JP2011529683A - Melkエピトープペプチドおよびそれを含むワクチン - Google Patents
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Abstract
Description
本発明の態様を実施または試験するにあたって、本明細書に記載の方法および材料と類似のまたは同等な任意の方法および材料を用いることができるが、好ましい方法、装置、および材料をここに記載する。しかしながら、本材料および方法について記載する前に、本明細書に記載の特定の大きさ、形状、寸法、材料、方法論、プロトコール等は慣行的な実験法および最適化に従って変更可能であるため、本発明がこれらに限定されないことが理解されるべきである。本記載に使用する専門用語は特定の型または態様のみを説明する目的のためのものであり、添付の特許請求の範囲によってのみ限定される本発明の範囲を限定することは意図されないことも、同様に理解されるべきである。
本明細書で用いる「1つの(a)」、「1つの(an)」、および「その(the)」という単語は、特に他に具体的に指示がない限り「少なくとも1つ」を意味する。
意味する。
MELK由来のペプチドが、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)によって認識される抗原として機能することを実証するために、MELK(SEQ ID NO:93)由来のペプチドを解析して、それらが、通常HLA対立遺伝子に見られるHLA−A24またはHLA−A02拘束性の抗原エピトープであるかどうかを判定した(Date Y et al., Tissue Antigens 47: 93-101, 1996;Kondo A et al., J Immunol 155: 4307-12, 1995;Kubo RT et al., J Immunol 152: 3913-24, 1994)。MELK由来のHLA−A24またはHLA−A02結合ペプチドの候補を、HLA−A24またはHLA−A02に対するそれらの結合親和性に基づいて同定した。これらのペプチドを負荷した樹状細胞(DC)によるT細胞のインビトロでの刺激後、以下の各ペプチドを用いてCTLをうまく樹立した:
MELK− A24−9−326 (SEQ ID NO:14)、
MELK−A24−9−78 (SEQ ID NO:21)、
MELK−A24−10−637 (SEQ ID NO:23)、
MELK−A24−10− 532 (SEQ ID NO:27)、
MELK−A02−9−138 (SEQ ID NO:36)、
MELK− A02−9−193 (SEQ ID NO:46)、
MELK− A02−9−171 (SEQ ID NO:57)、
MELK− A02−9−71 (SEQ ID NO:60)、および
MELK− A02− 9−532 (SEQ ID NO:62)。
樹立されたこれらのCTLは、各ペプチドをパルスした標的細胞に対して強力な特異的CTL活性を示す。本明細書におけるこれらの結果から、MELKがCTLによって認識される抗原であること、および前記ペプチドがHLA−A24またはHLA−A02拘束性のMELKのエピトープペプチドであり得ることが実証される。
1)アラニン(A)、グリシン(G);
2)アスパラギン酸(D)、グルタミン酸(E);
3)アスパラギン(N)、グルタミン(Q);
4)アルギニン(R)、リジン(K);
5)イソロイシン(I)、ロイシン(L)、メチオニン(M)、バリン(V);
6)フェニルアラニン(F)、チロシン(Y)、トリプトファン(W);
7)セリン(S)、スレオニン(T);および
8)システイン(C)、メチオニン(M)(例えば、Creighton, Proteins 1984を参照されたい)。
周知の技法を用いて、本発明のペプチドを調製することができる。例えば、組換えDNA技術または化学合成を用いて、ペプチドを合成的に調製することができる。本発明のペプチドは、個々に、または2つもしくはそれ以上のペプチドから構成されるより長いポリペプチドとして、合成することができる。その後ペプチドを単離すること、すなわち他の天然の宿主細胞タンパク質およびそれらの断片、または他の任意の化学物質を実質的に含まないように、精製または単離することができる。
(i)Peptide Synthesis, Interscience, New York, 1966;
(ii)The Proteins, Vol. 2, Academic Press, New York, 1976;
(iii)Peptide Synthesis (日本語), Maruzen Co., 1975;
(iv)Basics and Experiment of Peptide Synthesis (日本語), Maruzen Co., 1985;
(v)Development of Pharmaceuticals (second volume) (日本語), Vol. 14 (peptide synthesis), Hirokawa, 1991;
(vi)WO99/67288;および
(vii)Barany G. & Merrifield R.B., Peptides Vol. 2, 「Solid Phase Peptide Synthesis」, Academic Press, New York, 1980, 100-118。
本発明はまた、前述の本発明のペプチドのいずれかをコードするポリヌクレオチドを提供する。これらは、天然MELK遺伝子(GenBankアクセッション番号NM_014791(SEQ ID NO:93))由来のポリヌクレオチド、およびその保存的に改変されたヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含む。本明細書において「保存的に改変されたヌクレオチド配列」という語句は、同一のまたは本質的に同一のアミノ酸配列をコードする配列を指す。遺伝暗号の縮重のため、数多くの機能的に同一な核酸が任意の特定のタンパク質をコードする。例えば、コドンGCA、GCC、GCG、およびGCUはすべて、アミノ酸のアラニンをコードする。従って、あるコドンによってアラニンが指定されるあらゆる位置において、コードされるポリペプチドを変化させることなく、該コドンを記載された対応するコドンのいずれかに変更することができる。このような核酸の変異は「サイレント変異」であり、保存的に改変された変異の一種である。ペプチドをコードする本明細書中のあらゆる核酸配列は、該核酸の可能性のあるあらゆるサイレント変異をも表す。核酸中の各コドン(通常メチオニンに対する唯一のコドンであるAUG、および通常トリプトファンに対する唯一のコドンであるTGGを除く)を改変して、機能的に同一な分子を得ることができることを、当業者は認識するであろう。従って、ペプチドをコードする核酸の各サイレント変異は、公開した各配列において非明示的に記載されている。
本発明は、本発明のペプチドとHLA抗原との間で形成された複合体を自身の表面上に提示する、エキソソームと称される細胞内小胞をさらに提供する。エキソソームは、例えば公表特許公報特表平11−510507号およびWO99/03499に詳述されている方法を用いることによって調製することができ、治療および/または予防の対象となる患者から得られたAPCを用いて調製することができる。本発明のエキソソームは、本発明のペプチドと同様の様式で、ワクチンとして接種することができる。
本発明はまた、HLA抗原と本発明のペプチドとの間に形成される複合体を自身の表面上に提示する単離されたAPCを提供する。本発明のペプチドを接触させることによって、または本発明のペプチドをコードするヌクレオチドを発現可能な形態で導入することによって得られるAPCは、治療および/または予防の対象となる患者に由来してよく、かつ、単独で、または本発明のペプチド、エキソソーム、もしくは細胞傷害性T細胞を含む他の薬物と組み合わせて、ワクチンとして投与することができる。
a:第1の対象からAPCを回収する段階;
b:段階aのAPCとペプチドを接触させる段階;および
c:前記ペプチドを負荷したAPCを第2の対象に投与する段階。
本発明のペプチドのいずれかに対して誘導された細胞傷害性T細胞は、インビボで腫瘍関連内皮を標的とする免疫応答を増強させるため、ペプチド自体と同様の様式でワクチンとして用いることができる。従って本発明はまた、本ペプチドのいずれかよって特異的に誘導または活性化された、単離された細胞傷害性T細胞を提供する。
本発明はまた、T細胞受容体(TCR)のサブユニットを形成し得るポリペプチドをコードする核酸配列を含む組成物、およびそれを用いる方法を提供する。TCRサブユニットは、MELKを提示する腫瘍細胞に対する特異性をT細胞に付与するTCRを形成する能力を有する。当技術分野における公知の方法を用いることによって、本発明のペプチドで誘導されたCTLにおいて発現されるTCRのα鎖およびβ鎖の核酸配列を同定することができる(WO2007/032255、およびMorgan et al., J Immunol, 171, 3288 (2003))。TCR誘導体は、標的細胞上に提示されるMELKペプチドと高い結合力で結合することができ、かつ任意で、MELKペプチドを提示する標的細胞の効率的な殺傷をインビボおよびインビトロで媒介することができる。
予防(preventionおよびprophylaxis)は、疾患による死亡率または罹患率の負荷を軽減させる任意の行為を含む。予防(preventionおよびprophylaxis)は、「第一次、第二次、および第三次の予防レベルで」行われ得る。第一次の予防(preventionおよびprophylaxis)は、疾患の発生を回避するのに対し、第二次および第三次レベルの予防(preventionおよびprophylaxis)は、疾患の進行および症状の出現を予防(preventionおよびprophylaxis)することに加え、機能を回復させ、かつ疾患関連の合併症を減少させることによって、既存の疾患の悪影響を低下させることを目的とした行為を包含する。あるいは、予防(preventionおよびprophylaxis)は、特定の障害の重症度を軽減すること、例えば腫瘍の増殖および転移を減少させることを目的とした広範囲の予防的治療を含む。
(a)本発明のペプチド、
(b)本明細書に開示するようなペプチドを発現可能な形態でコードする核酸、
(c)本発明のペプチドを自身の表面上に提示するAPCまたはエキソソーム、および
(d)本発明の細胞傷害性T細胞。
(a)本発明のペプチド、
(b)本明細書に開示するようなペプチドを発現可能な形態でコードする核酸、
(c)本発明のペプチドを自身の表面上に提示するAPCまたはエキソソーム、および
(d)本発明の細胞傷害性T細胞。
(a)本発明のペプチド、
(b)本明細書に開示するようなペプチドを発現可能な形態でコードする核酸、
(c)本発明のペプチドを自身の表面上に提示するAPCまたはエキソソーム、および
(d)本発明の細胞傷害性T細胞。
(a)本発明のペプチド、
(b)本明細書に開示するようなペプチドを発現可能な形態でコードする核酸、
(c)本発明のペプチドを自身の表面上に提示するAPCまたはエキソソーム、および
(d)本発明の細胞傷害性T細胞。
本発明のペプチドは、薬学的な剤もしくは組成物として直接投与することができ、または必要であれば、従来の製剤方法によって製剤化される。後者の場合、本発明のペプチドに加えて、薬物に通常用いられる担体、賦形剤等が特に制限なく適宜含まれ得る。そのような担体の例は、滅菌水、生理食塩水、リン酸緩衝液、培養液等である。さらに、薬学的な剤または組成物は、必要に応じて、安定剤、懸濁液、保存剤、界面活性剤等を含み得る。本発明の薬学的な剤または組成物は、抗がん目的に用いることができる。
本発明の薬学的な剤または組成物はまた、本明細書に開示するペプチドをコードする核酸を発現可能な形態で含み得る。本明細書において、「発現可能な形態で」という語句は、ポリヌクレオチドが、細胞内に導入された場合に、抗腫瘍免疫を誘導するポリペプチドとしてインビボで発現され得ることを意味する。例示的な態様において、関心対象のポリヌクレオチドの核酸配列は、該ポリヌクレオチドの発現に必要な調節エレメントを含む。ポリヌクレオチドには、標的細胞のゲノム中への安定的な組み込みが達成されるように、必要なものを備えさせることができる(相同組換えカセットベクターの説明に関しては、例えばThomas KR & Capecchi MR, Cell 1987, 51: 503-12を参照されたい)。例えば、Wolff et al., Science 1990, 247: 1465-8;米国特許第5,580,859号;第5,589,466号;第5,804,566号;第5,739,118号;第5,736,524号;第5,679,647号;およびWO 98/04720を参照されたい。DNAに基づく送達技術の例には、「裸のDNA」、促進された(ブピバカイン、ポリマー、ペプチド媒介性)送達、カチオン性脂質複合体、および粒子媒介性(「遺伝子銃」)または圧力媒介性の送達が含まれる(例えば、米国特許第5,922,687号を参照されたい)。
APCおよびCTLを誘導するために、本発明のペプチドおよびそのようなペプチドをコードするポリヌクレオチドを用いることができる。CTLを誘導するために、本発明のエキソソームおよびAPCを用いることもできる。ペプチド、ポリヌクレオチド、エキソソーム、およびAPCは、任意の他の化合物がそれらのCTL誘導能を阻害しない限り、該化合物と組み合わせて用いることができる。従って、前述の本発明の薬学的な剤または組成物のいずれかをCTLを誘導するために用いることができ、それに加えて、前記ペプチドおよびポリヌクレオチドを含むものを、以下に議論されるように、APCを誘導するために用いることもできる。
本発明は、本発明のペプチドまたは該ペプチドをコードするポリヌクレオチドを用いた、APCを誘導する方法を提供する。APCの誘導は、「VI.抗原提示細胞」の章に上記したように行うことができる。本発明はまた、高レベルのCTL誘導能を有するAPCを誘導するための方法も提供し、その誘導もまた上記の「VI.抗原提示細胞」の項目で言及されている。
a:APCを本発明のペプチドと接触させる段階、および
b:発現可能な形態で本発明のポリペプチドをAPCに導入する段階。
さらに本発明は、本発明のペプチド、該ペプチドをコードするポリヌクレオチド、または該ペプチドを提示するエキソソームもしくはAPCを用いてCTLを誘導するための方法を提供する。
a:CD8陽性T細胞を、HLA抗原と本発明のペプチドの複合体を自身の表面上に提示する抗原提示細胞および/またはエキソソームと接触させる段階、ならびに
b:本発明のペプチドとHLA抗原の複合体を認識するTCRサブユニットを形成し得るポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを、CD8陽性T細胞に導入する段階。
a:対象からAPCを回収する段階;
b:段階aのAPCと前記ペプチドを接触させる段階;
c:段階bのAPCをCD8+ T細胞と混合し、CTLを誘導するために共培養する段階;および
d:段階cの共培養物からCD8+ T細胞を回収する段階。
細胞株
HLA−A24陽性ヒトBリンパ球をエプスタイン・バーウイルスで形質転換することによって、A24リンパ芽球様細胞株(A24LCL)を樹立した。T2(HLA−A2)、ヒトB−リンパ芽球様細胞株、およびCOS7は、ATCCから購入した。
HLA−A*2402およびHLA−A*0201分子に結合するMELK由来の9−merおよび10−merのペプチドを、Parker KC et al.(J Immunol 1994, 152(1): 163-75)およびKuzushima K et al.(Blood 2001, 98(6): 1872-81)によってアルゴリズムが記載されている結合予測ソフトウェア「BIMAS」(http://www-bimas.cit.nih.gov/molbio/hla_bind)を用いて予測した。これらのペプチドを、標準的な固相合成法に従ってSigma(札幌、日本)またはBiosynthesis Inc.(Lewisville,TX)によって合成し、逆相高速液体クロマトグラフィー(HPLC)によって精製した。該ペプチドの純度(>90%)および同一性を、それぞれ分析用HPLCおよび質量分析によって測定した。ペプチドをジメチルスルホキシド(DMSO)に20 mg/mlで溶解し、−80℃で保存した。
単球由来の樹状細胞(DC)を抗原提示細胞(APC)として用いて、ヒト白血球抗原(HLA)上に提示されたペプチドに対する細胞傷害性Tリンパ球(CTL)応答を誘導した。他所に記載されているように、DCをインビトロで作製した(Nakahara S et al., Cancer Res 2003 Jul 15, 63(14): 4112-8)。具体的には、Ficoll−Plaque(Pharmacia)溶液によって健常なボランティア(HLA−A*2402またはHLA−A*0201陽性)から単離した末梢血単核細胞(PBMC)を、プラスチック製の組織培養ディッシュ(Becton Dickinson)へ付着させることによって分離し、それらを単球画分として濃縮した。2%の加熱非働化した自己血清(AS)を含むAIM−V培地(Invitrogen)中で、1000 U/mlの顆粒球マクロファージコロニー刺激因子(GM−CSF)(R&D System)および1000 U/mlのインターロイキン(IL)−4(R&D System)の存在下で、単球が濃縮した集団を培養した。培養7日後、サイトカインで誘導したDCに、AIM−V培地中で3時間、37℃にて、3 マイクログラム/mlのβ2−ミクログロブリンの存在下で20 マイクログラム/mlの各合成ペプチドをパルスした。作製した細胞は、その細胞表面上に、CD80、CD83、CD86、およびHLAクラスIIなどのDC関連分子を発現しているようであった(データは示さず)。次いで、ペプチドパルスしたこれらのDCを、マイトマイシンC(MMC)で不活化し(30 マイクログラム/mlで30分間)、CD8 Positive Isolation Kit(Dynal)を用いた陽性選択によって得られた自己CD8+ T細胞と1:20の比率で混合した。これらの培養物を48ウェルプレート(Corning)中に準備し;各ウェルは、0.5 mlのAIM−V/2% AS培地中に、1.5×104個のペプチドパルスしたDC、3×105個のCD8+ T細胞、および10 ng/mlのIL−7(R&D System)を含んだ。3日後、これらの培養物に、IL−2(CHIRON)を最終濃度20 IU/mlまで補充した。7日目および14日目に、ペプチドパルスした自己DCでT細胞をさらに刺激した。該DCは上記と同じ方法によって毎回調製した。21日目に、3回目のペプチド刺激後、ペプチドパルスしたA24LCLまたはT2細胞に対してCTLを試験した(Tanaka H et al., Br J Cancer 2001 Jan 5, 84(1): 94-9; Umano Y et al., Br J Cancer 2001 Apr 20, 84(8): 1052-7; Uchida N et al., Clin Cancer Res 2004 Dec 15, 10(24): 8577-86; Suda T et al., Cancer Sci 2006 May, 97(5): 411-9; Watanabe T et al., Cancer Sci 2005 Aug, 96(8): 498-506)。
Riddellら(Walter EA et al., N Engl J Med 1995 Oct 19, 333(16): 1038-44;Riddell SR et al., Nat Med 1996 Feb, 2(2): 216-23)によって記載されている方法と類似の方法を用いて、CTLを培養下で増殖させた。40 ng/mlの抗CD3モノクローナル抗体(Pharmingen)の存在下で、MMCによって不活化した2種類のヒトBリンパ芽球様細胞株と共に、合計5×104個のCTLを25 mlのAIM−V/5% AS培地中に懸濁した。培養開始1日後に、120 IU/mlのIL−2を該培養物に添加した。5、8、および11日目に、30 IU/mlのIL−2を含む新たなAIM−V/5% AS培地を、該培養物に供給した(Tanaka H et al., Br J Cancer 2001 Jan 5, 84(1): 94-9;Umano Y et al., Br J Cancer 2001 Apr 20, 84(8): 1052-7;Uchida N et al., Clin Cancer Res 2004 Dec 15, 10(24): 8577-86;Suda T et al., Cancer Sci 2006 May, 97(5): 411-9;Watanabe T et al., Cancer Sci 2005 Aug, 96(8): 498-506)。
96丸底マイクロタイタープレート(Nalge Nunc International)において0.3個、1個、および3個のCTL/ウェルとなるように、希釈を行った。CTLを、1×104個細胞/ウェルの2種類のヒトBリンパ芽球様細胞株、30 ng/mlの抗CD3抗体、および125 U/mlのIL−2と共に、合計150μl/ウェルの5%AS含有AIM−V培地中で培養した。10日後、50μl/ウェルのIL−2を、125 U/mlのIL−2の最終濃度に到達するように培地に添加した。14日目にCTL活性を試験し、上記と同じ方法を用いてCTLクローンを増殖させた(Uchida N et al., Clin Cancer Res 2004 Dec 15, 10(24): 8577-86;Suda T et al., Cancer Sci 2006 May, 97(5): 411-9;Watanabe T et al., Cancer Sci 2005 Aug, 96(8): 498-506)。
特異的CTL活性を調べるために、インターフェロン(IFN)−γ酵素結合免疫スポット(ELISPOT)アッセイおよびIFN−γ酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)を行った。具体的には、ペプチドパルスしたA24LCLまたはT2(1×104個/ウェル)を刺激細胞として調製した。48ウェル中の培養細胞を応答細胞として使用した。IFN−γ ELISPOTアッセイおよびIFN−γ ELISAアッセイは、製造元の手順に従って行った。
がんにおける過剰発現
cDNAマイクロアレイを用いて様々ながんから得られた包括的遺伝子発現プロファイルデータから、MELK(GenBankアクセッション番号NM_014791;SEQ ID NO:93)の発現が上昇していることが明らかになった。MELK発現は、対応する正常組織と比較して、膀胱癌29例中29例、乳癌34例中31例、子宮頸癌15例中14例、胆管細胞癌11例中11例、CML 13例中10例、結腸直腸癌15例中12例、子宮内膜症2例中2例、食道癌42例中19例、胃癌6例中5例、肝癌4例中4例、NSCLC 11例中11例、リンパ腫14例中13例、骨肉腫18例中14例、卵巣癌6例中3例、膵癌2例中2例、前立腺癌21例中18例、腎癌6例中5例、および小細胞肺癌15例中15例において確かに上昇していた。(表1)。
表2は、MELKのHLA−A24およびHLA−A2結合ペプチドを、結合親和性の高い順に示す。潜在的なHLA−A24結合能を有する合計で34種のペプチドを選択して、エピトープペプチドを決定するために試験し(表2a)、かつ潜在的なHLA−A2結合能を有する合計で58種のペプチドを同様に選択して、エピトープペプチドを決定するために試験した(表2bおよびc)。
MELK由来のペプチドに対するCTLを、「材料および方法」に記載したプロトコールに従って作製した。IFN−γ ELISPOTアッセイによって、ペプチド特異的なCTL活性を測定した(図1a〜i)。それにより、MELK−A24−9−326(SEQ ID NO:14)で刺激した#5(a)、MELK−A24−9−78(SEQ ID NO:21)で刺激した#3(b)、MELK−A24−10−637(SEQ ID NO:23)で刺激した#4(c)、MELK−A24−10−532(SEQ ID NO:27)で刺激した#4(d)、MELK−A02−9−138(SEQ ID NO:36)で刺激した#5(e)、MELK−A02−9−193(SEQ ID NO:46)で刺激した#3(f)、MELK−A02−9−171(SEQ ID NO:57)で刺激した#1(g)、MELK−A02−9−71(SEQ ID NO:60)で刺激した#2(h)、およびMELK−A02−9−532(SEQ ID NO:62)で刺激した#2(i)が、対照ウェルと比較して強力なIFN−γ産生を示すことが示された。さらに、SEQ ID NO:14で刺激した陽性ウェル番号#5中の細胞、SEQ ID NO:21で刺激した陽性ウェル番号#3中の細胞、SEQ ID NO:23で刺激した陽性ウェル番号#4中の細胞、SEQ ID NO:27で刺激した陽性ウェル番号#4中の細胞、SEQ ID NO:36で刺激した陽性ウェル番号#5中の細胞、SEQ ID NO:46で刺激した陽性ウェル番号#3中の細胞、SEQ ID NO:57で刺激した陽性ウェル番号#1中の細胞、SEQ ID NO:60で刺激した陽性ウェル番号#2中の細胞、およびSEQ ID NO:62で刺激した陽性ウェル番号#2中の細胞を増殖させて、CTL株を樹立した。それらのCTL株のCTL活性を、IFN−γ ELISAアッセイによって測定した(図2a〜i)。すべてのCTL株が、ペプチドをパルスしなかった標的細胞と比較して、対応するペプチドをパルスした標的細胞に対して強力なIFN−γ産生を示した。一方、表2に示した他のペプチドは、HLA−A*2402またはHLA−A*0201との結合活性を有する可能性があるものの、それらのペプチドを用いた刺激ではCTL株は樹立できなかった(データは示さず)。結果として、MELK由来の92個の候補ペプチドのうち9ペプチドのみが、強力なCTL株を誘導することができた。
「材料および方法」に記載した通りに、CTL株から限界希釈によりCTLクローンを樹立し、ペプチドをパルスした標的細胞に対するCTLクローンからのIFN−γ産生をIFN−γ ELISAアッセイによって測定した。図3において、SEQ ID NO:27で刺激したCTLクローンから強力なIFN−γ産生が測定された。
これらのペプチドに対して産生された樹立CTL株を、MELKから内因的にプロセシングされた候補ペプチドをHLA−A*0201分子と共に提示している標的細胞を認識する能力について、試験した。MELKおよびHLA−A*0201分子遺伝子の全長の両方をトランスフェクトしたCOS7細胞(MELKおよびHLA−A*0201遺伝子を発現する標的細胞の特異的モデル)に対する特異的CTL活性を、対応するペプチドによって産生されたCTL株をエフェクター細胞として用いて試験した。MELK遺伝子またはHLA−A*0201の全長のいずれかをトランスフェクトしたCOS7細胞を対照として調製した。図4において、SEQ ID NO:36(a)およびSEQ ID NO:57(b)で刺激したCTLは、MELKおよびHLA−A02の両方を発現しているCOS7細胞に対して強力なCTL活性を示した。一方、対照に対しては有意な特異的CTL活性は検出されなかった。このように、これらのデータにより、SEQ ID NO:36およびSEQ ID NO:57のアミノ酸配列を有するペプチドは、HLA−A*0201分子と共に標的細胞上に天然で提示され、CTLによって認識されることが明確に実証される。これらの結果から、MELKに由来するそれら2つのペプチドが、MELKを発現している腫瘍を有する患者に対してがんワクチンを適用するために利用可能である可能性があることが示された。
MELK−A24−9−326(SEQ ID NO:14)、MELK−A24−9−78(SEQ ID NO:21)、MELK−A24−10−637(SEQ ID NO:23)、MELK−A24−10−532(SEQ ID NO:27)、MELK−A02−9−138(SEQ ID NO:36)、MELK−A02−9−193(SEQ ID NO:46)、MELK−A02−9−171(SEQ ID NO:57)、MELK−A02−9−71(SEQ ID NO:60)、およびMELK−A02−9−532(SEQ ID NO:62)で刺激したCTLは、有意でかつ特異的なCTL活性を示した。この結果は、MELK−A24−9−326(SEQ ID NO:14)、MELK−A24−9−78(SEQ ID NO:21)、MELK−A24−10−637(SEQ ID NO:23)、MELK−A24−10−532(SEQ ID NO:27)、MELK−A02−9−138(SEQ ID NO:36)、MELK−A02−9−193(SEQ ID NO:46)、MELK−A02−9−171(SEQ ID NO:57)、MELK−A02−9−71(SEQ ID NO:60)、およびMELK−A02−9−532(SEQ ID NO:62)の配列が、ヒト免疫系を感作することが知られている他の分子に由来するペプチドと相同であるという事実に起因する可能性がある。この可能性を排除するため、BLASTアルゴリズム(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/blast.cgi)を用いて、クエリーとしてのこれらのペプチド配列に対して相同性解析を行ったが、有意な相同性を有する配列は認められなかった。相同性解析の結果から、MELK−A24−9−326(SEQ ID NO:14)、MELK−A24−9−78(SEQ ID NO:21)、MELK−A24−10−637(SEQ ID NO:23)、MELK−A24−10−532(SEQ ID NO:27)、MELK−A02−9−138(SEQ ID NO:36)、MELK−A02−9−193(SEQ ID NO:46)、MELK−A02−9−171(SEQ ID NO:57)、MELK−A02−9−71(SEQ ID NO:60)、およびMELK−A02−9−532(SEQ ID NO:62)の配列は固有のものであり、従って、本発明者らの知る限りでは、これらの分子が、ある非関連分子に対して意図しない免疫応答を引き起こす可能性はほとんどないことが示される。
本発明は、新規TAA、特に強力かつ特異的な抗腫瘍免疫応答を誘導し、幅広いがんのタイプに対する適用可能性を有する、MELK由来の新規TAAについて記載する。このようなTAAは、MELKに関連した疾患、例えば乳癌、膀胱癌、子宮頸癌、胆管細胞癌、CML、結腸直腸癌、子宮内膜症、食道癌、胃癌、肝癌、NSCLC、リンパ腫、骨肉腫、卵巣癌、膵癌、前立腺癌、腎癌、およびSCCなどのがんに対するペプチドワクチンとしてのさらなる発展を保証する。
Claims (23)
- SEQ ID NO:94に由来する単離されたペプチドであって、
(a) SEQ ID NO:14、21、23、27、36、46、57、60、および62;ならびに
(b) 1個、2個、または数個のアミノ酸が置換、挿入、欠失、および/または付加されている、SEQ ID NO:14、21、23、27、36、46、57、60、および62
からなる群より選択されるアミノ酸配列を含み、かつ細胞傷害性Tリンパ球(CTL)誘導能を有する、単離されたペプチド。 - 15アミノ酸未満の残基からなる、請求項1記載のペプチド。
- ノナペプチドまたはデカペプチドである、請求項2記載のペプチド。
- SEQ ID NO:14、21、23、および27からなる群より選択されるアミノ酸配列を含み、以下の特徴の一方または両方を有する、請求項1〜3いずれか一項記載のペプチド:
(a) N末端から2番目のアミノ酸が、フェニルアラニン、チロシン、メチオニン、およびトリプトファンの群より選択される、ならびに
(b) C末端のアミノ酸が、フェニルアラニン、ロイシン、イソロイシン、トリプトファン、およびメチオニンの群より選択される。 - SEQ ID NO:36、46、57、60、および62からなる群より選択されるアミノ酸配列を含み、以下の特徴の一方または両方を有する、請求項1〜3いずれか一項記載のペプチド:
(a) N末端から2番目のアミノ酸が、ロイシンまたはメチオニンの群より選択される、および
(b) C末端のアミノ酸が、バリンまたはロイシンの群より選択される。 - 請求項1〜5のいずれか一項記載のペプチドをコードする、単離されたポリヌクレオチド。
- がんの治療および/もしくは予防、ならびに/または術後のその再発の予防のための薬剤であって、以下からなる群より選択される有効成分を含む、薬剤:
(a) 請求項1〜5のいずれか一項記載の1種または複数種のペプチド;
(b) 発現可能な形態で前記ペプチドをコードする1種または複数種のポリヌクレオチド;
(c) HLA抗原と請求項1〜5のいずれか一項記載のペプチドとの間で形成された複合体を自身の表面上に提示する、1種または複数種の抗原提示細胞および/またはエキソソーム;
(d) 請求項1〜6のいずれか一項記載のペプチドに対して誘導された1種または複数種のCTL;ならびに
(e) これらの組み合わせ。 - HLA抗原がHLA−A24またはHLA−A02である対象への投与のために製剤化される、請求項7記載の薬剤。
- 膀胱癌、乳癌、子宮頸癌、胆管細胞癌、慢性骨髄性白血病(CML)、結腸直腸癌、子宮内膜症、食道癌、胃癌、肝癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、リンパ腫、骨肉腫、卵巣癌、膵癌、前立腺癌、腎癌、および小細胞肺癌からなる群より選択されるがんの治療のために製剤化される、請求項7記載の薬剤。
- ワクチンとして製剤化される、請求項7記載の薬剤。
- 高いCTL誘導能を有する抗原提示細胞を誘導するための方法であって、抗原提示細胞を請求項1〜5のいずれか一項記載のペプチドと接触させる段階、または発現可能な形態で該ペプチドをコードするポリヌクレオチドを抗原提示細胞に導入する段階を含む、方法。
- 請求項1〜5のいずれか一項記載のペプチドを用いることによってCTLを誘導するための方法。
- CTLを誘導するための方法であって、以下からなる群より選択される段階を含む、方法:
(a) CD8陽性T細胞を、HLA抗原と請求項1〜5のいずれか一項記載のペプチドとの間で形成された複合体を自身の表面上に提示する抗原提示細胞および/またはエキソソームと接触させる段階;ならびに
(b) HLA抗原と請求項1〜5のいずれか一項記載のペプチドとの間で形成された複合体を認識するTCRサブユニットを形成し得るポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを、CD8陽性T細胞に導入する段階。 - 請求項1〜5に記載のペプチドのいずれかを標的とする、単離されたCTL。
- 請求項1〜5のいずれか一項記載のペプチドによって誘導された、単離されたCTL。
- 細胞上の、HLA抗原と請求項1〜5のいずれか一項記載のペプチドとの間で形成された複合体を認識し得る、請求項14または15記載のCTL。
- HLA抗原と請求項1〜5のいずれか一項記載のペプチドとの間で形成された複合体を自身の表面上に提示する、単離された抗原提示細胞。
- 請求項11記載の方法によって誘導された、請求項17記載の抗原提示細胞。
- HLA抗原がHLA−A24またはHLA−A02である、請求項17または18記載の抗原提示細胞。
- 対象においてがんに対する免疫応答を誘導する剤であって、以下からなる群より選択される有効成分を含む、剤:
(a) 請求項1〜5のいずれか一項記載の1種または複数種のペプチド;
(b) 発現可能な形態で前記ペプチドをコードする1種または複数種のポリヌクレオチド;
(c) HLA抗原と請求項1〜5のいずれか一項記載のペプチドとの間で形成された複合体を自身の表面上に提示する、1種または複数種の抗原提示細胞および/またはエキソソーム;
(d) 請求項1〜6のいずれか一項記載のペプチドに対して誘導された1種または複数種のCTL;ならびに
(e) これらの組み合わせ。 - 対象においてがんに対する免疫応答を誘導する方法であって、以下からなる群より選択される有効成分を含む剤を該対象に投与する段階を含む、方法:
(a) 請求項1〜5のいずれか一項記載の1種または複数種のペプチド;
(b) 発現可能な形態で前記ペプチドをコードする1種または複数種のポリヌクレオチド;
(c) HLA抗原と請求項1〜5のいずれか一項記載のペプチドとの間で形成された複合体を自身の表面上に提示する、1種または複数種の抗原提示細胞および/またはエキソソーム;
(d) 請求項1〜6のいずれか一項記載のペプチドに対して誘導された1種または複数種のCTL;ならびに
(e) これらの組み合わせ。 - がんが、膀胱癌、乳癌、子宮頸癌、胆管細胞癌、CML、結腸直腸癌、子宮内膜症、食道癌、胃癌、肝癌、NSCLC、リンパ腫、骨肉腫、卵巣癌、膵癌、前立腺癌、腎癌、および小細胞肺癌からなる群より選択される、請求項21記載の方法。
- 対象がHLA−A24またはHLA−A02を有する、請求項21または22記載の方法。
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