に開示されている抗体であり、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、米国特許第8,287,856号、同第8,580,247号、及び同第8,168,757号、ならびに米国特許出願公開第2009/0028857 A1号、同第2010/0285013 A1号、同第2013/0022600A1号、及び同第2011/0008369 A1号に記載されている抗PD-1抗体であり、それらの教示は参照により本明細書に組み込まれる。他の実施形態では、PD-1阻害剤は、米国特許第8,735,553 B1号に開示されている抗PD-1抗体であり、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、CT-011としても知られるピジリズマブであり、これは米国特許第8,686,119号に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、米国特許第8,907,053号、同第9,096,642号、及び同第9,044,442号、ならびに米国特許出願公開第2015/0087581号に記載されるものなどの小分子またはペプチドもしくはペプチド誘導体;米国特許出願公開第2015/0073024号に記載されるものなどの1,2,4-オキサジアゾール化合物及び誘導体;米国特許出願公開第2015/0073042号に記載されるものなどの環状ペプチド模倣化合物及び誘導体;米国特許出願公開第2015/0125491号に記載されるものなどの環状化合物及び誘導体;国際特許出願公開第WO2015/033301号に記載されるものなどの1,3,4-オキサジアゾール及び1,3,4-チアジアゾール化合物ならびに誘導体;国際特許出願公開第WO2015/036927号及び同第WO2015/04490号に記載されるものなどのペプチド系化合物及び誘導体、または米国特許出願公開第2014/0294898号に記載されるものなどの大環状ペプチド系化合物及び誘導体であり得、各々の開示は参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、Regeneron,Inc.から市販されているセミプリマブである。
いくつかの実施形態では、TIL及びPD-L1阻害剤またはPD-L2阻害剤は、NSCLCの治療のための併用療法または共療法として投与される。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、前療法を受けていない。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤またはPD-L2阻害剤は、フロントライン療法または初期療法
として投与される。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤またはPD-L2阻害剤は、本明細書に記載のTILと併用して、フロントライン療法または初期療法として投与される。
いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、当該技術分野で知られている任意のPD-L1もしくはPD-L2阻害剤、アンタゴニスト、または遮断剤であり得る。特に、次の段落でより詳細に記載されるPD-L1もしくはPD-L2阻害剤、アンタゴニスト、または遮断剤のうちの1つである。「阻害剤」、「アンタゴニスト」、及び「遮断剤」という用語は、本明細書では、PD-L1及びPD-L2阻害剤に関して交換可能に使用される。誤解を避けるために、抗体であるPD-L1またはPD-L2阻害剤への本明細書での言及は、化合物またはその抗原結合断片、バリアント、複合体、もしくはバイオシミラーを指し得る。誤解を避けるために、PD-L1またはPD-L2阻害剤への本明細書での言及は、化合物またはその薬学的に許容される塩、エステル、溶媒和物、水和物、共結晶、もしくはプロドラッグを指し得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組成物、プロセス、及び方法は、PD-L1またはPD-L2阻害剤を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、小分子である。いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、抗体(すなわち、抗PD-1抗体)、Fab断片を含むその断片、またはその一本鎖可変断片(scFv)である。いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、ポリクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、モノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、PD-L1もしくはPD-L2との結合について競合し、及び/またはPD-L1もしくはPD-L2上のエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、抗体は、PD-L1もしくはPD-L2との結合について競合し、及び/またはPD-L1もしくはPD-L2上のエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるPD-L1阻害剤は、化合物が、PD-L2受容体を含む他の受容体と結合または相互作用するよりも実質的に低い濃度でPD-L1と結合または相互作用するという点で、PD-L1に対して選択的である。特定の実施形態では、化合物は、PD-L2受容体に対するより少なくとも約2倍高い濃度、約3倍高い濃度、約5倍高い濃度、約10倍高い濃度、約20倍高い濃度、約30倍高い濃度、約50倍高い濃度、約100倍高い濃度、約200倍高い濃度、約300倍高い濃度、または約500倍高い濃度である結合定数でPD-L1受容体に結合する。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるPD-L2阻害剤は、化合物が、PD-L1受容体を含む他の受容体と結合または相互作用するよりも実質的に低い濃度でPD-L2と結合または相互作用するという点で、PD-L2に対して選択的である。ある特定の実施形態では、化合物は、PD-L1受容体に対するより少なくとも約2倍高い濃度、約3倍高い濃度、約5倍高い濃度、約10倍高い濃度、約20倍高い濃度、約30倍高い濃度、約50倍高い濃度、約100倍高い濃度、約200倍高い濃度、約300倍高い濃度、または約500倍高い濃度である結合定数でPD-L2受容体に結合する。
いかなる理論にも縛られることなく、腫瘍細胞はPD-L1を発現し、T細胞はPD-1を発現すると考えられている。しかしながら、腫瘍細胞によるPD-L1の発現は、PD-1またはPD-L1の阻害剤または遮断剤の有効性には必要とされない。いくつかの実施形態では、腫瘍細胞は、PD-L1を発現する。他の実施形態では、腫瘍細胞は、PD-L1を発現しない。いくつかの実施形態では、方法は、TILと組み合わせて、本明細書に記載されるものなどのPD-1及びPD-L1抗体の組み合わせを含むことができる。PD-1及びPD-L1抗体とTILとの組み合わせの投与は、同時または連続的で
あり得る。
いくつかの実施形態では、PD-L1及び/またはPD-L2阻害剤は、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約100pM以下のKDで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約90pM以下のKDで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約80pM以下のKDで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約70pM以下のKDで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約60pM以下のKDで結合する、約50pM以下のKD、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約40pM以下のKDで結合する、またはヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約30pM以下のKDで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-L1及び/またはPD-L2阻害剤は、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約8×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約8.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約9×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約9.5×101/M・s以上のkassocで結合する、またはヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約1×101/M・s以上のkassocで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-L1及び/またはPD-L2阻害剤は、ヒトPD-L1もしくはPD-L2に約2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.1×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.3×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.4×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.5×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.6×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-L1もしくはPD-L2に約2.7×10-51/s以下のkdissocで結合する、またはヒトPD-L1もしくはPD-L2に約3×10-51/s以下のkdissocで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-L1及び/またはPD-L2阻害剤は、約10nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約9nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約8nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約7nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約6nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約5nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約4nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約3nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約2nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、またはヒトPD-1を遮断し、または約1nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断するものである。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、MEDI4736としても知られるデュルバルマブ(これは、AstraZeneca plc.の子会社であるMedimmune,LLC(Gaithersburg,Maryland)から市販されている)
、またはその抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、米国特許第8,779,108号または米国特許出願公開第2013/0034559号に開示されている抗体であり、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。デュルバルマブの臨床的有効性は、Page,et al.,Rev.Med.,2014,65,185-202、Brahmer,et al.,J.Clin.Oncol.2014,32,5s(補足、要約8021)、及びMcDermott,et al.,Cancer Treatment Rev.,2014,40,1056-64に記載されている。デュルバルマブの調製及び特性は、米国特許第8,779,108号に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。デュルバルマブのアミノ酸配列を表20に示す。デュルバルマブモノクローナル抗体は、22-96、22′′-96′′、23′-89′、23′′′-89′′′、135′-195′、135′′′-195′′′、148-204、148′′-204′′、215′-224、215′′′-224′′′、230-230′′、233-233′′、265-325、265′′-325′′、371-429、及び371′′-429′におけるジスルフィド連結、ならびにAsn-301及びAsn-301′′におけるN-グリコシル化部位を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、配列番号178によって与えられる重鎖及び配列番号179によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、デュルバルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号180に示される配列を含み、PD-L1阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号181に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号182、配列番号
183、及び配列番号184に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号185、配列番号186、及び配列番号187に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはPD-L1上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、ペムブロリズマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-L1バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-L1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、デュルバルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-L1抗体であり、抗PD-L1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、デュルバルマブである。抗PD-L1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、デュルバルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、デュルバルマブである。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、MSB0010718C(Merck
KGaA/EMD Seronoから市販されている)としても知られるアベルマブ、またはその抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。アベルマブの調製及び特性は、米国特許出願公開第2014/0341917A1号に記載されており、その開示は参照により本明細書に具体的に組み込まれる。アベルマブのアミノ酸配列を表21に示す。アベルマブは、22-96、147-203、264-324、370-428、22′′-96′′、147′′-203′′、264′′-324′′、及び370′′-428′′における重鎖内ジスルフィド連結(C23-C104);22′-90′、138′-197′、22′′′-90′′′、及び138′′′-197′′′における軽鎖内ジスルフィド連結(C23-C104);223-215′及び223′′-215′′′における重鎖-軽鎖内ジスルフィド連結(h 5-CL 126);229-229′′及び232-232′′における重鎖-重鎖内ジスルフィド連結(h 11、h 14);300、300′′におけるN-グリコシル化部位(H CH2 N84.
4);フコシル化複合体二分性CHO型グリカン;ならびに450及び450′におけるH CHS K2 C末端リジンクリッピングを有する。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、配列番号188によって与えられる重鎖及び配列番号189によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、アベルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤重鎖可変領域(VH)は、配列番号190に示される配列を含み、PD-L1阻害剤軽鎖可変領域(VL)は、配列番号191に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号192、配列番号193、及び配列番号194に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号195、配列番号196、及び配列番号197に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはPD-L1上の同じエピトープに結合する。
いくつかの複合体実施形態では、PD-L1阻害剤は、アベルマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-L1バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの複合体実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-L1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、アベルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、
グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-L1抗体であり、抗PD-L1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、アベルマブである。抗PD-L1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、アベルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、アベルマブである。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、MPDL3280AまたはRG744
6としても知られるアテゾリズマブ(Roche Holding AG(Basel,Switzerland)の子会社であるGenentech,Inc.からTECENTRIQとして市販されている)、またはその抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、米国特許第8,217,149号に開示されている抗体であり、その開示は参照により本明細書に具体的に組み込まれる。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、米国特許出願公開第2010/0203056A1号、同第2013/0045200A1号、同第2013/0045201A1号、同第2013/0045202A1号、または同第2014/0065135A1号に開示されている抗体であり、その開示は参照により本明細書に具体的に組み込まれる。アテゾリズマブの調製及び特性は、米国特許第8,217,149号に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。アテゾリズマブのアミノ酸配列を表22に示す。アテゾリズマブは、22-96、145-201、262-322、368-426、22′′-96′′、145′′-201′′、262′′-322′′、及び368′′-426′′における重鎖内ジスルフィド連結(C23-C104);23′-88′、134′-194′、23′′′-88′′′、及び134′′′-194′′′における軽鎖内ジスルフィド連結(C23-C104);221-214′及び221′′-214′′′における重鎖-軽鎖内ジスルフィド連結(h 5-CL 126);227-227′′及び230-230′′における重鎖-重鎖内ジスルフィド連結(h 11、h 14);ならびに298及び298′におけるN-グリコシル化部位(H CH2 N84.4>A)を有する。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、配列番号198によって与えられる重鎖及び配列番号199によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、アテゾリズマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号200に示される配列を含み、PD-L1阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号201に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番
号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号202、配列番号203、及び配列番号204に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号205、配列番号206、及び配列番号207に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはPD-L1上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、抗PD-L1抗体は、アテゾリズマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-L1バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-L1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、アテゾリズマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-L1抗体であり、抗PD-L1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、アテゾリズマブである。抗PD-L1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、アテゾリズマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、アテゾリズマブである。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、米国特許出願公開第2014/0341917A1号に記載されている抗体を含み、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。他の実施形態では、PD-L1への結合についてこれらの抗体のうちのいずれかと競合する抗体も含まれる。いくつかの実施形態では、抗PD-L1抗体は、BMS-935559としても知られるMDX-1105であり、これは米国特許第7,943,743号に開示されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、抗PD-L1抗体は、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第7,943,743号に開示されている抗PD-L1抗体から選択される。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、INVIVOMAB抗m-PD-L1クローン10F.9G2(カタログ番号BE0101、Bio X Cell,Inc.,West Lebanon,NH,USA)などの市販のモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、抗PD-L1抗体は、AFFYMETRIX EBIOSCIENCE(MIH1)などの市販のモノクローナル抗体である。いくつかの市販の抗PD
-L1抗体が、当業者に知られている。
いくつかの実施形態では、PD-L2阻害剤は、BIOLEGEND24F.10C12マウスIgG2a、κアイソタイプ(カタログ番号329602 Biolegend,Inc.,San Diego,CA)、SIGMA抗PD-L2抗体(カタログ番号SAB3500395,Sigma-Aldrich Co.,St.Louis,MO)、または当業者に知られている他の市販のPD-L2抗体などの市販のモノクローナル抗体である。
C.CTLA-4阻害剤及び/またはCD40アゴニストとの組み合わせ
いくつかの実施形態では、がんを有する患者に提供されるTIL療法は、治療的TIL集合単独による治療を含んでもよく、またはTIL及び1つ以上のCTLA-4阻害剤を含む併用治療を含んでもよい。
細胞傷害性Tリンパ球抗原4(CTLA-4)は、免疫グロブリンスーパーファミリーのメンバーであり、ヘルパーT細胞の表面で発現する。CTLA-4は、CD28依存性T細胞活性化の負の制御因子であり、適応免疫応答のチェックポイントとして機能する。T細胞共刺激タンパク質CD28と同様に、CTLA-4結合抗原は、細胞上でCD80及びCD86を提示する。CTLA-4は抑制シグナルをT細胞に伝達し、CD28は刺激シグナルを伝達する。ヒトCTLA-4に対するヒト抗体は、ウイルス感染及び細菌感染を治療または予防すること、ならびにがんを治療するためのものなど、多くの疾患状態における免疫刺激調節因子として記載されている(WO01/14424及びWO00/37504)。イピリムマブ(MDX-010)及びトレメリムマブ(CP-675,206)を含むが、これらに限定されない、様々な種類の固形腫瘍の治療のためのいくつかの完全ヒト抗ヒトCTLA-4モノクローナル抗体(mAb)が、臨床試験で研究されている。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、当技術分野で知られている任意のCTLA-4阻害剤またはCTLA-4遮断剤であり得る。特に、次の段落でより詳細に記載されるCTLA-4阻害剤または遮断剤のうちの1つである。「阻害剤」、「アンタゴニスト」、及び「遮断剤」という用語は、本明細書では、CTLA-4阻害剤に関して互換的に使用される。誤解を避けるために、抗体であるCTLA-4阻害剤への本明細書での言及は、化合物またはその抗原結合断片、バリアント、複合体、もしくはバイオシミラーを指し得る。誤解を避けるために、CTLA-4阻害剤への本明細書での言及はまた、小分子化合物またはその薬学的に許容される塩、エステル、溶媒和物、水和物、共結晶、もしくはプロドラッグを指し得る。
本発明の方法で使用するための好適なCTLA-4阻害剤には、抗CTLA-4抗体、ヒト抗CTLA-4抗体、マウス抗CTLA-4抗体、哺乳動物抗CTLA-4抗体、ヒト化抗CTLA-4抗体、モノクローナル抗CTLA-4抗体、ポリクローナル抗CTLA-4抗体、キメラ抗CTLA-4抗体、MDX-010(イピリムマブ)、トレメリムマブ、抗CD28抗体、抗CTLA-4アドネクチン、抗CTLA-4ドメイン抗体、一本鎖抗CTLA-4断片、重鎖抗CTLA-4断片、軽鎖抗CTLA-4断片、共刺激経路を刺激するCTLA-4の阻害剤、PCT公開第WO2001/014424号に開示される抗体、PCT公開第WO2004/035607号に開示される抗体、米国公開第2005/0201994号に開示される抗体、ならびに付与された欧州特許第EP 1212422 B1号に開示された抗体が含まれるが、これらに限定されず、各々の開示が参照により本明細書に組み込まれる。さらなるCTLA-4抗体は、米国特許第5,811,097号、同第5,855,887号、同第6,051,227号、及び同第6,984,720号、PCT公開第WO01/14424号及び同第WO00/37504
号、ならびに米国公開第2002/0039581号及び同第2002/086014号に記載されており、各々の開示が参照により本明細書に組み込まれる。本発明の方法で使用することができる他の抗CTLA-4抗体には、例えば、WO98/42752、米国特許第6,682,736号及び同第6,207,156号、Hurwitz et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,95(17):10067-10071(1998)、Camacho et al.,J.Clin.Oncology,22(145):Abstract No.2505(2004)(抗体CP-675206)、Mokyr et al.,Cancer Res.,58:5301-5304(1998)、ならびに米国特許第5,977,318号、同第6,682,736号、同第7,109,003号、及び同第7,132,281号に開示されるものが含まれ、これらの各々の開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
さらなるCTLA-4阻害剤には、CD28抗原がその同族リガンドと結合する能力を妨害すること、CTLA-4がその同族リガンドと結合する能力を阻害すること、共刺激経路を介してT細胞応答を増強すること、B7がCD28及び/またはCTLA-4と結合する能力を破壊すること、B7が共刺激経路を活性化する能力を破壊すること、CD80がCD28及び/またはCTLA-4と結合する能力を破壊すること、CD80が共刺激経路を活性化する能力を破壊すること、CD86がCD28及び/またはCTLA-4と結合する能力を破壊すること、CD86が共刺激経路を活性化する能力を破壊すること、及び共刺激経路を一般に活性化されることから破壊することが可能である任意の阻害剤が含まれるが、これらに限定されない。これには、共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4の小分子阻害剤、共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4に対する抗体、共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4に指向するアンチセンス分子、共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4に指向するアドネクチン、他のCTLA-4阻害剤のなかでも共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4のRNAi阻害剤(一本鎖及び二本鎖の両方)が必ず含まれる。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、約10-6M以下、10-7M以下、10-8M以下、10-9M以下、10-10M以下、10-11M以下、10-12M以下、例えば、10-13M~10-16M、またはエンドポイントとして前述の値のうちのいずれか2つを有する任意の範囲内のKdでCTLA-4に結合する。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、同じアッセイを使用して比較した場合、イピリムマブのKdの10倍以下のKdでCTLA-4と結合する。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、同じアッセイを使用して比較した場合、イピリムマブとほぼ同じかまたはそれ以下(例えば、最大10倍低いか、または最大100倍低い)のKdでCTLA-4と結合する。いくつかの実施形態では、CD80またはCD86とのCTLA-4結合のCTLA-4阻害剤による阻害のIC50値は、同じアッセイを使用して比較した場合、それぞれCD80またはCD86とのCTLA-4結合のイピリムマブ媒介阻害より10倍以下で大きい。いくつかの実施形態では、CD80またはCD86とのCTLA-4結合のCTLA-4阻害剤による阻害のIC50値は、同じアッセイを使用して比較した場合、それぞれCD80またはCD86とのCTLA-4結合のイピリムマブ媒介性阻害とほぼ同じかまたはそれ以下(例えば、最大10倍低い、または最大100倍低い)である。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、好適な対照と比較して、少なくとも20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または100%、例えば、50%~75%、75%~90%、または90%~100%の間でCTLA-4の発現を阻害する、及び/または生物学的活性を減少させるのに十分な量で使用
される。いくつかの実施形態では、CTLA-4経路阻害剤は、好適な対照と比較して、少なくとも20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または100%、例えば、50%~75%、75%~90%、または90%~100%の間でCTLA-4のCD80、CD86、またはその両方との結合を減少させることにより、CTLA-4の生物学的活性を減少させるのに十分な量で使用される。対象となる薬剤の効果を評価または定量化する状況下における好適な対照は、典型的には、対象となる薬剤、例えば、CTLA-4経路阻害剤に曝露されていないか、または治療されていない(または僅かな量に曝露されているか、または治療されている)同等の生物学的系(例えば、細胞または対象)である。いくつかの実施形態では、生物学的系は、それ自体の対照として機能し得る(例えば、生物学的系は、薬剤への曝露または治療の前に評価され得、曝露または治療が開始または終了した後の状態と比較され得る。いくつかの実施形態では、歴史的対照が使用され得る。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブ(Bristol-Myers Squibb Co.からYervoyとして市販されている)、またはそのバイオシミラー、抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。当該技術分野で知られているように、イピリムマブは、機能的ヒトレパートリーを生成するための重鎖及び軽鎖をコードするヒト遺伝子を有するトランスジェニックマウスに由来する完全ヒトIgG 1κ抗体である、抗CTLA-4抗体を指す。イピリムマブは、そのCAS登録番号477202-00-9及びPCT公開第WO01/14424号で参照することもでき、その全体がすべての目的で参照により本明細書に組み込まれる。それは抗体10DIとして開示されている。具体的には、イピリムマブは、軽鎖可変領域及び重鎖可変領域(配列番号211を含む軽鎖可変領域を有し、配列番号210を含む重鎖可変領域を有する)を含む。イピリムマブの薬学的組成物は、イピリムマブ及び1つ以上の希釈剤、ビヒクル、または賦形剤を含有するすべての薬学的に許容される組成物を含む。イピリムマブを含有する薬学的組成物の例は、国際特許出願公開第WO2007/67959号に記載されている。イピリムマブは、静脈内(IV)投与され得る。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、配列番号208によって与えられる重鎖及び配列番号209によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくはコンジュゲートを含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブの重鎖及び軽鎖のCDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号210に示される配列を含み、CTLA-4阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号211に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域
を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号212、配列番号213、及び配列番号214に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号215、配列番号216、及び配列番号217に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはCTLA-4上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブに関して薬物規制当局によって承認されたCTLA-4バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、抗CTLA-4抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、イピリムマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。イピリムマブのアミノ酸配列を表23に示す。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗CTLA-4抗体であり、抗CTLA-4抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、イピリムマブである。抗CTLA-4抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、イピリムマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、イピリムマブである。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、約0.5mg/kg~約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約1.5mg/kg、約2mg/kg、約2.5mg/kg、約3mg/kg、約3.5mg/kg、約4mg/kg、約4.5mg/kg、約5mg/kg、約5.5mg/kg、約6mg/kg、約6.5mg/kg、約7mg/kg、約7.5mg/kg、約8mg/kg、約8.5mg/kg、約9mg/kg、約9.5mg/kg、または約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、約200mg~約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、約200mg、約220mg、約240mg、約260mg、約280mg、約300mg、約320mg、約340mg、約360mg、約380mg、約400mg、約420mg、約440mg、約460mg、約480mg、または約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に
)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、2週間毎、3週間毎、4週間毎、5週間毎、または6週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、切除不能または転移性黒色腫を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、切除不能または転移性黒色腫を治療するために、3週間毎に約mg/kgで最大4用量投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、黒色腫のアジュバント治療のために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、黒色腫のアジュバント治療のために、約10mg/kgで3週間毎に4用量、続いて10mg/kgで12週間毎に最大3年間投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、進行性腎細胞癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、進行性腎細胞癌を治療するために、約1mg/kgで投与され、直後に同じ日にニボルマブ3mg/kgを3週間毎に4用量投与される。いくつかの実施形態では、4用量の組み合わせを完了した後、ニボルマブは、進行性腎細胞癌及び/または腎細胞癌の標準的な投薬レジメンに従って単剤として投与され得る。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性大腸癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性大腸癌を治療するために、約1mg/kgで静脈内に30分間にわたって投与され、直後に同じ日にイピリムマブ3mg/kgを静脈内に30分間にわたって3週間毎に4用量投与される。いくつかの実施形態では、4用量の組み合わせを完了した後、高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)転移性大腸癌の標準的な投薬レジメンに従って推奨されるように単剤としてニボルマブを投与する。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、肝細胞癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、肝細胞癌を治療するために、約3mg/kgで静脈内に30分間にわたって投与され、直後に同じ日にニボルマブ1mg/kgを静脈内に30分間にわたって3週間毎に4用量投与される。いくつかの実施形態では、4用量の組み合わせを完了した後、肝細胞癌のための標準的な投薬レジメンに従って単剤としてニボルマブを投与する。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、6週間毎に約1mg/kgで、2週間毎に3mg/kgのニボルマブとともに投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、6週間毎に約1mg/kgで、3週間毎に360mgのニボルマブ及び2サイクルのプラチナダブレット化学療法とともに投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、悪性胸膜中皮腫を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、悪性胸膜中皮腫を治療するために、6週間毎に約1mg/kgで、3週間毎に360mgのニボルマブとともに投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
トレメリムマブ(CP-675,206としても知られる)は、完全ヒトIgG2モノクローナル抗体であり、CAS番号745013-59-6を有する。トレメリムマブは、米国特許第6,682,736号(参照により本明細書に組み込まれる)において抗体11.2.1として開示されている。トレメリムマブの重鎖及び軽鎖のアミノ酸配列を、それぞれ配列番号218及び219に示す。トレメリムマブは、黒色腫及び乳癌を含む種々の腫瘍の治療のための臨床試験において研究されており、トレメリムマブは、0.01及び15mg/kgの用量範囲で4週間または12週間毎に単回用量または複数回用量として静脈内投与される。本発明によって提供されるレジメンでは、トレメリムマブは、局所的に、特に皮内または皮下に投与される。皮内または皮下投与されるトレメリムマブの有効量は、典型的には、人当たり5~200mg/用量の範囲である。いくつかの実施形態では、トレメリムマブの有効量は、用量当たり人当たり10~150mg/用量の範囲である。いくつかの特定の実施形態では、トレメリムマブの有効量は、人当たり約10、25、37.5、40、50、75、100、125、150、175、または200mg/用量である。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、配列番号218によって与えられる重鎖及び配列番号219によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくはコンジュゲートを含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少
なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブの重鎖及び軽鎖のCDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号220に示される配列を含み、CTLA-4阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号221に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号222、配列番号223、及び配列番号224に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号225、配列番号226、及び配列番号227に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはCTLA-4上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブに関して薬物規制当局によって承認された抗CTLA-4バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、抗CTLA-4抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、トレメリムマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。トレメリムマブのアミノ酸配列を表24に示す。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗CTLA-4抗体であり、抗CTLA-4抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、トレメリムマブである。抗CTLA-4抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、トレメリムマブである。いくつか
の実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、トレメリムマブである。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、約0.5mg/kg~約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約1.5mg/kg、約2mg/kg、約2.5mg/kg、約3mg/kg、約3.5mg/kg、約4mg/kg、約4.5mg/kg、約5mg/kg、約5.5mg/kg、約6mg/kg、約6.5mg/kg、約7mg/kg、約7.5mg/kg、約8mg/kg、約8.5mg/kg、約9mg/kg、約9.5mg/kg、または約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)
開始される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、約200mg~約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、約200mg、約220mg、約240mg、約260mg、約280mg、約300mg、約320mg、約340mg、約360mg、約380mg、約400mg、約420mg、約440mg、約460mg、約480mg、または約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、2週間毎、3週間毎、4週間毎、5週間毎、または6週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、Agenusからのザリフレリマブ、またはそのバイオシミラー、抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。ザリフレリマブは、完全ヒトモノクローナル抗体である。ザリフレリマブには、Chemical Abstracts Service(CAS)登録番号2148321-69-9が割り当てられており、AGEN1884としても知られている。ザリフレリマブの調製及び特性は、米国特許第10,144,779号及び米国特許出願公開第2020/0024350 A1号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、配列番号228によって与えられる重鎖及び配列番号229によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくはコンジュゲートを含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、ザリフレリマブの重鎖及び軽鎖のCDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号230に示される配列を含み、CTLA-4阻害剤軽鎖可
変領域(V)は、配列番号231に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号231、配列番号233、及び配列番号234に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号235、配列番号236、及び配列番号237に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはCTLA-4上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、ザリフレリマブに関して薬物規制当局によって承認されたCTLA-4バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、抗CTLA-4抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ザリフレリマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。ザリフレリマブのアミノ酸配列を表25に示す。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗CTLA-4抗体であり、抗CTLA-4抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ザリフレリマブである。抗CTLA-4抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ザリフレリマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ザリフレリマブである。
さらなる抗CTLA-4抗体の例には、AGEN1181、BMS-986218、BCD-145、ONC-392、CS1002、REGN4659、及びADG116が含まれるが、これらに限定されず、これらは当業者に即知である。
いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、以下の特許公開のうちのいずれかに開示される抗CTLA-4抗体である:US2019/0048096A1、US2020/0223907、US2019/0201334、US2019/0201334、US2005/0201994、EP1212422B1、WO2018/204760、WO2018/204760、WO2001/014424、WO2004/035607、WO2003/086459、WO2012/120125、WO2000/037504、WO2009/100140、WO2006/09649、WO2005/092380、WO2007/123737、WO2006/029219、WO2010/0979597、WO2006/12168、及びWO1997/020574(これらの各々は参照により本明細書に組み込まれる)。さらなるCTLA-4抗体は、米国特
許第5,811,097号、同第5,855,887号、同第6,051,227号、及び同第6,984,720号、PCT公開第WO01/14424号及び同第WO00/37504号、ならびに米国公開第2002/0039581号及び同第2002/086014号、及び/または米国特許第5,977,318号、同第6,682,736号、同第7,109,003号、及び同第7,132,281号に記載されており、これらの各々は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、例えば、WO98/42752、米国特許第6,682,736号及び同第6,207,156号、Hurwitz et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1998,95,10067-10071(1998)、Camacho,et al.,J.Clin.Oncol.,2004,22,145(Abstract No.2505(2004)(抗体CP-675206)、またはMokyr,et al.,Cancer Res.,1998,58,5301-5304(1998)に開示されており、これらの各々は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、WO1996/040915(参照により本明細書に組み込まれる)に開示されるCTLA-4リガンドである。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、CTLA-4発現の核酸阻害剤である。例えば、抗CTLA-4RNAi分子は、PCT公開第WO1999/032619号及び同第WO2001/029058号、米国公開第2003/0051263号、同第2003/0055020号、同第2003/0056235号、同第2004/265839号、同第2005/0100913号、同第2006/0024798号、同第2008/0050342号、同第2008/0081373号、同第2008/0248576号、同第2008/055443号、及び/または米国特許第6,506,559号、同第7,282,564号、同第7,538,095号、及び同第7,560,438号(参照により本明細書に組み込まれる)において記載された分子の形態を取り得る。いくつかの事例では、抗CTLA-4RNAi分子は、欧州特許第EP1309726号(参照により本明細書に組み込まれる)において記載された二本鎖RNAi分子の形態を取る。いくつかの事例では、抗CTLA-4RNAi分子は、米国特許第7,056,704号及び同第7,078,196号(参照により本明細書に組み込まれる)において記載された二本鎖RNAi分子の形態を取る。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、国際特許出願公開第WO2004/081021(参照により本明細書に組み込まれる)に記載されたアプタマーである。
他の実施形態では、本発明の抗CTLA-4RNAi分子は、米国特許第5,898,031号、同第6,107,094号、同第7,432,249号、及び同第7,432,250号、ならびに欧州出願第0928290号(参照により本明細書に組み込まれる)において記載されたRNA分子である。
いくつかの実施形態では、がんを有する患者に提供されるTIL療法は、治療的TIL集団単独による治療を含んでもよく、またはTIL及び1つ以上のCD40アゴニストを含む併用治療を含んでもよい。
CD40Lは、CD40リガンドまたはCD154とも呼ばれ、主に活性化T細胞上で発現するタンパク質であり、分子のTNFスーパーファミリーのメンバーである。それは、標的細胞型に応じて多くの効果をもたらす、抗原提示細胞(APC)上のCD40に結合する。CD40Lは、共刺激分子として機能し、T濾胞ヘルパー細胞(TFH細胞)と呼ばれるT細胞のサブセットで特に重要である。TFH細胞では、CD40Lは、B細胞表面上のCD40と係合することによって、B細胞の成熟及び機能を促進し、したがって、細胞間通信を促進する。CD40Lの非存在はまた、胚中心の形成を停止させ、したが
って、適応免疫系における重要なプロセスである抗体親和性成熟を禁止する。
いくつかの実施形態では、CD40アゴニストは、抗CD40抗体であってもよい。誤解を避けるために、抗体であるCD40アゴニストへの本明細書での言及は、化合物またはその抗原結合断片、バリアント、複合体、もしくはバイオシミラーを指し得る。誤解を避けるために、CD40阻害剤への本明細書での言及はまた、小分子化合物またはその薬学的に許容される塩、エステル、溶媒和物、水和物、共結晶、もしくはプロドラッグを指し得る。
本発明の方法で使用するための好適なCD40アゴニストには、抗CD40抗体、ヒト抗CD40抗体、マウス抗CD40抗体、哺乳動物抗CD40抗体、ヒト化抗CD40抗体、モノクローナル抗CD40抗体、ポリクローナル抗CD40抗体、キメラ抗CD40抗体、米国特許出願公開第2010/0297154号、国際公開第2004/009615号、米国特許第10,844,131号、日本特許第5752865号、同第6807890号、同第6842488号、同第6807890号、及び韓国特許第101403910号(それらの各々の開示は、参照により本明細書に組み込まれる)に開示される組成物が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、CD40阻害剤は、約10-6M以下、10-7M以下、10-8M以下、10-9M以下、10-10M以下、10-11M以下、10-12M以下、例えば、10-13M~10-16M、またはエンドポイントとして前述の値のうちのいずれか2つを有する任意の範囲内のKdでCD40に結合する。いくつかの実施形態では、CD40アゴニストは、同じアッセイを使用して比較した場合、イピリムマブのKdの10倍以下のKdでCD40と結合する。いくつかの実施形態では、CD40アゴニストは、同じアッセイを使用して比較した場合、CD40Lとほぼ同じかまたはそれ以下(例えば、最大10倍低いか、または最大100倍低い)のKdでCD40と結合する。
いくつかの実施形態では、CD40アゴニストは、好適な対照と比較して、少なくとも10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または100%、例えば、50%~75%、75%~90%、または90%~100%の間でCD40を活性化する、及び/またはCD40の生物学的活性を増加させるのに十分な量で使用される。いくつかの実施形態では、生物学的系は、それ自体の対照として機能し得る(例えば、生物学的系は、薬剤への曝露または治療の前に評価され得、曝露または治療が開始または終了した後の状態と比較され得る。いくつかの実施形態では、歴史的対照が使用され得る。
D.PD-1、PD-L1、及びCTLA-4阻害剤との組み合わせ
いくつかの実施形態では、がんを有する患者に提供されるTIL療法は、治療的TIL集団単独による治療を含んでもよく、またはTILならびに1つ以上のPD-1及び/ま
たはPD-L1及び/またはCTLA-4阻害剤を含む併用治療を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、がんを有する患者に提供されるTIL療法は、1つ以上のPD-1阻害剤と組み合わせた治療的TIL集団による治療を含む。いくつかの実施形態では、がんを有する患者に提供されるTIL療法は、1つ以上のPD-L1阻害剤と組み合わせた治療的TIL集団による治療を含む。いくつかの実施形態では、がんを有する患者に提供されるTIL療法は、1つ以上のCTLA-4阻害剤と組み合わせた治療的TIL集団による療法を含む。いくつかの実施形態では、がんを有する患者に提供されるTIL療法は、1つ以上のPD-1阻害剤及び1つ以上のPD-L1阻害剤と組み合わせた治療的TIL集団による治療を含む。いくつかの実施形態では、がんを有する患者に提供されるTIL療法は、1つ以上のPD-L1阻害剤及び1つ以上のCTLA-4阻害剤と組み合わせた治療的TIL集団による治療を含む。いくつかの実施形態では、がんを有する患者に提供されるTIL療法は、1つ以上のCTLA-4阻害剤及び1つ以上のPD-1阻害剤と組み合わせた治療的TIL集団による治療を含む。いくつかの実施形態では、がんを有する患者に提供されるTIL療法は、1つ以上のPD-1阻害剤、1つ以上のPD-L1阻害剤、及び1つ以上のCTLA-4阻害剤と組み合わせた治療的TIL集団による治療を含む。本明細書に記載されるものなど、当該技術分野で知られている任意の好適なPD-1、PD-L1、またはCTLA-4阻害剤を使用してもよい。
E.患者のリンパ球枯渇プレコンディショニング
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL集団でがんを治療する方法を含み、患者は、本開示によるTILの注入前に骨髄非破壊的化学療法で前治療される。いくつかの実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的化学療法で前治療された患者のがんの治療に使用するためのTIL集団を含む。いくつかの実施形態では、TIL集団は、注入による投与用である。いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的化学療法は、シクロホスファミド60mg/kg/日で2日間(TIL注入の27日前及び26日前)、ならびにフルダラビン25mg/m/日で5日間(TIL注入の27日前~23日前)である。いくつかの実施形態では、本開示による骨髄非破壊的化学療法及びTIL注入(0日目)後、患者は、生理学的許容範囲まで8時間毎に720,000IU/kgで静脈内的にIL-2(PROLEUKINとして市販されている、アルデスロイキン)の静脈内注入を受ける。ある特定の実施形態では、TIL集団は、IL-2と組み合わせてがんを治療する際に使用するためのものであり、IL-2は、TIL集団の後に投与される。
実験結果は、腫瘍特異的Tリンパ球の養子移入前のリンパ球枯渇が、制御性T細胞及び免疫系の競合要素(「サイトカインシンク」)を排除することによって治療有効性を増強する上で重要な役割を果たすことを示している。したがって、本発明のいくつかの実施形態は、本発明のTILを導入する前に、患者に対してリンパ球枯渇ステップ(「免疫抑制コンディショニング」と称されることもある)を利用する。
一般に、リンパ球枯渇は、フルダラビンまたはシクロホスファミド(マホスファミドと称される活性形態)及びそれらの組み合わせの投与を使用して達成される。かかる方法は、Gassner,et al.,Cancer Immunol.Immunother.2011,60,75-85、Muranski,et al.,Nat.Clin.Pract.Oncol.,2006,3,668-681、Dudley,et al.,J.Clin.Oncol.2008,26,5233-5239、及びDudley,et al.,J.Clin.Oncol.2005,23,2346-2357に記載されており、これらはすべて、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、フルダラビンは、0.5μg/mL~10μg/mLのフル
ダラビン濃度で投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビンは、1μg/mLのフルダラビン濃度で投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビン治療は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日以上投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビンは、10mg/kg/日、15mg/kg/日、20mg/kg/日、25mg/kg/日、30mg/kg/日、35mg/kg/日、40mg/kg/日、または45mg/kg/日の投与量で投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビン治療は、35mg/kg/日で2~7日間投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビン治療は、35mg/kg/日で4~5日間投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビン治療は、25mg/kg/日で4~5日間投与される。
いくつかの実施形態では、シクロホスファミドの活性形態であるマホスファミドは、シクロホスファミドの投与により、0.5μg/mL~10μg/mLの濃度で取得される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミドの活性形態であるマホスファミドは、シクロホスファミドの投与により、1μg/mLの濃度で取得される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミド治療は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日以上投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミドは、100mg/m/日、150mg/m/日、175mg/m/日、200mg/m/日、225mg/m/日、250mg/m/日、275mg/m/日、または300mg/m/日の投与量で投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミドは、静脈内(すなわち、i.v.)投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミド治療は、35mg/kg/日で2~7日間投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミド治療は、250mg/m/日で4~5日間i.v.投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミド治療は、250mg/m/日で4日間i.v.投与される。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇は、患者にフルダラビンとシクロホスファミドを一緒に投与することによって行われる。いくつかの実施形態では、フルダラビンは、25mg/m/日でi.v.投与され、シクロホスファミドは、250mg/m/日で4日間にわたってi.v投与される。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われる。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計5日間で行われる。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを約50mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを約25mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計5日間で行われる。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを約50mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを約20mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計5日間で行われる。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを約40mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを約20mg/m/日の用量で5日間投与する
ことによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計5日間で行われる。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを約40mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを約15mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計3日間で行われる。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与することによって行われる。
いくつかの実施形態では、シクロホスファミドは、メスナとともに投与される。いくつかの実施形態では、メスナは、15mg/kgで投与される。メスナが注入されるいくつかの実施形態では、連続的に注入される場合、メスナは、約2時間にわたってシクロホスファミドを注入することができ(-5日目及び/または-4日目)、次いで、各シクロホスファミド用量と同時に開始する24時間にわたって残りの22時間で3mg/kg/時間の速度で注入することができる。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇は、第3のTIL集団を患者に投与した翌日から開始するIL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含む。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇は、第3のTIL集団を患者に投与したのと同じ日に開始するIL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含む。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇は、5日間のプレコンディショニング治療を含む。いくつかの実施形態では、該日は、-5日から-1日、または0日から4日として示される。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-4日目(すなわち、0日目及び1日目)にシクロホスファミドを含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-4日目(すなわち、0日目及び1日目)に静脈内シクロホスファミドを含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-4日目(すなわち、0日目及び1日目)に60mg/kgの静脈内シクロホスファミドを含む。いくつかの実施形態では、シクロホスファミドは、メスナとともに投与される。いくつかの実施形態では、レジメンは、フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、静脈内フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、25mg/mの静脈内フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-1日目(すなわち、0~4日目)に25mg/mの静脈内フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-1日目(すなわち、0~4日目)に25mg/mの静脈内フルダラビンをさらに含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミド
を60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で1日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表27に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表28に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表29に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表30に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表31に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表32に従って投与
される。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表33に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表34に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄破壊的リンパ球枯渇レジメンの前述の実施形態で使用されるTIL注入は、本明細書に記載の任意のTIL組成物であり得、また本明細書に記載されるようなIL-2レジメンの追加及び併用療法(PD-1及び/またはPD-L1阻害剤など)の投与であり得る。
F.IL-2レジメン
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、高用量IL-2レジメンを含み、高用量IL-2レジメンは、治療的TIL集団の治療上有効な部分を投与した翌日から静脈内投与されるアルデスロイキンまたはそのバイオシミラーもしくはバリアントを含み、アルデスロイキンまたはそのバイオシミラーもしくはバリアントは、許容範囲まで8時間毎に最大14用量にわたって、0.037mg/kgまたは0.044mg/kg IU/kg(患者の体重)の用量で15分のボーラス静脈内注入を使用して投与される。9日間の休止後、このスケジュールは、さらに14用量、合計最大28用量にわたって繰り返され得る。いくつかの実施形態では、IL-2は、1、2、3、4、5、または6用量で投与される。いくつかの実施形態では、IL-2は、最大6用量の最大投与量で投与される。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、デクレッシェンドIL-2レジメンを含む。デクレッシェンドIL-2レジメンは、O′Day,et al.,J.Clin.Oncol.1999,17,2752-61、及びEton,et al.,Cancer 2000,88,1703-9(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。いくつかの実施形態では、デクレッシェンドIL-2レジメンは、6時間にわたって静脈内投与される18×10IU/mアルデスロイキン、またはそのバイオシミラーもしくはバリアント、続いて12時間にわたって静脈内投与される18×10IU/m、続いて24時間にわたって静脈内投与される18×10IU/m、続いて72時間かけて静脈内投与される4.5×10IU/mを含む。この治療サイクルは、28日毎に最大4サイクル繰り返され得る。いくつかの実施形態では、デクレッシェンドIL-2レジメンは、1日目の18,000,000IU/m、2日目の9,000,000IU/m、3日目及び4日目の4,500,000IU/mを含む。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、低用量IL-2レジメンを含む。Dominguez-Villar and Hafler,Nat.Immunology
2000,19,665-673、Hartemann,et al.,Lancet
Diabetes Endocrinol.2013,1,295-305、及びRosenzwaig,et al.,Ann.Rheum.Dis.2019,78,209-217(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている低用量IL-2レジメンを含む、当該技術分野で知られている任意の低用量IL-2レジメンを使用することができる。いくつかの実施形態では、低用量IL-2レジメンは、m当たり18×10IUのアルデスロイキン、またはそのバイオシミラーもしくはバリアントを24時間当たり5日間の連続的注入として、その後IL-2療法なしで2~6日間、その後任意選択でアルデスロイキンまたはそのバイオシミラーもしくはバリアントを静脈内にさらに5日間、24時間当たりm当たり18×10IUの連続的注入として、その後任意選択でIL-2療法なしで3週間投与することを含み、その後追加のサイクルが投与され得る。
いくつかの実施形態では、IL-2は、最大6用量の最大投与量で投与される。いくつかの実施形態では、高用量IL-2レジメンは、小児の使用に適合される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に600,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に500,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に400,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に500,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間
毎に300,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に200,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に100,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、0.10mg/日~50mg/日の用量で、1、2、4、6、7、14、または21日毎にペグ化IL-2を投与することを含む。いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、0.10mg/日~50mg/日の用量で、1、2、4、6、7、14、または21日毎に、ベンペガルデスロイキン、またはその断片、バリアント、もしくはバイオシミラーを投与することを含む。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、0.10mg/日~50mg/日の用量で、1、2、4、6、7、14、または21日毎に、THOR-707、またはその断片、バリアント、もしくはバイオシミラーを投与することを含む。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、TILの投与後に、ネムバロイキンアルファ、またはその断片、バリアント、もしくはバイオシミラーの投与を含む。ある特定の実施形態では、患者にネムバロイキンを1日、2日、4日、6日、7日、14日または21日毎に、0.10mg/日~50mg/日の用量で投与される。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、抗体骨格に移植されたIL-2断片の投与を含む。いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、IL-2低親和性受容体と結合する抗体-サイトカイン移植タンパク質の投与を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、相補性決定領域HCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、重鎖可変領域(V)と、LCDR1、LCDR2、LCDR3を含む軽鎖可変領域(V)と、VまたはVのCDRに移植されたIL-2分子またはその断片と、を含み、抗体サイトカイン移植タンパク質は、制御性T細胞よりもTエフェクター細胞を優先的に拡張させる。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、相補性決定領域HCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、重鎖可変領域(V)と、LCDR1、LCDR2、LCDR3を含む軽鎖可変領域(V)と、VまたはVのCDRに移植されたIL-2分子またはその断片と、を含み、IL-2分子は、ムテインであり、抗体サイトカイン移植タンパク質は、制御性T細胞よりもTエフェクター細胞を優先的に拡張させる。いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、0.10mg/日~50mg/日の用量で、1、2、4、6、7、14または21日毎に、配列番号29及び配列番号38からなる群から選択される重鎖と、配列番号37及び配列番号39からなる群から選択される軽鎖と、を含む抗体、またはその断片、バリアント、もしくはバイオシミラーを投与することを含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の抗体サイトカイン移植タンパク質は、アルデスロイキン(Proleukin(登録商標))または同等の分子などであるがこれらに限定されない野生型IL-2分子よりも長い血清半減期を有する。
いくつかの実施形態では、骨髄破壊的リンパ球枯渇レジメンの前述の実施形態で使用されるTIL注入は、本明細書に記載の任意のTIL組成物であり得、また、TIL注入の代わりにMIL及びPBLの注入、ならびに本明細書に記載のIL-2レジメンの追加及び併用療法(PD-1及び/またはPD-L1阻害剤及び/またはCTLA-4阻害剤など)の投与を含み得る。
本明細書に包含される実施形態は、これから以下の実施例を参照して説明される。これらの実施例は、例示のみを目的として提供されており、本明細書に包含される本開示は、決してこれらの実施例に限定されると解釈されるべきではなく、むしろ、本明細書で提供される教示の結果として明らかになるありとあらゆる変形を包含すると解釈されるべきである。
実施例1:REP前プロセス及びREPプロセス用の培地の調製
この実施例は、様々な固形腫瘍に由来する腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の培養を含むプロトコルで使用するための組織培養培地の調製のための手順を説明する。この培地を、本出願及び他の実施例に記載のTILのうちのいずれかの調製に使用することができる。
CM1の調製。以下の試薬を冷蔵から取り出し、それらを37℃の水浴中で温めた(RPMI1640、ヒトAB血清、200mM L-グルタミン)。ろ過される容量に適した0.2μmフィルターユニットの上部に各成分を添加することによって、以下の表35に従ってCM1培地を調製した。4℃で保存する。
使用日に、37℃の水浴中で必要量のCM1を事前に温め、6000IU/mLのIL-2を追加した。
表36に従って必要に応じて追加の補充を行った。
CM2の調製
調製したCM1を冷蔵庫から取り出すか、または新鮮なCM1を調製した。AIM-V(登録商標)を冷蔵庫から取り出し、調製したCM1を滅菌培地ボトル内で同等体積のAIM-V(登録商標)と混合することによって、必要な量のCM2を調製した。使用日に3000IU/mLのIL-2をCM2培地に追加した。使用日に3000IU/mLのIL-2を含む十分な量のCM2を作製した。CM2培地ボトルにその名前、調製者のイニシャル、濾過/調製日、2週間の有効期限をラベル付けし、組織培養に必要になるまで4℃で保存した。
CM3の調製
使用が必要になった日にCM3を調製した。CM3は、AIM-V(登録商標)培地と同じであり、使用日に3000IU/mLのIL-2を補充した。IL-2ストック溶液をAIM-Vのボトルまたはバッグに直接追加することによって、実験のニーズに十分な量のCM3を調製した。穏やかに振盪することによって十分に混合した。ボトルに、AIM-Vに追加した直後に「3000IU/mL IL-2」とラベル付けする。過剰なCM3が存在する場合は、培地名、調製者のイニシャル、培地を調製した日、及びその有効期限(調製後7日)でラベル付けしたボトル内で4℃で保管した。4℃で7日間保管した後、IL-2を補充した培地を廃棄した。
CM4の調製
CM4は、CM3と同じであり、2mM GlutaMAX(商標)(最終濃度)を追加で補充した。1LのCM3毎に、10mLの200mM GlutaMAX(商標)を添加する。IL-2ストック溶液及びGlutaMAX(商標)ストック溶液をAIM-Vのボトルまたはバッグに直接追加することによって、実験のニーズに十分な量のCM4を調製する。穏やかに振盪することによって十分に混合した。ボトルに、AIM-Vに追加した直後に「3000IL/mL IL-2及びGlutaMAX」とラベル付けした。過剰なCM4が存在する場合、培地名、「GlutaMAX」、及びその有効期限(調製後7日)でラベル付けしたボトル内で4℃で保管した。4℃で7日間保管した後、IL-2を補充した培地を廃棄した。
実施例2:IL-2、IL-15、及びIL-21サイトカインカクテルの使用
この実施例は、本明細書の実施例のうちのいずれかのTILプロセスと組み合わせた、追加のT細胞成長因子として機能するIL-2、IL-15、及びIL-21サイトカインの使用を説明する。
本明細書に記載のプロセスを使用して、TILは、培養の開始時に、実験の一方のアームにおいてIL-2の存在下で腫瘍から、及びもう一方のアームではIL-2の代わりにIL-2、IL-15、及びIL-21の組み合わせから成長させることができる。REP前の完了時に、培養物を、拡張、表現型、機能(CD107a+及びIFN-γ)、及びにTCR Vβレパートリーについて評価した。IL-15及びIL-21は、本明細書の他の場所及びSantegoets,et al.,J.Transl.Med.,2013,11,37に記載されている。
結果は、IL-2、IL-15、及びIL-21処理条件でのCD4及びCD8細胞の両方で、IL-2のみの条件と比較して増強したTIL拡張(>20%)が観察できることを示し得る。IL-2単独培養物と比較して、IL-2、IL-15、及びIL-21で処理した培養物から取得されたTILには、歪んだTCR Vβレパートリーを伴う主にCD8集団への歪みがあった。IFN-γ及びCD107aは、IL-2単独で
処理したTILと比較して、IL-2、IL-15、及びIL-21で処理したTILで上昇した。
実施例3:ガンマ線照射末梢単核細胞の個々のロットを適格性確認する
この実施例は、本明細書に記載の例示的な方法において同種異系フィーダー細胞として使用するためのガンマ線照射末梢単核細胞(PBMC、単核細胞またはMNCとしても知られる)の個々のロットを適格性確認するための簡略化された手順を説明する。
放射線照射された各MNCフィーダーロットは、個々のドナーから調製した。各ロットまたはドナーは、精製された抗CD3(クローンOKT3)抗体及びインターロイキン-2(IL-2)の存在下でREP内のTILを拡張する能力について個々にスクリーニングした。さらに、フィーダー細胞の各ロットを、TILを添加せずに試験し、受けたガンマ線の線量がそれらを複製不全にするのに十分であることを確認した。
TILのREPには、ガンマ線を照射し、成長を停止させたMNCフィーダー細胞が必要である。フィーダーMNCの膜受容体は、抗CD3(クローンOKT3)抗体に結合し、REPフラスコ内のTILに架橋し、TILを刺激して拡張させる。フィーダーロットは、個々のドナーから採取した全血の白血球アフェレーシスから調製した。白血球アフェレーシス産物を、Ficoll-Hypaque上で遠心分離し、洗浄し、照射し、GMP条件下で凍結保存した。
TIL療法を受けた患者には、移植片対宿主病(GVHD)を引き起こす可能性があるため、生存可能なフィーダー細胞を注入しないことが重要である。したがって、フィーダー細胞は、細胞にガンマ線を照射することによって成長を停止させ、再培養時に二本鎖DNA切断が起こり、MNC細胞の細胞生存性が喪失する。
フィーダーロットを、2つの基準:1)共培養でTILを100倍超拡張する能力、及び2)複製不全で評価した。
フィーダーロットを、直立したT25組織培養フラスコ内で培養された2つの主要なREP前 TIL株を利用して、mini-REP形式で試験した。各TIL株は、REPでの活性化に応答して増殖する能力が独特であるため、フィーダーロットを、2つの異なるTIL株に対して試験した。対照として、上記の基準を満たすことが歴史的に示されている多くの放射線照射されたMNCフィーダー細胞を、試験ロットと並行して実行した。
1回の実験で試験されたすべてのロットが同等の試験を受けることを保証するために、すべての条件及びすべてのフィーダーロットを試験するために、同じREP前TIL株の十分なストックが利用可能であった。
試験したフィーダー細胞の各ロットに、合計6つのT25フラスコがあった:REP前TIL株番号1(2フラスコ)、REP前TIL株番号2(2フラスコ)、及びフィーダー対照(2フラスコ)。TIL株番号1及び番号2を含むフラスコは、フィーダーロットがTILを拡張する能力を評価した。フィーダー対照フラスコは、フィーダーロットの複製不全を評価した。
A.実験プロトコル
-2/3日目、TIL株の解凍CM2培地を調製し、CM2を37℃の水浴中で温める。3000IU/mLのIL-2を補充した40mLのCM2を調製する。使用まで保温する。IL-2を含まない20mLの予熱したCM2を、使用したTIL株の名前がラベル付けされた2本の50mLコニカルチューブの各々に入れる。LN2ストレージから2
つの指定されたREP前TIL株を取り出し、バイアルを組織培養室に移した。少量の氷が残るまで、37℃の水浴内の密封されたジッパーストレージバッグ内にバイアルを入れて解凍した。
無菌トランスファーピペットを使用して、各バイアルの内容物を、調製した、ラベル付けされた50mLのコニカルチューブ中の20mLのCM2に直ちに移した。細胞を洗浄し、400×CFで5分間遠心分離するために、IL-2なしのCM2を使用して40mLにQS。上清を吸引し、3000IU/mLのIL-2で補充された5mLの温かいCM2に再懸濁した。
自動セルカウンターを使用して細胞を計数するために、少量のアリコート(20μL)を重複して取り出した。計数を記録した。カウントしながら、TIL細胞を含む50mLのコニカルチューブを、加湿した37℃、5% COインキュベーターに入れ、ガス交換を可能にするためにキャップを緩めた。細胞濃度を決定し、TILを、3000IU/mLのIL-2を補充したCM2中で1×10細胞/mLに希釈した。
mini-REPの0日目まで、加湿した37℃のインキュベーターで必要な数のウェルにおいて、24ウェル組織培養プレートの1ウェル当たり2mLで培養した。混乱及び潜在的な相互汚染を避けるために、別々の24ウェル組織培養プレートで異なるTIL株を培養した。
0日目、Mini-REPを開始する試験されるフィーダーロットの数に十分なCM2培地を調製した。(例えば、一度に4つのフィーダーロットを試験するために、800mLのCM2培地を調製した)。上記で調製したCM2の一部を分注し、それを細胞の培養のために3000IU/mLのIL-2で補充した。(例えば、一度に4つのフィーダーロットを試験するために、3000IU/mLのIL-2を含む500mLのCM2培地を調製する)。
相互汚染を防ぐために各TIL株を別々に操作し、TIL培養物を入れた24ウェルプレートをインキュベーターから取り出し、BSCに移した。
無菌トランスファーピペットまたは100~1000μLピペッター及びチップを使用して、約1mLの培地を、使用されるTILの各ウェルから取り出し、24ウェル組織培養プレートの未使用のウェルに入れる。
新鮮な無菌トランスファーピペットまたは100~1000μLピペッター及びチップを使用して、残りの培地をウェル内のTILと混合して細胞を再懸濁し、次いで細胞懸濁液を、TILロット名のラベルが付いた50mLコニカルチューブに移し、容量を記録した。
予備の培地でウェルを洗浄し、その容量を同じ50mLコニカルチューブに移した。細胞を400×CFで回転させて、細胞ペレットを収集する。培地上清を吸引除去し、3000IU/mLのIL-2を含有する2~5mLのCM2培地に細胞ペレットを再懸濁し(採取したウェルの数及びペレットのサイズに基づいて使用される容量)、容量は、1.3×10細胞/mLを超える濃度を保証するのに十分である必要がある。
血清学的ピペットを使用して、細胞懸濁液を十分に混合し、容量を記録した。自動セルカウンターを使用して細胞を計数するために、200μLを取り出した。カウントしながら、TIL細胞を含む50mLのコニカルチューブを、加湿した5% CO、37℃インキュベーターに入れ、ガス交換を可能にするためにキャップを緩めた。計数を記録した
TIL細胞を含有する50mLのコニカルチューブをインキュベーターから取り出し、3000IU/mLのIL-2で補充された温かいCM2中、1.3×10細胞/mLの濃度でそれらの細胞を再懸濁した。キャップを緩めた状態で、50mLのコニカルチューブをインキュベーターに戻した。
第2のTIL株について、上記のステップを繰り返した。
TILを実験用のT25フラスコに入れる直前に、TILを、以下の通り1:10に希釈して1.3×10細胞/mLの最終濃度にした。
MACS GMP CD3ピュア(OKT3)作用溶液を調製するOKT3のストック溶液(1mg/mL)を4℃の冷蔵庫から取り出し、BSCに入れた。mini-REPの培地では、最終濃度30ng/mLのOKT3を使用した。
実験の各T25フラスコ内の20mLに対して600ngのOKT3が必要であり、これは、20mL毎に60μLの10μg/mL溶液、または各フィーダーロットについて試験した6つのフラスコすべてで360μLに相当する。
試験した各フィーダーロットについて、400μLの1:100希釈の1mg/mL OKT3を、10μg/mLの作業濃度で作製した(例えば、4つのフィーダーロットを一度に試験する場合、1600μLの1:100希釈の1mg/mL OKT3:16μLの1mg/mL OKT3+3000IU/mLのIL-2を含む1.584mLのCM2培地を作製する)。
T25フラスコを調製するフィーダー細胞を調製する前に、各フラスコにラベルを付け、フラスコにCM2培地を充填した。フラスコを37℃の加湿した5% COインキュベーターに入れ、残りの成分を添加するのを待つ間、培地を保温した。一旦フィーダー細胞が調製されると、各フラスコ内のCM2に成分が添加される。
さらなる情報を表37に提供する。
フィーダー細胞を調製する。このプロトコルについて試験されたロット当たり78×10フィーダー細胞の最小値が必要であった。SDBBによって凍結された各1mLバイアルは、凍結時に100×10個の生細胞を有していた。液体Nストレージからの解凍時の50%の回収率を仮定すると、ロット当たり少なくとも2つの1mLバイアルのフィーダー細胞を解凍して、各REPに推定100×10個の生細胞を与えることが推奨された。あるいは、1.8mLバイアルで供給された場合、1つのバイアルだけで十分なフィーダー細胞が提供された。
フィーダー細胞を解凍する前に、試験される各フィーダーロットにIL-2を含まないおよそ50mLのCM2を予熱した。指定されたフィーダーロットバイアルをLN2ストレージから取り出し、ジッパーストレージバッグに入れ、氷上に置いた。37℃の水浴に浸すことによって、閉じたジッパーストレージバッグ内のバイアルを解凍した。バイアルをジッパーバッグから取り出し、70% EtOHでスプレーまたはワイプし、BSCに移した。
トランスファーピペットを使用して、フィーダーバイアルの内容物を、50mLのコニカルチューブ中の30mLの温かいCM2に直ちに移した。バイアルを少量のCM2で洗浄して、バイアル内の残留細胞を除去し、400×CFで5分間遠心分離した。上清を吸引し、3000IU/mLのIL-2を加えた4mLの温かいCM2に再懸濁した。自動セルカウンターを使用して細胞を計数するために、200μLを取り出した。計数を記録した。
3000IU/mLのIL-2を加えた温かいCM2中、1.3×10細胞/mLで細胞を再懸濁した。TIL細胞を1.3×10細胞/mLから1.3×10細胞/mLに希釈した。
共培養物を準備する。TIL細胞を1.3×10細胞/mLから1.3×10細胞/mLに希釈した。4.5mLのCM2培地を15mLのコニカルチューブに追加した。インキュベーターからTIL細胞を取り出し、10mLの血清ピペットを使用して十分に再懸濁した。1.3×10細胞/mLのTIL懸濁液から0.5mLの細胞を取り出し、15mLのコニカルチューブ中の4.5mLの培地に添加した。TILストックバイアルをインキュベーターに戻した。よく混ぜた。第2のTIL株に対して繰り返した。
単一フィーダーロット用に予熱した培地を入れたフラスコを、インキュベーターからBSCに移した。1mLのピペットチップで数回上下にピペッティングすることによってフィーダー細胞を混合し、そのフィーダーロットの各フラスコに1mL(1.3×10細胞)を移した。60μLのOKT3作業ストック(10μg/mL)を各フラスコに追加した。2つの対照フラスコをインキュベーターに戻した。
各TILロットの1mL(1.3×10)を、対応するラベルの付いたT25フラスコに移した。フラスコをインキュベーターに戻し、直立させてインキュベートした。5日目まで乱さなかった。試験したすべてのフィーダーロットについて、この手順を繰り返した。
5日目、培地変更3000IU/mLのIL-2を含むCM2を調製した。各フラスコに10mLが必要である。10mLピペットを使用して、3000IU/mLのIL-2を含む10mLの温かいCM2を各フラスコに移した。フラスコをインキュベーターに戻し、7日目まで直立させてインキュベートした。試験したすべてのフィーダーロットにつ
いて繰り返した。
7日目、採取インキュベーターからフラスコを取り出し、BSCに移し、フラスコの底部の細胞層を乱さないように注意する。フラスコの底部で成長する細胞を乱すことなく、各試験フラスコから10mLの培地を取り出し、対照フラスコの各々から15mLの培地を取り出した。
10mLの血清ピペットを使用して、残りの培地に細胞を再懸濁し、よく混合して細胞の塊をすべて破壊した。ピペッティングすることによって細胞懸濁液を完全に混合した後、細胞計数のために200μLを取り出した。自動セルカウンター装置とともに適切な標準操作手順を使用して、TILを計数した。7日目に計数を記録した。試験したすべてのフィーダーロットについて、この手順を繰り返した。
フィーダー対照フラスコは、複製不全について評価し、TILを含むフラスコは、0日目からの倍率拡張について評価した。
7日目、フィーダー対照フラスコの14日目までの継続フィーダー対照フラスコの7日目の計数を完了した後、3000IU/mLのIL-2を含む15mLの新鮮なCM2培地を対照フラスコの各々に追加した。対照フラスコをインキュベーターに戻し、14日目まで直立位置でインキュベートした。
14日目、フィーダー対照フラスコの長期非増殖インキュベーターからフラスコを取り出し、BSCに移し、フラスコの底部の細胞層を乱さないように注意した。フラスコの底部で成長する細胞を乱すことなく、各対照フラスコからおよそ17mLの培地を取り出した。5mLの血清ピペットを使用して、残りの培地に細胞を再懸濁し、よく混合して細胞の塊をすべて破壊した。各フラスコについて、容量を記録した。
ピペッティングすることによって細胞懸濁液を完全に混合した後、細胞計数のために200μLを取り出した。TILは、自動セルカウンター装置と併せて適切な標準操作手順を使用して計数し、計数を記録した。試験したすべてのフィーダーロットについて、この手順を繰り返した。
B.結果及び承認基準プロトコル
結果ガンマ線照射の線量は、フィーダー細胞を複製不全にするのに十分であった。すべてのロットは、評価基準を満たすことが予想され、また0日目と比較して、REP培養の7日目に残っているフィーダー細胞の総有効数の低減を示した。すべてのフィーダーロットは、REP培養の7日目までのTIL成長の100倍拡張の評価基準を満たすことが予想された。フィーダー対照フラスコの14日目の計数は、7日目に見られた非増殖傾向を継続すると予想された。
承認基準フィーダー細胞の各ロットについて試験された各複製TIL株について、以下の承認基準が満たされた。承認基準は、以下の表38に示すように、2倍であった。
30ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養した場合に、MNCフィーダー細胞の複製を不全にするのに十分な放射線量を評価した。複製不全は、REPの7日目及び14日目の自動細胞計数によって決定された総生細胞数(TVC)によって評価した。
承認基準は、「成長なし」であり、これは、REPの0日目に培養された最初の生細胞数から7日目及び14日目に総生細胞数が増加していないことを意味する。
フィーダー細胞がTIL拡張をサポートする能力を評価した。TIL成長は、REPの0日目の培養開始からREPの7日目までの生細胞の倍率拡張の観点から測定された。自動細胞計数によって評価されるように、7日目に、TIL培養物は最低100倍の拡張を達成した(すなわち、REPの0日目に培養された生TIL細胞の総数の100倍超)。
承認基準を満たさないMNCフィーダーロットの偶発性試験MNCフィーダーロットが上で概説された承認基準のうちのいずれかを満たさなかった場合は、以下のステップを実行してロットを再試験し、単純な実験者エラーを原因として除外する。
ロットの衛星試験バイアルが2つ以上残っている場合は、ロットを再試験した。ロットの衛星試験バイアルが1つ残っているか、まったく残っていない場合、上記の承認基準に従ってロットは失敗であった。
適格となるには、問題のロット及び対照ロットが、上記の承認基準を達成する必要があった。これらの基準を満たすと、ロットは使用のために放出される。
実施例4:IL-2ストック溶液の調製
この実施例は、精製されて凍結乾燥された組換えヒトインターロイキン-2を、rhIL-2の使用を含むものを含む、本出願及び実施例に記載されるものすべてを含む、さらなる組織培養プロトコルでの使用に好適なストック試料に溶解するプロセスを説明する。
手順。0.2%酢酸溶液(HAc)を調製した。29mLの滅菌水を、50mLのコニカルチューブに移した。1mLの1N酢酸を、50mLのコニカルチューブに追加した。チューブを2~3回反転させながら十分に混合した。Steriflipフィルターを使用した濾過によってHAc溶液を滅菌した。
PBS中の1% HSAを調製する。4mLの25% HSAストック溶液を、150mLの滅菌フィルターユニット内の96mLのPBSに追加した。溶液を濾過した。4℃で保管した。調製したrhIL-2の各バイアルについて、フォームに記入する。
rhIL-2ストック溶液を調製した(最終濃度6×10IU/mL)。rhIL-2の各ロットは異なり、必要な情報は、以下のような製造業者の分析証明書(COA)に見出された:1)バイアル当たりのrhIL-2の質量(mg)、2)rhIL-2の比活性(IU/mg)、及び3)推奨0.2% HAc再構成体積(mL)。
以下の等式を使用して、rhIL-2ロットに必要な1%HSAの体積を計算した。

例えば、rhIL-2ロット10200121(Cellgenix)のCOAによると、1mgバイアルの比活性は、25×10IU/mgである。rhIL-2を2mLの0.2%HAc中で再構成することが推奨される。
IL-2バイアルのゴム栓をアルコールワイプで拭いた。3mLシリンジに取り付けた16G針を使用して、推奨体積の0.2% HAcをバイアルに注入した。針を抜くときに栓が外れないように注意した。バイアルを3回反転させ、すべての粉末が溶解するまで回転させた。栓を慎重に取り外し、アルコールワイプ上に置いた。計算された容量の1%
HSAをバイアルに添加した。
rhIL-2溶液の保管。短期保管(72時間未満)の場合、4℃でバイアルを保管した。長期保管(72時間超)の場合、バイアルをより小さい体積に等分し、使用の準備が整うまで-20℃でクライオバイアル内で保管した。凍結/解凍サイクルを回避した。調製日から6ヶ月後に有効期限が切れた。Rh-IL-2ラベルに、ベンダー及びカタログ番号、ロット番号、有効期限、オペレーターのイニシャル、濃度、ならびにアリコート体積を含めた。
実施例5:凍結保存プロセス
この実施例では、CryoMed制御速度冷凍庫、モデル7454(Thermo Scientific)を使用して、本明細書に記載の手順で調製したTILの凍結保存プロセス方法について説明する。
使用した機器は以下の通りであった:アルミニウムカセットホルダーラック(CS750フリーザーバッグに対応)、750mLバッグ用凍結保存カセット、低圧(22psi
)液体窒素タンク、冷蔵庫、熱電対センサー(バッグ用リボンタイプ)、及びCryoStore CS750冷凍バッグ(OriGen Scientific)。
凍結プロセスは、核形成から-20℃まで0.5℃の速度、及び-80℃の終了温度まで毎分1℃の冷却速度を提供する。プログラムパラメータは、以下の通りである:ステップ1-4℃で待つ、ステップ2:-4℃まで1.0℃/分(試料温度)、ステップ3:-45℃まで20.0℃/分(チャンバ温度)、ステップ4:-10.0℃まで10.0℃/分(チャンバ温度)、ステップ5:-20℃まで0.5℃/分(チャンバ温度)、及びステップ6:-80℃まで1.0℃/分(試料温度)。
実施例6:合成培地を用いた腫瘍拡張プロセス
上記で開示されるプロセスは、CM1培地及びCM2培地を、合成培地(例えば、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion SFM、ThermoFisher、例えば、DM1及びDM2を含む)で置き換えることによって行われ得る。
実施例7:凍結保存TIL細胞療法の例示的GEN2産生
この実施例は、Iovance Biotherapeutics,Inc.のcGMP製造を説明する。現在の適正組織基準及び現在の適正製造基準に従った、G-REXフラスコ内のTIL細胞療法プロセス。この実施例は、現在の適正組織基準及び現在の適正製造基準に従った、G-REXフラスコ内のTIL細胞療法プロセスの例示的なcGMP製造を説明する。
0日目のCM1培地の調製BSC内で、試薬をRPMI1640培地ボトルに追加した。ボトル当たり追加された以下の試薬を追加した:不活化ヒトAB血清(100.0mL)、GlutaMax(商標)(10.0mL)、硫酸ゲンタマイシン、50mg/mL(1.0mL)、2-メルカプトエタノール(1.0mL)を加熱する
BSCから不要な材料を取り出した。BSCから培地試薬を抜き取り、配合された洗浄培地の調製のために硫酸ゲンタマイシン及びHBSSをBSCの中に残した。
IL-2アリコートを解凍した。すべての氷が融解するまで、1つの1.1mLのIL-2アリコート(6×10IU/mL)(BR71424)を解凍した。IL-2:ロット番号及び有効期限を記録した。
IL-2ストック溶液を培地に移した。BSC内で、1.0mLのIL-2ストック溶液を、調製されたCM1の0日目培地ボトルに移した。CM1の0日目培地1ボトル及びIL-2(6×106IU/mL)1.0mLを追加した。
G-REX100MCSをBSCの中に通過させた。無菌的にG-REX100MCS(W3013130)をBSCの中に通過させた。
すべての完全なCM1の0日目培地をG-REX100MCSフラスコにポンプで注入した。組織断片円錐形またはGRex100MCS。
0日目の腫瘍洗浄培地の調製BSC内で、5.0mLのゲンタマイシン(W3009832またはW3012735)を1本の500mLのHBSS培地(W3013128)ボトルに追加した。ボトル当たりの追加:HBSS(500.0mL)、硫酸ゲンタマイシン、50mg/mL(5.0mL)。1Lの0.22ミクロンフィルターユニット(W1218810)をとおして調製されたゲンタマイシンを含有するHBSSを濾過した。
0日目の腫瘍処理腫瘍検体を取得し、即時に処理のために2~8℃における部屋に移した。腫瘍洗浄培地を等分した。腫瘍洗浄1は、8インチ鉗子(W3009771)を使用して行う。腫瘍を検体ボトルから取り出し、調製した「洗浄1」皿に移す。この後、腫瘍洗浄2及び腫瘍洗浄3が続く。腫瘍を測定し、評価した。腫瘍領域全体の30%未満が壊死及び/または脂肪性組織であることが観察されたかどうかを評価した。該当する場合、クリーンアップ解剖を行う。腫瘍が大きく、外部の組織の30%未満が壊死/脂肪性であることが観察された場合、メス及び/または鉗子の組み合わせを使用して、腫瘍の内側構造を温存しながら壊死/脂肪性組織を除去することによって、「クリーンアップ解剖」を行った。腫瘍を切除した。メス及び/または鉗子の組み合わせを使用して、腫瘍検体を均等で適切なサイズの断片(最大6つの中間断片)に切断した。中間腫瘍断片を移した。腫
瘍断片を、およそ3×3×3mmのサイズの小片に切除した。乾燥を防止するために中間断片を保存した。中間断片の解剖を繰り返した。収集された切片の数を決定した。望ましい組織が残っている場合、「好ましい中間断片」6ウェルプレートから追加の好ましい腫瘍片を選択し、最大50片のために液滴を充填した。
コニカルチューブを準備した。腫瘍片を50mLのコニカルチューブに移した。G-REX100MCSのためのBSCを準備した。インキュベーターからG-REX100MCSを取り出した。無菌的にG-REX100MCSフラスコをBSCの中に通過させた。腫瘍断片をG-REX100MCSフラスコに追加した。切片を均等に分配した。
以下のパラメータにおいてG-REX100MCSをインキュベートした:G-REXフラスコをインキュベートした:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5 %CO。計算:培養の時間、下限=培養の時間+252時間、上限=培養の時間+276時間。
プロセスが完了した後、いずれの残りの温められた培地も廃棄し、IL-2のアリコートを解凍した。
11日目-培地の調製インキュベーターを監視した。インキュベーターパラメータ:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、CO2パーセンテージ:5.0±1.5%
CO2
3本の1000mLのRPMI 1640培地(W3013112)ボトル及び3本の1000mLのAIM-V(W3009501)ボトルを、インキュベーター内で30分間以上温めた。インキュベーターからRPMI1640培地を取り出した。RPMI1640培地を調製した。培地を濾過した。3つのIL-2の1.1mLのアリコート(6×106IU/mL)(BR71424)を解凍した。インキュベーターからAIM-V培地を取り出した。IL-2をAIM-Vに追加した。10LのLabtainerバッグ及びリピータポンプ移送セットを、BSCの中に無菌的に移した。
10LのLabtainer培地バッグを準備した。Baxaポンプを準備した。10LのLabtainer培地バッグを準備した。培地を10LのLabtainerにポンプで注入した。Labtainerバッグからポンプマティックを取り出した。
培地を混合した。バッグを穏やかにマッサージして混合した。試料計画に従って培地を試料採取した。20.0mLの培地を取り出し、50mLのコニカルチューブに入れた。細胞計数希釈管を準備した。BSCに、「細胞計数希釈液用」及びロット番号でラベル付けされた4.5mLのAIM-V培地を、4本の15mLコニカルチューブに追加した。試薬をBSCから2~8℃に移した。1L移送パックを準備した。(プロセス注記5.11に従って)BSC溶接の外側で、「完全なCM2の11日目培地」バッグに取り付けられた移送セットへの1L移送パックを準備した。フィーダー細胞移送パックを準備した。完全なCM2の11日目培地をインキュベートした。
11日目-TIL採取前処理表。インキュベーターパラメータ:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5% CO.インキュベーターからG-REX100MCSを取り出した。300mL移送パックを準備した。移送パックをG-REX100MCSに溶接した。
TIL採取及びTIL採取の開始のためにフラスコを準備する。TILが採取された。GatheRexを使用して、血液フィルターを介して細胞懸濁液を300mLの移送パ
ックに移した。付着した細胞について膜を点検した。
フラスコ膜をすすいだ。G-REX100MCS上のクランプを閉じた。すべてのクランプが閉じられていることを確実にした。TIL及び「上清」移送パックを熱融着した。TIL懸濁液の体積を計算した。試料採取のために上清移送パックを準備した。
Bac-T試料を引き出した。BSC内で、1L「上清」移送パックからおよそ20.0mLの上清を引き上げ、無菌50mLコニカルチューブに分注する。
試料計画に従ってBacTを接種した。適切なサイズのシリンジを使用して調製されたBacTとラベル付けされた50mLコニカルから1.0mLの試料を取り出し、嫌気性ボトルに接種した。
TILをインキュベートした。必要とされるまで、TIL移送パックをインキュベーターに入れた。細胞計数及び計算を行った。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。生存率÷2。生細胞濃度÷2。計数の上限及び下限を決定した。下限:生細胞濃度の平均×0.9。上限:生細胞濃度の平均×1.1。許容限界内の両方の計数を確認した。行われた4つすべての計数から平均生細胞濃度を決定した。
TIL懸濁液の調整された体積:細胞計数試料を取り出した後のTIL懸濁液の調整された体積を計算する。総TIL細胞体積(A)。取り出された細胞計数試料の体積(4.0mL)(B)調整された総TIL細胞体積C=A-B。
総生TIL細胞を計算した。平均生細胞濃度*:総体積、総生細胞:C=AxB.
フローサイトメトリーのための計算:総生TIL細胞数が、4.0×10個以上であった場合、フローサイトメトリー試料のために1.0×10個の細胞を取得するための体積を計算した。
フローサイトメトリーに必要とされる総生細胞:1.0×10個の細胞。フローサイトメトリーに必要とされる細胞の体積:生細胞濃度を1.0×10個の細胞Aで割ったもの。
2.0×10個の生細胞に等しいTIL懸濁液の体積を計算した。必要に応じて、取り出すTIL細胞の過剰体積を計算し、過剰なTILを取り出し、必要に応じてTILをインキュベーターに入れた。必要に応じて、取り出された全過剰TILを計算した。
凍結のための標的細胞濃度が1.0×10細胞/mLである過剰なTIL細胞に追加するCS-10培地の量を計算した。必要に応じて、過剰なTILを遠心分離した。コニカルチューブを観察し、CS-10を追加した。
バイアルを充填した。1.0mLの細胞懸濁液を、適切なサイズの凍結バイアルに等分した。残留体積を適切なサイズのクライオバイアルに等分した。体積が≦0.5mLである場合、体積が0.5mLになるまでCS10をバイアルに追加する。
凍結保存のための1×10個の細胞を取得するために必要とされる細胞の体積を計算した。凍結保存のために試料を取り出した。TILをインキュベーターに入れた。
試料の凍結保存コニカルチューブを観察し、CS-10をゆっくりと追加し、追加された0.5mLのCS10の体積を記録した。
11日目-フィーダー細胞フィーダー細胞を取得した。LN2冷凍庫から少なくとも2つの異なるロット番号を伴うフィーダー細胞の3つのバッグを取得した。解凍する準備が整うまで、細胞をドライアイス上で保管した。水浴またはcryothermを準備した。37.0±2.0℃の水浴またはcytothermにおいて約3~5分間、または氷が消滅するまで、フィーダー細胞を解凍した。インキュベーターから培地を取り出した。解凍されたフィーダー細胞をプールした。フィーダー細胞を移送パックに追加した。シリンジから移送パックにフィーダー細胞を分注した。プールされたフィーダー細胞を混合し、移送パックをラベル付けした。
移送パック内のフィーダー細胞懸濁液の総体積を計算した。細胞計数試料を取り出した。各試料に別個の3mLシリンジを使用して、不要注入ポートを使用してフィーダー細胞懸濁液移送パックから4×1.0mLの細胞計数試料を引き出した。各試料をラベル付けされたクライオバイアルに等分した。細胞計数を行い、増倍率を決定し、プロトコルを選択し、増倍率を入力した。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定し、限界内で確認した。
フィーダー細胞懸濁液の調整された体積。細胞計数試料を取り出した後のフィーダー細胞懸濁液の調整された体積を計算した。総生フィーダー細胞を計算した。必要に応じて追加のフィーダー細胞を取得した。必要に応じて追加のフィーダー細胞を解凍した。第4のフィーダー細胞バッグをジップトップバッグに入れ、37.0±2.0℃の水浴またはcytotherm内で約3~5分間解凍し、追加のフィーダー細胞をプールした。体積を測定した。シリンジ内のフィーダー細胞の体積を測定し、以下に記録した(B)。フィーダー細胞の新しい総体積を計算した。フィーダー細胞を移送パックに追加した。
必要に応じて希釈液を調製し、4.5mLのAIM-V培地を4本の15mLコニカルチューブに追加した。細胞計数を準備した。各試料に対して別個の3mLシリンジを使用して、不要注入ポートを使用して、フィーダー細胞懸濁液移送パックから4×1.0mLの細胞計数試料を取り出した。細胞計数及び計算を行った。行われた4つすべての計数から平均生細胞濃度を決定した。フィーダー細胞懸濁液の体積を調整し、細胞計数試料を取り出した後のフィーダー細胞懸濁液の調整された体積を計算した。4.0mLを差し引いた総フィーダー細胞体積が取り出された。5×10個の生フィーダー細胞を取得するために必要とされたフィーダー細胞懸濁液の体積を計算した。過剰なフィーダー細胞体積を計算した。取り出す過剰なフィーダー細胞の体積を計算した。過剰なフィーダー細胞を取り出した。
1.0mLシリンジ及び16G針を使用して、0.15mLのOKT3を引き上げ、OKT3を追加した。フィーダー細胞懸濁液移送パックを熱融着した。
11日目 G-REX充填及びシード設定G-REX500MCS。「完全なCM2の11日目培地」をインキュベーターから取り出し、培地をG-REX500MCSにポンプで注入した。4.5Lの培地をG-REX500MCSにポンプで注入し、フラスコ上にマークされたラインまで充填した。必要に応じてフラスコを熱融着し、インキュベートした。フィーダー細胞の懸濁液移送パックを、G-REX500MCSに溶接した。フィーダー細胞をG-REX500MCSに追加した。熱融着した。TIL懸濁液移送パックをフラスコに溶接した。TILをG-REX500MCSに追加した。熱融着した。G-REX500MCSを37.0±2.0℃でインキュベートした。CO2パーセンテージ:5.0±1.5% CO2
インキュベーション時間帯を計算した。16日目にインキュベーターからG-REX5
00MCSを取り出すための適切な時間を決定するための計算を行った。下限:インキュベーションの時間108時間。上限:インキュベーションの時間132時間。
11日目 過剰TIL凍結保存。該当:過剰TILバイアルを凍結させた。凍結前にCRFが設定されていることを検証した。凍結保存を行った。バイアルを速度制御された冷凍庫から適切な保管場所に移した。凍結の完了時に、バイアルをCRFから適切な保管容器に移した。バイアルを適切な保管場所に移した。LN2における保管場所を記録した。
16日目 培地の調製AIM-V培地を事前に温めた。培地バッグ1、2、及び3について培地が温められた時間を計算した。すべてのバッグが12~24時間の持続時間にわたって温められていることを確実にした。上清用の10LのLabtainerを設定した。ルアーコネクタを使用して、流体ポンプ移送セットのより大きな直径の端部を10LのLabtainerバッグのメス型ポートのうちの1つに取り付けた。上清用の10LのLabtainerを設定し、ラベル付けした。上清用の10LのLabtainerを設定した。BSCから取り出す前に、すべてのクランプが閉じられていることを確実にした。注記:上清バッグは、培地調製と同時に行われ得るTIL採取中に使用された。
IL-2を解凍した。すべての氷が融解するまで、CTS AIM V培地の1バッグ当たりIL-2(6×10IU/mL)(BR71424)の5×1.1mLアリコートを解凍した。100.0mLのGlutaMax(商標)を等分した。IL-2をGlutaMax(商標)に追加した。配合用のCTS AIM V培地バッグを準備した。配合用のCTS AIM V培地バッグを準備した。ステージBaxaポンプ。培地を配合することを準備した。GlutaMax(商標)+IL-2をバッグにポンプで注入した。パラメータを監視した:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5% CO.完全なCM4の16日目培地を温めた。希釈液を調製した。
16日目 REP分割。インキュベーターパラメータを監視した:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5 %CO。インキュベーターからG-REX500MCSを取り出した。1Lの移送パックを準備し、TIL懸濁液としてラベル付けし、1Lの重量を量った。
G-REX500MCSの減容。約4.5Lの培養上清をG-REX500MCSから10LのLabtainerに移した。
TIL採取用のフラスコを準備した。上清を取り出した後に、赤色ラインへのすべてのクランプを閉じた。
TIL採取の開始。フラスコを激しく叩き、培地を旋回させて細胞を解放し、すべての細胞が引き離されていることを確実にする。
TIL採取。TIL懸濁液移送パックにつながるすべてのクランプを解放した。GatheRexを使用して、細胞懸濁液をTIL懸濁液移送パックの中に移した。注記:すべての細胞及び培地が収集されるまで、傾斜した縁を必ず維持すること。付着した細胞について膜を点検した。フラスコ膜をすすいだ。G-REX500MCS上のクランプを閉じた。TILを含む移送パックを熱融着した。上清を含む10LのLabtainerを熱融着した。細胞懸濁液を伴う移送パックの重量を記録し、細胞懸濁液を計算した。試料を取り出すための移送パックを準備した。細胞上清から試験試料を取り出した。
無菌性及びBacT試験サンプリング。調製したBacTラベル付けされた15mLの
コニカルから1.0mLの試料を取り出した。細胞計数試料を取り出した。BSC内で、各試料に別個の3mLシリンジを使用して、「TIL懸濁液」移送パックから4×1.0mLの細胞計数試料を取り出した。
マイコプラズマ試料を取り出した。3mLシリンジを使用して、TIL懸濁液移送パックから1.0mLを取り出し、調製された「マイコプラズマ希釈液」とラベル付けされた15mLコニカルチューブに入れた。
播種用の移送パックを準備した。TILをインキュベーターに入れた。細胞懸濁液をBSCから取り出し、必要とされるまでインキュベーターに入れた。細胞計数及び計算を行った。最初に、0.5mLの細胞懸濁液を調製された4.5mLのAIM-V培地に追加することによって、細胞計数試料を希釈し、1:10希釈液を生じた。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定した。注記:希釈は、細胞の期待濃度に基づいて調整され得る。行われた4つすべての計数から平均生細胞濃度を決定した。TIL懸濁液の調整された体積。細胞計数試料を取り出した後のTIL懸濁液の調整された体積を計算した。5.0mLを差し引いた総TIL細胞体積が試験のために取り出された。
総生TIL細胞を計算した。播種するフラスコの総数を計算した。注記:播種するG-REX500MCSフラスコの最大数は5であった。播種するフラスコの計算された数が5つを超えた場合、5つのみが利用可能な細胞懸濁液の体積全体を使用して播種された。
二次培養用のフラスコの数を計算した。準備されたバッグに加えて必要とされる培地バッグの数を計算した。計算されたように必要とされる2つのG-REX-500Mフラスコ毎に「CM4の16日目培地」の1つの10Lバッグを準備した。追加の培地が調製され、温められている間に、続けて第1のGREX-500Mフラスコ(複数可)を播種した。計算された数の決定された追加の培地バッグを調製し、温めた。G-REX500MCSを充填した。培地をポンプで注入するように準備し、4.5Lの培地をG-REX500MCSにポンプで注入した。熱融着した。充填を繰り返した。フラスコをインキュベートした。新しいG-REX500MCSフラスコに追加するTIL懸濁液の標的体積を計算した。フラスコの計算された数が5つを超える場合、5つのみが細胞懸濁液の体積全体を使用して播種されるであろう。播種用のフラスコを準備した。インキュベーターからG-REX500MCSを取り出した。ポンプで注入するためのG-REX500MCSを準備した。大型フィルターラインを除くすべてのクランプを閉じた。インキュベーターからTILを取り出した。播種用の細胞懸濁液を調製した。(プロセス注記5.11に従って)「TIL懸濁液」移送パックをポンプ入口ラインに滅菌溶接した。TIL懸濁液バッグを秤の上に置いた。
フラスコにTIL懸濁液を播種した。計算されたTIL懸濁液の体積をフラスコにポンプで注入した。熱融着した。残りのフラスコを充填した。
インキュベーターを監視した。インキュベーターパラメータ:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5% CO.フラスコをインキュベートした。
22日目にインキュベーターからG-REX500MCSを取り出す時間範囲を決定した。
22日目 洗浄緩衝液の調製10LのLabtainerバッグを準備した。BSC内で、ルアー接続を介して4インチ血漿移送セットを10LのLabtainerバッグに
取り付けた。10LのLabtainerバッグを準備した。BSCから外に移す前に、すべてのクランプを閉じた。注記:採取される2つのG-REX500MCSフラスコ毎に、1つの10L Labtainerバッグを準備した。Plasmalyteを3000mLバッグにポンプで注入し、ポンプを反転させてバッグの位置を操作することによって、3000mLのOrigenバッグから空気を除去した。ヒトアルブミン25%を3000mLのバッグに追加した。120.0mLの最終体積のヒトアルブミン25%を取得する。
IL-2希釈液を調製した。10mLシリンジを使用して、LOVO洗浄緩衝液バッグ上の無針注入ポートを使用して、5.0mLのLOVO洗浄緩衝液を取り出した。LOVO洗浄緩衝液を50mLのコニカルチューブに分注した。
等分されたCRFブランクバッグLOVO洗浄緩衝液。100mLのシリンジを使用して、無針注入ポートから70.0mLのLOVO洗浄緩衝液を引き上げた。
すべての氷が融解するまで、1つの1.1mLのIL-2(6×106IU/mL))を解凍した。50μLのIL-2ストック(6×10IU/mL)を「IL-2希釈液」とラベル付けされた50mLのコニカルチューブに追加した。
凍結保存調製。5つのクライオカセットを2~8℃に置き、最終製品の凍結保存のためにそれらを前調整した。
細胞計数希釈液を調製した。BSC内で、ロット番号及び「細胞計数希釈液用」でラベル付けされた4.5mLのAIM-V培地を、4本の別個の15mLコニカルチューブに追加した。細胞計数を準備した。4つのクライオバイアルをバイアル番号(1~4)でラベル付けした。使用されるBSCの下でバイアルを保存した。
22日目 TIL採取インキュベーターを監視した。インキュベーターパラメータ温度LEDディスプレイ:37±2.0℃、CO2パーセンテージ:5%±1.5%.インキュベーターからG-REX500MCSフラスコを取り外した。TIL収集バッグを準備し、ラベル付けした。余分な接続を密封した。減容:約4.5Lの上清をG-REX500MCSから上清バッグに移した。
TIL採取用のフラスコを準備した。TILの収集を開始した。フラスコを激しく叩き、培地旋回させて細胞を解放した。すべての細胞が引き離されていることを確実にした。TILの収集を開始した。TIL懸濁液収集バッグにつながるすべてのクランプを解放した。TIL採取。GatheRexを使用して、TIL懸濁液を3000mLの収集バッグに移した。付着した細胞について膜を点検した。フラスコ膜をすすいだ。G-Rex500MCS上のクランプを閉じ、すべてのクランプが閉じていることを確実にした。細胞懸濁液をLOVOソースバッグの中に移した。すべてのクランプを閉じた。熱融着した。4×1.0mLの細胞計数試料を取り出した。
細胞計数を行った。NC-200及びプロセス注記5.14を利用して、細胞計数及び計算を行った。最初に、0.5mLの細胞懸濁液を調製された4.5mLのAIM-V培地に追加することによって、細胞計数試料を希釈した。これは、1:10希釈液を生じた。行われた細胞計数の平均生存率、生細胞濃度、及び総有核細胞濃度を決定した。計数の上限及び下限を決定した。行われた細胞計数の平均生存率、生細胞濃度、及び総有核細胞濃度を決定した。LOVOソースバッグの重量を量った。総生TIL細胞を計算した。総有核細胞を計算した。
マイコプラズマ希釈液を調製した。ルアー試料ポートを介して1つの上清バッグから10.0mLを取り出し、15mLコニカルに入れた。
「TIL G-REX採取」プロトコルを行い、最終製品の標的体積を決定した。使い捨てキットを装填した。濾液バッグを取り出した。濾液容量を入力した。濾液容器をベンチトップの上に置いた。PlasmaLyteを取り付けた。PlasmaLyteが取り付けられていることを検証し、PlasmaLyteが動いていることを観察した。ソース容器をチューブに取り付け、ソース容器が取り付けられていることを検証した。PlasmaLyteが動いていることを確認した。
最終製剤及び充填標的体積/バッグの計算。ブランクバッグを配合するためのCS-10及びLOVO洗浄緩衝液の体積を計算した。CRFブランクを調製した。
最終製品に追加するIL-2の体積を計算した。所望される最終IL-2濃度(IU/mL)-300IU/mL。IL-2作業ストック:6×10IU/mL接続装置を組み立てた。4S-4M60をCC2細胞接続に滅菌溶接した。CS750クライオバッグを準備したハーネスに滅菌溶接した。CS-10バッグを4S-4M60のスパイクに溶接した。IL-2とともにTIL調製した。適切なサイズのシリンジを使用して、「IL-2 6×10」アリコートから決定されたIL-2の量を取り出した。配合されたTILバッグをラベル付けした。配合されたTILバッグを装置に追加した。CS10を追加した。シリンジを交換した。約10mLの空気を100mLのシリンジに引き込み、装置上の60mLシリンジを交換した。CS10を追加した。CS-750バッグを準備した。細胞を分注した。
最終製品バッグから空気を除去し、保持液を得た。最後の最終製品バッグが充填されると、すべてのクランプを閉じた。10mLの空気を新しい100mLシリンジに引き込み、装置のシリンジを交換する。保持液を50mLコニカルチューブに分注し、管を「保持液」及びロット番号としてラベル付けした。各バッグについて空気除去ステップを繰り返した。
目視検査を含み、凍結保存のための最終製品を調製した。凍結保存までクライオバッグを低温パック上で、または2~8℃で保持した。
細胞計数試料を取り出した。適切なサイズのピペットを使用して、2.0mLの保持液を取り出し、細胞計数に使用されるように15mLコニカルチューブに入れる。細胞計数及び計算を行った。注記:1つだけの試料を適切な希釈に希釈し、希釈が十分であることを検証した。追加の試料を適切な希釈倍率に希釈し、計数を進めた。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定した。注記:希釈は、細胞の期待濃度に基づいて調整され得る。生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定した。IFN-γを計算した。最終製品バッグを熱融着した。
以下の例示的試料計画に従って試料をラベル付けし、収集した。
無菌性及びBacT試験。試験試料採取。BSC内で、適切なサイズのシリンジを使用して収集された保持細胞懸濁液から1.0mLの試料を取り出し、嫌気性ボトルに接種する。好気性ボトルについて上記を繰り返す。
最終製品の凍結保存。制御速度冷凍庫(CRF)を準備した。CRFが設定されていることを検証した。CRFプローブを設定した。最終製品及び試料をCRFに入れた。4℃±1.5℃に達し、CRF実行を進めるために必要な時間を決定した。CRFが完了し、保管された。実行の完了後にCRFを停止させた。カセット及びバイアルをCRFから取り出した。保存のためにカセット及びバイアルを蒸気相LN2に移した。保管場所を記録した。
最終医薬品の後処理及び分析には、以下の試験が含まれた:(22日目)フローサイトメトリーによる22日目REPのCD3+細胞の決定、(22日目)グラム染色法(GMP)、(22日目)ゲルクロットLALアッセイ(GMP)による細菌内毒素試験、(16日目)BacT滅菌アッセイ(GMP)、(16日目)TD-PCRによるマイコプラズマDNA検出(GMP)、許容される外観属性、(22日目)BacT滅菌アッセイ(GMP)(22日目)、(22日目)IFN-ガンマアッセイ。本明細書に記載の他の効力アッセイもまた、TIL製品を分析するために用いられる。
実施例8:GEN3拡張プラットフォームの例示的な実施形態
0日目
腫瘍洗浄培地を調製した。培地を開始前に温めた。5mLのゲンタマイシン(50mg/mL)を500mLボトルのHBSSに添加した。5mLの腫瘍洗浄培地を、OKT3希釈に使用する15mLのコニカルチューブに添加した。フィーダー細胞バッグを調製した。フィーダー細胞をフィーダー細胞バッグに無菌で移し、使用するまで37℃で保管するか、または凍結させた。37℃の場合、フィーダー細胞をカウントした。凍結した場合は、解凍した後、フィーダー細胞をカウントした。
フィーダー細胞濃度の範囲は、5×10~5×10細胞/mLである。4.5mLのAIM-Vを含む4つのコニカルチューブを準備した。各細胞計数について0.5mLの細胞画分を追加した。総生フィーダー細胞数が1×10細胞以上であった場合、進んでフィーダー細胞濃度を調整した。フィーダー細胞の体積を計算し、第1のフィーダー細胞バッグから取り出して、1×10細胞を第2のフィーダー細胞バッグに添加した。
p1000マイクロピペットを使用して、900μLの腫瘍洗浄培地をOKT3アリコート(100μL)に移した。シリンジ及び滅菌技法を使用して、0.6mLのOKT3を吸引し、第2のフィーダー細胞バッグに添加した。培地体積を全体積2Lに調整した。第2のフィーダー細胞バッグをインキュベーターに移した。
OKT3製剤の詳細:OKT3は、100μLアリコート中のバイアル(1mg/mL)からの元のストック濃度でアリコートされ、凍結されてもよい。1mLバイアル当たり約10×アリコート。-80℃で保管した。0日目:15μg/フラスコ、すなわち500mL中30ng/mL~60μL最大約1アリコート。
5mLの腫瘍洗浄培地を、過剰腫瘍片とラベル付けした6ウェルプレートのすべてのウェルに添加した。解剖中に腫瘍を水和状態に保持する際に、腫瘍洗浄培地をさらなる使用のために利用可能にした。50mLの腫瘍洗浄培地を、各100mmペトリ皿に追加した。
解剖皿のふたの下の定規を参照として使用して、腫瘍を27mm断片(3×3×3mm)に解剖した。60個の断片に達するまで中間断片を解剖した。生成した最終断片の数に応じて、最終断片の総数を計数し、G-REX-100MCSフラスコを調製した(一般に、1フラスコ当たり60個の断片)。
断片チューブ1~断片チューブ4とラベル付けしたコニカルチューブ内に好ましい組織断片を保持した。起源とする断片チューブの数に応じて、フィーダー細胞懸濁液を播種するG-REX-100MCSフラスコの数を計算した。
フィーダー細胞バッグをインキュベーターから取り出し、G-REX-100MCSを播種する。D0(0日目)とラベル付けする。
G-REX-100MCS中の培養物への腫瘍断片の追加滅菌条件下で、腫瘍断片培養物(D0)1とラベル付けしたG-REX-100MCS及び断片チューブとラベル付けした50mLのコニカルチューブのキャップを緩めた。開いた断片チューブ1を回転させ、同時にG-REX100MCSのキャップをわずかに持ち上げた。断片を含む培地を、回転している間にG-REX100MCSに追加した。G-REX100MCSに移送された断片の数を記録した。
断片がGREXフラスコの底に配置された時点で、7mLの培地を吸引し、7つの1mLアリコートを作製した(拡張された特徴付け用に5mL、滅菌試料用に2mL)。拡張された特徴付け用の5つのアリコート(最終断片培養上清)を、必要になるまで-20℃で保管した。
1本の嫌気性BacT/Alertボトル及び1本の好気性BacT/Alertボトルに各々1mLの最終断片培養上清を接種した。サンプリングしたフラスコ毎に繰り返す。
7日目~8日目
フィーダー細胞バッグを調製した。凍結時に37℃の水浴中で3~5分間フィーダーバッグを解凍した。凍結している場合、フィーダー細胞を計数した。フィーダー細胞濃度の範囲は、5×10~5×10細胞/mLである。4.5mLのAIM-Vを含む4つのコニカルチューブを準備した。各細胞計数について0.5mLの細胞画分を新しいクライオバイアル管に追加した。試料を十分に混合し、細胞計数を続けた。
総生フィーダー細胞数が2×10細胞以上であった場合、次のステップに進んでフィーダー細胞濃度を調整した。フィーダー細胞の体積を計算し、第1のフィーダー細胞バッグから取り出して、2×10細胞を第2のフィーダー細胞バッグに追加した。
p1000マイクロピペットを使用して、900μLのHBSSを100μLのOKT3アリコートに移す。上下に3回ピペッティングして混合する。2つのアリコートを調製した。
OKT3製剤の詳細:OKT3は、100μLアリコート中のバイアル(1mg/mL)からの元のストック濃度でアリコートされ、凍結されてもよい。1mLバイアル当たり約10×アリコート。-80℃で保管した。7日目/8日目:30μg/フラスコ、すなわち500mL中60ng/mL~120μl最大約2アリコート。
シリンジ及び滅菌技法を使用して、0.6mLのOKT3を吸引し、フィーダー細胞バッグに添加して、すべて添加されたことを確認した。培地量を合計2Lに調整した。第2のOKT3アリコートで繰り返し、フィーダー細胞バッグに追加した。第2のフィーダー細胞バッグをインキュベーターに移した。
フィーダー細胞懸濁液を含むG-REX100MCSフラスコの準備。0日目に生成されたG-REXフラスコの数に従って処理するためにG-REX-100MCSフラスコの数を記録した。G-REXフラスコをインキュベーターから取り出し、第2のフィーダー細胞バッグをインキュベーターから取り出した。
フィーダー細胞懸濁液を添加する前の上清の除去:1本の10mLシリンジをG-REX100フラスコに接続し、5mLの培地を引き上げた。5つの1mLアリコート(拡張された特徴付け用に5mL)を作製し、治験依頼者からの要求があるまで、拡張された特徴付け用に5つのアリコート(最終断片培養上清)を-20℃で保管した。各G-REX100フラスコにラベル付けし、繰り返した。
フラスコの数に応じた、特徴付け用の5~20×1mL試料:
●5mL=1フラスコ
●10mL=2フラスコ
●15mL=3フラスコ
●20mL=4フラスコ
フィーダー細胞をG-REX100 MCSに播種し続け、G-REX100 MCSフラスコ毎に繰り返した。無菌移送法を使用して、各G-REX-100MCSフラスコに重量で500mLの第2のフィーダー細胞バッグを重力移送し(1g=1mLと想定)、量を記録した。7日目培養とラベル付けし、G-REX100フラスコ毎に繰り返した。G-REX-100MCSフラスコをインキュベーターに移した。
10~11日目
第1のG-REX-100MCSフラスコを取り出し、滅菌条件を使用して、10mL
シリンジを使用して7mLの前処理培養上清を取り出した。7つの1mLアリコートを作製した(拡張された特徴付け用に5mL、滅菌試料用に2mL)。
フラスコを注意深く混合し、新たな10mLシリンジを使用して10mLの上清を取り出し、D10/11マイコプラズマ上清とラベル付けした15mLのチューブに移す。
フラスコを注意深く混合し、新しい注射器を使用して、処理されるフラスコの数に応じて以下の量を除去した。
●1フラスコ=40mL
●2フラスコ=20mL/フラスコ
●3フラスコ=13.3mL/フラスコ
●4フラスコ=10mL/フラスコ
合計40mLをすべてのフラスコから取り出し、「10/11日目QC試料」とラベル付けした50mLのコニカルチューブにプールし、必要になるまでインキュベーター内で保管すべきである。細胞計数を行い、細胞を割り当てた。
必要になるまで-20℃以下で拡張された特徴付けのために5つのアリコート(前処理培養上清)を保管した。1本の嫌気性BacT/Alertボトル及び1本の好気性BacT/Alertボトルに各々1mLの前処理培養上清を接種した。
細胞懸濁液をG-REX-500MCSに移し、G-REX-100MCS毎に繰り返した。滅菌条件を使用して、各G-REX-100MCSの内容物をG-REX-500MCSに移し、一度に約100mLの液体移送を監視した。G-REX-100MCSの容量が500mLに低減したとき、移送を停止した。
移送ステップ中、10mLシリンジを使用し、G-REX-100MCSからシリンジに10mLの細胞懸濁液を引き上げた。培養中のフラスコの数に従って指示に従った。1つのフラスコのみの場合:2つのシリンジを使用して合計20mLを取り出した。フラスコが2つの場合:1フラスコ当たり10mLを取り出した。フラスコが3つの場合:1フラスコ当たり7mLを取り出した。フラスコが4つの場合:1フラスコ当たり5mLを取り出した。細胞懸濁液を1本の一般的な50mLのコニカルチューブに移した。細胞計数ステップ及びQC試料までインキュベーター内で保管する。QCに必要な細胞の総数は、約20e6細胞であった:4×0.5mLの細胞数(細胞数を最初に希釈しなかった)。
アッセイに必要な細胞の量は、以下の通りである。
1.本明細書に記載されるものなどの効力アッセイ、またはIFN-γもしくはグランザイムBアッセイのための最小10×10細胞
2.マイコプラズマのための1×10細胞
3.CD3+/CD45+のためのフローサイトメトリーのための5×10細胞
G-REX-500MCSフラスコをインキュベーターに移した。
QC試料を調製した。この実施形態のアッセイには少なくとも15×10細胞が必要であった。アッセイは、細胞数及び生存率、マイコプラズマ(1×10細胞/平均生存濃度)、フロー(5×10細胞/平均生存濃度)及びIFN-gアッセイ(5×10細胞~1×10細胞を含み、8~10×10細胞が、IFN-γアッセイに必要である。
10×10細胞/mLで凍結保存のための細胞画分の体積を計算し、調製するバイア
ルの数を計算した。
16~17日目
洗浄緩衝液の調製(1% HSA Plasmalyte A)。HSA及びPlasmalyteを5Lバッグに移して、LOVO洗浄緩衝液を作製した。滅菌条件を使用して、総体積125mLの25%HSAを5Lバッグに移した。10mLまたは40mLの洗浄緩衝液を取り出し、「IL-2 6×10IU/mL」チューブに移した(IL-2を事前に調製した場合は10mL、IL-2を新たに調製した場合は40mL)。
Plasmalyte+1% HSAに添加する再構成IL-2の量を計算した:再構成IL-2の量=(IL-2の最終濃度×最終量)/IL-2の比活性(標準アッセイに基づく)。IL-2の最終濃度は、6×10IU/mLであった。最終体積は、40mLであった。
再構成IL-2に必要なIL-2の計算された初期体積を取り出し、「IL-2 6×10IU/mL」チューブに移した。事前に調製したアリコートから100μLのIL-2 6×10IU/mLを、10mLのLOVO洗浄緩衝液を含有する「IL-2 6×10IU/mL」とラベル付けしたチューブに追加した。
約4500mLの上清をG-REX-500MCSフラスコから取り出した。残りの上清を回転させ、細胞を細胞収集プールバッグに移した。すべてのG-REX-500MCSフラスコで繰り返した。
60mLの上清を除去し、マイコプラズマ検出を含む品質管理アッセイのために上清チューブに添加した。+2~8℃で保管した。
細胞収集細胞を計数した。4.5mLのAIM-Vを含む4つの15mLコニカルチューブを準備する。これらは、事前に準備してもよい。範囲は、5×10~5×10細胞/mLである。(1:10希釈が推奨された)。1:10希釈の場合、事前に調製した4500μLのAIM Vに、500μLのCFを追加する。希釈倍率を記録した。
TC(総細胞)LOVO前(生+死)を計算した=
平均総細胞
濃度(TC濃度LOVO前)
(生+死)

ソースバッグの体積
TVC(総生細胞)LOVO前(生)を計算した=
平均総生細胞
濃度(TVC LOVO前)
(生)

LOVOソースバッグの体積
総細胞(TC)数が5×10超であった場合、5×10細胞を取り出して、MDA保持試料として凍結保存する。5×10÷平均TC濃度(ステップ14.44)=取り出す体積
総細胞(TC)数が≦5×10以下であった場合、4×10細胞を取り出して、MDA保持試料として凍結保存する。4×10÷平均TC濃度=取り出す体積。
総細胞数が決定された場合、取り出す細胞の数は、150×10生細胞の保持を可能にすべきである。TVC LOVO前5×10もしくは4×10を確認するか、または該当なしである。取り出す細胞の体積量を計算した。
バッグに残っている残りの総細胞を計算した。TC(総細胞)LOVO前を計算した。[平均総細胞濃度×残りの体積=残りのTC LOVO前]を計算した。
残存する細胞の総数に従って、表42の対応するプロセスを選択する。
使用したプロセスに対応して添加するIL-2の量を選択する。次のように計算された体積:保持量×2×300IU/mL=必要とされるIL-2のIU。必要なIL-2のIU/6×10IU/mL=LOVO後バッグに追加するIL-2の体積。添加したすべての体積を記録した。さらなる分析のために試料をクライオバイアル内に得た。
細胞製品を十分に混合した。該当する場合、凍結保存を含むさらなる処理のためにすべてのバッグを密封した。
得られたクライオバイアル試料に対して、内毒素、IFN-γ、無菌性、及び必要に応じて他のアッセイを行った。
実施例9:GEN2及びGEN3の例示的なプロセス
この実施例は、Gen2及びGen3のプロセスを示す。Gen2プロセス及びGen3プロセスのTILは、一般に腫瘍の外科的切除によって個々の患者から得られ、その後、エクスビボで拡張された自己TILで構成されている。Gen3プロセスのプライミングによる第1の拡張ステップは、インターロイキン-2(IL-2)及びモノクローナル抗体OKT3の存在下での細胞培養であり、放射線照射された末梢血単核細胞(PBMC)の足場上のT細胞共受容体CD3を標的とする。
Gen2 TIL製品の製造は、2つの相からなる:1)急速拡張前(REP前)及び2)急速拡張プロトコル(REP)。REP前中に、切除腫瘍を、各寸法2~3mmの50個以下の断片に切断し、血清含有培養培地(10%HuSABを補充したRPMI1640培地)及び6,000IU/mLのインターロイキン-2(IL-2)で11日間培養した。11日目にTILを採取し、大規模二次REP拡張に導入した。REPは、5日
間の3000IU/mLのrhIL-2を補充した5L体積のCM2中の150μgのモノクローナル抗CD3抗体(OKT3)を装填した5×10個の放射線照射された同種異系PBMCフィーダー細胞の共培養におけるREP前由来の200×10個以下の生細胞の活性化からなる。16日目に、培養物の体積を90%減少させ、細胞画分を1フラスコ当たり1×10個以上の生リンパ球で複数のG-REX-500フラスコに分割し、CM4で5LにQSする。TILをさらに6日間インキュベートする。REPを22日目に採取し、洗浄し、製剤化し、凍結保存した後に、注入のために臨床現場に-150℃で発送する。
Gen3 TIL製品の製造は、3つの相からなる:1)プライミングによる第1の拡張プロトコル、2)急速な第2の拡張プロトコル(急速拡張相またはREPとも称される)、及び3)継代培養分割。プライミングによる第1の拡張TIL増殖を行うために、切除した腫瘍を各寸法2~3mm以下の120個以下の断片に切断した。プライミングによる第1の拡張の0日目に、OKT-3を装填したおよそ2.5×10個の放射線照射された同種異系PBMCフィーダー細胞のフィーダー層を、3つの100MCS容器の各々内のおよそ100cmの表面積上に確立した。腫瘍断片を、各々が500mLの血清含有CM1培養培地及び6,000IU/mLのインターロイキン-2(IL-2)及び15ugのOKT-3を含む3つの100MCS容器に分布し、その中で7日間培養した。7日目に、OKT-3を負荷したおよそ5×10個の同種異系の放射線照射されたPBMCフィーダー細胞の追加のフィーダー細胞層を、3つの100MCS容器の各々において腫瘍断片化培養相に組み込み、500mLのCM2培養培地及び6,000IU/mLのIL-2及び30μgのOKT-3で培養することによってREPを開始した。REPの開始を、100MCS容器へのOKT3を装填したフィーダー細胞の閉鎖系流体移送を使用して、同じ容器内のプライミングによる第1の拡張培養物全体を活性化することによって増強した。Gen3の場合、TILのスケールアップまたは分割に、細胞培養物全体を閉鎖系流体移送によってより大きい容器にスケーリングし、移し(100Mフラスコから500Mフラスコに)、追加の4LのCM4培地を添加するプロセスステップを含めた。16日目にREP細胞を採取し、洗浄し、製剤化し、凍結保存した後に、注入のために臨床現場に-150℃で発送する。
全体として、Gen3プロセスは、より短く、よりスケーラブルであり、かつ簡単に修正可能な拡張プラットフォームであり、堅牢な製造及びプロセス比較可能性に適するように適応する。
0日目に、両方のプロセスについて、腫瘍を3回洗浄し、断片をランダム化し、2つのプールに分けた(プロセス毎に1つのプール)。Gen2プロセスの場合、断片を、6,000IU/mLのrhIL-2を含有する1LのCM1培地を含む1つのGREX100MCSフラスコに移した。Gen3プロセスでは、断片を、6,000IU/mLのrhIL-2、15ugのOKT-3及び2.5×10個のフィーダー細胞を含有する500mLのCM1を含む1つのG-REX-100MCSフラスコに移した。Rep開始日のTILの播種は、各プロセスに従って異なる日に起こった。G-REX G-REX
-100MCSフラスコを90%減容させたGen2プロセスの場合、収集した細胞懸濁液を新たなG-REX-500MCSに移して、IL-2(3000IU/mL)+5×10フィーダー細胞及びOKT-3(30ng/mL)を含有するCM2培地中で11日目にREPを開始した。細胞が拡張し、プロトコルに従って16日目にIL-2(3000IU/mL)を有するCM4培地を含む複数のG-REX-500MCSフラスコに分割した。その後、培養物を採取し、プロトコルに従って22日目に凍結保存した。Gen3プロセスの場合、REPの開始は7日目に起こり、同じG-REX -100MCSをREPの開始に使用した。簡潔には、IL-2(6000IU/mL)及び5×10個のフィーダー細胞を30ugのOKT-3とともに含有する500mLのCM2培地を各フラスコに添加した。9~11日目に、培養をスケールアップした。G-REX100Mの全体積(1L)をG-REX-500MCSに移し、IL-2(3000IU/mL)を含有する4LのCM4を添加した。フラスコを5日間インキュベートした。培養物を採取し、16日目に凍結保存した。
比較には、2つの肺腫瘍(L4054及びL4055)と1つの黒色腫腫瘍(M1085T)の3つの異なる腫瘍を含めた。
L4054及びL4055の場合、CM1培地(培養培地1)、CM2培地(培養培地2)、及びCM4培地(培養培地4)を事前に調製し、4℃で保持した。CM1培地及びCM2培地を、培地を濾過した場合の細胞増殖と培地を濾過しなかった場合の細胞増殖を比較するために、濾過せずに調製した。
L4055腫瘍の場合、REPの開始及びスケールアップ時に、培地を事前に37℃で最大24時間温めた。
結果達成された生細胞の総数について、Gen3の結果はGen2の30%以内であった。Gen3最終製品は、再刺激後により高いINF-γ産生を示した。Gen3最終製品は、存在する固有の全CDR3配列によって測定される、増加したクローンの多様性を示した。Gen3最終製品は、より長い平均テロメア長を示した。
Gen2及びGen3プロセスでのREP前及びREP拡張は、上記の手順に従った。各腫瘍について、2つのプールに同数の断片を含めた。腫瘍のサイズが小さいため、1フラスコ当たりの最大断片数は達成されなかった。総REP前細胞(TVC)を採取し、Gen2プロセスの場合は11日目に、Gen3プロセスの場合は7日目に計数した。2つのREP前群を比較するために、細胞計数を培養物中に提供された断片の数で割り、1断片当たりの平均生細胞を計算した。以下の表52に示されるように、Gen2プロセスは、Gen3プロセスと比較して、1断片当たりより多くの細胞を一貫して成長させた。REP前TVCを7で割り、その後、11を掛けて計算した、11日目にGen3プロセスで予想されるTVC数の外挿計算。
Gen2及びGen3プロセスの場合、TVCをプロセス条件毎に計数し、生細胞パーセントをプロセス日毎に生成した。採取時に、22日目(Gen2)及び16日目(Gen3)の細胞を収集し、TVC数を確立した。その後、TVCを0日目に提供された断片の数で割り、1断片当たりの平均生細胞を計算した。倍率拡張を、採取したTVCをREP開始TVCで割ることによって計算した。表53に示されるように、Gen2とGen3を比較すると、倍率拡張はL4054の場合では同様であり、L4055の場合、倍率拡張はGen2プロセスの方が高かった。具体的には、この場合、培地をREP開始日の前に24温めた。M1085Tの場合のGen3でもより高い倍率拡張が観察された。REP TVCを16で割り、その後、22を掛けて計算した、22日目にGen3プロセスで予想されるTVC数の外挿計算。
表54: TIL最終製品の生存率%:採取時に、最終TIL REP製品を生存率%の放出基準と比較した。Gen2及びGen3プロセスのすべての条件は、70%の生存率基準を超えており、プロセス及び腫瘍間で同等であった。
採取時に、最終TIL REP製品を生存率%の放出基準と比較した。Gen2及びGen3プロセスのすべての条件は、70%の生存率基準を超えており、プロセス及び腫瘍間で同等であった。
1フラスコ当たりの断片の数が最大必要数未満であったため、採取日の推定細胞計数を
腫瘍毎に計算した。推定は、臨床腫瘍が0日目に2つまたは3つのフラスコに播種するのに十分な大きさであるという予想に基づいた。
免疫表現型決定-TIL最終製品の表現型マーカー比較。3つの腫瘍L4054、L4055、及びM1085Tは、Gen2及びGen3プロセスの両方でTIL拡張を受けた。採取時に、REP TIL最終製品をフローサイトメトリー分析にかけ、純度、分化、及びメモリーマーカーを試験した。すべての条件で、TCR a/b+細胞パーセンテージは90%超であった。
Gen3プロセスから採取したTILは、Gen2プロセスから採取したTILと比較して、より高いCD8及びCD28発現を示した。Gen2プロセスは、より高いCD4+パーセンテージを示した。
Gen3プロセスから採取したTILは、Gen2プロセス由来のTILと比較して、セントラルメモリー区画でより高い発現を示した。
活性化及び疲弊マーカーを2つの腫瘍L4054及びL4055由来のTILで分析して、Gen2及びGen3 TIL拡張プロセス由来の最終TIL製品を比較した。活性化及び疲弊マーカーは、Gen2プロセスとGen3プロセスとの間で同等であった。
再刺激時のインターフェロンガンマ分泌採取日、Gen2の場合は22日目、Gen3の場合は16日目に、TILは、L4054及びL4055の場合、コーティングした抗CD3プレートで一晩再刺激を受けた。M1085Tでの再刺激は、抗CD3、CD28、及びCD137ビーズを使用して行った。すべての条件で再刺激の24時間後に上清を収集し、上清を凍結させた。ELISAによるIFNγ分析を、同じELISAプレートを使用して両方のプロセス由来の上清で同時に評価した。分析した3つの腫瘍で、Gen3プロセス由来のIFNγのより高い産生が観察された。
培養培地中のIL-2レベルの測定Gen2プロセスとGen3プロセスとの間のIL-2消費量を比較するために、腫瘍L4054及びL4055で、REPの開始時、スケールアップ時、及び採取日に細胞上清を収集した。細胞培養上清中のIL-2の量を、R&D製の定量化ELISAキットによって測定した。一般的な傾向は、Gen2プロセスと比較して、Gen3プロセスではIL-2濃度が高いままであることを示す。これは、プロセス全体を通して培地のキャリーオーバーと相まってGen3のREP開始時のIL-2濃度がより高い(6000IU/mL)ことに起因する可能性がある。
代謝基質及び代謝物分析D-グルコース及びL-グルタミンなどの代謝基質のレベルを、全培地消費量の代わりに測定した。乳酸及びアンモニアなどのそれらの相互代謝物を測
定した。グルコースは、ATPの形態でエネルギーを産生するためにミトコンドリアによって利用される培地中の単糖である。グルコースが酸化されると、乳酸が産生される(乳酸塩は乳酸のエステルである)。乳酸塩は、細胞の指数関数的成長期中に強く産生される。高レベルの乳酸塩は、細胞培養プロセスに悪影響を及ぼす。
L4054及びL4055の使用済み培地を、Gen2プロセス及びGen3プロセスの両方で、REP開始時、スケールアップ時、及び採取日に収集した。使用済み培地の収集は、Gen2の場合は11日目、16日目、及び22日目、Gen3の場合は7日目、11日目、及び16日目であった。上清を、グルコース、乳酸、グルタミン、GlutaMax(商標)、及びアンモニアの濃度についてCEDEXバイオアナライザーで分析した。
L-グルタミンは、細胞培養培地製剤に必要な不安定な必須アミノ酸である。グルタミンにはアミンが含まれており、このアミド構造基は、窒素を細胞に輸送して送達することができる。L-グルタミンが酸化すると、細胞によって有毒なアンモニア副産物が産生される。L-グルタミンの分解に対抗するために、Gen2及びGen3プロセスの培地に、水溶液中でより安定しており、かつ自発的に分解しないGlutaMax(商標)を補充した。2つの腫瘍株では、Gen3アームは、プロセス中のL-グルタミン及びGlutaMax(商標)の減少、ならびにREP全体でアンモニアの増加を示した。Gen2アームでは、L-グルタミン及びGlutaMax(商標)の濃度が一定であり、アンモニア産生のわずかな増加が観察された。Gen2及びGen3のプロセスは、アンモニアについて採取日に同等であり、L-グルタミン分解にわずかな違いが見られた。
テロメアは、Flow-FISHによって繰り返される。Flow-FISH技術を使用して、Gen2及びGen3プロセスでのL4054及びL4055のテロメア反復の平均長を測定した。相対テロメア長(RTL)の決定を、DAKO製のフローサイトメトリー分析用Telomere PNAキット/FITCを使用して計算した。Gen3は、Gen2と同等のテロメア長を示した。
CD3分析各プロセスで生成された細胞製品のクローン多様性を決定するために、L4054及びL4055の採取したTIL最終製品をサンプリングし、T細胞受容体のCDR3部分の配列決定によるクローン多様性分析についてアッセイした。
表56は、採取したTIL細胞製品のL4054における共有される固有のCDR3配列パーセンテージに関するGen2とGen3との比較を示す。199個の配列がGen3最終製品とGen2最終製品との間で共有され、Gen3最終製品と共有されるGen2由来の固有のCDR3配列の上位80%の97.07%に相当する。
表57は、採取したTIL細胞製品のL4055における共有される固有のCDR3配列パーセンテージに関するGen2とGen3との比較を示す。1833個の配列がGen3最終製品とGen2最終製品との間で共有され、Gen3最終製品と共有されるGen2由来の固有のCDR3配列の上位80%の99.45%に相当する。
CM1及びCM2培地は、濾過せずに事前に調製し、腫瘍L4055の場合、Gen2及びGen3プロセスで使用するまで4℃で保持した。
Gen2及びGen3プロセスのREP開始日に、腫瘍L4055の場合、培地を37℃で事前に24時間温めた。
これらのプロセスで収集した上清中にLDHは測定されなかった。
M1085T TIL細胞計数を、K2 cellometer細胞カウンターを使用して実行した。
腫瘍M1085Tでは、代謝分析用の上清、活性化及び疲弊マーカー分析用のTIL製品、テロメア長、及びCD3-TCRvb分析などの試料は入手できなかった。
結論この実施例では、3つの独立したドナー腫瘍組織を、機能的品質属性に加えて、拡張された表現型特徴付け、ならびにGen2プロセス及びGen3プロセス間の培地消費に関して比較する。
Gen2及びGen3のREP前及びREP拡張比較を、生成された全生細胞及び全有核細胞集団の生存率に関して評価した。採取日のTVC細胞用量は、Gen2(22日)とGen3(16日)との間で同等ではなかった。Gen3細胞用量は、採取時に収集した全生細胞の約40%であり、Gen2よりも低かった。
REP前採取は、7日目ではなく11日目に起こり、REP採取は、16日目ではなく22日目に起こると仮定して、Gen3プロセスの外挿細胞数を計算した。どちらの場合も、Gen3は、Gen2プロセスと比較してTVCの数値が近いことを示し、初期活性化により、TILの成長が増強したことを示す。
Gen3プロセスでの追加フラスコ(2つまたは3つ)の外挿値の場合、処理される腫
瘍サイズがより大きいと仮定し、記載されるようにプロセス毎に必要な最大断片数に到達する。22日目のGen2プロセスと比較して、Gen3プロセスの16日目の採取時にTVCで同様の用量に到達可能であり得ることが観察された。この観察は重要であり、培養物の早期活性化がTIL処理時間を短縮したことを示す。
Gen2及びGen3のREP前及びREP拡張比較を、生成された全生細胞及び全有核細胞集団の生存率に関して評価した。採取日のTVC細胞用量は、Gen2(22日)とGen3(16日)との間で同等ではなかった。Gen3細胞用量は、採取時に収集した全生細胞の約40%であり、Gen2よりも低かった。
表現型特徴付けに関して、Gen2プロセスと比較してGen3プロセスでの3つの腫瘍でより高いCD8+及びCD28+発現が観察された。
Gen3プロセスは、Gen2プロセスと比較してわずかに高いセントラルメモリー区画を示した。
Gen2プロセス及びGen3プロセスは、Gen3プロセスの持続期間がより短いにもかかわらず、同等の活性化及び疲弊マーカーを示した。
IFNガンマ(IFNγ)産生は、分析した3つの腫瘍において、Gen2と比較してGen3最終製品において3倍高かった。このデータは、Gen3プロセスがGen2プロセスと比較して高機能でより強力なTIL製品を生成したことを示し、Gen3でのCD8及びCD28発現がより高いことに起因する可能性がある。表現型特徴付けは、Gen2プロセスと比較して3つの腫瘍でCD8+、CD28+発現へのGen3の肯定的な傾向を示唆した。
Gen2とGen3との間のTIL最終製品のテロメア長は同等であった。
グルコース及び乳酸塩レベルは、Gen2最終製品とGen3最終製品との間で同等であり、プロセス日毎に減容除去が実行されなかったこと、及びGen2と比較してプロセスにおける培地全体の体積が少ないことに起因して、Gen3プロセスの培地の栄養素レベルが影響されなかったことを示唆する。
全体として、Gen3プロセスは、Gen2プロセスと比較してほぼ2倍の処理時間の短縮を示し、これにより、Gen3プロセスによって拡張されたTIL製品の売上原価(COG)の有意な削減がもたらされるであろう。
IL-2消費は、Gen2プロセスでのIL-2消費の一般的な傾向を示しており、Gen3プロセスでは、古い培地が除去されなかったため、IL-2が高かった。
Gen3プロセスは、CDR3 TCRab配列分析によって測定されたより高いクローン多様性を示した。
Gen3プロセスを使用して、REP前の0日目のフィーダー及びOKT-3の追加により、TILの初期活性化が可能になり、TIL成長が可能になった。
表58は、現在のGen2プロセスと比較したGen3プロセスの様々な実施形態及び成果を説明する。
実施例10:例示的なGEN3プロセス(GEN3.1とも称される)
この実施例は、「TIL拡張のためのGen2プロセスとGen3プロセスとの間の比較可能性」に関するさらなる研究について説明する。Gen3プロセスを、表現型及び機能プロファイルを維持しながら、最終総生細胞(TVC)出力を増やすことを目的として、プロセスの初期に活性化ステップを含むように修正した。以下に記載されるように、Gen3実施形態をさらなる実施形態として修正し、本明細書におけるこの実施例ではGen3.1と称する。
いくつかの実施形態では、Gen3.1 TIL製造プロセスは、以下の4つのオペレーター介入を有する。
1.腫瘍断片の単離及び活性化:プロセスの0日目に腫瘍を解剖し、最終断片を各々約3×3mm(合計で最大240個の断片)を生成し、1~4つのG-REX100MCSフラスコ内で培養した。各フラスコは、最大60個の断片、6,000IUのrhIL-2、15μgのOKT3、及び2.5×10個の放射線照射した同種異系単核細胞を補充した500mLのCM1またはDM1培地を含んだ。培養物を37℃で6~8日間インキュベートした。
2.TIL培養再活性化:7~8日目に、いずれの場合も6,000IUのrhIL-2、30μgのOKT3、及び5×10個の放射線照射した同種異系単核細胞を補充したCM2またはDM1培地をゆっくり添加することによって、培養物を補充した。フラスコの底にある既存の細胞を乱さないように注意した。培養物を37℃で3~4日間インキュベートした。
3.培養のスケールアップ:10~11日目に生じる。培養のスケールアップ中に、G-REX100MCSの全内容物を、いずれの場合も3,000IU/mLのIL-2を補充した4LのCM4またはDM2を含むG-REX500MCSフラスコに移した。採取するまでフラスコを37℃で5~6日間インキュベートした。
4.採取/洗浄/製剤化:16~17日目に、フラスコを減容させ、プールする。細胞を濃縮し、1%HSAを含有するPlasmaLyte A pH7.4で洗浄した。洗浄した細胞懸濁液を、CryoStor10と1:1の比で配合し、300IU/mLの最終濃度までrhIL-2を補充した。
DPを制御された速度の凍結で凍結保存し、気相液体窒素中で保管した。*完全標準TIL培地1、2、または4(CM1、CM2、CM4)は、上記のように、合成培地(DM1またはDM2)と称されるCTS(商標)OpTmizer(商標)T細胞無血清拡張培地の代用となり得た。
プロセスの説明0日目に、腫瘍を3回洗浄し、その後、3×3×3の最終断片に断片化した。全腫瘍を断片化した時点で、最終断片を均等にランダム化し、3つのプールに分割した。1つのランダム化断片プールを各群に導入し、3つの実験マトリックス毎に同じ数の断片を添加した。
全TIL拡張プロセスにわたって、腫瘍L4063拡張を標準培地で行い、腫瘍L4064拡張を合成培地(CTS OpTmizer)で行った。培地の成分を本明細書に記載する。
CM1完全培地1:2mM GlutaMax(商標)、10%ヒトAB血清、ゲンタマイシン(50ug/mL)、2-メルカプトエタノール(55uM)を補充したRPMI+グルタミン。6000IU/mLのIL-2を補充した最終培地製剤。
CM2完全培地2:50% CM1培地+50% AIM-V培地。6000IU/mLのIL-2を補充した最終培地製剤。
CM4完全培地4:GlutaMax(商標)(2mM)を補充したAIM-V。3000IU/mLのIL-2を補充した最終培地製剤。
CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplement(26mL/L)を補充したCTS OpTmizer CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Basal Medium。
DM1:CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion
Supplement(26mL/L)、及びCTS(商標)Immune Cell
SR(3%)をGlutaMax(商標)(2mM)とともに補充したCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Basal Medium。6,000IU/mLのIL-2を補充した最終製剤。
DM2:CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion
Supplement(26mL/L)、及びCTS(商標)Immune Cell
SR(3%)をGlutaMax(商標)(2mM)とともに補充したCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Basal Medium。3,000IU/mLのIL-2を補充した最終製剤。
使用したすべてのタイプの培地、すなわち、完全培地(CM)及び合成培地(DM)を事前に調製し、使用前日まで4℃で保持し、プロセス日前に事前に最長24時間にわたってインキュベーター内で37℃で温めた。
TIL培養再活性化は、両方の腫瘍で7日目に起こった。スケールアップは、L4063では10日目、L4064では11日目に起こった。両方の培養物を採取し、16日目に凍結保存した。
達成した結果Gen3.0プロセス及びGen3.1プロセスの細胞計数及び生存率%を決定した。すべての条件下での拡張は、この実施例に説明される詳細に従った。
腫瘍毎に、断片を同数の3つのプールに分割した。腫瘍のサイズが小さいため、1フラスコ当たりの断片の最大数は達成されなかった。3つの異なるプロセスについて、総生細胞及び細胞生存率を条件毎に評価した。細胞数を、7日目の再活性化のTVC、10日目(L4064)または11日目(L4063)のスケールアップのTVC、及び16/17日目の採取時のTVCとして決定した。
7日目及び10/11日目の細胞計数をFIOで測定した。倍率拡張を、16/17日目の採取時のTVCを7日目の再活性化日のTVCで割ることによって計算した。3つの群を比較するために、採取日のTVCを、0日目の培養物中に添加した断片の数で割って、1断片当たりの生細胞の平均を計算した。
L4063及びL4064について、細胞計数及び生存率アッセイを行った。Gen3.1-試験プロセスは、両方の腫瘍でGen3.0プロセスよりも多くの1断片当たりの細胞数をもたらした。
総生細胞数及び倍率拡張、プロセス中の生存率%再活性化時に、スケールアップして採取し、すべての条件で生存率%を行った。16/17日目の採取日に、最終TVCを生存率%の放出基準と比較した。評価したすべての条件は、70%の生存率基準を超え、プロセス及び腫瘍全体で同等であった。
免疫表現型決定-TIL最終製品の表現型特徴付け。最終製品をフローサイトメトリー分析にかけ、純度、分化、及びメモリーマーカーを試験した。集団パーセントは、すべての条件で、TCRα/β細胞、CD4+細胞、及びCD8+細胞で一貫していた。
REP TILの拡張表現型分析を行った。TIL製品は、両方の腫瘍でGen3.0と比較してGen3.1条件でより高いCD4+細胞パーセンテージを示し、両方の条件でGen3.1条件と比較してGen3.0でより高いCD8+集団由来のCD28+細胞パーセンテージを示した。
Gen3.0プロセス及びGen3.1プロセスから採取したTILは、CD4+細胞及びCD8+細胞でのCD27及びCD56発現、ならびにCD4+ゲート細胞集団での同等のCD28発現と同等の表現型マーカーを示した。TIL最終製品のメモリーマーカーの比較:
16日目に採取したTILの凍結試料を分析のために染色した。TILメモリーステータスは、Gen3.0プロセスとGen3.1プロセスとの間で同等であった。TIL最終製品の活性化及び疲弊マーカーの比較:
活性化及び疲弊マーカーは、CD4+細胞及びCD8+細胞上でゲートされたGen3.0プロセスとGen3.1プロセスとの間で同等であった。
再刺激時のインターフェロンガンマ分泌採取したTILは、L4063及びL4064用のコーティングされた抗CD3プレートで一晩再刺激を受けた。Gen3.0プロセスと比較して、分析した2つの腫瘍で、より高いGen3.1プロセスからのIFNγ産生が観察された。
培養培地中のIL-2レベルの測定すべての条件及びプロセス間のIL-2消費レベルを比較するために、細胞上清を、7日目の再活性化の開始時、10日目(L4064)/11日目(L4063)のスケールアップ時、及び16/17日目の採取及び凍結時に収集した。その後、上清を解凍し、分析した。細胞培養上清中のIL-2の量を、製造業者のプロトコルによって測定した。
全体的なGen3プロセス及びGen3.1プロセスは、同じ培地条件で評価した全プロセス中のIL-2消費に関して同等であった。L4063及びL4064用に収集した使用済み培地のIL-2濃度(pg/mL)分析。
代謝物分析使用済み培地の上清を、L4063及びL4064について、すべての条件で、7日目の再活性化の開始時、10日目(L4064)または11日目(L4063)のスケールアップ時、及び16/17日目の採取時に、L4063及びL4064から収集した。上清をCEDEXバイオアナライザーでグルコース、乳酸塩、グルタミン、GlutaMax(商標)、及びアンモニアの濃度について分析した。
合成培地は、完全培地(2g/L)と比較してより高いグルコース濃度4.5g/Lを有する。全体として、グルコースの濃度及び消費量は、各培地タイプ内でGen3.0プロセス及びGen3.1プロセスにおいて同等であった。
乳酸塩の増加が観察され、乳酸塩の増加は、Gen3.0条件とGen3.1条件との間、及び再活性化拡張に使用した2つの培地(完全培地と合成培地)間で同等であった。
いくつかの場合において、標準基礎培地は、2mMのL-グルタミンを含有し、培養条件下でL-グルタミンのL-グルタミン酸塩及びアンモニアへの自然分解を補うために、2mMのGlutaMax(商標)で補充された。
いくつかの場合において、使用した合成(無血清)培地は、基礎培地にL-グルタミンを含有せず、最終濃度が2mMになるまでGlutaMax(商標)のみで補充された。GlutaMax(商標)は、L-アラニンとL-グルタミンのジペプチドであり、水溶液中でL-グルタミンよりも安定しており、グルタミン酸塩及びアンモニアに自発的に分解しない。代わりに、ジペプチドは、個々のアミノ酸に徐々に解離し、それにより、より
低いが十分な濃度のL-グルタミンを維持して、強力な細胞成長を維持する。
いくつかの場合において、グルタミン濃度及びGlutaMax(商標)濃度は、スケールアップ日にわずかに減少したが、採取日には再活性化日と比較して同様またはより近いレベルへの増加を示した。L4064の場合、グルタミン濃度及びGlutaMax(商標)濃度は、全プロセス中、異なる条件間で同様の速度でわずかな分解を示した。
アンモニア濃度は、2mMのGlutaMax(商標)を含有する合成培地中で成長させた試料よりも、2mMのグルタミン+2mMのGlutaMax(商標)を含有する標準培地中で成長させた試料で高かった。さらに、予想通り、培養の過程にわたってアンモニアの段階的増加または蓄積があった。3つの異なる試験条件間でアンモニア濃度に差はなかった。
Flow-FISHによるテロメア反復:Flow-FISH技術を使用して、Gen3プロセス及びGen3.1プロセス下でのL4063及びL4064のテロメア反復の平均長を測定した。相対テロメア長(RTL)の決定を、DAKO製のフローサイトメトリー分析用Telomere PNAキット/FITCを使用して計算した。テロメアアッセイを行った。試料のテロメア長を、対照細胞株(1301白血病)と比較した。対照細胞株は、長くて安定したテロメアを有する四倍体細胞株であり、相対テロメア長の計算を可能にする。両方の腫瘍で評価したGen3プロセス及びGen3.1プロセスは、同等のテロメア長を示した。
TCR Vβレパートリー分析
各プロセスで生成された細胞製品のクローン多様性を決定するために、TIL最終製品をT細胞受容体のCDR3部分の配列決定によるクローン多様性分析のためにアッセイした。
3つのパラメータを3つの条件間で比較した。
●固有のCDR3(uCDR3)の多様性指数
●uCDR3共有%
●uCDR3の上位80%の場合:
○共有されるuCDR3コピーの%を比較する
○固有のクロノタイプの頻度を比較する
対照及びGen3.1試験、TILで採取した細胞製品で共有される固有のCDR3配列パーセンテージ:975個の配列がGen3試験最終製品とGen3.1試験最終製品との間で共有され、Gen3.1と共有されるGen3由来の固有のCDR3配列の上位80%の88%に相当する。
対照及びGen3.1試験、TILで採取した細胞製品で共有される固有のCDR3配列パーセンテージ:2163個の配列がGen3試験最終製品とGen3.1試験最終製品との間で共有され、Gen3.1と共有されるGen3由来の固有のCDR3配列の上位80%の87%に相当する。
異なるプロセスについて、16日目の採取時に収集した1×10個の細胞から特定された固有のCD3配列の数。Gen3.1試験条件は、試料内の固有のペプチドCDRの数に基づいて、Gen3.0と比較してわずかに高いクローン多様性を示した。
シャノンエントロピー多様性指数は、比較のための信頼性の高い一般的なメトリックであり、両方の腫瘍に対するGen3.1条件は、Gen3プロセスよりもわずかに高い多
様性を示し、Gen3.1試験条件のTCR VβレパートリーがGen3.0プロセスよりもポリクローナルであることを示唆する。
追加として、Gen3.1試験条件のTCR Vβレパートリーは、腫瘍L4063及びL4064の両方でGen3.0プロセスの対応するレパートリーと87%を超える重複を示した。
再活性化日のGen3.1試験L4064の使用済み培地のIL-2濃度の値は、期待値を下回った(Gen3.1対照及びGen3.0条件と同様であった)。
低い値はピペッティングエラーに起因した可能性があったが、最小限の試料しか採取できなかったため、アッセイを繰り返すことができなかった。
結論0日目のフィーダー及びOKT-3を含むGen3.1試験条件は、Gen3.0及びGen3.1対照と比較して、16日目の採取時の細胞用量のTVCがより高いことを示した。Gen3.1試験条件のTVC最終製品は、Gen3.0よりも約2.5倍高かった。
試験した腫瘍試料の両方について、0日目にOKT-3及びフィーダーを添加したGen3.1試験条件は、採取時にフラスコの最大容量に達した。これらの条件下で、0日目に最大4つのフラスコを開始した場合、最終細胞用量は、80~100×10TILである可能性があった。
最終TIL製品の純度、疲弊、活性化、及びメモリーマーカーを含む表現型特徴付けなどのすべての品質属性が、Gen3.1試験とGen3.0プロセスとの間で維持された。
最終TIL製品のIFN-γ産生は、分析した2つの腫瘍において、Gen3.0と比較して、0日目にフィーダー及びOKT-3を添加したGen3.1で3倍高く、Gen3.1プロセスが強力なTIL製品を生成したことを示唆する。
試験条件にわたって、グルコースまたは乳酸塩レベルに差異は観察されなかった。培地条件にわたって、Gen3.0プロセスとGen3.1プロセスとの間でグルタミン及びアンモニアに差異は観察されなかった。培地上の低レベルのグルタミンは、細胞増殖を制限しておらず、培地へのGlutaMax(商標)のみの添加が、細胞を増殖させるのに必要な栄養素を与えるのに十分であることを示唆する。
11日目及び10日目のスケールアップは、それぞれ、プロセスの採取日に到達した細胞数に関して大きな差異を示さず、代謝物の消費量は、全プロセスにわたって両方の場合で同等であった。この観察結果は、Gen3.0最適化プロセスが処理日に柔軟性を有し、それにより、製造スケジュールの柔軟性を促進することができることを示唆している。
0日目にフィーダー及びOKT-3を添加したGen3.1プロセスは、Gen3.0と比較して、CDR3 TCRab配列分析によって測定されたより高いクローン多様性を示した。
図32は、Gen3プロセス(Gen3最適化プロセス)の実施形態を説明する。標準培地及びCTS Optimizer無血清培地を、Gen3最適化プロセスTIL拡張に使用することができる。CTS Optimizerの場合、培地のGlutaMax(商標)を最終濃度4mMに増加させるために無血清培地が推奨される。
実施例11:CD39/CD69選択に関連した浸潤リンパ球(TIL)拡張及びTILにおける遺伝子ノックアウトのためのプロセス
腫瘍の調製
新たに切除された腫瘍試料は、消化、選別及びGen2製品生成に使用される。写真を撮り、パッケージから腫瘍を取り出し、バイアルを腫瘍の有無にかかわらず秤量し、腫瘍の質量を計算する。
腫瘍消化のために腫瘍全体をおよそ4~6mm3の断片に断片化する。拡張に使用されている細胞集団に応じて、腫瘍を、Gen2プロトコルを使用して、消化及び拡張する。
腫瘍消化のための酵素調製(研究グレードのDNAse、コラゲナーゼ及びヒアルロニダーゼを使用)
以下の消化酵素の各々について示されている滅菌HBSSの量で凍結乾燥酵素を再構成する。これらの酵素は、10倍として調製される。上下に数回ピペッティングし、旋回させて、完全な再構成を確実にする。
1gのコラゲナーゼIV(Sigma,MO,C5138)を10mlのHBSSで再構成する(100mg/mLのストックを作製するため)。上下にピペッティングすることによって混合して溶解する。再構成後に溶解していない場合、37℃のH20浴中で5分間置く。1mlのバイアルに分注する。これは、コラゲナーゼの100mg/mLの10倍作業ストックである。
DNAse(Sigma,MO,D5025)ストック溶液(10,000IU/mL)を調製する。各ロットのDNAseの単位は、添付のデータシートに提供される。HBSSの適切な量を計算して、100mgの凍結乾燥DNAseストックを再構成する。例えば、DNAseストックが2000U/mgである場合、ストック内のDNAseの合計は、200,000IU(2000IU/mg×100mg)である。10,000IUの作業ストックに希釈し、100mgのDNAseに20mlのHBSSを添加する(200,000IU/20ml=10,000U/mL)。1mlのバイアルに分注する。これは、DNAseの10,000IU/mLの10倍作業ストックである。
ヒアルロニダーゼ10mg/mL(Sigma,MO,H2126)ストック溶液を調製する。500mgのバイアルを50mlのHBSSで再構成して、10mg/mLのストック溶液を作製する。1mlのバイアルに分注する。これは、ヒアルロニダーゼの10mg/mLの10倍作業ストックであった。
ストック消化酵素を1倍に希釈する。1倍作業溶液を作製するために、コラゲナーゼ、DNAse、及びヒアルロニダーゼを各々500mlずつ3.5mlのHBSSに添加する。消化物カクテルをCチューブに直接添加する。
腫瘍消化のための酵素調製(GMPコラゲナーゼ及び中性プロテアーゼを使用)
以下の消化酵素の各々について示されている滅菌HBSSの量で凍結乾燥酵素を再構成する。ボトルの側面及びボトル開口部の保護ホイルからのいかなる残留粉末も必ず捕捉する。上下に数回ピペッティングし、旋回させて、完全な再構成を確実にする。
コラゲナーゼAF-1(Nordmark,Sweden,N0003554)を10mlの滅菌HBSSで再構成する。凍結乾燥ストック酵素は、2892PZ U/バイアルの濃度にある。再構成後に、コラゲナーゼストックは、289.2PZ U/mLであった。
中性プロテアーゼ(Nordmark,Sweden,N0003553)を1mlの滅菌HBSSで再構成する。凍結乾燥ストック酵素は、175DMC U/バイアルの濃度にある。したがって、再構成後、中性プロテアーゼストックは、175DMC/mLであった。
DNAse I(Roche,Switzerland,03724751)を1mlの滅菌HBSSで再構成する。凍結乾燥したストック酵素は、4KU/バイアルの濃度にある。したがって、再構成後、DNAseストックは、4KU/バイアルである。
作業GMP消化物カクテルを調製する。10.2μlの中性プロテアーゼ(0.36DMC U/mL)、21.3μlのコラゲナーゼAF-1(1.2PZ/mL)及び250μlのDNAse I(200U/mL)を4.7mlの滅菌HBSSに添加する。消化物カクテルをCチューブに直接入れる。
腫瘍の処理及び消化
GentleMACS OctoDissociatorを使用する場合、腫瘍断片をGentleMACS C-Tube(Cチューブ)または上記の5mlの消化物カクテル中(HBSS中)の50mlのコニカルチューブに移す。2~3個の断片(4~6mm)を各Cチューブに移す。
各Cチューブ(Miltenyi Biotec,Germany,130-096-334)をGentleMACS OctoDissociator(Miltenyi
Biotec,Germany,130-095-937)に移す。製造業者の指示に従って使用する。各腫瘍組織学には、腫瘍解離のための推奨プログラムがあることに留意する。それぞれの腫瘍組織学のために適切なプログラムを選択する。解離は、およそ1時間であった。
GentleMACS OctoDissociatorが利用できない場合、標準ローテーターを使用する。2~3個の腫瘍断片を50mlのコニカルチューブ(漏れを防ぐためにパラフィルムで密封)に入れ、ローテーターに固定した。ローテーターを37℃、5% CO2加湿インキュベーターに置き、1~2時間一定回転させる。代替的に、腫瘍断片は、一定回転させながら、室温で一晩消化され得る。
消化後、OctodissociatorまたはローテーターからCチューブを取り外す。0.22μmのストレーナーを滅菌Falconコニカルチューブに取り付ける。ピペットを使用して、Cチューブ/または50mlのコニカル(5ml)からのすべての内容物を0.22μmのストレーナーを通して50mlのコニカルに通す。Cチューブ/50mlのコニカルを10mlのHBSSで洗浄し、ストレーナーに適用する。滅菌シリンジプランジャーの平らな先端を使用して、フィルターを通していかなる残りの消化されていない腫瘍も解離する。最大50mlのCM1またはHBSSを添加し、チューブにキャップをする。
1500rpm、室温で5分間の遠心分離(9の加速及び減速)によって、試料をペレット化する。慎重に液体を取り除き、細胞計数及び生存率の評価のために、ペレットを5mlのCM1に再懸濁した。
以下のために全腫瘍消化物を取り分ける:1.細胞培養(選択されていないTIL対照)2.FMOフローサイトメトリー対照3.全腫瘍消化物表現型アッセイを予め選別する4.腫瘍反応性/細胞殺傷アッセイのために凍結させる。取り分けられた細胞の数は、総
消化物収量及び腫瘍組織学に依存する。
デブリ除去キットを使用した消化物のクリーンアップ
デブリは、デブリ除去溶液(Miltenyi Biotec,Germany、カタログ番号130-109-398)を製造業者の指示に従って使用して、腫瘍消化物から除去することができる。
腫瘍細胞懸濁液を300Xg、4℃で10分間遠心分離し、上清を完全に吸引する。
以下の表に従って適切な量の冷却緩衝液を用いて細胞懸濁液を慎重に再懸濁し、細胞懸濁液を15mlのコニカルチューブに移す。ボルテックスしない。
適切な量の冷却デブリ除去溶液を添加し、5mlピペットを使用して10~20回ゆっくりと上下にピペッティングすることによってよく混合する。4mlの冷却緩衝液で非常に穏やかに重層させた。PBS/D-PBS相が細胞懸濁液を重層させて、相が混合されないことを確認するために、チューブを傾け、非常にゆっくりとピペッティングする。腫瘍細胞懸濁液を3000Xg、4℃で10分間遠心分離し、完全に加速し、完全に破壊する。3つの相が形成されなければならない。上の2つの相を完全に吸引し、それらを破棄する。
下の相には、デブリ除去溶液及び細胞が含まれている。必ず、少なくとも添加したデブリ除去溶液と同じ量を底に残す。(すなわち、1mlの溶液を添加した場合は、チューブの底に少なくとも1mlを残す)。
冷却緩衝液を用いて15mlにし、チューブを少なくとも3回反転させる。ボルテックスしない。1000Xg、4℃で10分間遠心分離し、完全に加速し、完全に破壊する。細胞計数のために、HBSSまたは培地に細胞を再懸濁する。
細胞選別のために消化された腫瘍を染色する(エクスビボ及び拡張後選別の両方)
腫瘍消化物は、以下のプロトコルに従って、抗CD69、抗CD39、及び抗CD3抗体を含むカクテルで染色される。計数後、細胞を10mlのHBSSに再懸濁する。
ペレットをFACS緩衝液(1×HBSS、1mM EDTA、2%ウシ胎仔血清)に再懸濁する。ペレットに添加されるFACS緩衝液の量は、ペレットのサイズに基づいている。染色量は、ペレットの約3倍のサイズでなければならない。したがって、300μlの細胞がある場合、緩衝液の量は、少なくとも900μlでなければならない。
抗体添加の場合、各100μlの量は、1回の試験(抗体の滴定量)に相当する。すなわち、1mlの量がある場合、10倍量の滴定抗体が必要である。100μlの量当たり滴定量の抗CD3-PE-Cy7、抗CD69 PE及び抗CD39 FITCの各抗体を添加する。細胞を氷上で30分間インキュベートする。インキュベーション中に光から
保護する。インキュベーション中、数回撹拌する。細胞を20mlのFACS緩衝液に再懸濁する。溶液を70ミクロンの細胞ストレーナーに通して、新しい50mlコニカルに通す。400Xg、室温で5分間遠心分離する(9の加速及び減速)。吸引する。細胞を最大10e6/mL合計(live+dead)でFACS緩衝液に再懸濁する。最小量は、300μlである。滅菌ポリプロピレンFACSチューブまたは15mlコニカルチューブに移す。FACS選別用の3ml/チューブ。選別された集団用に15ml収集チューブを準備する。2mlのFACS緩衝液をチューブに入れる。
細胞計数及び生存率
細胞及び生存率の計数を取得するための手順は、Nexcelom Cellometer K2または同等の細胞カウンターを使用した。
FACS選別(FX500スタートアップ手順)
注記:他のフローサイトメーターのプロトコルは異なり、機械使用についての製造業者の指示に従い、必要に応じて適応される。
スタートアップ後、プロンプトが表示されたら、PBS/EDTA緩衝液の4つのバッグをすべて取り付ける。PEEK試料ラインを取り付ける。プロセスの詳細な説明については、「LE-FX500オペレーターガイド」を参照されたい。
機器を設定する。レーザー選択のプロンプトが表示されたら、3つのレーザーをすべて選択する(488nm、561nm、及び638nm)。フィルター設定を求めるプロンプトが表示されたら、「標準」ラジオボタンを選択する。自動キャリブレーションを実行する。キャリブレーションビーズをロードするようにプロンプトが表示されたら、15滴の自動セットアップビーズを5mlの滅菌FACSチューブに添加する。次いで、プロンプトに従う。
自動キャリブレーションの設定を選択するようにプロンプトが表示されたら、「標準」ラジオボタンを選択した。キャリブレーションが完了するのを待っている間に、以下を準備する。
●10mlの滅菌脱イオン水を用いて5本の滅菌15mlコニカルチューブを準備する。
●4mlの滅菌脱イオン水を用いて5本の滅菌5ml FACSチューブを準備する。
●12mlの70% EtOHを含む5本の滅菌15mlコニカルチューブを準備する。
●12mlの10%次亜塩素酸ナトリウムを含む5本の滅菌15mlコニカルチューブを準備する。
用いられる標準的な方法に従って、及び用いられるフルオロフォアに基づいて、細胞を選別する。
試料収集
試料チャンバ及び収集チャンバが5℃であり、撹拌試料アイコンが選択されていることを確認する。スクリーンの上部の[サイトメーター(Cytometer)]タブ及び[収集(Collection)5℃]アイコンならびに[試料(Sample)5℃]アイコンをクリックする。[撹拌(Agitate)]アイコンをクリックする。試料が補正されていることを確認する。スクリーンの上部の[補正(Compensation)]タブをクリックする。
PBMC対照を含むチューブ(5ml FACSチューブまたは15mlコニカルのい
ずれか)を試料収集プラットフォームに配置する。試料収集圧力を6に設定した。試料収集を開始する。[ゲート及び統計(Gates and Statistics)]テーブルをクリックし、上記に見られる両方のドロップダウンメニューで100,000を選択する。
細胞集団が正しくゲーティングされていることを検証する。BSCまたはFSCの設定を調整する必要があり得る。しかしながら、いずれの他のチャネルについても電圧を調整しない。
ゲートの調整が完了したら、記録せずに[停止(Stop)]をクリックし、チューブを取り外す。次のチューブアイコンをクリックし、チューブを右クリックして、[名前の変更(Rename)]を選択する。チューブを「PE fmo」とラベル付けする。チューブを装填し、再生を押す。注記:このチューブには通常、あまり多くの細胞は存在しなかった。必要に応じてゲートを調整する。
ゲートが満たされた場合、できるだけ多くの事象(または最大20,000のCD3事象)を記録する。この収集を高速化するために、試料圧力を10に設定することができる。
収集を停止し、チューブを取り外す。以前に作製された滅菌dH20の15mlコニカルチューブを試料プラットフォーム上に装填する。試料圧力として10を選択する。試料を1分間収集する。CD3ゲートに事象がなくなるまで繰り返す。dH20試料チューブを取り外して、廃棄した。メニスカスの底及び中間点に永続的なマーカーを付けて、収集されるチューブにラインを引く。
収集される試料を装填プラットフォーム上に添加する。設定を検証する。試料圧力として4を選択する。細胞がスクリーンに表示されるのを待つ。約15秒。画分が表示されたら、一時停止する。3つの画分のうち最も低い2つを最初に収集する。
試料チャンバのドアを開き、15mlの収集チャンバブロックをチャンバに装填する。収集緩衝液を含む収集チューブをチャンバブロックに装填する。キャップ付きチューブを数回反転させて、チューブの上部を収集緩衝液でコーティングする。BSCの表面上でチューブを軽くたたいて、チューブ及びキャップの上部から余分な緩衝液を取り除く。CD39-/CD69-(例えば、CD39LO/CD69LO及び/またはCD39/CD69二重陰性)画分を選択する。キャップを外し、チューブを試料チャンバブロックに入れる。チューブの位置に一致するように正しい右/左の向きを選択する。[ロード収集(Load Collection)]アイコンをクリックする。
1秒当たりの全事象が5,000未満になるように、試料圧力を調整する。選別開始アイコンをクリックする。少なくとも85%の選別効率を維持するように試料圧力を調整する。50,000件のCD3事象を記録する。試料のおよそ3分の2が空になったら、選別を停止する。最も多くの事象を含む収集された試料を取り除く。キャップを閉め、氷上または4℃で置く。最も高いパーセンテージの細胞の収集中に、より多くの細胞を収集することができるように、収集チャンバに少量の試料を残す。収集チューブをラベル付けし、キャップを取り外した。それを収集チャンバに入れる。
選別収集の適切な左/右方向を選択する。収集チューブを装填する。再生、記録を押して、選別を開始する。試料のおよそ3分の1が空になったら、選別を停止する。収集した画分を取り除く。キャップを閉め、氷上または4℃で置き、ホルダーの左側にCD3収集チューブを入れる。
左側をCD3用にし、右側の選別を空白にした。すべての試料が試料チューブからなくなるまで、選別を継続する。チューブが「枯渇」しても問題ない。試料チャンバから試料チューブを取り外し、廃棄する。収集チャンバから選別された画分を取り出す。チューブに蓋をし、チューブの上部近くの液滴を溶液に取り込むために、数回穏やかに反転させる。BSCの表面上でチューブを軽くたたいて、チューブとキャップの上部から余分な溶液を取り除く。チューブを氷上に置く。
CD39LOCD69LO画分の純度パーセントを確認する。滅菌dH2Oの14mlコニカルチューブを試料チャンバに入れる。[プローブ洗浄(Probe Wash)]アイコンをクリックする。繰り返す。dH2Oチューブを取り外し、陽性画分チューブを追加する。試料圧力値を10に変更する。次のチューブアイコンをクリックする。チューブに試料名及び「hi select」の名前を付ける。再生をクリックし、75のCD3陽性事象を記録する。すぐにチューブを停止し、試料チャンバからチューブを取り外す。
残りの試料についてもこれらの手順を繰り返す。
データをエクスポートする。
「fmo」チューブをダブルクリックして選択し、レポートを保存する。収集したチューブの各々に対して繰り返す。
REP1開始
細胞の数が最も少ない条件を使用して、REP1開始の細胞の数を決定することができる。(選別中に決定された)CD3細胞の%を使用して、選別された試料と同じ数のCD3細胞で、選択されていないTIL集団において、REP1を開始するために必要とされる消化物全体の細胞の総数を計算する。REP1開始のための全消化細胞の総数=REP1に接種された選別された細胞の数/CD3細胞の%。
およそ1000~100,000個の細胞CD3+細胞を、G-REX10または同等のフラスコに、それぞれ、3000IU/mLのIL-2を含む、7mlまたは40mlのCM2(50% RPMI 1640+10%ヒト血清、glutamax、ゲンタマイシン、及び50% AimV)とともに11日間入れる。CD39LOCD69LOで選別された集団及び選択されていないTILに対して、少なくとも1つのG-REXフラスコが開始される。抗CD3(クローン:OKT3)(30ng/mL)及びフィーダー(1:100比(TIL:フィーダー))を、培養開始時に各フラスコに添加する。
プレート/フラスコ内の細胞を11日間インキュベートし、培地の交換は行わない(REP1)。単一のREP条件は、細胞をさらに3~7日間培養し続け、次いで特性評価に進む。
REP1の完了時に、G-REX 10の場合は、およそ30mlの培地を取り出す。上下にピペッティングすることによって、細胞を残りの培地に再懸濁する。細胞を50mlのコニカルに入れ、1500rpmで5分間遠心分離する(9の加速及び減速)。
計数及び生存率の評価については、培地を吸引し、細胞を10~20mlのCM2に再懸濁する。
REP2開始
mini-REP2の開始のために、1e5細胞を、40mlのCM2培地及び3000IU/mLのIL-2を含むG-REX 10または同等物に入れた。抗CD3(クロ
ーン:OKT3)(30ng/mL)及びフィーダー(1:100比、TIL:フィーダー)を、培養開始時に添加した。
「フルスケール実行」の場合、2e6-30e6個の細胞を、G-REX 100Mまたは同等物中の1LのCM2培地及び3000IU/mのIL-2中で拡張する。抗CD3(クローン:OKT3)(30ng/mL)及びフィーダー(1:100比、TIL:フィーダー)を、培養開始時に添加した。
培地交換(小規模の場合)または培地交換+分割(「フルスケール実行の場合)」は、REP2の5日目(プロセスの16日目)に行われる。フラスコを、およそ10ml(G-REX 10)または100ml(G-REX 100M)に減容し、CM2またはAimV+3000IU/mLのIL-2のいずれかで、40ml(G-REX 10)または1L(G-REX 100M)に補充した。「フルスケール実行」の場合、フラスコを1:2に分割する。
REP2の11日目(またはプロセスの22日目)に、フラスコを減容し、1500rpm、室温で5分間遠心分離する(9の加速及び減速)。
最終産物を、細胞計数、生存率、表現型、サイトカイン産生、TCRVβレパートリー分析、及び腫瘍特異的反応性について評価する。
図34は、実施例15に概説されるプロセスの概略図を提供する。
実施例15の参考文献:
1.Rosenberg,S.A.,et al.,Durable complete
responses in heavily pretreated patients with metastatic melanoma using T-cell transfer immunotherapy.Clin Cancer Res,2011.17(13):p.4550-7。
2.Kvistborg,P.,et al.,TIL therapy broadens the tumor-reactive CD8(+)T cell compartment in melanoma patients.Oncoimmunology,2012.1(4):p.409-418。
3.Simoni,Y.,et al.,Bystander CD8(+)T cells are abundant and phenotypically distinct in human tumour infiltrates.Nature,2018.557(7706):p.575-579。
4.Schumacher,T.N.and R.D.Schreiber,Neoantigens in cancer immunotherapy.Science,2015.348(6230):p.69-74。
5.Turcotte,S.,et al.,Phenotype and function of T cells infiltrating visceral metastases from gastrointestinal cancers and melanoma:implications for adoptive cell transfer therapy.J Immunol,2013.191(5):p.2217-25。
6.Inozume,T.,et al.,Selection of CD8+PD-1+ lymphocytes in fresh human melanomas enriches for tumor-reactive T cells.J Immunother,2010.33(9):p.956-64。
7.Gros,A.,et al.,PD-1 identifies the patient-specific CD8(+)tumor-reactive repertoire infiltrating human tumors.J Clin Invest,2014.124(5):p.2246-59。
8.Thommen,D.S.,et al.,A transcriptionally and functionally distinct PD-1(+)CD8(+)T cell pool with predictive potential in non-small-cell lung cancer treated with PD-1 blockade.Nat Med,2018。
実施例12:急速拡張プロトコル(REP)中のAKT阻害は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)のメモリー特性及びサイトカイン産生を拡張し、メモリー前駆体幹細胞様(CD39-CD69-)細胞の集団を増加させる
異なる適応症からの患者の腫瘍を受け取り、断片化し、TIL製造のための拡張プロトコルに供した。異なる用量(0.3μM及び1μM)のpan-AKT阻害剤(AKTi)イパタセルチブを、エクスビボ拡張中に培養物に添加した。TILの拡張可能性、ならびに表現型及び機能的特性を最終TIL製品上で評価した。
1μM用量でのAKTi処理は、対照と比較してTILの同等の拡張及び生存率をもたらしたが、低分化CD39-CD69-細胞の集団を2倍にした。この効果は、再刺激後でさえも存在し、これらの細胞は、CD38ならびに転写因子T-bet及びToxの発現の低下を示し、分化が少なく、疲弊した表現型を示唆している。重要なことに、AKTi処理は、IFNγ+TNFα+CD8+T細胞の頻度の増加をもたらし、これは、細胞傷害性の増加につながった。
エクスビボTIL拡張中のAKTi処理は、分化のより少ない、よりメモリー様の機能的TILの割合を増加させた。したがって、TIL拡張中のAKTシグナル伝達を時間的に阻害することは、TILの質を向上させ、臨床設定におけるTILの持続性及び治療有効性を向上させるためのアプローチを表すことができる。
実施例13:黒色腫患者のB細胞及びT細胞治療効果を増強するための原発性リンパ球培養物の生体外刺激
この実施例は、本明細書に記載の例示的な方法において黒色腫の治療のための養子細胞療法において使用するためのREP前拡張中にB細胞及びT細胞を含む採取したTIL集団を刺激するための簡略化した手順を説明する。
最近の研究は、B細胞浸潤が免疫チェックポイント阻害剤への改善された臨床応答と関連していることを実証している。Petitprez F,et al.(2020).Nature.577:556-56。
黒色腫がTIL療法に応答しなかった12人(非応答者)及び応答した8人(応答者)を含む20人のアッセイでは、FFPE黒色腫試料のRNA-seq分析は、クラススイッチされたメモリーB細胞のより高い含有量が、診療所での療法に応答したクラスと密接に対応したことを実証する。
結果として、REP前刺激研究は、TIL集団におけるB細胞応答を増強することを試みるように設計された。簡潔には、凍結腫瘍消化物を、0日目に開始し、48時間継続するCD40Lの存在下または非存在下のいずれかで、標準的なプロトコル(実施例を参照されたい)によって培養した。次いで、細胞を特定の腫瘍認識についてアッセイし、応答した集団は、REP相で第2の拡張を受ける。
まず、CD40アゴニストによる刺激の効果をB細胞で評価した。48時間のCD40L処理は、フローサイトメトリーによってアッセイされるように、CD80+ CD86+ B細胞集団を有意に増加させ、これは、活性化された(すなわち、クラススイッチングされた)メモリーB細胞のマーカーであり、対照TIL集団と比較して、およそ20倍の平均増加を伴う。
次に、REP前TIL集団の全体的な細胞計数を行って、CD40L刺激が全体的な拡張に及ぼす影響を評価した。CD40Lによって刺激されたTIL集団は、対照条件下よりも3倍拡張する可能性が高く、拡張は、同様に、刺激された集団について平均して顕著により堅牢である。
TIL集団内のT細胞に対する刺激の影響も評価した。特に、CD40L刺激は、CD8+T細胞集団を減少させることなく、CD4+T細胞の数の有意な増加をもたらす。さらに、CD40L刺激は、TIL集団内のエフェクターメモリーT細胞(TEM細胞)の量の有意な増加をもたらすが、中央メモリーT細胞またはCD45+TEM細胞のいずれにおいても同様の増加は観察されない。最後に、CD39-CD69-T細胞の割合をこれら2つの条件の間で評価した。CD40L刺激は、対照と比較して、この亜集団の顕著な増加をもたらす。
次のステップは、REP後相におけるTIL集団に対するCD40L刺激の影響を評価することであった。REP後T細胞を、疲弊のマーカーについてアッセイした。拡張の14日後、CD40L刺激集団と対照TIL集団との間に有意差は認められなかった。さらに、同じ時点でCD39-CD69-亜集団の相対サイズを評価したときに有意差は見られなかった。
結論
少なくともCD40Lによる拡張前刺激は、有病率CD8に影響を与えることなく、CD4+T細胞集団の増加をもたらした。さらに、この刺激は、REP前アッセイした場合、CD39-CD69-集団の増加をもたらした。最後に、CD40Lによる刺激は、刺激のない標準的な拡張プロトコルと比較して、凍結保存した試料からより高い生存率及びより大きな拡張をもたらした。全体として、この実施例は、少なくともCD40Lによる拡張前刺激が、得られたTIL集団が患者に投与されるときに利益をもたらし得ることを示唆する。
実施例14:IL-2及びGDC-0068の滴定、REP前条件下でのREP前細胞におけるIL-2+IL-21(10ng/ml)の組み合わせの試験
この実施例は、凍結したREP前細胞を使用したREP前条件中の、より低用量のIL-2の単独での、またはAKT阻害剤GDC-0068及びIL-21(10ng/ml)の異なる濃度との組み合わせでの効果の決定を説明する。幹様属性及びエフェクター分化の防止に関連する、生存率、収率、ならびにREP前の後のTILの他の表現型特性及び機能的特性を含む、様々なパラメータを分析する。この研究の目的は、REP前中に使用するIL-2の用量を調べ、AKTi(及びどの濃度で)またはIL-21の組み合わせが、拡張プロセスのこの相でTILの表現型をさらに改善できるかどうかを決定することであった。
凍結したREP前TILを解凍し、24ウェルGREXプレート中の異なるサイトカイン条件を使用して、REP前条件下で培養した。サイトカインを2回与えた(REP前の0日目及び5日目)。
これらの実験の結論(図76~79に示される)は、REP前中のIL-2の濃度が、6000~3000IU/mlの範囲で有用である可能性が高いことを含む。REP前の間のAKTi処理の濃度は、REP中よりも低くする必要があり得る。GDC-0068の場合、1uMの濃度が選択される。10ng/mlのIL-2及びIL-21の組み合わせは、TILに有益な表現型の変化を与える。
実施例15:低用量のIL-2及びIL-21と組み合わせたREP中の異なるAKT阻害剤の効果の試験
この実施例は、TILの表現型に対する、低用量のIL-2(1000IU/ml)及びIL-21(10ng/ml)と組み合わせた、異なるAKT阻害剤の効果の評価を説明する。幹様属性及びエフェクター分化の防止に関連する、生存率、収率、ならびにREP後のTILの他の表現型特性及び機能的特性を含む、様々なパラメータを分析する。これらの実験の包括的な目標は、TILの機能的特徴及び表現型特徴を改善しながら、それらの幹様属性を増強するために、TILの拡張プロセス中の成長条件を決定することである。
凍結したREP前TILを解凍し、24ウェルのGREXプレート中の異なるサイトカイン条件下でREP化した。サイトカインを2回投与した(REPの0日目及び5日目)。REPプロトコルは、この時点で、以前の実験の結果に基づいて修正された。特に、当該修正は、以下を含む:
1)フィーダー:TIL比を、400万個のフィーダー及び1ウェル当たり20,000TIL、30ng/mLのOKT3によって200:1に増加させた。
2)0日目に、サイトカイン及び化合物を含む3mLのCM2でREPを開始する。
3)5日目に、5mLのCM4培地を各ウェルに添加した。
4)すべてのサイトカイン及び化合物を、0日目及び5日目に2回添加する。
5)4つの異なる適応症からのREP前TILを解凍し、G-REX 24ウェルプレート内でREP化した。
6)REP TILを一晩静置し、続いて細胞表面及び細胞内マーカーを作製した。
この研究で試験した条件は、以下を含む:IL-2 3000IU/mL、IL-2 1000IU/mL、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+5uM GDC-0068、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+3uM GSK2110183、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+3uM AZD5363、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+3uM MK-2206、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+0.2ボルセルチブ、及びIL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+1uM
AT7867。
この研究の結論(図80~88に示される)は、より低いレベルのIL-2(1000IU/ml)及びIL-21(10ng/ml)を有するREP条件下で添加されたAKTiが、CD127+TILの頻度の増加、より低い活性化PD1-TIM3-TILの頻度の増加、LAG3、TIM3及びTIGIT発現細胞の頻度の減少、TILにおけるCD25及びCD38発現の頻度の減少、ならびにより活性化及び分化されたCD69+CD39+TILの頻度の減少をさらに増強することを含む。
実施例16:IL-21及びAKTiの有無にかかわらず、より低用量のIL-2の効果を評価することによる、REP前の条件の選択
この実施例は、異なる濃度のIL-21及びAKTiの有無にかかわらず、より低用量のIL-2を使用することによる、TILのREP前拡張の条件の評価を説明する。この
研究では、MK-2206を使用した。幹様属性及びエフェクター分化の防止に関連する、生存率、収率、ならびにREP前の後のTILの他の表現型特性及び機能的特性を含む、様々なパラメータを分析する。これらの実験の包括的な目標は、TILの機能的特徴及び表現型特徴を改善しながら、それらの幹様属性を増強するために、TILの拡張プロセス中の成長条件を調べることである。
凍結したREP前TILを解凍し、24ウェルGREXプレート中の異なるサイトカイン条件下で再度REP前化した。サイトカインを2回投与した(REP前の0日目及び5日目)。凍結したREP前細胞を解凍し、24ウェルG-Rexプレート中に200万個の細胞でプレートして、別のREP前ラウンドを行った。4つの異なる適応症からのREP前TILを使用した。11日間のREP前プロセスの後、TILを、抗CD3/CD28ビーズで染色するか、または一晩刺激した。以下の条件を試験した:IL-2 6000IU/mL、IL-2 3000IU/mL、IL-2 3000IU/mL+0.5uM MK-2206、IL-2 1000IU/mL+1uM MK-2206、IL-2 1000IU/mL+IL-21(10ng/ml)、IL-2 1000IU/mL+IL-21(3ng/ml)、IL-2 1000IU/mL+IL-21(10ng/ml)+1uM MK-2206、及びIL-2 1000IU/mL+IL-21(3ng/ml)+1uM MK-2206。
これらの実験(図89~97に示される)の結論は、3000IU/mlのIL-2とIL-21(10ng/ml)との組み合わせが、活性化の低下及び機能の改善に関連するTILに有益な表現型変化を付与したことを含む。これらの条件は、I-TILプロセスのいくつかの実施形態では、REP前相について選択される。
実施例17:REP中のIL-2+IL-21と組み合わせた様々なAKT阻害剤の濃度の試験
この実施例は、IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)と組み合わせた滴定用量の異なるAKT阻害剤の、エフェクター分化を予防すること、より多くの幹様属性を促進すること、及びREP中のTILの機能性を改善することに対する効果に関するさらなる評価を説明する。これらの実験の包括的な目標は、TILの機能的特徴及び表現型特徴を改善しながら、それらの幹様属性を増強するために、TILの拡張プロセス中の成長条件を調べることである。
凍結したREP前TILを解凍し、24ウェルのGREXプレート中の異なる条件下でREP化した。サイトカインを2回投与した(REP前の0日目及び5日目)。以下の条件は、24ウェルG-Rexプレートで使用されるREPプロトコルに含まれていた:
1)フィーダー:TIL比を、400万個のフィーダー及び1ウェル当たり20,000TIL、30ng/mLのOKT3によって250:1にした。
2)0日目に、サイトカイン及び化合物を含む3mLのCM2でREPを開始する。
3)5日目に、5mLのCM4培地を各ウェルに添加した。
4)すべてのサイトカイン及び化合物を、0日目及び5日目に2回添加する。
3つの異なる適応症からのREP前TILを解凍し、G-REX 24ウェルプレート内でREP化した。以下の条件を試験した:IL-2 3000IU/mL、IL-2 1000IU/mL、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+5uM GDC-0068、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+5uM GDC-0068+20nM DAC、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+5uM GDC-0068+300uM L-2HG、IL-2
1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+0.2ボルセルチブ、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+3uM GSK2110183、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+1uM AZD5363、
IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+2uM AZD5363、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+1uM MK-2206、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+2uM MK-2206、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+3uM GDC-0068+TGFb(5ng/ml)、及びIL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+TGFb(5ng/ml)。
これらの実験の結論(図98~106に示される)は、IL-21(10ng/ml)と組み合わせた1000IU/mlのIL-2と組み合わせた異なるAKT阻害剤が、阻害性受容体の発現、活性化の低下、より多くの幹様特性、及び機能の改善に関連するIL-21と組み合わせたIL-2レベルの低下によって既に付与された変化を除いて、TILにさらなる有益な表現型変化を付与したという所見を含む。
実施例18:REP中のIL-2+IL-21と組み合わせたAZD5363の試験
この実施例は、エフェクター分化を予防すること、より多くの幹様属性を促進すること、及びREP中のTILの機能性を改善することに対するIL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)と組み合わせたAZD5363の濃度及び投与量の試験を説明する。これらの実験の包括的な目標は、TILの機能的特徴及び表現型特徴を改善しながら、それらの幹様属性を増強するために、TILの拡張プロセス中の成長条件を調べることである。
凍結したREP前TILを解凍し、24ウェルのGREXプレート中の異なる条件下でREP化した。サイトカインを2回与えた(REP前の0日目及び5日目)。3つの異なる適応症からのREP前TILを解凍し、G-REX 24ウェルプレート内でREP化した。以下の条件は、24ウェルG-Rexプレートで使用されるREPプロトコルに含まれていた:
1)フィーダー:TIL比を、400万個のフィーダー及び1ウェル当たり20,000TIL、30ng/mLのOKT3によって250:1にした。
2)0日目に、サイトカイン及び化合物を含む3mLのCM2でREPを開始する。
3)5日目に、5mLのCM4培地を各ウェルに添加した。
4)すべてのサイトカイン及び化合物を、0日目及び5日目に2回添加する。
以下の条件を試験した:IL-2 3000IU/mL、IL-2 1000IU/mL、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+1uM AZD5363(2回添加)、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+1uM AZD5363(1回添加)、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+2uM AZD5363(2回添加)、及びIL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+2uM AZD5363(1回添加)。
これらの実験(図107~117に示される)の結論には、1回または2回、1000IU/ml+IL-21(10ng/ml)でIL-2と組み合わせて投与された1または2uMのAZD5363が、阻害性受容体の発現の低下、活性化の低下、より多くの幹様特性、及び機能性の改善に関連するIL-21と組み合わせたIL-2レベルの低下によって既に付与された変化を除いて、TILにさらなる有益な表現型変化を付与したという所見が含まれる。
実施例19:高用量のIL-2またはIL-15とのIL-21及びAKTiの使用の比較
この実施例は、IL-2またはIL-15の用量の増加と併せて、IL-21(10n
g/ml)+AZD5363の効果の評価、ならびにエフェクター分化を予防すること、より多くの幹様属性を促進すること、及びREP中のTILの機能性を改善することに対する全体的な影響の評価を説明する。これらの実験の包括的な目標は、TILの機能的特徴及び表現型特徴を改善しながら、それらの幹様属性を増強するために、TILの拡張プロセス中の成長条件を調べることである。
凍結したREP前TILを解凍し、24ウェルのGREXプレート中の異なる条件下でREP化した。サイトカインを2回投与した(REP前の0日目及び5日目)。3つの異なる適応症からのREP前TILを解凍し、G-REX 24ウェルプレート内でREP化した。以下の条件は、24ウェルG-Rexプレートで使用されるREPプロトコルに含まれていた:
1)フィーダー:TIL比を、400万個のフィーダー及び1ウェル当たり20,000TIL、30ng/mLのOKT3によって250:1にした。
2)0日目に、サイトカイン及び化合物を含む3mLのCM2でREPを開始する。
3)5日目に、5mLのCM4培地を各ウェルに添加した。
4)すべてのサイトカイン及び化合物を、0日目及び5日目に2回添加する。
以下の条件を試験した:IL-2 3000IU/mL、IL-2 2000IU/mL、IL-2 1000IU/mL、IL-2 3000IU/mL+IL-21 10ng/ml、IL-2 2000IU/mL+IL-21 10ng/ml、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml、IL-2 3000IU/mL+IL-21 10ng/ml+2uM AZD5363(1回添加)、IL-2 2000IU/mL+IL-21 10ng/ml+2uM AZD5363(1回添加)、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+2uM AZD5363(1回添加)、及びIL-15 10ng/ml+IL-21 10ng/ml+1uM AZD5363(2回添加)。
これらの実験(図118~127に示される)の結論には、一度与えられたIL-2(1000IU/ml)、IL-21(10ng/ml)、及び2uM AZD5363の組み合わせが、阻害性受容体発現の頻度を低下させながら、REPプロセス中のエフェクター分化を防止すること、TILの幹様表現型を増加させること、及び機能的応答を改善することにおける所望の変化のうちの多くを誘導するという所見が含まれる。これらの効果は、IL-15(10ng/ml)、IL-21(10ng/ml)、及びAZD5363に匹敵したが、この後者の組み合わせによるサイトカイン産生、特にIL-2に対する効果は、非常に顕著であった。IL-15の組み合わせはまた、TILの活性化状態をさらに低下させた。
実施例20:IL-15(10ng/mL)及びIL-21(10ng/mL)とともに使用するためのAZD5363の濃度及び用量の評価
この実施例は、IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)と比較した、IL-15(10ng/ml)+IL-21(10ng/ml)と組み合わせたAZD5363に使用する用量及び濃度の評価、ならびにエフェクター分化を防止すること、幹様表現型を増加させること、及びREP中のTILの機能性を改善することに対する全体的な影響の評価を説明する。これらの実験の包括的な目標は、TILの機能的特徴及び表現型特徴を改善しながら、それらの幹様属性を増強するために、TILの拡張プロセス中の成長条件を調べることである。
3つの異なる適応症からのREP前TILを解凍し、G-REX 24ウェルプレート内でREP化した。サイトカインを2回投与した(REP前の0日目及び5日目)。以下の条件は、24ウェルG-Rexプレートで使用されるREPプロトコルに含まれていた:
1)フィーダー:TIL比を、400万個のフィーダー及び1ウェル当たり20,000TIL、30ng/mLのOKT3によって250:1にした。
2)0日目に、サイトカイン及び化合物を含む3mLのCM2でREPを開始する。
3)5日目に、5mLのCM4培地を各ウェルに添加した。
4)すべてのサイトカイン及び化合物を、0日目及び5日目に2回添加する。
以下の条件を試験した:IL-2 3000IU/mL、IL-2 1000IU/mL+IL-21 10ng/ml+2uM AZD5363(1回添加)、IL-15 10ng/ml+IL-21 10ng/ml+2uM AZD5363(1回添加)、IL-15 10ng/ml+IL-21 10ng/ml+1uM AZD5363(2回添加)、及びIL-15 10ng/ml+IL-21 10ng/ml+2uM、続いて1uM AZD5363。
これらの実験(図128~137に示される)の結論には、IL-15(10ng/ml)、IL-21(10ng/ml)、及びAZD5363の組み合わせが、阻害性受容体発現の頻度を低下させながら、REPプロセス中のエフェクター分化を防止すること、TILの幹様表現型を増加させること、及び機能的応答を改善することにおける所望の変化のうちの多くを誘導するという所見が含まれる。特に、IFNg、TNFa及びIL-2を増加させることに対する効果は、IL-2(1000IU/ml)及びIL-21(10ng/ml)よりも顕著である。IL-15(10ng/ml)及びIL-21(10ng/ml)と組み合わせたAZD5363の用量及び濃度は、I-TILプロセスの様々な実施形態において2回与えられる1μMである。
実施例21:I-TILプロセスの条件の評価
この実施例は、REP相中のIL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)+2uM AZD5363の使用と、IL-15(10ng/ml)+IL-21(10ng/ml)+2uM AZD5363の使用とを比較した、I-TILプロセスの条件の検討を説明する。これらの実験の包括的な目標は、TILの機能的特徴及び表現型特徴を改善しながら、それらの幹様属性を増強するために、TILの拡張プロセス中の成長条件を調べることである。
腫瘍(N=18)を受け取り、REP前及びREP拡張の両方について処理して、好ましい条件のセットを試験及び選択し、最終I-TIL(活性化TIL)条件として指名した。
新鮮な腫瘍を使用して6ウェルG-Rexプレートで試験したREP前条件は、以下を含む:IL-2(6000IU/ml)及びIL-2(3000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)。サイトカインを、REP前の0日目及び5日目に2回添加した。
次いで、REPを同時に開始するために、すべてのREP前試料が生成されるまでREP前細胞を凍結させた。凍結したREP前TILを解凍し、それらに対応する条件で一晩静置し、続いて、24ウェルのG-Rexプレート中でREPを行った。試験した条件は、以下を含む:IL-2(3000IU/mL)、IL-2(1000IU/mL)+IL-21(10ng/ml)、IL-2(1000IU/mL)+IL-21(10ng/ml)+2uM AZD5363、IL-15(10ng/ml)+IL-21(10ng/ml)、及びIL-15(10ng/ml)+IL-21(10ng/ml)+2uM AZD5363。サイトカインを0日目及び5日目に2回添加し、AZD5363をREPの0日目に1回のみ添加した。
これらの実験(図138~147に示される)の結論には、IL-15(10ng/ml)、IL-21(10ng/ml)、及びAZD5363の組み合わせが、阻害性受容
体発現の頻度を低下させながら、REPプロセス中のエフェクター分化を防止すること、TILの幹様表現型を増加させること、及び機能的応答を改善することにおける所望の変化のうちの多くを誘導するという所見が含まれる。特に、IFNg、TNFa及びIL-2の増加に対する効果は、IL-2(1000IU/ml)+IL-21(10ng/ml)+AZD5363条件の場合よりも顕著である。これは、CXCR3の発現及びCD69+CD39+細胞の減少についても同様である。このプロセスの収率及び生存率はまた、IL-15条件によって顕著に増強される。
実施例22:INVIGO-Tプロセスと他のプロセスとの比較
この実施例は、Invigo-T(本明細書ではI-TILとも称される)プロセスの態様を、Gen2プロセス及びAZD5363を含まないInvigo-Tプロトコルを含む、TILを拡張するために使用される他のプロセスと比較して説明する。これらの実験の包括的な目標は、Invigo-Tプロセスで拡張されたTILの表現型特徴と、それらが他のものとどのように異なるかを調べることである。
REP後TILをFACSによって、Brefeldin Aの存在下、1ug/mlで6時間のOKT3刺激後のサイトカイン発現について評価した。測定された3つのサイトカインすべての発現を示すCD8+TILの頻度は、Gen2対照またはAZD5363を含まないInvigo-Tと比較して顕著に上昇した。CD4+TILについて同様の結果が観察された(データは図示せず)。
次いで、10:1のエフェクター対標的細胞でのKILR(登録商標)THP-1細胞との24時間の共培養後、同種異系環境で細胞傷害性を試験した。Invigo-Tプロセスは、Gen2対照よりも顕著に高い細胞傷害性を示したが、AZD5363の有無にかかわらず有意差はなかった。次に、TILを、TransActで3日毎に刺激し、続いてKILR(登録商標)THP-1細胞で24時間共培養した後、細胞傷害性及びIFNg発現を評価した(フローサイトメトリー染色によって測定した)。Invigo-Tプロセスは、再び、Gen2対照よりも顕著に高い細胞傷害性を示した。これは、AZD5363を含まないGen2またはInvigo-Tのいずれかと比較した、I-TILプロセスのIFNgレベルの上昇と相関した。これらの結果は、試験した他の2つの条件と比較して、CD8+TILまたはCD4+TILのいずれかでInvigo-Tプロセスで観察された全体的な表現型変化と相関する。
これらの実験の結論(図148~150に示される)は、Invigo-Tの拡張プロセスが、同種異系設定におけるTILの多機能性及びTIL細胞傷害性を増加させることを含む。これらの変化は、CD8+及びCD4+TIL上の機能的マーカーのより大きな発現において表現型的に明らかである。
Invigo-T拡張プロセスは、増強された多官能性、阻害性受容体発現の減少、より幹様の表現型(図154B)、ならびに活性化及び分化のより少ないTILの頻度の増加を含む、TIL持続性及び応答の両方に相関する複数のメトリックを通じて顕著な改善を提供する。
scRNAseqデータは、Invigo-Tで処理された試料が、応答と相関するCD39CD69(DN)遺伝子クラスターで濃縮され(図155)、分化のより少ない表現型をさらに裏付けることを示す(図157及び159)。追加として、scRNAseqデータは、CD8(図154)及びCD4 TIL(図160)の両方についての疲弊関連遺伝子シグネチャの発現の減少を裏付ける。
方法:
単一細胞RNA配列決定
凍結保存した対照またはInvigoTで処理したTIL(1群当たりn=5)を解凍し、PBS+0.04% BSAで2回洗浄した。細胞生存率を、AOPIを使用して、Nexcelom Cellaca自動セルカウンターを使用して評価した。製造業者のガイドラインに従って、Miltenyi死細胞除去キットを使用して、75%未満の生細胞を含有する試料上で死細胞除去を行った。10×Chromium Xコントローラーを使用して、単一セルゲルビーズエマルションを調製した。配列決定ライブラリーを、製造業者ガイドラインに従って、10×5’免疫プロファイリングv2試薬を使用して調製し、90塩基対の挿入読み取り長さを有するIllumina NextSeq2000機器上で配列決定した。デフォルトパラメータを有するCell Ranger v7(10×ゲノミクス)を使用して、一次及び二次データ分析を行った。RパッケージSeurat1を、三次分析及びデータ可視化に使用した。3つ未満の細胞で検出された遺伝子を破棄した。クロノタイプクラスター化バイアスを回避するために、TCRA及びTCRB遺伝子を除去した。以下の経験的に決定されたフィルターを適用して、死細胞、二重鎖、または低品質の細胞を除去した。ミトコンドリア読み取り率が8%未満であり、検出された遺伝子の数が500~6000個である。得られた合計88,396個の個々の細胞を下流分析に使用した。細胞型識別のために、試料は、デフォルトパラメータを有するSeuratパッケージからのFindTransferAnchors及びMapQuery関数を使用して、社内で開発された、手動で注釈付けされた、マルチモーダルGEN2 TIL参照アトラスにマッピングされた。参照マッピング注釈に基づいて、細胞をCD4T細胞またはCD8T細胞にサブセットし、同じ方法で別々に分析した。変数特徴は、正規化後に特定された。次いで、試料を処理(CTRL対InvigoT)に基づいてグループ化し、異なるドナーにわたって統合した。次いで、データをスケーリングし、npcs=50で寸法を縮小した。クラスターは、0.5の分解能パラメータで定義した。FindMarkers関数を使用して、デフォルトパラメータを用いて、微分発現分析を行った。擬時間分析を、根細胞マーカー遺伝子としてIL7Rを有するRパッケージMonocle3を使用して行った。遺伝子セット分析のために、RパッケージEscape、UCell、及びpheatmapを使用して、Krishna et al.からのCD39/CD69二重陰性及び二重陽性遺伝子シグネチャの遺伝子セットスコア、Jansen et al.からの幹様メモリーシグネチャ、Zhang et al.からのTEXシグネチャ、Caushi et al.からのCD8幹様メモリー、Oliverira10からの腫瘍特異的TTEシグネチャ、及びFeldman11からの疲弊(番号3)シグネチャを定量化及び可視化した。
バルクTCR配列決定
NEB Monarch Total RNA Miniprepキットを使用して、およそ100万個の細胞から全RNAを抽出した。製造業者のガイドラインに従って、最大500ngの精製された全RNAを、Takara SMARTer Human TCR a/bプロファイリングキットv2を使用して、TCRベータ鎖ライブラリーを調製するためのテンプレートとして使用した。各ライブラリーの等モル量を一緒にプールし、対合した末端150bpリードを有するNextSeq2000上で配列決定した。生産的な再配置(クローンタイプ)を識別及び定量化するためのFASTQファイルの一次分析は、デフォルトパラメータを有するRTCR12を使用して行った。CDR3領域における完璧な平均ベース品質スコア未満のクロノタイプを除外した。三次分析及びデータ可視化は、Rパッケージimmunarch13を使用して行った。Rは、独自のクローンタイプ(リッチネス)の数を表し、Pは、クローンタイプiの相対存在量(割合)を表し、シャノン多様性指数は、以下のように計算し、

Simpsonクローン性指数は、以下のように計算した:
参考文献:
1.Hao Y,Hao S,Andersen-Nissen E,Mauck WM 3rd,Zheng S,Butler A,Lee MJ,Wilk AJ,Darby C,Zager M,Hoffman P,Stoeckius M,Papalexi E,Mimitou EP,Jain J,Srivastava A,Stuart T,Fleming LM,Yeung B,Rogers AJ,McElrath JM,Blish CA,Gottardo R,Smibert P,Satija R.Integrated analysis of multimodal
single-cell data.Cell.2021 Jun 24;184(13):3573-3587.e29.doi:10.1016/j.cell.2021.04.048.Epub 2021 May 31.PMID:34062119;PMCID:PMC8238499。
2.Cao J,Spielmann M,Qiu X,Huang X,Ibrahim DM,Hill AJ,Zhang F,Mundlos S,Christiansen L,Steemers FJ,Trapnell C,ShendureJ.The single-cell transcriptional landscape of mammalian organogenesis.Nature.2019
Feb;566(7745):496-502.doi:10.1038/s41586-019-0969-x.Epub 2019 Feb 20.PMID:30787437;PMCID:PMC6434952。
3.Borcherding N,Andrews J(2022).escape:Easy single cell analysis platform for enrichment.R package version 1.8.0。
4.Andreatta M,Carmona SJ.UCell:Robust and scalable single-cell gene signature scoring.Comput Struct BiotechnolJ.2021 Jun 30;19:3796-3798.doi:10.1016/j.csbj.2021.06.043.PMID:34285779;PMCID:PMC8271111。
5.Raivo Kolde(2019).pheatmap:Pretty Heatmaps.R package version 1.0.12。
6.Krishna S,Lowery FJ,Copeland AR,Bahadiroglu E,Mukherjee R,Jia L,Anibal JT,Sachs A,Adebola SO,Gurusamy D,Yu Z,Hill V,Gartner JJ,Li YF,Parkhurst M,Paria B,Kvistborg P,Kelly MC,Goff SL,Altan-Bonnet G,Robbins PF,Rosenberg SA.Stem-like CD8 T cells mediate response of adoptive cell immunotherapy against human cancer.Scien
ce.2020 Dec 11;370(6522):1328-1334.doi:10.1126/science.abb9847.PMID:33303615;PMCID:PMC8883579。
7.Jansen CS,Prokhnevska N,Master VA,Sanda MG,Carlisle JW,Bilen MA,Cardenas M,Wilkinson S,Lake R,Sowalsky AG,Valanparambil RM,Hudson WH,McGuire D,Melnick K,Khan
AI,Kim K,Chang YM,Kim A,Filson CP,Alemozaffar M,Osunkoya AO,Mullane P,Ellis C,Akondy R,Im SJ,Kamphorst AO,Reyes A,Liu Y,Kissick H.An intra-tumoral niche maintains and differentiates stem-like CD8 T cells.Nature.2019 Dec;576(7787):465-470.doi:10.1038/s41586-019-1836-5.Epub 2019 Dec 11.PMID:31827286;PMCID:PMC7108171。
8.Zheng L,Qin S,Si W,Wang A,Xing B,Gao R,Ren X,Wang L,Wu X,Zhang J,Wu N,Zhang N,Zheng H,Ouyang H,Chen K,Bu Z,Hu X,Ji J,Zhang Z.Pan-cancer single-cell landscape
of tumor-infiltrating T cells.Science.2021 Dec 17;374(6574):abe6474.doi:10.1126/science.abe6474.Epub 2021 Dec 17.PMID:34914499.
9.Caushi JX,Zhang J,Ji Z,Vaghasia A,Zhang B,Hsiue EH,Mog BJ,Hou W,Justesen S,Blosser R,Tam A,Anagnostou V,Cottrell TR,Guo H,Chan HY,Singh D,Thapa S,Dykema AG,Burman P,Choudhury B,Aparicio L,Cheung LS,Lanis M,Belcaid Z,El Asmar M,Illei PB,Wang R,Meyers J,Schuebel K,Gupta A,Skaist
A,Wheelan S,Naidoo J,Marrone KA,Brock M,Ha J,Bush EL,Park BJ,Bott M,Jones DR,Reuss JE,Velculescu VE,Chaft JE,Kinzler KW,Zhou S,Vogelstein B,Taube JM,Hellmann MD,Brahmer JR,Merghoub T,Forde PM,Yegnasubramanian S,Ji H,Pardoll DM,Smith KN.Transcriptional programs of neoantigen-specific TIL in anti-PD-1-treated lung cancers.Nature.2021 Aug;596(7870):126-132.doi:10.1038/s41586-021-03752-4.Epub 2021 Jul 21.Erratum in:Nature.2021 Oct;598(7881):E1.PMID:34290408;PMCID:PMC8338555。
10.Oliveira G,Stromhaug K,Klaeger S,Kula T,Frederick DT,Le PM,Forman J,Huang T,Li S,Zhang W,Xu Q,Cieri N,Clauser KR,Shukla SA,Neuberg D,Justesen S,MacBeath G,Carr SA,Fritsch EF,Hacohen N,Sade-Feldman
M,Livak KJ,Boland GM,Ott PA,Keskin DB,Wu CJ.Phenotype,specificity and avidity of antitumour CD8 T cells in melanoma.Na
ture.2021 Aug;596(7870):119-125.doi:10.1038/s41586-021-03704-y.Epub 2021 Jul 21.PMID:34290406;PMCID:PMC9187974。
11.Sade-Feldman M,Yizhak K,Bjorgaard SL,Ray JP,de Boer CG,Jenkins RW,Lieb DJ,Chen JH,Frederick DT,Barzily-Rokni M,Freeman SS,Reuben A,Hoover PJ,Villani AC,Ivanova E,Portell A,Lizotte PH,Aref AR,Eliane JP,Hammond MR,Vitzthum H,Blackmon SM,Li B,Gopalakrishnan V,Reddy SM,Cooper ZA,Paweletz CP,Barbie DA,Stemmer-Rachamimov
A,Flaherty KT,Wargo JA,Boland GM,Sullivan RJ,Getz G,Hacohen N.Defining T Cell States Associated with Response to Checkpoint Immunotherapy in Melanoma.Cell.2019
Jan 10;176(1-2):404.doi:10.1016/j.cell.2018.12.034.Erratum for:Cell.2018 Nov 1;175(4):998-1013.e20.PMID:30633907;PMCID:PMC6647017。
12.Gerritsen B,Pandit A,Andeweg AC,de Boer RJ.RTCR:a pipeline for complete and accurate recovery of T cell repertoires from high throughput sequencing data.Bioinformatics.2016 Oct 15;32(20):3098-3106.doi:10.1093/bioinformatics/btw339.Epub 2016 Jun 20.PMID:27324198;PMCID:PMC5048062。
13.Vadim I.Nazarov,Vasily O.Tsvetkov,Eugene Rumynskiy,Aleksandr A. Popov,Ivan Balashov and Maria Volobueva(2022).immunarch:Bioinformatics Analysis of T-Cell and B-Cell Immune Repertoires.R package version 0.6.9。
上記の実施例は、当業者に対して、本発明の組成物、系及び方法の実施形態の作製方法及び使用方法の完全な開示及び説明を提供するために提示されており、本発明者らが自身の発明とみなすものの範囲を限定することを意図しない。当業者に明らかな、本発明を実施するための上記のモードの修正は、添付の特許請求の範囲内にあることを意図している。本明細書で言及するすべての特許及び刊行物は、本発明が属する分野の当業者のレベルを示す。
すべての見出し及びセクションの指定は、明確化及び参照の目的のみのために使用されており、いかなる方法でも限定するものとしてみなされない。例えば、当業者は、本明細書に記載の本発明の趣旨及び範囲に従って異なる見出し及びセクションから様々な態様を適宜組み合わせることの有用性を理解する。
本明細書で引用されたすべての参考文献は、各個々の刊行物または特許もしくは特許出願がすべての目的のためにその全体が参照により組み込まれることが具体的かつ個別に示されているのと同じ程度にすべての目的のためにそれらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
当業者に明らかであるように、本出願の趣旨及び範囲から逸脱することなく、本出願の多くの修正及び変形が加えられてもよい。本明細書に記載の特定の実施形態及び実施例はほんの一例として提供されており、本出願は、特許請求の範囲が権利を与えられる等価物の全範囲に加えて、添付の特許請求の範囲の用語によってのみ限定されるべきである。
関連出願の相互参照
本出願は、2022年4月6日に出願された米国仮出願第63/328,236号の優先権を主張し、これは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
局所進行性または転移性非小細胞肺癌(NSCLC)患者の新たな治療選択肢に対する満たされていない重要なニーズが存在し、これらの患者は、新たに診断されたNSCLC患者のおよそ70%を占める(Molina JR,Yang P,Cassivi SD,Schild SE,Adjei AA.Mayo Clin Proc.2008;83(5):584-94)。肺癌は、世界のがん死亡の主な原因であり、2015年にはおよそ170万人の死亡が報告されている。肺癌による死亡のうち、>80%は、非小細胞肺癌(NSCLC)に起因していた(21)。2020年には、米国で肺癌及び気管支癌に起因する推定228,820人の新規症例及び135,720人の死亡が推定されると予想された(Siegel RL,2015.CA Cancer J Clin.2015;65(1):5-29)。したがって、NSCLCの治療及び転帰に革命をもたらしたチェックポイント阻害剤(CPI)の承認にもかかわらず、NSCLCには満たされていない重要な医療ニーズが残っている。
全体として、男性及び女性において、喫煙状況に関係なく肺癌を発症する生涯リスクは、それぞれ、およそ14分の1及び17分の1である。しかしながら、肺癌を発症するリスクは、非喫煙者に対して喫煙者でははるかに高く、例えば、喫煙する男性は、がんを発症する可能性が23倍高く、同様に、喫煙する女性は、喫煙しない女性よりも、肺癌を発症する可能性が13倍高い(American Lung Association-Lung cancer fact sheet 2017[American Lung Association-Lung cancer fact sheet]、ワールドワイドウェブlung.org/lung-health-and-diseases/lung-disease-lookup/lung-cancer/resource-library/lung-cancer-fact-sheet.htmlから入手可能)。
チェックポイント阻害剤に先立って、白金ダブレット化学療法が治癒不能なNSCLC患者の初期治療に利用され(SchillerJ.H.et al.2002 N Engl J Med 346(2):92-8.)、耐久性が限られた客観的奏効率(ORR)は、20%~30%であった。ペムブロリズマブは、単独または細胞傷害性療法と組み合わせて治療に革命をもたらし、より高い奏効率をもたらし、より耐久性があることも証明された(Gandhi Leena et al.2018 N Engl J Med 378(22):2078-2092、Paz-Ares L.et al.2018 N Engl J Med 379(21):2040-2051、Viteri S.et al.2020 Transl Lung Cancer Res 9(3):828-832、PachecoJ.M.2020 Transl Lung Cancer Res 9(1):148-153、Mok T.S.K.et al.2019 Lancet 393(10183):1819-1830、Nosaki K.et al.2019 Lung Cancer 135:188-195、Morgensztern D.2019 J Thorac Dis 11(Suppl 15):S1963-S1965、Reck M.et al.2016 N Engl J Med 375(19):1823-1833)。他のCPIは、NSCLCの第一選択設定において化学療法と組み合わせたORR及び耐久性の改善を実証している(Socinski MA et al 2018 New Engl J Med 378:2288-301)。これらの印象的な結果にもかかわらず、完全な反応はほとんどなく、ほぼすべての患者が反応しないか進行しているため、その後の治療が必要である。
同定されたドライバー変異を有するNSCLC患者の場合、好ましい選択肢は、関連する変異(例えば、表皮成長因子受容体[EGFR]変異のためのオシメルチニブ、ALK変異のためのセリチニブ、またはROS-1変異のためのクリゾチニブ)に向けられた標的TKIによる治療である。腫瘍がPD-L1を発現しているNSCLCの以前に治療されていない患者の場合、利用可能な治療選択肢には、ペムブロリズマブ単独療法(PD-L1発現の腫瘍割合スコア(TPS)が少なくとも50%の患者にのみ一般的に使用される)または化学療法との併用のペムブロリズマブが含まれる。NSCLC及びPD-L1発現が<50%の患者の場合、好ましい選択肢は、ペメトレキセド、カルボプラチンまたはシスプラチン、及びペムブロリズマブの組み合わせである。PD-L1に対するTPSが<1%であり、アクショナブルな(actionable)変異がない患者には、実行可能な治療選択肢がなく、PD-1またはPD-L1 CPIの候補ではない。白金ベースのダブレット化学療法、ベバシズマブ、及びアテゾリズマブの併用は、ニボルマブ、イピリムマブ、及び細胞傷害性療法の併用と同様に、NSCLC患者における別の潜在的な治療選択肢である(Hellmann et al.2019 New Engl J Med 381:2020-31)。
チェックポイント阻害剤療法+化学療法で患者の疾患が進行すると、治療選択肢は限られ、有効性が低く、客観的奏効率は約10%であり、無増悪生存期間(PFS)が短く、毒性も高い。最も一般的に使用される薬剤は、ドセタキソールであるが、VEGF阻害剤と組み合わせた他の単剤細胞傷害剤または細胞傷害剤が用いられることがあるが、いずれも同様の、不良な転帰を有する。故に、チェックポイント阻害剤療法+化学療法後の第2の選択治療において、より良い治療選択肢のための緊急の必要性が存在する。
さらに、現在のTIL製造及び治療プロセスは、長さ、コスト、無菌性の懸念、及び本明細書に記載の他の要因によって制限され、したがって、抗PD-1及び/または抗PD-L1及び/またはVEGF阻害剤治療に対して不応性である患者を治療する可能性が著しく制限されている。実行可能な治療選択肢がほとんどまたはまったく残っていない患者を治療する際の使用に適したTIL製造プロセス及びかかるプロセスに基づく療法を提供することが緊急に必要である。本発明は、難治性及び/または進行性非小細胞肺癌(NSCLC)患者の治療に用いられ得るTILの生成における使用のための短縮された製造プロセスを提供することによって、この必要性を満たす。
いくつかの実施形態では、本発明は、NSCLC患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであり、方法が、
(a)患者ががん治療を受ける前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片または腫瘍消化物に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容すること、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を産生することを含み、
その後、患者が、ICI治療及び/または標準治療の治療を受け、
任意選択で、患者がICI及び/または標準治療の治療時またはその後に進行性疾患を示す場合、第1のTIL集団が、治療的TIL集団にさらに拡張される、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、NSCLC患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)維持療法を再開する前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片または腫瘍消化物に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容すること、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を産生することを含み、
その後、患者が、維持療法を再開し、
任意選択で、患者が維持療法の再開の時またはその後に進行性疾患を示す場合、第1のTIL集団が、治療的TIL集団にさらに拡張される、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、NSCLC患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであり、
(a)患者ががん治療を受ける前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片または腫瘍消化物に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を産生することと、
(c)凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を解凍し、第1のTIL集団を閉鎖系に添加することと、
(d)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(f)ステップ(e)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(g)ステップ(f)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(h)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、NSCLC患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであり、
(a)患者ががん治療を受ける前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片または腫瘍消化物に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を産生することと、
(c)凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を解凍し、第1のTIL集団を閉鎖系に添加することと、
(d)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む容器内で行われ、プライミングによる第1の拡張が、約1~7/8日間の第1の期間行われて、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団が、第1のTIL集団よりも数が多い、第2のTIL集団を産生することと、
(e)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及びAPCで補充することにより、急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数の少なくとも2倍であり、急速な第2の拡張が、約1~11日間の第2の期間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、急速な第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を含む容器内で行われる、第3のTIL集団を産生することと、
(f)ステップ(e)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(g)ステップ(f)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(h)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、急速拡張は、急速拡張の開始後、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、または10日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、本開示は、NSCLC患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、中断されている維持療法を受けており、
(a)維持療法を再開する前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片または腫瘍消化物に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を産生することと、
(c)凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を解凍し、第1のTIL集団を閉鎖系に添加することと、
(d)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(f)ステップ(e)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(g)ステップ(f)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(h)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、NSCLC患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、中断されている維持療法を受けており、
(a)維持療法を再開する前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片または腫瘍消化物に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を産生することと、
(c)凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を解凍し、第1のTIL集団を閉鎖系に添加することと、
(d)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む容器内で行われ、プライミングによる第1の拡張が、約1~7/8日間の第1の期間行われて、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団が、第1のTIL集団よりも数が多い、第2のTIL集団を産生することと、
(e)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及びAPCで補充することにより、急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数の少なくとも2倍であり、急速な第2の拡張が、約1~11日間の第2の期間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、急速な第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を含む容器内で行われる、第3のTIL集団を産生することと、
(f)ステップ(e)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(g)ステップ(f)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(h)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、がん患者は、任意のがん治療に対してナイーブである。
いくつかの実施形態では、患者は、ICI治療、抗VEGF治療、または化学療法治療に対してナイーブである。
いくつかの実施形態では、患者は、ステップ(a)の時点で中断されている維持療法を受けており、維持療法は、ステップ(a)の後に再開される。
いくつかの実施形態では、患者は、ステップ(a)の開始時にウォッシュアウト期間にある。
いくつかの実施形態では、患者が、がん治療を受けるか、または維持療法を再開し、患者が進行性疾患を示した後に、解凍のステップ及び後続のステップが行われる。
いくつかの実施形態では、患者は、凍結保存のステップ(b)の少なくとも約1週間、2週間、3週間、1か月、2か月、3か月、4か月、5か月、6か月、7か月、8か月、9か月、10か月、11か月、12か月、13か月、14か月、15か月、16か月、17か月、18か月、19か月、20か月、21か月、22か月、23か月、24か月、25か月、26か月、27か月、28か月、29か月、30か月、31か月、32か月、33か月、34か月、35か月、36か月後、進行性疾患を示す。
いくつかの実施形態では、患者は、第1選択ICI治療及び/または標準治療を受けるか、または受けることになる。
いくつかの実施形態では、患者は、第2選択ICI治療及び/または標準治療を受けるか、または受けることになる。
いくつかの実施形態では、患者は、NSCLCと診断される。
いくつかの実施形態では、患者は、転移性ステージIVのNSCLCと診断される。
いくつかの実施形態では、対象または患者は、
i)<1%のPD-L1の所定の腫瘍割合スコア(TPS)、
ii)1%~49%のPD-L1のTPSスコア、または
iii)1つ以上のドライバー変異の所定の非存在のうちの少なくとも1つを有する。
いくつかの実施形態では、患者または対象は、1%~49%のPD-L1のTPSを有する。
いくつかの実施形態では、患者または対象は、<1%のPD-L1のTPSを有し、1つ以上のドライバー変異の所定の非存在を有する。
いくつかの実施形態では、1つ以上のドライバーは、EGFR変異、EGFR挿入、EGFRエクソン20、KRAS変異、BRAF変異、BRAF V600変異、ALK変異、c-ROS変異(ROS1変異)、ROS1融合、RET変異、RET融合、ERBB2変異、ERBB2増幅、BRCA変異、MAP2K1変異、PIK3CA、CDKN2A、PTEN変異、UMD変異、NRAS変異、KRAS変異、NF1変異、MET変異、METスプライス及び/または変化したMETシグナル伝達、TP53変異、CREBBP変異、KMT2C変異、KMT2D変異、ARID1A変異、RB1変異、ATM変異、SETD2変異、FLT3変異、PTPN11変異、FGFR1変異、EP300変異、MYC変異、EZH2変異、JAK2変異、FBXW7変異、CCND3変異、及びGNA11変異からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、患者または対象は、<1%のTPSを有し、EGFR阻害剤、BRAF阻害剤、ALK阻害剤、c-Ros阻害剤、RET阻害剤、ERBB2阻害剤、BRCA阻害剤、MAP2K1阻害剤、PIK3CA阻害剤、CDKN2A阻害剤、PTEN阻害剤、UMD阻害剤、NRAS阻害剤、KRAS阻害剤、NF1阻害剤、MET阻害剤、TP53阻害剤、CREBBP阻害剤、KMT2C阻害剤、KMT2D変異、ARID1A変異、RB1阻害剤、ATM阻害剤、SETD2阻害剤、FLT3阻害剤、PTPN11阻害剤、FGFR1阻害剤、EP300阻害剤、MYC阻害剤、EZH2阻害剤、JAK2阻害剤、FBXW7阻害剤、CCND3阻害剤、及びGNA11阻害剤による治療のために適応されていないNSCLCを有する。
いくつかの実施形態では、1つ以上のドライバー変異は、EGFR、ALK、またはROSのゲノム変化を含む。
いくつかの実施形態では、1つ以上のドライバー変異は、EGFR、ALK、またはROSのゲノム変化からなる。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、PD-L1の発現が低いか、または全くない。
いくつかの実施形態では、患者は、1つ以上のドライバー変異の所定の非存在を有する。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、化学療法剤による治療に対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、VEGF-A阻害剤による治療に対して不応性または耐性である。いくつかの実施形態では、NSCLCは、化学療法剤で治療されているが、現在は化学療法剤で治療されていない。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、化学療法剤で治療されているが、現在は化学療法剤で治療されておらず、<1%のTPSを有する。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、VEGF-A阻害剤で治療されてきたが、現在はVEGF-A阻害剤で治療されていない。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、VEGF-A阻害剤で治療されているがされていない、いくつかの実施形態では、NSCLCは、化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で治療されているが、現在は化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で治療されていない。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で治療されているが、現在は化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で治療されておらず、<1%のTPSを有する。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されていない。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されておらず、化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で以前に治療されている。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されておらず、化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で以前に治療されているが、現在は化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で治療されていない。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されておらず、VEGF-A阻害剤で以前に治療されているが、現在はVEGF-A阻害剤で治療されていない。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されておらず、化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で以前に治療されているが、現在は化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で治療されていない。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されておらず、PD-L1の発現が低いか、または全くない。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されておらず、化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で以前に治療されているが、現在は化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で治療されておらず、<1%のTPSを有する。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1及び/または抗PD-L1及び/または抗PD-L2抗体で以前に治療されている。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されており、化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で以前に治療されている。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体による治療に対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体治療の前に決定された。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-L1抗体治療の前に決定されているか、またはNSCLCは、抗PD-1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-1抗体治療の前に決定された。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で治療されている。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されておらず、ベースラインで巨大腫瘤病変を有する。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されており、ベースラインで巨大腫瘤病変を有する。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、化学療法剤で治療されており、ベースラインで巨大腫瘤病変を有する。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で治療されているが、現在は化学療法剤及び/またはVEGF-A阻害剤で治療されておらず、ベースラインで巨大腫瘤病変を有する。
いくつかの実施形態では、最大腫瘍直径が、横断面もしくは冠状面のいずれかで測定して7cmより大きいか、または腫れたリンパ節が20mm以上の短軸直径を有する場合、巨大腫瘤病変が示される。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、ネオアジュバント療法またはアジュバント療法を含まない、少なくとも2つの以前の全身治療過程に対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、ニボルマブ、ペムブロリズマブ、JS001、TSR-042、ピジリズマブ、BGB-A317、SHR-1210、REGN2810、MDX-1106、PDR001、クローン由来の抗PD-1:RMP1-14、米国特許第8,008,449号に開示される抗PD-1抗体、デュルバルマブ、アテゾリズマブ、アベルマブ、ならびにそれらの断片、誘導体、バリアント、及びバイオシミラーからなる群から選択される抗PD-1または抗PD-L1抗体に対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーに対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、ニボルマブまたはそのバイオシミラーに対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗CTLA-4抗体に対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗CTLA-4抗体、及びペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーに対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗CTLA-4抗体、及びニボルマブまたはそのバイオシミラーに対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーである。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、デュルバルマブまたはそのバイオシミラーに対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、アテゾリズマブまたはそのバイオシミラーに対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、アベルマブまたはそのバイオシミラーに対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、化学療法剤は、白金ダブレット化学療法剤(複数可)である。
いくつかの実施形態では、白金ダブレット化学療法剤療法は、
i)シスプラチン及びカルボプラチンからなる群から選択される第1の化学療法剤、
ii)及びビノレルビン、ゲムシタビン、及びタキサン(例えば、パクリタキセル、ドセタキセル、またはnab-パクリタキセルを含む)からなる群から選択される第2の化学療法剤を含む。
いくつかの実施形態では、第1及び/または第2の化学療法剤を含む化学療法剤は、ペメトレキセドとの組み合わせである。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、カルボプラチン、パクリタキセル、ペメトレキセド、及びシスプラチンを含む併用療法に対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、カルボプラチン、パクリタキセル、ペメトレキセド、シスプラチン、ニボルマブ、及びイピリムマブを含む併用療法に対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、VEGF-A阻害剤に対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、ベバシズマブ、ラニビズマブ、及びイクルクマブからなる群から選択されるVEGF-A阻害剤に対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、ベバシズマブに対して不応性または耐性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、1つ以上のドライバー変異の非存在または存在について分析されている。
いくつかの実施形態では、1つ以上のドライバー変異は存在しない。
いくつかの実施形態では、NSCLC治療は、1つ以上のドライバー変異の存在または非存在とは無関係である、請求項64または65に記載の方法。
いくつかの実施形態では、1つ以上のドライバー変異は、EGFR変異、EGFR挿入、KRAS変異、BRAF変異、ALK変異、c-ROS変異、c-ROS変異、EML4-ALK、及びMET変異からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、EGFR変異は、NSCLCから小細胞肺癌(SCLC)への腫瘍形質転換をもたらす。
いくつかの実施形態では、NSCLC治療は、高腫瘍変異負荷(高-TMB)及び/またはマイクロサテライト不安定性-高(MSI-高)状態の存在または非存在とは無関係である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、高-TMB及び/またはMSI-高状態を示す。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、
(a)患者ががん治療を受ける前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片または腫瘍消化物に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を産生することと、
(c)がん治療時またはその後に患者が進行性疾患を示すのを待つことと、
(d)凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を解凍し、第1のTIL集団を閉鎖系に添加することと、
(e)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(f)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(g)ステップ(f)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(h)ステップ(f)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(g)から(h)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(i)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、中断されている維持療法を受けており、
(a)維持療法を再開する前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片または腫瘍消化物に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を産生することと、
(c)がん治療時またはその後に患者が進行性疾患を示すのを待つことと、
(d)凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を解凍し、第1のTIL集団を閉鎖系に添加することと、
(e)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(f)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(g)ステップ(f)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(h)ステップ(f)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(g)から(h)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(i)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、
(a)患者ががん治療を受ける前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片または腫瘍消化物に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を産生することと、
(c)がん治療時またはその後に患者が進行性疾患を示すのを待つことと、
(d)凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を解凍し、第1のTIL集団を閉鎖系に添加することと、
(e)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む容器内で行われ、プライミングによる第1の拡張が、約1~7/8日間の第1の期間行われて、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団が、第1のTIL集団よりも数が多い、第2のTIL集団を産生することと、
(f)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及びAPCを補充することにより、急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数が、ステップ(c)において追加されるAPCの数の少なくとも2倍であり、急速な第2の拡張が、約1~11日間の第2の期間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療用TIL集団であり、急速な第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を含む容器内で行われる、第3のTIL集団を産生することと、
(g)ステップ(f)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(h)ステップ(f)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(g)から(h)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(i)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、急速拡張は、急速拡張の開始後、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、または10日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、
(a)患者ががん治療を受ける前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片または腫瘍消化物に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を産生することと、
(c)がん治療時またはその後に患者が進行性疾患を示すのを待つことと、
(d)凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を解凍し、第1のTIL集団を閉鎖系に添加することと、
(e)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む容器内で行われ、プライミングによる第1の拡張が、約1~7/8日間の第1の期間行われて、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団が、第1のTIL集団よりも数が多い、第2のTIL集団を産生することと、
(f)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及びAPCを補充することにより、急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数が、ステップ(c)において追加されるAPCの数の少なくとも2倍であり、急速な第2の拡張が、約1~11日間の第2の期間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療用TIL集団であり、急速な第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を含む容器内で行われる、第3のTIL集団を産生することと、
(g)ステップ(f)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(h)ステップ(f)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(g)から(h)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(i)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、患者は、任意のがん治療に対してナイーブである。
いくつかの実施形態では、患者は、第1選択ICI治療及び/または標準治療を受ける。
いくつかの実施形態では、患者は、第2選択ICI治療及び/または標準治療を受ける。
いくつかの実施形態では、ステップ(b)は、腫瘍断片または腫瘍消化物のフラッシュ凍結を含む。
いくつかの実施形態では、フラッシュ凍結は、
i)腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存培地中でインキュベートすること、任意選択で、約30分~約60分間、約2℃~約8℃で、10%v/vのDMSOを含む凍結保存培地中でインキュベートすることと、
ii)腫瘍を凍結することであって、凍結が、液体窒素の気相を使用したフラッシュ凍結である、凍結することと、を含む。
いくつかの実施形態では、ステップ(b)は、腫瘍断片または腫瘍消化物の制御された速度の凍結を含む。
いくつかの実施形態では、制御された速度の凍結は、
i)閉鎖可能な容器に凍結保存培地を添加することと、
ii)制御された速度の凍結装置で閉鎖可能な容器を予め冷却することと、
iii)腫瘍を、凍結保存培地を含む閉鎖可能な容器に入れ、容器を閉じることと、
iv)腫瘍及び凍結保存培地を含む閉鎖容器を、約30~60分間の時間、約2~8℃の温度でインキュベートすることと、
v)制御された速度の凍結装置中で容器をゆっくり凍結することと、を含む。
いくつかの実施形態では、がん患者は、任意のがん治療に対してナイーブである。
いくつかの実施形態では、患者は、ICI治療、抗VEGF治療、または化学療法治療に対してナイーブである。
いくつかの実施形態では、患者は、ステップ(a)の時点で中断されている維持療法を受けており、維持療法は、ステップ(a)の後に再開される。
いくつかの実施形態では、患者は、第1選択ICI治療及び/または標準治療を受ける。
いくつかの実施形態では、患者は、第2選択ICI治療及び/または標準治療を受ける。
いくつかの実施形態では、患者は、NSCLCと診断される。
いくつかの実施形態では、患者は、転移性ステージIVのNSCLCと診断される。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片または腫瘍消化物に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得すること、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を産生すること、
(c)凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を解凍し、第1のTIL集団を閉鎖系に添加すること、
(d)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~11日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生すること、
(e)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生すること、
(f)ステップ(e)から取得された第3のTIL集団を採取することであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取すること、
(g)ステップ(f)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すこと、
(h)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することを含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片または腫瘍消化物に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を産生することと、
(c)凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を解凍し、第1のTIL集団を閉鎖系に添加することと、
(d)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(f)ステップ(e)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(g)ステップ(f)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(h)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片または腫瘍消化物に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を産生することと、
(c)凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を解凍し、第1のTIL集団を閉鎖系に添加することと、
(d)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~11日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(f)ステップ(e)から取得された第3のTIL集団を採取することであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(g)ステップ(f)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(h)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または対象もしくは患者の腫瘍からの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む試料を凍結保存して、凍結保存された試料を産生することと、
(c)凍結保存された試料を解凍し、第1のTIL集団を閉鎖系に添加することと、
(d)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~11日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(f)ステップ(e)から取得された第3のTIL集団を採取することであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(g)ステップ(f)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(h)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から腫瘍を切除することであって、腫瘍が、任意選択で、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または腫瘍からの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段からの第1のTIL集団を含む、切除することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む試料を凍結保存して、凍結保存された試料を産生することと、
(c)凍結保存された試料を解凍し、第1のTIL集団を閉鎖系に添加することと、
(d)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~11日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(e)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(f)ステップ(e)から取得された第3のTIL集団を採取することであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(g)ステップ(e)からの採取された第3のTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(h)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片または腫瘍消化物に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片または腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を産生することと、
(c)凍結保存された腫瘍断片または腫瘍消化物を解凍し、第1のTIL集団を閉鎖系に添加することと、
(d)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む容器内で行われ、プライミングによる第1の拡張が、約1~7/8日間の第1の期間行われて、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団が、第1のTIL集団よりも数が多い、第2のTIL集団を産生することと、
(e)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及びAPCで補充することにより、急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数の少なくとも2倍であり、急速な第2の拡張が、約1~11日間の第2の期間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、急速な第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を含む容器内で行われる、第3のTIL集団を産生することと、
(f)ステップ(e)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(g)ステップ(f)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(h)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または対象もしくは患者からの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む試料を凍結保存して、凍結保存された試料を産生することと、
(c)凍結保存された試料を解凍し、閉鎖系内で第1のTIL集団を第1の細胞培養培地と接触させることと、
(d)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む容器内で行われ、プライミングによる第1の拡張が、約1~7/8日間の第1の期間行われて、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団が、第1のTIL集団よりも数が多い、第2のTIL集団を産生することと、
(e)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及びAPCで補充することにより、急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数の少なくとも2倍であり、急速な第2の拡張が、約1~11日間の第2の期間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、急速な第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を含む容器内で行われる、第3のTIL集団を産生することと、
(f)ステップ(f)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(g)ステップ(g)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(h)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、急速拡張は、急速拡張の開始後、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、または10日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、IL-2は、存在する場合、第1の細胞培養培地中に1000IU/mL~6000IU/mLの間の初期濃度で存在する。
いくつかの実施形態では、IL-2は、1000IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在し、OKT-3抗体が、第2中に約30ng/mLの初期濃度で存在し、初期拡張が、存在する場合、ガス透過性容器を使用して行われる。
いくつかの実施形態では、急速拡張は、存在する場合、ガス透過性容器を使用して行われる。
いくつかの実施形態では、第1の細胞培養培地は、存在する場合、IL-4、IL-7、IL-15、IL-21、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるサイトカインをさらに含む。
いくつかの実施形態では、第2の細胞培養培地は、存在する場合、IL-4、IL-7、IL-15、IL-21、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるサイトカインをさらに含む。
いくつかの実施形態では、採取されたTIL集団は、治療上有効なTIL集団を含み、治療上有効なTIL集団が、約2.3×1010~約13.7×1010個のTILを含む。
いくつかの実施形態では、初期拡張は、21日以内の期間にわたって行われる。
いくつかの実施形態では、初期拡張は、7日以内の期間にわたって行われる。
いくつかの実施形態では、急速拡張は、7日以内の期間にわたって行われる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張及び第2の拡張は、各々11日の期間内に個別に行われる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張を行うステップから採取のステップは、約10日~約24日で行われる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張を行うステップから採取のステップは、約10日~約22日で行われる。
いくつかの実施形態では、修飾されたTILの各々は、その表面膜と会合する免疫調節組成物を含むように、採取の前の任意の時点で、TILの一部分を修飾するステップをさらに含む。
いくつかの実施形態では、修飾のステップは、TILを遺伝子編集して、TALEN系、CRISPR系、及びジンクフィンガー系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子編集系の修飾されたTILへの移入を達成することを含む。
いくつかの実施形態では、修飾するステップ中に、修飾されたTILの細胞膜は、少なくとも1つの遺伝子編集系の移入を達成するために、マイクロ流体プラットフォームまたは無菌エレクトロポレーションを使用することによって、一時的に破壊される。
いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZプラットフォームである。
いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、1つ以上の膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、各々は、1つ以上の免疫調節剤及び細胞膜アンカー部分を含む。
いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、2つ以上の異なる膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、異なる膜アンカー免疫調節融合タンパク質の各々は、各々異なる免疫調節剤を含む。
いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、TIL表面抗原結合ドメインに連結された1つ以上の免疫調節剤を含む融合タンパク質を含む。
いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、複数の免疫調節剤を含むナノ粒子を含む。
いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、1つ以上のサイトカインを含む。
いくつかの実施形態では、1つ以上のサイトカインは、IL-2、IL-6、IL-7、IL-9、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、IL-23、IL-27、IFNガンマ、TNFa、IFNアルファ、IFNベータ、GM-CSF、もしくはGCSF、またはそれらのバリアントを含む。
いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、CD40アゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、膜アンカー免疫調節融合タンパク質は、N末端からC末端へ、式:S-IA-L-Cに従うものであり、式中、Sがシグナルペプチドであり、IAが免疫調節剤であり、Lがリンカーであり、Cが細胞膜アンカー部分である。
いくつかの実施形態では、細胞膜アンカー部分は、CD8a膜貫通細胞内ドメイン、B7-1膜貫通ドメイン、B7-2膜貫通ドメイン、またはCD8a膜貫通ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、1つ以上の免疫調節剤は、1つ以上のサイトカインを含む。
いくつかの実施形態では、1つ以上のサイトカインは、IL-2、IL-6、IL-7、IL-9、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、IL-23、IL-27、IFNガンマ、TNFa、IFNアルファ、IFNベータ、GM-CSF、もしくはGCSF、またはそれらのバリアントを含む。
いくつかの実施形態では、TIL表面抗原結合ドメインは、抗体可変重ドメイン及び可変軽ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、TIL表面抗原結合ドメインは、抗体またはその断片を含む。
いくつかの実施形態では、TIL表面抗原結合ドメインは、以下のTIL表面抗原:CD45、CD4、CD8、CD3、CDlla、CDllb、CDllc、CD18、CD25、CD127、CD19、CD20、CD22、HLA-DR、CD197、CD38、CD27、CD196、CXCR3、CXCR4、CXCR5、CD84、CD229、CCR1、CCR5、CCR4、CCR6、CCR8、CCR10、CD16、CD56、CD137、OX40、またはGITRのうちの1つ以上に対する親和性を示す。
いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、リポソーム、タンパク質ナノゲル、ヌクレオチドナノゲル、ポリマーナノ粒子、または固体ナノ粒子である。
いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、ナノゲルである。
いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、以下の抗原:CD45、CD1la(インテグリンアルファ-L)、CD18(インテグリンベータ-2)、CD1lb、CD1lc、CD25、CD8、またはCD4のうちの1つ以上に結合する抗原結合ドメインをさらに含む。
いくつかの実施形態では、修飾は、融合タンパク質をコードする異種核酸をTILの一部に導入し、融合タンパク質を修飾されたTILの表面上に発現させることを含む。
いくつかの実施形態では、異種核酸は、CRISPR法、TALE法、ジンクフィンガー法、及びそれらの組み合わせから選択される1つ以上の方法を使用して、修飾されたTILのゲノムに導入される。
いくつかの実施形態では、修飾は、融合タンパク質の、TILの一部への結合を可能にする条件下で、融合タンパク質をTILの一部とインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、修飾は、免疫調節組成物をTILの一部の表面に付着させることを含む。
いくつかの実施形態では、修飾は、第1の拡張からのTIL、または第2の拡張からのTIL、またはその両方で実行される。
いくつかの実施形態では、修飾は、プライミングによる第1の拡張からのTIL、または急速な第2の拡張からのTIL、またはその両方で実行される。
いくつかの実施形態では、修飾は、第1の拡張の後、及び第2の拡張の前に実行される。
いくつかの実施形態では、修飾は、プライミングによる第1の拡張の後、及び急速な第2の拡張の前、またはその両方に実行される。
いくつかの実施形態では、修飾は、第2の拡張の後に実行される。
いくつかの実施形態では、修飾は、急速な第2の拡張後に実行される。
いくつかの実施形態では、修飾は、採取後に実行される。
いくつかの実施形態では、修飾されたTILは、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは低減する遺伝子修飾をさらに含む。
いくつかの実施形態では、当該1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子は、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、TOX、SOCS1、ANKRD11、及びBCORを含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、当該1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子は、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、及びPKAを含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、修飾されたTILは、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる遺伝子修飾をさらに含み、免疫チェックポイント遺伝子(複数可)は、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-21、NOTCH 1/2細胞内ドメイン(ICD)、及び/またはNOTCHリガンドmDLL1を含む群から選択される。
いくつかの実施形態では、遺伝子修飾は、当該1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼを使用して産生される。
いくつかの実施形態では、遺伝子修飾は、CRISPR法、TALE法、ジンクフィンガー法、及びそれらの組み合わせから選択される1つ以上の方法を使用して産生される。
いくつかの実施形態では、修飾されたTILは、細胞表面上で免疫調節組成物を一過的に発現するように修飾される。
いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、1つ以上の膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、各融合タンパク質は、1つ以上の免疫調節剤及び細胞膜アンカー部分を含む。
いくつかの実施形態では、修飾されたTILは、融合タンパク質をコードする核酸でTILをトランスフェクトすることによって修飾される。
いくつかの実施形態では、核酸は、RNAである。
いくつかの実施形態では、RNAは、mRNAである。
いくつかの実施形態では、TILは、SQZプラットフォームまたはエレクトロポレーションによってmRNAでトランスフェクトされる。
いくつかの実施形態では、TILは、第1の拡張の後及び第2の拡張の前にSQZプラットフォームまたはエレクトロポレーションによってmRNAでトランスフェクトされる。
いくつかの実施形態では、TILは、第1の拡張の前に、SQZプラットフォームまたはエレクトロポレーションによってmRNAでトランスフェクトされる。
いくつかの実施形態では、修飾されたTILは、マイクロ流体装置を使用して融合タンパク質をコードする核酸でトランスフェクトされ、TILの細胞膜を一時的に破壊し、それによって核酸のトランスフェクションを可能にする。
いくつかの実施形態では、方法は、TILをmRNAでトランスフェクトする前に、抗CD3アゴニストでのインキュベーションによってTILを活性化することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、抗CD3アゴニストは、OKT-3である。
いくつかの実施形態では、TILをmRNAでトランスフェクトする前に、TILを抗CD3アゴニストで約1~3日間インキュベートすることによってTILが活性化される。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍組織を凍結保存して、凍結保存された腫瘍組織を産生することと、
(c)凍結保存された腫瘍組織を解凍し、IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)抗CD3アゴニストビーズもしくは抗体、または抗CD3アゴニスト及び抗CD28アゴニストビーズもしくは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍消化物を産生することと、
(d)凍結保存された腫瘍消化物を解凍し、IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(e)抗CD3アゴニストビーズもしくは抗体、または抗CD3アゴニスト及び抗CD28アゴニストビーズもしくは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生すること、
(f)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(g)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、酵素培地は、DNaseを含む。
いくつかの実施形態では、酵素培地は、コラゲナーゼを含む。
いくつかの実施形態では、酵素培地は、中性プロテアーゼを含む。
いくつかの実施形態では、酵素培地は、ヒアルロニダーゼを含む。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍組織を凍結保存して、凍結保存された腫瘍組織を産生することと、
(c)凍結保存された腫瘍組織を解凍し、IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)抗CD3アゴニストビーズもしくは抗体、または抗CD3アゴニスト及び抗CD28アゴニストビーズもしくは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約1~7日間培養して、第5のTIL集団の培養物を産生することと、
(g)第5のTIL集団の培養物を複数のサブ培養物に分割し、複数のサブ培養物の各々を、IL-2を含む第3の細胞培養培地中で約3~6日間培養し、複数のサブ培養物を組み合わせて、増加した数のTILを提供することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍消化物を産生することと、
(d)凍結保存された腫瘍消化物を解凍し、IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(e)抗CD3アゴニストビーズもしくは抗体、または抗CD3アゴニスト及び抗CD28アゴニストビーズもしくは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(f)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(g)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約1~7日間培養して、第5のTIL集団の培養物を産生することと、
(h)第5のTIL集団の培養物を複数のサブ培養物に分割し、複数のサブ培養物の各々を、IL-2を含む第3の細胞培養培地中で約3~6日間培養し、複数のサブ培養物を組み合わせて、増加した数のTILを提供することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍組織を凍結保存して、凍結保存された腫瘍組織を産生することと、
(c)凍結保存された腫瘍組織を解凍し、IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍消化物を産生することと、
(d)凍結保存された腫瘍消化物を解凍し、IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(e)第2のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第3のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍組織を凍結保存して、凍結保存された腫瘍組織を産生することと、
(c)凍結保存された腫瘍組織を解凍し、IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約1~7日間培養して、第4のTIL集団の培養物を産生することと、
(f)第4のTIL集団の培養物を複数のサブ培養物に分割し、複数のサブ培養物の各々を、IL-2を含む第3の細胞培養培地中で約3~7日間培養し、複数のサブ培養物を組み合わせて、増加した数のTILを含む第5のTIL集団を提供することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍消化物を産生することと、
(d)凍結保存された腫瘍消化物を解凍し、IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(e)第2のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第3のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約1~7日間培養して、第4のTIL集団の培養物を産生することと、
(g)第4のTIL集団の培養物を複数のサブ培養物に分割し、複数のサブ培養物の各々を、IL-2を含む第3の細胞培養培地中で約3~7日間培養し、複数のサブ培養物を組み合わせて、増加した数のTILを含む第5のTIL集団を提供することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍組織を凍結保存して、凍結保存された腫瘍組織を産生することと、
(c)凍結保存された腫瘍組織を解凍し、IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第3の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍消化物を産生することと、
(d)凍結保存された腫瘍消化物を解凍し、IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(e)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(f)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(g)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第3の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍組織を凍結保存して、凍結保存された腫瘍組織を産生することと、
(c)凍結保存された腫瘍組織を解凍し、IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約1~7日間培養して、第4のTIL集団の培養物を産生することと、
(g)第4のTIL集団の培養物を複数のサブ培養物に分割し、複数のサブ培養物の各々を、IL-2を含む第3の細胞培養培地中で約3~7日間培養し、複数のサブ培養物を組み合わせて、増加した数のTILを含む第5のTIL集団を提供することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍消化物を産生することと、
(d)凍結保存された腫瘍消化物を解凍し、IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(e)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(f)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(g)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約1~7日間培養して、第5のTIL集団の培養物を産生することと、
(h)第5のTIL集団の培養物を複数のサブ培養物に分割し、複数のサブ培養物の各々を、IL-2を含む第3の細胞培養培地中で約3~6日間培養し、複数のサブ培養物を組み合わせて、増加した数のTILを含む第5のTIL集団を提供することと、を含む、方法。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容すること、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍組織を凍結保存して、凍結保存された腫瘍組織を産生すること、
(c)凍結保存された腫瘍組織を解凍し、第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団の初期拡張(またはプライミングによる第1の拡張)を行い、第2のTIL集団を取得することであって、第1の細胞培養培地が、IL-2、任意選択でOKT-3、及び任意選択で抗原提示細胞(APC)を含み、プライミングによる第1の拡張が、約3~8日の期間にわたって起こる、第2のTIL集団を取得すること、
(d)抗CD3アゴニストビーズもしくは抗体、または抗CD3アゴニスト及び抗CD28アゴニストビーズもしくは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~6日間活性化して、第3のTIL集団を産生すること、
(e)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生すること、
(f)第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団の急速な第2の拡張を行い、増加した数のTIL集団を取得することであって、第2の細胞培養培地が、IL-2、OKT-3、及びAPCを含み、急速拡張が、14日以内の期間にわたって行われ、任意選択で、急速な第2の拡張が、急速な第2の拡張の開始後約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日または10日間進行することができる、増加した数のTIL集団を取得することを含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍組織を凍結保存して、凍結保存された腫瘍組織を産生することと、
(c)がんの進行後に凍結保存された腫瘍組織を解凍し、第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団の初期拡張(またはプライミングによる第1の拡張)を行い、第2のTIL集団を取得することであって、第1の細胞培養培地が、IL-2、任意選択でOKT-3、及び任意選択で抗原提示細胞(APC)を含み、プライミングによる第1の拡張が、約3~8日の期間にわたって起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(d)第2のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団の急速な第2の拡張を行い、増加した数のTIL集団を取得することであって、第2の細胞培養培地が、IL-2、OKT-3、及びAPCを含み、急速拡張が、14日以内の期間にわたって行われ、任意選択で、急速な第2の拡張が、急速な第2の拡張の開始後約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日または10日間進行することができる、増加した数のTIL集団を取得することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容すること、
(b)腫瘍断片を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生すること、
(c)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍消化物を産生すること、
(d)凍結保存された腫瘍消化物を解凍し、第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団の初期拡張(またはプライミングによる第1の拡張)を行い、第2のTIL集団を取得することであって、第1の細胞培養培地が、IL-2、任意選択でOKT-3、及び任意選択で抗原提示細胞(APC)を含み、プライミングによる第1の拡張が、約1~8日の期間にわたって起こる、第2のTIL集団を取得すること、
(e)抗CD3アゴニストビーズもしくは抗体、または抗CD3アゴニスト及び抗CD28アゴニストビーズもしくは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~6日間活性化して、第3のTIL集団を産生すること、
(f)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生すること、
(g)第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団の急速な第2の拡張を行い、増加した数のTIL集団を取得することであって、第2の細胞培養培地が、IL-2、OKT-3、及びAPCを含み、急速拡張が、14日以内の期間にわたって行われ、任意選択で、急速な第2の拡張が、急速な第2の拡張の開始後約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日または10日間進行することができる、増加した数のTIL集団を取得することを含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍断片を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍消化物を産生することと、
(d)凍結保存された腫瘍消化物を解凍し、第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団の初期拡張(またはプライミングによる第1の拡張)を行い、第2のTIL集団を取得することであって、第1の細胞培養培地が、IL-2、任意選択でOKT-3、及び任意選択で抗原提示細胞(APC)を含み、プライミングによる第1の拡張が、約1~8日の期間にわたって起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(e)第2のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第3のTIL集団を産生することと、
(f)第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団の急速な第2の拡張を行い、増加した数のTIL集団を取得することであって、第2の細胞培養培地が、IL-2、OKT-3、及びAPCを含み、急速拡張が、14日以内の期間にわたって行われ、任意選択で、急速な第2の拡張が、急速な第2の拡張の開始後約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日または10日間進行することができる、増加した数のTIL集団を取得することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または患者もしくは対象から腫瘍組織を取得するための他の手段によって産生される腫瘍組織の試料から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍組織を凍結保存して、凍結保存された腫瘍組織を産生することと、
(c)凍結保存された腫瘍組織を解凍し、腫瘍組織を閉鎖系に添加し、IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~9日間行われて、第2のTIL集団を取得する、第2のTIL集団を産生することと、
(d)抗CD3アゴニストビーズもしくは抗体、またはCD3アゴニスト及びCD28アゴニストビーズもしくは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(f)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を培養することによって第2の拡張を行い、第5のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約5~15日間行われて、第5のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第5のTIL集団が、治療的TIL集団である、第5のTIL集団を産生することと、
(g)ステップ(f)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(c)~(g)の各々が、閉鎖した滅菌系で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行、ステップ(d)からステップ(e)への移行、ステップ(e)からステップ(f)への移行、及び/またはステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者から凍結保存されたTIL集団を作製する方法であって、患者が、がん治療に対してナイーブであるか、または中断されている維持療法を受けており、方法が、
(a)がん治療または維持療法の再開の前に、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または患者もしくは対象から腫瘍組織を取得するための他の手段によって産生される腫瘍組織の試料から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織の試料を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍消化物組織を産生することと、
(d)凍結保存された腫瘍消化物を解凍し、腫瘍消化物を閉鎖系に添加し、IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~9日間行われて、第2のTIL集団を取得する、第2のTIL集団を産生することと、
(d)抗CD3アゴニストビーズもしくは抗体、またはCD3アゴニスト及びCD28アゴニストビーズもしくは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(f)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を培養することによって第2の拡張を行い、第5のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約5~15日間行われて、第5のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第5のTIL集団が、治療的TIL集団である、第5のTIL集団を産生することと、
(g)ステップ(f)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)~(g)の各々が、閉鎖した滅菌系で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行、ステップ(e)からステップ(f)への移行、及び/またはステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、第3のTIL集団または第4のTIL集団を第2の細胞培養培地中で約1~7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3~6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物が組み合わされて、増加した数のTILを提供する。
いくつかの実施形態では、第2のTIL集団または第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集するステップは、第2のTIL集団または第3のTIL集団に対して滅菌エレクトロポレーションステップまたはSQZマイクロ流体膜破壊ステップを行うことを含み、滅菌エレクトロポレーションステップまたはSQZマイクロ流体膜破壊ステップは、少なくとも2つの遺伝子エディターの移入を媒介する。
いくつかの実施形態では、エレクトロポレーションステップまたはSQZマイクロ流体膜破壊ステップは、少なくとも2つの遺伝子エディターの移入を媒介する単一の事象からなる。
いくつかの実施形態では、エレクトロポレーションステップまたはSQZマイクロ流体膜破壊ステップにおいて、少なくとも2つの遺伝子エディターの各々が、任意の他の遺伝子エディターの移入とは独立した事象によって個別に移入される。
いくつかの実施形態では、エレクトロポレーションステップは、各事象の後の休止期間をさらに含む。
いくつかの実施形態では、エレクトロポレーションステップまたはSQZマイクロ流体膜破壊ステップは、第1のタンパク質の発現を調節するための第1の遺伝子エディターの移入を媒介する第1の事象、第1の休止期間、第2のタンパク質の発現を調節するための第2の遺伝子エディターの移入を媒介する第2の事象、及び第2の休止期期間を含み、第1の休止期間及び第2の休止期間は、同じか、または異なる。
いくつかの実施形態では、第1の休止期間及び第2の休止期間は、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団をインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、第1の休止期間及び第2の休止期間は、第3のTIL集団または第4のTIL集団を、約30~40℃、約5%のCO2でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、第1の休止期間及び第2の休止期間は、独立して、約10時間~5日である。
いくつかの実施形態では、第1の休止期間及び第2の休止期間は、独立して、約10時間~3日である。
いくつかの実施形態では、第1の休止期間は、約1~3日である。
いくつかの実施形態では、第1の休止期間は、約3日である。
いくつかの実施形態では、第2の休止期間は、約10時間~1日である。
いくつかの実施形態では、第2の休止期間は、約12時間~24時間である。
いくつかの実施形態では、第2の休止期間は、約15時間~約18時間である。
いくつかの実施形態では、第2の休止期間は、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団を、約15時間~23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、第2の休止期間は、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団を、約約1時間、37℃で、続いて約15時間~23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、第2の休止期間は、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団を、約約1時間、37℃で、続いて約15時間~22時間、約30℃でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、第1の休止期間は、約3日であり、第2の休止期間は、約10~16時間である。
いくつかの実施形態では、少なくとも2つの遺伝子エディターは、第1のタンパク質の発現を調節するための第1のTALEヌクレアーゼ系を含む第1の遺伝子エディターと、第2のタンパク質の発現を調節するための第2のTALEヌクレアーゼ系を含む第2の遺伝子エディターと、を含む。
いくつかの実施形態では、エレクトロポレーションステップまたはSQZマイクロ流体膜破壊ステップは、第1のTALEヌクレアーゼ系の移入を媒介する第1の事象、第1の休止期間、第2のTALEヌクレアーゼ系の移入を媒介する第2の事象、及び第2の休止期期間を含み、第1の休止期間及び第2の休止期間は、同じか、または異なる。
いくつかの実施形態では、第1の休止期間及び第2の休止期間は、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団をインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、第1の休止期間及び第2の休止期間は、第3のTIL集団または第4のTIL集団を、約30~40℃、約5%のCO2でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、第1の休止期間及び第2の休止期間は、独立して、約10時間~5日である。
いくつかの実施形態では、第1の休止期間及び第2の休止期間は、独立して、約10時間~3日である。
いくつかの実施形態では、第1の休止期間は、約1~3日である。
いくつかの実施形態では、第1の休止期間は、約3日である。
いくつかの実施形態では、第2の休止期間は、約10時間~1日である。
いくつかの実施形態では、第2の休止期間は、約12時間~24時間である。
いくつかの実施形態では、第2の休止期間は、約15時間~約18時間である。
いくつかの実施形態では、第2の休止期間は、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団を、約15時間~23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、第2の休止期間は、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団を、約約1時間、37℃で、続いて約15時間~23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、第2の休止期間は、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団を、約約1時間、37℃で、続いて約15時間~22時間、約30℃でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、第1の休止期間は、約3日であり、第2の休止期間は、約10~16時間である。
いくつかの実施形態では、第2のTIL集団または第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集するステップは、第2のTIL集団または第3のTIL集団に対して滅菌エレクトロポレーションステップまたはSQZマイクロ流体膜破壊ステップを行うことを含み、滅菌エレクトロポレーションステップまたはSQZマイクロ流体膜破壊ステップは、少なくとも1つの遺伝子エディターの移入を媒介する。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、少なくとも1つのタンパク質の発現を調節するためのTALEヌクレアーゼ系である。
いくつかの実施形態では、TALEヌクレアーゼ系は、PD-1、CTLA-4、TIGIT、CBL-B、及び/またはLAG-3の発現を調節する。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、PD-1及びCTLA-4の発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、PD-1及びLAG-3の発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、PD-1及びCISHの発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、PD-1及びCBL-Bの発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、PD-1及びTIGITの発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、CTLA-4及びLAG-3の発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、CTLA-4及びCISHの発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、CTLA-4及びCBL-Bの発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、CISH及びCBL-Bの発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、CISH及びTIGITの発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、PD-1の発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、CTLA-4の発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、LAG-3の発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、CISHの発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターはCBL-Bの発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子エディターは、TIGITの発現を調節するTALEヌクレアーゼ系を含む。
いくつかの実施形態では、方法は、遺伝子編集ステップの後、及び第3のTIL集団または第4のTIL集団を培養するステップの前に、第3のTIL集団または第4のTIL集団を休止させるステップをさらに含む。
いくつかの実施形態では、休止ステップは、第3のTIL集団または第4のTIL集団を、約30~40℃、約5%のCO2でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、方法は、遺伝子編集ステップの後、及び第3のTIL集団または第4のTIL集団を培養するステップの前に、第3のTIL集団または第4のTIL集団を約1日間休止させるステップをさらに含む。
方法が、遺伝子編集ステップの後、及び第3のTIL集団または第4のTIL集団を培養するステップの前に、第3のTIL集団または第4のTIL集団を約12時間~24時間休止させるステップをさらに含む、請求項352~369のいずれかに記載の方法。
いくつかの実施形態では、第3のTIL集団または第4のTIL集団を休止させるステップは、第3のTIL集団または第4のTIL集団を約15時間~18時間休止させることを含む。
いくつかの実施形態では、第3のTIL集団または第4のTIL集団を休止させるステップは、第3のTIL集団または第4のTIL集団を約15時間休止させることを含む。
いくつかの実施形態では、第3のTIL集団または第4のTIL集団を休止させるステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団をインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、第3のTIL集団または第4のTIL集団を休止させるステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団を、約15時間~23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、第3のTIL集団または第4のTIL集団を休止させるステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約15時間~23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、第3のTIL集団または第4のTIL集団を休止させるステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約15時間~22時間、約30℃でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質及び第2のタンパク質は、PD-1、CTLA-4、LAG-3、CISH、TIGIT、及びCBL-Bからなる群から独立して選択され、ただし、第1のタンパク質及び第2のタンパク質が異なることを条件とする。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質及び第2のタンパク質は、PD-1及びCTLA-4からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質及び第2のタンパク質は、PD-1及びLAG-3からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質及び第2のタンパク質は、PD-1及びCISHからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質及び第2のタンパク質は、PD-1及びCBL-Bからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質及び第2のタンパク質は、PD-1及びTIGITからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質及び第2のタンパク質は、CTLA-4及びLAG-3からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質及び第2のタンパク質は、CTLA-4及びCISHからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質及び第2のタンパク質は、CTLA-4及びCBL-Bからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質及び第2のタンパク質は、LAG-3及びCISHからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質及び第2のタンパク質は、LAG-3及びCBL-Bからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質及び第2のタンパク質は、CISH及びCBL-Bからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、PD-1であり、第2のタンパク質は、CTLA-4である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、CTLA-4であり、第2のタンパク質は、PD-1である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、PD-1であり、第2のタンパク質は、LAG-3である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、LAG-3であり、第2のタンパク質は、PD-1である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、PD-1であり、第2のタンパク質は、CISHである。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、CISHであり、第2のタンパク質は、PD-1である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、PD-1であり、第2のタンパク質は、CBL-Bである。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、CBL-Bであり、第2のタンパク質は、PD-1である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、PD-1であり、第2のタンパク質は、TIGITである。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、TIGITであり、第2のタンパク質は、PD-1である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、CTLA-4であり、第2のタンパク質は、LAG-3である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、LAG-3であり、第2のタンパク質は、CTLA-4である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、CTLA-4であり、第2のタンパク質は、CISHである。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、CISHであり、第2のタンパク質は、CTLA-4である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、CTLA-4であり、第2のタンパク質は、CBL-Bである。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、CBL-Bであり、第2のタンパク質は、CTLA-4である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、LAG-3であり、第2のタンパク質は、CISHである。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、CISHであり、第2のタンパク質は、LAG-3である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、LAG-3であり、第2のタンパク質は、CBL-Bである。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、CBL-Bであり、第2のタンパク質は、LAG-3である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、CISHであり、第2のタンパク質は、CBL-Bである。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質は、CBL-Bであり、第2のタンパク質は、CISHである。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質または第2のタンパク質は、PD-1である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質または第2のタンパク質は、CTLA-4である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質または第2のタンパク質は、LAG-3である。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質または第2のタンパク質は、CISHである。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質または第2のタンパク質は、CBL-Bである。
いくつかの実施形態では、第1のタンパク質または第2のタンパク質は、TIGITである。
いくつかの実施形態では、第1の遺伝子エディターは、第1のタンパク質の発現を下方調節し、第2の遺伝子エディターは、第2のタンパク質の発現を下方調節する。
いくつかの実施形態では、増加した数のTILは、治療的TIL集団を含む。
いくつかの実施形態では、抗原提示細胞(APC)はPBMCである。
いくつかの実施形態では、PBMCは放射線照射されており、同種異系である。
いくつかの実施形態では、抗原提示細胞は、人工抗原提示細胞である。
いくつかの実施形態では、IL-2濃度は約10,000IU/mL~約5,000IU/mLである。
いくつかの実施形態では、第1の細胞培養培地及び/または第2の細胞培養培地は、4-1BBアゴニスト及び/またはOX40アゴニストをさらに含む。
いくつかの実施形態では、患者は、ICI治療、抗VEGF治療、化学療法治療、またはそれらの組み合わせに対してナイーブである。
いくつかの実施形態では、患者は、任意のがん治療に対してナイーブである。
いくつかの実施形態では、患者は、第1選択ICI治療及び/または標準治療を受ける。
いくつかの実施形態では、患者は、第2選択ICI治療及び/または標準治療を受ける。
いくつかの実施形態では、患者が、がん治療を受けるか、または維持療法を再開し、進行性疾患を示した後に、解凍のステップ及び後続のステップが行われる。
いくつかの実施形態では、患者は、ステップ(a)の開始時にウォッシュアウト期間にある。
いくつかの実施形態では、本開示は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団の投与を必要とするがん患者に腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を投与することによってがん患者を治療する方法であって、がん患者が、少なくとも1つの前の療法を受けており、少なくとも1つの前の療法の時またはその後にがん進行を示し、TIL集団の取得が、多病変試料採取を含み、TIL集団が、がん患者が少なくとも1つの前の療法を受ける前に採取された腫瘍試料から作製され、TIL集団が、がん患者が少なくとも1つの前の療法の時またはその後にがん進行を示した後に、対象または患者に投与される、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団の投与を必要とするがん患者に腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を投与することによってがん患者を治療する方法であって、がん患者が、少なくとも1つの前の療法を受けており、少なくとも1つの前の療法の時またはその後にがん進行を示し、TIL集団の取得が、多病変試料採取を含み、TIL集団が、がん患者が少なくとも1つの前の療法を受ける前に採取された腫瘍試料から作製され、TIL集団が、がん患者が少なくとも1つの前の療法の時またはその後にがん進行を示した後に、対象または患者に投与される、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、腫瘍試料を採取する時点で、がん患者は、任意のがん治療に対してナイーブである。
いくつかの実施形態では、腫瘍試料を採取する時点で、患者は、ICI治療、抗VEGF治療、または化学療法治療に対してナイーブである。
いくつかの実施形態では、腫瘍試料を採取する時点で、患者は、ステップ(a)の時点で中断されている維持療法を受けており、維持療法は、凍結保存の後に再開される。
いくつかの実施形態では、腫瘍試料を採取する時点で、患者は、凍結保存のステップの開始時にウォッシュアウト期間にある。
いくつかの実施形態では、患者は、第1選択ICI治療及び/または標準治療を受けるか、または受けることになる。
いくつかの実施形態では、患者は、第2選択ICI治療及び/または標準治療を受けるか、または受けることになる。
いくつかの実施形態では、方法は、ICIをがん患者に投与することをさらに含む。
いくつかの実施形態では、ICIは、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、BAFF(BR3)、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、TOX、SOCS1、ANKRD11、及びBCORからなる群から選択される遺伝子の阻害剤である。
TIL集団を患者に投与する前に、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンで患者を治療するステップをさらに含む、請求項1~76のいずれか1項に記載の方法。
骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m2/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m2/日の用量で5日間投与するステップを含む、請求項77に記載の方法。
骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m2/日の用量で、及びフルダラビンを25mg/m2/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m2/日の用量で3日間投与するステップを含む、請求項77に記載の方法。
シクロホスファミドは、メスナとともに投与される、請求項79~79に記載の方法。
患者へのTIL集団の投与の翌日に開始するIL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含む、請求項1~80のいずれか1項に記載の方法。
患者へのTIL集団の投与と同日に開始するIL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含む、請求項1~80のいずれか1項に記載の方法。
IL-2レジメンが、許容範囲まで8時間毎に15分間のボーラス静脈内注入として投与される、600,000もしくは720,000IU/kgのアルデスロイキン、またはそのバイオシミラーもしくはバリアントを含む高用量IL-2レジメンである、請求項1~82のいずれか1項に記載の方法。
請求項1~291のいずれかに記載の方法によって製造された増加した数の腫瘍浸潤リンパ球(TIL)または治療的TIL集団。
本明細書で提供される増加した数のTILまたは治療的TIL集団と、薬学的に許容される担体と、を含む、薬学的組成物。
本明細書で開示される方法を使用して製造されたTIL集団。
本明細書に開示されるTIL集団を含む、薬学的組成物。
ICIをさらに含む、本明細書で開示される薬学的組成物。
ICIが、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、BAFF(BR3)、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、TOX、SOCS1、ANKRD11、及びBCORからなる群から選択される遺伝子の阻害剤である、本明細書で開示される薬学的組成物。
いくつかの実施形態では、本開示は、がん患者に、本明細書で開示されるTIL集団または本明細書で開示される薬学的組成物を投与することによって、がん患者を治療する方法であって、がん患者が、少なくとも1つの前の療法を受けており、がん患者が、少なくとも1つの前の療法の時またはその後に、がん進行を示す、方法を提供する。
ステップA~Fの概要を提供する例示的なGen2(プロセス2A)タイプチャート。 Gen2(プロセス2A)タイププロセスの例示的なプロセスフローチャート。 Gen2(プロセス2A)タイププロセスの例示的なプロセスフローチャート。 Gen2(プロセス2A)タイププロセスの例示的なプロセスフローチャート。 凍結保存されたTILの例示的な製造プロセス(約22日)の実施形態の図を示す。 TIL製造のための22日プロセスであるGen2の実施形態の図を示す。 プロセス1C及びGen2の例示的な実施形態からのステップA~Fの比較表。 プロセス1Cの実施形態とGen2の実施形態との詳細な比較。 NSCLC腫瘍の例示的なGen3タイププロセス。 2Aプロセス(およそ22日プロセス)と、TIL製造のためのGen3プロセス(およそ14日~16日プロセス)の実施形態との比較を示す。 ステップA~Fの概要を提供する例示的なプロセスGen3チャート(およそ14日~16日プロセス)。 3つのプロセスバリエーションの各々について、ステップA~F(およそ14日~16日プロセス)の概要とともに3つの例示的なGen3プロセスを提供するチャート。 ステップA~Fの概要を提供する例示的な修正Gen2様プロセス(およそ22日プロセス)。 Gen2(Gen2)とGen3との比較のための実験フローチャートを提供する。 様々なGen2(2Aプロセス)とGen3.1プロセス実施形態との比較を示す。 Gen2、Gen2.1及びGen3.0プロセスの実施形態の様々な特徴を説明する表。 Gen3.1と称される、Gen3プロセスの実施形態のための培地条件の概要。 Gen2、Gen2.1及びGen3.0プロセスの実施形態の様々な特徴を説明する表。 Gen2及びGen3.0プロセスの実施形態の様々な特徴を比較する表。 記載された拡張プロセスの様々な実施形態における培地の使用を提供する表。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3拡張プラットフォームを使用して造血器悪性腫瘍からT細胞を拡張するための方法の例示的な実施形態の概略図。 構造I-A及びI-Bを提供し、円筒は、個々のポリペプチド結合ドメインを指す。構造I-A及びI-Bは、例えば、4-1BBLまたは4-1BBに結合する抗体から誘導される3つの線形に結合したTNFRSF結合ドメインを含み、これらを折り畳んで三価タンパク質を形成し、次いでこれをIgG1-Fc(CH3及びCH2ドメインを含む)によって第2の三価タンパク質に結合し、次いでこれを使用して、三価タンパク質のうちの2つをジスルフィド結合(小さい長楕円)によって一緒に結合し、構造を安定化し、6つの受容体及びシグナル伝達タンパク質の細胞内シグナル伝達ドメインを一緒にして、シグナル伝達複合体を形成することができるアゴニストを提供する。円筒として示されるTNFRSF結合ドメインは、例えば、親水性残基及び柔軟性のためのGly及びSer配列、ならびに溶解性のためのGlu及びLysを含み得るリンカーによって結合されたVH鎖及びVL鎖を含む、scFvドメインであり得る。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3.1プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態のプロセス概要を提供する。 Gen3.1試験プロセス(16~17日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 例示的なGen2プロセス及び例示的なGen3プロセスの比較表。 例示的なGen2プロセス及び例示的なGen3プロセスの比較表。 Gen3プロセス(16/17日プロセス)の調製タイムラインの例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(14~16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen3プロセス(16日プロセス)の例示的な実施形態の概略図。 Gen2、Gen2.1、及びGen3プロセス(16日プロセス)の実施形態の比較。 Gen2、Gen2.1、及びGen3プロセス(16日プロセス)の実施形態の比較。 Gen3実施形態の構成要素。 Gen3実施形態のフローチャート比較(Gen3.0、Gen3.1対照、Gen3.1試験)。 Gen3プロセス(16~17日プロセス)の例示的な実施形態の構成要素が示される。 承認基準表。 実施例19に記載の研究に関連する研究設計の図。 実施例19に記載の研究に関連するTILベースの免疫療法製造プロセスの概略図。略語:CMO=受託製造組織、GMP=適正製造規範、IL-2=インターロイキン-2、OKT3=CD3に対するモノクローナル抗体、TIL=腫瘍浸潤リンパ球。 研究フローチャート(全4コホート)。 ペイシェントジャーニー及び中央Gen2 GMP製造。 コホート3B患者治療スキーマ。 患者の性質。 経時的な有害事象(FAS)。 標的病変の直径和におけるベースラインからの最良の変化率(有効性評価対象セット)。 PR以上を達成した確認された応答者に対する最初の奏効までの時間、奏効期間、及び有効性評価の時間。 標的病変の直径和(FAS)におけるベースラインからの変化率。 TIL製造及び患者の遍歴。 研究設計及びエンドポイント。 治療スキーマ。 進行後及び進行前の腫瘍採取を有する患者の治療スキーマ。 KO TIL TALENプロセスの例示的な実施形態の概略図。 KO TIL TALENプロセスの例示的な実施形態の概略図。 KO TIL TALENプロセスの例示的な実施形態の概略図。 KO TIL TALENプロセスの例示的な実施形態の概略図。 フルスケールPD-1 KO TIL TALENプロセスの実験フロー図。 フルスケールPD-1 KO TIL TALENプロセスの実験フロー図。 フルスケールPD-1 KO TIL TALENプロセスの実験フロー図。 フルスケールPD-1 KO TIL TALENプロセスの実験フロー図。 本明細書に記載のTILに含まれ得る、例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質。 本明細書に記載のTILに含まれ得る、例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質。 本明細書に記載のTILに含まれ得る、例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質。 本明細書に記載のTILに含まれ得る、例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質。 本明細書に記載のTILに含まれ得る、例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質。 本明細書に記載のTILに含まれ得る、例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質。 本明細書に記載のTILに含まれ得る、例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質。 本明細書に記載のTILに含まれ得る、例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質。 本明細書に記載のTILに含まれ得る、例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質。 本明細書に記載のTILに含まれ得る、例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質。 本明細書に記載のTILに含まれ得る、例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質。 本明細書に記載のTILに含まれ得る、例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質。 本明細書に記載のTILに含まれ得る、例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質。 本明細書に記載のTILに含まれ得る、例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質。
配列表の簡単な説明
配列番号1は、ムロモナブの重鎖のアミノ酸配列である。
配列番号2は、ムロモナブの軽鎖のアミノ酸配列である。
配列番号3は、組換えヒトIL-2タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号4は、アルデスロイキンのアミノ酸配列である。
配列番号5は、IL-2形態である。
配列番号6は、ネムバロイキンアルファのアミノ酸配列である。
配列番号7は、IL-2形態である。
配列番号8は、ムチンドメインポリペプチドである。
配列番号9は、組換えヒトIL-4タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号10は、組換えヒトIL-7タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号11は、組換えヒトIL-15タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号12は、組換えヒトIL-21タンパク質のアミノ酸配列である。
配列番号13は、IL-2配列である。
配列番号14は、IL-2ムテイン配列である。
配列番号15は、IL-2ムテイン配列である。
配列番号16は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR1_IL-2である。
配列番号17は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR2である。
配列番号18は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR3である。
配列番号19は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR1_IL-2カバットである。
配列番号20は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR2カバットである。
配列番号21は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR3カバットである。
配列番号22は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR1_IL-2クロチアである。
配列番号23は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR2クロチアである。
配列番号24は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR3クロチアである。
配列番号25は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR1_IL-2 IMGTである。
配列番号26は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR2 IMGTである。
配列番号27は、IgG.IL2R67A.H1のHCDR3 IMGTである。
配列番号28は、IgG.IL2R67A.H1のVH鎖である。
配列番号29は、IgG.IL2R67A.H1の重鎖である。
配列番号30は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR1カバットである。
配列番号31は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR2カバットである。
配列番号32は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR3カバットである。
配列番号33は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR1クロチアである。
配列番号34は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR2クロチアである。
配列番号35は、IgG.IL2R67A.H1のLCDR3 chothiaである。
配列番号36は、VL鎖である。
配列番号37は、軽鎖である。
配列番号38は、軽鎖である。
配列番号39は、軽鎖である。
配列番号40は、ヒト4-1BBのアミノ酸配列である。
配列番号41は、マウス4-1BBのアミノ酸配列である。
配列番号42は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖である。
配列番号43は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖である。
配列番号44は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖可変領域(V)である。
配列番号45は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号46は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖CDR1である。
配列番号47は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖CDR2である。
配列番号48は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の重鎖CDR3である。
配列番号49は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖CDR1である。
配列番号50は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖CDR2である。
配列番号51は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウトミルマブ(PF-05082566)の軽鎖CDR3である。
配列番号52は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖である。
配列番号53は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖である。
配列番号54は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖可変領域(VH)である。
配列番号55は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖可変領域(VL)である。
配列番号56は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖CDR1である。
配列番号57は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖CDR2である。
配列番号58は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の重鎖CDR3である。
配列番号59は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖CDR1である。
配列番号60は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖CDR2である。
配列番号61は、4-1BBアゴニストモノクローナル抗体ウレルマブ(BMS-663513)の軽鎖CDR3である。
配列番号62は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のFcドメインである。
配列番号63は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号64は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号65は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号66は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号67は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号68は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号69は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号70は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号71は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号72は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号73は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のFcドメインである。
配列番号74は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号75は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号76は、TNFRSFアゴニスト融合タンパク質のリンカーである。
配列番号77は、4-1BBリガンド(4-1BBL)アミノ酸配列である。
配列番号78は、4-1BBLポリペプチドの可溶性部分である。
配列番号79は、4-1BBアゴニスト抗体4B4-1-1バージョン1の重鎖可変領域(V)である。
配列番号80は、4-1BBアゴニスト抗体4B4-1-1バージョン1の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号81は、4-1BBアゴニスト抗体4B4-1-1バージョン2の重鎖可変領域(VH)である。
配列番号82は、4-1BBアゴニスト抗体4B4-1-1バージョン2の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号83は、4-1BBアゴニスト抗体H39E3-2の重鎖可変領域(V)である。
配列番号84は、4-1BBアゴニスト抗体H39E3-2の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号85は、ヒトOX40のアミノ酸配列である。
配列番号86は、マウスOX40のアミノ酸配列である。
配列番号87は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖である。
配列番号88は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の軽鎖である。
配列番号89は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖可変領域(V)である。
配列番号90は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号91は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖CDR1である。
配列番号92は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖CDR2である。
配列番号93は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の重鎖CDR3である。
配列番号94は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の軽鎖CDR1である。
配列番号95は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の軽鎖CDR2である。
配列番号96は、OX40アゴニストモノクローナル抗体タボリキシズマブ(MEDI-0562)の軽鎖CDR3である。
配列番号97は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖である。
配列番号98は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖である。
配列番号99は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖可変領域(V)である。
配列番号100は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号101は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖CDR1である。
配列番号102は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖CDR2である。
配列番号103は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の重鎖CDR3である。
配列番号104は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖CDR1である。
配列番号105は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖CDR2である。
配列番号106は、OX40アゴニストモノクローナル抗体11D4の軽鎖CDR3である。
配列番号107は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖である。
配列番号108は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖である。
配列番号109は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖可変領域(V)である。
配列番号110は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号111は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖CDR1である。
配列番号112は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖CDR2である。
配列番号113は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の重鎖CDR3である。
配列番号114は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖CDR1である。
配列番号115は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖CDR2である。
配列番号116は、OX40アゴニストモノクローナル抗体18D8の軽鎖CDR3である。
配列番号117は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の重鎖可変領域(V)である。
配列番号118は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号119は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の重鎖CDR1である。
配列番号120は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の重鎖CDR2である。
配列番号121は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の重鎖CDR3である。
配列番号122は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の軽鎖CDR1である。
配列番号123は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の軽鎖CDR2である。
配列番号124は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu119-122の軽鎖CDR3である。
配列番号125は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の重鎖可変領域(V)である。
配列番号126は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号127は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の重鎖CDR1である。
配列番号128は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の重鎖CDR2である。
配列番号129は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の重鎖CDR3である。
配列番号130は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の軽鎖CDR1である。
配列番号131は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の軽鎖CDR2である。
配列番号132は、OX40アゴニストモノクローナル抗体Hu106-222の軽鎖CDR3である。
配列番号133は、OX40リガンド(OX40L)アミノ酸配列である。
配列番号134は、OX40Lポリペプチドの可溶性部分である。
配列番号135は、OX40Lポリペプチドの代替可溶性部分である。
配列番号136は、OX40アゴニストモノクローナル抗体008の重鎖可変領域(V)である。
配列番号137は、OX40アゴニストモノクローナル抗体008の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号138は、OX40アゴニストモノクローナル抗体011の重鎖可変領域(V)である。
配列番号139は、OX40アゴニストモノクローナル抗体011の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号140は、OX40アゴニストモノクローナル抗体021の重鎖可変領域(V)である。
配列番号141は、OX40アゴニストモノクローナル抗体021の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号142は、OX40アゴニストモノクローナル抗体023の重鎖可変領域(V)である。
配列番号143は、OX40アゴニストモノクローナル抗体023の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号144は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号145は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号146は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号147は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号148は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号149は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号150は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号151は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号152は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号153は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号154は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号155は、ヒト化OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号156は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の重鎖可変領域(V)である。
配列番号157は、OX40アゴニストモノクローナル抗体の軽鎖可変領域(V)である。
配列番号158は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号159は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号160は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号161は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号162は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号163は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号164は、PD-1阻害剤ニボルマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号165は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号166は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号167は、PD-1阻害剤ニボルマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号168は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号169は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号170は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号171は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号172は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号173は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号174は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号175は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号176は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号177は、PD-1阻害剤ペムブロリズマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号178は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号179は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号180は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号181は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号182は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号183は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号184は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号185は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号186は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号187は、PD-L1阻害剤デュルバルマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号188は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号189は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号190は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号191は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号192は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号193は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号194は、PD-L1阻害剤アベルマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号195は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号196は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号197は、PD-L1阻害剤アベルマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号198は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号199は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号200は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号201は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号202は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号203は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号204は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号205は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号206は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号207は、PD-L1阻害剤アテゾリズマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号208は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号209は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号210は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号211は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号212は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号213は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号214は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号215は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号216は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号217は、CTLA-4阻害剤イピリムマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号218は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号219は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号220は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号221は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号222は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号223は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号224は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号225は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号226は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号227は、CTLA-4阻害剤トレメリムマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号228は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖アミノ酸配列である。
配列番号229は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖アミノ酸配列である。
配列番号230は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号231は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖可変領域(V)アミノ酸配列である。
配列番号232は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号233は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号234は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの重鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号235は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖CDR1アミノ酸配列である。
配列番号236は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖CDR2アミノ酸配列である。
配列番号237は、CTLA-4阻害剤ザリフレリマブの軽鎖CDR3アミノ酸配列である。
配列番号238は、CD8a膜貫通ドメインである。
配列番号239は、B7-1膜貫通細胞内ドメインである。
配列番号240~245は、本明細書に記載の免疫調節融合タンパク質において有用である例示的なグリシン-セリンリンカーである。
配列番号246は、本明細書に記載の免疫調節融合タンパク質において有用である例示的なリンカーである。
配列番号247は、2AペプチドC末端配列である。
配列番号248は、ブタテシオウイルス-1 2Aペプチドである。
配列番号249は、ウマ鼻炎Aウイルス2Aペプチドである。
配列番号250は、口蹄疫ウイルス2Aペプチドである。
配列番号251は、例示的なフリン切断可能な2Aペプチドである。
配列番号252及び253は、ヒトIgEシグナルペプチド配列である。
配列番号254は、ヒトIL-2シグナルペプチド配列である。
配列番号255は、6×NFAT IL-2最小プロモーターである。
配列番号256は、NFAT応答性エレメントである。
配列番号257は、ヒトIL-2プロモーター配列である。
配列番号258は、ヒトIL-15(N72D変異体)である。
配列番号259は、ヒトIL-15R-アルファ-Su/Fcドメインである。
配列番号260は、ヒトIL-15R-アルファ-Su(65aa切断細胞外ドメイン)である。
配列番号261は、ヒトIL-15アイソフォーム2である。
配列番号262は、ヒトIL-15アイソフォーム1である。
配列番号263は、ヒトIL-15(シグナルペプチドを含まない)である。
配列番号264は、ヒトIL-15R-アルファ(85aa切断細胞外ドメイン)である。
配列番号265は、ヒトIL-15R-アルファ(182aa切断細胞外ドメイン)である。
配列番号266は、ヒトIL-15R-アルファである。
配列番号267は、ヒトIL-12 p35サブユニットである。
配列番号268は、ヒトIL-12 p40サブユニットである。
配列番号269は、ヒトIL-18である。
配列番号270は、ヒトIL-18バリアントである。
配列番号271は、ヒトIL-21である。
配列番号272は、ヒトIL-2である。
配列番号273は、ヒトCD40Lである。
配列番号274は、アゴニスト抗ヒトCD40 VH(ソチガリマブ)である。
配列番号275は、アゴニスト抗ヒトCD40 VL(ソチガリマブ)である。
配列番号276は、アゴニスト抗ヒトCD40 scFv(ソチガリマブ)である。
配列番号277は、アゴニスト抗ヒトCD40 VH(ダセツズマブ)である。
配列番号278は、アゴニスト抗ヒトCD40 VL(ダセツズマブ)である。
配列番号279は、アゴニスト抗ヒトCD40 scFv(ダセツズマブ)である。
配列番号280は、アゴニスト抗ヒトCD40 VH(ルカツツズマブ)である。
配列番号281は、アゴニスト抗ヒトCD40 VL(ルカツツズマブ)である。
配列番号282は、アゴニスト抗ヒトCD40 scFv(ルカツツズマブ)である。
配列番号283は、アゴニスト抗ヒトCD40 VH(セリクレルマブ)である。
配列番号284は、アゴニスト抗ヒトCD40 VL(セリクレルマブ)である。
配列番号285は、アゴニスト抗ヒトCD40 scFv(セリクレルマブ)である。
配列番号286は、標的PD-1配列である。
配列番号287は、標的PD-1配列である。
配列番号288は、反復PD-1左反復配列である。
配列番号289は、反復PD-1右反復配列である。
配列番号290は、反復PD-1左反復配列である。
配列番号291は、反復PD-1右反復配列である。
配列番号292は、PD-1左TALENヌクレアーゼ配列である。
配列番号293は、PD-1右TALENヌクレアーゼ配列である。
配列番号294は、PD-1左TALENヌクレアーゼ配列である。
配列番号295は、PD-1右TALENヌクレアーゼ配列である。
配列番号296は、配列番号328のテザリングされたIL-15をコードする核酸配列である。
配列番号297は、配列番号331のテザリングされたIL-21融合タンパク質をコードする核酸配列である。
配列番号298は、配列番号328のテザリングされたIL-15融合タンパク質及び配列番号331のテザリングされたテザーIL-21融合タンパク質をコードする核酸配列である。
配列番号299は、配列番号303のテザリングされたIL-12融合タンパク質をコードする核酸配列である。核酸配列は、NFATプロモーターを含む。
配列番号300は、配列番号328のテザリングされたIL-15融合タンパク質をコードする核酸配列である。核酸配列は、NFATプロモーターを含む。
配列番号301は、配列番号331のテザリングされたIL-21融合タンパク質をコードする核酸配列である。核酸配列は、NFATプロモーターを含む。
配列番号302は、配列番号328のテザリングされたIL-15融合タンパク質及び配列番号331のテザリングされたテザーIL-21融合タンパク質をコードする核酸配列である。核酸配列は、NFATプロモーターを含む。
配列番号303は、例示的なテザリングされたIL-12(テザリングされたIL-12-Lr1-Ar2)のアミノ酸配列である。
配列番号304は、配列番号303のテザリングされたIL-12をコードする核酸配列である。
配列番号305は、例示的なテザリングされたIL-18(テザリングされたIL-18-Lr1-Ar2)のアミノ酸配列である。
配列番号306は、配列番号305のテザリングされたIL-18をコードする核酸配列である。
配列番号307は、例示的なテザリングされたバリアントIL-18(テザリングされたDR-IL-18(6-27バリアント)-Lr1-Ar2)のアミノ酸配列である。
配列番号308は、配列番号307のテザリングされたバリアントIL-18をコードする核酸配列である。
配列番号309は、例示的なテザリングされたIL-12/IL-15のアミノ酸配列である。
配列番号310は、配列番号309のテザリングされたIL-12/IL-15をコードする核酸配列である。
配列番号311は、例示的なテザリングされたIL-18/IL-15のアミノ酸配列である。
配列番号312は、配列番号311のテザリングされたIL-18/IL-15をコードする核酸配列である。
配列番号313は、例示的なテザリングされた抗CD40scFV(APX005M)のアミノ酸配列である。
配列番号314は、配列番号313のテザリングされた抗CD40scFV(APX005M)をコードする核酸配列である。
配列番号315は、例示的なテザリングされた抗CD40scFV(ダセツズマブ)のアミノ酸配列である。
配列番号316は、配列番号315のテザリングされた抗CD40scFV(ダセツズマブ)をコードする核酸配列である。
配列番号317は、例示的なテザリングされた抗CD40scFV(ルカツツズマブ)のアミノ酸配列である。
配列番号318は、配列番号317のテザリングされた抗CD40scFV(ルカツツズマブ)をコードする核酸配列である。
配列番号319は、例示的なテザリングされた抗CD40scFV(セリクレルマブ)のアミノ酸配列である。
配列番号320は、配列番号319のテザリングされた抗CD40scFV(セリクレルマブ)をコードする核酸配列である。
配列番号321は、配列番号273のCD40Lをコードする核酸配列である。
配列番号322は、例示的なテザリングされたCD40L/IL-15のアミノ酸配列である。
配列番号323は、配列番号311のテザリングされたCD40L/IL-15をコードする核酸配列である。
配列番号324は、例示的なテザリングされたIL-2のアミノ酸配列である。
配列番号325は、配列番号313のテザリングされたIL-2をコードする核酸配列である。
配列番号326は、例示的なテザリングされたIL-12のアミノ酸配列である。
配列番号327は、配列番号315のテザリングされたIL-12をコードする核酸配列である。
配列番号328は、例示的なテザリングされたIL-15のアミノ酸配列である。
配列番号329は、配列番号317のテザリングされたIL-15をコードする核酸配列である。
配列番号330は、GFPをコードする核酸配列である。
配列番号331は、例示的なテザリングされたIL-21のアミノ酸配列である。
I.導入
急速拡張プロトコル(REP)によってエクスビボで培養されたTILを利用した養子細胞療法は、黒色腫などのがんを有する患者の宿主免疫抑制後の養子細胞療法に成功している。現在の注入受容パラメータは、TILの組成(例えば、CD28、CD8、またはCD4陽性)の読み取り値、ならびにREP産物の拡張の数値倍率及び生存率に依存している。
現在のREPプロトコルは、患者に注入されるTILの健康状態についてほとんど洞察を与えていない。T細胞は、ナイーブT細胞からエフェクターT細胞への成熟の過程で深刻な代謝シフトを受ける(Chang,et al.,Nat.Immunol.2016,17,364(その全体が本明細書に明示的に組み込まれる)、特に嫌気性及び好気性代謝の考察及びマーカーについて参照)。例えば、ナイーブT細胞は、ミトコンドリア呼吸に依存してATPを産生するが、TILなどの成熟した健康なエフェクターT細胞は、高度に解糖系であり、好気性解糖に依存して増殖、移動、活性化、及び抗腫瘍効果に必要な生体エネルギー基質を提供する。
現在のTILの製造及び治療プロセスは、長さ、コスト、無菌性の懸念、及び本明細書に記載される他の要因によって制限されているため、抗PD1に対して不応性であるために患者を治療する可能性は厳しく制限されている。実行可能な治療選択肢がほとんどまたはまったく残っていない患者を治療する際の使用に適したTIL製造プロセス及びかかるプロセスに基づく療法を提供することが緊急に必要である。本発明は、抗PD-1治療に対して不応性である非小細胞肺癌(NSCLC)患者の治療に用いることができるTILを生成する際に使用するための短縮された製造プロセスを提供することによって、この必要性を満たす。
II.定義
他に定義されない限り、本明細書で使用されるすべての技術用語及び科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者によって一般に理解される意味と同じである。本明細書で参照されるすべての特許及び刊行物は、参照によりそれらの全体が組み込まれる。
本明細書で使用される「同時投与」、「同時投与すること」、「組み合わせて投与される」、「組み合わせて投与すること」、「同時(simultaneous)」、及び「同時(concurrent)」という用語は、両方の医薬品有効成分及び/またはそれらの代謝物が、対象において同時に存在するように、対象へ2つ以上の医薬品有効成分(本発明の好ましい実施形態では、例えば、複数のTIL)投与することを包含する。同時投与には、別々の組成物での同時投与、別々の組成物での異なる時間での投与、または2つ以上の医薬品有効成分が存在する組成物での投与が含まれる。別々の組成物での同時投与及び両方の薬剤が存在する組成物での投与が好ましい。
「インビボ」という用語は、対象の体内で起こる事象を指す。
「インビトロ」という用語は、対象の体外で起こる事象を指す。インビトロアッセイには、生きている細胞または死んでいる細胞が用いられる細胞ベースのアッセイが包含され、無傷の細胞が用いられない無細胞アッセイも含み得る。
「エクスビボ」という用語は、対象の体から除去された細胞、組織、及び/または器官に対する治療または処置の実施を伴う事象を指す。適切には、細胞、組織、及び/または器官は、外科手術または治療の方法で対象の体に戻され得る。
「急速拡張」という用語は、1週間の期間にわたって少なくとも約3倍(または4、5、6、7、8、もしくは9倍)、より好ましくは1週間の期間にわたって少なくとも約10倍(または20、30、40、50、60、70、80、もしくは90倍)、あるいは最も好ましくは1週間の期間にわたって少なくとも約100倍の抗原特異的TILの数の増加を意味する。本明細書では、いくつかの急速拡張プロトコルが説明されている。
本明細書における「腫瘍浸潤リンパ球」または「TIL」とは、対象の血流を離れて腫瘍に移動した白血球として最初に取得された細胞の集団を意味する。TILには、CD8細胞傷害性T細胞(リンパ球)、Th1及びTh17 CD4T細胞、ナチュラルキラー細胞、樹状細胞、ならびにM1マクロファージが含まれるが、これらに限定されない。TILには、一次TIL及び二次TILの両方が含まれる。「一次TIL」は、本明細書に概説されるように患者組織試料から得られるもの(「新たに採取された」と称されることもある)であり、「二次TIL」は、本明細書で考察される拡張または増殖された任意のTIL細胞集団であり、バルクTIL及び拡張TIL(「REP TIL」または「post-REP TIL」)が含まれるが、これらに限定されない。TIL細胞集団には、遺伝子修飾TILが含まれ得る。
本明細書における「細胞の集団」(TILを含む)とは、共通の形質を共有するいくつかの細胞を意味する。一般に、集団は、概して1×10~1×1010の数の範囲であり、異なるTIL集団は、異なる数を含む。例えば、IL-2の存在下での一次TILの初期成長は、およそ1×10細胞のバルクTILの集団をもたらす。REP拡張は、一般に、注入用の1.5×10~1.5×1010細胞の集団を提供するために行われる。
本明細書における「凍結保存されたTIL」とは、一次、バルク、または拡張(REP TIL)のいずれかのTILが、約-150℃~-60℃の範囲で処理及び保管されることを意味する。凍結保存のための一般的な方法は、実施例を含む本明細書の他の場所にも記載されている。明確にするために、「凍結保存されたTIL」は、一次TILのソースとして使用される可能性のある凍結組織試料と区別することができる。
本明細書における「解凍された凍結保存TIL」とは、以前に凍結保存され、その後、細胞培養温度またはTILが患者に投与され得る温度を含むがこれらに限定されない、室温以上に戻るように処理されたTILの集団を意味する。
TILは、一般に、細胞表面マーカーを使用して生化学的に定義されるか、または腫瘍に浸潤して治療を達成するそれらの能力によって機能的に定義されるかのいずれかであり得る。TILは、一般に、CD4、CD8、TCRαβ、CD27、CD28、CD56、CCR7、CD45Ra、CD95、PD-1、及びCD25のうちの1つ以上のバイオマーカーの発現によって分類され得る。さらに及び代替的に、TILは、患者への再導入時に固形腫瘍に浸潤する能力により機能的に定義され得る。
「凍結保存培地(cryopreservation media)」または「凍結保存培地(cryopreservation medium)」という用語は、細胞の凍結保存に使用できる任意の培地を指す。かかる培地は、7%~10%のDMSOを含む培地を含むことができる。例示的な培地には、CryoStor CS10、Hyperthermasol、及びそれらの組み合わせが含まれる。「CS10」という用語は、Stemcell TechnologiesまたはBiolife Solutionsから入手した凍結保存培地を指す。CS10培地は、商品名「CryoStor(登録商標)CS10」と称され得る。CS10培地は、DMSOを含む無血清の動物成分を含まない培地である。
「セントラルメモリーT細胞」という用語は、ヒトではCD45R0+であり、CCR7(CCR7)及びCD62L(CD62)を構成的に発現するT細胞のサブセットを指す。セントラルメモリーT細胞の表面表現型には、TCR、CD3、CD127(IL-7R)、及びIL-15Rも含まれる。セントラルメモリーT細胞の転写因子には、BCL-6、BCL-6B、MBD2、及びBMI1が含まれる。セントラルメモリーT細胞は、TCRトリガー後、エフェクター分子としてIL-2及びCD40Lを主に分泌する。セントラルメモリーT細胞は、血液中のCD4コンパートメントで優勢であり、ヒトではリンパ節及び扁桃腺において比例して濃縮される。
「エフェクターメモリーT細胞」という用語は、セントラルメモリーT細胞と同様にCD45R0+であるが、CCR7の構成的発現を失い(CCR7)、CD62L発現が不均一であるかまたは低い(CD62L)、ヒトまたは哺乳動物T細胞のサブセットを指す。セントラルメモリーT細胞の表面表現型には、TCR、CD3、CD127(IL-7R)、及びIL-15Rも含まれる。セントラルメモリーT細胞の転写因子には、BLIMP1が含まれる。エフェクターメモリーT細胞は、インターフェロンガンマ、IL-4、及びIL-5を含む、抗原刺激後に高レベルの炎症性サイトカインを急速に分泌する。エフェクターメモリーT細胞は、血液中のCD8コンパートメントで優勢であり、ヒトでは肺、肝臓、及び腸において比例して濃縮される。CD8+エフェクターメモリーT細胞は、大量のパーフォリンを担持する。
「閉鎖系」という用語は、外部環境に対して閉鎖されている系を指す。細胞培養法に適した任意の閉鎖系を、本発明の方法で用いることができる。閉鎖系には、例えば、密閉G容器が含まれるが、これに限定されない。腫瘍セグメントが閉鎖系に付加されると、TILを患者に投与する準備ができるまで、系は外部環境に開かれない。
腫瘍を破壊するためのプロセスを説明するために本明細書で使用される「断片化すること」、「断片」、及び「断片化された」という用語は、腫瘍組織を破砕、スライス、分割、及び細切するなどの機械的断片化法、ならびに腫瘍組織の物理的構造を破壊するための任意の他の方法を含む。
「末梢血単核細胞」及び「PBMC」という用語は、リンパ球(T細胞、B細胞、NK細胞)及び単球を含む、丸い核を有する末梢血細胞を指す。抗原提示細胞として使用される場合(PBMCは抗原提示細胞の一種である)、末梢血単核細胞は、好ましくは、照射された同種異系末梢血単核細胞である。
「末梢血リンパ球」及び「PBL」という用語は、末梢血から拡張したT細胞を指す。いくつかの実施形態では、PBLは、ドナーからの全血またはアフェレーシス産物から分離される。いくつかの実施形態では、PBLは、CD3+CD45+のT細胞表現型などのT細胞表現型の正または負の選択によって、ドナー由来の全血またはアフェレーシス産物から分離される。
「抗CD3抗体」という用語は、成熟T細胞のT細胞抗原受容体におけるCD3受容体に対するヒト、ヒト化、キメラ、またはマウス抗体を含む、抗体またはそのバリアント、例えば、モノクローナル抗体を指す。抗CD3抗体には、ムロモナブとしても知られるOKT-3が含まれる。抗CD3抗体には、T3及びCD3εとしても知られるUHCT1クローンも含まれる。他の抗CD3抗体には、例えば、オテリキシズマブ、テプリズマブ、及びビシリズマブが含まれる。
「OKT-3」(本明細書では「OKT3」とも称される)という用語は、成熟T細胞のT細胞抗原受容体におけるCD3受容体に対するヒト、ヒト化、キメラ、またはマウス抗体を含む、モノクローナル抗体またはそのバイオシミラーもしくはバリアントを指し、市販の形態、例えば、OKT-3(30ng/mL、MACS GMP CD3 pure、Miltenyi Biotech,Inc.,San Diego,CA,USA)及びムロモナブ、またはそれらのバリアント、保存的アミノ酸置換物、グリコフォーム、またはバイオシミラーを含む。ムロモナブの重鎖及び軽鎖のアミノ酸配列を表1に示す(配列番号1及び配列番号2)。OKT-3を産生することができるハイブリドーマは、American Type Culture Collectionに寄託され、ATCC受託番号CRL8001が割り当てられている。OKT-3を産生することができるハイブリドーマは、European Collection of Authenticated Cell Cultures(ECACC)にも寄託され、カタログ番号86022706が割り当てられている。
「IL-2」(本明細書では「IL2」とも称される)という用語は、インターロイキン-2として知られるT細胞成長因子を指し、ヒト及び哺乳動物形態、保存的アミノ酸置換物、グリコフォーム、バイオシミラー、及びバリアントを含む、IL-2のすべての形態を含む。IL-2は、例えば、Nelson,J.Immunol.2004,172,3983-88及びMalek,Annu.Rev.Immunol.2008,26,453-79に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-2のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号3)。例えば、IL-2という用語は、アルデスロイキン(PROLEUKIN、単回使用バイアル当たり2200万IUで複数の供給業者から市販されている)などのヒト組換えIL-2形態、ならびにCellGenix,Inc.,Portsmouth,NH,USA(CELLGRO GMP)またはProSpec-Tany TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USAによって市販されている組換えIL-2形態(カタログ番号CYT-209-b)及び他のベンダーからの他の商用同等物を包含する。アルデスロイキン(デス-アラニル-1、セリン-125ヒトIL-2)は、およそ15kDaの分子量を有する非グリコシル化ヒト組換えIL-2形態である。本発明での使用に好適なアルデスロイキンのアミノ酸配列を表2に示す(配列番号4)。IL-2という用語はまた、ペグ化IL2プロドラッグベンペガルデスロイキン(NKTR-214、平均6個のリジン残基が[(2,7-ビス{[メチルポリ(オキシエチレン)]カルバモイル}-9H-フルオレン-9-イル)メトキシ]カルボニル)で置換されたNである、配列番号4のようなペグ化ヒト組換えIL-2)を含む、本明細書に記載のIL-2のペグ化形態も包含し、Nektar Therapeutics(South San Francisco,CA,USA)から入手可能であるか、または国際特許出願公開第WO2018/132496 A1号の実施例19に記載の方法、または米国特許出願公開第2019/0275133 A1号の実施例1に記載の方法など、当該技術分野で知られている方法によって調製することができ、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。本発明での使用に好適なベンペガルデスロイキン(NKTR-214)及び他のペグ化IL-2分子は、米国特許出願公開第2014/0328791 A1号及び国際特許出願公開第WO2012/065086 A1号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。本発明での使用に好適な複合化IL-2の代替形態は、米国特許第4,766,106号、同第5,206,344号、同第5,089,261号、及び同第4,902,502号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。本発明での使用に好適なIL-2の製剤は、米国特許第6,706,289号に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、Synthorx,Inc.から入手可能なTHOR-707である。本発明での使用に好適なTHOR-707及びIL-2の追加の代替形態の調製ならびに特性は、米国特許出願公開第2020/0181220 A1号及び同第2020/0330601 A1号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、単離及び精製IL-2ポリペプチドと、K35、T37、R38、T41、F42、K43、F44、Y45、E61、E62、E68、K64、P65、V69、L72、及びY107から選択されるアミノ酸位置で単離及び精製IL-2ポリペプチドに結合する複合部分と、を含む、インターロイキン2(IL-2)複合体であり、アミノ酸残基の番号付けは配列番号5に対応する。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、T37、R38、T41、F42、F44、Y45、E61、E62、E68、K64、P65、V69、L72、及びY107から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、T37、R38、T41、F42、F44、Y45、E61、E62、E68、P65、V69、L72、及びY107から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、T37、T41、F42、F44、Y45、P65、V69、L72、及びY107から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、R38及びK64から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、E61、E62、及びE68から選択される。いくつかの実施形態では、アミノ酸位置は、E62である。いくつかの実施形態では、K35、T37、R38、T41、F42、K43、F44、Y45、E61、E62、E68、K64、P65、V69、L72、及びY107から選択されるアミノ酸残基は、リジン、システイン、またはヒスチジンにさらに変異する。いくつかの実施形態では、アミノ酸残基は、システインに変異する。いくつかの実施形態では、アミノ酸残基は、リジンに変異する。いくつかの実施形態では、K35、T37、R38、T41、F42、K43、F44、Y45、E61、E62、E68、K64、P65、V69、L72、及びY107から選択されるアミノ酸残基は、非天然アミノ酸にさらに変異する。いくつかの実施形態では、非天然アミノ酸は、N6-アジドエトキシ-L-リジン(AzK)、N6-プロパルギルエトキシ-L-リジン(PraK)、BCN-L-リジン、ノルボルネンリジン、TCO-リジン、メチルテトラジンリジン、アリルオキシカルボニルリジン、2-アミノ-8-オキソノナン酸、2-アミノ-8-オキソオクタン酸、p-アセチル-L-フェニルアラニン、p-アジドメチル-L-フェニルアラニン(pAMF)、p-ヨード-L-フェニルアラニン、m-アセチルフェニルアラニン、2-アミノ-8-オキソノナン酸、p-プロパルギルオキシフェニルアラニン、p-プロパルギル-フェニルアラニン、3-メチル-フェニルアラニン、L-ドーパ、フッ素化フェニルアラニン、イソプロピル-L-フェニルアラニン、p-アジド-L-フェニルアラニン、p-アシル-L-フェニルアラニン、p-ベンゾイル-L-フェニルアラニン、p-ブロモフェニルアラニン、p-アミノ-L-フェニルアラニン、イソプロピル-L-フェニルアラニン、O-アリルチロシン、O-メチル-L-チロシン、O-4-アリル-L-チロシン、4-プロピル-L-チロシン、ホスホノチロシン、トリ-O-アセチル-GlcNAcp-セリン、L-ホスホセリン、ホスホノセリン、L-3-(2-ナフチル)アラニン、2-アミノ-3-((2-((3-(ベンジルオキシ)-3-オキソプロピル)アミノ)エチル)セラニル)プロパン酸、2-アミノ-3-(フェニルセラニル)プロパン酸、またはセレノシステインを含む。いくつかの実施形態では、IL-2複合体は、野生型IL-2ポリペプチドと比較して、IL-2受容体α(IL-2Rα)サブユニットに対する減少した親和性を有する。いくつかの実施形態では、減少した親和性は、野生型IL-2ポリペプチドと比較して、IL-2Rαに対する結合親和性の約10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、99%、または99%を超える減少である。いくつかの実施形態では、減少した親和性は、野生型IL-2ポリペプチドと比較して、約1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、30倍、50倍、100倍、200倍、300倍、500倍、1000倍以上である。いくつかの実施形態では、複合部分は、IL-2とIL-2Rαとの結合を損なうかまたは遮断する。いくつかの実施形態では、複合部分は、水溶性ポリマーを含む。いくつかの実施形態では、追加の複合部分は、水溶性ポリマーを含む。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、ポリエチレングリコール(PEG)、ポリ(プロピレングリコール)(PPG)、エチレングリコール及びプロピレングリコールのコポリマー、ポリ(オキシエチル化ポリオール)、ポリ(オレフィンアルコール)、ポリ(ビニルピロリドン)、ポリ(ヒドロキシアルキルメタクリルアミド)、ポリ(ヒドロキシアルキルメタクリレート)、ポリ(サッカライド)、ポリ(α-ヒドロキシ酸)、ポリ(ビニルアルコール)、ポリホスファゼン、ポリオキサゾリン(POZ)、ポリ(N-アクリロイルモルホリン)、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、PEGを含む。いくつかの実施形態では、PEGは、直鎖状PEGまたは分岐状PEGである。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、ポリサッカライドを含む。いくつかの実施形態では、ポリサッカライドは、デキストラン、ポリシアル酸(PSA)、ヒアルロン酸(HA)、アミロース、ヘパリン、ヘパランサルフェート(HS)、デキストリン、またはヒドロキシエチルデンプン(HES)を含む。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、グリカンを含む。いくつかの実施形態では、水溶性ポリマーの各々は、独立して、ポリアミンを含む。いくつかの実施形態では、複合部分は、タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、追加の複合部分は、タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質の各々は、独立して、アルブミン、トランスフェリン、またはトランスサイレチンを含む。いくつかの実施形態では、タンパク質の各々は、独立して、Fc部分を含む。いくつかの実施形態では、タンパク質の各々は、独立して、IgGのFc部分を含む。いくつかの実施形態では、複合部分は、ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、追加の複合部分は、ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、タンパク質の各々は、独立して、XTENペプチド、グリシンリッチホモアミノ酸ポリマー(HAP)、PASポリペプチド、エラスチン様ポリペプチド(ELP)、CTPペプチド、またはゼラチン様タンパク質(GLK)ポリマーを含む。いくつかの実施形態では、単離及び精製IL-2ポリペプチドは、グルタミル化によって修飾される。いくつかの実施形態では、複合部分は、単離及び精製IL-2ポリペプチドと直接的に結合される。いくつかの実施形態では、複合部分は、リンカーを介して単離及び精製されたIL-2ポリペプチドと間接的に結合される。いくつかの実施形態では、リンカーは、ホモ二官能性リンカーを含む。いくつかの実施形態では、ホモ二官能性リンカーは、ロマント試薬ジチオビス(スクシンイミジルプロピオネート)DSP、3’3’-ジチオビス(スルホスクシンイミジルプロピオネート)(DTSSP)、ジスクシンイミジルスベラート(DSS)、ビス(スルホスクシンイミジル)スベラート(BS)、ジスクシンイミジルタータラート(DST)、ジスルホスクシンイミジルタータラート(スルホDST)、エチレングリコビス(スクシンイミジルスクシネート)(EGS)、ジスクシンイミジルグルタラート(DSG)、N,N’-ジスクシンイミジルカーボナート(DSC)、ジメチルアジピミデート(DMA)、ジメチルピメリミデート(DMP)、ジメチルスベリミデート(DMS)、ジメチル-3,3’-ジチオビスプロピオンイミデート(DTBP)、1,4-ジ-(3’-(2’-ピリジルジチオ)プロピオンアミド)ブタン(DPDPB)、ビスマレイミドヘキサン(BMH)、ハロゲン化アリール含有化合物(DFDNB)、例えば、1,5-ジフルオロ-2,4-ジニトロベンゼンまたは1,3-ジフルオロ-4,6-ジニトロベンゼン、4,4’-ジフルオロ-3,3’-ジニトロフェニルスルホン(DFDNPS)、ビス-[β-(4-アジドサリチルアミド)エチル]ジスルフィド(BASED)、ホルムアルデヒド、グルタルアルデヒド、1,4-ブタンジオールジグリシジルエーテル、アジピン酸ジヒドラジド、カルボヒドラジド、o-トルイジン、3,3’-ジメチルベンジジン、ベンジジン、α,α’-p-ジアミノジフェニル、ジヨード-p-キシレンスルホン酸、N,N’-エチレン-ビス(ヨードアセトアミド)、またはN,N’-ヘキサメチレンビス(ヨードアセトアミド)を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、ヘテロ二官能性リンカーを含む。いくつかの実施形態では、ヘテロ二官能性リンカーは、N-スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート(sPDP)、長鎖N-スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート(LC-sPDP)、水溶性長鎖N-スクシンイミジル3-(2-ピリジルジチオ)プロピオネート(スルホ-LC-sPDP)、スクシンイミジルオキシカルボニル-α-メチル-α-(2-ピリジルジチオ)トルエン(sMPT)、スルホスクシンイミジル-6-[α-メチル-α-(2-ピリジルジチオ)トルアミド]ヘキサノエート(スルホ-LC-sMPT)、スクシンイミジル-4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(sMCC)、スルホスクシンイミジル-4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(スルホ-sMCC)、m-マレイミドベンゾイル-N-ヒドロキシスクシンイミドエステル(MB)、m-マレイミドベンゾイル-N-ヒドロキシスルホスクシンイミドエステル(スルホ-MB)、N-スクシンイミジル(4-ヨードアセチル)アミノベンゾエート(sIAB)、スルホスクシンイミジル(4-ヨードアセチル)アミノベンゾエート(スルホ-sIAB)、スクシンイミジル-4-(p-マレイミドフェニル)ブチレート(sMPB)、スルホスクシンイミジル-4-(p-マレイミドフェニル)ブチレート(スルホ-sMPB)、N-(γ-マレイミドブチリルオキシ)スクシンイミドエステル(GMB)、N-(γ-マレイミドブチリルオキシ)スルホスクシンイミドエステル(スルホ-GMB)、スクシンイミジル6-((ヨードアセチル)アミノ)ヘキサノエート(sIAX)、スクシンイミジル6-[6-(((ヨードアセチル)アミノ)ヘキサノイル)アミノ]ヘキサノエート(slAXX)、スクシンイミジル4-(((ヨードアセチル)アミノ)メチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(sIAC)、スクシンイミジル6-(((((4-ヨードアセチル)アミノ)メチル)シクロヘキサン-1-カルボニル)アミノ)ヘキサノエート(sIACX)、p-ニトロフェニルヨードアセテート(NPIA)、カルボニル反応性及びスルフヒドリル反応性架橋剤、例えば、4-(4-N-マレイミドフェニル)酪酸ヒドラジド(MPBH)、4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシル-ヒドラジド-8(M2C2H)、3-(2-ピリジルジチオ)プロピオニルヒドラジド(PDPH)、N-ヒドロキシスクシンイミジル-4-アジドサリチル酸(NHs-AsA)、N-ヒドロキシスルホスクシンイミジル-4-アジドサリチル酸(スルホ-NHs-AsA)、スルホスクシンイミジル-(4-ア

ジドサリチルアミド)ヘキサノエート(スルホ-NHs-LC-AsA)、スルホスクシンイミジル-2-(p-アジドサリチルアミド)エチル-1,3’-ジチオプロピオネート(sAsD)、N-ヒドロキシスクシンイミジル-4-アジドベンゾエート(HsAB)、N-ヒドロキシスルホスクシンイミジル-4-アジドベンゾエート(スルホ-HsAB)、N-スクシンイミジル-6-(4’-アジド-2’-ニトロフェニルアミノ)ヘキサノエート(sANPAH)、スルホスクシンイミジル-6-(4’-アジド-2’-ニトロフェニルアミノ)ヘキサノエート(スルホ-sANPAH)、N-5-アジド-2-ニトロベンゾイルオキシスクシンイミド(ANB-NO)、スルホスクシンイミジル-2-(m-アジド-o-ニトロベンズアミド)-エチル-1,3’-ジチオプロピオネート(sAND)、N-スクシンイミジル-4(4-アジドフェニル)1,3’-ジチオプロピオネート(sADP)、N-スルホスクシンイミジル(4-アジドフェニル)-1,3’-ジチオプロピオネート(スルホ-sADP)、スルホスクシンイミジル4-(p-アジドフェニル)ブチレート(スルホ-sAPB)、スルホスクシンイミジル2-(7-アジド-4-メチルクマリン-3-アセトアミド)エチル-1,3’-ジチオプロピオネート(sAED)、スルホスクシンイミジル7-アジド-4-メチルクマリン-3-アセテート(スルホ-sAMCA)、p-ニトロフェニルジアゾピルベート(pNPDP)、p-ニトロフェニル-2-ジアゾ-3,3,3-トリフルオロプロピオネート(PNP-DTP)、1-(ρ-アジドサリチルアミド)-4-(ヨードアセトアミド)ブタン(AsIB)、N-[4-(ρ-アジドサリチルアミド)ブチル]-3’-(2’-ピリジルジチオ)プロピオンアミド(APDP)、ベンゾフェノン-4-ヨードアセトアミド、p-アジドベンゾイルヒドラジド(ABH)、4-(ρ-アジドサリチルアミド)ブチルアミン(AsBA)、またはp-アジドフェニルグリオキサール(APG)を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、任意選択でジペプチドリンカーを含む、切断可能なリンカーを含む。いくつかの実施形態では、ジペプチドリンカーは、Val-Cit、Phe-Lys、Val-Ala、またはVal-Lysを含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、切断不可能なリンカーを含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、任意選択で、マレイミドカプロイル(mc)、スクシンイミジル-4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(sMCC)、またはスルホスクシンイミジル-4-(N-マレイミドメチル)シクロヘキサン-1-カルボキシレート(スルホ-sMCC)を含むマレイミド基を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、スペーサーをさらに含む。いくつかの実施形態では、スペーサーは、p-アミノベンジルアルコール(PAB)、p-アミノベンジルオキシカルボニル(PABC)、その誘導体、または類似体を含む。いくつかの実施形態では、複合部分は、IL-2複合体の血清半減期を延長することができる。いくつかの実施形態では、追加の複合部分は、IL-2複合体の血清半減期を延長することができる。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、本明細書に記載のIL-2形態のうちのいずれかの断片である。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、米国特許出願公開第2020/0181220 A1号及び米国特許出願公開第2020/0330601 A1号に開示されているようにペグ化されている。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ポリエチレングリコール(PEG)を含む複合部分に共有結合したN6-アジドエトキシ-L-リジン(AzK)を含むIL-2ポリペプチドを含む、IL-2複合体であり、IL-2ポリペプチドは、配列番号5と少なくとも80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、AzKは、配列番号5内のアミノ酸位置に関して、K35位、F42位、F44位、K43位、E62位、P65位、R38位、T41位、E68位、Y45位、V69位、またはL72位でアミノ酸を置換する。いくつかの実施形態では、IL-2ポリペプチドは、配列番号5に対して1残基のN末端欠失を含む。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、IL-2Rアルファ鎖会合を欠いているが、中間親和性IL-2Rベータ-ガンマシグナル伝達複合体との正常な結合を保持している。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ポリエチレングリコール(PEG)を含む複合部分に共有結合したN6-アジドエトキシ-L-リジン(AzK)を含むIL-2ポリペプチドを含む、IL-2複合体であり、IL-2ポリペプチドは、配列番号5と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、AzKは、配列番号5内のアミノ酸位置に関して、K35位、F42位、F44位、K43位、E62位、P65位、R38位、T41位、E68位、Y45位、V69位、またはL72位でアミノ酸を置換する。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ポリエチレングリコール(PEG)を含む複合部分に共有結合したN6-アジドエトキシ-L-リジン(AzK)を含むIL-2ポリペプチドを含む、IL-2複合体であり、IL-2ポリペプチドは、配列番号5と少なくとも95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、AzKは、配列番号5内のアミノ酸位置に関して、K35位、F42位、F44位、K43位、E62位、P65位、R38位、T41位、E68位、Y45位、V69位、またはL72位でアミノ酸を置換する。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ポリエチレングリコール(PEG)を含む複合部分に共有結合したN6-アジドエトキシ-L-リジン(AzK)を含むIL-2ポリペプチドを含む、IL-2複合体であり、IL-2ポリペプチドは、配列番号5と少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、AzKは、配列番号5内のアミノ酸位置に関して、K35位、F42位、F44位、K43位、E62位、P65位、R38位、T41位、E68位、Y45位、V69位、またはL72位でアミノ酸を置換する。
いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ALKS-4230(配列番号6)としても知られるネムバルキンアルファであり、Alkermes,Inc.から入手可能である。ネムバルキンアルファは、ペプチジルリンカー(60GG61)を介してヒトインターロイキン2断片(62-132)と融合し、ペプチジルリンカー(133GSGGGS138)を介してヒトインターロイキン2受容体α鎖断片(139-303)と融合し、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞で産生され、グリコシル化されている、ヒトインターロイキン2断片(1-59)、バリアント(Cys125>Ser51);Gペプチドリンカー(60-61)を介してヒトインターロイキン2(IL-2)(4-74)-ペプチド(62-132)と融合し、GSGSペプチドリンカー(133-138)を介してヒトインターロイキン2受容体α鎖(IL2Rサブユニットアルファ、IL2Rα、IL2RA)(1-165)-ペプチド(139-303)と融合し、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞で産生され、アルファグリコシル化されている、ヒトインターロイキン2(IL-2)(75-133)-ペプチド[Cys125(51)>Ser]-変異体(1-59)としても知られている。ネムバロイキンアルファのアミノ酸配列は、配列番号6に示されている。いくつかの実施形態では、ネムバロイキンアルファは、以下の翻訳後修飾を示す:以下の位置でのジスルフィド架橋:31-116、141-285、184-242、269-301、166-197、または166-199、168-199または168-197(配列番号6の番号付けを使用する)、及び以下の位置でのグリコシル化部位:配列番号6の番号付けを使用する、N187、N206、T212。ネムバルイキンアルファの調製及び特性、ならびに本発明での使用に好適な追加の代替形態のIL-2は、米国特許出願公開第2021/0038684 A1号及び米国特許第10,183,979号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、配列番号6と少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも90%の配列同一性を有するタンパク質である。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、配列番号6で示されるアミノ酸配列またはその保存的アミノ酸置換を有する。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、配列番号7のアミノ酸24~452、またはそのバリアント、断片、もしくは誘導体を含む融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、配列番号7のアミノ酸24~452と少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、もしくは少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列、またはそのバリアント、断片、もしくは誘導体を含む融合タンパク質である。本発明での使用に好適な他のIL-2形態は、米国特許第10,183,979号に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。任意選択で、いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、ムチンドメインポリペプチドリンカーによって第2の融合パートナーと連結された第1の融合パートナーを含む融合タンパク質であり、第1の融合パートナーは、IL-1Rα、またはIL-1Rαと少なくとも98%のアミノ酸配列同一性を有し、IL-Rαの受容体アンタゴニスト活性を有するタンパク質であり、第2の融合パートナーは、Fc領域を含む免疫グロブリンの全部または一部を含み、ムチンドメインポリペプチドリンカーは、配列番号8、または配列番号8と少なくとも90%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、融合タンパク質の半減期は、ムチンドメインポリペプチドリンカーの非存在下での第2の融合パートナーとの第1の融合パートナーの融合と比較して改善される。

いくつかの実施形態では、本発明での使用に好適なIL-2形態は、相補性決定領域HCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、重鎖可変領域(V)と、LCDR1、LCDR2、LCDR3を含む軽鎖可変領域(V)と、VまたはVのCDRに移植されたIL-2分子またはその断片と、を含む抗体サイトカイン移植タンパク質を含み、抗体サイトカイン移植タンパク質は、制御性T細胞よりもTエフェクター細胞を優先的に拡張させる。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、相補性決定領域HCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、重鎖可変領域(V)と、LCDR1、LCDR2、LCDR3を含む軽鎖可変領域(V)と、VまたはVのCDRに移植されたIL-2分子またはその断片と、を含み、IL-2分子は、ムテインであり、抗体サイトカイン移植タンパク質は、制御性T細胞よりもTエフェクター細胞を優先的に拡張させる。いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、米国特許出願公開第2020/0270334 A1号に記載されている抗体の投与を含み、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、相補性決定領域HCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、重鎖可変領域(VH)と、LCDR1、LCDR2、LCDR3を含む軽鎖可変領域(VL)と、VまたはVのCDRに移植されたIL-2分子またはその断片と、を含み、IL-2分子は、ムテインであり、抗体サイトカイン移植タンパク質は、制御性T細胞よりもTエフェクター細胞を優先的に拡張させ、抗体は、配列番号39を含むIgGクラス軽鎖及び配列番号38を含むIgGクラス重鎖、配列番号37を含むIgGクラスの軽鎖及び配列番号29を含むIgGクラスの重鎖、配列番号39を含むIgGクラス軽鎖及び配列番号29を含むIgGクラス重鎖、配列番号37を含むIgGクラス軽鎖及び配列番号38を含むIgGクラス重鎖からなる群から選択されるIgGクラスの重鎖及びIgGクラスの軽鎖をさらに含む。
いくつかの実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VのHCDR1に移植され、IL-2分子は、ムテインである。いくつかの実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VのHCDR2に移植され、IL-2分子は、ムテインである。いくつかの実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VのHCDR3に移植され、IL-2分子は、ムテインである。いくつかの実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VのLCDR1に移植され、IL-2分子は、ムテインである。いくつかの実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VのLCDR2に移植され、IL-2分子は、ムテインである。いくつかの実施形態では、IL-2分子またはその断片は、VLのLCDR3に移植され、IL-2分子は、ムテインである。
IL-2分子の挿入は、CDRのN末端領域もしくはその近く、CDRの中間領域、またはCDRのC末端領域もしくはその近くであり得る。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、CDRに組み込まれたIL-2分子を含み、IL2配列はCDR配列をフレームシフトしない。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、CDRに組み込まれたIL-2分子を含み、IL-2配列はCDR配列のすべてまたは一部を置き換える。IL-2分子による置き換えは、CDRのN末端領域、CDRの中間領域、またはCDRのC末端領域もしくはその近くであり得る。IL-2分子による置き換えは、CDR配列のわずか1個もしくは2個のアミノ酸、またはCDR配列全体であり得る。
いくつかの実施形態では、IL-2分子は、ペプチドリンカーなしで、CDR配列とIL-2配列との間に追加のアミノ酸なしで、CDRに直接的に移植される。いくつかの実施形態では、IL-2分子は、ペプチドリンカーを用いて、CDR配列とIL-2配列との間に1つ以上の追加のアミノ酸を伴って、CDRに間接的に移植される。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のIL-2分子は、IL-2ムテインである。いくつかの事例では、IL-2ムテインは、R67A置換を含む。いくつかの実施形態では、IL-2ムテインは、配列番号14または配列番号15のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、IL-2ムテインは、米国特許出願公開第2020/0270334 A1号の表1のアミノ酸配列を含み、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号16、配列番号19、配列番号22、及び配列番号25からなる群から選択されるHCDR1を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号7、配列番号10、配列番号13及び配列番号16からなる群から選択されるHCDR1を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号17、配列番号20、配列番号23、及び配列番号26からなる群から選択されるHCDR2からなる群から選択されるHCDR1を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号18、配列番号21、配列番号24、及び配列番号27からなる群から選択されるHCDR3を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号28のアミノ酸配列を含むV領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号36のアミノ酸配列を含むV領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号37のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号28のアミノ酸配列を含むV領域及び配列番号36のアミノ酸配列を含むV領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖領域及び配列番号37のアミノ酸配列を含む軽鎖領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号29のアミノ酸配列を含む重鎖領域及び配列番号39のアミノ酸配列を含む軽鎖領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖領域及び配列番号37のアミノ酸配列を含む軽鎖領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、配列番号38のアミノ酸配列を含む重鎖領域及び配列番号39のアミノ酸配列を含む軽鎖領域を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、米国特許出願公開第2020/0270334 A1号のIgG.IL2F71A.H1もしくはIgG.IL2R67A.H1、またはそのバリアント、誘導体、もしくは断片、またはその保存的アミノ酸置換体、またはそれと少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、または少なくとも98%の配列同一性を有するタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の抗体サイトカイン移植タンパク質の抗体成分は、免疫グロブリン配列、フレームワーク配列、またはパリビズマブのCDR配列を含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の抗体サイトカイン移植タンパク質は、アルデスロイキンまたは同等の分子などであるがこれらに限定されない野生型IL-2分子よりも長い血清半減期を有する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の抗体サイトカイン移植タンパク質は、表3に記載される配列を有する。


「IL-4」(本明細書では「IL4」とも称される)という用語は、インターロイキン4として知られるサイトカインを指し、これは、Th2 T細胞、ならびに好酸球、好塩基球、及び肥満細胞によって産生される。IL-4は、ナイーブヘルパーT細胞(Th0細胞)からTh2 T細胞への分化を調節する。Steinke and Borish,Respir.Res.2001,2,66-70。IL-4によって活性化されると、Th2 T細胞は、その後、正のフィードバックループで追加のIL-4を産生する。IL-4は、B細胞増殖及びクラスII MHC発現も刺激し、B細胞からのIgE及びIgG発現へのクラス切り替えを誘導する。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-4は、ProSpec-Tany TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USA(カタログ番号CYT-211)及びThermoFisher Scientific,Inc.,Waltham,MA,USA(ヒトIL-15組換えタンパク質、カタログ番号Gibco CTP0043)を含む、複数の供給業者から市販されている。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-4のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号9)。
「IL-7」(本明細書では「IL7」とも称される)という用語は、インターロイキン7として知られるグリコシル化組織由来のサイトカインを指し、これは、間質細胞及び上皮細胞、ならびに樹状細胞から得ることができる。Fry and Mackall,Blood 2002,99,3892-904。IL-7は、T細胞の発達を刺激することができる。IL-7は、IL-7受容体アルファ及び共通ガンマ鎖受容体からなるヘテロ二量体であるIL-7受容体に結合し、これは、胸腺内でのT細胞発生及び末梢内での生存に重要な一連のシグナルである。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-7は、ProSpec-Tany TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USA(カタログ番号CYT-254)及びThermoFisher Scientific,Inc.,Waltham,MA,USA(ヒトIL-15組換えタンパク質、カタログ番号Gibco PHC0071)を含む、複数の供給業者から市販されている。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-7のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号10)。
「IL-15」(本明細書では「IL15」とも称される)という用語は、インターロイキン-15として知られるT細胞成長因子を指し、ヒト及び哺乳動物形態、保存的アミノ酸置換物、グリコフォーム、バイオシミラー、及びバリアントを含む、IL-2のすべての形態を含む。IL-15は、例えば、Fehniger and Caligiuri,Blood 2001,97,14-32に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。IL-15は、β及びγシグナル伝達受容体サブユニットをIL-2と共有する。組換えヒトIL-15は、12.8kDaの分子量を有する114個のアミノ酸(及びN末端メチオニン)を含む単一の非グリコシル化ポリペプチド鎖である。組換えヒトIL-15は、ProSpec-Tany TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USA(カタログ番号CYT-230-b)及びThermoFisher Scientific,Inc.,Waltham,MA,USA(ヒトIL-15組換えタンパク質、カタログ番号34-8159-82)を含む、複数の供給業者から市販されている。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-15のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号11)。
「IL-21」(本明細書では「IL21」とも称される)という用語は、インターロイキン-21として知られる多面発現性サイトカインタンパク質を指し、ヒト及び哺乳動物形態、保存的アミノ酸置換物、グリコフォーム、バイオシミラー、及びバリアントを含む、IL-21のすべての形態を含む。IL-21は、例えば、Spolski and Leonard,Nat.Rev.Drug.Disc.2014,13,379-95に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。IL-21は、主にナチュラルキラーT細胞及び活性化ヒトCD4T細胞によって産生される。組換えヒトIL-21は、15.4kDaの分子量を有する132個のアミノ酸を含む単一の非グリコシル化ポリペプチド鎖である。組換えヒトIL-21は、ProSpec-Tany TechnoGene Ltd.,East Brunswick,NJ,USA(カタログ番号CYT-408-b)及びThermoFisher Scientific,Inc.,Waltham,MA,USA(ヒトIL-21組換えタンパク質、カタログ番号14-8219-80)を含む、複数の供給業者から市販されている。本発明での使用に好適な組換えヒトIL-21のアミノ酸配列を表2に示す(配列番号12)。
「抗腫瘍有効量」、「腫瘍阻害有効量」、または「治療量」が示される場合、投与される本発明の組成物の正確な量は、患者(対象)の年齢、体重、腫瘍サイズ、感染または転移の程度、及び健康状態の個人差を考慮して、医師によって決定され得る。本明細書に記載される腫瘍浸潤リンパ球(例えば、二次TILまたは遺伝子修飾細胞傷害性リンパ球)を含む薬学的組成物が、10~1011細胞/kg体重(例えば、10~10、10~1010、10~1011、10~1010、10~1011、10~1011、10~1010、10~1011、10~1010、10~1011、または10~1010細胞/kg体重)(それらの範囲内のすべての整数値を含む)の投与量で投与され得ると概説され得る。TIL(場合によっては、遺伝子修飾細胞傷害性リンパ球を含む)組成物もまた、これらの投与量で複数回投与され得る。TIL(場合によっては、遺伝的を含む)は、免疫療法で一般的に知られている注入技法を使用することにより投与され得る(例えば、Rosenberg et al.,New Eng.J.of Med.1988,319:1676を参照)。特定の患者に最適な投薬量及び治療レジーム(regime)は、患者を疾患の兆候について監視し、適宜に治療を調整することによって、医学分野の技術者によって容易に決定され得る。
「血液学的悪性腫瘍」、「血液系悪性腫瘍」という用語または相関する意味の用語は、血液、骨髄、リンパ節、及びリンパ系の組織を含むが、これらに限定されない、哺乳動物の造血組織及びリンパ組織のがん及び腫瘍を指す。血液学的悪性腫瘍は、「液体腫瘍」とも称される。血液学的悪性腫瘍には、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、慢性リンパ性リンパ腫(CLL)、小リンパ球性リンパ腫(SLL)、急性骨髄性白血病(AML)、慢性骨髄性白血病(CML)、多発性骨髄腫、急性単球性白血病(AMoL)、ホジキンリンパ腫、及び非ホジキンリンパ腫が含まれ得るが、これらに限定されない。「B細胞血液学的悪性腫瘍」という用語は、B細胞を冒す血液学的悪性腫瘍を指す。
「液体腫瘍」という用語は、本来流体である異常な細胞塊を指す。液体腫瘍癌には、白血病、骨髄腫、及びリンパ腫、ならびに他の血液学的悪性腫瘍が含まれるが、これらに限定されない。液体腫瘍から取得されたTILは、本明細書では骨髄浸潤リンパ球(MIL)とも称され得る。末梢血中で循環する液体腫瘍を含む液体腫瘍から得られるTILは、本明細書ではPBLとも称され得る。MIL、TIL、及びPBLという用語は、本明細書で互換的に使用され、細胞が由来する組織タイプに基づいてのみ異なる。
本明細書で使用される「微小環境」という用語は、全体としての固形もしくは血液学的腫瘍微小環境、または微小環境内の細胞の個々のサブセットを指し得る。本明細書で使用される腫瘍微小環境は、Swartz,et al.,Cancer Res.,2012,72,2473に記載されるように、「腫瘍性形質転換を促進し、腫瘍成長及び浸潤を支持し、腫瘍を宿主免疫から保護し、治療抵抗性を助長し、かつ優勢な転移を成功させるニッチを提供する、細胞、可溶性因子、シグナル伝達分子、細胞外マトリックス、及び機械的手がかり」の複合混合物を指す。腫瘍はT細胞によって認識されるべき抗原を発現するが、微小環境による免疫抑制のため、免疫系による腫瘍クリアランスはまれである。
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL集団でがんを治療する方法を含み、患者は、本発明によるTILの注入前に骨髄非破壊的化学療法で前治療される。いくつかの実施形態では、TIL集団が提供され得、患者は、本発明によるTILの注入前に骨髄非破壊的化学療法で前治療される。いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的化学療法は、シクロホスファミド60mg/kg/日で2日間(TIL注入の27日前及び26日前)、ならびにフルダラビン25mg/m2/日で5日間(TIL注入の27日前~23日前)である。いくつかの実施形態では、本発明による骨髄非破壊的化学療法及びTIL注入(0日目)後、患者は、生理学的許容範囲まで8時間毎に720,000IU/kgでIL-2の静脈内注入を受ける。
実験的発見は、腫瘍特異的Tリンパ球の養子移入前のリンパ球枯渇が、制御性T細胞及び免疫系の競合要素(「サイトカインシンク」)を排除することによって治療有効性を増強する上で重要な役割を果たすことを示す。したがって、本発明のいくつかの実施形態は、本発明のTILを導入する前に、患者に対してリンパ球枯渇ステップ(「免疫抑制コンディショニング」と称されることもある)を利用する。
「有効量」または「治療有効量」という用語は、疾患治療を含むが、これに限定されない、意図された用途を達成するのに十分である、本明細書に記載の化合物または化合物の組み合わせの量を指す。治療有効量は、意図される用途(インビトロもしくはインビボ)、または治療される対象及び病状(例えば、対象の体重、年齢、及び性別)、病状の重症度、または投与方法に応じて異なり得る。この用語は、標的細胞において特定の応答(例えば、血小板粘着及び/または細胞遊走の低減)を誘導する用量にも適用される。特定の用量は、選択された特定の化合物、従うべき投薬レジメン、化合物が他の化合物と組み合わせて投与されるか、投与のタイミング、それが投与される組織、及び化合物が運ばれる物理的送達系に応じて異なる。
「治療」、「治療すること」、「治療する」などの用語は、所望の薬理学的及び/または生理学的効果を得ることを指す。その効果は、その疾患または症状を完全にまたは部分的に予防するという観点において予防的であり得、及び/または疾患及び/またはその疾患に起因する副作用の部分的または完全な治癒という観点において治療的であり得る。「治療」は、本明細書で使用される場合、哺乳動物、特にヒトにおける疾患の任意の治療を包含し、(a)疾患にかかりやすい可能性があるが、まだ疾患を有すると診断されていない対象に疾患が生じるのを予防すること、(b)疾患を抑制すること、すなわち、その発症または進行を抑止すること、及び(c)疾患を軽減すること、すなわち、疾患の退行を引き起こし、及び/または1つ以上の疾患症状を軽減することを含む。「治療」は、疾患または状態がない場合でさえも、薬理学的効果を提供するための薬剤の送達を包含するようにも意図されている。例えば、「治療」は、病状がない場合、例えば、ワクチンの場合に免疫応答を誘発するか、または免疫を与えることができる組成物の送達を包含する。
本明細書で使用される場合、「免疫チェックポイント阻害剤(ICI)」という用語は、当該技術分野におけるその一般的な意味を有し、免疫阻害チェックポイントタンパク質の機能を阻害する任意の化合物を指す。本明細書で使用される場合、「免疫チェックポイントタンパク質」という用語は、当該技術分野におけるその一般的な意味を有し、シグナルを高める発現させる(刺激チェックポイント分子)か、またはシグナルを抑える(阻害チェックポイント分子)かのいずれかの点でT細胞によって発現される分子を指す。免疫チェックポイント分子は、CTLA-4及びPD-1依存性経路と同様の免疫チェックポイント経路を構成することが当技術分野で認識されている(例えば、Pardoll,2012.Nature Rev Cancer 12:252-264、Mellman et ah,2011.Nature 480:480-489を参照されたい)。阻害性チェックポイント分子の例としては、A2AR、B7-H3、B7-H4、CD277、IDO、KIR、VISTA、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、BAFF(BR3)、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、TOX、SOCS1、ANKRD11、及びBCORが挙げられる。例えば、本発明のTILにおいてサイレンシングまたは阻害され得る免疫チェックポイント遺伝子は、PD-1、CTLA-4、LAG-3、TIM-3、Cish、CBL-B、TIGIT、TET2、TGFβ、及びPKAを含む群から選択されてもよい。BAFF(BR3)は、Bloom,et al.,J.Immunother.,2018,in pressに記載されている。別の実施例によれば、本発明のTILにおいてサイレンスまたは阻害され得る免疫チェックポイント遺伝子は、PD-1、LAG-3、TIM-3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PRA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせを含む群から選択されてもよい。
阻害には、機能の低減及び完全な遮断が含まれる。好ましい免疫チェックポイント阻害剤は、免疫チェックポイントタンパク質を特異的に認識する抗体である。いくつかの免疫チェックポイント阻害剤が既知であり、これらの既知の免疫チェックポイントタンパク質阻害剤に類似して、代替の免疫チェックポイント阻害剤が(近い)将来、開発される可能性がある。免疫チェックポイント阻害剤には、ペプチド、抗体、核酸分子、及び小分子が含まれる。
「異種」という用語は、核酸またはタンパク質の一部に関して使用される場合、核酸またはタンパク質が、自然界では互いに同じ関係では見出されない2つ以上の部分配列を含むことを示す。例えば、核酸は、典型的には、組換え的に産生され、新たな機能的核酸、例えば、ある供給源からのプロモーター及び別の供給源からのコード領域、または異なる供給源からのコード領域を作製するように配置された無関係の遺伝子由来の2つ以上の配列を有する。同様に、異種タンパク質は、そのタンパク質が、自然界では互いに同じ関係では見出されない2つ以上の部分配列を含むことを示す(例えば、融合タンパク質)。
2つ以上の核酸またはポリペプチドの文脈における「配列同一性」、「同一性パーセント」、及び「配列同一性パーセント」(もしくはそれらの同義語、例えば「99%同一」)という用語は、同じであるか、または配列同一性の一部としていかなる保存的アミノ酸置換も考慮せずに、最大一致のために比較し整列させた場合(必要に応じてギャップを導入する)、特定のパーセンテージの同じヌクレオチドもしくはアミノ酸残基を有する2つ以上の配列または部分配列を指す。同一性パーセントは、配列比較ソフトウェアもしくはアルゴリズムを使用して、または目視検査によって測定することができる。アミノ酸またはヌクレオチド配列のアラインメントを取得するために使用され得る様々なアルゴリズム及びソフトウェアが当該技術分野で知られている。配列同一性パーセントの決定に好適なプログラムには、例えば、米国政府の国立生物工学情報センターのBLASTウェブサイトから入手可能なBLASTプログラム一式が含まれる。2つの配列間の比較は、BLASTNまたはBLASTPアルゴリズムのいずれかを使用して実行することができる。BLASTNは、核酸配列を比較するために使用され、BLASTPは、アミノ酸配列を比較するために使用される。DNASTARから入手可能なALIGN、ALIGN-2(Genentech,South San Francisco,California)、またはMegAlignは、配列を整列させるために使用することができる追加の公的に入手可能なソフトウェアプログラムである。当業者であれば、特定のアラインメントソフトウェアによって最大アラインメントに適切なパラメータを決定することができる。ある特定の実施形態では、アラインメントソフトウェアのデフォルトパラメータが使用される。
本明細書で使用される場合、「バリアント」という用語は、参照抗体のアミノ酸配列内または隣接する特定の位置における1つ以上の置換、欠失、及び/または付加により参照抗体のアミノ酸配列とは異なるアミノ酸配列を含む抗体または融合タンパク質を包含するが、これらに限定されない。バリアントは、参照抗体のアミノ酸配列と比較して、そのアミノ酸配列に1つ以上の保存的置換を含み得る。保存的置換は、例えば、同様に荷電したまたは非荷電のアミノ酸の置換を含み得る。バリアントは、参照抗体の抗原に特異的に結合する能力を保持している。バリアントという用語は、ペグ化抗体またはタンパク質も含む。
本明細書における「腫瘍浸潤リンパ球」または「TIL」とは、対象の血流を離れて腫瘍に移動した白血球として最初に取得された細胞の集団を意味する。TILには、CD8細胞傷害性T細胞(リンパ球)、Th1及びTh17 CD4T細胞、ナチュラルキラー細胞、樹状細胞、ならびにM1マクロファージが含まれるが、これらに限定されない。TILには、一次TIL及び二次TILの両方が含まれる。「一次TIL」は、本明細書に概説されるように患者組織試料から得られるもの(「新たに採取された」と称されることもある)であり、「二次TIL」は、本明細書で考察されるように拡張または増殖された任意のTIL細胞集団であり、本明細書で考察されるバルクTIL、拡張TIL(「REP TIL」)、ならびに「reREP TIL」が含まれるが、これらに限定されない。reREP TILは、例えば、第2の拡張TILまたは第2の追加の拡張TIL(例えば、reREP TILと称されるTILを含む、図8のステップDに記載されているものなど)を含み得る。
TILは、一般に、細胞表面マーカーを使用して生化学的に定義されるか、または腫瘍に浸潤して治療を達成するそれらの能力によって機能的に定義されるかのいずれかであり得る。TILは、一般に、CD4、CD8、TCRαβ、CD27、CD28、CD56、CCR7、CD45Ra、CD95、PD-1、及びCD25のうちの1つ以上のバイオマーカーの発現によって分類され得る。さらに及び代替的に、TILは、患者への再導入時に固形腫瘍に浸潤する能力により機能的に定義され得る。TILは、効力によってさらに特徴付けられ得、例えば、インターフェロン(IFN)放出が、約50pg/mLを超える、約100pg/mLを超える、約150pg/mLを超える、または約200pg/mLを超える場合、TILは強力であるとみなされ得る。例えば、インターフェロン(IFNγ)放出が、約50pg/mLを超える、約100pg/mLを超える、約150pg/mLを超える、または約200pg/mLを超える、約300pg/mLを超える、約400pg/mLを超える、約500pg/mLを超える、約600pg/mLを超える、約700pg/mLを超える、約800pg/mLを超える、約900pg/mL、約1000pg/mLを超える場合、TILは強力であるとみなされ得る。
「デオキシリボヌクレオチド」という用語は、天然及び合成の、未修飾の及び修飾されたデオキシリボヌクレオチドを包含する。修飾には、糖部分、塩基部分、及び/またはオリゴヌクレオチド中のデオキシリボヌクレオチド間の結合への変更が含まれる。
「RNA」という用語は、少なくとも1つのリボヌクレオチド残基を含む分子を定義する。「リボヌクレオチド」という用語は、b-D-リボフラノース部分の2’位にヒドロキシル基を有するヌクレオチドを定義する。RNAという用語には、二本鎖RNA、一本鎖RNA、部分的に精製されたRNAなどの単離されたRNA、本質的に純粋なRNA、合成RNA、組換え的に産生されたRNA、ならびに1つ以上のヌクレオチドの付加、欠失、置換、及び/または変化によって天然に存在するRNAとは異なる変化したRNAが含まれる。本明細書に記載のRNA分子のヌクレオチドはまた、非天然に存在するヌクレオチドまたは化学的に合成されたヌクレオチドもしくはデオキシヌクレオチドなどの非標準ヌクレオチドを含み得る。これらの変化したRNAは、類似体または天然に存在するRNAの類似体と称され得る。
「薬学的に許容される担体」または「薬学的に許容される賦形剤」という用語は、ありとあらゆる溶媒、分散媒、コーティング、抗細菌剤及び抗真菌剤、等張剤及び吸収遅延剤、ならびに不活性成分を含むよう意図されている。医薬品有効成分のためのかかる薬学的に許容される担体または薬学的に許容される賦形剤の使用は、当該技術分野で周知である。任意の従来の薬学的に許容される担体または薬学的に許容される賦形剤が医薬品有効成分と適合しない場合を除いて、本発明の治療用組成物におけるその使用が企図される。他の薬物などの追加の医薬品有効成分を、記載された組成物及び方法に組み込むこともできる。
「約」及び「およそ」という用語は、値の統計的に有意な範囲内を意味する。かかる範囲は、所与の値または範囲の1桁以内、好ましくは50%以内、より好ましくは20%以内、なおより好ましくは10%以内、さらにより好ましくは5%以内であり得る。「約」または「およそ」という用語によって包含される許容偏差は、研究中の特定のシステムに依存し、当業者によって容易に理解され得る。さらに、本明細書で使用される場合、「約」及び「およそ」という用語は、寸法、サイズ、配合、パラメータ、形状、ならびに他の量及び特徴が正確でなく、かつ正確である必要はないが、公差、変換係数、四捨五入、測定誤差など、及び当業者に知られている他の要因を反映して、必要に応じて、およそであってもよく、及び/またはそれよりも大きくても小さくてもよいことを意味する。一般に、寸法、サイズ、配合、パラメータ、形状、または他の量もしくは特徴は、そのように明示的に述べられているかにかかわらず、「約」または「およそ」である。非常に異なるサイズ、形状、及び寸法の実施形態が記載された配置を採用し得ることに留意されたい。
添付の特許請求の範囲で使用される場合、「含む」、「から本質的になる」、及び「からなる」という移行用語は、元の形式及び補正された形式で、存在する場合、列挙されていない追加のクレーム要素またはステップが特許請(複数可)求の範囲から除外されるかに関して特許請求の範囲を定義する。「含む」という用語は、包括的または自由形式であるよう意図されており、いずれの追加の列挙されていない要素、方法、ステップ、または材料も除外しない。「からなる」という用語は、特許請求の範囲で指定されたもの以外のいずれの要素、ステップ、または材料も除外し、後者の場合、指定された材料(複数可)に通常関連する不純物も除外する。「から本質的になる」という用語は、特許請求の範囲を、特定の要素、ステップ、または材料(複数可)、及び特許請求された本発明の基本的及び新規の特徴(複数可)に実質的に影響を及ぼさないに限定する。本発明を具体化する本明細書に記載のすべての組成物、方法、及びキットは、代替の実施形態では、「含む」、「から本質的になる」、及び「からなる」という移行用語のうちのいずれかによってより具体的に定義され得る。
「抗体(antibody)」及びその複数形の「抗体(antibodies)」という用語は、免疫グロブリン全体及び任意の抗原結合断片(「抗原結合部分」)またはその一本鎖を指す。「抗体」はさらに、ジスルフィド結合によって相互接続された少なくとも2つの重鎖(H)鎖及び2つの軽(L)鎖を含む糖タンパク質、またはその抗原結合部分を指す。各重鎖は、重鎖可変領域(本明細書ではVと略される)及び重鎖定常領域で構成される。重鎖定常領域は、CH1、CH2、及びCH3の3つのドメインで構成される。各軽鎖は、軽鎖可変領域(本明細書ではVと略される)及び軽鎖定常領域で構成される。軽鎖定常領域は、1つのドメイン、Cで構成される。抗体のV及びV領域は、相補性決定領域(CDR)または超可変領域(HVR)と称され、フレームワーク領域(FR)と呼ばれる、より保存された領域が点在し得る、超可変性の領域にさらに細分化することができる。各V及びVは、アミノ末端からカルボキシ末端へと以下の順序で配列された3つのCDR及び4つのFRで構成される:FR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。重鎖及び軽鎖の可変領域は、1つまたは複数の抗原エピトープと相互作用する結合ドメインを含む。抗体の定常領域は、免疫系の様々な細胞(例えば、エフェクター細胞)及び古典的な補体系の第1の成分(Clq)を含む宿主組織または因子への免疫グロブリンの結合を媒介し得る。
「抗原」という用語は、免疫応答を誘導する物質を指す。いくつかの実施形態では、抗原は、主要組織適合遺伝子複合体(MHC)分子によって提示される場合、抗体またはTCRによって結合されることができる分子である。本明細書で使用される「抗原」という用語はまた、T細胞エピトープを包含する。抗原は、追加として免疫系によって認識されることができる。いくつかの実施形態では、抗原は、体液性免疫応答または細胞性免疫応答を誘導することができ、Bリンパ球及び/またはTリンパ球の活性化につながる。場合によっては、これは、抗原がTh細胞エピトープを含むか、またはそれに結合されることを必要とし得る。抗原はまた、1つ以上のエピトープ(例えば、B-及びT-エピトープ)を有し得る。いくつかの実施形態では、抗原は、好ましくは、典型的には非常に特異的かつ選択的な方法で、対応する抗体またはTCRと反応し、他の抗原によって誘導され得る多数の他の抗体またはTCRとは反応しない。
「モノクローナル抗体」、「mAb」、「モノクローナル抗体組成物」という用語、またはそれらの複数形は、単一分子組成の抗体分子の調製物を指す。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープに対して単一の結合特異性及び親和性を示す。特定の受容体に特異的なモノクローナル抗体は、試験対象に好適な抗原を注入し、次いで、所望の配列または機能的特徴を有する抗体を発現するハイブリドーマを単離するという当該技術分野における知識及び技術を使用して作製することができる。モノクローナル抗体をコードするDNAは、従来の手順を使用して(例えば、モノクローナル抗体の重鎖及び軽鎖をコードする遺伝子に特異的に結合することができるオリゴヌクレオチドプローブを使用することによって)容易に単離され、配列決定される。ハイブリドーマ細胞は、かかるDNAの好ましい供給源として機能する。一旦単離されると、DNAは、発現ベクターに入れられ、次いで、E.coli細胞、サルCOS細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、または免疫グロブリンタンパク質を産生しない骨髄腫細胞などの宿主細胞にトランスフェクトされて、組換え宿主細胞におけるモノクローナル抗体の合成を取得することができる。抗体の組換え産生については、以下でより詳細に説明する。
本明細書で使用される、抗体の「抗原結合部分」または「抗原結合断片」(または単に「抗体部分」もしくは「断片」)という用語は、抗原に特異的に結合する能力を保持する抗体の1つ以上の断片を指す。抗体の抗原結合機能は、完全長抗体の断片によって行われ得ることが示されている。抗体の「抗原結合部分」という用語に包含される結合断片の例には、(i)V、V、C、及びCH1ドメインからなる一価断片である、Fab断片、(ii)ヒンジ領域でジスルフィド架橋によって結合された2つのFab断片を含む二価断片である、F(ab’)2断片、(iii)V及びCH1ドメインからなるFd断片、(iv)抗体の単一アームのV及びVドメインからなるFv断片、(v)VまたはVドメインからなり得るドメイン抗体(dAb)断片(Ward,et al.,Nature,1989,341,544-546)、ならびに(vi)単離した相補性決定領域(CDR)が含まれる。Fv断片の2つのドメイン、V及びVは、別々の遺伝子によってコードされるが、これらは、組み換え方法を使用して、V及びV領域が対合して、一本鎖Fv(scFv)として知られる一価分子を形成する単一タンパク質鎖としてそれらを作製することを可能にする合成リンカーによって接合され得、例えば、Bird,et al.,Science 1988,242,423-426、及びHuston,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 1988,85,5879-5883)を参照されたい。かかるscFv抗体はまた、抗体の「抗原結合部分」または「抗原結合断片」という用語に包含されることを意図している。これらの抗体断片は、当業者に知られている従来の技法を使用して得られ、断片は、無傷の抗体と同じ方法で有用性についてスクリーニングされる。いくつかの実施形態では、scFvタンパク質ドメインは、V部分及びV部分を含む。scFv分子は、VドメインがscFv分子のN末端部分である場合、V-L-V、またはVドメインがscFv分子のN末端部分である場合、V-L-Vのいずれかとして示される。scFv分子を作製し、好適なペプチドリンカーを設計するための方法は、米国特許第4,704,692号、米国特許第4,946,778号、R.Raag and M.Whitlow,“Single Chain Fvs.”FASEB Vol 9:73-80(1995)及びR.E.Bird and B.W.Walker,Single Chain Antibody Variable Regions,TIBTECH,Vol 9:132-137(1991)に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
本明細書で使用される「ヒト抗体」という用語は、フレームワーク及びCDR領域の両方が、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する抗体を含むことを意図している。さらに、抗体が定常領域を含む場合、定常領域はまた、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する。本発明のヒト抗体は、ヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列によってコードされないアミノ酸残基を含み得る(例えば、インビトロでのランダムもしくは部位特異的変異誘発によって、またはインビボでの体細胞変異によって導入される変異)。本明細書で使用される「ヒト抗体」という用語は、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖細胞系に由来するCDR配列が、ヒトフレームワーク配列に移植されている抗体を含むことを意図しない。
「ヒトモノクローナル抗体」という用語は、フレームワーク領域及びCDR領域の両方がヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する単一の結合特異性を示す抗体を指す。いくつかの実施形態では、ヒトモノクローナル抗体は、不死化細胞に融合したヒト重鎖導入遺伝子及び軽鎖導入遺伝子を含むゲノムを有する、トランスジェニック非ヒト動物、例えばトランスジェニックマウスから取得されたB細胞を含むハイブリドーマによって産生される。
本明細書で使用される「組換えヒト抗体」という用語は、組換え手段によって調製、発現、作成、または単離されるすべてのヒト抗体、例えば(a)ヒト免疫グロブリン遺伝子またはそれから調製されたハイブリドーマ(以下でさらに説明される)についてトランスジェニックまたはトランス染色体である動物(マウスなど)から単離された抗体、(b)ヒト抗体を発現するように形質転換された宿主細胞から、例えば、トランスフェクトーマから単離された抗体、(c)組換えコンビナトリアルヒト抗体ライブラリーから単離された抗体、及び(d)ヒト免疫グロブリン遺伝子配列の他のDNA配列へのスプライシングを含む、任意の他の手段によって調製、発現、作成、または単離された抗体を含む。かかる組換えヒト抗体は、フレームワーク及びCDR領域がヒト生殖細胞系免疫グロブリン配列に由来する可変領域を有する。しかしながら、ある特定の実施形態では、かかる組換えヒト抗体は、インビトロ変異誘発(または、ヒトIg配列についてトランスジェニックな動物が使用される場合、インビボ体細胞変異誘発)に供され得、したがって、組換え抗体のV及びV領域のアミノ酸配列は、ヒト生殖細胞系V及びV配列に由来し、関連しているが、インビボでヒト抗体生殖細胞系レパートリー内に自然に存在しない可能性がある配列である。
本明細書で使用される場合、「アイソタイプ」は、重鎖定常領域遺伝子によってコードされる抗体クラス(例えば、IgMまたはIgG1)を指す。
「抗原を認識する抗体」及び「抗原に特異的な抗体」という句は、本明細書では「抗原に特異的に結合する抗体」という用語と互換的に使用される。
「ヒト抗体誘導体」という用語は、抗体と別の医薬品有効成分または抗体とのコンジュゲートを含む、ヒト抗体の任意の修飾形態を指す。「コンジュゲート」、「抗体薬物コンジュゲート」、「ADC」、または「免疫コンジュゲート」という用語は、別の治療部分にコンジュゲートされた抗体またはその断片を指し、これは当該技術分野において使用可能な方法を使用して、本明細書に記載の抗体にコンジュゲートされ得る。
「ヒト化抗体」、「ヒト化抗体(複数)」、及び「ヒト化」という用語は、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖細胞系に由来するCDR配列が、ヒトフレームワーク配列に移植されている抗体を指すことを意図している。追加のフレームワーク領域の修飾は、ヒトフレームワーク配列内で行うことができる。非ヒト(例えば、マウス)抗体のヒト化形態は、非ヒト免疫グロブリンに由来する最小限の配列を含むキメラ抗体である。ほとんどの場合、ヒト化抗体は、ヒト免疫グロブリン(レシピエント抗体)であり、レシピエントの超可変領域からの残基が、所望の特異性、親和性、及び能力を有するマウス、ラット、ウサギなどの非ヒト種(ドナー抗体)または非ヒト霊長類の15超可変領域からの残基によって置き換えられる。場合によっては、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク(FR)残基は、対応する非ヒト残基によって置き換えられる。さらに、ヒト化抗体は、レシピエント抗体またはドナー抗体には見られない残基を含み得る。これらの修飾は、抗体の性能をさらに向上させるために行われる。一般に、ヒト化抗体は、超可変ループのすべてまたは実質的にすべてが非ヒト免疫グロブリンのものに対応し、FR領域のすべてまたは実質的にすべてがヒト免疫グロブリン配列のものである、少なくとも1つ、典型的には2つの可変ドメインの実質的すべてを含むことになる。ヒト化抗体はまた、任意選択で、免疫グロブリン定常領域(Fc)、典型的にはヒト免疫グロブリンの定常領域の少なくとも一部を含むであろう。さらなる詳細については、Jones,et al.,Nature 1986,321,522-525、Riechmann,et al.,Nature 1988,332,323-329、及びPresta,Curr.Op.Struct.Biol.1992,2,593-596を参照されたい。本明細書に記載される抗体はまた、エフェクター機能及び/またはFcR結合の改善(例えば、低減)を与えることが知られている任意のFcバリアントを用いるように修飾され得る。Fcバリアントは、例えば、国際特許出願公開第WO1988/07089A1号、同第WO1996/14339A1号、同第WO1998/05787A1号、同第WO1998/23289A1号、同第WO1999/51642A1号、同第WO99/58572A1号、同第WO2000/09560A2号、同第WO2000/32767A1号、同第WO2000/42072A2号、同第WO2002/44215A2号、同第WO2002/060919A2号、同第WO2003/074569A2号、同第WO2004/016750A2号、同第WO2004/029207A2号、同第WO2004/035752A2号、同第WO2004/063351A2号、同第WO2004/074455A2号、同第WO2004/099249A2号、同第WO2005/040217A2号、同第WO2005/070963A1号、同第WO2005/077981A2号、同第WO2005/092925A2号、同第WO2005/123780A2号、同第WO2006/019447A1号、同第WO2006/047350A2号、及び同第WO2006/085967A2号、ならびに米国特許第5,648,260号、同第5,739,277号、同第5,834,250号、同第5,869,046号、同第6,096,871号、同第6,121,022号、同第6,194,551号、同第6,242,195号、同第6,277,375号、同第6,528,624号、同第6,538,124号、同第6,737,056号、同第6,821,505号、同第6,998,253号、及び同第7,083,784号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に開示されるアミノ酸置換のうちのいずれか1つを含み得る。
「キメラ抗体」という用語は、可変領域配列が1つの種に由来し、定常領域配列が別の種に由来する抗体、例えば、可変領域配列がマウス抗体に由来し、定常領域配列がヒト抗体に由来する抗体を指すことを意図している。
「二重特異性抗体(diabody)」は、2つの抗原結合部位を有する小さな抗体断片である。断片は、同じポリペプチド鎖(V-VまたはV-V)中に軽鎖可変ドメイン(V)に接続された重鎖可変ドメイン(V)を含む。同じ鎖上の2つのドメインをペアリングするには短すぎるリンカーを使用すると、ドメインは別のチェーンの相補ドメインとペアリングさせられ、2つの抗原結合部位が作成される。二重特異性抗体は、例えば、欧州特許第EP404,097号、国際特許公開第WO93/11161号、及びBolliger,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 1993,90,6444-6448においてより完全に記載されている。
「グリコシル化」という用語は、抗体の修飾誘導体を指す。非グリコシル化抗体は、グリコシル化を欠いている。グリコシル化は、例えば、抗原に対する抗体の親和性を増加させるように変化され得る。かかる炭水化物修飾は、例えば、抗体配列内の1つ以上のグリコシル化部位を変化させることによって達成され得る。例えば、1つ以上の可変領域フレームワークのグリコシル化部位の排除をもたらす、1つ以上のアミノ酸置換を行ない、それによってその部位でのグリコシル化を排除することができる。米国特許第5,714,350号及び同第6,350,861号に記載されているように、非グリコシル化は、抗原に対する抗体の親和性を高める可能性がある。加えてまたは代替的に、改変した種類のグリコシル化を有する抗体、例えば、フコシル残基の量が低減した低フコシル化抗体または二分GlcNac構造が増加した抗体が作製され得る。かかるグリコシル化パターンの変化は、抗体の能力を増加させることが実証されている。かかる炭水化物修飾は、例えば、抗体をグリコシル化機構が変化した宿主細胞で発現させることによって達成され得る。グリコシル化機構が変化した細胞については、当該技術分野で説明されており、本発明の組換え抗体を発現させ、それによりグリコシル化が変化した抗体を産生する宿主細胞として使用され得る。例えば、Ms704、Ms705、及びMs709細胞株で発現される抗体が、それらの炭水化物上のフコースを欠くように、細胞株Ms704、Ms705、及びMs709は、フコシルトランスフェラーゼ遺伝子FUT8(アルファ(1,6)フコシルトランスフェラーゼ)を欠く。Ms704、Ms705、及びMs709 FUT8-/-細胞株は、2つの置換ベクターを使用したCHO/DG44細胞中のFUT8遺伝子の標的破壊によって作成された(例えば、米国特許公開第2004/0110704号またはYamane-Ohnuki,et al.,Biotechnol.Bioeng.,2004,87,614-622を参照)。別の例として、欧州特許第EP1,176,195号は、フコシルトランスフェラーゼをコードし、それによりかかる細胞株で発現される抗体が、アルファ1,6結合関連酵素を低減または排除することによって低フコシル化を示す、機能的に破壊されたFUT8遺伝子を有する細胞株を説明しており、抗体のFc領域に結合するN-アセチルグルコサミンにフコースを付加するための酵素活性が低いか、または酵素活性を有しない細胞株、例えばラット骨髄腫細胞株YB2/0(ATCC CRL 1662)についても説明している。国際特許公開第WO03/035835号は、フコースをAsn(297)結合型炭水化物に付着させる能力が低減し、さらにその宿主細胞で発現される抗体の低フコシル化ももたらすバリアントCHO細胞株、Lec13細胞について説明している(Shields,et al.,J.Biol.Chem.2002,277,26733-26740も参照)。国際特許公開第WO99/54342号は、糖タンパク質修飾グリコシルトランスフェラーゼ(例えば、ベータ(1,4)-N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼIII(GnTIII))を発現するように操作され、それにより操作された細胞株で発現される抗体が、二分性GlcNac構造の増加を示し、抗体のADCC活性の増加をもたらす、細胞株について記載している(Umana,et al.,Nat.Biotech.1999,17,176-180も参照)。代替てきに、フコシダーゼ酵素を使用して、抗体のフコース残基を切断でき得る。例えば、フコシダーゼアルファ-L-フコシダーゼは、Tarentino,et al.,Biochem.1975,14,5516-5523に記載されているように、抗体からフコシル残基を除去する。
「ペグ化」は、1つ以上のPEG基が抗体または抗体断片に付着する条件下で、PEGの反応性エステルまたはアルデヒド誘導体などのポリエチレングリコール(PEG)と反応させる、修飾抗体またはその断片を指す。ペグ化は、例えば、抗体の生物学的(例えば、血清)半減期を増加させることができる。好ましくは、ペグ化は、反応性PEG分子(または類似の反応性水溶性ポリマー)とのアシル化反応またはアルキル化反応を介して実行される。本明細書で使用される場合、「ポリエチレングリコール」という用語は、モノ(C~C10)アルコキシ-もしくはアリールオキシ-ポリエチレングリコール、またはポリエチレングリコール-マレイミドなどの、他のタンパク質を誘導体化するために使用されているPEGの形態のうちのいずれかを包含することが意図される。ペグ化される抗体は、非グリコシル化抗体であり得る。ペグ化のための方法は、当該技術分野で知られており、例えば欧州特許第EP0154316号及び同第EP0401384号、ならびに米国特許第5,824,778号(各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように、本発明の抗体に適用することができる。
「バイオシミラー」という用語は、モノクローナル抗体またはタンパク質を含む、臨床的に不活性な成分にわずかな違いがあるにもかかわらず、米国で認可された参照バイオ製品と非常に類似しており、製品の安全性、純度、及び効力に関してバイオ製品と参照製品との間に臨床的に意味のある差異がない、バイオ製品を意味する。さらに、類似のバイオまたは「バイオシミラー」医薬品は、欧州医薬品庁によって既に使用が許可されている別のバイオ医薬品に類似したバイオ医薬品である。「バイオシミラー」という用語は、他の国及び地域の規制機関によっても同義的に使用されている。バイオ製品またはバイオ医薬品は、細菌または酵母などの生物源によって作製された、またはそれに由来する医薬品である。それらは、ヒトインスリンもしくはエリスロポエチンなどの比較的小さな分子、またはモノクローナル抗体などの複雑な分子からなり得る。例えば、参照IL-2タンパク質がアルデスロイキン(PROLEUKIN)である場合、アルデスロイキンに関して薬物規制当局によって承認されたタンパク質は、アルデスロイキンの「バイオシミラー」であるか、またはアルデスロイキンの「そのバイオシミラー」である。欧州では、類似のバイオまたは「バイオシミラー」医薬品は、欧州医薬品庁(EMA)によって既に使用が許可されている別のバイオ医薬品に類似したバイオ医薬品である。欧州における同様の生物学的用途に関連する法的根拠は、補正されたRegulation(EC)No 726/2004の第6条及びDirective 2001/83/ECの第10(4)条であり、したがって欧州では、バイオシミラーは、Regulation(EC)No 726/2004の第6条及びDirective 2001/83/ECの第10(4)条の下で、認可または認可申請の対象について認可、承認され得る。すでに認可されているオリジナルのバイオ医薬品は、欧州では「参照医薬品」と称されることがある。バイオシミラーとみなされる製品に対する要件のうちのいくつかは、バイオシミラー医薬品に関するCHMPガイドラインに概説されている。さらに、モノクローナル抗体バイオシミラーに関連するガイドラインを含む製品固有のガイドラインは、EMAによって製品毎に提供され、そのウェブサイトで公開されている。本明細書に記載のバイオシミラーは、品質特徴、生物活性、作用機序、安全性プロファイル、及び/または有効性の点で、参照医薬品に類似している可能性がある。さらに、バイオシミラーは、参照医薬品と同じ状態を治療するために使用され得るか、または使用を意図され得る。したがって、本明細書に記載のバイオシミラーは、参照医薬品と類似または非常に類似した品質特徴を有するとみなされ得る。代替的に、またはさらに、本明細書に記載のバイオシミラーは、参照医薬品と類似または非常に類似した生物活性を有するとみなされ得る。代替的に、またはさらに、本明細書に記載のバイオシミラーは、参照医薬品と類似または非常に類似した安全性プロファイルを有するとみなされ得る。代替的に、またはさらに、本明細書に記載のバイオシミラーは、参照医薬品と類似または非常に類似した効力を有するとみなされ得る。本明細書に記載されているように、欧州におけるバイオシミラーは、EMAによって認可された参照医薬品と比較される。しかしながら、場合によっては、バイオシミラーは、特定の研究で欧州経済領域外で認可されたバイオ医薬品(EEA認可されていない「コンパレーター」)と比較される場合がある。かかる研究には、例えば、特定の臨床研究及びインビボ非臨床研究が含まれる。本明細書で使用される場合、「バイオシミラー」という用語は、EEA認可されていないコンパレーターと比較された、または比較され得るバイオ医薬品にも関する。特定のバイオシミラーは、抗体、抗体断片(例えば、抗原結合部分)、及び融合タンパク質などのタンパク質である。タンパク質バイオシミラーは、ポリペプチドの機能に有意な影響を及ぼさない、アミノ酸構造にわずかな修飾(例えば、アミノ酸の欠失、付加、及び/または置換を含む)を有するアミノ酸配列を有し得る。バイオシミラーは、その参照医薬品のアミノ酸配列に対して97%以上、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み得る。バイオシミラーは、その違いが医薬品の安全性及び/または有効性の変化をもたらさないならば、1つ以上の翻訳後修飾、例えば、限定されないが、参照医薬品の翻訳後修飾とは異なる、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び/または切断を含み得る。バイオシミラーは、参照医薬品と同一または異なるグリコシル化パターンを有し得る。特に、排他的ではないが、バイオシミラーは、その違いが参照医薬品に関連する安全性の懸念に対処するか、対処することを意図している場合、異なるグリコシル化パターンを有し得る。加えて、バイオシミラーは、医薬品の安全性及び有効性が損なわれないならば、例えば、その強度、剤形、製剤、賦形剤、及び/または提示において参照医薬品から逸脱する可能性がある。バイオシミラーは、参照医薬品と比較して、例えば薬物動態(PK)及び/または薬力学的(PD)プロファイルの違いを含み得るが、それでも、認可される、または認可に適しているとみなされるように、参照医薬品と十分に類似しているとみなされる。特定の状況において、バイオシミラーは、参照医薬品と比較して異なる結合特徴を示し、異なる結合特徴は、EMAなどの規制当局によって類似のバイオ製品としての認可の障壁ではないとみなされる。「バイオシミラー」という用語は、他の国及び地域の規制機関によっても同義的に使用されている。
III.腫瘍採取から凍結保存されたTIL調製物の作製
本明細書で提供される本発明のいくつかの実施形態は、患者が免疫チェックポイント阻害剤(ICI)及び/または標準治療の治療を受ける前に、がん患者から採取された腫瘍試料から凍結保存されたTIL調製物を作製する方法に関する。
いくつかの実施形態では、患者は、腫瘍採取及び凍結保存後にICI処置(本明細書に記載の抗免疫チェックポイント抗体など)を受ける。
いくつかの実施形態では、患者は、腫瘍採取及び凍結保存の後、がんの標準治療の治療を受ける。本明細書に記載のいくつかの治療方法は、標準治療の治療を患者に施すことを含む。本明細書で使用される場合、「標準治療の治療」は、特定のタイプの患者、疾患、または臨床状況に対して適切、認められた、及び/または広く使用されていると医師によって認識される薬物もしくは薬物の組み合わせ、放射線療法、手術、または他の医療介入を含む治療プロセスである。種々のタイプのがんを治療するための標準治療の治療は、当業者に周知である。例えば、米国の21の主要がんセンターの連合体であるNational Comprehensive Cancer Network(NCCN)は、NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology(NCCN GUIDELINES(登録商標))を発行し、これは、多種多様ながんの標準治療の治療に関する詳細な最新情報を提供している(NCCN GUIDELINES(登録商標)、2013を参照されたい)。いくつかの実施形態では、標準治療の治療は、化学療法、放射線療法、手術、標的療法、またはそれらの任意の組み合わせである。
いくつかの実施形態では、患者または対象からの凍結保存された腫瘍採取物は、患者がICI及び/または標準治療の治療で治療され、がんの進行を示した後にTILの集団を作製するために使用される。いくつかの実施形態では、腫瘍採取物の凍結保存後、患者または対象は、免疫チェックポイント阻害剤(ICI)及び/または標準治療の治療を受け、がんの進行について監視される。いくつかの実施形態では、がんの進行は、自己TIL療法の必要性を示す。
他の実施形態では、患者または対象からの腫瘍採取物の凍結保存は、がんの進行の前に完了する。
いくつかの実施形態では、本明細書で開示される方法は、ペーティント(paetint)が進行性疾患を発症しない場合、またはそうでなければ、将来的にTIL療法のために適応される場合に、TIL産生のコストを回避するという形態で薬学的経済的利点を提供する。
患者が、凍結保存のステップの少なくとも約1週間、2週間、3週間、1か月、2か月、3か月、4か月、5か月、6か月、7か月、8か月、9か月、10か月、11か月、12か月、13か月、14か月、15か月、16か月、17か月、18か月、19か月、20か月、21か月、22か月、23か月、24か月、25か月、26か月、27か月、28か月、29か月、30か月、31か月、32か月、33か月、34か月、35か月、36か月後、進行性疾患を示す、請求項1~14のいずれか1項に記載の方法。
いくつかの実施形態では、凍結保存されたTIL調製物は、患者または対象から取得及び/または受容されるTIL集団を含む腫瘍試料から作製され得る。患者の腫瘍試料は、一般に外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段を介して、当該技術分野で知られている方法を使用して取得することができる。いくつかの実施形態では、多病変試料採取が使用される。いくつかの実施形態では、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段は、多病変試料採取を含む(すなわち、患者の1つ以上の腫瘍部位及び/または場所、ならびに同じ場所または近接した1つ以上の腫瘍から試料を取得する)。一般に、腫瘍試料は、原発腫瘍、浸潤性腫瘍、または転移性腫瘍を含む、任意の固形腫瘍に由来し得る。腫瘍試料は、血液系悪性腫瘍から取得された腫瘍などの液体腫瘍であり得る。固形腫瘍は、肺組織のものであり得る。いくつかの実施形態では、有用なTILは、非小細胞肺癌(NSCLC)から得られる。固形腫瘍は、皮膚組織のものであり得る。いくつかの実施形態では、有用なTILは、黒色腫から取得される。
取得された時点で、腫瘍試料は、一般に、鋭的解剖を使用して1~約8mmの小片に断片化され、約2~3mmが特に有用である。いくつかの実施形態では、TILは、酵素腫瘍消化物を使用してこれらの断片から培養される。かかる腫瘍消化物は、酵素培地(例えば、Roswell Park Memorial Institute(RPMI)1640緩衝液、2mMグルタメート、10mcg/mLゲンタマイシン、30単位/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(例えば、組織解離機を使用する)によって産生され得る。腫瘍消化物は、腫瘍を酵素培地に入れ、腫瘍をおよそ1分間機械的に解離させ、続いて5%のCO2中、37℃で30分間インキュベートし、続いて、小さな組織片のみが存在するまで、前述の条件下で機械的解離及びインキュベーションのサイクルを繰り返すことによって産生され得る。このプロセスの最後に、細胞懸濁液中に多数の赤血球または死細胞が含まれている場合、FICOLL分岐親水性多糖類を使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。米国特許出願公開第2012/0244133A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているものなどの当該技術分野で知られている代替の方法を使用することができる。前述の方法のうちのいずれかが、TILを拡張する方法またはがんを治療する方法について本明細書に記載される実施形態のうちのいずれかにおいて使用され得る。
いくつかの実施形態では、凍結保存されたTIL調製物は、将来の使用のために保管される。いくつかの実施形態では、腫瘍採取物の凍結保存は、進行前に完了する。いくつかの実施形態では、凍結保存されたTIL調製物の作製後、患者は、ICI及び/または標準治療の治療時またはその後に進行性疾患の発現を監視される。いくつかの実施形態では、患者は、ICI及び/または標準治療の治療時またはその後に進行性癌を示し、自己TIL療法に適応される。いくつかの実施形態では、進行後、凍結保存されたTIL調製物を解凍し、以下のセクションに記載の拡張方法に従って拡張する。
いくつかの実施形態では、患者は、NSCLC癌患者である。いくつかの実施形態では、患者は、NSCLCに罹患しているか、罹患したか、またはNSCLCに罹患しやすい。いくつかの実施形態では、患者は、転移性NSCLCを有する。いくつかの実施形態では、患者は、転移性ステージIVのNSCLCを有する。
いくつかの実施形態では、対象または患者は、
i.<1%のPD-L1の所定の腫瘍割合スコア(TPS)、
ii.1%~49%のPD-L1のTPSスコア、または
iii.1つ以上のドライバー変異の所定の非存在のうちの少なくとも1つを有する。
いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、1つ以上のアクショナブルなドライバー変異を有しない。いくつかの実施形態では、本明細書で開示されるアクショナブルなドライバー変異には、EGFR変異、EGFR挿入、EGFRエクソン20、KRAS変異、BRAF変異、BRAF V600E変異、BRAF V600K変異、BRAF V600変異、ALK変異、c-ROS変異(ROS1変異)、ROS1融合、RET変異、RET融合、ERBB2変異、ERBB2増幅、BRCA変異、MAP2K1変異、PIK3CA、CDKN2A、PTEN変異、UMD変異、NRAS変異、KRAS変異、NF1変異、MET変異、METスプライス及び/または変化したMETシグナル伝達、TP53変異、CREBBP変異、KMT2C変異、KMT2D変異、ARID1A変異、RB1変異、ATM変異、SETD2変異、FLT3変異、PTPN11変異、FGFR1変異、EP300変異、MYC変異、EZH2変異、JAK2変異、FBXW7変異、CCND3変異、及びGNA11変異が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、NSCLCは、<1%のTPSを示し、1つ以上のドライバー変異の所定の非存在を有する。
いくつかの実施形態では、凍結保存されたTIL調製物が作製される時点で、患者は、すべてのがん治療にナイーブである。いくつかの実施形態では、患者は、標的療法にナイーブである。いくつかの実施形態では、凍結保存されたTIL調製物が作製される時点で、患者は、ICI治療にナイーブである。いくつかの実施形態では、凍結保存されたTIL調製物が作製される時点で、患者は、抗VEGF(例えば、avastin/ベバシズマブ)治療にナイーブである。いくつかの実施形態では、凍結保存されたTIL調製物が作製される時点で、患者は、化学療法治療にナイーブである。いくつかの実施形態では、凍結保存されたTIL調製物が作製される時点で、患者は、前述の治療のうちの2つ以上の組み合わせにナイーブである。
いくつかの実施形態では、凍結保存されたTIL調製物が作製される時点で、患者は、維持療法を受けている。いくつかの実施形態では、凍結保存されたTIL調製物が作製される時点で、患者の維持療法は中断される。いくつかの実施形態では、凍結保存されたTIL調製物が作製される時点で、患者は、維持療法の中断後のウォッシュアウト期間にあり、続いて、維持療法の再開または異なる療法が行われる。いくつかの実施形態では、維持療法は、腫瘍試料が患者から採取された後に再開される。いくつかの実施形態では、がん(NSCLCなど)は、維持療法時またはその後に処理される。
いくつかの実施形態では、凍結保存されたTIL調製物が作製される時点で、患者は、がんの第1選択(1L)ICI及び/または標準療法を受けることになる。
いくつかの実施形態では、凍結保存されたTIL調製物が作製される時点で、患者は、がんの第2選択(2L)ICI及び/または標準療法を受けることになる。
いくつかの実施形態では、患者の採取された腫瘍試料は、フラッシュ凍結方法または制御された速度の凍結を使用して凍結保存される。例示的なフラッシュ凍結方法及び制御された速度の凍結方法は、国際特許公開第WO/2020/061429号に見出され得、これは、すべての目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、本発明のフラッシュ凍結方法は、
(i)腫瘍組織を断片化することと、
(ii)凍結保存培地中で断片をインキュベートすることと、
(iii)断片を凍結することであって、凍結が、液体窒素の気相を使用したフラッシュ凍結である、凍結することと、を含む。
ある実施形態では、腫瘍組織は、約1.5mm~約6mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。好ましい実施形態では、ほぼ球形の断片は、約6mmの直径を有する。一実施形態では、ほぼ球形の断片は、約3mmの直径を有する。
いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、少なくとも1.5mmの最短辺長及び約6mmの最長辺長を有する概して長方形の断片に断片化される。ある実施形態では、腫瘍組織は、約1.5mm~6mmの辺長を有する概して立方体の断片に断片化される。ある実施形態では、概して立方体の断片は、約6mmの辺長を有する。ある実施形態では、概して立方体の断片は、約3mmの辺長を有する。
いくつかの実施形態では、組織試料は、腫瘍組織から非腫瘍組織を分離するようにトリミングされる。
いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、解剖された腫瘍由来のものである。ある実施形態では、腫瘍組織は、腫瘍生検由来のものである。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、切開生検由来のものである。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、切除生検由来のものである。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、1つ以上のコア針生検由来のものであり得る。
いくつかの実施形態では、新鮮な腫瘍組織は、約1.5mm×1.5mm、約2mm×2mm、約2.5mm×2.5mm、約3mm×3mm、約3.5mm×3.5mm、約4mm×4mm、約4.5mm×4.5mm、約5mm×5mm、約5.5mm×約5.5mm、または約6mm×約6mmの横断面を有する断片にトリミングされる。
ある実施形態では、腫瘍組織は、12時間未満の古さのものである。ある実施形態では、腫瘍組織は、8時間未満の古さのものである。ある実施形態では、腫瘍組織は、3時間未満、2時間未満、または1時間未満の古さのものである。
本開示を考慮して、当業者に既知の任意の好適な凍結保存培地が、本明細書に記載の方法において使用され得る。好適な凍結保存培地の例としては、CryoStor(登録商標)CS10、HypoThermosol(登録商標)、またはそれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約2%v/vのDMSO~約15%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約2%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約2%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約3%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約4%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約5%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約6%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約7%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約8%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約9%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約10%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約11%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約12%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約13%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約14%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約15%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、少なくとも1つの抗菌剤を含む。本開示を考慮して、当業者に既知の任意の好適な抗菌剤が、本明細書に記載の方法において使用され得る。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、ゲンタマイシンを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、少なくとも50μg/mLの濃度のゲンタマイシンを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、少なくとも40μg/mLの濃度のゲンタマイシンを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、少なくとも30μg/mLの濃度のゲンタマイシンを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、少なくとも20μg/mLの濃度のゲンタマイシンを含む。
いくつかの実施形態では、腫瘍断片を、凍結保存培地中で約20分~約70分間インキュベートする。いくつかの実施形態では、腫瘍断片を、凍結保存培地中で約30分~約60分間インキュベートする。いくつかの実施形態では、インキュベーションは、少なくとも10分、少なくとも20分、少なくとも25分、少なくとも30分、少なくとも35分、少なくとも40分、少なくとも45分、少なくとも50分、少なくとも55分、少なくとも60分、または少なくとも70分である。いくつかの実施形態では、インキュベーションは、約10分、約20分、約25分、約30分、約35分、約40分、約45分、約50分、約55分、約60分、または約70分である。いくつかの実施形態では、インキュベーションは、10分未満、20分未満、25分未満、30分未満、35分未満、40分未満、45分未満、50分未満、55分未満、60分未満、または70分未満である。いくつかの実施形態では、インキュベーション時間は、腫瘍断片密度に比例する。いくつかの実施形態では、インキュベーション時間は、腫瘍断片の表面対体積比に比例する。
いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、凍結保存媒体中で、約2℃~約8℃の温度でインキュベートされる。
いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、生理学的緩衝等張生理食塩水溶液中で洗浄される。いくつかの実施形態では、洗浄は、各々少なくとも3分の3回の連続洗浄を含み、各連続洗浄後に生理学的緩衝等張生理食塩水溶液が置き換えられる。いくつかの実施形態では、生理学的緩衝等張生理食塩水溶液は、ハンクス平衡塩溶液(HBSS)を含む。いくつかの実施形態では、生理学的緩衝等張生理食塩水溶液は、トリス緩衝生理食塩水(TBS)を含む。いくつかの実施形態では、生理学的緩衝等張生理食塩水溶液は、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)を含む。いくつかの実施形態では、生理学的緩衝等張生理食塩水溶液は、ダルベッコのリン酸緩衝生理食塩水(DPBS)を含む。いくつかの実施形態では、1つの連続洗浄中の生理学的緩衝等張生理食塩水溶液は、他の連続洗浄のうちの1つ以上において使用されるものとは異なる生理学的緩衝等張生理食塩水溶液であってもよい。
ある実施形態では、凍結は、約-125℃~約-196℃の範囲の温度で行われる。ある実施形態では、凍結は、約-140℃~約-185℃の範囲の温度で行われる。ある実施形態では、凍結は、約-140℃~約-175℃の範囲の温度で行われる。ある実施形態では、凍結は、約-145℃の温度で行われる。いくつかの実施形態では、凍結は、液体窒素の気相で行われる。
当該技術分野で周知の問題は、凍結プロセス中に細胞または組織を損傷することなく凍結保存することである。理論に拘束されないが、凍結中の損傷の1つの原因は、細胞破裂をもたらす細胞内氷核形成である。Muldrew及びMcGannは、“The osmotic rupture hypothesis of intracellular freezing injury”,Biophysical Journal,66:532-41(1994)で、細胞、特に全組織凍結保存についてのこの周知で、広く認識されている困難についての定量的な理論を概説している。Acker及びMcGannは、その後の論文“Membrane damage occurs during the formation of intracellular ice,”Cryo Letter,22:241-54(2001)で、細胞内氷形成及び細胞損傷の基本的な機構をさらに発展させている。
凍結中の損傷が検出され、解凍時に、組織が生理学的構造を実質的に失ったか、または組織を構成する細胞が実質的にその生存能を失っている。生存率は、増殖するか、または正常な細胞機能のマーカーを示すそのような細胞の数と比較して、培地に導入された細胞の割合によって決定され得る。生存細胞の割合を特定するための多数の方法、例えば、限定されないが、トリパンブルー排除などの染料除外試験が、当該技術分野で知られている。例えば、Strober,Curr.Protoc.Immunol.,2001,Appendix 3B,available at https://dx.doi.org/10.1002/0471142735.ima03bs21を参照されたい。限定されないが、生存率はまた、MTTアッセイなどの代謝活性アッセイによって決定され得、MTT、3-(4,5-ジメチルチアゾール-2-イル)-2,5-ジフェニルテトラゾリウムブロミドは、細胞酵素によってホルマザンに代謝される。この酵素反応は、黄色のMTTを紫色のホルマザンに変換する。例えば、Berridge et al.,Tetrazolium dyes as tools in cell biology:new insights into their cellular reduction.Biotechnology Annual Review,11:127-152(2005)、Mosmann,“Rapid colorimetric assay for cellular growth and survival:application to proliferation and cytotoxicity assays,”J.Immunol.Methods 65(1-2):55-63(1983)を参照されたい。
理論に拘束されないが、ゆっくりとした冷却は無害な細胞内の氷を産生すると仮定されており、Acker and McGann,“Protective effect of intracellular ice during freezing?”Cryobiology,46(2):197-202(2003)を参照されたい。過度の細胞損傷なしに凍結を達成するか、または細胞生存率を著しく低減させることなく凍結を達成する従来のアプローチは、ゆっくりとした凍結速度を採用することであった。Watson et al.、米国特許第5,891,617号は、このアプローチを強調し、例えば、請求項1のステップ(c)は、非常に遅い冷却速度:「毎分約-0.3℃以下」を教示する。同様に、Comhaire et al.、米国特許第9,938,495号は、幹細胞について「解凍後の高い細胞生存率は、DMSOを含まない凍結保存培地を使用してゆっくり凍結することによって得られた」と教示している。
これらの例示的な教示に基づいて、本開示の方法及び産物は驚くべきものであり、予想外である。さらに、実施例及びその中のデータを含む、本開示は、治療のための腫瘍浸潤リンパ球の製造における使用のために、腫瘍組織、腫瘍断片、または腫瘍検体を迅速かつ効率的に凍結保護する問題に対する技術的解決策を実証する。
いくつかの実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の製造のための腫瘍組織の凍結保存方法は、少なくとも-130℃を下回る温度で凍結された断片を保管するステップ(iv)をさらに含む。いくつかの実施形態では、凍結された断片は、液体窒素の気相中に保管される。いくつかの実施形態では、凍結された断片は、液体窒素に浸されて保管される。いくつかの実施形態では、凍結保存された断片は、自己治療的使用のための、後のTILの製造のために保管される。
いくつかの実施形態では、本開示は、制御された速度の凍結/ゆっくりとした凍結方法を使用して腫瘍組織を凍結保存するための方法を本明細書で提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍組織を凍結保存するための方法、ならびに
(i)閉鎖可能な容器に凍結保存培地を添加するステップと、
(ii)制御された速度の凍結装置で閉鎖可能な容器を予め冷却するステップと、
(iii)腫瘍組織を断片化して、腫瘍断片を得るステップと、
(iv)腫瘍断片を、凍結保存培地を含む閉鎖可能な容器に入れ、容器を閉鎖するステップと、
(v)任意選択で、腫瘍断片及び凍結保存培地を含む閉鎖容器をインキュベートするステップと、
(vi)制御された速度の凍結装置中で容器をゆっくり凍結するステップと、
(vii)容器を液体窒素冷凍庫に移すステップと、を含むプロセスによって調製された凍結保存された腫瘍組織を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍組織を凍結保存するための方法、ならびに
(i)腫瘍組織の断片化から取得された腫瘍断片を凍結保存培地を含む予め冷却された閉鎖可能な容器中に入れ、容器を閉鎖するステップと、
(ii)任意選択で、腫瘍断片及び凍結保存培地を含む閉鎖容器をインキュベートするステップと、
(iii)制御された速度の凍結装置中で容器をゆっくり凍結するステップと、
(iv)容器を液体窒素冷凍庫に移すステップと、を含むプロセスによって調製された凍結保存された腫瘍組織を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍組織を凍結保存するための方法、ならびに
(i)酵素培地中での腫瘍消化物の消化から取得された腫瘍消化物または腫瘍組織の断片化から産生された腫瘍断片を凍結保存培地を含む予め冷却された閉鎖可能な容器中に入れ、容器を閉鎖するステップと、
(ii)任意選択で、腫瘍消化物及び凍結保存培地を含む閉鎖容器をインキュベートするステップと、
(iii)制御された速度の凍結装置中で容器をゆっくり凍結するステップと、
(iv)容器を液体窒素冷凍庫に移すステップと、を含むプロセスによって調製された凍結保存された腫瘍組織を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍組織を凍結保存するための方法、ならびに
(i)閉鎖可能な容器に凍結保存培地を添加するステップと、
(ii)制御された速度の凍結装置で閉鎖可能な容器を予め冷却するステップと、
(iii)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を取得するステップと、
(iv)腫瘍消化物を閉鎖可能な容器中の凍結保存培地中に入れ、容器を閉鎖するステップと、
(v)任意選択で、腫瘍消化物及び凍結保存培地を含む閉鎖容器をインキュベートするステップと、
(vi)制御された速度の凍結装置中で容器をゆっくり凍結するステップと、
(vii)容器を液体窒素冷凍庫に移すステップと、を含むプロセスによって調製された凍結保存された腫瘍組織を提供する。
本開示を考慮して、当業者に既知の任意の好適な凍結保存培地が、本明細書に記載の方法において使用され得る。好適な凍結保存培地の例としては、CryoStor(登録商標)CS10、HypoThermosol(登録商標)、またはそれらの組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約2%v/vのDMSO~約15%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約2%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約2%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約3%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約4%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約5%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約6%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約7%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約8%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約9%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約10%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約11%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約12%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約13%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約14%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、約15%v/vのDMSOを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、少なくとも1つの抗菌剤を含む。本開示を考慮して、当業者に既知の任意の好適な抗菌剤が、本明細書に記載の方法において使用され得る。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、ゲンタマイシンを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、少なくとも50μg/mLの濃度のゲンタマイシンを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、少なくとも40μg/mLの濃度のゲンタマイシンを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、少なくとも30μg/mLの濃度のゲンタマイシンを含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、少なくとも20μg/mLの濃度のゲンタマイシンを含む。
本開示を考慮して、当業者に既知の任意の好適な閉鎖可能な容器が、本明細書に記載の方法において使用され得る。好適な閉鎖可能な容器の例としては、キャップ付きマイクロ遠心チューブ、蓋付きマイクロ遠心チューブ、及び極低温検体保管バイアルが含まれるが、これらに限定されない。「極低温検体保管バイアル」という用語は、容器を極低温(-80℃以下であることを意味し、任意選択で液体窒素に浸されるか、または約-196℃の温度で液体窒素の上の気相につるされる)で安全かつ確実に保管することができる、任意の及びすべての閉鎖、密封、または再閉鎖可能な容器(例えば、ねじキャップまたは摩擦密封スナップキャップを有する)を含む、クライオバイアル、極低温容器、極低温チューブなどの用語を含むことを意味する。一般的にポリエチレンまたはポリプロピレンから製造されるキャップ付きまたは蓋付きのマイクロ遠心チューブ及びクライオバイアルは、多くの場合、極低温検体保管バイアルとして使用される。
いくつかの実施形態では、閉鎖可能な容器は、約50%~約85%の体積が凍結保存培地で満たされる。いくつかの実施形態では、閉鎖可能な容器は、約50%~約85%の体積が凍結保存培地で満たされる。いくつかの実施形態では、閉鎖可能な容器は、約50%~約75%の体積が凍結保存培地で満たされる。いくつかの実施形態では、閉鎖可能な容器は、約50%~約65%の体積が凍結保存培地で満たされる。いくつかの実施形態では、閉鎖可能な容器は、約50%~約55%の体積が凍結保存培地で満たされる。いくつかの実施形態では、閉鎖可能な容器は、約60%~約85%の体積が凍結保存培地で満たされる。いくつかの実施形態では、閉鎖可能な容器は、約60%~約75%の体積が凍結保存培地で満たされる。いくつかの実施形態では、閉鎖可能な容器は、約60%~約65%の体積が凍結保存培地で満たされる。いくつかの実施形態では、閉鎖可能な容器は、約70%~約85%の体積が凍結保存培地で満たされる。いくつかの実施形態では、閉鎖可能な容器は、約70%~約75%の体積が凍結保存培地で満たされる。いくつかの実施形態では、閉鎖可能な容器は、約80%~約85%の体積が凍結保存培地で満たされる。
いくつかの実施形態では、予め冷却するステップは、閉鎖可能な容器を、約-80℃~約8℃の温度である制御された速度の凍結装置に、少なくとも約5分~約8時間の期間入れることを含む。いくつかの実施形態では、予め冷却するステップは、閉鎖可能な容器を、約80℃、約-79℃、約-78℃、約-77℃、約-76℃、約-75℃、約-70℃、約-65℃、約-60℃、約-55℃、約-50℃、約-45℃、約-40℃、約-35℃、約-30℃、約-25℃、約-20℃、約-15℃、約-10℃、約-5℃、約0℃、約1℃、約2℃、約3℃、約4℃、約5℃、約6℃、約7℃、約8℃、または間の任意の温度である制御された速度の凍結装置に、少なくとも約5分、少なくとも約10分、少なくとも約15分、少なくとも約20分、少なくとも約25分、少なくとも約30分、少なくとも約35分、少なくとも約40分、少なくとも約45分、少なくとも約50分、少なくとも約55分、少なくとも約1時間、少なくとも約1.5時間、少なくとも約2時間、少なくとも約3時間、少なくとも約4時間、少なくとも約5時間、少なくとも約6時間、少なくとも約7時間、少なくとも約8時間、またはそれ以上の期間入れることを含む。
いくつかの実施形態では、腫瘍断片及び凍結保存媒体を含む閉鎖容器を、約2~8℃の温度で約30~60分間インキュベート後、制御された速度の凍結装置中で容器をゆっくりと凍結する。いくつかの実施形態では、腫瘍断片及び凍結保存媒体を含む容器を、約2℃、約3℃、約4℃、約5℃、約6℃、約7℃、約8℃、またはその間の任意の温度で、約5分間、約10分間、約15分間、約20分間、約25分間、約30分間、約35分間、約40分間、約45分間、約50分間、約55分間、約60分間、またはそれ以上の期間インキュベート後、制御された速度の凍結装置中で容器をゆっくりと凍結する。
本開示を考慮して、当業者に既知の任意の好適な制御された速度の凍結装置が、本明細書に記載の方法において使用され得る。好適な制御された速度の凍結装置の例としては、Corning CoolCell(商標)装置またはNalgene Mr.Frosty(商標)装置が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、制御された速度の凍結装置は、約-0.1℃/分~約-10℃/分の速度で冷却する、IPAを含まない制御された速度の凍結装置である。いくつかの実施形態では、制御された速度の凍結装置は、約-0.1℃/分~約-10℃/分、約-0.2℃/分~約-5℃/分、約-0.5℃/分~約-2.5℃/分、約-1℃/分~約-2℃/分の速度で冷却する、IPAを含まない制御された速度の凍結装置である。いくつかの実施形態では、制御された速度の凍結装置は、約-1℃/分の速度で冷却するIPAフリーの制御された速度の凍結装置である。
いくつかの実施形態では、制御された速度の凍結装置の位置のすべては、凍結保存培地を含有する閉鎖可能な容器で満たされる。いくつかの実施形態では、制御された速度の凍結装置の位置の90%以上は、凍結保存培地を含有する閉鎖可能な容器で満たされる。いくつかの実施形態では、制御された速度の凍結装置の位置の80%以上は、凍結保存培地を含有する閉鎖可能な容器で満たされる。いくつかの実施形態では、制御された速度の凍結装置の位置の70%以上は、凍結保存培地を含有する閉鎖可能な容器で満たされる。いくつかの実施形態では、制御された速度の凍結装置の位置の60%以上は、凍結保存培地を含有する閉鎖可能な容器で満たされる。いくつかの実施形態では、制御された速度の凍結装置の位置の50%以上は、凍結保存培地を含有する閉鎖可能な容器で満たされる。いくつかの実施形態では、制御された速度の凍結装置の位置の40%以上は、凍結保存培地を含有する閉鎖可能な容器で満たされる。
本明細書で使用される「ゆっくりとした凍結方法」という用語は、液体窒素などで最終的に凍結保存する前に、試料を冷却環境で制御された速度で冷却するプロセスを指す。いくつかの実施形態では、冷却速度は、約-0.1℃/分~約-10℃/分、約-0.2℃/分~約-5℃/分、約-0.5℃/分~約-2.5℃/分、約-1℃/分~約-2℃/分である。いくつかの実施形態では、冷却速度は、約-1℃/分である。いくつかの実施形態では、冷却環境は、約-90℃、約-89℃、約-88℃、約-87℃、約-86℃、約-85℃、約-84℃、約-83℃、約-82℃、約-81℃、約-80℃、約-79℃、約-78℃、約-77℃、約-76℃、約-75℃、約-74℃、約-73℃、約-72℃、約-72℃、約-71℃、もしくはその間の任意の温度などの約-90℃~約70℃の間に設定された-80℃冷凍庫またはドライアイスである。
いくつかの実施形態では、ゆっくりとした凍結は、制御された速度の凍結装置を約-70℃~約-90℃の温度でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態では、ゆっくりとした凍結は、制御された速度の凍結装置を約-75℃~約-85℃の温度でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態では、ゆっくりとした凍結は、制御された速度の凍結装置を約-78℃~約-80℃の温度でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態では、ゆっくりとした凍結は、制御された速度の凍結装置をドライアイスでインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態では、ゆっくりとした凍結は、制御された速度の凍結装置を-80℃の冷凍庫中でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態では、ゆっくりとした凍結は、制御された速度の凍結装置をドライアイス中でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、ゆっくりとした凍結は、制御された速度の凍結装置を約-80℃の温度で約3~5時間インキュベートすることを含む。いくつかの実施形態では、ゆっくりとした凍結は、制御された速度の凍結装置を約-80℃の温度で約3時間インキュベートすることを含む。いくつかの実施形態では、ゆっくりとした凍結は、制御された速度の凍結装置を約-80℃の温度で約4時間インキュベートすることを含む。いくつかの実施形態では、ゆっくりとした凍結は、制御された速度の凍結装置を約-80℃の温度で約5時間インキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、凍結から回復した後、細胞は、少なくとも約80%の解凍後生存率を有する。いくつかの実施形態では、凍結から回復した後、細胞は、少なくとも約75%の解凍後生存率を有する。いくつかの実施形態では、凍結から回復した後、細胞は、少なくとも約70%の解凍後生存率を有する。いくつかの実施形態では、凍結から回復した後、細胞は、少なくとも約65%の解凍後生存率を有する。いくつかの実施形態では、凍結から回復した後、細胞は、少なくとも約60%の解凍後生存率を有する。いくつかの実施形態では、凍結から回復した後、細胞は、少なくとも約55%の解凍後生存率を有する。いくつかの実施形態では、凍結から回復した後、細胞は、少なくとも約50%の解凍後生存率を有する。いくつかの実施形態では、凍結から回復した後、細胞は、少なくとも約45%の解凍後生存率を有する。いくつかの実施形態では、凍結から回復した後、細胞は、少なくとも約40%の解凍後生存率を有する。いくつかの実施形態では、凍結から回復した後、細胞は、少なくとも約35%の解凍後生存率を有する。いくつかの実施形態では、凍結から回復した後、細胞は、少なくとも約30%の解凍後生存率を有する。いくつかの実施形態では、凍結から回復した後、細胞は、少なくとも約25%の解凍後生存率を有する。いくつかの実施形態では、凍結から回復した後、細胞は、少なくとも約20%の解凍後生存率を有する。本開示を考慮して、当該技術分野で既知の解凍後生存率を測定または決定するための任意の好適な方法が、本明細書に記載の方法において使用され得る。
いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、例えば、RPMI1640、2mM GlutaMAX、10mg/mLゲンタマイシン、30U/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼであるが、これらに限定されない酵素培地中で腫瘍をインキュベートすること、続いて、機械的解離(GentleMACS,Miltenyi Biotec,Auburn,CA)によって生成される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはタイプのコラゲナーゼを含む)、Accutase(商標)、Accumax(商標)、ヒアルロニダーゼ、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)、キモトリプシン、キモパパイン、トリプシン、カゼイナーゼ、エラスターゼ、パパイン、プロテアーゼタイプXIV(プロナーゼ)、デオキシリボヌクレアーゼI(DNase)、トリプシン阻害剤、任意の他の解離酵素またはタンパク質分解酵素、及びこれらの任意の組み合わせ等の1つ以上の解離(消化)酵素を含むが、これらに限定されない腫瘍解離酵素混合物の中に配置される。他の実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはタイプのコラゲナーゼを含む)、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)及びデオキシリボヌクレアーゼI(DNase)を含む腫瘍解離酵素混合物中に配置される。
IV.遺伝子編集プロセス
A.概要:TIL拡張+遺伝子編集
本発明のいくつかの実施形態では、TIL集団を拡張するための方法に関し、本方法は、それらの治療効果を増強するために、TILの少なくとも一部を遺伝子編集する1つ以上のステップを含む。本明細書で使用される場合、「遺伝子編集」、「遺伝子編集」、及び「ゲノム編集」は、DNAが細胞のゲノム内で永続的に修飾され、例えば、DNAが細胞のゲノム内で挿入、欠失、修飾、または置換される遺伝子修飾のタイプを指す。いくつかの実施形態では、遺伝子編集は、DNA配列の発現をサイレンシング(遺伝子ノックアウトと称されることもある)または阻害/低減(遺伝子ノックダウンと称されることもある)させる。他の実施形態では、遺伝子編集は、DNA配列の発現を増強させる(例えば、過剰発現を引き起こすことによって)。本発明の実施形態によれば、遺伝子編集技術は、TILの治療的集団の有効性を増強するために使用される。本発明の例示的な遺伝子編集プロセス/方法、ならびに遺伝子編集されたTIL産物はまた、国際特許出願第PCT/US22/14425号、米国仮出願第63/304,498号及び同第63/242,373号に見出され得、これらはすべて、関連するすべての目的のために参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態に従って実行することができ(例えば、プロセス2Aとして知られる例示的なTIL拡張法を以下に記載する)、この方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。さらなる実施形態によれば、TILを治療的集団のTILに拡張するための方法は、米国特許第10,517,894号、米国特許出願公開第2020/0121719A1号、または米国特許第10,894,063号(これらは参照によりそれら全体が本明細書に組み込まれる)に記載されている方法のうちのいずれかの実施形態に従って実行され、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。したがって、本発明のいくつかの実施形態は、本明細書に記載される任意の実施形態に従って拡張された治療的TIL集団を提供し、治療的集団の少なくとも一部は遺伝子編集されており、例えば、注入バッグに移される治療的TIL集団の少なくとも一部は、永続的に遺伝子編集される。
TIL集団を拡張するための方法を対象とする本発明のいくつかの実施形態では、方法は、(i)培養物中で拡張するときのサイトカインへの依存性の低減及び/または(ii)治療効果の増強を伴って、修飾されたTILを生成するために、免疫調節タンパク質、例えば、膜アンカーに融合した免疫調節タンパク質を含む免疫調節融合タンパク質の一過性発現のために、TIL核酸、例えば、mRNAの少なくとも一部に導入する1つ以上のステップを含む。本明細書で使用される場合、「一過性遺伝子編集」、「一過性遺伝子編集」、「一過性表現型改変」、「一過性表現型修飾」、「一過性表現型改変」、「一時的表現型修飾」、「一過性細胞変化」、「一過性細胞修飾」、「一時的細胞改変」、「一時的細胞修飾」、「一過性発現」、「発現の一過性改変」、「タンパク質発現の一過性改変」、「一過性修飾」、「一時的表現型改変」、「非永続的表現型改変」、「一過的に修飾された」、「一時的に修飾された」、「非永続的に修飾された」、「一過的に改変された」、「一時的に改変された」、前述のうちのいずれかの文法的変形、及び同様の意味を有する任意の発現は、細胞表面上の膜アンカー免疫調節融合タンパク質の一過的表示などの、細胞における一過性または非永続的表現型変化をもたらすために、核酸(例えば、mRNA)が細胞内に導入される(例えば、エレクトロポレーションによる細胞への核酸の移入、リン酸カルシウムトランスフェクション、ウイルス形質導入など)、及び細胞において発現される(例えば、膜アンカーに融合された免疫調節タンパク質を含む免疫調節融合タンパク質などの免疫調節タンパク質の発現)細胞修飾または表現型変化のタイプを指す。本発明の実施形態によれば、一過性表現型改変技術は、培養物中のTILの拡張におけるサイトカインへの依存を低減する、及び/または治療的TIL集団の有効性を高めるために使用される。
いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、本明細書に提供される免疫調節融合タンパク質をコードする核酸の細胞内送達のために使用される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。SQZプラットフォームは、T細胞を含む様々な一次ヒト細胞に核酸及びタンパク質を送達することができる(Sharei et al.PNAS 2013、ならびにSharei et al.PLOS ONE 2015及びGreisbeck et al.J.Immunology vol.195,2015)。SQZプラットフォームでは、修飾のための細胞(例えば、TIL)の細胞膜は、マイクロ流体収縮によって一時的に破壊され、それによって、免疫調節融合タンパク質をコードする核酸を細胞内に送達することを可能にする。国際特許出願公開第WO2013/059343A1号、同第WO2017/008063A1号、または同第WO2017/123663A1号、または米国特許出願公開第2014/0287509A1号、同第2018/0201889A1号、または同第2018/0245089A1号(参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる)に記載のそうような方法は、対象の免疫調節融合タンパク質をコードする核酸をTIL集団に送達するために本発明とともに用いられ得る。いくつかの実施形態では、送達された核酸は、修飾されたTILにおける免疫調節融合タンパク質の一過性のタンパク質発現を可能にする。いくつかの実施形態では、SQZプラットフォームは、免疫調節融合タンパク質をコードする送達核酸をTIL細胞ゲノムに安定的に組み込むために使用される。SQZプラットフォーム及びその使用に関する追加の例示的な開示は、国際特許出願公開第WO/2019/136456号に見出され得、これはすべての目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
B.TIL拡張中の遺伝子編集/一過性表現型改変のタイミング
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2及び任意選択でOKT-3(例えば、OKT-3は拡張プロセスの開始日に開始して細胞培地中に存在し得る)を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(e)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(f)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(g)ステップ(f)の注入バッグへの移行前の方法中の任意の時点で、TIL細胞の少なくとも一部を遺伝子編集して、TIL細胞の表面上に免疫調節剤(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)を含む免疫調節組成物を発現させることと、を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
上記の実施形態のステップ(g)に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、ステップ(f)における注入バッグへの移送前のTIL拡張方法中の任意の時点で実行されてもよく、これは、遺伝子編集が、拡張方法のステップのうちのいずれかの前、最中、または後に、例えば、上記の方法で概説されたステップ(a)~(f)のうちのいずれかの間、または上記の方法で概説されたステップ(a)~(e)のうちのいずれかの前もしくは後に、TIL上で実行されてもよいことを意味する。ある特定の実施形態によれば、TILは、拡張方法中に収集され(例えば、拡張方法は、TILの少なくとも一部について「一時停止」され)、収集されたTILは、遺伝子編集プロセスに供され、場合によっては、その後、拡張プロセスを継続するために拡張方法に戻され(例えば、培地に戻され)、それにより最終的に注入バッグに移される治療的TIL集団の少なくとも一部が永続的に遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TILを活性化し、活性化されたTILに対して遺伝子編集ステップを行い、本明細書に記載のプロセスに従って遺伝子編集TILを拡張することによって、拡張の前に実行されてもよい。いくつかの実施形態では、遺伝子編集のための核酸は、マイクロ流体プラットフォームを使用してTILに送達される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、第1のTIL拡張ステップの後に実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、第1のTIL拡張ステップの後及び第2の拡張ステップの前に実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TILが活性化された後に実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、第1の拡張ステップの後、及びTILが活性化された後、しかし第2の拡張ステップの前に実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、第1の拡張ステップの後及びTILが活性化された後に実行され、TILは、遺伝子編集の後及び第2の拡張ステップの前に静置される。いくつかの実施形態では、TILは、遺伝子編集後、及び第2の拡張ステップの前に、約1~2日間静置される。いくつかの実施形態では、TILは、抗CD3アゴニスト及び抗CD28アゴニストへの曝露によって活性化される。いくつかの実施形態では、抗CD3アゴニストは、抗CD3アゴニスト抗体であり、抗CD28アゴニストは、抗CD28アゴニスト抗体である。いくつかの実施形態では、抗CD3抗体は、OKT-3である。いくつかの実施形態では、TILは、抗CD3アゴニスト抗体及び抗CD28アゴニスト抗体コンジュゲートビーズへの曝露によって活性化される。いくつかの実施形態では、抗CD3アゴニスト抗体及び抗CD28アゴニスト抗体コンジュゲートビーズは、MiltenyiのTransAct(商標)生成物である。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、ウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、レトロウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、レンチウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー免疫調節融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、免疫調節融合タンパク質は、IL-15を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節融合タンパク質は、IL-21を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、2つ以上の異なる膜結合融合タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、IL-15を含む第1の免疫調節タンパク質及びIL-21を含む第2の免疫調節融合タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で免疫調節組成物を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-15を含む免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-21を含む免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-15を含む第1の免疫調節融合タンパク質及びIL-21を含む第2の免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、ウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、レトロウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、レンチウイルス形質導入によって実行される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2及び任意選択でOKT-3(例えば、OKT-3は拡張プロセスの開始日に開始して細胞培地中に存在し得る)を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団におけるTIL細胞の少なくとも一部を遺伝子編集して、TIL細胞の表面上に免疫調節剤(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)を含む免疫調節組成物を発現させることと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(f)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(g)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TILは、遺伝子編集ステップ後及び第2の拡張ステップ前に静置される。いくつかの実施形態では、TILは、遺伝子編集後、及び第2の拡張ステップの前に、約1~2日間静置される。いくつかの実施形態では、TILは、抗CD3アゴニスト及び抗CD28アゴニストへの曝露によって活性化される。いくつかの実施形態では、抗CD3アゴニストは、抗CD3アゴニスト抗体であり、抗CD28アゴニストは、抗CD28アゴニスト抗体である。いくつかの実施形態では、抗CD3抗体は、OKT-3である。いくつかの実施形態では、TILは、抗CD3アゴニスト抗体及び抗CD28アゴニスト抗体コンジュゲートビーズへの曝露によって活性化される。いくつかの実施形態では、抗CD3アゴニスト抗体及び抗CD28アゴニスト抗体コンジュゲートビーズは、MiltenyiのTransAct(商標)生成物である。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、ウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、任意選択で約2日間、TILのレトロウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、任意選択で約2日間、TILのレンチウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー免疫調節融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、免疫調節融合タンパク質は、IL-15を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節融合タンパク質は、IL-21を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、2つ以上の異なる膜結合融合タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、IL-15を含む第1の免疫調節タンパク質及びIL-21を含む第2の免疫調節融合タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で免疫調節組成物を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-15を含む免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-21を含む免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-15を含む第1の免疫調節融合タンパク質及びIL-21を含む第2の免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。
拡張プロセスの代替実施形態は、上記に示される方法とは異なり得ることに留意されたく、例えば、代替実施形態は、同じステップ(a)~(g)を有し得ないか、または異なる数のステップを有し得る。特定の実施形態にかかわらず、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行されてもよい。例えば、代替実施形態は、2つを超える拡張を含み得、第3または第4の拡張中にTILに対して遺伝子編集が実施され得ることなどが可能である。
他の実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2及び任意選択でOKT-3(例えば、OKT-3は拡張プロセスの開始日に開始して細胞培地中に存在し得る)を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(e)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(f)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(g)ステップ(f)における注入バッグへの移行前の方法中の任意の時点で、TIL細胞の少なくとも一部に一過性表現型改変を導入して、TIL細胞の表面上に免疫調節剤(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)を含む免疫調節組成物を発現させることと、を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、一過性表現型改変のための核酸は、マイクロ流体プラットフォームを使用してTILに送達される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
上記の実施形態のステップ(g)に記載されるように、一過性表現型改変プロセスは、ステップ(f)における注入バッグへの移送前のTIL拡張方法中の任意の時点で実行されてもよく、これは、一過性表現型改変が、拡張方法のステップのうちのいずれかの前、最中、または後に、例えば、上記の方法で概説されたステップ(a)~(f)のうちのいずれかの間、または上記の方法で概説されたステップ(a)~(e)のうちのいずれかの前もしくは後に、TIL上で実行されてもよいことを意味する。ある特定の実施形態によれば、TILは、拡張方法中に収集され(例えば、拡張方法は、TILの少なくとも一部について「一時停止」され)、収集されたTILは、一過性修飾プロセスに供され、場合によっては、その後、拡張プロセスを継続するために拡張方法に戻され(例えば、培地に戻され)、それにより最終的に注入バッグに移される治療的TIL集団の少なくとも一部が、一過的に改変されて、TIL細胞の表面上に免疫調節組成物を発現する。いくつかの実施形態では、一過性細胞修飾プロセスは、TILを活性化し、活性化されたTILに対して一過性表現型改変ステップを行い、本明細書に記載のプロセスに従って修飾されたTILを拡張することによって、拡張の前に実行されてもよい。
拡張プロセスの代替実施形態は、上記に示される方法とは異なり得ることに留意されたく、例えば、代替実施形態は、同じステップ(a)~(g)を有し得ないか、または異なる数のステップを有し得る。特定の実施形態にかかわらず、一過性細胞修飾プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行されてもよい。例えば、代替実施形態は、2つを超える拡張を含み得、第3または第4の拡張中にTILに対して一過性細胞修飾が実施され得ることなどが可能である。
いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集プロセスは、第1の集団、第2の集団、及び第3の集団のうちの1つ以上からのTIL上で実行される。例えば、遺伝子編集は、第1のTIL集団上で、または第1の集団から収集されたTILの一部上で実行されてもよく、遺伝子編集プロセスに続いて、それらのTILをその後、拡張プロセスに戻してもよい(例えば、培養培地に戻してもよい)。代替的に、遺伝子編集は、第2もしくは第3の集団からのTIL上で、または第2もしくは第3の集団から収集されたTILの一部上で実行されてもよく、遺伝子編集プロセスに続いて、それらのTILをその後、拡張プロセスに戻してもよい(例えば、培養培地に戻してもよい)。他の実施形態によれば、遺伝子編集は、TILがまだ培養培地中にある間、及び拡張が実行されている間に行われ、すなわち、遺伝子編集を実施するために必ずしも拡張から「除去」されるわけではない。
いくつかの実施形態によれば、一過性細胞修飾プロセスは、第1の集団、第2の集団、及び第3の集団のうちの1つ以上からのTIL上で実行される。例えば、一過性細胞修飾は、第1のTIL集団上で、または第1の集団から収集されたTILの一部上で実行されてもよく、遺伝子編集プロセスに続いて、それらの一過的に修飾されたTILをその後、拡張プロセスに戻してもよい(例えば、培養培地に戻してもよい)。代替的に、一過性細胞修飾は、第2もしくは第3の集団からのTIL上で、または第2もしくは第3の集団から収集されたTILの一部上で実行されてもよく、遺伝子編集プロセスに続いて、それらの修飾されたTILをその後、拡張プロセスに戻してもよい(例えば、培養培地に戻してもよい)。他の実施形態によれば、一過性細胞修飾は、TILがまだ培養培地中にある間、及び拡張が実行されている間に行われ、すなわち、一過性細胞修飾を実施するために必ずしも拡張から「除去」されるわけではない。
他の実施形態によれば、遺伝子編集プロセスは、第1の拡張からのTIL、または第2の拡張からのTIL、またはその両方で実行される。例えば、第1の拡張または第2の拡張中に、遺伝子編集は、培養培地から収集されたTIL上で実行され得、遺伝子編集プロセスの後、それらのTILは、その後、例えば、それらを培養培地に再導入することによって、拡張方法に戻され得る。
他の実施形態によれば、一過性細胞修飾プロセスは、第1の拡張からのTIL、または第2の拡張からのTIL、またはその両方で実行される。例えば、第1の拡張または第2の拡張中に、一過性細胞修飾は、培養培地から収集されたTIL上で実行され得、一過性細胞修飾プロセスの後、それらの修飾されたTILは、その後、例えば、それらを培養培地に再導入することによって、拡張方法に戻され得る。
他の実施形態によれば、遺伝子編集プロセスは、第1の拡張後及び第2の拡張前にTILの少なくとも一部上で実行される。例えば、第1の拡張後に、遺伝子編集は、培養培地から収集されたTIL上で実行され得、遺伝子編集プロセスの後、それらのTILは、その後、例えば、それらを第2の拡張のための培養培地に再導入することによって、拡張方法に戻され得る。
他の実施形態によれば、一過性細胞修飾プロセスは、第1の拡張後及び第2の拡張前にTILの少なくとも一部上で実行される。例えば、第1の拡張後に、一過性細胞修飾は、培養培地から収集されたTIL上で実行され得、一過性細胞修飾プロセスの後、それらの修飾されたTILは、その後、例えば、それらを第2の拡張のための培養培地に再導入することによって、拡張方法に戻され得る。
代替実施形態によれば、遺伝子編集プロセスは、ステップ(c)の前(例えば、ステップ(a)~(b)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)、ステップ(d)の前(例えば、ステップ(a)~(c)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)、ステップ(e)の前(例えば、ステップ(a)~(d)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)、またはステップ(f)の前(例えば、ステップ(a)~(e)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)に実行される。
代替実施形態によれば、一過性細胞修飾プロセスは、ステップ(c)の前(例えば、ステップ(a)~(b)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)、ステップ(d)の前(例えば、ステップ(a)~(c)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)、ステップ(e)の前(例えば、ステップ(a)~(d)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)、またはステップ(f)の前(例えば、ステップ(a)~(e)のうちのいずれかの前、最中、もしくは後)に実行される。
OKT-3に関しては、ある特定の実施形態によれば、細胞培養培地は、開始日(0日目)、または第1の拡張の1日目に開始するOKT-3を含んでもよく、その結果、遺伝子編集または一過性細胞修飾は、0日目及び/または1日目に細胞培養培地中でOKT-3に曝露した後にTIL上で実行される。他の実施形態によれば、細胞培養培地は、第1の拡張中及び/または第2の拡張中にOKT-3を含み、OKT-3が細胞培養培地に導入される前に、遺伝子編集または一過性細胞修飾が実行される。代替的に、細胞培養培地は、第1の拡張中及び/または第2の拡張中にOKT-3を含み、OKT-3が細胞培養培地中に導入された後に、遺伝子編集または一過性細胞修飾が実行される。
4-1BBアゴニストに関しては、ある特定の実施形態によれば、細胞培養培地は、開始日(0日目)、または第1の拡張の1日目に開始する4-1BBを含んでもよく、その結果、遺伝子編集または一過性細胞修飾は、0日目及び/または1日目に細胞培養培地中で4-1BBに曝露した後にTIL上で実行されることも留意されたい。他の実施形態によれば、細胞培養培地は、第1の拡張中及び/または第2の拡張中に4-1BBを含み、4-1BBアゴニストが細胞培養培地に導入される前に、遺伝子編集または一過性細胞修飾が実行される。代替的に、細胞培養培地は、第1の拡張中及び/または第2の拡張中に4-1BBアゴニストを含み、4-1BBアゴニストが細胞培養培地中に導入された後に、遺伝子編集または一過性細胞修飾が実行される。
IL-2に関しては、ある特定の実施形態によれば、細胞培養培地は、開始日(0日目)、または第1の拡張の1日目に開始するIL-2を含んでもよく、その結果、遺伝子編集または一過性細胞修飾は、0日目及び/または1日目に細胞培養培地中でIL-2に曝露した後にTIL上で実行されることも留意されたい。他の実施形態によれば、細胞培養培地は、第1の拡張中及び/または第2の拡張中にIL-2を含み、IL-2が細胞培養培地に導入される前に、遺伝子編集または一過性細胞修飾が実行される。代替的に、細胞培養培地は、第1の拡張中及び/または第2の拡張中にIL-2を含み、IL-2が細胞培養培地中に導入された後に、遺伝子編集または一過性細胞修飾が実行される。
上述のように、OKT-3、4-1BBアゴニスト及びIL-2のうちの1つ以上は、第1の拡張の0日目または1日目に開始する細胞培地中に含まれてもよい。いくつかの実施形態によれば、OKT-3は、第1の拡張の0日目または1日目に開始する細胞培地中に含まれ、及び/または4-1BBアゴニストは、第1の拡張の0日目または1日目に開始する細胞培地中に含まれ、及び/またはIL-2は、第1の拡張の0日目または1日目に開始する細胞培地中に含まれる。他の実施例によれば、細胞培養培地は、第1の拡張の0日目または1日目に開始するOKT-3及び4-1BBアゴニストを含む。他の実施例によれば、細胞培養培地は、第1の拡張の0日目または1日目に開始するOKT-3、4-1BBアゴニスト、及びIL-2を含む。当然のことながら、本明細書に記載の様々な実施形態に記載されるように、OKT-3、4-1BBアゴニスト及びIL-2のうちの1つ以上を、拡張プロセス中の1つ以上の追加の時点で細胞培地に添加してもよい。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる、第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~2日間培養することによって、第2のTIL集団を活性化することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、活性化することと、
(e)第2のTIL集団におけるTIL細胞の少なくとも一部を遺伝子編集して、TIL細胞の表面上に免疫調節剤(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)を含む免疫調節組成物を発現させることと、
(f)任意選択で、第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TILは、遺伝子編集ステップ後及び第2の拡張ステップ前に静置される。いくつかの実施形態では、TILは、遺伝子編集後、及び第2の拡張ステップの前に、約1~2日間静置される。いくつかの実施形態では、TILは、約2日間の抗CD3アゴニスト及び抗CD28アゴニストへの曝露によって活性化される。いくつかの実施形態では、抗CD3アゴニストは、抗CD3アゴニスト抗体であり、抗CD28アゴニストは、抗CD28アゴニスト抗体である。いくつかの実施形態では、抗CD3抗体は、OKT-3である。いくつかの実施形態では、TILは、抗CD3アゴニスト抗体及び抗CD28アゴニスト抗体コンジュゲートビーズへの曝露によって活性化される。いくつかの実施形態では、抗CD3アゴニスト抗体及び抗CD28アゴニスト抗体コンジュゲートビーズは、MiltenyiのTransAct(商標)生成物である。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、ウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、任意選択で約2日間、TILのレトロウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、任意選択で約2日間、TILのレンチウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー免疫調節融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、免疫調節融合タンパク質は、IL-15を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節融合タンパク質は、IL-21を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、2つ以上の異なる膜結合融合タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、IL-15を含む第1の免疫調節タンパク質及びIL-21を含む第2の免疫調節融合タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で免疫調節組成物を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-15を含む免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-21を含む免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-15を含む第1の免疫調節融合タンパク質及びIL-21を含む第2の免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(e)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の細胞の一部に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、を含み、
第2のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの滅菌エレクトロポレーションが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
他の実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(e)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの核酸分子を第2のTIL集団の細胞の一部に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、を含み、
第2のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの核酸分子の無菌エレクトロポレーションが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(e)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の細胞の一部に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、を含み、
第2のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの滅菌エレクトロポレーションが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(e)第2のTIL集団の細胞膜を一過的に破壊して、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の細胞の一部に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、を含み、
第2のTIL集団の細胞の一部に送達される少なくとも1つの遺伝子エディターが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
他の実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(e)第2のTIL集団の細胞膜を一過的に破壊して、少なくとも1つの核酸分子を第2のTIL集団の細胞の一部に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、を含み、
第2のTIL集団の細胞の一部に送達される少なくとも1つの核酸分子が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(e)第2のTIL集団の細胞膜を一過的に破壊して、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の細胞の一部に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、を含み、
第2のTIL集団の細胞の一部に送達される少なくとも1つの遺伝子エディターが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの滅菌エレクトロポレーションが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団におけるTIL細胞の少なくとも一部を遺伝子編集して、TIL細胞の表面上に免疫調節剤(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)を含む免疫調節組成物を発現させることと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TILは、遺伝子編集ステップ後及び第2の拡張ステップ前に静置される。いくつかの実施形態では、TILは、遺伝子編集後、及び第2の拡張ステップの前に、約1~2日間静置される。いくつかの実施形態では、TILは、約2日間の抗CD3アゴニスト及び抗CD28アゴニストへの曝露によって活性化される。いくつかの実施形態では、抗CD3アゴニストは、抗CD3アゴニスト抗体であり、抗CD28アゴニストは、抗CD28アゴニスト抗体である。いくつかの実施形態では、抗CD3抗体は、OKT-3である。いくつかの実施形態では、TILは、抗CD3アゴニスト抗体及び抗CD28アゴニスト抗体コンジュゲートビーズへの曝露によって活性化される。いくつかの実施形態では、抗CD3アゴニスト抗体及び抗CD28アゴニスト抗体コンジュゲートビーズは、MiltenyiのTransAct(商標)生成物である。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、ウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、任意選択で約2日間、TILのレトロウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、任意選択で約2日間、TILのレンチウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー免疫調節融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、免疫調節融合タンパク質は、IL-15を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節融合タンパク質は、IL-21を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、2つ以上の異なる膜結合融合タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、IL-15を含む第1の免疫調節タンパク質及びIL-21を含む第2の免疫調節融合タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で免疫調節組成物を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-15を含む免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-21を含む免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-15を含む第1の免疫調節融合タンパク質及びIL-21を含む第2の免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの核酸分子を第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部に送達される少なくとも1つの核酸分子が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第2のTIL集団におけるTIL細胞の少なくとも一部を遺伝子編集して、TIL細胞の表面上に免疫調節剤(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)を含む免疫調節組成物を発現させることと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TILは、遺伝子編集ステップ後及び第2の拡張ステップ前に静置される。いくつかの実施形態では、TILは、遺伝子編集後、及び第2の拡張ステップの前に、約1~2日間静置される。いくつかの実施形態では、TILは、約2日間の抗CD3アゴニスト及び抗CD28アゴニストへの曝露によって活性化される。いくつかの実施形態では、抗CD3アゴニストは、抗CD3アゴニスト抗体であり、抗CD28アゴニストは、抗CD28アゴニスト抗体である。いくつかの実施形態では、抗CD3抗体は、OKT-3である。いくつかの実施形態では、TILは、抗CD3アゴニスト抗体及び抗CD28アゴニスト抗体コンジュゲートビーズへの曝露によって活性化される。いくつかの実施形態では、抗CD3アゴニスト抗体及び抗CD28アゴニスト抗体コンジュゲートビーズは、MiltenyiのTransAct(商標)生成物である。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、ウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、任意選択で約2日間、TILのレトロウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、任意選択で約2日間、TILのレンチウイルス形質導入によって実行される。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー免疫調節融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、免疫調節融合タンパク質は、IL-15を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節融合タンパク質は、IL-21を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、2つ以上の異なる膜結合融合タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、IL-15を含む第1の免疫調節タンパク質及びIL-21を含む第2の免疫調節融合タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で免疫調節組成物を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-15を含む免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-21を含む免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。いくつかの実施形態では、TILは、NFATプロモーターの制御下で、IL-15を含む第1の免疫調節融合タンパク質及びIL-21を含む第2の免疫調節融合タンパク質を発現するように遺伝子編集される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの滅菌エレクトロポレーションが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの核酸分子を第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部に送達される少なくとも1つの核酸分子が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊して、少なくとも1つの遺伝子エディターを第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの遺伝子エディターの移入が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊して、少なくとも1つの核酸分子を第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの核酸分子の移入が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊して、少なくとも1つの遺伝子エディターを第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの遺伝子エディターの移入が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊して、少なくとも1つの核酸分子を第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの核酸分子の移入が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、前述の方法のうちのいずれかは、第4のTIL集団を培養するステップが、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約1~7日間培養して、第5のTIL集団の培養物を産生するステップと、
(g)第5のTIL集団の培養物を複数のサブ培養物に分割し、複数のサブ培養物の各々を、IL-2を含む第3の細胞培養培地中で約3~7日間培養し、複数のサブ培養物を組み合わせて、増加した数のTILを提供するステップとで置き換えられるように修正される。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団を活性化するステップが約1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第7のTIL集団を活性化するステップが約2~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第7のTIL集団を活性化するステップが約3~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第7のTIL集団を活性化するステップが約4~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第7のTIL集団を活性化するステップが約5~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第7のTIL集団を活性化するステップが約6~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第6のTIL集団を活性化するステップが約1~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第5のTIL集団を活性化するステップが約1~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第4のTIL集団を活性化するステップが約1~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3のTIL集団を活性化するステップが約1~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団を活性化するステップが約1~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第6のTIL集団を活性化するステップが約2~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第6のTIL集団を活性化するステップが約3~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第6のTIL集団を活性化するステップが約4~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第6のTIL集団を活性化するステップが約5~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第5のTIL集団を活性化するステップが約3~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第4のTIL集団を活性化するステップが約3~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第5のTIL集団を活性化するステップが約2~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第4のTIL集団を活性化するステップが約2~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3のTIL集団を活性化するステップが約2~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第5のTIL集団を活性化するステップが約4~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団を活性化するステップが約1日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団を活性化するステップが約2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団を活性化するステップが約3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団を活性化するステップが約4日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団を活性化するステップが約5日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団を活性化するステップが約6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団を活性化するステップが約7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第3のTIL集団を産生することと、
(d)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの滅菌エレクトロポレーションが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの核酸分子を第2のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第3のTIL集団を産生することと、
(d)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの核酸分子の無菌エレクトロポレーションが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第3のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第2のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの滅菌エレクトロポレーションが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、及びIL-21からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの核酸分子を第2のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第3のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第2のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの核酸分子の無菌エレクトロポレーションが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊して、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第3のTIL集団を産生することと、
(d)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第2のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの遺伝子エディターの移入が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊して、少なくとも1つの核酸分子を第2のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第3のTIL集団を産生することと、
(d)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第2のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの遺伝子エディターの移入が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊して、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第3のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第2のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの遺伝子エディターの移入が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊して、少なくとも1つの核酸分子を第2のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第3のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第2のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの核酸分子の移入が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、第3のTIL集団を第2の細胞培養培地中で約1~7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物が複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々が、IL-2を含む第3の培養培地中で約3~7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物が組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日または11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約4~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約5~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約6~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約7~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約8~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約9~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約10~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約4~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約5~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約6~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約7~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約8~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約9~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約4~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約5~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約6~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約7~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約8~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約3~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約3~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約3~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約3~5日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約3~4日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約4~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約4~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約4~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約4~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約5~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約5~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約5~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約6~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約6~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約7~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約4~5日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約4日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約5日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を第1の細胞培養培地中で培養するステップが、約11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第3の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの滅菌エレクトロポレーションが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの核酸分子を第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第3の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの核酸分子の無菌エレクトロポレーションが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第3の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの滅菌エレクトロポレーションが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの核酸分子を第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第3の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの核酸分子の無菌エレクトロポレーションが、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊して、少なくとも1つの遺伝子エディターを第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第3の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの遺伝子エディターの移入が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊して、少なくとも1つの核酸分子を第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第3の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの核酸分子の移入が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊して、少なくとも1つの遺伝子エディターを第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第3の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの遺伝子エディターの移入が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊して、少なくとも1つの核酸分子を第3のTIL集団の細胞の一部に移入させ、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第3の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含み、
第3のTIL集団の細胞の一部への少なくとも1つの核酸分子の移入が、その一部における複数の細胞を修飾して、細胞の表面上に免疫調節組成物を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第2のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第3の細胞培養培地中で約1~7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物が複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々が、IL-2を含む第4の培養培地中で約3~7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物が組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を第1の培養培地中で培養するステップにおいて、第1の培養培地は、抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体をさらに含む。
いくつかの実施形態では、抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体は、第1の培養培地中にOKT-3を含む。
いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を第2の培養培地中で培養するステップにおいて、第2の培養培地は、抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体をさらに含む。
いくつかの実施形態では、抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体は、第2の培養培地中にOKT-3を含む。
いくつかの実施形態によれば、前述の方法は、凍結保存培地を使用して採取されたTIL集団を凍結保存することをさらに含む。いくつかの実施形態では、凍結保存培地はジメチルスルホキシド系凍結保存培地である。他の実施形態では、凍結保存培地は、CS10である。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団を第2の培養培地中で培養するステップが約2~3日間行われるように、該当する場合に修正された、上記の任意の前段落に記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団を第2の培養培地中で培養するステップが約3~4日間行われるように、該当する場合に修正された、上記の任意の前段落に記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団を第2の培養培地中で培養するステップが約2日間行われるように、該当する場合に修正された、上記の任意の前段落に記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団を第2の培養培地中で培養するステップが約3日間行われるように、該当する場合に修正された、上記の任意の前段落に記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団を第2の細胞培養培地中で培養するステップが、約4日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、該当する場合に第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、または15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約6~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約7~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約8~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約9~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約10~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約11~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約12~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約13~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約14~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約5~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約6~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約7~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約8~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約9~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約10~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約11~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約12~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約13~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約5~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約5~12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約5~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約5~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約5~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約5~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約5~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約5~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約6~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約6~12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約6~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約6~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約6~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約6~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約6~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約7~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約7~12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約7~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約7~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約7~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約7~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約8~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約8~12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約8~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約8~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約8~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約9~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約9~12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約9~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約9~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約10~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約10~12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約10~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約11~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約11~12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約12~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約5日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を第2または第3の細胞培養培地中で培養するステップが、約15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態によれば、前述の方法のうちのいずれかを使用して、がんを有するヒト対象の治療のために自己採取されたTIL集団を提供することができる。
C.PD-1 TALENノックダウン
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約1~7日間培養して、第5のTIL集団の培養物を産生することと、
(f)第5のTIL集団の培養物を複数のサブ培養物に分割し、複数のサブ培養物の各々を、IL-2を含む第3の細胞培養培地中で約3~7日間培養し、複数のサブ培養物を組み合わせて、増加した数のTILを提供することと、を含む。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約1~7日間培養して、第5のTIL集団の培養物を産生するステップと、
(g)第5のTIL集団の培養物を複数のサブ培養物に分割し、複数のサブ培養物の各々を、IL-2を含む第3の細胞培養培地中で約3~7日間培養し、複数のサブ培養物を組み合わせて、増加した数のTILを提供するステップとで置き換えられるように修正される。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約3~9日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約3~9日、約3~8日、約4~8日、約5~8日、約6~8日、約7~8日、約3~7日、約4~7日、約5~7日、約6~7日、約3~6日、約4~6日、約5~6日、約3~5日、約4~5日、約3~4日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約3日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約4日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約7日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約8日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約9日間行われる。
いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約1~7日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約1~7日、約1~6日、約2~6日、約3~6日、約4~6日、約5~6日、約1~5日、約2~5日、約3~5日、約4~5日、約1~4日、約2~4日、約3~4日、約1~3日、約2~3日、約1~2日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約1日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約2日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約3日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約4日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約7日間行われる。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約5~15日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約5~15日、約6~15日、約7~15日、約8~15日、約9~15日、約10~15日、約11~15日、約12~15日、約13~15日、約14~15日、約5~14日、約6~14日、約7~14日、約8~14日、約9~14日、約10~14日、約11~14日、約12~14日、約13~14日、約5~13日、約6~13日、約7~13日、約8~13日、約9~13日、約10~13日、約11~13日、約12~13日、約5~12日、約6~12日、約7~12日、約8~12日、約9~12日、約10~12日、約11~12日、約5~11日、6~11日、7~11日、約8~11日、約9~11日、約10~11日、約5~10日、6~10日、7~10日、約8~10日、約9~10日、約5~9日、6~9日、7~9日、約8~9日、約5~8日、約6~8日、7~8日、約5~7日、約6~7日、約5~6日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約7日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約8日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約9日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約10日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約11日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約12日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約13日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約14日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約15日間行われる。
いくつかの実施形態では、方法のステップは、約22日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約8日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約9日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約10日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約11日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約12日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約13日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約14日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約15日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約16日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約17日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約18日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約19日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約20日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約21日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約22日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約23日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約24日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約25日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約26日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約27日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約28日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約29日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約30日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約31日の期間内に完了する。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行され得、これは、遺伝子編集が、拡張方法のステップのうちのいずれかの前、最中、または後に、例えば、上記の方法で概説されたステップ(a)~(e)、(a)~(f)、もしくは(a)~(g)のうちのいずれかの間、または上記の方法で概説されたステップ(a)~(e)、(a)~(f)、もしくは(a)~(g)のうちのいずれかの前もしくは後に、TIL上で実行され得ることを意味する。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で2回以上実行され得る。ある特定の実施形態によれば、TILは、培養ステップ中に収集され(例えば、培養ステップは、TILの少なくとも一部について「一時停止」され)、収集されたTILは、遺伝子編集プロセスに供され、場合によっては、その後、培養ステップを継続するために培養ステップに戻され(例えば、培地に戻され)、それにより最終的に注入バッグに移される治療的TIL集団の少なくとも一部が永続的に遺伝子編集される。
拡張プロセスの代替実施形態は、上に示される方法とは異なり得ることに留意されたく、例えば、代替実施形態は、同じステップ(a)~(e)、(a)~(f)、もしくは(a)~(g)を有しなくてもよいか、または異なる数のステップを有し得る。特定の実施形態にかかわらず、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行されてもよい。例えば、代替実施形態は、2つを超える培養ステップを含み得、第3または第4の培養ステップ中にTILに対して遺伝子編集が実施され得ることなどが可能である。
いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集は、TILがまだ培養培地中にある間、及び培養ステップが実行されている間に行われ、すなわち、遺伝子編集を実施するために必ずしも培養ステップから「除去」されるわけではない。いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集は、培養培地から収集されたTIL上で実行され、遺伝子編集プロセスの後、それらのTILは、その後、培養培地に戻される。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)第2のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約3~9日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約3~9日、約3~8日、約4~8日、約5~8日、約6~8日、約7~8日、約3~7日、約4~7日、約5~7日、約6~7日、約3~6日、約4~6日、約5~6日、約3~5日、約4~5日、約3~4日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約3日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約4日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップ5日。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約7日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約8日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約9日間行われる。
いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約5~15日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約5~15日、約6~15日、約7~15日、約8~15日、約9~15日、約10~15日、約11~15日、約12~15日、約13~15日、約14~15日、約5~14日、約6~14日、約7~14日、約8~14日、約9~14日、約10~14日、約11~14日、約12~14日、約13~14日、約5~13日、約6~13日、約7~13日、約8~13日、約9~13日、約10~13日、約11~13日、約12~13日、約5~12日、約6~12日、約7~12日、約8~12日、約9~12日、約10~12日、約11~12日、約5~11日、6~11日、7~11日、約8~11日、約9~11日、約10~11日、約5~10日、6~10日、7~10日、約8~10日、約9~10日、約5~9日、6~9日、7~9日、約8~9日、約5~8日、約6~8日、7~8日、約5~7日、約6~7日、約5~6日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約7日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約8日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約9日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約10日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約11日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約12日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約13日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約14日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約15日間行われる。
いくつかの実施形態では、方法のステップは、約22日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約8日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約9日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約10日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約11日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約12日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約13日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約14日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約15日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約16日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約17日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約18日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約19日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約20日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約21日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約22日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約23日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約24日の期間内に完了する。
いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、第3のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、第3のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行され得、これは、遺伝子編集が、拡張方法のステップのうちのいずれかの前、最中、または後に、例えば、上記の方法で概説されたステップ(a)~(d)もしくは(a)~(e)のうちのいずれかの間、または上記の方法で概説されたステップ(a)~(d)もしくは(a)~(e)のうちのいずれかの前もしくは後に、TIL上で実行され得ることを意味する。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で2回以上実行され得る。ある特定の実施形態によれば、TILは、培養ステップ中に収集され(例えば、培養ステップは、TILの少なくとも一部について「一時停止」され)、収集されたTILは、遺伝子編集プロセスに供され、場合によっては、その後、培養ステップを継続するために培養ステップに戻され(例えば、培地に戻され)、それにより最終的に注入バッグに移される治療的TIL集団の少なくとも一部が永続的に遺伝子編集される。
拡張プロセスの代替実施形態は、上に示される方法とは異なり得ることに留意されたく、例えば、代替実施形態は、同じステップ(a)~(d)もしくは(a)~(e)を有しなくてもよいか、または異なる数のステップを有し得る。特定の実施形態にかかわらず、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行されてもよい。例えば、代替実施形態は、2つを超える培養ステップを含み得、第3または第4の培養ステップ中にTILに対して遺伝子編集が実施され得ることなどが可能である。
いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集は、TILがまだ培養培地中にある間、及び培養ステップが実行されている間に行われ、すなわち、遺伝子編集を実施するために必ずしも培養ステップから「除去」されるわけではない。いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集は、培養培地から収集されたTIL上で実行され、遺伝子編集プロセスの後、それらのTILは、その後、培養培地に戻される。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)第2のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約1~7日間培養して、第4のTIL集団の培養物を産生することと、
(e)第4のTIL集団の培養物を複数のサブ培養物に分割し、複数のサブ培養物の各々を、IL-2を含む第3の細胞培養培地中で約3~7日間培養し、複数のサブ培養物を組み合わせて、増加した数のTILを含む第5のTIL集団を提供することと、を含む。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2及びOKT-3を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)第2のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約1~7日間培養して、第4のTIL集団の培養物を産生することと、
(f)第4のTIL集団の培養物を複数のサブ培養物に分割し、複数のサブ培養物の各々を、IL-2を含む第3の細胞培養培地中で約3~7日間培養し、複数のサブ培養物を組み合わせて、増加した数のTILを含む第5のTIL集団を提供することと、を含む。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約3~9日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約3~9日、約3~8日、約4~8日、約5~8日、約6~8日、約7~8日、約3~7日、約4~7日、約5~7日、約6~7日、約3~6日、約4~6日、約5~6日、約3~5日、約4~5日、約3~4日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約3日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約4日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約7日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約8日間行われる。いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を培養するステップは、約9日間行われる。
いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約1~7日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約1~7日、約2~7日、約3~7日、約4~7日、約5~7日、約6~7日、約1~6日、約2~6日、約3~6日、約4~6日、約5~6日、約1~5日、約2~5日、約3~5日、約4~5日、約1~4日、約2~4日、約3~4日、約1~3日、約2~3日、約1~2日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約1日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約2日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約3日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約4日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約7日間行われる。
いくつかの実施形態では、複数のサブ培養物の各々を培養するステップは、約3~6日間行われる。いくつかの実施形態では、複数のサブ培養物の各々を培養するステップは、約3~6日、約4~6日、約5~6日、約3~5日、約4~5日、約3~4日間行われる。いくつかの実施形態では、複数のサブ培養物の各々を培養するステップは、約3日間行われる。いくつかの実施形態では、複数のサブ培養物の各々を培養するステップは、約4日間行われる。いくつかの実施形態では、複数のサブ培養物の各々を培養するステップは、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、複数のサブ培養物の各々を培養するステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、複数のサブ培養物の各々を培養するステップは、約7日間行われる。
いくつかの実施形態では、方法のステップは、約22日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約8日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約9日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約10日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約11日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約12日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約13日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約14日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約15日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約16日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約17日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約18日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約19日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約20日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約21日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約22日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約23日の期間内に完了する。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行され得、これは、遺伝子編集が、拡張方法のステップのうちのいずれかの前、最中、または後に、例えば、上記の方法で概説されたステップ(a)~(e)もしくは(a)~(f)のうちのいずれかの間、または上記の方法で概説されたステップ(a)~(e)もしくは(a)~(f)のうちのいずれかの前もしくは後に、TIL上で実行され得ることを意味する。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で2回以上実行され得る。ある特定の実施形態によれば、TILは、培養ステップ中に収集され(例えば、培養ステップは、TILの少なくとも一部について「一時停止」され)、収集されたTILは、遺伝子編集プロセスに供され、場合によっては、その後、培養ステップを継続するために培養ステップに戻され(例えば、培地に戻され)、それにより最終的に注入バッグに移される治療的TIL集団の少なくとも一部が永続的に遺伝子編集される。
拡張プロセスの代替実施形態は、上に示される方法とは異なり得ることに留意されたく、例えば、代替実施形態は、同じステップ(a)~(e)もしくは(a)~(f)を有しなくてもよいか、または異なる数のステップを有し得る。特定の実施形態にかかわらず、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行されてもよい。例えば、代替実施形態は、2つを超える培養ステップを含み得、第3または第4の培養ステップ中にTILに対して遺伝子編集が実施され得ることなどが可能である。
いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集は、TILがまだ培養培地中にある間、及び培養ステップが実行されている間に行われ、すなわち、遺伝子編集を実施するために必ずしも培養ステップから「除去」されるわけではない。いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集は、培養培地から収集されたTIL上で実行され、遺伝子編集プロセスの後、それらのTILは、その後、培養培地に戻される。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第3の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第3の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を培養するステップは、約2~4日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約2~4日、約3~4日、約2~3日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を培養するステップは、約2日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約2日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約2日間行われる。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約5~15日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約5~15日、約6~15日、約7~15日、約8~15日、約9~15日、約10~15日、約11~15日、約12~15日、約13~15日、約14~15日、約5~14日、約6~14日、約7~14日、約8~14日、約9~14日、約10~14日、約11~14日、約12~14日、約13~14日、約5~13日、約6~13日、約7~13日、約8~13日、約9~13日、約10~13日、約11~13日、約12~13日、約5~12日、約6~12日、約7~12日、約8~12日、約9~12日、約10~12日、約11~12日、約5~11日、6~11日、7~11日、約8~11日、約9~11日、約10~11日、約5~10日、6~10日、7~10日、約8~10日、約9~10日、約5~9日、6~9日、7~9日、約8~9日、約5~8日、約6~8日、7~8日、約5~7日、約6~7日、約5~6日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約7日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約8日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約9日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約10日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約11日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約12日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約13日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約14日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約15日間行われる。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、方法のステップは、約22日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約8日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約9日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約10日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約11日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約12日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約13日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約14日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約15日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約16日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約17日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約18日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約19日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約20日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約21日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約22日の期間内に完了する。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行され得、これは、遺伝子編集が、拡張方法のステップのうちのいずれかの前、最中、または後に、例えば、上記の方法で概説されたステップ(a)~(f)もしくは(a)~(g)のうちのいずれかの間、または上記の方法で概説されたステップ(a)~(f)もしくは(a)~(g)のうちのいずれかの前もしくは後に、TIL上で実行され得ることを意味する。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で2回以上実行され得る。ある特定の実施形態によれば、TILは、培養ステップ中に収集され(例えば、培養ステップは、TILの少なくとも一部について「一時停止」され)、収集されたTILは、遺伝子編集プロセスに供され、場合によっては、その後、培養ステップを継続するために培養ステップに戻され(例えば、培地に戻され)、それにより最終的に注入バッグに移される治療的TIL集団の少なくとも一部が永続的に遺伝子編集される。
拡張プロセスの代替実施形態は、上に示される方法とは異なり得ることに留意されたく、例えば、代替実施形態は、同じステップ(a)~(f)もしくは(a)~(g)を有しなくてもよいか、または異なる数のステップを有し得る。特定の実施形態にかかわらず、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行されてもよい。例えば、代替実施形態は、2つを超える培養ステップを含み得、第3または第4の培養ステップ中にTILに対して遺伝子編集が実施され得ることなどが可能である。
いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集は、TILがまだ培養培地中にある間、及び培養ステップが実行されている間に行われ、すなわち、遺伝子編集を実施するために必ずしも培養ステップから「除去」されるわけではない。いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集は、培養培地から収集されたTIL上で実行され、遺伝子編集プロセスの後、それらのTILは、その後、培養培地に戻される。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(e)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団を約1~7日間培養して、第4のTIL集団の培養物を産生することと、
(f)第4のTIL集団の培養物を複数のサブ培養物に分割し、複数のサブ培養物の各々を、IL-2を含む第3の細胞培養培地中で約3~7日間培養し、複数のサブ培養物を組み合わせて、増加した数のTILを含む第5のTIL集団を提供することと、を含む。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)IL-2及びOKT-3を含む第2の細胞培養培地中で第2のTIL集団を2~4日間培養して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約1~7日間培養して、第5のTIL集団の培養物を産生するステップと、
(g)第5のTIL集団の培養物を複数のサブ培養物に分割し、複数のサブ培養物の各々を、IL-2を含む第3の細胞培養培地中で約3~7日間培養し、複数のサブ培養物を組み合わせて、増加した数のTILを含む第5のTIL集団を提供することと、を含む。
いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を培養するステップは、約2~4日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約2~4日、約3~4日、約2~3日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を培養するステップは、約2日間行われる。いくつかの実施形態では、第3のTIL集団を培養するステップは、約2日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約2日間行われる。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約1~7日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約1~7日、約1~6日、約2~6日、約3~6日、約4~6日、約5~6日、約1~5日、約2~5日、約3~5日、約4~5日、約1~4日、約2~4日、約3~4日、約1~3日、約2~3日、約1~2日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約1日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約2日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約3日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約4日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、約7日間行われる。
いくつかの実施形態では、複数のサブ培養物の各々を培養するステップは、約3~6日間行われる。いくつかの実施形態では、複数のサブ培養物の各々を培養するステップは、約3~6日、約4~6日、約5~6日、約3~5日、約4~5日、約3~4日間行われる。いくつかの実施形態では、複数のサブ培養物の各々を培養するステップは、約3日間行われる。いくつかの実施形態では、複数のサブ培養物の各々を培養するステップは、約4日間行われる。いくつかの実施形態では、複数のサブ培養物の各々を培養するステップは、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、複数のサブ培養物の各々を培養するステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、複数のサブ培養物の各々を培養するステップは、約7日間行われる。
いくつかの実施形態では、方法のステップは、約22日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約8日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約9日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約10日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約11日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約12日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約13日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約14日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約15日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約16日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約17日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約18日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約19日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約20日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約21日の期間内に完了する。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行され得、これは、遺伝子編集が、拡張方法のステップのうちのいずれかの前、最中、または後に、例えば、上記の方法で概説されたステップ(a)~(f)もしくは(a)~(g)のうちのいずれかの間、または上記の方法で概説されたステップ(a)~(f)もしくは(a)~(g)のうちのいずれかの前もしくは後に、TIL上で実行され得ることを意味する。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で2回以上実行され得る。ある特定の実施形態によれば、TILは、培養ステップ中に収集され(例えば、培養ステップは、TILの少なくとも一部について「一時停止」され)、収集されたTILは、遺伝子編集プロセスに供され、場合によっては、その後、培養ステップを継続するために培養ステップに戻され(例えば、培地に戻され)、それにより最終的に注入バッグに移される治療的TIL集団の少なくとも一部が永続的に遺伝子編集される。
拡張プロセスの代替実施形態は、上に示される方法とは異なり得ることに留意されたく、例えば、代替実施形態は、同じステップ(a)~(f)もしくは(a)~(g)を有しなくてもよいか、または異なる数のステップを有し得る。特定の実施形態にかかわらず、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行されてもよい。例えば、代替実施形態は、2つを超える培養ステップを含み得、第3または第4の培養ステップ中にTILに対して遺伝子編集が実施され得ることなどが可能である。
いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集は、TILがまだ培養培地中にある間、及び培養ステップが実行されている間に行われ、すなわち、遺伝子編集を実施するために必ずしも培養ステップから「除去」されるわけではない。いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集は、培養培地から収集されたTIL上で実行され、遺伝子編集プロセスの後、それらのTILは、その後、培養培地に戻される。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団の初期拡張(またはプライミングによる第1の拡張)を行い、第2のTIL集団を取得することであって、第1の細胞培養培地が、IL-2、任意選択でOKT-3、及び任意選択で抗原提示細胞(APC)を含み、プライミングによる第1の拡張が、約3~9日の期間にわたって起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(e)第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団の急速な第2の拡張を行い、増加した数のTIL集団を取得することであって、第2の細胞培養培地が、IL-2、OKT-3、及びAPCを含み、急速拡張が、14日以内の期間にわたって行われ、任意選択で、急速な第2の拡張が、急速な第2の拡張の開始後約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日または10日間進行することができる、増加した数のTIL集団を取得することと、を含む。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団の初期拡張(またはプライミングによる第1の拡張)を行い、第2のTIL集団を取得することであって、第1の細胞培養培地が、IL-2、任意選択でOKT-3、及び任意選択で抗原提示細胞(APC)を含み、プライミングによる第1の拡張が、約3~9日の期間にわたって起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(c)第2のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第2の細胞培養培地中で第3のTIL集団の急速な第2の拡張を行い、増加した数のTIL集団を取得することであって、第2の細胞培養培地が、IL-2、OKT-3、及びAPCを含み、急速拡張が、14日以内の期間にわたって行われ、任意選択で、急速な第2の拡張が、急速な第2の拡張の開始後約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日または10日間進行することができる、増加した数のTIL集団を取得することと、を含む。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍断片を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団の初期拡張(またはプライミングによる第1の拡張)を行い、第2のTIL集団を取得することであって、第1の細胞培養培地が、IL-2、任意選択でOKT-3、及び任意選択で抗原提示細胞(APC)を含み、プライミングによる第1の拡張が、約1~9日の期間にわたって起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(d)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(f)第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団の急速な第2の拡張を行い、増加した数のTIL集団を取得することであって、第2の細胞培養培地が、IL-2、OKT-3、及びAPCを含み、急速拡張が、14日以内の期間にわたって行われ、任意選択で、急速な第2の拡張が、急速な第2の拡張の開始後約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日または10日間進行することができる、増加した数のTIL集団を取得することを含む。
いくつかの実施形態では、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法は、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍断片を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団の初期拡張(またはプライミングによる第1の拡張)を行い、第2のTIL集団を取得することであって、第1の細胞培養培地が、IL-2、任意選択でOKT-3、及び任意選択で抗原提示細胞(APC)を含み、プライミングによる第1の拡張が、約1~9日の期間にわたって起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(d)第2のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団の急速な第2の拡張を行い、増加した数のTIL集団を取得することであって、第2の細胞培養培地が、IL-2、OKT-3、及びAPCを含み、急速拡張が、14日以内の期間にわたって行われ、任意選択で、急速な第2の拡張が、急速な第2の拡張の開始後約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日または10日間進行することができる、増加した数のTIL集団を取得することを含む。
いくつかの実施形態では、初期拡張は、約3~9日間行われる。いくつかの実施形態では、初期拡張は、約1~9日、2~9日、3~9日、約4~9日、約5~9日、約6~9日、約7~9日、約8~9日、約1~8日、約2~8日、約3~8日、約4~8日、約5~8日、約6~8日、約7~8日、約1~7日、約2~7日、約3~7日、約4~7日、約5~7日、約6~7日、約1~6日、約2~6日、約3~6日、約4~6日、約5~6日、約1~5日、約2~5日、約3~5日、約4~5日、約1~4日、約2~4日、約3~4日、約1~3日、約2~3日、または約1~2日間行われる。いくつかの実施形態では、初期拡張は、約1日間行われる。いくつかの実施形態では、初期拡張は、約2日間行われる。いくつかの実施形態では、初期拡張は、約3日間行われる。いくつかの実施形態では、初期拡張は、約4日間行われる。いくつかの実施形態では、初期拡張は、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、初期拡張は、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、初期拡張は、約7日間行われる。いくつかの実施形態では、初期拡張は、約8日間行われる。いくつかの実施形態では、初期拡張は、約9日間行われる。
いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約1~7日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約1~7日、約2~7日、約3~7日、約4~7日、約5~7日、約6~7日、約1~6日、約2~6日、約3~6日、約4~6日、約5~6日、約1~5日、約2~5日、約3~5日、約4~5日、約1~4日、約2~4日、約3~4日、約1~3日、約2~3日、または約1~2日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約1日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約2日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約3日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約4日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約7日間行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、約5~15日間行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、約5~15日、約6~15日、約7~15日、約8~15日、約9~15日、約10~15日、約11~15日、約12~15日、約13~15日、約14~15日、約5~14日、約6~14日、約7~14日、約8~14日、約9~14日、約10~14日、約11~14日、約12~14日、約13~14日、約5~13日、約6~13日、約7~13日、約8~13日、約9~13日、約10~13日、約11~13日、約12~13日、約5~12日、約6~12日、約7~12日、約8~12日、約9~12日、約10~12日、約11~12日、約5~11日、6~11日、7~11日、約8~11日、約9~11日、約10~11日、約5~10日、6~10日、7~10日、約8~10日、約9~10日、約5~9日、6~9日、7~9日、約8~9日、約5~8日、約6~8日、7~8日、約5~7日、約6~7日、約5~6日間行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、約7日間行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、約8日間行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、約9日間行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、約10日間行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、約11日間行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、約12日間行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、約13日間行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、約14日間行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、約15日間行われる。
いくつかの実施形態では、方法のステップは、約22日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約8日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約9日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約10日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約11日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約12日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約13日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約14日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約15日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約16日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約17日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約18日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約19日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約20日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約21日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約22日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約23日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約24日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約25日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約26日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約27日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約28日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約29日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約30日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約31日の期間内に完了する。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、第3のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物が組み合わされて、増加した数のTILを提供する。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、第3のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物が組み合わされて、増加した数のTILを提供する。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行され得、これは、遺伝子編集が、拡張方法のステップのうちのいずれかの前、最中、または後に、例えば、上記の方法で概説されたステップ(a)~(e)もしくは(a)~(f)のうちのいずれかの間、または上記の方法で概説されたステップ(a)~(e)もしくは(a)~(f)のうちのいずれかの前もしくは後に、TIL上で実行され得ることを意味する。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で2回以上実行され得る。ある特定の実施形態によれば、TILは、培養ステップ中に収集され(例えば、培養ステップは、TILの少なくとも一部について「一時停止」され)、収集されたTILは、遺伝子編集プロセスに供され、場合によっては、その後、培養ステップを継続するために培養ステップに戻され(例えば、培地に戻され)、それにより最終的に注入バッグに移される治療的TIL集団の少なくとも一部が永続的に遺伝子編集される。
拡張プロセスの代替実施形態は、上に示される方法とは異なり得ることに留意されたく、例えば、代替実施形態は、同じステップ(a)~(e)もしくは(a)~(f)を有しなくてもよいか、または異なる数のステップを有し得る。特定の実施形態にかかわらず、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行されてもよい。例えば、代替実施形態は、2つを超える培養ステップを含み得、第3または第4の培養ステップ中にTILに対して遺伝子編集が実施され得ることなどが可能である。
いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集は、TILがまだ培養培地中にある間、及び培養ステップが実行されている間に行われ、すなわち、遺伝子編集を実施するために必ずしも培養ステップから「除去」されるわけではない。いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集は、培養培地から収集されたTIL上で実行され、遺伝子編集プロセスの後、それらのTILは、その後、培養培地に戻される。
いくつかの実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または患者もしくは対象から腫瘍組織を取得するための他の手段によって産生される腫瘍組織の試料から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を閉鎖系に添加し、IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~9日間行われて、第2のTIL集団を取得する、第2のTIL集団を産生することと、
(c)CD3及びCD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(e)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を培養することによって第2の拡張を行い、第5のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約5~15日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第5のTIL集団が、治療的TIL集団である、第5のTIL集団を産生することと、
(f)ステップ(e)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(b)~(f)の各々が、閉鎖した滅菌系で行われ、ステップ(b)からステップ(c)への移行、ステップ(c)からステップ(d)への移行、ステップ(d)からステップ(e)への移行、及び/またはステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、を含む。
いくつかの実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または患者もしくは対象から腫瘍組織を取得するための他の手段によって産生される腫瘍組織の試料から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織または腫瘍断片の試料を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)腫瘍組織を閉鎖系に添加し、IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~9日間行われて、第2のTIL集団を取得する、第2のTIL集団を産生することと、
(d)CD3及びCD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を産生することと、
(f)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を培養することによって第2の拡張を行い、第5のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約5~15日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第5のTIL集団が、治療的TIL集団である、第5のTIL集団を産生することと、
(g)ステップ(e)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(c)~(g)の各々が、閉鎖した滅菌系で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行、ステップ(d)からステップ(e)への移行、ステップ(e)からステップ(f)への移行、及び/またはステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、を含む。
いくつかの実施形態では、第1の拡張は、約3~9日間行われる。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、約3~9日、約3~8日、約3~7日、約3~6日、約3~5日、約3~4日、約4~9日、約4~8日、約5~9日、約5~8日、約6~9日、約6~8日、約7~9日、約7~8日、約3~7日、約4~7日、約5~7日、約6~7日、約3~6日、約4~6日、約5~6日、約3~5日、約4~5日、約3~4日間行われる。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、約3日間行われる。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、約4日間行われる。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、約7日間行われる。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、約8日間行われる。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、約9日間行われる。
いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約1~7日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約1~7日、約2~7日、約3~7日、4~7日、約5~7日、約6~7日、約1~6日、約2~6日、約3~6日、約4~6日、約5~6日、約1~5日、約2~5日、約3~5日、約4~5日、約1~4日、約2~4日、約3~4日、約1~3日、約2~3日、約1~2日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約1日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約2日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約3日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約4日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、第2のTIL集団を活性化するステップは、約7日間行われる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約5~15日間行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約5~15日、約6~15日、約7~15日、約8~15日、約9~15日、約10~15日、約11~15日、約12~15日、約13~15日、約14~15日、約5~14日、約6~14日、約7~14日、約8~14日、約9~14日、約10~14日、約11~14日、約12~14日、約13~14日、約5~13日、約6~13日、約7~13日、約8~13日、約9~13日、約10~13日、約11~13日、約12~13日、約5~12日、約6~12日、約7~12日、約8~12日、約9~12日、約10~12日、約11~12日、約5~11日、6~11日、7~11日、約8~11日、約9~11日、約10~11日、約5~10日、6~10日、7~10日、約8~10日、約9~10日、約5~9日、6~9日、7~9日、約8~9日、約5~8日、約6~8日、7~8日、約5~7日、約6~7日、約5~6日間行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約7日間行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約8日間行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約9日間行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約10日間行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約11日間行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約12日間行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約13日間行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約14日間行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、約15日間行われる。
いくつかの実施形態では、方法のステップは、約22日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約8日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約9日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約10日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約11日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約12日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約13日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約14日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約15日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約16日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約17日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約18日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約19日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約20日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約21日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約22日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約23日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約24日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約25日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約26日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約27日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約28日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約29日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約30日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約31日の期間内に完了する。いくつかの実施形態では、方法のステップは、約32日の期間内に完了する。
いくつかの実施形態では、第2の拡張は、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物が組み合わされて、増加した数のTILを提供する。
いくつかの実施形態では、第2の拡張は、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物が組み合わされて、増加した数のTILを提供する。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約1日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約2日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約3日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約4日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約5日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約6日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約3日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約4日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約5日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約6日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の培養培地中で約7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物は、複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々は、IL-2を含む第3の培養培地中で約7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物は、組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行され得、これは、遺伝子編集が、拡張方法のステップのうちのいずれかの前、最中、または後に、例えば、上記の方法で概説されたステップ(a)~(f)もしくは(a)~(g)のうちのいずれかの間、または上記の方法で概説されたステップ(a)~(f)もしくは(a)~(g)のうちのいずれかの前もしくは後に、TIL上で実行され得ることを意味する。いくつかの実施形態では、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で2回以上実行され得る。ある特定の実施形態によれば、TILは、培養ステップ中に収集され(例えば、培養ステップは、TILの少なくとも一部について「一時停止」され)、収集されたTILは、遺伝子編集プロセスに供され、場合によっては、その後、培養ステップを継続するために培養ステップに戻され(例えば、培地に戻され)、それにより最終的に注入バッグに移される治療的TIL集団の少なくとも一部が永続的に遺伝子編集される。
拡張プロセスの代替実施形態は、上に示される方法とは異なり得ることに留意されたく、例えば、代替実施形態は、同じステップ(a)~(f)もしくは(a)~(g)を有しなくてもよいか、または異なる数のステップを有し得る。特定の実施形態にかかわらず、遺伝子編集プロセスは、TIL拡張方法中の任意の時点で実行されてもよい。例えば、代替実施形態は、2つを超える培養ステップを含み得、第3または第4の培養ステップ中にTILに対して遺伝子編集が実施され得ることなどが可能である。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集は、TILがまだ培養培地中にある間、及び培養ステップが実行されている間に行われ、すなわち、遺伝子編集を実施するために必ずしも培養ステップから「除去」されるわけではない。いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集は、培養培地から収集されたTIL上で実行され、遺伝子編集プロセスの後、それらのTILは、その後、培養培地に戻される。
いくつかの実施形態では、第2または第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集するステップは、第2または第3のTIL集団に対して無菌エレクトロポレーションステップを行うことを含む。
いくつかの実施形態では、無菌エレクトロポレーションステップは、少なくとも1つの遺伝子エディターの移入を媒介する。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、少なくとも1つのタンパク質の発現を調節するためのTALEヌクレアーゼ系である。いくつかの実施形態によれば、TALEヌクレアーゼ系は、PD-1の発現を下方調節する。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、CTLA-4の発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、LAG-3の発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、CISHの発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、CBL-Bの発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、TIGITの発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1ノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4ノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3ノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CISHノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CBL-BノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、TIGITノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1の下方調節された発現、ならびにCTLA-4、LAG-3、CISH、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4の下方調節された発現、ならびにPD-1、LAG-3、CISH、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3の下方調節された発現、ならびにPD-1、CTLA-4、CISH、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CISHの下方調節された発現、ならびにPD-1、LAG-3、CTLA-4、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CBL-Bの下方調節された発現、ならびにCTLA-4、LAG-3、CISH、TIGIT、及びPD-1のうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/CTLA-4ダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/LAG-3ダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/CISHダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/CBL-BダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/TIGITダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4/LAG-3ダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4/CISHダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4/CBL-BダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4/TIGITダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3/CISHダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3/CBL-BダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3/TIGITダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CISH/CBL-BダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CISH/TIGITダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CBL-B/TIGITダブルノックアウトTILである。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集のステップは、休止ステップをさらに含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、第4のTIL集団を、約30~40℃、約5%のCO2でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、約30℃、約30.5℃、約31℃、約31.5℃、約32℃、約32.5℃、約33℃、約33.5℃、約34℃、約34.5℃、約35℃、約35.5℃、約36℃、約36.5℃、約37℃、約37.5℃、約38℃、約38.5℃、約39℃、約39.5℃、約40℃で実行される。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、約1時間、約2時間、約3時間、約4時間、約5時間、約6時間、約7時間、約8時間、約9時間、約10時間、約11時間、約12時間、約13時間、約14時間、約15時間、約16時間、約17時間、約18時間、約19時間、約20時間、約21時間、約22時間、約23時間、約24時間実行される。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団をインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約15時間~約23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約15時間~約23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約15時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約16時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約17時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約18時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約19時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約20時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約21時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約22時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、抗原提示細胞(APC)はPBMCである。いくつかの実施形態によれば、PBMCは、放射線照射される。いくつかの実施形態によれば、PBMCは、同種異系である。いくつかの実施形態によれば、PBMCは、放射線照射されており、同種異系である。いくつかの実施形態によれば、抗原提示細胞は、人工抗原提示細胞である。
いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、解剖された腫瘍由来のものである。
いくつかの実施形態では、解剖された腫瘍は、8時間未満の古さのものである。
いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、黒色腫腫瘍組織、頭頸部腫瘍組織、乳房腫瘍組織、腎臓腫瘍組織、膵臓腫瘍組織、神経膠芽細胞腫腫瘍組織、肺腫瘍組織、結腸直腸腫瘍組織、肉腫腫瘍組織、トリプルネガティブ乳房腫瘍組織、子宮頸部腫瘍組織、卵巣腫瘍組織、及びHPV陽性腫瘍組織からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約1.5mm~6mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約2mm~6mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約2.5mm~6mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約3mm~6mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約3.5mm~6mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約4mm~6mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約4.5mm~6mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約5mm~6mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約5.5mm~6mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約1.5mm~5mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約2mm~5mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約2.5mm~5mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約3mm~5mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約3.5mm~5mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約4mm~5mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約4.5mm~5mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約1.5mm~4mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約2mm~4mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約2.5mm~4mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約3mm~4mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約3.5mm~4mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約1.5mm~3mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約2mm~3mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約2.5mm~3mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約1.5mm~2mmの直径を有するほぼ球形の断片に断片化される。
いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、少なくとも1.5mmの最短辺長及び約6mmの最長辺長を有する概して長方形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、少なくとも2mmの最短辺長及び約6mmの最長辺長を有する概して長方形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、少なくとも2.5mmの最短辺長及び約6mmの最長辺長を有する概して長方形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、少なくとも3mmの最短辺長及び約6mmの最長辺長を有する概して長方形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、少なくとも3.5mmの最短辺長及び約6mmの最長辺長を有する概して長方形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、少なくとも4mmの最短辺長及び約6mmの最長辺長を有する概して長方形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、少なくとも4.5mmの最短辺長及び約6mmの最長辺長を有する概して長方形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、少なくとも5mmの最短辺長及び約6mmの最長辺長を有する概して長方形の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、少なくとも5.5mmの最短辺長及び約6mmの最長辺長を有する概して長方形の断片に断片化される。
いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約3mmまたは約6mmの辺長を有する概して立方体の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約3mmの辺長を有する概して立方体の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約3.5mmの辺長を有する概して立方体の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約4mmの辺長を有する概して立方体の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約4.5mmの辺長を有する概して立方体の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約5mmの辺長を有する概して立方体の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約5.5mmの辺長を有する概して立方体の断片に断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍組織は、約6mmの辺長を有する概して立方体の断片に断片化される。
いくつかの実施形態では、本発明は、本明細書に記載の方法によって産生される治療的腫瘍浸潤リンパ球(TIL)産物集団を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、患者に、有効量の本明細書に記載の方法によって産生される治療的TIL集団を投与することを含む、患者におけるがん治療のための方法を提供する。いくつかの実施形態では、がんは、神経膠芽細胞腫(GBM)、胃腸癌、黒色腫、転移性黒色腫、卵巣癌、子宮内膜癌、甲状腺癌、結腸直腸癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、転移性NSCLC、肺癌、膀胱癌、乳癌、子宮内膜癌、胆管癌、ヒトパピローマウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、腎癌、腎細胞癌、多発性骨髄腫、慢性リンパ球性白血病、急性リンパ球性白血病、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、非ホジンリンリンパ腫、ホジンリンパ腫、濾胞性リンパ腫、及びマントル細胞リンパ腫からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、がんは、皮膚黒色腫、眼黒色腫、ブドウ膜黒色腫、結膜悪性黒色腫、転移性黒色腫、多形黄色星細胞腫、胚芽異形成神経上皮腫瘍、神経節膠腫、及び毛様細胞性星細胞腫、著しい粘液分化を有する類内膜腺癌(ECMD)、甲状腺乳頭癌、漿液性低悪性度または境界卵巣癌、有毛細胞白血病、及びランゲルハンス細胞組織球症からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に1000IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に1500IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に2000IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に2500IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に3000IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に3500IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に4000IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に4500IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に5000IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に5500IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に1000IU/mL~5000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に1500IU/mL~5000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に2000IU/mL~5000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に2500IU/mL~5000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に3000IU/mL~5000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に3500IU/mL~5000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に4000IU/mL~5000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に4500IU/mL~5000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に1000IU/mL~4000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に1500IU/mL~4000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に2000IU/mL~4000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に2500IU/mL~4000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に3000IU/mL~4000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に3500IU/mL~4000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に1000IU/mL~3000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に1500IU/mL~3000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に2000IU/mL~3000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に2500IU/mL~3000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に1000IU/mL~2000IU/mLの初期濃度で存在する。いくつかの実施形態では、IL-2は、第1の拡張において、細胞培養培地中に1500IU/mL~2000IU/mLの初期濃度で存在する。
いくつかの実施形態では、第2の拡張ステップ、IL-2は、1000IU/mL~6000IU/mLの初期濃度で存在し、OKT-3抗体は、約30ng/mLの初期濃度で存在する。
いくつかの実施形態では、第1の細胞培養培地及び/または第2の細胞培養培地は、4-1BBアゴニスト及び/またはOX40アゴニストをさらに含む。
いくつかの実施形態では、第1の拡張は、ガス透過性容器を使用して行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、ガス透過性容器を使用して行われる。
いくつかの実施形態では、第1の細胞培養培地は、IL-4、IL-7、IL-15、IL-21、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるサイトカインをさらに含む。いくつかの実施形態では、第2の細胞培養培地及び/または第3の細胞培養培地は、IL-4、IL-7、IL-15、IL-21、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるサイトカインをさらに含む。
いくつかの実施形態では、この方法は、TILまたはPBL産物を患者に投与する前に、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンで患者を治療するステップをさらに含む。いくつかの実施形態では、この方法は、TILまたはPBL産物を患者に投与した翌日から開始するIL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含む。いくつかの実施形態では、この方法は、TILまたはPBL産物を患者に投与したのと同じ日に開始するIL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含む。いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、アルデスロイキン、ネムバロイキン、またはそのバイオシミラーもしくはバリアントを含む。
いくつかの実施形態では、治療有効量のTIL産物は、約2.3×1010~約13.7×1010個のTILを含む。
いくつかの実施形態では、第2のTIL集団は、第1のTIL集団よりも数が少なくとも50倍多い。
PD-1 TALENノックダウンの例示的な開示は、米国仮出願第63/242,373号に提供され、これはすべての関連目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
D.遺伝子編集法
上で考察されたように、本発明の実施形態は、それらの治療効果を増強する(例えば、その細胞表面での免疫調節融合タンパク質の発現)ために遺伝子編集を介して遺伝子修飾された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を提供する。本発明の実施形態は、1つ以上のタンパク質の発現の促進及び1つ以上のタンパク質の発現の阻害の両方、ならびにそれらの組み合わせのために、TIL集団へのヌクレオチド挿入(RNAまたはDNA)による遺伝子編集を包含する。本発明の実施形態は、TILを治療用集団に拡張するための方法も提供し、方法は、TILを遺伝子編集することを含む。TIL集団を遺伝子修飾するために使用され得るいくつかの遺伝子編集技術が存在し、それらは本発明による使用に好適である。
いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、1つ以上のタンパク質の産生のために遺伝子の安定した組み込みステップを含む。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、レトロウイルス形質導入ステップを含む。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、レンチウイルス形質導入ステップを含む。レンチウイルス形質導入系は、当該技術分野で知られており、例えば、Levine,et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.2006,103,17372-77、Zufferey,et al.,Nat.Biotechnol.1997,15,871-75、Dull,et al.,J.Virology 1998,72,8463-71、及び米国特許第6,627,442号(それらの各々の開示は、参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、ガンマレトロウイルス形質導入ステップを含む。ガンマレトロウイルス形質導入系は、当該技術分野で知られており、例えば、Cepko and Pear,Cur.Prot.Mol.Biol.1996,9.9.1-9.9.16に記載されており、この開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、トランスポゾン媒介遺伝子導入ステップを含む。トランスポゾン媒介遺伝子導入系は、当該技術分野で知られており、トランスポザーゼが、DNA発現ベクターとしてまたは発現可能なRNAもしくはタンパク質として提供される系を含み、これにより、トランスポザーゼ、例えば、mRNA(例えば、キャップ及びポリA尾部を含むmRNA)として提供されるトランスポザーゼの長期発現がトランスジェニック細胞で起こらないようになる。SB10、SB11、及びSB100xなどのサケ科型Tel様トランスポザーゼ(SBまたはSleeping Beautyトランスポザーゼ)を含む好適なトランスポゾン媒介遺伝子導入系、ならびに増加した酵素活性を有する操作された酵素は、例えば、Hackett,et al.,Mol.Therapy 2010,18,674-83及び米国特許第6,489,458号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、1つ以上のタンパク質の産生または阻害(例えば、サイレンシング)のために遺伝子の安定した組み込みステップを含む。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、エレクトロポレーションステップを含む。エレクトロポレーション法は、当該技術分野で知られており、例えば、Tsong,Biophys.J.1991,60,297-306及び米国特許出願公開第2014/0227237A1号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。米国特許第5,019,034号、同第5,128,257号、同第5,137,817号、同第5,173,158号、同第5,232,856号、同第5,273,525号、同第5,304,120号、同第5,318,514号、同第6,010,613号、及び同第6,078,490号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるものなどの当該技術分野で知られている他のエレクトロポレーション法が使用され得る。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、滅菌エレクトロポレーション法である。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、パルスエレクトロポレーション法である。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのDC電気パルス列は、以下の特徴のうちの1つ、2つ、または3つを有する:(1)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる、(2)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる、及び(3)少なくとも3つのパルスのうちの2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILにおける細孔形成を誘導するステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つのDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのDC電気パルス列は、以下の特徴のうちの1つ、2つ、または3つを有する:(1)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる、(2)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる、及び(3)少なくとも3つのパルスのうちの2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なり、これにより、誘導された細孔が比較的長期間にわたって持続され、TILの生存率が維持される。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、リン酸カルシウムトランスフェクションステップを含む。リン酸カルシウムトランスフェクション法(リン酸カルシウムDNA沈殿、細胞表面コーティング、及びエンドサイトーシス)は、当該技術分野で知られており、Graham and van der Eb,Virology 1973,52,456-467、Wigler,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.1979,76,1373-1376、及びChen and Okayarea,Mol.Cell.Biol.1987,7,2745-2752、ならびに米国特許第5,593,875号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、リポソームトランスフェクションステップを含む。リポソームトランスフェクション法、例えば、カチオン性脂質N-[1-(2,3-ジオレイルオキシ)プロピル]-n,n,n-トリメチルアンモニウムクロリド(DOTMA)及びジオレオイルホスホチジルエタノールアミン(DOPE)の1:1(w/w)リポソーム製剤を用いる方法は、当該技術分野において既知であり、Rose,et al.,Biotechniques 1991,10,520-525及びFelgner,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1987,84,7413-7417、ならびに米国特許第5,279,833号、同第5,908,635号、同第6,056,938号、同第6,110,490号、同第6,534,484号、及び同第7,687,070号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、米国特許第5,766,902号、同第6,025,337号、同第6,410,517号、同第6,475,994号、及び同第7,189,705号に記載の方法を使用するトランスフェクションステップを含み、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集プロセスは、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。かかるプログラム可能なヌクレアーゼは、特定のゲノム遺伝子座に切断を導入することによって正確なゲノム編集を可能にし、すなわち、ゲノム内の特定のDNA配列の認識に依存して、ヌクレアーゼドメインをこの位置に標的し、標的配列での二本鎖切断の生成を媒介する。DNAの二本鎖切断は、その後、内因性修復機構を切断部位に動員して、非相同末端結合(NHEJ)または相同指向修復(HDR)のいずれかによるゲノム編集を媒介する。したがって、切断の修復は、標的遺伝子産物を破壊する(例えば、サイレンス、抑制、または増強する)挿入/欠失変異の導入をもたらす可能性がある。
部位特異的ゲノム編集を可能にするために開発されたヌクレアーゼの主要なクラスには、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)、転写活性化因子様ヌクレアーゼ(TALEN)、及びCRISPR関連ヌクレアーゼ(例えば、CRISPR/Cas9)が含まれる。これらのヌクレアーゼシステムは、DNA認識のモードに基づいて大きく2つのカテゴリーに分類され得、ZFN及びTALENは、タンパク質-DNA相互作用を介して特定のDNA結合を達成するが、Cas9などのCRISPRシステムは、標的DNAと直接塩基対を形成する短いRNAガイド分子によって、かつタンパク質-DNA相互作用によって特定のDNA配列を標的とする。例えば、Cox et al.,Nature Medicine,2015,Vol.21,No.2を参照されたい。
本発明のTIL拡張法に従って使用され得る遺伝子編集法の非限定的な例には、CRISPR法、TALE法、及びZFN法が含まれ、これらの実施形態は以下でより詳細に説明される。いくつかの実施形態によれば、TILを治療的集団に拡張するための方法を、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A)に従って、またはPCT/US2017/058610、PCT/US2018/012605、もしくはPCT/US2018/012633に記載されるように実行することができ、方法は、増強された治療効果を提供することができるTILを生成するために、CRISPR法、TALE法、またはZFN法のうちの1つ以上によって、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。いくつかの実施形態によれば、遺伝子編集されたTILは、インビトロでそれらを修飾されていないTILと比較することによって、例えば、修飾されていないTILと比較してインビトロでのエフェクター機能、サイトカインプロファイルなどを評価することによって、治療効果の改善について評価され得る。
本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーションは、CRISPRシステム、TALENシステム、及びZFNシステムなどの遺伝子編集システムの送達のために使用される。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーションシステムは、フローエレクトロポレーションシステムである。本発明のいくつかの実施形態との使用に好適な、好適なフローエレクトロポレーションシステムの例は、市販のMaxCyte STXシステムである。本発明との使用に好適であり得る、BTX-Harvard Apparatusから入手可能なAgilePulseシステムもしくはECM830、Cellaxess Elektra(Cellectricon)、Nucleofector(Lonza/Amaxa)、GenePulser MXcell(BIORAD)、iPorator-96(Primax)、またはsiPORTer96(Ambion)などのいくつかの代替の市販エレクトロポレーション機器が存在する。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーションシステムは、TIL拡張法の残りとともに、閉鎖した滅菌系を形成する。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーションシステムは、本明細書に記載のパルスエレクトロポレーションシステムであり、TIL拡張法の残りとともに、閉鎖した滅菌系を形成する。
いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、遺伝子編集系の送達のために使用される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
a.CRISPR法
TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A)に従って、またはPCT/US2017/058610、PCT/US2018/012605、もしくはPCT/US2018/012633に記載されるように実行することができ、この方法は、CRISPR法(例えば、CRISPR/Cas9またはCRISPR/Cpf1)によって、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のCRISPR法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の細胞表面での少なくとも1つの免疫調節組成物の発現を引き起こし、任意選択で、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子を治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは減少させる。代替的に、TIL拡張プロセス中のCRISPR法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の細胞表面での少なくとも1つの免疫調節組成物の発現を引き起こし、任意選択で、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子を治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
CRISPRは、「Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats(クラスター化された定期的に間隔をあけた短いパリンドロミックリピート)」の略語である。遺伝子編集のためにCRISPRシステムを使用する方法は、本明細書ではCRISPR法とも称される。CRISPR系は、クラス1及びクラス2の2つの主要なクラスに分類され得、これらは、異なるタイプ及びサブタイプにさらに分類される。CRISPR系の分類は、特定の核酸を切断することができるエフェクターCasタンパク質に基づいている。クラス1CRISPR系では、エフェクターモジュールは、マルチタンパク質複合体からなるが、クラス2の系は、1つのエフェクタータンパク質のみを使用する。クラス1CRISPRには、I型、III型、及びIV型が含まれ、クラス2 CRISPRには、II型、V型、及びVI型が含まれる。これらの型のCRISPR系のうちのいずれかは、本発明に従って使用され得るが、RNA及びCasタンパク質を組み込み、かつ本発明に従って使用されることが好ましいCRISPR系には、3つの型:I型(Cas3によって例示される)、II型(Cas9によって例示される)、及びIII型(Cas10によって例示される)がある。II型CRISPRは、最もよく特徴付けられている系のうちの1つである。
CRISPR技術は、細菌及び古細菌(単細胞微生物のドメイン)の自然防御機構から適合された。これらの生物は、CRISPR由来のRNA及びCas9を含む様々なCasタンパク質を使用して、外来侵入物のDNAを切り刻んで破壊することによって、ウイルス及び他の異物による攻撃を阻止する。CRISPRは、ヌクレオチド反復配列及びスペーサーの存在という2つの異なる特徴を有するDNAの特殊な領域である。ヌクレオチドの反復配列は、CRISPR領域全体に分布しており、外来DNA(スペーサー)の短いセグメントが反復配列の間に散在している。II型CRISPR/Casシステムでは、スペーサーは、CRISPRゲノム遺伝子座内に組み込まれ、転写され、短いCRISPR RNA(crRNA)に処理される。これらのcrRNAは、トランス活性化crRNA(tracrRNA)にアニーリングし、Casタンパク質による病原性DNAの配列特異的切断及びサイレンシングを指示する。Cas9タンパク質による標的認識には、crRNA内の「シード」配列、及びcrRNA結合領域の上流にある保存されたジヌクレオチドを含むプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列が必要である。これにより、CRISPR/Casシステムが再標的されて、crRNAを再設計することにより、実質的にいずれのDNA配列も切断することができる。したがって、ある特定の実施形態によれば、Cas9は、crRNA-tracrRNA認識時にDNAを切断するRNA誘導DNAエンドヌクレアーゼとして機能する。天然システムにおけるcrRNA及びtracrRNAは、遺伝子操作で使用するために、およそ100ヌクレオチドの単一ガイドRNA(sgRNA)に簡略化され得る。sgRNAは、Cas結合に必要な足場配列と、修飾されるゲノム標的を定義するユーザ定義のおよそ17~20ヌクレオチドスペーサーとを含む合成RNAである。したがって、ユーザは、sgRNAに存在する標的配列を変更することによって、Casタンパク質のゲノム標的を変更することができる。CRISPR/Cas系は、Cas9エンドヌクレアーゼを発現するプラスミドとRNA成分(例えば、sgRNA)を同時送達することにより、ヒト細胞に直接運搬可能である。Casタンパク質の異なるバリアント(例えば、Cpf1などのCas9のオルソログ)を使用して、標的の制限を低減することができる。
いくつかの実施形態によれば、操作された、プログラム可能な、天然に存在しないII型CRISPR-Cas系は、Cas9タンパク質及びTILにおいてDNA分子の標的配列を標的とし、それにハイブリダイズする少なくとも1つのガイドRNAを含み、DNA分子が少なくとも1つの免疫チェックポイント分子をコードし、TILが少なくとも1つの免疫チェックポイント分子を発現し、Cas9タンパク質がDNA分子を切断し、それによって、少なくとも1つの免疫チェックポイント分子の発現が改変され、Cas9タンパク質及びガイドRNAが、天然に一緒に存在しない。いくつかの実施形態によれば、2つ以上の免疫チェックポイント分子の発現が改変される。いくつかの実施形態によれば、ガイドRNA(複数可)は、tracr配列に融合したガイド配列を含む。例えば、ガイドRNAは、crRNA-tracrRNAまたはsgRNAを含み得る。本発明の態様によれば、「ガイドRNA」、「単一ガイドRNA」及び「合成ガイドRNA」という用語は、互換的に使用され得、ガイド配列を含むポリヌクレオチド配列を指し、これは、標的部位を特定するガイドRNA内の約17~20bpの配列である。
Cas9と比較して改善されたオンターゲット特異性を有するCas9のバリアントもまた、本発明の実施形態に従って使用され得る。そのようなバリアントは、高忠実度Cas-9と称され得る。いくつかの実施形態によれば、デュアルニッカーゼアプローチを利用してもよく、反対のDNA鎖を標的とする2つのニッカーゼは、標的DNA内でDSBを生成する(多くの場合、ダブルニッカーゼまたはデュアルニッカーゼCRISPR系と称される)。例えば、このアプローチは、2つのCas9ヌクレアーゼドメインのうちの1つの変異を伴い、Cas9をヌクレアーゼからニッカーゼに変えることを伴い得る。高忠実度Cas9の非限定的な例としては、eSpCas9、SpCas9-HF1及びHypaCas9が挙げられる。そのようなバリアントは、非標的DNA部位における望ましくない変化を低減または排除し得る。例えば、Slaymaker IM,et al.Science.2015 Dec 1、Kleinstiver BP,et al.Nature.2016 Jan 6、及びRan et al.,Nat Protoc.2013 Nov;8(11):2281-2308(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)を参照されたい。
追加として、特定の実施形態によれば、参照により本明細書に組み込まれる、米国特許出願公開第2016/0102324号に開示されているものなどの、細胞へのCas9の遺伝子送達を改善し、標的特異性を改善する、Cas9足場を使用することができる。例えば、Cas9足場は、(D-[I/L]-G-X-X-S-X-G-W-A)によって定義されるRuvCモチーフ及び/または(Y-X-X-D-H-X-X-P-X-S-X-X-X-D-X-S)によって定義されるHNHモチーフを含んでよく、Xは、20個の天然に存在するアミノ酸のうちのいずれか1つを表し、[I/L]は、イソロイシンまたはロイシンを表す。HNHドメインは、標的dsDNAの一方の鎖をニッキングすることに関与し、RuvCドメインは、dsDNAの他方の鎖の切断に関与する。したがって、これらのドメインの各々は、PAMのすぐ近くのプロトスペーサー内の標的DNAの鎖をニックし、DNAの鈍い切断をもたらす。これらのモチーフを互いに組み合わせて、よりコンパクト及び/またはより特異的なCas9足場を作製してもよい。さらに、モチーフを使用して、分割されたCas9タンパク質(すなわち、RuvCドメインまたはHNHドメインのいずれかを含むCas9タンパク質またはCas9バリアントの還元型または切断型)を作製してもよく、分割されたCas9タンパク質は、2つの別個のRuvCドメイン及びHNHドメインに分割され、標的DNAを一緒にまたは別個に処理することができる。
特定の実施形態によれば、CRISPR法は、Cas9ヌクレアーゼ及び免疫チェックポイント遺伝子(複数可)の標的DNA配列に特異的なおよそ17~20ヌクレオチドの配列を含むガイドRNA(例えば、crRNA-tracrRNAまたはsgRNA)を導入することによって、TILにおける1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現をサイレンシングまたは減少させることを含む。ガイドRNAは、RNAとして、またはプロモーターの下でガイドRNAコード配列を有するプラスミドを形質転換することによって送達されてもよい。CRISPR/Cas酵素は、sgRNAにより定義された標的配列に基づいて、特定の位置に二本鎖切断(DSB)を導入する。DSBは、DNAの挿入または欠失(インデル)を頻繁に引き起こす機序である、非相同末端結合(NHEJ)によって細胞内で修復され得る。インデルは、多くの場合、フレームシフトをもたらし、例えば、標的遺伝子のオープンリーディングフレーム(ORF)内で早期停止コドンを引き起こすことによって、機能対立遺伝子の喪失を引き起こす。ある特定の実施形態によれば、結果は、標的免疫チェックポイント遺伝子内の機能喪失変異である。
代替的に、CRISPR/Cas酵素によって誘導されるDSBは、NHEJの代わりに相同性指向修復(HDR)によって修復されてもよい。NHEJ媒介DSB修復は、しばしば遺伝子のオープンリーディングフレームを破壊するが、相同指向修復(HDR)を使用して、単一ヌクレオチド変化から大きな挿入までの範囲の特異的なヌクレオチド変化を生成することができる。いくつかの実施形態によれば、HDRは、sgRNA(複数可)及びCas9またはCas9ニッカーゼを有するTILに所望の配列を含むDNA修復テンプレートを送達することによって、免疫チェックポイント遺伝子を遺伝子編集するために使用される。修復テンプレートは、好ましくは、所望の編集、ならびに標的遺伝子のすぐ上流及び下流の追加の相同配列(多くの場合、左及び右の相同アームと称される)を含む。
特定の実施形態によれば、酵素的に不活性なバージョンのCas9(deadCas9またはdCas9)は、開始を遮断することによって転写を抑制するために、転写開始部位を標的とし得る。したがって、標的とされた免疫チェックポイント遺伝子は、DSBを使用せずに抑制され得る。dCas9分子は、sgRNA標的化配列に基づいて標的DNAに結合する能力を保持している。本発明のいくつかの実施形態によれば、CRISPR法は、標的遺伝子(複数可)の転写を阻害または防止することによって、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現をサイレンスまたは減少させることを含む。例えば、CRISPR法は、Kruppel関連ボックス(KRAB)ドメインなどの転写リプレッサードメインをCas9の酵素不活性バージョンに融合させ、それによって、例えば、免疫チェックポイント遺伝子の転写開始部位を標的とするdCas9-KRABを形成し、遺伝子の転写の阻害または防止をもたらすことを含み得る。好ましくは、リプレッサードメインは、転写開始部位の下流、例えば、約500bp下流のウィンドウを標的とする。CRISPR干渉(CRISPRi)と称され得るこのアプローチは、標的RNAの転写還元を介して堅牢な遺伝子ノックダウンをもたらす。
特定の実施形態によれば、酵素的に不活性なバージョンのCas9(deadCas9またはdCas9)は、転写を活性化するために、転写開始部位を標的とし得る。このアプローチは、CRISPR活性化(CRISPRa)と称され得る。いくつかの実施形態によれば、CRISPR法は、標的遺伝子(複数可)の転写を活性化することによって1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を増加させることを含む。そのような実施形態によれば、標的とされた免疫チェックポイント遺伝子は、DSBを使用せずに活性化され得る。CRISPR法は、例えば、VP64などの転写活性化因子をdCas9に融合させ、それによって例えば、免疫チェックポイント遺伝子の転写開始部位を標的とするdCas9-VP64を形成することによって、転写活性化ドメインを転写開始部位に標的化することを含み得、遺伝子の転写の活性化をもたらす。好ましくは、活性化因子ドメインは、転写開始部位から上流のウィンドウ、例えば、約50~400bp下流を標的とする。
本発明の追加の実施形態は、哺乳動物細胞における標的遺伝子の強力な活性化のために開発された活性化戦略を利用し得る。非限定的な例としては、エピトープタグ付きdCas9及び抗体活性化剤エフェクタータンパク質(例えば、SunTag系)の共発現、複数の異なる活性化ドメインに直列に融合したdCas9(例えば、dCas9-VPR)、またはdCas9-VP64と修飾された足場gRNA及び追加のRNA結合ヘルパー活性化因子(例えば、SAM活性化因子)との共発現が挙げられる。
他の実施形態によれば、参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第9,982,278号に開示されるように、CRISPR支援合理的タンパク質操作(CARPE)と称されるCRISPR媒介ゲノム編集方法を、本発明の実施形態に従って使用してもよい。CARPEは、一本鎖DNA(ssDNA)または二本鎖DNA(dsDNA)編集カセットからの指向性変異をゲノムに直接組み込む「ドナー」及び「デスティネーション」ライブラリーの生成を伴う。ドナーライブラリーの構築は、標的DNA配列にハイブリダイズするガイドRNA(gRNA)を用いて、合理的に設計された編集オリゴヌクレオチドを細胞に同時形質転換することを伴う。編集オリゴヌクレオチドは、PAMの欠失または変異を、隣接遺伝子内の1つ以上の所望のコドンの変異とカップリングするように設計される。これにより、ドナーライブラリー全体を単一の形質転換で生成することができる。ドナーライブラリーは、編集オリゴヌクレオチドからの合成特徴、すなわち、遺伝子の3’末端に同時に組み込まれる第2のPAM欠失または変異を使用して、PCR反応などによる組換え染色体の増幅によって回収される。これは、PAM欠失に指向されたコドン標的変異を共有結合する。次いで、ドナーライブラリーを、デスティネーションgRNAベクターを有する細胞に同時形質転換して、合理的に設計されたタンパク質ライブラリーを発現する細胞の集団を作製する。
他の実施形態によれば、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第9,982,278号に開示されるように、追跡可能なCRISPR濃縮組換えによるゲノム操作(GEn-TraCER)と称されるCRISPR媒介系を使用する、追跡可能な精密ゲノム編集のための方法を、本発明の実施形態に従って使用してもよい。GEn-TraCER方法及びベクターは、編集カセットを、単一のベクター上のgRNAをコードする遺伝子と組み合わせる。カセットは、所望の変異及びPAM変異を含有する。Cas9もコードし得るベクターは、細胞または細胞集団に導入される。これは、細胞または細胞集団におけるCRISPR系の発現を活性化し、gRNAにCas9を標的領域に動員させ、dsDNA切断が発生し、PAM変異の組み込みを可能にする。
CRISPR法によりTILを永久に遺伝子編集することによってサイレンスまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例には、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、TOX、SOCS1、ANKRD11、及びBCORが含まれる。
CRISPR法によりTILを永続的に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の非限定的な例には、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18、IL-21、NOTCH1/2細胞内ドメイン(ICD)、及び/またはNOTCHリガンドmDLL1が含まれる。
CRISPR法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得るシステム、方法、及び組成物の例は、米国特許第8,697,359号、同第8,993,233号、同第8,795,965号、同第8,771,945号、同第8,889,356号、同第8,865,406号、同第8,999,641号、同第8,945,839号、同第8,932,814号、同第8,871,445号、同第8,906,616号、及び同第8,895,308号に記載されており、これらは参照により本明細書に組み込まれる。CRISPR/Cas9及びCRISPR/Cpf1を発現するためのプラスミドなどのCRISPR法を行うための資源は、GenScriptなどの企業から市販されている。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のTIL集団の遺伝子修飾は、米国特許第9790490号に記載されているCRISPR/Cpf1システムを使用して行うことができ、この開示は参照により本明細書に組み込まれる。CRISPR/Cpf1系は、Cpf1関連CRISPRアレイが追加のtracrRNAを必要とすることなく成熟したcrRNAに処理されるという点で、CRISPR-Cas9系とは機能的に異なる。CRISPR/Cpf1系で使用されるcrRNAは、スペーサーまたはガイド配列及び直接反復配列を有する。この方法を使用して形成されるCpf1p-crRNA複合体は、それ自体で標的DNAを切断するのに十分である。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(e)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップは、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)/Cas9系及びCRISPR/Cpf1系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系の送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディター系は、第2のTIL集団の複数の細胞において、少なくとも1つのチェックポイントタンパク質の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、少なくとも1つのチェックポイントタンパク質発現を調節する。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激して、第2のTIL集団を取得することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(e)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップは、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)/Cas9系及びCRISPR/Cpf1系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系の送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディター系は、第2のTIL集団の複数の細胞において、PD-1及びLAG-3の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1及びLAG-3の発現を阻害する。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
b.TALE法
TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A)に従って、またはWO2018/081473、WO2018/129332、またはWO2018/182817に記載されるように実行することができ、この方法は、TALE法によってTILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のTALE法の使用は、細胞表面での少なくとも1つの免疫調節組成物の発現を引き起こし、任意選択で、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは減少させる。代替的に、TIL拡張プロセス中のTALE法の使用は、細胞表面での少なくとも1つの免疫調節組成物の発現を引き起こし、任意選択で、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。
TALEは、TALEN(「転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ」)を含む、「Transcription Activator-Like Effector(転写活性化因子様エフェクター)」タンパク質の略語である。遺伝子編集のためにTALEシステムを使用する方法は、本明細書ではTALE法とも称され得る。TALEは、植物病原菌Xanthomonas属由来の天然に存在するタンパク質であり、各々単一の塩基対を認識する一連の33~35アミノ酸反復ドメインで構成されるDNA結合ドメインを含む。TALE特異性は、反復可変二残基(RVD)として知られる2つの超可変アミノ酸によって決定される。モジュラーTALE反復配列は、隣接するDNA配列を認識するために一緒に結合される。DNA結合ドメイン内の特定のRVDは、標的遺伝子座内の塩基を認識し、予測可能なDNA結合ドメインを組み立てるための構造的特徴を提供する。TALEのDNA結合ドメインは、IIS型FokIエンドヌクレアーゼの触媒ドメインに融合して、標的可能なTALEヌクレアーゼを作製する。部位特異的変異を誘導するために、14~20塩基対のスペーサー領域によって分離された2つの個々のTALENアームがFokIモノマーを密接に接近させて二量体化し、標的とされる二本鎖切断を産生する。
様々な組み立て方法を利用したいくつかの大規模な系統的研究により、TALE反復配列を組み合わせて、実質的にすべてのユーザ定義配列を認識することができることが示されている。カスタムTALEアレイの迅速な組み立てを可能にする戦略には、ゴールデンゲート分子クローニング、高スループット固相組み立て、及びライゲーション非依存性クローニング技術が含まれる。カスタム設計されたTALEアレイも、Cellectis Bioresearch(Paris,France)、Transposagen Biopharmaceuticals(Lexington,KY,USA)、及びLife Technologies(Grand Island,NY,USA)から市販されている。追加として、所望の標的のためのカスタムTALエフェクター反復アレイの設計を可能にし、また、予測されるTALエフェクター結合部位を提供する、TALエフェクター-ヌクレオチドターゲット2.0などのウェブベースのツールが利用可能である。Doyle,et al.,Nucleic Acids Research,2012,Vol.40,W117-W122を参照されたい。本発明での使用に好適なTALE法及びTALEN法の例は、米国特許公開第2011/0201118A1号、同第2013/0117869A1号、同第2013/0315884A1号、同第2015/0203871A1号、同第2016/0120906A1号に記載されており、これらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
本発明のいくつかの実施形態によれば、TALE法は、標的遺伝子(複数可)の転写を阻害または防止することによって、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現をサイレンスまたは減少させることを含む。例えば、TALE法は、KRAB-TALEを利用することを含み得、この方法は、転写Kruppel関連ボックス(KRAB)ドメインを、遺伝子の転写開始部位を標的とするDNA結合ドメインに融合することを含み、遺伝子の転写の阻害または防止につながる。
他の実施形態によれば、TALE法は、標的遺伝子(複数可)に変異を導入することによって1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現をサイレンスまたは減少させることを含む。例えば、TALE法は、FoklなどのヌクレアーゼエフェクタードメインをTALE DNA結合ドメインに融合させ、TALENをもたらすことを含み得る。Foklは、二量体として活性であり、したがって、この方法は、FOKLヌクレアーゼドメインを隣接するゲノム標的部位に位置決めするためのTALEN対を構築することを含み、DNA二本鎖切断を導入する。Foklの正しい位置決め及び二量体化後、二本鎖切断が完了し得る。二本鎖切断が導入されると、DNA修復は、高忠実度相同組換え対(HRR)(相同性指向修復またはHDRとしても知られる)またはエラーが発生しやすい非相同性末端結合(NHEJ)の2つの異なる機序を介して達成することができる。NHEJを介した二本鎖切断の修復は、好ましくは、DNA標的部位の欠失、挿入または置換をもたらす、すなわち、NHEJは、典型的には、切断部位での小さな挿入及び欠失の導入をもたらし、多くの場合、遺伝子機能をノックアウトするフレームシフトを誘導する。特定の実施形態によれば、TALEN対は、遺伝子の最5’エクソンを標的とし、早期フレームシフト変異または早期停止コドンを促進する。TALENによって導入される遺伝子変異(複数可)は、好ましくは永続的である。したがって、いくつかの実施形態によれば、この方法は、二量体化TALENを利用して、エラーが発生しやすいNHEJを介して修復される部位特異的二本鎖切断を誘導し、標的免疫チェックポイント遺伝子に1つ以上の変異をもたらすことによって、免疫チェックポイント遺伝子の発現をサイレンシングまたは減少させることを含む。
追加の実施形態によれば、TALENは、非ランダム点変異、標的欠失、またはDNA断片の付加などのHRRを介して遺伝子改変を導入するために利用される。DNA二本鎖切断の導入は、好適なドナーDNAの存在下での相同組換えを介した遺伝子編集を可能にする。いくつかの実施形態によれば、この方法は、部位特異的二本鎖切断を誘導し、1つ以上の導入遺伝子をDNAに組み込むために、二量体化TALEN及び遺伝子座特異的相同性アームを有するドナープラスミドを同時送達することを含む。
他の実施形態によれば、米国特許公開第2011/0201118号に開示されているように、FokI及びAvrXa7に由来するハイブリッドタンパク質であるTALENを、本発明の実施形態に従って使用してもよい。このTALENは、AvrXa7の標的ヌクレオチド及びFokIの二本鎖DNA切断活性に対する認識特異性を保持する。同じ方法を使用して、異なる認識特異性を有する他のTALENを調製することができる。例えば、コンパクトTALENは、DNA結合特異性を変化させ、特定の単一のdsDNA標的配列を標的とするために、RVDの異なるセットを有するコアTALE足場を操作することによって生成され得る。米国特許公開第2013/0117869号を参照されたい。触媒ドメインの選択は、DNA処理をもたらすために足場に付着させることができ、これは、触媒ドメインが、コアTALE足場に融合されたときに、単一のdsDNA標的配列の近くでDNAを処理することができることを確実にするように操作され得る。ペプチドリンカーはまた、触媒ドメインを足場に融合させて、特定の単一のdsDNA配列を標的とするために二量体化を必要としない単一のポリペプチド鎖からなるコンパクトなTALENを作製するように操作されてもよい。コアTALE足場はまた、TALモノマーであり得る触媒ドメインをそのN末端に融合させることによって修飾され得、この触媒ドメインが別のTALモノマーに融合された別の触媒ドメインと相互作用する可能性を可能にし、それによって標的配列の近傍でDNAを処理する可能性が高い触媒エンティティを作製する。米国特許公開第2015/0203871号を参照されたい。このアーキテクチャは、1つのDNA鎖のみを標的とすることを可能にするが、これは古典的なTALENアーキテクチャの選択肢ではない。
本発明のいくつかの実施形態によれば、従来のRVDを使用して、遺伝子発現を大幅に低減することができるTALENを作製してもよい。いくつかの実施形態では、4つのRVD、NI、HD、NN、及びNGを使用して、それぞれ、アデニン、シトシン、グアニン、及びチミンを標的とする。これらの従来のRVDを使用して、例えば、PD-1遺伝子を標的とするTALENを作製することができる。従来のRVDを使用するTALENの例としては、Gautron et al.,Molecular Therapy:Nucleic Acids Dec.2017,Vol.9:312-321(Gautron)(これは参照により本明細書に組み込まれる)に開示されているT3v1及びT1 TALENが挙げられる。T3v1及びT1 TALENは、PD-L1結合部位が位置するPDCD1遺伝子座の第2のエクソンを標的とし、PD-1産生を著しく低減することができる。いくつかの実施形態では、T1 TALENは、標的配列番号256を使用することによってそれを行い、T3v1 TALENは、標的配列番号257を使用することによってそれを行う。
他の実施形態によれば、TALENは、Gautronに開示されるような、標的遺伝子に対するそれらの活性及び特異性を改善するために、非従来型RVDを使用して修飾される。天然に存在するRVDは、超可変アミノ酸位置の潜在的な多様性レパートリーのごく一部のみをカバーする。非従来のRVDは、天然のRVDの代替物を提供し、TALENによるオフサイト標的(標的配列に対していくつかのミスマッチを含むゲノム内の配列)の標的化を除外するために使用され得る、新規の固有の標的化特異性特徴を有する。非従来型RVDは、Juillerat,et al.,Scientific Reports 5,Article Number 8150(2015)(これは参照により本明細書に組み込まれる)に開示されるようなアレイの定義された位置における2つの超可変アミノ酸位置にアミノ酸の代替組み合わせを含むTALENの集合を生成及びスクリーニングすることによって同定され得る。次に、ミスマッチの位置に存在するヌクレオチドを区別する非従来型RVDを選択してもよく、これにより、標的位置の適切な処理を依然として可能にしながら、オフサイト配列でのTALEN活性を防止することができる。次いで、選択された非従来型RVDは、TALEN内の従来のRVDを置き換えるために使用され得る。従来のRVDが非従来型RVDに置き換えられたTALENの例としては、Gautronによって産生されたT3v2及びT3v3 PD-1 TALENが挙げられる。これらのTALENは、従来のRVDを使用したTALENと比較した場合、特異性が増加していた。
追加の実施形態によれば、TALENを利用して、2つの遺伝子の発現をサイレンシングまたは減少させるための遺伝子改変を導入してもよい。例えば、2つの異なる遺伝子を標的とするために2つの別個のTALENを生成し、次いで一緒に使用してもよい。2つのTALENによってそれぞれの遺伝子座及び潜在的なオフターゲット部位で生成される分子事象は、ハイスループットDNA配列決定によって特徴付けられ得る。これにより、オフターゲット部位の分析、及び両方のTALENの使用から生じる可能性のある部位の特定が可能になる。この情報に基づいて、一緒に使用されても特異性及び活性が増加したTALENを操作するために、適切な従来型及び非従来型のRVDが選択され得る。例えば、Gautronは、T3v4 PD-1及びTRAC TALENを併用して、強力なインビトロ抗腫瘍機能を維持したダブルノックアウトCAR T細胞を産生することを開示する。
いくつかの実施形態では、Gautronの方法または本明細書に記載の他の方法は、TILを遺伝子編集するために用いられてもよく、このTILは、次いで、本明細書に記載の手順のうちのいずれかによって拡張されてもよい。いくつかの実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)CD3及びCD28活性化ビーズまたは抗体を使用して、患者から切除された腫瘍から取得されたTILの第1の集団を1~5日間活性化するステップと、
(b)転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸のエレクトロポレーションを使用して第1のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第2のTIL集団を取得するステップであって、遺伝子編集が、第2のTIL集団の細胞の一部において、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、少なくとも1つの免疫チェックポイントタンパク質の発現を阻害する、第2のTIL集団を取得するステップと、
(c)任意選択で、第2のTIL集団をインキュベートするステップと、
(d)IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む細胞培養培地中で第2のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第3のTIL集団を産生するステップと、
(e)第3のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第4のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第4のTIL集団を取得し、第4のTIL集団が、治療的TIL集団である、第4のTIL集団を産生するステップと、
(f)ステップ(e)から取得された治療的TIL集団を採取するステップと、
(g)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すステップと、を含み、
(h)ステップ(a)~(g)のうちの1つ以上が、閉鎖した無菌系で行われる。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)CD3及びCD28活性化ビーズまたは抗体を使用して、患者から切除された腫瘍から取得されたTILの第1の集団を1~5日間活性化するステップと、
(b)転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸のエレクトロポレーションを使用して第1のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第2のTIL集団を取得するステップであって、遺伝子編集が、第2のTIL集団の細胞の一部において、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、少なくとも1つの免疫チェックポイントタンパク質の発現を阻害する、第2のTIL集団を取得するステップと、
(c)任意選択で、第2のTIL集団をインキュベートするステップと、
(d)IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む細胞培養培地中で第2のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約6~9日間行われて、第3のTIL集団を産生するステップと、
(e)第3のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第4のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約9~11日間行われて、第4のTIL集団を取得し、第4のTIL集団が、治療的TIL集団である、第4のTIL集団を産生するステップと、
(f)ステップ(e)から取得された治療的TIL集団を採取するステップと、
(g)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すステップと、を含み、
(h)ステップ(a)~(g)のうちの1つ以上が、閉鎖した無菌系で行われる。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)CD3及びCD28活性化ビーズまたは抗体を使用して、患者から切除された腫瘍から取得されたTILの第1の集団を1~5日間活性化するステップと、
(b)転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸のエレクトロポレーションを使用して第1のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第2のTIL集団を取得するステップであって、遺伝子編集が、第2のTIL集団の細胞の一部において、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、少なくとも1つの免疫チェックポイントタンパク質の発現を阻害する、第2のTIL集団を取得するステップと、
(c)任意選択で、第2のTIL集団をインキュベートするステップであって、インキュベーションが、約30~40℃で、約5%のCOで行われる、インキュベートするステップと、
(d)IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む細胞培養培地中で第2のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約6~9日間行われて、第3のTIL集団を産生するステップと、
(e)第3のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第4のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約9~11日間行われて、第4のTIL集団を取得し、第4のTIL集団が、治療的TIL集団である、第4のTIL集団を産生するステップと、
(f)ステップ(e)から取得された治療的TIL集団を採取するステップと、
(g)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すステップと、を含み、
(h)ステップ(a)~(g)のうちの1つ以上が、閉鎖した無菌系で行われる。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸のエレクトロポレーションを使用して第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を取得することであって、遺伝子編集が、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させる、第4のTIL集団を取得することと、
(e)任意選択で、第4のTIL集団をインキュベートすることと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(d)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(e)転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸のエレクトロポレーションを使用して第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を取得することであって、遺伝子編集が、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させる、第4のTIL集団を取得することと、
(f)任意選択で、第4のTIL集団をインキュベートすることであって、インキュベーションが、約30~40℃で、約5%のCOで行われる、インキュベートすることと、
(g)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊することによって第3のTIL集団を遺伝子編集して、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸を、第3のTIL集団に移入させ、第4のTIL集団を取得することであって、遺伝子編集が、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させる、第4のTIL集団を取得することと、
(e)任意選択で、第4のTIL集団をインキュベートすることと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊することによって第3のTIL集団を遺伝子編集して、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸を、第3のTIL集団に移入させ、第4のTIL集団を取得することであって、遺伝子編集が、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させる、第4のTIL集団を取得することと、
(e)任意選択で、第4のTIL集団をインキュベートすることであって、インキュベーションが、約30~40℃で、約5%のCOで行われる、インキュベートすることと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。
いくつかの実施形態では、第4のTIL集団を培養するステップは、第4のTIL集団を第2の細胞培養培地中で約1~7日の第1の期間培養することによって行われ、第1の期間の終了時に、培養物が複数のサブ培養物に分割され、複数のサブ培養物の各々が、IL-2を含む第3の培養培地中で約3~7日の第2の期間培養され、第2の期間の終了時に、複数のサブ培養物が組み合わされて、増加した数のTILが提供される。
他の実施形態によれば、TALENは特異的に設計されてもよく、これにより、遺伝子の特異的選択を標的とすることができる標的細胞(複数可)内の、より高い割合のDSB事象が可能になる。米国特許公開第2013/0315884号を参照されたい。そのようなまれな切断エンドヌクレアーゼの使用は、トランスフェクトされた細胞内で標的遺伝子の二重不活性化を得る可能性を高め、T細胞などの操作された細胞の産生を可能にする。さらに、変異誘発を増加させ、標的遺伝子不活性化を強化するために、追加の触媒ドメインをTALENで導入することができる。米国特許公開第2013/0315884号に記載されているTALENは、免疫療法に適するようにT細胞を操作するために首尾よく使用された。TALENを使用して、単一のT細胞内の少なくとも2つの遺伝子の不活性化を含む、T細胞内の様々な免疫チェックポイント遺伝子を不活性化することもできる。米国特許公開第2016/0120906号を参照されたい。追加として、TALENを使用して、参照により本明細書に組み込まれる米国特許公開第2018/0021379号に開示されるように、免疫抑制剤及びT細胞受容体の標的をコードする遺伝子を不活性化することができる。さらに、TALENは、米国特許公開第2019/0010514号(これは参照により本明細書に組み込まれる)に開示されるように、ベータ2-ミクログロブリン(B2M)及び/またはクラスII主要組織適合性複合体トランスアクチベーター(CIITA)の発現を阻害するために使用され得る。
TALE法によりTILを永久に遺伝子編集することによってサイレンスまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例には、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、TOX、SOCS1、ANKRD11、及びBCORが含まれる。
PD-1遺伝子を標的とするTALEヌクレアーゼの非限定的な例を、以下の表に提供する。これらの実施例では、標的化ゲノム配列は、15bpのスペーサー(小文字で示される)によって分離された2つの17塩基対(bp)の長い配列(大文字で示される、半分の標的と称される)を含有する。各半分の標的は、表11に列挙される半分のTALEヌクレアーゼの反復によって認識される。したがって、特定の実施形態によれば、本発明によるTALEヌクレアーゼは、配列番号286及び配列番号287からなる群から選択される標的配列を認識し、切断する。TALEN配列及び遺伝子編集方法はまた、上述のGautronに記載されている。









いくつかの実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)CD3及びCD28活性化ビーズまたは抗体を使用して、患者から切除された腫瘍から取得されたTILの第1の集団を1~5日間活性化するステップと、
(b)第1のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集するステップであって、遺伝子編集が、サイトポレーション培地中のPD-1を標的とする転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸のエレクトロポレーションを使用して、第2のTIL集団を取得することを含み、遺伝子編集が、第2のTIL集団の細胞の一部において、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1の発現を阻害する、遺伝子編集するステップと、
(c)任意選択で、第2のTIL集団をインキュベートするステップであって、インキュベーションが、約30~40℃で、約5%のCOで行われる、インキュベートするステップと、
(d)IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む細胞培養培地中で第2のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約6~9日間行われて、第3のTIL集団を産生するステップと、
(e)第3のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第4のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約9~11日間行われて、第4のTIL集団を取得し、第4のTIL集団が、治療的TIL集団である、第4のTIL集団を産生するステップと、
(f)ステップ(e)から取得された治療的TIL集団を採取するステップと、
(g)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すステップと、を含み、
(h)ステップ(a)~(g)のうちの1つ以上が、閉鎖した無菌系で行われる。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集することであって、遺伝子編集が、サイトポレーション培地中のPD-1を標的とする転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸のエレクトロポレーションを使用して、第4のTIL集団を取得することを含み、遺伝子編集が、第3のTIL集団の細胞の一部において、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1の発現を阻害する、遺伝子編集することと、
(e)任意選択で、第4のTIL集団をインキュベートすることであって、インキュベーションが、約30~40℃で、約5%のCOで行われる、インキュベートすることと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊することによって第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、PD-1を標的とする転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸を、第3のTIL集団に移入させ、第4のTIL集団を取得することであって、遺伝子編集が、第3のTIL集団の細胞の一部において、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1の発現を阻害する、第4のTIL集団を取得することと、
(e)任意選択で、第4のTIL集団をインキュベートすることであって、インキュベーションが、約30~40℃で、約5%のCOで行われる、インキュベートすることと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)CD3及びCD28活性化ビーズまたは抗体を使用して、患者から切除された腫瘍から取得されたTILの第1の集団を1~5日間活性化するステップと、
(b)第1のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集するステップであって、遺伝子編集が、サイトポレーション培地中の配列番号149または配列番号150を標的とする転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸のエレクトロポレーションを使用して、第2のTIL集団を取得することを含み、遺伝子編集が、第2のTIL集団の細胞の一部において、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1の発現を阻害する、遺伝子編集するステップと、
(c)任意選択で、第2のTIL集団をインキュベートするステップであって、インキュベーションが、約30~40℃で、約5%のCOで行われる、インキュベートするステップと、
(d)IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む細胞培養培地中で第2のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約6~9日間行われて、第3のTIL集団を産生するステップと、
(e)第3のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第4のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約9~11日間行われて、第4のTIL集団を取得し、第4のTIL集団が、治療的TIL集団である、第4のTIL集団を産生するステップと、
(f)ステップ(e)から取得された治療的TIL集団を採取するステップと、
(g)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すステップと、を含み、
(h)ステップ(a)~(g)のうちの1つ以上が、閉鎖した無菌系で行われる。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集することであって、遺伝子編集が、サイトポレーション培地中の配列番号149または配列番号150を標的とする転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸のエレクトロポレーションを使用して、第4のTIL集団を取得することを含み、遺伝子編集が、第3のTIL集団の細胞の一部において、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1の発現を阻害する、遺伝子編集することと、
(e)任意選択で、第4のTIL集団をインキュベートすることであって、インキュベーションが、約30~40℃で、約5%のCOで行われる、インキュベートすることと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊して、配列番号149または配列番号150を標的とする転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸を、第3のTIL集団に移入させることによって、第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を取得することであって、遺伝子編集が、第3のTIL集団の細胞の一部において、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1の発現を阻害する、第4のTIL集団を取得することと、
(e)任意選択で、第4のTIL集団をインキュベートすることであって、インキュベーションが、約30~40℃で、約5%のCOで行われる、インキュベートすることと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)CD3及びCD28活性化ビーズまたは抗体を使用して、患者から切除された腫瘍から取得されたTILの第1の集団を1~5日間活性化するステップと、
(b)第1のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集するステップであって、遺伝子編集が、サイトポレーション培地中の配列番号157及び配列番号158または配列番号153及び配列番号154に従って転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸のエレクトロポレーションを使用して、第2のTIL集団を取得することを含み、遺伝子編集が、第2のTIL集団の細胞の一部において、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1の発現を阻害する、遺伝子編集するステップと、
(c)任意選択で、第2のTIL集団をインキュベートするステップであって、インキュベーションが、約30~40℃で、約5%のCOで行われる、インキュベートするステップと、
(d)IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む細胞培養培地中で第2のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約6~9日間行われて、第3のTIL集団を産生するステップと、
(e)第3のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第4のTIL集団を産生するステップであって、第2の拡張が、約9~11日間行われて、第4のTIL集団を取得し、第4のTIL集団が、治療的TIL集団である、第4のTIL集団を産生するステップと、
(f)ステップ(e)から取得された治療的TIL集団を採取するステップと、
(g)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すステップと、を含み、
(h)ステップ(a)~(g)のうちの1つ以上が、閉鎖した無菌系で行われる。
いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集することであって、遺伝子編集が、サイトポレーション培地中の配列番号157及び配列番号158または配列番号153及び配列番号154に従って転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードする核酸のエレクトロポレーションを使用して、第4のTIL集団を取得することを含み、遺伝子編集が、第3のTIL集団の細胞の一部において、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1の発現を阻害する、遺伝子編集することと、
(e)任意選択で、第4のTIL集団をインキュベートすることであって、インキュベーションが、約30~40℃で、約5%のCOで行われる、インキュベートすることと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるのは、拡張された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を調製するための方法であり、
(a)対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)IL-2を含む第1の細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~9日間培養して、第2のTIL集団を産生することと、
(c)抗CD3及び抗CD28ビーズまたは抗体を使用して、第2のTIL集団を1~7日間活性化して、第3のTIL集団を産生することと、
(d)第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊して、配列番号157及び配列番号158または配列番号153及び配列番号154に記載の転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼをコードするmRNAを、第3のTIL集団に移入させることによって、第3のTIL集団の少なくとも一部を遺伝子編集して、第4のTIL集団を取得することであって、遺伝子編集が、第3のTIL集団の細胞の一部において、細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1の発現を阻害する、第4のTIL集団を取得することと、
(e)任意選択で、第4のTIL集団をインキュベートすることであって、インキュベーションが、約30~40℃で、約5%のCOで行われる、インキュベートすることと、
(f)抗原提示細胞(APC)、OKT-3、及びIL-2を含む第2の細胞培養培地中で第4のTIL集団を約5~15日間培養して、増加した数のTILを産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
TALE法によりTILを永続的に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の他の非限定的な例には、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-21、NOTCH1/2細胞内ドメイン(ICD)、及び/またはNOTCHリガンドmDLL1が含まれる。
TALE法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得るシステム、方法、及び組成物の例は、米国特許第8,586,526号に記載されており、これは参照により本明細書に組み込まれる。これらの開示される例は、反復RVDを含有する2つ以上のTALE反復単位を有する天然に存在しないDNA結合ポリペプチド、TALEタンパク質の残基からなるN-キャップポリペプチド、及びTALEタンパク質の全長C末端領域の断片からなるC-キャップポリペプチドの使用を含む。
TALEN介在性遺伝子組み込み及び不活性化を効率的に行うために使用することができ、本発明の実施形態に従って使用することができるTALEN設計及び設計戦略、活性評価、スクリーニング戦略、ならびに方法の例は、Valton,et al.,Methods,2014,69,151-170(これは参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(e)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、第2のTIL集団の複数の細胞において、少なくとも1つの免疫チェックポイントタンパク質及び/または接着分子の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、少なくとも1つの免疫チェックポイントタンパク質及び/または接着分子の発現を調節する、TALEヌクレアーゼ系の送達を含む。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(e)第2のTIL集団の細胞膜を一過的に破壊して、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
少なくとも1つの遺伝子エディターの移入ステップが、第2のTIL集団の複数の細胞において、少なくとも1つの免疫チェックポイントタンパク質及び/または接着分子の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、少なくとも1つの免疫チェックポイントタンパク質及び/または接着分子の発現を調節する、TALEヌクレアーゼ系の送達を含む。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激して、第2のTIL集団を取得することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(e)少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させるための第2のTIL集団上での無菌エレクトロポレーションステップと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、第2のTIL集団の複数の細胞において、PD-1及びLAG-3の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1及びLAG-3の発現を抑制する、TALEヌクレアーゼ系の送達を含む。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカーに融合したサイトカインを含む。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激して、第2のTIL集団を取得することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(e)第2のTIL集団の細胞膜を一過的に破壊して、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
少なくとも1つの遺伝子エディターの移入ステップが、第2のTIL集団の複数の細胞において、PD-1及びLAG-3の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1及びLAG-3の発現を抑制する、TALEヌクレアーゼ系の送達を含む。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
c.ジンクフィンガー法
TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A)に従って、またはPCT/US2017/058610、PCT/US2018/012605、もしくはPCT/US2018/012633に記載されるように実行することができ、この方法は、ジンクフィンガーまたはジンクフィンガーヌクレアーゼ法によって、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のジンクフィンガー法の使用は、細胞表面での少なくとも1つの免疫調節組成物の発現を引き起こし、任意選択で、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは減少させる。代替的に、TIL拡張プロセス中のジンクフィンガー法の使用は、細胞表面での少なくとも1つの免疫調節組成物の発現を引き起こし、任意選択で、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。
個々のジンクフィンガーは、保存されたββα立体配置でおよそ30個のアミノ酸を含む。αらせんの表面上のいくつかのアミノ酸は、典型的には、異なる選択性レベルでDNAの主溝の3bpと接触する。ジンクフィンガーは、2つのタンパク質ドメインを有する。第1のドメインは、DNA結合ドメインであり、真核生物転写因子を含み、ジンクフィンガーを含む。第2のドメインは、ヌクレアーゼドメインであり、FokI制限酵素を含み、DNAの触媒的切断を担っている。
個々のZFNのDNA結合ドメインは、典型的には、3~6個の個々のジンクフィンガー反復配列を含み、各々9~18塩基対を認識することができる。ジンクフィンガードメインが目的の標的部位に特異的である場合、合計18塩基対を認識する3フィンガーZFNの対でさえ、理論的には、哺乳動物ゲノムの単一遺伝子座を標的とすることができる。新たなジンクフィンガーアレイを生成するための1つの方法は、既知の特異性を有するより小さいジンクフィンガー「モジュール」を組み合わせることである。最も一般的なモジュラーアセンブリプロセスは、各々3塩基対のDNA配列を認識することができる3つの別個のジンクフィンガーを組み合わせて、9塩基対の標的部位を認識することができる3フィンガーアレイを生成することを含む。あるいは、オリゴマー化プールエンジニアリング(OPEN)などの選択ベースのアプローチを使用して、隣接するフィンガー間のコンテキスト依存的相互作用を考慮したランダム化ライブラリーから新たなジンクフィンガーアレイを選択することができる。設計されたジンクフィンガーは市販されており、Sangamo Biosciences(Richmond,CA,USA)は、Sigma-Aldrich(St.Louis,MO,USA)と協同して、ジンクフィンガー構築のための独自のプラットフォーム(CompoZr(登録商標))を開発した。
ジンクフィンガー法によりTILを永久に遺伝子編集することによってサイレンスまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例には、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、TOX、SOCS1、ANKRD11、及びBCORが含まれる。
ジンクフィンガー法によりTILを永続的に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の非限定的な例には、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18、IL-21、NOTCH1/2細胞内ドメイン(ICD)、及び/またはNOTCHリガンドmDLL1が含まれる。
ジンクフィンガー法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得るシステム、方法、及び組成物の例は、米国特許第6,534,261号、同第6,607,882号、同第6,746,838号、同第6,794,136号、同第6,824,978号、同第6,866,997号、同第6,933,113号、同第6,979,539号、同第7,013,219号、同第7,030,215号、同第7,220,719号、同第7,241,573号、同第7,241,574号、同第7,585,849号、同第7,595,376号、同第6,903,185号、及び同第6,479,626号に記載されており、これらは参照により本明細書に組み込まれる。
ジンクフィンガー法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得るシステム、方法、及び組成物の他の例は、Beane,et al.,Mol.Therapy,2015,23 1380-1390に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激して、第2のTIL集団を取得することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(e)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、第2のTIL集団の複数の細胞において、少なくとも1つの免疫チェックポイントタンパク質及び/または接着分子の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、少なくとも1つの免疫チェックポイントタンパク質及び/または接着分子の発現を調節する、ジンクフィンガーヌクレアーゼ系の送達を含む。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激して、第2のTIL集団を取得することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(e)第2のTIL集団の細胞膜を一過的に破壊して、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
少なくとも1つの遺伝子エディターの移入ステップが、第2のTIL集団の複数の細胞において、少なくとも1つの免疫チェックポイントタンパク質及び/または接着分子の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、少なくとも1つの免疫チェックポイントタンパク質及び/または接着分子の発現を調節する、ジンクフィンガーヌクレアーゼ系の送達を含む。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(e)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、第2のTIL集団の複数の細胞において、PD-1及びLAG-3の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1及びLAG-3の発現を抑制する、ジンクフィンガーヌクレアーゼ系の送達を含む。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(e)第2のTIL集団の細胞膜を一過的に破壊して、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
少なくとも1つの遺伝子エディターの移入ステップが、第2のTIL集団の複数の細胞において、PD-1及びLAG-3の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1及びLAG-3の発現を抑制する、ジンクフィンガーヌクレアーゼ系の送達を含む。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームを使用して、第3のTIL集団の細胞膜を一時的に破壊する。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニストからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニストからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3のまたは第4のTIL集団を培養するステップ、または第2の拡張ステップが、第3のまたは第4のTIL集団を約1~7日間の第1の期間にわたって培養することによって行われるか、または第2の拡張を約1~7日間の第1の期間にわたって行い、第1の期間の終わりに、培養物を複数の継代培養物に分割し、複数の継代培養物の各々を追加のIL-2で約3~7日間の第2の期間にわたって培養し、第2の期間の終わりに、複数の継代培養物を組み合わせて、増加した数のTILまたは治療的TIL集団を提供するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日または11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約4~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約5~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約6~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約7~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約8~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約9~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約10~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約4~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約5~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約6~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約7~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約8~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約9~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約4~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約5~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約6~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約7~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約8~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約3~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約3~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約3~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約3~5日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約3~4日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約4~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約4~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約4~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約4~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約5~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約5~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約5~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約6~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約6~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約7~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約4~5日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約4日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約5日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のTIL集団を培養するステップまたは第1の拡張ステップが、約11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化するステップが約1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約2~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約3~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約4~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約5~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約6~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約1~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約1~5日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約1~4日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約1~3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約1~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約2~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約3~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約4~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約5~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約3~5日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約3~4日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約2~5日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約2~4日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約2~3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約4~5日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約1日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約4日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約5日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、活性化ステップが約7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、刺激ステップが約1日、2日、または3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、刺激ステップが約1~2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、刺激ステップが約2~3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、刺激ステップが約1日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、刺激ステップが約2日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、刺激ステップが約3日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3または第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが、約5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、14日、または15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約6~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約7~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約8~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約9~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約10~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約11~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約12~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約13~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約14~15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約5~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約6~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約7~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約8~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約9~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約10~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約11~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約12~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約13~14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約5~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約5~12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約5~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約5~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約5~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約5~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約5~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約5~6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約6~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約6~12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約6~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約6~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約6~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約6~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約6~7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約7~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約7~12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約7~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約7~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約7~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約7~8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約8~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約8~12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約8~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約8~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約8~9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約9~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約9~12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約9~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約9~10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約10~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約10~12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約10~11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約11~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約11~12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約12~13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約5日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約6日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約7日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約8日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約9日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約10日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約11日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約12日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約13日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約14日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第3もしくは第4のTIL集団を培養するステップまたは第2の拡張ステップが約15日間行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
E.一過性細胞修飾
いくつかの実施形態では、本発明の拡張TILは、タンパク質発現を一過的に変化させるために、各々本明細書で提供されるように、閉鎖滅菌製造プロセス中を含む、拡張ステップ前、拡張ステップ中、または拡張ステップ後にさらに操作される。いくつかの実施形態では、本発明は、1つ以上のタンパク質の発現の促進または1つ以上のタンパク質の発現の阻害、ならびに一組のタンパク質の促進及び別の組のタンパク質の阻害の両方の組み合わせの同時発生のために、TIL集団へのリボ核酸(RNA)挿入(メッセンジャーRNA(mRNA)の挿入を含む)などのヌクレオチド挿入による一過性細胞修飾を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の拡張TILは、タンパク質発現の一過性の変化を受ける。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、第1の拡張前にバルクTIL集団において生じる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、第1の拡張後に生じる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、第2の拡張前にバルクTIL集団において生じる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、第2の拡張後に生じる。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、免疫調節組成物の一過性の発現をもたらす。いくつかの実施形態では、免疫調節組成物は、免疫調節融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、免疫調節融合タンパク質は、免疫調節剤に融合した膜アンカーを含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-7、IL-10、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、及びIL-21からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択されるインターロイキンである。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択されるインターロイキンである。
本明細書で考察されたように、本発明の実施形態は、それらの治療効果を増強するためにタンパク質発現の一過性の改変を介して一過的に修飾された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を提供する。本発明の実施形態は、免疫調節組成物の発現のために、TIL集団へのヌクレオチド挿入(例えば、RNA)による一過性の修飾を包含する。本発明の実施形態は、TILを治療用集団に拡張するための方法も提供し、方法は、TILの一過性の修飾を含む。TIL集団を一過的に修飾するために使用され得るいくつかの遺伝子編集技術が存在し、それらは本発明による使用に好適である。
いくつかの実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に改変する方法は、TILを、免疫調節組成物をコードする核酸(例えば、mRNA)と接触させ、次いで、細胞にエレクトロポレーションステップを課すことを含む。エレクトロポレーション法は、当該技術分野で知られており、例えば、Tsong,Biophys.J.1991,60,297-306及び米国特許出願公開第2014/0227237A1号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。米国特許第5,019,034号、同第5,128,257号、同第5,137,817号、同第5,173,158号、同第5,232,856号、同第5,273,525号、同第5,304,120号、同第5,318,514号、同第6,010,613号、及び同第6,078,490号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるものなどの当該技術分野で知られている他のエレクトロポレーション法が使用され得る。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、滅菌エレクトロポレーション法である。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、パルスエレクトロポレーション法である。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのDC電気パルス列は、以下の特徴のうちの1つ、2つ、または3つを有する:(1)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる、(2)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる、及び(3)少なくとも3つのパルスのうちの2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILにおける細孔形成を誘導するステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つのDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのDC電気パルス列は、以下の特徴のうちの1つ、2つ、または3つを有する:(1)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる、(2)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる、及び(3)少なくとも3つのパルスのうちの2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なり、これにより、誘導された細孔が比較的長期間にわたって持続され、TILの生存率が維持される。
いくつかの実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、リン酸カルシウムトランスフェクションステップを含む。リン酸カルシウムトランスフェクション法(リン酸カルシウム核酸沈殿、細胞表面コーティング、及びエンドサイトーシス)は、当該技術分野で知られており、Graham and van der Eb,Virology 1973,52,456-467、Wigler,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.1979,76,1373-1376、及びChen and Okayarea,Mol.Cell.Biol.1987,7,2745-2752、ならびに米国特許第5,593,875号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、リポソームトランスフェクションステップを含む。リポソームトランスフェクション法、例えば、カチオン性脂質N-[1-(2,3-ジオレイルオキシ)プロピル]-n,n,n-トリメチルアンモニウムクロリド(DOTMA)及びジオレオイルホスホチジルエタノールアミン(DOPE)の1:1(w/w)リポソーム製剤を用いる方法は、当該技術分野において既知であり、Rose,et al.,Biotechniques 1991,10,520-525及びFelgner,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1987,84,7413-7417、ならびに米国特許第5,279,833号、同第5,908,635号、同第6,056,938号、同第6,110,490号、同第6,534,484号、及び同第7,687,070号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、米国特許第5,766,902号、同第6,025,337号、同第6,410,517号、同第6,475,994号、及び同第7,189,705号に記載されている方法を使用するトランスフェクションステップを含み、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。TILは、本明細書に記載のTILの第1の集団、第2の集団、及び/または第3の集団であり得る。
いくつかの実施形態では、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームが、タンパク質発現を一過的に改変するために使用される。例えば、国際特許出願公開第WO2013/059343A1号、同第WO2017/008063A1号、もしくは同第WO2017/123663A1号、または米国特許出願公開第2014/0287509A1号、同第2018/0201889A1号、もしくは同第2018/0245089A1号を参照されたい(これらのすべては、参照によりそれら全体が、特に核酸送達のためのマイクロ流体プラットフォームの開示について本明細書に組み込まれる)。SQZプラットフォームでは、修飾のためのTILの細胞膜は、マイクロ流体収縮によって一時的に破壊され、それによって一過的に発現されたタンパク質をコードする核酸の送達を可能にする。TILは、本明細書に記載のTILの第1の集団、第2の集団、及び/または第3の集団であり得る。
F.免疫チェックポイント
本発明の特定の実施形態によれば、TIL集団は、TIL集団におけるTIL細胞の細胞表面で1つ以上の免疫調節組成物を発現し、TIL集団における1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子を遺伝子修飾するように遺伝子編集される。別の言い方をすると、細胞表面で1つ以上の免疫調節組成物を発現させるようにTIL集団を改変することに加えて、TILの1つ以上の免疫チェックポイントをコードするTIL内のDNA配列が、TILのゲノム内で永続的に修飾される、例えば、挿入される、欠失される、または置換される。免疫チェックポイントは、阻害経路または刺激経路を介して免疫応答を調節するリンパ球によって発現される分子である。がんの場合、免疫チェックポイント経路は、しばしば活性化されて抗腫瘍応答を阻害する、すなわち、悪性細胞によるある特定の免疫チェックポイントの発現は、抗腫瘍免疫を阻害し、がん細胞の成長を促進する。例えば、Marin-Acevedo et al.,Journal of Hematology&Oncology(2018)11:39を参照されたい。したがって、ある特定の阻害チェックポイント分子は、本発明の免疫療法の標的として機能する。特定の実施形態によれば、TILは、ある特定の免疫チェックポイント経路を遮断または刺激し、それによって腫瘍に対する体の免疫学的活性を増強するように遺伝子編集される。
本明細書で使用される場合、免疫チェックポイント遺伝子は、免疫チェックポイント分子をコードするDNA配列を含む。本発明の特定の実施形態によれば、TIL拡張法中の遺伝子編集TILは、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは減少させる。例えば、遺伝子編集は、免疫反応を増強するために、PD-1またはCTLA-4などの阻害性受容体の発現をサイレンスまたは減少させ得る。
最も広く研究されているチェックポイントには、プログラムされた細胞死受容体-1(PD-1)及び細胞傷害性Tリンパ球関連分子-4(CTLA-4)が含まれ、これらは、それらが阻害リガンドと相互作用するときに、主要なエフェクター機能(例えば、活性化、増殖、サイトカイン放出、細胞傷害性など)を阻害する免疫細胞上の阻害性受容体である。以下でさらに詳細に論じられるように、PD-1及びCTLA-4に加えて、多数のチェックポイント分子が免疫療法の潜在的な標的として浮上している。
本発明のTILを永続的に遺伝子編集することによってサイレンスまたは阻害され得る免疫チェックポイント遺伝子の非限定的な例には、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、BAFF(BR3)、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、TOX、SOCS1、ANKRD11、及びBCORが含まれる。例えば、本発明のTILにおいてサイレンシングまたは阻害され得る免疫チェックポイント遺伝子は、PD-1、CTLA-4、LAG-3、TIM-3、Cish、CBL-B、TIGIT、TET2、TGFβ、及びPKAを含む群から選択されてもよい。BAFF(BR3)は、Bloom,et al.,J.Immunother.,2018,in pressに記載されている。別の実施例によれば、本発明のTILにおいてサイレンスまたは阻害され得る免疫チェックポイント遺伝子は、PD-1、LAG-3、TIM-3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PRA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせを含む群から選択されてもよい。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(e)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われ、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された第3のTIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップは、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)系、転写活性化因子様エフェクター(TALE)系、またはジンクフィンガー系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系の送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディター系は、第2のTIL集団の複数の細胞において、PD-1、LAG-3、TIM-3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PRA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される分子の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、その分子の発現を阻害する。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。
1.PD-1
チェックポイント遮断の誘導のために最も研究されている標的のうちの1つは、T細胞調節因子のCD28スーパーファミリーのメンバーであるプログラム死受容体(PD1またはPD-1、PDCD1としても知られている)である。そのリガンドであるPD-L1及びPD-L2は、メラノーマを含む様々な腫瘍細胞上で発現する。PD-1とPD-L1との相互作用は、T細胞エフェクター機能を阻害し、慢性刺激の設定においてT細胞疲弊をもたらし、腫瘍微小環境においてT細胞アポトーシスを誘導する。PD1はまた、免疫監視からの腫瘍特異的エスケープにおいても役割を果たし得る。
特定の実施形態によれば、TIL中のPD1の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは減少される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、PD1の発現をサイレンシングまたは抑制することによって、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、PD1などの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のPD1の発現をサイレンシングまたは低減し得る。
2.CTLA-4
CTLA-4発現は、活性化T細胞上でのT細胞活性化時に誘導され、抗原提示細胞活性化抗原CD80及びCD86との結合について競合する。CTLA-4とCD80またはCD86との相互作用は、T細胞阻害を引き起こし、免疫応答のバランスを維持するのに役立つ。しかしながら、CD80またはCD86とのCTLA-4相互作用の阻害は、T細胞の活性化を延長し、したがって、がん抗原に対する免疫応答のレベルを増加させ得る。
特定の実施形態によれば、TIL中のCTLA-4の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは減少される。特定の実施形態によれば、TIL中のPD-1及びCTLA-4の両方の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは低減される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のCTLA-4の発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、CTLA-4などの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のCTLA-4の発現をサイレンスまたは抑制し得る。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TALEN法を使用して、TIL中のPD-1及びCTLA-4の発現をサイレンシングまたは低減し得る。
3.LAG-3
リンパ球活性化遺伝子-3(LAG-3、CD223)は、主要組織適合複合体(MHC)クラスIIのライゲーション後に、T細胞及びナチュラルキラー(NK)細胞によって発現される。その機序は不明なままであるが、その調節は、T細胞機能に対して負の調節効果を引き起こし、組織損傷及び自己免疫を防止する。LAG-3及びPD-1は、TIL上でしばしば共発現及び上方制御され、免疫疲弊及び腫瘍成長につながる。したがって、LAG-3遮断は、抗腫瘍応答を改善する。例えば、Marin-Acevedo et al.,Journal of Hematology&Oncology(2018)11:39を参照されたい。
特定の実施形態によれば、TIL中のLAG-3の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは減少される。特定の実施形態によれば、TIL中のPD-1及びLAG-3の両方の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは低減される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のLAG-3の発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、LAG-3などの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。特定の実施形態によれば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のLAG-3の発現をサイレンスまたは抑制し得る。いくつかの実施形態では、TALEN法を使用して、TIL中のPD-1及びLAG-3の発現をサイレンシングまたは低減し得る。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。
4.TIM-3
T細胞免疫グロブリン-3(TIM-3)は、T細胞の直接的な負の調節因子であり、NK細胞及びマクロファージ上で発現する。TIM-3は、骨髄由来サプレッサー細胞(MDSC)の増殖を誘導することにより、間接的に免疫抑制を促進する。そのレベルは、機能不全及び疲弊したT細胞で特に上昇することが見出されており、悪性腫瘍における重要な役割を示唆している。
特定の実施形態によれば、TIL中のTIM-3の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは減少される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のTIM-3の発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、TIM-3などの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のTIM-3の発現をサイレンスまたは抑制し得る。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。
5.Cish
サイトカインシグナル伝達(SOCS)ファミリーのサプレッサーのメンバーであるCishは、CD8+T細胞におけるTCR刺激によって誘導され、腫瘍に対するそれらの機能的不活性を阻害する。CD8+T細胞におけるCishの遺伝的欠失は、それらの拡大、機能的親和性、及びサイトカイン多機能性を増強し得、確立された腫瘍の顕著で持続的な退縮をもたらす。例えば、Palmer et al.,Journal of Experimental Medicine,212(12):2095(2015)を参照されたい。
特定の実施形態によれば、TIL中のCishの発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは減少される。特定の実施形態によれば、TIL中のPD-1及びCishの両方の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは低減される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のCishの発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、Cishなどの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のCishの発現をサイレンスまたは抑制し得る。いくつかの実施形態では、TALEN法を使用して、TIL中のPD-1及びCishの発現をサイレンシングまたは低減し得る。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。
6.TGFβ
TGFβシグナル伝達経路は、細胞増殖、分化、アポトーシス、運動性及び侵入、細胞外マトリックス産生、血管新生、ならびに免疫応答を調節することにおいて複数の機能を有する。TGFβシグナル伝達の調節解除は、腫瘍において頻繁に行われ、腫瘍の開始、発達及び転移において重要な役割を有する。微小環境レベルでは、TGFβ経路は、発がん全体にわたる腫瘍成長及び転移のための好ましい微小環境を生成することに寄与する。例えば、Neuzillet et al.Pharmacology&Therapeutics,Vol.147,pp.22-31(2015)を参照されたい。
特定の実施形態によれば、TIL中のTGFβの発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは減少される。特定の実施形態によれば、TIL中のPD-1及びTGFβの両方の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは低減される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のTGFβの発現をサイレンシングまたは減少させることを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、TGFβなどの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のTGFβの発現をサイレンスまたは抑制し得る。いくつかの実施形態では、TALEN法を使用して、TIL中のPD-1及びTGFβの発現をサイレンシングまたは低減し得る。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、TGFβR2(TGFベータ受容体2)は、CRISPR/Cas9系を使用してTGFβR2をサイレンシングすることによって、または当該技術分野で知られている方法を使用してTGFβR2優性陰性細胞外トラップを使用することによって抑制され得る。
7.PKA
タンパク質キナーゼA(PKA)は、セリン-トレオニンタンパク質キナーゼスーパーファミリーの周知のメンバーである。cAMP依存性タンパク質キナーゼとしても知られるPKAは、cAMP結合時の活性化を介してGタンパク質結合受容体のシグナル伝達を媒介するマルチユニットプロテインキナーゼである。それは、代謝からイオンチャネル活性化、細胞成長及び分化、遺伝子発現及びアポトーシスまでの多種多様な細胞プロセスの制御に関与する。重要なことに、PKAは、多くの腫瘍の開始及び進行に関与している。例えば、Sapio et al.,EXCLI Journal;2014;13:843-855.
特定の実施形態によれば、TIL中のPKAの発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンスまたは減少される。特定の実施形態によれば、TIL中のPD-1及びPKAの両方の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは低減される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のPKAの発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、PKAなどの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のPKAの発現をサイレンスまたは抑制し得る。いくつかの実施形態では、TALEN法を使用して、TIL中のPD-1及びPKAの発現をサイレンシングまたは低減し得る。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。
8.CBLB
CBLB(またはCBL-B)は、E3ユビキチン-タンパク質リガーゼであり、T細胞活性化の負の制御因子である。Bachmaier,et al.,Nature,2000,403,211-216、Wallner,et al.,Clin.Dev.Immunol.2012,692639。
特定の実施形態によれば、TIL中のCBLBの発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンスまたは減少される。特定の実施形態によれば、TIL中のPD-1及びCBL-Bの両方の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは低減される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のCBLBの発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、CBLBなどの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のPKAの発現をサイレンスまたは抑制し得る。いくつかの実施形態では、TALEN法を使用して、TIL中のPD-1及びCBL-Bの発現をサイレンシングまたは低減し得る。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、CBLBは、TALENノックアウトを使用してサイレンシングされる。いくつかの実施形態では、CBLBは、TALE-KRAB転写阻害剤ノックインを使用してサイレンシングされる。これらの方法のさらなる詳細は、Boettcher and McManus,Mol.Cell Review,2015,58,575-585に見出すことができる。
9.TIGIT
Ig及びITIM(免疫受容体チロシンベースの阻害モチーフ)ドメインまたはTIGITを有するT細胞免疫受容体は、Ig様V型ドメインを有し、その細胞質ドメイン内にITIMを有する膜貫通糖タンパク質受容体である。Khalil,et al.,Advances in Cancer Research,2015,128,1-68、Yu,et al.,Nature Immunology,2009,Vol.10,No.1,48-57。TIGITは、いくつかのT細胞及びナチュラルキラー細胞によって発現される。追加として、TIGITは、特にメラノーマを有する個体から、抗原特異的CD8+T細胞及びCD8+TIL上で過剰発現することが示されている。研究では、TIGIT経路が腫瘍免疫回避に寄与し、TIGIT阻害がポリクローナル及び抗原特異的刺激に応答して、T細胞の活性化及び増殖を増加させることが示されている。Khalil,et al.,Advances in Cancer Research,2015,128,1-68.さらに、PD-1またはTIM3のいずれかとのTIGITの共遮断は、マウスモデルにおいて固形腫瘍に対する相乗効果を示している。Id.;Kurtulus,et al.,The Journal of Clinical Investigation,2015,Vol.125,No.11,4053-4062も参照されたい。
特定の実施形態によれば、TIL中のTIGITの発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンスまたは減少される。特定の実施形態によれば、TIL中のPD-1及びTIGITの両方の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは低減される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TIL中のTIGITの発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、TIGITなどの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のTIGITの発現をサイレンスまたは抑制し得る。いくつかの実施形態では、TALEN法を使用して、TIL中のPD-1及びTIGITの発現をサイレンシングまたは低減し得る。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。TIGITは、TALENノックアウトを使用してサイレンシングされる。いくつかの実施形態では、TIGITは、TALE-KRAB転写阻害剤ノックインを使用してサイレンシングされる。これらの方法のさらなる詳細は、Boettcher and McManus,Mol.Cell Review,2015,58,575-585に見出すことができる。いくつかの実施形態では、TALEN法を使用して、TIL中のPD-1及びTIGITの発現をサイレンシングまたは低減し得る。
10.TOX
胸腺細胞選択関連高移動度群(HMG)ボックス(TOX)は、HMGボックスDNA結合ドメインを含有する転写因子である。TOXは、配列非依存であるが構造依存的な方法でDNAに結合すると考えられるHMGボックススーパーファミリーのメンバーである。
TOXは、腫瘍特異的CD8T細胞機能障害またはT細胞枯渇の重要な調節因子として同定され、例えば、Scott,et al.,Nature,2019,571,270-274及びKhan,et al.,Nature,2019,571,211-218(これらの両方は、参照によりそれら全体が本明細書に組み込まれる)に記載されるように、CD8T細胞疲弊を転写的かつ後成的にプログラムすることが見出された。TOXはまた、Alfei,et al.,Nature,2019,571,265-269(これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に記載されるように、慢性感染中のT細胞機能不全の進行及び疲弊したT細胞の維持に対する重要な因子であることが見出された。TOXは、腫瘍及び慢性ウイルス感染からの機能不全または疲弊したT細胞において高度に発現される。インビトロでのエフェクターT細胞におけるTOXの異所発現は、T細胞疲弊に関連する転写プログラムを誘導したが、T細胞におけるTOXの欠失は、T疲弊プログラムを廃止した。
特定の実施形態によれば、TIL中のTOXの発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンスまたは減少される。特定の実施形態によれば、TIL中のPD-1及びTOXの両方の発現は、本発明の組成物及び方法に従ってサイレンシングまたは低減される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGEN3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TILの細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、TOXの発現をサイレンシングまたは抑制することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、TOXなどの免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TIL中のTOXの発現をサイレンスまたは抑制し得る。いくつかの実施形態では、TALEN法を使用して、TIL中のPD-1及びTOXの発現をサイレンシングまたは低減し得る。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。
G.共刺激受容体または接着分子の過剰発現
追加の実施形態によれば、TIL拡張法中の遺伝子編集TILは、細胞表面における少なくとも1つの免疫調節組成物の発現を引き起こし、1つ以上の共刺激受容体、接着分子及び/またはサイトカインの発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。例えば、遺伝子編集は、共刺激受容体、接着分子またはサイトカインの発現を増強させ得、これは、遺伝子修飾されていない共刺激受容体、接着分子またはサイトカインの発現と比較して、それが過剰発現されることを意味する。本発明のTILを永続的に遺伝子編集することによって増強された発現を示し得る共刺激性受容体、接着分子またはサイトカイン遺伝子の非限定的な例には、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18、IL-21、NOTCH1/2細胞内ドメイン(ICD)、及び/またはNOTCHリガンドmDLL1などのある特定のケモカイン受容体及びインターロイキンが含まれる。
1.CCRs
養子T細胞免疫療法が有効であるためには、T細胞をケモカインによって腫瘍内に適切に輸送する必要がある。腫瘍細胞によって分泌されるケモカイン、末梢に存在するケモカイン、及びT細胞によって発現されるケモカイン受容体との間の一致は、T細胞の腫瘍床への輸送を成功させるために重要である。
特定の実施形態によれば、本発明の遺伝子編集方法を使用して、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3及びCX3CR1のうちの1つ以上などのTILにおけるある特定のケモカイン受容体の発現を増加させてもよい。CCRの過剰発現は、エフェクター機能及び養子移植後のTILの増殖を促進するのに役立ち得る。
特定の実施形態によれば、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3及びCX3CR1のうちの1つ以上のTILにおける発現は、本発明の組成物及び方法に従って増強される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGen3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を遺伝子編集して、TIL中のCCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3及びCX3CR1のうちの1つ以上の細胞表面において少なくとも1つの免疫調節組成物を発現し、発現を増強することを含む。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。
以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、ケモカイン受容体遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TILにおけるある特定のケモカイン受容体の発現を増強することができる。
いくつかの実施形態では、CCR4及び/またはCCR5接着分子は、本明細書に記載のガンマ-レトロウイルスまたはレンチウイルス法を使用して、TIL集団に挿入される。いくつかの実施形態では、CXCR2接着分子は、Forget,et al.,Frontiers Immunology 2017,8,908またはPeng,et al.,Clin.Cancer Res.2010,16,5458(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるようなガンマレトロウイルスまたはレンチウイルス法を使用して、TIL集団に挿入される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激して、第2のTIL集団を取得することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(e)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われ、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された第3のTIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)系、転写活性化因子様エフェクター(TALE)系、またはジンクフィンガー系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系の送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディター系が、第2のTIL集団の複数の細胞において、PD-1及び任意選択でLAG-3の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1及び任意選択でLAG-3の発現を阻害し、さらに少なくとも1つの遺伝子エディター系が、第2のTIL集団の複数の細胞の細胞表面でCXCR2接着分子を発現させる、またはCXCR2接着分子が、ガンマレトロウイルスまたはレンチウイルス法によって第1のTIL集団、第2のTIL集団、または採取されたTIL集団に挿入される。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、刺激することと、
(e)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われ、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された第3のTIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)系、転写活性化因子様エフェクター(TALE)系、またはジンクフィンガー系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系の送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディター系が、第2のTIL集団の複数の細胞において、PD-1及び任意選択でLAG-3の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1及び任意選択でLAG-3の発現を阻害し、さらに少なくとも1つの遺伝子エディター系が、第2のTIL集団の複数の細胞の細胞表面でCCR4及び/またはCCR5接着分子を発現させる、またはCXCR2接着分子が、ガンマレトロウイルスまたはレンチウイルス法によって第1のTIL集団、第2のTIL集団、または採取されたTIL集団に挿入される。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激して、第2のTIL集団を取得することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(e)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを第2のTIL集団の複数の細胞に移入させることと、
(f)第2のTIL集団を約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われ、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された第3のTIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)系、転写活性化因子様エフェクター(TALE)系、またはジンクフィンガー系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系の送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディター系が、第2のTIL集団の複数の細胞において、PD-1及び任意選択でLAG-3の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1及び任意選択でLAG-3の発現を阻害し、さらに少なくとも1つの遺伝子エディター系が、第2のTIL集団の複数の細胞の細胞表面でCCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される接着分子を発現させる、または接着分子が、ガンマレトロウイルスまたはレンチウイルス法によって第1のTIL集団、第2のTIL集団、または採取されたTIL集団に挿入される。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカー(例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質)に融合された免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21及びCD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)からなる群から選択される。
2.インターロイキン
追加の実施形態によれば、本発明の遺伝子編集方法を使用して、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18及びIL-21のうちの1つ以上などのある特定のインターロイキンの発現を増加させてもよい。ある特定のインターロイキンは、T細胞のエフェクター機能を増加させ、腫瘍制御を媒介することが実証されている。
特定の実施形態によれば、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18、及びIL-21のうちの1つ以上のTILにおける発現は、本発明の組成物及び方法に従って増強される。例えば、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、プロセス2A、プロセスGen3、または図34及び35に示される方法)に従って実行することができ、方法は、TILの少なくとも一部を、IL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18及びIL-21のうちの1つ以上の発現を増強することによって遺伝子編集することを含む。以下でより詳細に記載されるように、遺伝子編集プロセスは、インターロイキン遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。例えば、CRISPR法、TALE法、またはジンクフィンガー法を使用して、TILにおけるある特定のインターロイキンの発現を増強することができる。
いくつかの実施形態によると、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法は、
(a)患者から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、
(b)腫瘍断片を閉鎖系に添加することと、
(c)IL-2を含み、任意選択でOKT-3及び/または4-1BBアゴニスト抗体を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3~11日間培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われる第2のTIL集団を産生することと、
(d)OKT-3を添加し、約1~3日間培養することによって、第2のTIL集団を刺激して、第2のTIL集団を取得することであって、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を取得することと、
(e)第2のTIL集団を無菌エレクトロポレーションして、少なくとも1つの遺伝子エディターを移入させることと、
(f)第2のTIL集団を、第2のTIL集団内の複数の細胞内に約1日間静置することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、任意選択でOKT-3抗体、任意選択でOX40抗体、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~11日間行われ、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(g)から取得された治療的TIL集団を採取して、採取されたTIL集団を提供することであって、ステップ(g)からステップ(h)への移行が、系を開くことなく起こり、採取されたTIL集団が、治療的TIL集団である、提供することと、
(i)採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(h)から(i)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)任意選択で、凍結保存培地を使用して、採取されたTIL集団を凍結保存することと、を含み、
エレクトロポレーションステップが、クラスター化規則的散在短回文反復(CRISPR)系、転写活性化因子様エフェクター(TALE)系、またはジンクフィンガー系からなる群から選択される少なくとも1つの遺伝子エディター系の送達を含み、少なくとも1つの遺伝子エディター系が、第2のTIL集団の複数の細胞において、PD-1及び任意選択でLAG-3の細胞表面で少なくとも1つの免疫調節組成物を発現させ、PD-1及び任意選択でLAG-3の発現を阻害し、さらに少なくとも1つの遺伝子エディター系が、第2のTIL集団の複数の細胞の細胞表面でIL-2、IL-4、IL-7、IL-10、IL-15、IL-18、IL-21、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるインターロイキンを発現させる、またはインターロイキンが、ガンマレトロウイルスまたはレンチウイルス法によって第1のTIL集団、第2のTIL集団、または採取されたTIL集団に挿入される。いくつかの実施形態では、少なくとも1つの免疫調節組成物は、膜アンカーに融合したサイトカインを含む。いくつかの実施形態では、サイトカインは、IL-12、IL-15、IL-18、及びIL-21からなる群から選択される。
V.Gen2 TIL製造プロセス
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の凍結保存されたTIL調製物の作製後、患者は、ICI及び/または標準治療の治療時またはその後に進行性疾患の発現を監視される。いくつかの実施形態では、患者は、ICI及び/または標準治療の治療時またはその後に進行性癌を示し、自己TIL療法に適応される。いくつかの実施形態では、進行後、凍結保存されたTIL調製物を解凍し、以下のセクションに記載の拡張方法に従って拡張する。
これらの特徴のうちのいくつかを含む、Gen2として知られる(プロセス2Aとしても知られる)TILプロセスの例示的なファミリーが、図1及び2に示される。Gen2の実施形態を図2に示す。
本明細書で考察されるように、本発明は、患者への移植前に凍結保存されたTILを再刺激して、それらの代謝活性、ひいては相対的健康を向上させることに関するステップ、及び当該代謝健康を試験する方法を含み得る。本明細書で一般に概説されるように、TILは、一般に、患者試料から採取され、患者への移植前にそれらの数を拡張するように操作される。いくつかの実施形態では、TILは、以下で考察されるように、任意で遺伝子操作され得る。
いくつかの実施形態では、TILは、凍結保存され得る。解凍した時点で、それらが再刺激されて、患者への注入前に代謝を高めることができる。
いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図で詳細に考察されるように、第1の拡張(REP前と称されるプロセス、ならびに図1にステップAとして示されるプロセスを含む)は、3~14日に短縮され、第2の拡張(REPと称されるプロセス、ならびに図1にステップBとして示されるプロセスを含む)は、7~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、第1の拡張(例えば、図1にステップBとして記載される拡張)は、11日に短縮され、第2の拡張(例えば、図1にステップDとして記載される拡張)は、11日に短縮される。いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図で詳細に考察されるように、第1の拡張と第2の拡張との組み合わせ(例えば、図1にステップB及びステップDとして記載される拡張)は、22日に短縮される。
以下の「ステップ」表記A、B、Cなどは、図1を参照し、本明細書に記載のある特定の実施形態を参照する。以下及び図1におけるステップの順序は例示であり、ステップの任意の組み合わせまたは順序、ならびに追加のステップ、ステップの繰り返し、及び/またはステップの省略は、本出願及び本明細書に開示される方法によって企図される。
A.ステップA:患者の腫瘍試料を取得する
一般に、TILは、最初に患者の腫瘍試料から取得され、その後、本明細書に記載されるさらなる操作のためにより大きい集団に拡張され、任意選択で凍結保存され、本明細書に概説されるように再刺激され、任意選択でTIL健康の指標として表現型及び代謝パラメータについて評価される。
患者の腫瘍試料は、一般に外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段を介して、当該技術分野で知られている方法を使用して取得することができる。いくつかの実施形態では、多病変試料採取が使用される。いくつかの実施形態では、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段は、多病変試料採取を含む(すなわち、患者の1つ以上の腫瘍部位及び/または場所、ならびに同じ場所または近接した1つ以上の腫瘍から試料を取得する)。一般に、腫瘍試料は、原発腫瘍、浸潤性腫瘍、または転移性腫瘍を含む、任意の固形腫瘍に由来し得る。腫瘍試料は、血液系悪性腫瘍から取得された腫瘍などの液体腫瘍であり得る。固形腫瘍は、肺組織のものであり得る。いくつかの実施形態では、有用なTILは、非小細胞肺癌(NSCLC)から得られる。固形腫瘍は、皮膚組織のものであり得る。いくつかの実施形態では、有用なTILは、黒色腫から取得される。
取得された時点で、腫瘍試料は、一般に、鋭的解剖を使用して1~約8mmの小片に断片化され、約2~3mmが特に有用である。いくつかの実施形態では、TILは、酵素腫瘍消化物を使用してこれらの断片から培養される。かかる腫瘍消化物は、酵素培地(例えば、Roswell Park Memorial Institute(RPMI)1640緩衝液、2mMグルタメート、10mcg/mLゲンタマイシン、30単位/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(例えば、組織解離機を使用する)によって産生され得る。腫瘍消化物は、腫瘍を酵素培地に入れ、腫瘍をおよそ1分間機械的に解離させ、続いて5% CO中37℃で30分間インキュベートし、続いて小さな組織片のみが存在するまで、前述の条件下で機械的解離及びインキュベーションのサイクルを繰り返すことによって産生することができる。このプロセスの最後に、細胞懸濁液中に多数の赤血球または死細胞が含まれている場合、FICOLL分岐親水性多糖類を使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。米国特許出願公開第2012/0244133A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているものなどの当該技術分野で知られている代替の方法を使用することができる。前述の方法のうちのいずれかが、TILを拡張する方法またはがんを治療する方法について本明細書に記載される実施形態のうちのいずれかにおいて使用され得る。
腫瘍解離酵素混合物には、1つ以上の解離(消化)酵素、例えば、限定されないが、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはコラゲナーゼの種類を含む)、Accutase(商標)、Accumax(商標)、ヒアルロニダーゼ、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)、キモトリプシン、キモパパイン、トリプシン、カゼイナーゼ、エラスターゼ、パパイン、XIV型プロテアーゼ(プロナーゼ)、デオキシリボヌクレアーゼI(DNase)、トリプシン阻害剤、任意の他の解離酵素またはタンパク質分解酵素、及びそれらの任意の組み合わせが含まれ得る。
いくつかの実施形態では、解離酵素は、凍結乾燥酵素から再構成される。いくつかの実施形態では、凍結乾燥酵素は、HBSSなどの滅菌緩衝液の量で再構成される。
いくつかの事例では、コラゲナーゼ(アニマルフリー1型コラゲナーゼなど)を、10mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝液で再構成する。凍結乾燥ストック酵素は、2892PZ U/バイアルの濃度であり得る。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼは、5mL~15mLの緩衝液中で再構成される。いくつかの実施形態では、再構成後のコラゲナーゼストックは、約100PZ U/mL~約400PZ U/mLの範囲、例えば、約100PZ U/mL~約400PZ U/mL、約100PZ U/mL~約350PZ U/mL、約100PZ U/mL~約300PZ U/mL、約150PZ U/mL~約400PZ U/mL、約100PZ U/mL、約150PZ U/mL、約200PZ U/mL、約210PZ U/mL、約220PZ U/mL、約230PZ U/mL、約240PZ U/mL、約250PZ U/mL、約260PZ U/mL、約270PZ U/mL、約280PZ U/mL、約289.2PZ U/mL、約300PZ U/mL、約350PZ U/mL、または約400PZ U/mLである。
いくつかの実施形態では、中性プロテアーゼは、1mlの滅菌HBSSまたは別の緩衝液中で再構成される。凍結乾燥ストック酵素は、175DMC U/バイアルの濃度であり得る。いくつかの実施形態では、再構成後の中性プロテアーゼストックは、約100DMC/mL~約400DMC/mLの範囲、例えば、約100DMC/mL~約400DMC/mL、約100DMC/mL~約350DMC/mL、約100DMC/mL~約300DMC/mL、約150DMC/mL~約400DMC/mL、約100DMC/mL、約110DMC/mL、約120DMC/mL、約130DMC/mL、約140DMC/mL、約150DMC/mL、約160DMC/mL、約170DMC/mL、約175DMC/mL、約180DMC/mL、約190DMC/mL、約200DMC/mL、約250DMC/mL、約300DMC/mL、約350DMC/mL、または約400DMC/mLである。
いくつかの実施形態において、DNAse Iは、1mlの滅菌HBSSまたは別の緩衝液中で再構成される。凍結乾燥したストック酵素は、4KU/バイアルの濃度であった。いくつかの実施形態では、再構成後のDNase Iストックは、約1KU/mL~10KU/mL、例えば、約1KU/mL、約2KU/mL、約3KU/mL、約4KU/mL、約5KU/mL、約6KU/mL、約7KU/mL、約8KU/mL、約9KU/mL、または約10KU/mLの範囲である。
いくつかの実施形態では、酵素のストックは可変であり、濃度を決定する必要があり得る。いくつかの実施形態では、凍結乾燥ストックの濃度を検証することができる。いくつかの実施形態では、消化カクテルに添加される酵素の最終量は、決定されたストック濃度に基づいて調整される。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、約4.7mlの滅菌HBSS中に約10.2ulの中性プロテアーゼ(0.36DMC U/mL)、21.3ulのコラゲナーゼ(1.2PZ/mL)及び250ulのDNAse I(200U/mL)を含む。
上に示されるように、いくつかの実施形態では、TILは、固形腫瘍に由来する。いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、断片化されない。いくつかの実施形態では、固形腫瘍は断片化されず、全腫瘍として酵素消化に供される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間、37℃、5%COで消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で、37℃、5%COで、回転を伴って1~2時間消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、37℃、5%COで一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、全腫瘍が酵素と組み合わされて、腫瘍消化反応混合物が形成される。
いくつかの実施形態では、腫瘍は、滅菌緩衝液中の凍結乾燥酵素で再構成される。いくつかの実施形態では、緩衝液は、滅菌HBSSである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、コラゲナーゼを含む。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼは、コラゲナーゼIVである。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼの作業ストックは、100mg/mLの10倍作業ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、DNAseを含む。いくつかの実施形態では、DNAseの作業ストックは、10,000IU/mLの10倍作業ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、ヒアルロニダーゼを含む。いくつかの実施形態では、ヒアルロニダーゼの作業ストックは、10mg/mLの10倍作業ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、10mg/mLのコラゲナーゼ、1000IU/mLのDNAse、及び1mg/mLのヒアルロニダーゼを含む。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、10mg/mLのコラゲナーゼ、500IU/mLのDNAse、及び1mg/mLのヒアルロニダーゼを含む。
一般に、採取された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに採取された」細胞集団と呼ばれる。
いくつかの実施形態では、断片化は、例えば、解剖及び消化を含む物理的断片化を含む。いくつかの実施形態では、断片化は、物理的断片化である。いくつかの実施形態では、断片化は、解剖である。いくつかの実施形態では、断片化は、消化によるものである。いくつかの実施形態では、TILは、患者から取得された腫瘍試料を消化または断片化することから取得された酵素腫瘍消化物及び腫瘍断片から最初に培養され得る。
腫瘍が固形腫瘍であるいくつかの実施形態では、腫瘍試料が、例えば、ステップA(図1に提供される)で取得された後、腫瘍は物理的断片化を受ける。いくつかの実施形態では、断片化は、凍結保存前に起こる。いくつかの実施形態では、断片化は、凍結保存後に起こる。いくつかの実施形態では、断片化は、腫瘍を得た後に、いずれの凍結保存もない場合に起こる。いくつかの実施形態では、腫瘍は断片化され、10、20、30、40個またはそれ以上の断片または小片が、第1の拡張のために各容器内に配置される。いくつかの実施形態では、腫瘍は断片化され、30または40個の断片または小片が、第1の拡張のために各容器内に配置される。いくつかの実施形態では、腫瘍は断片化され、40個の断片または小片が、第1の拡張のために各容器内に配置される。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約4~約50個の断片を含み、各断片は、約27mmの体積を有する。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1300mm~約1500mmの総体積を伴う約30~約60個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1350mmの総体積を伴う約50個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1グラム~約1.5グラムの総質量を伴う約50個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約4個の断片を含む。
いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍断片から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、鋭的解剖によって取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~10mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~8mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約2mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約3mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約4mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約5mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約6mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約7mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約8mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約9mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約10mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、1~4mm×1~4mm×1~4mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、1mm×1mm×1mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、2mm×2mm×2mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、3mm×3mm×3mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍は、4mm×4mm×4mmである。
いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の出血性、壊死性、及び/または脂肪性組織の量を最小化するために切除される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の出血性組織の量を最小化するために切除される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の壊死性組織の量を最小化するために切除される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の脂肪性組織の量を最小化するために切除される。
いくつかの実施形態では、腫瘍の断片化は、腫瘍の内部構造を維持するために行われる。いくつかの実施形態では、腫瘍の断片化は、メスでのこ引き動作を行うことなく行われる。いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍消化物から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、例えば、RPMI1640(2mM GlutaMAX、10mg/mLゲンタマイシン、30U/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)であるが、これに限定されない酵素培地中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(GentleMACS,Miltenyi Biotec,Auburn,CA)によって生成された。腫瘍を酵素培地に入れた後、腫瘍は、およそ1分間機械的に解離され得る。その後、溶液が5%CO中37℃で30分間インキュベートされ、その後、およそ1分間再び機械的に破壊され得る。5% CO中37℃で30分間再びインキュベートした後、腫瘍を、およそ1分間、3回目に機械的に破壊することができる。いくつかの実施形態では、大きい組織片が存在する場合、3回目の機械的破壊後、5%CO中37℃でさらに30分間インキュベートするかにかかわらず、1回または2回の追加の機械的解離が試料に適用された。いくつかの実施形態では、細胞懸濁液が多数の赤血球または死細胞を含む場合、最終インキュベーションの終わりに、Ficollを使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張ステップの前に採取された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに採取された」細胞集団と呼ばれる。
いくつかの実施形態では、細胞は、試料採取後に任意選択で凍結され、ステップBに記載される拡張に入る前に凍結保存され得、これは、以下でさらに詳細に説明され、図1及び図8にも例示される。
1.胸水T細胞またはTIL
いくつかの実施形態では、試料は、胸腔内液試料である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセスによる拡張のためのT細胞またはTILの供給源は、胸腔内液試料である。いくつかの実施形態では、試料は、胸水由来試料である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセスによる拡張のためのTILの供給源は、胸水由来試料である。例えば、米国特許公開第2014/0295426号に記載されている方法を参照されたく、これはすべての目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、TILと思われる、及び/またはTILを含む任意の胸腔内液または胸水を利用することができる。かかる試料は、NSCLCもしくはSCLCなどの原発性または転移性肺癌に由来し得る。いくつかの実施形態では、試料は、別の臓器、例えば、乳房、卵巣、結腸、または前立腺に由来する二次転移性がん細胞であり得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用する試料は、胸膜浸出液である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用する試料は、胸膜漏出液である。他の生体試料は、例えば、腹部からの腹水または膵嚢胞液を含む、TILを含有する他の漿液を含み得る。腹水及び胸腔内液は、非常に類似した化学系を伴い、腹部及び肺の両方が、悪性腫瘍における同じ物質の胸膜空間及び腹部空間に中皮線及び流体形態を有し、いくつかの実施形態では、かかる流体は、TILを含有する。本開示が胸水を例示するいくつかの実施形態では、同じ方法が、胸腔内液またはTILを含有する他の嚢胞液を使用して同様の結果で実行されてもよい。
いくつかの実施形態では、胸腔内液は、患者から直接除去された未処理の形態である。いくつかの実施形態では、未処理の胸腔内液は、接触ステップの前に、EDTAまたはヘパリンチューブなどの標準的な採血管に入れられる。いくつかの実施形態では、未処理の胸腔内液は、接触ステップの前に、標準的なCellSave(登録商標)チューブ(Veridex)に入れられる。いくつかの実施形態では、試料は、生存TILの数の減少を避けるために、患者から採取した直後にCellSaveチューブに入れられる。生存TILの数は、4℃であっても、未処理の胸腔内液中に放置されると、24時間以内に大幅に減少する可能性がある。いくつかの実施形態では、試料は、患者からの除去後1時間、5時間、10時間、15時間、または最大24時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。いくつかの実施形態では、試料は、4℃で、患者からの除去後1時間、5時間、10時間、15時間、または最大24時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。
いくつかの実施形態では、選択された対象からの胸腔内液試料は、希釈され得る。一実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:10である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:9である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:8である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:5である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:2である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:1である。いくつかの実施形態では、希釈剤には、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水、別の緩衝液、または生理学的に許容される希釈剤が含まれる。いくつかの実施形態では、試料は、患者からの収集及び希釈の直後にCellSaveチューブ内に入れられ、生存TILの減少を回避し、これは、4℃であっても、未処理の胸腔内液中に放置された場合、24~48時間以内に有意に生じ得る。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、患者からの除去及び希釈後1時間、5時間、10時間、15時間、24時間、36時間、最大48時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、4℃で、患者からの除去及び希釈後1時間、5時間、10時間、15時間、24時間、36時間、最大48時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。
さらに別の実施形態では、胸腔内液試料は、さらなる処理ステップの前に、従来の手段によって濃縮される。いくつかの実施形態では、胸腔内液のこの前処理は、方法を実施する実験室への輸送のために、またはその後の分析のために(例えば、採取後24~48時間より後に)胸水を凍結保存しなければならない状況において好ましい。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、それが対象から採取された後に胸腔内液試料を遠心分離し、遠心分離物またはペレットを緩衝液中に再懸濁することによって調製される。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、輸送または後の分析及び/または処理のために凍結保存される前に、複数の遠心分離及び再懸濁に供される。
いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、濾過法を使用することによって、さらなる処理ステップの前に濃縮される。いくつかの実施形態では、接触ステップで使用される胸腔内液試料は、胸腔内液が膜を通過することを可能にするが腫瘍細胞を保持する、既知で本質的に均一な孔径を含むフィルターをとおして流体を濾過することによって調製される。いくつかの実施形態では、膜の細孔の直径は、少なくとも4μMであり得る。いくつかの実施形態では、細孔直径は、5μM以上であり得、他の実施形態では、6、7、8、9、または10μMのうちのいずれかである。濾過後、膜によって保持されたTILを含む細胞を、膜から適切な生理学的に許容される緩衝液にすすいでもよい。次いで、このように濃縮されたTILを含む細胞は、方法の接触ステップで使用することができる。
いくつかの実施形態では、胸腔内液試料(例えば、未処理の胸腔内液を含む)、希釈胸水、または再懸濁細胞ペレットは、試料中に存在する無核赤血球を特異的に溶解する溶解試薬と接触させる。いくつかの実施形態では、このステップは、胸腔内液がかなりの数のRBCを含む状況で、さらなる処理ステップの前に行われる。好適な溶解試薬には、単一の溶解試薬もしくは溶解試薬及びクエンチ試薬、または溶解剤、クエンチ試薬及び固定試薬が含まれる。好適な溶解システムは市販されており、BD Pharm Lyse(商標)システム(Becton Dickenson)が含まれる。他の溶解システムには、Versalyse(商標)システム、FACSlyse(商標)システム(Becton Dickenson)、Immunoprep(商標)システム、またはErythrolyse IIシステム(Beckman Coulter,Inc.)、または塩化アンモニウムシステムが含まれる。いくつかの実施形態では、溶解試薬は、赤血球の効率的な溶解、ならびに胸水におけるTIL及びTILの表現型特性の保存のような主要な要件によって異なり得る。溶解のための単一の試薬を利用することに加えて、本明細書に記載の方法に有用な溶解システムは、第2の試薬、例えば、方法の残りのステップ中に溶解試薬の効果をクエンチまたは遅延させるもの、例えばStabilyse(商標)試薬(Beckman Coulter,Inc.)を含むことができる。溶解試薬の選択または方法の好ましい実施に応じて、従来の固定試薬を使用することもできる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、未処理、希釈または多重遠心分離または処理された胸腔内液試料は、本明細書で提供されるようにさらに処理及び/または拡張される前に、約-140℃の温度で凍結保存される。
A1.ステップA1:進行前凍結保存
いくつかの実施形態では、本方法は、患者が免疫チェックポイント阻害剤(ICI)及び/または標準治療の治療を受ける時または受けた後にがん進行を示す後、ステップAから取得された採取された腫瘍試料を凍結保存し、将来のTIL製造のための凍結保存TIL調製物を作製することを提供する。
いくつかの実施形態では、凍結保存は、
(a)少なくとも1つの前の療法の前に、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または対象もしくは患者のNSCLC腫瘍から腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から第1のTIL集団を取得及び/または受容すること、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む試料を凍結保存して、凍結保存された試料を産生することを含む。
いくつかの実施形態では、凍結保存は、
(a)少なくとも1つの前の療法の前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片を産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、凍結保存は、
(a)少なくとも1つの前の療法の前に、対象から取得された腫瘍試料を、腫瘍消化物に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍消化物を産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、凍結保存は、
(a)少なくとも1つの前の療法の前に、対象または患者からNSCLC腫瘍を切除することであって、腫瘍が、任意選択で、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、またはNSCLC腫瘍から腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段からの第1のTIL集団を含む、切除することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む試料を凍結保存して、凍結保存された試料を産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、凍結保存は、
(a)少なくとも1つの前の療法の前に、対象または患者からNSCLC腫瘍を切除することであって、腫瘍が、任意選択で、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、またはNSCLC腫瘍から腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段からの第1のTIL集団を含む、切除することと、
(b)腫瘍を、腫瘍断片に断片化することと、
(c)ステップ(b)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片を産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、凍結保存は、
(a)少なくとも1つの前の療法の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍消化物を産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、凍結保存は、
(a)少なくとも1つの前の療法の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を解離して、解離された腫瘍物質を産生することと、
(c)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む解離された腫瘍物質を凍結保存して、凍結保存された解離された腫瘍物質を産生することと、を含む。
B.ステップB:第1の拡張
いくつかの実施形態では、本方法は、対象/患者への投与時に複製サイクルを増加させることができ、したがって、より古いTIL(すなわち、対象/患者への投与前により多くの複製ラウンドをさらに受けたTIL)よりも追加の治療的利益を提供し得る、若いTILを得ることを提供する。若いTILの特徴は、文献、例えば、Donia,et al.,Scand.J.Immunol.2012,75,157-167、Dudley,et al.,Clin.Cancer Res.2010,16,6122-6131、Huang,et al.,J.Immunother.2005,28,258-267、Besser,et al.,Clin.Cancer Res.2013,19,OF1-OF9、Besser,et al.,J.Immunother.2009,32:415-423、Robbins,et al.,J.Immunol.2004,173,7125-7130、Shen,et al.,J.Immunother.,2007,30,123-129、Zhou,et al.,J.Immunother.2005,28,53-62、及びTran,et al.,J.Immunother.,2008,31,742-751に記載されており、それらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
Tリンパ球及びBリンパ球の多様な抗原受容体は、限られた数であるが、多数の遺伝子セグメントの体細胞組換えによって産生される。これらの遺伝子セグメント:V(可変)、D(多様性)、J(接合)、及びC(一定)は、免疫グロブリン及びT細胞受容体(TCR)の結合特異性及び下流での適用を決定する。本発明は、生成するための方法を提供する。
T細胞レパートリー多様性を示し、かつ増加させるTIL。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、新たに採取されたTIL及び/または例えば、図1に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILと比較して、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、新たに採取されたTIL及び/または図5及び/または図6に例示されるようにプロセス1Cと称される方法を使用して調製されたTILと比較して、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、第1の拡張で取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、多様性の増加は、免疫グロブリン多様性及び/またはT細胞受容体多様性の増加である。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン重鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン軽鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、T細胞受容体にある。いくつかの実施形態では、多様性は、アルファ、ベータ、ガンマ、及びデルタ受容体からなる群から選択されるT細胞受容体のうちの1つにある。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファ及び/またはベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)ベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、TCRab(すなわち、TCRα/β)の発現が増加する。
例えば、図1のステップAに記載されるものなどの腫瘍断片の解剖または消化後に、結果として得られた細胞は、腫瘍及び他の細胞よりもTILの成長を好む条件下で、IL-2を含む血清中で培養される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、6000IU/mLのIL-2を有する不活性化ヒトAB血清を含む培地中2mLのウェル中でインキュベートされる。この一次細胞集団は、数日間、一般に3~14日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10バルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、7~14日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10バルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、10~14日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10バルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、約11日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10バルクTIL細胞を生じる。
好ましい実施形態では、TILの拡張は、以下及び本明細書に記載の初期バルクTIL拡張ステップ(例えば、REP前と称されるプロセスを含み得る、図1のステップBに記載のものなど)、続いて以下のステップD及び本明細書に記載の第2の拡張(ステップD、急速拡張プロトコル(REP)ステップと称されるプロセスを含む)、続いて任意の凍結保存、続いて以下及び本明細書に記載の第2のステップD(再刺激REPステップと称されるプロセスを含む)を使用して行われ得る。このプロセスから取得されたTILは、本明細書に記載の表現型特徴及び代謝パラメータについて任意で特徴付けられ得る。
TIL培養物が24ウェルプレートで開始される実施形態では、例えば、Costar 24ウェル細胞培養クラスター、平底(Corning Incorporated,Corning,NY)を使用して、IL-2(6000IU/mL、Chiron Corp.,Emeryville,CA)を含む2mLの完全培地(CM)中の1×10個の腫瘍消化細胞または1つの腫瘍断片を、各ウェルに播種することができる。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~10mmである。
いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、培養培地の略語である「CM」と称される。いくつかの実施形態では、ステップBのCMは、10%ヒトAB血清、25mM Hepes、及び10mg/mLゲンタマイシンを補充した、GlutaMAXを含むRPMI 1640からなる。培養物が40mL容量及び10cmガス透過性シリコン底部(例えば、G-REX10、Wilson Wolf Manufacturing,New Brighton,MN)を有するガス透過性フラスコ内で開始される実施形態では、各フラスコに、IL-2を含む10~40mLのCM中の10~40×10個の生きた腫瘍消化細胞または5~30個の腫瘍断片を装填した。G-REX10及び24ウェルプレートの両方を、5%CO中37℃の加湿インキュベーター内でインキュベートし、培養開始から5日後、培地の半分を取り除き、新たなCM及びIL-2と交換し、5日後、培地の半分を2~3日毎に交換した。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される拡張プロセスで使用される培地は、無血清培地または合成培地である。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、血清含有培地のロット間の変動に部分的に起因する実験変動を防止及び/または減少させるために使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地には、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CTS(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI 1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、血清サプリメントまたは血清代替物には、CTS(商標)OpTmizer T-Cell Expansion Serum Supplement、CTS(商標)Immune Cell Serum Replacement、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代用物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代用物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代用物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の抗生物質、及び1つ以上の微量元素のうちの1つ以上が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/または2-メルカプトエタノールをさらに含む。
いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Immune Cell Serum Replacementは、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CST(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI 1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地を含むが、これらに限定されない、従来の成長培地とともに使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地中の総血清代替物濃度(vol%)は、総無血清または合成培地の約1体積%、2体積%、3体積%、4体積%、5体積%、6体積%、7体積%、8体積%、9体積%、10体積%、11体積%、12体積%、13体積%、14体積%、15体積%、16体積%、17体積%、18体積%、19体積%、または20体積%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約3%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約5%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約10%である。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されており、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されており、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約0.1mM~約10mM、0.5mM~約9mM、1mM~約8mM、2mM~約7mM、3mM~約6mM、または4mM~約5mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約2mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約5mM~約150mM、10mM~約140mM、15mM~約130mM、20mM~約120mM、25mM~約110mM、30mM~約100mM、35mM~約95mM、40mM~約90mM、45mM~約85mM、50mM~約80mM、55mM~約75mM、60mM~約70mM、または約65mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約55mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、参照により本明細書に組み込まれる国際PCT公開第WO/1998/030679号に記載されている合成培地は、本発明において有用である。その刊行物には、無血清真核細胞培養培地が記載されている。無血清真核細胞培養培地には、無血清培養下で細胞の成長を支持することができる無血清サプリメントを補充した基礎細胞培養培地が含まれる。無血清真核細胞培養培地サプリメントは、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代替物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の微量元素、及び1つ以上の抗生物質からなる群から選択される1つ以上の成分を含むか、またはそれらを組み合わせることによって取得される。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/またはベータ-メルカプトエタノールをさらに含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンまたはアルブミン代替物と、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、及び1つ以上の微量元素からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地は、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI 1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、合成培地中のグリシンの濃度は、約5~200mg/Lの範囲であり、L-ヒスチジンの濃度は、約5~250mg/Lであり、L-イソロイシンの濃度は、約5~300mg/Lであり、L-メチオニンの濃度は、約5~200mg/Lであり、L-フェニルアラニンの濃度は、約5~400mg/Lであり、L-プロリンの濃度は、約1~1000mg/Lであり、L-ヒドロキシプロリンの濃度は、約1~45mg/Lであり、L-セリンの濃度は、約1~250mg/Lであり、L-スレオニンの濃度は、約10~500mg/Lであり、L-トリプトファンの濃度は、約2~110mg/Lであり、L-チロシンの濃度は、約3~175mg/Lであり、L-バリンの濃度は、約5~500mg/Lであり、チアミンの濃度は、約1~20mg/Lであり、還元型グルタチオンの濃度は、約1~20mg/Lであり、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩の濃度は、約1~200mg/Lであり、鉄飽和トランスフェリンの濃度は、約1~50mg/Lであり、インスリンの濃度は、約1~100mg/Lであり、亜セレン酸ナトリウムの濃度は、約0.000001~0.0001mg/Lであり、アルブミン(例えば、AlbuMAX(登録商標)I)の濃度は、約5000~50,000mg/Lである。
いくつかの実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地中の濃度範囲」という見出しの下の列にリストされた濃度範囲で存在する。他の実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされた最終濃度で存在する。他の実施形態では、合成培地は、無血清サプリメントを含む基礎細胞培地である。これらの実施形態のうちのいくつかでは、無血清サプリメントは、以下の表4の「サプリメント中の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされたタイプ及び濃度の非微量部分成分を含む。
いくつかの実施形態では、合成培地の浸透圧は、約260~350mOsmolである。いくつかの実施形態では、浸透圧は、約280~310mOsmolである。いくつかの実施形態では、合成培地には、最大約3.7g/L、または約2.2g/Lの重炭酸ナトリウムが補充されている。合成培地には、L-グルタミン(最終濃度約2mM)、1つ以上の抗生物質、非必須アミノ酸(NEAA、最終濃度約100μM)、2-メルカプトエタノール(最終濃度約100μM)がさらに補充されていてもよい。
いくつかの実施形態では、Smith,et al.,Clin Transl Immunology,4(1)2015(doi:10.1038/cti.2014.31)に記載の定義された培地が、本発明において有用である。簡潔には、RPMIまたはCTS(商標)OpTmizer(商標)を基礎細胞培地として使用し、0、2%、5%、または10%のいずれかのCTS(商標)Immune Cell Serum Replacementを補充した。
いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、濾過されていない。濾過されていない細胞培地の使用は、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化することができる。いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、ベータ-メルカプトエタノール(BMEまたはβME、2-メルカプトエタノールとしても知られる、CAS60-24-2)を欠いている。
腫瘍断片の調製後、結果として得られた細胞(すなわち、断片)は、腫瘍及び他の細胞よりもTILの成長を好む条件下で、IL-2を含む血清中で培養される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、6000IU/mLのIL-2を有する不活性化ヒトAB血清を含む培地中2mLのウェル中(または、いくつかの事例では、本明細書で概説されるように、APC細胞集団の存在下)でインキュベートされる。この一次細胞集団は、数日間、一般に10~14日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10個のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、第1の拡張中の成長培地は、IL-2またはそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ILは、組換えヒトIL-2(rhIL-2)である。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき20~30×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき20×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき25×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき30×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、4~8×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、5~7×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、6×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、実施例5に記載されるように調製される。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約10,000IU/mLのIL-2、約9,000IU/mLのIL-2、約8,000IU/mLのIL-2、約7,000IU/mLのIL-2、約6000IU/mLのIL-2、または約5,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約9,000IU/mLのIL-2~約5,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約8,000IU/mLのIL-2~約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約7,000IU/mLのIL-2~約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-2さらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-2さらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、約4000IU/mL、約4500IU/mL、約5000IU/mL、約5500IU/mL、約6000IU/mL、約6500IU/mL、約7000IU/mL、約7500IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、1000~2000IU/mL、2000~3000IU/mL、3000~4000IU/mL、4000~5000IU/mL、5000~6000IU/mL、6000~7000IU/mL、7000~8000IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。
いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15、約400IU/mLのIL-15、約300IU/mLのIL-15、約200IU/mLのIL-15、約180IU/mLのIL-15、約160IU/mLのIL-15、約140IU/mLのIL-15、約120IU/mLのIL-15、または約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約400IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約300IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約200IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-15をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。
いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21、約15IU/mLのIL-21、約12IU/mLのIL-21、約10IU/mLのIL-21、約5IU/mLのIL-21、約4IU/mLのIL-21、約3IU/mLのIL-21、約2IU/mLのIL-21、約1IU/mLのIL-21、または約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約15IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約12IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約10IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約5IU/mLのIL-21~約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、約2IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-21をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、抗CD3アゴニスト抗体、例えば、OKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約0.1ng/mL、約0.5ng/mL、約1ng/mL、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約200ng/mL、約500ng/mL、及び約1μg/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、0.1ng/mL~1ng/mL、1ng/mL~5ng/mL、5ng/mL~10ng/mL、10ng/mL~20ngの間、20ng/mL~30ng/mL、30ng/mL~40ng/mL、40ng/mL~50ng/mL、及び50ng/mL~100ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、OKT-3抗体を含まない。いくつかの実施形態では、OKT-3抗体は、ムロモナブである。例えば、表1を参照されたい。
いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の開始(0日目)に細胞培養培養培地中に存在する。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張中の任意の時点で細胞培養培地に添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の1日目に細胞培養培地に添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の2日目に細胞培養培地に添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の3日目に細胞培養培地に添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の4日目に細胞培養培地に添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の5日目に細胞培養培地に添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の6日目に細胞培養培地に添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の7日目に細胞培養培地に添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の8日目に細胞培養培地に添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の9日目に細胞培養培地に添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の10日目に細胞培養培地に添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の11日目に細胞培養培地に添加される。
いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の0日目~11日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の0日目~3日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の0日目~2日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の0日目~1日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の1日目~2日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の1日目~3日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の2日目~3日目に1回以上添加される。
いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の1日目~11日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の2日目~11日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の3日目~11日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の4日目~11日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の5日目~11日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の6日目~11日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の7日目~11日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の8日目~11日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の9日目~11日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の10日目~11日目に1回以上添加される。
いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の0日目~7日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の0日目~6日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の0日目~5日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の0日目~4日目に1回以上添加される。
いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の1日目~7日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の1日目~6日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の1日目~5日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の1日目~4日目に1回以上添加される。
いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の2日目~7日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の2日目~6日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の2日目~5日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の2日目~4日目に1回以上添加される。
いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の3日目~7日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の3日目~6日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の3日目~5日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の3日目~4日目に1回以上添加される。
いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の4日目~7日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の4日目~6日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の4日目~5日目に1回以上添加される。
いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の5日目~7日目に1回以上添加される。いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の5日目~6日目に1回以上添加される。
いくつかの実施形態では、OKT-3は、第1の拡張の6日目~7日目に1回以上添加される。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、細胞培養培地中に1つ以上のTNFRSFアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは4-1BBアゴニストであり、4-1BBアゴニストは、ウレルマブ、ウトミルマブ、EU-101、融合タンパク質、ならびにそれらの断片、誘導体、バリアント、バイオシミラー、及び組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、0.1μg/mL~100μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、20μg/mL~40μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。
いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、細胞培養培地は、IL-2を約3000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、培養培地の略語である「CM」と称される。いくつかの実施形態では、それは、CM1(培養培地1)と称される。いくつかの実施形態では、CMは、10%ヒトAB血清、25mM Hepes、及び10mg/mLゲンタマイシンを補充した、GlutaMAXを含むRPMI1640からなる。培養物が40mL容量及び10cmガス透過性シリコン底部(例えば、G-REX10、Wilson Wolf Manufacturing,New Brighton,MN)を有するガス透過性フラスコ内で開始される実施形態では、IL-2を含む10~40mLのCM中の10~40×10個の生きた腫瘍消化細胞または5~30個の腫瘍断片を、各フラスコに入れた。G-REX10及び24ウェルプレートの両方を、5%CO中37℃の加湿インキュベーター内でインキュベートし、培養開始から5日後、培地の半分を取り除き、新たなCM及びIL-2と交換し、5日後、培地の半分を2~3日毎に交換した。いくつかの実施形態では、CMは、実施例に記載されるCM1であり、実施例1を参照されたい。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、初期細胞培養培地または第1の細胞培養培地中で起こる。いくつかの実施形態では、初期細胞培養培地または第1の細胞培養培地は、IL-2を含む。
いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、第1の拡張(例えば、REP前と称されることもあるものを含み得る、図1のステップBに記載されるものなどのプロセスを含む)プロセスは、3~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、実施例で考察され、かつ図4及び図5に示されるように、例えば、図1のステップBに記載される拡張も含む、第1の拡張(例えば、REP前と称されることもあるものを含み得る、図1のステップBに記載されるものなどのプロセスを含む)は、7~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、ステップBの第1の拡張は、10~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、例えば、図1のステップBに記載される拡張において考察されるように、11日に短縮される。
いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、または14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、1日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、2日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、3日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、4日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、5日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、6日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、7日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、8日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、9日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、10日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、11日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、12日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、13日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、1日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、2日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、3日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、4日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、5日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、6日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、7日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、8日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、9日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、10日~11日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、11日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21の組み合わせは、第1の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、例えば、図1よる、かつ本明細書に記載されるステップBのプロセス中を含む、第1の拡張中に含まれ得る。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21の組み合わせは、第1の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、図1による、かつ本明細書に記載されるステップBのプロセス中に含まれ得る。
いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、第1の拡張(REP前と称されるプロセスを含む、例えば、図1によるステップB)プロセスは、3~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、ステップBの第1の拡張は、7~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、ステップBの第1の拡張は、10~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、第1の拡張は、11日に短縮される。
いくつかの実施形態では、第1の拡張、例えば、図1によるステップBは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、G-REX-10またはG-REX-100である。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。
1.サイトカイン及び他の添加物
本明細書に記載の拡張方法は、一般に、当該技術分野で知られているように、高用量のサイトカイン、特にIL-2を含む培養培地を使用する。
代替的に、TILの急速拡張及び/または第2の拡張のためにサイトカインの組み合わせを使用することは、米国特許出願公開第2017/0107490A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載のように、IL-2、IL-15及びIL-21のうちの2つ以上の組み合わせを用いて追加として可能である。したがって、可能な組み合わせには、IL-2及びIL-15、IL-2及びIL-21、IL-15及びIL-21、ならびにIL-2またはIL-15及びIL-21が含まれ、後者は、多くの実施形態において特定の用途を見出す。サイトカインの組み合わせの使用は、リンパ球、特にそこに記載されているようにT細胞の生成に特に有利に働く。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、OKT-3抗体またはムロモナブの、培養培地への添加を含み得る。いくつかの実施形態では、ステップBはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、4-1BBアゴニストの、培養培地への添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、ステップBはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、OX-40アゴニストの、培養培地への添加を含み得る。他の実施形態では、チアゾリジンジオン化合物などの増殖因子活性化受容体(PPAR)-ガンマアゴニストを含む、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体ガンマコアクチベーターI-アルファアゴニストなどの添加剤は、米国特許出願公開第2019/0307796 A1号(この開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるように、ステップB中の培養培地で使用されてもよい。
C.ステップC:第1の拡張から第2の拡張へと移行
いくつかの事例では、例えば、図1に示されるステップBから取得されたTIL集団を含む、第1の拡張から取得されたバルクTIL集団は、以下で考察されるプロトコルを使用して、直ちに凍結保存され得る。あるいは、第2のTIL集団と称される第1の拡張から取得されたTIL集団は、以下で考察されるように、第2の拡張(REPと称されることもある拡張を含み得る)に供され、その後、凍結保存され得る。同様に、遺伝子修飾TILが治療に使用される場合、第1のTIL集団(バルクTIL集団と称されることもある)または第2のTIL集団(いくつかの実施形態では、REP TIL集団と称される集団を含み得る)は、拡張前または第1の拡張後及び第2の拡張前に、好適な治療のために遺伝子修飾に供され得る。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から(例えば、図1に示されるステップBから)取得されたTILは、選択のために表現型決定されるまで保管される。いくつかの実施形態では、第1の拡張から(例えば、図1に示されるステップBから)取得されたTILは保管されず、第2の拡張に直接進む。いくつかの実施形態では、第1の拡張から取得されたTILは、第1の拡張後及び第2の拡張前に凍結保存されない。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、または14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約3日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約4日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約4日~10日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約7日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから約14日で起こる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、または14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから1日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、2日~14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから3日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから4日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから5日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから6日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから7日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから8日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから9日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから10日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから11日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから12日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから13日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから1日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから2日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから3日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから4日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから5日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから6日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから7日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから8日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから9日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから10日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こってから11日で起こる。
いくつかの実施形態では、TILは、第1の拡張の後及び第2の拡張の前に保管されず、TILは、第2の拡張に直接進む(例えば、いくつかの実施形態では、図1に示されるステップBからステップDへの移行中に保管されない)。いくつかの実施形態では、移行は、本明細書に記載されるように、閉鎖系内で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張由来のTILである第2のTIL集団は、移行期間なしで第2の拡張に直接進む。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行、例えば、図1によるステップCは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、G-REX-10またはG-REX-100である。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から(例えば、図48A~Dに示されるステップBから)取得されたTILは、活性化または遺伝子編集ステップに移行される。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、または14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~13日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~12日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~10日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~9日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~6日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~5日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~4日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~13日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~12日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~10日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~9日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~6日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~5日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~13日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~12日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~10日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~9日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~6日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~13日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~12日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~10日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~9日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~7日で起こる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、本明細書に記載の閉鎖系中で起こる。
いくつかの実施形態では、活性化ステップは、TILを、抗CD3及び/または抗CD38ビーズを含む培地中で約1~7日間培養することを含む。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、TILを、抗CD3ビーズを含む培地中で約1~7日間培養することを含む。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、TILを、抗CD38ビーズを含む培地中で約1~7日間培養することを含む。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、TILを、抗CD3及び抗CD38ビーズを含む培地中で約1~7日間培養することを含む。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約1~7日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約1~7日、約2~7日、約3~7日、約4~7日、約5~7日、約6~7日、約1~6日、約2~6日、約3~6日、約4~6日、約5~6日、約1~5日、約2~5日、約3~5日、約4~5日、約1~4日、約2~4日、約3~4日、約1~3日、約2~3日、または約1~2日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約1日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約2日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約3日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約4日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約7日間行われる。
本明細書を考慮して、当業者に既知の任意の好適な抗CD3/抗CD38ビーズが使用され得る。好適な抗CD3/抗CD38ビーズには、T細胞拡大及び活性化のためのDynabeads(商標)ヒトT活性化剤CD3/CD28(Invitrogenから市販されている)、ImmunoCult(商標)ヒトCD3/CD28T細胞活性化剤(StemCell Technologiesから市販されている)、及びT Cell TransAct(商標)(Miltenyi Biotecから市販されている)を含むが、これらに限定されない市販の製品が、含まれるがこれらに限定されない。
いくつかの実施形態では、活性化ステップは、任意選択である。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、第1の拡張がOKT-3を含む場合、任意選択である。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から(例えば、図48C~Dに示されるステップBから)または活性化ステップから(例えば、図48A~Bに示されるステップCから)取得されたTILは、遺伝子編集ステップに移行される。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集ステップは、TIL集団に対して滅菌エレクトロポレーションステップを行うことを含む。いくつかの実施形態では、無菌エレクトロポレーションステップは、少なくとも1つの遺伝子エディターの移入を媒介する。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、少なくとも1つのタンパク質の発現を調節するためのTALEヌクレアーゼ系である。いくつかの実施形態によれば、TALEヌクレアーゼ系は、PD-1の発現を下方調節する。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、CTLA-4の発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、LAG-3の発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、CISHの発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、TIGITの発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、CBL-Bの発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1ノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4ノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3ノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CISHノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CBL-BノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、TIGITノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1の下方調節された発現、ならびにCTLA-4、LAG-3、CISH、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4の下方調節された発現、ならびにPD-1、LAG-3、CISH、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3の下方調節された発現、ならびにPD-1、CTLA-4、CISH、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CISHの下方調節された発現、ならびにPD-1、LAG-3、CTLA-4、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CBL-Bの下方調節された発現、ならびにCTLA-4、LAG-3、CISH、TIGIT、及びPD-1のうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、TIGITの下方調節された発現、ならびにCTLA-4、LAG-3、CISH、CBL-B、及びPD-1のうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/CTLA-4ダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/LAG-3ダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/CISHダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/CBL-BダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/TIGITダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4/LAG-3ダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4/CISHダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4/CBL-BダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4/TIGITダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3/CISHダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3/CBL-BダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3/TIGITダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CISH/CBL-BダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CISH/TIGITダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CBL-B/TIGITダブルノックアウトTILである。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集のステップは、休止ステップをさらに含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、第4のTIL集団を、約30~40℃、約5%のCO2でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、約30℃、約30.5℃、約31℃、約31.5℃、約32℃、約32.5℃、約33℃、約33.5℃、約34℃、約34.5℃、約35℃、約35.5℃、約36℃、約36.5℃、約37℃、約37.5℃、約38℃、約38.5℃、約39℃、約39.5℃、約40℃で実行される。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、約1時間、約2時間、約3時間、約4時間、約5時間、約6時間、約7時間、約8時間、約9時間、約10時間、約11時間、約12時間、約13時間、約14時間、約15時間、約16時間、約17時間、約18時間、約19時間、約20時間、約21時間、約22時間、約23時間、約24時間実行される。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団をインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約15時間~約23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約15時間~約23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約15時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約16時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約17時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約18時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約19時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約20時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約21時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約22時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集ステップまたは休止ステップから(例えば、図48A~Dに示されるステップCから)取得されたTILは、第2の拡張ステップ(例えば、図48A~Dに示されるステップDから)に移行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集ステップまたは休止ステップから第2の拡張ステップへの移行は、遺伝子編集ステップまたは休止ステップから約0.5日、1日、2日、3日、または4日で起こる。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集ステップまたは休止ステップから第2の拡張ステップへの移行は、本明細書に記載の閉鎖系中で起こる。
いくつかの実施形態では、TILは、遺伝子編集ステップまたは休止ステップの後及び第2の拡張の前に保管されず、TILは、第2の拡張に直接進む(例えば、いくつかの実施形態では、図48A~Dに示されるステップCからステップDへの移行中に保管されない)。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行、例えば、図48によるステップCは、閉鎖系バイオリアクター中で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、G-REX-10またはG-REX-100バイオリアクターである。
D.ステップD:第2の拡張
いくつかの実施形態では、TIL細胞集団は、採取及び初期バルク処理後、例えば、図1に示される、ステップA及びステップB、ならびにステップCと称される移行後に数が拡張される)。このさらなる拡張は、本明細書では第2の拡張と称され、これは、当該技術分野で一般に急速拡張プロセス(REP、ならびに図1のステップDに示されるプロセス)と称される拡張プロセスを含み得る。第2の拡張は、概して、フィーダー細胞、サイトカイン源、及び抗CD3抗体を含むいくつかの成分を含む培養培地を使用して、ガス透過性容器中で達成される。
いくつかの実施形態では、第2の拡張または第2のTIL拡張(REPと称されることもある拡張、ならびに図1のステップDに示されるプロセスを含み得る)は、当業者に知られている任意のTILフラスコまたは容器を使用して行われ得る。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、または14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約7日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約8日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約9日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約10日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約11日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約12日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約13日~約14日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、約14日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張は、本開示の方法(例えば、REPと称される拡張、ならびに図1のステップDに示されるプロセスを含む)を使用して、ガス透過性容器内で行われ得る。例えば、TILは、インターロイキン-2(IL-2)またはインターロイキン-15(IL-15)の存在下で非特異的T細胞受容体刺激を使用して、急速に拡張され得る。非特異的T細胞受容体刺激は、例えば、約30ng/mLのOKT3、マウスモノクローナル抗CD3抗体(Ortho-McNeil,Raritan,NJもしくはMiltenyi Biotech,Auburn,CAから市販されている)またはUHCT-1(BioLegend,San Diego,CA,USAから市販されている)などの抗CD3抗体を含み得る。TILは、がんのエピトープ(複数可)などの抗原性部分を含む、第2の拡張中に1つ以上の抗原を含むことによって、インビトロでTILのさらなる刺激を誘導するように拡張することができ、これは、ベクター、例えば、ヒト白血球抗原A2(HLA-A2)結合ペプチド、例えば、0.3μM MART-1:26-35(27L)またはgpl00:209-217(210M)から、任意選択で300IU/mLのIL-2またはIL-15などのT細胞成長因子の存在下で任意で発現され得る。他の好適な抗原には、例えば、NY-ESO-1、TRP-1、TRP-2、チロシナーゼがん抗原、MAGE-A3、SSX-2、及びVEGFR2、またはそれらの抗原性部分が含まれ得る。TILは、HLA-A2を発現する抗原提示細胞にパルスされたがんの同じ抗原(複数可)で再刺激することによっても急速に拡張され得る。あるいは、TILは、例えば、例として放射線照射された自己リンパ球または放射線照射されたHLA-A2+同種異系リンパ球及びIL-2でさらに再刺激され得る。いくつかの実施形態では、再刺激は、第2の拡張の一部として起こる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、放射線照射された自己リンパ球の存在下で、または放射線照射されたHLA-A2+同種異系リンパ球及びIL-2を用いて起こる。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、約4000IU/mL、約4500IU/mL、約5000IU/mL、約5500IU/mL、約6000IU/mL、約6500IU/mL、約7000IU/mL、約7500IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、1000~2000IU/mL、2000~3000IU/mL、3000~4000IU/mL、4000~5000IU/mL、5000~6000IU/mL、6000~7000IU/mL、7000~8000IU/mL、または8000IU/mLのIL-2を含む。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、OKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約0.1ng/mL、約0.5ng/mL、約1ng/mL、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約200ng/mL、約500ng/mL、及び約1μg/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、0.1ng/mL~1ng/mL、1ng/mL~5ng/mL、5ng/mL~10ng/mL、10ng/mL~20ngの間、20ng/mL~30ng/mL、30ng/mL~40ng/mL、40ng/mL~50ng/mL、及び50ng/mL~100ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、OKT-3抗体を含まない。いくつかの実施形態では、OKT-3抗体は、ムロモナブである。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、細胞培養培地中に1つ以上のTNFRSFアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは4-1BBアゴニストであり、4-1BBアゴニストは、ウレルマブ、ウトミルマブ、EU-101、融合タンパク質、ならびにそれらの断片、誘導体、バリアント、バイオシミラー、及び組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、0.1μg/mL~100μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、20μg/mL~40μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。
いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、細胞培養培地は、IL-2を約3000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21の組み合わせは、第2の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、例えば、図1による、かつ本明細書に記載されるステップDのプロセス中を含む、第2の拡張中に含まれ得る。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21の組み合わせは、第2の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、図1による、かつ本明細書に記載されるステップDのプロセス中に含まれ得る。
いくつかの実施形態では、第2の拡張は、IL-2、OKT-3、抗原提示フィーダー細胞、及び任意でTNFRSFアゴニストを含む補充された細胞培養培地において実施され得る。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、補充された細胞培養培地中で起こる。いくつかの実施形態では、補充された細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、第2の細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC、抗原提示フィーダー細胞とも称される)を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞(すなわち、抗原提示細胞)を含む細胞培養培地中で起こる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15、約400IU/mLのIL-15、約300IU/mLのIL-15、約200IU/mLのIL-15、約180IU/mLのIL-15、約160IU/mLのIL-15、約140IU/mLのIL-15、約120IU/mLのIL-15、または約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約400IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約300IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約200IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-15をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21、約15IU/mLのIL-21、約12IU/mLのIL-21、約10IU/mLのIL-21、約5IU/mLのIL-21、約4IU/mLのIL-21、約3IU/mLのIL-21、約2IU/mLのIL-21、約1IU/mLのIL-21、または約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約15IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約12IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約10IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約5IU/mLのIL-21~約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約2IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-21をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞(APC)は、PBMCである。いくつかの実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMC及び/または抗原提示細胞に対する比は、約1:25、約1:50、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。いくつかの実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMCに対する比は、1:50~1:300である。いくつかの実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMCに対する比は、1:100~1:200である。
いくつかの実施形態では、REP及び/または第2の拡張は、バルクTILが150mLの培地中の100倍または200倍過剰の不活性化フィーダー細胞、30mg/mLのOKT3抗CD3抗体、及び3000IU/mLのIL-2と混合されているフラスコ内で行われる。細胞が代替の成長チャンバに移されるまで、培地交換が行われる(一般に、新鮮な培地との呼吸による3分の2の培地交換)。代替の成長チャンバには、以下でより完全に考察されるように、G-REXフラスコ及びガス透過性容器が含まれる。
いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、第2の拡張(REPプロセスと称されるプロセスを含み得る)は、7~14日に短縮される。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、11日に短縮される。
いくつかの実施形態では、REP及び/または第2の拡張は、以前に記載されたT-175フラスコ及びガス透過性バッグ(Tran,et al.,J.Immunother.2008,31,742-51、Dudley,et al.,J.Immunother.2003,26,332-42)またはガス透過性培養器具(G-REXフラスコ)を使用して行われ得る。いくつかの実施形態では、第2の拡張(急速拡張と称される拡張を含む)は、T-175フラスコ内で行われ、150mLの培地に懸濁された約1×10個のTILが、各T-175フラスコに添加され得る。TILは、3000IU/mLのIL-2及び30ng/mLの抗CD3を補充した、1:1のCMとAIM-V培地との混合物中で培養され得る。T-175フラスコは、5%CO中37℃でインキュベートされ得る。培地の半分が、3000IU/mLのIL-2を含む50/50培地を使用して5日目に交換され得る。いくつかの実施形態では、7日目に、2つのT-175フラスコからの細胞が3Lバッグ内で組み合わせられ得、5%ヒトAB血清及び3000IU/mLのIL-2を含む300mLのAIM Vが、300mLのTIL懸濁液に添加された。各バッグ内の細胞の数が毎日または隔日計数され、新鮮な培地が添加されて、0.5~2.0×10細胞/mLの細胞数を維持した。
いくつかの実施形態では、第2の拡張(REPと称される拡張、ならびに図1のステップDで参照される拡張を含み得る)は、100cmのガス透過性シリコン底部(G-REX100、Wilson Wolf Manufacturing Corporation,New Brighton,MN,USAから市販されている)を有する500mL容量のガス透過性フラスコ内で行われ得る。5×10または10×10TILは、5%ヒトAB血清、3000IU/mLのIL-2、及び30ng/mLの抗CD3(OKT3)を補充した400mLの50/50培地中、PBMCで培養され得る。G-REX 100フラスコは、5%CO中37℃でインキュベートされ得る。5日目に、250mLの上清が除去され、遠心分離ボトルに入れられ、1500rpm(491×g)で10分間遠心分離される。TILペレットが、5%ヒトAB血清、3000IU/mLのIL-2を含む150mLの新鮮な培地で再懸濁され、元のG-REX100フラスコに戻し添加され得る。TILがG-REX100フラスコ内で連続的に拡張される場合、7日目に、各G-REX100内のTILが、各フラスコに存在する300mLの培地に懸濁され得、細胞懸濁液が3つの100mLアリコートに分割され得、それを使用して、3つのG-REX100フラスコに播種することができる。その後、5%ヒトAB血清及び3000IU/mLのIL-2を含む150mLのAIM-Vが各フラスコに添加され得る。G-REX 100フラスコが5%CO中37℃でインキュベートされ、4日後に、3000IU/mLのIL-2を含む150mLのAIM-Vが、各G-REX 100フラスコに添加され得る。培養14日目に、細胞が採取され得る。
いくつかの実施形態では、第2の拡張(REPと称される拡張を含む)は、バルクTILが150mLの培地中の100倍または200倍過剰の不活性化フィーダー細胞、30mg/mLのOKT3抗CD3抗体、及び3000IU/mLのIL-2と混合されているフラスコで行われる。いくつかの実施形態では、培地交換は、細胞が代替の成長チャンバに移されるまで行われる。いくつかの実施形態では、培地の3分の2が、新鮮な培地と呼吸によって交換される。いくつかの実施形態では、代替の成長チャンバには、以下でより完全に考察されるように、G-REXフラスコ及びガス透過性容器が含まれる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張(REPと称される拡張を含む)が行われ、優れた腫瘍反応性のためにTILが選択されるステップをさらに含む。当該技術分野で知られている任意の選択方法が使用され得る。例えば、米国特許出願公開第2016/0010058A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている方法が、優れた腫瘍反応性のためのTILの選択に使用され得る。
任意選択で、細胞生存率アッセイは、当該技術分野で知られている標準的なアッセイを使用して、第2の拡張(REP拡張と称される拡張を含む)後に行われ得る。例えば、死細胞を選択的に標識し、生存率の評価を可能にするトリパンブルー排除アッセイが、バルクTILの試料上で行われ得る。いくつかの実施形態では、TIL試料は、Cellometer K2自動セルカウンター(Nexcelom Bioscience,Lawrence,MA)を使用して計数され、生存率が決定され得る。いくつかの実施形態では、生存率は、標準のCellometer K2 Image Cytometer Automatic Cell Counterプロトコルに従って決定される。
いくつかの実施形態では、TILの第2の拡張(REPと称される拡張を含む)は、以前に記載されているT-175フラスコ及びガス透過性バッグ(Tran,et al.,2008,J Immunother.,31:742-751及びDudley,et al.,2003,J Immunother.,26:332-342)またはガス透過性G-REXフラスコを使用して行われ得る。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、フラスコを使用して行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、ガス透過性G-REXフラスコを使用して行われる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、T-175フラスコ内で行われ、約1×10個のTILが約150mLの培地に懸濁され、これが各T-175フラスコに添加される。TILは、「フィーダー」細胞として1対100の比で放射線照射された(50Gy)同種異系PBMCと培養され、細胞が、3000IU/mLのIL-2及び30ng/mLの抗CD3を補充した、1:1のCMとAIM-V培地との混合物(50/50培地)中で培養された。T-175フラスコを、5% CO中37℃でインキュベートする。いくつかの実施形態では、培地の半分が、3000IU/mLのIL-2を含む50/50培地を使用して5日目に交換される。いくつかの実施形態では、7日目に、2つのT-175フラスコからの細胞が3Lバッグ内で組み合わせられ、5%ヒトAB血清及び3000IU/mLのIL-2を含む300mLのAIM-Vが、300mLのTIL懸濁液に添加される。各バッグ内の細胞の数が毎日または隔日計数され得、新鮮な培地が添加されて、約0.5~約2.0×10細胞/mLの細胞数を維持することができる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張(REPと称される拡張を含む)は、100cmのガス透過性シリコン底部(G-REX100、Wilson Wolf)を有する500mL容量のフラスコ内で行われ、約5×10または10×10TILが、3000IU/mLのIL-2及び30ng/mLの抗CD3を補充した、400mLの50/50培地中、1対100の比で放射線照射された同種異系PBMCと培養される。G-REX 100フラスコは、5%CO中37℃でインキュベートされる。いくつかの実施形態では、5日目に、250mLの上清が除去され、遠心分離ボトルに入れられ、1500rpm(491g)で10分間遠心分離される。その後、TILペレットが、3000IU/mLのIL-2を含む150mLの新鮮な50/50培地に再懸濁され、元のG-REX100フラスコに戻し添加され得る。TILがG-REX100フラスコ内で連続的に拡張される実施形態では、7日目に、各G-REX100内のTILが、各フラスコ内に存在する300mLの培地に懸濁され、細胞懸濁液が3つの100mLアリコートに分割されて、それを使用して、3つのG-REX100フラスコに播種された。その後、5%ヒトAB血清及び3000IU/mLのIL-2を含む150mLのAIM-Vが各フラスコに添加される。G-REX 100フラスコが5%CO中37°Cでインキュベートされ、4日後に、3000IU/mLのIL-2を含む150mLのAIM-Vが、各G-REX 100フラスコに添加される。培養14日目に、細胞が採取される。
Tリンパ球及びBリンパ球の多様な抗原受容体は、限られた数であるが、多数の遺伝子セグメントの体細胞組換えによって産生される。これらの遺伝子セグメント:V(可変)、D(多様性)、J(接合)、及びC(一定)は、免疫グロブリン及びT細胞受容体(TCR)の結合特異性及び下流での適用を決定する。本発明は、T細胞レパートリー多様性を示し、かつ増加させるTILを生成するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、第2の拡張において取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、多様性の増加は、免疫グロブリン多様性及び/またはT細胞受容体多様性の増加である。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン重鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン軽鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、T細胞受容体にある。いくつかの実施形態では、多様性は、アルファ、ベータ、ガンマ、及びデルタ受容体からなる群から選択されるT細胞受容体のうちの1つにある。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファ及び/またはベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)ベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、TCRab(すなわち、TCRα/β)の発現が増加する。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地と称されることもある)は、以下でさらに詳細に考察されるように、IL-2、OKT-3、ならびに抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される拡張プロセスで使用される培地は、無血清培地または合成培地である。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、血清含有培地のロット間の変動に部分的に起因する実験変動を防止及び/または減少させるために使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地には、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CTS(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI 1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、血清サプリメントまたは血清代替物には、CTS(商標)OpTmizer T-Cell Expansion Serum Supplement、CTS(商標)Immune Cell Serum Replacement、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代用物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代用物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代用物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の抗生物質、及び1つ以上の微量元素のうちの1つ以上が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/または2-メルカプトエタノールをさらに含む。
いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Immune Cell Serum Replacementは、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CST(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI 1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地を含むが、これらに限定されない、従来の成長培地とともに使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地中の総血清代替物濃度(vol%)は、総無血清または合成培地の約1体積%、2体積%、3体積%、4体積%、5体積%、6体積%、7体積%、8体積%、9体積%、10体積%、11体積%、12体積%、13体積%、14体積%、15体積%、16体積%、17体積%、18体積%、19体積%、または20体積%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約3%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約5%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約10%である。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されており、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されており、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約0.1mM~約10mM、0.5mM~約9mM、1mM~約8mM、2mM~約7mM、3mM~約6mM、または4mM~約5mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約2mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約5mM~約150mM、10mM~約140mM、15mM~約130mM、20mM~約120mM、25mM~約110mM、30mM~約100mM、35mM~約95mM、40mM~約90mM、45mM~約85mM、50mM~約80mM、55mM~約75mM、60mM~約70mM、または約65mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約55mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、参照により本明細書に組み込まれる国際PCT公開第WO/1998/030679号に記載されている合成培地は、本発明において有用である。その刊行物には、無血清真核細胞培養培地が記載されている。無血清真核細胞培養培地には、無血清培養下で細胞の成長を支持することができる無血清サプリメントを補充した基礎細胞培養培地が含まれる。無血清真核細胞培養培地サプリメントは、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代替物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の微量元素、及び1つ以上の抗生物質からなる群から選択される1つ以上の成分を含むか、またはそれらを組み合わせることによって取得される。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/またはベータ-メルカプトエタノールをさらに含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンまたはアルブミン代替物と、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、及び1つ以上の微量元素からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地は、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI 1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、合成培地中のグリシンの濃度は、約5~200mg/Lの範囲であり、L-ヒスチジンの濃度は、約5~250mg/Lであり、L-イソロイシンの濃度は、約5~300mg/Lであり、L-メチオニンの濃度は、約5~200mg/Lであり、L-フェニルアラニンの濃度は、約5~400mg/Lであり、L-プロリンの濃度は、約1~1000mg/Lであり、L-ヒドロキシプロリンの濃度は、約1~45mg/Lであり、L-セリンの濃度は、約1~250mg/Lであり、L-スレオニンの濃度は、約10~500mg/Lであり、L-トリプトファンの濃度は、約2~110mg/Lであり、L-チロシンの濃度は、約3~175mg/Lであり、L-バリンの濃度は、約5~500mg/Lであり、チアミンの濃度は、約1~20mg/Lであり、還元型グルタチオンの濃度は、約1~20mg/Lであり、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩の濃度は、約1~200mg/Lであり、鉄飽和トランスフェリンの濃度は、約1~50mg/Lであり、インスリンの濃度は、約1~100mg/Lであり、亜セレン酸ナトリウムの濃度は、約0.000001~0.0001mg/Lであり、アルブミン(例えば、AlbuMAX(登録商標)I)の濃度は、約5000~50,000mg/Lである。
いくつかの実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地中の濃度範囲」という見出しの下の列にリストされた濃度範囲で存在する。他の実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされた最終濃度で存在する。他の実施形態では、合成培地は、無血清サプリメントを含む基礎細胞培地である。これらの実施形態のうちのいくつかでは、無血清サプリメントは、表4の「サプリメント中の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされたタイプ及び濃度の非微量部分成分を含む。
いくつかの実施形態では、合成培地の浸透圧は、約260~350mOsmolである。いくつかの実施形態では、浸透圧は、約280~310mOsmolである。いくつかの実施形態では、合成培地には、最大約3.7g/L、または約2.2g/Lの重炭酸ナトリウムが補充されている。合成培地には、L-グルタミン(最終濃度約2mM)、1つ以上の抗生物質、非必須アミノ酸(NEAA、最終濃度約100μM)、2-メルカプトエタノール(最終濃度約100μM)がさらに補充されていてもよい。
いくつかの実施形態では、Smith,et al.,Clin Transl Immunology,4(1)2015(doi:10.1038/cti.2014.31)に記載の定義された培地が、本発明において有用である。簡潔には、RPMIまたはCTS(商標)OpTmizer(商標)を基礎細胞培地として使用し、0、2%、5%、または10%のいずれかのCTS(商標)Immune Cell Serum Replacementを補充した。
いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、濾過されていない。濾過されていない細胞培地の使用は、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化することができる。いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、ベータ-メルカプトエタノール(BMEまたはβME、2-メルカプトエタノールとしても知られる、CAS60-24-2)を欠いている。
いくつかの実施形態では、第2の拡張、例えば、図1によるステップDは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、G-REX-10またはG-REX-100である。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。
いくつかの実施形態では、急速なまたは第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX-100 MCS容器内での小規模培養で約3~7日間培養することによって急速なまたは第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養でのTILを、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX-500-MCS容器に移し、小規模培養由来のTILを、第2の容器内でのより大規模な培養で約4~7日間培養することとによって、培養のスケールアップを達成する。
いくつかの実施形態では、急速なまたは第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX-100 MCS容器内での第1の小規模培養で約3~7日間培養することによって急速なまたは第2の拡張を行うことと、その後、(b)第1の小規模培養由来のTILを、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、かかる第2の容器に移された第1の小規模培養由来のTILの一部が、第2の小規模培養で約4~7日間培養される。
いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、TILの複数の約2~5亜集団に配分される。
いくつかの実施形態では、急速なまたは第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX-100 MCS容器内での小規模培養で約3~7日間培養することによって急速なまたは第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来のTILを、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX-500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、かかる第2の容器に移された小規模培養由来のTILの一部が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。
いくつかの実施形態では、急速なまたは第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX-100 MCS容器内での小規模培養で約5日間培養することによって急速なまたは第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来のTILを、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX-500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、かかる第2の容器に移された小規模培養由来のTILの一部が、より大規模な培養で約6日間培養される。
いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の分割時に、各第2の容器は、少なくとも10個のTILを含む。いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の分割時に、各第2の容器は、少なくとも10個のTIL、少なくとも10個のTIL、または少なくとも1010個のTILを含む。例示的な一実施形態では、各第2の容器は、少なくとも1010個のTILを含む。
いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の亜集団に配分される。いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の約2~5亜集団に配分される。いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の約2、3、4、または5亜集団に配分される。
いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の完了後、複数の亜集団は、治療有効量のTILを含む。いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の完了後、1つ以上のTILの亜集団を一緒にプールして、治療有効量のTILを産生する。いくつかの実施形態では、急速拡張の完了後、各TIL亜集団は、治療有効量のTILを含む。
いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張は、複数のステップに分割される前に、約3~7日間行われる。いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の分裂は、急速または第2の拡張の開始後約3日目、4日目、5日目、6日目、または7日目に起こる。
いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の分裂は、第1の拡張(すなわち、REP前拡張)の開始後の約7日目、8日目、9日目、10日目、11日目、12日目、13日目、14日目、15日目、または16日目、17日目、または18日目に起こる。例示的な一実施形態では、急速または第2の拡張の分裂は、第1の拡張の開始後約16日目に起こる。
いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張は、分裂後約7~11日間、さらに行われる。いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張は、分裂後約5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日間、さらに行われる。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂後の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地と同じ成分を含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂後の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地とは異なる成分を含む。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、任意選択でOKT-3、及びさらに任意選択でAPCを含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及びさらに任意選択でAPCを含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、OKT-3及びAPCを含む。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、任意選択でOKT-3及びさらに任意選択でAPCを含む新鮮な培養培地で補充することによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、OKT-3及びAPCを含む新鮮な培養培地で補充することによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、任意選択でOKT-3及びさらに任意選択でAPCを含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、OKT-3及びAPCを含む新鮮な細胞培養培地で置き換えることによって生成される。
いくつかの実施形態では、分裂後の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、分裂後の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2及びOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、分裂後の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地を、IL-2及び任意選択でOKT-3を含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂後の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂前の急速または第2の拡張に使用される細胞培養培地を、IL-2及びOKT-3を含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。
いくつかの実施形態では、急速な膨張の分裂は、閉鎖系において起こる。
いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張中のTIL培養物のスケールアップは、新鮮な細胞培養培地をTIL培養物に添加すること(TILを供給することとも称される)を含む。いくつかの実施形態では、供給は、新鮮な細胞培養培地をTIL培養物に頻繁に添加することを含む。いくつかの実施形態では、供給は、新鮮な細胞培養培地をTIL培養物に一定の間隔で添加することを含む。いくつかの実施形態では、新鮮な細胞培養培地は、一定の流れを介してTILに供給される。いくつかの実施形態では、Xuri W25などの自動細胞拡張システムは、急速な拡張及び供給のために使用される。
1.フィーダー細胞及び抗原提示細胞
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順(例えば、図1のステップDに記載されるような拡張、ならびにREPと称されるものを含む)は、REP TIL拡張中及び/または第2の拡張中に過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、健康な献血者由来の標準の全血単位から得られる末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。
一般に、同種異系PBMCは、放射線照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、実施例に記載されるように、REP手順で使用され、これは、放射線照射された同種異系PBMCの複製無能力を評価するための例示的なプロトコルを提供する。
いくつかの実施形態では、14日目の生細胞の総数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数よりも少ない場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。
いくつかの実施形態では、7日目及び14日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された生細胞の総数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、7日目及び14日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された生細胞の総数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、5~60ng/mLのOKT3抗体及び1000~6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、10~50ng/mLのOKT3抗体及び2000~5000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、20~40ng/mLのOKT3抗体及び2000~4000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、25~35ng/mLのOKT3抗体及び2500~3500IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、PBMCである。いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、人工抗原提示フィーダー細胞である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、約1:25、約1:50、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、1:50~1:300である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの、抗原提示フィーダー細胞に対する比は、1:100~1:200である。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約100×10TILの比を必要とする。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約50×10TILの比を必要とする。さらに別の実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約25×10TILを必要とする。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、第2の拡張中に過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、健康な献血者由来の標準の全血単位から得られる末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。いくつかの実施形態では、人工抗原提示(aAPC)細胞がPBMCの代わりに使用される。
概して、同種異系PBMCは、放射線照射または熱処理のいずれかを介して不活性化され、図及び実施例に記載の例示的な手順を含む、本明細書に記載のTIL拡張手順で使用される。
いくつかの実施形態では、人工抗原提示細胞は、PBMCの代替物として、またはPBMCと組み合わせて、第2の拡張において使用される。
2.サイトカイン
本明細書に記載の拡張方法は、一般に、当該技術分野で知られているように、高用量のサイトカイン、特にIL-2を含む培養培地を使用する。
代替的に、TILの急速な拡張及び/または第2の拡張のためにサイトカインの組み合わせを使用することは、米国特許出願第2017/0107490 A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように、IL-2、IL-15及びIL-21のうちの2つ以上の組み合わせを用いて追加として可能である。したがって、可能な組み合わせには、IL-2及びIL-15、IL-2及びIL-21、IL-15及びIL-21、ならびにIL-2、IL-15、及びIL-21が含まれ、後者は多くの実施形態において特定の用途を見出す。サイトカインの組み合わせの使用は、リンパ球、特にそこに記載されているようにT細胞の生成に特に有利に働く。
いくつかの実施形態では、ステップDはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、OKT-3抗体またはムロモナブの、培養培地への添加を含み得る。いくつかの実施形態では、ステップDはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、4-1BBアゴニストの、培養培地への添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、ステップDはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、OX-40アゴニストの、培養培地への添加を含み得る。加えて、チアゾリジンジオン化合物などの増殖因子活性化受容体(PPAR)-ガンマアゴニストを含む、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体ガンマコアクチベーターI-アルファアゴニストなどの添加剤は、米国特許出願公開第2019/0307796 A1号(この開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるように、ステップD中の培養培地で使用されてもよい。
E.ステップE:TILを採取する
第2の拡張ステップ後、細胞が採取され得る。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、図1に提供されるように、1、2、3、4つ、またはそれ以上の拡張ステップ後に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、図1に提供されるように、2つの拡張ステップ後に採取される。
TILは、例えば、遠心分離を含む、任意の適切な滅菌様式で採取され得る。TILを採取するための方法は、当該技術分野で周知であり、いずれかのかかる既知の方法が本プロセスで用いられ得る。いくつかの実施形態では、TILは、自動化システムを使用して採取される。
細胞採取機及び/または細胞処理システムは、例えば、Fresenius Kabi、Tomtec Life Science、Perkin Elmer、及びInotech Biosystems International,Incを含む、様々な供給源から市販されている。任意の細胞ベースの採取機が本方法とともに用いられ得る。いくつかの実施形態では、細胞採取機及び/または細胞処理システムは、膜ベースの細胞採取機である。いくつかの実施形態では、細胞採取は、LOVOシステム(Fresenius Kabiによって製造されたもの)などの細胞処理システムによるものである。「LOVO細胞処理システム」という用語は、細胞を含む溶液を、滅菌及び/または閉鎖系環境で回転膜または回転フィルターなどの膜またはフィルターをとおしてポンプ輸送し、連続フローを可能にし、細胞を処理して、ペレット化せずに上清または細胞培養培地を除去する、任意のベンダーによって製造された任意の機器または装置も指す。いくつかの実施形態では、細胞採取機及び/または細胞処理システムは、閉鎖した滅菌系内で、細胞分離、洗浄、流体交換、濃縮、及び/または他の細胞処理ステップを行うことができる。
いくつかの実施形態では、採取、例えば、図1によるステップEは、閉鎖系バイオリアクターから行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、G-REX-10またはG-REX-100である。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。
いくつかの実施形態では、図1によるステップEは、本明細書に記載のプロセスに従って行われる。いくつかの実施形態では、閉鎖系は、閉鎖系の無菌性及び閉鎖性を維持するために、滅菌条件下でシリンジを介してアクセスされる。いくつかの実施形態では、実施例に記載の閉鎖系が用いられる。
いくつかの実施形態では、TILは、実施例に記載の方法に従って採取される。いくつかの実施形態では、1日目~11日目の間のTILは、実施例における11日目のTIL採取のような、本明細書で言及されるステップにおいて記載される方法を使用して採取される。いくつかの実施形態では、12日目~24日目の間のTILは、実施例における22日目のTIL採取のような、本明細書で言及されるステップにおいて記載される方法を使用して採取される。いくつかの実施形態では、12日目~22日目の間のTILは、実施例における22日目のTIL採取のような、本明細書で言及されるステップにおいて記載される方法を使用して採取される。
F.ステップF:最終製剤及び輸液容器への移行
図1に例示的な順序で提供され、かつ上及び本明細書で詳細に概説されるステップA~Eが完了した後、細胞は、注入バッグまたは無菌バイアルなどの患者への投与に使用するために容器に移される。いくつかの実施形態では、治療的に十分な数のTILが上記の拡張方法を使用して得られると、それらは、患者への投与に使用するために容器に移される。
いくつかの実施形態では、本開示のAPCを使用して拡張されたTILは、薬学的組成物として患者に投与される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、滅菌緩衝液中のTIL懸濁液である。本開示のPBMCを使用して拡張されたTILは、当該技術分野で知られている任意の好適な経路によって投与され得る。いくつかの実施形態では、T細胞は、単回の動脈内または静脈内注入として投与され、これは、好ましくは、およそ30~60分続く。他の好適な投与経路には、腹腔内、髄腔内、及びリンパ内投与が含まれる。
VI.Gen3 TIL製造プロセス
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の凍結保存されたTIL調製物の作製後、患者は、ICI及び/または標準治療の治療時またはその後に進行性疾患の発現を監視される。いくつかの実施形態では、患者は、ICI及び/または標準治療の治療時またはその後に進行性癌を示し、自己TIL療法に適応される。いくつかの実施形態では、進行後、凍結保存されたTIL調製物を解凍し、以下のセクションに記載の拡張方法に従って拡張する。
いかなる特定の理論にも限定されないが、本発明の方法に記載の、T細胞の活性化をプライミングするプライミングによる第1の拡張、それに続くT細胞の活性化を促進する急速な第2の拡張により、「より若い」表現型を保持する拡張されたT細胞の調製が可能になると考えられ、したがって、本発明の拡張されたT細胞が、他の方法によって拡張されたT細胞よりもがん細胞に対する高い細胞傷害性を示すことが予想される。特に、本発明の方法によって教示される、抗CD3抗体(例えば、OKT-3)、IL-2、及び任意選択で抗原提示細胞(APC)への曝露によってプライミングされ、その後、追加の抗CD-3抗体(例えば、OKT-3)、IL-2、及びAPCへのその後の曝露によって促進されるT細胞の活性化が、培養下でT細胞の成熟を限定または回避し、成熟度の低い表現型を有するT細胞集団を産生し、これらのT細胞が、培養下での拡張によってあまり疲弊せず、より高いがん細胞に対する細胞傷害性を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)T細胞を、第1の容器、例えば、G-REX-100 MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養でのT細胞を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移し、小規模培養由来のT細胞を、第2の容器内でのより大規模な培養で約4~7日間培養することとによって、培養のスケールアップを達成する。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分割されて、(a)T細胞を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での第1の小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)第1の小規模培養由来のT細胞を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたT細胞の一部が、第2の小規模培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速拡張ステップは、複数のステップに分割されて、(a)T細胞を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来のT細胞を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたT細胞の一部が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速な拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)T細胞を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来のT細胞を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたT細胞の一部が、より大規模な培養で約5日間培養される。
いくつかの実施形態では、急速拡張の分割時に、各第2の容器は、少なくとも10個のTILを含む。いくつかの実施形態では、急速拡張の分割時に、各第2の容器は、少なくとも10個のTIL、少なくとも10個のTIL、または少なくとも1010個のTILを含む。例示的な一実施形態では、各第2の容器は、少なくとも1010個のTILを含む。
いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の亜集団に配分される。いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の約2~5亜集団に配分される。いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の約2、3、4、または5亜集団に配分される。
いくつかの実施形態では、急速拡張の完了後、複数の亜集団は、治療有効量のTILを含む。いくつかの実施形態では、急速拡張の完了後、1つ以上のTILの亜集団を一緒にプールして、治療有効量のTILを産生する。いくつかの実施形態では、急速拡張の完了後、TILの各亜集団は、治療有効量のTILを含む。
いくつかの実施形態では、急速拡張は、複数のステップに分割される前に、約1~5日の期間行われる。いくつかの実施形態では、急速拡張の分裂は、急速拡張の開始後約1日目、2日目、3日目、4日目、または5日目に起こる。
いくつかの実施形態では、急速拡張の分割は、第1の拡張(すなわち、REP前拡張)の開始後約8日目、9日目、10日目、11日目、12日目、または13日目に起こる。例示的な一実施形態では、急速拡張の分裂は、プライミングによる第1の拡張の開始後約10日目に起こる。例示的な一実施形態では、急速拡張の分裂は、第1の拡張の開始後約11日目に起こる。
いくつかの実施形態では、急速拡張は、分割後約4~11日の期間、さらに行われる。いくつかの実施形態では、急速拡張は、分裂後約3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日間、さらに行われる。
いくつかの実施形態では、分割前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、分割後の急速拡張に使用される細胞培養培地と同じ成分を含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、分裂後の急速拡張に使用される細胞培養培地とは異なる成分を含む。
いくつかの実施形態では、分割前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、任意選択でOKT-3、及びさらに任意選択でAPCを含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及びさらに任意選択でAPCを含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、OKT-3及びAPCを含む。
いくつかの実施形態では、分割前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、任意選択でOKT-3及びさらに任意選択でAPCを含む新鮮な培養培地で補充することによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、OKT-3及びAPCを含む新鮮な培養培地で補充することによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、任意選択でOKT-3及びさらに任意選択でAPCを含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、OKT-3及びAPCを含む新鮮な細胞培養培地で置き換えることによって生成される。
いくつかの実施形態では、分割後の急速拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、分裂後の急速拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2及びOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、分裂後の急速拡張に使用される細胞培養培地は、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地を、IL-2及び任意選択でOKT-3を含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂後の急速拡張に使用される細胞培養培地は、分裂前の急速拡張に使用される細胞培養培地を、IL-2及びOKT-3を含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。
いくつかの実施形態では、急速な膨張の分裂は、閉鎖系において起こる。
いくつかの実施形態では、急速拡張中のTIL培養物のスケールアップは、新鮮な細胞培養培地をTIL培養物に添加すること(TILを供給することとも称される)を含む。いくつかの実施形態では、供給は、新鮮な細胞培養培地をTIL培養物に頻繁に添加することを含む。いくつかの実施形態では、供給は、新鮮な細胞培養培地をTIL培養物に一定の間隔で添加することを含む。いくつかの実施形態では、新鮮な細胞培養培地は、一定の流れを介してTILに供給される。いくつかの実施形態では、Xuri W25などの自動細胞拡張システムは、急速な膨張及び供給のために使用される。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が減少、軽減、衰退、または沈静化し始めた後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が、正確にまたは約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が、正確にまたは約1%~100%の範囲のパーセンテージ減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が、正確にまたは約1%~10%、10%~20%、20%~30%、30%~40%、40%~50%、50%~60%、60%~70%、70%~80%、80%~90%、または90%~100%の範囲のパーセンテージ減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が、少なくとも正確にまたは約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、または99%減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化が、最大で正確にまたは約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99、または100%減少した後に行われる。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張によってもたらされるT細胞の活性化の減少は、抗原による刺激に応答してT細胞によって放出されるインターフェロンガンマの量の低減によって決定される。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、最大で正確にまたは約7日または約8日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、最大で正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞の急速な第2の拡張は、最大で正確にまたは約11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞の急速な第2の拡張は、最大で正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞の急速な第2の拡張は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約7日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、最大で正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、最大で正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約8日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約9日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、8日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、9日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約7日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、正確にまたは約1日~正確にまたは約9日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞のプライミングによる第1の拡張は、7日の期間中に行われ、T細胞の急速な第2の拡張は、9日の期間中に行われる。
いくつかの実施形態では、T細胞は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)である。
いくつかの実施形態では、T細胞は、骨髄浸潤リンパ球(MIL)である。
いくつかの実施形態では、T細胞は、末梢血リンパ球(PBL)である。
いくつかの実施形態では、T細胞は、がんに罹患しているドナーから取得される。
いくつかの実施形態では、T細胞は、がんに罹患している患者から切除された腫瘍から取得されたTILである。
いくつかの実施形態では、T細胞は、血液系悪性腫瘍に罹患している患者の骨髄から取得されたMILである。
いくつかの実施形態では、T細胞は、ドナー由来の末梢血単核細胞(PBMC)から取得されたPBLである。いくつかの実施形態では、ドナーは、がんに罹患している。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫、卵巣癌、子宮内膜癌、甲状腺癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭腫ウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択されるがんである。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭腫ウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、ドナーは、腫瘍に罹患している。いくつかの実施形態では、腫瘍は、液体腫瘍である。いくつかの実施形態では、腫瘍は、固形腫瘍である。いくつかの実施形態では、ドナーは、血液系悪性腫瘍に罹患している。
本開示の特定の態様では、免疫エフェクター細胞、例えば、T細胞は、FICOLL分離などの当業者に知られている任意の数の技法を使用して対象から収集された血液の単位から得ることができる。好ましい一態様では、個体の循環血液由来の細胞は、アフェレーシスによって取得される。アフェレーシス産物は、典型的には、リンパ球、例えば、T細胞、単球、顆粒球、B細胞、他の有核白血球、赤血球、血小板を含む。一態様では、アフェレーシスによって収集された細胞が洗浄されて、血漿画分が除去され、任意選択で、その後の処理ステップのために細胞を適切な緩衝液または培地に入れられ得る。一実施形態では、細胞は、リン酸緩衝生理食塩水(PBS)で洗浄される。代替の実施形態では、洗浄溶液は、カルシウムを欠き、マグネシウムを欠き得るか、またはすべてではないが多くの二価カチオンを欠き得る。一態様では、T細胞は、赤血球を溶解し、かつ単球を枯渇させることによって、例えば、PERCOLL勾配による遠心分離によって、または対向流遠心溶出法によって末梢血リンパ球から単離される。
いくつかの実施形態では、T細胞は、ドナー由来のリンパ球が濃縮された全血またはアフェレーシス産物から分離されたPBLである。いくつかの実施形態では、ドナーは、がんに罹患している。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫、卵巣癌、子宮内膜癌、甲状腺癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭腫ウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択されるがんである。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭腫ウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、ドナーは、腫瘍に罹患している。いくつかの実施形態では、腫瘍は、液体腫瘍である。いくつかの実施形態では、腫瘍は、固形腫瘍である。いくつかの実施形態では、ドナーは、血液系悪性腫瘍に罹患している。いくつかの実施形態では、PBLは、正または負の選択法を使用することによって、すなわち、T細胞表現型について、マーカー(複数可)、例えば、CD3+CD45+を使用してPBLを除去することによって、または非T細胞表現型細胞を除去してPBLを残すことによって、リンパ球が濃縮された全血またはアフェレーシス産物から単離される。他の実施形態では、PBLは、勾配遠心分離によって単離される。ドナー組織からPBLを単離した時点で、PBLのプライミングによる第1の拡張は、本明細書に記載される方法のうちのいずれかのプライミングによる第1の拡張ステップに従って、プライミングによる第1の拡張培養下で好適な数の単離されたPBL(いくつかの実施形態では、およそ1×10PBL)を播種することによって開始され得る。
これらの特徴のうちのいくつかを含む、プロセス3として知られる(本明細書ではGen3とも称される)例示的なTILプロセスが、図8及び図48(KO TIL TALENプロセス)(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に示され、ならびに本発明のこの実施形態のGen2を超える利点のうちのいくつかが、図1、2、8、30及び31(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に記載される。Gen3の実施形態は、図1、8、及び30(特に、図8A、及び/または図8B、及び/または図8C、及び/または図8D、及び/または図48A、及び/または図48B、及び/または図48C、及び/または図48D)に示される。プロセス2AまたはGen2またはGen2Aはまた、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる米国特許公開第2018/0280436号にも記載されている。Gen3プロセスはまた、国際特許公開第WO2020/096988号に記載されている。
本明細書で考察され、かつ一般に概説されるように、TILは、患者試料から採取され、本明細書に記載され、かつGen3と称されるTIL拡張プロセスを使用して患者に移植する前に、それらの数を拡張するように操作される。いくつかの実施形態では、TILは、以下で考察されるように、任意で遺伝子操作され得る。いくつかの実施形態では、TILは、拡張前または拡張後に凍結保存され得る。解凍した時点で、それらが再刺激されて、患者への注入前に代謝を高めることができる。
いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図で詳細に考察されるように、プライミングによる第1の拡張(本明細書では急速な拡張前(REP前)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップBとして示されるプロセスを含む)は、1~8日に短縮され、急速な第2の拡張(本明細書では急速な拡張プロトコル(REP)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップDとして示されるプロセスを含む)は、1~9日に短縮される。いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図で詳細に考察されるように、プライミングによる第1の拡張(本明細書では急速な拡張前(REP前)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップBとして示されるプロセスを含む)は、1~8日に短縮され、急速な第2の拡張(本明細書では急速な拡張プロトコル(REP)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップDとして示されるプロセスを含む)は、1~8日に短縮される。いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図で詳細に考察されるように、プライミングによる第1の拡張(本明細書では急速な拡張前(REP前)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップBとして示されるプロセスを含む)は、1~7日に短縮され、急速な第2の拡張(本明細書では急速な拡張プロトコル(REP)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップDとして示されるプロセスを含む)は、1~9日に短縮される。いくつかの実施形態では、以下ならびに実施例及び図において詳細に考察されるように、プライミングによる第1の拡張(本明細書において急速拡張前(REP前)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば図1B及び/または図8C)においてステップBとして示されるプロセスを含む)は、1~7日に短縮され、急速な第2の拡張(本明細書において急速拡張プロトコル(REP)と称されるプロセス、ならびに図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)においてステップDとして示されるプロセスを含む)は、1~10日間である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップBとして記載の拡張)は、8日に短縮され、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップDに記載の拡張)は、7~9日である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップBとして記載の拡張)は、8日であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップDに記載の拡張)は、8~9日である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップBとして記載の拡張)は、7日に短縮され、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップDに記載の拡張)は、7~8日である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップBとして記載の拡張)は、8日に短縮され、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップDに記載の拡張)は、8日である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップBとして記載の拡張)は、8日であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップDに記載の拡張)は、9日である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップBとして記載の拡張)は、8日であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップDに記載の拡張)は、10日である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップBとして記載の拡張)は、7日であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップDに記載の拡張)は、7~10日である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップBとして記載の拡張)は、7日であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップDに記載の拡張)は、8~10日である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップBとして記載の拡張)は、7日であり、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップDに記載の拡張)は、9~10日である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップBとして記載の拡張)は、7日に短縮され、急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)でステップDに記載の拡張)は、7~9日である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張と急速な第2の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図1B及び/または図8C)においてステップB及びステップDとして記載される拡張)との組み合わせは、以下ならびに実施例及び図面において詳細に考察されるように、14~16日間である。特に、本発明のある特定の実施形態が、IL-2の存在下での抗CD3抗体、例えば、OKT-3への曝露、または少なくともIL-2及び抗CD3抗体、例えば、OKT-3の存在下での抗原への曝露によってTILが活性化される、プライミングによる第1の拡張ステップを含むと考えられる。ある特定の実施形態では、上記のようにプライミングによる第1の拡張ステップで活性化されるTILは、第1のTIL集団であり、すなわち、一次細胞集団である。
以下の「ステップ」表記A、B、Cなどは、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)における非限定的な例を参照し、かつ本明細書に記載されるある特定の非限定的な実施形態を参照する。以下及び図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)におけるステップの順序は例示的であり、ステップの任意の組み合わせまたは順序、ならびに追加のステップ、ステップの繰り返し、及び/またはステップの省略は、本出願及び本明細書に開示される方法によって企図される。
A.ステップA:患者の腫瘍試料を取得する
一般に、TILは、最初に患者の腫瘍試料(「一次TIL」)から、またはTIL様の特徴を有する末梢血リンパ球を含む末梢血リンパ球などの循環リンパ球から得られ、その後、本明細書に記載されるように、さらなる操作のためにより大きな集団に拡張され、任意選択で凍結保存され、任意選択でTILの健康の指標として表現型及び代謝パラメータについて評価される。
患者の腫瘍試料は、一般に、外科的切除、針生検、または腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を得るための他の手段により、当該技術分野で知られている方法を使用して得ることができる。一般に、腫瘍試料は、原発腫瘍、浸潤性腫瘍、または転移性腫瘍を含む、任意の固形腫瘍に由来し得る。腫瘍試料は、血液系悪性腫瘍から取得された腫瘍などの液体腫瘍であり得る。固形腫瘍は、乳癌、膵臓癌、前立腺癌、結腸直腸癌、肺癌、脳癌、腎癌、胃癌、及び皮膚癌を含むが、これらに限定されない(扁平上皮癌、基底細胞癌、及び黒色腫を含むが、これらに限定されない)、任意の種類のがんであり得る。いくつかの実施形態では、がんは、子宮頸癌、頭頸部癌(例えば、頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBM)、胃腸癌、卵巣癌、肉腫、膵臓癌、膀胱癌、乳癌、トリプルネガティブ乳癌、及び非小細胞肺癌から選択される。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫である。いくつかの実施形態では、悪性黒色腫腫瘍が特に高レベルのTILを有することが報告されているため、有用なTILは、悪性黒色腫腫瘍から取得される。
取得された時点で、腫瘍試料は、一般に、鋭的解剖を使用して1~約8mmの小片に断片化され、約2~3mmが特に有用である。TILは、酵素腫瘍消化物を使用してこれらの断片から培養される。かかる腫瘍消化物は、酵素培地(例えば、Roswell Park Memorial Institute(RPMI)1640緩衝液、2mMグルタメート、10mcg/mLゲンタマイシン、30単位/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(例えば、組織解離機を使用する)によって産生され得る。腫瘍消化物は、腫瘍を酵素培地に入れ、腫瘍をおよそ1分間機械的に解離させ、続いて5%CO中37℃で30分間インキュベートし、続いて小さな組織片のみが存在するまで、前述の条件下で機械的解離及びインキュベーションのサイクルを繰り返すことによって産生することができる。このプロセスの最後に、細胞懸濁液中に多数の赤血球または死細胞が含まれている場合、FICOLL分岐親水性多糖類を使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。米国特許出願公開第2012/0244133A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているものなどの当該技術分野で知られている代替の方法を使用することができる。前述の方法のうちのいずれかが、TILを拡張する方法またはがんを治療する方法について本明細書に記載される実施形態のうちのいずれかにおいて使用され得る。
腫瘍解離酵素混合物には、1つ以上の解離(消化)酵素、例えば、限定されないが、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはコラゲナーゼの種類を含む)、Accutase(商標)、Accumax(商標)、ヒアルロニダーゼ、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)、キモトリプシン、キモパパイン、トリプシン、カゼイナーゼ、エラスターゼ、パパイン、XIV型プロテアーゼ(プロナーゼ)、デオキシリボヌクレアーゼI(DNase)、トリプシン阻害剤、任意の他の解離酵素またはタンパク質分解酵素、及びそれらの任意の組み合わせが含まれ得る。
いくつかの実施形態では、解離酵素は、凍結乾燥酵素から再構成される。いくつかの実施形態では、凍結乾燥酵素は、HBSSなどの滅菌緩衝液の量で再構成される。
いくつかの事例では、コラゲナーゼ(アニマルフリー1型コラゲナーゼなど)を、10mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝液で再構成する。凍結乾燥ストック酵素は、2892PZ U/バイアルの濃度であり得る。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼは、5mL~15mLの緩衝液中で再構成される。いくつかの実施形態では、再構成後のコラゲナーゼストックは、約100PZ U/mL~約400PZ U/mLの範囲、例えば、約100PZ U/mL~約400PZ U/mL、約100PZ U/mL~約350PZ U/mL、約100PZ U/mL~約300PZ U/mL、約150PZ U/mL~約400PZ U/mL、約100PZ U/mL、約150PZ U/mL、約200PZ U/mL、約210PZ U/mL、約220PZ U/mL、約230PZ U/mL、約240PZ U/mL、約250PZ U/mL、約260PZ U/mL、約270PZ U/mL、約280PZ U/mL、約289.2PZ U/mL、約300PZ U/mL、約350PZ U/mL、または約400PZ U/mLである。
いくつかの実施形態では、中性プロテアーゼは、1mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝液中で再構成される。凍結乾燥ストック酵素は、175DMCU/バイアルの濃度であり得る。いくつかの実施形態では、再構成後の中性プロテアーゼストックは、約100DMC/mL~約400DMC/mLの範囲、例えば、約100DMC/mL~約400DMC/mL、約100DMC/mL~約350DMC/mL、約100DMC/mL~約300DMC/mL、約150DMC/mL~約400DMC/mL、約100DMC/mL、約110DMC/mL、約120DMC/mL、約130DMC/mL、約140DMC/mL、約150DMC/mL、約160DMC/mL、約170DMC/mL、約175DMC/mL、約180DMC/mL、約190DMC/mL、約200DMC/mL、約250DMC/mL、約300DMC/mL、約350DMC/mL、または約400DMC/mLである。
いくつかの実施形態では、DNAse Iは、1mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝液中で再構成される。凍結乾燥したストック酵素は、4KU/バイアルの濃度であった。いくつかの実施形態では、再構成後のDNase Iストックは、約1KU/mL~10KU/mL、例えば、約1KU/mL、約2KU/mL、約3KU/mL、約4KU/mL、約5KU/mL、約6KU/mL、約7KU/mL、約8KU/mL、約9KU/mL、または約10KU/mLの範囲である。
いくつかの実施形態では、酵素のストックは可変であり、濃度を決定する必要があり得る。いくつかの実施形態では、凍結乾燥ストックの濃度を検証することができる。いくつかの実施形態では、消化カクテルに添加される酵素の最終量は、決定されたストック濃度に基づいて調整される。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、約4.7mlの滅菌HBSS中に約10.2ulの中性プロテアーゼ(0.36DMC U/mL)、21.3μLのコラゲナーゼ(1.2PZ/mL)及び250ulのDNAse I(200U/mL)を含む。
上に示されるように、いくつかの実施形態では、TILは、固形腫瘍に由来する。いくつかの実施形態では、固形腫瘍は、断片化されない。いくつかの実施形態では、固形腫瘍は断片化されず、全腫瘍として酵素消化に供される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で1~2時間、37℃、5%COで消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及びヒアルロニダーゼを含む酵素混合物中で、37℃、5%COで、回転を伴って1~2時間消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、37℃、5%COで一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、全腫瘍が酵素と組み合わされて、腫瘍消化反応混合物が形成される。
いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及び中性プロテアーゼを含む酵素混合物中中で消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及び中性プロテアーゼを含む酵素混合物中中で1~2時間消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及び中性プロテアーゼを含む酵素混合物中中で1~2時間、37℃、5%のCO2で消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及び中性プロテアーゼを含む酵素混合物中中で1~2時間、37℃、5%のCO2で回転を伴って消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、37℃、5%のCO2で、一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、全腫瘍が酵素と組み合わされて、腫瘍消化反応混合物が形成される。
いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及び中性プロテアーゼを含む酵素混合物中中で消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及び中性プロテアーゼを含む酵素混合物中中で1~2時間消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及び中性プロテアーゼを含む酵素混合物中中で1~2時間、37℃、5%のCO2で消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ、DNase、及び中性プロテアーゼを含む酵素混合物中中で1~2時間、37℃、5%のCO2で回転を伴って消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、37℃、5%のCO2で、一定の回転を伴って一晩消化される。いくつかの実施形態では、全腫瘍が酵素と組み合わされて、腫瘍消化反応混合物が形成される。
いくつかの実施形態では、腫瘍は、滅菌緩衝液中の凍結乾燥酵素で再構成される。いくつかの実施形態では、緩衝液は、滅菌HBSSである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、コラゲナーゼを含む。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼは、コラゲナーゼIVである。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼの作業ストックは、100mg/mLの10倍作業ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、DNAseを含む。いくつかの実施形態では、DNAseの作業ストックは、10,000IU/mLの10倍作業ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、ヒアルロニダーゼを含む。いくつかの実施形態では、ヒアルロニダーゼの作業ストックは、10mg/mLの10倍作業ストックである。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、10mg/mLのコラゲナーゼ、1000IU/mLのDNAse、及び1mg/mLのヒアルロニダーゼを含む。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、10mg/mLのコラゲナーゼ、500IU/mLのDNAse、及び1mg/mLのヒアルロニダーゼを含む。
一般に、腫瘍から取得された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに取得された」または「新たに単離された」細胞集団と呼ばれる。ある特定の実施形態では、新たに取得されたTIL細胞集団は、抗原提示細胞、IL-12、及びOKT-3を含む細胞培養培地に曝露される。
いくつかの実施形態では、断片化には、例えば、解剖及び消化を含む物理的断片化が含まれる。いくつかの実施形態では、断片化は、物理的断片化である。いくつかの実施形態では、断片化は、解剖である。いくつかの実施形態では、断片化は、消化によるものである。いくつかの実施形態では、TILは、最初に、患者から取得された酵素腫瘍消化物及び腫瘍断片から培養され得る。いくつかの実施形態では、TILは、最初に、患者から取得された酵素腫瘍消化物及び腫瘍断片から培養され得る。
腫瘍が固形腫瘍であるいくつかの実施形態では、腫瘍試料が、例えば、ステップA(図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に提供される)で得られた後に、腫瘍は物理的断片化を受ける。いくつかの実施形態では、断片化は、凍結保存前に起こる。いくつかの実施形態では、断片化は、凍結保存後に起こる。いくつかの実施形態では、断片化は、腫瘍を得た後に、いずれの凍結保存もない場合に起こる。いくつかの実施形態では、断片化ステップは、インビトロまたはエクスビボプロセスである。いくつかの実施形態では、腫瘍が断片化され、10、20、30、40個、またはそれ以上の断片または小片が、プライミングによる第1の拡張のために各容器に入れられる。いくつかの実施形態では、腫瘍が断片化され、30個または40個の断片または小片が、プライミングによる第1の拡張のために各容器に入れられる。いくつかの実施形態では、腫瘍が断片化され、40個の断片または小片が、プライミングによる第1の拡張のために各容器に入れられる。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約4~約50個の断片を含み、各断片は、約27mmの体積を有する。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1300mm~約1500mmの総体積を伴う約30~約60個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1350mmの総体積を伴う約50個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約1グラム~約1.5グラムの総質量を伴う約50個の断片を含む。いくつかの実施形態では、複数の断片は、約4個の断片を含む。
いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍断片から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、鋭的解剖によって取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~10mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~8mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約2mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約3mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約4mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約5mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約6mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約7mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約8mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約9mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約10mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、1~4mm×1~4mm×1~4mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、1mm×1mm×1mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、2mm×2mm×2mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、3mm×3mm×3mmである。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、4mm×4mm×4mmである。
いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の出血性、壊死性、及び/または脂肪性組織の量を最小限に抑えるために断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の出血性組織の量を最小限に抑えるために断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の壊死性組織の量を最小限に抑えるために断片化される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、各小片上の脂肪性組織の量を最小限に抑えるために断片化される。ある特定の実施形態では、腫瘍の断片化ステップは、インビトロまたはエクスビボ方法である。
いくつかの実施形態では、腫瘍の断片化は、腫瘍の内部構造を維持するために行われる。いくつかの実施形態では、腫瘍の断片化は、メスでのこ引き動作を行うことなく行われる。いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍消化物から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、例えば、RPMI1640(2mM GlutaMAX、10mg/mLゲンタマイシン、30U/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)であるが、これに限定されない酵素培地中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(GentleMACS,Miltenyi Biotec,Auburn,CA)によって生成された。腫瘍を酵素培地に入れた後、腫瘍は、およそ1分間機械的に解離され得る。その後、溶液が5%CO中37℃で30分間インキュベートされ、その後、およそ1分間再び機械的に破壊され得る。5% CO中37℃で30分間再びインキュベートした後、腫瘍を、およそ1分間、3回目に機械的に破壊することができる。いくつかの実施形態では、大きい組織片が存在する場合、3回目の機械的破壊後、5%CO中37℃でさらに30分間インキュベートするかにかかわらず、1回または2回の追加の機械的解離が試料に適用された。いくつかの実施形態では、細胞懸濁液が多数の赤血球または死細胞を含む場合、最終インキュベーションの終わりに、Ficollを使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張ステップ前の細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに取得された」または「新たに単離された」細胞集団と称される。
いくつかの実施形態では、細胞は、試料単離後(例えば、腫瘍試料を得た後及び/または腫瘍試料から細胞懸濁液を得た後)、任意選択で凍結され得、ステップBに記載の拡張に入る前に凍結保存され得、これは以下でさらに詳細に説明されるとともに、図8(特に、例えば図8B)に例示される。
1.コア/小生検由来のTIL
いくつかの実施形態では、TILは、最初に、コア生検または同様の手順によって取得された患者腫瘍試料(「一次TIL」)から得られ、その後、本明細書に記載されるように、さらなる操作のためにより大きい集団に拡張され、任意で凍結保存され、任意で表現型及び代謝パラメータについて評価される。
いくつかの実施形態では、患者の腫瘍試料は、一般に、小生検、コア生検、針生検、または腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を得るための他の手段により、当該技術分野で知られている方法を使用して取得することができる。一般に、腫瘍試料は、原発腫瘍、浸潤性腫瘍、または転移性腫瘍を含む、任意の固形腫瘍に由来し得る。腫瘍試料は、血液系悪性腫瘍から取得された腫瘍などの液体腫瘍であり得る。いくつかの実施形態では、試料は、複数の小さい腫瘍試料または生検に由来し得る。いくつかの実施形態では、試料は、同じ患者由来の単一の腫瘍からの複数の腫瘍試料を含むことができる。いくつかの実施形態では、試料は、同じ患者由来の1、2、3、または4つの腫瘍からの複数の腫瘍試料を含むことができる。いくつかの実施形態では、試料は、同じ患者由来の複数の腫瘍からの複数の腫瘍試料を含むことができる。固形腫瘍は、肺癌及び/または非小細胞肺癌(NSCLC)であり得る。
一般に、腫瘍コアまたは断片から取得された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに取得された」または「新たに単離された」細胞集団と呼ばれる。ある特定の実施形態では、新たに取得されたTIL細胞集団は、抗原提示細胞、IL-2、及びOKT-3を含む細胞培養培地に曝露される。
いくつかの実施形態では、腫瘍が転移性であり、かつ原発性病変が過去に効率的に治療/除去された場合、転移性病変のうちの1つの除去が必要とされ得る。いくつかの実施形態では、最も侵襲性の低いアプローチは、皮膚病変、または利用可能な場合、首または腋窩領域のリンパ節を除去することである。いくつかの実施形態では、皮膚病変が除去されるか、またはその小生検が除去される。いくつかの実施形態では、リンパ節またはその小生検が除去される。いくつかの実施形態では、肺もしくは肝臓の転移性病変、または腹腔内リンパ節もしくは胸部リンパ節、または小生検が除去される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、黒色腫である。いくつかの実施形態では、黒色腫の小生検は、ほくろまたはその一部分を含む。
いくつかの実施形態では、小生検は、パンチ生検である。いくつかの実施形態では、パンチ生検は、皮膚に押し込まれた円形の刃で取得される。いくつかの実施形態では、パンチ生検は、疑わしいほくろの周りの皮膚に押し込まれた円形の刃で得られる。いくつかの実施形態では、パンチ生検は、皮膚に押し込まれた円形の刃で得られ、丸い皮膚片が採取される。いくつかの実施形態では、小生検は、パンチ生検であり、腫瘍の丸い部分が採取される。
いくつかの実施形態では、小生検は、切除生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、切除生検であり、ほくろまたは増殖全体が除去される。いくつかの実施形態では、小生検は、切除生検であり、ほくろまたは増殖全体が、正常に見える皮膚の小縁とともに除去される。
いくつかの実施形態では、小生検は、切開生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、切開生検であり、ほくろまたは増殖の最も不規則な部分のみが採取される。いくつかの実施形態では、小生検は、切開生検であり、切開生検は、疑わしいほくろが非常に大きい場合など、他の技法を達成することができない場合に使用される。
いくつかの実施形態では、小生検は、肺生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、気管支鏡検査によって取得される。一般に、気管支鏡検査では、患者は麻酔をかけられ、小さい用具が鼻または口を通り、喉を下って気管支通路に入り、そこで小さい用具を使用していくらかの組織を採取する。気管支鏡検査によって腫瘍または成長に到達できないいくつかの実施形態では、経胸腔針生検が用いられ得る。一般に、経胸腔針生検の場合も、患者は麻酔をかけられ、針が皮膚をとおして疑わしい場所に直接挿入されて、小さい組織試料を採取する。いくつかの実施形態では、経胸壁針生検は、介入放射線医学(例えば、針をガイドするためのX線またはCT走査の使用)を必要とし得る。いくつかの実施形態では、小生検は、針生検によって取得される。いくつかの実施形態では、小生検は、超音波内視鏡検査によって得られる(例えば、照明を備えた内視鏡であり、口をとおして食道に配置される)。いくつかの実施形態では、小生検は、外科的に取得される。
いくつかの実施形態では、小生検は、頭頸部生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、切開生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、切開生検であり、小さい組織片が異常に見える領域から切り取られる。いくつかの実施形態では、異常な領域に容易にアクセスできる場合、試料は、入院することなく採取され得る。いくつかの実施形態では、腫瘍が口または喉のより深くにある場合、生検は、全身麻酔を用いて手術室で行われる必要があり得る。いくつかの実施形態では、小生検は、切除生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、全領域が除去される切除生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、細針吸引(FNA)である。いくつかの実施形態では、小生検は、細針吸引(FNA)であり、シリンジに取り付けられた非常に細い針を使用して、腫瘍または塊から細胞を抽出(吸引)する。いくつかの実施形態では、小生検は、パンチ生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、パンチ生検であり、パンチ鉗子を使用して、疑わしい領域の一片を採取する。
いくつかの実施形態では、小生検は、子宮頸部生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、膣鏡検査によって取得される。一般に、膣鏡検査は、拡大双眼鏡に取り付けられた照明付き拡大器具(膣鏡)の使用を採用し、その後、これを使用して、子宮頸部の表面の小さい切片を生検する。いくつかの実施形態では、小生検は、円錐切除/錐体生検である。いくつかの実施形態では、小生検は、円錐切除/錐体生検であり、子宮頸部からより大きい組織片を採取するために外来手術が必要になる場合がある。いくつかの実施形態では、錐体生検は、診断の確認を助けることに加えて、錐体生検が初期治療となり得る。
「固形腫瘍」という用語は、通常、嚢胞または液体領域を含まない異常な組織塊を指す。固形腫瘍は、良性または悪性であり得る。「固形腫瘍がん」という用語は、悪性、腫瘍性、またはがん性の固形腫瘍を指す。固形腫瘍がんには、肺の癌が含まれる。いくつかの実施形態では、がんは、黒色腫である。いくつかの実施形態では、がんは、非小細胞肺癌(NSCLC)である。固形腫瘍の組織構造には、実質(がん細胞)を含む相互依存的組織区画、及びがん細胞が分散しており、かつ支持微小環境を提供し得る支持間質細胞が含まれる。
いくつかの実施形態では、腫瘍由来の試料は、細針吸引物(FNA)、コア生検、小生検(例えば、パンチ生検を含む)として取得される。いくつかの実施形態では、試料は、最初にG-REX 10に入れられる。いくつかの実施形態では、1つまたは2つのコア生検及び/または小生検試料が存在する場合、試料は、最初にG-REX 10に入れられる。いくつかの実施形態では、3、4、5、6、8、9、または10個以上のコア生検及び/または小生検試料が存在する場合、試料は、最初にG-REX100に入れられる。いくつかの実施形態では、3、4、5、6、8、9、または10個以上のコア生検及び/または小生検試料が存在する場合、試料は、最初にG-REX500に入れられる。
FNAは、例えば、黒色腫を含む皮膚腫瘍から取得することができる。いくつかの実施形態では、FNAは、転移性黒色腫を有する患者からの皮膚腫瘍などの皮膚腫瘍から取得される。いくつかの事例では、黒色腫を有する患者は、外科的治療を以前に受けたことがある。
FNAは、例えば、NSCLCを含む肺腫瘍から得ることができる。いくつかの実施形態では、FNAは、非小細胞肺癌(NSCLC)を有する患者由来の肺腫瘍などの肺腫瘍から取得される。いくつかの事例では、NSCLCを有する患者は、外科的治療を以前に受けたことがある。
本明細書に記載のTILは、FNA試料から得られ得る。いくつかの事例では、FNA試料は、18ゲージ針~25ゲージ針の範囲の細いゲージ針を使用して、患者から得られるか、または単離される。細いゲージ針は、18ゲージ、19ゲージ、20ゲージ、21ゲージ、22ゲージ、23ゲージ、24ゲージ、または25ゲージであり得る。いくつかの実施形態では、患者由来のFNA試料は、少なくとも400,000個のTIL、例えば、400,000個のTIL、450,000個のTIL、500,000個のTIL、550,000個のTIL、600,000個のTIL、650,000個のTIL、700,000個のTIL、750,000個のTIL、800,000個のTIL、850,000個のTIL、900,000個のTIL、950,000個のTIL、またはそれ以上を含み得る。
いくつかの事例では、本明細書に記載のTILは、コア生検試料から取得される。いくつかの事例では、コア生検試料は、11ゲージ針~16ゲージ針の範囲の外科用または医療用針を使用して、患者から得られるか、または単離される。針は、11ゲージ、12ゲージ、13ゲージ、14ゲージ、15ゲージ、または16ゲージであり得る。いくつかの実施形態では、患者由来のコア生検試料は、少なくとも400,000個のTIL、例えば、400,000個のTIL、450,000個のTIL、500,000個のTIL、550,000個のTIL、600,000個のTIL、650,000個のTIL、700,000個のTIL、750,000個のTIL、800,000個のTIL、850,000個のTIL、900,000個のTIL、950,000個のTIL、またはそれ以上を含み得る。
一般に、採取された細胞懸濁液は、「一次細胞集団」または「新たに採取された」細胞集団と呼ばれる。
いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍消化物から得られない。いくつかの実施形態では、固形腫瘍コアは、断片化されない。
いくつかの実施形態では、TILは、腫瘍消化物から取得される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、例えば、RPMI1640(2mM GlutaMAX、10mg/mLゲンタマイシン、30U/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼ)であるが、これに限定されない酵素培地中でのインキュベーション、続いて、機械的解離(GentleMACS,Miltenyi Biotec,Auburn,CA)によって生成された。腫瘍を酵素培地に入れた後、腫瘍は、およそ1分間機械的に解離され得る。その後、溶液が5%CO中37℃で30分間インキュベートされ、その後、およそ1分間再び機械的に破壊され得る。5% CO中37℃で30分間再びインキュベートした後、腫瘍を、およそ1分間、3回目に機械的に破壊することができる。いくつかの実施形態では、大きい組織片が存在する場合、3回目の機械的破壊後、5%CO中37℃でさらに30分間インキュベートするかにかかわらず、1回または2回の追加の機械的解離が試料に適用された。いくつかの実施形態では、細胞懸濁液が多数の赤血球または死細胞を含む場合、最終インキュベーションの終わりに、Ficollを使用した密度勾配分離が行われて、これらの細胞を除去することができる。
いくつかの実施形態では、第1のTIL集団を取得することは、多病変試料採取法を含む。
腫瘍解離酵素混合物には、1つ以上の解離(消化)酵素、例えば、限定されないが、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはコラゲナーゼの種類を含む)、Accutase(商標)、Accumax(商標)、ヒアルロニダーゼ、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)、キモトリプシン、キモパパイン、トリプシン、カゼイナーゼ、エラスターゼ、パパイン、XIV型プロテアーゼ(プロナーゼ)、デオキシリボヌクレアーゼI(DNase)、トリプシン阻害剤、任意の他の解離酵素またはタンパク質分解酵素、及びそれらの任意の組み合わせが含まれ得る。
いくつかの実施形態では、解離酵素は、凍結乾燥酵素から再構成される。いくつかの実施形態では、凍結乾燥酵素は、ハンクス平衡塩溶液(HBSS)などの滅菌緩衝液の量で再構成される。
いくつかの事例では、コラゲナーゼ(アニマルフリー1型コラゲナーゼなど)を、10mLの滅菌HBSSまたは別の緩衝液で再構成する。凍結乾燥ストック酵素は、2892PZ U/バイアルの濃度であり得る。いくつかの実施形態では、コラゲナーゼは、5mL~15mLの緩衝液中で再構成される。いくつかの実施形態では、再構成後のコラゲナーゼストックは、約100PZ U/mL~約400PZ U/mLの範囲、例えば、約100PZ U/mL~約400PZ U/mL、約100PZ U/mL~約350PZ U/mL、約100PZ U/mL~約300PZ U/mL、約150PZ U/mL~約400PZ U/mL、約100PZ U/mL、約150PZ U/mL、約200PZ U/mL、約210PZ U/mL、約220PZ U/mL、約230PZ U/mL、約240PZ U/mL、約250PZ U/mL、約260PZ U/mL、約270PZ U/mL、約280PZ U/mL、約289.2PZ U/mL、約300PZ U/mL、約350PZ U/mL、または約400PZ U/mLである。
いくつかの実施形態では、中性プロテアーゼは、1mlの滅菌HBSSまたは別の緩衝液中で再構成される。凍結乾燥ストック酵素は、175DMCU/バイアルの濃度であり得る。いくつかの実施形態では、再構成後の中性プロテアーゼストックは、約100DMC/mL~約400DMC/mLの範囲、例えば、約100DMC/mL~約400DMC/mL、約100DMC/mL~約350DMC/mL、約100DMC/mL~約300DMC/mL、約150DMC/mL~約400DMC/mL、約100DMC/mL、約110DMC/mL、約120DMC/mL、約130DMC/mL、約140DMC/mL、約150DMC/mL、約160DMC/mL、約170DMC/mL、約175DMC/mL、約180DMC/mL、約190DMC/mL、約200DMC/mL、約250DMC/mL、約300DMC/mL、約350DMC/mL、または約400DMC/mLである。
いくつかの実施形態において、DNAse Iは、1mlの滅菌HBSSまたは別の緩衝液中で再構成される。凍結乾燥したストック酵素は、4KU/バイアルの濃度であった。いくつかの実施形態では、再構成後のDNase Iストックは、約1KU/mL~10KU/mL、例えば、約1KU/mL、約2KU/mL、約3KU/mL、約4KU/mL、約5KU/mL、約6KU/mL、約7KU/mL、約8KU/mL、約9KU/mL、または約10KU/mLの範囲である。
いくつかの実施形態では、酵素のストックは変化する可能性があるため、凍結乾燥ストックの濃度を確認し、それに応じて消化カクテルに追加される酵素の最終量を修正することに留意されたい。
いくつかの実施形態では、酵素混合物は、約4.7mlの滅菌HBSS中に約10.2ulの中性プロテアーゼ(0.36DMC U/mL)、21.3ulのコラゲナーゼ(1.2PZ/mL)及び250ulのDNAse I(200U/mL)を含む。
2.胸水T細胞及びTIL
いくつかの実施形態では、試料は、胸腔内液試料である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセスによる拡張のためのT細胞またはTILの供給源は、胸腔内液試料である。いくつかの実施形態では、試料は、胸水由来試料である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセスによる拡張のためのTILの供給源は、胸水由来試料である。例えば、米国特許公開第2014/0295426号に記載されている方法を参照されたく、これはすべての目的のためにその全体が参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、TILと思われる、及び/またはTILを含む任意の胸腔内液または胸水を利用することができる。かかる試料は、NSCLCもしくはSCLCなどの原発性または転移性肺癌に由来し得る。いくつかの実施形態では、試料は、別の臓器、例えば、乳房、卵巣、結腸、または前立腺に由来する二次転移性がん細胞に由来し得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用する試料は、胸膜浸出液である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用する試料は、胸膜漏出液である。他の生体試料は、例えば、腹部からの腹水または膵嚢胞液を含む、TILを含有する他の漿液を含み得る。腹水及び胸腔内液は、非常に類似した化学系を伴い、腹部及び肺の両方が、悪性腫瘍における同じ物質の胸膜空間及び腹部空間に中皮線及び流体形態を有し、いくつかの実施形態では、かかる流体は、TILを含有する。開示される方法が胸水を利用するいくつかの実施形態では、同じ方法が、TILを含有する他の嚢胞液を使用して同様の結果で行われてもよい。
いくつかの実施形態では、胸腔内液は、患者から直接除去された未処理の形態である。いくつかの実施形態では、未処理の胸腔内液は、さらなる処理ステップの前に、EDTAまたはヘパリンチューブなどの標準的な採血管に入れられる。いくつかの実施形態では、未処理の胸腔内液は、さらなる処理ステップの前に、標準的なCellSave(登録商標)チューブ(Veridex)に入れられる。いくつかの実施形態では、試料は、生存TILの数の減少を避けるために、患者から採取した直後にCellSaveチューブに入れられる。生存TILの数は、4℃であっても、未処理の胸腔内液中に放置されると、24時間以内に大幅に減少する可能性がある。いくつかの実施形態では、試料は、患者からの除去後1時間、5時間、10時間、15時間、または最大24時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。いくつかの実施形態では、試料は、4℃で、患者からの除去後1時間、5時間、10時間、15時間、または最大24時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。
いくつかの実施形態では、選択された対象からの胸腔内液試料は、希釈され得る。一実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:10である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:9である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:8である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:5である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:2である。いくつかの実施形態では、希釈は、胸腔内液対希釈剤が1:1である。いくつかの実施形態では、希釈剤には、生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水、別の緩衝液、または生理学的に許容される希釈剤が含まれる。いくつかの実施形態では、試料は、患者からの収集及び希釈の直後にCellSaveチューブ内に入れられ、生存TILの減少を回避し、これは、4℃であっても、未処理の胸腔内液中に放置された場合、24~48時間以内に有意に生じ得る。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、患者からの除去及び希釈後1時間、5時間、10時間、15時間、24時間、36時間、最大48時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、4℃で、患者からの除去及び希釈後1時間、5時間、10時間、15時間、24時間、36時間、最大48時間以内に適切な収集チューブ内に入れられる。
さらに別の実施形態では、胸腔内液試料は、さらなる処理ステップの前に、従来の手段によって濃縮される。いくつかの実施形態では、胸腔内液のこの前処理は、方法を実施する実験室への輸送のために、またはその後の分析のために(例えば、採取後24~48時間より後に)胸水を凍結保存しなければならない状況において好ましい。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、それが対象から採取された後に胸腔内液試料を遠心分離し、遠心分離物またはペレットを緩衝液中に再懸濁することによって調製される。いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、輸送または後の分析及び/または処理のために凍結保存される前に、複数の遠心分離及び再懸濁に供される。
いくつかの実施形態では、胸腔内液試料は、濾過法を使用することによって、さらなる処理ステップの前に濃縮される。いくつかの実施形態では、さらなる処理で使用される胸腔内液試料は、胸腔内液が膜を通過することを可能にするが腫瘍細胞を保持する、既知で本質的に均一な孔径を含むフィルタを通して流体を濾過することによって調製される。いくつかの実施形態では、膜の細孔の直径は、少なくとも4μMであり得る。いくつかの実施形態では、細孔直径は、5μM以上であり得、他の実施形態では、6、7、8、9、または10μMのうちのいずれかである。濾過後、膜によって保持されたTILを含む細胞を、膜から適切な生理学的に許容される緩衝液にすすいでもよい。次いで、このように濃縮されたTILを含む細胞は、方法のさらなる処理ステップで使用することができる。
いくつかの実施形態では、胸腔内液試料(例えば、未処理の胸腔内液を含む)、希釈胸水、または再懸濁細胞ペレットは、試料中に存在する無核赤血球を特異的に溶解する溶解試薬と接触させる。いくつかの実施形態では、このステップは、胸腔内液がかなりの数のRBCを含む状況で、さらなる処理ステップの前に行われる。好適な溶解試薬には、単一の溶解試薬もしくは溶解試薬及びクエンチ試薬、または溶解剤、クエンチ試薬及び固定試薬が含まれる。好適な溶解システムは市販されており、BD Pharm Lyse(商標)システム(Becton Dickenson)が含まれる。他の溶解システムには、Versalyse(商標)システム、FACSlyse(商標)システム(Becton Dickenson)、Immunoprep(商標)システム、またはErythrolyse IIシステム(Beckman Coulter,Inc.)、または塩化アンモニウムシステムが含まれる。いくつかの実施形態では、溶解試薬は、赤血球の効率的な溶解、ならびに胸水におけるTIL及びTILの表現型特性の保存のような主要な要件によって異なり得る。溶解のための単一の試薬を利用することに加えて、本明細書に記載の方法に有用な溶解システムは、第2の試薬、例えば、方法の残りのステップ中に溶解試薬の効果をクエンチまたは遅延させるもの、例えばStabilyse(商標)試薬(Beckman Coulter,Inc.)を含むことができる。溶解試薬の選択または方法の好ましい実施に応じて、従来の固定試薬を使用することもできる。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、未処理、希釈または多重遠心分離または処理された胸腔内液試料は、本明細書で提供されるようにさらに処理及び/または拡張される前に、約-140℃の温度で凍結保存される。
1.末梢血から末梢血リンパ球(PBL)を拡張する方法
PBL法1。本発明のいくつかの実施形態では、PBLは、本明細書に記載のプロセスを使用して拡張される。本発明のいくつかの実施形態では、方法は、全血からPBMC試料を取得することを含む。いくつかの実施形態では、方法は、非CD19+画分の負の選択を使用して、PBMCから純粋なT細胞を単離することによってT細胞を濃縮することを含む。いくつかの実施形態では、方法は、非CD19+画分の磁気ビーズベースの負の選択を使用して、PBMCから純粋なT細胞を単離することによってT細胞を濃縮することを含む。
本発明のいくつかの実施形態では、PBL法1は、以下のように行われる:0日目に、凍結保存されたPBMC試料を解凍し、PBMCを計数する。T細胞を、ヒトPan T細胞単離キット及びLSカラム(Miltenyi Biotec)を使用して単離する。
PBL法2。本発明のいくつかの実施形態では、PBLは、全血からPBMC試料を得ることを含むPBL法2を使用して拡張される。PBMC由来のT細胞は、PBMCを37℃で少なくとも3時間インキュベートし、その後、非接着細胞を単離することによって濃縮される。
本発明のいくつかの実施形態では、PBL法2は、以下のように行われる:0日目に、凍結保存されたPMBC試料を解凍し、PBMC細胞を、CM-2培地中の6ウェルプレートに600万細胞/ウェルで播種し、37℃で3時間インキュベートする。3時間後、PBLである非接着細胞を取り出し、計数する。
PBL方法3。本発明のいくつかの実施形態では、PBLは、末梢血からPBMC試料を得ることを含むPBL法3を使用して拡張される。B細胞は、CD19+選択を使用して単離され、T細胞は、PBMC試料の非CD19+画分の負の選択を使用して選択される。
本発明のいくつかの実施形態では、PBL法3は、以下のように行われる:0日目に、末梢血から取得された凍結保存されたPBMCを解凍し、計数する。CD19+B細胞を、CD19 Multisortキット、ヒト(Miltenyi Biotec)を使用して選別する。非CD19+細胞画分のうち、T細胞を、ヒトPan T細胞単離キット及びLSカラム(Miltenyi Biotec)を使用して精製する。
いくつかの実施形態では、PBMCは、全血試料から単離される。いくつかの実施形態では、PBMC試料は、PBLを拡張するための出発材料として使用される。いくつかの実施形態では、試料は、拡張プロセス前に凍結保存される。他の実施形態では、新鮮な試料が、PBLを拡張するための出発材料として使用される。本発明のいくつかの実施形態では、T細胞は、当該技術分野で知られている方法を使用してPBMCから単離される。いくつかの実施形態では、T細胞は、ヒトT汎細胞単離キット及びLSカラムを使用して単離される。本発明のいくつかの実施形態では、T細胞は、当該技術分野で知られている抗体選択方法、例えば、CD19の負の選択を使用して、PBMCから単離される。
本発明のいくつかの実施形態では、PBMC試料は、非接着細胞を特定するのに有効な所望の温度である期間インキュベートされる。本発明のいくつかの実施形態では、インキュベーション時間は、約3時間である。本発明のいくつかの実施形態では、温度は、約37℃である。その後、非接着細胞は、上記のプロセスを使用して拡張される。
いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで任意選択で前治療された対象または患者由来のものである。いくつかの実施形態では、腫瘍試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療された対象または患者由来のものである。いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療されており、少なくとも1ヶ月間、少なくとも2ヶ月間、少なくとも3ヶ月間、少なくとも4ヶ月間、少なくとも5ヶ月間、少なくとも6ヶ月間、または1年間、またはそれ以上治療を受けた対象または患者由来のものである。他の実施形態では、PBMCは、イブルチニブなどのITK阻害剤レジメンを現在受けている患者に由来する。
いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療されており、キナーゼ阻害剤またはイブルチニブなどのITK阻害剤での治療に不応性である対象または患者由来のものである。
いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療されたが、もはやキナーゼ阻害剤またはITK阻害剤での治療を受けていない対象または患者由来のものである。いくつかの実施形態では、PBMC試料は、キナーゼ阻害剤またはITK阻害剤を含むレジメンで前治療されたが、もはやキナーゼ阻害剤またはITK阻害剤での治療を受けておらず、少なくとも1ヶ月間、少なくとも2ヶ月間、少なくとも3ヶ月間、少なくとも4ヶ月間、少なくとも5ヶ月間、少なくとも6ヶ月間、または少なくとも1年間、またはそれ以上治療を受けていない対象または患者由来のものである。他の実施形態では、PBMCは、ITK阻害剤に以前に曝露されたが、少なくとも3ヶ月、少なくとも6ヶ月、少なくとも9ヶ月、または少なくとも1年以内に治療されていない患者に由来する。
本発明のいくつかの実施形態では、0日目に、細胞がCD19+について選択され、それに応じて選別される。本発明のいくつかの実施形態では、選択は、抗体結合ビーズを使用して行われる。本発明のいくつかの実施形態では、純粋なT細胞が、0日目にPBMCから単離される。
本発明のいくつかの実施形態では、イブルチニブまたは他のITK阻害剤で前治療されていない患者の場合、10~15mLのバフィーコートは、約5×10のPBMCを産生し、これは、次いで、約5.5×10のPBLを産生する。
本発明のいくつかの実施形態では、イブルチニブまたは他のITK阻害剤で前治療された患者の場合、拡張プロセスは、約20×10のPBLを産生する。本発明のいくつかの実施形態では、40.3×10のPBMCは、約4.7×10のPBLを産生する。
前述の実施形態のうちのいずれにおいても、PBMCは、全血試料から、アフェレーシスによって、バフィーコートから、またはPBMCを得るための当該技術分野で知られている任意の他の方法から得られ得る。
いくつかの実施形態では、PBLは、米国特許出願公開第2020/0347350 A1号(この開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載される方法を使用して調製される。
2.骨髄由来のPBMCから骨髄浸潤リンパ球(MIL)を拡張する方法
MIL方法3。本発明のいくつかの実施形態では、方法は、骨髄からPBMCを取得することを含む。0日目に、PBMCがCD3+/CD33+/CD20+/CD14+について選択され、選別され、非CD3+/CD33+/CD20+/CD14+細胞画分が超音波処理され、超音波処理された細胞画分の一部が選択された細胞画分に戻し追加される。
本発明のいくつかの実施形態では、MIL法3は、以下のように行われる:0日目に、凍結保存されたPBMC試料を解凍し、PBMCを計数する。細胞を、CD3、CD33、CD20、及びCD14抗体で染色し、選別されたS3e細胞(Bio-Rad)を使用して選別する。細胞を、免疫細胞画分(またはMIL画分)(CD3+CD33+CD20+CD14+)及びAML芽球画分(非CD3+CD33+CD20+CD14+)の2つの画分に選別する。
本発明のいくつかの実施形態では、PBMCは、骨髄から取得される。いくつかの実施形態では、PBMCは、アフェレーシス、吸引、針生検、または当該技術分野で知られている他の同様の手段により骨髄から取得される。いくつかの実施形態では、PBMCは、新鮮である。他の実施形態では、PBMCは、凍結保存される。
本発明のいくつかの実施形態では、MILは、10~50mLの骨髄穿刺液から拡張される。本発明のいくつかの実施形態では、10mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。他の実施形態では、20mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。他の実施形態では、30mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。他の実施形態では、40mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。他の実施形態では、50mLの骨髄穿刺液が患者から取得される。
本発明のいくつかの実施形態では、約10~50mLの骨髄穿刺液から産生されたPBMCの数は、約5×10~約10×10PBMCである。他の実施形態では、産生されるPMBCの数は、約7×10のPBMCである。
本発明のいくつかの実施形態では、約5×10~約10×10個のPBMCから約0.5×10~約1.5×10個のMILが得られる。本発明のいくつかの実施形態では、約1×10MILが産生される。
本発明のいくつかの実施形態では、骨髄穿刺液由来の12×10個のPBMCから、およそ1.4×10個のMILが得られる。
前述の実施形態のうちのいずれにおいても、PBMCは、全血試料から、骨髄から、アフェレーシスによって、バフィーコートから、またはPBMCを得るための当該技術分野で知られている任意の他の方法から得られ得る。
いくつかの実施形態では、MILは、米国特許出願公開第2020/0347350 A1号(この開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載される方法を使用して調製される。
A1.ステップA1:進行前凍結保存
いくつかの実施形態では、本方法は、患者が免疫チェックポイント阻害剤(ICI)及び/または標準治療の治療を受ける時または受けた後にがん進行を示す後、ステップAから取得された採取された腫瘍試料を凍結保存し、将来のTIL製造のための凍結保存TIL調製物を作製することを提供する。
いくつかの実施形態では、凍結保存は、
(a)少なくとも1つの前の療法の前に、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または対象もしくは患者のNSCLC腫瘍から腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む試料を凍結保存して、凍結保存された試料を産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、凍結保存は、
(a)少なくとも1つの前の療法の前に、対象から取得された腫瘍試料を、複数の腫瘍断片に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片を産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、凍結保存は、
(a)少なくとも1つの前の療法の前に、対象から取得された腫瘍試料を、腫瘍消化物に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍消化物を産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、凍結保存は、
(a)少なくとも1つの前の療法の前に、対象または患者からNSCLC腫瘍を切除することであって、腫瘍が、任意選択で、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、またはNSCLC腫瘍から腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段からの第1のTIL集団を含む、切除することと、
(b)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む試料を凍結保存して、凍結保存された試料を産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、凍結保存は、
(a)少なくとも1つの前の療法の前に、対象または患者からNSCLC腫瘍を切除することであって、腫瘍が、任意選択で、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、またはNSCLC腫瘍から腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段からの第1のTIL集団を含む、切除することと、
(b)腫瘍を、腫瘍断片に断片化することと、
(c)ステップ(b)からの第1のTIL集団を含む腫瘍断片を凍結保存して、凍結保存された腫瘍断片を産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、凍結保存は、
(a)少なくとも1つの前の療法の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を酵素培地中で消化して、腫瘍消化物を産生することと、
(c)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を凍結保存して、凍結保存された腫瘍消化物を産生することと、を含む。
いくつかの実施形態では、凍結保存は、
(a)少なくとも1つの前の療法の前に、対象または患者から切除された腫瘍組織から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)腫瘍組織を解離して、解離された腫瘍物質を産生することと、
(c)ステップ(a)からの第1のTIL集団を含む解離された腫瘍物質を凍結保存して、凍結保存された解離された腫瘍物質を産生することと、を含む。
B.ステップB:プライミングによる第1の拡張
いくつかの実施形態では、本方法は、より古いTIL(すなわち、対象/患者への投与前により多くの複製ラウンドをさらに受けたTIL)よりも追加の治療的利益を提供し得る、より若いTILを提供する。若いTILの特徴は、文献、例えば、Donia,et al.,Scand.J.Immunol.2012,75,157-167、Dudley,et al.,Clin.Cancer Res.2010,16,6122-6131、Huang,et al.,J.Immunother.2005,28,258-267、Besser,et al.,Clin.Cancer Res.2013,19,OF1-OF9、Besser,et al.,J.Immunother.2009,32:415-423、Robbins,et al.,J.Immunol.2004,173,7125-7130、Shen,et al.,J.Immunother.,2007,30,123-129、Zhou,et al.,J.Immunother.2005,28,53-62、及びTran,et al.,J.Immunother.,2008,31,742-751に記載されており、それらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップAに記載されるものなどの腫瘍断片及び/または腫瘍断片の解剖または消化後に、結果として得られた細胞は、腫瘍及び他の細胞よりもTILの成長を好む条件下で、IL-2、OKT-3、及びフィーダー細胞(例えば、抗原提示フィーダー細胞)を含む血清中で培養される。いくつかの実施形態では、IL-2、OKT-3、及びフィーダー細胞は、腫瘍消化物及び/または腫瘍断片とともに培養開始時に(例えば、0日目に)追加される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物及び/または腫瘍断片は、1容器当たり最大60個の断片及び6000IU/mLのIL-2を含む容器内でインキュベートされる。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、数日間、一般に1~8日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、数日間、一般に1~7日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、1~8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、1~7日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、5~8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、5~7日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約6~8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に、約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約6~7日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に、約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約7~8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に、約1×10のバルクTIL細胞を生じる。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約7日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞をもたらす。いくつかの実施形態では、このプライミングによる第1の拡張は、約8日間起こり、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞をもたらす。
いくつかの実施形態では、TILの拡張は、以下及び本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張ステップ(例えば、REP前またはプライミングREPと称されるプロセスを含み得、かつ0日目及び/または培養開始からフィーダー細胞を含む、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに記載されるものなど)、その後、以下のステップD及び本明細書に記載の急速な第2の拡張(ステップD、急速な拡張プロトコル(REP)ステップと称されるプロセスを含む)、続いて、任意の凍結保存、その後、以下及び本明細書に記載の第2のステップD(再刺激REPステップと称されるプロセスを含む)を使用して行われ得る。このプロセスから取得されたTILは、本明細書に記載の表現型特徴及び代謝パラメータについて任意で特徴付けられ得る。いくつかの実施形態では、腫瘍断片は、約1mm~10mmである。
いくつかの実施形態では、第1の拡張培養培地は、培養培地の略語である「CM」と称される。いくつかの実施形態では、ステップBのCMは、10%ヒトAB血清、25mM Hepes、及び10mg/mLゲンタマイシンを補充した、GlutaMAXを含むRPMI 1640からなる。
いくつかの実施形態では、240個以下の腫瘍断片が存在する。いくつかの実施形態では、4つ以下の容器に入れられた240個以下の腫瘍断片が存在する。いくつかの実施形態では、容器は、G-REX100 MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、60個以下の腫瘍断片が1つの容器に入れられる。いくつかの実施形態では、各容器は、1容器当たり500mL以下の培地を含む。いくつかの実施形態では、培地は、IL-2を含む。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、培地は、抗原提示フィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、OKT-3を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり30ng/mLのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、G-REX100 MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2、30ngのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり6000IU/mLのIL-2、30ng/mLのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。
腫瘍断片の調製後、結果として得られた細胞(すなわち、一次細胞集団である断片)は、腫瘍及び他の細胞よりもTILの成長を好み、かつ0日目の培養開始からTILプライミング及び加速された成長を可能にする条件下で、IL-2、抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含有する培地中で培養される。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物及び/または腫瘍断片は、6000IU/mLのIL-2、ならびに抗原提示フィーダー細胞及びOKT-3とインキュベートされる。この一次細胞集団は、数日間、一般に1~8日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞をもたらす。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張中の成長培地は、IL-2またはそのバリアント、ならびに抗原提示フィーダー細胞及びOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、この一次細胞集団は、数日間、一般に1~7日間培養され、その結果、バルクTIL集団、一般に約1×10のバルクTIL細胞をもたらす。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張中の成長培地は、IL-2またはそのバリアント、ならびに抗原提示フィーダー細胞及びOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、IL-2は、組換えヒトIL-2(rhIL-2)である。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき20~30×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき20×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき25×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、1mgバイアルにつき30×10IU/mgの比活性を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、4~8×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、5~7×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、6×10IU/mgのIL-2の最終濃度を有する。いくつかの実施形態では、IL-2ストック溶液は、実施例Cに記載されるように調製される。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約10,000IU/mLのIL-2、約9,000IU/mLのIL-2、約8,000IU/mLのIL-2、約7,000IU/mLのIL-2、約6000IU/mLのIL-2、または約5,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約9,000IU/mLのIL-2~約5,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約8,000IU/mLのIL-2~約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約7,000IU/mLのIL-2~約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約6,000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-2さらに含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。ある実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、約4000IU/mL、約4500IU/mL、約5000IU/mL、約5500IU/mL、約6000IU/mL、約6500IU/mL、約7000IU/mL、約7500IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、1000~2000IU/mL、2000~3000IU/mL、3000~4000IU/mL、4000~5000IU/mL、5000~6000IU/mL、6000~7000IU/mL、7000~8000IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15、約400IU/mLのIL-15、約300IU/mLのIL-15、約200IU/mLのIL-15、約180IU/mLのIL-15、約160IU/mLのIL-15、約140IU/mLのIL-15、約120IU/mLのIL-15、または約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約400IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約300IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約200IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、IL-15をさらに含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21、約15IU/mLのIL-21、約12IU/mLのIL-21、約10IU/mLのIL-21、約5IU/mLのIL-21、約4IU/mLのIL-21、約3IU/mLのIL-21、約2IU/mLのIL-21、約1IU/mLのIL-21、または約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約15IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約12IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約10IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約5IU/mLのIL-21~約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、約2IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-21をさらに含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、OKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、約0.1ng/mL、約0.5ng/mL、約1ng/mL、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約200ng/mL、約500ng/mL、及び約1μg/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、0.1ng/mL~1ng/mL、1ng/mL~5ng/mL、5ng/mL~10ng/mL、10ng/mL~20ngの間、20ng/mL~30ng/mL、30ng/mL~40ng/mL、40ng/mL~50ng/mL、及び50ng/mL~100ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、15ng/mL~30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、OKT-3抗体は、ムロモナブである。表1を参照されたい。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、細胞培養培地中に1つ以上のTNFRSFアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは4-1BBアゴニストであり、4-1BBアゴニストは、ウレルマブ、ウトミルマブ、EU-101、融合タンパク質、ならびにそれらの断片、誘導体、バリアント、バイオシミラー、及び組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、0.1μg/mL~100μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、20μg/mL~40μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。
いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、IL-2を約3000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、プライミングによる第1の拡張細胞培養培地は、IL-2を約6000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培養培地は、培養培地の略語である「CM」と称される。いくつかの実施形態では、それは、CM1(培養培地1)と称される。いくつかの実施形態では、CMは、10%ヒトAB血清、25mM Hepes、及び10mg/mLゲンタマイシンを補充した、GlutaMAXを含むRPMI1640からなる。いくつかの実施形態では、CMは、実施例に記載されるCM1であり、実施例Aを参照されたい。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、初期細胞培養培地または第1の細胞培養培地中で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張培地または初期細胞培養培地または第1の細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞(本明細書ではフィーダー細胞とも称される)を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される拡張プロセスで使用される培地は、無血清培地または合成培地である。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、血清含有培地のロット間の変動に部分的に起因する実験変動を防止及び/または減少させるために使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地には、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CTS(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI 1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、血清サプリメントまたは血清代替物には、CTS(商標)OpTmizer T-Cell Expansion Serum Supplement、CTS(商標)Immune Cell Serum Replacement、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代用物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代用物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代用物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の抗生物質、及び1つ以上の微量元素のうちの1つ以上が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/または2-メルカプトエタノールをさらに含む。
いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Immune Cell Serum Replacementは、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CST(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI 1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地を含むが、これらに限定されない、従来の成長培地とともに使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地中の総血清代替物濃度(vol%)は、総無血清または合成培地の約1体積%、2体積%、3体積%、4体積%、5体積%、6体積%、7体積%、8体積%、9体積%、10体積%、11体積%、12体積%、13体積%、14体積%、15体積%、16体積%、17体積%、18体積%、19体積%、または20体積%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約3%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約5%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約10%である。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されており、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されており、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約0.1mM~約10mM、0.5mM~約9mM、1mM~約8mM、2mM~約7mM、3mM~約6mM、または4mM~約5mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約2mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約5mM~約150mM、10mM~約140mM、15mM~約130mM、20mM~約120mM、25mM~約110mM、30mM~約100mM、35mM~約95mM、40mM~約90mM、45mM~約85mM、50mM~約80mM、55mM~約75mM、60mM~約70mM、または約65mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約55mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、培地中の2-メルカプトエタノールの最終濃度は、55μMである。
いくつかの実施形態では、参照により本明細書に組み込まれる国際PCT公開第WO/1998/030679号に記載されている合成培地は、本発明において有用である。その刊行物には、無血清真核細胞培養培地が記載されている。無血清真核細胞培養培地には、無血清培養下で細胞の成長を支持することができる無血清サプリメントを補充した基礎細胞培養培地が含まれる。無血清真核細胞培養培地サプリメントは、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代替物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の微量元素、及び1つ以上の抗生物質からなる群から選択される1つ以上の成分を含むか、またはそれらを組み合わせることによって取得される。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/またはベータ-メルカプトエタノールをさらに含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンまたはアルブミン代替物と、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、及び1つ以上の微量元素からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地は、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI 1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、合成培地中のグリシンの濃度は、約5~200mg/Lの範囲であり、L-ヒスチジンの濃度は、約5~250mg/Lであり、L-イソロイシンの濃度は、約5~300mg/Lであり、L-メチオニンの濃度は、約5~200mg/Lであり、L-フェニルアラニンの濃度は、約5~400mg/Lであり、L-プロリンの濃度は、約1~1000mg/Lであり、L-ヒドロキシプロリンの濃度は、約1~45mg/Lであり、L-セリンの濃度は、約1~250mg/Lであり、L-スレオニンの濃度は、約10~500mg/Lであり、L-トリプトファンの濃度は、約2~110mg/Lであり、L-チロシンの濃度は、約3~175mg/Lであり、L-バリンの濃度は、約5~500mg/Lであり、チアミンの濃度は、約1~20mg/Lであり、還元型グルタチオンの濃度は、約1~20mg/Lであり、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩の濃度は、約1~200mg/Lであり、鉄飽和トランスフェリンの濃度は、約1~50mg/Lであり、インスリンの濃度は、約1~100mg/Lであり、亜セレン酸ナトリウムの濃度は、約0.000001~0.0001mg/Lであり、アルブミン(例えば、AlbuMAX(登録商標)I)の濃度は、約5000~50,000mg/Lである。
いくつかの実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地中の濃度範囲」という見出しの下の列にリストされた濃度範囲で存在する。他の実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされた最終濃度で存在する。他の実施形態では、合成培地は、無血清サプリメントを含む基礎細胞培地である。これらの実施形態のうちのいくつかでは、無血清サプリメントは、表4の「サプリメント中の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされたタイプ及び濃度の非微量部分成分を含む。
いくつかの実施形態では、合成培地の浸透圧は、約260~350mOsmolである。いくつかの実施形態では、浸透圧は、約280~310mOsmolである。いくつかの実施形態では、合成培地には、最大約3.7g/L、または約2.2g/Lの重炭酸ナトリウムが補充されている。合成培地には、L-グルタミン(最終濃度約2mM)、1つ以上の抗生物質、非必須アミノ酸(NEAA、最終濃度約100μM)、2-メルカプトエタノール(最終濃度約100μM)がさらに補充されていてもよい。
いくつかの実施形態では、Smith,et al.,Clin Transl Immunology,4(1)2015(doi:10.1038/cti.2014.31)に記載の定義された培地が、本発明において有用である。簡潔には、RPMIまたはCTS(商標)OpTmizer(商標)を基礎細胞培地として使用し、0、2%、5%、または10%のいずれかのCTS(商標)Immune Cell Serum Replacementを補充した。
いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、濾過されていない。濾過されていない細胞培地の使用は、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化することができる。いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、ベータ-メルカプトエタノール(BMEまたはβME、2-メルカプトエタノールとしても知られる、CAS60-24-2)を欠いている。
いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、1~8日である。いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、2~8日である。いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、3~8日である。いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、4~8日である。いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、5~8日である。いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、6~8日である。いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、プライミングによる第1の拡張(例えば、図1(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに提供されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、7~8日である。いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに提供されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、8日である。いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、1~7日である。いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、2~7日である。いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、3~7日である。いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、4~7日である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば図8B及び/または図8C)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、実施例及び図において考察されるように、5~7日間である。いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに記載されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、6~7日である。いくつかの実施形態では、実施例及び図で考察されるように、プライミングによる第1の拡張(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップBに提供されるものなどのプロセスを含み、これは、REP前またはプライミングREPと称されることもあるものを含み得る)プロセスは、7日である。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから1日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから1日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから2日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから2日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから3日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから3日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから4日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから4日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから5日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから5日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから6日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから6日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから7日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1のTIL拡張は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから7日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、TILのプライミングによる第1の拡張は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL増殖は、1日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、1日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、2日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL増殖は、2日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、3日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL増殖は、3日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、4日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL増殖は、4日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、5日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL増殖は、5日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、6日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL増殖は、6日~7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、7日~8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL拡張は、8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第1のTIL増殖は、7日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21の組み合わせは、プライミングによる第1の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)による、及び本明細書に記載のステップBプロセス中を含む、プライミングによる第1の拡張中に含まれ得る。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21の組み合わせは、プライミングによる第1の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)による、及び本明細書に記載のステップBプロセス中に含まれ得る。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)によるステップBは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが容器として用いられる。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、例えば、G-REX-10またはG-REX-100である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-REX-100である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-REX-10である。
1.フィーダー細胞及び抗原提示細胞
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップBに記載のもの、及びREP前またはプライミングによるREPと称されるものなどの拡張を含む)は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろプライミングによる第1の拡張中に添加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップBに記載のもの、及びREP前またはプライミングによるREPと称されるものなどの拡張を含む)は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ4~8日目中の任意の時点で、プライミングによる第1の拡張中に添加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップBに記載のもの、及びにREP前またはプライミングによるREPと称されるものなどの拡張を含む)は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ4~7日目中の任意の時点で、プライミングによる第1の拡張中に添加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップBに記載のもの、及びにREP前またはプライミングによるREPと称されるものなどの拡張を含む)は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ5~8日目中の任意の時点で、プライミングによる第1の拡張中に添加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップBに記載のもの、及びにREP前またはプライミングによるREPと称されるものなどの拡張を含む)は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ5~7日目中の任意の時点で、プライミングによる第1の拡張中に添加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップBに記載のもの、及びにREP前またはプライミングによるREPと称されるものなどの拡張を含む)は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ6~8日目中の任意の時点で、プライミングによる第1の拡張中に添加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップBに記載のもの、及びにREP前またはプライミングによるREPと称されるものなどの拡張を含む)は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ6~7日目中の任意の時点で、プライミングによる第1の拡張中に添加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップBに記載のもの、及びREP前またはプライミングによるREPと称されるものなどの拡張を含む)は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ7または8日目中の任意の時点で、プライミングによる第1の拡張中に添加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップBに記載のもの、及びにREP前またはプライミングによるREPと称されるものなどの拡張を含む)は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ7日目中の任意の時点で、プライミングによる第1の拡張中に添加される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップBに記載のもの、及びREP前またはプライミングによるREPと称されるものなどの拡張を含む)は、TIL拡張の開始時にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要とせず、むしろ8日目中の任意の時点で、プライミングによる第1の拡張中に添加される。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば図8B)からのステップBに記載されるもの、ならびにREP前またはプライミングREPと称されるものなどの拡張を含む))は、TIL拡張の開始時及びプライミングによる第1の拡張中にフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)を必要する。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、同種異系の健康な献血者由来の標準の全血単位から取得される末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。いくつかの実施形態では、2.5×10のフィーダー細胞が、プライミングによる第1の拡張中に使用される。いくつかの実施形態では、容器当たり2.5×10のフィーダー細胞が、プライミングによる第1の拡張中に使用される。いくつかの実施形態では、GREX-10当たり2.5×10のフィーダー細胞が、プライミングによる第1の拡張中に使用される。いくつかの実施形態では、GREX-100当たり2.5×10のフィーダー細胞が、プライミングによる第1の拡張中に使用される。
一般に、同種異系PBMCは、放射線照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、実施例に記載されるように、REP手順で使用され、これは、放射線照射された同種異系PBMCの複製無能力を評価するための例示的なプロトコルを提供する。
いくつかの実施形態では、14日目の生細胞の総数が、プライミングによる第1の拡張の0日目に培養された初期の生細胞数よりも少ない場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。
いくつかの実施形態では、7日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された生細胞の総数が、プライミングによる第1の拡張の0日目に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、7日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された生細胞の総数が、プライミングによる第1の拡張の0日目に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、5~60ng/mLのOKT3抗体及び1000~6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、10~50ng/mLのOKT3抗体及び2000~5000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、20~40ng/mLのOKT3抗体及び2000~4000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、25~35ng/mLのOKT3抗体及び2500~3500IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、15ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、15ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、PBMCである。いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、人工抗原提示フィーダー細胞である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、約1:25、約1:50、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、1:50~1:300である。いくつかの実施形態では、第2の増殖におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、1:100~1:200である。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順は、約2.5×10個のフィーダー細胞:約100×10個のTILの比を必要とする。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順は、約2.5×10フィーダー細胞:約50×10TILの比を必要とする。さらに別の実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順は、約2.5×10個のフィーダー細胞:約25×10個のTILを必要とする。さらに別の実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張には、約2.5×10のフィーダー細胞が必要である。さらに別の実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、急速な第2の拡張で使用されるフィーダー細胞の数の4分の1、3分の1、12分の5、または2分の1を必要とする。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、IL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、6000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、容器当たり2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、OKT-3を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり30ngのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、GREX100 MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2、30ng/mLのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり6000IU/mLのIL-2、30ng/mLのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞当たり15μgのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地及び15μgのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、GREX100 MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、培地は、500mLの培養培地、6000IU/mLのIL-2、30ng/mLのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地、6000IU/mLのIL-2、15μgのOKT-3、及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地及び2.5×10の抗原提示フィーダー細胞当たり15μgのOKT-3を含む。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張手順は、第2の拡張中にTILを超える過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、同種異系の健康な献血者由来の標準の全血単位から取得される末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。いくつかの実施形態では、人工抗原提示(aAPC)細胞がPBMCの代わりに使用される。
概して、同種異系PBMCは、放射線照射または熱処理のいずれかを介して不活性化され、図及び実施例に記載の例示的な手順を含む、本明細書に記載のTIL拡張手順で使用される。
いくつかの実施形態では、人工抗原提示細胞は、PBMCの代替物として、またはPBMCと組み合わせて、プライミングによる第1の拡張において使用される。
2.サイトカイン
本明細書に記載の拡張方法は、一般に、当該技術分野で知られているように、高用量のサイトカイン、特にIL-2を含む培養培地を使用する。
代替的に、国際公開第WO2015/189356号及び同第WO2015/189357号(参照によりそれらの全体が本明細書に明示的に組み込まれる)に一般に概説されているように、IL-2、IL-15、及びIL-21のうちの2つ以上の組み合わせで、TILのプライミングによる第1の拡張のためにサイトカインの組み合わせを使用することもさらに可能である。したがって、可能な組み合わせには、IL-2及びIL-15、IL-2及びIL-21、IL-15及びIL-21、ならびにIL-2、IL-15、及びIL-21が含まれ、後者は多くの実施形態で特に有用である。サイトカインの組み合わせの使用は、リンパ球、特にそこに記載されているようにT細胞の生成に特に有利に働く。表2を参照されたい。
いくつかの実施形態では、ステップBはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、OKT-3抗体またはムロモナブの、培養培地への添加を含み得る。いくつかの実施形態では、ステップBはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、4-1BBアゴニストの、培養培地への添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、ステップBはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、OX-40アゴニストの、培養培地への添加を含み得る。加えて、チアゾリジンジオン化合物などの増殖因子活性化受容体(PPAR)-ガンマアゴニストを含む、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体ガンマコアクチベーターI-アルファアゴニストなどの添加剤は、米国特許出願公開第2019/0307796 A1号(この開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるように、ステップB中の培養培地で使用されてもよい。
C.ステップC:プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行
いくつかの事例では、例えば、例えば図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に示されるステップBから取得されるTIL集団を含む、プライミングによる第1の拡張から取得されたバルクTIL集団(REP前と称されることもある拡張を含み得る)は、急速な第2の拡張(急速な拡張プロトコル(REP)と称されることもある拡張を含み得る)に供され、次いで、以下で論じられるように凍結保存され得る。同様に、遺伝子修飾されたTILが療法に使用される場合、プライミングによる第1の拡張由来の拡張されたTIL集団または急速な第2の拡張由来の拡張されたTIL集団は、拡張ステップ前またはプライミングによる第1の拡張後及び急速な第2の拡張前に好適な治療のために遺伝子修飾に供され得る。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に示されるステップBから)取得されたTILは、選択のために表現型決定されるまで保管される。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に示されるステップBから)取得されたTILは、保管されず、急速な第2の拡張に直接進む。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から取得されたTILは、プライミングによる第1の拡張後及び急速な第2の拡張前に凍結保存されない。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、腫瘍の断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約3日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約3日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約4日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約4日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約5日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約5日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約6日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約6日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約7日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから約8日で起こる。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、または8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから1日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから1日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから2日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから2日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから3日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから3日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから4日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから4日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから5日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから5日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから6日~7日で起こる。。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから6日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから7日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき、及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから7日で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、断片化が起こったとき及び/またはプライミングによる第1の拡張ステップが開始されたときから8日で起こる。
いくつかの実施形態では、TILは、一次の第1の拡張後及び急速な第2の拡張前に保管されず、TILは、急速な第2の拡張に直接進む(例えば、いくつかの実施形態では、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に示されるステップBからステップDへの移行中に保管されない)。いくつかの実施形態では、移行は、本明細書に記載されるように、閉鎖系内で起こる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張由来のTILである第2のTIL集団は、移行期間なしで急速な第2の拡張に直接進む。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)によるステップCは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、GREX-10またはGREX-100である。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張から急速な第2の拡張への移行は、容器サイズのスケールアップを伴う。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、急速な第2の拡張よりも小さい容器内で行われる。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張は、GREX-100内で行われ、急速な第2の拡張は、GREX-500内で行われる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から(例えば、図48A~Dに示されるステップBから)取得されたTILは、活性化または遺伝子編集ステップに移行される。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、11日、12日、13日、または14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~13日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~12日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~10日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~9日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~6日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~5日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約3日~4日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~13日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~12日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~10日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~9日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~6日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約4日~5日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~13日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~12日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~10日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~9日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~7日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約5日~6日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~14日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~13日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~12日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~11日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~10日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~9日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~8日で起こる。いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、断片化が起こってから約6日~7日で起こる。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から活性化または遺伝子編集ステップへの移行は、本明細書に記載の閉鎖系中で起こる。
いくつかの実施形態では、活性化ステップは、TILを、抗CD3及び/または抗CD38ビーズを含む培地中で約1~7日間培養することを含む。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、TILを、抗CD3ビーズを含む培地中で約1~7日間培養することを含む。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、TILを、抗CD38ビーズを含む培地中で約1~7日間培養することを含む。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、TILを、抗CD3及び抗CD38ビーズを含む培地中で約1~7日間培養することを含む。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約1~7日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化するステップは、約1~7日、約1~6日、約2~6日、約3~6日、約4~6日、約5~6日、約1~5日、約2~5日、約3~5日、約4~5日、約1~4日、約2~4日、約3~4日、約1~3日、約2~3日、約1~2日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約1日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約2日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約3日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約4日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約5日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約6日間行われる。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、約7日間行われる。
本明細書を考慮して、当業者に既知の任意の好適な抗CD3/抗CD38ビーズが使用され得る。好適な抗CD3/抗CD38ビーズには、T細胞拡大及び活性化のためのDynabeads(商標)ヒトT活性化剤CD3/CD28(Invitrogenから市販されている)、ImmunoCult(商標)ヒトCD3/CD28T細胞活性化剤(StemCell Technologiesから市販されている)、及びT Cell TransAct(商標)(Miltenyi Biotecから市販されている)を含むが、これらに限定されない市販の製品が、含まれるがこれらに限定されない。
いくつかの実施形態では、活性化ステップは、任意選択である。いくつかの実施形態では、活性化ステップは、第1の拡張がOKT-3を含む場合、任意選択である。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から(例えば、図48C~Dに示されるステップBから)または活性化ステップから(例えば、図48A~Bに示されるステップCから)取得されたTILは、遺伝子編集ステップに移行される。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集ステップは、TIL集団に対して滅菌エレクトロポレーションステップを行うことを含む。いくつかの実施形態では、無菌エレクトロポレーションステップは、少なくとも1つの遺伝子エディターの移入を媒介する。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、少なくとも1つのタンパク質の発現を調節するためのTALEヌクレアーゼ系である。いくつかの実施形態によれば、TALEヌクレアーゼ系は、PD-1の発現を下方調節する。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、CTLA-4の発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、LAG-3の発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、CISHの発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、CBL-Bの発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、遺伝子エディターは、TIGITの発現を下方調節するTALEヌクレアーゼ系をさらに含む。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1ノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4ノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3ノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CISHノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CBL-BノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、TIGITノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1の下方調節された発現、ならびにCTLA-4、LAG-3、CISH、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4の下方調節された発現、ならびにPD-1、LAG-3、CISH、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3の下方調節された発現、ならびにPD-1、CTLA-4、CISH、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CISHの下方調節された発現、ならびにPD-1、LAG-3、CTLA-4、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CBL-Bの下方調節された発現、ならびにCTLA-4、LAG-3、CISH、TIGIT、及びPD-1のうちの1つ以上の下方調節された発現を示す。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/CTLA-4ダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/LAG-3ダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/CISHダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/CBL-BダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、PD-1/TIGITダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4/LAG-3ダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4/CISHダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4/CBL-BダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CTLA-4/TIGITダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3/CISHダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3/CBL-BダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、LAG-3/TIGITダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CISH/CBL-BダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CISH/TIGITダブルノックアウトTILである。いくつかの実施形態によれば、得られるTILは、CBL-B/TIGITダブルノックアウトTILである。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集のステップは、休止ステップをさらに含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、第4のTIL集団を、約30~40℃、約5%のCO2でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、約30℃、約30.5℃、約31℃、約31.5℃、約32℃、約32.5℃、約33℃、約33.5℃、約34℃、約34.5℃、約35℃、約35.5℃、約36℃、約36.5℃、約37℃、約37.5℃、約38℃、約38.5℃、約39℃、約39.5℃、約40℃で実行される。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、約1時間、約2時間、約3時間、約4時間、約5時間、約6時間、約7時間、約8時間、約9時間、約10時間、約11時間、約12時間、約13時間、約14時間、約15時間、約16時間、約17時間、約18時間、約19時間、約20時間、約21時間、約22時間、約23時間、約24時間実行される。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3のTIL集団または第4のTIL集団をインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約15時間~約23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約15時間~約23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約15時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約16時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約17時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約18時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約19時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約20時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約21時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約22時間、約30℃でインキュベートすることを含む。いくつかの実施形態によれば、休止ステップは、IL-2を含む細胞培養培地中で第3または第4のTIL集団を、約1時間、37℃で、続いて約23時間、約30℃でインキュベートすることを含む。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集ステップまたは休止ステップから(例えば、図48A~Dに示されるステップCから)取得されたTILは、第2の拡張ステップ(例えば、図48A~Dに示されるステップDから)に移行される。いくつかの実施形態では、遺伝子編集ステップまたは休止ステップから第2の拡張ステップへの移行は、遺伝子編集ステップまたは休止ステップから約0.5日、1日、2日、3日、または4日で起こる。
いくつかの実施形態では、遺伝子編集ステップまたは休止ステップから第2の拡張ステップへの移行は、本明細書に記載の閉鎖系中で起こる。
いくつかの実施形態では、TILは、遺伝子編集ステップまたは休止ステップの後及び第2の拡張の前に保管されず、TILは、第2の拡張に直接進む(例えば、いくつかの実施形態では、図48A~Dに示されるステップCからステップDへの移行中に保管されない)。
いくつかの実施形態では、第1の拡張から第2の拡張への移行、例えば、図48によるステップCは、閉鎖系バイオリアクター中で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるように、閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、単一のバイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、用いられる単一のバイオリアクターは、例えば、G-REX-10またはG-REX-100バイオリアクターである。いくつかの実施形態では、閉鎖系バイオリアクターは、単一のバイオリアクターである。
D.ステップD:急速な第2の拡張
いくつかの実施形態では、TIL細胞集団は、採取及びプライミングによる第1の拡張後、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D))に示されるステップA及びステップB、ならびにステップCと称される移行後、数がさらに拡張される。このさらなる拡張は、本明細書では急速な第2の拡張または急速拡張と称され、これは、当該技術分野で概して急速拡張プロセス(急速拡張プロトコルまたはREP、及び図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48DのステップDに示されるプロセス)と称される拡張プロセスを含み得る。急速な第2の拡張は、概して、フィーダー細胞、サイトカイン源、及び抗CD3抗体を含む、いくつかの成分を含む培養培地を使用して、ガス透過性容器内で達成される。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張開始の1日、2日、3日、または4日後(すなわち、Gen3プロセス全体の8、9、10、または11日目)に、TILは、より大容量の容器に移される。
いくつかの実施形態では、TILの急速な第2の拡張(REPと称されることもある拡張、及び図8(特に、例えば図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップDに示されるプロセスを含み得る)は、当業者に既知の任意のTILフラスコまたは容器を使用して行われ得る。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、または10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約1日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約1日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL増殖は、急速な第2の増殖の開始後、約3日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL増殖は、急速な第2の増殖の開始後、約3日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第4のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第4のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第5のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第5のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第6のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第6のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第7のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第7のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第8のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第8のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第9のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日~約10日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約1日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約2日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約3日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約4日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約5日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約6日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約7日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約8日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約9日間続行することができる。いくつかの実施形態では、第2のTIL拡張は、急速な第2の拡張の開始後、約10日間続行することができる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、本開示の方法(例えば、REPと称される拡張、ならびに図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48DのステップDに示されるプロセスを含む)を使用して、ガス透過性容器内で行われ得る。いくつかの実施形態では、TILは、IL-2、OKT-3、及びフィーダー細胞(本明細書では「抗原提示細胞」とも称される)の存在下での急速な第2の拡張において拡張される。いくつかの実施形態では、TILは、IL-2、OKT-3、及びフィーダー細胞の存在下での急速な第2の拡張において拡張され、フィーダー細胞は、プライミングによる第1の拡張において存在するフィーダー細胞の濃度の2倍、2.4倍、2.5倍、3倍、3.5倍、または4倍である最終濃度まで追加される。例えば、TILは、インターロイキン-2(IL-2)またはインターロイキン-15(IL-15)の存在下で非特異的T細胞受容体刺激を使用して、急速に拡張され得る。非特異的T細胞受容体刺激は、例えば、抗CD3抗体、例えば約30ng/mLのOKT3、マウスモノクローナル抗CD3抗体(Ortho-McNeil,Raritan,NJもしくはMiltenyi Biotech,Auburn,CAから市販)またはUHCT-1(BioLegend,San Diego,CA,USAから市販)を含み得る。TILは、がんのエピトープ(複数可)などの抗原性部分を含む、第2の拡張中に1つ以上の抗原を含むことによって、インビトロでTILのさらなる刺激を誘導するように拡張することができ、これは、ベクター、例えば、ヒト白血球抗原A2(HLA-A2)結合ペプチド、例えば、0.3μM MART-1:26-35(27L)またはgpl00:209-217(210M)から、任意選択で300IU/mLのIL-2またはIL-15などのT細胞成長因子の存在下で任意で発現され得る。他の好適な抗原には、例えば、NY-ESO-1、TRP-1、TRP-2、チロシナーゼがん抗原、MAGE-A3、SSX-2、及びVEGFR2、またはそれらの抗原性部分が含まれ得る。TILは、HLA-A2を発現する抗原提示細胞にパルスされたがんの同じ抗原(複数可)で再刺激することによっても急速に拡張され得る。あるいは、TILは、例えば、例として放射線照射された自己リンパ球または放射線照射されたHLA-A2+同種異系リンパ球及びIL-2でさらに再刺激され得る。いくつかの実施形態では、再刺激は、第2の拡張の一部として起こる。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、放射線照射された自己リンパ球の存在下で、または放射線照射されたHLA-A2+同種異系リンパ球及びIL-2を用いて起こる。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約3000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1000IU/mL、約1500IU/mL、約2000IU/mL、約2500IU/mL、約3000IU/mL、約3500IU/mL、約4000IU/mL、約4500IU/mL、約5000IU/mL、約5500IU/mL、約6000IU/mL、約6500IU/mL、約7000IU/mL、約7500IU/mL、または約8000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、1000~2000IU/mL、2000~3000IU/mL、3000~4000IU/mL、4000~5000IU/mL、5000~6000IU/mL、6000~7000IU/mL、7000~8000IU/mL、または8000IU/mLのIL-2を含む。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、OKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約0.1ng/mL、約0.5ng/mL、約1ng/mL、約2.5ng/mL、約5ng/mL、約7.5ng/mL、約10ng/mL、約15ng/mL、約20ng/mL、約25ng/mL、約30ng/mL、約35ng/mL、約40ng/mL、約50ng/mL、約60ng/mL、約70ng/mL、約80ng/mL、約90ng/mL、約100ng/mL、約200ng/mL、約500ng/mL、及び約1μg/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、0.1ng/mL~1ng/mL、1ng/mL~5ng/mL、5ng/mL~10ng/mL、10ng/mL~20ngの間、20ng/mL~30ng/mL、30ng/mL~40ng/mL、40ng/mL~50ng/mL、及び50ng/mL~100ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、15ng/mL~30ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約30ng/mL~60ng/mLのOKT-3抗体を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約30ng/mLのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約60ng/mLのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、OKT-3抗体は、ムロモナブである。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、IL-2を含む。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、容器当たり7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、OKT-3を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培地中に、容器当たり500mLの培養培地及び30μgのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、GREX100 MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培地中に、6000IU/mLのIL-2、60ng/mLのOKT-3、及び7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり500mLの培養培地、6000IU/mLのIL-2、30μgのOKT-3、及び7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、IL-2を含む。いくつかの実施形態では、培地は、6000IU/mLのIL-2を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、培地は、容器当たり5×10~7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、OKT-3を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、容器当たり500mLの培養培地及び30μgのOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、容器は、GREX100 MCSフラスコである。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、6000IU/mLのIL-2、60ng/mLのOKT-3、及び5×10~7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張における培地は、容器当たり500mLの培養培地、ならびに6000IU/mLのIL-2、30μgのOKT-3、及び5×10~7.5×10の抗原提示フィーダー細胞を含む。
いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、細胞培養培地中に1つ以上のTNFRSFアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BBアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは4-1BBアゴニストであり、4-1BBアゴニストは、ウレルマブ、ウトミルマブ、EU-101、融合タンパク質、ならびにそれらの断片、誘導体、バリアント、バイオシミラー、及び組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、0.1μg/mL~100μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、20μg/mL~40μg/mLの細胞培養培地中濃度を達成するのに十分な濃度で追加される。
いくつかの実施形態では、1つ以上のTNFRSFアゴニストに加えて、細胞培養培地は、IL-2を約3000IU/mLの初期濃度で、及びOKT-3を約30ng/mLの初期濃度でさらに含み、1つ以上のTNFRSFアゴニストが、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21の組み合わせは、第2の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-7、IL-15、及び/またはIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)による、及び本明細書に記載のステップDプロセス中を含む、第2の拡張中に含まれ得る。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21の組み合わせは、第2の拡張中に組み合わせとして用いられる。いくつかの実施形態では、IL-2、IL-15、及びIL-21、ならびにそれらの任意の組み合わせは、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)による、及び本明細書に記載のステップDプロセス中に含まれ得る。
いくつかの実施形態では、第2の拡張は、IL-2、OKT-3、抗原提示フィーダー細胞、及び任意でTNFRSFアゴニストを含む補充された細胞培養培地において実施され得る。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、補充された細胞培養培地中で起こる。いくつかの実施形態では、補充された細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞を含む。いくつかの実施形態では、第2の細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC、抗原提示フィーダー細胞とも称される)を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、IL-2、OKT-3、及び抗原提示フィーダー細胞(すなわち、抗原提示細胞)を含む細胞培養培地中で起こる。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15、約400IU/mLのIL-15、約300IU/mLのIL-15、約200IU/mLのIL-15、約180IU/mLのIL-15、約160IU/mLのIL-15、約140IU/mLのIL-15、約120IU/mLのIL-15、または約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約500IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約400IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約300IU/mLのIL-15~約100IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約200IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-15をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約180IU/mLのIL-15を含む。
いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21、約15IU/mLのIL-21、約12IU/mLのIL-21、約10IU/mLのIL-21、約5IU/mLのIL-21、約4IU/mLのIL-21、約3IU/mLのIL-21、約2IU/mLのIL-21、約1IU/mLのIL-21、または約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約20IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約15IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約12IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約10IU/mLのIL-21~約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約5IU/mLのIL-21~約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、第2の拡張培養培地は、約2IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約0.5IU/mLのIL-21を含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、IL-21をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞培養培地は、約1IU/mLのIL-21を含む。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞(APC)は、PBMCである。いくつかの実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMC及び/または抗原提示細胞に対する比は、約1:10、約1:15、約1:20、約1:25、約1:30、約1:35、約1:40、約1:45、約1:50、約1:75、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。いくつかの実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMCに対する比は、1:50~1:300である。いくつかの実施形態では、急速拡張及び/または第2の拡張におけるTILのPBMCに対する比は、1:100~1:200である。
いくつかの実施形態では、REP及び/または急速な第2の拡張は、バルクTILを100倍または200倍過剰の不活性化フィーダー細胞と混合してフラスコ内で行われ、フィーダー細胞濃度は、150mL培地中のプライミングによる第1の拡張、30ng/mLのOKT3抗CD3抗体及び6000IU/mLのIL-2におけるフィーダー細胞濃度の少なくとも1.1倍(1.1×)、1.2倍、1.3倍、1.4倍、1.5倍、1.6倍、1.7倍、1.8倍、1.8倍、2倍、2.1倍、2.2倍、2.3倍、2.4倍、2.5倍、2.6倍、2.7倍、2.8倍、2.9倍、3.0倍、3.1倍、3.2倍、3.3倍、3.4倍、3.5倍、3.6倍、3.7倍、3.8倍、3.9倍または4.0倍である。培地交換(一般に、使用済み培地の3分の2の吸引及び等量の新鮮な培地との交換による、3分の2培地交換)は、細胞が代替の成長チャンバに移されるまで行われる。代替の成長チャンバには、以下でより完全に考察されるように、G-REXフラスコ及びガス透過性容器が含まれる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張(REPプロセスと称されるプロセスを含み得る)は、実施例及び図で考察されるように、7~9日間である。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、7日間である。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、8日間である。いくつかの実施形態では、第2の拡張は、9日間である。
いくつかの実施形態では、第2の拡張(REPと称される拡張、ならびに図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップDで参照される拡張を含み得る)は、100cmのガス透過性シリコン底部を有する500mL容量のガス透過性フラスコ(G-REX 100、Wilson Wolf Manufacturing Corporation,New Brighton,MN,USAから市販されている)内で行われ得、5×10または10×10のTILが、5%ヒトAB血清、3000IU/mLのIL-2、及び30ng/mLの抗CD3(OKT3)を補充した400mLの50/50培地中でPBMCとともに培養され得る。G-REX 100フラスコは、5%CO中37℃でインキュベートされ得る。5日目に、250mLの上清が除去され、遠心分離ボトルに入れられ、1500rpm(491×g)で10分間遠心分離される。TILペレットが、5%ヒトAB血清、6000IU/mLのIL-2を含む150mLの新鮮な培地で再懸濁され、元のGREX-100フラスコに戻し追加され得る。TILがGREX-100フラスコで連続して拡張される場合、10日目または11日目に、TILは、GREX-500などのより大きいフラスコに移され得る。培養14日目に、細胞が採取され得る。培養15日目に、細胞が採取され得る。培養16日目に、細胞が採取され得る。いくつかの実施形態では、培地交換は、細胞が代替の成長チャンバに移されるまで行われる。いくつかの実施形態では、培地の3分の2は、使用済み培地の吸引及び等体積の新鮮な培地との交換によって交換される。いくつかの実施形態では、代替の成長チャンバには、以下でより完全に考察されるように、GREXフラスコ及びガス透過性容器が含まれる。
いくつかの実施形態では、本明細書に開示される拡張プロセスで使用される培地は、無血清培地または合成培地である。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、血清含有培地のロット間の変動に部分的に起因する実験変動を防止及び/または減少させるために使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、基礎細胞培地ならびに血清サプリメント及び/または血清代替物を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地には、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CTS(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI 1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地が含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、血清サプリメントまたは血清代替物には、CTS(商標)OpTmizer T-Cell Expansion Serum Supplement、CTS(商標)Immune Cell Serum Replacement、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代用物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代用物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代用物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の抗生物質、及び1つ以上の微量元素のうちの1つ以上が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/または2-メルカプトエタノールをさらに含む。
いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Immune Cell Serum Replacementは、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Medium、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM、CTS(商標)AIM-V Medium、CST(商標)AIM-V SFM、LymphoONE(商標)T-Cell Expansion Xeno-Free Medium、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI 1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地を含むが、これらに限定されない、従来の成長培地とともに使用される。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地中の総血清代替物濃度(vol%)は、総無血清または合成培地の約1体積%、2体積%、3体積%、4体積%、5体積%、6体積%、7体積%、8体積%、9体積%、10体積%、11体積%、12体積%、13体積%、14体積%、15体積%、16体積%、17体積%、18体積%、19体積%、または20体積%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約3%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約5%である。いくつかの実施形態では、総血清代替物濃度は、無血清または合成培地の総体積の約10%である。
いくつかの実施形態では、無血清または合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。
いくつかの実施形態では、合成培地は、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFM(ThermoFisher Scientific)である。CTS(商標)OpTmizer(商標)のいずれの製剤も、本発明において有用である。CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMは、1LのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion Basal Mediumと、26mLのCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplementとの組み合わせであり、これらは使用前に一緒に混合される。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、55mMの2-メルカプトエタノールとともに、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)が補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されている。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)、55mMの2-メルカプトエタノール、及び2mMのL-グルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び55mMの2-メルカプトエタノールが補充されており、約1000IU/mL~約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約1000IU/mL~約8000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約3000IU/mLのIL-2をさらに含む。いくつかの実施形態では、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-cell Expansion SFMには、約3%のCTS(商標)Immune Cell Serum Replacement(SR)(ThermoFisher Scientific)及び約2mMのグルタミンが補充されており、約6000IU/mLのIL-2をさらに含む。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約0.1mM~約10mM、0.5mM~約9mM、1mM~約8mM、2mM~約7mM、3mM~約6mM、または4mM~約5mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約2mMの濃度でグルタミン(すなわち、GlutaMAX(登録商標))が補充されている。
いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約5mM~約150mM、10mM~約140mM、15mM~約130mM、20mM~約120mM、25mM~約110mM、30mM~約100mM、35mM~約95mM、40mM~約90mM、45mM~約85mM、50mM~約80mM、55mM~約75mM、60mM~約70mM、または約65mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。いくつかの実施形態では、無血清培地または合成培地には、約55mMの濃度で2-メルカプトエタノールが補充されている。
いくつかの実施形態では、国際特許出願公開第WO/1998/030679号及び米国特許出願公開第2002/0076747 A1号(参照により本明細書に組み込まれる)に記載される定義された媒体は、本発明において有用である。その刊行物には、無血清真核細胞培養培地が記載されている。無血清真核細胞培養培地には、無血清培養下で細胞の成長を支持することができる無血清サプリメントを補充した基礎細胞培養培地が含まれる。無血清真核細胞培養培地サプリメントは、1つ以上のアルブミンまたはアルブミン代替物、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、1つ以上の微量元素、及び1つ以上の抗生物質からなる群から選択される1つ以上の成分を含むか、またはそれらを組み合わせることによって取得される。いくつかの実施形態では、合成培地は、L-グルタミン、重炭酸ナトリウム、及び/またはベータ-メルカプトエタノールをさらに含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンまたはアルブミン代替物と、1つ以上のアミノ酸、1つ以上のビタミン、1つ以上のトランスフェリンまたはトランスフェリン代替物、1つ以上の抗酸化剤、1つ以上のインスリンまたはインスリン代替物、1つ以上のコラーゲン前駆体、及び1つ以上の微量元素からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、合成培地は、アルブミンと、グリシン、L-ヒスチジン、L-イソロイシン、L-メチオニン、L-フェニルアラニン、L-プロリン、L-ヒドロキシプロリン、L-セリン、L-スレオニン、L-トリプトファン、L-チロシン、L-バリン、チアミン、還元型グルタチオン、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩、鉄飽和トランスフェリン、インスリン、ならびに微量元素部分Ag、Al3+、Ba2+、Cd2+、Co2+、Cr3+、Ge4+、Se4+、Br、T、Mn2+、P、Si4+、V5+、Mo6+、Ni2+、Rb、Sn2+、及びZr4+を含有する化合物からなる群から選択される1つ以上の成分と、を含む。いくつかの実施形態では、基礎細胞培地は、ダルベッコ改変イーグル培地(DMEM)、最小必須培地(MEM)、イーグル基礎培地(BME)、RPMI 1640、F-10、F-12、最小必須培地(αMEM)、グラスゴー最小必須培地(G-MEM)、RPMI成長培地、及びイスコフ改変ダルベッコ培地からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、合成培地中のグリシンの濃度は、約5~200mg/Lの範囲であり、L-ヒスチジンの濃度は、約5~250mg/Lであり、L-イソロイシンの濃度は、約5~300mg/Lであり、L-メチオニンの濃度は、約5~200mg/Lであり、L-フェニルアラニンの濃度は、約5~400mg/Lであり、L-プロリンの濃度は、約1~1000mg/Lであり、L-ヒドロキシプロリンの濃度は、約1~45mg/Lであり、L-セリンの濃度は、約1~250mg/Lであり、L-スレオニンの濃度は、約10~500mg/Lであり、L-トリプトファンの濃度は、約2~110mg/Lであり、L-チロシンの濃度は、約3~175mg/Lであり、L-バリンの濃度は、約5~500mg/Lであり、チアミンの濃度は、約1~20mg/Lであり、還元型グルタチオンの濃度は、約1~20mg/Lであり、L-アスコルビン酸-2-リン酸塩の濃度は、約1~200mg/Lであり、鉄飽和トランスフェリンの濃度は、約1~50mg/Lであり、インスリンの濃度は、約1~100mg/Lであり、亜セレン酸ナトリウムの濃度は、約0.000001~0.0001mg/Lであり、アルブミン(例えば、AlbuMAX(登録商標)I)の濃度は、約5000~50,000mg/Lである。
いくつかの実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地中の濃度範囲」という見出しの下の列にリストされた濃度範囲で存在する。他の実施形態では、合成培地中の非微量元素部分成分は、表4の「1×培地の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされた最終濃度で存在する。他の実施形態では、合成培地は、無血清サプリメントを含む基礎細胞培地である。これらの実施形態のうちのいくつかでは、無血清サプリメントは、表4の「サプリメント中の好ましい実施形態」という見出しの下の列にリストされたタイプ及び濃度の非微量部分成分を含む。
いくつかの実施形態では、合成培地の浸透圧は、約260~350mOsmolである。いくつかの実施形態では、浸透圧は、約280~310mOsmolである。いくつかの実施形態では、合成培地には、最大約3.7g/L、または約2.2g/Lの重炭酸ナトリウムが補充されている。合成培地には、L-グルタミン(最終濃度約2mM)、1つ以上の抗生物質、非必須アミノ酸(NEAA、最終濃度約100μM)、2-メルカプトエタノール(最終濃度約100μM)がさらに補充されていてもよい。
いくつかの実施形態では、Smith,et al.,Clin Transl Immunology,4(1)2015(doi:10.1038/cti.2014.31)に記載の定義された培地が、本発明において有用である。簡潔には、RPMIまたはCTS(商標)OpTmizer(商標)を基礎細胞培地として使用し、0、2%、5%、または10%のいずれかのCTS(商標)Immune Cell Serum Replacementを補充した。
いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、濾過されていない。濾過されていない細胞培地の使用は、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化することができる。いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、ベータ-メルカプトエタノール(BMEまたはβME、2-メルカプトエタノールとしても知られる、CAS60-24-2)を欠いている。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張(REPと称される拡張を含む)が行われ、優れた腫瘍反応性のTILが選択されるステップをさらに含む。当該技術分野で知られている任意の選択方法が使用され得る。例えば、米国特許出願公開第2016/0010058A1号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている方法が、優れた腫瘍反応性のためのTILの選択に使用され得る。
任意選択で、細胞生存率アッセイは、当該技術分野で既知の標準のアッセイを使用して、急速な第2の拡張(REP拡張と称される拡張を含む)後に行われ得る。例えば、死細胞を選択的に標識し、生存率の評価を可能にするトリパンブルー排除アッセイが、バルクTILの試料上で行われ得る。いくつかの実施形態では、TIL試料は、Cellometer K2自動セルカウンター(Nexcelom Bioscience,Lawrence,MA)を使用して計数され、生存率が決定され得る。いくつかの実施形態では、生存率は、標準のCellometer K2 Image Cytometer Automatic Cell Counterプロトコルに従って決定される。
Tリンパ球及びBリンパ球の多様な抗原受容体は、限られた数であるが、多数の遺伝子セグメントの体細胞組換えによって産生される。これらの遺伝子セグメント:V(可変)、D(多様性)、J(接合)、及びC(一定)は、免疫グロブリン及びT細胞受容体(TCR)の結合特異性及び下流での適用を決定する。本発明は、T細胞レパートリー多様性を示し、かつ増加させるTILを生成するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、第2の拡張において取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、多様性の増加は、免疫グロブリン多様性及び/またはT細胞受容体多様性の増加である。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン重鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン軽鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、T細胞受容体にある。いくつかの実施形態では、多様性は、アルファ、ベータ、ガンマ、及びデルタ受容体からなる群から選択されるT細胞受容体のうちの1つにある。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファ及び/またはベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)ベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、TCRab(すなわち、TCRα/β)の発現が増加する。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地とも称される)は、以下でさらに詳細に論じられるように、IL-2、OKT-3、ならびに抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地とも称される)は、以下でさらに詳細に論じられるように、6000IU/mLのIL-2、30ug/フラスコのOKT-3、ならびに7.5×10の抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地とも称される)は、以下でさらに詳細に論じられるように、IL-2、OKT-3、ならびに抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張培養培地(例えば、CM2または第2の細胞培養培地とも称される)は、以下でさらに詳細に論じられるように、6000IU/mLのIL-2、30ug/フラスコのOKT-3、ならびに5×10の抗原提示フィーダー細胞(APC)を含む。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)によるステップDは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが容器として用いられる。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、例えば、G-REX-100またはG-REX-500である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-REX-100である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-REX-500である。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分割されて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX-100 MCS容器内での小規模培養で約3~7日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養でのTILを、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX-500-MCS容器に移し、小規模培養由来のTILを、第2の容器内でのより大規模な培養で約4~7日間培養することとによって、培養のスケールアップを達成する。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX-100MCS容器内での第1の小規模培養で約3~7日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)第1の小規模培養由来のTILを、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたTILの一部が、第2の小規模培養で約4~7日間培養される。
いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、TILの複数の約2~5亜集団に配分される。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX-100MCS容器内での小規模培養で約3~7日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来のTILを、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX-500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたTILの一部が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)TILを、第1の容器、例えば、G-REX-100MCS容器内での小規模培養で約5日間培養することによって急速なまたは第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来のTILを、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX-500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移されたTILの一部が、より大規模な培養で約6日間培養される。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張の分割時に、各第2の容器は、少なくとも10個のTILを含む。いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の分割時に、各第2の容器は、少なくとも10個のTIL、少なくとも10個のTIL、または少なくとも1010個のTILを含む。例示的な一実施形態では、各第2の容器は、少なくとも1010個のTILを含む。
いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の亜集団に配分される。いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の約2~5亜集団に配分される。いくつかの実施形態では、第1の小規模TIL培養物は、複数の約2、3、4、または5亜集団に配分される。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張の完了後、複数の亜集団は、治療有効量のTILを含む。いくつかの実施形態では、急速または第2の拡張の完了後、1つ以上のTILの亜集団を一緒にプールして、治療有効量のTILを産生する。いくつかの実施形態では、急速拡張の完了後、各TIL亜集団は、治療有効量のTILを含む。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、複数のステップに分割される前に、約3~7日間行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張の分裂は、急速または第2の拡張の開始後約3日目、4日目、5日目、6日目、または7日目に起こる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張の分裂は、第1の拡張(すなわち、REP前拡張)の開始後の約7日目、8日目、9日目、10日目、11日目、12日目、13日目、14日目、15日目、または16日目、17日目、または18日目に起こる。例示的な一実施形態では、急速または第2の拡張の分裂は、第1の拡張の開始後約16日目に起こる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、分裂後約7~11日間、さらに行われる。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張は、分裂後約5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日間、さらに行われる。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂後の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地と同じ成分を含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂後の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地とは異なる成分を含む。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、任意選択でOKT-3、及びさらに任意選択でAPCを含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、OKT-3、及びさらに任意選択でAPCを含む。いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、OKT-3及びAPCを含む。
いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、任意選択でOKT-3及びさらに任意選択でAPCを含む新鮮な培養培地で補充することによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、OKT-3及びAPCを含む新鮮な培養培地で補充することによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、任意選択でOKT-3及びさらに任意選択でAPCを含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、第1の拡張中の細胞培養培地を、IL-2、OKT-3及びAPCを含む新鮮な細胞培養培地で置き換えることによって生成される。
いくつかの実施形態では、分裂後の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2、及び任意選択でOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、分裂後の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、IL-2及びOKT-3を含む。いくつかの実施形態では、分裂後の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地を、IL-2及び任意選択でOKT-3を含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。いくつかの実施形態では、分裂後の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地は、分裂前の急速な第2の拡張に使用される細胞培養培地を、IL-2及びOKT-3を含む新鮮な培養培地で置き換えることによって生成される。
1.フィーダー細胞及び抗原提示細胞
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の急速な第2の拡張手順(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)のステップDに記載のもののような拡張、及びREPと称されるものを含む)は、REP TIL拡張中及び/または急速な第2の拡張中に過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、健康な献血者由来の標準の全血単位から得られる末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。
一般に、同種異系PBMCは、放射線照射または熱処理のいずれかによって不活性化され、実施例に記載されるように、REP手順で使用され、これは、放射線照射された同種異系PBMCの複製無能力を評価するための例示的なプロトコルを提供する。
いくつかの実施形態では、7日目または14日目の生細胞の総数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数よりも少ない場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。
いくつかの実施形態では、7日目及び14日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された生細胞の総数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、60ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、60ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、7日目及び14日目のOKT3及びIL-2の存在下で培養された生細胞の総数が、REPの0日目及び/または第2の拡張の0日目(すなわち、第2の拡張の開始日)に培養された初期の生細胞数から増加しなかった場合、PBMCは、複製能力がないとみなされ、本明細書に記載のTIL拡張手順での使用が認められる。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び1000~6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び2000~5000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び2000~4000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び2500~3500IU/mLのIL-2の存在下で培養される。いくつかの実施形態では、PBMCは、30~60ng/mLのOKT3抗体及び6000IU/mLのIL-2の存在下で培養される。
いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、PBMCである。いくつかの実施形態では、抗原提示フィーダー細胞は、人工抗原提示フィーダー細胞である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、約1:10、約1:25、約1:50、約1:100、約1:125、約1:150、約1:175、約1:200、約1:225、約1:250、約1:275、約1:300、約1:325、約1:350、約1:375、約1:400、または約1:500である。いくつかの実施形態では、第2の拡張におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、1:50~1:300である。いくつかの実施形態では、第2の増殖におけるTILの抗原提示フィーダー細胞に対する比は、1:100~1:200である。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約5×10個のフィーダー細胞:約100×10個のTILの比を必要とする。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の増殖手順は、約7.5×10フィーダー細胞:約100×10TILの比率を必要とする。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約5×10フィーダー細胞:約50×10TILの比を必要とする。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第2の増殖手順は、約7.5×10フィーダー細胞:約50×10TILの比率を必要とする。さらに別の実施形態では、本明細書に記載の第2の拡張手順は、約5×10フィーダー細胞:約25×10TILを必要とする。さらに他の実施形態では、本明細書に記載の第2の増殖手順は、約7.5×10個のフィーダー細胞:約25×10個のTILを必要とする。さらに別の実施形態では、急速な第2の拡張は、急速な第2の拡張の2倍の数のフィーダー細胞を必要とする。さらに別の実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張が約2.5×10フィーダー細胞を必要とする場合、急速な第2の拡張は、約5×10フィーダー細胞を必要とする。さらに別の実施形態では、本明細書に記載のプライミングによる第1の拡張が約2.5×10個のフィーダー細胞を必要とする場合、急速な第2の拡張は、約7.5×10個のフィーダー細胞を必要とする。さらに別の実施形態では、急速な第2の拡張は、プライミングによる第1の拡張の2倍(2.0×)、2.5倍、3.0倍、3.5倍または4.0倍の数のフィーダー細胞を必要とする。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の急速な第2の拡張手順は、急速な第2の拡張中に過剰のフィーダー細胞を必要とする。多くの実施形態では、フィーダー細胞は、同種異系の健康な献血者由来の標準の全血単位から取得される末梢血単核細胞(PBMC)である。PBMCは、Ficoll-Paque勾配分離などの標準の方法を使用して取得される。いくつかの実施形態では、人工抗原提示(aAPC)細胞がPBMCの代わりに使用される。いくつかの実施形態では、PBMCは、プライミングによる第1の拡張に追加されたPBMCの2倍の濃度で、急速な第2の拡張に追加される。
概して、同種異系PBMCは、放射線照射または熱処理のいずれかを介して不活性化され、図及び実施例に記載の例示的な手順を含む、本明細書に記載のTIL拡張手順で使用される。
いくつかの実施形態では、人工抗原提示細胞は、PBMCの代替物として、またはPBMCと組み合わせて、急速な第2の拡張において使用される。
2.サイトカイン
本明細書に記載の急速な第2の拡張方法は、概して、当該技術分野で既知の高用量のサイトカイン、特にIL-2を含む培養培地を使用する。
代替的に、WO2015/189356及びWO2015/189357(参照によりそれらの全体が本明細書に明示的に組み込まれる)に一般に概説されているように、IL-2、IL-15、及びIL-21のうちの2つ以上の組み合わせで、TILの急速な第2の拡張のためにサイトカインの組み合わせを使用することもさらに可能である。したがって、可能な組み合わせには、IL-2及びIL-15、IL-2及びIL-21、IL-15及びIL-21、ならびにIL-2、IL-15、及びIL-21が含まれ、後者は多くの実施形態で特に有用である。サイトカインの組み合わせの使用は、リンパ球、特にそこに記載されているようにT細胞の生成に特に有利に働く。
いくつかの実施形態では、ステップD(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dから)はまた、本明細書の他の箇所に記載のOKT-3抗体またはムロモナブの培養培地への添加を含み得る。いくつかの実施形態では、ステップDはまた、本明細書の他の箇所に記載されるように、4-1BBアゴニストの、培養培地への添加を含んでもよい。いくつかの実施形態では、ステップD(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dから)はまた、本明細書の他の箇所に記載のOX-40アゴニストの培養培地への添加を含み得る。加えて、チアゾリジンジオン化合物などの増殖因子活性化受容体(PPAR)-ガンマアゴニストを含む、ペルオキシソーム増殖因子活性化受容体ガンマコアクチベーターI-アルファアゴニストなどの添加剤は、米国特許出願公開第2019/0307796 A1号(この開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるように、ステップD(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dから)中の培養培地で使用され得る。
E.ステップE:TILを採取する
急速な第2の拡張ステップ後、細胞が採取され得る。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に提供される、1、2、3、4個またはそれ以上の拡張ステップ後に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に提供される、2つの拡張ステップ後に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に提供される、2つの拡張ステップ、1つのプライミングによる第1の拡張及び1つの急速な第2の拡張後に採取される。
TILは、任意の適切な滅菌様式で、例えば、遠心分離によって採取され得る。TILを採取するための方法は、当該技術分野で周知であり、任意のかかる既知の方法が本プロセスとともに用いられ得る。いくつかの実施形態では、TILは、自動化システムを使用して採取される。
細胞採取機及び/または細胞処理システムは、例えば、Fresenius Kabi、Tomtec Life Science、Perkin Elmer、及びInotech Biosystems International,Incを含む、様々な供給源から市販されている。任意の細胞ベースの採取機が本方法とともに用いられ得る。いくつかの実施形態では、細胞採取機及び/または細胞処理システムは、膜ベースの細胞採取機である。いくつかの実施形態では、細胞採取は、LOVOシステム(Fresenius Kabiによって製造されたもの)などの細胞処理システムによるものである。「LOVO細胞処理システム」という用語は、細胞を含む溶液を、滅菌及び/または閉鎖系環境で回転膜または回転フィルターなどの膜またはフィルターをとおしてポンプ輸送し、連続フローを可能にし、細胞を処理して、ペレット化せずに上清または細胞培養培地を除去する、任意のベンダーによって製造された任意の機器または装置も指す。いくつかの実施形態では、細胞採取機及び/または細胞処理システムは、閉鎖した滅菌系内で、細胞分離、洗浄、流体交換、濃縮、及び/または他の細胞処理ステップを行うことができる。
いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)によるステップDは、閉鎖系バイオリアクター内で行われる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の閉鎖系がTIL拡張のために用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが用いられる。いくつかの実施形態では、バイオリアクターが容器として用いられる。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、例えば、G-REX-100またはG-REX-500である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-REX-100である。いくつかの実施形態では、用いられるバイオリアクターは、G-REX-500である。
いくつかの実施形態では、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)によるステップEは、本明細書に記載のプロセスに従って行われる。いくつかの実施形態では、閉鎖系は、閉鎖系の無菌性及び閉鎖性を維持するために、滅菌条件下でシリンジを介してアクセスされる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるような閉鎖系が用いられる。
いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に記載の方法に従って採取される。いくつかの実施形態では、14~16日目のTILが本明細書に記載の方法を使用して採取される。いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に記載の方法を使用して14日目に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に記載の方法を使用して15日目に採取される。いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に記載の方法を使用して16日目に採取される。
F.ステップF:最終製剤及び輸液容器への移行
図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に例示的な順序で提供され、かつ上及び本明細書で詳細に概説されるステップA~Eが完了した後、細胞は、注入バッグまたは無菌バイアルなどの患者への投与に使用するために容器に移される。いくつかの実施形態では、治療的に十分な数のTILが上記の拡張方法を使用して得られると、それらは、患者への投与に使用するために容器に移される。
いくつかの実施形態では、本開示の方法を使用して拡張されたTILは、薬学的組成物として患者に投与される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、滅菌緩衝液中のTIL懸濁液である。本明細書に開示されるように拡張されたTILは、当該技術分野で知られている任意の好適な経路によって投与され得る。いくつかの実施形態では、TILは、単回の動脈内または静脈内注入として投与され、これは、好ましくは、およそ30~60分続く。他の好適な投与経路には、腹腔内、髄腔内、及びリンパ内投与が含まれる。
VII.さらなるGen2、Gen3、及び他のTIL製造プロセスの実施形態
A.PBMCフィーダー細胞比
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用される培養培地(例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)を参照されたい)は、抗CD3抗体、例えば、OKT-3を含む。IL-2と組み合わせた抗CD3抗体は、TIL集団におけるT細胞活性化及び細胞分裂を誘導する。この効果は、全長抗体、ならびにFab及びF(ab’)2断片で見ることができ、前者が一般に好まれ、例えば、Tsoukas et al.,J.Immunol.1985,135,1719(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)を参照されたい。
いくつかの実施形態では、PBMCフィーダー層の数は、以下のように計算される:
A.T細胞の体積(10μm直径):V=(4/3)πr=523.6μm
B.40μm(4細胞)の高さを有するG-REX100(M)のカラム:V=(4/3)πr=4×1012μm
C.カラムBを充填するために必要な細胞数:4×1012μm/523.6μm=7.6×10μm*0.64=4.86×10
D.四次元空間で最適に活性化され得る細胞の数:4.86×10/24=20.25×10
E.G-REX500に外挿されるフィーダー及びTILの数:TIL:100×10及びフィーダー:2.5×10
この計算では、100cmの底部を有するシリンジ中でのTILの活性化のために二十面体形状を提供するのに必要な単核細胞の数の近似値が使用される。この計算は、Jin,et.al.,J.Immunother.2012,35,283-292に記載のように、NCI実験データを密接に反映するT細胞の閾値活性化について、約5×10の実験結果を導き出す。(C)では、乗数(0.64)は、Jaeger and Nagel,Science,1992,255,1523-3によって計算された等価球のランダム充填密度である。(D)において、除数24は、Musin,Russ.Math.Surv.,2003,58,794-795に記載の四次元空間内の同様の物体と接触する可能性のある等価球の数または「ニュートン数」である。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給される抗原提示フィーダー細胞の数は、急速な第2の拡張中に外因的に供給される抗原提示フィーダー細胞の数のおよそ半分である。ある特定の実施形態では、この方法は、急速な第2の拡張の細胞培養培地と比較しておよそ50%少ない抗原提示細胞を含む細胞培養培地中でプライミングによる第1の拡張を行うことを含む。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給される抗原提示フィーダー細胞(APC)の数は、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数よりも多い。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約20:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約9:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約8:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約7:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約6:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比)は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約約2:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約2:1である。
他の実施形態では、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数の、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数に対する比は、正確にまたは約1.1:1、1.2:1、1.3:1、1.4:1、1.5:1、1.6:1、1.7:1、1.8:1、1.9:1、2:1、2.1:1、2.2:1、2.3:1、2.4:1、2.5:1、2.6:1、2.7:1、2.8:1、2.9:1、3:1、3.1:1、3.2:1、3.3:1、3.4:1、3.5:1、3.6:1、3.7:1、3.8:1、3.9:1、4:1、4.1:1、4.2:1、4.3:1、4.4:1、4.5:1、4.6:1、4.7:1、4.8:1、4.9:1、または5:1である。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約1×10、1.1×10、1.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、または3.5×10個のAPCであり、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、7.5×10、7.6×10、7.7×10、7.8×10、7.9×10、8×10、8.1×10、8.2×10、8.3×10、8.4×10、8.5×10、8.6×10、8.7×10、8.8×10、8.9×10、9×10、9.1×10、9.2×10、9.3×10、9.4×10、9.5×10、9.6×10、9.7×10、9.8×10、9.9×10、または1×10個のAPCである。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約1.5×10個のAPC~正確にまたは約3×10個のAPCの範囲から選択され、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約4×10個のAPC~正確にまたは約7.5×10個のAPCの範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約2×10個のAPC~正確にまたは約2.5×10個のAPCの範囲から選択され、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約4.5×10個のAPC~正確にまたは約5.5×10個のAPCの範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約2.5×10個のAPCであり、急速な第2の拡張中に外因的に供給されるAPCの数は、正確にまたは約5×10個のAPCである。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に追加されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、プライミングによる第1の拡張の7日目(例えば、方法の7日目)に追加されるPBMCの数のおよそ半分である。ある特定の実施形態では、方法は、プライミングによる第1の拡張の0日目に抗原提示細胞を第1のTIL集団に追加することと、7日目に抗原提示細胞を第2のTIL集団に追加することとを含み、0日目に追加される抗原提示細胞の数は、プライミングによる第1の拡張の7日目(例えば、方法の7日目)に追加される抗原提示細胞の数のおよそ50%である。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるPBMCの数よりも多い。
他の実施形態では、プライミングによる第1の増殖において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.0×10個のAPC/cm~正確にまたは約4.5×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の増殖において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.5×10個のAPC/cm~正確にまたは約3.5×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の増殖において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2×10個のAPC/cm~正確にまたは約3×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2×10個のAPC/cmの密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.0×10、1.1×10、1.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、または4.5×10個のAPC/cmの密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2.5×10個のAPC/cm~正確にまたは約7.5×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約3.5×10個のAPC/cm~正確にまたは約6.0×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約4.0×10個のAPC/cm~正確にまたは約5.5×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約4.0×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2.5×10個のAPC/cm、2.6×10個のAPC/cm、2.7×10個のAPC/cm、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、または7.5×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.0×10、1.1×10、1.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、または4.5×10個のAPC/cmの密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2.5×10個のAPC/cm、2.6×10個のAPC/cm、2.7×10個のAPC/cm、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、または7.5×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.0×10個のAPC/cm~正確にまたは約4.5×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2.5×10個のAPC/cm~正確にまたは約7.5×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約1.5×10個のAPC/cm~正確にまたは約3.5×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約3.5×10個のAPC/cm~正確にまたは約6×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2×10個のAPC/cm~正確にまたは約3×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約4×10個のAPC/cm~正確にまたは約5.5×10個のAPC/cmの範囲から選択される密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約2×10APC/cmの密度で培養フラスコに播種され、急速な第2の拡張において外因的に供給されるAPCは、正確にまたは約4×10APC/cmの密度で培養フラスコに播種される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるPBMCの数に対する比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約20:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるPBMCの数に対する比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるPBMCの数に対する比率は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約9:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約8:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約7:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約6:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約約2:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択される。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約2:1である。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数の、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数に対する比は、正確にまたは約1.1:1、1.2:1、1.3:1、1.4:1、1.5:1、1.6:1、1.7:1、1.8:1、1.9:1、2:1、2.1:1、2.2:1、2.3:1、2.4:1、2.5:1、2.6:1、2.7:1、2.8:1、2.9:1、3:1、3.1:1、3.2:1、3.3:1、3.4:1、3.5:1、3.6:1、3.7:1、3.8:1、3.9:1、4:1、4.1:1、4.2:1、4.3:1、4.4:1、4.5:1、4.6:1、4.7:1、4.8:1、4.9:1、または5:1である。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約1×10、1.1×10、1.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、または3.5×10個のAPC(例えば、PBMCを含む)であり、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、7.5×10、7.6×10、7.7×10、7.8×10、7.9×10、8×10、8.1×10、8.2×10、8.3×10、8.4×10、8.5×10、8.6×10、8.7×10、8.8×10、8.9×10、9×10、9.1×10、9.2×10、9.3×10、9.4×10、9.5×10、9.6×10、9.7×10、9.8×10、9.9×10、または1x10個のAPC(例えば、PBMCを含む)である。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約1×10個のAPC(例えば、PBMCを含む)~正確にまたは約3.5×10個のAPC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択され、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約3.5×10個のAPC(例えば、PBMCを含む)~正確にまたは約1×10個のAPC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約1.5×10個のAPC~約3×10個のAPC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択され、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、約4×10個のAPC(例えば、PBMCを含む)~約7.5×10個のAPC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約2×10個のAPC(例えば、PBMCを含む)~正確にまたは約2.5×10個のAPC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択され、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約4.5×10個のAPC(例えば、PBMCを含む)~正確にまたは約5.5×10個のAPC(例えば、PBMCを含む)の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約2.5×10APC(例えば、PBMCを含む)であり、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)の数は、正確にまたは約5×10APC(例えば、PBMCを含む)である。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目に追加されるAPC(例えば、PBMCを含む)層の数は、急速な第2の拡張の7日目に追加されるAPC(例えば、PBMCを含む)層の数のおよそ半分である。ある特定の実施形態では、方法は、プライミングによる第1の拡張の0日目に抗原提示細胞層を第1のTIL集団に追加することと、7日目に抗原提示細胞を第2のTIL集団に追加することとを含み、0日目に追加される抗原提示細胞層の数は、7日目に追加される抗原提示細胞層の数のおよそ50%である。
他の実施形態では、急速な第2の拡張の7日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)層の数は、プライミングによる第1の拡張の0日目に外因的に供給されるAPC(例えば、PBMCを含む)層の数よりも多い。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約2細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約4細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約3細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1.5細胞層~正確にまたは約2.5細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約3細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約2細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、または3細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約3.1、3.2、3.3、3.4、3.5、3.6、3.7、3.8、3.9、4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、または8細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1細胞層~正確にまたは約2細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約3細胞層~正確にまたは約10細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約2細胞層~正確にまたは約3細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約2細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、正確にまたは約1、2、または3細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、正確にまたは約3、4、5、6、7、8、9、または10細胞層の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こる。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:10の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:8の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:7の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:6の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:5の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:4の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:3の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:2の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.2~正確にまたは約1:8の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.3~正確にまたは約1:7の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.4~正確にまたは約1:6の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.5~正確にまたは約1:5の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.6~正確にまたは約1:4の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.7~正確にまたは約1:3.5の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.8~正確にまたは約1:3の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第1の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.9~正確にまたは約1:2.5の範囲から選択される。
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:2.
他の実施形態では、プライミングによる第1の拡張の0日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数に等しい第1の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、急速な第2の拡張の7日目は、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に等しい第2の平均厚さを有する層状APC(例えば、PBMCを含む)の存在下で起こり、APC(例えば、PBMCを含む)の第1の層の数の、APC(例えば、PBMCを含む)の第2の層の数に対する比は、正確にまたは約1:1.1、1:1.2、1:1.3、1:1.4、1:1.5、1:1.6、1:1.7、1:1.8、1:1.9、1:2、1:2.1、1:2.2、1:2.3、1:2.4、1:2.5、1:2.6、1:2.7、1:2.8、1:2.9、1:3、1:3.1、1:3.2、1:3.3、1:3.4、1:3.5、1:3.6、1:3.7、1:3.8、1:3.9、1:4、1:4.1、1:4.2、1:4.3、1:4.4、1:4.5、1:4.6、1:4.7、1:4.8、1:4.9、1:5、1:5.1、1:5.2、1:5.3、1:5.4、1:5.5、1:5.6、1:5.7、1:5.8、1:5.9、1:6、1:6.1、1:6.2、1:6.3、1:6.4、1:6.5、1:6.6、1:6.7、1:6.8、1:6.9、1:7、1:7.1、1:7.2、1:7.3、1:7.4、1:7.5、1:7.6、1:7.7、1:7.8、1:7.9、1:8、1:8.1、1:8.2、1:8.3、1:8.4、1:8.5、1:8.6、1:8.7、1:8.8、1:8.9、1:9、1:9.1、1:9.2、1:9.3、1:9.4、1:9.5、1:9.6、1:9.7、1:9.8、1:9.9、または1:10から選択される。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張におけるAPCの数は、約1.0×10個のAPC/cm~約4.5×10個のAPC/cmの範囲から選択され、急速な第2の拡張におけるAPCの数は、約2.5×10個のAPC/cm~約7.5×10個のAPC/cmの範囲から選択される。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張におけるAPCの数は、約1.5×10個のAPC/cm~約3.5×10個のAPC/cmの範囲から選択され、急速な第2の拡張におけるAPCの数は、約3.5×10個のAPC/cm~約6.0×10個のAPC/cmの範囲から選択される。
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張におけるAPCの数は、約2.0×10個のAPC/cm~約3.0×10個のAPC/cmの範囲から選択され、急速な第2の拡張におけるAPCの数は、約4.0×10個のAPC/cm~約5.5×10個のAPC/cmの範囲から選択される。
B.任意選択の細胞培地成分
1.抗CD3抗体
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の拡張方法で使用される培養培地(REPと称されるものを含む、例えば、図1及び8(特に、例えば図8B)を参照)は、抗CD3抗体を含む。IL-2と組み合わせた抗CD3抗体は、TIL集団におけるT細胞活性化及び細胞分裂を誘導する。この効果は、全長抗体、ならびにFab及びF(ab’)2断片で見ることができ、前者が一般に好まれ、例えば、Tsoukas et al.,J.Immunol.1985,135,1719(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)を参照されたい。
当業者によって理解されるように、マウス、ヒト、霊長類、ラット、及びイヌ抗体を含むが、これらに限定されない、様々な哺乳動物由来の抗ヒトCD3ポリクローナル及びモノクローナル抗体を含む、本発明での使用が見出されるいくつかの好適な抗ヒトCD3抗体が存在する。特定の実施形態では、抗CD3抗体ムロモナブであるOKT3が使用される(Ortho-McNeil,Raritan,NJまたはMiltenyi Biotech,Auburn,CAから市販されている)。表1を参照されたい。
当業者によって理解されるように、マウス、ヒト、霊長類、ラット、及びイヌ抗体を含むが、これらに限定されない、様々な哺乳動物由来の抗ヒトCD3ポリクローナル及びモノクローナル抗体を含む、本発明での使用が見出されるいくつかの好適な抗ヒトCD3抗体が存在する。いくつかの実施形態では、抗CD3抗体ムロモナブであるOKT3が使用される(Ortho-McNeil,Raritan,NJまたはMiltenyi Biotech,Auburn,CAから市販されている)。
2.4-1BB(CD137)アゴニスト
いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張及び/または急速な第2の拡張の細胞培養培地は、TNFRSFアゴニストを含む。いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、4-1BB(CD137)アゴニストである。4-1BBアゴニストは、当該技術分野で知られている任意の4-1BB結合分子であり得る。4-1BB結合分子は、ヒトまたは哺乳動物4-1BBに結合することができるモノクローナル抗体または融合タンパク質であり得る。4-1BBアゴニストまたは4-1BB結合分子は、任意のアイソタイプ(例えば、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA、及びIgY)、クラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、及びIgA2)、またはサブクラスの免疫グロブリン分子の免疫グロブリン重鎖を含み得る。4-1BBアゴニストまたは4-1BB結合分子は、重鎖及び軽鎖の両方を有し得る。本明細書で使用される場合、結合分子という用語は、抗体(全長抗体を含む)、モノクローナル抗体(全長モノクローナル抗体を含む)、ポリクローナル抗体、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、ヒト、ヒト化またはキメラ抗体、及び抗体断片、例えば、Fab断片、F(ab’)断片、Fab発現ライブラリーによって産生された断片、上記のうちのいずれかのエピトープ結合断片、ならびに4-1BBに結合する抗体の操作された形態、例えば、scFv分子も含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、完全ヒト抗体である抗原結合タンパク質である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、ヒト化抗体である抗原結合タンパク質である。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法及び組成物に使用するための4-1BBアゴニストには、抗4-1BB抗体、ヒト抗4-1BB抗体、マウス抗4-1BB抗体、哺乳動物抗4-1BB抗体、モノクローナル抗4-1BB抗体、ポリクローナル抗4-1BB抗体、キメラ抗4-1BB抗体、抗4-1BBアドネクチン、抗4-1BBドメイン抗体、一本鎖抗4-1BB断片、重鎖抗4-1BB断片、軽鎖抗4-1BB断片、抗4-1BB融合タンパク質、及びそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、またはバイオシミラーが含まれる。アゴニスト抗4-1BB抗体は、強力な免疫応答を誘導することが知られている。Lee,et al.,PLOS One 2013,8,e69677。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、アゴニスト、抗4-1BBヒト化、または完全ヒトモノクローナル抗体(すなわち、単一の細胞株に由来する抗体)である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、EU-101(Eutilex Co.Ltd.)、ウトミルマブ、もしくはウレルマブ、またはそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、もしくはバイオシミラーである。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウトミルマブもしくはウレルマブ、またはそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、もしくはバイオシミラーである。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストまたは4-1BB結合分子は、融合タンパク質である場合もある。いくつかの実施形態では、三量体または六量体4-1BBアゴニスト(3つまたは6つのリガンド結合ドメインを有する)などの多量体4-1BBアゴニストは、典型的に2つのリガンド結合ドメインを有するアゴニストモノクローナル抗体と比較して、優れた受容体(4-1BBL)クラスター化及び内部細胞シグナル伝達複合体形成を誘導し得る。3つのTNFRSF結合ドメイン及びIgG1-Fcを含み、かつ任意選択でこれらの融合タンパク質のうちの2つ以上をさらに結合する三量体(三価)または六量体(もしくは六価)またはそれ以上の融合タンパク質は、例えば、Gieffers,et al.,Mol.Cancer Therapeutics 2013,12,2735-47に記載されている。
アゴニスト4-1BB抗体及び融合タンパク質は、強い免疫応答を誘導することが知られている。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、毒性を低減するのに十分な様式で4-1BB抗原に特異的に結合するモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、抗体依存性細胞毒性(cellular toxicity)(ADCC)、例えば、NK細胞細胞傷害性(cytotoxicity)を抑制するアゴニスト4-1BBモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、抗体依存性細胞食作用(ADCP)を抑制するアゴニスト4-1BBモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、補体依存性細胞傷害性(CDC)を抑制するアゴニスト4-1BBモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、Fc領域機能性を抑制するアゴニスト4-1BBモノクローナル抗体または融合タンパク質である。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、高い親和性及びアゴニスト活性でヒト4-1BB(配列番号9)に結合することを特徴とする。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、ヒト4-1BB(配列番号40)に結合する結合分子である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、マウス4-1BB(配列番号41)に結合する結合分子である。4-1BBアゴニストまたは結合分子が結合する4-1BB抗原のアミノ酸配列を表5に要約する。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス及び方法は、ヒトもしくはマウス4-1BBに約100pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約90pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約80pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約70pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約60pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約50pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約40pM以下のKで結合する、またはヒトもしくはマウス4-1BBに約30pM以下のKで結合する4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウス4-1BBに約7.5×10l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約7.5×10l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約8×10l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約8.5×10l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約9×10l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約9.5×10l/M・s以上のkassocで結合する、またはヒトもしくはマウス4-1BBに約1×10l/M・s以上のkassocで結合する4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.1×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.2×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.3×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.4×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.5×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.6×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.7×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.8×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2.9×10-5l/s以下のkdissocで結合する、またはヒトもしくはマウス4-1BBに約3×10-5l/s以下のkdissocで結合する、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス及び方法は、ヒトもしくはマウス4-1BBに約10nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約9nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約8nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約7nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約6nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約5nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約4nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約3nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約2nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウス4-1BBに約1nM以下のIC50で結合する、4-1BBアゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、PF-05082566もしくはMOR-7480としても知られるウトミルマブ、またはその断片、誘導体、バリアント、もしくはバイオシミラーである。ウトミルマブは、Pfizer,Inc.から入手可能である。ウトミルマブは、免疫グロブリンG2-ガンマ、抗[ホモサピエンスTNFRSF9(腫瘍壊死因子受容体(TNFR)スーパーファミリーメンバー9、4-1BB、T細胞抗原ILA、CD137)]、ホモサピエンス(完全ヒト)モノクローナル抗体である。ウトミルマブのアミノ酸配列を表6に示す。ウトミルマブは、Asn59及びAsn292にグリコシル化部位、22-96位(V-V)、143-199位(C1-C)、256-316位(C2)、及び362-420位(C3)に重鎖鎖内ジスルフィド架橋、22’-87’位(V-V)及び136’-195’位(C1-C)に軽鎖鎖内ジスルフィド架橋、IgG2Aアイソフォーム218-218、219-219、222-222、及び225-225位、IgG2A/Bアイソフォーム218-130、219-219、222-222、及び225-225位、ならびにIgG2Bアイソフォーム219-130(2)、222-222、及び225-225位に鎖間重鎖-重鎖ジスルフィド架橋、ならびにIgG2Aアイソフォーム130-213’(2)位、IgG2A/Bアイソフォーム218-213’位、及び130-213’位、ならびにIgG2Bアイソフォーム218-213’(2)位に鎖間重鎖-軽鎖ジスルフィド架橋を含む。ウトミルマブならびにそのバリアント及び断片の調製及び特性は、米国特許第8,821,867号、同第8,337,850号、及び同第9,468,678号、ならびに国際特許出願公開第WO2012/032433A1(これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。ウトミルマブの前臨床特徴は、Fisher,et al.,Cancer Immunolog.&Immunother.2012,61,1721-33に記載されている。様々な血液学的及び固形腫瘍適応症におけるウトミルマブの現在の臨床試験には、米国国立衛生研究所のclinicaltrials.gov識別子NCT02444793、NCT01307267、NCT02315066、及びNCT02554812が含まれる。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、配列番号42によって示される重鎖及び配列番号43によって示される軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号42及び配列番号43に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウトミルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号44に示される配列を含み、4-1BBアゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号45に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、配列番号44及び配列番号45に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含むscFv抗体を含む。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、それぞれ、配列番号46、配列番号47、及び配列番号48に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号49、配列番号50、及び配列番号51に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウトミルマブに関して薬物規制当局によって承認された4-1BBアゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照バイオ製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含む4-1BB抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウトミルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出された4-1BBアゴニスト抗体であり、4-1BBアゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウトミルマブである。4-1BBアゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウトミルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウトミルマブである。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、BMS-663513及び20H4.9.h4aとしても知られるモノクローナル抗体ウレルマブ、またはそれらの断片、誘導体、バリアント、もしくはバイオシミラーである。ウレルマブは、Bristol-Myers Squibb,Inc.及びCreative Biolabs,Inc.から入手可能である。ウレルマブは、免疫グロブリンG4-カッパ、抗[ホモサピエンスTNFRSF9(腫瘍壊死因子受容体スーパーファミリーメンバー9、4-1BB、T細胞抗原ILA、CD137)]、ホモサピエンス(完全ヒト)モノクローナル抗体である。ウレルマブのアミノ酸配列を表7に示す。ウレルマブは、298位(及び298’’)にN-グリコシル化部位、22-95位(V-V)、148-204位(C1-C)、262-322位(C2)、及び368-426位(C3)(22’’-95’’、148’’-204’’、262’’-322’’、及び368’’-426’’位)に重鎖鎖内ジスルフィド架橋、23’-88’位(V-V)及び136’-196’位(C1-C)(23’’’-88’’’及び136’’’-196’’’位)に軽鎖鎖内ジスルフィド架橋、227-227’’位及び230-230’’位に鎖間重鎖-重鎖ジスルフィド架橋ならびに135-216’及び135’’-216’’’に鎖間重鎖-軽鎖ジスルフィド架橋を含む。ウレルマブならびにそのバリアント及び断片の調製及び特性は、米国特許第7,288,638号及び同第8,962,804号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。ウレルマブの前臨床及び臨床特徴は、Segal,et al.,Clin.Cancer Res.2016に記載されており、http:/dx.doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-16-1272で入手可能である。様々な血液学的及び固形腫瘍適応症におけるウレルマブの現在の臨床試験には、米国国立衛生研究所のclinicaltrials.gov識別子NCT01775631、NCT02110082、NCT02253992、及びNCT01471210が含まれる。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、配列番号52によって示される重鎖及び配列番号53によって示される軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号52及び配列番号53に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウレルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号54に示される配列を含み、4-1BBアゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号55に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、各々が、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含むscFv抗体を含む。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、それぞれ、配列番号56、配列番号57、及び配列番号58に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号59、配列番号60、及び配列番号61に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、ウレルマブに関して薬物規制当局によって承認された4-1BBアゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照バイオ製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含む4-1BB抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウレルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出された4-1BBアゴニスト抗体であり、4-1BBアゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウレルマブである。4-1BBアゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウレルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ウレルマブである。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、1D8、3Elor、4B4(BioLegend 309809)、H4-1BB-M127(BD Pharmingen 552532)、BBK2(Thermo Fisher MS621PABX)、145501(Leinco Technologies B591)、ATCC番号HB-11248として寄託された細胞株によって産生され、米国特許第6,974,863号に開示される抗体、5F4(BioLegend 31 1503)、C65-485(BD Pharmingen 559446)、米国特許出願公開第2005/0095244号に開示される抗体、米国特許第7,288,638号に開示される抗体(例えば、20H4.9-IgGl(BMS-663031))、米国特許第6,887,673号に開示される抗体(例えば、4E9もしくはBMS-554271)、米国特許第7,214,493号に開示される抗体、米国特許第6,303,121号に開示される抗体、米国特許第6,569,997号に開示される抗体、米国特許第6,905,685号に開示される抗体(例えば、4E9もしくはBMS-554271)、米国特許第6,362,325号に開示される抗体(例えば、1D8もしくはBMS-469492、3H3もしくはBMS-469497、または3El)、米国特許第6,974,863号に開示される抗体(例えば、53A2)、米国特許第6,210,669号に開示される抗体(例えば、1D8、3B8、もしくは3El)、米国特許第5,928,893号に開示される抗体、米国特許第6,303,121号に開示される抗体、米国特許第6,569,997号に開示される抗体、国際特許出願公開第WO2012/177788号、同第WO2015/119923号、及び同第WO2010/042433号に開示される抗体、ならびにそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、またはバイオシミラーからなる群から選択され、前述の特許または特許出願公開の各々の開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、国際特許出願公開第WO2008/025516A1号、同第WO2009/007120A1号、同第WO2010/003766A1号、同第WO2010/010051A1号、及び同第WO2010/078966A1号、米国特許出願公開第2011/0027218A1号、同第2015/0126709A1号、同第2011/0111494A1号、同第2015/0110734A1号、及び同第2015/0126710A1号、ならびに米国特許第9,359,420号、同第9,340,599号、同第8,921,519号、及び同第8,450,460号に記載される4-1BBアゴニスト融合タンパク質であり、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、構造I-A(C末端Fc抗体断片融合タンパク質)もしくは構造I-B(N末端Fc抗体断片融合タンパク質)に示されるような4-1BBアゴニスト融合タンパク質、またはそれらの断片、誘導体、コンジュゲート、バリアント、もしくはバイオシミラーである(図18を参照)。構造I-A及びI-Bにおいて、円筒は、個々のポリペプチド結合ドメインを指す。構造I-A及びI-Bは、例えば、4-1BBL(4-1BBリガンド、CD137リガンド(CD137L)、もしくは腫瘍壊死因子スーパーファミリーメンバー9(TNFSF9))または4-1BBに結合する抗体に由来する3つの直線的に連結されたTNFRSF結合ドメインを含み、これらが折り重なって三価タンパク質を形成し、その後、これがIgG1-Fc(C3及びC2ドメインを含む)によって第2の三価タンパク質に連結され、その後、これを使用して、三価タンパク質のうちの2つをジスルフィド結合(小さく長細い楕円)によって一緒に連結し、構造を安定化し、6つの受容体及びシグナル伝達タンパク質の細胞内シグナル伝達ドメインを一緒にして、シグナル伝達複合体を形成することができるアゴニストを提供する。円筒として示されるTNFRSF結合ドメインは、例えば、親水性残基及び柔軟性のためのGly及びSer配列、ならびに溶解性のためのGlu及びLysを含み得るリンカーによって結合されたV鎖及びV鎖を含む、scFvドメインであり得る。de Marco,Microbial Cell Factories,2011,10,44、Ahmad,et al.,Clin.&Dev.Immunol.2012,980250、Monnier,et al.,Antibodies,2013,2,193-208、または本明細書の他の場所に組み込まれている参照文献に記載されるものなどの任意のscFvドメイン設計が使用され得る。この形態の融合タンパク質構造は、米国特許第9,359,420号、同第9,340,599号、同第8,921,519号、及び同第8,450,460号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
図18に示される構造I-Aの他のポリペプチドドメインのアミノ酸配列は、表8に見出される。Fcドメインは、好ましくは、完全な定常ドメイン(配列番号62のアミノ酸17~230)、完全なヒンジドメイン(配列番号62のアミノ酸1~16)、またはヒンジドメインの一部(例えば、配列番号62のアミノ酸4~16)を含む。C末端Fc抗体を結合するための好ましいリンカーは、追加のポリペプチドの融合に好適なリンカーを含む、配列番号63~配列番号72に示される実施形態から選択され得る。
図18に示される構造I-Bの他のポリペプチドドメインのアミノ酸配列は、表9に見出される。Fc抗体断片が構造I-BにあるようなTNRFSF融合タンパク質のN末端に融合される場合、Fcモジュールの配列は、好ましくは、配列番号73に示されるものであり、リンカー配列は、好ましくは、配列番号74~配列番号76に示される実施形態から選択される。
いくつかの複合体実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、ウトミルマブの可変重鎖及び可変軽鎖、ウレルマブの可変重鎖及び可変軽鎖、ウトミルマブの可変重鎖及び可変軽鎖、表5に記載の可変重鎖及び可変軽鎖から選択される可変重鎖及び可変軽鎖、前述の可変重鎖及び可変軽鎖の任意の組み合わせ、ならびにそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、及びバイオシミラーからなる群から選択される1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。
いくつかの複合体実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、4-1BBL配列を含む1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、配列番号77による配列を含む1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、可溶性4-1BBL配列を含む1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、配列番号78による配列を含む1つ以上の4-1BB結合ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号43及び配列番号44に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上の4-1BB結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインはリンカーによって結合されている。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号54及び配列番号55に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上の4-1BB結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインはリンカーによって結合されている。いくつか実施形態では、構造I-AまたはI-Bによる4-1BBアゴニスト融合タンパク質は、各々が、表10に示されるV配列及びV配列と少なくとも95%同一であるV配列及びV配列を含むscFvドメインである1つ以上の4-1BB結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインはリンカーによって結合されている。
いくつか実施形態では、4-1BBアゴニストは、(i)第1の可溶性4-1BB結合ドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性4-1BB結合ドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性4-1BB結合ドメインを含む4-1BBアゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、N末端及び/またはC末端に追加のドメインをさらに含み、追加のドメインは、FabまたはFc断片ドメインである。いくつか実施形態では、4-1BBアゴニストは、(i)第1の可溶性4-1BB結合ドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性4-1BB結合ドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性4-1BB結合ドメインを含む4-1BBアゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、N末端及び/またはC末端に追加のドメインをさらに含み、追加のドメインは、FabまたはFc断片ドメインであり、可溶性4-1BBドメインは各々、茎領域(三量体化に寄与し、細胞膜まである特定の距離を提供するが、4-1BB結合ドメインの一部分ではない)を欠き、第1及び第2のペプチドリンカーは独立して、3~8アミノ酸長を有する。
いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、(i)第1の可溶性腫瘍壊死因子(TNF)スーパーファミリーサイトカインドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメインを含む4-1BBアゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメインは各々、茎領域を欠き、第1及び第2のペプチドリンカーは独立して、3~8アミノ酸長であり、各TNFスーパーファミリーサイトカインドメインは、4-1BB結合ドメインである。
いくつか実施形態では、4-1BBアゴニストは、前述のVドメインのうちのいずれかに連結された前述のVドメインのうちのいずれかを含む4-1BBアゴニストscFv抗体である。
いくつか実施形態では、4-1BBアゴニストは、BPS Bioscience(San Diego,CA,USA)から市販されているBPS Bioscience 4-1BBアゴニスト抗体カタログ番号79097-2である。いくつかの実施形態では、4-1BBアゴニストは、Creative Biolabs(Shirley,NY,USA)から市販されているCreative Biolabs 4-1BBアゴニスト抗体カタログ番号MOM-18179である。
3.OX40(CD134)アゴニスト
いくつかの実施形態では、TNFRSFアゴニストは、OX40(CD134)アゴニストである。OX40アゴニストは、当該技術分野で知られている任意のOX40結合分子であり得る。OX40結合分子は、ヒトまたは哺乳動物OX40に結合することができるモノクローナル抗体または融合タンパク質であり得る。OX40アゴニストまたはOX40結合分子は、任意のアイソタイプ(例えば、IgG、IgE、IgM、IgD、IgA、及びIgY)、クラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、及びIgA2)、またはサブクラスの免疫グロブリン分子の免疫グロブリン重鎖を含み得る。OX40アゴニストまたはOX40結合分子は、重鎖及び軽鎖の両方を有し得る。本明細書で使用される場合、結合分子という用語は、抗体(全長抗体を含む)、モノクローナル抗体(全長モノクローナル抗体を含む)、ポリクローナル抗体、多重特異性抗体(例えば、二重特異性抗体)、ヒト、ヒト化またはキメラ抗体、及び抗体断片、例えば、Fab断片、F(ab’)断片、Fab発現ライブラリーによって産生された断片、上記のうちのいずれかのエピトープ結合断片、ならびにOX40に結合する抗体の操作された形態、例えば、scFv分子も含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、完全ヒト抗体である抗原結合タンパク質である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、ヒト化抗体である抗原結合タンパク質である。いくつかの実施形態では、本明細書に開示される方法及び組成物に使用するためのOX40アゴニストには、抗OX40抗体、ヒト抗OX40抗体、マウス抗OX40抗体、哺乳動物抗OX40抗体、モノクローナル抗OX40抗体、ポリクローナル抗OX40抗体、キメラ抗OX40抗体、抗OX40アドネクチン、抗OX40ドメイン抗体、一本鎖抗OX40断片、重鎖抗OX40断片、軽鎖抗OX40断片、抗OX40融合タンパク質、及びそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、またはバイオシミラーが含まれる。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、アゴニスト、抗OX40ヒト化、または完全ヒトモノクローナル抗体(すなわち、単一の細胞株に由来する抗体)である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストまたはOX40結合分子は、融合タンパク質である場合もある。OX40Lに融合されたFcドメインを含むOX40融合タンパク質は、例えば、Sadun,et al.,J.Immunother.2009,182,1481-89に記載されている。いくつかの実施形態では、三量体または六量体OX40アゴニスト(3つまたは6つのリガンド結合ドメインを有する)などの多量体OX40アゴニストは、典型的に2つのリガンド結合ドメインを有するアゴニストモノクローナル抗体と比較して、優れた受容体(OX40L)クラスター化及び内部細胞シグナル伝達複合体形成を誘導し得る。3つのTNFRSF結合ドメイン及びIgG1-Fcを含み、かつ任意選択でこれらの融合タンパク質のうちの2つ以上をさらに結合する三量体(三価)または六量体(もしくは六価)またはそれ以上の融合タンパク質は、例えば、Gieffers,et al.,Mol.Cancer Therapeutics 2013,12,2735-47に記載されている。
アゴニストOX40抗体及び融合タンパク質は、強い免疫応答を誘導することが知られている。Curti,et al.,Cancer Res.2013,73,7189-98。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、毒性を低減するのに十分な様式でOX40抗原に特異的に結合するモノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体依存性細胞毒性(cellular toxicity)(ADCC)、例えば、NK細胞細胞傷害性(cytotoxicity)を抑制するアゴニストOX40モノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体依存性細胞食作用(ADCP)を抑制するアゴニストOX40モノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、補体依存性細胞傷害性(CDC)を抑制するアゴニストOX40モノクローナル抗体または融合タンパク質である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Fc領域機能性を抑制するアゴニストOX40モノクローナル抗体または融合タンパク質である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、高い親和性及びアゴニスト活性でヒトOX40(配列番号85)に結合することを特徴とする。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、ヒトOX40に結合する結合分子である(配列番号85)。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、マウスOX40に結合する結合分子である(配列番号86)。OX40アゴニストまたは結合分子が結合するOX40抗原のアミノ酸配列を表11に要約する。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウスOX40に約100pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約90pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約80pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約70pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約60pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約50pM以下のKで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約40pM以下のKで結合する、またはヒトもしくはマウスOX40に約30pM以下のKで結合するOX40アゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウスOX40に約7.5×10l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約7.5×10l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約8×10l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約8.5×10l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約9×10l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約9.5×10l/M・s以上のkassocで結合する、またはヒトもしくはマウスOX40に約1×10l/M・s以上のkassocで結合するOX40アゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウスOX40に約2×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.1×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.2×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.3×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.4×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.5×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.6×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.7×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.8×10-5l/s以下のkdissocで結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2.9×10-5l/s以下のkdissocで結合する、またはヒトもしくはマウスOX40に約3×10-5l/s以下のkdissocで結合する、OX40アゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、記載される組成物、プロセス、及び方法は、ヒトもしくはマウスOX40に約10nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約9nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約8nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約7nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約6nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約5nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約4nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約3nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約2nM以下のIC50で結合する、ヒトもしくはマウスOX40に約1nM以下のIC50で結合する、OX40アゴニストを含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、MEDI0562またはMEDI-0562としても知られるタボリキシズマブである。タボリキシズマブは、AstraZeneca,Inc.の子会社であるMedImmuneから入手可能である。タボリキシズマブは、免疫グロブリンG1-カッパ、抗[ホモサピエンスTNFRSF4(腫瘍壊死因子受容体(TNFR)スーパーファミリーメンバー4、OX40、CD134)]、ヒト化及びキメラモノクローナル抗体である。タボリキシズマブのアミノ酸配列を表12に示す。タボリキシズマブは、301及び301’’位にN-グリコシル化部位(フコシル化複合二分岐CHO型グリカンを有する)、22-95位(V-V)、148-204位(C1-C)、265-325位(C2)、及び371-429位(C3)(及び22’’-95’’、148’’-204’’、265’’-325’’、及び371’’-429’’位)に重鎖鎖内ジスルフィド架橋、23’-88’位(V-V)及び134’-194’位(C1-C)(及び23’’’-88’’’及び134’’’-194’’’位)に軽鎖鎖内ジスルフィド架橋、230-230”及び233-233”位に重鎖鎖内ジスルフィド架橋、ならびに224-214’及び224’’-214’’’に鎖間重鎖-軽鎖ジスルフィド架橋を含む。様々な固形腫瘍適応症におけるタボリキシズマブの現在の臨床試験には、米国国立衛生研究所のclinicaltrials.gov識別子NCT02318394及びNCT02705482が含まれる。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、配列番号87によって示される重鎖及び配列番号88によって示される軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号87及び配列番号88に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、タボリキシズマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号89に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号90に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含むscFv抗体を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号91、配列番号92、及び配列番号93に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号94、配列番号95、及び配列番号96に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
ある実施形態では、OX40アゴニストは、タボリキシズマブに関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。ある実施形態ではいくつかの実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照バイオ製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、タボリキシズマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、タボリキシズマブである。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、タボリキシズマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、タボリキシズマブである。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Pfizer,Inc.から入手可能な完全ヒト抗体である11D4である。11D4の調製及び特性は、米国特許第7,960,515号、同第8,236,930号、及び同第9,028,824号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。11D4のアミノ酸配列を表13に示す。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、配列番号97によって示される重鎖及び配列番号98によって示される軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号97及び配列番号98に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、11D4の重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号99に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号100に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号101、配列番号102、及び配列番号103に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号194、配列番号105、及び配列番号106に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、11D4に関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照バイオ製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、11D4である。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、11D4である。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、11D4である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、11D4である。

いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Pfizer,Inc.から入手可能な完全ヒト抗体である18D8である。18D8の調製及び特性は、米国特許第7,960,515号、同第8,236,930号、及び同第9,028,824号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。18D8のアミノ酸配列を表14に示す。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、配列番号107によって示される重鎖及び配列番号108によって示される軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号107及び配列番号108に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、18D8の重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号109に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号110に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号111、配列番号112、及び配列番号113に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号114、配列番号115、及び配列番号116に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、18D8に関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照バイオ製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、18D8である。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、18D8である。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、18D8である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、18D8である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、GlaxoSmithKline plc.から入手可能なヒト化抗体であるHu119-122である。Hu119-122の調製及び特性は、米国特許第9,006,399号及び同第9,163,085号、ならびに国際特許公開第WO2012/027328号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。Hu119-122のアミノ酸配列を表15に示す。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Hu119-122の重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号117に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号118に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号117及び配列番号118に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号119、配列番号120、及び配列番号121に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号122、配列番号123、及び配列番号124に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Hu119-122に関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照バイオ製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu119-122である。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu119-122である。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu119-122である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu119-122である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、GlaxoSmithKline plc.から入手可能なヒト化抗体であるHu106-222である。Hu106-222の調製及び特性は、米国特許第9,006,399号及び同第9,163,085号、ならびに国際特許公開第WO2012/027328号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。Hu106-222のアミノ酸配列を表16に示す。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Hu106-222の重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニスト重鎖可変領域(V)は、配列番号125に示される配列を含み、OX40アゴニスト軽鎖可変領域(V)は、配列番号126に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、それぞれ、配列番号127、配列番号128、及び配列番号129に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号130、配列番号131、及び配列番号132に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Hu106-222に関して薬物規制当局によって承認されたOX40アゴニストバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーモノクローナル抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列と少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、かつ参照医薬品または参照バイオ製品と比較して1つ以上の翻訳後修飾を含むOX40抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu106-222である。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可されたまたは認可を得るために提出されたOX40アゴニスト抗体であり、OX40アゴニスト抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu106-222である。OX40アゴニスト抗体は、米国FDA及び/または欧州連合EMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu106-222である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、Hu106-222である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニスト抗体は、MEDI6469(9B12とも称される)である。MEDI6469は、マウスモノクローナル抗体である。Weinberg,et al.,J.Immunother.2006,29,575-585。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Weinberg,et al.,J.Immunother.2006,29,575-585に記載されているように、Biovest Inc.(Malvern,MA,USA)に寄託された9B12ハイブリドーマによって産生された抗体であり、その開示は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、抗体は、MEDI6469のCDR配列を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、MEDI6469の重鎖可変領域配列及び/または軽鎖可変領域配列を含む。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、L106 BD(Pharmingen製品番号340420)である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体L106(BD Pharmingen製品番号340420)のCDRを含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体L106(BD Pharmingen製品番号340420)の重鎖可変領域配列及び/または軽鎖可変領域配列を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、ACT35(Santa Cruz Biotechnology、カタログ番号20073)である。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体ACT35(Santa Cruz Biotechnology、カタログ番号20073)のCDRを含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、抗体ACT35(Santa Cruz Biotechnology、カタログ番号20073)の重鎖可変領域配列及び/または軽鎖可変領域配列を含む。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、InVivoMAb、BioXcell Inc(West Lebanon,NH)から市販されているマウスモノクローナル抗体抗mCD134/mOX40(クローンOX86)である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、国際特許出願公開第WO95/12673号、同第WO95/21925号、同第WO2006/121810号、同第WO2012/027328号、同第WO2013/028231号、同第WO2013/038191号、及び同第WO2014/148895号、欧州特許出願第EP0672141号、米国特許出願公開第2010/136030号、同第2014/377284号、同第2015/190506号、及び同第2015/132288号(クローン20E5及び12H3を含む)、ならびに米国特許第7,504,101号、同第7,550,140号、同第7,622,444号、同第7,696,175号、同第7,960,515号、同第7,961,515号、同第8,133,983号、同第9,006,399号、及び同第9,163,085号に記載されるOX40アゴニストから選択され、その各々の開示は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、構造I-A(C末端Fc抗体断片融合タンパク質)もしくは構造I-B(N末端Fc抗体断片融合タンパク質)に示されるOX40アゴニスト融合タンパク質、またはそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、もしくはバイオシミラーである。構造I-A及びI-Bの特性は、上記及び米国特許第9,359,420号、同第9,340,599号、同第8,921,519号、及び同第8,450,460号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。図18に示される構造I-Aのポリペプチドドメインのアミノ酸配列は、表9に見出される。Fcドメインは、好ましくは、完全な定常ドメイン(配列番号62のアミノ酸17~230)、完全なヒンジドメイン(配列番号62のアミノ酸1~16)、またはヒンジドメインの一部(例えば、配列番号62のアミノ酸4~16)を含む。C末端Fc抗体を結合するための好ましいリンカーは、追加のポリペプチドの融合に好適なリンカーを含む、配列番号63~配列番号72に示される実施形態から選択され得る。同様に、図18に示される構造I-Bのポリペプチドドメインのアミノ酸配列は、表9に見出される。Fc抗体断片が構造I-BにあるようなTNRFSF融合タンパク質のN末端に融合される場合、Fcモジュールの配列は、好ましくは、配列番号73に示されるものであり、リンカー配列は、好ましくは、配列番号74~配列番号76に示される実施形態から選択される。
いくつかの複合体実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、タボリキシズマブの可変重鎖及び可変軽鎖、11D4の可変重鎖及び可変軽鎖、18D8の可変重鎖及び可変軽鎖、Hu119-122の可変重鎖及び可変軽鎖、Hu106-222の可変重鎖及び可変軽鎖、表17に記載の可変重鎖及び可変軽鎖から選択される可変重鎖及び可変軽鎖、前述の可変重鎖及び可変軽鎖の任意の組み合わせ、ならびにそれらの断片、誘導体、複合体、バリアント、及びバイオシミラーからなる群から選択される1つ以上のOX40結合ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、OX40L配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、配列番号133による配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、可溶性OX40L配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、配列番号134による配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、配列番号135による配列を含む1つ以上のOX40結合ドメインを含む。
いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号89及び配列番号90に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインは、リンカーによって結合されている。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号99及び配列番号100に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインは、リンカーによって結合されている。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号109及び配列番号110に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインは、リンカーによって結合されている。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号127及び配列番号128に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインは、リンカーによって結合されている。いくつかの実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、それぞれ、配列番号125及び配列番号126に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインは、リンカーによって結合されている。いくつか実施形態では、構造I-AまたはI-BによるOX40アゴニスト融合タンパク質は、各々が、表17に示されるV配列及びV配列と少なくとも95%同一であるV配列及びV配列を含むscFvドメインである1つ以上のOX40結合ドメインを含み、Vドメイン及びVドメインは、リンカーによって結合されている。

いくつか実施形態では、OX40アゴニストは、(i)第1の可溶性OX40結合ドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性OX40結合ドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性OX40結合ドメインを含むOX40アゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、N末端及び/またはC末端に追加のドメインをさらに含み、追加のドメインは、FabまたはFc断片ドメインである。いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、(i)第1の可溶性OX40結合ドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性OX40結合ドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性OX40結合ドメインを含むOX40アゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、N末端及び/またはC末端に追加のドメインをさらに含み、追加のドメインは、FabまたはFc断片ドメインであり、可溶性OX40ドメインは各々、茎領域(三量体化に寄与し、細胞膜まである特定の距離を提供するが、OX40結合ドメインの一部分ではない)を欠き、第1及び第2のペプチドリンカーは独立して、3~8アミノ酸長を有する。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、(i)第1の可溶性腫瘍壊死因子(TNF)スーパーファミリーサイトカインドメイン、(ii)第1のペプチドリンカー、(iii)第2の可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメイン、(iv)第2のペプチドリンカー、及び(v)第3の可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメインを含むOX40アゴニスト一本鎖融合ポリペプチドであり、可溶性TNFスーパーファミリーサイトカインドメインは各々、茎領域を欠き、第1及び第2のペプチドリンカーは独立して、3~8アミノ酸長であり、TNFスーパーファミリーサイトカインドメインは、OX40結合ドメインである。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、MEDI6383である。MEDI6383は、OX40アゴニスト融合タンパク質であり、米国特許第6,312,700号に記載されているように調製することができ、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつか実施形態では、OX40アゴニストは、前述のVドメインのうちのいずれかに連結された前述のVドメインのうちのいずれかを含むOX40アゴニストscFv抗体である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、Creative Biolabs,Inc.,Shirley,NY,USAから市販されているCreative Biolabs OX40アゴニストモノクローナル抗体MOM-18455である。
いくつかの実施形態では、OX40アゴニストは、BioLegend,Inc.,San Diego,CA,USAから市販されているOX40アゴニスト抗体クローンBer-ACT35である。
C.任意選択の細胞生存率分析
任意選択で、細胞生存率アッセイは、当該技術分野で既知の標準のアッセイを使用して、プライミングによる第1の拡張(初期バルク拡張と称されることもある)後に行われ得る。したがって、ある特定の実施形態では、方法は、プライミングによる第1の拡張後に細胞生存率アッセイを行うことを含む。例えば、死細胞を選択的に標識し、生存率の評価を可能にするトリパンブルー排除アッセイが、バルクTILの試料上で行われ得る。生存率の試験に使用する他のアッセイには、アラマーブルーアッセイ及びMTTアッセイが含まれるが、これらに限定されない。
1.細胞計数、生存率、フローサイトメトリー
いくつかの実施形態では、細胞数及び/または生存率が測定される。CD3、CD4、CD8、及びCD56などであるが、これらに限定されないマーカー、ならびに本明細書に開示または記載される任意の他のマーカーの発現は、FACSCanto(商標)フローサイトメーター(BD Biosciences)を使用して、例えば、BD Bio-sciences(BD Biosciences,San Jose,CA)から市販されているものであるが、これに限定されない抗体を用いたフローサイトメトリーによって測定され得る。細胞は、使い捨てのcチップ血球計数器(VWR,Batavia,IL)を使用して手動で計数することができ、生存率は、トリパンブルー染色を含むが、これに限定されない、当該技術分野で知られている任意の方法を使用して評価することができる。細胞生存率は、米国特許出願公開第2018/0282694号(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に基づいてアッセイされ得る。細胞生存率は、米国特許公開第2018/0280436号または国際特許公開第WO/2018/081473号(いずれもあらゆる目的のためにそれらの全体が本明細書に組み込まれる)に基づいてアッセイすることもできる。
いくつかの事例では、バルクTIL集団は、以下で考察されるプロトコルを使用して直ちに凍結保存され得る。あるいは、以下で論じられるように、バルクTIL集団がREPに供されて、凍結保存され得る。同様に、遺伝子修飾TILが療法に使用される場合、バルクまたはREP TIL集団が好適な治療のために遺伝子修飾に供され得る。
2.細胞培養
いくつかの実施形態では、上記で論じられるもの、ならびに図1及び8、特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dに例示されるものを含む、TILを拡張するための方法は、約5,000mL~約25,000mLの細胞培地、約5,000mL~約10,000mLの細胞培地、または約5,800mL~約8,700mLの細胞培地を使用することを含み得る。いくつかの実施形態では、培地は、無血清培地である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張における培地は、無血清である。いくつかの実施形態では、第2の拡張における培地は、無血清である。いくつかの実施形態では、プライミングによる第1の拡張及び第2の拡張(急速な第2の拡張とも称される)における培地は、両方とも無血清である。いくつかの実施形態では、TILの数を拡張することは、わずか1種類の細胞培養培地を使用する。任意の好適な細胞培養培地、例えば、AIM-V細胞培地(L-グルタミン、50μMの硫酸ストレプトマイシン、及び10μMの硫酸ゲンタマイシン)細胞培養培地(Invitrogen,Carlsbad CA)が使用され得る。これに関して、本発明の方法は、TILの数を拡張するために必要な培地の量及び培地の種類の数を有利に減少させる。いくつかの実施形態では、TILの数を拡張することは、3日または4日に1回以下の頻度で細胞にフィードすることを含み得る。ガス透過性容器内で細胞の数を拡張することは、細胞を拡張するために必要なフィード頻度を減少させることによって、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化する。
いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培養培地は、濾過されていない。濾過されていない細胞培地の使用は、細胞の数を拡張するために必要な手順を簡素化することができる。いくつかの実施形態では、第1及び/または第2のガス透過性容器内の細胞培地は、ベータ-メルカプトエタノール(BME)を欠いている。
いくつかの実施形態では、方法の期間は、哺乳動物から腫瘍組織試料を取得することと、プライミングによる第1の拡張として約1~8日間、例えば約7日間、またはプライミングによる第1の拡張として約8日間にわたってIL-2、1X抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第1のガス透過性容器内で腫瘍組織試料を培養することと、TILを第2のガス透過性容器に移し、IL-2、2X抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第2のガス透過性容器内でTILの数を約7~9日間、例えば約7日間、約8日間、または約9日間にわたって拡張することと、を含む。
いくつかの実施形態では、方法の期間は、哺乳動物から腫瘍組織試料を取得することと、プライミングによる第1の拡張として約1~8日間、例えば約7日間にわたってIL-2、1X抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第1のガス透過性容器内で腫瘍組織試料を培養することと、TILを第2のガス透過性容器に移し、IL-2、2X抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を含有する第2のガス透過性容器内でTILの数を約7~14日間、または約7~9日間、例えば約7日間、約8日間、約9日間、約10日間約11日間にわたって拡張することと、を含む。
いくつかの実施形態では、方法の期間は、哺乳動物から腫瘍組織試料を取得することと、プライミングによる第1の拡張として約1~7日間、例えば、約7日間にわたってIL-2、1×抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を収容する第1のガス透過性容器内で腫瘍組織試料を培養することと、TILを第2のガス透過性容器に移し、IL-2、2×抗原提示フィーダー細胞、及びOKT-3を含む細胞培地を収容する第2のガス透過性容器内でTILの数を約7~11日間、例えば約7日間、約8日間、約9日間、約10日間、または約11日間にわたって拡張することと、を含む。
いくつかの実施形態では、TILは、ガス透過性容器内で拡張される。ガス透過性容器は、米国特許出願公開第2005/0106717A1号に記載されるものを含む、当該技術分野で知られている方法、組成物、及び装置を使用して、PBMCを使用してTILを拡張するために使用されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TILは、ガス透過性バッグ内で拡張される。いくつかの実施形態では、TILは、Xuri Cell Expansion System W25(GE Healthcare)などのガス透過性バッグ内のTILを拡張する細胞拡張システムを使用して拡張される。いくつかの実施形態では、TILは、Xuri Cell Expansion System W5(GE Healthcare)としても知られるWAVE Bioreactor Systemなどのガス透過性バッグ内でTILを拡張する細胞拡張システムを使用して拡張される。いくつかの実施形態では、細胞拡張システムは、約100mL、約200mL、約300mL、約400mL、約500mL、約600mL、約700mL、約800mL、約900mL、約1L、約2L、約3L、約4L、約5L、約6L、約7L、約8L、約9L、及び約10Lからなる群から選択される体積を有するガス透過性細胞バッグを含む。
いくつかの実施形態では、TILは、G-REXフラスコ(Wilson Wolf Manufacturingから市販されている)内で拡張され得る。かかる実施形態は、細胞集団が約5×10細胞/cmから10×10~30×10細胞/cmまで拡張するのを可能にする。いくつかの実施形態では、これは、フィードなしである。いくつかの実施形態では、これは、培地がG-REXフラスコ内の約10cmの高さに存在する限り、フィードなしである。いくつかの実施形態では、これは、フィードなしであるが、1つ以上のサイトカインの追加を伴う。いくつかの実施形態では、サイトカインを培地と混合する必要なしに、サイトカインがボーラスとして追加され得る。かかる容器、装置、及び方法は、当該技術分野で知られており、TILを拡張するために使用されており、米国特許出願公開第2014/0377739A1号、国際公開第WO2014/210036A1号、米国特許出願公開第2013/0115617A1号、国際公開第WO2013/188427A1、米国特許出願公開第2011/0136228A1、米国特許第8,809,050B2号、国際公開第WO2011/072088A2号、米国特許出願公開第2016/0208216A1号、米国特許出願公開第2012/0244133A1号、国際公開第WO2012/129201A1号、米国特許出願公開第2013/0102075A1号、米国特許第8,956,860B2号、国際公開第WO2013/173835A1号、米国特許出願公開第2015/0175966A1号に記載されるものを含み、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。かかるプロセスはまた、Jin et al.,J.Immunotherapy,2012,35:283-292に記載されている。
D.TILにおける遺伝子の任意選択のノックダウンまたはノックアウト
いくつかの実施形態では、本発明の拡張TILは、タンパク質発現を一過的に変化させるために、各々本明細書で提供されるように、閉鎖滅菌製造プロセス中を含む、拡張ステップ前、拡張ステップ中、または拡張ステップ後にさらに操作される。いくつかの実施形態では、一過的に変化したタンパク質発現は、一過性の遺伝子編集によるものである。いくつかの実施形態では、本発明の拡張TILは、TILにおけるタンパク質発現を一過的に変化させることができる転写因子(TF)及び/または他の分子で処理される。いくつかの実施形態では、タンパク質発現を一過的に変化させることができるTF及び/または他の分子は、腫瘍抗原の発現の変化及び/またはTIL集団における腫瘍抗原特異的T細胞の数の変化を提供する。
ある特定の実施形態では、方法は、TIL集団を遺伝子編集することを含む。ある特定の実施形態では、この方法は、第1のTIL集団、第2のTIL集団、及び/または第3のTIL集団を遺伝子編集することを含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、1つ以上のタンパク質の発現の促進または1つ以上のタンパク質の発現の阻害、ならびに一組のタンパク質の促進及び別の組のタンパク質の阻害の両方の組み合わせの同時発生のために、リボ核酸(RNA)挿入、例えば、メッセンジャーRNA(mRNA)または低分子(もしくは短)干渉RNA(siRNA)のTIL集団への挿入などのヌクレオチド挿入を介する遺伝子編集を含む。
いくつかの実施形態では、本発明の拡張TILは、タンパク質発現の一過性の変化を受ける。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8(特に、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に示されるステップAから取得されたTIL集団を含む、第1の拡張前のバルクTIL集団において起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8(例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に示される、例えば、ステップBで拡張されたTIL集団におけるものを含む、第1の拡張中に起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8に示されるように、ステップBから取得され、ステップCに含まれるTIL集団である、例えば、第1の拡張と第2の拡張との間の移行中のTIL集団(例えば、本明細書に記載の第2のTIL集団)を含む、第1の拡張後に起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8に示されるように、例えば、ステップCから取得され、ステップDでのその拡張前のTIL集団を含む、第2の拡張前のバルクTIL集団において起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8に示されるように、例えば、ステップDで拡張されたTIL集団(例えば、第3のTIL集団)を含む、第2の拡張中に起こる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、図8に示されるように、例えば、ステップDでの拡張から取得されたTIL集団を含む、第2の拡張後に起こる。
いくつかの実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、エレクトロポレーションステップを含む。エレクトロポレーション法は、当該技術分野で知られており、例えば、Tsong,Biophys.J.1991,60,297-306及び米国特許出願公開第2014/0227237A1号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、リン酸カルシウムトランスフェクションステップを含む。リン酸カルシウムトランスフェクション法(リン酸カルシウムDNA沈殿、細胞表面コーティング、及びエンドサイトーシス)は、当該技術分野で知られており、Graham and van der Eb,Virology 1973,52,456-467、Wigler,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.1979,76,1373-1376、及びChen and Okayarea,Mol.Cell.Biol.1987,7,2745-2752、ならびに米国特許第5,593,875号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、リポソームトランスフェクションステップを含む。リポソームトランスフェクション法、例えば、カチオン性脂質N-[1-(2,3-ジオレイルオキシ)プロピル]-n,n,n-トリメチルアンモニウムクロリド(DOTMA)及びジオレオイルホスホチジルエタノールアミン(DOPE)の1:1(w/w)リポソーム製剤を用いる方法は、当該技術分野において既知であり、Rose,et al.,Biotechniques 1991,10,520-525及びFelgner,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1987,84,7413-7417、ならびに米国特許第5,279,833号、同第5,908,635号、同第6,056,938号、同第6,110,490号、同第6,534,484号、及び同第7,687,070号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団におけるタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、米国特許第5,766,902号、同第6,025,337号、同第6,410,517号、同第6,475,994号、及び同第7,189,705号に記載されている方法を使用するトランスフェクションステップを含み、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、幹細胞メモリーT細胞(TSCM)の増加をもたらす。TSCMは、抗原を経験したセントラルメモリーT細胞の初期前駆細胞である。TSCMは、一般に、幹細胞を定義する長期生存、自己再生、及び多分化能を示し、一般に、効果的なTIL製品の生成に望ましいものである。TSCMは、養子細胞移植のマウスモデルにおいて他のT細胞サブセットと比較して増強された抗腫瘍活性を示している。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、高い割合のTSCMを含む組成を有するTIL集団をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TSCMパーセンテージの少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%の増加をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIL集団中のTSCMの少なくとも1倍、2倍、3倍、4倍、5倍、または10倍の増加をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%のTSCMを有するTIL集団をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、少なくとも5%、少なくとも10%、少なくとも10%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、または少なくとも95%のTSCMを有する治療的TIL集団をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、抗原を経験したT細胞の幼若化をもたらす。いくつかの実施形態では、幼若化には、例えば、増加した増殖、増加したT細胞活性化、及び/または増加した抗原認識が含まれる。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、腫瘍由来のTCRレパートリーを保存するために、T細胞の大部分における発現を変化させる。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、腫瘍由来のTCRレパートリーを変化させない。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、腫瘍由来のTCRレパートリーを維持する。
いくつかの実施形態では、タンパク質の一過性の変化は、特定の遺伝子の発現の変化をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1(PDCD1またはCC279とも称される)、TGFBR2、CCR4/5、CBLB(CBL-B)、CISH、CCR(キメラ共刺激受容体)、IL-2、IL-12、IL-15、IL-21、NOTCH 1/2 ICD、CTLA-4、TIM3、LAG3、TIGIT、TET2、TGFβ、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR1、CXCR2、CSCR3、CCL2(MCP-1)、CCL3(MIP-1α)、CCL4(MIP1-β)、CCL5(RANTES)、CXCL1/CXCL8、CCL22、CCL17、CXCL1/CXCL8、VHL、CD44、PIK3CD、SOCS1、胸腺細胞選択関連高移動度群(HMG)ボックス(TOX)、アンキリンリピートドメイン11(ANKRD11)、BCL6コリプレッサー(BCOR)、及び/またはcAMPタンパク質キナーゼA(PKA)を含むが、これらに限定されない遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、TGFBR2、CCR4/5、CTLA-4、CBLB(CBL-B)、CISH、CCR(キメラ共刺激受容体)、IL-2、IL-12、IL-15、IL-21、NOTCH 1/2 ICD、TIM3、LAG3、TIGIT、TET2、TGFβ、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR1、CXCR2、CSCR3、CCL2(MCP-1)、CCL3(MIP-1α)、CCL4(MIP1-β)、CCL5(RANTES)、CXCL1/CXCL8、CCL22、CCL17、CXCL1/CXCL8、VHL、CD44、PIK3CD、SOCS1、胸腺細胞選択関連高移動度群(HMG)ボックス(TOX)、アンキリンリピートドメイン11(ANKRD11)、BCL6コリプレッサー(BCOR)、及び/またはcAMPタンパク質キナーゼA(PKA)からなる群から選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TGFBR2を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR4/5を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CTLA-4を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CBLBを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性変化は、CISHを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR(キメラ共刺激受容体)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-2を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-12を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-15を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-21を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、NOTCH1/2 ICDを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TET2を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TGFβを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR2を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR4を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR5を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CXCR1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CXCR2を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CSCR3を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL2(MCP-1)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL3(MIP-1α)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL4(MIP1-β)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL5(RANTES)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CXCL1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CXCL8を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL22を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCL17を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性変化は、VHLを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD44を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PIK3CDを標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、SOCS1を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性変化は、胸腺細胞選択関連高移動度群(HMG)ボックス(TOX)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、アンキリンリピートドメイン11(ANKRD11)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性変化は、BCL6コリプレッサー(BCOR)を標的とする。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、cAMPタンパク質キナーゼA(PKA)を標的とする。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、ケモカイン受容体の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、一過性タンパク質発現によって過剰発現されるケモカイン受容体は、CCL2(MCP-1)、CCL3(MIP-1α)、CCL4(MIP1-β)、CCL5(RANTES)、CXCL1、CXCL8、CCL22、及び/またはCCL17を含むが、これらに限定されないリガンドを有する受容体を含む。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、CTLA-4、CBLB、CISH、TIM-3、LAG-3、TIGIT、TET2、TGFβR2、及び/またはTGFβの発現の低下及び/または減少をもたらす(例えば、TGFβ経路の遮断をもたらすことを含む)。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CBLB(CBL-B)の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CISHの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM-3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG-3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIGITの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TET2の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TGFβR2の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TGFβの発現の低下及び/または減少をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、例えば、腫瘍部位へのTILの輸送または移動を改善するために、ケモカイン受容体の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR(キメラ共刺激受容体)の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CCR1、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR1、CXCR2、及び/またはCSCR3からなる群から選択されるケモカイン受容体の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、インターロイキンの発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、IL-2、IL-12、IL-15、及び/またはIL-21からなる群から選択されるインターロイキンの発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、NOTCH1/2 ICDの発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、VHLの発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CD44の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PIK3CDの発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、SOCS1の発現の増加及び/または過剰発現をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、cAMPタンパク質キナーゼA(PKA)の発現の減少及び/または低減をもたらす。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される分子の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される2つの分子の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、ならびにLAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される1つの分子の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、CTLA-4、LAG-3、CISH、CBLB、TIM3、TIGIT、TET2及びそれらの組み合わせの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、ならびにCTLA-4、LAG3、CISH、CBLB、TIM3、TIGIT、TET2、及びそれらの組み合わせのうちの1つの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びCTLA-4の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びLAG3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びCISHの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びCBLBの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びTIM3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びTIGITの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1及びTET2の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CTLA-4及びLAG3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CTLA-4及びCISHの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CTLA-4及びCBLBの発現の減少及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CTLA-4及びTIM3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CTLA-4及びTIGITの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CTLA-4及びTET2の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3及びCISHの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3及びCBLBの発現の減少及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3及びTIM3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3及びTIGITの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、LAG3及びTET2の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CISH及びCBLBの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CISH及びTIM3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CISH及びTIGITの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CISH及びTET2の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CBLB及びTIM3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CBLB及びTIGITの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、CBLB及びTET2の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びPD-1の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びLAG3の発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びCISHの発現の低下及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びCBLBの発現の減少及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びTIGITの発現の減少及び/または減少をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TIM3及びTET2の発現の低下及び/または減少をもたらす。
いくつかの実施形態では、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される接着分子は、ガンマレトロウイルスまたはレンチウイルス法によって、第1のTIL集団、第2のTIL集団、または採取されたTIL集団に挿入される(例えば、接着分子の発現が増加する)。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される分子の発現の低下及び/または減少、ならびにCCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、及びそれらの組み合わせの発現の増加及び/または増強をもたらす。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、PD-1、CTLA-4、LAG3、TIM3、CISH、CBLB、TIGIT、TET2、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される分子の発現の減少及び/または低減、ならびにCCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、及びそれらの組み合わせの発現の増加及び/または増強をもたらす。
いくつかの実施形態では、発現が約5%、約10%、約10%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約90%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約95%減少する。いくつかの実施形態では、少なくとも約99%の発現の低減がある。
いくつかの実施形態では、発現が約5%、約10%、約10%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%、約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%、約90%、または約95%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約90%増加する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約95%増加する。いくつかの実施形態では、少なくとも約99%の発現の増加がある。
いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性の変化は、TILにおけるタンパク質発現を一過的に変化させることができる転写因子(TF)及び/または他の分子でのTILの処理によって誘導される。いくつかの実施形態では、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームが、タンパク質発現を一過的に変化させることができる転写因子(TF)及び/または他の分子の細胞内送達のために用いられる。かかる方法は、転写因子を含むタンパク質をT細胞を含む様々な初代ヒト細胞に送達する能力を示す(これらは、米国特許出願公開第2019/0093073 A1号、同第2018/0201889 A1号、及び同第2019/0017072 A1号、ならびにSharei et al.PNAS 2013、及びSharei et al.PLOS ONE 2015、及びGreisbeck et al.J.Immunology vol.195,2015に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)。かかる方法は、TIL集団を、転写因子(TF)及び/または一過性タンパク質発現を誘導することができる他の分子に曝露するために本発明で用いることができ、一過性タンパク質発現を誘導することができる当該TF及び/または他の分子は、腫瘍抗原の発現の増加及び/またはTIL集団における腫瘍抗原特異的T細胞の数の増加をもたらし、それ故に、TIL集団の再プログラミング及び再プログラミングされていないTIL集団と比較して再プログラミングされたTIL集団の治療的有効性の増加をもたらす。いくつかの実施形態では、再プログラミングは、本明細書に記載されるように、TIL開始集団またはTIL前集団(すなわち、再プログラミング前の)集団と比較して、エフェクターT細胞及び/またはセントラルメモリーT細胞の亜集団の増加をもたらす。
いくつかの実施形態では、転写因子(TF)には、TCF-1、NOTCH1/2 ICD、及び/またはMYBが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、TCF-1である。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、NOTCH1/2 ICDである。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、MYBである。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、さらなるTIL再プログラミングを誘導するために、市販のKNOCKOUT Serum Replacement(Gibco/ThermoFisher)などの誘導多能性幹細胞培養物(iPSC)とともに投与される。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、さらなるTIL再プログラミングを誘導するために、iPSCカクテルとともに投与される。いくつかの実施形態では、転写因子(TF)は、iPSCカクテルなしで投与される。いくつかの実施形態では、再プログラミングは、TSCMのパーセンテージの増加をもたらす。いくつかの実施形態では、再プログラミングは、TSCMのパーセンテージの約5%、約10%、約10%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%のTSCMの増加をもたらす。
いくつかの実施形態では、上記のようにタンパク質発現を一過的に変化させる方法は、TILの集団を遺伝子修飾する方法と組み合わせられてもよく、1つ以上のタンパク質の産生のための遺伝子の安定した組み込みステップを含む。ある特定の実施形態では、この方法は、TIL集団を遺伝子修飾するステップを含む。ある特定の実施形態では、この方法は、第1のTIL集団、第2のTIL集団、及び/または第3のTIL集団を遺伝子修飾することを含む。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、レトロウイルス形質導入ステップを含む。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、レンチウイルス形質導入ステップを含む。レンチウイルス形質導入系は、当該技術分野で知られており、例えば、Levine,et al.,Proc.Nat‘l Acad.Sci.2006,103,17372-77、Zufferey,et al.,Nat.Biotechnol.1997,15,871-75、Dull,et al.,J.Virology 1998,72,8463-71、及び米国特許第6,627,442号(それらの各々の開示は、参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、ガンマレトロウイルス形質導入ステップを含む。ガンマレトロウイルス形質導入系は、当該技術分野で知られており、例えば、Cepko and Pear,Cur.Prot.Mol.Biol.1996,9.9.1-9.9.16に記載されており、この開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、トランスポゾン媒介遺伝子導入ステップを含む。トランスポゾン媒介遺伝子導入系は、当該技術分野で知られており、トランスポザーゼが、DNA発現ベクターとしてまたは発現可能なRNAもしくはタンパク質として提供される系を含み、これにより、トランスポザーゼ、例えば、mRNA(例えば、キャップ及びポリA尾部を含むmRNA)として提供されるトランスポザーゼの長期発現がトランスジェニック細胞で起こらないようになる。SB10、SB11、及びSB100xなどのサケ科型Tel様トランスポザーゼ(SBまたはSleeping Beautyトランスポザーゼ)を含む好適なトランスポゾン媒介遺伝子導入系、ならびに増加した酵素活性を有する操作された酵素は、例えば、Hackett,et al.,Mol.Therapy 2010,18,674-83及び米国特許第6,489,458号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、TIL中のタンパク質発現の一過性変化は、短干渉RNAまたはサイレンシングRNAとして知られることもある、低分子干渉RNA(siRNA)は、一般に19~25塩基対長の二本鎖RNA分子である。siRNAは、RNA干渉(RNAi)において使用され、相補的なヌクレオチド配列を有する特定の遺伝子の発現に干渉する。いくつかの実施形態では、タンパク質発現の一過性変化は、発現の低下である。いくつかの実施形態では、TILにおけるタンパク質発現の一過性の変化は、高パーセンテージの2’-OH置換(典型的にはフッ素または-OCH)を有する化学的に合成された非対称siRNA二重鎖である自己送達RNA干渉(sdRNA)によって誘導され、これはテトラエチレングリコール(TEG)リンカーを使用してその3’末端でコレステロールに複合された、20ヌクレオチドアンチセンス(ガイド)鎖及び13~15塩基センス(パッセンジャー)鎖を含む。短干渉RNAまたはサイレンシングRNAとして知られることもある、低分子干渉RNA(siRNA)は、一般に19~25塩基対長の二本鎖RNA分子である。siRNAは、RNA干渉(RNAi)において使用され、相補的なヌクレオチド配列を有する特定の遺伝子の発現に干渉する。sdRNAは、共有結合及び疎水的に修飾されたRNAi化合物であり、細胞に侵入するために送達媒体を必要としない。sdRNAは、一般に、最小限の二本鎖領域を有する非対称の化学修飾された核酸分子である。sdRNA分子は、典型的に一本鎖領域及び二本鎖領域を含み、分子の一本鎖領域及び二本鎖領域の両方に様々な化学修飾を含み得る。加えて、sdRNA分子は、本明細書に記載されているように、従来の高度なステロール型分子などの疎水性複合体に結合することができる。sdRNA及びかかるsdRNAを作製するための関連方法は、例えば、米国特許出願公開第2016/0304873 A1号、同第2019/0211337 A1号、同第2019/0048341 A1号、及び同第2019/0048341 A1号、ならびに米国特許第10,633,654号及び同第10,913,948 B2号(これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)にも広く記載されている。sdRNA構造、化学、標的化位置、配列の好み等を最適化するために、sdRNA力価予測用のアルゴリズムが開発及び利用されている。これらの分析に基づいて、機能的なsdRNA配列は、概して、1μMの濃度で70%を超える発現の低減を有すると定義されており、確率は40%を超える。
二本鎖DNA(dsRNA)は、一般に、RNAの相補鎖の対、一般にセンス(パッセンジャー)鎖及びアンチセンス(ガイド)鎖を含む任意の分子を定義するために使用することができ、一本鎖オーバーハング領域を含み得る。siRNAとは対照的に、dsRNAという用語は、一般に、ダイサーを含む切断酵素系の作用によりより大きいdsRNA分子から放出されるsiRNA分子の配列を含む前駆体分子を指す。
いくつかの実施形態では、方法は、CCRを発現するように修飾されたTILを含むTIL集団におけるタンパク質発現の一過性変化を含み、例えば、テトラエチレングリコール(TEG)リンカーを使用して20ヌクレオチドアンチセンス(ガイド)鎖及び3’末端でコレステロールにコンジュゲートされた13~15塩基センス(パッセンジャー)鎖を含む、高いパーセンテージの2’-OH置換(典型的にはフッ素または-OCH)を有する化学的に合成された非対称siRNA二本鎖である、自己送達RNA干渉(sdRNA)の使用を含む。siRNA及びsdRNAを使用する方法は、Khvorova and Watts,Nat.Biotechnol.2017,35,238-248、Byrne,et al.,J.Ocul.Pharmacol.Ther.2013,29,855-864、及びLigtenberg,et al.,Mol.Therapy,2018,26,1482-93(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている。いくつかの実施形態では、siRNAの送達は、エレクトロポレーションまたは細胞膜破壊(スクイーズまたはSQZ法など)を使用して達成される。いくつかの実施形態では、TIL集団へのsiRNAまたはsdRNAの送達は、エレクトロポレーション、SQZ、または他の方法を使用せず、代わりに、TIL集団が培地中1μM/10,000TILの濃度でsiRNAまたはsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成される。ある特定の実施形態では、方法は、TIL集団を培地中1μM/10,000TILの濃度のsiRNAまたはsdRNAに1~3日間曝露することを含む、TIL集団への送達またはsiRNAまたはsdRNAを含む。いくつかの実施形態では、TIL集団へのsiRNAまたはsdRNAの送達は、TIL集団が培地中10μM/10,000TILの濃度でsiRNAまたはsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成される。いくつかの実施形態では、TIL集団へのsdRNAの送達は、TIL集団が培地中50μM/10,000TILの濃度でsiRNAまたはsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成される。いくつかの実施形態では、TIL集団へのsiRNAまたはsdRNAの送達は、TIL集団が培地中0.1μM/10,000TIL~50μM/10,000TILの濃度でsiRNAまたはsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成される。いくつかの実施形態では、TIL集団へのsiRNAまたはsdRNAの送達は、TIL集団が培地中0.1μM/10,000TIL~50μM/10,000TILの濃度でsiRNAまたはsdRNAに曝露される1~3日の期間を使用して達成され、siRNAまたはsdRNAへの曝露は、新鮮なsiRNAまたはsdRNAを培地に追加することによって、2回、3回、4回、または5回行われる。他の好適なプロセスは、例えば、米国特許出願公開第2011/0039914A1号、同第2013/0131141A1号、及び同第2013/0131142A1号、ならびに米国特許第9,080,171号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、製造中にTIL集団に挿入される。いくつかの実施形態では、sdRNAは、NOTCH1/2 ICD、PD-1、CTLA-4 TIM-3、LAG-3、TIGIT、TGFβ、TGFBR2、cAMPプロテインキナーゼA(PKA)、BAFF BR3、CISH、及び/またはCBLBに干渉するRNAをコードする。いくつかの実施形態では、発現の減少は、例えば、フローサイトメトリー及び/またはqPCRによって評価される、遺伝子サイレンシングのパーセンテージに基づいて決定される。いくつかの実施形態では、発現が約5%、約10%、約10%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%、約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%、約90%、または約95%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約80%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約85%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約90%減少する。いくつかの実施形態では、発現が少なくとも約95%減少する。いくつかの実施形態では、少なくとも約99%の発現の低減がある。
siRNAの化学修飾に基づく自己送達可能なRNAi技術を本発明の方法とともに用いて、本明細書に記載されるように、sdRNAをTILに首尾よく送達することができる。非対称siRNA構造及び疎水性リガンドとの骨格修飾の組み合わせ(例えば、Ligtenberg,et al.Mol.Therapy,2018,26,1482-93及び米国特許出願公開第2016/0304873 A1(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)を参照)は、sdRNAのヌクレアーゼ安定性を利用して、培養培地に単純に添加することによって、追加の製剤及び方法なしに、sdRNAが培養された哺乳類細胞に浸透することを可能にする。この安定性により、単に培地中のsdRNAの活性濃度を維持することによって、標的遺伝子活性の一定レベルのRNAiを介した減少を支援することができる。理論に拘束されないが、sdRNAの骨格安定化は、非分裂細胞で数か月間続く可能性のある遺伝子発現効果の延長された低減を提供する。
いくつかの実施形態では、TILの95%を超えるトランスフェクション効率及び様々な特定のsiRNAまたはsdRNAによる標的の発現の減少が起こる。いくつかの実施形態では、いくつかの未修飾リボース残基を含むsiRNAまたはsdRNAは、RNAi効果の効力及び/または寿命を増加させるために、完全に修飾された配列で置き換えられた。いくつかの実施形態では、発現効果の減少は、12時間、24時間、36時間、48時間、5日間、6日間、7日間、または8日間以上維持される。いくつかの実施形態では、発現効果の減少は、TILのsiRNAまたはsdRNA処理後10日以上で低下する。いくつかの実施形態では、標的発現の発現の70%を超える減少が維持される。いくつかの実施形態では、標的発現の発現の70%を超える減少が維持されるTIL。いくつかの実施形態では、PD-1/PD-L1経路における発現の減少により、TILがより強力なインビボ効果を示すことが可能になり、これは、いくつかの実施形態では、PD-1/PD-L1経路の抑制効果の回避に起因する。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAによるPD-1の発現の低減は、TIL増殖の増加をもたらす。
いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の70%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の75%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の80%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の85%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の90%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の95%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、標的遺伝子の発現の99%の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約0.25μM~約4μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約0.25μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約0.5μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約0.75μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約1.0μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約1.25μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約1.5μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約1.75μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約2.0μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約2.25μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約2.5μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約2.75μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約3.0μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約3.25μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約3.5μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約3.75μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の減少を示す。いくつかの実施形態では、本発明で使用されるsdRNA配列は、約4.0μMの濃度で送達された場合、標的遺伝子の発現の低減を示す。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチド剤は、治療剤の安定性及び/または有効性を増加させ、かつ治療される細胞または組織へのオリゴヌクレオチドの効率的な送達をもたらすための1つ以上の修飾を含む。かかる修飾には、2’-O-メチル修飾、2’-O-フルロ修飾、ジホスホロチオエート修飾、2’F修飾ヌクレオチド、2’-O-メチル修飾、及び/または2’デオキシヌクレオチドが含まれ得る。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、例えば、ステロール、コレステロール、ビタミンD、ナフチル、イソブチル、ベンジル、インドール、トリプトファン、及び/またはフェニルを含む1つ以上の疎水性修飾を含むように修飾される。いくつかの実施形態では、化学修飾ヌクレオチドは、ホスホロチオエート、2’-O-メチル、2’デオキシ、疎水性修飾及びホスホロチオエートの組み合わせである。いくつかの実施形態では、糖が修飾され得、修飾された糖には、D-リボース、2’-O-アルキル(2’-O-メチル及び2’-0-エチルを含む)、すなわち、2’-アルコキシ、2’-アミノ、2’-S-アルキル、2’-ハロ(2’-フルオロを含む)、T-メトキシエトキシ、2’-アリルオキシ(-OCHCH=CH)、2’-プロパルギル、2’-プロピル、エチニル、エテニル、プロペニル、及びシアノなどが含まれ得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、糖部分は、ヘキソースであり得、Augustyns,et al.,Nucl.Acids.Res.1992,18,4711(この開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているようにオリゴヌクレオチドに組み込まれ得る。
いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、その全長にわたって二本鎖であり、すなわち、分子のいずれかの末端にも一本鎖配列が突出しておらず、すなわち、平滑末端である。いくつかの実施形態では、個々の核酸分子は、異なる長さであり得る。言い換えれば、本発明の二本鎖siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、その全長にわたって二本鎖ではない。例えば、2つの別個の核酸分子が使用される場合、アンチセンス配列を含むそれらの分子の一方、例えば、第1の分子は、それにハイブリダイズする(分子の一部分を一本鎖のままにする)第2の分子よりも長い可能性がある。いくつかの実施形態では、単一の核酸分子が使用される場合、いずれかの末端の分子の一部分は、一本鎖のままであり得る。
いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、ミスマッチ及び/またはループもしくはバルジを含むが、オリゴヌクレオチドの長さの少なくとも約70%にわたって二本鎖である。いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの長さの少なくとも約80%にわたって二本鎖である。他の実施形態では、本発明の二本鎖siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの長さの少なくとも約90%~95%にわたって二本鎖である。いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの長さの少なくとも約96%~98%にわたって二本鎖である。いくつかの実施形態では、本発明の二本鎖siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、少なくともまたは最大1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、または15個のミスマッチを含む。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、例えば、米国特許第5,849,902号(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように3’または5’結合を修飾することによって、ヌクレアーゼから実質的に保護され得る。例えば、オリゴヌクレオチドは、「ブロッキング基」を含めることによって耐性にすることができる。本明細書で使用される場合、「ブロッキング基」という用語は、合成のための保護基またはカップリング基のいずれかとして(例えば、FITC、プロピル(CH-CH-CH)、グリコール(-0-CH-CH-O-)ホスフェート(PO 2’’)、リン酸水素、もしくはホスホロアミダイト)、オリゴヌクレオチドまたはヌクレオモノマーに結合され得る置換基(例えば、OH基以外)を指す。「ブロッキング基」は、修飾ヌクレオチド及び非ヌクレオチドエキソヌクレアーゼ耐性構造を含む、オリゴヌクレオチドの5’及び3’末端を保護する「末端ブロッキング基」または「エキソヌクレアーゼブロッキング基」も含み得る。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNA内の隣接するポリヌクレオチドの少なくとも一部分は、置換結合、例えば、ホスホロチオエート結合によって結合されている。
いくつかの実施形態では、化学修飾は、siRNAまたはsdRNAの細胞取り込みの少なくとも1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、225、250、275、300、325、350、375、400、425、450、475、または500パーセントの増強をもたらし得る。いくつかの実施形態では、C残基またはU残基の少なくとも一方が疎水性修飾を含む。いくつかの実施形態では、複数のC及びUが疎水性修飾を含む。いくつかの実施形態では、C及びUの少なくとも10%、15%、20%、30%、40%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、または少なくとも95%が疎水性修飾を含み得る。いくつかの実施形態では、C及びUのすべてが疎水性修飾を含有する。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNA分子は、プロトン化可能なアミンの組み込みにより増強されたエンドソーム放出を示す。いくつかの実施形態では、プロトン化可能なアミンは、センス鎖(RISC負荷後に廃棄される分子の一部分)に組み込まれる。いくつかの実施形態では、本発明のsiRNAまたはsdRNA化合物は、二重鎖領域(10~15塩基長の効率的なRISC侵入に必要)及び4~12ヌクレオチド長の一本鎖領域を13ヌクレオチド二重鎖とともに含む非対称化合物を含む。いくつかの実施形態では、6ヌクレオチドの一本鎖領域が用いられる。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAの一本鎖領域は、2~12個のホスホロチオエートヌクレオチド間結合(ホスホロチオエート修飾と称される)を含む。いくつかの実施形態では、6~8個のホスホロチオエートヌクレオチド間結合が用いられる。いくつかの実施形態では、本発明のsiRNAまたはsdRNA化合物は、安定性を提供し、かつRISC侵入と互換性がある固有の化学修飾パターンを含む。
ガイド鎖は、例えば、RISC侵入に干渉することなく安定性を確証する任意の化学修飾によって修飾することもできる。いくつかの実施形態では、ガイド鎖における化学修飾パターンは、2’Fが修飾され、かつ5’末端がリン酸化されたC及びUヌクレオチドの大部分を含む。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAのヌクレオチドの少なくとも30%が修飾されている。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAのヌクレオチドの少なくとも30%、31%、32%、33%、34%、35%、36%、37%、38%、39%、40%、41%、42%、43%、44%、45%、46%、47%、48%、49%、50%、51%、52%、53%、54%、55%、56%、57%、58%、59%、60%、61%、62%、63%、64%、65%、66%、67%、68%、69%、70%、71%、72%、73%、74%、75%、76%、77%、78%、79%、80%、81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、または99%が修飾されている。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAのヌクレオチドの100%が修飾されている。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNA分子は、最小の二本鎖領域を有する。いくつかの実施形態では、二本鎖である分子の領域は、8~15ヌクレオチド長の範囲である。いくつかの実施形態では、二本鎖である分子の領域は、8、9、10、11、12、13、14、または15ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、二本鎖領域は、13ヌクレオチド長である。ガイド鎖とパッセンジャー鎖との間に100%の相補性が存在する場合もあれば、ガイド鎖とパッセンジャー鎖との間に1つ以上の不一致が存在する場合もある。いくつかの実施形態では、二本鎖分子の一端で、分子は、平滑末端であるか、または1ヌクレオチドのオーバーハングを有するかのいずれかである。分子の一本鎖領域は、いくつかの実施形態では、4~12ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、一本鎖領域は、4、5、6、7、8、9、10、11または12ヌクレオチド長であり得る。いくつかの実施形態では、一本鎖領域は、4ヌクレオチド長未満または12ヌクレオチド長超であることもできる。ある特定の実施形態では、一本鎖領域は、6または7ヌクレオチド長である。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNA分子は、増加した安定性を有する。いくつかの事例では、化学修飾されたsiRNAまたはsdRNA分子は、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24時間以上、または24時間超(任意の中間値を含む)の培地中での半減期を有する。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、12時間以上の培地中での半減期を有する。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、効力の増加及び/または毒性の低減のために最適化されている。いくつかの実施形態では、ガイド鎖及び/またはパッセンジャー鎖のヌクレオチド長、及び/またはガイド鎖及び/またはパッセンジャー鎖におけるホスホロチオエート修飾の数が、いくつかの態様では、RNA分子の効力に影響を与え得る一方で、2’-フルオロ(2’F)修飾の2’-0-メチル(2’OMe)修飾での置き換えは、いくつかの態様では、分子の毒性に影響を与え得る。いくつかの実施形態では、分子の2’F含有量の減少は、分子の毒性を低減すると予測される。いくつかの実施形態では、RNA分子におけるホスホロチオエート修飾の数は、細胞への分子の取り込み、例えば、細胞への分子の受動的取り込みの効率に影響を及ぼし得る。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、2’F修飾を有しないが、それにもかかわらず、細胞取り込み及び組織浸透における同等の有効性を特徴とする。
いくつかの実施形態では、ガイド鎖は、およそ18~19ヌクレオチド長であり、およそ2~14個のリン酸修飾を有する。例えば、ガイド鎖は、リン酸修飾された2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14個、または14個超のヌクレオチドを含み得る。ガイド鎖は、RISCの侵入に干渉することなく増加した安定性を付与する1つ以上の修飾を含み得る。ホスホロチオエート修飾ヌクレオチドなどのリン酸修飾ヌクレオチドは、3’末端にあるか、5’末端にあるか、またはガイド鎖全体に広がっている可能性がある。いくつかの実施形態では、ガイド鎖の3’末端10ヌクレオチドは、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のホスホロチオエート修飾ヌクレオチドを含む。ガイド鎖は、分子全体に位置し得る2’F及び/または2’OMe修飾も含み得る。いくつかの実施形態では、ガイド鎖の1位のヌクレオチド(ガイド鎖の最も5’側のヌクレオチド)は、2’OMe修飾及び/またはリン酸化されている。ガイド鎖内のC及びUヌクレオチドは、2’F修飾されていてもよい。例えば、19ntガイド鎖の2~10位(または異なる長さのガイド鎖における対応する位置)のC及びUヌクレオチドは、2’F修飾されていてもよい。ガイド鎖内のC及びUヌクレオチドは、2’OMe修飾されている場合もある。例えば、19ntガイド鎖の11~18位(または異なる長さのガイド鎖における対応する位置)のC及びUヌクレオチドは、2’OMe修飾されていてもよい。いくつかの実施形態では、ガイド鎖の最も3’側の末端のヌクレオチドは修飾されていない。ある特定の実施形態では、ガイド鎖内のC及びUの大部分は2’F修飾されており、ガイド鎖の5’末端はリン酸化されている。他の実施形態では、1位及び11~18位のCまたはUは2’OMe修飾されており、ガイド鎖の5’末端はリン酸化されている。他の実施形態では、位置1及び位置11~18のCsまたはUsは2’OMe修飾されており、ガイド鎖の5’末端はリン酸化されており、2~10位のCまたはUは2’F修飾されている。
自己送達可能なRNAi技術は、追加の製剤または技法を必要とすることなくRNAi剤(siRNA、sdRNA、または他のRNAi剤のいずれか)で細胞を直接トランスフェクトする方法を提供する。トランスフェクションが困難な細胞株をトランスフェクトする能力、高いインビボ活性、及び使用の単純さは、従来のsiRNAベースの技法に優る重大な機能的利点を提示する組成物及び方法の特徴であり、したがって、sdRNA法は、本発明のTILにおける標的遺伝子の発現を減少させる方法に関連するいくつかの実施形態で用いられる。sdRNA法により、化学合成された化合物をエクスビボ及びインビボの両方で広範囲の一次細胞及び組織に直接送達することが可能になる。本明細書における本発明のいくつかの実施形態に記載のsdRNAは、Advirna LLC(Worcester,MA,USA)から市販されている。
siRNAまたはsdRNAは、疎水的に修飾されたsiRNA-アンチセンスオリゴヌクレオチドハイブリッド構造として形成され得、例えば、Byrne,et al.,J.Ocular Pharmacol.Therapeut.,2013,29,855-864(その開示は参照により本明細書に組み込まれる)に開示されている。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドは、滅菌エレクトロポレーションを使用して本明細書に記載のTILに送達され得る。ある特定の実施形態では、方法は、siRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドを送達するためにTIL集団の滅菌エレクトロポレーションを含む。
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、膜貫通送達システムと組み合わせて細胞に送達され得る。いくつかの実施形態では、この膜貫通送達システムは、脂質、ウイルスベクターなどを含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド剤は、自己送達RNAi剤であり、いかなる送達剤も必要としない。特定の実施形態では、方法は、TILの集団にsiRNAまたはsdRNAオリゴヌクレオチドを送達するための膜貫通送達システムの使用を含む。
オリゴヌクレオチド及びオリゴヌクレオチド組成物は、本明細書に記載のTILと接触し(例えば、接触させられ、本明細書では投与または送達されるとも称される)、TILによって取り込まれる(TILによる受動的取り込みを含む)。sdRNAは、第1の拡張中(例えば、ステップB)、第1の拡張後(例えば、ステップC中)、第2の拡張前または拡張中(例えば、ステップDの前またはステップD中)、ステップD後及びステップEにおける採取前、ステップFにおける採取中または採取後、ステップFにおける最終製剤化及び/または注入バッグへの移行前または採取中、ならびにステップFにおける任意選択の凍結保存ステップ前に、本明細書に記載のTILに添加され得る。さらに、sdRNAは、ステップFにおける任意の凍結保存ステップから解凍した後に添加され得る。いくつかの実施形態では、PD-1、LAG-3、TIM-3、CISH、CTLA-4、TIGIT、TET2及びCBLBを含む、本明細書に記載の1つ以上のsdRNA標的遺伝子が、100nM~20mM、200nM~10mM、500nm~1mM、1μM~100μM、及び1μM~100μMからなる群から選択される濃度でTIL及び他の薬剤を含む細胞培養培地に添加され得る。いくつかの実施形態では、PD-1、LAG-3、TIM-3、CISH、CTLA-4、TIGIT、TET2及びCBLBを含む、本明細書に記載の1つ以上のsdRNA標的遺伝子は、0.1μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、0.5μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、0.75μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、1μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、1.25μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、1.5μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、2μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、5μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地、または10μM sdRNA/10,000TIL/100μL培地からなる群から選択される量でTIL及び他の薬剤を含む細胞培養培地に添加され得る。いくつかの実施形態では、PD-1、LAG-3、TIM-3、CISH、CTLA-4、TIGIT、TET2及びCBLBを含む、本明細書に記載の1つ以上のsdRNA標的遺伝子は、REP前段階またはREP段階中に1日2回、1日1回、2日毎、3日毎、4日毎、5日毎、6日毎、または7日毎にTIL培養物に添加され得る。
siRNAまたはsdRNAを含む本発明のオリゴヌクレオチド組成物は、例えば、細胞培養培地にsdRNAを高濃度で溶解し、かつ受動的取り込みが起こるのに十分な時間を許容することによって、増殖プロセス中に本明細書に記載のTILと接触することができる。ある特定の実施形態では、本発明の方法は、TIL集団を、本明細書に記載のオリゴヌクレオチド組成物と接触させることを含む。ある特定の実施形態では、この方法は、オリゴヌクレオチド、例えば、sdRNAを細胞培養培地に溶解することと、細胞培養培地をTIL集団と接触させることとを含む。TILは、本明細書に記載の第1の集団、第2の集団、及び/または第3の集団であり得る。
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの細胞への送達は、リン酸カルシウム、DMSO、グリセロールもしくはデキストラン、エレクトロポレーションを含む好適な技術分野で認識される方法によって、またはトランスフェクションによって、例えば、当該技術分野で知られている方法、例えば、米国特許第4,897,355号、同第5,459,127号、同第5,631,237号、同第5,955,365号、同第5,976,567号、同第10,087,464号、及び同第10,155,945号、ならびにBergan,et al.,Nucl.Acids Res.1993,21,3567(それらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載される方法を使用して、カチオン性、アニオン性、もしくは中性脂質組成物またはリポソームを使用して増強され得る。
いくつかの実施形態では、1つを超えるsiRNAまたはsdRNAが、標的遺伝子の発現を減少させるために使用されるいくつかの実施形態では、PD-1、TIM-3、CBLB、LAG3、CTLA-4、TIGIT、TET2及び/またはCISHを標的とするsiRNAまたはsdRNAのうちの1つ以上が一緒に使用される。いくつかの実施形態では、PD-1 siRNAまたはsdRNAは、1つを超える遺伝子標的の発現を減少させるために、TIM-3、CBLB、LAG3、CTLA-4、TIGIT、TET2及び/またはCISHのうちの1つ以上とともに使用される。いくつかの実施形態では、LAG3 siRNAまたはsdRNAは、両方の標的の遺伝子発現を減少させるために、CISHを標的とするsiRNAまたはsdRNAと組み合わせて使用される。いくつかの実施形態では、TIGIT siRNAまたはsdRNAは、両方の標的の遺伝子発現を低減させるために、PD-1を標的とするsiRNAまたはsdRNAと組み合わせて使用される。いくつかの実施形態では、CISH siRNAまたはsdRNAは、両方の標的の遺伝子発現を低減させるために、PD-1を標的とするsiRNAまたはsdRNAと組み合わせて使用される。いくつかの実施形態では、CTLA-4 siRNAまたはsdRNAは、両方の標的の遺伝子発現を低減させるために、PD-1を標的とするsiRNAまたはsdRNAと組み合わせて使用される。いくつかの実施形態では、LAG-3 siRNAまたはsdRNAは、両方の標的の遺伝子発現を低減させるために、PD-1を標的とするsiRNAまたはsdRNAと組み合わせて使用される。いくつかの実施形態では、CBL-B siRNAまたはsdRNAは、両方の標的の遺伝子発現を低減させるために、PD-1を標的とするsiRNAまたはsdRNAと組み合わせて使用される。いくつかの実施形態では、本明細書におけるPD-1、TIM-3、CBLB、LAG3、CTLA-4、TIGIT、TET2及び/またはCISHのうちの1つ以上を標的とするsiRNAまたはsdRNAは、Advirna LLC(Worcester,MA,USA)または複数の他のベンダーから市販されている。
いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、PD-1、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、別のsiRNAまたはsdRNAは、LAG3、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、CISH、TGFβR2、PKA、CBLB、BAFF(BR3)、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、PD-1、LAG-3、CISH、CBLB、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2、及びそれらの組み合わせから選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、siRNAまたはsdRNAは、PD-1、ならびにLAG3、CISH、CBLB、TIM3、CTLA-4、TIGIT、TET2のうちの1つ、及びそれらの組み合わせから選択される遺伝子を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CTLA-4を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TET2を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CTLA-4を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TET2を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CTLA-4を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TET2を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CTLA-4を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TET2を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、PD-1を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、LAG3を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CISHを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CBLBを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CTLA-4を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIM3を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TET2を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CTLA-4を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIGITを標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、CTLA-4を標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TET2を標的とする。いくつかの実施形態では、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TIGITを標的とし、1つのsiRNAまたはsdRNAは、TET2を標的とする。
本明細書で考察されたように、本発明の実施形態は、それらの治療効果を増強するために遺伝子編集を介して遺伝子修飾された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を提供する。本発明の実施形態は、1つ以上のタンパク質の発現の促進及び1つ以上のタンパク質の発現の阻害の両方、ならびにそれらの組み合わせのために、TIL集団へのヌクレオチド挿入(RNAまたはDNA)による遺伝子編集を包含する。本発明の実施形態は、TILを治療用集団に拡張するための方法も提供し、方法は、TILを遺伝子編集することを含む。TIL集団を遺伝子修飾するために使用され得るいくつかの遺伝子編集技術が存在し、それらは本発明による使用に好適である。かかる方法は、以下に記載の方法、ならびに本明細書の他の場所に記載のウイルス及びトランスポゾン方法を含む。いくつかの実施形態では、TIL、MIL、またはPBLを遺伝子修飾してCCRを発現させる方法はまた、かかる遺伝子の安定したノックアウトまたはかかる遺伝子の一過性ノックダウンのいずれかを介して遺伝子の発現を抑制する修飾を含んでもよい。
いくつかの実施形態では、この方法は、本明細書に記載の第1の集団、第2の集団、及び/または第3の集団におけるTIL集団を遺伝子修飾する方法を含む。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、1つ以上のタンパク質の産生または阻害(例えば、サイレンシング)のために遺伝子の安定した組み込みステップを含む。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、エレクトロポレーションステップを含む。エレクトロポレーション法は、当該技術分野で知られており、例えば、Tsong,Biophys.J.1991,60,297-306及び米国特許出願公開第2014/0227237A1号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。米国特許第5,019,034号、同第5,128,257号、同第5,137,817号、同第5,173,158号、同第5,232,856号、同第5,273,525号、同第5,304,120号、同第5,318,514号、同第6,010,613号、及び同第6,078,490号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるものなどの当該技術分野で知られている他のエレクトロポレーション法が使用され得る。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、滅菌エレクトロポレーション法である。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、パルスエレクトロポレーション法である。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのDC電気パルス列は、以下の特徴のうちの1つ、2つ、または3つを有する:(1)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる、(2)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる、及び(3)少なくとも3つのパルスのうちの2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILの定義及び制御された永続的または一時的変更を変える、操作する、または引き起こすステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つの単一オペレーターが制御する、独立してプログラムされたDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なる。いくつかの実施形態では、エレクトロポレーション法は、TILをパルス電場で処理して、TILにおける細孔形成を誘導するステップを含むパルスエレクトロポレーション法であり、100V/cm以上の電界強度を有する、少なくとも3つのDC電気パルス列をTILに適用するステップを含み、少なくとも3つのDC電気パルス列は、以下の特徴のうちの1つ、2つ、または3つを有する:(1)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス振幅が互いに異なる、(2)少なくとも3つのパルスのうちの少なくとも2つのパルス幅が互いに異なる、及び(3)少なくとも3つのパルスのうちの2つの第1のセットの第1のパルス間隔が、少なくとも3つのパルスのうちの2つの第2のセットの第2のパルス間隔とは異なり、これにより、誘導された細孔が比較的長期間にわたって持続され、TILの生存率が維持される。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、リン酸カルシウムトランスフェクションステップを含む。リン酸カルシウムトランスフェクション法(リン酸カルシウムDNA沈殿、細胞表面コーティング、及びエンドサイトーシス)は、当該技術分野で知られており、Graham and van der Eb,Virology 1973,52,456-467、Wigler,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.1979,76,1373-1376、及びChen and Okayarea,Mol.Cell.Biol.1987,7,2745-2752、ならびに米国特許第5,593,875号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、リポソームトランスフェクションステップを含む。リポソームトランスフェクション法、例えば、カチオン性脂質N-[1-(2,3-ジオレイルオキシ)プロピル]-n,n,n-トリメチルアンモニウムクロリド(DOTMA)及びジオレオイルホスホチジルエタノールアミン(DOPE)の1:1(w/w)リポソーム製剤を用いる方法は、当該技術分野において既知であり、Rose,et al.,Biotechniques 1991,10,520-525及びFelgner,et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,1987,84,7413-7417、ならびに米国特許第5,279,833号、同第5,908,635号、同第6,056,938号、同第6,110,490号、同第6,534,484号、及び同第7,687,070号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TIL集団を遺伝子修飾する方法は、米国特許第5,766,902号、同第6,025,337号、同第6,410,517号、同第6,475,994号、及び同第7,189,705号に記載の方法を使用するトランスフェクションステップを含み、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。TILは、本明細書に記載のTILの第1の集団、第2の集団、及び/または第3の集団であり得る。
ある実施形態によれば、遺伝子編集プロセスは、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子での二本鎖または一本鎖切断の生成を媒介するプログラム可能なヌクレアーゼの使用を含み得る。かかるプログラム可能なヌクレアーゼは、特定のゲノム遺伝子座に切断を導入することによって正確なゲノム編集を可能にし、すなわち、ゲノム内の特定のDNA配列の認識に依存して、ヌクレアーゼドメインをこの位置に標的し、標的配列での二本鎖切断の生成を媒介する。DNAの二本鎖切断は、その後、内因性修復機構を切断部位に動員して、非相同末端結合(NHEJ)または相同指向修復(HDR)のいずれかによるゲノム編集を媒介する。したがって、切断の修復は、標的遺伝子産物を破壊する(例えば、サイレンス、抑制、または増強する)挿入/欠失変異の導入をもたらす可能性がある。
部位特異的ゲノム編集を可能にするために開発されたヌクレアーゼの主要なクラスには、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFN)、転写活性化因子様ヌクレアーゼ(TALEN)、及びCRISPR関連ヌクレアーゼ(例えば、CRISPR/Cas9)が含まれる。これらのヌクレアーゼシステムは、DNA認識のモードに基づいて大きく2つのカテゴリーに分類され得、ZFN及びTALENは、タンパク質-DNA相互作用を介して特定のDNA結合を達成するが、Cas9などのCRISPRシステムは、標的DNAと直接塩基対を形成する短いRNAガイド分子によって、かつタンパク質-DNA相互作用によって特定のDNA配列を標的とする。例えば、Cox et al.,Nature Medicine,2015,Vol.21,No.2を参照されたい。
本発明のTIL拡張法に従って使用され得る遺伝子編集法の非限定的な例には、CRISPR法、TALE法、及びZFN法が含まれ、これらは以下でより詳細に説明される。ある実施形態によれば、TILを治療用集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、Gen3)に従って、または米国特許出願公開第2020/0299644 A1号及び同第2020/0121719 A1号、ならびに米国特許第10,925,900号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されるように実行することができ、方法は、増強された治療効果を提供することができるTILを生成するために、CRISPR法、TALE法、またはZFN法のうちの1つ以上によって、TILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。ある実施形態によれば、遺伝子編集されたTILは、インビトロでそれらを修飾されていないTILと比較することによって、例えば、修飾されていないTILと比較してインビトロでのエフェクター機能、サイトカインプロファイルなどを評価することによって、治療効果の改善について評価され得る。ある特定の実施形態では、この方法は、CRISPR法、TALE法、及び/またはZFN法を使用してTIL集団を遺伝子編集することを含む。
本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーションは、CRISPRシステム、TALENシステム、及びZFNシステムなどの遺伝子編集システムの送達のために使用される。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーションシステムは、フローエレクトロポレーションシステムである。本発明のいくつかの実施形態との使用に好適な、好適なフローエレクトロポレーションシステムの例は、市販のMaxCyte STXシステムである。本発明との使用に好適であり得る、BTX-Harvard Apparatusから入手可能なAgilePulseシステムもしくはECM830、Cellaxess Elektra(Cellectricon)、Nucleofector(Lonza/Amaxa)、GenePulser MXcell(BIORAD)、iPorator-96(Primax)、またはsiPORTer96(Ambion)などのいくつかの代替の市販エレクトロポレーション機器が存在する。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーションシステムは、TIL拡張法の残りとともに、閉鎖した滅菌系を形成する。本発明のいくつかの実施形態では、エレクトロポレーションシステムは、本明細書に記載のパルスエレクトロポレーションシステムであり、TIL拡張法の残りとともに、閉鎖した滅菌系を形成する。
TILを治療用集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、Gen2)に従って、または米国特許出願公開第2020/0299644 A1号及び同第2020/0121719 A1号、ならびに米国特許第10,925,900号(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されているように実施することができ、方法は、CRISPR法(例えば、CRISPR/Cas9またはCRISPR/Cpf1)によってTILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のCRISPR法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは減少させる。代替的に、TIL拡張プロセス中のCRISPR法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。
CRISPRは、「clustered regularly interspaced short palindromic repeats(クラスター化された定期的に間隔をあけた短いパリンドロミックリピート)」の略語である。遺伝子編集のためにCRISPRシステムを使用する方法は、本明細書ではCRISPR法とも称される。RNA及びCasタンパク質を組み込み、かつ本発明に従って使用され得るCRISPRシステムには、3つの型:I型、II型、及びIII型がある。II型CRISPR(Cas9によって例示される)は、最もよく特徴付けられているシステムのうちの1つである。
CRISPR技術は、細菌及び古細菌(単細胞微生物のドメイン)の自然防御機構から適合された。これらの生物は、CRISPR由来のRNA及びCas9を含む様々なCasタンパク質を使用して、外来侵入物のDNAを切り刻んで破壊することによって、ウイルス及び他の異物による攻撃を阻止する。CRISPRは、ヌクレオチド反復配列及びスペーサーの存在という2つの異なる特徴を有するDNAの特殊な領域である。ヌクレオチドの反復配列は、CRISPR領域全体に分布しており、外来DNA(スペーサー)の短いセグメントが反復配列の間に散在している。II型CRISPR/Casシステムでは、スペーサーは、CRISPRゲノム遺伝子座内に組み込まれ、転写され、短いCRISPR RNA(crRNA)に処理される。これらのcrRNAは、トランス活性化crRNA(tracrRNA)にアニーリングし、Casタンパク質による病原性DNAの配列特異的切断及びサイレンシングを指示する。Cas9タンパク質による標的認識には、crRNA内の「シード」配列、及びcrRNA結合領域の上流にある保存されたジヌクレオチドを含むプロトスペーサー隣接モチーフ(PAM)配列が必要である。これにより、CRISPR/Casシステムが再標的されて、crRNAを再設計することにより、実質的にいずれのDNA配列も切断することができる。天然システムにおけるcrRNA及びtracrRNAは、遺伝子操作で使用するために、およそ100ヌクレオチドの単一ガイドRNA(sgRNA)に簡略化され得る。CRISPR/Casシステムは、Cas9エンドヌクレアーゼを発現するプラスミドと必要なcrRNA成分を同時送達することにより、ヒト細胞に直接運搬可能である。Casタンパク質の異なるバリアント(例えば、Cpf1などのCas9のオルソログ)を使用して、標的の制限を低減することができる。
CRISPR法を介してTILを永久に遺伝子編集することによってサイレンシングまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例としては、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、TOX、SOCS1、ANKRD11、及びBCORが挙げられる。
CRISPR法を介してTILを永続的に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の非限定的な例としは、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL12、IL-15、IL-18、及びIL-21が挙げられる。
CRISPR法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得るシステム、方法、及び組成物の例は、米国特許第8,697,359号、同第8,993,233号、同第8,795,965号、同第8,771,945号、同第8,889,356号、同第8,865,406号、同第8,999,641号、同第8,945,839号、同第8,932,814号、同第8,871,445号、同第8,906,616号、及び同第8,895,308号に記載されており、各々の開示は、参照により本明細書に組み込まれる。CRISPR/Cas9及びCRISPR/Cpf1を発現するためのプラスミドなどのCRISPR法を行うための資源は、GenScriptなどの企業から市販されている。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のTIL集団の遺伝子修飾は、米国特許第9790490号に記載されているCRISPR/Cpf1システムを使用して行われ得、この開示は参照により本明細書に組み込まれる。
TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態(例えば、Gen2)に従って、または米国特許出願公開第2020/0299644 A1号及び同第2020/0121719 A1号、ならびに米国特許第10,925,900号に記載されているように実施することができ、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれ、方法は、TALE法によってTILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のTALE法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部分においてサイレンスまたは減少させる。代替的に、TIL拡張プロセス中のTALE法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。
TALEは、転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN「」)を含む、転写活性化因子様エフェクター「」タンパク質を表す。遺伝子編集のためにTALEシステムを使用する方法は、本明細書ではTALE法とも称され得る。TALEは、植物病原菌Xanthomonas属由来の天然に存在するタンパク質であり、各々単一の塩基対を認識する一連の33~35アミノ酸反復ドメインで構成されるDNA結合ドメインを含む。TALE特異性は、反復可変二残基(RVD)として知られる2つの超可変アミノ酸によって決定される。モジュラーTALE反復配列は、隣接するDNA配列を認識するために一緒に結合される。DNA結合ドメイン内の特定のRVDは、標的遺伝子座内の塩基を認識し、予測可能なDNA結合ドメインを組み立てるための構造的特徴を提供する。TALEのDNA結合ドメインは、IIS型FokIエンドヌクレアーゼの触媒ドメインに融合して、標的可能なTALEヌクレアーゼを作製する。部位特異的変異を誘導するために、14~20塩基対のスペーサー領域によって分離された2つの個々のTALENアームがFokIモノマーを密接に接近させて二量体化し、標的とされる二本鎖切断を産生する。
様々な組み立て方法を利用したいくつかの大規模な系統的研究により、TALE反復配列を組み合わせて、実質的にすべてのユーザ定義配列を認識することができることが示されている。カスタム設計されたTALEアレイも、Cellectis Bioresearch(Paris,France)、Transposagen Biopharmaceuticals(Lexington,KY,USA)、及びLife Technologies(Grand Island,NY,USA)から市販されている。本発明での使用に好適なTALE法及びTALEN法は、米国特許公開第2011/0201118 A1号、同第2013/0117869 A1号、同第2013/0315884 A1号、同第2015/0203871 A1号、及び同第2016/0120906 A1号に記載されており、これらの各々の開示は参照により本明細書に組み込まれる。
TALE法を介してTILを永久に遺伝子編集することによってサイレンシングまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例としては、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、TOX、SOCS1、ANKRD11、及びBCORが挙げられる。
TALE法を介してTILを永続的に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の非限定的な例としは、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL12、IL-15、IL-18、及びIL-21が挙げられる。
TALE法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得るシステム、方法、及び組成物の例は、米国特許第8,586,526号に記載されており、これは参照により本明細書に組み込まれる。
TILを治療的集団に拡張するための方法は、本明細書に記載の方法のいずれかの実施形態に従って、または米国特許出願公開第2020/0299644 A1号及び同第2020/0121719 A1号、ならびに米国特許第10,925,900号に記載されているように実施することができ、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれ、方法は、ジンクフィンガーまたはジンクフィンガーヌクレアーゼ法によってTILの少なくとも一部を遺伝子編集することをさらに含む。特定の実施形態によれば、TIL拡張プロセス中のジンクフィンガー法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部においてサイレンスまたは減少させる。代替的に、TIL拡張プロセス中のジンクフィンガー法の使用は、1つ以上の免疫チェックポイント遺伝子の発現を、治療的TIL集団の少なくとも一部において増強させる。
個々のジンクフィンガーは、保存されたββα立体配置でおよそ30個のアミノ酸を含む。αらせんの表面上のいくつかのアミノ酸は、典型的には、異なる選択性レベルでDNAの主溝の3bpと接触する。ジンクフィンガーは、2つのタンパク質ドメインを有する。第1のドメインは、DNA結合ドメインであり、真核生物転写因子を含み、ジンクフィンガーを含む。第2のドメインは、ヌクレアーゼドメインであり、FokI制限酵素を含み、DNAの触媒的切断を担っている。
個々のZFNのDNA結合ドメインは、典型的には、3~6個の個々のジンクフィンガー反復配列を含み、各々9~18塩基対を認識することができる。ジンクフィンガードメインが目的の標的部位に特異的である場合、合計18塩基対を認識する3フィンガーZFNの対でさえ、理論的には、哺乳動物ゲノムの単一遺伝子座を標的とすることができる。新たなジンクフィンガーアレイを生成するための1つの方法は、既知の特異性を有するより小さいジンクフィンガー「モジュール」を組み合わせることである。最も一般的なモジュラーアセンブリプロセスは、各々3塩基対のDNA配列を認識することができる3つの別個のジンクフィンガーを組み合わせて、9塩基対の標的部位を認識することができる3フィンガーアレイを生成することを含む。あるいは、オリゴマー化プールエンジニアリング(OPEN)などの選択ベースのアプローチを使用して、隣接するフィンガー間のコンテキスト依存的相互作用を考慮したランダム化ライブラリーから新たなジンクフィンガーアレイを選択することができる。操作されたジンクフィンガーは、Sangamo Biosciences(Richmond,CA,USA)及びSigma-Aldrich(St.Louis,MO,USA)から市販されている。
ジンクフィンガー法を介してTILを永久に遺伝子編集することによってサイレンシングまたは阻害され得る遺伝子の非限定的な例としては、PD-1、CTLA-4、LAG-3、HAVCR2(TIM-3)、Cish、TGFβ、PKA、CBL-B、PPP2CA、PPP2CB、PTPN6、PTPN22、PDCD1、BTLA、CD160、TIGIT、TET2、CD96、CRTAM、LAIR1、SIGLEC7、SIGLEC9、CD244、TNFRSF10B、TNFRSF10A、CASP8、CASP10、CASP3、CASP6、CASP7、FADD、FAS、SMAD2、SMAD3、SMAD4、SMAD10、SKI、SKIL、TGIF1、IL10RA、IL10RB、HMOX2、IL6R、IL6ST、EIF2AK4、CSK、PAG1、SIT1、FOXP3、PRDM1、BATF、GUCY1A2、GUCY1A3、GUCY1B2、GUCY1B3、TOX、SOCS1、ANKRD11、及びBCORが挙げられる。
ジンクフィンガー法を介してTILを永続的に遺伝子編集することによって増強され得る遺伝子の非限定的な例としは、CCR2、CCR4、CCR5、CXCR2、CXCR3、CX3CR1、IL-2、IL12、IL-15、IL-18、及びIL-21が挙げられる。
ジンクフィンガー法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得るシステム、方法、及び組成物の例は、米国特許第6,534,261号、同第6,607,882号、同第6,746,838号、同第6,794,136号、同第6,824,978号、同第6,866,997号、同第6,933,113号、同第6,979,539号、同第7,013,219号、同第7,030,215号、同第7,220,719号、同第7,241,573号、同第7,241,574号、同第7,585,849号、同第7,595,376号、同第6,903,185号、及び同第6,479,626号に記載されており、これらの各々は参照により本明細書に組み込まれる。
ジンクフィンガー法によって標的遺伝子配列の発現を変化させるための、本発明の実施形態に従って使用され得るシステム、方法、及び組成物の他の例は、Beane,et al.,Mol.Therapy,2015,23 1380-1390に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、TILは、高親和性TCR、例えば、MAGE-1、HER2、もしくはNY-ESO-1などの腫瘍関連抗原で標的とされるTCR、または腫瘍関連細胞表面分子(例えば、メソセリン)もしくは系統制限細胞表面分子(例えば、CD19)に結合するキメラ抗原受容体(CAR)を含むが、これらに限定されない追加の機能を含むように任意選択で遺伝子操作される。いくつかの実施形態では、この方法は、高親和性TCR、例えば、MAGE-1、HER2、もしくはNY-ESO-1などの腫瘍関連抗原で標的とされるTCR、または腫瘍関連細胞表面分子(例えば、メソセリン)もしくは系統制限細胞表面分子(例えば、CD19)に結合するキメラ抗原受容体(CAR)を含むようにTIL集団を遺伝子操作することを含む。適切には、TIL集団は、本明細書に記載の第1の集団、第2の集団、及び/または第3の集団であり得る。
E.TIL製造のための閉鎖系
本発明は、TIL培養プロセス中に閉鎖系の使用を提供する。かかる閉鎖系は、微生物汚染の防止及び/または低減を可能にし、より少数のフラスコの使用を可能にし、コスト削減を可能にする。いくつかの実施形態では、閉鎖系は、2つの容器を使用する。
かかる閉鎖系は当該技術分野でよく知られており、例えば、http://www.fda.gov/cber/guidelines.htm及びhttps://www.fda.gov/BiologicsBloodVaccines/GuidanceComplianceRegulatoryInformation/Guidances/Blood/ucm076779.htmで見つけることができる。
滅菌接続装置(STCD)は、互換性のある2本の管間の滅菌溶接をもたらす。この手順により、様々な容器と管径との滅菌接続が可能になる。いくつかの実施形態では、閉鎖系には、実施例に記載のルアーロック系及びヒートシール系が含まれる。いくつかの実施形態では、閉鎖系は、閉鎖系の無菌性及び閉鎖性を維持するために、滅菌条件下でシリンジを介してアクセスされる。いくつかの実施形態では、実施例21に記載の閉鎖系が用いられる。いくつかの実施形態では、TILは、実施例「」において本明細書に記載される方法に従って、最終製品製剤容器に製剤化される。
いくつかの実施形態では、閉鎖系は、腫瘍断片が得られてから、TILを患者に投与するかまたは凍結保存する準備が整うまで、1つの容器を使用する。いくつかの実施形態では、2つの容器が使用される場合、第1の容器は密閉G容器であり、TIL集団が遠心分離され、第1の密閉G容器を開かずに注入バッグに移される。いくつかの実施形態では、2つの容器が使用される場合、注入バッグは、HypoThermosolを含有する注入バッグである。閉鎖系または閉鎖TIL細胞培養系は、腫瘍試料及び/または腫瘍断片が追加されると、系が外部からしっかりと密閉され、細菌、真菌、及び/またはいずれの他の微生物汚染も侵入しない閉鎖環境を形成することを特徴とする。
いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約5%~約100%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約5%~約95%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約5%~約90%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約10%~約90%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約15%~約85%である。いくつかの実施形態では、微生物汚染の低減は、約5%、約10%、約15%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約55%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、約95%、約97%、約98%、約99%、または約100%である。
閉鎖系は、微生物汚染の不在下で及び/または微生物汚染が大幅に低減された状態で、TILの成長を可能にする。
さらに、TIL細胞培養環境のpH、二酸化炭素分圧、及び酸素分圧は各々、細胞が培養されるにつれて変化する。したがって、細胞培養に適切な培地を循環させても、TIL増殖に最適な環境として閉鎖環境を常に一定に維持する必要がある。この目的のために、閉鎖環境の培養液中のpH、二酸化炭素分圧、及び酸素分圧の物理的要因がセンサーによって監視されること、そのシグナルが培養環境の入口に設置されたガス交換器を制御するために使用されること、及び閉鎖環境のガス分圧が細胞培養環境を最適化するように培養液の変化に応じてリアルタイムで調整されることが望ましい。いくつかの実施形態では、本発明は、閉鎖環境のpH、二酸化炭素分圧、及び酸素分圧を測定する監視装置を備えたガス交換器を閉鎖環境の入口に組み込み、かつ監視装置からのシグナルに基づいてガス濃度を自動的に調整することによって細胞培養環境を最適化する閉鎖細胞培養系を提供する。
いくつかの実施形態では、閉鎖環境内の圧力は、連続的または断続的に制御される。すなわち、閉鎖環境内の圧力を、例えば、圧力維持装置によって変化させることができ、それ故に、空間が正圧状態でTILの成長に好適であることを確実にするか、または負圧状態で流体の浸出を促進し、ひいては細胞増殖を促進する。さらに、負圧を断続的に加えることにより、閉鎖環境内の体積の一時的な収縮によって、閉鎖環境内の循環液体を均一かつ効率的に置き換えることが可能である。
いくつかの実施形態では、TILの増殖に最適な培養成分を置換または追加することができ、IL-2及び/またはOKT3などの因子、ならびに組み合わせを追加することができる。
F.TILの任意選択の凍結保存
バルクTIL集団(例えば、第2のTIL集団)または拡張されたTIL集団(例えば、第3のTIL集団)のいずれかを、任意選択で凍結保存することができる。いくつかの実施形態では、凍結保存は、治療的TIL集団に起こる。いくつかの実施形態では、凍結保存は、第2の拡張後に採取されたTILに起こる。いくつかの実施形態では、凍結保存は、図1及び/または8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)の例示的なステップFにおいてTILに対して起こる。いくつかの実施形態では、TILは、注入バッグ内で凍結保存される。いくつかの実施形態では、TILは、注入バッグに入れる前に凍結保存される。いくつかの実施形態では、TILは、凍結保存され、注入バッグに入っていない。いくつかの実施形態では、凍結保存は、凍結保存培地を使用して行われる。いくつかの実施形態では、凍結保存培地は、ジメチルスルホキシド(DMSO)を含有する。これは、一般に、TIL集団を凍結溶液、例えば、85%補体不活性化AB血清及び15%ジメチルスルホキシド(DMSO)に入れることによって達成される。溶液中の細胞が極低温バイアルに入れられ、-80℃で24時間保存され、任意選択で凍結保存のためにガス状窒素冷凍庫に移される。Sadeghi,et al.,Acta Oncologica 2013,52,978-986を参照されたい。
適切な場合、細胞が冷凍庫から取り出され、溶液のおよそ5分の4が解凍されるまで37℃の水浴中で解凍される。細胞は、一般に、完全培地中に再懸濁され、任意で1回以上洗浄される。いくつかの実施形態では、解凍されたTILは、当該技術分野で知られているように計数され、生存率について評価され得る。
いくつかの実施形態では、TIL集団は、CS10凍結保存培地(CryoStor 10、BioLife Solutions)を使用して凍結保存される。いくつかの実施形態では、TIL集団は、ジメチルスルホキシド(DMSO)を含有する凍結保存培地を使用して凍結保存される。いくつかの実施形態では、TIL集団は、1:1(体積:体積)比のCS10及び細胞培養培地を使用して凍結保存される。いくつかの実施形態では、TIL集団は、約1:1(体積:体積)比のCS10及び細胞培養培地を使用して凍結保存され、追加のIL-2をさらに含む。
上で考察されたように、図1及び/または8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に示されるステップA~Eで例示されるように、凍結保存は、TIL拡張プロセス全体を通して様々な時点で起こり得る。いくつかの実施形態では、第1の拡張後の拡張されたTIL集団(例えば、ステップBに従って提供される、または図1もしくは8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48DのステップDによる1つ以上の第2の拡張後の拡張されたTIL集団)は、凍結保存され得る。凍結保存は、一般に、TIL集団を凍結溶液、例えば、85%補体不活性化AB血清及び15%ジメチルスルホキシド(DMSO)に入れることによって達成され得る。溶液中の細胞が極低温バイアルに入れられ、-80℃で24時間保存され、任意選択で凍結保存のためにガス状窒素冷凍庫に移される。Sadeghi,et al.,Acta Oncologica 2013,52,978-986を参照されたい。いくつかの実施形態では、TILは、5% DMSO中で凍結保存される。いくつかの実施形態では、TILは、5% DMSOを加えた細胞培養培地中で凍結保存される。いくつかの実施形態では、TILは、実施例6に提供される方法に従って凍結保存される。
適切な場合、細胞が冷凍庫から取り出され、溶液のおよそ5分の4が解凍されるまで37℃の水浴中で解凍される。細胞は、一般に、完全培地中に再懸濁され、任意で1回以上洗浄される。いくつかの実施形態では、解凍されたTILは、当該技術分野で知られているように計数され、生存率について評価され得る。
場合によっては、図1または8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップBのTIL集団は、以下に論じられるプロトコルを使用して、直ちに凍結保存され得る。代替的に、バルクTIL集団は、図1または8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップC及びステップDに供され、その後、図1または8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップDの後に凍結保存され得る。同様に、遺伝子修飾されたTILが療法に使用される場合、図1または8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップBまたはステップDのTIL集団は、好適な治療のために遺伝子修飾に供され得る。
G.拡張TILの表現型特徴
いくつかの実施形態では、TILは、本明細書及び実施例に記載されているものを含む、拡張後の多数の表現型マーカーの発現について分析される。いくつかの実施形態では、1つ以上の表現型マーカーの発現が調べられる。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、図1または8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップBにおける第1の拡張後に分析される。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、図1または8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップCにおける移行中に分析される。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、図1または8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップCによる移行中及び凍結保存後に分析される。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、図1または8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップDによる第2の拡張後に分析される。いくつかの実施形態では、TILの表現型特徴は、図1または8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)からのステップDによる2つ以上の拡張後に分析される。
いくつかの実施形態では、マーカーは、CD8及びCD28からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、CD8の発現が調べられる。いくつかの実施形態では、CD28の発現が調べられる。いくつかの実施形態では、CD8及び/またはCD28の発現は、他のプロセス(例えば、例えば図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dに提供されるGen3プロセス)と比較して、例えば図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に提供される2Aプロセスと比較して、本発明のプロセスに従って産生されたTIL上でより高い。いくつかの実施形態では、CD8の発現は、他のプロセス(例えば、例えば図8(特に、例えば図8Bに提供されるGen3プロセス)と比較して、例えば図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に提供される2Aプロセスと比較して、本発明のプロセスに従って産生されたTIL上でより高い。いくつかの実施形態では、CD28の発現は、他のプロセス(例えば、例えば図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に提供されるGen3プロセス、例えば図8(特に、例えば、図8A)に提供される2Aプロセスと比較して)と比較して、本発明のプロセスに従って産生されたTIL上でより高い。いくつかの実施形態では、高いCD28発現は、より若く、より持続的なTIL表現型を示す。いくつかの実施形態では、1つ以上の調節マーカーの発現が測定される。
いくつかの実施形態では、CD8及び/またはCD28に基づく第1のTIL集団、第2のTIL集団、第3のTIL集団、または採取されたTIL集団の選択は、本明細書に記載の腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を拡張するための方法のいずれのステップ中にも行われない。
いくつかの実施形態では、セントラルメモリー細胞のパーセンテージは、他のプロセス(例えば、例えば図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に提供されるGen3プロセス、例えば図8(特に、例えば、図8A)に提供される2Aプロセスと比較して)と比較して、本発明のプロセスに従って産生されたTIL上でより高い。いくつかの実施形態では、セントラルメモリー細胞のメモリーマーカーは、CCR7及びCD62Lからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILメモリーサブセットは、異なるメモリーサブセットに分類され得る。いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILは、ナイーブ(CD45RA+CD62L+)TILを含む。いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILは、セントラルメモリー(CM、CD45RA-CD62L+)TILを含む。いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILは、エフェクターメモリー(EM、CD45RA-CD62L-)TILを含む。いくつかの実施形態では、CD4+及び/またはCD8+TILは、RA+エフェクターメモリー/エフェクター(TEMRA/TEFF、CD45RA+CD62L+)TILを含む。
いくつかの実施形態では、TILは、グランザイムB、パーフォリン、及びグラニュライシンからなる群から選択されるもう1つのマーカーを発現する。いくつかの実施形態では、TILは、グランザイムBを発現する。いくつかの実施形態では、TILは、パーフォリンを発現する。いくつかの実施形態では、TILは、グラニュライシンを発現する。
いくつかの実施形態では、再刺激されたTILは、サイトカイン放出アッセイを使用して、サイトカイン放出についても評価され得る。いくつかの実施形態では、TILは、インターフェロンガンマ(IFN-γ)分泌について評価され得る。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、ELISAアッセイによって測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に提供されるステップDの後の急速な第2の拡張ステップ後にELISAアッセイによって測定される。いくつかの実施形態では、TILの健康は、IFN-ガンマ(IFN-γ)分泌によって測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、活性なTILを示す。いくつかの実施形態では、IFN-γ産生の効力アッセイが用いられる。IFN-γ産生は、細胞傷害能の別の尺度である。IFN-γ産生は、CD3、CD28、及びCD137/4-1BBに対する抗体で刺激されたTILの培地中のサイトカインIFN-γのレベルを決定することによって測定され得る。これらの刺激されたTILからの培地中のIFN-γレベルは、IFN-γ放出を測定することによって決定され得る。いくつかの実施形態では、例えば、図8(特に、例えば、図8A)に提供される2AプロセスのステップDと比較した、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に提供される、例えば、Gen3プロセスのステップDのTILにおけるIFN-γ産生の増加は、ステップDのTILの細胞傷害能の増加を示す。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、1倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、2倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、3倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、4倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、5倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γは、Quantikine ELISAキットを使用して測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、エクスビボでのTIL中で測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、例えば図8Bの方法を含む、本発明の方法によって産生されたTILを含む、TILにおいてエクスビボで測定される。
いくつかの実施形態では、少なくとも1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも1倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも2倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも3倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも4倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも5倍多くのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、少なくとも100pg/mL~約1000pg/mL以上のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL、少なくとも250pg/mL、少なくとも300pg/mL、少なくとも350pg/mL、少なくとも400pg/mL、少なくとも450pg/mL、少なくとも500pg/mL、少なくとも550pg/mL、少なくとも600pg/mL、少なくとも650pg/mL、少なくとも700pg/mL、少なくとも750pg/mL、少なくとも800pg/mL、少なくとも850pg/mL、少なくとも900pg/mL、少なくとも950pg/mL、または少なくとも1000pg/mL以上のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも300pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも400pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも500pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも600pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも700pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも800pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも900pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも1000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも2000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも3000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも4000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも5000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも6000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも7000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも8000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも9000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも10,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも15,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも20,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも25,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも30,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも35,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも40,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも45,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも50,000pg/mLのIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、少なくとも100pg/mL/5e5細胞~約1000pg/mL/5e5細胞以上のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL/5e5細胞、少なくとも250pg/mL/5e5細胞、少なくとも300pg/mL/5e5細胞、少なくとも350pg/mL/5e5細胞、少なくとも400pg/mL/5e5細胞、少なくとも450pg/mL/5e5細胞、少なくとも500pg/mL/5e5細胞、少なくとも550pg/mL/5e5細胞、少なくとも600pg/mL/5e5細胞、少なくとも650pg/mL/5e5細胞、少なくとも700pg/mL/5e5細胞、少なくとも750pg/mL/5e5細胞、少なくとも800pg/mL/5e5細胞、少なくとも850pg/mL/5e5細胞、少なくとも900pg/mL/5e5細胞、少なくとも950pg/mL/5e5細胞、または少なくとも1000pg/mL/5e5細胞以上のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも300pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも400pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも500pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも600pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも700pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも800pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも900pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも1000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも2000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも3000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも4000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも5000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも6000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも7000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも8000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも9000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも10,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも15,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも20,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも25,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも30,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも35,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも40,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも45,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも50,000pg/mL/5e5細胞のIFN-γ分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
Tリンパ球及びBリンパ球の多様な抗原受容体は、限られた数であるが、多数の遺伝子セグメントの体細胞組換えによって産生される。これらの遺伝子セグメント:V(可変)、D(多様性)、J(接合)、及びC(一定)は、免疫グロブリン及びT細胞受容体(TCR)の結合特異性及び下流での適用を決定する。本発明は、T細胞レパートリー多様性を示し、かつ増加させるTILを生成するための方法を提供する。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、新たに採取されたTIL及び/または例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に具体化される方法以外の方法を含む、本明細書に提供される方法以外の方法を使用して調製されたTILと比較して、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、新たに採取されたTIL及び/または図8(特に、例えば図8A)に例示されるようにGen2と称される方法を使用して調製されたTILと比較して、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、第1の拡張で取得されたTILは、T細胞レパートリー多様性の増加を示す。いくつかの実施形態では、多様性の増加は、免疫グロブリン多様性及び/またはT細胞受容体多様性の増加である。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン重鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、免疫グロブリンにあり、免疫グロブリン軽鎖にある。いくつかの実施形態では、多様性は、T細胞受容体にある。いくつかの実施形態では、多様性は、アルファ、ベータ、ガンマ、及びデルタ受容体からなる群から選択されるT細胞受容体のうちの1つにある。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファ及び/またはベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)アルファの発現が増加する。いくつかの実施形態では、T細胞受容体(TCR)ベータの発現が増加する。いくつかの実施形態では、TCRαβ(すなわち、TCRα/β)の発現が増加する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプロセス(例えば、Gen3プロセス)は、他のプロセス、例えば、試料中の固有のペプチドCDRの数に基づくGen2と称されるプロセスと比較して、より高いクローン多様性を示す。
いくつかの実施形態では、TILの活性化及び疲弊は、1つ以上のマーカーを調べることによって決定され得る。いくつかの実施形態では、活性化及び疲弊は、多色フローサイトメトリーを使用して決定され得る。いくつかの実施形態では、活性化及び疲弊のマーカーには、CD3、PD-1、2B4/CD244、CD8、CD25、BTLA、KLRG、TIM-3、CD194/CCR4、CD4、TIGIT、CD183、CD69、CD95、CD127、CD103、及び/またはLAG-3)からなる群から選択される1つ以上のマーカーが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、活性化及び疲弊のマーカーには、BTLA、CTLA-4、ICOS、Ki67、LAG-3、PD-1、TIGIT、及び/またはTIM-3からなる群から選択される1つ以上のマーカーが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、活性化及び疲弊のマーカーには、BTLA、CTLA-4、ICOS、Ki67、LAG-3、CD103+/CD69+、CD103+/CD69-、PD-1、TIGIT及び/またはTIM-3からなる群から選択される1つ以上のマーカーが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、T細胞マーカー(活性化及び疲弊マーカーを含む)は、T細胞の活性化、阻害、または機能を調べるために決定及び/または分析され得る。いくつかの実施形態では、T細胞マーカーには、TIGIT、CD3、FoxP3、Tim-3、PD-1、CD103、CTLA-4、LAG-3、BTLA-4、ICOS、Ki67、CD8、CD25、CD45、CD4、及び/またはCD59からなる群から選択される1つ以上のマーカーが含まれ得るが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、3000pg/10TIL超~300000pg/10TIL以上のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されるTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10TIL超、5000pg/10TIL超、7000pg/10TIL超、9000pg/10TIL超、11000pg/10TIL超、13000pg/10TIL超、15000pg/10TIL超、17000pg/10TIL超、19000pg/10TIL超、20000pg/10TIL超、40000pg/10TIL超、60000pg/10TIL超、80000pg/10TIL超、100000pg/10TIL超、120000pg/10TIL超、140000pg/10TIL超、160000pg/10TIL超、180000pg/10TIL超、200000pg/10TIL超、220000pg/10TIL超、240000pg/10TIL超、260000pg/10TIL超、280000pg/10TIL超、300000pg/10TIL超またはそれ以上のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されるTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、5000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、7000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、9000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、11000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、13000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、15000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、17000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、19000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、20000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、40000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、60000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、80000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、100000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、120000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、140000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、160000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、180000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、200000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、220000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、240000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、260000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、280000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、300000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10TIL超~300000pg/10TIL以上のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されるTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10TIL超、5000pg/10TIL超、7000pg/10TIL超、9000pg/10TIL超、11000pg/10TIL超、13000pg/10TIL超、15000pg/10TIL超、17000pg/10TIL超、19000pg/10TIL超、20000pg/10TIL超、40000pg/10TIL超、60000pg/10TIL超、80000pg/10TIL超、100000pg/10TIL超、120000pg/10TIL超、140000pg/10TIL超、160000pg/10TIL超、180000pg/10TIL超、200000pg/10TIL超、220000pg/10TI

L超、240000pg/10TIL超、260000pg/10TIL超、280000pg/10TIL超、300000pg/10TIL超またはそれ以上のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されるTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、5000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、7000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、9000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、11000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、13000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、15000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、17000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、19000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、20000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、40000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、60000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、80000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、100000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、120000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、140000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、160000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、180000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、200000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、220000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、240000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、260000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、280000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、300000pg/10TIL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、1000pg/mL超~300000pg/mL以上のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されるTILである。いくつかの実施形態では、1000pg/mL超、2000pg/mL超、3000pg/mL超、4000pg/mL超、5000pg/mL超、6000pg/mL超、7000pg/mL超、8000pg/mL超、9000pg/mL超、10000pg/mL超、20000pg/mL超、30000pg/mL超、40000pg/mL超、50000pg/mL超、60000pg/mL超、70000pg/mL超、80000pg/mL超、90000pg/mL超、100000pg/mL超またはそれ以上のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、1000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、2000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、3000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、4000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、5000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、6000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、7000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、8000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、9000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、10000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、20000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、30000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、40000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、50000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、60000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、70000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、80000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、90000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、100000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、120000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、140000pg/mL超のグランザイムBを示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILであるTILグランザイムBである。いくつかの実施形態では、160000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、180000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、200000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、220000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、240000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、260000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、280000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、300000pg/mL超のグランザイムB分泌を示すTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dを含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、本発明の拡張方法は、拡張されていないTIL集団と比較して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dに提供されるTILを含む、インビトロで増加したグランザイムB分泌を示す拡張されたTIL集団を産生する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも1倍~50倍以上増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、1倍、少なくとも2倍、少なくとも3倍、少なくとも4倍、少なくとも5倍、少なくとも6倍、少なくとも7倍、少なくとも8倍、少なくとも9倍、少なくとも10倍、少なくとも20倍、少なくとも30倍、少なくとも40倍、少なくとも50倍以上増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも1倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも2倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも3倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも4倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも5倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも6倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも7倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも8倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも9倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも10倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも20倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも30倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも40倍増加する。いくつかの実施形態では、本発明の拡張されたTIL集団のグランザイムB分泌は、拡張されていないTIL集団と比較して、少なくとも50倍増加する。
いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上低いレベルのTNF-α(すなわち、TNF-アルファ)分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも1倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも2倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも3倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも4倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌と比較して、少なくとも5倍低いレベルのTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、少なくとも200pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α(すなわち、TNF-アルファ)分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも500pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも1000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも2000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも3000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも4000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも5000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも6000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも7000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも8000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。いくつかの実施形態では、少なくとも9000pg/mL/5e5細胞~約10,000pg/mL/5e5細胞以上のTNF-α分泌が可能なTILは、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILである。
いくつかの実施形態では、IFN-γ及びグランザイムBのレベルを測定して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILの表現型特性を決定する。いくつかの実施形態では、IFN-γ及びTNF-αのレベルを測定して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILの表現型特性を決定する。いくつかの実施形態では、グランザイムB及びTNF-αのレベルを測定して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILの表現型特性を決定する。いくつかの実施形態では、IFN-γ、グランザイムB、及びTNF-αのレベルを測定して、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dの方法を含む、本発明の拡張方法によって産生されたTILの表現型特性を決定する。
いくつかの実施形態では、表現型特徴付けは、凍結保存後に調べられる。
H.追加のプロセスの実施形態
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、(b)IL-2及びOKT-3を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行うことであって、プライミングによる第1の拡張を約1~7日間または約1~8日間行って第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団が、第1のTIL集団よりも数が多い、プライミングによる第1の拡張を行うことと、(c)第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及び外因性抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地と接触させて急速な第2の拡張を行って第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張を約1~11日間または約1~10日間行って第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団である、第3のTIL集団を産生することと、(d)ステップ(c)から取得された治療的TIL集団を採取することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間、または約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX500MCS容器に移すこととによって、培養のスケールアップを達成し、第2の容器内で、小規模培養由来の第2のTIL集団が、より大規模な培養で約4~7日間、または約4~8日間培養される。いくつかの実施形態では、急速な拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX100MCS容器内での第1の小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、第2の小規模培養で約4~7日間、または約約4~8日間培養される。いくつかの実施形態では、急速な拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間、または約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約4~7日間、または約4~8日間培養される。いくつかの実施形態では、急速な拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の増殖を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約5~7日間培養される。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、(b)IL-2及びOKT-3を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行うことであって、プライミングによる第1の拡張が約1~8日間行われて第2のTIL集団が取得され、第2のTIL集団は第1のTIL集団よりも数が多い、プライミングによる第1の拡張を行うことと、(c)第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3及び外因性抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地と接触させることによって急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張が約1~8日間行われて第3のTIL集団が取得され、第3のTIL集団が治療的TIL集団である、第3のTIL集団を産生することと、(d)ステップ(c)から取得された治療的TIL集団を採取することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移すこととによって、培養のスケールアップを達成し、第2の容器内で、小規模培養由来の第2のTIL集団が、より大規模な培養で約4~8日間培養される。いくつかの実施形態では、急速な拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での第1の小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、第2の小規模培養で約4~6日間培養される。いくつかの実施形態では、急速な拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の増殖を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約4~6日間培養される。いくつかの実施形態では、急速な拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の増殖を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約4~5日間培養される。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得することと、(b)IL-2及びOKT-3を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行うことであって、プライミングによる第1の拡張が約1~7日間行われ、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団は第1のTIL集団よりも数が多い、プライミングによる第1の拡張を行うことと、(c)第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3及び外因性抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地と接触させることによって急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張が約1~11日間行われ、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が治療的TIL集団である、第3のTIL集団を産生することと、(d)ステップ(c)から取得された治療的TIL集団を採取することと、を含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の増殖を行うことと、その後、(2)小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移すこととによって、培養のスケールアップを達成し、第2の容器内で、小規模培養由来の第2のTIL集団が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速な拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での第1の小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、第2の小規模培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速な拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の増殖を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速な拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(1)第2のTIL集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約4日間培養することによって急速な第2の増殖を行うことと、その後、(2)第1の小規模培養由来の第2のTIL集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第2のTIL集団の一部が、より大規模な培養で約5日間培養される。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、一次の第1の拡張が、第1のTIL集団を、外因性抗原提示細胞(APC)をさらに含む培養培地と接触させることによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)における培養培地中のAPCの数が、ステップ(b)における培養培地中のAPCの数よりも多い、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において培養培地に追加の外因性APCが補充されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約20:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約9:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約8:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約7:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約6:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1~正確にまたは約2:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約10:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約5:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約4:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約3:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.9:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.8:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.7:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.6:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.5:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.4:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.3:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.2:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1~正確にまたは約2.1:1の範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約2:1になるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数の、ステップ(b)において追加されるAPCの数に対する比が、正確にまたは約1.1:1、1.2:1、1.3:1、1.4:1、1.5:1、1.6:1、1.7:1、1.8:1、1.9:1、2:1、2.1:1、2.2:1、2.3:1、2.4:1、2.5:1、2.6:1、2.7:1、2.8:1、2.9:1、3:1、3.1:1、3.2:1、3.3:1、3.4:1、3.5:1、3.6:1、3.7:1、3.8:1、3.9:1、4:1、4.1:1、4.2:1、4.3:1、4.4:1、4.5:1、4.6:1、4.7:1、4.8:1、4.9:1、または5:1になるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、一次の第1の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約1×10、1.1×10、1.2×10、1.3×10、1.4×10、1.5×10、1.6×10、1.7×10、1.8×10、1.9×10、2×10、2.1×10、2.2×10、2.3×10、2.4×10、2.5×10、2.6×10、2.7×10、2.8×10、2.9×10、3×10、3.1×10、3.2×10、3.3×10、3.4×10、または3.5×10個のAPCになるように、かつ急速な第2の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約3.5×10、3.6×10、3.7×10、3.8×10、3.9×10、4×10、4.1×10、4.2×10、4.3×10、4.4×10、4.5×10、4.6×10、4.7×10、4.8×10、4.9×10、5×10、5.1×10、5.2×10、5.3×10、5.4×10、5.5×10、5.6×10、5.7×10、5.8×10、5.9×10、6×10、6.1×10、6.2×10、6.3×10、6.4×10、6.5×10、6.6×10、6.7×10、6.8×10、6.9×10、7×10、7.1×10、7.2×10、7.3×10、7.4×10、7.5×10、7.6×10、7.7×10、7.8×10、7.9×10、8×10、8.1×10、8.2×10、8.3×10、8.4×10、8.5×10、8.6×10、8.7×10、8.8×10、8.9×10、9×10、9.1×10、9.2×10、9.3×10、9.4×10、9.5×10、9.6×10、9.7×10、9.8×10、9.9×10、または1×10個のAPCになるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、一次の第1の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約1×10個のAPC~正確にまたは約3.5×10個のAPCの範囲から選択され、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約3.5×10個のAPC~正確にまたは約1×10個のAPCの範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、一次の第1の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約1.5×10個のAPC~正確にまたは約3×10個のAPCの範囲から選択され、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約4×10個のAPC~正確にまたは約7.5×10個のAPCの範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、一次の第1の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約2×10個のAPC~正確にまたは約2.5×10個のAPCの範囲から選択され、急速な第2の拡張において追加されるAPCの数が、正確にまたは約4.5×10個のAPC~正確にまたは約5.5×10個のAPCの範囲から選択されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、正確にまたは約2.5×10個のAPCが一次の第1の拡張に追加され、かつ正確にまたは約5×10個のAPCが急速な第2の拡張に追加されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、抗原提示細胞が末梢血単核細胞(PBMC)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の腫瘍断片が複数の別個の容器に分配され、それらの別個の容器の各々内で、第1のTIL集団がステップ(a)において取得され、第2のTIL集団がステップ(b)において取得され、第3のTIL集団がステップ(c)において取得され、ステップ(c)における複数の容器からの治療的TIL集団が組み合わせられて、ステップ(d)からの採取されたTIL集団を得るように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の腫瘍が複数の別個の容器に均一に分配されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が少なくとも2個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2~20個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2~15個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2~10個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2~5個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の別個の容器が2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の別個の容器を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、プライミングによる第1の拡張がステップ(b)において第1のTIL集団で行われる各容器の場合、ステップ(c)における急速な第2の拡張が、同じ容器内でかかる第1のTIL集団から産生された第2のTIL集団で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、別個の容器の各々が第1のガス透過性表面積を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の腫瘍断片が単一の容器に分配されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、単一の容器が第1のガス透過性表面積を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、ステップ(b)において、一次の第1の拡張が、第1のTIL集団の細胞培養培地に追加の抗原提示細胞(APC)を補充することによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1細胞層~正確にまたは約3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1.5細胞層~正確にまたは約2.5細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約2細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、または3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3細胞層~正確にまたは約10細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3、4、5、6、7、8、9、または10細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、または8細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む第1の容器内で行われ、ステップ(c)において、急速な第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を含む第2の容器内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第2の容器が第1の容器よりも大きいように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、ステップ(b)において、一次の第1の拡張が、第1のTIL集団の細胞培養培地に追加の抗原提示細胞(APC)を補充することによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1細胞層~正確にまたは約3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1.5細胞層~正確にまたは約2.5細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約2細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、または3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3細胞層~正確にまたは約10細胞層の平均厚さで第2のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さで第2のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3、4、5、6、7、8、9、または10細胞層の平均厚さで第2のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、または8細胞層の平均厚さで第2のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む第1の容器内で行われ、ステップ(c)において、急速な第2の拡張が、第1の容器内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、ステップ(b)において、一次の第1の拡張が、第1のTIL集団の細胞培養培地に追加の抗原提示細胞(APC)を補充することによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1細胞層~正確にまたは約3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1.5細胞層~正確にまたは約2.5細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約2細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、APCが、正確にまたは約1、1.1、1.2、1.3、1.4、1.5、1.6、1.7、1.8、1.9、2、2.1、2.2、2.3、2.4、2.5、2.6、2.7、2.8、2.9、または3細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3細胞層~正確にまたは約10細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4細胞層~正確にまたは約8細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約3、4、5、6、7、8、9、または10細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において、APCが、正確にまたは約4、4.1、4.2、4.3、4.4、4.5、4.6、4.7、4.8、4.9、5、5.1、5.2、5.3、5.4、5.5、5.6、5.7、5.8、5.9、6、6.1、6.2、6.3、6.4、6.5、6.6、6.7、6.8、6.9、7、7.1、7.2、7.3、7.4、7.5、7.6、7.7、7.8、7.9、または8細胞層の平均厚さで第1のガス透過性表面積上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:10の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:9の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:8の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:7の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:6の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:5の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:4の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:3の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1~正確にまたは約1:2の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.2~正確にまたは約1:8の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.3~正確にまたは約1:7の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.4~正確にまたは約1:6の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.5~正確にまたは約1:5の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.6~正確にまたは約1:4の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.7~正確にまたは約1:3.5の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.8~正確にまたは約1:3の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.9~正確にまたは約1:2.5の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のTIL集団の細胞培養培地を追加の抗原提示細胞(APC)で補充することにより一次の第1の拡張が行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:2の範囲から選択される、方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、一次の第1の拡張が、第1のTIL集団の細胞培養培地に追加の抗原提示細胞(APC)を補充することによって行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法であって、ステップ(c)において追加されるAPCの数が、ステップ(b)において追加されるAPCの数よりも多く、ステップ(b)において層状化されるAPCの層の平均数の、ステップ(c)において層状化されるAPCの層の平均数に対する比が、正確にまたは約1:1.1、1:1.2、1:1.3、1:1.4、1:1.5、1:1.6、1:1.7、1:1.8、1:1.9、1:2、1:2.1、1:2.2、1:2.3、1:2.4、1:2.5、1:2.6、1:2.7、1:2.8、1:2.9、1:3、1:3.1、1:3.2、1:3.3、1:3.4、1:3.5、1:3.6、1:3.7、1:3.8、1:3.9、1:4、1:4.1、1:4.2、1:4.3、1:4.4、1:4.5、1:4.6、1:4.7、1:4.8、1:4.9、1:5、1:5.1、1:5.2、1:5.3、1:5.4、1:5.5、1:5.6、1:5.7、1:5.8、1:5.9、1:6、1:6.1、1:6.2、1:6.3、1:6.4、1:6.5、1:6.6、1:6.7、1:6.8、1:6.9、1:7、1:7.1、1:7.2、1:7.3、1:7.4、1:7.5、1:7.6、1:7.7、1:7.8、1:7.9、1:8、1:8.1、1:8.2、1:8.3、1:8.4、1:8.5、1:8.6、1:8.7、1:8.8、1:8.9、1:9、1:9.1、1:9.2、1:9.3、1:9.4、1:9.5、1:9.6、1:9.7、1:9.8、1:9.9、または1:10から選択される、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団におけるTILの数の、第1のTIL集団におけるTILの数に対する比が、約1.5:1~約100:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団中のTILの数の、第1のTIL集団中のTILの数に対する比率が、正確にまたは約50:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団中のTILの数の、第1のTIL集団中のTILの数に対する比率が、正確にまたは約25:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団中のTILの数の、第1のTIL集団中のTILの数に対する比率が、正確にまたは約20:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のTIL集団中のTILの数の、第1のTIL集団中のTILの数に対する比率が、正確にまたは約10:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第2のTIL集団の数が、第1のTIL集団よりも少なくとも正確にまたは約50倍多いように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第2のTIL集団の数が、第1のTIL集団よりも少なくとも正確にまたは約1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、または50倍多いように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第2の期間の開始の正確にまたは約2日または正確にまたは約3日後に、細胞培養培地に追加のIL-2が補充されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、凍結保存プロセスを使用して、ステップ(d)において採取されたTIL集団を凍結保存するステップをさらに含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(d)の後に、(e)ステップ(d)から採取したTIL集団を、任意選択でHypoThermosolを含有する注入バッグに移す追加のステップを行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、凍結保存プロセスを使用して、ステップ(e)において採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存するステップを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、凍結保存プロセスが、採取されたTIL集団の凍結保存培地に対する1:1の比を使用して行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、抗原提示細胞が末梢血単核細胞(PBMC)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、PBMCが放射線照射され、かつ同種異系であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において細胞培養に追加されるAPCの総数が2.5×10であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)において細胞培養に追加されるAPCの総数が5×10であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、APCがPBMCであるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、PBMCが放射線照射され、かつ同種異系であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、抗原提示細胞が人工抗原提示細胞であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(d)での採取が膜ベースの細胞処理システムを使用して行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(d)での採取がLOVO細胞処理システムを使用して行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約5~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約10~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約15~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約20~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約25~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約30~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約35~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約40~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約45~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約50~正確にまたは約60個の断片を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、複数の断片が1容器当たり正確にまたは約2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、または60個の断片(複数可)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約27mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約20mm~正確にまたは約50mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約21mm~正確にまたは約30mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約22mm~正確にまたは約29.5mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約23mm~正確にまたは約29mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約24mm~正確にまたは約28.5mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約25mm~正確にまたは約28mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約26.5mm~正確にまたは約27.5mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、各断片が正確にまたは約21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、または50mmの体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の断片が正確にまたは約30~正確にまたは約60個の断片を含み、正確にまたは約1300mm~正確にまたは約1500mmの総体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の断片が正確にまたは約50個の断片を含み、正確にまたは約1350mmの総体積を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、複数の断片が正確にまたは約50個の断片を含み、正確にまたは約1グラム~正確にまたは約1.5グラムの総質量を有するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、細胞培養培地がG容器またはXuriセルバッグである容器内に提供されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、細胞培養培地中のIL-2濃度が約10,000IU/mL~約5000IU/mLであるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、細胞培養培地中のIL-2濃度が約6,000IU/mLであるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、凍結保存培地がジメチルスルホキシド(DMSO)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、凍結保存培地が7%~10%DMSOを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)における第1の期間が正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日の期間内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第2の期間が正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、7日、8日、9日、10日、または11日の期間内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)における第1の期間及びステップ(c)における第2の期間が各々、正確にまたは約1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日の期間内に個別に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)における第1の期間及びステップ(c)における第2の期間が各々、正確にまたは約5日、6日、または7日の期間内に個別に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(b)における第1の期間及びステップ(c)における第2の期間が各々、正確にまたは約7日の期間内に個別に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日~正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日~正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約16日~正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約17日~正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日~正確にまたは約17日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日~正確にまたは約17日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約16日~正確にまたは約17日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日~正確にまたは約16日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日~正確にまたは約16日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約16日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約17日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約18日で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約14日以内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約15日以内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約16日以内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(a)~(d)が合計で正確にまたは約18日以内で行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(d)で採取された治療的TIL集団が、TILの治療上有効な投与量に十分なTILを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量に十分なTILの数が、正確にまたは約2.3×1010~正確にまたは約13.7×1010であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第3のTIL集団が、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第3のTIL集団が、16日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍~5倍以上のインターフェロンガンマ産生を提供するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第3のTIL集団が、17日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍~5倍以上のインターフェロンガンマ産生を提供するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)における第3のTIL集団が、18日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍~5倍以上のインターフェロンガンマ産生を提供するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、ステップ(c)の第3のTIL集団から取得されたエフェクターT細胞及び/またはセントラルメモリーT細胞が、ステップ(b)の第2の細胞集団から取得されたエフェクターT細胞及び/またはセントラルメモリーT細胞と比較して増加したCD8及びCD28発現を示すように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器が密閉容器であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器がG容器であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器がGREX-10であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器がGREX-100であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、方法に列挙された各容器がGREX-500であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法によって作製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供する。
他の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、第1のTIL拡張が抗原提示細胞(APC)またはOKT3を追加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
他の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、第1のTIL拡張が抗原提示細胞(APC)を追加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
他の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、第1のTIL拡張がOKT3を追加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
他の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、第1のTIL拡張が抗原提示細胞(APC)及びOKT3を追加した。追加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
他の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、16日より長いプロセスによってプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
他の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、17日より長いプロセスによってプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
他の実施形態では、本発明は、患者の腫瘍組織から調製された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の治療的集団を提供し、この治療的TIL集団は、18日より長いプロセスによってプロセスによって調製されたTILと比較して、増加した有効性、増加したインターフェロンガンマ産生、及び/または増加したポリクローン性を提供する。
他の実施形態では、本発明は、増加したインターフェロンガンマ産生を提供する、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。
他の実施形態では、本発明は、増加したポリクローン性を提供する、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載された治療的TIL集団を提供する。
他の実施形態では、本発明は、増加した有効性を提供する、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、16日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、17日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、18日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、TILは、本明細書に記載の、例えば、上記のステップA~Fに記載の、または上記のステップA~Fによる(また、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dに示される)拡張プロセスによる少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、16日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、17日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、18日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、TILは、本明細書に記載の、例えば、上記のステップA~Fに記載の、または上記のステップA~Fによる(また、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dに示される)拡張プロセスによる少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、16日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、17日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、本発明は、治療的TIL集団が、18日より長いプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンガンマ産生が可能であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、TILは、本明細書に記載の、例えば、上記のステップA~Fに記載の、または上記のステップA~Fによる(また、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dに示される)拡張プロセスによる少なくとも3倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL拡張が抗原提示細胞(APC)を追加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能である治療的腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を提供する。他の実施形態では、TILは、本明細書に記載の、例えば、上記のステップA~Fに記載の、または上記のステップA~Fによる(また、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dに示される)拡張プロセスによる少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL拡張がOKT3を追加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能である治療的腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を提供する。他の実施形態では、TILは、本明細書に記載の、例えば、上記のステップA~Fに記載の、または上記のステップA~Fによる(また、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dに示される)拡張プロセスによる少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL拡張がAPCを追加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能である治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、TILは、本明細書に記載の、例えば、上記のステップA~Fに記載の、または上記のステップA~Fによる(また、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dに示される)拡張プロセスによる少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL拡張がOKT3を追加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能である治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、TILは、本明細書に記載の、例えば、上記のステップA~Fに記載の、または上記のステップA~Fによる(また、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dに示される)拡張プロセスによる少なくとも2倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL拡張がAPCを追加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンガンマ産生が可能である治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、TILは、本明細書に記載の、例えば、上記のステップA~Fに記載の、または上記のステップA~Fによる(また、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dに示される)拡張プロセスによる少なくとも1倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL拡張がOKT3を追加せずに行われるプロセスによって調製されたTILと比較して、少なくとも3倍多いインターフェロンガンマ産生が可能である治療的TIL集団を提供する。他の実施形態では、TILは、本明細書に記載の、例えば、上記のステップA~Fに記載の、または上記のステップA~Fによる(また、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48Dに示される)拡張プロセスによる少なくとも3倍多いインターフェロンガンマ産生が可能になる。
他の実施形態では、本発明は、腫瘍断片が、小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物であるように修正された、上記の該当する前の段落のいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、腫瘍断片がコア生検であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、腫瘍断片が細針吸引物であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、腫瘍断片が小生検(例えば、パンチ生検を含む)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、腫瘍断片がコア針生検であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1つ以上の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から第1のTIL集団を得ることを含み、(ii)方法が、プライミングによる第1の拡張ステップを行う前に、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、約8日間にわたってプライミングによる第1の拡張を行うことを含み、かつ(iv)方法が、約11日間にわたって急速な第2の拡張を行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
他の実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1つ以上の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から第1のTIL集団を得ることを含み、(ii)方法が、プライミングによる第1の拡張ステップを行う前に、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、約8日間にわたってプライミングによる第1の拡張を行うことを含み、かつ(iv)方法が、第2のTIL集団の培養物を約5日間培養し、培養物を最大5つの継代培養物に分割し、かつ継代培養物を約6日間培養することによって、急速な第2の拡張を行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、最大5つの継代培養物が各々、第2のTIL集団の培養が急速な第2の拡張で開始される容器と同じサイズのまたはそれよりも大きい容器内で培養される。前述の実施形態のうちのいくつかでは、第2のTIL集団の培養物は、最大5つの継代培養物間で均等に分けられる。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検、または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア生検から第1のTIL集団を得ることを含み、(ii)方法が、プライミングによる第1の拡張ステップを行う前に、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、第1のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む培養培地中で約8日間培養することによってプライミングによる第1の拡張ステップを行い、第2のTIL集団を得ることを含み、かつ(iv)方法が、第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及びAPCを含む培養培地中で約11日間培養することによって急速な第2の拡張ステップを行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個のコア生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のコア生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のコア生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個の細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個の細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個のコア針生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア針生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のコア針生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のコア針生検から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、第1のTIL集団が、対象由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア生検から第1のTIL集団を得ることを含み、(ii)方法が、プライミングによる第1の拡張ステップを行う前に、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、第1のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む培養培地中で約8日間培養することによってプライミングによる第1の拡張ステップを行い、第2のTIL集団を得ることを含み、かつ(iv)方法が、第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及びAPCを含む培養培地中で約11日間培養することによって急速な第2の拡張ステップを行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
いくつかの実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア生検から第1のTIL集団を取得することを含み、(ii)方法が、プライミングによる第1の拡張ステップを行う前に、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、第1のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む培養培地中で約8日間培養することによってプライミングによる第1の拡張ステップを行い、第2のTIL集団を取得することを含み、かつ(iv)方法が、第2のTIL集団の培養物を、IL-2、OKT-3、及びAPCを含む培養培地中で約5日間培養し、培養物を最大5つの継代培養物に分割し、かつ継代培養物の各々を、IL-2を含む培養培地中で約6日間培養することによって、急速な第2の拡張を行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、最大5つの継代培養物が各々、第2のTIL集団の培養が急速な第2の拡張で開始される容器と同じサイズのまたはそれよりも大きい容器内で培養される。前述の実施形態のうちのいくつかでは、第2のTIL集団の培養物は、最大5つの継代培養物間で均等に分けられる。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
いくつかの実施形態では、本発明は、(i)方法が、対象由来の腫瘍組織の1~約10個のコア生検から第1のTIL集団を取得することを含み、(ii)方法が、プライミングによる第1の拡張ステップを行う前に、G-REX100Mフラスコ内の0.5LのCM1培養培地中6000IU IL-2/mLを含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を約3日間培養するステップを行うことを含み、(iii)方法が、6000IU/mL IL-2、30ng/mL OKT-3、及び約10個のフィーダー細胞を含む0.5LのCM1培養培地を添加し、約8日間培養することによって、プライミングによる第1の拡張を行うことを含み、かつ(iv)方法が、(a)第2のTIL集団を、3000IU/mL IL-2、30ng/mL OKT-3、及び5×10個のフィーダー細胞を有する5LのCM2培養培地を含むG-REX500MCSフラスコに移し、約5日間培養し、(b)10個のTILを、3000IU/mL IL-2を有する5LのAIM-V培地を含む最大5つのG-REX500MCSフラスコの各々に移すことによって培養物を最大5つの継代培養物に分割し、継代培養物を約6日間培養することによって、急速な第2の拡張を行うことを含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。前述の実施形態のうちのいくつかでは、方法のこれらのステップは、約22日で完了する。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞を拡張する方法であって、(a)第1のT細胞集団を培養することによってドナーから取得された第1のT細胞集団のプライミングによる第1の拡張を行って成長をもたらし、第1のT細胞集団の活性化をプライミングすることと、(b)ステップ(a)においてプライミングされた第1のT細胞集団の活性化が減衰し始めた後、第1のT細胞集団を培養することによって第1のT細胞集団の急速な第2の拡張を行って成長をもたらし、第1のT細胞集団の活性化を促進して第2のT細胞集団を取得することと、(c)第2のT細胞集団を採取することと、を含む、T細胞を拡張する方法を提供する。いくつかの実施形態では、急速な第2の拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX-100 MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養での第1のT細胞集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移し、小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第2の容器内でのより大規模な培養で約4~7日間培養することとによって、培養のスケールアップを達成する。いくつかの実施形態では、急速な拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での第1の小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)第1の小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、第2の小規模培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速な拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約4~7日間培養される。いくつかの実施形態では、急速な拡張ステップは、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約5日間培養される。
いくつかの実施形態では、本発明は、急速な第2の拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX-100 MCS容器内での小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養での第1のT細胞集団を、第1の容器よりも大きい第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移し、小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第2の容器内でのより大規模な培養で約5~7日間培養することとによって、培養のスケールアップを達成するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分割されて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での第1の小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)第1の小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器とサイズが等しい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウトを達成するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、各第2の容器内で、第1の小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、第2の小規模培養で約5~7日間培養される。
いくつかの実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約2~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約5~7日間培養される。
いくつかの実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約5~6日間培養される。
いくつかの実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約5日間培養される。
いくつかの実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約6日間培養される。
いくつかの実施形態では、本発明は、急速拡張のステップが、複数のステップに分けられて、(a)第1のT細胞集団を、第1の容器、例えば、G-REX 100MCS容器内での小規模培養で約3~4日間培養することによって急速な第2の拡張を行うことと、その後、(b)小規模培養由来の第1のT細胞集団を、第1の容器よりもサイズが大きい2、3、または4個の第2の容器、例えば、G-REX 500MCS容器に移して配分することとによって、培養のスケールアウト及びスケールアップを達成するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供し、各第2の容器内で、小規模培養由来のかかる第2の容器に移された第1のT細胞集団の一部が、より大規模な培養で約7日間培養される。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)のプライミングによる第1の拡張が最大7日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(b)の急速な第2の拡張が最大8日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(b)の急速な第2の拡張が最大9日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(b)の急速な第2の拡張が最大10日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(b)の急速な第2の拡張が最大11日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が7日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大9日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が7日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大10日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が7日または8日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大9日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が7日または8日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大10日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が8日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大9日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)におけるプライミングによる第1の拡張が8日の期間中に行われ、かつステップ(b)の急速な第2の拡張が最大8日の期間中に行われるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団がOKT-3及びIL-2を含む第1の培養培地中で培養されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1の培養培地が4-1BBアゴニスト、OKT-3及びIL-2を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1の培養培地がOKT-3、IL-2及び抗原提示細胞(APC)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1の培養培地が4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2及び抗原提示細胞(APC)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第1のT細胞集団がOKT-3、IL-2及び抗原提示細胞(APC)を含む第2の培養培地中で培養されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2の培養培地が4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2及び抗原提示細胞(APC)を含むように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団が、第1のガス透過性表面を含む容器内の第1の培養培地中で培養され(ここで、第1の培養培地が、OKT-3、IL-2及び第1の抗原提示細胞(APC)集団を含み、第1のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第1のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化される)、ステップ(b)において、第1のT細胞集団が、容器内の第2の培養培地中で培養される(ここで、第2の培養培地が、OKT-3、IL-2及び第2のAPC集団を含み、第2のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第2のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化され、第2のAPC集団が、第1のAPC集団よりも多い)ように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団が、第1のガス透過性表面を含む容器内の第1の培養培地中で培養され(ここで、第1の培養培地が、4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2及び第1の抗原提示細胞(APC)集団を含み、第1のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第1のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化される)、ステップ(b)において、第1のT細胞集団が、容器内の第2の培養培地中で培養される(ここで、第2の培養培地が、OKT-3、IL-2及び第2のAPC集団を含み、第2のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第2のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化され、第2のAPC集団が、第1のAPC集団よりも多い)ように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団が、第1のガス透過性表面を含む容器内の第1の培養培地中で培養され(ここで、第1の培養培地が、OKT-3、IL-2及び第1の抗原提示細胞(APC)集団を含み、第1のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第1のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化される)、ステップ(b)において、第1のT細胞集団が、容器内の第2の培養培地中で培養される(ここで、第2の培養培地が、4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2及び第2のAPC集団を含み、第2のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第2のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化され、第2のAPC集団が、第1のAPC集団よりも多い)ように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のT細胞集団が、第1のガス透過性表面を含む容器内の第1の培養培地中で培養され(ここで、第1の培養培地が、4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2及び第1の抗原提示細胞(APC)集団を含み、第1のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第1のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化される)、ステップ(b)において、第1のT細胞集団が、容器内の第2の培養培地中で培養される(ここで、第2の培養培地が、4-1BBアゴニスト、OKT-3、IL-2及び第2のAPC集団を含み、第2のAPC集団が、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であり、第2のAPC集団が、第1のガス透過性表面上に層状化され、第2のAPC集団が、第1のAPC集団よりも多い)ように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2のAPC集団中のAPCの数の、第1のAPC集団中のAPCの数に対する比が約2:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のAPC集団中のAPCの数が約2.5×10あり、第2のAPC集団中のAPCの数が約5×10であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が、2層のAPCの平均厚さで第1のガス透過性表面上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が、4~8層のAPCから選択される平均厚さで第1のガス透過性表面上に層状化されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(b)において第1のガス透過性表面上に層状化されたAPCの平均層数の、ステップ(a)において第1のガス透過性表面上に層状化されたAPCの平均層数に対する比が、2:1であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が約1.0×10APC/cm~約4.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が約1.5×10APC/cm~約3.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が約2.0×10APC/cm~約3.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約2.0×10APC/cmの密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約2.5×10APC/cm~正確にまたは約7.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約3.5×10APC/cm~正確にまたは約6.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約4.0×10APC/cm~正確にまたは約5.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約4.0×10APC/cmの密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約1.0×10APC/cm~正確にまたは約4.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種され、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約2.5×10APC/cm~正確にまたは約7.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約1.5×10APC/cm~正確にまたは約3.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種され、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約3.5×10APC/cm~正確にまたは約6.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約2.0×10APC/cm~正確にまたは約3.0×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種され、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約4.0×10APC/cm~正確にまたは約5.5×10APC/cmの範囲から選択される密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(a)において、第1のAPC集団が正確にまたは約2.0×10APC/cmの密度で第1のガス透過性表面に播種され、ステップ(b)において、第2のAPC集団が正確にまたは約4.0×10APC/cmの密度で第1のガス透過性表面に播種されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、APCが末梢血単核細胞(PBMC)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、PBMCが放射線照射され、第1のT細胞集団のドナーに対して外因性であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞が腫瘍浸潤リンパ球(TIL)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞が骨髄浸潤リンパ球(MIL)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞が末梢血リンパ球(PBL)であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団がドナーの全血からの分離によって取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団がドナーのアフェレーシス産物からの分離によって取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、T細胞表現型の正または負の選択によってドナーの全血またはアフェレーシス産物から分離されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞表現型がCD3+及びCD45+であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団のプライミングによる第1の拡張を行う前に、T細胞がNK細胞から分離されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。いくつかの実施形態では、T細胞は、第1のT細胞集団からのCD3-CD56+細胞の除去によって、第1のT細胞集団中のNK細胞から分離される。いくつかの実施形態では、CD3-CD56+細胞は、CD3-CD56+細胞画分を除去し、かつ陰性画分を回収するゲーティング戦略を使用して、第1のT細胞集団を細胞選別に供することによって、第1のT細胞集団から除去される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、高いNK細胞パーセンテージを特徴とする第1のT細胞集団におけるT細胞の拡張のために利用される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、高いCD3-CD56+細胞パーセンテージを特徴とする第1のT細胞集団におけるT細胞の拡張のために利用される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、多数のNK細胞の存在を特徴とする腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、多数のCD3-CD56+細胞を特徴とする腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、多数のNK細胞の存在を特徴とする腫瘍に罹患している患者から取得された腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、多数のCD3-CD56+細胞の存在を特徴とする腫瘍に罹患している患者から取得された腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。いくつかの実施形態では、前述の方法は、卵巣癌に罹患している患者から取得された腫瘍組織におけるT細胞の拡張のために利用される。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団由来の正確にまたは約1×10T細胞が容器内に播種されて、かかる容器内で一次の第1の拡張を開始するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が複数の容器に分配され、各容器内で、第1のT細胞集団由来の正確にまたは約1×10T細胞が播種されて、かかる容器内で一次の第1の拡張を開始するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、ステップ(c)において採取された第2のT細胞集団が治療的TIL集団であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)、コア生検、コア針生検または細針吸引物から得られるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上のコア生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個のコア生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個のコア生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のコア生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のコア生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上の細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個の細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個の細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の細針吸引物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の小生検(例えば、パンチ生検を含む)から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1つ以上のコア針生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~20個のコア針生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1~10個のコア針生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のコア針生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第1のT細胞集団が、ドナー由来の腫瘍組織の1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個のコア針生検から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、i)IL-2を含む第1の細胞培養倍地中で腫瘍試料を約3日間培養することによって対象における腫瘍の1つ以上の小生検、コア生検、または針生検から取得された腫瘍試料から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、(ii)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む第2の細胞培養倍地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、プライミングによる第1の拡張が第1のガス透過性表面積を含む容器内で行われ、プライミングによる第1の拡張が約7日または8日の第1の期間行われて、第2のTIL集団を取得し、第2のTIL集団は第1のTIL集団よりも数が多い、第2のTIL集団を産生することと、(iii)第2のTIL集団の第2の細胞培養倍地に追加のIL-2、OKT-3、及びAPCを補充することによって急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張において添加されるAPCの数が、ステップ(ii)において添加されるAPCの数の少なくとも2倍であり、急速な第2の拡張が約11日の第2の期間行われて、第3のTIL集団が取得され、第3のTIL集団が治療的TIL集団であり、急速な第2の拡張が第2のガス透過性表面積を含む容器内で行われる、第3のTIL集団を産生することと、(iv)ステップ(iii)から取得され治療的TIL集団を採取することと、(v)ステップ(iv)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、(i)IL-2を含む第1の細胞培養倍地中で腫瘍試料を約3日間培養することによって対象における腫瘍の1つ以上の小生検、コア生検、または針生検から取得された腫瘍試料から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、(ii)IL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む第2の細胞培養倍地中で第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、プライミングによる第1の拡張が約7日または8日間の第1の期間行われて、第2のTIL集団が取得され、第2のTIL集団は第1のTIL集団よりも数が多い、第2のTIL集団を産生することと、(iii)第2のTIL集団を、IL-2、OKT-3、及びAPCを含む第3の細胞培養培地と接触させることによって急速な第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、急速な第2の拡張が約11日間の第2の期間行われて、第3のTIL集団が取得され、第3のTIL集団が治療的TIL集団である、第3のTIL集団を産生することと、(iv)ステップ(iii)から取得された治療的TIL集団を採取することと、を含む、方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2の期間の5日目の後に、培養物が2つ以上の継代培養物に分割され、各継代培養物に追加量の第3の培養培地が補充され、約6日間培養されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2の期間の5日目の後に、培養物が2つ以上の継代培養物に分割され、各継代培養物にIL-2を含む第4の培養培地が補充され、約6日間培養されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、第2の期間の5日目の後に、培養物が最大5つの継代培養物に分割されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、方法におけるすべてのステップが約24日で完了するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。いくつかの実施形態では、本発明は、方法におけるすべてのステップが約22日で完了するように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞を拡張する方法であって、(i)第1のT細胞集団を培養することによって、ドナーにおける腫瘍の1つ以上の小生検、コア生検、または針生検から取得された腫瘍細胞由来の第1のT細胞集団のプライミングによる第1の拡張を行って成長をもたらし、第1のT細胞集団の活性化をプライミングすることと、(ii)ステップ(a)においてプライミングされた第1のT細胞集団の活性化が減衰し始めた後に、第1のT細胞集団を培養することによって第1のT細胞集団の急速な第2の拡張を行って成長をもたらし、第1のT細胞集団の活性化を促進して第2のT細胞集団を取得することと、(iv)第2のT細胞集団を採取することと、を含む、T細胞を拡張する方法を提供する。いくつかの実施形態では、腫瘍試料は、複数のコア生検から得られる。いくつかの実施形態では、複数のコア生検は、2、3、4、5、6、7、8、9及び10個のコア生検からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、本発明は、T細胞またはTILが腫瘍消化物から取得されるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載される方法。いくつかの実施形態では、腫瘍消化物は、例えば、RPMI1640、2mM GlutaMAX、10mg/mLゲンタマイシン、30U/mL DNase、及び1.0mg/mLコラゲナーゼであるが、これらに限定されない酵素培地中で腫瘍をインキュベートすること、続いて、機械的解離(GentleMACS,Miltenyi Biotec,Auburn,CA)によって生成される。いくつかの実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはタイプのコラゲナーゼを含む)、Accutase(商標)、Accumax(商標)、ヒアルロニダーゼ、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)、キモトリプシン、キモパパイン、トリプシン、カゼイナーゼ、エラスターゼ、パパイン、プロテアーゼタイプXIV(プロナーゼ)、デオキシリボヌクレアーゼI(DNase)、トリプシン阻害剤、任意の他の解離酵素またはタンパク質分解酵素、及びこれらの任意の組み合わせ等の1つ以上の解離(消化)酵素を含むが、これらに限定されない腫瘍解離酵素混合物の中に配置される。他の実施形態では、腫瘍は、コラゲナーゼ(任意のブレンドまたはタイプのコラゲナーゼを含む)、中性プロテアーゼ(ディスパーゼ)及びデオキシリボヌクレアーゼI(DNase)を含む腫瘍解離酵素混合物中に配置される。
VIII.免疫調節剤関連腫瘍浸潤リンパ球
本明細書で提供されるのは、TIL細胞表面と会合する1つ以上の免疫調節剤を含む修飾された腫瘍浸潤リンパ球(TIL)である。いくつかの実施形態では、対象の修飾されたTILは、患者レシピエントにおけるインビボ生存、増殖及び/または抗腫瘍効果の向上を示す。
免疫調節剤は、任意の好適な方法を使用して、本明細書に開示されるTIL(例えば、本明細書で提供される治療薬TIL)に付着させることができる。いくつかの実施形態では、1種以上の免疫調節剤は、TIL細胞表面に付着される免疫調節融合タンパク質の一部である。いくつかの実施形態では、1種以上の免疫調節剤は、TIL細胞表面と会合するナノ粒子の一部として含まれる。免疫調節剤は、患者レシピエントにおけるTIL生存増殖、及び/または抗腫瘍効果を促進する任意の免疫調節剤であり得る。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、サイトカイン(例えば、インターロイキン)である。例示的な実施形態では、TILは、IL-12、IL-15、及び/またはIL-21を含む。
任意の好適なTIL集団は、本明細書に記載の製造プロセスを使用して産生されるTILを含む、対象の組成物を産生するように修飾され得る。いくつかの実施形態では、修飾されたTILは、本明細書のプロセス2A方法開示のステップのうちのいずれかの間に産生されるTILに由来する(例えば、図2~6を参照)。例示的な実施形態では、修飾されたTILは、本明細書のGEN3方法開示のステップのうちのいずれかの間に産生されるTILに由来する(例えば、図7を参照)。いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に開示される方法に由来するPD-1陽性TILである。
対象の修飾されたTILの態様は、本明細書でさらに詳述される。
A.免疫調節融合タンパク質
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、TILの表面への免疫調節剤のテザリングを容易にする部分に連結された免疫調節剤(例えば、サイトカイン)を含む免疫調節融合タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、融合タンパク質は、細胞膜アンカー部分(膜貫通ドメイン)を含む。ある特定の実施形態では、融合タンパク質は、TIL表面抗原に結合するTIL表面抗原結合部分を含む。これらの融合タンパク質の態様は、以下でさらに詳細に考察される。
1.膜アンカー免疫調節融合タンパク質
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含む。膜アンカー免疫調節融合タンパク質は、細胞膜アンカー部分に連結された免疫調節剤(例えば、サイトカイン)のうちの1つ以上を含む。そのような実施形態では、膜アンカー免疫調節剤は、細胞膜アンカー部分を介してTIL表面膜にテザリングされ、したがって、免疫調節剤がその効果を標的化された方法で発揮することを可能にする。
免疫調節剤は、例えば、本明細書で提供される免疫調節剤のうちのいずれかを含む、任意の好適な免疫調節剤であり得る。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、抗腫瘍応答を促進するインターロイキンである。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、サイトカインである。特定の実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、またはCD40アゴニスト(例えば、CD40Lもしくはアゴニスト抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40scFv))またはその生体活性バリアントである。ある特定の実施形態では、2つ以上の異なる膜アンカー免疫調節融合タンパク質が、TIL表面上で発現される。例示的な実施形態では、TILは、2、3、4、5、6、7、8、9、または10の異なる膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含む。
免疫調節剤は、免疫調節剤の、TIL細胞表へのテザリングを可能にする細胞膜アンカー部分に連結される。好適な細胞膜アンカー部分には、例えば、内因性TIL細胞表面タンパク質の膜貫通ドメイン及びそれらの断片が含まれる。対象の融合タンパク質で使用することができる例示的な膜貫通ドメインには、例えば、B7-1、B7-2、及びCD8a膜貫通ドメイン及びそれらの断片が含まれる。いくつかの実施形態では、細胞膜アンカー部分は、内因性TIL細胞表面タンパク質の膜貫通ドメイン及び細胞内ドメインまたはその断片をさらに含む。いくつかの実施形態では、細胞膜アンカー部分は、B7-1、B7-2もしくはCD8a膜貫通細胞内ドメインまたはその断片である。ある特定の実施形態では、細胞膜アンカー部分は、IYIWAPLAGTCGVLLLSLVIT(配列番号238)のアミノ酸配列を有するCD8a膜貫通ドメインである。ある特定の実施形態では、細胞膜アンカー部分は、LLPSWAITLISVNGIFVICCLTYCFAPRCRERRRNERLRRESVRPV(配列番号239)のアミノ酸配列を有するB7-1膜貫通細胞内ドメインである。ある特定の実施形態では、細胞膜アンカー部分は、非ペプチド細胞膜アンカー部分である。例示的な実施形態では、非ペプチド細胞膜アンカー部分は、グリコホスファチジルイノシトール(GPI)アンカーである。GPIアンカーは、ホスホエタノールアミンリンカー、糖鎖コア、及びリン脂質尾部を含む構造を有する。いくつかの実施形態では、糖鎖コアは、1つ以上の側鎖で修飾される。いくつかの実施形態では、糖鎖コアは、以下の側鎖:ホスホエタノールアミン基、マンノース、ガラクトース、シアル酸、または他の糖のうちの1つ以上で修飾される。
膜アンカー免疫調節融合タンパク質は、膜アンカー免疫調節融合タンパク質(例えば、細胞膜アンカー部分に対する免疫調節剤)の成分の連結を可能にするリンカーを含む。好適なリンカーとしては、少なくとも約5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、または30アミノ酸残基の長さであるリンカーが挙げられる。いくつかの実施形態では、リンカーは、5~10、10~15、15~20、20~25、25~30、30~35、35~40、45~50、50~60アミノ酸の長さである。好適なリンカーとしては、限定されないが、切断可能なリンカー、非切断可能なリンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリカルリンカー、または非ヘリカルリンカーが挙げられる。いくつかの実施形態では、リンカーは、Gly及びSerを任意選択で含むペプチドリンカーである。ある特定の実施形態では、ペプチドリンカーは、例えば、(GS)n(配列番号240)、(GSGGS)n(配列番号241)、(GGGS)n(配列番号242)、(GGGGS)n(配列番号243)、(GGGGGS)n(配列番号244)、及び(GGGGGGS)n(配列番号245)を含む、グリシン-セリンポリマーを利用し、nは、少なくとも1つの整数(及び一般に、3~10)である。本組成物及び方法で使用することができる追加のリンカーは、米国特許公開第2006/0074008号、同第2005/0238649号、及び2006/0024317号に記載されており、これらの各々は参照によりその全体が本明細書に組み込まれ、特にリンカーに関連する関連部分に組み込まれる。いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーは、SGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGSLQ(配列番号246)である。
いくつかの実施形態では、リンカーは、切断不可能なリンカーである。例示的な実施形態では、切断可能なリンカーは、免疫調節剤の、腫瘍微小環境への放出を可能にする。切断可能なリンカーは、2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質が同じTILで共発現される実施形態においても有用である(例えば、図51ならびに以下の表58及び59を参照されたい)。



例示的な実施形態では、リンカーは、自己切断2Aペプチドである。例えば、Liu et al.,Sci.Rep.7(1):2193(2017)を参照されたく、これは、2Aペプチドに関連する関連部分に参照により組み込まれる。2Aペプチドは、真核細胞における翻訳中のポリペプチドの切断を媒介するウイルスオリゴペプチドである。いくつかの実施形態では、2Aペプチドは、アミノ酸配列GDVEXiNPGP(配列番号247)を有するC末端を含み、Xiは、任意の天然に存在するアミノ酸残基である。ある特定の実施形態では、2Aペプチドは、ブタテシオウイルス-1 2Aペプチド(GSGATNFSLLKQAGDVEENPGP、配列番号248)である。いくつかの実施形態では、2Aペプチドは、ウマ鼻炎Aウイルス2Aペプチド(GSGQCTNYALLKLAGDVESNPGP、配列番号249)である。ある特定の実施形態では、2Aペプチドは、口蹄疫ウイルス2Aペプチド:(GSGEGRGSLLTCGDVEENPGP、配列番号250)である。いくつかの実施形態では、切断可能なリンカーは、フリン切断可能な配列を含む。例示的なフリン切断可能配列は、例えば、Duckert et al.,Protein Engineering,Design&Selection 17(1):107-112(2004)、及び米国特許第8,871,906号に記載されており、これらの各々は参照により、特にフリン切断可能配列に関連する関連部分において本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、リンカーは、2Aペプチド及びフリン切断可能な配列を含む。例示的ない実施形態では、フリン切断可能な2Aペプチドは、アミノ酸配列RAKRSGSGATNFSLLKQAGDVEENPGP(配列番号251)を含む。
いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、生理学的条件下で、リンカーが分解し、それによって免疫調節剤を放出するように、分解可能なリンカー(例えば、ジスルフィドリンカー)によって膜アンカー免疫調節融合タンパク質に付着される。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、生理学的条件下で、リンカーが分解し、免疫調節剤を放出するように、分解可能なリンカーを介して官能基に可逆的に連結される。好適な分解可能なリンカーには、腫瘍微小環境または炎症組織中に存在するマトリックスメタロプロテアーゼ(例えば、マトリックスメタロプロテアーゼ2(MMP2)またはマトリックスメタロプロテアーゼ9(MMP9))などの腫瘍微小環境中のプロテアーゼなどの生物学的培地中に存在する1つ以上の酵素に感受性であるプロテアーゼ感受性リンカーが含まれるが、これに限定されない。
他の実施形態では、膜アンカー免疫調節融合タンパク質の成分は、酵素感受性リンカーによって連結される。例示的な切断可能なリンカーとしては、以下の酵素:メタロプロテアーゼMMP-1、MMP-2、MMP-3、MMP-8、MMP-9、MMP-14、プラスミン、PSA、PSMA、カテプシンD、カテプシンK、カテプシンS、ADAM10、ADAM12、ADAMTS、カスパーゼ-1、カスパーゼ-2、カスパーゼ-3、カスパーゼ-4、カスパーゼ-5、カスパーゼ-6、カスパーゼ-7、カスパーゼ-8、カスパーゼ-9、カスパーゼ-10、カスパーゼ-11、カスパーゼ-12、カスパーゼ-13、カスパーゼ-14、及びTACEのうちの1つによって認識されるものが挙げられる。例えば、米国特許第8,541,203号及び同第8,580,244号(これらの各々は参照によりその全体が組み込まれ、切断可能なリンカーに関連する関連部分に組み込まれる)を参照されたい。
ある特定の実施形態では、膜アンカー免疫調節融合タンパク質は、融合タンパク質の、TIL細胞膜への転座を容易にするシグナルペプチドを含む。融合タンパク質の、TIL細胞膜への局在化を容易にする任意の好適なシグナルペプチドを使用することができる。いくつかの実施形態では、シグナルペプチドは、免疫調節剤の生体活性を干渉しない。例示的なシグナルペプチド配列としては、ヒト顆粒球-マクロファージコロニー刺激因子(GM-CSF)受容体シグナル配列、ヒトプロラクチンシグナル配列、及びヒトIgEシグナル配列が挙げられるが、これらに限定されない。ある特定の実施形態では、融合タンパク質は、ヒトIgEシグナル配列を含む。例示的な実施形態では、ヒトIgEシグナル配列は、アミノ酸配列MDWTWILFLVAAATRVHS(配列番号252)を有する。いくつかの実施形態では、ヒトIgEシグナル配列は、アミノ酸配列NIKGSPWKGSLLLLLVSNLLLCQSVAP(配列番号253)を含む。いくつかの実施形態では、シグナルペプチド配列は、アミノ酸配列MYRMQLLSCIALSLALVTNS(配列番号254)を有するIL-2シグナル配列である。
いくつかの実施形態では、膜アンカー免疫調節融合タンパク質は、N末端からC末端へ、式:
S-IA-L-Cに従うものであり、
式中、Sは、シグナルペプチドであり、IAは、免疫調節剤であり、Lは、リンカーであり、Cは、細胞膜アンカー部分である。
いくつかの実施形態では、シグナルペプチドSは、配列番号252~254のうちのいずれか1つである。いくつかの実施形態では、細胞膜アンカー部分は、配列番号277である。例示的な実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、またはCD40アゴニスト(例えば、本明細書に記載のCD40Lもしくは抗CD40 scFv)である。いくつかの実施形態では、Cは、B7-1膜貫通-細胞内ドメイン(例えば、配列番号239)である。上記式による例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質を図51及び52に示す。
いくつかの実施形態では、TILは、N末端からC末端へ、式:S-IA-L-Cに従う2つ以上の異なる膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、異なる膜アンカー免疫調節融合タンパク質の各々が、異なる免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、2つ以上の異なる免疫調節剤は、IL-12及びIL-15、IL-15及びIL-18、CD40L及びIL-15、IL-15及びIL-21、ならびにIL-2及びIL-12からなる群から選択される。
2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含むいくつかの実施形態では、膜アンカー免疫調節融合タンパク質は、N末端からC末端へ、式:
S1-IA1-L1-C1-L2-S2-IA2-L3-C2に従って配置され、
式中、S1及びS2は、各々シグナルペプチドであり、IA1及びIA2は、各々免疫調節剤であり、L1-L3は、各々リンカーであり、C1及びC2は、各々細胞膜アンカー部分である。いくつかの実施形態では、IA1及びIA2は、同じ免疫調節剤である。ある特定の実施形態では、IA1及びIA2は、異なる免疫調節剤である。本明細書に記載されるもののうちのいずれかを含む、好適な免疫調節剤。いくつかの実施形態では、IA1及びIA2は、独立して、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、CD40アゴニスト(例えば、CD40Lまたはアゴニスト抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40 scFv))、またはそれらの生体活性バリアントから選択される。いくつかのさらなる実施形態では、IA1及びIA2は、IL-12及びIL-15、IL-15及びIL-18、CD40L及びIL-15、IL-15及びIL-21、ならびにIL-2及びIL-12からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、L1~L3のうちの1つ以上は、切断可能なリンカーである。いくつかの実施形態では、L1~L3のうちの2つ以上は、異なるリンカーである。例示的な実施形態では、L2は、切断可能なリンカーである。いくつかの実施形態では、L2は、フリン切断可能なP2Aリンカーである(例えば、配列番号251)。いくつかの実施形態では、C1及びC2は、独立して、膜貫通ドメイン及び/または膜貫通-細胞内ドメインである。ある特定の実施形態では、C1及びC2は、同じである。例示的な実施形態では、C1及びC2は、各々B7-1膜貫通-細胞内ドメイン(例えば、配列番号239)である。例示的な実施形態では、C1とC2は異なる。上記式による2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含む例示的な構築物を、図51、ならびに表58及び59に示す。
それらの表面と会合する細胞膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含む修飾されたTILは、融合タンパク質をコードする核酸を含むようにTIL集団を遺伝子修飾することによって作製することができる。任意の好適な遺伝子修飾方法を使用して、例えば、本明細書に記載のCRISPR法、TALE法、及びジンクフィンガー法を含む、そのような修飾されたTILを産生することができる。
任意の好適なTIL集団を遺伝子修飾して、対象の修飾されたTIL組成物を作製することができる。いくつかの実施形態では、本明細書のプロセス2A方法開示のステップのうちのいずれかの間に産生されたTIL集団(例えば、図2~6を参照)は、対象の修飾されたTILを産生するように遺伝子修飾される。例示的な実施形態では、本明細書のGEN3方法開示のステップのうちのいずれかの間に産生されたTIL集団(例えば、図7を参照)は、対象の修飾されたTILを産生するように遺伝子修飾される。例示的な実施形態では、本明細書で提供されるプロセス2A方法の第2のステップ及び/またはGEN3方法の急速拡張ステップから産生されるTILは、対象の修飾されたTILを産生するように遺伝子修飾される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法を使用して事前に選択されたPD-1陽性TILは、対象の修飾されたTILを産生するように遺伝子修飾される。
任意の好適なTIL集団を一過的に遺伝子修飾して、対象の一過的に修飾されたTIL組成物を作製することができる。いくつかの実施形態では、本明細書のプロセス2A方法開示のステップのうちのいずれかの間に産生されたTIL集団(例えば、図2~6を参照)を、細胞膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする核酸でトランスフェクトして、対象の一過的に修飾されたTILにおいて細胞膜アンカー免疫調節融合タンパク質を一過的に発現する。例示的な実施形態では、本明細書のGEN3方法開示のステップのうちのいずれかの間に産生されたTIL集団(例えば、図7を参照)を、細胞膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする核酸でトランスフェクトして、対象の一過的に修飾されたTILにおいて細胞膜アンカー免疫調節融合タンパク質を一過的に発現する。例示的な実施形態では、本明細書で提供されるプロセス2A方法における第1の拡張ステップ及び/またはGEN3方法におけるプライミングによる拡張ステップから産生されるTILを、細胞膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする核酸でトランスフェクトして、対象の一過的に修飾されたTILにおいて細胞膜アンカー免疫調節融合タンパク質を一過的に発現させる。例示的な実施形態では、本明細書で提供されるプロセス2A方法における第2の拡張ステップ及び/またはGEN3方法における急速拡張ステップから産生されるTILを、細胞膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする核酸でトランスフェクトして、対象の一過的に修飾されたTILにおいて細胞膜アンカー免疫調節融合タンパク質を一過的に発現させる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法を使用して事前に選択されたPD-1陽性TILを、細胞膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする核酸でトランスフェクトして、対象の一過的に修飾されたTILにおいて細胞膜アンカー免疫調節融合タンパク質を一過的に発現させる。
また、本明細書で提供されるのは、膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする核酸、そのような核酸を含む発現ベクター、及び核酸または発現ベクターを含む宿主細胞である。任意の好適なプロモーターを、膜アンカー免疫調節融合タンパク質の発現に使用することができる。例示的な実施形態では、プロモーターは、誘導性プロモーターである。例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質及びそのような融合タンパク質の成分をコードする例示的な核酸を、図51及び52、ならびに表58及び59に示す。
いくつかの実施形態では、膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする核酸は、mRNAである。例示的な実施形態では、mRNAは、mRNAの細胞内安定性及び/または翻訳効率を改善する1つ以上の修飾を含む。いくつかの実施形態では、mRNAは、mRNAの半減期を改善する5’キャップまたはキャップ類似体を含む。例示的なキャップ構造としては、ARCA、mCAP、mGpppN(キャップ0)、mGpppNm(キャップ1)、及びmGpppNmpNm(キャップ2)キャップが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、5’キャップは、式:m7Gppp[N2’Ome[N]に従うものであり、式中、m7Gは、N7-メチル化グアノシンまたは任意のグアノシン類似体であり、Nは、任意の天然、修飾または非天然ヌクレオシドであり、「n」は、0~4の任意の整数であり得、「m」は、1~9の整数であり得る。例示的な5’キャップは、米国特許第10,703,789号及びWO2017/053297に開示されており、これらは参照によりそれら全体が組み込まれており、具体的には5’キャップ及びキャップ類似体に関する開示についてである。
いくつかの実施形態では、膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする核酸は、mRNAであり、3’非翻訳領域(UTR)またはアデノシン及びウリジンのストレッチを有することが知られている修飾UTRをさらに含む。これらのAUリッチシグネチャーは、高い転換率を有する遺伝子において特に一般的である。それらの配列特徴及び機能的特性に基づいて、AUリッチエレメント(ARE)は、3つのクラスに分けることができる(Chen et al.,1995):クラスI AREは、Uリッチ領域内にAUUUAモチーフのいくつかの分散コピーを含有する。C-Myc及びMyoDは、クラスI AREを含有する。クラスII AREは、2つ以上の重複するUUAUUUA(U/A)(U/A)ノナマーを有する。このタイプのAREを含有する分子としては、GM-CSF及びTNF-aが挙げられる。クラスIII ARESは、あまり明確に定義されていない。これらのUリッチ領域は、AUUUAモチーフを含有しない。c-Jun及びMyogeninは、このクラスの2つのよく研究された例である。AREに結合するほとんどのタンパク質は、メッセンジャーを不安定化することが知られているが、ELAVファミリーのメンバー、特にHuRは、mRNAの安定性を増加させることが報告されている。HuRは、3つすべてのクラスのAREに結合する。HuR特異的結合部位を核酸分子の3’UTRに操作すると、HuR結合、したがってインビボでのメッセージの安定化につながる。
3’UTR AUリッチエレメント(ARE)の導入、除去、または修飾を使用して、本明細書に記載の核酸の安定性を調節することができる。特定の核酸を操作する場合、AREの1つ以上のコピーを導入して、本発明のポリヌクレオチドを不安定にし、それによって翻訳を抑制し、得られるタンパク質の産生を減少させることができる。同様に、AREを同定し、除去または変異させて、細胞内安定性を増加させ、したがって、結果として生じるタンパク質の翻訳及び産生を増加させることができる。トランスフェクション実験は、関連する細胞株において、核酸を使用して実施することができ、タンパク質産生は、トランスフェクション後の様々な時点でアッセイすることができる。例えば、細胞は、異なるARE操作分子で、かつELISAキットを使用することによって関連するタンパク質にトランスフェクトすることができ、トランスフェクションの6時間、12時間、24時間、48時間、及び7日後に産生されるタンパク質をアッセイする。
いくつかの実施形態では、膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする核酸は、活性化T細胞(NFAT)プロモーターの核因子、またはその機能的部分もしくは機能的バリアントに作動可能に連結される。本明細書で使用される「NFATプロモーター」とは、T細胞によって発現される任意の遺伝子の最小プロモーターに連結された1つ以上のNFAT応答性エレメントを意味する。好ましくは、T細胞によって発現される遺伝子の最小プロモーターは、最小ヒトIL-2プロモーターである。NFAT応答性エレメントは、例えば、NFAT1、NFAT2、NFAT3、及び/またはNFAT4応答性エレメントを含み得る。NFATプロモーター(またはその機能的部分もしくは機能的バリアント)は、任意の数の結合モチーフ、例えば、少なくとも2個、少なくとも3個、少なくとも4個、少なくとも5個、または少なくとも6個、少なくとも7個、少なくとも8個、少なくとも9個、少なくとも10個、少なくとも11個、または最大12個の結合モチーフを含み得る。
好ましい実施形態では、NFATプロモーターは、6つのNFAT結合モチーフを含む。例えば、米国特許第8,556,882号(参照によりその全体が、特にNFATプロモーターに関連する関連部分について組み込まれる)を参照されたい。いくつかの実施形態では、NFATプロモーター系は、本明細書に記載の免疫調節剤のうちのいずれかを含む免疫調節融合タンパク質の発現を制御する。ある特定の実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニスト(例えば、CD40Lもしくはアゴニスト抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40scFv))またはその生体活性バリアントから選択される。NFATプロモーターに作動可能に連結された例示的な対象の膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする例示的な核酸を表59に示す。いくつかの実施形態では、NFATプロモーター系は、IL-15を含む免疫調節融合タンパク質の発現を制御する。いくつかの実施形態では、NFATプロモーター系は、IL-21を含む免疫調節融合タンパク質の発現を制御する。いくつかの実施形態では、NFATプロモーター系は、IL-15及びIL-21を含む免疫調節融合タンパク質の発現を制御する。
いくつかの実施形態では、本発明は、NFATプロモーターに作動可能に連結された免疫調節融合タンパク質をコードするDNAを含むように遺伝子修飾されたTILを提供する。いくつかの実施形態では、NFATプロモーターは、本明細書に記載の免疫調節剤のうちのいずれかを含む免疫調節融合タンパク質をコードするDNAの発現を制御する。ある特定の実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、及びCD40アゴニスト(例えば、CD40Lもしくはアゴニスト抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40scFv))またはその生体活性バリアントから選択される。いくつかの実施形態では、NFATプロモーターは、IL-15を含む免疫調節融合タンパク質をコードするDNAの発現を制御する。いくつかの実施形態では、NFATプロモーターは、IL-21を含む免疫調節融合タンパク質をコードするDNAの発現を制御する。いくつかの実施形態では、NFATプロモーターは、IL-15及びIL-21を含む免疫調節融合タンパク質をコードするDNAの発現を制御する。
いくつかの実施形態では、本発明は、NFATプロモーターに作動可能に連結された免疫調節融合タンパク質をコードするDNAを含むように遺伝子修飾されたTILを提供し、免疫調節融合タンパク質は、N末端からC末端へ、式:
S1-IA1-L1-C1-L2-S2-IA2-L3-C2に従って配置され、
式中、S1及びS2は、各々シグナルペプチドであり、IA1及びIA2は、各々免疫調節剤であり、L1-L3は、各々リンカーであり、C1及びC2は、各々細胞膜アンカー部分である。いくつかの実施形態では、IA1及びIA2は、同じ免疫調節剤である。ある特定の実施形態では、IA1及びIA2は、異なる免疫調節剤である。本明細書に記載されるもののうちのいずれかを含む、好適な免疫調節剤。いくつかの実施形態では、IA1及びIA2は、独立して、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、CD40アゴニスト(例えば、CD40Lまたはアゴニスト抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40 scFv))、またはそれらの生体活性バリアントから選択される。いくつかのさらなる実施形態では、IA1及びIA2は、IL-12及びIL-15、IL-15及びIL-18、CD40L及びIL-15、IL-15及びIL-21、ならびにIL-2及びIL-12からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、IA1及びIA2は、独立して、IL-15及びIL-21から選択される。いくつかの実施形態では、IA1は、IL-15であり、IA2は、IL-21である。いくつかの実施形態では、IA1は、IL-21であり、IA2は、IL-15である。いくつかの実施形態では、L1~L3のうちの1つ以上は、切断可能なリンカーである。いくつかの実施形態では、L1~L3のうちの2つ以上は、異なるリンカーである。例示的な実施形態では、L2は、切断可能なリンカーである。いくつかの実施形態では、L2は、フリン切断可能なP2Aリンカーである(例えば、配列番号251)。いくつかの実施形態では、C1及びC2は、独立して、膜貫通ドメイン及び/または膜貫通-細胞内ドメインである。ある特定の実施形態では、C1及びC2は、同じである。例示的な実施形態では、C1及びC2は、各々B7-1膜貫通-細胞内ドメイン(例えば、配列番号239)である。例示的な実施形態では、C1とC2は異なる。上記式による2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含む例示的な構築物を図51に示す。
対象の膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする核酸をTIL集団に導入して、任意の好適な方法を使用して、膜アンカー免疫調節融合タンパク質を発現する一過的に修飾されたまたは遺伝子修飾されたTILを産生してもよい。いくつかの実施形態では、膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする核酸は、マイクロ流体プラットフォームを使用してTIL集団に導入される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。例えば、国際特許出願公開第WO2013/059343A1号、同第WO2017/008063A1号、もしくは同第WO2017/123663A1号、または米国特許出願公開第2014/0287509A1号、同第2018/0201889A1、もしくは同第2018/0245089A1号を参照されたい(これらのすべては、参照によりそれら全体が、特に核酸送達のためのマイクロ流体プラットフォームの開示について本明細書に組み込まれる)。SQZプラットフォームでは、修飾のための細胞(例えば、TIL)の細胞膜は、マイクロ流体収縮によって一時的に破壊され、それによって、膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする核酸を細胞内に送達することを可能にする。
いくつかの実施形態では、膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする核酸は、mRNAであり、マイクロ流体プラットフォーム(例えば、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォーム)を使用してmRNAをTILに送達し、一過的に修飾されたTILを産生する。いくつかの実施形態では、膜アンカー免疫調節融合タンパク質をコードする核酸は、DNAであり、マイクロ流体プラットフォーム(例えば、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォーム)を使用してDNAをTILに送達し、安定した遺伝子修飾されたTILを産生する。マイクロ流体プラットフォーム(例えば、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォーム)を使用して、本明細書のプロセス2A方法開示(例えば、図2~6を参照)または本明細書のGEN3方法開示(例えば、図7を参照)の任意のステップ中に産生される任意のTIL集団に核酸を送達して、修飾されたTILを産生してもよい。いくつかの実施形態では、膜アンカー免疫調節融合タンパク質は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、CD40アゴニスト(例えば、CD40Lもしくはアゴニスト抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40scFv))、またはそれらの任意の組み合わせを含む。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-15である。いくつかの実施形態では、第2の免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-18、IL-21、CD40Lまたは抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40 scFv)である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、CD40Lである。いくつかの実施形態では、第2の免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、またはCD40アゴニスト(例えば、CD40Lもしくはアゴニスト抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40scFv))またはその生体活性バリアントである。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-12である。いくつかの実施形態では、第2の免疫調節剤は、IL-2、IL-15、IL-18、IL-21、CD40Lまたは抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40 scFv)である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-18である。いくつかの実施形態では、第2の免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-21、CD40Lまたは抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40 scFv)である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-21である。いくつかの実施形態では、第2の免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、CD40Lまたは抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40 scFv)である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-2である。いくつかの実施形態では、第2の免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、CD40Lまたは抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40 scFv)である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-2であり、第2の免疫調節剤は、IL-12である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-2であり、第2の免疫調節剤は、IL-15である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-2であり、第2の免疫調節剤は、IL-18である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-2であり、第2の免疫調節剤は、IL-21である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-2であり、第2の免疫調節剤は、CD40Lまたは抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40 scFv)である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-12であり、第2の免疫調節剤は、IL-15である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-12であり、第2の免疫調節剤は、IL-18である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-12であり、第2の免疫調節剤は、IL-21である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-12であり、第2の免疫調節剤は、CD40Lまたは抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40 scFv)である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-15であり、第2の免疫調節剤は、IL-18である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-15であり、第2の免疫調節剤は、IL-21である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-15であり、第2の免疫調節剤は、CD40Lまたは抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40 scFv)である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-18であり、第2の免疫調節剤は、IL-21である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-18であり、第2の免疫調節剤は、CD40Lまたは抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40 scFv)である。
例示的な実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、各々が異なる免疫調節剤(すなわち、第1及び第2の免疫調節剤)を含む2つの膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含み、第1の免疫調節剤は、IL-21であり、第2の免疫調節剤は、CD40Lまたは抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40 scFv)である。
本明細書で提供される修飾されたTILに含まれ得る追加の膜アンカー免疫調節融合タンパク質は、WO2019/157130A1(これは参照によりその全体が、特に膜アンカー免疫調節融合タンパク質に関連する関連部分に組み込まれる)に記載されている。
本明細書で提供される修飾されたTILに含まれる例示的な膜アンカー免疫調節融合タンパク質を図51及び52、ならびに表58及び59に示す。
いくつかの実施形態では、上記の膜アンカー免疫調節融合タンパク質のうちのいずれかをコードする核酸は、NFATプロモーターまたはその機能的部分もしくは機能的バリアントに作動可能に連結される。
2.免疫調節剤-TIL抗原結合ドメイン融合タンパク質
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、免疫調節融合タンパク質を含み、そのような融合タンパク質は、TIL抗原結合ドメイン(ABD)に連結された1つ以上の免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、1種以上の免疫調節剤は、TIL ABDがTIL表面抗原に結合すると、TIL表面膜にテザリングされる。
TIL抗原結合ドメインは、抗体可変重ドメイン(VH)及び可変軽ドメイン(VL)を含む。いくつかの実施形態では、TIL抗原結合ドメインは、式:VH-CH1-ヒンジ-CH2-CH3による重鎖及び式:VL-CLによる軽鎖(式中、VHは可変重ドメインであり、CH1、CH2、CH3は重鎖定常ドメインであり、VLは可変軽ドメインであり、CLは軽鎖定常ドメインである)を含む全長抗体である。いくつかの実施形態では、TIL抗原結合ドメインは、抗体断片である。ある特定の実施形態では、TIL抗原結合ドメインは、Fab、Fab’、F(ab’)2、F(ab)2、可変断片(Fv)、ドメイン抗体(dAb)、または一本鎖可変断片(scFv)である。
TIL抗原結合ドメインは、免疫調節剤-TIL ABD融合タンパク質の、TILの表面への付着を可能にする任意の好適なTIL抗原に結合することができる。例示的な実施形態では、TIL抗原結合ドメインは、TIL表面抗原に結合することができる。TIL表面抗原には、D16、CD45、CD4、CD8、CD3、CD11a、CD11b、CD11c、CD18、LFA-1、CD25、CD127、CD56、CD19、CD20、CD22、HLA-DR、CD197、CD38、CD27、CD137、OX40、GITR、CD56、CD196、CXCR3、CXCR4、CXCR5、CD84、CD229、CCR1、CCR5、CCR4、CCR6、CCR8、及び/またはCCR10が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、ABDは、CD45に結合する。特定の実施形態では、ABDは、CD45RA、CD45RB、CD45RCまたはCD45Rβから選択されるCD45アイソフォームに結合する。特定の実施形態では、ABDは、T細胞上で一次的に発現されるCD45に結合する。
ある特定の実施形態では、ABDは、チェックポイント阻害剤に結合する。例示的なチェックポイント阻害剤としては、PD-1、PD-L1、LAG-3、TIM-3及びCTLA-4が挙げられるが、これらに限定されない(例えば、Qin et al.,Molecular Cancer 18:155(2019)を参照)。いくつかの実施形態では、ABDは、免疫エフェクター細胞(例えば、T細胞またはNK細胞)上に発現されるチェックポイント阻害剤に結合する。例示的な抗PD-1抗体は、例えば、米国特許第7,695,715号、同第7,332,582号、同第9,205,148号、同第8,686,119号、同第8,735,553号、同第7,488,802号、同第8,927,697号、同第8,993,731号、及び同第9,102,727号において開示されており、これらは参照によりそれら全体が、特に抗PD-1抗体に関連する関連部分が組み込まれる。例示的な抗PD-L1抗体は、米国特許第8,217,149号、同第8,779,108号、同第8,168,179号、同第8,552,154号、同第8,460,927号、及び同第9,175,082号において開示されており、これらは参照によりそれら全体が、特に抗PD-L1抗体に関連する関連部分が組み込まれる。例示的な抗LAG-3抗体は、米国特許第9,244,059号、同第9,244,059号、同第9,505,839号に開示されており、これらは参照によりそれら全体が、特に抗LAG-3抗体に関連する関連部分が組み込まれる。例示的なTIM-3抗体は、WO2016/161270、US8,841,418、及びUS9,163,087において開示されており、これらは参照によりそれら全体が、特に抗TIM-3抗体に関連する関連部分が組み込まれる。例示的なCTLA-4抗体は、US6,984,720及びUS7,411,057において開示されており、これらは参照によりそれら全体が、特に抗CTLA-4抗体に関連する関連部分が組み込まれる。
いくつかの実施形態では、ABDは、抗CD45抗体またはその断片である。ある特定の実施形態では、抗CD45抗体は、ヒト抗CD45抗体、ヒト化抗CD45抗体、またはキメラ抗CD45抗体である。例示的な実施形態では、ABDは、抗CD45抗体BC8のvhCDR1-3及びvlCDR1-3を含む(参照により本明細書に組み込まれる、US2017/0326259、特に抗CD45抗体配列に関連する関連する部分を参照)。いくつかの実施形態では、ABDは、抗CD45抗体BC8の可変重ドメイン及び可変ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ABDは、以下の抗CD45抗体:10G10、UCHL1、9.4、4B2、またはGAP8.3のうちの1つのvhCDR1-3及びvlCDR1-3またはVH及びVLを含む(Spertini et al.,Immunology 113(4):441-452(2004)、Buzzi et al.Cancer Research 52:4027-4035(1992)を参照)。
免疫調節融合タンパク質は、例えば、本明細書で提供される免疫調節剤のうちのいずれかを含む、任意の好適な免疫調節剤であり得る。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、抗腫瘍応答を促進するインターロイキンである。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、サイトカインである。特定の実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-21、またはそれらの生体活性バリアントである。ある特定の実施形態では、融合タンパク質は、2つ以上の免疫調節剤を含む。例示的な実施形態では、融合タンパク質は、2、3、4、5、6、7、8、9、または10の異なる免疫調節剤を含む。
TIL抗原結合ドメインは、任意の好適なリンカーを使用して免疫調節剤に付着する。好適なリンカーとしては、限定されないが、切断可能なリンカー、非切断可能なリンカー、ペプチドリンカー、可撓性リンカー、剛性リンカー、ヘリカルリンカー、または非ヘリカルリンカーが挙げられる。いくつかの実施形態では、リンカーは、任意選択でGly及びSerを含むペプチドリンカーである。好適なリンカーとしては、少なくとも約5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、または30アミノ酸残基の長さであるリンカーが挙げられる。いくつかの実施形態では、リンカーは、5~10、10~15、15~20、20~25、25~30、30~35、35~40、45~50、または50~60アミノ酸の長さである。ある特定の実施形態では、ペプチドリンカーは、(GGGS)または(GGGGS)リンカーであり、式中、nは、モチーフの反復の数を示し、1~10から選択される整数である。いくつかの実施形態では、リンカーは、抗体ヒンジドメインまたはその断片である。ある特定の実施形態では、リンカーは、ヒト免疫グロブリン(Ig)ヒンジドメイン(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgD、IgE、IgM、もしくはIgAヒンジ)またはその断片である。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、リンカーなしでTILに直接連結される。
免疫調節剤は、融合タンパク質のTILへの結合を妨げない好適な位置でTIL抗原結合ドメインに付着することができる。抗原結合ドメインが全長抗体であるいくつかの実施形態では、免疫調節剤は、重鎖または軽鎖のいずれかのC末端またはN末端に付着される。抗原結合ドメインがscFvであるいくつかの実施形態では、免疫調節剤は、可変重ドメインまたは可変軽ドメインのC末端またはN末端に付着される。抗原結合ドメインがFabであるいくつかの実施形態では、免疫調節剤は、可変重ドメインまたは可変軽ドメインのC末端またはN末端に付着される。抗原結合ドメインがFab’であるいくつかの実施形態では、免疫調節剤は、可変重ドメインまたは可変軽ドメインのC末端またはN末端に付着される。抗原結合ドメインがFab’であるいくつかの実施形態では、免疫調節剤は、可変重ドメインまたは可変軽ドメインのC末端またはN末端に付着される。
融合タンパク質が2つ以上の免疫調節剤を含むいくつかの実施形態では、免疫調節剤は、本明細書に記載のリンカーのうちのいずれかを使用して互いに付着する。いくつかの実施形態では、2つ以上の免疫調節剤が、抗原結合ドメインの異なる位置に付着する。例えば、TIL抗原結合ドメインが全長抗体であるいくつかの実施形態では、2つ以上の免疫調節剤は、(i)重鎖上の異なる位置、(ii)軽鎖上の異なる位置または(iii)重鎖及び/または軽鎖上の異なる位置に付着される。
対象の免疫調節剤-TIL抗原結合ドメイン融合タンパク質は、任意の好適な方法を使用して作製することができる。一態様では、本明細書で提供されるのは、対象の融合タンパク質をコードする核酸、かかる核酸を含む発現ベクター、及び発現ベクターを含む宿主細胞である。対象の融合タンパク質をコードする発現ベクターを含む宿主細胞を、融合タンパク質の発現のための条件下で培養し、その後、融合タンパク質を単離し、精製する。いくつかの実施形態では、次いで、精製された融合タンパク質を、融合タンパク質のTILへの結合を可能にする条件下で、TIL集団とともにインキュベートする。
いくつかの実施形態では、対象の免疫調節剤-TIL抗原結合ドメイン融合タンパク質は、本明細書のプロセス2A方法開示のステップのうちのいずれかの間に産生されたTILに付着される(例えば、図2~6を参照)。例示的な実施形態では、融合タンパク質は、本明細書のGEN3方法開示のステップのうちのいずれかの間に産生されたTILに付着される(例えば、図7を参照)。例示的な実施形態では、融合タンパク質は、プロセス2A方法における第1の拡張ステップ及び/または本明細書で提供されるGEN3方法におけるプライミングによる拡張ステップから産生されたTILに付着される。例示的な実施形態では、融合タンパク質は、プロセス2A方法の第2の拡張ステップ及び/または本明細書で提供されるGEN3方法の急速拡張ステップから産生されたTILに付着される。いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に記載される方法を使用して事前選択されたPD-1陽性TILである。
対象の免疫調節剤-TIL抗原結合ドメイン融合タンパク質をコードする核酸をTIL集団に導入して、任意の好適な方法を使用して、対象の免疫調節剤-TIL抗原結合ドメイン融合タンパク質を発現する一過的に修飾されたまたは遺伝子修飾されたTILを産生してもよい。いくつかの実施形態では、対象の免疫調節剤-TIL抗原結合ドメイン融合タンパク質をコードする核酸は、マイクロ流体プラットフォームを使用して、TIL集団に導入される。いくつかの実施形態では、マイクロ流体プラットフォームは、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォームである。例えば、国際特許出願公開第WO2013/059343A1号、同第WO2017/008063A1号、もしくは同第WO2017/123663A1号、または米国特許出願公開第2014/0287509A1号、同第2018/0201889A1、もしくは同第2018/0245089A1号を参照されたい(これらのすべては、参照によりそれら全体が、特に核酸送達のためのマイクロ流体プラットフォームの開示について本明細書に組み込まれる)。SQZプラットフォームでは、修飾のための細胞(例えば、TIL)の細胞膜は、マイクロ流体収縮によって一時的に破壊され、それによって免疫調節剤-TIL抗原結合ドメイン融合タンパク質をコードする核酸を細胞に送達することを可能にする。
いくつかの実施形態では、対象の免疫調節剤-TIL抗原結合ドメイン融合タンパク質をコードする核酸は、mRNAであり、マイクロ流体プラットフォーム(例えば、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォーム)を使用して、mRNAをTILに送達し、一過的に修飾TILを産生する。いくつかの実施形態では、対象の免疫調節剤-TIL抗原結合ドメイン融合タンパク質をコードする核酸は、DNAであり、マイクロ流体プラットフォーム(例えば、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォーム)を使用して、核酸をTILに送達し、安定した遺伝子修飾TILを産生する。マイクロ流体プラットフォーム(例えば、SQZベクターを含まないマイクロ流体プラットフォーム)を使用して、本明細書のプロセス2A方法開示(例えば、図2~6を参照)または本明細書のGEN3方法開示(例えば、図7を参照)の任意のステップ中に産生される任意のTIL集団に核酸を送達して、修飾されたTILを産生してもよい。いくつかの実施形態では、膜アンカー免疫調節融合タンパク質は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-21、またはそれらの組み合わせ(例えば、IL-15及びIL-21)を含む。
本明細書で提供される組成物及び方法に有用な例示的な免疫調節剤-TIL抗原結合ドメイン融合タンパク質は、例えば、米国特許出願公開第2020/0330514号(これは参照によりその全体が組み込まれる)、及び免疫調節剤-TIL抗原結合ドメイン融合タンパク質に関連する関連部分にさらに記載されている。
I.ナノ粒子組成物
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される対象の修飾されたTILは、1つ以上のナノ粒子を含み、それらのナノ粒子は、1種以上の免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるナノ粒子は、互いにカップリングされた複数の2つ以上のタンパク質及び/または粒子の第2の成分(例えば、分解可能なリンカーを介して可逆的に連結された)を含む。いくつかの実施形態では、ナノ粒子のタンパク質は、ポリマーまたはシリカ中に存在する。ある特定の実施形態では、ナノ粒子は、ナノシェルを含む。本明細書で提供されるナノ粒子は、1つ以上の免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、またはCD40アゴニスト(例えば、CD40Lもしくはアゴニスト抗CD40結合ドメイン(例えば、抗CD40 scFv))またはその生体活性バリアントである。ナノ粒子は、本明細書に記載される任意の好適な技術を使用して、TILの表面に付着される。
本明細書で提供される対象の修飾されたTILにおける使用の例示的なナノ粒子としては、リポソーム、タンパク質ナノゲル、ヌクレオチドナノゲル、ポリマーナノ粒子、または固体ナノ粒子が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、リポソームを含む。例示的な実施形態では、ナノ粒子は、免疫調節剤ナノゲルを含む。特定の実施形態では、ナノ粒子は、互いに共有結合した複数の免疫調節剤(例えば、サイトカイン)を有する免疫調節剤ナノゲルである。いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、ナノ粒子表面上に少なくとも1種のポリマー、カチオン性ポリマー、またはカチオン性ブロックコポリマーを含む。本明細書で提供される組成物に使用することができる例示的なナノ粒子は、例えば、米国特許第9,283,184号及び同第9,603,944号に開示されており、これらの各々は参照によりその全体が組み込まれ、ナノ粒子に関連する関連部分に組み込まれる。
免疫調節剤は、例えば、本明細書で提供される免疫調節剤のうちのいずれかを含む、任意の好適な免疫調節剤であり得る。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、抗腫瘍応答を促進するインターロイキンである。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、サイトカインである。特定の実施形態では、免疫調節剤は、IL-2、IL-12、IL-15、IL-21、またはそれらの生体活性バリアントである。ある特定の実施形態では、融合タンパク質は、2つ以上の免疫調節剤を含む。例示的な実施形態では、融合タンパク質は、2、3、4、5、6、7、8、9、または10の異なる免疫調節剤を含む。
いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、互いに共有結合的に架橋されたタンパク質及び/または第2の成分(例えば、分解可能なリンカー)を含む。いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、分解可能なリンカーを介して機能基もしくはポリマーに可逆的に連結されるか、または「可逆的に修飾される」免疫調節剤を含む。いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、分解可能なリンカーを介して互いに架橋された複数の免疫調節剤を含むナノゲルである(米国特許第9,603,944号を参照)。例示的な実施形態では、ナノゲルのタンパク質は、ポリマー(例えば、ポリエチレングリコール(PEG))に架橋される。いくつかの実施形態では、ポリマーは、ナノゲル表面に架橋される。
いくつかの実施形態では、ナノ粒子の免疫調節剤は、生理学的条件下でリンカーが分解し、それによって免疫調節剤を放出するように、分解可能なリンカー(例えば、ジスルフィドリンカー)を介して互いに可逆的に連結される。いくつかの実施形態では、ナノ粒子の免疫調節剤は、生理学的条件下で、リンカーが分解し、免疫調節剤を放出するように、分解可能なリンカーを介して官能基に可逆的に連結される。好適な分解可能なリンカーとしては、還元生理学的環境に感受性のある可撓性ジスルフィド含有リンカーによって一緒に接合された2つのN-ヒドロキシスクシンイミド(NHS)エステル基、酸性生理学的環境(pH<7、例えば、pH4~5、5~6、または6~7未満、例えば、6.9)に感受性の加水分解可能なリンカー、あるいは腫瘍微小環境または炎症組織(例えば、マトリックスメタロプロテイナーゼ2(MMP2)もしくはマトリックスメタロプロテイナーゼ9(MMP9))に存在するマトリックスメタロプロテイナーゼなどの生物学的媒体中に存在する1つ以上の酵素に感受性のあるプロテアーゼ感受性リンカーが挙げられるが、これらに限定されない。還元的な生理学的環境に感受性のある架橋剤は、例えば、タンパク質を高密度タンパク質ナノゲルに架橋するNHS基の存在によってタンパク質上のアミン基と反応するジスルフィド含有リンカーを有する架橋剤である。いくつかの実施形態では、分解可能な架橋剤は、ビス[2-(N-スクシンイミジル-オキシカルボニルオキシ)エチル]ジスルフィドを含む。
いくつかの実施形態では、分解可能なリンカーは、少なくとも1種のN-ヒドロキシスクシンイミドエステルを含む。いくつかの実施形態では、分解可能なリンカーは、酸化還元応答性リンカーである。いくつかの実施形態では、酸化還元応答性リンカーは、ジスルフィド結合を含む。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される分解可能なリンカーには、タンパク質を実質的に変性させることなく、中性pH(例えば、約6~約8または約7)でタンパク質と反応することができる、少なくとも1つのNヒドロキシスクシンイミドエステルが含まれる。いくつかの実施形態では、分解可能なリンカーは、「酸化還元応答性」リンカーであり、それらが生理学的条件下(例えば、20~40℃及び/またはpH4~8)で還元剤(例えば、グルタチオン、GSH)の存在下で分解され、それによって、それが可逆的に連結される化合物から無傷のタンパク質を放出することを意味する。いくつかの実施形態では、ナノ粒子のタンパク質は、末端または内部のNH官能基(例えば、リジンの側鎖)を介して分解可能なリンカーに連結されている。
他の実施形態では、ナノ粒子のタンパク質は、酵素感受性リンカーによって連結される。例示的な切断可能なリンカーとしては、以下の酵素:メタロプロテアーゼMMP-1、MMP-2、MMP-3、MMP-8、MMP-9、MMP-14、プラスミン、PSA、PSMA、カテプシンD、カテプシンK、カテプシンS、ADAM10、ADAM12、ADAMTS、カスパーゼ-1、カスパーゼ-2、カスパーゼ-3、カスパーゼ-4、カスパーゼ-5、カスパーゼ-6、カスパーゼ-7、カスパーゼ-8、カスパーゼ-9、カスパーゼ-10、カスパーゼ-11、カスパーゼ-12、カスパーゼ-13、カスパーゼ-14、及びTACEのうちの1つによって認識されるものが挙げられる。例えば、米国特許第8,541,203号及び同第8,580,244号(これらの各々は参照によりその全体が組み込まれ、切断可能なリンカーに関連する関連部分に組み込まれる)を参照されたい。
いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、単分散複数の免疫調節剤(例えば、サイトカイン)を含むナノゲルである。いくつかの実施形態では、ナノゲルの免疫調節剤は、ポリマーに架橋される。ある特定の実施形態では、ポリマーは、ナノゲルの表面に架橋される。特定の実施形態では、ナノゲルは、a)分解可能なリンカーを介して互いに可逆的かつ共有結合的に架橋された1つ以上の免疫調節剤、及びb)ナノゲルの表面露出タンパク質に架橋されたポリマーを含む。そのようなナノゲルは、分解可能なリンカーを介して免疫調節剤を互いに可逆的に共有結合して複数の免疫調節剤ナノゲルを形成することを可能にする条件下で、1種以上の免疫調節剤を分解可能なリンカーと接触させることによって作製することができる。その後、免疫調節剤ナノゲルは、ポリマーの免疫調節剤ナノゲルへの架橋を可能にする条件下でポリマー(例えば、ポリエチレングリコール)と接触し、それによって複数の免疫調節剤ポリマーナノゲルを生成する。
いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、1つ以上のポリマーを含む。例示的なポリマーとしては、脂肪族ポリエステル、ポリ(乳酸)(PLA)、ポリ(グリコール酸)(PGA)、乳酸及びグリコール酸のコポリマー(PLGA)、ポリカープロラクトン(PCL)、ポリ無水物、ポリ(オルト)エステル、ポリウレタン、ポリ(酪酸)、ポリ(吉草酸)、及びポリ(ラクチド-コ-カプロラクトン)、ならびにアルギン酸塩及びデキストラン及びセルロースを含む他の多糖類、コラーゲン、それらの化学誘導体(例えば、アルキル、アルキレン、ヒドロキシル化、酸化、及び当業者によって日常的に行われる他の修飾などの化学基の置換、付加を含む)、アルブミン及び他の親水性タンパク質、ゼイン及び他のプロラミン、ならびにそれらの親水性タンパク質、コポリマー及び混合物などの天然ポリマーが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、ナノ粒子の免疫調節剤は、親水性ポリマーに連結されている。例示的な親水性ポリマーとしては、ポリエチレングリコール(PEG)、ポリエチレングリコール-b-ポリリジン(PEG-PLL)、及び/またはポリエチレングリコール-b-ポリアルギニン(PEG-PArg)が挙げられるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、ナノ粒子(例えば、ナノゲル)は、その表面に1つ以上のポリカチオンを含む。対象のナノ粒子で使用するための例示的なポリカチオンとしては、ポリリジン(ポリ-L-リジン及び/またはポリ-D-リジン)、ポリ(アルギニン酸グリセリルコハク酸塩)(PAGS、アルギニン系ポリマー)、ポリエチレンイミン、ポリヒスチジン、ポリアルギニン、プロタミン硫酸塩、ポリエチレングリコール-b-ポリリジン(PEG-PLL)、及びポリエチレングリコール-g-ポリリジンが挙げられるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、TILへの静電吸引によってTIL表面と会合する。ある特定の実施形態では、ナノ粒子は、TILの表面分子(例えば、表面タンパク質、炭水化物及び/または脂質)に対して親和性を有するリガンドを含む。
特定の実施形態では、ナノ粒子は、本明細書に記載のTIL表面抗原に結合する抗原結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、抗原結合ドメインは、抗体またはその断片である。例示的な実施形態では、TIL表面抗原は、CD45、LFA-1、CD11a(インテグリンアルファ-L)、CD18(インテグリンベータ-2)、CD11b、CD11c、CD25、CD8、またはCD4である。例示的な実施形態では、抗原結合ドメイン(ABD)は、抗CD45抗体またはその断片である。ある特定の実施形態では、抗CD45抗体は、ヒト抗CD45抗体、ヒト化抗CD45抗体、またはキメラ抗CD45抗体である。例示的な実施形態では、ABDは、抗CD45抗体BC8のvhCDR1-3及びvlCDR1-3を含む(参照により本明細書に組み込まれる、US2017/0326259、特に抗CD45抗体配列に関連する関連する部分を参照)。いくつかの実施形態では、ABDは、抗CD45抗体BC8の可変重ドメイン及び可変ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ABDは、以下の抗CD45抗体:10G10、UCHL1、9.4、4B2、またはGAP8.3のうちの1つのvhCDR1-3及びvlCDR1-3またはVH及びVLを含む(Spertini et al.,Immunology 113(4):441-452(2004)、Buzzi et al.Cancer Research 52:4027-4035(1992)を参照)。そのような実施形態では、ナノ粒子は、ナノ粒子がTILの表面に結合する条件下で、ナノ粒子の存在下でTILをインキュベートすることにより、TIL集団の表面に付着される。
いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、静電吸引によってTIL細胞表面と会合する。いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、TILと共有結合される。他の実施形態では、ナノ粒子は、TILに共有結合されない。
いくつかの実施形態では、対象のナノ粒子は、本明細書のプロセス2A方法開示のステップのうちのいずれかの間に産生されたTILに付着される(例えば、図2~6を参照)。例示的な実施形態では、対象のナノ粒子は、本明細書のGEN3方法開示のステップのうちのいずれかの間に産生されたTILに付着される(例えば、図7を参照)。例示的な実施形態では、対象のナノ粒子は、プロセス2A方法における第1の拡張ステップ及び/または本明細書で提供されるGEN3方法におけるプライミングによる拡張ステップから産生されたTILに付着される。例示的な実施形態では、対象のナノ粒子は、プロセス2A方法の第2の拡張ステップ及び/または本明細書で提供されるGEN3方法の急速拡張ステップから産生されたTILに付着される。いくつかの実施形態では、TILは、本明細書に記載される方法を使用して事前選択されたPD-1陽性TILである。
本明細書で提供される修飾されたTILで使用するための追加の適切なナノ粒子は、米国特許出願公開第2020/0131239号及びWO2020/205808(これらの各々は参照によりその全体が組み込まれる)、及びナノ粒子に関連する関連部分において開示されている。
B.免疫調節剤
本明細書で提供される修飾されたTILには、その表面に付着された1つ以上の免疫調節剤が含まれ得る。免疫調節剤は、例えば、本明細書に記載の膜アンカー免疫調節融合タンパク質を含む、本明細書に記載の免疫調節融合タンパク質のうちのいずれかに組み込むことができる。任意の好適な免疫調節剤を、対象の修飾されたTILに含めることができる。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、一度患者に移されると、TIL生存及び/または抗腫瘍活性を増強する。例示的な免疫調節剤としては、例えば、サイトカインが挙げられる。いくつかの実施形態では、修飾されたTILは、以下のサイトカイン:IL-2、IL-7、IL-12、IL-15、IL-18、IL-21、IL-23、IL-27、IL-4、IL-1α、IL-1β、IL-5、IFNγ、TNFα(TNFa)、IFNα、IFNβ、GM-CSF、もしくはGCSF、またはそれらの生物学的に活性なバリアントのうちの1つ以上を含む。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、共刺激分子である。特定の実施形態では、共刺激分子は、以下:OX40、CD28、GITR、VISTA、CD40、CD3、またはCD137のアゴニストのうちの1つである。いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、CD40アゴニスト(例えば、CD40LまたはアゴニストCD40結合ドメイン)である。例示的な免疫調節剤は、以下でさらに詳細に論じられる。
1.IL-15
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される修飾されたTILは、IL-15を含む。例示的な実施形態では、IL-15は、本明細書に記載の免疫調節融合タンパク質(例えば、膜アンカー免疫調節融合タンパク質)の一部として含まれる。
本明細書で使用される場合、「インターロイキン15」、「IL-15」及び「IL15」はすべて、IL-15特異的受容体アルファ鎖(IL-15Rα)、IL-2/IL-15受容体ベータ鎖(CD122)及び共通のガンマ鎖(ガンマ-C、CD132)(例えば、Genbank受託番号:NM_00000585、NP_000576及びNP_751915(ヒト);ならびにNM_001254747及びNP_001241676(マウス))で構成された複合体に結合し、それを通じてシグナル伝達するインターロイキンを指す。IL-15は、腫瘍内のT細胞増殖を刺激することが示されている。IL-15はまた、エフェクターメモリーCD8+T細胞の生存可能性を拡張することができ、NK細胞の発達にとって重要である。したがって、いかなる特定の操作理論にも縛られることなく、本明細書に記載のIL-15と会合する修飾されたTILは、向上した生存及び/または抗腫瘍効果を示すと考えられる。
IL-15は、インビボで40分未満の短い半減期を有する。IL-15モノマーへの修飾は、がんの治療におけるそのインビボ薬物動態を改善することができる。これらの修飾は、概して、IL-15受容体のアルファサブユニット、IL-15RαによるIL-15のトランスプレゼンテーションの改善に焦点を当てている。そのような修正には、以下が含まれる:1)IL-15とその可溶性受容体a-サブユニット-Fc融合体との事前会合により、IL-15:IL-15Rα-Fc複合体の形成(例えば、Rubinstein et al.,Proc Natl Acad Sci U.S.A.103:9166-71(2006)を参照)、2)スーパーアゴニストIL-15-sIL-15Rα-sushiタンパク質の発現(例えば、Bessard et al.,Molecular cancer therapeutics 8:2736-45(2009)を参照)、及び3)ヒトIL-15変異体IL-15N72DとIL-15Rα-Fc sushi-Fc融合複合体との事前会合(例えば、Zhu et al.,Journal of Immunology 183:3598-6007(2009)を参照)。
いくつかの実施形態では、修飾されたTILと会合するIL-15は、全長IL-15、IL-15の断片またはバリアントである。いくつかの実施形態では、IL-15は、ヒトIL-15またはバリアントヒトIL-15である。例示的な実施形態では、IL-15は、生物学的に活性なヒトIL-15バリアントである。いくつかの実施形態では、IL-15は、野生型IL-15と比較して、1、2、3、4、5、6 7、8、9、または10個の変異を含む。ある特定の実施形態では、IL-15は、野生型ヒトIL-15に対してN72D変異を含む。いくつかの実施形態では、バリアントIL-15は、IL-15Rα結合活性を示す。
いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-15及びIL-15Rαの細胞外ドメインを含む。ある特定の実施形態では、免疫調節剤は、Fcドメインに融合したIL-15及びIL-15Rα(IL-15Rα-Fc)を含む。

いくつかの実施形態では、免疫刺激タンパク質は、ヒトIL-15と可溶性ヒトIL-15Rαとの複合体を含むスーパーアゴニストIL-15(IL-15SA)である。ヒトIL-15と可溶性ヒトIL-15Rαとの組み合わせは、ヒトIL-15単独よりも高い生物活性を有するIL-15SA複合体を形成する。可溶性ヒトIL-15Rα、ならびに細胞外ドメインの切断型は、当該技術分野において記載されている(Wei et al.,2001 J of Immunol.167:277-282)。ヒトIL-15Rαのアミノ酸配列は、配列番号266に示されている。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、ヒトIL-15と可溶性ヒトとの複合体を含む。膜貫通ドメインまたは細胞質ドメインなしで、細胞外ドメインの全部または一部を含むIL-15Rα。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、完全な細胞外ドメインまたはIL-15結合活性を保持する細胞外ドメインの切断形態を含む、ヒトIL-15と可溶性ヒトIL-15Rαとの複合体を含む。
いくつかの実施形態では、IL-15SAは、IL-15結合活性を保持する細胞外ドメインの切断形態を含む、ヒトIL-15と可溶性ヒトIL-15Rαとの複合体を含む。いくつかの実施形態では、可溶性ヒトIL-15Rαは、ヒトIL-15Rαのアミノ酸1-60、1-61、1-62、1-63、1-64または1-65を含む。いくつかの実施形態では、可溶性ヒトIL-15Rαは、ヒトIL-15Rαのアミノ酸1-80、1-81、1-82、1-83、1-84または1-85を含む。いくつかの実施形態では、可溶性ヒトIL-15Rαは、ヒトIL-15Rαのアミノ酸1-180、1-181、または1-182を含む。
いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、IL-15結合活性を保持し、Sushiドメインを含む細胞外ドメインの切断型を含む、ヒトIL-15と可溶性ヒトIL-15Rαとの複合体を含むIL-15SAである。IL-15RαのSushiドメインは、当該技術分野では、およそ60アミノ酸長であり、4つのシステインを含むと説明されている。(Wei et al.,2001)。IL-15活性を保持し、Sushiドメインを含む可溶性ヒトIL-15Rαの切断形態は、本開示のIL-15SAにおいて有用である。
いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、本明細書に記載のFc融合体(例えば、ヒトIgG1 Fc)などの融合タンパク質として発現される可溶性ヒトIL-15RαとIL-15とを含む複合体を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、2つのヒトIL-15分子と複合体化された二量体ヒトIL-15RαFc融合タンパク質(例えば、ヒトIgG1 Fc)を含む。
いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、配列番号258、配列番号261、配列番号262、または配列番号263に示されるアミノ酸配列を含むIL-15分子を含む、IL-15SAサイトカイン複合体である。いくつかの実施形態では、IL-15SAサイトカイン複合体は、配列番号260、配列番号264または配列番号265の配列を含む、可溶性IL-15Rα分子を含む。
いくつかの実施形態では、免疫調節剤は、2つのIL-15分子と複合体化された二量体IL-15RαFc融合タンパク質を含むIL-15SAサイトカイン複合体である。いくつかの実施形態では、IL-15-SAは、2014/0134128(参照により本明細書に組み込まれる)に記載の二量体IL-15RαSu(Sushiドメイン)/Fc(配列番号259)及び2つのIL-15N72D(配列番号258)分子(ALT-803としても知られる)を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、二量体IL-15RαSu/Fc分子(配列番号259)及び2つのIL-15分子(配列番号261)を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、二量体IL-15RαSu/Fc分子(配列番号259)及び2つのIL-15分子(配列番号262)を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、二量体IL-15RαSu/Fc分子(配列番号259)及び2つのIL-15分子(配列番号263)を含む。
いくつかの実施形態では、IL-15SAは、二量体IL-15RαSu/Fc分子(配列番号259)、及び配列番号258、258、262、及び263から選択されるアミノ酸配列を有する2つのIL-15分子を含む。
いくつかの実施形態では、IL-15SAは、可溶性IL-15Rα分子(配列番号260)及び2つのIL-15分子(配列番号258)を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、可溶性IL-15Rα分子(配列番号260)及び2つのIL-15分子(配列番号261)を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、可溶性IL-15Rα分子(配列番号260)及び2つのIL-15分子(配列番号262)を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、可溶性IL-15Rα分子(配列番号260)及び2つのIL-15分子(配列番号263)を含む。
いくつかの実施形態では、IL-15SAは、可溶性IL-15Rα分子(配列番号264)及び2つのIL-15分子(配列番号258)を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、可溶性IL-15Rα分子(配列番号264)及び2つのIL-15分子(配列番号261)を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、可溶性IL-15Rα分子(配列番号264)及び2つのIL-15分子(配列番号262)を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、可溶性IL-15Rα分子(配列番号264)及び2つのIL-15分子(配列番号261)を含む。
いくつかの実施形態では、IL-15SAは、可溶性IL-15Rα分子(配列番号265)及び2つのIL-15分子(配列番号258)を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、可溶性IL-15Rα分子(配列番号265)及び2つのIL-15分子(配列番号261)を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、可溶性IL-15Rα分子(配列番号265)及び2つのIL-15分子(配列番号262)を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、可溶性IL-15Rα分子(配列番号265)及び2つのIL-15分子(配列番号263)を含む。
いくつかの実施形態では、IL-15SAは、二量体IL-15RαSu/Fc(配列番号269)分子及び2つのIL-15分子(配列番号262)を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、二量体IL-15RαSu/Fc(配列番号259)分子及び2つのIL-15分子(配列番号263)を含む。
いくつかの実施形態では、IL-15SAは、配列番号259及び配列番号260を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、配列番号261または配列番号262を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、配列番号261及び配列番号259を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、配列番号262及び配列番号259を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、配列番号263及び配列番号259を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、配列番号261及び配列番号260を含む。いくつかの実施形態では、IL-15SAは、配列番号262及び配列番号260を含む。
いくつかの実施形態では、TIL組成物は、IL-15またはその生体活性バリアントを含む免疫調節融合タンパク質またはナノ粒子組成物を含む。IL-15を含む例示的な融合タンパク質を、図51及び52、ならびに表58及び59に示す。
例示的な実施形態では、本明細書で提供されるTIL組成物は、IL-15を含む免疫調節融合タンパク質をコードする核酸を含み、核酸は、本明細書に記載のNFATプロモーターに作動可能に連結される。IL-15を含む免疫調節融合タンパク質の発現のための例示的なNFATプロモーター駆動型構築物を表59に示す。
2.IL-12
いくつかの実施形態では、修飾されたTILは、IL-12またはそのバリアントと会合する。例示的な実施形態では、IL-12は、本明細書に記載の免疫調節融合タンパク質(例えば、膜アンカー免疫調節融合タンパク質)の一部として含まれる。
本明細書で使用される場合、「インターロイキン12」、「IL-12」及び「IL12」はすべて、IL-12A及びIL-12B遺伝子(Genbank受託番号:NM_000882(IL-12A)及びNM_002187(IL-12B))によってコードされるヘテロ二量体サイトカインであるインターロイキンを指す。IL-12は、4つのアルファヘリックスのバンドルで構成され、天然T細胞のTH1細胞への分化に関与する。それは2つの別々の遺伝子、IL-12A(p35)及びIL-12B(p40)によってコードされる。活性ヘテロ二量体(「p70」と称される)、及びp40のホモ二量体は、タンパク質合成の後に形成される。IL-12は、IL-12R-β1及びIL-12R-β2によって形成されるヘテロ二量体受容体である、IL-12受容体に結合する。IL-12は、T細胞の成長及び機能を刺激することができるT細胞刺激因子として知られている。特に、IL-12は、T細胞及びナチュラルキラー(NK)細胞からのインターフェロンガンマ(IFN-γ)及び腫瘍壊死因子-アルファ(TNF-α)の産生を刺激し、IFN-γのIL-4媒介抑制を低減することができる。IL-12は、NK細胞及びCD8+細胞傷害性Tリンパ球の細胞傷害活性の増強をさらに媒介することができる。さらに、IL-12はまた、インターフェロンガンマの産生を増加させることによって抗血管新生活性を有し得、これは順に、ケモカイン誘導性タンパク質-10(IP-10またはCXCL10)の産生を増加させる。次いで、IP-10が、この抗血管新生効果を媒介する。したがって、いかなる特定の操作理論にも縛られることなく、IL-12は、本明細書で提供されるTIL組成物の生存可能性及び/または抗腫瘍効果を増加させることができると考えられる。
いくつかの実施形態では、修飾されたTILと会合するIL-12は、全長IL-12、IL-12の断片またはバリアントである。いくつかの実施形態では、IL-12は、ヒトIL-12またはバリアントヒトIL-12である。例示的な実施形態では、IL-12は、生物学的に活性なヒトIL-12バリアントである。いくつかの実施形態では、IL-12は、野生型IL-12と比較して、1、2、3、4、5、6 7、8、9、または10個の変異を含む。
いくつかの実施形態では、修飾されたTIL組成物に含まれるIL-12は、IL-12 p35サブユニットまたはそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、IL-12 p35サブユニットは、ヒトIL-12 p35サブユニットである。いくつかの実施形態では、IL-12 p35サブユニットは、アミノ酸配列を有する。ある特定の実施形態では、修飾されたTIL組成物に含まれるIL-12は、IL-12 p40サブユニットまたはそのバリアントを含む。ある特定の実施形態では、IL-12は、IL-12 p40サブユニットに付着したIL-12 p35サブユニットを含む一本鎖IL-12ポリペプチドである。そのようなIL-12一本鎖ポリペプチドは、野生型IL-12の生物学的活性のうちの1つ以上を有利に保持する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の一本鎖IL-12ポリペプチドは、N末端からC末端へ、式(p40)-(L)-(p35)に従うものであり、式中、「p40」は、IL-12 p40サブユニットであり、「p35」は、IL-12 p35サブユニットであり、Lは、リンカーである。他の実施形態では、一本鎖IL-12は、N末端からC末端へ、式(p35)-(L)-(p40)によるものである。任意の好適なリンカーは、本明細書に記載のものを含む、一本鎖IL-12ポリペプチドで使用され得る。好適なリンカーには、例えば、アミノ酸配列(GGGGS)を有するリンカーが含まれ得、xは、1~10の整数である。他の好適なリンカーとしては、例えば、アミノ酸配列GGGGGGSが挙げられる。対象の一本鎖IL-12ポリペプチドとともに使用することができる例示的な一本鎖IL-12リンカーもまた、Lieschke et al.,Nature Biotechnology 15:35~40(1997)(これは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)において、特にIL-12ポリペプチドリンカーの教示のために記載されている。例示的な実施形態では、一本鎖IL-12ポリペプチドは、一本鎖ヒトIL-12ポリペプチドである(すなわち、それは、ヒトp35及びp40 IL-12サブユニットを含む)。
いくつかの実施形態では、TIL組成物は、IL-12またはその生体活性バリアントを含む免疫調節融合タンパク質またはナノ粒子組成物を含む。
例示的な実施形態では、本明細書で提供されるTIL組成物は、IL-12を含む免疫調節融合タンパク質をコードする核酸を含み、核酸は、本明細書に記載のNFATプロモーターに作動可能に連結される。例えば、米国特許第8,556,882号(これは参照によりその全体が、特にIL-12発現のためのNFATプロモーターに関連する関連部分について組み込まれる)を参照されたい。IL-12を含む例示的な融合タンパク質を、図51及び52、ならびに表58に示す。
3.IL-18
いくつかの実施形態では、修飾されたTILは、IL-18またはそのバリアントと会合する。例示的な実施形態では、IL-18は、本明細書に記載の免疫調節融合タンパク質(例えば、膜アンカー免疫調節融合タンパク質)の一部として含まれる。
本明細書で使用される場合、「インターロイキン18」、「IL-18」、「IL18」、「IGIF」、「IL-1g」、「インターフェロン-ガンマ誘導因子」、及び「IL1F4」はすべて、IL-18遺伝子(例えば、Genbank受託番号:NM_001243211、NM_001562及びNM_001386420)によってコードされるヘテロ二量体サイトカインである、インターロイキンを指す。IL-1βと構造的に類似するIL-18は、サイトカインのIL-1スーパーファミリーのメンバーである。多くのヒトリンパ球及び非リンパ球細胞によって発現されるこのサイトカインは、炎症プロセスにおいて重要な役割を果たす。IL-12と組み合わせたIL-18は、細胞傷害性T細胞(CTL)、ならびにナチュラルキラー(NK)細胞を活性化して、IFN-γを産生することができ、したがって、腫瘍免疫に寄与する。したがって、いかなる特定の操作理論にも縛られることなく、IL-18は、本明細書で提供されるTIL組成物の抗腫瘍効果を増強することができると考えられる。
いくつかの実施形態では、修飾されたTILと会合するIL-18は、全長IL-18、IL-18の断片またはバリアントである。いくつかの実施形態では、IL-18は、ヒトIL-18またはバリアントヒトIL-18である。例示的な実施形態では、IL-18は、生物学的に活性なヒトIL-18バリアントである。いくつかの実施形態では、IL-18は、野生型IL-18と比較して、1、2、3、4、5、6 7、8、9、または10個の変異を含む。いくつかの実施形態では、バリアントIL-18は、以下のアミノ酸配列を有する:
いくつかの実施形態では、TIL組成物は、IL-18またはその生体活性バリアントを含む免疫調節融合タンパク質またはナノ粒子組成物を含む。IL-18を含む例示的な融合タンパク質を図51に示す。
例示的な実施形態では、本明細書で提供されるTIL組成物は、IL-18を含む免疫調節融合タンパク質をコードする核酸を含み、核酸は、本明細書に記載のNFATプロモーターに作動可能に連結される。IL-21を含む免疫調節融合タンパク質の発現のための例示的なNFATプロモーター駆動型構築物を表59に示す。
4.IL-21
いくつかの実施形態では、修飾されたTILは、IL-21またはそのバリアントと会合する。例示的な実施形態では、IL-21は、本明細書に記載の免疫調節融合タンパク質(例えば、膜アンカー免疫調節融合タンパク質)の一部として含まれる。
ある特定の実施形態では、サイトカイン-ABDは、IL-21分子またはその断片を含む。本明細書で使用される場合、「インターロイキン21」、「IL-21」、及び「IL21」(例えば、Genbank受託番号:NM_001207006及びNP_001193935(ヒト)、ならびにNM_0001291041及びNP_001277970(マウス))はすべて、IL-21受容体に結合し、ナチュラルキラー(NK)細胞及び細胞傷害性細胞を含む免疫系の細胞に対して強力な調節効果を有し、ウイルス感染またはがん細胞を破壊することができるIL-21受容体に結合するサイトカインのメンバーを指す。したがって、いかなる特定の操作理論にも縛られることなく、IL-21は、本明細書で提供されるTIL組成物の生存可能性及び/または抗腫瘍効果を増加させることができると考えられる。
いくつかの実施形態では、IL-21は、ヒトIL-21である。いくつかの実施形態では、修飾されたTILと会合するIL-21は、全長IL-21、IL-21の断片またはバリアントである。いくつかの実施形態では、IL-21は、ヒトIL-21またはバリアントヒトIL-21である。例示的な実施形態では、IL-21は、生物学的に活性なヒトIL-21バリアントである。いくつかの実施形態では、IL-21は、野生型IL-21と比較して、1、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の変異を含む。
いくつかの実施形態では、TIL組成物は、IL-21またはその生体活性バリアントを含む免疫調節融合タンパク質またはナノ粒子組成物を含む。IL-21を含む例示的な融合タンパク質を、図51及び52、ならびに表58及び59に示す。
例示的な実施形態では、本明細書で提供されるTIL組成物は、IL-21を含む免疫調節融合タンパク質をコードする核酸を含み、核酸は、本明細書に記載のNFATプロモーターに作動可能に連結される。
5.IL-2
いくつかの実施形態では、修飾されたTILは、IL-2またはそのバリアントと会合する。例示的な実施形態では、IL-2は、本明細書に記載の免疫調節融合タンパク質(例えば、膜アンカー免疫調節融合タンパク質)の一部として含まれる。
ある特定の実施形態では、サイトカイン-ABDは、IL-2分子またはその断片を含む。本明細書で使用される場合、「インターロイキン2」、「IL-2」、「IL2」、及び「TCGF」(例えば、Genbank受託番号:NM_000586及びNP_000577(ヒト)はすべて、IL-2受容体に結合するサイトカインのメンバーを指す。IL-2は、活性化誘発性細胞死(AICD)を増強する。IL-2はまた、初期T細胞が抗原によっても刺激されるときに、T細胞の、エフェクターT細胞への分化及びメモリーT細胞への分化を促進し、したがって、身体が感染症を撃退するのを助ける。他の分極サイトカインとともに、IL-2は、Th1及びTh2リンパ球へのナイーブCD4+T細胞分化を刺激し、Th17及び濾胞性Thリンパ球への分化を阻害する。IL-2はまた、ナチュラルキラー細胞及び細胞傷害性T細胞の両方の細胞殺傷活性を増加させる。したがって、いかなる特定の操作理論にも縛られることなく、IL-2は、本明細書で提供されるTIL組成物の生存可能性及び/または抗腫瘍効果を増加させることができると考えられる。
いくつかの実施形態では、IL-2は、ヒトIL-2である。いくつかの実施形態では、修飾されたTILと会合するIL-2は、全長IL-2、IL-2の断片またはバリアントである。いくつかの実施形態では、IL-2は、ヒトIL-2またはバリアントヒトIL-2である。例示的な実施形態では、IL-2は、生物学的に活性なヒトIL-2バリアントである。いくつかの実施形態では、IL-2は、野生型IL-2と比較して、1、2、3、4、5、6 7、8、9、または10個の変異を含む。
いくつかの実施形態では、TIL組成物は、IL-2またはその生体活性バリアントを含む免疫調節融合タンパク質またはナノ粒子組成物を含む。IL-2を含む例示的な融合タンパク質を図51及び52に示す。
例示的な実施形態では、本明細書で提供されるTIL組成物は、IL-2を含む免疫調節融合タンパク質をコードする核酸を含み、核酸は、本明細書に記載のNFATプロモーターに作動可能に連結される。
6.CD40アゴニスト
いくつかの実施形態では、修飾されたTILは、CD40アゴニストと会合する。例示的な実施形態では、CD40アゴニストは、本明細書に記載の免疫調節融合タンパク質(例えば、膜アンカー免疫調節融合タンパク質)の一部として含まれる。
分化クラスター40、CD40は、抗原提示細胞(APC)上に見出される共刺激タンパク質であり、APC活性化に必要である。Tヘルパー細胞上のCD40L(CD154)のCD40への結合は、抗原提示細胞(例えば、樹状細胞)を活性化し、様々な下流効果を誘導する。いかなる特定の操作理論によるものではないが、抗原提示細胞(すなわち、CD40アゴニスト)上でCD40を活性化する1つ以上の免疫調節剤の添加は、本明細書で提供されるTIL組成物の抗腫瘍効果を増強することができると考えられる。CD40アゴニストとしては、例えば、CD40L及びCD40にアゴニスト的に結合する抗体またはその抗体断片(例えば、scFv)が挙げられる。いくつかの実施形態では、TIL組成物は、CD40Lまたはその生体活性バリアントを含む免疫調節融合タンパク質またはナノ粒子組成物を含む。いくつかの実施形態では、TIL組成物は、アゴニスト抗CD40結合ドメイン(例えば、scFv)を含む免疫調節融合タンパク質を含む。例示的なCD40アゴニスト配列を以下の表に示す。
CD40アゴニスト活性は、当該技術分野で知られている任意の好適な方法を使用して測定することができる。例えば、DC上のCD40のライゲーションは、共刺激及びMHC分子の表面発現の増加、炎症誘発性サイトカインの産生、ならびにT細胞トリガーの増強を誘導する。安静B細胞上のCD40ライゲーションは、抗原提示機能及び増殖を増加させる。例示的な実施形態では、CD40アゴニストは、ヒト樹状細胞を活性化することができる。
いくつかの実施形態では、TIL組成物は、表10に示される抗CD40 scFvのVH及びVL配列を有するアゴニスト抗CD40結合ドメイン、またはその生体活性バリアントを含む。いくつかの実施形態では、抗CD40結合ドメインは、表10に示されるVH配列と少なくとも約80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一であるVH配列を含む。いくつかの実施形態では、アゴニスト抗CD40結合ドメインは、表10に示されるVH配列と比較して、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸置換を含むVH配列を含む。いくつかの実施形態では、抗CD40結合ドメインは、表10に示されるVL配列と少なくとも約80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%同一であるVL配列を含む。いくつかの実施形態では、抗CD40結合ドメインは、表10に示されるVL配列と比較して、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸置換を含むVL配列を含む。例示的な実施形態では、抗CD40結合ドメインは、表10の配列番号276、279、282、及び285から選択される抗CD40 scFvである。
いくつかの実施形態では、抗CD40結合ドメインは、ヒトCD40に結合することができる、表10の抗CD40 scFvのバリアントである。例示的な実施形態では、バリアント抗CD40 scFvは、表10の配列番号276、279、282、及び285から選択される抗CD40 scFvと少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、または99%同一である。
CD40結合ドメイン結合の評価は、Biacore、表面プラズモン共鳴(SPR)及び/またはBLI(バイオレイヤー干渉法、例えば、Octetアッセイ)アッセイを含むがこれらに限定されない、当該技術分野で知られている任意の好適なアッセイを使用して測定することができる。
免疫調節剤として有用な追加のCD40結合ドメイン(VH及びVL)としては、米国特許第6,838,261号、同第6,843,989号、同第7,338,660号、同第8,7778,345号に記載されるものが挙げられ、これらは特に抗CD40抗体ならびにVH、VL及びCDR配列の教示に関して参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、CD40アゴニストは、CD40リガンド(CD40L)である。例示的な実施形態では、CD40Lは、ヒトCD40L(配列番号270)である。いくつかの実施形態では、CD40Lは、配列番号253と少なくとも約75%、80%、85%、90%、95%、または99%同一であるヒトCD40Lのバリアントである。いくつかの実施形態では、CD40Lは、配列番号273と比較して、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、または20個のアミノ酸置換を含む、ヒトCD40Lのバリアントである。
CD40アゴニストを含む例示的な融合タンパク質を図51及び52に示す。
例示的な実施形態では、本明細書で提供されるTIL組成物は、CD40アゴニストを含む免疫調節融合タンパク質をコードする核酸を含み、核酸は、本明細書に記載されるように、NFATプロモーターに作動可能に連結される。


IX.薬学的組成物、投与量、及び投薬レジメン
いくつかの実施形態では、本開示の方法を使用して拡張及び/または遺伝子修飾された(CCRを発現するように遺伝子修飾されたTIL、MIL、またはPBLを含む)TIL、MIL、またはPBLは、薬学的組成物として患者に投与される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、滅菌緩衝液中のTIL懸濁液である。本開示のPBMCを使用して拡張されたTILは、当該技術分野で知られている任意の好適な経路によって投与され得る。いくつかの実施形態では、T細胞は、単回の動脈内または静脈内注入として投与され、これは、好ましくは、およそ30~60分続く。他の好適な投与経路には、腹腔内、髄腔内、及びリンパ内投与が含まれる。
任意の好適な用量のTILが投与され得る。いくつかの実施形態では、特にがんがNSCLCまたは黒色腫である場合、約2.3×1010~約13.7×1010のTILが投与され、平均約7.8×1010のTILである。いくつかの実施形態では、特にがんがNSCLCまたは黒色腫である場合、平均約7.8×1010個のTILで、約2.3×1010~約13.7×1010個のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約1.2×1010~約4.3×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約3×1010~約12×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約4×1010~約10×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約5×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約6×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約7×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約2.3×1010~約13.7×1010である。いくつかの実施形態では、特にがんが黒色腫である場合、治療上有効な投与量は、約7.8×1010のTILである。いくつかの実施形態では、特にがんが黒色腫である場合、治療上有効な投与量は、約7.8×1010個のTILである。いくつかの実施形態では、特にがんがNSCLCである場合、治療上有効な投与量は、約7.8×1010個のTILである。いくつかの実施形態では、特にがんが転移性NSCLCである場合、治療上有効な投与量は、約7.8×1010個のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約1.2×1010~約4.3×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約3×1010~約12×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約4×1010~約10×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約5×1010~約8×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約6×1010~約8×1010のTILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約7×1010~約8×1010のTILである。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物で提供されるTILの数は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、及び9×1013である。いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物で提供されるTILの数は、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×1010、1×1010~5×1010、5×1010~1×1011、5×1011~1×1012、1×1012~5×1012、及び5×1012~1×1013の範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、例えば、薬学的組成物の100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%、0.1%、0.09%、0.08%、0.07%、0.06%、0.05%、0.04%、0.03%、0.02%、0.01%、0.009%、0.008%、0.007%、0.006%、0.005%、0.004%、0.003%、0.002%、0.001%、0.0009%、0.0008%、0.0007%、0.0006%、0.0005%、0.0004%、0.0003%、0.0002%、または0.0001%w/w、w/v、またはv/v未満である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、19.75%、19.50%、19.25%、19%、18.75%、18.50%、18.25%、18%、17.75%、17.50%、17.25%、17%、16.75%、16.50%、16.25%、16%、15.75%、15.50%、15.25%、15%、14.75%、14.50%、14.25%、14%、13.75%、13.50%、13.25%、13%、12.75%、12.50%、12.25%、12%、11.75%、11.50%、11.25%、11%、10.75%、10.50%、10.25%、10%、9.75%、9.50%、9.25%、9%、8.75%、8.50%、8.25%、8%、7.75%、7.50%、7.25%、7%、6.75%、6.50%、6.25%、6%、5.75%、5.50%、5.25%、5%、4.75%、4.50%、4.25%、4%、3.75%、3.50%、3.25%、3%、2.75%、2.50%、2.25%、2%、1.75%、1.50%、125%、1%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%、0.1%、0.09%、0.08%、0.07%、0.06%、0.05%、0.04%、0.03%、0.02%、0.01%、0.009%、0.008%、0.007%、0.006%、0.005%、0.004%、0.003%、0.002%、0.001%、0.0009%、0.0008%、0.0007%、0.0006%、0.0005%、0.0004%、0.0003%、0.0002%、または0.0001%w/w、w/v、またはv/v超である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の約0.0001%~約50%、約0.001%~約40%、約0.01%~約30%、約0.02%~約29%、約0.03%~約28%、約0.04%~約27%、約0.05%~約26%、約0.06%~約25%、約0.07%~約24%、約0.08%~約23%、約0.09%~約22%、約0.1%~約21%、約0.2%~約20%、約0.3%~約19%、約0.4%~約18%、約0.5%~約17%、約0.6%~約16%、約0.7%~約15%、約0.8%~約14%、約0.9%~約12%、または約1%~約10%w/w、w/v、またはv/vの範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の約0.001%~約10%、約0.01%~約5%、約0.02%~約4.5%、約0.03%~約4%、約0.04%~約3.5%、約0.05%~約3%、約0.06%~約2.5%、約0.07%~約2%、約0.08%~約1.5%、約0.09%~約1%、約0.1%~約0.9%w/w、w/v、またはv/vの範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの量は、10g、9.5g、9.0g、8.5g、8.0g、7.5g、7.0g、6.5g、6.0g、5.5g、5.0g、4.5g、4.0g、3.5g、3.0g、2.5g、2.0g、1.5g、1.0g、0.95g、0.9g、0.85g、0.8g、0.75g、0.7g、0.65g、0.6g、0.55g、0.5g、0.45g、0.4g、0.35g、0.3g、0.25g、0.2g、0.15g、0.1g、0.09g、0.08g、0.07g、0.06g、0.05g、0.04g、0.03g、0.02g、0.01g、0.009g、0.008g、0.007g、0.006g、0.005g、0.004g、0.003g、0.002g、0.001g、0.0009g、0.0008g、0.0007g、0.0006g、0.0005g、0.0004g、0.0003g、0.0002g、または0.0001g以下である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの量は、0.0001g、0.0002g、0.0003g、0.0004g、0.0005g、0.0006g、0.0007g、0.0008g、0.0009g、0.001g、0.0015g、0.002g、0.0025g、0.003g、0.0035g、0.004g、0.0045g、0.005g、0.0055g、0.006g、0.0065g、0.007g、0.0075g、0.008g、0.0085g、0.009g、0.0095g、0.01g、0.015g、0.02g、0.025g、0.03g、0.035g、0.04g、0.045g、0.05g、0.055g、0.06g、0.065g、0.07g、0.075g、0.08g、0.085g、0.09g、0.095g、0.1g、0.15g、0.2g、0.25g、0.3g、0.35g、0.4g、0.45g、0.5g、0.55g、0.6g、0.65g、0.7g、0.75g、0.8g、0.85g、0.9g、0.95g、1g、1.5g、2g、2.5、3g、3.5、4g、4.5g、5g、5.5g、6g、6.5g、7g、7.5g、8g、8.5g、9g、9.5g、または10g超である。
本発明の薬学的組成物中に提供されるTILは、広い投与量範囲にわたって有効である。正確な投与量は、投与経路、化合物が投与される形態、治療される対象の性別及び年齢、治療される対象の体重、ならびに主治医の選好及び経験に依存するであろう。適切な場合、TILの臨床的に確立された投与量が使用される場合もある。TILの投与量などの本明細書の方法を使用して投与される薬学的組成物の量は、治療されるヒトまたは哺乳動物、障害または状態の重症度、投与速度、医薬品有効成分の性質、及び処方医師の裁量に依存するであろう。
いくつかの実施形態では、TILは、単回用量で投与され得る。かかる投与は、注射、例えば、静脈内注射によるものであり得る。いくつかの実施形態では、TILは、複数回用量で投与され得る。投薬は、1年に1回、2回、3回、4回、5回、6回、または6回超であり得る。投薬は、月1回、2週間に1回、週1回、または隔日に1回であり得る。TILの投与は、必要な限り継続することができる。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、及び9×1013である。いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×1010、1×1010~5×1010、5×1010~1×1011、5×1011~1×1012、1×1012~5×1012、及び5×1012~1×1013の範囲内である。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約0.01mg/kg~約4.3mg/kg、約0.15mg/kg~約3.6mg/kg、約0.3mg/kg~約3.2mg/kg、約0.35mg/kg~約2.85mg/kg、約0.15mg/kg~約2.85mg/kg、約0.3mg~約2.15mg/kg、約0.45mg/kg~約1.7mg/kg、約0.15mg/kg~約1.3mg/kg、約0.3mg/kg~約1.15mg/kg、約0.45mg/kg~約1mg/kg、約0.55mg/kg~約0.85mg/kg、約0.65mg/kg~約0.8mg/kg、約0.7mg/kg~約0.75mg/kg、約0.7mg/kg~約2.15mg/kg、約0.85mg/kg~約2mg/kg、約1mg/kg~約1.85mg/kg、約1.15mg/kg~約1.7mg/kg、約1.3mg/kg~約1.6mg/kg、約1.35mg/kg~約1.5mg/kg、約2.15mg/kg~約3.6mg/kg、約2.3mg/kg~約3.4mg/kg、約2.4mg/kg~約3.3mg/kg、約2.6mg/kg~約3.15mg/kg、約2.7mg/kg~約3mg/kg、約2.8mg/kg~約3mg/kg、または約2.85mg/kg~約2.95mg/kgの範囲内である。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約1mg~約500mg、約10mg~約300mg、約20mg~約250mg、約25mg~約200mg、約1mg~約50mg、約5mg~約45mg、約10mg~約40mg、約15mg~約35mg、約20mg~約30mg、約23mg~約28mg、約50mg~約150mg、約60mg~約140mg、約70mg~約130mg、約80mg~約120mg、約90mg~約110mg、または約95mg~約105mg、約98mg~約102mg、約150mg~約250mg、約160mg~約240mg、約170mg~約230mg、約180mg~約220mg、約190mg~約210mg、約195mg~約205mg、または約198~約207mgの範囲内である。
TILの有効量は、鼻腔内経路及び経皮経路を含む、同様の有用性を有する薬剤の認められた投与様式のうちのいずれかによって、動脈内注射によって、静脈内、腹腔内、非経口、筋肉内、皮下、局所、移植によって、または吸入によって、単回用量または複数回用量のいずれかで投与され得る。
いくつかの実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を含む注入バッグを提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団及び薬学的に許容される担体を含む腫瘍浸潤リンパ球(TIL)組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を含む注入バッグを提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団の凍結保存された調製物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団及び凍結保存された培地を含む腫瘍浸潤リンパ球(TIL)組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、凍結保存培地がDMSOを含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、凍結保存培地が7~10%のDMSOを含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物の凍結保存された調製物を提供する。
いくつかの実施形態では、本開示の方法を使用して拡張されたTILは、薬学的組成物として患者に投与される。いくつかの実施形態では、薬学的組成物は、滅菌緩衝液中のTIL懸濁液である。本開示のPBMCを使用して拡張されたTILは、当該技術分野で知られている任意の好適な経路によって投与され得る。いくつかの実施形態では、T細胞は、単回の動脈内または静脈内注入として投与され、これは、好ましくは、およそ30~60分続く。他の好適な投与経路には、腹腔内、髄腔内、及びリンパ内投与が含まれる。
任意の好適な用量のTILが投与され得る。いくつかの実施形態では、特にがんがNSCLCである場合、約2.3×1010~約13.7×1010のTILが投与され、平均は約7.8×1010のTILである。いくつかの実施形態では、約1.2×1010~約4.3×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約3×1010~約12×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約4×1010~約10×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約5×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約6×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、約7×1010~約8×1010のTILが投与される。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約2.3×1010~約13.7×1010である。いくつかの実施形態では、特にがんがNSCLCである場合、治療上有効な投与量は、約7.8×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約1.2×1010~約4.3×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約3×1010~約12×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約4×1010~約10×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約5×1010~約8×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約6×1010~約8×1010TILである。いくつかの実施形態では、治療上有効な投与量は、約7×1010~約8×1010TILである。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物で提供されるTILの数は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、及び9×1013である。いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物で提供されるTILの数は、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×1010、1×1010~5×1010、5×1010~1×1011、5×1011~1×1012、1×1012~5×1012、及び5×1012~1×1013の範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、例えば、薬学的組成物の100%、90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%、0.1%、0.09%、0.08%、0.07%、0.06%、0.05%、0.04%、0.03%、0.02%、0.01%、0.009%、0.008%、0.007%、0.006%、0.005%、0.004%、0.003%、0.002%、0.001%、0.0009%、0.0008%、0.0007%、0.0006%、0.0005%、0.0004%、0.0003%、0.0002%、または0.0001%w/w、w/v、またはv/v未満である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の90%、80%、70%、60%、50%、40%、30%、20%、19.75%、19.50%、19.25%、19%、18.75%、18.50%、18.25%、18%、17.75%、17.50%、17.25%、17%、16.75%、16.50%、16.25%、16%、15.75%、15.50%、15.25%、15%、14.75%、14.50%、14.25%、14%、13.75%、13.50%、13.25%、13%、12.75%、12.50%、12.25%、12%、11.75%、11.50%、11.25%、11%、10.75%、10.50%、10.25%、10%、9.75%、9.50%、9.25%、9%、8.75%、8.50%、8.25%、8%、7.75%、7.50%、7.25%、7%、6.75%、6.50%、6.25%、6%、5.75%、5.50%、5.25%、5%、4.75%、4.50%、4.25%、4%、3.75%、3.50%、3.25%、3%、2.75%、2.50%、2.25%、2%、1.75%、1.50%、125%、1%、0.5%、0.4%、0.3%、0.2%、0.1%、0.09%、0.08%、0.07%、0.06%、0.05%、0.04%、0.03%、0.02%、0.01%、0.009%、0.008%、0.007%、0.006%、0.005%、0.004%、0.003%、0.002%、0.001%、0.0009%、0.0008%、0.0007%、0.0006%、0.0005%、0.0004%、0.0003%、0.0002%、または0.0001%w/w、w/v、またはv/v超である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の約0.0001%~約50%、約0.001%~約40%、約0.01%~約30%、約0.02%~約29%、約0.03%~約28%、約0.04%~約27%、約0.05%~約26%、約0.06%~約25%、約0.07%~約24%、約0.08%~約23%、約0.09%~約22%、約0.1%~約21%、約0.2%~約20%、約0.3%~約19%、約0.4%~約18%、約0.5%~約17%、約0.6%~約16%、約0.7%~約15%、約0.8%~約14%、約0.9%~約12%、または約1%~約10%w/w、w/v、またはv/vの範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの濃度は、薬学的組成物の約0.001%~約10%、約0.01%~約5%、約0.02%~約4.5%、約0.03%~約4%、約0.04%~約3.5%、約0.05%~約3%、約0.06%~約2.5%、約0.07%~約2%、約0.08%~約1.5%、約0.09%~約1%、約0.1%~約0.9%w/w、w/v、またはv/vの範囲内である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの量は、10g、9.5g、9.0g、8.5g、8.0g、7.5g、7.0g、6.5g、6.0g、5.5g、5.0g、4.5g、4.0g、3.5g、3.0g、2.5g、2.0g、1.5g、1.0g、0.95g、0.9g、0.85g、0.8g、0.75g、0.7g、0.65g、0.6g、0.55g、0.5g、0.45g、0.4g、0.35g、0.3g、0.25g、0.2g、0.15g、0.1g、0.09g、0.08g、0.07g、0.06g、0.05g、0.04g、0.03g、0.02g、0.01g、0.009g、0.008g、0.007g、0.006g、0.005g、0.004g、0.003g、0.002g、0.001g、0.0009g、0.0008g、0.0007g、0.0006g、0.0005g、0.0004g、0.0003g、0.0002g、または0.0001g以下である。
いくつかの実施形態では、本発明の薬学的組成物中に提供されるTILの量は、0.0001g、0.0002g、0.0003g、0.0004g、0.0005g、0.0006g、0.0007g、0.0008g、0.0009g、0.001g、0.0015g、0.002g、0.0025g、0.003g、0.0035g、0.004g、0.0045g、0.005g、0.0055g、0.006g、0.0065g、0.007g、0.0075g、0.008g、0.0085g、0.009g、0.0095g、0.01g、0.015g、0.02g、0.025g、0.03g、0.035g、0.04g、0.045g、0.05g、0.055g、0.06g、0.065g、0.07g、0.075g、0.08g、0.085g、0.09g、0.095g、0.1g、0.15g、0.2g、0.25g、0.3g、0.35g、0.4g、0.45g、0.5g、0.55g、0.6g、0.65g、0.7g、0.75g、0.8g、0.85g、0.9g、0.95g、1g、1.5g、2g、2.5、3g、3.5、4g、4.5g、5g、5.5g、6g、6.5g、7g、7.5g、8g、8.5g、9g、9.5g、または10g超である。
本発明の薬学的組成物中に提供されるTILは、広い投与量範囲にわたって有効である。正確な投与量は、投与経路、化合物が投与される形態、治療される対象の性別及び年齢、治療される対象の体重、ならびに主治医の選好及び経験に依存するであろう。適切な場合、TILの臨床的に確立された投与量が使用される場合もある。TILの投与量などの本明細書の方法を使用して投与される薬学的組成物の量は、治療されるヒトまたは哺乳動物、障害または状態の重症度、投与速度、医薬品有効成分の性質、及び処方医師の裁量に依存するであろう。
いくつかの実施形態では、TILは、単回用量で投与され得る。かかる投与は、注射、例えば、静脈内注射によるものであり得る。いくつかの実施形態では、TILは、複数回用量で投与され得る。投薬は、1年に1回、2回、3回、4回、5回、6回、または6回超であり得る。投薬は、月1回、2週間に1回、週1回、または隔日に1回であり得る。TILの投与は、必要な限り継続することができる。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×10、2×10、3×10、4×10、5×10、6×10、7×10、8×10、9×10、1×1010、2×1010、3×1010、4×1010、5×1010、6×1010、7×1010、8×1010、9×1010、1×1011、2×1011、3×1011、4×1011、5×1011、6×1011、7×1011、8×1011、9×1011、1×1012、2×1012、3×1012、4×1012、5×1012、6×1012、7×1012、8×1012、9×1012、1×1013、2×1013、3×1013、4×1013、5×1013、6×1013、7×1013、8×1013、及び9×1013である。いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×10、1×10~5×10、5×10~1×1010、1×1010~5×1010、5×1010~1×1011、5×1011~1×1012、1×1012~5×1012、及び5×1012~1×1013の範囲内である。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約0.01mg/kg~約4.3mg/kg、約0.15mg/kg~約3.6mg/kg、約0.3mg/kg~約3.2mg/kg、約0.35mg/kg~約2.85mg/kg、約0.15mg/kg~約2.85mg/kg、約0.3mg~約2.15mg/kg、約0.45mg/kg~約1.7mg/kg、約0.15mg/kg~約1.3mg/kg、約0.3mg/kg~約1.15mg/kg、約0.45mg/kg~約1mg/kg、約0.55mg/kg~約0.85mg/kg、約0.65mg/kg~約0.8mg/kg、約0.7mg/kg~約0.75mg/kg、約0.7mg/kg~約2.15mg/kg、約0.85mg/kg~約2mg/kg、約1mg/kg~約1.85mg/kg、約1.15mg/kg~約1.7mg/kg、約1.3mg/kg~約1.6mg/kg、約1.35mg/kg~約1.5mg/kg、約2.15mg/kg~約3.6mg/kg、約2.3mg/kg~約3.4mg/kg、約2.4mg/kg~約3.3mg/kg、約2.6mg/kg~約3.15mg/kg、約2.7mg/kg~約3mg/kg、約2.8mg/kg~約3mg/kg、または約2.85mg/kg~約2.95mg/kgの範囲内である。
いくつかの実施形態では、TILの有効な投与量は、約1mg~約500mg、約10mg~約300mg、約20mg~約250mg、約25mg~約200mg、約1mg~約50mg、約5mg~約45mg、約10mg~約40mg、約15mg~約35mg、約20mg~約30mg、約23mg~約28mg、約50mg~約150mg、約60mg~約140mg、約70mg~約130mg、約80mg~約120mg、約90mg~約110mg、または約95mg~約105mg、約98mg~約102mg、約150mg~約250mg、約160mg~約240mg、約170mg~約230mg、約180mg~約220mg、約190mg~約210mg、約195mg~約205mg、または約198~約207mgの範囲内である。
TILの有効量は、鼻腔内経路及び経皮経路を含む、同様の有用性を有する薬剤の認められた投与様式のうちのいずれかによって、動脈内注射によって、静脈内、腹腔内、非経口、筋肉内、皮下、局所、移植によって、または吸入によって、単回用量または複数回用量のいずれかで投与され得る。
X.患者を治療する方法
治療方法は、最初のTIL収集及びTILの培養から始まる。かかる方法は両方とも、例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Jin et al.,J.Immunotherapy,2012,35(3):283-292によって当該技術分野で説明されている。治療方法の実施形態は、実施例を含む以下の節全体に記載されている。
本明細書に記載の方法に従って、例えば、上記のステップA~Fに記載されるように、または上記のステップA~Fに従って(また例えば、図1及びまたは図8に示されるように)産生される拡張されたTILは、がんを有する患者の治療における特定の使用を見出す(例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Goff,et al.,J.Clinical Oncology,2016,34(20):2389-239、及び補足内容に記載される)。いくつかの実施形態では、TILは、以前に記載されたように、転移性黒色腫の切除された沈着物から増殖された(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Dudley,et al.,J Immunother.,2003,26:332-342を参照されたい)。新鮮な腫瘍は、滅菌条件下で解剖され得る。代表的な試料は、正式な病理学的分析のために収集され得る。2mm~3mmの単一断片が使用され得る。いくつかの実施形態では、患者当たり5、10、15、20、25、または30個の試料が取得される。いくつかの実施形態では、患者当たり20、25、または30個の試料が取得される。いくつかの実施形態では、患者当たり20、22、24、26、または28個の試料が取得される。いくつかの実施形態では、患者当たり24個の試料が取得される。試料は、24ウェルプレートの個々のウェル内に配置され、高用量IL-2(6,000IU/mL)を含む成長培地中で維持され、腫瘍の破壊及び/またはTILの増殖について監視され得る。処理後に生細胞が残っている腫瘍は、本明細書に記載されるように、単一細胞懸濁液中に酵素的に消化され、凍結保存され得る。
いくつかの実施形態では、成功裏に成長したTILは、表現型分析(CD3、CD4、CD8、及びCD56)のために試料採取され、利用可能な場合、自己腫瘍に対して試験され得る。一晩の共培養によりインターフェロンガンマ(IFN-γ)レベルが200pg/mLを超え、バックグラウンドの2倍になった場合、TILは反応性があるとみなされ得る。(Goff,et al.,J Immunother.,2010,33:840-847、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)。いくつかの実施形態では、自己反応性または十分な成長パターンの証拠を有する培養物は、急速拡張(REP)と称されることもある第2の拡張を含む、第2の拡張(例えば、図1及び/または図8のステップDに従って提供される第2の拡張)のために選択され得る。いくつかの実施形態では、高い自己反応性(例えば、第2の拡張中の高い増殖)を有する拡張TILが、追加の第2の拡張のために選択される。いくつかの実施形態では、高い自己反応性(例えば、図1及び/または図8のステップDで提供されるような第2の拡張中の高い増殖)を有するTILが、図1及び/または図8のステップDに従って、追加の第2の拡張のために選択される。
注入バッグTILの凍結保存試料の細胞表現型は、表面マーカーCD3、CD4、CD8、CCR7、及びCD45RA(BD BioSciences)のフローサイトメトリー(例えば、FlowJo)、ならびに本明細書に記載の方法のうちのいずれかによって分析され得る。血清サイトカインは、標準的な酵素結合免疫吸着アッセイ技術を使用することにより測定された。血清IFN-gの上昇は、100pg/mL超及び4 3ベースラインレベルを超えると定義された。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法、例えば図1及び/または図8に例示される方法によって産生されるTILは、TILの臨床効果の驚くべき改善を提供する。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法、例えば図1及び/または図8に例示される方法によって産生されるTILは、例えば、図1及び/または図8に例示されるもの以外の方法を含む、本明細書に記載されるもの以外の方法によって産生されるTILと比較して、増加した臨床効果を示す。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるもの以外の方法は、プロセス1C及び/または第1世代(Gen1)と称される方法を含む。いくつかの実施形態では、増加した有効性は、DCR、ORR、及び/または他の臨床応答によって測定される。いくつかの実施形態では、本明細書で提供される方法、例えば図1に例示される方法によって産生されるTILは、例えば、図1及び/または図8に例示されるもの以外の方法を含む、本明細書に記載されるもの以外の方法によって産生されるTILと比較して、同様の応答時間及び安全性プロファイルを示す。
いくつかの実施形態では、IFN-ガンマ(IFN-γ)は、治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。いくつかの実施形態では、TILで治療された対象の血液中のIFN-γは、活性なTILを示す。いくつかの実施形態では、IFN-γ産生の効力アッセイが用いられる。IFN-γ産生は、細胞傷害能の別の尺度である。IFN-γ産生は、例えば、図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象のエクスビボでの血液、血清、またはTIL中のサイトカインIFN-γのレベルを決定することによって測定することができる。いくつかの実施形態では、IFN-γの増加は、本発明の方法によって産生されたTILで治療された患者における治療有効性を示す。いくつかの実施形態では、IFN-γは、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、IFN-γが1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、2倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、3倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、4倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、5倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γは、Quantikine ELISAキットを使用して測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、例えば、図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象のエクスビボでのTILにおいて測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、例えば図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象の血液において測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、例えば、図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象のTIL血清において測定される。いくつかの実施形態では、IFN-ガンマ(IFN-γ)は、がんの治療における治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。
いくつかの実施形態では、例えば図1及び/または図8のIFN-ガンマ(IFN-γ)に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されるTILは、治療有効性及び/または臨床有効性の増加を示す。いくつかの実施形態では、TILで治療された対象の血液中のIFN-γは、活性なTILを示す。いくつかの実施形態では、IFN-γ産生の効力アッセイが用いられる。IFN-γ産生は、細胞傷害能の別の尺度である。IFN-γ産生は、例えば、図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象のエクスビボでの血液、血清、またはTIL中のサイトカインIFN-γのレベルを決定することによって測定することができる。いくつかの実施形態では、IFN-γの増加は、本発明の方法によって産生されたTILで治療された患者における治療有効性を示す。いくつかの実施形態では、IFN-γは、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、IFN-γが1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上増加する。
いくつかの実施形態では、例えば図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されるTILは、例えばプロセス1C法と称される方法を含む、図1及び/または図8に例示されていないものを含む他の方法によって産生されるTILと比較して、増加したポリクローン性を示す。いくつかの実施形態では、有意に改善されたポリクローン性及び/または増加したポリクローン性は、治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、T細胞レパートリーの多様性を指す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性の増加は、本発明の方法によって産生されたTILの投与に関する治療有効性を示すことができる。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILと比較して、1倍、2倍、10倍、100倍、500倍、または1000倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、2倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、10倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、100倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、500倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1及び/または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1000倍増加する。
有効性の尺度には、当該技術分野で知られており、本明細書にも記載されている、疾患制御率(DCR)ならびに全応答率(ORR)が含まれ得る。
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL集団でNSCLCを治療する方法を含み、患者は、本開示によるTILの注入前に骨髄非破壊的化学療法で前治療される。いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的化学療法は、シクロホスファミド60mg/kg/日で2日間(TIL注入の27日前及び26日前)、ならびにフルダラビン25mg/m2/日で5日間(TIL注入の27日前~23日前)である。いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的化学療法は、シクロホスファミド60mg/kg/日で2日間(TIL注入の27日前及び26日前)、ならびにフルダラビン25mg/m2/日で3日間(TIL注入の27日前~25日前)である。いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的化学療法は、シクロホスファミド60mg/kg/日で2日間(TIL注入の27日前及び26日前)、続いてフルダラビン25mg/m2/日で3日間(TIL注入の25日前~23日前)である。いくつかの実施形態では、本開示による骨髄非破壊的化学療法及びTIL注入(0日目)後、患者は、生理学的許容範囲まで8時間毎に720,000IU/kgでIL-2の静脈内注入を受ける。
示される疾患または障害の治療、予防、及び/または管理における本明細書に記載の化合物及び化合物の組み合わせの有効性は、ヒト疾患の治療のためのガイダンスを提供する当技術分野で知られている様々なモデルを使用して試験され得る。例えば、肺癌の治療の有効性を決定するためのモデルは、例えば、Meuwissen,et al.,Genes&Development,2005,19,643-664に記載されている。肺癌の治療の有効性を決定するためのモデルは、例えば、Kim,Clin.Exp.Otorhinolaryngol.2009,2,55-60、及びSano,Head Neck Oncol.2009,1,32に記載されている。
いくつかの実施形態では、IFN-ガンマ(IFN-γ)は、NSCLC治療の治療有効性を示す。いくつかの実施形態では、TILで治療された対象の血液中のIFN-γは、活性なTILを示す。いくつかの実施形態では、IFN-γ産生の効力アッセイが用いられる。IFN-γ産生は、細胞傷害能の別の尺度である。IFN-γ産生は、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に記載の方法を含む、本発明の方法によって調製されたTILで治療された対象の血液中のサイトカインIFN-γのレベルを決定することによって測定され得る。いくつかの実施形態では、本方法によって取得されたTILは、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)及び本明細書全体を通して例示されるGen3プロセスと称される方法を使用して調製されたTILで治療された対象と比較して、本方法のTILで治療された対象の血液中のIFN-γの増加を提供する。いくつかの実施形態では、IFN-γの増加は、本発明の方法によって産生されたTILで治療された患者における治療有効性を示す。いくつかの実施形態では、IFN-γは、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍、2倍、3倍、4倍、または5倍以上増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、2倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、3倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、4倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γ分泌は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、5倍増加する。いくつかの実施形態では、IFN-γは、Quantikine ELISAキットを使用して測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、Quantikine ELISAキットを使用して測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、本発明の方法によって産生されたTILで治療された患者由来のエクスビボでのTIL中で測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、本発明の方法によって産生されたTILで治療された患者由来の血液中で測定される。いくつかの実施形態では、IFN-γは、本発明の方法によって産生されたTILで治療された患者由来の血清中で測定される。
いくつかの実施形態では、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D及び/または図8E及び/または図8F及び/または図8G)に記載の方法を含む、本発明の方法によって調製されたTILは、例えば、プロセス1C法と称される方法などの、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に例示されていないものを含む他の方法によって産生されたTILと比較して、増加したポリクローン性を示す。いくつかの実施形態では、有意に改善されたポリクローン性及び/または増加したポリクローン性は、がん治療に対する治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、T細胞レパートリーの多様性を指す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性の増加は、本発明の方法によって産生されたTILの投与に関する治療有効性を示すことができる。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILと比較して、1倍、2倍、10倍、100倍、500倍、または1000倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、2倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、10倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、100倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、500倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図8(特に、例えば、図8A及び/または図8B及び/または図8C及び/または図8D及び/または図48A及び/または図48B及び/または図48C及び/または図48D)に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1000倍増加する。
A.がんを治療する方法
本明細書に記載の組成物及び方法は、疾患を治療するための方法で使用され得る。いくつかの実施形態では、それらは、成人患者または小児患者における、がんなどの過剰増殖性障害の治療に使用するためのものである。それらは、本明細書及び以下の段落に記載される他の障害の治療にも使用され得る。
いくつかの実施形態では、過剰増殖性障害は、がんである。いくつかの実施形態では、過剰増殖性障害は、固形腫瘍がんである。いくつかの実施形態では、固形腫瘍がんは、肛門癌、膀胱癌、乳癌(トリプルネガティブ乳癌を含む)、骨癌、ヒトパピローマウイルス(HPV)によって引き起こされるがん、中枢神経系関連癌(上衣腫、髄芽腫、神経芽腫、松果体芽腫、及び未分化神経外胚葉性腫瘍を含む)、子宮頸癌(扁平上皮癌、腺扁平上皮癌、及び子宮頸部腺癌)、結腸癌、結腸直腸癌、子宮内膜癌、食道癌、食道胃接合癌、胃癌、消火器癌、消化管間質腫瘍、神経膠芽細胞腫、神経膠腫、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、下咽頭癌、喉頭癌、鼻咽頭癌、中咽頭癌、及び咽頭癌)、腎臓癌、肝臓癌、肺癌(非小細胞肺癌(NSCLC)、転移性NSCLC、及び小細胞肺癌を含む)、黒色腫(ブドウ膜黒色腫、脈絡膜黒色腫、毛様体黒色腫、虹彩黒色腫、または転移性黒色腫を含む)、中皮腫(悪性胸膜中皮腫を含む)、卵巣癌、膵臓癌(膵管腺癌を含む)、陰茎癌、直腸癌、腎癌、腎細胞癌、肉腫(ユーイング肉腫、骨肉腫、横紋筋肉腫、ならびに他の骨及び軟部組織肉腫を含む)、甲状腺癌(未分化甲状腺癌を含む)、子宮癌、ならびに膣癌からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、過剰増殖性障害は、血液学的悪性腫瘍である。いくつかの実施形態では、血液学的悪性腫瘍は、慢性リンパ性白血病、急性リンパ芽球性白血病、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫、濾胞性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、及び多発性骨髄腫からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、本発明は、がん患者を治療する方法を含み、がんは、血液学的悪性腫瘍である。いくつかの実施形態では、本発明は、PD-1、CTLA-4、LAG-3、CISH、及びCBL-Bのうちの1つ以上を下方調節するように修飾されたTIL、MIL、またはPBLを使用して、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、血液学的悪性腫瘍である。いくつかの実施形態では、本発明は、PD-1、CTLA-4、LAG-3、CISH、及びCBL-BRのうちの1つ以上を下方調節するように修飾されたMILまたはPBLを使用して、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、血液学的悪性腫瘍である。
いくつかの実施形態では、がんは、化学療法、放射線療法、または免疫療法を含む少なくとも1つの前療法による治療に対して再発するか、または不応性である、固形腫瘍がん及び血液学的悪性腫瘍を含む、前述のがんのうちの1つである。いくつかの実施形態では、がんは、化学療法、放射線療法、及び/または免疫療法を含む少なくとも2つの以前の療法による治療に対して再発するか、または不応性である、前述のがんのうちの1つである。いくつかの実施形態では、がんは、化学療法、放射線療法、及び/または免疫療法を含む少なくとも3つの以前の療法による治療に対して再発するか、または不応性である前述のがんのうちの1つである。
いくつかの実施形態では、がんは、高頻度マイクロサテライト不安定性(MSI-H)またはミスマッチ修復欠損(dMMR)癌である。したがって、MSI-H及びdMMR癌ならびに試験は、Kawakami,et al.,Curr.Treat.Options Oncol.2015,16,30に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、本発明は、PD-1、CTLA-4、LAG-3、CISH、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上を下方調節するように修飾されたTIL、MIL、またはPBLを使用してがんを有する患者を治療する方法を含み、患者は、ヒトである。いくつかの実施形態では、本発明は、PD-1、CTLA-4、LAG-3、CISH、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上を下方調節するように修飾されたTIL、MIL、またはPBLを使用してがんを有する患者を治療する方法を含み、患者は、非ヒトである。いくつかの実施形態では、本発明は、PD-1、CTLA-4、LAG-3、CISH、TIGIT、及びCBL-Bのうちの1つ以上を下方調節するように修飾されたTIL、MIL、またはPBLを使用してがんを有する患者を治療する方法を含み、患者は、伴侶動物である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、BRAF阻害剤及び/またはMEK阻害剤による治療に対して不応性である。いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、及びそれらの薬学的に許容される塩または溶媒和物からなる群から選択されるBRAF阻害剤による治療に対して不応性である。いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、トラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、ピマセルチニブ、レファメチニブ、及びそれらの薬学的に許容される塩または溶媒和物からなる群から選択されるMEK阻害剤による治療に対して不応性である。いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、ベムラフェニブ、ダブラフェニブ、エンコラフェニブ、ソラフェニブ、及びそれらの薬学的に許容される塩または溶媒和物からなる群から選択されるBRAF阻害剤、ならびにトラメチニブ、コビメチニブ、ビニメチニブ、セルメチニブ、ピマセルチニブ、レファメチニブ、及びそれらの薬学的に許容される塩または溶媒和物からなる群から選択されるMEK阻害剤による治療に対して不応性である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がん患者を治療する方法を含み、がんは、小児癌である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、がんは、ブドウ膜黒色腫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、ブドウ膜黒色腫は、脈絡膜黒色腫、毛様体黒色腫、または虹彩黒色腫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、小児癌は、神経芽腫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、小児癌は、肉腫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、肉腫は、骨肉腫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、肉腫は、軟部組織肉腫である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、軟部組織肉腫は、横紋筋肉腫、ユーイング肉腫、または未分化神経外胚葉性腫瘍(PNET)である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、小児癌は、中枢神経系(CNS)関連癌である。いくつかの実施形態では、小児癌は、化学療法による治療に対して不応性である。いくつかの実施形態では、小児癌は、放射線療法による治療に対して不応性である。いくつかの実施形態では、小児癌は、ジヌツキシマブによる治療に対して不応性である。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんを有する患者を治療する方法を含み、CNS関連癌は、髄芽腫、松果芽腫、神経膠腫、上衣腫、または神経膠芽細胞腫である。
本明細書に記載の組成物及び方法は、がんを治療するための方法において使用することができ、がんは、抗PD-1または抗PD-L1抗体による治療に対して不応性または耐性である。いくつかの実施形態では、患者は、抗PD-1または抗PD-L1抗体に対する一次不応性患者である。いくつかの実施形態では、患者は、抗PD-1または抗PD-L1抗体に対する事前の応答を示さない。いくつかの実施形態では、患者は、患者のがんの進行に続く、抗PD-1または抗PD-L1抗体に対する事前の応答を示す。いくつかの実施形態では、がんは、少なくとも1つの化学療法剤と組み合わせた抗CTLA-4抗体及び/または抗PD-1もしくは抗PD-L1抗体に対して不応性である。いくつかの実施形態では、以前の化学療法剤は、カルボプラチン、パクリタキセル、ペメトレキセド、及び/またはシスプラチンである。いくつかの実施形態では、化学療法剤(複数可)は、白金ダブレット化学療法剤である。いくつかの実施形態では、白金ダブレット療法は、シスプラチン及びカルボプラチンからなる群から選択される第1の化学療法剤と、ビノレルビン、ゲムシタビン、及びタキサン(例えば、パクリタキセル、ドセタキセル、またはナブ-パクリタキセルを含む)からなる群から選択される第2の化学療法剤と、を含む。いくつかの実施形態では、白金ダブレット化学療法剤は、ペメトレキセドと組み合わされている。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、PD-L1陰性であり、及び/または本明細書の他の場所に記載されるように、腫瘍割合スコア(TPS)が1%未満でPD-L1を発現するがんを有する患者に由来する。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1または抗PD-L1抗体及び白金ダブレット療法を含む併用療法に対して不応性であり、白金ダブレット療法は、
i)シスプラチン及びカルボプラチンからなる群から選択される第1の化学療法剤、
ii)及びビノレルビン、ゲムシタビン、及びタキサン(例えば、パクリタキセル、ドセタキセル、またはnab-パクリタキセルを含む)からなる群から選択される第2の化学療法剤を含む。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1または抗PD-L1抗体、ペメトレキセド、及び白金ダブレット療法を含む併用療法に対して不応性であり、白金ダブレット療法は、
i)シスプラチン及びカルボプラチンからなる群から選択される第1の化学療法剤、
ii)及びビノレルビン、ゲムシタビン、及びタキサン(例えば、パクリタキセル、ドセタキセル、またはnab-パクリタキセルを含む)からなる群から選択される第2の化学療法剤を含む。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1抗体で治療されている。いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-L1抗体で処理されている。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、治療未経験である。いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1抗体で治療されていない。いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-L1抗体で治療されていない。いくつかの実施形態では、NSCLCは、以前に化学療法剤で治療されている。いくつかの実施形態では、NSCLCは、以前に化学療法剤で治療されているが、もはや化学療法剤で治療されていない。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、抗PD-1/PD-L1ナイーブである。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、低いPD-L1の発現を有する。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、治療未経験のNSCLCを有するか、または化学療法治療後であるが、抗PD-1/PD-L1未経験である。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、治療未経験または化学療法治療後であるが、抗PD-1/PD-L1未経験であり、低いPD-L1の発現を有する。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、ベースラインで巨大腫瘤病変を有する。いくつかの実施形態では、対象は、ベースラインで巨大腫瘤病変を有し、低いPD-L1の発現を有する。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、検出可能なPD-L1の発現を有しない。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、治療未経験または化学療法治療後であるが、抗PD-1/PD-L1未経験であり、検出可能なPD-L1の発現を有しない。いくつかの実施形態では、患者は、ベースラインで巨大腫瘤病変を有し、検出可能なPD-L1の発現を有しない。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、治療未経験のNSCLCまたは化学療法後(例えば、化学療法剤後)であるが、PD-L1の発現が低く、及び/またはベースラインで巨大腫瘤病変を有する抗PD-1/PD-L1未経験である。いくつかの実施形態では、最大腫瘍直径が横方向または冠状面のいずれかで測定された7cmより大きい場合、巨大腫瘤病変が示される。いくつかの実施形態では、巨大腫瘤病変は、20mm以上の短軸直径を有する腫れたリンパ節がある場合に示される。いくつかの実施形態では、化学療法剤は、NSCLCの標準治療の治療薬を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1発現は、腫瘍割合スコアによって決定される。いくつかの実施形態では、不応性NSCLC腫瘍を有する対象は、<1%の腫瘍割合スコア(TPS)を有する。いくつかの実施形態では、不応性NSCLC腫瘍を有する対象は、≧1% TPSを有する。いくつかの実施形態では、不応性NSCLCを有する対象は、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、該抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体治療の前に決定された。いくつかの実施形態では、不応性NSCLCを有する対象は、抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、該抗PD-L1抗体治療の前に決定された。
いくつかの実施形態では、例えば、図1、図36、または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されるTILは、例えば、プロセス1C法と称される方法などの、図1、図36、または図8に例示されていないものを含む他の方法によって産生されるTILと比較して、増加したポリクローン性を示す。いくつかの実施形態では、有意に改善されたポリクローン性及び/または増加したポリクローン性は、がん治療に対する治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、T細胞レパートリーの多様性を指す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性の増加は、本発明の方法によって産生されたTILの投与に関する治療有効性を示すことができる。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、例えば、図1、図36、または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILと比較して、1倍、2倍、10倍、100倍、500倍、または1000倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1、図36、または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1、図36、または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、2倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1、図36、または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、10倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1、図36、または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、100倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1、図36、または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、500倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1、図36、または図8に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1000倍増加する。
いくつかの実施形態では、PD-L1発現は、本明細書に記載の1つのさらなる試験方法を使用して、腫瘍割合スコアによって決定される。いくつかの実施形態では、NSCLC腫瘍を有する対象または患者は、<1%の腫瘍割合スコア(TPS)を有する。いくつかの実施形態では、NSCLC腫瘍は、≧1% TPSを有する。いくつかの実施形態では、NSCLCを有する対象または患者は、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体治療の前に決定された。いくつかの実施形態では、NSCLCを有する対象または患者は、抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-L1抗体治療の前に決定された。いくつかの実施形態では、不応性または耐性NSCLC腫瘍を有する対象または患者は、<1%の腫瘍割合スコア(TPS)を有する。いくつかの実施形態では、不応性または耐性NSCLC腫瘍を有する対象または患者は、≧1%TPSを有する。いくつかの実施形態では、不応性または耐性NSCLCを有する対象または患者は、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体治療の前に決定された。いくつかの実施形態では、不応性または耐性NSCLCを有する対象または患者は、抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-L1抗体治療の前に決定された。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、1%未満(TPS<1%)のPD-L1タンパク質についての任意の強度での部分的または完全な膜染色を示す、抗PD-1または抗PD-L1療法の前に採取された患者からの腫瘍割合スコア(TPS)または生存腫瘍細胞のパーセンテージを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、<50%、<45%、<40%、<35%、<30%、<25%、<20%、<15%、<10%、<9%、<8%、<7%、<6%、<5%、<4%、<3%、<2%、<1%、<0.9%、<0.8%、<0.7%、<0.6%、<0.5%、<0.4%、<0.3%、<0.2%、<0.1%、<0.09%、<0.08%、<0.07%、<0.06%、<0.05%、<0.04%、<0.03%、<0.02%、及び<0.01%からなる群から選択されるTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、約50%、約45%、約40%、約35%、約30%、約25%、約20%、約15%、約10%、約9%、約8%、約7%、約6%、約5%、約4%、約3%、約2%、約1%、約0.9%、約0.8%、約0.7%、約0.6%、約0.5%、約0.4%、約0.3%、約0.2%、約0.1%、約0.09%、約0.08%、約0.07%、約0.06%、約0.05%、約0.04%、約0.03%、約0.02%,及び約0.01%からなる群から選択されるTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~1%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.9%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.8%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.7%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.6%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.5%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.4%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.3%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.2%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.1%のTPSを示すNSCLCである。TPSは、当該技術分野で知られている方法、例えば、Hirsch,et al.J.Thorac.Oncol.2017,12,208-222に記載される方法、あるいはペムブロリズマブまたは他の抗PD-1もしくは抗PD-L1療法による治療前のTPSの決定に使用される方法によって測定され得る。米国食品医薬品局(U.S.Food and Drug Administration)によって承認されたTPSの測定のための方法を使用することもできる。いくつかの実施形態では、PD-L1は、エクソソームPD-L1である。いくつかの実施形態では、PD-L1は、循環腫瘍細胞上に見出される。
いくつかの実施形態では、部分的な膜染色は、1%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、99%、またはそれ以上を含む。いくつかの実施形態では、完了した膜染色は、およそ100%の膜染色を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1の試験は、患者の血清中のPD-L1のレベルを測定することを伴い得る。これらの実施形態では、患者の血清中のPD-L1の測定は、腫瘍の不均一性の不確実性及び連続生検の患者の不快感を除去する。
いくつかの実施形態では、ベースラインまたは標準レベルと比較して、可溶性PD-L1の上昇は、NSCLCにおける予後の悪化と相関する。例えば、Okuma,et al.,Clinical Lung Cancer,2018,19,410-417、Vecchiarelli,et al.,Oncotarget,2018,9,17554-17563を参照されたい。いくつかの実施形態では、PD-L1は、エクソソームPD-L1である。いくつかの実施形態では、PD-L1は、循環腫瘍細胞上に発現される。
いくつかの実施形態では、対象または患者は、
i.<1%のPD-L1所定の腫瘍割合スコア(TPS)、
ii.1%~49%のPD-L1のTPSスコア、または
iii.1つ以上のドライバー変異の所定の非存在のうちの少なくとも1つを特徴とする非小細胞肺癌(NSCLC)を有し、
ドライバー変異は、EGFR変異、EGFR挿入、EGFRエクソン20、KRAS変異、BRAF変異、ALK変異、c-ROS変異(ROS1変異)、ROS1融合、RET変異、RET融合、ERBB2変異、ERBB2増幅、BRCA変異、MAP2K1変異、PIK3CA、CDKN2A、PTEN変異、UMD変異、NRAS変異、KRAS変異、NF1変異、MET変異、METスプライス及び/または変化したMETシグナル伝達、TP53変異、CREBBP変異、KMT2C変異、KMT2D変異、ARID1A変異、RB1変異、ATM変異、SETD2変異、FLT3変異、PTPN11変異、FGFR1変異、EP300変異、MYC変異、EZH2変異、JAK2変異、FBXW7変異、CCND3変異、及びGNA11変異からなる群から選択される。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の、本明細書に記載の治療的TIL集団を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の、本明細書に記載のTIL組成物を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、それぞれ、治療上有効な投与量の治療的TIL集団及び本明細書に記載のTIL組成物を投与する前に、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが対象に投与されるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、60mg/m2/日の用量で2日間のシクロホスファミドの投与に続いて、25mg/m2/日の用量で5日間のフルダラビンを投与するステップを含むように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、対象にTIL細胞を投与した翌日に開始する、高用量のIL-2レジメンで対象を治療するステップをさらに含むように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、高用量IL-2レジメンが、許容範囲まで8時間毎に15分間のボーラス静脈内注入として投与される600,000または720,000IU/kgを含むように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが固形腫瘍であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫、転移性黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、転移性NSCLC、肺癌、膀胱癌、乳癌、トリプルネガティブ乳癌、ヒト乳頭癌ウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、または腎細胞癌であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫、転移性黒色腫、HNSCC、子宮頸癌、NSCLC、転移性NSCLC、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、及び胃腸癌であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが転移性黒色腫であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんがHNSCCであるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが子宮頸癌であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんがNSCLCであるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが転移性NSCLCであるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが神経膠芽細胞腫(GBMを含む)であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが胃腸癌であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが高頻度変異癌であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが小児の高頻度変異癌であるように修正された、本明細書に記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の治療的TIL集団を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法で使用するための、本明細書に記載の治療的TIL集団を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量のTIL組成物を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法で使用するための、本明細書に記載のTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の、本明細書に記載の治療用TIL集団または本明細書に記載のTIL組成物を対象に投与する前に、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが対象に投与されるように修正された、本明細書に記載の治療用TIL集団または本明細書に記載のTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、60mg/m/日の用量で2日間のシクロホスファミドの投与に続いて、25mg/m/日の用量で5日間のフルダラビンを投与するステップを含むように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、TIL細胞を患者に投与した翌日から開始する、高用量IL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含むように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、高用量IL-2レジメンが、許容範囲まで8時間毎に15分間のボーラス静脈内注入として投与される600,000または720,000IU/kgを含むように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが固形腫瘍であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫、転移性黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、転移性NSCLC、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭癌ウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、または腎細胞癌であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫、転移性黒色腫、HNSCC、子宮頸癌、NSCLC、転移性NSCLC、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、及び胃腸癌であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが黒色腫であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが転移性黒色腫であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんがHNSCCであるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが子宮頸癌であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんがNSCLCであるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが転移性NSCLCであるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが、神経膠芽細胞腫であるように修正された、本明細書に記載の治療用TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが胃腸癌であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが高頻度変異癌であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、がんが小児の高頻度変異癌であるように修正された、本明細書に記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の治療的TIL集団を対象に投与することを含む、対象におけるがんを治療する方法における本明細書に記載の治療的TIL集団の使用を提供する。
他の実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量のTIL組成物を対象に投与することを含む、対象におけるがんを治療する方法における前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物の使用を提供する。
他の実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンを対象に投与することと、次いで治療上有効な投与量の、本明細書に記載の治療的TIL集団または本明細書に記載のTIL組成物を対象に投与することと、を含む、患者におけるがんを治療する方法における、本明細書に記載の治療的TIL集団または本明細書に記載のTIL組成物の使用を提供する。
1.NSCLCを治療する方法
本明細書に記載の組成物及び方法は、非小細胞肺癌(NSCLC)を治療するための方法で使用され得る。いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1または抗PD-L1抗体による治療に対して不応性である。いくつかの実施形態では、NSCLCは、転移性NSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、転移性ステージIVのNSCLCである。いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体には、例えば、ニボルマブ(BMS-936558,Bristol-Myers Squibb、Opdivo(登録商標))、ペムブロリズマブ(ラムブロリズマブ、MK03475またはMK-3475、Merck、Keytruda(登録商標))、ヒト化抗PD-1抗体JS001(ShangHai JunShi)、モノクローナル抗PD-1抗体TSR-042(Tesaro,Inc.)、ピジリズマブ(抗PD-1 mAb CT-011、Medivation)、抗PD-1モノクローナル抗体BGB-A317(BeiGene)、及び/または抗PD-1抗体SHR-1210(ShangHai HengRui)、ヒトモノクローナル抗体REGN2810(Regeneron)、ヒトモノクローナル抗体MDX-1106(Bristol-Myers Squibb)、及び/またはヒト化抗PD-1 IgG4抗体PDR001(Novartis)が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、PD-1抗体は、クローン:RMP1-14(ラットA)-BioXcellカタログ番号BP0146に由来する。本明細書に記載のステップA~Fに従って産生されたTILとの同時投与方法における使用に好適な他の好適な抗体は、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第8,008,449号に開示される抗PD-1抗体である。いくつかの実施形態では、抗体またはその抗原結合部分は、PD-L1に特異的に結合し、PD-1との相互作用を阻害し、それにより、免疫活性を増加させる。PD-L1に結合し、PD-1とPD-L1との間の相互作用を破壊し、抗腫瘍immu2740274ne応答を刺激する当該技術分野で知られている任意の抗体が含まれる。例えば、PD-L1を標的とし、かつ臨床試験中である抗体には、BMS-936559(Bristol-Myers Squibb)及びMPDL3280A(Genentech)が含まれる。PD-L1を標的とする他の好適な抗体は、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第7,943,743号に開示されている。PD-1またはPD-L1に結合し、PD-1/PD-L1相互作用を破壊し、抗腫瘍免疫応答を刺激する任意の抗体が含まれることは、当業者には理解されるであろう。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗CTLA-4及び/または抗PD-1ならびに化学療法剤に対して不応性である。いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗CTLA-4及び/または抗PD-1ならびに化学療法に対して不応性であり、化学療法剤は、カルボプラチン、パクリタキセル、ペメトレキセド、シスプラチンである。いくつかの実施形態では、NSCLSは、イピリムマブま(Yervoy(登録商標)などの抗CTLA-4抗体に対して不応性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、PD-1(例えば、ペムブロリズマブを含む)と化学療法剤との組み合わせによる治療に対して不応性である。いくつかの実施形態では、化学療法剤(複数可)は、白金ダブレット化学療法剤である。いくつかの実施形態では、白金ダブレット療法は、シスプラチン及びカルボプラチンからなる群から選択される第1の化学療法剤と、ビノレルビン、ゲムシタビン、及びタキサン(例えば、パクリタキセル、ドセタキセル、またはナブ-パクリタキセルを含む)からなる群から選択される第2の化学療法剤と、を含む。いくつかの実施形態では、白金ダブレット化学療法剤は、ペメトレキセドと組み合わされている。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1及び化学療法剤を含む併用治療または併用療法に対して不応性である。いくつかの実施形態では、抗PD-1または抗PD-L1抗体は、ニボルマブ、ペムブロリズマブ、JS001、TSR-042、ピジリズマブ、BGB-A317、SHR-1210、REGN2810、MDX-1106、PDR001、クローン由来の抗PD-1:RMP1-14、米国特許第8,008,449号に開示される抗PD-1抗体、デュルバルマブ、アテゾリズマブ、アベルマブ、ならびにそれらの断片、誘導体、バリアント、及びバイオシミラーからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、抗PD-1は、ペムブロリズマブである。いくつかの実施形態では、化学療法剤は、白金ダブレット化学療法剤である。いくつかの実施形態では、化学療法剤は、ペメトレキセドと組み合わされている。いくつかの実施形態では、NSCLCは、カルボプラチン、パクリタキセル、ペメトレキセド、及びシスプラチンを含む併用療法に対して不応性である。いくつかの実施形態では、NSCLCは、カルボプラチン、パクリタキセル、ペメトレキセド、シスプラチン、ニボルマブ、及びイピリムマブを含む併用療法に対して不応性である。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、前療法を受けていない。いくつかの実施形態では、NSCLCは、ICI治療に対してナイーブである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗VEGF(例えば、avastin)治療に対してナイーブである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、化学療法治療に対してナイーブである。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、維持療法を受けていない。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、PD-1陰性であり、及び/またはPD-1である対象に由来する。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1または抗PD-L1及び白金ダブレット療法を含む併用療法に対して不応性であり、白金ダブレット療法は、
i)シスプラチン及びカルボプラチンからなる群から選択される第1の化学療法剤、
ii)及びビノレルビン、ゲムシタビン、及びタキサン(例えば、パクリタキセル、ドセタキセル、またはnab-パクリタキセルを含む)からなる群から選択される第2の化学療法剤を含む。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1または抗PD-L1、ペメトレキセド、及び白金ダブレット療法を含む併用療法に対して不応性であり、白金ダブレット療法は、
i)シスプラチン及びカルボプラチンからなる群から選択される第1の化学療法剤、
ii)及びビノレルビン、ゲムシタビン、及びタキサン(例えば、パクリタキセル、ドセタキセル、またはnab-パクリタキセルを含む)からなる群から選択される第2の化学療法剤を含む。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1抗体で治療されている。いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-L1抗体で処理されている。いくつかの実施形態では、NSCLC対象は、治療ナイーブである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-1抗体で治療されていない。いくつかの実施形態では、NSCLCは、抗PD-L1抗体で治療されていない。いくつかの実施形態では、NSCLCは、以前に化学療法剤で治療されている。いくつかの実施形態では、NSCLCは、以前に化学療法剤で治療されているが、もはや化学療法剤で治療されていない。いくつかの実施形態では、NSCLC患者は、抗PD-1/PD-L1ナイーブである。いくつかの実施形態では、NSCLC対象は、低いPD-L1の発現を有する。いくつかの実施形態では、NSCLC対象は、治療ナイーブのNSCLCを有するか、または化学療法治療後であるが、抗PD-1/PD-L1ナイーブである。いくつかの実施形態では、NSCLC対象は、治療ナイーブのNSCLCまたは化学療法治療後であるが、抗PD-1/PD-L1ナイーブであり、低いPD-L1の発現を有する。いくつかの実施形態では、NSCLC対象は、ベースラインで巨大腫瘤病変を有する。いくつかの実施形態では、対象は、ベースラインで巨大腫瘤病変を有し、低いPD-L1の発現を有する。いくつかの実施形態では、NSCLC対象は、検出可能なPD-L1の発現を有しない。いくつかの実施形態では、NSCLC対象は、治療ナイーブのNSCLCまたは化学療法治療後であるが、抗PD-1/PD-L1ナイーブであり、検出可能なPD-L1の発現を有しない。いくつかの実施形態では、対象は、ベースラインで巨大腫瘤病変を有し、検出可能なPD-L1の発現を有しない。いくつかの実施形態では、NSCLC対象は、治療ナイーブのNSCLCまたは化学療法後(例えば、化学療法剤後)であるが、PD-L1の発現が低く、及び/またはベースラインで巨大腫瘤病変を有する抗PD-1/PD-L1ナイーブである。いくつかの実施形態では、最大腫瘍直径が横方向または冠状面のいずれかで測定された7cmより大きい場合、巨大腫瘤病変が示される。いくつかの実施形態では、巨大腫瘤病変は、20mm以上の短軸直径を有する腫れたリンパ節がある場合に示される。いくつかの実施形態では、化学療法剤は、NSCLCの標準治療の治療薬を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1発現は、腫瘍割合スコアによって決定される。いくつかの実施形態では、不応性NSCLC腫瘍を有する対象は、<1%の腫瘍割合スコア(TPS)を有する。いくつかの実施形態では、不応性NSCLC腫瘍を有する対象は、≧1% TPSを有する。いくつかの実施形態では、不応性NSCLCを有する対象は、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、該抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体治療の前に決定された。いくつかの実施形態では、不応性NSCLCを有する対象は、抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、該抗PD-L1抗体治療の前に決定された。
いくつかの実施形態では、例えば図1及び/または図8に記載されるものを含む、本発明の方法によって調製されるTILは、例えばプロセス1C法と称される方法などの、図1及び/または図8に例示されていないものを含む他の方法によって産生されるTILと比較して、増加したポリクローン性を示す。いくつかの実施形態では、有意に改善されたポリクローン性及び/または増加したポリクローン性は、がん治療に対する治療有効性及び/または増加した臨床的有効性を示す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、T細胞レパートリーの多様性を指す。いくつかの実施形態では、ポリクローン性の増加は、本発明の方法によって産生されたTILの投与に関する治療有効性を示すことができる。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、例えば、図1に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILと比較して、1倍、2倍、10倍、100倍、500倍、または1000倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、2倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、10倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、100倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、500倍増加する。いくつかの実施形態では、ポリクローン性は、未治療の患者と比較して、及び/または例えば、図1に具体化されるもの以外の方法を含む、本明細書で提供されるもの以外の方法を使用して調製されたTILで治療された患者と比較して、1000倍増加する。
a.例示的なPD-L1試験方法
いくつかの実施形態では、PD-L1発現は、本明細書に記載の1つのさらなる試験方法を使用して、腫瘍割合スコアによって決定される。いくつかの実施形態では、NSCLC腫瘍を有する対象または患者は、<1%の腫瘍割合スコア(TPS)を有する。いくつかの実施形態では、NSCLC腫瘍は、≧1% TPSを有する。いくつかの実施形態では、NSCLCを有する対象または患者は、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体治療の前に決定された。いくつかの実施形態では、NSCLCを有する対象または患者は、抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-L1抗体治療の前に決定された。いくつかの実施形態では、不応性または耐性NSCLC腫瘍を有する対象または患者は、<1%の腫瘍割合スコア(TPS)を有する。いくつかの実施形態では、不応性または耐性NSCLC腫瘍を有する対象または患者は、≧1%TPSを有する。いくつかの実施形態では、不応性または耐性NSCLCを有する対象または患者は、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-1及び/または抗PD-L1抗体治療の前に決定された。いくつかの実施形態では、不応性または耐性NSCLCを有する対象または患者は、抗PD-L1抗体で以前に治療されており、腫瘍割合スコアは、抗PD-L1抗体治療の前に決定された。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、1%未満(TPS<1%)のPD-L1タンパク質についての任意の強度での部分的または完全な膜染色を示す、抗PD-1または抗PD-L1療法の前に採取された患者からの腫瘍割合スコア(TPS)または生存腫瘍細胞のパーセンテージを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、<50%、<45%、<40%、<35%、<30%、<25%、<20%、<15%、<10%、<9%、<8%、<7%、<6%、<5%、<4%、<3%、<2%、<1%、<0.9%、<0.8%、<0.7%、<0.6%、<0.5%、<0.4%、<0.3%、<0.2%、<0.1%、<0.09%、<0.08%、<0.07%、<0.06%、<0.05%、<0.04%、<0.03%、<0.02%、及び<0.01%からなる群から選択されるTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、約50%、約45%、約40%、約35%、約30%、約25%、約20%、約15%、約10%、約9%、約8%、約7%、約6%、約5%、約4%、約3%、約2%、約1%、約0.9%、約0.8%、約0.7%、約0.6%、約0.5%、約0.4%、約0.3%、約0.2%、約0.1%、約0.09%、約0.08%、約0.07%、約0.06%、約0.05%、約0.04%、約0.03%、約0.02%,及び約0.01%からなる群から選択されるTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~1%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.9%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.8%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.7%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.6%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.5%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.4%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.3%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.2%のTPSを示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、0%~0.1%のTPSを示すNSCLCである。TPSは、当該技術分野で知られている方法、例えば、Hirsch,et al.J.Thorac.Oncol.2017:12,208-222に記載される方法、あるいはペムブロリズマブまたは他の抗PD-1もしくは抗PD-L1療法による治療前のTPSの決定に使用される方法によって測定され得る。米国食品医薬品局(U.S.Food and Drug Administration)によって承認されたTPSの測定のための方法を使用することもできる。いくつかの実施形態では、PD-L1は、エクソソームPD-L1である。いくつかの実施形態では、PD-L1は、循環腫瘍細胞上に見出される。
いくつかの実施形態では、部分的な膜染色は、1%、5%、10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、97%、99%、またはそれ以上を含む。いくつかの実施形態では、完了した膜染色は、およそ100%膜染色を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1の試験は、患者の血清中のPD-L1のレベルを測定することを伴い得る。これらの実施形態では、患者の血清中のPD-L1の測定は、腫瘍の不均一性の不確実性及び連続生検の患者の不快感を除去する。
いくつかの実施形態では、ベースラインまたは標準レベルと比較して、可溶性PD-L1の上昇は、NSCLCにおける予後の悪化と相関する。例えば、Okuma,Y.et al.,2018,Clinical Lung Cancer,19(5):410-417、Vecchiarelli,S.,et al.,2018,Oncotarget,9(25):17554-17563を参照されたい。いくつかの実施形態では、PD-L1は、エクソソームPD-L1である。いくつかの実施形態では、PD-L1は、循環腫瘍細胞上に発現される。
2.ドライバー変異
本明細書で使用される場合、「ドライバー変異」及び/または「アクショナブルな変異」及び/または「発がん性ドライバー変異」という語句は、典型的には、発がん性ドライバー(すなわち、がんドライバーまたはがん誘導物質)とみなされる変異を指す。これらの変異のうちの1つ以上の存在は、伝統的に、標的療法の標的として利用されてきた。多くの場合、ドライバー変異は、例えば、チロシンキナーゼ阻害剤(TKI)を含む標的治療部分での治療のために検査及び/または分析される。かかるドライバー変異は、いくつかの実施形態では、第1選択の治療的処置に対する応答に影響を及ぼすか、または作用することができる。本明細書に記載のTIL療法方法及び組成物は、かかるドライバー変異が患者または対象に存在するか否かにかかわらず、治療に有効である。かかるドライバー変異は、全エクソーム配列決定または特定のドライバー変異の検出を標的とする方法を含む、当該技術分野で知られている任意の方法によって試験及び決定することができる。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、1つ以上のドライバー変異の存在または非存在を示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、1つ以上のドライバー変異の存在を示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、1つ以上のドライバー変異の非存在を示すNSCLCである。いくつかの実施形態では、NSCLCは、1つ以上のドライバー変異の非存在または存在について分析されている。いくつかの実施形態では、1つ以上のドライバー変異は存在しない。いくつかの実施形態では、NSCLC治療は、1つ以上のドライバー変異の存在または非存在とは無関係である。いくつかの実施形態では、1つ以上のドライバー変異は、EGFR変異、EGFR挿入、EGFRエクソン20、KRAS変異、BRAF変異、BRAF V600E変異、BRAF V600K変異、BRAF V600変異、ALK変異、c-ROS変異(ROS1変異)、ROS1融合、RET変異、RET融合、ERBB2変異、ERBB2増幅、BRCA変異、MAP2K1変異、PIK3CA、CDKN2A、PTEN変異、UMD変異、NRAS変異、KRAS変異、NF1変異、MET変異、METスプライス及び/または変化したMETシグナル伝達、TP53変異、CREBBP変異、KMT2C変異、KMT2D変異、ARID1A変異、RB1変異、ATM変異、SETD2変異、FLT3変異、PTPN11変異、FGFR1変異、EP300変異、MYC変異、EZH2変異、JAK2変異、FBXW7変異、CCND3変異、及びGNA11変異からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、NSCLCは、<1%のTPSを示し、1つ以上のドライバー変異の所定の非存在を有する。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、EGFR阻害剤、BRAF阻害剤、ALK阻害剤、c-Ros阻害剤、RET阻害剤、ERBB2阻害剤、BRCA阻害剤、MAP2K1阻害剤、PIK3CA阻害剤、CDKN2A阻害剤、PTEN阻害剤、UMD阻害剤、NRAS阻害剤、KRAS阻害剤、NF1阻害剤、MET阻害剤、TP53阻害剤、CREBBP阻害剤、KMT2C阻害剤、KMT2D変異、ARID1A変異、RB1阻害剤、ATM阻害剤、SETD2阻害剤、FLT3阻害剤、PTPN11阻害剤、FGFR1阻害剤、EP300阻害剤、MYC阻害剤、EZH2阻害剤、JAK2阻害剤、FBXW7阻害剤、CCND3阻害剤、及びGNA11阻害剤による治療のために適応されていないNSCLCである。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、<1%のTPSを有し、EGFR阻害剤、BRAF阻害剤、ALK阻害剤、c-Ros阻害剤、RET阻害剤、ERBB2阻害剤、BRCA阻害剤、MAP2K1阻害剤、PIK3CA阻害剤、CDKN2A阻害剤、PTEN阻害剤、UMD阻害剤、NRAS阻害剤、KRAS阻害剤、NF1阻害剤、MET阻害剤、TP53阻害剤、CREBBP阻害剤、KMT2C阻害剤、KMT2D変異、ARID1A変異、RB1阻害剤、ATM阻害剤、SETD2阻害剤、FLT3阻害剤、PTPN11阻害剤、FGFR1阻害剤、EP300阻害剤、MYC阻害剤、EZH2阻害剤、JAK2阻害剤、FBXW7阻害剤、CCND3阻害剤、及びGNA11阻害剤による治療のために適応されていないNSCLCである。
いくつかの実施形態では、EGFR変異は、NSCLCから小細胞肺癌(SCLC)への腫瘍形質転換をもたらす。
いくつかの実施形態では、NSCLC(またはその生検)は、高腫瘍変異負荷(高TMB、>10mut/kb)及び/またはマイクロサテライト不安定性高(MSI-高)を示す。いくつかの実施形態では、NSCLC(またはその生検)は、高腫瘍変異負荷(高TMB、>10mut/kb)を示す。いくつかの実施形態では、NSCLC(またはその生検)は、マイクロサテライト不安定性高(MSI-高)を示す。腫瘍変異負荷を評価するための方法及びシステムは、当該技術分野で知られている。かかる方法及びシステムの例示的な開示は、米国特許第9,792,403号、米国出願公開第2018/0363066A1号、国際出願公開第WO2013/070634号及びWO2018/106884号、ならびに参照により本明細書に組み込まれる、Metzker,M.(2010)Nature Biotechnology Reviews 11:31-46(これらのすべては参照によりそれら全体が組み込まれる)に見出され得る。
いくつかの実施形態では、NSCLC(またはその生検)は、高腫瘍変異負荷(高TMB、>10mut/kb)及び/またはマイクロサテライト不安定性高(MSI-高)を示す。いくつかの実施形態では、NSCLC(またはその生検)は、高腫瘍変異負荷(高TMB、>10mut/kb)を示す。いくつかの実施形態では、NSCLC(またはその生検)は、マイクロサテライト不安定性高(MSI-高)を示す。腫瘍変異負荷を評価するための方法及びシステムは、当該技術分野で知られている。かかる方法及びシステムの例示的な開示は、米国特許第9,792,403号、米国出願公開第2018/0363066A1号、国際出願公開第WO2013/070634号及びWO2018/106884号、ならびに参照により本明細書に組み込まれる、Metzker,M.(2010)Nature Biotechnology Reviews 11:31-46(これらのすべては参照によりそれら全体が組み込まれる)に見出され得る。
いくつかの実施形態では、EGFR変異には、例えば、T790M、Ex19Del、L858R、エクソン20挿入、delE709-T710insD、I744_K745insKIPVAI、K745_E746insTPVAIK、E709X、E709K、E709A、エクソン18欠失、G719X、G719A、G719S、L861Q、S768I、L747P、A763_764insFQEA、D770_N771insNPG、A763_764insFQEA、P772_H773insDNPエクソン20挿入、H773_V774insNPHエクソン20挿入、S768I、D770_N771insSVD、V769_D770InsASV、p.K745_E746insIPVAIK、p.K745_E746insTPVAIK、p.I744_K745insKIPVAI、D770_N771insNPG、P772_H773insPNP、A763_Y764insFQEA、及び/またはEGFRキナーゼドメイン重複(EGFR-KDD)が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、EGFR変異には、T790M、Ex19Del、L858R、エクソン20挿入、delE709-T710insD、I744_K745insKIPVAI、K745_E746insTPVAIK、E709X、E709K、E709A、エクソン18欠失、G719X、G719A、G719S、L861Q、S768I、L747P、A763_764insFQEA、D770_N771insNPG、A763_764insFQEA、P772_H773insDNPエクソン20挿入、H773_V774insNPHエクソン20挿入、S768I、D770_N771insSVD、V769_D770InsASV、p.K745_E746insIPVAIK、p.K745_E746insTPVAIK、p.I744_K745insKIPVAI、D770_N771insNPG、P772_H773insPNP、A763_Y764insFQEA、及びEGFRキナーゼドメイン重複(EGFR-KDD)からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、EGFR変異は、例えば、L858R/T790M、Ex19Del/T790M、G719X/L861Q、G719X/S768I(またはS768I/G719X)、S768I/L858R、L858R/E709A、及び/またはE746_T751delinsA+T790Mを含むが、これらに限定されない二重変異である。いくつかの実施形態では、EGFR変異は、L858R/T790M、Ex19Del/T790M、G719X/L861Q、G719X/S768I(またはS768I/G719X)、S768I/L858R、L858R/E709A、及びE746_T751delinsA+T790Mからなる群から選択される二重変異である。
EGFR変異のさらなる開示は、国際出願公開第WO2010/020618号(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に提供される。
いくつかの実施形態では、ALK変異には、EML4-ALKバリアント1(AB274722.1;BAF73611.1)、EML4-ALKバリアント2(AB275889.1;BAF73612.1)、EML4-ALKバリアント3a(AB374361.1;BAG55003.1)、EML4-ALKバリアント3b(AB374362.1;BAG55004.1)、EML4-ALKバリアント4(AB374363.1;BAG75147.1)、EML4-ALKバリアント5a(AB374364.1;BAG75148.1)、EML4-ALKバリアント5b(AB374365.1;BAG75149.1)、EML4-ALKバリアント6(AB462411.1;BAH57335.1)、EML4-ALKバリアント7(AB462412.1;BAH57336.1)、KIF5B-ALK(AB462413.1;BAH57337.1)、NPM-ALK、TPM3-ALK、TFGXL-ALK、TEGL-ALK、TFGS-ALK、A11C-ALK、CLTC-ALK、MSN-ALK、TPM4-ALK、MYH9-ALK、RANBP2-ALK、AL017-ALK、及びCARS-ALKが含まれるが、これらに限定されない(例えば、Pulford et al.,(2004)J.Cell.Physiol.199:330-358を参照)。さらに、熟練者は、ALKキナーゼとその融合パートナーとの間の特定の融合事象に応じて、ALKキナーゼバリアントが生じ得ることを理解するであろう(例えば、EML4は、例えば、Horn and Pao,(2009)J.Clin.Oncol.27:4247-4253に記載されるように、少なくともエクソン2、6a、6b、13、14、及び/または15を融合することができる)(参照によりその全体が組み込まれる)。
ALK変異のさらなる例は、米国特許第9,018,230号及び第9,458,508号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、本発明のROS1変異は、ROS1融合であり、ROS1タンパク質のキナーゼドメインを含むROS1ポリペプチドの一部(またはそれをコードするポリヌクレオチド)が別のポリペプチド(またはそれをコードするポリヌクレオチド)の全部または一部に融合し、その第2のポリペプチドまたはポリヌクレオチドの名前が融合において命名される。いくつかの実施形態では、ROS1変異は、ROS1融合タンパク質(例えば、IHCによって)及び/またはROS融合遺伝子(例えば、FISHによって)、及び/またはROS1 mRNA(例えば、qRT-PCRによって)として決定され、好ましくはSLC34A2-ROS1(ROS1エクソン32及び34に融合されたSLC34A2エクソン13del2046及び4)、CD74-ROS1(ROS1エクソン32及び34に融合されたCD74エクソン6)、EZR-ROS1(ROS1エクソン34に融合されたEZRエクソン10)、TPM3-ROS1(ROS1エクソン35に融合されたTPM3エクソン8)、LRIG3-ROS1(ROS1エクソン35に融合されたLRIG3エクソン16)、SDC4-ROS1(ROS1エクソン32に融合されたSDC4エクソン2及び4ならびにROS1エクソン34に融合されたSDC4エクソン4)、FIG-ROS1としても知られるGOPC-ROS1(ROS1エクソン35に融合されたGOPCエクソン8及びROS1エクソン36に融合されたGOPCエクソン4)、ならびにG2032R、すなわちROS1 G2032Rからなる群から選択されるROS1融合タンパク質を示す。
ROS1変異及びROS融合の追加の開示は、米国特許公開第2010/0221737号、同第2015/0056193号、及び同第2010/0143918号、ならびにPCT公開第WO2010/093928号に提供されており、これらのすべては、参照によりそれら全体が本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、RET変異は、RET融合または点変異である。
いくつかの実施形態では、RET点変異には、H6650、K666E、K666M、S686N、G691S、R694Q、M700L、V706M、V706A、E713K、G736R、G748C、A750P、S765P、P766S、E768Q、E768D、L769L、R770Q、D771N、N777S、V7781、Q781R、L790F、Y791F、Y791N、V804L、V804M、V804E、E805K、E806C、Y806E、Y806F、Y806S、Y806G Y806C E818K S819I G823E Y826M R833C P841L P841P E843D R844W、R844Q、R844L、M848T、1852M A866W R873W A876V L881V A883F A883S A883T E884K R886W、S891A、R8970、D898V、E901K 5904F S904C2 K907E K907M R908K G911D R912P R912Q M918T、M918V、M918L6、A919V、E921K、S922P S922Y T930M F961L R972G R982C M1009V D1017N V10416、及びM1064Tが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、RET融合は、RETと、BCR、BCR、CLIP1、KIFSB、CCDC6、PTClex9、NCOA4、TRIM33、ERC1、FGFRIOP、MBD1、RAB61P2、PRKARIA、TRIM24、KTN1、GOLGA5、HOOK3、KIAA1468、TRIM27、AKAP13、FKBP15、SPECCIL、TBL1XR1、CEP55、CUX1、ACBD5、MYH13、PIBF1、KIAA1217、及びMPRIPからなる群から選択される融合パートナーとの間の融合である。
RET変異の追加の開示は、参照によりそれら全体が本明細書に組み込まれる米国特許第10035789号に提供されている。
いくつかの実施形態では、BRAF変異は、BRAF V600E/K変異である。他の実施形態では、BRAF変異は、非V600E/K変異である。
いくつかの実施形態では、非V600E/K BRAF変異は、キナーゼ活性化変異、キナーゼ障害変異、またはキナーゼ意義不明変異、及びそれらの組み合わせである。いくつかの実施形態では、キナーゼ活性化変異は、R4621、1463S、G464E、G464R、G464V、G466A、G469A、N58 is、E586K、F595L、L597Q、L597R、L5975、L597V、A598V、T599E、V600R、K601E、5602D、A728V、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、キナーゼ障害変異は、G466E、G466R、G466V、Y472C、K483M、D594A、D594E、D594G、D594H、D594N、D594V、G596R、T599A、5602A、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、キナーゼ意義不明変異は、T4401、5467L、G469E、G469R、G4695、G469V、L584F、L588F、V600 K6OldelinsE、56051、Q609L、E611Q、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、非V600E/K BRAF変異は、D594、G469、K601E、L597、T599重複、L485W、F247L、G466V、BRAF融合、BRAF-AGAP3再配列、BRAFエクソン15スライスバリアント、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、Met変異は、点変異、欠失変異、挿入変異、逆行、異常スプライシング、ミスセンス変異、またはc-Metタンパク質の少なくとも1つの生物活性の増加を引き起こす遺伝子拡大、チロシンキナーゼ活性、例えば、改善された受容体ホモログ二量体化、形成のリガンド結合、体及びヘテロ二量体の増強等を含む。Met変異は、c-Met遺伝子の任意の部分に位置し得る。一実施形態では、変異は、c-MET遺伝子によってコードされるc-Metタンパク質のキナーゼドメインにある。いくつかの実施形態では、c-Met変異は、N375、V13、V923、R175、V136、L229、S323、R988、S1058/T1010及びE168における点変異である。
いくつかの実施形態では、ERBB2変異は、ERBB2のアミノ酸配列における点変異である。いくつかの実施形態では、ERBB2の点変異は、アミノ酸置換を引き起こす点変異、mRNAスプライシングを引き起こす点変異、または上流領域における点変異である。ここで、変異は、Q568E、P601R、I628M、P885S、R143Q、R434Q、及びE874Kからなる群から選択される少なくとも1つのアミノ酸置換を引き起こすヌクレオチド変異を含む。
いくつかの実施形態では、ERBB2変異は、ERBB2増幅である。いくつかの実施形態では、ERBB2増幅は、V659E、G309A、G309E、S310F、D769H、D769Y、V777L、P780ins、P780-Y781insGSP、V842I、R896C、K753E、及びL755Sからなる群から選択される点変異を含み、ポリメラーゼ連鎖反応または任意の配列決定技法によって検出され得る(Bose et al.Cancer Discov.2013,3(2),224-237、Zuo et al.Clin Cancer Res 2016,22(19),4859-4869)。
いくつかの実施形態では、BRCA変異は、BRCA1及び/またはBRCA2、好ましくはBRCA1、及び/またはタンパク質生成物がDNA損傷部位においてBRCA1及び/またはBRCA2と会合する1つ以上の他の遺伝子(ATM、ATR、Chk2、H2AX、53BP1、NFBD1、Mre11、Rad50、ニブリン、BRCA1関連環ドメイン(BARD1)、Abraxas、及びMSH2を含む)における変異である。これらの遺伝子のうちの1つ以上の変異は、BRCA1及び/またはBRCA2の変異を模倣する遺伝子発現パターンをもたらし得る。
ある特定の実施形態では、BRCA変異は、非同義変異を含む。いくつかの実施形態では、BRCA変異は、ナンセンス変異を含む。いくつかの実施形態では、BRCA変異は、フレームシフト変異を含む。いくつかの実施形態では、BRCA変異は、スプライシング変異を含む。いくつかの実施形態では、BRCA変異は、変異体mRNAとして、また最終的には変異体タンパク質として発現される。いくつかの実施形態では、BRCA1/2タンパク質は、機能的である。他の実施形態では、BRCA1/2タンパク質は、低下した活性を有する。他の実施形態では、BRCA1/2タンパク質は、非機能的である。
置換に関して本明細書で使用される場合、変異に関しての「=」記号は、一般に、同義置換、サイレントコドン、及び/またはサイレント置換を指す。特に、同義置換(サイレント置換またはサイレントコドンとも呼ばれる)は、タンパク質をコードする遺伝子のエクソンにおける、あるヌクレオチド塩基の別のヌクレオチド塩基の置換を指し、生成されたアミノ酸配列は修飾されない。これは、遺伝子コードが「縮退」であるという事実、すなわち、いくつかのアミノ酸が2つ以上の3塩基対コドンによってコードされるという事実に起因する。所与のアミノ酸のコドンのうちのいくつかは、同じアミノ酸をコードする他のものとはわずか1塩基対だけ異なるため、野生型塩基を代替物のうちの1つに置き換える点変異は、遺伝子の翻訳中に同じアミノ酸を細長いポリペプチド鎖に組み込むことをもたらす。いくつかの実施形態では、非コードDNAに影響を及ぼす同義の置換及び変異は、しばしばサイレント変異とみなされるが、変異がサイレントであり、いかなる影響もないとは限らない。例えば、同義変異は、転写、スプライシング、mRNA輸送、及び翻訳に影響を及ぼし得、それらのいずれも結果として生じる表現型を変化させることができ、同義変異を非サイレントにする。希少なコドンに対するtRNAの基質特異性は、翻訳のタイミングに影響を及ぼし、順番にタンパク質の共翻訳折り畳みに影響を及ぼす可能性がある。これは、多くの種で観察されているコドン使用バイアスに現れている。非同義の置換/変異は、保存的(類似の生理化学的特性を有するアミノ酸への変化)、半保存的(例えば、正に荷電したアミノ酸に対して陰性)、またはラジカル(大幅に異なるアミノ酸)として任意に分類され得るアミノ酸の変化をもたらす。いくつかの実施形態では、BRCA変異は、P871L、K1183R、D693N、S1634G、E1038G、S1040N、S694=(=:サイレンスコドン)、M1673I、Q356R、S1436=、L771=、K654Sfs*47、S198N、R496H、R841W、R1347G、H619N、S1533I、L30=、A622V、Y655Vfs*18、R496C、E597K、R1443*、E23Vfs*17、L30F、E111Gfs*3、K339Rfs*2、L512F、D693N、P871S、S1140G、Q1240*、P1770S、R7=、L52F、T176M、A224S、L347=、S561F、E597*、K820E、K893Rfs*107、E962K、M1014I、R1028H、E1258D、E1346K、R1347T、L1439F、H1472R、Q1488*、S1572C、E1602K、R1610C、L1621=、Q1625*、Q1625=、D1754N、R1772Q、R1856*、及びそれらの任意の組み合わせを含むが、これらに限定されないBRCA1変異である。
いくつかの実施形態では、BRCA変異は、V2466A、N289H、N991D、S455=(=;サイレンスコドン)、N372H、H743=、V1269=、S2414=、V2171=、L1521=、T3033Nfs*11、K1132=、T3033Lfs*29、R2842C、N1784Tfs*7、K3326*、K3326*、D1420Y、I605Yfs*9、I3412V、A2951T、T3085Nfs*26、R2645Nfs*3、S1013*、T1915M、F3090=、V3244I、A1393V、R2034C、L1356=、E2981Rfs*37、N1784Kfs*3、K3416Nfs*11、K1691Nfs*15、S1982Rfs*22、及びそれらの任意の組み合わせを含むが、これらに限定されないBRCA2変異である。
いくつかの実施形態では、本発明のNRAS変異には、E63K、Q61R、Q61K、G12D、G13D、Q61R、Q61L、Q61K、G12S、G12C、G13R、Q61H、G12V、G12A、Q61L、G13V、Q61H、Q61H、G12R、G13C、Q61P、G13S、G12D、G13A、G13D、A18T、Q61X、G60E、G12S、Q61=(=:サイレンスコドン)、Q61E、Q61R、A146T、A59T、A59D、Q61=、R68T、A146T、G12A、E62Q、G75=、A91V、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
E132Kいくつかの実施形態では、PIK3CA変異は、置換変異、欠失変異、及び挿入変異を含む。いくつかの実施形態では、変異は、PIK3CAのヘリカルドメイン及びそのキナーゼにおいて起こる。他の実施形態では、PIK3CAのP85BDドメインにおいて。いくつかの実施形態では、PIK3CA変異は、エクソン1、2、4、5、7、9、13、18、及び20にある。いくつかの実施形態では、PIK3CA変異は、エクソン9及び20にある。さらに他の実施形態では、PIK3CA変異は、上記の任意の変異の組み合わせである。これらのエクソンの任意の組み合わせを、任意選択で、他のエクソンの試験と併せて試験することができる。変異の試験は、コード配列全体に沿って行うことができ、または変異がクラスター化することが見出された領域に焦点を当てることができる。変異の特定のホットスポットは、PIK3CAコード配列の1624、1633、1636、及び3140位のヌクレオチドで生じる。
いくつかの実施形態では、PIK3CA変異のサイズは、1~3ヌクレオチドの範囲で小さい。いくつかの実施形態では、PIK3CA変異には、G1624A、G1633A、C1636A、A3140G、G113A、T1258C、G3129T、C3139T、E542K、E545K、Q546R、H1047L、H1047R、及びG2702Tが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、MAP2K1変異は、体細胞MAP2K1変異、任意選択で、MEK1レベルを上方制御するMAP2K1変異である。いくつかの実施形態では、MAP2K1変異は、RAS/MAPK経路に関連する1つ以上の遺伝子における変異であり、HRAS、KRAS、NRAS、ARAF、BRAF、RAFl、MAP2K2、MAPKl、MAPK3、MAP3K3を含む。ある特定の実施形態では、MAP2K1変異は、RASA、PTEN、ENG、ACVRL1、SMAD4、GDF2、またはそれらの組み合わせからなる群から選択される1つ以上の遺伝子にある。
いくつかの実施形態では、MAP2K1変異には、P124S、Q56P、K57N、E203K、G237*、P124L、G128D、D67N、K57E、E102_I103del、C121S、K57T、K57N、Q56P、P124L、K57N、G128V、Q58_E62del、F53L、I126=、I103_K104del、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
ある特定の実施形態では、KRAS変異は、非同義変異を含む。いくつかの実施形態では、KRAS変異は、ナンセンス変異を含む。いくつかの実施形態では、KRAS変異は、フレームシフト変異を含む。いくつかの実施形態では、KRAS変異は、スプライシング変異を含む。いくつかの実施形態では、KRAS変異は、変異体mRNAとして、また最終的には変異体タンパク質として発現される。いくつかの実施形態では、変異型KRASタンパク質は、機能的である。他の実施形態では、変異型KRASタンパク質は、低下した活性を有する。他の実施形態では、変異型KRASタンパク質は、非機能的である。
いくつかの実施形態では、KRAS変異には、G12D、G12V、G13D、G12C、G12A、G12S、G12R、G13C、Q61H、A146T、Q61R、Q61H、Q61L、G13S、A146V、Q61K、G13R、G12F、K117N、G13A、G13V、A59T、V14I、K117N、Q22K、Q61P、A146P、G13D、L19F、L19F、Q61K、G12V、G60=、G12=、G13=、A18D、T58I、Q61E、E63K、G12L、G13V、A59G、G60D、G10R、G10dup、D57N、A59E、、V14G、D33E、G12I、G13dup、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない(=は、サイレンスコーディングを示す)。
いくつかの実施形態では、NF1変異は、置換変異、欠失変異、ミスセンス変異、異常なスプライシング変異、及び挿入変異を含む。いくつかの実施形態では、NF1変異は、機能喪失(LOF)変異である。いくつかの実施形態では、NF1変異は、R1947X(C5839T)、R304X、エクソン37変異、エクソン4b変異、エクソン7変異、エクソン10b変異、及びエクソン10c変異(例えば、1570G→T,E524X)からなる群から選択される。
いくつかの実施形態では、CDKN2A変異には、R24P、D108G、D108N、D108Y、G125R、P114L、R80*、R58*、H83Y、W110*、P114L、E88*、W110*、E120*、D108Y、D84Y、D84N、E69*、P81L、Q50*、L78Hfs*41、D108N、S12*、P48L、E61*、Y44*、E88K、R80*、D84G、L16Pfs*9、Y129*、D108H,A148T、A36G、A102V、W15*、H83R、A57V、E33*、D74Y、A76V、E153K、D74N、H83D、V82M、R58*、Y129*、E119*、Y44*、D74A、T18_A19dup、Y44Lfs*76、L32_L37del、V28_E33del、D14_L16del、A68T、またはそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
ある特定の実施形態では、PTEN変異は、非同義変異を含む。いくつかの実施形態では、PTEN変異は、ナンセンス変異を含む。いくつかの実施形態では、PTEN変異は、フレームシフト変異を含む。いくつかの実施形態では、PTEN変異は、スプライシング変異を含む。いくつかの実施形態では、変異型PTENは、mRNA及び最終的にはタンパク質として発現される。いくつかの実施形態では、変異型PTENタンパク質は、機能的である。他の実施形態では、変異型PTENタンパク質は、低下した活性を有する。他の実施形態では、変異型PTENタンパク質は、非機能的である。いくつかの実施形態では、PTEN変異には、R130Q、R130G、T319*、R233*、R130*、K267Rfs*9、N323Mfs*21、N323Kfs*2、R173C、R173H、R335*、Q171*、Q245*、E7*、D268Gfs*30、R130Q、Q214*、R130L、C136R、Q298*、Q17*、H93R、P248Tfs*5、I33del、R233*、E299*、G132D、Y68H、T319Kfs*24、N329Kfs*14、V166Sfs*14、V290*、T319Nfs*6、R142W、P38S、A126T、H61R、F278L、S229*、R130P、G129R、R130Qfs*4、P246L、R130*、G165R、C136Y、R173C、I101T、Y155C、D92E、K164Rfs*3、N184Efs*6、G129E,R130G、G36R、F341V、H123Y、C124S、M35VG127E、G165E、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、TP53変異には、R175H、G245S、R248Q、R248W、R249S、R273C、R273H、R282W、C135Y、C141Y、P151S、V157F、R158L、Y163C、V173L、V173M、C176F、H179R、H179Y、H179Q、Y205C、Y220C、Y234C、M237I、C238Y、S241F、G245D、G245C、R248L、R249M、V272M、R273L、P278L、R280T、E285K、E286K、R158H、C176Y、I195T、G214R、G245V、G266R、G266E、P278S、R280K、またはそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。いくつかのさらなる実施形態では、TP53変異は、G245S;R249S;R273C;R273H;C141Y、V157F、R158L、Y163C、V173L、V173M、Y205C、Y220C、G245C、R249M、V272M、R273L、及びE286Kからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、TP53変異は、上記の変異のうちの1つ以上を含む。
いくつかの実施形態では、CREBBP変異には、R1446C、R1446H、S1680del、I1084Sfs*15、P1948L、I1084Nfs*3、?R386*、S893L、R1341*、P1423Lfs*36、P1488L、Y1503H、R1664C、A1824T、R1173*、R1360*、Y1450C、H2228D、S71L、P928=、D1435N、W1502C、Y1503D、R483*、R601Q、S945L、R1103*、R1288W、R1392*、C1408Y、D1435G、R1446L、H1485Y、Q1491K、Q96*、L361M、L524Wfs*6、Q540*、Q1073*、A1100V、R1169C、C1237Y、R1347W、G1411E、W1472C、I1483F、P1488T、R1498*、Y1503F、Q1856*、R1985C、R2104C、S2328L、V2349=、S2377L、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、KMT2C変異には、D348N、P350=、R380L、C391*、P309S、C988F、Y987H、S990G、K2797Rfs*26、V346=、R894Q、R284Q、S806=、R1690=、P986=、A1685S、G315S、Q755*、R909K、T316S、S772L、G838S、L291F、P335=、C988F、Q2680=、E765G、K339N、Y816*、R526P、N729D、G845E、I817Nfs*11、G892R、C1103*、S3660L、F4496Lfs*21、G315C、R886C、D348N、S793=、V919L、R2481S、R2884*、R4549C、M305Dfs*28、T316S、P377=、I455M、T820I、S965=、S730Y、P860S、Q873Hfs*40、R904*、R2610Q、R4478*、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、KMT2D変異には、L1419P、E640D、E541D、E455D、T2131P、K1420R、P2354Lfs*30、G2493=、Q3612=、I942=、T1195Hfs*17、P4170=、P1194H、G1235Vfs*95、P4563=、P647Hfs*283、L449_P457del、P3557=、Q3603=、R1702*、P648Tfs*2、R5501*、R4198*、R4484*、R83Q、R1903*、、R2685*、R4282*、L5326=、R5432W、R2734*、Q2800*、R2830*、Q3745dup、S4010P、R4904*、G5182Afs*61、R5214H、R1615*、Q2380*、R2687*、R2771*、V3089Wfs*30、Q3799Gfs*212、R4536*、R5030C、R5048C、R5432Q、A221Lfs*40、A476T、A2119Lfs*25,P2557L、R2801*、Q3913*、R4420W、G4641=、R5097*、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、ARID1A変異には、が含まれるが、これらに限定されない。例えば、対象は、C884*(*:ナンセンス変異)、E966K、Q1411*、F1720fs(fs:フレームシフト)、G1847fs、C1874fs、D1957E、Q1430、R1721fs、G1255E、G284fs、R1722*、M274fs、G1847fs、P559fs、R1276*、Q2176fs、H203fs、A591fs、Q1322*、S2264*、Q586*、Q548fs、及びN756fsからなる群から選択されるARID1Aの変異を有する。
いくつかの実施形態では、RB1変異には、R320X、R467X、R579X、R455X、R358X、R251X、R787X、R552X、R255X、R556X、Y790X、Q575X、E323X、R661W、R579*、R455*、R556*、R787*、R661W、R445*、R467*、Q217*、Q471*、W195*、Q395*、I680T、E137*、R255*、Q344*、Q62*、E440K、A488V、P777Lfs*33、E322K、R656W、G617Rfs*36、C221*、E440*、Q93*、Q504*、E125*、S834*、E323*、Q685*、S829*、W516*、G435*、Q257*、E79*、S567L、V654M、V654Sfs*14、G100Efs*11、K715*、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、ATM変異は、10744A>G;10744A>G、11482G>A、IVS3-558A>T、146C>G、381delA、IVS8-3delGT、1028delAAAA、1120C>T、1930ins16、IVS16+2T>C、2572T>C、IVS21+1G>A、3085delA、3381delTGAC、3602delTT、4052delT、4396C>T、5188C>T、5290delC、5546delT、5791G>CCT、6047A>G、IVS44-1G>T、6672delGC/6677delTACG、6736dell 1/6749del7、7159insAGCC、7671delGTTT、7705del14、7865C>T、7979delTGT、8177C>T、8545C>T、8565T>A、IVS64+1G>T、及び9010del28を含むが、これらに限定されない、ATM遺伝子配列における変異である。
本発明のいくつかの実施形態では、SETD2変異は、NCBI受託番号NM_014159のmRNA配列の転写開始コドン位置が1に設定されたときの、SETD2タンパク質をコードする遺伝子配列の変化である。いくつかの実施形態では、7558番目のG(グアニン)は、T(チミン)で置換され、4774番目のC(シトシン)は、Tによって置換され、1210番目のA(アデニン)は、Tによって置換され、4883番目は、Gによって置換され、5290番目のCは、Tによって置換され、7072番目のCは、Tによって置換され、4144番目のGは、Tによって置換され、1297は、Tによって置換され、755は、Gによって置換され、7261は、Gによって置換され、6700は、Tによって置換され、2536は、Tによって置換され、7438は、Tによって置換され、3866位での置換、Aの挿入、6712位でのTの挿入、7572位でのTの挿入、913番目のAの欠失、5619番目のCの欠失、塩基4603~4604、894~897の欠失、第1の塩基の欠失、1936番目のCの欠失、3094~3118塩基の欠失、5289位におけるAの挿入、及び6323~6333塩基の欠失。含まれる真のルアーの群から選択される1つ以上の変異。
本発明の一実施形態では、SETD2タンパク質の変異は、2520グルタミン酸後に停止し、1592アルギニン後に停止し、404アルギニン後に停止し、1764グルタミン後に停止し、NCBI受託番号NP_054878に対応するSETD2アミノ酸配列の1032は、第1のセリン後にフレームシフトし、646ヒスチジン後にフレームシフトし、2108番目のバリン後にフレームシフトし、1764グルタミン後にフレームシフトし、298番目のイソロイシン後にフレームシフトし、1289番目のアスパラギン後にフレームシフトし、289番目のセリン以降フレームシフトし、後にフレームシフトし、2525リジン後に停止し、305スレオニン後にフレームシフトし、1873プロリン後にフレームシフトし、1535アスパラギン後にフレームシフトし、2234グルタミン後後に停止し、2536アラニンをスレオニンで置換し、7438グルタミンを停止し、アスパラギンからなる1628基をセリンによって置換し、2358番目のプロリンをセリンによって置換し、1382アラニンをセリンによって置換し、433番目のアルギニンをシトシンによって置換し、252番目のアラニンをグリシンによって置換し、2421スレオニンをアラニンによって置換する。から選択される1つ以上の変異。
いくつかの実施形態では、FLT3変異には、(Q569_E648)ins、D835X、(Q569_E648)delins、(D835_I836)、D835Y、D835V、D835Y、D835H、T227M、I836del、N676K、D835E、Y597_E598insDYVDFREY、D835E、D835del、F594_D600dup、A680V、D839G、D96=、D835H、V491L、D835E、Q989*、D835V、L561=、I836del、P986Afs*27、D7G、D324N、S451F、D835N、L576P、Y597_E598insDVDFREY、V491L、N841T、D324N、Y572C、R595_L601dup、K663R、N676K、F691L、D835A、I836H、N841K、S993L、L832F、I836M、A66V、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、PTPN11変異には、c E76K、A72V、A72T、D61Y、D61V、G60V、E69K、E76G、G507V、S506L、G507A、T73I、E76A、E76Q、S506P、D61N、F71L、E76V、F71L、A72D、V432M、T472M、P495L、N58Y、F285S、S506A、S189A、A465T、R502W、G507R、T511K、D61H、D61G、G507E、G60R、G60A、Q514L、E139D、Y197*、N308D、Q514H、Q514H、N58S、E123D、L206=、A465G、P495S、G507R、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、FGFR1変異には、N577K、K687E、N577K、D166del、T371M、R476W、T350=、E498K、N577D、D683G、R87C、A154D、N303=、A374V、D550=、S633=、V695L、G728=、R765W、P803S、W19C、P56=、R113C、V149I、S158L、D166dupR220C、N224Kfs*8、D249N、R281W、R281Q、A299S、S424L、S461F、S467F、R506Q、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、EP300変異には、D1399N、Y1414C、M1470Cfs*26、Y1111*、H2324Pfs*55、R1627W、N2209_Q2213delinsK、Q2268del、L415P、M1470Nfs*3、E1514K、C1201Y、P1452L、S952*、C1164Y、D1399Y、S507G、Q824*、D1507N、H2324Tfs*29、P925T、P1440L、W1466C、P1502L、A1629V、R1645*、N1700Tfs*9、P1869L、Q65*、A171V、R202*、R580Q、A627V、Q1082*、N1236Kfs*2、N1286S、R1312*、R1356*、C1385F、H1451L、R1462*、Y1467N、Y1467H、R1478H、R1627Q、R86*、R370H、R397*、R754C、P842S、I997V、E1014*、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、MYC変異には、E61T、E68I、R74Q、R75N、W135E、W136E、V394D、L420P、W96E、V325D、L351P、41アミノ酸がN末端で欠失したMYCタンパク質(dN2MYC)、N26S、S161L、P74L、V7M、F153S、E54D、P246、L164V、P74S、A59V、T73I、P72T、T73A、H374R、P17S、T73N、S264N、P72S、Q52del、S21T、P74A、S107N、P75S、S77P、P261S、P74Q、S190R、A59T、F153C、P75H、T73I、S77F、N11S、S21N、P78L、P72L、N9K、S190N、S267F、T73P、P78S、G105D、S187C、L71M、Q10H、L191x、Q50x、L191F、R25K、F130L、Y27S、D195N、D2G、V20A、V6G、V20I、D2H、P75A、G152D、P74T、C40Y、E8K、Q48x、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、EZH2変異は、変化したヒストンメチル化パターンに関連付けられる。いくつかの実施形態では、EZH2変異は、アミノ酸Y641(Y646、触媒ドメインに相当する)のF、N、H、SまたはCのいずれかへの変換をもたらし、H3K27の高トリメチル化をもたらし、リンパ誘発を駆動する。いくつかの実施形態では、EZH2変異は、EZH2 SETドメイン変異、EZH2の過剰発現、他のPRC2サブユニットの過剰発現、ヒストンアセチルトランスフェラーゼ(HAT)の機能変異の喪失、及びMLL2の機能の喪失を含む。EZH2 Y646変異に対してヘテロ接合である細胞は、EZH2タンパク質に対してホモ接合野生型(WT)である細胞、またはY646変異に対してホモ接合である細胞と比較して、H3K27の高トリメチル化をもたらす。
いくつかの実施形態では、EZH2変異には、Y646F、Y646N、D185H、Y646F、Y646S、Y646H、R690H、Y646X、E745K、Y646C、V626M、V679M、R690H、R684H、A682G、E249K、G159R、R288Q、N322S、A692V、R690C、D730*(挿入フレームシフト)、S695L、R684C、M667T、R288*、S644*、D192N、K550T、Q653E、D664G、R347Q、Y646C、G660R、R213C、A255T、S538L、N693K、I55M、R561H、A692V、K515R、Y733*、R63*、Q570*、Q328*、R25Q、T467P、A656V、T573I、C571Y、E725K、R16W、P577L、F145S、V680M、G686D、G135R、K634E、S652F、R298C、G648E、R566H、L149R、R502Q、Y731D、R313W、N675K、S652C、T374Hfs*3、N152Ifs*15、E401Kfs*22、K406Mfs*17、E246*、S624C、I146T、V626M、L674S、H694R、A581S、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、JAK2変異は、G1920T変異、G1920T/C1922T変異、またはG1920A変異と組み合わせたT1923C変異を含むが、これらに限定されないJAK2遺伝子の変異である。いくつかの実施形態では、JAK2変異は、V617F、V617I、R683G、N542_E543del、E543_D544del、R683S、R683X、F537_K539delinsL(フレーム中の欠失)、K539L、N1108S、R1113H、R1063H、R487C、I540Mfs*3(欠失-フレームシフト)、R867Q、K539L、G571S、R1113C、R938Q、R228Q、L830*、E1080*、K539L、C618R、R564Q、D1036H、L1088S、H538Nfs*4、D873N、V392M、I682F、L393V、M535I、C618R、T875N、L611V、D319N、L611S、G921S、H538Y、S1035L、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない1つ以上の置換を含む、変異体JAK2タンパク質である。
いくつかの実施形態では、FBXW7変異は、W244*(*:停止コドン)R222*、R278*、E192A、S282*、E113D、R465H/C、726+1 G>Aスプライス、R505C、R479Q、R465C、R367*、R499Vfs*25(fs*:フレームシフト)、R658*、D600Y、D520N、D520Y、及びそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される点変異である。さらなる実施形態では、FBXW7変異は、R479Q及びS582L、R465H及びS582L、D520N、D520Y及びR14Q、ならびにR367*及びS582Lを含むが、これらに限定されない二重または三重変異である。
いくつかの実施形態では、CCND3変異には、S259A、R271Pfs*53(挿入により引き起こされたフレームシフト)、E51*、Q260*、P199S、T283A、T283P、V287D、D286_T288del、R271Gfs*33、Q276*、R241Q、D238G、R33P、I290K、I290T、I290R、P267fs、P284S、P284L、P100S、E253D、S262I、R14W、R114L、D238N、A266E、R167W、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、GNA11変異には、Q209L、R183C、T257=、R183C、G208Afs*16、Q209H、R183C、Q209P、Q209R、Q209H、?T96=、R210W、R256Q、T334=、G48D、S53G、Q209P、R213Q、及びそれらの任意の組み合わせが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、GNA11変異は、エクソン4において2つの変異、例えば、V182における変異及びT175における変異、またはエクソン5における1つ以上の変異を有する。
3.PD-1及びPD-L1阻害剤との併用
プログラム死1(PD-1)は、T細胞、B細胞、ナチュラルキラー(NK)T細胞、活性化単球、及び樹状細胞によって発現される288アミノ酸の膜貫通免疫チェックポイント受容体タンパク質である。CD279としても知られるPD-1は、CD28ファミリーに属し、ヒトでは第2染色体上のPdcd1遺伝子によってコードされる。PD-1は、1つの免疫グロブリン(Ig)スーパーファミリードメイン、膜貫通領域、ならびに免疫受容体チロシンベースの阻害モチーフ(ITIM)及び免疫受容体チロシンベースのスイッチモチーフ(ITSM)を含む細胞内ドメインからなる。PD-1とそのリガンド(PD-L1及びPD-L2)は、Keir,et al.,Annu.Rev.Immunol.2008,26,677-704に記載されるように、免疫寛容において重要な役割を果たすことが知られている。PD-1は、T細胞の免疫応答を負に調節する阻害シグナルを提供する。PD-L1(B7-H1またはCD274としても知られる)及びPD-L2(B7-DCまたはCD273としても知られる)は、腫瘍細胞及び間質細胞上に発現され、PD-1を発現する活性化T細胞が遭遇する可能性があり、T細胞の免疫抑制につながる。PD-L1は、ヒト第9染色体上のCd274遺伝子によってコードされる290アミノ酸の膜貫通タンパク質である。例えば、Topalian,et al.,N.Eng.J.Med.2012,366,2443-54に記載される最近の臨床研究で実証されているように、PD-1阻害剤、PD-L1阻害剤、及び/またはPD-L2阻害剤の使用による、PD-1とそのリガンドPD-L1及びPD-L2との間の相互作用をブロックすることで、免疫抵抗を克服することができる。PD-L1は、多くの腫瘍細胞株上で発現されるが、PD-L2は、主に樹状細胞及びいくつかの腫瘍株上で発現される発現される。T細胞(活性化後にPD-1を誘導的に発現する)に加えて、PD-1は、B細胞、ナチュラルキラー細胞、マクロファージ、活性化単球、樹状細胞上でも発現される。
いくつかの実施形態では、TIL及びPD-1阻害剤は、NSCLCの治療のための併用療法または共療法として投与される。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、前療法を受けていない。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、フロントライン療法または初期療法として投与される。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、本明細書に記載のTILと併用して、フロントライン療法または初期療法として投与される。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、当該技術分野で知られている任意のPD-1阻害剤またはPD-1遮断剤であり得る。特に、次の段落でより詳細に記載されるPD-1阻害剤または遮断剤のうちの1つである。「阻害剤」、「アンタゴニスト」、及び「遮断剤」という用語は、本明細書では、PD-1阻害剤に関して互換的に使用される。誤解を避けるために、抗体であるPD-1阻害剤への本明細書での言及は、化合物またはその抗原結合断片、バリアント、複合体、もしくはバイオシミラーを指し得る。誤解を避けるために、PD-1阻害剤への本明細書での言及はまた、小分子化合物またはその薬学的に許容される塩、エステル、溶媒和物、水和物、共結晶、もしくはプロドラッグを指し得る。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、抗体(すなわち、抗PD-1抗体)、Fab断片を含むその断片、またはその一本鎖可変断片(scFv)である。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ポリクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、モノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、PD-1との結合について競合し、及び/またはPD-1上のエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、抗体は、PD-1との結合について競合し、及び/またはPD-1上のエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ヒトPD-1に約100pM以下のKで結合する、ヒトPD-1に約90pM以下のKで結合する、ヒトPD-1に約80pM以下のKで結合する、ヒトPD-1に約70pM以下のKで結合する、ヒトPD-1に約60pM以下のKで結合する、ヒトPD-1に約50pM以下のKで結合する、ヒトPD-1に約40pM以下のKで結合する、ヒトPD-1に約30pM以下のKで結合する、ヒトPD-1に約20pM以下のKで結合する、ヒトPD-1に約10pM以下のKで結合する、またはヒトPD-1に約1pM以下のKで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ヒトPD-1に約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約8×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約8.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約9×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-1に約9.5×101/M・s以上のkassocで結合する、またはヒトPD-1に約1×101/M・s以上のkassocで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ヒトPD-1に約2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.1×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.3×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.4×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.5×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.6×10-51/s以下のkdissocで結合する、またはヒトPD-1に約2.7×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.8×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.9×10-51/s以下のkdissocで結合する、またはヒトPD-1に約3×10-51/s以下のkdissocで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、約10nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約9nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約8nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約7nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約6nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約5nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約4nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約3nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約2nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、または約1nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害するものである。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブ(Bristol-Myers Squibb Co.からOPDIVOとして市販されている)、またはそれらのバイオシミラー、抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。ニボルマブは、PD-1受容体を遮断する完全ヒトIgG4抗体である。いくつかの実施形態では、抗PD-1抗体は、免疫グロブリンG4カッパ、抗(ヒトCD274)抗体である。ニボルマブには、Chemical Abstracts Service(CAS)登録番号946414-94-4が割り当てられており、5C4、BMS-936558、MDX-1106、及びONO-4538としても知られている。ニボルマブの調製及び特性は、米国特許第8,008,449号及び国際特許公開第WO2006/121168号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。様々な形態の癌におけるニボルマブの臨床的安全性及び有効性は、Wang,et al.,Cancer Immunol Res.2014,2,846-56;Page,et al.,Ann.Rev.Med.,2014,65,185-202、及びWeber,et al.,J.Clin.Oncology,2013,31,4311-4318に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。ニボルマブのアミノ酸配列を表18に示す。ニボルマブは、22-96、140-196、254-314、360-418、22’’-96’’、140’’-196’’、254’’-314’’、及び360’’-418’’での重鎖内ジスルフィド結合;23’-88’、134’-194’、23’’’-88’’’、及び134’’’-194’’’での軽鎖内ジスルフィド結合;127-214’、127’’-214’’’での重鎖-軽鎖間ジスルフィド結合;219-219’’及び222-222’’での重鎖-重鎖間ジスルフィド結合;ならびに290、290’’でのN-グリコシル化部位(H CH84.4)を有する。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、配列番号158によって与えられる重鎖及び配列番号159によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号158及び配列番号159に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号160に示される配列を含み、PD-1阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号161に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも99%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも98%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも97%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも96%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号160及び配列番号161に示される配列と少なくとも95%同一であるV及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、それぞれ、配列番号162、配列番号163、及び配列番号164に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号165、配列番号166、及び配列番号167に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはPD-1上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-1バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ニボルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-1抗体であり、抗PD-1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ニボルマブである。抗PD-1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可されている場合がある。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ニボルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ニボルマブである。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約0.5mg/kg~約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約1.5mg/kg、約2mg/kg、約2.5mg/kg、約3mg/kg、約3.5mg/kg、約4mg/kg、約4.5mg/kg、約5mg/kg、約5.5mg/kg、約6mg/kg、約6.5mg/kg、約7mg/kg、約7.5mg/kg、約8mg/kg、約8.5mg/kg、約9mg/kg、約9.5mg/kg、または約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約200mg~約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約200mg、約220mg、約240mg、約260mg、約280mg、約300mg、約320mg、約340mg、約360mg、約380mg、約400mg、約420mg、約440mg、約460mg、約480mg、または約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ニボルマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、2週間毎、3週間毎、4週間毎、5週間毎、または6週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ニボルマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、2週間毎に約3mg/kgで、6週間毎に1mg/kgのイピリムマブとともに投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、3週間毎に約360mgで、6週間毎に1mg/kgのイピリムマブ及び2サイクルのプラチナダブレット化学療法とともに投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、2週間毎に約240mgまたは4週間毎に480mg投与される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ニボルマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブ(Merck&Co.,Inc(Kenilworth,NJ,USA)からKEYTRUDAとして市販されている)、またはそれらの抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントを含む。ペムブロリズマブには、CAS登録番号1374853-91-4が割り当てられており、ラムブロリズマブ、MK-3475、及びSCH-900475としても知られている。ペムブロリズマブは、免疫グロブリンG4、抗(ヒトタンパク質PDCD1(プログラム細胞死1))(ヒト-ハツカネズミモノクローナル重鎖)、ヒト-ハツカネズミモノクローナル軽鎖、二量体構造を有するジスルフィドを有する。ペムブロリズマブの構造は、免疫グロブリンG4、抗(ヒトプログラム細胞死1);ヒト化マウスモノクローナルκ軽鎖二量体(226-226’’:229-229’’)-ビスジスルフィドを有するヒト化マウスモノクローナル[228-L-プロリン(H10-S>P)]γ4重鎖(134-218’)-ジスルフィドとしても記載され得る。ペムブロリズマブの特性、使用、及び調製は、国際特許公開第WO2008/156712A1号、米国特許第8,354,509号、ならびに米国特許出願公開第2010/0266617A1号、同第2013/0108651A1号、及び同第2013/0109843A2に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。様々な形態のがんにおけるペムブロリズマブの臨床的安全性及び有効性は、Fuerst,Oncology Times,2014,36,35-36、Robert,et al.,Lancet,2014,384,1109-17、及びThomas,et al.,Exp.Opin.Biol.Ther.,2014,14,1061-1064に記載されている。ペムブロリズマブのアミノ酸配列を表19に示す。ペムブロリズマブは、ジスルフィド架橋:22-96、22’’-96’’、23’-92’、23’’’-92’’’、134-218’、134’’-218’’’、138’-198’、138’’’-198’’’、147-203、147’’-203’’、226-226’’、229-229’’、261-321、261’’-321’’、367-425、及び367’’-425’’、ならびにグリコシル化部位(N):Asn-297及びAsn-297’’を含む。ペムブロリズマブは、Fc領域に安定化S228P変異を有するIgG4/カッパアイソタイプであり、この変異をIgG4ヒンジ領域に挿入すると、IgG4抗体で典型的に観察される半分子の形成が防止される。ペムブロリズマブは、各重鎖のFcドメイン内のAsn297で不均一にグリコシル化されており、無傷の抗体の分子量はおよそ149kDaになる。ペムブロリズマブの優性グリコフォームは、フコシル化アガラクト二分性グリカンフォーム(G0F)である。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、配列番号168によって与えられる重鎖及び配列番号169によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号168及び配列番号169に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号170に示される配列を含み、PD-1阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号171に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも99%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも98%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも97%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも96%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号170及び配列番号171に示される配列と少なくとも95%同一であるV及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、それぞれ、配列番号172、配列番号173、及び配列番号174に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号175、配列番号176、及び配列番号177に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはPD-1上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-1バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ペムブロリズマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-1抗体であり、抗PD-1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ペムブロリズマブである。抗PD-1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可されている場合がある。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ペムブロリズマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ペムブロリズマブである。

いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ペムブロリズマブは、約0.5mg/kg~約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ペムブロリズマブは、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約1.5mg/kg、約2mg/kg、約2.5mg/kg、約3mg/kg、約3.5mg/kg、約4mg/kg、約4.5mg/kg、約5mg/kg、約5.5mg/kg、約6mg/kg、約6.5mg/kg、約7mg/kg、約7.5mg/kg、約8mg/kg、約8.5mg/kg、約9mg/kg、約9.5mg/kg、または約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ペムブロリズマブは、約200mg~約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ニボルマブは、約200mg、約220mg、約240mg、約260mg、約280mg、約300mg、約320mg、約340mg、約360mg、約380mg、約400mg、約420mg、約440mg、約460mg、約480mg、または約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、ペムブロリズマブまたはそのバイオシミラーであり、ペムブロリズマブは、2週間毎、3週間毎、4週間毎、5週間毎、または6週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、NSCLCを治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、NSCLCを治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、NSCLCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、小細胞肺癌(SCLC)を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、SCLCを治療するために、3週間毎に約200mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブは、SCLCを治療するために、6週間毎に約400mgで投与される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、患者または対象が成人である場合、すなわち、成人適応症の治療、及び6週間毎の400mgの追加の投薬レジメンが用いられ得る。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、3、4、または5日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブ投与は、IL-2投与後1、2、または3日で開始される。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。いくつかの実施形態では、ペムブロリズマブはまた、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)投与することができる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、抗m-PD-1クローンJ43(カタログ番号BE0033-2)及びRMP1-14(カタログ番号BE0146)(Bio X Cell,Inc.,West Lebanon,NH,USA)などの市販の抗PD-1モノクローナル抗体である。いくつかの市販の抗PD-1抗体が、当業者に知られている。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、米国特許第8,354,509号または米国特許出願公開第2010/0266617 A1号、同第2013/0108651A1号、同第2013/0109843 A2号に開示されている抗体であり、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、米国特許第8,287,856号、同第8,580,247号、及び同第8,168,757号、ならびに米国特許出願公開第2009/0028857 A1号、同第2010/0285013 A1号、同第2013/0022600A1号、及び同第2011/0008369 A1号に記載されている抗PD-1抗体であり、それらの教示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、米国特許第8,735,553 B1号に開示されている抗PD-1抗体であり、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、CT-011としても知られるピジリズマブであり、これは米国特許第8,686,119号に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、PD-1阻害剤は、米国特許第8,907,053号、同第9,096,642号、及び同第9,044,442号、ならびに米国特許出願公開第2015/0087581号に記載されるものなどの小分子またはペプチドもしくはペプチド誘導体;米国特許出願公開第2015/0073024号に記載されるものなどの1,2,4-オキサジアゾール化合物及び誘導体;米国特許出願公開第2015/0073042号に記載されるものなどの環状ペプチド模倣化合物及び誘導体;米国特許出願公開第2015/0125491号に記載されるものなどの環状化合物及び誘導体;国際特許出願公開第WO2015/033301号に記載されるものなどの1,3,4-オキサジアゾール及び1,3,4-チアジアゾール化合物ならびに誘導体;国際特許出願公開第WO2015/036927号及びWO2015/04490号に記載されるものなどのペプチド系化合物及び誘導体、または米国特許出願公開第2014/0294898号に記載されるものなどの大環状ペプチド系化合物及び誘導体であり得、各々の開示は参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、TIL及びPD-L1阻害剤またはPD-L2阻害剤は、NSCLCの治療のための併用療法または共療法として投与される。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、前療法を受けていない。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤またはPD-L2阻害剤は、フロントライン療法または初期療法として投与される。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤またはPD-L2阻害剤は、本明細書に記載のTILと併用して、フロントライン療法または初期療法として投与される。
いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、当該技術分野で知られている任意のPD-L1もしくはPD-L2阻害剤、アンタゴニスト、または遮断剤であり得る。特に、次の段落でより詳細に記載されるPD-L1もしくはPD-L2阻害剤、アンタゴニスト、または遮断剤のうちの1つである。「阻害剤」、「アンタゴニスト」、及び「遮断剤」という用語は、本明細書では、PD-L1及びPD-L2阻害剤に関して互換的に使用される。誤解を避けるために、抗体であるPD-L1またはPD-L2阻害剤への本明細書での言及は、化合物またはその抗原結合断片、バリアント、複合体、もしくはバイオシミラーを指し得る。誤解を避けるために、PD-L1またはPD-L2阻害剤への本明細書での言及は、化合物またはその薬学的に許容される塩、エステル、溶媒和物、水和物、共結晶、もしくはプロドラッグを指し得る。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組成物、プロセス、及び方法は、PD-L1またはPD-L2阻害剤を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、小分子である。いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、抗体(すなわち、抗PD-1抗体)、Fab断片を含むその断片、またはその一本鎖可変断片(scFv)である。いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、ポリクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、モノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、PD-L1またはPD-L2阻害剤は、PD-L1もしくはPD-L2との結合について競合し、及び/またはPD-L1もしくはPD-L2上のエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、抗体は、PD-L1もしくはPD-L2との結合について競合し、及び/またはPD-L1もしくはPD-L2上のエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるPD-L1阻害剤は、化合物が、PD-L2受容体を含む他の受容体と結合または相互作用するよりも実質的に低い濃度でPD-L1と結合または相互作用するという点で、PD-L1に対して選択的である。ある特定の実施形態では、化合物は、PD-L2受容体に対するよりも少なくとも約2倍高い濃度、約3倍高い濃度、約5倍高い濃度、約10倍高い濃度、約20倍高い濃度、約30倍高い濃度、約50倍高い濃度、約100倍高い濃度、約200倍高い濃度、約300倍高い濃度、または約500倍高い濃度である結合定数でPD-L1受容体に結合する。
いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるPD-L2阻害剤は、化合物が、PD-L1受容体を含む他の受容体と結合または相互作用するよりも実質的に低い濃度でPD-L2と結合または相互作用するという点で、PD-L2に対して選択的である。ある特定の実施形態では、化合物は、PD-L1受容体に対するよりも少なくとも約2倍高い濃度、約3倍高い濃度、約5倍高い濃度、約10倍高い濃度、約20倍高お濃度、約30倍高い濃度、約50倍高い濃度、約100倍高い濃度、約200倍高い濃度、約300倍高い濃度、または約500倍高い濃度である結合定数でPD-L2受容体に結合する。
いかなる理論にも縛られることなく、腫瘍細胞はPD-L1を発現し、T細胞はPD-1を発現すると考えられている。しかしながら、腫瘍細胞によるPD-L1の発現は、PD-1またはPD-L1の阻害剤または遮断剤の有効性には必要とされない。いくつかの実施形態では、腫瘍細胞は、PD-L1を発現する。いくつかの実施形態では、腫瘍細胞は、PD-L1を発現しない。いくつかの実施形態では、方法は、TILと組み合わせて、本明細書に記載されるものなどのPD-1及びPD-L1抗体の組み合わせを含むことができる。PD-1及びPD-L1抗体とTILとの組み合わせの投与は、同時または連続的であり得る。
いくつかの実施形態では、PD-L1及び/またはPD-L2阻害剤は、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約100pM以下のKで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約90pM以下のKで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約80pM以下のKで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約70pM以下のKで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約60pM以下のKで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約50pM以下のKで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約40pM以下のKで結合する、またはヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約30pM以下のKDで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-L1及び/またはPD-L2阻害剤は、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約8×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約8.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約9×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約9.5×101/M・s以上のkassocで結合する、またはヒトPD-L1及び/またはPD-L2に約1×101/M・s以上のkassocで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-L1及び/またはPD-L2阻害剤は、ヒトPD-L1もしくはPD-L2に約2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.1×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.3×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.4×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.5×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-1に約2.6×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトPD-L1もしくはPD-L1に約2.7×10-51/s以下のkdissocで結合する、またはヒトPD-L1もしくはPD-L2に約3×10-51/s以下のkdissocで結合するものである。
いくつかの実施形態では、PD-L1及び/またはPD-L2阻害剤は、約10nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約9nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約8nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約7nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約6nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約5nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約4nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約3nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、約2nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断もしくは阻害し、または約1nM以下のIC50でのヒトPD-1へのヒトPD-L1もしくはヒトPD-L2の結合を遮断するものである。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、MEDI4736としても知られるデュルバルマブ(これは、AstraZeneca plc.の子会社であるMedimmune,LLC(Gaithersburg,Maryland)から市販されている)、またはその抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、米国特許第8,779,108号または米国特許出願公開第2013/0034559号に開示されている抗体であり、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。デュルバルマブの臨床的有効性は、Page,et al.,Rev.Med.,2014,65,185-202、Brahmer,et al.,J.Clin.Oncol.2014,32,5s(補足、要約8021)、及びMcDermott,et al.,Cancer Treatment Rev.,2014,40,1056-64に記載されている。デュルバルマブの調製及び特性は、米国特許第8,779,108号に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。デュルバルマブのアミノ酸配列を表20に示す。デュルバルマブモノクローナル抗体は、22-96、22’’-96’’、23’-89’、23’’’-89’’’、135’-195’、135’’’-195’’’、148-204、148’’-204’’、215’-224、215’’’-224’’’、230-230’’、233-233’’、265-325、265’’-325’’、371-429、及び371’’-429’におけるジスルフィド結合、ならびにAsn-301及びAsn-301’’におけるN-グリコシル化部位を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、配列番号178によって与えられる重鎖及び配列番号179によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号178及び配列番号179に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、デュルバルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号180に示される配列を含み、PD-L1阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号181に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも99%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも98%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも97%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも96%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号180及び配列番号181に示される配列と少なくとも95%同一であるV及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号182、配列番号183、及び配列番号184に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号185、配列番号186、及び配列番号187に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはPD-L1上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、ペムブロリズマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-L1バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-L1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、デュルバルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-L1抗体であり、抗PD-L1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、デュルバルマブである。抗PD-L1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、デュルバルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、デュルバルマブである。

いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、MSB0010718C(Merck KGaA/EMD Seronoから市販されている)としても知られるアベルマブ、またはその抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。アベルマブの調製及び特性は、米国特許出願公開第2014/0341917A1号に記載されており、その開示は参照により本明細書に具体的に組み込まれる。アベルマブのアミノ酸配列を表21に示す。アベルマブは、22-96、147-203、264-324、370-428、22’’-96’’、147’’-203’’、264’’-324’’、及び370’’-428’’における重鎖内ジスルフィド結合(C23-C104);22’-90’、138’-197’、22’’’-90’’’、及び138’’’-197’’’における軽鎖内ジスルフィド結合(C23-C104);223-215’及び223’’-215’’’における重鎖-軽鎖内ジスルフィド結合(h5-CL126);229-229’’及び232-232’’における重鎖-重鎖内ジスルフィド結合(h11、h14);300、300’’におけるN-グリコシル化部位(H CH N84.4);フコシル化複合体二分性CHO型グリカン;ならびに450及び450’におけるH CHS K2 C末端リジンクリッピングを有する。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、配列番号188によって与えられる重鎖及び配列番号189によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号188及び配列番号189に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、アベルマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤重鎖可変領域(VH)は、配列番号190に示される配列を含み、PD-L1阻害剤軽鎖可変領域(VL)は、配列番号191に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも99%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも98%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも97%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも96%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号190及び配列番号191に示される配列と少なくとも95%同一であるV及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号192、配列番号193、及び配列番号194に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号195、配列番号196、及び配列番号197に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはPD-L1上の同じエピトープに結合する。
いくつかの複合体実施形態では、PD-L1阻害剤は、アベルマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-L1バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの複合体実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-L1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、アベルマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-L1抗体であり、抗PD-L1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、アベルマブである。抗PD-L1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、アベルマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、アベルマブである。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、MPDL3280AまたはRG7446としても知られるアテゾリズマブ(Roche Holding AG(Basel,Switzerland)の子会社であるGenentech,Inc.からTECENTRIQとして市販されている)、またはその抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、米国特許第8,217,149号に開示されている抗体であり、その開示は参照により本明細書に具体的に組み込まれる。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、米国特許出願公開第2010/0203056A1号、同第2013/0045200A1号、同第2013/0045201A1号、同第2013/0045202A1号、または同第2014/0065135A1号に開示されている抗体であり、その開示は参照により本明細書に具体的に組み込まれる。アテゾリズマブの調製及び特性は、米国特許第8,217,149号に記載されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。アテゾリズマブのアミノ酸配列を表22に示す。アテゾリズマブは、22-96、145-201、262-322、368-426、22’’-96’’、145’’-201’’、262’’-322’’、及び368’’-426’’における重鎖内ジスルフィド結合(C23-C104);23’-88’、134’-194’、23’’’-88’’’、及び134’’’-194’’’における軽鎖内ジスルフィド結合(C23-C104);221-214’及び221’’-214’’’における重鎖-軽鎖内ジスルフィド結合(h5-CL126);227-227’’及び230-230’’における重鎖-重鎖内ジスルフィド結合(h11、h14);ならびに298及び298’におけるN-グリコシル化部位(H CH N84.4>A)を有する。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、配列番号198によって与えられる重鎖及び配列番号199によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号198及び配列番号199に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、アテゾリズマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号200に示される配列を含み、PD-L1阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号201に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも99%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも98%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも97%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも96%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号200及び配列番号201に示される配列と少なくとも95%同一であるV及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、それぞれ、配列番号202、配列番号203、及び配列番号204に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号205、配列番号206、及び配列番号207に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはPD-L1上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、抗PD-L1抗体は、アテゾリズマブに関して薬物規制当局によって承認された抗PD-L1バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、PD-L1抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、アテゾリズマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗PD-L1抗体であり、抗PD-L1抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、アテゾリズマブである。抗PD-L1抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、アテゾリズマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、アテゾリズマブである。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、米国特許出願公開第2014/0341917A1号に記載されている抗体を含み、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、PD-L1への結合についてこれらの抗体のうちのいずれかと競合する抗体も含まれる。いくつかの実施形態では、抗PD-L1抗体は、BMS-935559としても知られるMDX-1105であり、これは米国特許第7,943,743号に開示されており、その開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、抗PD-L1抗体は、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第7,943,743号に開示されている抗PD-L1抗体から選択される。
いくつかの実施形態では、PD-L1阻害剤は、INVIVOMAB抗m-PD-L1クローン10F.9G2(カタログ番号BE0101、Bio X Cell,Inc.,West Lebanon,NH,USA)などの市販のモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、抗PD-L1抗体は、AFFYMETRIX EBIOSCIENCE(MIH1)などの市販のモノクローナル抗体である。いくつかの市販の抗PD-L1抗体が、当業者に知られている。
いくつかの実施形態では、PD-L2阻害剤は、BIOLEGEND 24F.10C12マウスIgG2a、κアイソタイプ(カタログ番号329602 Biolegend,Inc.,San Diego,CA)、SIGMA抗PD-L2抗体(カタログ番号SAB3500395,Sigma-Aldrich Co.,St.Louis,MO)、または当業者に知られている他の市販のPD-L2抗体などの市販のモノクローナル抗体である。
4.CTLA-4阻害剤との併用
いくつかの実施形態では、TIL及びCTLA-4阻害剤は、NSCLCの治療のための併用療法または共療法として投与される。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、前療法を受けていない。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、フロントライン療法または初期療法として投与される。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、本明細書に記載のTILと併用して、フロントライン療法または初期療法として投与される。
細胞傷害性Tリンパ球抗原4(CTLA-4)は、免疫グロブリンスーパーファミリーのメンバーであり、ヘルパーT細胞の表面で発現する。CTLA-4は、CD28依存性T細胞活性化の負の制御因子であり、適応免疫応答のチェックポイントとして機能する。T細胞共刺激タンパク質CD28と同様に、CTLA-4結合抗原は、細胞上でCD80及びCD86を提示する。CTLA-4は抑制シグナルをT細胞に伝達し、CD28は刺激シグナルを伝達する。ヒトCTLA-4に対するヒト抗体は、ウイルス感染及び細菌感染を治療または予防すること、ならびにがんを治療するためのものなど、多くの疾患状態における免疫刺激調節因子として記載されている(WO01/14424及びWO00/37504)。様々な前臨床研究は、モノクローナル抗体などのCTLA-4阻害剤によるCTLA-4遮断が、免疫原性腫瘍に対する宿主免疫応答を増強し、確立された腫瘍を排除することさえ可能であることを示している。イピリムマブ(MDX-010)及びトレメリムマブ(CP-675,206)を含むが、これらに限定されない、様々な種類の固形腫瘍の治療のためのいくつかの完全ヒト抗ヒトCTLA-4モノクローナル抗体(mAb)が、臨床試験で研究されている。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、当技術分野で知られている任意のCTLA-4阻害剤またはCTLA-4遮断剤であり得る。特に、次の段落でより詳細に記載されるCTLA-4阻害剤または遮断剤のうちの1つである。「阻害剤」、「アンタゴニスト」、及び「遮断剤」という用語は、本明細書では、CTLA-4阻害剤に関して互換的に使用される。誤解を避けるために、抗体であるCTLA-4阻害剤への本明細書での言及は、化合物またはその抗原結合断片、バリアント、複合体、もしくはバイオシミラーを指し得る。誤解を避けるために、CTLA-4阻害剤への本明細書での言及はまた、小分子化合物またはその薬学的に許容される塩、エステル、溶媒和物、水和物、共結晶、もしくはプロドラッグを指し得る。
本発明の方法で使用するための好適なCTLA-4阻害剤には、抗CTLA-4抗体、ヒト抗CTLA-4抗体、マウス抗CTLA-4抗体、哺乳動物抗CTLA-4抗体、ヒト化抗CTLA-4抗体、モノクローナル抗CTLA-4抗体、ポリクローナル抗CTLA-4抗体、キメラ抗CTLA-4抗体、MDX-010(イピリムマブ)、トレメリムマブ、抗CD28抗体、抗CTLA-4アドネクチン、抗CTLA-4ドメイン抗体、一本鎖抗CTLA-4断片、重鎖抗CTLA-4断片、軽鎖抗CTLA-4断片、共刺激経路を刺激するCTLA-4の阻害剤、PCT公開第WO2001/014424号に開示される抗体、PCT公開第WO2004/035607号に開示される抗体、米国特許出願公開第2005/0201994号に開示される抗体、ならびに付与された欧州特許第EP 1212422 B1号に開示された抗体が含まれるが、これらに限定されず、各々の開示が参照により本明細書に組み込まれる。さらなるCTLA-4抗体は、米国特許第5,811,097号、同第5,855,887号、同第6,051,227号、及び同第6,984,720号、PCT公開第WO01/14424号及び同第WO00/37504号、ならびに米国公開第2002/0039581号及び同第2002/086014号に記載されており、各々の開示が参照により本明細書に組み込まれる。本発明の方法で使用することができる他の抗CTLA-4抗体には、例えば、WO98/42752、米国特許第6,682,736号及び同第6,207,156号、Hurwitz et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,95(17):10067-10071(1998)、Camacho et al.,J.Clin.Oncology,22(145):Abstract No.2505(2004)(抗体CP-675206)、Mokyr et al.,Cancer Res.,58:5301-5304(1998)、ならびに米国特許第5,977,318号、同第6,682,736号、同第7,109,003号、及び同第7,132,281号に開示されるものが含まれ、これらの各々の開示は、骨髄非破壊的リンパ枯渇レジメンを参照することにより本明細書に組み込まれる。
さらなるCTLA-4阻害剤には、CD28抗原がその同族リガンドと結合する能力を妨害すること、CTLA-4がその同族リガンドと結合する能力を阻害すること、共刺激経路を介してT細胞応答を増強すること、B7がCD28及び/またはCTLA-4と結合する能力を破壊すること、B7が共刺激経路を活性化する能力を破壊すること、CD80がCD28及び/またはCTLA-4と結合する能力を破壊すること、CD80が共刺激経路を活性化する能力を破壊すること、CD86がCD28及び/またはCTLA-4と結合する能力を破壊すること、CD86が共刺激経路を活性化する能力を破壊すること、及び共刺激経路を一般に活性化されることから破壊することが可能である任意の阻害剤が含まれるが、これらに限定されない。これには、共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4の小分子阻害剤、共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4に対する抗体、共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4に指向するアンチセンス分子、共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4に指向するアドネクチン、他のCTLA-4阻害剤のなかでも共刺激経路の他のメンバーのなかでもCD28、CD80、CD86、CTLA-4のRNAi阻害剤(一本鎖及び二本鎖の両方)が必ず含まれる。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、約10-6M以下、約10-7M以下、約10-8M以下、約10-9M以下、約10-10M以下、約10-11M以下、約10-12M以下、例えば、約10-13M~10-16Mの間、またはエンドポイントとして前述の値のうちの任意の2つを有する任意の範囲内で、CTLA-4と結合する。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、同じアッセイを使用して比較した場合、イピリムマブのKdの10倍以下のKdでCTLA-4と結合する。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、同じアッセイを使用して比較した場合、イピリムマブとほぼ同じかまたはそれ以下(例えば、最大10倍低いか、または最大100倍低い)のKdでCTLA-4と結合する。いくつかの実施形態では、CD80またはCD86とのCTLA-4結合のCTLA-4阻害剤による阻害のIC50値は、同じアッセイを使用して比較した場合、それぞれCD80またはCD86とのCTLA-4結合のイピリムマブ媒介阻害より10倍以下で大きい。いくつかの実施形態では、CD80またはCD86とのCTLA-4結合のCTLA-4阻害剤による阻害のIC50値は、同じアッセイを使用して比較した場合、それぞれCD80またはCD86とのCTLA-4結合のイピリムマブ媒介性阻害とほぼ同じかまたはそれ以下(例えば、最大10倍低い、または最大100倍低い)である。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、好適な対照と比較して、少なくとも20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または100%、例えば、50%~75%、75%~90%、または90%~100%の間でCTLA-4の発現を阻害する、及び/または生物学的活性を減少させるのに十分な量で使用される。いくつかの実施形態では、CTLA-4経路阻害剤は、好適な対照と比較して、少なくとも20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、または100%、例えば、50%~75%、75%~90%、または90%~100%の間でCTLA-4のCD80、CD86、またはその両方との結合を減少させることにより、CTLA-4の生物学的活性を減少させるのに十分な量で使用される。対象となる薬剤の効果を評価または定量化する状況下における好適な対照は、典型的には、対象となる薬剤、例えば、CTLA-4経路阻害剤に曝露されていないか、または治療されていない(または僅かな量に曝露されているか、または治療されている)同等の生物学的システム(例えば、細胞または対象)である。いくつかの実施形態では、生物学的システムは、それ自体の対照として機能し得る(例えば、生物学的システムは、薬剤への曝露または治療の前に評価され得、曝露または治療が開始または終了した後の状態と比較され得る。いくつかの実施形態では、歴史的対照が使用され得る。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブ(Bristol-Myers Squibb Co.からYervoyとして市販されている)、またはそのバイオシミラー、抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。当該技術分野で知られているように、イピリムマブは、機能的ヒトレパートリーを生成するための重鎖及び軽鎖をコードするヒト遺伝子を有するトランスジェニックマウスに由来する完全ヒトIgG 1κ抗体である、抗CTLA-4抗体を指す。イピリムマブは、そのCAS登録番号477202-00-9及びPCT公開第WO01/14424号で参照することもでき、その全体がすべての目的で参照により本明細書に組み込まれる。それは抗体10DIとして開示されている。具体的には、イピリムマブは、軽鎖可変領域及び重鎖可変領域(配列番号516を含む軽鎖可変領域を有し、配列番号515を含む重鎖可変領域を有する)を含む。CTLA-4と特異的に結合するヒトモノクローナル抗体またはその抗原結合部位を表す。イピリムマブの薬学的組成物は、イピリムマブ及び1つ以上の希釈剤、ビヒクル及び/または賦形剤を含有するすべての薬学的に許容される組成物を含む。イピリムマブを含有する薬学的組成物の例は、PCT公開第WO2007/67959号に記載されている。イムピリムマブは、静脈内(IV)投与され得る。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、配列番号208によって与えられる重鎖及び配列番号209によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号208及び配列番号209に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブの重鎖及び軽鎖のCDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号210に示される配列を含み、CTLA-4阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号211に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも99%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも98%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも97%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも96%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号210及び配列番号211に示される配列と少なくとも95%同一であるV及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号212、配列番号213、及び配列番号214に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号215、配列番号216、及び配列番号217に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはCTLA-4上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブに関して薬物規制当局によって承認されたCTLA-4バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、抗CTLA-4抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、イピリムマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。イピリムマブのアミノ酸配列を表23に示す。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗CTLA-4抗体であり、抗CTLA-4抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、イピリムマブである。抗CTLA-4抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、イピリムマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、イピリムマブである。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、約0.5mg/kg~約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約1.5mg/kg、約2mg/kg、約2.5mg/kg、約3mg/kg、約3.5mg/kg、約4mg/kg、約4.5mg/kg、約5mg/kg、約5.5mg/kg、約6mg/kg、約6.5mg/kg、約7mg/kg、約7.5mg/kg、約8mg/kg、約8.5mg/kg、約9mg/kg、約9.5mg/kg、または約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、約200mg~約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、約200mg、約220mg、約240mg、約260mg、約280mg、約300mg、約320mg、約340mg、約360mg、約380mg、約400mg、約420mg、約440mg、約460mg、約480mg、または約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、イピリムマブまたはそのバイオシミラーであり、イピリムマブは、2週間毎、3週間毎、4週間毎、5週間毎、または6週間毎に投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、トレメリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
いくつかの実施形態では、イピリムマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、6週間毎に約1mg/kgで、2週間毎に3mg/kgのニボルマブとともに投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブは、転移性非小細胞肺癌を治療するために、6週間毎に約1mg/kgで、3週間毎に360mgのニボルマブ及び2サイクルのプラチナダブレット化学療法とともに投与される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、3、4、または5週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。いくつかの実施形態では、イピリムマブ投与は、切除前1、2、または3週間で(すなわち、対象または患者から腫瘍試料を取得する前に)開始される。
トレメリムマブ(CP-675,206としても知られる)は、完全ヒトIgG2モノクローナル抗体であり、CAS番号745013-59-6を有する。トレメリムマブは、米国特許第6,682,736号(参照により本明細書に組み込まれる)において、抗体11.2.1として開示されている。トレメリムマブの重鎖及び軽鎖のアミノ酸配列を、それぞれ表24に示す。トレメリムマブは、黒色腫及び乳癌を含む種々の腫瘍の治療のための臨床試験において研究されており、トレメリムマブは、0.01及び15mg/kgの用量範囲で4週間または12週間毎に単回用量または複数回用量として静脈内投与される。本発明によって提供されるレジメンでは、トレメリムマブは、局所的に、特に皮内または皮下に投与される。皮内または皮下投与されるトレメリムマブの有効量は、典型的には、人当たり5~200mg/用量の範囲である。いくつかの実施形態では、トレメリムマブの有効量は、用量当たり人当たり10~150mg/用量の範囲である。いくつかの特定の実施形態では、トレメリムマブの有効量は、人当たり約10、25、37.5、40、50、75、100、125、150、175、または200mg/用量である。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、配列番号218によって与えられる重鎖及び配列番号219によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号218及び配列番号219に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブの重鎖及び軽鎖のCDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号220に示される配列を含み、CTLA-4阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号221に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも99%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも98%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも97%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも96%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号220及び配列番号221に示される配列と少なくとも95%同一であるV及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号222、配列番号223、及び配列番号224に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号225、配列番号226、及び配列番号227に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはCTLA-4上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブに関して薬物規制当局によって承認された抗CTLA-4バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、抗CTLA-4抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、トレメリムマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。トレメリムマブのアミノ酸配列を表24に示す。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗CTLA-4抗体であり、抗CTLA-4抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、トレメリムマブである。抗CTLA-4抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、トレメリムマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、トレメリムマブである。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、約0.5mg/kg~約10mg/kgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、約0.5mg/kg、約1mg/kg、約1.5mg/kg、約2mg/kg、約2.5mg/kg、約3mg/kg、約3.5mg/kg、約4mg/kg、約4.5mg/kg、約5mg/kg、約5.5mg/kg、約6mg/kg、約6.5mg/kg、約7mg/kg、約7.5mg/kg、約8mg/kg、約8.5mg/kg、約9mg/kg、約9.5mg/kg、または約10mg/kgの用量で投与される。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、約200mg~約500mgの用量で投与される。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、約200mg、約220mg、約240mg、約260mg、約280mg、約300mg、約320mg、約340mg、約360mg、約380mg、約400mg、約420mg、約440mg、約460mg、約480mg、または約500mgの用量で投与される。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、トレメリムマブまたはそのバイオシミラーであり、トレメリムマブは、2週間毎、3週間毎、4週間毎、5週間毎、または6週間毎に投与される。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、Agenusからのザリフレリマブ、またはそのバイオシミラー、抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。ザリフレリマブは、完全ヒトモノクローナル抗体である。ザリフレリマブには、Chemical Abstracts Service(CAS)登録番号2148321-69-9が割り当てられており、AGEN1884としても知られている。ザリフレリマブの調製及び特性は、米国特許第10,144,779号及び米国特許出願公開第2020/0024350 A1号に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、配列番号228によって与えられる重鎖及び配列番号229によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号228及び配列番号229に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、ザリフレリマブの重鎖及び軽鎖のCDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号230に示される配列を含み、CTLA-4阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号231に示される配列、またはその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも99%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも98%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも97%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも96%同一であるV及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号230及び配列番号231に示される配列と少なくとも95%同一であるV及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、それぞれ、配列番号231、配列番号233、及び配列番号234に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号235、配列番号236、及び配列番号237に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、またはそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはCTLA-4上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、ザリフレリマブに関して薬物規制当局によって承認されたCTLA-4バイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、抗CTLA-4抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ザリフレリマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。ザリフレリマブのアミノ酸配列を表25に示す。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗CTLA-4抗体であり、抗CTLA-4抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ザリフレリマブである。抗CTLA-4抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ザリフレリマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ザリフレリマブである。
さらなる抗CTLA-4抗体の例には、AGEN1181、BMS-986218、BCD-145、ONC-392、CS1002、REGN4659、及びADG116が含まれるが、これらに限定されず、これらは当業者に即知である。
いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、以下の特許公開(参照により本明細書に組み込まれる)のうちのいずれかに開示される抗CTLA-4抗体である:US2019/0048096A1、US2020/0223907、US2019/0201334、US2019/0201334、US2005/0201994、EP1212422 B1、WO2018/204760、WO2018/204760、WO20010/14424、WO2004/035607、WO2003/086459、WO2012/120125、WO2000/037504、WO2009/100140、WO2006/09649、WO2005/092380、WO2007/123737、WO2006/029219、WO2010/0979597、WO2006/12168、及びWO1997/020574。さらなるCTLA-4抗体は、米国特許第5,811,097号、同第5,855,887号、同第6,051,227号、及び同第6,984,720号、PCT公開第WO01/14424号及び同第WO00/37504号、ならびに米国公開第2002/0039581号及び同第2002/086014号、及び/または米国特許第5,977,318号、同第6,682,736号、同第7,109,003号、及び同第7,132,281号に記載されており、参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、抗CTLA-4抗体は、例えば、WO98/42752、米国特許第6,682,736号及び同第6,207,156号、Hurwitz et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,95(17):10067-10071(1998)、Camacho et al.,J.Clin.Oncol.,22(145):Abstract No.2505(2004)(抗体CP-675206)、Mokyr et al.,Cancer Res.,58:5301-5304(1998)(参照により本明細書に組み込まれる)に開示されるものである。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、WO1996/040915(参照により本明細書に組み込まれる)に開示されるCTLA-4リガンドである。
いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、CTLA-4発現の核酸阻害剤である。例えば、抗CTLA-4 RNAi分子は、PCT公開第WO1999/032619及びWO2001/029058、米国公開第2003/0051263号、同第2003/0055020号、同第2003/0056235号、同第2004/265839号、同第2005/0100913号、同第2006/0024798号、同第2008/0050342号、同第2008/0081373号、同第2008/0248576号、同第2008/055443号、及び/または米国特許第6,506,559号、同第7,282,564号、同第7,538,095号、及び同第7,560,438号(参照により本明細書に組み込まれる)においてMello及びFireによって記載された分子の形態を取り得る。いくつかの事例では、抗CTLA-4 RNAi分子は、欧州特許第EP1309726号(参照により本明細書に組み込まれる)においてTuschlによって記載された二本鎖RNAi分子の形態を取る。いくつかの事例では、抗CTLA-4 RNAi分子は、米国特許第7,056,704号及び同第7,078,196号(参照により本明細書に組み込まれる)においてTuschlによって記載された二本鎖RNAi分子の形態を取る。いくつかの実施形態では、CTLA-4阻害剤は、PCT公開第WO2004/081021号(参照により本明細書に組み込まれる)に記載されたアプタマーである。
他の実施形態では、本発明の抗CTLA-4 RNAi分子は、米国特許第5,898,031号、同第6,107,094号、同第7,432,249号、及び同第7,432,250号、ならびに欧州出願第EP0928290号(参照により本明細書に組み込まれる)においてCrookeによって記載されたRNA分子である。
5.VEGF-A阻害剤との組み合わせ
いくつかの実施形態では、TIL及びVEGF-A阻害剤は、NSCLCの治療のための併用療法または共療法として投与される。
いくつかの実施形態では、NSCLCは、前療法を受けていない。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、フロントライン療法または初期療法として投与される。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、本明細書に記載のTILと併用して、フロントライン療法または初期療法として投与される。
VEGF-A(それぞれ、配列番号1及び2に示されるポリヌクレオチド及びポリペプチド配列)は、ホルモン及び細胞外シグナル伝達分子のシスチンノットスーパーファミリーのVEGF/PDGF(血小板由来成長因子)群に属する分泌されたジスルフィド結合ホモ二量体糖タンパク質であり(Vitt et al.,Mol.Endocrinol.,15:681-694,2001を参照)を含み、これらはすべて、典型的なシスチンノット構造を形成する8つの保存されたシステイン残基(ジスルフィド結合によって連結される2つのシステインの二量体であるシスチンにちなんで名付けられる)の存在を特徴とする。異なるmRNAスプライスバリアントによってコードされる、121、145、165、189または206アミノ酸長の5つのヒトVEGF-Aアイソフォーム(VEGF-A121~206)が記載されており、これらはすべて、内皮細胞における分裂形成を刺激することができる。これらのアイソフォームは、VEGF-Aの低親和性受容体として振る舞う、細胞表面及び細胞外マトリックス関連ヘパラン-硫酸プロテオグリカンに対する生物学的活性、受容体特異性、及び親和性が異なる。VEGF-A121は、ヘパリンまたはヘパラン-硫酸のいずれにも結合せず、VEGF-A145及びVEGF-A165(GenBank受託番号M32977)の両方は、ヘパリンに結合することができ、VEGF-A189及びVEGF-A206は、ヘパリン及びヘパラン-硫酸に対して最も強い親和性を示す。VEGF-A121、VEGF-A145、及びVEGF-A165は、可溶性形態で分泌されるが、VEGF-A165の大部分は、細胞表面及び細胞外マトリックスプロテオグリカンに限定され、一方、VEGF-A189及びVEGF-A206は、細胞外マトリックスと関連付けられたままである。VEGF-A189及びVEGF-A206の両方は、ヘパリンまたはヘパリナーゼによる処理によって放出され得、これらのアイソフォームがプロテオグリカンを介して細胞外マトリックスに結合していることを示す。細胞結合型VEGF-A180は、プラスミンなどのプロテアーゼによって切断することもでき、その結果、活性可溶性VEGF-A110が放出される。
VEGF-A駆動型血管新生は、がん、眼疾患、及び関節リウマチを含む多様なヒト疾患の病因において主要な役割を有する。Carmeliet et al.,Nature 407:249-257,2000を参照されたい。いくつかの重要なクラスのがんの発症に対するVEGF-Aの重要性の認識は、最近、転移性結腸直腸癌の治療のためのVEGF-Aに対するヒト化モノクローナル抗体であるAVASTIN(商標)の承認に至った。Ferrara et al.,Nat.Rev.Drug Discov.2004,3:391-400,2004を参照されたい。同様に、新生血管性眼障害の病因におけるVEGF-Aの重要性は、新生血管(wet)加齢性黄斑変性症(AMD)の治療のためのヒト化モノクローナル抗体断片であるLUCENTIS(商標)の最近の承認に反映される。
本発明内で使用されるVEGF-A阻害剤には、VEGF-AまたはVEGF-A受容体に結合し、それによって、例えば、VEGFR-1、VEGFR-2、ニューロピリン-1、及び/またはニューロピリン-2などの受容体を発現する細胞上のVEGF-Aの活性を低下させる分子が含まれる。特に、VEGF-A阻害剤は、抗VEGF-A抗体を含む。他の好適なVEGF-A阻害剤としては、VEGFR細胞外ドメインを含む可溶性VEGF-A受容体、ならびにVEGF-Aとその受容体との相互作用を阻害することができるか、またはそうでなければ、VEGF-A受容体を介したVEGF-A誘導細胞内シグナル伝達を阻害することができる小分子アンタゴニストが挙げられる。加えて、非抗体足場に基づく結合タンパク質を用いてもよい。(例えば、Koide et al.,J.Mol.Biol.284:1141-1151,1998、Hosse et al.Protein Sci.15:14-27,2006、及びそこでの参考文献を参照されたい)。本発明内で使用するための好ましいVEGF-A阻害剤としては、PDGFRβの結合部位も含む二重特異性抗体を含む、VEGF-Aに特異的に結合する抗体が挙げられる。VEGF-Aに特異的な抗体は、少なくとも可溶性分泌形態のVEGF-Aに結合し、好ましくは細胞表面関連形態にも結合する。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、当該技術分野で知られている任意のVEGF-A阻害剤またはVEGF-A遮断剤であり得る。特に、次の段落でより詳細に記載されるVEGF-A阻害剤または遮断剤のうちの1つである。「阻害剤」、「アンタゴニスト」、及び「遮断剤」という用語は、本明細書では、VEGF-A阻害剤に関して互換的に使用される。誤解を避けるために、抗体であるVEGF-A阻害剤への本明細書での言及は、化合物またはその抗原結合断片、バリアント、複合体、もしくはバイオシミラーを指し得る。誤解を避けるために、VEGF-A阻害剤への本明細書での言及はまた、小分子化合物またはその薬学的に許容される塩、エステル、溶媒和物、水和物、共結晶、もしくはプロドラッグを指し得る。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、当該技術分野で知られている任意のVEGF-A阻害剤またはVEGF-A遮断剤であり得る。特に、次の段落でより詳細に記載されるVEGF-A阻害剤または遮断剤のうちの1つである。「阻害剤」、「アンタゴニスト」、及び「遮断剤」という用語は、本明細書では、VEGF-A阻害剤に関して互換的に使用される。誤解を避けるために、抗体であるVEGF-A阻害剤への本明細書での言及は、化合物またはその抗原結合断片、バリアント、複合体、もしくはバイオシミラーを指し得る。誤解を避けるために、VEGF-A阻害剤への本明細書での言及はまた、小分子化合物またはその薬学的に許容される塩、エステル、溶媒和物、水和物、共結晶、もしくはプロドラッグを指し得る。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、抗体(すなわち、抗VEGF-A抗体)、Fab断片を含むその断片、またはその一本鎖可変断片(scFv)である。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、ポリクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、モノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、VEGF-Aとの結合について競合する、及び/またはVEGF-A上のエピトープに結合する。いくつかの実施形態では、抗体は、VEGF-Aとの結合について競合する、及び/またはVEGF-A上のエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、ヒトVEGF-Aに約100pM以下のKで結合する、ヒトVEGF-Aに約90pM以下のKで結合する、ヒトVEGF-Aに約80pM以下のKで結合する、ヒトVEGF-Aに約70pM以下のKで結合する、ヒトVEGF-Aに約60pM以下のKで結合する、ヒトVEGF-Aに約50pM以下のKで結合する、ヒトVEGF-Aに約40pM以下のKで結合する、ヒトVEGF-Aに約30pM以下のKで結合する、ヒトVEGF-Aに約20pM以下のKで結合する、ヒトVEGF-Aに約10pM以下のKで結合する、またはヒトVEGF-Aに約1pM以下のKで結合するものである。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、ヒトVEGF-Aに約7.5×10l/M・s以上のkassocで結合する、ヒトVEGF-Aに約7.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトVEGF-Aに約8×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトVEGF-Aに約8.5×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトVEGF-Aに約9×101/M・s以上のkassocで結合する、ヒトVEGF-Aに約9.5×101/M・s以上のkassocで結合する、またはヒトVEGF-Aに約1×101/M・s以上のkassocで結合するものである。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、ヒトVEGF-Aに約2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトVEGF-Aに約2.1×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトVEGF-Aに約2.2×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトVEGF-Aに約2.3×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトVEGF-Aに約2.4×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトVEGF-Aに約2.5×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトVEGF-Aに約2.6×10-51/s以下のkdissocで結合する、またはヒトVEGF-Aに約2.7×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトVEGF-Aに約2.8×10-51/s以下のkdissocで結合する、ヒトVEGF-Aに約2.9×10-51/s以下のkdissocで結合する、またはヒトVEGF-Aに約3×10-51/s以下のkdissocで結合するものである。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、約10nM以下のIC50でのヒトVEGF-AへのヒトVEGFR-1受容体もしくはヒトVEGFR-2受容体の結合を遮断もしくは阻害し、約9nM以下のIC50でのヒトVEGF-AへのヒトVEGFR-1受容体もしくはヒトVEGFR-2受容体の結合を遮断もしくは阻害し、約8nM以下のIC50でのヒトVEGF-AへのヒトVEGFR-1受容体もしくはヒトVEGFR-2受容体の結合を遮断もしくは阻害し、約7nM以下のIC50でのヒトVEGF-AへのヒトVEGFR-1受容体もしくはヒトVEGFR-2受容体の結合を遮断もしくは阻害し、約6nM以下のIC50でのヒトVEGF-AへのヒトVEGFR-1受容体もしくはヒトVEGFR-2受容体の結合を遮断もしくは阻害し、約5nM以下のIC50でのヒトヒトVEGF-AへのヒトVEGFR-1受容体もしくはヒトVEGFR-2受容体の結合を遮断もしくは阻害し、約4nM以下のIC50でのヒトVEGF-AへのヒトVEGFR-1受容体もしくはヒトVEGFR-2受容体の結合を遮断もしくは阻害し、約3nM以下のIC50でのヒトVEGF-AへのヒトVEGFR-1受容体もしくはヒトVEGFR-2受容体の結合を遮断もしくは阻害し、約2nM以下のIC50でのヒトVEGF-AへのヒトVEGFR-1受容体もしくはヒトVEGFR-2受容体の結合を遮断もしくは阻害し、または約1nM以下のIC50でのヒトVEGF-AへのヒトVEGFR-1受容体もしくはヒトVEGFR-2受容体の結合を遮断もしくは阻害するものである。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、ベバシズマブ、またはそのバイオシミラー、抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。ベバシズマブ(CAS登録番号216974-75-3、AVASTIN(登録商標)、Genentech)は、がん治療に使用される血管内皮成長因子に対する抗VEGFモノクローナル抗体(US7227004、US6884879、US7060269、US7169901、US7297334)であり、これは新生血管形成を遮断することによって腫瘍成長を阻害する。ベバシズマブは、米国で初の臨床的に入手可能な血管新生阻害剤である。転移性結腸癌及びほとんどの形態の転移性非小細胞肺癌の治療のための標準化学療法と組み合わせて、2004年にFDAによって承認された。以下の疾患:補助/非転移性結腸癌、転移性乳癌、転移性腎細胞癌、転移性多型神経膠芽腫新生物、転移性卵巣癌、転移性ホルモン不応性前立腺癌及び転移、転移性膵臓癌または切除不能な局所進行膵臓癌を有する患者におけるその安全性及び有効性を決定するために、いくつかの臨床後研究が進行中である。
ベバシズマブは、ヒトVEGFのその受容体への結合を遮断する、マウス抗hVEGFモノクローナル抗体A.4.6.1からの変異体ヒトIgG1フレームワーク領域及び抗原結合相補性決定領域を含む。ベバシズマブアミノ酸配列(ほとんどのフレームワーク領域を含む)の約93%はヒトIgG1に由来し、配列の約7%はマウス抗体A4.6.1に由来する。ベバシズマブは、約149,000ダルトンの分子量を有し、グリコシル化される。ベバシズマブ及び他のヒト化抗VEGF抗体は、US6884879にさらに記載されている。追加の抗VEGF抗体としては、国際特許公開第WO2005/012359号の図27~29のいずれかに記載されるG6またはB20シリーズ抗体(例えば、G6-31、B20-4.1)が挙げられる。一実施形態において、B20シリーズ抗体は、残基F17、M18、D19、Y21、Y25、Q89、I91、K101、E103、及びC104を含有するヒトVEGF上の機能性エピトープに結合する。追加のVEGF抗体は、国際特許公開第WO2010/148223号に記載されている。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、配列番号207によって与えられる重鎖及び配列番号208によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、それぞれ、配列番号207及び配列番号208に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号207及び配列番号208に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号207及び配列番号208に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号207及び配列番号208に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号207及び配列番号208に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号207及び配列番号208に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、ベバシズマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号209に示される配列を含み、VEGF-A阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号210に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号209及び配列番号210に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号209及び配列番号210に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号209及び配列番号210に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号209及び配列番号210に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号209及び配列番号210に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、それぞれ、配列番号211、配列番号212、及び配列番号213に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号214、配列番号215、及び配列番号216に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはVEGF-A上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、ベバシズマブに関して薬物規制当局によって承認されたVEGF-Aバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、抗VEGF-A抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ベバシズマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗VEGF-A抗体であり、抗VEGF-A抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ベバシズマブである。抗VEGF-A抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ベバシズマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ベバシズマブである。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、ラニビズマブ、またはそのバイオシミラー、抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。ラニビズマブ(CAS登録番号347396-82-1、Lucentis(登録商標))は、ベバシズマブと同じ親マウス抗体から作製されるモノクローナル抗体断片(Fab)である。加齢性黄斑変性症(AMD、またARMD)、加齢性視力喪失の一般的な形態を治療するために承認されている抗血管新生剤である。その副作用の割合は、ベバシズマブのものと同様である。しかしながら、ラニビズマブは、典型的には1用量当たり2,000ドルかかり、一方、同等用量のベバシズマブは、典型的には50ドルかかる。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、配列番号217によって与えられる重鎖及び配列番号218によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、それぞれ、配列番号217及び配列番号218に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号217及び配列番号218に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号217及び配列番号218に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号217及び配列番号218に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号217及び配列番号218に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号217及び配列番号218に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、ラニビズマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号219に示される配列を含み、VEGF-A阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号220に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号219及び配列番号220に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号219及び配列番号220に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号219及び配列番号220に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号219及び配列番号220に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号219及び配列番号220に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、それぞれ、配列番号221、配列番号222、及び配列番号223に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号224、配列番号225、及び配列番号226に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはVEGF-A上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、ラニビズマブに関して薬物規制当局によって承認されたVEGF-Aバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、抗VEGF-A抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、ラニビズマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗VEGF-A抗体であり、抗VEGF-A抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、ラニビズマブである。抗VEGF-A抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ラニビズマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、ラニビズマブである。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、イクルクマブ、またはそのバイオシミラー、抗原結合断片、複合体、もしくはバリアントである。イクルクマブ(CAS登録番号1024603-92-6、IMC-18F1としても知られる)は、固形腫瘍の治療のために設計されたヒトモノクローナル抗体である。潜在的な抗血管新生及び抗腫瘍活性を有するヒト血管内皮増殖因子受容体1(VEGFR-1/FLT-1)に対する完全ヒトIgG1モノクローナル抗体。イクルクマブは、下流のシグナル伝達経路の活性化を阻害し、腫瘍血管新生を阻害し得るVEGFR-1の活性に特異的に結合し、阻害し、腫瘍栄養供給のその後の低下は、腫瘍細胞の増殖を阻害し得る。VEGFR-1の腫瘍細胞の過剰発現は、腫瘍血管新生及び腫瘍細胞の増殖及び浸潤と関連し得、VEGFR-1は、VEGFR-2シグナル伝達を調節し得る。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、配列番号227によって与えられる重鎖及び配列番号228によって与えられる軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、それぞれ、配列番号227及び配列番号564に示される配列を有する重鎖及び軽鎖、またはそれらの抗原結合断片、Fab断片、一本鎖可変断片(scFv)、バリアント、もしくは複合体を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号227及び配列番号228に示される配列と少なくとも99%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号227及び配列番号228に示される配列と少なくとも98%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号227及び配列番号228に示される配列と少なくとも97%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号227及び配列番号228に示される配列と少なくとも96%同一である重鎖及び軽鎖を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号227及び配列番号228に示される配列と少なくとも95%同一である重鎖及び軽鎖を含む。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、イクルクマブの重鎖及び軽鎖CDRまたは可変領域(VR)を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤重鎖可変領域(V)は、配列番号229に示される配列を含み、VEGF-A阻害剤軽鎖可変領域(V)は、配列番号230に示される配列、及びその保存的アミノ酸置換を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号229及び配列番号230に示される配列と少なくとも99%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号229及び配列番号230に示される配列と少なくとも98%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号229及び配列番号230に示される配列と少なくとも97%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号229及び配列番号230に示される配列と少なくとも96%同一であるV領域及びV領域を含む。いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、各々が、それぞれ、配列番号229及び配列番号230に示される配列と少なくとも95%同一であるV領域及びV領域を含む。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、それぞれ、配列番号231、配列番号232、及び配列番号233に示される配列を有する重鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、それぞれ、配列番号234、配列番号235、及び配列番号236に示される配列を有する軽鎖CDR1、CDR2及びCDR3ドメイン、ならびにそれらの保存的アミノ酸置換と、を含む。いくつかの実施形態では、抗体は、前述の抗体のうちのいずれかと結合するために競合し、及び/またはVEGF-A上の同じエピトープに結合する。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、イクルクマブに関して薬物規制当局によって承認されたVEGF-Aバイオシミラーモノクローナル抗体である。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、参照医薬品または参照バイオ製品のアミノ酸配列に対して少なくとも97%の配列同一性、例えば、97%、98%、99%、または100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、参照医薬品または参照バイオ製品と比較して、1つ以上の翻訳後修飾を含む、抗VEGF-A抗体を含み、参照医薬品または参照バイオ製品は、イクルクマブである。いくつかの実施形態では、1つ以上の翻訳後修飾は、グリコシル化、酸化、脱アミド化、及び切断のうちの1つ以上から選択される。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、認可された、または認可のために提出された抗VEGF-A抗体であり、抗VEGF-A抗体は、参照医薬品または参照バイオ製品の製剤とは異なる製剤で提供され、参照医薬品または参照バイオ製品は、イクルクマブである。抗VEGF-A抗体は、米国FDA及び/または欧州連合のEMAなどの薬物規制当局によって認可され得る。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、イクルクマブである。いくつかの実施形態では、バイオシミラーは、1つ以上の賦形剤をさらに含む組成物として提供され、1つ以上の賦形剤は、参照医薬品または参照バイオ製品に含まれる賦形剤と同じまたは異なるものであり、参照医薬品または参照バイオ製品は、イクルクマブである。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、デコイVEGF受容体(VEGFトラップとしても知られる)、例えば、米国特許出願公開第2019/0298801号及び国際特許出願公開第WO2014/006113A1号(参照により本明細書に組み込まれる開示)に開示されるAflibercept(Eylea,Zaltrap)または米国特許出願公開第2019/0002546号及び同第2019/0343918号(参照により本明細書に組み込まれる開示)に開示されるConberceptである。デコイVEGF受容体の追加の開示及び例は、米国特許第6,383,486号、同第6,375,929号、同第6,348,333号、同第6,100,071号、及び同第9,777,261号に提供され、それらの開示は参照によりそれら全体が本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、低分子チロシンキナーゼ阻害剤である。低分子チロシンキナーゼは、当業者に知られている。小分子チロシンキナーゼ阻害剤の例としては、ペガプタニブ、パゾパニブ、ラパチニブ、スニチニブ、ソラフェニブ、レゴラフェニブ、ポナチニブ、レンバチニブ、アキシチニブ(AG-013736)、セディラニブ(AZD2171)、バタラニブ、及び/またはルシタニブが挙げられるが、これらに限定されない。
いくつかの実施形態では、VEGF-A阻害剤は、抗VEGFRリボザイム、抗VEGFRアンチセンス、ならびに米国特許第7,148,342号及び国際特許出願第WO2010/058426号(参照によりそれら全体が本明細書に組み込まれる開示)に開示されるVEGFRを阻害するsiRNAである。
6.患者のリンパ球枯渇プレコンディショニング
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL集団でがんを治療する方法を含み、患者は、本開示によるTILの注入前に骨髄非破壊的化学療法で前治療される。いくつかの実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的化学療法で前治療された患者のがんの治療に使用するためのTIL集団を含む。いくつかの実施形態では、TIL集団は、注入による投与用である。いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的化学療法は、シクロホスファミド60mg/kg/日で2日間(TIL注入の27日前及び26日前)、ならびにフルダラビン25mg/m/日で5日間(TIL注入の27日前~23日前)である。いくつかの実施形態では、本開示による骨髄非破壊的化学療法及びTIL注入(0日目)後、患者は、生理学的許容範囲まで8時間毎に720,000IU/kgで静脈内的にIL-2(PROLEUKINとして市販されている、アルデスロイキン)の静脈内注入を受ける。ある特定の実施形態では、TIL集団は、IL-2と組み合わせてがんを治療する際に使用するためのものであり、IL-2は、TIL集団の後に投与される。
実験結果は、腫瘍特異的Tリンパ球の養子移入前のリンパ球枯渇が、制御性T細胞及び免疫系の競合要素(「サイトカインシンク」)を排除することによって治療有効性を増強する上で重要な役割を果たすことを示している。したがって、本発明のいくつかの実施形態は、本発明のTILを導入する前に、患者に対してリンパ球枯渇ステップ(「免疫抑制コンディショニング」と称されることもある)を利用する。
一般に、リンパ球枯渇は、フルダラビンまたはシクロホスファミド(マホスファミドと称される活性形態)及びそれらの組み合わせの投与を使用して達成される。かかる方法は、Gassner,et al.,Cancer Immunol.Immunother.2011,60,75-85、Muranski,et al.,Nat.Clin.Pract.Oncol.,2006,3,668-681、Dudley,et al.,J.Clin.Oncol.2008,26,5233-5239、及びDudley,et al.,J.Clin.Oncol.2005,23,2346-2357に記載されており、これらはすべて、参照によりそれらの全体が本明細書に組み込まれる。
いくつかの実施形態では、フルダラビンは、0.5μg/mL~10μg/mLのフルダラビン濃度で投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビンは、1μg/mLのフルダラビン濃度で投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビン治療は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日以上投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビンは、10mg/kg/日、15mg/kg/日、20mg/kg/日、25mg/kg/日、30mg/kg/日、35mg/kg/日、40mg/kg/日、または45mg/kg/日の投与量で投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビン治療は、35mg/kg/日で2~7日間投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビン治療は、35mg/kg/日で4~5日間投与される。いくつかの実施形態では、フルダラビン治療は、25mg/kg/日で4~5日間投与される。
いくつかの実施形態では、シクロホスファミドの活性形態であるマホスファミドは、シクロホスファミドの投与により、0.5μg/mL~10μg/mLの濃度で取得される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミドの活性形態であるマホスファミドは、シクロホスファミドの投与により、1μg/mLの濃度で取得される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミド治療は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、または7日以上投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミドは、100mg/m/日、150mg/m/日、175mg/m/日、200mg/m/日、225mg/m/日、250mg/m/日、275mg/m/日、または300mg/m/日の投与量で投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミドは、静脈内(すなわち、i.v.)投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミド治療は、35mg/kg/日で2~7日間投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミド治療は、250mg/m/日で4~5日間i.v.投与される。いくつかの実施形態では、シクロホスファミド治療は、250mg/m/日で4日間i.v.投与される。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇は、患者にフルダラビンとシクロホスファミドを一緒に投与することによって行われる。いくつかの実施形態では、フルダラビンは、25mg/m/日でi.v.投与され、シクロホスファミドは、250mg/m/日で4日間にわたってi.v投与される。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われる。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計5日間で行われる。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを約50mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを約25mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計5日間で行われる。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを約50mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを約20mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計5日間で行われる。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを約40mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを約20mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計5日間で行われる。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを約40mg/m/日の用量で2日間投与し、フルダラビンを約15mg/m/日の用量で5日間投与することによって行われ、シクロホスファミド及びフルダラビンは、両方とも最初の2日間に投与され、リンパ球枯渇は合計5日間で行われる。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇が、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、フルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与することによって行われる。
いくつかの実施形態では、シクロホスファミドは、メスナとともに投与される。いくつかの実施形態では、メスナは、15mg/kgで投与される。メスナが注入されるいくつかの実施形態では、連続的に注入される場合、メスナは、約2時間にわたってシクロホスファミドを注入することができ(-5日目及び/または-4日目)、次いで、各シクロホスファミド用量と同時に開始する24時間にわたって残りの22時間で3mg/kg/時間の速度で注入することができる。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇は、第3のTIL集団を患者に投与した翌日から開始するIL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含む。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇は、第3のTIL集団を患者に投与したのと同じ日に開始するIL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含む。
いくつかの実施形態では、リンパ球枯渇は、5日間のプレコンディショニング治療を含む。いくつかの実施形態では、該日は、-5日から-1日、または0日から4日として示される。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-4日目(すなわち、0日目及び1日目)にシクロホスファミドを含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-4日目(すなわち、0日目及び1日目)に静脈内シクロホスファミドを含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-4日目(すなわち、0日目及び1日目)に60mg/kgの静脈内シクロホスファミドを含む。いくつかの実施形態では、シクロホスファミドは、メスナとともに投与される。いくつかの実施形態では、レジメンは、フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、静脈内フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、25mg/mの静脈内フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-1日目(すなわち、0~4日目)に25mg/mの静脈内フルダラビンをさらに含む。いくつかの実施形態では、レジメンは、-5日目及び-1日目(すなわち、0~4日目)に25mg/mの静脈内フルダラビンをさらに含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、フルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で5日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、フルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、フルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で1日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、フルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表29に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表30に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表31に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表32に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表33に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表34に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表35に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンは、表36に従って投与される。
いくつかの実施形態では、骨髄破壊的リンパ球枯渇レジメンの前述の実施形態で使用されるTIL注入は、本明細書に記載の任意のTIL組成物であり得、また本明細書に記載されるようなIL-2レジメンの追加及び併用療法(PD-1及び/またはPD-L1阻害剤など)の投与であり得る。
7.IL-2レジメン
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、高用量IL-2レジメンを含み、高用量IL-2レジメンは、治療的TIL集団の治療有効分量を投与した翌日から静脈内投与されるアルデスロイキンまたはそのバイオシミラーもしくはバリアントを含み、アルデスロイキンまたはそのバイオシミラーもしくはバリアントは、許容範囲まで8時間毎に最大14用量にわたって、0.037mg/kgまたは0.044mg/kg IU/kg(患者の体重)の用量で15分のボーラス静脈内注入を使用して投与される。9日間の休止後、このスケジュールは、さらに14用量、合計最大28用量にわたって繰り返され得る。いくつかの実施形態では、IL-2は、1、2、3、4、5、または6用量で投与される。いくつかの実施形態では、IL-2は、最大6用量の最大投与量で投与される。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、デクレッシェンドIL-2レジメンを含む。デクレッシェンドIL-2レジメンは、O’Day,et al.,J.Clin.Oncol.1999,17,2752-61、及びEton,et al.,Cancer 2000,88,1703-9に記載されており、それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、デクレッシェンドIL-2レジメンは、6時間にわたって静脈内投与される18×10IU/mアルデスロイキン、またはそのバイオシミラーもしくはバリアント、続いて12時間にわたって静脈内投与される18×10IU/m、続いて24時間にわたって静脈内投与される18×10IU/m、続いて72時間かけて静脈内投与される4.5×10IU/mを含む。この治療サイクルは、28日毎に最大4サイクル繰り返され得る。いくつかの実施形態では、デクレッシェンドIL-2レジメンは、1日目の18,000,000IU/m、2日目の9,000,000IU/m、3日目及び4日目の4,500,000IU/mを含む。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、低用量IL-2レジメンを含む。Dominguez-Villar and Hafler,Nat.Immunology 2000,19,665-673、Hartemann,et al.,Lancet Diabetes Endocrinol.2013,1,295-305、及びRosenzwaig,et al.,Ann.Rheum.Dis.2019,78,209-217(それらの開示は参照により本明細書に組み込まれる)に記載されている低用量IL-2レジメンを含む、当該技術分野で知られている任意の低用量IL-2レジメンを使用することができる。いくつかの実施形態では、低用量IL-2レジメンは、5日間の連続的注入として投与された、24時間当たりm当たり18×10IUのアルデスロイキンまたはそのバイオシミラーもしくはバリアント、その後IL-2療法なしで2~6日間、その後任意選択でアルデスロイキンまたはそのバイオシミラーもしくはバリアントを静脈内にさらに5日間、24時間当たりm当たり18×10IUの連続的注入として、その後任意選択でIL-2療法なしで3週間を含み、その後、追加のサイクルが投与され得る。
いくつかの実施形態では、IL-2は、最大6用量の最大投与量で投与される。いくつかの実施形態では、高用量IL-2レジメンは、小児の使用に適合される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に600,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に500,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に400,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に500,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に300,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に200,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。いくつかの実施形態では、最大6用量まで、8~12時間毎に100,000国際単位(IU)/kgのアルデスロイキンの用量が使用される。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、0.10mg/日~50mg/日の用量で、1、2、4、6、7、14、または21日毎にペグ化IL-2を投与することを含む。いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、0.10mg/日~50mg/日の用量で、1、2、4、6、7、14、または21日毎に、ベンペガルデスロイキン、またはその断片、バリアント、もしくはバイオシミラーを投与することを含む。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、0.10mg/日~50mg/日の用量で、1、2、4、6、7、14、または21日毎に、THOR-707、またはその断片、バリアント、もしくはバイオシミラーを投与することを含む。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、TILの投与後に、ネムバロイキンアルファ、またはその断片、バリアント、もしくはバイオシミラーの投与を含む。ある特定の実施形態では、患者にネムバロイキンを1日、2日、4日、6日、7日、14日または21日毎に、0.10mg/日~50mg/日の用量で投与される。
いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、抗体骨格に移植されたIL-2断片の投与を含む。いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、IL-2低親和性受容体と結合する抗体-サイトカイン移植タンパク質の投与を含む。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、相補性決定領域HCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、重鎖可変領域(V)と、LCDR1、LCDR2、LCDR3を含む軽鎖可変領域(V)と、VまたはVのCDRに移植されたIL-2分子またはその断片と、を含み、抗体サイトカイン移植タンパク質は、制御性T細胞よりもTエフェクター細胞を優先的に拡張させる。いくつかの実施形態では、抗体サイトカイン移植タンパク質は、相補性決定領域HCDR1、HCDR2、HCDR3を含む、重鎖可変領域(V)と、LCDR1、LCDR2、LCDR3を含む軽鎖可変領域(V)と、VまたはVのCDRに移植されたIL-2分子またはその断片と、を含み、IL-2分子は、ムテインであり、抗体サイトカイン移植タンパク質は、制御性T細胞よりもTエフェクター細胞を優先的に拡張させる。いくつかの実施形態では、IL-2レジメンは、0.10mg/日~50mg/日の用量で、1、2、4、6、7、14または21日毎に、配列番号29及び配列番号38からなる群から選択される重鎖と、配列番号37及び配列番号39からなる群から選択される軽鎖と、を含む抗体、またはその断片、バリアント、もしくはバイオシミラーを投与することを含む。.
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の抗体サイトカイン移植タンパク質は、アルデスロイキン(Proleukin(登録商標))または同等の分子などであるがこれらに限定されない野生型IL-2分子よりも長い血清半減期を有する。
いくつかの実施形態では、骨髄破壊的リンパ球枯渇レジメンの前述の実施形態で使用されるTIL注入は、本明細書に記載の任意のTIL組成物であり得、また、TIL注入の代わりにMIL及びPBLの注入、ならびに本明細書に記載のIL-2レジメンの追加及び併用療法(PD-1及び/またはPD-L1阻害剤及び/またはCTLA-4阻害剤など)の投与を含み得る。
8.追加の治療方法
いくつかの実施形態では、本発明は、非小細胞肺癌(NSCLC)の治療を必要とする対象または患者に腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の集団を投与することによって、NSCLCを治療する方法を提供し、対象または患者は、
i.PD-L1<1%の所定の腫瘍割合スコア(TPS)、
ii.1%~49%のPD-L1のTPSスコア、または
iii.1つ以上のドライバー変異の所定の非存在のうちの少なくとも1つを有し、ドライバー変異は、EGFR変異、EGFR挿入、EGFRエクソン20、KRAS変異、BRAF変異、ALK変異、c-ROS変異(ROS1変異)、ROS1融合、RET変異、RET融合、ERBB2変異、ERBB2増幅、BRCA変異、MAP2K1変異、PIK3CA、CDKN2A、PTEN変異、UMD変異、NRAS変異、KRAS変異、NF1変異、MET変異、METスプライス及び/または変化したMETシグナル伝達、TP53変異、CREBBP変異、KMT2C変異、KMT2D変異、ARID1A変異、RB1変異、ATM変異、SETD2変異、FLT3変異、PTPN11変異、FGFR1変異、EP300変異、MYC変異、EZH2変異、JAK2変異、FBXW7変異、CCND3変異、及びGNA11変異からなる群から選択され、この方法は、
(a)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(b)第1のTIL集団を閉鎖系に付加することと、
(c)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(b)からステップ(c)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生すること
と、
(d)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(e)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(f)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(g)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(h)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(g)の注入バッグから対象または患者に投与することと、を含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、非小細胞肺癌(NSCLC)の治療を必要とする対象または患者に腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の集団を投与することによって、NSCLCを治療する方法を提供し、この方法は、
(a)PD-L1のPD-L1発現及び腫瘍割合スコア(TPS)について患者の腫瘍を試験することと、
(b)1つ以上のドライバー変異の所定の非存在について患者を試験することであって、ドライバー変異が、EGFR変異、EGFR挿入、EGFRエクソン20、KRAS変異、BRAF変異、ALK変異、c-ROS変異(ROS1変異)、ROS1融合、RET変異、RET融合、ERBB2変異、ERBB2増幅、BRCA変異、MAP2K1変異、PIK3CA、CDKN2A、PTEN変異、UMD変異、NRAS変異、KRAS変異、NF1変異、MET変異、METスプライス及び/または変化したMETシグナル伝達、TP53変異、CREBBP変異、KMT2C変異、KMT2D変異、ARID1A変異、RB1変異、ATM変異、SETD2変異、FLT3変異、PTPN11変異、FGFR1変異、EP300変異、MYC変異、EZH2変異、JAK2変異、FBXW7変異、CCND3変異、及びGNA11変異からなる群から選択される、試験することと、
(c)患者が、約1%~約49%のPD-L1のTPSスコアを有していることを判定し、また患者がドライバー変異を有しないことを判定することと、
(d)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(e)第1のTIL集団を閉鎖系に付加することと、
(f)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(i)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(k)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(g)の注入バッグから対象または患者に投与することと、を含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、非小細胞肺癌(NSCLC)の治療を必要とする対象または患者に腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の集団を投与することによって、NSCLCを治療する方法を提供し、この方法は、
(a)PD-L1のPD-L1発現及び腫瘍割合スコア(TPS)について患者の腫瘍を試験することと、
(b)1つ以上のドライバー変異の所定の非存在について患者を試験することであって、ドライバー変異が、EGFR変異、EGFR挿入、EGFRエクソン20、KRAS変異、BRAF変異、ALK変異、c-ROS変異(ROS1変異)、ROS1融合、RET変異、RET融合、ERBB2変異、ERBB2増幅、BRCA変異、MAP2K1変異、PIK3CA、CDKN2A、PTEN変異、UMD変異、NRAS変異、KRAS変異、NF1変異、MET変異、METスプライス及び/または変化したMETシグナル伝達、TP53変異、CREBBP変異、KMT2C変異、KMT2D変異、ARID1A変異、RB1変異、ATM変異、SETD2変異、FLT3変異、PTPN11変異、FGFR1変異、EP300変異、MYC変異、EZH2変異、JAK2変異、FBXW7変異、CCND3変異、及びGNA11変異からなる群から選択される、試験することと、
(c)患者が、約1%未満のPD-L1のTPSスコアを有していることを判定し、また患者がドライバー変異を有しないことを判定することと、
(d)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(e)第1のTIL集団を閉鎖系に付加することと、
(f)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(i)ステップ(e)から採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(k)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(g)の注入バッグから対象または患者に投与することと、を含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、非小細胞肺癌(NSCLC)の治療を必要とする対象または患者に腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の集団を投与することによって、NSCLCを治療する方法を提供し、この方法は、
(a)PD-L1のPD-L1発現及び腫瘍割合スコア(TPS)について患者の腫瘍を試験することと、
(b)1つ以上のドライバー変異の非存在について患者を試験することであって、ドライバー変異が、EGFR変異、EGFR挿入、KRAS変異、BRAF変異、ALK変異、c-ROS変異(ROS1変異)、ROS1融合、RET変異、またはRET融合からなる群から選択される、試験することと、
(c)患者が、約1%~約49%のPD-L1のTPSスコアを有していることを判定し、また患者がドライバー変異を有しないことを判定することと、
(d)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(e)第1のTIL集団を閉鎖系に付加することと、
(f)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(i)ステップ(e)から採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(k)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(g)の注入バッグから対象または患者に投与することと、を含む。
いくつかの実施形態では、本発明は、非小細胞肺癌(NSCLC)の治療を必要とする対象または患者に腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の集団を投与することによって、NSCLCを治療する方法を提供し、この方法は、
(a)PD-L1のPD-L1発現及び腫瘍割合スコア(TPS)について患者の腫瘍を試験することと、
(b)1つ以上のドライバー変異の非存在について患者を試験することであって、ドライバー変異が、EGFR変異、EGFR挿入、KRAS変異、BRAF変異、ALK変異、c-ROS変異(ROS1変異)、ROS1融合、RET変異、またはRET融合からなる群から選択される、試験することと、
(c)患者が、約1%未満のPD-L1のTPSスコアを有していることを判定し、また患者がドライバー変異を有しないことを判定することと、
(d)対象から取得された腫瘍試料を複数の腫瘍断片に処理することによって、対象または患者から切除された腫瘍から第1のTIL集団を取得及び/または受容することと、
(e)第1のTIL集団を閉鎖系に付加することと、
(f)IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、第1の拡張が、約3~14日間行われて、第2のTIL集団を取得し、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、系を開くことなく起こる、第2のTIL集団を産生することと、
(g)第2のTIL集団の細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)で補充することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、第2の拡張が、約7~14日間行われて、第3のTIL集団を取得し、第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(f)からステップ(g)への移行が、系を開くことなく起こる、第3のTIL集団を産生することと、
(h)ステップ(d)から取得された治療的TIL集団を採取することであって、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、系を開くことなく起こる、採取することと、
(i)ステップ(e)からの採取されたTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(e)から(f)への移行が、系を開くことなく起こる、移すことと、
(j)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(f)からの採取されたTIL集団を含む注入バッグを凍結保存することと、
(k)治療上有効な投与量の第3のTIL集団を、ステップ(g)の注入バッグから対象または患者に投与することと、を含む。
いくつかの実施形態では、第2のTIL集団は、第1のTIL集団よりも数が少なくとも50倍多い。
いくつかの実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、それぞれ、治療上有効な投与量の治療的TIL集団及び上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を投与する前に、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが対象に投与されるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、60mg/m/日の用量で2日間のシクロホスファミドの投与に続いて、25mg/m/日の用量で5日間のフルダラビンを投与するステップを含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、対象にTIL細胞を投与した翌日に開始する、高用量のIL-2レジメンで対象を治療するステップをさらに含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、高用量IL-2レジメンが、許容範囲まで8時間毎に15分間のボーラス静脈内注入として投与される600,000または720,000IU/kgを含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが固形腫瘍であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭癌ウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、または腎細胞癌であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが黒色腫、HNSCC、子宮頸癌、NSCLC、膠芽腫(GBMを含む)、及び胃腸癌であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが黒色腫であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんがHNSCCであるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが子宮頸癌であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんがNSCLCであるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが膠芽腫(GBMを含む)であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが胃腸癌であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが高頻度変異癌であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが小児の高頻度変異癌であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載のがんを有する対象を治療するための方法を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の治療的TIL集団を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法で使用するための、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量のTIL組成物を対象に投与することを含む、がんを有する対象を治療するための方法で使用するための、上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団または上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を対象に投与する前に、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが対象に投与されるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団または上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、60mg/m/日の用量で2日間のシクロホスファミドの投与に続いて、25mg/m/日の用量で5日間のフルダラビンを投与するステップを含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、TIL細胞を患者に投与した翌日から開始する、高用量IL-2レジメンで患者を治療するステップをさらに含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、高用量IL-2レジメンが、許容範囲まで8時間毎に15分間のボーラス静脈内注入として投与される600,000または720,000IU/kgを含むように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが固形腫瘍であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、ヒト乳頭癌ウイルスによって引き起こされるがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、神経膠芽細胞腫(GBMを含む)、胃腸癌、腎癌、または腎細胞癌であるように修正された、上記の該当する前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが黒色腫、HNSCC、子宮頸癌、NSCLC、神経膠芽腫(GBMを含む)、及び胃腸癌であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが黒色腫であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんがHNSCCであるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが子宮頸癌であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんがNSCLCであるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが膠芽腫(GBMを含む)であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが胃腸癌であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが高頻度変異癌であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、がんが小児の高頻度変異癌であるように修正された、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団またはTIL組成物を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量の治療的TIL集団を対象に投与することを含む、対象におけるがんを治療する方法における上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団の使用を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、治療上有効な投与量のTIL組成物を対象に投与することを含む、対象におけるがんを治療する方法における上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物の使用を提供する。
いくつかの実施形態では、本発明は、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンを対象に投与すること、次いで治療上有効な投与量の、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団または上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物を対象に投与することと、を含む、対象におけるがんを治療する方法における、上記の前段落のうちのいずれかに記載の治療的TIL集団または上記の前段落のうちのいずれかに記載のTIL組成物の使用を提供する。
本明細書に包含される実施形態は、これから以下の実施例を参照して説明される。これらの実施例は、例示のみを目的として提供されており、本明細書に包含される本開示は、決してこれらの実施例に限定されると解釈されるべきではなく、むしろ、本明細書で提供される教示の結果として明らかになるありとあらゆる変形を包含すると解釈されるべきである。
実施例1:REP前プロセス及びREPプロセス用の培地の調製
この実施例は、非小細胞肺癌(NSCLC)を含む様々な腫瘍タイプに由来する腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の培養を含むプロトコルで使用するための組織培養培地の調製手順を説明する。この培地を、本出願及び実施例に記載のTILのうちのいずれかの調製に使用することができる。
CM1の調製
以下の試薬を冷蔵から取り出し、37℃の水浴中で温めた。(RPMI1640、ヒトAB血清、200mM L-グルタミン)。濾過される体積に適した0.2umフィルターユニットの上部に成分の各々を追加することによって、以下の表37に従ってCM1培地を調製した。4℃で保存する。
使用日に、37℃の水浴中で必要量のCM1を事前に温め、6000IU/mlのIL-2を追加した。
表38に従って必要に応じた追加の補充。
CM2の調製
調製したCM1を冷蔵庫から取り出すか、または上記のセクション7.3に従って新鮮なCM1を調製する。AIM-V(登録商標)を冷蔵庫から取り出し、調製したCM1を滅菌培地ボトル内で同等体積のAIM-V(登録商標)と混合することによって、必要な量のCM2を調製した。使用日に3000IU/mLのIL-2をCM2培地に追加した。使用日に3000IU/mLのIL-2を含む十分な量のCM2を作製した。CM2培地ボトルにその名前、調製者のイニシャル、濾過/調製日、2週間の有効期限をラベル付けし、組織培養に必要になるまで4℃で保存した。
CM3の調製
使用が必要になった日にCM3を調製した。CM3は、AIM-V(登録商標)培地と同じであり、使用日に3000IU/mLのIL-2を補充した。IL-2ストック溶液をAIM-Vのボトルまたはバッグに直接追加することによって、実験のニーズに十分な量のCM3を調製した。穏やかに振盪することによって十分に混合した。ボトルに、AIM-Vに追加した直後に「3000IU/mL IL-2」とラベル付けする。過剰なCM3が存在する場合は、培地名、調製者のイニシャル、培地を調製した日、及びその有効期限(調製後7日)でラベル付けしたボトル内で4℃で保管した。4℃で7日間保管した後、IL-2を補充した培地を廃棄した。
CM4の調製
CM4は、CM3と同じであり、2mM GlutaMAX(商標)(最終濃度)を追加で補充した。1LのCM3毎に、10mlの200mM GlutaMAX(商標)を追加した。IL-2ストック溶液及びGlutaMAX(商標)ストック溶液をAIM-Vのボトルまたはバッグに直接追加することによって、実験のニーズに十分な量のCM4を調製した。穏やかに振盪することによって十分に混合した。ボトルに、AIM-Vに追加した直後に「3000IU/nil IL-2及びGlutaMAX」とラベル付けした。過剰なCM4が存在する場合、培地名、「GlutaMAX」、及びその有効期限(調製後7日)でラベル付けしたボトル内で4°Cで保管した。4℃で7日間保管した後、IL-2を補充した培地を廃棄した。
実施例2:IL-2、IL-15、及びIL-21サイトカインカクテルの使用
この実施例は、実施例A~GのTILプロセスと組み合わせた、追加のT細胞成長因子として機能するIL-2、IL-15、及びIL-21サイトカインの使用を説明する。
本明細書に記載のプロセスを使用して、TILは、培養の開始時に、実験の一方のアームにおいてIL-2の存在下で非小細胞肺癌(NSCLC)腫瘍から、及びもう一方のアームではIL-2の代わりにIL-2、IL-15、及びIL-21の組み合わせから成長させることができる。REP前の完了時に、培養物を、拡張、表現型、機能(CD107a+及びIFN-γ)、及びにTCR Vβレパートリーについて評価した。IL-15及びIL-21は、本明細書の他の場所に記載されており、Gruijlらにおいて、IL-21は、CD27+CD28+腫瘍浸潤リンパ球の拡張を促進し、細胞傷害能が高く、調節性T細胞の側副拡張が少ない、Santegoets,S.J.,J Transl Med.,2013,11:37(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3626797/)。
結果は、IL-2、IL-15、及びIL-21処理条件でのCD4及びCD8細胞の両方で、IL-2のみの条件と比較して増強したTIL拡張(>20%)が観察できることを示し得る。IL-2単独培養物と比較して、IL-2、IL-15、及びIL-21で処理した培養物から取得されたTILには、歪んだTCR Vβレパートリーを伴う主にCD8集団への歪みがあった。IFN-γ及びCD107aは、IL-2単独で処理したTILと比較して、IL-2、IL-15、及びIL-21で処理したTILで上昇した。
実施例3:ガンマ線照射末梢単核細胞の個々のロットを適格性確認する
この実施例は、本明細書に記載の例示的な方法において同種異系フィーダー細胞として使用するためのガンマ線照射末梢単核細胞(PBMC、単核細胞またはMNCとしても知られる)の個々のロットを適格性確認するための簡略化された手順を説明する。
照射された各MNCフィーダーロットは、個々のドナーから調製した。各ロットまたはドナーは、精製された抗CD3(クローンOKT3)抗体及びインターロイキン-2(IL-2)の存在下でREP内のTILを拡張する能力について個々にスクリーニングした。さらに、フィーダー細胞の各ロットを、TILを添加せずに試験し、受けたガンマ線の線量がそれらを複製不全にするのに十分であることを確認した。
TILのREPには、ガンマ線を照射し、成長を停止させたMNCフィーダー細胞が必要である。フィーダーMNCの膜受容体は、抗CD3(クローンOKT3)抗体に結合し、REPフラスコ内のTILに架橋し、TILを刺激して拡張させる。フィーダーロットは、個々のドナーから採取した全血の白血球アフェレーシスから調製した。白血球アフェレーシス産物を、Ficoll-Hypaque上で遠心分離し、洗浄し、照射し、GMP条件下で凍結保存した。
TIL療法を受けた患者には、移植片対宿主病(GVHD)を引き起こす可能性があるため、生存可能なフィーダー細胞を注入しないことが重要である。したがって、フィーダー細胞は、細胞にガンマ線を照射することによって成長を停止させ、再培養時に二本鎖DNA切断が起こり、MNC細胞の細胞生存性が喪失する。
フィーダーロットを、2つの基準:1)共培養でTILを100倍超拡張する能力、及び2)複製不全で評価した。
フィーダーロットを、直立したT25組織培養フラスコ内で培養された2つの主要なREP前TIL株を利用して、mini-REP形式で試験した。各TIL株は、REPでの活性化に応答して増殖する能力が独特であるため、フィーダーロットを、2つの異なるTIL株に対して試験した。対照として、上記の基準を満たすことが歴史的に示されている多くの照射されたMNCフィーダー細胞を、試験ロットと並行して実行した。
1回の実験で試験されたすべてのロットが同等の試験を受けることを保証するために、同じREP前TIL株の十分なストックがすべての条件及びすべてのフィーダーロットを試験するのに利用可能であった。
試験したフィーダー細胞の各ロットに、合計6つのT25フラスコがあった:REP前TIL株#1(2フラスコ)、REP前TIL株#2(2フラスコ)、及びフィーダー対照(2フラスコ)。TIL株番号1及び番号2を含むフラスコは、フィーダーロットがTILを拡張する能力を評価した。フィーダー対照フラスコは、フィーダーロットの複製不全を評価した。
A.実験プロトコル
-2/3日目、TIL株の解凍CM2培地を調製し、37℃の水浴中で温める。3000IU/mLのIL-2を補充した40mLのCM2を調製する。使用まで保温する。IL-2を含まない20mLの予熱したCM2を、使用したTIL株の名前がラベル付けされた2本の50mLコニカルチューブの各々に入れる。LN2ストレージから2つの指定されたREP前TIL株を取り出し、バイアルを組織培養室に移した。少量の氷が残るまで、37℃の水浴内の密封されたジッパーストレージバッグ内にバイアルを入れて解凍した。
無菌トランスファーピペットを使用して、各バイアルの内容物を、調製した、ラベル付けされた50mLのコニカルチューブ中の20mLのCM2に直ちに移した。細胞を洗浄し、400×CFで5分間遠心分離するために、IL-2なしのCM2を使用して40mLにQS。上清を吸引し、3000IU/mLのIL-2で補充された5mLの温かいCM2に再懸濁した。
自動セルカウンターを使用して細胞を計数するために、少量のアリコート(20μL)を重複して取り出した。計数を記録した。計数しながら、TIL細胞を含む50mLのコニカルチューブを、加湿した37℃、5% COインキュベーターに入れ、ガス交換を可能にするためにキャップを緩めた。細胞濃度を決定し、TILを、3000IU/mLのIL-2を補充したCM2中で1×10細胞/mLに希釈した。
mini-REPの0日目まで、加湿した37℃のインキュベーターで必要な数のウェルにおいて、24ウェル組織培養プレートの1ウェル当たり2mLで培養した。混乱及び潜在的な相互汚染を避けるために、別々の24ウェル組織培養プレートで異なるTIL株を培養した。
0日目、Mini-REPを開始する試験されるフィーダーロットの数に十分なCM2培地を調製した。(例えば、一度に4つのフィーダーロットを試験するために、800mLのCM2培地を調製した)。上記で調製されたCM2の一部を分注し、それを細胞の培養のために3000IU/mLのIL-2を補充した。(例えば、一度に4つのフィーダーロットを試験するために、3000IU/mLのIL-2を含む500mLのCM2培地を調製する)。
相互汚染を防ぐために各TIL株を別々に操作し、TIL培養物を入れた24ウェルプレートをインキュベーターから取り出し、BSCに移した。
無菌トランスファーピペットまたは100~1000μLピペッター及びチップを使用して、約1mLの培地を、使用されるTILの各ウェルから取り出し、24ウェル組織培養プレートの未使用のウェルに入れる。
新鮮な無菌トランスファーピペットまたは100~1000μLピペッター及びチップを使用して、残りの培地をウェル内のTILと混合して細胞を再懸濁し、次いで細胞懸濁液を、TILロット名のラベルが付いた50mLコニカルチューブに移し、容量を記録した。
予備の培地でウェルを洗浄し、その容量を同じ50mLコニカルチューブに移した。細胞を400×CFで回転させて、細胞ペレットを収集する。培地上清を吸引除去し、3000IU/mLのIL-2を含有する2~5mLのCM2培地に細胞ペレットを再懸濁し(採取したウェルの数及びペレットのサイズに基づいて使用される容量)、容量は、1.3×10細胞/mLを超える濃度を保証するのに十分である必要がある。
血清学的ピペットを使用して、細胞懸濁液を十分に混合し、容量を記録した。自動セルカウンターを使用して細胞を計数するために、200μLを取り出した。計数しながら、TIL細胞を含む50mLのコニカルチューブを、加湿した5% CO、37℃インキュベーターに入れ、ガス交換を可能にするためにキャップを緩めた。計数を記録した。
TIL細胞を含有する50mLのコニカルチューブをインキュベーターから取り出し、3000IU/mLのIL-2で補充された温かいCM2中、1.3×10細胞/mLの濃度でそれらの細胞を再懸濁した。キャップを緩めた状態で、50mLのコニカルチューブをインキュベーターに戻した。
第2のTIL株について、上記のステップを繰り返した。
TILを実験用のT25フラスコに入れる直前に、TILを、以下の通り1:10に希釈して1.3×10細胞/mLの最終濃度にした。
MACS GMP CD3ピュア(OKT3)作用溶液を調製するOKT3のストック溶液(1mg/mL)を4℃の冷蔵庫から取り出し、BSCに入れた。mini-REPの培地では、最終濃度30ng/mLのOKT3を使用した。
実験の各T25フラスコ内の20mLに対して600ngのOKT3が必要であり、これは、20mL毎に60μLの10μg/mL溶液、または各フィーダーロットについて試験した6つのフラスコすべてで360μLに相当する。
試験した各フィーダーロットについて、400μLの1:100希釈の1mg/mL OKT3を、10μg/mLの作業濃度で作製した(例えば、4つのフィーダーロットを一度に試験する場合、1600μLの1:100希釈の1mg/mL OKT3:16μLの1mg/mL OKT3+3000IU/mLのIL-2を含む1.584mLのCM2培地を作製する)。
T25フラスコを調製するフィーダー細胞を調製する前に、各フラスコにラベルを付け、フラスコにCM2培地を充填した。フラスコを37℃の加湿した5% COインキュベーターに入れ、残りの成分を添加するのを待つ間、培地を保温した。一旦フィーダー細胞が調製されると、各フラスコ内のCM2に成分が添加される。
さらなる情報を表39に提供する。
フィーダー細胞を調製する。このプロトコルについて試験されたロット当たり78×10フィーダー細胞の最小値が必要であった。SDBBによって凍結された各1mLバイアルは、凍結時に100×10個の生細胞を有していた。液体Nストレージからの解凍時の50%の回収率を仮定すると、ロット当たり少なくとも2つの1mLバイアルのフィーダー細胞を解凍して、各REPに推定100×10個の生細胞を与えることが推奨された。あるいは、1.8mLバイアルで供給された場合、1つのバイアルだけで十分なフィーダー細胞が提供された。
フィーダー細胞を解凍する前に、試験される各フィーダーロットにIL-2を含まないおよそ50mLのCM2を予熱した。指定されたフィーダーロットバイアルをLN2ストレージから取り出し、ジッパーストレージバッグに入れ、氷上に置いた。37℃の水浴に浸すことによって、閉じたジッパーストレージバッグ内のバイアルを解凍した。バイアルをジッパーバッグから取り出し、70% EtOHでスプレーまたはワイプし、BSCに移した。
トランスファーピペットを使用して、フィーダーバイアルの内容物を、50mLのコニカルチューブ中の30mLの温かいCM2に直ちに移した。バイアルを少量のCM2で洗浄して、バイアル内の残留細胞を除去し、400×CFで5分間遠心分離した。上清を吸引し、3000IU/mLのIL-2を加えた4mLの温かいCM2に再懸濁した。自動セルカウンターを使用して細胞を計数するために、200μLを取り出した。計数を記録した。
3000IU/mLのIL-2を加えた温かいCM2中、1.3×10細胞/mLで細胞を再懸濁した。TIL細胞を1.3×10細胞/mLから1.3×10細胞/mLに希釈した。
共培養物を準備する。TIL細胞を1.3×10細胞/mLから1.3×10細胞/mLに希釈した。4.5mLのCM2培地を15mLのコニカルチューブに添加した。インキュベーターからTIL細胞を取り出し、10mLの血清ピペットを使用して十分に再懸濁した。1.3×10細胞/mLのTIL懸濁液から0.5mLの細胞を取り出し、15mLのコニカルチューブ中の4.5mLの培地に添加した。TILストックバイアルをインキュベーターに戻した。よく混ぜた。第2のTIL株に対して繰り返した。
単一フィーダーロット用に予熱した培地を入れたフラスコを、インキュベーターからBSCに移した。1mLのピペットチップで数回上下にピペッティングすることによってフィーダー細胞を混合し、そのフィーダーロットの各フラスコに1mL(1.3×10細胞)を移した。60μLのOKT3作用ストック(10μg/mL)を各フラスコに追加した。2つの対照フラスコをインキュベーターに戻した。
各TILロットの1mL(1.3×10)を、対応するラベルの付いたT25フラスコに移した。フラスコをインキュベーターに戻し、直立させてインキュベートした。5日目まで乱さなかった。試験したすべてのフィーダーロットについて、この手順を繰り返した。
5日目、培地変更3000IU/mLのIL-2を含むCM2を調製した。各フラスコに10mLが必要である。10mLピペットを使用して、3000IU/mLのIL-2を含む10mLの温かいCM2を各フラスコに移した。フラスコをインキュベーターに戻し、7日目まで直立させてインキュベートした。試験したすべてのフィーダーロットについて繰り返した。
7日目、採取インキュベーターからフラスコを取り出し、BSCに移し、フラスコの底部の細胞層を乱さないように注意する。フラスコの底部で成長する細胞を乱すことなく、各試験フラスコから10mLの培地を取り出し、対照フラスコの各々から15mLの培地を取り出した。
10mLの血清ピペットを使用して、残りの培地に細胞を再懸濁し、よく混合して細胞の塊をすべて破壊した。ピペッティングすることによって細胞懸濁液を完全に混合した後、細胞計数のために200μLを取り出した。自動セルカウンター装置とともに適切な標準操作手順を使用して、TILを計数した。7日目に計数を記録した。試験したすべてのフィーダーロットについて、この手順を繰り返した。
フィーダー対照フラスコは、複製不全について評価し、TILを含むフラスコは、0日目からの倍率拡張について評価した。
7日目、フィーダー対照フラスコの14日目までの継続フィーダー対照フラスコの7日目の計数を完了した後、3000IU/mLのIL-2を含む15mLの新鮮なCM2培地を対照フラスコの各々に追加した。対照フラスコをインキュベーターに戻し、14日目まで直立位置でインキュベートした。
14日目、フィーダー対照フラスコの長期非増殖インキュベーターからフラスコを取り出し、BSCに移し、フラスコの底部の細胞層を乱さないように注意した。フラスコの底部で成長する細胞を乱すことなく、各対照フラスコからおよそ17mLの培地を取り出した。5mLの血清ピペットを使用して、残りの培地に細胞を再懸濁し、よく混合して細胞の塊をすべて破壊した。各フラスコについて、容量を記録した。
ピペッティングすることによって細胞懸濁液を完全に混合した後、細胞計数のために200μLを取り出した。TILは、自動セルカウンター装置と併せて適切な標準操作手順を使用して計数し、計数を記録した。試験したすべてのフィーダーロットについて、この手順を繰り返した。
B.結果及び承認基準プロトコル
結果ガンマ線照射の線量は、フィーダー細胞を複製不全にするのに十分であった。すべてのロットは、評価基準を満たすことが予想され、また0日目と比較して、REP培養の7日目に残っているフィーダー細胞の総有効数の低減を示した。すべてのフィーダーロットは、REP培養の7日目までのTIL成長の100倍拡張の評価基準を満たすことが予想された。フィーダー対照フラスコの14日目の計数は、7日目に見られた非増殖傾向を継続すると予想された。
承認基準フィーダー細胞の各ロットについて試験された各複製TIL株について、以下の承認基準が満たされた。承認基準は、以下の表40に示すように、2倍であった。
30ng/mLのOKT3抗体及び3000IU/mLのIL-2の存在下で培養した場合に、MNCフィーダー細胞の複製を不全にするのに十分な放射線量を評価した。複製不全は、REPの7日目及び14日目の自動細胞計数によって決定された総生細胞数(TVC)によって評価した。
承認基準は、「成長なし」であり、これは、REPの0日目に培養された最初の生細胞数から7日目及び14日目に総生細胞数が増加していないことを意味する。
フィーダー細胞がTIL拡張をサポートする能力を評価した。TIL成長は、REPの0日目の培養開始からREPの7日目までの生細胞の倍率拡張の観点から測定された。自動細胞計数によって評価されるように、7日目に、TIL培養物は最低100倍の拡張を達成した(すなわち、REPの0日目に培養された生TIL細胞の総数の100倍超)。
承認基準を満たさないMNCフィーダーロットの偶発性試験MNCフィーダーロットが上で概説された承認基準のうちのいずれかを満たさなかった場合は、以下のステップを実行してロットを再試験し、単純な実験者エラーを原因として除外する。
ロットの衛星試験バイアルが2つ以上残っている場合は、ロットを再試験した。ロットの衛星試験バイアルが1つ残っているか、まったく残っていない場合、上記の承認基準に従ってロットは失敗であった。
適格となるには、問題のロット及び対照ロットが、上記の承認基準を達成する必要があった。これらの基準を満たすと、ロットは使用のために放出される。
実施例4:IL-2ストック溶液(CELLGENIX)の調製
この実施例は、精製されて凍結乾燥された組換えヒトインターロイキン-2を、rhIL-2の使用を含むものを含む、本出願及び実施例に記載されるものすべてを含む、さらなる組織培養プロトコルでの使用に好適なストック試料に溶解するプロセスを説明する。
手順
0.2%酢酸溶液(HAc)を調製した。29mLの滅菌水を、50mLのコニカルチューブに移した。50mLのコニカルチューブに1mLの1N酢酸を追加した。チューブを2~3回反転させながら十分に混合した。Steriflipフィルターを使用した濾過によってHAc溶液を滅菌した。
PBS中の1% HSAを調製する。4mLの25%HSAストック溶液を、150mLの滅菌フィルターユニット内の96mLのPBSに追加した。溶液を濾過した。4℃で保管した。調製したrhIL-2の各バイアルについて、フォームに記入する。
rhIL-2ストック溶液を調製した(最終濃度6×10IU/mL)。rhIL-2の各ロットは異なり、必要な情報は、以下のような製造業者の分析証明書(COA)に見出された:1)バイアル当たりのrhIL-2の質量(mg)、2)rhIL-2の比活性(IU/mg)、及び3)推奨0.2% HAc再構成体積(mL)。
以下の等式を使用して、rhIL-2ロットに必要な1%HSAの体積を計算した。
例えば、CellGenixのrhIL-2ロット10200121 COAによると、1mgバイアルの比活性は、25×10IU/mgである。rhIL-2を2mLの0.2%HAc中で再構成することが推奨される。
IL-2バイアルのゴム栓をアルコールワイプで拭いた。3mLシリンジに取り付けた16G針を使用して、推奨体積の0.2%HAcをバイアルに注入した。針を抜くときに栓が外れないように注意した。バイアルを3回反転させ、すべての粉末が溶解するまで回転させた。栓を慎重に取り外し、アルコールワイプ上に置いた。計算された容量の1% HSAをバイアルに添加した。
rhIL-2溶液の保管。短期保管(72時間未満)の場合、4℃でバイアルを保管した。長期保管(72時間超)の場合、バイアルをより小さい体積に等分し、使用の準備が整うまで-20℃でクライオバイアル内で保管した。凍結/解凍サイクルを回避した。調製日から6ヶ月後に有効期限が切れた。Rh-IL-2ラベルに、ベンダー及びカタログ番号、ロット番号、有効期限、オペレーターのイニシャル、濃度、ならびにアリコート体積を含めた。
実施例5:凍結保存プロセス
この実施例では、CryoMed制御速度冷凍庫、モデル7454(Thermo Scientific)を使用して、本明細書に記載の手順で調製したTILの凍結保存プロセス方法について説明する。
使用した機器は以下の通りであった:アルミニウムカセットホルダーラック(CS750フリーザーバッグに対応)、750mLバッグ用凍結保存カセット、低圧(22psi)液体窒素タンク、冷蔵庫、熱電対センサー(バッグ用リボンタイプ)、及びCryoStore CS750冷凍バッグ(OriGen Scientific)。
凍結プロセスは、核形成から-20℃まで0.5℃の速度、及び-80℃の終了温度まで毎分1℃の冷却速度を提供する。プログラムパラメータは、以下の通りである:ステップ1-4℃で待つ、ステップ2:-4℃まで1.0℃/分(試料温度)、ステップ3:-45℃まで20.0℃/分(チャンバ温度)、ステップ4:-10.0℃まで10.0℃/分(チャンバー温度)、ステップ5:-20℃まで0.5℃/分(チャンバー温度)、及びステップ6:-80℃まで1.0℃/分(試料温度)。
実施例6:合成培地を用いた腫瘍拡張プロセス
上記で開示されるプロセスは、CM1培地及びCM2培地を、合成培地(例えば、CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion SFM、ThermoFisher、例えば、DM1及びDM2を含む)で置き換えることによって行われ得る。
実施例7:抗PD-1抗体によるNSCLC治療
患者集団:
治療ナイーブのNSCLCまたは化学療法後であるが抗PD-1/PD-L1ナイーブ
治療スケジュール:
腫瘍断片は、最大4用量の抗PD-1/PD-L1で治療し、原発性不応性の患者を、凍結保存され、即時進行の際に使用する準備ができているTIL製品で治療する。原発性不応性の患者は、2用量後に進行した可能性がある。
再発患者はまた、進行時に治療することもできる(タイミングは、数ヶ月から数年後まで異なる場合がある)。
最大6用量の全強IL-2。
前述の同じ製造順列でさらに検討する患者集団:
●治療ナイーブのNSCLC、または化学療法後であるが抗PD-1/PD-L1ナイーブ
●治療ナイーブのNSCLC、または化学療法後であるが、低いPD-L1の発現を有する抗PD-1/PD-L1ナイーブ
●治療ナイーブのNSCLC、または化学療法後であるが、低いPD-L1の発現を有する、及び/またはベースラインで巨大腫瘤病変を有する抗PD-1/PD-L1ナイーブ(例えば、横断面または冠状面のいずれかで測定された最大腫瘍径が7cmを超えるか、またはCTで短軸径が20mm以上の膨れたリンパ節が巨大腫瘤として定義された場合、巨大腫瘤病変が示される。例えば、参照により本明細書に組み込まれる、Samejima,J.,Japanese Journal of Clinical Oncology,45(11):1050-10541 2015を参照)。
実施例8:凍結保存TIL細胞療法の例示的GEN2産生
この実施例は、Iovance Biotherapeutics,Inc.のcGMP製造を説明する。現在の適正組織基準及び現在の適正製造基準に従った、G-REXフラスコ内のTIL細胞療法プロセス。この実施例は、現在の適正組織基準及び現在の適正製造基準に従った、G-REXフラスコ内のTIL細胞療法プロセスの例示的なcGMP製造を説明する。
0日目のCM1培地の調製BSC内で、試薬をRPMI 1640培地ボトルに追加した。ボトル当たり追加された以下の試薬を追加した:不活化ヒトAB血清(100.0mL)、GlutaMax(商標)(10.0mL)、硫酸ゲンタマイシン、50mg/mL(1.0mL)、2-メルカプトエタノール(1.0mL)を加熱する
BSCから不要な材料を取り出した。BSCから培地試薬を抜き取り、配合された洗浄培地の調製のために硫酸ゲンタマイシン及びHBSSをBSCの中に残した。
IL-2アリコートを解凍した。すべての氷が融解するまで、1つの1.1mLのIL-2アリコート(6×10IU/mL)(BR71424)を解凍した。IL-2:ロット番号及び有効期限を記録した。
IL-2ストック溶液を培地に移した。BSC内で、1.0mLのIL-2ストック溶液を、調製されたCM1の0日目培地ボトルに移した。CM1の0日目培地1ボトル及びIL-2(6×106IU/mL)1.0mLを追加した。
G-REX100MCSをBSCの中に通過させた。無菌的にG-REX100MCS(W3013130)をBSCの中に通過させた。
すべての完全なCM1の0日目培地をG-REX100MCSフラスコにポンプで注入した。組織断片円錐形またはGRex100MCS。
0日目の腫瘍洗浄培地の調製BSC内で、5.0mLのゲンタマイシン(W3009832またはW3012735)を1本の500mLのHBSS培地(W3013128)ボトルに追加した。ボトル当たりの追加:HBSS(500.0mL)、硫酸ゲンタマイシン、50mg/mL(5.0mL)。1Lの0.22ミクロンフィルターユニット(W1218810)をとおして調製されたゲンタマイシンを含有するHBSSを濾過した。
0日目の腫瘍処理腫瘍検体を取得し、即時に処理のために2~8℃における部屋に移した。腫瘍洗浄培地を等分した。腫瘍洗浄1は、8インチ鉗子(W3009771)を使用して行う。腫瘍を検体ボトルから取り出し、調製した「洗浄1」皿に移す。この後、腫瘍洗浄2及び腫瘍洗浄3が続く。腫瘍を測定し、評価した。腫瘍領域全体の30%未満が壊死及び/または脂肪組織であることが観察されたかどうかを評価した。該当する場合、クリーンアップ解剖を行う。腫瘍が大きく、外部の組織の30%未満が壊死/脂肪性であることが観察された場合、メス及び/または鉗子の組み合わせを使用して、腫瘍の内側構造を温存しながら壊死/脂肪組織を除去することによって、「クリーンアップ解剖」を行った。腫瘍を切除した。メス及び/または鉗子の組み合わせを使用して、腫瘍検体を均等で適切なサイズの断片(最大6つの中間断片)に切断した。中間腫瘍断片を移した。腫瘍断片を、およそ3×3×3mmのサイズの小片に切除した。乾燥を防止するために中間断片を保存した。中間断片の解剖を繰り返した。収集された切片の数を決定した。望ましい組織が残っている場合、「好ましい中間断片」6ウェルプレートから追加の好ましい腫瘍片を選択し、最大50片のために液滴を充填した。
コニカルチューブを準備した。腫瘍片を50mLのコニカルチューブに移した。G-REX100MCSのためのBSCを準備した。インキュベーターからG-REX100MCSを取り出した。無菌的にG-REX100MCSフラスコをBSCの中に通過させた。腫瘍断片をG-REX100MCSフラスコに追加した。切片を均等に分配した。
以下のパラメータにおいてG-REX100MCSをインキュベートした:G-REXフラスコをインキュベートした:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5%CO。計算:培養の時間、下限=培養の時間+252時間、上限=培養の時間+276時間。
プロセスが完了した後、いずれの残りの温められた培地も廃棄し、IL-2のアリコートを解凍した。
11日目-培地の調製インキュベーターを監視した。インキュベーターパラメータ:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、CO2パーセンテージ:5.0±1.5%CO2。
3本の1000mLのRPMI 1640培地(W3013112)ボトル及び3本の1000mLのAIM-V(W3009501)ボトルを、インキュベーター内で30分間以上温めた。インキュベーターからRPMI 1640培地を取り出した。RPMI 1640培地を調製した。培地を濾過した。3つのIL-2の1.1mLのアリコート(6×106IU/mL)(BR71424)を解凍した。インキュベーターからAIM-V培地を取り出した。IL-2をAIM-Vに追加した。10LのLabtainerバッグ及びリピータポンプ移送セットを、BSCの中に無菌的に移した。
10LのLabtainer培地バッグを準備した。Baxaポンプを準備した。10LのLabtainer培地バッグを準備した。培地を10LのLabtainerにポンプで注入した。Labtainerバッグからポンプマティックを取り出した。
培地を混合した。バッグを穏やかにマッサージして混合した。試料計画に従って培地を試料採取した。20.0mLの培地を取り出し、50mLのコニカルチューブに入れた。細胞計数希釈管を準備した。BSCに、「細胞計数希釈液用」及びロット番号でラベル付けされた4.5mLのAIM-V培地を、4本の15mLコニカルチューブに追加した。試薬をBSCから2~8℃に移した。1L移送パックを準備した。(プロセス注記5.11に従って)BSC溶接の外側で、「完全なCM2の11日目培地」バッグに取り付けられた移送セットへの1L移送パックを準備した。フィーダー細胞移送パックを準備した。完全なCM2の11日目培地をインキュベートした。
11日目-TIL採取前処理表。インキュベーターパラメータ:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5%CO。インキュベーターからG-REX100MCSを取り出した。300mL移送パックを準備した。移送パックをG-REX100MCSに溶接した。
TIL採取及びTIL採取の開始のためにフラスコを準備する。TILが採取された。GatheRexを使用して、血液フィルターを介して細胞懸濁液を300mLの移送パックに移した。付着した細胞について膜を点検した。
フラスコ膜をすすいだ。G-REX100MCS上のクランプを閉じた。すべてのクランプが閉じられていることを確実にした。TIL及び「上清」移送パックを熱融着した。TIL懸濁液の体積を計算した。試料採取のために上清移送パックを準備した。
Bac-T試料を引き出した。BSC内で、1L「上清」移送パックからおよそ20.0mLの上清を引き上げ、無菌50mLコニカルチューブに分注する。
試料計画に従ってBacTを接種した。適切なサイズのシリンジを使用して調製されたBacTとラベル付けされた50mLコニカルから1.0mLの試料を取り出し、嫌気性ボトルに接種した。
TILをインキュベートした。必要とされるまで、TIL移送パックをインキュベーターに入れた。細胞計数及び計算を行った。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。生存率÷2。生細胞濃度÷2。計数の上限及び下限を決定した。下限:生細胞濃度の平均×0.9。上限:生細胞濃度の平均×1.1。許容限界内の両方の計数を確認した。行われた4つすべての計数から平均生細胞濃度を決定した。
TIL懸濁液の調整された体積:細胞計数試料を取り出した後のTIL懸濁液の調整された体積を計算する。総TIL細胞体積(A)。取り出された細胞計数試料の体積(4.0mL)(B)調整された総TIL細胞体積C=A-B。
総生TIL細胞を計算した。平均生細胞濃度*:総体積、総生細胞:C=AxB。
フローサイトメトリーのための計算:総生TIL細胞数が、4.0×10個以上であった場合、フローサイトメトリー試料のために1.0×10個の細胞を取得するための体積を計算した。
フローサイトメトリーに必要とされる総生細胞:1.0×10個の細胞。フローサイトメトリーに必要とされる細胞の体積:生細胞濃度を1.0×10個の細胞Aで割ったもの。
2.0×10個の生細胞に等しいTIL懸濁液の体積を計算した。必要に応じて、取り出すTIL細胞の過剰体積を計算し、過剰なTILを取り出し、必要に応じてTILをインキュベーターに入れた。必要に応じて、取り出された全過剰TILを計算した。
凍結のための標的細胞濃度が1.0×10細胞/mLである過剰なTIL細胞に追加するCS-10培地の量を計算した。必要に応じて、過剰なTILを遠心分離した。コニカルチューブを観察し、CS-10を追加した。
バイアルを充填した。1.0mLの細胞懸濁液を、適切なサイズの凍結バイアルに等分した。残留体積を適切なサイズのクライオバイアルに等分した。体積が≦0.5mLである場合、体積が0.5mLになるまでCS10をバイアルに追加する。
凍結保存のための1×10個の細胞を取得するために必要とされる細胞の体積を計算した。凍結保存のために試料を取り出した。TILをインキュベーターに入れた。
試料の凍結保存。コニカルチューブを観察し、CS-10をゆっくりと追加し、追加された0.5mLのCS10の体積を記録した。
11日目-フィーダー細胞フィーダー細胞を取得した。LN2冷凍庫から少なくとも2つの異なるロット番号を伴うフィーダー細胞の3つのバッグを取得した。解凍する準備が整うまで、細胞をドライアイス上で保管した。水浴またはcryothermを準備した。37.0±2.0℃の水浴またはcytothermにおいて約3~5分間、または氷が消滅するまで、フィーダー細胞を解凍した。インキュベーターから培地を取り出した。解凍されたフィーダー細胞をプールした。フィーダー細胞を移送パックに追加した。シリンジから移送パックにフィーダー細胞を分注した。プールされたフィーダー細胞を混合し、移送パックをラベル付けした。
移送パック内のフィーダー細胞懸濁液の総体積を計算した。細胞計数試料を取り出した。各試料に別個の3mLシリンジを使用して、不要注入ポートを使用してフィーダー細胞懸濁液移送パックから4×1.0mLの細胞計数試料を引き出した。各試料をラベル付けされたクライオバイアルに等分した。細胞計数を行い、増倍率を決定し、プロトコルを選択し、増倍率を入力した。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定し、限界内で確認した。
フィーダー細胞懸濁液の調整された体積。細胞計数試料を取り出した後のフィーダー細胞懸濁液の調整された体積を計算した。総生フィーダー細胞を計算した。必要に応じて追加のフィーダー細胞を取得した。必要に応じて追加のフィーダー細胞を解凍した。第4のフィーダー細胞バッグをジップトップバッグに入れ、37.0±2.0℃の水浴またはcytotherm内で約3~5分間解凍し、追加のフィーダー細胞をプールした。体積を測定した。シリンジ内のフィーダー細胞の体積を測定し、以下に記録した(B)。フィーダー細胞の新しい総体積を計算した。フィーダー細胞を移送パックに追加した。
必要に応じて希釈液を調製し、4.5mLのAIM-V培地を4本の15mLコニカルチューブに追加した。細胞計数を準備した。各試料に対して別個の3mLシリンジを使用して、不要注入ポートを使用して、フィーダー細胞懸濁液移送パックから4×1.0mLの細胞計数試料を取り出した。細胞計数及び計算を行った。行われた4つすべての計数から平均生細胞濃度を決定した。フィーダー細胞懸濁液の体積を調整し、細胞計数試料を取り出した後のフィーダー細胞懸濁液の調整された体積を計算した。4.0mLを差し引いた総フィーダー細胞体積が取り出された。5×10個の生フィーダー細胞を取得するために必要とされたフィーダー細胞懸濁液の体積を計算した。過剰なフィーダー細胞体積を計算した。取り出す過剰なフィーダー細胞の体積を計算した。過剰なフィーダー細胞を取り出した。
1.0mLシリンジ及び16G針を使用して、0.15mLのOKT3を引き上げ、OKT3を追加した。フィーダー細胞懸濁液移送パックを熱融着した。
11日目 G-REX充填及びシード設定G-REX500MCS。「完全なCM2の11日目培地」をインキュベーターから取り出し、培地をG-REX500MCSにポンプで注入した。4.5Lの培地をG-REX500MCSにポンプで注入し、フラスコ上にマークされたラインまで充填した。必要に応じてフラスコを熱融着し、インキュベートした。フィーダー細胞の懸濁液移送パックを、G-REX500MCSに溶接した。フィーダー細胞をG-REX500MCSに追加した。熱融着した。TIL懸濁液移送パックをフラスコに溶接した。TILをG-REX500MCSに追加した。熱融着した。G-REX500MCSを37.0±2.0℃でインキュベートした。CO2パーセンテージ:5.0±1.5%CO2。
インキュベーション時間帯を計算した。16日目にインキュベーターからG-REX500MCSを取り出すための適切な時間を決定するための計算を行った。下限:インキュベーションの時間+108時間。上限:インキュベーションの時間132時間。
11日目 過剰TILの凍結保存。該当:過剰TILバイアルを凍結させた。凍結前にCRFが設定されていることを検証した。凍結保存を行った。バイアルを速度制御された冷凍庫から適切な保管場所に移した。凍結の完了時に、バイアルをCRFから適切な保管容器に移した。バイアルを適切な保管場所に移した。LN2における保管場所を記録した。
16日目 培地の調製。AIM-V培地を事前に温めた。培地バッグ1、2、及び3について培地が温められた時間を計算した。すべてのバッグが12~24時間の持続時間にわたって温められていることを確実にした。上清用の10LのLabtainerを設定した。ルアーコネクタを使用して、流体ポンプ移送セットのより大きな直径の端部を10LのLabtainerバッグのメス型ポートのうちの1つに取り付けた。上清用の10LのLabtainerを設定し、ラベル付けした。上清用の10LのLabtainerを設定した。BSCから取り出す前に、すべてのクランプが閉じられていることを確実にした。注記:上清バッグは、培地調製と同時に行われ得るTIL採取中に使用された。
IL-2を解凍した。すべての氷が融解するまで、CTS AIM V培地の1バッグ当たりIL-2(6×10IU/mL)(BR71424)の5×1.1mLアリコートを解凍した。100.0mLのGlutaMax(商標)を等分した。IL-2をGlutaMax(商標)に追加した。配合用のCTS AIM V培地バッグを準備した。配合用のCTS AIM V培地バッグを準備した。ステージBaxaポンプ。培地を配合することを準備した。GlutaMax(商標)+IL-2をバッグにポンプで注入した。パラメータを監視した:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5% CO。完全なCM4の16日目培地を温めた。希釈液を調製した。
16日目 REP分割。インキュベーターパラメータを監視した:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5%CO。インキュベーターからG-REX500MCSを取り出した。1Lの移送パックを準備し、TIL懸濁液としてラベル付けし、1Lの重量を量った。
G-REX500MCSの減容。約4.5Lの培養上清をG-REX500MCSから10LのLabtainerに移した。
TIL採取用のフラスコを準備した。上清を取り出した後に、赤色ラインへのすべてのクランプを閉じた。
TIL採取の開始。フラスコを激しく叩き、培地を旋回させて細胞を解放し、すべての細胞が引き離されていることを確実にする。
TIL採取。TIL懸濁液移送パックにつながるすべてのクランプを解放した。GatheRexを使用して、細胞懸濁液をTIL懸濁液移送パックの中に移した。注記:すべての細胞及び培地が収集されるまで、傾斜した縁を必ず維持すること。付着した細胞について膜を点検した。フラスコ膜をすすいだ。G-REX500MCS上のクランプを閉じた。TILを含む移送パックを熱融着した。上清を含む10LのLabtainerを熱融着した。細胞懸濁液を伴う移送パックの重量を記録し、細胞懸濁液を計算した。試料を取り出すための移送パックを準備した。細胞上清から試験試料を取り出した。
無菌性及びBacT試験試料採取。調製したBacTラベル付けされた15mLのコニカルから1.0mLの試料を取り出した。細胞計数試料を取り出した。BSC内で、各試料に別個の3mLシリンジを使用して、「TIL懸濁液」移送パックから4×1.0mLの細胞計数試料を取り出した。
マイコプラズマ試料を取り出した。3mLシリンジを使用して、TIL懸濁液移送パックから1.0mLを取り出し、調製された「マイコプラズマ希釈液」とラベル付けされた15mLコニカルチューブに入れた。
播種用の移送パックを準備した。TILをインキュベーターに入れた。細胞懸濁液をBSCから取り出し、必要とされるまでインキュベーターに入れた。細胞計数及び計算を行った。最初に、0.5mLの細胞懸濁液を調製された4.5mLのAIM-V培地に追加することによって、細胞計数試料を希釈し、1:10希釈液を生じた。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定した。注記:希釈は、細胞の期待濃度に基づいて調整され得る。行われた4つすべての計数から平均生細胞濃度を決定した。TIL懸濁液の調整された体積。細胞計数試料を取り出した後のTIL懸濁液の調整された体積を計算した。5.0mLを差し引いた総TIL細胞体積が試験のために取り出された。
総生TIL細胞を計算した。播種するフラスコの総数を計算した。注記:播種するG-REX500MCSフラスコの最大数は5であった。播種するフラスコの計算された数が5つを超えた場合、5つのみが利用可能な細胞懸濁液の体積全体を使用して播種された。
二次培養用のフラスコの数を計算した。準備されたバッグに加えて必要とされる培地バッグの数を計算した。計算されたように必要とされる2つのG-REX-500Mフラスコ毎に「CM4の16日目培地」の1つの10Lバッグを準備した。追加の培地が調製され、温められている間に、続けて第1のGREX-500Mフラスコ(複数可)を播種した。計算された数の決定された追加の培地バッグを調製し、温めた。G-REX500MCSを充填した。培地をポンプで注入するように準備し、4.5Lの培地をG-REX500MCSにポンプで注入した。熱融着した。充填を繰り返した。フラスコをインキュベートした。新しいG-REX500MCSフラスコに追加するTIL懸濁液の標的体積を計算した。フラスコの計算された数が5つを超える場合、5つのみが細胞懸濁液の体積全体を使用して播種されるであろう。播種用のフラスコを準備した。インキュベーターからG-REX500MCSを取り出した。ポンプで注入するためのG-REX500MCSを準備した。大型フィルターラインを除くすべてのクランプを閉じた。インキュベーターからTILを取り出した。播種用の細胞懸濁液を調製した。(プロセス注記5.11に従って)「TIL懸濁液」移送パックをポンプ入口ラインに滅菌溶接した。TIL懸濁液バッグを秤の上に置いた。
フラスコにTIL懸濁液を播種した。計算されたTIL懸濁液の体積をフラスコにポンプで注入した。熱融着した。残りのフラスコを充填した。
インキュベーターを監視した。インキュベーターパラメータ:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、COパーセンテージ:5.0±1.5%CO。フラスコをインキュベートした。
22日目にインキュベーターからG-REX500MCSを取り出す時間範囲を決定した。
22日目 洗浄緩衝液の調製。10LのLabtainerバッグを準備した。BSC内で、ルアー接続を介して4インチ血漿移送セットを10LのLabtainerバッグに取り付けた。10LのLabtainerバッグを準備した。BSCから外に移す前に、すべてのクランプを閉じた。注記:採取される2つのG-REX500MCSフラスコ毎に、1つの10L Labtainerバッグを準備した。Plasmalyteを3000mLバッグにポンプで注入し、ポンプを反転させてバッグの位置を操作することによって、3000mLのOrigenバッグから空気を除去した。ヒトアルブミン25%を3000mLのバッグに追加した。120.0mLの最終体積のヒトアルブミン25%を取得する。
IL-2希釈液を調製した。10mLシリンジを使用して、LOVO洗浄緩衝液バッグ上の無針注入ポートを使用して、5.0mLのLOVO洗浄緩衝液を取り出した。LOVO洗浄緩衝液を50mLのコニカルチューブに分注した。
等分されたCRFブランクバッグLOVO洗浄緩衝液。100mLのシリンジを使用して、無針注入ポートから70.0mLのLOVO洗浄緩衝液を引き上げた。
すべての氷が融解するまで、1つの1.1mLのIL-2(6×106IU/mL))を解凍した。50μLのIL-2ストック(6×10IU/mL)を「IL-2希釈液」とラベル付けされた50mLのコニカルチューブに追加した。
凍結保存調製。5つのクライオカセットを2~8℃に置き、最終製品の凍結保存のためにそれらを前調整した。
細胞計数希釈液を調製した。BSC内で、ロット番号及び「細胞計数希釈液用」でラベル付けされた4.5mLのAIM-V培地を、4本の別個の15mLコニカルチューブに追加した。細胞計数を準備した。4つのクライオバイアルをバイアル番号(1~4)でラベル付けした。使用されるBSCの下でバイアルを保存した。
22日目 TIL採取インキュベーターを監視した。インキュベーターパラメータ温度LEDディスプレイ:37±2.0°C、CO2パーセンテージ:5%±1.5%.インキュベーターからG-REX500MCSフラスコを取り外した。TIL収集バッグを準備し、ラベル付けした。余分な接続を密封した。減容:約4.5Lの上清をG-REX500MCSから上清バッグに移した。
TIL採取用のフラスコを準備した。TILの収集を開始した。フラスコを激しく叩き、培地旋回させて細胞を解放した。すべての細胞が引き離されていることを確実にした。TILの収集を開始した。TIL懸濁液収集バッグにつながるすべてのクランプを解放した。TIL採取。GatheRexを使用して、TIL懸濁液を3000mLの収集バッグに移した。付着した細胞について膜を点検した。フラスコ膜をすすいだ。G-Rex500MCS上のクランプを閉鎖し、すべてのクランプが閉鎖していることを確実にした。細胞懸濁液をLOVOソースバッグの中に移した。すべてのクランプを閉じた。熱融着した。4×1.0mLの細胞計数試料を取り出した。
細胞計数を行った。NC-200及びプロセス注記5.14を利用して、細胞計数及び計算を行った。最初に、0.5mLの細胞懸濁液を調製された4.5mLのAIM-V培地に追加することによって、細胞計数試料を希釈した。これは、1:10希釈液を生じた。行われた細胞計数の平均生存率、生細胞濃度、及び総有核細胞濃度を決定した。計数の上限及び下限を決定した。行われた細胞計数の平均生存率、生細胞濃度、及び総有核細胞濃度を決定した。LOVOソースバッグの重量を量った。総生TIL細胞を計算した。総有核細胞を計算した。
マイコプラズマ希釈液を調製した。ルアー試料ポートを介して1つの上清バッグから10.0mLを取り出し、15mLコニカルに入れた。
「TIL G-REX採取」プロトコルを行い、最終製品の標的体積を決定した。使い捨てキットを装填した。濾液バッグを取り出した。濾液容量を入力した。濾液容器をベンチトップの上に置いた。PlasmaLyteを取り付けた。PlasmaLyteが取り付けられていることを検証し、PlasmaLyteが動いていることを観察した。ソース容器をチューブに取り付け、ソース容器が取り付けられていることを検証した。PlasmaLyteが動いていることを確認した。
最終製剤及び充填。標的体積/バッグの計算。ブランクバッグを配合するためのCS-10及びLOVO洗浄緩衝液の体積を計算した。CRFブランクを調製した。
最終製品に追加するIL-2の体積を計算した。所望される最終IL-2濃度(IU/mL)-300IU/mL。IL-2作業ストック:6×10IU/mL.接続装置を組み立てた。4S-4M60をCC2細胞接続に滅菌溶接した。CS750クライオバッグを準備したハーネスに滅菌溶接した。CS-10バッグを4S-4M60のスパイクに溶接した。IL-2とともにTIL調製した。適切なサイズのシリンジを使用して、「IL-2 6×10」アリコートから決定されたIL-2の量を取り出した。配合されたTILバッグをラベル付けした。配合されたTILバッグを装置に追加した。CS10を追加した。シリンジを交換した。約10mLの空気を100mLのシリンジに引き込み、装置上の60mLシリンジを交換した。CS10を追加した。CS-750バッグを準備した。細胞を分注した。
最終製品バッグから空気を除去し、保持液を得た。最後の最終製品バッグが充填されると、すべてのクランプを閉じた。10mLの空気を新しい100mLシリンジに引き込み、装置のシリンジを交換する。保持液を50mLコニカルチューブに分注し、管を「保持液」及びロット番号としてラベル付けした。各バッグについて空気除去ステップを繰り返した。
目視検査を含み、凍結保存のための最終製品を調製した。凍結保存までクライオバッグを低温パック上で、または2~8℃で保持した。
細胞計数試料を取り出した。適切なサイズのピペットを使用して、2.0mLの保持液を取り出し、細胞計数に使用されるように15mLコニカルチューブに入れる。細胞計数及び計算を行った。注記:1つだけの試料を適切な希釈に希釈し、希釈が十分であることを検証した。追加の試料を適切な希釈倍率に希釈し、計数を進めた。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定した。注記:希釈は、細胞の期待濃度に基づいて調整され得る。生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定した。IFN-γを計算した。最終製品バッグを熱融着した。
以下の例示的試料計画に従って試料をラベル付けし、収集した。
無菌性及びBacT試験。試験試料採取。BSC内で、適切なサイズのシリンジを使用して収集された保持細胞懸濁液から1.0mLの試料を取り出し、嫌気性ボトルに接種する。好気性ボトルについて上記を繰り返す。
最終産物の凍結保存。制御速度冷凍庫(CRF)を準備した。CRFが設定されていることを検証した。CRFプローブを設定した。最終製品及び試料をCRFに入れた。4℃±1.5℃に達し、CRF実行を進めるために必要な時間を決定した。CRFが完了し、保管された。実行の完了後にCRFを停止させた。カセット及びバイアルをCRFから取り出した。保存のためにカセット及びバイアルを蒸気相LN2に移した。保管場所を記録した。
最終医薬品の後処理及び分析には、以下の試験が含まれた:(22日目)フローサイトメトリーによる22日目REPのCD3+細胞の決定、(22日目)グラム染色法(GMP)、(22日目)ゲルクロットLALアッセイ(GMP)による細菌内毒素試験、(16日目)BacT滅菌アッセイ(GMP)、(16日目)TD-PCRによるマイコプラズマDNA検出(GMP)、許容される外観属性、(22日目)BacT滅菌アッセイ(GMP)(22日目)、(22日目)IFN-ガンマアッセイ。本明細書に記載の他の効力アッセイもまた、TIL製品を分析するために用いられる。
実施例9:GEN3拡張プラットフォームの例示的な実施形態
0日目
腫瘍洗浄培地を調製した。培地を開始前に温めた。5mLのゲンタマイシン(50mg/mL)を500mLボトルのHBSSに添加した。5mLの腫瘍洗浄培地を、OKT3希釈に使用する15mLのコニカルチューブに添加した。フィーダー細胞バッグを調製した。フィーダー細胞をフィーダー細胞バッグに無菌で移し、使用するまで37℃で保管するか、または凍結させた。37℃の場合、フィーダー細胞をカウントした。凍結した場合は、解凍した後、フィーダー細胞をカウントした。
フィーダー細胞濃度の最適範囲は、5×10~5×10細胞/mLである。4.5mLのAIM-Vを含む4つのコニカルチューブを準備した。各細胞計数について0.5mLの細胞画分を追加した。総生フィーダー細胞数が1×10細胞以上であった場合、進んでフィーダー細胞濃度を調整した。フィーダー細胞の体積を計算し、第1のフィーダー細胞バッグから取り出して、1×10細胞を第2のフィーダー細胞バッグに添加した。
p1000マイクロピペットを使用して、900μLの腫瘍洗浄培地をOKT3アリコート(100μL)に移した。シリンジ及び滅菌技法を使用して、0.6mLのOKT3を吸引し、第2のフィーダー細胞バッグに添加した。培地体積を全体積2Lに調整した。第2のフィーダー細胞バッグをインキュベーターに移した。
OKT3製剤の詳細:OKT3は、100μLアリコート中のバイアル(1mg/mL)からの元のストック濃度でアリコートされ、凍結されてもよい。1mLバイアル当たり約10×アリコート。-80℃で保管した。0日目:15μg/フラスコ、すなわち500mL中30ng/mL~60μL最大約1アリコート。
5mLの腫瘍洗浄培地を、過剰腫瘍片とラベル付けした6ウェルプレートのすべてのウェルに添加した。解剖中に腫瘍を水和状態に保持する際に、腫瘍洗浄培地をさらなる使用のために利用可能にした。50mLの腫瘍洗浄培地を、各100mmペトリ皿に追加した。
解剖皿のふたの下の定規を参照として使用して、腫瘍を27mm断片(3×3×3mm)に解剖した。60個の断片に達するまで中間断片を解剖した。生成した最終断片の数に応じて、最終断片の総数を計数し、G-REX-100MCSフラスコを調製した(一般に、1フラスコ当たり60個の断片)。
断片チューブ1~断片チューブ4とラベル付けしたコニカルチューブ内に好ましい組織断片を保持した。起源とする断片チューブの数に応じて、フィーダー細胞懸濁液を播種するG-REX-100MCSフラスコの数を計算した。
フィーダー細胞バッグをインキュベーターから取り出し、G-REX-100MCSを播種する。D0(0日目)とラベル付けする。
G-REX-100MCS中の培養物への腫瘍断片の追加。滅菌条件下で、腫瘍断片培養物(D0)1とラベル付けしたG-REX-100MCS及び断片チューブとラベル付けした50mLのコニカルチューブのキャップを緩めた。開いた断片チューブ1を回転させ、同時にG-REX100MCSのキャップをわずかに持ち上げた。断片を含む培地を、回転している間にG-REX100MCSに追加した。G-REX100MCSに移送された断片の数を記録した。
断片がGREXフラスコの底に配置された時点で、7mLの培地を吸引し、7つの1mLアリコートを作製した(拡張された特徴付け用に5mL、滅菌試料用に2mL)。拡張された特徴付け用の5つのアリコート(最終断片培養上清)を、必要になるまで-20℃で保管した。
1本の嫌気性BacT/Alertボトル及び1本の好気性BacT/Alertボトルに各々1mLの最終断片培養上清を接種した。試料採取したフラスコ毎に繰り返す。
7日目~8日目
フィーダー細胞バッグを調製した。凍結時に37℃の水浴中で3~5分間フィーダーバッグを解凍した。凍結している場合、フィーダー細胞を計数した。フィーダー細胞濃度の最適範囲は、5×10~5×10細胞/mLである。4.5mLのAIM-Vを含む4つのコニカルチューブを準備した。各細胞計数について0.5mLの細胞画分を新しいクライオバイアル管に追加した。試料を十分に混合し、細胞計数を続けた。
総生フィーダー細胞数が2×10細胞以上であった場合、次のステップに進んでフィーダー細胞濃度を調整した。フィーダー細胞の体積を計算し、第1のフィーダー細胞バッグから取り出して、2×10細胞を第2のフィーダー細胞バッグに追加した。
p1000マイクロピペットを使用して、900μLのHBSSを100μLのOKT3アリコートに移す。上下に3回ピペッティングして混合する。2つのアリコートを調製した。
OKT3製剤の詳細:OKT3は、100μLアリコート中のバイアル(1mg/mL)からの元のストック濃度でアリコートされ、凍結されてもよい。1mLバイアル当たり約10×アリコート。-80℃で保管した。7日目/8日目:30μg/フラスコ、すなわち500mL中60ng/mL~120μl最大約2アリコート。
シリンジ及び滅菌技法を使用して、0.6mLのOKT3を吸引し、フィーダー細胞バッグに添加して、すべて添加されたことを確認した。培地量を合計2Lに調整した。第2のOKT3アリコートで繰り返し、フィーダー細胞バッグに追加した。第2のフィーダー細胞バッグをインキュベーターに移した。
フィーダー細胞懸濁液を含むG-REX100MCSフラスコの準備。0日目に生成されたG-REXフラスコの数に従って処理するためにG-REX-100MCSフラスコの数を記録した。G-REXフラスコをインキュベーターから取り出し、第2のフィーダー細胞バッグをインキュベーターから取り出した。
フィーダー細胞懸濁液を添加する前の上清の除去:1本の10mLシリンジをG-REX100フラスコに接続し、5mLの培地を引き上げた。5つの1mLアリコート(拡張された特徴付け用に5mL)を作製し、治験依頼者からの要求があるまで、拡張された特徴付け用に5つのアリコート(最終断片培養上清)を-20℃で保管した。各G-REX100フラスコにラベル付けし、繰り返した。
フラスコの数に応じた、特徴付け用の5~20×1mL試料:
●5mL=1フラスコ
●10mL=2フラスコ
●15mL=3フラスコ
●20mL=4フラスコ
フィーダー細胞をG-REX100 MCSに播種し続け、G-REX100 MCSフラスコ毎に繰り返した。無菌移送法を使用して、各G-REX-100MCSフラスコに重量で500mLの第2のフィーダー細胞バッグを重力移送し(1g=1mLと想定)、量を記録した。7日目培養とラベル付けし、G-REX100フラスコ毎に繰り返した。G-REX-100MCSフラスコをインキュベーターに移した。
10~11日目
第1のG-REX-100MCSフラスコを取り出し、滅菌条件を使用して、10mLシリンジを使用して7mLの前処理培養上清を取り出した。7つの1mLアリコートを作製した拡張された特徴付け用に5mL、滅菌試料用に2mL。
フラスコを注意深く混合し、新たな10mLシリンジを使用して10mLの上清を取り出し、D10/11マイコプラズマ上清とラベル付けした15mLのチューブに移す。
フラスコを注意深く混合し、新しい注射器を使用して、処理されるフラスコの数に応じて以下の量を除去した。
●1フラスコ=40mL
●2フラスコ=20mL/フラスコ
●3フラスコ=13.3mL/フラスコ
●4フラスコ=10mL/フラスコ
合計40mLをすべてのフラスコから取り出し、「10/11日目QC試料」とラベル付けした50mLのコニカルチューブにプールし、必要になるまでインキュベーター内で保管すべきである。細胞計数を行い、細胞を割り当てた。
必要になるまで-20℃以下で拡張された特徴付けのために5つのアリコート(前処理培養上清)を保管した。1本の嫌気性BacT/Alertボトル及び1本の好気性BacT/Alertボトルに各々1mLの前処理培養上清を接種した。
細胞懸濁液をG-REX-500MCSに移し、G-REX-100MCS毎に繰り返した。滅菌条件を使用して、各G-REX-100MCSの内容物をG-REX-500MCSに移し、一度に約100mLの液体移送を監視した。G-REX-100MCSの容量が500mLに低減したとき、移送を停止した。
移送ステップ中、10mLシリンジを使用し、G-REX-100MCSからシリンジに10mLの細胞懸濁液を引き上げた。培養中のフラスコの数に従って指示に従った。1つのフラスコのみの場合:2つのシリンジを使用して合計20mLを取り出した。フラスコが2つの場合:1フラスコ当たり10mLを取り出した。フラスコが3つの場合:1フラスコ当たり7mLを取り出した。フラスコが4つの場合:1フラスコ当たり5mLを取り出した。細胞懸濁液を1本の一般的な50mLのコニカルチューブに移した。細胞計数ステップ及びQC試料までインキュベーター内で保管する。QCに必要な細胞の総数は、約20e6細胞であった:4×0.5mLの細胞数(細胞数を最初に希釈しなかった)。
アッセイに必要な細胞の量は、以下の通りである。
1.本明細書に記載されるものなどの効力アッセイ、またはIFN-γもしくはグランザイムBアッセイのための最小10×10細胞
2.マイコプラズマのための1×10細胞
3.CD3+/CD45+のためのフローサイトメトリーのための5×10細胞
G-REX-500MCSフラスコをインキュベーターに移した。
QC試料を調製した。この実施形態のアッセイには少なくとも15×10細胞が必要であった。アッセイは、細胞数及び生存率、マイコプラズマ(1×10細胞/平均生存濃度)、フロー(5×10細胞/平均生存濃度)及びIFN-gアッセイ(5×10細胞~1×10細胞を含み、8~10×10細胞が、IFN-γアッセイに必要である。
10×10細胞/mLで凍結保存のための細胞画分の体積を計算し、調製するバイアルの数を計算した。
16~17日目
洗浄緩衝液の調製(1% HSA Plasmalyte A)。HSA及びPlasmalyteを5Lバッグに移して、LOVO洗浄緩衝液を作製した。滅菌条件を使用して、総体積125mLの25%HSAを5Lバッグに移した。10mLまたは40mLの洗浄緩衝液を取り出し、「IL-2 6×10IU/mL」チューブに移した(IL-2を事前に調製した場合は10mL、IL-2を新たに調製した場合は40mL)。
Plasmalyte+1% HSAに添加する再構成IL-2の量を計算した:再構成IL-2の量=(IL-2の最終濃度×最終量)/IL-2の比活性(標準アッセイに基づく)。IL-2の最終濃度は、6×10IU/mLであった。最終体積は、40mLであった。
再構成IL-2に必要なIL-2の計算された初期体積を取り出し、「IL-2 6×10IU/mL」チューブに移した。事前に調製したアリコートから100μLのIL-2 6×10IU/mLを、10mLのLOVO洗浄緩衝液を含有する「IL-2 6×10IU/mL」とラベル付けしたチューブに追加した。
約4500mLの上清をG-REX-500MCSフラスコから取り出した。残りの上清を回転させ、細胞を細胞収集プールバッグに移した。すべてのG-REX-500MCSフラスコで繰り返した。
60mLの上清を除去し、マイコプラズマ検出を含む品質管理アッセイのために上清チューブに添加した。+2~8℃で保管した。
細胞収集細胞を計数した。4.5mLのAIM-Vを含む4つの15mLコニカルチューブを準備する。これらは、事前に準備してもよい。最適な範囲は、5×10~5×10細胞/mLである。(1:10希釈が推奨された)。1:10希釈の場合、事前に調製した4500μLのAIM Vに、500μLのCFを追加する。希釈倍率を記録した。
TC(総細胞)LOVO前(生+死)を計算した=
平均総細胞
濃度(TC濃度LOVO前)
(生+死)

ソースバッグの体積
TVC(総生細胞)LOVO前(生)を計算した=
平均総生細胞
濃度(TVC LOVO前)
(生)

LOVOソースバッグの体積
総細胞(TC)数が5×10超であった場合、5×10細胞を取り出して、MDA保持試料として凍結保存する。5×10÷平均TC濃度(ステップ14.44)=取り出す体積
総細胞(TC)数が≦5×10以下であった場合、4×10細胞を取り出して、MDA保持試料として凍結保存する。4×10÷平均TC濃度=取り出す体積。
総細胞数が決定された場合、取り出す細胞の数は、150×10生細胞の保持を可能にすべきである。TVC LOVO前5×10もしくは4×10を確認するか、または該当なしである。取り出す細胞の体積量を計算した。
バッグに残っている残りの総細胞を計算した。TC(総細胞)LOVO前を計算した。[平均総細胞濃度×残りの体積=残りのTC LOVO前]を計算した。
残存する細胞の総数に従って、表44の対応するプロセスを選択する。
使用したプロセスに対応して添加するIL-2の量を選択する。次のように計算された体積:保持量×2×300IU/mL=必要とされるIL-2のIU。必要なIL-2のIU/6×10IU/mL=LOVO後バッグに追加するIL-2の体積。添加したすべての体積を記録した。さらなる分析のために試料をクライオバイアル内に得た。
細胞製品を十分に混合した。該当する場合、凍結保存を含むさらなる処理のためにすべてのバッグを密封した。
取得されたクライオバイアル試料に対して、内毒素、IFN-γ、無菌性、及び必要に応じて他のアッセイを行った。
実施例10:GEN2及びGEN3の例示的なプロセス
この実施例は、Gen2及びGen3のプロセスを示す。Gen2プロセス及びGen3プロセスのTILは、一般に腫瘍の外科的切除によって個々の患者から得られ、その後、エクスビボで拡張された自己TILで構成されている。Gen3プロセスのプライミングによる第1の拡張ステップは、インターロイキン-2(IL-2)及びモノクローナル抗体OKT3の存在下での細胞培養であり、放射線照射された末梢血単核細胞(PBMC)の足場上のT細胞共受容体CD3を標的とする。
Gen2 TIL製品の製造は、2つの相からなる:1)急速拡張前(REP前)及び2)急速拡張プロトコル(REP)。REP前中に、切除腫瘍を、各寸法2~3mmの50個以下の断片に切断し、血清含有培養培地(10%HuSABを補充したRPMI1640培地)及び6,000IU/mLのインターロイキン-2(IL-2)で11日間培養した。11日目にTILを採取し、大規模二次REP拡張に導入した。REPは、5日間の3000IU/mLのrhIL-2を補充した5L体積のCM2中の150μgのモノクローナル抗CD3抗体(OKT3)を装填した5×10個の放射線照射された同種異系PBMCフィーダー細胞の共培養におけるREP前由来の200×10個以下の生細胞の活性化からなる。16日目に、培養物の体積を90%減少させ、細胞画分を1フラスコ当たり1×10個以上の生リンパ球で複数のG-REX-500フラスコに分割し、CM4で5LにQSする。TILをさらに6日間インキュベートする。REPを22日目に採取し、洗浄し、製剤化し、凍結保存した後に、注入のために臨床現場に-150℃で発送する。
Gen3 TIL製品の製造は、3つの相からなる:1)プライミングによる第1の拡張プロトコル、2)急速な第2の拡張プロトコル(急速拡張相またはREPとも称される)、及び3)継代培養分割。プライミングによる第1の拡張TIL増殖を行うために、切除した腫瘍を各寸法2~3mm以下の120個以下の断片に切断した。プライミングによる第1の拡張の0日目に、OKT-3を装填したおよそ2.5×10個の放射線照射された同種異系PBMCフィーダー細胞のフィーダー層を、3つの100MCS容器の各々内のおよそ100cmの表面積上に確立した。腫瘍断片を、各々が500mLの血清含有CM1培養培地及び6,000IU/mLのインターロイキン-2(IL-2)及び15ugのOKT-3を含む3つの100MCS容器に分布し、その中で7日間培養した。7日目に、OKT-3を負荷したおよそ5×10個の同種異系の照射されたPBMCフィーダー細胞の追加のフィーダー細胞層を、3つの100MCS容器の各々において腫瘍断片化培養相に組み込み、500mLのCM2培養培地及び6,000IU/mLのIL-2及び30μgのOKT-3で培養することによってREPを開始した。REPの開始を、100MCS容器へのOKT3を装填したフィーダー細胞の閉鎖系流体移送を使用して、同じ容器内のプライミングによる第1の拡張培養物全体を活性化することによって増強した。Gen3の場合、TILのスケールアップまたは分割に、細胞培養物全体を閉鎖系流体移送によってより大きい容器にスケーリングし、移し(100Mフラスコから500Mフラスコに)、追加の4LのCM4培地を添加するプロセスステップを含めた。16日目にREP細胞を採取し、洗浄し、製剤化し、凍結保存した後に、注入のために臨床現場に-150℃で発送する。
全体として、Gen3プロセスは、より短く、よりスケーラブルであり、かつ簡単に修正可能な拡張プラットフォームであり、堅牢な製造及びプロセス比較可能性に適するように適応する。
0日目に、両方のプロセスについて、腫瘍を3回洗浄し、断片をランダム化し、2つのプールに分けた(プロセス毎に1つのプール)。Gen2プロセスの場合、断片を、6,000IU/mLのrhIL-2を含有する1LのCM1培地を含む1つのGREX100MCSフラスコに移した。Gen3プロセスでは、断片を、6,000IU/mLのrhIL-2、15ugのOKT-3及び2.5×10個のフィーダー細胞を含有する500mLのCM1を含む1つのG-REX-100MCSフラスコに移した。Rep開始日のTILの播種は、各プロセスに従って異なる日に起こった。G-REX-100MCSフラスコを90%減容させたGen2プロセスの場合、収集した細胞懸濁液を新たなG-REX-500MCSに移して、IL-2(3000IU/mL)+5×10フィーダー細胞及びOKT-3(30ng/mL)を含有するCM2培地中で11日目にREPを開始した。細胞が拡張し、プロトコルに従って16日目にIL-2(3000IU/mL)を有するCM4培地を含む複数のG-REX-500MCSフラスコに分割した。その後、培養物を採取し、プロトコルに従って22日目に凍結保存した。Gen3プロセスの場合、REPの開始は7日目に起こり、同じG-REX-100MCSをREPの開始に使用した。簡潔には、IL-2(6000IU/mL)及び5×10個のフィーダー細胞を30ugのOKT-3とともに含有する500mLのCM2培地を各フラスコに添加した。9~11日目に、培養をスケールアップした。G-REX100Mの全体積(1L)をG-REX-500MCSに移し、IL-2(3000IU/mL)を含有する4LのCM4を添加した。フラスコを5日間インキュベートした。培養物を採取し、16日目に凍結保存した。
比較には、2つの肺腫瘍(L4054及びL4055)及び1つの黒色腫腫瘍(M1085T)の3つの異なる腫瘍を含めた。
L4054及びL4055の場合、CM1培地(培養培地1)、CM2培地(培養培地2)、及びCM4培地(培養培地4)を事前に調製し、4℃で保持した。CM1培地及びCM2培地を、培地を濾過した場合の細胞増殖と培地を濾過しなかった場合の細胞増殖を比較するために、濾過せずに調製した。
L4055腫瘍の場合、REPの開始及びスケールアップ時に、培地を事前に37℃で最大24時間温めた。
結果達成された生細胞の総数について、Gen3の結果はGen2の30%以内であった。Gen3最終製品は、再刺激後により高いINF-γ産生を示した。Gen3最終製品は、存在する固有の全CDR3配列によって測定される、増加したクローンの多様性を示した。Gen3最終製品は、より長い平均テロメア長を示した。
Gen2及びGen3プロセスでのREP前及びREP拡張は、上記の手順に従った。各腫瘍について、2つのプールに同数の断片を含めた。腫瘍のサイズが小さいため、1フラスコ当たりの最大断片数は達成されなかった。総REP前細胞(TVC)を採取し、Gen2プロセスの場合は11日目に、Gen3プロセスの場合は7日目に計数した。2つのREP前群を比較するために、細胞計数を培養物中に提供された断片の数で割り、1断片当たりの平均生細胞を計算した。以下の表46に示されるように、Gen2プロセスは、Gen3プロセスと比較して、1断片当たりより多くの細胞を一貫して成長させた。REP前TVCを7で割り、その後、11を掛けて計算した、11日目にGen3プロセスで予想されるTVC数の外挿計算。
Gen2及びGen3プロセスの場合、TVCをプロセス条件毎に計数し、生細胞パーセントをプロセス日毎に生成した。採取時に、22日目(Gen2)及び16日目(Gen3)の細胞を収集し、TVC数を確立した。その後、TVCを0日目に提供された断片の数で割り、1断片当たりの平均生細胞を計算した。倍率拡張を、採取したTVCをREP開始TVCで割ることによって計算した。表47に示されるように、Gen2とGen3を比較すると、倍率拡張はL4054の場合では同様であり、L4055の場合、倍率拡張はGen2プロセスの方が高かった。具体的には、この場合、培地をREP開始日の前に24温めた。M1085Tの場合のGen3でもより高い倍率拡張が観察された。REP TVCを16で割り、その後、22を掛けて計算した、22日目にGen3プロセスで予想されるTVC数の外挿計算。
表48:TIL最終産物の生存率%:採取時に、最終TIL REP製品を生存率%の放出基準と比較した。Gen2及びGen3プロセスのすべての条件は、70%の生存率基準を超えており、プロセス及び腫瘍間で同等であった。
採取時に、最終TIL REP製品を生存率%の放出基準と比較した。Gen2及びGen3プロセスのすべての条件は、70%の生存率基準を超えており、プロセス及び腫瘍間で同等であった。
1フラスコ当たりの断片の数が最大必要数未満であったため、採取日の推定細胞数を腫瘍毎に計算した。推定は、臨床腫瘍が0日目に2つまたは3つのフラスコに播種するのに十分な大きさであるという予想に基づいた。
免疫表現型決定-TIL最終製品の表現型マーカー比較。3つの腫瘍L4054、L4055、及びM1085Tは、Gen2及びGen3プロセスの両方でTIL拡張を受けた。採取時に、REP TIL最終製品をフローサイトメトリー分析にかけ、純度、分化、及びメモリーマーカーを試験した。すべての条件で、TCR a/b+細胞パーセンテージは90%超であった。
Gen3プロセスから採取されたTILは、Gen2プロセスから採取されたTILと比較して、より高いCD8及びCD28発現を示した。Gen2プロセスは、より高いCD4+パーセンテージを示した。
Gen3プロセスから採取したTILは、Gen2プロセス由来のTILと比較して、セントラルメモリー区画でより高い発現を示した。
活性化及び疲弊マーカーを2つの腫瘍L4054及びL4055由来のTILで分析して、Gen2及びGen3 TIL拡張プロセス由来の最終TIL製品を比較した。活性化及び疲弊マーカーは、Gen2プロセスとGen3プロセスとの間で同等であった。
再刺激時のインターフェロンガンマ分泌。採取日、Gen2の場合は22日目、Gen3の場合は16日目に、TILは、L4054及びL4055の場合、コーティングした抗CD3プレートで一晩再刺激を受けた。M1085Tでの再刺激は、抗CD3、CD28、及びCD137ビーズを使用して行った。すべての条件で再刺激の24時間後に上清を収集し、上清を凍結させた。ELISAによるIFNγ分析を、同じELISAプレートを使用して両方のプロセス由来の上清で同時に評価した。分析した3つの腫瘍で、Gen3プロセス由来のIFNγのより高い産生が観察された。
培養培地中のIL-2レベルの測定。Gen2プロセスとGen3プロセスとの間のIL-2消費量を比較するために、腫瘍L4054及びL4055で、REPの開始時、スケールアップ時、及び採取日に細胞上清を収集した。細胞培養上清中のIL-2の量を、R&D製の定量化ELISAキットによって測定した。一般的な傾向は、Gen2プロセスと比較して、Gen3プロセスではIL-2濃度が高いままであることを示す。これは、プロセス全体を通して培地のキャリーオーバーと相まってGen3のREP開始時のIL-2濃度がより高い(6000IU/mL)ことに起因する可能性がある。
代謝基質及び代謝物分析。D-グルコース及びL-グルタミンなどの代謝基質のレベルを、全培地消費量の代わりに測定した。乳酸及びアンモニアなどのそれらの相互代謝物を測定した。グルコースは、ATPの形態でエネルギーを産生するためにミトコンドリアによって利用される培地中の単糖である。グルコースが酸化されると、乳酸が産生される(乳酸塩は乳酸のエステルである)。乳酸塩は、細胞の指数関数的成長期中に強く産生される。高レベルの乳酸塩は、細胞培養プロセスに悪影響を及ぼす。
L4054及びL4055の使用済み培地を、Gen2及びGen3プロセスの両方で、REP開始時、スケールアップ時、及び採取日に収集した。使用済み培地の収集は、Gen2の場合は11日目、16日目、及び22日目、Gen3の場合は7日目、11日目、及び16日目であった。上清を、グルコース、乳酸、グルタミン、GlutaMax(商標)、及びアンモニアの濃度についてCEDEXバイオアナライザーで分析した。
L-グルタミンは、細胞培養培地製剤に必要な不安定な必須アミノ酸である。グルタミンにはアミンが含まれており、このアミド構造基は、窒素を細胞に輸送して送達することができる。L-グルタミンが酸化すると、細胞によって有毒なアンモニア副産物が産生される。L-グルタミンの分解に対抗するために、Gen2及びGen3プロセスの培地に、水溶液中でより安定しており、かつ自発的に分解しないGlutaMax(商標)を補充した。2つの腫瘍株では、Gen3アームは、プロセス中のL-グルタミン及びGlutaMax(商標)の減少、ならびにREP全体でアンモニアの増加を示した。Gen2アームでは、L-グルタミン及びGlutaMax(商標)の濃度が一定であり、アンモニア産生のわずかな増加が観察された。Gen2及びGen3のプロセスは、アンモニアについて採取日に同等であり、L-グルタミン分解にわずかな違いが見られた。
テロメアは、Flow-FISHによって繰り返される。Flow-FISH技術を使用して、Gen2及びGen3プロセスでのL4054及びL4055のテロメア反復の平均長を測定した。相対テロメア長(RTL)の決定を、DAKO製のフローサイトメトリー分析用Telomere PNAキット/FITCを使用して計算した。Gen3は、Gen2と同等のテロメア長を示した。
CD3分析各プロセスで生成された細胞製品のクローン多様性を決定するために、L4054及びL4055の採取したTIL最終製品を試料採取し、T細胞受容体のCDR3部分の配列決定によるクローン多様性分析についてアッセイした。
表50は、採取したTIL細胞製品のL4054における共有される固有のCDR3配列パーセンテージに関するGen2とGen3との比較を示す。199個の配列がGen3最終製品とGen2最終製品との間で共有され、Gen3最終製品と共有されるGen2由来の固有のCDR3配列の上位80%の97.07%に相当する。
表51は、採取したTIL細胞製品のL4055における共有される固有のCDR3配列パーセンテージに関するGen2とGen3との比較を示す。1833個の配列がGen3最終製品とGen2最終製品との間で共有され、Gen3最終製品と共有されるGen2由来の固有のCDR3配列の上位80%の99.45%に相当する。
CM1及びCM2培地は、濾過せずに事前に調製し、腫瘍L4055の場合、Gen2及びGen3プロセスで使用のために使用するまで4℃で保持した。
Gen2及びGen3プロセスのREP開始日に、腫瘍L4055の場合、培地を37℃で事前に24時間温めた。
これらのプロセスで収集した上清中にLDHは測定されなかった。
M1085T TIL細胞計数を、K2 cellometer細胞カウンターを使用して実行した。
腫瘍M1085Tでは、代謝分析用の上清、活性化及び疲弊マーカー分析用のTIL産物、テロメア長、及びCD3-TCR vb分析などの試料は入手できなかった。
結論この実施例では、3つの独立したドナー腫瘍組織を、機能的品質属性に加えて、拡張された表現型特徴付け、ならびにGen2プロセス及びGen3プロセス間の培地消費に関して比較する。
Gen2及びGen3のREP前及びREP拡張の比較を、生成された全生細胞及び全有核細胞集団の生存率に関して評価した。採取日のTVC細胞用量は、Gen2(22日)とGen3(16日)との間で同等ではなかった。Gen3細胞用量は、採取時に収集した全生細胞の約40%であり、Gen2よりも低かった。
REP前採取は、7日目ではなく11日目に起こり、REP採取は、16日目ではなく22日目に起こると仮定して、Gen3プロセスの外挿細胞数を計算した。どちらの場合も、Gen3は、Gen2プロセスと比較してTVCの数値が近いことを示し、初期活性化により、TILの成長が増強したことを示す。
Gen3プロセスでの追加フラスコ(2つまたは3つ)の外挿値の場合、処理される腫瘍サイズがより大きいと仮定し、記載されるようにプロセス毎に必要な最大断片数に到達する。22日目のGen2プロセスと比較して、Gen3プロセスの16日目の採取時にTVCで同様の用量に到達可能であり得ることが観察された。この観察は重要であり、培養物の早期活性化がTIL処理時間を短縮したことを示す。
Gen2及びGen3のREP前及びREP拡張の比較を、生成された全生細胞及び全有核細胞集団の生存率に関して評価した。採取日のTVC細胞用量は、Gen2(22日)とGen3(16日)との間で同等ではなかった。Gen3細胞用量は、採取時に収集した全生細胞の約40%であり、Gen2よりも低かった。
表現型特徴付けに関して、Gen2プロセスと比較してGen3プロセスでの3つの腫瘍でより高いCD8+及びCD28+発現が観察された。
Gen3プロセスは、Gen2プロセスと比較してわずかに高いセントラルメモリー区画を示した。
Gen2及びGen3プロセスは、Gen3プロセスの期間がより短いにもかかわらず、同等の活性化及び疲弊マーカーを示した。
IFNガンマ(IFNγ)産生は、分析した3つの腫瘍において、Gen2と比較してGen3最終製品において3倍高かった。このデータは、Gen3プロセスがGen2プロセスと比較して高機能でより強力なTIL製品を生成したことを示し、Gen3でのCD8及びCD28発現がより高いことに起因する可能性がある。表現型特徴付けは、Gen2プロセスと比較して3つの腫瘍でCD8+、CD28+発現へのGen3の肯定的な傾向を示唆した。
Gen2とGen3との間のTIL最終製品のテロメア長は同等であった。
グルコース及び乳酸塩レベルは、Gen2最終産物とGen3最終産物との間で同等であり、プロセス日毎に減容除去が実行されなかったこと、及びGen2と比較してプロセスにおける培地全体の体積が少ないことに起因して、Gen3プロセスの培地の栄養素レベルが影響されなかったことを示唆する。
全体として、Gen3プロセスは、Gen2プロセスと比較してほぼ2倍の処理時間の短縮を示し、これにより、Gen3プロセスによって拡張されたTIL製品の売上原価(COG)の有意な削減がもたらされるであろう。
IL-2消費は、Gen2プロセスでのIL-2消費の一般的な傾向を示しており、Gen3プロセスでは、古い培地が除去されなかったため、IL-2が高かった。
Gen3プロセスは、CDR3 TCRab配列分析によって測定されたより高いクローン多様性を示した。
Gen3プロセスを使用して、REP前の0日目のフィーダー及びOKT-3の追加により、TILの初期活性化が可能になり、TIL成長が可能になった。
表52は、現在のGen2プロセスと比較したGen3プロセスの様々な実施形態及び成果を説明する。
実施例11:例示的なGEN3プロセス(GEN3.1とも称される)
この実施例は、「TIL拡張のためのGen2プロセスとGen3プロセスとの間の比較可能性」に関するさらなる研究について説明する。Gen3プロセスを、表現型及び機能プロファイルを維持しながら、最終総生細胞(TVC)出力を増やすことを目的として、プロセスの初期に活性化ステップを含むように修正した。以下に記載されるように、Gen3実施形態をさらなる実施形態として修正し、本明細書におけるこの実施例ではGen3.1と称する。
いくつかの実施形態では、Gen3.1 TIL製造プロセスは、以下の4つのオペレーター介入を有する。
1.腫瘍断片の単離及び活性化:プロセスの0日目に腫瘍を解剖し、最終断片を各々約3×3mm(合計で最大240個の断片)を生成し、1~4つのG-REX100MCSフラスコ内で培養した。各フラスコは、最大60個の断片、6,000IUのrhIL-2、15μgのOKT3、及び2.5×10個の放射線照射した同種異系単核細胞を補充した500mLのCM1またはDM1培地を含んだ。培養物を37℃で6~8日間インキュベートした。
2.TIL培養再活性化:7~8日目に、いずれの場合も6,000IUのrhIL-2、30μgのOKT3、及び5×10個の放射線照射した同種異系単核細胞を補充したCM2またはDM1培地をゆっくり添加することによって、培養物を補充した。フラスコの底にある既存の細胞を乱さないように注意した。培養物を37℃で3~4日間インキュベートした。
3.培養のスケールアップ:10~11日目に生じる。培養のスケールアップ中に、G-REX100MCSの全内容物を、いずれの場合も3,000IU/mLのIL-2を補充した4LのCM4またはDM2を含むG-REX500MCSフラスコに移した。採取するまでフラスコを37℃で5~6日間インキュベートした。
4.採取/洗浄/製剤化:16~17日目に、フラスコを減容させ、プールする。細胞を濃縮し、1%HSAを含有するPlasmaLyte A pH7.4で洗浄した。洗浄した細胞懸濁液を、CryoStor10と1:1の比で配合し、300IU/mLの最終濃度までrhIL-2を補充した。
DPを制御された速度の凍結で凍結保存し、気相液体窒素中で保管した。*完全標準TIL培地1、2、または4(CM1、CM2、CM4)は、上記のように、合成培地(DM1またはDM2)と称されるCTS(商標)OpTmizer(商標)T細胞無血清拡張培地の代用となり得た。
プロセスの説明0日目に、腫瘍を3回洗浄し、その後、3×3×3の最終断片に断片化した。全腫瘍を断片化した時点で、最終断片を均等にランダム化し、3つのプールに分割した。1つのランダム化断片プールを各群に導入し、3つの実験マトリックス毎に同じ数の断片を添加した。
全TIL拡張プロセスにわたって、腫瘍L4063拡張を標準培地で行い、腫瘍L4064拡張を合成培地(CTS OpTmizer)で行った。培地の成分を本明細書に記載する。
CM1完全培地1:2mM GlutaMax(商標)、10%ヒトAB血清、ゲンタマイシン(50ug/mL)、2-メルカプトエタノール(55uM)を補充したRPMI+グルタミン。6000IU/mLのIL-2を補充した最終培地製剤
CM2完全培地2:50% CM1培地+50% AIM-V培地。6000IU/mLのIL-2を補充した最終培地製剤
CM4完全培地4:GlutaMax(商標)(2mM)を補充したAIM-V。3000IU/mLのIL-2を補充した最終培地製剤
CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplement(26mL/L)を補充したCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Basal Medium。
DM1:CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplement(26mL/L)、及びCTS(商標)Immune Cell SR(3%)をGlutaMax(2mM)とともに補充したCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Basal Medium。6,000IU/mLのIL-2を補充した最終製剤。
DM2:CTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Supplement(26mL/L)、及びCTS(商標)Immune Cell SR(3%)をGlutaMax(2mM)とともに補充したCTS(商標)OpTmizer(商標)T-Cell Expansion Basal Medium。3,000IU/mLのIL-2を補充した最終製剤。
使用したすべてのタイプの培地、すなわち、完全培地(CM)及び合成培地(DM)を事前に調製し、使用前日まで4℃で保持し、プロセス日前に事前に最長24時間にわたってインキュベーター内で37℃で温めた。
TIL培養再活性化は、両方の腫瘍で7日目に起こった。スケールアップは、L4063では10日目、L4064では11日目に起こった。両方の培養物を採取し、16日目に凍結保存した。
達成した結果Gen3.0プロセス及びGen3.1プロセスの細胞計数及び生存率%を決定した。すべての条件下での拡張は、この実施例に説明される詳細に従った。
腫瘍毎に、断片を同数の3つのプールに分割した。腫瘍のサイズが小さいため、1フラスコ当たりの断片の最大数は達成されなかった。3つの異なるプロセスについて、総生細胞及び細胞生存率を条件毎に評価した。細胞数を、7日目の再活性化のTVC、10日目(L4064)または11日目(L4063)のスケールアップのTVC、及び16/17日目の採取時のTVCとして決定した。
7日目及び10/11日目の細胞数をFIO測定した。倍率拡張を、16/17日目の採取時のTVCを7日目の再活性化日のTVCで割ることによって計算した。3つの群を比較するために、採取日のTVCを、0日目の培養物中に添加した断片の数で割って、1断片当たりの生細胞の平均を計算した。
L4063及びL4064について、細胞数及び生存率アッセイを行った。Gen3.1-試験プロセスは、両方の腫瘍でGen3.0プロセスよりも多くの1断片当たりの細胞数をもたらした。
総生細胞数及び倍率拡張、プロセス中の生存率%再活性化時に、スケールアップして採取し、すべての条件で生存率%を行った。16/17日目の採取日に、最終TVCを生存率%の放出基準と比較した。評価したすべての条件は、70%の生存率基準を超え、プロセス及び腫瘍全体で同等であった。
免疫表現型決定-TIL最終製品の表現型特徴付け。最終製品をフローサイトメトリー分析にかけ、純度、分化、及びメモリーマーカーを試験した。集団の割合は、すべての条件で、TCRα/β細胞、CD4+細胞、及びCD8+細胞で一貫していた。
REP TILの拡張表現型分析を行った。TIL製品は、両方の腫瘍でGen3.0と比較してGen3.1条件でより高いCD4+細胞パーセンテージを示し、両方の条件でGen3.1条件と比較してGen3.0でより高いCD8+集団由来のCD28+細胞パーセンテージを示した。
Gen3.0プロセス及びGen3.1プロセスから採取されたTILは、CD4+細胞及びCD8+細胞でのCD27及びCD56発現と同等の表現型マーカー、ならびにCD4+ゲート細胞集団での同等のCD28発現を示した。TIL最終製品のメモリーマーカーの比較:
16日目に採取したTILの凍結試料を分析のために染色した。TILメモリーステータスは、Gen3.0プロセスとGen3.1プロセスとの間で同等であった。TIL最終製品の活性化及び疲弊マーカーの比較:
活性化及び疲弊マーカーは、CD4+細胞及びCD8+細胞上でゲートされたGen3.0プロセスとGen3.1プロセスとの間で同等であった。
再刺激時のインターフェロンガンマ分泌。採取したTILは、L4063及びL4064用のコーティングされた抗CD3プレートで一晩再刺激を受けた。Gen3.0プロセスと比較して、分析した2つの腫瘍で、より高いGen3.1プロセスからのIFNγ産生が観察された。
培養培地中のIL-2レベルの測定。すべての条件及びプロセス間のIL-2消費レベルを比較するために、細胞上清を、7日目の再活性化の開始時、10日目(L4064)/11日目(L4063)のスケールアップ時、及び16/17日目の採取及び凍結時に収集した。その後、上清を解凍し、分析した。細胞培養上清中のIL-2の量を、製造業者のプロトコルによって測定した。
全体的なGen3プロセス及びGen3.1プロセスは、同じ培地条件で評価した全プロセス中のIL-2消費に関して同等であった。L4063及びL4064用に収集した使用済み培地のIL-2濃度(pg/mL)分析。
代謝物分析使用済み培地の上清を、L4063及びL4064について、すべての条件で、7日目の再活性化の開始時、10日目(L4064)または11日目(L4063)のスケールアップ時、及び16/17日目の採取時に、L4063及びL4064から収集した。上清をCEDEXバイオアナライザーでグルコース、乳酸塩、グルタミン、GlutaMax(商標)、及びアンモニアの濃度について分析した。
合成培地は、完全培地(2g/L)と比較してより高いグルコース濃度4.5g/Lを有する。全体として、グルコースの濃度及び消費量は、各培地タイプ内でGen3.0プロセス及びGen3.1プロセスにおいて同等であった。
乳酸塩の増加が観察され、乳酸塩の増加は、Gen3.0条件とGen3.1条件との間、及び再活性化拡張に使用した2つの培地(完全培地と合成培地)間で同等であった。
いくつかの場合において、標準基礎培地は、2mMのL-グルタミンを含有し、培養条件下でL-グルタミンのL-グルタミン酸塩及びアンモニアへの自然分解を補うために、2mMのGlutaMax(商標)で補充された。
いくつかの場合において、使用した合成(無血清)培地は、基礎培地にL-グルタミンを含有せず、最終濃度が2mMになるまでGlutaMax(商標)のみで補充された。GlutaMax(商標)は、L-アラニンとL-グルタミンのジペプチドであり、水溶液中でL-グルタミンよりも安定しており、グルタミン酸塩及びアンモニアに自発的に分解しない。代わりに、ジペプチドは、個々のアミノ酸に徐々に解離し、それにより、より低いが十分な濃度のL-グルタミンを維持して、強力な細胞成長を維持する。
いくつかの場合において、グルタミン濃度及びGlutaMax(商標)濃度は、スケールアップ日にわずかに減少したが、採取日には再活性化日と比較して同様またはより近いレベルへの増加を示した。L4064の場合、グルタミン濃度及びGlutaMax(商標)濃度は、全プロセス中、異なる条件間で同様の速度でわずかな分解を示した。
アンモニア濃度は、2mMのGlutaMax(商標)を含有する合成培地中で成長させた試料よりも、2mMのグルタミン+2mMのGlutaMax(商標)を含有する標準培地中で成長させた試料で高かった。さらに、予想通り、培養の過程にわたってアンモニアの段階的増加または蓄積があった。3つの異なる試験条件間でアンモニア濃度に差はなかった。
Flow-FISHによるテロメア反復:Flow-FISH技術を使用して、Gen3プロセス及びGen3.1プロセス下でのL4063及びL4064のテロメア反復の平均長を測定した。相対テロメア長(RTL)の決定を、DAKO製のフローサイトメトリー分析用Telomere PNAキット/FITCを使用して計算した。テロメアアッセイを行った。試料のテロメア長を、対照細胞株(1301白血病)と比較した。対照細胞株は、長くて安定したテロメアを有する四倍体細胞株であり、相対テロメア長の計算を可能にする。両方の腫瘍で評価したGen3プロセス及びGen3.1プロセスは、同等のテロメア長を示した。
TCR Vβレパートリー分析
各プロセスで生成された細胞製品のクローン多様性を決定するために、TIL最終製品をT細胞受容体のCDR3部分の配列決定によるクローン多様性分析のためにアッセイした。
3つのパラメータを3つの条件間で比較した。
●固有のCDR3(uCDR3)の多様性指数
●uCDR3共有%
●uCDR3の上位80%の場合:
○共有されるuCDR3コピーの%を比較する
○固有のクロノタイプの頻度を比較する
対照及びGen3.1試験、TILで採取した細胞製品で共有される固有のCDR3配列パーセンテージ:975個の配列がGen3試験最終産物とGen2試験最終産物との間で共有され、Gen3.1と共有されるGen3由来の固有のCDR3配列の上位80%の88%に相当する。
対照及びGen3.1試験、TILで採取した細胞製品で共有される固有のCDR3配列パーセンテージ:2163個の配列がGen3試験最終製品とGen2試験最終製品との間で共有され、Gen3.1と共有されるGen3由来の固有のCDR3配列の上位80%の87%に相当する。
異なるプロセスについて、16日目の採取時に収集した1×10個の細胞から特定された固有のCD3配列の数。Gen3.1試験条件は、試料内の固有のペプチドCDRの数に基づいて、Gen3.0と比較してわずかに高いクローン多様性を示した。
シャノンエントロピー多様性指数は、比較のための信頼性の高い一般的なメトリックであり、両方の腫瘍に対するGen3.1条件は、Gen3.0プロセスよりもわずかに高い多様性を示し、Gen3.1試験条件のTCR VβレパートリーがGen3.0プロセスよりもポリクローナルであることを示唆する。
加えて、Gen3.1試験条件のTCR Vβレパートリーは、腫瘍L4063及びL4064の両方でGen3.0プロセスの対応するレパートリーと87%を超える重複を示した。
再活性化日のGen3.1試験L4064の使用済み培地のIL-2濃度の値は、期待値を下回った(Gen3.1対照及びGen3.0条件と同様であった)。
低い値はピペッティングエラーに起因した可能性があったが、最小限の試料しか採取できなかったため、アッセイを繰り返すことができなかった。
結論0日目のフィーダー及びOKT-3を含むGen3.1試験条件は、Gen3.0及びGen3.1対照と比較して、16日目の採取時の細胞用量のTVCがより高いことを示した。Gen3.1試験条件のTVC最終製品は、Gen3.0よりも約2.5倍高かった。
試験した腫瘍試料の両方について、0日目にOKT-3及びフィーダーを添加したGen3.1試験条件は、採取時にフラスコの最大容量に達した。これらの条件下で、0日目に最大4つのフラスコを開始した場合、最終細胞用量は、80~100×10TILである可能性があった。
最終TIL製品の純度、疲弊、活性化、及びメモリーマーカーを含む表現型特徴付けなどのすべての品質属性が、Gen3.1試験とGen3.0プロセスとの間で維持された。
最終TIL製品のIFN-γ産生は、分析した2つの腫瘍において、Gen3.0と比較して、0日目にフィーダー及びOKT-3を添加したGen3.1で3倍高く、Gen3.1プロセスが強力なTIL製品を生成したことを示唆する。
試験条件にわたって、グルコースまたは乳酸塩レベルに差異は観察されなかった。培地条件にわたって、Gen3.0プロセスとGen3.1プロセスとの間でグルタミン及びアンモニアに差異は観察されなかった。培地上の低レベルのグルタミンは、細胞増殖を制限しておらず、培地へのGlutaMax(商標)のみの添加が、細胞を増殖させるのに必要な栄養素を与えるのに十分であることを示唆する。
11日目及び10日目のスケールアップは、それぞれ、プロセスの採取日に到達した細胞数に関して大きな差異を示さず、代謝物の消費量は、全プロセスにわたって両方の場合で同等であった。この観察結果は、Gen3.0最適化プロセスが処理日に柔軟性を有し、それにより、製造スケジュールの柔軟性を促進することができることを示唆している。
0日目にフィーダー及びOKT-3を添加したGen3.1プロセスは、Gen3.0と比較して、CDR3 TCRab配列分析によって測定されたより高いクローン多様性を示した。
図32は、Gen3プロセス(Gen3最適化プロセス)の実施形態を説明する。標準培地及びCTS Optimizer無血清培地を、Gen3最適化プロセスTIL拡張に使用することができる。CTS Optimizerの場合、培地のGlutaMax(商標)を最終濃度4mMに増加させるために無血清培地が推奨される。
実施例12:CLL患者におけるPBMC由来のPBLを選択及び拡張する例示的な実施形態。
PBMCを患者から収集し、後に使用するために凍結させるか、または新鮮な状態で使用するかのいずれかを行う。十分な量の末梢血を収集して、本発明の方法における出発材料用に少なくとも約400,000,000(400×10)個のPBMCを産生する。方法の0日目に、6×10IU/mLのIL-2を新たに調製するかまたは解凍し、使用する準備ができるまで4℃または氷上で保存する。200mLのCM2培地を、100mLのCM1培地(GlutaMAX(登録商標)を含有する)を100mLのAIM-Vと合わせ、その後、それをAIM-Vと1:1で希釈してCM2を作製することによって調製する。CM2を光から保護し、使用しないときはしっかりと密閉する。
以下のステップをすべて、滅菌細胞培養条件下で行う。CM2のアリコートを、凍結したPBMC試料の解凍及び/または洗浄に使用するために、37℃の水浴内の50mLコニカルチューブ中で温める。凍結PBMC試料を使用する場合、試料を冷凍庫から取り出し、解凍する準備が整うまでドライアイス上で保管する。PBMCクライオバイアルを解凍する準備が整った時点で、5mLのCM2培地を50mLの滅菌コニカルチューブに入れる。PBMC試料クライオバイアルを、数個の氷晶しか残らなくなるまで37℃の水浴中に配置する。温めたCM2培地を、1:1の試料:培地体積比(約1mL)で試料バイアルに滴加する。全内容物をクライオバイアルから取り出し、50mLのコニカルチューブ内の残りのCM2培地に移す。追加の1~2mLのCM2培地を使用してクライオバイアルをすすぎ、クライオバイアルの全内容物を取り出し、50mLのコニカルチューブに移す。その後、コニカルチューブ内の体積を追加のCM2培地で15mLに調整し、穏やかに回転させて、細胞をすすぐ。その後、コニカルチューブを400gで5分間、室温で遠心分離して、細胞ペレットを収集する。
上清をペレットから除去し、コニカルチューブにキャップをし、その後、細胞ペレットを、例えば、粗面に沿ってチューブをこすることによって破砕する。約1mLのCM2培地を細胞ペレットに添加し、ペレット及び培地をピペットで5~10回上下に吸引して、細胞ペレットを破砕する。さらに3~5mLのCM2培地をチューブに添加し、ピペットで混合して、細胞を懸濁する。この時点で、細胞懸濁液の体積を記録する。自動セルカウンター、例えばNexcelom Cellometer K2で細胞を計数するために、100uLの細胞懸濁液をチューブから取り出す。試料中の生細胞の数を決定し、記録する。
表現型決定及び他の特徴付け実験のために、最低5×10個の細胞を保存する。保管した細胞を室温で5分間、400gで回転させて、細胞ペレットを収集する。細胞ペレットを凍結培地(20%DMSOを含有する滅菌熱不活性化FBS)に再懸濁する。保存した細胞の1つまたは2つのアリコートを凍結培地中で凍結し、-80℃の冷凍庫内のセルフリーザー(Mr.Frosty)でアリコートをゆっくりと凍結させる。-80℃で最低24時間後、液体窒素ストレージに移す。
以下のステップでは、予冷した溶液を使用し、素早く作業し、細胞を冷たく保つ。次のステップは、PBMC試料のT細胞画分を精製することである。これは、Pan T細胞単離キット(Miltenyi、カタログ番号130-096-535)を使用して完了する。PBS、0.5% BSA、及び2mM EDTAを含有するpH7.2の無菌ろ過洗浄バッファーで細胞を洗浄することによって、精製用の細胞を調製する。PBMC試料を400gで5分間遠心分離して、細胞ペレットを収集する。上清を吸引除去し、細胞ペレットを10個の細胞毎に40uLの洗浄緩衝液中に再懸濁する。10個の細胞毎に10uLのPan T細胞ビオチン抗体カクテルを添加する。十分に混合し、冷蔵庫内または氷上で5分間インキュベートする。10個の細胞毎に30uLの洗浄緩衝液を添加する。10個の細胞毎に20uLのPan T細胞マイクロビーズカクテルを添加する。十分に混合し、冷蔵庫内または氷上で10分間インキュベートする。LSカラムを調製し、細胞をマイクロビーズから磁気的に分離する。LSカラムをQuadroMACS磁場に配置する。LSカラムを、3mLの冷たい洗浄緩衝液で洗浄し、洗浄液を収集して廃棄する。細胞懸濁液をカラムに適用し、フロースルー(非標識細胞)を収集する。このフロースルーは、濃縮されたT細胞画分(PBL)である。カラムを3mLの洗浄緩衝液で洗浄し、最初のフロースルーと同じチューブ内にフロースルーを収集する。チューブにキャップをし、氷上に置く。これは、T細胞画分またはPBLである。LSカラムを磁場から取り除き、カラムを5mLの洗浄緩衝液で洗浄し、非T細胞画分(磁気標識細胞)を別のチューブ内に収集する。両方の画分を400gで5分間遠心分離し、細胞ペレットを収集する。上清を両方の試料から吸引し、ペレットを破砕し、各ペレットに対して3000IU/mLのIL-2を補充した1mLのCM2培地中で細胞を再懸濁し、上下に5~10回ピペットしてペレットを破砕する。1~2mLのCM2を各試料に添加し、各試料を十分に混合し、次のステップのために組織培養インキュベーター内で保管する。各試料から約50uLのアリコートを取り出し、細胞を計数し、数及び生存率を記録する。
その後、T細胞(PBL)をDunabeads(商標)Human T-Expander CD3/CD28で培養する。Dynabeadsのストックバイアルを、中速で30秒間ボルテックスする。ビーズの必要なアリコートを、ストックバイアルから1.5mLの滅菌マイクロチューブに取り出す。ビーズを含有する1.5mLのマイクロチューブに1mLのビーズ洗浄液を添加することによって、ビーズをビーズ洗浄液で洗浄する。穏やかに混合する。チューブをDynaMag(商標)-2磁石上に置き、ビーズが磁石に向かって引き寄せられるまで30分間放置する。洗浄液をビーズから吸引し、チューブを磁石から取り外す。3000IU/mLのIL-2を補充した1mLのCM2培地をビーズに添加する。マイクロチューブの全内容物を、15mLまたは50mLのコニカルチューブに移す。IL-2を含むCM2培地を使用して、ビーズを約500,000/mLの最終濃度にする。
T細胞(PBL)とビーズを以下のように一緒に培養する。0日目:G-Rex-REX24ウェルプレート中、合計7mL/ウェルで、500,000T細胞、500,000 CD3/CD28 Dynabeads、及びIL-2を補充したCM2を添加する。プロセスの次のステップまで、G-Rex-REXプレートを加湿した37℃、5% COインキュベーターに配置する(4日目)。残りの細胞を、Mr.Frostyセルフリーザーを使用してCS10凍結保存培地中で凍結させる。細胞の非T細胞画分を、Mr.Frostyセルフリーザーを使用してCS10凍結保存培地中で凍結させる。4日目に、培地を交換する。培地の半分(約3.5mL)を、G-rexプレートの各ウェルから取り出す。37℃に温めた3000IU/mLのIL-2を補充した十分な量(約3.5mL)のCM4培地を添加して、各試料ウェルから取り出した培地を交換する。G-rexプレートをインキュベーターに戻す。
7日目に、細胞をREPによる拡張のために調製する。G-rexプレートをインキュベーターから取り出し、培地の半分を各ウェルから取り出し、廃棄する。細胞を残りの培地に再懸濁し、15mLのコニカルチューブに移す。ウェルを、37℃に温めた3000IU/mLのIL-2を補充した各1mLのCM4で洗浄し、洗浄培地を細胞とともに同じ15mLのチューブに移す。細胞の代表的な試料を取り出し、自動セルカウンターを使用して計数する。1×10個未満の生細胞が存在する場合、0日目にDynabead拡張プロセスを繰り返す。残りの細胞を、バックアップ拡張のために、または表現型決定及び他の特徴付け研究のために凍結させる。1×10個以上の生細胞が存在する場合、REP拡張は0日目からのプロトコルに従って複製で設定される。代替的に、十分な細胞を用いて、1フラスコ当たり10~15×10個のPBL、及び3000IU/mLのIL-2を補充した最終量100mL/ウェルのCM4培地中の1:1比のDynabeads:PBLを使用して、G-rex 10M培養フラスコ内での拡張を設定することができる。プレート及び/またはフラスコをインキュベーターに戻す。過剰なPBLを等分し、-80℃の冷凍庫内のMr.Frostyセルフリーザーでゆっくりと凍結させ、-80℃で最低24時間後に液体窒素ストレージに移すことができる。これらのPBLを、拡張のため、または表現型決定もしくは他の特徴付け研究のためのバックアップ試料として使用することができる。
11日目に、培地を交換する。培地の半分をG-rexプレートの各ウェルまたはフラスコのいずれかから取り出し、37℃で3000IU/mLのIL-2を補充した同量の新鮮なCM4培地と交換する。
14日目に、PBLを採取する。G-rexプレートを使用する場合、培地の約半分をプレートの各ウェルから取り出し、廃棄する。PBL及びビーズを残りの培地に懸濁し、15mLの滅菌コニカルチューブ(チューブ1)に移す。ウェルを37℃に温めた1~2mLの新鮮なAIM-V培地で洗浄し、洗浄液をチューブ1に移す。チューブ1にキャップをし、DynaMag(商標)-15磁石中に1分間置き、ビーズが磁石に引き寄せられるようにする。細胞懸濁液を新しい15mLチューブ(チューブ2)に移し、ビーズを2mLの新鮮なAIM-Vで37℃で洗浄する。チューブ1をさらに1分間磁石中に戻して置き、その後、洗浄培地をチューブ2に移す。最終洗浄ステップ後、必要に応じてウェルを組み合わせてもよい。細胞の代表的な試料を取り出し、計数し、数及び生存率を記録する。計数中、チューブをインキュベーターに入れてもよい。細胞が非常に密に見える場合、追加のAIM-V培地をチューブ2に添加してもよい。フラスコを使用する場合、フラスコ内の体積を約10mLに低減する必要がある。フラスコの内容物を混合し、15mLのコニカルチューブ(チューブA)に移す。フラスコを上記のように2mLのAIM-V培地で洗浄し、洗浄培地も管Aに移す。管Aにキャップをして、DynaMag(商標)-15 Magnetに1分間入れ、ビーズが磁石に引き寄せられるようにする。細胞懸濁液を新しい15mLチューブ(チューブB)に移し、ビーズを2mLの新鮮なAIM-Vで37℃で洗浄する。チューブAをさらに1分間磁石中に戻して置き、その後、洗浄培地をチューブBに移す。最終洗浄ステップ後、必要に応じてウェルを組み合わせてもよい。細胞の代表的な試料を取り出し、計数し、数及び生存率を記録する。計数中、チューブをインキュベーターに入れてもよい。細胞が非常に密に見える場合、追加のAIM-V培地をチューブBに添加してもよい。細胞を、新鮮な状態で使用しても、所望の濃度でCS10保存培地中で凍結させてもよい。
実施例13:固形腫瘍を有する患者における自己腫瘍浸潤リンパ球の第2相多施設研究
研究設計
概要
この実施例では、本出願ならびにこの実施例に記載されるように調製されたTILを使用して、TILをペムブロリズマブと組み合わせて、またはTILを単剤療法として使用してACTを評価する、前向き、非盲検、マルチコホート、非ランダム化、多施設第2相試験について説明する。
目的:
一次:
治験責任医師が評価した固形腫瘍の奏効評価基準(RECIST 1.1)を使用して、客観的奏効率(ORR)によって決定されるように、MM、HNSCC、もしくはNSCLC患者におけるペムブロリズマブと組み合わせた自己TILの有効性、またはCPIによる治療中もしくは治療後に以前に進行した再発もしくは不応性(r/r)NSCLC患者における単剤療法としてのTILの有効性を評価すること。
グレード3以上の治療に起因する有害事象(TEAE)の発生率によって測定される、MM、HNSCC、及びNSCLC患者におけるペムブロリズマブと組み合わせたTILの安全性プロファイル、またはr/r NSCLC患者における単剤療法としてのTILの安全性プロファイルを特徴付けること。
二次:
完全奏効(CR)率、奏効期間(DOR)、疾患制御率(DCR)、治験責任医師によって評価されたRECIST 1.1を使用した無増悪生存期間(PFS)、及び全生存期間(OS)を使用して、MM、HNSCC、及びNSCLC患者におけるペムブロリズマブと組み合わせた自己TILの有効性、またはr/r NSCLC患者における単剤療法としてのTILの有効性をさらに評価すること。
コホート:
コホート1A:免疫療法を除く3つ以下の以前の全身療法を伴う、切除不能なステージIIICもしくはステージIV、またはMMの患者におけるペムブロリズマブと組み合わせたTIL療法。以前に治療を受けた場合、患者は、最近の治療中または治療後にX線写真で進行が記録されていなければならない。
コホート2A:免疫療法を除く3つ以下の以前の全身療法を伴う、進行性、再発性、または転移性のHNSCC(例えば、ステージT1N1-N2B、T2-4N0-N2b)の患者におけるペムブロリズマブと組み合わせたTIL療法。以前に治療を受けた場合、患者は、最近の治療中または治療後にX線写真で進行が記録されていなければならない。
コホート3A:免疫療法を除く3つ以下の以前の全身療法を伴う、局所進行性または転移性(ステージIII~IV)NSCLC患者におけるペムブロリズマブと組み合わせたTIL療法。以前に治療を受けた場合、患者は、最近の治療中または治療後にX線写真で進行が記録されていなければならない。
コホート3B:3つ以下の以前の全身療法の一部として、CPI(例えば、抗PD-1/抗PD-L1)による全身療法を以前に受けたことがあるステージIIIまたはステージIVのNSCLC患者における単剤としてのTIL療法。以前に治療を受けた場合、患者は、最近の治療中または治療後にX線写真で進行が記録されていなければならない。
有効な標的療法が利用可能な癌遺伝子駆動腫瘍を有するコホート3A及び3B(NSCLC)の患者は、少なくとも1つの標的療法を受けていなければならない。
すべての患者は、シクロホスファミド及びフルダラビンからなる骨髄非破壊的リンパ球枯渇(NMA-LD)プレコンディショニングレジメンの前に、自己凍結保存TIL療法(コホートの割り当てに応じて、ペムブロリズマブの有無にかかわらず)を受けた。TIL注入後、最大6回のIVインターロイキン-2(IL-2)の最大用量が投与された。
以下の一般的な研究期間は、特に明記されていない限り、4つのコホートすべてで行われた。
スクリーニング及び腫瘍切除:研究登録から最大4週間(28日)、TIL製品の製造:腫瘍切除からおよそ22日以内、及び以下で考察される治療期間。
治療期間(コホート1A、2A、及び3A):NMA-LD(7日)、TIL注入(1日)、続いてIL-2投与(1~4日)を含む最大2年。患者は、TIL産生のための腫瘍切除及びベースライン走査の完了後であるが、NMA-LDレジメンの開始前にペムブロリズマブの単回注入を受ける。ペムブロリズマブの次の用量は、IL-2の完了後以降であり、その後2年(24ヶ月)以内または疾患の進行もしくは許容できない毒性のいずれか早い方までQ3W±3日間継続する。治療終了(EOT)来院は、ペムブロリズマブの最後の用量後30日以内に起こった。該当する場合、この来院は評価終了(EOA)来院と組み合わされ得る(例えば、ペムブロリズマブの中止は、疾患の進行時または新しい抗癌療法の開始時に起こった)。
治療期間(コホート3B):NMA-LD(7日)、TIL、注入(1日)、続いてIL-2投与(1~4日)を含む最大12日。EOT来院は、患者がIL-2の最後の用量を受けたときに起こった。EOT来院は、治療中止後30日以内に行われ、評価期間中にこの間隔内に起こる予定の任意の来院と組み合わせることができる。
評価期間:0日目のTIL注入後に開始し、疾患の進行、新しい抗がん療法の開始、研究評価への同意の部分的撤回、または5年(60か月)のいずれか早い時点で終了する。患者が疾患の進行に達するか、または新しい抗癌療法を開始すると、評価終了(EOA)来院が起こった。
本明細書に記載されるように調製されたTILを用いたTIL自己療法は、以下のステップから構成されていた。
1.TIL細胞製品の供給源として機能する自己組織を提供するための腫瘍切除。
2.中央の適正製造基準(GMP)施設で産生されたTIL製品。
3.7日間のNMA-LDプレコンディショニングレジメン。
4.コホート1A、2A、及び3A:患者は、TIL産生のための腫瘍切除及びベースライン走査の完了後であるが、NMA-LDレジメンの開始前にペムブロリズマブの単回注入を受ける。ペムブロリズマブの次の用量は、IL-2の完了後以降であり、その後Q3W±3日継続する。
5.自己TIL製品の注入(0日目)、ならびに
6.最大6用量までのIV IL-2投与。
コホート1A、2A、及び3Aでは、ペムブロリズマブの次の用量は、IL-2の完了後以降であり、その後2年(24ヶ月)以内または疾患の進行もしくは許容できない毒性のいずれか早い方までQ3W±3日間継続する。
コホート1A、2A、及び3Aのフローチャートは、図7に見出すことができる。コホート3Bのフローチャートは、図8に見出すことができる。患者は、腫瘍の適応によって適切なコホートに割り当てられた。
TIL療法+ペムブロリズマブ(コホート1A、2A、及び3A)
患者はスクリーニングされ、腫瘍切除のための手術が予定された。その後、患者は1つ以上の腫瘍病変を切除し、TIL産生のために中央製造施設に送られた。
次に、NMA-LDレジメンは模倣され、-7日目及び-6日目にメスナ(部位当たりの標準治療またはUSPI/SmPC)を含む2日間のIVシクロホスファミド(60mg/kg)、ならびにその後5日間のIVフルダラビン(25mg/m2:-5日目~-1日目)で構成された。
コホート1A、2A、及び3Aの患者は、TIL産生のために腫瘍切除の完了後にペムブロリズマブの単回注入を受け、NMA-LDレジメンの開始前にベースライン走査を受けた。600,000IU/kgの用量でIVでのIL-2投与は、0日目のTIL注入の完了の3時間後、ただし24時間後までに開始された。追加のIL-2投与は、最大6用量まで、およそ8~12時間毎に行われる。ペムブロリズマブの第2の用量は、IL-2の完了後以降であった。患者は、第2のペムブロリズマブ投与前に、すべてのIL-2関連毒性(グレード≦2)から回復している必要がある。ペムブロリズマブは、その後2年以内(24ヶ月)または疾患の進行もしくは許容できない毒性のいずれか早い方まで、Q3W±3日間継続する。
単剤としてのTIL療法(コホート3B)
患者はスクリーニングされ、腫瘍切除のための手術が予定された。その後、患者は1つ以上の腫瘍病変を切除し、TIL産生のために中央製造施設に送られた。
次に、NMA-LDレジメンは、-7日目及び-6日目にメスナ(部位当たりの標準治療またはUSPI/SmPC)を含む2日間のIVシクロホスファミド(60mg/kg)、ならびにその後5日間のIVフルダラビン(25mg/m2:-5日目~-1日目)で構成された。
腫瘍由来の自己TIL製品の注入は、フルダラビンの最後の用量から24時間以内に起こった。600,000IU/kgの用量でIVでのIL-2投与は、TIL注入の完了後3時間後、ただし24時間後までに開始された可能性がある。
追加のIL-2投与は、最大6用量、およそ8~12時間毎に行われた。
腫瘍浸潤リンパ球の産生及び拡張
TIL自己細胞製品は、患者の腫瘍/病変に由来する生存可能な細胞傷害性Tリンパ球で構成されており、中央のGMP施設でエクスビボで製造される。例えば、TIL産生プロセスを示す例示的なフロー図を図9に示す。
TIL製造プロセスは、個々の患者ごとに直径1.5cm以上の原発性または続発性転移性腫瘍病変(複数可)を外科的に切除した後に臨床現場で開始された。様々な解剖学的位置からの複数の腫瘍病変を切除して、腫瘍組織の全凝集体をまとめることができるが、輸送ボトルに存在する生体保存培地の量が限られているため、凝集体は、直径4.0cm、または重量10gを超えてはならない。
腫瘍病変(複数可)が生体保存輸送ボトルに入れられると、それは中央のGMP製造施設への速達宅配便を使用して2℃~8℃で出荷される。到着時に、腫瘍標本(複数可)を断片に解剖し、その後、ヒト組換えIL-2を用いたプレ急速拡張プロトコル(REP前)において約11日間培養した。
次いで、これらのREP前細胞を、IL-2、OKT3([ムロモナブ-CD3]としても知られるヒトCD3に対するマウスモノクローナル抗体)、及びフィーダー細胞としての放射線照射された同種異系末梢血単核細胞(PBMC)の存在下で11日間、急速拡張プロトコル(REP)を使用してさらに拡張した。
次いで、拡張した細胞を採取し、洗浄し、配合し、凍結保存し、速達宅配便で臨床現場に出荷した。TIL細胞製品の剤形は、TILが由来する患者への注入の準備ができている凍結保存された自己の「生細胞懸濁液」であった。患者は、製品仕様当たり1×10~150×10生細胞の間に含まれる、製造及び放出された製品の全用量を受容することとした。臨床経験は、客観的な腫瘍応答がこの用量範囲全体で達成されたことを示し、これも安全であることが示されている(Radvanyi L.G.,et al.,Clin Cancer Res.2012;18(24):6758-70)。製品の全用量は、最大4つの注入バッグで提供された。
TIL細胞製品を受容する患者の準備
この研究で使用されたNMA-LDプレコンディショニングレジメン(すなわち、2日間のシクロホスファミド+メスナ、続いて5日間のフルダラビン)は、国立がん研究所によって開発及び試験された方法に基づいていた(Rosenberg S.A.,et al.,Clin Cancer Res.2011;17(13):4550-7、Radvanyi L.G.,et al.,Clin Cancer Res.2012;18(24):6758-70、Dudley M.E.,et al.,J Clin Oncol.2008;26(32):5233-9、Pilon-Thomas S,et al.,J Immunother.2012;35(8):615-20、Dudley M.E.,et al.,J Clin Oncol.2005;23(10):2346-57、及びDudley M.E.,et al.,Science.2002;298(5594):850-4)。7日間のプレコンディショニングレジメンに続いて、患者にTIL細胞製品を注入した。
TIL注入後、8~12時間毎にIV IL-2(600,000IU/kg)を投与し、最初の用量は、TIL注入の完了の3~24時間後に投与され、最大6用量まで継続した。施設の基準に従って、IL-2の用量は、実際の体重に基づいて計算することができる。
患者集団の選択
コホート1A:
患者は、切除不能なMMの確定診断を受けた(ステージIIICまたはステージIV、米国癌合同委員会[AJCC]病期分類システムに従って組織学的に確認された)。眼内黒色腫患者は除外された。患者は、以前に免疫腫瘍学を標的とした薬剤を受けていてはならない。BRAF変異が陽性の場合、患者は、以前にBRAF/MEK標的療法を受けていた可能性があった。
コホート2A:
患者は、進行性、再発性、及び/または転移性のHNSCCを有しており、治療ナイーブであり得、病理学レポートを介した原発腫瘍の組織学的診断が必要である。患者は、以前に免疫療法レジメンを受けていてはならない。
コホート3A:
患者は、ステージIIIまたはステージIVのNSCLC(扁平上皮癌、腺癌、大細胞癌)の確定診断を受けた。有効な標的療法が利用可能ながん遺伝子駆動腫瘍を有する患者は、少なくとも1つの標的療法を受けていた。
コホート3B:
患者は、ステージIIIまたはステージIVのNSCLC(扁平上皮癌、腺癌、大細胞癌)の確定診断を受けており、以前にCPI(例えば、抗PD-1/抗PD-L1)による全身療法を受けていた。有効な標的療法が利用可能ながん遺伝子駆動腫瘍を有する患者は、少なくとも1つの標的療法を受けていた。
コホート1A、2A、及び3Aの免疫療法を除き、すべての患者は、最大3つの全身抗癌療法を受けていた(以下の包含基準を参照)。以前に治療を受けた場合、患者は、最近の治療中または治療後にX線写真で進行が確認されていた。
包含基準
患者は、研究に参加するために以下の包含基準をすべて満たしている必要がある。
1.すべての患者は、組織学的または病理学的にそれぞれの組織学的悪性腫瘍の確定診断を受けた。
○切除不能または転移性黒色腫(コホート1A)
○頭頸部の進行性、再発性、または転移性扁平上皮癌(コホート2A)
○ステージIIIまたはステージIVのNSCLC(扁平上皮癌、非扁平上皮癌、腺癌、大細胞癌)(コホート3A及び3B)。
2.コホート1A、2A、及び3Aのみ:患者は、免疫療法ナイーブであった。以前に治療された場合、患者は、最近の治療中または治療後に進行していた。コホート1A、2A、及び3Aは、最大3つの全身性抗癌療法を以前に受けている可能性があり、具体的には以下の通りである。
○コホート1A:切除不能または転移性黒色腫(ステージIIICまたはステージIV)を有する患者。BRAF変異陽性の場合、患者は、BRAF阻害剤を投与されている可能性がある。
○コホート2A:切除不能または転移性HNSCCの患者。最初の化学放射線療法を受けていた患者は許可された。
○コホート3A:ステージIIIまたはステージIVのNSCLC(扁平上皮癌、非扁平上皮癌、腺癌、または大細胞癌)を有し、免疫療法ナイーブであり、局所進行または転移の状況で3選択以下の前の全身療法後に進行した患者。アジュバントもしくはネオアジュバントの設定で、または根治的化学放射線療法の一部として全身療法を受けた患者は適格であり、以前の全身療法の完了から12ヶ月以内に疾患が進行した場合、1つの治療を受けたとみなされた。標的療法に感受性のある変異を有する既知のがん遺伝子ドライバー(例えば、EGFR、ALK、ROS)を有する患者は、少なくとも1つの標的療法の後に進行したに違いない。
3.コホート3Bのみ:ステージIIIまたはステージIVのNSCLC(扁平上皮癌、非扁平上皮癌、腺癌、または大細胞癌)を有し、3つ以下の以前の全身療法の一部として、CPI(例えば、抗PD-1/抗PD-L1)による全身療法を以前に受けていた患者。
○患者は、最近の治療中または治療後にX線写真で進行が確認されていた。
○アジュバントもしくはネオアジュバントの設定で、または根治的化学放射線療法の一部として全身療法を受けた患者は適格であり、以前の全身療法の完了から12ヶ月以内に疾患が進行していた場合、1つの治療を受けたとみなされた。
○標的療法に感受性のある変異を有する既知のがん遺伝子ドライバー(例えば、EGFR、ALK、ROS)を有する患者は、少なくとも1つの標的療法の後に進行したに違いない。
4.患者は、TIL治験薬産生のために、切除後に最少直径1.5cmの切除可能な病変(または凝集病変)を少なくとも1つ有していた。外科的切除が患者に追加のリスクをもたらさない限り、腫瘍組織を、複数の多様な転移性病変から得ることが奨励された。
○TIL生成のために切除が検討されている病変が、以前に照射された領域内にある場合、その病変は、切除前にX線写真で進行を示している必要がある。
○患者は、プロトコルが必要とする検査に適正な組織病理標本を有していなければならない。
5.患者は、TIL製造の腫瘍切除の後に、標準かつ周知のRECIST 1.1ガイドラインによって定義されているように、残留する測定可能な疾患を有していた(例えば、Eisenhauer,European Journal of Cancer 45:228-247(2009)を参照、www.project.eortc.org/recist/wp-content/uploads/sites/4/2015/03/RECISTGuidelines.pdfでも入手可能):
○以前に照射された領域内の病変は、それらの病変で疾患の進行が示されていない限り、標的病変として選択されなかった。
○RECIST毎に依然として測定可能なTIL生成のために部分的に切除された病変を、非標的病変として選択することができるが、応答評価の標的病変としては機能することができなかった。
6.患者は、同意時に18歳以上であった。
7.患者の米国東海岸癌臨床試験グループ(Eastern Cooperative Oncology Group、ECOG)のパフォーマンスステータスは0または1であり、推定平均余命は3ヶ月以上であった。
8.妊娠可能性のある患者または妊娠可能性のあるパートナーがいる患者は、治療中に承認された非常に効果的な避妊方法を実践し、すべてのプロトコル関連療法を受けてから12ヶ月間継続しなければならなかった(注記:生殖可能性のある女性は、治療中及びIL-2の最後の投与後12ヶ月間、またはペムブロリズマブの最後の投与後4ヶ月間のいずれか遅い時期に有効な避妊法を使用することとした)。男性は、研究中または治療中止後12ヶ月のいずれか遅い方で、精子を提供することができなかった。
9.患者は、以下の血液学的パラメータを有していた:
○絶対好中球数(ANC)≧1000/mm3、
○ヘモグロビン≧9.0g/dL、
○血小板数≧100,000/mm3。
10.患者は、適正な臓器機能を有していた:
○血清アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)/血清グルタミン酸ピルビン酸トランスアミナーゼ(SGPT)及びアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)/SGOTが、正常上限(ULN)の3倍以下、肝転移がULNの5倍以下の患者。
○スクリーニング時にコッククロフト・ゴールト式を使用して推定されたクレアチニンクリアランス≧40mL/分。
○総ビリルビン≦2mg/dL。
○ジルベール症候群の患者は、総ビリルビン≦3mg/dLでなければならない。
11.患者は、ヒト免疫不全ウイルス(HIV1及びHIV2)に対して血清陰性であった。B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)、B型肝炎コア抗体(抗HBc)、または急性もしくは慢性感染を示すC型肝炎ウイルス(抗HCV)の血清学が陽性の患者は、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)に基づくウイルス量及び特定のウイルス曝露の局所有病率に応じて登録した。
12.患者は、最初の研究治療(すなわち、NMA-LDまたはペムブロリズマブの開始)の前に、以下に詳述されるように、最小期間の前の抗がん療法(複数可)からのウォッシュアウト期間を有していた。
○標的療法:ウォッシュアウトが治療の開始の最低14日前であれば、上皮成長因子受容体(EGFR)、MEK、BRAF、ALK、ROS1または他の標的薬剤(例えば、エルロチニブ、アファチニブ、ダコミチニブ、オシメルチニブ、クリゾチニブ、セリチニブ、ロラチニブ)による以前の標的療法が許可された。
○化学療法:ウォッシュアウトが治療開始の最低21日前という条件で、アジュバント、ネオアジュバント、または根治的化学療法/化学放射線療法が許可された。
○コホート3Bのみの免疫療法、抗PD-1、他のmAb、またはワクチンによる以前のチェックポイント標的療法は、NMA-LDの開始前21日以上のウォッシュアウト期間で許可された。
○緩和的放射線療法:脱毛症、皮膚色素沈着の変化、または他の臨床的に重要でない事象、例えば小領域放射線皮膚炎または直腸もしくは尿意切迫感を除いて、すべての放射線関連毒性がグレード1またはベースラインに解決された場合、以前の外部ビーム放射線療法が許可された
○RECIST 1.1を介して応答のターゲットとして評価されている腫瘍病変(複数可)は、放射線ポータルの外側にあったが、ポータル内の場合は、進行が実証されていなければならない(上記の包含基準を参照)。
○手術/事前に計画された手順:創傷治癒が起こり、すべての合併症が解消され、腫瘍切除の前に少なくとも14日が経過している場合(主要な手術手順の場合)、以前の外科的手順(複数可)が許可された。
13.患者は、コホートの割り当て前に、脱毛症または白斑を除いて、以前のすべての抗癌治療関連有害事象(TRAE)からグレード1以下(有害事象の一般用語基準[CTCAE]による)に回復していた。
14.以前の抗癌療法から安定したグレード2以上の毒性を有する患者は、医療モニターと相談した後、ケースバイケースで検討された。
15.ペムブロリズマブによる治療によって悪化すると合理的に予想されない不可逆的毒性を有するコホート1A、2A、及び3Aの患者は、医療モニターとの協議後にのみ含まれた。コホート3Bの患者のみ、免疫チェックポイント阻害剤CPI(複数可)による以前の治療の結果として、グレード2以上の下痢または大腸炎が記録されている患者は、少なくとも6ヶ月間無症候性であったか、または治療後腫瘍切除前の目視評価による結腸内視鏡検査で正常でなければならない。
16.患者は、保護された健康情報の使用及び開示について、書面による承認を提供していなければならない。
除外基準
以下の基準のうちのいずれかを満たす患者は、研究から除外した。
1.ブドウ膜/眼起源の黒色腫を有する患者
2.過去20年以内に骨髄非破壊的または骨髄破壊的化学療法レジメンを含む、臓器同種移植または以前の細胞移植療法を受けていた患者。(注記:この基準は、以前のTIL治療で以前のNMA-LDレジメンがあったことを除いて、TILによる再治療を受けている患者に適用可能であった。)
3.症候性及び/または未治療の脳転移を有する患者。
○●脳転移が根治的に治療された患者は、治療開始前に患者が2週間以上にわたって臨床的に安定し、治療後の磁気共鳴画像法(MRI)による新たな脳病変がなく、患者が継続的なコルチコステロイド治療を必要としない場合、医療モニターと相談した後に登録が検討される。
4.登録から21日以内に全身ステロイド療法を受けている患者。
5.妊娠中または授乳中の患者。
6.治験責任医師の意見では、研究参加のリスクが高い、活動性の医学的疾患(複数可)、例えば全身性感染症(例えば、梅毒もしくは抗生物質を必要とする他の感染症)、凝固障害、または心臓血管系、呼吸器系、もしくは免疫系の他の活動性の主要な医学的疾患を有していた患者。
7.患者は、活動性または以前に記録された自己免疫または炎症性障害(肺炎、炎症性腸疾患[例えば、大腸炎もしくはクローン病]、憩室炎[憩室症を除く]、全身性紅斑性狼瘡、サルコイドーシス症候群、またはウェゲナー症候群[多発血管炎を伴う肉芽腫症、グレイブス病、関節リウマチ、下垂体炎、ブドウ膜炎等])を有しない場合がある。以下は、この基準の例外であった。
○白斑または脱毛症を有する患者。
○甲状腺機能低下症(例えば、橋本症候群に続く)が安定している患者
○ホルモン補充療法。
○全身療法を必要としない任意の慢性皮膚疾患。
○食事療法だけで制御されるセリアック病の患者。
8.治療開始前28日以内に生ワクチン接種または弱毒化ワクチン接種を受けていた患者。
9.何らかの形態の原発性免疫不全症(重症複合免疫不全症[SCID]及び後天性免疫不全症候群[AIDS]など)を有していた患者。
10.治験薬のいずれかの成分に対する過敏症の病歴を有する患者。TILは、以下のうちのいずれかを含むがこれらに限定されない、TIL製品製剤のいずれかの成分に対する既知の過敏症を有する患者には投与されなかった。
○●NMA-LD(シクロホスファミド、メスナ、及びフルダラビン)
○●Proleukin(登録商標)、アルデスロイキン、IL-2
○●アミノグリコシド系抗生物質(すなわち、ストレプトマイシン、ゲンタマイシン[ゲンタマイシン過敏症の皮膚検査陰性者を除く])
○●ジメチルスルホキシドを含むTIL産物製剤の任意の成分
○[DMSO]、HSA、IL-2、及びデキストラン-40
○●ペムブロリズマブ
11.左心室駆出率(LVEF)が45%未満の患者、またはニューヨーク心臓協会クラスII以上の患者。60歳以上の患者、あるいは虚血性心疾患、胸痛、または臨床的に重大な心房性及び/または心室性不整脈の病歴のある患者において、不可逆的な壁運動異常を示す心臓ストレス試験。
○治験依頼者のメディカルモニターの承認を得て、駆出率及び心臓病クリアランスが十分であれば、心臓ストレス試験に異常がある患者を登録することができた。
12.閉塞性または拘束性肺疾患があり、予測正常値の60%以下のFEV1(1秒の強制呼気量)が記録されている患者。
○●患者が上気道の解剖学的構造の異常(すなわち、気管切開)のために信頼できる肺活量測定を行うことができなかった場合は、6分間の歩行試験を使用して呼吸機能を評価した。年齢及び性別に対して予測される少なくとも80%の距離を歩くことができなかった患者、または試験中の任意の時点で低酸素症の証拠を示した患者(SpO2<90%)は除外される。
13.過去3年以内に別の原発性悪性腫瘍があった患者(治療を必要としなかった、または1年以上前に治癒的に治療された患者を除き、治験責任医師の判断では、非黒色腫皮膚癌、DCIS、LCIS、前立腺癌グリーソンスコア≦6または膀胱癌を含むが、これらに限定されない重大な再発リスクをもたらさなかった)。
14.治療開始から21日以内に治験薬を用いた別の臨床試験への参加。
研究エンドポイント及び計画された分析
一次エンドポイント及び二次エンドポイントは、コホートによって別々に分析した。
一次エンドポイント:
ORRは、有効性分析セットの中でRECIST1.1に従って治験責任医師が評価した最良の応答として確認されたPRまたはCRのいずれかを達成した患者の割合として定義された。
客観的反応を各疾患評価ごとに評価し、ORRは、対応する両側90% CIを用いて二項比率として表された。各コホートの一次分析は、評価期間の早期に進行/期限切れまたは中止されない限り、コホート毎に治療を受けたすべての患者が12ヶ月間追跡される機会があるときに行った。
安全性一次エンドポイントは、各コホート内のグレード3以上のTEAE発生率によって測定され、対応する両側90% CIの二項比率として表された。
二次エンドポイント:
有効性:
二次有効性エンドポイントは、次のように定義された。
治験責任医師によって評価された確認済みCRを達成した応答者に基づくCR率。DCRは、確認されたPR/CRまたは持続的なSD(少なくとも6週間)を達成した患者数の合計を、有効性分析セットの患者数で割り、100%を掛けたものとして導き出された。CR率及びDCRは、点推定及びその両側90% CIを使用して要約した。
DORは、客観的な応答を達成した患者の間で定義された。再発性もしくは進行性疾患が客観的に記録された最初の日付、またはその後の抗癌療法の受容もしくは患者の死亡(最初に記録された方)まで、初回応答(PR/CR)基準が満たされていることから測定した。PDを経験していない、またはデータカットもしくは最終データベースロックの時点より前に死亡していない患者は、腫瘍状態の適切な評価が行われた最終日に事象時間が打ち切られる。
PFSは、リンパ球枯渇からPDまでの時間(月単位)、または何らかの原因による死亡のいずれか早い方の事象として定義された。PDを経験していない、またはデータカットもしくは最終データベースロックの時点で死亡していない患者は、腫瘍状態の適切な評価が行われた最終日に事象時間が打ち切られた。
OSは、リンパ球枯渇の時点から何らかの原因による死亡までの時間(月単位)として定義された。データカットまたは最終的なデータベースロックの時点までに死亡していない患者は、既知の生存状態の最終日に事象時間が打ち切られた。
DOR、PFS、及びOSは、右側打ち切りを受けた。カプラン・マイヤー法を使用して、事象までの時間の有効性エンドポイントを要約する。腫瘍評価のベースラインデータは、すべてのコホートのリンパ球枯渇前の最後の走査であった。
上記の有効性パラメーターは、ベースラインの疾患特徴:BRAFステータス(コホート1Aのみ)、HPVステータス(コホート2Aのみ)、扁平上皮または非扁平上皮肺疾患(コホート3A及び3Bのみ)、ならびに抗PD-L1ステータスによって定義されたサブセットに適用可能なコホートについて推定される。
実施例14:固形腫瘍を有する患者における自己腫瘍浸潤リンパ球の第2相多施設研究
研究設計
概要
この実施例では、本出願ならびにこの実施例に記載されるように調製されたTILを使用して、TILをペムブロリズマブと組み合わせて、またはTILを単剤療法として使用してACTを評価する、前向き、非盲検、マルチコホート、非ランダム化、多施設第2相試験について説明する。
目的:
一次:
治験責任医師が評価した固形腫瘍の奏効評価基準(RECIST 1.1)を使用して、客観的奏効率(ORR)によって決定されるように、MM、HNSCC、もしくはNSCLC患者におけるペムブロリズマブと組み合わせた自己TILの有効性、またはCPIによる治療中もしくは治療後に以前に進行した再発もしくは不応性(r/r)NSCLC患者における単剤療法としてのTILの有効性を評価すること。
グレード3以上の治療に起因する有害事象(TEAE)の発生率によって測定される、MM、HNSCC、及びNSCLC患者におけるペムブロリズマブと組み合わせたTILの安全性プロファイル、またはr/r NSCLC患者における単剤療法としてのTILの安全性プロファイルを特徴付けること。
二次:
完全奏効(CR)率、奏効期間(DOR)、疾患制御率(DCR)、治験責任医師によって評価されたRECIST 1.1を使用した無増悪生存期間(PFS)、及び全生存期間(OS)を使用して、MM、HNSCC、及びNSCLC患者におけるペムブロリズマブと組み合わせた自己TILの有効性、またはr/r NSCLC患者における単剤療法としてのTILの有効性をさらに評価すること。
コホート:
コホート1A:免疫療法を除く3つ以下の以前の全身療法を伴う、切除不能なステージIIICもしくはステージIV、またはMMの患者におけるペムブロリズマブと組み合わせたTIL療法。以前に治療を受けた場合、患者は、最近の治療中または治療後にX線写真で進行が記録されていなければならない。
コホート2A:免疫療法を除く3つ以下の以前の全身療法を伴う、進行性、再発性、または転移性のHNSCC(例えば、ステージT1N1-N2B、T2-4N0-N2b)の患者におけるペムブロリズマブと組み合わせたTIL療法。以前に治療を受けた場合、患者は、最近の治療中または治療後にX線写真で進行が記録されていなければならない。
コホート3A:免疫療法を除く3つ以下の以前の全身療法を伴う、局所進行性または転移性(ステージIII~IV)NSCLC患者におけるペムブロリズマブと組み合わせたTIL療法。以前に治療を受けた場合、患者は、最近の治療中または治療後にX線写真で進行が記録されていなければならない。
コホート3B:3つ以下の以前の全身療法の一部として、CPI(例えば、抗PD-1/抗PD-L1)による全身療法を以前に受けたことがあるステージIIIまたはステージIVのNSCLC患者における単剤としてのTIL療法。以前に治療を受けた場合、患者は、最近の治療中または治療後にX線写真で進行が記録されていなければならない。
有効な標的療法が利用可能な癌遺伝子駆動腫瘍を有するコホート3A及び3B(NSCLC)の患者は、少なくとも1つの標的療法を受けていなければならない。
すべての患者は、シクロホスファミド及びフルダラビンからなる骨髄非破壊的リンパ球枯渇(NMA-LD)プレコンディショニングレジメンの前に、自己凍結保存TIL療法(コホートの割り当てに応じて、ペムブロリズマブの有無にかかわらず)を受けた。TIL注入後、最大6回のIVインターロイキン-2(IL-2)の最大用量が投与された。
以下の一般的な研究期間は、特に明記されていない限り、4つのコホートすべてで行われた。
スクリーニング及び腫瘍切除:研究登録から最大4週間(28日)、TIL製品の製造:腫瘍切除からおよそ22日以内、及び以下で考察される治療期間。
治療期間(コホート1A、2A、及び3A):NMA-LD(7日)、TIL注入(1日)、続いてIL-2投与(1~4日)を含む最大2年。患者は、TIL産生のための腫瘍切除及びベースライン走査の完了後であるが、NMA-LDレジメンの開始前にペムブロリズマブの単回注入を受ける。ペムブロリズマブの次の用量は、IL-2の完了後以降であり、その後2年(24ヶ月)以内または疾患の進行もしくは許容できない毒性のいずれか早い方までQ3W±3日間継続する。治療終了(EOT)来院は、ペムブロリズマブの最後の用量後30日以内に起こった。該当する場合、この来院は評価終了(EOA)来院と組み合わされ得る(例えば、ペムブロリズマブの中止は、疾患の進行時または新しい抗癌療法の開始時に起こった)。
治療期間(コホート3B):NMA-LD(7日)、TIL、注入(1日)、続いてIL-2投与(1~4日)を含む最大12日。EOT来院は、患者がIL-2の最後の用量を受けたときに起こった。EOT来院は、治療中止後30日以内に行われ、評価期間中にこの間隔内に起こる予定の任意の来院と組み合わせることができる。
評価期間:0日目のTIL注入後に開始し、疾患の進行、新しい抗がん療法の開始、研究評価への同意の部分的撤回、または5年(60か月)のいずれか早い時点で終了する。患者が疾患の進行に達するか、または新しい抗癌療法を開始すると、評価終了(EOA)来院が起こった。
本明細書に記載されるように調製されたTILを用いたTIL自己療法は、以下のステップから構成されていた。
1.TIL細胞製品の供給源として機能する自己組織を提供するための腫瘍切除。
2.中央の適正製造基準(GMP)施設で産生されたTIL製品。
3.7日間のNMA-LDプレコンディショニングレジメン。
4.コホート1A、2A、及び3A:患者は、TIL産生のための腫瘍切除及びベースライン走査の完了後であるが、NMA-LDレジメンの開始前にペムブロリズマブの単回注入を受ける。ペムブロリズマブの次の用量は、IL-2の完了後以降であり、その後Q3W±3日継続する。
5.自己TIL製品の注入(0日目)、ならびに
6.最大6用量までのIV IL-2投与。
コホート1A、2A、及び3Aでは、ペムブロリズマブの次の用量は、IL-2の完了後以降であり、その後2年(24ヶ月)以内または疾患の進行もしくは許容できない毒性のいずれか早い方までQ3W±3日間継続する。
コホート1A、2A、及び3Aのフローチャートは、図7に見出すことができる。コホート3Bのフローチャートは、図8に見出すことができる。患者は、腫瘍の適応によって適切なコホートに割り当てられた。
TIL療法+ペムブロリズマブ(コホート1A、2A、及び3A)
患者はスクリーニングされ、腫瘍切除のための手術が予定された。その後、患者は1つ以上の腫瘍病変を切除し、TIL産生のために中央製造施設に送られた。
次に、NMA-LDレジメンは模倣され、-7日目及び-6日目にメスナ(部位当たりの標準治療またはUSPI/SmPC)を含む2日間のIVシクロホスファミド(60mg/kg)、ならびにその後5日間のIVフルダラビン(25mg/m2:-5日目~-1日目)で構成された。
コホート1A、2A、及び3Aの患者は、TIL産生のために腫瘍切除の完了後にペムブロリズマブの単回注入を受け、NMA-LDレジメンの開始前にベースライン走査を受けた。600,000IU/kgの用量でIVでのIL-2投与は、0日目のTIL注入の完了の3時間後、ただし24時間後までに開始された。追加のIL-2投与は、最大6用量まで、およそ8~12時間毎に行われる。ペムブロリズマブの第2の用量は、IL-2の完了後以降であった。患者は、第2のペムブロリズマブ投与前に、すべてのIL-2関連毒性(グレード≦2)から回復している必要がある。ペムブロリズマブは、その後2年以内(24ヶ月)または疾患の進行もしくは許容できない毒性のいずれか早い方まで、Q3W±3日間継続する。
単剤としてのTIL療法(コホート3B)
患者はスクリーニングされ、腫瘍切除のための手術が予定された。その後、患者は1つ以上の腫瘍病変を切除し、TIL産生のために中央製造施設に送られた。
次に、NMA-LDレジメンは、-7日目及び-6日目にメスナ(部位当たりの標準治療またはUSPI/SmPC)を含む2日間のIVシクロホスファミド(60mg/kg)、ならびにその後5日間のIVフルダラビン(25mg/m2:-5日目~-1日目)で構成された。
腫瘍由来の自己TIL製品の注入は、フルダラビンの最後の用量から24時間以内に起こった。600,000IU/kgの用量でIVでのIL-2投与は、TIL注入の完了後3時間後、ただし24時間後までに開始された可能性がある。
追加のIL-2投与は、最大6用量、およそ8~12時間毎に行われた。
腫瘍浸潤リンパ球の産生及び拡張
TIL自己細胞製品は、患者の腫瘍/病変に由来する生存可能な細胞傷害性Tリンパ球で構成されており、中央のGMP施設でエクスビボで製造される。例えば、TIL産生プロセスを示す例示的なフロー図を図9に示す。
TIL製造プロセスは、個々の患者ごとに直径1.5cm以上の原発性または続発性転移性腫瘍病変(複数可)を外科的に切除した後に臨床現場で開始された。様々な解剖学的位置からの複数の腫瘍病変を切除して、腫瘍組織の全凝集体をまとめることができるが、輸送ボトルに存在する生体保存培地の量が限られているため、凝集体は、直径4.0cm、または重量10gを超えてはならない。
腫瘍病変(複数可)が生体保存輸送ボトルに入れられると、それは中央のGMP製造施設への速達宅配便を使用して2℃~8℃で出荷される。到着時に、腫瘍標本(複数可)を断片に解剖し、その後、ヒト組換えIL-2を用いたプレ急速拡張プロトコル(REP前)において約11日間培養した。
次いで、これらのREP前細胞を、IL-2、OKT3([ムロモナブ-CD3]としても知られるヒトCD3に対するマウスモノクローナル抗体)、及びフィーダー細胞としての放射線照射された同種異系末梢血単核細胞(PBMC)の存在下で11日間、急速拡張プロトコル(REP)を使用してさらに拡張した。
次いで、拡張した細胞を採取し、洗浄し、配合し、凍結保存し、速達宅配便で臨床現場に出荷した。TIL細胞製品の剤形は、TILが由来する患者への注入の準備ができている凍結保存された自己の「生細胞懸濁液」であった。患者は、製品仕様当たり1×10~150×10生細胞の間に含まれる、製造及び放出された製品の全用量を受容することとした。臨床経験は、客観的な腫瘍応答がこの用量範囲全体で達成されたことを示し、これも安全であることが示されている(Radvanyi L.G.,et al.,Clin Cancer Res.2012;18(24):6758-70)。製品の全用量は、最大4つの注入バッグで提供された。
TIL細胞製品を受容する患者の準備
この研究で使用されたNMA-LDプレコンディショニングレジメン(すなわち、2日間のシクロホスファミド+メスナ、続いて5日間のフルダラビン)は、国立がん研究所によって開発及び試験された方法に基づいていた(Rosenberg S.A.,et al.,Clin Cancer Res.2011;17(13):4550-7、Radvanyi L.G.,et al.,Clin Cancer Res.2012;18(24):6758-70、Dudley M.E.,et al.,J Clin Oncol.2008;26(32):5233-9、Pilon-Thomas S,et al.,J Immunother.2012;35(8):615-20、Dudley M.E.,et al.,J Clin Oncol.2005;23(10):2346-57、及びDudley M.E.,et al.,Science.2002;298(5594):850-4)。7日間のプレコンディショニングレジメンに続いて、患者にTIL細胞製品を注入した。
TIL注入後、8~12時間毎にIV IL-2(600,000IU/kg)を投与し、最初の用量は、TIL注入の完了の3~24時間後に投与され、最大6用量まで継続した。施設の基準に従って、IL-2の用量は、実際の体重に基づいて計算することができる。
患者集団の選択
コホート1A:
患者は、切除不能なMMの確定診断を受けた(ステージIIICまたはステージIV、米国癌合同委員会[AJCC]病期分類システムに従って組織学的に確認された)。眼内黒色腫患者は除外された。患者は、以前に免疫腫瘍学を標的とした薬剤を受けていてはならない。BRAF変異が陽性の場合、患者は、以前にBRAF/MEK標的療法を受けていた可能性があった。
コホート2A:
患者は、進行性、再発性、及び/または転移性のHNSCCを有しており、治療ナイーブであり得、病理学レポートを介した原発腫瘍の組織学的診断が必要である。患者は、以前に免疫療法レジメンを受けていてはならない。
コホート3A:
患者は、ステージIIIまたはステージIVのNSCLC(扁平上皮癌、腺癌、大細胞癌)の確定診断を受けた。有効な標的療法が利用可能ながん遺伝子駆動腫瘍を有する患者は、少なくとも1つの標的療法を受けていた。
コホート3B:
患者は、ステージIIIまたはステージIVのNSCLC(扁平上皮癌、腺癌、大細胞癌)の確定診断を受けており、以前にCPI(例えば、抗PD-1/抗PD-L1)による全身療法を受けていた。有効な標的療法が利用可能ながん遺伝子駆動腫瘍を有する患者は、少なくとも1つの標的療法を受けていた。
コホート1A、2A、及び3Aの免疫療法を除き、すべての患者は、最大3つの全身抗癌療法を受けていた(以下の包含基準を参照)。以前に治療を受けた場合、患者は、最近の治療中または治療後にX線写真で進行が確認されていた。
包含基準
患者は、研究に参加するために以下の包含基準をすべて満たしている必要がある。
1.すべての患者は、組織学的または病理学的にそれぞれの組織学的悪性腫瘍の確定診断を受けた。
○切除不能または転移性黒色腫(コホート1A)
○頭頸部の進行性、再発性、または転移性扁平上皮癌(コホート2A)
○ステージIIIまたはステージIVのNSCLC(扁平上皮癌、非扁平上皮癌、腺癌、大細胞癌)(コホート3A及び3B)。
2.コホート1A、2A、及び3Aのみ:患者は、免疫療法ナイーブであった。以前に治療された場合、患者は、最近の治療中または治療後に進行していた。コホート1A、2A、及び3Aは、最大3つの全身性抗癌療法を以前に受けている可能性があり、具体的には以下の通りである。
○コホート1A:切除不能または転移性黒色腫(ステージIIICまたはステージIV)を有する患者。BRAF変異陽性の場合、患者は、BRAF阻害剤を投与されている可能性がある。
○コホート2A:切除不能または転移性HNSCCの患者。最初の化学放射線療法を受けていた患者は許可された。
○コホート3A:ステージIIIまたはステージIVのNSCLC(扁平上皮癌、非扁平上皮癌、腺癌、または大細胞癌)を有し、免疫療法ナイーブであり、局所進行または転移の状況で3選択以下の前の全身療法後に進行した患者。アジュバントもしくはネオアジュバントの設定で、または根治的化学放射線療法の一部として全身療法を受けた患者は適格であり、以前の全身療法の完了から12ヶ月以内に疾患が進行した場合、1つの治療を受けたとみなされた。標的療法に感受性のある変異を有する既知のがん遺伝子ドライバー(例えば、EGFR、ALK、ROS)を有する患者は、少なくとも1つの標的療法の後に進行したに違いない。
3.コホート3Bのみ:ステージIIIまたはステージIVのNSCLC(扁平上皮癌、非扁平上皮癌、腺癌、または大細胞癌)を有し、3つ以下の以前の全身療法の一部として、CPI(例えば、抗PD-1/抗PD-L1)による全身療法を以前に受けていた患者。
○患者は、最近の治療中または治療後にX線写真で進行が確認されていた。
○アジュバントもしくはネオアジュバントの設定で、または根治的化学放射線療法の一部として全身療法を受けた患者は適格であり、以前の全身療法の完了から12ヶ月以内に疾患が進行していた場合、1つの治療を受けたとみなされた。
○標的療法に感受性のある変異を有する既知のがん遺伝子ドライバー(例えば、EGFR、ALK、ROS)を有する患者は、少なくとも1つの標的療法の後に進行したに違いない。
4.患者は、TIL治験薬産生のために、切除後に最少直径1.5cmの切除可能な病変(または凝集病変)を少なくとも1つ有していた。外科的切除が患者に追加のリスクをもたらさない限り、腫瘍組織を、複数の多様な転移性病変から得ることが奨励された。
○TIL生成のために切除が検討されている病変が、以前に照射された領域内にある場合、その病変は、切除前にX線写真で進行を示している必要がある。
○患者は、プロトコルが必要とする検査に適正な組織病理標本を有していなければならない。
5.患者は、TIL製造の腫瘍切除の後に、標準かつ周知のRECIST 1.1ガイドラインによって定義されているように、残留する測定可能な疾患を有していた(例えば、Eisenhauer,European Journal of Cancer 45:228-247(2009)を参照、www.project.eortc.org/recist/wp-content/uploads/sites/4/2015/03/RECISTGuidelines.pdfでも入手可能):
○以前に照射された領域内の病変は、それらの病変で疾患の進行が示されていない限り、標的病変として選択されなかった。
○RECIST毎に依然として測定可能なTIL生成のために部分的に切除された病変を、非標的病変として選択することができるが、応答評価の標的病変としては機能することができなかった。
6.患者は、同意時に18歳以上であった。
7.患者の米国東海岸癌臨床試験グループ(Eastern Cooperative Oncology Group、ECOG)のパフォーマンスステータスは0または1であり、推定平均余命は3ヶ月以上であった。
8.妊娠可能性のある患者または妊娠可能性のあるパートナーがいる患者は、治療中に承認された非常に効果的な避妊方法を実践し、すべてのプロトコル関連療法を受けてから12ヶ月間継続しなければならなかった(注記:生殖可能性のある女性は、治療中及びIL-2の最後の投与後12ヶ月間、またはペムブロリズマブの最後の投与後4ヶ月間のいずれか遅い時期に有効な避妊法を使用することとした)。男性は、研究中または治療中止後12ヶ月のいずれか遅い方で、精子を提供することができなかった。
9.患者は、以下の血液学的パラメータを有していた:
○絶対好中球数(ANC)≧1000/mm3、
○ヘモグロビン≧9.0g/dL、
○血小板数≧100,000/mm3。
10.患者は、適正な臓器機能を有していた:
○血清アラニンアミノトランスフェラーゼ(ALT)/血清グルタミン酸ピルビン酸トランスアミナーゼ(SGPT)及びアスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ(AST)/SGOTが、正常上限(ULN)の3倍以下、肝転移がULNの5倍以下の患者。
○スクリーニング時にコッククロフト・ゴールト式を使用して推定されたクレアチニンクリアランス≧40mL/分。
○総ビリルビン≦2mg/dL。
○ジルベール症候群の患者は、総ビリルビン≦3mg/dLでなければならない。
11.患者は、ヒト免疫不全ウイルス(HIV1及びHIV2)に対して血清陰性であった。B型肝炎ウイルス表面抗原(HBsAg)、B型肝炎コア抗体(抗HBc)、または急性もしくは慢性感染を示すC型肝炎ウイルス(抗HCV)の血清学が陽性の患者は、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)に基づくウイルス量及び特定のウイルス曝露の局所有病率に応じて登録した。
12.患者は、最初の研究治療(すなわち、NMA-LDまたはペムブロリズマブの開始)の前に、以下に詳述されるように、最小期間の前の抗がん療法(複数可)からのウォッシュアウト期間を有していた。
○標的療法:ウォッシュアウトが治療の開始の最低14日前であれば、上皮成長因子受容体(EGFR)、MEK、BRAF、ALK、ROS1または他の標的薬剤(例えば、エルロチニブ、アファチニブ、ダコミチニブ、オシメルチニブ、クリゾチニブ、セリチニブ、ロラチニブ)による以前の標的療法が許可された。
○化学療法:ウォッシュアウトが治療開始の最低21日前という条件で、アジュバント、ネオアジュバント、または根治的化学療法/化学放射線療法が許可された。
○コホート3Bのみの免疫療法、抗PD-1、他のmAb、またはワクチンによる以前のチェックポイント標的療法は、NMA-LDの開始前21日以上のウォッシュアウト期間で許可された。
○緩和的放射線療法:脱毛症、皮膚色素沈着の変化、または他の臨床的に重要でない事象、例えば小領域放射線皮膚炎または直腸もしくは尿意切迫感を除いて、すべての放射線関連毒性がグレード1またはベースラインに解決された場合、以前の外部ビーム放射線療法が許可された
○RECIST 1.1を介して応答のターゲットとして評価されている腫瘍病変(複数可)は、放射線ポータルの外側にあったが、ポータル内の場合は、進行が実証されていなければならない(上記の包含基準を参照)。
○手術/事前に計画された手順:創傷治癒が起こり、すべての合併症が解消され、腫瘍切除の前に少なくとも14日が経過している場合(主要な手術手順の場合)、以前の外科的手順(複数可)が許可された。
13.患者は、コホートの割り当て前に、脱毛症または白斑を除いて、以前のすべての抗癌治療関連有害事象(TRAE)からグレード1以下(有害事象の一般用語基準[CTCAE]による)に回復していた。
14.以前の抗癌療法から安定したグレード2以上の毒性を有する患者は、医療モニターと相談した後、ケースバイケースで検討された。
15.ペムブロリズマブによる治療によって悪化すると合理的に予想されない不可逆的毒性を有するコホート1A、2A、及び3Aの患者は、医療モニターとの協議後にのみ含まれた。コホート3Bの患者のみ、免疫チェックポイント阻害剤CPI(複数可)による以前の治療の結果として、グレード2以上の下痢または大腸炎が記録されている患者は、少なくとも6ヶ月間無症候性であったか、または治療後腫瘍切除前の目視評価による結腸内視鏡検査で正常でなければならない。
16.患者は、保護された健康情報の使用及び開示について、書面による承認を提供していなければならない。
除外基準
以下の基準のうちのいずれかを満たす患者は、研究から除外した。
1.ブドウ膜/眼起源の黒色腫を有する患者
2.過去20年以内に骨髄非破壊的または骨髄破壊的化学療法レジメンを含む、臓器同種移植または以前の細胞移植療法を受けていた患者。(注記:この基準は、以前のTIL治療で以前のNMA-LDレジメンがあったことを除いて、TILによる再治療を受けている患者に適用可能であった。)
3.症候性及び/または未治療の脳転移を有する患者。
○●脳転移が根治的に治療された患者は、治療開始前に患者が2週間以上にわたって臨床的に安定し、治療後の磁気共鳴画像法(MRI)による新たな脳病変がなく、患者が継続的なコルチコステロイド治療を必要としない場合、医療モニターと相談した後に登録が検討される。
4.登録から21日以内に全身ステロイド療法を受けている患者。
5.妊娠中または授乳中の患者。
6.治験責任医師の意見では、研究参加のリスクが高い、活動性の医学的疾患(複数可)、例えば全身性感染症(例えば、梅毒もしくは抗生物質を必要とする他の感染症)、凝固障害、または心臓血管系、呼吸器系、もしくは免疫系の他の活動性の主要な医学的疾患を有していた患者。
7.患者は、活動性または以前に記録された自己免疫または炎症性障害(肺炎、炎症性腸疾患[例えば、大腸炎もしくはクローン病]、憩室炎[憩室症を除く]、全身性紅斑性狼瘡、サルコイドーシス症候群、またはウェゲナー症候群[多発血管炎を伴う肉芽腫症、グレイブス病、関節リウマチ、下垂体炎、ブドウ膜炎等])を有しない場合がある。以下は、この基準の例外であった。
○白斑または脱毛症を有する患者。
○甲状腺機能低下症(例えば、橋本症候群に続く)が安定している患者
○ホルモン補充療法。
○全身療法を必要としない任意の慢性皮膚疾患。
○食事療法だけで制御されるセリアック病の患者。
8.治療開始前28日以内に生ワクチン接種または弱毒化ワクチン接種を受けていた患者。
9.何らかの形態の原発性免疫不全症(重症複合免疫不全症[SCID]及び後天性免疫不全症候群[AIDS]など)を有していた患者。
10.治験薬のいずれかの成分に対する過敏症の病歴を有する患者。TILは、以下のうちのいずれかを含むがこれらに限定されない、TIL製品製剤のいずれかの成分に対する既知の過敏症を有する患者には投与されなかった。
○●NMA-LD(シクロホスファミド、メスナ、及びフルダラビン)
○●Proleukin(登録商標)、アルデスロイキン、IL-2
○●アミノグリコシド系抗生物質(すなわち、ストレプトマイシン、ゲンタマイシン[ゲンタマイシン過敏症の皮膚検査陰性者を除く])
○●ジメチルスルホキシドを含むTIL産物製剤の任意の成分
○[DMSO]、HSA、IL-2、及びデキストラン-40
○●ペムブロリズマブ
11.左心室駆出率(LVEF)が45%未満の患者、またはニューヨーク心臓協会クラスII以上の患者。60歳以上の患者、あるいは虚血性心疾患、胸痛、または臨床的に重大な心房性及び/または心室性不整脈の病歴のある患者において、不可逆的な壁運動異常を示す心臓ストレス試験。
○治験依頼者のメディカルモニターの承認を得て、駆出率及び心臓病クリアランスが十分であれば、心臓ストレス試験に異常がある患者を登録することができた。
12.閉塞性または拘束性肺疾患があり、予測正常値の60%以下のFEV1(1秒の強制呼気量)が記録されている患者。
○●患者が上気道の解剖学的構造の異常(すなわち、気管切開)のために信頼できる肺活量測定を行うことができなかった場合は、6分間の歩行試験を使用して呼吸機能を評価した。年齢及び性別に対して予測される少なくとも80%の距離を歩くことができなかった患者、または試験中の任意の時点で低酸素症の証拠を示した患者(SpO2<90%)は除外される。
13.過去3年以内に別の原発性悪性腫瘍があった患者(治療を必要としなかった、または1年以上前に治癒的に治療された患者を除き、治験責任医師の判断では、非黒色腫皮膚癌、DCIS、LCIS、前立腺癌グリーソンスコア≦6または膀胱癌を含むが、これらに限定されない重大な再発リスクをもたらさなかった)。
14.治療開始から21日以内に治験薬を用いた別の臨床試験への参加。
研究エンドポイント及び計画された分析
一次エンドポイント及び二次エンドポイントは、コホートによって別々に分析した。
一次エンドポイント:
ORRは、有効性分析セットの中でRECIST1.1に従って治験責任医師が評価した最良の応答として確認されたPRまたはCRのいずれかを達成した患者の割合として定義された。
客観的反応を各疾患評価ごとに評価し、ORRは、対応する両側90% CIを用いて二項比率として表された。各コホートの一次分析は、評価期間の早期に進行/期限切れまたは中止されない限り、コホート毎に治療を受けたすべての患者が12ヶ月間追跡される機会があるときに行った。
安全性一次エンドポイントは、各コホート内のグレード3以上のTEAE発生率によって測定され、対応する両側90% CIの二項比率として表された。
二次エンドポイント:
有効性:
二次有効性エンドポイントは、次のように定義された。
治験責任医師によって評価された確認済みCRを達成した応答者に基づくCR率。DCRは、確認されたPR/CRまたは持続的なSD(少なくとも6週間)を達成した患者数の合計を、有効性分析セットの患者数で割り、100%を掛けたものとして導き出された。CR率及びDCRは、点推定及びその両側90% CIを使用して要約した。
DORは、客観的な応答を達成した患者の間で定義された。再発性もしくは進行性疾患が客観的に記録された最初の日付、またはその後の抗癌療法の受容もしくは患者の死亡(最初に記録された方)まで、初回応答(PR/CR)基準が満たされていることから測定した。PDを経験していない、またはデータカットもしくは最終データベースロックの時点より前に死亡していない患者は、腫瘍状態の適切な評価が行われた最終日に事象時間が打ち切られる。
PFSは、リンパ球枯渇からPDまでの時間(月単位)、または何らかの原因による死亡のいずれか早い方の事象として定義された。PDを経験していない、またはデータカットもしくは最終データベースロックの時点で死亡していない患者は、腫瘍状態の適切な評価が行われた最終日に事象時間が打ち切られた。
OSは、リンパ球枯渇の時点から何らかの原因による死亡までの時間(月単位)として定義された。データカットまたは最終的なデータベースロックの時点までに死亡していない患者は、既知の生存状態の最終日に事象時間が打ち切られた。
DOR、PFS、及びOSは、右側打ち切りを受けた。カプラン・マイヤー法を使用して、事象までの時間の有効性エンドポイントを要約する。腫瘍評価のベースラインデータは、すべてのコホートのリンパ球枯渇前の最後の走査であった。
上記の有効性パラメーターは、ベースラインの疾患特徴:BRAFステータス(コホート1Aのみ)、HPVステータス(コホート2Aのみ)、扁平上皮または非扁平上皮肺疾患(コホート3A及び3Bのみ)、ならびに抗PD-L1ステータスによって定義されたサブセットに適用可能なコホートについて推定される。
実施例15:固形腫瘍を有する患者における自己腫瘍浸潤リンパ球の第2相多施設研究
この実施例の研究は、選択された固形腫瘍(転移性黒色腫、頭頸部扁平上皮癌、及び非小細胞肺癌(NSCLC))の患者における自己腫瘍浸潤リンパ球(TIL)の第2相多施設グローバル非盲検研究である。この実施例は、実施例10~17を含む本明細書の実施例に従って製造され、本出願全体を通して説明され、凍結保存されるTIL製品を使用し、22日間の製造プロセスを有する。患者がシクロホスファミド(60mg/kg×2日)及びフルダラビン(25mg/m×5日)による骨髄非破壊的リンパ球枯渇の調製レジメンを完了した後、TIL製品の単回注入を行った。以下に説明されるように、4つの患者コホートが存在する。
●コホート1A(併用コホート):免疫療法ナイーブであり、3選択以下の前の全身療法が3つ以下である、IIIC期またはIV期の切除不能または転移性黒色腫の患者。これらの患者は、ペムブロリズマブと合わせてTIL製品を受容する。
●コホート2A(併用コホート):免疫療法ナイーブであり、3選択以下の前の全身療法がある、進行性、再発性、または転移性の頭頸部扁平上皮癌患者。これらの患者は、ペムブロリズマブと合わせてTIL製品を受容する。
●コホート3A(併用コホート):免疫療法ナイーブであり、3選択以下の前の全身療法がある、局所進行性または転移性(ステージIII-IV)のNSCLC患者。これらの患者は、ペムブロリズマブと合わせてTIL製品を受容する。
●コホート3B(単剤コホート):3つ以下の全身療法の一部として、チェックポイント阻害剤(抗PD-1/抗PD-L1)による全身療法を以前に受けたことがある、ステージIII-IVのNSCLC患者。これらの患者は、単剤としてTIL製品を受容する。
2人のNSCLC患者がコホート3B(免疫チェックポイント阻害剤後のTIL単独)に登録され、42日目に最初の反応評価訪問を完了した)を以下に説明する。
患者Aは、ステージIVA肺腺癌と診断された63歳の女性である。彼女は、ペムブロリズマブ、カルボプラチン/ベバシズマブ、及びビノレルビンを含む3選択以下の以前の全身療法を受けていた。以前のペムブロリズマブ療法に対する彼女の最良の応答は、進行性疾患であり、カルボプラチン/ベバシズマブに対する応答は、部分応答であり、彼女のビノレルビン応答は、評価できなかった(彼女は応答評価の前に中止した)。彼女は、TILの生成のために下葉肺切除術を受け、TIL製品の3.75×10個の細胞を注入した。患者は、最初の応答評価(42日目)のために訪問し、そこでのコンピューター断層撮影(CT)走査は、ベースライン走査と比較して腫瘍量の4%低減を示し、これはRECIST1.1による安定した疾患応答である。
患者Bは、ステージIVBの基底細胞扁平上皮癌と診断された70歳の女性である。彼女は、カルボプラチン/アブラキサン、ニボルマブ、及びシスプラチン/ゲムシタビンを含む3選択以下の前の治療を受けていた。以前のカルボ/アブラキサンに対する彼女の最良の応答は評価できなかった(毒性のために治療が中止された)、ニボルマブに対する応答は、進行性疾患であり、シスプラチン/ゲムシタビンは部分応答であった。彼女は、TILの生成のために脾臓病変切除を受け、TIL製品の39×10個の細胞を注入した。患者は、最初の応答評価(42日目)のために訪問し、そこでのCT走査は、ベースライン走査と比較して腫瘍量の44%低減を示し、これはRECIST1.1による部分応答である。
実施例16:局所進行性または転移性非小細胞肺癌患者における自己腫瘍浸潤リンパ球の第2相多施設研究
この実施例は、局所進行性、切除不能または転移性の非小細胞肺癌(NSCLC)で、アクショナブルなドライバー変異がなく、チェックポイント阻害剤(CPI)+化学療法±ベバシズマブ(ベバシズマブ(AVASTIN)、VEGFA阻害剤を含む)からなる承認された単一の全身療法中の疾患進行またはそれに続く疾患進行を有する患者の治療に関するものであり、治療のためのコホートを以下に要約する。
●コホート1:CPI治療前に腫瘍がプログラム細胞死-リガンド1(PD-L1)を発現しなかった患者(腫瘍割合スコア[TPS]<1%)。
●コホート2:CPI治療前に腫瘍がPD-L1(TPS≧1%)を発現した患者。コホート3:CPI治療前に腫瘍がPD-L1(TPS<1%)を発現しなかった患者で、以下のうちの少なくとも1つが原因でTIL生成のための外科的採取を安全に受けられない患者:
〇許容できない外科的リスク、または
〇固形腫瘍における奏効評価基準(RECIST)v1.1評価には、外科的にアプローチ可能な病変が必要であった。
●コホート4:再治療コホート:この研究のコホート1、2または3でTILベースの免疫療法で以前に治療されたことのある患者。
治療は、患者指向の療法のための個々の患者の腫瘍由来の自己TILベースの免疫療法を使用して行われる。
研究の詳細
自己TIL療法レジメン
TILベースの免疫療法治療レジメンは、TILベースの免疫療法注入の前に合計5日間のシクロホスファミド及びフルダラビンを使用したNMA-LD調製レジメンのコースを含み、TILベースの免疫療法注入後のIL-2投与(最大6回の用量)の限られたコースを含んでいた。移送されたTILの移植、拡張、及び活性化をサポートするために、NMA-LD調製レジメン及びIL-2をレジメンに含めた。
いくつかの調製レジメンがTIL療法と併せて使用されていた。NMA-LDの調製レジメンには、シクロホスファミド/フルダラビン、全身照射(TBI)、または両方の組み合わせが含まれた。本例示的な研究は、cy-fluレジメンを利用した。現在の研究で使用されているNMA-LD調製レジメンは、国立がん研究所(NCI)によって開発及び試験された方法に基づいており、患者の入院期間を短縮するために、2日間のシクロホスファミドと5日間のフルダラビンを併用した。各患者は、TILベースの免疫療法の注入前にNMA-LD調製レジメンを受ける。
治療の簡単な説明
治療は、すぐに注入可能な自己TILベースの免疫療法であった。TILベースの免疫療法は、個々の患者の腫瘍から取得され、サイトカインIL-2及びマウスモノクローナル抗体(mAb)からヒトCD3(OKT3)の存在下での細胞培養を介してエクスビボで拡張した自己TILから構成された。
最終医薬品は、IV注入のために製剤化された凍結保存された生細胞懸濁液であった。エクスビボで拡張された自己TILは、CryoStor(登録商標)CS10凍結保存培地/PlasmaLyte(最終ジメチルスルホキシド[DMSO]濃度:5%)中で、0.5%ヒト血清アルブミン(HSA)及び300IU/mL(12ng/mL)のIL-2とともに製剤化された。製剤化された製品を、気相液体窒素中で-150℃未満に制御された速度で凍結し、クライオシッパーで適切な臨床現場に発送し、患者に注入するために使用する前に解凍した。
TILの産生及び拡張
製造プロセスは、生存可能な腫瘍材料を含有する腫瘍病変の外科的切除またはコア生検によって臨床現場で開始された。複数の別個の病変生検の集合体を患者から切除することもでき、患者の安全性が認められる場合は奨励された。腫瘍検体を輸送培地に置き、速達便で2~8℃で適正製造基準(GMP)製造施設に発送した。GMP製造施設に到着すると、腫瘍検体を断片に解剖し、次いで活性化し(初期拡張ステップ)、急速拡張プロトコル(REP)段階に必要な生細胞の最小数を生成した。腫瘍はまた、酵素的に解離することもでき、TILは、REPに進む前にバイオマーカーの発現のために選択することができる。REPステージ(第2の拡張ステップ)は、IL-2、OKT3、及び照射された同種異系末梢血単核細胞(PBMC)の存在下で細胞をさらに拡張させる。次いで、REP拡張細胞を採取し、洗浄し、血液輸送/注入バッグ中に製剤化して、宅配便によって臨床現場に発送する。TILベースの免疫療法の製造プロセスの図は、図34及び35に提供される。
TILベースの免疫療法最終製品の各凍結保存バッグを、患者特有のラベルでラベル付けした。TILベースの免疫療法は、患者に投与するために製造施設から臨床現場に発送された。
この実施例は、局所的に進行した切除不能または転移性NSCLCを有する患者におけるTILベースの免疫療法を評価する前向き、非盲検、マルチコホート、非ランダム化、多施設第2相研究に関連していた。
以下のコホートを研究した。
コホート1:既知のアクショナブルなドライバー変異がなく、CPI治療の前に腫瘍がPD-L1(腫瘍割合スコア[TPS]<1%)を発現しなかったステージIVのNSCLC患者、CPI+化学療法±ベバシズマブの併用からなる単一の承認された全身療法中またはその後に疾患進行が認められた患者、TIL産生のために直径が最小1.5cmの少なくとも1つの切除可能な病変(または凝集した病変)を有し、切除後にRECIST 1.1によって定義されるように少なくとも1つの残りの測定可能な病変を有していた患者における、単剤療法としてのTILベースの免疫療法。
コホート2:既知のアクショナブルなドライバー変異がなく、CPI治療の前に腫瘍がPD-L1(TPS>1%)を発現したステージIVのNSCLC患者、CPI+化学療法±ベバシズマブの併用からなる単一の承認された全身療法中またはその後に疾患進行が認められた患者、及びTIL産生のために直径が最小1.5cmの少なくとも1つの切除可能な病変(または凝集した病変)を有し、切除後にRECIST1.1によって定義されるように少なくとも1つの残りの測定可能な病変を有していた患者における、単剤療法としてのTILベースの免疫療法。
コホート3:任意の既知のアクショナブルなドライバー変異がなく、腫瘍がCPI治療の前にPD-L1(TPS<1%)を発現しなかったステージIVのNSCLC患者、CPI+化学療法±ベバシズマブの併用からなる単一の承認された全身療法中またはその後に疾患進行が認められた患者、及び以下:1)許容できない外科的リスク、または2)外科的にアプローチ可能な病変が、RECIST評価のために必要である、のうちの少なくとも1つが原因でTIL生成のための外科的採取を安全に受けることができなかった患者における、単剤療法としてのTILベースの免疫療法。
コホート4:コホート1、2または3への参加の一環として以前にTILベースの免疫療法を受けた患者における、再治療としてのTILベースの免疫療法単剤療法。
コホート1、2、3、及び4について、すべての患者は、シクロホスファミド及びフルダラビンからなる骨髄非破壊的リンパ球枯渇(NMA-LD)前処置レジメンが先行して、自己凍結保存TILベースの免疫療法を受けた。TILベースの免疫療法注入後、最大6用量のIV IL-2(アルデスロイキンまたはそのバイオシミラーもしくはバリアントなど)を投与した。あるいは、デクレッシェンドIL-2または低用量IL-2を、本明細書に記載されるように使用してもよい。
TILベースの免疫療法による自己TIL療法には、以下の一般的なステップが含まれていた。
●自己TIL細胞製品のソースとして機能した自己組織を提供するための腫瘍採取、
●中央適正製造基準(GMP)施設における自己TILベースの免疫療法治験薬(IP)の製造、
●5日間の骨髄非破壊的リンパ球枯渇(NMA-LD)前処置レジメン、
●TILベースの免疫療法製品の注入(0日目)、及び
●6用量以下のIV IL-2の投与。
主な目的:
独立審査委員会(IRC)(コホート1及び2)または治験責任医師コホート3及びコホート4によって評価された、固形腫瘍の奏効評価基準(RECIST1.1)を使用して、客観的奏効率(ORR)によって決定されたチェックポイント阻害剤(複数可)(CPI[s])+化学療法±ベバシズマブからなる単一の承認された全身療法中またはその後に疾患進行が認められた、アクショナブルなドライバー変異がない、局所的に進行した切除不能または転移性のNSCLC患者におけるTILベースの免疫療法の有効性を評価した。
副次的目的:
RECIST1.1を使用してORRによって決定され、治験責任医師によって評価される(コホート1及び2)、TILベースの免疫療法の有効性を評価した。
完全奏効率(CR);奏効期間(DOR);疾患制御率(DCR);RECIST1.1を使用して、IRC(コホート1及び2)ならびに治験責任医師(すべてのコホート)によって評価される無増悪生存期間(PFS);ならびに全生存期間(OS)を使用して、TILベースの免疫療法の有効性をさらに評価した。
グレード≧3の治療下で発現した有害事象(TEAE)の発生率によって測定した、NSCLC患者におけるTILベースの免疫療法の安全性プロファイルを特徴付けた。
コホート3のみ:コア生検からTILベースの免疫療法を生成する効率を評価した。
探索的目的:
TILベースの免疫療法の持続性を評価し、反応、転帰、及び毒性変数に影響を与える可能性のある免疫相関を特定した。
それぞれの適応症固有の健康関連生活の質(HRQoL)パラメータを評価した。
エンドポイント-主要エンドポイント:
ORRは、IRC(コホート1及び2)または治験責任医師(コホート3及び4)によってRECIST1.1に従って評価された。
エンドポイント-副次的エンドポイント:
重症度、重篤度、研究治療との関係、ならびに重篤な有害事象(SAE)、治療関連有害事象、及び早期治療中止または評価期間からの離脱または死亡につながる有害事象を含む、治療下で発現した有害事象(TEAE)の特徴。
RECIST1.1(コホート1及び2)に従ってIRCによって評価された、CR(完全奏効)率、DOR(奏効期間)、DCR(疾患制御率)、及びPFS(無増悪生存期間)。
RECIST1.1(すべてのコホート)に従って治験責任医師によって評価された、ORR(客観的奏効率)、CR率、DOR、DCR、及びPFS。
OS(全生存)。
コア生検から生成されたTIL製品の成功率(コホート3)。
エンドポイント-探索的エンドポイント:
TIL製品を含むT細胞のインビボ持続性を、経時的に患者の血液中のTIL製品特異的T細胞受容体-ベータ相補性決定領域3(CDR3)配列の存在を監視することによって評価した。製品及び末梢血試料中に存在するCDR3配列を、ディープシーケンシングを使用して同定した。
TILベースの免疫療法の活性の予測及び薬力学的臨床バイオマーカーの同定を目的とした探索的エンドポイント:
●TILベースの免疫療法の表現型及び機能的特徴、
●腫瘍組織の免疫プロファイル、
●TIL製品、腫瘍組織、及び/またはPBMCの遺伝子発現プロファイル、
●腫瘍の変異ランドスケープ、
●循環免疫因子、ならびに
●PBMCの免疫組成物。
欧州がん研究治療機関(EORTC)の生活の質質問票(QLQ)C30及びQLQ LC13によって評価されたHRQoL(健康関連の生活の質)。
研究デザインの詳細:
前向き、非盲検、マルチコホート、非ランダム化、多施設第2相研究では、TILベースの免疫療法による養子細胞療法(ACT)が評価された。
すべての患者は、以下のステップからなるTILベースの免疫療法を受けた。
●腫瘍採取は自己TIL細胞製品のソースとして機能する自己組織を提供した、
●中央適正製造基準(GMP)施設における自己TILベースの免疫療法治験薬(IP)の製造、
●5日間の骨髄非破壊的リンパ球枯渇(NMA-LD)前処置レジメン、
●TILベースの免疫療法製品の注入(0日目)、及び
●6用量以下のIV IL-2の投与。
別段の指定がない限り、以下の一般的な連続期間が4つのコホートすべてで発生する。
1.スクリーニング期間:インフォームドコンセントフォーム(ICF)の署名から登録まで
2.前治療期間:登録から調製NMA-LDレジメンの開始まで。
3.治療期間:調製NMA-LDの開始から治療終了(EOT)来院まで。これは、NMA-LD(-5日目~-1日目)、TILベースの免疫療法注入(0日目)、続いてIL-2投与(0日目または1~3日目または4日目)を含む、8~9日間の治療で構成された。EOTは、0日目のおよそ30日後に起こった。
4.治療後のフォローアップ期間。これは以下で構成されている。
a.治療後有効性フォローアップ期間(TEFU):疾患の進行または新しい抗がん療法の開始のいずれか早い方によって促される、EOT来院から研究完了(治療後5年[60ヶ月])または有効性評価終了(EOEA)来院まで。
b.長期フォローアップ期間(LTFU):上記のようなEOEAから研究完了まで(治療後5年[60ヶ月])。
研究参加者(登録患者)は、早期にLTFUに移行する(例えば、同意の部分的撤回、または何らかの理由でTILベースの免疫療法を受けないと判断された場合)。研究の早期中止は、治験依頼者による同意撤回、死亡、フォローアップ不能、または研究終了のいずれかによって促された。研究デザインのフローチャートを図36に提示する。
詳細な用量及び治療スケジュール:
TILベースの免疫療法
患者は、0日目(すなわち、-5日目~-1日目)に予定されているTILベースの免疫療法注入の前に開始された5日間の前処置NMA-LDレジメンを受ける。NMA LDレジメンは、-5日目及び-4日目のメスナ(現場の標準治療またはUSPI/SmPC毎)を伴う2日間の静脈内(IV)シクロホスファミド(60mg/kg)、及び5日間のフルダラビンIV(25mg/m2、-5日目~-1日目)で構成された。
600,000IU/kgの用量でIVでのIL-2 IV投与は、0日目のTILベースの免疫療法注入の完了の3時間後、ただし24時間後までに開始された。追加のIL-2用量は、およそ8~12時間毎に、最大6回の合計用量で与えた。
メスナの調製
メスナは、シクロホスファミド投与に関連する出血性膀胱炎のリスクを低減するために投与された。メスナは、局所標準に従って連続的または断続的な注入として投与された。
シクロホスファミドの量が減少した場合、メスナの総用量は調整されなかった。施設標準に従ってメスナ注入または注入の量を希釈する。
シクロホスファミド及びメスナの注入
250mLまたは500mLの総体積中のシクロホスファミド(60mg/kg)(例えば、水中5%のデキストロース[D5W]または0.9%の塩化ナトリウム[NaCl])。
メスナ(15mg/kg)を、連続的に注入した場合、シクロホスファミドをおよそ2時間にわたって(-5日目及び-4日目に)注入し、次いで、各シクロホスファミド用量と同時に開始して24時間にわたって、好適な希釈剤中で残りの22時間、3mg/kg/時間の速度で注入した。
投与された総用量は、シクロホスファミドの用量の少なくとも1.3倍であった。出血性膀胱炎の予防のために、高用量または継続用量のメスナを投与することができる。
フルダラビンの注入
フルダラビン(25mg/m2)は、-5日目~-1日目の5日間連続して1日1回、およそ30分間にわたってIV投与されるものとした。
参加期間:
全体として、研究参加期間は、治療から完了まで最大5年となる。
選択された包含基準:
NSCLC(扁平上皮、非扁平上皮、腺癌、大細胞、または混合組織型)の組織学的または病理学的に確定された診断を受けており、受けたCPI治療(すなわち、最初の治療選択を通知した歴史的TPS)の前に腫瘍割合スコア(TPS)によって決定されたPD-L1発現状態が文書化されていなければならない(コホート1及び3の場合、TPS<1%、ならびにコホート2の場合、TPS≧1%)。
CPI及び化学療法を同時に含む単一の全身療法を受けており、この単一の全身療法では放射線疾患の進行が記録されている。
アジュバントまたはネオアジュバント設定における、または決定的な化学放射線療法の一部としての以前の全身療法は、疾患がそのような療法の完了の間または12ヶ月以内に進行しなかった場合、治療選択として計数されなかった。このプロトコルのTIL治療前は、コホート4(再治療)患者の治療選択として計数されなかった。
運動耐性が予想される年齢の正常範囲の85%以上であり、虚血または臨床的に重大な不整脈の徴候または症状はなかった。
米国東海岸がん臨床試験グループ(Eastern Cooperative Oncology Group、ECOG)のパフォーマンスステータスは0または1であり、治験責任医師の意見において、推定平均余命は6ヶ月超であった。
コホート1及び2:TIL産生のために、直径が最小1.5cmの切除可能な病変(または凝集病変)を少なくとも1つ有していなければならない。
コホート3のみ:患者は、単一のRECIST1.1測定可能な病変を有し、外科的採取のために利用可能な追加の病変がないか、またはTIL生成のために安全に外科的採取を受けることができないが、TIL生成のために十分な放射線学的ガイド付きコア生検を介して安全に腫瘍採取を有することができる。
コホート4:いずれかのパラダイムに従った。
すべてのコホート:採取を検討した病変が以前に照射された領域内にあった場合、病変は、採取前にX線画像による進行を示し、照射は登録の少なくとも3ヶ月前に完了していなければならない。患者は、プロトコルが必要とする検査に適正な組織病理標本を有していなければならない。
TIL製造のための腫瘍採取後、すべての患者は、以下の事項を考慮して、RECIST1.1によって定義されるように、少なくとも1つの残りの測定可能な病変を有していなければならない。
●以前に照射された領域内の病変は、それらの病変に進行が示され、照射が登録の少なくとも3ヶ月前に完了していない限り、標的病変として選択されなかった。
●コホート1及び2のみ:RECIST v1.1毎に依然として測定可能なTIL生成のために外科的に部分切除された病変を、非標的病変として選択することができるが、応答評価の標的病変としては機能することができなかった。
●コホート3のみ:TIL生成のコア生検に他の病変が利用できなかった場合、単一のRECIST v1.1測定可能病変が、コア生検の採取部位及び応答モニタリングの病変の両方として機能していた可能性がある。
●コホート4:いずれかのパラダイムに従ってもよいが、応答には少なくとも1つのRECIST v1.1測定可能な病変がある必要がある。
有効性評価:
NSCLC患者における単一療法としてのTILベースの免疫療法の以下の有効性パラメータを各コホートで調査した:ORR、CR率、DOR、DCR、PFS、及びOS。
統計上の考慮事項:
統計解析は、有効性及び安全性パラメータの推定に基づいており、コホート別に行われる。正式な統計学的比較は、コホート間で適用されなかった。
主要有効性エンドポイントは、IRC(コホート1及び2)または治験責任医師(コホート3及び4)によってRECIST v1.1に従って評価されたORRであった。
ORR、CR率、及びDCRを、Clopper-Pearson正確法に基づく点推定及び両側95%信頼限界を使用して要約した。DOR、PFS、及びOSなどの事象までの時間有効性エンドポイントを要約するために、Kaplan-Meier法を使用した。DOR分析は、客観的奏効を達成した患者に対して行った。
安全性解析は記述的であり、研究の中止、バイタルサイン、及び臨床検査につながるTEAE、SAE、及びAEの要約に基づいていた。
試料サイズの決定:
コホート1、2及び3において、TILベースの免疫療法を注入された計画患者の総数は、およそ95人であった。
コホート1及び2:各コホートでおよそ40人の患者。各コホートについて、ミニマックスを用いたサイモンの2段階デザイン(Simon,1989)を使用して、ORR>10%の代替仮説に対する≦10% ORRの帰無仮説を検証した。第1段階では、25人の患者が集められた。これらの25人の患者で治療に応答する患者が2人以下であれば、コホートを終了することができた。それ以外の場合、ステージ1の解析と同時に、合計40人の患者に対してステージ2への拡張が起こった。第2段階の終わりに、合計40人の患者のうち少なくとも7人の患者が治療に反応した場合、帰無仮説は却下された。この2段階デザインは、0.1の片側アルファレベルでのTILベースの免疫療法のための20% ORRの仮定に基づいて、10% ORRの帰無仮説を却下するために70%のパワーを提供した。
コホート3:およそ15人の患者が計画され、これにより、Clopper-Pearson正確法による半幅90%信頼区間(CI)<0.23の推定ORRが得られた。
コホート4:再治療コホート:この研究のコホート1、2または3でTILベースの免疫療法で以前に治療されたことのある患者。
実施例17:再発性非小細胞肺癌(NSCLC)患者に単独で投与されるIOVANCE腫瘍浸潤リンパ球(TIL)に対する完全奏効(CR):症例報告
序文
NSCLCは最も一般的で致命的ながんであり、世界的な有病率は年間200万人以上、170万人以上が死亡している。治療の選択肢は限られており、白金ダブレット化学療法及びチェックポイント阻害剤(CPI)を含む標準治療に失敗した後の再発転移性NSCLC(mNSCLC)を有する患者の予後は依然として不良である。CPI後に進行した患者にとって、NSCLCには満たされていない重要な医療ニーズが残っている。
腫瘍浸潤リンパ球(TIL)による養子細胞療法は、黒色腫、子宮頸癌、NSCLC及びHNSCCを単独でまたはチェックポイント阻害剤(CPI)と組み合わせて含む様々な悪性腫瘍において応答を示している。
PD-L1発現レベルが1%未満の重度に前治療された患者の症例研究において、TIL療法の安全性及び有効性が提示される。
方法
我々は、咳及び風邪の症状を呈した後に診断された転移性NSCLCを有する72歳の女性、非喫煙者について報告している。検査には、135mmの肺腫瘤を示す胸部コンピューター断層撮影(CT)が含まれていた。病期分類では、肺、脾臓及び結節性リンパ病変が同定された(T4N1M1b、ステージIVB)、PD-L1<1%)。生検により基底様扁平上皮細胞癌が確認された。治療法は、カルボプラチン及び+Nabパクリタキセルで開始したが、アレルギー反応及び耐容性の低さにより3サイクル後に中止した。第二選択の治療法は、ニボルマブからなり、疾患の進行により4サイクル後に中止した。患者のPD-L1レベルは、1%未満であった。次いで、ゲムシタビン及びシスプラチンダブレット療法の第三選択レジメンを投与した。4サイクル後にシスプラチンを中止し、6サイクル後にゲムシタビンを完了した。初期反応の後、疾患の進行が観察された。
ゲムシタビンを完了してからおよそ4ヶ月後、疾患が横隔膜の下で急速に進行し、患者は(NCT03645928)、TILによるACTを評価する前向き、非盲検、マルチコホート、非ランダム化、多施設第2相研究に登録した。患者のECOGパフォーマンスステータスは1であり、ベースライン標的病変の直径和SODは50mmであり、TILを受ける前の研究では、スクリーニングからベースラインまでSODが127%増加した。患者は、TIL生成のために腫瘍切除を受け、単回療法及び1回治療としてTILを受けた。前処置化学療法は、シクロホスファミド/フルダラビン、次いでTIL、続いて3用量の600,000IU/kg IL-2(すなわち、アルデスロイキン)からなった。RECIST v1.1を使用して、治験責任医師による有効性評価とともに、治療の耐容性及び安全性を継続的に評価した。
結果
有害事象は、リンパ破壊及びIL-2の既知の毒性と一致していた。治療中に発生した有害事象は、急性、自己制限、管理可能であり、かつ持続期間が短かった。有害事象≧G3は、G4汎血球減少症、G3低血圧症及び菌血症に限定された。患者は、重篤な有害事象を経験しなかった。
6週目に、標的病変におけるPRの部分奏効(44%減少)が患者の最初の評価で観察された。TILの投与後7ヶ月で、直径和(SOD)の低減が48%減少したとき、陽電子放射断層撮影(PET)CTを実施し、残留CT病変内で代謝活性を示さなかった。患者は、PET-CTによって完全奏効(CR)とみなされる。試験は、TIL投与後15ヶ月で継続し、総SOD低減率は60%に達した。患者は、TIL投与以来、他の抗がん療法を投与する必要がなかった。
結論
この症例提示は、本出願に記載のTILによる治療が、CPIを含む複数の標準的なケア療法の後にmNSCLCで疾患進行を有する転移性NSCLC患者に治療選択肢を提供することができることを実証する。登録は進行中であり、NSCLC患者におけるTILの影響を監視及び評価するための研究が続けられている。
実施例18:凍結保存TIL細胞療法の例示的生産
この実施例は、現在の適正組織基準及び現在の適正製造基準に従った、G-REXフラスコ内のTIL細胞療法プロセスの例示的なcGMP製造を説明する。
主要なプロセス情報
0日目のCM1培地の調製
BSC内で、試薬をRPMI 1640培地ボトルに追加した。ボトル当たり追加された以下の試薬を追加した:不活化ヒトAB血清(100.0mL)、GlutaMax(10.0mL)、硫酸ゲンタマイシン、50mg/mL(1.0mL)、2-メルカプトエタノール(1.0mL)を加熱した。
BSCから不要な材料を取り出した。BSCから培地試薬を抜き取り、配合された洗浄培地の調製のために硫酸ゲンタマイシン及びHBSSをBSCの中に残した。
IL-2アリコートを解凍した。すべての氷が融解するまで、1つの1.1mLのIL-2アリコート(6×106IU/mL)(BR71424)を解凍した。IL-2:ロット番号及び有効期限を記録した。
IL-2ストック溶液を培地に移した。BSC内で、1.0mLのIL-2ストック溶液を、調製されたCM1の0日目培地ボトルに移した。CM1の0日目培地1ボトル及びIL-2(6×106IU/mL)1.0mLを追加した。
G-REX100MCSをBSCの中に通過させた。無菌的にG-REX100MCS(W3013130)をBSCの中に通過させた。
すべての完全なCM1の0日目培地をG-REX100MCSフラスコにポンプで注入した。組織断片円錐形またはGRex100MCS。
0日目の腫瘍洗浄培地の調製
BSC内で、5.0mLのゲンタマイシン(W3009832またはW3012735)を1本の500mLのHBSS培地(W3013128)ボトルに追加した。ボトル当たりの追加:HBSS(500.0mL)、硫酸ゲンタマイシン、50mg/mL(5.0mL)。1Lの0.22ミクロンフィルターユニット(W1218810)をとおして調製されたゲンタマイシンを含有するHBSSを濾過した。
0日目の腫瘍処理
腫瘍を取得した。QARから腫瘍検体を取得し、即時に処理のために2~8℃における部屋に移した。
腫瘍洗浄培地を等分した。
8インチ鉗子(W3009771)を使用した腫瘍洗浄1、検体ボトルから腫瘍を取り出し、調製された「洗浄1」皿に移した。腫瘍洗浄2及び腫瘍洗浄3が続いた。
腫瘍を測定した。腫瘍を評価した。腫瘍領域全体の30%未満が壊死及び/または脂肪組織であることが観察されたかどうかを評価した。該当する場合:クリーンアップ解剖。腫瘍が大きく、外部の組織の30%未満が壊死/脂肪性であることが観察された場合、メス及び/または鉗子の組み合わせを使用して、腫瘍の内側構造を温存しながら壊死/脂肪組織を除去することによって、「クリーンアップ解剖」を行った。
メス及び/または鉗子の組み合わせを使用して、腫瘍を解剖し、腫瘍検体を均等で適切なサイズの断片(最大6つの中間断片)に切断した。中間腫瘍断片を移した。腫瘍断片をサイズが約3×3×3mmの切片に解剖した。乾燥を防止するために中間断片を保存した。
中間断片解剖を繰り返した。収集された切片の数を決定した。望ましい組織が残っている場合、「好ましい中間断片」6ウェルプレートから追加の好ましい腫瘍片を選択し、最大50片のために液滴を充填した。
コニカルチューブを準備した。腫瘍片を50mLコニカルチューブに移した。G-REX100MCSのためにBSCを準備した。インキュベーターからG-REX100MCSを取り出した。無菌的にG-REX100MCSフラスコをBSCの中に通過させた。腫瘍断片をG-REX100MCSフラスコに追加した。切片を均等に分配した。
以下のパラメータにおいてG-REX100MCSをインキュベートした:G-REXフラスコをインキュベートした:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、CO2パーセンテージ:5.0±1.5%CO2。計算:培養の時間、下限=培養の時間+252時間、上限=培養の時間+276時間。
プロセスが完了した後、いずれの残りの温められた培地も廃棄し、IL-2のアリコートを解凍した。
11日目-培地の調製
インキュベーターを監視した。インキュベーターを監視した。インキュベーターパラメータ:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、CO2パーセンテージ:5.0±1.5%CO2。
3本の1000mLのRPMI 1640培地(W3013112)ボトル及び3本の1000mLのAIM-V(W3009501)をインキュベーター内で30分間以上温めた。インキュベーターからRPMI 1640培地を取り出した。RPMI 1640培地を調製した。培地を濾過した。3つのIL-2の1.1mLのアリコート(6×106IU/mL)(BR71424)を解凍した。インキュベーターからAIM-V培地を取り出した。IL-2をAIM-Vに追加した。10LのLabtainerバッグ及びリピータポンプ移送セットをBSCの中に無菌的に移した。
10LのLabtainer培地バッグを準備した。Baxaポンプを準備した。10LのLabtainer培地バッグを準備した。培地を10LのLabtainerにポンプで注入した。Labtainerバッグからポンプマティックを取り出した。
培地を混合した。バッグを穏やかにマッサージして混合した。試料計画に従って培地を試料採取した。20.0mLの培地を取り出し、50mLコニカルチューブに入れた。
BSC内で細胞計数希釈チューブを準備し、「細胞計数希釈液用」及びロット番号でラベル付けされた4.5mLのAIM-V培地を4本の15mLコニカルチューブに追加した。試薬をBSCから2~8℃に移した。1L移送パックを準備した。(プロセス注記5.11に従って)BSC溶接の外側で、「完全なCM2の11日目培地」バッグに取り付けられた移送セットへの1L移送パックを準備した。フィーダー細胞移送パックを準備した。完全なCM2の11日目培地をインキュベートした。
11日目-TIL採取
前処理表。インキュベーターパラメータ:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、CO2パーセンテージ:5.0±1.5%CO2。インキュベーターからG-REX100MCSを取り出した。300mL移送パックを準備した。移送パックをG-REX100MCSに溶接した。
TIL採取及びTIL採取の開始のためにフラスコを準備した。TILが採取された。GatheRexを使用して、血液フィルターをとおして300mL移送パックの中に細胞懸濁液を移した。付着した細胞について膜を点検した。
フラスコ膜をすすいだ。G-REX100MCS上のクランプを閉じた。すべてのクランプが閉じられていることを確実にした。TIL及び「上清」移送パックを熱融着した。TIL懸濁液の体積を計算した。試料採取のために上清移送パックを準備した。
Bac-T試料を引き出した。BSC内で、1L「上清」移送パックから約20.0mLの上清を引き上げ、滅菌50mLコニカルチューブに分注する。
試料計画に従ってBacTを接種した。適切なサイズのシリンジを使用して調製されたBacTとラベル付けされた50mLコニカルから1.0mLの試料を取り出し、嫌気性ボトルに接種した。
TILをインキュベートした。必要とされるまでTIL移送パックをインキュベーターに入れた。細胞計数及び計算を行った。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。生存率÷2。生細胞濃度÷2。計数の上限及び下限を決定した。下限:生細胞濃度の平均×0.9。上限:生細胞濃度の平均×1.1。許容限界内の両方の計数を確認した。行われた4つすべての計数から平均生細胞濃度を決定した。
TIL懸濁液の体積を調整した。細胞計数試料を取り出した後のTIL懸濁液の調整された体積を計算する。総TIL細胞体積(A)。除去された細胞計数試料の体積(4.0ml)(B)調整された総TIL細胞体積C=A-B。
総生TIL細胞を計算した。平均総細胞濃度*:総体積、総生細胞:C=A×B。
フローサイトメトリーのための計算:総生TIL細胞数が4.0×10個以上であった場合、フローサイトメトリー試料のために1.0×10個の細胞を取得するための体積を計算した。
フローサイトメトリーに必要とされる総生細胞:1.0×10個の細胞。フローサイトメトリーに必要とされる細胞の体積:1.0×10個の細胞Aで除算された生細胞濃度。
2.0×10個の生細胞に等しいTIL懸濁液の体積を計算した。必要に応じて、取り出すTIL細胞の過剰体積を計算し、過剰なTILを取り出し、必要に応じてTILをインキュベーターに入れた。必要に応じて、取り出された全過剰TILを計算した。
凍結のための標的細胞濃度が1.0×10細胞/mLである過剰なTIL細胞に追加するCS-10培地の量を計算した。必要に応じて、過剰なTILを遠心分離した。コニカルチューブを観察し、CS-10を追加した。
バイアルを充填した。適当なサイズのクライオバイアルに等分された1.0mL細胞懸濁液。SOP-00242毎の適切なサイズのクライオバイアルに等分された残余の体積。体積が≦0.5mLである場合、容量が0.5mLになるまでCS10をバイアルに追加する。
試料のTIL凍結保存
凍結保存のための1×10個の細胞を取得するために必要とされる細胞の体積を計算した。凍結保存のために試料を取り出した。TILをインキュベーターに入れた。
試料の凍結保存。
コニカルチューブを観察し、CS-10をゆっくりと追加し、追加された0.5mLのCS10を記録した。
11日目-フィーダー細胞
フィーダー細胞を取得した。LN2冷凍庫から少なくとも2つの異なるロット番号を伴うフィーダー細胞の3つのバッグを取得した。解凍する準備が整うまで、細胞をドライアイス上で保管した。水浴またはCryothermを準備した。37.0±2.0℃の水浴またはcytothermにおいて約3~5分間、または氷が消滅するまで、フィーダー細胞を解凍した。インキュベーターから培地を取り出した。解凍されたフィーダー細胞をプールした。フィーダー細胞を移送パックに追加した。シリンジから移送パックにフィーダー細胞を分注した。プールされたフィーダー細胞を混合し、移送パックをラベル付けした。
移送パック内のフィーダー細胞懸濁液の総体積を計算した。
細胞計数試料を取り出した。各試料に別個の3mLシリンジを使用して、不要注入ポートを使用してフィーダー細胞懸濁液移送パックから4×1.0mLの細胞計数試料を引き出した。各試料をラベル付けされたクライオバイアルに等分した。細胞計数を行い、増倍率を決定し、プロトコルを選択し、増倍率を入力した。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定し、限界内で確認した。
フィーダー細胞懸濁液の体積を調整した。細胞計数試料を取り出した後のフィーダー細胞懸濁液の調整された体積を計算した。全生存フィーダー細胞を計算した。必要に応じて追加のフィーダー細胞を取得した。必要に応じて追加のフィーダー細胞を解凍した。第4のフィーダー細胞バッグをジップトップバッグに入れ、37.0±2.0℃の水浴またはcytotherm内で約3~5分間解凍し、追加のフィーダー細胞をプールした。体積を測定した。シリンジ内のフィーダー細胞の体積を測定し、以下に記録した(B)。フィーダー細胞の新しい総体積を計算した。フィーダー細胞を移送パックに追加した。
必要に応じて希釈液を調製し、4.5mLのAIM-V培地を4本の15mLコニカルチューブに追加した。細胞計数を準備した。各試料に別個の3mLシリンジを使用して、不要注入ポートを使用して、フィーダー細胞懸濁液移送パックから4×1.0mLの細胞計数試料を取り出した。細胞計数及び計算を行った。行われた4つすべての計数から平均生細胞濃度を決定した。フィーダー細胞懸濁液の体積を調整し、細胞計数試料を除去した後のフィーダー細胞懸濁液の調整された体積を計算した。4.0mLを差し引いた総フィーダー細胞体積が取り出された。5×10個の生存フィーダー細胞を取得するために必要とされたフィーダー細胞懸濁液の体積を計算した。過剰なフィーダー細胞体積を計算した。取り出す過剰なフィーダー細胞の体積を計算した。過剰なフィーダー細胞を取り出した。
1.0mLシリンジ及び16G針を使用して、0.15mLのOKT3を引き上げ、OKT3を追加した。フィーダー細胞懸濁液移送パックを熱融着した。
11日目のG-REX充填及び播種
G-REX500MCSを設定した。「完全なCM2の11日目培地」をインキュベーターから取り出し、培地をG-REX500MCSにポンプで注入した。4.5Lの培地をG-REX500MCSにポンプで注入し、フラスコ上にマークされたラインまで充填した。必要に応じてフラスコを熱融着し、インキュベートした。フィーダー細胞の懸濁液移送パックを、G-REX500MCSに溶接した。フィーダー細胞をG-REX500MCSに追加した。熱融着した。TIL懸濁液移送パックをフラスコに溶接した。TILをG-REX500MCSに追加した。熱融着した。G-REX500MCSを37.0±2.0℃でインキュベートした。CO2パーセンテージ:5.0±1.5%CO2。
インキュベーション時間帯を計算した。16日目にインキュベーターからG-REX500MCSを取り出すための適切な時間を決定するための計算を行った。下限:インキュベーションの時間+108時間。上限:インキュベーションの時間132時間。
11日目の過剰TIL凍結保存
該当:過剰TILバイアルを凍結させた。凍結前にCRFが設定されていることを検証した。凍結保存を行った。バイアルを速度制御された冷凍庫から適切な保管場所に移した。凍結の完了時に、バイアルをCRFから適切な保管容器に移した。バイアルを適切な保管場所に移した。LN2における保管場所を記録した。
16日目の培地の調製
AIM-V培地を事前に温めた。培地バッグ1、2、及び3について培地が温められた時間を計算した。すべてのバッグが12~24時間の持続時間にわたって温められていることを確実にした。上清用の10LのLabtainerを設定した。ルアーコネクタを使用して、流体ポンプ移送セットのより大きな直径の端部を10LのLabtainerバッグのメス型ポートのうちの1つに取り付けた。上清用の10LのLabtainerを設定し、ラベル付けした。上清用の10LのLabtainerを設定した。BSCから取り出す前に、すべてのクランプが閉じられていることを確実にした。注記:上清バッグは、培地調製と同時に行われ得るTIL採取中に使用された。
IL-2を解凍した。すべての氷が融解するまで、CTS AIM V培地の1つのバッグ当たりIL-2(6×10IU/mL)(BR71424)の5×1.1mLアリコートを解凍した。100.0mLのGlutaMaxを等分した。IL-2をGlutaMaxに追加した。配合用のCTS AIM V培地バッグを準備した。配合用のCTS AIM V培地バッグを準備した。ステージBaxaポンプ。培地を配合することを準備した。GlutaMax+IL-2をバッグにポンプで注入した。パラメータを監視した:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、CO2パーセンテージ:5.0±1.5%のCO2。完全なCM4の16日目培地を温めた。希釈液を調製した。
16日目のREP分割
インキュベーターパラメータを監視した:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、CO2パーセンテージ:5.0±1.5%CO2。インキュベーターからG-REX500MCSを取り出した。1Lの移送パックを準備し、TIL懸濁液としてラベル付けし、1Lの重量を量った。
G-REX500MCSの減容。約4.5Lの培養上清をG-REX500MCSからSOP-01777当たり10LのLabtainerに移した。
TIL採取用のフラスコを準備した。上清を取り出した後に、赤色ラインへのすべてのクランプを閉じた。
TIL採取の開始。フラスコを激しく叩き、培地を旋回させて細胞を解放し、すべての細胞が引き離されていることを確実にする。
TIL採取。TIL懸濁液移送パックにつながるすべてのクランプを解放した。GatheRexを使用して、細胞懸濁液をTIL懸濁液移送パックの中に移した。注記:すべての細胞及び培地が収集されるまで、傾斜した縁を必ず維持すること。付着した細胞について膜を点検した。フラスコ膜をすすいだ。G-REX500MCS上のクランプを閉じた。TILを含む移送パックを熱融着した。上清を含む10LのLabtainerを熱融着した。細胞懸濁液を伴う移送パックの重量を記録し、細胞懸濁液を計算した。試料を取り出すための移送パックを準備した。細胞上清から試験試料を取り出した。
無菌性及びBacT試験試料採取:調製されたBacTとラベル付けされた15mLのコニカルから1.0mLの試料を取り出した。細胞計数試料を取り出した。BSC内で、各試料に別個の3mLシリンジを使用して、「TIL懸濁液」移送パックから4×1.0mLの細胞計数試料を取り出した。
マイコプラズマ試料を取り出した。3mLシリンジを使用して、TIL懸濁液移送パックから1.0mLを取り出し、調製された「マイコプラズマ希釈液」とラベル付けされた15mLコニカルに入れた。
播種用の移送パックを準備した。TILをインキュベーターに入れた。細胞懸濁液をBSCから取り出し、必要とされるまでインキュベーターに入れた。細胞計数及び計算を行った。最初に、0.5mLの細胞懸濁液を調製された4.5mLのAIM-V培地に追加することによって、細胞計数試料を希釈し、1:10希釈液を生じた。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定した。注記:希釈は、細胞の期待濃度に基づいて調整され得る。行われた4つすべての計数から平均生細胞濃度を決定した。TIL懸濁液の体積を調整した。細胞計数試料を取り出した後のTIL懸濁液の調整された体積を計算した。5.0mLを差し引いた総TIL細胞体積が試験のために取り出された。
総生TIL細胞を計算した。播種するフラスコの総数を計算した。注記:播種するG-REX500MCSフラスコの最大数は5であった。播種するフラスコの計算された数が5つを超えた場合、5つのみが利用可能な細胞懸濁液の体積全体を使用して播種された。
二次培養用のフラスコの数を計算した。準備されたバッグに加えて必要とされる培地バッグの数を計算した。計算されたように必要とされる2つのG-REX-500Mフラスコ毎に「CM4の16日目培地」の1つの10Lバッグを準備した。追加の培地が調製され、温められている間に、続けて第1のGREX-500Mフラスコ(複数可)を播種した。計算された数の決定された追加の培地バッグを調製し、温めた。G-REX500MCSを充填した。培地をポンプで注入するように準備し、4.5Lの培地をG-REX500MCSにポンプで注入した。熱融着した。充填を繰り返した。フラスコをインキュベートした。新しいG-REX500MCSフラスコに追加するTIL懸濁液の標的体積を計算した。フラスコの計算された数が5つを超える場合、5つのみが細胞懸濁液の体積全体を使用して播種されるであろう。播種用のフラスコを準備した。インキュベーターからG-REX500MCSを取り出した。ポンプで注入するためのG-REX500MCSを準備した。大型フィルターラインを除くすべてのクランプを閉じた。インキュベーターからTILを取り出した。播種用の細胞懸濁液を調製した。(プロセス注記5.11に従って)「TIL懸濁液」移送パックをポンプ入口ラインに滅菌溶接した。TIL懸濁液バッグを秤の上に置いた。
フラスコにTIL懸濁液を播種した。計算されたTIL懸濁液の体積をフラスコにポンプで注入した。熱融着した。残りのフラスコを充填した。
インキュベーターを監視した。インキュベーターパラメータ:温度LEDディスプレイ:37.0±2.0℃、CO2パーセンテージ:5.0±1.5%CO2。フラスコをインキュベートした。
22日目にインキュベーターからG-REX500MCSを取り出す時間範囲を決定した。
22日目の洗浄緩衝液の調製
10LのLabtainerバッグを準備した。BSC内で、ルアー接続を介して4インチ血漿移送セットを10LのLabtainerバッグに取り付けた。10LのLabtainerバッグを準備した。BSCから外に移す前に、すべてのクランプを閉じた。注記:採取される2つのG-REX500MCSフラスコ毎に、1つの10L Labtainerバッグを準備した。Plasmalyteを3000mLバッグにポンプで注入し、ポンプを反転させてバッグの位置を操作することによって、3000mLのOrigenバッグから空気を除去した。ヒトアルブミン25%を3000mLバッグに追加した。120.0mLの最終体積のヒトアルブミン25%を取得した。
IL-2希釈液を調製した。10mLシリンジを使用して、LOVO洗浄緩衝液バッグ上の無針注入ポートを使用して、5.0mLのLOVO洗浄緩衝液を取り出した。LOVO洗浄緩衝液を50mLコニカルチューブに分注した。
CRFブランクバッグLOVO洗浄緩衝液が等分された。100mLシリンジを使用して、無針注入ポートから70.0mLのLOVO洗浄緩衝液を引き上げた。
IL-2を解凍した。すべての氷が融解するまで、1つの1.1mLのIL-2(6×106IU/mL))を解凍した。IL-2の調製。50μLのIL-2ストック(6×106IU/mL)を、「IL-2希釈液」とラベル付けされた50mLのコニカルチューブに添加した。
凍結保存調製。5つのクライオカセットを2~8℃に置き、最終製品の凍結保存のためにそれらを前調整した。
細胞計数希釈液を調製した。BSC内で、ロット番号及び「細胞計数希釈液用」でラベル付けされた4.5mLのAIM-V培地を4本の別個の15mLコニカルチューブに追加した。細胞計数を準備した。4つのクライオバイアルをバイアル番号(1~4)でラベル付けした。使用されるBSCの下でバイアルを保存した。
22日目のTIL採取
インキュベーターを監視した。インキュベーターパラメータ温度LEDディスプレイ:37±2.0°C、CO2パーセンテージ:5%±1.5%.インキュベーターからG-REX500MCSフラスコを取り外した。TIL収集バッグを準備し、ラベル付けした。余分な接続を密封した。減容:約4.5Lの上清をG-REX500MCSから上清バッグに移した。
TIL採取用のフラスコを準備した。TILの収集を開始した。フラスコを激しく叩き、培地旋回させて細胞を解放した。すべての細胞が引き離されていることを確実にした。TILの収集を開始した。TIL懸濁液収集バッグにつながるすべてのクランプを解放した。TIL採取。GatheRexを使用して、TIL懸濁液を3000mL収集バッグの中に移した。付着した細胞について膜を点検した。フラスコ膜をすすいだ。G-Rex500MCS上のクランプを閉鎖し、すべてのクランプが閉鎖していることを確実にした。細胞懸濁液をLOVOソースバッグの中に移した。すべてのクランプを閉じた。熱融着した。4×1.0mLの細胞計数試料を取り出した。
細胞計数を行った。NC-200及びプロセス注記5.14を利用して、細胞計数及び計算を行った。最初に、0.5mLの細胞懸濁液を調製された4.5mLのAIM-V培地の中に追加することによって、細胞計数試料を希釈した。これは、1:10希釈液を生じた。行われた細胞計数の平均生存率、生細胞濃度、及び総有核細胞濃度を決定した。計数の上限及び下限を決定した。行われた細胞計数の平均生存率、生細胞濃度、及び総有核細胞濃度を決定した。LOVOソースバッグの重量を量った。総生TIL細胞を計算した。総有核細胞を計算した。
マイコプラズマ希釈液を調製した。ルアー試料ポートを介して1つの上清バッグから10.0mLを取り出し、15mLコニカルに入れた。
LOVO
「TIL G-REX採取」プロトコルを行い、最終製品の標的体積を決定した。使い捨てキットを装填した。濾液バッグを取り出した。濾液容量を入力した。濾液容器をベンチトップの上に置いた。PlasmaLyteを取り付けた。PlasmaLyteが取り付けられていることを検証し、PlasmaLyteが動いていることを観察した。ソース容器をチューブに取り付け、ソース容器が取り付けられていることを検証した。PlasmaLyteが動いていることを確認した。
最終製剤及び充填
標的体積/バッグの計算。ブランクバッグを配合するためのCS-10及びLOVO洗浄緩衝液の体積を計算した。CRFブランクを調製した。
最終製品に追加するIL-2の体積を計算した。所望される最終IL-2濃度(IU/mL)-300IU/mL。IL-2作業ストック:6×10IU/mL.接続装置を組み立てた。4S-4M60をCC2細胞接続に滅菌溶接した。(プロセス注記5.11に従って)CS750クライオバッグを準備されたハーネスに滅菌溶接した。CS-10バッグを4S-4M60のスパイクに溶接した。IL-2を用いてTILを調製した。適切なサイズのシリンジを使用して、「IL-2 6×10」アリコートから決定されたIL-2の量を取り出した。配合されたTILバッグをラベル付けした。配合されたTILバッグを装置に追加した。CS10を追加した。シリンジを交換した。約10mLの空気を100mLシリンジに引き込み、装置上の60mLシリンジを交換した。CS10を追加した。CS-750バッグを準備した。細胞を分注した。
最終製品バッグから空気を除去し、保持液を得た。最後の最終製品バッグが充填されると、すべてのクランプを閉じた。10mLの空気を新しい100mLのシリンジに引き込み、装置上のシリンジを交換した。保持液を50mLコニカルチューブに分注し、チューブを「保持液」及びロット番号としてラベル付けした。各バッグについて空気除去ステップを繰り返した。
目視検査を含み、凍結保存のための最終製品を調製した。凍結保存までクライオバッグを低温パック上で、または2~8℃で保持した。
細胞計数試料を取り出した。適切なサイズのピペットを使用して、2.0mLの保持液を取り出し、細胞計数に使用されるために15mLコニカルチューブに入れた。細胞計数及び計算を行った。注記:1つだけの試料を適切な希釈に希釈し、希釈が十分であることを検証した。追加の試料を適切な希釈倍率に希釈し、計数を進めた。行われた細胞計数の生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定した。注記:希釈は、細胞の期待濃度に基づいて調整され得る。生細胞濃度及び生存率の平均を決定した。計数の上限及び下限を決定した。IFN-γを計算した。最終製品バッグを熱融着した。
以下の例示的試料計画に従って試料をラベル付けし、収集した。
無菌性及びBacT。試験試料採取。BSC内で、適切なサイズのシリンジを使用して収集された保持細胞懸濁液から1.0mLの試料を取り出し、嫌気性ボトルに接種する。好気性ボトルについて上記を繰り返す。
最終製品の凍結保存
速度制御された冷凍庫を準備した。CRFが設定されていることを検証した。CRFプローブを設定した。最終製品及び試料をCRFに入れた。4℃±1.5℃に達し、CRF実行を進めるために必要な時間を決定した。CRFが完了し、保管された。実行の完了後にCRFを停止させた。カセット及びバイアルをCRFから取り出した。保存のためにカセット及びバイアルを蒸気相LN2に移した。保管場所を記録した。
後処理の概要
後処理:最終医薬品
(22日目)フローサイトメトリーによる22日目のREPでのCD3+細胞の決定
(22日目)グラム染色方法(GMP)
(22日目)ゲルクロットLALアッセイ(GMP)による細菌内毒素試験
(16日目)BacT無菌性アッセイ(GMP)
(16日目)TD-PCR(GMP)によるマイコプラズマDNA検出
許容される外観属性
(22日目)BacT無菌性アッセイ(GMP)(22日目)
(22日目)IFN-ガンマアッセイ
実施例19:進行した免疫チェックポイント阻害剤で治療された非小細胞肺癌(NSCLC)患者における自己腫瘍浸潤リンパ球単剤療法の第1相2結果
序文
背景
進行性NSCLCを有する患者の大部分は、第1選択ICI±化学療法で疾患の進行を発達させる
ICI耐性の設定では、深く、持続的な対応を提供するための効果的な戦略が緊急に必要とされている。
Gen2プロセスTILは、進行性黒色腫、子宮頸癌、及び頭頸部癌において活性を示した、中央で製造された自己TIL細胞産物である2~5
TIL+ニボルマブは、第1相治験において、進行性NSCLCを有するICIナイーブ患者における安全性及び有効性を実証している
この実施例は、多施設第2相研究からの進行性NSCLCを有する患者における単剤Gen2プロセスTIL細胞療法の最初の安全性及び有効性データを実証する。
方法
研究設計
報告は、複数の設定及び適応症における自己TIL細胞療法を評価する前向き、第2相、多施設、多コホート、非盲検研究である。
本明細書では、進行性または転移性NSCLCを有する患者におけるTIL単剤療法を調査するコホート3Bのデータが提供される。
コホート3B患者
適格性には、18歳以上、ICIまたはがん遺伝子指向型療法を含む1~3つの以前の全身療法、ECOGパフォーマンスステータス0~1、TIL製造時に1つ以上の切除可能な病変(直径約1.5cm)、奏効評価のための切除後の1つ以上の測定可能な病変が必要であった。
エンドポイント
一次
有効性、RECIST v1.1に従って治験責任医師が評価したORRとして定義される。
安全性、グレード≧3のTEAE(TIL注入時からTIL注入の30日後までまたは新しい抗がん療法の開始までに発生するAEとして定義)の発生率によって測定される。
探索的
バイオマーカー分析、RNA配列決定を使用したTIL製品のTCRレパートリー(HTBlvcアッセイ、iRepertoire,Inc.,Huntsville,AL)を含む。各個々の患者のTIL製品ロットにおける検出限界を超えて存在するクローンをカウントし、TILクローン性及び多様性を評価するためにそれらの割合を推定した。
TIL産物の患者の遍歴及び中央Gen2 GMP製造を図37に示す。
コホート3Bの患者治療スキーマを図38に示す。
結果
患者の性質を図39に提示する。
完全分析セットには、仕様内でTIL療法の注入を受けたすべての患者が含まれる。
有効性評価対象セットには、仕様内でTIL療法を受け、有効性評価が1以上であったすべての患者が含まれる。
トランスレーショナルセットには、TIL療法の注入を受け、トランスレーショナル分析のための最終医薬品から利用可能なTILを有していたすべての患者が含まれる。
腫瘍採取検体からの中央検査室当たり、6人の患者の腫瘍PD-L1発現データが欠損していた。
すべての患者が、以前のICIを受けた。
TILは、肺転移から最も一般的に採取された(60.7%)。
TEAEは、TIL注入時からTIL注入の30日後までまたは新しい抗がん療法の開始までに発生するAEを含む。
臨床的に有意と考えられる検査室の異常のみが、AEとして報告された。
1つのグレード5の事象は、各々慢性心不全及び多臓器機能障害症候群について報告された。
安全性は、NMA-LD及びIL-2の基礎となる進行疾患及び既知の安全性プロファイルと一致していた。
任意のグレードの腫瘍採取関連AEが、16人(41.0%)の患者で報告され、最も一般的な処置痛はn=7(17.9%)であり、低酸素症はn=4(10.3%)であった。
腫瘍採取関連AEの大部分は、グレード1または2であった。
経時的有害事象(FAS)を図40に示す。
大部分のAEは、TIL注入前またはTIL注入後の最初の2週間以内に発生した。
IL-2用量数の中央値:5.5.
ORR:FASで21.4%、有効性評価対象セットで25.0%。
すべての応答者は、2つ以上の以前の全身療法を受けた。
注入されたTIL数の中央値は、20.9×10であった。切除から注入までの期間の中央値は、35.0日であった。注入からBORまでの期間の中央値は、2.2ヶ月であった。
標的病変の直径和におけるベースラインからの最良の変化率(有効性評価対象セット)データを図41に示す。患者2について、CRの全奏効は、陰性FDG-PET走査を介した完全代謝奏効の研究者評価に基づいていた。
PR以上を達成した確認された応答者に対する最初の奏効までの時間、奏効期間、及び有効性評価の時間を図42に示す。アーカイブ腫瘍試料を使用して局所的にTPSを評価した患者2を除いて、腫瘍採取検体から中央検査室ごと。患者25は、新たな病変によるPDを有し、患者26及び22は、非標的疾患の明確なPDを有した。
1人の患者は、完全代謝奏効を有し、20.7ヶ月で継続していた。
CRを含む2つの奏効は、TPS<1%の患者で発生した。
標的病変の直径和(FAS)データにおけるベースラインからの変化パーセンテージを図43に示す。
CRの全奏効は、陰性FDG-PET走査に基づく。
このデータセットに適用される検出限界を使用して、以前に公開されたデータセット7,8との比較。固有のTCRクローン:黒色腫の場合は5596、子宮頸癌の場合は6874。シャノンエントロピー指数:黒色腫の場合は7.60、子宮頸癌の場合は7.11。シンプソンクローン性指数:黒色腫の場合は0.18、子宮頸癌の場合は0.20。
より大きなシャノンエントロピー指数は、より多様なCDR3集団を示す。値は、0(モノクローナル試料)からlog2(R)(R固有のクローンを有する均等に分布するポリクローナル試料)までの範囲であり得る。
シンプソンクローン性指数は、試料のモノクローン性またはポリクローン性を反映し、多様性(シャノンエントロピー指数)に反比例する。値は、0(均等に分布したポリクローナル試料)から1(モノクローナル試料)までの範囲であり得る。
27人の患者は、TCRレパートリー分析のための最終医薬品から入手可能なTILを有していた。臨床転帰との相関性の分析は進行中である。
結論
このシグナル検出研究は、進行性NSCLCを有する患者における腫瘍採取、TIL製造、及びTIL治療の実現可能性を実証した。
患者は、肺病変を含む外科的切除を忍容した。TIL製造は、大部分の患者にとって可能であった。コンディショニングレジメンによる1回のTIL治療は、十分に忍容された。
NSCLC腫瘍から生成されたTILのTCRレパートリーは、黒色腫のリフィリューセル及び子宮頸癌のTIL療法について既に公表されているように、同様の数の固有のTCRクローンならびに多様性及びクローン性の測定値を実証した。
複数の以前の治療にもかかわらず、6人の患者が奏効を経験し、そのうち2人は持続的奏効を示し、1年を超えて延長する持続的CRを含む公表された経験と一致していた
略語:
AE、有害事象;BOR、最良の全奏効;CR、完全奏効;CTLA-4、細胞傷害性Tリンパ球抗原-4;CY、シクロホスファミド;ECOG、Eastern Cooperative Oncology Group;EGFR、上皮成長因子受容体;EOA、評価の終了;EOS、研究の終了;EOT、治療の終了;FAS、完全分析セット;FDG-PET、フルオロデオキシグルコース-陽電子放出断層撮影;FLU、フルダラビン;GMP、適正製造基準;ICI、免疫チェックポイント阻害剤;IL-2、インターロイキン-2;NA、評価なし;ND、検出なし;NMA-LD、骨髄非破壊的リンパ球枯渇;NSCLC、非小細胞肺癌;ORR、客観的奏効率;PD、進行性疾患;PR、部分奏効;Pt、患者;PD-1、プログラム細胞死タンパク質1;PD-L1、プログラム死リガンド-1;RECIST、固形腫瘍の奏効評価基準;SD、安定な疾患;TCR、T細胞受容体;TEAE、治療下で出現した有害事象、TIL、腫瘍浸潤リンパ球;TPS、腫瘍割合スコア。
参考文献
1.Horvath L,et al.Molecular Cancer(2020)19:141.
2.Sarnaik AA,et al.J Clin Oncol(2021);doi:10.1200/JCO.21.00612.
3.Thomas SS,et al.J Clin Oncol(2021);39(suppl;abstract 9537).
4.Jazaeri A,et al.J Clin Oncol(2019);37(suppl;abstract 2538).
5.Jimeno A,et al.J Immunother Cancer(2020);8 (suppl;abstract A378).
6.Creelan BC,et al.Nature Med(2021):doi:10.1038/s41591-021-01462-y.
7.Gontcharova V,et al.Cancer Research(2019);79:13(suppl;abstract 14).
8.Jazaeri A,et al.Annals Oncol(2020);31:S642(suppl;abstract 3688).
実施例20:転移性非小細胞肺癌(mNSCLC)を有する患者における自己腫瘍浸潤リンパ球(TIL)細胞療法の第2相多施設研究
背景
アクショナブルなドライバー変異を有しない転移性非小細胞肺癌(mNSCLC)を有する患者は、同時または連続の最前線の免疫チェックポイント阻害剤(ICI)+化学療法±ベバシズマブで進行した後、第2選択(2L)が限られている。
自己腫瘍浸潤リンパ球(TIL)細胞療法は、切除不能及び転移性黒色腫、再発性、難治性または持続性子宮頸癌、転移性頭頸部扁平上皮癌、ならびにmNSCLC3~5を含む満たされていない医療ニーズを有するいくつかの患者集団において、有効性、及び安全性を同時に有する第一選択治療の進行後の第二選択治療(2L)選択肢を実証している。
mNSCLCの重度の前治療患者におけるTILでの初期臨床経験は、PD-L1陰性腫瘍を有する6人の応答者のうちの2人を含む、実行可能性、安全性、及び21.4%の客観的応答率(ORR)を実証している(Schoenfeld AJ,SITC 2021[abs 458])
TIL細胞療法はまた、ニボルマブと組み合わせた第1相研究において、mNSCLCにおける有効性の証拠を示した
より良い2Lの治療選択肢のための緊急のニーズに対処するために、現在進行中の臨床試験は、許可されている前の治療を明確にし、疾患進行前の腫瘍採取及びTIL生成のための患者登録を可能にし、前の治療とTIL治療の開始との間の時間、及びTIL産生のコストを最小限に抑えるように修正されている。
研究の概要
この研究は、同時または連続的なICI+白金ベースの化学療法±ベバシズマブ、または標的療法を含む、前の療法時またはその後に進行した、EGFR、ALK、またはROSゲノム変化を伴わない転移性ステージIVのNSCLCを有する患者における自己TILによる養子細胞療法を評価する非盲検、多コホート、多施設第2相研究である。
患者は、進行時にTIL治療を進めることを意図して疾患の進行前に腫瘍採取及び生成のために登録され得る。
図45に示されるように、ICI+化学療法±ベバシズマブまたは標的療法時またはその後に疾患進行を有し、EGFR、ALK、またはROSゲノム変化を伴わない転移性NSCLCを有する患者は、以下のように4つのコホートに分けられる:
コホート1-ICI前のTPS<1%、または歴史的TPSなし(n=40)。
コホート2-ICI前のTPS≧1%(n=40)。
コホート3-外科的腫瘍切除(任意のTPS)を受けることができない患者のための画像誘導コア腫瘍生検を使用した16日間のGen3製造(n=15)。
コホート4-再治療(TILへの以前の応答者またはコホート1~3からの未確認のPDを有する患者)(nは特定されていない)。
コホート1、2、及び3において、およそ95人の患者にTILを注入することが計画されている。
本研究の一次エンドポイントは、IRC(コホート1及び2)または治験責任医師(コホート3及び4)によって評価されるRECIST1.1に従ってORRを評価することを目的とする。
二次エンドポイントには、安全性及び追加の有効性パラメータ、ならびにコア生検から生成された成功裏のTILのパーセンテージを評価することが含まれる(コホート3)。
本研究の探索的エンドポイントには、TILの臨床活性の予測的及び薬力学的バイオマーカーの分析が含まれる。
主要な適格基準には、アクショナブルな変異(例えば、MET、HER2、RET、BRAF、KRAS)を有するものにおける標的療法を含む、2選択以下の前の治療(同時ICI+化学療法の場合;連続する場合以前の3選択以下)の後に進行する、EGFR、ALK、またはROS1ゲノム変化を伴わないmNSCLC;アクショナブルな変異を伴わないものでは、1つの以前の同時ICI+化学療法(連続する場合以前の2つ以下)の後の進行;TIL生成のための1.5cm以上の病変(複数可);腫瘍採取後の1つ以上の残りのRECIST測定可能な病変(複数可);及び0または1のECOG PSが含まれる。腫瘍採取及びTIL製造は、確認された進行の前または後に生じ得る。TILは集中型GMP施設で生成され、最終的な凍結保存された輸液産物が各施設に出荷される。進行時に、患者は、2用量のシクロホスファミド(60mg/kg)及び5用量のフルダラビン(25mg/m2)、続いてTIL(1~150×10個の細胞)の1回の注入、ならびに≦6用量のIL-2(600,000IU/kg)による骨髄非破壊的リンパ枯渇の調節レジメンを受ける。
登録のための主要な包含基準
●患者は、NSCLCの組織学的または病理学的診断が確認されている必要がある。
●ICI及びプラチナベースの化学療法±ベバシズマブ、または標的療法を含む第一選択療法時またはその後の放射線疾患進行が確認された、EGFR、ALK、またはROSゲノム変化のない転移性ステージIVのNSCLC
●アクショナブルな変異のない患者の場合:ICI及びプラチナベースの化学療法を併用する場合は1選択以下の以前の療法、連続する場合は以前の2選択以下
●アクショナブルな変異を有する患者(EGFR、ALKまたはROSを除く)の場合:適切な標的療法を1選択追加が許可される
●進行前腫瘍採取及びTIL生成を有する患者の場合:同時または連続的なICI及びプラチナベースの化学療法のいずれかのプラチナベースの化学療法成分後の残存切除可能な疾患の存在
●コホート1及び2:1つ以上の切除可能な病変及び1つ以上の測定可能な病変;コホート3:画像誘導コア生検を介したTIL生成のための腫瘍採取を受けることができ、標的病変(複数可)として機能するのに十分な残存病変(複数可)を有することができる。
●0または1のECOGのパフォーマンスステータス、及び6か月以上の推定平均余命
●LVEF>45%、New York Heart Association Class1
●FEV>50%またはFEV/FVC>70%
登録ための主要な除外基準
●既知のアクショナブルなEGFR、ALK、またはROSドライバーの変異
●症候性及び/または未治療の脳転移
●過去20年以内の臓器同種移植または以前の細胞移植
●プレドニゾンまたは他のステロイド同等物の全身ステロイド療法≧10mg/日
●任意の形態の原発性免疫不全症
●治療開始前28日以内に生ワクチン接種または弱毒化ワクチン接種
●リスクが増大した活動性の医学的疾患(複数可)
●治療開始から21日以内に別の介入臨床研究への参加
略語:
2L、第2選択;CY、シクロホスファミド;FLU、フルダラビン;ECOG、Eastern Cooperative Oncology Group;EOA、評価の終了;EOS、研究の終了;EOT、治療の終了;FEV1、1秒間の強制呼気量;FVC、強制肺活量;GMP、適正製造基準;ICI、免疫チェックポイント阻害剤;IL-2、インターロイキン-2;IRC、独立審査委員会;LVEF、左室駆出分画;NMA-LD、骨髄非破壊的リンパ枯渇;mNSCLC、転移性非小細胞肺癌;ORR、客観的奏効率;PD、進行性疾患;RECIST、固形腫瘍の奏効評価基準;TIL、腫瘍浸潤リンパ球;TPS、腫瘍割合スコア(腫瘍PD-L1発現の尺度)
参考文献
1.Horvath L,et al.Mol Cancer.2020;19:141.
2.Socinski M et al.N Engl J Med.2018;378:2288-2301.
3.Sarnaik A,et al.JCO.2021;39(24):2656-2666.
4.Jazaeri A,et al.JCO.2019;37(suppl;abstract 2538).
5.Jimeno A,et al.JITC.2020;8(suppl;abstract A378).
6.Schoenfeld A,et al.JITC.2021;9(suppl 2;abstract 458).
7.Creelan B,et al.Nat Med.2021;27:1410-1481.
上記の実施例は、当業者に対して、本発明の組成物、システム及び方法の実施形態の作製方法及び使用方法の完全な開示及び説明を提供するために提示されており、本発明者らが自身の発明とみなすものの範囲を限定することを意図しない。当業者に明らかな、本発明を実施するための上記のモードの修正は、添付の特許請求の範囲内にあることを意図している。本明細書で言及するすべての特許及び刊行物は、本発明が属する分野の当業者のレベルを示す。
すべての見出し及びセクションの指定は、明確化及び参照の目的のみのために使用されており、いかなる方法でも限定するものとしてみなされない。例えば、当業者は、本明細書に記載の本発明の趣旨及び範囲に従って異なる見出し及びセクションから様々な態様を適宜組み合わせることの有用性を理解する。
本明細書で引用されたすべての参考文献は、各個々の刊行物または特許もしくは特許出願がすべての目的のためにその全体が参照により組み込まれることが具体的かつ個別に示されているのと同じ程度にすべての目的のためにそれらの全体が参照により本明細書に組み込まれる。
当業者に明らかであるように、本出願の趣旨及び範囲から逸脱することなく、本出願の多くの修正及び変形が加えられてもよい。本明細書に記載の特定の実施形態及び実施例はほんの一例として提供されており、本出願は、特許請求の範囲が権利を与えられる等価物の全範囲に加えて、添付の特許請求の範囲の用語によってのみ限定されるべきである。

Claims (131)

  1. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、前記腫瘍が、第1のTIL集団を含む、前記取得するステップと、
    (b)前記腫瘍を複数の腫瘍断片に処理するステップと、
    (c)前記複数の腫瘍断片を閉鎖系に付加するステップと、
    (d)前記第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (e)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、
    (f)ステップ(f)から取得された前記第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記採取するステップと、
    (g)ステップ(g)からの採取された前記第3のTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記移すことと、を含む、前記方法。
  2. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、前記腫瘍が、第1のTIL集団を含む、前記取得するステップと、
    (b)前記腫瘍を腫瘍消化物に処理するステップと、
    (c)前記腫瘍消化物を閉鎖系に付加するステップと、
    (d)前記第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (e)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり
    、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、
    (f)ステップ(f)から取得された前記第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記採取するステップと、
    (g)ステップ(g)からの採取された前記第3のTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記移すことと、を含む、前記方法。
  3. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、前記腫瘍が、第1のTIL集団を含む、前記取得するステップと、
    (b)前記腫瘍を腫瘍断片または腫瘍消化物に処理するステップと、
    (c)前記腫瘍断片または前記腫瘍消化物を閉鎖系に付加するステップと、
    (d)前記第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (e)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、
    (f)ステップ(f)から取得された前記第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記採取するステップと、
    (g)ステップ(g)からの採取された前記第3のTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記移すことと、を含む、前記方法。
  4. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、前記腫瘍が、第1のTIL集団を含む、前記取得するステップと、
    (b)前記腫瘍を腫瘍消化物に処理し、前記腫瘍消化物を凍結保存するステップと、
    (c)前記凍結保存した腫瘍消化物を解凍し、前記腫瘍消化物を閉鎖系に付加するステップと、
    (d)前記第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の
    拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (e)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、
    (f)ステップ(f)から取得された前記第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記採取するステップと、
    (g)ステップ(g)からの採取された前記第3のTIL集団を注入バッグに移すことであって、ステップ(f)から(g)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記移すことと、を含む、前記方法。
  5. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から取得された腫瘍から取得された腫瘍断片を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (b)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、
    (c)ステップ(b)から取得された前記第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記採取するステップと、
    (d)ステップ(g)からの採取された前記第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記移すステップと、を含む、前記方法。
  6. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から取得された腫瘍から取得された腫瘍消化物を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くこ
    となく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (b)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、
    (c)ステップ(b)から取得された前記第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記採取するステップと、
    (d)ステップ(g)からの採取された前記第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記移すステップと、を含む、前記方法。
  7. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から取得された腫瘍から取得された腫瘍断片または腫瘍消化物を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (b)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、
    (c)ステップ(b)から取得された前記第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記採取するステップと、
    (d)ステップ(g)からの採取された前記第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記移すステップと、を含む、前記方法。
  8. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から取得された腫瘍から取得された凍結保存した腫瘍消化物を解凍し、前記腫瘍消化物を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張
    が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (b)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、
    (c)ステップ(b)から取得された前記第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記採取するステップと、
    (d)ステップ(g)からの採取された前記第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記移すステップと、を含む、前記方法。
  9. 凍結乾燥プロセスを使用して、採取された前記第3のTIL集団を含む前記注入バッグを凍結乾燥するステップをさらに含む、請求項1~8のいずれか1項に記載の方法。
  10. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、前記腫瘍が、第1のTIL集団を含む、前記取得するステップと、
    (b)前記腫瘍を、複数の腫瘍断片に処理するステップと、
    (c)前記複数の腫瘍断片を閉鎖系に付加するステップと、
    (d)前記第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (e)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、を含む、前記方法。
  11. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、前記腫瘍が、第1のTIL集団を含む、前記取得するステップと、
    (b)前記腫瘍を腫瘍消化物に処理するステップと、
    (c)前記腫瘍消化物を閉鎖系に付加するステップと、
    (d)前記第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (e)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、を含む、前記方法。
  12. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、前記腫瘍が、第1のTIL集団を含む、前記取得するステップと、
    (b)前記腫瘍を腫瘍断片または腫瘍消化物に処理するステップと、
    (c)前記腫瘍断片または前記腫瘍消化物を閉鎖系に付加するステップと、
    (d)前記第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (e)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、を含む、前記方法。
  13. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、前記腫瘍が、第1のTIL集団を含む、前記取得するステップと、
    (b)前記腫瘍を腫瘍消化物に処理し、前記腫瘍消化物を凍結保存するステップと、
    (c)前記凍結保存した腫瘍消化物を解凍し、前記腫瘍消化物を閉鎖系に付加するステップと、
    (d)前記第1のTIL集団を、IL-2を含む細胞培養培地中で培養することによって
    第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (e)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、
    (f)ステップ(f)から取得された前記第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記採取するステップと、
    (g)ステップ(g)からの採取された前記第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記移すステップと、を含む、前記方法。
  14. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から取得された腫瘍から取得された腫瘍断片を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (b)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、を含む、前記方法。
  15. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から取得された腫瘍から取得された腫瘍消化物を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張
    の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (b)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、を含む、前記方法。
  16. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から取得された腫瘍から取得された腫瘍断片または腫瘍消化物を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (b)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、を含む、前記方法。
  17. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から取得された腫瘍から取得された凍結保存した腫瘍消化物を解凍し、前記腫瘍消化物を培養することによって第1の拡張を行い、IL-2を含む細胞培養培地中で第1のTIL集団を生成して、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (b)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(a)からステップ(b)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、を含む、前記方法。
  18. ステップ(d)の前記培養培地が、3000IU/mL以下のIL-2、及び/またはタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む、請求項1~4及び10~13のいずれか1項に記載の方法。
  19. ステップ(e)の前記培養培地が、タンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む、請求項1~4及び10~13のいずれか1項に記載の方法。
  20. ステップ(d)またはステップ(e)の前記培養培地が、約0.1μM~約10μMの濃度の前記AKT阻害剤を含む、請求項18または19に記載の方法。
  21. ステップ(d)またはステップ(e)の前記培養培地が、約1μMの濃度の前記AKT阻害剤を含む、請求項18または19に記載の方法。
  22. ステップ(d)及び/またはステップ(e)の前記培養培地が、IL-15及び/またはIL-21を含む、請求項1~4及び10~13のいずれか1項に記載の方法。
  23. ステップ(d)及び/またはステップ(e)の前記培養培地が、約1ng/mL~約100ng/mLの濃度のIL-15及び/またはIL-21を含む、請求項22に記載の方法。
  24. ステップ(d)及び/またはステップ(e)の前記培養培地が、約10ng/mLの濃度のIL-15及び/またはIL-21を含む、請求項22に記載の方法。
  25. ステップ(d)のD0、D1またはD2中に、200ng/mlの濃度のIFNγ及び抗PD-1抗体を添加することをさらに含む、請求項1~4及び10~13のいずれか1項に記載の方法。
  26. ステップ(d)のD0、D1またはD2中に、CD40アゴニスト及び/またはCTLA-4の阻害剤を添加することをさらに含む、請求項1~4及び10~13のいずれか1項に記載の方法。
  27. 前記AKT阻害剤が、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド(Tehranolide)、イソリキリゲニン、スクテラリン、及びホノキオールからなる群から選択される、請求項1~4及び10~13のいずれか1項に記載の方法。
  28. 前記AKT阻害剤が、AZD5363である、請求項1~4及び10~13のいずれか1項に記載の方法。
  29. ステップ(b)の後かつステップ(c)の前に、前記方法が、前記複数の腫瘍断片を酵素的に消化して、前記第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を取得するステップを含み、ステップ(c)が、前記腫瘍消化物を閉鎖系に付加することによって行われる、請求項1~4及び10~13のいずれか1項に記載の方法。
  30. 前記第1のTIL集団が、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または前記がんからの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から取得される、請求項1~29のいずれか1項に記載の方法。
  31. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)がん患者から腫瘍を取得するステップであって、前記腫瘍が、第1のTIL集団を含む、前記取得するステップと、
    (b)前記腫瘍を、複数の腫瘍断片に処理するステップと、
    (c)前記複数の腫瘍断片を閉鎖系に付加するステップと、
    (d)前記第1のTIL集団を、IL-15及び/またはIL-21を含む細胞培養培地中で培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、ステップ(c)からステップ(d)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (e)前記第2のTIL集団を、IL-15及び/またはIL-21、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、前記第2の拡張が、第2のガス透過性表面積を提供する密閉容器内で行われ、ステップ(d)からステップ(e)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こり、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、
    (f)ステップ(f)から取得された前記第3のTIL集団を採取するステップであって、ステップ(e)からステップ(f)への移行が、前記系を開くことなく起こる、前記採取するステップと、
    (g)ステップ(g)からの採取された前記第3のTIL集団を注入バッグに移すステップであって、ステップ(f)から(g)への移行が、前記閉鎖系を開くことなく起こる、前記移すステップと、を含む、前記方法。
  32. (h)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(g)からの採取された前記第3のTIL集団を含む前記注入バッグを凍結保存することをさらに含む、請求項31に記載の方法。
  33. ステップ(d)またはステップ(e)の前記培養培地が、IL-2を含む、請求項31または32に記載の方法。
  34. 前記IL-2が、3000IU/mL以下の濃度にある、請求項33に記載の方法。
  35. ステップ(d)またはステップ(e)の前記培養培地が、添加されたIL-2を含まない、請求項31または32に記載の方法。
  36. ステップ(d)及び/またはステップ(e)の前記培養培地が、約1ng/mL~約100ng/mLの濃度のIL-15及び/またはIL-21を含む、請求項31~35のいずれか1項に記載の方法。
  37. ステップ(d)及び/またはステップ(e)の前記培養培地が、約10ng/mLの濃度のIL-15及び/またはIL-21を含む、請求項31~35のいずれか1項に記載の方法。
  38. ステップ(d)の前記培養培地が、IL-2及びIL-21を含む、請求項31~37のいずれか1項に記載の方法。
  39. ステップ(d)の前記培養培地が、3000IU/mLのIL-2及び約10ng/mLの濃度のIL-21を含む、請求項38に記載の方法。
  40. ステップ(e)の前記培養培地が、IL-2及びIL-21を含む、請求項31~39のいずれか1項に記載の方法。
  41. ステップ(e)の前記培養培地が、3000IU/mLのIL-2及び約10ng/mLの濃度のIL-21を含む、請求項39に記載の方法。
  42. ステップ(e)の前記培養培地が、IL-15及びIL-21を含む、請求項31~38のいずれか1項に記載の方法。
  43. ステップ(e)の前記培養培地が、約10ng/mLの濃度のIL-15及び約10ng/mLの濃度のIL-21を含む、請求項42に記載の方法。
  44. ステップ(e)の前記培養培地が、添加されたIL-2を含まない、請求項43に記載の方法。
  45. ステップ(d)及び/またはステップ(e)の前記培養培地が、タンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む、請求項31~44のいずれか1項に記載の方法。
  46. 前記AKT阻害剤が、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、及びホノキオールからなる群から選択される、請求項45に記載の方法。
  47. 前記AKT阻害剤が、AZD5363である、請求項45に記載の方法。
  48. ステップ(d)及び/またはステップ(e)の前記培養培地が、約0.1μM~約10μMの濃度の前記AKT阻害剤を含む、請求項45~47のいずれか1項に記載の方法。
  49. ステップ(d)及び/またはステップ(e)の前記培養培地が、約1μMの濃度の前記AKT阻害剤を含む、請求項45~47のいずれか1項に記載の方法。
  50. ステップ(d)のD0、D1またはD2中に、200ng/mlの濃度のIFNγ及び抗PD-1抗体を添加することをさらに含む、請求項31~49のいずれか1項に記載の方法。
  51. ステップ(d)のD0、D1またはD2中に、CD40アゴニスト及び/またはCTLA-4の阻害剤を添加することをさらに含む、請求項31~50のいずれか1項に記載の方法。
  52. ステップ(a)の後かつステップ(b)の前に、前記方法が、前記複数の腫瘍断片を酵素的に消化して、前記第1のTIL集団を取得するステップを含む、請求項31~51のいずれか1項に記載の方法。
  53. 前記第1のTIL集団が、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または前記がんからの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から取得される、請求項31~52のいずれか1項に記載の方法。
  54. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)集団を作製する方法であって、前記方法が、
    (a)IL-2を含む細胞培養培地中で、がん患者からの腫瘍から取得された第1のTIL集団を培養することによって第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生するステップであって、前記第1の拡張が、約3~14日間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生するステップと、
    (b)前記第2のTIL集団を、3000IU/mL以下の濃度のIL-2、OKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を有する細胞培養培地中で培養することによって第2の拡張を行い、第3のTIL集団を産生するステップであって、前記第2の拡張が、約7~14日間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団を含み、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生するステップと、
    (c)ステップ(b)から取得された前記第3のTIL集団を採取するステップと、
    (d)ステップ(c)からの採取された前記第3のTIL集団を注入バッグに移すステップと、を含む、前記方法。
  55. (e)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(d)からの採取された前記第3のTIL集団を含む前記注入バッグを凍結保存することをさらに含む、請求項54に記載の方法。
  56. ステップ(d)の前記培養培地が、3000IU/mL以下のIL-2、及び/またはタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む、請求項54または55に記載の方法。
  57. ステップ(a)またはステップ(b)の前記培養培地が、タンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む、請求項54または56に記載の方法。
  58. ステップ(a)またはステップ(b)の前記培養培地が、約0.1μM~約10μMの濃度の前記AKT阻害剤を含む、請求項57に記載の方法。
  59. ステップ(a)またはステップ(b)の前記培養培地が、約1μMの濃度の前記AKT阻害剤を含む、請求項58に記載の方法。
  60. ステップ(a)及び/またはステップ(b)の前記培養培地が、IL-15及び/またはIL-21を含む、請求項54~59に記載の方法。
  61. ステップ(a)及び/またはステップ(b)の前記培養培地が、約1ng/mL~約100ng/mLの濃度のIL-15及び/またはIL-21を含む、請求項60に記載の方法。
  62. ステップ(a)及び/またはステップ(b)の前記培養培地が、約10ng/mLの濃度のIL-15及び/またはIL-21を含む、請求項60に記載の方法。
  63. ステップ(a)及び/またはステップ(b)のD0、D1またはD2中に、200ng/mlの濃度のIFNγ及び抗PD-1抗体を添加することをさらに含む、請求項54~
    62のいずれか1項に記載の方法。
  64. ステップ(a)及び/またはステップ(b)のD0、D1またはD2中に、CD40アゴニスト及び/またはCTLA-4の阻害剤を添加することをさらに含む、請求項54~63のいずれか1項に記載の方法。
  65. 前記AKT阻害剤が、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、及びホノキオールからなる群から選択される、請求項54~64のいずれか1項に記載の方法。
  66. 前記AKT阻害剤が、AZD5363である、請求項54~64のいずれか1項に記載の方法。
  67. 前記方法が、複数の腫瘍断片を酵素的に消化して、前記第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を取得するステップを含む、請求項54~66のいずれか1項に記載の方法。
  68. 前記第1のTIL集団が、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または前記がんからの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から取得される、請求項54~67のいずれか1項に記載の方法。
  69. 前記がんが、黒色腫、卵巣癌、子宮頸癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、肺癌、膀胱癌、乳癌、トリプルネガティブ乳癌、ヒトパピローマウイルスによって引き起こされたがん、頭頸部癌(頭頸部扁平上皮癌(HNSCC)を含む)、腎癌、及び腎細胞癌からなる群から選択される、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  70. 前記第1のTIL集団が、IFNg(インターフェロンガンマ)、PD-1の阻害剤(例えば、抗PD-1抗体)、CD40アゴニスト(例えば、CD40L、抗CD40アゴニスト抗体)、及び/またはCTLA-4アゴニスト(例えば、抗CTLA-4アゴニスト抗体)で、前記第1の拡張前に最大約48時間、及び任意選択で、前記第1の拡張前に24時間または48時間刺激される、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  71. 抗原提示細胞(APC)が、前記第1のTIL集団、前記第2のTIL集団、または両方に添加される、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  72. 前記CD40またはCD40Lが、前記刺激中に前記細胞培養培地中に約30ng/mLの初期濃度で存在する、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  73. IFNgが、前記刺激中に前記細胞培養培地中に約200ng/mLの初期濃度で存在する、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  74. 前記第1の拡張が、約11日の期間にわたって行われる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  75. 前記第2の拡張が、約11日の期間にわたって行われる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  76. 前記第1の拡張及び前記第2の拡張が、各々、5日、6日、または7日の期間内で個別に行われる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  77. 前記第1の拡張が、7日、8日、または9日の期間内で行われる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  78. 前記第2の拡張が、7日、8日、または9日の期間内で行われる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  79. 前記第1の拡張及び前記第2の拡張が、各々、7日の期間内で個別に行われる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  80. 前記治療的TIL集団の前記採取をとおした前記第1の拡張のステップが、約14日~約16日の期間内で行われる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  81. 前記治療用TIL集団の前記採取をとおした前記第1の拡張のステップが、約15日~約16日の期間内で行われる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  82. 前記治療的TIL集団の前記採取をとおした前記第1の拡張のステップが、約14日の期間内で行われる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  83. 前記治療的TIL集団の前記採取をとおした前記第1の拡張のステップが、約15日の期間内で行われる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  84. 前記治療的TIL集団の前記採取をとおした前記第1の拡張のステップが、約16日の期間内で行われる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  85. 凍結保存プロセスを使用して、採取された前記治療的TIL集団を凍結保存するステップをさらに含み、前記治療的TIL集団の前記採取をとおしたプライミングによる第1の拡張のステップ及び凍結保存のステップが、16日以内で行われる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  86. 前記第1の拡張が、ガス透過性容器を使用して行われる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  87. 前記第2の拡張が、ガス透過性容器を使用して行われる、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  88. 前記ガス透過性容器が、G容器及びXuriセルバッグからなる群から選択される、請求項86または87に記載の方法。
  89. 先行請求項のいずれか1項に記載の方法を使用して製造された、治療的TIL集団。
  90. 約2.3×1010~約13.7×1010TILを含む、請求項89に記載の治療的TIL集団。
  91. 約1×10~約1×1011TILを含む、請求項89に記載の治療的TIL集団。
  92. 前記治療的TIL集団が、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、増強された多官能性を示す、請求項89~91のいずれか1項に記載の治療的TIL集団。
  93. 前記治療的TIL集団が、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、より幹様の表現型を示す、請求項89~92のいずれか1項に記載の治療的TIL集団。
  94. 前記治療的TIL集団が、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、活性化及び/または分化のより少ないTILの頻度の増加を示す、請求項89~93のいずれか1項に記載の治療的TIL集団。
  95. 前記治療的TIL集団が、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、同種異系設定において改善された腫瘍細胞殺傷を示す、請求項89~94のいずれか1項に記載の治療的TIL集団。
  96. 前記治療的TIL集団が、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、CD27、CD28、CD62L、及びIL-7Rからなる群から選択されるメモリー関連マーカーの増加した発現を示す、請求項89~95のいずれか1項に記載の治療的TIL集団。
  97. 前記治療的TIL集団が、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、CD38、CD39、及びCD69からなる群から選択される活性化マーカーの発現の低下を示す、請求項89~96のいずれか1項に記載の治療的TIL集団。
  98. 前記治療的TIL集団が、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、LAG3、TIM3、TIGIT、及びTOXからなる群から選択される阻害/枯渇関連マーカーの発現の低下を示す、請求項89~97のいずれか1項に記載の治療的TIL集団。
  99. 前記治療的TIL集団が、参照TIL製造プロセスを使用して製造されたTIL集団と比較して、GZMB、CXCR3、IFNg、TNFa、及びIL-2からなる群から選択される機能的マーカーの増加した発現を示す、請求項89~98のいずれか1項に記載の治療的TIL集団。
  100. 請求項89~99のいずれか1項に記載の治療的TIL集団を含む、薬学的組成物。
  101. がん患者を治療する方法であって、請求項89~99のいずれか1項に記載のTIL集団または請求項100に記載の薬学的組成物を前記がん患者に投与することを含む、前記方法。
  102. 前記TIL集団または前記薬学的組成物を前記がん患者に投与する前に、骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンで前記がん患者を治療するステップをさらに含む、請求項101に記載の方法。
  103. 前記骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む、請求項102に記載の方法。
  104. 前記骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で3日間投与するステップを含む、請求項102に記載の方法。
  105. 前記骨髄非破壊的リンパ球枯渇レジメンが、シクロホスファミドを60mg/m/日の用量で、及びフルダラビンを25mg/m/日の用量で2日間投与し、続いてフルダラビンを25mg/m/日の用量で1日間投与するステップを含む、請求項102に記載の方法。
  106. 前記シクロホスファミドが、メスナとともに投与される、請求項103~105のいずれか1項に記載の方法。
  107. 前記がん患者に前記TILを投与した翌日に開始するIL-2レジメンで前記がん患者を治療するステップをさらに含む、請求項101~106のいずれか1項に記載の方法。
  108. 前記がん患者へのTILの投与と同じ日に開始するIL-2レジメンで前記がん患者を治療するステップをさらに含む、請求項101~106のいずれか1項に記載の方法。
  109. 前記IL-2レジメンが、許容範囲まで8時間毎に15分間のボーラス静脈内注入として投与される、600,000もしくは720,000IU/kgのアルデスロイキン、またはそのバイオシミラーもしくはバリアントを含む高用量IL-2レジメンである、請求項107または108に記載の方法。
  110. 治療上有効なTIL集団が投与され、約2.3×1010~約13.7×1010TILを含む、請求項101~109のいずれか1項に記載の方法。
  111. 治療上有効なTIL集団が投与され、約1×10~約1×1011TILを含む、請求項101~109のいずれか1項に記載の方法。
  112. 腫瘍浸潤リンパ球(TIL)を治療的TIL集団に拡張するための方法であって、
    (a)IL-2、任意選択でOKT-3、及び抗原提示細胞(APC)を含む細胞培養培地中で、がん患者からの腫瘍から取得された第1のTIL集団を培養することによってプライミングによる第1の拡張を行い、第2のTIL集団を産生することであって、前記プライミングによる第1の拡張が、第1のガス透過性表面積を含む容器内で行われ、前記プライミングによる第1の拡張が、約1~7/8日間の第1の期間行われて、前記第2のTIL集団を取得し、前記第2のTIL集団の数が、前記第1のTIL集団よりも多く、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第1の拡張の3日目、前記第1の拡張の4日目、前記第1の拡張の5日目、前記第1の拡張の6日目、または前記第1の拡張の7日目に置き換えられる、前記第2のTIL集団を産生することと、
    (b)前記第2のTIL集団の前記細胞培養培地を追加のIL-2、OKT-3、及びAPCで補充することによって第2の急速拡張を行い、第3のTIL集団を産生することであって、前記第2の急速拡張に追加されるAPCの数が、ステップ(b)で追加されるAPCの数の少なくとも2倍であり、前記第2の急速拡張が、約1~11日間の第2の期間行われて、前記第3のTIL集団を取得し、前記第3のTIL集団が、治療的TIL集団であり、前記第2の急速拡張が、第2のガス透過性表面積を含む容器内で行われ、任意選択で、前記細胞培養培地が、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、前記第2の拡張の5日目、前記第2の拡張の6日目、または前記第2の拡張の7日目に置き換えられる、前記第3のTIL集団を産生することと、
    (c)ステップ(b)から取得された前記治療的TIL集団を採取することと、を含む、前記方法。
  113. (d)ステップ(c)からの採取された前記第3のTIL集団を注入バッグに移すことと、
    (e)凍結保存プロセスを使用して、ステップ(d)からの採取された前記第3のTIL
    集団を含む前記注入バッグを凍結保存することをさらに含む、請求項112に記載の方法。
  114. ステップ(a)の前記培養培地が、3000IU/mL以下のIL-2、及び/またはタンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む、請求項112または113に記載の方法。
  115. ステップ(a)またはステップ(b)の前記培養培地が、タンパク質キナーゼB(AKT)阻害剤を含む、請求項112または113に記載の方法。
  116. ステップ(a)またはステップ(b)の前記培養培地が、約0.1μM~約10μMの濃度の前記AKT阻害剤を含む、請求項115に記載の方法。
  117. ステップ(a)またはステップ(b)の前記培養培地が、約1μMの濃度の前記AKT阻害剤を含む、請求項116に記載の方法。
  118. ステップ(a)及び/またはステップ(b)の前記培養培地が、IL-15及び/またはIL-21を含む、請求項112~117のいずれか1項に記載の方法。
  119. ステップ(a)及び/またはステップ(b)の前記培養培地が、約1ng/mL~約100ng/mLの濃度のIL-15及び/またはIL-21を含む、請求項118に記載の方法。
  120. ステップ(a)及び/またはステップ(b)の前記培養培地が、約10ng/mLの濃度のIL-15及び/またはIL-21を含む、請求項118に記載の方法。
  121. ステップ(a)及び/またはステップ(b)のD0、D1またはD2中に、200ng/mlの濃度のIFNγ及び抗PD-1抗体を添加することをさらに含む、請求項112~120のいずれか1項に記載の方法。
  122. ステップ(a)及び/またはステップ(b)のD0、D1またはD2中に、CD40アゴニスト及び/またはCTLA-4の阻害剤を添加することをさらに含む、請求項112~121のいずれか1項に記載の方法。
  123. 前記AKT阻害剤が、イパタセルチブ、GSK690693、GSK2141795、GSK2110183、AZD5363、GDC-0068、AT7867、CCT128930、MK-2206、BAY1125976、ペリフォシン、オリドニン、ヘルバセチン、テヘラノリド、イソリキリゲニン、スクテラリン、及びホノキオールからなる群から選択される、請求項115~122のいずれか1項に記載の方法。
  124. 前記AKT阻害剤が、AZD5363である、請求項115~122のいずれか1項に記載の方法。
  125. 前記方法が、複数の腫瘍断片を酵素的に消化して、前記第1のTIL集団を含む腫瘍消化物を取得するステップを含む、請求項112~123のいずれか1項に記載の方法。
  126. 前記第1のTIL集団が、外科的切除、針生検、コア生検、小生検、または前記がんからの腫瘍細胞とTIL細胞との混合物を含有する試料を取得するための他の手段から取得される、請求項112~125のいずれか1項に記載の方法。
  127. 前記第2の拡張中に、前記第2のTIL集団を1つ以上の培養物に分割し、IL-2、OKT-3、及びAPCを含む追加の細胞培養培地で補充する、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  128. 前記第2のTIL集団が、2、3、4、5、6、7、8、9、または10個の培養物に分割される、請求項127に記載の方法。
  129. 前記第2のTIL集団が、前記第2の拡張の2日目、前記第2の拡張の3日目、前記第2の拡張の4日目、または前記第2の拡張の5日目に分割される、請求項127または128に記載の方法。
  130. 前記閉鎖系が、任意選択である、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
  131. 前記系が、閉鎖していない、先行請求項のいずれか1項に記載の方法。
JP2024559177A 2022-04-06 2023-04-05 腫瘍浸潤リンパ球療法によるnsclc患者の治療 Pending JP2025512313A (ja)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US202263328236P 2022-04-06 2022-04-06
US63/328,236 2022-04-06
PCT/US2023/065404 WO2023196877A1 (en) 2022-04-06 2023-04-05 Treatment of nsclc patients with tumor infiltrating lymphocyte therapies

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2025512313A true JP2025512313A (ja) 2025-04-17

Family

ID=86424695

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2024559177A Pending JP2025512313A (ja) 2022-04-06 2023-04-05 腫瘍浸潤リンパ球療法によるnsclc患者の治療

Country Status (4)

Country Link
EP (1) EP4504220A1 (ja)
JP (1) JP2025512313A (ja)
CA (1) CA3247638A1 (ja)
WO (1) WO2023196877A1 (ja)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2025101484A1 (en) * 2023-11-06 2025-05-15 Iovance Biotherapeutics, Inc. Treatment of endometrial cancers with tumor infiltrating lymphocyte therapies
WO2025189025A2 (en) * 2024-03-07 2025-09-12 Biontech Us Inc. Methods and compositions for engineering t cells

Family Cites Families (120)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE3572982D1 (en) 1984-03-06 1989-10-19 Takeda Chemical Industries Ltd Chemically modified lymphokine and production thereof
US4766106A (en) 1985-06-26 1988-08-23 Cetus Corporation Solubilization of proteins for pharmaceutical compositions using polymer conjugation
US5206344A (en) 1985-06-26 1993-04-27 Cetus Oncology Corporation Interleukin-2 muteins and polymer conjugation thereof
US4704692A (en) 1986-09-02 1987-11-03 Ladner Robert C Computer based system and method for determining and displaying possible chemical structures for converting double- or multiple-chain polypeptides to single-chain polypeptides
US4946778A (en) 1987-09-21 1990-08-07 Genex Corporation Single polypeptide chain binding molecules
WO1988007089A1 (en) 1987-03-18 1988-09-22 Medical Research Council Altered antibodies
US5128257A (en) 1987-08-31 1992-07-07 Baer Bradford W Electroporation apparatus and process
WO1989006555A1 (en) 1988-01-21 1989-07-27 Massachusetts Institute Of Technology Transport of molecules across tissue using electroporation
US6780613B1 (en) 1988-10-28 2004-08-24 Genentech, Inc. Growth hormone variants
CA2006596C (en) 1988-12-22 2000-09-05 Rika Ishikawa Chemically-modified g-csf
US5089261A (en) 1989-01-23 1992-02-18 Cetus Corporation Preparation of a polymer/interleukin-2 conjugate
US4902502A (en) 1989-01-23 1990-02-20 Cetus Corporation Preparation of a polymer/interleukin-2 conjugate
DE3920358A1 (de) 1989-06-22 1991-01-17 Behringwerke Ag Bispezifische und oligospezifische, mono- und oligovalente antikoerperkonstrukte, ihre herstellung und verwendung
US5279833A (en) 1990-04-04 1994-01-18 Yale University Liposomal transfection of nucleic acids into animal cells
CA2019758C (en) 1990-06-25 2001-09-04 Kevin L. Firth Improved electroporation device and method
US5137817A (en) 1990-10-05 1992-08-11 Amoco Corporation Apparatus and method for electroporation
US5173158A (en) 1991-07-22 1992-12-22 Schmukler Robert E Apparatus and methods for electroporation and electrofusion
WO1993011161A1 (en) 1991-11-25 1993-06-10 Enzon, Inc. Multivalent antigen-binding proteins
US5714350A (en) 1992-03-09 1998-02-03 Protein Design Labs, Inc. Increasing antibody affinity by altering glycosylation in the immunoglobulin variable region
US5304120A (en) 1992-07-01 1994-04-19 Btx Inc. Electroporation method and apparatus for insertion of drugs and genes into endothelial cells
US5273525A (en) 1992-08-13 1993-12-28 Btx Inc. Injection and electroporation apparatus for drug and gene delivery
US5318514A (en) 1992-08-17 1994-06-07 Btx, Inc. Applicator for the electroporation of drugs and genes into surface cells
GB9317380D0 (en) 1993-08-20 1993-10-06 Therexsys Ltd Transfection process
US5891617A (en) 1993-09-15 1999-04-06 Organogenesis Inc. Cryopreservation of harvested skin and cultured skin or cornea equivalents by slow freezing
US6989434B1 (en) 1994-02-11 2006-01-24 Invitrogen Corporation Reagents for intracellular delivery of macromolecules
JPH11505505A (ja) 1994-06-27 1999-05-21 ザ・ジョンズ・ホプキンス・ユニバーシティー ターゲッティングされた遺伝子輸送システム
US5908635A (en) 1994-08-05 1999-06-01 The United States Of America As Represented By The Department Of Health And Human Services Method for the liposomal delivery of nucleic acids
US5484720A (en) 1994-09-08 1996-01-16 Genentech, Inc. Methods for calcium phosphate transfection
GB9422383D0 (en) 1994-11-05 1995-01-04 Wellcome Found Antibodies
US5830430A (en) 1995-02-21 1998-11-03 Imarx Pharmaceutical Corp. Cationic lipids and the use thereof
US5869046A (en) 1995-04-14 1999-02-09 Genentech, Inc. Altered polypeptides with increased half-life
US5739277A (en) 1995-04-14 1998-04-14 Genentech Inc. Altered polypeptides with increased half-life
US6096871A (en) 1995-04-14 2000-08-01 Genentech, Inc. Polypeptides altered to contain an epitope from the Fc region of an IgG molecule for increased half-life
US6121022A (en) 1995-04-14 2000-09-19 Genentech, Inc. Altered polypeptides with increased half-life
US5981501A (en) 1995-06-07 1999-11-09 Inex Pharmaceuticals Corp. Methods for encapsulating plasmids in lipid bilayers
US6010613A (en) 1995-12-08 2000-01-04 Cyto Pulse Sciences, Inc. Method of treating materials with pulsed electrical fields
DE69738522T2 (de) 1996-08-02 2009-04-02 Bristol-Myers Squibb Co. Ein verfahren zur inhibierung immunglobulininduzierter toxizität aufgrund von der verwendung von immunoglobinen in therapie und in vivo diagnostik
WO1998023289A1 (en) 1996-11-27 1998-06-04 The General Hospital Corporation MODULATION OF IgG BINDING TO FcRn
US6277375B1 (en) 1997-03-03 2001-08-21 Board Of Regents, The University Of Texas System Immunoglobulin-like domains with increased half-lives
JP2002511741A (ja) 1997-03-11 2002-04-16 リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ ミネソタ 細胞のdnaに核酸を導入するためのdna系トランスポゾンシステム
GB9710809D0 (en) 1997-05-23 1997-07-23 Medical Res Council Nucleic acid binding proteins
US6475994B2 (en) 1998-01-07 2002-11-05 Donald A. Tomalia Method and articles for transfection of genetic material
ES2341926T3 (es) 1998-03-02 2010-06-29 Massachusetts Institute Of Technology Poliproteinas con dedos de cinc que tienen enlazadores mejorados.
US6194551B1 (en) 1998-04-02 2001-02-27 Genentech, Inc. Polypeptide variants
US6528624B1 (en) 1998-04-02 2003-03-04 Genentech, Inc. Polypeptide variants
ATE375365T1 (de) 1998-04-02 2007-10-15 Genentech Inc Antikörper varianten und fragmente davon
US6242195B1 (en) 1998-04-02 2001-06-05 Genentech, Inc. Methods for determining binding of an analyte to a receptor
PT1071700E (pt) 1998-04-20 2010-04-23 Glycart Biotechnology Ag Modificação por glicosilação de anticorpos para melhorar a citotoxicidade celular dependente de anticorpos
GB9809951D0 (en) 1998-05-08 1998-07-08 Univ Cambridge Tech Binding molecules
AU770555B2 (en) 1998-08-17 2004-02-26 Abgenix, Inc. Generation of modified molecules with increased serum half-lives
EP1006183A1 (en) 1998-12-03 2000-06-07 Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. Recombinant soluble Fc receptors
US7013219B2 (en) 1999-01-12 2006-03-14 Sangamo Biosciences, Inc. Regulation of endogenous gene expression in cells using zinc finger proteins
US6534261B1 (en) 1999-01-12 2003-03-18 Sangamo Biosciences, Inc. Regulation of endogenous gene expression in cells using zinc finger proteins
EP1141024B1 (en) 1999-01-15 2018-08-08 Genentech, Inc. POLYPEPTIDE COMPRISING A VARIANT HUMAN IgG1 Fc REGION
US6737056B1 (en) 1999-01-15 2004-05-18 Genentech, Inc. Polypeptide variants with altered effector function
US6794136B1 (en) 2000-11-20 2004-09-21 Sangamo Biosciences, Inc. Iterative optimization in the design of binding proteins
US20030104526A1 (en) 1999-03-24 2003-06-05 Qiang Liu Position dependent recognition of GNN nucleotide triplets by zinc fingers
US7030215B2 (en) 1999-03-24 2006-04-18 Sangamo Biosciences, Inc. Position dependent recognition of GNN nucleotide triplets by zinc fingers
ES2601882T5 (es) 1999-04-09 2021-06-07 Kyowa Kirin Co Ltd Procedimiento para controlar la actividad de una molécula inmunofuncional
US7189705B2 (en) 2000-04-20 2007-03-13 The University Of British Columbia Methods of enhancing SPLP-mediated transfection using endosomal membrane destabilizers
US6627442B1 (en) 2000-08-31 2003-09-30 Virxsys Corporation Methods for stable transduction of cells with hiv-derived viral vectors
JP2004534721A (ja) 2000-10-31 2004-11-18 ピーアール ファーマシューティカルズ,インク. 生理活性分子の向上した送達のための方法及び組成物
GB0029407D0 (en) 2000-12-01 2001-01-17 Affitech As Product
EP1355919B1 (en) 2000-12-12 2010-11-24 MedImmune, LLC Molecules with extended half-lives, compositions and uses thereof
HUP0600342A3 (en) 2001-10-25 2011-03-28 Genentech Inc Glycoprotein compositions
US20040002587A1 (en) 2002-02-20 2004-01-01 Watkins Jeffry D. Fc region variants
US20040132101A1 (en) 2002-09-27 2004-07-08 Xencor Optimized Fc variants and methods for their generation
EP1487879B1 (en) 2002-03-01 2012-12-26 Immunomedics, Inc. Bispecific antibody point mutations for enhancing rate of clearance
CN102911987B (zh) 2002-04-09 2015-09-30 协和发酵麒麟株式会社 基因组被修饰的细胞
ES2381617T5 (es) 2002-08-14 2016-02-24 Macrogenics, Inc. Anticuerpos específicos frente a FcgammaRIIB y sus procedimientos de uso
WO2004029207A2 (en) 2002-09-27 2004-04-08 Xencor Inc. Optimized fc variants and methods for their generation
ATE480562T1 (de) 2002-10-15 2010-09-15 Facet Biotech Corp Veränderung von fcrn-bindungsaffinitäten oder von serumhalbwertszeiten von antikörpern mittels mutagenese
AU2004204494B2 (en) 2003-01-09 2011-09-29 Macrogenics, Inc. Identification and engineering of antibodies with variant Fc regions and methods of using same
GB0324368D0 (en) 2003-10-17 2003-11-19 Univ Cambridge Tech Polypeptides including modified constant regions
WO2005077981A2 (en) 2003-12-22 2005-08-25 Xencor, Inc. Fc POLYPEPTIDES WITH NOVEL Fc LIGAND BINDING SITES
BRPI0506771A (pt) 2004-01-12 2007-05-22 Applied Molecular Evolution anticorpo, e, composição farmacêutica
EP1737890A2 (en) 2004-03-24 2007-01-03 Xencor, Inc. Immunoglobulin variants outside the fc region
WO2005123780A2 (en) 2004-04-09 2005-12-29 Protein Design Labs, Inc. Alteration of fcrn binding affinities or serum half-lives of antibodies by mutagenesis
WO2006085967A2 (en) 2004-07-09 2006-08-17 Xencor, Inc. OPTIMIZED ANTI-CD20 MONOCONAL ANTIBODIES HAVING Fc VARIANTS
CN103172731A (zh) 2004-07-15 2013-06-26 赞科股份有限公司 优化的Fc变体
WO2006047350A2 (en) 2004-10-21 2006-05-04 Xencor, Inc. IgG IMMUNOGLOBULIN VARIANTS WITH OPTIMIZED EFFECTOR FUNCTION
PL2161336T5 (pl) 2005-05-09 2017-10-31 Ono Pharmaceutical Co Ludzkie przeciwciała monoklonalne przeciwko białku Programmed Death 1 (PD-1) oraz sposoby leczenia raka z zastosowaniem samych przeciwciał anty-PD-1 lub w połączeniu z innymi środkami immunoterapeutycznymi
EP2571512B1 (en) 2010-05-17 2017-08-23 Sangamo BioSciences, Inc. Novel dna-binding proteins and uses thereof
JP2013534417A (ja) 2010-06-14 2013-09-05 アイオワ ステート ユニバーシティ リサーチ ファウンデーション,インコーポレーティッド Talエフェクターとfokiの融合タンパク質のヌクレアーゼ活性
KR20200070407A (ko) 2010-11-12 2020-06-17 넥타르 테라퓨틱스 Il-2 부분 및 중합체의 접합체
WO2012129201A1 (en) 2011-03-22 2012-09-27 The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Methods of growing tumor infiltrating lymphocytes in gas-permeable containers
SG194115A1 (en) 2011-04-05 2013-11-29 Cellectis Method for the generation of compact tale-nucleases and uses thereof
EA201490636A1 (ru) 2011-09-16 2014-08-29 Дзе Трастиз Оф Дзе Юниверсити Оф Пенсильвания Сконструированные с помощью рнк t-клетки для лечения злокачественных новообразований
CA2852672C (en) 2011-10-17 2021-07-20 Massachusetts Institute Of Technology A microfluidic system and method for delivering a payload into a cell by causing perturbations in a cell membrane of the cell
WO2013176915A1 (en) 2012-05-25 2013-11-28 Roman Galetto Methods for engineering allogeneic and immunosuppressive resistant t cell for immunotherapy
WO2013182910A2 (en) 2012-06-05 2013-12-12 Cellectis New transcription activator-like effector (tale) fusion protein
CA2869786A1 (en) 2012-06-08 2013-12-12 Alkermes, Inc. Fusion polypeptides comprising mucin-domain polypeptide linkers
KR20150105634A (ko) 2012-12-12 2015-09-17 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 서열 조작을 위한 개선된 시스템, 방법 및 효소 조성물의 유전자 조작 및 최적화
EP4234696A3 (en) 2012-12-12 2023-09-06 The Broad Institute Inc. Crispr-cas component systems, methods and compositions for sequence manipulation
WO2014093655A2 (en) 2012-12-12 2014-06-19 The Broad Institute, Inc. Engineering and optimization of systems, methods and compositions for sequence manipulation with functional domains
WO2014093694A1 (en) 2012-12-12 2014-06-19 The Broad Institute, Inc. Crispr-cas nickase systems, methods and compositions for sequence manipulation in eukaryotes
US8697359B1 (en) 2012-12-12 2014-04-15 The Broad Institute, Inc. CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products
ES2553782T3 (es) 2012-12-12 2015-12-11 The Broad Institute, Inc. Ingeniería de sistemas, métodos y composiciones de guía optimizadas para manipulación de secuencias
US11311575B2 (en) 2013-05-13 2022-04-26 Cellectis Methods for engineering highly active T cell for immunotherapy
AU2014273085B2 (en) 2013-05-29 2020-10-22 Cellectis New compact scaffold of Cas9 in the type II CRISPR system
US9458424B2 (en) 2013-12-19 2016-10-04 FertiPro N.V. Methods for cryopreservation of stem cells via slow-freezing
CN111705365B (zh) 2014-02-11 2024-12-17 科罗拉多州立大学董事会(法人团体) Crispr支持的多路基因组工程化
CN106103475B (zh) 2014-03-11 2021-01-12 塞勒克提斯公司 产生同种异体移植相容的t细胞的方法
EP3034092A1 (en) * 2014-12-17 2016-06-22 Université de Lausanne Adoptive immunotherapy for treating cancer
US9790490B2 (en) 2015-06-18 2017-10-17 The Broad Institute Inc. CRISPR enzymes and systems
EP3320082B1 (en) 2015-07-09 2023-05-24 Massachusetts Institute of Technology Delivery of materials to anucleate cells
WO2017041051A1 (en) 2015-09-04 2017-03-09 Sqz Biotechnologies Company Intracellular delivery of biomolecules to cells comprising a cell wall
CN108779475A (zh) 2016-01-12 2018-11-09 Sqz生物技术公司 复合物的细胞内递送
MX2019004707A (es) 2016-10-26 2019-08-12 Iovance Biotherapeutics Inc Reestimulacion de linfocitos infiltrantes de tumor crioconservados.
EP3538130A4 (en) 2016-11-10 2020-06-03 Nektar Therapeutics IMMUNOTHERAPEUTIC TUMOR TREATMENT PROCEDURE
AU2018205234B2 (en) 2017-01-06 2024-09-19 Iovance Biotherapeutics, Inc. Expansion of tumor infiltrating lymphocytes (TILs) with tumor necrosis factor receptor superfamily (TNFRSF) agonists and therapeutic combinations of TILs and TNFRSF agonists
WO2018132496A1 (en) 2017-01-10 2018-07-19 Nektar Therapeutics Multi-arm polymer conjugates of tlr agonist compounds and related immunotherapeutic treatment methods
JOP20190224A1 (ar) 2017-03-29 2019-09-26 Iovance Biotherapeutics Inc عمليات من أجل إنتاج الخلايا اللمفاوية المرتشحة للأورام واستخداماتها في العلاج المناعي
MX2019014023A (es) 2017-05-24 2020-02-17 Novartis Ag Proteinas de anticuerpo injertadas con citocina y metodos de uso en el tratamiento del cancer.
IL322312A (en) 2017-08-03 2025-09-01 Synthorx Inc Cytokine conjugates for the treatment of infectious diseases and cell proliferation
SG11202006541UA (en) 2018-01-08 2020-08-28 Iovance Biotherapeutics Inc Processes for generating til products enriched for tumor antigen-specific t-cells
AU2019342749B2 (en) * 2018-09-20 2025-07-10 Iovance Biotherapeutics, Inc. Expansion of tils from cryopreserved tumor samples
CA3127689A1 (en) 2019-02-06 2020-08-13 Synthorx, Inc. Il-2 conjugates and methods of use thereof
US11246906B2 (en) 2019-06-11 2022-02-15 Alkermes Pharma Ireland Limited Compositions and methods for subcutaneous administration of cancer immunotherapy
CN115244173A (zh) * 2019-12-20 2022-10-25 英研生物(英国)有限公司 用于分离肿瘤浸润淋巴细胞的装置及方法及其用途

Also Published As

Publication number Publication date
WO2023196877A1 (en) 2023-10-12
EP4504220A1 (en) 2025-02-12
CA3247638A1 (en) 2023-10-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2024506557A (ja) 修飾された腫瘍浸潤リンパ球を作製する方法及び養子細胞療法におけるそれらの使用
JP2024501452A (ja) Braf阻害剤及び/またはmek阻害剤と併用した腫瘍浸潤リンパ球治療によるがん患者の治療
JP2024510505A (ja) Cd39/cd69選択に関連した腫瘍浸潤リンパ球(til)拡張及びtilにおける遺伝子ノックアウトのための方法
JP2024527961A (ja) Kras阻害剤と併用した腫瘍浸潤リンパ球療法によるがん患者の治療
CN112969469A (zh) 抗pd-1抗体难治性nsclc患者的治疗
US20240368543A1 (en) Treatment of nsclc patients with tumor infiltrating lymphocyte therapies
JP2024515189A (ja) 細胞免疫療法におけるキメラ共刺激受容体、ケモカイン受容体、及びそれらの使用
JP2024519029A (ja) Pd-1遺伝子編集された腫瘍浸潤リンパ球及び免疫療法におけるその使用
WO2022076606A1 (en) Treatment of nsclc patients with tumor infiltrating lymphocyte therapies
JP2023524108A (ja) 改良された腫瘍反応性t細胞の選択
JP2023554395A (ja) Ctla-4及びpd-1阻害剤と併用した腫瘍浸潤リンパ球療法による治療
JP2025504908A (ja) サイトカイン関連腫瘍浸潤リンパ球組成物及び方法
JP2025512313A (ja) 腫瘍浸潤リンパ球療法によるnsclc患者の治療
JP2024500403A (ja) 腫瘍浸潤リンパ球によるがんの治療
JP2024535002A (ja) Pd-1 talenノックダウンを使用したtil製品を生成するためのプロセス
JP2023544199A (ja) 腫瘍浸潤リンパ球療法によるnsclc患者の治療
US20230416680A1 (en) Til expansion processes using specific cytokine combinations and/or akti treatment
JP2025503987A (ja) ペイロードを発現するように操作された腫瘍浸潤リンパ球
JP2024509184A (ja) 腫瘍保存及び細胞培養組成物
JP2025516551A (ja) Il-15rアゴニストと併用した腫瘍浸潤リンパ球療法によるがん患者の治療
JP2025537155A (ja) Cd39/cd103選択に関連した腫瘍浸潤リンパ球(til)拡張のための方法
JP2024526898A (ja) 固形腫瘍断片の凍結保存のための方法
JP2024534581A (ja) 腫瘍浸潤リンパ球のための拡張プロセス及び薬剤
JP2024541911A (ja) 患者特異的免疫療法のための細胞の製造を調整するためのシステム及び方法
JP2024544867A (ja) Cd8腫瘍浸潤リンパ球を利用する拡張治療の方法

Legal Events

Date Code Title Description
A524 Written submission of copy of amendment under article 19 pct

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A524

Effective date: 20241204

A521 Request for written amendment filed

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523

Effective date: 20250305