JP2002533695A - スライド上で生物学的試料を効率的に処理する装置および方法 - Google Patents
スライド上で生物学的試料を効率的に処理する装置および方法Info
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-
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Abstract
(57)【要約】
顕微鏡スライド(70)上の生物学的サンプルの処理方法を記述する。本発明の一態様は、その上にスライドを配置したトレイ(90)上のウエル(24)中で前乾燥した試薬を使用すること、特に、逐次的に溶解する前乾燥した複数試薬を使用することである。本発明の他の態様は、アッセイする生物学的サンプルと併せて、顕微鏡スライド(70)上に直接配置した外部対照(230)を使用することである。外部対照(230)を、スライドに貼り付け得る膜上に、都合良いように配置することができる。本発明のさらなる態様は、単一スライド上で、細胞サンプルの全染色体の全体染色体彩色を可能とするように、特別に設計されたトレイ(90)である。本発明は、スライド(70)に対向してに配置し緩衝液で満たした場合に反応チャンバーとして役立つ、凹形ウエル群を有するカバースリップ(500)も示す。好ましくは、試薬をウェル(24)内で前乾燥する。本発明のさらなる態様は、表面に前乾燥した試薬を有するカバースリップ(500)と一緒に、複数のスライド(70)を反応チャンバー(280)内に配置して、それらの上でサンプルを反応させる方法である。
Description
【0001】 (発明の背景) 本発明は、多様な目的のためにスライド上で生物学的試料を処理する装置に関
する。生物学的試料は多くの目的のために異種多様なアッセイを用いて分析され
る。病理学者はしばしば生物学的試料を分析するために組織化学または免疫細胞
化学を用い、分子生物学者は生物学的試料などにin situハイブリダイゼーショ
ンまたはin situポリメラーゼ連鎖反応法を行うことがある。分析される試料は
しばしば、パラフィン中に埋め込まれて顕微鏡スライドに取り付けられる。
する。生物学的試料は多くの目的のために異種多様なアッセイを用いて分析され
る。病理学者はしばしば生物学的試料を分析するために組織化学または免疫細胞
化学を用い、分子生物学者は生物学的試料などにin situハイブリダイゼーショ
ンまたはin situポリメラーゼ連鎖反応法を行うことがある。分析される試料は
しばしば、パラフィン中に埋め込まれて顕微鏡スライドに取り付けられる。
【0002】 アッセイは通常、抗体、酵素および他の高価な試薬の使用を伴うので、試薬の
使用量を最小にしてコストを下げるのが望ましい。現在いくつかの自動化システ
ム(例えば、Ventana ESIHC Staining System, the Shandon Lipshaw Cadenza A
utomated Immunostainer; 参照、Brigati et al. (1988))があるが、これらの
アッセイはまた非常に労働集約的である。本発明の背景を説明し、実施に関する
さらなる詳細を提供するために、本明細書に用いられる公報および他の文献を出
典明示により本明細書の一部とし、便宜上、付属の参考文献リストに各々まとめ
た。大部分の自動化システムは1回の運転で40〜48のスライドを操作し得る
だけである。Fisher自動化システムは1回の運転で120のスライドを操作し得
る。免疫細胞化学を行うだけの大部分の自動化システムは、脱パラフィン処理(
deparaffinize)、組織化学(例えばヘマトキシリンおよびエオシン染色)およ
びカバースリップ取付けを行わないので、結果としてこれらは手作業により別々
に行われなければならず、時間および労働集約的である。自動化システムは、ス
ライドを準備し、分析する全工程のごく一部を行うにすぎない。自動化部分の前
に依然手作業で行われる段階には、ケースおよびスライドの分類、スライドの標
識化、自動化装備のプログラミング、毎日の抗体および試薬の製造、スライドに
取り付けられる対照組織の製造およびマイクロ波抗原回復が含まれる。自動化段
階後に依然手作業で行われる処理は、脱水、カバースリップ取付け、スライド標
識化およびスライドとケースの分類である。さらに、多くの市販の既製試薬は、
特別に設計された試薬の使用を必要とする自動化システムには適していない。多
数の試料を処理する製造所は、これらの自動化システムの購入に関連する高いコ
ストおよびアッセイを行うための使い捨て付属品および試薬の使用に関連する高
いコストの支払いをいとわないであろうが、中小規模の製造所は、手作業により
試料を処理しつづけるほうがより費用効果が高い。
使用量を最小にしてコストを下げるのが望ましい。現在いくつかの自動化システ
ム(例えば、Ventana ESIHC Staining System, the Shandon Lipshaw Cadenza A
utomated Immunostainer; 参照、Brigati et al. (1988))があるが、これらの
アッセイはまた非常に労働集約的である。本発明の背景を説明し、実施に関する
さらなる詳細を提供するために、本明細書に用いられる公報および他の文献を出
典明示により本明細書の一部とし、便宜上、付属の参考文献リストに各々まとめ
た。大部分の自動化システムは1回の運転で40〜48のスライドを操作し得る
だけである。Fisher自動化システムは1回の運転で120のスライドを操作し得
る。免疫細胞化学を行うだけの大部分の自動化システムは、脱パラフィン処理(
deparaffinize)、組織化学(例えばヘマトキシリンおよびエオシン染色)およ
びカバースリップ取付けを行わないので、結果としてこれらは手作業により別々
に行われなければならず、時間および労働集約的である。自動化システムは、ス
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に依然手作業で行われる段階には、ケースおよびスライドの分類、スライドの標
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取り付けられる対照組織の製造およびマイクロ波抗原回復が含まれる。自動化段
階後に依然手作業で行われる処理は、脱水、カバースリップ取付け、スライド標
識化およびスライドとケースの分類である。さらに、多くの市販の既製試薬は、
特別に設計された試薬の使用を必要とする自動化システムには適していない。多
数の試料を処理する製造所は、これらの自動化システムの購入に関連する高いコ
ストおよびアッセイを行うための使い捨て付属品および試薬の使用に関連する高
いコストの支払いをいとわないであろうが、中小規模の製造所は、手作業により
試料を処理しつづけるほうがより費用効果が高い。
【0003】 典型的な免疫細胞化学アッセイは一連の多くの段階を要する。これらには:生
検標本(biopsy)からなどの生物学的試料を得ること、試料をホルマリン固定す
ること、試料を一夜処理すること、試料をパラフィンに埋め込むこと、連続切片
を切り出して顕微鏡スライドに取り付けることおよび乾燥させることが含まれる
。これらの段階の後に脱パラフィン処理(deparaffinize)する(キシレン、エ
タノールおよび水における処理)段階が続き、最後にスライドに取り付けられた
試料において反応が行われ得る。典型的には、酵素、一次抗体、二次抗体、検出
試薬、色素原、対比染色などの試薬類を含む一連の溶液を、スライドに滴下し、
インキュベートして、洗浄する。最後に試料を顕微鏡下で観察し得る。明らかに
多くの個別の段階が必要とされ、スライド上の各試料は個別に処理されなければ
ならない。さらに非常に労働集約的であるので、顕微鏡スライド上に取り付けら
れた試料の上部に溶液を単に滴下する通常の使用方法には欠点がある。溶液は生
物学的試料そのものの領域に単に制限されず、溶液は薄い層というより比較的深
い層であり得る。これらの特徴は、非常に高価な試薬の余分な使用を必要とする
。試料を長時間インキュベートしなければならない場合、溶液をスライド上に置
いて、空気中に開放すると、蒸発がおこり得る。蒸発により試薬の濃縮または乾
燥が引き起こされ、高濃度は明らかに望ましくない背景レベルの増加をもたらし
得る。溶液が全体的に蒸発する場合、アッセイは失敗する。カバーを有する湿室
で試料をインキュベートすると蒸発の問題は防ぎ得るが、湿室のカバー上で液化
する水滴がスライド上に落下することもあるのでアッセイが台無しとなる。
検標本(biopsy)からなどの生物学的試料を得ること、試料をホルマリン固定す
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ならない。さらに非常に労働集約的であるので、顕微鏡スライド上に取り付けら
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する水滴がスライド上に落下することもあるのでアッセイが台無しとなる。
【0004】 ハイコストの自動化システムを用いずに、いくつかの試料を一度により迅速に
アッセイする改良方法は、中小規模の製造所にとって喜ばしいものである。さら
に、試薬の使用をより少量にし、大気中に開放されたスライド上の試料を処理す
ることに関する欠点を克服する方法は、喜ばしい進歩となる。
アッセイする改良方法は、中小規模の製造所にとって喜ばしいものである。さら
に、試薬の使用をより少量にし、大気中に開放されたスライド上の試料を処理す
ることに関する欠点を克服する方法は、喜ばしい進歩となる。
【0005】 (発明の要約) 本発明は、顕微鏡スライド上に取り付けた(マウントした)生物学的試料につ
いてアッセイを行う装置および方法に関する。この装置および/または方法の使
用は、アッセイをより迅速および好都合に行うのに役立つ。本発明の一態様は、
試薬をトレイの複数ウエル内で予乾燥して使用することであり、それによって単
にアッセイ時にウエルに水または緩衝液を添加するだけでよく、試薬を添加する
必要がないようにすることである。次いで、生物学的試料を予め取りつけたスラ
イドでウエルを覆う。複数ウエルトレイの種々のウエルを、各ウエル内で種々の
試薬を乾燥させて前処理し得る。多段階のアッセイは、複数ウエルトレイの各ウ
エル内で所望の試薬を予乾燥してある一つの複数ウエルトレイからその隣へスラ
イドを装着したスライドホルダーを移動させることにより行い得る。この変形は
、第1セットの試薬が迅速に溶解して生物学的試料に作用し、次いで、第二層が
溶解して第二段階のための試薬を放出するようなやり方で、より少数のトレイ、
うまくゆけば単一トレイの使用のみですむように、各ウエル内で試薬の多層コー
ティングを使用することである。
いてアッセイを行う装置および方法に関する。この装置および/または方法の使
用は、アッセイをより迅速および好都合に行うのに役立つ。本発明の一態様は、
試薬をトレイの複数ウエル内で予乾燥して使用することであり、それによって単
にアッセイ時にウエルに水または緩衝液を添加するだけでよく、試薬を添加する
必要がないようにすることである。次いで、生物学的試料を予め取りつけたスラ
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、第1セットの試薬が迅速に溶解して生物学的試料に作用し、次いで、第二層が
溶解して第二段階のための試薬を放出するようなやり方で、より少数のトレイ、
うまくゆけば単一トレイの使用のみですむように、各ウエル内で試薬の多層コー
ティングを使用することである。
【0006】 本発明の別の態様は、各スライドに対照をビルトインすることである。これは
そこに陽性対照および陰性対照を取り付けたスライドの一部である。これらの対
照により、各スライドが各自で対照のセットを有するので、各個別のスライドに
ついてアッセイが適切に作動しているか否かを判断し、各スライドについてどれ
が標識として同時に作用しているかを決定することを可能にする。
そこに陽性対照および陰性対照を取り付けたスライドの一部である。これらの対
照により、各スライドが各自で対照のセットを有するので、各個別のスライドに
ついてアッセイが適切に作動しているか否かを判断し、各スライドについてどれ
が標識として同時に作用しているかを決定することを可能にする。
【0007】 本発明はまた、試薬を保有するための凹面ウエルを有するカバースリップに関
する。このカバースリップは、分析を行うための試薬を保持するが、スライドを
洗浄するために容易に取り外せるように、スライド上に取り付けられ得る。カバ
ースリップはアッセイのためにそこで予乾燥した対照を含み得る。
する。このカバースリップは、分析を行うための試薬を保持するが、スライドを
洗浄するために容易に取り外せるように、スライド上に取り付けられ得る。カバ
ースリップはアッセイのためにそこで予乾燥した対照を含み得る。
【0008】 本発明の別の態様は、カバースリップを連結した反応室において生物学的試料
を自動処理することであり、該カバースリップにはその上で試薬を予乾燥し、か
つその上に対照の試料を場合により予めスポットしておくこともできる。
を自動処理することであり、該カバースリップにはその上で試薬を予乾燥し、か
つその上に対照の試料を場合により予めスポットしておくこともできる。
【0009】 図1は、複数のスライド70を有するスライドホルダー1を例示する。スライ
ドホルダー1は穴11を設けたハンドル5を含む。スライドホルダーの各開口部
7により、各スライド70の標識が見える。標識はまたスライドホルダー1の領
域15に直接添付してもよい。各スライド70はスライドホルダー1の各スロッ
ト56に挿入してある。
ドホルダー1は穴11を設けたハンドル5を含む。スライドホルダーの各開口部
7により、各スライド70の標識が見える。標識はまたスライドホルダー1の領
域15に直接添付してもよい。各スライド70はスライドホルダー1の各スロッ
ト56に挿入してある。
【0010】 図2A−Bは、トレイ14およびスライド70を例示する。図2Aは、トレイ
14の正面立面図である。ウエル24は溝38によって分けられている。ウエル
24の境界44は平らで、ウエル24の内部より隆起している。溝90は溝38
に隣接している。図2Bは、図2Aのライン54−54により切断したトレイ1
4の断面図である。この図はウエル24、溝38およびウエルの境界44を示す
。スライド70は一つのウエル24上に置かれているところを示す。
14の正面立面図である。ウエル24は溝38によって分けられている。ウエル
24の境界44は平らで、ウエル24の内部より隆起している。溝90は溝38
に隣接している。図2Bは、図2Aのライン54−54により切断したトレイ1
4の断面図である。この図はウエル24、溝38およびウエルの境界44を示す
。スライド70は一つのウエル24上に置かれているところを示す。
【0011】 図3は、生物学的試料220とスタンプ230を有するスライド70を例示す
る。図示したスタンプは、試薬A−Fを含有する。
る。図示したスタンプは、試薬A−Fを含有する。
【0012】 図4は、ウエル24を例示し、該ウエル内には3種の試薬(250、260お
よび270で示される)が乾燥させてあり、該ウエル上には生物学的試料220
を取り付けたスライド70を置いてある。試薬の層を互いに分ける非活性物質の
層は図示していない。
よび270で示される)が乾燥させてあり、該ウエル上には生物学的試料220
を取り付けたスライド70を置いてある。試薬の層を互いに分ける非活性物質の
層は図示していない。
【0013】 図5A−Bは、熱サイクラー、ポンプおよび中央処理ユニットと共に、生物学
的試料をアッセイする数段階の自動化処理に用いる多数ウエルのトレイ330の
一つのウエルを例示する。図5Aは、取り付けた生物学的試料220がウエルま
たは反応室280に置かれているスライド70を示す。反応室280と連結して
いる入口300および302、および出口294および296を図示している。
反応室280の底部を形成するトレイ330の一部を282として図示している
。反応室の底部282が試料220を押し付けるのを防ぐ任意の歯止め281を
図示している。図5Aの図は、“開”状態にある反応室の底部282を示し、こ
の状態によって反応室280は大容量を有する。図5Bは、他の任意の装備に連
結している図5Aのトレイおよびスライドを示す。図5Bにおいて、反応室の底
部282は“閉”状態にあるので、反応室280は図5Aで示されたのよりも少
ない容量を包含する。反応室の底部282を動かすピストン284を図示する。
ピストン284は中央処理ユニット286により制御する。スライド70に押し
付けられている熱サイクラー288を図示する。熱サイクラーはまた中央処理ユ
ニット286により制御し得る。管材料は入口300および302、および出口
294および296に取り付け得る。管材料に取り付けられたポンプ290を図
示し、ポンプはタンク291または292へ、またはタンク291または292
から、またはゲル298へ液体を押し出す。
的試料をアッセイする数段階の自動化処理に用いる多数ウエルのトレイ330の
一つのウエルを例示する。図5Aは、取り付けた生物学的試料220がウエルま
たは反応室280に置かれているスライド70を示す。反応室280と連結して
いる入口300および302、および出口294および296を図示している。
反応室280の底部を形成するトレイ330の一部を282として図示している
。反応室の底部282が試料220を押し付けるのを防ぐ任意の歯止め281を
図示している。図5Aの図は、“開”状態にある反応室の底部282を示し、こ
の状態によって反応室280は大容量を有する。図5Bは、他の任意の装備に連
結している図5Aのトレイおよびスライドを示す。図5Bにおいて、反応室の底
部282は“閉”状態にあるので、反応室280は図5Aで示されたのよりも少
ない容量を包含する。反応室の底部282を動かすピストン284を図示する。
ピストン284は中央処理ユニット286により制御する。スライド70に押し
付けられている熱サイクラー288を図示する。熱サイクラーはまた中央処理ユ
ニット286により制御し得る。管材料は入口300および302、および出口
294および296に取り付け得る。管材料に取り付けられたポンプ290を図
示し、ポンプはタンク291または292へ、またはタンク291または292
から、またはゲル298へ液体を押し出す。
【0014】 図6A−Eは、単一のスライド上で細胞の多数の染色体の全染色体彩色を行う
ために使用するか、または生物学的試料にin situハイブリダイゼーションまた
はFISHを行うために使用し得るトレイを例示する。図6Aは各ウエル410
を有する8ウエルトレイ400を例示する。各ウエルは隣接のウエルと溝420
で分けられている。各ウエル410は開口部またはチャネル430を有し、そこ
から液体をピペットで採取し得る。図6Bは図6Aに示した8ウエルトレイ40
0の側面図である。スライド70はトレイ400上に示してある。4つのウエル
410を図示しているが、そのうちの3つのウエルは空であり、1つは液体で満
たされている。開口部430および溝420も図示してある。図6Cは図6Aお
よび6Bのスライドおよびトレイの正面図である。溝420を2つのウエル41
0の間に示す。ウエル410への開口部430を図示してある。スライド70は
トレイ400の上方に置かれているところを示してあり、スライド70をトレイ
400に保持するための任意のクリップ402を示してある。図6Dは、8ウエ
ル410の各々に接触しているスライドの8領域440を示しているスライド7
0の概略図である。これは例示にすぎず、実際使用されるスライドにこれらの領
域440を実際に表示する必要はない。図6Eは、1つの領域440の拡大図を
示して、スライド70上にビルトインした対照を設計する一つの方法を示す。各
領域440は核酸442を有し、該核酸はアッセイで使用されるプローブをハイ
ブリダイズし、領域440の周辺部に配置される。これらの対照はハイブリダイ
ゼーションの間プローブと接触している。
ために使用するか、または生物学的試料にin situハイブリダイゼーションまた
はFISHを行うために使用し得るトレイを例示する。図6Aは各ウエル410
を有する8ウエルトレイ400を例示する。各ウエルは隣接のウエルと溝420
で分けられている。各ウエル410は開口部またはチャネル430を有し、そこ
から液体をピペットで採取し得る。図6Bは図6Aに示した8ウエルトレイ40
0の側面図である。スライド70はトレイ400上に示してある。4つのウエル
410を図示しているが、そのうちの3つのウエルは空であり、1つは液体で満
たされている。開口部430および溝420も図示してある。図6Cは図6Aお
よび6Bのスライドおよびトレイの正面図である。溝420を2つのウエル41
0の間に示す。ウエル410への開口部430を図示してある。スライド70は
トレイ400の上方に置かれているところを示してあり、スライド70をトレイ
400に保持するための任意のクリップ402を示してある。図6Dは、8ウエ
ル410の各々に接触しているスライドの8領域440を示しているスライド7
0の概略図である。これは例示にすぎず、実際使用されるスライドにこれらの領
域440を実際に表示する必要はない。図6Eは、1つの領域440の拡大図を
示して、スライド70上にビルトインした対照を設計する一つの方法を示す。各
領域440は核酸442を有し、該核酸はアッセイで使用されるプローブをハイ
ブリダイズし、領域440の周辺部に配置される。これらの対照はハイブリダイ
ゼーションの間プローブと接触している。
【0015】 図7A−Hは、凹面ウエルを有するカバースリップと連結しているスライド上
での生物学的試料の処理を例示する。
での生物学的試料の処理を例示する。
【0016】 図8A−Dは、カバースリップと連結している顕微鏡スライド上での生物学的
試料の処理を例示する。
試料の処理を例示する。
【0017】 (技術分野) 本発明は、複数の生物学的試料(生物学的サンプル)を顕微鏡スライド上にお
いて、通常方式より一層迅速かつ効果的なしかもより低コストな方式で、処理す
るための集積システムである。本発明の開示の背景技術は、その多くが米国特許
第5958341号(W.-S. Chu; September 28,1999 付)に記載されており、それらは参
照して本明細書の一部とする。本書の開示中で使用する各部品の付与番号は、も
し本書中に記載がなければ、米国特許第5958341号(W.-S. Chu)に示されている
番号を参照するものである。
いて、通常方式より一層迅速かつ効果的なしかもより低コストな方式で、処理す
るための集積システムである。本発明の開示の背景技術は、その多くが米国特許
第5958341号(W.-S. Chu; September 28,1999 付)に記載されており、それらは参
照して本明細書の一部とする。本書の開示中で使用する各部品の付与番号は、も
し本書中に記載がなければ、米国特許第5958341号(W.-S. Chu)に示されている
番号を参照するものである。
【0018】 (発明の開示) 生物学的試料とは、組織切片、生検標本(biopsy)、細胞塗布標本(cell smear)
、核酸、タンパク質またはペプチド、染色体、体液またはその他の一般的に顕微
鏡下で観察される生物学的材料、などを意味する。図1および2A−Bに例示説
明したシステムは、スライドホルダーとトレイまたはカバースリップ(図7A−
Hおよび8A−D参照)とからなり、同時に多数の、好ましくは6つまでの、顕
微鏡スライドを保持し、多数のスライドの同時処理を可能とするものである。こ
のスライドホルダーは再使用してもよい。
、核酸、タンパク質またはペプチド、染色体、体液またはその他の一般的に顕微
鏡下で観察される生物学的材料、などを意味する。図1および2A−Bに例示説
明したシステムは、スライドホルダーとトレイまたはカバースリップ(図7A−
Hおよび8A−D参照)とからなり、同時に多数の、好ましくは6つまでの、顕
微鏡スライドを保持し、多数のスライドの同時処理を可能とするものである。こ
のスライドホルダーは再使用してもよい。
【0019】 実際では、生物学的試料を分析しようとする各スライド上にマウントする。こ
れはしばしば生物学的試料をホルマリン中で固定させ、該試料をパラフィン中に
埋め込み、薄く連続した切片を該パラフィンまたは凍結した組織から切り出し、
該切片を顕微鏡スライド上にマウントする各段階を含む。これらは室温で一夜乾
燥させる。マウントした生物学的試料は、ある種のアッセイ例えば、染色工程に
付される。このためマウントした各試料は、洗浄段階では試薬を変えて処理する
間一連の異種溶液といつも接触しているように置かれねばならない。本発明では
、各試薬をトレイ14中の各ウエル24中に秤り込みまたは予乾燥する。充分な
試薬と緩衝剤をウエル24に加えて完全に満たし、該ウエル中の溶液が、該ウエ
ル24の上部に置かれることとなる顕微鏡スライド70と接触するようにする。
ウエル24中の溶液と顕微鏡スライド70との間には気泡が存在してはならない
。正確にウエル24を満たすか、またはやや多めにウエル24を満たすようにす
ると、スライド70をウエル24の上部に置いたときに軽度のオーバーフローが
生じるようになる(表面張力がウエル24中の溶液をスライド70がその上部に
置かれるまで保持している)ので、気泡生成の問題は全くない。ウエル24中の
スライド70と接触している液体の毛管作用が、生物学的試料と試薬との横ざま
での良好な接触をウエル24の全領域で可能とし、かつウエル24の封止を助け
る。トレイ14は、ウエルの境界44の一端にあるフックを含むように設計し得
る。これは、米国特許第5958341号(W.-S. Chu)の図4Cおよび4Fに示されて
いる。全スライド70をこのフックに押しつけることにより、全スライドをウエ
ルの境界44に対して保持させ、各ウエル24内で試薬との良好な接触を確実に
することができる。
れはしばしば生物学的試料をホルマリン中で固定させ、該試料をパラフィン中に
埋め込み、薄く連続した切片を該パラフィンまたは凍結した組織から切り出し、
該切片を顕微鏡スライド上にマウントする各段階を含む。これらは室温で一夜乾
燥させる。マウントした生物学的試料は、ある種のアッセイ例えば、染色工程に
付される。このためマウントした各試料は、洗浄段階では試薬を変えて処理する
間一連の異種溶液といつも接触しているように置かれねばならない。本発明では
、各試薬をトレイ14中の各ウエル24中に秤り込みまたは予乾燥する。充分な
試薬と緩衝剤をウエル24に加えて完全に満たし、該ウエル中の溶液が、該ウエ
ル24の上部に置かれることとなる顕微鏡スライド70と接触するようにする。
ウエル24中の溶液と顕微鏡スライド70との間には気泡が存在してはならない
。正確にウエル24を満たすか、またはやや多めにウエル24を満たすようにす
ると、スライド70をウエル24の上部に置いたときに軽度のオーバーフローが
生じるようになる(表面張力がウエル24中の溶液をスライド70がその上部に
置かれるまで保持している)ので、気泡生成の問題は全くない。ウエル24中の
スライド70と接触している液体の毛管作用が、生物学的試料と試薬との横ざま
での良好な接触をウエル24の全領域で可能とし、かつウエル24の封止を助け
る。トレイ14は、ウエルの境界44の一端にあるフックを含むように設計し得
る。これは、米国特許第5958341号(W.-S. Chu)の図4Cおよび4Fに示されて
いる。全スライド70をこのフックに押しつけることにより、全スライドをウエ
ルの境界44に対して保持させ、各ウエル24内で試薬との良好な接触を確実に
することができる。
【0020】 上記の要領で各スライド70をトレイ14上に置くことにより、マウントした
生物学的試料はウエル24中で下向きになり、かつ空気に触れないようになる。
このことは、インキュベーションの間中、無関係の物質が試薬中にまたは生物学
的試料上に落ち込むのを防ぐ。さらに、スライド70はウエル24を覆い、イン
キュベーションの間中、ウエル24内の試薬溶液が蒸発することも防ぐ。蒸発は
極めて悪い背景シグナルをもたらし得る。本発明はこの問題の克服にも役立つ。 各試薬とインキュベーションの後、スライドホルダー1とトレイ14とを摘ま
み上げ、500ml のリン酸塩緩衝生理食塩水(PBS)を入れた標準的染色皿中に入
れる。PBS中に入れると、スライド70とトレイ14との間の表面張力は消滅
し、各スライドは極めて容易にトレイから除去できるようになる。次いで各スラ
イドは適当な洗浄段階を経由させる。6つのスライド70を一回で摘まみ上げる
ことは、それらが全部単一のホルダー1に着いているので簡単なことである。実
験室内の標準的染色皿は、6つのスライド70を横ざまにして(単一のホルダー
1に着いている場合)収容するのに充分な大きさがあり、また20のスライドホ
ルダー1を含有し得る。それ故、120のスライド70を同時に洗浄し、処理で
きる。
生物学的試料はウエル24中で下向きになり、かつ空気に触れないようになる。
このことは、インキュベーションの間中、無関係の物質が試薬中にまたは生物学
的試料上に落ち込むのを防ぐ。さらに、スライド70はウエル24を覆い、イン
キュベーションの間中、ウエル24内の試薬溶液が蒸発することも防ぐ。蒸発は
極めて悪い背景シグナルをもたらし得る。本発明はこの問題の克服にも役立つ。 各試薬とインキュベーションの後、スライドホルダー1とトレイ14とを摘ま
み上げ、500ml のリン酸塩緩衝生理食塩水(PBS)を入れた標準的染色皿中に入
れる。PBS中に入れると、スライド70とトレイ14との間の表面張力は消滅
し、各スライドは極めて容易にトレイから除去できるようになる。次いで各スラ
イドは適当な洗浄段階を経由させる。6つのスライド70を一回で摘まみ上げる
ことは、それらが全部単一のホルダー1に着いているので簡単なことである。実
験室内の標準的染色皿は、6つのスライド70を横ざまにして(単一のホルダー
1に着いている場合)収容するのに充分な大きさがあり、また20のスライドホ
ルダー1を含有し得る。それ故、120のスライド70を同時に洗浄し、処理で
きる。
【0021】 上記方法は、汚染を防ぐのに役立つ包み込まれたアッセイシステムとなるので
改良である。また、この包み込まれたシステムは、蒸発を防いで試薬の存在量を
一定にし、その結果、試薬の量が分かっており一定濃度にあるようにする。これ
らの特徴は、単に試薬類をスライド上にマウントした組織試料の上に滴加する、
従ってそれが周囲の雰囲気に開放されており汚染および蒸発が起こり得る従来技
術より、一層良好かつより首尾一貫した結果をもたらす。
改良である。また、この包み込まれたシステムは、蒸発を防いで試薬の存在量を
一定にし、その結果、試薬の量が分かっており一定濃度にあるようにする。これ
らの特徴は、単に試薬類をスライド上にマウントした組織試料の上に滴加する、
従ってそれが周囲の雰囲気に開放されており汚染および蒸発が起こり得る従来技
術より、一層良好かつより首尾一貫した結果をもたらす。
【0022】 本発明の他の態様は、トレイ14の複数のウエル24内で試薬類を前乾燥する
ことであり、その結果、アッセイに際して、該トレイ14と各スライド70とを
水または緩衝液に単に浸漬するか、または水または緩衝液をピペットで各ウエル
24に掛けるだけでよいようにすることである。このトレイ14は、例えば多数
のウエルを有するトレイ14の各ウエル24内に前乾燥した異種試薬類のセット
を有し得る複数ウエルのトレイ14のような、多数のウエルを有するトレイ14
の各ウエル24内に前乾燥した一連の試薬類を含むのもとして製作できる。アッ
セイに際し、各スライド70は、それらの上に単一の患者由来のまたは異なる患
者群由来の生物学的試料をマウントし、そして単一のトレイ14上に置いて一度
に多数のアッセイを実施することができる。前乾燥した試薬類を有するそのよう
なトレイ14は、事前に製作しておき使用時点まで貯蔵することができる。近時
実用されている生物学的試料についての実施アッセイは、試料をスライド上にマ
ウントし、次いで試薬を該試料上に滴加して実施する。そのような方法は、試薬
類が予め測定されており、前乾燥してあるため、水または緩衝液を添加するだけ
で済むというような利点は有し得ない。本明細書中に開示する本発明では、試薬
類はトレイ14上のウエル24内で前乾燥しておくことができ、水または緩衝液
をウエル24に添加し、生物学的試料をそれにマウントしてあるスライド70を
該ウエル24上に置き、試料側を下向きにする。水または緩衝液は、スライド7
0をウエル24の上部に置いてからチューブを経由してウエル24に加えるよう
にしてもよい。スライド70をウエル24上に置くことは、包み込んだ反応室を
形成し、汚染並びに蒸発を防ぐとともに、現時一般的に実施されているようなス
ライド上に溶液を滴加するのと比較して試薬類の均一な分布を確実にする。
ことであり、その結果、アッセイに際して、該トレイ14と各スライド70とを
水または緩衝液に単に浸漬するか、または水または緩衝液をピペットで各ウエル
24に掛けるだけでよいようにすることである。このトレイ14は、例えば多数
のウエルを有するトレイ14の各ウエル24内に前乾燥した異種試薬類のセット
を有し得る複数ウエルのトレイ14のような、多数のウエルを有するトレイ14
の各ウエル24内に前乾燥した一連の試薬類を含むのもとして製作できる。アッ
セイに際し、各スライド70は、それらの上に単一の患者由来のまたは異なる患
者群由来の生物学的試料をマウントし、そして単一のトレイ14上に置いて一度
に多数のアッセイを実施することができる。前乾燥した試薬類を有するそのよう
なトレイ14は、事前に製作しておき使用時点まで貯蔵することができる。近時
実用されている生物学的試料についての実施アッセイは、試料をスライド上にマ
ウントし、次いで試薬を該試料上に滴加して実施する。そのような方法は、試薬
類が予め測定されており、前乾燥してあるため、水または緩衝液を添加するだけ
で済むというような利点は有し得ない。本明細書中に開示する本発明では、試薬
類はトレイ14上のウエル24内で前乾燥しておくことができ、水または緩衝液
をウエル24に添加し、生物学的試料をそれにマウントしてあるスライド70を
該ウエル24上に置き、試料側を下向きにする。水または緩衝液は、スライド7
0をウエル24の上部に置いてからチューブを経由してウエル24に加えるよう
にしてもよい。スライド70をウエル24上に置くことは、包み込んだ反応室を
形成し、汚染並びに蒸発を防ぐとともに、現時一般的に実施されているようなス
ライド上に溶液を滴加するのと比較して試薬類の均一な分布を確実にする。
【0023】 さらに本発明の別の態様は、各スライド上に、対照および/または標識をビル
トインすることである。既知の対照は、生物学的試料から離れた領域に固定化さ
れたものである。例えば、この対照は、生物学的試料中で検査されようとしてい
る抗原、ペプチド、タンパク質または細胞であることができ、あるいはもしハイ
ブリダイゼーションアッセイが実施されようとしているなら既知配列の核酸でも
あり得る。これらは、アッセイが適切に機能するなら、シグナルを出すかまたは
呈色するような陽性対照として作用する。陰性対照、例えば、タンパク質または
抗原または核酸もスライド上に設けることができるが、ウエル中の試薬類と反応
しないものでなければならない。例えば、6つの抗原性測定物A−Fの存在につ
いて検査されると仮定する。各ウエルが異なる抗体A’−F’を有する1枚の6
ウエルトレイ使用することができる。この6種の異なる抗原性測定物を全6スラ
イド上にスポットしておくことができる。すべての場合に、これらの対照の中で
一つだけが、各スライド上で陽性を示すものであるべきである。例えば、スライ
ドAは抗原性測定物Aだけが陽性のシグナルを示すべきであり、スライドBは抗
原性測定物Bだけが陽性のシグナルを示すべきである。これらは外部対照として
働くものである。もし、1以上の対照が陽性を示すならば、これは抗体交叉反応
が起こったことを示す。もし、どの対照も陽性を示さないならば、右反応が起こ
らなかったこと、即ち、その試薬がなくなっていることを示す。検査する生物学
的試料は、内部対照として働く。
トインすることである。既知の対照は、生物学的試料から離れた領域に固定化さ
れたものである。例えば、この対照は、生物学的試料中で検査されようとしてい
る抗原、ペプチド、タンパク質または細胞であることができ、あるいはもしハイ
ブリダイゼーションアッセイが実施されようとしているなら既知配列の核酸でも
あり得る。これらは、アッセイが適切に機能するなら、シグナルを出すかまたは
呈色するような陽性対照として作用する。陰性対照、例えば、タンパク質または
抗原または核酸もスライド上に設けることができるが、ウエル中の試薬類と反応
しないものでなければならない。例えば、6つの抗原性測定物A−Fの存在につ
いて検査されると仮定する。各ウエルが異なる抗体A’−F’を有する1枚の6
ウエルトレイ使用することができる。この6種の異なる抗原性測定物を全6スラ
イド上にスポットしておくことができる。すべての場合に、これらの対照の中で
一つだけが、各スライド上で陽性を示すものであるべきである。例えば、スライ
ドAは抗原性測定物Aだけが陽性のシグナルを示すべきであり、スライドBは抗
原性測定物Bだけが陽性のシグナルを示すべきである。これらは外部対照として
働くものである。もし、1以上の対照が陽性を示すならば、これは抗体交叉反応
が起こったことを示す。もし、どの対照も陽性を示さないならば、右反応が起こ
らなかったこと、即ち、その試薬がなくなっていることを示す。検査する生物学
的試料は、内部対照として働く。
【0024】 外部対照は、各種の手段で各スライド上に置くことができる。好ましいやり方
は、キシレンまたはアルコールに抵抗性の糊を使用する、スタンプやスティッカ
ーと均等な物の上に試薬をスポットすることであり、それは、次いで各スライド
上に糊付けする。それらのスタンプやスティッカーは、それにタンパク質、ペプ
チド、細胞または核酸が緊密に結着する任意の適した材料で製造できる。これに
は、それらに限定されないが、常用の例えば、ニトロセルロース、プラスチック
、ガラスまたはナイロン製膜類が含まれる。そのような膜様材料の具体的な例は
、ニトロセルロースそれ自体、Immobilon-P (Millipore), Hybond-N, Hybond-N+ およびHybond C-extra ニトロセルロース(Amersham), Genescreen および Genes
creen Plus (Du Pont), Clearblot-P (ATTO Co.) およびポリビニルジフルオリ
ド膜類 (Millipore or BioRad)などである。これらのスタンプやスティッカーは
、図3中に示す領域A−Fを有し得る。これらのスタンプやスティッカーは、予
め製造しておき、該スタンプやスティッカー上に抗原性測定物である、タンパク
質、ペプチド、細胞または核酸を乾燥させるのにすぐ使用できるよう貯蔵してお
くことができる。これらのスタンプやスティッカー上には、抗原、タンパク質、
細胞、などの名称を印刷しておくことができる。これは大量生産の場合には特に
適している。乳癌検査用パネルまたはホジキンス病検査用パネルのような、アッ
セイの標準的セットを予製しておくことができるが、所望に応じて外部対照とし
て任意の試薬組合わせを設計することも勿論できる。対照のスタンプはスライド
に生物学的試料を置く前にスライドに取付けておいてもよいが、スライドに生物
学的試料をマウントし、その対照に適合する反応を実施するよう処理する時点ま
で対照のスタンプの取付けを遅らせてもよい。
は、キシレンまたはアルコールに抵抗性の糊を使用する、スタンプやスティッカ
ーと均等な物の上に試薬をスポットすることであり、それは、次いで各スライド
上に糊付けする。それらのスタンプやスティッカーは、それにタンパク質、ペプ
チド、細胞または核酸が緊密に結着する任意の適した材料で製造できる。これに
は、それらに限定されないが、常用の例えば、ニトロセルロース、プラスチック
、ガラスまたはナイロン製膜類が含まれる。そのような膜様材料の具体的な例は
、ニトロセルロースそれ自体、Immobilon-P (Millipore), Hybond-N, Hybond-N+ およびHybond C-extra ニトロセルロース(Amersham), Genescreen および Genes
creen Plus (Du Pont), Clearblot-P (ATTO Co.) およびポリビニルジフルオリ
ド膜類 (Millipore or BioRad)などである。これらのスタンプやスティッカーは
、図3中に示す領域A−Fを有し得る。これらのスタンプやスティッカーは、予
め製造しておき、該スタンプやスティッカー上に抗原性測定物である、タンパク
質、ペプチド、細胞または核酸を乾燥させるのにすぐ使用できるよう貯蔵してお
くことができる。これらのスタンプやスティッカー上には、抗原、タンパク質、
細胞、などの名称を印刷しておくことができる。これは大量生産の場合には特に
適している。乳癌検査用パネルまたはホジキンス病検査用パネルのような、アッ
セイの標準的セットを予製しておくことができるが、所望に応じて外部対照とし
て任意の試薬組合わせを設計することも勿論できる。対照のスタンプはスライド
に生物学的試料を置く前にスライドに取付けておいてもよいが、スライドに生物
学的試料をマウントし、その対照に適合する反応を実施するよう処理する時点ま
で対照のスタンプの取付けを遅らせてもよい。
【0025】 このスタンプ類は、実施しようとする特定の検査用パネルを指示する着色コー
ドまたは番号を付しておくことができる。同様にしてトレイ14も、実施しよう
とする検査用パネルを指示する着色コードまたは番号を付すかその他の標識を付
しておくことができ、それはトレイ14のウエル24中で前乾燥する試薬に応ず
るものとする。スタンプとトレイとは、色または番号あるいは他の標識がマッチ
するようにすべきである。 本発明のさらなる態様は、ウエル24中で乾燥させる試薬類を、それらが働く
順序と逆の各層中で乾燥させ得ることである。緩衝液を加えたとき最後に加えた
試薬がまず溶けて活性となり、続いてその前の最後に加えた試薬が順に活性とな
るような具合にである。このようにして、2またはそれ以上の試薬を単一のウエ
ル24に加えることができ、その結果、スライド70を第1のトレイ14から第
2のトレイ14へ移動させる要なく、連続的な試薬群の作用を可能とする。多段
階反応の場合、これは必要なトレイ14の数を減少させ、また、関与する労力を
も減少させる。
ドまたは番号を付しておくことができる。同様にしてトレイ14も、実施しよう
とする検査用パネルを指示する着色コードまたは番号を付すかその他の標識を付
しておくことができ、それはトレイ14のウエル24中で前乾燥する試薬に応ず
るものとする。スタンプとトレイとは、色または番号あるいは他の標識がマッチ
するようにすべきである。 本発明のさらなる態様は、ウエル24中で乾燥させる試薬類を、それらが働く
順序と逆の各層中で乾燥させ得ることである。緩衝液を加えたとき最後に加えた
試薬がまず溶けて活性となり、続いてその前の最後に加えた試薬が順に活性とな
るような具合にである。このようにして、2またはそれ以上の試薬を単一のウエ
ル24に加えることができ、その結果、スライド70を第1のトレイ14から第
2のトレイ14へ移動させる要なく、連続的な試薬群の作用を可能とする。多段
階反応の場合、これは必要なトレイ14の数を減少させ、また、関与する労力を
も減少させる。
【0026】 本発明の他の態様は、単一スライド上の各セル上で、24ヒト染色体のすべて
の全染色体描出を実施可能とするように特に設計したトレイまたはチップである
。 本発明のさらなる態様は、トレイのウエル内空間容積を調節して、PCRのよ
うな反応を実施できる小容積を存在可能とし、そして該空間容積を次いで増加さ
せ、液体が該ウエルを通ってポンプ可能なように調節可能とした、トレイとスラ
イドとの組合せ構成物である。 当業者は、スライド上の検査しようとするタンパク質、ペプチド、DNA、R
NAまたは細胞を含有する試料、あるいは、スタンプ上の対照タンパク質、ペプ
チド、DNA、RNAまたは細胞は、アッセイの間中解放しないよう固定化して
おくべきことを理解するはずである。タンパク質、ペプチド、核酸、などを含み
得る、トレイ内で前乾燥し得る試薬類は、しかしながら、もし多層化してあるも
のであれば、水または緩衝液を加えたとき、プログラムした順序で解放されなけ
ればならない。
の全染色体描出を実施可能とするように特に設計したトレイまたはチップである
。 本発明のさらなる態様は、トレイのウエル内空間容積を調節して、PCRのよ
うな反応を実施できる小容積を存在可能とし、そして該空間容積を次いで増加さ
せ、液体が該ウエルを通ってポンプ可能なように調節可能とした、トレイとスラ
イドとの組合せ構成物である。 当業者は、スライド上の検査しようとするタンパク質、ペプチド、DNA、R
NAまたは細胞を含有する試料、あるいは、スタンプ上の対照タンパク質、ペプ
チド、DNA、RNAまたは細胞は、アッセイの間中解放しないよう固定化して
おくべきことを理解するはずである。タンパク質、ペプチド、核酸、などを含み
得る、トレイ内で前乾燥し得る試薬類は、しかしながら、もし多層化してあるも
のであれば、水または緩衝液を加えたとき、プログラムした順序で解放されなけ
ればならない。
【0027】実施例 各実施例では、生物学的サンプルを顕微鏡スライド70上に最初にマウントし
、次いでアッセイする。種々の器官(リンパ節、肝臓、腎臓、肺、乳房、皮膚、
前立腺)由来の、外科的および解剖学的なヒトの生物学的サンプルを、10%中
性緩衝性ホルマリン中で通常通り固定し、組織プロセッサー上で一晩処理し、パ
ラフィン中に埋め込んだ。連続切片を4−5ミクロン厚に切り出し、Probe-On-P
lus Slides(#15-188-52; Fisher Scientific)上にマウントし、室温で一晩乾燥
させた。次いで、スライド70を、再利用可能なスライドホルダー1中に挿入す
る。この時点で、単一ホルダー1中のすべてのスライド70(6つまでのスライ
ド)を同時に取り扱うことが出来る。スライド70は、キシレンを入れ、それぞ
れ5分間づつ4回取りかえた染色皿中にスライド70を置き、100%エタノー
ルでそれぞれ1分間づつ2回処理し、そして95%エタノールでそれぞれ1分間
づつ2回処理し、脱パラフィン化する。各脱パラフィン化組織切片スライド70
を綺麗にし、脱イオン水で洗浄する。
、次いでアッセイする。種々の器官(リンパ節、肝臓、腎臓、肺、乳房、皮膚、
前立腺)由来の、外科的および解剖学的なヒトの生物学的サンプルを、10%中
性緩衝性ホルマリン中で通常通り固定し、組織プロセッサー上で一晩処理し、パ
ラフィン中に埋め込んだ。連続切片を4−5ミクロン厚に切り出し、Probe-On-P
lus Slides(#15-188-52; Fisher Scientific)上にマウントし、室温で一晩乾燥
させた。次いで、スライド70を、再利用可能なスライドホルダー1中に挿入す
る。この時点で、単一ホルダー1中のすべてのスライド70(6つまでのスライ
ド)を同時に取り扱うことが出来る。スライド70は、キシレンを入れ、それぞ
れ5分間づつ4回取りかえた染色皿中にスライド70を置き、100%エタノー
ルでそれぞれ1分間づつ2回処理し、そして95%エタノールでそれぞれ1分間
づつ2回処理し、脱パラフィン化する。各脱パラフィン化組織切片スライド70
を綺麗にし、脱イオン水で洗浄する。
【0028】 本発明は、更に下記実施例において詳細に説明するが、それは、例示説明のた
めに提供するものであって、いかなる意味においても本発明を制限することを意
図するものではない。当分野に既知の標準的な技術または特に以下に述べる技術
を用いる。
めに提供するものであって、いかなる意味においても本発明を制限することを意
図するものではない。当分野に既知の標準的な技術または特に以下に述べる技術
を用いる。
【0029】実施例1 免疫細胞化学 この実施例では、生物学的サンプルは、抗体(一次および二次)で処理し、クロ
モゲンカラー顕色処理し、最終的に対比染色する。
モゲンカラー顕色処理し、最終的に対比染色する。
【0030】 A.マウントした組織サンプルのタンパク質分解性前処理 当分野では、免疫細胞化学染色用の特定の抗体を用いるとき0.4%ペプシン
、pH2.0のようなタンパク質分解性酵素によりホルマリン固定した組織切片
を前処理する必要があることが知られている。これが必要であるとき下記のステ
ップが有用となり得る。数滴(150-200μL)のタンパク質分解性消化溶液を3また
は6ウェルトレイ14の各ウェル24に置く。スライド70の組織スライドを下
に向けてウェル24に合せる。スライド70を伴うスライドホルダー1をゆっく
りと下し、トレイ14のウェル24上に置く。気泡が、スライド70の組織側と
トレイ14のウェル24中の溶液との間に残らないようにすべきである。スライ
ド70、スライドホルダー1および溶液を有するトレイ14を15分間40℃で
インキュベーションする。
、pH2.0のようなタンパク質分解性酵素によりホルマリン固定した組織切片
を前処理する必要があることが知られている。これが必要であるとき下記のステ
ップが有用となり得る。数滴(150-200μL)のタンパク質分解性消化溶液を3また
は6ウェルトレイ14の各ウェル24に置く。スライド70の組織スライドを下
に向けてウェル24に合せる。スライド70を伴うスライドホルダー1をゆっく
りと下し、トレイ14のウェル24上に置く。気泡が、スライド70の組織側と
トレイ14のウェル24中の溶液との間に残らないようにすべきである。スライ
ド70、スライドホルダー1および溶液を有するトレイ14を15分間40℃で
インキュベーションする。
【0031】 多くのサンプルを一度に処理しようとするならば、このタンパク質分解性前処
理ステップの間はトレイ14の使用を差し控えるとより効率的である。まだ、ス
ライド70は、一つのホルダー1あたり6つのスライドホルダー1中に置いてお
く。次いで、スライドホルダー1およびスライド70をタンパク質分解性消化溶
液(再利用し得る)500mLの入った染色皿中に垂直に入れ、水浴中で20分間
40℃でインキュベーションする。この前処理ステップで20までのスライドホ
ルダー1(120スライド)を染色皿中に同時に入れることができる。
理ステップの間はトレイ14の使用を差し控えるとより効率的である。まだ、ス
ライド70は、一つのホルダー1あたり6つのスライドホルダー1中に置いてお
く。次いで、スライドホルダー1およびスライド70をタンパク質分解性消化溶
液(再利用し得る)500mLの入った染色皿中に垂直に入れ、水浴中で20分間
40℃でインキュベーションする。この前処理ステップで20までのスライドホ
ルダー1(120スライド)を染色皿中に同時に入れることができる。
【0032】 ある種の抗体では、組織切片がマイクロ波抗原修復で前処理する必要がある。
スライド70を有するスライド1(20まで)を0.01M クエン酸緩衝液50
0mLの入った染色皿中に垂直に入れ、その染色皿をマイクロ波オーブンの中央
に置き、そして当該オーブンで、ハイパワー(800-850ワット)で7−8分間、溶
液を高速沸騰させる。当該オーブンのスイッチを切り、そのパワーレベルを40
0ワットにセットし、そのオーブンで再び7−8分間、溶液を加熱する。
スライド70を有するスライド1(20まで)を0.01M クエン酸緩衝液50
0mLの入った染色皿中に垂直に入れ、その染色皿をマイクロ波オーブンの中央
に置き、そして当該オーブンで、ハイパワー(800-850ワット)で7−8分間、溶
液を高速沸騰させる。当該オーブンのスイッチを切り、そのパワーレベルを40
0ワットにセットし、そのオーブンで再び7−8分間、溶液を加熱する。
【0033】 タンパク質分解性消化およびマイクロ波処理後、組織切片をリン酸塩緩衝性生
理食塩水(PBS)各500mLで3回、染色皿中で洗浄する。
理食塩水(PBS)各500mLで3回、染色皿中で洗浄する。
【0034】 B.ヤギおよびウマ血清による組織切片の処理 タンパク質分解性消化およびマイクロ波処理をするにしろ、しないにせよ、室
温で20−30分間、5%混合の通常のヤギおよびウマの血清と共にインキュベ
ーションする。トレイ14の各ウェル24(約150-200μl)を混合したヤギおよび
ウマ血清で満たす。スライド70の組織側を下向けてウェル24上に置き血清と
接触させる。スライドホルダー1を、スライド70とウェル24の間に気泡が入
らないようにゆっくりと下す。さらに、多くのサンプルを同時に処理しようとす
るならば、20までのスライドホルダー1を5%混合の通常のヤギおよびウマ血
清500mLの入った染色皿中に20−30分間、垂直に入れることにより一度
にこのステップを行うことがより効率的である。
温で20−30分間、5%混合の通常のヤギおよびウマの血清と共にインキュベ
ーションする。トレイ14の各ウェル24(約150-200μl)を混合したヤギおよび
ウマ血清で満たす。スライド70の組織側を下向けてウェル24上に置き血清と
接触させる。スライドホルダー1を、スライド70とウェル24の間に気泡が入
らないようにゆっくりと下す。さらに、多くのサンプルを同時に処理しようとす
るならば、20までのスライドホルダー1を5%混合の通常のヤギおよびウマ血
清500mLの入った染色皿中に20−30分間、垂直に入れることにより一度
にこのステップを行うことがより効率的である。
【0035】 C.一次抗血清または抗体の適用 血清とのインキュベーション後、スライドホルダー1およびスライド70なら
びにトレイ14をPBSの入った染色皿中に入れる。トレイ14をスライドホル
ダーから離し、両方をPBSで一度洗浄する。洗浄したトレイ14を次のステッ
プに再利用する。前希釈した一次抗血清または抗体(約150-200μl)をトレイ14
の各ウェル24に適用する。まだスライド1内にある洗浄したスライド70を組
織側を下にウェル24上にのせる。いつものように、スライド70とウェル24
中の試薬溶液との間に気泡が入るのを避けるよう注意しなければならない。当該
サンプルは、室温で2−4時間抗血清または抗体と共にインキュベーションする
か、40℃2時間、湿チャンバー内でインキュベーションするか、または室温で
一夜、湿チャンバー内でインキュベーションし得る。インキュベーション後、ス
ライドホルダー1および付着スライド70をトレイ14から取り出し、PBSで
3回染色皿中で洗浄する。
びにトレイ14をPBSの入った染色皿中に入れる。トレイ14をスライドホル
ダーから離し、両方をPBSで一度洗浄する。洗浄したトレイ14を次のステッ
プに再利用する。前希釈した一次抗血清または抗体(約150-200μl)をトレイ14
の各ウェル24に適用する。まだスライド1内にある洗浄したスライド70を組
織側を下にウェル24上にのせる。いつものように、スライド70とウェル24
中の試薬溶液との間に気泡が入るのを避けるよう注意しなければならない。当該
サンプルは、室温で2−4時間抗血清または抗体と共にインキュベーションする
か、40℃2時間、湿チャンバー内でインキュベーションするか、または室温で
一夜、湿チャンバー内でインキュベーションし得る。インキュベーション後、ス
ライドホルダー1および付着スライド70をトレイ14から取り出し、PBSで
3回染色皿中で洗浄する。
【0036】 D.二次抗体の適用 前希釈した二次抗体(約150−200μl)を新しいトレイ14の各ウェル24中に
適用する。スライドホルダー1のスライド70を、気泡を注意深く避けながら組
織側を下向けにしてウェル24上に置く。これを30分間40℃、湿チャンバー
内でインキュベーションする。インキュベーション後スライドホルダー1および
付着スライド70をトレイ14から取り出し、PBSで3回、染色皿中で洗浄す
る。
適用する。スライドホルダー1のスライド70を、気泡を注意深く避けながら組
織側を下向けにしてウェル24上に置く。これを30分間40℃、湿チャンバー
内でインキュベーションする。インキュベーション後スライドホルダー1および
付着スライド70をトレイ14から取り出し、PBSで3回、染色皿中で洗浄す
る。
【0037】 E.内因性ペルオキシダーゼ活性除去のための処置 付着スライド70を有するすべてのスライドホルダー1を3%過酸化水素およ
び0.1%アジド化ナトリウムを有するPBS500mLの入った染色皿に入れ
、室温で15分間インキュベーションする。過酸化水素PBSとのインキュベー
ション後、スライドホルダー1および付着スライド70をPBSで3回、染色皿
中で洗浄する。
び0.1%アジド化ナトリウムを有するPBS500mLの入った染色皿に入れ
、室温で15分間インキュベーションする。過酸化水素PBSとのインキュベー
ション後、スライドホルダー1および付着スライド70をPBSで3回、染色皿
中で洗浄する。
【0038】 F.ABC複合体“ELITE”の適用 ABC複合体(Vector Laboratories Inc., Burlingame, CA)を、PBSを用い
作業濃度にまで希釈する。作業濃度(約150-200μL)を新しいトレイ14の各ウェ
ル24に適用する。スライド70を付着スライドホルダー1とともに、溶液とス
ライド70との間に気泡が入らないようにトレイ14上に組織側を下に注意深く
置く。スライド70およびABC溶液を有するトレイ14を40℃30分間、湿
チャンバー内でインキュベーションする。インキュベーション後、付着スライド
70を有するスライドホルダー1をトレイ14から取り出し、PBSで3回、染
色皿中で洗浄する。
作業濃度にまで希釈する。作業濃度(約150-200μL)を新しいトレイ14の各ウェ
ル24に適用する。スライド70を付着スライドホルダー1とともに、溶液とス
ライド70との間に気泡が入らないようにトレイ14上に組織側を下に注意深く
置く。スライド70およびABC溶液を有するトレイ14を40℃30分間、湿
チャンバー内でインキュベーションする。インキュベーション後、付着スライド
70を有するスライドホルダー1をトレイ14から取り出し、PBSで3回、染
色皿中で洗浄する。
【0039】 G.ジアミノベンジジン(DAB)を用いるクロモゲンカラー顕色 DAB溶液を、PBS100mLにDAB100mgを添加し、30%H2O 2 50μLを加えることにより調製する。約150−200μLのDAB溶液を
、各ウェル24を完全に満たすように新しいトレイ14の各ウェル24に加える
。スライド70を付着スライドホルダー1とともに気泡が入らないように注意深
く各ウェル24上に組織側を下向に置く。顕微鏡で、DABを有するスライドホ
ルダー1およびトレイ14を観察することにより色顕色をモニターし得る。着色
沈殿が、陽性細胞の部分において生成する。色は、2−5分後現われ始め、通常
、10分以内に充分な顕色に到達するが、20−30分のインキュベーションが
、染色の弱いサンプルには必要であり得る。顕色を停止するために、スライド7
0を有するすべてのスライドホルダー1をトレイ14から取り出し、脱イオン水
で3回、染色皿中で洗浄する。
、各ウェル24を完全に満たすように新しいトレイ14の各ウェル24に加える
。スライド70を付着スライドホルダー1とともに気泡が入らないように注意深
く各ウェル24上に組織側を下向に置く。顕微鏡で、DABを有するスライドホ
ルダー1およびトレイ14を観察することにより色顕色をモニターし得る。着色
沈殿が、陽性細胞の部分において生成する。色は、2−5分後現われ始め、通常
、10分以内に充分な顕色に到達するが、20−30分のインキュベーションが
、染色の弱いサンプルには必要であり得る。顕色を停止するために、スライド7
0を有するすべてのスライドホルダー1をトレイ14から取り出し、脱イオン水
で3回、染色皿中で洗浄する。
【0040】 H.対比染色 スライドホルダー1および付着スライド70を10−50秒間、Harris's ヘ
マトキシリン中に浸漬し、脱イオン水中に3回くぐらせて洗浄する。次いで、全
てのスライド70を30秒間、0.2%水酸化アンモニウム中に浸し、脱イオン
水中に3回くぐらせて洗浄する。スライド70を95%エタノール中に2回、そ
れぞれ2分間、少し浸し、その後、100%エタノール中に2回、それぞれ2分
間、少し浸し、そして、最終的にスライド70をキシレン中に2回、それぞれ2
分間、少し浸すことにより綺麗にする。
マトキシリン中に浸漬し、脱イオン水中に3回くぐらせて洗浄する。次いで、全
てのスライド70を30秒間、0.2%水酸化アンモニウム中に浸し、脱イオン
水中に3回くぐらせて洗浄する。スライド70を95%エタノール中に2回、そ
れぞれ2分間、少し浸し、その後、100%エタノール中に2回、それぞれ2分
間、少し浸し、そして、最終的にスライド70をキシレン中に2回、それぞれ2
分間、少し浸すことにより綺麗にする。
【0041】 I.カバースリップの取付け スライドホルダー1にまだ装着してあるスライド70について各スライドの組
織片側にCytoseal 60を一滴たらすか該側をプレマウントする。カバーガラスを
各スライド70上に置く。これは、1つずつ行い得るが、適当に間を空けて整列
させた実際には6つ(または3つ)のカバーガラスを6つ(または3つ)のスライド
70と対応するように、特に設計したカバーガラスを用いるのがより効率的であ
る。この特別なカバーガラスを用い、6つまでの個々のカバーガラスを実際に整
列させ、同時にスライド70上に置く。当該カバーガラスは、それらを保持して
いるプラスチックのストリップから、スライド70と結合したままのカバーガラ
スからストリップをポキッと折れるように予め刻目を付けてあるカバーガラスを
単に曲げることにより、一緒に、容易に分離される。この時点で、各スライド7
0を、個々に取り扱うためにスライドホルダー1から取り出し得るが、あるいは
輸送容易とするためにスライドホルダー1に装着させたままとしてもよい。
織片側にCytoseal 60を一滴たらすか該側をプレマウントする。カバーガラスを
各スライド70上に置く。これは、1つずつ行い得るが、適当に間を空けて整列
させた実際には6つ(または3つ)のカバーガラスを6つ(または3つ)のスライド
70と対応するように、特に設計したカバーガラスを用いるのがより効率的であ
る。この特別なカバーガラスを用い、6つまでの個々のカバーガラスを実際に整
列させ、同時にスライド70上に置く。当該カバーガラスは、それらを保持して
いるプラスチックのストリップから、スライド70と結合したままのカバーガラ
スからストリップをポキッと折れるように予め刻目を付けてあるカバーガラスを
単に曲げることにより、一緒に、容易に分離される。この時点で、各スライド7
0を、個々に取り扱うためにスライドホルダー1から取り出し得るが、あるいは
輸送容易とするためにスライドホルダー1に装着させたままとしてもよい。
【0042】 米国特許5,958,341(W.-S. Chu)の図10−12は、本発明の使用と、
スライドにマウントした組織サンプルの表面上に試薬を滴下する標準手動方法を
単に用い、インキュベーションの間中、大気に試薬を開放したままとする、染色
方法と比較する研究の結果について示す。これらの図は、当該2つの方法で得ら
れる結果が、従来の方法を用いて得られる結果と少なくとも同程度およびそれよ
りも良好となる本発明を用いて得られる結果とよく匹敵することを示している。
しかし、本発明では、これらの結果を少ない労力およびより少量の試薬の使用で
得ることを可能とする。
スライドにマウントした組織サンプルの表面上に試薬を滴下する標準手動方法を
単に用い、インキュベーションの間中、大気に試薬を開放したままとする、染色
方法と比較する研究の結果について示す。これらの図は、当該2つの方法で得ら
れる結果が、従来の方法を用いて得られる結果と少なくとも同程度およびそれよ
りも良好となる本発明を用いて得られる結果とよく匹敵することを示している。
しかし、本発明では、これらの結果を少ない労力およびより少量の試薬の使用で
得ることを可能とする。
【0043】 2つの方法を比較すると、バックグラウンドの染色は、本発明を使用すること
により、特にポリクローナル抗体(抗κ軽鎖抗体および抗λ軽鎖抗体)を用いると
きに、有意に減少する。本発明は、バックグラウンドを減少することにより、染
色結果を有意に改善する。バックグラウンドは、重力により沈殿し、組織に非特
異的に結合する遊離FCフラグメントに部分的に起因する。本発明の方法は、ス
ライドを逆さまにして当該組織を上記溶液上に位置させ、そのため遊離FCフラ
グメントが重力により組織上に沈殿出来ないようにする。
により、特にポリクローナル抗体(抗κ軽鎖抗体および抗λ軽鎖抗体)を用いると
きに、有意に減少する。本発明は、バックグラウンドを減少することにより、染
色結果を有意に改善する。バックグラウンドは、重力により沈殿し、組織に非特
異的に結合する遊離FCフラグメントに部分的に起因する。本発明の方法は、ス
ライドを逆さまにして当該組織を上記溶液上に位置させ、そのため遊離FCフラ
グメントが重力により組織上に沈殿出来ないようにする。
【0044】実施例2 in situ ハイブリダイゼーション この実施例では、生物学的サンプルをスライド70上にマウントし、ビオチン
またはジゴキシゲニン標識プローブでハイブリダイズし、抗ビオチンまたは抗ジ
ゴキシゲニン抗体と反応させる。次いで、当該サンプルを染色する。
またはジゴキシゲニン標識プローブでハイブリダイズし、抗ビオチンまたは抗ジ
ゴキシゲニン抗体と反応させる。次いで、当該サンプルを染色する。
【0045】 A.組織サンプルの調製および取付け 組織サンプルを、核酸崩壊を防止する余分の手段以外は、上記と同様にして調
製する。組織サンプルを10%中性緩衝性ホルマリン中で固定し、組織プロセッ
サー上で一夜処理し、パラフィンに埋め込み、4−5ミクロンの連続切片に切り
出し、Probe-On-Plus Slides(#15-188-52; Fisher Scientific)上にマウントし
、室温で一夜乾燥させる。スライド70をスライドホルダー1に挿入し、染色皿
中に入れることにより脱パラフィン化する。スライド70をキシレンでそれぞれ
5分間づつ4回処置し、100%エタノールでそれぞれ1分間づつ2回処置し、
そして、95%エタノールでそれぞれ1分間づつ2回処置する。次いで、当該脱
パラフィン化組織切片スライドを綺麗にし、RNase Block(BioGenex, San Ramon,
CA)を有する脱イオン水で洗浄する。
製する。組織サンプルを10%中性緩衝性ホルマリン中で固定し、組織プロセッ
サー上で一夜処理し、パラフィンに埋め込み、4−5ミクロンの連続切片に切り
出し、Probe-On-Plus Slides(#15-188-52; Fisher Scientific)上にマウントし
、室温で一夜乾燥させる。スライド70をスライドホルダー1に挿入し、染色皿
中に入れることにより脱パラフィン化する。スライド70をキシレンでそれぞれ
5分間づつ4回処置し、100%エタノールでそれぞれ1分間づつ2回処置し、
そして、95%エタノールでそれぞれ1分間づつ2回処置する。次いで、当該脱
パラフィン化組織切片スライドを綺麗にし、RNase Block(BioGenex, San Ramon,
CA)を有する脱イオン水で洗浄する。
【0046】 B.マウントした組織サンプルのプロテイナーゼK処理 約150−200μLの新しい希釈プロテイナーゼK溶液をトレイ14の各ウ
ェル24内に入れ、各ウェル24を完全に満たす。各顕微鏡スライド70(まだ
スライドホルダー1にある)を組織側を下向きに各ウェル24上に置く。スライ
ド70をウェル24中の溶液とスライド70との間に気泡が入らないように注意
深くウェル24上にのせる。これを15分間室温でインキュベーションする。
ェル24内に入れ、各ウェル24を完全に満たす。各顕微鏡スライド70(まだ
スライドホルダー1にある)を組織側を下向きに各ウェル24上に置く。スライ
ド70をウェル24中の溶液とスライド70との間に気泡が入らないように注意
深くウェル24上にのせる。これを15分間室温でインキュベーションする。
【0047】 消化後、スライド70を装着したスライドホルダー1をトレイ14から取り出
し、染色皿中、RNase Blockを含有するPBS500mLで5分間洗浄する。当
該組織切片スライド70を、染色皿中の以下の溶液中に連続的に浸漬することに
より、脱水する:RNase Blockを加えた蒸留水500mLに10秒間、RNase Blo
ckを加えた50%エタノール500mLに10秒間、95%エタノール500m
Lに10秒間、そして100%エタノール500mLに10秒間。当該スライド
70を室温で5分間乾燥する。
し、染色皿中、RNase Blockを含有するPBS500mLで5分間洗浄する。当
該組織切片スライド70を、染色皿中の以下の溶液中に連続的に浸漬することに
より、脱水する:RNase Blockを加えた蒸留水500mLに10秒間、RNase Blo
ckを加えた50%エタノール500mLに10秒間、95%エタノール500m
Lに10秒間、そして100%エタノール500mLに10秒間。当該スライド
70を室温で5分間乾燥する。
【0048】 C.ビオチニル化またはジゴキシゲニン標識プローブによるハイブリダイゼーシ
ョン ここでは、浅いウェル24(深さ0.02−0.08)を有するトレイ14を材
料保持に用い得る。ビオチニル化またはジゴキシゲニン標識オリゴヌクレオチド
プローブを含むハイブリダイゼーション溶液をトレイ14の各ウェル24に入れ
る。十分量の溶液を、各ウェル24に添加してウェル24を完全に満たす。これ
は、約50−100μLの溶液を必要とする。各スライド70を、気泡が入らな
いように注意深く各ウェル24の上部に置く(この時はまだ3または6つをスラ
イドホルダー1に装着させたままである)。スライドホルダー1を有するトレイ
14およびスライド70を95℃のオーブンまたはヒートブロックに8−10分
間置き、核酸を変性させる。このステップは、mRNA配列のヘアピン構造また
は再度の折畳みを取り除く。当該変性後、スライド70を湿チャンバー中45℃
で一夜インキュベーションする。ハイブリダイゼーションステップ後、スライド
70を、トレイ14からスライド70を装着したスライドホルダー1を取り出し
、スライド70を、染色皿中、2×SSC(標準クエン酸生理食塩水)で、37℃
、5分間洗浄し、その後、1×SSCで37℃、5分間洗浄することにより洗浄
する。この後、0.2×SSC中で30分間60℃で洗浄する。最終的に、スラ
イド70をPBSで2回、それぞれ2−5分間、洗浄する。
ョン ここでは、浅いウェル24(深さ0.02−0.08)を有するトレイ14を材
料保持に用い得る。ビオチニル化またはジゴキシゲニン標識オリゴヌクレオチド
プローブを含むハイブリダイゼーション溶液をトレイ14の各ウェル24に入れ
る。十分量の溶液を、各ウェル24に添加してウェル24を完全に満たす。これ
は、約50−100μLの溶液を必要とする。各スライド70を、気泡が入らな
いように注意深く各ウェル24の上部に置く(この時はまだ3または6つをスラ
イドホルダー1に装着させたままである)。スライドホルダー1を有するトレイ
14およびスライド70を95℃のオーブンまたはヒートブロックに8−10分
間置き、核酸を変性させる。このステップは、mRNA配列のヘアピン構造また
は再度の折畳みを取り除く。当該変性後、スライド70を湿チャンバー中45℃
で一夜インキュベーションする。ハイブリダイゼーションステップ後、スライド
70を、トレイ14からスライド70を装着したスライドホルダー1を取り出し
、スライド70を、染色皿中、2×SSC(標準クエン酸生理食塩水)で、37℃
、5分間洗浄し、その後、1×SSCで37℃、5分間洗浄することにより洗浄
する。この後、0.2×SSC中で30分間60℃で洗浄する。最終的に、スラ
イド70をPBSで2回、それぞれ2−5分間、洗浄する。
【0049】 D.シグナル検出 スライド70を装着したスライドホルダー1を、5%混合の通常のヤギおよび
ウマ血清500mLの入った染色皿中に垂直に室温で20分間入れる。前希釈し
たマウス抗ビオチンまたはマウス抗ジゴキシゲニン抗体(150-200μL)を新しいト
レイ14の各ウェル24に適用する。当該スライド70を、気泡が入らないよう
に注意してトレイ14のウェル24上に置く。当該スライド70および抗体を有
するトレイ14は湿チャンバー内で40℃、2時間インキュベーションする。
ウマ血清500mLの入った染色皿中に垂直に室温で20分間入れる。前希釈し
たマウス抗ビオチンまたはマウス抗ジゴキシゲニン抗体(150-200μL)を新しいト
レイ14の各ウェル24に適用する。当該スライド70を、気泡が入らないよう
に注意してトレイ14のウェル24上に置く。当該スライド70および抗体を有
するトレイ14は湿チャンバー内で40℃、2時間インキュベーションする。
【0050】 抗ビオチンまたは抗ジゴキシゲニン抗体によるインキュベーション後、スライ
ド70を有するスライドホルダー1をトレイ14から取り出し、PBSで3回、
染色皿中で洗浄する。
ド70を有するスライドホルダー1をトレイ14から取り出し、PBSで3回、
染色皿中で洗浄する。
【0051】 E.二次抗体の適用 前希釈二次抗体(約150-200μL)を新しいトレイ14の各ウェル24中に適用す
る。スライドホルダー1中の当該スライド70を、気泡が入らないよう注意深く
組織側を下向にウェル24上に置く。これを、湿チャンバー中、40℃、30分
間インキュベーションする。インキュベーション後、スライドホルダー1および
装着スライド70をトレイ14から取り出し、PBSで3回、染色皿中で洗浄す
る。
る。スライドホルダー1中の当該スライド70を、気泡が入らないよう注意深く
組織側を下向にウェル24上に置く。これを、湿チャンバー中、40℃、30分
間インキュベーションする。インキュベーション後、スライドホルダー1および
装着スライド70をトレイ14から取り出し、PBSで3回、染色皿中で洗浄す
る。
【0052】 F.内因性ペルオキシダーゼ活性の除去処理 スライド70を装着したすべてのスライドホルダー1を、3%過酸化水素およ
び0.1%アジド化ナトリウムを有するPBS500mLの入った染色皿に入れ
、室温で15分間インキュベーションする。過酸化水素PBSとのインキュベー
ション後、スライド1および装着スライド70をPBSで3回、染色皿中で洗浄
する。
び0.1%アジド化ナトリウムを有するPBS500mLの入った染色皿に入れ
、室温で15分間インキュベーションする。過酸化水素PBSとのインキュベー
ション後、スライド1および装着スライド70をPBSで3回、染色皿中で洗浄
する。
【0053】 G.ABC複合体“ELTE”の適用 ABC複合体を、PBSを用い作業濃度にまで希釈する。作業濃度(約150-200
μL)を新しいトレイ14の各ウェル24に適用する。装着スライドホルダー1に
装着したスライド70を、溶液とスライド70との間に気泡が入らないようにト
レイ14上に組織側を下向に注意深く置く。スライド70およびABC溶液を有
するトレイ14を40℃30分間、湿チャンバー内でインキュベーションする。
インキュベーション後、スライド70を装着したスライドホルダー1をトレイ1
4から取り出し、PBSで3回、染色皿中で洗浄する。
μL)を新しいトレイ14の各ウェル24に適用する。装着スライドホルダー1に
装着したスライド70を、溶液とスライド70との間に気泡が入らないようにト
レイ14上に組織側を下向に注意深く置く。スライド70およびABC溶液を有
するトレイ14を40℃30分間、湿チャンバー内でインキュベーションする。
インキュベーション後、スライド70を装着したスライドホルダー1をトレイ1
4から取り出し、PBSで3回、染色皿中で洗浄する。
【0054】 H.ジアミノベンジジン(DAB)を用いるクロモゲンカラー顕色 DAB溶液を、PBS100mLにDAB100mgを添加し、30%H2O 2 50μLを加えることにより調製する。約150−200μLのDAB溶液を
、各ウェル24を完全に満たすように新しいトレイ14の各ウェル24に加える
。スライドホルダー1に装着したスライド70を、気泡が入らないように注意深
く各ウェル24上に組織側を下向に置く。カラー顕色を、顕微鏡で、DABを有
するスライドホルダー1およびトレイ14を観察することによりモニターし得る
。着色した沈殿は、陽性細胞の部分において生成する。色は、2−5分後現われ
始め、通常、10分以内に充分顕色するが、20−30分のインキュベーション
が、染色の弱いサンプルには必要であり得る。顕色を停止するために、スライド
70を有するすべてのスライドホルダー1をトレイ14から取り出し、脱イオン
水で3回、染色皿中で洗浄する。
、各ウェル24を完全に満たすように新しいトレイ14の各ウェル24に加える
。スライドホルダー1に装着したスライド70を、気泡が入らないように注意深
く各ウェル24上に組織側を下向に置く。カラー顕色を、顕微鏡で、DABを有
するスライドホルダー1およびトレイ14を観察することによりモニターし得る
。着色した沈殿は、陽性細胞の部分において生成する。色は、2−5分後現われ
始め、通常、10分以内に充分顕色するが、20−30分のインキュベーション
が、染色の弱いサンプルには必要であり得る。顕色を停止するために、スライド
70を有するすべてのスライドホルダー1をトレイ14から取り出し、脱イオン
水で3回、染色皿中で洗浄する。
【0055】 I.対比染色 スライドホルダー1および付着スライド70を10−50秒間、Harris's ヘ
マトキシリン中に浸漬し、脱イオン水中に3回くぐらせることにより洗浄する。
全てのスライド70を30秒間、0.2%水酸化アンモニウム中に浸し、脱イオ
ン水中に3回くぐらせることにより洗浄する。次いで、スライド70を95%エ
タノール中に2回、それぞれ2分間、くぐらせ、その後、100%エタノール中
に2回、それぞれ2分間、くぐらせ、そして、最終的にスライド70をキシレン
中に2回、それぞれ2分間、くぐらせることにより綺麗にする。
マトキシリン中に浸漬し、脱イオン水中に3回くぐらせることにより洗浄する。
全てのスライド70を30秒間、0.2%水酸化アンモニウム中に浸し、脱イオ
ン水中に3回くぐらせることにより洗浄する。次いで、スライド70を95%エ
タノール中に2回、それぞれ2分間、くぐらせ、その後、100%エタノール中
に2回、それぞれ2分間、くぐらせ、そして、最終的にスライド70をキシレン
中に2回、それぞれ2分間、くぐらせることにより綺麗にする。
【0056】 J.カバースリップの取付け スライドホルダー1にまだ装着してあるスライド70について、各スライドの
組織片側にCytoseal 60を一滴たらすか該側をプレマウントする。カバーガラス
を各スライド70上に置く。これは、1つずつ行い得るが、適当に間を空けて一
列に並べた実際には6つ(または3つ)のカバーガラスを6つ(または3つ)のスラ
イド70と対応するように、特に設計したカバーガラスを用いるのがより効率的
である。この特別なカバーガラスを用い、6つまでの個々のカバーガラスを実際
に整列させ、同時にスライド70上に置く。当該カバーガラスは、それらを保持
しているプラスチックのストリップから、スライド70と結合したままのカバー
ガラスからストリップをポキッと折れるように予め刻目を付けてあるストリップ
を単に曲げることにより、一緒に、容易に分離される。この時点で、各スライド
70を、個々に取り扱うためにスライドホルダー1から取り出し得るが、あるい
は輸送容易とするためにスライドホルダー1に装着させたままとしてもよい。
組織片側にCytoseal 60を一滴たらすか該側をプレマウントする。カバーガラス
を各スライド70上に置く。これは、1つずつ行い得るが、適当に間を空けて一
列に並べた実際には6つ(または3つ)のカバーガラスを6つ(または3つ)のスラ
イド70と対応するように、特に設計したカバーガラスを用いるのがより効率的
である。この特別なカバーガラスを用い、6つまでの個々のカバーガラスを実際
に整列させ、同時にスライド70上に置く。当該カバーガラスは、それらを保持
しているプラスチックのストリップから、スライド70と結合したままのカバー
ガラスからストリップをポキッと折れるように予め刻目を付けてあるストリップ
を単に曲げることにより、一緒に、容易に分離される。この時点で、各スライド
70を、個々に取り扱うためにスライドホルダー1から取り出し得るが、あるい
は輸送容易とするためにスライドホルダー1に装着させたままとしてもよい。
【0057】実施例3 PCRによるin situ ハイブリダイゼーション ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)をインビトロ法として核酸の特定の断片少量を
増幅するために行った。これは、後に組織切片内にある核酸の増幅を起すように
in situ での研究に適応させた。本発明の装置はこれらをin situ PCRで行うた
めに適切である。in situ PCRハイブリッド形成用プロトコルの一例はNuovo (1
994) に記載されている。
増幅するために行った。これは、後に組織切片内にある核酸の増幅を起すように
in situ での研究に適応させた。本発明の装置はこれらをin situ PCRで行うた
めに適切である。in situ PCRハイブリッド形成用プロトコルの一例はNuovo (1
994) に記載されている。
【0058】 A.in situ PCR 一連の組織断片を4〜5ミクロンの厚さに薄切りにし、Probe−on−Plusスラ
イド70に装着し、室温で一夜乾燥する。装着した組織切片を脱パラフィンし、
ペプシンを用い、ホルマリン中での固定時間の長さに応じて40℃で15〜90
分間消化する。ピロ炭酸ジエチル(DEPC)で処理した水でスライド70を1分間
洗浄してペプシンを不活性化し、続いて100%エタノールで1分間洗浄する。
次にスライド70を風乾する。
イド70に装着し、室温で一夜乾燥する。装着した組織切片を脱パラフィンし、
ペプシンを用い、ホルマリン中での固定時間の長さに応じて40℃で15〜90
分間消化する。ピロ炭酸ジエチル(DEPC)で処理した水でスライド70を1分間
洗浄してペプシンを不活性化し、続いて100%エタノールで1分間洗浄する。
次にスライド70を風乾する。
【0059】 ポリメラーゼ連鎖反応溶液はいずれかの標準的な操作法に従って作製する。た
とえば、K.B,Mullis et al., 米国特許第4,800,159号を参照。緩衝液、5’−プ
ライマー、3‘’−プライマー、水、Taq ポリメラーゼ(AmpliTaq, Perkin Elm
er) (またはその他の好熱性ポリメラーゼ)およびセルフシール試薬(MJ Rese
arch, Inc.)を混合して全容20〜50μLとする。この溶液20〜50μLを特
別に設計したin situ PCRアルミニウム製トレー14のウェル24に入れる。実
施例1で使用するためのトレー14は好ましくは使い捨てのプラスチック材料で
製造するが、PCR研究用のトレー14は95℃〜100℃に達することもある一
連の温度を経過して循環して使用されることができなければならない。それ故、
このトレー14は熱抵抗性である必要があり(すなわち、高温によって溶融また
は破壊されてはならない)、また、熱の良導体である必要がある。アルミニウム
はトレー14を製造するために好適な材料である。これらアルミニウムトレー1
4は深さ0.005〜0.03mmで、溶液約20〜50μLを保持できるウェル24を有する。
とえば、K.B,Mullis et al., 米国特許第4,800,159号を参照。緩衝液、5’−プ
ライマー、3‘’−プライマー、水、Taq ポリメラーゼ(AmpliTaq, Perkin Elm
er) (またはその他の好熱性ポリメラーゼ)およびセルフシール試薬(MJ Rese
arch, Inc.)を混合して全容20〜50μLとする。この溶液20〜50μLを特
別に設計したin situ PCRアルミニウム製トレー14のウェル24に入れる。実
施例1で使用するためのトレー14は好ましくは使い捨てのプラスチック材料で
製造するが、PCR研究用のトレー14は95℃〜100℃に達することもある一
連の温度を経過して循環して使用されることができなければならない。それ故、
このトレー14は熱抵抗性である必要があり(すなわち、高温によって溶融また
は破壊されてはならない)、また、熱の良導体である必要がある。アルミニウム
はトレー14を製造するために好適な材料である。これらアルミニウムトレー1
4は深さ0.005〜0.03mmで、溶液約20〜50μLを保持できるウェル24を有する。
【0060】 アルミニウムトレー14の各ウェル24の全てに注入した後に、スライドホル
ダー1および装着したスライド70をトレー14の上部に置いて、組織切片を持
つ表面を下向きにして、置かれた位置の下にあるウェル24の中にある溶液と接
触させる。溶液とスライドとの間に気泡が存在しないように注意しなければなら
ない。スライドホルダー1、スライド70、およびアルミニウムトレー14を次
にサーマルサイクラーのブロック上に95℃で3〜5分間置いて、組織内の核酸
を変性させる。次に60℃で2分間と94℃で1分間との間での20〜30サイ
クルを行う。
ダー1および装着したスライド70をトレー14の上部に置いて、組織切片を持
つ表面を下向きにして、置かれた位置の下にあるウェル24の中にある溶液と接
触させる。溶液とスライドとの間に気泡が存在しないように注意しなければなら
ない。スライドホルダー1、スライド70、およびアルミニウムトレー14を次
にサーマルサイクラーのブロック上に95℃で3〜5分間置いて、組織内の核酸
を変性させる。次に60℃で2分間と94℃で1分間との間での20〜30サイ
クルを行う。
【0061】 サイクル段階に続いて、2xSSCを入れた染色皿にスライドホルダー1、スラ
イド70、およびアルミニウムトレー14を垂直に入れて35℃で5分間保持す
る。アルミニウムトレー14からスライドホルダー1を外し、0.5〜1xSSCを
用いて37〜60℃で10〜30分間(バックグラウンドに応じて)洗浄する。
in situ ハイブリダイゼーションをプライマー内部に選択されたビオチン化プロ
ーブまたはジゴキシゲニン標識プローブを用いて実施例2に記載した通りに実行
する。
イド70、およびアルミニウムトレー14を垂直に入れて35℃で5分間保持す
る。アルミニウムトレー14からスライドホルダー1を外し、0.5〜1xSSCを
用いて37〜60℃で10〜30分間(バックグラウンドに応じて)洗浄する。
in situ ハイブリダイゼーションをプライマー内部に選択されたビオチン化プロ
ーブまたはジゴキシゲニン標識プローブを用いて実施例2に記載した通りに実行
する。
【0062】 B.逆転写酵素in situ PCR 一連の組織断片を4〜5ミクロンの厚さに薄切りにし、Probe−on−Plusスラ
イド70に装着し、室温で一夜乾燥する。RTin situ PCRではネガティブおよび
ポジティブ対照の双方を試験することが重要であり、また、これらを同じスライ
ドグラス上で行うことが好適である。ポジティブ対照はDNアーゼ消化段階を省略
するものであって、標的とする特異的な増幅、DNA修復およびミスプライミング
、からの強い核シグナルを発生させるべきものである。ネガティブ対照にはDNア
ーゼ処理に加えて細胞内の標的に対応しないプライマーを使用する。被検検体で
はDNアーゼ処理を進行させるが、所望の標的核酸に特異的なプライマーを使用す
る。装着した組織断片を脱パラフィンし、ペプシンを用い、ホルマリン中での固
定時間の長さに応じて40℃で15〜90分間消化する。ピロ炭酸ジエチル(DE
PC)で処理した水でスライド70を1分間洗浄してペプシンを不活性化し、続い
て100%エタノールで1分間洗浄する。次にスライド70を風乾する。
イド70に装着し、室温で一夜乾燥する。RTin situ PCRではネガティブおよび
ポジティブ対照の双方を試験することが重要であり、また、これらを同じスライ
ドグラス上で行うことが好適である。ポジティブ対照はDNアーゼ消化段階を省略
するものであって、標的とする特異的な増幅、DNA修復およびミスプライミング
、からの強い核シグナルを発生させるべきものである。ネガティブ対照にはDNア
ーゼ処理に加えて細胞内の標的に対応しないプライマーを使用する。被検検体で
はDNアーゼ処理を進行させるが、所望の標的核酸に特異的なプライマーを使用す
る。装着した組織断片を脱パラフィンし、ペプシンを用い、ホルマリン中での固
定時間の長さに応じて40℃で15〜90分間消化する。ピロ炭酸ジエチル(DE
PC)で処理した水でスライド70を1分間洗浄してペプシンを不活性化し、続い
て100%エタノールで1分間洗浄する。次にスライド70を風乾する。
【0063】 予め希釈したRNアーゼ不含のDNアーゼ(約150〜200μLを要する)でプ
ラスチックトレー14の各ウェル24を満たし、スライド70(スライドホルダ
ー1に装着した)の組織側を下向きにしてウェル24の上に位置させることによ
って装着した組織断片3個の中の2個をRNアーゼ不含のDNアーゼで消化する。この
際、気泡が捕捉されないように、また、ウェル24の中の溶液と組織検体との間
が接触するように注意する。一夜37℃でインキュベーションする。DEPC水で1
分間洗浄し、続いて100%エタノールで1分間洗浄してRNアーゼ不含のDNアー
ゼを不活性化する。スライド70を風乾する。
ラスチックトレー14の各ウェル24を満たし、スライド70(スライドホルダ
ー1に装着した)の組織側を下向きにしてウェル24の上に位置させることによ
って装着した組織断片3個の中の2個をRNアーゼ不含のDNアーゼで消化する。この
際、気泡が捕捉されないように、また、ウェル24の中の溶液と組織検体との間
が接触するように注意する。一夜37℃でインキュベーションする。DEPC水で1
分間洗浄し、続いて100%エタノールで1分間洗浄してRNアーゼ不含のDNアー
ゼを不活性化する。スライド70を風乾する。
【0064】 逆転写はEZ RT PCRシステム(Perkin−Elmer)を用いて行う。RT/増幅(RT-PC
R)溶液はEZ rTth緩衝液、各200μMのd ATP、dCTP、dGTPおよびdTTP、4
00μg/mlのウシ血清アルブミン、40単位のRNasin、0.8μMの5’−および
3’−プライマー、2.5mM−塩化マンガン、5単位のrTthおよび2x濃セルフシー
ル試薬(MJ Research, Inc.)を含有する。RT-PCR混合物20μLから50μLを
特別に設計したin situ PCRアルミニウムトレー14の3個のウェル24の中を
満たす(ウェル24の深さは約0.005〜0.03mmである)。スライド70を注意深
くウェル24の上に置いて、組織をウェル24の中にある溶液と接触させる。ス
ライド70、スライドホルダー1およびアルミニウムトレー14を65℃のサー
マルサイクラーのブロック上に30分間置き、続いて94℃で3分間変性段階に
置く。各サイクルを60℃で2分間と94℃で1分間との間に設定して20〜3
0サイクルを行う。
R)溶液はEZ rTth緩衝液、各200μMのd ATP、dCTP、dGTPおよびdTTP、4
00μg/mlのウシ血清アルブミン、40単位のRNasin、0.8μMの5’−および
3’−プライマー、2.5mM−塩化マンガン、5単位のrTthおよび2x濃セルフシー
ル試薬(MJ Research, Inc.)を含有する。RT-PCR混合物20μLから50μLを
特別に設計したin situ PCRアルミニウムトレー14の3個のウェル24の中を
満たす(ウェル24の深さは約0.005〜0.03mmである)。スライド70を注意深
くウェル24の上に置いて、組織をウェル24の中にある溶液と接触させる。ス
ライド70、スライドホルダー1およびアルミニウムトレー14を65℃のサー
マルサイクラーのブロック上に30分間置き、続いて94℃で3分間変性段階に
置く。各サイクルを60℃で2分間と94℃で1分間との間に設定して20〜3
0サイクルを行う。
【0065】 循環段階の後に、スライドホルダー1、スライド70およびアルミニウムトレ
ー14を2xSSCを入れた染色皿に垂直に入れて37℃に5分間保持する。スラ
イドホルダー1をアルミニウムトレー14から外し、0.5〜1xSSCにより37
〜60℃で10〜30分間(バックグラウンドに応じて)洗浄する。in situ ハ
イブリダイゼーションをプライマー内部に選択されたビオチン化プローブまたは
ジゴキシゲニン標識プローブを用いて実施例2に記載した通りに実行する。
ー14を2xSSCを入れた染色皿に垂直に入れて37℃に5分間保持する。スラ
イドホルダー1をアルミニウムトレー14から外し、0.5〜1xSSCにより37
〜60℃で10〜30分間(バックグラウンドに応じて)洗浄する。in situ ハ
イブリダイゼーションをプライマー内部に選択されたビオチン化プローブまたは
ジゴキシゲニン標識プローブを用いて実施例2に記載した通りに実行する。
【0066】 当業者が認識するようにPCR以外の増幅方式も今ではよく知られており、PCRの
代わりに広範に使用されている。これらには連結増幅(またはリガーゼ連鎖反応
、LCR)およびQ−β−レプリカーゼの使用に基づく増幅法を包含する。また、鎖
置換増幅法(SDA)、好熱SDA、および核酸配列に基づく増幅法(3SRまたはNASB
A)も有用である。たとえば、PCRについては米国特許第4,683,195 および 4,683
,202号および Innis et al. (1990);LCR についてはWuとWallace (1989);SDA
については米国特許第5,270,184 および 5,455,166号および Walker et al. (19
92);好熱SDAについては Spargo et al. (1996);および3SR および NASBAにつ
いては米国特許第5,409,818号、Fahy et al. (1991) およびCompton (1991)を参
照。
代わりに広範に使用されている。これらには連結増幅(またはリガーゼ連鎖反応
、LCR)およびQ−β−レプリカーゼの使用に基づく増幅法を包含する。また、鎖
置換増幅法(SDA)、好熱SDA、および核酸配列に基づく増幅法(3SRまたはNASB
A)も有用である。たとえば、PCRについては米国特許第4,683,195 および 4,683
,202号および Innis et al. (1990);LCR についてはWuとWallace (1989);SDA
については米国特許第5,270,184 および 5,455,166号および Walker et al. (19
92);好熱SDAについては Spargo et al. (1996);および3SR および NASBAにつ
いては米国特許第5,409,818号、Fahy et al. (1991) およびCompton (1991)を参
照。
【0067】実施例4 多層乾燥試薬入りのウェル アッセイはウェル24の中で予め乾燥した単一の試薬を用いて行うことができ
る。また、数種の試薬が必要なら、生物学的検体を載せたスライド70を第一の
試薬を入れた第一ウェル24から第二の試薬を入れた第二ウェル24に移動させ
ることができるなどでるが、この様々なウェル24は同一または別々のトレー1
4上のいずれにあってもよい。あるいは、1種を超える試薬をウェル24の中で
予め乾燥しておいてもよい。これらの試薬は最も外側の層を使用すべき最初の試
薬の層とする、数層として乾燥することもできる。これを図4に示すが、そこで
のスライド70は細胞または組織の切片220を載せてある。これはウェル24
の上に置いてあるが、このウェルには第二の抗体270、第一の抗体260およ
びプロテイン遮断剤250の順序で予め乾燥してある。このようにして様々な試
薬を分離し、乾燥し、保存して、ウェルに水または緩衝液を加えるまで反応を防
止する。ウェルに水(塩がウェル中で予め乾燥してあれば)または緩衝液を加え
ると、ウェル24中の最終層の中に乾燥してあるプロテイン遮断剤250が最初
に溶解する。次に第一の抗体260が溶解し、最後に第二の抗体270が溶解し
て反応が可能になる。このような系では、スライド70をトレー14から別のト
レー14に、またはウェル24から別のウェル24に、移動させる必要なしに、
3段階の全てを行うことが可能になる。例えば一連の試薬4種が必要なものなど、
別型のアッセイには、単一のウェル24中で反応とは逆の順序で試薬4種を予め
乾燥しておくか、または各々が試薬2種を持つトレー2枚を使用するか、一方の
トレーには試薬3種を入れ、第二のトレーには第一のまたは第四の試薬を入れて
おいてもよい。例えば、第一トレーの操作と第二トレーの操作の間に洗浄が必要
な場合など、有効に作用するようにすることがよい。これらの方式に関するその
他の変形は当業者には自明なものである。このような組合せでは、いずれも別々
にトレー4枚を使用するよりも必要とする取扱いの数が少なくて楽である。実施
すべきアッセイの型が十分に標準化されている、特に病理学の分野では、このよ
うな系は予め乾燥した試薬を有し、次に使用するまで貯蔵できるトレーを大量生
産するのによく適している。この系は抗原/抗体反応の使用に限定するものでは
なく、他種の反応にも使用できるものであって、たとえば、酵素をウェル中で乾
燥でき;核酸のハイブリッド形成をウェル中で乾燥した様々なプローブを用いて
実施でき;蛍光プローブが乾燥試薬であることができ;ビオチンがウェル中で乾
燥でき;その他がある。
る。また、数種の試薬が必要なら、生物学的検体を載せたスライド70を第一の
試薬を入れた第一ウェル24から第二の試薬を入れた第二ウェル24に移動させ
ることができるなどでるが、この様々なウェル24は同一または別々のトレー1
4上のいずれにあってもよい。あるいは、1種を超える試薬をウェル24の中で
予め乾燥しておいてもよい。これらの試薬は最も外側の層を使用すべき最初の試
薬の層とする、数層として乾燥することもできる。これを図4に示すが、そこで
のスライド70は細胞または組織の切片220を載せてある。これはウェル24
の上に置いてあるが、このウェルには第二の抗体270、第一の抗体260およ
びプロテイン遮断剤250の順序で予め乾燥してある。このようにして様々な試
薬を分離し、乾燥し、保存して、ウェルに水または緩衝液を加えるまで反応を防
止する。ウェルに水(塩がウェル中で予め乾燥してあれば)または緩衝液を加え
ると、ウェル24中の最終層の中に乾燥してあるプロテイン遮断剤250が最初
に溶解する。次に第一の抗体260が溶解し、最後に第二の抗体270が溶解し
て反応が可能になる。このような系では、スライド70をトレー14から別のト
レー14に、またはウェル24から別のウェル24に、移動させる必要なしに、
3段階の全てを行うことが可能になる。例えば一連の試薬4種が必要なものなど、
別型のアッセイには、単一のウェル24中で反応とは逆の順序で試薬4種を予め
乾燥しておくか、または各々が試薬2種を持つトレー2枚を使用するか、一方の
トレーには試薬3種を入れ、第二のトレーには第一のまたは第四の試薬を入れて
おいてもよい。例えば、第一トレーの操作と第二トレーの操作の間に洗浄が必要
な場合など、有効に作用するようにすることがよい。これらの方式に関するその
他の変形は当業者には自明なものである。このような組合せでは、いずれも別々
にトレー4枚を使用するよりも必要とする取扱いの数が少なくて楽である。実施
すべきアッセイの型が十分に標準化されている、特に病理学の分野では、このよ
うな系は予め乾燥した試薬を有し、次に使用するまで貯蔵できるトレーを大量生
産するのによく適している。この系は抗原/抗体反応の使用に限定するものでは
なく、他種の反応にも使用できるものであって、たとえば、酵素をウェル中で乾
燥でき;核酸のハイブリッド形成をウェル中で乾燥した様々なプローブを用いて
実施でき;蛍光プローブが乾燥試薬であることができ;ビオチンがウェル中で乾
燥でき;その他がある。
【0068】 様々な試薬の多重層を有するウェルを製造するためには、試薬層の間に不活性
材料層を挟むことが好適である。例えば、各ウェルは次のようにして試薬で被覆
してもよい。第二の抗体をウェル上に被覆し、乾燥させる。この表面を、高濃度
の不活性材料(すなわち、反応のいずれにも必要ではなく、かつ、反応を妨害し
ない材料)たとえば、ウシ血清アルブミン、ゼラチン、蔗糖、ウシ胎児血清、澱
粉、アガロースまたはその他の不活性材料のようなもので被覆する。これを乾燥
させる。たとえば、ゼラチン溶液を加え、乾燥させ、次にゼラチン溶液を追加し
、乾燥する、など、不活性材料を数層として加えることは好適である。これは所
望の回数行うことができるが、層の数は第二抗体の放出に至る時間の延長に影響
を与える。第二抗体の表面上のこのような被覆5層は、この不活性層が溶解し始
めた時間から第二抗体の放出までに約15〜20分間の遅延を示す良好な結果が
見出されている。不活性材料のこの第一層(または多層)の上に第一抗体を被覆
して乾燥させる。第一抗体の上は不活性材料の第二層または多層で被覆する。こ
れは低濃度のウシ血清アルブミン、ゼラチン、ウシ胎児血清、澱粉、アガロース
、またはその他の不活性材料であることができる。第二不活性層のこのような被
覆3層は、第二不活性層が溶解し始める時間から第一の放出まで約10分間の遅
延を示す良好な結果が見出されている。第二不活性層の上を、たとえばウマおよ
びヤギの血清のようなプロテイン遮断剤で被覆する。プロテイン遮断剤を風乾す
る。不活性材料の多層は溶解に時間がかかるので、活性試薬の次の層が溶解する
前に、各反応を進行させるために十分な時間が与えられる。
材料層を挟むことが好適である。例えば、各ウェルは次のようにして試薬で被覆
してもよい。第二の抗体をウェル上に被覆し、乾燥させる。この表面を、高濃度
の不活性材料(すなわち、反応のいずれにも必要ではなく、かつ、反応を妨害し
ない材料)たとえば、ウシ血清アルブミン、ゼラチン、蔗糖、ウシ胎児血清、澱
粉、アガロースまたはその他の不活性材料のようなもので被覆する。これを乾燥
させる。たとえば、ゼラチン溶液を加え、乾燥させ、次にゼラチン溶液を追加し
、乾燥する、など、不活性材料を数層として加えることは好適である。これは所
望の回数行うことができるが、層の数は第二抗体の放出に至る時間の延長に影響
を与える。第二抗体の表面上のこのような被覆5層は、この不活性層が溶解し始
めた時間から第二抗体の放出までに約15〜20分間の遅延を示す良好な結果が
見出されている。不活性材料のこの第一層(または多層)の上に第一抗体を被覆
して乾燥させる。第一抗体の上は不活性材料の第二層または多層で被覆する。こ
れは低濃度のウシ血清アルブミン、ゼラチン、ウシ胎児血清、澱粉、アガロース
、またはその他の不活性材料であることができる。第二不活性層のこのような被
覆3層は、第二不活性層が溶解し始める時間から第一の放出まで約10分間の遅
延を示す良好な結果が見出されている。第二不活性層の上を、たとえばウマおよ
びヤギの血清のようなプロテイン遮断剤で被覆する。プロテイン遮断剤を風乾す
る。不活性材料の多層は溶解に時間がかかるので、活性試薬の次の層が溶解する
前に、各反応を進行させるために十分な時間が与えられる。
【0069】 この系の限界は一連の段階の間に洗浄段階が不要なときにのみ使用できる点に
ある。例えば、第一抗体の反応に第二抗体の反応を続けるならば、第二抗体は検
出操作の前に洗い流さなければならない。それ故、検出試薬は第二抗体のウェル
と同じウェル内で予め乾燥しておくことはできない。同様に、ある段階が加熱を
要するなら(たとえば、核酸プローブの変性など)、熱で不活性化または分解さ
れる試薬と組み合わせることはできない。
ある。例えば、第一抗体の反応に第二抗体の反応を続けるならば、第二抗体は検
出操作の前に洗い流さなければならない。それ故、検出試薬は第二抗体のウェル
と同じウェル内で予め乾燥しておくことはできない。同様に、ある段階が加熱を
要するなら(たとえば、核酸プローブの変性など)、熱で不活性化または分解さ
れる試薬と組み合わせることはできない。
【0070】実施例5 ビルトインした対照および自動ラベル-イムノアッセイまたはISH/FISH アッセイを臨床的条件で行なう場合、米国食品医薬品局により、対照を必要と
される。アッセイしようとするスライドそのものの上にビルトインした対照があ
るようにすることは、対照の試験に非常によい方法である。対照が完全に別のス
ライド上にある場合は、問題として、対照または実際の試験サンプル上の何れか
で生物学的サンプルに接触しない試薬があったのかどうか、あるいは対照または
試験サンプルの何れかに試薬を加える工程が欠けていたのか示され得ないので、
その対照はよくない。また、とりわけ幾つかの試験を同時に行なう場合、対照サ
ンプル上に滴下する試薬が、ヒトまたは装置の過誤による事故で、試験サンプル
上に滴下される試薬と異なっているかもしれない。対照が試験サンプルと同じス
ライド上にある場合、このような問題は対照によって示されるであろうが、しか
し対照が標準または悪性腫瘍組織の切片である場合は、対照サンプルの調製に非
常に苦労し、時間がかかる。
される。アッセイしようとするスライドそのものの上にビルトインした対照があ
るようにすることは、対照の試験に非常によい方法である。対照が完全に別のス
ライド上にある場合は、問題として、対照または実際の試験サンプル上の何れか
で生物学的サンプルに接触しない試薬があったのかどうか、あるいは対照または
試験サンプルの何れかに試薬を加える工程が欠けていたのか示され得ないので、
その対照はよくない。また、とりわけ幾つかの試験を同時に行なう場合、対照サ
ンプル上に滴下する試薬が、ヒトまたは装置の過誤による事故で、試験サンプル
上に滴下される試薬と異なっているかもしれない。対照が試験サンプルと同じス
ライド上にある場合、このような問題は対照によって示されるであろうが、しか
し対照が標準または悪性腫瘍組織の切片である場合は、対照サンプルの調製に非
常に苦労し、時間がかかる。
【0071】 図3は、組織スライス220をその上に固定したスライド70を例示説明して
おり、そしてスタンプまたは展着剤230(例えば、ニトロセルロースまたは他
の膜の一片、あるいはスライド70上に接着したプラスティックまたはガラス型
の基質)その上に付け、6つの別個の領域A-Fを有するスライド70の別の領域
を例示説明しているが、しかしスタンプまたは展着剤の使用は必須なものではな
く、例えば対照をスライド70上に直接被覆することもできる。A-Fの各領域
に、例えば明確な抗原性物質または核酸を、実施するアッセイの形式に応じてス
ポットしてもよいが、スタンプまたは展着剤230を使用する代わりに、これら
の物質をスライド70の領域に直接適用することもできる。6つの分離アッセイ
を、6ウェルのトレイを使用して行なうことができる。各ウェル24は、それぞ
れA-Fと反応する試薬 A'-F'を有している。対照Aは、試薬A'をウェル24
上に配置したスライド70上でのみ陽性であり、そして残りの5つのウェルに対
しては陰性であろう。対照Bは、スライド70上では、試薬B'をウェル24上
に配置した場合のみ陽性であり、他の5つのウェルに対しては陰性であろう。等
。これらの外部対照を有するスタンプまたは展着剤230を市販大量販売用に、
または購入者側で調製できるように、前もって調製することができる。一般の臨
床的アッセイパネル用のスタンプまたは展着剤230がカラーコードしたもので
あるか、または他の方式でラベリングされているこのであれば、一目でアッセイ
が行なわれたか表示されるので有用である。このカラーコードまたは他のラベリ
ングを、トレイ14のカラーコードまたは他のラベリングと一致させて、スタン
プと併せて使用することができる。例えば、緑色スタンプは、その上に抗原性決
定子A-Fを有し、そして緑色トレイは、抗体A'-F'を有する。カラーコード化
スキームの代わりにナンバリングまたはレタリングシステムを使用することもで
きる。これらを乳癌の一連の試験に使用して、赤色スタンプおよび赤色トレイは
ホジキン病のアッセイに用いられるよう示すことも可能であろう。何れの型のカ
ラーコード化(一連の色のストライプなど)を使用することもできる。このような
カラーコード化は、臨床的実験での誤用を少なくするであろう。陽性外部対照は
そのスライドで行なわれるアッセイを表示するので、各スライド上の陽性対照を
使用するとスライドに対して自動ラベリングシステムとして作用する。所望によ
り、スタンプを対応するトレイとともに包装し、さらにスタンプを包装するとき
に各トレイ上に置いて、その後使用するときにトレイから引き剥がし、そしてス
ライド上に置くことができる。このような、対照を有するスタンプまたは展着剤
を使用することは非常に簡便であり、対照生物学的サンプル(例えば、対照とし
て使用する、正常または悪性腫瘍組織の組織切片)を調製するよりも時間がかか
らない。
おり、そしてスタンプまたは展着剤230(例えば、ニトロセルロースまたは他
の膜の一片、あるいはスライド70上に接着したプラスティックまたはガラス型
の基質)その上に付け、6つの別個の領域A-Fを有するスライド70の別の領域
を例示説明しているが、しかしスタンプまたは展着剤の使用は必須なものではな
く、例えば対照をスライド70上に直接被覆することもできる。A-Fの各領域
に、例えば明確な抗原性物質または核酸を、実施するアッセイの形式に応じてス
ポットしてもよいが、スタンプまたは展着剤230を使用する代わりに、これら
の物質をスライド70の領域に直接適用することもできる。6つの分離アッセイ
を、6ウェルのトレイを使用して行なうことができる。各ウェル24は、それぞ
れA-Fと反応する試薬 A'-F'を有している。対照Aは、試薬A'をウェル24
上に配置したスライド70上でのみ陽性であり、そして残りの5つのウェルに対
しては陰性であろう。対照Bは、スライド70上では、試薬B'をウェル24上
に配置した場合のみ陽性であり、他の5つのウェルに対しては陰性であろう。等
。これらの外部対照を有するスタンプまたは展着剤230を市販大量販売用に、
または購入者側で調製できるように、前もって調製することができる。一般の臨
床的アッセイパネル用のスタンプまたは展着剤230がカラーコードしたもので
あるか、または他の方式でラベリングされているこのであれば、一目でアッセイ
が行なわれたか表示されるので有用である。このカラーコードまたは他のラベリ
ングを、トレイ14のカラーコードまたは他のラベリングと一致させて、スタン
プと併せて使用することができる。例えば、緑色スタンプは、その上に抗原性決
定子A-Fを有し、そして緑色トレイは、抗体A'-F'を有する。カラーコード化
スキームの代わりにナンバリングまたはレタリングシステムを使用することもで
きる。これらを乳癌の一連の試験に使用して、赤色スタンプおよび赤色トレイは
ホジキン病のアッセイに用いられるよう示すことも可能であろう。何れの型のカ
ラーコード化(一連の色のストライプなど)を使用することもできる。このような
カラーコード化は、臨床的実験での誤用を少なくするであろう。陽性外部対照は
そのスライドで行なわれるアッセイを表示するので、各スライド上の陽性対照を
使用するとスライドに対して自動ラベリングシステムとして作用する。所望によ
り、スタンプを対応するトレイとともに包装し、さらにスタンプを包装するとき
に各トレイ上に置いて、その後使用するときにトレイから引き剥がし、そしてス
ライド上に置くことができる。このような、対照を有するスタンプまたは展着剤
を使用することは非常に簡便であり、対照生物学的サンプル(例えば、対照とし
て使用する、正常または悪性腫瘍組織の組織切片)を調製するよりも時間がかか
らない。
【0072】 一例として、胸部のアッセイパネルを、6つの別個の診断用マーカーを使用し
て実施することができる。これらの診断用マーカーは、サイトケラチン 7、サイ
トケラチン 20、ER、Bc1-2、PR、およびカテプシン Dであり得る。これらの抗原
性決定因子をそれぞれスタンプまたは展着剤上に被覆して対照として使用たり、
対応する抗体を6ウェルトレイの分離ウェル上で前乾燥することができる。もし
サイトケラチン 7 または均等な抗原性決定因子をスタンプまたは展着剤のポジ
ションA上に置くならば、サイトケラチン 7に対する抗体をウェルA'中に置く
こととなる。スタンプまたは展着剤の切片Aは、ウェルA'上に配置されたスラ
イドで陽性であるが、しかし他の 5 ウェルでは陰性であろう。また、スタンプ
の切片Aのみ、ウェルA'に配置されたスライド70で陽性であるが、スタンプ
または展着剤の切片 B-Fは陰性であろう。これは、ビルトインした対照によるス
ライドの自動ラベリングをもたらす。切片Aが陽性でなく、また切片B-Fがこ
のスライド上で陽性である場合は、問題が生じており、この試験を信頼してはな
らないことを意味している。
て実施することができる。これらの診断用マーカーは、サイトケラチン 7、サイ
トケラチン 20、ER、Bc1-2、PR、およびカテプシン Dであり得る。これらの抗原
性決定因子をそれぞれスタンプまたは展着剤上に被覆して対照として使用たり、
対応する抗体を6ウェルトレイの分離ウェル上で前乾燥することができる。もし
サイトケラチン 7 または均等な抗原性決定因子をスタンプまたは展着剤のポジ
ションA上に置くならば、サイトケラチン 7に対する抗体をウェルA'中に置く
こととなる。スタンプまたは展着剤の切片Aは、ウェルA'上に配置されたスラ
イドで陽性であるが、しかし他の 5 ウェルでは陰性であろう。また、スタンプ
の切片Aのみ、ウェルA'に配置されたスライド70で陽性であるが、スタンプ
または展着剤の切片 B-Fは陰性であろう。これは、ビルトインした対照によるス
ライドの自動ラベリングをもたらす。切片Aが陽性でなく、また切片B-Fがこ
のスライド上で陽性である場合は、問題が生じており、この試験を信頼してはな
らないことを意味している。
【0073】 使用し得るパネルの他の実施例は、Ki-67、Her-2/neu (c-erbB-2)、P53、pS2
、EGFK、および因子 VIIIなどの、乳癌用の予想マーカーのパネルである。他の
腫瘍(例えば、前立腺、膀胱、および大腸)も、同一の予後パネルトレイを使用す
ることができる。一般的な病理学的業務では、4種のパネルトレイで、全造血性
疾患の診断の90-95%をカバーすることができる;1)ホジキン病のパネルに、マー
カー LCA (CD45)、L26 (CD20)、CD3、Leu-M1 (CD15)、Ki-1 (CD30)、およびLMP
が含まれてもよい。2)ホジキンでないパネルに、L26 (CD20)、CD3、MT1、Bcl-1
、Bc1-2、Ki-1(CD30)が含まれ得る。3)別のホジキンでないパネルに、カッパー
、ラムダ、UCHL-1 (CD45RO)、CD5、CD23、およびCD10が含まれ得る。4)白血病パ
ネルに、L26 (CD20)、CD34、MPO、Lyso、TdT、およびDBA44が含まれ得る。他の
所望試験パネルで同様に実施することができる;例えば限定するものではないが
、知られていない第1次部位の未分化型腫瘍用のパネル、肉腫分類、リンパ腫
対 癌 対 黒色腫、腺癌 対 中皮腫、肝細胞性/胆管癌 対 転移性癌、下垂体パネ
ル、パジェット病 対 黒色腫 対 扁平上皮癌 対 線維性組織球腫、乳房パネル、
および膀胱 対 前立腺癌。さらに他の可能なパネルは、神経内分泌パネル、 小
円形細胞腫瘍、生殖細胞腫瘍、ホジキン 対 ホジキンでないリンパ腫、リンパ腫 対 反応性肥大、形質細胞血液疾患、白血病パネルおよびウイルスパネルである
。
、EGFK、および因子 VIIIなどの、乳癌用の予想マーカーのパネルである。他の
腫瘍(例えば、前立腺、膀胱、および大腸)も、同一の予後パネルトレイを使用す
ることができる。一般的な病理学的業務では、4種のパネルトレイで、全造血性
疾患の診断の90-95%をカバーすることができる;1)ホジキン病のパネルに、マー
カー LCA (CD45)、L26 (CD20)、CD3、Leu-M1 (CD15)、Ki-1 (CD30)、およびLMP
が含まれてもよい。2)ホジキンでないパネルに、L26 (CD20)、CD3、MT1、Bcl-1
、Bc1-2、Ki-1(CD30)が含まれ得る。3)別のホジキンでないパネルに、カッパー
、ラムダ、UCHL-1 (CD45RO)、CD5、CD23、およびCD10が含まれ得る。4)白血病パ
ネルに、L26 (CD20)、CD34、MPO、Lyso、TdT、およびDBA44が含まれ得る。他の
所望試験パネルで同様に実施することができる;例えば限定するものではないが
、知られていない第1次部位の未分化型腫瘍用のパネル、肉腫分類、リンパ腫
対 癌 対 黒色腫、腺癌 対 中皮腫、肝細胞性/胆管癌 対 転移性癌、下垂体パネ
ル、パジェット病 対 黒色腫 対 扁平上皮癌 対 線維性組織球腫、乳房パネル、
および膀胱 対 前立腺癌。さらに他の可能なパネルは、神経内分泌パネル、 小
円形細胞腫瘍、生殖細胞腫瘍、ホジキン 対 ホジキンでないリンパ腫、リンパ腫 対 反応性肥大、形質細胞血液疾患、白血病パネルおよびウイルスパネルである
。
【0074】 各研究所は、人員、および実施するアッセイ数およびタイプに対して最も適切
である、独自のシステムを工夫することができる。例えば、あるアッセイで、抗
体の第1セットの使用、次いで第2次抗体が全てのサンプルに対して同一である
第2次抗体との反応を必要とする場合、それから少数のアッセイを行なわなけれ
ばならない場合は、トレイ14上でこれらの反応を行なうことができるが、多数
のアッセイを行なわなければならない以外は、全スライドを、第2次抗体および
/または検出システムとともに大型タンク中に配置して行なうようにしてもよい(
"バッチ"または"バルク"インキュベーション方法)。あるいは、少量のアッセイ
を実施する研究室用、フィルターペーパー片で第2次抗体および/または検出シ
ステムを被覆し、全スライドをフィルターペーパー上に置き、そして使用時にフ
ィルターペーパーを湿らすこともできる。これはトレイを使用するよりも安価で
あり得る。同様に、核酸プローブをフィルターペーパー上に置いてもよい。
である、独自のシステムを工夫することができる。例えば、あるアッセイで、抗
体の第1セットの使用、次いで第2次抗体が全てのサンプルに対して同一である
第2次抗体との反応を必要とする場合、それから少数のアッセイを行なわなけれ
ばならない場合は、トレイ14上でこれらの反応を行なうことができるが、多数
のアッセイを行なわなければならない以外は、全スライドを、第2次抗体および
/または検出システムとともに大型タンク中に配置して行なうようにしてもよい(
"バッチ"または"バルク"インキュベーション方法)。あるいは、少量のアッセイ
を実施する研究室用、フィルターペーパー片で第2次抗体および/または検出シ
ステムを被覆し、全スライドをフィルターペーパー上に置き、そして使用時にフ
ィルターペーパーを湿らすこともできる。これはトレイを使用するよりも安価で
あり得る。同様に、核酸プローブをフィルターペーパー上に置いてもよい。
【0075】実施例6 ビルトインした対照−核酸ハイブリダイゼーション 実施例5のイムノアッセイについての記載と同様の方法で、ビルトインした対
照を、核酸アッセイ(ISHまたは蛍光in situ ハイブリダイゼーション(FISH)など
)に使用することができる。FISHの一例として、蛍光プローブを使用して染色体
の大部分を照射する。これは全体染色体彩色(WCP)といわれる。この技術は、転
移などの総染色体異常の観測出に有用である。使用プローブを、種々の異なる色
のフルオロフォアと併せて使用することもできる。例えば、染色体 1に対するプ
ローブは橙色の蛍光を発することができ、染色体 2に対するプローブは緑色の蛍
光を発するようにすることができ、そして染色体 3に対するプローブは赤色の蛍
光を発するフルオロフォアを使用することができる。こうして、3つの染色体全
てを同時に染色することが可能となり、相互を容易に区別することができる。ヒ
ト細胞では、24までの別個の核染色体、染色体 1-22、XおよびY、がある。3
つの異なるフルオロフォアを使用する場合、全24染色体を、たった8つの異なる
組織切片または8つの異なる細胞セットを使用して研究することができる。 これらは、8つの分離スライドで研究をすることができ、または所望により、
幾つかの組織切片または細胞セットを、単一スライドの別の区域上に配置するこ
とができる。単一スライド上に8つの組織区域を配置することができ、その結果
、単一スライド上で全24染色体を、3種混合プローブの異なる8セットを使用し
て全ての反応を同時に実行して研究することができる。スライドを8つの分離ウ
ェル(各ウェルはその中に前乾燥した3つのプローブの異なるセットを有する)を
有するトレイまたはチップ上に配置して、これらを単一の細胞塗抹標本スライド
上で試験することができる。ミクロアレイ技術を使用して24のビルトインした対
照をスライド上で直接被覆し、内部の輪郭内で、各ウェル領域を包囲するように
してもよい(図6E参照)。当業者が認識するように、3つのプローブの8セット
を使用することは必須ではない。4種の異なる標識を付したプローブの6セット
など、他の変形も可能である。前乾燥した試薬を有するトレイを使用することも
必須ではなく、むしろ試薬は液体形態でトレイに加えることもできる。同様に、
ウェルの内部輪郭をとりまく領域中でスライド上に直接被覆した所望の数の対照
を使用して、他の技術(in situ ハイブリダイゼーションなど)を実施することも
できる。対照をウェルの端を包囲するようにスライド上に配置して示しているが
、これらのパターンは必須ではなく、それらがウェル中で対照が試薬と接触する
領域内にある限り、対照をアレンジする他のパターンを使用することもできる。
照を、核酸アッセイ(ISHまたは蛍光in situ ハイブリダイゼーション(FISH)など
)に使用することができる。FISHの一例として、蛍光プローブを使用して染色体
の大部分を照射する。これは全体染色体彩色(WCP)といわれる。この技術は、転
移などの総染色体異常の観測出に有用である。使用プローブを、種々の異なる色
のフルオロフォアと併せて使用することもできる。例えば、染色体 1に対するプ
ローブは橙色の蛍光を発することができ、染色体 2に対するプローブは緑色の蛍
光を発するようにすることができ、そして染色体 3に対するプローブは赤色の蛍
光を発するフルオロフォアを使用することができる。こうして、3つの染色体全
てを同時に染色することが可能となり、相互を容易に区別することができる。ヒ
ト細胞では、24までの別個の核染色体、染色体 1-22、XおよびY、がある。3
つの異なるフルオロフォアを使用する場合、全24染色体を、たった8つの異なる
組織切片または8つの異なる細胞セットを使用して研究することができる。 これらは、8つの分離スライドで研究をすることができ、または所望により、
幾つかの組織切片または細胞セットを、単一スライドの別の区域上に配置するこ
とができる。単一スライド上に8つの組織区域を配置することができ、その結果
、単一スライド上で全24染色体を、3種混合プローブの異なる8セットを使用し
て全ての反応を同時に実行して研究することができる。スライドを8つの分離ウ
ェル(各ウェルはその中に前乾燥した3つのプローブの異なるセットを有する)を
有するトレイまたはチップ上に配置して、これらを単一の細胞塗抹標本スライド
上で試験することができる。ミクロアレイ技術を使用して24のビルトインした対
照をスライド上で直接被覆し、内部の輪郭内で、各ウェル領域を包囲するように
してもよい(図6E参照)。当業者が認識するように、3つのプローブの8セット
を使用することは必須ではない。4種の異なる標識を付したプローブの6セット
など、他の変形も可能である。前乾燥した試薬を有するトレイを使用することも
必須ではなく、むしろ試薬は液体形態でトレイに加えることもできる。同様に、
ウェルの内部輪郭をとりまく領域中でスライド上に直接被覆した所望の数の対照
を使用して、他の技術(in situ ハイブリダイゼーションなど)を実施することも
できる。対照をウェルの端を包囲するようにスライド上に配置して示しているが
、これらのパターンは必須ではなく、それらがウェル中で対照が試薬と接触する
領域内にある限り、対照をアレンジする他のパターンを使用することもできる。
【0076】実施例7 自動化マルチウエルトレイおよび装置 たとえ自動化システムを用いても、その自動化システムがなお手動で操作すべ
き幾つかのステップを必要とするので、生物試料の分析は非常に労働集約型であ
る。配管および一つもしくは複数のポンプに取り付けるかまたは自動化プロセッ
シング装置に接続したマルチウエルトレイもしくは予め乾燥した試薬を持つマル
チウエルトレイを用いて、生物試料のプロセッシングを部分的にもしくは完全に
自動化することができる。そのようなマルチウエルトレイは、先に議論したトレ
イ14とデザイン的に同様であり得る。しかし、自動化マルチウエルトレイ33
0(図5A〜B参照)は、洗浄もしくは大量に用い得る高価でない試薬を用いるよ
うなステップに使用される。自動化マルチウエルトレイ330の反応チャンバー
280は、0.01〜1mLのような容量を保持するようにデザインされている
が、この量は重大ではなくこれより多くても少なくてもよい。ウェルは一つもし
くはそれ以上の注入口および一つもしくはそれ以上の排出口を含んで配管を収容
する。注入口に入る配管はポンプに取り付けられている。取り付けたスライド7
0を持つスライドホルダー1は自動化マルチウエルトレイ330の上部に置かれ
、そして液体を300もしくは302のような注入口を通して反応チャンバー2
80中に注入することができる。試薬は反応時間の間は再循環し、所望により、
ポンプ290ならびに排出口に通じる配管310と共同で注入口302に通じる
配管295を使用することにより(例えば、図5Bに示すように)再使用し得る。
この代わりに、使用した材料を直接に廃液容器291もしくは流しに送るか、ま
たは排出口296を経由して、ゲル上でもしくは他の機器により分析されること
ができる。循環する試薬は、培養もしくは反応時間を減少させそしてバックグラ
ウンドを減少させ得る。循環する試薬の濃度はまた、特にマルチプルプローブを
使用するときに、段階的に増加もしくは減少させたりして最適反応条件に達する
ことができる。これは特に、種々の濃度の使用を可能にする柔らかい底のトレイ
を用いるときには、適用可能である。
き幾つかのステップを必要とするので、生物試料の分析は非常に労働集約型であ
る。配管および一つもしくは複数のポンプに取り付けるかまたは自動化プロセッ
シング装置に接続したマルチウエルトレイもしくは予め乾燥した試薬を持つマル
チウエルトレイを用いて、生物試料のプロセッシングを部分的にもしくは完全に
自動化することができる。そのようなマルチウエルトレイは、先に議論したトレ
イ14とデザイン的に同様であり得る。しかし、自動化マルチウエルトレイ33
0(図5A〜B参照)は、洗浄もしくは大量に用い得る高価でない試薬を用いるよ
うなステップに使用される。自動化マルチウエルトレイ330の反応チャンバー
280は、0.01〜1mLのような容量を保持するようにデザインされている
が、この量は重大ではなくこれより多くても少なくてもよい。ウェルは一つもし
くはそれ以上の注入口および一つもしくはそれ以上の排出口を含んで配管を収容
する。注入口に入る配管はポンプに取り付けられている。取り付けたスライド7
0を持つスライドホルダー1は自動化マルチウエルトレイ330の上部に置かれ
、そして液体を300もしくは302のような注入口を通して反応チャンバー2
80中に注入することができる。試薬は反応時間の間は再循環し、所望により、
ポンプ290ならびに排出口に通じる配管310と共同で注入口302に通じる
配管295を使用することにより(例えば、図5Bに示すように)再使用し得る。
この代わりに、使用した材料を直接に廃液容器291もしくは流しに送るか、ま
たは排出口296を経由して、ゲル上でもしくは他の機器により分析されること
ができる。循環する試薬は、培養もしくは反応時間を減少させそしてバックグラ
ウンドを減少させ得る。循環する試薬の濃度はまた、特にマルチプルプローブを
使用するときに、段階的に増加もしくは減少させたりして最適反応条件に達する
ことができる。これは特に、種々の濃度の使用を可能にする柔らかい底のトレイ
を用いるときには、適用可能である。
【0077】 中央プロセッシングユニット286は試薬の注入を制御し、そして、一つのポ
ンプが幾つかの異なった試薬を制御するか、もしくは、その代わりに複数のポン
プを全て中央プロセッシングユニットで制御して使用し得るように、ポンプに取
り付けた配管の色々な部品上のバルブを開閉することができる。このセットアッ
プで、スライドおよびのせられた生物試料を持つスライドホルダーをマルチウエ
ルトレイ上に置くことができ、中央プロセッシングユニットを作動させ得て所望
の液体および試薬を反応チャンバーに注入して、液体を再循環させるかまたは液
体を直接に廃棄する。人がスライドを一つのトレイからもう一つのトレイに移す
必要なしに、異なった試薬を反応チャンバーに順次注入することができる。例え
ば、生物試料を持つスライドを自動化マルチウエルトレイ上に置くことができ、
そしてシステムが以下の試薬を注入することができる: キシレン、100%エ
タノール、90%エタノール、過酸化水素、2次抗体、検出試薬(ABC)、ジア
ミノベンジジン、ヘマトキシリン、各ステップ間のPBS洗浄溶液、および、更
に90%エタノール、100%エタノールおよびキシレン、ならびにカバーグラ
ス用溶液。先に説明したように、その間は反応を普通のマルチウエルトレイ14
上で行わせるのが望ましいところの適切な中間ステップのどれについても、スラ
イドを自動化マルチウエルトレイから取り外すことができる。
ンプが幾つかの異なった試薬を制御するか、もしくは、その代わりに複数のポン
プを全て中央プロセッシングユニットで制御して使用し得るように、ポンプに取
り付けた配管の色々な部品上のバルブを開閉することができる。このセットアッ
プで、スライドおよびのせられた生物試料を持つスライドホルダーをマルチウエ
ルトレイ上に置くことができ、中央プロセッシングユニットを作動させ得て所望
の液体および試薬を反応チャンバーに注入して、液体を再循環させるかまたは液
体を直接に廃棄する。人がスライドを一つのトレイからもう一つのトレイに移す
必要なしに、異なった試薬を反応チャンバーに順次注入することができる。例え
ば、生物試料を持つスライドを自動化マルチウエルトレイ上に置くことができ、
そしてシステムが以下の試薬を注入することができる: キシレン、100%エ
タノール、90%エタノール、過酸化水素、2次抗体、検出試薬(ABC)、ジア
ミノベンジジン、ヘマトキシリン、各ステップ間のPBS洗浄溶液、および、更
に90%エタノール、100%エタノールおよびキシレン、ならびにカバーグラ
ス用溶液。先に説明したように、その間は反応を普通のマルチウエルトレイ14
上で行わせるのが望ましいところの適切な中間ステップのどれについても、スラ
イドを自動化マルチウエルトレイから取り外すことができる。
【0078】 もう一つの例として、のせられた組織切片を持つスライドを脱パラフィンして
別個に処理し、そしてそれから、予め乾燥した試薬を有するマルチウエルトレイ
上に置き、そしてそれから、自動化プロセッシング装置に取り付けることができ
るが、その装置は、例えば、2次抗体、検出試薬(ABC)、ジアミノベンジジン
およびヘマトキシリン、ならびに、各々のステップ間のPBS洗浄緩衝液、ひき
続いて90%エタノール、100%エタノール、キシレンおよびカバーグラス溶
液のような望ましい試薬を注入するであろう。
別個に処理し、そしてそれから、予め乾燥した試薬を有するマルチウエルトレイ
上に置き、そしてそれから、自動化プロセッシング装置に取り付けることができ
るが、その装置は、例えば、2次抗体、検出試薬(ABC)、ジアミノベンジジン
およびヘマトキシリン、ならびに、各々のステップ間のPBS洗浄緩衝液、ひき
続いて90%エタノール、100%エタノール、キシレンおよびカバーグラス溶
液のような望ましい試薬を注入するであろう。
【0079】 自動化マルチウエルトレイの使用は幾つかの利点を有する。それは数個のステ
ップを、各ステップにおいて手動労力を必要としないで、連続して行うことを可
能にする。それはまたより安全であるが、その理由は、例えば発がん物質である
キシレンやジアミノベンジジンのような幾らかの危険な化学薬品を容器から直接
に反応チャンバーに注入したり、そこから廃液容器中にもしくは別の容器に注入
し得るが、その別の容器からは、人がこれらの試薬をウェルにピペッティングし
たりこれらの発がん物質をのせたトレイを取り扱う必要なしに、試薬を再使用す
ることができるからである。スライドにのせられた生物試料の上部に単に試薬を
滴下する従来の技術方法を用いるそんな試薬のリサイクリングは実用的でない。
それ故に、自動化マルチウエルトレイは有害な化学薬品への露出を減少し、有害
な化学薬品を廃棄することを容易にし、そしてまた、再使用してリサイクルし得
るので、そのような化学薬品の使用を減少させる。
ップを、各ステップにおいて手動労力を必要としないで、連続して行うことを可
能にする。それはまたより安全であるが、その理由は、例えば発がん物質である
キシレンやジアミノベンジジンのような幾らかの危険な化学薬品を容器から直接
に反応チャンバーに注入したり、そこから廃液容器中にもしくは別の容器に注入
し得るが、その別の容器からは、人がこれらの試薬をウェルにピペッティングし
たりこれらの発がん物質をのせたトレイを取り扱う必要なしに、試薬を再使用す
ることができるからである。スライドにのせられた生物試料の上部に単に試薬を
滴下する従来の技術方法を用いるそんな試薬のリサイクリングは実用的でない。
それ故に、自動化マルチウエルトレイは有害な化学薬品への露出を減少し、有害
な化学薬品を廃棄することを容易にし、そしてまた、再使用してリサイクルし得
るので、そのような化学薬品の使用を減少させる。
【0080】 中央プロセッシングユニット286はまた加熱ブロック288の加熱および冷
却を制御して、in situ PCRを自動で実施しもしくはin situ
ハイブリダイゼーションに用いられるプローブを変性させることができる。所望
によりビオチンもしくはジゴキシゲニンを含むPCR試薬およびプライマーセッ
トは、トレイ330のウェルの上で被膜させたり乾燥させたりし得る。試料22
0を持つスライド70をトレイ330の上に置いて、そして水もしくは緩衝液を
加える。加熱ブロック288は、スライド70(図5Bに示すように)もしくはト
レイ330を背にして置いてもよく、またはスライドプラストレイの両面に接触
させるようにデザインしたものでもよく、そして中央プロセッシングユニット2
86によって制御させることができる。各々のウェル410から2つの結果を得
ることができる。第一に、ウェル410からの液体を取り出してゲル298上で
アッセイしてDNAのバンドが見られるかどうか決定することができる。そのよ
うなどのバンドのサイズもまたゲル298上で測定することができる。これは、
PCRがうまく作動しているかどうかを見るためのコントロールとしての役割を
果たす。このことが可能であるのは、増幅されたDNAの大部分は試料の細胞中
に残らないでウェル中の液体に漏れ出すからである。第二に、わずかなDNAは
試料の細胞中に残り、そしてこれは当業者によく知られた方法によりビオチンも
しくはジゴキシゲニンを検出することによって観察し得る。かくして、in s
itu PCRは、どの細胞がアッセイにより検出されるかを示す。
却を制御して、in situ PCRを自動で実施しもしくはin situ
ハイブリダイゼーションに用いられるプローブを変性させることができる。所望
によりビオチンもしくはジゴキシゲニンを含むPCR試薬およびプライマーセッ
トは、トレイ330のウェルの上で被膜させたり乾燥させたりし得る。試料22
0を持つスライド70をトレイ330の上に置いて、そして水もしくは緩衝液を
加える。加熱ブロック288は、スライド70(図5Bに示すように)もしくはト
レイ330を背にして置いてもよく、またはスライドプラストレイの両面に接触
させるようにデザインしたものでもよく、そして中央プロセッシングユニット2
86によって制御させることができる。各々のウェル410から2つの結果を得
ることができる。第一に、ウェル410からの液体を取り出してゲル298上で
アッセイしてDNAのバンドが見られるかどうか決定することができる。そのよ
うなどのバンドのサイズもまたゲル298上で測定することができる。これは、
PCRがうまく作動しているかどうかを見るためのコントロールとしての役割を
果たす。このことが可能であるのは、増幅されたDNAの大部分は試料の細胞中
に残らないでウェル中の液体に漏れ出すからである。第二に、わずかなDNAは
試料の細胞中に残り、そしてこれは当業者によく知られた方法によりビオチンも
しくはジゴキシゲニンを検出することによって観察し得る。かくして、in s
itu PCRは、どの細胞がアッセイにより検出されるかを示す。
【0081】 本発明はまた新規な修飾法を用い、それは、組織試料の後処理を続ける前に、
反応液体を回収しそしてこの液体をアッセイしてPCRが適切に作動しているか
もしくは汚染されているかどうかを決定することを可能にする。このアッセイは
非常に迅速そして簡単であり、例えば、単に反応液体をアガロースゲル上で展開
しそして特定のバンドサイズを探索する。PCRが適切に作動したことを決定し
た場合には、組織試料の後処理を続ける価値がある。然しながら、もしPCRが
失敗したことを決定されたならば、その特定の試料でもって続ける労力と費用に
値しないことを知ることになる。
反応液体を回収しそしてこの液体をアッセイしてPCRが適切に作動しているか
もしくは汚染されているかどうかを決定することを可能にする。このアッセイは
非常に迅速そして簡単であり、例えば、単に反応液体をアガロースゲル上で展開
しそして特定のバンドサイズを探索する。PCRが適切に作動したことを決定し
た場合には、組織試料の後処理を続ける価値がある。然しながら、もしPCRが
失敗したことを決定されたならば、その特定の試料でもって続ける労力と費用に
値しないことを知ることになる。
【0082】 反応液体をアッセイする上述の能力は、その特定の試料の後処理を続ける価値
があるかどうかを決定するのに有用であるだけでなく、その能力はまた、組織内
におけるin situハイブリダイゼーションの結果のみを見ることから得ら
れないデータを与える。in situハイブリダイゼーションを実施するとき
に、残りが溶液中で完了する間に、アンプリコンの多少の部分が増幅された所で
残存する。溶液中のこの部分をアッセイすることにより、核酸の相対的な量を測
定し得るだけでなく、増幅された核酸のサイズもまた測定することができる。単
に組織試料を見るときには、生成されたサイズ生成物を測定し得ず、単に多少の
核酸が増幅されたことを知り、そしてまた,どの細胞が核酸を発現していたかを
知ることになる。これら二つのセットのデータは相補的である。本発明は両方が
相補的であるデータと共に両方のセットの結果を見ることを可能にすることは明
らかである。単一のポリメラーゼ連鎖反応から両方のタイプのデータを得ること
を可能にするところの装置は現在まで入手可能ではない。
があるかどうかを決定するのに有用であるだけでなく、その能力はまた、組織内
におけるin situハイブリダイゼーションの結果のみを見ることから得ら
れないデータを与える。in situハイブリダイゼーションを実施するとき
に、残りが溶液中で完了する間に、アンプリコンの多少の部分が増幅された所で
残存する。溶液中のこの部分をアッセイすることにより、核酸の相対的な量を測
定し得るだけでなく、増幅された核酸のサイズもまた測定することができる。単
に組織試料を見るときには、生成されたサイズ生成物を測定し得ず、単に多少の
核酸が増幅されたことを知り、そしてまた,どの細胞が核酸を発現していたかを
知ることになる。これら二つのセットのデータは相補的である。本発明は両方が
相補的であるデータと共に両方のセットの結果を見ることを可能にすることは明
らかである。単一のポリメラーゼ連鎖反応から両方のタイプのデータを得ること
を可能にするところの装置は現在まで入手可能ではない。
【0083】 この発明の更なる態様は、反応チャンバー280の容量が調節可能であること
である。好ましくは中央プロセッシングユニット286は、フレキシブルもしく
は可動性のどちらかである反応チャンバーの底282に対して押しているところ
のピストン284を制御する。この動きは反応チャンバー280中のスペースの
容量を調節する。例えば、in situ PCRを実施するとき、反応容量を
非常に少量に、例えば10〜50μLに保つことが望ましい。PCR反応後には
、反応液体を反応チャンバーからくみ出すことが望まれるであろう。然しながら
、そのような小容量の液体はスライド70と反応チャンバーの底282との間に
毛管作用により保持されるであろう。より多くの液体を含むように反応チャンバ
ーを拡大させることにより、望ましいポンピングを達成することが容易になる。
当業者は、種々の手段を用いて反応チャンバー280の容量を調節できることを
認識している。中央プロセッシングユニットにより制御されるピストンを用いる
必要はない。例えば、ねじ用具を反応チャンバーの底の背に置いてもよく、その
ねじ用具を回すことによりねじ用具はトレイの底を反対方向に押して反応チャン
バーの底を顕微鏡のスライドの方に押すことで、反応チャンバー280の容量を
減少させるであろう。このプロセスの逆転は容量を再び拡大する。
である。好ましくは中央プロセッシングユニット286は、フレキシブルもしく
は可動性のどちらかである反応チャンバーの底282に対して押しているところ
のピストン284を制御する。この動きは反応チャンバー280中のスペースの
容量を調節する。例えば、in situ PCRを実施するとき、反応容量を
非常に少量に、例えば10〜50μLに保つことが望ましい。PCR反応後には
、反応液体を反応チャンバーからくみ出すことが望まれるであろう。然しながら
、そのような小容量の液体はスライド70と反応チャンバーの底282との間に
毛管作用により保持されるであろう。より多くの液体を含むように反応チャンバ
ーを拡大させることにより、望ましいポンピングを達成することが容易になる。
当業者は、種々の手段を用いて反応チャンバー280の容量を調節できることを
認識している。中央プロセッシングユニットにより制御されるピストンを用いる
必要はない。例えば、ねじ用具を反応チャンバーの底の背に置いてもよく、その
ねじ用具を回すことによりねじ用具はトレイの底を反対方向に押して反応チャン
バーの底を顕微鏡のスライドの方に押すことで、反応チャンバー280の容量を
減少させるであろう。このプロセスの逆転は容量を再び拡大する。
【0084】実施例8 全染色体画法 染色体は、全染色体画法として知られる技法により転座のような著しい異常を
検査することができる。この方法は、染色体に結合して効果的に全染色体を「ラ
イトアップする」ところの数多くの蛍光的に標識したプローブを用いる。各染色
体に対して特異的なプローブのセットを用いてどんな所望の染色体も研究できる
。人間は全体で24の核染色体を有し、これらは染色体1−22、XおよびYで
ある。一度に多数の染色体を描くことは一般的である。異なった色の蛍光プロー
ブを用いることにより染色体は容易に識別される。例えば、染色体1,2および
3は、一つの染色体に対してオレンジ色に蛍光発光するプローブを、第二の染色
体に対して緑色に蛍光発光するプローブを、そして第三の染色体に対して赤色に
蛍光発光するプローブを用いることにより同時に着色させることができる。その
ようなシステムを用いると、一つの試験が典型的には8スライドの細胞を用いて
人間の完全核ゲノムを検査するであろう。この試験は、トレイの8ウェルの上に
8スライドを置くことを含むであろう。アッセイされるべき組織の一例は血液も
しくは骨髄スミアである。プローブは、所望により、ウェル中で予め乾燥するこ
とができる。
検査することができる。この方法は、染色体に結合して効果的に全染色体を「ラ
イトアップする」ところの数多くの蛍光的に標識したプローブを用いる。各染色
体に対して特異的なプローブのセットを用いてどんな所望の染色体も研究できる
。人間は全体で24の核染色体を有し、これらは染色体1−22、XおよびYで
ある。一度に多数の染色体を描くことは一般的である。異なった色の蛍光プロー
ブを用いることにより染色体は容易に識別される。例えば、染色体1,2および
3は、一つの染色体に対してオレンジ色に蛍光発光するプローブを、第二の染色
体に対して緑色に蛍光発光するプローブを、そして第三の染色体に対して赤色に
蛍光発光するプローブを用いることにより同時に着色させることができる。その
ようなシステムを用いると、一つの試験が典型的には8スライドの細胞を用いて
人間の完全核ゲノムを検査するであろう。この試験は、トレイの8ウェルの上に
8スライドを置くことを含むであろう。アッセイされるべき組織の一例は血液も
しくは骨髄スミアである。プローブは、所望により、ウェル中で予め乾燥するこ
とができる。
【0085】 単一のスライド70上で全ての24染色体の分析を可能にするようにデザイン
されたチップもしくはトレイ400をここで提示する。このトレイ400は顕微
鏡スライド70にパチンと止めるか他の方法で取り付けることができるものであ
る。このチップもしくはトレイ400は、各ウェル410が隣接するウェル41
0から隙間もしくは溝420により分離された8つのウェル410を含む。その
ようなトレイ400は図6Aに図示されている。トレイ400中の各ウェル41
0は、それを通して試薬をウェル410に添加できる狭い開口部430を有して
いる。
されたチップもしくはトレイ400をここで提示する。このトレイ400は顕微
鏡スライド70にパチンと止めるか他の方法で取り付けることができるものであ
る。このチップもしくはトレイ400は、各ウェル410が隣接するウェル41
0から隙間もしくは溝420により分離された8つのウェル410を含む。その
ようなトレイ400は図6Aに図示されている。トレイ400中の各ウェル41
0は、それを通して試薬をウェル410に添加できる狭い開口部430を有して
いる。
【0086】 実用的には、検査すべき細胞は顕微鏡スライド70の端から端まで滴下される
かもしくは広げられる。それからスライド70は、細胞がトレイ400のウェル
410に面するようにトレイ400に取り付けられる。それから試薬は、トレイ
中で各ウェル410への開口部430を通じて個別にウェル410ヘ加えられる
。試薬は毛管作用によりウェル410およびスライド70の間に広がるであろう
。種々の染色体に特異的な異なる試薬が各ウェル410に加えられる。ウェル4
10の間の隙間もしくは溝420は、試薬が一つのウェル410から隣接するウ
ェル410に広がるのを防ぎ、それにより相互汚染を防止する。ウェル410は
予め決められた量、例えば各々10〜20μLの液体を保持し、そして毛管作用
が、過剰のオーバーフロウを引き起こすことなくウェル410を満たすのに十分
なだけの緩衝液が加えられることを可能にする。これは相互汚染の防止を手助け
する。三つの異なる染色体を、例えば、オレンジ色、緑色および赤色の蛍光プロ
ーブを用いて、各ウェル410中でアッセイさせることができ、それにより単一
のスライド70上で全て24の人間の染色体アッセイすることを可能にする。
かもしくは広げられる。それからスライド70は、細胞がトレイ400のウェル
410に面するようにトレイ400に取り付けられる。それから試薬は、トレイ
中で各ウェル410への開口部430を通じて個別にウェル410ヘ加えられる
。試薬は毛管作用によりウェル410およびスライド70の間に広がるであろう
。種々の染色体に特異的な異なる試薬が各ウェル410に加えられる。ウェル4
10の間の隙間もしくは溝420は、試薬が一つのウェル410から隣接するウ
ェル410に広がるのを防ぎ、それにより相互汚染を防止する。ウェル410は
予め決められた量、例えば各々10〜20μLの液体を保持し、そして毛管作用
が、過剰のオーバーフロウを引き起こすことなくウェル410を満たすのに十分
なだけの緩衝液が加えられることを可能にする。これは相互汚染の防止を手助け
する。三つの異なる染色体を、例えば、オレンジ色、緑色および赤色の蛍光プロ
ーブを用いて、各ウェル410中でアッセイさせることができ、それにより単一
のスライド70上で全て24の人間の染色体アッセイすることを可能にする。
【0087】 好ましい実施態様において、各ウェル410中に三つの異なる染色体に対する
プローブを持つトレイ400の8つのウェル410上でプローブが予め乾燥され
る。所望であれば、塩類のような他の試薬もまた各ウェル410の中で予め乾燥
し得る。分裂中期もしくは中間期の細胞はスライド70の端から端までに固定さ
れ、そしてスライド70はトレイ400と接触して置かれる。それから緩衝液を
開口部430から各ウェル410に加える。この方法では、異なる試薬を各ウェ
ル410の中にピペッティングする必要はなく、むしろ同じ緩衝液が全てのウェ
ル410に加えられ、そのために間違った試薬(人的エラー)をウェル410の中
にピペッティングする可能性を防止する。予め乾燥したプローブと塩類は緩衝液
をウェル410に添加すると溶解し、そしてハイブリダイゼーションを起こさせ
る。典型的な培養は、プローブを変性するために70〜90℃で1〜2分間であ
ってもよく同様に細胞のDNAは引き続いて37〜45℃で約2時間の培養でよ
いが、どこについての培養でも30分から終夜で実施するのが一般的である。ハ
イブリダイゼーション緩衝液は、技術上一般的に使用される幾つかの緩衝システ
ムでもって望みどおりに選択され得る。例えば2XSSCが一般的に用いられる
。フォルムアミドが時には緩衝液に加えられる。好ましい実施態様において、培
養後にトレイ400をブロッティング材料、例えばペーパータオル、の上に置い
てもよく、そしてウェル410中の反応液体は毛管作用により物理的にウェル4
10から除去されて、ブロッティング材料がハイブリダイゼーション液体を吸い
取る。これは、スライド70をトレイ400から分離するときに、ウェル410
の間における交差汚染を防止する。
プローブを持つトレイ400の8つのウェル410上でプローブが予め乾燥され
る。所望であれば、塩類のような他の試薬もまた各ウェル410の中で予め乾燥
し得る。分裂中期もしくは中間期の細胞はスライド70の端から端までに固定さ
れ、そしてスライド70はトレイ400と接触して置かれる。それから緩衝液を
開口部430から各ウェル410に加える。この方法では、異なる試薬を各ウェ
ル410の中にピペッティングする必要はなく、むしろ同じ緩衝液が全てのウェ
ル410に加えられ、そのために間違った試薬(人的エラー)をウェル410の中
にピペッティングする可能性を防止する。予め乾燥したプローブと塩類は緩衝液
をウェル410に添加すると溶解し、そしてハイブリダイゼーションを起こさせ
る。典型的な培養は、プローブを変性するために70〜90℃で1〜2分間であ
ってもよく同様に細胞のDNAは引き続いて37〜45℃で約2時間の培養でよ
いが、どこについての培養でも30分から終夜で実施するのが一般的である。ハ
イブリダイゼーション緩衝液は、技術上一般的に使用される幾つかの緩衝システ
ムでもって望みどおりに選択され得る。例えば2XSSCが一般的に用いられる
。フォルムアミドが時には緩衝液に加えられる。好ましい実施態様において、培
養後にトレイ400をブロッティング材料、例えばペーパータオル、の上に置い
てもよく、そしてウェル410中の反応液体は毛管作用により物理的にウェル4
10から除去されて、ブロッティング材料がハイブリダイゼーション液体を吸い
取る。これは、スライド70をトレイ400から分離するときに、ウェル410
の間における交差汚染を防止する。
【0088】 更に好ましい実施態様において、スライド70はポジティブおよびネガティブ
コントロールを区画440中に含み、それらは8つのウェル410の各々の中に
おいてハイブリダイゼーション液体と接触するところのものである。最近全くポ
プラーになっているミクロアレイ技術を用いて、染色体を描くために用いられる
プローブに相補的であるところの核酸が、好ましくはスライド70の上に細胞を
置く前に、被膜されてスライド70の上で固定化される。これは工業的条件下に
最善に実施され、そしてコントロールを組込んでスライド70を販売することが
できる。24のコントロール442は、ハイブリダイゼーション緩衝液と接触す
べきである全て8つの区画において各スライド70の上に置かれることが好まし
い。アレイの一例が図6Eに示されていて、そこでは24全ての核酸が、8つの
ウェル410の各々に接触するであろう各区画440の縁の周りに配置されてい
る。もし例えば、最初の区画440が染色体1,2および3に対するプローブを
含むウェル410と接触するであろうものであるならば、これらの染色体に対す
るコントロール核酸は着色後にライトアップ(各々が単一の色を示して)する筈で
あるが、一方において残りの21のコントロールはハイブリダイズしないでそし
て蛍光発光もしないはずである。このようにして、8つのウェル410の各々に
対して両方のポジティブおよびネガティブコントロールがある。
コントロールを区画440中に含み、それらは8つのウェル410の各々の中に
おいてハイブリダイゼーション液体と接触するところのものである。最近全くポ
プラーになっているミクロアレイ技術を用いて、染色体を描くために用いられる
プローブに相補的であるところの核酸が、好ましくはスライド70の上に細胞を
置く前に、被膜されてスライド70の上で固定化される。これは工業的条件下に
最善に実施され、そしてコントロールを組込んでスライド70を販売することが
できる。24のコントロール442は、ハイブリダイゼーション緩衝液と接触す
べきである全て8つの区画において各スライド70の上に置かれることが好まし
い。アレイの一例が図6Eに示されていて、そこでは24全ての核酸が、8つの
ウェル410の各々に接触するであろう各区画440の縁の周りに配置されてい
る。もし例えば、最初の区画440が染色体1,2および3に対するプローブを
含むウェル410と接触するであろうものであるならば、これらの染色体に対す
るコントロール核酸は着色後にライトアップ(各々が単一の色を示して)する筈で
あるが、一方において残りの21のコントロールはハイブリダイズしないでそし
て蛍光発光もしないはずである。このようにして、8つのウェル410の各々に
対して両方のポジティブおよびネガティブコントロールがある。
【0089】 当業者は、他の同様にデザインされたトレイが利用され得ることを認識してい
る。8つのウェルトレイのためである必要はない。例えば、もし4つの異なって
発色する蛍光プローブが用いられるならば、同じ結果が6つのウェルトレイでも
って得られ得るであろう。更に、この発明は人の染色体の分析に限定されるもの
ではない。他の生物からの染色体は同様に検査され、そしてトレイ上のウェルの
数は個人的な選択の事項であって、しばしば検査されるべき染色体もしくはプロ
ーブの数により決定される。当業者はまた、多数の細胞試料が一度にアッセイさ
れ得るように単一以上のスライドを保持するようにトレイをデザインできて、多
数のスライドが数個の別々のスライドより容易に一緒に取り扱えることを認識し
ている。
る。8つのウェルトレイのためである必要はない。例えば、もし4つの異なって
発色する蛍光プローブが用いられるならば、同じ結果が6つのウェルトレイでも
って得られ得るであろう。更に、この発明は人の染色体の分析に限定されるもの
ではない。他の生物からの染色体は同様に検査され、そしてトレイ上のウェルの
数は個人的な選択の事項であって、しばしば検査されるべき染色体もしくはプロ
ーブの数により決定される。当業者はまた、多数の細胞試料が一度にアッセイさ
れ得るように単一以上のスライドを保持するようにトレイをデザインできて、多
数のスライドが数個の別々のスライドより容易に一緒に取り扱えることを認識し
ている。
【0090】実施例9 凹形のウェルを有するカバーグラス スライドの上にのせられた生物試料の上に試薬を単に滴下したりもしくは試薬
を満たしたウェルを持つトレイの上にスライドを置く方法を用いるよりむしろ、
スライドもしくは一連の取り付けられたスライドをカバーグラスでカバーするこ
とができるが、そこではこのカバーグラスは凹形であり、それにより一つもしく
はそれ以上のウェルから成っている。これは、6つのスライド上で同時に分析さ
れている試料を示すところの図7A〜Eで図示されている。図7Aは、スライド
ホルダー515中に保持されているところの、のせられた生物試料520を持つ
スライド510を図示している。図7Bは、図7Aのスライド510の真上にフ
ィットすべきところのカバーグラス500を図示している。下記に議論するイン
サート540は、情報を提示し得る書き込み501を含んでもよい。区分502
および503はそれぞれポジティブおよびネガティブコントロールである。コン
トロール502および503は実施されるアッセイの特異的なタイプ次第で、例
えば、タンパク質、核酸もしくは細胞系であってもよい。液体の入り口および空
気の出口となるチャネルは504および505として示されている。ウェル53
0もまた図示されている。カバーグラス500はまた、図7Bに506として示
すバーコードでラベルされてもよくもしくはそれらの上に文字を書かせてもよい
。
を満たしたウェルを持つトレイの上にスライドを置く方法を用いるよりむしろ、
スライドもしくは一連の取り付けられたスライドをカバーグラスでカバーするこ
とができるが、そこではこのカバーグラスは凹形であり、それにより一つもしく
はそれ以上のウェルから成っている。これは、6つのスライド上で同時に分析さ
れている試料を示すところの図7A〜Eで図示されている。図7Aは、スライド
ホルダー515中に保持されているところの、のせられた生物試料520を持つ
スライド510を図示している。図7Bは、図7Aのスライド510の真上にフ
ィットすべきところのカバーグラス500を図示している。下記に議論するイン
サート540は、情報を提示し得る書き込み501を含んでもよい。区分502
および503はそれぞれポジティブおよびネガティブコントロールである。コン
トロール502および503は実施されるアッセイの特異的なタイプ次第で、例
えば、タンパク質、核酸もしくは細胞系であってもよい。液体の入り口および空
気の出口となるチャネルは504および505として示されている。ウェル53
0もまた図示されている。カバーグラス500はまた、図7Bに506として示
すバーコードでラベルされてもよくもしくはそれらの上に文字を書かせてもよい
。
【0091】 図7Cはスライド510上に置かれたカバーグラス500を示す。カバーグラ
ス500は、のせられた生物試料520持つスライド510上に置かれ、そして
カバーグラス500の上部の部分においてスライド510に付けられている。ス
ライド510およびカバーグラス500はそれから水、緩衝液もしくは試薬の中
に浸漬される。毛管作用が液体をカバーグラス500のウェル530の中に押し
上げるであろう。表面張力はカバーグラス500をしっかりとスライド510に
保持するであろう。これは既知の容量および濃度の試薬を持つ密閉されたシステ
ムもたらす。
ス500は、のせられた生物試料520持つスライド510上に置かれ、そして
カバーグラス500の上部の部分においてスライド510に付けられている。ス
ライド510およびカバーグラス500はそれから水、緩衝液もしくは試薬の中
に浸漬される。毛管作用が液体をカバーグラス500のウェル530の中に押し
上げるであろう。表面張力はカバーグラス500をしっかりとスライド510に
保持するであろう。これは既知の容量および濃度の試薬を持つ密閉されたシステ
ムもたらす。
【0092】 図7Dは、反応が起こりカバーグラス500が取り除かれた後の結果を図示し
ている。生物試料520およびポジティブコントロール502が着色されて示さ
れている。
ている。生物試料520およびポジティブコントロール502が着色されて示さ
れている。
【0093】 発明の好ましい態様において、カバーグラス500はその上に予め乾燥された
試薬もしくは試薬類を有している。予め乾燥された試薬を持つカバーグラス50
0が生物試料520を持つスライド510顕微鏡の上に置かれるときに、スライ
ド510およびカバーグラス500が水もしくは緩衝液にちょっと浸漬され、そ
れにより液体がカバーグラス500のウェル530を満たしそして乾燥された試
薬を溶かすようになる。スライド510およびカバーグラス500をそれから水
もしくは緩衝液から取り出し、そして反応を進行させる。既知量の試薬もしくは
試薬類が予め乾燥され、それによりウェル530内において正確に既知量の試薬
類および生物試料520の接触をもたらす。ウェル530の容量がまた既知であ
り、それにより既知の濃度の試薬をもたらす。
試薬もしくは試薬類を有している。予め乾燥された試薬を持つカバーグラス50
0が生物試料520を持つスライド510顕微鏡の上に置かれるときに、スライ
ド510およびカバーグラス500が水もしくは緩衝液にちょっと浸漬され、そ
れにより液体がカバーグラス500のウェル530を満たしそして乾燥された試
薬を溶かすようになる。スライド510およびカバーグラス500をそれから水
もしくは緩衝液から取り出し、そして反応を進行させる。既知量の試薬もしくは
試薬類が予め乾燥され、それによりウェル530内において正確に既知量の試薬
類および生物試料520の接触をもたらす。ウェル530の容量がまた既知であ
り、それにより既知の濃度の試薬をもたらす。
【0094】 発明のもうひとつの好ましい態様において、カバーグラス500は、インサー
ト540、例えばガラスもしくはプラスチック、を有機性および水性の液体の両
方に耐性である接着剤を用いてスライド510に貼り付けることによりスライド
510に取り付けられる。図7E〜Hはこれを、単一のスライドに対する単一の
スライドおよびカバーグラスについて図示している。チャネル504および50
5を持つウェル530を含むカバーグラス500はインサート540の上に置か
れる。図7Fは、ポジティブ502および503ネガティブコントロール、イン
サート540を確認する書き込み501ならびに水溶性接着剤542の区分を含
むインサート540を図示している。カバーグラス500の上部はそのために、
水溶性である接着剤を用いてインサート540に貼り付けられる。コントロール
502および503は、それらがカバーグラス500のウェル530区画内にあ
るように位置している。インサート540の背面は、有機性および水性の液体の
両方に耐性である接着剤のような手段によりスライド510に対して置かれそし
て付けられている。スライド510プラスカバーグラス500は緩衝液中に浸漬
してから取り出して、そして反応を進行させる。それからスライド510プラス
カバーグラス500は、試薬もしくは洗浄液のタンクの中に置くことによりプロ
セッシングすることができる。水溶液が水溶性接着剤を溶解することによりカバ
ーグラス500を放すがインサート540を放さない。カバーグラス500はこ
の時点で容易に取り除かれる。インサート540はスライド510上にコントロ
ールおよびラベルとして残る。
ト540、例えばガラスもしくはプラスチック、を有機性および水性の液体の両
方に耐性である接着剤を用いてスライド510に貼り付けることによりスライド
510に取り付けられる。図7E〜Hはこれを、単一のスライドに対する単一の
スライドおよびカバーグラスについて図示している。チャネル504および50
5を持つウェル530を含むカバーグラス500はインサート540の上に置か
れる。図7Fは、ポジティブ502および503ネガティブコントロール、イン
サート540を確認する書き込み501ならびに水溶性接着剤542の区分を含
むインサート540を図示している。カバーグラス500の上部はそのために、
水溶性である接着剤を用いてインサート540に貼り付けられる。コントロール
502および503は、それらがカバーグラス500のウェル530区画内にあ
るように位置している。インサート540の背面は、有機性および水性の液体の
両方に耐性である接着剤のような手段によりスライド510に対して置かれそし
て付けられている。スライド510プラスカバーグラス500は緩衝液中に浸漬
してから取り出して、そして反応を進行させる。それからスライド510プラス
カバーグラス500は、試薬もしくは洗浄液のタンクの中に置くことによりプロ
セッシングすることができる。水溶液が水溶性接着剤を溶解することによりカバ
ーグラス500を放すがインサート540を放さない。カバーグラス500はこ
の時点で容易に取り除かれる。インサート540はスライド510上にコントロ
ールおよびラベルとして残る。
【0095】 発明の更にひとつの好ましい態様において、スライド510は、それらに付け
られたコントロール試料502および503を有する。コントロール502およ
び503は、スライド510の上にかスライド510に貼り付けられた紙もしく
はスタンプの切片上のどちらかにスポットしてもよく、またはインサート540
上にスポットしてもよい。ポジティブコントロール、ネガティブコントロール、
もしくは両方(別々のスポットとして付けられた)でもよいこれらのコントロール
試料は、反応が適切に作動していることを決定するために使用される。もしもコ
ントロール502および503がインサート540に付けられているならば、そ
れらは、コントロール試料502および503が緩衝液および試薬と接触するよ
うに、接着剤によりカバーされないであろうようなそしてカバーグラス500の
ウェル530と重なるような点で付けられる。
られたコントロール試料502および503を有する。コントロール502およ
び503は、スライド510の上にかスライド510に貼り付けられた紙もしく
はスタンプの切片上のどちらかにスポットしてもよく、またはインサート540
上にスポットしてもよい。ポジティブコントロール、ネガティブコントロール、
もしくは両方(別々のスポットとして付けられた)でもよいこれらのコントロール
試料は、反応が適切に作動していることを決定するために使用される。もしもコ
ントロール502および503がインサート540に付けられているならば、そ
れらは、コントロール試料502および503が緩衝液および試薬と接触するよ
うに、接着剤によりカバーされないであろうようなそしてカバーグラス500の
ウェル530と重なるような点で付けられる。
【0096】 インサート540はコントロール502および503と共に予め作成し必要な
ときに使用することができる。インサート540は更に、コントロール502お
よび503の名称およびポジティブもしくはネガティブかどうかを示す書き込み
を含んでもよい。
ときに使用することができる。インサート540は更に、コントロール502お
よび503の名称およびポジティブもしくはネガティブかどうかを示す書き込み
を含んでもよい。
【0097】 カバーグラス500はまたラベルを貼られてもよくそして容易なもしくは自動
的な読み取りのためのバーコード560を含んでもよい。予め乾燥した試薬を持
つカバーグラス500は容易に保管されそしていつでも使用されて、それらの使
用を非常に便利にしている。予め乾燥した試薬を持つカバーグラス500の使用
は、小量で、正確な量の試薬のピペッティングは分析時点では必要でなくて、そ
のために生物試料のより迅速な分析を可能にすることを更に意味する。
的な読み取りのためのバーコード560を含んでもよい。予め乾燥した試薬を持
つカバーグラス500は容易に保管されそしていつでも使用されて、それらの使
用を非常に便利にしている。予め乾燥した試薬を持つカバーグラス500の使用
は、小量で、正確な量の試薬のピペッティングは分析時点では必要でなくて、そ
のために生物試料のより迅速な分析を可能にすることを更に意味する。
【0098】実施例10 スライド上で生物試料をプロセッシングする自動化法 実施例9のものと同様な方法は、図5A〜Bに図示されているような反応チャ
ンバーを用いるようにして自動化することができる。一つの相違は、自動化操作
で用いるべきカバーグラスはウェルを含む必要がなくて平坦であり得ることであ
る。図8A〜Dはこの方法を図示している。生物試料610を持つスライド60
0はスライドホールダー620の中に置かれる。カバーグラス630は書かれた
情報を含み得る区分640を含む。コントロール試料650および660はカバ
ーグラス630上に含まれ得る。カバーグラス630はまた、バーコード670
を含み得るかもしくはその上に書かれた文字を含み得る。生物試料610を持つ
スライド600は、有機試薬とプロセッシングして試料610を脱パラフィン化
するための反応チャンバーに、例えば図5A〜Bに示すように、置かれる。好ま
しい実施態様において、幾つかのスライド600が単一のスライドホールダー6
20の中に図8Aに示すように置かれる。試料610を脱パラフィン化して洗浄
後、試薬を反応チャンバーに加えることができる。好ましい実施態様において、
カバーグラス630はスライド600と一緒に反応チャンバーの中に置かれる。
これは図8Cに図示されていて、この図は、反応チャンバーは図示されていない
が、カバーグラス630およびスライド600を持つライドホールダー620の
両方を示している。好ましくはカバーグラス630は、その上で予め乾燥された
試薬を、好ましくは区画680中に、有する。水もしくは緩衝液の添加はこの試
薬を溶解し、これがそれから生物試料610ならびにコントロール試料650お
よび660と反応する。反応後、洗浄液を反応チャンバーに通すことができる。
洗浄が完了すると、カバーグラス630をスライド600に対して押し付け得る
が、これらは一緒に反応チャンバーから取り除かれて一緒に保存される、すなわ
ち、カバーグラス630は、実施例9におけるカバーグラス500と異なり、恒
久的なカバーグラスとしての役割をする。図8Dは、生物試料610およびポジ
ティブであるポジティブコントロール650を持つスライド600の上にのせら
れたカバーグラス630を示している。
ンバーを用いるようにして自動化することができる。一つの相違は、自動化操作
で用いるべきカバーグラスはウェルを含む必要がなくて平坦であり得ることであ
る。図8A〜Dはこの方法を図示している。生物試料610を持つスライド60
0はスライドホールダー620の中に置かれる。カバーグラス630は書かれた
情報を含み得る区分640を含む。コントロール試料650および660はカバ
ーグラス630上に含まれ得る。カバーグラス630はまた、バーコード670
を含み得るかもしくはその上に書かれた文字を含み得る。生物試料610を持つ
スライド600は、有機試薬とプロセッシングして試料610を脱パラフィン化
するための反応チャンバーに、例えば図5A〜Bに示すように、置かれる。好ま
しい実施態様において、幾つかのスライド600が単一のスライドホールダー6
20の中に図8Aに示すように置かれる。試料610を脱パラフィン化して洗浄
後、試薬を反応チャンバーに加えることができる。好ましい実施態様において、
カバーグラス630はスライド600と一緒に反応チャンバーの中に置かれる。
これは図8Cに図示されていて、この図は、反応チャンバーは図示されていない
が、カバーグラス630およびスライド600を持つライドホールダー620の
両方を示している。好ましくはカバーグラス630は、その上で予め乾燥された
試薬を、好ましくは区画680中に、有する。水もしくは緩衝液の添加はこの試
薬を溶解し、これがそれから生物試料610ならびにコントロール試料650お
よび660と反応する。反応後、洗浄液を反応チャンバーに通すことができる。
洗浄が完了すると、カバーグラス630をスライド600に対して押し付け得る
が、これらは一緒に反応チャンバーから取り除かれて一緒に保存される、すなわ
ち、カバーグラス630は、実施例9におけるカバーグラス500と異なり、恒
久的なカバーグラスとしての役割をする。図8Dは、生物試料610およびポジ
ティブであるポジティブコントロール650を持つスライド600の上にのせら
れたカバーグラス630を示している。
【0099】 カバーグラス630の上で既知量の試薬を予め乾燥する好ましい方法は臨床検
査室において非常に迅速で容易な使用を可能にする。試薬を量ったりピペッティ
ングする必要は無い。代わりに、カバーグラス630を生物試料610を持つス
ライド600と共に反応チャンバーの中に単に落として反応を進行させる。更に
、カバーグラス630は、その上に予めスポットされたポジティブおよびネガテ
ィブコントロールを含むことができて、それにより反応が適切に作動しているか
どうかについて簡単な分析を可能にする。 ***
査室において非常に迅速で容易な使用を可能にする。試薬を量ったりピペッティ
ングする必要は無い。代わりに、カバーグラス630を生物試料610を持つス
ライド600と共に反応チャンバーの中に単に落として反応を進行させる。更に
、カバーグラス630は、その上に予めスポットされたポジティブおよびネガテ
ィブコントロールを含むことができて、それにより反応が適切に作動しているか
どうかについて簡単な分析を可能にする。 ***
【0100】 上記の方法の使用は、パネル全体のマーカーの結果を15〜30分という短時
間で得ることを可能にする。かくして、患者が未だ手術室にいる間に結果を得る
ことができる。病理学者および外科医は、更に手術を行うべきかまたは化学療法
もしくは放射線治療が必要かどうかについて直ちに決定することができる。この
ことで外科医は後日に更に手術を行うことよりむしろ直ぐに手術することが可能
になる。もしこのすばやい発明の方法の代わりに現在販売されている自動化シス
テムを用いるならば、結果を受け取るのにより長時間を取るであろうが、その部
分的な理由は、現在販売されている自動化システムは一人の患者について一回に
アッセイするのではなく、むしろ多くの試料を一度に自動化機器に充てんしそし
てそれらが全て充てんされプロセッシングされる間待つ必要があるためである。
現在販売されている自動化システムは試薬をススライドの上部に滴下しそして生
物試料は必ずしも完全にカバーされないが、一方において、試薬を満たしたウェ
ルの上部に生物試料を置く本方法は全体の試料が試薬と接触することを保証する
。
間で得ることを可能にする。かくして、患者が未だ手術室にいる間に結果を得る
ことができる。病理学者および外科医は、更に手術を行うべきかまたは化学療法
もしくは放射線治療が必要かどうかについて直ちに決定することができる。この
ことで外科医は後日に更に手術を行うことよりむしろ直ぐに手術することが可能
になる。もしこのすばやい発明の方法の代わりに現在販売されている自動化シス
テムを用いるならば、結果を受け取るのにより長時間を取るであろうが、その部
分的な理由は、現在販売されている自動化システムは一人の患者について一回に
アッセイするのではなく、むしろ多くの試料を一度に自動化機器に充てんしそし
てそれらが全て充てんされプロセッシングされる間待つ必要があるためである。
現在販売されている自動化システムは試薬をススライドの上部に滴下しそして生
物試料は必ずしも完全にカバーされないが、一方において、試薬を満たしたウェ
ルの上部に生物試料を置く本方法は全体の試料が試薬と接触することを保証する
。
【0101】 上の実施例は単に例示的なものでありそして本発明により規定される装置を用
いて実施してもよい技法を限定することを意味していない。この発明は、免疫組
織化学、in situハイブリダイゼーション、in situPCR、およ
び蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)に適用可能でるが、そ
れらに限定されるものではない。正確な測定は重大ではなくそして変更してもな
お好結果を与えることは当業者にとって明白であるので、記述した測定もまた例
示的なものでありそして限定的であることを意味していない。当業者は本発明の
ための他の応用に容易に気づくであろう。
いて実施してもよい技法を限定することを意味していない。この発明は、免疫組
織化学、in situハイブリダイゼーション、in situPCR、およ
び蛍光in situハイブリダイゼーション(FISH)に適用可能でるが、そ
れらに限定されるものではない。正確な測定は重大ではなくそして変更してもな
お好結果を与えることは当業者にとって明白であるので、記述した測定もまた例
示的なものでありそして限定的であることを意味していない。当業者は本発明の
ための他の応用に容易に気づくであろう。
【0102】参照文献 Bngati DJ, et al. (1988). J Histotechnology 11 :165-183. Compton J (1991). Nature 350:91-92. Fahy E, et al. (1991). PCR Methods Appl. 1:25-33. Innis MA, et al. (1990). PCR Protocols: A Guide to Methods and Applicati
ons (Academic Press, San Diego). Nuovo GJ (1994). J. Histotechnology 17:235 242. Spargo CA, et al. (1996). Mol. Cell Proves 10:247-256. Walker GT, et al. (1992). Nucl Acids Res. 20: 1691-1696. Wu DY and Wal1ace RB (1989). Genomics 4:560-569. 米国特許第4,683,195号 米国特許第4,683,202号 米国特許第5,270,184号 米国特許第5,409,818号 米国特許第5,455,166号 米国特許第5,958,341号
ons (Academic Press, San Diego). Nuovo GJ (1994). J. Histotechnology 17:235 242. Spargo CA, et al. (1996). Mol. Cell Proves 10:247-256. Walker GT, et al. (1992). Nucl Acids Res. 20: 1691-1696. Wu DY and Wal1ace RB (1989). Genomics 4:560-569. 米国特許第4,683,195号 米国特許第4,683,202号 米国特許第5,270,184号 米国特許第5,409,818号 米国特許第5,455,166号 米国特許第5,958,341号
【図1】 複数のスライド70を有するスライドホルダー1を例示する。
【図2A】 トレイ14の正面立面図である。
【図2B】 図2Aのライン54−54により切断したトレイ14の断面図
である。
である。
【図3】 生物学的試料220とスタンプ230を有するスライド70を例
示する。
示する。
【図4】 ウエル24を例示し、該ウエル内には3種の試薬(250、26
0および270で示される)が乾燥させてあり、該ウエル上には生物学的試料2
20を取り付けたスライド70を置いてある。
0および270で示される)が乾燥させてあり、該ウエル上には生物学的試料2
20を取り付けたスライド70を置いてある。
【図5A】 取り付けた生物学的試料220がウエルまたは反応室280に
置かれているスライド70を示す。
置かれているスライド70を示す。
【図5B】 他の任意の装備に連結している図5Aのトレイおよびスライド
を示す。
を示す。
【図6A】 各ウエル410を有する8ウエルトレイ400を例示する。
【図6B】 図6Aに示した8ウエルトレイ400の側面図である。
【図6C】 図6Aおよび6Bのスライドおよびトレイの正面図である。
【図6D】 8ウエル410の各々に接触しているスライドの8領域440
を示しているスライド70の概略図である。
を示しているスライド70の概略図である。
【図6E】 1つの領域440の拡大図を示して、スライド70上にビルト
インした対照を設計する一つの方法を示す。
インした対照を設計する一つの方法を示す。
【図7A】 凹面ウエルを有するカバースリップと連結しているスライド上
での生物学的試料の処理を例示する。
での生物学的試料の処理を例示する。
【図7B】 凹面ウエルを有するカバースリップと連結しているスライド上
での生物学的試料の処理を例示する。
での生物学的試料の処理を例示する。
【図7C】 凹面ウエルを有するカバースリップと連結しているスライド上
での生物学的試料の処理を例示する。
での生物学的試料の処理を例示する。
【図7D】 凹面ウエルを有するカバースリップと連結しているスライド上
での生物学的試料の処理を例示する。
での生物学的試料の処理を例示する。
【図7E】 凹面ウエルを有するカバースリップと連結しているスライド上
での生物学的試料の処理を例示する。
での生物学的試料の処理を例示する。
【図7F】 凹面ウエルを有するカバースリップと連結しているスライド上
での生物学的試料の処理を例示する。
での生物学的試料の処理を例示する。
【図7G】 凹面ウエルを有するカバースリップと連結しているスライド上
での生物学的試料の処理を例示する。
での生物学的試料の処理を例示する。
【図7H】 凹面ウエルを有するカバースリップと連結しているスライド上
での生物学的試料の処理を例示する。
での生物学的試料の処理を例示する。
【図8A】 カバースリップと連結している顕微鏡スライド上での生物学的
試料の処理を例示する。
試料の処理を例示する。
【図8B】 カバースリップと連結している顕微鏡スライド上での生物学的
試料の処理を例示する。
試料の処理を例示する。
【図8C】 カバースリップと連結している顕微鏡スライド上での生物学的
試料の処理を例示する。
試料の処理を例示する。
【図8D】 カバースリップと連結している顕微鏡スライド上での生物学的
試料の処理を例示する。
試料の処理を例示する。
1:スライドホルダー、5:ハンドル、7:開口部、11:穴、14:トレイ、
15:領域、24:ウエル、38:溝、44:境界、56:スロット、70:ス
ライド、90:溝、220:生物学的試料、230:スタンプ、250:試薬、
260:試薬、270:試薬、280:反応室、281:歯止め、282:反応
室の底部、284:ピストン、286:中央処理ユニット、288:熱サイクラ
ー、290:ポンプ、291:タンク、292:タンク、294:出口、296
:出口、298:ゲル、300:入口、302:入口、330:トレイ、400
:8ウエルトレイ、402:クリップ、410:ウエル、420:溝、430:
チャネル、430:開口部、440:領域、442:核酸。
15:領域、24:ウエル、38:溝、44:境界、56:スロット、70:ス
ライド、90:溝、220:生物学的試料、230:スタンプ、250:試薬、
260:試薬、270:試薬、280:反応室、281:歯止め、282:反応
室の底部、284:ピストン、286:中央処理ユニット、288:熱サイクラ
ー、290:ポンプ、291:タンク、292:タンク、294:出口、296
:出口、298:ゲル、300:入口、302:入口、330:トレイ、400
:8ウエルトレイ、402:クリップ、410:ウエル、420:溝、430:
チャネル、430:開口部、440:領域、442:核酸。
【手続補正書】
【提出日】平成13年8月27日(2001.8.27)
【手続補正1】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】特許請求の範囲
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) G01N 33/53 G02B 21/34 4B063 33/566 G01N 1/28 F G02B 21/34 C12N 15/00 A (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SL,SZ,TZ,UG,ZW ),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU, TJ,TM),AE,AL,AM,AT,AU,AZ, BA,BB,BG,BR,BY,CA,CH,CN,C R,CU,CZ,DE,DK,DM,EE,ES,FI ,GB,GD,GE,GH,GM,HR,HU,ID, IL,IN,IS,JP,KE,KG,KP,KR,K Z,LC,LK,LR,LS,LT,LU,LV,MA ,MD,MG,MK,MN,MW,MX,NO,NZ, PL,PT,RO,RU,SD,SE,SG,SI,S K,SL,TJ,TM,TR,TT,TZ,UA,UG ,US,UZ,VN,YU,ZA,ZW Fターム(参考) 2G045 BB22 BB24 DA12 DA13 DA36 FA16 FB02 FB03 FB07 HA12 HA16 2G052 AA28 AA33 AB16 AB20 AD32 AD52 CA03 DA06 DA07 EB11 EC03 FA09 FA10 FD18 GA30 GA32 HB02 JA06 JA07 2H052 AE00 4B024 AA11 BA80 CA01 CA11 HA12 HA14 4B029 AA07 BB20 CC03 FA12 4B063 QA01 QQ01 QQ42 QQ52 QR08 QR42 QR56 QR62 QS25 QS34 QS36 QX02 【要約の続き】 である。
Claims (42)
- 【請求項1】 生物学的試料を試薬群で処理する方法であって: (a)該生物学的試料を顕微鏡スライド上にマウントする段階、 (b)該顕微鏡スライドをスライドホルダー中に装着する段階、但し該スライド
ホルダーは複数のスライドを保持し得るものである、 (c)トレイ上のウエル内で少なくとも1種の試薬を予乾燥する段階、 (d)該スライドホルダー内の該顕微鏡スライドを該ウエルの上方に置き、該生
物学的試料が該ウエル内の試薬と接触可能にする段階、および、 (e)水または緩衝液を該ウエルに加え該試薬群を溶解させる段階、 の各段階を含んでなる方法。 - 【請求項2】 該ウエル内で1以上の試薬を予乾燥し、かつ、該1以上の試
薬が水または緩衝液の添加により溶解する、請求項1に記載の方法。 - 【請求項3】 試薬群を、作用順とは逆順に配列して乾燥させる、請求項2
に記載の方法。 - 【請求項4】 該試薬群が不活性材料で相互に分離されている、請求項3に
記載の方法。 - 【請求項5】 スライド上の生物学的試料をアッセイする方法であって、該
スライド上に1またはそれ以上の外部対照が置かれてあり、該生物学的試料につ
いて1またはそれ以上の上記段階を同時に処理する方法。 - 【請求項6】 該外部対照が、該スライド上に置いた膜上にある、請求項5
に記載の方法。 - 【請求項7】 該スライドが、該生物学的試料と反応する1またはそれ以上
の試薬を含有するウエル上に置かれる、請求項5に記載の方法。 - 【請求項8】 生物学的試料と外部対照とを含んでなるスライド。
- 【請求項9】 複数の対照物質を含んでなる膜。
- 【請求項10】 該対照物質が、抗原、ペプチド、タンパク質、核酸および
細胞からなる群から選択される、請求項9に記載の膜。 - 【請求項11】 該膜が、該膜の第1面上に上記外部対照を、そして該膜の
第2面上にスライドと接触したとき該膜を該スライドに付着させる物質を含む、
請求項9に記載の膜。 - 【請求項12】 該膜がスライドに付着している、請求項9に記載の膜。
- 【請求項13】 請求項9に記載の膜を、多数ウエルのトレイと組合わせて
含んでなるキット。 - 【請求項14】 該多数ウエルトレイが、予乾燥した試薬類を含むものであ
る、請求項13に記載のキット。 - 【請求項15】 該多数ウエルトレイのウエルに加えた試薬が、該膜上の対
照物質と反応するものである、請求項13に記載のキット。 - 【請求項16】 該ウエルが、生物学的試料のアッセイに使用しようとする
試薬を含んでおり、該試薬は該アッセイの実施に先立って該ウエル内で乾燥させ
てある、ウエルを含んでなるトレイ。 - 【請求項17】 1またはそれ以上の試薬を該ウエル内で乾燥させてある、
請求項16に記載のトレイ。 - 【請求項18】 異なる試薬群が、水または緩衝液を該ウエルに加えた後、
そこで最初に作用する試薬が2番目に作用する試薬の溶解に先立って溶解するよ
うに、順番に溶解してゆくような様式で、該ウエル内で乾燥させてある、請求項
17に記載のトレイ。 - 【請求項19】該試薬群が不活性層で相互に分離されている、請求項18に
記載のトレイ。 - 【請求項20】 該カバースリップの一部が凹面であり、顕微鏡スライド
上に置いたとき既知容積を囲みこむようになる、顕微鏡スライド用カバースリッ
プ。 - 【請求項21】 さらにその中に乾燥させた試薬群を含有する、請求項20
に記載のカバースリップ。 - 【請求項22】 請求項20に記載のカバースリップ、顕微鏡スライド、お
よび該カバースリップの一部と該顕微鏡スライドとの間に挟み込まれた挿入物、
の組合わせ。 - 【請求項23】 該挿入物が対照試料を含むものである、請求項22に記載
の組合わせ。 - 【請求項24】 該カバースリップが、バーコードまたはテキストで標識さ
れている、請求項20に記載のカバースリップ。 - 【請求項25】 生物学的試料について顕微鏡スライド上でアッセイを実施
する方法であって: (a)生物学的試料を顕微鏡スライド上に置く段階、 (b)該顕微鏡スライド上に請求項20に記載のカバースリップを置く段階、 (c)水、緩衝液または試薬を、該顕微鏡スライドと該カバースリップとの間の
既知容積内に流入させる段階、および、 (d)反応を生起させる段階、 の各段階を含んでなる方法。 - 【請求項26】 該カバースリップがその上に予乾燥した試薬を含むもので
ある、請求項25に記載の方法。 - 【請求項27】 生物学的試料について顕微鏡スライド上でアッセイを実施
する方法であって: (a)生物学的試料を顕微鏡スライド上に置く段階、 (b)段階(a)の該顕微鏡スライドを、処理するために反応室内に入れる段階
、 (c)カバースリップを該反応室内に入れる段階、および、 (d)反応を生起させる段階、 の各段階を含んでなる方法。 - 【請求項28】 該カバースリップが、該カバースリップを該反応室内に入
れるに先立って、その中に乾燥した試薬を含むものである、請求項27に記載の
方法。 - 【請求項29】 該カバースリップが、該反応を生起させるに先立って、そ
の上に置かれた対照試料を含むものである、請求項27に記載の方法。 - 【請求項30】 該カバースリップが、バーコードまたはテキストを含むも
のである、請求項27に記載の方法。 - 【請求項31】 該装置の各反応室内への1またはそれ以上の流入口および
1またはそれ以上の流出口を含んでなる、多数反応室装置。 - 【請求項32】 加熱用ブロックと組み合わせた、請求項31に記載の多数
反応室装置。 - 【請求項33】 管部が該流入口へのポンプと連結している該ポンプと組み
合わせた、請求項31に記載の多数反応室装置。 - 【請求項34】 該ポンプを制御する中央処理ユニットと組合わせた、請求
項33に記載の多数反応室装置。 - 【請求項35】 該装置の1またはそれ以上の反応室内の空間容積を変える
手段と組み合わせた、請求項31に記載の多数反応室装置。 - 【請求項36】 該手段が中央処理ユニットを含むものである、請求項35
に記載の多数反応室装置。 - 【請求項37】 生物学的試料について、in situ 核酸増幅と組合わせてin situ ハイブリダイゼーションを実施する方法であって、 該生物学的試料を、核酸増幅を実施するための試薬群を含有する溶液と接触させ
、必要なら該溶液を核酸増幅の生起に充分な熱循環させ、次いで該生物学的試料
をin situ ハイブリダイゼーションのために分析し、さらに該溶液の試料を増幅
させた核酸について分析すること、を含む方法。 - 【請求項38】 試薬を有するスライド上で生物学的試料を処理する方法で
あって、 i)該試薬がフィルターペーパーの切片上に被覆してあり、そして、 ii)該スライド上の該生物学的試料を該フィルターペーパーと接触するように置
く、方法。 - 【請求項39】 スライドに接触させるトレイであって、該トレイが多数の
ウエルを含むものであり、各ウエルが該スライドの一部とのみ接触しており、か
つ各ウエルが隙間または溝により隣接ウエル群と分離されている、トレイ。 - 【請求項40】 請求項39に記載のトレイを使用する、in situ ハイブリ
ダイゼーション実施方法。 - 【請求項41】 核酸プローブを該トレイのウエル内で予乾燥してある、請
求項40に記載の方法。 - 【請求項42】 該スライドが、該スライド上に予めアレンジしてある対照
核酸を含むものである、請求項40に記載の方法。
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