HUT77034A - Ribonukleinsavak hasítására szolgáló oligonukleotid konjugátumok, készítmények és eljárás - Google Patents
Ribonukleinsavak hasítására szolgáló oligonukleotid konjugátumok, készítmények és eljárás Download PDFInfo
- Publication number
- HUT77034A HUT77034A HU9701971A HU9701971A HUT77034A HU T77034 A HUT77034 A HU T77034A HU 9701971 A HU9701971 A HU 9701971A HU 9701971 A HU9701971 A HU 9701971A HU T77034 A HUT77034 A HU T77034A
- Authority
- HU
- Hungary
- Prior art keywords
- oligonucleotide
- group
- target rna
- sequence
- building blocks
- Prior art date
Links
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 title claims description 167
- 239000000203 mixture Substances 0.000 title claims description 24
- 238000000034 method Methods 0.000 title claims description 20
- 229920002477 rna polymer Polymers 0.000 title claims description 6
- 108091032973 (ribonucleotides)n+m Proteins 0.000 claims description 117
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 57
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 54
- -1 substituted Chemical class 0.000 claims description 45
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims description 41
- 239000003054 catalyst Substances 0.000 claims description 40
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 claims description 30
- 239000002184 metal Substances 0.000 claims description 30
- 238000005809 transesterification reaction Methods 0.000 claims description 26
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 claims description 25
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 24
- JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N [3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-[[5-(2-amino-6-oxo-1H-purin-9-yl)-3-hydroxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxyoxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(5-methyl-2,4-dioxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(6-aminopurin-9-yl)oxolan-2-yl]methoxy-hydroxyphosphoryl]oxy-5-(4-amino-2-oxopyrimidin-1-yl)oxolan-2-yl]methyl [5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-yl] hydrogen phosphate Polymers Cc1cn(C2CC(OP(O)(=O)OCC3OC(CC3OP(O)(=O)OCC3OC(CC3O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)C(COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3COP(O)(=O)OC3CC(OC3CO)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3ccc(N)nc3=O)n3cc(C)c(=O)[nH]c3=O)n3cnc4c3nc(N)[nH]c4=O)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)n3cnc4c(N)ncnc34)O2)c(=O)[nH]c1=O JLCPHMBAVCMARE-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 20
- 125000001997 phenyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(*)C([H])=C1[H] 0.000 claims description 20
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 claims description 19
- 230000003301 hydrolyzing effect Effects 0.000 claims description 19
- 239000008139 complexing agent Substances 0.000 claims description 17
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 claims description 16
- 125000000217 alkyl group Chemical group 0.000 claims description 16
- 125000004432 carbon atom Chemical group C* 0.000 claims description 16
- 229910052747 lanthanoid Inorganic materials 0.000 claims description 16
- IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N Thymidine Chemical compound O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-XLPZGREQSA-N 0.000 claims description 14
- 125000002947 alkylene group Chemical group 0.000 claims description 14
- 125000005842 heteroatom Chemical group 0.000 claims description 14
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 claims description 14
- JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N Pyridine Chemical group C1=CC=NC=C1 JUJWROOIHBZHMG-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 13
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 13
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 claims description 12
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 claims description 12
- 125000003710 aryl alkyl group Chemical group 0.000 claims description 11
- 125000000524 functional group Chemical group 0.000 claims description 11
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 claims description 11
- OLXZPDWKRNYJJZ-UHFFFAOYSA-N 5-(6-aminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1C1CC(O)C(CO)O1 OLXZPDWKRNYJJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 10
- 150000001450 anions Chemical class 0.000 claims description 10
- 239000002585 base Substances 0.000 claims description 10
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 10
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 claims description 10
- 229910052746 lanthanum Inorganic materials 0.000 claims description 10
- 229910052757 nitrogen Inorganic materials 0.000 claims description 10
- 125000004433 nitrogen atom Chemical group N* 0.000 claims description 10
- 239000002777 nucleoside Substances 0.000 claims description 10
- 125000001797 benzyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])* 0.000 claims description 9
- 201000010099 disease Diseases 0.000 claims description 9
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 9
- 125000000956 methoxy group Chemical group [H]C([H])([H])O* 0.000 claims description 9
- 125000006413 ring segment Chemical group 0.000 claims description 9
- 229910052717 sulfur Inorganic materials 0.000 claims description 9
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 8
- 125000003843 furanosyl group Chemical group 0.000 claims description 8
- 150000002602 lanthanoids Chemical class 0.000 claims description 8
- 229910052760 oxygen Inorganic materials 0.000 claims description 8
- JFJNVIPVOCESGZ-UHFFFAOYSA-N 2,3-dipyridin-2-ylpyridine Chemical compound N1=CC=CC=C1C1=CC=CN=C1C1=CC=CC=N1 JFJNVIPVOCESGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 108091093037 Peptide nucleic acid Proteins 0.000 claims description 7
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 claims description 7
- IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N beta-L-thymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1OC(CO)C(O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 125000004122 cyclic group Chemical group 0.000 claims description 7
- 125000000753 cycloalkyl group Chemical group 0.000 claims description 7
- 125000003835 nucleoside group Chemical group 0.000 claims description 7
- 229910052706 scandium Inorganic materials 0.000 claims description 7
- SIXSYDAISGFNSX-UHFFFAOYSA-N scandium atom Chemical compound [Sc] SIXSYDAISGFNSX-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 7
- 150000004820 halides Chemical class 0.000 claims description 6
- FZLIPJUXYLNCLC-UHFFFAOYSA-N lanthanum atom Chemical compound [La] FZLIPJUXYLNCLC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 6
- 150000002739 metals Chemical class 0.000 claims description 6
- 125000004430 oxygen atom Chemical group O* 0.000 claims description 6
- 125000001424 substituent group Chemical group 0.000 claims description 6
- 229910052727 yttrium Inorganic materials 0.000 claims description 6
- YKBGVTZYEHREMT-KVQBGUIXSA-N 2'-deoxyguanosine Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](CO)O1 YKBGVTZYEHREMT-KVQBGUIXSA-N 0.000 claims description 5
- YKBGVTZYEHREMT-UHFFFAOYSA-N 2'-deoxyguanosine Natural products C1=2NC(N)=NC(=O)C=2N=CN1C1CC(O)C(CO)O1 YKBGVTZYEHREMT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- IQFYYKKMVGJFEH-BIIVOSGPSA-N 2'-deoxythymidine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@@H](CO)[C@@H](O)C1 IQFYYKKMVGJFEH-BIIVOSGPSA-N 0.000 claims description 5
- CKTSBUTUHBMZGZ-SHYZEUOFSA-N 2'‐deoxycytidine Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 CKTSBUTUHBMZGZ-SHYZEUOFSA-N 0.000 claims description 5
- CKTSBUTUHBMZGZ-UHFFFAOYSA-N Deoxycytidine Natural products O=C1N=C(N)C=CN1C1OC(CO)C(O)C1 CKTSBUTUHBMZGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 229910052693 Europium Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 229910052688 Gadolinium Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 claims description 5
- 239000007900 aqueous suspension Substances 0.000 claims description 5
- VGONTNSXDCQUGY-UHFFFAOYSA-N desoxyinosine Natural products C1C(O)C(CO)OC1N1C(NC=NC2=O)=C2N=C1 VGONTNSXDCQUGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- 239000011133 lead Substances 0.000 claims description 5
- 229910052763 palladium Inorganic materials 0.000 claims description 5
- 125000000843 phenylene group Chemical group C1(=C(C=CC=C1)*)* 0.000 claims description 5
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 claims description 5
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 5
- VWQVUPCCIRVNHF-UHFFFAOYSA-N yttrium atom Chemical compound [Y] VWQVUPCCIRVNHF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 5
- KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 7H-purine Chemical compound N1=CNC2=NC=NC2=C1 KDCGOANMDULRCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 4
- 229910052684 Cerium Inorganic materials 0.000 claims description 4
- NYHBQMYGNKIUIF-UUOKFMHZSA-N Guanosine Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O NYHBQMYGNKIUIF-UUOKFMHZSA-N 0.000 claims description 4
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 claims description 4
- OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N adenosine Chemical compound C1=NC=2C(N)=NC=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O OIRDTQYFTABQOQ-KQYNXXCUSA-N 0.000 claims description 4
- 229910052783 alkali metal Inorganic materials 0.000 claims description 4
- 229910052794 bromium Inorganic materials 0.000 claims description 4
- 229910052801 chlorine Inorganic materials 0.000 claims description 4
- 150000004696 coordination complex Chemical class 0.000 claims description 4
- 229910021645 metal ion Inorganic materials 0.000 claims description 4
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 claims description 4
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 claims description 4
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 4
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 4
- UHDGCWIWMRVCDJ-UHFFFAOYSA-N 1-beta-D-Xylofuranosyl-NH-Cytosine Natural products O=C1N=C(N)C=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- UHDGCWIWMRVCDJ-PSQAKQOGSA-N Cytidine Natural products O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-PSQAKQOGSA-N 0.000 claims description 3
- 229910052779 Neodymium Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 208000036142 Viral infection Diseases 0.000 claims description 3
- DGEZNRSVGBDHLK-UHFFFAOYSA-N [1,10]phenanthroline Chemical compound C1=CN=C2C3=NC=CC=C3C=CC2=C1 DGEZNRSVGBDHLK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 150000001340 alkali metals Chemical class 0.000 claims description 3
- 229910052802 copper Inorganic materials 0.000 claims description 3
- UHDGCWIWMRVCDJ-ZAKLUEHWSA-N cytidine Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-ZAKLUEHWSA-N 0.000 claims description 3
- 238000001514 detection method Methods 0.000 claims description 3
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 claims description 3
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 claims description 3
- 150000003833 nucleoside derivatives Chemical class 0.000 claims description 3
- 229910052698 phosphorus Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 150000003230 pyrimidines Chemical class 0.000 claims description 3
- 229910052707 ruthenium Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 229910052719 titanium Inorganic materials 0.000 claims description 3
- 230000009385 viral infection Effects 0.000 claims description 3
- 229910052725 zinc Inorganic materials 0.000 claims description 3
- NOLHIMIFXOBLFF-KVQBGUIXSA-N (2r,3s,5r)-5-(2,6-diaminopurin-9-yl)-2-(hydroxymethyl)oxolan-3-ol Chemical compound C12=NC(N)=NC(N)=C2N=CN1[C@H]1C[C@H](O)[C@@H](CO)O1 NOLHIMIFXOBLFF-KVQBGUIXSA-N 0.000 claims description 2
- QGKMIGUHVLGJBR-UHFFFAOYSA-M (4z)-1-(3-methylbutyl)-4-[[1-(3-methylbutyl)quinolin-1-ium-4-yl]methylidene]quinoline;iodide Chemical compound [I-].C12=CC=CC=C2N(CCC(C)C)C=CC1=CC1=CC=[N+](CCC(C)C)C2=CC=CC=C12 QGKMIGUHVLGJBR-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims description 2
- ZDTFMPXQUSBYRL-UUOKFMHZSA-N 2-Aminoadenosine Chemical compound C12=NC(N)=NC(N)=C2N=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O ZDTFMPXQUSBYRL-UUOKFMHZSA-N 0.000 claims description 2
- LRSASMSXMSNRBT-UHFFFAOYSA-N 5-methylcytosine Chemical compound CC1=CNC(=O)N=C1N LRSASMSXMSNRBT-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O Ammonium Chemical compound [NH4+] QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-O 0.000 claims description 2
- 229910017008 AsF 6 Inorganic materials 0.000 claims description 2
- DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N Beta-D-1-Arabinofuranosylthymine Natural products O=C1NC(=O)C(C)=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 DWRXFEITVBNRMK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 239000002126 C01EB10 - Adenosine Substances 0.000 claims description 2
- MIKUYHXYGGJMLM-GIMIYPNGSA-N Crotonoside Natural products C1=NC2=C(N)NC(=O)N=C2N1[C@H]1O[C@@H](CO)[C@H](O)[C@@H]1O MIKUYHXYGGJMLM-GIMIYPNGSA-N 0.000 claims description 2
- NYHBQMYGNKIUIF-UHFFFAOYSA-N D-guanosine Natural products C1=2NC(N)=NC(=O)C=2N=CN1C1OC(CO)C(O)C1O NYHBQMYGNKIUIF-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 229960005305 adenosine Drugs 0.000 claims description 2
- 229910052797 bismuth Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052793 cadmium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052804 chromium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 150000003983 crown ethers Chemical class 0.000 claims description 2
- 229940039227 diagnostic agent Drugs 0.000 claims description 2
- 239000000032 diagnostic agent Substances 0.000 claims description 2
- 229910052737 gold Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229940029575 guanosine Drugs 0.000 claims description 2
- 229910052735 hafnium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052738 indium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052742 iron Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052745 lead Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052748 manganese Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 2
- 229910052753 mercury Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052750 molybdenum Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052759 nickel Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052758 niobium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052762 osmium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 230000000737 periodic effect Effects 0.000 claims description 2
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 claims description 2
- IEQIEDJGQAUEQZ-UHFFFAOYSA-N phthalocyanine Chemical compound N1C(N=C2C3=CC=CC=C3C(N=C3C4=CC=CC=C4C(=N4)N3)=N2)=C(C=CC=C2)C2=C1N=C1C2=CC=CC=C2C4=N1 IEQIEDJGQAUEQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 2
- 229910052697 platinum Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 125000003367 polycyclic group Chemical group 0.000 claims description 2
- 150000004032 porphyrins Chemical class 0.000 claims description 2
- 229910052700 potassium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052703 rhodium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052715 tantalum Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 claims description 2
- 229940104230 thymidine Drugs 0.000 claims description 2
- 229910052718 tin Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052721 tungsten Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052720 vanadium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 229910052726 zirconium Inorganic materials 0.000 claims description 2
- 125000004434 sulfur atom Chemical group 0.000 claims 3
- 230000000415 inactivating effect Effects 0.000 claims 2
- LUCHPKXVUGJYGU-XLPZGREQSA-N 5-methyl-2'-deoxycytidine Chemical compound O=C1N=C(N)C(C)=CN1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)C1 LUCHPKXVUGJYGU-XLPZGREQSA-N 0.000 claims 1
- 229910052772 Samarium Inorganic materials 0.000 claims 1
- 241000617809 Sinum Species 0.000 claims 1
- 230000000536 complexating effect Effects 0.000 claims 1
- 238000003776 cleavage reaction Methods 0.000 description 41
- 230000007017 scission Effects 0.000 description 38
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 30
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 28
- 239000000047 product Substances 0.000 description 25
- OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N Methanol Chemical compound OC OKKJLVBELUTLKV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 24
- WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N Tetrahydrofuran Chemical compound C1CCOC1 WYURNTSHIVDZCO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 24
- 239000000074 antisense oligonucleotide Substances 0.000 description 22
- 238000012230 antisense oligonucleotides Methods 0.000 description 22
- YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N Dichloromethane Chemical compound ClCCl YMWUJEATGCHHMB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 21
- 102000040650 (ribonucleotides)n+m Human genes 0.000 description 17
- RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N Diethyl ether Chemical compound CCOCC RTZKZFJDLAIYFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 16
- YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N Furan Chemical compound C=1C=COC=1 YLQBMQCUIZJEEH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 13
- UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N Benzene Chemical compound C1=CC=CC=C1 UHOVQNZJYSORNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical compound CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 12
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 11
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 11
- HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N Chloroform Chemical compound ClC(Cl)Cl HEDRZPFGACZZDS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 10
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 10
- WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N Acetonitrile Chemical compound CC#N WEVYAHXRMPXWCK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N citric acid Chemical compound OC(=O)CC(O)(C(O)=O)CC(O)=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 238000001816 cooling Methods 0.000 description 9
- 239000000499 gel Substances 0.000 description 9
- 239000002904 solvent Substances 0.000 description 9
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N Acetic acid Chemical compound CC(O)=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N Hydrochloric acid Chemical compound Cl VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 8
- 238000001502 gel electrophoresis Methods 0.000 description 8
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 8
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 8
- 101710163270 Nuclease Proteins 0.000 description 7
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 7
- KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N palladium Substances [Pd] KDLHZDBZIXYQEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 7
- 230000008569 process Effects 0.000 description 7
- 239000000758 substrate Substances 0.000 description 7
- XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N Argon Chemical compound [Ar] XKRFYHLGVUSROY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical compound NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N Toluene Chemical compound CC1=CC=CC=C1 YXFVVABEGXRONW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 125000003118 aryl group Chemical group 0.000 description 6
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 6
- 125000001495 ethyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 6
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 6
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 5
- 230000007022 RNA scission Effects 0.000 description 5
- 230000000692 anti-sense effect Effects 0.000 description 5
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 description 5
- 150000001732 carboxylic acid derivatives Chemical class 0.000 description 5
- 239000000460 chlorine Substances 0.000 description 5
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 5
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 5
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 5
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 5
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 5
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 5
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 5
- UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N pyridine Natural products COC1=CC=CN=C1 UMJSCPRVCHMLSP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 238000000926 separation method Methods 0.000 description 5
- RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 1,4-Dioxane Chemical compound C1COCCO1 RYHBNJHYFVUHQT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;hydron;chloride Chemical compound Cl.OCC(N)(CO)CO QKNYBSVHEMOAJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N Ammonia chloride Chemical compound [NH4+].[Cl-] NLXLAEXVIDQMFP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- CTQNGGLPUBDAKN-UHFFFAOYSA-N O-Xylene Chemical compound CC1=CC=CC=C1C CTQNGGLPUBDAKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 108091000080 Phosphotransferase Proteins 0.000 description 4
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M Potassium chloride Chemical compound [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 4
- PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L Sodium Sulfate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]S([O-])(=O)=O PMZURENOXWZQFD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 4
- 108020004566 Transfer RNA Proteins 0.000 description 4
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 4
- 230000003197 catalytic effect Effects 0.000 description 4
- MVPPADPHJFYWMZ-UHFFFAOYSA-N chlorobenzene Chemical compound ClC1=CC=CC=C1 MVPPADPHJFYWMZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000004587 chromatography analysis Methods 0.000 description 4
- ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N dimethylformamide Substances CN(C)C=O ZMXDDKWLCZADIW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000000706 filtrate Substances 0.000 description 4
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 4
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 4
- 239000012074 organic phase Substances 0.000 description 4
- 102000020233 phosphotransferase Human genes 0.000 description 4
- 125000002924 primary amino group Chemical group [H]N([H])* 0.000 description 4
- 229910052938 sodium sulfate Inorganic materials 0.000 description 4
- 235000011152 sodium sulphate Nutrition 0.000 description 4
- 239000007790 solid phase Substances 0.000 description 4
- 239000007858 starting material Substances 0.000 description 4
- AQRLNPVMDITEJU-UHFFFAOYSA-N triethylsilane Chemical compound CC[SiH](CC)CC AQRLNPVMDITEJU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000008096 xylene Substances 0.000 description 4
- PBKONEOXTCPAFI-UHFFFAOYSA-N 1,2,4-trichlorobenzene Chemical compound ClC1=CC=C(Cl)C(Cl)=C1 PBKONEOXTCPAFI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- OSBLTNPMIGYQGY-UHFFFAOYSA-N 2-amino-2-(hydroxymethyl)propane-1,3-diol;2-[2-[bis(carboxymethyl)amino]ethyl-(carboxymethyl)amino]acetic acid;boric acid Chemical compound OB(O)O.OCC(N)(CO)CO.OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O OSBLTNPMIGYQGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M Acetate Chemical compound CC([O-])=O QTBSBXVTEAMEQO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N Acetic anhydride Chemical compound CC(=O)OC(C)=O WFDIJRYMOXRFFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N Acetone Chemical compound CC(C)=O CSCPPACGZOOCGX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N Ammonium hydroxide Chemical compound [NH4+].[OH-] VHUUQVKOLVNVRT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- QMMFVYPAHWMCMS-UHFFFAOYSA-N Dimethyl sulfide Chemical compound CSC QMMFVYPAHWMCMS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N Ethyl acetate Chemical compound CCOC(C)=O XEKOWRVHYACXOJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N Ethylene glycol Chemical compound OCCO LYCAIKOWRPUZTN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- SJRJJKPEHAURKC-UHFFFAOYSA-N N-Methylmorpholine Chemical compound CN1CCOCC1 SJRJJKPEHAURKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Natural products OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N Propylene glycol Chemical compound CC(O)CO DNIAPMSPPWPWGF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000008051 TBE buffer Substances 0.000 description 3
- 229960000583 acetic acid Drugs 0.000 description 3
- QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N ammonia Natural products N QGZKDVFQNNGYKY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000008346 aqueous phase Substances 0.000 description 3
- 229910052786 argon Inorganic materials 0.000 description 3
- JFDZBHWFFUWGJE-UHFFFAOYSA-N benzonitrile Chemical compound N#CC1=CC=CC=C1 JFDZBHWFFUWGJE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N bromophenol blue Chemical compound C1=C(Br)C(O)=C(Br)C=C1C1(C=2C=C(Br)C(O)=C(Br)C=2)C2=CC=CC=C2S(=O)(=O)O1 UDSAIICHUKSCKT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 125000002843 carboxylic acid group Chemical group 0.000 description 3
- 230000015556 catabolic process Effects 0.000 description 3
- 150000001768 cations Chemical class 0.000 description 3
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 3
- 238000006731 degradation reaction Methods 0.000 description 3
- 238000000502 dialysis Methods 0.000 description 3
- MTHSVFCYNBDYFN-UHFFFAOYSA-N diethylene glycol Chemical compound OCCOCCO MTHSVFCYNBDYFN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 125000004185 ester group Chemical group 0.000 description 3
- 230000032050 esterification Effects 0.000 description 3
- 238000005886 esterification reaction Methods 0.000 description 3
- 125000001301 ethoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])O* 0.000 description 3
- 238000004128 high performance liquid chromatography Methods 0.000 description 3
- 150000002430 hydrocarbons Chemical group 0.000 description 3
- VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N n-Hexane Chemical compound CCCCCC VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 125000001624 naphthyl group Chemical group 0.000 description 3
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 description 3
- 239000012071 phase Substances 0.000 description 3
- 125000000286 phenylethyl group Chemical group [H]C1=C([H])C([H])=C(C([H])=C1[H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 3
- 238000006116 polymerization reaction Methods 0.000 description 3
- 239000002002 slurry Substances 0.000 description 3
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 3
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 3
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 3
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 3
- FPGGTKZVZWFYPV-UHFFFAOYSA-M tetrabutylammonium fluoride Chemical compound [F-].CCCC[N+](CCCC)(CCCC)CCCC FPGGTKZVZWFYPV-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- UOCLXMDMGBRAIB-UHFFFAOYSA-N 1,1,1-trichloroethane Chemical compound CC(Cl)(Cl)Cl UOCLXMDMGBRAIB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- QPFMBZIOSGYJDE-UHFFFAOYSA-N 1,1,2,2-tetrachloroethane Chemical compound ClC(Cl)C(Cl)Cl QPFMBZIOSGYJDE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- RFFLAFLAYFXFSW-UHFFFAOYSA-N 1,2-dichlorobenzene Chemical compound ClC1=CC=CC=C1Cl RFFLAFLAYFXFSW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- MCTWTZJPVLRJOU-UHFFFAOYSA-N 1-methyl-1H-imidazole Chemical compound CN1C=CN=C1 MCTWTZJPVLRJOU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- PAMIQIKDUOTOBW-UHFFFAOYSA-N 1-methylpiperidine Chemical compound CN1CCCCC1 PAMIQIKDUOTOBW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XLLIQLLCWZCATF-UHFFFAOYSA-N 2-methoxyethyl acetate Chemical compound COCCOC(C)=O XLLIQLLCWZCATF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- YEJRWHAVMIAJKC-UHFFFAOYSA-N 4-Butyrolactone Chemical compound O=C1CCCO1 YEJRWHAVMIAJKC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- VHYFNPMBLIVWCW-UHFFFAOYSA-N 4-Dimethylaminopyridine Chemical compound CN(C)C1=CC=NC=C1 VHYFNPMBLIVWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OZJPLYNZGCXSJM-UHFFFAOYSA-N 5-valerolactone Chemical compound O=C1CCCCO1 OZJPLYNZGCXSJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N Acrylamide Chemical compound NC(=O)C=C HRPVXLWXLXDGHG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N Ammonium acetate Chemical compound N.CC(O)=O USFZMSVCRYTOJT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000005695 Ammonium acetate Substances 0.000 description 2
- CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N Carbon dioxide Chemical compound O=C=O CURLTUGMZLYLDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- XTHFKEDIFFGKHM-UHFFFAOYSA-N Dimethoxyethane Chemical compound COCCOC XTHFKEDIFFGKHM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-M Methanesulfonate Chemical compound CS([O-])(=O)=O AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- BAVYZALUXZFZLV-UHFFFAOYSA-N Methylamine Chemical compound NC BAVYZALUXZFZLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- KWYHDKDOAIKMQN-UHFFFAOYSA-N N,N,N',N'-tetramethylethylenediamine Chemical compound CN(C)CCN(C)C KWYHDKDOAIKMQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) Chemical compound CCN(C(C)C)C(C)C JGFZNNIVVJXRND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N N-Butanol Chemical compound CCCCO LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N N-Methylpyrrolidone Chemical compound CN1CCCC1=O SECXISVLQFMRJM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910002651 NO3 Inorganic materials 0.000 description 2
- NHNBFGGVMKEFGY-UHFFFAOYSA-N Nitrate Chemical compound [O-][N+]([O-])=O NHNBFGGVMKEFGY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 229910003849 O-Si Inorganic materials 0.000 description 2
- 229910003872 O—Si Inorganic materials 0.000 description 2
- VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N Silicium dioxide Chemical compound O=[Si]=O VYPSYNLAJGMNEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000039471 Small Nuclear RNA Human genes 0.000 description 2
- CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L Sodium Carbonate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]C([O-])=O CDBYLPFSWZWCQE-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L Sulfate Chemical compound [O-]S([O-])(=O)=O QAOWNCQODCNURD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- WCDYMMVGBZNUGB-ORPFKJIMSA-N [(2r,3r,4s,5r,6r)-6-[[(1r,3r,4r,5r,6r)-4,5-dihydroxy-2,7-dioxabicyclo[4.2.0]octan-3-yl]oxy]-3,4,5-trihydroxyoxan-2-yl]methyl 3-hydroxy-2-tetradecyloctadecanoate Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](COC(=O)C(CCCCCCCCCCCCCC)C(O)CCCCCCCCCCCCCCC)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H]2OC[C@H]2O1 WCDYMMVGBZNUGB-ORPFKJIMSA-N 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 2
- 125000003172 aldehyde group Chemical group 0.000 description 2
- 150000001336 alkenes Chemical class 0.000 description 2
- 229910021529 ammonia Inorganic materials 0.000 description 2
- 229940043376 ammonium acetate Drugs 0.000 description 2
- 235000019257 ammonium acetate Nutrition 0.000 description 2
- 235000019270 ammonium chloride Nutrition 0.000 description 2
- 239000000908 ammonium hydroxide Substances 0.000 description 2
- 235000011114 ammonium hydroxide Nutrition 0.000 description 2
- ROOXNKNUYICQNP-UHFFFAOYSA-N ammonium persulfate Chemical compound [NH4+].[NH4+].[O-]S(=O)(=O)OOS([O-])(=O)=O ROOXNKNUYICQNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000012736 aqueous medium Substances 0.000 description 2
- KGBXLFKZBHKPEV-UHFFFAOYSA-N boric acid Chemical compound OB(O)O KGBXLFKZBHKPEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000004327 boric acid Substances 0.000 description 2
- ILAHWRKJUDSMFH-UHFFFAOYSA-N boron tribromide Chemical compound BrB(Br)Br ILAHWRKJUDSMFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 125000005392 carboxamide group Chemical group NC(=O)* 0.000 description 2
- 125000003178 carboxy group Chemical group [H]OC(*)=O 0.000 description 2
- 230000008859 change Effects 0.000 description 2
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 2
- 239000012141 concentrate Substances 0.000 description 2
- 239000010949 copper Substances 0.000 description 2
- 230000008878 coupling Effects 0.000 description 2
- 238000010168 coupling process Methods 0.000 description 2
- 238000005859 coupling reaction Methods 0.000 description 2
- 238000010511 deprotection reaction Methods 0.000 description 2
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N dimethylselenoniopropionate Natural products CCC(O)=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 2
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 2
- 150000002168 ethanoic acid esters Chemical class 0.000 description 2
- 125000001072 heteroaryl group Chemical group 0.000 description 2
- 239000005457 ice water Substances 0.000 description 2
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 2
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 2
- 238000004255 ion exchange chromatography Methods 0.000 description 2
- 150000002500 ions Chemical class 0.000 description 2
- ULYZAYCEDJDHCC-UHFFFAOYSA-N isopropyl chloride Chemical compound CC(C)Cl ULYZAYCEDJDHCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 125000005647 linker group Chemical group 0.000 description 2
- 239000012160 loading buffer Substances 0.000 description 2
- 230000014759 maintenance of location Effects 0.000 description 2
- 230000013011 mating Effects 0.000 description 2
- VNWKTOKETHGBQD-UHFFFAOYSA-N methane Chemical compound C VNWKTOKETHGBQD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- OJURWUUOVGOHJZ-UHFFFAOYSA-N methyl 2-[(2-acetyloxyphenyl)methyl-[2-[(2-acetyloxyphenyl)methyl-(2-methoxy-2-oxoethyl)amino]ethyl]amino]acetate Chemical compound C=1C=CC=C(OC(C)=O)C=1CN(CC(=O)OC)CCN(CC(=O)OC)CC1=CC=CC=C1OC(C)=O OJURWUUOVGOHJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LQNUZADURLCDLV-UHFFFAOYSA-N nitrobenzene Chemical compound [O-][N+](=O)C1=CC=CC=C1 LQNUZADURLCDLV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CTSLXHKWHWQRSH-UHFFFAOYSA-N oxalyl chloride Chemical compound ClC(=O)C(Cl)=O CTSLXHKWHWQRSH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000008188 pellet Substances 0.000 description 2
- LLYCMZGLHLKPPU-UHFFFAOYSA-M perbromate Chemical compound [O-]Br(=O)(=O)=O LLYCMZGLHLKPPU-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- SUSQOBVLVYHIEX-UHFFFAOYSA-N phenylacetonitrile Chemical compound N#CCC1=CC=CC=C1 SUSQOBVLVYHIEX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-M phosphonate Chemical compound [O-]P(=O)=O UEZVMMHDMIWARA-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 150000008300 phosphoramidites Chemical class 0.000 description 2
- 239000003880 polar aprotic solvent Substances 0.000 description 2
- 239000001103 potassium chloride Substances 0.000 description 2
- 235000011164 potassium chloride Nutrition 0.000 description 2
- 125000001436 propyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 2
- 238000010992 reflux Methods 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 230000002441 reversible effect Effects 0.000 description 2
- 239000012146 running buffer Substances 0.000 description 2
- JPJALAQPGMAKDF-UHFFFAOYSA-N selenium dioxide Chemical compound O=[Se]=O JPJALAQPGMAKDF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 108091029842 small nuclear ribonucleic acid Proteins 0.000 description 2
- HHVIBTZHLRERCL-UHFFFAOYSA-N sulfonyldimethane Chemical compound CS(C)(=O)=O HHVIBTZHLRERCL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 2
- 239000010936 titanium Substances 0.000 description 2
- YNJBWRMUSHSURL-UHFFFAOYSA-N trichloroacetic acid Chemical group OC(=O)C(Cl)(Cl)Cl YNJBWRMUSHSURL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- ITMCEJHCFYSIIV-UHFFFAOYSA-N triflic acid Chemical compound OS(=O)(=O)C(F)(F)F ITMCEJHCFYSIIV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N trimethylamine Chemical compound CN(C)C GETQZCLCWQTVFV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K tripotassium phosphate Chemical compound [K+].[K+].[K+].[O-]P([O-])([O-])=O LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 239000011701 zinc Substances 0.000 description 2
- IWZSHWBGHQBIML-ZGGLMWTQSA-N (3S,8S,10R,13S,14S,17S)-17-isoquinolin-7-yl-N,N,10,13-tetramethyl-2,3,4,7,8,9,11,12,14,15,16,17-dodecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-3-amine Chemical compound CN(C)[C@H]1CC[C@]2(C)C3CC[C@@]4(C)[C@@H](CC[C@@H]4c4ccc5ccncc5c4)[C@@H]3CC=C2C1 IWZSHWBGHQBIML-ZGGLMWTQSA-N 0.000 description 1
- LYNDWSARZJHIKU-UHFFFAOYSA-N (4-methylphenyl)phosphonic acid Chemical compound CC1=CC=C(P(O)(O)=O)C=C1 LYNDWSARZJHIKU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AVQQQNCBBIEMEU-UHFFFAOYSA-N 1,1,3,3-tetramethylurea Chemical compound CN(C)C(=O)N(C)C AVQQQNCBBIEMEU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WSLDOOZREJYCGB-UHFFFAOYSA-N 1,2-Dichloroethane Chemical compound ClCCCl WSLDOOZREJYCGB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LZDKZFUFMNSQCJ-UHFFFAOYSA-N 1,2-diethoxyethane Chemical compound CCOCCOCC LZDKZFUFMNSQCJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KPZGRMZPZLOPBS-UHFFFAOYSA-N 1,3-dichloro-2,2-bis(chloromethyl)propane Chemical compound ClCC(CCl)(CCl)CCl KPZGRMZPZLOPBS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LFRBFOYGUABPKX-UHFFFAOYSA-N 1-(2-bromo-1h-pyridin-2-yl)ethanone Chemical compound CC(=O)C1(Br)NC=CC=C1 LFRBFOYGUABPKX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DURPTKYDGMDSBL-UHFFFAOYSA-N 1-butoxybutane Chemical compound CCCCOCCCC DURPTKYDGMDSBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RRQYJINTUHWNHW-UHFFFAOYSA-N 1-ethoxy-2-(2-ethoxyethoxy)ethane Chemical compound CCOCCOCCOCC RRQYJINTUHWNHW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- MBDUIEKYVPVZJH-UHFFFAOYSA-N 1-ethylsulfonylethane Chemical compound CCS(=O)(=O)CC MBDUIEKYVPVZJH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VNHGETRQQSYUGZ-UHFFFAOYSA-N 1-nitro-2-phenoxybenzene Chemical compound [O-][N+](=O)C1=CC=CC=C1OC1=CC=CC=C1 VNHGETRQQSYUGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IKMBXKGUMLSBOT-UHFFFAOYSA-N 2,3,4,5,6-pentafluorobenzenesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)C1=C(F)C(F)=C(F)C(F)=C1F IKMBXKGUMLSBOT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SMZOUWXMTYCWNB-UHFFFAOYSA-N 2-(2-methoxy-5-methylphenyl)ethanamine Chemical compound COC1=CC=C(C)C=C1CCN SMZOUWXMTYCWNB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SBASXUCJHJRPEV-UHFFFAOYSA-N 2-(2-methoxyethoxy)ethanol Chemical compound COCCOCCO SBASXUCJHJRPEV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XNWFRZJHXBZDAG-UHFFFAOYSA-N 2-METHOXYETHANOL Chemical compound COCCO XNWFRZJHXBZDAG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N 2-Propenoic acid Natural products OC(=O)C=C NIXOWILDQLNWCW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IUVCFHHAEHNCFT-INIZCTEOSA-N 2-[(1s)-1-[4-amino-3-(3-fluoro-4-propan-2-yloxyphenyl)pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]ethyl]-6-fluoro-3-(3-fluorophenyl)chromen-4-one Chemical compound C1=C(F)C(OC(C)C)=CC=C1C(C1=C(N)N=CN=C11)=NN1[C@@H](C)C1=C(C=2C=C(F)C=CC=2)C(=O)C2=CC(F)=CC=C2O1 IUVCFHHAEHNCFT-INIZCTEOSA-N 0.000 description 1
- CGMMPMYKMDITEA-UHFFFAOYSA-N 2-ethylbenzoic acid Chemical compound CCC1=CC=CC=C1C(O)=O CGMMPMYKMDITEA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- VKIGAWAEXPTIOL-UHFFFAOYSA-N 2-hydroxyhexanenitrile Chemical compound CCCCC(O)C#N VKIGAWAEXPTIOL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ULKFLOVGORAZDI-UHFFFAOYSA-N 3,3-dimethyloxetan-2-one Chemical compound CC1(C)COC1=O ULKFLOVGORAZDI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PXACTUVBBMDKRW-UHFFFAOYSA-M 4-bromobenzenesulfonate Chemical compound [O-]S(=O)(=O)C1=CC=C(Br)C=C1 PXACTUVBBMDKRW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- BSDGZUDFPKIYQG-UHFFFAOYSA-N 4-bromopyridine Chemical compound BrC1=CC=NC=C1 BSDGZUDFPKIYQG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZHNFOHFZWIRCNY-UHFFFAOYSA-N 4-ethoxybenzenesulfonic acid Chemical compound CCOC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 ZHNFOHFZWIRCNY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000191291 Abies alba Species 0.000 description 1
- 108020000948 Antisense Oligonucleotides Proteins 0.000 description 1
- DJHGAFSJWGLOIV-UHFFFAOYSA-K Arsenate3- Chemical compound [O-][As]([O-])([O-])=O DJHGAFSJWGLOIV-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M Bicarbonate Chemical compound OC([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N Bromine atom Chemical compound [Br] WKBOTKDWSSQWDR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-M Butyrate Chemical compound CCCC([O-])=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N Butyric acid Natural products CCCC(O)=O FERIUCNNQQJTOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004406 C3-C8 cycloalkylene group Chemical group 0.000 description 1
- 244000025254 Cannabis sativa Species 0.000 description 1
- 235000012766 Cannabis sativa ssp. sativa var. sativa Nutrition 0.000 description 1
- 235000012765 Cannabis sativa ssp. sativa var. spontanea Nutrition 0.000 description 1
- BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L Carbonate Chemical compound [O-]C([O-])=O BVKZGUZCCUSVTD-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 108091092236 Chimeric RNA Proteins 0.000 description 1
- VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M Chloride anion Chemical compound [Cl-] VEXZGXHMUGYJMC-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N Chlorine atom Chemical compound [Cl] ZAMOUSCENKQFHK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108020004635 Complementary DNA Proteins 0.000 description 1
- RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N Copper Chemical compound [Cu] RYGMFSIKBFXOCR-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920000742 Cotton Polymers 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- UNXHWFMMPAWVPI-QWWZWVQMSA-N D-threitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@H](O)CO UNXHWFMMPAWVPI-QWWZWVQMSA-N 0.000 description 1
- 230000007018 DNA scission Effects 0.000 description 1
- 229920002307 Dextran Polymers 0.000 description 1
- QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N Dicylcohexylcarbodiimide Chemical compound C1CCCCC1N=C=NC1CCCCC1 QOSSAOTZNIDXMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SNRUBQQJIBEYMU-UHFFFAOYSA-N Dodecane Natural products CCCCCCCCCCCC SNRUBQQJIBEYMU-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102100030011 Endoribonuclease Human genes 0.000 description 1
- 108010093099 Endoribonucleases Proteins 0.000 description 1
- UNXHWFMMPAWVPI-UHFFFAOYSA-N Erythritol Natural products OCC(O)C(O)CO UNXHWFMMPAWVPI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IAYPIBMASNFSPL-UHFFFAOYSA-N Ethylene oxide Chemical group C1CO1 IAYPIBMASNFSPL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N Fluorine Chemical compound FF PXGOKWXKJXAPGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-M Formate Chemical compound [O-]C=O BDAGIHXWWSANSR-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229920002527 Glycogen Polymers 0.000 description 1
- 239000004866 Hashish Substances 0.000 description 1
- UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N Hydrogen Chemical compound [H][H] UFHFLCQGNIYNRP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108090000604 Hydrolases Proteins 0.000 description 1
- 102000004157 Hydrolases Human genes 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- 102000014150 Interferons Human genes 0.000 description 1
- 108010050904 Interferons Proteins 0.000 description 1
- KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N Isopropanol Chemical compound CC(C)O KFZMGEQAYNKOFK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000002841 Lewis acid Substances 0.000 description 1
- WHXSMMKQMYFTQS-UHFFFAOYSA-N Lithium Chemical compound [Li] WHXSMMKQMYFTQS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N Methanesulfonic acid Chemical compound CS(O)(=O)=O AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- RJUFJBKOKNCXHH-UHFFFAOYSA-N Methyl propionate Chemical compound CCC(=O)OC RJUFJBKOKNCXHH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FXHOOIRPVKKKFG-UHFFFAOYSA-N N,N-Dimethylacetamide Chemical compound CN(C)C(C)=O FXHOOIRPVKKKFG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SUAKHGWARZSWIH-UHFFFAOYSA-N N,N‐diethylformamide Chemical compound CCN(CC)C=O SUAKHGWARZSWIH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N N-Hydroxysuccinimide Chemical compound ON1C(=O)CCC1=O NQTADLQHYWFPDB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZWXPDGCFMMFNRW-UHFFFAOYSA-N N-methylcaprolactam Chemical compound CN1CCCCCC1=O ZWXPDGCFMMFNRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101100014539 Neurospora crassa (strain ATCC 24698 / 74-OR23-1A / CBS 708.71 / DSM 1257 / FGSC 987) get-1 gene Proteins 0.000 description 1
- 102000043276 Oncogene Human genes 0.000 description 1
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 1
- 208000017787 Paraneoplastic neurologic syndrome Diseases 0.000 description 1
- ABLZXFCXXLZCGV-UHFFFAOYSA-N Phosphorous acid Chemical class OP(O)=O ABLZXFCXXLZCGV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010021757 Polynucleotide 5'-Hydroxyl-Kinase Proteins 0.000 description 1
- 102000008422 Polynucleotide 5'-hydroxyl-kinase Human genes 0.000 description 1
- ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N Potassium Chemical compound [K] ZLMJMSJWJFRBEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M Potassium hydroxide Chemical compound [OH-].[K+] KWYUFKZDYYNOTN-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-M Propionate Chemical compound CCC([O-])=O XBDQKXXYIPTUBI-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 102000006382 Ribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010083644 Ribonucleases Proteins 0.000 description 1
- KJTLSVCANCCWHF-UHFFFAOYSA-N Ruthenium Chemical compound [Ru] KJTLSVCANCCWHF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 244000007853 Sarothamnus scoparius Species 0.000 description 1
- 108020004682 Single-Stranded DNA Proteins 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- PPBRXRYQALVLMV-UHFFFAOYSA-N Styrene Chemical group C=CC1=CC=CC=C1 PPBRXRYQALVLMV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N Sulfur Chemical compound [S] NINIDFKCEFEMDL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 240000005572 Syzygium cordatum Species 0.000 description 1
- 235000006650 Syzygium cordatum Nutrition 0.000 description 1
- RTAQQCXQSZGOHL-UHFFFAOYSA-N Titanium Chemical compound [Ti] RTAQQCXQSZGOHL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000004357 Transferases Human genes 0.000 description 1
- 108090000992 Transferases Proteins 0.000 description 1
- 229910052770 Uranium Inorganic materials 0.000 description 1
- 108020000999 Viral RNA Proteins 0.000 description 1
- HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N Zinc Chemical compound [Zn] HCHKCACWOHOZIP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UXINPVXORRRJKX-UHFFFAOYSA-N [6-(acetyloxymethyl)-4-bromopyridin-2-yl]methyl acetate Chemical compound CC(=O)OCC1=CC(Br)=CC(COC(C)=O)=N1 UXINPVXORRRJKX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- IPBVNPXQWQGGJP-UHFFFAOYSA-N acetic acid phenyl ester Natural products CC(=O)OC1=CC=CC=C1 IPBVNPXQWQGGJP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- DPXJVFZANSGRMM-UHFFFAOYSA-N acetic acid;2,3,4,5,6-pentahydroxyhexanal;sodium Chemical compound [Na].CC(O)=O.OCC(O)C(O)C(O)C(O)C=O DPXJVFZANSGRMM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- PNZVFASWDSMJER-UHFFFAOYSA-N acetic acid;lead Chemical compound [Pb].CC(O)=O PNZVFASWDSMJER-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002378 acidificating effect Effects 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 238000001042 affinity chromatography Methods 0.000 description 1
- 150000001298 alcohols Chemical class 0.000 description 1
- 229910052784 alkaline earth metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 125000004450 alkenylene group Chemical group 0.000 description 1
- 125000003545 alkoxy group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004419 alkynylene group Chemical group 0.000 description 1
- IYABWNGZIDDRAK-UHFFFAOYSA-N allene Chemical group C=C=C IYABWNGZIDDRAK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004075 alteration Effects 0.000 description 1
- 229910052782 aluminium Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000002862 amidating effect Effects 0.000 description 1
- 238000007112 amidation reaction Methods 0.000 description 1
- 150000001409 amidines Chemical class 0.000 description 1
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 1
- 125000002431 aminoalkoxy group Chemical group 0.000 description 1
- VAZSKTXWXKYQJF-UHFFFAOYSA-N ammonium persulfate Chemical compound [NH4+].[NH4+].[O-]S(=O)OOS([O-])=O VAZSKTXWXKYQJF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229910001870 ammonium persulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019395 ammonium persulphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000003242 anti bacterial agent Substances 0.000 description 1
- 229940088710 antibiotic agent Drugs 0.000 description 1
- 125000001204 arachidyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 229940000489 arsenate Drugs 0.000 description 1
- 125000000732 arylene group Chemical group 0.000 description 1
- 230000001174 ascending effect Effects 0.000 description 1
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 1
- 239000012298 atmosphere Substances 0.000 description 1
- 150000001555 benzenes Chemical class 0.000 description 1
- SRSXLGNVWSONIS-UHFFFAOYSA-M benzenesulfonate Chemical compound [O-]S(=O)(=O)C1=CC=CC=C1 SRSXLGNVWSONIS-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N benzoic acid Chemical compound OC(=O)C1=CC=CC=C1 WPYMKLBDIGXBTP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OGBVRMYSNSKIEF-UHFFFAOYSA-L benzyl-dioxido-oxo-$l^{5}-phosphane Chemical compound [O-]P([O-])(=O)CC1=CC=CC=C1 OGBVRMYSNSKIEF-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 239000011230 binding agent Substances 0.000 description 1
- 230000000975 bioactive effect Effects 0.000 description 1
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 1
- GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N bromine Substances BrBr GDTBXPJZTBHREO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ODWXUNBKCRECNW-UHFFFAOYSA-M bromocopper(1+) Chemical compound Br[Cu+] ODWXUNBKCRECNW-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 239000004067 bulking agent Substances 0.000 description 1
- QDHFHIQKOVNCNC-UHFFFAOYSA-N butane-1-sulfonic acid Chemical compound CCCCS(O)(=O)=O QDHFHIQKOVNCNC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002837 carbocyclic group Chemical group 0.000 description 1
- 150000001718 carbodiimides Chemical class 0.000 description 1
- 239000001569 carbon dioxide Substances 0.000 description 1
- 229910002092 carbon dioxide Inorganic materials 0.000 description 1
- ZFOLVCBZIXDRBJ-UHFFFAOYSA-N carbonic acid;perchloric acid Chemical compound OC(O)=O.OCl(=O)(=O)=O ZFOLVCBZIXDRBJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001728 carbonyl compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000001768 carboxy methyl cellulose Substances 0.000 description 1
- 150000001733 carboxylic acid esters Chemical class 0.000 description 1
- 230000019522 cellular metabolic process Effects 0.000 description 1
- 239000003610 charcoal Substances 0.000 description 1
- 238000009833 condensation Methods 0.000 description 1
- 230000005494 condensation Effects 0.000 description 1
- 238000010276 construction Methods 0.000 description 1
- 239000005289 controlled pore glass Substances 0.000 description 1
- 150000001879 copper Chemical class 0.000 description 1
- BPLKXBNWXRMHRE-UHFFFAOYSA-N copper;1,10-phenanthroline Chemical compound [Cu].C1=CN=C2C3=NC=CC=C3C=CC2=C1 BPLKXBNWXRMHRE-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002993 cycloalkylene group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001995 cyclobutyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000000582 cycloheptyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000000113 cyclohexyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000004956 cyclohexylene group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000640 cyclooctyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C([H])([H])C([H])([H])C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000001511 cyclopentyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(*)C1([H])[H] 0.000 description 1
- 125000004979 cyclopentylene group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001559 cyclopropyl group Chemical group [H]C1([H])C([H])([H])C1([H])* 0.000 description 1
- 230000016396 cytokine production Effects 0.000 description 1
- 125000002704 decyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 239000005547 deoxyribonucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000002637 deoxyribonucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- NPOMSUOUAZCMBL-UHFFFAOYSA-N dichloromethane;ethoxyethane Chemical compound ClCCl.CCOCC NPOMSUOUAZCMBL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940019778 diethylene glycol diethyl ether Drugs 0.000 description 1
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 1
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 1
- QLZHNIAADXEJJP-UHFFFAOYSA-L dioxido-oxo-phenyl-$l^{5}-phosphane Chemical compound [O-]P([O-])(=O)C1=CC=CC=C1 QLZHNIAADXEJJP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- CEALXSHFPPCRNM-UHFFFAOYSA-L disodium;carboxylato carbonate Chemical compound [Na+].[Na+].[O-]C(=O)OC([O-])=O CEALXSHFPPCRNM-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 1
- 125000003438 dodecyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- IOIFRTZBJMZZFO-UHFFFAOYSA-N dysprosium(3+) Chemical compound [Dy+3] IOIFRTZBJMZZFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000012149 elution buffer Substances 0.000 description 1
- 239000003995 emulsifying agent Substances 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- CCIVGXIOQKPBKL-UHFFFAOYSA-M ethanesulfonate Chemical compound CCS([O-])(=O)=O CCIVGXIOQKPBKL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- GATNOFPXSDHULC-UHFFFAOYSA-N ethylphosphonic acid Chemical compound CCP(O)(O)=O GATNOFPXSDHULC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LNBHUCHAFZUEGJ-UHFFFAOYSA-N europium(3+) Chemical compound [Eu+3] LNBHUCHAFZUEGJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NNMXSTWQJRPBJZ-UHFFFAOYSA-K europium(iii) chloride Chemical compound Cl[Eu](Cl)Cl NNMXSTWQJRPBJZ-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 description 1
- 239000011737 fluorine Substances 0.000 description 1
- 229910052731 fluorine Inorganic materials 0.000 description 1
- QEWYKACRFQMRMB-UHFFFAOYSA-M fluoroacetate Chemical compound [O-]C(=O)CF QEWYKACRFQMRMB-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 1
- 238000004108 freeze drying Methods 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 1
- 238000005227 gel permeation chromatography Methods 0.000 description 1
- 239000012362 glacial acetic acid Substances 0.000 description 1
- 229940096919 glycogen Drugs 0.000 description 1
- 239000010931 gold Substances 0.000 description 1
- 150000002357 guanidines Chemical class 0.000 description 1
- 229940083094 guanine derivative acting on arteriolar smooth muscle Drugs 0.000 description 1
- 150000008282 halocarbons Chemical class 0.000 description 1
- 229910052736 halogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000002367 halogens Chemical class 0.000 description 1
- 125000003187 heptyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- GNOIPBMMFNIUFM-UHFFFAOYSA-N hexamethylphosphoric triamide Chemical compound CN(C)P(=O)(N(C)C)N(C)C GNOIPBMMFNIUFM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004051 hexyl group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])* 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- AFQIYTIJXGTIEY-UHFFFAOYSA-N hydrogen carbonate;triethylazanium Chemical compound OC(O)=O.CCN(CC)CC AFQIYTIJXGTIEY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004356 hydroxy functional group Chemical group O* 0.000 description 1
- 125000005113 hydroxyalkoxy group Chemical group 0.000 description 1
- 125000004029 hydroxymethyl group Chemical group [H]OC([H])([H])* 0.000 description 1
- 125000002883 imidazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001841 imino group Chemical group [H]N=* 0.000 description 1
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 1
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 description 1
- 229940060367 inert ingredients Drugs 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 239000003978 infusion fluid Substances 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 229910052500 inorganic mineral Inorganic materials 0.000 description 1
- 229940079322 interferon Drugs 0.000 description 1
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 1
- 238000005342 ion exchange Methods 0.000 description 1
- 230000002427 irreversible effect Effects 0.000 description 1
- 238000002955 isolation Methods 0.000 description 1
- 125000003253 isopropoxy group Chemical group [H]C([H])([H])C([H])(O*)C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 150000002540 isothiocyanates Chemical class 0.000 description 1
- 125000000468 ketone group Chemical group 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 150000003951 lactams Chemical class 0.000 description 1
- 150000002596 lactones Chemical class 0.000 description 1
- 229910021644 lanthanide ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 150000007517 lewis acids Chemical class 0.000 description 1
- 229910052744 lithium Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- DVSDBMFJEQPWNO-UHFFFAOYSA-N methyllithium Chemical compound C[Li] DVSDBMFJEQPWNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- YACKEPLHDIMKIO-UHFFFAOYSA-N methylphosphonic acid Chemical compound CP(O)(O)=O YACKEPLHDIMKIO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000011707 mineral Substances 0.000 description 1
- 235000010755 mineral Nutrition 0.000 description 1
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 1
- HDZGCSFEDULWCS-UHFFFAOYSA-N monomethylhydrazine Chemical compound CNN HDZGCSFEDULWCS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000000465 moulding Methods 0.000 description 1
- 125000001421 myristyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- ZIUHHBKFKCYYJD-UHFFFAOYSA-N n,n'-methylenebisacrylamide Chemical compound C=CC(=O)NCNC(=O)C=C ZIUHHBKFKCYYJD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004957 naphthylene group Chemical group 0.000 description 1
- QZGIWPZCWHMVQL-UIYAJPBUSA-N neocarzinostatin chromophore Chemical compound O1[C@H](C)[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](NC)[C@H]1O[C@@H]1C/2=C/C#C[C@H]3O[C@@]3([C@@H]3OC(=O)OC3)C#CC\2=C[C@H]1OC(=O)C1=C(O)C=CC2=C(C)C=C(OC)C=C12 QZGIWPZCWHMVQL-UIYAJPBUSA-N 0.000 description 1
- PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N nickel Substances [Ni] PXHVJJICTQNCMI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000002825 nitriles Chemical class 0.000 description 1
- 108091027963 non-coding RNA Proteins 0.000 description 1
- 102000042567 non-coding RNA Human genes 0.000 description 1
- 125000001196 nonadecyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000001400 nonyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 125000002347 octyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 238000006384 oligomerization reaction Methods 0.000 description 1
- 230000003204 osmotic effect Effects 0.000 description 1
- 125000002971 oxazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 1
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 1
- 238000007248 oxidative elimination reaction Methods 0.000 description 1
- YJVFFLUZDVXJQI-UHFFFAOYSA-L palladium(ii) acetate Chemical compound [Pd+2].CC([O-])=O.CC([O-])=O YJVFFLUZDVXJQI-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- NFHFRUOZVGFOOS-UHFFFAOYSA-N palladium;triphenylphosphane Chemical compound [Pd].C1=CC=CC=C1P(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1.C1=CC=CC=C1P(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1.C1=CC=CC=C1P(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1.C1=CC=CC=C1P(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 NFHFRUOZVGFOOS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000913 palmityl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 238000007911 parenteral administration Methods 0.000 description 1
- 125000002958 pentadecyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- QPCDCPDFJACHGM-UHFFFAOYSA-K pentetate(3-) Chemical compound OC(=O)CN(CC([O-])=O)CCN(CC([O-])=O)CCN(CC(O)=O)CC([O-])=O QPCDCPDFJACHGM-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 125000001147 pentyl group Chemical group C(CCCC)* 0.000 description 1
- LDUTUIZOVBBNCS-UHFFFAOYSA-N perchloric acid phosphoric acid Chemical compound OP(O)(O)=O.OCl(=O)(=O)=O LDUTUIZOVBBNCS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KHIWWQKSHDUIBK-UHFFFAOYSA-N periodic acid Chemical compound OI(=O)(=O)=O KHIWWQKSHDUIBK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940049953 phenylacetate Drugs 0.000 description 1
- WLJVXDMOQOGPHL-UHFFFAOYSA-N phenylacetic acid Chemical compound OC(=O)CC1=CC=CC=C1 WLJVXDMOQOGPHL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NIXKBAZVOQAHGC-UHFFFAOYSA-N phenylmethanesulfonic acid Chemical compound OS(=O)(=O)CC1=CC=CC=C1 NIXKBAZVOQAHGC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 125000002467 phosphate group Chemical group [H]OP(=O)(O[H])O[*] 0.000 description 1
- 239000011574 phosphorus Substances 0.000 description 1
- 229910000073 phosphorus hydride Inorganic materials 0.000 description 1
- BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N platinum Substances [Pt] BASFCYQUMIYNBI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229920002401 polyacrylamide Polymers 0.000 description 1
- 239000011591 potassium Substances 0.000 description 1
- 229910000160 potassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011009 potassium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N propan-1-ol Chemical compound CCCO BDERNNFJNOPAEC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KCXFHTAICRTXLI-UHFFFAOYSA-N propane-1-sulfonic acid Chemical compound CCCS(O)(=O)=O KCXFHTAICRTXLI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000019260 propionic acid Nutrition 0.000 description 1
- FVSKHRXBFJPNKK-UHFFFAOYSA-N propionitrile Chemical compound CCC#N FVSKHRXBFJPNKK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000004076 pyridyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000000168 pyrrolyl group Chemical group 0.000 description 1
- IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N quinbolone Chemical compound O([C@H]1CC[C@H]2[C@H]3[C@@H]([C@]4(C=CC(=O)C=C4CC3)C)CC[C@@]21C)C1=CCCC1 IUVKMZGDUIUOCP-BTNSXGMBSA-N 0.000 description 1
- 238000001953 recrystallisation Methods 0.000 description 1
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 1
- 238000004007 reversed phase HPLC Methods 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 150000003283 rhodium Chemical class 0.000 description 1
- 239000010948 rhodium Substances 0.000 description 1
- 239000002342 ribonucleoside Substances 0.000 description 1
- 239000012047 saturated solution Substances 0.000 description 1
- 125000003198 secondary alcohol group Chemical group 0.000 description 1
- 230000009834 selective interaction Effects 0.000 description 1
- 125000003607 serino group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])C(O[H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000000741 silica gel Substances 0.000 description 1
- 229910002027 silica gel Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000010944 silver (metal) Substances 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000012279 sodium borohydride Substances 0.000 description 1
- 229910000033 sodium borohydride Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910000029 sodium carbonate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019812 sodium carboxymethyl cellulose Nutrition 0.000 description 1
- 229920001027 sodium carboxymethylcellulose Polymers 0.000 description 1
- 239000012265 solid product Substances 0.000 description 1
- 239000011877 solvent mixture Substances 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 1
- 230000000087 stabilizing effect Effects 0.000 description 1
- 125000004079 stearyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 239000004575 stone Substances 0.000 description 1
- 229960002317 succinimide Drugs 0.000 description 1
- NVBFHJWHLNUMCV-UHFFFAOYSA-N sulfamide Chemical compound NS(N)(=O)=O NVBFHJWHLNUMCV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- HXJUTPCZVOIRIF-UHFFFAOYSA-N sulfolane Chemical compound O=S1(=O)CCCC1 HXJUTPCZVOIRIF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 229940124530 sulfonamide Drugs 0.000 description 1
- 150000003456 sulfonamides Chemical class 0.000 description 1
- 150000003871 sulfonates Chemical class 0.000 description 1
- 150000003457 sulfones Chemical class 0.000 description 1
- 150000003462 sulfoxides Chemical class 0.000 description 1
- 239000011593 sulfur Substances 0.000 description 1
- 125000000999 tert-butyl group Chemical group [H]C([H])([H])C(*)(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- ISXSCDLOGDJUNJ-UHFFFAOYSA-N tert-butyl prop-2-enoate Chemical compound CC(C)(C)OC(=O)C=C ISXSCDLOGDJUNJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000001981 tert-butyldimethylsilyl group Chemical group [H]C([H])([H])[Si]([H])(C([H])([H])[H])[*]C(C([H])([H])[H])(C([H])([H])[H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 150000003512 tertiary amines Chemical class 0.000 description 1
- ISXOBTBCNRIIQO-UHFFFAOYSA-N tetrahydrothiophene 1-oxide Chemical compound O=S1CCCC1 ISXOBTBCNRIIQO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003536 tetrazoles Chemical class 0.000 description 1
- 125000000335 thiazolyl group Chemical group 0.000 description 1
- 125000001544 thienyl group Chemical group 0.000 description 1
- FCFMKFHUNDYKEG-UHFFFAOYSA-N thietane 1,1-dioxide Chemical compound O=S1(=O)CCC1 FCFMKFHUNDYKEG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003573 thiols Chemical class 0.000 description 1
- ZWZVWGITAAIFPS-UHFFFAOYSA-N thiophosgene Chemical compound ClC(Cl)=S ZWZVWGITAAIFPS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-M toluene-4-sulfonate Chemical compound CC1=CC=C(S([O-])(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 1
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 230000002110 toxicologic effect Effects 0.000 description 1
- 231100000027 toxicology Toxicity 0.000 description 1
- 125000002889 tridecyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-O triethylammonium ion Chemical compound CC[NH+](CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-O 0.000 description 1
- ITMCEJHCFYSIIV-UHFFFAOYSA-M triflate Chemical compound [O-]S(=O)(=O)C(F)(F)F ITMCEJHCFYSIIV-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- YFNKIDBQEZZDLK-UHFFFAOYSA-N triglyme Chemical compound COCCOCCOCCOC YFNKIDBQEZZDLK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical compound OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000002948 undecyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- 210000002700 urine Anatomy 0.000 description 1
- 210000003462 vein Anatomy 0.000 description 1
- 238000005303 weighing Methods 0.000 description 1
- UTODFRQBVUVYOB-UHFFFAOYSA-P wilkinson's catalyst Chemical compound [Cl-].C1=CC=CC=C1P(C=1C=CC=CC=1)(C=1C=CC=CC=1)[Rh+](P(C=1C=CC=CC=1)(C=1C=CC=CC=1)C=1C=CC=CC=1)P(C=1C=CC=CC=1)(C=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 UTODFRQBVUVYOB-UHFFFAOYSA-P 0.000 description 1
- 239000011995 wilkinson's catalyst Substances 0.000 description 1
- 229950009268 zinostatin Drugs 0.000 description 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K41/00—Medicinal preparations obtained by treating materials with wave energy or particle radiation ; Therapies using these preparations
- A61K41/0042—Photocleavage of drugs in vivo, e.g. cleavage of photolabile linkers in vivo by UV radiation for releasing the pharmacologically-active agent from the administered agent; photothrombosis or photoocclusion
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
- A61P31/12—Antivirals
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Public Health (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Virology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Immunology (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Oncology (AREA)
- Communicable Diseases (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Saccharide Compounds (AREA)
Description
SVÁJC
A nemzetközi bejelentés száma: PCT/EP95/03408
A nemzetközi közzététel száma: WO 96/07667
A találmány tárgyát olyan oligonukleotid konjugátumok képezik, amelyekben az oligonukleotid dezoxiribonukleinsav, nem természetes, szintetikus nukleotid vagy peptidnukleinsav építőelemekből épül fel, az oligonukleotidhoz átészterező vagy hidrolizáló katalizátor — előnyösen texafirin-fém-komplex — kötődik, és az oligonukleotid belső szekvenciája részben nem-komplementer egy természetben előforduló cél-RNS-sel.
A találmány szerinti oligonukleotid konjugátumok kiválóan alkalmasak komplementer cél-RNS hasítására, ahol az oligonukleotid a hasítási reakció után újra szabaddá válik és ezáltal katalitikus hatást fejt ki.
Gyógyászatban diagnosztikai és terápiás célra alkalmazható.
c (°)A( v 9
63.455/PA
II-,
Tíleíon: 34 ;‘H ko-Ha
·. Andrássy úí ι1 ,
-24-950, Fax: 34-24-323
Ribonukleinsavak hasítására szolgáló oligonukleotid konjugátumok, készítmények és eljárás
Novartis AG, BÁZEL, SVÁJC
Feltalálók: HÜSKEN, Dieter, | FREIBURG, | NÉMETORSZÁG |
MOSER, Heinz, | MÖHLIN, | SVÁJC |
HÁNER, Róbert, | FEHREN, | SVÁJC |
HALL, Jonathan, | DONNERBÜHLWEG, SVÁJC |
A bejelentés napja:
1995
Elsőbbsége
1994. 09. 02. (2694/94-5),
SVÁJC
A nemzetközi bejelentés száma: PCT/EP95/03408
A nemzetközi közzététel száma: WO 96/07667
A találmány tárgyát képezik átészterező vagy hidrolizáló katalizátorokkal rendelkező oligonukleotid konjugátumok, amelyeknek az oligonukleotid-szekvenciája részben nem-komplementer egy természetben előforduló cél-ribonukleinsavval (cél-RNS); eljárás cél-RNS szekvencia-specifikus hasítására fiziológiai körülmények között és az oligonukleotid-asszociátum hatására; inért hordozó anyagból és az oligonukleotid-asszociátumból álló készítmény ugyanúgy, mint ezek alkalmazása.
Egyszálú RNS-ek hidrolitikus hasítása fémionok katalitikus hatására már régóta ismert. A hasítás alapvetően az RNS pár nélküli — angolul „loop-nak (huroknak) nevezett — részén következik be. Krzyzosiak és munkatársai az ólom-diacetát használatát ajánlják [ Biochemistry 27, 5771-5777 (1988)] . Murakawa és munkatársai az 1,1O-fenantrolin réz komplexeinek bevetését írják le [ Nucleic Acid Research 17, 5361-5375 (1989)] . Ugyanezen alkalmaz Phe zás céljára, tRNS hasitasara Ciesiolka és munkatársai az európium-trikloridot teszik közzé [Eur. J. Biochem. 182, 445-450 (1989)] . Chow és munkatársai ugyanezen RNS-hez ruténium- és ródium-komplexeket használnak fenantrolin ligandumokkal [ J. Am.
Chem. Soc. 112, 2839-2841 (1990)] . Behlen és munkatársai ólomPhe diacetáttal létrehozott tRNS mutánsokat említenek [ Biochemistry 29, 2515-2523 (1990)] . Továbbá Hayashi és munkatársai leírják [ Inorg. Chem. 32, 5899-5900 (1993)] , hogy tRNS-ek hasítására lantanida fénomplexek is alkalmasak.
Kappen és munkatársai [Biochemistry 32, 13138-13145 (1993) leírják, hogy egy- vagy kettősszálú DNS-nek neokarcinosztatinnal történő oxidatív hasításánál azután egy helyzetspecifikus hasítás következik be, amikor például pár nélküli részek egy DNS szálon kitüremkedéshez vezetnek. Williams és munkatársai [ Nucleic Acid Research 16, 11607-11615 (1988)] azt teszik közzé, hogy kettőszálú DNS-nek réz-fenantrolinnal való hidrolitikus reakciójánál a hasítás előnyösen olyan helyeken következik be, amelyek kiegészítésként egy pár nélküli citidint tartalmaznak a láncban.
A DE-A 2451358 számú szabadalmi iratban már leírják, hogy az egy kettősszálú (rln. rCn)-komplexszel történő utánzott interferon képződésénél csökken a toxicitás az interferon termelődés fennmaradása alatt, ha az rCn-lánc módosításával szerkezeti zavart idézünk elő oly módon, hogy az rCn-lánc a sejtekben nukleázok által könnyebben hidrolizálódjon. Szerkezeti zavarként egy olyan nukleotid bevezetését ajánlják, amely megakadályozza a komplexben a párképződést. Meg kell még említeni, hogy Kolasa és munkatársai [Inorg. Chem. 32, 3983-3984 (1993)] rámutatnak, hogy DNSRNS hibridekben az RNS-ek háromértékű lantanid ionokkal nem hasadnak .
Továbbá leírták, hogy európium(III)-texafirin-ből és DNS építőköveket tartalmazó oligonukleotidokból álló konjugátumok cél-RNS-t hasítani képesek, ahol az RNS/oligonukleotid komplexben a texafirin-komplexek területén csupán körülbelül 30%-os megnövekedett hasítás figyelhető meg [D. Magda et al., J. Am. Chem. Soc. 116, 7439-7440 (1994)] . Ezeknél a texafirin-komp4 lexeknél hátrányos még az is, hogy a ligandumokhoz kiegészítésként hidroxi-propil-csoportot kell kötni, amellyel kielégítő oldhatóságot biztosítunk. Továbbá a ligandumok iminocsoportjai hidrolízisre hajlamosak, így vizes környezetben a hatékonyság gyorsan alábbhagy, illetve túl csekély tartózkodási idővel rendelkezik terápiás felhasználáshoz. A ligandumok hidrolízise révén ráadásul a fém szabaddá válik, amely komoly toxikológiai problémát és az RNS nem-specifikus hasítását idézheti elő. Továbbá ezek gyenge Lewis-savak, mivel az Eu-kationoknak egy töltését egy ligandum semlegesíti és ezáltal egy kettős töltésű komplex jön létre. A vázolt komplexek ezenfelül csak szintetikus, költséges eljárásokkal kaphatók meg.
A WO 94/29316 közzétételi számú nemzetközi szabadalmi bejelentés nyilvánosságra hoz egy foszfát-észter hidrolízisére szolgáló eljárást oligonukleotidnak texafirin-fém-komplexszel alkotott konjugátuma felhasználásával. Egy példában olyan konjugátumokat írnak le, amelyek fémként diszprózium(III)-at tartalmaznak, és amelyeknek az oligonukleotid-szekvenciáját úgy választják meg, hogy az oligonukleotid-szekvenciá kötődése a cél-RNShez ennél egy vagy több nukleotidból álló hurkot hoz létre.
Ismert, hogy sejtekben a fiziológiailag károsodott polipeptidek keletkezése a gének által irányított mRNS képződéséből következik. Betegségek legyőzésére illetve megakadályozására ezért kívánatosak olyan szerek, amelyek a mRNS hatását megakadályozzák. Különösen azt kell elérni, hogy a mRNS-t egy meghatározott helyen irreverzibilis hasítás révén tönkretegyük és ezáltal az i::rmació-tartalom elvész. Továbbá kívánatos az RNS láncoknak * Λ szekvencia-specifikus hasítása révén olyan széttört darabok előállítása, amelyek megfelelő oligonukleotidoknak az „antiszenzterületen történő gyorsabb azonosítására, diagnosztikai célra (bioszenzorok), vagy a sejtben végbemenő anyagcsere-folyamatok befolyása alatt álló betegségek gyógyítására alkalmazhatók.
A fent említett szerekkel szemben magas követelményeket állítanak. A cél-RNS-sel specifikusan hibridizálniuk kell és nem befolyásolhatnak más előforduló DNS és/vagy RNS molekulákat. Különösen hatásosnak kell lenniük már kis mennyiségekben is, és stabilnak kell lenniük a test saját immunanyagai (például nukleázok) által okozott lebontással szemben.
Azt találtuk, hogy olyan oligonukleotidok, amelyeknek a szekvenciája csak részben komplementer egy cél-RNS-sel, és amelyekhez egy átészterező vagy hidrolizáló katalizátor kötődik, nagyon hatásosak és velük egy cél-RNS-ben akár szekvencia-specifikus hasítások is elvégezhetők. Továbbá azt találtuk, hogy öszszehasonlítható reakció körülmények között jelentősen kevesebb oligonukleotid-átészterező katalizátor szükséges, mint szabad, tehát nem oligonukleotidhoz kötődő átészterező katalizátor. A cél-RNS-nek kettősszálú területen történő hasítása révén az RNS/oligonukleotid komplexek instabilitása az RNS hasítása után erősen megnő és megkönnyíti a szabad RNS darabokra és a szabad oligonukleotidból és hidrolízis ill. átészterező katalizátorból álló - konjugátumra történő szétesést. Ennek következtében kibontakozhat a konjugátum katalitikus aktivitása és a bevetési mennyiségek jelentősen csökkenthetők.
A találmány tárgyát dezoxiribonukleotidokból (NS), nem tér• · · mészetes szintetikus nukleotidokból vagy peptid-nukleinsavakból (PNS) álló oligonukleotid képezi, amelyben az oligonukleotid átészterező vagy hidrolizáló katalizátorhoz kötődik, és az oligonukleotidok belső szekvenciája részben nem-komplementer egy természetben előforduló cél-RNS-sel.
A találmány keretein belül a cél-RNS azt jelenti, hogy a célpontban egy RNS szekvenciának kell lennie. Ennek megfelelően rendelkezésre állhatnak poli-ribonukleinsavak (poli-RNS-ek). Előnyösen mRNS-ről (messenger RNS) , elő-mRNS-ről, tRNS-ről (transzfer RNS), snRNS-ről (kis nukleáris RNS), rRNS-ről (riboszómális RNS) és vírus RNS-ről van szó. Lehetnek azonban RNS-ből és poli-dezoxiribonukleinsavakból (DNS) álló keverék szekvenciák is, például a kiméra RNS-DNS Okazaki-fragmentum. Az RNS annyi építőelemből áll, hogy az oligonukleotiddal komplex (kettős szál) képződhet.
A találmány keretein belül a részben nem-komplementer azt jelenti, hogy az oligonukleotid szekvenciája egy szerkezeti zavart tartalmaz oly módon, hogy a cél-RNS megfelelő nukleotid építőelemeivel nem következik be bázispárosodás (például a célRNS-ben és az oligonukleotidban a következő komplementer nukleozidok bázispárosodását jelenti: A-U, T/U-A, G-C és C-G). Egy kiviteli alakban hiányzik a cél-RNS-hez egyébként komplementer oligonukleotid-szekvencia egy vagy több, egymás után következő nukleotid építőeleme. Ezáltal a cél-RNS-ben kitüremkedés keletkezik, amely különösen instabil átészterezésre és/vagy hidrolízisre. Egy másik kiviteli alakban az oligonukleotid egy vagy több, egymás után következő olyan nukleotid építőelemet tártál7 • · « máz, amelyek a cél-RNS megfelelő nukleotid építőelemeivel nem képeznek párt. Az RNS a kettős hélixben bekövetkezett szerkezeti zavar miatt ezeken a területeken átészterező és/vagy hidrolízis reakciókkal szemben instabil. Az oligonukleotidnak előnyösen 110, különösen előnyösen 1-4 és egészen különösen előnyösen 1 vagy 2 egymást követő nukleotidja hiányzik. Egy másik kiviteli alakban az oligonukleotid előnyösen 1-10, különösen előnyösen 14 és egészen különösen előnyösen 1 vagy 2 egymást követő, párt nem képező nukleotidot tartalmaz (ezeket a szerkezeti zavarásokat angolul „internál loop (belső hurok) és „mismatch (hibás párosítás) elnevezésekkel illetik).
A találmány keretein belül a belső szekvencia azt jelenti, hogy a szekvenciának például 10, előnyösen 5, különösen előnyösen 3 és egészen különösen előnyösen 1 vagy 2 külső építőeleméig nem kell komplementernek lennie a cél-RNS-sel. Ez olyan vonatkozásban előny lehet, hogy egy szekvencia végéhez kötött átészterező vagy hidrolizáló katalizátor mozgékonyabb és ezáltal hatékonyabb lehet.
Az oligonukleotid részben vagy teljes egészében felépülhet a cél-RNS-sel komplementer természetes DNS építőelemekből vagy a cél-RNS-sel szintén teljes egészében komplementer nem természetes, szintetikus nukleotidokból, ahol részben azt jelenti, hogy az oligonukleotid-szekvenciában a cél-RNS-sel komplementer természetes DNS építőelemeket szintén komplementer nem természetes, szintetikus nukleotidokkal helyettesítjük. Szintetikus építőelemek felölelik természetes építőelemek módosításait a nukleinbézisban, a furanóz-gyűrűben és/vagy az oligonukleotid hidat ké8 pező csoportjaiban. Szintetikus építőelemeket általában azért építünk be, hogy erősítsük a komplexkötést a duplex-szerkezetben és/vagy megnöveljük az oligonukleotid stabilitását például a nukleázok okozta lebontással szemben. Komplementer oligonukleotidok szintézisére vagy módosítására szolgáló módosított nukleozidok az „antiszenz-technológia területén nagy számban váltak ismertté és ezért azokat itt nem taglaljuk közelebbről [ lásd például E. Uhlmann et al., Chemical Reviews 90(4) , 543-584 (1990)] .
Módosításként a nukleinbázisban (például szubsztitúciók, szubsztituensek kihagyása), a nukleotid-híd csoportban (például változtatás a foszforsav-észter csoportban vagy annak helyettesítése más hídképző csoportokkal) és a furanóz-gyűrűben (például szubsztitúciók a 2' -hidroxilcsoporton, a furanóz O-atomjának helyettesítése, a furanóz-gyűrű kicserélése mono- vagy dikarbacilgyűrűvel, a furanóz-gyűrű kicserélése nyíltláncú szerkezetekkel) történő változtatások jönnek szóba.
Az építőelemek választékát és sorrendjét az oligonukleotid szekvenciájában egy cél-RNS-sel való szükséges duplexképződés segítségével határozzuk meg. A katalizátor fajtája és kapcsolódási helye is befolyásolhatja az építőelemek választékát és sorrendjét .
A párt nem képző nukleotidoknál olyan természetes nukleotidokról lehet szó, amelyeket úgy választunk ki, hogy azok nemkomplementerek a cél-RNS nukleotidjaival (a Watson/Crick féle definíciónak megfelelően például az olyan párok, mint A-A, U-U,
A-G, A-C, G-T, T-U) . A párt nem képző nukleotidoknál azonban szóba jöhetnek nem természetes, szintetikus nukleotidok is. Ezek a nukleotidok lehetnek a nukleotidbázisnál, a nukleotid-foszforsav-észter hídnál vagy a furanóz-gyűrűnél módosítottak. Ilyen típusú módosított és szintetikus, nem-komplementer építőelemek nagy számban váltak ismertté és a szakember számára közismertek. Egy előnyben részesített kiviteli alakban az oligonukleotid nem természetes komplementer nukleotidokból épül fel, ahol az oligonukleotid különösen előnyösen nem-komplementer nem természetes építőelemeket is tartalmaz.
Az építőelemek számát az oligonukleotidban úgy mérjük meg, hogy hibridizációt végzünk a cél-RNS-sel. Az oligonukleotidok tartalmazhatnak például 5-100, előnyösen 5-50, különösen előnyösen 8-30 és egészen különösen előnyösen 10-25 építőelemet. Azok a területek, amelyek a cél-RNS-sel való párképződést megakadályozzák (hiányzó illetve párt nem képző nukleotid építőelemek), előnyösen az oligonukleotid középső szekvenciáiban helyezkednek el, például a szekvenciának a mindenkori utolsó előtti negyedik vagy a mindenkori utolsó előtti harmadik vagy a mindenkori utolsó előtti vagy a mindenkori utolsó építőelemei között. Egy 20 építőelemből álló oligonukleotidnál például hiányoznak, vagy párt nem képző építőelemek találhatók előnyösen a negyediktől a tizenhetedik építőelemig terjedő területen. A találmány szerint olyan oligonukleotidokat részesítünk előnyben, amelyekben nukleotidok hiányoznak.
Előnyben részesítjük a purin és pirimidin sorozat nukleozidjaiból felépülő oligonukleotidokat. Különösen előnyben részesítjük a 2' -dezoxi-2-amino-adenozinból, 2' -dezoxi-5-metil-citidin10
* · a a • .·· ··. :·· ··· ·»·.·· bői, 2' -dezoxiadenozinból, 2' -dezoxicitidinből, 2' -dezoxiuridinből, 2' -dezoxiguanozinból és 2' -dezoxitimidinből felépülőket. Egészen különösen előnyben részesítjük a 2' -dezoxiadenozint (A), 2' -dezoxicitidint (C) , 2' -dezoxiguanozint (G) és 2' -dezoxitimidint (T). Módosított építőelemek előnyösen adenozinból, citidinből, guanozinból, 2-amino-adenozinból, 5-metil-citozinből, timidinből és az előzőekben megnevezett dezoxi-származékokból vezethetők le. A nukleozidoknál 2' -módosított ribonukleozidok is szóba jöhetnek.
A találmánynak egy egészen különösen előnyben részesített kiviteli alakjában a cél-RNS-sel részben komplementer oligonukleotid (1) természetes dezoxinukleozidokból — különösen előnyösen a 2' -dezoxiadenozint (A) , 2' -dezoxicitidint (C) , 2' -dezoxiguanozint (G) és 2' -dezoxitimidint (T) tartalmazó csoportból — vagy komplementer nem természetes szintetikus építőelemekből épül fel, és (2) a csak részben komplementer sajátság előnyösen 1-4, különösen előnyösen 1-3, és egészen különösen előnyösen 1-2 építőelem hiánya révén jön létre az egyébként komplementer szekvenciában. A találmány keretein belül különösen előnyben részesítünk ilyen módosított nukleozidokat, amelyek megnövelik az oligonukleotid stabilitását nukleázokkal szemben.
Az oligonukleotid peptidnukleinsavak (PNS) szekvenciáiból is állhat, ahol a katalizátor előnyösen a nukleinbázishoz, az amino- vagy a karboxi-elágazáshoz kötött. A nukleinbázisok a peptid-szekvencia amid-N-atomjához kötöttek. A komplementer szekvencia állhat természetes vagy nem természetes szintetikus aminosav építőelemekből, ahol az előzőekben leírt nem-komplementer • · β sajátság építőelemek elhagyása révén vagy nem-komplementer építőelemek beépítése révén érhető el. A PNS szekvencia felépítésére ugyanazok az előnyben részesítések érvényesek, mint az oligonukleotidokra. PNS-ekre példák találhatók a Science 254, 14971500 publikációban.
Átészterező és/vagy hidrolizáló katalizátor adott esetben kötődhet hidat képező csoporton keresztül N-, S- vagy O-atomokhoz az oligonukleotid-szekvencia 3’ vagy 5’ végcsoportjaiban. A katalizátorok kötődhetnek azonban nukleinbázisok C-, N- vagy 0atomjaihoz a szekvencia belsejében vagy végén, 0-, S- vagy Natomokhoz furanóz-gyűrűk 2’-helyzetében a szekvencia belsejében vagy végén, vagy a nukleotid hídképző csoportjának 0-, S- vagy N-atomjaihoz a szekvencia belsejében. A kötés jellege a katalizátor típusától és funkciós csoportjainak fajtájától függ. Egy katalizátor molekula például közvetlenül vagy hídképző csoporton keresztül kötődhet az oligonukleotidhoz. Hídképző csoport lehet például egy olyan átalakított funkciós csoport, amely a maga részéről közvetlenül vagy összekötő csoporton keresztül képes a katalizátorhoz és/vagy az oligonukleotidhoz kötődni. Az oligonukleotidhoz való kötődés lehet ionos és előnyösen kovalens. A katalizátorok kötődhetnek egy karbociklusos nukleotid-analóg 6’szénatomjához is.
A hídképző csoport előnyösen megfelelhet például az I. általános képletnek,
-x1-x2-x3-(x4)x- (I.) amelyben X3 közvetlen kötést vagy olyan kétértékű, 1-22 szénatomos nyíltláncú vagy ciklusos szénhidrogén csoportot, amely meg12 • · · szakítás nélküli vagy az -S-, -NR-, -0(0)-0-, -C(O)-NR- csoportok maradékaival megszakított, vagy 1-12 oxa-alkilén egységet és az alkilénben 2 vagy 3 szénatomot tartalmazó polioxa-alkilénmaradékot jelent; X2 -0-, -S-, -NR-, -NH-C(0)-NH-, -NH-C (S)-NH-,
-0-C (O)-NH-, -NH-C(O)-O-, -0-C (0)-0-, -0(0)-0-, -C (S) -0-,
-0-C(0)-, -O-C(S)-, -C(O)-NR-, -RN-C(O)-, -S (0)-0-,-0-S (0) 2~,
-S(O)2-NR-, -NR-S(O)-, -P (0) - (OM)-0-, -0-P (0) - (OM)-, -P(0)-(0M)-NR-, -NR-P (0) - (OM)-, -PH(O)-O-, -O-PH(O)-, -PH(O)-NR- és
-NR-PH(O)- csoportokat szemléltet; X3 függetlenül Xx jelentésével bír és x 0-val azonos, ha X3 közvetlen kötést szemléltet; X4 egy nukleozid építőelem 0-, N- vagy C-atomjához való kötődést jelent, vagy X4 -0-P (0) (OM)-0-, -NR-P (0) (OM)-0-, -0-P (0) (OM)-NR-, vagy -NR-P(O)(OM)-NR- csoportokat szemléltet, ha x 1-gyel azonos és X3 nem közvetlen kötés; R H-, Cj-Cg-alkil-, fenil- vagy benzilcsoport; Μ H-, C1-C6-alkil-, fenil- vagy benzilcsoport, alkálifém kation vagy ammónium kation helyén áll; és x 0 vagy 1.
XT kétértékű szénhidrogén csoportként előnyösen 1-18, különösen előnyösen 1-12 és egészen különösen előnyösen 1-8 szénatomot; és polioxa-alkilén-maradékként — a -CH2-CH2-O- és -CH2-CH(CH3)-O- csoportból — előnyösen 1-6, különösen előnyösen 1-4 oxa-alkilén egységet tartalmaz. A szénhidrogén csoportnál például lineáris vagy elágazó C1-C22-alkilén-, előnyösen C1-C18-alkilén-, különösen előnyösen C1-C12-alkilén- és egészen különösen előnyösen C1-C8-alkilén-; C3-C8-cikloalkilén-, előnyösen C5-vagy Cg-cikloalkilén-; C6-C12-arilén- vagy C7-C12-aralkilén-csoportok jöhetnek szóba. Néhány példa kétértékű szénhidrogén csoportokra a metilén-, etilén-, 1,2- vagy 1,3-propilén-, 1,2-, 1,3- vagy • ·
1.4- butilén-, 1,2-, 1,3-, 1,4- vagy 1,5-pentilén-, 1,2-, 1,3-,
1.4- , 1,5- vagy 1,6-hexilén-, 1,2-, 1,3-, 1,4-, 1,5-, 1,6- vagy 1,7-heptilén-, 1,2-, 1,3-, 1,4-, 1,5-, 1,6-, 1,7- vagy 1,8oktilén-, és izomer nonilén-, decilén-, undecilén-, dodecilén-, tridecilén-, teradecilén-, pentadecilén-, hexadecilén-, heptadecilén-, oktadecilén-, nonadecilén- és eikozilén-csoportok; ciklopentilén-, ciklohexilén-; naftilén- és különösen fenilén-; benzilén- és fenil-etilén-csoport. Néhány példa polioxa-alkilénmaradékra etilénoxi-, dietilénoxi-, trietilénoxi-, tetraetilénoxi- és 1,2-propoxi-csoportok.
Alkilcsoportként R előnyösen 1-4 szénatomos és előnyösen metil- vagy etilcsoport. Különösen előnyösen R H-nel azonos.
Ha M alkilcsoportot jelent, akkor előnyösen 1-4 szénatomos; különösen előnyösen metil- vagy etilcsoport. Alkálifém és ammónium kationokként Na+, K+, NH4+ és N (C1-C6-alkil) 4 + kationokat részesítünk előnyben.
Az I. általános képlet hídképző csoportjainak előnyben részesített alcsoportjai azok, ahol Xx közvetlen kötés és előnyösen C1-C4-alkilén-, fenilén- vagy benziléncsoportot jelent, ahol az alkilén-csoportot -C(0)-0- vagy -C(O)-NH- csoportok szakíthatják meg; X2C(O)-O-, -C(O)-NH-, -NH-C(O)-NH- vagy -NH-C (S)-NH-; X3 C2~ C18-alkilén-, előnyösen C2-C12-alkilén-csoportot szemléltet; X4 0-P (0) (OM) -0-, -NR-P (0) (OM)-0-, -0-P (0) (OM)-NR- vagy -NR-P(O)- (OM)-NR- csoportokat jelent (magyarázatként: az -0-P(0) (OM)-0-,
-NR-P (0) (OM)-0-, -0-P (0) (OM)-NR- vagy -NR-P (0) (OM)-NR- maradékoknál ezekbe a hídképző csoportokba a nukleozid építőelemek Νέε 0-atomjair integráltuk).
·>
·»·
Oligonukleotidhoz kötődő katalizátorokként például polipeptidek (transzferázok/hidrolázok), fémsók és fémkomplexek jönnek szóba, ahol a fémeket előnyösen az elemek periódusos rendszerének mellékcsoportjaiból, valamint főcsoportjaiból, In, TI, Sn, Pb és Bi választjuk ki. Példák a Se, Y, La, lantanidák, Ti, Zr,
Hf, V, Nb, Ta, Cr, Mo, W, Mn, Fe, Ru, Os, Co, Rh, ír, Ni, Pd, Pt, Cu, Ag, Au, Zn, Cd és Hg. Előnyben részesítjük a szkandiumot, ittriumot, lantánt, lantanida fémeket, rezet és ólmot. A lantanida fémeken belül előnyben részesítjük a következőket: Ce,
Eu, Gd, és Sm. A fémek előnyösen két- vagy háromértékű kationként állnak rendelkezésre.
A fémsókhoz és fémsó-komplexekhez megfelelő anionokat a következő csoportból választhatunk: halogenid (például Cl , Br és I ) , oxisavak anionja, BF4 , PF6 , SiF6 és AsF6 .
Az oxisavak anionjainál például szulfát-, foszfát- perklorát-, perbromát-, perjodát-, antimonát-, arzenát-, nitrát-, karbonát-, C1-C8-karbonsav anionja, mint például formiát-, acetát-, propionát-, butirát-, benzoát-, fenil-acetát-, mono-, divagy triklór- vagy -fluoracetát-, szulfonát-, mint például metil-szulfonát-, etil-szulfonát-, propil-szulfonát-, butil-szulfonát-, trifluor-metil-szulfonát- (triflat-), adott esetben C4C4-alkillel, C1-C4-alkoxival vagy halogénnel, különösen fluorral, klórral vagy brómmal szubsztituált fenil-szulfonát- vagy benzilszulfonát-, mint például tozilát-, mezilát-, brozilát-, p-metoxi- vagy p-etoxi-fenil-szulfonát-, pentafluor-fenil-szulfonátvagy 2,4,6-triizopropil-szulfonát- és foszfonátok-, mint például metil-foszfonát-, etil-foszfonát-, propil-foszfonát-, butil15 foszfonát-, fenil-foszfonát-, p-metil-fenil-foszfonát- és benzil-foszfonát- jöhet számításba.
Fémkomplex katalizátorok előnyösen hetero-organikus vegyületekkel, mint komplexképzőkkel képzett fémsó-komplexként állnak rendelkezésre, ahol a komplexképző az oligonukleotidhoz kapcsolódik. Komplexképzők nagy számban ismertek. Az 0, S, N és P csoportból kiválasztott hetero-atomokat tartalmazó nyíltláncú vagy ciklusos szerves vegyületekről lehet szó. Előnyben részesítünk összesen 8-26, előnyösen 12-20 gyűrűtagot tartalmazó és 2-12, előnyösen 4-12, és különösen előnyösen 6-12 hetero-atommal rendelkező ciklusos vagy policiklusos szerves vegyületeket. A hetero-atomok közül az O-t és különösen a N-t részesítjük előnyben. Néhány példa komplexképzőkre a koronaéter, cianin, ftálocianin, porfirin, fenantrolin, nyílt és ciklusos di- és terpiridin, etilén-diamin-tetraecetsav és dietilén-triamin-pentaacetát.
Egy előnyben részesített kiviteli alakban a találmány szerinti katalitikusán hatásos oligonukleotidok esetében a II. általános képletű konjugátumról van szó,
A-B-oligó (II.) amelyben A a B-hez előnyösen szénatomon keresztül kötődő ciklusos vagy policiklusos fémsókomplex, amelyet olyan komplexképzővel állítunk elő, amely a gyűrűben legalább 12 gyűrűatomot és legalább 4 hetero-atomot — N és 0 csoportból - tartalmaz kétértékű vagy háromértékű fémionokhoz kötve, amelyeket a szkandiumot, ittriumot, lantánt és lantanida fémeket tartalmazó csoportból választottunk ki; B az I. általános képlet hídképző csoportjául szolgál és oligó olyan oligonukleotidot jelent, amelynek belső szekvenciája cél-RNS-sel részben nem-komplementer.
Az oligóra és B-re az előzőekben megadott előnyben részesítések érvényesek.
A komplexképző legtöbb 22, előnyösen 6-20, előnyösebben ΙΣΣΟ és különösen előnyösen 14-20 gyűrűatomot tartalmazhat, ahol a gyűrűatomok a hetero-atomokon kívül előnyösen C-atomok. A N és/vagy 0 hetero-atomok száma előnyösen 4-12, különösen előnyösen 4-10, és egészen különösen előnyösen 4-8. Kisebb gyűrűméreteknél (például 6-12 gyűrűatom) alacsonyabb hetero-atom tartalmat részesítünk előnyben, 4-8, előnyösebben 4-6. Előnyben részesített alcsoportnál a komplexképző 16-20 és különösen 18 gyűrűatomot, valamint 6-10 és előnyösebben 8 N-atomot tartalmaz, ahol a fennmaradó gyűrűtagok esetében C-atomokról van szó, és az 1-6.
és előnyösen a 2-4. gyűrűre nem-szubsztituált és szubsztituált
-CH=CH-CH=CH- csoportok kötődnek 1,3 helyzetben, és a gyűrű Natomjaival piridinocsoportot alkotnak. Ez a komplexképző előnyösen 2-4 piridin-csoportot és további 4 N-atomot tartalmaz a gyűrűben. Előnyben részesített fémionok a La, Ce, Nd, Eu és Gd. Előnyben részesített anionok a fémsókomplexekben a halogenidek (Cl-, Br-), szulfát-, PF6 , nitrát-, acetát-, metil-szulfonét-, trifluor-metil-szulfonát-, karbonát-, hidrogén-szulfát-, hidrogén-karbonát- és perklorát-.
Egy különösen előnyben részesített kiviteli alakban a II. és
III. általános képlet szerinti konjugátumokról van szó,
ahol R2 és R7 egymástól függetlenül H-, C1-C4-alkil-, C1-C4-alkoxi- C7-C12-aralkil- vagy Ce-Cie-arilcsoportot jelent,
R3 és R6 egymástól függetlenül H-, C1-C4-alkil-, C7-C12-aralkilvagy C6-C16-arilcsoport,
R4 H-, C1-C20-alkil-, C5-C8-cikloalkil-, C6-C12-aril- vagy C7-C12aralkilcsoport helyén áll,
Me lantán, lantanid fém, ittrium vagy szkandium helyén áll,
Y egy aniont helyettesít, n 2 vagy 3, és m 1,2 vagy 3, ahol az alkil-, cikloalkil-, aralkil- és aril-maradékok nemszubsztituáltak vagy Cx-C4-alkoxi-, F-, Cl-, Br-, -CN, C1-C4-alkil- vagy -NO2 csoporttal szubsztituáltak,
R5 a IV. általános képlet maradéka -B-oligó (IV.) és RT K vagy egy szubsztituens vagy • · ·
R5 H vagy egy szubsztituens és R4 a IV. általános képlet egy maradékát jelenti, ahol B és oligó az előzőekben megadott jelentésekkel rendelkeznek, beleértve az előnyben részesítéseket. Alkalmas és szintén előnyben részesített anionokat Ym-re az előzőekben említettünk. Különösen előnyben részesítjük ha Ym = Cl .
R2, R3, Rg és R7 alkilcsoportként előnyösen metil- vagy etilcsoportot, alkoxi-csoportként előnyösen metoxi- vagy etoxicsoportot, aralkil-csoportként előnyösen benzilén- vagy fenil-etilén- és árucsoportként előnyösen naftil- és különösen benzilcsoportot jelent. Egy előnyben részesített kiviteli alakban R2 és R7 H-t és R3 és Rg alkilcsoportot jelent. Különösen előnyösen R2 és R7 H-t valamint R3 és Rg C1-C4-alkil- és egészen különlegesen metilcsoportot jelent. R2, R3, Rg és R7 esetében 0, S, N hetero-atomokkal C4-C12-hetero-arilcsoportról is lehet szó. Példák a pirridil-, tiazolil-, imidazolil-, oxazolil-, furanozil-, pirrolil-, tiofenil-csoportok. Továbbá szóba jöhetnek ^-C^-alkiltio-, halogenid, di-(C1-C4-alkil)-amino-, szulfonamid- és karboxamid-csoportok.
R-l és R5 szubsztituensként előnyben részesítjük a Cj-C^-alkil-, C1-C4-alkoxi-, C7-C12-aralkil- vagy C6-C16-aril-, az 0, S, N hetero-atomokkal rendelkező C4-C12-hetero-aril-, C1-C4-alkiltio-, di-(C1-C4-alkil)-amino-, halogenid, szulfonamid- és karboxamidcsoportokat.
R4 és R5 előnyösen p-helyzetben kötődik a piridin-gyűrű Natomj ához.
R4 alkilcsoportként előnyösen 1-12, különösen előnyösen 1-8 és egészen különösen 1-4 C-atomot tartalmaz. Néhány példa alkil19 csoportokra a metil- és etil- és az izomer propil-, butil-, pentil-, hexil-, heptil-, oktil-, nonil-, decil-, undecil-, dodecil-, tridecil-, tetradecil-, pentadecil-, hexadecil-, oktadecil-, nonadecil- és eikozil-csoportok.
R4 cikloalkil-csoportként előnyösen 5 vagy 6 gyűrű-szénatomot tartalmaz. Néhány példa cikloalkil-csoportokra a ciklopropil-, ciklobutil-, ciklopentil-, ciklohexil-, cikloheptil- és ciklooktil-csoport.
R4 arilcsoportként előnyösen naftil- és különösen fenilcsoportot szemléltet. Ha R4 aralkil-csoport, előnyösen benzil- vagy fenil-etil-csoport jön szóba.
Előnyben részesített alcsoport R4-re H-, Cj-C^-alkil-, különösen metil-, valamint fenil- vagy benzilcsoport.
Rx illetve R5 alkilcsoportként metil- vagy etilcsoportot, alkoxi-csoportként előnyösen metoxi- vagy etoxi-csoportot, arilcsoportként naftil- vagy fenilcsoportot és aralkil-csoportként előnyösen fenil- vagy fenil-etil-csoportot jelent. R2 illetve R5 előnyösen H-, metil-, etil-, metoxi- vagy etoxicsoport.
A III. általános képletű vegyületek előnyben részesített alcsoportjai azok, amelyekben R2 és R7 H- helyén áll, R3 és R6 CjC4-alkilcsoportot jelent, R4 H-, C1-C4-alkil-, fenil- vagy benzilcsoportot szemléltet, R2 az -X1-X2-X3-(X4)x-oligó csoport és R5 H-, metil- vagy metoxicsoport vagy R5 az -Xx-X2-X3- (X4) x-oligó csoport és R-l H-, metil- vagy metoxicsoport, X2 közvetlen kötés vagy C2-C6-alkilén-, X2 -0-, -NH-, -C(O)-O-, -C(0)-NH-, -NH-C(O)-NH- vagy -NH-C (S) -NH-csoportot jelent, X3 C2-C12-alkilén- vagy fenilén-csoportot szemléltet, X4 nukleozid építőelem 0, N, vagy .’· .·· ····. :··. :··.
• · · ·
C-atomjához való kötődést jelent, vagy X4 -O-P(O) (OM)-O-csoportot szemléltet, x 0 vagy 1 helyett áll, Me jelenthet La, Ce, Nd, Eu vagy Gd fémeket, n 2 vagy 3 és m 1 vagy 2 helyett áll, Y mutathat Cl-, Br-, CH3C(O)O-, C1O4-, BF4 , PF6 , F3C-SO3- vagy tozilát aniont, M állhat H, Na vagy K helyett, és oligó egy olyan oligonukleotidot jelent, amelynek belső szekvenciája egy cél-RNS-sel csak részben komplementer, és amely természetes dezoxiribonukleotid építőelemekből vagy nem természetes szintetikus nukleotid építőelemekből épül fel, ahol a cél-RNS-re vonatkoztatva 1-4 építőelem hiányzik.
Alkalmas átészterező és hidrolizáló katalizátorok a nukleázok is vagy nukleáz fragmentumok, bázikus polipeptidek, amidinés guanidin-származékok, oligo-aminok és diimidazolok. Ezek ugyanolyan hídképző csoportokon keresztül kötődhetnek az oligonukleotidhoz, mint a fémkomplexek.
A találmány egy további tárgyát olyan oligonukleotidok előállítására irányuló eljárás képezi, amelyekhez átészterező vagy hidrolizáló katalizátor kötődik, és az oligonukleotid belső szekvenciái részben nem-komplementerek egy természetben előforduló cél-RNS-sel, és az oligonukleotid természetes dezoxiribonukleotid építőelemekből vagy nem természetes szintetikus nukleotid építőelemekből épül fel. Az eljárás azzal jellemezhető, hogy az alapvázhoz kötve funkciós csoportot felmutató, átészterező vagy hidrolizáló katalizátort egy nukleotid építőelem funkciós csoportjával vagy egy nukleotid építőelem funkcionálisan módosított csoportjával kicseréljük.
Példák olyan funkciós csoportokra, amelyek adott esetben
hídképző csoporton keresztül kapcsolódnak az alapvázhoz, -OH, -SH, -NCO, -NCS, -CN, -O-CH2-OH, -NHR, -C(O)OR, -C(O)SH, -C(0)-NHR, -C(O)Hal halogenidként F-, Cl- vagy Br-, -C(S)SR, C(S)NHR, -C(S)OR, -SO3R, -SO2NHR, -SO2C1, -P(O)(OH)2, -P (0) (OH)NHR, P(S)-(SH)2, -P(S) (SH)NHR, -P(S) (0H)2, -P (S) (OH) NHR, -P(O)(SH)2,
-P (0) (SH) NHR, -P(O)(OH)H, -P(O)(NHR)H, -P(S)(SH)H, -P(S)(NHR)H,
-P(S)(OH)H, -P(0) (SH)H, ahol R H, Cj-Cg-alkil-, -CzH2z-NH2,
-CzH2z-SH vagy -(CzH2zO)y-H csoportokat jelent, és z 2 és 6 közötti szám, és y 1 és 20 közötti szám. Példák funkcionálisan módosított csoportokra a hidroxi-alkoxi- vagy amino-alkoxicsoportok, amelyek adott esetben linkeren -— például -P(0)OM-O-csoporton — keresztül kötődnek egy nukleotid építőelemhez. A funkciós csoport kötődhet közvetlenül vagy egy X3 csoporton keresztül az alapvázhoz, és Xx csoport előnyösen C1-C12-alkilén-, C1-C12-alkenilén-, C1-C12-alkinilén-, C5-C8-cikloalkilén-, C8-C12-arilénvagy C7-C12-aralkilén-csoport.
A találmány szerinti eljárás oligonukleotid konjugátumok előállítására például oly módon végezhető, hogy egy adott esetben funkcionalizált oligonukleotidot oldószerben vagy oldószer keverékben feloldunk és azután egy funkciós csoportot hordozó átészterező vagy hidrolizáló katalizátort adunk hozzá és ezekután a reakciókeverék, adott esetben rázásra, reagálni fog. A képződött konjugátumot azután ehhez kapcsolódóan ismert módon tisztíthatjuk és kívánság szerint izolálhatjuk.
A reakció hőmérséklete lehet például 0-120 °C, előnyösen 2080 °C. Különösen előnyben részesítjük a szobahőmérsékleten végzett reakciót.
• ·
Ha észterező, átészterező vagy amidálási reakció összekapcsolásáról van szó, megfelelő karbonsav-csoporotokat előzőleg ismert módon aktiválunk, például karbodiimidekkel és N-hidroxiszukcinimiddel végzett reakcióval.
Alkalmas oldószerek például a víz és olyan poláros aprotikus oldószerek, amelyek előnyösen vízzel keverhetők. Példák ilyen oldószerekre az alkoholok (metanol, etanol, n- vagy i-propanol, butanol, etilénglikol, propilénglikol, etilénglikol-monometil-éter, dietilénglikol, dietilénglikol-monometil-éter), éter (dietil-éter, dibutil-éter, tetrahidrofurán, dioxán, etilénglikol-dimetil-éter, etilénglikol-dietil-éter, dietilénglikol-dietil-éter, trietilénglikol-dimetil-éter) , halogénezett szénhidrogének (metilén-klorid, kloroform, 1,2-diklór-etán) 1,1,1-triklór-etán, 1,1,2,2-tetraklór-etán, klór-benzol), karbonsavészterek és laktonok (ecetsav-etilészter, propionsav-metilészter, benzoesav-etilészter, 2-metoxi-etilacetát, γ-butirolakton, δ-valerolakton, pivalolakton), N-alkilezett karbonsav-amidok és laktámok (Ν,Ν-dimetil-formamid, N,N-dietil-formamid, N,N-dimetil-acetamid, tetrametil-karbamid, hexametil-foszforsav-triamid, N-metil-y-butirolaktám, N-metil-e-kaprolaktám, N-metil-pirrolidon), szulfoxidok (dimetil-szulfoxid, tetrametilén-szulfoxid), szulfonok (dimetil-szulfon, dietil-szulfon, trimetilén-szulfon, tetrametilén-szulfon), tercier aminok (trimetil-amin, trietliamin, N-metil-piperidin, N-metil-morfolin, piridin) , szubsztituált benzolok (klór-benzol, o-diklór-benzol, 1,2,4-triklór-benzol, nitro-benzol, toluol, xilol) és nitrilek (acetonitril, propionitril, benzonitril, fenil-acetonitril).
A reagáltatandó anyagokat célszerűen moláris arányokbar visszük be. A katalizátort vagy az oligonuklectidot azonban alkalmazna ί ok feleslegben is.
Tisztításhoz alkalmazhatjuk a szokásos módszereket, előnyösen például· dialízise, eleksroforéziss és kromaoográfiás eljárásoké, már. nagy nyomású folyadékkromatográfiát ÍHPLC), reverz fázisú HPLC-t, affinitás kromatográfiás, ioncserés kromatográfiás és géikromatográfiás.
Az alkalmazandó, adcfs esesben funkcionalizáit oligonukleosidot ismert módon előállíthatjuk kereskedelemben kapható, automatikus szinsesizáló segítségével. E szmsézishez nukleozidok ismertek, részben kereskedelemben kaphatók vagy analóg eljárásokkal eikészíehetők.
ló η Ί
Funkciós csoporsokkal rendelkező ásészterező vagy nidrolizákatalizátorok ismertek, részben megvásárolhatók vagy ismert, etve analóg eljárásokkal elkészíthetők.
A 111. általános képlet szerinsi alapvázzal rendelkező funkcionalizált kiindulási vegyületek újak. Megkaphatok azáltal, hogy az V. általános képlet egy terpiridinjét
9
9 oiriorn-cta.
ο ι r><
iei vagy a
VI. általános ké:
a a L· szí di n - dl ke a c r.n a 1
(VI) általános kéolet szenti aie i , n/-,p kondenzáljuk, ahol R,, R2, R3, R4, R5, R-, R7, Me, Y, n és m az előzőleg megadott jelentésekkel bírnak.
Az eljárást elvégezhetjük például égy, hogy az V., VI. és
VII. általános képlet szerinti vegyületeket egyenlő mennyiségben feloldjuk egy oldószerben és azután megemelt hőmérsékleten egymással összehozzuk. Célszerűen felhasználunk kondenzáctős katalizátorokat, például koncentrált ásványt savakat, különösen sósavat vagy savas ioncserélőt. Célszerű lehet vízkötő anyag hoziesKcioeiecjvzáadása vagy a reakció során keletkezett víznek a bői történő eltávolítása.
A reakció hőmérséklete lehet például 4C-22C
0 — 1 o 0 C .
Oldószerként előnyösen szerves, poláros aprotikus oldó.
használhatók. Ilve.n oldószereket említettünk az előzőekben.
naovreszt mi
;saz isterfeκ nos κ e o — e' , zunrotos csórón talmaz.ó veovüle . oz • · • // • · »· ♦· hoz [Polyhedron 2(24), 2531-2536 (1988)] hasonló módon történhet, ahol a funkciós csoportokat adott esetben védőcsoportokkal látjuk el .
Άζ V. és VI. általános képletű vegyületek funkciós csoportokkal vagy anélkül nagyrészt ismertek, vagy ismert illetve analóg eljárásokkal előállíthatok. Az olyan VI. általános képletű vegyületek, ahol R4 H helyett, R5 C2-C18-alkilén-X5 helyett áll, és X5 -C(O)-OR, -C(O)-NHR, -SO2-R vagy -SO2-NHR csoportot jelent, valamint R H vagy C8-Cg-alki 1csoport, újak és a következő módon kaphatók meg: egy megfelelő 3-haiogén-piridin-l,5-dikarbonsavésztert palládium katalizátor mellett CH2=CH-C1-C16-alkilén-karbonsav-észtér általános képletű alkénnel alkenilezünk, az alkéncsoportot hrdráljuk, például katalitikusán, ehhez kapcsolódóan hidráljuk a megfelelő 1,5-dihidroxi-metil-piridin-alkil-karbonsav-észterré, a hidroxi-meti1-csoportot aldehidcsoporttá oxidáljuk és adott esetben az észtercsoportot karbonsav-csoporttá hidrolizáljuk vagy az észtercsoportot karbonsavamiddá amidáljuk.
Az olyan VI. általános képletű vegyületek, ahol R8 R vagy
C;-C12-alki lesöpört helyett, R5 C2-Ci8-alkilén-X5 helyett áll, és X5 -C(O)-OR, -C(O)-NHR, -SO2-R vagy -SO2-NHR csoportot jelent, valamint R H vagy C^Cg-alkilcsoport, újak és a következő módon kaphatók meg: egy megfelelő, például acetillel védett 3-halogén1,5-dihidroxi-metil-piridint (a megfelelő 3,5-dikarbonsav-metilészterekből kapható redukcióval) palládium katalizátor mellett
CH2 = CH-C--C: e-alkilén-karbonsav-észfer altalános képletű alkénnel vesszük a h r d sok;
aoot t • ·
esetben megfelelő 3,5-piridin-aldehidaé, amelynek az aldehidcsoportjai például Grinard-reagenssel C1-C12-alkilezhetők, az észter-csoportot adott esetben karbonsav-csoporttá hídrólizál3uk vagy az észtercsoportot karbonsav-araiddá amiaáljuk és a másodlagos alkoholcsoportokat ketocsoportokká oxidáljuk.
A találmány szerinti oligonukleotidok kiválóan alkalmasak
RNS szekvenciák különleges, szekvencia-specifikus hasíoására, ahol katalitikus hatás kifejtésére való képességük révén csak meglepően alacsony mennyiségben kell bevinni azokat.
A találmánynak egy további tárgyát ribonukleinsavak nukleotidfoszfát hídjainak — fiziológiai körülmények között és szintetikus átészterező és/vagy hidrolizáló kaoalizátor hatására történő — hasítására szolgáló eljárás képezi, azzal jellemezve, hogy a (a) komplexbe visszük a cél-RNS-t egy olyan oligonukleotiddal, amelynek belső szekvenciája részben nem-komplementer a cél-RNS-sel, és amely átészterező és/vagy hidrolizáló katalizátorhoz kötődik, és (b) azután hagyjuk reagálni és hasadni.
A találmány szerinti eljárás in vivő az oligonukleotid beadásával, vagy in vitro egy cél-RNS és egy találmány szerint alkalmazandó oligonukleotid összehozásával végezhető.
Fiziológiai körülmények ismertek a szakember számára és felölelik például az eljárás véghezvitelét vizes közegben és 5-9, előnyösen 5-8 és különösen előnyösen 5-7,5 terjedő pH taruományban, ahol a vizes közeg további, inért alkotórészeket tartalmazhat, például alkálifém-sókat vagy alkáiiföldfém-sókat és különösen puffer-rendszereket.
Az eljárás elvégezhető például 0-100 'C, előnyösen 21-50 0 ··
Q és különösen előnyösen 30-40 C között.
A találmány szerinti eljárásnál a hasítás a foszfát-híd kötés átészterezésénél következik be egy 2' , 3' -ciklikus foszfátvégcsoporttal rendelkező hasítási darab, és egy további, 5' -hidroxi-elágazást tartalmazó hasítási darab létrejöttével. A ciklikus foszfát-csoport ehhez kapcsolódóan tovább hidrolizálhat.
A találmány szerinti oligonukleotidokat gyógyszerként használjuk fel. A találmány szerinti oligonukleotidok ráadásul nagy stabilitást mutatnak nukleázok okozta lebontással szemben. Különösen meglepő kiváló párképző sajátságuk komplementer RNS típusú nukleinsav szálakkal. Ezenfelül várakozáson felül magas sejtbe történő felvételt mutatnak. A találmány szerinti oligonukleotidok ezért különösen alkalmasak antiszenz-technológiához, amely nem-kívánatos fehérje termékek kifejeződésének gátlását jelenti a mRNS megfelelő komplementer nukleotid-szekvenciájához történő kötődés révén (266,099 számú európai szabadalmi leírás, 87/07300 és 89/08146 közzétételi számú nemzetközi szabadalmi bejelentés).
Bevethetők fertőzések és betegségek kezelésére, például bioaktív fehérjék kifejeződésének a nukleinsavak (például onkogének) szintjén történő blokkolása révén. A találmány szerint előállított oligonukleotid hasítási darabok alkalmasak diagnos zti kürtként és felhasználhatók gén-szondaként vírusfertőzések vagy genetikai eredetű betegségek kimutatására az egy- vagy kétszálú nukleinsavak szintjén történő szelektív kölcsönhatás („gén próbák ) segítségével.
A találmány egy további tárgyát a találmány szerint előállított oligonukleotidoknak - vírusfertőzések vagy genetikai erede• · • · ·· • · ·· ·· • · • · · · · · • · · tű betegségek kimutatására — diagnosztikumként történő felhasználása képezi.
A találmánynak egy másik tárgyát szintén a találmány szerinti o.l i gonukleotidoknak a felhasználása képezi, melegvérűek — beleértve az embert — betegségeinek kezelésére irányuló olyan terápiás eljárásban, ahol nukieotio-szekvenciákat inaktiválunk a testben. Körülbelül 10 kg testtömegű melegvérűeknek történő beadásnál az adagolás lehet például 0,01-1000 mg naponta. A beadás előnyösen gyógyszerészeti készítmény formájában történik parenterálisan (gyomor- és bélrendszeren kívül), például intravénásán (vénába adva) vagy intraperitoneálisan (hashártyán át). Parenterális beadáshoz elsősorban vízoldható hatóanyag vizes oldatai alkalmasak, például vízoldható, fiziológiailag jelentéktelen sóé, vagy olyan hatóanyagok vizes szuszpenziói, amelyek viszkozitást növelő anyagokat - mint például nátrium-karboximetil-cellulózt, szorbitot és/vagy dextránt és adott esetben stabiiizátc-rokat - tartalmaznak. A hatóanyag - adott esetben segédanyagokkal együtt - liofilizátum formájában is rendelkezésre állhat, és a beadás előtt megfelelő oldószerek hozzáadásával oldatba vihető.
A találmánynak egy további tárgyát olyan vizes készítmény és különösen vizes oldaton vagy szuszpenzión alapuló gyógyszerészeti preparátum képezi, amely egy találmány szerinti oligonukleotidot hatékony mennyiségben egymagában vagy más hatóanyagokkal együtt, gyógyszerészeti hordozóanyagként előnyösen jelentős mennyiségű vizez, és adott esetben segédanyagokat tartalmaz.
A gyógyszerészetileg hatékony találmány szerinti cligonukle·· otid parenterálisan beadható készítmények vagy infúziós oldatok formájában alkalmazható. Ilyen oldatok előnyösen izotóniás vizes oldatok vagy szuszpenziók, ahol ezek — például liofilizált preparátumoknál, amelyek a hatóanyagot egymagában vagy hordozóanyaggal , példáu1 mánnitta! egvüut tarráírnázzák - felhasználás előtt készíthetők el. A gyógyszerészeti készítmények lehetnek sterilizáltak és/vagy tartalmazhatnak segédanyagokat, például konzerváló, stabilizáló, térnálósító és/vagy emulgeáló anyagokat, oldhatóságot fokozókat, sókat az ozmózisnyomás szabályozására és/vagy fuffereket. A gyógyszerészéül készítményeket - amelyek kívánság szerint további, gyógyszerészetileg hatékony anyagokat, mint például antibiotikumokat tartalmazhatnak — ismert módon, például szokásos feloldási vagy liofilizálási eljárások segítségével állítjuk elő, és körülbelül 0,1-90%, különösen körülbelül 0,5-30%, például 1-5% hatóanyago(ka)t tartalmaznak. A találmány szerinti konjugátumok inhalálással vagy liposzómás beadási formában is alkalmazhatók.
A találmány szerinti konjugátumok felhasználást nyerhetnek diagnosztikai célra, vagy mint molekuláris biológiai segédanyag, szekvencia-specifikus endoribonukleázként.
Az ábrákon példaszerűen mutatjuk be egy találmány szerinti antiszenz-oligonukleotid konjug&tumból és cél-RNS molekulából álló hibrid szerkezetének különböző lehetőségeit, ahol a konjugátum szerkezetét mindenkor úgy választjuk meg, hogy a cél-RNSsel képzett hibridben legalább egy páratlan nukleotid kelethez2 Q
Az 1. ábra vázlatosan mutatja egy cél-RNS („5'-vei jelölt • · vonal) és egy antiszenz-oligonukleotid („3'-vei jelölt vonal) — amelyhez a találmány szerint egy komplex („Ln-nel jelölt vonal), mint átészterező illetve hidrolizáló katalizátor kötődődik (úgynevezett konjugátum) — hibridjét, ahol a komplex kötőhelye az antiszenz-oligonukleotid-szekvenc:ár belül található. A megadott számozás a cél-RNS nukleotid építőelemeire vonatkozik, ahol a számozás úgy halad, hogy az antiszenz-oligonukleotidnak a komplexet kötő nukleotidjával komplementer cél-RNS nukleotidot jelöljük „0-val. A további számozás növekvő sorrendben (+1, +2 stb.) 3' -irányban illetve csökkenő sorrendben (-1, -2 stb.) 5' irányban halad a cél-RNS-en. Egy, az antiszenz-oligonukleotid szerkezete alapján a cél-R.NS-en fellépő páratlan nukleotidot (lehet több páratlan nukleotid is) kitüremkedésként ábrázolunk és a jelen esetben ez a 0. helyzetből kiindulva 3'-irányban (itt a +2. helyzetben) található a cél-RNS-en.
A 2. ábra vázlatosan mutatja egy cél-RNS és egy találmány szerinti antiszenz-oligonukleotid-konjugátum hibridjét, ahol egy páratlan nukleotid a 0. helyzetből kiindulva 5' -irányban (ebben az esetben a -2. helyzetben) található a cél-RNS-en. Egyébként az 1. ábrához megadott megfelelő definíciók érvényesek.
A 3. ábra vázlatosan mutatja egy cél-RNS és egy találmány szerinti antiszenz-oligonukleotid-konjugátum hibridjét, amelynél a komplex kötőhelye az antiszenz-oligonukleotid végén található, és ahol egy páratlan nukleotid a 0. hely: jtből kiindulva 5' irányban (ebben az esetben a -3. helyzetben) található a célRNS-en. Egyék ként az 1. ábrához megadott megfelelő definíciók érvényesek.
A következő példák világossá teszik a találmányt -
• « terplridm-iantanid-komplexek kiindulási vegyuM előállítása
Al, példa: Terpiridin-bisz-hidrazino-vegyületek előállítása
a) o-acetil-2-bróm-pirrdin (100 mM) 200 mi metancdos oldatához jégfürdcber. történő hűtés közben 40 ml 2 M vizes kálium-hidroxid oldatot adunk. A megfelelően szubsztituált banzaldehid (400 mM) hozzáadása után eltávolítjuk a hűtőfürdőt és a keveréket 4 órán át szobahőmérsékleten tovább keverjük. A terméket leszűrjük, háromszor mossuk vízzel és kétszer hideg metanollal és erős vákuumban szárítjuk.
Ezen előírás szerint állítjuk elő az a/1. (Rí.: fe.nil-4-OCH3;
mM) és vei le-
b) Az a,β-telítetlen karbonil-vegyületet a)-bői (30 mM), (2-brőm-piridil-karbonil-metil)-piridin-jodidot (12,1 g, 30 és ammónium-acetátot (13,9 g, 180 mM) egy lombikba helyezőül
100 ml ecetsavval vegyítjük. A keveréket visszafolyó hőt felszerelve forraljuk. 2 óra után szobahőmérsékletre hűtjük, szűrj ok és az így kapott terméket erős vákuumban regszárítjuk • · • · ·
Ξ Ζ θ Ω G
Mt: 497,1)
Titán(absz . ) szc tium-alumín
Ο nercig
Hozzáadjuk lőírás szerint állítjuk elő és b/2. (R : fenil-4-NO2; Mt:
tetraklorid oldatához (30 mM) üahőmérsékleten argon átmos;
íum-hidridet (22 mM) adagolu szobahőmérsékleten keverjük, a b/2. vegyületet (10 mik) és a b/1. (Rí: fenil-4-OCH3
512) vegyületeket.
ml tetrahidrczuránba zférában részletekben li nk. A kapott szuszpenzió maja 0 ^-ra lennejuk a szuszpenziót 30 perei szobahőmérsékleten keverjük. 0 C-on, 50 ml víz cseppenként tör tén.ő óvatos hozzáadása után 25 ml 25%-os ammónium-hidroxid clda tet adunk hozzá. A keveréket 150 mi kloroformmal elegyítjük é celiten szűrjük. A vizes fázist elválasztjuk és háromszor extra háljuk kloroformmal. Minden szerves fázist egyesítünk, egvsze mossuk vízzel, nátrium-szulfáton szárítjuk és koncentráljuk.
Ezen előírás szerint állítjuk elő a b/3. (íb: fenil-4-NH2
Mt: 432,5) vegyületet.
A megfelelő dibrőm-terpiridm vegyületet b)-bői (10 mM) 3 ml metil-hidrazinban oldjuk és 17 órán át visszafolyó hűtőve felszerelve forraljuk. Szobahőmérsékletre történő lehűtés utá beoároljuk és a maradékot 20 ml metanolban zelvesszun. A termé két leszűrjük és erős vákuumban megszárítjuk.
Ezen előírás szerint állítjuk elő a o/l. (b: fenil-4-OCE3 • · • */'· · · * υ · · ·
Μΐ /2. (Ft-, : f enil-4-NH? ; Mt :
igyületeket.
“ih;
szusz— tendáljuk és jeges fürdőben történő hűtés közben 20 perc bor-tribrcmid (50 mM) 1 mólos metiién-kioridos oldatával elegyítjük. k szuszpenziót 5 napig visszafolyó hűtővel felszerelve forraljuk. Szobahőmérsékletre történő lehűtés után 300 ml jeges vízre öntjük, 200 ml 2 M vizes sósavval megsavanyítjuk. Éterrel történő kétszeri extrakció után a vizes fázist 10%-os vizes nátrium-karbonát oldattal pH 9,0-re állítjuk be és 30 percig keverjük. A kicsapódó terméket c/3. (R:: fenrl-4-ΟΗ; Mt: 413,5) leszűrjük és erős vákuumban megszárítjuk.
(c)
A2, példa: 3- [4'- (2' ,6'-diformil-piridin)]-propionsav előállítása
a) 3,5 g 4-bróm-piridin-2,6-karbonsav-dimetilésztert, 390 mg tritol11-foszfint, 9,3 ml akrilsav-tercier-butilésztert, 7,1 mi trietil-amrnt, 30 ml dimetil-formamidot és 237 mg palládium-acetátot keverünk össze és 110 °C-ra melegítjük. 90 perc után a reakciókeveréket szobahőmérsékletre hűtjük le, éter-'metilén-klorid uk es avmeuiuv-Klórra/v;
;rves ráz is' 'ZUZd-S pár l· en : ez mérví z f ák é s erí n ve kuuvhen ve «·
C Η Ν számított 59,81 5,96 4,36 kapott 59,8 6,0 4,1
250 mg palládiumot aktív szénen (5%) és a fent kapott vegyület 2,5 g-ját 250 ml metanolban oldunk és egy éjszakán át szobahőmérsékleten hidrogén atmoszférában hidráljuk. A rerméket Hyflo-n szűrjük, a szűrletet rotációs bepárlón betöményírjük és szobahőmérsékleten erős vákuumban megszárítjuk.
C
H
N
számított | 59,43 | 6, 55 | 4,33 |
kapott | 59,3 | 6, 6 | 4,3 |
A fent Kapott vegyület 5,0 g-ját 50 ml metanolban és 50 ml tetrahidrofuránban oldjuk. 0 CC-ra történő lehűtés után 1,1 g NaBH^-et adunk hozzá. 50 perc elteltével további 1,1 g NaBH4-et adunk hozzá és 130 perc múlva további 0,5 g NaBH/j-et adunk hozzá. Összesen 165 perc után szobahőmérsékletre melegítjük fel. Újra lehűtjük 0 °C-ra. 3,5 óra múlva mégegyszer 1,1 g NaBH4-et adunk hozzá. 6 óra elteltével 60 ml térfogatra pároljuk be. Ezután telített ammónium-klorid oldatot csepegtetünk hozzá, négyszer extraháljuk metilén-kloriddal, a szerves fázisokat egyszer mossuk ammónium-kíorid oldattal, nátrium-szulfáton szárítjuk, leszűrjük és bepároljuk.
C | H | K | |
számítót! | 6 2, 90 | 7, 92 | 5,24 |
kapott | 63,0 | 7,9 | 1 ? |
kaocsolc :e.er:-aio nk hozza
A fent kapóit vegyület 19,
ICL
0 ml dioxánban oldjuk.
· .’· .·· :>···:· :··♦ ciókeveréket 100 °C-ra melegítjük fel és keverjük, 45 perc múlva szobahőmérsékletre hűtjük le. További két órás keverés után a
reakciókeveréket | szűrjük és | rotációs | bepárlón betöményítjük. |
C | H | N | |
számított | 63, 87 | 6, 51 | 5,32 |
kapott | 64,14 | 6, 53 | 5,43 |
A fent kapó | tt vegyület | 4,7 g-já | t 17,2 ml jéghideg tnfluor |
ecetsavhoz adjuk | . Az összeöntés után | a keveréket 0 fc-on betörné | |
n y 11 j ü k . | |||
C | H | N | |
számított | 57, 97 | 4, 38 | 6,76 |
kapott | 57,55 | 4,21 | 6,61 |
b) 5 g 4-bróm-piridir | ι-2,6-karbonsav-dimetilésztert 175 m |
tetrahidrofuránban oldunk szobahőmérsékleten. Ehhez kapcsolódóan 75 ml metanolt adunk hozzá. 0 °C-ra hűtjük, 45 perc alatt részletekben 3,44 g nátrium-bórhidridet adunk hozzá és hagyjuk szobahőmérsékletre melegedni. 1 óra múlva 30 ml acetont csepegtetünk hozzá 10 percen belül. A reakciókeveréket 1 óra hosszat visszafolyó hűtővel felszerelve melegítjük, majd a reakciókeveréket rotációs bepárlón szárazra pároljuk. A maradékot szobahőmérsékleten 50 ml piridinbe keverjük bele. Ehhez 0,1 g 4-dimetil-ami0 no-piriaint adunk, majd 0 C-ra lehűtjük. 30 percen belül 34,4 ml ecetsavanhidridet csepegtetünk hozzá. A szuszpenziót hagyjuk szobahőmérsékletre felmelegedni. 50 ml tetrahidrofuránt adunk hozzá. Egy éjszakán ét szobahőmérsékleten történő keverés után a reakciókeveréket szűrjük és kétszer 50-50 ml tetrahidrofuránnal mossuk. A szűrletet rotációs bepárlón koncentráljuk. Kristályo36 ·· ·-·. .’· ,·· .·· ϊ :··. ··· i..
··· ·· .. · .· · · sítással 4-bróm-2,6-di(acetoxi-metil)-piridint kapunk.
(Olvadáspont: 66-69 C.)
0,982 g 4-bróm-2,6-di(acetoxi-metil)-piridint, 1,5 g 3-(tributil-sztannil)-akrilsav-etilésztert és 176 mg palládium-tetrakisz-(trifenil-foszfin)-t oldunk 25 mi dioxánban és 90 °C-ra melegítjük fel. 90 perc múlva a reakciókeveréket lehűtjük. A szilárd terméket elválasztjuk és hexán/ecetsav-észter eleggyel átkristályosítjuk. Mt : 321 (M )
A fent kapott vegyület 2,74 g-ját és 70 mg Wilkinson-katalizátort 150 ml benzolban oldunk. 12,2 ml trietil-szilánt adunk hozzá és az oldatot visszafolyó hűtővel felszerelve forraljuk. 270 mg katalizátor trietil-szilánt feleslegben adagolunk egy órán belül részletekben. A terméket kromatográfiásan tisztítjuk.
Mt: 323.
267 mg nátriumot oldunk 50 ml etanolban. Ennek az oldatnak
7,2 ml-ét a fent kapott vegyület 1,845 g-jának 35 ml etanolban történt feloldásával kapott oldathoz adjuk hozzá. 2,5 óra szobahőmérsékleten történő keverés után a reakciókeveréket Kieselgélen szűrjük és a szűrletet szárazra pároljuk. A terméket egy éjszakán át erős vákuumban szárítjuk.
NMR(CDC13)Ő7, 0(2H, s) , 4, 7 (4H, s) , 4, 1 (2H, q) , 2, 9 (2H, t) , 1,2 (3H, t)
A fent kapott vegyület 1,27 g-ját 30 ml dioxánban oldjuk.
Ehhez adunk 714 mg szelén-dioxidot. A teakorókeveréket felmelegítjük és 2 óra múlva vattán szűrjük. A szűrletet szárazra pároljuk. A maradékot ecetsav-észter/metiién-klorrd (51) elegyben felvesszük es Kreselgélen szűrjük.
Έ NME (CDCl δ!0, 1 (2H, s ) , 8, 0 (2H, s ) , 4 , 1 (2H, q) , 3 , 1 (2H, t) , 2 , 7 (2H, t) , • ·
1,2(3Η,ο)
Q ml éter és 350 mg fent kapott vegyület oldatához 0 C-on egy előzőleg elkészített oldat (0,949 g réz-bromid, dimetilszolfid 10 ml éterben 0 °C-ra hűtve és 5,9 ml metil-lítiumot hozzáadva) 13 ml-ét adjuk. 5,5 óra szobahőmérsékleten történő keverés után 0 °C-ra hűtjük. Hozzáadunk 2 ml jégecetet 8 ml éterben és 8 ml etánuiolt. Egy éjszakán át szobahőmérsékleten történő keverés után 60 ml vizet adunk hozzá és metilén-kloriddal négyszer kirázzuk. A szerves fázist nátrium-szulfáttal szárítjuk, szűrjük, rotációs bepárlón betöményítjük és kromatográfiásan tisztítjuk. Mt: 266 (M+H) o
4,5 ml metilén-klorid és oxalil-klorid oldatához -78 C-on
0,5 ml DMSO-t adunk. 15 perc után ezt az oldatot a fent kapott vegyület 193 mg-ját 4 ml metilén-kloridban tartalmazó oldathoz adjuk. Két óra -78 C-on tartás után 1,5 ml trietil-amint adunk o
hozzá. 30 perces 0 C-on történő keverés után 15 ml vizet adunk hozzá és dietil-éterrel négyszer kirázzuk. A szerves fázist nátrium-szulfáttal szárítjuk, szűrjük, rotációs bepárlón betöményítjük és kromatográfiásan tisztítjuk.
számított kapott
63, 87
3,96
6,51
6,55
5, 32
5,4 5
A fent kapott vegyület 0,464 qml 4 M sósavat együtt u0 C-ra melegítünk. 90 perc elteltével a reakciókeverékei szobahőmérsékletre hűfjük vissza és jeges vízzel hígítjuk. Kristályos terméket kanunk.
• · · • · számított
61,27
5,57
5,95 kapott
61,2
5,5
B) A terpiridin-lantanid-komplexek előállítása
Bl. példa:
a) Az Al· c) példából a megfelelő terpiridin-bisz-hidrazinovegyület 1 mM-ját argon áramban 60 ml abszolút metanolban veszszük fel, lantanid (111)-acetáttal (1 mii) elegyítjük és 10 percig visszafolyó hűtővel felszerelve felforraljuk. Ehhez az oldathoz egymás után a megfelelő 2,6-dikarbonil-vegyűlet 1,2 mM-ját és 5 mM koncentrált vizes sósavat adunk. 2 napig forraljuk. Szobahőmérsékletre történő lehűtés után a terméket leszűrjük és erős vákuumban szárítjuk.
Ezen leírás szerint állítjuk elő az 1. táblázatban az 1.1től 1.28-ig terjedő vegyületeket.
b) Az Al. c) példából a megfelelő terpiridin-bisz-hidrazinovegyület 1 mM-ját argon áramban 60 ml abszolút metanolban veszszük fel, lantanid (111)-klorid (1 mM) elegyítjük és 10 percig visszafolyó hűtővel felszerelve felforraljuk. Ehhez az oldathoz egymás után adjuk az A2. a) példában kapott vegyület 1,2 mM-ját. Egy éjszakán át forraljuk. Szobahőmérsékletre történő lehűtés után az oldószert lehúzzuk és a terméket dimetil-szulfoxidból és toiuolbói történő átknstályosítással kapjuk.
Ezen leírás szerint állítjuk elő az 1. táblázatban tői 1.32-ig terjedő vegyületeket.
az 1.2939 tahu
R.
Rs
/gyület | Lr/ | Rí | υ | R; | Μ Α ? τ Q ro ζ* ~ Γ Μ — υ |
számított/ kap- | |||||
1 . 1 | La | ?h-H | H | Η | 706/705 |
1.2 | La | Ph-OH | H | Η | 722,4/722,3 |
Ί j. . | La | ?h-OCH3 | H | Η | 736,4/735,6 |
1 . 4 | La | Ph-NH2 | u | Η | |
1 . 5 | La | Ph-H | CH3 | Η | 734,4/734,4 |
1 . 6 | La | Ph-OH | ch3 | Η | /50,1/ / υ 0, |
1 . 7 | La | ?h-OCH3 | ch3 | Η | 764,5/755,0 |
1 . 3 | Í-.G | Ph-NK2 | ch3 | Η | 7 4 9,5/74 9,5 |
1 . 9 | T? ? i | ?h-H | Η | Η | 719,4/718,9 |
1 .10 | Eu | Ph-OH | Η | Η | / 3 υ f ο |
1.11 | Ευ | ?h-OCH-; | Η | Η | 7 4 9, 5 174 9 ,3 |
__ , J, F. | υ υ | Ph-NHR | Η | Η | / 0 4 , 0 / /01,0 |
CHR • · · • ·
1 . 15 | Eu | Ph-OCH3 | ch3 | u | 777 , | 5/777, | 3 |
1.16 | Eu | Ph-NH2 | ch3 | H | 762, | 5/762, | c |
1 . 17 | Ce | Ph-NH2 | ch3 | H | 750, | 7/749, | 3 |
1 . 18 | Pr | Ph-NH2 | ch3 | H | 751, | 4/750, | 9 |
1.19 | Nd | Ph-NH2 | ch3 | H | 754 , | 8/752, | 7 |
1.20 | Gd | Ph-NH2 | ch3 | H | 767, | 8/766, | 3 |
1.21 | Tb | Ph-NH2 | ch3 | H | 769, | 5/768, | 7 |
1.22 | Dy | Ph-NH2 | ch3 | H | 773, | 1/773, | 2 |
1 . 23 | Ho | Ph-NH2 | ch3 | H | 775, | 5/774, | ú |
1 . 24 | Er | Ph-NH2 | ch3 | H | 777, | 8/776, | Q |
1.25 | Tm | Ph-NH2 | ch3 | H | 77 9, | 5/778, | 8 |
1.26 | Yb | Ph-NH2 | ch3 | H | 783, | 6/783, | 0 |
1 . 27 | Lu | Ph-NH2 | ch3 | H | 7 8 5, | 5/784, | 7 |
1 .28 | Y | Ph-NH2 | ch3 | H | 699, | 4/698, | 1 |
1 .29 | La | H | H | ch2 | CH2COOH | ||
1.30 | Eu | H | H | ch2 | ch2cooh | ||
1 . 31 | La | Ph-H | H | <---2 | CPbCOOH | k | |
1 . 32 | Eu | Ph-H | H | C H 2 | CHoCOOH | X * | |
Ph: 4-fenil | én | ||||||
★ | c | H | N | Cl | |||
számított | +2DMSO) | 45, 81 | 4,16 | 11,55 1 | 0,9 6 | ||
kapott | 45,3 | 4,3 | 11,8 | 0, 6 | |||
X ★ | C | H | N | Cl | |||
számított | +2DMSO+4H2O) | 42,11 | 4 , r 8 | 10,62 1 | 0, 07 | ||
kapott | 4 2,2 | r Γ ί-, - r ~~ | 10, 6 | Ϊ f |
• · • ··· ··· ·
Β2. példa: Izotiocianát-származékok előállítása
4,4 mM nátrium-dikarbonátből és 3,5 mM tiofoszgénből 4 ml kloroformban készült szuszpenzióhoz az 1. táblázat megfelelő komplexének oldatát adjuk. A keveréket szobahőmérsékleten 2,5 órán át erőteljesen keverjük. A kloroformcs fázist elválasztjuk és egyszer mossuk vízzel. Minden vizes fázist egyesítünk és megszárít3uk. A.z így kapott, a 2. táblázatban 2.1-től 2.15-ig jelölt termékeket további tisztítás nélkül tovább felhasználjuk.
2. táblázat
Vegyület | Ln J | R1 | R4 | R5 | Móltömeg [ M-Cl] számított/kapott |
2.1 | Ce | Ph-NCS | ch3 | H | 792,7/792,7 |
2 . 2 | Pr | Ph-NCS | CPE | H | 793,5/791,2 |
2.3 | Gd | Ph-NCS | CH3 | H | 809,9/807,4 |
2.4 | Tb | Ph-NCS | ch3 | H | 811,5/811,7 |
2.5 | Dy | Ph-NCS | ch3 | H | 815,1/815,9 |
2.6 | Ho | Ph-NCS | ch3 | H | 817,5/816,2 |
2.7 | Er | Ph-NCS | ch3 | H | 819,9/819,0 |
2.8 | Tm | Ph-NCS | ch3 | p | 821,5/820,1 |
2 . 9 | Yb | Ph-NCS | che | H | 825,6/826,4 |
2 .10 | Eu | Ph-NCS | ch3 | H | 827,6/825,5 |
2.11 | á | Ph-NCS | CH'.· | 741,5/740,2 | |
2.12 | La | Ph-NCS | CH ς | H | 791,5/792,1 |
Eu oh j
804,6/804,7
2.13
2.14
Z 'V
Eu
Ph-NCS
Ph-NCS
Ph-NCS
C) Amino-oligonukleotidck előállítása
Az ellenőrzött pórusé üveg („oontrcied poré glass = G?G) szilárd fázisából körülbelül 30 mg-ct mérünk be egy standard, biológiai rendszerekhez alkalmazott edénybe (Applied 3iosystem) 1,5 pM szintézishez. Az 1. képletű CPG szilárd fázis hordozza a szintetizálandó· ammo-oligonukleotid védett 3' -építőelemét (a oéldában dC).
CPG • · · · ·· · · · ··· ··· • · · · · · · ,z oligomerizáláshoz a 6., 7., 8. és 3. képletű foszfor-amidit •együleteket visszük be.
O
p—och2ch2cn N(CH(CH3)2)2
/ p—OCH2CH2CN
N(CH(Cf-y2), • · · • · · 9 '9 • · · · · · • · · · · 9 9
N(CH(CH3)2)2
P — OCH-CH,CN I
N(CH(CH3)2)2 • · · • ·
ff
A szintézis ciklusokat az Applied Biosvstem 394-es számú szintézis automatájával (Svntheseautomat 394) végezzük az
Applied Biosvstem cég standard leírásának (User Manual Version
2.0 (1992) 1.0 pMol Cyclus, Appen. 1-41) megfelelően, a következő változtatással: a 6., 7., 8. és 9. dezoxi-sorba tartozó foszfor-amidit kapcsolási ideje 2 percet tesz ki, a 10. és 11.
foszíor-amidité 10 percet tesz kr, a 12. képletűé 5 percig és a :é 40 percig tart; a 13. képletű fcszfor-amiditet 10013. kéol szoros .eslecmen visszük be.
;vaooi, KeresKeoe_emben ki
0,1 M fos • · tetrazol/aoetonitril: 4%, 96%, tercier-buti 1-fenoxi-ecetsavanhidrid/piridin/tetrahidrofurán:
10%, 10%, 80%,
N-meuil-imrdazol/tetrahidrofurán: 16%, 84%, urrklór-ecetsav/dimetil-klór-metán: 2%, 93%,
V YΟ p ο η z o z υ ι, / a -ε szintetizáljuk:
(8
, ahol T timm
5' -GTA GAC TGG helyet
CGA GA
Opm
• · · (631)
3’-GA TCG GCT GAC GGC TAG AGC
Terein din-lan tanid-oliconukle konnoátumok előállítása
Dl. példa: Olyan konjugátumok előállítása, amelyeknél az oligonukleotid a lantanid-komplex terpiridin részéhez kötődik
a) A megfelelő oligonukleotid 0,2 mg-ját 150 ul ptridin/viz/ /trietil-amin (30:15:1) elegyében oldjuk. A 2. táblázat megfeleegvs
20%
6,0, cen őszi .zoftocianát-kcmplexe 1 mg-jának hozzáadása urán a keveréket :án ár szobahőmérsékleten állni hagyjuk. A reakciókevereket zer 0,1 M kálium-klond oldatra! és háromszor vízzel szemben izáljuk. A terméket reverz fázisú H?LC-n (gradiens: 0-30% omtril 0,05 M trietil-ammónium-acetátban, 90 percig) kétől nukleozil-C18-oszlopra, vagy ioncserélő H?LC-n (gradiens: 1 M kálium-klorid oldat és 80% 20 mM kálium-foszfát oldat pH amely 20% acetonitrilt tartalmaz, 10 percig; azután 60 perbeiül 80% kálium-kiorid oldat) keresztül 60 °C-on 3VDI.4000Aopra (5 pm) visszük fel, amely azután a 3. táblázat 3.1-től
-rg és 3.18-tól 3.21-rg terjedő tiszta konjugátumait eredméD2. példa: Olyan konjugátumok előállítása, amelyeknél az oligonukleotid a lantanid-komplex piridin részéhez kötődik
Az 1.29-től 1.32-tg terjedő megfelelő karbonsav-származék 3 gM-jának 200 ul dtmetil-szulfcxidos oldatát 3,3 uM dicikiohexil-karbodrtmiddei és 3,3 uh N-hrdrcxi-szukcinimrddel elegyítjük és • · ·
-diizopropil-etil-amm hozzáadása után a megfelelő amino-oligo nukleotid 0,2 mg-ját adjuk hozzá. Négy nap szobahőmérséklete tartás után kétszer 50 mM trietil-ammór.ium-hidrogén-karbor.átta és kétszer vízzel szemben dializáljuk. P. reverz fázisú H?LC-ve történő tisztítás (lásd a)-t) a 3. táblázat 3.14-3.17, 3.19
3.20 és 3.22-3.25 vegyületeit eredményezi.
Vegy | ölet | , 3 + ! | ^4 | Rg | Rg | MM | RZ | |||
1 | La | ch3 | Ph-691 | H | 7 0 | 82/7093 | ||||
3 . | p | Eu | fi -Ί | Ph-691 | H | 0 >> | 95/7090 | |||
3 . | 3 | C Θ | ch3 | Ph-691 | H | 2 | 7, | /1 | ||
3 . | 4 | ?r | Ph-691 | H | 4 | 2, | 5* | |||
3 . | G | Cg | ch3 | Ph-691 | H | o | 7 , | 0 | ||
3 . | 6 | ib | CH, | Ph-6 91 | H | 2 | t | |||
3 . | 7 | Dv | ch3 | p b - 5 3 p | H | - | ! l | ö | ||
3 . | 6 | Ho | ? G ~ 6 9 3 | H | 3 | t | - | |||
3 | 9 | - | pu-A 93 | u | 0 | 0 | 0 | |||
- | 1 |
* ·« · · • · ·
3.10 | Tm | ch3 | Ph-691 | H | 27,5 | |
3 . 11 | Yb | ch3 | Ph-691 | H | 28,8 | |
3 . 12 | Lu | ch. | Ph-691 | H | 27, 9 | |
3 . 13 | Y | ch3 | Ph-691 | H | 27,4 | |
3.14 | Eu | H | fenil- | A-691 | 7064/7086 | |
3.15 | La | H | fenil- | A- 691 | 7051/7072 | |
3.16 | Eu | H | H | A-691 | ||
3.17 | La | H | H | A-691 | ||
3 . 18 | Eu | ch3 | Ph-821 | H | 9843/9853 | |
3.19 | La | H | feni 1- | A-821 | 9800/9800 | |
3.20 | Eu | H | fenil- | A-821 | 9813/9839 | |
3.21 | Eu | ch3 | Ph-823 | H | 9842/9861 | |
3.22 | La | H | fenil- | A-82 3 | 3 5,6* | |
3.23 | Eu | H | fenil- | A-823 | 9811/9826 | |
3.24 | La | H | fenil- | A-940 | 9757/9829 | |
3.25 | Eu | H | fenil- | A-940 | 9770/9794 | |
MM: szárnitott/kapott móltömeg | ||||||
RZ: ioncserél | ő HPLC retenciós idő | (perc) | ||||
Ph-691 : | -feni | 1-N(H) C (S) - | oligó 691 | |||
Ph-821 : | -feni | 1-N(H)C (S) - | oligó 821 | |||
Ph-323 : | -feni | 1-N(H)C(S)- | oligó 823 | |||
A-691 : | -ch2ck | 2C (0)-oligó | 691 | |||
A-821 : | -ch2ce | 2C (0) -oligó | 821 | |||
A-823 : | -ck2ch | 2C (0) -oligó | 823 | |||
A-94 0 : | -ch2ce | 2C (Op -oligó | 940 | |||
* reverz | fázis | ú HPLC retenciós idő | (perc) |
• * » a « »5 * ·♦
RN lítái kén v okokból
visszük be.
OCH3 ó O-Si(CH3)2-C(CH3)3 /
P — OCH-CH-CN
I
Ν(ΟΗ(ΟΗ3)2)2
• ·
N(CH(CH3)3)2 (4)
OCH3 o 0-Si(CHj2-C(CHj3 (5)
P —OCH.CH.CN I
N(CH(CH3)2)2
Ο
och3 ο ρ—och?ch2cn I
N(CH(CH3)2)2
p—och7ch2cn 1
N(CH(CPy )2
A szintézis ciklusokat az Applied Biosystem 394-es számú szintézis automatájával (Syntheseautomat 394) végezzük az Applied Biosystem cég standard leírásának (User Manual Version 2.0 (1992) 1.0 pMoi Cvclus, Appen. 1-41) megtelelően, a következő változtatással: a ribo-sorba tartozó bősttor-amidit kapcsolási ideje 10 percet tesz ki.
A további, kereskedelemben kapható reagenseket alkalmazzuk:
teszt;
te seprőnél' tercier-butil-fenoxi-ecetsavanhidrid/piridin/tetrahidrofurán:
10%, 10%, 80%,
N-metil-imrdazol/tetrahidrofurán: 16%, 84%, triklór-ecetsav/dimetil-klór-metán: 2%, 98%, j ód/víz/pirrdin/tetrahidrofurán: 3%, 2%, 20%, 75%
A következő szubsztrát-RNS-eket szintetizáljuk: A címben szereplő RNS-E1
b) Leválás a szilárd fázisról (CPG) és a bázis védelmének megszüntetése: a szilárd fázist (1,5 pM szintézis) 800 pl ammóniával telített etanollal elegyítjük és szobahőmérsékleten egy éjszakán át inkubáljuk. Az ammóniával telített etanolt 1 rész etanolból és 3 rész 33%-os ammónium-hidroxidból állítjuk elő. Az inkubáció után az ammóniával telített etanolos oldatot aekantáljuk, a CPG-t ammóniás etanollal lemossuk és az egyesített oldac) A tercier-butil-dimetil-szilil-védőcsoport védelmének megszüntetése: A liofilizált próbát 800 pl 1 M tetrabutil-ammónium-fluorid/tetrahidrofurán (TBAF/THF) oldattal elegyítjük. A próbát 30 percig intenzíven elkeverjük. Az inkubációt 24 órán keresztül szobahőmérsékleten, fény kizárásával végezzük. Az RNSt 50 mM trietrl-amin-hidrogén-karbonát (TAHC) oldattal pH 7,0 (1
Q + 1) keverjük és közvetlenül 4 C-on dializáljuk. (A víz „Nanopure minőségű.)
d) Dialízis: 3-szor dializálunk 7,5 mM TAHC oldattal pH 7,0 szemben. (A.z oldatot „Nanopure minőségű vízzel állítjuk elő, szén-droxiddai pH 7,0-re állítjuk be és 4 C-ra előhűtjük.) A próbát liofilizáljtk és dieti1-plrokarbonattal kezelt [ Sambrook, • · • ·
Fritsch, Maniatis: Molecular Cloning, A Laboratory Manual,
Second Ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)] és autoklávozott vízben (DEPC-H2O) vesszük fel. Egy részét 260 nm-en koncentráció meghatározásnak vetjük alá. A további RNS-sel végzete műveletekben mindig RNáz-tól és idegen ionoktól mentesen dolgozunk.
e) A szubsztrát RNS 5'végének markerezése [ P] γ-ΑΤΡ-vel:
Enzimes kináz reakcióhoz 100 pM RNS-t a fenti szintézis leírásból 20 pl térfogatban 37 °C-on, 20 percig inkubálunk. A reakcióelegy 0,5 pl T4-polinukleotid-kinázt (Promega, 10 egység/pl), 2 pl kináz puffért (50 mM Tris-HCl pH 7,5, 10 mM MgCl2, 5 mM 1,4ditio-D,L-treitol, 0,1 mM spermidm) és 0,5 pl 32[ P] γ-ΑΤΡ-t (Amersham, >1000 Ci/mM, 10 pCi/pl) tartalmaz . Ehhez kapcsolódóan
138 pl Tris-HCl/EDTA (10 mM/Ι mM, pH 7,5) keverékét, 2 pl glikogént (35 mg/ml) és 40 pl ammónium-acetátot (10 mM) adunk hozzá.
Q
600 pl etanol hozzáadása után a próbát 30 percig -20 C-on hűtjuk, majd 20 percig 4 °C-on centrifugáljuk. A pelletet liofilizáljuk, 15 pl felvevő pufferrel (0,025% brómfenolkék, 0,025% xilol cylanol 1:1 keverékben 80% formamiddal és 7 M karbamiddal, 20 mM citromsav, 1 mM EDTA) egészítjük ki, 1 percig 95 C-on denaturáljuk, azonnal jégre tesszük és a gelelektroforézises elválasztáshoz egy 1, 0 cm x 1 mm zsebre visszük fel. A gélelektroforézises elválasztást egy 40 perces 55 watt-nál végzett előfutam után 2,5 órán át 55 watt mellett végezzük el.
f) A kmázzal kezelt szubsztrát RNS tisztítása és izolálása:
A kináz reakció gélelektroforézises felbontásához 12%-os poliaknlamid gélt (1 mm x 30 cm x 40 cm) készítünk elő. A polimeri• · · • ·· · · · · * • · · · · · · zációs reakciót 170 ml-ben végezzük. Itt 51 ml akrilamid oldatot (40% akrilamid/bisz-akrilamid 10:1), 17 ml TBE-puffert (0,89 M
Tris-(hidroxi-metil)-amino-metán, 0,89 M bórsav, 0,02 M EDTA) és
71,4 g karbamidot megfelelő mennyiségű vízzel keverünk össze. A polimer!zációt 170 pl ammónium-peroxi-diszulfát oldattal (25% tömeg/térfogat) és 170 pl TEMED-del (Ν,Ν,Ν' ,Ν' -tetrametil-etilén-diamm) indítjuk. A gél 1 óra múlva felhasználható. Futtató pufferként 10-szeresére hígított TBE-puffert alkalmazunk.
A gélelektroforézises felbontás után a kinázzal kezelt RNS-t ráfektetett röntgen film segítségével mutatjuk ki és kivágjuk a gélből. Egy elektroelúciós készülékben (Schleicher és Schuell) az RNS a géldarabból 100 V feszültségnél eluál (3,3 V/cm) . Elúciós pufferként 10-szeresére hígított TBE-puffert alkalmazunk.
Az izolált RNS-t 360 pl eluátumban 40 pl nátrium-acetáttal (3 M, o
pH 5,2) és 1 ml etanollal elegyítjük. A próbát 20 percig -20 Con hűtjük, majd 20 percig 4 °C-on centrifugáljuk. A pelletet liofilizáljuk, 30 pl vízben felvesszük. Az oldatot a Czerenkow-féle előírás szerint szcintillációs számlálóban megmérjük, és 12000 cpm/pl-re állítjuk be.
E2. példa:
Az El. példában leírtak szerint járunk el, és a következő szekvenciával rendelkező „RNS-E2 cél-RNS-t állítjuk elő:
5'd(CTA GCC GAC TG) r (CCC AUC UCA AG)d(CCA GTC TAC) .
E3-E31. példák:
Az El példához hasonlóan további E3-E30. cél-RNS molekulákat, valamint az E31 molekulát állítjuk elő, amelyeknek a szerkezetét az F)-ben, a 4., 6. és 8. táblázatokban mutatjuk be.
• · ·
F) Felhasználási példák (RNS hasítás)
Különböző, találmány szerinti antiszenz-oligonukleotid-konjugátum hasító tulajdonságát vizsgáljuk különböző cél-RNS-ekkel szemben. A komplexnek a mindenkori antiszenz-oligonukleotidszekvenciához való kötődése szerinti, illetve a hibridben a célRNS-ből és antiszenz-oligonukleotid-konjugátumból keletkező, pár nélküli nukleotidok (mismatch) helyzete szerinti vonatkozásban az 1., 2. és 3. ábrákon bemutatott esetekben különböznek.
Fi. példa:
Itt egy találmány szerinti antis zenz-oligonukleotid-konjugátum — ahogyan azt a 3. ábrán szemléltetjük — által előidézett cél-RNS hasításról van szó.
A hasítási reakciót követően, az RNS termék gélelktroforézises felbontásához és azonosításához 12%-os Long Ranger gélt (AT
Biochem, módosított poliakrilamid gél) (0,4 mm x 30 cm x 40 cm) készítünk elő. Ehhez 21 ml Long Ranger oldatot (50%) 11 ml TBEpuffert (0,89 M Tris-(hidroxi-metil)-amino-metán, 0,89 M bórsav,
0,02 M EDTA) és 37 g karbamidot megfelelő mennyiségű vízzel keverünk össze. A polimerizációt 450 pl ammónium-peroxi-diszulfét oldattal (10% tömeg/térfogat) és 45 pl TEMED-del indítjuk. A gél 1 óra múlva felhasználható. Futtató pufferként 16,66-szorosára hígított TBE-puffert alkalmazunk. Az eiváiaszrás 60 watt mellett percen belül megtörténik. A gélelektroforézises elválasztás után a markerezett hasítási termékeket (RNS oligomereket) ráhelyezett röntgen film segítségével, vagy Phosphonmager segítségével mutatjuk ki, illetve kiszámítjuk.
A hasítási reakciót IC pl térfogatban végezzük.
Példa egy koncentráció sorozatra:
pl szubsztrát RNS-hez (12000 cpm) 1 pl oligonukleotidkonjugátumot (10 pM) vagy megfelelő hígításokat (végső koncentráció 1 pM, 750 nM, 500 nM, 250 nM, 100 nM, 50 nM, 10 nM, 1 nM és 0,5 nM) , 4 pl Tris-HCl puffért (50 mM pH 7,4 37 “C-on) és a megfelelő mennyiségű vizet hozzápipettázzuk. Ezt a keveréket 1 percig 85 °C-ra hevítjük, és ehhez kapcsolódóan 16 órán át 37 “’Con inkubáljuk. A reakciót 5 pi felvivő puffer (0,025% brómfenolkék, 0,025% xilol cylanol 1:1 keverékben 80% formamiddai és 7 M karbamiddal, 20 mM citromsav, 1 mM EDTA) hozzáadásával állítjuk meg. A gélelektroforézises elválasztáshoz a próba 7,5 pl-ét 1 percig 95 °C-on denaturáljuk, azonnal jégre helyezzük és gélzsebre visszük fel.
Példa egy idősorozatra:
pl szubsztrát RNS/DNS-hez (12000 cpm) 1 pl oligonukleotidkonjugátumot (10 pM) , 4 pl Tris-HCl puffért (50 mM pH 7,4 37 °Con) és a megfelelő mennyiségű vizet hozzápipettázzuk. Ezt a keveréket 1 percig 85 °C-ra hevítjük, és ehhez kapcsolódóan 2, 8,
16, 40 és 64 órán keresztül 37 °C-on inkubáljuk. A reakciót 5 pl felvivő puffer (0,025% brómfenolkék, 0,025% xilol cylanol 1:1 keverékben 80% formamiddai és 7 M karbamiddal, 20 mM citromsav, mM EDTA) hozzáadásával állítjuk meg. A gélelektroforézises elválasztáshoz a próba 7,5 pl-ét 1 percig 95 “C-on denaturáljuk, azonnal jégre helyezzük és gél-zsebre visszük fel.
A szubsztrát RNS koncentrációt 25-szörös feleslegben a következők szerint becsüljük meg: 100 pM RNS nyersterméknél és a
10%-os hozamánál az előírás szerint r- r·. o
U Ό' *7 ·* trát RNS végső koncentráció és 1 μΜ oiigonukleotid-konjugátum található a reakciókeverékben. Amennyiben a terpiridin-lantanidkomplexet visszük be összehasonlításként, úgy 400 μΜ komplexre van szükség körülbelül ugyanolyan hasítás eléréséhez, mint amelyet 40 nM oligonukleotid-komplexnél érünk el. Ebben az esetben 10000-szeres feleslegben van a komplex az oiigonukleotid-konjugátumhoz képest.
A koncentráció sorozatnál 40 μΜ szubsztrát RNS/DNS hasítását 40 nM oligonukleotid-konjugátummal 16 óra alatt 37 °C-on szemléltethető .
Hasítási termékek a 3. táblázat 3.2 vegyületével RNS-El-en végzett hasításnál:
az 5'd(CTA GCC GAC TGC)r(CGA UGA CUC GCC AC) kiindulási anyagnak kevesebb, mint 20%-a marad hasítatlan.
Fő hasítási termékek (Σ80%):
5' d (CTA GCC GAC TGC)r(CGA UGcp)
5'ö(CTA GCC GAC TGC)r(CGA Ucp)
5' d(CTA GCC GAC TGC)r(CGcp)
További hasítási termékek (Σ5%):
5' r (CUA GCC GAC UGC CGA UCU CGCcp)
5' r (CUA GCC GAC UGC CGA UCU Ccp) op 2' ,3' -ciklofoszfátot jelent
F2 . példa:
Itt egy találmány szerinti antiszenz-oligonukleotid-konjucátum - ahogyan azt az 1. ábrán szemléltetjük - által előidézett cél-RNS hasításról van sző.
Az El példához hasonlóan járunk el a 3. oablázatban találka• · tó 3.20 vegyület és az RNS-E2, mint cél-RNS felhasználásával.
Hasítási termékek:
az 5' d(CTA GCC GAC TG) r (CCG AUC UCA AG)d(CCA GTC TAC) kiindulási anyagnak kevesebb, mint 5%-a marad hasítatlan.
Fő hasítási termékek (Σ95%):
5' | d | (CTA | GCC | GAC | TG) | r | (CCG | AUC | UCA Acp |
5' | d | (CTA | GCC | GAC | TG) | r | (CCG | AUC | UCAcp) |
5' | d | (CTA | GCC | GAC | TG) | K | { CCo | AUC | Uccp) |
F3, példa:
Itt további, különböző cél-RNS-ek különböző antiszenzoligonukleotid-konjugátumokkal — ahogyan azt az 1. ábrán szemléltetjük — történő hasításának vizsgálatáról van szó.
A következő 4 . táblázatban az alkalmazandó cél-RNS-ek szerkezetét mutatjuk be. A vastagon szedett nukleotidok komplementerek az antiszenz-oligonukleotid-konjugátum azon nukleotidjával, amelyhez a komplex kötődik. Az aláhúzott nukleotidok a cél-RNSóől és konjugátumból álló hibridben pár nélkül állnak (mismatch). A cél-RNS-E-17 esetében a kettőzött aláhúzás azt jelenti, hogy a kiválasztott szekvencia környezetében mindenkor 2 szomszédos nukleotid az aláhúzott területen pár nélküli, anélkül hogy egyértelműen meg lehetne határozni, mely nukleotidokról van szó. Továbbá vázolja a konjugárum helyzetét, különösen a komplexét a cél-RNS-re vonatkozóan.
4. táblázat: Különböző cél-RNS-ek szerkezete
Antiszenz oligonukleotid konjugátum (vázlat)
Ln
ZZ cél-RNS
E3 | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | UCU | CUUG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E4 | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | CUCU | CG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E5 | 5’d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | UGCU | CG) d(C | CAG | ί C ι | AC) |
E6 | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | UCGU | CG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E7 | 5'd | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | UCU | GCG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E3 | 5’d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | UCU | CUG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E9 | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | CAG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E10 | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | ACG) d(C | CAG | TCT | AC) |
Eli | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | CG UC | C) d(AG | TCT | AC) |
E12 | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | CG CG | C) d(AG | TCT | AC) |
E13 | 5' d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | GACG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E14 | 5' d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | GGCG) d(C CAG | TCT | AC) | |
E15 | 5' d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | AGCG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E16 | 5’d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | AACG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E17 | 5’d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | CUCG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E18 | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | CGAG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E2 (s.o.) | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | CAAG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E19 | 5’ r | CUA | GCC | GAC | UGC | CGA | UCU | AACGC | CAG | UCU | AC |
A 1 | sasi | tásho | z az | FI . p | éldában lei | rtak s | zerlnt j | árunk | cr, ' — ! | ahol | |
követ | keze | h 5. | tábi | ázatban bemutató | tt ant | .is zenz-olroont | ikle | C f· i Q _ | |||
aj ugá’ | rumokat ( | lásd | a 3 . | tábláz | a a o a | is) és cél-RNS-eket | - (V | ásd a | |||
0 á2 | á | ZOt) | h a s z r | i a i z a κ | fel. | Az í | i 79 2 | dazatbar | i a m 2 | _nde | n k orr |
1 - RNS | -r uk | hasít | rási | termékeit 1' | j ra megadji | -k. Például a | C é 2 | -RNS- | |||
3.22 | ko | nj u cs. | summa | tor | ténő h | . a s 2 a s a ώΑ ί | a „ +5 Ah | aaa | ί el· | e.ntr, | |
?y a - | r 5 A | és -ró | A rm- | tleotr | dók ko | zöot | a Q a n | m hasisé | i 3 . |
• · · • ··
5. táblázat: Különböző cél-RNS-eknek különböző antiszenz-oligonukleotid-konjugátumokkal történő hasításával keletkező fő hasítási termékek
Konjugátum | 3.18 | i 3.21 | 3.19 | 3.20 | 3.22 | 3.23 |
cél-RNS (mismatch megadva) | i | | | ||||
E3 ~5U,+6y | +5U, +6U | í +3U, i -r-6U | * | +3U | +3U | -1G |
E4 + 1C | -1G | +2U | * | -1G | -1G | -1G |
E5 +2G | -1G, OA | +2G | * | -1G | -1G | -1G |
E6 +3G | -1G, +3G | +3G | ★ | +4U | ★ | * |
E7 +4G | +5C | +5C | nincs hasítás | +5C | ★ | * I |
E3 +5U | +5U | +5U | -1G | ★ | ★ | |
E9 +5 A | ★ | +5A +4C | ★ | +4C | * | « l |
E10 +4A | ★ | +5C, +3U | +5C | +5C | * | * ί í I |
E11 +6LJ | ★ | no | ★ | +6U | ★ | * |
E12 +7G | ★ | no | ★ | +7G | * | ★ |
E13 +4G, +5 A | +4G, +5A | +4G +3U | ★ | +3U, +4G,+5A, +6C | * | +4G, +5A +6C, |
E14 +4G, +5G | -1G | +3U, +4G | +5G | +5G | +5G, -1G | +5G |
E15 -MA, ±5G | +3U,+4 A+5G, +6C | +3U | +5G | +5G | +5G, +3U | -5G, +3U, -1G |
E16 | +4A, | +3U, | +3U, | +3U, | +3U, | -1G, |
-4A, -5 A | +5A | +4A | +4 A, +5A | +4A, +5A | +4A | +3U,+4 At5A |
E17 +1U — — +6C | -1G | +3U | ★ | -1G | nincs hasítás | -1G |
E18 +5G, +6A | +5G, +6A | +5G | +5G | +5G | +5G | -1G, +4C, +5G |
E2 -r^A, +6A | +5A, +6A | +5A | +4C, +5A | lásd az F2 példát | +oA | +4C,+5 A+6A,- 1G |
E19 +4A,+5A | +4A, +3U | * | +3U, +4A, +5A | +3U, +4A, +5A I | -1G, +3U,+4 A-5A |
* nem vizsgáltuk
F4 , példa:
Itt további, különböző cél-RNS-ek különböző antiszenzoiigonukleetid-konjugátumokkai - ahogyan azt a 2. ábrán szemléltetjük — történő hasításának vizsgálatáról van. szó.
A következő 6. táblázatban tüntetjük fel az alkalmazott célRNS-ek szerkezetét. A 4. táblázatnál megadott magyarázatok érvén' -sek.
6. táblázat: Különböző cél-P^NS-ek szerkezete
Antiszenz oligo- | [ Ln | ||||||||||
nukleotid | 3 | J | \ | ||||||||
konjugátum (vázlat) | |||||||||||
cél-RNS | |||||||||||
E4 | 5' d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | C'JCU | CG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E5 | 5' d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | UGCU | CG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E6 | 5'd | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | UCGU | CG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E7 | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | UCU | GCG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E8 | 5'd | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | UCU | CUG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E9 | 5'd | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | CAG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E10 | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | AGG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E20 | 5'd | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCAU | CG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E12 | 5’d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | CG CG | C) d(AG | TCT | AC) |
E13 | 5' d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | GACG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E14 | 5'd | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | GGCG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E15 | 5’d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | AGCG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E16 | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | AACG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E18 | 5'd | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | CGAG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E2 | 5'd | (CTA | GCC | GAC | TG) r(C | CGA | UCU | CAAG) d(C | CAG | TCT | AC) |
E19 | 5’ r | CUA | GCC | GAC | UGC | CGA | UCU | AACGC | CAG | UCU | AC |
A hasításhoz az FI. példában leírtak szerint járunk el, aho a következő, 7. táblázatban bemutatott antiszenz-oligonukleotid konjugátumot (lásd a 3. táblázatot is) és oel-RNS-eket (lásd zabhoz fűzött m.aovarázatot rs) .
séi-RNS lő hasítási termékeit újra megadjuk (lásd az 5. táblá
7. táblázat: Különböző cél-RNS-eknek egy antiszenz-oligonukleotiö-konjugátummal történő hasításával keletkező fő hasítási termékek
Konjugátum | 3.25 |
cél-RNS | |
(mismatch megadva) | |
E4 | -10G |
-8C | |
E5 | -10G |
-7G | |
ES | -6G |
-6G |
E7 j -€U, ! -5G ί -7C, ! -8U
I tzo -4LJ | -ac, -6U, -7C |
E9 | -5C, |
-4A | -4A |
E10 | -6U |
-5A | |
E20 | -7C |
-6A | |
E12 | -2G, |
-2G | -3C |
E13 | -5A, |
-5A, -6G | -6G |
E14 -5G, -6G | -7U |
E15 | -5G, |
-5G, -6A | -6A |
E16 | -5A, |
-5A, -6A | -6A |
E18 | -3G, |
-4A, -5G | -4A |
E2 | ^A, |
-4A, -5A | -5A |
E19 | -6A, |
-5A, -6A | -7U |
• ··
F5 . példa :
Itt további, különböző cél-RNS-ek különböző antiszenzoligonukleotid-kor. jogátumokkal — ahogyan azt a 3. áorán szemléltetjük — történő hasításának vizsgálatáról van szó.
A következő 8. táblázatban tüntetjük fel az alkalmazott célRNS-ek szerkezetét. Ezen kívül egy kor.troll-DNS-t (Ξ31) is alkalmazunk. A 4. táblázatnál megadott magyarázatok érvényesek.
8. táblázat: Különböző cél-RNS-ek szerkezete
Antiszenz oligonukleotid konjugátum g, / (vázlat) cél-RNS
E2: | 5’d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGAC | UCU | CGC | CAC) | ||
E22 | 5' d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | UGCU | CGC | CAC) | ||
E23 | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGAG | UC'J | CGC | CAC) | ||
E24 | 5' d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGACC | UCU | CGC | CAC) | ||
E1 (s.o.) | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | UGACU | CGC | CAC) | ||
E14 | 5‘d | (CTA | GCC | GAC | TG)r(C | CGA | UCUGG | CG) | d(CCA | GTC | TAC) |
E2 | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TG)r(C | CGA | UCUCAA | G)d(C | CAG | TCT | AC) |
E2S | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TGC | CGA) | r(UGACU | CGC | CAC) | ||
E26 | 5’d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | UGGCU | CGC | CAC) | ||
E27 | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | UAGCU | CGC | CAC) | ||
E2S | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | U-CWU | £GC | CAC) | ||
E29 | 5' d | (CTA | GCC | GAC | TGC) | r(CGA | UACU | CGC | CAC) | ||
E30 | 5’ r | CUA | GCC | GAC | UGC | CGA | UGACU | CGC | CAC | UCU | AC |
kontroll DNS | |||||||||||
E31 | 5’ d | (CTA | GCC | GAC | TGC | CGA | TGACT | CGC | CAC) |
A hasításhoz az FI. példában leírtak szerint járunk el, ahol a következő, 9. táblázatban bemutatott antiszenz-cligonukleotidkonjugátumokat (lásd a 3. táblázatot is) és cél-RNS-eket (lásd a cél-RNS tő hasítási termékeit újra megaojuk zathoz fűzött magyarázatot is).
9. táblázat: Különböző cél-RNS-ekr.ek különbc nukleotrd-konjagátsmokkal történő hasításával ί1ásd az 5 tábla— ő antiszenz-oligoκ e r e t K e ζ ο t o sasi- tiási termékek
Konjugátum | 3.2 | 3.14 |
cél-RNS (mismatch megadva) | ||
E21 -5C | -1C, | -1C |
E22 -4G | -5U, | ★ |
E23 -5G | -7G, +2C | +2C |
E24 -5C, -6C | -1C | -21) |
E1 -4A, -5G | lásd az FI példát | -5G |
E14 -2G,-3G | * | 0G,-1C, -2G |
ι E2 l -1A,-2A | * | -1A, -2A |
E25 -4A, -5G | -5G | -5G, -6U |
E26 | -6U | +2C, |
-4G, -5G | -5G | |
E27 | -6U | -6U |
-4G, -5A | ||
E28 | -1C | -2U |
-6U — - -1C | ||
E29 | -5U | -5U |
-4A | ||
E30 | -5G, -6U, - | ★ |
-4A, -5G | 7A | |
E31 -4A, -5G | rímes hasítás | nincs hasítás |
• · · ··
SZABADALMI IGÉNYPONTOK
Claims (3)
1. ábra
1/ • · · · · · · • · · ··· ··· ···>
-· .:. ·..* ·..* * .* '·.· +5
5’ 3’
1-6. és előnyösen a 2-4. gyűrűre nem-szubsztituált és szubsztituált -CH=CH-CH=CH- csoportok kötődnek 1,3 helyzetben, és a gyűrű N-atomjaival piridinocsoportot alkotnak.
37. A 33. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a konjugátumoknál a III. általános képletű vegyületekről van szó, * · · · ·· ·«« ··· ··* • * · 9 · · · • » ·· * ·· v m' n/m ahol· R? és R? egymástól függetlenül H-, C2-C4-alkil-, Cx-C4-alk oxi- C^-C12-aralkil- vagy Cg-C^-arilcsopcrtct jelent,
R- és R6 egymástól függetlenül H-, C2-C4-alkil-, C7-Ci2 _aralkil vagy Cg-C2S-arilosoport,
R4 H-, C2-ü2Q-aikil-, C5-Cg-cikloalktl-, Cg-C22 _^rÍl_ vagy C7-C12 aralkilcsoport telvén áll,
Me lantén, iantanid fém, ittrium vagy szkandium helyén áll,
Y egy aniont helyettesít, n 2 vagy 3, és m 1,2 vagy 3, ahol az alkil-, cikloalkil-, aralkil- és anl-maradékok nem szubsztituáltak vagy Cy-C4-alkoxi-, F-, Cl-, 3r-, -CN, C2-C4-al kil- vagy -NO2 csoporttal szubsztituáltak,
R5 a IV. általános képlet maradéka
-B-oligo (IV. ) es Rx H vagy egy szubsztituenst jelent, vagy
Rc K vagy egy. szubsztituens és R, a IV. általános képlet egy ma raoekat jelenti, ahol 3 es oligó a 33. luenvoontban megadott je ·· ··· ··· ··· • * · ·· · · · • · · · » ·» lentéssel rendelkezik.
38. A 37. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol az III. általános képletű vegyületekben R2 és R7 H- helyén áll, R3 és R6 C0C4-alkiicsoportot jelent, R4 H-, C1-C4-aikil-, fenil- vagy benzilcsoportot szemléltet, az -X,-X2-X3-(XJx-oligó csoport és R5 H-, metil- vagy metoxicsoport vagy R5 az -X2-X2-X3- (X J x-oiigó csoport és R2 H-, metil- vagy metoxicsoport, X2 közvetlen kötés vagy C2-C6-alkilén-, X2 -0-, -NK-, -0(0)-0-, -C(O)-NH-, -NH-C(O)-NH- vagy -NH-C (S) -NH-csoportot jelent, X3 C2-C12-alkilén- vagy fenilén-csoportot szemléltet, X4 nukleozid építőelem 0, N, vagy
C-atomjához való kötődést jelent, vagy X,-; -0-P(0) (OM)-0-csoportot szemléltet, x 0 vagy 1 helyett áll, Me jelenthet La, Ce, Nd, Eu vagy Gd fémeket, n 2 vagy 3 és m 1 vagy 2 helyett áll, Y mutathat Cl-, Br-, CH3C(O)O-, C104-, BF4 , PF6 , F3C-SO3- vagy tozilát aniont, M állhat H, Na vagy K helyett, és oligó egy olyan oligonukleotidot jelent, amelynek belső szekvenciája egy cél-RNS-sel csak részben komplementer, és amely természetes dezoxiribonukleotid építőelemekből vagy nem természetes szintetikus nukleotid építőelemekből épül fel, ahol a cél-RNS-re vonatkoztatva 1-4 építőelem hiányzik.
39. Eljárás olyan oligonukleotidok előállítására, amelyekhez átészterező vagy hidrolizáló katalizátor kötődik, és az oligonukleotid belső szekvenciái részben nem-komplementerek egy természetben előforduló cél-RNS-sel, és az oligonukleotid természetes dezoxiribonukleotid építőelemekből vagy nem természetes szintetikus nukleotid építőelemekből épül fel, azzal jellemezve, hogy az alapvázhoz kötve funkciós csoportot felmutató, átészte78 rező vagy hidrolizáló katalizátort egy nukleotid építőelem funkciós csoportjával vagy egy nukleotid építőelem funkcionálisan módosított csoportjával kicseréljük.
40. Eljárás ribonukleinsavak nukleotidfoszfát hídjainak — fiziológiai körülmények között és szintetikus átészterező és/vagy hidrolizáló katalizátor hatására történő — hasítására, azzal jellemezve, hogy (a) komplexbe visszük a cél-RNS-t egy olyan oligonukleotiddal, amelynek belső szekvenciája részben nem-komplementer a cél-RNS-sel, és amely átészterező és/vagy hidrolizáló katalizátorhoz kötődik, azzal az kikötéssel, hogy kiemeljük az olyan oligonukleotidokat, amelyeknek belső szekvenciája részben nem-komplementer egy természetben előforduló cél-RNS-sel és amelyhez átészterező vagy hidrolizáló katalizátorként texafirinfém-komplex kötődik, és (b) azután hagyjuk reagálni és hasadni.
41. Eljárás az 1. igénypont szerinti oligonukleotidok felhasználására egy terápiás eljárás során, melegvérűek — beleértve az embert — betegségeinek kezelésére nukleotid-szekvenciák inaktiválása révén a testben.
42. Vizes oldat vagy szuszpenzió alapú készítmény, amely az 1. igénypont szerinti oligonukleotid hatásos mennyiségét egymagában vagy egyéb hatóanyagokkal, gyógyszerészeti hordozóanyagként vízzel és adott esetben segédanyagokkal együtt tartalmazza.
43. Vizes oldat vagy szuszpenzió alapú gyógyszerészeti preparátum, amely az i. igénypont szerinti oligonukleotid hatásos menynyiségét egymagában vagy egyéb hatóanyagokkal, gyógyszerészeti hordozóanyagként jelentős mennyiségű vízzel és adott esetben segédanyagokkal együtt tartalmazza.
• · ·» ·· ·· • · · · · ·· ··· ··* ··· • · · · · · · · • «· ·· · ··
44. A 39. igénypont szerint előállított, 1. igénypont szerinti oligonukleotid felhasználása diagnosztikumként vírusfertőzések vagy genetikai eredetű betegségek kimutatására.
45. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid felhasználása melegvérűek — beleértve az embert — betegségeinek kezelésére nukleotid-szekvenciák inaktiválása révén a testben.
A meghatalmazott:
1. Dezoxinbonukleot időkből, nem természetes, szintetikus nukleotid építőelemekből, vagy peptidnukleinsavakból felépülő olyan oligonukleotid, amelynél az oligonukleotidhoz átészterező vagy hidrolizáló katalizátor kötődik, és az oligonukleotid belső szekvenciája részben nem-komplementer egy természetben előforduló cél-RNS-sel, azzal az kikötéssel, hogy kiemeljük az olyan oligonukleotidokat, amelyeknek belső szekvenciája részben nemkomplementer egy természetben előforduló cél-RNS-sel és amelyhez átészterező vagy hidrolizáló katalizátorként texafirin-fém-komplex kötődik.
2. ábra • ·« ··· · ·· · ·* , * ········<
ι
2/3
2. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid, amelyben a részben nem-komplementer jelleget a szekvenciában szerkezeti zavarás okozza oly módon, hogy nem tud bekövetkezni bázispár képződés.
3. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol az oligonukleotid szekvenciájában — a cél-RNS-sel összehasonlítva — egy vagy több egymás után következő nukleotid építőelem hiányzik.
4. A 3. igénypont szerinti oligonukleotid, amelyben az 1-10 nukleotid építőelem hiányzik.
5. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol az oligonukleotid egy vagy több olyan egymást követő nukleotid építőelemet tartalmaz, amelyek a cél-RNS megfelelő nukleotid építőelemeivel nem képeznek párt.
6. Az 5. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol az oligonukleotid 1—10 párt nem képző építőelemet tartalmaz.
7. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid, amelyben a cél-RNS• * · sel párt nem képző külső nukleotid építőelemek 10-ig a belső szekvenciához kötődnek.
8. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid, amely párt nem képző épízőelemként természetes nukleotid építőelemeket tartalmaz.
9. Az 1. igénypont szerinti oligonukleorid, amely párt nem képző építőelemként nem természetes, szintetikus nukleotid építőeleme-
nukleotid építőelemet tartalmaz.
13. Az 5. igénypont szerinti oligonukleotid, amelyben a párt nem képző rész a szekvencia belső területén helyezkedik el.
14. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid, amely a purin és pirimidin sorozat természetes dezoxinukleozidjaiból épül fel.
15. A 14. igénypont szerinti oligonukleotid, amely 2'-dezoxi-2amino-adenozinból, 2' -dezoxi-5-metil-citidinbői, 2' -dezoxiadenozinból, 2' -dezoxicitídmből, 2' -dezoxiguanozmból és 2' -dezoxitimidinből épül fel .
16. A 14. igénypont szerinti oligonukleotid, amely 2'-dezoxiadenozinból (A), 2' -dezoxicitidinből (C), 2'-dezoxiguanozinból (G) és 2' -dezoxitimidinből (T) épül fel.
17. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid, amelyben a nem természetes, szintetikus építőelemek a purm és pirimidin sorozat természetes nukleozidjaiból vezethetők le.
• · ·
9 9 ·
18. A 17. igénypont szerinti oligonukleotid, amelyben az építőelem adenozinból, citidinből, guanozinból, 2-amino-adenozinból,
5-metil-citozinból, timidinből és az előzőekben megnevezett dezoxi-származékokból vezethető le.
19. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a cél-RNS-sel részben komplementer oligonukleotid (1) természetes dezoxinukleozidokból vagy nem természetes, szintetikus építőelemekből épül fel, és (2) a részben komplementer sajátságot az egyébként komplementer szekvencia 1-4 építőelemének hiánya okozza.
20. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol átészterező vagy hídrólizáló katalizátor az oligonukleotid-szekvencia 3’ vagy
5’ végcsoportjaiban N-, S- vagy O-atomokhoz; a szekvencia belsejében vagy végén nukleinbázisok C-, N- vagy O-atomjaihoz; furanóz-gyűrűk 2'-helyzetében a szekvencia belsejében vagy végén 0-, S- vagy N-atomokhoz; vagy a szekvenciában közvetlenül vagy hídképző csoporton keresztül, a nukleotid hídképző csoportjának 0-, S- vagy N-atomjaihoz kötődik.
21. A 20. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a hídképző csoport az I. általános képletnek felel meg,
-X1-X2-X3-(XJx- (I.) amelyben X2 közvetlen kötést vagy olyan kétértékű, 1-22 szénatomos nyíltláncú vagy ciklusos szénhidrogén csoportot, amely megszakítás nélküli vagy az -S-, -NR-, -C(0)-0-, -C(O)-NR- csoportok maradékaival megszakított, vagy 1-12 oxa-alkilén egyseget és az alkilénben 2 vagy 3 szénatomot tartalmazó polioxa-slkilénmaradékot jelent; X2 -0-, -S-, -NR-, -NH-C(O)-NH-, -NH-C(S)-NH-,
-0-C (O) -0-,
-0-C (0) -NH-,
-NH-C(0)-0-,
-C (0) -0-,
-C (S)-0-, « * ···
-O-C(O)-, -O-C(S)-, -C(O)-NR-, -RN-C(O)-, -S (Ο ) -0-, -0-S (0 ) 2~ ,
-S(O)2~NR-, -NR-S(O)-, -P (0) - (OM) -0-, -0-P (0) - (OM)-, -P(O)-(OM)-NR-, -NR-P (0) - (OM)-, -PH(O)-O-, -O-PH(O)-, -PH(O)-NR- és
-NR-PH(O)- csoportokat szemléltet; X3 függetlenül X3 jelentésével bír és x 0-val azonos, ha Χς közvetlen kötést szemléltet; Xj egy nukleozid építőelem 0-, N- vagy C-atomjához való kötődést jelent, vagy X4 -0-P (0 ) (OM)-0-, -NR-P (0 ) (OM)-0-, -0-P (0 ) (OM)-NR-, vagy -NR-P(O)(OM)-NR- csoportokat szemléltet, ha x 1-gyel azonos és X3 nem közvetlen kötés; R H-, Ο3-Ο6-alkil-, fenil- vagy benzilcsoport; Μ H-, C2-Cg-alkil-, fenil- vagy benzilcsoport, alkálifém kation vagy ammónium kation helyén áll; és x 0 vagy 1.
22. A 21. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol az I. általános képletben X3 közvetlen kötés és előnyösen Cj-C4-alkilén-, fenilén- vagy benzilénosoportot jelent, ahol az alkilén-csoportot -0(0)-0- vagy -C(0)NH-csoportok szakíthatják meg; X2 0(0)-0-, -C(O)-NH-, -NH-C(0)-NH- vagy -NH-C(S)-NH-; X3 C2-C18-alkilén-, előnyösen C2-C12-alkilén-csoportot szemléltet; X4 -0-P(0)(OM)-O-, -NR-P (0) (OM)-0-, -0-P (0) (OM)-NR- vagy -NR-P (0) - (OM)-NR- csoportokat jelent.
23. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol az oligonukleotidhoz kötődő katalizátorok esetében polipeptiöekről, fémsókról és fém-komplexekről van szó.
24. A 23. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a fémeket az elemek periódusos rendszerének mellékcsoportjaiból, valamint főcsoportjaiból, In, TI, Sn, Pb és Bi választjuk ki.
25. A 23. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a fémeket szkandium, ittrium, lantán, lantanidák, Ti, Zr, Hf, V, Nb, Ta, • r 9 ♦ · ··♦ · · *
Cr, Mo, W, Mn, Fe, Ru, Os, Co, Rh, ír, Ni, Pd, Pt, Cu, Ag, Au,
Zn, Cd és Hg közül választjuk ki.
26. A 23. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a fémeket szkandium, ittnum, lantán, lantanidák, Cu és ólom közül választjuk ki.
27. A 23. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol lantanida fémekként a Ce, Eu, Gd és Sm csoportját választjuk ki.
28. A 23. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a fémsókhoz és fémsó-komplexekhez megfelelő anionokat a következő csoportból választunk: halogenid, oxisavak anionja, BF4 , PF6 , SiF6 és
AsF6.
29. A 23. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a fémkomplex katalizátorok előnyösen hetero-organikus vegyületekkel, mint komplexképzőkkel képzett fémsó-komplexként állnak rendelkezésre, ahol a komplexképző az oligonukleotidhoz kapcsolódik.
30. A 29.. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a komplexképzőknél az 0, S, N és P csoportból kiválasztott hetero-atomokat tartalmazó nyiltláncú vagy ciklusos szerves vegyületekről van szó .
31. A 29. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a komplexképzőknél összesen 8-26 gyűrűtagot tartalmazó és 2-12 hetero-atommal rendelkező ciklusos vagy policiklusos szerves vegyületekről van szó.
32. A 29. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a komplexképzőknél koronaéter, cianin, ftálo-cianin, porfirin, fenantrolin, nyílt és ciklusos di- és terpiridin, etilén-diamin-tetraecetsav és dietilén-uriamin-pentaacetát jön szóba.
β« · * · « ·♦ # • · « * < ·· ·»
33. Az 1. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a konjugátum a
II. általános képletnek felel meg,
A-B-oligó (II.) amelyben A a B-hez előnyösen szénatomon keresztül kötődő ciklusos vagy policiklusos fémsókomplex, amelyet olyan komplexképzővel állítunk elő, amely a gyűrűben legalább 12 gyűrűatomot és legalább 4 hetero-atomot — N és 0 csoportból — tartalmaz kétértékű vagy háromértékű fémionokhoz kötve, amelyeket a szkandiumot, ittnumot, lantánt és lantanida fémeket tartalmazó csoportból választottunk ki; B az I . általános képlet hídképző csoportjául szolgál és oligó olyan oligonukleotidot jelent, amelynek belső szekvenciája cél-RNS-sel részben nem-komplementer.
34. A 33. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a komplexképző összesen legfeljebb 22 gyűrűatomot tartalmaz, és a gyűrűatomok a hetero-atomokon kívül előnyösen C-atomok.
35. A 34. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a komplexképző 4-12 hetero-atomot tartalmaz az 0 és N csoportból.
36. A 33. igénypont szerinti oligonukleotid, ahol a komplexképző összesen 16-20 gyűrűatomot, valamint 6-10 N-atomot tartalmaz, ahol a fennmaradó gyűrűtagok esetében C-atomokról van szó, és az
3/3
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
CH269494 | 1994-09-02 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
HUT77034A true HUT77034A (hu) | 1998-03-02 |
Family
ID=4239485
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
HU9701971A HUT77034A (hu) | 1994-09-02 | 1995-08-30 | Ribonukleinsavak hasítására szolgáló oligonukleotid konjugátumok, készítmények és eljárás |
Country Status (8)
Country | Link |
---|---|
EP (1) | EP0778845A1 (hu) |
JP (1) | JPH10505353A (hu) |
AU (1) | AU3519095A (hu) |
CA (1) | CA2197785A1 (hu) |
FI (1) | FI970696L (hu) |
HU (1) | HUT77034A (hu) |
NO (1) | NO970885L (hu) |
WO (1) | WO1996007667A1 (hu) |
Families Citing this family (8)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5798491A (en) * | 1993-06-09 | 1998-08-25 | Board Of Regents, The University Of Texas System | Multi-mechanistic chemical cleavage using certain metal complexes |
US5714328A (en) * | 1995-06-07 | 1998-02-03 | Board Of Regents, The University Of Texas System | RNA photocleavage using texaphyrins |
WO1998007733A1 (en) * | 1996-08-20 | 1998-02-26 | Pharmacyclics, Inc. | Nucleic acids internally-derivatized with a texaphyrin metal complex and uses thereof |
US6022959A (en) * | 1996-08-20 | 2000-02-08 | Pharmacyclics, Inc. | Nucleic acids internally-derivatized with a texaphyrin metal complex and uses thereof |
US6255476B1 (en) * | 1999-02-22 | 2001-07-03 | Pe Corporation (Ny) | Methods and compositions for synthesis of labelled oligonucleotides and analogs on solid-supports |
KR101040700B1 (ko) * | 2006-11-16 | 2011-06-10 | 주식회사 엘지화학 | 테레프탈알데히드의 정제방법 |
NZ580457A (en) | 2007-04-06 | 2012-03-30 | Neurocrine Biosciences Inc | Gonadotropin-releasing hormone receptor antagonists and methods relating thereto |
CL2008000986A1 (es) | 2007-04-06 | 2008-10-17 | Neurocrine Biosciences Inc | COMPUESTO DERIVADO DE HETEROCICLOS DE NITROGENO, AGONISTAS DEL RECEPTOR GnRH; COMPOSICION FARMACEUTICA QUE COMPRENDE A DICHO COMPUESTO; Y USO PARA TRATAR UNA AFECCION RELACIONADA CON LAS HORMONAS SEXUALES, ENDOMETRIOSIS, DISMENORREA, ENFERMEDAD DE OV |
Family Cites Families (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US5559207A (en) * | 1989-03-06 | 1996-09-24 | Board Of Regents, University Of Texas | Texaphyrin metal complex mediated ester hydrolysis |
-
1995
- 1995-08-30 WO PCT/EP1995/003408 patent/WO1996007667A1/de not_active Application Discontinuation
- 1995-08-30 HU HU9701971A patent/HUT77034A/hu unknown
- 1995-08-30 JP JP8509173A patent/JPH10505353A/ja active Pending
- 1995-08-30 EP EP95931942A patent/EP0778845A1/de not_active Withdrawn
- 1995-08-30 CA CA002197785A patent/CA2197785A1/en not_active Abandoned
- 1995-08-30 AU AU35190/95A patent/AU3519095A/en not_active Abandoned
-
1997
- 1997-02-19 FI FI970696A patent/FI970696L/fi unknown
- 1997-02-27 NO NO970885A patent/NO970885L/no unknown
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
EP0778845A1 (de) | 1997-06-18 |
FI970696A0 (fi) | 1997-02-19 |
CA2197785A1 (en) | 1996-03-14 |
NO970885D0 (no) | 1997-02-27 |
JPH10505353A (ja) | 1998-05-26 |
AU3519095A (en) | 1996-03-27 |
WO1996007667A1 (de) | 1996-03-14 |
FI970696L (fi) | 1997-02-19 |
NO970885L (no) | 1997-04-25 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
Brodyagin et al. | Chemical approaches to discover the full potential of peptide nucleic acids in biomedical applications | |
AU763518B2 (en) | Ligand-conjugated oligomeric compounds | |
CA2071536C (en) | Triple helix formation in oligonucleotide therapy | |
JP3186795B2 (ja) | 末端3′−3′または5′−5′ヌクレオチド間結合を有するオリゴヌクレオチド類似体 | |
EP3862024A1 (en) | Sirna conjugate, preparation method therefor and use thereof | |
JP2021046396A (ja) | ホスホルアミダイト化学を使用する骨格修飾モルホリノオリゴヌクレオチド及びキメラの合成 | |
IL185569A (en) | Cyclic acid and analogues of nucleotide nucleotides and oligonucleotides | |
JP2004500330A (ja) | グアニジニウム官能化オリゴマーとその製造法 | |
CN101534643A (zh) | 用于递送寡核苷酸的基于位阻酯的生物可降解连接体 | |
JPH07501527A (ja) | 修飾されたピリミジンを含有するオリゴマーを使用する増強された三重らせんおよび二重らせんの成形 | |
US20240167033A1 (en) | Method of producing hairpin single-stranded rna molecule | |
JP2002522449A (ja) | 2’−o−アミノエチルオキシエチル修飾オリゴヌクレオチド類 | |
WO1992010590A1 (en) | Inhibition of transcription by formation of triple helixes | |
EP3842534A1 (en) | Nucleic acid, pharmaceutical composition and conjugate containing nucleic acid, and use thereof | |
Astakhova et al. | Peptide–LNA oligonucleotide conjugates | |
WO2022056273A1 (en) | Lipid conjugates for the delivery of therapeutic agents | |
US5925744A (en) | Functional terpyridine-metal complexes, a process for the preparation thereof and oligonucleotide conjugates with terpyridine-metal complexes | |
HUT77034A (hu) | Ribonukleinsavak hasítására szolgáló oligonukleotid konjugátumok, készítmények és eljárás | |
WO2024140101A1 (zh) | 修饰的双链寡核苷酸分子、修饰的双链寡核苷酸缀合物及其用途 | |
US5746997A (en) | Radiohalogenation of oligonucleotides via trialkylstannylaryl conjugates | |
EP0777498B1 (en) | Conjugates made of metal complexes and oligonucleotides | |
JP6491233B2 (ja) | ハイブリダイゼーション安定化用核酸複合体、核酸ハイブリダイゼーションの安定化方法、アンチセンス核酸医薬品及びmicroRNA抑制剤 | |
CN119285688A (zh) | 修饰的核苷酸单体及其用途 | |
EP1295892A1 (en) | Antisense molecules and method of controlling expression of gene function by using the same | |
Noronha | Synthesis Physicochemical and Biological Studies on Oligonucleotides Containing D-arabinose |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
DFD9 | Temporary protection cancelled due to non-payment of fee |