JP2000262288A - コリネ型細菌の温度感受性プラスミド - Google Patents
コリネ型細菌の温度感受性プラスミドInfo
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Abstract
相同性を示さない、あるいは不和合性を示さないプラス
ミドより温度感受性プラスミドを取得し、宿主の遺伝的
性質を効率よく短期間で改変できる方法を提供する。 【解決手段】 (a)特定の塩基配列を有する野生型の
複製制御領域部分に変異を有し、培養温度が31℃より
低温でコリネ型細菌細胞内で自律複製できるが、31℃
以上の温度では同細胞内で自律複製ができないプラスミ
ドに、コリネ型細菌の染色体上に存在する遺伝子と相同
な配列を有するDNA断片を連結して組換えプラスミド
を得、(b)同組換えプラスミドをコリネ型細菌細胞に
導入し、(c)同細菌を31℃以上の温度で培養し、
(d)同DNA断片と、同DNA断片と相同な配列を有
するコリネ型細菌の染色体上に存在する遺伝子との間に
相同組換えを生じせしめ、(e)同DNA断片が染色体
上に組み込まれたコリネ型細菌を選択することにより、
DNA断片が染色体上に組み込まれたコリネ型細菌を調
製する。
Description
規な温度感受性プラスミドに関する。同プラスミドは、
アミノ酸などの有用物質の発酵生産に用いられているコ
リネ型細菌の染色体遺伝子を改変し、その遺伝的形質を
変換する方法に利用することができるものであり、アミ
ノ酸などの発酵生産等に有用な微生物の育種に利用する
ことができる。
特定の遺伝子を計画的に改変し、また、定まったコピー
数の遺伝子を安定に染色体上に固定することにより改変
し、アミノ酸など有用物質の発酵生産に利用しようとい
う試みは既に報告されている(特開平5-7491号)。これ
は、コリネ型細菌中で自律複製可能なプラスミドDNAの
複製制御領域を、培養温度を上昇させることにより複製
不能になる、温度感受性変異型の複製制御領域に改変し
たプラスミドを利用したものである。しかし、この温度
感受性複製制御領域を有するプラスミドは、この複製制
御領域が由来する野生型複製制御領域を有する他のプラ
スミドを保持するコリネ型細菌においては、プラスミド
間での相同組み換えが起こることがあり、形質転換体が
保持するプラスミドが温度感受性の複製制御領域でなく
なる現象が観察されていた。同様に、このプラスミドを
用いてコリネ型細菌の染色体上の遺伝子を改変しようと
する場合、宿主コリネ型細菌が前記プラスミドと同じ由
来の複製制御領域を有するプラスミドを保持している
と、このプラスミドが育種の過程で不和合性により脱落
する現象も観察されていた。
報告されている温度感受性プラスミドと相同性を示さな
い、あるいは不和合性を示さないプラスミドより温度感
受性プラスミドを取得し、宿主の遺伝的性質を効率よく
短期間で改変できる方法を提供することである。
を解決すべく鋭意検討を行った結果、ブレビバクテリウ
ム・ラクトファーメンタムATCC13869より抽出したプラ
スミドpAM330(特開昭58-67699号公報、Miwa, K.
et al., Agric. Biol. Chem., 48, 2901 (1984))から、
低温では自律複製できるが、それよりも高い温度では自
律複製できないような変異を有するプラスミドを取得す
ることに成功し、本発明を完成するに至った。
ラクトファーメンタムATCC13869が保持するプラスミドp
AM330に由来する複製制御領域であって、コリネ型細菌
中で、同細菌が生育可能な温度範囲において低温では自
律複製でき、高温では自律複製できない温度感受性複製
制御領域と、マーカー遺伝子とを含むプラスミドであ
る。
コッカス属細菌に由来する抗生物質耐性遺伝子が好まし
く、具体的にはカナマイシン耐性遺伝子、エリスロマイ
シン耐性遺伝子、テトラサイクリン耐性遺伝子およびス
ペクチノマイシン耐性遺伝子が挙げられる。
エシェリヒア属細菌中でプラスミドを自律複製可能にす
る複製制御領域をさらに含むプラスミドを提供する。本
発明はさらに、配列表の配列番号17に示す塩基配列中
に含まれるブレビバクテリウム・ラクトファーメンタム
ATCC13869が保持するプラスミドpAM330に由来する複製
制御領域であって、同塩基配列において塩基番号125
5のCがTに置換される変異、塩基番号1534のCが
Tに置換される変異、塩基番号1866のGがAに置換
される変異、塩基番号2058のGがAに置換される変
異、塩基番号2187のCがTに置換される変異、及び
塩基番号3193のGがAに置換される変異から選ばれ
る変異、又は、前記塩基配列に含まれるコード領域によ
りコードされるアミノ酸配列においてN末端から73番
目のプロリンが他のアミノ酸に置換される変異を有し、
コリネ型細菌が生育可能な温度範囲において低温では自
律複製でき、高温では自律複製できない温度感受性複製
制御領域を提供する。
み込まれたコリネ型細菌の創製方法であって、下記工程
を含む方法を提供する。 (a)前記プラスミドに、コリネ型細菌の染色体上に存
在するDNA配列と相同な配列を有するDNA断片を連
結して得られる組換えプラスミドを、コリネ型細菌細胞
に導入し、(b)前記細菌を、前記プラスミドが自律複
製できる温度で培養して、前記DNA断片と、同DNA
断片と相同な配列を有するコリネ型細菌の染色体上に存
在するDNA配列との間に相同組換えを生じさせ、そし
て(c)前記DNA断片が前記プラスミドとともに染色
体上に組み込まれた細菌を選択する。
程を含む。 (d)前記細菌を培養して、前記染色体に組み込まれた
DNA断片と、このDNA断片と相同な配列を有するコ
リネ型細菌の染色体上に元来存在するDNA配列との間
に相同組換えを生じさせ、(e)前記細菌を高温で培養
して、染色体上に元来存在するDNA配列と前記プラス
ミドを染色体から脱落させ、そして(f)染色体上のD
NA配列が前記DNA断片に置換された細菌を選択す
る。
域」とは、プラスミドを自律複製可能にする複製制御領
域であって、コリネ型細菌中でこれを有するプラスミド
がある温度では自律複製できるが、それよりも高い温度
では自律複製できないような変異を有するものをいう。
また、温度感受性複製制御領域を有するプラスミドを温
度感受性プラスミドという。
本発明のプラスミドは、pAM330に由来する、温度感受性
を示す複製制御領域を有する。pAM330は、野生型コリネ
型細菌であるブレビバクテリウム・ラクトファーメンタ
ムATCC13869が保持するプラスミドであり、同株から通
常のプラスミドの分離法にしたがって分離することがで
きる。ATCC13869株は、アメリカン・タイプ・カルチャ
ー・コレクション(American Type Culture Collectio
n)、住所 12301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland
20852, United States of America)から何人も入手す
ることができる。
由来のプラスミド、例えばpHM1519(K. Miwa et al., A
gric. Biol. Chem., 48, 2901-2903(1984)、特開昭58-1
92900号公報)とは異なる複製制御領域を有しているた
め、これらのプラスミドは不和合性を示さず、コリネ型
細菌中で共存させることができる。
pAM330又はpAM330から誘導されるプラスミドを変異処理
し、コリネ型細菌が生育可能な温度範囲において、低温
では自律複製でき、高温では自律複製できない変異型プ
ラスミドを選択することによって、取得することができ
る。
ミン等でインビトロ処理する方法(G. O. Humpherys et
al., Molec. gen. Genet., 145, 101-108 (1976)等参
照)、及びプラスミドを保持する微生物を紫外線照射ま
たはN−メチル−N'−ニトロ−N−ニトロソグアニジン
(NTG)もしくは亜硝酸等の通常変異処理に用いられて
いる変異剤によって処理する方法が挙げられるが、イン
ビトロ処理する方法が好ましい。
同プラスミドに抗生物質耐性遺伝子等のマーカー遺伝子
を搭載させておくと、コリネ型細菌細胞中でのマーカー
遺伝子の表現型によって、判別することができる。すな
わち、変異処理したプラスミドで形質転換したコリネ型
細菌を、例えば適当な濃度で抗生物質を添加した培地で
培養したときに、生育することができれば同プラスミド
は自律複製可能であり、生育することができなければ同
プラスミドは自律複製することができない。
カス属細菌に由来する抗生物質耐性遺伝子が挙げられ
る。具体的には、カナマイシン耐性遺伝子、エリスロマ
イシン耐性遺伝子、テトラサイクリン耐性遺伝子および
スペクチノマイシン耐性遺伝子が挙げられる。これらの
遺伝子は、市販のベクターpDG783、pDG646、pDG1513又
はpDG1726(Anne-Marie Guerout- Fleury et al., Gen
e, 167, 335-337(1995))から調製することができる。
これらのベクターは、Bacillus Genetic Stock Center,
The Ohio State University, Department of Biochemi
stry(484 West Twelfth Avenue, Columbus, Ohio 4321
0 USA)から入手できる。
83を鋳型として、配列番号1及び2に示す塩基配列を有
するプライマーを用いたポリメラーゼチェインリアクシ
ョン(PCR:polymerase chain reaction; White,T.
J. et al., Trends Genet.,5,185 (1989)参照)を行う
ことによって、取得することができる。
用いてコリネ型細菌の染色体に目的遺伝子を効率よく組
み込む為には、コリネ型細菌中に1コピー存在するだけ
で十分な薬剤耐性を示す薬剤耐性遺伝子を含むことが好
ましい。ストレプトコッカス・フェカリスのカナマイシ
ン耐性遺伝子は、コリネ型細菌中に1コピー存在するだ
けで十分な薬剤耐性を示す。具体的には、本発明のプラ
スミドを保持するコリネ型細菌は、好適な条件では少な
くとも25μg/mlのカナマイシンを含む培地で生育するこ
とが期待できる。
ア・コリ等のエシェリヒア属細菌中でプラスミドを自律
複製可能にする複製制御領域をさらに含むことが好まし
い。このように、本発明のプラスミドにエシェリヒア・
コリで機能する複製制御領域を持たせてシャトルベクタ
ーとすることにより、プラスミドの調製、目的遺伝子を
搭載させた組換えプラスミドの調製等の操作をエシェリ
ヒア・コリを用いて行うことができる。また、pAM330又
はその誘導体をシャトルベクターとした後に変異処理を
行い、温度感受性プラスミドを取得することもできる。
としては、例えばpUC19、pUC18、pBR322、pHSG299、pHS
G298、pHSG399、pHSG398、RSF1010、pMW119、pMW118、p
MW219、pMW218等が挙げられる。
び連結、形質転換、PCR、プライマーとして用いるオ
リゴヌクレオチドの設定等の方法は、当業者によく知ら
れている通常の方法を採用することができる。これらの
方法は、Sambrook, J., Fritsch, E. F., and Maniati
s, T., "Molecular Cloning A Laboratory Manual, Sec
ond Edition", Cold Spring Harbor Laboratory Press
(1989)等に記載されている。
施例で得られた温度感受性プラスミドp48K、pSFKT1、pS
FKT2、pSFKT3、pSFKT4、pSFKT5及びpSFKT6が挙げられ
る。これらのプラスミドは、コリネ型細菌中で少なくと
も25℃では自律複製することができ、37℃では自律
複製できない。
型複製制御領域を含む塩基配列において、塩基番号1255
のCがTに置換される変異、塩基番号1534のCがTに置換さ
れる変異、塩基番号1866のGがAに置換される変異、塩基
番号2058のGがAに置換される変異、塩基番号2187のCがT
に置換される変異、及び塩基番号3193のGがAに置換され
る変異を有する。また、pSFKT1、pSFKT2、pSFKT3、pSFK
T4、pSFKT5及びpSFKT6は、上記変異を順に一つずつ有す
る。本発明のプラスミドは、上記変異の任意の2〜5個
の組み合わせを有するものであってもよい。配列番号1
7に示す塩基配列中にはオープンリーディングフレーム
(ORF)が一つ存在する。上記の変異のうち、塩基番
号1534のCからTへの置換によって、このORFによって
コードされるアミノ酸配列(配列番号18に示す)にお
いてN末端から73番目のプロリンがセリンに置換され
る。他の塩基置換は、前記アミノ酸配列においてアミノ
酸置換を起こさない。前記プロリンがセリン以外の他の
アミノ酸に置換され、コリネ型細菌が生育可能な温度範
囲において低温では自律複製でき、高温では自律複製で
きない温度感受性複製制御領域を含むプラスミドも、本
発明のプラスミドに含まれる。
御領域を取り出し、それを用いて遺伝子置換用ベクター
を調製することができる。複製制御領域は、プラスミド
の自律複製に関与する酵素がコードされる領域及びこれ
らの酵素が認識して複製反応が開始される複製開始点
(ori領域)を含む。複製制御領域は、これらの領域を
認識しない制限酵素でプラスミドを消化することにより
切り出すことができ、切り出された複製制御領域を連結
したDNAは、レプリコンとして機能することができ
る。このようにして本発明のプラスミドから構築される
誘導体も、本発明に含まれる。
したDNA断片の染色体への組み込み、遺伝子置換又は
遺伝子破壊に利用することができる。例えばDNA断片
の染色体への組み込みは、次のようにして行うことがで
きる。本発明のプラスミドに、コリネ型細菌の染色体上
に存在するDNA配列と相同な配列を有するDNA断片
を連結して組換えプラスミドを構築し、この組換えプラ
スミドでコリネ型細菌を形質転換する。形質転換体を低
温で培養して、前記DNA断片と同DNA断片と相同な
配列を有するコリネ型細菌の染色体上に存在するDNA
配列との間に相同組換えを生じさせ、前記DNA断片が
プラスミドとともに染色体上に組み込まれた細菌を選択
する。
培養して、前記染色体に組み込まれたDNA断片と染色
体上に元来存在するDNA配列との間に相同組換えを生
じさせると、染色体上に元来存在するDNA配列はプラ
スミドとともに染色体から切り出される。切り出された
DNA配列は、コリネ型細菌を高温で培養すると、同細
菌細胞から脱落する。こうして、導入したDNA断片と
染色体上のDNA配列を置換することができる。
対的な概念であり、コリネ型細菌が生育可能な温度であ
れば特にこれらの温度の境界は制限されない。コリネ型
細菌は、通常20℃〜36℃で生育することができる。前記
低温と高温との境界は、例えば30℃〜32℃の範囲内、よ
り具体的には約31℃である。好ましくは、低温は10〜27
℃であり、より好ましくは20〜25℃である。また、好ま
しくは高温は31〜37℃であり、より好ましくは33〜36℃
である。
細菌に導入するには、これまでに報告されている形質転
換法に従って行えばよい。例えば、エシェリヒア・コリ
K−12について報告されているような、受容菌細胞
を塩化カルシウムで処理してDNAの透過性を増す方法
(Mandel,M. and Higa,A., J. Mol. Biol., 53, 159(19
70))があり、バチルス・ズブチリスについて報告され
ているような、増殖段階の細胞からコンピテントセルを
調製してDNAを導入する方法( Duncan, C.H., Wilso
n, G.A. and Young, F.E., Gene, 1, 153 (1977))があ
る。あるいは、バチルス・ズブチリス、放線菌類及び酵
母について知られているような、DNA受容菌の細胞
を、組換えDNAを容易に取り込むプロトプラストまた
はスフェロプラストの状態にして組換えDNAをDNA
受容菌に導入する方法(Chang, S.and Choen, S.N., Mo
lec. Gen. Genet., 168, 111 (1979); Bibb, M.J., War
d,J.M. and Hopwood, O.A., Nature, 274, 398 (1978);
Hinnen, A., Hicks, J.B.and Fink, G.R., Proc. Nat
l. Acad. Sci. USA, 75 1929 (1978))も応用できる。
本発明の実施例で用いた形質転換の方法は、電気パルス
法(特開平2-207791号公報参照)である。
型細菌は、従来ブレビバクテリウム属に分類されていた
が現在コリネバクテリウム属に統合された細菌を含み
(Int.J. Syst. Bacteriol., 41, 255 (1981))、また
コリネバクテリウム属と非常に近縁なブレビバクテリウ
ム属細菌を含む。このようなコリネ型細菌の例として以
下のものが挙げられる。
グルタミカム) コリネバクテリウム・メラセコーラ コリネバクテリウム・サーモアミノゲネス コリネバクテリウム・ハーキュリス ブレビバクテリウム・ディバリカタム(コリネバクテリ
ウム・グルタミカム) ブレビバクテリウム・フラバム(コリネバクテリウム・
グルタミカム) ブレビバクテリウム・インマリオフィラム ブレビバクテリウム・ラクトファーメンタム(コリネバ
クテリウム・グルタミカム) ブレビバクテリウム・ロゼウム ブレビバクテリウム・サッカロリティカム ブレビバクテリウム・チオゲニタリス ブレビバクテリウム・アンモニアゲネス(コリネバクテ
リウム・アンモニアゲネス) ブレビバクテリウム・アルバム ブレビバクテリウム・セリヌム ミクロバクテリウム・アンモニアフィラム
的に説明する。
薬剤耐性遺伝子を持つベクターの構築 ストレプトコッカス・フェカリスのカナマイシン耐性遺
伝子を、同遺伝子を含む公知のプラスミドからPCRによ
り増幅した。ストレプトコッカス・フェカリスのカナマ
イシン耐性遺伝子の塩基配列は既に明らかにされている
(Trieu-Cuot,P. and Courvalin,P.:Gene 23(3), 331
-341(1983))。この配列を基に配列番号1および2に
示すプライマーを合成し、pDG783(Anne-Marie Guerout
- Fleuryet al., Gene, 167, 335-337(1995))を鋳型と
してPCRを行ない、カナマイシン耐性遺伝子とそのプロ
モーターを含むDNA断片を増幅した。
精製した後、制限酵素HindIIIとHincIIで完全分解し平
滑末端化した。平滑末端化は宝酒造社製のBlunting Kit
により行なった。このDNA断片と、配列番号3および4
に示すプライマーを用いてpHSG399(S.Takeshita et al
: Gene 61,63-74(1987)参照)を鋳型としてPCRを行って
得られた増幅産物を精製し平滑末端化したDNA断片と
を、混合し連結した。連結反応は宝酒造社製 DNA ligat
ion kit ver2にて行なった。連結したDNAを用いて、エ
シェリヒア・コリJM109のコンピテントセル(宝酒造社
製)を形質転換し、IPTG(イソプロピル-β-D-チオガラ
クトピラノシド)10μg/ml、X-Gal(5-ブロモ-4-クロロ
-3-インドリル-β-D−ガラクトシド)40μg/ml及びカナ
マイシン25μg/mlを含むL培地(バクトトリプトン10g/
L、バクトイーストエキストラクト5g/L、NaCl 5g/L、寒
天15g/L、pH7.2)に塗布し、一晩培養後、出現した青色
のコロニーを釣り上げ、単コロニー分離し、形質転換株
を得た。
書、日本生物工学会編、105頁、培風館、1992年)を用
いてプラスミドを調製し、制限酵素地図を作成し、図1
に示す制限酵素地図と同等であるものをpK1と名付け
た。このプラスミドはエシェリヒア・コリ中にて安定に
保持され、宿主にカナマイシン耐性を付与する。また、
lazZ'遺伝子を含むため、クローニングベクターに適し
ている。
シア・コリと、コリネ型細菌の双方の菌体中で自律複製
可能なプラスミドベクターを作製した。ブレビバクテリ
ウム・ラクトファーメンタムATCC13869より抽出したプ
ラスミドpAM330(特開昭58-67699号公報参照)を制限酵素
HindIIIで完全分解したのち平滑末端化し、これと、上
記pK1を制限酵素BsaAIで完全分解したものを、連結し
た。連結後のDNAを用いてブレビバクテリウム・ラクト
ファーメンタムATCC13869を形質転換した。形質転換の
方法は、電気パルス法(特開平2-207791号参照)を用い
た。形質転換体の選択は、カナマイシン25μg/mlを含む
M-CM2Bプレート(ポリペプトン10g/L、酵母エキス10g/
L、NaCl 5g/L、ビオチン10μg/L、寒天15g/L、pH7.2)に
て行った。二晩培養後、コロニーを釣り上げ単コロニー
分離し、形質転換体とした。形質転換体からプラスミド
DNAを調製し、制限酵素地図を作成し、図2に示す制限
酵素切断地図と同一の制限酵素地図を持つものをpSFK6
と命名した。このプラスミドは、エシェリシア・コリと
コリネ型細菌中で自律複製でき、宿主にカナマイシン耐
性を付与する。
プライマーはそれぞれEcoRV、StuI部位を有しているの
で、pSFK6をEcoRV、StuIで分解することによりカナマイ
シン耐性遺伝子のみを取り除くことができる。カナマイ
シン耐性遺伝子を取り除いたpSFK6と、ストレプトコッ
カス・フェカリス由来エリスロマイシン耐性遺伝子、テ
トラサイクリン耐性遺伝子、又はスペクチノマイシン耐
性遺伝子を有するpDG646、pDG1513、及びpDG1726(Anne
-Marie Guerout- Fleury et al., Gene, 167, 335-337
(1995))をそれぞれBamHIとClaI、ClaIとEcoRI、PstIと
BamHIで切断し、平滑末端化したものとを連結し、pSFE
6、pSFT6、pSFS6を得た。これらはそれぞれ宿主にエリ
スロマイシン耐性、テトラサイクリン耐性、又はスペク
チノマイシン耐性を付与する。
スミドの取得 pSFK6をインビトロでヒドロキシルアミン処理した。ヒ
ドロキシルアミン処理は、公知の方法(G. O. Humphery
s et al., Molec. Gen. Genet., 145, 101-108(1976)等
参照)によった。処理後のDNAを回収し、ブレビバクテ
リウム・ラクトファーメンタムATCC13869株を形質転換
した。形質転換体は、カナマイシン25μg/mlを含むCM2B
プレート上で低温(25℃)にて選択した。出現した形質転
換体を、同様の選択プレートにレプリカし、高温(34℃)
にて培養した。高温でカナマイシンを含む選択プレート
上で生育できない株1株を取得した。この株から、プラ
スミドを回収しp48Kと命名した。
の決定 野生型の複製制御領域を持つプラスミドpSFK6、および
温度感受性型の複製制御領域を持つプラスミドp48Kにつ
いて、それぞれの複製制御領域部分の塩基配列を決定し
た。塩基配列は、ABI社のDNA Sequencing Kitを用いてA
BI社の全自動シーケンサーABI310にて決定した。その結
果、野生型複製制御領域と、温度感受性変異型複製制御
領域の間には、6個の塩基置換があることが判明した。
pSFK6に含まれるコリネ型細菌中で機能する複製制御領
域部分(pAM330由来の全配列)の塩基配列を配列番号1
7に、p48Kに含まれるコリネ型細菌中で機能する温度感
受性複製制御領域部分の塩基配列を配列番号19に示
す。また、これらの塩基配列中に存在するORFによっ
てコードされ得るアミノ酸配列を配列番号18及び20
に示す。温度感受性複製制御領域では、配列上の1255番
目のCがTに、1534番目のCがTに、1866番目のGがAに、20
58番目のGがAに、2187番目のCがTに、 3193番目のGがA
に変異している。このうちアミノ酸変異を伴うものは15
34番目の変異点のみであり、プロリンからセリンへの置
換を引き起こす。
クターの構築 p48Kが持つ6個の変異を、一点ずつシャトルベクターpS
FKに導入した(図3参照)。変異の導入は、公知の方法
(Mikaelian, I., Sergeant, A. Nucleic Acids Res.,
20, 376 (1992))によって行った。具体的方法を以下に
示す。1255番目のC→Tの変異を導入するために、配列番
号5および6に示すプライマーの組み合わせと、配列番
号7および8に示すプライマーの組み合わせを用いて、
pAM330を鋳型としてPCRを行なった。得られた増幅産物
はそれぞれアガロースゲルで電気泳動後、ゲルから回収
することにより精製した。ゲルからのDNA断片の回収は
宝酒造社製のEASYTRAP Ver.2にて行なった。精製したDN
Aを1:1のモル比となるように混合し、これを鋳型として
配列番号9および10に示すプライマーを用いてPCR反
応を行なった。増幅産物は制限酵素MluIで完全分解し、
アガロースゲルにて電気泳動後、およそ3.2KbのDNA断片
を回収した。pSFK6も同様に制限酵素MluIで完全分解
し、アガロースゲルにて電気泳動後、およそ3.8KbのDNA
断片を回収した。得られたDNA断片を混合して連結し、
エシェリヒア・コリJM109のコンピテントセル(宝酒造
社製)を用いて形質転換を行い、カナマイシン25μg/ml
を含むL培地に塗布し、一晩培養後、出現したコロニー
を釣り上げ、単コロニー分離し、形質転換株を得た。形
質転換株からアルカリ法を用いてプラスミドを調製し、
塩基配列を決定し、配列番号11に示す配列の1255番目
のCがTに変異していることを確認した。このプラスミド
をpSFKT1と名付けた(ず 3)。同様に、表1に示すプ
ライマーの組み合わせにて、5種類の変異が一つずつ導
入されたプラスミド、pSFKT2、pSFKT3、pSFKT4、pSFKT
5、pSFKT6を得た。
クターの構築 ブレビバクテリウム・ラクトファーメンタムATCC13869
をpSFKT2で形質転換し、カナマイシン25μg/mlを含むCM
2Bプレートに塗布し25℃にて二晩培養した。出現したコ
ロニーを釣り上げ、単コロニー分離した後、CM2B液体培
地に接種し、カナマイシン非存在下で25℃および34℃に
て培養し、15世代分裂後のプラスミドの保持率を調べ
た。その結果、表2に示すように、15世代分裂後、25℃
ではプラスミドが脱落していないのに対し、34℃ではプ
ラスミドが保持されないことが確認できた。
な温度感受性プラスミドが提供される。本プラスミド
は、従来知られている他のプラスミドとコリネ型細菌細
胞中で共存することができるので、そのようなプラスミ
ドを保持する微生物の育種等に有用である。
1)
コッカス属細菌に由来する抗生物質耐性遺伝子が好まし
く、具体的にはカナマイシン耐性遺伝子、テトラサイク
リン耐性遺伝子およびスペクチノマイシン耐性遺伝子が
挙げられる。
カス属細菌に由来する抗生物質耐性遺伝子が挙げられ
る。具体的には、カナマイシン耐性遺伝子遺伝子、テト
ラサイクリン耐性遺伝子およびスペクチノマイシン耐性
遺伝子が挙げられる。これらの遺伝子は、市販のベクタ
ーpDG783、pDG1513又はpDG1726(Anne-Marie Guerout-F
leury et al., Gene, 167, 335-337(1995))から調製す
ることができる。これらのベクターは、Bacillus Genet
ic Stock Center, The Ohio State University, Depart
ment of Biochemistry(484 West Twelfth Avenue, Col
umbus, Ohio 43210 USA)から入手できる。
プライマーはそれぞれEcoRV、StuI部位を有しているの
で、pSFK6をEcoRV、StuIで分解することによりカナマイ
シン耐性遺伝子のみを取り除くことができる。カナマイ
シン耐性遺伝子を取り除いたpSFK6と、ストレプトコッ
カス由来テトラサイクリン耐性遺伝子、又はスペクチノ
マイシン耐性遺伝子を有するpDG1513、及びpDG1726(An
ne-Marie Guerout- Fleury et al., Gene, 167, 335-33
7(1995))をそれぞれClaIとEcoRI、PstIとBamHIで切断
し、平滑末端化したものとを連結し、pSFT6、pSFS6を得
た。これらはそれぞれ宿主にテトラサイクリン耐性、又
はスペクチノマイシン耐性を付与する。
クターの構築 p48Kが持つ6個の変異を、一点ずつシャトルベクターpS
FKに導入した(図3参照)。変異の導入は、公知の方法
(Mikaelian, I., Sergeant, A. Nucleic Acids Res.,
20, 376 (1992))によって行った。具体的方法を以下に
示す。1255番目のC→Tの変異を導入するために、配列番
号5および6に示すプライマーの組み合わせと、配列番
号7および8に示すプライマーの組み合わせを用いて、
pAM330を鋳型としてPCRを行なった。得られた増幅産物
はそれぞれアガロースゲルで電気泳動後、ゲルから回収
することにより精製した。ゲルからのDNA断片の回収は
宝酒造社製のEASYTRAP Ver.2にて行なった。精製したDN
Aを1:1のモル比となるように混合し、これを鋳型として
配列番号15および16に示すプライマーを用いてPCR
反応を行なった。増幅産物は制限酵素MluIで完全分解
し、アガロースゲルにて電気泳動後、およそ3.2KbのDNA
断片を回収した。pSFK6も同様に制限酵素MluIで完全分
解し、アガロースゲルにて電気泳動後、およそ3.8KbのD
NA断片を回収した。得られたDNA断片を混合して連結
し、エシェリヒア・コリJM109のコンピテントセル(宝
酒造社製)を用いて形質転換を行い、カナマイシン25μ
g/mlを含むL培地に塗布し、一晩培養後、出現したコロ
ニーを釣り上げ、単コロニー分離し、形質転換株を得
た。形質転換株からアルカリ法を用いてプラスミドを調
製し、塩基配列を決定し、配列番号17に示す配列の12
55番目のCがTに変異していることを確認した。このプラ
スミドをpSFKT1と名付けた(図3)。同様に、表1に示
すプライマーの組み合わせにて、5種類の変異が一つず
つ導入されたプラスミド、pSFKT2、pSFKT3、pSFKT4、pS
FKT5、pSFKT6を得た。
認 ブレビバクテリウム・ラクトファーメンタムATCC13869
をpSFKT2で形質転換し、カナマイシン25μg/mlを含むCM
2Bプレートに塗布し25℃にて二晩培養した。出現したコ
ロニーを釣り上げ、単コロニー分離した後、CM2B液体培
地に接種し、カナマイシン非存在下で25℃および34℃に
て培養し、15世代分裂後のプラスミドの保持率を調べ
た。その結果、表2に示すように、15世代分裂後、25℃
ではプラスミドが脱落していないのに対し、34℃ではプ
ラスミドが保持されないことが確認できた。
Claims (12)
- 【請求項1】 ブレビバクテリウム・ラクトファーメン
タムATCC13869が保持するプラスミドpAM3
30に由来する複製制御領域であって、コリネ型細菌中
で、同細菌が生育可能な温度範囲において低温では自律
複製でき、高温では自律複製できない温度感受性複製制
御領域と、マーカー遺伝子とを含むプラスミド。 - 【請求項2】 前記マーカー遺伝子がストレプトコッカ
ス属細菌に由来する抗生物質耐性遺伝子である請求項1
記載のプラスミド。 - 【請求項3】 エシェリヒア属細菌中で自律複製可能に
する複製制御領域をさらに含む請求項1又は2記載のプ
ラスミド。 - 【請求項4】 前記低温と高温との境界が、30℃〜3
2℃の範囲内にある請求項1記載のプラスミド。 - 【請求項5】 コリネ型細菌中で少なくとも25℃では
自律複製することができ、37℃では自律複製できない
請求項1記載のプラスミド。 - 【請求項6】 前記ストレプトコッカス属細菌に由来す
る抗生物質耐性遺伝子が、カナマイシン耐性遺伝子、エ
リスロマイシン耐性遺伝子、テトラサイクリン耐性遺伝
子およびスペクチノマイシン耐性遺伝子から選ばれる請
求項2記載のプラスミド。 - 【請求項7】 前記温度感受性複製制御領域は、配列表
の配列番号17に示す塩基配列中に含まれ、かつ、同塩
基配列において塩基番号1255のCがTに置換される
変異、塩基番号1534のCがTに置換される変異、塩
基番号1866のGがAに置換される変異、塩基番号2
058のGがAに置換される変異、塩基番号2187の
CがTに置換される変異、及び塩基番号3193のGが
Aに置換される変異から選ばれる変異を有することを特
徴とする請求項1記載のプラスミド。 - 【請求項8】 前記温度感受性複製制御領域は、配列番
号18に示すアミノ酸配列においてアミノ酸番号73の
プロリンが他のアミノ酸に置換される変異を有するアミ
ノ酸配列をコードするコード領域を含むことを特徴とす
る請求項1記載のプラスミド。 - 【請求項9】 配列表の配列番号17に示す塩基配列中
に含まれるブレビバクテリウム・ラクトファーメンタム
ATCC13869が保持するプラスミドpAM330
に由来する複製制御領域であって、同塩基配列において
塩基番号1255のCがTに置換される変異、塩基番号
1534のCがTに置換される変異、塩基番号1866
のGがAに置換される変異、塩基番号2058のGがA
に置換される変異、塩基番号2187のCがTに置換さ
れる変異、及び塩基番号3193のGがAに置換される
変異から選ばれる変異を有し、コリネ型細菌が生育可能
な温度範囲において低温では自律複製でき、高温では自
律複製できない温度感受性複製制御領域。 - 【請求項10】 配列表の配列番号17に示す塩基配列
中に含まれるブレビバクテリウム・ラクトファーメンタ
ムATCC13869が保持するプラスミドpAM33
0に由来する複製制御領域であって、同塩基配列に含ま
れるコード領域によりコードされるアミノ酸配列におい
てN末端から73番目のプロリンが他のアミノ酸に置換
される変異を有し、コリネ型細菌が生育可能な温度範囲
において低温では自律複製でき、高温では自律複製でき
ない温度感受性複製制御領域。 - 【請求項11】 DNA断片が染色体上に組み込まれた
コリネ型細菌の創製方法であって、下記工程を含む方
法: (a)請求項3記載のプラスミドに、コリネ型細菌の染
色体上に存在するDNA配列と相同な配列を有するDN
A断片を連結して得られる組換えプラスミドを、コリネ
型細菌細胞に導入し、(b)前記細菌を、前記プラスミ
ドが自律複製できる温度で培養して、前記DNA断片
と、同DNA断片と相同な配列を有するコリネ型細菌の
染色体上に存在するDNA配列との間に相同組換えを生
じさせ、そして(c)前記DNA断片が前記プラスミド
とともに染色体上に組み込まれた細菌を選択する。 - 【請求項12】 さらに下記工程を含む請求項9記載の
方法: (d)前記細菌を培養して、前記染色体に組み込まれた
DNA断片と、このDNA断片と相同な配列を有するコ
リネ型細菌の染色体上に元来存在するDNA配列との間
に相同組換えを生じさせ、(e)前記細菌を高温で培養
して、染色体上に元来存在するDNA配列と前記プラス
ミドを染色体から脱落させ、そして(f)染色体上のD
NA配列が前記DNA断片に置換された細菌を選択す
る。
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