JP2022153244A - 熱安定性が向上した変異型グルコースデヒドロゲナーゼ及びその利用 - Google Patents
熱安定性が向上した変異型グルコースデヒドロゲナーゼ及びその利用 Download PDFInfo
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Abstract
【課題】熱安定性の向上したグルコース脱水素酵素を提供すること【解決手段】本発明は、触媒サブユニット、電子伝達サブユニット、及びヒッチハイカーサブユニットを含む変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素であって、前記触媒サブユニットのアミノ酸配列と前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列の各々がその中に導入されたシステイン残基を含み、前記触媒サブユニット及び前記電子伝達サブユニットが前記システイン残基間のジスルフィド結合を介して相互に結合することで熱安定性が改善された前記FAD依存性グルコース脱水素酵素を提供する。【選択図】図1
Description
本発明はバイオテクノロジー、及び変異型グルコース脱水素酵素を利用するグルコースの電気化学測定に関する。
タンパク質の熱安定性を改善するために多数の方法が開発されてきた。改善のための公知の人工的アプローチの例にはグリコシル化、化学的架橋、及び重合体への結合が挙げられる。これらの方法は任意の標的タンパク質に対して広範に適用可能であり、それはこれらの方法がこれらの標的タンパク質を包括的に保護することでそれらのタンパク質を安定化させるからである。しかしながら、酵素の場合ではこれらの方法は酵素活性に対して結果の再現性の低下という無視できない影響を有し、精製及び修飾のための追加工程が必要になる等、実用上の問題を引き起こす。
米国特許第9074239号明細書(特許文献1)及び米国特許第8945359号明細書(特許文献2)は部位特異的変異導入によりFAD依存性グルコース脱水素酵素(FAD-GDH)の熱安定性を改善するための技法について開示している。ただし、これらの文書はサブユニット間の結合の安定化を触媒サブユニット内での変異導入との関連で示唆していない。米国特許第8945359号明細書(特許文献2)はその変異体の50℃における特異的活性が30℃における特異的活性と比べてわずかに50%であること、及びその変異体が60℃という高温条件では不活性化されることを記載している。
Biotechnol Lett誌、1774~8頁(2015年)(非特許文献1)には触媒サブユニットの2つの特定の部位に導入されたシステイン残基を含む変異型酵素が活性及び特異性を維持しながらも、改善された耐熱性を示したことが報告されている。
Biotechnol Lett誌、1774~8頁(2015年)(非特許文献1)には触媒サブユニットの2つの特定の部位に導入されたシステイン残基を含む変異型酵素が活性及び特異性を維持しながらも、改善された耐熱性を示したことが報告されている。
Biotechnol Lett誌、1774~8頁(2015年)
グルコース脱水素酵素はグルコースセンサーに使用されることが多い酵素である。
糖尿病患者による血糖自己測定において日常的に使用されるグルコースセンサーにはどんな状況又は環境でも正確な測定値を示すことが求められている。したがって、性能の重要な因子である前記酵素は熱不活化を回避するような高い安定性を有することが必要とされる。
したがって、本発明は、熱安定性の向上したグルコース脱水素酵素を提供することを課題とする。
糖尿病患者による血糖自己測定において日常的に使用されるグルコースセンサーにはどんな状況又は環境でも正確な測定値を示すことが求められている。したがって、性能の重要な因子である前記酵素は熱不活化を回避するような高い安定性を有することが必要とされる。
したがって、本発明は、熱安定性の向上したグルコース脱水素酵素を提供することを課題とする。
電子伝達サブユニットを含むヘテロ三量体であるFAD-GDHの結晶構造についての情報に基づき、本発明者らはサブユニット間接触面上の特定の部位にシステイン残基を導入してその接触面上にジスルフィド結合を形成することによりそのヘテロ三量体の高次構
造の安定化及び耐熱性の顕著な改善に成功した。さらに、この変異型酵素の電子伝達活性は、この酵素の分子内電子伝達経路内にあると考えられている位置にシステイン残基が導入されていることにより顕著に増大している可能性があるため、本発明者らはこれらのシステイン残基が前記サブユニット間の架橋だけでなく、電子伝達の促進にも重要な役割を果たしていることを見出した。
造の安定化及び耐熱性の顕著な改善に成功した。さらに、この変異型酵素の電子伝達活性は、この酵素の分子内電子伝達経路内にあると考えられている位置にシステイン残基が導入されていることにより顕著に増大している可能性があるため、本発明者らはこれらのシステイン残基が前記サブユニット間の架橋だけでなく、電子伝達の促進にも重要な役割を果たしていることを見出した。
本発明の1つの形態では酵素活性を低下させることなく熱安定性が安定した変異型グルコース脱水素酵素が提供される。
本発明の1つの態様によると、
触媒サブユニット、
電子伝達サブユニット、及び
ヒッチハイカーサブユニット
を含む変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素であって、前記触媒サブユニットのアミノ酸配列と前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列の各々がその中に導入されたシステイン残基を含み、前記触媒サブユニット及び前記電子伝達サブユニットが前記システイン残基間のジスルフィド結合を介して相互に結合している前記変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素が提供される。
触媒サブユニット、
電子伝達サブユニット、及び
ヒッチハイカーサブユニット
を含む変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素であって、前記触媒サブユニットのアミノ酸配列と前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列の各々がその中に導入されたシステイン残基を含み、前記触媒サブユニット及び前記電子伝達サブユニットが前記システイン残基間のジスルフィド結合を介して相互に結合している前記変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素が提供される。
本発明の別の態様によると、前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列がその中に導入された別のシステイン残基を含み、且つ、前記ヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列がその中に導入されたシステイン残基を含み、前記システイン残基間のジスルフィド結合を介して前記ヒッチハイカーサブユニット及び前記電子伝達サブユニットが相互に結合している前記変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素が提供される。
本発明の別の態様によると、前記触媒サブユニットのアミノ酸配列及び前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列がそれらの中に導入されたシステイン残基を含み、前記触媒サブユニット及び前記電子伝達サブユニットが前記システイン残基間のジスルフィド結合を介して相互に結合しており、同時に前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列がその中に導入された別のシステイン残基を含み、前記ヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列がその中に導入されたシステイン残基を含み、前記システイン残基間のジスルフィド結合を介して前記ヒッチハイカーサブユニット及び前記電子伝達サブユニットが相互に結合している前記変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素が提供される。
本発明の別の態様によると、前記変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素を含む酵素電極が提供される。
本発明の別の態様によると、前記酵素電極を含むバイオセンサーが提供される。
本発明によれば、熱安定性の向上したFAD依存性グルコース脱水素酵素が提供される。
本発明の1つの実施形態による前記グルコース脱水素酵素は、
触媒サブユニット(αサブユニット)、
電子伝達サブユニット(βサブユニット)、及び
ヒッチハイカーサブユニット(γサブユニット)
を含むFAD依存性グルコース脱水素酵素であって、少なくとも前記触媒サブユニット及び前記電子伝達サブユニットの各々がその中に導入されたシステイン残基を含み、これらのシステイン残基がそれらの間にジスルフィド結合を形成している前記FAD依存性グルコース脱水素酵素である。
これより後に本明細書において前記グルコース脱水素酵素を変異型グルコース脱水素酵素(GDH)又は変異型FAD-GDHと呼ぶ。
本明細書では、酵素はシステイン残基の導入により変異体となり、触媒活性はフラビンアデニンジヌクレオチド(FAD)に依存する。 なお、本明細書において、システイン残基の導入とは、配列中の既存の残基をシステイン残基に置換して導入すること(例えば、以下に示す残基に導入すること)、または配列中にシステイン残基を導入すること(例えば、以下に示す残基の直前または直後に導入すること)をいう。 したがって、本発明の変
異型GDHは、以下に示す残基の位置にシステイン残基を含んでいてもよいし、以下に示す
残基の直前または直後の隣接する残基にシステイン残基を含んでいてもよい。
触媒サブユニット(αサブユニット)、
電子伝達サブユニット(βサブユニット)、及び
ヒッチハイカーサブユニット(γサブユニット)
を含むFAD依存性グルコース脱水素酵素であって、少なくとも前記触媒サブユニット及び前記電子伝達サブユニットの各々がその中に導入されたシステイン残基を含み、これらのシステイン残基がそれらの間にジスルフィド結合を形成している前記FAD依存性グルコース脱水素酵素である。
これより後に本明細書において前記グルコース脱水素酵素を変異型グルコース脱水素酵素(GDH)又は変異型FAD-GDHと呼ぶ。
本明細書では、酵素はシステイン残基の導入により変異体となり、触媒活性はフラビンアデニンジヌクレオチド(FAD)に依存する。 なお、本明細書において、システイン残基の導入とは、配列中の既存の残基をシステイン残基に置換して導入すること(例えば、以下に示す残基に導入すること)、または配列中にシステイン残基を導入すること(例えば、以下に示す残基の直前または直後に導入すること)をいう。 したがって、本発明の変
異型GDHは、以下に示す残基の位置にシステイン残基を含んでいてもよいし、以下に示す
残基の直前または直後の隣接する残基にシステイン残基を含んでいてもよい。
したがって、前記変異型グルコース脱水素酵素は3サブユニットから構成される三量体である。これらのサブユニットはリンカー及び/又はそのようなものを介して相互に結合していてよい。
前記3サブユニットから構成される三量体であるFAD-GDHの公知の例にはバークホルデリア・セパシア(Burkholderia cepacia)、バークホルデリア・セノセパシア(Burkholderia cenocepacia)、バークホルデリア・タイランデンシス(Burkholderia thailandensis)、ラルストニア・ピケッティイ(Ralstonia pickettii)、ラルストニア・ソ
ラナセアラム(Ralstonia solanacearum)、バークホルデリア・ファイトフィルマンス(Burkholderia phytofirmans)、ラルストニア エスピー(Ralstonia sp.)、モラクセラ
科細菌(Moraxellaceae bacterium)、シュードモナス・クナックムッシイ(Pseudomonas
knackmussii)、エルシニア・ヌルミイ(Yersinia nurmii)、エダホビルガ・クレメア
(Edaphovirga cremea)、シルビモナス・テラエ(Silvimonas terrae)ザイモバクター・パルマエ(Zymobacter palmae)、コベティア エスピー(Cobetia sp.)、ハロモナス エスピー(Halomonas sp.)またはエウィンゲラ・アメリカナ(Ewingella americana)のFAD-GDHが挙げられる。本発明の1つの実施形態による前記変異型FAD-GDHは前記FAD-GDHに変異を導入することにより得られる。
前記3サブユニットから構成される三量体であるFAD-GDHの公知の例にはバークホルデリア・セパシア(Burkholderia cepacia)、バークホルデリア・セノセパシア(Burkholderia cenocepacia)、バークホルデリア・タイランデンシス(Burkholderia thailandensis)、ラルストニア・ピケッティイ(Ralstonia pickettii)、ラルストニア・ソ
ラナセアラム(Ralstonia solanacearum)、バークホルデリア・ファイトフィルマンス(Burkholderia phytofirmans)、ラルストニア エスピー(Ralstonia sp.)、モラクセラ
科細菌(Moraxellaceae bacterium)、シュードモナス・クナックムッシイ(Pseudomonas
knackmussii)、エルシニア・ヌルミイ(Yersinia nurmii)、エダホビルガ・クレメア
(Edaphovirga cremea)、シルビモナス・テラエ(Silvimonas terrae)ザイモバクター・パルマエ(Zymobacter palmae)、コベティア エスピー(Cobetia sp.)、ハロモナス エスピー(Halomonas sp.)またはエウィンゲラ・アメリカナ(Ewingella americana)のFAD-GDHが挙げられる。本発明の1つの実施形態による前記変異型FAD-GDHは前記FAD-GDHに変異を導入することにより得られる。
本発明の1つの実施形態によると前記変異型FAD-GDHでは前記触媒サブユニットのアミノ酸配列と前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列の各々がその中に導入されたシステイン残基を含み、前記触媒サブユニット及び前記電子伝達サブユニットが前記システイン残基間のジスルフィド結合を介して相互に結合している。システイン残基の導入にはアミノ酸置換による導入及び挿入による導入が挙げられる。
バークホルデリア・セパシアのFAD-GDHを例として用いて各サブユニットを以下に説明する。ただし、前記変異型GDHは以下の実施形態に限定されない。
前記バークホルデリア・セパシアは限定されない。例えば、バークホルデリア・セパシアKS1株が使用されてよい。バークホルデリア・セパシアKS1株はFERM BP-7306の受入番号で2000年9月25日に産業技術総合研究所特許生物寄託センター(現在の独立行政法人製品評価技術基盤機構生物資源センター特許生物寄託センター(NITE IPOD))に寄託されている。
前記バークホルデリア・セパシアは限定されない。例えば、バークホルデリア・セパシアKS1株が使用されてよい。バークホルデリア・セパシアKS1株はFERM BP-7306の受入番号で2000年9月25日に産業技術総合研究所特許生物寄託センター(現在の独立行政法人製品評価技術基盤機構生物資源センター特許生物寄託センター(NITE IPOD))に寄託されている。
<触媒サブユニット>
αサブユニットとも呼ばれる前記触媒サブユニットはFAD(フラビンアデニンジヌク
レオチド)に依存してグルコース脱水素の触媒活性を有するポリペプチドである。前記触媒サブユニットは、Fe-Sクラスターを含有していることが好ましい。
配列番号3はバークホルデリア・セパシアKS1株のFAD-GDH触媒サブユニットのアミノ酸配列である。この配列を参照しながら以下の説明を行う。
αサブユニットとも呼ばれる前記触媒サブユニットはFAD(フラビンアデニンジヌク
レオチド)に依存してグルコース脱水素の触媒活性を有するポリペプチドである。前記触媒サブユニットは、Fe-Sクラスターを含有していることが好ましい。
配列番号3はバークホルデリア・セパシアKS1株のFAD-GDH触媒サブユニットのアミノ酸配列である。この配列を参照しながら以下の説明を行う。
前記触媒サブユニットのアミノ酸配列中のシステイン導入部位は、前記FAD-GDHの空間的構造中で前記電子伝達サブユニットとの接触面を形成する領域中にあることが好ましい。例えば、配列番号3のアミノ酸位置200~240の領域中の位置にシステインが導入される。したがって、配列番号3のアミノ酸位置200~240の領域中のアミノ酸残基がシステインで置換される。前記触媒サブユニット中のこの領域はGDHの空間的構造中の前記電子伝達サブユニットとの接触面上に位置する領域である。
この領域中の前記アミノ酸の具体的な例には配列番号3のアミノ酸配列中の位置205のプロリン残基、位置208のグリシン残基、位置215のアスパラギン残基、位置224のイソロイシン残基、及び位置235のグルタミン酸残基が挙げられる。システイン残基の導入にはシステインによる置換及びシステインの挿入が含まれる。例えば、上記のアミノ酸残基のうちのどの残基もシステイン残基で置換されてよい。あるいは、システイン残基が挿入される場合、そのシステイン残基はこれらの残基の直前又は直後の位置に挿入されてよい。
この領域中の前記アミノ酸の具体的な例には配列番号3のアミノ酸配列中の位置205のプロリン残基、位置208のグリシン残基、位置215のアスパラギン残基、位置224のイソロイシン残基、及び位置235のグルタミン酸残基が挙げられる。システイン残基の導入にはシステインによる置換及びシステインの挿入が含まれる。例えば、上記のアミノ酸残基のうちのどの残基もシステイン残基で置換されてよい。あるいは、システイン残基が挿入される場合、そのシステイン残基はこれらの残基の直前又は直後の位置に挿入されてよい。
上記のアミノ酸置換位置は配列番号3中の位置である。しかしながら、前記変異が導入される前記触媒サブユニットのアミノ酸配列は配列番号3の長さとは異なる長さを有してよい。例えば、前記変異が導入される前記触媒サブユニットのアミノ酸配列が配列番号3と比較してN末端側で3アミノ酸だけ短い場合、配列番号3の位置205のプロリン残基は前記アミノ酸配列の位置202のプロリンに対応する。このような事例も「位置205のプロリン残基」に対応するプロリン残基の置換とされ、本発明の形態に含まれる。同じことが他の残基にも当てはまる。
上記アミノ酸残基のうち、位置205のプロリン残基がシステイン残基に置換されることが好ましい。このプロリン残基は、アミノ酸モチーフ「ARNSRPYD」(配列番号23)中に存在する。一態様においては、システイン残基がこのモチーフ内のプロリン残基を置換するように導入される。そして、変異型グルコース脱水素酵素の触媒サブユニットは、配列番号3、7、13、17または21のアミノ酸配列と少なくとも60、70、80、90または95%同一性を有するアミノ酸配列において、「ARNSRCYD」(配列番号24)を有する。
FAD-GDHは他の微生物でも知られている。それらの触媒サブユニットのアミノ酸配列、例えば配列番号3に対して少なくとも60%、少なくとも80%、少なくとも90%、又は少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列においてシステインを上記の領域内に、又は上記の特定のアミノ酸残基に対応するアミノ酸残基の位置に導入してよい。
より具体的には、前記変異が導入される前記触媒サブユニットのアミノ酸配列を配列番号3のアミノ酸配列と整列させ、配列番号3のアミノ酸位置200~240の領域中のアミノ酸残基、例えば位置205のプロリン残基、位置208のグリシン残基、位置215のアスパラギン残基、位置224のイソロイシン残基、又は位置235のグルタミン酸残基の位置に対応する位置のアミノ酸をシステインで置換してよい。
より具体的には、前記変異が導入される前記触媒サブユニットのアミノ酸配列を配列番号3のアミノ酸配列と整列させ、配列番号3のアミノ酸位置200~240の領域中のアミノ酸残基、例えば位置205のプロリン残基、位置208のグリシン残基、位置215のアスパラギン残基、位置224のイソロイシン残基、又は位置235のグルタミン酸残基の位置に対応する位置のアミノ酸をシステインで置換してよい。
配列番号3または下記で示す触媒サブユニットの他の配列とある程度の配列同一性を有するポリペプチドであれば、触媒サブユニットの機能を維持する限りにおいて、変異型グルコース脱水素酵素の触媒サブユニットを調製するために使用しうる。触媒サブユニットの機能とは、例えば、電子伝達サブユニット及びヒッチハイカーサブユニットと複合体を形成し、グルコース脱水素酵素の活性を発揮する機能を意味する。
配列の同一性とは、2つのアミノ酸配列の同一性の割合のことで、目視や計算によって
求めることができる。ここでいうアミノ酸配列の同一性とは、2つのアミノ酸を、必要に
応じてギャップを挿入しながら、一致するアミノ酸の数が最大となるようにアライメントし、アライメントされた部分の全アミノ酸数に対する一致するアミノ酸の数の割合を算出することで定義できる(以下、同様)。
配列の同一性とは、2つのアミノ酸配列の同一性の割合のことで、目視や計算によって
求めることができる。ここでいうアミノ酸配列の同一性とは、2つのアミノ酸を、必要に
応じてギャップを挿入しながら、一致するアミノ酸の数が最大となるようにアライメントし、アライメントされた部分の全アミノ酸数に対する一致するアミノ酸の数の割合を算出することで定義できる(以下、同様)。
配列番号3に対して60%以上の同一性を有するGDH αサブユニットのアミノ酸配列の例にはバークホルデリア・セノセパシアJ2315株(GenBank受入番号WP_006482972)、バークホルデリア・タイランデンシスTXDOH株(WP_009900298)、ラルストニア・ピケッティイ12D株(WP_012761508)、ラルストニア・ソラナセアラムIPO1609株(WP_003265143)、バークホルデリア・ファイトフィルマンスPsJN株(WP_012428610)、ラルストニア エスピー(WP_048931828)、モラクセラ科細菌(WP_1148
99537)、シュードモナス・クナックムッシイ(WP_043248521)、エルシニア・ヌルミイ(WP_049596850)、エダホビルガ・クレメア(WP_114193339)、シルビモナス・テラエ (WP_184102398)、ザイモバクター・パルマエ
(WP_027705356)、コベティア エスピー(WP_158773851)、
ハロモナス エスピー(WP_107334716)、及びエウィンゲラ・アメリカナ(
WP_034788281)の各々のαサブユニットの配列が挙げられる。
99537)、シュードモナス・クナックムッシイ(WP_043248521)、エルシニア・ヌルミイ(WP_049596850)、エダホビルガ・クレメア(WP_114193339)、シルビモナス・テラエ (WP_184102398)、ザイモバクター・パルマエ
(WP_027705356)、コベティア エスピー(WP_158773851)、
ハロモナス エスピー(WP_107334716)、及びエウィンゲラ・アメリカナ(
WP_034788281)の各々のαサブユニットの配列が挙げられる。
上記のように、これらの触媒サブユニットにおいてシステイン残基が導入される前記領域及び残基は、各触媒サブユニットの配列をバークホルデリア・セパシアの触媒サブユニットの配列(配列番号3)と整列させることによって決定可能である。例えば、エウィンゲラ・アメリカナGDHの触媒サブユニット(配列番号7)の場合では図10に示されているように配列番号3中の領域200~240は配列番号7中の領域197~237に位置し、位置205のプロリン残基、位置208のグリシン残基、位置215のアスパラギン残基、位置224のイソロイシン残基、及び位置235のグルタミン酸残基はそれぞれ配列番号7中の位置202のプロリン残基、位置205のグリシン残基、位置212のアスパラギン残基、位置221のイソロイシン残基、及び位置232のグルタミン酸残基に対応する。
前記触媒サブユニットの別の実施形態には配列番号7に対して少なくとも60%、80%、90%、又は95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む触媒サブユニットであって、配列番号7中の位置202のプロリン残基、位置205のグリシン残基、位置212のアスパラギン残基、位置221のイソロイシン残基、又は位置232のグルタミン酸残基に対応する位置にシステインが導入されている前記触媒サブユニットが挙げられる。
例えば、シルビモナス・テラエGDHの触媒サブユニット(配列番号13)においては、
図18に示されるように、配列番号3の位置205のプロリン残基は配列番号13の位置204のプロリン残基に該当する。
触媒サブユニットの別の態様は、配列番号13のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号13の位置204のプロリン残基に相当する位置にシステイン残基が導入されている。
図18に示されるように、配列番号3の位置205のプロリン残基は配列番号13の位置204のプロリン残基に該当する。
触媒サブユニットの別の態様は、配列番号13のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号13の位置204のプロリン残基に相当する位置にシステイン残基が導入されている。
例えば、ザイモバクター・パルマエGDHの触媒サブユニット(配列番号17)において
は、図18に示されるように、配列番号3の位置205のプロリン残基は配列番号17の位置200のプロリン残基に該当する。
触媒サブユニットの別の態様は、配列番号17のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号17の位置200のプロリン残基に相当する位置にシステイン残基が導入されている。
は、図18に示されるように、配列番号3の位置205のプロリン残基は配列番号17の位置200のプロリン残基に該当する。
触媒サブユニットの別の態様は、配列番号17のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号17の位置200のプロリン残基に相当する位置にシステイン残基が導入されている。
例えば、コベティア エスピーGDHの触媒サブユニット(配列番号21)においては、図18に示されるように、配列番号3の位置205のプロリン残基は配列番号21の位置204のプロリン残基に該当する。
触媒サブユニットの別の態様は、配列番号21のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号21の位置204のプロリン残基に相当する位置にシステイン残基が導入されている。
触媒サブユニットの別の態様は、配列番号21のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号21の位置204のプロリン残基に相当する位置にシステイン残基が導入されている。
前記触媒サブユニット(αサブユニット)のアミノ酸配列はシステインを導入する前記変異だけでなくその他の変異も含んでよい。バークホルデリア・セパシアに由来するFAD依存性GDHの触媒サブユニット中に変異を含む変異体の公知の例には位置472及び位置475のアミノ酸残基が置換されている変異体(国際公開第2005/103248号)、位置326、位置365、及び位置472のアミノ酸残基が置換されている変異体(QYY変異体、特開2012-090563号公報)、位置365と位置326、位置472、位置475、位置529などの位置が置換されている変異体(国際公開第2006/137283号)が挙げられる。本発明の1つの実施形態による前記変異型GDHの触媒サブユニットはこれらの変異を有してよい。
<電子伝達サブユニット>
前記電子伝達サブユニットはβサブユニットとも呼ばれ、少なくとも1つのヘム結合ドメインを含む。このサブユニットはグルコースを基質として用いる反応により生成した電子を電極へ伝達する機能(電子授受機能)を有する。
前記電子伝達サブユニットはその中に導入されたシステイン残基を含み、このシステイン残基は前記触媒サブユニットに導入された前記システイン残基とジスルフィド結合を形成する。
前記電子伝達サブユニットはβサブユニットとも呼ばれ、少なくとも1つのヘム結合ドメインを含む。このサブユニットはグルコースを基質として用いる反応により生成した電子を電極へ伝達する機能(電子授受機能)を有する。
前記電子伝達サブユニットはその中に導入されたシステイン残基を含み、このシステイン残基は前記触媒サブユニットに導入された前記システイン残基とジスルフィド結合を形成する。
前記電子伝達サブユニットはグルコース脱水素により生成した電子を電極へ伝達する機能を有する限り限定されない。公知の電子伝達サブユニットを含む様々な生物に由来する電子伝達サブユニットが使用されてよい。前記電子伝達サブユニットは、前記触媒サブユニットが由来する微生物と同じ微生物に由来してよい。前記電子伝達サブユニットの例にはバークホルデリア・セパシアのGDHの電子伝達サブユニットが挙げられる。バークホルデリア・セパシアKS1株のGDH電子伝達サブユニットの例には配列番号4のアミノ酸配列を含むポリペプチドが挙げられる。配列番号4はバークホルデリア・セパシアKS1株のGDH βサブユニットのアミノ酸配列である。この配列を参照しながら以下の説明を行う。
前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列中のシステイン導入部位は、前記触媒サブユニットとの接触面を形成する領域中にあることが好ましい。例えば、配列番号4のアミノ酸配列のアミノ酸位置330~400の領域中の位置にシステインが導入される。したがって、配列番号4のアミノ酸位置330~400の領域中のアミノ酸残基がシステインで置換される。前記電子伝達サブユニット中のこの領域はGDHの空間的構造中の前記触媒サブユニットとの接触面上に位置する領域である。
この領域中の前記アミノ酸のより具体的な例には配列番号4のアミノ酸配列中の位置336のスレオニン残基、位置385のグリシン残基、位置383のアスパラギン酸残基、及び位置391のチロシン残基が挙げられる。これらのうちのどの残基もシステイン残基で置換されてよい。システイン残基が挿入される場合、そのシステイン残基はこれらの残基の直前又は直後の位置に挿入されてよい。
この領域中の前記アミノ酸のより具体的な例には配列番号4のアミノ酸配列中の位置336のスレオニン残基、位置385のグリシン残基、位置383のアスパラギン酸残基、及び位置391のチロシン残基が挙げられる。これらのうちのどの残基もシステイン残基で置換されてよい。システイン残基が挿入される場合、そのシステイン残基はこれらの残基の直前又は直後の位置に挿入されてよい。
上記アミノ酸残基のうち、位置383のアスパラギン酸残基がシステイン残基に置換されることが好ましい。このアスパラギン酸残基は、アミノ酸モチーフ「MP(A/G)F」(配列
番号25)の3アミノ酸前に存在する。一態様においては、システイン残基がこのモチーフの3アミノ酸前のアミノ酸残基を置換するように導入される。そして、変異型グルコース脱水素酵素の電子伝達サブユニットは、配列番号4、8、14、18または22のアミノ酸配列と少なくとも60、70、80、90または95%同一性を有するアミノ酸配列において、「CXXMP(A/G)F」(配列番号26)を有する。
番号25)の3アミノ酸前に存在する。一態様においては、システイン残基がこのモチーフの3アミノ酸前のアミノ酸残基を置換するように導入される。そして、変異型グルコース脱水素酵素の電子伝達サブユニットは、配列番号4、8、14、18または22のアミノ酸配列と少なくとも60、70、80、90または95%同一性を有するアミノ酸配列において、「CXXMP(A/G)F」(配列番号26)を有する。
前記触媒サブユニット中の前記領域(配列番号3のアミノ酸位置200~240の領域)内の前記システイン導入部位と前記電子伝達サブユニット中の前記領域(配列番号4のアミノ酸位置330~400の領域)内の前記システイン導入部位の好ましい組合せの例には前記触媒サブユニットの位置205のプロリンと前記電子伝達サブユニットの位置383のアスパラギン酸の組合せ、及び前記触媒サブユニットの位置215のアスパラギンと電子伝達サブユニットの位置336のスレオニンの組合せが挙げられる。残基のこれらの組合せは、FAD-GDHの空間的構造において互いに約5Åの距離があり、且つ、より効率的にジスルフィド結合を形成できる残基の組合せである。
前記変異型グルコース脱水素酵素は、導入された別のシステイン残基が前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列に含まれており、そのシステイン残基が前記ヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列中に導入されたシステイン残基とジスルフィド結合を形成して前記ヒッチハイカーサブユニットと前記電子伝達サブユニットが相互に結合している変異型グルコース脱水素酵素であってもよい。
前記の別のシステイン残基は、前記ヒッチハイカーサブユニットとの接触面上にある前記電子伝達サブユニットの領域内に導入されることが好ましい。このような領域の例には配列番号4のアミノ酸配列中のアミノ酸位置341~350の領域が挙げられる。したがって、配列番号4のアミノ酸位置341~350の領域中のアミノ酸残基がシステインで置換されてよい。前記電子伝達サブユニット中のこの領域はGDHの空間的構造中の前記ヒッチハイカーサブユニットとの接触面上に位置する領域である。
この領域中の前記アミノ酸のより具体的な例には配列番号4の前記領域のアミノ酸配列中の位置345のスレオニン残基、位置346のプロリン残基、及び位置349のチロシン残基が挙げられる。システイン残基の導入にはシステインによる置換及びシステインの挿入が含まれる。例えば、上記のアミノ酸残基のうちのいずれもシステイン残基によって置換されてよい。あるいは、システイン残基が挿入される場合、そのシステイン残基はこれらの残基の直前又は直後の位置に挿入されてよい。
この領域中の前記アミノ酸のより具体的な例には配列番号4の前記領域のアミノ酸配列中の位置345のスレオニン残基、位置346のプロリン残基、及び位置349のチロシン残基が挙げられる。システイン残基の導入にはシステインによる置換及びシステインの挿入が含まれる。例えば、上記のアミノ酸残基のうちのいずれもシステイン残基によって置換されてよい。あるいは、システイン残基が挿入される場合、そのシステイン残基はこれらの残基の直前又は直後の位置に挿入されてよい。
上記アミノ酸残基のうち、位置349のチロシン残基がシステイン残基に置換されることが好ましい。このチロシン残基は、アミノ酸モチーフ「YPS(L/M)」(配列番号27)の1アミノ酸前に存在する。一態様においては、システイン残基がこのモチーフの1アミノ酸前のアミノ酸残基を置換するように導入される。そして、変異型グルコース脱水素酵素の電子伝達サブユニットは、配列番号4、8、14、18または22のアミノ酸配列と少なくとも60、70、80、90または95%同一性を有するアミノ酸配列において、「CYPS(L/M)」(配列番号28)を有する。
上記のアミノ酸置換変異位置は配列番号4中の位置である。しかしながら、前記変異が導入される前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列は配列番号4の長さと異なる長さを有してよい。例えば、前記変異が導入される前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列が配列番号4と比較してN末端側で5アミノ酸だけ短い場合、配列番号4の位置336のスレオニン残基は前記アミノ酸配列の位置331のスレオニンに対応する。このような事例も「位置336のスレオニン残基」に対応するスレオニン残基の置換とされ、本発明の形態に含まれる。同じことが他の残基にも当てはまる。
前記電子伝達サブユニットはシステインを導入する前記変異に加えて別の変異を含んでもよい。
前記電子伝達サブユニットは3つのヘム結合ドメインを含む。前記電子伝達サブユニットは第1ヘム結合ドメインと第2ヘム結合ドメイン、すなわちN末端側から数えて1番目と2番目のドメインがそれぞれ欠失している変異型(短縮型)電子伝達サブユニットであってよい。このような変異型電子伝達サブユニットは米国特許出願公開第2019-0010215号明細書中に開示されている。
したがって、3つのヘム結合ドメイン(CXXCHモチーフ(配列番号31))を有する前記電子伝達サブユニットではN末端側から数えて第1と第2のヘム結合ドメイン又はこれらのドメインを含む領域が欠失していてよい。以下の説明はバークホルデリア・セパシアの電子伝達サブユニットを代表的な例として使用する。配列番号4には第1ヘム結合ドメイン(アミノ酸位置43~47)、第2ヘム結合ドメイン(アミノ酸位置191~195)、及び第3ヘム結合ドメイン(アミノ酸位置334~338)が存在する。これらの内、第1ヘム結合ドメインと第2ヘム結合ドメインが欠失していてもよく、又は第1と第2のヘム結合ドメインを含む領域(アミノ酸位置43~195)が欠失していてもよい。
第1と第2のヘム結合ドメインを含む領域が欠失している変異体電子伝達サブユニットの例には配列番号4のアミノ酸位置314~425又は位置330~425から構成される変異型電子伝達サブユニットが挙げられる。
第1と第2のヘム結合ドメインを含む領域が欠失している変異体電子伝達サブユニットの例には配列番号4のアミノ酸位置314~425又は位置330~425から構成される変異型電子伝達サブユニットが挙げられる。
GDHは他の微生物でも知られている。それらの電子伝達サブユニットのアミノ酸配列、例えば配列番号4に対して、又は配列番号4のアミノ酸位置314~425若しくはアミノ酸位置330~425から構成される前記短縮型配列に対して少なくとも60%、少なくとも80%、少なくとも90%、又は少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列においてシステインを位置336のスレオニン残基、位置385のグリシン残基、位置383のアスパラギン酸残基、又は位置391のチロシン残基、及び/又は位置345のスレオニン残基、位置346のプロリン残基、又は位置349のチロシン残基のようなアミノ酸残基に対応する位置に導入してよい。
具体的には、前記変異が導入される前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列を配列番号4のアミノ酸配列と整列させ、配列番号4の位置336のスレオニン残基、位置385のグリシン残基、位置383のアスパラギン酸残基、又は位置391のチロシン残基;又は位置345のスレオニン残基、位置346のプロリン残基、又は位置349のチロシン残基の位置に対応する位置のアミノ酸をシステインで置換してよい。
具体的には、前記変異が導入される前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列を配列番号4のアミノ酸配列と整列させ、配列番号4の位置336のスレオニン残基、位置385のグリシン残基、位置383のアスパラギン酸残基、又は位置391のチロシン残基;又は位置345のスレオニン残基、位置346のプロリン残基、又は位置349のチロシン残基の位置に対応する位置のアミノ酸をシステインで置換してよい。
配列番号4または下記で示す電子伝達サブユニットの他の配列とある程度の配列同一性を有するポリペプチドであれば、電子伝達サブユニットの機能を維持する限りにおいて、変異型グルコース脱水素酵素の電子伝達サブユニットを調製するために使用しうる。電子伝達サブユニットの機能とは、例えば、触媒サブユニット及びヒッチハイカーサブユニットと複合体を形成し、電子の授受を行う機能を意味する。電子伝達サブユニットは好ましくは3つのヘム結合領域を有し、短縮型の場合は、第3ヘム結合領域を有する。
配列番号4に対して少なくとも60%の同一性を有する前記GDH電子伝達サブユニットのアミノ酸配列の例にはバークホルデリア・セノセパシアJ2315株(WP_006482958)、バークホルデリア・タイランデンシスTXDOH株(WP_009900297)、ラルストニア・ピケッティイ12D株(WP_012761509)、ラルストニア・ソラナセアラムIPO1609株(WP_049281214)、バークホルデリア・ファイトフィルマンスPsJN株(WP_012428609)、ラルストニア
エスピー(WP_048931829)、モラクセラ科細菌(WP_11489953
6)、シュードモナス・クナックムッシイ(WP_043248520)、エルシニア・ヌルミイ(WP_049596851)、エダホビルガ・クレメア(WP_114193
338)、シルビモナス・テラエ (WP_184102397)、ザイモバクター・パル
マエ(WP_211245188)、コベティア エスピー(Cobetia sp)(W
P_158773850)、ハロモナス エスピー(WP_107336529)及びエ
ウィンゲラ・アメリカナ(WP_034788317)の各々の電子伝達サブユニットの配列が挙げられる。
配列番号4に対して少なくとも60%の同一性を有する前記GDH電子伝達サブユニットのアミノ酸配列の例にはバークホルデリア・セノセパシアJ2315株(WP_006482958)、バークホルデリア・タイランデンシスTXDOH株(WP_009900297)、ラルストニア・ピケッティイ12D株(WP_012761509)、ラルストニア・ソラナセアラムIPO1609株(WP_049281214)、バークホルデリア・ファイトフィルマンスPsJN株(WP_012428609)、ラルストニア
エスピー(WP_048931829)、モラクセラ科細菌(WP_11489953
6)、シュードモナス・クナックムッシイ(WP_043248520)、エルシニア・ヌルミイ(WP_049596851)、エダホビルガ・クレメア(WP_114193
338)、シルビモナス・テラエ (WP_184102397)、ザイモバクター・パル
マエ(WP_211245188)、コベティア エスピー(Cobetia sp)(W
P_158773850)、ハロモナス エスピー(WP_107336529)及びエ
ウィンゲラ・アメリカナ(WP_034788317)の各々の電子伝達サブユニットの配列が挙げられる。
上記のように、これらの電子伝達サブユニットにおいてシステイン残基が導入される前記領域及び残基は、各電子伝達サブユニットの配列をバークホルデリア・セパシアの電子伝達サブユニットの配列(配列番号4)と整列させることによって決定可能である。例えば、エウィンゲラ・アメリカナの電子伝達サブユニット(配列番号8)の場合では図11に示されているように配列番号4中の領域330~400は配列番号8中の領域322~392に位置し、位置336のスレオニン残基、位置383のアスパラギン酸残基、位置385のグリシン残基、及び位置391のチロシン残基はそれぞれ配列番号8中の位置328のセリン残基、位置375のグルタミン酸残基、位置377のフェニルアラニン残基、及び位置383のアスパラギン酸残基に対応する。
さらに、エウィンゲラ・アメリカナの電子伝達サブユニット(配列番号8)の場合では図11に示されているように配列番号4中の領域341~350は配列番号8中の領域333~342に位置し、位置345のスレオニン残基、位置346のプロリン残基、及び位置349のチロシン残基はそれぞれ配列番号8中の位置337のセリン残基、位置338のグルタミン残基、及び位置341のチロシン残基に対応する。
配列番号8には第1ヘム結合ドメイン(アミノ酸位置41~45)、第2ヘム結合ドメイン(アミノ酸位置187~191)、及び第3ヘム結合ドメイン(アミノ酸位置326~330)が存在する。これらの内、第1ヘム結合ドメイン及び第2ヘム結合ドメインが欠失していてもよく、又は第1と第2のヘム結合ドメインを含む領域(アミノ酸位置41~191)が欠失していてもよい。第1と第2のヘム結合ドメインを含む領域が欠失している変異型電子伝達サブユニットの例には配列番号8のアミノ酸位置306~420又はアミノ酸位置322~420から構成される変異型電子伝達サブユニットが挙げられる。
前記電子伝達サブユニットの別の実施形態には配列番号8に対して、又は配列番号8のアミノ酸306~420に対して少なくとも60%、80%、90%、又は95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む電子伝達サブユニットであって、配列番号8中の位置328のセリン残基、位置375のグルタミン酸残基、位置377のフェニルアラニン残基又は位置383のアスパラギン酸に対応する位置に第1のシステインが導入され、配列番号8中の位置337のセリン残基、位置338のグルタミン残基、又は位置341のチロシン残基に対応する位置に第2のシステインが導入されている前記電子伝達サブユニットが挙げられる。
さらに、例えば、シルビモナス・テラエGDHの電子伝達サブユニット(配列番号14)
においては、図19に示されるように、配列番号4の位置383のアスパラギン酸残基は配列番号14の位置382のヒスチジン残基に該当する。配列番号4の位置349のチロシン残基は配列番号14の位置347のアラニン残基に該当する。
配列番号14において、第1ヘム結合領域(アミノ酸番号43~47)、第2ヘム結合領域(アミノ酸番号191~195)、第3ヘム結合領域(アミノ酸番号332~336)が存在する。これらのうち、第1ヘム結合領域及び第2ヘム結合領域は欠失してもよく、第1ヘム結合領域と第2ヘム結合領域を含む領域(アミノ酸番号43~195)が欠失してもよい。第1ヘム結合領域と第2ヘム結合領域を含む領域が欠失した変異型電子伝達サブユニットの例は、配列番号14のアミノ酸番号332~481からなるアミノ酸配列を有する。
電子伝達サブユニットの別の態様は、配列番号14または配列番号14のアミノ酸番号332~481のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号14の位置382のヒスチジン残基に相当する位置に第1のシステイン残基が導入され、及び/又は配列番号14の位置347のアラニン残基に相当する位置に第2のシステイン残基が導入されている。
においては、図19に示されるように、配列番号4の位置383のアスパラギン酸残基は配列番号14の位置382のヒスチジン残基に該当する。配列番号4の位置349のチロシン残基は配列番号14の位置347のアラニン残基に該当する。
配列番号14において、第1ヘム結合領域(アミノ酸番号43~47)、第2ヘム結合領域(アミノ酸番号191~195)、第3ヘム結合領域(アミノ酸番号332~336)が存在する。これらのうち、第1ヘム結合領域及び第2ヘム結合領域は欠失してもよく、第1ヘム結合領域と第2ヘム結合領域を含む領域(アミノ酸番号43~195)が欠失してもよい。第1ヘム結合領域と第2ヘム結合領域を含む領域が欠失した変異型電子伝達サブユニットの例は、配列番号14のアミノ酸番号332~481からなるアミノ酸配列を有する。
電子伝達サブユニットの別の態様は、配列番号14または配列番号14のアミノ酸番号332~481のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号14の位置382のヒスチジン残基に相当する位置に第1のシステイン残基が導入され、及び/又は配列番号14の位置347のアラニン残基に相当する位置に第2のシステイン残基が導入されている。
さらに、例えば、ザイモバクター・パルマエGDHの電子伝達サブユニット(配列番号1
8)においては、図19に示されるように、配列番号4の位置383のアスパラギン酸残基は配列番号18の位置389のアスパラギン酸残基に該当する。配列番号4の位置349のチロシン残基は配列番号18の位置355のチロシン残基に該当する。
配列番号18において、第1ヘム結合領域(アミノ酸番号49~53)、第2ヘム結合領域(アミノ酸番号196~200)、第3ヘム結合領域(アミノ酸番号340~344)が存在する。これらのうち、第1ヘム結合領域及び第2ヘム結合領域は欠失してもよく、第1ヘム結合領域と第2ヘム結合領域を含む領域(アミノ酸番号49~200)が欠失してもよい。第1ヘム結合領域と第2ヘム結合領域を含む領域が欠失した変異型電子伝達サブユニットの例は、配列番号18のアミノ酸番号340~433からなるアミノ酸配列を有する。
電子伝達サブユニットの別の態様は、配列番号18または配列番号18のアミノ酸番号340~433のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号18の位置389のアスパラギン酸残基に相当する位置に第1のシステイン残基が導入され、及び/又は配列番号18の位置355のチロシン残基に相当する位置に第2のシステイン残基が導入されている。
8)においては、図19に示されるように、配列番号4の位置383のアスパラギン酸残基は配列番号18の位置389のアスパラギン酸残基に該当する。配列番号4の位置349のチロシン残基は配列番号18の位置355のチロシン残基に該当する。
配列番号18において、第1ヘム結合領域(アミノ酸番号49~53)、第2ヘム結合領域(アミノ酸番号196~200)、第3ヘム結合領域(アミノ酸番号340~344)が存在する。これらのうち、第1ヘム結合領域及び第2ヘム結合領域は欠失してもよく、第1ヘム結合領域と第2ヘム結合領域を含む領域(アミノ酸番号49~200)が欠失してもよい。第1ヘム結合領域と第2ヘム結合領域を含む領域が欠失した変異型電子伝達サブユニットの例は、配列番号18のアミノ酸番号340~433からなるアミノ酸配列を有する。
電子伝達サブユニットの別の態様は、配列番号18または配列番号18のアミノ酸番号340~433のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号18の位置389のアスパラギン酸残基に相当する位置に第1のシステイン残基が導入され、及び/又は配列番号18の位置355のチロシン残基に相当する位置に第2のシステイン残基が導入されている。
さらに、例えば、コベティア エスピーGDHの電子伝達サブユニット(配列番号22)においては、図19に示されるように、配列番号4の位置383のアスパラギン酸残基は配列番号22の位置467のセリン残基に該当する。配列番号4の位置349のチロシン残基は配列番号22の位置433のチロシン残基に該当する。
配列番号22において、第1ヘム結合領域(アミノ酸番号84~88)、第2ヘム結合領域(アミノ酸番号231~235)、第3ヘム結合領域(アミノ酸番号418~422)が存在する。これらのうち、第1ヘム結合領域及び第2ヘム結合領域は欠失してもよく、第1ヘム結合領域と第2ヘム結合領域を含む領域(アミノ酸番号84~235)が欠失してもよい。第1ヘム結合領域と第2ヘム結合領域を含む領域が欠失した変異型電子伝達サブユニットの例は、配列番号22のアミノ酸番号418~522からなるアミノ酸配列を有する。
電子伝達サブユニットの別の態様は、配列番号22または配列番号22のアミノ酸番号418~522のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号22の位置467のセリン残基に相当する位置に第1のシステイン残基が導入され、及び/又は配列番号22の位置433のチロシン残基に相当する位置に第2のシステイン残基が導入されている。
配列番号22において、第1ヘム結合領域(アミノ酸番号84~88)、第2ヘム結合領域(アミノ酸番号231~235)、第3ヘム結合領域(アミノ酸番号418~422)が存在する。これらのうち、第1ヘム結合領域及び第2ヘム結合領域は欠失してもよく、第1ヘム結合領域と第2ヘム結合領域を含む領域(アミノ酸番号84~235)が欠失してもよい。第1ヘム結合領域と第2ヘム結合領域を含む領域が欠失した変異型電子伝達サブユニットの例は、配列番号22のアミノ酸番号418~522からなるアミノ酸配列を有する。
電子伝達サブユニットの別の態様は、配列番号22または配列番号22のアミノ酸番号418~522のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号22の位置467のセリン残基に相当する位置に第1のシステイン残基が導入され、及び/又は配列番号22の位置433のチロシン残基に相当する位置に第2のシステイン残基が導入されている。
<ヒッチハイカーサブユニット>
前記グルコース脱水素酵素はヒッチハイカーサブユニットも内包する。前記ヒッチハイカーサブユニットはγサブユニットとも呼ばれ、αサブユニット及びβサブユニットと共に複合体を形成し、且つ、ペリプラズム中に分泌される機能を有する。前記ヒッチハイカーサブユニットはこの機能を有する限り限定されない。公知のγサブユニットを含む様々な生物に由来するγサブユニットが使用されてよい。前記ヒッチハイカーサブユニットは、前記触媒サブユニット又は電子伝達サブユニットが由来する微生物と同じ微生物に由来してよい。前記ヒッチハイカーサブユニットの例にはバークホルデリア・セパシアのGDHのヒッチハイカーサブユニットが挙げられる。
配列番号2はバークホルデリア・セパシアKS1株のGDHヒッチハイカーサブユニッ
トのアミノ酸配列である。この配列を参照しながら以下の説明を行う。
前記グルコース脱水素酵素はヒッチハイカーサブユニットも内包する。前記ヒッチハイカーサブユニットはγサブユニットとも呼ばれ、αサブユニット及びβサブユニットと共に複合体を形成し、且つ、ペリプラズム中に分泌される機能を有する。前記ヒッチハイカーサブユニットはこの機能を有する限り限定されない。公知のγサブユニットを含む様々な生物に由来するγサブユニットが使用されてよい。前記ヒッチハイカーサブユニットは、前記触媒サブユニット又は電子伝達サブユニットが由来する微生物と同じ微生物に由来してよい。前記ヒッチハイカーサブユニットの例にはバークホルデリア・セパシアのGDHのヒッチハイカーサブユニットが挙げられる。
配列番号2はバークホルデリア・セパシアKS1株のGDHヒッチハイカーサブユニッ
トのアミノ酸配列である。この配列を参照しながら以下の説明を行う。
上記のように、前記ヒッチハイカーサブユニットは、前記電子伝達サブユニットとジスルフィド結合を形成するためにその中に導入されたシステイン残基を含む場合がある。
前記ヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列中のシステイン導入部位は、前記電子伝達サブユニットとの接触面を形成する領域中にあることが好ましい。例えば、配列番号2のアミノ酸配列中のアミノ酸位置140~160の領域中の位置にシステインが導入される。したがって、配列番号2のアミノ酸位置140~160の領域中のアミノ酸残基がシステインで置換される。前記ヒッチハイカーサブユニット中のこの領域はGDHの空間的構造中の前記電子伝達サブユニットとの接触面上に位置する領域である。
この領域中の前記アミノ酸の具体的な例には配列番号2のアミノ酸配列中の位置145のスレオニン残基、位置154のアスパラギン残基、及び位置155のリジン残基が挙げられる。システイン残基の導入にはシステインによる置換及びシステインの挿入が含まれる。例えば、上記のアミノ酸残基のうちのいずれもシステイン残基によって置換されてよい。あるいは、システイン残基が挿入される場合、そのシステイン残基はこれらの残基の直前又は直後の位置に挿入されてよい。
前記ヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列中のシステイン導入部位は、前記電子伝達サブユニットとの接触面を形成する領域中にあることが好ましい。例えば、配列番号2のアミノ酸配列中のアミノ酸位置140~160の領域中の位置にシステインが導入される。したがって、配列番号2のアミノ酸位置140~160の領域中のアミノ酸残基がシステインで置換される。前記ヒッチハイカーサブユニット中のこの領域はGDHの空間的構造中の前記電子伝達サブユニットとの接触面上に位置する領域である。
この領域中の前記アミノ酸の具体的な例には配列番号2のアミノ酸配列中の位置145のスレオニン残基、位置154のアスパラギン残基、及び位置155のリジン残基が挙げられる。システイン残基の導入にはシステインによる置換及びシステインの挿入が含まれる。例えば、上記のアミノ酸残基のうちのいずれもシステイン残基によって置換されてよい。あるいは、システイン残基が挿入される場合、そのシステイン残基はこれらの残基の直前又は直後の位置に挿入されてよい。
上記アミノ酸残基のうち、位置155のリジン残基がシステイン残基に置換されることが好ましい。このリジン残基は、アミノ酸モチーフ「PXXWXXXP」(配列番号29)の1アミノ酸前に存在する。一態様においては、システイン残基がこのモチーフの1アミノ酸前のアミノ酸残基を置換するように導入される。そして、変異型グルコース脱水素酵素のヒッチハイカーサブユニットは、配列番号2、6、12、16または20のアミノ酸配列と少なくとも60、70、80、90または95%同一性を有するアミノ酸配列において、「CPXXWXXXP」(配列番号30)を有する。
上記のアミノ酸置換変異位置は配列番号2中の位置である。しかしながら、前記変異が導入される前記ヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列は配列番号2の長さと異なる長さを有してよい。例えば、前記変異が導入される前記ヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列が配列番号2と比較してN末端側で2アミノ酸だけ長い場合、配列番号2の位置145のスレオニン残基は前記アミノ酸配列の位置147のスレオニンに対応する。このような事例も「位置145のスレオニン残基」に対応するスレオニン残基の置換とされ、本発明の形態に含まれる。同じことが他の残基にも当てはまる。
前記電子伝達サブユニット(配列番号4のアミノ酸位置341~350の領域)中の前記ヒッチハイカーサブユニットとのジスルフィド形成のためのシステイン導入部位と前記ヒッチハイカーサブユニット(配列番号2のアミノ酸位置140~160の領域)中のシステイン導入部位の好ましい組合せの例には前記電子伝達サブユニットの位置345のスレオニンと前記ヒッチハイカーサブユニットの位置154のアスパラギンの組合せ、及び前記電子伝達サブユニットの位置349のチロシンと前記ヒッチハイカーサブユニットの位置155のリジンの組合せが挙げられる。残基のこれらの組合せは、FAD-GDHの空間的構造において互いに約5Åの距離があり、且つ、より効率的にジスルフィド結合を形成できる残基の組合せである。
前記ヒッチハイカーサブユニットはシステインを導入する前記変異に加えて別の変異を含んでもよい。
GDHは他の微生物でも知られている。それらのヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列、例えば配列番号2に対して少なくとも60%、少なくとも80%、少なくとも90%、又は少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列においてシステインを上記の領域内に、又は上記の特定のアミノ酸残基に対応するアミノ酸残基の位置に導入してよい
。
具体的には、前記変異が導入される前記ヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列を配列番号2のアミノ酸配列と整列させ、配列番号2の位置145のスレオニン残基、位置154のアスパラギン残基、又は位置155のリジン残基の位置に対応する位置のアミノ酸をシステインで置換してよい。
。
具体的には、前記変異が導入される前記ヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列を配列番号2のアミノ酸配列と整列させ、配列番号2の位置145のスレオニン残基、位置154のアスパラギン残基、又は位置155のリジン残基の位置に対応する位置のアミノ酸をシステインで置換してよい。
配列番号2または下記で示すヒッチハイカーサブユニットの他の配列とある程度の配列同一性を有するポリペプチドであれば、ヒッチハイカーサブユニットの機能を維持する限りにおいて、変異型グルコース脱水素酵素のヒッチハイカーサブユニットを調製するために使用しうる。ヒッチハイカーサブユニットの機能とは、例えば、触媒サブユニット及び電子伝達サブユニットと複合体を形成し、ペリプラズム中に分泌される機能を意味する。
配列番号2に対して少なくとも60%の同一性を有する前記GDHヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列の例にはバークホルデリア・セノセパシアJ2315株(WP_006482974)、バークホルデリア・タイランデンシスTXDOH株(WP_009900299)、ラルストニア・ピケッティイ12D株(WP_012761507)、ラルストニア・ソラナセアラムIPO1609株(WP_003265142)、バークホルデリア・ファイトフィルマンスPsJN株(WP_012428611)、ラルストニア エスピー(WP_048931990)、モラクセラ科細菌(WP_11489
9538)、シュードモナス・クナックムッシイ(WP_043248523)、エルシニア・ヌルミイ(WP_049596849)、エダホビルガ・クレメア(WP_114193340)、シルビモナス・テラエ (WP_184102399),ザイモバクター・パルマエ(BBG29837)、コベティア エスピー(WP_158773852)、
ハロモナス エスピー(WP_107334715)及びエウィンゲラ・アメリカナ(W
P_034788279)の各々のγサブユニットの配列が挙げられる。
配列番号2に対して少なくとも60%の同一性を有する前記GDHヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列の例にはバークホルデリア・セノセパシアJ2315株(WP_006482974)、バークホルデリア・タイランデンシスTXDOH株(WP_009900299)、ラルストニア・ピケッティイ12D株(WP_012761507)、ラルストニア・ソラナセアラムIPO1609株(WP_003265142)、バークホルデリア・ファイトフィルマンスPsJN株(WP_012428611)、ラルストニア エスピー(WP_048931990)、モラクセラ科細菌(WP_11489
9538)、シュードモナス・クナックムッシイ(WP_043248523)、エルシニア・ヌルミイ(WP_049596849)、エダホビルガ・クレメア(WP_114193340)、シルビモナス・テラエ (WP_184102399),ザイモバクター・パルマエ(BBG29837)、コベティア エスピー(WP_158773852)、
ハロモナス エスピー(WP_107334715)及びエウィンゲラ・アメリカナ(W
P_034788279)の各々のγサブユニットの配列が挙げられる。
上記のように、これらのヒッチハイカーサブユニットにおいてシステイン残基が導入される前記領域及び残基は、各ヒッチハイカーサブユニットの配列をバークホルデリア・セパシアのヒッチハイカーサブユニットの配列(配列番号2)と整列させることによって決定可能である。例えば、エウィンゲラ・アメリカナのヒッチハイカーサブユニット(配列番号6)の場合では図9に示されているように配列番号2中の領域140~160は配列番号6中の領域142~162に位置し、位置145のスレオニン残基、位置154のアスパラギン残基、及び位置155のリジン残基はそれぞれ配列番号6中の位置147のバリン残基、位置156のアスパラギン残基、及び位置157のアルギニン残基に対応する。
前記ヒッチハイカーサブユニットの別の実施形態には配列番号6に対して少なくとも60%、80%、90%、又は95%の同一性を有するアミノ酸配列を含むヒッチハイカーサブユニットであって、システインが配列番号6中の位置147のバリン残基、位置156のアスパラギン残基、又は位置157のアルギニン残基に対応する位置に導入されている前記ヒッチハイカーサブユニットが挙げられる。
例えば、シルビモナス・テラエGDHのヒッチハイカーサブユニット(配列番号12)に
おいては、図20に示されるように、配列番号2の位置155のリジン残基は配列番号12の位置168のアラニン残基に該当する。
ヒッチハイカーサブユニットの別の態様は、配列番号12のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号12の位置168のアラニン残基に相当する位置にシステイン残基が導入されている。
おいては、図20に示されるように、配列番号2の位置155のリジン残基は配列番号12の位置168のアラニン残基に該当する。
ヒッチハイカーサブユニットの別の態様は、配列番号12のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号12の位置168のアラニン残基に相当する位置にシステイン残基が導入されている。
例えば、ザイモバクター・パルマエGDHのヒッチハイカーサブユニット(配列番号16
)においては、図20に示されるように、配列番号2の位置155のリジン残基は配列番
号16の位置182のアルギニン残基に該当する。
ヒッチハイカーサブユニットの別の態様は、配列番号16または配列番号16のアミノ酸19~195のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号16の位置182のアルギニン残基に相当する位置にシステイン残基が導入されている。
)においては、図20に示されるように、配列番号2の位置155のリジン残基は配列番
号16の位置182のアルギニン残基に該当する。
ヒッチハイカーサブユニットの別の態様は、配列番号16または配列番号16のアミノ酸19~195のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号16の位置182のアルギニン残基に相当する位置にシステイン残基が導入されている。
例えば、コベティア エスピーGDHのヒッチハイカーサブユニット(配列番号20)においては、図20に示されるように、配列番号2の位置155のリジン残基は配列番号20の位置198のグルタミン残基に該当する。
ヒッチハイカーサブユニットの別の態様は、配列番号20または配列番号20のアミノ酸14~207のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号20の位置198のグルタミン残基に相当する位置にシステイン残基が導入されている。
ヒッチハイカーサブユニットの別の態様は、配列番号20または配列番号20のアミノ酸14~207のアミノ酸配列と少なくとも60%、80%、90%または95%の配列同一性を有し、配列番号20の位置198のグルタミン残基に相当する位置にシステイン残基が導入されている。
変異型FAD依存グルコース脱水素酵素の一態様として、触媒サブユニットは配列番号3
のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号3の位置205のプロリンに相当する位置にシステインが導入されており、電子伝達サブユニットは配列番号4または配列番号4のアミノ酸番号330~425のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号4の位置383のアスパラギン酸に相当する位置に第1のシステインが導入されており、配列番号4の位置345のスレオニンに相当する位置に第2のシステインが導入されており、ヒッチハイカーサブユニットは配列番号2のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号2の位置154のアスパラギンに相当する位置にシステインが導入されている。
のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号3の位置205のプロリンに相当する位置にシステインが導入されており、電子伝達サブユニットは配列番号4または配列番号4のアミノ酸番号330~425のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号4の位置383のアスパラギン酸に相当する位置に第1のシステインが導入されており、配列番号4の位置345のスレオニンに相当する位置に第2のシステインが導入されており、ヒッチハイカーサブユニットは配列番号2のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号2の位置154のアスパラギンに相当する位置にシステインが導入されている。
変異型FAD依存グルコース脱水素酵素の一態様として、触媒サブユニットは配列番号3
のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号3の位置205のプロリンに相当する位置にシステインが導入されており、電子伝達サブユニットは配列番号4または配列番号4のアミノ酸番号330~425のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号4の位置383のアスパラギン酸に相当する位置に第1のシステインが導入されており、配列番号4の位置349のチロシンに相当する位置に第2のシステインが導入されており、ヒッチハイカーサブユニットは配列番号2のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号2の位置155のリジンに相当する位置にシステインが導入されている。
のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号3の位置205のプロリンに相当する位置にシステインが導入されており、電子伝達サブユニットは配列番号4または配列番号4のアミノ酸番号330~425のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号4の位置383のアスパラギン酸に相当する位置に第1のシステインが導入されており、配列番号4の位置349のチロシンに相当する位置に第2のシステインが導入されており、ヒッチハイカーサブユニットは配列番号2のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号2の位置155のリジンに相当する位置にシステインが導入されている。
変異型FAD依存グルコース脱水素酵素の一態様として、触媒サブユニットは配列番号7
のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号7の位置202のプロリンに相当する位置にシステインが導入されており、電子伝達サブユニットは配列番号8または配列番号8のアミノ酸番号326~420のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号8の位置375のグルタミン酸に相当する位置に第1のシステインが導入されており、配列番号8の位置341のチロシンに相当する位置に第2のシステインが導入されており、ヒッチハイカーサブユニットは配列番号6のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号6の位置157のアルギニンに相当する位置にシステインが導入されている。
のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号7の位置202のプロリンに相当する位置にシステインが導入されており、電子伝達サブユニットは配列番号8または配列番号8のアミノ酸番号326~420のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号8の位置375のグルタミン酸に相当する位置に第1のシステインが導入されており、配列番号8の位置341のチロシンに相当する位置に第2のシステインが導入されており、ヒッチハイカーサブユニットは配列番号6のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号6の位置157のアルギニンに相当する位置にシステインが導入されている。
変異型FAD依存グルコース脱水素酵素の一態様として、触媒サブユニットは配列番号1
3のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号13の位置204のプロリンに相当する位置にシステインが導入されており、電子伝達サブユニットは配列番号14または配列番号14のアミノ酸番号332~481のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号14の位置382のヒスチジンに相当する位置に第1のシステインが導入されており、配列番号14の位置347のアラニンに相当する位置に第2のシステインが導入されており、ヒッチハイカーサブユニットは配列番号12のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号12の位置168のアラニンに相当する位置にシステインが導入されている。
3のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号13の位置204のプロリンに相当する位置にシステインが導入されており、電子伝達サブユニットは配列番号14または配列番号14のアミノ酸番号332~481のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号14の位置382のヒスチジンに相当する位置に第1のシステインが導入されており、配列番号14の位置347のアラニンに相当する位置に第2のシステインが導入されており、ヒッチハイカーサブユニットは配列番号12のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号12の位置168のアラニンに相当する位置にシステインが導入されている。
変異型FAD依存グルコース脱水素酵素の一態様として、触媒サブユニットは配列番号1
7のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号17の位置200のプロリンに相当する位置にシステインが導入されており、電子伝達サブユニットは配列番号18または配列番号18のアミノ酸番号340~465のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号18の位置389のアスパラギン酸に相当する位置に第1のシステインが導入されており、配列番号18の位置355のチロシンに相当する位置に第2のシステインが導入されており、ヒッチハイカーサブユニットは配列番号16または配列番号16のアミノ酸19~195のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号16の位置182のアルギニンに相当する位置にシステインが導入されている。
7のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号17の位置200のプロリンに相当する位置にシステインが導入されており、電子伝達サブユニットは配列番号18または配列番号18のアミノ酸番号340~465のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号18の位置389のアスパラギン酸に相当する位置に第1のシステインが導入されており、配列番号18の位置355のチロシンに相当する位置に第2のシステインが導入されており、ヒッチハイカーサブユニットは配列番号16または配列番号16のアミノ酸19~195のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号16の位置182のアルギニンに相当する位置にシステインが導入されている。
変異型FAD依存グルコース脱水素酵素の一態様として、触媒サブユニットは配列番号2
1のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号21の位置204のプロリンに相当する位置にシステインが導入されており、電子伝達サブユニットは配列番号22または配列番号22のアミノ酸番号418~522のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号22の位置467のセリンに相当する位置に第1のシステインが導入されており、配列番号22の位置433のチロシンに相当する位置に第2のシステインが導入されており、ヒッチハイカーサブユニットは配列番号20または配列番号20のアミノ酸14~207のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号20の位置198のグルタミンに相当する位置にシステインが導入されている。
1のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号21の位置204のプロリンに相当する位置にシステインが導入されており、電子伝達サブユニットは配列番号22または配列番号22のアミノ酸番号418~522のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号22の位置467のセリンに相当する位置に第1のシステインが導入されており、配列番号22の位置433のチロシンに相当する位置に第2のシステインが導入されており、ヒッチハイカーサブユニットは配列番号20または配列番号20のアミノ酸14~207のアミノ酸配列と少なくとも60%、70%、80%、90%または95%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、配列番号20の位置198のグルタミンに相当する位置にシステインが導入されている。
本発明の1つの実施形態による前記変異型GDHは遺伝子工学により得られる。より具体的には、前記変異型GDHは、GDHをコードする遺伝子に部位特異的変異導入等により目的の変異を導入し、そしてそれにより生じた変異型GDH遺伝子を任意の宿主細胞又は無細胞翻訳系内で発現させることにより得られる。
したがって、FAD依存性GDHを発現する核酸分子に本明細書に記載の変異を導入し、前記変異型FAD依存性GDHを発現させることを含む、変異型FAD依存性GDHの製造方法も本発明の範囲に含まれる。前記GDHは単離または精製されることが好ましい。
したがって、FAD依存性GDHを発現する核酸分子に本明細書に記載の変異を導入し、前記変異型FAD依存性GDHを発現させることを含む、変異型FAD依存性GDHの製造方法も本発明の範囲に含まれる。前記GDHは単離または精製されることが好ましい。
前記GDH触媒(α)サブユニットをコードする遺伝子は前記GDH αサブユニットのアミノ酸配列に対応するヌクレオチド配列を有する限り限定されない。この遺伝子の具体的な例には配列番号1のヌクレオチド位置764~2380から構成されるDNAが挙げられる。前記αサブユニット遺伝子は、配列番号1のヌクレオチド配列のヌクレオチド
位置764~2380から構成されるヌクレオチド配列を有するDNAであってよく、又はこの配列から調製され得るプローブとストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、GDH活性を有するタンパク質をコードするDNA(たとえば、配列番号1のヌクレオチド位置764~2380から構成されるDNAと少なくとも80%、90%または95%の同一性を有する塩基配列を有するDNA)であってよい。
位置764~2380から構成されるヌクレオチド配列を有するDNAであってよく、又はこの配列から調製され得るプローブとストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、GDH活性を有するタンパク質をコードするDNA(たとえば、配列番号1のヌクレオチド位置764~2380から構成されるDNAと少なくとも80%、90%または95%の同一性を有する塩基配列を有するDNA)であってよい。
前記GDH電子伝達(β)サブユニットをコードする遺伝子の具体的な例には配列番号1のヌクレオチド位置2386~3660から構成されるヌクレオチド配列を含むDNAが挙げられる。前記βサブユニット遺伝子は、配列番号1のヌクレオチド位置2386~3660から構成されるヌクレオチド配列を有するDNAであってよく、又はこの配列から調製され得るプローブとストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、βサブユニットとして機能し得るタンパク質をコードするDNA(たとえば、配列番号1のヌクレオチド位置2386~3660から構成されるDNAと少なくとも80%、90%または95%の同一性を有する塩基配列を有するDNA)であってよい。
前記GDHヒッチハイカーサブユニット(γ)サブユニットをコードする遺伝子の具体的な例には配列番号1のヌクレオチド位置258~761から構成されるヌクレオチド配列を含むDNAが挙げられる。前記γサブユニット遺伝子は、配列番号1のヌクレオチド位置258~761から構成されるヌクレオチド配列を有するDNAであってよく、又はこの配列から調製され得るプローブとストリンジェントな条件下でハイブリダイズする、γサブユニットとして機能し得るタンパク質をコードするDNA(たとえば、配列番号1のヌクレオチド位置258~761から構成されるDNAと少なくとも80%、90%または95%の同一性を有する塩基配列を有するDNA)であってよい。
上記のストリンジェントな条件の例には好ましくは少なくとも80%、より好ましくは少なくとも90%、特に好ましくは少なくとも95%の同一性を有するDNA同士のハイブリダイゼーションを許し、且つ、80%未満、90%未満、又は95%未満の同一性を有するDNA同士のハイブリダイゼーションを許さない条件が挙げられる。このストリンジェントな条件の具体的な例には60℃、65℃、又は68℃で0.1×SSC及び0.1%SDSを使用して洗浄が行われる条件が挙げられる。
前記αサブユニット遺伝子、βサブユニット遺伝子、及びγサブユニット遺伝子は例えばバークホルデリア・セパシアKS1株の染色体DNAを鋳型として使用するPCRにより得られる。このためのPCRプライマーは、上記のヌクレオチド配列に基づいて化学合成により調製可能である。あるいは、前記遺伝子は、上記の配列に基づいて調製されたオリゴヌクレオチドをプローブとして使用するハイブリダイゼーションによってバークホルデリア・セパシアKS1株の染色体DNAから得られる。KS1株以外の株、例えばバークホルデリア・セノセパシアJ2315株、バークホルデリア・タイランデンシスTXDOH株、ラルストニア・ピケッティイ12D株、ラルストニア・ソラナセアラムIPO1609株、及びバークホルデリア・ファイトフィルマンスPsJN株が使用されてもよい。
所望の変異を有する前記GDH αサブユニット、βサブユニット、及びγサブユニットの各々は、そのGDHサブユニットをコードするDNAへ所望のアミノ酸変異(システイン残基による置換等)に対応するヌクレオチド変異を部位特異的変異導入により導入し、そしてそれにより生じた変異体DNAが適切な発現系の使用により発現することによって得られる。さらに、変異型GDHは、前記変異型GDH αサブユニットをコードするDNAから発現させ、そして前記変異型βサブユニットをコードするDNA及び前記変異型γサブユニットをコードするDNAからも発現させることによって得られる。各サブユニットをコードするDNAへの変異の導入は、前記γサブユニット、αサブユニット、及
びβサブユニットをこの順序でコードするポリシストロン性DNA断片を使用して実施されてよい。
びβサブユニットをこの順序でコードするポリシストロン性DNA断片を使用して実施されてよい。
前記γサブユニット、αサブユニット、及びβサブユニットをこの順序でコードする前記ポリシストロン性DNA断片は、例えばバークホルデリア・セパシアKS1株の染色体DNAを鋳型として、並びに配列番号9及び10のヌクレオチド配列を有するオリゴヌクレオチドをプライマーとして使用するPCRにより得られる。
前記GDHサブユニットの遺伝子を得るため、前記変異を導入するため、前記遺伝子を発現させるため等に使用されるベクターにはエシェリキア属に属する細菌において機能し得るベクター、例えばpTrc99A、pBR322、pUC18、pUC118、pUC19、pUC119、pACYC184、及びpBBR122が挙げられる。遺伝子発現に使用されるプロモーターの例にはlac、trp、tac、trc、PL、tet、及びPhoAが挙げられる。プロモーターを含有する発現ベクター中の適切な部位へ前記γサブユニット遺伝子、αサブユニット遺伝子、及びβサブユニット遺伝子を導入することによってそれらの遺伝子のベクターへの挿入とプロモーターの結合を同一の処理内で実行できる。そのような発現ベクターの例にはpTrc99A、pBluescript、及びpKK223-3が挙げられる。
前記γサブユニット遺伝子、αサブユニット遺伝子、及びβサブユニット遺伝子は、発現を可能にする形で宿主微生物の染色体DNAに組み込まれてよい。組換えベクターを使用する微生物の形質転換法の例にはカルシウム処理によるコンピテント細胞法、プロトプラスト法、及び電気穿孔法が挙げられる。
前記宿主微生物の例には枯草菌などのバチルス属に属する細菌、サッカロマイセス・セレビシエなどの酵母、及びアスペルギルス・ニガーなどの糸状菌が挙げられるがこれらに限定されない。外来性タンパク質の生産に適切などの宿主微生物も使用可能である。
前記変異型GDH遺伝子を使用して形質転換された微生物などの形質転換体は、その形質転換体の種類の応じた適切な培養方法によって培養可能である。その培養のための条件の例には30~37℃における12~24間にわたる培養が挙げられる。
前記変異型GDHは精製後に使用されてもよい。前記変異型GDHは精製のためのタグ配列などの追加の配列を含んでよい。
前記変異型GDH遺伝子を使用して形質転換された微生物などの形質転換体は、その形質転換体の種類の応じた適切な培養方法によって培養可能である。その培養のための条件の例には30~37℃における12~24間にわたる培養が挙げられる。
前記変異型GDHは精製後に使用されてもよい。前記変異型GDHは精製のためのタグ配列などの追加の配列を含んでよい。
本発明の1つの実施形態による前記変異型GDH又は前記変異型GDHを発現する前記微生物はグルコースセンサーの酵素電極の構成要素として使用される場合がある。このグルコースセンサーの具体的な例には金電極、プラチナ電極、又は炭素電極などの電極の表面上に前記変異型GDHを固定化することにより形成される酵素電極を作用電極として使用するグルコースセンサーが挙げられる。このセンサーは目的の被験物質の濃度を電気化学的に測定するための測定系を意味し、そのセンサーは3本の電極を通常含み、これらの電極は作用電極(酵素電極)、対電極(プラチナ等)、及び基準電極(Ag/AgCl等)である。前記センサーは作用電極と対電極、例えば従来の簡易血糖レベルシステムに使用される電極から構成される2電極系であってもよい。前記センサーは、緩衝液及び被験試料を入れるための恒温セル、作用電極に電圧を印加するための電源、電流計、記録装置等をさらに含むことが好ましい。前記センサーはバッチタイプセンサー又はフロータイプセンサーのどちらであってもよい。具体的には、このフロータイプセンサーは血糖レベルの連続測定が可能なセンサーであってよい。より具体的には、前記センサーは本発明の前記酵素が固定化される2電極系又は3電極系を有するセンサーであってよく、連続的に供給される血液試料又は透析試料の中、又は血液若しくは間質液の中にこの電極系を入れて測定が実施される。このような酵素センサーの構造は当技術分野においてよく知られており、Biosensors - Fundamental and Applicati
ons、Anthony P. F. Turner、Isao Karube、及びGeroge S. Wilson著、Oxford University Press社、1987年等に記載されている。
本発明の1つの形態による前記センサーは電子伝達媒体を含有しない直接電子伝達型センサーであってよい。
ons、Anthony P. F. Turner、Isao Karube、及びGeroge S. Wilson著、Oxford University Press社、1987年等に記載されている。
本発明の1つの形態による前記センサーは電子伝達媒体を含有しない直接電子伝達型センサーであってよい。
前記電極上に前記酵素(変異型GDH)を固定化する方法は限定されない。この方法の例には架橋剤等を使用して酵素分子を前記電極上に化学的に固定化する方法、結合剤等を使用して酵素分子を前記電極上に間接的に固定化する方法、及び前記電極への酵素分子の物理的吸着による方法が挙げられる。
架橋剤等を使用して前記酵素を前記電極上に化学的に固定化する前記方法は前記酵素を前記電極上に直接的に固定化する方法であってよい。あるいは、米国特許第10563242(B2)号明細書中に開示される方法などの方法が使用可能である。より具体的には、この方法は、前記電極上に単分子層(SAM)形成分子を固定化し、そしてこのSAM形成分子を介して前記酵素を含む分子認識要素を固定化する方法である。
前記単分子層形成分子は、前記電極に結合し、且つ、前記酵素分子をその電極へ結合させることが可能な化合物である。前記電極表面上で前記化合物の複数の分子が同方向で結合することによって単分子層膜が形成され得る。この単分子層形成分子を使用することによって前記電極と前記酵素分子との間の距離を制御することができる。
前記単分子層形成分子は、前記電極に対する親和性を有する第1官能基、スペーサー領域、及び前記酵素分子に含まれる官能基と反応する第2官能基を含むことが好ましい。前記単分子層形成分子は、前記電極に対する親和性を有する前記第1官能基が前記スペーサー領域の第1末端に結合しており、且つ、前記酵素分子に含まれる官能基と反応する前記第2官能基が前記スペーサー領域の第2末端に結合している構造を有していることがより好ましい。ここで、前記電極に対する親和性を有する前記第1官能基の例には前記電極が金属である場合のチオール基及びジチオール基、並びに前記電極が炭素である場合のピレン及びポルフィリンが挙げられる。他方、前記酵素分子に含まれる官能基と反応する前記第2官能基の例には前記酵素分子に含まれるアミノ基(末端アミノ基及び側鎖アミノ基を含む)と反応する場合のスクシンイミド基、及び前記酵素分子に含まれるカルボキシル基(末端カルボキシル基及び側鎖カルボキシル基を含む)と反応する場合のオキサゾリン基が挙げられる。チオール基又はジチオール基及びスクシンイミド基を含む単分子層形成分子の例には実施例において後に説明されるDSHが挙げられる。
前記単分子層形成分子は、前記電極に結合し、且つ、前記酵素分子をその電極へ結合させることが可能な化合物である。前記電極表面上で前記化合物の複数の分子が同方向で結合することによって単分子層膜が形成され得る。この単分子層形成分子を使用することによって前記電極と前記酵素分子との間の距離を制御することができる。
前記単分子層形成分子は、前記電極に対する親和性を有する第1官能基、スペーサー領域、及び前記酵素分子に含まれる官能基と反応する第2官能基を含むことが好ましい。前記単分子層形成分子は、前記電極に対する親和性を有する前記第1官能基が前記スペーサー領域の第1末端に結合しており、且つ、前記酵素分子に含まれる官能基と反応する前記第2官能基が前記スペーサー領域の第2末端に結合している構造を有していることがより好ましい。ここで、前記電極に対する親和性を有する前記第1官能基の例には前記電極が金属である場合のチオール基及びジチオール基、並びに前記電極が炭素である場合のピレン及びポルフィリンが挙げられる。他方、前記酵素分子に含まれる官能基と反応する前記第2官能基の例には前記酵素分子に含まれるアミノ基(末端アミノ基及び側鎖アミノ基を含む)と反応する場合のスクシンイミド基、及び前記酵素分子に含まれるカルボキシル基(末端カルボキシル基及び側鎖カルボキシル基を含む)と反応する場合のオキサゾリン基が挙げられる。チオール基又はジチオール基及びスクシンイミド基を含む単分子層形成分子の例には実施例において後に説明されるDSHが挙げられる。
本発明の前記グルコースセンサーを使用するグルコース濃度の測定は以下のように実施可能である。前記センサーの恒温セルに緩衝液を入れ、このセルの温度を一定に保つ。作用電極として前記変異型GDHが固定化されている酵素電極を使用する。対電極として例えばプラチナ電極を使用する。基準電極として例えばAg/AgCl電極を使用する。この作用電極に定電圧を印加する。電流が一定になった後にグルコースを含む試料をこの恒温セルに入れ、電流の増加を測定する。標準濃度を有するグルコース溶液を使用して用意された検量線に従ってこの試料中のグルコース濃度を計算できる。
本発明の1つの実施形態による前記変異型GDHはグルコースアッセイキットの構成要素としても利用可能である。このグルコースアッセイキットは前記変異型GDHに加えて発色試薬又は発光試薬、希釈緩衝液、標準物質、製造業者の説明書等を含んでよい。
例えば、バークホルデリア・セパシアの野生型GDHを使用するグルコースセンサー及びグルコースアッセイキットが米国特許出願公開第2004/0023330(A1)号明細書中に記載されている。前記変異型GDHは同様の方法で適用可能である。
非限定的な実施例を示すことによって本発明を以下でさらに具体的に説明する。
実施例1
変異型GDHの発現
シトクロムC含有サブユニットを含むGDH(CyGDH)としてバークホルデリア・セパシア由来のCyGDHを使用した。このバークホルデリア・セパシア由来のCyGDHはγサブユニット、αサブユニット、及びβサブユニットから構成されるオリゴマー酵素である。これらの3サブユニットは配列番号1のヌクレオチド配列を有する遺伝子にコードされている。この配列に基づき、コードされるαサブユニットがQYY変異を有するように改変されたポリヌクレオチドを含むpTrc99Aγα(QYY)β、及びαサブユニットがQYY変異を有し、且つ、コードされるβサブユニットがアミノ酸位置330~425から構成される短縮型βサブユニットであるように改変されたポリヌクレオチドを含むpTrc99Aγα(QYY)β330-Hisを使用した(米国特許出願公開第2019-0010215号明細書)。
変異型GDHの発現
シトクロムC含有サブユニットを含むGDH(CyGDH)としてバークホルデリア・セパシア由来のCyGDHを使用した。このバークホルデリア・セパシア由来のCyGDHはγサブユニット、αサブユニット、及びβサブユニットから構成されるオリゴマー酵素である。これらの3サブユニットは配列番号1のヌクレオチド配列を有する遺伝子にコードされている。この配列に基づき、コードされるαサブユニットがQYY変異を有するように改変されたポリヌクレオチドを含むpTrc99Aγα(QYY)β、及びαサブユニットがQYY変異を有し、且つ、コードされるβサブユニットがアミノ酸位置330~425から構成される短縮型βサブユニットであるように改変されたポリヌクレオチドを含むpTrc99Aγα(QYY)β330-Hisを使用した(米国特許出願公開第2019-0010215号明細書)。
これらのベクターを使用して前記サブユニットに以下のアミノ酸置換が導入されるように部位特異的変異導入を実行した。変異体1は、γサブユニットの位置154がシステインで置換されており、βサブユニットの位置345がシステインで置換されており、そしてこれらのシステイン間でジスルフィド結合が形成されている変異体である。変異体2は、γサブユニットの位置155がシステインで置換されており、βサブユニットの位置349がシステインで置換されており、そしてこれらのシステイン間でジスルフィド結合が形成されている変異体である。変異体3は、αサブユニットの位置205がシステインで置換されており、βサブユニットの位置383がシステインで置換されており、そしてこれらのシステイン間でジスルフィド結合が形成されている変異体である。変異体4は、αサブユニットの位置205がシステインで置換されており、βサブユニットの位置383がシステインで置換されており、これらのシステイン間でジスルフィド結合(α-βジスルフィド結合)が形成されており、βサブユニットの位置345がシステインで置換されており、γサブユニットの位置154がシステインで置換されており、そしてこれらのシステイン間でジスルフィド結合(β-γジスルフィド結合)が形成されている変異体である。変異体5は、αサブユニットの位置205がシステインで置換されており、βサブユニットの位置383がシステインで置換されており、これらのシステイン間でジスルフィド結合(α-βジスルフィド結合)が形成されており、βサブユニットの位置349がシステインで置換されており、γサブユニットの位置155がシステインで置換されており、そしてこれらのシステイン間でジスルフィド結合(β-γジスルフィド結合)が形成されている変異体である。
得られた各ベクターを使用して大腸菌を形質転換し、それにより生じた形質転換体を培養して各変異型GDHを発現させた。
米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法によって培養及びグルコース脱水素酵素の精製を実施した。
米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法によって培養及びグルコース脱水素酵素の精製を実施した。
酵素活性の測定
各変異型GDHを各温度で15分間にわたって加熱処理し、その後で米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法に従ってPMS/DCIPを使用する系を用いて酵素活性を測定した。
各変異型GDHを各温度で15分間にわたって加熱処理し、その後で米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法に従ってPMS/DCIPを使用する系を用いて酵素活性を測定した。
結果が図1に示されている。システイン残基が導入されていないQYYは55℃から活性の激減を示し、一方で変異体1、変異体2、及び変異体3の場合では55℃及び65℃においても活性が維持された。
図2に示されているように、前記短縮型βサブユニットが使用され、且つ、そのサブユニットにシステインが導入されている場合では活性の減少がほとんど認められなかった。
その後、α-βジスルフィド結合とβ-γジスルフィド結合を形成するためにαサブユニットだけでなくγサブユニットにもシステインが導入されている変異体4及び変異体5について熱安定性を評価した。
結果として、図3に示されているように変異体4は75℃において元の活性と比べて約3分の1まで活性の減少を示した。対照的に変異体5は正常型βサブユニット又は短縮型サブユニットのどちらについても75℃において元の活性の約70%を示し、高温でもその酵素の性能が低下する可能性が低いことを示した。
結果として、図3に示されているように変異体4は75℃において元の活性と比べて約3分の1まで活性の減少を示した。対照的に変異体5は正常型βサブユニット又は短縮型サブユニットのどちらについても75℃において元の活性の約70%を示し、高温でもその酵素の性能が低下する可能性が低いことを示した。
その後、様々な長さの時間にわたって75℃で加熱処理を実施した後に活性を調査した。結果として、変異体4及び変異体5はこの加熱処理の60分後でも活性の維持を示した。特に、変異体5はこの加熱処理の60分後でも元の活性の60%以上が維持可能な高い熱安定性を有する酵素であることが分かった。
酵素電極の調製及びグルコースの測定
その後、変異体5を使用して酵素電極を調製し、この酵素電極をグルコース濃度の測定に使用した。
まず、単分子層形成分子を介して金表面に前記変異型を固定化することにより酵素電極を調製した。前記単分子層形成分子として以下に示されるDSHを使用した。
その後、変異体5を使用して酵素電極を調製し、この酵素電極をグルコース濃度の測定に使用した。
まず、単分子層形成分子を介して金表面に前記変異型を固定化することにより酵素電極を調製した。前記単分子層形成分子として以下に示されるDSHを使用した。
具体的には、金線(直径、0.5mm;長さ、6~7cm)を室温で2時間にわたってピラニア溶液(200μl)中に浸漬し、その後にアセトンで洗浄した。その後、この線
をアセトン中のDSH溶液(濃度20μM)中に浸漬し、25℃で24時間にわたってインキュベートしてDSHのチオール基を金表面に結合させた。その後、この線をアセトンで洗浄し、その後で前記変異型GDH(濃度、0.03mg/ml)を含むリン酸緩衝液(300μl)中に浸漬し、4℃で一晩にわたってインキュベートしてDSHの官能基を介して前記変異型GDHを結合させることにより前記変異型GDHが表面上に固定化されている酵素電極を得た。
をアセトン中のDSH溶液(濃度20μM)中に浸漬し、25℃で24時間にわたってインキュベートしてDSHのチオール基を金表面に結合させた。その後、この線をアセトンで洗浄し、その後で前記変異型GDH(濃度、0.03mg/ml)を含むリン酸緩衝液(300μl)中に浸漬し、4℃で一晩にわたってインキュベートしてDSHの官能基を介して前記変異型GDHを結合させることにより前記変異型GDHが表面上に固定化されている酵素電極を得た。
上記の通り調製された前記酵素電極を使用して0mM(バックグラウンド)、1mM、2mM、5mM、10mM、20mM、又は50mMのグルコース水溶液に対する応答電流値をクロノアンペロメトリーによって測定した。対電極(プラチナ(Pt)線)及び基準電極(銀/塩化銀)を使用し、(銀/塩化銀と比べて)+0.4Vの電位を前記作用電極に対して印加することにより37℃でグルコース測定を実施した。
結果として、図5に示されているように応答電流のグルコース濃度依存性が分かった。
したがって、ジスルフィド結合によってサブユニットを相互に結合するためにシステインが導入されているGDHを使用するセンサーを用いてグルコース濃度を測定できることが示された。さらに、驚くべきことにこれらのシステインの導入によって電極特性が改善されることが分かった。
したがって、ジスルフィド結合によってサブユニットを相互に結合するためにシステインが導入されているGDHを使用するセンサーを用いてグルコース濃度を測定できることが示された。さらに、驚くべきことにこれらのシステインの導入によって電極特性が改善されることが分かった。
応答電流の連続測定
上記の通り調製された変異体5を担持する前記酵素電極を対電極(プラチナ(Pt)線)及び基準電極(銀/塩化銀)と共に室温で20mMのグルコース溶液中に浸漬した。(銀/塩化銀と比べて)+0.2Vの電位を前記作用電極に印加することによって電流応答を連続的に4週間にわたって測定し、結果をシステイン残基が導入されていないQYY GDHを担持する前記酵素電極に対して比較した。図6に示されているように変異体5を担持する前記酵素電極の電流応答が4週間にわたって高いレベルで維持され、一方でQYY GDHを担持する前記酵素電極の電流応答は約40%まで減少した。
上記の通り調製された変異体5を担持する前記酵素電極を対電極(プラチナ(Pt)線)及び基準電極(銀/塩化銀)と共に室温で20mMのグルコース溶液中に浸漬した。(銀/塩化銀と比べて)+0.2Vの電位を前記作用電極に印加することによって電流応答を連続的に4週間にわたって測定し、結果をシステイン残基が導入されていないQYY GDHを担持する前記酵素電極に対して比較した。図6に示されているように変異体5を担持する前記酵素電極の電流応答が4週間にわたって高いレベルで維持され、一方でQYY GDHを担持する前記酵素電極の電流応答は約40%まで減少した。
次に、変異体5を担持する前記酵素電極を対電極(プラチナ(Pt)線)及び基準電極(銀/塩化銀)と共に室温でグルコース溶液(0mM、1mM、3mM、5mM、10mM、15mM、及び20mM)中に浸漬した。(銀/塩化銀と比べて)+0.2Vの電位を連続的に前記作用電極に対して印加し、応答電流を開示的に測定及びプロットし、結果をシステイン残基が導入されていないQYY GDHを担持する前記酵素電極に対して比較した。図7に示されているように変異体5を担持する前記酵素電極の電流応答のグルコース濃度依存性が約5週間にわたって維持され、一方でQYY GDHを担持する前記酵素電極の電流応答のグルコース濃度依存性が26日目及び34日目にほぼ失われた。
これらのデータはシステイン残基が導入された前記酵素が非常に安定しており、グルコースの長期測定に好適に使用可能であることを明確に示している。
これらのデータはシステイン残基が導入された前記酵素が非常に安定しており、グルコースの長期測定に好適に使用可能であることを明確に示している。
実施例2
エウィンゲラ・アメリカナ由来の変異型GDHの調製及び耐熱性の評価
シトクロムC含有サブユニットを含むGDHとしてエウィンゲラ・アメリカナ由来のCyGDHを使用した。このエウィンゲラ・アメリカナ由来のCyGDHはγサブユニット、αサブユニット、及びβサブユニットから構成されるオリゴマー酵素である。これらの3サブユニットは配列番号5のヌクレオチド配列を有する遺伝子にコードされている。このCyGDH遺伝子をpTrc99Aに挿入した。
エウィンゲラ・アメリカナ由来の変異型GDHの調製及び耐熱性の評価
シトクロムC含有サブユニットを含むGDHとしてエウィンゲラ・アメリカナ由来のCyGDHを使用した。このエウィンゲラ・アメリカナ由来のCyGDHはγサブユニット、αサブユニット、及びβサブユニットから構成されるオリゴマー酵素である。これらの3サブユニットは配列番号5のヌクレオチド配列を有する遺伝子にコードされている。このCyGDH遺伝子をpTrc99Aに挿入した。
このベクターを使用して前記サブユニットに以下のアミノ酸置換が導入されるように部位特異的変異導入を実行した。変異体Eは、αサブユニットの位置202がシステインで置換されており、βサブユニットの位置375がシステインで置換されており、これらの
システイン間でジスルフィド結合(α-βジスルフィド結合)が形成されており、βサブユニットの位置341がシステインで置換されており、γサブユニットの位置157がシステインで置換されており、そしてこれらのシステイン間でジスルフィド結合(β-γジスルフィド結合)が形成されている変異体である。
システイン間でジスルフィド結合(α-βジスルフィド結合)が形成されており、βサブユニットの位置341がシステインで置換されており、γサブユニットの位置157がシステインで置換されており、そしてこれらのシステイン間でジスルフィド結合(β-γジスルフィド結合)が形成されている変異体である。
得られた各ベクターを使用して大腸菌を形質転換し、それにより生じた形質転換体を培養して前記変異型GDHを発現させた。
米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法によって培養及びグルコース脱水素酵素の精製を実施した。
米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法によって培養及びグルコース脱水素酵素の精製を実施した。
酵素活性の測定
前記変異型GDHを65℃で加熱処理し、米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法に従ってPMS/DCIPを使用する系を用いて酵素活性を測定し、そして酵素活性の時間依存的変化をプロットした。
前記変異型GDHを65℃で加熱処理し、米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法に従ってPMS/DCIPを使用する系を用いて酵素活性を測定し、そして酵素活性の時間依存的変化をプロットした。
結果が図8に示されている。システイン残基が導入されていない野生型GDHは65℃で活性の激減を示し、一方でα-βジスルフィド結合及びβ-γジスルフィド結合を有する前記変異型GDHの活性は65℃において30分間にわたって維持された。
実施例3
シルビモナス・テラエ由来の変異型GDHの調製及び耐熱性の評価
シトクロムC含有サブユニットを含むGDHとしてシルビモナス・テラエ由来のCyGDHを使用した。このCyGDHはγサブユニット、αサブユニット、及びβサブユニットから構成されるオリゴマー酵素である。これらの3サブユニットは配列番号11のヌクレオチド配列を有する遺伝子にコードされている。このCyGDH遺伝子をpTrc99Aに挿入した。
シルビモナス・テラエ由来の変異型GDHの調製及び耐熱性の評価
シトクロムC含有サブユニットを含むGDHとしてシルビモナス・テラエ由来のCyGDHを使用した。このCyGDHはγサブユニット、αサブユニット、及びβサブユニットから構成されるオリゴマー酵素である。これらの3サブユニットは配列番号11のヌクレオチド配列を有する遺伝子にコードされている。このCyGDH遺伝子をpTrc99Aに挿入した。
このベクターを使用して前記サブユニットに以下のアミノ酸置換が導入されるように部位特異的変異導入を実行した。2つの変異型CyGDHを作成した。一つは、αサブユニットの位置204のプロリンがシステインで置換されており、βサブユニットの位置382のヒスチジンがシステインで置換されており、これらのシステイン間でジスルフィド結合(α-βジスルフィド結合)が形成されており、βサブユニットの位置347のアラニンがシステインで置換されており、γサブユニットの位置168のアラニンがシステインで置換されており、そしてこれらのシステイン間でジスルフィド結合(β-γジスルフィド結合)が形成されている変異体(αP204CβH382C-γA168CβA347C)である。もう一つは
、αサブユニットの位置204のプロリンがシステインで置換されており、βサブユニットの位置382のヒスチジンがシステインで置換されており、これらのシステイン間でジスルフィド結合(α-βジスルフィド結合)が形成されている変異体(αP204CβH382C)である。
、αサブユニットの位置204のプロリンがシステインで置換されており、βサブユニットの位置382のヒスチジンがシステインで置換されており、これらのシステイン間でジスルフィド結合(α-βジスルフィド結合)が形成されている変異体(αP204CβH382C)である。
得られた各ベクターを使用して大腸菌を形質転換し、それにより生じた形質転換体を培養して前記変異型GDHを発現させた。
米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法によって培養及びグルコース脱水素酵素の精製を実施した。
米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法によって培養及びグルコース脱水素酵素の精製を実施した。
酵素活性の測定
前記変異型GDHを60℃で加熱処理し、米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法に従ってRu/MTTを使用する系を用いて酵素活性を測定し、そして酵素活性の時間依存的変化をプロットした。
前記変異型GDHを60℃で加熱処理し、米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法に従ってRu/MTTを使用する系を用いて酵素活性を測定し、そして酵素活性の時間依存的変化をプロットした。
結果が図12に示されている。システイン残基が導入されていない野生型GDHは温度の増加とともに活性が激減したが、α-βジスルフィド結合を有する変異型GDHは熱安定性の向上を示し、α-βジスルフィド結合及びβ-γジスルフィド結合を有する変異型GDHの活性は60℃まで維持された。また、図13に示されるように、システイン残基が導入されていない野生型GDHは60℃で活性の激減を示し、一方でα-βジスルフィド結合を有する変異型GDHは熱安定性の向上を示し、α-βジスルフィド結合及びβ-γジスルフィド結合を有する前記変異型GDHの活性は60℃において30分間にわたって維持された。
実施例4
ザイモバクター・パルマエ由来の変異型GDHの調製及び耐熱性の評価
シトクロムC含有サブユニットを含むGDHとしてザイモバクター・パルマエ由来のCyGDHを使用した。このCyGDHはγサブユニット、αサブユニット、及びβサブユニットから構成されるオリゴマー酵素である。これらの3サブユニットは配列番号15のヌクレオチド配列を有する遺伝子にコードされている。配列番号15のヌクレオチド配列において、位置55のgをaに置換して、配列番号16のアミノ酸配列の位置19のバリンがメチオニンに置換されてγサブユニットがこの位置から翻訳される改変型CyGDH遺伝子をpTrc99Aに挿入した。
ザイモバクター・パルマエ由来の変異型GDHの調製及び耐熱性の評価
シトクロムC含有サブユニットを含むGDHとしてザイモバクター・パルマエ由来のCyGDHを使用した。このCyGDHはγサブユニット、αサブユニット、及びβサブユニットから構成されるオリゴマー酵素である。これらの3サブユニットは配列番号15のヌクレオチド配列を有する遺伝子にコードされている。配列番号15のヌクレオチド配列において、位置55のgをaに置換して、配列番号16のアミノ酸配列の位置19のバリンがメチオニンに置換されてγサブユニットがこの位置から翻訳される改変型CyGDH遺伝子をpTrc99Aに挿入した。
このベクターを使用して前記サブユニットに以下のアミノ酸置換が導入されるように部位特異的変異導入を実行した。2つの変異型CyGDHを作成した。一つは、αサブユニットの位置200のプロリンがシステインで置換されており、βサブユニットの位置389のアスパラギン酸がシステインで置換されており、これらのシステイン間でジスルフィド結合(α-βジスルフィド結合)が形成されており、βサブユニットの位置355のチロシンがシステインで置換されており、γサブユニットの位置164のアルギニン(配列番号16の位置182のアルギニンに相当)がシステインで置換されており、そしてこれらのシステイン間でジスルフィド結合(β-γジスルフィド結合)が形成されている変異体(αP200CβD389C-γR182CβY355C)である。もう一つは、αサブユニットの位置200
のプロリンがシステインで置換されており、βサブユニットの位置389のアスパラギン酸がシステインで置換されており、これらのシステイン間でジスルフィド結合(α-βジスルフィド結合)が形成されている変異体(αP200CβD389C)である。
のプロリンがシステインで置換されており、βサブユニットの位置389のアスパラギン酸がシステインで置換されており、これらのシステイン間でジスルフィド結合(α-βジスルフィド結合)が形成されている変異体(αP200CβD389C)である。
得られた各ベクターを使用して大腸菌を形質転換し、それにより生じた形質転換体を培養して前記変異型GDHを発現させた。
米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法によって培養及びグルコース脱水素酵素の精製を実施した。
米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法によって培養及びグルコース脱水素酵素の精製を実施した。
酵素活性の測定
前記変異型GDHを60℃で加熱処理し、米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法に従ってRu/MTTを使用する系を用いて酵素活性を測定し、そして酵素活性の時間依存的変化をプロットした。
前記変異型GDHを60℃で加熱処理し、米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法に従ってRu/MTTを使用する系を用いて酵素活性を測定し、そして酵素活性の時間依存的変化をプロットした。
結果が図14に示されている。システイン残基が導入されていない野生型GDHは温度の増加とともに活性が激減したが、α-βジスルフィド結合を有する変異型GDHおよびα-βジスルフィド結合及びβ-γジスルフィド結合を有する変異型GDHの活性は65℃まで維持された。また、図15に示されるように、システイン残基が導入されていない野生型GDHは60℃で活性がゼロになるまで激減し、一方でα-βジスルフィド結合を有する変異型GDHおよびα-βジスルフィド結合及びβ-γジスルフィド結合を有する変異型GDHの活性は60℃において30分間にわたって維持された。
実施例5
コベティア エスピー由来の変異型GDHの調製及び耐熱性の評価
シトクロムC含有サブユニットを含むGDHとしてコベティア エスピー由来のCyG
DHを使用した。このCyGDHはγサブユニット、αサブユニット、及びβサブユニットから構成されるオリゴマー酵素である。これらの3サブユニットは配列番号19のヌクレオチド配列を有する遺伝子にコードされている。配列番号19のヌクレオチド配列において、位置40~42のatgを開始コドンとし、γサブユニットが、配列番号20のアミノ酸配列の位置14のメチオニンから翻訳されるCyGDH遺伝子をpTrc99Aに挿入した。
コベティア エスピー由来の変異型GDHの調製及び耐熱性の評価
シトクロムC含有サブユニットを含むGDHとしてコベティア エスピー由来のCyG
DHを使用した。このCyGDHはγサブユニット、αサブユニット、及びβサブユニットから構成されるオリゴマー酵素である。これらの3サブユニットは配列番号19のヌクレオチド配列を有する遺伝子にコードされている。配列番号19のヌクレオチド配列において、位置40~42のatgを開始コドンとし、γサブユニットが、配列番号20のアミノ酸配列の位置14のメチオニンから翻訳されるCyGDH遺伝子をpTrc99Aに挿入した。
このベクターを使用して前記サブユニットに以下のアミノ酸置換が導入されるように部位特異的変異導入を実行した。1つの変異型CyGDHを作成した。その変異型CyGDHでは、αサブユニットの位置204のプロリンがシステインで置換されており、βサブユニットの位置467のセリンがシステインで置換されており、これらのシステイン間でジスルフィド結合(α-βジスルフィド結合)が形成されており、βサブユニットの位置433のチロシンがシステインで置換されており、γサブユニットの位置185のグルタミン(配列番号20の位置198のグルタミンに相当)がシステインで置換されており、そしてこれらのシステイン間でジスルフィド結合(β-γジスルフィド結合)が形成されている変異体(αP204CβS467C-γQ198CβY433C)である。
得られた各ベクターを使用して大腸菌を形質転換し、それにより生じた形質転換体を培養して前記変異型GDHを発現させた。
米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法によって培養及びグルコース脱水素酵素の精製を実施した。
米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法によって培養及びグルコース脱水素酵素の精製を実施した。
酵素活性の測定
前記変異型GDHを60℃で加熱処理し、米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法に従ってRu/MTTを使用する系を用いて酵素活性を測定し、そして酵素活性の時間依存的変化をプロットした。
前記変異型GDHを60℃で加熱処理し、米国特許出願公開第2019-0010215号明細書に記載される方法に従ってRu/MTTを使用する系を用いて酵素活性を測定し、そして酵素活性の時間依存的変化をプロットした。
結果が図16に示されている。システイン残基が導入されていない野生型GDHは温度の増加とともに活性が低下したが、α-βジスルフィド結合及びβ-γジスルフィド結合を有する変異型GDHの活性は60℃まで維持された。また、図17に示されるように、システイン残基が導入されていない野生型GDHは60℃で活性がゼロになるまで激減し、一方でα-βジスルフィド結合及びβ-γジスルフィド結合を有する変異型GDHの活性は60℃において30分間にわたって維持された。
これらのデータは起源が様々なオリゴマーGDH酵素の安定性を向上させるためにジスルフィド結合の形成も効果的であることを明確に示している。
本明細書において引用されている特許及び特許出願並びに非特許文書を含む全ての刊行物の内容は、全ての内容が明確に説明された場合と同程度に参照により本明細書に援用される。
Claims (19)
- 触媒サブユニット、
電子伝達サブユニット、及び
ヒッチハイカーサブユニット
を含む変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素であって、前記触媒サブユニットのアミノ酸配列と前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列の各々がその中に導入されたシステイン残基を含み、前記触媒サブユニット及び前記電子伝達サブユニットが前記システイン残基間のジスルフィド結合を介して相互に結合している、変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。 - 前記触媒サブユニットのアミノ酸配列が、配列番号3のアミノ酸位置200~240の領域に対応する領域内に導入されたシステイン残基を含む、請求項1に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。
- 前記触媒サブユニットのアミノ酸配列が、配列番号3の位置205のプロリン残基、位置208のグリシン残基、位置215のアスパラギン残基、位置224のイソロイシン残基、又は位置235のグルタミン酸残基に対応するアミノ酸残基の位置に導入されたシステイン残基を含む、請求項2に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。
- 前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列が、配列番号4のアミノ酸位置330~400の領域に対応する領域内に導入されたシステイン残基を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。
- 前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列が、配列番号4の位置336のスレオニン残基、位置385のグリシン残基、位置383のアスパラギン酸残基、又は位置391のチロシン残基に対応するアミノ酸残基の位置に導入されたシステイン残基を含む、請求項4に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。
- 前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列がその中に導入された別のシステイン残基を含み、且つ、前記ヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列がその中に導入されたシステイン残基を含み、前記システイン残基間のジスルフィド結合を介して前記ヒッチハイカーサブユニット及び前記電子伝達サブユニットが相互に結合している、請求項1~5のいずれか一項に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。
- 前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列が、配列番号4のアミノ酸位置341~350の領域に対応する領域内に導入された別のシステイン残基を含む、請求項6に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。
- 前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列が、配列番号4の位置345のスレオニン残基、位置346のプロリン残基、又は位置349のチロシン残基に対応するアミノ酸残基の位置に置換されることで導入された別のシステイン残基を含む、請求項7に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。
- 前記ヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列が、配列番号2のアミノ酸位置140~160の領域に対応する領域内に導入されたシステイン残基を含む、請求項6~8のいずれか一項に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。
- 前記ヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列が、配列番号2の位置145のスレオニン残基、位置154のアスパラギン残基、又は位置155のリジン残基に対応するアミ
ノ酸残基の位置に置換されることで導入されたシステイン残基を含む、請求項9に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。 - 前記触媒サブユニットのアミノ酸配列が配列番号3に対して少なくとも60%の同一性を有する、請求項1~10のいずれか一項に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。
- 前記電子伝達サブユニットのアミノ酸配列が
配列番号4のアミノ酸配列、又は
配列番号4のアミノ酸位置314~425のアミノ酸配列
に対して少なくとも60%の同一性を有する、請求項1~11のいずれか一項に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。 - 前記ヒッチハイカーサブユニットのアミノ酸配列が配列番号2に対して少なくとも60%の同一性を有する、請求項1~12のいずれか一項に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。
- 前記触媒サブユニットが配列番号7に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含み、システインが配列番号7中の位置202のプロリン残基、位置205のグリシン残基、位置212のアスパラギン残基、位置221のイソロイシン残基、又は位置232のグルタミン酸残基に対応する位置に導入されており、
前記電子伝達サブユニットが配列番号8又は配列番号8のアミノ酸306~420に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、第1のシステインが配列番号8中の位置328のセリン残基、位置375のグルタミン残基、位置377のフェニルアラニン残基または位置383のアスパラギン酸残基に対応する位置に導入されており、第2のシステインが配列番号8中の位置337のセリン残基、位置338のグルタミン残基、または位置341のチロシン残基に対応する位置に導入されており、且つ、
前記ヒッチハイカーサブユニットが配列番号6に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、システインが配列番号6中の位置147のバリン残基、位置156のアスパラギン残基、又は位置157のアルギニン残基に対応する位置に導入されている、請求項1~10のいずれか一項に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。 - 前記触媒サブユニットが配列番号13に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含み、システインが配列番号13中の位置204のプロリン残基に対応する位置に導入されており、
前記電子伝達サブユニットが配列番号14又は配列番号14のアミノ酸332~481に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、第1のシステインが配列番号14中の位置382のヒスチジン残基に対応する位置に導入されており、第2のシステインが配列番号14中の位置347のアラニン残基に対応する位置に導入されており、且つ、
前記ヒッチハイカーサブユニットが配列番号12に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、システインが配列番号12中の位置168のアラニン残基に対応する位置に導入されている、請求項1~10のいずれか一項に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。 - 前記触媒サブユニットが配列番号17に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含み、システインが配列番号17中の位置200のプロリン残基に対応する位置に導入されており、
前記電子伝達サブユニットが配列番号18又は配列番号18のアミノ酸340~465
に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、第1のシステインが配列番号18中の位置389のアスパラギン酸残基に対応する位置に導入されており、第2のシステインが配列番号18中の位置355のチロシン残基に対応する位置に導入されており、且つ、
前記ヒッチハイカーサブユニットが配列番号16または配列番号16のアミノ酸19~195に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、システインが配列番号16中の位置182のアルギニン残基に対応する位置に導入されている、請求項1~10のいずれか一項に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。 - 前記触媒サブユニットが配列番号21に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を含み、システインが配列番号21中の位置204のプロリン残基に対応する位置に導入されており、
前記電子伝達サブユニットが配列番号22又は配列番号22のアミノ酸418~522に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、第1のシステインが配列番号22中の位置467のセリン残基に対応する位置に導入されており、第2のシステインが配列番号22中の位置433のチロシン残基に対応する位置に導入されており、且つ、
前記ヒッチハイカーサブユニットが配列番号20または配列番号20のアミノ酸14~207に対して少なくとも60%の同一性を有するアミノ酸配列を有し、システインが配列番号20中の位置198のグルタミン残基に対応する位置に導入されている、請求項1~10のいずれか一項に記載の変異型FAD依存性グルコース脱水素酵素。 - 請求項1~17のいずれか一項に記載のFAD依存性グルコース脱水素酵素を含む酵素電極。
- 請求項18に記載の酵素電極を含むバイオセンサー。
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