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JP2024523264A - Ｍｓｔ１関連疾患および障害の処置 - Google Patents

Ｍｓｔ１関連疾患および障害の処置 Download PDF

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JP2024523264A
JP2024523264A JP2023576323A JP2023576323A JP2024523264A JP 2024523264 A JP2024523264 A JP 2024523264A JP 2023576323 A JP2023576323 A JP 2023576323A JP 2023576323 A JP2023576323 A JP 2023576323A JP 2024523264 A JP2024523264 A JP 2024523264A
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seq
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antisense strand
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oligonucleotide
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JP2023576323A
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ゴッテスマン，オムリ
ブルース，シャノン
バスケ，ポール
カジェス，ブライアン
ジャクボウスキ，デイビッド
クラインシュタイン，サラ
ルイス，デイビッド
ロゼマ，デイビッド
ヴェキック，ジョン
Original Assignee
エンピリコ インク．
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Abstract

【解決手段】ＭＳＴ１を標的とするオリゴヌクレオチドを含む組成物が本明細書に開示される。オリゴヌクレオチドは、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）またはアンチセンスオリゴヌクレオチド（ＡＳＯ）を含み得る。さらに、ＭＳＴ１を標的とするオリゴヌクレオチドを対象に提供する工程を含む、ＭＳＴ１突然変異に関連する疾病を処置する方法も本明細書で提供される。【選択図】図１

Description

相互参照
本出願は、２０２１年６月１６日に出願された米国仮特許出願第６３／２１１，３６４号の利益を主張し、これは引用によって本明細書に組み込まれる。
肺障害は共通の問題であり、様々な人に影響を与えかねない。これらの障害を処置するために、治療薬の改善が必要となっている。
いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１を標的とするオリゴヌクレオチドを含む組成物が本明細書で開示される。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１を標的とし、かつ有効量で対象に投与されると肺機能測定値を増加させるオリゴヌクレオチドを含む組成物が本明細書に開示される。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、１秒量（ｆｏｒｃｅｄ ｅｘｐｉｒａｔｏｒｙ ｖｏｌｕｍｅ ｉｎ １ ｓｅｃｏｎｄ）（ＦＥＶ１）測定値、予測１秒量に対する比率（ｆｏｒｃｅｄ ｅｘｐｉｒａｔｏｒｙ ｖｏｌｕｍｅ ｉｎ １ ｓｅｃｏｎｄ ｐｅｒｃｅｎｔ ｐｒｅｄｉｃｔｅｄ）（ＦＥＶ１ｐｐ）測定値、努力肺活量（ＦＶＣ）測定値、ＦＥＶ１／ＦＶＣ比測定値、努力呼気量、または最大呼気流量（ｐｅａｋ ｅｘｐｉｒａｔｏｒｙ ｆｌｏｗ）測定値を含む。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、投与前と比較して、約１０％以上増加する。本明細書には、いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されると白血球測定値を減少させるオリゴヌクレオチドを含む組成物が開示されている。いくつかの実施形態において、白血球測定値は肺白血球測定値を含む。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、循環白血球測定値を含む。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、好中球測定値、好酸球測定値、好塩基球測定値、単球測定値、もしくはリンパ球測定値、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、投与前と比較して、約１０％以上減少する。本明細書には、いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されると慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）または喘息増悪の測定値を減少させるオリゴヌクレオチドを含む組成物が開示されている。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤまたは喘息増悪の測定値は、投与前と比較して、約１０％以上減少する。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシド間結合を含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシド間結合は、アルキルホスホネート、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ホスホロジチオエート、アルキルホスホノチオエート、ホスホロアミデート、カルバメート、カーボネート、リン酸トリエステル、アセトアミデート、もしくはカルボキシメチルエステル、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシド間結合は、１個以上のホスホロチオエート結合を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個の修飾ヌクレオシド間結合を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、ロックド核酸（ＬＮＡ）、ヘキシトール核酸（ＨＬＡ）、シクロヘキセン核酸（ＣｅＮＡ）、２’－メトキシエチル、２’－Ｏ－アルキル、２’－Ｏ－アリル、２’－Ｏ－アリル、２’－フルオロ、もしくは２’－デオキシ、またはこれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、ＬＮＡを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’，４’拘束エチル核酸を含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－メチルヌクレオシド、２’－デオキシフルオロヌクレオシド、２’－Ｏ－Ｎ－メチルアセトアミド（２’－Ｏ－ＮＭＡ）ヌクレオシド、２’－Ｏ－ジメチルアミノエトキシエチル（２’－Ｏ－ＤＭＡＥＯＥ）ヌクレオシド、２’－Ｏ－アミノプロピル（２’－Ｏ－ＡＰ）ヌクレオシド、もしくは２’－ａｒａ－Ｆ、またはこれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、１つ以上の２’フルオロ修飾ヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’Ｏ－アルキル修飾ヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、または２１個の修飾ヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの３’末端または５’末端で結合した脂質を含む。いくつかの実施形態において、脂質は、コレステロール、ミリストイル、パルミトイル、ステアロイル、リトコロイル（ｌｉｔｈｏｃｈｏｌｏｙｌ）、ドコサノイル、ドコサヘキサエノイル、ミリスチル、パルミチルステアリル、もしくはα－トコフェロール、またはこれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの３’末端または５’末端で結合した糖部分を含む。いくつかの実施形態において、糖部分はＮ－アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ－アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）、またはマンノースを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの３’末端または５’末端で結合したインテグリン標的化リガンドを含む。いくつかの実施形態において、インテグリンはインテグリンα－ｖ－β－６を含む。いくつかの実施形態において、インテグリン標的化リガンドは、アルギニン－グリシン－アスパラギン酸（ＲＧＤ）ペプチドを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含む低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は１２～３０ヌクレオシド長である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は１２～３０ヌクレオシド長である。本明細書では、いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含む組成物が開示され、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、各鎖は独立して約１２～３０ヌクレオシド長であり、センス鎖およびアンチセンス鎖の少なくとも１つは、配列番号６１８５の約１２～３０個の隣接するヌクレオシドを含むヌクレオシド配列を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖に関して、以下：（ｉ）すべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、すべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含み、（ｉｉ）すべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、すべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含み、（ｉｉｉ）すべてのプリンは２’フルオロ修飾プリンを含み、すべてのピリミジンは２’メチル修飾ピリミジンを含み、（ｉｖ）すべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、すべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含み、（ｖ）すべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、すべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含み、または、（ｖｉ）すべてのピリミジンは２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、すべてのプリンは２’メチル修飾プリンを含む、のいずれか１つが当てはまる。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、２４Ｓ、または３５Ｓのいずれか１つを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖に関して、以下：（ｉ）すべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、すべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含み、（ｉｉ）すべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、すべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含み、（ｉｉｉ）すべてのプリンは２’メチル修飾プリンを含み、すべてのピリミジンは２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、（ｉｖ）すべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、すべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含み、（ｖ）すべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、すべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含み、または、（ｖｉ）すべてのピリミジンは２’メチル修飾ピリミジンを含み、すべてのプリンは２’フルオロ修飾プリンを含む、のいずれか１つが当てはまる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳのいずれか１つを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、配列番号１～３０２４または６３５８～６３９７のいずれか１つの核酸配列を含み、アンチセンス鎖は、配列番号３０２５～６０４８または６３９８～６４１７のいずれか１つの核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、配列番号６３７３、６３７５、６３８５、６３８６、または６３８７のいずれか１つの核酸配列を含み、アンチセンス鎖は、配列番号６４０３、６４０５、６４１５、６４１６、または６４１７のいずれか１つの核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチド（ＡＳＯ）を含む。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは１２～３０ヌクレオシド長である。本明細書には、いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含む組成物が開示され、オリゴヌクレオチドは、約１２～３０ヌクレオシド長のＡＳＯと、配列番号６１８５の約１２～３０個の隣接するヌクレオシドに相補的なヌクレオシド配列とを含む。いくつかの実施形態は、薬学的に許容可能な担体を含む。いくつかの実施形態は、有効量の組成物を対象に投与する工程を含む、肺障害を有する対象を処置する方法を含む。いくつかの実施形態において、肺障害は、ＣＯＰＤ、ＣＯＰＤの急性増悪、気腫、慢性気管支炎、喘息、喘息重積状態、喘息－ＣＯＰＤ重複症候群（ＡＣＯＳ）、咳、肺癌、間質性肺疾患、または肺線維症を含む。
本発明の新規な特徴は添付の特許請求の範囲で詳細に記載されている。本発明の特徴と利点をより良く理解するには、本発明の原理が用いられる例示的な実施形態を説明する以下の詳細な説明と添付図面とを参照されたい。
ＭＳＴ１タンパク質のウエスタンブロットを示す。
大規模なヒトの遺伝子データは、医薬品の発見と開発の成功率を向上させることができる。ゲノムワイド関連解析（ＧＷＡＳ）は、集団試料における遺伝子変異と形質との関連を検出することができる。ＧＷＡＳは、疾病の生物学的な理解を深め、適切な治療法を提供することができる。ＧＷＡＳは、ジェノタイピングデータおよび／またはシーケンシングデータを利用することができ、多くの場合、ゲノム上に比較的均一に分布している数百万の遺伝子変異を評価することを含んでいる。最も一般的なＧＷＡＳのデザインは症例対照研究であり、症例と対照における変異体頻度を比較することを含んでいる。ある変異体が症例と対照で有意に異なる頻度を有する場合、その変異体は疾患に関連していると言われる。ＧＷＡＳで使用される可能性のある関連統計は、統計的有意性の指標としてのｐ値、効果量の指標としてのオッズ比（ＯＲ）、または効果量の指標としてのベータ係数（β）である。研究者はしばしば加法遺伝モデルを仮定して、対立遺伝子オッズ比を計算し、これは、ある対立遺伝子のコピーが１つ増えるごとに（その対立遺伝子のコピーを持たない場合と比較して）、与えられる疾患のリスクが増加する（または減少する）ことを示すものである。ＧＷＡＳのデザインおよび解釈における追加的な概念は連鎖不平衡の概念であり、これは対立遺伝子のランダムではない関連性（ｎｏｎ－ｒａｎｄｏｍ ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ）である。連鎖不平衡が存在すると、どの変異体が「原因である」のかが不明瞭になりかねない。
変異体の機能的アノテーションおよび／またはウェットラボ実験は、ＧＷＡＳを介して同定された原因遺伝子変異体を同定することができ、多くの場合、疾患原因遺伝子の同定につなげることができる。とりわけ、原因遺伝子変異体の機能的効果（例えば、タンパク質機能の喪失、タンパク質機能の獲得、遺伝子発現の増加、または遺伝子発現の減少）を理解することにより、その変異体を標的遺伝子の治療的調節の代理として使用し、その標的を調節する治療薬の潜在的な治療効果および安全性についての洞察を得ることができるようになる。
このような遺伝子と疾患との関連性の特定は、疾患生物学に対する洞察を与え、製薬産業にとって新規の治療標的を特定するために使用することができる。ヒト遺伝学から得られた治療上の洞察を翻訳するためには、患者における疾患生物学が外来的に「プログラム」され、ヒト遺伝学からの観察を再現する必要がある。ヒト遺伝学によって同定された治療標的を新薬に応用する際に加えることができる治療モダリティにはいくつかの選択肢がある。これらは、低分子化合物およびモノクローナル抗体などの十分に確立された治療モダリティ、オリゴヌクレオチドなどの成熟したモダリティ、ならびに遺伝子治療や遺伝子編集などの新しいモダリティを含んでもよい。治療モダリティの選択は、標的の位置（例えば、細胞内、細胞外、または分泌物）、関連組織（例えば、肺または肝臓）、および関連適応症を含むいくつかの要因に依存し得る。
ＭＳＴ１（マクロファージ刺激１）遺伝子は、第３染色体上に位置し、肝細胞増殖因子様タンパク質（ＨＬＰ、ＨＧＦＬ、またはＨＧＦＬＰ）としても知られるマクロファージ刺激タンパク質（ＭＳＰ）をコードする。ＭＳＰはＭＳＴ１タンパク質とも呼ばれ得る。ＭＳＴ１遺伝子は、様々な転写物またはスプライス変異体をコードし得る。ＭＳＰは、７１１個のアミノ酸を含み得、約８０．３ｋＤａの質量を有し得る。ＭＳＰは、α鎖およびβ鎖に切断され得る。ＭＳＰは細胞質であってもよい。ＭＳＰは分泌され得る。ＭＳＰは、ＭＳＴ１Ｒによってコードされるマクロファージ刺激タンパク質受容体（マクロファージ刺激１受容体）と相互作用し得る。ＭＳＴ１は、肝臓細胞（ｌｉｖｅｒ ｃｅｌｌｓ）、例えば、肝細胞（ｈｅｐａｔｏｃｙｔｅｓ）において発現され得る。分泌されたＭＳＰは、肺においてマクロファージ刺激タンパク質受容体と結合または相互作用し得る。ＭＳＰは、肺の毛様体運動性を刺激し得る。ＭＳＴ１は、肺細胞において発現され得る。ＭＳＰアミノ酸配列の例、およびＭＳＰのさらなる記載は、ｕｎｉｐｒｏｔ．ｏｒｇにアクセッション番号Ｐ２６９２７（２００７年５月１５日最後の改変）として含まれる。
ここで、ヒトにおいてＭＳＴ１遺伝子の機能の喪失をもたらし得る遺伝子変異体は、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）のリスクの低下、ＣＯＰＤの家族歴、喘息、および吸入ベータアゴニスト薬物療法の使用に関連することが示されている。したがって、ＭＳＴ１またはＭＳＰの阻害は、ＣＯＰＤ、ＣＯＰＤの急性増悪、肺気腫、慢性気管支炎、喘息、喘息重積状態、喘息－ＣＯＰＤ重複症候群（ＡＣＯＳ）、咳、肺癌、間質性肺疾患、または肺線維症などの肺障害の治療のための治療戦略として役立ち得る。
本明細書には、ＭＳＴ１またはＭＳＰを阻害または標的化する方法または組成物が開示される。ＭＳＴ１の阻害または標的化が開示される場合、いくつかの実施形態は、ＭＳＰを阻害または標的化することを含んでもよく、逆もまた同様であることが企図される。例えば、本明細書に記載されるオリゴヌクレオチドを使用してＭＳＴ１遺伝子によってコードされるＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ）を阻害または標的化することによって、ＭＳＴ１ ＲＮＡの翻訳によるＭＳＰの産生がより少ないという結果として、ＭＳＰを阻害または標的化することができ、あるいは、ＭＳＰは、ＭＳＴ１ ＲＮＡと結合または相互作用し、ＭＳＴ１ ＲＮＡからのＭＳＰの産生を低減するオリゴヌクレオチドによって標的化または阻害され得る。したがって、ＭＳＴ１の標的化は、ＭＳＴ１ ＲＮＡの結合、およびＭＳＴ１ ＲＮＡレベルまたはＭＳＰレベルの低下を指すことがある。オリゴヌクレオチドは、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）またはアンチセンスオリゴヌクレオチド（ＡＳＯ）を含み得る。ＭＳＴ１を標的化するオリゴヌクレオチドを、処置を必要とする対象に提供することによって肺障害を処置する方法も本明細書で提供される。
Ｉ．組成物
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドを含む組成物が本明細書で開示される。いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１を標的化するオリゴヌクレオチドを含んでいる。いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１を標的化するオリゴヌクレオチドからなる。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、対象のＭＳＴ１ ｍＲＮＡ発現を減少させる。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、対象のＭＳＰ発現を減少させる。オリゴヌクレオチドは、本明細書に記載される低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）を含み得る。オリゴヌクレオチドは、本明細書に記載されるアンチセンスオリゴヌクレオチド（ＡＳＯ）を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書に記載される組成物は、処置を必要とする対象における障害を処置する方法において使用される。いくつかの実施形態は、本明細書に記載される障害を処置する方法において使用するためのオリゴヌクレオチドを含む組成物に関する。いくつかの実施形態は、本明細書に記載されるような障害を処置する方法における、オリゴヌクレオチドを含む組成物の使用に関する。
いくつかの実施形態は、ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されると細胞、流体、または組織中のＭＳＴ１ ｍＲＮＡまたはＭＳＰレベルを減少させるオリゴヌクレオチドを含む組成物を含んでいる。いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されると細胞または組織のＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルを減少させるオリゴヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、細胞は肝臓細胞または肝細胞である。いくつかの実施形態において、細胞は、肺細胞、肺上皮細胞、Ｉ型またはＩＩ型の肺胞細胞、マクロファージ、肺胞マクロファージ、杯細胞、クラブ細胞（ｃｌｕｂ ｃｅｌｌ）、または線維芽細胞である。いくつかの実施形態において、組織は肝臓組織である。いくつかの実施形態において、組織は肺組織である。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、投与前と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、投与前と比較して、約１０％以上減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、投与前と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、または約１００％以上減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、投与前と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、投与前と比較して、約１０％以下減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、投与前と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、または約９０％以下減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、２．５％、５％、７．５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５、％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、もしくは１００％、または前述の２つの割合のいずれかによって定義される範囲だけ減少する。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されると細胞、流体、または組織中のＭＳＰレベルを減少させるオリゴヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、細胞は肝臓細胞または肝細胞である。いくつかの実施形態において、細胞は、肺細胞、肺上皮細胞、Ｉ型またはＩＩ型の肺胞細胞、マクロファージ、肺胞マクロファージ、杯細胞、クラブ細胞（ｃｌｕｂ ｃｅｌｌ）、または線維芽細胞である。いくつかの実施形態において、組織は肝臓組織である。いくつかの実施形態において、組織は肺組織である。いくつかの実施形態において、流体は血液、血清、または血漿のサンプルである。いくつかの実施形態において、流体は肺液、例えば、気管支肺胞液である。いくつかの実施形態において、ＭＳＰレベルは、投与前と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＰレベルは、投与前と比較して、約１０％以上減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＰレベルは、投与前と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、または約１００％以上減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＰレベルは、投与前と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＰレベルは、投与前と比較して、約１０％以下減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＰレベルは、投与前と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、または約９０％以下減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＰレベルは、２．５％、５％、７．５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、もしくは１００％、または前述の２つの割合のいずれかによって定義される範囲だけ減少する。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されると対象における肺障害の有害表現型を減少させるオリゴヌクレオチドを含む。肺障害は、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、ＣＯＰＤの急性増悪、気腫、慢性気管支炎、喘息、喘息重積状態、喘息－ＣＯＰＤ重複症候群（ＡＣＯＳ）、咳、肺癌、間質性肺疾患、または肺線維症を含み得る。いくつかの実施形態において、有害表現型は、投与前と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上減少する。いくつかの実施形態において、有害表現型は、投与前と比較して、約１０％以上減少する。いくつかの実施形態において、有害表現型は、投与前と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、または約１００％、減少する。いくつかの実施形態において、有害表現型は、投与前と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下減少する。いくつかの実施形態において、有害表現型は、投与前と比較して、約１０％以下減少する。いくつかの実施形態において、有害表現型は、投与前と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、または約９０％以下減少する。いくつかの実施形態において、有害表現型は、２．５％、５％、７．５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、もしくは１００％、または前述の２つの割合のいずれかによって定義される範囲だけ減少する。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されると肺障害の保護表現型を増強するオリゴヌクレオチドを含む。肺障害は、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、ＣＯＰＤの急性増悪、気腫、慢性気管支炎、喘息、喘息重積状態、喘息－ＣＯＰＤ重複症候群（ＡＣＯＳ）、咳、肺癌、間質性肺疾患、または肺線維症を含み得る。いくつかの実施形態において、保護表現型は、投与前と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上増加する。いくつかの実施形態において、保護表現型は、投与前と比較して、約１０％以上増加する。いくつかの実施形態において、保護表現型は、投与前と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、または約１００％以上増加する。いくつかの実施形態において、保護表現型は、投与前と比較して、約２００％以上、約３００％以上、約４００％以上、約５００％以上、約６００％以上、約７００％以上、約８００％以上、約９００％以上、または約１０００％以上増加する。いくつかの実施形態において、保護表現型は、投与前と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下増加する。いくつかの実施形態において、保護表現型は、投与前と比較して、約１０％以下増加する。いくつかの実施形態において、保護表現型は、投与前と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、約９０％以下、または約１００％以下増加する。いくつかの実施形態において、保護表現型は、投与前と比較して、約２００％以下、約３００％以下、約４００％以下、約５００％以下、約６００％以下、約７００％以下、約８００％以下、約９００％以下、または約１０００％以下増加する。いくつかの実施形態において、保護表現型は、２．５％、５％、７．５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、１５０％、２００％、２５０％、３００％、４００％、５００％、６００％、７００％、８００％、９００％、もしくは１０００％、または前述の２つの割合のいずれかによって定義される範囲だけ増加する。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されると肺機能測定値を改善する（上昇させる）オリゴヌクレオチドを含む。肺機能測定値は、１秒量（ｆｏｒｃｅｄ ｅｘｐｉｒａｔｏｒｙ ｖｏｌｕｍｅ ｉｎ １ ｓｅｃｏｎｄ）（ＦＥＶ１）、予測１秒量に対する比率（ｆｏｒｃｅｄ ｅｘｐｉｒａｔｏｒｙ ｖｏｌｕｍｅ ｉｎ １ ｓｅｃｏｎｄ ｐｅｒｃｅｎｔ ｐｒｅｄｉｃｔｅｄ）（ＦＥＶ１ｐｐ）、努力肺活量（ＦＶＣ）、ＦＥＶ１／ＦＶＣ比、努力呼気量、または最大呼気流量（ｐｅａｋ ｅｘｐｉｒａｔｏｒｙ ｆｌｏｗ）の測定値を含み得る。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、投与前と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上改善する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、投与前と比較して、約１０％以上改善する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、投与前と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、または約１００％以上改善する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、投与前と比較して、約２００％以上、約３００％以上、約４００％以上、約５００％以上、約６００％以上、約７００％以上、約８００％以上、約９００％以上、または約１０００％以上改善する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、投与前と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下改善する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、投与前と比較して、約１０％以下改善する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、投与前と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、約９０％以下、または約１００％以下改善する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、投与前と比較して、約２００％以下、約３００％以下、約４００％以下、約５００％以下、約６００％以下、約７００％以下、約８００％以下、約９００％以下、または約１０００％以下改善する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、２．５％、５％、７．５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、１５０％、２００％、２５０％、３００％、４００％、５００％、６００％、７００％、８００％、９００％、もしくは１０００％、または前述の２つの割合のいずれかによって定義される範囲だけ改善する。
白血球測定値は肺障害によって影響を受けることがある。例えば、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）または喘息を含み得るいくつかの炎症性肺障害は、オリゴヌクレオチドを含む組成物を使用して処置され得る炎症および循環白血球数の増加を引き起こし得るか、あるいは、肺障害に伴う肺炎症は、肺組織または肺液（例えば、気管支肺胞液）中の白血球の増加を含み得る。いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されると対象の細胞、流体、または組織中の白血球測定値を変化させるオリゴヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、細胞は肝臓細胞または肝細胞である。いくつかの実施形態において、細胞は、肺細胞、肺上皮細胞、Ｉ型またはＩＩ型の肺胞細胞、マクロファージ、肺胞マクロファージ、杯細胞、クラブ細胞（ｃｌｕｂ ｃｅｌｌ）、または線維芽細胞である。いくつかの実施形態において、組織は肝臓組織である。いくつかの実施形態において、組織は肺組織である。いくつかの実施形態において、流体は血液、血清、または血漿のサンプルである。いくつかの実施形態において、流体は肺液、例えば、気管支肺胞液である。変化は、減少（例えば、白血球の循環レベル、または肺における白血球のレベルが炎症性肺障害に起因して増加する場合）であってもよい。変化は、いくつかの実施形態において増加であってもよい。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、投与前と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上変化する。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、投与前と比較して、約１０％以上変化する。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、投与前と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、または約８０％以上変化する。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、投与前と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下変化する。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、投与前と比較して、約１０％以下変化する。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、投与前と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、または約９０％以下変化する。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、２．５％、５％、７．５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、もしくは９０％、または前述の２つの割合のいずれかによって定義される範囲だけ変化する。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されると対象における慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）の増悪を減少させるオリゴヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤ増悪は、投与前と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上減少する。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤ増悪は、投与前と比較して、約１０％以上減少する。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤ増悪は、投与前と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、または約１００％減少する。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤ増悪は、投与前と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下減少する。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤ増悪は、投与前と比較して、約１０％以下減少する。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤ増悪は、投与前と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、または約９０％以下減少する。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤ増悪は、２．５％、５％、７．５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、もしくは１００％、または前述の２つの割合のいずれかによって定義される範囲だけ減少する。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されると対象における喘息の増悪を減少させるオリゴヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、喘息の増悪は、投与前と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上減少する。いくつかの実施形態において、喘息の増悪は、投与前と比較して、約１０％以上減少する。いくつかの実施形態において、喘息の増悪は、投与前と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、または約１００％減少する。いくつかの実施形態において、喘息の増悪は、投与前と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下減少する。いくつかの実施形態において、喘息の増悪は、投与前と比較して、約１０％以下減少する。いくつかの実施形態において、喘息の増悪は、投与前と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、または約９０％以下減少する。いくつかの実施形態において、喘息の増悪は、２．５％、５％、７．５％、１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、もしくは１００％、または前述の２つの割合のいずれかによって定義される範囲だけ減少する。
Ａ．ｓｉＲＮＡ
いくつかの実施形態において、組成物はＭＳＴ１を標的とするオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）を含む。いくつかの実施形態において、組成物はＭＳＴ１を標的とするオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含む低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）を含む。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、センス鎖は１２～３０ヌクレオシド長である。いくつかの実施形態において、組成物は、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、もしくは３０ヌクレオシドの長さであり、または、前述の２つの数字のいずれかによって定義される範囲のセンス鎖を含む。センス鎖は１４～３０ヌクレオシド長であり得る。いくつかの実施形態において、組成物は１２～３０ヌクレオシド長のアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、もしくは３０ヌクレオシドの長さであり、または、前述の２つの数字のいずれかによって定義される範囲のセンス鎖を含む。アンチセンス鎖は１４～３０ヌクレオシド長であり得る。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、各鎖は独立して約１２～３０ヌクレオシド長であり、センス鎖およびアンチセンス鎖の少なくとも１つは、配列番号６１６３などの完全長のヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡ配列の約１２～３０個の隣接するヌクレオシドを含むヌクレオシド配列を含んでいる。いくつかの実施形態において、センス鎖およびアンチセンス鎖の少なくとも１つは、配列番号６１６３の１つの少なくとも約１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、またはそれ以上の隣接するヌクレオシドを含むヌクレオシド配列を含んでいる。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、各鎖は独立して約１２～３０ヌクレオシド長であり、センス鎖およびアンチセンス鎖の少なくとも１つは、配列番号６１８５などの完全長のヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡ配列の約１２～３０個の隣接するヌクレオシドを含むヌクレオシド配列を含んでいる。いくつかの実施形態において、センス鎖およびアンチセンス鎖の少なくとも１つは、配列番号６１８５の１つの少なくとも約１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、またはそれ以上の隣接するヌクレオシドを含むヌクレオシド配列を含んでいる。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、センス鎖とアンチセンス鎖は、二本鎖ＲＮＡ二重鎖（ｄｏｕｂｌｅ－ｓｔｒａｎｄｅｄ ＲＮＡ ｄｕｐｌｅｘ）を形成する。いくつかの実施形態において、二本鎖ＲＮＡ二重鎖の最初の塩基対は、ＡＵ塩基対である。
いくつかの実施形態において、センス鎖はさらに３’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はさらに、５’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。
いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖はさらに３’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖はさらに、５’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、ｓｉＲＮＡは、ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡにおいて１９量体と結合する。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡにおいて、１２量体、１３量体、１４量体、１５量体、１６量体、１７量体、１８量体、１９量体、２０量体、２１量体、２２量体、２３量体、２４量体、または２５量体と結合する。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、ｓｉＲＮＡは、非ヒト霊長類ＭＳＴ１ ｍＲＮＡにおいて１７量体と結合する。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、非ヒト霊長類ＭＳＴ１ ｍＲＮＡにおいて、１２量体、１３量体、１４量体、１５量体、１６量体、１７量体、１８量体、１９量体、２０量体、２１量体、２２量体、２３量体、２４量体、または２５量体と結合する。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、ｓｉＲＮＡは、ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよび２０個以下のヒトのオフターゲットと結合し、アンチセンス鎖のミスマッチは２個以下である。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよび１０個以下のヒトのオフターゲットと結合し、アンチセンス鎖のミスマッチは２個以下である。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよび３０個以下のヒトのオフターゲットと結合し、アンチセンス鎖のミスマッチは２個以下である。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよび４０個以下のヒトのオフターゲットと結合し、アンチセンス鎖のミスマッチは２個以下である。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよび５０個以下のヒトのオフターゲットと結合し、アンチセンス鎖のミスマッチは２個以下である。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよび１０個以下のヒトのオフターゲットと結合し、アンチセンス鎖のミスマッチは３個以下である。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよび２０個以下のヒトのオフターゲットと結合し、アンチセンス鎖のミスマッチは３個以下である。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよび３０個以下のヒトのオフターゲットと結合し、アンチセンス鎖のミスマッチは３個以下である。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよび４０個以下のヒトのオフターゲットと結合し、アンチセンス鎖のミスマッチは３個以下である。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよび５０個以下のヒトのオフターゲットと結合し、アンチセンス鎖のミスマッチは３個以下である。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、ｓｉＲＮＡは、ＳＮＰを有していないヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡ標的部位に結合し、マイナーアレル頻度（ＭＡＦ）は１％以上である（位置２～１８）。いくつかの実施形態において、ＭＡＦは、約２％以上、約３％以上、約４％以上、約５％以上、約６％以上、約７％以上、約８％以上、約９％以上、約１０％以上、約１１％以上、約１２％以上、約１３％以上、約１４％以上、約１５％以上、約１６％以上、約１７％以上、約１８％以上、約１９％以上、または約２０％以上である。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、センス鎖は、配列番号１～３０２４のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、配列番号１～３０２４のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列、または３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はさらに、３’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はさらに、５’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、配列番号１～３０２４のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列、または、３’末端に１個もしくは２個のヌクレオシド付加を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、センス鎖は、配列番号１～３０２４のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列を含んでいる。センス鎖またはアンチセンス鎖は、本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖またはアンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、アンチセンス鎖は、配列番号３０２５～６０４８のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号３０２５～６０４８のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列、または３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖はさらに、３’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖はさらに、５’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、配列番号３０２５～６０４８のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列、または、３’末端に１個もしくは２個のヌクレオシド付加を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、アンチセンス鎖は、配列番号３０２５～６０４８のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列を含んでいる。センス鎖またはアンチセンス鎖は、本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖またはアンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、センス鎖は、配列番号６３５８～６３９７のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、配列番号６３５８～６３９７のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列、または３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はさらに、３’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はさらに、５’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、配列番号６３５８～６３９７のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列、または、３’末端に１個もしくは２個のヌクレオシド付加を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、センス鎖は、配列番号６３５８～６３９７のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列を含んでいる。センス鎖またはアンチセンス鎖は、本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖またはアンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、アンチセンス鎖は、配列番号６３９８～６４１７のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６３９８～６４１７のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列、または３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖はさらに、３’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖はさらに、５’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、配列番号６３９８～６４１７のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列、または、３’末端に１個もしくは２個のヌクレオシド付加を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、アンチセンス鎖は、配列番号６３９８～６４１７のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列を含んでいる。センス鎖またはアンチセンス鎖は、本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖またはアンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは表３～８のいずれか１つのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは表３～８のいずれか１つのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表３～８のいずれか１つのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／またはアンチセンス鎖の配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは非ヒト霊長類（ＮＨＰ）ＭＳＴ１ ｍＲＮＡと交差反応性である。センス鎖またはアンチセンス鎖は、本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖またはアンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４Ｂのセンス鎖の配列、または３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４Ｂのセンス鎖の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４Ｂのセンス鎖の配列を含む。センス鎖は、３’ＵＵオーバーハングなどのオーバーハングを含み得るこれらの配列のいずれかを含み得る。センス鎖は本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４Ｂのアンチセンス鎖の配列、または３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４Ｂのアンチセンス鎖の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４Ｂのアンチセンス鎖の配列を含む。アンチセンス鎖は、３’ＵＵオーバーハングなどのオーバーハングを含み得るこれらの配列のいずれかを含み得る。アンチセンス鎖は本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。アンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４Ｄのセンス鎖の配列、または３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４Ｄのセンス鎖の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４Ｄのセンス鎖の配列を含む。センス鎖は、３’ＵＵオーバーハングなどのオーバーハングを含み得るこれらの配列のいずれかを含み得る。センス鎖は本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４Ｄのアンチセンス鎖の配列、または３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４Ｄのアンチセンス鎖の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４Ｄのアンチセンス鎖の配列を含む。アンチセンス鎖は、３’ＵＵオーバーハングなどのオーバーハングを含み得るこれらの配列のいずれかを含み得る。アンチセンス鎖は本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。アンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表３３Ｂまたは表３３ＣのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、または欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表３３Ｂまたは表３３ＣのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、または欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表３３Ｂまたは表３３ＣのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／またはアンチセンス鎖の配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは非ヒト霊長類（ＮＨＰ）ＭＳＴ１ ｍＲＮＡと交差反応性である。センス鎖またはアンチセンス鎖は、本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖またはアンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
ｓｉＲＮＡは、本明細書に含まれる任意の表中のｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖塩基配列（例えば、修飾されていない配列、もしくは他の修飾を有する塩基配列）を含み得、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含み得、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含み得る。場合によっては、配列は表に含まれるオーバーハング（例えば、ＵＵ）を含まない。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＡのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＡのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＡのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／またはアンチセンス鎖の配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは非ヒト霊長類（ＮＨＰ）ＭＳＴ１ ｍＲＮＡと交差反応性である。センス鎖またはアンチセンス鎖は、本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖またはアンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＢのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＢのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＢのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／またはアンチセンス鎖の配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは非ヒト霊長類（ＮＨＰ）ＭＳＴ１ ｍＲＮＡと交差反応性である。センス鎖またはアンチセンス鎖は、本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖またはアンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＣのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＣのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＣのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／またはアンチセンス鎖の配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは非ヒト霊長類（ＮＨＰ）ＭＳＴ１ ｍＲＮＡと交差反応性である。センス鎖またはアンチセンス鎖は、本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖またはアンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＤのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＤのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＤのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／またはアンチセンス鎖の配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは非ヒト霊長類（ＮＨＰ）ＭＳＴ１ ｍＲＮＡと交差反応性である。センス鎖またはアンチセンス鎖は、本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖またはアンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＥのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＥのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＥのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／またはアンチセンス鎖の配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは非ヒト霊長類（ＮＨＰ）ＭＳＴ１ ｍＲＮＡと交差反応性である。センス鎖またはアンチセンス鎖は、本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖またはアンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＦのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＦのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、サブセットＦのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／またはアンチセンス鎖の配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは非ヒト霊長類（ＮＨＰ）ＭＳＴ１ ｍＲＮＡと交差反応性である。センス鎖またはアンチセンス鎖は、本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖またはアンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６３７３、６３７５、６３８５、６３８６、または６３８７のいずれかに記載の配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３７３、６３７５、６３８５、６３８６、もしくは６３８７のいずれかと少なくとも７５％同一、配列番号６３７３、６３７５、６３８５、６３８６、もしくは６３８７のいずれかと少なくとも８０％同一、配列番号６３７３、６３７５、６３８５、６３８６、もしくは６３８７のいずれかと少なくとも８５％同一、配列番号６３７３、６３７５、６３８５、６３８６、もしくは６３８７のいずれかと少なくとも９０％同一、または配列番号６３７３、６３７５、６３８５、６３８６、もしくは６３８７のいずれか１つと少なくとも９５％同一である配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３７３、６３７５、６３８５、６３８６、もしくは６３８７のいずれか１つの配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３７３、６３７５、６３８５、６３８６、もしくは６３８７のいずれか１つの配列、または１もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３７３、６３７５、６３８５、６３８６、もしくは６３８７と１００％同一である配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖配列は、前述の配列のいずれかの最初の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、または１９個のヌクレオチド（５’から３’方向に）を含み得る。センス鎖配列は、前述の配列のいずれかの最後の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、または１９個のヌクレオチド（５’から３’方向に）を含み得る。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４０３、６４０５、６４１５、６４１６、または６４１７のいずれかに記載の配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４０３、６４０５、６４１５、６４１６、もしくは６４１７のいずれかと少なくとも７５％同一、配列番号６４０３、６４０５、６４１５、６４１６、もしくは６４１７のいずれかと少なくとも８０％同一、配列番号６４０３、６４０５、６４１５、６４１６、もしくは６４１７のいずれかと少なくとも８５％同一、配列番号６４０３、６４０５、６４１５、６４１６、もしくは６４１７のいずれかと少なくとも９０％同一、または配列番号６４０３、６４０５、６４１５、６４１６、もしくは６４１７のいずれか１つと少なくとも９５％同一である配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４０３、６４０５、６４１５、６４１６、もしくは６４１７のいずれか１つの配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４０３、６４０５、６４１５、６４１６、もしくは６４１７のいずれか１つの配列、または１もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４０３、６４０５、６４１５、６４１６、もしくは６４１７に１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖配列は、前述の配列のいずれかの最初の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、または１９個のヌクレオチド（５’から３’方向に）を含み得る。アンチセンス鎖配列は、前述の配列のいずれかの最後の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、または１９個のヌクレオチド（５’から３’方向に）を含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６３７３に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３７３と少なくとも７５％同一、配列番号６３７３と少なくとも８０％同一、配列番号６３７３と少なくとも８５％同一、配列番号６３７３と少なくとも９０％同一、または配列番号６３７３と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３７３の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３７３の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３７３と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６３７４に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３７４と少なくとも７５％同一、配列番号６３７４と少なくとも８０％同一、配列番号６３７４と少なくとも８５％同一、配列番号６３７４と少なくとも９０％同一、または配列番号６３７４と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３７４の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３７４の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３７４と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６３８５に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３８５と少なくとも７５％同一、配列番号６３８５と少なくとも８０％同一、配列番号６３８５と少なくとも８５％同一、配列番号６３８５と少なくとも９０％同一、または配列番号６３８５と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３８５の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３８５の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３８５と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６３８６に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３８６と少なくとも７５％同一、配列番号６３８６と少なくとも８０％同一、配列番号６３８６と少なくとも８５％同一、配列番号６３８６と少なくとも９０％同一、または配列番号６３８６と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３８６の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３８６の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３８６と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６３８７に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３８７と少なくとも７５％同一、配列番号６３８７と少なくとも８０％同一、配列番号６３８７と少なくとも８５％同一、配列番号６３８７と少なくとも９０％同一、または配列番号６３８７と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３８７の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３８７の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６３８７と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４０３に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４０３と少なくとも７５％同一、配列番号６４０３と少なくとも８０％同一、配列番号６４０３と少なくとも８５％同一、配列番号６４０３と少なくとも９０％同一、または配列番号６４０３と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４０３の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４０３の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４０３と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は脂質部分を含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４０５に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４０５と少なくとも７５％同一、配列番号６４０５と少なくとも８０％同一、配列番号６４０５と少なくとも８５％同一、配列番号６４０５と少なくとも９０％同一、または配列番号６４０５と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４０５の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４０５の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４０５と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は脂質部分を含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４１５に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４１５と少なくとも７５％同一、配列番号６４１５と少なくとも８０％同一、配列番号６４１５と少なくとも８５％同一、配列番号６４１５と少なくとも９０％同一、または配列番号６４１５と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４１５の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４１５の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４１５と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は脂質部分を含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４１６に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４１６と少なくとも７５％同一、配列番号６４１６と少なくとも８０％同一、配列番号６４１６と少なくとも８５％同一、配列番号６４１６と少なくとも９０％同一、または配列番号６４１６と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４１６の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４１６の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４１６と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は脂質部分を含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４１７に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４１７と少なくとも７５％同一、配列番号６４１７と少なくとも８０％同一、配列番号６４１７と少なくとも８５％同一、配列番号６４１７と少なくとも９０％同一、または配列番号６４１７と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４１７の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４１７の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４１７と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は脂質部分を含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４４０に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４０と少なくとも７５％同一、配列番号６４４０と少なくとも８０％同一、配列番号６４４０と少なくとも８５％同一、配列番号６４４０と少なくとも９０％同一、または配列番号６４４０と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４０の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４０の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４０と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４９９に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４９９と少なくとも７５％同一、配列番号６４９９と少なくとも８０％同一、配列番号６４９９と少なくとも８５％同一、配列番号６４９９と少なくとも９０％同一、または配列番号６４９９と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４９９の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４９９の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６４９９と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４４６に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４６と少なくとも７５％同一、配列番号６４４６と少なくとも８０％同一、配列番号６４４６と少なくとも８５％同一、配列番号６４４６と少なくとも９０％同一、または配列番号６４４６と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４６の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４６の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４６と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６５０５に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５０５と少なくとも７５％同一、配列番号６５０５と少なくとも８０％同一、配列番号６５０５と少なくとも８５％同一、配列番号６５０５と少なくとも９０％同一、または配列番号６５０５と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５０５の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５０５の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５０５と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４４７に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４７と少なくとも７５％同一、配列番号６４４７と少なくとも８０％同一、配列番号６４４７と少なくとも８５％同一、配列番号６４４７と少なくとも９０％同一、または配列番号６４４７と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４７の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４７の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４７と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６５０６に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５０６と少なくとも７５％同一、配列番号６５０６と少なくとも８０％同一、配列番号６５０６と少なくとも８５％同一、配列番号６５０６と少なくとも９０％同一、または配列番号６５０６と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５０６の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５０６の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５０６と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４４８に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４８と少なくとも７５％同一、配列番号６４４８と少なくとも８０％同一、配列番号６４４８と少なくとも８５％同一、配列番号６４４８と少なくとも９０％同一、または配列番号６４４８と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４８の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４８の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４４８と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６５０７に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５０７と少なくとも７５％同一、配列番号６５０７と少なくとも８０％同一、配列番号６５０７と少なくとも８５％同一、配列番号６５０７と少なくとも９０％同一、または配列番号６５０７と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５０７の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５０７の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５０７と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４６１に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４６１と少なくとも７５％同一、配列番号６４６１と少なくとも８０％同一、配列番号６４６１と少なくとも８５％同一、配列番号６４６１と少なくとも９０％同一、または配列番号６４６１と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４６１の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４６１の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４６１と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６５２０に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５２０と少なくとも７５％同一、配列番号６５２０と少なくとも８０％同一、配列番号６５２０と少なくとも８５％同一、配列番号６５２０と少なくとも９０％同一、または配列番号６５２０と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５２０の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５２０の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５２０と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４６６に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４６６と少なくとも７５％同一、配列番号６４６６と少なくとも８０％同一、配列番号６４６６と少なくとも８５％同一、配列番号６４６６と少なくとも９０％同一、または配列番号６４６６と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４６６の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４６６の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４６６と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６５２５に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５２５と少なくとも７５％同一、配列番号６５２５と少なくとも８０％同一、配列番号６５２５と少なくとも８５％同一、配列番号６５２５と少なくとも９０％同一、または配列番号６５２５と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５２５の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５２５の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５２５と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４７０に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４７０と少なくとも７５％同一、配列番号６４７０と少なくとも８０％同一、配列番号６４７０と少なくとも８５％同一、配列番号６４７０と少なくとも９０％同一、または配列番号６４７０と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４７０の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４７０の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４７０と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６５２９に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５２９と少なくとも７５％同一、配列番号６５２９と少なくとも８０％同一、配列番号６５２９と少なくとも８５％同一、配列番号６５２９と少なくとも９０％同一、または配列番号６５２９と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５２９の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５２９の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５２９と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６４７６に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４７６と少なくとも７５％同一、配列番号６４７６と少なくとも８０％同一、配列番号６４７６と少なくとも８５％同一、配列番号６４７６と少なくとも９０％同一、または配列番号６４７６と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４７６の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４７６の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６４７６と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６５３５に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５３５と少なくとも７５％同一、配列番号６５３５と少なくとも８０％同一、配列番号６５３５と少なくとも８５％同一、配列番号６５３５と少なくとも９０％同一、または配列番号６５３５と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５３５の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５３５の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６５３５と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
Ｂ．ＡＳＯ
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドはアンチセンスオリゴヌクレオチド（ＡＳＯ）を含む。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは１２～３０ヌクレオシド長である。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは１４～３０ヌクレオシド長である。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、少なくとも約１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、もしくは３０ヌクレオシドの長さであり、または、前述の２つの数字のいずれかによって定義される範囲である。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは１５～２５ヌクレオシド長である。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは２０ヌクレオシド長である。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、約１２～３０ヌクレオシド長であり、かつ、配列番号６１６３などの完全長のヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡ配列の約１２～３０の隣接するヌクレオシドに相補的なヌクレオシド配列を含むＡＳＯを含み、ここで、（ｉ）オリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシドおよび／または修飾ヌクレオシド間結合を含み、ならびに／もしくは、（ｉｉ）組成物は薬学的に許容可能な担体を含む。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、配列番号６１６３のうちの１つの少なくとも約１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、またはそれ以上の隣接するヌクレオシドに相補的なヌクレオシド配列を含む。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、約１２～３０ヌクレオシド長であり、かつ、配列番号６１８５などの完全長のヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡ配列の約１２～３０の隣接するヌクレオシドに相補的なヌクレオシド配列を含むＡＳＯを含み、ここで、（ｉ）オリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシドおよび／または修飾ヌクレオシド間結合を含み、ならびに／もしくは、（ｉｉ）組成物は薬学的に許容可能な担体を含む。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、配列番号６１８５のうちの１つの少なくとも約１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、またはそれ以上の隣接するヌクレオシドに相補的なヌクレオシド配列を含む。
Ｃ．修飾パターン
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、ここで、オリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシドおよび／もしくは修飾ヌクレオシド間結合を含み、ならびに／または、（ｉｉ）組成物は薬学的に許容可能な担体を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシドおよび／または修飾ヌクレオシド間結合を含む修飾を含んでいる。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシド間結合を含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシド間結合は、アルキルホスホネート、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ホスホロジチオエート、アルキルホスホノチオエート、ホスホロアミデート、カルバメート、カーボネート、リン酸トリエステル、アセトアミデート、もしくはカルボキシメチルエステル、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシド間結合は、１個以上のホスホロチオエート結合を含む。ホスホロチオエートは硫黄と取り替えられるオリゴヌクレオチドのリン酸骨格中に非架橋酸素原子を含み得る。修飾ヌクレオシド間結合はｓｉＲＮＡまたはＡＳＯに含まれ得る。修飾ヌクレオシド間結合の利点は、減少した毒性または改善された薬物動態を含み得る。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは修飾ヌクレオシド間結合を含み、オリゴヌクレオチドは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、もしくは２０の修飾ヌクレオシド間結合、または前述の数のいずれか２つによって定義された一連の修飾ヌクレオシド間結合を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１８個以下の修飾ヌクレオシド間結合を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、２０個以下の修飾ヌクレオシド間結合を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、２個以上の修飾ヌクレオシド間結合、３個以上の修飾ヌクレオシド間結合、４個以上の修飾ヌクレオシド間結合、５個以上の修飾ヌクレオシド間結合、６個以上の修飾ヌクレオシド間結合、７個以上の修飾ヌクレオシド間結合、８個以上の修飾ヌクレオシド間結合、９個以上の修飾ヌクレオシド間結合、１０個以上の修飾ヌクレオシド間結合、１１個以上の修飾ヌクレオシド間結合、１２個以上の修飾ヌクレオシド間結合、１３個以上の修飾ヌクレオシド間結合、１４個以上の修飾ヌクレオシド間結合、１５個以上の修飾ヌクレオシド間結合、１６個以上の修飾ヌクレオシド間結合、１７個以上の修飾ヌクレオシド間結合、１８個以上の修飾ヌクレオシド間結合、１９個以上の修飾ヌクレオシド間結合、または２０個以上の修飾ヌクレオシド間結合を含む。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは修飾ヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、ロックド核酸（ＬＮＡ）、ヘキシトール核酸（ＨＬＡ）、シクロヘキセン核酸（ＣｅＮＡ）、２’－メトキシエチル、２’－Ｏ－アルキル、２’－Ｏ－アリル、２’－フルオロ、もしくは２’－デオキシ、またはこれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、ＬＮＡを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’，４’拘束エチル核酸を含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、ＨＬＡを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、ＣｅＮＡを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’－メトキシエチル基を含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－アルキル基を含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－アリル基を含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’－フルオロ基を含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’－デオキシ基を含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－メチルヌクレオシド、２’－デオキシフルオロヌクレオシド、２’－Ｏ－Ｎ－メチルアセトアミド（２’－Ｏ－ＮＭＡ）ヌクレオシド、２’－Ｏ－ジメチルアミノエトキシエチル（２’－Ｏ－ＤＭＡＥＯＥ）ヌクレオシド、２’－Ｏ－アミノプロピル（２’－Ｏ－ＡＰ）ヌクレオシド、もしくは２’－ａｒａ－Ｆ、またはこれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－メチルヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’－デオキシフルオロヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－ＮＭＡヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－ＤＭＡＥＯＥヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－アミノプロピル（２’－Ｏ－ＡＰ）ヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’－ａｒａ－Ｆを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、１つ以上の２’フルオロ修飾ヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、修飾ヌクレオシドは、２’Ｏ－アルキル修飾ヌクレオシドを含む。修飾ヌクレオシドの利点は、減少した毒性または改善された薬物動態を含み得る。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、もしくは２１の修飾ヌクレオシド、または前述の数のいずれか２つによって定義される一連のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１９個以下の修飾ヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、２１個以下の修飾ヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、２個以上の修飾ヌクレオシド、３個以上の修飾ヌクレオシド、４個以上の修飾ヌクレオシド、５個以上の修飾ヌクレオシド、６個以上の修飾ヌクレオシド、７個以上の修飾ヌクレオシド、８個以上の修飾ヌクレオシド、９個以上の修飾ヌクレオシド、１０個以上の修飾ヌクレオシド、１１個以上の修飾ヌクレオシド、１２個以上の修飾ヌクレオシド、１３個以上の修飾ヌクレオシド、１４個以上の修飾ヌクレオシド、１５個以上の修飾ヌクレオシド、１６個以上の修飾ヌクレオシド、１７個以上の修飾ヌクレオシド、１８個以上の修飾ヌクレオシド、１９個以上の修飾ヌクレオシド、２０個以上の修飾ヌクレオシド、または２１個以上の修飾ヌクレオシドを含む。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの３’末端または５’末端に結合された部分を含む。部分の例は、インテグリン標的化リガンド、疎水性部分、糖部分、またはその組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドはセンス鎖を有するｓｉＲＮＡであり、上記部分はセンス鎖の５’末端に結合される。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドはセンス鎖を有するｓｉＲＮＡであり、上記部分はセンス鎖の３’末端に結合される。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドはアンチセンス鎖を有するｓｉＲＮＡであり、上記部分はアンチセンス鎖の５’末端に結合される。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドはアンチセンス鎖を有するｓｉＲＮＡであり、上記部分はアンチセンス鎖の３’末端に結合される。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドはＡＳＯであり、上記部分はＡＳＯの５’末端に結合される。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドはＡＳＯであり、上記部分はＡＳＯの３’末端に結合される。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドを標的化群に結合することにより、細胞または組織に送達される。いくつかの実施形態において、標的化群は、インテグリン標的化リガンドなどの細胞受容体リガンドを含む。インテグリンは、細胞－細胞外マトリックス（ＥＣＭ）接着を促す膜貫通性受容体のファミリーを含み得る。いくつかの実施形態において、上記部分は上皮特異性インテグリンを含む。インテグリンα－ｖ－β－６（αｖβ６）は、上皮特異的インテグリンαｖβ６の一例であり得、ＥＣＭタンパク質またはＴＧＦ－β潜伏関連ペプチド（ＬＡＰ）の受容体であり得る。インテグリンαｖβ６は、細胞または組織において発現され得る。インテグリンαｖβ６は、損傷した肺上皮において発現またはアップレギュレートされ得る。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、インテグリンαｖβ６に対する親和性を有するインテグリン標的化リガンドに結合される。インテグリン標的化リガンドは、インテグリンαｖβ６またはインテグリンα－ｖ－β－３（αｖβ３）に対する親和性を有する化合物を含み得、特定の細胞型または組織（例えば、インテグリンαｖβ３またはαｖβ６を発現する細胞）に結合されるオリゴヌクレオチドの標的化または送達を促すためのリガンドとして有用であり得る。いくつかの実施形態において、複数のインテグリン標的化リガンドはオリゴヌクレオチドに結合される。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチド－インテグリン標的化リガンドコンジュゲートは、受容体依存性エンドサイトーシスまたは他の手段のいずれかによって、肺上皮細胞によって選択的に内在化される。
インテグリン標的化リガンドを含むオリゴヌクレオチドを送達するのに有用な標的化基の例は、アルギニン－グリシン－アスパラギン酸（ＲＧＤ）ペプチドを含有するペプチドまたはペプチド模倣体に基づき得る。いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドはＲＧＤペプチドを含む。いくつかの実施形態において、組成物はＲＧＤペプチドを含む。いくつかの実施形態において、組成物はＲＧＤペプチド誘導体を含む。いくつかの実施形態において、ＲＧＤペプチドは、オリゴヌクレオチドの３’末端で結合される。いくつかの実施形態において、ＲＧＤペプチドは、オリゴヌクレオチドの５’末端で結合される。いくつかの実施形態において、組成物はセンス鎖を含み、ＲＧＤペプチドはセンス鎖に結合される（例えば、センス鎖の５’末端に結合し、またはセンス鎖の３’末端に結合している）。いくつかの実施形態において、組成物はアンチセンス鎖を含み、ＲＧＤペプチドはアンチセンス鎖に結合される（例えば、アンチセンス鎖の５’末端に結合し、またはアンチセンス鎖の３’末端に結合している）。いくつかの実施形態において、組成物は、オリゴヌクレオチドの３’または５’末端で結合したＲＧＤペプチドを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの３’または５’末端で結合したＲＧＤペプチドと脂質とを含む。ＲＧＤペプチドは線形であり得る。ＲＧＤペプチドは環状であり得る。ＲＧＤペプチドはＤ－アミノ酸を含み得る。いくつかの実施形態において、ＲＧＤペプチドは、シクロ（－Ａｒｇ－Ｇｌｙ－Ａｓｐ－Ｄ－Ｐｈｅ－Ｃｙｓ）（配列番号６１８２）を含む。いくつかの実施形態において、ＲＧＤペプチドは、シクロ（－Ａｒｇ－Ｇｌｙ－Ａｓｐ－Ｄ－Ｐｈｅ－Ｌｙｓ）（配列番号６１８３）を含む。いくつかの実施形態において、ＲＧＤペプチドは、シクロ（－Ａｒｇ－Ｇｌｙ－Ａｓｐ－Ｄ－Ｐｈｅ－アジド）（配列番号６１８４）を含む。いくつかの実施形態において、ＲＧＤペプチドは、アミノ安息香酸由来のＲＧＤを含む。いくつかの実施形態において、ＲＧＤペプチドは、シクロ（－Ａｒｇ－Ｇｌｙ－Ａｓｐ－Ｄ－Ｐｈｅ－Ｃｙｓ）（配列番号６１８２）、シクロ（－Ａｒｇ－Ｇｌｙ－Ａｓｐ－Ｄ－Ｐｈｅ－Ｌｙｓ）（配列番号６１８３）、シクロ（－Ａｒｇ－Ｇｌｙ－Ａｓｐ－Ｄ－Ｐｈｅ－Ａｚｉｄｏ）（配列番号６１８４）、アミノ安息香酸由来のＲＧＤ、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、ＲＧＤペプチドは複数のそのようなＲＧＤペプチドを含む。例えば、ＲＧＤペプチドは、２個、３個、または４個のＲＧＤペプチドを含み得る。いくつかの実施形態は、アルギニン－グリシン－グルタミン酸ペプチドを含む。
オリゴヌクレオチドはプリンを含み得る。プリンの例としては、アデニン（Ａ）もしくはグアニン（Ｇ）、またはその修飾版を含む。オリゴヌクレオチドはピリミジンを含み得る。ピリミジンの例としては、シトシン（Ｃ）、チミン（Ｔ）、もしくはウラシル（Ｕ）、またはその修飾版を含む。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのプリンは、２’メチル修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのすべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのすべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのすべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのすべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのすべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのすべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、オリゴヌクレオチドのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、オリゴヌクレオチドのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、オリゴヌクレオチドのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、オリゴヌクレオチドのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、オリゴヌクレオチドのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、オリゴヌクレオチドのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、オリゴヌクレオチドのプリンは、２’メチル修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、オリゴヌクレオチドのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含む。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのすべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、オリゴヌクレオチドのすべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのすべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、オリゴヌクレオチドのすべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのすべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、オリゴヌクレオチドのすべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのすべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、オリゴヌクレオチドのすべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのすべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、オリゴヌクレオチドのすべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのすべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、オリゴヌクレオチドのすべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのすべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、オリゴヌクレオチドのすべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、オリゴヌクレオチドのすべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含む。
場合によっては、オリゴヌクレオチドは、特定の修飾パターンを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの鎖の５’末端から数えて９位は、２’Ｆ修飾を有し得る。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの鎖の９位がピリミジンである場合、オリゴヌクレオチドの鎖中のすべてのプリンは２’ＯＭｅ修飾を有する。いくつかの実施形態において、９位がセンス鎖の５位と１１位の間の唯一のピリミジンである場合、９位はオリゴヌクレオチドの鎖において２’Ｆ修飾を有する唯一の位置である。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの鎖の９位、および５位と１１位との間の１つの他の塩基のみがピリミジンである場合、これらのピリミジンの両方は、オリゴヌクレオチドの鎖において２’Ｆ修飾を有する２つしかない位置である。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの鎖の９位、および５位と１１位との間の２つの他の塩基のみがピリミジンであり、これらの２つの他のピリミジンが隣接する位置にあり、したがって一列に３つの２’Ｆ修飾が存在しない場合、合計で３つの２’Ｆ修飾を与える２’Ｆ修飾の任意の組み合わせを作ることができる。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの鎖の５位と１１位との間に２個を超えるピリミジンが存在する場合、オリゴヌクレオチドの鎖が一列に３つの２’Ｆ修飾を有しないことを条件として、合計で３～５個の２’Ｆ修飾を有する２’Ｆ修飾を有するピリミジンのすべての組み合わせが可能である。場合によっては、ｓｉＲＮＡのいずれかのオリゴヌクレオチドの鎖は、オリゴヌクレオチド規則のこれらの鎖のいずれかまたはすべてに適合する修飾パターンを含む。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの鎖の９位がプリンである場合、オリゴヌクレオチドの鎖中のすべてのプリンは２’ＯＭｅ修飾を有する。いくつかの実施形態において、９位がセンス鎖の５位と１１位との間の唯一のプリンである場合、９位はオリゴヌクレオチドの鎖において２’Ｆ修飾を有する唯一の位置である。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの鎖の９位、および５位と１１位との間の１つの他の塩基のみがプリンである場合、これらのプリンの両方は、オリゴヌクレオチドの鎖において２’Ｆ修飾を有する２つしかない位置である。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの鎖の９位、および５位と１１位との間の２つの他の塩基のみがプリンであり、これらの２つの他のプリンが隣接する位置にあり、したがって一列に３つの２’Ｆ修飾が存在しない場合、合計で３つの２’Ｆ修飾を与える２’Ｆ修飾の任意の組み合わせを作ることができる。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドの鎖の５位と１１位との間に２個を超えるプリンが存在する場合、オリゴヌクレオチドの鎖が一列に３つの２’Ｆ修飾を有しないことを条件として、合計で３～５個の２’Ｆ修飾を有する２’Ｆ修飾を有するプリンのすべての組み合わせが可能である。場合によっては、ｓｉＲＮＡのいずれかのオリゴヌクレオチドの鎖は、オリゴヌクレオチド規則のこれらの鎖のいずれかまたはすべてに適合する修飾パターンを含む。
場合によっては、オリゴヌクレオチドの鎖の９位は２’デオキシであり得る。これらの場合、２’Ｆおよび２’ＯＭｅ修飾は、オリゴヌクレオチドの鎖の他の位置で生じ得る。場合によっては、ｓｉＲＮＡのいずれかのオリゴヌクレオチドの鎖は、オリゴヌクレオチド規則のこれらの鎖に適合する修飾パターンを含む。
いくつかの実施形態において、センス鎖の９位は、２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのプリンは、２’－Ｏ－メチル修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、５位と１１位との間の１、２、３、４、または５個のピリミジンは、一列に３つの２’フルオロ修飾ピリミジンが存在しないことを条件として、２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の奇数位置は、２’－Ｏ－メチル修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の偶数位置は、２’フルオロ修飾ヌクレオチドおよび非修飾デオキシリボヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の偶数位置は、２’フルオロ修飾ヌクレオチド、２’－Ｏ－メチル修飾ヌクレオチド、および非修飾デオキシリボヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖の９位は、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、センス鎖のすべてのプリンは、２’－Ｏ－メチル修飾プリンを含み、５位と１１位との間の１、２、３、４、または５個のピリミジンは、一列に３つの２’フルオロ修飾ピリミジンが存在しないことを条件として、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、アンチセンス鎖の奇数位置は、２’－Ｏ－メチル修飾ヌクレオチドを含み、アンチセンス鎖の偶数位置は、２’フルオロ修飾ヌクレオチドおよび非修飾デオキシリボヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態において、センス鎖の９位は、２’フルオロ修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのピリミジンは、２’－Ｏ－メチル修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、５位と１１位との間の１、２、３、４、または５個のプリンは、一列に３つの２’フルオロ修飾プリンが存在しないことを条件として、２’フルオロ修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の奇数位置は、２’－Ｏ－メチル修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の偶数位置は、２’フルオロ修飾ヌクレオチドおよび非修飾デオキシリボヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の偶数位置は、２’フルオロ修飾ヌクレオチド、２’－Ｏ－メチル修飾ヌクレオチド、および非修飾デオキシリボヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖の９位は、２’フルオロ修飾プリンを含み、センス鎖のすべてのピリミジンは、２’－Ｏ－メチル修飾ピリミジンを含み、５位と１１位との間の１、２、３、４、または５個のプリンは、一列に３つの２’フルオロ修飾プリンが存在しないことを条件として、２’フルオロ修飾プリンを含み、アンチセンス鎖の奇数位置は、２’－Ｏ－メチル修飾ヌクレオチドを含み、アンチセンス鎖の偶数位置は、２’フルオロ修飾ヌクレオチドおよび非修飾デオキシリボヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、一列に３つの２’フルオロ修飾プリンが存在しない。いくつかの実施形態において、一列に３つの２’フルオロ修飾ピリミジンが存在しない。
いくつかの実施形態において、センス鎖の９位は、非修飾デオキシリボヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖の５位、７位、および８位は、２’フルオロ修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖の１０～２１位のすべてのピリミジンは、２’－Ｏ－メチル修飾ピリミジンを含み、その１０～２１位のすべてのプリンは２’－Ｏ－メチル修飾プリンまたは２’フルオロ修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の奇数位置は、２’－Ｏ－メチル修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の偶数位置は、２’フルオロ修飾ヌクレオチドおよび非修飾デオキシリボヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の偶数位置は、２’フルオロ修飾ヌクレオチド、２’－Ｏ－メチル修飾ヌクレオチド、および非修飾デオキシリボヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖の９位は、非修飾デオキシリボヌクレオチドを含み、センス鎖の５位、７位、および８位は、２’フルオロ修飾ヌクレオチドを含み、センス鎖の１０～２１位のすべてのピリミジンは、２’－Ｏ－メチル修飾ピリミジンを含み、その１０～２１位のすべてのプリンは、２’－Ｏ－メチル修飾プリンまたは２’フルオロ修飾プリンを含み、アンチセンス鎖の奇数位置は、２’－Ｏ－メチル修飾ヌクレオチドを含み、アンチセンス鎖の偶数位置は、２’フルオロ修飾ヌクレオチドおよび非修飾デオキシリボヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態において、センス鎖の９位は、非修飾デオキシリボヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖の５位、７位、および８位は、２’フルオロ修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖の１０～２１位のすべてのプリンは、２’－Ｏ－メチル修飾プリンを含み、その１０～２１位のすべてのピリミジンは２’－Ｏ－メチル修飾ピリミジンまたは２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の奇数位置は、２’－Ｏ－メチル修飾ヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の偶数位置は、２’フルオロ修飾ヌクレオチドおよび非修飾デオキシリボヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖の偶数位置は、２’フルオロ修飾ヌクレオチド、２’－Ｏ－メチル修飾ヌクレオチド、および非修飾デオキシリボヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖の９位は、非修飾デオキシリボヌクレオチドを含み、センス鎖の５位、７位、および８位は、２’フルオロ修飾ヌクレオチドを含み、センス鎖の１０～２１位のすべてのプリンは、２’－Ｏ－メチル修飾プリンを含み、その１０～２１位のすべてのピリミジンは２’－Ｏ－メチル修飾ピリミジンまたは２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、アンチセンス鎖の奇数位置は、２’－Ｏ－メチル修飾ヌクレオチドを含み、アンチセンス鎖の偶数位置は、２’フルオロ修飾ヌクレオチドおよび非修飾デオキシリボヌクレオチドを含む。
いくつかの実施形態において、部分は、オリゴヌクレオチドの５’末端に結合した負に荷電した基を含む。これは５’末端基と呼ばれ得る。いくつかの実施形態において、負に荷電した基は、本明細書に開示されるｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖の５’末端に結合される。５’－末端基は、５’－末端ホスホロチオエート、５’－末端ホスホロジチオエート、５’－末端ビニルホスホネート（５’－ＶＰ）、５’－末端メチルホスホネート、５’－末端シクロプロピルホスホネート、または５’－デオキシ－５’－Ｃ－マロニルであってもよく、またはこれらを含んでもよい。５’末端基は５’－ＶＰを含んでもよい。いくつかの実施形態において、５’－ＶＰはトランス－ビニルホスフェートまたはシス－ビニルホスフェートを含む。５’末端基は余分な５’ホスフェートを含み得る。５’末端基の組み合わせを使用してもよい。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、負に荷電した基を含む。負に荷電した基は、細胞または組織の浸透を助けることができる。負に荷電した基は、オリゴヌクレオチドの５’または３’末端（例えば、５’末端）に結合し得る。これは末端基と呼ばれ得る。末端基は、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ビニルホスホネート、メチルホスホネート、シクロプロピルホスホネート、またはデオキシ－Ｃ－マロニルであってもよく、またはこれらを含んでもよい。末端基は、余分な５’ホスフェート、例えば、余分な５’ホスフェートを含み得る。末端基の組み合わせを使用してもよい。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドはホスフェート模倣体を含む。いくつかの実施形態において、ホスフェート模倣体は、ビニルホスホネートを含む。いくつかの実施形態において、ビニルホスホネートはトランス－ビニルホスフェートを含む。いくつかの実施形態において、ビニルホスホネートはシス－ビニルホスフェートを含む。ビニルホスホネートを含むヌクレオチドの例を以下に示す。
いくつかの実施形態において、ビニルホスホネートは、オリゴヌクレオチドの安定性を増加させる。いくつかの実施形態において、ビニルホスホネートは、組織におけるオリゴヌクレオチドの蓄積を増加させる。いくつかの実施形態において、ビニルホスホネートは、オリゴヌクレオチドをエキソヌクレアーゼまたはホスファターゼから保護する。いくつかの実施形態において、ビニルホスホネートは、ｓｉＲＮＡプロセシング機構とのオリゴヌクレオチドの結合親和性を改善する。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは１つのビニルホスホネートを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは２つのビニルホスホネートを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは３つのビニルホスホネートを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは４つのビニルホスホネートを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖は、５’末端にビニルホスホネートを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのアンチセンス鎖は、３’末端にビニルホスホネートを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのセンス鎖は、５’末端にビニルホスホネートを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドのセンス鎖は、３’末端にビニルホスホネートを含む。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドはセンス鎖とアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、センス鎖は、配列番号６０４９～６０８６、６１２５～６１６２、もしくは６１８６～６２４２のいずれか１つの配列を含むか、もしくはこの配列からなるヌクレオシド配列、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、配列番号６０４９～６０８６、６１２５～６１６２、もしくは６１８６～６２４２のいずれか１つの配列を含むか、もしくはこの配列からなるヌクレオシド配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はさらに、３’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はさらに、５’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、配列番号６０４９～６０８６、６１２５～６１６２、もしくは６１８６～６２４２のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列、または、３’末端に１個または２個のヌクレオシド付加を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、センス鎖は、配列番号６０４９～６０８６、６１２５～６１６２、もしくは６１８６～６２４２のいずれか１つの配列を含むか、またはその配列からなるヌクレオシド配列を含む。センス鎖またはアンチセンス鎖は、本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖またはアンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、アンチセンス鎖は、配列番号６０８７～６１２４もしくは６２５３～６３０９のいずれか１つの配列を含むか、もしくはその配列からなるヌクレオシド配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６０８７～６１２４もしくは６２５３～６３０９のいずれか１つの配列を含むか、もしくはこの配列からなるヌクレオシド配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖はさらに、３’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、３’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖はさらに、５’オーバーハングを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、もしくは１０個のヌクレオシド、または前述の数のうちのいずれか２つによって定義された一連のヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは、１、２、またはそれ以上のヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、５’オーバーハングは２つのヌクレオシドを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、配列番号６０８７～６１２４もしくは６２５３～６３０９のいずれか１つの配列を含むか、もしくはこの配列からなるヌクレオシド配列、または、３’末端に１個もしくは２個のヌクレオシドの付加を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、アンチセンス鎖は、配列番号６０８７～６１２４もしくは６２５３～６３０９のいずれか１つの配列を含むか、またはその配列からなるヌクレオシド配列を含んでいる。センス鎖またはアンチセンス鎖は、本明細書に記載される任意の修飾を含み得る。センス鎖またはアンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２０６、６２１２、６２１３、６２１４、６２２７、６２３２、６２３６、または６２４２のいずれかに記載の配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２０６、６２１２、６２１３、６２１４、６２２７、６２３２、６２３６、もしくは６２４２のいずれか１つと少なくとも７５％同一、配列番号６２０６、６２１２、６２１３、６２１４、６２２７、６２３２、６２３６、もしくは６２４２のいずれか１つと少なくとも８０％同一、配列番号６２０６、６２１２、６２１３、６２１４、６２２７、６２３２、６２３６、もしくは６２４２のいずれか１つと少なくとも８５％同一、配列番号６２０６、６２１２、６２１３、６２１４、６２２７、６２３２、６２３６、もしくは６２４２のいずれか１つと少なくとも９０％同一、または配列番号６２０６、６２１２、６２１３、６２１４、６２２７、６２３２、６２３６、もしくは６２４２のいずれか１つと少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２０６、６２１２、６２１３、６２１４、６２２７、６２３２、６２３６、もしくは６２４２のいずれか１つの配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２０６、６２１２、６２１３、６２１４、６２２７、６２３２、６２３６、もしくは６２４２のいずれか１つの配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２０６、６２１２、６２１３、６２１４、６２２７、６２３２、６２３６、もしくは６２４２と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖配列は、前述の配列のいずれかの最初の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、または１９個のヌクレオチド（５’から３’方向に）を含み得る。センス鎖配列は、前述の配列のいずれかの最後の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、または１９個のヌクレオチド（５’から３’方向に）を含み得る。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２７３、６２７９、６２８０、６２８１、６２９４、６２９９、６３０３、または６３０９のいずれかに記載の配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２７３、６２７９、６２８０、６２８１、６２９４、６２９９、６３０３、もしくは６３０９のいずれか１つと少なくとも７５％同一、配列番号６２７３、６２７９、６２８０、６２８１、６２９４、６２９９、６３０３、もしくは６３０９のいずれか１つと少なくとも８０％同一、配列番号６２７３、６２７９、６２８０、６２８１、６２９４、６２９９、６３０３、もしくは６３０９のいずれか１つと少なくとも８５％同一、配列番号６２７３、６２７９、６２８０、６２８１、６２９４、６２９９、６３０３、もしくは６３０９のいずれか１つと少なくとも９０％同一、または配列番号６２７３、６２７９、６２８０、６２８１、６２９４、６２９９、６３０３、もしくは６３０９のいずれか１つと少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７３、６２７９、６２８０、６２８１、６２９４、６２９９、６３０３、もしくは６３０９のいずれか１つの配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７３、６２７９、６２８０、６２８１、６２９４、６２９９、６３０３、もしくは６３０９のいずれか１つの配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７３、６２７９、６２８０、６２８１、６２９４、６２９９、６３０３、もしくは６３０９と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖配列は、前述の配列のいずれかの最初の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、または１９個のヌクレオチド（５’から３’方向に）を含み得る。アンチセンス鎖配列は、前述の配列のいずれかの最後の５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、または１９個のヌクレオチド（５’から３’方向に）を含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖は、脂質部分またはＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２０６に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２０６と少なくとも７５％同一、配列番号６２０６と少なくとも８０％同一、配列番号６２０６と少なくとも８５％同一、配列番号６２０６と少なくとも９０％同一、または配列番号６２０６と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２０６の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２０６の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２０６と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２１２に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１２と少なくとも７５％同一、配列番号６２１２と少なくとも８０％同一、配列番号６２１２と少なくとも８５％同一、配列番号６２１２と少なくとも９０％同一、または配列番号６２１２と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１２の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１２の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１２と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２１３に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１３と少なくとも７５％同一、配列番号６２１３と少なくとも８０％同一、配列番号６２１３と少なくとも８５％同一、配列番号６２１３と少なくとも９０％同一、または配列番号６２１３と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１３の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１３の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１３と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２１４に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１４と少なくとも７５％同一、配列番号６２１４と少なくとも８０％同一、配列番号６２１４と少なくとも８５％同一、配列番号６２１４と少なくとも９０％同一、または配列番号６２１４と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１４の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１４の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１４と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２２７に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２２７と少なくとも７５％同一、配列番号６２２７と少なくとも８０％同一、配列番号６２２７と少なくとも８５％同一、配列番号６２２７と少なくとも９０％同一、または配列番号６２２７と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２２７の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２２７の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２２７と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２３２に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３２と少なくとも７５％同一、配列番号６２３２と少なくとも８０％同一、配列番号６２３２と少なくとも８５％同一、配列番号６２３２と少なくとも９０％同一、または配列番号６２３２と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３２の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３２の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３２と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２３６に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３６と少なくとも７５％同一、配列番号６２３６と少なくとも８０％同一、配列番号６２３６と少なくとも８５％同一、配列番号６２３６と少なくとも９０％同一、または配列番号６２３６と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３６の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３６の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３６と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２４２に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２４２と少なくとも７５％同一、配列番号６２４２と少なくとも８０％同一、配列番号６２４２と少なくとも８５％同一、配列番号６２４２と少なくとも９０％同一、または配列番号６２４２と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２４２の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２４２の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２４２と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。センス鎖はオーバーハングを含み得る。センス鎖は脂質部分を含み得る。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２７３に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７３と少なくとも７５％同一、配列番号６２７３と少なくとも８０％同一、配列番号６２７３と少なくとも８５％同一、配列番号６２７３と少なくとも９０％同一、または配列番号６２７３と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７３の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７３の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７３と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は脂質部分を含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２７９に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７９と少なくとも７５％同一、配列番号６２７９と少なくとも８０％同一、配列番号６２７９と少なくとも８５％同一、配列番号６２７９と少なくとも９０％同一、または配列番号６２７９と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７９の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７９の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７９と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は脂質部分を含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２８０に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２８０と少なくとも７５％同一、配列番号６２８０と少なくとも８０％同一、配列番号６２８０と少なくとも８５％同一、配列番号６２８０と少なくとも９０％同一、または配列番号６２８０と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２８０の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２８０の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２８０と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は脂質部分を含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２８１に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２８１と少なくとも７５％同一、配列番号６２８１と少なくとも８０％同一、配列番号６２８１と少なくとも８５％同一、配列番号６２８１と少なくとも９０％同一、または配列番号６２８１と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２８１の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２８１の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２８１と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は脂質部分を含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２９４に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９４と少なくとも７５％同一、配列番号６２９４と少なくとも８０％同一、配列番号６２９４と少なくとも８５％同一、配列番号６２９４と少なくとも９０％同一、または配列番号６２９４と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９４の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９４の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９４と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は脂質部分を含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２９９に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９９と少なくとも７５％同一、配列番号６２９９と少なくとも８０％同一、配列番号６２９９と少なくとも８５％同一、配列番号６２９９と少なくとも９０％同一、または配列番号６２９９と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９９の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９９の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９９と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は脂質部分を含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６３０３に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６３０３と少なくとも７５％同一、配列番号６３０３と少なくとも８０％同一、配列番号６３０３と少なくとも８５％同一、配列番号６３０３と少なくとも９０％同一、または配列番号６３０３と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６３０３の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６３０３の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６３０３と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は脂質部分を含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６３０９に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６３０９と少なくとも７５％同一、配列番号６３０９と少なくとも８０％同一、配列番号６３０９と少なくとも８５％同一、配列番号６３０９と少なくとも９０％同一、または配列番号６３０９と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６３０９の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６３０９の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６３０９と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖は、本明細書に記載される修飾パターンを含み得る。アンチセンス鎖はオーバーハングを含み得る。アンチセンス鎖は脂質部分を含み得る。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分を含み得る。
１．疎水性部分
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは疎水性部分を含む。疎水性部分は、オリゴヌクレオチドの３’末端または５’末端に結合され得る。疎水性部分は脂肪酸などの脂質を含み得る。疎水性部分は炭化水素を含み得る。炭化水素は線形であり得る。炭化水素は非線形であり得る。疎水性部分は脂質部分もしくはコレステロール部分、またはその組み合わせを含み得る。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの３’末端または５’末端に結合された脂質を含む。いくつかの実施形態において、脂質は、コレステロール、ミリストイル、パルミトイル、ステアロイル、リトコロイル、ドコサノイル、ドコサヘキサエノイル、ミリスチル、パルミチル、ステアリル、もしくはα－トコフェロール、またはこれらの組み合わせを含む。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは疎水性リガンドまたは疎水性部分を含む。いくつかの実施形態において、疎水性リガンドまたは疎水性部分はコレステロールを含む。いくつかの実施形態において、疎水性リガンドまたは疎水性部分はコレステロール誘導体を含む。いくつかの実施形態において、疎水性リガンドまたは疎水性部分はオリゴヌクレオチドの３’末端で結合される。いくつかの実施形態において、疎水性リガンドまたは疎水性部分はオリゴヌクレオチドの５’末端で結合される。いくつかの実施形態において、組成物はセンス鎖を含み、疎水性リガンドまたは疎水性部分はセンス鎖に結合される（例えば、センス鎖の５’末端に結合し、またはセンス鎖の３’末端に結合している）。いくつかの実施形態において、組成物はアンチセンス鎖を含み、疎水性リガンドまたは疎水性部分はアンチセンス鎖に結合される（例えば、アンチセンス鎖の５’末端に結合し、またはアンチセンス鎖の３’末端に結合している）。いくつかの実施形態において、組成物は、オリゴヌクレオチドの３’末端または５’末端で結合した疎水性リガンドまたは疎水性部分を含む。
いくつかの実施形態において、疎水性部分は、オリゴヌクレオチド（例えば、ｓｉＲＮＡのセンス鎖および／またはアンチセンス鎖）に結合される。いくつかの実施形態において、疎水性部分はオリゴヌクレオチドの３’末端で結合される。いくつかの実施形態において、疎水性部分はオリゴヌクレオチドの５’末端で結合される。いくつかの実施形態において、疎水性部分はコレステロールを含む。いくつかの実施形態において、疎水性部分はシクロヘキサニルを含む。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの３’末端または５’末端に結合された脂質を含む。いくつかの実施形態において、脂質はオリゴヌクレオチドの３’末端で結合される。いくつかの実施形態において、脂質はオリゴヌクレオチドの５’末端で結合される。いくつかの実施形態において、脂質は、コレステロール、ミリストイル、パルミトイル、ステアロイル、リトコロイル、ドコサノイル、ドコサヘキサエノイル、ミリスチル、パルミチル、ステアリル、もしくはα－トコフェロール、またはこれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、脂質は、ステアリル、リトコリル（ｌｉｔｈｏｃｈｏｌｙｌ）、ドコサニル、ドコサヘキサエニル、またはミリスチルを含む。いくつかの実施形態において、脂質は、コレステロールを含む。いくつかの実施形態において、脂質は、コレステロールなどのステロールを含む。いくつかの実施形態において、脂質は、ステアリル、ｔ－ブチルフェノール、ｎ－ブチルフェノール、オクチルフェノール、ドデシルフェノール、フェニルｎ－ドデシル、オクタデシルベンズアミド、ヘキサデシルベンズアミド、またはオクタデシルシクロヘキシルを含む。いくつかの実施形態において、脂質は、フェニルパラＣ１２を含む。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、以下の構造のいずれかの態様を含む。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、以下の構造のいずれかの態様を含む。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、以下の構造のいずれかの態様を含む。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、以下の構造のいずれかの態様を含む。オリゴヌクレオチドに含まれる態様は、全体の構造を含むこともあれば、示された構造のうちのいずれかの脂質部分を含むこともある。いくつかの実施形態において、ｎは１～３である。いくつかの実施形態において、ｎは１である。いくつかの実施形態において、ｎは２である。いくつかの実施形態において、ｎは３である。いくつかの実施形態において、Ｒはアルキル基である。いくつかの実施形態において、アルキル基は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個の炭素を含有している。いくつかの実施形態において、アルキル基は、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、もしくは１８個の炭素、または、前述の数字の炭素のいずれか２つによって定義される範囲を含有している。いくつかの実施形態において、アルキル基は４～１８個の炭素を含有している。いくつかの実施形態において、脂質部分はアルコールまたはエーテルを含む。
いくつかの実施形態において、脂質は脂肪酸を含む。いくつかの実施形態において、脂質は、表１に描かれた脂質を含む。表１の例示的な脂質部分は、オリゴヌクレオチドの５’末端に結合して示され、オリゴヌクレオチドの５’末端リン酸は、脂質部分と共に示される。いくつかの実施形態において、表１の脂質部分は、示されているのとは異なる結合点に結合することができる。例えば、表中の脂質部分のいずれかの結合点は、３’オリゴヌクレオチド末端にあり得る。いくつかの実施形態において、脂質は、オリゴヌクレオチドを非肝細胞または組織に標的化するために使用される。
いくつかの実施形態において、脂質または脂質部分は１６～１８個の炭素を含む。いくつかの実施形態において、脂質は１６個の炭素を含む。いくつかの実施形態において、脂質は１７個の炭素を含む。いくつかの実施形態において、脂質は１８個の炭素を含む。いくつかの実施形態において、脂質部分は１６個の炭素を含む。いくつかの実施形態において、脂質部分は１７個の炭素を含む。いくつかの実施形態において、脂質部分は１８個の炭素を含む。
疎水性部分は、炭素環を含むリンカーを含み得る。炭素環は６員であり得る。炭素環のいくつかの例はフェニルまたはシクロヘキシルを含む。リンカーはフェニルを含み得る。リンカーはシクロヘキシルを含み得る。脂質は炭素環に結合することができ、これは次にオリゴヌクレオチドのホスフェート（例えば５’または３’ホスフェート）に結合することができる。いくつかの実施形態において、脂質または炭化水素、およびセンス鎖の末端は、１，４、１，３、または１，２置換パターン（例えば、パラ、メタ、またはオルトフェニル構成）中のフェニルまたはシクロヘキシルリンカーに接続される。いくつかの実施形態において、脂質または炭化水素、およびセンス鎖の末端は、１，４置換パターン（例えば、パラフェニル構成）でフェニルまたはシクロヘキシルリンカーに接続される。脂質は、オリゴヌクレオチドに対して１，４置換パターンで炭素環に結合し得る。脂質は、オリゴヌクレオチドに対して１，３置換パターンで炭素環に結合し得る。脂質は、オリゴヌクレオチドに対して１，２置換パターンで炭素環に結合し得る。脂質は、オリゴヌクレオチドに対してオルト配向で炭素環に結合し得る。脂質は、オリゴヌクレオチドに対してパラ配向で炭素環に結合し得る。脂質は、オリゴヌクレオチドに対してメタ配向で炭素環に結合し得る。
脂質部分は、以下の構造
を含み得るか、または上記構造からなり得る。いくつかの実施形態において、脂質部分は、以下の構造
を含むか、または上記構造からなる。いくつかの実施形態において、脂質部分は、以下の構造
を含むか、または上記構造からなる。いくつかの実施形態において、脂質部分は、以下の構造
を含むか、または上記構造からなる。いくつかの実施形態において、点線は共有結合を示す。共有結合は、センス鎖またはアンチセンス鎖の末端間であり得る。例えば、結合はセンス鎖の５’末端に対するものであり得る。いくつかの実施形態において、ｎは０～３である。いくつかの実施形態において、ｎは１～３である。いくつかの実施形態において、ｎは０である。いくつかの実施形態において、ｎは１である。いくつかの実施形態において、ｎは２である。いくつかの実施形態において、ｎは３である。いくつかの実施形態において、ｎは４である。いくつかの実施形態において、ｎは５である。いくつかの実施形態において、ｎは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０である。いくつかの実施形態において、Ｒはアルキル基である。いくつかの実施形態において、アルキル基は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個の炭素を含有する。いくつかの実施形態において、アルキル基は、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、もしくは１８個の炭素、または、前述の数字の炭素のいずれか２つによって定義される範囲を含有する。いくつかの実施形態において、Ｒは４～１８個の炭素を含有するアルキル基を含むか、またはこれからなる。
脂質部分は、オリゴヌクレオチドの５’末端に結合し得る。５’末端は、脂質部分をオリゴヌクレオチドの糖の５’炭素に結合する１つのリン酸を有し得る。５’末端は、脂質部分をオリゴヌクレオチドの糖の５’炭素に結合する２つのホスフェートを有し得る。５’末端は、脂質部分をオリゴヌクレオチドの糖の５’炭素に結合する３つのホスフェートを有し得る。５’末端は、オリゴヌクレオチドの糖の５’炭素に結合した１つのリン酸を有することができ、ここで、１つのホスフェートは脂質部分に結合している。５’末端は、オリゴヌクレオチドの糖の５’炭素に結合した２つのホスフェートを有することができ、２つのホスフェートのうちの１つは脂質部分に結合している。５’末端は、オリゴヌクレオチドの糖の５’炭素に結合した３つのホスフェートを有することができ、３つのホスフェートのうちの１つは脂質部分に結合している。糖はリボースを含み得る。糖はデオキシリボースを含み得る。糖は、２’修飾糖（例えば、２’Ｏ－メチルまたは２’フルオロリボース）などのように修飾され得る。５’末端のホスフェートは、酸素の代わりに硫黄などの修飾を含み得る。５’末端の２つのホスフェートは、酸素の代わりに硫黄などの修飾を含み得る。５’末端の３つのホスフェートは、酸素の代わりに硫黄などの修飾を含み得る。
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは１つの脂質部分を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは２つの脂質部分を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは３つの脂質部分を含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは４つの脂質部分を含む。
いくつかの実施形態は、疎水性コンジュゲートを含むオリゴヌクレオチドを作製する方法に関する。疎水性コンジュゲートを作製するための戦略は、フェノールまたはシクロヘキサノールなどの６員環アルコールに基づくホスホロアミダイト試薬の使用を含み得る。ホスホロアミダイトをヌクレオチドと反応させて、ヌクレオチドを疎水性部分に結合し、それによって疎水性コンジュゲートを生成することができる。疎水性コンジュゲートを生成するために使用され得るホスホラミダイト試薬のいくつかの例は、以下のように提供される。
いくつかの実施形態において、ｎは１～３である。いくつかの実施形態において、ｎは１である。いくつかの実施形態において、ｎは２である。いくつかの実施形態において、ｎは３である。いくつかの実施形態において、Ｒはアルキル基である。いくつかの実施形態において、アルキル基は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個の炭素を含有する。いくつかの実施形態において、アルキル基は、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、もしくは１８個の炭素、または、前述の数字の炭素のいずれか２つによって定義される範囲を含有する。いくつかの実施形態において、Ｒは４～１８個の炭素を含有するアルキル基を含むか、またはこれからなる。ホスホロアミダイト試薬のいずれか１つをオリゴヌクレオチドの５’末端に反応させて、疎水性部分を含むオリゴヌクレオチドを生成することができる。いくつかの実施形態において、ホスホラミダイト試薬は、ｓｉＲＮＡのセンス鎖の５’末端に反応する。次いで、センス鎖をアンチセンス鎖にハイブリダイズさせて二重鎖を形成することができる。ハイブリダイゼーションは、所定の温度で溶液中のセンス鎖およびアンチセンス鎖をインキュベートすることによって行うことができる。温度を徐々に下げてもよい。温度は、センス鎖およびアンチセンス鎖のアニーリング温度を含む温度を含むか、または含み得る。温度は、センス鎖およびアンチセンス鎖のアニーリング温度を下回るか、または下回る温度を含み得る。温度は、センス鎖およびアンチセンス鎖の融解温度未満であり得る。
脂質は、リンカーによってオリゴヌクレオチドに結合され得る。リンカーは、ポリエチレングリコール（例えば、テトラエチレングリコール）を含み得る。
本明細書に記載される修飾は、細胞または組織への送達、例えば、オリゴヌクレオチド組成物の肝外送達または標的化に有用であり得る。本明細書に記載される修飾は、オリゴヌクレオチド組成物を細胞または組織に標的化するために有用であり得る。
２．糖部分
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは糖部分を含む。糖部分は、Ｎ－アセチルガラクトース部分（例えば、Ｎ－アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）部分）、Ｎ－アセチルグルコース部分（例えば、Ｎ－アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）部分）、フコース部分、またはマンノース部分を含み得る。糖部分は、１、２、３、またはそれ以上の糖分子を含み得る。糖部分は、オリゴヌクレオチドの３’または５’末端に結合し得る。糖部分は、Ｎ－アセチルガラクトース部分を含み得る。糖部分は、Ｎ－アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）部分を含み得る。糖部分は、Ｎ－アセチルグルコース部分を含み得る。糖部分は、Ｎ－アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）部分を含み得る。糖部分は、フコース部分を含み得る。糖部分は、マンノース部分を含み得る。Ｎ－アセチルグルコース、ＧｌｃＮＡｃ、フコース、またはマンノースは、ＣＤ２０６などのマンノース受容体を標的とするか、またはこれと結合する場合、マクロファージを標的とするために有用であり得る。糖部分は、肝細胞のアシアロ糖タンパク質受容体などのアシアロ糖タンパク質受容体と結合するか、またはこれを標的とするために有用であり得る。ＧａｌＮＡｃ部分は、アシアロ糖タンパク質受容体に結合し得る。ＧａｌＮＡｃ部分は、肝細胞を標的とし得る。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、Ｎ－アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）部分を含む。ＧａｌＮＡｃは肝細胞標的化に有用であり得る。ＧａｌＮＡｃ部分は、二価または三価の分岐リンカーを含み得る。オリゴは、二価または三価の分岐リンカーを介して１、２、または３個のＧａｌＮＡｃに結合され得る。ＧａｌＮＡｃ部分は、１、２、３、またはそれ以上のＧａｌＮＡｃ分子を含み得る。ＧａｌＮＡｃ部分は、オリゴヌクレオチドの３’末端または５’末端に結合され得る。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドは、肝細胞標的化のためにＮ－アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）リガンドを含む。いくつかの実施形態において、組成物はＧａｌＮＡｃを含む。いくつかの実施形態において、組成物はＧａｌＮＡｃ誘導体を含む。いくつかの実施形態において、ＧａｌＮＡｃリガンドは、オリゴヌクレオチドの３’末端に結合している。いくつかの実施形態において、ＧａｌＮＡｃリガンドは、オリゴヌクレオチドの５’末端に結合している。いくつかの実施形態において、組成物はセンス鎖を含み、ＧａｌＮＡｃリガンドはセンス鎖（例えば、センス鎖の５’末端に結合するか、またはセンス鎖の３’末端に結合する）に結合している。いくつかの実施形態において、組成物はアンチセンス鎖を含み、ＧａｌＮＡｃリガンドはアンチセンス鎖に結合している（例えば、アンチセンス鎖の５’末端に結合するか、またはアンチセンス鎖の３’末端に結合する）。いくつかの実施形態において、組成物は、オリゴヌクレオチドの３’末端または５’末端で結合したＧａｌＮＡｃリガンドを含む。
いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含む組成物が本明細書で開示され、オリゴヌクレオチドはＧａｌＮＡｃ部分を含む。ＧａｌＮＡｃ部分は、以下に示される任意の式、構造、またはＧａｌＮＡｃ部分に含まれ得る。いくつかの実施形態において、本明細書には、式（Ｉ）または（ＩＩ）
によって表される化合物（例えば、オリゴヌクレオチド）、またはその塩が記載され、
Ｊはオリゴヌクレオチドであり、
各ｗは独立して、１～２０の任意の値から選択され、
各ｖは独立して、１～２０の任意の値から選択され、
ｎは１～２０の任意の値から選択され、
ｍは１～２０の任意の値から選択され、
ｚは１～３の任意の値から選択され、
ｚが３である場合、ＹはＣであり、
ｚが２である場合、ＹはＣＲ６であり、または
ｚが１である場合、ＹはＣ（Ｒ６）２であり、
Ｑは、ハロゲン、－ＣＮ、－ＮＯ２、－ＯＲ７、－ＳＲ７、－Ｎ（Ｒ７）２、－Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）ＯＲ７、－Ｃ（Ｏ）ＯＲ７、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７、－Ｓ（Ｏ）Ｒ７、およびＣ１－６アルキルから独立して選択される１つ以上の置換基で任意選択で置換されるＣ３－１０炭素環（ここで、Ｃ１－６アルキルは、ハロゲン、－ＣＮ、－ＯＨ、－ＳＨ、－ＮＯ２、および－ＮＨ２から独立して選択される１つ以上の置換基で任意選択で置換される）から選択され、
Ｒ１は、－Ｏ－、－Ｓ－、－Ｎ（Ｒ７）－、Ｃ（Ｏ）－、－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）－、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）－、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）－、－ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）－、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｏ－、Ｃ（Ｏ）Ｏ－、－ＯＣ（Ｏ）－、－Ｓ（Ｏ）－、－Ｓ（Ｏ）２－、－ＯＳ（Ｏ）２－、－ＯＰ（Ｏ）（ＯＲ７）Ｏ－、－ＳＰ（Ｏ）（ＯＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｓ）（ＯＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（ＳＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（ＯＲ７）Ｓ－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｏ－）Ｏ－、－ＳＰ（Ｏ）（Ｏ－）Ｏ－、－ＯＰ（Ｓ）（Ｏ－）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｓ－）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｏ－）Ｓ－、－ＯＰ（Ｏ）（ＯＲ７）ＮＲ７－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｎ（Ｒ７）２）ＮＲ７－、－ＯＰ（ＯＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｎ（Ｒ７）２）Ｏ－、－ＯＰ（ＯＲ７）Ｎ（Ｒ７）－、および－ＯＰＮ（Ｒ７）２－ＮＲ７－から選択されたリンカーであり、
Ｒ２はそれぞれ、ハロゲン、－ＯＲ７、－ＳＲ７、－Ｎ（Ｒ７）２、－Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）ＯＲ７、－Ｃ（Ｏ）ＯＲ７、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７、および－Ｓ（Ｏ）Ｒ７から独立して選択される１つ以上の置換基で任意選択で置換されるＣ１－６アルキルから独立して選択され、
Ｒ３およびＲ４はそれぞれ、－ＯＲ７、－ＳＲ７、－Ｎ（Ｒ７）２、－Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）ＯＲ７、－Ｃ（Ｏ）ＯＲ７、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７、および－Ｓ（Ｏ）Ｒ７から独立して選択され、
Ｒ５はそれぞれ、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７、－ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）ＯＲ７、－Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｃ（Ｏ）ＯＲ７、および－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２から独立して選択され、
Ｒ６はそれぞれ、
水素、
ハロゲン、－ＣＮ、－ＮＯ２、－ＯＲ７、－ＳＲ７、－Ｎ（Ｒ７）２、－Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）ＯＲ７、－Ｃ（Ｏ）ＯＲ７、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７、および－Ｓ（Ｏ）Ｒ７、ならびに、
ハロゲン、－ＣＮ、－ＮＯ２、－ＯＲ７、－ＳＲ７、－Ｎ（Ｒ７）２、－Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）ＯＲ７、－Ｃ（Ｏ）ＯＲ７、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７、および－Ｓ（Ｏ）Ｒ７から独立して選択される１つ以上の置換基で任意選択で置換されるＣ１－６アルキル、から独立して選択され、
Ｒ７はそれぞれ、
水素、
Ｃ１－６アルキル、Ｃ２－６アルケニル、およびＣ２－６アルキニル（その各々はハロゲン、－ＣＮ、－ＯＨ、－ＳＨ、－ＮＯ２、－ＮＨ２、＝Ｏ、＝Ｓ、－Ｏ－Ｃ１－６アルキル、－Ｓ－Ｃ１－６アルキル、－Ｎ（Ｃ１－６アルキル）２、－ＮＨ（Ｃ１－６アルキル）、Ｃ３－１０炭素環、および３員～１０員の複素環から独立して選択される１つ以上の置換基で任意選択で置換される）、ならびに、
Ｃ３－１０炭素環および３員～１０員の複素環（その各々は、ハロゲン、－ＣＮ、－ＯＨ、－ＳＨ、－ＮＯ２、－ＮＨ２、＝Ｏ、＝Ｓ、－Ｏ－Ｃ１－６アルキル、－Ｓ－Ｃ１－６アルキル、－Ｎ（Ｃ１－６アルキル）２、－ＮＨ（Ｃ１－６アルキル）、Ｃ１－６アルキル、Ｃ２－６アルケニル、Ｃ２－６アルキニル、Ｃ３－１０炭素環、３員～１０員の複素環、およびＣ１－６ハロアルキルから独立して選択される１つ以上の置換基で任意選択で置換される）から独立して選択される。いくつかの実施形態において、ｗはそれぞれ独立して、１～１０までの任意の値から選択される。いくつかの実施形態において、ｗはそれぞれ独立して、１～５までの任意の値から選択される。いくつかの実施形態において、ｗはそれぞれ１である。いくつかの実施形態において、ｖはそれぞれ独立して、１～１０までの任意の値から選択される。いくつかの実施形態において、ｖはそれぞれ独立して、１～５までの任意の値から選択される。いくつかの実施形態において、ｖはそれぞれ１である。いくつかの実施形態において、ｎは１～１０までの任意の値から選択される。いくつかの実施形態において、ｎは１～５までの任意の値から選択される。いくつかの実施形態において、ｎは２である。いくつかの実施形態において、ｍは１～１０までの任意の値から選択される。いくつかの実施形態において、ｍは１～５までの任意の値から選択される。いくつかの実施形態において、ｍは１および２から選択される。いくつかの実施形態において、ｚは３であり、ＹはＣである。いくつかの実施形態において、Ｑは、ハロゲン、－ＣＮ、－ＮＯ２、－ＯＲ７、－ＳＲ７、－Ｎ（Ｒ７）２、－Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）ＯＲ７、－Ｃ（Ｏ）ＯＲ７、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７、および－Ｓ（Ｏ）Ｒ７から独立して選択される１つ以上の置換基で任意選択で置換されるＣ５－６炭素環から選択される。いくつかの実施形態において、Ｑは、ハロゲン、－ＣＮ、－ＯＨ、－ＳＨ、－ＮＯ２、および－ＮＨ２から独立して選択された１つ以上の置換基で任意選択で置換されたＣ５－６炭素環から選択される。いくつかの実施形態において、Ｑはフェニルおよびシクロヘキシルから選択され、その各々は、ハロゲン、－ＣＮ、－ＯＨ、－ＳＨ、－ＮＯ２、および－ＮＨ２から独立して選択された１つ以上の置換基で任意選択で置換される。いくつかの実施形態において、Ｑはフェニルから選択される。いくつかの実施形態において、Ｑはシクロヘキシルから選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ１は、－ＯＰ（Ｏ）（ＯＲ７）Ｏ－、－ＳＰ（Ｏ）（ＯＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｓ）（ＯＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（ＳＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（ＯＲ７）Ｓ－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｏ－）Ｏ－、－ＳＰ（Ｏ）（Ｏ－）Ｏ－、－ＯＰ（Ｓ）（Ｏ－）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｓ－）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｏ－）Ｓ－、－ＯＰ（Ｏ）（ＯＲ７）ＮＲ７－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｎ（Ｒ７）２）ＮＲ７－、－ＯＰ（ＯＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｎ（Ｒ７）２）Ｏ－、－ＯＰ（ＯＲ７）Ｎ（Ｒ７）－、および、－ＯＰＮ（Ｒ７）２－ＮＲ７から選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ１は、－ＯＰ（Ｏ）（ＯＲ７）Ｏ－、－ＳＰ（Ｏ）（ＯＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｓ）（ＯＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（ＳＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（ＯＲ７）Ｓ－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｏ－）Ｏ－、－ＳＰ（Ｏ）（Ｏ－）Ｏ－、－ＯＰ（Ｓ）（Ｏ－）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｓ－）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｏ－）Ｓ－、および－ＯＰ（ＯＲ７）Ｏ－から選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ１は、－ＯＰ（Ｏ）（ＯＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｓ）（ＯＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｏ－）Ｏ－、－ＯＰ（Ｓ）（Ｏ－）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｓ－）Ｏ－、および－ＯＰ（ＯＲ７）Ｏ－から選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ１は、－ＯＰ（Ｏ）（ＯＲ７）Ｏ－および－ＯＰ（ＯＲ７）Ｏ－から選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ２は、ハロゲン、－ＯＲ７、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７、－ＳＲ７、－Ｎ（Ｒ７）２、Ｃ（Ｏ）Ｒ７、および－Ｓ（Ｏ）Ｒ７から独立して選択された１つ以上の置換基で置換されたＣ１－３アルキルから選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ２は、－ＯＲ７、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７、－ＳＲ７、および－Ｎ（Ｒ７）２から独立して選択された１つ以上の置換基で置換されたＣ１－３アルキルから選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ２は、－ＯＲ７および－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７から独立して選択された１つ以上の置換基で置換されたＣ１－３アルキルから選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ３は、ハロゲン、－ＯＲ７、－ＳＲ７、－Ｎ（Ｒ７）２、－Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７、および－Ｓ（Ｏ）Ｒ７から選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ３は、－ＯＲ７、－ＳＲ７、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７、および－Ｎ（Ｒ７）２から選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ３は、－ＯＲ７－および－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７から選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ４は、ハロゲン、－ＯＲ７、－ＳＲ７、－Ｎ（Ｒ７）２、－Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７、および－Ｓ（Ｏ）Ｒ７から選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ４は、－ＯＲ７、－ＳＲ７、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７、および－Ｎ（Ｒ７）２から選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ４は、－ＯＲ７－および－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７から選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ５は、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７、－ＯＣ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｒ７、－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ７）２、および－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）ＯＲ７から選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ５は、－ＯＣ（Ｏ）Ｒ７および－Ｎ（Ｒ７）Ｃ（Ｏ）Ｒ７から選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ７はそれぞれ、
水素、
および、ハロゲン、－ＣＮ、－ＯＨ、－ＳＨ、－ＮＯ２、－ＮＨ２、＝Ｏ、＝Ｓ、－Ｏ－Ｃ１－６アルキル、－Ｓ－Ｃ１－６アルキル、－Ｎ（Ｃ１－６アルキル）２、－ＮＨ（Ｃ１－６アルキル）、Ｃ３－１０炭素環、または３員～１０員の複素環から独立して選択される１つ以上の置換基で任意選択で置換されるＣ１－６アルキルから独立して選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ７はそれぞれ、ハロゲン、－ＣＮ、－ＯＨ、－ＳＨ、－ＮＯ２、－ＮＨ２、＝Ｏ、＝Ｓ、－Ｏ－Ｃ１－６アルキル、－Ｓ－Ｃ１－６アルキル、－Ｎ（Ｃ１－６アルキル）２、および－ＮＨ（Ｃ１－６アルキル）から独立して選択される１つ以上の置換基で任意選択で置換されるＣ１－６アルキルから独立して選択される。いくつかの実施形態において、Ｒ７はそれぞれ、ハロゲン、－ＣＮ、－ＯＨ、および－ＳＨから独立して選択された１つ以上の置換基で任意選択で置換されるＣ１－６アルキルから独立して選択される。いくつかの実施形態において、
ｗは１であり、
ｖは１であり、
ｎは２であり、
ｍは１または２であり、
ｚは３であり、およびＹはＣであり、
Ｑはフェニルまたはシクロヘキシルであり、その各々は、ハロゲン、－ＣＮ、－ＯＨ、－ＳＨ、－ＮＯ２、－ＮＨ２、およびＣ１－３アルキルから独立して選択された１つ以上の置換基で任意選択で置換され、Ｒ１は、－ＯＰ（Ｏ）（ＯＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｓ）（ＯＲ７）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｏ－）Ｏ－、－ＯＰ（Ｓ）（Ｏ－）Ｏ－、－ＯＰ（Ｏ）（Ｓ－）Ｏ－、および－ＯＰ（ＯＲ７）Ｏ－から選択され、
Ｒ２は、－ＯＨまたは－ＯＣ（Ｏ）ＣＨ３で置換されたＣ１アルキルであり、
Ｒ３は－ＯＨまたは－ＯＣ（Ｏ）ＣＨ３であり、
Ｒ４は－ＯＨまたは－ＯＣ（Ｏ）ＣＨ３であり、
および、Ｒ５は－ＮＨ（Ｏ）ＣＨ３である。いくつかの実施形態において、化合物は、
いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチド（Ｊ）は、オリゴヌクレオチドの５’末端または３’末端で結合している。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドはＤＮＡを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドはＲＮＡを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１個以上の修飾ヌクレオシド間結合を含む。いくつかの実施形態において、１個以上の修飾ヌクレオシド間結合は、アルキルホスホネート、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ホスホロジチオエート、アルキルホスホノチオエート、ホスホロアミダート、カルバメート、カーボネート、リン酸トリエステル、アセトアミダート、もしくはカルボキシメチルエステル、またはそれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個の修飾ヌクレオシド間結合を含む。いくつかの実施形態において、化合物はアシアロ糖タンパク質受容体に結合する。いくつかの実施形態において、化合物は肝細胞を標的とする。
いくつかの実施形態は、Ｊがオリゴヌクレオチドである以下のものを含む。
Ｊは、１つ以上の追加のホスフェート、またはオリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスホロチオエートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上の追加のホスフェートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスホロチオエートを含み得る。
いくつかの実施形態は、Ｊがオリゴヌクレオチドである以下のものを含む。
Ｊは、１つ以上の追加のホスフェート、またはオリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスホロチオエートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上の追加のホスフェートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスホロチオエートを含み得る。
いくつかの実施形態は、Ｊがオリゴヌクレオチドである以下のものを含む。
Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスフェートまたはホスホロチオエートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスフェートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合するホスフェートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスホロチオエートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合するホスホロチオエートを含み得る。
いくつかの実施形態は、Ｊがオリゴヌクレオチドである以下のものを含む。
オリゴヌクレオチド（Ｊ）に結合したこの化合物中の構造は「ＥＴＬ１７」と呼ばれることがあり、ＧａｌＮＡｃ部分の一例である。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスフェートまたはホスホロチオエートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスフェートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合するホスフェートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスホロチオエートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合するホスホロチオエートを含み得る。
いくつかの実施形態は、ホスフェートまたは「５’」がオリゴヌクレオチドへの接続部を示す以下のものを含む。
いくつかの実施形態は、ホスフェートまたは「５’」がオリゴヌクレオチドへの接続部を示す以下のものを含む。
いくつかの実施形態は、Ｊがオリゴヌクレオチドである以下のものを含み、
オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスフェートまたはホスホロチオエートを含む。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスフェートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合するホスフェートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスホロチオエートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合するホスホロチオエートを含み得る。
いくつかの実施形態は、Ｊがオリゴヌクレオチドである以下のものを含む。
オリゴヌクレオチド（Ｊ）に結合したこの化合物中の構造は「ＥＴＬ１」と呼ばれることがあり、ＧａｌＮＡｃ部分の一例である。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスフェートまたはホスホロチオエートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスフェートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合するホスフェートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合する１つ以上のホスホロチオエートを含み得る。Ｊは、オリゴヌクレオチドに結合するホスホロチオエートを含み得る。
３．ｓｉＲＮＡ修飾パターン
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドはセンス鎖とアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、センス鎖は修飾パターン１Ｓ：５’ ＮｆｓｎｓＮｆｎＮｆｎＮｆＮｆＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｓｎｓｎ－３’（配列番号６１６４）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は修飾パターン２Ｓ：５’ ｎｓｎｓｎｎＮｆｎＮｆＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６１６５）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である、いくつかの実施形態において、センス鎖は以下の修飾パターン３Ｓ：５’ ｎｓｎｓｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６１６６）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である、いくつかの実施形態において、センス鎖は修飾パターン４Ｓ：５’ ＮｆｓｎｓＮｆｎＮｆｎＮｆＮｆＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｓｎｓｎＮ－ｍｏｉｅｔｙ－３’（配列番号６１６７）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合であり、Ｎは１つ以上のヌクレオシドを含む、いくつかの実施形態において、センス鎖は以下の修飾パターン５Ｓ：５’－ｎｓｎｓｎｎＮｆｎＮｆＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎＮ－ｍｏｉｅｔｙ－３’（配列番号６１６８）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合であり、Ｎは１つ以上のヌクレオシドを含む、いくつかの実施形態において、修飾パターン４Ｓまたは５Ｓにおける部分は、インテグリン標的化リガンドを含む。いくつかの実施形態において、修飾パターン４Ｓまたは５Ｓにおける部分は、糖部分である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン６Ｓ：５’ ＮｆｓｎｓＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｓｎｓｎ－３’（配列番号６１６９）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン７Ｓ：５’ ｎｓｎｓｎｎＮｆＮｆＮｆＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６１７０）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン８Ｓ：５’ ｎｓｎｓｎｎｎＮｆＮｆＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６１７１）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン９Ｓ：５’ ｎｓｎｓｎｎｎｎＮｆＮｆＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６１７２）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン１０Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎＮｆｎｎｎＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３２０）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン１１Ｓ：５’－ｓＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｄＮｎＮｆｎｎｎＮｆｎＮｆｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３２１）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン１２Ｓ：５’－ｓＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｄＮｎｎｎＮｆｎＮｆｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３２２）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン１３Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎＮｆＮｆｎＮｆＮｆｎＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３２３）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン１４Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎｎＮｆＮｆＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３２４）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン１５Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３２５）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン１６Ｓ：５’－ｎｓｎｓｎｎＮｆＮｆｎＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３２６）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン１７Ｓ：５’－ＮｆｓｎｓＮｆｎＮｆｎＮｆｎｄＮｎＮｆｎｎｎＮｆｎＮｆｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３２７）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン１８Ｓ：５’－ｎｓｎｓｎｎｎｎＮｆＮｆＮｆＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３２８）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン１９Ｓ：５’－ｎｓｎｓｎｎｎＮｆＮｆＮｆＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３２９）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン２０Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎｎＮｆｎＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３３０）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン２１Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎｎｎＮｆＮｆＮｆＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３３１）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン２２Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎＮｆＮｆｎｎＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３３２）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン２３Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎＮｆＮｆｎＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３３３）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン２４Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎｎＮｆＮｆｎＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３３４）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン２５Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３３５）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン２６Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎｎＮｆｎｎＮｆｎＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３３６）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン２７Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎＮｆｎｎＮｆＮｆＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３３７）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン２８Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎｎＮｆＮｆＮｆＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３３８）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン２９Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎｎＮｆｎｎＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３３９）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン３０Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎｎｎＮｆｎＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３４０）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン３１ｓ：５’－ｓｎｎｎｎＮｆＮｆｎｎＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３４１）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン３２Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎＮｆｎｎＮｆＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３４２）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン３３Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎＮｆｎｄＮｎＮｆｎＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３４３）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン３４
Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎｎｎｎｎＮｆｄＮＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３４４）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン３５Ｓ：５’－ｓｎｎｎｎＮｆｎｎｎＮｆｎＮｆｎｎｎｎｎｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３１９）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドはセンス鎖とアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、アンチセンス鎖は修飾パターン１ＡＳ：５’ ｎｓＮｆｓｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６１７３）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は修飾パターン２ＡＳ：５’ ｎｓＮｆｓｎｎｎＮｆｎＮｆＮｆｎｎｎｎＮｆｎＮｆｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６１７４）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は修飾パターン３ＡＳ：５’ ｎｓＮｆｓｎｎｎＮｆｎｎｎｎｎｎｎＮｆｎＮｆｎｎｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６１７５）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は修飾パターン４ＡＳ：５’ ｎｓＮｆｓｎＮｆｎＮｆｎｎｎｎｎｎｎＮｆｎＮｆｎｎｎｓｎｓｎ ３’（配列番号６１７６）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン５ＡＳ：５’ ｎｓＮｆｓｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎＮｆｎＮｆｎｎｎｓｎｓｎ ３’（配列番号６１７７）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン６ＡＳ：５’ ｎｓＮｆｓｎｎｎＮｆｎｎＮｆｎｎｎｎＮｆｎＮｆｎｎｎｓｎｓｎ ３’（配列番号６１７８）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン７ＡＳ：５’ ｎｓＮｆｓｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ ３’（配列番号６１７９）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン８ＡＳ：５’ ｎｓＮｆｓｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎｎＮｆｎｎｎｎｎｓｎｓｎ ３’（配列番号６１８０）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン９ＡＳ：５’－ｎｓＮｆｓｎＮｆｎｎｎＮｆｎｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３４５）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン１０ＡＳ：５’－ｎｓＮｆｓｎＮｆｎＮｆｎｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３４６）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン１１ＡＳ：５’－ｎｓＮｆｓｎＮｆｎＮｆｎｎｎｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３４７）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン１２ＡＳ：５’－ｎｓＮｆｓｎＮｆｎｎＮｆＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３４８）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン１３ＡＳ：５’－ｎｓＮｆｓｎＮｆｎｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３４９）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン１４ＡＳ：５’－ｎｓＮｆｓｎｎＮｆｎＮｆｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３５０）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン１５ＡＳ：５’－ｎｓＮｆｓｎｎｎｎＮｆｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３５１）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン１６ＡＳ：５’－ｎｓＮｆｓｎｎｎＮｆｎｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３５２）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン１７ＡＳ：５’－ｎｓＮｆｓｎＮｆｎｎＮｆｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３５３）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン１８ＡＳ：５’－ｎｓＮｆｓｎｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３５４）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン１９ＡＳ：５’－ｎｓＮｆｓｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３５５）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン２０ＡＳ：５’－ｎｓＮｆｓｎｎｎＮｆｎＮｆｎｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３５６）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン２１ＡＳ：５’－ｎｓＮｆｓｎｎＮｆｎｎｎｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎＮｆｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６３５７）を含み、ここで、「Ｎｆ」は２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドはセンス鎖とアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、センス鎖はパターン１Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン２Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン３Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン４Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン６Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン７Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン８Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン９Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン１０Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン１１Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン１２Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン１３Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン１４Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン１５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン１６Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン１７Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン１８Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン１９Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン２０Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン２１Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン２２Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン２３Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン２４Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン２５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン２６Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン２７Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン２８Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン２９Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン３０Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン３１Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン３２Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン３３Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン３４Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖はパターン３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。
いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン２ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン３ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン４ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン５ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン６ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン７ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン８ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン９ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１０ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１２ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１３ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１４ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１５ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１６ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１７ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１８ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン１９ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン２０ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖は、パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含み、アンチセンス鎖はパターン２１ＡＳを含む。
いくつかの実施形態において、センス鎖は、修飾パターン１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１３ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖は、修飾パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、または３５Ｓを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖またはアンチセンス鎖は修飾パターンＡＳＯ１を含む。
いくつかの実施形態において、センス鎖のプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のプリンは、２’メチル修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。
いくつかの実施形態において、センス鎖のピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。
いくつかの実施形態において、センス鎖のプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、センス鎖のピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、センス鎖のピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、センス鎖のピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、センス鎖のピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、センス鎖のプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、センス鎖のプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、センス鎖のプリンは、２’メチル修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、センス鎖のプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含む。
いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、センス鎖のすべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、センス鎖のすべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、センス鎖のすべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、センス鎖のすべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、センス鎖のすべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、センス鎖のすべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、センス鎖のすべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、センス鎖のすべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、センス鎖のすべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含む。
いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のプリンは、２’メチル修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のすべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のすべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のすべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。
いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のすべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のすべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のすべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。
いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、アンチセンス鎖のピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、アンチセンス鎖のピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、アンチセンス鎖のピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、アンチセンス鎖のピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、アンチセンス鎖のプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、アンチセンス鎖のプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、アンチセンス鎖のプリンは、２’メチル修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、アンチセンス鎖のプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含む。
いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のすべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、アンチセンス鎖のすべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のすべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、アンチセンス鎖のすべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のすべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、アンチセンス鎖のすべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のすべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、アンチセンス鎖のすべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のすべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、アンチセンス鎖のすべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のすべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、アンチセンス鎖のすべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のすべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、アンチセンス鎖のすべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖のすべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、アンチセンス鎖のすべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含む。
いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されるとＭＳＴ１の発現を減少させるオリゴヌクレオチドを含む組成物が本明細書で開示され、オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含む低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）を含み、センス鎖は、少なくとも１つのヌクレオシド間結合が修飾され、少なくとも１つのヌクレオシドが修飾される本明細書に記載されるセンス鎖配列、または、少なくとも１つのヌクレオシド間結合が修飾され、少なくとも１つのヌクレオシドが修飾される、オリゴヌクレオチド配列の１つもしくは２つのヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を含むセンス鎖配列を含み、アンチセンス鎖は、少なくとも１つのヌクレオシド間結合が修飾され、少なくとも１つのヌクレオシドが修飾される、本明細書に記載されるアンチセンス鎖配列、または、少なくとも１つのヌクレオシド間結合が修飾され、少なくとも１つのヌクレオシドが修飾される、１つもしくは２つのヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を含むオリゴヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態は、対象に組成物を投与する工程を含む方法に関する。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表９のｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表９のｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表９のｓｉＲＮＡのセンス鎖および／またはアンチセンス鎖の配列を含む。ｓｉＲＮＡは、表９のものと同じヌクレオシド間結合修飾またはヌクレオシド修飾を含み得る。ｓｉＲＮＡは、表９のものとは異なる任意の異なるヌクレオシド結合修飾またはヌクレオシド修飾を含み得る。ｓｉＲＮＡはいくつかの未修飾のヌクレオシド間結合またはヌクレオシドを含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表１０のｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表１０のｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表１０のｓｉＲＮＡのセンス鎖および／またはアンチセンス鎖の配列を含む。ｓｉＲＮＡは、表１０のものと同じヌクレオシド間結合修飾またはヌクレオシド修飾を含み得る。ｓｉＲＮＡは、表１０のものとは異なる任意の異なるヌクレオシド結合修飾またはヌクレオシド修飾を含み得る。ｓｉＲＮＡはいくつかの未修飾のヌクレオシド間結合またはヌクレオシドを含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４ＡのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４ＡのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４ＡのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／またはアンチセンス鎖の配列を含む。ｓｉＲＮＡは、表２４Ａのものと同じヌクレオシド間結合修飾またはヌクレオシド修飾を含み得る。ｓｉＲＮＡは、表２４Ａのものとは異なる任意の異なるヌクレオシド結合修飾またはヌクレオシド修飾を含み得る。ｓｉＲＮＡはいくつかの未修飾のヌクレオシド間結合またはヌクレオシドを含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４ＣのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４ＣのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表２４ＣのｓｉＲＮＡのセンス鎖および／またはアンチセンス鎖の配列を含む。ｓｉＲＮＡは、表２４Ｃのものと同じヌクレオシド間結合修飾またはヌクレオシド修飾を含み得る。ｓｉＲＮＡは、表２４Ｃのものとは異なる任意の異なるヌクレオシド結合修飾またはヌクレオシド修飾を含み得る。ｓｉＲＮＡはいくつかの未修飾のヌクレオシド間結合またはヌクレオシドを含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表３０のｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表３０のｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含む。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、表３０のｓｉＲＮＡのセンス鎖および／またはアンチセンス鎖の配列を含む。ｓｉＲＮＡは、表３０のものと同じヌクレオシド間結合修飾またはヌクレオシド修飾を含み得る。ｓｉＲＮＡは、表３０のものとは異なる任意の異なるヌクレオシド結合修飾またはヌクレオシド修飾を含み得る。ｓｉＲＮＡはいくつかの未修飾のヌクレオシド間結合またはヌクレオシドを含み得る。
ｓｉＲＮＡは、修飾を含む本明細書に含まれる任意の表のｓｉＲＮＡのセンス鎖および／もしくはアンチセンス鎖の配列を含み得、または、１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含み得、または、３個もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するその核酸配列を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２０８に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２０８と少なくとも７５％同一、配列番号６２０８と少なくとも８０％同一、配列番号６２０８と少なくとも８５％同一、配列番号６２０８と少なくとも９０％同一、または配列番号６２０８と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２０８の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２０８の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２０８と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２６７に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２６７と少なくとも７５％同一、配列番号６２６７と少なくとも８０％同一、配列番号６２６７と少なくとも８５％同一、配列番号６２６７と少なくとも９０％同一、または配列番号６２６７と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２６７の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２６７の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２６７と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２１４に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１４と少なくとも７５％同一、配列番号６２１４と少なくとも８０％同一、配列番号６２１４と少なくとも８５％同一、配列番号６２１４と少なくとも９０％同一、または配列番号６２１４と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１４の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１４の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１４と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２７３に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７３と少なくとも７５％同一、配列番号６２７３と少なくとも８０％同一、配列番号６２７３と少なくとも８５％同一、配列番号６２７３と少なくとも９０％同一、または配列番号６２７３と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７３の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７３の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７３と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２１５に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１５と少なくとも７５％同一、配列番号６２１５と少なくとも８０％同一、配列番号６２１５と少なくとも８５％同一、配列番号６２１５と少なくとも９０％同一、または配列番号６２１５と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１５の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１５の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１５と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２７４に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７４と少なくとも７５％同一、配列番号６２７４と少なくとも８０％同一、配列番号６２７４と少なくとも８５％同一、配列番号６２７４と少なくとも９０％同一、または配列番号６２７４と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７４の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７４の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７４と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２１６に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１６と少なくとも７５％同一、配列番号６２１６と少なくとも８０％同一、配列番号６２１６と少なくとも８５％同一、配列番号６２１６と少なくとも９０％同一、または配列番号６２１６と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１６の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１６の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２１６と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２７５に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７５と少なくとも７５％同一、配列番号６２７５と少なくとも８０％同一、配列番号６２７５と少なくとも８５％同一、配列番号６２７５と少なくとも９０％同一、または配列番号６２７５と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７５の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７５の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２７５と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２２９に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２２９と少なくとも７５％同一、配列番号６２２９と少なくとも８０％同一、配列番号６２２９と少なくとも８５％同一、配列番号６２２９と少なくとも９０％同一、または配列番号６２２９と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２２９の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２２９の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２２９と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２８８に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２８８と少なくとも７５％同一、配列番号６２８８と少なくとも８０％同一、配列番号６２８８と少なくとも８５％同一、配列番号６２８８と少なくとも９０％同一、または配列番号６２８８と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２８８の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２８８の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２８８と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２３４に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３４と少なくとも７５％同一、配列番号６２３４と少なくとも８０％同一、配列番号６２３４と少なくとも８５％同一、配列番号６２３４と少なくとも９０％同一、または配列番号６２３４と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３４の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３４の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３４と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２９３に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９３と少なくとも７５％同一、配列番号６２９３と少なくとも８０％同一、配列番号６２９３と少なくとも８５％同一、配列番号６２９３と少なくとも９０％同一、または配列番号６２９３と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９３の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９３の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９３と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２３８に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３８と少なくとも７５％同一、配列番号６２３８と少なくとも８０％同一、配列番号６２３８と少なくとも８５％同一、配列番号６２３８と少なくとも９０％同一、または配列番号６２３８と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３８の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３８の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２３８と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２９７に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９７と少なくとも７５％同一、配列番号６２９７と少なくとも８０％同一、配列番号６２９７と少なくとも８５％同一、配列番号６２９７と少なくとも９０％同一、または配列番号６２９７と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９７の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９７の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６２９７と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６２４４に記載される配列を有するセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２４４と少なくとも７５％同一、配列番号６２４４と少なくとも８０％同一、配列番号６２４４と少なくとも８５％同一、配列番号６２４４と少なくとも９０％同一、または配列番号６２４４と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２４４の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２４４の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、センス鎖配列は、配列番号６２４４と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。センス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。いくつかの実施形態において、ｓｉＲＮＡは、配列番号６３０３に記載される配列を有するアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６３０３と少なくとも７５％同一、配列番号６３０３と少なくとも８０％同一、配列番号６３０３と少なくとも８５％同一、配列番号６３０３と少なくとも９０％同一、または配列番号６３０３と少なくとも９５％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６３０３の配列、または１、２、３、もしくは４個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６３０３の配列、または１個もしくは２個のヌクレオシドの置換、付加、もしくは欠失を有するそのアンチセンス鎖配列を含むか、またはその配列からなる。いくつかの実施形態において、アンチセンス鎖配列は、配列番号６３０３と１００％同一の配列を含むか、またはその配列からなる。アンチセンス鎖はＧａｌＮＡｃ部分または脂質部分などの部分を含み得る。
４．ＡＳＯ修飾パターン
いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含み、オリゴヌクレオチドはアンチセンスオリゴヌクレオチド（ＡＳＯ）を含む。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、修飾パターンＡＳＯ１：５’ ｎｓｎｓｎｓｎｓｎｓｄＮｓｄＮｓｄＮｓｄＮｓｄＮｓｄＮｓｄＮｓｄＮｓｄＮｓｄＮｓｎｓｎｓｎｓｎｓｎ－３’（配列番号６１８１）を含み、ここで、「ｄＮ」は任意のデオキシヌクレオチドであり、「ｎ」は２’Ｏ－メチルまたは２’Ｏ－メトキシエチル修飾ヌクレオシドであり、および、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態において、ＡＳＯは、修飾パターン１Ｓ、２Ｓ、３Ｓ、４Ｓ、５Ｓ、６Ｓ、７Ｓ、８Ｓ、９Ｓ、１０Ｓ、１１Ｓ、１２Ｓ、１３Ｓ、１４Ｓ、１５Ｓ、１６Ｓ、１７Ｓ、１８Ｓ、１９Ｓ、２０Ｓ、２１Ｓ、２２Ｓ、２３Ｓ、２４Ｓ、２５Ｓ、２６Ｓ、２７Ｓ、２８Ｓ、２９Ｓ、３０Ｓ、３１Ｓ、３２Ｓ、３３Ｓ、３４Ｓ、３５Ｓ、１ＡＳ、２ＡＳ、３ＡＳ、４ＡＳ、５ＡＳ、６ＡＳ、７ＡＳ、８ＡＳ、９ＡＳ、１０ＡＳ、１１ＡＳ、１２ＡＳ、１２ＡＳ、１４ＡＳ、１５ＡＳ、１６ＡＳ、１７ＡＳ、１８ＡＳ、１９ＡＳ、２０ＡＳ、または２１ＡＳを含む。
Ｄ．製剤
いくつかの実施形態において、組成物は医薬組成物である。いくつかの実施形態において、組成物は無菌である。いくつかの実施形態において、組成物はさらに、薬学的に許容可能な担体を含む。
いくつかの実施形態において、薬学的に許容可能な担体は水を含む。いくつかの実施形態において、薬学的に許容可能な担体は緩衝液を含む。いくつかの実施形態において、薬学的に許容可能な希釈剤は食塩水である。いくつかの実施形態において、薬学的に許容可能な担体は、水、緩衝液、または生理食塩水を含む。いくつかの実施形態において、組成物はリポソームを含む。いくつかの実施形態において、薬学的に許容可能な担体は、リポソーム、脂質、ナノ粒子、タンパク質、タンパク質－抗体複合体、ペプチド、セルロース、ナノゲル、またはこれらの組み合わせを含む。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、脂質、ナノ粒子、ポリマー、リポソーム、ミセル、または別の送達系と組み合わされる。
いくつかの実施形態において、組成物は、対象の肺に送達するために製剤化される。いくつかの実施形態において、組成物は、吸入のために製剤化される。いくつかの実施形態において、組成物は、エアロゾル化のために製剤化される。いくつかの実施形態において、組成物は、噴霧器による投与のために製剤化される。
ＩＩ．方法と使用
いくつかの実施形態において、本明細書に記載される組成物を対象に投与する方法が本明細書で開示されている。いくつかの実施形態は、本明細書に記載される組成物を対象に投与するなどの組成物の使用に関する。
いくつかの実施形態は、処置を必要としている対象の障害を処置する方法に関する。いくつかの実施形態は、処置方法における本明細書に記載される組成物の使用に関する。いくつかの実施形態は、障害を抱える対象に、本明細書に記載される組成物を投与する工程を含む。いくつかの実施形態において、投与は対象の障害を処置する。いくつかの実施形態において、組成物は対象の障害を処置する。
いくつかの実施形態において、処置は、対象の障害の予防、阻害、または回復を含む。いくつかの実施形態は、障害を予防し、阻害し、または、回復に向かわせる方法における、本明細書に記載される組成物の使用に関する。いくつかの実施形態は、対象の障害を予防し、阻害し、または、回復に向かわせる方法に関する。いくつかの実施形態は、障害を抱える対象に、本明細書に記載される組成物を投与する工程を含む。いくつかの実施形態において、投与は、対象の障害を予防し、阻害し、または回復に向かわせる。いくつかの実施形態において、組成物は、対象の障害を予防し、阻害し、または回復に向かわせる。
いくつかの実施形態は、対象の障害を予防する方法に関する。いくつかの実施形態は、障害を予防する方法における本明細書に記載される組成物の使用に関する。いくつかの実施形態は、障害を抱える対象に、本明細書に記載される組成物を投与する工程を含む。いくつかの実施形態において、投与は対象の障害を予防する。いくつかの実施形態において、組成物は対象の障害を予防する。
いくつかの実施形態は、対象の障害を阻害する方法に関する。いくつかの実施形態は、障害を阻害する方法における本明細書に記載される組成物の使用に関する。いくつかの実施形態は、障害を抱える対象に、本明細書に記載される組成物を投与する工程を含む。いくつかの実施形態において、投与は対象の障害を阻害する。いくつかの実施形態において、組成物は対象の障害を阻害する。
いくつかの実施形態は、対象の障害を回復に向かわせる方法に関する。いくつかの実施形態は、障害を回復に向かわせる方法における本明細書に記載される組成物の使用に関する。いくつかの実施形態は、障害を抱える対象に、本明細書に記載される組成物を投与する工程を含む。いくつかの実施形態において、投与は対象の障害を回復に向かわせる。いくつかの実施形態において、組成物は対象の障害を回復に向かわせる。
いくつかの実施形態において、投与は全身的である。いくつかの実施形態において、投与は静脈内である。いくつかの実施形態において、投与は注入によりなされる。いくつかの実施形態において、投与は対象の肺になされる。いくつかの実施形態において、投与は吸入によりなされる。いくつかの実施形態において、投与は噴霧器を用いて行われる。
Ａ．障害
本明細書に記載される方法のいくつかの実施形態は、処置を必要としている対象の障害を処置することを含む。いくつかの実施形態において、障害は肺障害である。肺障害の非限定的な例は、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）、ＣＯＰＤの急性増悪、気腫、慢性気管支炎、喘息、喘息重積状態、喘息－ＣＯＰＤ重複症候群（ＡＣＯＳ）、咳、肺癌、間質性肺疾患、または肺線維症を含み得る。肺障害はＣＯＰＤまたは喘息などの閉塞性気道障害を含み得る。いくつかの実施形態において、肺障害はＣＯＰＤを含む。いくつかの実施形態において、肺障害はＣＯＰＤの急性増悪を含む。いくつかの実施形態において、肺障害は肺気腫を含む。いくつかの実施形態において、肺障害は慢性気管支炎を含む。いくつかの実施形態において、肺障害は喘息を含む。いくつかの実施形態において、肺障害は喘息重積状態を含む。いくつかの実施形態において、肺障害はＡＣＯＳを含む。いくつかの実施形態において、肺障害は咳を含む。いくつかの実施形態において、肺障害は肺癌を含む。いくつかの実施形態において、肺障害は間質性肺疾患を含む。いくつかの実施形態において、肺障害は肺線維症を含む。肺障害は喫煙または煙吸入に起因することがある。
Ｂ．対象
本明細書に記載される方法のいくつかの実施形態は、対象の処置を含む。対象の非限定的な例は、脊椎動物、動物、哺乳動物、イヌ、ネコ、ウシ、げっ歯類、マウス、ラット、霊長類、サル、およびヒトを含む。いくつかの実施形態において、対象は脊椎動物である。いくつかの実施形態において、対象は動物である。いくつかの実施形態において、対象は哺乳動物である。いくつかの実施形態において、対象はイヌである。いくつかの実施形態において、対象はネコである。いくつかの実施形態において、対象はウシである。いくつかの実施形態において、対象はマウスである。いくつかの実施形態において、対象はラットである。いくつかの実施形態において、対象は霊長類である。いくつかの実施形態において、対象はサルである。いくつかの実施形態において、対象は、動物、哺乳動物、イヌ、ネコ、ウシ、げっ歯類、マウス、ラット、霊長類、またはサルである。いくつかの実施形態において、対象はヒトである。いくつかの実施形態において、対象は男性である。いくつかの実施形態において、対象は女性である。いくつかの実施形態において、対象は成人（例えば、少なくとも１８歳）である。
Ｃ．ベースライン測定値
本明細書に記載される方法のいくつかの実施形態は、対象からベースライン測定値を得ることを含む。例えば、いくつかの実施形態において、ベースライン測定値は、対象を処置する前に対象から得られる。ベースライン測定の非限定的な例としては、ベースライン肺機能測定値、ベースライン白血球測定値、ベースライン慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）増悪測定値、ベースライン喘息増悪測定値、ベースラインＭＳＰ測定値、またはベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値が挙げられる。
いくつかの実施形態において、ベースライン測定値は、対象から直接得られる。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値は、観察によって、例えば、対象または対象の組織の観察によって得られる。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値は、撮像デバイスを使用して非侵襲的に得られる。
いくつかの実施形態において、ベースライン測定値は、対象由来の試料において得られる。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値は、１つ以上の組織学的組織切片において得られる。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値は、対象から得られた試料に対して、イムノアッセイ、比色アッセイ、または蛍光アッセイなどのアッセイを行うことによって得られる。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値は、イムノアッセイ、比色アッセイ、蛍光アッセイ、またはクロマトグラフィー（例えば、ＨＰＬＣ）アッセイによって得られる。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値はＰＣＲによって得られる。
いくつかの実施形態において、ベースライン測定値は、ベースライン肺機能測定値である。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値はベースライン肺活量測定値である。ベースライン肺活量測定値は肺活量計を使用して得られ得る。肺活量計は、容積－時間（ｖｏｌｕｍｅ－ｔｉｍｅ）曲線またはフローボリューム（ｆｌｏｗ－ｖｏｌｕｍｅ）ループを含む呼吸曲線を生成してもよい。いくつかの実施形態において、ベースライン肺活量測定値は、対象に肺活量計センサーへ息を吹き込ませることにより得られる。ベースライン肺活量測定値の例は、ベースライン１秒量（ｆｏｒｃｅｄ ｅｘｐｉｒａｔｏｒｙ ｖｏｌｕｍｅ ｉｎ １ ｓｅｃｏｎｄ）（ＦＥＶ１）測定値、ベースラインの予測１秒量に対する比率（ｆｏｒｃｅｄ ｅｘｐｉｒａｔｏｒｙ ｖｏｌｕｍｅ ｉｎ １ ｓｅｃｏｎｄ ｐｅｒｃｅｎｔ ｐｒｅｄｉｃｔｅｄ）（ＦＥＶ１ｐｐ）測定値、ベースライン努力肺活量（ＦＶＣ）測定値、ベースラインＦＥＶ１／ＦＶＣ比、ベースライン努力呼気量、またはベースライン最大呼気流量（ｐｅａｋ ｅｘｐｉｒａｔｏｒｙ ｆｌｏｗ）測定値を含み得る。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値はベースライン１秒量（ＦＥＶ１）測定値を含む。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値はベースラインの予測１秒量に対する比率（ＦＥＶ１ｐｐ）測定値を含む。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値はベースライン努力肺活量（ＦＶＣ）測定値を含む。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値はベースラインＦＥＶ１／ＦＶＣ比を含む。ベースラインＦＥＶ１／ＦＶＣ比は、場合によっては７０％未満または８０％未満であり得る。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値はベースライン努力呼気量を含む。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値はベースライン最大呼気流量測定値を含む。
いくつかの実施形態において、ベースライン測定値はベースライン白血球測定値を含む。いくつかの実施形態において、ベースライン白血球測定値は、ベースライン循環白血球測定値を含む。いくつかの実施形態において、ベースライン白血球測定値は、ベースライン肺組織白血球測定値を含む。いくつかの実施形態において、ベースライン白血球測定値は、ベースライン肺液（例えば、気管支肺胞液）白血球測定値を含む。いくつかの実施形態において、ベースライン白血球測定値は、ベースライン白血球数を含む。いくつかの実施形態において、ベースライン白血球測定値は、ベースライン白血球濃度を含む。いくつかの実施形態において、ベースライン白血球測定値は、ベースライン白血球割合を含む。割合は他の細胞に関連することもある。ベースライン白血球測定値に含まれ得る白血球の例としては、好中球、好酸球、好塩基球、単球、またはリンパ球が挙げられる。白血球は好中球を含み得る。白血球は好酸球を含み得る。白血球は好塩基球を含み得る。白血球は単球を含み得る。白血球はリンパ球を含み得る。いくつかの実施形態において、ベースライン白血球測定値は、イムノアッセイ、比色アッセイ、または蛍光アッセイなどのアッセイによって得られる。いくつかの実施形態において、ベースライン白血球測定値は、対照白血球測定値と比較して高い。例えば、本明細書に記載される組成物で処置されておらず、炎症性の肺障害を患っている対象は、対象の血液または肺で高い白血球数を有していることがある。いくつかの実施形態において、ベースライン白血球測定値は、肺組織または肺液、例えば、気管支肺胞液で決定され、好中球およびマクロファージのベースライン測定値を含み得る。
いくつかの実施形態において、ベースライン測定値は、ベースライン慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）増悪測定値を含む。ＣＯＰＤ増悪は、呼吸困難などの呼吸器症状の重症度の急性増加などのＣＯＰＤ再発を含み得る。ベースラインＣＯＰＤ増悪測定値は、ＣＯＰＤ再発のベースライン数を含み得、日、週、月、または年ごとの再発などの所与の時間枠に含まれ得る。ベースラインＣＯＰＤ増悪測定値は、ＣＯＰＤ増悪のベースライン頻度を含み得る。ベースラインＣＯＰＤ増悪測定値は、呼吸困難、咳、痰量、または痰化膿の増加などの呼吸器症状の悪化のベースライン測定値を含み得る。ベースラインＣＯＰＤ増悪測定値は、対象の状態が処置の変更を必要とするほど変化するときなどの事象のベースライン測定値を含み得る。ベースラインＣＯＰＤ増悪測定値は、ベースラインピーク流量試験、ベースライン呼吸一酸化窒素測定値、またはベースライン血中酸素濃度試験を含み得る。
いくつかの実施形態において、ベースライン測定値は、ベースライン喘息増悪測定値を含む。喘息増悪は、喘息発作、例えば、呼吸困難を引き起こす気管支の狭窄を含み得る。ベースライン喘息増悪測定値は、喘息発作の数のベースライン数を含み得、日、週、月、または年ごとの再発などの所与の時間枠に含まれ得る。ベースライン喘息増悪測定値は、喘息増悪のベースライン頻度を含み得る。ベースライン喘息増悪測定値は、気管支直径、気管支円周、または気管支面積の測定値などのベースライン気管支測定値を含み得る。ベースライン喘息増悪測定値は、収縮率などの気管支狭窄のベースライン量を含み得る。ベースライン喘息増悪測定値は、ベースライン喘鳴測定値、ベースライン咳測定値、ベースライン胸部締め付け測定値、ベースライン息切れ測定値、ベースライン激越測定値、ベースライン過換気測定値、ベースライン心拍数測定値、ベースライン肺機能測定値、または発話もしくは呼吸困難のベースライン測定値を含み得る。ベースライン喘息増悪測定値は、ベースラインピーク流量試験、ベースライン呼吸一酸化窒素測定値、またはベースライン血中酸素濃度試験を含み得る。
いくつかの実施形態において、ベースライン測定値はベースラインＭＳＰ測定値である。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＰ測定値は、ベースラインＭＳＰレベルを含む。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＰレベルは、試料重量あたりのＭＳＰの質量または割合として示される。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＰレベルは、試料体積あたりのＭＳＰの質量または割合として示される。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＰレベルは、試料内での総タンパク質あたりのＭＳＰの質量または割合として示される。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＰ測定値はベースライン循環ＭＳＰ測定値である。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＰ測定値は、イムノアッセイ、比色アッセイ、または蛍光アッセイなどのアッセイによって得られる。
いくつかの実施形態において、ベースライン測定値は、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値である。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値は、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルである。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、試料重量あたりのＭＳＴ１ ｍＲＮＡの量または割合として示される。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、試料体積あたりのＭＳＴ１ ｍＲＮＡの量または割合として示される。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、試料内での総ｍＲＮＡあたりのＭＳＴ１ ｍＲＮＡの量または割合として示される。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、試料内での総核酸あたりのＭＳＴ１ ｍＲＮＡの量または割合として示される。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、試料内のハウスキーピング遺伝子のｍＲＮＡレベルなどの別のｍＲＮＡレベルと比較して示される。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）アッセイなどのアッセイによって得られる。いくつかの実施形態において、ＰＣＲは定量的ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）を含む。いくつかの実施形態において、ＰＣＲはＭＳＴ１ ｍＲＮＡの逆転写を含む。
本明細書に記載される方法のいくつかの実施形態は、対象から試料を得ることを含む。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値は対象から得られた試料を得られる。いくつかの実施形態において、試料は、本明細書に記載される組成物を用いる対象の投与または処置の前に、対象から得られる。いくつかの実施形態において、ベースライン測定値は、対象への組成物の投与の前に対象から得られた試料中で得られる。
いくつかの実施形態において、試料は流体を含む。いくつかの実施形態において、試料は流体試料である。例えば、ベースラインＭＳＰ測定値は、患者から得られた流体試料中で得られ得る。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値は、流体試料中で得られる。いくつかの実施形態において、試料は血液、血漿、または血清の試料である。いくつかの実施形態において、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値は、流体試料中で得られる。いくつかの実施形態において、試料は血液を含む。いくつかの実施形態において、試料は血液試料である。いくつかの実施形態において、試料は全血試料である。いくつかの実施形態において、血液は分画または遠心分離される。いくつかの実施形態において、試料は血漿を含む。いくつかの実施形態において、試料は血漿試料である。血液試料は血漿試料であってもよい。いくつかの実施形態において、試料は血清を含む。いくつかの実施形態において、試料は血清試料である。血液試料は血清試料であってもよい。いくつかの実施形態において、流体試料は肺流体試料を含む。いくつかの実施形態において、肺流体試料は肺胞液を含む。いくつかの実施形態において、肺流体試料は気管支液を含む。いくつかの実施形態において、肺流体試料は気管支肺胞液を含む。肺体液は気管支肺胞洗浄方法などの洗浄方法によって得られ得る。洗浄方法は気管支鏡の使用を含み得る。
いくつかの実施形態において、試料は組織を含む。いくつかの実施形態において、試料は組織試料である。いくつかの実施形態において、組織は、肝臓、肺、または血管の組織を含む。例えば、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値またはベースラインＭＳＰ測定値は、患者から得られた肺または肝臓の試料において得られ得る。いくつかの実施形態において、組織は肝臓組織を含む。肝臓は肝細胞を含み得る。いくつかの実施形態において、組織は肺組織を含む。肺は、肺上皮細胞、Ｉ型肺胞細胞、ＩＩ型肺胞細胞、マクロファージ、肺胞マクロファージ、杯細胞、クラブ細胞、または線維芽細胞を含み得る。いくつかの実施形態において、組織は血管組織を含む。血管組織は血管内皮細胞を含み得る。例えば、肺組織は、血管内皮細胞を含み得る。
いくつかの実施形態において、試料は細胞を含む。いくつかの実施形態において、試料は細胞を含む。いくつかの実施形態において、細胞は肝臓細胞である。いくつかの実施形態において、肝臓細胞は肝細胞である。いくつかの実施形態において、細胞は肺細胞である。いくつかの実施形態において、肺細胞は肺上皮細胞である。いくつかの実施形態において、肺細胞はＩ型肺胞細胞である。いくつかの実施形態において、肺細胞はＩＩ型肺胞細胞である。いくつかの実施形態において、肺細胞はマクロファージである。いくつかの実施形態において、肺細胞は肺胞マクロファージである。いくつかの実施形態において、肺細胞は杯細胞である。いくつかの実施形態において、肺細胞はクラブ細胞である。いくつかの実施形態において、肺細胞は線維芽細胞である。いくつかの実施形態において、細胞は血管系細胞である。いくつかの実施形態において、血管系細胞は内皮細胞である。
Ｄ．効果
いくつかの実施形態において、組成物または組成物の投与は、ベースライン測定値と比較して、肺機能測定値、白血球測定値、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）増悪測定値、喘息増悪測定値、ＭＳＰ測定値（例えば、循環もしくは組織ＭＳＰレベル）、またはＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値などの測定値に影響を及ぼす。
本明細書に記載される方法のいくつかの実施形態は、対象から測定値を得る工程を含む。例えば、測定値は、対象を処置した後に対象から得られてもよい。いくつかの実施形態において、測定値は、組成物が対象に投与された後に対象から得られた第２の試料（本明細書に記載される流体または組織試料など）において得られる。いくつかの実施形態において、測定値は、障害が処置されたことを示すものである。
いくつかの実施形態において、測定値は、対象から直接得られる。いくつかの実施形態において、測定値は、撮像デバイスを使用して非侵襲的に得られる。いくつかの実施形態において、測定値は、対象からの第２の試料において得られる。いくつかの実施形態において、測定値は、１つ以上の組織学的組織切片において得られる。いくつかの実施形態において、測定値は、対象から得られた第２の試料に対してアッセイを行うことにより得られる。いくつかの実施形態において、測定値は、本明細書に記載されるアッセイなどのアッセイによって得られる。いくつかの実施形態において、アッセイは、イムノアッセイ、比色アッセイ、蛍光アッセイ、クロマトグラフィー（例えば、ＨＰＬＣ）アッセイ、またはＰＣＲアッセイである。いくつかの実施形態において、測定値は、イムノアッセイ、比色アッセイ、蛍光アッセイ、またはクロマトグラフィー（例えば、ＨＰＬＣ）アッセイなどのアッセイによって得られる。いくつかの実施形態において、測定値はＰＣＲによって得られる。いくつかの実施形態において、測定値は組織学的検査によって得られる。いくつかの実施形態において、測定値は観察によって得られる。いくつかの実施形態において、さらなる測定値は、第３の試料、第４の試料、または第５の試料などにおいてもたらされる。
いくつかの実施形態において、測定値は、組成物の投与後１時間以内、２時間以内、３時間以内、４時間以内、５時間以内、６時間以内、１２時間以内、１８時間以内、または２４時間以内に得られる。いくつかの実施形態において、測定値は、組成物の投与後１日以内、２日以内、３日以内、４日以内、５日以内、６日以内、または７日以内に得られる。いくつかの実施形態において、測定値は、組成物の投与後、１週間以内、２週間以内、３週間以内、１ヶ月以内、２ヶ月以内、３ヶ月以内、６ヶ月以内、１年以内、２年以内、３年以内、４年以内、または５年以内に得られる。いくつかの実施形態において、測定値は、組成物の投与の１時間後、２時間後、３時間後、４時間後、５時間後、６時間後、１２時間後、１８時間後、または２４時間後に得られる。いくつかの実施形態において、測定値は、組成物の投与の１日後、２日後、３日後、４日後、５日後、６日後、または７日後に得られる。いくつかの実施形態において、測定値は、組成物の投与の１週間後、２週間後、３週間後、１ヶ月後、２ヶ月後、３ヶ月後、６ヶ月後、１年後、２年後、３年後、４年後、または５年後に得られる。
いくつかの実施形態において、組成物はベースライン測定値と比較して、測定値を減少させる。例えば、肺障害の有害な表現型は組成物の投与で減少し得る。いくつかの実施形態において、減少は、対象へ組成物を投与後に対象から得られた第２の試料中で測定される。いくつかの実施形態において、減少は、対象へ組成物を投与した後に対象において直接測定される。いくつかの実施形態において、測定値は、ベースライン測定値と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上、減少する。いくつかの実施形態において、測定値は、ベースライン測定値と比較して、約１０％以上減少する。いくつかの実施形態において、測定値は、ベースライン測定値と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、減少する。いくつかの実施形態において、測定値は、ベースライン測定値と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下、減少する。いくつかの実施形態において、測定値は、ベースライン測定値と比較して、約１０％以下減少する。いくつかの実施形態において、測定値は、ベースライン測定値と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、約９０％以下、または約１００％以下、減少する。いくつかの実施形態において、測定値は、２．５％、５％、７．５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、もしくは１００％、または２つの前述の割合のいずれかによって定義される範囲だけ、減少する。
いくつかの実施形態において、組成物はベースライン測定値と比較して、測定値を増加させる。例えば、保護的な肺表現型は組成物の投与で増加し得る。いくつかの実施形態において、増加は、対象へ組成物を投与後に対象から得られた第２の試料中で測定される。いくつかの実施形態において、増加は、対象へ組成物を投与した後に対象において直接測定される。いくつかの実施形態において、測定値は、ベースライン測定値と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上、増加する。いくつかの実施形態において、測定値は、ベースライン測定値と比較して、約１０％以上増加する。いくつかの実施形態において、測定値は、ベースライン測定値と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、増加する。いくつかの実施形態において、測定値は、ベースライン測定値と比較して、約１００％以上増加し、約２５０％以上増加し、約５００％以上増加し、約７５０％以上増加し、または約１０００％以上増加する。いくつかの実施形態において、測定値は、ベースライン測定値と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下、増加する。いくつかの実施形態において、測定値は、ベースライン測定値と比較して、約１０％以下増加する。いくつかの実施形態において、測定値は、ベースライン測定値と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、約９０％以下、または約１００％以下、増加する。いくつかの実施形態において、測定値は、ベースライン測定値と比較して、約１００％以下増加し、約２５０％以下増加し、約５００％以下増加し、約７５０％以下増加し、または約１０００％以下増加する。いくつかの実施形態において、測定値は、２．５％、５％、７．５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、２５０％、５００％、７５０％、もしくは１０００％、または２つの前述の割合のいずれかによって定義される範囲だけ、増加する。
いくつかの実施形態において、測定値は、肺機能測定値である。いくつかの実施形態において、測定値は肺活量測定値である。肺活量測定値は肺活量計を使用して得られ得る。肺活量計は、容積－時間（ｖｏｌｕｍｅ－ｔｉｍｅ）曲線またはフローボリューム（ｆｌｏｗ－ｖｏｌｕｍｅ）ループを含む呼吸曲線を生成してもよい。いくつかの実施形態において、肺活量測定値は、対象に肺活量計センサーへ息を吹き込ませることにより得られる。肺活量測定値の例は、１秒量（ｆｏｒｃｅｄ ｅｘｐｉｒａｔｏｒｙ ｖｏｌｕｍｅ ｉｎ １ ｓｅｃｏｎｄ）（ＦＥＶ１）測定値、予測１秒量に対する比率（ｆｏｒｃｅｄ ｅｘｐｉｒａｔｏｒｙ ｖｏｌｕｍｅ ｉｎ １ ｓｅｃｏｎｄ ｐｅｒｃｅｎｔ ｐｒｅｄｉｃｔｅｄ）（ＦＥＶ１ｐｐ）測定値、努力肺活量（ＦＶＣ）測定値、ＦＥＶ１／ＦＶＣ比、努力呼気量、または最大呼気流量（ｐｅａｋ ｅｘｐｉｒａｔｏｒｙ ｆｌｏｗ）測定値を含み得る。いくつかの実施形態において、測定値は１秒量（ＦＥＶ１）測定値を含む。いくつかの実施形態において、測定値は予測１秒量に対する比率（ＦＥＶ１ｐｐ）測定値を含む。いくつかの実施形態において、測定値は努力肺活量（ＦＶＣ）測定値を含む。いくつかの実施形態において、測定値はＦＥＶ１／ＦＶＣ比を含む。ＦＥＶ１／ＦＶＣ比は、場合によっては７０％未満または８０％未満であり得る。いくつかの実施形態において、測定値は努力呼気量を含む。いくつかの実施形態において、測定値は最大呼気流量測定値を含む。
いくつかの実施形態において、組成物はベースライン肺機能測定値と比較して、肺機能測定値を増加させる。いくつかの実施形態において、増加は、対象へ組成物を投与した後に対象において直接測定される。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、ベースライン肺機能測定値と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上、増加する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、ベースライン肺機能測定値と比較して、約１０％以上増加する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、ベースライン肺機能測定値と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、増加する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、ベースライン肺機能測定値と比較して、約１００％以上増加し、約２５０％以上増加し、約５００％以上増加し、約７５０％以上増加し、または約１０００％以上増加する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、ベースライン肺機能測定値と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下、増加する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、ベースライン肺機能測定値と比較して、約１０％以下増加する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、ベースライン肺機能測定値と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、約９０％以下、または約１００％以下、増加する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、ベースライン肺機能測定値と比較して、約１００％以下増加し、約２５０％以下増加し、約５００％以下増加し、約７５０％以下増加し、または約１０００％以下増加する。いくつかの実施形態において、肺機能測定値は、２．５％、５％、７．５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、１００％、２５０％、５００％、７５０％、もしくは１０００％、または２つの前述の割合のいずれかによって定義される範囲だけ、増加する。
いくつかの実施形態において、測定値は白血球測定値を含む。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、循環白血球測定値を含む。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、肺組織白血球測定値を含む。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、肺液（例えば、気管支肺胞液）白血球測定値を含む。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、白血球数を含む。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、白血球濃度を含む。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、白血球割合を含む。割合は他の細胞に関連することもある。白血球測定値に含まれ得る白血球の例としては、好中球、好酸球、好塩基球、単球、またはリンパ球が挙げられる。白血球は好中球を含み得る。白血球は好酸球を含み得る。白血球は好塩基球を含み得る。白血球は単球を含み得る。白血球はリンパ球を含み得る。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、イムノアッセイ、比色アッセイ、または蛍光アッセイなどのアッセイによって得られる。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、対照白血球測定値と比較して、正常である。例えば、本明細書に記載される組成物で処置されておらず、炎症性の肺障害を患っている対象は、今は低いか正常である白血球数が高かった可能性がある。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、肺組織または肺液、例えば、気管支肺胞液で決定され、好中球およびマクロファージの測定値を含み得る。
いくつかの実施形態において、組成物はベースライン白血球測定値と比較して、白血球測定値を減少させる。いくつかの実施形態において、減少は、対象へ組成物を投与後に対象から得られた第２の試料中で測定される。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、ベースライン白血球測定値と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上、減少する。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、ベースライン白血球測定値と比較して、約１０％以上減少する。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、ベースライン白血球測定値と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、または約８０％以上減少する。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、ベースライン白血球測定値と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下、減少する。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、ベースライン白血球測定値と比較して、約１０％以下減少する。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、ベースライン白血球測定値と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、または約８０％以下、減少する。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、２．５％、５％、７．５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、もしくは１００％、または２つの前述の割合のいずれかによって定義される範囲だけ、減少する。いくつかの実施形態において、白血球測定値は、ベースライン白血球測定値と比較して、前述の割合のいずれか、または割合の範囲だけ、減少する。
いくつかの実施形態において、測定値は、慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）増悪測定値を含む。ＣＯＰＤ増悪は、呼吸困難などの呼吸器症状の重症度の急性増加などのＣＯＰＤ再発を含み得る。ＣＯＰＤ増悪測定値は、ＣＯＰＤ再発の数を含み得、日、週、月、または年ごとの再発などの所与の時間枠に含まれ得る。ＣＯＰＤ増悪測定値は、ＣＯＰＤ増悪の頻度を含み得る。ＣＯＰＤ増悪測定値は、呼吸困難、咳、痰量、または痰化膿の増加などの呼吸器症状の悪化の測定値を含み得る。ＣＯＰＤ増悪測定値は、対象の状態が処置の変更を必要とするほど変化するときなどの事象の測定値を含み得る。ＣＯＰＤ増悪測定値は、ピーク流量試験、呼吸一酸化窒素測定値、または血中酸素濃度試験を含み得る。
いくつかの実施形態において、組成物はベースラインＣＯＰＤ増悪測定値と比較して、ＣＯＰＤ増悪測定値を減少させる。いくつかの実施形態において、減少は、対象へ組成物を投与後に対象から得られた第２の試料中で測定される。いくつかの実施形態において、減少は、対象へ組成物を投与した後に対象において直接測定される。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤ増悪測定値は、ベースラインＣＯＰＤ増悪測定値と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上、減少する。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤ増悪測定値は、ベースラインＣＯＰＤ増悪測定値と比較して、約１０％以上減少する。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤ増悪測定値は、ベースラインＣＯＰＤ増悪測定値と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、減少する。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤ増悪測定値は、ベースラインＣＯＰＤ増悪測定値と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下、減少する。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤ増悪測定値は、ベースラインＣＯＰＤ増悪測定値と比較して、約１０％以下減少する。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤ増悪測定値は、ベースラインＣＯＰＤ増悪測定値と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、約９０％以下、または約１００％以下、減少する。いくつかの実施形態において、ＣＯＰＤ増悪測定値は、２．５％、５％、７．５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、もしくは１００％、または２つの前述の割合のいずれかによって定義される範囲だけ、減少する。
いくつかの実施形態において、測定値は、喘息増悪測定値を含む。喘息増悪は、喘息発作、例えば、呼吸困難を引き起こす気管支の狭窄を含み得る。喘息増悪測定値は、喘息発作の数の数を含み得、日、週、月、または年ごとの再発などの所与の時間枠に含まれ得る。喘息増悪測定値は、気管支直径、気管支円周、または気管支面積の測定値などの気管支測定値を含み得る。喘息増悪測定値は、収縮率などの気管支狭窄の量を含み得る。喘息増悪測定値は、喘鳴測定値、咳測定値、胸部締め付け測定値、息切れ測定値、激越測定値、過換気測定値、心拍数測定値、肺機能測定値、または発話もしくは呼吸困難の測定値を含み得る。喘息増悪測定値は、ピーク流量試験、呼吸一酸化窒素測定値、または血中酸素濃度試験を含み得る。
いくつかの実施形態において、組成物は、ベースライン喘息増悪測定値と比較して、喘息増悪測定値を減少させる。いくつかの実施形態において、減少は、対象へ組成物を投与後に対象から得られた第２の試料中で測定される。いくつかの実施形態において、減少は、対象へ組成物を投与した後に対象において直接測定される。いくつかの実施形態において、喘息増悪測定値は、ベースライン喘息増悪測定値と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上、減少する。いくつかの実施形態において、喘息増悪測定値は、ベースライン喘息増悪測定値と比較して、約１０％以上減少する。いくつかの実施形態において、喘息増悪測定値は、ベースライン喘息増悪測定値と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、減少する。いくつかの実施形態において、喘息増悪測定値は、ベースライン喘息増悪測定値と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下、減少する。いくつかの実施形態において、喘息増悪測定値は、ベースライン喘息増悪測定値と比較して、約１０％以下減少する。いくつかの実施形態において、喘息増悪測定値は、ベースライン喘息増悪測定値と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、約９０％以下、または約１００％以下、減少する。いくつかの実施形態において、喘息増悪測定値は、２．５％、５％、７．５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、もしくは１００％、または２つの前述の割合のいずれかによって定義される範囲だけ、減少する。
いくつかの実施形態において、測定値はＭＳＰ測定値である。いくつかの実施形態において、ＭＳＰ測定値は、ＭＳＰレベルを含む。いくつかの実施形態において、ＭＳＰレベルは、試料重量あたりのＭＳＰの質量または割合として示される。いくつかの実施形態において、ＭＳＰレベルは、試料体積あたりのＭＳＰの質量または割合として示される。いくつかの実施形態において、ＭＳＰレベルは、試料内での総タンパク質あたりのＭＳＰの質量または割合として示される。いくつかの実施形態において、ＭＳＰ測定値は循環ＭＳＰ測定値である。いくつかの実施形態において、ＭＳＰ測定値は、イムノアッセイ、比色アッセイ、または蛍光アッセイなどのアッセイによって得られる。
いくつかの実施形態において、組成物はベースラインＭＳＰ測定値と比較して、ＭＳＰ測定値を減少させる。いくつかの実施形態において、組成物はベースラインＭＳＰ測定値と比較して、循環ＭＳＰレベルを減少させる。いくつかの実施形態において、組成物はベースラインＭＳＰ測定値と比較して、組織ＭＳＰレベルを減少させる。いくつかの実施形態において、減少したＭＳＰレベルは、対象へ組成物を投与後に対象から得られた第２の試料中で測定される。いくつかの実施形態において、第２の試料は血液、血清、血漿、肝臓、または肺の試料である。いくつかの実施形態において、ＭＳＰ測定値は、ベースラインＭＳＰ測定値と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上、減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＰ測定値は、ベースラインＭＳＰ測定値と比較して、約１０％以上減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＰ測定値は、ベースラインＭＳＰ測定値と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、または約１００％、減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＰ測定値は、ベースラインＭＳＰ測定値と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下、減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＰ測定値は、ベースラインＭＳＰ測定値と比較して、約１０％以下減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＰ測定値は、ベースラインＭＳＰ測定値と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、約９０％以下、または約１００％以下、減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＰ測定値は、２．５％、５％、７．５％、１９％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、もしくは１００％、または２つの前述の割合のいずれかによって定義される範囲だけ、減少する。
いくつかの実施形態において、測定値はＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値である。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値は、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルを含む。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、試料重量あたりのＭＳＴ１ ｍＲＮＡの量または割合として示される。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、試料体積あたりのＭＳＴ１ ｍＲＮＡの量または割合として示される。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、試料内での総ｍＲＮＡあたりのＭＳＴ１ ｍＲＮＡの量または割合として示される。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、試料内での総核酸あたりのＭＳＴ１ ｍＲＮＡの量または割合として示される。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、試料内のハウスキーピング遺伝子のｍＲＮＡレベルなどの別のｍＲＮＡレベルと比較して示される。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値は、ＰＣＲアッセイなどのアッセイによって得られる。いくつかの実施形態において、ＰＣＲはｑＰＣＲを含む。いくつかの実施形態において、ＰＣＲはＭＳＴ１ ｍＲＮＡの逆転写を含む。
いくつかの実施形態において、組成物はベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値と比較して、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値を減少させる。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値は、対象へ組成物を投与後に対象から得られた第２の試料中で得られる。いくつかの実施形態において、組成物は、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルに対して、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルを減少させる。いくつかの実施形態において、減少したＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルは、対象へ組成物を投与後に対象から得られた第２の試料中で測定される。いくつかの実施形態において、第２の試料は肺試料である。いくつかの実施形態において、第２の試料は肝臓試料である。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値は、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値と比較して、約２．５％以上、約５％以上、または約７．５％以上、減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値は、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値と比較して、約１０％以上減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値は、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値と比較して、約２０％以上、約３０％以上、約４０％以上、約５０％以上、約６０％以上、約７０％以上、約８０％以上、約９０％以上、または約１００％以上、減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値は、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値と比較して、約２．５％以下、約５％以下、または約７．５％以下、減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値は、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値と比較して、約１０％以下、減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値は、ベースラインＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値と比較して、約２０％以下、約３０％以下、約４０％以下、約５０％以下、約６０％以下、約７０％以下、約８０％以下、約９０％以下、または約１００％以下、減少する。いくつかの実施形態において、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡ測定値は、２．５％、５％、７．５％、１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、もしくは１００％、または２つの前述の割合のいずれかによって定義される範囲だけ、減少する。
ＩＩＩ．定義
他に定義されていない限り、本明細書で使用されているすべての専門用語、表記、その他の技術的および科学的な用語は、主張された主題が属する技術分野の当業者によって一般的に理解されているものと同じ意味を有する。場合によっては、一般に理解されている意味を有する用語が、明確化のため、および／または、すぐに参照できるように本明細書に定義されており、そのような定義を本明細書に含めることは、必ずしも、当該技術分野で一般に理解されているものと実質的に異なることを示すと解釈されてはならない。
本出願の全体にわたって、様々な実施形態が範囲フォーマット（ｒａｎｇｅ ｆｏｒｍａｔ）で提示されてもよい。範囲のフォーマットにおける記載は利便性と簡潔さのためのものに過ぎず、本開示の範囲に対する確固たる制限として解釈されるべきでないことを理解されたい。したがって、範囲の記載は、すべての可能な部分範囲と、その範囲内の個々の数値を具体的に開示したものであると考慮されなければならない。例えば、１～６などの範囲の記載は、１～３、１～４、１～５、２～４、２～６、３～６といった具体的に開示された部分範囲と、例えば、１、２、３、４、５、および６といった範囲内にある個々の数字を有するものとして考慮されなければならない。これは、範囲の広さにかかわらず適用される。
本明細書および特許請求の範囲で使用されるように、「ａ」、「ａｎ」、および「ｔｈｅ」は、内容が他に明確に示していない限り、複数の参照を含む。例えば、「試料」という用語は複数の試料を含み、その混合物も含む。
「決定すること」、「測定すること」、「評価すること」、「査定すること」、「アッセイすること」、および「分析すること」は、測定の形態を参照するために、本明細書においてしばしば交換可能に使用される。上記用語は、要素が存在するかどうかを決定することを含む（例えば、検出）。このような用語は、定量的、定性的、または定量的かつ定性的な決定を含み得る。査定することは相対的または絶対的であり得る。「～の存在を検出すること」は、あるものが文脈次第で存在するか存在しないかを決定することに加えて、存在するあるものの量を決定することを含み得る。
「対象」および「患者」という用語は互換的に使用されてもよい。「対象」は、発現した遺伝物質を含む生物学的実体であり得る。生物学的実体は、例えば、細菌、ウイルス、真菌類、および原生動物を含む、植物、動物、または微生物であり得る。対象は哺乳動物で有り得る。哺乳動物はヒトで有り得る。対象は、疾患について高いリスクがあると診断されるか、またはそうであると疑われることもある。場合によっては、対象は必ずしも、疾患について高いリスクがあると診断されたり疑われたりするわけではない。
本明細書で使用されるように、「約」という用語が付く数字は、その数字のプラスまたはマイナス１０％の数字を指す。「約」という用語が付く範囲は、最低値のマイナス１０％、および最大値のプラス１０％の範囲を指す。
本明細書で使用されるように、「処置（ｔｒｅａｔｍｅｎｔ）」または「処置すること（ｔｒｅａｔｉｎｇ）」という用語は、レシピエントにおける有益な結果または所望の結果を得るための医薬的またはその他の介入レジメンに関して使用される。有益な結果または所望の結果は、限定されないが、治療上の利点および／または予防上の利点を含む。治療上の利点は、処置されている症状または基礎疾患の根絶または寛解を指すこともある。同様に、治療上の利点は、対象が依然として基礎疾患による影響を受ける可能性があるにもかかわらず、対象の改善が観察されるように、基礎疾患に関連する生理学的症状の１以上の根絶または寛解により達成され得る。予防効果は、疾患もしくは疾病の出現を遅延、予防、もしくは排除すること、疾患もしくは疾病の症状の発症を遅延もしくは排除すること、疾患もしくは疾病の進行を遅くする、止める、もしくは撤回させること、またはそれらの任意の組み合わせを含む。予防効果に関して、特定の疾患を進行させる危険のある対象、または、疾患の生理学低症状の１つ以上を報告する対象は、たとえこの疾患の診断が行われなかったとしても、処置を受けることができる。
いくつかの実施形態は、核酸配列情報を指す。いくつかの実施形態において、チミン（Ｔ）は、ウラシル（Ｕ）と交換されてもよく、またはその逆であってもよいことが企図される。例えば、配列表中のいくつかの配列はＴを列挙し得るが、いくつかの実施形態において、これらはＵで置き換えられ得る。ウラシルを含む核酸配列を有するいくつかのオリゴヌクレオチドにおいて、ウラシルはチミンで置き換えられ得る。同様に、チミンを含む核酸配列を有するいくつかのオリゴヌクレオチドにおいて、チミンはウラシルで置き換えられ得る。いくつかの実施形態では、ｓｉＲＮＡなどのオリゴヌクレオチドはＲＮＡを含み、または、ＲＮＡからなる。いくつかの実施形態において、オリゴヌクレオチドは、ＤＮＡを含むこともあれば、ＤＮＡからなることもある。例えば、ＡＳＯはＤＮＡを含み得る。
本明細書で使用される章の見出しは、構成上の目的のためにすぎず、記載される主題を限定するものと解釈されるべきではない。
ＶＩ．実施例
実施例１：ＭＳＴ１における変異体は、閉塞性肺疾患および関連する形質に対する保護的関連性を示す。
ＭＳＴ１における変異体を、ＵＫ Ｂｉｏｂａｎｋコホートからの遺伝子型データを用いて、約３８２，０００人の個体における肺疾患ならびに関連する肺および白血球の形質との関連について評価した。評価した変異体には以下：（１）アミノ酸６５１でＭＳＴ１タンパク質を早期に終結させる低頻度（ＡＡＦ＝０．０２）ＭＳＴ１停止利得変異体（Ａｒｇ６５１Ｔｅｒ；Ｒ６５１Ｔｅｒ）であるｒｓ１４２６９００３２、（２）ＭＳＴ１低次形態変異体として実験的に特徴付けられ、ＭＳＴ１↓ｐＱＴＬでもある、共通の（ＡＡＦ＝０．２９）ＭＳＴ１ミスセンス変異体（Ａｒｇ７０３Ｃｙｓ；Ｒ７０３Ｃ）であるｒｓ３１９７９９９、および（３）肝臓と肺のＭＳＴ１ ｓＱＴＬであり、および遺伝子をコードするＭＳＰの受容体であるＭＳＴ１Ｒの肺↓ｅＱＴＬである、共通（ＡＡＦ＝０．８２）のＭＳＴ１同義変異体（Ｐｒｏ１５３Ｐｒｏ；Ｐ１５３Ｐ）であるｒｓ３０２０７７９が含まれた。３つの変異体はすべて、ＭＳＴ１遺伝子産物の存在量または活性の減少をもたらした低次形態または機能喪失変異体とみなされた。
分析は、年齢、性別、および共変量としての遺伝子祖先の最初の１０の主成分を用いたロジスティック回帰モデルまたは線形回帰モデルを使用した。分析は、個々のＭＳＴ１変異体の関連の同定をもたらした（表２Ａ、２Ｂ、２Ｃ、および２Ｄ）。例えば、複数の肺疾患関連形質との保護的関連があった。評価された変異体は、ＣＯＰＤ、喘息からの保護、および低リスクの吸入ベータアゴニスト処方と関連していた（表２Ａおよび２Ｂ）。さらに、評価された変異体は、肺機能（ＦＥＶ１およびＦＶＣ）の増加および循環好中球数の減少と関連していた（表２Ｃおよび２Ｄ）。
これらの結果は、ＭＳＴ１の機能喪失がＣＯＰＤおよび喘息からの保護、肺機能の改善、ならびに閉塞性気道疾患における重要な炎症誘発性細胞型である循環好中球の低下をもたらすことを示している。これらの結果はさらに、ＭＳＴ１の治療的阻害が同様の疾患保護効果をもたらし得ることを示す。
ＭＳＴ１における保護変異体は、ＭＳＴ１タンパク質の喪失をもたらす
野生型およびＲ６５１Ｔｅｒ（Ａｒｇ６５１Ｔｅｒ；ｒｓ１４２６９００３２）タンパク質をコードするｍＲＮＡ前駆体発現構築物を作製した。エキソン、イントロン、ならびに５’および３’ＵＴＲを含有するＭＳＴ１のタンパク質コード転写物（ＥＮＳＴ０００００４４９６８２）のｍＲＮＡ前駆体を、ＣＭＶプロモーターによって駆動されるｐｃＤＮＡ３．１（＋）ベクターにクローニングした。空のベクターを対照として使用した。Ｒ６５１Ｔｅｒ発現構築物については、Ａ対立遺伝子は、ＤＮＡ配列位置ｃｈｒ３：４９６８４３７９（ヒトゲノムビルド３８）でＧ対立遺伝子に取って代わった。これにより、Ｒ６５１Ｔｅｒ未成熟停止コドンが生成された。
Ｈｕｈ７細胞のトランスフェクションを最適化した。Ｈｕｈ７細胞を完全増殖培地中のＴ７５フラスコに播種し、４８時間増殖させた後、培地を交換した。その後、細胞を１５μｇのプラスミドＤＮＡおよび４５μｌのＴｒａｎｓＩＴ－２０２０でトランスフェクトした。細胞を４８時間インキュベートし、その後、回収した。
トランスフェクト細胞からの細胞溶解物をアッセイして、ウエスタンブロットによって細胞内ＭＳＴ１タンパク質を評価した（図１）。空ベクターをトランスフェクトしたＨｕｈ７細胞において、ＭＳＴ１は、ウエスタンブロットでは検出できなかった。野生型構築物でトランスフェクトした細胞において、ＭＳＴ１は、約８０ｋＤａのバンドとしてウエスタンブロットによって検出された。Ｒ６５１Ｔｅｒ構築物でトランスフェクトした細胞において、ＭＳＴ１は、野生型と比較してウエスタンブロットによって実質的に減少し、早期停止コドンが、ナンセンス介在的分解またはタンパク質レベルでの分解を介してＭＳＴ１の喪失をもたらすことを示唆している。
これらのデータは、ＣＯＰＤおよび喘息からの保護、肺機能の改善、および循環好中球の低下に関連するＭＳＴ１遺伝子変異体が、ＭＳＴ１タンパク質の存在量または機能の喪失をもたらすという実験的検証を提供する。したがって、場合によっては、ＭＳＴ１の治療的阻害または調節は、これらの疾患および尺度の有効な遺伝的に情報伝達された処置方法であり得る。
実施例２：ＭＳＴ１ ｍＲＮＡの発現を下方制御するための治療用ｓｉＲＮＡを同定するための配列のバイオインフォーマティックな選択
スクリーニングセットを、バイオインフォーマティックな分析に基づいて定義した。治療用ｓｉＲＮＡは、ヒトＭＳＴ１、および少なくとも１つの毒性学関連種、この場合、非ヒト霊長類（ＮＨＰ）アカゲザルおよびカニクイザルのＭＳＴ１配列を標的とするように設計された。スクリーニングセットの設計の原動力は、関連種のトランスクリプトームに対するｓｉＲＮＡの予測される特異性と、種間の交差反応性であった。ヒト、アカゲザル、カニクイザル、マウス、およびラットにおける予測される特異性が、センス（Ｓ）鎖とアンチセンス（ＡＳ）鎖について決定された。これらに「特異性スコア」が割り当てられ、これは、ミスマッチの数および位置と同様に、ｓｉＲＮＡ鎖の完全なまたは部分的な相補性（２～１８位内に最大４つのミスマッチ）により任意の他の転写物の意図しない下方制御の可能性を考慮したものである。このようにして、各ｓｉＲＮＡのアンチセンス鎖およびセンス鎖のオフターゲットが同定された。加えて、可能性のあるオフターゲットの数は、特異性スコアの追加特異性因子として使用された。同定される場合、高い特異性と予測されるオフターゲットの数が少ないｓｉＲＮＡは、ターゲティングの特異性を高めるという利点を与える。
ＭＳＴ１ ｍＲＮＡに対して高い配列特異性を有するｓｉＲＮＡ配列を選択することに加えて、シード領域内のｓｉＲＮＡ配列を、既知のｍｉＲＮＡのシード領域との類似性について分析した。ｓｉＲＮＡは、ｍＲＮＡ分子の３’－ＵＴＲ内の相補的配列との塩基対形成を介して、ｍｉＲＮＡのように機能することができる。相補性は通常、ｍｉＲＮＡの２～７位の５’－塩基（シード領域）を包含している。機能的なｍｉＲＮＡ結合部位を介して作用するｓｉＲＮＡを回避するために、天然のｍｉＲＮＡシード領域を含有するｓｉＲＮＡ鎖を回避した。ヒト、マウス、ラット、アカゲザル、イヌ、ウサギ、およびブタからのｍｉＲＮＡで同定されたシード領域は「保存型」と呼ばれる。「特異性スコア」とｍｉＲＮＡシード解析を組み合わせることで、「特異性カテゴリー」が得られる。これは１～４のカテゴリーに分けられ、１が最も特異性が高く、４が最も特異性が低い。ｓｉＲＮＡの各鎖は特異性カテゴリーに割り当てられる。
特異性および種の交差反応性を、ヒト、カニクイザル、アカゲザル、マウス、およびラットのＭＳＴ１について評価した。解析は、１９塩基と１７塩基（１位と１９位を考慮しない）を用いたカノニカルｓｉＲＮＡ設計に基づき、交差反応性について評価した。完全一致と単一のミスマッチの解析も含まれた。
ヒト一塩基多型（ＳＮＰ）データベース（ＮＣＢＩ－ＤＢ－ＳＮＰ）の解析であって、既知のＳＮＰを有するｓｉＲＮＡ標的化領域を同定するための解析も、ＳＮＰを含む個体において非機能的である可能性があるｓｉＲＮＡを同定するために実施された。この解析では、標的配列内のＳＮＰの位置に関する情報だけでなく、症例データにおけるマイナーアレル頻度（ＭＡＦ）も得られた。
関連するＭＳＴ１ ｍＲＮＡ配列の初期分析により、分析した関連種のすべてにおいて特異性パラメータを満たし、同時にＭＳＴ１ ｍＲＮＡを標的とする配列はほとんどないことが判明した。したがって、治療用ｓｉＲＮＡのための独立したスクリーニングサブセットを設計することが決まった。
これらのサブセット中のｓｉＲＮＡは、ヒト、カニクイザル、アカゲザルのＭＳＴ１配列を認識する。したがって、これらのサブセット中のｓｉＲＮＡは、治療環境においてヒトＭＳＴ１を標的とするために使用することができる。
特異性または種交差反応性を考慮することなくヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡ（ＮＭ＿＿０２０９９８．４ 配列番号６１８５）に由来し得るｓｉＲＮＡ配列の数は、３０２４個（配列番号１～６０４８に含まれるセンス鎖とアンチセンス鎖の配列）であった。
上記のように標的特異性、種交差反応性、ｍｉＲＮＡシード領域配列、およびＳＮＰについて配列に優先順位を付けると、サブセットＡが得られる。サブセットＡは、その塩基配列が表３に示されている２３１個のｓｉＲＮＡを含有している。
サブセットＡにおけるｓｉＲＮＡは、以下の特徴を有する。
・交差反応性：ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡ中の１９量体とのもの、ＮＨＰ ＭＳＴ１中の１７量体／１９量体とのもの
・特異性カテゴリー：ヒトとＮＨＰについて：ＡＳ２またはそれよりも良く、ＳＳ３またはそれよりも良い
・ｍｉＲＮＡシード：ＡＳ＋ＳＳ鎖：ヒト、マウス、およびラットでは保存されず、４を超える種では存在しないシード領域
・オフターゲット頻度：アンチセンス鎖中で２つのミスマッチと一致した２０個以下のヒトオフターゲット
・ＳＮＰ：ｓｉＲＮＡ標的部位は１％以上のＭＡＦを有するＳＮＰを保有していない（２～１８位）
サブセットＡのｓｉＲＮＡ配列は、サブセットＢを得るために、よりストリンジェントな特異性について選択された。サブセットＢは、その塩基配列が表４に示されている１９７個のｓｉＲＮＡを含む。
サブセットＢにおけるｓｉＲＮＡは、以下の特徴を有する。
・交差反応性：ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡ中の１９量体とのもの、ＮＨＰ ＭＳＴ１中の１７量体／１９量体とのもの
・特異性カテゴリー：ヒトとＮＨＰについて：ＡＳ２またはそれよりも良く、ＳＳ３またはそれよりも良い
・ｍｉＲＮＡシード：ＡＳ＋ＳＳ鎖：ヒト、マウス、およびラットでは保存されず、４を超える種では存在しないシード領域
・オフターゲット頻度：アンチセンス鎖中で２つのミスマッチと一致した１５個以下のヒトオフターゲット
・ＳＮＰ：ｓｉＲＮＡ標的部位は１％以上のＭＡＦを有するＳＮＰを保有していない（２～１８位）
サブセットＢのｓｉＲＮＡ配列はさらに、サブセットＣを得るために、既知のヒトｍｉＲＮＡのシード領域と同一であるＡＳ鎖のシード領域がないものについて選択された。サブセットＣは、その塩基配列が表５に示されている１４０個のｓｉＲＮＡを含む。
サブセットＣにおけるｓｉＲＮＡは、以下の特徴を有する。
・交差反応性：ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡ中の１９量体とのもの、ＮＨＰ ＭＳＴ１中の１７量体／１９量体とのもの
・特異性カテゴリー：ヒトとＮＨＰについて：ＡＳ２またはそれよりも良く、ＳＳ３またはそれよりも良い
・ｍｉＲＮＡシード：ＡＳ＋ＳＳ鎖：ヒト、マウス、およびラットでは保存されず、４個を超える種では存在しないシード領域。ＡＳ鎖：既知のヒトｍｉＲＮＡのシード領域とは同一ではないシード領域
・オフターゲット頻度：アンチセンス鎖によって２つのミスマッチと一致した１５個以下のヒトオフターゲット
・ＳＮＰ：ｓｉＲＮＡ標的部位は１％以上のＭＡＦを有するＳＮＰを保有していない（２～１８位）
サブセットＣのｓｉＲＮＡ配列はさらに、サブセットＤを得るために、既知のヒトｍｉＲＮＡのシード領域と同一であるＡＳ鎖またはＳ鎖のシード領域がないものについて選択された。サブセットＤは、その塩基配列が表６に示されている１０２個のｓｉＲＮＡを含む。
サブセットＤにおけるｓｉＲＮＡは、以下の特徴を有する。
・交差反応性：ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡ中の１９量体とのもの、ＮＨＰ ＭＳＴ１中の１７量体／１９量体とのもの
・特異性カテゴリー：ヒトとＮＨＰについて：ＡＳ２またはそれよりも良く、ＳＳ３またはそれよりも良い
・ｍｉＲＮＡシード：ＡＳ＋ＳＳ鎖：ヒト、マウス、およびラットでは保存されず、４個を超える種では存在しないシード領域。ＡＳ＋ＳＳ鎖：既知のヒトｍｉＲＮＡのシード領域とは同一ではないシード領域
・オフターゲット頻度：アンチセンス鎖によって２つのミスマッチと一致した２０個以下のヒトオフターゲット
・ＳＮＰ：ｓｉＲＮＡ標的部位は１％以上のＭＡＦを有するＳＮＰを保有していない（２～１８位）
サブセットＤのｓｉＲＮＡ配列はさらに、サブセットＥを得るために、よりストリンジェントな特異性について選択された。サブセットＥは、その塩基配列が表７に示されている９１個のｓｉＲＮＡを含む。
サブセットＥにおけるｓｉＲＮＡは、以下の特徴を有する。
・交差反応性：ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡ中の１９量体とのもの、ＮＨＰ ＭＳＴ１中の１７量体／１９量体とのもの
・特異性カテゴリー：ヒトとＮＨＰについて：ＡＳ２またはそれよりも良く、ＳＳ３またはそれよりも良い
・ｍｉＲＮＡシード：ＡＳ＋ＳＳ鎖：ヒト、マウス、およびラットでは保存されず、４個を超える種では存在しないシード領域。ＡＳ＋ＳＳ鎖：既知のヒトｍｉＲＮＡのシード領域とは同一ではないシード領域
・オフターゲット頻度：アンチセンス鎖によって２つのミスマッチと一致した１５個以下のヒトオフターゲット
・ＳＮＰ：ｓｉＲＮＡ標的部位は１％以上のＭＡＦを有するＳＮＰを保有していない（２～１８位）
サブセットＦは３８個のｓｉＲＮＡを含む。サブセットＦのｓｉＲＮＡは、サブセットＡのｓｉＲＮＡを含み、表８に含まれている。場合によっては、サブセットＦのｓｉＲＮＡのいずれかのセンス鎖は、修飾パターン６Ｓを含む（表９）。場合によっては、サブセットＦのｓｉＲＮＡのいずれかのアンチセンス鎖は、修飾パターン７ＡＳを含む（表９）。場合によっては、サブセットＦのｓｉＲＮＡのいずれかのセンス鎖は、代替的な修飾パターンを含む（表１０）。場合によっては、サブセットＦのｓｉＲＮＡのいずれかのアンチセンス鎖は、修飾パターン７ＡＳを含む（表１０）。サブセットＦのｓｉＲＮＡは、任意の他の修飾パターンを含み得る。表９および表１０において、Ｎｆ（例えば、Ａｆ、Ｃｆ、Ｇｆ、Ｔｆ、またはＵｆ）は、２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、ｎ（例えば、ａ、ｃ、ｇ、ｔ、またはｕ）は２’Ｏメチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。
サブセットＡ～Ｈのいずれかの中の任意のｓｉＲＮＡは、本明細書に記載される任意の修飾パターンを含み得る。配列が修飾パターンとは異なる数のヌクレオチド長である場合、修飾パターンは、修飾パターン中のヌクレオチドの数に一致するように５’または３’に付加された適切な数のさらなるヌクレオチドと共に依然として使用することができる。例えば、サブセットＡ～ＦのいずれかのｓｉＲＮＡのセンス鎖またはアンチセンス鎖が１９個のヌクレオチドを含み、修飾パターンが２１個のヌクレオチドを含む場合、センス鎖またはアンチセンス鎖の５’末端にＵＵを付加することができる。
実施例３：培養物中のヒト細胞における活性についてのＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡのスクリーニング
ヒトおよび非ヒト霊長類に対して交差反応性であり、ｓｉＲＮＡサブセットＦ（表８）中の配列に由来し、表１０に示される化学修飾されたＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡを、培養中の細胞におけるＭＳＴ１ ｍＲＮＡノックダウン活性についてアッセイした。Ｈｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞（ＡＴＣＣ（登録商標） ＨＢ－８０６４（商標））を、１０％ウシ胎児血清を補充したＥＭＥＭ（ＡＴＣＣカタログ番号３０－２００３）中、１ウェル当たり７，５００個の細胞密度で９６ウェル組織培養プレートに播種し、ウォータージャケット付きの加湿インキュベーターにおいて、空気＋５％二酸化炭素で構成される雰囲気中３７℃で一晩インキュベートした。ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡは、１ウェルあたり０．１５μＬのＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ ＲＮＡｉＭａｘ（Ｆｉｓｈｅｒ）を用いて、１０ｎＭの最終濃度で２連のウェル中のＨｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞に個々にトランスフェクトした。対照として、Ｓｉｌｅｎｃｅｒ Ｓｅｌｅｃｔ Ｎｅｇａｔｉｖｅ Ｃｏｎｔｒｏｌ ＃１（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ，カタログ番号４３９０８４３）を１０ｎＭの最終濃度でトランスフェクトした。Ｓｉｌｅｎｃｅｒ ＳｅｌｅｃｔヒトＭＳＴ１（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、カタログ番号４４２７０３７、ＩＤ：ｓ８９９４）を１０ｎＭの最終濃度でトランスフェクトし、陽性対照として使用した。３７℃で４８時間インキュベートした後、各ウェルから総ＲＮＡを回収し、ＴａｑＭａｎ（登録商標）Ｆａｓｔ Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｃｅｌｌｓ－ｔｏ－ＣＴ（商標）Ｋｉｔ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ，カタログ番号Ａ３５３７４）を用いて、製造者の指示に従ってｃＤＮＡを調製した。各ウェルからのＭＳＴ１ ｍＲＮＡのレベルは、ヒトＭＳＴ１用のＴａｑＭａｎ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ａｓｓａｙ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ，アッセイ番号Ｈｓ００３６０６８４＿ｍ１）を用いて、ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ（商標）６Ｐｒｏ Ｒｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ ＳｙｓｔｅｍでのリアルタイムｑＰＣＲによって３連で測定された。ＰＰＩＡ ｍＲＮＡのレベルは、ＴａｑＭａｎ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ａｓｓａｙ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ，アッセイ番号Ｈｓ９９９９９９０４＿ｍ１）を用いて測定され、デルターデルタＣｔ法を用いて各ウェルにおける相対的なＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルを決定するために使用された。すべてのデータは、未処理のＨｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞における相対的なＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルに対して正規化した。結果を表１１に示す。ｓｉＲＮＡ ＥＴＤ０１２９０、ＥＴＤ０１２７４、ＥＴＤ０１２９８、ＥＴＤ０１２９９、ＥＴＤ０１２９６、ＥＴＤ０１２９７、ＥＴＤ０１２８１、ＥＴＤ０１３０３、ＥＴＤ０１３０８、ＥＴＤ０１２８９、ＥＴＤ０１３０２、ＥＴＤ０１３０５、およびＥＴＤ０１３０６は、１０ｎＭでトランスフェクトした場合、ＭＳＴ１レベルを５０％超低下させた。
実施例４：ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡｓのＩＣ５０の決定
選択ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡによるＭＳＴ１ ｍＲＮＡのノックダウンのＩＣ５０値を、Ｈｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞（ＡＴＣＣ（登録商標）ＨＢ－８０６４（商標））細胞において決定する。ｓｉＲＮＡは、３０ｎＭ、１０ｎＭ、３ｎＭ、１ｎＭ、および０．３ｎＭ、または３ｎＭ、１ｎＭ、０．３ｎＭ、０．１ｎＭ、および０．０３ｎＭ、または３０ｎＭ、１０ｎＭ、３ｎＭ、１ｎＭ、０．３ｎＭ、０．１ｎＭ、および０．０３ｎＭで個別にアッセイされる。ＨｅｐＧ２細胞を、１０％ウシ胎児血清を補充したＥＭＥＭ（ＡＴＣＣカタログ番号３０－２００３）中、１ウェル当たり７，５００個の細胞密度で９６ウェル組織培養プレートに播種し、ウォータージャケット付きの加湿インキュベーターにおいて、空気＋５％二酸化炭素で構成される雰囲気中３７℃で一晩インキュベートする。ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡは、１ウェルあたり０．１５μＬのＬｉｐｏｆｅｃｔａｍｉｎｅ ＲＮＡｉＭａｘ（Ｆｉｓｈｅｒ）を用いて、ＨｅｐＧ２細胞に個別に３連のウェルでトランスフェクトする。３７℃で４８時間インキュベートした後、各ウェルから総ＲＮＡを回収し、ＴａｑＭａｎ（登録商標）Ｆａｓｔ Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｃｅｌｌｓ－ｔｏ－ＣＴ（商標）Ｋｉｔ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ，カタログ番号Ａ３５３７４）を用いて、製造者の指示に従ってｃＤＮＡを調製する。各ウェルからのＭＳＴ１ ｍＲＮＡのレベルは、ヒトＭＳＴ１用のＴａｑＭａｎ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ａｓｓａｙ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ，アッセイ番号Ｈｓ００３６０６８４＿ｍ１）を用いて、ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ（商標）６Ｐｒｏ Ｒｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ ＳｙｓｔｅｍでのリアルタイムｑＰＣＲによって３連で測定される。ＰＰＩＡ ｍＲＮＡのレベルは、ＴａｑＭａｎ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ａｓｓａｙ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ，アッセイ番号Ｈｓ９９９９９９０４＿ｍ１）を用いて測定され、デルターデルタＣｔ法を用いて各ウェルにおける相対的なＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルを決定するために使用された。すべてのデータは、未処理のＨｅｐＧ２細胞における相対的なＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルに対して正規化する。曲線適合は、ＧｒａｐｈＰａｄ Ｐｒｉｓｍ ソフトウェアの［ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ（阻害剤）］ｖｓ．ｒｅｓｐｏｎｓｅ（反応）（３つのパラメータ（ｔｈｒｅｅ ｐａｒａｍｅｔｅｒｓ））関数を用いて達成される。
実施例５：Ｈｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞株におけるＭＳＴ１のｓｉＲＮＡ媒介性ノックダウン
ＭＳＴ１ ｍＲＮＡを標的とするｓｉＲＮＡは、培養ヒト肝細胞株Ｈｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞（ＡＴＣＣ（登録商標）ＨＢ－８０６４（商標））に投与する場合、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰのレベルを下方制御し、結果的にＭＳＰ分泌を減少させることができる。したがって、これらの結果は、インビボでＭＳＴ１ ｍＲＮＡを標的とするｓｉＲＮＡがさらに、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰのレベルを下方制御し、血流へのＭＳＰ分泌を減少させることを実証する。循環ＭＳＰレベルの付随する減少は、特に肺障害を有する対象において、肺状態を改善し得る。
０日目に、Ｈｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞を、１ウェルあたり０．５ｍＬでＦａｌｃｏｎ ２４ウェル組織培養プレート（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号３５３０４７）に１５０，０００細胞／ｍＬで播種する。
１日目に、ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡおよび陰性対照ｓｉＲＮＡマスターミックスを調製する。ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡマスターミックスは、３５０μＬのＯｐｔｉ－ＭＥＭ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ カタログ番号４４２７０３７－ｓ１２８８ ロット番号ＡＳ０２Ｂ０２Ｄ）および３．５μＬの２つのＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡの混合物（１０μＭストック）を含有する。陰性対照ｓｉＲＮＡマスターミックスは、３５０μＬのＯｐｔｉ－ＭＥＭおよび３．５μＬの陰性対照ｓｉＲＮＡ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号４３９０８４３、１０μＭストック）を含有する。次に、３μＬのＴｒａｎｓＩＴ－Ｘ２（Ｍｉｒｕｓカタログ番号ＭＩＲ－６０００）を各マスターミックスに加える。ミックスを１５分間インキュベートしてトランスフェクション複合体を形成させ、その後、５１μＬの適切なマスターミックス＋ＴｒａｎｓＩＴ－Ｘ２を、１０ｎＭの最終ｓｉＲＮＡ濃度でＨＥＰＧ２細胞の２連のウェルに加える。
３日目に、トランスフェクションの４８時間後、培地を回収し、プロテアーゼおよびホスファターゼ阻害剤を含有するタンパク質溶解緩衝液と混合し、製造業者のプロトコル（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号４３９９００２）に従ってＣｅｌｌｓ－ｔｏ－Ｃｔキットを使用して細胞を溶解する。Ｃｅｌｌｓ－ｔｏ－Ｃｔについては、細胞を、冷たい１×ＰＢＳを用いて５０μＬで洗浄し、１ウェルあたり４９．５μＬの溶解溶液および０．５μＬのＤＮａｓｅ Ｉを添加し、５回上下にピペッティングし、室温で５分間インキュベートすることによって溶解する。停止溶液（５μＬ／ウェル）を各ウェルに添加し、５回上下にピペッティングし、室温で２分間インキュベートすることによって混合する。製造業者のプロトコルに従って２２．５μＬの溶解物を用いて逆転写酵素反応を行う。ＴａｑＭａｎ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ａｓｓａｙｓ（ＢｉｏＲａｄ ＣＦＸ９６カタログ番号１８５５１９５を用いるＡｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ ＦＡＭ／ＭＳＴ１）を用いてリアルタイムｑＰＣＲを３連で実施するまで、試料を－８０℃で保存する。タンパク質定量化のために、等量（３０～５０μｇ）のタンパク質を１０％ＳＤＳポリアクリルアミドゲルによって分離し、ポリフッ化ビニリデン膜に移す。膜を５％脱脂乳でブロッキングし、製造業者によって指定された希釈で適切な一次抗体と一晩インキュベートする。次に、膜をＴＢＳＴで３回洗浄し、対応する西洋ワサビペルオキシダーゼコンジュゲート二次抗体と１：５０００希釈で１時間インキュベートする。結合した二次抗体を、増強化学発光系を用いて検出する。一次免疫ブロッティング抗体は、抗ＭＳＰ抗体（Ａｂｃａｍ、英国ケンブリッジ）である。
Ｈｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞におけるｍＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰ発現の減少が、トランスフェクションの４８時間後に非特異的対照ｓｉＲＮＡでトランスフェクトしたＨＥＰＧ２細胞におけるＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰのレベルと比較して、ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡによるトランスフェクション後に予想される。トランスフェクションの４８時間後に、非特異的対照ｓｉＲＮＡでトランスフェクトしたＨｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞の培地中のＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰの量と比較して、ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡでトランスフェクトしたＨｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞の培地中のＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰの量を定量化することによって測定される、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよび分泌されたＭＳＰの量の減少が予想される。これらの結果は、ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡがＨｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞においてＭＳＴ１ ｍＲＮＡのノックダウンを誘発すること、ならびにｍＭＳＴ１発現の減少がＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰ分泌の減少に対応し得ることを示すと予想される。
実施例６：Ｈｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞株におけるＭＳＴ１のＡｓｏ媒介性ノックダウン
ＭＳＴ１ ｍＲＮＡを標的とするＡｓｏは、培養ヒト肝細胞株Ｈｅｐ ３Ｂ２．１－７に投与する場合、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰのレベルを下方制御し、結果的にＭＳＰ分泌を減少させることができる。したがって、これらの結果は、インビボでＭＳＴ１ ｍＲＮＡを標的とするｓｉＲＮＡがさらに、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰのレベルを下方制御し、血流へのＭＳＰ分泌を減少させることを実証する。循環ＭＳＰレベルの付随する減少は、特に肺障害を有する対象において、肺状態を改善し得る。
０日目に、Ｈｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞を、１ウェルあたり０．５ｍＬでＦａｌｃｏｎ ２４ウェル組織培養プレート（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号３５３０４７）に１５０，０００細胞／ｍＬで播種する。
１日目に、ＭＳＴ１ ＡＳＯおよび陰性対照ＡＳＯマスターミックスを調製する。ＭＳＴ１ ＡＳＯマスターミックスは、３５０μＬのＯｐｔｉ－ＭＥＭ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ カタログ番号４４２７０３７－ｓ１２８８ ロット番号ＡＳ０２Ｂ０２Ｄ）および３．５μＬの２つのＭＳＴ１ＡＳＯの混合物（１０μＭストック）を含有する。陰性対照ＡＳＯマスターミックスは、３５０μＬのＯｐｔｉ－ＭＥＭおよび３．５μＬの陰性対照ＡＳＯ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号４３９０８４３、１０μＭストック）を含有する。次に、３μＬのＴｒａｎｓＩＴ－Ｘ２（Ｍｉｒｕｓカタログ番号ＭＩＲ－６０００）を各マスターミックスに加える。ミックスを１５分間インキュベートしてトランスフェクション複合体を形成させ、その後、５１μＬの適切なマスターミックス＋ＴｒａｎｓＩＴ－Ｘ２を、１０ｎＭの最終ＡＳＯ濃度でＨＥＰＧ２細胞の２連のウェルに加える。
３日目に、トランスフェクションの４８時間後、培地を回収し、プロテアーゼおよびホスファターゼ阻害剤を含有するタンパク質溶解緩衝液と混合し、製造業者のプロトコル（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号４３９９００２）に従ってＣｅｌｌｓ－ｔｏ－Ｃｔキットを使用して細胞を溶解する。Ｃｅｌｌｓ－ｔｏ－Ｃｔについては、細胞を、冷たい１×ＰＢＳを用いて５０μＬで洗浄し、１ウェルあたり４９．５μＬの溶解溶液および０．５μＬのＤＮａｓｅ Ｉを添加し、５回上下にピペッティングし、室温で５分間インキュベートすることによって溶解する。停止溶液（５μＬ／ウェル）を各ウェルに添加し、５回上下にピペッティングし、室温で２分間インキュベートすることによって混合する。製造業者のプロトコルに従って２２．５μＬの溶解物を用いて逆転写酵素反応を行う。ＴａｑＭａｎ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ａｓｓａｙｓ（ＢｉｏＲａｄ ＣＦＸ９６カタログ番号１８５５１９５を用いるＡｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ ＦＡＭ／ＭＳＴ１）を用いてリアルタイムｑＰＣＲを３連で実施するまで、試料を－８０℃で保存する。タンパク質定量化のために、等量（３０～５０μｇ）のタンパク質を１０％ＳＤＳポリアクリルアミドゲルによって分離し、ポリフッ化ビニリデン膜に移す。膜を５％脱脂乳でブロッキングし、製造業者によって指定された希釈で適切な一次抗体と一晩インキュベートする。次に、膜をＴＢＳＴで３回洗浄し、対応する西洋ワサビペルオキシダーゼコンジュゲート二次抗体と１：５０００希釈で１時間インキュベートする。結合した二次抗体を、増強化学発光系を用いて検出する。一次免疫ブロッティング抗体は、抗ＭＳＰ抗体（Ａｂｃａｍ、英国ケンブリッジ）である。
Ｈｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞におけるｍＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰ発現の減少が、トランスフェクションの４８時間後に非特異的対照ＡＳＯでトランスフェクトしたＨｅｐ３Ｂ２．１－７細胞におけるＭＳＴ１ ｍＲＮＡレベルと比較して、ＭＳＴ１ ＡＳＯによるトランスフェクション後に予想される。トランスフェクションの４８時間後に、非特異的対照ＡＳＯでトランスフェクトしたＨｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞の培地中のＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰの量と比較して、ＭＳＴ１ ＡＳＯでトランスフェクトしたＨｅｐ ３Ｂ２．１－７細胞の培地中のＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰの量を定量化することによって測定される、ＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよび分泌されたＭＳＰの量の減少が予想される。これらの結果は、ＭＳＴ１ ＡＳＯがＨＥＰＧ２細胞においてＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰのノックダウンを誘発すること、ならびにｍＭＳＴ１発現の減少がＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰ分泌の減少に対応し得ることを示すと予想される。
実施例７：ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡまたはＡＳＯを用いた急性タバコ煙曝露による肺炎症のマウスモデルにおけるＭＳＴ１の阻害
この実験では、急性タバコ煙曝露によって誘発される肺炎症のマウスモデルを使用して、ＭＳＴ１のｓｉＲＮＡまたはＡＳＯ阻害の効果を評価する。このタバコ煙誘発モデルでは、マウスをタバコ煙に３時間曝露し、その結果、一過性炎症反応が生じる。肺炎症を、気管支肺胞洗浄液および肺組織中の好中球およびマクロファージを測定することによって評価する。
簡潔に述べると、マウスを６つの群：群１－非標的化対照ｓｉＲＮＡおよびタバコ煙吸入で処置された群、群２－非標的化対照ＡＳＯおよびタバコ煙吸入で処置された群、群３－ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡ１およびタバコ煙吸入で処置された群、群４－ＭＳＴ１ ＡＳＯ１およびタバコ煙吸入で処置された群、群５－ビヒクルおよびタバコ煙吸入で処置された群、群６－ビヒクルで処置され、タバコ煙の刺激を受けていない群に分ける。各群は８匹のマウス（４匹のオス、４匹のメス）を含む。
ｓｉＲＮＡまたはＡＳＯの投与は、１０μＭの濃度でＰＢＳ中に再懸濁されたｓｉＲＮＡまたはＡＳＯの２００μＬの皮下注射によって達成される。時間０において、群１のマウスに非標的化対照ｓｉＲＮＡを皮下注射し、群２のマウスに非標的化対照ＡＳＯを皮下注射し、群３のマウスにマウスＭＳＴ１を標的とするｓｉＲＮＡ１を皮下注射し、群４のマウスにマウスＭＳＴ１を標的とするＡＳＯ１を皮下注射し、群５および６のマウスにビヒクルを皮下注射する。
煙吸入処置の２４時間後、気管支肺胞洗浄液を採取し、マウスを０．３ｍｌのネンブタール（５ｍｇ／ｍｌ）（Ｓｉｇｍａカタログ番号１５０７００２）の腹腔内注射後の頸部脱臼によって屠殺する。最終血液試料を採取し、肝臓および肺を除去して、切片をＲＮＡｌａｔｅｒに入れてｍＲＮＡを単離させる。
製造業者のプロトコル（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号１２１８３０２０）に従ってＰｕｒｅＬｉｎｋキットを使用して、ＲＮＡｌａｔｅｒ溶液中に入れた組織からｍＲＮＡを単離する。逆転写酵素反応を製造業者のプロトコルに従って実施する。ＴａｑＭａｎ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ａｓｓａｙｓ（ＢｉｏＲａｄ ＣＦＸ９６カタログ番号１８５５１９５を用いるＡｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ ＦＡＭ／ＭＳＴ１）を用いてリアルタイムｑＰＣＲを３連で実施するまで、試料を－８０℃で保存する。ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡ１またはＡＳＯ１を投与したマウス由来の肝臓組織中のＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰ発現、ならびに血液中の循環ＭＳＰの減少が、非特異的対照を投与したマウス由来の肝臓組織中のＭＳＴ１ ｍＲＮＡまたはＭＳＰ発現、および血液中の循環ＭＳＰと比較して予想される。ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡまたはＡＳＯを投与されたタバコ煙曝露マウスの気管支肺胞洗浄液中の好中球およびマクロファージの数は、非特異的対照を投与されたタバコ煙曝露マウスの気管支肺胞洗浄液中の好中球およびマクロファージの数と比較して、減少することが予想される。これらの結果は、ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡまたはＡＳＯが肝臓組織においてＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰのノックダウンを誘発し、循環ＭＳＰを減少させること、ならびにＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰ発現の減少が、タバコ煙に曝露されたマウスにおける気管支肺胞洗浄液中の好中球およびマクロファージの数の減少に対応し得ることを示すと予想される。
実施例８：ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡまたはＡＳＯを用いたＣＯＰＤのマウスモデルにおけるＭＳＴ１の阻害
この実験では、タバコ煙誘発ＣＯＰＤのマウスモデルを使用して、ＭＳＴ１のｓｉＲＮＡまたはＡＳＯ阻害の効果を評価する。タバコ煙誘発ＣＯＰＤモデルでは、マウスを６ヶ月間タバコ煙に曝露して、タバコ喫煙の実質的な病歴を有する患者を模倣させる。肺炎症を、気管支肺胞洗浄液および肺組織中の好中球およびマクロファージを測定することによって評価する。肺機能はさらに、一回呼吸量、耐性、および動的コンプライアンスを測定することによって評価される。加えて、肺の形態および気腔の拡大は、肺を固定および染色し、気腔、中隔壁厚、および平均線形切片などの構造パラメータを測定することによって評価される。
簡潔に述べると、マウスを６つの群：群１－非標的化対照ｓｉＲＮＡおよびタバコ煙吸入で処置された群、群２－非標的化対照ＡＳＯおよびタバコ煙吸入で処置された群、群３－ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡ１およびタバコ煙吸入で処置された群、群４－ＭＳＴ１ ＡＳＯ１およびタバコ煙吸入で処置された群、群５－ビヒクルおよびタバコ煙吸入で処置された群、群６－ビヒクルで処置され、タバコ煙の刺激を受けていない群に分ける。各群は８匹のマウス（４匹のオス、４匹のメス）を含む。
ｓｉＲＮＡまたはＡＳＯの投与は、１０μＭの濃度でＰＢＳ中に再懸濁されたｓｉＲＮＡまたはＡＳＯの２００μＬの皮下注射によって達成される。試験０日目に、群１のマウスに非標的化対照ｓｉＲＮＡを皮下注射し、群２のマウスに非標的化対照ＡＳＯを皮下注射し、群３のマウスにマウスＭＳＴ１を標的とするｓｉＲＮＡ１を皮下注射し、群４のマウスにマウスＭＳＴ１を標的とするＡＳＯ１を皮下注射し、群５および６のマウスにビヒクルを皮下注射する。最初の注射後１４日毎に、各群の動物に合計１２回の注射を投与する。
最後の煙吸入処置の２４時間後、気管支肺胞洗浄液を採取し、マウスを０．３ｍｌのネンブタール（５ｍｇ／ｍｌ）（Ｓｉｇｍａカタログ番号１５０７００２）の腹腔内注射後の頸部脱臼によって屠殺する。最終血液試料を採取し、肝臓および肺を除去して、切片をＲＮＡｌａｔｅｒに入れてｍＲＮＡを単離させるか、パラホルムアルデヒドで固定し、その後、組織の切開のためにパラフィンに包埋する。
製造業者のプロトコル（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号１２１８３０２０）に従ってＰｕｒｅＬｉｎｋキットを使用して、ＲＮＡｌａｔｅｒ溶液中に入れた組織からｍＲＮＡを単離する。逆転写酵素反応を製造業者のプロトコルに従って実施する。ＴａｑＭａｎ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ａｓｓａｙｓ（ＢｉｏＲａｄ ＣＦＸ９６カタログ番号１８５５１９５を用いるＡｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ ＦＡＭ／ＭＳＴ１）を用いてリアルタイムｑＰＣＲを３連で実施するまで、試料を－８０℃で保存する。ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡ１またはＡＳＯ１を投与したマウス由来の肝臓組織中のＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰ発現、ならびに血液中の循環ＭＳＰの減少が、非特異的対照を投与したマウス由来の肝臓組織中のＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰ発現、ならびに血液中の循環ＭＳＰと比較して予想される。ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡまたはＡＳＯを投与されたタバコ煙曝露マウスの気管支肺胞洗浄液中の好中球およびマクロファージの数は、非特異的対照を投与されたタバコ煙曝露マウスの気管支肺胞洗浄液中の好中球およびマクロファージの数と比較して、減少することが予想される。ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡまたはＡＳＯを投与されたタバコ煙曝露マウスでは、非特異的対照を投与されたタバコ煙曝露マウスの気腔、平均直線切片、および中隔壁厚と比較して、気腔および平均直線切片の減少と中隔壁厚の増加も予想される。さらに、ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡまたはＡＳＯを投与されたタバコ煙曝露マウスでは、非特異的対照を投与されたタバコ煙曝露マウスのコンプライアンス、１回呼吸量、および抵抗性と比較して、コンプライアンスおよび１回呼吸量の減少と抵抗性の増加も予想される。これらの結果は、ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡまたはＡＳＯが肝臓組織においてＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰのノックダウンを誘発し、循環ＭＳＰを減少させ得ること、ならびにＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰ発現の減少が、タバコ煙に曝露されたマウスにおける気管支肺胞洗浄液中の好中球およびマクロファージの数の減少と肺機能の増加および病理の減少に対応し得ることを示す。
実施例９：ＡＡＶ８－ＴＢＧ－ｈ－ＭＳＴ１をトランスフェクトしたマウスにおけるヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡを標的とするｓｉＲＮＡのスクリーニング
ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡを標的とするいくつかのｓｉＲＮＡを、アデノ随伴ウイルスベクターによるトランスフェクション後にマウスにおける活性について試験した。ｓｉＲＮＡをＧａｌＮＡｃリガンドＥＴＬ１に結合させ、その後、センス鎖の５’末端でホスホロチオエート結合させた。本実施例で使用したｓｉＲＮＡを表２４Ａに含める。
６～８週齢の雌マウス（Ｃ５７Ｂｌ／６）に、１０μＬの組換えアデノ随伴ウイルス８（ＡＡＶ８）ベクター（１．５×１０Ｅ１３ゲノムコピー／ｍＬ）を後眼窩経路によって注射した。組換えＡＡＶ８は、ＡＡＶ８カプシド（ＡＡＶ８－ＴＢＧ－ｈ－ＭＳＴ１）中にパッケージングされたＡＡＶ２骨格中のヒトチロキシン結合グロブリンプロモーターの制御下にあるヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡ配列（ＮＭ＿０２０９９８．４）のオープンリーディングフレームおよび３’ＵＴＲの大部分を含有していた。感染後１４日目に、血清を採取し、各マウスにおけるヒトＭＳＰタンパク質のレベルを、ＰＢＳ中１：２５の血清試料希釈液を使用して、Ｂｏｓｔｅｒ Ｂｉｏ（カタログ番号ＥＫ０８１４）のＨｕｍａｎ ＭＳＰ／ＭＳＴ１／Ｍａｃｒｏｐｈａｇｅ Ｓｔｉｍｕｌａｔｉｎｇ Ｐｒｏｔｅｉｎ ＥＬＩＳＡ Ｋｉｔ ＰｉｃｏＫｉｎｅ（商標）を製造業者の説明書に従って使用して測定した。キットに含まれる組換えＭＳＰを使用して、１０，０００ｐｇ／ｍＬ～０ｐｇ／ｍＬのＭＳＰの標準曲線を作成した。プレートの光学密度を、ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ Ｅｎｖｉｓｉｏｎマルチモードプレートリーダーを用いて４５０ｎｍで読み取った。各マウス血清試料中のＭＳＰの濃度を、最小二乗適合（Ｐｒｉｓｍバージョン９、Ｓｏｆｔｗａｒｅ ＭａｃＫｉｅｖ）を用いた補間によって標準曲線から計算した。
マウスを群（ｎ＝３）に割り当てて、群がヒトＭＳＰの類似の血清レベルを有するようにし、次いで、ビヒクル対照として単回１００ｕｇ用量のＧａｌＮＡｃコンジュゲートｓｉＲＮＡまたはＰＢＳの皮下注射を与えた。注射後０日目、４日目、および１３日目に、血清を採取して、上記の方法を用いてＥＬＩＳＡにより血清ＭＳＰ濃度を評価した。各時点におけるＭＳＰ血清濃度を、個々のマウスそれぞれについての０日目の試料におけるＭＳＰのレベルに対して作製した。結果を表１２に示す。ＥＴＤ０１７２３を注射したマウスは、試験したｓｉＲＮＡの血清ＭＳＰが最大に減少し、１３日目は０日目と比較して４日目よりも低いレベルであった。ＥＴＤ０１７２８、ＥＴＤ０１７２５、およびＥＴＤ０１７２９を注射したマウスはさらに、血清ＭＳＰの実質的な減少を示した。ＥＴＤ０１７２４は、ＡＡＶ８－ＴＢＧ－ｈ－ＭＳＴ１構築物中にその標的配列を有さず、したがって、この研究において陰性対照ｓｉＲＮＡとして機能したことに留意されたい。
１３日目にマウスを屠殺し、それぞれから肝臓試料を回収し、処理するまでＲＮＡｌａｔｅｒ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号ＡＭ７０２０）に入れた。５０００ｒｐｍに設定したＰｅｒｃｅｌｌｙｓ ２４組織ホモジナイザー（Ｂｅｒｔｉｎ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）を用いて、１０秒サイクルを２回、ホモジナイゼーションバッファー（Ｍａｘｗｅｌｌ ＲＳＣ ｓｉｍｐｌｙＲＮＡ Ｔｉｓｓｕｅ Ｋｉｔ）中で肝臓組織をホモジナイズすることによって、全肝ＲＮＡを調製した。ライセートからの総ＲＮＡは、製造者の推奨に従って、Ｍａｘｗｅｌｌ ＲＳＣ ４８プラットフォーム（Ｐｒｏｍｅｇａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ）で精製した。製造業者の説明書に従ってＱｕａｎｔａ ｑＳｃｒｉｐｔ ｃＤＮＡ ＳｕｐｅｒＭｉｘ（ＶＷＲ、カタログ番号９５０４８－５００）を使用してｃＤＮＡの調製を行った。肝臓ＭＳＴ１ ｍＲＮＡの相対レベルを、ヒトＭＳＴ１（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｈｓ００３６０６８４＿ｍ１）およびマウスハウスキーピング遺伝子ＰＰＩＡ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｍｍ０２３４２４３０＿ｇ１）についてのＴａｑＭａｎアッセイ、ならびにＰｅｒｆｅＣＴａ（登録商標）ｑＰＣＲ ＦａｓｔＭｉｘ（登録商標）、Ｌｏｗ ＲＯＸ（商標）（ＶＷＲ、カタログ番号１０１４１９－２２２）を使用して、ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ（商標）６Ｐｒｏ Ｒｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ上で３連でＲＴ－ｑＰＣＲによって評価した。データは、ＰＢＳを投与した動物のレベルに正規化した。結果を表１３に示す。ＥＴＤ０１７２３、ＥＴＤ０１７２８、ＥＴＤ０１７２５、ＥＴＤ０１７２９、およびＥＴＤ０１７３１を注射したマウスは、ＰＢＳを投与されたマウスと比較して、１３日目に平均肝臓ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡのレベルが実質的に低かった。
実施例１０：ＡＶ８－ＴＢＧ－ｈ－ＭＳＴ１をトランスフェクトしたマウスにおけるヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡを標的とする追加のｓｉＲＮＡのスクリーニング、ならびにＥＴＤ０１７２３、ＥＴＤ０１７２５、ＥＴＤ０１７２８、およびＥＴＤ０１７２９の活性の確認
ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡを標的とする追加のｓｉＲＮＡ（ＥＴＤ０１７９５、ＥＴＤ０１７９８、ＥＴＤ０１７９９、ＥＴＤ０１８００）を、アデノ随伴ウイルスベクターによるトランスフェクション後のマウスにおいて活性について試験した。ｓｉＲＮＡをＧａｌＮＡｃリガンドＥＴＬ１７に結合させ、その後、センス鎖の５’末端でホスホロチオエート結合させた。上記実施例からのＥＴＤ０１７２３、ＥＴＤ０１７２５、ＥＴＤ０１７２８、およびＥＴＤ０１７２９の活性の確認も行った。本実施例で使用したｓｉＲＮＡを表２４Ａに含める。
６～８週齢の雌マウス（Ｃ５７Ｂｌ／６）に、１０μＬの組換えアデノ随伴ウイルス８（ＡＡＶ８）ベクター（１．５×１０Ｅ１３ゲノムコピー／ｍＬ）を後眼窩経路によって注射した。組換えＡＡＶ８は、ＡＡＶ８カプシド（ＡＡＶ８－ＴＢＧ－ｈ－ＭＳＴ１）中にパッケージングされたＡＡＶ２骨格中のヒトチロキシン結合グロブリンプロモーターの制御下にあるヒトＭＳＴ１ 配列（ＮＭ＿０２０９９８．４）のオープンリーディングフレームおよび３’ＵＴＲの大部分を含有していた。感染後１４日目に、血清を採取し、各マウスにおけるヒトＭＳＰのレベルを、Ｒ＆ＤからのヒトＭＳＰ／ＭＳＴ１ ＤｕｏＳｅｔ ＥＬＩＳＡ（カタログ番号ＤＹ３５２）を使用して測定した。緩衝液および溶液のすべての試薬調製に関する製造業者の説明書に従った。１：２５０の血清試料希釈液をすべての試験試料に利用した。キットに含まれる組換えＭＳＰを使用して、１０，０００ｐｇ／ｍＬ～０ｐｇ／ｍＬの標準曲線を作成した。プレートの光学密度を、ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ Ｅｎｖｉｓｉｏｎマルチモードプレートリーダーを用いて４５０ｎｍで読み取った。各マウス血清試料中のＭＳＰの濃度を、最小二乗適合（Ｐｒｉｓｍバージョン９、Ｓｏｆｔｗａｒｅ ＭａｃＫｉｅｖ）を用いた補間によって標準曲線から計算した。
マウスを群（ｎ＝３）に割り当てて、群がヒトＭＳＰの類似の血清レベルを有するようにし、次いで、ビヒクル対照として単回１００ｕｇ用量のＧａｌＮＡｃコンジュゲートｓｉＲＮＡまたはＰＢＳの皮下注射を与えた。注射後０日目、４日目、および１０日目に、血清を採取して、上記の方法を用いてＥＬＩＳＡにより血清ＭＳＰ濃度を評価した。各時点におけるＭＳＰ血清濃度を、個々のマウスそれぞれについての０日目の試料におけるＭＳＰのレベルに対して作製した。結果を表１４に示す。ＥＴＤ１７９９またはＥＴＤ０１８００を注射したマウスは、試験した追加のｓｉＲＮＡの血清ＭＳＰが最大に減少し、１０日目は０日目と比較して４日目よりも低いレベルであった。ＥＴＤ０１７２３、ＥＴＤ０１７２５、ＥＴＤ０１７２８、およびＥＴＤ０１７２９の活性は、ＥＴＤ０１７２３およびＥＴＤ０１７２８によるマウスの処置によって確認され、血清ＭＳＰの最大の減少をもたらした。ＭＳＴ１ ｍＲＮＡを標的とする追加のｓｉＲＮＡ（ＥＴＤ０１７９５、ＥＴＤ０１７９８、ＥＴＤ０１７９９、ＥＴＤ０１８００）のうち、ＥＴＤ０１７９９およびＥＴＤ０１８００は、血清ＭＳＰの最大の減少を与えた。ＥＴＤ０１７２３上のＥＴＬ１リガンドを同じ配列（ＥＴＤ０１８２３）上のＥＴＬ１７リガンドと置き換えることで、ＭＳＰのより大きな減少がもたらされた。
１０日目にマウスを屠殺し、それぞれから肝臓試料を回収し、処理するまでＲＮＡｌａｔｅｒ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号ＡＭ７０２０）に入れた。５０００ｒｐｍに設定したＰｅｒｃｅｌｌｙｓ ２４組織ホモジナイザー（Ｂｅｒｔｉｎ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）を用いて、１０秒サイクルを２回、ホモジナイゼーションバッファー（Ｍａｘｗｅｌｌ ＲＳＣ ｓｉｍｐｌｙＲＮＡ Ｔｉｓｓｕｅ Ｋｉｔ）中で肝臓組織をホモジナイズすることによって、全肝ＲＮＡを調製した。ライセートからの総ＲＮＡは、製造者の推奨に従って、Ｍａｘｗｅｌｌ ＲＳＣ ４８プラットフォーム（Ｐｒｏｍｅｇａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ）で精製した。製造業者の説明書に従ってＱｕａｎｔａ ｑＳｃｒｉｐｔ ｃＤＮＡ ＳｕｐｅｒＭｉｘ（ＶＷＲ、カタログ番号９５０４８－５００）を使用してｃＤＮＡの調製を行った。肝臓ＭＳＴ１ ｍＲＮＡの相対レベルを、ヒトＭＳＴ１（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｈｓ００３６０６８４＿ｍ１）およびマウスハウスキーピング遺伝子ＰＰＩＡ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｍｍ０２３４２４３０＿ｇ１）についてのＴａｑＭａｎアッセイ、ならびにＰｅｒｆｅＣＴａ（登録商標）ｑＰＣＲ ＦａｓｔＭｉｘ（登録商標）、Ｌｏｗ ＲＯＸ（商標）（ＶＷＲ、カタログ番号１０１４１９－２２２）を使用して、ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ（商標）６Ｐｒｏ Ｒｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ上で３連でＲＴ－ｑＰＣＲによって評価した。データは、ＰＢＳを投与した動物のレベルに正規化した。結果を表１５に示す。ＭＳＴ１を標的とするｓｉＲＮＡを投与されたマウスは、ＰＢＳを投与されたマウスと比較して、１０日目の平均肝臓ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡが実質的により低いレベルであった。ＥＴＤ０１７２３、ＥＴＤ０１７２５、ＥＴＤ０１７２８、およびＥＴＤ０１７２９の活性は、ＥＴＤ０１７２３およびＥＴＤ０１７２８によるマウスの処置によって確認され、肝臓ＭＳＴ１ ｍＲＮＡの最大の減少をもたらした。ＭＳＴ１ ｍＲＮＡを標的とする追加のｓｉＲＮＡ（ＥＴＤ０１７９５、ＥＴＤ０１７９８、ＥＴＤ０１７９９、ＥＴＤ０１８００）のうち、ＥＴＤ０１７９９およびＥＴＤ０１８００は、肝臓ＭＳＴ１ ｍＲＮＡの最大の減少をもたらした。
実施例１１：ＡＡＶ８－ＴＢＧ－ｈ－ＭＳＴ１をトランスフェクトしたマウスにおけるヒトＭＳＴ１を標的とする追加のｓｉＲＮＡのスクリーニング、ならびにＥＴＤ０１７２３およびＥＴＤ０１７２８の代替修飾パターンを含むｓｉＲＮＡの活性の試験。
ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡを標的とする追加のｓｉＲＮＡ（ＥＴＤ０１７８９およびＥＴＤ０１７９４）を、アデノ随伴ウイルスベクターによるトランスフェクション後のマウスにおける活性について試験した。ｓｉＲＮＡをＧａｌＮＡｃリガンドＥＴＬ１に結合させ、その後、センス鎖の５’末端でホスホロチオエート結合させた。ＥＴＤ０１７２３（ＥＴＤ０１８２７～ＥＴＤ０１８３１）およびＥＴＤ０１７２８（ＥＴＤ０１８３２～ＥＴＤ０１８３７）の代替手段修飾パターンを含むｓｉＲＮＡの活性も評価された。ｓｉＲＮＡをＧａｌＮＡｃリガンドＥＴＬ１７に結合させ、その後、センス鎖の５’末端でホスホロチオエート結合させた。ＥＴＤ０１８２７～ＥＴＤ０１８３１の活性を、ＥＴＤ０１７２３と同一の配列および修飾パターンを有するがＥＴＬ１７に結合したＥＴＤ０１８２３と比較した。ＥＴＤ０１８３２～ＥＴＤ０１８３７の活性を、ＥＴＤ０１７２８と同一の配列および修飾パターンを有するがＥＴＬ１７に結合したＥＴＤ０１８２１と比較した。本実施例で使用したｓｉＲＮＡを表２４Ａに含める。
６～８週齢の雌マウス（Ｃ５７Ｂｌ／６）に、１０μＬの組換えアデノ随伴ウイルス８（ＡＡＶ８）ベクター（２．４×１０Ｅ１３ゲノムコピー／ｍＬ）を後眼窩経路によって注射した。組換えＡＡＶ８は、ＡＡＶ８カプシド（ＡＡＶ８－ＴＢＧ－ｈ－ＭＳＴ１）中にパッケージングされたＡＡＶ２骨格中のヒトチロキシン結合グロブリンプロモーターの制御下にあるヒトＭＳＴ１ 配列（ＮＭ＿０２０９９８．４）のオープンリーディングフレームおよび３’ＵＴＲの大部分を含有していた。感染後１３日目に、血清を採取し、各マウスにおけるヒトＭＳＰのレベルを、Ｒ＆ＤからのヒトＭＳＰ／ＭＳＴ１ ＤｕｏＳｅｔ ＥＬＩＳＡ（カタログ番号ＤＹ３５２）を使用して測定した。緩衝液および溶液のすべての試薬調製に関する製造業者の説明書に従った。１：２５０の血清試料希釈液をすべての試験試料に利用した。キットに含まれる組換えＭＳＰを使用して、１０，０００ｐｇ／ｍＬ～０ｐｇ／ｍＬの標準曲線を作成した。プレートの光学密度を、ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ Ｅｎｖｉｓｉｏｎマルチモードプレートリーダーを用いて４５０ｎｍで読み取った。各マウス血清試料中のＭＳＰの濃度を、最小二乗適合（Ｐｒｉｓｍバージョン９、Ｓｏｆｔｗａｒｅ ＭａｃＫｉｅｖ）を用いた補間によって標準曲線から計算した。
マウスを群（ｎ＝３）に割り当てて、群がヒトＭＳＰの類似の血清レベルを有するようにし、次いで、ビヒクル対照として単回６０ｕｇ用量のＧａｌＮＡｃコンジュゲートｓｉＲＮＡまたはＰＢＳの皮下注射を与えた。注射後０日目および１１日目に、血清を採取して、上記の方法を用いてＥＬＩＳＡにより血清ＭＳＰ濃度を評価した。各時点におけるＭＳＰ血清濃度を、個々のマウスそれぞれについての０日目の試料におけるＭＳＰタンパク質レベルに対して作製した。結果を表１６に示す。ＥＴＤ０１７８９またはＥＴＤ０１７９４を注入されたマウスは、１１日目にＥＴＤ０１８２３またはＥＴＤ０１８２１ほどの血清ＭＳＰの大きな減少はなかった。ＥＴＤ０１７２３およびＥＴＤ０１８２３の代替修飾パターンを有するｓｉＲＮＡ、すなわち、ＥＴＤ０１８２４～ＥＴＤ０１８３１の活性は、ＥＴＤ０１８２３に匹敵し、ＥＴＤ０１８２８およびＥＴＤ０１８３１は、１１日目に最大レベルの血清ＭＳＰ減少を示した。ＥＴＤ０１７２８およびＥＴＤ０１８２１の代替修飾パターンを有するｓｉＲＮＡ、すなわち、ＥＴＤ０１８３２～ＥＴＤ０１８３７の活性は、ＥＴＤ０１８２３に匹敵し、ＥＴＤ０１８３４、ＥＴＤ０１８３５、およびＥＴＤ０１８３６は、１１日目に最大レベルの血清ＭＳＰ減少を示した。
１１日目にマウスを屠殺し、それぞれから肝臓試料を回収し、処理するまでＲＮＡｌａｔｅｒ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号ＡＭ７０２０）に入れた。５０００ｒｐｍに設定したＰｅｒｃｅｌｌｙｓ ２４組織ホモジナイザー（Ｂｅｒｔｉｎ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）を用いて、１０秒サイクルを２回、ホモジナイゼーションバッファー（Ｍａｘｗｅｌｌ ＲＳＣ ｓｉｍｐｌｙＲＮＡ Ｔｉｓｓｕｅ Ｋｉｔ）中で肝臓組織をホモジナイズすることによって、全肝ＲＮＡを調製した。ライセートからの総ＲＮＡは、製造者の推奨に従って、Ｍａｘｗｅｌｌ ＲＳＣ ４８プラットフォーム（Ｐｒｏｍｅｇａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ）で精製した。製造業者の説明書に従ってＱｕａｎｔａ ｑＳｃｒｉｐｔ ｃＤＮＡ ＳｕｐｅｒＭｉｘ（ＶＷＲ、カタログ番号９５０４８－５００）を使用してｃＤＮＡの調製を行った。肝臓ＭＳＴ１ ｍＲＮＡの相対レベルを、ヒトＭＳＴ１（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｈｓ００３６０６８４＿ｍ１）およびマウスハウスキーピング遺伝子ＰＰＩＡ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｍｍ０２３４２４３０＿ｇ１）についてのＴａｑＭａｎアッセイ、ならびにＰｅｒｆｅＣＴａ（登録商標）ｑＰＣＲ ＦａｓｔＭｉｘ（登録商標）、Ｌｏｗ ＲＯＸ（商標）（ＶＷＲ、カタログ番号１０１４１９－２２２）を使用して、ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ（商標）６Ｐｒｏ Ｒｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ上で３連でＲＴ－ｑＰＣＲによって評価した。データは、ＰＢＳを投与した動物のレベルに正規化した。結果を表１７に示す。ＥＴＤ０１７８９またはＥＴＤ０１７９４を注入されたマウスは、１１日目にＥＴＤ０１８２３またはＥＴＤ０１８２１ほどの肝臓ＭＳＴ１ ｍＲＮＡの大きな減少はなかった。ＥＴＤ０１７２３およびＥＴＤ０１８２３の代替修飾パターンを有するｓｉＲＮＡ、すなわち、ＥＴＤ０１８２４～ＥＴＤ０１８３１を投与されたマウスのｍＲＮＡ減少活性は、ＰＢＳを投与されたマウスと比較して、ＥＴＤ０１８２３に匹敵した。ＥＴＤ０１７２８およびＥＴＤ０１８２１の代替修飾パターンを有するｓｉＲＮＡ、すなわち、ＥＴＤ０１８３２～ＥＴＤ０１８３７の活性は、ＥＴＤ０１８２１に匹敵した。
実施例１２：ＡＡＶ８－ＴＢＧ－ｈ－ＭＳＴ１をトランスフェクトしたマウスにおけるヒトＭＳＴ１を標的とする追加のｓｉＲＮＡのスクリーニング
ヒトＭＳＴ１を標的とする追加のｓｉＲＮＡ、つまり、ＥＴＤ１８６０～ＥＴＤ０１８６８を、アデノ随伴ウイルスベクターによるトランスフェクション後のマウスにおいて活性について試験した。ｓｉＲＮＡをＧａｌＮＡｃリガンドＥＴＬ１７に結合させ、その後、センス鎖の５’末端でホスホロチオエート結合させた。ｓｉＲＮＡであるＥＴＤ０１８２３およびＥＴＤ０１８００を陽性対象として含めた。本実施例で使用したｓｉＲＮＡを表２４Ａに含める。
６～８週齢の雌マウス（Ｃ５７Ｂｌ／６）に、１０μＬの組換えアデノ随伴ウイルス８（ＡＡＶ８）ベクター（２．４×１０Ｅ１３ゲノムコピー／ｍＬ）を後眼窩経路によって注射した。組換えＡＡＶ８は、ＡＡＶ８カプシド（ＡＡＶ８－ＴＢＧ－ｈ－ＭＳＴ１）中にパッケージングされたＡＡＶ２骨格中のヒトチロキシン結合グロブリンプロモーターの制御下にあるヒトＭＳＴ１ 配列（ＮＭ＿０２０９９８．４）のオープンリーディングフレームおよび３’ＵＴＲの大部分を含有していた。感染後１４日目に、血清を採取し、各マウスにおけるヒトＭＳＰのレベルを、Ｒ＆ＤからのヒトＭＳＰ／ＭＳＴ１ ＤｕｏＳｅｔ ＥＬＩＳＡ（カタログ番号ＤＹ３５２）を使用して測定した。緩衝液および溶液のすべての試薬調製に関する製造業者の説明書に従った。１：５０の血清試料希釈液をすべての試験試料に利用した。キットに含まれる組換えＭＳＰを使用して、１０，０００ｐｇ／ｍＬ～０ｐｇ／ｍＬの標準曲線を作成した。プレートの光学密度を、ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ Ｅｎｖｉｓｉｏｎマルチモードプレートリーダーを用いて４５０ｎｍで読み取った。各マウス血清試料中のＭＳＰの濃度を、最小二乗適合（Ｐｒｉｓｍバージョン９、Ｓｏｆｔｗａｒｅ ＭａｃＫｉｅｖ）を用いた補間によって標準曲線から計算した。
マウスを群（ｎ＝３）に割り当てて、群がＭＳＰの類似の血清レベルを有するようにし、次いで、ビヒクル対照として単回１００μｇ用量のＧａｌＮＡｃコンジュゲートｓｉＲＮＡまたはＰＢＳの皮下注射を与えた。注射後０日目および１０日目に、血清を採取して、上記の方法を用いてＥＬＩＳＡにより血清ＭＳＰ濃度を評価した。各時点におけるＭＳＰ血清濃度を、個々のマウスそれぞれについての０日目の試料におけるＭＳＰのレベルに対して作製した。結果を表１８に示す。ＥＴＤ０１８６７またはＥＴＤ０１８６８を注射したマウスは、試験した追加のｓｉＲＮＡの血清ＭＳＰにおいて最大に減少していた。減少の大きさは、ＥＴＤ０１８２３およびＥＴＤ０１８００に匹敵した。
１０日目にマウスを屠殺し、それぞれから肝臓試料を回収し、処理するまでＲＮＡｌａｔｅｒ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号ＡＭ７０２０）に入れた。５０００ｒｐｍに設定したＰｅｒｃｅｌｌｙｓ ２４組織ホモジナイザー（Ｂｅｒｔｉｎ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）を用いて、１０秒サイクルを２回、ホモジナイゼーションバッファー（Ｍａｘｗｅｌｌ ＲＳＣ ｓｉｍｐｌｙＲＮＡ Ｔｉｓｓｕｅ Ｋｉｔ）中で肝臓組織をホモジナイズすることによって、全肝ＲＮＡを調製した。ライセートからの総ＲＮＡは、製造者の推奨に従って、Ｍａｘｗｅｌｌ ＲＳＣ ４８プラットフォーム（Ｐｒｏｍｅｇａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ）で精製した。製造業者の説明書に従ってＱｕａｎｔａ ｑＳｃｒｉｐｔ ｃＤＮＡ ＳｕｐｅｒＭｉｘ（ＶＷＲ、カタログ番号９５０４８－５００）を使用してｃＤＮＡの調製を行った。肝臓ＭＳＴ１ ｍＲＮＡの相対レベルを、ヒトＭＳＴ１（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｈｓ００３６０６８４＿ｍ１）およびマウスハウスキーピング遺伝子ＰＰＩＡ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｍｍ０２３４２４３０＿ｇ１）についてのＴａｑＭａｎアッセイ、ならびにＰｅｒｆｅＣＴａ（登録商標）ｑＰＣＲ ＦａｓｔＭｉｘ（登録商標）、Ｌｏｗ ＲＯＸ（商標）（ＶＷＲ、カタログ番号１０１４１９－２２２）を使用して、ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ（商標）６Ｐｒｏ Ｒｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ上で３連でＲＴ－ｑＰＣＲによって評価した。データは、ＰＢＳを投与した動物のレベルに正規化した。結果を表１９に示す。本実施例で試験した追加のｓｉＲＮＡのうち、ＥＴＤ０１８６７およびＥＴＤ０１８６８は、ＥＴＤ０１８２３およびＥＴＤ０１８００で観察されたＭＳＴ１ ｍＲＮＡ減少活性に匹敵する最大のＭＳＴ１ ｍＲＮＡ減少活性を有していた。
実施例１３：ＡＡＶ８－ＴＢＧ－ｈ－ＭＳＴ１をトランスフェクトしたマウスにおけるヒトＭＳＴ１を標的とするＥＴＤ０１８００の代替修飾パターンを含むｓｉＲＮＡの活性の試験。
ＥＴＤ０１８００の代替修飾パターンを有するｓｉＲＮＡ、すなわち、ＥＴＤ０１８７１～ＥＴＤ０１８７８の活性を評価した。代替修飾パターンを有するｓｉＲＮＡをＧａｌＮＡｃリガンドＥＴＬ１７に結合させ、その後、センス鎖の５’末端でホスホロチオエート結合させた。ＥＴＤ０１８７１～ＥＴＤ０１８７８の活性をＥＴＤ０１８００と比較した。本実施例で使用したｓｉＲＮＡを表２４Ａに含める。
６～８週齢の雌マウス（Ｃ５７Ｂｌ／６）に、１０μＬの組換えアデノ随伴ウイルス８（ＡＡＶ８）ベクター（２．７×１０Ｅ１３ゲノムコピー／ｍＬ）を後眼窩経路によって注射した。組換えＡＡＶ８は、ＡＡＶ８カプシド（ＡＡＶ８－ＴＢＧ－ｈ－ＭＳＴ１）中にパッケージングされたＡＡＶ２骨格中のヒトチロキシン結合グロブリンプロモーターの制御下にあるヒトＭＳＴ１ 配列（ＮＭ＿０２０９９８．４）のオープンリーディングフレームおよび３’ＵＴＲの大部分を含有していた。感染後１３日目に、血清を採取し、各マウスにおけるヒトＭＳＰのレベルを、Ｒ＆ＤからのヒトＭＳＰ／ＭＳＴ１ ＤｕｏＳｅｔ ＥＬＩＳＡ（カタログ番号ＤＹ３５２）を使用して測定した。緩衝液および溶液のすべての試薬調製に関する製造業者の説明書に従った。１：１００の血清試料希釈液をすべての試験試料に利用した。キットに含まれる組換えＭＳＰを使用して、１０，０００ｐｇ／ｍＬ～０ｐｇ／ｍＬの標準曲線を作成した。プレートの光学密度を、ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ Ｅｎｖｉｓｉｏｎマルチモードプレートリーダーを用いて４５０ｎｍで読み取った。各マウス血清試料中のＭＳＰの濃度を、最小二乗適合（Ｐｒｉｓｍバージョン９、Ｓｏｆｔｗａｒｅ ＭａｃＫｉｅｖ）を用いた補間によって標準曲線から計算した。
マウスを群（ｎ＝３）に割り当てて、群がＭＳＰの類似の血清レベルを有するようにし、次いで、ビヒクル対照として単回６０μｇ用量のＧａｌＮＡｃコンジュゲートｓｉＲＮＡまたはＰＢＳの皮下注射を与えた。注射後０日目および１０日目に、血清を採取して、上記の方法を用いてＥＬＩＳＡにより血清ＭＳＰ濃度を評価した。各時点におけるＭＳＰ血清濃度を、個々のマウスそれぞれについての０日目の試料におけるＭＳＰのレベルに対して作製した。結果を表２０に示す。ＥＴＤ０１８００の代替修飾パターンを有するｓｉＲＮＡ、すなわち、ＥＴＤ０１８７１～ＥＴＤ０１８７８の活性は、ＥＴＤ０１８００に匹敵し、ＥＴＤ０１８７３およびＥＴＤ０１８７８は、１０日目に最大レベルの血清ＭＳＰ減少を示した。
１０日目にマウスを屠殺し、それぞれから肝臓試料を回収し、処理するまでＲＮＡｌａｔｅｒ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号ＡＭ７０２０）に入れた。５０００ｒｐｍに設定したＰｅｒｃｅｌｌｙｓ ２４組織ホモジナイザー（Ｂｅｒｔｉｎ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）を用いて、１０秒サイクルを２回、ホモジナイゼーションバッファー（Ｍａｘｗｅｌｌ ＲＳＣ ｓｉｍｐｌｙＲＮＡ Ｔｉｓｓｕｅ Ｋｉｔ）中で肝臓組織をホモジナイズすることによって、全肝ＲＮＡを調製した。ライセートからの総ＲＮＡは、製造者の推奨に従って、Ｍａｘｗｅｌｌ ＲＳＣ ４８プラットフォーム（Ｐｒｏｍｅｇａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ）で精製した。製造業者の説明書に従ってＱｕａｎｔａ ｑＳｃｒｉｐｔ ｃＤＮＡ ＳｕｐｅｒＭｉｘ（ＶＷＲ、カタログ番号９５０４８－５００）を使用してｃＤＮＡの調製を行った。肝臓ＭＳＴ１ ｍＲＮＡの相対レベルを、ヒトＭＳＴ１（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｈｓ００３６０６８４＿ｍ１）およびマウスハウスキーピング遺伝子ＰＰＩＡ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｍｍ０２３４２４３０＿ｇ１）についてのＴａｑＭａｎアッセイ、ならびにＰｅｒｆｅＣＴａ（登録商標）ｑＰＣＲ ＦａｓｔＭｉｘ（登録商標）、Ｌｏｗ ＲＯＸ（商標）（ＶＷＲ、カタログ番号１０１４１９－２２２）を使用して、ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ（商標）６Ｐｒｏ Ｒｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ上で３連でＲＴ－ｑＰＣＲによって評価した。データは、ＰＢＳを投与した動物のレベルに正規化した。結果を表２１に示す。ＥＴＤ０１８００を投与されたマウスは、ＰＢＳを投与されたマウスと比較して、１０日目の肝臓ＭＳＴ１ ｍＲＮＡが実質的により低かった。ＭＳＴ１を標的とする代替修飾ｓｉＲＮＡのいずれかを投与されたマウスも、ＰＢＳを投与されたマウスと比較して、１０日目の平均肝臓ヒトＭＳＴ１ ｍＲＮＡが実質的により低いレベルであった。
実施例１４：ＡＡＶ８－ＴＢＧ－ｈ－ＭＳＴ１をトランスフェクトしたマウスにおけるＥＴＤ０１８６７およびＥＴＤ０１８６８の代替修飾パターンを含むＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡの活性の試験。
ＥＴＤ０１８６７の代替修飾パターンを有するｓｉＲＮＡ、すなわち、ＥＴＤ０１９６３～ＥＴＤ０１９６６、およびＥＴＤ０１８６８の代替修飾パターンを有するｓｉＲＮＡ、すなわち、ＥＴＤ０１９６７～ＥＴＤ０１９７２の活性を評価した。ｓｉＲＮＡをＧａｌＮＡｃリガンドＥＴＬ１７に結合させ、その後、センス鎖の５’末端でホスホロチオエート結合させた。本実施例で使用したｓｉＲＮＡを表２４Ａに含める。
６～８週齢の雌マウス（Ｃ５７Ｂｌ／６）に、５μＬの組換えアデノ随伴ウイルス８（ＡＡＶ８）ベクター（２．７×１０Ｅ１３ゲノムコピー／ｍＬ）を後眼窩経路によって注射した。組換えＡＡＶ８は、ＡＡＶ８カプシド（ＡＡＶ８－ＴＢＧ－ｈ－ＭＳＴ１）中にパッケージングされたＡＡＶ２骨格中のヒトチロキシン結合グロブリンプロモーターの制御下にあるヒトＭＳＴ１ 配列（ＮＭ＿０２０９９８．４）のオープンリーディングフレームおよび３’ＵＴＲの大部分を含有していた。感染後１３日目に、血清を採取し、各マウスにおけるヒトＭＳＰのレベルを、Ｒ＆ＤからのヒトＭＳＰ／ＭＳＴ１ ＤｕｏＳｅｔ ＥＬＩＳＡ（カタログ番号ＤＹ３５２）を使用して測定した。緩衝液および溶液のすべての試薬調製に関する製造業者の説明書に従った。１：５０の血清試料希釈液をすべての試験試料に利用した。キットに含まれる組換えＭＳＰを使用して、１０，０００ｐｇ／ｍＬ～０ｐｇ／ｍＬの標準曲線を作成した。プレートの光学密度を、ＰｅｒｋｉｎＥｌｍｅｒ Ｅｎｖｉｓｉｏｎマルチモードプレートリーダーを用いて４５０ｎｍで読み取った。各マウス血清試料中のＭＳＰの濃度を、最小二乗適合（Ｐｒｉｓｍバージョン９、Ｓｏｆｔｗａｒｅ ＭａｃＫｉｅｖ）を用いた補間によって標準曲線から計算した。
マウスを群（ｎ＝３）に割り当てて、群がＭＳＰの類似の血清レベルを有するようにし、次いで、ビヒクル対照として単回６０μｇ用量のＧａｌＮＡｃコンジュゲートｓｉＲＮＡまたはＰＢＳの皮下注射を与えた。注射後０日目、４日目、および１２日目に、血清を採取して、上記の方法を用いてＥＬＩＳＡにより血清ＭＳＰ濃度を評価した。各時点におけるＭＳＰ血清濃度を、個々のマウスそれぞれについての０日目の試料におけるＭＳＰのレベルに対して作製した。その結果を表２２に示す。ＥＴＤ０１８６７の代替修飾パターンを有するｓｉＲＮＡ、すなわち、ＥＴＤ０１９６３～ＥＴＤ０１９６６の活性は、ＥＴＤ０１８６７に匹敵し、ＥＴＤ０１９６４およびＥＴＤ０１９６６は、１２日目に最大レベルの血清ＭＳＰ減少を示した。ＥＴＤ０１８６８の代替修飾パターンを有するｓｉＲＮＡ、すなわち、ＥＴＤ０１９６７～ＥＴＤ０１９７２の活性は、ＥＴＤ０１８６８に匹敵し、ＥＴＤ０１９７２は、１２日目に最大レベルの血清ＭＳＰ減少を示した。
１２日目にマウスを屠殺し、それぞれから肝臓試料を回収し、処理するまでＲＮＡｌａｔｅｒ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号ＡＭ７０２０）に入れた。５０００ｒｐｍに設定したＰｅｒｃｅｌｌｙｓ ２４組織ホモジナイザー（Ｂｅｒｔｉｎ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）を用いて、１０秒サイクルを２回、ホモジナイゼーションバッファー（Ｍａｘｗｅｌｌ ＲＳＣ ｓｉｍｐｌｙＲＮＡ Ｔｉｓｓｕｅ Ｋｉｔ）中で肝臓組織をホモジナイズすることによって、全肝ＲＮＡを調製した。ライセートからの総ＲＮＡは、製造者の推奨に従って、Ｍａｘｗｅｌｌ ＲＳＣ ４８プラットフォーム（Ｐｒｏｍｅｇａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ）で精製した。製造業者の説明書に従ってＱｕａｎｔａ ｑＳｃｒｉｐｔ ｃＤＮＡ ＳｕｐｅｒＭｉｘ（ＶＷＲ、カタログ番号９５０４８－５００）を使用してｃＤＮＡの調製を行った。肝臓ＭＳＴ１ ｍＲＮＡの相対レベルを、ヒトＭＳＴ１（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｈｓ００３６０６８４＿ｍ１）およびマウスハウスキーピング遺伝子ＰＰＩＡ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｍｍ０２３４２４３０＿ｇ１）についてのＴａｑＭａｎアッセイ、ならびにＰｅｒｆｅＣＴａ（登録商標）ｑＰＣＲ ＦａｓｔＭｉｘ（登録商標）、Ｌｏｗ ＲＯＸ（商標）（ＶＷＲ、カタログ番号１０１４１９－２２２）を使用して、ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ（商標）６Ｐｒｏ Ｒｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ上で３連でＲＴ－ｑＰＣＲによって評価した。データは、ＰＢＳを投与した動物のレベルに正規化した。結果を表２３に示す。ＥＴＤ０１８６７の代替修飾パターンを有するｓｉＲＮＡ、すなわち、ＥＴＤ０１９６５およびＥＴＤ０１９６６の活性は、１２日目にＭＳＴ１ ｍＲＮＡ減少について親と類似するか、または親よりもわずかに良好な活性を示した。ＥＴＤ０１８６８の代替修飾パターンを有するｓｉＲＮＡ、すなわち、ＥＴＤ０１９６７およびＥＴＤ０１９７２の活性は、１２日目に最も高いＭＳＴ１ ｍＲＮＡ減少を示した。
表２４Ａの実施例のｓｉＲＮＡのセンス鎖はそれぞれ、示されるようなＧａｌＮＡｃ部分を含む。表２４Ａおよび表２４Ｃにおいて、Ｎｆ（例えば、Ａｆ、Ｃｆ、Ｇｆ、Ｔｆ、またはＵｆ）は、２’フルオロ修飾ヌクレオシドであり、ｄＮ（例えば、ｄＡ、ｄＣ、ｄＧ、ｄＴ、またはｄＵ）は２’デオキシ修飾ヌクレオシドであり、ｎ（例えば、ａ、ｃ、ｇ、ｔ、またはｕ）は２’Ｏメチル修飾ヌクレオシドであり、「ｓ」はホスホロチオエート結合である。
実施例１５：ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡを用いたＬＰＳ曝露による肺炎症のマウスモデルにおけるＭＳＴ１の阻害
この実験では、ＬＰＳ曝露によって誘発される肺炎症のマウスモデルを使用して、ＭＳＴ１のｓｉＲＮＡ阻害の効果を評価した。このＬＰＳ誘発モデルでは、マウスをＬＰＳに６時間曝露し、その結果、一過性炎症反応が生じる。肺炎症は、気管支肺胞洗浄液および肺組織において好中球、マクロファージ、好酸球、リンパ球、およびサイトカインを測定することにより評価された。
簡潔に述べると、マウスを５つの群：群１－ビヒクルおよび生理食塩水の気管内注入で処置した群、群２－ビヒクルおよびＬＰＳの気管内注入で処置した群、群３－低用量ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡ ＥＴＤ０１２１８（５０ｕｇ）およびＬＰＳの気管内注入で処置した群、群４－高用量ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡ ＥＴＤ０１２１８（１５０ｕｇ）およびＬＰＳの気管内注入で処置した群、群５－ベタメタゾンおよびＬＰＳの気管内注入で処置した群に分けた。各群は１２匹のマウス（オス）を含んでいた。ＥＴＤ０１２１８の配列を表２９に示す。
ｓｉＲＮＡの投与は、０．５ｍｇ／ｍｌまたは１．５ｍｇ／ｍｌの濃度でＰＢＳに再懸濁したｓｉＲＮＡの１００μＬの皮下注射によって達成した。３ｍｇ／ｋｇのベタメタゾンの投与は、０．３ｍｇ／ｍｌの濃度でＰＢＳ中に再懸濁したベタメタゾンによる経口胃管栄養法によって達成した。－２１日目、－１４日目、および－７日目に、群１のマウスにビヒクルを皮下注射し、群２のマウスにビヒクルを皮下注射し、群３のマウスにマウスＭＳＴ１を標的とする低用量ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡ ＥＴＤ０１２１８を皮下注射し、群４のマウスに、マウスＭＳＴ１を標的とする高用量ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡ ＥＴＤ０１２１８を皮下注射し、群５のマウスにビヒクルを皮下注射した。１日目に、ＬＰＳ投与の３０分前に、群５のマウスに、経口胃管栄養法によってベタメタゾンを投与した。
１日目に、ＬＰＳ投与の６時間後、気管支肺胞洗浄液を採取し、イソフルラン吸入および腹部大動脈の放血によりマウスを安楽死させた。最終血液試料を採取し、肝臓および肺を除去して、切片をＲＮＡｌａｔｅｒに入れてｍＲＮＡを単離させた。
１日目に、ＬＰＳ投与の６時間後、マウスを屠殺し、それぞれから肝臓と肺の試料を回収し、処理するまでＲＮＡｌａｔｅｒ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号ＡＭ７０２０）に入れた。５０００ｒｐｍに設定したＰｅｒｃｅｌｌｙｓ ２４組織ホモジナイザー（Ｂｅｒｔｉｎ Ｉｎｓｔｒｕｍｅｎｔｓ）を用いて、１０秒サイクルを２回、ホモジナイゼーションバッファー（Ｍａｘｗｅｌｌ ＲＳＣ ｓｉｍｐｌｙＲＮＡ Ｔｉｓｓｕｅ Ｋｉｔ）中で肝臓組織をホモジナイズすることによって、全肝ＲＮＡを調製した。ライセートからの総ＲＮＡは、製造者の推奨に従って、Ｍａｘｗｅｌｌ ＲＳＣ ４８プラットフォーム（Ｐｒｏｍｅｇａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ）で精製した。製造業者の説明書に従ってＱｕａｎｔａ ｑＳｃｒｉｐｔ ｃＤＮＡ ＳｕｐｅｒＭｉｘ（ＶＷＲ、カタログ番号９５０４８－５００）を使用してｃＤＮＡの調製を行った。肝臓ＭＳＴ１ ｍＲＮＡの相対レベルを、マウスＭＳＴ１（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｍｍ０１２２９８３４＿ｍ１）およびマウスハウスキーピング遺伝子ＰＰＩＡ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｍｍ０２３４２４３０＿ｇ１）についてのＴａｑＭａｎアッセイ、ならびにＰｅｒｆｅＣＴａ（登録商標）ｑＰＣＲ ＦａｓｔＭｉｘ（登録商標）、Ｌｏｗ ＲＯＸ（商標）（ＶＷＲ、カタログ番号１０１４１９－２２２）を使用して、ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ（商標）６Ｐｒｏ Ｒｅａｌ－Ｔｉｍｅ ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ上で３連でＲＴ－ｑＰＣＲによって評価した。データを、ビヒクルおよびＬＰＳ気管内注入を受けた動物におけるレベルに対して正規化した。ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡを投与し、ＬＰＳを投与したマウス由来の肝臓組織におけるＭＳＴ１ ｍＲＮＡ発現は、ビヒクルを投与し、ＬＰＳを投与したマウス由来の肝臓組織におけるＭＳＴ１ ｍＲＮＡ発現と比較して、低用量および高用量ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡで、それぞれ８５％および９８％、減少した（表２５）。ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡを投与し、ＬＰＳを投与したマウス由来の肝臓組織におけるＭＳＰタンパク質は、低用量ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡでは８．９４ｎｇ／ｍｌから１．７１ｎｇ／ｍｌに、高用量ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡでは０．５３ｎｇ／ｍｌに減少した。これは、ビヒクルを投与し、ＬＰＳを投与したマウス由来の肝臓組織におけるＭＳＰタンパク質と比較して、低用量および高用量ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡでのそれぞれ８１％および９４％の減少に等しい（表２５）。ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡを投与し、ＬＰＳを投与したマウス由来の血清中のＭＳＰタンパク質は、ビヒクルを投与し、ＬＰＳを投与したマウス由来の血清中のＭＳＰタンパク質と比較して、低用量および高用量ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡでそれぞれ約８０％および約９０％減少した（表２６）。高用量ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡは、ビヒクル対照を投与されたＬＰＳ曝露マウスの気管支肺胞洗浄液中の好中球、好酸球、およびリンパ球の数と比較して、ＬＰＳ曝露マウスの気管支肺胞洗浄液中の好中球、好酸球、およびリンパ球の数をそれぞれ４５％、３０％、および４８％減少させた（表２７）。低用量ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡは、ビヒクル対照を投与されたＬＰＳ曝露マウスの気管支肺胞洗浄液中の好中球、好酸球、およびリンパ球の数と比較して、ＬＰＳ曝露マウスの気管支肺胞洗浄液中の好中球、好酸球、およびリンパ球の数をそれぞれ４２％、４０％、および１４％減少させることができる（表２７）。好中球、好酸球、およびリンパ球の数を減少させるＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡの能力は、ビヒクル対照を投与されたＬＰＳ曝露マウスの気管支肺胞洗浄液中の好中球、好酸球、およびリンパ球の数と比較して、ＬＰＳ曝露マウスの気管支肺胞洗浄液中の好中球、好酸球、およびリンパ球の数をそれぞれ４８％、３２％、および４１％減少させることができる陽性対照ベタメタゾンに匹敵した（表２７）。さらに、ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡは、陽性対照ベタメタゾンと同様に、炎症誘発性サイトカインであるＩＬ－１ｂ、ＩＬ－６、ＫＣ－ＧＲＯ、ＭＣＰ－１、およびＴＮＦ－ａを減少させることができた（表２８）。これらの結果は、ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡが肝臓組織においてＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰのノックダウンを誘発し、血清中の循環ＭＳＰを減少させたこと、ならびにＭＳＴ１ ｍＲＮＡおよびＭＳＰ発現の減少が、ＬＰＳに曝露されたマウスにおける気管支肺胞洗浄液中の好中球、好酸球、およびリンパ球の数と関連サイトカインの減少に対応することを示す。
実施例１６：ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡを使用する非ヒト霊長類におけるＭＳＴ１の阻害
この実験では、非ヒト霊長類を使用して、ＭＳＴ１のｓｉＲＮＡ阻害の有効性を評価する。
簡潔に言えば、カニクイザルを４つの群：群１（この群をｓｉＲＮＡ ＥＴＤ０１８２１で処理する）、群２（この群をｓｉＲＮＡ ＥＴＤ０１８２２で処理する）、群３（この群をｓｉＲＮＡ ＥＴＤ０１８２３で処理する）、および群４（この群をｓｉＲＮＡ ＥＴＤ０１８２６で処理する）に分ける。これらのｓｉＲＮＡを表３０に示す。それらの配列を表２４Ａに含め、これらのｓｉＲＮＡはそれぞれＥＴＤ０１７２８、ＥＤ０１７２５、ＥＴＤ０１７２３、およびＥＴＤ０１７２９の誘導体であった。各群は３匹のカニクイザル（オス）を含む。
ｓｉＲＮＡの投与は、２５ｍｇ／ｍｌの濃度でＰＢＳ中に再懸濁されたｓｉＲＮＡの１ｍＬの皮下注射によって達成される。０日目に、群１のカニクイザルにｓｉＲＮＡ ＥＴＤ０１７２３を皮下注射し、群２のカニクイザルにｓｉＲＮＡ ＥＴＤ０１７２５を皮下注射し、群３のカニクイザルにｓｉＲＮＡ ＥＴＤ０１７２８を皮下注射し、群４のカニクイザルにｓｉＲＮＡ ＥＴＤ０１７２９を皮下注射する。
ｓｉＲＮＡ投与の２日前に、肝生検を血清試料と共に採取する。２８日目に、最後の肝生検および血液試料を採取し、肝臓切片をＲＮＡｌａｔｅｒに入れてｍＲＮＡを単離させる。
全肝臓ＲＮＡを組織から単離し、製造業者のプロトコル（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒカタログ番号１２１８３０２０）に従ってＰｕｒｅＬｉｎｋキットを使用して、ＲＮＡｌａｔｅｒ溶液中に入れる。逆転写酵素反応を製造業者のプロトコルに従って実施する。カニクイザルＭＳＴ１（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｍｆ０２８７８５７３＿ｇ１）およびカニクイザルハウスキーピング遺伝子ＧＡＰＤＨ（ＴｈｅｒｍｏＦｉｓｈｅｒ、アッセイ番号Ｍｆ０４３９２５４６＿ｇ１）に対するＴａｑＭａｎ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ａｓｓａｙｓ ＴａｑＭａｎアッセイを使用してリアルタイムｑＰＣＲが三連で実施されるまで、試料を－８０℃で保存する。ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡ１を投与したカニクイザル由来の肝臓組織中のＭＳＴ１ ｍＲＮＡ、および血清中の循環ＭＳＰの減少が、投与前に採取した試料に由来する肝臓組織中のＭＳＴ１ ｍＲＮＡまたはＭＳＰ発現、および血液中の循環ＭＳＰと比較して予想される。これらの結果は、ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡが非ヒト霊長類においてＭＳＴ１ ｍＲＮＡのノックダウンを誘発し、循環ＭＳＰを減少させることを示すと予想される。
実施例１８：オリゴヌクレオチドの肝細胞標的化のためのＧａｌＮＡｃリガンド
これらの個々の方法に本開示を限定することなく、多価Ｎ－アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）リガンドのオリゴヌクレオチドへの結合のための少なくとも２つの一般的な方法：固相または溶液相のコンジュゲーションが存在する。ＧａｌＮＡｃリガンドは、ＧａｌＮＡｃホスホラミダイト試薬を用いて、３’コンジュゲーションのために、または５’末端において、固相樹脂に結合することができる。ＧａｌＮＡｃホスホラミダイトは、オリゴヌクレオチド配列の他のヌクレオシドと同様に、配列中の任意の位置で固相で結合することができる。オリゴヌクレオチドに対するＧａｌＮＡｃコンジュゲーションのための試薬を表３１に示す。
実施例１７：オリゴヌクレオチド合成
ｓｉＲＮＡなどのオリゴヌクレオチドは、固相上でホスホラミダイト技術に従って合成することができる。例えば、Ｋ＆Ａオリゴヌクレオチド合成装置を使用することができる。合成は、制御細孔ガラス（米国カリフォルニア州オーシャンサイドのＡＭ Ｃｈｅｍｉｃａｌｓから入手したＣＰＧ、５００Åまたは６００Å）で作られた固体支持体上で行うことができる。すべての２’－ＯＭｅおよび２’－Ｆホスホラミダイトは、Ｈｏｎｇｅｎｅ Ｂｉｏｔｅｃｈ（米国カリフォルニア州ユニオンシティ）から購入することができる。すべてのホスホラミダイトを無水アセトニトリル（１００ｍＭ）に溶解してもよく、モレキュラーシーブ（３Å）を添加してもよい。５－ベンジルチオ－１Ｈ－テトラゾール（ＢＴＴ、アセトニトリル中２５０ｍＭ）または５－エチルチオ－１Ｈ－テトラゾール（ＥＴＴ、アセトニトリル中２５０ｍＭ）をアクチベーター溶液として使用することができる。カップリング時間は、９～１８分（例えば、ＥＴＬ１７などのＧａｌＮＡｃを用いる）、６分（例えば、２’ＯＭｅおよび２’Ｆを用いる）であり得る。ホスホロチオエート結合を導入するために、無水アセトニトリル中の３－フェニル１，２，４－ジチアゾリン－５－オン（ＰＯＳ。米国マサチューセッツ州レミンスターのＰｏｌｙＯｒｇ，Ｉｎｃ．から入手）１００ｍＭ溶液を用いることができる。
固相合成後、乾燥した固体支持体を、水中の４０重量％メチルアミンおよび２８％水酸化アンモニウム溶液（Ａｌｄｒｉｃｈ）の１：１体積溶液で、３０℃で２時間処理することができる。溶液を蒸発させてもよく、固体残渣を水中で再構成し、ＴＫＳｇｅｌ ＳｕｐｅｒＱ－５ＰＷ １３ｕカラムを使用する陰イオン交換ＨＰＬＣによって精製してもよい。緩衝液Ａは、２０ｍＭのトリス、５ｍＭのＥＤＴＡ、ｐＨ９．０であってもよく、２０％アセトニトリルを含有し、緩衝液Ｂは、１Ｍの塩化ナトリウムを添加した緩衝液Ａと同じであってもよい。２６０ｎｍでのＵＶトレースを記録することができる。適切な画分をプールし、その後、Ｓｅｐｈａｄｅｘ Ｇ－２５培地を用いて脱塩することができる。
等モル量のセンス鎖およびアンチセンス鎖を組み合わせて、二重鎖を調製することができる。二重鎖溶液は、０．１×ＰＢＳ（リン酸緩衝生理食塩水、１倍、Ｇｉｂｃｏ）中で調製することができる。二重鎖溶液を９５℃で５分間アニーリングし、室温までゆっくり冷ますことができる。二重鎖濃度は、０．１×ＰＢＳ中２６０ｎｍのＵＶ－Ｖｉｓ分光計で溶液吸光度を測定することによって決定することができる。いくつかの実験では、変換係数は、実験的に決定された吸光係数から計算され得る。
溶液相コンジュゲーションでは、反応性コンジュゲーション部位を含むオリゴヌクレオチド配列が樹脂上に形成される。次に、オリゴヌクレオチドは樹脂から除去され、ＧａｌＮＡｃが反応部位にコンジュゲートされる。
カルボキシＧａｌＮＡｃ誘導体は、アミノ修飾オリゴヌクレオチドにカップリングさせることができる。ペプチドカップリング条件は、ＤＣＣ（Ｎ，Ｎ’－ジシクロヘキシルカルボジイミド）、ＥＤＣ（Ｎ－（３－ジメチルアミノプロピル）－Ｎ’－エチルカルボジイミド）またはＥＤＣ．ＨＣｌ（Ｎ－（３－ジメチルアミノプロピル）－Ｎ’－エチルカルボジイミド塩酸塩）のようなカルボジイミドカップリング剤、およびＨＯＢｔ（１－ヒドロキシベンズトリアゾール）、ＨＯＳｕ（Ｎ－ヒドロキシスクシンイミド）、ＴＢＴＵ（Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’－テトラメチル－Ｏ－（ベンゾトリアゾール－１－イル）ユーロニウムテトラフルオロボレート、ＨＢＴＵ（２－（１Ｈ－ベンゾトリアゾール－１－イル）－１，１，３，３－テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート）、またはＨＯＡｔ（１－ヒドロキシ－７－アザベンゾトリアゾールのような添加剤、ならびに、ＴＢＴＵ／ＨＯＢｔまたはＨＢＴＵ／ＨＯＡｔなどの一般的な組み合わせを用いて、活性化アミン反応エステルを形成することができることが当業者に知られている。
アミン基は、５’末端、３’末端、またはその間の任意の場所で、多数の既知の市販の試薬を使用して、オリゴヌクレオチドに組み込むことができる。
アミノ基を組み込むためのオリゴヌクレオチド合成用試薬の非限定的な例としては、以下のものが挙げられる。
・５’結合：
・６－（４－モノメトキシトリチルアミノ）ヘキシル－（２－シアノエチル）－（Ｎ，Ｎ－ジイソプロピル）－ホスホラミダイト ＣＡＳ番号：１１４６１６－２７－２
・５’－アミノ－修飾因子ＴＥＧ ＣＥ－ホスホラミダイト
・１０－（Ｏ－トリフルオロアセトアミド－Ｎ－エチル）－トリエチレングリコール－１－［（２－シアノエチル）－（Ｎ，Ｎ－ジイソプロピル）］－ホスホラミダイト
・３’結合：
・３’アミノ－修飾因子セリノールＣＰＧ
・３－ジメトキシトリチルオキシ－２－（３－（フルオレニルメトキシカルボニルアミノ）プロパンアミド）プロピル－１－Ｏ－スクシニル－長鎖アルキルアミノ－ＣＰＧ（ここで、ＣＰＧは制御細孔ガラス（ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ－ｐｏｒｅ ｇｌａｓｓ）の略で固体支持体である）
・アミノ－修飾因子セリノールホスホラミダイト
・３－ジメトキシトリチルオキシ－２－（３－（フルオレニルメトキシカルボニルアミノ）プロパンアミド）プロピル－１－Ｏ－（２－シアノエチル）－（Ｎ，Ｎ－ジイソプロピル）－ホスホラミダイト
内部（塩基修飾）：
・アミノ－修飾因子 Ｃ６ ｄＴ
・５’－ジメトキシトリチル－５－［Ｎ－（トリフルオロアセチルアミノヘキシル）－３－アクリルイミド］－２’－デオキシウリジン，３’－［（２－シアノエチル）－（Ｎ，Ｎ－ジイソプロピル）］ホスホラミダイト。ＣＡＳ番号：１７８９２５－２１－８
溶液相コンジュゲーションは、オリゴヌクレオチドに結合している非ヌクレオシド性求核性官能基と求電子性ＧａｌＮＡｃ試薬との間の反応を通じて、オリゴヌクレオチド合成後に起こり得る。求核性基の例としては、アミンおよびチオールが挙げられ、求電子性試薬の例としては、活性化エステル（例えば、Ｎ－ヒドロキシスクシンイミド、ペンタフルオロフェニル）およびマレイミドが挙げられる。
実施例１９：オリゴヌクレオチドの肝細胞標的化のためのＧａｌＮＡｃリガンド
これらの個々の方法に本開示を限定することなく、多価Ｎ－アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）リガンドのオリゴヌクレオチドへの結合のための少なくとも２つの一般的な方法：固相または溶液相のコンジュゲーションが存在する。ＧａｌＮＡｃリガンドは、ＧａｌＮＡｃホスホラミダイト試薬を用いて、３’コンジュゲーションのために、または５’末端において、固相樹脂に結合させることができる。ＧａｌＮＡｃホスホラミダイトは、オリゴヌクレオチド配列の他のヌクレオシドと同様に、配列中の任意の位置で固相で結合させることができる。５’末端のオリゴヌクレオチドへのＧａｌＮＡｃコンジュゲーションのためのホスホラミダイト試薬の非限定的な例が、表３２に示される。
以下は、ＧａｌＮＡｃ部分を作製するために使用される合成反応の例を含む。
ＮＡｃｅｇａｌ－リンカー－ＴＭＳＯＴｆの調製のためのスキーム
化合物２Ａの調製のための基本手順
２－メチル－ＴＨＦ（２．００Ｌ）中の化合物１Ａ（５００ｇ、４．７６ｍｏｌ、４７６ｍＬ）の溶液に、２－メチル－ＴＨＦ（７５０ｍＬ）中のＣｂｚＣｌ（４０６ｇ、２．３８ｍｏｌ、３３８ｍＬ）を０℃で滴下する。混合物をＮ２雰囲気下２５℃で２時間撹拌する。ＴＬＣ（ＤＣＭ：ＭｅＯＨ＝２０：１、ＰＭＡ）は、ＣｂｚＣｌが完全に消費され、１つの新しい斑点（Ｒｆ＝０．４３）が形成されることを示すことができる。反応混合物にＨＣｌ／ＥｔＯＡｃ（１Ｎ、１８０ｍＬ）を添加し、３０分間撹拌し、白色固形物をセライトによる濾過によって除去し、濾液を真空下で濃縮することで淡黄色油として化合物２Ａ（５４０ｇ、２．２６ｍｏｌ、４７．５％の収率）を得て、それ以上精製することなく次の工程に使用する。１Ｈ ＮＭＲ：δ ７．２８－７．４１（ｍ，５Ｈ），５．５５ （ｂｒ ｓ， １Ｈ），５．０１－５．２２（ｍ，２Ｈ），３．６３－３．８０（ｍ，２Ｈ），３．４６－３．５９（ｍ，４Ｈ），３．２９－３．４４（ｍ，２Ｈ），２．８３－３．０２（ｍ，１Ｈ）．
化合物４Ａの調製のための基本手順
ピリジン（５．００Ｌ）中の化合物３Ａ（１．００ｋｇ、４．６４ｍｏｌ、ＨＣｌ）の溶液に、アセチルアセテート（４．７３ｋｇ、４６．４ｍｏｌ、４．３４Ｌ）をＮ２雰囲気下０℃で滴下する。混合物をＮ２雰囲気下２５℃で１６時間撹拌する。ＴＬＣ（ＤＣＭ：ＭｅＯＨ＝２０：１、ＰＭＡ）は、化合物３Ａが完全に消費され、２つの新しい斑点（Ｒｆ＝０．３５）が形成されることを示した。反応混合物を冷水（３０．０Ｌ）に添加し、０．５時間０℃で撹拌し、白色固形物が形成され、濾過し、乾燥させることで、白色固形物として化合物４Ａ（１．５５ｋｇ、３．９８ｍｏｌ、８５．８％の収率）を得て、これをそれ以上精製することなく次の工程で使用する。１Ｈ ＮＭＲ：δ ７．９０（ｄ，Ｊ＝９．２９Ｈｚ，１Ｈ），５．６４（ｄ，Ｊ＝８．７８Ｈｚ，１Ｈ），５．２６（ｄ，Ｊ＝３．０１Ｈｚ，１Ｈ），５．０６（ｄｄ，Ｊ＝１１．２９， ３．２６Ｈｚ，１Ｈ），４．２２（ｔ，Ｊ＝６．１５Ｈｚ，１Ｈ），３．９５－４．１６（ｍ，３Ｈ），２．１２（ｓ，３Ｈ），２．０３（ｓ，３Ｈ），１．９９（ｓ，３Ｈ），１．９０（ｓ，３Ｈ），１．７８（ｓ，３Ｈ）．
化合物５Ａの調製のための基本手順
ＤＣＥ（１．５０Ｌ）中の化合物４Ａ（３００ｇ、７７１ｍｍｏｌ）の溶液に、ＴＭＳＯＴｆ（２５７ｇ、１．１６ｍｏｌ、２０９ｍＬ）を添加し、６０℃で２時間で撹拌し、その後、２５℃で１時間撹拌する。化合物２Ａ（２０３ｇ、８４８ｍｍｏｌ）をＤＣＥ（１．５０Ｌ）に溶解させ、Ｎ２雰囲気下で３０分間撹拌しながら４Åの粉末モレキュラーシーブ（１５０ｇ）を添加する。その後、ＤＣＥ中の化合物４Ａの溶液を０℃で混合物に滴下する。混合物をＮ２雰囲気下２５℃で１６時間撹拌する。ＴＬＣ（ＤＣＭ：ＭｅＯＨ＝２５：１、ＰＭＡ）は、化合物４Ａが完全に消費され、新しい斑点（Ｒｆ＝０．２４）が形成されることを示した。反応混合物を濾過し、飽和したＮａＨＣＯ３（２．００Ｌ）、水（２．００Ｌ）、および飽和したブライン（２．００Ｌ）で洗浄した。有機層を無水のＮａ２ＳＯ４で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮することで残渣を得た。残渣を２時間２－Ｍｅ－ＴＨＥ／ヘプタン（５／３、ｖ／ｖ、１．８０Ｌ）で粉末状にし、濾過し、乾燥させることで、白色固形物として化合物５Ａ（２２５ｇ、３８９ｍｍｏｌ、５０．３％の収率、９８．４％の純度）を得る。１Ｈ ＮＭＲ：δ ７．８１（ｄ，Ｊ＝９．２９Ｈｚ，１Ｈ），７．２０－７．４２（ｍ，６Ｈ），５．２１（ｄ，Ｊ＝３．２６Ｈｚ，１Ｈ），４．９２－５．０５（ｍ，３Ｈ），４．５５（ｄ，Ｊ＝８．２８Ｈｚ，１Ｈ），３．９８－４．０７（ｍ，３Ｈ），３．８２－３．９３（ｍ，１Ｈ），３．７１－３．８１（ｍ，１Ｈ），３．５５－３．６２（ｍ，１Ｈ），３．４３－３．５３（ｍ，２Ｈ），３．３７－３．４３（ｍ，２Ｈ），３．１４（ｑ，Ｊ＝５．７７Ｈｚ，２Ｈ），２．１０（ｓ，３Ｈ），１．９９（ｓ，３Ｈ），１．８９（ｓ，３Ｈ），１．７７（ｓ，３Ｈ）．
ＮＡｃｅｇａｌ－リンカー－トシレート塩の調製のための基本手順
ＴＨＦ（１．０Ｌ）中の化合物５Ａ（２００ｇ、３５２ｍｍｏｌ）の溶液に、乾燥したＰｄ／Ｃ（１５．０ｇ、１０％の純度）およびＴｓＯＨ（６０．６ｇ、３５２ｍｍｏｌ）をＮ２雰囲気下で添加する。懸濁液を真空下で脱気して、Ｈ２で複数回パージする。混合物をＨ２（４５ｐｓｉ）雰囲気下２５℃で３時間撹拌する。ＴＬＣ（ＤＣＭ：ＭｅＯＨ＝１０：１、ＰＭＡ）は、化合物５Ａが完全に消費され、１つの新しい斑点（Ｒｆ＝０．０４）が形成されることを示した。反応混合物を濾過し、減圧下で濃縮する（４０℃以下）ことで、残渣を得た。無水ＤＣＭ（５００ｍＬ。４Åのモレキュラーシーブ（１２時間３００℃で乾燥させた）で一晩乾燥させる）で希釈し、濃縮することで残渣を得て、カール・フィッシャー滴定（ＫＦ）を実行して含水量をチェックする。これを無水ＤＣＭ（５００ｍＬ）希釈液で３回繰り返し、濃縮することで、泡状の白色固形物としてＮＡｃｅｇａｌ－リンカー－ＴＭＳＯＴｆ（２０５ｇ、９５．８％の収率、ＴｓＯＨ塩）を得る。１Ｈ ＮＭＲ：δ ７．９１（ｄ，Ｊ＝９．０３Ｈｚ，１Ｈ），７．５３－７．８６（ｍ，２Ｈ），７．４９（ｄ，Ｊ＝８．０３Ｈｚ，２Ｈ），７．１３（ｄ，Ｊ＝８．０３Ｈｚ，２Ｈ），５．２２（ｄ，Ｊ＝３．２６Ｈｚ，１Ｈ），４．９８（ｄｄ，Ｊ＝１１．２９， ３．２６Ｈｚ，１Ｈ），４．５７（ｄ，Ｊ＝８．５３Ｈｚ，１Ｈ），３．９９－４．０５（ｍ，３Ｈ），３．８７－３．９４（ｍ，１Ｈ），３．７９－３．８５（ｍ，１Ｈ），３．５１－３．６２（ｍ，５Ｈ），２．９６ （ｂｒ ｔ， Ｊ＝５．１４Ｈｚ，２Ｈ），２．２９（ｓ，３Ｈ），２．１０（ｓ，３Ｈ），２．００（ｓ，３Ｈ），１．８９（ｓ，３Ｈ），１．７８（ｓ，３Ｈ）．
ＴＲＩＳ－ＰＥＧ２－ＣＢＺの調製のためのスキーム
化合物５Ｂの調製のための基本手順
ＴＨＦ（２．００Ｌ）中の化合物４Ｂ（４００ｇ、１．６７ｍｏｌ、１．００当量）およびＮａＯＨ（１０Ｍ、１６．７ｍＬ、０．１０当量）の溶液に、化合物４Ｂ＿２（１．０７ｋｇ、８．３６ｍｏｌ、１．２０Ｌ、５．００当量）を添加し、混合物を３０℃で２時間撹拌する。ＬＣＭＳは、所望のＭＳが与えられることを示した。溶液の５つのバッチを１つのバッチに合わせ、その後、混合物を水（６．００Ｌ）で希釈し、酢酸エチル（３．００Ｌ＊３）で抽出し、組み合わせた有機層をブライン（３．００Ｌ）で洗浄し、Ｎａ２ＳＯ４で乾燥させ、濾過し、真空下で濃縮する。粗製物をカラムクロマトグラフィー（ＳｉＯ２、石油エーテル：酢酸エチル＝１００：１～１０：１、Ｒｆ＝０．５）により精製することで、淡黄色油として化合物５Ｂ（２．３６ｋｇ、６．４３ｍｏｌ、７６．９％の収率）を得る。Ｈ ＮＭＲ：δ ７．３１－７．３６（ｍ，５Ｈ），５．３８（ｓ，１Ｈ），５．１１－５．１６（ｍ，２Ｈ），３．７５（ｔ，Ｊ＝６．４Ｈｚ），３．５４－３．６２（ｍ，６Ｈ），３．３９（ｄ，Ｊ＝５．２Ｈｚ），２．６１（ｔ，Ｊ＝６．０ Ｈｚ）．
３－オキソ－１－フェニル－２，７，１０－トリオキサ－４－アザトリデカン－１３－酸（以下の化合物２Ｂ）の調製のための基本手順
ＤＣＭ（２．８０Ｌ）中の化合物５Ｂ（７４１ｇ、２．０２ｍｏｌ、１．００当量）の溶液に、ＴＦＡ（１．４３ｋｇ、１２．５ｍｏｌ、９２８ｍＬ、６．２２当量）を添加し、混合物を２５℃で３時間撹拌する。ＬＣＭＳは、所望のＭＳが与えられることを示した。混合物をＤＣＭ（５．００Ｌ）で希釈し、水（３．００Ｌ＊３）、ブライン（２．００Ｌ）で洗浄し、組み合わせた有機層をＮａ２ＳＯ４で乾燥させ、濾過し、真空下で濃縮することで、淡黄色油として化合物２Ｂ（１８００ｇ、粗製）を得る。Ｈ ＮＭＲ：δ ９．４６（ｓ，５Ｈ），７．２７－７．３４（ｍ，５Ｈ），６．５０－６．６５（ｍ，１Ｈ），５．７１（ｓ，１Ｈ），５．１０－５．１５（ｍ，２Ｈ），３．６８－３．７０（ｍ，１４Ｈ），３．５８－３．６１（ｍ，６Ｈ），３．３９（ｓ，２Ｈ），２．５５（ｓ，６Ｈ），２．４４（ｓ，２Ｈ）．
化合物３Ｂの調製のための基本手順
ＤＣＭ（１．８０Ｌ）中の化合物２Ｂ（３７５ｇ、９９９ｍｍｏｌ、純度８３．０％、１．００当量）の溶液に、ＨＡＴＵ（５７０ｇ、１．５０ｍｏｌ、１．５０当量）およびＤＩＥＡ（２５８ｇ、２．００ｍｏｌ、３４８ｍＬ、２．００当量）を０℃で添加し、混合物を０℃で３０分間撹拌し、その後、化合物１Ｂ（６０６ｇ、１．２０ｍｏｌ、１．２０当量）を添加し、混合物を２５℃で１時間撹拌する。ＬＣＭＳは、所望のＭＳが与えられることを示した。混合物を１バッチに合わせ、その後、混合物をＤＣＭ（５．００Ｌ）で希釈し、１ＮのＨＣｌ水溶液（２．００Ｌ＊２）で洗浄し、有機層を飽和Ｎａ２ＣＯ３水溶液（２．００Ｌ＊２）およびブライン（２．００Ｌ）で洗浄し、有機層をＮａ２ＳＯ４で乾燥させ、濾過し、真空下で濃縮することで、黄色油として化合物３Ｂ（３．８８ｋｇ、粗製）を得た。
ＴＲＩＳ－ＰＥＧ２－ＣＢＺの調製のための基本手順
ＨＣｌ／ジオキサン（４Ｍ、２．９１Ｌ、２３．８当量）中の化合物３Ｂ（７７５ｇ、４８７ｍｍｏｌ、５０．３％の純度、１．００当量）の溶液を、２時間２５℃で撹拌する。ＬＣＭＳは、所望のＭＳが与えられることを示した。混合物を真空下で濃縮することで、残渣を得た。次いで、組み合わせた残渣をＤＣＭ（５．００Ｌ）で希釈し、２．５ＭのＮａＯＨ水溶液でｐＨ＝８に調整し、分離する。水相をＤＣＭ（３．００Ｌ）で再度抽出し、その後、水溶液を１ＮのＨＣｌ水溶液でｐＨ＝３に調整し、次いでＤＣＭ（５．００Ｌ＊２）で抽出し、組み合わせた有機層をブライン（３．００Ｌ）で洗浄し、Ｎａ２ＳＯ４で乾燥させ、濾過し、真空下で濃縮する。粗製物をカラムクロマトグラフィー（ＳｉＯ２、ＤＣＭ：ＭｅＯＨ＝０：１～１２：１、０．１％ＨＯＡｃ、Ｒｆ＝０．４）によって精製する。残渣をＤＣＭ（５．００Ｌ）で希釈し、２．５ＭのＮａＯＨ水溶液でｐＨ＝８に調整し、分離させ、水溶液をＤＣＭ（３．００Ｌ）で再度抽出し、その後、水溶液を６ＮのＨＣｌ水溶液でｐＨ＝３に調整し、ＤＣＭ：ＭｅＯＨ＝１０：１（５．００Ｌ＊２）で抽出し、組み合わせた有機層をブライン（２．００Ｌ）で洗浄し、Ｎａ２ＳＯ４で乾燥させ、濾過し、真空下で濃縮することで、残渣を得る。その後、残渣をＭｅＣＮ（５．００Ｌ）で希釈し、真空下で濃縮し、この手順を２回繰り返して水を除去することで、淡黄色の油としてＴＲＩＳ－ＰＥＧ２－ＣＢＺ（１．２５ｋｇ、１．９１ｍｏｌ、７８．１％の収率、９５．８％の純度）を得る。１Ｈ ＮＭＲ：４００ ＭＨｚ， ＭｅＯＤ， δ ７．３０－７．３５（５Ｈ），５．０７（ｓ，２Ｈ），３．６５－３．７０（ｍ，１６Ｈ），３．５９（ｓ，４Ｈ），３．４５（ｔ，Ｊ＝５．６Ｈｚ），２．５１（ｔ，Ｊ＝６．０Ｈｚ），２．４３（ｔ，６．４ Ｈｚ）．
ＴｒｉＮＧａｌ－ＴＲＩＳ－Ｐｅｇ２－Ｐｈｏｓｐｈ ８ｃの調製のためのスキーム
ＴｒｉＧＮａｌ－ＴＲＩＳ－Ｐｅｇ２－Ｐｈｏｓｐｈ ８ｃ
化合物３Ｃの調製のための基本手順
ＡＣＮ（１５００ｍＬ）中の化合物１Ｃ（１５５ｇ、２４５ｍｍｏｌ、１．００当量）の溶液に、ＴＢＴＵ（２６０ｇ、８１１ｍｍｏｌ、３．３０当量）、ＤＩＥＡ（２０９ｇ、１．６２ｍｏｌ、２８２ｍＬ、６．６０当量）、および化合物２Ｃ（４９２ｇ、８１１ｍｍｏｌ、３．３０当量、ＴｓＯＨ）を０℃で添加し、混合物を１５℃で１６時間撹拌する。ＬＣＭＳは、所望のＭＳが与えられることを示した。混合物を真空下で濃縮して残渣を得て、その後、混合物をＤＣＭ（２０００ｍＬ）で希釈し、１ＮのＨＣｌ水溶液（７００ｍＬ×２）、次いで、飽和ＮａＨＣＯ３水溶液（７００ｍＬ×２）で洗浄し、真空下で濃縮する。粗製物をカラムクロマトグラフィーにより精製して、黄色固形物として化合物３Ｃ（３０４ｇ、１５５ｍｍｏｌ、６３．１％の収率、純度９６．０％）を得る。
化合物４Ｃの調製のための基本手順
ＭｅＯＨ（１６００ｍＬ）中の化合物３Ｃ（５５．０ｇ、２９．２ｍｍｏｌ、１．００当量）の２バッチ溶液に、Ｐｄ／Ｃ（６．６０ｇ、１９．１ｍｍｏｌ、純度１０．０％）およびＴＦＡ（３．３４ｇ、２９．２ｍｍｏｌ、２．１７ｍＬ、１．００当量）を添加し、混合物を真空下で脱気し、Ｈ２でパージする。混合物を２時間１５℃にてＨ２（１５ｐｓｉ）下で撹拌する。ＬＣＭＳは、所望のＭＳが与えられることを示した。混合物を濾過し、濾液を真空下で濃縮して、白色固形物として化合物４Ｃ（１０６ｇ、５４．８ｍｍｏｌ、収率９３．７％、純度９６．２％、ＴＦＡ）を得る。
化合物５Ｃの調製のための基本手順
並行する２つのバッチ。ＤＣＭ（１２５ｍＬ）中のＥＤＣＩ（２８．８ｇ、１５０ｍｍｏｌ、１．００当量）の溶液に、化合物４ａ（２５．０ｇ、１５０ｍｍｏｌ、１．００当量）を０℃で滴下し、その後、混合物をＤＣＭ（１２５ｍＬ）中の化合物４（２５．０ｇ、１５０ｍｍｏｌ、１．００当量）に０℃で添加し、混合物を２５℃で１時間撹拌する。ＴＬＣ（石油エーテル：酢酸エチル＝３：１、Ｒｆ＝０．４５）は、反応物が消費され、１つの新しい斑点が形成されることを示した。反応混合物をＤＣＭ（１００ｍＬ）で希釈し、その後、飽和ＮａＨＣＯ３水溶液（２５０ｍＬ＊１）およびブライン（２５０ｍＬ）で洗浄し、Ｎａ２ＳＯ４で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮することで、残渣を得る。残渣をカラムクロマトグラフィー（ＳｉＯ２、石油エーテル：酢酸エチル＝１００：１～３：１）、ＴＬＣ（ＳｉＯ２、石油エーテル：酢酸エチル＝３：１）、Ｒｆ＝０．４５により精製し、その後、減圧下で濃縮することで、残渣を得る。化合物５Ｃ（５７．０ｇ、１７６ｍｍｏｌ、５８．４％の収率、純度９６．９％）を無色の油として得て、１Ｈ ＮＭＲを確認した。ＥＷ３３０７２－２－Ｐ１Ａ， ４００ ＭＨｚ， ＤＭＳＯ δ ９．２１（ｓ，１Ｈ），７．０７－７．０９（ｍ，２Ｈ），６．６７－６．７０（ｍ，２Ｈ），３．０２－３．０４（ｍ，２Ｈ），２．８６－２．９０（ｍ，２Ｈ）
化合物６の調製のための基本手順
ＤＣＭ（８００ｍＬ）中の化合物３（７９．０ｇ、４１．０ｍｍｏｌ、純度９６．４％、１．００当量、ＴＦＡ）および化合物６Ｃ（１４．２ｇ、４３．８ｍｍｏｌ、純度９６．９％、１．０７当量）の混合物に、０℃でＴＥＡ（１６．６ｇ、１６４ｍｍｏｌ、２２．８ｍＬ、４．００当量）を滴下し、混合物を１５℃で１６時間撹拌する。ＬＣＭＳ（ＥＷ３３０７２－１２－Ｐ１Ｂ、Ｒｔ＝０．８４４分）は、所望の質量が検出されることを示した。反応混合物をＤＣＭ（４００ｍＬ）で希釈し、飽和ＮａＨＣＯ３水溶液（４００ｍＬ＊１）およびブライン（４００ｍＬ＊１）で洗浄し、混合物をＤＣＭ（２．００Ｌ）で希釈し、０．７ＭのＮａ２ＣＯ３（１０００ｍＬ＊３）およびブライン（８００ｍＬ＊３）で洗浄し、Ｎａ２ＳＯ４で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮することで、残渣を得た。残渣を精製することなく次の工程に直接使用する。化合物６（８０．０ｇ、粗製）を白色固形物として得て、１Ｈ ＮＭＲによって確認する。ＥＷ３３０７２－１２－Ｐ１Ａ， ４００ ＭＨｚ， ＭｅＯＤ δ ７．０２－７．０４（ｍ，２Ｈ），６．６８－６．７０（ｍ，２Ｈ），５．３４－５．３５（ｓ，３Ｈ），５．０７－５．０８（ｄ，Ｊ＝４．００Ｈｚ，３Ｈ），４．６２－４．６４（ｄ，Ｊ＝８．００Ｈｚ，３Ｈ），３．７１－４．１６（ｍ，１６Ｈ），３．３１－３．７０（ｍ，４４Ｈ），２．８０－２．８３（ｍ，２Ｈ），２．６８（ｍ，２Ｈ），２．４６－２．４７（ｍ，１０Ｈ），２．１４（ｓ，９Ｈ），２．０３（ｓ，９Ｈ），１．９４－１．９５（ｄ，Ｊ＝４．００Ｈｚ，１８Ｈ）．
ＴｒｉＧＮａｌ－ＴＲＩＳ－Ｐｅｇ２－Ｐｈｏｓｐｈ ８ｃの調製のための基本手順
２つのバッチは並行して合成される。ＤＣＭ（６００ｍＬ）中の化合物６Ｃ（４０．０ｇ、２１．１ｍｍｏｌ、１．００当量）の溶液に、ＤＣＭ（８．００ｍＬ）中のジイソプロピルアンモニウムテトラゾリド（３．６２ｇ、２１．１ｍｍｏｌ、１．００当量）および化合物７ｃ（６．３７ｇ、２１．１ｍｍｏｌ、６．７１ｍＬ、１．００当量）を滴加し、混合物を３０℃で１時間撹拌し、その後、ＤＣＭ（８．００ｍＬ）中の化合物７ｃ（３．１８ｇ、１０．６ｍｍｏｌ、３．３５ｍＬ、０．５０当量）を滴下し、混合物を３０℃で３０分間撹拌し、その後、ＤＣＭ（８．００ｍＬ）中の化合物７ｃ（３．１８ｇ、１０．６ｍｍｏｌ、３．３５ｍＬ、０．５０当量）を滴下し、混合物を３０℃で１．５時間撹拌する。ＬＣＭＳ（ＥＷ３３０７２－１７－Ｐ１Ｃ１、Ｒｔ＝０．９２１分）は、所望のＭＳ＋１が検出されることを示した。ＬＣＭＳ（ＥＷ３３０７２－１７－Ｐ１Ｃ２、Ｒｔ＝０．９１９分）は、所望のＭＳ＋１が検出されることを示した。２つのバッチをワークアップのために組み合わせる。混合物をＤＣＭ（１．２０Ｌ）で希釈し、飽和ＮａＨＣＯ３水溶液（１．６０Ｌ＊２）、Ｈ２Ｏ中３％ＤＭＦ（１．６０Ｌ＊２）、Ｈ２Ｏ（１．６０Ｌ＊３）、ブライン（１．６０Ｌ）で洗浄し、Ｎａ２ＳＯ４で乾燥させ、濾過し、減圧下で濃縮することで、残渣を得る。残渣をカラムクロマトグラフィー（ＳｉＯ２、ＤＣＭ：ＭｅＯＨ：ＴＥＡ＝１００：３：２）ＴＬＣ（ＳｉＯ２、ＤＣＭ：ＭｅＯＨ＝１０：１、Ｒｆ＝０．４５）によって精製し、その後、減圧下で濃縮することで、残渣を得る。化合物８Ｃ（７６．０ｇ、３４．８ｍｍｏｌ、８２．５％の収率、純度９６．０％）を白色固形物として得て、１Ｈ ＮＭＲによって確認する。ＥＷ３３０７２－１９－Ｐ１Ｃ， ４００ ＭＨｚ， ＭｅＯＤ δ ７．１３－７．１５（ｄ，Ｊ＝８．５０Ｈｚ，２Ｈ），６．９５－６．９７（ｄｄ，Ｊ＝８．３８， １．１３Ｈｚ，２Ｈ），５．３４（ｄ，Ｊ＝２．８８Ｈｚ，３Ｈ），．０９（ｄｄ，Ｊ＝１１．２６， ３．３８Ｈｚ，３Ｈ），４．６４（ｄ，Ｊ＝８．５０Ｈｚ，３Ｈ），３．９９－４．２０（ｍ，１２Ｈ），３．８８－３．９８（ｍ，５Ｈ），３．６６－３．８３（ｍ，２０Ｈ），３．５１－３．６５（ｍ，１７Ｈ），３．３３－３．５０（ｍ，９Ｈ），２．８７（ｔ，Ｊ＝７．６３Ｈｚ，２Ｈ），２．７６（ｔ，Ｊ＝５．９４Ｈｚ，２Ｈ），２．４２－２．５０（ｍ，１０Ｈ），２．１４（ｓ，９Ｈ），２．０３（ｓ，９Ｈ），１．９４－１．９５（ｄ，Ｊ＝６．１３Ｈｚ，１８Ｈ），１．２４－１．２６（ｄ，Ｊ＝６．７５Ｈｚ，６Ｈ），１．１８－１．２０（ｄ，Ｊ＝６．７５Ｈｚ，６Ｈ）
実施例２０：修飾モチーフ１
ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡの例は、以下の修飾の組み合わせを含む。
・センス鎖の９位（５’から３’）は２’Ｆである。
・９位がピリミジンである場合、センス鎖中のすべてのプリンは２’ＯＭｅであり、５位と１１位との間の１～５個のピリミジンは２’Ｆであるが、ただし、一列に３つの２’Ｆ修飾は存在しない。
・９位がプリンである場合、センス鎖中のすべてのピリミジンは２’ＯＭｅであり、５位と１１位との間の１～５個のプリンは２’Ｆであるが、ただし、一列に３つの２’Ｆ修飾は存在しない。
・アンチセンス鎖の奇数位は２’ＯＭｅであり、偶数位は２’Ｆ、２’ＯＭｅ、および２’デオキシの混合物である。
実施例２１：修飾モチーフ２
ＭＳＴ１ ｓｉＲＮＡの例は、以下の修飾の組み合わせを含む。
・センス鎖の９位（５’から３’）は２’デオキシである。
・センス鎖の５位、７位、および８位は２’Ｆである。
・１０位～２１位のピリミジンはすべて２’ＯＭｅであり、プリンは２’ＯＭｅおよび２’Ｆの混合物である。代替的に、１０位～２１位のすべてのプリンは２’ＯＭｅであり、１０位～２１位のすべてのピリミジンは２’ＯＭｅおよび２’Ｆの混合物である。
・アンチセンス鎖の奇数位は２’ＯＭｅであり、偶数位は２’Ｆ、２’ＯＭｅ、および２’デオキシの混合物である。
本発明の好ましい実施形態が本明細書に示され、説明されてきたが、そのような実施形態はほんの一例としてのみ提供されることが当業者には明らかであろう。当業者であれば、多くの変形、変更、および置換が、本発明から逸脱することなく思い浮かぶであろう。本明細書に記載される本発明の実施形態の様々な代替案が、本発明の実施に際して利用され得ることを理解されたい。以下の特許請求の範囲は本発明の範囲を定義し、この特許請求の範囲内の方法および組成物、ならびにその均等物がそれによって包含されることが意図されている。
ＩＶ．配列情報
いくつかの実施形態は、以下の表の１つ以上の核酸配列を含む。

Claims (41)

  1. ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されると肺機能測定値を増加させるオリゴヌクレオチドを含む組成物。
  2. 前記肺機能測定値は、１秒量（ＦＥＶ１）測定値、予測１秒量に対する比率（ＦＥＶ１ｐｐ）測定値、努力肺活量（ＦＶＣ）測定値、ＦＥＶ１／ＦＶＣ比測定値、努力呼気量、または最大呼気流量測定値を含む、請求項１に記載の組成物。
  3. 前記肺機能測定値は、投与前と比較して、約１０％以上増加する、請求項１に記載の組成物。
  4. ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されると白血球測定値を減少させるオリゴヌクレオチドを含む、組成物。
  5. 前記白血球測定値は肺白血球測定値を含む、請求項４に記載の組成物。
  6. 前記白血球測定値は循環白血球測定値を含む、請求項４に記載の組成物。
  7. 前記白血球測定値は、好中球測定値、好酸球測定値、好塩基球測定値、単球測定値、もしくはリンパ球測定値、またはそれらの組み合わせを含む、請求項４に記載の組成物。
  8. 前記白血球測定値は、投与前と比較して、約１０％以上減少する、請求項４に記載の組成物。
  9. ＭＳＴ１を標的とし、かつ、有効量で対象に投与されると慢性閉塞性肺疾患（ＣＯＰＤ）または喘息増悪の測定値を減少させるオリゴヌクレオチドを含む、組成物。
  10. 前記ＣＯＰＤまたは喘息増悪の測定値は、投与前と比較して、約１０％以上減少する、請求項９に記載の組成物。
  11. 前記オリゴヌクレオチドは修飾ヌクレオシド間結合を含む、請求項１、４、または９のいずれか１つに記載の組成物。
  12. 前記修飾ヌクレオシド間結合は、アルキルホスホネート、ホスホロチオエート、メチルホスホネート、ホスホロジチオエート、アルキルホスホノチオエート、ホスホロアミデート、カルバメート、カーボネート、リン酸トリエステル、アセトアミデート、もしくはカルボキシメチルエステル、またはそれらの組み合わせを含む、請求項１１に記載の組成物。
  13. 前記修飾ヌクレオシド間結合は、１個以上のホスホロチオエート結合を含む、請求項１１に記載の組成物。
  14. 前記オリゴヌクレオチドは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、請求項１、４、または９のいずれか１つに記載の組成物。
  15. 前記オリゴヌクレオチドは修飾ヌクレオシドを含む、請求項１、４、または９のいずれか１つに記載の組成物。
  16. 前記修飾ヌクレオシドは、ロックド核酸（ＬＮＡ）、ヘキシトール核酸（ＨＬＡ）、シクロヘキセン核酸（ＣｅＮＡ）、２’－メトキシエチル、２’－Ｏ－アルキル、２’－Ｏ－アリル、２’－Ｏ－アリル、２’－フルオロ、もしくは２’－デオキシ、またはこれらの組み合わせを含む、請求項１５に記載の組成物。
  17. 前記修飾ヌクレオシドはＬＮＡを含む、請求項１５に記載の組成物。
  18. 前記修飾ヌクレオシドは、２’，４’拘束エチル核酸を含む、請求項１５に記載の組成物。
  19. 前記修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－メチルヌクレオシド、２’－デオキシフルオロヌクレオシド、２’－Ｏ－Ｎ－メチルアセトアミド（２’－Ｏ－ＮＭＡ）ヌクレオシド、２’－Ｏ－ジメチルアミノエトキシエチル（２’－Ｏ－ＤＭＡＥＯＥ）ヌクレオシド、２’－Ｏ－アミノプロピル（２’－Ｏ－ＡＰ）ヌクレオシド、もしくは２’－ａｒａ－Ｆ、またはこれらの組み合わせを含む、請求項１５に記載の組成物。
  20. 前記修飾ヌクレオシドは、１つ以上の２’フルオロ修飾ヌクレオシドを含む、請求項１５に記載の組成物。
  21. 前記修飾ヌクレオシドは、２’Ｏ－アルキル修飾ヌクレオシドを含む、請求項１５に記載の組成物。
  22. 前記オリゴヌクレオチドは、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、または２１個の修飾ヌクレオシドを含む、請求項１、４、または９のいずれか１つに記載の組成物。
  23. 前記オリゴヌクレオチドは、前記オリゴヌクレオチドの３’末端または５’末端で結合した脂質を含む、請求項１、４、または９のいずれか１つに記載の組成物。
  24. 前記脂質は、コレステロール、ミリストイル、パルミトイル、ステアロイル、リトコロイル、ドコサノイル、ドコサヘキサエノイル、ミリスチル、パルミチルステアリル、もしくはα－トコフェロール、またはこれらの組み合わせを含む、請求項２３に記載の組成物。
  25. 前記オリゴヌクレオチドは、前記オリゴヌクレオチドの３’末端または５’末端で結合した糖部分を含む、請求項１、４、または９のいずれか１つに記載の組成物。
  26. 前記糖部分はＮ－アセチルガラクトサミン（ＧａｌＮＡｃ）、Ｎ－アセチルグルコサミン（ＧｌｃＮＡｃ）、またはマンノースを含む、請求項２５に記載の組成物。
  27. 前記オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの３’末端または５’末端で結合したインテグリン標的化リガンドを含む、請求項１、４、または９のいずれか１つに記載の組成物。
  28. インテグリンはインテグリンα－ｖ－β－６を含む、請求項２７に記載の組成物。
  29. 前記インテグリン標的化リガンドは、アルギニン－グリシン－アスパラギン酸（ＲＧＤ）ペプチドを含む、請求項２７に記載の組成物。
  30. 前記オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含む低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）を含む、請求項１、４、または９のいずれか１つに記載の組成物。
  31. 前記センス鎖は１２～３０ヌクレオシド長である、請求項３０に記載の組成物。
  32. 前記アンチセンス鎖は１２～３０ヌクレオシド長である、請求項３０に記載の組成物。
  33. ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含む組成物であって、前記オリゴヌクレオチドは、センス鎖およびアンチセンス鎖を含むｓｉＲＮＡを含み、各鎖は独立して約１２～３０ヌクレオシド長であり、センス鎖およびアンチセンス鎖の少なくとも１つは、配列番号６１８５の約１２～３０個の隣接するヌクレオシドを含むヌクレオシド配列を含む、組成物。
  34. 前記センス鎖に関して、以下：
    すべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、すべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含み、
    すべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、すべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含み、
    すべてのプリンは２’フルオロ修飾プリンを含み、すべてのピリミジンは２’メチル修飾ピリミジンを含み、
    すべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、すべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含み、
    すべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、すべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含み、または、
    すべてのピリミジンは２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、すべてのプリンは２’メチル修飾プリンを含む、
    のいずれか１つが当てはまる、請求項１、４、９、または３３のいずれか１つに記載の組成物。
  35. 前記アンチセンス鎖に関して、以下：
    すべてのプリンは、２’フルオロ修飾プリンを含み、すべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含み、
    すべてのプリンは、２’メチル修飾プリンを含み、すべてのピリミジンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾ピリミジンの混合物を含み、
    すべてのプリンは２’メチル修飾プリンを含み、すべてのピリミジンは２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、
    すべてのピリミジンは、２’フルオロ修飾ピリミジンを含み、すべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含み、
    すべてのピリミジンは、２’メチル修飾ピリミジンを含み、すべてのプリンは、２’フルオロおよび２’メチル修飾プリンの混合物を含み、または、
    すべてのピリミジンは２’メチル修飾ピリミジンを含み、すべてのプリンは２’フルオロ修飾プリンを含む、
    のいずれか１つが当てはまる、請求項３０に記載の組成物。
  36. 前記オリゴヌクレオチドはアンチセンスオリゴヌクレオチド（ＡＳＯ）を含む、請求項１、４、または９のいずれか１つに記載の組成物。
  37. 前記ＡＳＯは１２～３０ヌクレオシド長である、請求項３６に記載の組成物。
  38. ＭＳＴ１の発現を阻害するオリゴヌクレオチドを含む組成物であって、前記オリゴヌクレオチドは、約１２～３０ヌクレオシド長のＡＳＯと、配列番号６１８５の約１２～３０個の隣接するヌクレオシドに相補的なヌクレオシド配列とを含む、組成物。
  39. 薬学的に許容可能な担体をさらに含む、請求項１、４、９、３３、または３８のいずれか１つに記載の組成物。
  40. 肺障害を有する対象を処置する方法であって、有効量の請求項３９に記載の組成物を前記対象に投与する工程を含む、方法。
  41. 前記肺障害は、ＣＯＰＤ、ＣＯＰＤの急性増悪、気腫、慢性気管支炎、喘息、喘息重積状態、喘息－ＣＯＰＤ重複症候群（ＡＣＯＳ）、咳、肺癌、間質性肺疾患、または肺線維症を含む、請求項４０に記載の方法。
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