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ES2219657T3 - Proteinas quimericas que comprenden polipeptidos de borrelia: usos para las mismas. - Google Patents

Proteinas quimericas que comprenden polipeptidos de borrelia: usos para las mismas.

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ES2219657T3
ES2219657T3 ES95900453T ES95900453T ES2219657T3 ES 2219657 T3 ES2219657 T3 ES 2219657T3 ES 95900453 T ES95900453 T ES 95900453T ES 95900453 T ES95900453 T ES 95900453T ES 2219657 T3 ES2219657 T3 ES 2219657T3
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protein
ospa
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ES95900453T
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John J. Dunn
Benjamin J. Luft
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Brookhaven Science Associates LLC
Research Foundation of the State University of New York
Original Assignee
Brookhaven Science Associates LLC
Research Foundation of the State University of New York
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    • C07K14/20Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Spirochaetales (O), e.g. Treponema, Leptospira
    • AHUMAN NECESSITIES
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Abstract

SE PRESENTAN NUEVOS ACIDOS NUCLEICOS QUIMERICOS, QUE CODIFICAN PROTEINAS QUIMERICAS DE "BORRELIA" DE AL MENOS DOS POLIPEPTIDOS ANTIGENICOS DE LAS PROTEINAS CORRESPONDIENTES Y/O NO CORRESPONDIENTES DE LA MISMA Y/O DE ESPECIES DIFERENTES DE LA "BORRELIA". TAMBIEN SE PRESENTAN LAS PROTEINAS QUIMERICAS CODIFICADAS POR LAS SECUENCIAS DE ACIDOS NUCLEICOS. LAS PROTEINAS QUIMERICAS SON UTILES COMO INMUNOGENOS DE VACUNA CONTRA LA BORRELIOSIS ASI COMO PARA REAGENTES DE INMUNODIAGNOSTICO.

Description

Proteínas quiméricas que comprenden polipéptidos de Borrelia: usos para las mismas.
Antecedentes de la invención
La borreliosis de Lyme es la enfermedad infecciosa portada por ácaros más común en Norte América, Europa y el norte de Asia. El agente bacteriano causante de esta enfermedad, Borrelia burgdorferi, se aisló y cultivó por primera vez en 1982 (Burgdorferi, W.A. et al., Science 216: 1317-1319 (1982); Steere, A. R. et al., N. Engl. J. Med. 308: 733-740 (1983)). Con ese descubrimiento, un amplio conjunto de síndromes clínicos, descritos tanto en la bibliografía europea como americana desde principios del Siglo XX, pudo atribuirse a la infección por B. burgdorferi (Afzelius, A., Acta Derm. Venereol. 2: 120-125 (1921); Bannwarth, A., Arch. Psychiatr. Nervenkrankh. 117: 161-185 (1944); Garin, C. y A. Bujadouz, J. Med. Lyon 71: 765-767 (1922); Herxheimer, k. y K. Hartmann, Arch. Dermatol. Syphilol. 61: 57-76, 255-300 (1902)).
La respuesta inmunológica a B. burgdorferi se caracteriza por una respuesta humoral temprana, prominente y persistente hacia el extremo de la proteína flagelar, p41 (fla), y a un constituyente proteínico del cilindro protoplásmico, p93 (Szczepanski, A., y J. L. Benach, Microbiol. Rev. 55: 21 (1991)). El antígeno de la flagelina p41 es una proteína inmunodominante; sin embargo, comparte una homología significativa con flagelinas de otros microorganismos y, por lo tanto, es muy reactiva de forma cruzada. El antígeno p93 es el antígeno inmunodominante mayor de B. burgdorferi. Tanto las proteínas p41 como p93 son antígenos físicamente crípticos, cubiertos del sistema inmune por una membrana exterior, cuyos constituyentes proteínicos principales son las proteínas de la superficie exterior A y B (OspA y OspB). OspA es una lipoproteína básica de aproximadamente 31 kd, que es codificada sobre un plásmido lineal grande junto con OspB, una lipoproteína básica de aproximadamente 34 kd (Szczepanski, A., y J. L. Benach, Microbiol. Rev. 55: 21 (1991)). El análisis de materiales aislados de B. burgdorferi, obtenidos de Norte América y Europa, ha demostrado que OspA tiene una variabilidad antigénica, y que varios grupos distintos pueden ser definidos serológica y genotípicamente (Wilske, B., et al., World J. Microbiol. 7: 130 (1991)). Otras proteínas de Borrelia demuestran una variabilidad antigénica similar. Sorprendentemente, la respuesta inmunológica a estas proteínas de la superficie exterior tiende a producirse, si es que lo hace, en una fase tardía de la enfermedad (Craft, J. E. et al., J. Clin Invest. 78: 934-939 (1986); Dattwyler, R. J. y B. J. Luft, Rheum. Clin. North Am. 15: 727-734 (1989)). Además, pacientes infestados de modo agudo y crónico con B. burgdorferi responden de forma variable a los diferentes antígenos, incluidos OspA, OspB, OspC, OspD, p39, p41 y p93.
Se han ensayado vacunas contra la borreliosis de Lyme. Ratones inmunizados con una forma recombinante de OspA están protegidos del enfrentamiento con la misma cepa de B. burgdorferi de la que se obtuvo la proteína (Fikrig, E. et al., Science 250: 553-556 (1990)). Además, anticuerpos monoclonales (acms) anti-OspA, pasivamente transferidos, han demostrado ser protectores en ratones, y la vacunación con una proteína recombinante indujo una inmunidad protectora contra la subsiguiente infección con la cepa homóloga de B. burgdorferi (Simon, M.M., et al., J. Infect. Dis. 164: 123 (1991)). Desgraciadamente, la inmunización con una proteína procedente de una cepa no confiere necesariamente resistencia a una cepa heteróloga (Fikrig, E. et al., J. Immunol. 7: 2256-1160 (1992)), sino más bien se limita a las "especies" homólogas de las que se preparó la proteína. Además, la inmunización con una proteína sencilla procedente de una cepa particular de Borrelia no conferirá resistencia a esa cepa en todos los individuos. Existe una variaciación considerable exhibida en OspA y OspB, así como p93, que incluye las regiones que confieren antigenicidad. Por lo tanto, el grado y la frecuencia de protección que proceden de la vacunación con una proteína procedente de una cepa sencilla dependen de la respuesta del sistema inmunológico a la variación particular, así como la frecuencia de variación genética en B. burgdorferi. Actualmente existe la necesidad de una vacuna que proporcione inmunogenicidad a través de las especies y a más epítopos dentro de una especie, así como inmunogenicidad contra más de una proteína.
Rosa et al. (Molec. Biol. 6: 3031-3040 (1992)), describen el aislamiento de cepas clonales de B. burgdorferi, en las que la recombinación se ha producido dentro del operón ospA/ospB.
Sumario de la invención
La presente invención pertenece a proteínas quiméricas de Borrelia que incluyen dos o más polipéptidos de Borrelia antigénicos que no se producen de forma natural (en la naturaleza) en la misma proteína en Borrelia, así como a los ácidos nucleicos que codifican proteínas quiméricas de este tipo. Los polipéptidos antigénicos incorporados en las proteínas quiméricas se derivan de cualquier proteína de Borrelia procedente de cualquier cepa de Borrelia, e incluyen las proteínas de la superficie exterior (Osp)A, OspB, OspC, OspD, p12, p39, p41, p66 y p93. Las proteínas de las que se derivan los polipéptidos antigénicos pueden proceder de la misma cepa de Borrelia, de diferentes cepas o de combinaciones de proteínas procedentes de la misma o de diferentes cepas. Si las proteínas de las que se derivan los polipéptidos antigénicos son OspA u OspB, el polipéptido antigénico se puede derivar de la porción de la proteína OspA u OspB presente entre el extremo amino y triptófano conservado de la proteína (al que se alude como una porción proximal) o la porción de la proteína OspA u OspB presente entre el triptófano conservado de la proteína y el extremo carboxi (al que se alude como porción distal). En las figuras 23-37 y 43-46 se recogen proteínas quiméricas particulares y las secuencias de nucleótidos que las codifican.
Las proteínas quiméricas de la presente invención proporcionan polipéptidos antigénicos de una diversidad de cepas de Borrelia y/o proteínas dentro de una proteína sencilla. Proteínas de este tipo son particularmente útiles en análisis inmunodiagnósticos para detectar la presencia de anticuerpos contra Borrelia nativa en individuos potencialmente infectados, así como para medir la reactividad de células T y, por lo tanto, se pueden utilizar como reactivos inmunodiagnósticos. Las proteínas quiméricas de la presente invención son adicionalmente útiles como inmunógenos de vacuna contra la infección por Borrelia.
Para una mejor comprensión de la presente invención junto con otros y adicionales objetos se hace referencia a la siguiente descripción, considerada junto con los dibujos que se acompañan.
Breve descripción de los dibujos
La figura 1 resume péptidos y dominios antigénicos localizados por fragmentación proteolítica y química de OspA.
La figura 2 es una comparación de los dominios antigénicos representados en la figura 1, para OspA en nueve cepas de B. burgdorferi.
La figura 3 es una gráfica que muestra una representación de polimorfismo ponderado frente a la posición del aminoácido entre 14 variantes de OspA. Los picos marcados son: a) aminoácidos 132-145; b) aminoácidos 163-177; c) aminoácidos 208-221. La línea discontinua inferior en el valor del polimorfismo 1.395 denota excesos estadísticamente significativos de polimorfismo a p = 0,05. La línea discontinua superior a 1.520 es la misma, excepto que los primeros 29 aminoácidos en el extremo N monomórfico han sido retirados del análisis original.
La figura 4 muestra la alineación de aminoácidos de los residuos 200 a 220 para OspAs procedentes de las cepas B31 y K48, así como para los mutantes 613, 625, 640, 613/625 y 613/640 dirigidos al lugar. La flecha indica Trp216. Los cambios en los aminoácidos están subrayados.
La figura 5 es una proyección de rueda helicoidal de los residuos 204-217 de OspA B31. Las letras en mayúscula indican residuos hidrófobos; las letras minúsculas indican residuos hidrófilos; +/- indican residuos positiva/negativamente cargados. La línea discontinua indica la división de la hélice alfa en el arco hidrófobo (por encima de la línea) y el arco polar (por debajo de la línea). Adaptado de France et al. (Biochem. Biophys. Acta 1120: 59 (1992)).
La figura 6 describe un árbol filogénico para las cepas de Borrelia descritas en la Tabla I. Las cepas son como sigue: 1 = B31; 2 = Pka1; 3 = ZS7; 4 = N40; 5 = 25015; 6 = K48; 7 = DK29; 8 = PHei; 9 = Ip90; 10 = PTrob; 11 = ACAI; 12 = PGau; 13 = Ip3; 14 = PBo; 15 = PKo.
La figura 7 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de OspA-B31 (SEQ ID NO. 6) y la secuencia de la proteína codificada (SEQ ID NO. 7).
La figura 8 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de OspA-K48 (SEQ ID NO. 8) y la secuencia de la proteína codificada (SEQ ID NO. 9).
La figura 9 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de OspA-PGau (SEQ ID NO. 10) y la secuencia de la proteína codificada (SEQ ID NO. 11).
La figura 10 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de OspA-25015 (SEQ ID NO. 12) y la secuencia de la proteína codificada (SEQ ID NO. 13).
La figura 11 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de OspB-B31 (SEQ ID NO. 21) y la secuencia de la proteína codificada (SEQ ID NO. 22).
La figura 12 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de OspC-B31 (SEQ ID NO. 29) y la secuencia de la proteína codificada (SEQ ID NO. 30).
La figura 13 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de OspC-K48 (SEQ ID NO. 31) y la secuencia de la proteína codificada (SEQ ID NO. 32).
La figura 14 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de OspC-PKo (SEQ ID NO. 33) y la secuencia de la proteína codificada (SEQ ID NO. 34).
La figura 15 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de OspC-pTrob (SEQ ID NO. 35) y la secuencia de la proteína codificada (SEQ ID NO. 36).
La figura 16 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de p93-B31 (SEQ ID NO. 65) y la secuencia de la proteína codificada (SEQ ID NO. 66).
La figura 17 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de p93-K48 (SEQ ID NO. 67).
La figura 18 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de p93-Pbo (SEQ ID NO. 69).
La figura 19 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de p93-pTrob (SEQ ID NO. 71).
La figura 20 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de p93-pGau (SEQ ID NO. 73).
La figura 21 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de p93-25015 (SEQ ID NO. 75).
La figura 22 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de p93-pKo (SEQ ID NO. 77).
La figura 23 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspA-K48/OspA-PGau (SEQ ID NO. 85) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 86).
La figura 24 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspA-B31/OspA-PGau (SEQ ID NO. 88) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 89).
La figura 25 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspA-B31/OspA-K48 (SEQ ID NO. 91) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 92).
La figura 26 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspA-B31/OspA-25015 (SEQ ID NO. 94) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 95).
La figura 27 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspA-K48/OspA-B31/OspA-K48 (SEQ ID NO. 97) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 98).
La figura 28 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspA-B31/OspA-K48/OspA-B31/OspA-K48 (SEQ ID NO. 100) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 101).
La figura 29 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspA-B31/OspB-B31 (SEQ ID NO. 103) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 104).
La figura 30 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspA-B31/OspB-B31/OspC-B31 (SEQ ID NO. 106) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 107).
La figura 31 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspC-B31/OspA-B31/OspB-31 (SEQ ID NO. 109) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 110).
La figura 32 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspA-B31/p93-B31 (SEQ ID NO. 111) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 112).
La figura 33 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspB-B31/p41-B31 (122-234) (SEQ ID NO. 113) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 114).
La figura 34 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspB-B31/p41-B31 (122-295) (SEQ ID NO. 115) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 116).
La figura 35 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspB-B31/p41-B31 (140-234) (SEQ ID NO. 117) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 118).
La figura 36 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspB-B31/p41-B31 (140-295) (SEQ ID NO. 119) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 120).
La figura 37 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspB-B31/p41-B31 (122-234)/OspC-B31 (SEQ ID NO. 121) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 122).
La figura 38 muestra una alineación de la secuencia de ácidos nucleicos para OspC-B31 (SEQ ID NO. 29), OspC-PKo (SEQ ID NO. 33), OspC-pTrob (SEQ ID NO. 35) y OspC-K48 (SEQ ID NO.31). Los ácidos nucleicos que son idénticos a los que aparecen en la secuencia de ácidos nucleicos conductora (aquí, OspC-B31) están representados por un punto (.); los ácidos nucleicos que difieren se muestran en letras minúsculas.
La figura 39 muestra una alineación de la secuencia de ácidos nucleicos para OspD-pBo (SEQ ID NO. 123), OspD-PGau (SEQ ID NO. 124), OspD-DK29 (SEQ ID NO. 125) y OspD-K48 (SEQ ID NO. 126). Los ácidos nucleicos que son idénticos a los que aparecen en la secuencia de ácidos nucleicos conductora (aquí, OspD-pBo) están representados por un punto (.); los ácidos nucleicos que difieren se muestran en letras minúsculas.
La figura 40 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de p41-B31 (SEQ ID NO. 127) y la secuencia de la proteína codificada (SEQ ID NO. 128).
La figura 41 muestra una alineación de la secuencia de ácidos nucleicos para p41-B31 (SEQ ID NO. 127), p41-pKa1 (SEQ ID NO. 129), p41-PGau (SEQ ID NO. 51), p41-PBo (SEQ ID NO. 130), p41-DK29 (SEQ ID NO. 53) y p41-PKo (SEQ ID NO. 131). Los ácidos nucleicos que son idénticos a los que aparecen en la secuencia de ácidos nucleicos conductora (aquí, p41-B31) están representados por un punto (.); los ácidos nucleicos que difieren se muestran en letras minúsculas.
La figura 42 muestra una alineación de la secuencia de ácidos nucleicos para OspA-B31 (SEQ ID NO. 6), OspA-pKa1 (SEQ ID NO. 132), OspA-N40 (SEQ ID NO. 133), OspA-ZS7 (SEQ ID NO. 134), OspA-25015 (SEQ ID NO. 12), OspA-pTrob (SEQ ID NO. 135), OspA-K48 (SEQ ID NO. 8), OspA-Hei (SEQ ID NO. 136), OspA-DK29 (SEQ ID NO. 49), OspA-Ip90 (SEQ ID NO. 50), OspA-pBo (SEQ ID NO. 55), OspA-Ip3 (SEQ ID NO. 56), OspA-PKo (SEQ ID NO. 57), OspA-ACAI (SEQ ID NO. 58) y OspA-PGau (SEQ ID NO. 10). Los ácidos nucleicos que son idénticos a los que aparecen en la secuencia de ácidos nucleicos conductora (aquí, OspA-B31) están representados por un punto (.); los ácidos nucleicos que difieren se muestran en letras minúsculas.
La figura 43 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspA-Tro/OspA-Bo (SEQ ID NO. 137) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 138).
La figura 44 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspA-PGau/OspA-Bo (SEQ ID NO. 139) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 140).
La figura 45 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspA-B31/OspA-PGau/OspA-B31/OspA-K48 (SEQ ID NO. 141) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 142).
La figura 46 muestra la secuencia de ácidos nucleicos de la quimera OspA-PGau/OspA-B31/OspA-K48 (SEQ ID NO. 143) y la secuencia de la proteína quimérica codificada (SEQ ID NO. 144).
Descripción detallada de la invención
La presente invención pertenece a proteínas quiméricas que comprenden polipéptidos de Borrelia antigénicos que no se producen en la naturaleza en la misma proteína de Borrelia. La proteínas quiméricas son una combinación de dos o más polipéptidos antigénicos derivados de proteínas de Borrelia. Los polipéptidos antigénicos se pueden derivar de diferentes proteínas de la misma especie de Borrelia, o proteínas diferentes de diferentes especies de Borrelia, así como de correspondientes proteínas procedentes de diferentes especies. Tal como se utiliza en esta memoria, la expresión "proteína quimérica" describe una proteína que comprende dos o más polipéptidos que se derivan de una proteína de Borrelia nativa correspondiente y/o no correspondiente. Un polipéptido "derivado de" una proteína nativa de Borrelia es un polipéptido que tiene una secuencia de aminoácidos igual a una secuencia de aminoácidos presente en una proteína de Borrelia, una secuencia de aminoácidos equivalente a la secuencia de aminoácidos de una proteína de Borrelia que se produce de modo natural, o una secuencia de aminoácidos sustancialmente similar a la secuencia de aminoácidos de una proteína de Borrelia que se produce de forma natural (por ejemplo, difiriendo en unos pocos aminoácidos) tal como cuando un ácido nucleico que codifica una proteína se somete a una mutagénesis dirigida al lugar. Proteínas "correspondientes" son proteínas equivalentes procedentes de diferentes especies o cepas de Borrelia, tal como la proteína de la superficie exterior A (OspA) procedente de la cepa B31 y OspA procedente de la cepa K48. La invención pertenece adicionalmente a ácidos nucleicos que codifican estas proteínas quiméricas.
Como se describe a continuación, las solicitantes han identificado dos dominios antigénicos separados de OspA y OspB que flanquean al único triptófano conservado presente en OspA y en OspB. Estos dominios comparten una reactividad cruzada con diferentes geno-especies de Borrelia. Los aminoácidos precisos responsables de la variabilidad antigénica se determinaron a través de mutagénesis dirigida al lugar, de modo que proteínas con sustituciones específicas de aminoácidos están disponibles para el desarrollo de proteínas quiméricas. Además, las solicitantes han identificado dominios hipervariables inmunológicamente importantes en las proteínas OspA, tal como se describe a continuación en el Ejemplo 2. El primer dominio hipervariable de interés para las proteínas quiméricas, el dominio A, incluye los residuos de aminoácidos 120-140 de OspA, el segundo dominio hipervariable, el dominio B, incluye los residuos 150-180, y el tercer dominio hipervariable, el dominio C, incluye los residuos 200-216 ó 217 (dependiendo de la posición del residuo triptófano único conservado en la OspA de esa especie particular de Borrelia) (véase la figura 3). Además, las solicitantes han secuenciado los genes para varias proteínas de Borrelia.
Estos descubrimientos han ayudado al desarrollo de nuevas proteínas recombinantes de Borrelia que incluyen dos o más regiones o secuencias de aminoácidos que no se producen en la misma proteína de Borrelia en la naturaleza. Las proteínas recombinantes comprenden polipéptidos procedentes de una diversidad de proteínas de Borrelia, que incluyen pero no se limitan a OspA, OspB, OspC, OspD, p12, p39, p41, p66 y p93. Polipéptidos antigénicamente relevantes procedentes de cada una de un cierto número de proteínas se reúnen en una proteína quimérica única.
En una realización de la presente invención, están ahora disponibles quimeras que incluyen polipéptidos antigénicos que flanquean un residuo triptófano. Los polipéptidos antigénicos se derivan de la porción proximal desde el triptófano (la porción de la proteína OspA u OspB presente entre el extremo amino y el triptófano conservado de la proteína), o la porción distal desde el triptófano (la porción de la proteína OspA u OspB presente entre el triptófano conservado de la proteína y el extremo carboxi) en OspA y/u OspB. Las quimeras resultantes pueden ser quimeras OspA-OspA (es decir quimeras que incorporan polipéptidos derivados de OspA procedentes de diferentes cepas de Borrelia), quimeras OspA-OspB o quimeras OspB-OspB, y se construyen de modo que los residuos aminoácidos amino-proximales a un triptófano invariable proceden de una proteína, y los residuos carboxi-proximales al triptófano invariable proceden de la otra proteína. Por ejemplo, una quimera disponible consiste en un polipéptido derivado de la región amino-proximal de OspA procedente de la cepa B31, seguido del residuo triptófano, seguido de un polipéptido derivado de la región carboxi-proximal de OspA procedente de la cepa K48 (SEQ ID NO. 92). Otra quimera disponible incluye un polipéptido derivado de la región amino-proximal de OspA procedente de la cepa B31, y un polipéptido derivado de la región carboxi-proximal de OspB procedente de la cepa B31 (SEQ ID NO. 104). Si el polipéptido proximal al triptófano de estas proteínas quiméricas se deriva de OspA, el polipéptido proximal se puede subdividir, adicionalmente, en tres dominios hipervariables (dominios A, B y C), cada uno de los cuales se puede derivar de OspA procedente de una cepa diferente de Borrelia. Estas proteínas quiméricas pueden comprender, además, polipéptidos antigénicos procedentes de otra proteína, además de los polipéptidos antigénicos que flanquean el residuo triptófano.
En otra realización de la presente invención, están disponibles proteínas quiméricas que incorporan dominios antigénicos de dos o más proteínas de Borrelia, tales como proteínas Osp (Osp A, B, C y/o D), así como p12, p39, p41, p66 y/o p93.
Las quimeras descritas en esta memoria se pueden producir de modo que sean muy solubles, se hiper-produzcan en E. coli, y no estén lipidadas. Además, las proteínas quiméricas se pueden diseñar para que terminen en una marca de afinidad (His-tag) para facilitar la purificación. Las proteínas recombinantes descritas en esta memoria han sido construidas para mantener altos niveles de antigenicidad. Además, las proteínas recombinantes específicas para las diversas geno-especies de Borrelia que provocan la enfermedad de Lyme están ahora disponibles, ya que han sido secuenciados los genes procedentes de cada una de las geno-especies principales; en lo que sigue se recogen las secuencias. Estas proteínas recombinantes con sus nuevas propiedades biofísicas y antigénicas serán importantes candidatos de reactivo diagnóstico y de vacuna.
Las proteínas quiméricas de la presente invención son ventajosas, debido a que conservan una reactividad específica hacia anticuerpos monoclonales y policlonales contra proteínas de Borrelia de tipo salvaje, son inmunógenas e inhiben el crecimiento o inducen la lisis de Borrelia in vitro. Además, en algunas realizaciones, las proteínas proporcionan dominios antigénicos de dos o más cepas de Borrelia y/o proteínas dentro de una única proteína. Proteínas de este tipo son particularmente útiles en ensayos inmunodiagnósticos. Por ejemplo, las proteínas de la presente invención se pueden utilizar como reactivos en ensayos para detectar la presencia de anticuerpos contra Borrelia nativa en individuos potencialmente infestados. Estas proteínas también se pueden utilizar como reactivos diagnósticos, tales como en borrones de puntos, transferencias Western, ensayo de inmunosorbente enlazado a enzima o ensayos de aglutinación. Las proteínas quiméricas de la presente invención se pueden producir por técnicas conocidas tales como por metodología recombinante, reacción en cadena de la polimerasa o mutagénesis.
Además, las proteínas de la presente invención son útiles como inmunógenos de vacuna contra la infección por Borrelia. Ya que Borrelia ha demostrado ser clonal, una proteína que comprenda polipéptidos antigénicos procedentes de una diversidad de proteínas y/o especies de Borrelia, proporcionarán una inmunoprotección durante un tiempo considerable cuando se dirigen a una vacuna. La carencia de una recombinación intragénica significativa, un proceso que podría generar rápidamente nuevos epítopos con propiedades antigénicas modificadas, asegura que Borrelia pueda únicamente cambiar el tipo antigénico simulando un cambio mutacional, que es lento cuando se compara con la recombinación para generar diferentes tipos antigénicos. La proteína quimérica se puede combinar con un vehículo fisiológicamente aceptable y administrar a un animal vertebrado por métodos convencionales (por ejemplo por vía intravenosa o intramuscular).
La invención se ilustra mediante los siguientes ejemplos que no han de considerarse limitantes de modo alguno.
Ejemplo 1 Purificación de la proteína de la superficie externa de Borrelia burgdorferi y análisis de dominios de unión a anticuerpos
Este ejemplo detalla un método para la purificación de grandes cantidades de proteína de la superficie exterior A nativa (OspA) hasta homogeneidad, y describe la representación en mapa de las especificidades antigénicas de varios acms anti-OspA. La OspA se purificó hasta homogeneidad explotando su resistencia a la digestión con tripsina. El marcaje intrínseco con ácido ^{14}C-palmítico confirmó que OspA estaba lipidada y la digestión parcial estableció una lipidación en la cisterna amino-terminal de la molécula.
La reactividad de siete anticuerpos monoclonales murínicos anti-OspA hacia nueve diferentes materiales aislados de Borrelia se confirmó mediante análisis de transferencia Western. La OspA purificada se fragmentó mediante escisión enzimática o química, y los anticuerpos monoclonales fueron capaces de definir cuatro dominios inmunogénicos distintos (véase la figura 1). El dominio 3, que incluía los residuos 190-220 de OspA era reactivo con anticuerpos protectores que se sabe se aglutinan en el organismo in vitro e incluían distintas especificidades, algunas de las cuales no se limitaron a un genotipo de B. burgdorferi.
A. Purificación de OspA nativa
La solubilización con detergente de B. burgdorferi despoja a las proteínas de la superficie exterior y proporciona preparaciones parcialmente purificadas que contienen tanto OspA como proteína de la superficie exterior B (Osp B) (Barbour, A. G. et al., Infect. Immun. 52 (5): 549-554 (1986); Coleman, J. L. y J. L. Benach, J. Infect. Dis. 155 (4): 756-765 (1987); Cunningham, T. M. et al., Ann. NY Acad. Sci. 539: 376-378 (1988); Brandt, M. E. et al., Infect. Immun. 58: 983-991 (1990); Sambri, V. y R. Cevenini, Microbiol. 14: 307-314 (1991)). A pesar de que tanto OspA como OspB son sensibles a la digestión con proteínasa K, a diferencia de OspB, OspA es resistente a la escisión por parte de tripsina (Dunn, J. et al., Prot. Exp. Purif. 1: 159-168 (1990); Barbour, A. G. et al., Infect. Immun. 45: 94-100 (1984)). Es sorprendente la insensibilidad relativa a tripsina a la vista del hecho de que OspA tiene un alto contenido en lisina (16% para B31), puede relacionarse con la configuración relativa de OspA y B en la membrana externa.
Radiomarcaje intrínseco de Borrelia
El marcaje para lipoproteínas se efectuó como se describe por Brandt et al. (Infect. Immun. 58: 983-991 (1990)). Ácido ^{14}C-palmítico (ICN, Irvine, California) se añadió al medio BSK II hasta una concentración final de 0,5 \muCi por mililitro (ml). En este medio se cultivaron organismos a 34ºC hasta que se alcanzó una densidad de 10^{8} células por ml.
Purificación de la proteína OspA procedente de la cepa B31 de Borrelia
Borrelia burgdorferi, ya sean marcadas con ácido ^{14}C-palmítico o no marcadas, se recolectaron y lavaron según se describe (Brandt, M. E. et al., Infect. Immun. 58: 983-991 (1990)). Los organismos enteros se tripsinizaron de acuerdo con el protocolo de Barbour et al., (Infect. Immun. 45: 94-100 (1984)) con algunas modificaciones. El sedimento se suspendió en solución salina tamponada con fosfato (PBS, 10 mM, pH 7,2) que contenía 0,8% de tripsina tratada con tosil-L-fenilalanina-clorometil cetona (TPCK) (Sigma, St. Louis, Missouri), esta última a una relación de 1 \mug por cada 10^{8} células. La reacción se llevó a cabo a 25ºC durante 1 hora, tras lo cual las células se centrifugaron. El sedimento se lavó en PBS con 100 \mug/ml de fluoruro de metilfenilsulfonilo (PMSF). La división del sedimento con Triton X-114 se llevó a cabo según se describe por Brandt et al. (Infect. Immun. 58: 983-991 (1990)). Después del tratamiento con tripsina, las células se resuspendieron en Triton X-114 enfriado con hielo al 2% (v/v) en PBS a razón de 10^{9} células por ml. La suspensión se centrifugó durante una noche a 4ºC y la fracción insoluble se separó en forma de un sedimento después de la centrifugación a 10.000 x g durante 15 minutos a 4ºC. El sobrenadante (fracción soluble) se incubó a 37ºC durante 15 minutos y se centrifugó a la temperatura ambiente a 1000 x g durante 15 minutos para separar las fases acuosa y detergente. La fase acuosa se decantó y se añadió PBS enfriada con hielo a la fase inferior de Triton, se mezcló, se calentó hasta 37ºC y se centrifugó de nuevo a 1000 x g durante 15 minutos. El lavado se repitió dos veces más. Finalmente, el detergente se separó de la preparación utilizando una columna de spin de Bio-beads SM2 (BioRad, Melville, Nueva York) según se describe (Holloway, P. W., Anal. Biochem. 53: 304-308 (1973)).
La cromatografía de intercambio de iones se llevó a cabo según se describe por Dunn et al. (Prot. Exp. Purif. 1: 159-168 (1990)) con pequeñas modificaciones. OspA bruta se disolvió en tampón a (Triton X-100 al 1%, tampón fosfato 10 mM (pH 5,0)) y se cargó sobre una resina de SP Sepharose (Pharmacia, Piscataway, Nueva Jersey), pre-equilibrada con tampón A a 25ºC. Después de lavar la columna con 10 volúmenes de lecho de tampón A, la OspA unida se eluyó con tampón B (Triton X-100 al 1%, tampón fosfato 10 mM (pH 8,0)). Las fracciones de OspA se detectaron mediante análisis de proteínas utilizando el método BCA (Pierce, Rockford, Illinois) o como radiactividad cuando se fraccionó material intrínsecamente marcado. Triton X-100 se separó utilizando una columna de spin de Bio-beads SM2.
Este método purifica OspA procedente de una preparación de membrana de la superficie exterior. En ausencia de tratamiento con tripsina, OspA y B eran los componentes principales de la fracción soluble obtenida después de la separación con Triton de la cepa B31. En contraposición, cuando la extracción con Triton se llevó a cabo después del tratamiento con tripsina, no se observa la banda de OspB. La purificación adicional de OspA-B31 en una columna SP Sepharose dio como resultado una banda única mediante SDS-PAGE. El rendimiento, después de la retirada de detergente, era de aproximadamente 2 mg por litro de cultivo. Este método de purificación de OspA, según se describe en esta memoria para la cepa B31, se puede utilizar también para otros materiales aislados de Borrelia. El tratamiento con tripsina se puede omitir para cepas tales como la cepa K48, que carece de OspB.
Sitio de lipidación de OspA-B31
OspA marcada con ácido ^{14}C-palmítico procedente de la cepa B31 se purificó según se describe anteriormente y se digerió parcialmente con la endoproteinasa Asp-N (datos no mostrados). Después de la digestión, resultó evidente una nueva banda de bajo peso molecular mediante SDS-PAGE, encontrada mediante secuenciación directa amino-terminal que comenzaba en Asp_{25}. Esta banda no tenía ninguna traza de radiactividad por autorradiografía (datos no mostrados). OspA y B contienen una secuencia señal (L-X-Y-C) similar al consenso descrito para lipoproteínas de E. coli, y se ha predicho que el sitio de lipidación de OspA y B debería ser cisteína amino-terminal (Brandt, M. E. et al., Infect. Immun 58: 983-991 (1990)). Los resultados presentados en esta memoria sustentan esta predicción.
B. Comparación de regiones de unión al anticuerpo de OspA en nueve cepas de Borrelia burgdorferi
La disponibilidad del aminoácido secuenciado para OspA procedente de un cierto número de diferentes materiales aislados, combinada con la representación en mapa de los péptidos y el análisis por transferencia Western, permitió la identificación de los dominios antigénicos reconocidos por anticuerpos monoclonales (acms) y permitió la deducción de los residuos clave de aminoácidos responsables de la reactividad específica del anticuerpo.
Cepas de Borrelia burgdorferi
Nueve cepas de Borrelia incluidas siete cepas europeas y dos cepas de Norte América se utilizaron en este estudio de los dominios de unión de anticuerpos de varias proteínas. En la Tabla I que figura a continuación se resume la información concerniente a las cepas.
TABLA I Cepas representativas de Borrelia
1
Las cepas K48, PGau y DK29 fueron suministradas por R. Johnson, Universidad de Minnesota; PKo y pTrob fueron proporcionadas por B. Wilske y V. Preac-Mursic del Instituto Pettenkhofer, Munich, Alemania; e Ip3 e Ip90 fueron suministradas por L. Mayer del Center for Disease Control, Atlanta, Georgia. Las cepas de Norte América incluían la cepa 25015, proporcionada por J. Anderson del Departamento de Agricultura de Connecticut; y la cepa B31 (ATCC 35210).
Anticuerpos monoclonales
En este estudio se utilizaron siete anticuerpos monoclonales (acms). Cinco de los acms (12, 13, 15, 83 y 336) se produjeron a partir de hibridomas clonados y subclonados como se ha descrito previamente (Schubach, W. H., et al., Infect. Immun. 59(6): 1911-1915 (1991)). El acm H5332 (Barbour, A. G. et al., Infect. Immun. 41: 795-804 (1983)) fue una donación de Drs. Alan Barbour, Universidad de Texas, y el acm CIII.78 Sears, J. E. et al., J. Immunol. 147(6): 1995-2000 (1991)) fue una donación de Richard A. Flavell, Universidad de Yale. Los acms 12 y 15 se desarrollaron contra B3 totalmente sonicado; el acm 336 se produjo contra PGau completo; y los acms 132 y 83 se desarrollaron a una forma truncada de OspA clonada a partir de la cepa K48 y se expresaron en E. coli utilizando el sistema ARN polimerasa de T7 (McGrath, B.C. et al., Vaccines, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview, Nueva York, páginas 365-370 (1993)). Todos los acms se tiparon como si fueran inmunoglobulina G (IgG).
Métodos de la escisión de proteínas, transferencia Western y secuenciación amino-terminal
La predicción de los diversos sitios de escisión se consiguió conociendo la secuencia primaria de aminoácidos derivada de las secuencias completas de nucleótidos de OspA, muchas de las cuales están actualmente disponibles (véase la Tabla II que figura a continuación). Los sitios de escisión también se pueden predecir en base a la secuencia de péptidos de OspA, que se puede determinar mediante técnicas convencionales después del aislamiento y la purificación de OspA por el método descrito anteriormente. La escisión de varios materiales aislados de OspA se realizó para determinar la localización del anticuerpo monoclonal de las proteínas.
La escisión de OspA con hidroxilamina-HCl (HA), N-clorosuccinimida (NCS) y bromuro de cianógeno siguió los métodos descritos por Bornstein (Biochem. 9 (12): 2408-2421 (1970)), Shechter et al., (Biochem. 15 (23): 5071-5075 (1976)) y Gross (en Hirs, C.H.W. (ed): Methods in Enzymology, (N.Y. Acad. Press), 11: 238-255 (1967)), respectivamente. La escisión de la proteasa mediante endoproteinasa, Asp-N (Boehringer Mannheim, Indianapolis, Indiana) se efectuó según se describe por Cleveland D.W. et al., (J. Biol. Chem, 252: 1102-1106 (1977)). Para cada reacción se utilizaron diez microgramos de OspA. La relación de enzima a OspA era de aproximadamente 1 a 10 (p/p).
Las proteínas y los péptidos generados por la escisión se separaron mediante electroforesis en gel de poliacrilamida con SDS (SDS-PAGE) (Laemmli, U.K., Nature (Londres) 227: 680-685 (1970)), y se electrotransfirieron sobre membranas de difluoruro de polivinilidina (PVDF) Immobilon (Ploskal, M.G. et al., Biotechniques 4: 272-283 (1986)). Estos se detectaron mediante tinción con negro amido o mediante inmunotinción con acms murínicos, seguido de IgG anti-ratón de cabra conjugada con fosfatasa alcalina. La unión específica se detectó utilizando un sistema de revelado de fosfato de 5-bromo-4-cloro-3-indolilo (BCIP)/tetrazolio nitroazul (NBT) (KPL Inc., Gathersburg, Maryland).
Además, el análisis de la secuencia de aminoácidos amino-terminal se llevó a cabo en varios productos de escisión, según se describe por Luft et al. (Infect. Immun. 57: 3637-3645 (1989)). Las bandas manchadas con negro amido se escindieron a partir de manchas PVDF y se secuenciaron mediante la degradación de Edman utilizando un secuenciador Biosystems modelo 475A con un analizador PTH modelo 120A y analizador de control/datos modelo 900A.
Productos de escisión de materiales aislados de la proteína de la superficie exterior A
OspA-B31 purificada, marcada con ácido ^{14}C-palmítico, se fragmentó con hidroxilamina-HCl (HA) en dos péptidos, designados HA1 y HA2 (datos no mostrados). La banda de HA1 migró a 27 kD y retuvo su radiactividad, indicando que el péptido incluía el sitio de lipidación en el extremo N de la molécula (datos no mostrados). A partir del punto de escisión predicho, HA1 debería corresponder a los residuos 1 a 251 de OspA-B31. HA2 tenía un P.M. de 21,6 kD mediante SDS-PAGE, mostrando el análisis de la secuencia amino-terminal que comienza en Gly72, es decir los residuos 72 a 273 de OspA-B31. En contraposición, HA escindió OspA-K48 en tres péptidos, designados HA1, HA2 y HA3, con P.M.s aparentes de 22 kD, 16 kD y 12 kD, respectivamente. La secuenciación amino-terminal mostró que HA1 comienza en Gly72, y HA3 en Gly142. Se encontró que HA2 tenía un extremo amino bloqueado, según se observó para la proteína OspA de longitud completa. Se predijo que HA1, 2 y 3 de OspA-K48 eran los residuos 72-274, 1 a 141 y 142 a 274, respectivamente.
N-clorosuccinimida (NCS) escinde triptófano (W), que se encuentra en el residuo 216 de OspA-B31 o en el residuo 217 de OspA-K48 (datos no mostrados). NCS escindió OspA-B31 en 2 fragmentos, NCS1, con un P.M. de 23 kD, los residuos 1-216 de la proteína, y NCS2, con un P.M. de 6,2 kD, los residuos 217 a 273 (datos no mostrados). De manera similar, OspA-K48 se dividió en 2 trozos, NCS1, residuos 1-217, y NCS2, residuos 218 a 274 (datos no mostrados).
La escisión de OspA mediante bromuro de cianógeno (CNBr) se produce en el lado carboxi de metionina, residuo 39. El fragmento principal, CNBr1, tiene un P.M. de 25,7 kD, residuos 39-274 mediante análisis de la secuencia de aminoácidos amino-terminal (datos no mostrados). CNBr2 (aproximadamente 4 kD) podría no visualizarse mediante tinción con negro amido; en su lugar, se observaron bandas ligeramente manchadas de aproximadamente un P.M. de 20 kD. Estas bandas reaccionaron con acms anti-OspA y, lo más probablemente, eran productos de degradación debido a la escisión por ácido fórmico.
Determinación de los dominios de unión de anticuerpos para anticuerpos monoclonales anti-OspA
Los productos de escisión de OspA-B31 y OspA-K48 se analizaron mediante transferencia Western para confirmar su capacidad de unirse a seis acms diferentes. El análisis de transferencia Western preliminar de los productos de escisión demostró que las cepas K48 y DK29 tienen modelos similares de reactividad, al igual que IP3, PGau y PKo. La OspA de la cepa PTrob era inmunológicamente distinta a las otras, siendo únicamente reconocida por el acm 336. El acm 12 reconoció únicamente las dos cepas norteamericanas, B31 y 25015. Cuando los materiales aislados se separaron en genogrupos, era notable que todos los acms, excepto el acm 12, se cruzaran para reaccionar con múltiples genogrupos.
El acm 12, específico para OspA-B31, se unía tanto a HA1 como a HA2 de OspA-B31. Sin embargo, la escisión de OspA-B31 por NCS en el residuo Trp216 creó fragmentos que no reaccionaban con el acm, sugiriendo que el dominio relevante está próximo o es estructuralmente dependiente de la integridad de este residuo (datos no mostrados). El acm 13 se unía únicamente a Osp-K48 y a los péptidos que contenían el extremo amino de esa molécula (por ejemplo HA2; NCS1). No se unía a CNBr1, residuos 39 a 274. Así, el dominio reconocido por el acm 13 se encuentra en el extremo amino-terminal de Osp-K48, próximo a Met38.
El acm15 reacciona con la OspA tanto de las cepas B31 como K48, y a los péptidos que contienen el extremo N de OspA, tal como HA1 de OspA-B31 y NCS1, pero no a los péptidos HA2 de OspA-B31 y HA1 de OspA-K48 (datos no mostrados). Ambos péptidos incluyen el residuo 72 al extremo C de las moléculas. El acm15 se unió a CNBr1 de OspA-K48, indicando que el dominio para este anticuerpo eran los residuos 39 a 72, específicamente próximos a Gly72 (datos no mostrados).
El acm83 se une a OspA-K48 y a los péptidos que contienen la porción C-terminal de la molécula tal como HA1. Estos no se unen a HA2 de Ospa-K48, lo más probablemente debido a que el extremo C de HA2 de OspA-K48 termina en 141. De manera similar al acm12 y OspA-B31, la unión de los acms 83 y CIII.78 se elimina mediante la escisión de OspA en el residuo triptófano. Así, la unión de los acms 12, 83 y CIII.78 a OspA depende de la integridad estructural del residuo Trp_{216}, que parece ser crítico para la antigenicidad. Es también evidente que, a pesar de que estos acms se unen a un dominio antigénico común, los epítopos precisos que reconocen son distintos uno de otro, dado los grados variables de reactividad cruzada a estos acms entre cepas.
A pesar de que existe una pérdida similar de la actividad de unión del acm 336 con la escisión en Trp_{216}, este acm no se une a HA1 de OspA-B31, sugiriendo que el dominio para este anticuerpo incluye el extremo carboxi-terminal de la molécula, incluidos los residuos 251 a 273. Péptidos de bajo P.M., tales como HA3 (10 KD) y NCS2 (6 KD), de OspA-K48 no unen este acm en transferencias Western. Con el fin de confirmar esta observación, los autores de la invención sometieron a ensayo la unión de los 6 acms con una construcción de fusión recombinante p3A/EC que contiene una proteína conductora trpE fusionada con los residuos 217 a 273 de OspA-B31 (Schubach, W. H. et al., Infect. Immun. 59 (6): 1911-1915 (1991)). Únicamente el acm 336 reaccionó con esta construcción (datos no mostrados). Los péptidos y dominios antigénicos localizados por la fragmentación de OspA están resumidos en la figura 1.
Representación en mapa de dominios para definir la base molecular para el análisis del serotipo
Para definir la base molecular para el análisis del serotipo de OspA, los autores de la invención compararon las secuencias de aminoácidos derivadas de OspA para los nueve materiales aislados (figura 2). En el extremo amino de la proteína, estas predicciones pueden ser más precisas dado el número relativamente pequeño de sustituciones de aminoácidos en esta región comparado con el extremo carboxi. Dominio 1, que es reconocido por el acm13, incluye los residuos Leu34 a Leu41. El acm13 únicamente se une a la OspA de las especies K48, DK29 e IP90. Dentro de esta región, el residuo 37 es variable, pero Gly37 se conserva entre las tres cepas reactivas. Cuando Gly37 cambia a Glu37, como es el caso en la OspA de las cepas B31, pTrob, PGau y PKo, el acm13 no reconoce la proteína (datos no mostrados). Mediante análisis similares, se puede observar que Asp70 es un residuo crucial para el Dominio 2, que incluye los residuos 65 a 75 y es reconocido por el acm15. El Dominio 3 es reactivo con los acms H5332, 12 y 83, e incluye los residuos 190-220. Es evidente que existe una heterogeneidad significativa entre los acms reactivos con este dominio, y que dentro de la secuencia debe estar contenido más de un epítopo conformacional. El Dominio 4 se une al acm336, e incluye los residuos 250 a 270. En esta región, el residuo 266 es variable y, por lo tanto, puede ser un determinante importante. Sin embargo, es evidente que en la región que comprende los aminoácidos 217-250 residen otros determinantes de la reactividad de este anticuerpo monoclonal. Además, la integridad estructural de Trp216 es esencial para la reactividad del anticuerpo en la proteína intacta. Finalmente, es importante enfatizar que la figura 2 indica únicamente las localizaciones de los dominios y no abarca necesariamente el dominio completo. Están siendo analizados epítopos exactos mediante mutagénesis dirigida al lugar de residuos específicos.
En general, la evidencia sugiere que la porción N-terminal no es el dominio inmunodominante de OspA, posiblemente en virtud de su lipidación, y la supuesta función del resto lípido en el anclaje de la proteína a la envuelta exterior. El extremo C-terminal es inmunodominante e incluye los dominios que explican en parte la heterogeneidad estructural (Wilske, B. et al., Med. Microbiol. Immunol. 181: 191-207 (1992)), y pueden proporcionar epítopos para la neutralización de los anticuerpos (Sears, J. E. et al., J. Immunol. 147 (6) 1995-2000 (1991)), y se refieren a otras actividades tales como la inducción de la proliferación de células T (Shanafel, M.M., et al., J. Immunol. 148: 218-224 (1992)). Existen epítopos comunes en el extremo carboxi de la proteína que son compartidos entre geno-especies que pueden tener un potencial inmunoprotector (Wilske, B., et al., Med. Microbiol. Immunol. 181: 191-207 (1992)).
La predicción de la estructura secundaria sobre la base del análisis de la hidropatía y mediciones del dicroismo circular y de espectroscopia de fluorescencia (McGrath, B. C., et al., Vaccines, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview, Nueva York; págs. 365-370 (1993)) sugieren que los dominios 3 y 4 se encuentren en una región de la molécula con una propensión a formar una hélice alfa, mientras que los dominios 1 y 2 se producen en regiones de las que se predijo que eran láminas beta (véase la figura 1). Estas diferencias pueden distinguir dominios en accesibilidad al anticuerpo o a células T reactivas (Shanafel, M. M. et al., J. Immunol. 148: 218-224 (1992)). La mutagénesis dirigida al lugar de epítopos específicos, según se describe a continuación en el Ejemplo 2, ayuda a identificar los epítopos exactos.
Ejemplo 2 Identificación de un dominio hipervariable inmunológicamente importante de la proteína de la superficie exterior A principal de Borrelia
Este Ejemplo describe los estudios de representación en mapa de los epítopos utilizando proteínas de fusión OspA y TrpE-OspA químicamente escindidas. Los estudios indican una región hipervariable que rodea al residuo triptófano único conservado de OspA (en el residuo 216 o, en algunos casos, 217), según se determina por un análisis de la población de ventana en movimiento de OspA procedente de quince materiales aislados europeos y norteamericanos de Borrelia. La región hipervariable es importante para el reconocimiento inmune.
La mutagénesis dirigida al lugar también se realizó para examinar más estrechamente las regiones hipervariables. La espectroscopia de fluorescencia y de dicroismo circular han indicado que el triptófano conservado es parte de una región de la hélice alfa en la que el triptófano está encerrado en un entorno hidrófobo (McGrath, B. C., et al., Vaccines, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview, Nueva York; págs. 365-370 (1993)). Es probable que cadenas laterales de aminoácidos más polares que flanquean el triptófano queden expuestas al disolvente hidrófilo. La hipervariabilidad de estos residuos expuestos al disolvente entre las diversas cepas de Borrelia sugirió que estos residuos aminoácidos pueden contribuir a la variación antigénica en OspA. Por lo tanto, la mutagénesis dirigida al lugar se realizó para reemplazar alguna de las cadenas laterales de aminoácidos potencialmente expuestas en la proteína de una cepa con los residuos análogos de una segunda cepa. A continuación, las proteínas alteradas se analizaron mediante transferencia Western utilizando anticuerpos monoclonales que unen OspA sobre la superficie del espiroqueto no mutado. Los resultados indicaron que determinados cambios específicos de aminoácidos próximos al triptófano pueden anular la reactividad de OspA a estos anticuerpos monoclonales.
A. Verificación de polimorfismos en racimos en secuencias de la proteína de la superficie exterior A
La clonación y secuenciación de la proteína OspA procedente de quince materiales aislados europeos y norteamericanos (descritos anteriormente en la Tabla I) demostraron que el polimorfismo de los aminoácidos no se distribuye aleatoriamente a lo largo de la proteína; más bien, el polimorfismo tendió a formar racimos en tres regiones de OspA. El análisis se llevó a cabo representando el polimorfismo en movimiento y de media ponderada de una ventana (una subsección de longitud fija de la secuencia total) a medida que se desliza a lo largo de la secuencia. El tamaño de la ventana en este análisis era de trece aminoácidos, basado en la determinación del número mayor de puntos significativamente desviantes, según se establece por el método de Tajima (J. Mol. Evol. 33: 470-473 (1991). El polimorfismo ponderado medio se calculó sumando el número de alelos variantes para cada sitio. Los cálculos del polimorfismo se sopesaron por la severidad del reemplazamiento de aminoácidos (Dayhoff, M. O. et al., en: Dayhoff, M. O. (ed.) Atlas of Protein Sequence and Structure NBRF, Washington, Vol. 5, Supl. 3 345 (1978)). La suma se normalizó mediante el tamaño de la ventana y se representó gráficamente. La posición de la secuencia de aminoácidos corresponde a una ventana que abarca los aminoácidos 1 a 13. Se utilizó un remuestreo del cordón de la bota ("bootstrap") para generar intervalos de confianza del 95% en el análisis de la ventana deslizante. Dado que Borrelia ha demostrado ser clonal, el análisis del cordón de la bota debería dar una estimación fiable de la varianza esperada de los cálculos de polimorfismo. El cordón de la bota se repitió quinientas veces en cada posición y la media se calculó a partir de la suma de todas las posiciones. La naturaleza clonal de Borrelia asegura que se minimizará la varianza estocástica que resulta de diferentes historias genealógicas de las posiciones de la secuencia (como sería de esperar si la recombinación fuera prevalerte).
Este ensayo verificó que las tres regiones en torno a los picos observados tienen todas excesos significativos de polimorfismo. Los excesos de polimorfismo se observaron en las regiones que incluían los residuos de aminoácidos 132-145, los residuos 163-177 y los residuos 208-221 (figura 3). En la figura 4 se muestra una alineación de los aminoácidos entre los residuos 200 y 220 para B31, K48 y los cuatro mutantes dirigidos al lugar. La región 208-221 del aminoácido incluye la región de OspA que ha sido modelada como una hélice alfa orientada en la que el residuo único de triptófano en el aminoácido 216 está encerrado en una bolsa hidrófoba, exponiendo con ello más aminoácidos polares al disolvente (figura 5). (France, L. L., et al., Biochem. Biophys. Acta 1120: 59 (1992)). Estos residuos expuestos potencialmente al disolvente mostraron una variabilidad considerable entre las OspAs de diversas cepas y pueden ser un importante componente de la variación antigénica de OspA. Para los fines de genera proteínas quiméricas, los dominios hipervariables de interés son el Dominio A, que incluye los residuos 120-140 de aminoácidos de OspA; el Dominio B, que incluye los residuos 150-180; y el Dominio C que incluye los residuos 200-216 ó 217.
B. Mutagénesis dirigida al lugar de la región hipervariable
Se llevó a cabo la mutagénesis dirigida al lugar para convertir los residuos dentro del dominio 204-219 de la OspA B31 recombinante en los residuos análogos de una variante de OspA europea, K48. En la región de OspA entre los residuos 204 y 219, que incluye el dominio helicoidal (aminoácidos 204-217), existen siete diferencias de aminoácidos entre OspAB31 y OspA-K48. Se generan tres oligonucleótidos, cada uno de los cuales contenía cambios de nucleótidos que incorporarían los aminoácidos K48 en sus posiciones análogas en la proteína B31 OspA. Los oligos utilizados para crear los mutantes dirigidos al lugar eran:
5'-CTTAATGACTCTGACACTAGTGC-3' (nº 613, que convierte treonina en la posición 204 en serina, y serina en 206 en treonina (Thr204-Ser, Thr206-Ser)) (SEQ ID NO. 1);
5'-GCTACTAAAAAAACCGGGAAATGGAATTCA-3' (nº 625, que convierte alanina en 214 en glicina, y alanina en 215 en lisina (Ala214-Gly, Ala215-Lys)) (SEQ ID NO. 2); y
5'-GCAGCTTGGGATTCAAAAACATCCACTTTAACA-3' (nº 640, que convierte asparagina en 217 en aspartato, y glicina en 219 en lisina (Asn217-Asp, Gly 219-Lys) (SEQ ID NO. 3).
La mutagénesis dirigida al lugar se llevó a cabo realizando mutagénesis con pares de los oligos anteriores. Se crearon tres mutantes dirigidos al lugar, cada uno con dos cambios: OspA 613 (Thr204-Ser, Thr206-Ser), OspA 625 (Ala214-Gly, Ala215-Lys), y 640 (Asn217-Asp, Gly219-Lys). Existían también dos proteínas con cuatro cambios: OspA 613/625 (Thr204-Ser, Thr206-Ser, Ala214-Gly, Ala215-Lys) y OspA 613/640 (Thr204-Ser, Thr206-Ser, Ala217-Asp, Gly219-Lys).
Especificidad de la unión del anticuerpo a epítopos de la región hipervariable no mutada
Anticuerpos monoclonales que aglutinan espiroquetos, incluidos varios que son neutralizantes in vitro, reconocen epítopos que se representan en el mapa de la región hipervariable en torno a Trp216 (Barbour, A. G. et al., Infect. and Immun. 41: 759 (1983); Schubach, W. H. et al., Infect. and Immun. 59: 1911 (1991)). El análisis por transferencia Western demostró que la escisión química de OspA procedente de la cepa B31 en Trp216 anula la reactividad de la proteína con el acm 105 aglutinante, un anticuerpo monoclonal desarrollado contra espiroquetos B31 (datos no mostrados). El reactivo, N-clorosuccinimida (NCS) escinde OspA en el Trp216, formando un fragmento de 23,2 kd y un péptido de 6,2 kd que no es retenido en la membrana de Imobilon-P después de la transferencia. El material no escindido une el acm 105; sin embargo, el fragmento de 23,2 kd, no es reactivo. Transferencias Western similares con una proteína de fusión TrpE-OspA que contenía la porción carboxi- terminal de la proteína OspA demostraron que el pequeño trozo de 6,2 kd también falla en unir el acm 105 (Schubach, W. H. et al., Infect. and Immun. 59: 1911 (1991)).
Los anticuerpos monoclonales H5332 y H3TS (Barbour, A. G. et al., Infect. and Immun. 41: 759 (1983)) han demostrado, por inmunofluorescencia, decorar la superficie de espiroquetos fijados (Wilske, B. et al., World J. Microbiol. 7: 130 (1991)). Estos anticuerpos monoclonales también inhiben el crecimiento del organismo en cultivo. La representación en mapa del epítopo con proteínas de fusión ha confirmado que los epítopos que unen estos acms están conformacionalmente determinados y residen en la mitad carboxi de la proteína. El acm H5332 es el que reacciona cruzadamente entre la totalidad de los grupos filogenéticos conocidos, mientras que acm H3TS y acm 105 parecen ser específicos de la cepa B31 contra la que fueron desarrollados. Al igual que el acm 105, las reactividades de H5332 y H3TS a OspA son eliminadas mediante fragmentación de la proteína en Trp216 (datos no mostrados). El acm 336 se desarrolló a los espiroquetos completos de la cepa P/Gau. Reacciona cruzadamente con OspA del grupo 1 (el grupo al que pertenece B31), pero no al grupo 2 (del que K48 es un miembro). Estudios previos utilizando proteínas de fusión y escisión química han indicado que este anticuerpo reconoce un dominio de OspA en la región entre los residuos 217 y 273 (datos no mostrados). Todos estos acms aglutinarán el espiroqueto B31.
Análisis de la transferencia Western de anticuerpos que se unen a regiones hipervariables mutadas
Se utilizaron acms para el análisis de la transferencia Western de los mutantes de OspA dirigidos al lugar inducidos en E. coli utilizando el sistema de expresión T7 (Dunn, J. J. et al., Protein Expresión and Purification 1: 159 (1990)). Células de E. coli que portan plásmidos Pet9c con una inserción mutante de OspA dirigida al lugar se indujeron en la fase de crecimiento medio logarítmico con IPTG durante cuatro horas a 37ºC. Los lisados de células se realizaron hirviendo una parte alícuota de los cultivos inducidos en colorante de carga de gel SDS, y este material se cargó luego en un gel de SDS al 12% (BioRad mini Protean II) y se sometieron a electroforesis. A continuación, las proteínas se transfirieron a membranas Imobilon-P (Millipore) 70V, 2 horas a 4ºC, utilizando el sistema de minitransferencia de BioRad. El análisis de Western se llevó a cabo según se describe por Schubach et al. (Infect. Immun. 59: 1911 (1991)).
El análisis de la transferencia Western indicó que únicamente el mutante 625 (Ala214-Gly y Ala215-Lys) retuvo la unión al H3TS monoclonal aglutinante (datos no mostrados). Sin embargo, el mutante 613/625, que tiene alteraciones adicionales al extremo amino de Trp216 (Ser204-Thr y Thr206-Ser) no unía este anticuerpo monoclonal. Las dos OspAs 640 y 613/640 que tienen los cambios Asn217-Asp y Gly219-Lys en el lado carboxi-terminal de Trp216 también fracasaron en unir el acm H3TS. Esto indicó que el epítopo de la OspA B31 que une H3TS está constituido por cadenas laterales de aminoácidos a ambos lados de Trp216.
El mutante 613/625 no se unió a los acms 105 y H5332, mientras que los otros mutantes conservaron su capacidad de unir estos acms. Esto es importante a la vista de los datos utilizando proteínas de fusión que indican que el acm 105 se comporta más como el acm H3TS en términos de su especificidad por el serotipio y unión a OspA ( Wilske, B. et al., Med. Microbiol. Immunol. 181: 191 (1992)). La proteína 613/625 tiene, además de las diferencias en los residuos Thr204 y Ser206, cambios inmediatamente amino-terminales a Trp216 (Ala214-Gly y Ala215-Lys). La supresión de la reactividad de los acms 105 y H5332 hacia esta proteína indicó que los epítopos de OspA que unen estos anticuerpos monoclonales están constituidos por residuos en el lado amino-terminal de Trp216.
Las dos proteínas que portan los reemplazamientos Asn217-Asp y Gly219-Lys en el lado carboxi-terminal de Trp216 (OspAs 640 y 613/640) conservaron su unión a los acms 105 y H5332; sin embargo, no fueron capaces de reaccionar con el acm 336, un anticuerpo monoclonal que ha sido representado en mapa con proteínas de fusión TrpE-OspA y por escisión química a un dominio más carboxi-terminal. Este resultado puede explicar el por qué el acm 336 no reconoció el tipo K48 de OspA (Grupo 2).
Es claro que los aminoácidos Ser205 y Thr206 juegan un importante papel en la aglutinación de epítopos de aglutinantes en la región de OspA B31 que flanquea a Trp216. El reemplazamiento de estos dos residuos alteró los epítopos de OspA que unen los acms 105, H3TS y H5332. La capacidad de los cambios de 640 sólo para anular la reactividad del acm 336 indicó que Thr204 y Ser206 no están implicados en una interacción directa con el acm
336.
Los resultados indicaron que los epítopos de OspA que están disponibles para acms que aglutinan espiroquetos están constituidos, al menos en parte, por aminoácidos en la vecindad inmediata de Trp216. Dado que el reciente análisis del dicroismo circular indicó que las estructuras de OspA B31 y K48 difieren muy poco dentro de este dominio, es improbable que los cambios hechos por mutación hayan alterado radicalmente la estructura global de la proteína OspA (France, L. L. et al., Biochem. Biophys. Acta 1120: 59 (1992); y France et al., Biochem. Biophys Acta, referida (1993)). Esta hipótesis está sustentada por el hallazgo de que las OspAs mutantes y recombinantes exhiben las mismas propiedades de elevada solubilidad y purificación que la proteína B31 parental (datos no mostrados).
En resumen, las cadenas laterales de los aminoácidos en Ser204 y Thr206 son importantes para muchos de los epítopos aglutinantes. Sin embargo, un conjunto limitado de cambios conservativos en estos sitios no eran suficientes para anular la unión de la totalidad de los acms aglutinantes. Estos resultados sugirieron que los epítopos aglutinantes de OspA son distintos, pero todavía tienen un cierto solapamiento. Los resultados también sustentaron la hipótesis de que el epítopo expuesto a la superficie en torno a Trp216, que se piensa que es importante para el reconocimiento y la neutralización inmunológica, es un dominio conformacionalmente determinado y complejo de
OspA.
Ejemplo 3 Cepas y proteínas de Borrelia
En la presente invención se pueden utilizar proteínas y genes procedentes de cualquier cepa de Borrelia. Las cepas representativas están resumidas en la Tabla I que figura anteriormente.
A. Genes que codifican proteínas de Borrelia
Los péptidos quiméricos de la presente invención pueden contener derivados de cualesquiera proteínas de Borrelia. Proteínas representativas incluyen OspA, OspB, OspC, OspD, p12, p39, p41 (fla), p66 y p93. Secuencias de ácidos nucleicos que codifican varias proteínas de Borrelia están actualmente disponibles (véase la Tabla II que figura a continuación); alternativamente, secuencias de ácidos nucleicos que codifican proteínas de Borrelia se pueden aislar y caracterizar utilizando métodos como los descritos más abajo.
TABLA II Referencias de secuencias de ácidos nucleicos para varias proteínas de diversas cepas de Borrelia
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B. Aislamiento de genes de Borrelia
Secuencias de ácidos nucleicos que codifican proteínas lipidadas de longitud completa procedentes de cepas de Borrelia conocidas se aislaron utilizando la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) según se describe más abajo. Además, se generaron secuencias de ácidos nucleicos que codificaban proteínas truncadas (proteínas en las que la señal de lipidación ha sido retirada, tal como eliminando la secuencia de ácidos nucleicos que codifica los primeros 18 aminoácidos, dando como resultado proteínas no lipidadas). Se generaron otras proteínas que codificaban polipéptidos de un gen particular (es decir que codifican un segmento de la proteína que tiene un número diferente de aminoácidos que el que tiene la proteína de la naturaleza). Utilizando métodos similares a los descritos más abajo, se pueden generar cebadores a partir de secuencias de ácidos nucleicos conocidas que codifican proteínas de Borrelia y se utilizan para aislar otros genes que codifican proteínas de Borrelia. Los cebadores se pueden diseñar para que amplifiquen la totalidad de un gen, así como para que amplifiquen una secuencia de ácidos nucleicos que codifica secuencias de proteínas truncadas tales como las que se describen más abajo para OspC, o secuencias de ácidos nucleicos que codifican un polipéptido derivado de una proteína de Borrelia. Los cebadores también se pueden diseñar para que incorporen sitios de escisión de enzimas de restricción únicos en las secuencias de ácidos nucleicos amplificadas. El análisis de las secuencias de ácidos nucleicos amplificadas se puede luego realizar utilizando técnicas convencionales.
Clonación y secuenciación de genes de OspA y secuencias de ácidos nucleicos relevantes
Secuencias de OspA de Borrelia se aislaron de la siguiente manera: se utilizaron 100 \mul de mezclas de reacción que contenían KCl 50 mM, Tris-HCl 10 mM (pH 8,3), MgCl_{2}1,5 mM, 200 \muM de cada NTP, 2,5 unidades de TaqI ADN polimerasa (Amplitaq, Perkin-Elmer/Cetus) y 100 pmol de cada uno de los cebadores 5' y 3' (descritos más abajo). La amplificación se realizó en un ciclador térmico Perkin-Elmer/Cetus según se describe (Schubach, W. H. et al., Infect. Immun. 59: 1811-1915 (1991)). El amplicón se visualizó en un gel de agarosa mediante tinción con bromuro de etidio. Veinte nanogramos del producto de PCR extraído con cloroformo se clonaron directamente en el vector PC-TA (Invitrogen) siguiendo las instrucciones del fabricante. Se seleccionaron colonias recombinantes que contenían el fragmento amplificado, los plásmidos se prepararon y la secuencia de ácidos nucleicos de cada OspA se determinó mediante la técnica de terminación en cadena didesoxi utilizando el kit Sequenase (United States Biochemical). La secuenciación dirigida se realizó con cebadores M13, seguido de cebadores específicos para OspA derivados de secuencias previamente obtenidas con cebadores M13.
Dado que los extremos 5' y 3' del gen de OspA están muy conservados (Fikrig, E.S. et al., J. Immunol. 7: 2256-2260 (1992); Bergstrom, S. et al., (Mol. Microbiol. 3: 479-486 (1989); Zumstein, G. et al., (Med. Microbiol. Immunol. 181: 57-70 (1992)), los cebadores 5' y 3' para la clonación se pueden basar en cualesquiera secuencias conocidas de OspA. Por ejemplo, se utilizaron los siguientes cebadores basados en la secuencia de ácidos nucleicos de OspA procedente de la cepa B31:
5'-GGAGAATATATTATGAAA-3' (-12 a +6) (SEQ ID NO. 4); y
5'-CTCCTTATTTTAAAGCG-3' (+826 a +809) (SEQ ID NO. 5).
(Schubach, W.H. et al., Infect. Immun 59: 1811-1915 (1991)).
Los genes de OspA aislados de esta manera incluyen los de las cepas B31, K48, PGau y 25015; las secuencias de ácidos nucleicos se describen en el listado de secuencias como SEQ ID NO. 6 (OspA-B31), SEQ ID NO. 8 (OspA-K48), SEQ ID NO. 10 (OspA-PGau) y SEQ ID NO. 12 (OspA-25015). En la figura 42 se muestra una alineación de ésta y otras secuencias de ácidos nucleicos de OspA. Las secuencias de aminoácidos de las proteínas codificadas por estas secuencias de ácidos nucleicos están representadas como SEQ ID NO. 7 (OspA-B31), SEQ ID NO. 9 (OspA-K48), SEQ ID NO. 11 (OspA-PGau) y SEQ ID NO. 13 (OspA-25015).
Los siguientes cebadores se utilizaron para generar secuencias específicas de ácidos nucleicos del gen de OspA, a utilizar para generar secuencias de ácidos nucleicos quiméricas (según se describe en el Ejemplo 4):
5'-GTCTGCAAAAACCATGACAAG-3' (cebador de la cadena positiva nº 369) (SEQ ID NO. 14);
5'-GTCATCAACAGAAGAAAAATTC-3' (cebador de la cadena positiva nº 357) (SEQ ID NO. 15);
5'-CCGGATCCATATGAAAAAATATTTATTGGG-3' (cebador de la cadena positiva nº 607) (SEQ ID NO. 16);
5'-CCGGGATCCATATGGCTAAGCAAAATGTTAGC-3'(cebador de la cadena positiva nº 584) (SEQ ID NO. 17);
5'-GCGTTCAAGTACTCCAGA-3' (cebador de la cadena negativa nº 200) (SEQ ID NO. 18);
5'-GATATCTAGATCTTATTTTAAAGCGTT-3' (cebador de la cadena negativa nº 586) (SEQ ID NO. 19);
5'-GGATCCGGTGACCTTTTAAAGCGTTTTTAT-3' (cebador de la cadena negativa nº 1169) (SEQ ID NO. 20).
Clonación y secuenciación de OspB
Se utilizaron también métodos similares para aislar genes de OspB. Un gen de OspB aislado se representa como SEQ ID NO. 21 (Osp-B31); su secuencia de aminoácidos codificada es SEQ ID NO. 22.
Se utilizaron los siguientes cebadores para generar secuencias específicas de ácidos nucleicos del gen de OspB, a utilizar en la generación de secuencias de ácidos nucleicos quiméricas (según se describe en el Ejemplo 4):
5'-GGTACAATTACAGTACAA-3' (cebador de la cadena negativa nº 271) (SEQ ID NO. 23);
5'-CCGAGAATCTCATATGGCACAAAAAGGTGCTGAGTCAATTGG-3' (cebador de la cadena positiva nº
1105) (SEQ ID NO. 24);
5'-CCGATATCGGATCCTATTTTAAAGCGTTTTTAAGC-3' (cebador de la cadena negativa nº 1106) (SEQ ID NO. 25); y
5'-GGATCCGGTGACCTTTTAAAGCGTTTTTAAG-3' (cebador de la cadena negativa nº 1170) (SEQ ID NO. 26).
Clonación y secuenciación de OspC
Se utilizaron también métodos similares para aislar genes de OspC. Se utilizaron los siguientes cebadores para aislar genes de OspC completos procedentes de las cepas de Borrelia B31, K48, PKo y pTrob.
5'-GTGCGCGACCATATGAAAAAGAATACATTAAGTGCG-3' (cebador de la cadena positiva que tiene un sitio Nde1 combinado con el codón de iniciación) (SEQ ID NO. 27), y
5'-GTCGGCGGATCCTTAAGGTTTTTTTGGACTTTCTGC-3' (cebador de la cadena negativa que tiene un sitio BamH1 seguido por el codón de detención) (SEQ ID NO. 28).
Las secuencias de ácidos nucleicos de los genes de OspC se determinaron entonces mediante la técnica de terminación en cadena didesoxi utilizando el kit Sequenase (United States Biochemical). Los genes de OspC aislados y secuenciados de esta manera incluyen aquellos para las cepas B31, K48, PKo y Tro; las secuencias de ácidos nucleicos están representadas en el listado de secuencias como SEQ ID NO. 29 (OspC-B31), SEQ ID NO. 31 (OspC-K48), SEQ ID NO. 33 (OspC-PKo) y SEQ ID NO. 35 (OspC-Tro). En la figura 38 se muestra una alineación de estas secuencias. Las secuencias de aminoácidos de las proteínas codificadas por estas secuencias de ácidos nucleicos se representan como SEQ ID NO. 30 (OspC-B31), SEQ ID NO. 32 (OspC-K48), SEQ ID NO. 34 (OspC-PKo) y SEQ ID NO. 36 (OspC-Tro).
Los genes de OspC truncados se generaron utilizando otros cebadores. Estos cebadores se diseñaron para amplificar las secuencias de ácidos nucleicos derivadas del gen de OspC, que carecían de los ácidos nucleicos que codifican la secuencia de peptidasa señal de la proteína de longitud completa. Los cebadores correspondían a los pb 58-75 de la proteína natural, con un codón para Met-Ala fijado en la parte de cabeza. Para la cepa B31 se utilizó el siguiente cebador:
5'-GTGCGCGACCATATGGCTAATAATTCAGGGAAAGAT-3' (SEQ ID Nº 37).
Para la cepa PKo, se utilizó
5'-GTGCGCGACCATATGGCTAGTAATTCAGGGAAAGGT-3' (SEQ ID Nº 38).
Para las cepas pTrob y K48, se utilizó
5'-GTGCGCGACCATATGGCTAATAATTCAGGTGGGGAT-3' (SEQ ID Nº 39).
También se diseñaron cebadores adicionales para amplificar ácidos nucleicos que codifican polipéptidos particulares, para uso en la creación de secuencias quiméricas de ácidos nucleicos (véase el Ejemplo 4). Estos cebadores incluían:
5'-CTTGGAAAATTATTTGAA-3' (cebador de la cadena positiva nº 520) (SEQ ID NO. 40);
5'-CACGGTCACCCCATGGGAAATAATTCAGGGAAAGG-3' (cebador de la cadena positiva nº 58) (SEQ ID NO. 41);
5'-TATAGATGACAGCAACGC-3' (cebador de la cadena negativa nº 207 (SEQ ID NO. 42); y
5'-CCGGTGACCCCATGGTACCAGGTTTTTTTGGACTTTCTGC-3' (cebador de la cadena negativa nº 636) (SEQ ID NO. 43).
Clonación y secuenciación de OspD
Se pueden utilizar métodos similares para aislar genes de OspD. En la figura 39 se muestra una alineación de cuatro secuencias de ácidos nucleicos de OspD (procedentes de las cepas pBo, PGau, DK29 y K48).
Clonación y secuenciación de p12
El gen de p12 se identificó de modo similar. Los cebadores utilizados para clonar el gen de p12 completo incluían: 5'-CCGGATCCATATGGTTAAAAAAATAATATTTATTTC-3' (cebador delantero nº 757) (SEQ ID NO. 44); y 5'GATATCTAGATCTTTAATTGCTCTGCTCACTCTCTTC-3' (cebador inverso nº 758) (SEQ ID NO. 45).
Para amplificar un gen de p12 truncado (uno en el que la proteína transcrita no está lipidada y comienza en el aminoácido 18 de la secuencia nativa) se utilizaron los siguientes cebadores: 5'CCGGGATCCATATGGCTAGTGCAATTGGTCGTGG-3' (cebador delantero nº 759) (SEQ ID NO. 45).
Clonación y secuenciación de p41 (fla)
Se utilizó un enfoque similar para clonar y secuenciar genes que codifican la proteína p41 (fla). Las secuencias de p41 listadas en la Tabla II con los números de acceso a GenBank se aislaron utilizando los siguientes cebadores procedentes de la cepa B31: 5'-ATGATTATCAATCATAAT-3' (+1 a +18) (SEQ ID NO. 47); y 5'-TCTGAACAATGACAAAAC-3' (+1008 a +991) (SEQ ID NO. 48). Las secuencias de ácidos nucleicos de p41 aisladas de esta manera están representadas en el listado de secuencias como SEQ ID NO. 51 (p41-PGau) y SEQ ID NO. 53 (p41-DK29). En la figura 41 se muestra una alineación de varias secuencias de ácidos nucleicos p41, incluidas las de las cepas B31, pKa1, PGau, pBo, DK29 y pKo. La secuencia de aminoácidos de las proteínas codificadas por estas secuencias de ácidos nucleicos se representan como SEQ ID NO. 50 (p41-K48), SEQ ID NO. 52 (p41-PGau), SEQ ID NO. 54 (p41-DK29), SEQ ID NO. 56 (p41-PTrob) y SEQ ID NO. 58 (p41-PHei).
Se diseñaron otros cebadores para amplificar secuencias de ácidos nucleicos que codifican los polipéptidos de p41, a utilizar en las secuencias de ácidos nucleicos quiméricas. Estos cebadores incluían:
5'-TTGGATCCGGTCACCCCATGGCTCAATATAACCAATG-3' (cebador de la cadena negativa nº 122) (SEQ ID NO. 59);
5'-TTGGATCCGGTCACCCCATGGCTTCTCAAAATGTAAG-3' (cebador de la cadena positiva nº 140) (SEQ ID NO. 60);
5'-TTGGATCCGGTGACCAACTCCGCCTTGAGAAGG-3' (cebador de la cadena negativa nº 234) (SEQ ID NO. 61); y
5'-TTGGATCCGGTGACCTATTTGAGCATAAGATGC-3' (cebador de la cadena negativa nº 141) (SEQ ID NO. 62).
Clonación y secuenciación de p93
También se utilizó el mismo enfoque para clonar y secuenciar la proteína p93. Genes que codifican p93, según se lista en la Tabla II con los números de acceso a GenBank, se aislaron mediante este método con los siguientes cebadores procedentes de la cepa B31:
5'-GGTGAATTTAGTTGGTAAGG-3' (-54 a -35) (SEQ ID NO. 63); y
5'-CACCAGTTTCTTTAAGCTGCTCCTGC-3' (+1117 a +1092) (SEQ ID NO. 64).
Las secuencias de ácidos nucleicos de p93 aisladas de esta manera se representan en el listado de secuencias como SEQ ID NO. 65 (p93-B31), SEQ ID NO. 67 (p93-K48), SEQ ID NO. 69 (p93-PBo), SEQ ID NO. 71 (p93-PTrob), SEQ ID NO. 73 (p93-PGau), SEQ ID NO. 75 (p93-25015), y SEQ ID NO. 77 (p93-PKo). Las secuencias de aminoácidos de las proteínas codificadas por estas secuencias de ácidos nucleicos se representan como SEQ ID NO. 66 (p93-B31), SEQ ID NO. 68 (p93-K48), SEQ ID NO. 70 (p93-PBo), SEQ ID NO. 72 (p93-PTrob), SEQ ID NO. 74 (p93-PGau), SEQ ID NO. 76 (p93-25015) y SEQ ID NO. 78 (p93-PKo).
Se utilizaron otros cebadores para amplificar secuencias de ácidos nucleicos que codifican polipéptidos de p93 a utilizar en la generación de secuencias de ácidos nucleico quiméricas. Estos cebadores incluían:
5'-CCGGTCACCCCATGGCTGCTTTAAAGTCTTTA-3' (cebador de la cadena positiva nº 475) (SEQ ID NO. 79);
5'-CCGGTCACCCCATGAATCTTGATAAAGCTCAG-3' (cebador de la cadena positiva nº 900) (SEQ ID NO. 80);
5'-CCGGTCACCCCATGGATGAAAAGCTTTTAAAAAGT-3' (cebador de la cadena positiva nº 1168) (SEQ ID NO. 81);
5'-CCGGTCACCCCCATGGTTGAGAAATTAGATAAG-3' (cebador de la cadena positiva nº 1423) (SEQ ID NO. 82); y
5'-TTGGATCCGGTGACCCTTAACTTTTTTTAAAG-3' (cebador de la cadena negativa nº 2100) (SEQ ID NO. 83).
C. Expresión de proteínas a partir de genes de Borrelia
Las secuencias de ácidos nucleicos descritas anteriormente se pueden incorporar en plásmidos de expresión, utilizando técnicas convencionales, y se pueden transfectar en células huésped compatibles con el fin de expresar las proteínas codificadas por las secuencias de ácidos nucleicos. Como ejemplo, se recoge la expresión del gen de p12 y el aislamiento de la proteína p12.
La amplificación de la secuencia de ácidos nucleicos de p12 se realizó con los cebadores que incluían un sitio de restricción NdeI en la secuencia de ácidos nucleicos. El producto de PCR se extrajo con fenol/cloroformo y se precipitó con etanol. El producto precipitado se digirió y ligó en un plásmido de expresión como sigue: 15 \mul (aproximadamente 1 \mug) de ADN de PCR se combinó con 2 \mul de tampón de restricción 10X para NdeI (Gibco/BRL), 1 \mul de NdeI (Gibco/BRL) y 2 \mul de agua destilada, y se incubó durante una noche a 37ºC. Subsiguientemente, esta mezcla se combinó con 3 \mul de tampón 10X (tampón 3, New England BioLabs), 1 \mul de BamHI (NEB) y 6 \mul de agua destilada, y se incubó a 37ºC durante dos horas. El material resultante se purificó mediante electroforesis en gel preparativa utilizando agarosa de bajo punto de fusión, y la banda se visualizó bajo luz ultravioleta de onda larga y se escindió del gel. La rodaja de gel se trató con Gelase utilizando las condiciones recomendadas por el fabricante (Epicentre Technologies). El ADN resultante sedimentado se resuspendió en 25-50 \mul de Tris-CL 10 mM (pH 8,0) y EDTA 10 mM (TE). Una parte alícuota de este material se ligó en el vector de expresión Pet9c (Dunn, J. J. et al., Protein Expression and Purificaticon 1: 159 (1990)).
Para ligar el material en el vector de expresión Pet9c, 20-50 ng de la secuencia de ácidos nucleicos de p12, cortados y purificados según se describe antes, se combinaron con 5 \mul de tampón 10 One-Phor-All (OPA) (Pharmacia), 30-60 ng de Pet9c se cortaron con NdeI y BamHI, 2,5 \mul de ATP 20 mM, 2 \mul de ADN ligasa de T4 (Pharmacia) diluida a razón de 1:5 en tampón 1X OPA y suficiente agua destilada para llevar el volumen final hasta 50 \mul. La mezcla se incubó a 12ºC durante una noche.
Los ligamientos resultantes se transformaron en células DH5-alfa competentes y se extendieron en placas de agar nutriente que contenían 50 \mug/ml de canamicina y se incubaron durante una noche a 37ºC. DH5-alfa se utiliza como una "cepa de almacenamiento" para clones de expresión de T7, dado que es RecA deficiente, de modo que no son problemáticas la recombinación y la concatenación, y debido a que carece del gen de ARN polimerasa de T7 necesario para expresar el gen clonado. El uso de esta cepa permite la clonación de productos génicos potencialmente tóxicos al tiempo que minimiza la posibilidad de deleción y/o redisposición de los genes deseados. También se pueden utilizar otras líneas de células con propiedades similares.
Colonias resistentes a canamicina eran de colonia única purificada sobre placas de agar nutriente suplementadas con canamicina a razón de 50 \mug/ml. Una colonia procedente de cada material aislado se inoculó en 3-5 ml de un medio líquido que contenía 50 \mug/ml de canamicina, y se incubó a 37ºC sin agitación. El ADN del plásmido se obtuvo a partir de 1 ml de cada material aislado utilizando un proceso de lisis alcalina en caliente (Maniatis, T. et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY (1982)).
El ADN del plásmido se digirió con EcoRI y BglII de la siguiente manera: 15 \mul de ADN del plásmido se combinaron con 2 \mul de tampón 10 X 3 (NEB), 1 \mul de EcoRI (NEB), 1 \mul de BglII (NEB) y 1 \mul de agua destilada, y se incubó durante dos horas a 37ºC. Toda la mezcla de reacción se sometió a electroforesis en gel de agarosa analítico. Plásmidos que portaban la inserción p12 se identificaron por la presencia de una banda correspondiente a 925 pares de bases (p12 de longitud completa) u 875 pares de bases (p12 no lipidada).
Uno o dos ADNs del plásmido procedente de los clones de p12 de longitud completa y no lipidado en Pet9c se usaron para transformar BL21 DE3 pLysS en resistencia a la canamicina según se describe por Studier et al. (Methods in Enzymology, Goeddel, D. (Ed.), Academic Press, 185: 60-89 (1990)). Uno o dos transformantes de los clones de longitud completa y no lipidados eran una colonia única purificada sobre placas nutrientes que contenían 25 \mug/ml de cloranfenicol (para mantener pLysS) y 50 \mug/ml de canamicina a 37ºC. Una colonia de cada material aislado se inoculó en medio líquido suplementado con cloranfenicol y canamicina y se incubó durante una noche a 37ºC. El cultivo durante una noche se subcultivó a la mañana siguiente en 500 ml de un caldo líquido con cloranfenicol (25 \mug/ml) y canamicina (50 \mug/ml) y se desarrolló con aireación a 37ºC en un sacudidor de aire orbital hasta que la absorbancia a 600 nm alcanzó 0,4-0,7. Se añadió isopropil-tio-galactósido (IPTG) hasta una concentración final de 0,5 mM, para la inducción, y el cultivo se incubó durante 3-4 horas a 37º como antes. Las células inducidas se sedimentaron mediante centrifugación y se resuspendieron en 25 ml de NaPO_{4}(pH 7,7). Una pequeña parte alícuota se retiró para el análisis mediante electroforesis en gel. Los clones de expresión producían proteínas que migraban en la posición de 12 kDa.
Se preparó un lisado de células bruto a partir del cultivo según se describe para la OspA recombinante por Dunn, J. J. et al., (Protein Expression and Purification 1: 159 (1990)). El lisado bruto se hizo pasar primeramente sobre una columna de Q-Sepharose (Pharmacia) que había sido pre-equilibrada en tampón A: NaPO_{4} 10 mM (pH 7,7), NaCl 10 mM, PMSF 0,5 mM. La columna se lavó con NaPO_{4} 10 mM, NaCl 50 mM y PMSF 0,5 mM y luego p12 se eluyó en NaPO_{4} 10 mM, PMSF 0,5 mM con un gradiente de NaCl de 50-400 mM. p12 eluía aproximadamente a mitad de camino a través del gradiente entre NaCl 100 y 200 mM. Las fracciones pico se agruparon y dializaron contra NaPO_{4} 10 mM (pH 7,7), NaCl 10 mM, PMSF 0,5 mM. A continuación, la proteína se concentró y aplicó a una columna de filtración en gel Sephadex G50 con un volumen de lecho de aproximadamente 50 ml (Pharmacia) en NaPO_{4} 10 mM, NaCl 200 mM, PMSF 0,5 mM. p12 eluiría típicamente poco después del marcador de volumen excluido. Las fracciones pico se determinaron haciendo pasar pequeñas partes alícuotas de todas las fracciones sobre un gel. El pico de p12 se agrupó y almacenó en pequeñas partes alícuotas a -20ºC.
Ejemplo 4 Generación de secuencias de ácidos nucleicos quiméricas y proteínas quiméricas A. Protocolo general para la creación de secuencias de ácidos nucleicos quiméricas
El método del megacebador de la mutagénesis dirigida al lugar y su modificación se utilizaron para generar secuencias de ácidos nucleicos quiméricas (Sarkar y Sommer, Biotechniques 8(4): 404-407 (1990); Aiyar, A. y J. Leis, Biotechniques 14 (3): 366-369 (1993)). Se utilizan un cebador 5' para la primera plantilla genómica y una fusión oligo 3' para amplificar la región deseada. El cebador de fusión consiste en un extremo 3' de la primera plantilla (ADN que codifica el polipéptido amino-proximal de la proteína de fusión), acoplado a un extremo 5' de la segunda plantilla (ADN que codifica el polipéptido carboxi-proximal de la proteína de fusión).
Las amplificaciones por PCR se realizan utilizando ADN polimerasa de Taq, tampón 10X PCR y MgCl_{2} (Promega Corp., Madison, WI), y dNTPs de Ultrapure (Pharmacia, Piscataway, NJ). Un \mug de plantilla genómica 1, 5 \mu de 10 \muM 5' oligo y 5 \mul de 10 \muM de fusión oligo se combinan con los reactivos siguientes con las concentraciones finales indicadas: tampón 10X-Mg FREE (1X), MgCl_{2} (2 mM), mezcla de dNTPs (200 \muM de cada dNTP), ADN polimerasa de Taq (2,5 unidades), agua hasta llegar a un volumen final de 100 \mul. Se utiliza un ciclador térmico (Perkin Elmer Cetus, Norwalk, CT) para amplificar bajo las siguientes condiciones: 35 ciclos a 95ºC durante un minuto, 55ºC durante dos minutos y 72º durante tres minutos. Este proceso da como resultado un "megacebador".
El megacebador resultante se hace pasar sobre un gel de agarosa 1X TAE de bajo punto de fusión al 4%. La banda del megacebador se corta del gel y se purifica utilizando el sistema de purificación de ADN Promega Magic PCR Preps. A continuación, el megacebador purificado se utiliza en una segunda etapa de PCR. Un \mug de plantilla genómica 2, aproximadamente 0,5 \mug del megacebador y 5 \mu de 10 \muM 3' oligo se añaden a un cóctel de tampón 10X, MgCl_{2}, dNTPs y Taq a las mismas concentraciones finales que las señaladas anteriormente, y se llevan hasta 100 \mul con agua. Las condiciones de PCR son las mismas que antes. La proteína de fusión que resulta de esta amplificación se purifica también utilizando el sistema de purificación de ADN Promega Magic PCR Preps.
El producto de fusión se liga luego en vector TA y se transforma en E. coli utilizando el kit de clonación TA de Invitrogen (San Diego, CA). Aproximadamente 50 ng de producto de fusión por PCR se ligan a 50 ng de vector pCRII con tampón de ligamiento 1X, 4 unidades de ligasa de T4 y se llevan a 10 Nl con agua. Esta mezcla de productos ligados se incuba a 12ºC durante una noche (aproximadamente 14 horas). Dos \mul de la mezcla de productos de ligamiento se añaden a 50 \mul de células F' INC competentes y 2 \mu de beta-mercaptoetanol. A continuación, las células se incuban durante 30 minutos, seguido de tratamiento por choque térmico a 42ºC durante 60 segundos, y un enfriamiento brusco con hielo durante dos minutos. Después se añaden a las células 450 \mul de medio SOC calentado, dando como resultado un cultivo de células transformadas que se incuba a 37ºC durante una hora con ligero sacudimiento. 50 \mul del cultivo de células transformadas se extienden en placas de LB + 50 \mug/ \mul de ampicilina y se incuban durante una noche a 37ºC. Se recogen las colonias de color blanco sencillas y se añaden a cultivos individuales durante una noche que contenían 3 ml de LB con ampicilina (50 \mug/\mul).
Los cultivos de una noche individuales se preparan utilizando el sistema de purificación de ADN Promega Magic Miniprep. Una pequeña cantidad del ADN resultante se corta utilizando una digestión de restricción como verificación. La secuenciación del ADN se realiza luego para verificar la secuencia de la secuencia de ácidos nucleicos de fusión utilizando el kit de secuenciación de ADN de United States Biochemical (Cleveland, OH) Sequenase Versión 2.0. Por cada reacción se utilizan de tres a cinco \mug de ADN de plásmido. Al ADN se añaden 2 \mul de NaOH/EDTA 2 mM, y el volumen se lleva a 20 \mul con agua. La mezcla se incuba luego a la temperatura ambiente durante cinco minutos. Se añaden 7 \mul de agua, 3 \mul de NaAc 3 M, 75 \mul de EtOH. La mezcla resultante se combina mediante arremolinamiento y se incuba durante 10 minutos a -70ºC y luego se somete a microfugación. Después de microcentrifugar durante diez minutos, el sobrenadante se separa por aspiración y el sedimento se seca en el speed vac durante 30 segundos. Después se añaden 6 \mul de agua, 2 \mul de tampón de reasociación y 2 \mul de 10 \muM del oligo apropiado. Esta mezcla se incuba durante 10 minutos a 37ºC y luego se deja reposar a la temperatura ambiente durante 10 minutos. Subsiguientemente, se añaden a cada muestra de la mezcla 5,5 \mul de cóctel de marcaje (descrito anteriormente) que se incuban a la temperatura ambiente durante cinco minutos adicionales. Luego se añaden 3,5 \mul de ADN marcado a cada muestra que luego se incuba durante cinco minutos a 37ºC. A cada pocillo se añaden 4 \mul de solución de terminación. El ADN se desnaturaliza a 95º durante dos minutos y luego se coloca sobre hielo.
Los clones con las secuencias de ácidos nucleicos de fusión deseadas se reclonan luego en el marco en el sistema de expresión de pEt en las formas lipidadas (longitud completa) y no lipidada (truncada, es decir sin los primeros 17 aminoácidos). El producto se amplifica utilizando sitios de restricción contenidos en los cebadores de PCR. El vector y el producto se cortan con las mismas enzimas y se ligan juntos con la ligasa de T4. El plásmido resultante se transforma en E. coli competente utilizando técnicas de transformación convencionales. Las colonias se rastrean según se describe anteriormente y clones positivos se transforman en células de expresión tales como E. coli BL21, para la expresión de proteínas con IPTG para inducción. La proteína expresada en su forma de lisado de cultivo bacteriano y/o forma purificada se inyecta luego en ratones para la producción de anticuerpos. Los ratones son desangrados y los sueros son recogidos para la aglutinación, inhibición del desarrollo in vitro y ensayos de lisis dependiente e independiente del complemento.
B. Secuencias de ácidos nucleicos quiméricas específicas
Se generaron diversas secuencias de ácidos nucleicos quiméricas. Las secuencias de ácidos nucleicos se describen como codificadoras de polipéptidos de proteínas de Borrelia. Las secuencias de ácidos nucleicos quiméricas se producen de modo que la secuencia de ácido nucleico que codifica un polipéptido se encuentra en el mismo marco de lectura que la secuencia de ácidos nucleicos que codifica el siguiente polipéptido en la secuencia de proteína quimérica codificada por la secuencia de ácidos nucleicos quimérica. Las proteínas se listan secuencialmente (en el orden de presencia de la secuencia codificante) en la descripción de la secuencia de ácidos nucleicos quimérica. Por ejemplo, si se secuenciara una secuencia de ácidos nucleicos quimérica consistente en los pb 1-650 de OspA-1 y los pb 651-820 de OspA-2, la secuencia de la quimera incluiría los primeros 650 pares de bases de OspA-1, seguido inmediatamente de los pares de bases 651-820 de OspA-2.
OspA-K48/OspA-PGau
Una quimera de OspA procedente de la cepa K48 (OspA-K48) y OspA procedente de la cepa PGau (OspA-PGau) se generó utilizando el método descrito anteriormente. Esta secuencia de ácidos nucleicos quimérica incluía los pb 1-654 de OspA-K48, seguido de los pb 655-820 de OspA-PGau. Los cebadores utilizados incluían: la secuencia amino-terminal del cebador de OspA nº 607 (SEQ ID NO. 16); el cebador de fusión, 5'-AAAGTAGAAGTTTTTGAATCCCATTTTCCAGTTTTTTT-3' (cebador de la cadena negativa nº 668-654) (SEQ ID NO. 84); la secuencia carboxi-terminal del cebador de OspA nº 586 (SEQ ID NO. 19); y los cebadores de secuencia nº 369 (SEQ ID NO. 14) y nº 358 (SEQ ID NO. 15). La secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 85; la proteína quimérica codificada por esta secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 86.
OspA-B31/OspA-PGau
Una quimera de OspA procedente de la cepa B31 (OspA-B31) y OspA procedente de la cepa PGau (OspA-PGau) se generó utilizando el método descrito anteriormente. Esta secuencia de ácidos nucleicos quimérica incluía los pb 1-651 de OspA-B31, seguido de los pb 652-820 de OspA-PGau. Los cebadores utilizados incluían: el cebador de fusión, 5'-AAAGTAGAAGTTTTTGAATTCCAAGCTGCAGTTTT-3' (cebador de la cadena negativa nº 668-651) (SEQ ID NO. 87); y el cebador de la secuencia nº 369 (SEQ ID NO 14) La secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 88; la proteína quimérica codificada por esta secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 89.
OspA-B31/OspA-K48
Una quimera de OspA procedente de la cepa B31 (OspA-B31) y OspA procedente de la cepa K48 (OspA-K48) se generó utilizando el método descrito anteriormente. Esta secuencia de ácidos nucleicos quimérica incluía los pb 1-651 de OspA-B31, seguido de los pb 652-820 de OspA-K48. Los cebadores utilizados incluían: el cebador de fusión, 5'-AAAGTGGAAGTTTTTGAATTCCAAGCTGCAGTTTTTTT-3' (cebador de la cadena negativa nº 671-651) (SEQ ID NO. 90); y el cebador de la secuencia nº 369 (SEQ ID NO. 14) La secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 91; la proteína quimérica codificada por esta secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 92.
OspA-B31/OspA-25015
Una quimera de OspA procedente de la cepa B31 (OspA-B31) y OspA procedente de la cepa 25015 (OspA-25015) se generó utilizando el método descrito anteriormente. Esta secuencia de ácidos nucleicos quimérica incluía los pb 1-651 de OspA-B31, seguido de los pb 652-820 de OspA-25015. Los cebadores utilizados incluían: el cebador de fusión, 5'-TAAAGTTGAAGTGCCTGCATTCCAAGCTGCAGTTT-3' (SEQ ID NO 93). La secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 94; la proteína quimérica codificada por esta secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 95.
OspA-K48/OspA-B31/OspA-K48
Una quimera de OspA procedente de la cepa B31 (OspA-B31) y OspA procedente de la cepa K48 (OspA-K48) se generó utilizando el método descrito anteriormente. Esta secuencia de ácidos nucleicos quimérica incluía los pb 1-570 de OspA-B31, seguido de los pb 570-651 de OspA-B31, seguido de los pb 650-820 de OspA-K48. Los cebadores utilizados incluían: el cebador de fusión, 5'-CCCCAGATTTTGAAATCTTGCTTAAAACAAC-3'(SEQ ID NO. 96); y el cebador de la nº 357 (SEQ ID NO. 15). La secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 97; la proteína quimérica codificada por esta secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 98.
OspA-B31/OspA-K48/OspA-B31/OspA-K48
Una quimera de OspA procedente de la cepa B31 (OspA-B31) y OspA procedente de la cepa K48 (OspA-K48) se generó utilizando el método descrito anteriormente. Esta secuencia de ácidos nucleicos quimérica incluía los pb 1-420 de OspA-B31, seguido de los pb 420-570 de OspA-K48, seguido de los pb 570-650 de OspA-B31, seguido de los pb 651-820 de OspA-K48. Los cebadores utilizados incluían: el cebador de fusión, 5'-CAAGTCTGGTTCCAATTTGCTCTTGTTATTAT-3' (cebador de la cadena negativa nº 436-420) (SEQ ID NO. 99); y el cebador de la secuencia nº 357 (SEQ ID NO. 15). La secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 100; la proteína quimérica codificada por esta secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID
NO. 101.
Osp-B31/OspB-B31
Una quimera de OspA y OspB procedente de la cepa B31 (OspA-B31, OspB-B31) se generó utilizando el método descrito anteriormente. La secuencia de ácidos nucleicos quimérica incluía los pb 1-651 de OspA-B31, seguido de los pb 652-820 de OspB-B31. Los cebadores utilizados incluían: el cebador de fusión, 5'-GTTAAAGTGCTAGTACTGTCATTCCAAGCTGCAGTTTTTTT-3' (cebador de la cadena negativa nº 740-651) (SEQ ID NO. 102); la secuencia carboxi-terminal del cebador de OspB nº 1106 (SEQ ID NO. 25); y el cebador de la secuencia nº 357 (SEQ ID NO. 15). La secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 103; la proteína quimérica codificada por esta secuencia de ácidos nucleicos se presenta como SEQ ID NO. 104.
OspA-B31/OspB-B31/OspC-B31
Una quimera de OspA, OspB y OspC procedente de la cepa B31 (OspA-B31, OspB-B31 y OspC-B31) se generó utilizando el método descrito anteriormente. La secuencia de ácidos nucleicos quimérica incluía los pb 1-650 de OspA-B31, seguido de los pb 652-820 de OspB-B31, seguido de los pb 74-630 de OspC-B31. Los cebadores utilizados incluían: el cebador de fusión, 5'-TGCAGATGTAATCCCATCCGCCATTTTTAAAGCGTTTTT-3' (SEQ ID NO. 105); y la secuencia carboxi-terminal del cebador de OspC nº 1106 (SEQ ID NO. 28). La secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 106; la proteína quimérica codificada por esta secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 107.
OspC-B31/OspA-B31/OspB-B31
Una quimera de OspA, OspB y OspC procedente de la cepa B31 (OspA-B31, OspB-B31 y OspC-B31) se generó utilizando el método descrito anteriormente. La secuencia de ácidos nucleicos quimérica incluía los pb 1-630 de OspC-B31, seguido de los pb 52-650 de OspA-B31, seguido de los pb 650-820 de OspB-B31. Los cebadores utilizados incluían: el cebador de fusión, 5'-GCTGCTAACATTTTGCTTAGGTTTTTTTGGACTTTC-3' (cebador de la cadena negativa nº 69-630)(SEQ ID NO. 108); y los cebadores de la secuencia nº 520 (SEQ ID NO. 40) y nº 200 (SEQ ID NO. 18). La secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 109; la proteína quimérica codificada por esta secuencia de ácidos nucleicos quimérica se presenta como SEQ ID NO. 110.
Secuencias de ácidos nucleicos quiméricas adicionales
Utilizando los métodos descritos anteriormente, se produjeron otras secuencias de ácidos nucleicos quiméricas. Estas secuencias de ácidos nucleicos quiméricas y las proteínas codificadas se resumen en la Tabla 3:
TABLA III Secuencias de ácidos nucleicos quiméricas y las proteínas codificadas
3
C. Purificación de proteínas generadas por secuencias de ácidos nucleicos quiméricas
Las secuencias de ácidos nucleicos quiméricas descritas anteriormente, así como las secuencias de ácidos nucleicos quiméricas producidas por los métodos descritos anteriormente, se utilizan para producir proteínas quiméricas codificadas por las secuencias de ácidos nucleicos. Métodos convencionales tales como los descritos anteriormente en el Ejemplo 3, concernientes a la expresión de proteínas procedentes de genes de Borrelia, se pueden utilizar para expresar las proteínas en un organismo huésped compatible. A continuación, las proteínas quiméricas se pueden aislar y purificar utilizando técnicas convencionales.
Si la proteína quimérica es soluble, ésta se puede purificar en una columna de Sepharose. Las proteínas insolubles se pueden solubilizar en guanidina y purificar en una columna de Ni++; alternativamente, se pueden solubilizar en NaPO_{4} 10 mM con TRITON X 114 al 0,1-1%, y subsiguientemente purificar sobre una columna S (Pharmacia). Las proteínas lipidadas se purificaron generalmente por el método citado en último lugar. La solubilidad se determinó separando tanto las fracciones solubles como insolubles del lisado de células en un gel de PAGE al 12%, y verificando la localización de la proteína mediante tinción con Coomasie, o mediante transferencia Western con anticuerpos monoclonales dirigidos contra un polipéptido antigénico de la proteína quimérica.
Equivalentes
Los expertos en la técnica reconocerán, o serán capaces de verificar utilizando no más de una experimentación rutinaria, muchos equivalentes a las realizaciones específicas de la invención descrita en esta memoria. Equivalentes de este tipo pretenden ser abarcados en el alcance de las siguientes reivindicaciones.
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Associated Universities, Inc.
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: Suite 730
\hskip4,2cm
1400 16th Street, NW
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Washington
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO/PROVINCIA: Distrito de Columbia
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Estados Unidos de América
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL: 20036
\vskip0.500000\baselineskip
(G)
TELÉFONO: (516) 282-7338
\vskip0.500000\baselineskip
(I)
TELEFAX:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
INVENTOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Dunn, John J.
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 5 Mott Drive
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Bellport
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO/PROVINCIA: Nueva York
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Estados Unidos de América
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL: 11713
\vskip0.500000\baselineskip
(G)
TELÉFONO:
\vskip0.500000\baselineskip
(I)
TELEFAX:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
INVENTOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Luft, Benjamin J.
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 232 Lincoln Avenue
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Port Jefferson
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO/PROVINCIA: Nueva York
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Estados Unidos de América
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL: 11777
\vskip0.500000\baselineskip
(G)
TELÉFONO:
\vskip0.500000\baselineskip
(I)
TELEFAX:
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Proteínas quiméricas que comprenden polipéptidos de Borrelia; usos para las mismas
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 144
\vskip0.800000\baselineskip
(iv)
DIRECCIÓN DE CORRESPONDENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
RECEPTOR: Hamilton, Brook, Smith & Reynolds, P.C.
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: Two Militia Drive
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Lexington
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO: MA
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: EE.UU.
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
CÓDIGO POSTAL: 02173
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
FORMA LEGIBLE POR ORDENADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TIPO DE MEDIO: disquete
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
SOFTWARE: PatentIn Release nº 1.0, versión nº 1.25
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
DATOS ACTUALES DE LA SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD: PCT/US94/12352
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN: 27 de octubre de 1994
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
DATOS DE SOLICITUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD: US 235.836
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN: 29 de abril de 1994
\vskip0.800000\baselineskip
(vii)
DATOS DE SOLICITUD ANTERIOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD: US 08/148.191
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA DE PRESENTACIÓN: 01 de noviembre de 1993
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
INFORMACIÓN SOBRE EL APODERADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Granan, Patricia
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
NÚMERO DE REGISTRO: 32.227
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
REFERENCIA/NÚMERO DE EXPEDIENTE: BNL93-28A PCT
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIÓN:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TELÉFONO: (617) 861-6240
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TELEFAX: (617) 861-9540
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:1:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CTTAATGACT CTGACACTAG TGC
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GCTACTAAAA AAACCGGGAA ATGGAATTCA
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 33 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GCAGCTTGGG ATTCAAAAAC ATCCACTTTA ACA
\hfill
33
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GGAGAATATA TTATGAAA
\hfill
18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 17 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
SECUENCIA DE LA DESCRIPCIÓN: SEQ ID NO: 5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CTCCTTATTT TAAAGCG
\hfill
17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 822 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..822
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 6:
\vskip1.000000\baselineskip
4
5
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 273 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 7:
6
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 825 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..825
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 8:
\vskip1.000000\baselineskip
7
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 274 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 9:
9
10
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 10:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 822 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..822
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 10:
11
13
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 273 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 11:
\vskip1.000000\baselineskip
14
15
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 819 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleótido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..819
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
Descripción de la secuencia: SEQ ID NO:12:
\vskip1.000000\baselineskip
16
17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 273 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 13:
\vskip1.000000\baselineskip
18
19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 21 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
SECUENCIA DE LA DESCRIPCIÓN: SEQ ID NO: 14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTCTGCAAAA ACCATGACAA G
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CTCATCAACA GAAGAAAAAT TC
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 30 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCGGATCCAT ATGAAAAAAT ATTTATTGGG
\hfill
30
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCGGGATCCAC TATGGCTAAG CAAAATGTTA GC
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 18:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GCGTTCAAGT ACTCCAGA
\hfill
18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 27 pares de base
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GATATCTAGA TCTTATTTTA AAGCGTT
\hfill
27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 31 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GGATCCGGTG ACCTTTTAAA GCGTTTTTAA T
\hfill
31
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 21:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 891 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TIPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..891
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 21:
\vskip1.000000\baselineskip
20
21
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 22:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 296 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TIPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 22:
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 23:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 23:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GGTACAATTA CAGTACAA
\hfill
18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 24:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 42 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCGAGAATCT CATATGGCAC AAAAAGGTGC TGAGTCAATT GG
\hfill
42
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 25:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 35 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCGATATCGG ATCCTATTTT AAAGCGTTTT TAAGC
\hfill
35
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 26:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 31 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 26:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GGATCCGGTG ACCTTTTAAA GCGTTTTTAA G
\hfill
31
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 27:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 27:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTGCGCGACC ATATGAAAAA GAATACATTA AGTGCG
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 28:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 28:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTCGGCGGAT CCTTAAGGTT TTTTTGGACT TTCTGC
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 29:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 633 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..633
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 29:
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 30:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 210 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 30:
\vskip1.000000\baselineskip
25
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 31:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 630 pares de base
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..630
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 31:
26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 32:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 209 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 32:
27
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 33:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 639 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..639
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 33:
28
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 34:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 212 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 34:
29
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 35:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 624 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..624
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 35:
30
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:36:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 207 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA SEQ ID NO: 36:
31
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 37:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 37:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTGCGCGACC ATATGGCTAA TAATTCAGGG AAAGAT
\hfill
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 38:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 37 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 38:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTGCGCGACC ATATGGGCTA GTAATTCAGG GAAAGGT
\hfill
37
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 39:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 39:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTGCGCGACC ATATGGCTAA TAATTCAGGT GGGGAT
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 40:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 40:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CTTGGAAAAT TATTTGAA
\hfill
18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 41:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 35 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA SEQ ID NO: 41
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CACGGTCACC CCATGGGAAA TAATTCAGGG AAAGG
\hfill
35
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 42:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 42:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TATAGATGAC AGCAACGC
\hfill
18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 43:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 40 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 43:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCGGTGACCC CATGGTACCA GGTTTTTTTG GACTTTCTGC
\hfill
40
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 44:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 44:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCGGATCCAT ATGGTTAAAA AAATAATATT TATTTC
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 45:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 37 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 45:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GATATCTAGA TCTTTAATTG CTCTGCTCAC TCTCTTC
\hfill
37
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 46:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 34 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 46:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCGGGATCCA TATGGCTAGT GCAATTGGTC GTGG
\hfill
34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 47:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 47:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ATGATTATCA ATCATAAT
\hfill
18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 48:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 48:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TCTCAACAAT GACAAAAC
\hfill
18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 49:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 825 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 49:
\vskip1.000000\baselineskip
32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 50:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 824 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 50:
33
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 51:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1011 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..1011
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 51:
\vskip1.000000\baselineskip
35
36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 52:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 336 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 52:
37
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 53:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1008 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..1008
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEO ID NO: 53:
\vskip1.000000\baselineskip
38
39
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 54:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 336 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 54
40
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 55:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 821 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 55:
\vskip1.000000\baselineskip
41
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 56:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 821 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 56:
42
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 57:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 821 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 57:
43
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 58:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 822 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID NO: 58:
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 59:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 37 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 59:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TTGGATCCGG TCACCCCATG GCTCAATATA ACCAATG
\hfill
37
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 60:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 37 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 60:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TTGGATCCGG TCACCCCATG GCTTCTCAAA ATGTAAG
\hfill
37
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 61:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 33 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 61:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TTGGATCCGG TGACCAACTC CGCCTTGAGA AGG
\hfill
33
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 62:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 33 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 62:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TTGGATCCGG TGACCTATTT GAGCATAAGA TGC
\hfill
33
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 63:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 20 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 63:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GGTGAATTTA GTTGGTAAGG
\hfill
20
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 64:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 26 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 64:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CACCAGTTTC TTTAAGCTGC TCCTGC
\hfill
26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 65:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2102 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..2100
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 65:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
46
48
49
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 66:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 700 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 66:
\vskip1.000000\baselineskip
50
51
52
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 67:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2081 pares de base
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..2079
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 67:
\vskip1.000000\baselineskip
53
54
55
56
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 68:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 693 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 68:
\vskip1.000000\baselineskip
57
58
59
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 69:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1991 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(x)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..1989
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 69:
60
62
63
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 70:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 663 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 70:
64
65
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 71:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2081 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..2079
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 71:
\vskip1.000000\baselineskip
66
67
68
69
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 72:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 693 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 72:
\vskip1.000000\baselineskip
70
71
72
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 73:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2107 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..2100
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 73:
73
74
75
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 74:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 700 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 74:
76
77
78
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 75:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 2126 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..2124
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 75
\vskip1.000000\baselineskip
79
80
81
82
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 76:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 708 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 76:
\vskip1.000000\baselineskip
83
84
85
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 77:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1991 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..989
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 77:
\vskip1.000000\baselineskip
86
87
88
89
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 78:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 663 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 78:
\vskip1.000000\baselineskip
90
91
92
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 79:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 79:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCGGTCACCC CATGGCTGCT TTAAAGTCTT TA
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 80:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 80:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCGGTCACCC CATGAATCTT GATAAAGCTC AG
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 81:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 81:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCGGTCACCC CATGGATGAA AAGCTTTTAA AAAGT
\hfill
35
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 82:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 33 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 82:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCGGTCACCC CCATGGTTGA GAAATTAGAT AAG
\hfill
33
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 83:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 83:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TTGGATCCGG TGACCCTTAA CTTTTTTTAA AG
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 84:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 38 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 84:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AAAGTAGAAG TTTTTGAATC CCATTTTCCA GTTTTTTT
\hfill
38
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 85:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 825 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..825
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 85:
93
94
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 86:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 274 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 86:
\vskip1.000000\baselineskip
95
96
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 87:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 35 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 87:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AAAGTAGAAG TTTTTGAATT CCAAGCTGCA GTTTT
\hfill
35
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 88:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 822 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..822
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 88:
97
98
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 89:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 273 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 89:
99
100
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 90:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 38 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 90:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AAAGTGGAAG TTTTTGAATT CCAAGCTGCA GTTTTTTT
\hfill
38
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 91:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 822 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..822
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 91:
\vskip1.000000\baselineskip
101
102
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 92:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 273 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 92:
103
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 93:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 35 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 93:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TAAAGTTGAA GTGCCTGCAT TCCCAAGCTGC AGTTT
\hfill
35
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 94:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 819 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..819
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 94:
\vskip1.000000\baselineskip
104
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 95:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 273 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 95:
\vskip1.000000\baselineskip
106
107
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 96:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 31 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 96:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CCCCAGATTT TGAAATCTTG CTTAAAACAA C
\hfill
31
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 97:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 822 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..822
\vskip0.500000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 97:
108
109
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 98:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 273 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA SEQ ID NO: 98:
\vskip1.000000\baselineskip
110
111
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 99:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 32 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 99:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CAAGTCTGGT TCCAATTTGC TCTTGTTATT AT
\hfill
32
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 100:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 822 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICAS:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..822
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 100:
112
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
113
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO:101:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 273 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA SEQ ID NO: 101:
\vskip1.000000\baselineskip
114
115
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 102:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 41 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 102:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTTAAAGTGC TAGTACTGTC ATTCCAAGCT GCAGTTTTTT T
\hfill
41
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 103:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA SEQ ID NO: 103:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 822 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..822
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 103:
\vskip1.000000\baselineskip
116
117
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 104:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 273 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 104:
118
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 105:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 39 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 105:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TGCAGATGTA ATCCCATCCG CCATTTTTAA AGCGTTTTT
\hfill
39
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 106:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1401 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..1401
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 106:
\vskip1.000000\baselineskip
119
120
121
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 107:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 466 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 107:
\vskip1.000000\baselineskip
122
123
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 108:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 36 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: sencilla
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 108:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GCTGCTAACA TTTTGCTTAG GTTTTTTGG ACTTTC
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID NO: 109:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1401 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..1401
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 109:
\vskip1.000000\baselineskip
124
125
126
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 110:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 466 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 110:
\vskip1.000000\baselineskip
127
128
129
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 111:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1720 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..1719
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 111:
\vskip1.000000\baselineskip
130
131
132
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 112:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 573 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 112:
133
134
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 113:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1180 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..1179
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA SEQ ID NO: 113:
\vskip1.000000\baselineskip
135
136
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 114:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 393 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 114:
137
138
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 115:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1363 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1.. 1362
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 115:
\vskip1.000000\baselineskip
139
140
141
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 116:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 454 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 116:
\vskip1.000000\baselineskip
142
143
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 117:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1141 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..1140
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 117:
\vskip1.000000\baselineskip
144
145
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 118:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 380 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 118:
146
147
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 119:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1324 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..1323
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 119:
\vskip1.000000\baselineskip
148
149
150
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 120:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 441 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 120:
\vskip1.000000\baselineskip
151
152
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 121:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1765 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..1764
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 121:
\vskip1.000000\baselineskip
153
154
155
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 122:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 588 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 122:
\vskip1.000000\baselineskip
156
157
158
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 123:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 704 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 123
\vskip1.000000\baselineskip
159
160
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 124:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 704 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 124:
161
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 125:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 704 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 125:
162
163
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 126:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 704 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 126:
164
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 127:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1011 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..1011
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 127:
165
166
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 128:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 336 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 128:
167
168
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 129:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1008 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 129:
\vskip1.000000\baselineskip
169
170
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 130:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1008 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 130:
\vskip1.000000\baselineskip
171
172
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 131:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1008 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 131:
173
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 132:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 822 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 132:
174
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 133:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 822 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 133:
\vskip1.000000\baselineskip
175
176
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 134:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICA DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 822 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 134:
\vskip1.000000\baselineskip
177
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 135:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 821 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 135:
178
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 136:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 821 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 136:
\vskip1.000000\baselineskip
179
180
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 137:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 825 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..825
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 137:
\vskip1.000000\baselineskip
181
182
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 138:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 274 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 138:
183
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 139:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 822 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..822
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA SEQ ID NO: 139:
184
185
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 140:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 273 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 140:
\vskip1.000000\baselineskip
186
187
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 141:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 822 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..822
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 141:
188
189
\newpage
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 142:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 273 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 142:
\vskip1.000000\baselineskip
190
191
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 143:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 822 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
TIPO DE CADENA: doble
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: ADN (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
CARACTERÍSTICA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE/CLAVE: CDS
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
LOCALIZACIÓN: 1..822
\vskip0.500000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 143:
\vskip1.000000\baselineskip
192
193
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA SEQ ID NO: 144:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE LA SECUENCIA
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 273 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE LA SECUENCIA: SEQ ID NO: 144:
\vskip1.000000\baselineskip
194
195

Claims (9)

1. Una proteína quimérica, producida de modo recombinante, que comprende dos polipéptidos derivados de la proteína de la superficie exterior A o de la proteína de la superficie exterior B procedente de diferentes cepas de Borrelia causantes de la enfermedad de Lyme, en donde el primer polipéptido comprende la proteína de la superficie exterior A o B desde el extremo N hasta e incluido un triptófano conservado, y el segundo polipéptido comprende la proteína de la superficie exterior A o B desde el triptófano conservado hasta el extremo C de la proteína, en donde dicho primer polipéptido y dicho segundo polipéptido proceden de diferentes cepas de Borrelia causantes de la enfermedad de Lyme, y en donde la secuencia de aminoácidos de dicha proteína quimérica no es la misma que la secuencia de aminoácidos de la proteína de la superficie exterior A o B de las que se obtienen dicho primer polipéptido y dicho segundo polipéptido, y en donde cada polipéptido conserva una antigenicidad en la proteína quimérica.
2. La proteína quimérica de la reivindicación 1, en donde:
a)
el primer polipéptido comprende la proteína de la superficie exterior A o B desde el extremo N hasta e incluido un triptófano conservado, en donde dicho primer polipéptido incluye regiones hipervariables de la proteína de la superficie exterior A que comprende los residuos 120 a 140, los residuos 150 a 180 y los residuos 200 a 217, y
b)
el segundo polipéptido comprende la proteína de la superficie exterior A o la proteína de la superficie exterior B desde el triptófano conservado hasta el extremo C de la proteína;
en donde la cepa de Borrelia causante de la enfermedad de Lyme se obtiene a partir de al menos uno del grupo que consiste en: una cualquiera de dichas regiones hipervariables y dicho segundo polipéptido difiere de la cepa de Borrelia que causa la enfermedad de Lyme de la que se obtiene el resto de dicho primer polipéptido,
en donde la región variable que comprende los residuos 200 a 217 y dicho segundo polipéptido proceden de diferentes cepas de Borrelia causantes de la enfermedad de Lyme, y en donde la secuencia de aminoácidos de dicha proteína quimérica no es la misma que la secuencia de aminoácidos de cualquier proteína de la superficie exterior A o B de la que se obtienen dicho primer polipéptido y dicho segundo polipéptido, y
en donde la proteína quimérica conserva antigenicidad representativa de la proteína OspA o B de las cepas de Borrelia parentales.
3. La proteína quimérica de la reivindicación 2, en la que los primero y segundo dominios hipervariables se derivan de la proteína de la superficie exterior A procedente de diferentes cepas de Borrelia burgdorferi.
4. La secuencia de ácidos nucleicos que codifica una proteína quimérica, producida de modo recombinante, que comprende los polipéptidos derivados de la proteína de la superficie exterior A o de la proteína de la superficie exterior B procedente de diferentes cepas de Borrelia causantes de la enfermedad de Lyme, en donde el primer polipéptido comprende la proteína de la superficie exterior A o B desde el extremo N hasta e incluido un triptófano conservado, y el segundo polipéptido comprende la proteína de la superficie exterior A o B desde el triptófano conservado hasta el extremo C de la proteína, en donde dicho primer polipéptido y dicho segundo polipéptido son de diferentes cepas de Borrelia causantes de la enfermedad de Lyme, y en donde la secuencia de aminoácidos de dicha proteína quimérica no es la misma que la secuencia de aminoácidos de la proteína de la superficie exterior A o B de la que se obtienen dicho primer polipéptido y dicho segundo polipéptido, y en donde cada polipéptido conserva antigenicidad en la proteína quimérica.
5. La secuencia de ácidos nucleicos de la reivindicación 4, en donde:
a)
el primer polipéptido comprende la proteína de la superficie exterior A o B desde el extremo N hasta e incluido un triptófano conservado, en donde dicho primer polipéptido incluye regiones hipervariables de la proteína de la superficie exterior A que comprende los residuos 120 a 140, los residuos 150 a 180 y los residuos 200 a 217, y
b)
el segundo polipéptido comprende la proteína de la superficie exterior A o la proteína de la superficie exterior B desde el triptófano conservado hasta el extremo C de la proteína;
en donde la cepa de Borrelia causante de la enfermedad de Lyme se obtiene a partir de al menos uno del grupo que consiste en: una cualquiera de dichas regiones hipervariables y dicho segundo polipéptido difiere de la cepa de Borrelia que causa la enfermedad de Lyme de la que se obtiene el resto de dicho primer polipéptido,
y en donde la región hipervariable que comprende los residuos 200 a 217 y dicho segundo polipéptido proceden de diferentes cepas de Borrelia causantes de la enfermedad de Lyme, y en donde la secuencia de aminoácidos de dicha proteína quimérica no es la misma que la secuencia de aminoácidos de cualquier proteína de la superficie exterior A o B de la que se obtienen dicho primer polipéptido y dicho segundo polipéptido y en donde la proteína quimérica conserva antigenicidad representativa de la proteína OspA o B de las cepas de Borrelia parentales.
6. La secuencia de ácidos nucleicos de la reivindicación 5, en la que los primero y segundo dominios hipervariables se derivan de la proteína de la superficie exterior A procedente de diferentes cepas de Borrelia burgdorferi.
7. Una secuencia de ácidos nucleicos que tiene una secuencia seleccionada del grupo que consiste: SEQ ID NO. 85, SEQ ID NO. 88, SEQ ID NO. 91, SEQ ID NO. 94, SEQ ID NO. 97, SEQ ID NO. 100, SEQ ID NO. 103, SEQ ID NO. 106, SEQ ID NO. 109, SEQ ID NO. 111, SEQ ID NO. 113, SEQ ID NO. 115, SEQ ID NO. 117, SEQ ID NO. 119, SEQ ID NO. 121, SEQ ID NO. 137, SEQ ID NO. 139, SEQ ID NO. 141 y SEQ ID NO. 143, o una proteína que tiene una secuencia de aminoácidos seleccionada de los grupos que consisten en SEQ ID NO. 86, SEQ ID NO. 89, SEQ ID NO. 92, SEQ ID NO. 95, SEQ ID NO. 98, SEQ ID NO. 101, SEQ ID NO. 104, SEQ ID NO. 107, SEQ ID NO. 110, SEQ ID NO. 112, SEQ ID NO. 114, SEQ ID NO. 116, SEQ ID NO. 118, SEQ ID NO. 120, SEQ ID NO. 122, SEQ ID NO. 138, SEQ ID NO. 140, SEQ ID NO. 142 y SEQ ID NO. 144.
8. Una proteína quimérica, producida de modo recombinante, de acuerdo con una cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3 y 7, para uso en la terapia o diagnosis, por ejemplo en calidad de una vacuna contra una infección por Borrelia burgdorferi, en ensayos inmunodiagnósticos para detectar la presencia de anticuerpos contra Borrelia burgdorferi o para medir la reactividad de células T, siendo el ensayo inmunodiagnóstico, por ejemplo, una mancha por punto, transferencia Western, ELISA o ensayo de aglutinación.
9. Uso de la proteína quimérica de acuerdo con una cualquiera de las revindicaciones 1 a 3 y 7 o la secuencia de ácidos nucleicos de una cualquiera de las reivindicaciones 4 a 7, para la preparación de un compuesto para uso en la terapia o diagnosis, por ejemplo en calidad de una vacuna contra una infección por Borrelia burgdorferi, en ensayos inmunodiagnósticos para detectar la presencia de anticuerpos contra Borrelia burgdorferi o para medir la reactividad de células T, siendo el ensayo inmunodiagnóstico, por ejemplo, un borrón por puntos, transferencia Western, ELISA o ensayo de aglutinación.
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