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CN118317795A - 用在治疗化疗耐药性癌症的方法中的抗体-药物偶联物 - Google Patents

用在治疗化疗耐药性癌症的方法中的抗体-药物偶联物 Download PDF

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CN118317795A
CN118317795A CN202280076130.6A CN202280076130A CN118317795A CN 118317795 A CN118317795 A CN 118317795A CN 202280076130 A CN202280076130 A CN 202280076130A CN 118317795 A CN118317795 A CN 118317795A
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antibody
amino acid
drug
cancer
acid sequence
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长濑翔太郎
齐藤智枝美
铃木宏和
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Daiichi Sankyo Co Ltd
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Daiichi Sankyo Co Ltd
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Abstract

本公开涉及使用ADC治疗癌症的治疗方法的领域。本公开还涉及用于治疗癌症的包含ADC的药物产品的领域。更具体地，所述ADC由经由连接子与拓扑异构酶I抑制剂连接的抗钙粘蛋白‑6(CDH6)抗体组成，并且所述癌症可能对化疗具有耐药性。

Description

用在治疗化疗耐药性癌症的方法中的抗体-药物偶联物
对相关申请的交叉引用
本申请要求2021年9月15日提交的美国临时专利申请No.63/244,458的优先权和利益。该申请的内容整体经此引用并入本文。
关于序列表的声明
与本申请相关的序列表以文本格式代替纸质副本提供，并经此引用并入本说明书。含有序列表的文本文件的名称是098065-0296_SL.txt。文本文件的大小为～112kb，创建于2021年9月9日，并经由EFS-Web以电子方式提交。
技术领域
本公开涉及治疗方法、抗体-药物偶联物(ADC)的用途、用于治疗癌症的ADC药物产品等领域。
背景
钙粘蛋白是存在于细胞膜表面上的糖蛋白，并通过其N-末端胞外结构域的钙离子依赖性结合而充当细胞-细胞粘附分子，或充当负责细胞-细胞相互作用的信号分子。经典钙粘蛋白属于钙粘蛋白超家族，并且是由五个胞外结构域(EC结构域)、一个跨膜区和胞内结构域组成的单次跨膜蛋白。经典钙粘蛋白根据其氨基酸序列的同源性分类为以E-钙粘蛋白和N-钙粘蛋白为代表的I型家族和II型家族。
钙粘蛋白-6(CDH6)是由790个氨基酸组成的单次跨膜蛋白，其被分类为II型钙粘蛋白家族，并且这种蛋白具有N-末端胞外结构域和C-末端胞内结构域。在1995年首次克隆了人CDH6基因(非专利文献1)，并且其序列可以参考例如登录号NM_004932和NP_004923(NCBI)。
CDH6在发育阶段在脑或肾中特异性表达，并且已被报道在中枢神经系统的回路形成(非专利文献2和3)和肾中的肾单位发育(非专利文献4和5)中起到重要作用。CDH6在成人正常组织中的表达局限于肾小管、胆管上皮细胞等。
同时，已知CDH6在一些类型的成人癌症中在肿瘤部位特异性过表达。关于人肾细胞癌，特别是肾透明细胞癌，已经报道了CDH6表达与不良预后的相关性及其作为肿瘤标志物的适用性(非专利文献6和7)。关于人卵巢癌也报道了CDH6的高表达(非专利文献8)。还已经报道了CDH6参与人甲状腺癌的上皮-间充质转化(非专利文献9)。此外，已经报道了CDH6也在人胆管癌和人小细胞肺癌中表达(非专利文献12和13)。
癌症在死亡原因中排名靠前。尽管癌症患者的数量预期随着人口老龄化而增加，但治疗需求尚未得到充分满足。常规化疗药物的问题在于：由于它们的选择性低，这些化疗药物不仅对肿瘤细胞有毒性，而且对正常细胞也有毒性，因此具有不良反应；化疗药物无法以足够的量施用，因此无法充分发挥其效果。因此，近年来，已经开发出更高选择性的分子靶向药物或抗体药物，其靶向在癌细胞中表现出突变或高表达特征的分子，或参与细胞恶性转化的特异性分子。
此外，还有一个主要问题在于，用常规化疗药物(如铂类化疗)进行的普通癌症治疗经常导致出现对一种或多种化疗药物耐药的癌细胞。化疗耐药性癌细胞引起癌症的再发或复发，这是癌症扩散的原因。
抗体在血液中高度稳定，并且特异性结合至它们的靶抗原。由于这些原因，预计不良反应减少，并且已经针对在癌细胞表面上高度表达的分子开发出大量抗体药物。依赖于抗体的抗原特异性结合能力的技术之一是使用抗体-药物偶联物(ADC)。ADC是一种偶联物，其中与癌细胞表面上表达的抗原结合并且可以通过该结合将抗原内化到细胞中的抗体偶联至具有细胞毒性活性的药物。ADC可以将药物高效递送至癌细胞，从而有望通过将药物积聚在癌细胞中来杀死癌细胞(非专利文献10和专利文献1和2)。关于ADC，例如，包含与一甲基澳瑞他汀(monomethyl auristatinE)偶联的抗CD30单克隆抗体的Adcetris(TM)(brentuximab vedotin)已被批准作为霍奇金淋巴瘤和间变性大细胞淋巴瘤的治疗药物。此外，包含与emtansine偶联的抗HER2单克隆抗体的Kadcyla(TM)(恩美曲妥珠单抗(trastuzumab emtansine))用于治疗HER2阳性的进行性或复发性乳腺癌。
适用于作为抗肿瘤药物的ADC的靶抗原的特征在于：该抗原在癌细胞的表面上特异性高度表达，但在正常细胞中表达低或不表达；该抗原可以内化到细胞中；该抗原不从细胞表面分泌；等等。抗体的内化能力取决于靶抗原和抗体的性质。难以由靶标的分子结构预测适于内化的抗原结合位点，或难以由抗体的结合强度、物理性质等预测具有高内化能力的抗体。因此，开发具有高效力的ADC的重要挑战是获得对靶抗原具有高内化能力的抗体(非专利文献11)。
包含与特异性结合至CDH6的EC结构域5(EC5)的抗CDH6抗体偶联的DM4的ADC被称为靶向CDH6的ADC(专利文献3、非专利文献14和15)。
引文清单
专利文献
专利文献1:WO2014/057687
专利文献2:US2016/0297890
专利文献3:WO2016/024195
专利文献4:WO2018/212136
非专利文献
非专利文献1:Shimoyama Y等人,Cancer Research,2206-2211,55,1995年5月15日
非专利文献2:Inoue T等人,Developmental Biology,183-194,1997
非专利文献3:Osterhout J A等人,Neuron,632-639,71,2011年8月25日
非专利文献4:Cho E A等人,Development,803-812,125,1998
非专利文献5:Mah S P等人,Developmental Biology,38-53,223,2000
非专利文献6:Paul R等人,Cancer Research,2741-2748,1997年7月1日,57
非专利文献7:Shimazui T等人,Cancer,963-968,101(5),2004年9月1日
非专利文献8:Koebel M等人,PLoS Medicine,1749-1760,5(12),e232,2008年12月
非专利文献9:Gugnoni M等人,Oncogene,667-677,36,2017
非专利文献10:Polakis P.,Pharmacological Reviews,3-19,68,2016
非专利文献11:Peters C等人,Bioscience Reports,1-20,35,2015
非专利文献12:Goeppert B等人,Epigenetics,780-790,11(11),2016
非专利文献13:Yokoi S等人,American Journal of Pathology,207-216,161,1,2002
非专利文献14:Bialucha等人,Cancer Discovery,1030-1045,7,9.2017.
非专利文献15:等人,Oncology Research and Treatment,547-556,44,10,2021.
发明概述
技术问题
本公开的一个目的是提供使用ADC治疗癌症的治疗方法、用于治疗癌症的包含ADC的药物产品等。更具体地，该ADC由经由连接子与拓扑异构酶I抑制剂，如依喜替康衍生物连接的抗钙粘蛋白-6(CDH6)抗体组成，并且该癌症可能对化疗具有耐药性。
对问题的解决方案
本发明人已经为了实现上述目的进行了深入研究，并且令人惊讶地发现，本公开的AD表现出优异的抗肿瘤效果和安全性。更具体地，本发明人已经发现，其抗体特异性结合至胞外结构域3(在本说明书中也称为EC3)的抗CDH6抗体-药物偶联物表现出优异的抗肿瘤效果和安全性。
本公开包括本发明的以下方面：
[1]用于治疗癌症的治疗方法，所述方法包括向有需要的受试者施用抗体-药物偶联物(ADC)。
[2]根据[1]的治疗方法，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)具有由下式表示的结构：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子。
[3]根据[1]或[2]的治疗方法，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)是抗CDH6抗体-药物偶联物。
[4]根据[1]至[3]任一项的治疗方法，其中所述癌症选自肾细胞癌、卵巢癌、间皮瘤、甲状腺癌、子宫癌、胆管癌、胰腺癌、非小细胞肺癌、宫颈癌、脑肿瘤、头颈癌、肉瘤、骨肉瘤、小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。
[5]根据[1]至[3]任一项的治疗方法，其中所述癌症选自卵巢癌、非小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。
[6]根据[1]至[3]任一项的治疗方法，其中所述癌症是卵巢癌。
[7]根据[6]的治疗方法，其中所述卵巢癌选自上皮性卵巢癌、输卵管癌或原发性腹膜癌。
[8]根据[6]或[7]的治疗方法，其中所述卵巢癌是转移性的。
[9]根据[1]至[8]任一项的治疗方法，其中所述抗体是包含选自以下组合(1)至(4)的任一组合的轻链和重链的抗体，或所述抗体的功能片段：
(1)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，
(2)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，
(3)由SEQ ID NO:65中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，和
(4)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链。
[10]根据[1]至[9]任一项的治疗方法，其中所述抗体是包含由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
[11]根据[1]至[9]任一项的治疗方法，其中所述抗体是包含由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
[12]根据[1]至[11]任一项的治疗方法，其中所述重链或所述轻链已经经过选自以下的一种或多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
[13]根据[1]至[11]任一项的治疗方法，其中所述重链或所述轻链已经经过选自以下的两种或更多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
[14]根据[1]至[13]任一项的治疗方法，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在1至10的范围内。
[15]根据[1]至[14]任一项的治疗方法，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在2至8的范围内。
[16]根据[1]至[14]任一项的治疗方法，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在5至8的范围内。
[17]根据[1]至[14]任一项的治疗方法，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在7至8的范围内。
[18]根据[1]至[17]任一项的治疗方法，其中所述癌症包含一种或多种表达CDH6的肿瘤。
[19]根据[1]至[18]任一项的治疗方法，其中所述受试者具有用包含铂类药物的化疗方案治疗的历史。
[20]根据[1]至[18]任一项的治疗方法，其中所述受试者具有用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗的历史。
[21]根据[1]至[20]任一项的治疗方法，其中所述受试者先前已经用包含铂类药物的化疗方案治疗。
[22]根据[1]至[20]任一项的治疗方法，其中所述受试者先前已经用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗。
[23]根据[1]至[22]任一项的治疗方法，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)与一种或多种化疗药物同时或在不同时间组合施用.
[24]根据[23]的治疗方法，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)在所述一种或多种化疗药物之后施用。
[25]根据[23]的治疗方法，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)和所述一种或多种化疗药物分开作为活性成分包含在不同制剂中并同时或在不同时间施用。
[26]根据[23]的治疗方法，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)和所述一种或多种化疗药物一起作为活性成分包含在同一制剂中并同时施用。
[27]根据[23]至[26]任一项的治疗方法，其中所述一种或多种化疗药物是抗代谢物、铂类药物、紫杉烷、或铂类药物和紫杉烷。
[28]根据[1]至[27]任一项的治疗方法，其中所述受试者已经在用包含铂类药物的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)、部分缓解(PR)或疾病稳定(SD)。
[29]根据[1]至[27]任一项的治疗方法，其中所述受试者已经在用包含铂类药物的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)或部分缓解(PR)。
[30]根据[1]至[27]任一项的治疗方法，其中所述受试者已经在用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)、部分缓解(PR)或疾病稳定(SD)。
[31]根据[1]至[27]任一项的治疗方法，其中所述受试者已经在用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)或部分缓解(PR)。
[32]根据[1]至[31]任一项的治疗方法，其中所述受试者具有对铂类化疗耐药的癌症。
[33]根据[1]至[32]任一项的治疗方法，其中所述受试者具有对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案耐药的癌症。
[34]根据[1]至[33]任一项的治疗方法，其中所述受试者在施用所述ADC之前表现出癌症复发。
[35]根据[34]的治疗方法，其中所述癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的不到大约六个月或大约六个月内发生。
[36]根据[34]的治疗方法，其中所述癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的不到大约六个月或大约六个月内发生。
[37]根据[34]的治疗方法，其中所述癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的大约六个月或之后发生。
[38]根据[34]的治疗方法，其中所述癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的大约六个月或之后发生。
[39]根据[1]至[38]任一项的治疗方法，其中向受试者施用所述ADC与第二药物。
[40]根据[39]的治疗方法，其中所述ADC在第二药物之前施用。
[41]根据[39]的治疗方法，其中所述ADC在第二药物之后施用。
[42]根据[39]的治疗方法，其中所述ADC与第二药物同时施用。
[43]用于治疗癌症的治疗方法，所述方法包括向具有对铂类化疗耐药的卵巢癌和/或在施用所述药物组合物之前表现出卵巢癌复发的受试者施用药物组合物，其中所述药物组合物包含具有由下式表示的结构的抗体-药物偶联物(ADC)：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO:87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列。
[44]用于治疗癌症的治疗方法，所述方法包括向具有卵巢癌并且先前已经用包含铂类药物、紫杉烷或铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗的受试者施用药物组合物，其中所述药物组合物包含具有由下式表示的结构的抗体-药物偶联物(ADC)：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO:87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列。
[45]根据[1]至[44]任一项的治疗方法，所述方法包括使用来源于试验受试者的生物样品以检测所述生物样品中存在或不存在CDH6和向检测到CDH6的试验受试者施用药物组合物。
[46]根据[1]至[45]任一项的治疗方法，其中所述癌症已对包含铂类药物的化疗方案获得耐药性。
[47]根据[1]至[45]任一项的治疗方法，其中所述癌症已对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案获得耐药性。
[48]根据[1]至[47]任一项的治疗方法，其中所述抗代谢物是吉西他滨。
[49]根据[1]至[47]任一项的治疗方法，其中所述铂类药物是卡铂。
[50]根据[1]至[47]任一项的治疗方法，其中所述铂类药物是卡铂并且所述紫杉烷是紫杉醇(paclitaxel)。
[51]癌症治疗剂，其包含如本文公开的抗体-药物偶联物(ADC)。
[52]根据[51]的治疗剂，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)具有由下式表示的结构：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子。
[53]根据[51]或[52]的治疗剂，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)是抗CDH6抗体-药物偶联物。
[54]根据[51]至[53]任一项的治疗剂，其中所述癌症选自肾细胞癌、卵巢癌、间皮瘤、甲状腺癌、子宫癌、胆管癌、胰腺癌、非小细胞肺癌、宫颈癌、脑肿瘤、头颈癌、肉瘤、骨肉瘤、小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。
[55]根据[51]至[53]任一项的治疗剂，其中所述癌症选自卵巢癌、非小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。
[56]根据[51]至[53]任一项的治疗剂，其中所述癌症是卵巢癌。
[57]根据[56]的治疗剂，其中所述卵巢癌选自上皮性卵巢癌、输卵管癌或原发性腹膜癌。
[58]根据[56]或[57]的治疗剂，其中所述卵巢癌是转移性的。
[59]根据[51]至[58]任一项的治疗剂，其中所述抗体是包含选自以下组合(1)至(4)的任一组合的轻链和重链的抗体，或所述抗体的功能片段：
(1)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，
(2)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，
(3)由SEQ ID NO:65中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，和
(4)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链。
[60]根据[51]至[59]任一项的治疗剂，其中所述抗体是包含由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
[61]根据[51]至[59]任一项的治疗剂，其中所述抗体是包含由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ IDNO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
[62]根据[51]至[61]任一项的治疗剂，其中所述重链或所述轻链已经经过选自以下的一种或多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
[63]根据[51]至[61]任一项的治疗剂，其中所述重链或所述轻链已经经过选自以下的两种或更多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
[64]根据[51]至[63]任一项的治疗剂，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在1至10的范围内。
[65]根据[51]至[64]任一项的治疗剂，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在2至8的范围内。
[66]根据[51]至[64]任一项的治疗剂，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在5至8的范围内。
[67]根据[51]至[64]任一项的治疗剂，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在7至8的范围内。
[68]根据[51]至[67]任一项的治疗剂，其中所述癌症包含一种或多种表达CDH6的肿瘤。
[69]根据[51]至[68]任一项的治疗剂，其中所述受试者具有用包含铂类药物的化疗方案治疗的历史。
[70]根据[51]至[68]任一项的治疗剂，其中所述受试者具有用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗的历史。
[71]根据[51]至[70]任一项的治疗剂，其中所述受试者先前已经用包含铂类药物的化疗方案治疗。
[72]根据[51]至[70]任一项的治疗剂，其中所述受试者先前已经用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗。
[73]根据[51]至[72]任一项的治疗剂，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)与一种或多种化疗药物同时或在不同时间组合施用。
[74]根据[73]的治疗剂，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)在所述一种或多种化疗药物之后施用。
[75]根据[73]的治疗剂，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)和所述一种或多种化疗药物分开作为活性成分包含在不同制剂中并同时或在不同时间施用。
[76]根据[73]的治疗剂，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)和所述一种或多种化疗药物一起作为活性成分包含在同一制剂中并同时施用。
[77]根据[73]至[76]任一项的治疗剂，其中所述一种或多种化疗药物是抗代谢物、铂类药物、紫杉烷、或铂类药物和紫杉烷。
[78]根据[51]至[77]任一项的治疗剂，其中所述受试者已经在用包含铂类药物的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)、部分缓解(PR)或疾病稳定(SD)。
[79]根据[51]至[77]任一项的治疗剂，其中所述受试者已经在用包含铂类药物的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)或部分缓解(PR)。
[80]根据[51]至[77]任一项的治疗剂，其中所述受试者已经在用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)、部分缓解(PR)或疾病稳定(SD)。
[81]根据[51]至[77]任一项的治疗剂，其中所述受试者已经在用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)或部分缓解(PR)。
[82]根据[51]至[81]任一项的治疗剂，其中所述受试者具有对铂类化疗耐药的癌症。
[83]根据[51]至[82]任一项的治疗剂，其中所述受试者具有对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案耐药的癌症.
[84]根据[51]至[83]任一项的治疗剂，其中所述受试者在施用所述ADC之前表现出癌症复发。
[85]根据[84]的治疗剂，其中所述癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的不到大约六个月或大约六个月内发生。
[86]根据[84]的治疗剂，其中所述癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的不到大约六个月或大约六个月内发生。
[87]根据[84]的治疗剂，其中所述癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的大约六个月或之后发生。
[88]根据[84]的治疗剂，其中所述癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的大约六个月或之后发生。
[89]根据[51]至[88]任一项的治疗剂，其中向受试者施用所述ADC与第二药物。
[90]根据[89]的治疗剂，其中所述ADC在第二药物之前施用。
[91]根据[89]的治疗剂，其中所述ADC在第二药物之后施用。
[92]根据[89]的治疗剂，其中所述ADC与第二药物同时施用。
[93]癌症治疗剂，所述治疗剂包含用于向具有对铂类化疗耐药的卵巢癌和/或在施用所述药物组合物之前表现出卵巢癌复发的受试者施用的药物组合物，其中所述药物组合物包含具有由下式表示的结构的抗体-药物偶联物(ADC)：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO:87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列。
[94]用于治疗癌症的治疗剂，所述治疗剂包含用于向具有卵巢癌并且先前已经用包含铂类药物、紫杉烷或铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗的受试者施用的药物组合物，其中所述药物组合物包含具有由下式表示的结构的抗体-药物偶联物(ADC)：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO:87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列。
[95]根据[51]至[94]任一项的治疗剂，其中使用来源于试验受试者的生物样品检测所述生物样品中存在或不存在CDH6，然后向检测到CDH6的试验受试者施用所述药物组合物。
[96]根据[51]至[95]任一项的治疗剂，其中所述癌症已对包含铂类药物的化疗方案获得耐药性。
[97]根据[51]至[95]任一项的治疗剂，其中所述癌症已对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案获得耐药性。
[98]根据[51]至[97]任一项的治疗剂，其中所述抗代谢物是吉西他滨。
[99]根据[51]至[97]任一项的治疗剂，其中所述铂类药物是卡铂。
[100]根据[51]至[97]任一项的治疗剂，其中所述铂类药物是卡铂并且所述紫杉烷是紫杉醇(paclitaxel)。
[101]如本文公开的抗体-药物偶联物(ADC)，其用于治疗癌症。
[102]根据[101]的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)具有由下式表示的结构：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子。
[103]根据[101]或[102]的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)是抗CDH6抗体-药物偶联物。
[104]根据[101]至[103]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述癌症选自肾细胞癌、卵巢癌、间皮瘤、甲状腺癌、子宫癌、胆管癌、胰腺癌、非小细胞肺癌、宫颈癌、脑肿瘤、头颈癌、肉瘤、骨肉瘤、小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。
[105]根据[101]至[103]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述癌症选自卵巢癌、非小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。
[106]根据[101]至[103]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述癌症是卵巢癌。
[107]根据[106]的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述卵巢癌选自上皮性卵巢癌、输卵管癌或原发性腹膜癌。
[108]根据[106]或[107]的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述卵巢癌是转移性的。
[109]根据[101]至[108]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述抗体是包含选自以下组合(1)至(4)的任一组合的轻链和重链的抗体，或所述抗体的功能片段：
(1)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，
(2)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，
(3)由SEQ ID NO:65中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，和
(4)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链。
[110]根据[101]至[109]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述抗体是包含由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
[111]根据[101]至[109]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述抗体是包含由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
[112]根据[101]至[111]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述重链或所述轻链已经经过选自以下的一种或多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
[113]根据[101]至[111]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述重链或所述轻链已经经过选自以下的两种或更多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
[114]根据[101]至[113]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在1至10的范围内。
[115]根据[101]至[114]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在2至8的范围内。
[116]根据[101]至[114]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在5至8的范围内。
[117]根据[101]至[114]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在7至8的范围内。
[118]根据[101]至[117]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述癌症包含一种或多种表达CDH6的肿瘤。
[119]根据[101]至[118]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述受试者具有用包含铂类药物的化疗方案治疗的历史。
[120]根据[101]至[118]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述受试者具有用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗的历史。
[121]根据[101]至[120]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述受试者先前已经用包含铂类药物的化疗方案治疗。
[122]根据[101]至[120]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述受试者先前已经用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗。
[123]根据[101]至[122]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)与一种或多种化疗药物同时或在不同时间组合施用。
[124]根据[123]的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)在所述一种或多种化疗药物之后施用。
[125]根据[123]的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)和所述一种或多种化疗药物分开作为活性成分包含在不同制剂中并同时或在不同时间施用。
[126]根据[123]的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)和所述一种或多种化疗药物一起作为活性成分包含在同一制剂中并同时施用。
[127]根据[123]至[126]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述一种或多种化疗药物是抗代谢物、铂类药物、紫杉烷、或铂类药物和紫杉烷。
[128]根据[101]至[127]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述受试者已经在用包含铂类药物的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)、部分缓解(PR)或疾病稳定(SD)。
[129]根据[101]至[127]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述受试者已经在用包含铂类药物的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)或部分缓解(PR)。
[130]根据[101]至[127]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述受试者已经在用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)、部分缓解(PR)或疾病稳定(SD)。
[131]根据[101]至[127]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述受试者已经在用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)或部分缓解(PR)。
[132]根据[101]至[131]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述受试者具有对铂类化疗耐药的癌症。
[133]根据[101]至[132]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述受试者具有对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案耐药的癌症。
[134]根据[101]至[133]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述受试者在施用所述ADC之前表现出癌症复发。
[135]根据[134]的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的不到大约六个月或大约六个月内发生。
[136]根据[134]的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的不到大约六个月或大约六个月内发生。
[137]根据[134]的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的大约六个月或之后发生。
[138]根据[134]的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的大约六个月或之后发生。
[139]根据[101]至[138]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中向受试者施用所述ADC与第二药物。
[140]根据[139]的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述ADC在第二药物之前施用。
[141]根据[139]的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述ADC在第二药物之后施用。
[142]根据[139]的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述ADC与第二药物同时施用。
[143]用于治疗具有对铂类化疗耐药的卵巢癌和/或在施用所述药物组合物之前表现出卵巢癌复发的受试者的癌症的抗体-药物偶联物(ADC)，所述ADC具有由下式表示的结构：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO:87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列。
[144]用于治疗具有卵巢癌并且先前已经用包含铂类药物、紫杉烷或铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗的受试者的癌症的抗体-药物偶联物(ADC)，所述ADC具有由下式表示的结构：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO:87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列。
[145]ADC根据[101]至[144]任一项的ADC，其中使用来源于试验受试者的生物样品检测所述生物样品中存在或不存在CDH6，然后向检测到CDH6的试验受试者施用所述ADC。
[146]根据[101]至[145]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述癌症已对包含铂类药物的化疗方案获得耐药性。
[147]根据[101]至[145]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述癌症已对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案获得耐药性。
[148]根据[101]至[147]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述抗代谢物是吉西他滨。
[149]根据[101]至[147]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述铂类药物是卡铂。
[150]根据[101]至[147]任一项的抗体-药物偶联物(ADC)，其中所述铂类药物是卡铂并且所述紫杉烷是紫杉醇(paclitaxel)。
[151]用于治疗癌症的药物组合物，其包含如本文公开的抗体-药物偶联物(ADC)或其盐作为活性组分，和可药用的制剂组分。
[152]根据[151]的药物组合物，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)具有由下式表示的结构：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子。
[153]根据[151]或[152]的药物组合物，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)是抗CDH6抗体-药物偶联物。
[154]根据[151]至[153]任一项的药物组合物，其中所述癌症选自肾细胞癌、卵巢癌、间皮瘤、甲状腺癌、子宫癌、胆管癌、胰腺癌、非小细胞肺癌、宫颈癌、脑肿瘤、头颈癌、肉瘤、骨肉瘤、小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。
[155]根据[151]至[153]任一项的药物组合物，其中所述癌症选自卵巢癌、非小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。
[156]根据[151]至[153]任一项的药物组合物，其中所述癌症是卵巢癌。
[157]根据[156]的药物组合物，其中所述卵巢癌选自上皮性卵巢癌、输卵管癌或原发性腹膜癌。
[158]根据[156]或[157]的药物组合物，其中所述卵巢癌是转移性的。
[159]根据[151]至[158]任一项的药物组合物，其中所述抗体是包含选自以下组合(1)至(4)的任一组合的轻链和重链的抗体，或所述抗体的功能片段：
(1)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，
(2)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，
(3)由SEQ ID NO:65中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，和
(4)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链。
[160]根据[151]至[159]任一项的药物组合物，其中所述抗体是包含由SEQ IDNO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
[161]根据[151]至[159]任一项的药物组合物，其中所述抗体是包含由SEQ IDNO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
[162]根据[151]至[161]任一项的药物组合物，其中所述重链或所述轻链已经经过选自以下的一种或多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
[163]根据[151]至[161]任一项的药物组合物，其中所述重链或所述轻链已经经过选自以下的两种或更多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
[164]根据[151]至[163]任一项的药物组合物，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在1至10的范围内。
[165]根据[151]至[164]任一项的药物组合物，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在2至8的范围内。
[166]根据[151]至[164]任一项的药物组合物，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在5至8的范围内。
[167]根据[151]至[164]任一项的药物组合物，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在7至8的范围内。
[168]根据[151]至[167]任一项的药物组合物，其中所述癌症包含一种或多种表达CDH6的肿瘤。
[169]根据[151]至[168]任一项的药物组合物，其中所述受试者具有用包含铂类药物的化疗方案治疗的历史。
[170]根据[151]至[168]任一项的药物组合物，其中所述受试者具有用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗的历史。
[171]根据[151]至[170]任一项的药物组合物，其中所述受试者先前已经用包含铂类药物的化疗方案治疗。
[172]根据[151]至[170]任一项的药物组合物，其中所述受试者先前已经用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗。
[173]根据[151]至[172]任一项的药物组合物，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)与一种或多种化疗药物同时或在不同时间组合施用。
[174]根据[173]的药物组合物，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)在所述一种或多种化疗药物之后施用。
[175]根据[173]的药物组合物，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)和所述一种或多种化疗药物分开作为活性成分包含在不同制剂中并同时或在不同时间施用。
[176]根据[173]的药物组合物，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)和所述一种或多种化疗药物一起作为活性成分包含在同一制剂中并同时施用。
[177]根据[173]至[176]任一项的药物组合物，其中所述一种或多种化疗药物是抗代谢物、铂类药物、紫杉烷、或铂类药物和紫杉烷。
[178]根据[173]至[177]任一项的药物组合物，其中所述受试者已经在用包含铂类药物的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)、部分缓解(PR)或疾病稳定(SD)。
[179]根据[173]至[177]任一项的药物组合物，其中所述受试者已经在用包含铂类药物的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)或部分缓解(PR)。
[180]根据[173]至[177]任一项的药物组合物，其中所述受试者已经在用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)、部分缓解(PR)或疾病稳定(SD)。
[181]根据[173]至[177]任一项的药物组合物，其中所述受试者已经在用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)或部分缓解(PR)。
[182]根据[151]至[181]任一项的药物组合物，其中所述受试者具有对铂类化疗耐药的癌症。
[183]根据[151]至[182]任一项的药物组合物，其中所述受试者具有对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案耐药的癌症。
[184]根据[151]至[183]任一项的药物组合物，其中所述受试者在施用所述ADC之前表现出癌症复发。
[185]根据[184]的药物组合物，其中所述癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的不到大约六个月或大约六个月内发生。
[186]根据[184]的药物组合物，其中所述癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的不到大约六个月或大约六个月内发生。
[187]根据[184]的药物组合物，其中所述癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的大约六个月或之后发生。
[188]根据[184]的药物组合物，其中所述癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的大约六个月或之后发生。
[189]根据[151]至[188]任一项的药物组合物，其中向受试者施用所述ADC与第二药物。
[190]根据[189]的药物组合物，其中所述ADC在第二药物之前施用。
[191]根据[189]的药物组合物，其中所述ADC在第二药物之后施用。
[192]根据[189]的药物组合物，其中所述ADC与第二药物同时施用。
[193]用于治疗具有对铂类化疗耐药的卵巢癌和/或在施用所述药物组合物之前表现出卵巢癌复发的受试者的癌症的药物组合物，其中所述药物组合物包含具有由下式表示的结构的抗体-药物偶联物(ADC)：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO:87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列。
[194]用于治疗具有卵巢癌并且先前已经用包含铂类药物、紫杉烷或铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗的受试者的癌症的药物组合物，其中所述药物组合物包含具有由下式表示的结构的抗体-药物偶联物(ADC)：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO:87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列。
[195]根据[151]至[194]任一项的药物组合物，其中使用来源于试验受试者的生物样品检测所述生物样品中存在或不存在CDH6，然后向检测到CDH6的试验受试者施用所述药物组合物。
[196]根据[151]至[195]任一项的药物组合物，其中所述癌症已对包含铂类药物的化疗方案获得耐药性。
[197]根据[151]至[195]任一项的药物组合物，其中所述癌症已对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案获得耐药性。
[198]根据[151]至[197]任一项的药物组合物，其中所述抗代谢物是吉西他滨。
[199]根据[151]至[197]任一项的药物组合物，其中所述铂类药物是卡铂。
[200]根据[151]至[197]任一项的药物组合物，其中所述铂类药物是卡铂并且所述紫杉烷是紫杉醇(paclitaxel)。
[201]如本文公开的抗体-药物偶联物(ADC)在用于治疗癌症的药剂制造中的用途。
[202]根据[201]的用途，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)具有由下式表示的结构：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子。
[203]根据[201]或[202]的用途，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)是抗CDH6抗体-药物偶联物。
[204]根据[201]至[203]任一项的用途，其中所述癌症选自肾细胞癌、卵巢癌、间皮瘤、甲状腺癌、子宫癌、胆管癌、胰腺癌、非小细胞肺癌、宫颈癌、脑肿瘤、头颈癌、肉瘤、骨肉瘤、小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。
[205]根据[201]至[203]任一项的用途，其中所述癌症选自卵巢癌、非小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。
[206]根据[201]至[203]任一项的用途，其中所述癌症是卵巢癌。
[207]根据[206]的用途，其中所述卵巢癌选自上皮性卵巢癌、输卵管癌或原发性腹膜癌。
[208]根据[206]或[207]的用途，其中所述卵巢癌是转移性的。
[209]根据[201]至[208]任一项的用途，其中所述抗体是包含选自以下组合(1)至(4)的任一组合的轻链和重链的抗体，或所述抗体的功能片段：
(1)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，
(2)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，
(3)由SEQ ID NO:65中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，和
(4)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链。
[210]根据[201]至[209]任一项的用途，其中所述抗体是包含由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
[211]根据[201]至[209]任一项的用途，其中所述抗体是包含由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
[212]根据[201]至[211]任一项的用途，其中所述重链或所述轻链已经经过选自以下的一种或多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
[213]根据[201]至[211]任一项的用途，其中所述重链或所述轻链已经经过选自以下的两种或更多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
[214]根据[201]至[213]任一项的用途，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在1至10的范围内。
[215]根据[201]至[214]任一项的用途，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在2至8的范围内。
[216]根据[201]至[214]任一项的用途，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在5至8的范围内。
[217]根据[201]至[214]任一项的用途，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在7至8的范围内。
[218]根据[201]至[217]任一项的用途，其中所述癌症包含一种或多种表达CDH6的肿瘤。
[219]根据[201]至[218]任一项的用途，其中所述受试者具有用包含铂类药物的化疗方案治疗的历史。
[220]根据[201]至[218]任一项的用途，其中所述受试者具有用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗的历史。
[221]根据[201]至[220]任一项的用途，其中所述受试者先前已经用包含铂类药物的化疗方案治疗。
[222]根据[201]至[220]任一项的用途，其中所述受试者先前已经用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗。
[223]根据[201]至[222]任一项的用途，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)与一种或多种化疗药物同时或在不同时间组合施用。
[224]根据[223]的用途，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)在所述一种或多种化疗药物之后施用。
[225]根据[223]的用途，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)和所述一种或多种化疗药物分开作为活性成分包含在不同制剂中并同时或在不同时间施用。
[226]根据[223]的用途，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)和所述一种或多种化疗药物一起作为活性成分包含在同一制剂中并同时施用。
[227]根据[223]至[226]任一项的用途，其中所述一种或多种化疗药物是抗代谢物、铂类药物、紫杉烷、或铂类药物和紫杉烷。
[228]根据[201]至[227]任一项的用途，其中所述受试者已经在用包含铂类药物的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)、部分缓解(PR)或疾病稳定(SD)。
[229]根据[201]至[227]任一项的用途，其中所述受试者已经在用包含铂类药物的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)或部分缓解(PR)。
[230]根据[201]至[227]任一项的用途，其中所述受试者已经在用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)、部分缓解(PR)或疾病稳定(SD)。
[231]根据[201]至[227]任一项的用途，其中所述受试者已经在用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)或部分缓解(PR)。
[232]根据[201]至[231]任一项的用途，其中所述受试者具有对铂类化疗耐药的癌症。
[233]根据[201]至[232]任一项的用途，其中所述受试者具有对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案耐药的癌症。
[234]根据[201]至[233]任一项的用途，其中所述受试者在施用所述ADC之前表现出癌症复发。
[235]根据[234]的用途，其中所述癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的不到大约六个月或大约六个月内发生。
[236]根据[234]的用途，其中所述癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的不到大约六个月或大约六个月内发生。
[237]根据[234]的用途，其中所述癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的大约六个月或之后发生。
[238]根据[234]的用途，其中所述癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的大约六个月或之后发生。
[239]根据[201]至[238]任一项的用途，其中向受试者施用所述ADC与第二药物。
[240]根据[239]的用途，其中所述ADC在第二药物之前施用。
[241]根据[239]的用途，其中所述ADC在第二药物之后施用。
[242]根据[239]的用途，其中所述ADC与第二药物同时施用。
[243]药物组合物用于治疗癌症的用途，所述用途包括向具有对铂类化疗耐药的卵巢癌和/或在施用所述药物组合物之前表现出卵巢癌复发的受试者施用药物组合物，其中所述药物组合物包含具有由下式表示的结构的抗体-药物偶联物(ADC)：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO:87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列。
[244]药物组合物用于治疗癌症的用途，所述用途包括向具有卵巢癌并且先前已经用包含铂类药物、紫杉烷或铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗的受试者施用药物组合物，其中所述药物组合物包含具有由下式表示的结构的抗体-药物偶联物(ADC)：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO:87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列。
[245]根据[201]至[244]任一项的用途，所述用途包括使用来源于试验受试者的生物样品以检测所述生物样品中存在或不存在CDH6和向检测到CDH6的试验受试者施用药物组合物，
[246]根据[201]至[245]任一项的用途，其中所述癌症已对包含铂类药物的化疗方案获得耐药性。
[247]根据[201]至[245]任一项的用途，其中所述癌症已对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案获得耐药性。
[248]根据[201]至[247]任一项的用途，其中所述抗代谢物是吉西他滨。
[249]根据[201]至[247]任一项的用途，其中所述铂类药物是卡铂。
[250]根据[201]至[247]任一项的用途，其中所述铂类药物是卡铂并且所述紫杉烷是紫杉醇(paclitaxel)。
在一些方面，所公开的治疗广泛地涉及用于治疗癌症的治疗用途或方法，所述用途或方法包括向有需要的受试者施用抗体-药物偶联物(ADC)。
在一些方面，抗体-药物偶联物(ADC)具有由下式表示的结构：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子。
在一些方面，抗体-药物偶联物(ADC)是抗CDH6抗体-药物偶联物。
在一些方面，抗体-药物偶联物(ADC)是其抗体特异性结合至胞外结构域3的抗CDH6抗体-药物偶联物。
在一些方面，癌症选自肾细胞癌、卵巢癌、间皮瘤、甲状腺癌、子宫癌、胆管癌、胰腺癌、非小细胞肺癌、宫颈癌、脑肿瘤、头颈癌、肉瘤、骨肉瘤、小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。在一些方面，癌症选自卵巢癌、非小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。在一些方面，癌症是卵巢癌。在一些方面，卵巢癌选自上皮性卵巢癌、输卵管癌或原发性腹膜癌。在一些方面，卵巢癌是转移性的。
在一些方面，抗体是包含选自以下组合(1)至(4)的任一组合的轻链和重链的抗体，或所述抗体的功能片段：(1)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，(2)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，(3)由SEQ ID NO:65中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ IDNO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，和(4)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链。
在一些方面，抗体是包含由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。在一些方面，抗体是包含由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
在一些方面，重链或轻链已经经过选自以下的一种或多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
在一些方面，重链或轻链已经经过选自以下的两种或更多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
在一些方面，每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在1至10的范围内。在一些方面，每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在2至8的范围内。在一些方面，每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在5至8的范围内。在一些方面，每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在7至8的范围内。
在一些方面，癌症包含一种或多种表达CDH6的肿瘤。
在一些方面，受试者具有用包含铂类药物的化疗方案治疗的历史。在一些方面，受试者具有用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗的历史。
在一些方面，受试者先前已经用包含铂类药物的化疗方案治疗。在一些方面，受试者先前已经用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗。
在一些方面，抗体-药物偶联物(ADC)与一种或多种化疗药物同时或在不同时间组合施用。
在一些方面，抗体-药物偶联物(ADC)在所述一种或多种化疗药物之后施用。
在一些方面，在抗体-药物偶联物(ADC)与一种或多种化疗药物组合施用之后施用抗体-药物偶联物(ADC)。
在一些方面，抗体-药物偶联物(ADC)和所述一种或多种化疗药物分开作为活性成分包含在不同制剂中并同时或在不同时间施用。
在一些方面，抗体-药物偶联物(ADC)和所述一种或多种化疗药物一起作为活性成分包含在同一制剂中并同时施用。
在一些方面，所述一种或多种化疗药物是抗代谢物、铂类药物、紫杉烷、或铂类药物和紫杉烷。在一些方面，所述一种或多种化疗药物是抗代谢物。在一些方面，所述一种或多种化疗药物是铂类药物。在一些方面，所述一种或多种化疗药物是铂类药物和紫杉烷。
在一些方面，受试者已经在用包含铂类药物的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)、部分缓解(PR)或疾病稳定(SD)。
在一些方面，受试者已经在用包含铂类药物的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)或部分缓解(PR)。
在一些方面，受试者已经在用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)、部分缓解(PR)或疾病稳定(SD)。
在一些方面，受试者已经在用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)或部分缓解(PR)。
在一些方面，受试者具有对铂类化疗耐药的癌症。在一些方面，受试者具有对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案耐药的癌症。在一些方面，受试者在施用所述ADC之前表现出癌症复发。在一些方面，受试者具有对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案耐药的癌症。
在一些方面，癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的不到大约六个月或大约六个月内发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的不到大约六个月发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的大约六个月内发生。
在一些方面，癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的不到六个月或六个月内发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的不到六个月发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的六个月内发生。
在一些方面，癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的大约六个月或之后发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的大约六个月发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的大约六个月之后发生。
在一些方面，癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的不到大约六个月或大约六个月内发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的不到大约六个月发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的大约六个月内发生。
在一些方面，癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的不到六个月或六个月内发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的不到六个月发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的六个月内发生。
在一些方面，癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的大约六个月或之后发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的大约六个月发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的大约六个月之后发生。
在一些方面，癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的六个月或之后发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的六个月发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的六个月之后发生。
在一些方面，癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的六个月或之后发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的六个月发生。在一些方面，癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的六个月之后发生。
在一些方面，向受试者施用所述ADC与第二药物。在一些方面，所述ADC在第二药物之前施用。在一些方面，所述ADC在第二药物之后施用。在一些方面，所述ADC与第二药物同时施用。
在一些方面，本公开一般涉及用于治疗癌症的治疗方法，所述方法包括向具有对铂类化疗耐药的卵巢癌和/或在施用所述药物组合物之前表现出卵巢癌复发的受试者施用药物组合物，其中所述药物组合物包含具有由下式表示的结构的抗体-药物偶联物(ADC)：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO 87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列。
在一些方面，本公开一般涉及用于治疗癌症的治疗方法，所述方法包括向具有卵巢癌并且先前已经用包含铂类药物、紫杉烷或铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗的受试者施用药物组合物，其中所述药物组合物包含具有由下式表示的结构的抗体-药物偶联物(ADC)：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO:87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列。
在一些方面，本公开一般涉及用于治疗癌症的治疗方法，所述方法包括使用来源于试验受试者的生物样品以检测所述生物样品中存在或不存在CDH6和向检测到CDH6的试验受试者施用药物组合物。
在一些方面，所述癌症已对包含铂类药物的化疗方案获得耐药性。在一些方面，所述癌症已对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案获得耐药性。
在一些方面，抗代谢物是吉西他滨。在一些方面，铂类药物是卡铂。在一些方面，铂类药物是卡铂并且紫杉烷是紫杉醇(paclitaxel)。
本发明包括本发明的以下方面：
[1A]用于治疗癌症的治疗方法，所述方法包括向有需要的受试者施用具有由下式表示的结构抗体-药物偶联物(ADC)：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子。
[2A]根据[1A]的治疗方法，其中所述癌症选自卵巢癌、非小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。
[3A]根据[2A]的治疗方法，其中所述癌症是卵巢癌。
[4A]根据[3A]的治疗方法，其中所述卵巢癌选自上皮性卵巢癌、输卵管癌或原发性腹膜癌。
[5A]根据[3A]的治疗方法，其中所述卵巢癌是转移性的。
[6A]根据[1A]的治疗方法，其中所述抗体是包含选自以下组合(1)至(4)的任一组合的轻链和重链的抗体，或所述抗体的功能片段：
(1)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，
(2)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，
(3)由SEQ ID NO:65中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，和
(4)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链。
[7A]根据[1A]的治疗方法，其中所述抗体是包含由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
[8A]根据[1A]的治疗方法，其中所述抗体是包含由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
[9A]根据[1A]的治疗方法，其中所述重链或所述轻链已经经过选自以下的一种或多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
[10A]根据[1A]的治疗方法，其中所述重链或所述轻链已经经过选自以下的两种或更多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
[11A]根据[1A]的治疗方法，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在1至10的范围内。
[12A]根据[11A]的治疗方法，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在2至8的范围内。
[13A]根据[11A]的治疗方法，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在5至8的范围内。
[14A]根据[11A]的治疗方法，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在7至8的范围内。
[15A]根据[1A]的治疗方法，其中所述癌症包含一种或多种表达CDH6的肿瘤。
[16A]根据[1A]的治疗方法，其中所述受试者具有对铂类化疗耐药的癌症。
[17A]根据[1A]的治疗方法，其中所述受试者在施用所述ADC之前表现出癌症复发。
[18A]根据[1A]的治疗方法，其中所述受试者具有对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案耐药的癌症。
[19A]根据[17A]的治疗方法，其中所述癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的大约六个月内发生。
[20A]根据[17A]的治疗方法，其中所述癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的大约六个月内发生。
[21A]根据[1A]的治疗方法，其中向受试者施用所述ADC与第二药物。
[22A]根据[21A]的治疗方法，其中所述ADC在第二药物之前施用。
[23A]根据[21A]的治疗方法，其中所述ADC在第二药物之后施用。
[24]根据[21A]的治疗方法，其中所述ADC与第二药物同时施用。
[25A]用于治疗癌症的治疗方法，所述方法包括向具有对铂类化疗耐药的卵巢癌和/或在施用所述药物组合物之前表现出卵巢癌复发的受试者施用药物组合物，其中所述药物组合物包含具有由下式表示的结构的抗体-药物偶联物(ADC)：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO:87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列或由SEQ ID NO:88所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列。
本发明的有利效果
本公开提供使用ADC治疗癌症的治疗方法，和用于治疗癌症的包含ADC的药物产品等。本公开还提供使用其抗体特异性结合至EC3的抗CDH6抗体-药物偶联物治疗化疗耐药性癌症的治疗方法，其具有发挥和维持肿瘤消退效果和安全性的优异抗肿瘤效果。本公开还提供包含抗CDH6抗体-药物偶联物的药物组合物。
附图简述
[图1]图1显示检查四种大鼠抗CDH6单克隆抗体(克隆编号RG019、RG055、RG056和RG061)或大鼠IgG对照与对照细胞或hCDH6转染的293T细胞的结合的流式细胞术结果。横坐标描绘指示结合的抗体的量的FITC荧光强度，而纵坐标描绘细胞计数。
[图2-1]图2-1显示四种大鼠抗CDH6单克隆抗体(rG019、rG055、rG056和rG061)或阴性对照抗体大鼠IgG2b对于对照细胞或全长hCDH6转染的293细胞的结合活性。横坐标描绘指示结合的抗体量的FITC荧光强度，而纵坐标描绘细胞计数。
[图2-2]图2-2显示四种大鼠抗CDH6单克隆抗体(rG019、rG055、rG056和rG061)或大鼠IgG对照对于对照细胞或EC1缺失的hCDH6转染的293细胞的结合活性。横坐标描绘指示结合的抗体量的FITC荧光强度，而纵坐标描绘细胞计数。
[图2-3]图2-3显示四种大鼠抗CDH6单克隆抗体(rG019、rG055、rG056和rG061)或大鼠IgG对照对于对照细胞或EC2缺失的hCDH6转染的293细胞的结合活性。横坐标描绘指示结合的抗体量的FITC荧光强度，而纵坐标描绘细胞计数。
[图2-4]图2-4显示四种大鼠抗CDH6单克隆抗体(rG019、rG055、rG056和rG061)或大鼠IgG对照对于对照细胞或EC3缺失的hCDH6转染的293细胞的结合活性。横坐标描绘指示结合的抗体量的FITC荧光强度，而纵坐标描绘细胞计数。
[图2-5]图2-5显示四种大鼠抗CDH6单克隆抗体(rG019、rG055、rG056和rG061)或大鼠IgG对照对于对照细胞或EC4缺失的hCDH6转染的293细胞的结合活性。横坐标描绘指示结合的抗体量的FITC荧光强度，而纵坐标描绘细胞计数。
[图2-6]图2-6显示四种大鼠抗CDH6单克隆抗体(rG019、rG055、rG056和rG061)或大鼠IgG对照对于对照细胞或EC5缺失的hCDH6转染的293细胞的结合活性。横坐标描绘指示结合的抗体量的FITC荧光强度，而纵坐标描绘细胞计数。
[图3]图3显示评估CDH6在4种类型的人肿瘤细胞系(人卵巢肿瘤细胞系NIH:OVCAR-3、PA-1和ES-2和人肾细胞肿瘤细胞系786-O)的细胞膜表面上的表达的流式细胞术结果。横坐标描绘指示结合的抗体量的FITC荧光强度，而纵坐标描绘细胞计数。
[图4]图4显示用于在NIH:OVCAR-3细胞和786-O细胞中使用与抑制蛋白质合成的毒素(皂草素)偶联的抗大鼠IgG试剂Rat-ZAP或作为阴性对照的未与该毒素偶联的Fc(γ)片段特异性山羊抗大鼠IgG(Goat Anti-Rat IgG,Fc(gamma)Fragment Specific)评估4种类型的大鼠抗CDH6抗体(rG019、rG055、rG056和rG061)或大鼠IgG对照的内化活性的图表。该图表的纵坐标描绘ATP活性(RLU)。细胞存活率(％)显示在各图表下方，其计算为将补充了阴性对照而非Rat-ZAP的孔中的活细胞数定义为100％时的相对存活率。
[图5]图5显示人嵌合抗CDH6抗体chG019至人CDH6和猴CDH6的结合。横坐标描绘抗体浓度，而纵坐标描绘基于平均荧光强度的结合抗体量。
[图6-1]图6-1和6-2各自显示四种人源化hG019抗体(H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)或阴性对照抗体人IgG1对于人CDH6、猴CDH6、小鼠CDH6和大鼠CDH6的结合活性。横坐标描绘抗体浓度，而纵坐标描绘基于平均荧光强度的结合抗体量。
[图6-2]图6-1和6-2各自显示四种人源化hG019抗体(H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)或阴性对照抗体人IgG1对于人CDH6、猴CDH6、小鼠CDH6和大鼠CDH6的结合活性。横坐标描绘抗体浓度，而纵坐标描绘基于平均荧光强度的结合抗体量。
[图7-1]图7-1显示四种人源化hG019抗体(H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)、抗CDH6抗体NOV0712或阴性对照抗体hIgG1对于对照细胞或全长hCDH6转染的293α细胞的结合活性。横坐标描绘指示结合的抗体量的APC荧光强度。纵坐标描绘细胞计数。
[图7-2]图7-2显示四种人源化hG019抗体(H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)、抗CDH6抗体NOV0712或阴性对照抗体hIgG1对于对照细胞或EC1缺失的hCDH6转染的293α细胞的结合活性。横坐标描绘指示结合的抗体量的APC荧光强度。纵坐标描绘细胞计数。
[图7-3]图7-3显示四种人源化hG019抗体(H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)、抗CDH6抗体NOV0712或阴性对照抗体hIgG1对于对照细胞或EC2缺失的hCDH6转染的293α细胞的结合活性。横坐标描绘指示结合的抗体量的APC荧光强度。纵坐标描绘细胞计数。
[图7-4]图7-4显示四种人源化hG019抗体(H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)、抗CDH6抗体NOV0712或阴性对照抗体hIgG1对于对照细胞或EC3缺失的hCDH6转染的293α细胞的结合活性。横坐标描绘指示结合的抗体量的APC荧光强度。纵坐标描绘细胞计数。
[图7-5]图7-5显示四种人源化hG019抗体(H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)、抗CDH6抗体NOV0712或阴性对照hIgG1对于对照细胞或EC4缺失的hCDH6转染的293α细胞的结合活性。横坐标描绘指示结合的抗体量的APC荧光强度。纵坐标描绘细胞计数。
[图7-6]图7-6显示四种人源化hG019抗体(H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)、抗CDH6抗体NOV0712或阴性对照hIgG1对于对照细胞或EC5缺失的hCDH6转染的293α细胞的结合活性。横坐标描绘指示结合的抗体量的APC荧光强度。纵坐标描绘细胞计数。
[图8]图8显示检查786-O/hCDH6稳定表达细胞系及其亲本细胞系786-O中的人CDH6的表达的流式细胞术结果。横坐标描绘指示结合的抗体量的Alexa Fluor 647荧光强度，而纵坐标描绘细胞计数。
[图9]图9显示使用(a)标记的NOV0712或(b)标记的H01L02的四种未标记人源化hG019抗体(H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)、抗CDH6抗体NOV0712或阴性对照hIgG1的结合竞争测定。横坐标描绘添加的未标记抗体的最终浓度，而纵坐标描绘基于平均荧光强度的结合抗体量。
[图10-1]图10-1显示用于在NIH:OVCAR-3细胞中使用与抑制蛋白质合成的毒素(皂草素)偶联的抗人IgG试剂Hum-ZAP或作为阴性对照的未与该毒素偶联的Fc(γ)片段特异性F(ab')2片段山羊抗人IgG(F(ab')2Fragment Goat Anti-human IgG,Fc(gamma)Fragment Specific)评估四种人源化hG019抗体(H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)、抗CDH6抗体NOV0712和阴性对照抗体的内化活性的图表。该图表的纵坐标描绘ATP活性(RLU)。细胞存活率(％)显示在各图表下方，其计算为将补充了阴性对照而非Hum-ZAP的孔中的活细胞数定义为100％时的相对存活率。
[图10-2]图10-2显示用于在786-O细胞中使用与抑制蛋白质合成的毒素(皂草素)偶联的抗人IgG试剂Hum-ZAP或作为阴性对照的未与该毒素偶联的Fc(γ)片段特异性F(ab')2片段山羊抗人IgG(F(ab')2Fragment Goat Anti-human IgG,Fc(gamma)FragmentSpecific)评估四种人源化hG019抗体(H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)、抗CDH6抗体NOV0712和阴性对照抗体的内化活性的图表。该图表的纵坐标描绘ATP活性(RLU)。细胞存活率(％)显示在各图表下方，其计算为将补充了阴性对照而非Hum-ZAP的孔中的活细胞数定义为100％时的相对存活率。
[图10-3]图10-3显示用于在PA-1细胞中使用与抑制蛋白质合成的毒素(皂草素)偶联的抗人IgG试剂Hum-ZAP或作为阴性对照的未与该毒素偶联的Fc(γ)片段特异性F(ab')2片段山羊抗人IgG(F(ab')2Fragment Goat Anti-human IgG,Fc(gamma)FragmentSpecific)评估四种人源化hG019抗体(H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)、抗CDH6抗体NOV0712和阴性对照抗体的内化活性的图表。该图表的纵坐标描绘ATP活性(RLU)。细胞存活率(％)显示在各图表下方，其计算为将补充了阴性对照而非Hum-ZAP的孔中的活细胞数定义为100％时的相对存活率。
[图11]图11显示评估四种人源化hG019-药物偶联物(H01L02-DXd、H02L02-DXd、H02L03-DXd和H04L02-DXd)或NOV0712-DM4对PA-1细胞的体外细胞生长抑制活性的结果。横坐标描绘抗体-药物偶联物浓度，而纵坐标描绘细胞存活率(％)。
[图12]图12显示四种人源化hG019-药物偶联物(H01L02-DXd、H02L02-DXd、H02L03-DXd和H04L02-DXd)或NOV0712-DM4的体内抗肿瘤效果。使用其中将CDH6阳性人肾细胞肿瘤细胞系786-O接种到免疫缺陷小鼠中的动物模型进行评估。横坐标描绘天数，而纵坐标描绘肿瘤体积。误差范围描绘了标准误差(SE)值。
[图13]图13显示人源化hG019-药物偶联物H01L02-DXd或NOV0712-DM4或NOV0712-DXd的体内抗肿瘤效果。使用其中将CDH6阳性人卵巢肿瘤细胞系PA-1接种到免疫缺陷小鼠中的动物模型进行评估。横坐标描绘天数，而纵坐标描绘肿瘤体积。误差范围描绘了SE值。
[图14]图14显示人源化hG019-药物偶联物H01L02-DXd或NOV0712-DM4的体内抗肿瘤效果。使用其中将CDH6阳性人卵巢肿瘤细胞系NIH:OVCAR-3接种到免疫缺陷小鼠中的动物模型进行评估。横坐标描绘天数，而纵坐标描绘肿瘤体积。误差范围描绘了SE值。
[图15]图15显示人源化hG019-药物偶联物H01L02-DXd或NOV0712-DM4的体内抗肿瘤效果。使用其中将CDH6阳性人肾细胞肿瘤细胞系786-O接种到免疫缺陷小鼠中的动物模型进行评估。横坐标描绘天数，而纵坐标描绘肿瘤体积。误差范围描绘了SE值。
[图16]图16显示人源化hG019-药物偶联物H01L02-DXd或NOV0712-DM4的体内抗肿瘤效果。使用其中将CDH6阴性人卵巢肿瘤细胞系ES-2接种到免疫缺陷小鼠中的动物模型进行评估。横坐标描绘天数，而纵坐标描绘肿瘤体积。误差范围描绘了SE值。
[图17]图17显示在用卡铂和紫杉醇(paclitaxel)长期治疗后抗体-药物偶联物(1)的体内抗肿瘤效果。使用其中将CDH6阳性人卵巢肿瘤细胞系NIH:OVCAR-3接种到免疫缺陷小鼠中的动物模型进行评估。在施用卡铂50mg/kg和紫杉醇30mg/kg9次后(白色三角形)，选择估计肿瘤体积在150mm3至500mm3的范围内的小鼠并接受抗体-药物偶联物(1)10mg/kg的施用(黑色三角形)。横坐标描绘天数，而纵坐标描绘肿瘤体积。误差范围描绘了SE值(赋形剂组:N＝6。治疗组:N＝5)。
[图18]图18是显示在抗体-药物偶联物(1)和卡铂的分别单次施用组以及抗体-药物偶联物(1)和卡铂的组合施用组中在皮下移植NIH:OVCAR-3细胞的小鼠中的肿瘤生长抑制效果的图。
[图19]图19是显示在抗体-药物偶联物(1)和卡铂的分别单次施用组以及抗体-药物偶联物(1)和卡铂的组合施用组中在皮下移植OV-90细胞的小鼠中的肿瘤生长抑制效果的图。
[图20]图20是显示在抗体-药物偶联物(1)的单次施用组、卡铂和紫杉醇的组合施用组以及抗体-药物偶联物(1)、卡铂和紫衫醇的组合施用组中在皮下移植OV-90细胞的小鼠中的肿瘤生长抑制效果的图。
[图21]图21是显示在抗体-药物偶联物(1)和吉西他滨的分别单次施用组以及抗体-药物偶联物(1)和吉西他滨的组合施用组中在皮下移植OV-90细胞的小鼠中的肿瘤生长抑制效果的图。
实施方案的描述
在下文中，参考附图描述用于进行本发明的优选实施方案。要指出，下面描述的实施方案仅例示本发明的代表性实施方案，而本发明的范围不应由于这些实例而被狭义地解释。
在本说明书中，术语“癌症”用于具有与术语“肿瘤”相同的含义。
在本说明书中，术语“基因”的使用不仅包括DNA，还包括其mRNA和cDNA，及其cRNA。
在本说明书中，术语“多核苷酸”或“核苷酸”用于具有与核酸相同的含义，并且还包括DNA、RNA、探针、寡核苷酸和引物。在本说明书中，除非另有说明，术语“多核苷酸”和“核苷酸”可以彼此互换使用。
在本说明书中，术语“多肽”和“蛋白质”可以彼此互换使用。
在本说明书中，术语“细胞”包括个体动物中的细胞和培养的细胞。
在本说明书中，术语“CDH6”可用于具有与CDH6蛋白质相同的含义。在本说明书中，人CDH6也称为“hCDH6”。
在本说明书中，术语“细胞毒活性”用于表示以任何给定方式造成细胞的病理性变化。该术语不仅意指直接创伤，而且意指对细胞造成的所有类型的结构或功能损伤，如DNA切割、碱基二聚体的形成、染色体断裂、对细胞有丝分裂器的损伤和各种类型的酶活性的降低。
在本说明书中，短语“在细胞中发挥毒性”用于表示以任何给定方式在细胞中表现出毒性。该术语不仅意指直接创伤，而且意指对细胞造成的所有类型的结构、功能或代谢影响，如DNA切割、碱基二聚体的形成、染色体断裂、对细胞有丝分裂器的损伤、各种类型的酶活性的降低和抑制细胞生长因子的作用。
在本说明书中，术语“抗体的功能片段”，也称为“抗体的抗原结合片段”，用于表示具有抗原结合活性的抗体的部分片段，并且包括Fab、F(ab')2、scFv、双特异抗体、线性抗体和由抗体片段形成的多特异性抗体等。Fab'，其是通过在还原条件下处理F(ab')2而获得的抗体可变区的单价片段，也包括在抗体的抗原结合片段中。但是，抗体的抗原结合片段不限于这些分子，只要抗原结合片段具有抗原结合能力。这些抗原结合片段不仅包括通过用适当的酶处理抗体蛋白的全长分子而获得的那些，还包括使用遗传工程抗体基因在适当的宿主细胞中产生的蛋白质。
在本说明书中，术语“表位”用于表示特异性抗CDH6抗体结合至的CDH6的部分肽或部分三维结构。这样的表位(其是CDH6的上述部分肽)可以通过本领域技术人员熟知的方法，如免疫测定法确定。首先，生产抗原的各种部分结构。关于这样的部分结构的生产，可以应用已知的寡肽合成技术。例如，通过本领域技术人员熟知的遗传重组技术生产一系列多肽，其中CDH6已经从其C-末端或N-末端以适当的长度相继截短。此后，研究抗体对这些多肽的反应性，并大致确定识别位点。此后，合成更短的肽，然后可以研究其对这些肽的反应性，以确定表位。当与具有多个胞外结构域的膜蛋白结合的抗体指向作为表位的由多个结构域组成的三维结构时，可以通过修饰特定胞外结构域的氨基酸序列并由此修饰三维结构来确定抗体结合至的结构域。表位，即与特异性抗体结合的抗原的部分三维结构，也可以通过由X射线结构分析指定与抗体相邻的抗原的氨基酸残基来确定。
在本说明书中，短语“结合至相同表位的抗体”用于表示结合至共同表位的抗体。如果第二抗体与第一抗体结合至的部分肽或部分三维结构结合，可以确定第一抗体和第二抗体结合至相同表位。或者，通过确认第二抗体与第一抗体竞争第一抗体与抗原的结合(即，第二抗体干扰第一抗体与抗原的结合)，可以确定第一抗体和第二抗体结合至相同表位，即使尚未确定该表位的特定序列或结构。在本说明书中，短语“结合至相同表位”是指通过这些测定方法的任一种或两种确定第一抗体和第二抗体结合至共同表位的情况。当第一抗体和第二抗体结合至相同表位并且进一步地，第一抗体具有特殊作用如抗肿瘤活性或内化活性时，可以期望第二抗体具有与第一抗体相同的活性。
在本说明书中，术语“CDR”用于表示互补决定区。已知的是，抗体分子的重链和轻链各具有三个CDR。这样的CDR也被称为高变区，并且位于抗体的重链和轻链的可变区中。这些区域具有特别高度可变的一级结构并在重链和轻链各自中的多肽链的一级结构上分成三个位点。在本说明书中，关于抗体的CDR，重链的CDR从重链的氨基酸序列的氨基末端侧开始分别被称为CDRH1、CDRH2和CDRH3，而轻链的CDR从轻链的氨基酸序列的氨基末端侧开始分别被称为CDRL1、CDRL2和CDRL3。这些位点在三维结构上彼此靠近，并决定抗体对抗体所结合的抗原的特异性。
在本发明中，短语“在严格条件下杂交”用于表示杂交在市售杂交溶液ExpressHybHybridization Solution(由Clontech Laboratories,Inc.制造)中在68℃下进行，或杂交在使用DNA固定化过滤器在0.7至1.0M NaCl存在下在68℃下进行杂交的条件下进行，所得物然后在68℃下用0.1至2倍浓度的SSC溶液(其中1倍浓度的SSC由150mM NaCl和15mM柠檬酸钠组成)洗涤以用于鉴定，或与其等同的条件。
在本说明书中，术语“一个至几个”用于表示1至10、1至9、1至8、1至7、1至6、1至5、1至4、1至3、或1或2。
在本说明书中，术语“耐药”用于表示对抗癌剂治疗无反应。该术语也可以表示为“难治性”、“无响应性”或“无应答性”。此外，该术语也可以表示为“不耐受(intolerant)”，因为由于无响应性质而无法阻止肿瘤生长。
在本说明书中，术语“耐药”可以是“由于用抗癌剂治疗而使癌症获得耐药性”或者可以是“独立于抗癌剂治疗的癌症固有的耐药性”。
在本说明书中，术语“对化疗耐药”用于表示对化疗治疗无响应。
在本说明书中，术语“对化疗方案耐药”用于表示对根据化疗方案进行的化疗无响应。
在本说明书中，术语“对铂类化疗耐药”用于表示对用铂类化疗治疗无响应。
在本说明书中，术语“化疗”用于表示使用一种或多种用于治疗癌症的化疗药物的疗法。
在本说明书中，术语“化疗药物”用于表示用于治疗癌症的化疗剂。化疗药物包括但不限于：烷基化剂(例如氮芥、环磷酰胺、异环磷酰胺、美法仑、苯丁酸氮芥、六甲三聚氰胺、噻替派、白消安、卡莫司汀、洛莫司汀、司莫司汀、链脲霉素、达卡巴嗪)、抗代谢物(例如吉西他滨、甲氨蝶呤、氟尿嘧啶、去氧氟尿苷、卡培他滨、氟尿苷、阿糖胞苷、巯嘌呤、硫鸟嘌呤、喷司他丁)、长春花生物碱(例如长春碱、长春新碱)、表鬼臼毒素(例如依托泊苷、替尼泊苷)、抗生素(例如更生霉素、柔红霉素、多柔比星、博来霉素、普卡霉素、丝裂霉素)、铂络合物(例如顺铂、卡铂、奥沙利铂)、紫杉烷(例如紫杉醇、多西他赛)、蒽二酮(例如米托蒽醌)、取代脲(例如羟基脲)、甲基肼(例如盐酸丙卡巴肼)、维生素A代谢物(例如，维甲酸)。
在本说明书中，术语“铂类化疗”用于表示使用一种或多种铂类药物的癌症疗法，与/不与其它一种或多种化疗药物一起。
在本说明书中，术语“铂类药物”用于表示用于治疗癌症的铂络合物。铂类药物包括但不限于：顺铂、卡铂和奥沙利铂。
在本说明书中，术语“癌症复发”用于表示在一段时间无法检测到癌症之后癌症回到与原发肿瘤相同的位置或体内的另一个位置。该术语在以下参考文献中基于“复发”进行定义。
NCI词典,“recurrence”,NCIDictionary of Cancer Terms[在线].NationalCancer Institute[2022-09-06检索].检索自<cancer.gov/publications/dictionaries/cancer-terms/def/recurrence>。
在本说明书中，术语“化疗方案”用于表示限定药物、剂量、频率等的化疗治疗计划。
在本说明书中，术语“完全反应(complete response)(CR)”用于表示癌症的所有征象响应治疗而消失。“完全反应(CR)”并不总是意味着癌症已经治愈。该术语也可表示为“完全缓解(complete remission)”。该术语在以下参考文献中基于“完全反应”进行定义。
NCI词典,“complete response”,NCIDictionary of Cancer Terms[在线].National Cancer Institute[2022-09-06检索].检索自<cancer.gov/publications/dictionaries/cancer-terms/def/complete-response>。
在本说明书中，术语“部分反应(partial response)(PR)”用于表示体内肿瘤的大小或癌症的程度响应治疗而降低。该术语也可表示为“部分缓解(partial remission)”。该术语在以下参考文献中基于“部分反应”进行定义。
NCI词典,“partial response”,NCIDictionary ofCancer Terms[在线].National Cancer Institute[2022-09-06检索].检索自<cancer.gov/publications/dictionaries/cancer-terms/def/partial-response>。
在本说明书中，术语“疾病稳定(SD)”用于表示癌症的程度或严重性既没有减小也没有增加。该术语在以下参考文献中基于“部分反应(partial response)”进行定义。
NCI词典,“stabledisease”,NCIDictionary of Cancer Terms[在线].NationalCancer Institute[2022-09-06检索].检索自<cancer.gov/publications/dictionaries/cancer-terms/def/stable-disease>。
1.CDH6
钙粘蛋白是存在于细胞膜表面上的糖蛋白，并通过其N-末端胞外结构域的钙离子依赖性结合而充当细胞-细胞粘附分子，或充当负责细胞-细胞相互作用的信号分子。经典钙粘蛋白属于钙粘蛋白超家族，并且是由五个胞外结构域(EC结构域)、一个跨膜区和胞内结构域组成的单次跨膜蛋白。
钙粘蛋白-6(CDH6)是由790个氨基酸组成的单次跨膜蛋白，其被分类为II型钙粘蛋白家族，并且这种蛋白具有N-末端胞外结构域和C-末端胞内结构域。在1995年首次克隆了人CDH6基因(非专利文献1)，并且其序列可以参考例如登录号NM_004932和NP_004923(NCBI)。
本发明中使用的CDH6蛋白可以直接从人或非人哺乳动物(例如大鼠、小鼠或猴)的表达CDH6的细胞中纯化，然后可以使用，或者可以制备上述细胞的细胞膜成分(cellmembrane fraction)并且可用作CDH6蛋白。或者，CDH6也可以通过在体外合成，或通过经由遗传操纵使宿主细胞产生CDH6而获得。根据这样的遗传操纵，CDH6蛋白可以具体通过将CDH6 cDNA并入能够表达CDH6 cDNA的载体中，然后在含有转录和翻译所必需的酶、底物和含能材料的溶液中合成CDH6，或通过转化其它原核生物或真核生物的宿主细胞以使它们表达CDH6而获得。此外，基于上述遗传操纵的表达CDH6的细胞或表达CDH6的细胞系可用于呈递CDH6蛋白。或者，可以将其中已并入CDH6 cDNA的表达载体直接施用于待免疫的动物，并且可以在由此免疫的动物体内表达CDH6。
此外，由在CDH6的上述氨基酸序列中包含一个或几个氨基酸的取代、缺失和/或添加的氨基酸序列组成并且具有与CDH6蛋白等同的生物活性的蛋白也包括在术语“CDH6”内。
人CDH6蛋白具有SEQ ID NO:1中所示的氨基酸序列。人CDH6蛋白的胞外区由具有SEQ ID NO:1中所示的氨基酸序列中的位置54至159的氨基酸序列的胞外结构域1(在本说明书中也称为EC1)、具有SEQ ID NO:1中所示的氨基酸序列中的位置160至268的氨基酸序列的胞外结构域2(在本说明书中也称为EC2)、具有SEQ ID NO:1中所示的氨基酸序列中的位置269至383的氨基酸序列的胞外结构域3(在本说明书中也称为EC3)、具有SEQ ID NO:1中所示的氨基酸序列中的位置384至486的氨基酸序列的胞外结构域4(在本说明书中也称为EC4)和具有SEQ ID NO:1中所示的氨基酸序列中的位置487至608的氨基酸序列的胞外结构域5(在本说明书中也称为EC5)组成。EC1至EC5的氨基酸序列分别显示在SEQ ID NOs:2至6中(表1)。
2.抗CDH6抗体的生产
本发明的抗CDH6抗体的一个实例可包括识别包含SEQ ID NO:4中所示的氨基酸序列的氨基酸序列并具有内化活性的抗CDH6抗体。本发明的抗CDH6抗体的一个实例可包括特异性识别包含SEQ ID NO:4中所示的氨基酸序列的氨基酸序列并具有内化活性的抗CDH6抗体。本发明的抗CDH6抗体的一个实例可包括识别由SEQ ID NO:4中所示的氨基酸序列组成的氨基酸序列并具有内化活性的抗CDH6抗体。本发明的抗CDH6抗体的一个实例可包括特异性识别由SEQ ID NO:4中所示的氨基酸序列组成的氨基酸序列并具有内化活性的抗CDH6抗体。如应用于抗体的短语“特异性识别包含SEQ ID NO:4中所示的氨基酸序列的氨基酸序列”或“特异性识别EC3结构域”用于表示与CDH6的其它细胞外结构域相比，抗体强烈识别或强烈结合至CDH6的EC3结构域。
本发明的抗CDH6抗体可来源于任何物种。物种的优选实例可包括人、猴、大鼠、小鼠和兔。当本发明的抗CDH6抗体来源于人以外的物种时，优选通过熟知的技术将抗CDH6抗体嵌合或人源化。本发明的抗体可以是多克隆抗体或可以是单克隆抗体，并且单克隆抗体是优选的。
本发明的抗CDH6抗体是可以靶向肿瘤细胞的抗体。具体地，本发明的抗CDH6抗体具有能够识别肿瘤细胞的性质、能够结合至肿瘤细胞的性质和/或通过细胞摄取而内化到肿瘤细胞中的性质等。因此，本发明的抗CDH6抗体可以经由连接子偶联至具有抗肿瘤活性的化合物以制备抗体-药物偶联物。
抗体对肿瘤细胞的结合活性可通过流式细胞术证实。可以如下确认抗体摄取到肿瘤细胞中：(1)使用结合至该抗体的二级抗体(荧光标记的)在荧光显微镜下使细胞摄取的抗体可视化的测定(Cell Death and Differentiation,2008,15,751-761)，(2)使用结合至该抗体的二级抗体(荧光标记的)测量细胞摄取的荧光的测定(Molecular Biologyofthe Cell Vol.15,5268-5282,12月2004)或(3)使用结合至抗体的免疫毒素的Mab-ZAP测定，其中该毒素在细胞摄取后释放以抑制细胞生长(Bio Techniques 28:162-165,2000年1月)。白喉毒素的催化区和蛋白G的重组偶联蛋白可用作免疫毒素。
在本说明书中，术语“高内化能力”用于指已经施用了上述抗体和皂草素标记的抗大鼠IgG抗体的表达CDH6的细胞的存活率(其通过相对于被定义为100％的无抗体添加的细胞存活率的比率表示)优选为70％或更低，更优选60％或更低。
本发明的抗肿瘤抗体-药物偶联物包含发挥抗肿瘤作用的偶联化合物。因此，优选但不是必需的是，抗体本身应该具有抗肿瘤作用。为了在肿瘤细胞中特异性地和/或选择性地发挥抗肿瘤化合物的细胞毒性，重要并且优选的是，该抗体应该具有内化并转移到肿瘤细胞中的性质。
抗CDH6抗体可以通过用充当抗原的多肽经由本领域中通常实施的方法免疫动物，然后收集和纯化在其活体中产生的抗体而获得。优选使用保留三维结构的CDH6作为抗原。这样的方法的实例可包括DNA免疫法。
抗原的来源不限于人，因此，动物也可以用来源于非人类动物如小鼠或大鼠的抗原免疫。在这种情况下，可以通过检查所获得的与异源抗原结合的抗体与人抗原的交叉反应性来选择适用于人类疾病的抗体。
此外，产生针对该抗原的抗体的抗体生成细胞可以根据已知方法(例如，Kohler和Milstein,Nature(1975)256,495-497；和Kennet,R.ed.,Monoclonal Antibodies,365-367,Plenum Press,N.Y.(1980))与骨髓瘤细胞融合以建立杂交瘤，从而获得单克隆抗体。
在下文中，具体描述获得针对CDH6的抗体的方法。
(1)抗原的制备
可以通过允许宿主细胞根据遗传操纵产生编码抗原蛋白的基因来获得抗原。具体地，产生能够表达抗原基因的载体，然后将载体引入宿主细胞中，以使该基因在其中表达，此后可以将表达的抗原纯化。也可以通过用基于上述遗传操纵的抗原表达细胞或表达抗原的细胞系对动物进行免疫的方法获得抗体。
或者，也可以在不使用抗原蛋白的情况下通过将抗原蛋白的cDNA并入表达载体中，然后将表达载体施用于待免疫的动物并在由此免疫的动物体内表达抗原蛋白以在其中产生针对该抗原蛋白的抗体来获得抗体。
(2)抗CDH6单克隆抗体的生产
本发明中使用的抗CDH6抗体不受特别限制。例如，可以合适地使用由本申请的序列表中所示的氨基酸序列指定的抗体。本发明中使用的抗CDH6抗体理想地是具有以下性质的抗体：
(1)具有以下性质的抗体：
(a)特异性结合至CDH6，和
(b)具有通过结合至CDH6而内化到表达CDH6的细胞中的活性；
(2)根据上述(1)的抗体，其中所述CDH6是人CDH6；或
(3)根据上述(1)或(2)的抗体，其中所述抗体特异性识别人CDH6的EC3并具有内化活性。
获得本发明的针对CDH6的抗体的方法不受特别限制，只要可以获得抗CDH6抗体。优选使用保留其构象的CDH6作为抗原。
获得抗体的方法的一个优选实例可以包括DNA免疫法。DNA免疫法是一种涉及用抗原表达质粒转染动物(例如小鼠或大鼠)个体，然后在个体中表达抗原以诱导对该抗原的免疫的方法。转染方法包括将质粒直接注射到肌肉的方法、将转染试剂如脂质体或聚乙烯亚胺注射到静脉的方法、使用病毒载体的方法、使用基因枪注射附带质粒的金颗粒的方法、将大量质粒溶液快速注射到静脉的流体动力学方法等。关于将表达质粒注射到肌肉的转染方法，一种被称为体内电穿孔的技术(其涉及将电穿孔应用于质粒的肌内注射位点)已知作为用于改进表达水平的方法(Aihara H,Miyazaki J.Nat Biotechnol.1998Sep；16(9):867-70或Mir LM,Bureau MF,Gehl J,Rangara R,Rouy D,Caillaud JM,Delaere P,BranellecD,Schwartz B,Scherman D.Proc Natl Acad Sci U SA.1999年4月13日；96(8):4262-7)。这种方法通过在肌内注射质粒之前用透明质酸酶处理肌肉而进一步改进表达水平(McMahon JM1,Signori E,Wells KE,Fazio VM,Wells DJ.,Gene Ther.2001年8月；8(16):1264-70)。此外，杂交瘤产生可以通过已知方法进行，并且也可以使用例如HybrimuneHybridoma Production System(Cyto Pulse Sciences,Inc.)进行。
获得单克隆抗体的具体实例可包括以下程序：
(a)可以通过将CDH6 cDNA并入表达载体(例如pcDNA3.1；Thermo FisherScientific Inc.)并通过如电穿孔或基因枪之类的方法将该载体直接施用于待免疫的动物(例如大鼠或小鼠)以在动物体内表达CDH6而诱导免疫应答。如果需要增强抗体滴度，通过电穿孔等施用载体可以进行一次或多次，优选多次；
(b)从其中已经诱导免疫应答的上述动物收集含有抗体生成细胞的组织(例如淋巴结)；
(c)制备骨髓瘤细胞(下文称为“骨髓瘤”)(例如，小鼠骨髓瘤SP2/0-ag14细胞)；
(d)抗体生成细胞与骨髓瘤之间的细胞融合；
(e)选择产生目标抗体的杂交瘤组；
(f)分裂成单细胞克隆(克隆)；
(g)任选地，培养杂交瘤以用于大量生产单克隆抗体，或繁育接种杂交瘤的动物；和/或
(h)研究由此产生的单克隆抗体的生理活性(内化活性)和结合特异性，或检查该抗体作为标记试剂的性质。
本文所用的测量抗体滴度的方法的实例可以包括但不限于流式细胞术和Cell-ELISA。
由此建立的杂交瘤细胞株的实例可包括产生抗CDH6抗体的杂交瘤rG019、rG055、rG056和rG061。要指出，在本说明书中，由产生抗CDH6抗体的杂交瘤rG019产生的抗体被称为“rG019抗体”或简称为“rG019”，由杂交瘤rG055产生的抗体被称为“rG055抗体”或简称为“rG055”，由杂交瘤rG056产生的抗体被称为“rG056抗体”或简称为“rG056”，并且由杂交瘤rG061产生的抗体被称为“rG061抗体”或简称为“rG061”。
rG019抗体的轻链可变区由SEQ ID NO:10中所示的氨基酸序列组成。rG019抗体的轻链可变区的氨基酸序列由SEQ ID NO:11中所示的核苷酸序列编码。rG019抗体的轻链可变区具有由SEQ ID NO:12中所示的氨基酸序列组成的CDRL1、由SEQ ID NO:13中所示的氨基酸序列组成的CDRL2和由SEQ ID NO:14中所示的氨基酸序列组成的CDRL3。rG019抗体的重链可变区由SEQ ID NO:15中所示的氨基酸序列组成。rG019抗体的重链可变区的氨基酸序列由SEQ ID NO:16中所示的核苷酸序列编码。rG019抗体的重链可变区具有由SEQ IDNO:17中所示的氨基酸序列组成的CDRH1、由SEQ ID NO:18中所示的氨基酸序列组成的CDRH2和由SEQ ID NO:19中所示的氨基酸序列组成的CDRH3。rG019抗体的序列显示在表1中。
rG055抗体的轻链可变区由SEQ ID NO:20中所示的氨基酸序列组成。rG055抗体的轻链可变区的氨基酸序列由SEQ ID NO:21中所示的核苷酸序列编码。rG055抗体的轻链可变区具有由SEQ ID NO:22中所示的氨基酸序列组成的CDRL1、由SEQ ID NO:23中所示的氨基酸序列组成的CDRL2和由SEQ ID NO:24中所示的氨基酸序列组成的CDRL3。rG055抗体的重链可变区由SEQ ID NO:25中所示的氨基酸序列组成。rG055抗体的重链可变区的氨基酸序列由SEQ ID NO:26中所示的核苷酸序列编码。rG055抗体的重链可变区具有由SEQ IDNO:27中所示的氨基酸序列组成的CDRH1、由SEQ ID NO:28中所示的氨基酸序列组成的CDRH2和由SEQ ID NO:29中所示的氨基酸序列组成的CDRH3。rG055抗体的序列显示在表1中。
rG056抗体的轻链可变区由SEQ ID NO:30中所示的氨基酸序列组成。rG056抗体的轻链可变区的氨基酸序列由SEQ ID NO:31中所示的核苷酸序列编码。rG056抗体的轻链可变区具有由SEQ ID NO:32中所示的氨基酸序列组成的CDRL1、由SEQ ID NO:33中所示的氨基酸序列组成的CDRL2和由SEQ ID NO:34中所示的氨基酸序列组成的CDRL3。rG056抗体的重链可变区由SEQ ID NO:35中所示的氨基酸序列组成。rG056抗体的重链可变区的氨基酸序列由SEQ ID NO:36中所示的核苷酸序列编码。rG056抗体的重链可变区具有由SEQ IDNO:37中所示的氨基酸序列组成的CDRH1、由SEQ ID NO:38中所示的氨基酸序列组成的CDRH2和由SEQ ID NO:39中所示的氨基酸序列组成的CDRH3。rG056抗体的序列显示在表1中。
rG061抗体的轻链可变区由SEQ ID NO:40中所示的氨基酸序列组成。rG061抗体的轻链可变区的氨基酸序列由SEQ ID NO:41中所示的核苷酸序列编码。rG061抗体的轻链可变区具有由SEQ ID NO:42中所示的氨基酸序列组成的CDRL1、由SEQ ID NO:43中所示的氨基酸序列组成的CDRL2和由SEQ ID NO:44中所示的氨基酸序列组成的CDRL3。rG061抗体的重链可变区由SEQ ID NO:45中所示的氨基酸序列组成。rG061抗体的重链可变区的氨基酸序列由SEQ ID NO:46中所示的核苷酸序列编码。rG061抗体的重链可变区具有由SEQ IDNO:47中所示的氨基酸序列组成的CDRH1、由SEQ ID NO:48中所示的氨基酸序列组成的CDRH2和由SEQ ID NO:49中所示的氨基酸序列组成的CDRH3。rG061抗体的序列显示在表1中。
此外，在再次进行上述“2.抗CDH6抗体的生产”中的步骤(a)至(h)以分别独立地获得单克隆抗体的情况下，以及在通过其它方法分别获得单克隆抗体的情况下，可以获得具有与rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体或rG061抗体等同的内化活性的抗体。这样的抗体的一个实例可包括与rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体或rG061抗体所结合的相同表位结合的抗体。如果新制备的单克隆抗体与rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体或rG061抗体所结合的部分肽或部分三维结构结合，可以确定该单克隆抗体与rG019抗体、tG055抗体、rG056抗体或rG061抗体所结合的相同表位结合。此外，通过确认该单克隆抗体与rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体或rG061抗体竞争抗体与CDH6的结合(即，该单克隆抗体干扰rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体或rG061抗体与CDH6的结合)，可以确定该单克隆抗体结合至抗CDH6抗体所结合的相同表位，即使尚未确定该表位的特定序列或结构。当确认该单克隆抗体结合至rG019抗体、rGO55抗体、rG056抗体或rG061抗体所结合的相同表位时，强烈预期该单克隆抗体应该具有与rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体或rG061抗体等同的抗原结合能力、生物活性和/或内化活性。
(3)其它抗体
本发明的抗体还包括为了降低对人的异源抗原性而人工修饰的基因重组抗体，如嵌合抗体、人源化抗体和人抗体，以及针对CDH6的上述单克隆抗体。这些抗体可通过已知方法生产。
嵌合抗体的实例可包括其中可变区和恒定区彼此异源的抗体，例如通过将小鼠或大鼠源性抗体的可变区与人源性恒定区偶联而形成的嵌合抗体(参见Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.,81,6851-6855,(1984))。
衍生自大鼠抗人CDH6抗体的嵌合抗体的实例包括由包含本说明书中描述的各大鼠抗人CDH6抗体(例如rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体或rG061抗体)的轻链可变区和人源性恒定区的轻链和包含其重链可变区和人源性恒定区的重链组成的抗体。
衍生自大鼠抗人CDH6抗体的嵌合抗体的其它实例包括由包含下述轻链可变区的轻链和包含下述重链可变区的重链组成的抗体：所述轻链可变区由本说明书中描述的各大鼠抗人CDH6抗体(例如rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体或rG061抗体)的轻链可变区中的氨基酸的一个至几个残基、1至3个残基、1或2个残基，优选1个残基被其它氨基酸残基取代而得，所述重链可变区由其重链可变区中的氨基酸的一个至几个残基、1至3个残基、1或2个残基，优选1个残基被其它氨基酸残基取代而得。这种抗体可具有任何给定的人源性恒定区。
衍生自大鼠抗人CDH6抗体的嵌合抗体的其它实例包括由包含下述轻链可变区的轻链和包含下述重链可变区的重链组成的抗体：所述轻链可变区由本说明书中描述的各大鼠抗人CDH6抗体(例如rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体或rG061抗体)的轻链可变区中的任何1至3个CDR中的氨基酸的1或2个残基，优选1个残基被其它氨基酸残基取代而得，所述重链可变区由其重链可变区中的任何1至3个CDR中的氨基酸的1或2个残基，优选1个残基被其它氨基酸残基取代而得。这种抗体可具有任何给定的人源性恒定区。
衍生自rG019抗体的嵌合抗体的实例包括由包含由SEQ ID NO:10中所示的氨基酸序列组成的轻链可变区的轻链和包含由SEQ ID NO:15中所示的氨基酸序列组成的重链可变区的重链组成的抗体。这种抗体可具有任何给定的人源性恒定区。
衍生自rG019抗体的嵌合抗体的其它实例包括由包含下述轻链可变区的轻链和包含下述重链可变区的重链组成的抗体：所述轻链可变区通过由SEQ ID NO:10中所示的氨基酸序列组成的轻链可变区中的氨基酸的一个至几个残基、1至3个残基、1或2个残基，优选1个残基被其它氨基酸残基取代而得，所述重链可变区通过由SEQ ID NO:15中所示的氨基酸序列组成的重链可变区中的氨基酸的一个至几个残基、1至3个残基、1或2个残基，优选1个残基被其它氨基酸残基取代而得。这种抗体可具有任何给定的人源性恒定区。
衍生自rG019抗体的嵌合抗体的其它实例包括由包含下述轻链可变区的轻链和包含下述重链可变区的重链组成的抗体：所述轻链可变区通过由SEQ ID NO:10中所示的氨基酸序列组成的轻链可变区中的任何1至3个CDR中的氨基酸的1或2个残基(优选1个残基)被其它氨基酸残基取代而得，所述重链可变区通过由SEQ ID NO:15中所示的氨基酸序列组成的重链可变区中的任何1至3个CDR中的氨基酸的1或2个残基(优选1个残基)被其它氨基酸残基取代而得。这种抗体可具有任何给定的人源性恒定区。
衍生自rG019抗体的嵌合抗体的其它实例包括由包含由SEQ ID NO:10中所示的氨基酸序列组成的轻链可变区的轻链和包含由SEQ ID NO:58中所示的氨基酸序列组成的重链可变区的重链组成的抗体。这种抗体可具有任何给定的人源性恒定区。SEQ ID NO:58中所示的氨基酸序列是SEQ ID NO:15中所示的氨基酸序列中的CDRH2中的半胱氨酸残基被脯氨酸残基取代的序列。
衍生自rG019抗体的嵌合抗体的具体实例包括由下述轻链和下述重链组成的抗体：所述轻链由SEQ ID NO:53中所示的轻链全长氨基酸序列组成，所述重链由SEQ ID NO:56中所示的重链全长氨基酸序列组成。在本说明书中，这种嵌合抗人CDH6抗体被称为“嵌合G019抗体”、“chG019抗体”或“chG019”。chG019抗体的轻链全长氨基酸序列由SEQ ID NO:54中所示的核苷酸序列编码，并且chG019抗体的重链全长氨基酸序列由SEQ ID NO:57中所示的核苷酸序列编码。
chG019抗体的轻链可变区的氨基酸序列与rG019抗体的轻链可变区的氨基酸序列相同，并且由SEQ ID NO:10中所示的氨基酸序列组成。chG019抗体的轻链具有由SEQ IDNO:12中所示的氨基酸序列组成的CDRL1、由SEQ ID NO:13中所示的氨基酸序列组成的CDRL2和由SEQ ID NO:14中所示的氨基酸序列组成的CDRL3，它们分别与rG019的轻链CDRL1、CDRL2和CDRL3相同。chG019抗体的轻链可变区的氨基酸序列由SEQ ID NO:55中所示的核苷酸序列编码。
chG019抗体的重链可变区的氨基酸序列由SEQ ID NO:58中所示的氨基酸序列组成。chG019抗体的重链具有由SEQ ID NO:17中所示的氨基酸序列组成的CDRH1、由SEQ IDNO:60中所示的氨基酸序列组成的CDRH2和由SEQ ID NO:19中所示的氨基酸序列组成的CDRH3。SEQ ID NO:58中所示的氨基酸序列是SEQ ID NO:15中所示的氨基酸序列中的CDRH2中的半胱氨酸残基被脯氨酸残基取代的序列。由SEQ ID NO:60中所示的氨基酸序列组成的CDRH2是SEQ ID NO:18中所示的rG019 CDRH2中的半胱氨酸残基被脯氨酸残基取代的序列。chG019抗体的重链可变区的氨基酸序列由SEQ ID NO:59中所示的核苷酸序列编码。
chG019抗体的序列显示在表1中。
衍生自大鼠抗人CDH6抗体rG055抗体的嵌合抗体的实例包括由下述轻链和下述重链组成的嵌合抗体：所述轻链包含由SEQ ID NO:20中所示的氨基酸序列组成的轻链可变区，所述重链包含由SEQ ID NO:25中所示的氨基酸序列组成的重链可变区。这种抗体可具有任何给定的人源性恒定区。
衍生自大鼠抗人CDH6抗体rG056抗体的嵌合抗体的实例包括由下述轻链和下述重链组成的嵌合抗体：所述轻链包含由SEQ ID NO:30中所示的氨基酸序列组成的轻链可变区，所述重链包含由SEQ ID NO:35中所示的氨基酸序列组成的重链可变区。这种抗体可具有任何给定的人源性恒定区。
衍生自大鼠抗人CDH6抗体rG061抗体的嵌合抗体的实例包括由下述轻链和下述重链组成的嵌合抗体：所述轻链包含由SEQ ID NO:40中所示的氨基酸序列组成的轻链可变区，所述重链包含由SEQ ID NO:45中所示的氨基酸序列组成的重链可变区。这种抗体可具有任何给定的人源性恒定区。
人源化抗体的实例可包括通过仅将互补决定区(CDR)并入人源性抗体而形成的抗体(参见Nature(1986)321,第522-525页)、通过将来自一些框架(frameworks)的氨基酸残基以及CDR序列根据CDR移植方法并入人类抗体中而形成的抗体(国际公开号No.WO90/07861)，以及通过在保持抗原结合能力的同时修饰一些CDR的氨基酸序列而形成的抗体。
在本说明书中，衍生自rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体、rG061抗体或chG019抗体的人源化抗体不限于特定的人源化抗体，只要该人源化抗体保留rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体、rG061抗体或chG019抗体独有的所有6个CDR序列并具有内化活性。可以进一步修饰这种人源化抗体的一些CDR的氨基酸序列，只要其具有内化活性。
chG019抗体的人源化抗体的具体实例可以包括以下任何给定组合：包含由选自以下的任一氨基酸序列组成的轻链可变区的轻链：(1)SEQ ID NO:63或67中所示的氨基酸序列，(2)与上述氨基酸序列(1)具有至少95％或更高的一致性的氨基酸序列(优选与除各CDR序列以外的构架区的序列具有至少95％或更高的序列一致性的氨基酸序列)，和(3)在上述氨基酸序列(1)中包含一个或几个氨基酸的缺失、取代或添加的氨基酸序列；和包含由选自以下的任一氨基酸序列组成的重链可变区的重链：(4)SEQ ID NO:71、75或79中所示的氨基酸序列，(5)与上述氨基酸序列(4)具有至少95％或更高的一致性的氨基酸序列(优选与除各CDR序列以外的构架区的序列具有至少95％或更高的序列一致性的氨基酸序列)，和(6)在上述氨基酸序列(4)中包含一个或几个氨基酸的缺失、取代或添加的氨基酸序列。
或者，也可以使用具有人源化重链或轻链和衍生自大鼠抗体或嵌合抗体的另一个链的抗体。这样的抗体的实例可以包括以下任何给定组合：包含由选自以下的任一氨基酸序列组成的轻链可变区的轻链：(1)SEQ ID NO:63或67中所示的氨基酸序列，(2)与上述氨基酸序列(1)具有至少95％或更高的一致性的氨基酸序列(优选与除各CDR序列以外的构架区的序列具有至少95％或更高的序列一致性的氨基酸序列)，和(3)在上述氨基酸序列(1)中包含一个或几个氨基酸的缺失、取代或添加的氨基酸序列；和包含由选自以下的任一氨基酸序列组成的重链可变区的重链：(4)SEQ ID NO:15、25、35、45或58中所示的氨基酸序列，(5)与上述氨基酸序列(4)具有至少95％或更高的一致性的氨基酸序列(优选与除各CDR序列以外的构架区的序列具有至少95％或更高的序列一致性的氨基酸序列)，和(6)在上述氨基酸序列(4)中包含一个或几个氨基酸的缺失、取代或添加的氨基酸序列。这样的抗体的其它实例可以包括以下任何给定组合：包含由选自以下的任一氨基酸序列组成的轻链可变区的轻链：(1)SEQ ID NO:10、20、30或40中所示的氨基酸序列，(2)与上述氨基酸序列(1)具有至少95％或更高的一致性的氨基酸序列(优选与除各CDR序列以外的构架区的序列具有至少95％或更高的序列一致性的氨基酸序列)，和(3)在上述氨基酸序列(1)中包含一个或几个氨基酸的缺失、取代或添加的氨基酸序列；和包含由选自以下的任一氨基酸序列组成的重链可变区的重链：(4)SEQ ID NO:71、75或79中所示的氨基酸序列，(5)与上述氨基酸序列(4)具有至少95％或更高的一致性的氨基酸序列(优选与除各CDR序列以外的构架区的序列具有至少95％或更高的序列一致性的氨基酸序列)，和(6)在上述氨基酸序列(4)中包含一个或几个氨基酸的缺失、取代或添加的氨基酸序列。
本说明书中的氨基酸取代优选是保守氨基酸取代。保守氨基酸取代是在与某些氨基酸侧链相关的氨基酸群组内发生的取代。优选的氨基酸群组如下：酸性群组＝天冬氨酸和谷氨酸；碱性群组＝赖氨酸、精氨酸和组氨酸；非极性群组＝丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸和色氨酸；以及不带电荷的极性家族＝甘氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、半胱氨酸、丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸。其它优选的氨基酸群组如下：脂族羟基群组＝丝氨酸和苏氨酸；含酰胺的群组＝天冬酰胺和谷氨酰胺；脂族群组＝丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸；和芳族群组＝苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸。这样的氨基酸取代优选在不损害具有原始氨基酸序列的物质的性质的情况下进行。
具有上述轻链和重链的优选组合的抗体的实例包括由具有SEQ ID NO:63中所示的轻链可变区氨基酸序列(在本说明书中也称为hL02轻链可变区氨基酸序列)的轻链或具有SEQ ID NO:67中所示的轻链可变区氨基酸序列(在本说明书中也称为hL03轻链可变区氨基酸序列)的轻链，和具有SEQ ID NO:71中所示的重链可变区氨基酸序列(在本说明书中也称为hH01重链可变区氨基酸序列)的重链、具有SEQ ID NO:75中所示的重链可变区氨基酸序列(在本说明书中也称为hH02重链可变区氨基酸序列)的重链或具有SEQ ID NO:79中所示的重链可变区氨基酸序列(在本说明书中也称为hH04重链可变区氨基酸序列)的重链组成的抗体。其优选实例包括：由具有SEQ ID NO:63中所示的轻链可变区氨基酸序列的轻链和具有SEQ ID NO:71中所示的重链可变区氨基酸序列的重链组成的抗体；由具有SEQ IDNO:63中所示的轻链可变区氨基酸序列的轻链和具有SEQ ID NO:75中所示的重链可变区氨基酸序列的重链组成的抗体；由具有SEQ ID NO:63中所示的轻链可变区氨基酸序列的轻链和具有SEQ ID NO:79中所示的重链可变区氨基酸序列的重链组成的抗体；由具有SEQ IDNO:67中所示的轻链可变区氨基酸序列的轻链和具有SEQ ID NO:71中所示的重链可变区氨基酸序列的重链组成的抗体；由具有SEQ ID NO:67中所示的轻链可变区氨基酸序列的轻链和具有SEQ ID NO:75中所示的重链可变区氨基酸序列的重链组成的抗体；和由具有SEQ IDNO:67中所示的轻链可变区氨基酸序列的轻链和具有SEQ ID NO:79中所示的重链可变区氨基酸序列的重链组成的抗体。其更优选的实例包括：由具有SEQ ID NO:63中所示的轻链可变区氨基酸序列的轻链和具有SEQ ID NO:71中所示的重链可变区氨基酸序列的重链组成的抗体；由具有SEQ ID NO:63中所示的轻链可变区氨基酸序列的轻链和具有SEQ ID NO:75中所示的重链可变区氨基酸序列的重链组成的抗体；由具有SEQ ID NO:63中所示的轻链可变区氨基酸序列的轻链和具有SEQ ID NO:79中所示的重链可变区氨基酸序列的重链组成的抗体；和由具有SEQ ID NO:67中所示的轻链可变区氨基酸序列的轻链和具有SEQ ID NO:75中所示的重链可变区氨基酸序列的重链组成的抗体。
具有上述轻链和重链的优选组合的抗体的其它实例包括由下述轻链和重链组成的抗体：由SEQ ID NO:61中所示的轻链全长氨基酸序列(在本说明书中也称为hL02轻链全长氨基酸序列)中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链或由SEQ ID NO:65中所示的轻链全长氨基酸序列(在本说明书中也称为hL03轻链全长氨基酸序列)中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链，和由SEQ ID NO:69中所示的重链全长氨基酸序列(在本说明书中也称为hH01重链全长氨基酸序列)中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链、由SEQ ID NO:73中所示的重链全长氨基酸序列(在本说明书中也称为hH02重链全长氨基酸序列)中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链或由SEQ ID NO:77中所示的重链全长氨基酸序列(在本说明书中也称为hH04重链全长氨基酸序列)中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链。其优选实例包括：用由SEQ ID NO:61中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体；用由SEQ ID NO:61中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体；用由SEQ ID NO:61中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体；用由SEQ ID NO:65中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ IDNO:69中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体；用由SEQ ID NO:65中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体；和用由SEQ ID NO:65中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体其更优选的实例包括：用由SEQ ID NO:61中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体(在本说明书中也称为"H01L02抗体"或"H01L02")；用由SEQ ID NO:61中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体(在本说明书中也称为"H02L02抗体"或"H02L02")；用由SEQ ID NO:61中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体(在本说明书中也称为"H04L02抗体"或"H04L02")；和用由SEQ ID NO:65中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体(在本说明书中也称为"H02L03抗体"或"H02L03")。H01L02抗体、H02L02抗体、H02L03抗体或H04L02抗体的序列显示在表1中。
通过将表现出与上述重链氨基酸序列和轻链氨基酸序列的高度一致性的序列组合在一起，有可能选择具有与各上述抗体等同的生物活性的抗体。这样的一致性是通常80％或更高，优选90％或更高，更优选95％或更高，最优选99％或更高的一致性。此外，也通过组合相对于重链或轻链的氨基酸序列包含其一个或几个氨基酸残基的取代、缺失或添加的重链和轻链的氨基酸序列，有可能选择具有与各上述抗体等同的生物活性的抗体。
两种类型的氨基酸序列之间的一致性可以通过使用Clustal W版本2的默认参数比对序列来测定(Larkin MA,Blackshields G,Brown NP,Chenna R,McGettigan PA,McWilliam H,Valentin F,Wallace IM,Wilm A,Lopez R,Thompson JD,Gibson TJ和Higgins DG(2007),"Clustal Wand Clustal X version 2.0",Bioinformatics.23(21):2947-2948)。
要指出，在SEQ ID NO:61中所示的hL02轻链全长氨基酸序列中，由位置1至20的氨基酸残基组成的氨基酸序列是信号序列，由位置21至128的氨基酸残基组成的氨基酸序列是可变区，并且由位置129至233的氨基酸残基组成的氨基酸序列是恒定区。在SEQ ID NO:62中所示的hL02轻链全长核苷酸序列中，由位置1至60的核苷酸组成的核苷酸序列编码信号序列，由位置61至384的核苷酸组成的核苷酸序列编码可变区，并且由位置385至699的核苷酸组成的核苷酸序列编码恒定区。
在SEQ ID NO:65中所示的hL03轻链全长氨基酸序列中，由位置1至20的氨基酸残基组成的氨基酸序列是信号序列、由位置21至128的氨基酸残基组成的氨基酸序列是可变区，并且由位置129至233的氨基酸残基组成的氨基酸序列是恒定区。在SEQ ID NO:66中所示的hL03轻链全长核苷酸序列中，由位置1至60的核苷酸组成的核苷酸序列编码信号序列，由位置61至384的核苷酸组成的核苷酸序列编码可变区，并且由位置385至699的核苷酸组成的核苷酸序列编码恒定区。
在SEQ ID NO:69中所示的hH01重链全长氨基酸序列中，由位置1至19的氨基酸残基组成的氨基酸序列是信号序列，由位置20至141的氨基酸残基组成的氨基酸序列是可变区，并且由位置142至471的氨基酸残基组成的氨基酸序列是恒定区。在SEQ ID NO:70中所示的hH01重链全长核苷酸序列中，由位置1至57的核苷酸组成的核苷酸序列编码信号序列，由位置58至423的核苷酸组成的核苷酸序列编码可变区，并且由位置424至1413的核苷酸组成的核苷酸序列编码恒定区。
在SEQ ID NO:73中所示的hH02重链全长氨基酸序列中，由位置1至19的氨基酸残基组成的氨基酸序列是信号序列，由位置20至141的氨基酸残基组成的氨基酸序列是可变区，并且由位置142至471的氨基酸残基组成的氨基酸序列是恒定区。在SEQ ID NO:74中所示的hH02重链全长核苷酸序列中，由位置1至57的核苷酸组成的核苷酸序列编码信号序列，由位置58至423的核苷酸组成的核苷酸序列编码可变区，并且由位置424至1413的核苷酸组成的核苷酸序列编码恒定区。
在SEQ ID NO:77中所示的hH04重链全长氨基酸序列中，由位置1至19的氨基酸残基组成的氨基酸序列是信号序列，由位置20至141的氨基酸残基组成的氨基酸序列是可变区，并且由位置142至471的氨基酸残基组成的氨基酸序列是恒定区。在SEQ ID NO:78中显示的hH04重链全长核苷酸序列中，由位置1至57的核苷酸组成的核苷酸序列编码信号序列，由位置58至423的核苷酸组成的核苷酸序列编码可变区，并且由位置424至1413的核苷酸组成的核苷酸序列编码恒定区。
[表1-1]
[表1-2]
[表1-3]
[表1-4]
[表1-5[
[表1-6]
[表1-7]
[表1-8]
[表1-9]
[表1-10]
[表1-11]
[表1-12]
[表1-13]
[表1-14]
[表1-15]
[表1-16]
在本说明书中，表1-1至1-16也统称为表1。
本发明的抗体的进一步实例可包括结合至CDH6的人抗体。抗CDH6人抗体是指仅具有衍生自人染色体的抗体的基因序列的人抗体。抗CDH6人抗体可以通过使用具有包含人抗体的重链和轻链基因的人染色体片段的产生人抗体的小鼠的方法获得(参见Tomizuka,K.等人,Nature Genetics(1997)16,第133-143页；Kuroiwa,Y.等人,Nucl.Acids Res.(1998)26,第3447-3448页；Yoshida,H.等人,Animal Cell Technology:Basic and AppliedAspects第10卷,第69-73页(Kitagawa,Y.,Matsuda,T.和Iijima,S.编辑),KluwerAcademic Publishers,1999；Tomizuka,K.等人,Proc.Natl.Acad.Sci.USA(2000)97,第722-727页；等等)。
这样的产生人抗体的小鼠可以通过使用基因修饰动物特异性地产生，该动物的内源免疫球蛋白重链和轻链的基因座已经被破坏，然后取而代之地使用酵母人工染色体(YAC)载体等引入人免疫球蛋白重链和轻链的基因座，然后由这样的基因修饰动物产生敲除动物和转基因动物，然后将这些动物相互繁殖。
或者，抗CDH6人抗体也可以如下获得：用编码这样的人抗体的各重链和轻链的cDNA或优选用包含该cDNA的载体根据基因重组技术转化真核细胞，然后培养转化细胞以产生基因修饰的人单克隆抗体，以使该抗体可从培养上清液中获得。
在本文中，真核细胞，优选哺乳动物细胞，如CHO细胞、淋巴细胞或骨髓瘤可以例如用作宿主。
此外，获得已经从人抗体库选择的噬菌体展示衍生的人抗体的方法也是已知的(参见Wormstone,I.M.等人,Investigative Ophthalmology&Visual Science.(2002)43(7),第2301-2308页；Carmen,S.等人,Briefings in Functional Genomics和Proteomics(2002),1(2),第189-203页；Siriwardena,D.等人,Ophthalmology(2002)109(3),第427-431页；等等)。
例如，可以应用噬菌体展示方法，其包括使人抗体的可变区作为单链抗体(scFv)在噬菌体的表面上表达，然后选择与抗原结合的噬菌体(Nature Biotechnology(2005),23,(9),第1105-1116页)。
通过分析由于其与抗原的结合能力而选择的噬菌体基因，可以确定编码与抗原结合的人抗体的可变区的DNA序列。
一旦确定与抗原结合的scFv的DNA序列，生产具有上述序列的表达载体，然后将生产的表达载体引入适当的宿主，并使其在其中表达，由此获得人抗体(国际公开号WO92/01047、WO92/20791、WO93/06213、WO93/11236、WO93/19172、WO95/01438和WO95/15388、Annu.Rev.Immunol(1994)12,第433-455页、Nature Biotechnology(2005)23(9),第1105-1116页)。
如果新产生的人抗体与本说明书中描述的任一种大鼠抗人CDH6抗体、嵌合抗人CDH6抗体或人源化抗人CDH6抗体(例如rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体、rG061抗体、chG019抗体、H01L02抗体、H02L02抗体、H02L03抗体或H04L02抗体)所结合的部分肽或部分三维结构结合，可以确定该人抗体与大鼠抗人CDH6抗体、嵌合抗人CDH6抗体或人源化抗人CDH6抗体所结合的相同表位结合。或者，通过确认该人抗体与本说明书中描述的大鼠抗人CDH6抗体、嵌合抗人CDH6抗体或人源化抗人CDH6抗体(例如rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体、rG061抗体、chG019抗体、H01L02抗体、H02L02抗体、H02L03抗体或H04L02抗体)竞争抗体与CDH6的结合(例如，该人抗体干扰rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体、rG061抗体、chG019抗体、H01L02抗体、H02L02抗体、H02L03抗体或H04L02抗体与CDH6，优选CDH6的EC3结合)，可以确定该人抗体结合至本说明书中描述的大鼠抗人CDH6抗体、嵌合抗人CDH6抗体或人源化抗人CDH6抗体所结合的相同表位，即使尚未确定该表位的特定序列或结构。在本说明书中，当通过这些测定方法的至少一种确定该人抗体“结合至相同表位”时，结论是该新制备的人抗体与本说明书中描述的大鼠抗人CDH6抗体、嵌合抗人CDH6抗体或人源化抗人CDH6抗体“结合至相同表位”。当确认该人抗体结合至相同表位时，预期该人抗体应该具有与大鼠抗人CDH6抗体、嵌合抗人CDH6抗体或人源化抗人CDH6抗体(例如rG019抗体、rG055抗体、rG056抗体、rG061抗体、chG019抗体、H01L02抗体、H02L02抗体、H02L03抗体或H04L02抗体)等同的生物活性。
根据已知方法等评估通过上述方法获得的嵌合抗体、人源化抗体或人抗体对抗原的结合活性，从而可以选择优选抗体。
用于比较抗体性质的另一指标的一个实例可以包括抗体的稳定性。差示扫描量热计(DSC)是能够迅速准确地测量作为蛋白质的相对结构稳定性的良好指标的热变性中点(Tm)的装置。通过使用DSC测量Tm值并对所得值进行比较，可以比较热稳定性的差异。已知抗体的保存稳定性与抗体的热稳定性具有一定相关性(Lori Burton等人,PharmaceuticalDevelopment andTechnology(2007)12,第265-273页)，因此，可以使用热稳定性作为指标来选择优选抗体。用于选择抗体的指标的其它实例可包括在合适的宿主细胞中的高产率和在水溶液中的低凝集。例如，由于具有最高产率的抗体并不总是表现出最高的热稳定性，必须通过基于上述指标对其进行综合测定来选择最适合施用于人的抗体。
本发明的抗体还包括抗体的修饰。修饰用于意指经过化学或生物修饰的本发明的抗体。这样的化学修饰的实例包括化学部分与氨基酸骨架的结合，以及N-连接或O-连接的碳水化合物链的化学修饰。这样的生物修饰的实例包括已经经过翻译后修饰(例如，N-连接或O-连接糖基化、N-末端或C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化以及N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸)的抗体，以及由于允许使用原核生物宿主细胞表达而在其N-末端添加甲硫氨酸残基的抗体。此外，这样的修饰还意在包括为了使得能够检测或分离本发明的抗体或抗原而标记的抗体，例如酶标记的抗体、荧光标记的抗体和亲和标记的抗体。本发明的抗体的这种修饰可用于改善抗体在血液中的稳定性和保留；降低抗原性；检测或分离抗体或抗原；等。
此外，通过调节与本发明的抗体结合的糖链修饰(糖基化、去岩藻糖基化等)，可以增强抗体依赖性细胞毒性活性。作为调节抗体的糖链修饰的技术，国际公开号WO1999/54342、WO2000/61739和WO2002/31140等中描述的那些是已知的，但技术不限于此。本发明的抗体还包括已经对其调节上述糖链修饰的抗体。
一旦分离出抗体基因，可以使用宿主和表达载体的适当组合将该基因引入适当的宿主以产生抗体。抗体基因的特定实例可以是编码本说明书中描述的抗体的重链序列的基因和编码其中描述的抗体的轻链序列的基因的组合。在宿主细胞转化后，可以将这样的重链序列基因和轻链序列基因插入单个表达载体中，或者这些基因可以取而代之地各自插入不同的表达载体中。
当使用真核细胞作为宿主时，可以使用动物细胞、植物细胞或真核微生物。特别地，动物细胞的实例可以包括哺乳动物细胞，如COS细胞，其是猴细胞(Gluzman,Y.,Cell(1981)23,第175-182页，ATCC CRL-1650)、小鼠成纤维细胞NIH3T3(ATCC No.CRL-1658)、中国仓鼠卵巢细胞的二氢叶酸还原酶缺陷细胞系(CHO细胞，ATCC CCL-61)(Urlaub,G.和Chasin,L.A.Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.(1980)77，第4126-4220页)和Freestyle 293F细胞(Invitrogen Corp.)。
当使用原核细胞作为宿主时，例如可以使用大肠杆菌或枯草芽孢杆菌。
将感兴趣的抗体基因引入这些细胞以进行转化，然后将转化细胞体外培养以获得抗体。在上述培养中，存在产率随抗体的序列而不同的情况，因此，有可能使用产率作为指标从具有等同结合活性的抗体中选择容易作为药剂生产的抗体。因此，本发明的抗体还包括通过上述用于生产抗体的方法获得的抗体，所述方法包括培养转化的宿主细胞的步骤和从上述步骤中获得的培养物中收集感兴趣的抗体或抗体的功能片段的步骤。
已知删除在培养的哺乳动物细胞中产生的抗体的重链的羧基末端的赖氨酸残基(Journal ofChromatographyA,705:129-134(1995))，并且还已知删除在重链羧基末端的两个氨基酸残基，甘氨酸和赖氨酸，并且新定位于羧基末端的脯氨酸残基被酰胺化(Analytical Biochemistry,360:75-83(2007))。但是，这些重链序列的此类删除和修饰对抗体的抗原结合活性和效应子功能(补体活化、抗体依赖性细胞毒性等)没有影响。因此，根据本发明的抗体也包括已经经过上述修饰的抗体和该抗体的功能片段，并且这样的抗体的具体实例包括在重链羧基末端包含1或2个氨基酸缺失的缺失突变体，和通过上述缺失突变体的酰胺化形成的缺失突变体(例如，其中羧基末端位点的脯氨酸残基被酰胺化的重链)。但是，涉及根据本发明的抗体的重链的羧基末端处的缺失的缺失突变体不限于上述缺失突变体，只要它们保留抗原结合活性和效应子功能。构成根据本发明的抗体的两个重链可以是选自全长抗体和上述缺失突变体的任何一种类型的重链，或者可以是选自上述组的任何两种类型的组合。个别缺失突变体的比率可受产生根据本发明的抗体的培养哺乳动物细胞的类型和培养条件影响。根据本发明的抗体的主要成分的实例可以包括在两个重链的各羧基末端缺失一个氨基酸残基的抗体。
本发明的抗体的同种型的实例可包括IgG(IgG1、IgG2、IgG3和IgG4)。其中，IgG1和IgG4是优选的。
抗体的生物活性的实例通常可以包括抗原结合活性、通过与抗原结合而内化到表达抗原的细胞中的活性、中和抗原活性的活性、增强抗原活性的活性、抗体依赖性细胞毒性(ADCC)活性、补体依赖性细胞毒性(CDC)活性和抗体依赖性细胞吞噬作用(ADCP)。根据本发明的抗体的功能是针对CDH6的结合活性，并且优选是通过与CDH6结合而内化到表达CDH6的细胞中的活性。此外，本发明的抗体可具有ADCC活性、CDC活性和/或ADCP活性，以及细胞内化活性。
可以将所得抗体纯化至均质状态。对于抗体的分离和纯化，可以使用用于普通蛋白质的分离和纯化方法。例如，适当地选择柱色谱法、过滤、超滤、盐析、透析、制备型聚丙烯酰胺凝胶电泳和等电聚焦并彼此组合，以使抗体可以分离和纯化(Strategies forProtein Purification and Characterization:A Laboratory Course Manual,DanielR.Marshak等人编辑,Cold Spring Harbor Laboratory Press(1996)；和Antibodies:ALaboratory Manual.Ed Harlow和David Lane,Cold Spring Harbor Laboratory(1988))，尽管分离和纯化方法的实例不限于此。
色谱法的实例可包括亲和色谱法、离子交换色谱法、疏水色谱法、凝胶过滤色谱法、反相色谱法和吸收色谱法。
这些色谱技术可以使用液相色谱法如HPLC或FPLC进行。
用于亲和色谱法的柱的实例可包括蛋白A柱和蛋白G柱。涉及使用蛋白A的柱的实例可包括Hyper D、POROS和Sepharose F.F.(Pharmacia)。
此外，使用抗原固定化载体，可以利用抗体对抗原的结合活性来纯化抗体。
3.抗CDH6抗体-药物偶联物
(1)药物
上述“2.抗CDH6抗体的生产”中获得的抗CDH6抗体可以经由连接子结构部分与药物偶联以制备抗CDH6抗体-药物偶联物。对药物没有特别限制，只要其具有可以连接到连接子结构的取代基或部分结构。抗CDH6抗体-药物偶联物可以根据偶联的药物用于各种目的。这样的药物的实例可包括具有抗肿瘤活性的物质、对血液疾病有效的物质、对自身免疫性疾病有效的物质、抗炎物质、抗微生物物质、抗真菌物质、抗寄生虫物质、抗病毒物质和抗麻醉物质。
(1)-1抗肿瘤化合物
下面描述使用抗肿瘤化合物作为本发明的抗CDH6抗体-药物偶联物中偶联的化合物的一个实例。对抗肿瘤化合物没有特别限制，只要该化合物具有抗肿瘤作用并且具有可以连接到连接子结构的取代基或部分结构。在连接子的一部分或全部在肿瘤细胞中断裂后，释放抗肿瘤化合物部分，以使抗肿瘤化合物表现出抗肿瘤作用。当连接子在与药物的连接位置断裂时，抗肿瘤化合物以其原始结构释放以发挥其原始抗肿瘤作用。
在上述“2.抗CDH6抗体的生产”中获得的抗CDH6抗体可以经由连接子结构部分与抗肿瘤化合物偶联，以制备抗CDH6抗体-药物偶联物。
作为本发明中使用的抗肿瘤化合物的一个实例，可以优选使用依喜替康，一种喜树碱衍生物(由下式表示的(1S,9S)-1-氨基-9-乙基-5-氟-2,3-二氢-9-羟基-4-甲基-1H,12H-苯并[de]吡喃并[3',4':6,7]吲哚嗪并[1,2-b]喹啉-10,13(9H,15H)-二酮)。
[式5]
该化合物可以通过例如美国专利公开号US2016/0297890中描述的方法或其它已知方法容易地获得，并且在位置1处的基团可以优选用作连接子结构的连接位置。此外，依喜替康可以在肿瘤细胞中释放，而连接子的一部分仍然连接在其上。但是，该化合物即使在这种状态下也发挥优异的抗肿瘤作用。
由于依喜替康具有喜树碱结构，已知在酸性水性介质(例如，大约pH 3)中平衡移动到具有形成的内酯环(闭环)的结构，而在碱性水性介质(例如，大约pH 10)中平衡移动到具有打开的内酯环(开环)的结构。其中已经引入与这样的闭环结构和开环结构对应的依喜替康残基的药物偶联物也预期具有等同的抗肿瘤作用，并且不用说，任何这样的药物偶联物都包括在本发明的范围内。
抗肿瘤化合物的其它实例可包括文献中描述的抗肿瘤化合物(PharmacologicalReviews,68,第3-19页,2016)。其具体实例可包括多柔比星、卡奇霉素(calicheamicin)、海兔毒素10(dolastatin 10)、澳瑞他汀(auristatins)如单甲基澳瑞他汀E(MMAE)和单甲基澳瑞他汀F(MMAF)、美登素类(maytansinoids)如DM1和DM4、吡咯并苯并二氮杂二聚体(pyrrolobenzodiazepine dimer)SG2000(SJG-136)、喜树碱衍生物SN-38、倍癌霉素(duocarmycins)如CC-1065、鹅膏蕈碱、柔红霉素、丝裂霉素C、博来霉素、环胞苷、长春新碱、长春碱、甲氨蝶呤、铂类抗肿瘤剂(顺铂及其衍生物)和紫杉醇(Taxol)及其衍生物。
在抗体-药物偶联物中，每抗体分子的偶联药物分子数是影响其效力和安全性的关键因素。抗体-药物偶联物的生产通过指定反应条件(如用于反应的起始材料和试剂的量)来进行，以获得恒定数目的偶联药物分子。与低分子量化合物的化学反应不同，通常获得含有不同数目的偶联药物分子的混合物。限定每抗体分子的偶联药物分子数并表示为平均值，即偶联药物分子的平均数。除非另有说明，即，除非表示具有不同数目的偶联药物分子的抗体-药物偶联物混合物中的具有特定数目的偶联药物分子的抗体-药物偶联物，根据本发明的偶联药物分子数通常也是指平均值。与抗体分子偶联的依喜替康分子数是可控的，并且作为每抗体的偶联药物分子的平均数，可以偶联约1至10个依喜替康分子。依喜替康分子数优选为2至8、3至8、4至8。5至8、6至8或7至8，更优选5至8，进一步优选7至8，再进一步优选8。要指出，本领域技术人员可以基于本申请的实施例的描述设计用于将所需数目的药物分子与抗体分子偶联的反应，并且可以获得具有受控数目的偶联依喜替康分子的抗体-药物偶联物。
(2)连接子结构
将描述本发明的抗CDH6抗体-药物偶联物中的将药物与抗CDH6抗体偶联的连接子结构。
在本申请的抗体-药物偶联物中，将抗CDH6抗体与药物偶联的连接子结构不受特别限制，只要可以使用所得的抗体-药物偶联物。可以根据使用目的适当选择和使用连接子结构。连接子结构的一个实例可包括已知文献(Pharmacol Rev 68:3-19,2016年1月,Protein Cell DOI10.1007/s13238-016-0323-0等)中描述的连接子。其进一步的具体实例可包括VC(缬氨酸-瓜氨酸)、MC(马来酰亚胺基己酰基)、SMCC(4-(N-马来酰亚胺基甲基)环己烷-1-甲酸琥珀酰亚胺酯)、SPP(N-琥珀酰亚胺基4-(2-吡啶基二硫代)戊酸酯，SS(二硫化物))、SPDB(N-琥珀酰亚胺基4-(2-吡啶基二硫代)丁酸酯，SS/腙、腙和碳酸酯。
另一个实例可以包括美国专利公开号US2016/0297890中描述的连接子结构(作为一个实例，其段落[0260]至[0289]中描述的那些)。可以优选使用下面给出的任何连接子结构。要指出，该结构的左端是与抗体的连接位置，其右端是与药物的连接位置。此外，下面给出的连接子结构中的GGFG代表由经由肽键连接的甘氨酸-甘氨酸-苯丙氨酸-甘氨酸(GGFG)组成的氨基酸序列。
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-,
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-,
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(＝O)-,
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2-O-CH2-C(＝O)-,
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-，和
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-。
更优选的是以下：
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(＝O)-,
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2-O-CH2-C(＝O)-，和
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-。
再更优选的是以下：
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(＝O)-，和
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-。
抗体连接至-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)的末端(例如，“-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(＝O)-”中与连接CH2CH2CH2CH2CH2-的末端相反的末端(左末端))，并且抗肿瘤化合物连接至与抗体连向-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)的末端相反的末端(上述实例中的右端的CH2-O-CH2-C(＝O)-的羰基)。“-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-”具有由下式表示的结构：
[式6]
该部分结构的位置3是与抗CDH6抗体的连接位置。在位置3处与抗体的这种连接的特征在于形成硫醚键。该结构部分的位置1处的氮原子连接至包括该结构的连接子内存在的亚甲基的碳原子。
在具有依喜替康作为药物的本发明的抗体-药物偶联物中，具有下面给出的任何结构的药物-连接子结构部分优选用于与抗体偶联。对于这些药物-连接子结构部分，每抗体偶联的平均数可为1至10，优选2至8，更优选5至8，进一步优选7至8，再进一步优选8。
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-(NH-DX),
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-(NH-DX),
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(＝O)-(NH-DX),
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2-O-CH2-C(＝O)-(NH-DX),
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-(NH-DX)，和
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-(NH-DX)。
更优选的是以下：
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(＝O)-(NH-DX),
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2-O-CH2-C(＝O)-(NH-DX)，和
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-(NH-DX)。
再更优选的是以下：
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(＝O)-(NH-DX)，和
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-(NH-DX)。
-(NH-DX)具有由下式表示的结构：
[式7]
并且其代表通过从依喜替康的位置1处的氨基除去一个氢原子而衍生的基团。
(3)生产抗体-药物偶联物的方法
对本发明的抗体-药物偶联物中可使用的抗体没有特别限制，只要其是如上述章节“2.抗CDH6抗体的生产”和实施例中所述的具有内化活性的抗CDH6抗体或该抗体的功能片段，。
接下来，将描述生产本发明的抗体-药物偶联物的典型方法。要指出，在下面的描述中，各反应图式中所示的“化合物编号”用于代表化合物。具体地，各化合物被称为“式(1)的化合物”、“化合物(1)”等。其它化合物编号也是如此。
(3)-1生产方法1
下面给出的式(1)所示的抗体-药物偶联物(其中抗CDH6抗体经由硫醚连接至连接子结构)可以通过使具有通过抗CDH6抗体的还原而从二硫键转化的巯基的抗体与化合物(2)反应来生产，化合物(2)可通过已知方法获得(例如，可通过专利公开文献US2016/297890中描述的方法(例如段落[0336]至[0374]中描述的方法)获得)。这种抗体-药物偶联物可以例如通过以下方法生产。
[表达式1]
其中AB代表具有巯基的抗体，其中
L1具有由-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-表示的结构，和、and
L1'代表由下式表示的马来酰亚胺基。
[式8]
-L1-LX具有由以下任一式表示的结构：
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-,
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-,
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(＝O)-,
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2-O-CH2-C(＝O)-,
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-，和
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-。
其中，更优选的是以下：
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(＝O)-,
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2-O-CH2-C(＝O)-，和
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-。
进一步优选的是以下：
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2CH2CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2-O-CH2-C(＝O)-，和
-(琥珀酰亚胺-3-基-NN)-CH2CH2-C(＝O)-NH-CH2CH2O-CH2CH2O-CH2CH2-C(＝O)-GGFG-NH-CH2CH2CH2-C(＝O)-。
在上述反应图式中，抗体-药物偶联物(1)可以被理解为具有这样的结构，其中从药物到连接子末端的一个结构部分与一个抗体连接。但是，这一描述是为了方便起见给出的，实际上在许多情况中多个上述结构部分与一个抗体分子连接。这同样适用于下述生产方法的解释。
具体地，抗体-药物偶联物(1)可以通过使可通过已知方法获得(例如，可通过专利公开文献US2016/297890中描述的方法获得(例如可通过段落[0336]至[0374]中描述的方法获得))的化合物(2)与具有巯基的抗体(3a)反应来生产。
具有巯基的抗体(3a)可以通过本领域技术人员熟知的方法获得(Hermanson,G.T.,Bioconjugate Techniques,第56-136页,第456-493页,Academic Press(1996))。该方法的实例可以包括但不限于：使Traut试剂与抗体的氨基反应；使N-琥珀酰亚胺基S-乙酰基硫代链烷酸酯与抗体的氨基反应，然后与羟胺反应；使N-琥珀酰亚胺基3-(吡啶基二硫代)丙酸酯与抗体反应，然后与还原剂反应；使抗体与还原剂如二硫苏糖醇、2-巯基乙醇或三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP)反应以还原抗体中的链间二硫键，以形成巯基。
具体地，可以通过抗体中的每链间二硫键使用0.3至3摩尔当量的TCEP作为还原剂并使还原剂与抗体在含有螯合剂的缓冲溶液中反应来获得链间二硫键部分或完全被还原的抗体。螯合剂的实例可包括乙二胺四乙酸(EDTA)和二亚乙基三胺五乙酸(DTPA)。螯合剂可以以1mM至20mM的浓度使用。可以使用磷酸钠、硼酸钠、乙酸钠等的溶液作为缓冲溶液。作为一个具体实例，可以通过使抗体与TCEP在4℃至37℃下反应1至4小时而获得具有部分或完全还原的巯基的抗体(3a)。
要指出，通过进行巯基与药物-连接子部分的加成反应，药物-连接子部分可以通过硫醚键偶联。
然后，每具有巯基的抗体(3A)使用2至20摩尔当量的化合物(2)，可以生产其中每抗体偶联2至8个药物分子的抗体-药物偶联物(1)。具体地，可以将含有溶解于其中的化合物(2)的溶液添加到含有具有巯基的抗体(3a)的缓冲溶液中以进行反应。在这种情况下，可以使用乙酸钠溶液、磷酸钠、硼酸钠等作为缓冲溶液。该反应的pH为5至9，更优选地，该反应可以在pH 7附近进行。可以使用有机溶剂如二甲亚砜(DMSO)、二甲基甲酰胺(DMF)、二甲基乙酰胺(DMA)或N-甲基-2-吡咯烷酮(NMP)作为用于溶解化合物(2)的溶剂。可以通过将含有以1至20％v/v溶解在有机溶剂中的化合物(2)的溶液添加到含有具有巯基的抗体(3a)的缓冲溶液中来进行反应。反应温度为0至37℃，更优选10至25℃，反应时间为0.5至2小时。可以通过用含硫醇试剂使未反应的化合物(2)的反应性失活来终止反应。含硫醇试剂是例如半胱氨酸或N-乙酰基-L-半胱氨酸(NAC)。更具体地，可以通过向所用的化合物(2)中加入1至2摩尔当量的NAC，并将所得混合物在室温下培育10至30分钟来终止反应。
(4)抗体-药物偶联物的鉴定
可以根据下述常用程序对产生的抗体-药物偶联物(1)进行浓缩、缓冲液交换、纯化以及测量抗体浓度和每抗体分子的偶联药物分子的平均数，以鉴定抗体-药物偶联物(1)。
(4)-1常用程序A：抗体或抗体-药物偶联物的水溶液的浓缩
向AmiconUltra(50,000MWCO，Millipore Corporation)容器中加入抗体或抗体-药物偶联物的溶液，并且该抗体或抗体-药物偶联物的溶液使用离心机(AllegraX-15R,Beckman Coulter,Inc.)通过离心(以2000G至3800G离心5至20分钟)浓缩。
(4)-2常用程序B:抗体浓度的测量
使用UV检测器(Nanodrop 1000,Thermo Fisher Scientific Inc.)根据制造商定义的方法进行抗体浓度的测量。在这方面，使用在抗体之间不同的280nm吸收系数(1.3mLmg-1cm-1至1.8mLmg-1cm-1)。
(4)-3常用程序C:抗体的缓冲液交换
使用Sephadex G-25载体的NAP-25柱(Cat.No.17-0852-02,GE Healthcare JapanCorporation)根据制造商定义的方法用含有氯化钠(50mM)和EDTA(2mM)的磷酸盐缓冲液(50mM，pH 6.0)(在本说明书中称为PBS6.0/EDTA)平衡。以每个NAP-25柱2.5mL的量施加抗体的水溶液，此后，收集用3.5mL PBS6.0/EDTA洗脱的级分(3.5mL)。该级分通过常用程序A浓缩。在使用常用程序B测量抗体浓度后，使用PBS6.0/EDTA将抗体浓度调节至20mg/ml。
(4)-4常用程序D:抗体-药物偶联物的纯化
NAP-25柱用任何市售缓冲溶液平衡，如含有山梨糖醇(5％)的乙酸盐缓冲液(10mM，pH 5.5；在本说明书中称为ABS)。将抗体-药物偶联物的水性反应溶液(大约2.5mL)施加到NAP-25柱，此后用缓冲溶液以制造商限定的量进行洗脱，以收集抗体级分。将凝胶过滤纯化过程(其中将收集的级分再次施加到NAP-25柱，并用缓冲溶液进行洗脱)重复总共2或3次，以获得不包括非偶联的药物连接子和低分子量化合物(三(2-羧乙基)膦盐酸盐(TCEP)、N-乙酰基-L-半胱氨酸(NAC)和二甲亚砜)的抗体-药物偶联物。
(4)-5常用程序E:抗体-药物偶联物中的抗体浓度和每抗体分子的偶联药物分子的平均数的测量
抗体-药物偶联物中的偶联药物浓度可以通过测量抗体-药物偶联物的水溶液在280nm和370nm的两个波长下的UV吸光度，此后进行下示计算来计算。
在任何给定波长下的总吸光度等于系统中存在的所有吸光化学物类的吸光度之和[吸光度的相加性]。因此，基于抗体和药物的摩尔吸收系数在抗体和药物之间偶联之前和之后没有变化的假设，抗体-药物偶联物中的抗体浓度和药物浓度由以下等式表示。
A280＝AD,280+AA,280＝εD,280CD+εA,280CA等式(1)
A370＝AD,370+AA,370＝εD,370CD+εA,370CA等式(2)
在这种情况下，A280代表抗体-药物偶联物的水溶液在280nm下的吸光度，A370代表抗体-药物偶联物的水溶液在370nm下的吸光度，AA,280代表抗体在280nm下的吸光度，AA,370代表抗体在370nm下的吸光度，AD,280代表偶联物前体在280nm下的吸光度，AD,370代表偶联物前体在370nm下的吸光度，εA,280代表抗体在280nm下的摩尔吸收系数，εA,370代表抗体在370nm下的摩尔吸收系数，εD,280代表偶联物前体在280nm下的摩尔吸收系数，εD,370代表偶联物前体在370nm下的摩尔吸收系数，CA代表抗体-药物偶联物中的抗体浓度，并且CD代表抗体-药物偶联物中的药物浓度。
在这种情况下，关于εA,280、εA,370、εD,280和εD,370，使用预先准备的值(基于计算的估计值或通过化合物的UV测量获得的测量值)。例如，εA,280可以由抗体的氨基酸序列通过已知的计算方法估计(Protein Science,1995,第4卷,2411-2423)。εA,370通常为零。εD,280和εD,370可以根据朗伯-比尔定律(Lambert-Beerlaw)(吸光度＝摩尔浓度×摩尔吸收系数×池(cell)路径长度)通过测量所用偶联物前体以特定摩尔浓度溶解的溶液的吸光度来获得。CA和CD可以通过测量抗体-药物偶联物的水溶液的A280和A370，然后代入这些值以将联立方程(1)和(2)求解来测定。此外，通过将CD除以CA，可以测定每抗体的偶联药物分子的平均数。
(4)-6常用程序F:抗体-药物偶联物中的每抗体分子的偶联药物分子的平均数的测量-(2)
除了上述“(4)-5常用程序E”外，还可以使用以下方法通过高效液相色谱(HPLC)分析测定抗体-药物偶联物中的每抗体分子的偶联药物分子的平均数。在下文中，将描述当抗体通过二硫键与药物连接子偶联时通过HPLC测量偶联药物分子的平均数的方法。参考这种方法，本领域技术人员能够根据抗体和药物连接子之间的连接方式通过HPLC适当地测量偶联药物分子的平均数。
F-1.用于HPLC分析的样品的制备(抗体-药物偶联物的还原)
将将抗体-药物偶联物溶液(大约1mg/mL，60μL)与二硫苏糖醇(DTT)的水溶液(100mM，15μL)混合。通过将该混合物在37℃下培育30分钟，使抗体-药物偶联物的轻链和重链之间的二硫键断裂。所得样品用于HPLC分析。
F-2.HPLC分析
HPLC分析在以下测量条件下进行。
HPLC系统:Agilent 1290HPLC system(Agilent Technologies,Inc.)
检测器:紫外吸收光谱仪(测量波长:280nm)
柱:ACQUITY UPLC BEH Phenyl(2.1×50mm，1.7μm，130埃；Waters Corp.,P/N186002884)
柱温:80℃
流动相A:含有0.10％三氟乙酸(TFA)和15％2-丙醇的水溶液流动相B:含有0.075％TFA和15％2-丙醇的乙腈溶液
梯度程序:14％-36％(0min-15min)、36％-80％(15min-17min)、80％-14％(17min-17.01min.)和14％(17.01min-25min)
样品注射:10μL
F-3.数据分析
F-3-1.与非偶联抗体轻链(L0)和重链(H0)相比，结合至药物分子的轻链(结合至i个药物分子的轻链：Li)和结合至药物分子的重链(结合至i个药物分子的重链：Hi)表现出与偶联药物分子数成比例的更高疏水性并因此具有更大的保留时间。这些链因此以例如L0和L1或H0、H1、H2和H3的顺序洗脱。通过将保留时间与L0和H0进行比较，可以将检测峰分配给L0、L1、H0、H1、H2和H3的任一个。偶联的药物分子数可以由本领域技术人员限定，但优选为L0、L1、H0、H1、H2和H3。
F-3-2.由于药物连接子具有UV吸收，根据以下表达式使用轻链或重链和药物连接子的摩尔吸收系数响应偶联的药物连接子分子数校正峰面积值。
[表达式2]
[表达式3]
在这种情况下，由各抗体的轻链或重链的氨基酸序列通过已知的计算方法(Protein Science,1995,第4卷,2411-2423)估计的值可用作抗体的轻链或重链的摩尔吸收系数(280nm)。在H01L02的情况下，根据抗体的氨基酸序列，分别使用摩尔吸收系数31710和摩尔吸收系数79990作为轻链和重链的估计值。其中马来酰亚胺基团已经通过各药物连接子与巯基乙醇或N-乙酰半胱氨酸的反应转化成琥珀酰亚胺硫醚的化合物的实际测量的摩尔吸收系数(280nm)用作药物连接子的摩尔吸收系数(280nm)。用于吸光度测量的波长可以由本领域技术人员适当地设定，但优选是可以测量抗体峰的波长，更优选为280nm。
F-3-3.对于峰面积的校正值的总和，根据以下表达式计算各链的峰面积比(％)。
[表达式4]
ALi和AHi：分别为Li和Hi的峰面积的校正值
F-3-4.根据以下表达式计算抗体-药物偶联物中的每抗体分子的偶联药物分子的平均数。
偶联药物分子的平均数＝(L0峰面积比x 0+L1峰面积比x 1+H0峰面积比x 0+H1峰面积比x 1+H2峰面积比x 2+H3峰面积比x 3)/100x2
要指出，为了确保抗体-药物偶联物的量，可以将已经在类似条件下生产的具有几乎相同的偶联药物分子平均数(例如，大约±1)的多个抗体-药物偶联物混合以制备新批次。在这种情况下，新批次的药物分子的平均数在混合前的药物分子的平均数之间。
本发明的抗体-药物偶联物的一个具体实例可包括具有由下式表示的结构的抗体-药物偶联物：
[式9]
或由下式表示的结构的抗体-药物偶联物：
[式10]
在这种情况下，AB代表本说明书中公开的抗CDH6抗体，并且该抗体经由来源于抗体的巯基与药物连接子偶联。在这种情况下，n具有与所谓的DAR(药物/抗体比)相同的含义，并且代表每抗体的药物/抗体比。具体地，n代表每抗体分子的偶联药物分子数，其是定义并指示为平均值的数值，即偶联药物分子的平均数。在由本发明的[式9]或[式10]表示的抗体-药物偶联物的情况下，在通过常用程序F的测量中，n可为2至8，优选5至8，更优选7至8，再更优选8。
本发明的抗体-药物偶联物的一个实例可包括具有由上述式[式9]或[式10]表示的结构的抗体-药物偶联物，或该抗体-药物偶联物的药理学可接受的盐，其中由AB所示的抗体包含选自以下抗体(a)至(g)的任一抗体，或该抗体的功能片段：
(a)用由SEQ ID NO:61中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体；
(b)用由SEQ ID NO:61中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体；
(c)用由SEQ ID NO:61中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体；
(d)用由SEQ ID NO:65中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和a由SEQ ID NO:69中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体；
(e)用由SEQ ID NO:65中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体；
(f)用由SEQ ID NO:65中所示的轻链全长氨基酸序列中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中所示的重链全长氨基酸序列中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链组成的抗体；和
(g)选自抗体(a)至(f)的任一抗体，其中重链或轻链包含选自以下的一种或两种或更多种修饰：以N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化和N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸为代表的翻译后修饰，以及羧基末端的一个或两个氨基酸的缺失。
4.药剂
由于上述章节“2.抗CDH6抗体的生产”和实施例中描述的本发明的抗CDH6抗体或该抗体的功能片段与肿瘤细胞表面上的CDH6结合并具有内化活性，其可单独或与另外的药物组合用作药剂，特别是用作癌症，如肾细胞肿瘤或卵巢肿瘤，例如肾细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、卵巢癌、卵巢浆液性腺癌、甲状腺癌、胆管癌、肺癌(例如小细胞肺癌或非小细胞肺癌)、胶质母细胞瘤、间皮瘤、子宫癌、胰腺癌、维尔姆斯瘤(wilms'tumor)或神经母细胞瘤的治疗剂。
此外，本发明的抗CDH6抗体或该抗体的功能片段可用于检测表达CDH6的细胞。
此外，由于本发明的抗CDH6抗体或该抗体的功能片段具有内化活性，其可用作抗体-药物偶联物中的抗体。
当使用具有抗肿瘤活性如细胞毒活性的药物作为该药物时，上述章节“3.抗CDH6抗体-药物偶联物”和实施例中描述的本发明的抗CDH6抗体-药物偶联物是具有内化活性的抗CDH6抗体和/或该抗体的功能片段与具有抗肿瘤活性如细胞毒活性的药物的偶联物。由于这种抗CDH6抗体-药物偶联物表现出对表达CDH6的癌细胞的抗肿瘤活性，其可用作药剂，特别是用作癌症的治疗剂和/或预防剂。
本发明的抗CDH6抗体-药物偶联物可以吸收水分或具有吸附水，例如，在将其置于空气中或施以重结晶或纯化程序时转变成水合物。含有水的这种化合物或药理学可接受盐也包括在本发明中。
当本发明的抗CDH6抗体-药物偶联物具有碱性基团如氨基时，如果需要，其可以形成药理学可接受的酸加成盐。这样的酸加成盐的实例可包括：氢卤化物，如氢氟化物、盐酸盐、氢溴酸盐和氢碘酸盐；无机酸盐，如硝酸盐、高氯酸盐、硫酸盐和磷酸盐；低级烷烃磺酸盐，如甲磺酸盐、三氟甲磺酸盐和乙磺酸盐；芳基磺酸盐，如苯磺酸盐和对甲苯磺酸盐；有机酸盐，如甲酸盐、乙酸盐、三氟乙酸盐、苹果酸盐、富马酸盐、琥珀酸盐、柠檬酸盐、酒石酸盐、草酸盐和马来酸盐；和氨基酸盐，如鸟氨酸盐、谷氨酸盐和天冬氨酸盐。
当本发明的抗CDH6抗体-药物偶联物具有酸性基团如羧基时，如果需要，它可以形成药理学可接受的碱加成盐。这样的碱加成盐的实例可包括：碱金属盐，如钠盐、钾盐和锂盐；碱土金属盐，如钙盐和镁盐；无机盐，如铵盐；和有机胺盐，如二苄胺盐、吗啉盐、苯基甘氨酸烷基酯盐、乙二胺盐、N-甲基葡糖胺盐、二乙胺盐、三乙胺盐、环己胺盐、二环己胺盐、N,N'-二苄基乙二胺盐、二乙醇胺盐、N-苄基-N-(2-苯基乙氧基)胺盐、哌嗪盐、四甲基铵盐和三(羟甲基)氨基甲烷盐。
本发明还可包括其中构成抗体-药物偶联物的一个或多个原子被该原子的同位素替代的抗CDH6抗体-药物偶联物。存在两种类型的同位素：放射性同位素和稳定同位素。同位素的实例可包括氢的同种型(isotypes，疑为isotopes之误)(2H和3H)、碳的同位素(11C、13C和14C)、氮的同位素(13N和15N)、氧的同位素(15O、17O和18O)和氟的同位素(18F)。包含用这样的同位素标记的抗体-药物偶联物的组合物可用作例如治疗剂、预防剂、研究试剂、测定试剂、诊断剂和体内诊断成像剂。用同位素标记的每种抗体-药物偶联物，以及用同位素标记的抗体-药物偶联物以任何给定比率的混合物包括在本发明中。用同位素标记的抗体-药物偶联物可以例如根据本领域已知的方法通过使用用同位素标记的起始材料代替稍后提到的用于本发明的生产方法的起始材料来生产。
可以例如基于抑制细胞增殖反应的活性来测量体外细胞毒性。例如，培养过表达CDH6的癌细胞系，并将抗体-药物偶联物以不同浓度添加到培养系统中。此后，可以测量其对病灶形成、集落形成和球状体(spheroid)生长的抑制活性。在这种情况下，例如，通过使用肾细胞肿瘤或卵巢肿瘤衍生的癌细胞系，可以检查对肾细胞肿瘤或卵巢肿瘤的细胞生长抑制活性。
可以例如通过将抗CDH6抗体-药物偶联物施用于已接种高度表达CDH6的肿瘤细胞系的裸鼠，然后测量癌细胞的变化来测量对实验动物的癌症的体内治疗效果。在这种情况下，例如，通过使用由免疫缺陷小鼠通过接种肾细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、卵巢癌、卵巢浆液性腺癌或甲状腺癌衍生的细胞而得到的动物模型，可以测量对肾细胞癌、肾透明细胞癌、乳头状肾细胞癌、卵巢癌、卵巢浆液性腺癌或甲状腺癌的治疗效果。
对本发明的抗CDH6抗体-药物偶联物应用于的癌症类型没有特别限制，只要该癌症在待治疗的癌细胞中表达CDH6。其实例可包括肾细胞癌(例如，肾透明细胞癌或乳头状肾细胞癌)、卵巢癌、卵巢浆液性腺癌、甲状腺癌、胆管癌、肺癌(例如，小细胞肺癌或非小细胞肺癌)、胶质母细胞瘤、间皮瘤、子宫癌、胰腺癌、维尔姆斯瘤和神经母细胞瘤，不过癌症不限于此，只要该癌症表达CDH6。其实例还可包括肾细胞癌、卵巢癌、间皮瘤、甲状腺癌、子宫癌、胆管癌、胰腺癌、非小细胞肺癌、宫颈癌、脑肿瘤、头颈癌、肉瘤、骨肉瘤、小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。癌症的更优选实例可包括肾细胞癌(例如，肾透明细胞癌和乳头状肾细胞癌)和卵巢癌。此外，癌症的优选实例可包括卵巢癌(例如，上皮性卵巢癌、输卵管癌和原发性腹膜癌)。
本发明的抗CDH6抗体-药物偶联物可优选施用于哺乳动物，更优选施用于人。
包含本发明的抗CDH6抗体-药物偶联物的药物组合物中所用的物质可以根据施用剂量或施用浓度适当地选自本领域常用的药物添加剂和其它物质，然后使用。
本发明的抗CDH6抗体-药物偶联物可以作为包含一种或多种药学相容组分的药物组合物施用。例如，该药物组合物通常包含一种或多种药物载体(例如，灭菌液体(例如，水和油(包括石油和动物来源的油、植物来源的油或合成来源的油(例如，花生油、大豆油、矿物油和芝麻油)))。当该药物组合物静脉施用时，水是更典型的载体。盐水溶液、葡萄糖水溶液和甘油水溶液也可用作液体载体，特别是用于注射溶液。合适的药物载体是本领域已知的。如果需要，该组合物还可包含痕量的保湿剂、乳化剂或pH缓冲剂。合适的药物载体的实例公开在E.W.Martin的"Remington's Pharmaceutical Sciences"中。处方对应于施用模式。
在一些方面，该抗体-药物偶联物(ADC)包含式4。在一些方面，将包含式4的ADC施用于对铂类癌症治疗表现出耐药性的患者。在一些方面，将包含式4的ADC施用于在铂类癌症治疗完成的2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个月内癌症复发的铂耐药的癌症患者。在一些方面，将包含式4的ADC施用于在铂类癌症治疗完成的至少2、3、4、5、6、7、8、9、10、11或12个月内疾病复发的铂耐药的癌症患者。在一些方面，将包含式4的ADC施用于在卡铂和/或紫杉醇方案完成的至少2、3、4、5、6、8、8、9、10、11或12个月疾病复发的铂耐药的癌症患者。
在一些方面，在用铂/紫杉烷化疗法，如卡铂/紫杉醇、卡铂/多西他赛、顺铂/紫杉醇和卡铂/紫杉醇/贝伐珠单抗方案治疗后施用包含式4的ADC。
在一些方面，在用一种或多种以下铂类化疗法，如卡铂/紫杉醇、卡铂/脂质体多柔比星、卡铂/吉西他滨、顺铂/吉西他滨、卡铂/异环磷酰胺、顺铂/异环磷酰胺、奥沙利铂/5-FU/Luecovorin和奥沙利铂/卡培他滨方案治疗后施用包含式4的ADC。
在一些方面，将包含式4的ADC施用于有需要的患者以治疗铂耐药的，优选疾病复发的卵巢癌、非小细胞肺癌(NSCLC)、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌、去势抵抗性前列腺癌(CRPC)和其它表达CDH6的癌症。在一些方面，卵巢癌包括上皮性卵巢癌、输卵管癌和原发性腹膜癌。
在一些方面，包含式4的ADC适用于治疗其疾病在铂类化疗后已经进展或复发的卵巢癌患者。在一些方面，包含式4的ADC适用于治疗一线铂类化疗方案已经失败的女性的晚期卵巢癌。在一些方面，包含式4的ADC适用于治疗在化疗后疾病进展后的卵巢癌。
在一些方面，包含式4的ADC适合作为单一试剂用于治疗在初始或后续化疗之时或之后疾病进展后的转移性卵巢癌患者。在一些方面，包含式4的ADC适用于在一线疗法或后续疗法失败后治疗转移性卵巢癌患者。
各种递送系统是已知的，并且它们可用于施用本发明的抗CDH6抗体-药物偶联物。施用途径的实例可以包括但不限于皮内、肌肉内、腹膜内、静脉内和皮下途径。例如，可以通过注射或团注进行施用。根据一个具体的优选实施方案，上述抗体-药物偶联物的施用通过注射进行。肠胃外施用是优选给药途径。
根据一个代表性实施方案，该药物组合物根据常规程序作为适合静脉施用于人类的药物组合物开处方。用于静脉施用的组合物通常是在无菌和等渗水性缓冲溶液中的溶液。如果需要，该药剂还可以含有增溶剂和局部麻醉剂以减轻注射区域的疼痛(例如利多卡因)。通常，上述成分分开或一起在单位剂型的混合物中，作为包含在容器中的冻干粉末或无水浓缩物(其通过密封在例如指示活性剂的量的安瓿或小袋中而获得)提供。当该药剂通过注射施用时，其可以使用例如含有无菌药物级的水或盐水的注射瓶施用。当该药剂要通过注射施用时，可以提供注射用的无菌水或盐水的安瓿，以使上述成分在施用前与彼此混合。
本发明的药物组合物可以是仅包含本申请的抗CDH6抗体-药物偶联物的药物组合物，或可以是包含抗CDH6抗体-药物偶联物和至少一种其它癌症治疗剂的药物组合物。本发明的抗CDH6抗体-药物偶联物也可以与另外的癌症治疗剂一起施用，由此可以增强抗癌作用。用于这种目的的另外的抗癌剂可以与该抗体-药物偶联物一起同时、分开或连续施用于个体。或者，另外的抗癌剂和抗CDH6抗体-药物偶联物可以各自以不同的施用间隔施用于受试者。在本发明中，短语“第二药物”是指本发明的抗CDH6抗体-药物偶联物以外的治疗剂。另外的抗癌剂可以是“第二药物”。但是，在本发明中，“第二药物”不必是用于所谓的“二线治疗”的药物。这样的治疗剂或用于癌症的第二药物或另外的抗癌剂的实例可包括酪氨酸激酶抑制剂(包括伊马替尼、舒尼替尼和瑞格非尼)、CDK4/6抑制剂(包括帕博西尼)、Hsp90抑制剂(包括TAS-116)、MEK抑制剂(包括MEK162)和免疫检查点抑制剂(包括纳武单抗(nivolumab)、派姆单抗(pembrolizumab)和伊匹单抗(ipilimumab))，不过用于癌症的治疗剂不限于此，只要该药物具有抗肿瘤活性。
这样的药物组合物可以制备成冻干制剂或液体制剂形式的具有所选组成和必要纯度的制剂。制备成冻干制剂的药物组合物可以是含有本领域中使用的适当药物添加剂的制剂。同样地，可以制备液体制剂，以使液体制剂含有本领域中使用的各种药物添加剂。
该药物组合物的组成和浓度也随施用方法而变化。关于本发明的药物组合物中包含的抗CDH6抗体-药物偶联物对抗原的亲和力，即抗CDH6抗体-药物偶联物对抗原的解离常数(Kd值)，随着亲和力增加(即Kd值低)，该药物组合物可以发挥药效，即使其施用剂量降低。因此，也可以通过基于抗体-药物偶联物对抗原的亲和力状态设定施用剂量来确定抗体-药物偶联物的施用剂量。当本发明的抗体-药物偶联物施用于人类时，其可以以例如大约0.001至100mg/kg的剂量一次施用或以1至180天的间隔多次施用。其可以优选以0.1至50mg/kg，更优选1至50mg/kg、1至30mg/kg、1至20mg/kg、1至15mg/kg、2至50mg/kg、2至30mg/kg、2至20mg/kg或2至15mg/kg的剂量以1至4周，优选2至3周的间隔多次施用。
当本公开中使用的铂类药物或化疗药物是顺铂时，施用方法的实例包括但不限于以下剂量和施用。
例如，15至20mg/m2(体表面积)的顺铂每天一次施用连续5天，然后休息至少2周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，50至70mg/m2(体表面积)的顺铂每天一次施用，然后休息至少3周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，25至35mg/m2(体表面积)的顺铂每天一次施用，然后休息至少1周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，10至20mg/m2(体表面积)的顺铂每天一次施用连续5天，然后休息至少2周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，70至90mg/m2(体表面积)的顺铂每天一次施用，然后休息至少3周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，20mg/m2(体表面积)的顺铂每天一次施用连续5天，然后休息至少2周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，100mg/m2(体表面积)的顺铂每天一次施用，然后休息至少3周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，75mg/m2(体表面积)的顺铂每天一次施用，然后休息至少20天。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，25mg/m2(体表面积)的顺铂作为静脉滴注经60分钟施用，并且持续每周施用连续2周，，然后第三周休息。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，与盐酸多柔比星组合，100mg/m2(体表面积)的顺铂每天一次施用，然后休息至少3周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，与盐酸多柔比星组合，50mg/m2(体表面积)的顺铂每天一次施用，然后休息至少3周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，与一种或多种其它抗肿瘤剂组合，100mg/m2(体表面积)/天的顺铂作为连续静脉输注施用1天，然后休息至少20天。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，与一种或多种其它抗肿瘤剂组合，25mg/m2(体表面积)/天的顺铂作为连续静脉输注施用连续4天，然后休息至少17天。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，与一种或多种其它抗肿瘤剂组合，60至100mg/m2(体表面积)的顺铂每天一次施用，然后休息至少3周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，与一种或多种其它抗肿瘤剂组合，20mg/m2(体表面积)的顺铂每天一次施用连续5天，然后休息至少2周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，与甲氨蝶呤、硫酸长春碱和盐酸多柔比星组合，70mg/m2(体表面积)的顺铂通常作为单次静脉输注施用。
作为标准剂量和施用方法，在第1天施用30mg/m2的甲氨蝶呤，然后在第2天静脉输注3mg/m2的硫酸长春碱、30mg/m2的盐酸多柔比星(滴度)和70mg/m2的顺铂。在第15和22天静脉施用30mg/m2的甲氨蝶呤和3mg/m2的硫酸长春碱。这被视为一个疗程，并且该疗程每4周重复一次。
作为另一种剂量和施用，注射用顺铂以20mg/m2每天静脉施用，每周期5天。
作为另一种剂量和施用，注射用顺铂在每3至4周的第1天以每周期75至100mg/m2静脉施用一次。
作为另一种剂量和施用，注射用顺铂每3至4周以每周期50至70mg/m2静脉施用一次。对于重度预处理的患者，可以使用每周期50mg/m2的初始剂量，每4周重复一次。
当本公开中使用的铂类药物或化疗药物是卡铂时，施用方法的实例包括但不限于以下剂量和施用。
例如，300至400mg/m2(体表面积)的卡铂每天一次施用，然后休息至少4周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，与曲妥珠单抗(遗传重组)和紫杉烷组合，300至400mg/m2(体表面积)的卡铂每天一次施用，然后休息至少3周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，与派姆单抗(pembrolizumab)(遗传重组)和盐酸吉西他滨组合，卡铂以等同于2[(mg/mL)·min]的AUC的剂量每天施用一次。每周施用持续连续2周，然后第三周休息。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，与异环磷酰胺和依托泊苷组合，635mg/m2(体表面积)的卡铂作为静脉滴注施用1天或400mg/m2(体表面积)的卡铂作为静脉滴注施用2天，然后休息至少3至4周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，与硫酸长春新碱和依托泊苷组合，560mg/m2(体表面积)的卡铂作为静脉滴注施用1天，并停药至少3至4周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，360mg/m2的卡铂在每4周的第1天静脉施用
作为另一种剂量和施用，例如，300mg/m2的卡铂在每4周的第1天静脉施用，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，卡铂AUC 1.0至10[(mg/mL)·min]作为静脉输注经0.1至48小时施用，然后经0.1至48小时静脉施用1至100mg/m2的聚乙二醇化脂质体多柔比星，并且该治疗每2至4周重复一次，持续1至10个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，卡铂AUC 5[(mg/mL)·min]作为静脉输注经30分钟施用，然后经60分钟静脉施用30mg/m2的聚乙二醇化脂质体多柔比星，并且该治疗每3或4周重复一次，持续3或6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，卡铂AUC 5[(mg/mL)·min]作为静脉输注经30分钟施用，然后经60分钟静脉施用30mg/m2的聚乙二醇化脂质体多柔比星，并且该治疗每3周重复一次，持续3个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，卡铂AUC 5[(mg/mL)·min]作为静脉输注经30分钟施用，然后经60分钟静脉施用30mg/m2的聚乙二醇化脂质体多柔比星，并且该治疗每3周重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，卡铂AUC 5[(mg/mL)·min]作为静脉输注经30分钟施用，然后经60分钟静脉施用30mg/m2的聚乙二醇化脂质体多柔比星，并且该治疗每4周重复一次，持续3个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，卡铂AUC 5[(mg/mL)·min]作为静脉输注经30分钟施用，然后经60分钟静脉施用30mg/m2的聚乙二醇化脂质体多柔比星，并且该治疗每4周重复一次，持续6个周期。
当本公开中使用的紫杉烷(taxanes)或化疗药物是紫杉醇(paclitaxel)时，施用方法的实例包括但不限于以下剂量和施用。
例如，210mg/m2(体表面积)的紫杉醇每天一次作为静脉滴注经3小时施用，然后休息至少3周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，100mg/m2(体表面积)的紫杉醇每天一次作为静脉滴注经1小时施用，并且每周施用持续连续6周，然后休息至少2周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，80mg/m2(体表面积)的紫杉醇每天一次作为静脉滴注经1小时施用，并且每周施用持续连续3周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，135mg/m2(体表面积)的紫杉醇每天一次作为静脉滴注经24小时施用，然后休息至少3周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，80mg/m2(体表面积)的紫杉醇每天一次作为静脉滴注经1小时施用，每周施用持续连续3周，然后休息至少2周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，260mg/m2(体表面积)的紫杉醇每天一次作为静脉滴注经30分钟施用，然后休息至少20天。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，100mg/m2(体表面积)的紫杉醇每天一次作为静脉滴注经30分钟施用，然后休息至少6天。每周施用持续连续3周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，与吉西他滨组合，125mg/m2(体表面积)的紫杉醇每天一次作为静脉滴注经30分钟施用，然后休息至少6天。每周施用持续连续3周。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，100mg/m2(体表面积)的紫杉醇每天一次作为静脉滴注经30分钟施用，然后休息至少6天。每周施用持续连续3周并在第四周停药。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，与一种或多种其它抗肿瘤剂组合，100mg/m2(体表面积)的紫杉醇每天一次作为静脉滴注经30分钟施用，然后休息至少6天。每周施用持续连续3周，然后第四周休息。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，50、90、100、135或175mg/m2的紫杉醇每2或3周经3或24小时静脉施用。
当本公开中使用的紫杉烷(taxanes)或化疗药物是多西他赛时，施用方法的实例包括但不限于以下剂量和施用。
例如，60mg/m2(体表面积)的多西他赛每天一次作为静脉滴注经1小时施用，每3至4周一次。
作为另一种剂量和施用，例如，70mg/m2(体表面积)的多西他赛每天一次作为静脉滴注经1小时施用，每3至4周一次。
作为另一种剂量和施用，例如，75mg/m2(体表面积)的多西他赛每天一次作为静脉滴注经1小时施用，每3周一次。
作为另一种剂量和施用，例如，60至100mg/m2的多西他赛每3周经1小时静脉施用。
作为另一种剂量和施用，例如，每3周在50mg/m2的多柔比星和500mg/m2的环磷酰胺之后1小时，静脉施用75mg/m2的多西他赛，持续6个疗程。
作为另一种剂量和施用，例如，75mg/m2的多西他赛每3周经1小时静脉施用。
作为另一种剂量和施用，例如，每3周经1小时静脉施用75mg/m2的多西他赛，此后立即经30-60分钟施用顺铂75mg/m2。
作为另一种剂量和施用，例如，每3周作为1小时静脉输注施用75mg/m2的多西他赛。可以连续施用泼尼松5mg，每日两次口服。
作为另一种剂量和施用，例如，75mg/m2的多西他赛作为1小时静脉输注施用，然后是作为1至3小时静脉输注的顺铂75mg/m2(两者都仅在第1天)，然后在顺铂输注结束时开始作为24小时连续静脉输注给予氟尿嘧啶750mg/m2/天，持续5天。治疗每三周重复一次。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，75mg/m2的多西他赛作为1小时静脉输注施用，然后经1小时静脉施用顺铂75mg/m2，然后作为连续静脉输注以750mg/m2/天施用氟尿嘧啶5天。这一方案每3周施用一次，持续4个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，75mg/m2的多西他赛作为1小时静脉输注施用，然后作为30分钟至3小时输注施用顺铂100mg/m2，然后从第1天至第4天作为连续输注施用氟尿嘧啶1000mg/m2/天。这一方案每3周施用一次，持续3个周期。
当本公开中使用的铂类药物和紫杉烷是顺铂和紫杉醇时，施用方法的实例包括但不限于以下剂量和施用。
例如，在第1天作为连续静脉输注经0.1至48小时施用10至300mg/m2的紫杉醇，然后在第1天或第2天腹膜内施用1至200mg/m2的顺铂，在第8腹膜内施用天10至30mg/m2的紫杉醇，并且该治疗每2至5周重复一次，持续1至10个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天作为连续静脉输注经3或24小时施用135或175mg/m2的紫杉醇，然后在第1天或第2天腹膜内施用75至100mg/m2的顺铂，在第8天腹膜内施用60mg/m2的紫杉醇，并且该治疗每3周重复一次，持续3至6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天作为连续静脉输注经24小时施用135mg/m2的紫杉醇，然后在第2天腹膜内施用75mg/m2的顺铂，在第8天腹膜内施用60mg/m2的紫杉醇，并且该治疗每3周重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天作为连续静脉输注经24小时施用135mg/m2的紫杉醇，然后在第2天腹膜内施用100mg/m2的顺铂，在第8天腹膜内施用60mg/m2的紫杉醇，并且该治疗每3周重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，以175mg/m2的剂量经3小时静脉施用紫杉醇，然后以75mg/m2的剂量施用顺铂，该方案可以每3周给予一次。
作为另一种剂量和施用，例如，以135mg/m2的剂量经24小时静脉施用紫杉醇，然后以75mg/m2的剂量施用顺铂，该方案可以每3周给予一次。
当本公开中使用的铂类药物和紫杉烷是卡铂和紫杉醇时，施用方法的实例包括但不限于以下剂量和施用。
例如，在第1天，作为静脉输注经0.1至48小时施用10至300mg/m2的紫杉醇，然后以1.0至10[(mg/mL)·min]的AUC作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续1至10个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用175mg/m2或180mg/m2的紫杉醇，然后以5至6[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续3至6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用175mg/m2的紫杉醇，然后以5[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续3个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用175mg/m2的紫杉醇，然后以5[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续4个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用175mg/m2的紫杉醇，然后以5[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续5个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用175mg/m2的紫杉醇，然后以5[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用175mg/m2的紫杉醇，然后以[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续3个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用175mg/m2的紫杉醇，然后以[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续4个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用175mg/m2的紫杉醇，然后以5.5[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续5个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用175mg/m2的紫杉醇，然后以5.5[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用175mg/m2的紫杉醇，然后以6[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续3个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用175mg/m2的紫杉醇，然后以6[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续4个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用175mg/m2的紫杉醇，然后以6[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续5个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用175mg/m2的紫杉醇，然后以6[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用180mg/m2的紫杉醇，然后以5[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用180mg/m2的紫杉醇，然后以5.5[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经3小时施用180mg/m2的紫杉醇，然后以6[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1、8和15天作为静脉输注经1小时施用80mg/m2的剂量密集紫杉醇，然后在第1天以5至6[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1、8和15天作为静脉输注经1小时施用80mg/m2的剂量密集紫杉醇，然后在第1天以5[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1、8和15天作为静脉输注经1小时施用80mg/m2的剂量密集紫杉醇，然后在第1天以5.5[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1、8和15天作为静脉输注经1小时施用80mg/m2的剂量密集紫杉醇，然后在第1天以6[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1、8和15天，作为静脉输注经1小时施用60mg/m2的紫杉醇，然后以2[(mg/mL)·min]的AUC经30分钟作为静脉输注施用卡铂，并且该周期每21天重复一次，持续6个周期(18周)。
作为另一种剂量和施用，例如，每周作为静脉输注经1小时施用80mg/m2的剂量密集紫杉醇，然后每3周以6[(mg/mL)·min]的AUC作为静脉输注施用卡铂。
作为另一种剂量和施用，例如，每周经1小时静脉施用80mg/m2的剂量密集紫杉醇，并且每3周施用AUC 6[(mg/mL)·min]的卡铂。
当本公开中使用的铂类药物和紫杉烷是卡铂和多西他赛时，施用方法的实例包括但不限于以下剂量和施用。
例如，在第1天，作为静脉输注经0.1至48小时施用10至300mg/m2的多西他赛，然后以1.0至10[(mg/mL)·min]的AUC经0.1至48小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每21天重复一次，持续1至10个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经1小时施用60-75mg/m2的多西他赛，然后以5至6[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每3周重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经1小时施用60mg/m2的多西他赛，然后以5[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每3周重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经1小时施用65mg/m2的多西他赛，然后以5[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每3周重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经1小时施用70mg/m2的多西他赛，然后以5[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每3周重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经1小时施用75mg/m2的多西他赛，然后以5[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每3周重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经1小时施用60-75mg/m2的多西他赛，然后以6[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每3周重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经1小时施用60mg/m2的多西他赛，然后以6[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每3周重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经1小时施用65mg/m2的多西他赛，然后以6[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每3周重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经1小时施用70mg/m2的多西他赛，然后以6[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每3周重复一次，持续6个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，作为静脉输注经1小时施用75mg/m2的多西他赛，然后以6[(mg/mL)·min]的AUC经1小时作为静脉输注施用卡铂，并且该治疗每3周重复一次，持续6个周期。
当本公开中使用的抗代谢物或化疗药物是吉西他滨时，施用方法的实例包括但不限于以下剂量和施用。
例如，1000mg/m2的吉西他滨作为单次静脉滴注经30分钟施用，并且每周施用持续连续3周，然后第四周休息。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，1250mg/m2的吉西他滨作为单次静脉滴注经30分钟施用，并且持续每周施用连续2周，然后第三周休息。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，与顺铂组合，1250mg/m2的吉西他滨作为单次静脉滴注经30分钟施用，并且持续每周施用连续2周，然后第三周休息。这被视为一个疗程，并且重复该施用。
作为另一种剂量和施用，例如，1000mg/m2的吉西他滨在各21天周期的第1天和第8天经30分钟静脉施用。
作为另一种剂量和施用，例如，1000mg/m2的吉西他滨在各21天周期的第1天和第8天经30分钟静脉施用，在第1天在吉西他滨施用后组合静脉施用卡铂AUC 4[(mg/mL)·min]。
作为另一种剂量和施用，例如，800mg/m2的吉西他滨在各21天周期的第1天和第8天经30分钟静脉施用，在第1天在吉西他滨施用后组合静脉施用卡铂AUC 4[(mg/mL)·min]。
作为另一种剂量和施用，例如，800mg/m2的吉西他滨在各21天周期的第1天和第8天经30分钟静脉施用，在第1天在吉西他滨施用后组合静脉施用卡铂AUC 4[(mg/mL)·min]。
作为另一种剂量和施用，例如，在各21天周期的第1天经30分钟静脉施用1000mg/m2的吉西他滨，并在第8天经30分钟静脉施用800mg/m2的吉西他滨，在第1天在吉西他滨施用后组合静脉施用卡铂AUC 4[(mg/mL)·min]。
作为另一种剂量和施用，例如，1250mg/m2的吉西他滨在各21天周期的第1天和第8天经30分钟静脉施用。
作为另一种剂量和施用，例如，1250mg/m2的吉西他滨在各21天周期的第1天和第8天经30分钟静脉施用，在第1天在吉西他滨施用之前作为3小时静脉输注施用紫杉醇175mg/m2。
作为另一种剂量和施用，例如，1000mg/m2的吉西他滨在各28天周期的第1天、第8天和第15天经30分钟静脉施用。
作为另一种剂量和施用，例如，1000mg/m2的吉西他滨在各28天周期的第1天、第8天和第15天经30分钟静脉施用，在第1天在吉西他滨施用后经3小时静脉施用顺铂100mg/m2。
作为另一种剂量和施用，例如，1250mg/m2的吉西他滨在各21天周期的第1天和第8天经30分钟静脉施用。
作为另一种剂量和施用，例如，1250mg/m2的吉西他滨在各21天周期的第1天和第8天经30分钟静脉施用，在第1天在吉西他滨施用后静脉施用顺铂100mg/m2。
作为另一种剂量和施用，例如，前7周每周一次经30分钟静脉施用1000mg/m2的吉西他滨，然后休息一周，并在各28天周期的在第1天、第8天和第15天每周给药。
当本公开中使用的铂类药物和紫杉烷是卡铂和紫杉醇并且第二药物是贝伐珠单抗时，施用方法的实例包括但不限于以下剂量和施用。
例如，经0.1至48小时静脉施用10至300mg/m2的紫杉醇，然后经0.1至48小时静脉施用AUC 1.0至10[(mg/mL)·min]的卡铂，并经0.1至48小时静脉施用1.0至50mg/kg的贝伐珠单抗。治疗每2至5周重复一次，持续1至10个周期。贝伐珠单抗可以施用最多另外30个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，经3小时静脉施用175mg/m2的紫杉醇，然后经30至60分钟静脉施用AUC 5或6[(mg/mL)·min]的卡铂，并经30-90分钟静脉施用7.5mg/kg的贝伐珠单抗。治疗每3周重复一次，持续5或6个周期。贝伐珠单抗可以施用最多另外12个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，经3小时静脉施用175mg/m2的紫杉醇，然后经30至60分钟静脉施用AUC 6[(mg/mL)·min]的卡铂，并经30-90分钟静脉施用7.5mg/kg的贝伐珠单抗。治疗每3周重复一次，持续6个周期。贝伐珠单抗可以施用最多另外12个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，经3小时静脉施用175mg/m2的紫杉醇，然后经30至60分钟静脉施用AUC 6[(mg/mL)·min]的卡铂，并经30-90分钟静脉施用7.5mg/kg的贝伐珠单抗。治疗每3周重复一次，持续5个周期。贝伐珠单抗可以施用最多另外12个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，经3小时静脉施用175mg/m2的紫杉醇，然后经30至60分钟静脉施用AUC 5[(mg/mL)·min]的卡铂，并经30-90分钟静脉施用7.5mg/kg的贝伐珠单抗。治疗每3周重复一次，持续6个周期。贝伐珠单抗可以施用最多另外12个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，经3小时静脉施用175mg/m2的紫杉醇，然后经30至60分钟静脉施用AUC 5[(mg/mL)·min]的卡铂，并经30-90分钟静脉施用7.5mg/kg的贝伐珠单抗。治疗每3周重复一次，持续5个周期。贝伐珠单抗可以施用最多另外12个周期。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，经3小时静脉施用175mg/m2的紫杉醇，然后经30分钟静脉施用AUC 6[(mg/mL)·min]的卡铂。在疗程2开始，在第1天经30至90分钟静脉施用15mg/kg的贝伐珠单抗。治疗每21天重复一次，持续6个疗程。在疗程7开始，在第1天经30-90分钟单独静脉施用贝伐珠单抗。贝伐珠单抗治疗每21天重复一次，持续最多22个疗程。
作为另一种剂量和施用，例如，在第1天，经3小时静脉施用175mg/m2的紫杉醇，然后经1小时静脉施用AUC 6[(mg/mL)·min]的卡铂。在疗程2开始，在第1天经30至90分钟静脉施用15mg/kg的贝伐珠单抗。治疗每21天重复一次，持续6个疗程。在疗程7开始，在第1天经30-90分钟单独静脉施用贝伐珠单抗。贝伐珠单抗治疗每21天重复一次，持续最多22个疗程。
实施例
在下文中，将在以下实施例中具体描述本发明。但是，这些实施例无意限制本发明的范围。此外，这些实施例无论如何不应以限制的方式解释。要注意的是，在以下实施例中，除非另有说明，关于遗传操纵的各个操作已经根据"Molecular Cloning"(Sambrook,J.、Fritsch,E.F.和Maniatis,T.,由Cold Spring HarborLaboratory Press在1989年出版)中描述的方法或本领域技术人员使用的实验手册中描述的其它方法进行，或当使用市售试剂或试剂盒时，实施例已经根据市售产品中包括的说明书进行。在本说明书中，除非另有说明，试剂、溶剂和起始材料可容易地获自市售来源。
[参考实施例1:获得具有内化活性的大鼠抗人CDH6抗体]
1)-1人、小鼠、大鼠和食蟹猴CDH6表达载体的构建
使用编码人CDH6蛋白(NP_004923)的cDNA表达载体(OriGene TechnologiesInc.,RC217889)，根据本领域技术人员已知的方法将cDNA并入用于哺乳动物表达的载体中以产生人CDH6表达载体pcDNA3.1-hCDH6。人CDH6 ORF(开放阅读框)的氨基酸序列显示在SEQ ID NO:1中。
使用编码小鼠CDH6蛋白(NP_031692)的cDNA表达载体(OriGene TechnologiesInc.,MC 221619)，根据本领域技术人员已知的方法将cDNA并入用于哺乳动物表达的载体中，以产生小鼠CDH6表达载体pcDNA3.1-mCDH6和p3xFLAG-CMV-9-mCDH6。小鼠CDH6 ORF的氨基酸序列显示在SEQ ID NO:7中。
使用编码大鼠CDH6蛋白(NP_037059)的cDNA表达载体(OriGene TechnologiesInc.,RN 211850)的各cDNA部分，根据本领域技术人员已知的方法将cDNA并入用于哺乳动物表达的载体中，以产生大鼠CDH6表达载体pcDNA3.1-rCDH6和p3xFLAG-CMV-9-rCDH6。大鼠CDH6 ORF的氨基酸序列显示在SEQ ID NO:8中。
使用引物1(5'-CACCATGAGAACTTACCGCTACTTCTTGCTGCTC-3')(SEQ ID NO:85)和引物2(5'-TTAGGAGTCTTTGTCACTGTCCACTCCTCC-3')(SEQ ID NO:86)，用由食蟹猴肾的总RNA合成的cDNA作为模板克隆编码食蟹猴CDH6蛋白的cDNA85。证实了所得序列对应于食蟹猴CDH6(NCBI，XP_005556691.1)的胞外区。还证实该序列对应于EMBL中登记的食蟹猴CDH6(EHH54180.1)的全长序列。根据本领域技术人员已知的方法将cDNA并入用于哺乳动物表达的载体中以产生食蟹猴CDH6表达载体pcDNA3.1-cynoCDH6。食蟹猴CDH6 ORF的氨基酸序列显示在SEQ ID NO:9中。
EndoFree Plasmid Giga Kit(QiagenN.V.)用于所产生的质粒DNA的大批量生产。
1)-2免疫
对于免疫，使用WKY/IZM雌性大鼠(Japan SLC,Inc.)。首先，用透明质酸酶(Sigma-Aldrich Co.LLC)预处理每只大鼠的下肢，此后，将参考实施例1)-1中制成的人CDH6表达载体pcDNA3.1-hCDH6肌肉内注射到相同位点。随后，使用ECM830(BTX)，使用双针电极在相同位点进行体内电穿孔。大约每两周一次，重复相同的体内电穿孔，此后从大鼠收集淋巴结或脾，然后用于杂交瘤的生产。
1)-3杂交瘤的生产
根据电细胞融合，使用LF301细胞融合单元(BEX Co.,Ltd.)将淋巴结细胞或脾细胞与小鼠骨髓瘤SP2/0-ag14细胞(ATCC，No.CRL-1581)融合，然后细胞用ClonaCell-HY选择培养基D(StemCell Technologies Inc.)悬浮并稀释，然后在37℃和5％CO2的条件下培养。收集培养基中出现的单个杂交瘤集落作为单克隆杂交瘤，然后悬浮在ClonaCell-HY选择培养基E(StemCell Technologies Inc.)中，然后在37℃和5％CO2的条件下培养。在细胞适度增殖后，产生单个杂交瘤细胞的冻存液(frozen stocks)，同时将所得杂交瘤培养上清液用于筛选产生抗人CDH6抗体的杂交瘤。
1)-4根据Cell-ELISA方法筛选产生抗体的杂交瘤
1)-4-1用于Cell-ELISA的抗原基因表达细胞的制备
在补充10％FBS的DMEM培养基中以5x105个细胞/毫升的浓度制备293α细胞(衍生自表达整联蛋白αv和整联蛋白β3的HEK 293细胞的稳定表达细胞系)。根据使用Lipofectamine 2000(Thermo Fisher Scientific Inc.)的转导程序，将pcDNA3.1-hCDH6或pcDNA3.1-cynoCDH6或pcDNA3.1的DNA作为阴性对照引入293α细胞中，并将细胞以100μL/孔的量分配到96孔板(Corning Inc.)上。此后，细胞在37℃和5％CO2的条件下在补充10％FBS的DMEM培养基中培养24至27小时。所得转染细胞以粘附状态用于Cell-ELISA。
1)-4-2Cell-ELISA
除去参考实施例1)-4-1中制备的用表达载体转染的293α细胞的培养上清液，然后将来自各杂交瘤的培养上清液添加到用pcDNA3.1-hCDH6或pcDNA3.1-cynoCDH6或pcDNA3.1转染的293α细胞中。将细胞在4℃下静置1小时。孔中的细胞用补充5％FBS的PBS(+)洗涤一次，此后向孔中加入已经用补充5％FBS的PBS(+)稀释500倍的在兔中产生的抗大鼠IgG-过氧化物酶抗体(Sigma-Aldrich Co.LLC)。将细胞在4℃下静置1小时。孔中的细胞用补充5％FBS的PBS(+)洗涤三次，此后将OPD着色溶液(其通过将邻苯二胺二盐酸盐(Wako PureChemical Industries,Ltd.)和H2O2溶解在OPD溶液(0.05M柠檬酸三钠、0.1M磷酸氢二钠12-水；pH 4.5)中制备，以使物质分别变为0.4mg/ml和0.6％(v/v))以100μL/孔的量添加到孔中。在偶尔搅拌下进行显色反应。此后向板中加入1M HCl(100μL/孔)以终止显色反应，然后使用读板器(ENVISION:PerkinElmer,Inc)测量在490nm的吸光度。选择产生在用pcDNA3.1-hCDH6或pcDNA3.1-cynoCDH6表达载体转染的293α细胞中表现出的吸光度高于在用对照pcDNA3.1转染的293α细胞中的吸光度的培养上清液的杂交瘤作为产生与人CDH6和食蟹猴CDH6结合的抗体的杂交瘤。
1)-5根据流式细胞术选择性筛选与食蟹猴CDH6结合的抗体
1)-5-1用于流式细胞术分析的抗原基因表达细胞的制备
将293T细胞以5×104个细胞/cm2接种在225-cm2烧瓶(Sumitomo Bakelite Co.,Ltd.)中，然后将细胞在37℃和5％CO2的条件下在补充10％FBS的DMEM培养基中培养过夜。使用Lipofectamine 2000将pcDNA3.1-cynoCDH6或pcDNA3.1作为阴性对照引入293T细胞中，并将细胞在37℃和5％CO2的条件下进一步培养过夜。用TrypLE Express(ThermoFisher Scientific Corp.)处理用各载体转染的293T细胞，并用补充10％FBS的DMEM洗涤细胞，然后悬浮在补充5％FBS的PBS中。所得细胞悬液用于流式细胞术分析。
1)-5-2流式细胞术分析
通过流式细胞术进一步证实由在参考实施例1)-4中通过Cell-ELISA选择的产生人CDH6-和食蟹猴CDH6-结合抗体的杂交瘤产生的抗体对食蟹猴CDH6的结合特异性。将参考实施例1)-5-1中制备的瞬时表达293T细胞的悬液离心，然后除去上清液。此后，通过加入来自各杂交瘤的培养上清液而悬浮细胞。将细胞在4℃下静置1小时。细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，此后，通过添加已经用补充5％FBS的PBS稀释500倍的抗大鼠IgGFITC偶联物(Sigma-Aldrich Co.LLC)而悬浮细胞。将细胞在4℃下静置1小时。细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，然后重悬在补充5％FBS和2μg/ml 7-氨基放线菌素D(Molecular Probes,Inc.)的PBS中，然后使用流式细胞仪(FC500；Beckman Coulter,Inc.)进行检测。使用FlowJo(Tree Star,Inc.)分析数据。在通过门控输出(gating out)7-氨基放线菌素D阳性细胞而从分析中除去死细胞后，生成活细胞的FITC荧光强度的直方图。基于其中抗体的直方图与用对照pcDNA3.1转染的293T细胞相比移位到用pcDNA3.1-cynoCDH6转染的293T细胞中的强荧光强度侧的结果选择产生与细胞膜表面上表达的食蟹猴CDH6特异性结合的抗体的杂交瘤。
1)-6大鼠单克隆抗体的同种型的测定
从参考实施例1)-5中选择的产生大鼠抗CDH6抗体的杂交瘤中选择被认为特异性地并且强烈地结合至人CDH6和猴CDH6的克隆rG019、rG055、rG056和rG061，并鉴定各抗体的同种型。使用大鼠单克隆抗体同种型测试试剂盒(RAT MONOCLONAL ANTIBODY ISOTYPINGTEST KIT)(DS Pharma Biomedical Co.,Ltd.)测定抗体的重链亚类和轻链类型。结果，证实所有这4个克隆rG019、rG055、rG056和rG061都具有IgG2b亚类的重链和κ链类型的轻链。
1)-7大鼠抗人CDH6抗体的制备
1)-7-1培养上清液的生产
从杂交瘤培养上清液中纯化大鼠抗人CDH6单克隆抗体。首先，用ClonaCell-HY选择培养基E(StemCell Technologies Inc.)充分增加每种产生大鼠抗CDH6单克隆抗体的杂交瘤的体积，此后用已经添加了20％UltraLow IgGFBS(Thermo Fisher ScientificCorp.)的杂交瘤SFM(Thermo Fisher Scientific Corp.)更换培养基。此后，将杂交瘤培养4至5天。收获所得培养上清液，并通过经过0.8-μm过滤器和0.2-μm过滤器而从中除去不溶性物质。
1)-7-2大鼠抗CDH6抗体的纯化
根据蛋白G亲和色谱法从参考实施例1)-7-1中制备的杂交瘤的培养上清液中纯化抗体(大鼠抗CDH6抗体(rG019、rG055、rG056或rG061))。将抗体吸附在蛋白G柱(GEHealthcare Biosciences Corp.)上，然后用PBS洗涤该柱，然后用0.1M甘氨酸/HCl水溶液(pH2.7)洗脱抗体。将1MTris-HCl(pH 9.0)添加到洗脱液中，以将pH调节至pH 7.0至7.5。此后，使用离心UF过滤装置(CentrifugalUF FilterDevice)VIVASPIN20(分子量截留值：UF30K，Sartorius Inc.)，用HBSor(25mM组氨酸/5％山梨糖醇，pH 6.0)更换缓冲液，同时将抗体浓缩，以将抗体的浓度调节至1mg/mL。最后，通过Minisart-Plus过滤器(SartoriusInc.)过滤抗体以获得纯化样品。
[参考实施例2:大鼠抗CDH6抗体的体外评估]
2)-1通过流式细胞术评估大鼠抗CDH6抗体的结合能力
通过流式细胞术评估参考实施例1)-7中生产的大鼠抗CDH6抗体的人CDH6结合活性。使用Lipofectamine 2000(Thermo Fisher Scientific Inc.)，将参考实施例1)-1中生产的pcDNA3.1-hCDH6瞬时引入293T细胞(ATCC)中。细胞在37℃和5％CO2的条件下培养过夜，此后制备细胞悬液。将转染的293T细胞的悬液离心，然后除去上清液。此后，通过加入参考实施例1)-7中制备的4种大鼠抗CDH6单克隆抗体(克隆号：rG019、rG055、rG056和rG061)的每一种或大鼠IgG对照(R&DSystems,Inc.)(最终浓度：10ng/ml)而悬浮细胞。将细胞在4℃下静置1小时。细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，然后通过加入已经用补充5％FBS的PBS稀释50倍的在兔中产生的抗大鼠IgG(全分子)-FITC抗体(Sigma-Aldrich Co.LLC)而悬浮。将细胞在4℃下静置1小时。将细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，然后使用流式细胞仪(FC500；Beckman Coulter,Inc.)检测。使用FlowJo(Tree Star,Inc.)分析数据。结果显示在图1中。在图1的直方图中，横坐标描绘指示结合的抗体量的FITC荧光强度，而纵坐标描绘细胞计数。阴影直方图显示使用未用hCDH6转染的阴性对照293T细胞，空心实线直方图显示使用hCDH6转染的293T细胞。如所见，通过抗体与细胞表面上的hCDH6的结合增强荧光强度。大鼠IgG对照没有结合至任何细胞。结果，证实这4种产生的大鼠抗CDH6单克隆抗体与用pcDNA3.1-hCDH6转染的293T细胞结合。
2)-2通过流式细胞术分析大鼠抗CDH6抗体的CDH6-结合位点
2)-2-1人CDH6的各结构域缺失突变体的表达载体的构建
人CDH6的全长胞外区具有五个胞外结构域，EC1(SEQ ID NO:2)、EC2(SEQ ID NO:3)、EC3(SEQ ID NO:4)、EC4(SEQ ID NO:5)和EC5(SEQ ID NO:6)。通过GeneArt合成待表达的基因，以使五个EC结构域的各个可以从全长人CDH6中缺失，并根据本领域技术人员已知的方法并入用于哺乳动物表达的p3xFLAG-CMV-9载体(Sigma-Aldrich Co.LLC)中，以产生缺少EC1至EC5任一个的各结构域缺失突变体的表达载体。
2)-2-2使用结构域缺失突变体通过流式细胞术对大鼠抗-人CDH6抗体进行表位分析
使用用各EC结构域缺失载体转染的293α细胞系通过流式细胞术分析鉴定大鼠抗人CDH6抗体结合的表位。使用Lipofectamine 2000(Thermo Fisher Scientific Inc.)，将参考实施例2)-2-1中生产的各结构域缺失突变表达载体或用于表达全长人CDH6的pcDNA3.1-hCDH6瞬时引入293α细胞系中，所述293α细胞系是由HEK293细胞通过用整联蛋白αv和整联蛋白β3表达载体稳定转染而衍生的细胞系。细胞在37℃和5％CO2的条件下培养过夜，此后制备细胞悬液。将转染的293α细胞的悬液离心，然后除去上清液。此后，通过加入参考实施例1)-7中制备的4种大鼠抗CDH6单克隆抗体(克隆号：rG019、rG055、rG056和rG061)的每一种或大鼠IgG对照(R&D Systems,Inc.)(最终浓度：20ng/ml)而悬浮细胞。将细胞在4℃下静置1小时。细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，然后通过加入已经用补充5％FBS的PBS稀释50倍的在兔中产生的抗大鼠IgG(全分子)-FITC抗体(Sigma-AldrichCo.LLC)而悬浮。将细胞在4℃下静置1小时。将细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，然后使用流式细胞仪(Canto II；BD Biosciences)检测。使用FlowJo(Tree Star,Inc.)分析数据。结果显示在图2-1至2-6中。在图2-1至2-6的直方图中，横坐标描绘指示结合的抗体量的FITC荧光强度，而纵坐标描绘细胞计数。阴影直方图显示使用阴性对照未转染293α细胞，空心实线直方图显示使用表达全长hCDH6或各EC结构域缺失突变体的293细胞。当抗体结合至细胞表面上的全长hCDH6或各EC结构域缺失突变体时，荧光强度增强。大鼠IgG对照没有结合至任一转染细胞。这4种产生的大鼠抗CDH6单克隆抗体结合至全长hCDH6、EC1缺失突变体、EC2缺失突变体、EC4缺失突变体和EC5缺失突变体，但没有结合至EC3缺失突变体。根据这一结果，证明这4种大鼠抗CDH6单克隆抗体以EC3作为表位特异性结合至hCDH6。
2)-3大鼠抗CDH6抗体的内化活性
2)-3-1人肿瘤细胞系中的CDH6表达的确认
为了选择CDH6阳性人肿瘤细胞系用于评估所得抗体，从已知数据库检索CDH6表达信息，并通过流式细胞术评估细胞膜表面上的CDH6的表达。将人卵巢肿瘤细胞系NIH:OVCAR-3、PA-1和ES-2以及人肾细胞肿瘤细胞系786-O(都获自ATCC)各自在37℃和5％CO2的条件下培养，此后制备细胞悬液。将细胞离心，然后除去上清液。此后，通过加入市售抗人CDH6抗体(MABU2715,R&D Systems,Inc.)或作为阴性对照的小鼠IgG1(BD Pharmingen)(最终浓度：50μg/mL)而悬浮细胞。将细胞在4℃下静置1小时。细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，然后通过加入已经用补充5％FBS的PBS稀释50倍的FITC偶联的山羊抗小鼠免疫球蛋白(Dako)的F(ab')2片段而悬浮。将细胞在4℃下静置1小时。细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，然后使用流式细胞仪(Canto II；BD Biosciences)检测。使用FlowJo(Tree Star,Inc.)分析数据。结果显示在图3中。在图3的直方图中，横坐标描绘指示结合的抗体量的FITC荧光强度，而纵坐标描绘细胞计数。阴影直方图显示在染色中使用阴性对照mIgG1，空心实线直方图显示在染色中使用抗人CDH6抗体。如所见，通过抗体与细胞表面上的hCDH6的结合增强荧光强度。mIgG1对照没有结合至任一细胞。结果，证实NIH:OVCAR-3、PA-1和786-O细胞系在细胞表面上内源性表达CDH6。另一方面，证明ES-2细胞系没有表达CDH6。
2)-3-2大鼠抗CDH6抗体的内化活性的评估
使用与抑制蛋白质合成的毒素(皂草素)偶联的抗大鼠IgG试剂Rat-ZAP(AdvancedTarGeting Systems)评估大鼠抗CDH6抗体的内化活性。具体地，将人CDH6阳性卵巢肿瘤细胞系NIH:OVCAR-3(ATCC)以4x103个细胞/孔接种在96孔板上，然后在37℃和5％CO2的条件下培养过夜。将人CDH6阳性肾细胞肿瘤细胞系786-O(ATCC)以1x103个细胞/孔接种在96孔板上，然后培养过夜。第二天，将各大鼠抗CDH6抗体(最终浓度：1nM)或作为阴性对照抗体的大鼠IgG2b抗体(R&D Systems,Inc.)添加到板中。将未与毒素偶联的Rat-ZAP(最终浓度：0.5nM)或Fc(γ)片段特异性山羊抗大鼠IgG(GoatAnti-Rat IgG,Fc(gamma)FragmentSpecific)(Jackson ImmunoResearch Laboratories，Inc.)(最终浓度：0.5nM)作为阴性对照进一步添加到板中，并将细胞在37℃和5％CO2的条件下培养3天。通过使用CellTiter-Glo(TM)发光细胞活力测定(Luminescent CellViabilityAssay)(Promega Corp.)量化ATP活性(RLU)而测量活细胞的数量。在这一评估中，Rat-ZAP以依赖于大鼠抗CDH6抗体的内化活性的方式摄取到细胞中，以使抑制蛋白质合成的皂草素被释放到细胞中，从而抑制细胞生长。通过将补充了阴性对照而非Rat-ZAP的孔中的活细胞数定义为100％时的相对存活率指示由加入抗CDH6抗体引起的细胞生长抑制效应。图4显示细胞存活率的图和表。结果，证明大鼠抗CDH6抗体结合至CDH6并引起内化。
[参考实施例3:编码大鼠抗CDH6抗体的可变区的cDNA的核苷酸序列的测定]
3)-1rG019重链可变区和轻链可变区基因片段的扩增和测序
3)-1-1由G019制备总RNA
为了扩增编码rG019的各可变区的cDNA，使用TRIzol Reagent(Ambion,Inc.)由G019制备总RNA。
3)-1-2通过5'-RACE PCR扩增编码rG019重链可变区的cDNA和测定核苷酸序列
使用大约1μg参考实施例3)-1-1中制备的总RNA和SMARTer RACE cDNA扩增试剂盒(ClontechLaboratories,Inc.)扩增编码重链可变区的cDNA。作为用于根据PCR扩增rG019重链基因的可变区的cDNA的引物，使用UPM(通用引物A混合物(Universal Primer AMix)：包括在SMARTer RACE cDNA扩增试剂盒中)和由已知大鼠重链的恒定区的序列设计的引物。
将通过5'-RACE PCR扩增的编码重链可变区的cDNA克隆到质粒中，此后，对重链可变区的cDNA的核苷酸序列进行序列分析。
编码rG019的重链可变区的cDNA的测定核苷酸序列显示在SEQ ID NO:16中，其氨基酸序列显示在SEQ ID NO:15中。
3)-1-3通过5'-RACE PCR扩增编码rG019轻链可变区的cDNA和测定核苷酸序列
通过如参考实施例3)-1-2中所用的相同方法进行扩增和测序。但是，作为用于根据PCR扩增rG019轻链基因的可变区的cDNA的引物，使用UPM(通用引物A混合物(UniversalPrimer A Mix)：包括在SMARTer RACE cDNA扩增试剂盒中)和由已知大鼠轻链的恒定区的序列设计的引物。
编码rG019的轻链可变区的cDNA的测定核苷酸序列显示在SEQ ID NO:11中，其氨基酸序列显示在SEQ ID NO:10中。
3)-2rG055重链可变区和轻链可变区基因片段的扩增和测序
通过如参考实施例3)-1中所用的相同方法测定序列。
编码rG055的重链可变区的cDNA的测定核苷酸序列显示在SEQ ID NO:26中，其氨基酸序列显示在SEQ ID NO:25中。编码rG055的轻链可变区的cDNA的核苷酸序列显示在SEQID NO:21中，其氨基酸序列显示在SEQ ID NO:20。
3)-3rG056重链可变区和轻链可变区基因片段的扩增和测序
通过如参考实施例3)-1中所用的相同方法测定序列。
编码rG056的重链可变区的cDNA的测定核苷酸序列显示在SEQ ID NO:36中，其氨基酸序列显示在SEQ ID NO:35。编码rG056的轻链可变区的cDNA的核苷酸序列显示在SEQID NO:31中，其氨基酸序列显示在SEQ ID NO:30中。
3)-4rG061重链可变区和轻链可变区基因片段的扩增和测序
通过如参考实施例3)-1中所用的相同方法测定序列。
编码rG061的重链可变区的cDNA的测定核苷酸序列显示在SEQ ID NO:46中，其氨基酸序列显示在SEQ ID NO:45。编码rG061的轻链可变区的cDNA的核苷酸序列显示在SEQID NO:41中，其氨基酸序列显示在SEQ ID NO:40。
[参考实施例4:人嵌合抗CDH6抗体chG019的生产]
4)-1人嵌合抗CDH6抗体chG019表达载体的构建
4)-1-1嵌合和人源化轻链表达载体pCMA-LK的构建
已经通过用限制酶XbaI和PmeI消化质粒pcDNA3.3-TOPO/LacZ(InvitrogenCorp.)而获得的大约5.4-kb片段使用In-FusionAdvantage PCR克隆试剂盒(ClontechLaboratories,Inc.)结合至包含编码人轻链信号序列和人κ链恒定区的DNA序列(SEQ IDNO:50)的DNA片段，以产生pcDNA3.3/LK。
从pcDNA3.3/LK中除去新霉素表达单元以构建pCMA-LK。
嵌合和人源化IgG1型重链表达载体pCMA-G1的构建
已经通过用XbaI和PmeI消化pCMA-LK以从中除去编码轻链信号序列和人κ链恒定区的DNA序列而获得的DNA片段使用In-Fusion Advantage PCR克隆试剂盒(ClontechLaboratories,Inc.)结合至包含编码人重链信号序列和人IgG1恒定区的DNA序列(SEQ ID NO:51)的DNA片段，以构建pCMA-G1。
4)-1-3chG019重链表达载体的构建
合成SEQ ID NO:57中所示的chG 019重链的核苷酸序列中的核苷酸位置36至440的DNA片段(GENEART)。使用In-Fusion HD PCR克隆试剂盒(Clontech Laboratories,Inc.)，将合成的DNA片段插入已经用限制酶BlpI切割的pCMA-G1的位点，以构建chG019重链表达载体。要指出，对于chG019重链，使用半胱氨酸被脯氨酸取代的CDR序列，以防止不可预测的二硫键。
4)-1-4chG019轻链表达载体的构建
合成包含编码chG 019轻链的DNA序列(SEQ ID NO:52)的DNA片段(GENEART)。使用In-Fusion HD PCR克隆试剂盒(Clontech Laboratories,Inc.)，将合成的DNA片段结合至已经通过用XbaI和PmeI消化pCMA-LK以从中除去编码轻链信号序列和人κ链恒定区的DNA序列而获得的DNA片段，以构建chG019轻链表达载体。
4)-2人嵌合抗CDH6抗体chG019的生产和纯化
4)-2-1chG019的生产
根据手册，培养和传代Freestyle 293F细胞(Invitrogen Corp.)。将对数生长期的1.2×109个Freestyle 293F细胞(Invitrogen Corp.)接种在3-L Fernbach Erlenmeyer烧瓶(Corning Inc.)上，然后用Freestyle293表达培养基(Invitrogen Corp.)以2.0×106个细胞/mL稀释。向40ml Opti-Pro SFM培养基(Invitrogen Corp.)中加入0.24mg重链表达载体、0.36mg轻链表达载体和1.8mg聚乙烯亚胺(Polyscience#24765)，并轻轻搅拌所得混合物。在培养5分钟后，将混合物添加到FreeStyle293F细胞中。将细胞在8％CO2培养器中在37℃下以90rpm振荡培养4小时，此后将600mL EX-CELL VPRO培养基(SAFC BiosciencesInc.)、18mL GlutaMAX I(GIBCO)和30mLYeastolate Ultrafiltrate(GIBCO)添加到培养基中。将细胞8％CO2培养器中在37℃下以90rpm振荡培养7天。所得培养上清液经由一次性胶囊过滤器(Disposable Capsule Filter)(Advantec#CCS-045-E1H)过滤。
4)-2-2chG019的纯化
根据rProteinA亲和色谱法，通过一步法从参考实施例4)-2-1中获得的培养上清液中纯化抗体。将培养物上清液施加到已经填充了用PBS平衡的MabSelectSuRe(GEHealthcare Biosciences Corp.)的柱上，此后用柱体积的两倍或更多倍的量的PBS洗涤该柱。随后，用2M精氨酸盐酸盐溶液(pH4.0)洗脱抗体，以收集含有抗体的级分。将级分透析(Thermo Fisher Scientific Inc.,Slide-A-Lyzer透析盒)，以用HBSor(25mM组氨酸/5％山梨糖醇，pH 6.0)替换缓冲液。使用离心UF过滤装置(Centrifugal UF Filter Device)VIVASPIN20(分子量截留值：UF10K，Sartorius Inc.)，浓缩抗体，以将IgG的浓度调节至5mg/ml以上。最后，通过Minisart-Plus过滤器(Sartorius Inc.)过滤抗体以获得纯化样品。
4)-3人嵌合抗CDH6抗体chG019的结合活性的评估
通过流式细胞术证实4)-2中纯化的人嵌合抗CDH6抗体chG019的CDH6结合活性。使用Lipofectamine 2000，将参考实施例1)-1中生产的pcDNA3.1-hCDH6或pcDNA3.1-cynoCDH6，或pcDNA3.1瞬时引入293α细胞中。细胞在37℃和5％CO2的条件下培养过夜，此后制备细胞悬液。将chG019添加到这些细胞各自的悬液中。将细胞在4℃下静置1小时。此后，细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，然后通过加入已经用补充5％FBS的PBS稀释500倍的PE标记的F(ab')2片段抗人IgG，Fcγ抗体(Jackson ImmunoResearchLaboratories,Inc.)而悬浮。将细胞在4℃下静置1小时。细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，然后重悬在补充5％FBS的PBS中，然后使用流式细胞仪(Canto II；BD Biosciences)检测。使用FlowJo(TreeStar,Inc.)分析数据。如图5中所示，chG019没有结合至作为阴性对照的用pcDNA3.1转染的293α细胞，但以抗体浓度依赖性方式结合至用pcDNA3.1-hCDH6或pcDNA3.1-cynoCDH6转染的293α细胞。在图5中，横坐标描绘抗体浓度，而纵坐标描绘基于平均荧光强度的结合抗体量。从这一结果可以明显看出，chG019以几乎相等的结合活性特异性结合至人CDH6和食蟹猴CDH6。
[参考实施例5:人源化抗CDH6抗体的生产]
5)-1抗CDH6抗体的人源化形式的设计
5)-1-1chG019可变区的分子建模
chG 019的可变区的分子建模利用被称为同源建模的方法(Methods inEnzymology,203,121-153,(1991))。使用市售蛋白质三维结构分析程序BioLuminate(由Schrodinger,LLC制造)，使用蛋白质数据库(Nuc.Acid Res.35,D301-D303(2007))中登记的与chG019的重链和轻链可变区具有高序列一致性的结构(PDB ID:2I9L)作为模板。
5)-1-2人源化hG019的氨基酸序列的设计
通过CDR移植将chG019人源化(Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86,10029-10033(1989))。由Kabat等人(Sequences of Proteins of Immunological Interest,第5版,Public Health Service National Institutes ofHealth,Bethesda,MD.(1991))确定的人γ链亚组1和κ链亚组1的共有序列与chG019的框架区具有高度一致性，并且基于此，分别选择它们作为重链和轻链的受体。通过参考例如Queen等人给出的标准(Proc.Natl.Acad.Sci.USA 86,10029-10033(1989))分析三维模型来选择要移植到受体上的供体残基。
5)-2chG019重链的人源化
将由此设计的三个重链命名为hH01、hH02和hH04。hH 01重链的全长氨基酸序列显示在SEQ ID NO:69中。编码SEQ ID NO:69的氨基酸序列的核苷酸序列显示在SEQ ID NO:70中。重链hH02的全长氨基酸序列显示在SEQ ID NO:73中。编码SEQ ID NO:73的氨基酸序列的核苷酸序列显示在SEQ ID NO:74中。重链hH04的全长氨基酸序列显示在SEQ ID NO:77中。编码SEQ ID NO:77的氨基酸序列的核苷酸序列显示在SEQ ID NO:78中。
5)-3chG019轻链的人源化
将由此设计的两个轻链命名为hL02和hL03。hL02轻链的全长氨基酸序列显示在SEQ ID NO:61中。编码SEQ ID NO:61的氨基酸序列的核苷酸序列显示在SEQ ID NO:62中。轻链h103的全长氨基酸序列显示在SEQ ID NO:65中。编码SEQ ID NO:65的氨基酸序列的核苷酸序列显示在SEQ ID NO:66中。
5)-4通过重链和轻链的组合设计人源化hG019
由hH01和hL02组成的抗体被命名为“H01L02抗体”或“H01L02”。由hH02和hL02组成的抗体被命名为“H02L02抗体”或“H02L02”。由hH02和hL03组成的抗体被命名为“H02L03抗体”或“H02L03”。由hH04和hL02组成的抗体被命名为“H04L02抗体”或“H04L02”。
5)-5人源化抗CDH6抗体的表达
5)-5-1人源化hG019重链表达载体的构建
5)-5-1-1人源化hG019-H01型重链表达载体的构建
合成SEQ ID NO:70中所示的人源化hG019-H01型重链的核苷酸序列中的核苷酸位置36至440的DNA片段(GENEART)。通过如参考实施例4)-1-3中所用的相同方法构建人源化hG019-H01型重链表达载体。
5)-5-1-2人源化hG019-H02型重链表达载体的构建
合成SEQ ID NO:74中所示的人源化hG019-H02型重链的核苷酸序列中的核苷酸位置36至440的DNA片段(GENEART)。通过如参考实施例4)-1-3中所用的相同方法构建人源化hG019-H02型重链表达载体。
5)-5-1-3人源化hG019-H04型重链表达载体的构建
合成SEQ ID NO:78中所示的人源化hG019-H04型重链的核苷酸序列中的核苷酸位置36至440的DNA片段(GENEART)。通过如参考实施例4)-1-3中所用的相同方法构建人源化hG019-H04型重链表达载体。
5)-5-2人源化hG019轻链表达载体的构建
5)-5-2-1人源化hG019-L02型轻链表达载体的构建
合成SEQ ID NO:62中所示的人源化hG019-L02型轻链的核苷酸序列中的核苷酸位置37至399的包含编码人源化hG019-L02型轻链可变区的DNA序列的DNA片段(GENEART)。使用In-FusionHD PCR克隆试剂盒(Clontech Laboratories,Inc.)，将合成的DNA片段插入已经用限制酶BsiWI切割的pCMA-LK的位点，以构建人源化hG019-L02型轻链表达载体。
5)-5-2-2人源化hG019-L03型轻链表达载体的构建
合成SEQ ID NO:66中所示的人源化hG019-L03型轻链的核苷酸序列中的核苷酸位置37至399的包含编码人源化hG019-L03型轻链可变区的DNA序列的DNA片段(GENEART)。通过如参考实施例5)-5-2-1中所用的相同方法构建人源化hG019-L03型轻链表达载体。
5)-5-3人源化hG019的制备
5)-5-3-1H01L02、H02L02、H02L03和H04L02的生产
通过如参考实施例4)-2-1中所用的相同方法生产抗体。通过参考实施例5)-4中所示的重链和轻链的组合生产H01L02、H02L02、H02L03和H04L02。
5)-5-3-2H01L02、H02L02、H02L03和H04L02的两步纯化
通过两步法，即通过rProteinA亲和色谱法和陶瓷羟基磷灰石，从参考实施例5)-5-3-1中获得的培养上清液中纯化抗体。将培养物上清液施加到已经填充了用PBS平衡的MabSelectSuRe(GE Healthcare Biosciences Corp.制造)的柱上，此后用柱体积的两倍或更多倍的量的PBS洗涤该柱。随后，用2M精氨酸盐酸盐溶液(pH 4.0)洗脱抗体。将含有抗体的级分透析(Thermo Fisher Scientific Inc.,Slide-A-Lyzer透析盒)，以用PBS替换缓冲液。将抗体溶液用5mM磷酸钠/50mM MES/pH 7.0的缓冲液稀释5倍，然后施加到已经用5mMNaPi/50mM MES/30mM NaCl/pH 7.0的缓冲液平衡的陶瓷羟基磷灰石柱(Bio-RadLaboratories,Inc.,Bio-Scale CHT Type-1 Hydroxyapatite Column)上。在氯化钠的线性浓度梯度上进行洗脱，以收集含有抗体的级分。将这种级分透析(Thermo FisherScientific Inc.,Slide-A-Lyzer透析盒)，以用HBSor(25mM组氨酸/5％山梨糖醇，pH 6.0)替换缓冲液。用离心UF过滤装置(Centrifugal UF FilterDevice)VIVASPIN20(分子量截留值：UF10K，Sartorius Inc.)浓缩抗体，由此将IgG浓度调节至20mg/ml。最后，通过Minisart-Plus过滤器(Sartorius Inc.)过滤抗体以获得纯化样品。
[参考实施例A:抗CDH6抗体NOV0712的生产]
参考国际公开号WO 2016/024195中描述的NOV0712的轻链全长和重链全长氨基酸序列(在国际公开号WO 2016/024195中分别为SEQ ID NO:235和SEQ ID NO:234)生产该参考实施例中使用的抗CDH6抗体NOV0712。
参考实施例A)-1抗CDH6抗体NOV0712
参考实施例A)-1-1抗CDH6抗体NOV0712重链表达载体的构建
合成SEQ ID NO:84中所示的NOV0712重链的核苷酸序列中的核苷酸位置36至428的编码NOV0712重链可变区的DNA片段(GENEART)。通过如参考实施例4)-1-3中所用的相同方法构建NOV0712重链表达载体。由NOV0712重链表达载体表达的NOV0712重链的氨基酸序列显示在SEQ ID NO:83中。在SEQ ID NO:83中所示的氨基酸序列中，由位置1至19的氨基酸残基组成的氨基酸序列是信号序列。
参考实施例A)-1-2抗CDH6抗体NOV0712轻链表达载体的构建
合成SEQ ID NO:82中所示的NOV0712轻链的核苷酸序列中的核苷酸位置37至405的包含编码NOV0712轻链可变区的DNA序列的DNA片段(GENEART)。通过如参考实施例5)-5-2-1中所用的相同方法构建NOV0712轻链表达载体。由NOV0712轻链表达载体表达的NOV0712轻链的氨基酸序列显示在SEQ ID NO:81中。在SEQ ID NO:81中所示的氨基酸序列中，由位置1至20的氨基酸残基组成的氨基酸序列是信号序列。
参考实施例A)-2抗CDH6抗体NOV0712的制备
参考实施例A)-2-1抗CDH6抗体NOV0712的生产
通过如参考实施例4)-2-1中所用的相同方法生产NOV0712。
参考实施例A)-2-2抗CDH6抗体NOV0712的一步纯化
通过如参考实施例4)-2-2中所用的相同方法从参考实施例A)-2-1中获得的培养上清液中纯化抗CDH6抗体NOV0712(抗体浓度:5mg/lHBSor)。
[参考实施例6:人源化hG019和NOV0712的体外评估]
6)-1人源化hG019的结合活性的评估
6)-1-1人源化hG019的人CDH6抗原结合能力
根据捕获方法，通过使用Biacore T200(GE Healthcare Biosciences Corp.)测量抗体和抗原(重组人CDH6 Fc His嵌合体，R&D Systems,Inc.)之间的解离常数，所述捕获方法包括用固定化的抗His抗体捕获作为配体的抗原，然后使用抗体作为分析物测量解离常数。通过胺偶联方法将大约1000RU的抗组氨酸抗体(His捕获试剂盒，GE HealthcareBiosciences Corp.)共价结合至传感器芯片CM5(GE Healthcare Biosciences Corp.)。还以与上述相同的方式将抗体固定在参考细胞上。使用补充了1mM CaCl2的HBS-P+(10mMHEPES pH 7.4、0.15MNaCl、0.05％表面活性剂P20)作为运行缓冲液。将抗原添加到抗组氨酸抗体固定化芯片上60秒，然后以30μl/min的流量加入抗体的稀释系列溶液(0.391至100nM)300秒。随后，监测解离阶段600秒。作为再生溶液，将补充了5M MgCl2的甘氨酸溶液(pH 1.5)以10μl/min的流量两次加入30秒。在数据分析中使用分析软件(BIAevaluationsoftware，版本4.1)中的稳态亲和力模型，并计算解离常数(KD)。结果显示在表2中。
[表2]
抗体 KD(M)
1 H01L02 1.5E-09
2 H02L02 1.1E-09
3 H02L03 1.4E-09
4 H04L02 1.1E-09
6)-1-2对人、猴、小鼠或大鼠CDH6的结合活性
使用Lipofectamine 2000(Thermo Fisher Scientific Inc.)，将参考实施例1)-1中生产的pcDNA3.1-hCDH6、pcDNA3.1-cynoCDH6、p3xFLAG-CMV-9-mCDH6或p3xFLAG-CMV-9-rCDH6瞬时引入293α细胞中。细胞在37℃和5％CO2的条件下培养过夜，此后制备细胞悬液。使用未转染的293α细胞作为阴性对照。将如上所述制成的293α细胞悬液离心，然后除去上清液。此后，通过加入参考实施例5)-5-3中制备的4种人源化hG019抗体(克隆号：H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)的每一种或人IgG1对照(Calbiochem)而悬浮细胞。将细胞在4℃下静置1小时。细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，然后通过加入已经用补充5％FBS的PBS稀释500倍的抗人IgG，Fc(γ)PE山羊F(ab')(Jackson ImmunoResearch Laboratories,Inc.)而悬浮。将细胞在4℃下静置1小时。细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，然后使用流式细胞仪(Canto II；BD Biosciences)检测。使用FlowJo(Tree Star,Inc.)分析数据。在图6-1和6-2中，横坐标描绘抗体浓度，而纵坐标描绘基于平均荧光强度的结合抗体量。如图6-1和6-2中所示，作为阴性对照的人IgG1对照没有结合至任一CDH6转染细胞。4种人源化hG019抗体(克隆号：H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)结合至人CDH6和食蟹猴CDH6，但既没有结合至小鼠CDH6也没有结合至大鼠CDH6。没有任何抗体结合至作为阴性对照的用空载体pcDNA3.1转染的细胞。另一方面，国际公开号WO 2016/024195公开了NOV0712抗体表现出对人CDH6、食蟹猴CDH6、小鼠CDH6和大鼠CDH6的全部的结合活性。结果，证明本说明书中获得的4种人源化hG019抗体是表现出与NOV0712抗体不同的结合性质的抗CDH6抗体。
6)-2人源化hG019和NOV0712的CDH6-结合位点的分析
6)-2-1使用结构域缺失突变体的表位分析
使用Lipofectamine 2000(Thermo Fisher Scientific Inc.)，将参考实施例2)-2-1中生产的各结构域缺失突变体表达载体或用于表达全长人CDH6的pcDNA3.1-hCDH6瞬时引入细胞。细胞在37℃和5％CO2的条件下培养过夜，此后制备细胞悬液。将转染的293α细胞的悬液离心，然后除去上清液。此后，通过加入参考实施例5)-5-3中制备的4种人源化hG019抗体(克隆号：H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)的每一种、或参考实施例A中制备的抗CDH6抗体NOV0712或作为阴性对照的人IgG1(Calbiochem)而悬浮细胞。将细胞在4℃下静置1小时。细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，然后通过加入已经用补充5％FBS的PBS稀释500倍的APC抗人IgG山羊F(ab')2(Jackson ImmunoResearch Laboratories,Inc.)而悬浮。将细胞在4℃下静置1小时。细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，然后使用流式细胞仪(Canto II；BDBiosciences)检测。使用FlowJo(Tree Star,Inc.)分析数据。结果显示在图7-1至7-6中。在图7-1至7-6的直方图中，横坐标描绘指示结合的抗体量的APC荧光强度，而纵坐标描绘细胞计数。阴影直方图显示使用阴性对照未转染293α细胞，空心实线直方图显示使用表达全长hCDH6或各EC结构域缺失突变体的293α细胞。当抗体结合至细胞表面上的全长hCDH6或各EC结构域缺失突变体时，荧光强度增强。人IgG1对照没有结合至任一转染细胞。这4种人源化hG019抗体(克隆号：H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)结合至全长hCDH6、EC1缺失突变体、EC2缺失突变体、EC4缺失突变体和EC5缺失突变体，但没有结合至EC3缺失突变体。具体地，证明这4种人源化hG019抗体以EC3作为表位特异性结合至hCDH6。另一方面，抗CDH6抗体NOV0712结合至全长hCDH6、EC1缺失突变体、EC2缺失突变体、EC3缺失突变体和EC4缺失突变体，但没有结合至EC5缺失突变体。具体地，证明抗CDH6抗体NOV0712以EC5作为表位特异性结合至hCDH6。这与国际公开号WO 2016/024195中描述的关于NOV0712的表位信息一致。由这一结果，证明在本说明书中获得的4种人源化HG019抗体是表现出与NOV0712的性质不同的性质的抗CDH6抗体。
6)-2-2抗体的结合竞争测定
6)-2-2-1786-O/hCDH6稳定表达细胞系的生产
通过用用于表达全长人CDH6的重组逆转录病毒感染786-O细胞(ATCC)而生产786-O/hCDH6稳定表达细胞系。通过使用编码人CDH6蛋白(NP_004923)的cDNA表达载体(OrigeneTechnologies Inc.,RC217889)并根据本领域技术人员已知的方法将该cDNA并入逆转录病毒载体pQCXIN(Clontech Laboratories,Inc.)中而生产人CDH6表达逆转录病毒载体(pQCXIN-hCDH6)。使用FuGene HD(Promega Corp.)，将pQCXIN-hCDH6瞬时引入逆转录病毒包装细胞RetroPack PT67(Clontech Laboratories,Inc.)。在48小时后，回收含有重组逆转录病毒的培养物上清液，然后添加到786-O细胞培养系统中，以感染细胞。从感染后3天开始，将感染的细胞在37℃和5％CO2的条件下在补充G4188(Gibco)(最终浓度：50mg/mL)的培养基中培养，并用药物筛选，以建立稳定表达人CDH6的细胞系786-O/hCDH6。以如参考实施例2)-3-1中所用的相同方式通过流式细胞术确认该稳定表达系中的人CDH6的高表达(图8)。使用已经用补充5％FBS的PBS稀释500倍的山羊抗小鼠IgG1二抗Alexa Fluor 647(Thermo Fisher Scientific Inc.)作为用于检测的抗体。结果显示在图8中。在图8的直方图中，横坐标描绘指示结合的抗体量的Alexa Fluor 647荧光强度，而纵坐标描绘细胞计数。阴影直方图显示在染色中使用阴性对照mIgG1，空心实线直方图显示在染色中使用抗人CDH6抗体。如所见，通过抗体与细胞表面上的hCDH6的结合增强荧光强度。mIgG1对照没有结合至任一细胞。结果，证明786-O/hCDH6稳定表达细胞系比亲本系786-O细胞更高度表达人CDH6。
6)-2-2-2使用标记的H01L02和标记的NOV0712的结合竞争测定
使用Alexa Fluor 488单克隆抗体标记试剂盒(Thermo Fisher ScientificInc.)生产标记的H01L02和标记的NOV0712。将6)-2-2-1中生产的786-O/hCDH6稳定表达细胞系的细胞悬液离心，然后除去上清液。此后，通过加入标记的NOV0712或标记的H01L02(最终浓度：5nM)而悬浮细胞，并且进一步加入参考实施例5)-5-3中制备的4种人源化hG019抗体(克隆号：H01L02、H02L02、H02L03和H04L02)的每一种、或参考实施例A中制备的抗CDH6抗体NOV0712或作为阴性对照的人IgG1(Calbiochem)(最终浓度：如图9的横坐标中所示)。将细胞在4℃下静置1小时。此后，细胞用补充5％FBS的PBS洗涤两次，然后使用流式细胞仪(Canto II；BD Biosciences)检测。使用FlowJo(Tree Star,Inc.)分析数据。结果显示在图9中。横坐标描绘添加的未标记抗体的最终浓度，而纵坐标描绘基于平均荧光强度的结合抗体量。在将未标记的NOV0712添加到补充了标记的NOV0712的细胞中时，结合的标记抗体的量通过被未标记的抗体以添加浓度依赖性方式替代而减少，因为它们彼此竞争结合至相同的表位。另一方面，即使将这4种人源化HG019抗体的每一种或作为阴性对照的人IgG1添加到补充了标记的NOV0712的细胞中，结合的标记抗体的量也没有变化，表明这些抗体的表位不同，因此彼此不竞争结合。同样地，在将这4种未标记的人源化HG019抗体的每一种添加到补充了标记的H01L02的细胞中时，结合的标记抗体的量通过被未标记的抗体以添加浓度依赖性方式替代而减少，因为它们彼此竞争结合至相同的表位。另一方面，即使将NOV0712或作为阴性对照的人IgG1添加到补充了标记的H01L02的细胞中，结合的标记抗体的量也没有变化，表明这些抗体的表位不同，因此彼此不竞争结合。
6)-3人源化hG019和NOV0712的内化活性的评估
使用与抑制蛋白质合成的毒素(皂草素)偶联的抗人IgG试剂Hum-ZAP(AdvancedTarGeting Systems)评估人源化hG019和NOV0712的内化活性。具体地，将人CDH6阳性卵巢肿瘤细胞系NIH:OVCAR-3(ATCC)以4x103个细胞/孔接种在96孔板上，然后在37℃和5％CO2的条件下培养过夜。将人CDH6阳性肾细胞肿瘤细胞系786-O(ATCC)以1x103个细胞/孔接种在96孔板上，然后培养过夜。将人CDH6阳性卵巢肿瘤细胞系PA-1(ATCC)以1x103个细胞/孔接种在96孔板上，然后在37℃和5％CO2的条件下培养过夜。第二天，将各抗CDH6抗体(最终浓度：1nM)或作为阴性对照抗体的人IgG1抗体(Calbiochem)添加到板中。将未与毒素偶联的Hum-ZAP(最终浓度：0.5nM)或Fc(γ)片段特异性F(ab')2片段山羊抗人IgG(F(ab')2Fragment Goat Anti-human IgG,Fc(gamma)Fragment Specific)(JacksonImmunoResearchLaboratories，Inc.)(最终浓度：0.5nM)作为阴性对照进一步添加到板中，并将细胞在37℃和5％CO2的条件下培养3天。通过使用CellTiter-Glo(TM)发光细胞活力测定(Luminescent Cell ViabilityAssay)量化ATP活性(RLU)而测量活细胞的数量。在这一评估中，Hum-ZAP以依赖于人源化抗CDH6抗体的内化活性的方式摄取到细胞中，以使抑制蛋白质合成的皂草素被释放到细胞中，从而抑制细胞生长。通过将补充了阴性对照而非Hum-ZAP的孔中的活细胞数定义为100％时的相对存活率指示由加入抗CDH6抗体引起的细胞生长抑制效应。图10-1至10-3各自显示细胞存活率的图和表。在这一实验中，具有强内化活性的抗体被认为提供低细胞存活率。结果，这4种人源化hG019抗体具有由所有3种细胞系的细胞存活率预测的大约50至75％的内化率。因此，这4种人源化hG019抗体表现出非常高的内化活性，并且表现出比NOV0712高得多的内化活性。根据ADC的药效机理，具有较高内化活性的抗体被认为更适合作为ADC抗体。
[参考实施例7:人源化hG019-药物偶联物的生产]
7)-1抗体-药物偶联物H01L02-DXd的生产
步骤1:抗体-药物偶联物(1)
[式11]
抗体的还原：通过使用生产方法1中描述的常用程序B(使用1.53mLmg-1cm-1作为280nm吸收系数)和C，用PBS6.0/EDTA将参考实施例5中生产的H01L02调节至9.85mg/mL。向这种溶液(5.7ml)中加入10mM TCEP水溶液(Tokyo Chemical Industry Co.,Ltd.)(0.231mL；6.0当量/抗体分子)和1M磷酸氢二钾水溶液(Nacalai Tesque,Inc.；0.0855mL)。在确认该溶液的pH在7.0±0.1内之后，通过将溶液在37℃下温育2小时而还原抗体中的链间二硫键。
抗体和药物连接子之间的偶联：将上述溶液在15℃下温育10分钟。随后，向其中加入N-[6-(2,5-二氧代-2,5-二氢-1H-吡咯-1-基)己酰基]甘氨酰甘氨酰-L-苯丙氨酰基-N-(2-{[(1S,9S)-9-乙基-5-氟-9-羟基-4-甲基-10,13-二氧代-2,3,9,10,13,15-六氢-1H,12H-苯并[de]吡喃并[3',4':6,7]吲哚嗪并[1,2-b]喹啉-1-基]氨基}-2-氧代乙氧基)甲基]甘氨酰胺在二甲亚砜中的10mM溶液(0.386mL；10当量/抗体分子)，并将所得混合物在15℃下温育1小时以将药物连接子与抗体偶联。随后，向其中加入100mMNAC的水溶液(Sigma-Aldrich Co.LLC)(0.0347mL；9当量/抗体分子)，并将所得混合物在室温下进一步搅拌20分钟以终止药物连接子的反应。
纯化：上述溶液通过生产方法1中描述的常用程序D纯化以获得19mL含有标题抗体-药物偶联物"H01L02-ADC"的溶液。
表征：使用生产方法1中描述的常用程序E(使用εD,280＝5440和εD,370＝21240)，获得以下特征值。
抗体浓度：2.26mg/mL、抗体产量：42.9mg(76％)、通过常用程序E测得的每抗体分子的偶联药物分子的平均数(n)：5.9和通过常用程序F测得的每抗体分子的偶联药物分子的平均数(n)：7.7。
7)-2抗体-药物偶联物H02L02-DXd的生产
步骤1:抗体-药物偶联物(2)
[式12]
抗体的还原：通过使用生产方法1中描述的常用程序B(使用1.51mLmg-1cm-1作为280nm吸收系数)和C，用PBS6.0/EDTA将参考实施例5中生产的H02L02调节至9.95mg/mL。向这种溶液(5.7ml)中加入10mM TCEP水溶液(Tokyo Chemical Industry Co.,Ltd.)(0.234mL；6.0当量/抗体分子)和1M磷酸氢二钾水溶液(Nacalai Tesque,Inc.；0.0855mL)。在确认该溶液的pH在7.0±0.1内之后，通过将溶液在37℃下温育2小时而还原抗体中的链间二硫键。
抗体和药物连接子之间的偶联：将上述溶液在15℃下温育10分钟。随后，向其中加入N-[6-(2,5-二氧代-2,5-二氢-1H-吡咯-1-基)己酰基]甘氨酰甘氨酰-L-苯丙氨酰基-N-[(2-{[(1S,9S)-9-乙基-5-氟-9-羟基-4-甲基-10,13-二氧代-2,3,9,10,13,15-六氢-1H,12H-苯并[de]吡喃并[3',4':6,7]吲哚嗪并[1,2-b]喹啉-1-基]氨基}-2-氧代乙氧基)甲基]甘氨酰胺在二甲亚砜中的10mM溶液(0.389mL；10当量/抗体分子)，并将所得混合物在15℃下温育1小时以将药物连接子与抗体偶联。随后，向其中加入100mMNAC的水溶液(Sigma-Aldrich Co.LLC)(0.0350mL；9当量/抗体分子)，并将所得混合物在室温下进一步搅拌20分钟以终止药物连接子的反应。
纯化：上述溶液通过生产方法1中描述的常用程序D纯化以获得19mL含有标题抗体-药物偶联物"H02L02-ADC"的溶液。
表征：使用生产方法1中描述的常用程序E(使用εD,280＝5440和εD,370＝21240)，获得以下特征值。
抗体浓度：2.61mg/mL、抗体产量：49.6mg(87％)、通过常用程序E测得的每抗体分子的偶联药物分子的平均数(n)：5.9和通过常用程序F测得的每抗体分子的偶联药物分子的平均数(n)：7.6。
7)-3抗体-药物偶联物H02L03-DXd的生产
步骤1:抗体-药物偶联物(3)
[式13]
抗体的还原：通过使用生产方法1中描述的常用程序B(使用1.53mLmg-1cm-1作为280nm吸收系数)和C，用PBS6.0/EDTA将参考实施例5中生产的H02L03调节至9.86mg/mL。向这种溶液(5.7ml)中加入10mM TCEP水溶液(Tokyo Chemical Industry Co.,Ltd.)(0.270mL；7.0当量/抗体分子)和1M磷酸氢二钾水溶液(Nacalai Tesque,Inc.；0.0855mL)。在确认该溶液的pH在7.0±0.1内之后，通过将溶液在37℃下温育2小时而还原抗体中的链间二硫键。
抗体和药物连接子之间的偶联：将上述溶液在15℃下温育10分钟。随后，向其中加入N-[6-(2,5-二氧代-2,5-二氢-1H-吡咯-1-基)己酰基]甘氨酰甘氨酰-L-苯丙氨酰基-N-[(2-{[(1S,9S)-9-乙基-5-氟-9-羟基-4-甲基-10,13-二氧代-2,3,9,10,13,15-六氢-1H,12H-苯并[de]吡喃并[3',4':6,7]吲哚嗪并[1,2-b]喹啉-1-基]氨基}-2-氧代乙氧基)甲基]甘氨酰胺在二甲亚砜中的10mM溶液(0.386mL；10当量/抗体分子)，并将所得混合物在15℃下温育1小时以将药物连接子与抗体偶联。随后，向其中加入100mMNAC的水溶液(Sigma-Aldrich Co.LLC)(0.0347mL；9当量/抗体分子)，并将所得混合物在室温下进一步搅拌20分钟以终止药物连接子的反应。
纯化：上述溶液通过生产方法1中描述的常用程序D纯化以获得19mL含有标题抗体-药物偶联物"H01L02-ADC"的溶液。
表征：使用生产方法1中描述的常用程序E(使用εD,280＝5440和εD,370＝21240)，获得以下特征值。
抗体浓度：2.71mg/mL、抗体产量：51.4mg(91％)、通过常用程序E测得的每抗体分子的偶联药物分子的平均数(n)：5.7和通过常用程序F测得的每抗体分子的偶联药物分子的平均数(n)：7.6。
7)-4抗体-药物偶联物H04L02-DXd的生产
步骤1:抗体-药物偶联物(4)
[式14]
抗体的还原：通过使用生产方法1中描述的常用程序B(使用1.53mLmg-1cm-1作为280nm吸收系数)和C，用PBS6.0/EDTA将参考实施例5中生产的H04L02调节至9.86mg/mL。向这种溶液(5.7ml)中加入10mM TCEP水溶液(Tokyo Chemical Industry Co.,Ltd.)(0.232mL；6.0当量/抗体分子)和1M磷酸氢二钾水溶液(Nacalai Tesque,Inc.；0.0855mL)。在确认该溶液的pH在7.0±0.1内之后，通过将溶液在37℃下温育2小时而还原抗体中的链间二硫键。
抗体和药物连接子之间的偶联：将上述溶液在15℃下温育10分钟。随后，向其中加入N-[6-(2,5-二氧代-2,5-二氢-1H-吡咯-1-基)己酰基]甘氨酰甘氨酰-L-苯丙氨酰基-N-[(2-{[(1S,9S)-9-乙基-5-氟-9-羟基-4-甲基-10,13-二氧代-2,3,9,10,13,15-六氢-1H,12H-苯并[de]吡喃并[3',4':6,7]吲哚嗪并[1,2-b]喹啉-1-基]氨基}-2-氧代乙氧基)甲基]甘氨酰胺在二甲亚砜中的10mM溶液(0.386mL；10当量/抗体分子)，并将所得混合物在15℃下温育1小时以将药物连接子与抗体偶联。随后，向其中加入100mMNAC的水溶液(Sigma-Aldrich Co.LLC)(0.0347mL；9当量/抗体分子)，并将所得混合物在室温下进一步搅拌20分钟以终止药物连接子的反应。
纯化：上述溶液通过生产方法1中描述的常用程序D纯化以获得19mL含有标题抗体-药物偶联物"H04L02-ADC"的溶液。
表征：使用生产方法1中描述的常用程序E(使用εD,280＝5440和εD,370＝21240)，获得以下特征值。
抗体浓度：2.56mg/mL、抗体产量：48.7mg(87％)、通过常用程序E测得的每抗体分子的偶联药物分子的平均数(n)：5.8和通过常用程序F测得的每抗体分子的偶联药物分子的平均数(n)：7.6。
[参考实施例B:NOV0712-药物偶联物的生产]
参考实施例B)-1抗体-药物偶联物NOV0712-DM4的生产
抗体-药物偶联物(5)
抗体和药物连接子之间的偶联：通过使用生产方法1中描述的常用程序B(使用1.51mLmg-1cm-1作为280nm吸收系数)和C，用20mM HEPES8.1(将Life Technologies Corp.制造的HEPES，1M缓冲溶液(20mL)用1M氢氧化钠调节pH至8.1，然后用蒸馏水制成1L)将参考实施例A中生产的NOV0712调节至9.7mg/mL。将溶液在20℃下温育10分钟。随后，向其中加入WO2016/024195中描述的1-(2,5-二氧代吡咯烷-1-氧基)-1-氧代-4-(吡啶-2-基二硫烷基)丁-2-磺酸在DMA中的10mM溶液(0.366mL；5.2当量/抗体分子)、N2-去乙酰基-去乙酰基-N2-(4-甲基-4-巯基-1-氧代戊基)-美登素(DM4)在DMA中的10mM溶液(0.366mL；6.8当量/抗体分子)和0.243mL DMA，并将所得混合物在20℃下温育16小时以将药物连接子与抗体偶联。随后，向其中加入1M乙酸水溶液以将pH调节至5.0，并将所得混合物在室温下进一步搅拌20分钟以终止药物连接子的反应。
纯化：上述溶液通过生产方法1中描述的常用程序D纯化以获得28mL含有标题抗体-药物偶联物"NOV0712-DM4"的溶液。
表征：使用生产方法1中描述的常用程序E(使用εA,280＝200500、εA,252＝76295、εD,280＝43170和εD,252＝23224)，获得以下特征值。
抗体浓度：2.58mg/mL、抗体产量：72.2mg(93％)和通过常用程序E测得的每抗体分子的偶联药物分子的平均数(n)：3.0。
参考实施例B)-2抗体-药物偶联物NOV0712-DXd的生产
步骤1:抗体-药物偶联物(6)
[式15]
抗体的还原：通过使用生产方法1中描述的常用程序B(使用1.5mLmg-1cm-1作为280nm吸收系数)和C，用PBS6.0/EDTA将参考实施例A中生产的NOV0712调节至9.26mg/mL。向这种溶液(6.6mL)中加入10mM TCEP水溶液(Tokyo Chemical Industry Co.,Ltd.)(0.254mL；6.0当量/抗体分子)和1M磷酸氢二钾水溶液(Nacalai Tesque,Inc.；0.0990mL)。在确认该溶液的pH在7.0±0.1内之后，通过将溶液在37℃下温育2小时而还原抗体中的链间二硫键。
抗体和药物连接子之间的偶联：将上述溶液在15℃下温育10分钟。随后，向其中加入N-[6-(2,5-二氧代-2,5-二氢-1H-吡咯-1-基)己酰基]甘氨酰甘氨酰-L-苯丙氨酰基-N-[(2-{[(1S,9S)-9-乙基-5-氟-9-羟基-4-甲基-10,13-二氧代-2,3,9,10,13,15-六氢-1H,12H-苯并[de]吡喃并[3',4':6,7]吲哚嗪并[1,2-b]喹啉-1-基]氨基}-2-氧代乙氧基)甲基]甘氨酰胺在二甲亚砜中的10mM溶液(0.381mL；9当量/抗体分子)，并将所得混合物在15℃下温育1小时以将药物连接子与抗体偶联。随后，向其中加入100mMNAC的水溶液(Sigma-Aldrich Co.LLC)(0.0381mL；9当量/抗体分子)，并将所得混合物在室温下进一步搅拌20分钟以终止药物连接子的反应。
纯化：上述溶液通过生产方法1中描述的常用程序D纯化以获得23.5mL含有标题抗体-药物偶联物"NOV0712-ADC"的溶液。
表征：使用生产方法1中描述的常用程序E(使用εD,280＝5440和εD,370＝21240)，获得以下特征值。
抗体浓度：2.26mg/mL、抗体产量：56.4mg(92％)、通过常用程序E测得的每抗体分子的偶联药物分子的平均数(n)：6.4和通过常用程序F测得的每抗体分子的偶联药物分子的平均数(n)：7.8。
[参考实施例C:H01L02-DM4的生产]
参考实施例C)-1抗体-药物偶联物H01L02-DM4的生产
抗体-药物偶联物(7)
抗体和药物连接子之间的偶联：通过使用生产方法1中描述的常用程序B(使用1.53mLmg-1cm-1作为280nm吸收系数)和C，用20mM HEPES8.1(将Life Technologies Corp.制造的HEPES，1M缓冲溶液(20mL)用1M氢氧化钠调节pH至8.1，然后用蒸馏水制成1L)将参考实施例5中生产的H01L02调节至9.8mg/mL。将溶液在20℃下温育10分钟。随后，向其中加入WO2016/024195中描述的1-(2,5-二氧代吡咯烷-1-氧基)-1-氧代-4-(吡啶-2-基二硫烷基)丁-2-磺酸在DMA中的10mM溶液(0.062mL；11.5当量/抗体分子)和N2-去乙酰基-N2-(4-甲基-4-巯基-1-氧代戊基)-美登素(DM4)在DMA中的10mM溶液(0.082mL；15.1当量/抗体分子)，并将所得混合物在20℃下温育18小时以将药物连接子与抗体偶联。随后，向其中加入1M乙酸水溶液以将pH调节至5.0，并将所得混合物在室温下进一步搅拌20分钟以终止药物连接子的反应。
纯化：上述溶液通过生产方法1中描述的常用程序D纯化以获得3.5mL含有标题抗体-药物偶联物"H01L02-DM4"的溶液。
表征：使用生产方法1中描述的常用程序E(使用εA,280＝223400、εA,252＝85646、εD,280＝4317和εD,252＝23224)，获得以下特征值。
抗体浓度：1.97mg/mL、抗体产量：6.90mg(88％)和通过常用程序E测得的每抗体分子的偶联药物分子的平均数(n)：3.6。
[参考实施例8:抗体-药物偶联物的体外活性的评估]
8)-1抗体-药物偶联物对CDH6阳性人肿瘤细胞系的体外细胞生长抑制活性的评估
将CDH6阳性人卵巢肿瘤细胞系PA-1在补充了10％FBS的MEM培养基中以2x103个细胞/100μL/孔接种在96-孔板上，然后将细胞在37℃和5％CO2的条件下培养过夜。第二天，将参考实施例7中生产的4种人源化hG019-药物偶联物(克隆名称：H01L02-DXd、H02L02-DXd、H02L03-DXd和H04L02-DXd)的每一种或参考实施例B中生产的NOV0712-药物偶联物(NOV0712-DM4)添加到细胞中，以使最终浓度为0.0001(nM)至100(nM)。在培养4天后，通过使用CellTiter-Glo(TM)发光细胞活力测定(Luminescent Cell ViabilityAssay)(Promega Corp.)量化ATP而测量活细胞的数量。图11显示在将各抗体-药物偶联物添加到细胞中时的浓度依赖性细胞生长抑制活性。由这一结果，证明这4种人源化hG019-药物偶联物从比NOV0712-药物偶联物更低的添加浓度开始表现出对肿瘤细胞的生长抑制活性，并且具有高抗肿瘤活性。
[参考实施例9:抗体-药物偶联物的体内抗肿瘤作用]
使用由免疫缺陷小鼠通过接种CDH6阳性人肿瘤细胞系细胞而得到的动物模型评估抗体-药物偶联物的抗肿瘤作用。在用于该实验之前，使4至5周龄的BALB/c裸小鼠(CAnN.Cg-Foxnl[nu]/CrlCrlj[Foxnlnu/Foxnlnu],Charles River Laboratories JapanInc.)和SCID小鼠(CB17/Icr-Prkdc[scid]/CrlCrlj,Charles River Laboratories JapanInc.)在SPF条件下适应3天或更长时间。给小鼠喂食灭菌固体饮食(FR-2，Funabashi FarmsCo.,Ltd)，并给予灭菌自来水(已经通过将5至15ppm次氯酸钠溶液添加到自来水中制备)。使用电子数字卡尺(CD-15CX，Mitutoyo Corp.)每周两次测量接种的肿瘤的长直径和短直径，然后根据以下表达式计算肿瘤的体积。
肿瘤体积(mm3)＝1/2×长直径(mm)×[短直径(mm)]2
各抗体-药物偶联物用ABS缓冲液(10mM乙酸盐缓冲液、5％山梨糖醇，pH 5.5)(Nacalai Tesque,Inc.)稀释，并将稀释液以各参考实施例中所示的剂量静脉施用于各小鼠的尾部。以上述相同方式向对照组(赋形剂组)施用ABS缓冲液。在实验中使用每组六只小鼠。
9)-1抗肿瘤作用-(1)
将CDH6阳性人肾细胞肿瘤细胞系786-O(ATCC)(其CDH6表达已在参考实施例2)-3-1中证实)悬浮在Matrigel(Corning Inc.)中，并将细胞悬液以5×106个细胞的剂量皮下接种至各雄性SCID小鼠的右胁腹区(第0天)。在第18天，将小鼠随机分组。在分组当天，将参考实施例7中生产的4种抗体-药物偶联物(克隆名称：H01L02-DXd、H02L02-DXd、H02L03-DXd和H04L02-DXd)的每一种或参考实施例B中生产的NOV0712-DM4以3mg/kg的剂量静脉施用于各小鼠的尾部。结果显示在图12中。横坐标描绘天数，而纵坐标描绘肿瘤体积。误差范围描绘了SE值。
NOV0712-DM4在这种肿瘤模型中没有表现出显著的抗肿瘤作用。参考实施例7中生产的所有四种抗体-药物偶联物在施用后减小肿瘤体积、实现显著的肿瘤消退，并在施用后维持肿瘤消退作用24天(图12)。
9)-2抗肿瘤作用-(2)
将CDH6阳性人卵巢肿瘤细胞系PA-1(ATCC)(其CDH6表达已在参考实施例2)-3-1中证实)悬浮在Matrigel(Corning Inc.)中，并将细胞悬液以8.5×106个细胞的剂量皮下接种至各雌性裸小鼠的右胁腹区(第0天)。在第11天，将小鼠随机分组。在分组当天，将参考实施例7中生产的抗体-药物偶联物H01L02-DXd或参考实施例B中生产的NOV0712-DM4或NOV0712-DXd以1或3mg/kg的剂量静脉施用于各小鼠的尾部。结果显示在图13中。横坐标描绘天数，而纵坐标描绘肿瘤体积。误差范围描绘了SE值。
NOV0712-DM4在这种肿瘤模型中在1和3mg/kg的任何剂量下都没有表现出抗肿瘤作用。另一方面，H01L02-DXd在以1和3mg/kg的剂量施用后都显著减小肿瘤体积，并发挥肿瘤消退作用(图13)。将本说明书中获得的H01L02抗体和NOV0712抗体与相同药物DXd偶联，并比较所得样品的药效。结果，在1和3mg/kg的剂量下，H01L02-DXd都发挥出比NOV0712-DXd更强的抗肿瘤作用。具体地，证明本发明的H01L02抗体是比NOV0712抗体优异的用于作为抗肿瘤剂的抗体-药物偶联物的抗体(图13)。
9)-3抗肿瘤作用-(3)
将CDH6阳性人卵巢肿瘤细胞系NIH:OVCAR-3(ATCC)(其CDH6表达已在参考实施例2)-3-1中证实)悬浮在Matrigel(Corning Inc.)中，并将细胞悬液以1×107个细胞的剂量皮下接种至各雌性裸小鼠的右胁腹区(第0天)。在第22天，将小鼠随机分组。在分组当天，将参考实施例7中生产的抗体-药物偶联物H01L02-DXd或参考实施例B中生产的NOV0712-DM4以1或3mg/kg的剂量静脉施用于各小鼠的尾部。结果显示在图14中。横坐标描绘天数，而纵坐标描绘肿瘤体积。误差范围描绘了SE值。
NOV0712-DM4在1mg/kg的剂量下没有表现出抗肿瘤作用，在3mg/kg的剂量下表现出抗肿瘤作用，尽管在施用后2周观察到肿瘤再生长。另一方面，H01L02-DXd在以1和3mg/kg的剂量施用后都显著抑制肿瘤体积的增加，并且特别在3mg/kg的剂量下在施用后经过31天的长时间维持肿瘤生长抑制作用(图14)。
以上述相同方式使用PA-1细胞评估参考实施例B中生产的NOV0712-DM4或参考实施例C中生产的H01L02-DM4的肿瘤生长抑制作用。H01L02-DM4比NOV0712-DM4进一步减小肿瘤体积。因此，与NOV0712抗体相比，本发明的H01L02抗体作为用于充当抗肿瘤剂的抗体-药物偶联物的抗体更加优异。
9)-4抗肿瘤作用-(4)
将CDH6阳性人肾细胞肿瘤细胞系786-O(ATCC)(其CDH6表达已在参考实施例2)-3-1中证实)悬浮在Matrigel(Corning Inc.)中，并将细胞悬液以5×106个细胞的剂量皮下接种至各雄性SCID小鼠的右胁腹区(第0天)。在第20天、将小鼠随机分组。在分组当天，将参考实施例7中生产的抗体-药物偶联物H01L02-DXd或参考实施例B中生产的NOV0712-DM4以1或3mg/kg的剂量静脉施用于各小鼠的尾部。结果显示在图15中。横坐标描绘天数，而纵坐标描绘肿瘤体积。误差范围描绘了SE值。
NOV0712-DM4在这种肿瘤模型中在1和3mg/kg的任何剂量下都没有表现出显著的抗肿瘤作用。另一方面，H01L02-DXd在以1和3mg/kg的剂量施用后都减小肿瘤体积，并且特别在3mg/kg的剂量下实现显著的肿瘤消退，并在施用后维持肿瘤消退作用20天(图15)。
9)-5抗肿瘤作用-(5)
将CDH6阴性人卵巢肿瘤细胞系ES-2(ATCC)(已经在参考实施例2)-3-1中证实其不存在CDH6表达)悬浮在生理盐水中，并将细胞悬液以1×106个细胞的剂量皮下接种至各雌性裸小鼠的右胁腹区(第0天)。在第7天，将小鼠随机分组。在分组当天，将参考实施例7中生产的抗体-药物偶联物H01L02-DXd或参考实施例B中生产的NOV0712-DM4以1或3mg/kg的剂量静脉施用于各小鼠的尾部。结果显示在图16中。横坐标描绘天数，而纵坐标描绘肿瘤体积。误差范围描绘了SE值。
在这种没有表达CDH6的肿瘤模型中，H01L02-DXd和NOV0712-DM4在任何剂量下都没有表现出抗肿瘤作用。根据这一结果，参考实施例9)-1、9)-2、9)-3和9)-4中证明的抗体-药物偶联物在CDH6阳性肿瘤模型中的抗肿瘤作用是依赖于肿瘤细胞中的CDH6表达的作用。因此，本发明的抗体-药物偶联物被认为是选择性的和安全的抗肿瘤药物，其对CDH6阳性肿瘤特异性地表现出抗肿瘤作用而没有对CDH6阴性正常组织造成细胞毒性(图16)。
[实施例1:在卡铂和紫杉醇长期治疗后抗体-药物偶联物(1)的体内抗肿瘤作用]
小鼠：对雌性5周龄BALB/c裸小鼠(CHARLES RIVER LABORATORIES JAPAN,Inc.)进行实验。
测量和计算公式：在该研究中，用电子数字卡尺(CD15-CX，Mitutoyo Corp.)每周最多三次测量肿瘤的长轴和短轴，并计算肿瘤体积(mm3)。计算公式如下所示。肿瘤体积(mm3)＝1/2×长轴(mm)×[短轴(mm)]2。
卡铂用生理盐水稀释，并以10mL/kg的流体体积静脉施用于尾静脉。紫杉醇用cremophor和乙醇(1:1)溶解，用生理盐水稀释，然后以10mL/kg的流体体积静脉施用于尾静脉。将抗体-药物偶联物(式4)用ABS缓冲液(10mM乙酸盐缓冲液[pH 5.5]、5％山梨糖醇)稀释，并以10mL/kg的流体体积静脉施用于尾静脉。
将购自ATCC(American Type Culture Collection)的人卵巢癌细胞系NIH:OVCAR-3悬浮在Matrigel基底膜基质(Matrigel,Corning Inc.)中，以1.0×107个细胞皮下移植到雌性裸小鼠的右侧(第0天)，并在移植后22天将小鼠随机分组。在第22天、第66天、第88天、第109天、第128天、第149天、第169天、第192天和第212天，将卡铂以50mg/kg的剂量静脉施用于尾静脉。在第22天、第66天、第88天、第109天、第128天、第149天、第169天、第192天和第212天将紫杉醇以30mg/kg的剂量静脉施用于尾静脉。在第22天将紫杉醇的溶剂静脉施用于尾静脉。设立卡铂和紫杉醇联合给药组，和作为对照组的溶剂给药组。在联合给药组中，选择在第232天肿瘤体积在150mm3至500mm3的范围内的小鼠，并在第232天、第253天和第274天将基本根据参考实施例7的7)-1制备的包含分别由SEQ ID NOS:87和88表示的重链氨基酸序列和轻链氨基酸序列的抗体-药物偶联物(1)(式4)(DAR:7.8)以10mg/kg的剂量静脉施用于尾静脉。为清楚起见，所施用的抗体-药物偶联物(1)中包含的抗体在本发明中称为“H01L02”。
在卡铂和紫杉醇长期治疗后抗体-药物偶联物(1)的肿瘤生长抑制作用的结果显示在图17中。当平均肿瘤体积达到大约250mm3时，向12只荷载NIH:OVCAR-3肿瘤的小鼠重复给药卡铂和紫杉醇。在第一次给药中，所有病例中的肿瘤消退，但是，在所有大多数病例中在6周内再生长。在第9次给药后，将肿瘤体积在150mm3至500mm3的范围内的5只小鼠分组到抗体-药物偶联物(1)治疗。抗体-药物偶联物(1)表现出在施用后的肿瘤体积减小，实现显著的肿瘤消退，并维持肿瘤消退作用。在此，在该图中，横轴代表细胞移植后的天数，纵轴代表肿瘤体积。此外，没有一个给药组表现出任何特别值得注意的发现，如严重的体重减轻。
[实施例2:抗肿瘤研究(1)]
小鼠：对雌性5周龄BALB/c裸小鼠(CHARLES RIVER LABORATORIES JAPAN,Inc.)进行实验。
测量和计算公式：在该研究中，用电子数字卡尺(CD15-CX，Mitutoyo Corp.)每周两次测量肿瘤的长轴和短轴，并计算肿瘤体积(mm3)。计算公式如下所示。肿瘤体积(mm3)＝1/2×长轴(mm)×[短轴(mm)]2。
将购自ATCC的人卵巢癌细胞系NIH:OVCAR-3悬浮在Matrigel(Corning Inc.)中，以1.0×107个细胞皮下移植到雌性裸小鼠的右侧，并在移植后24天将小鼠随机分组(第0天)。在第0天将抗体-药物偶联物(1)(式4)(DAR:7.9)以0.3mg/kg的剂量静脉施用于尾静脉。在第0天将卡铂以50mg/kg的剂量静脉施用于尾静脉。设立各药物的单一给药组、联合给药组和作为对照组的溶剂给药组。
抗体-药物偶联物(1)和卡铂的组合的结果显示在图18中。卡铂的单一给药表现出在第21天47％的肿瘤生长抑制(TGI)。抗体-药物偶联物(1)的单一给药表现出65％的TGI。另一方面，抗体-药物偶联物(1)和卡铂的联合给药表现出比卡铂的单一给药显著更优的肿瘤生长抑制作用(P<0.001)，也表现出比抗体-药物偶联物(1)的单一给药显著更优的肿瘤生长抑制作用(P<0.001)；TGI为93％。此外，单一给药组和联合给药组无一表现出任何特别值得注意的发现，如体重减轻。
[实施例3:抗肿瘤研究(2)]
小鼠：对雌性5周龄BALB/c裸小鼠(CHARLES RIVER LABORATORIES JAPAN,Inc.)进行实验。
测量和计算公式：在该研究中，用电子数字卡尺(CD15-CX，Mitutoyo Corp.)每周两次测量肿瘤的长轴和短轴，并计算肿瘤体积(mm3)。计算公式如下所示。肿瘤体积(mm3)＝1/2×长轴(mm)×[短轴(mm)]2。
将购自ATCC的人卵巢癌细胞系OV-90悬浮在Matrigel(Corning Inc.)中，以2.5×106个细胞皮下移植到雌性裸小鼠的右侧，并在移植后14天将小鼠随机分组(第0天)。在第0天将抗体-药物偶联物(1)(式4)(DAR:7.9)以1mg/kg的剂量静脉施用于尾静脉。在第0天将卡铂以50mg/kg的剂量静脉施用于尾静脉。设立各药物的单一给药组、联合给药组和作为对照组的溶剂给药组。
抗体-药物偶联物(1)和卡铂的组合的结果显示在图19中。卡铂的单一给药表现出在第21天23％的TGI。抗体-药物偶联物(1)的单一给药表现出67％的TGI。另一方面，抗体-药物偶联物(1)和卡铂的联合给药表现出比卡铂的单一给药显著更优的肿瘤生长抑制作用(P<0.001)，也表现出比抗体-药物偶联物(1)的单一给药显著更优的肿瘤生长抑制作用(P<0.001)；TGI为92％。此外，单一给药组和联合给药组无一表现出任何特别值得注意的发现，如体重减轻。
[实施例4:抗肿瘤研究(3)]
小鼠：对雌性5周龄BALB/c裸小鼠(CHARLES RIVER LABORATORIES JAPAN,Inc.)进行实验。
测量和计算公式：在该研究中，用电子数字卡尺(CD15-CX，Mitutoyo Corp.)每周两次测量肿瘤的长轴和短轴，并计算肿瘤体积(mm3)。计算公式如下所示。肿瘤体积(mm3)＝1/2×长轴(mm)×[短轴(mm)]2。
将购自ATCC的人卵巢癌细胞系OV-90悬浮在Matrigel(Corning Inc.)中，以2.5×106个细胞皮下移植到雌性裸小鼠的右侧，并在移植后15天将小鼠随机分组(第0天)。在第0天将抗体-药物偶联物(1)(式4)(DAR:7.8)以10mg/kg的剂量静脉施用于尾静脉。在第0天将卡铂以50mg/kg的剂量静脉施用于尾静脉。在第1天将紫杉醇以20mg/kg的剂量静脉施用于尾静脉。设立抗体-药物偶联物(1)的单一给药组、卡铂和紫杉醇的联合给药组、抗体-药物偶联物(1)、卡铂和紫杉醇的联合给药组和作为对照组的溶剂给药组。
抗体-药物偶联物(1)、卡铂和紫杉醇的组合的结果显示在图20中。卡铂和紫杉醇的联合给药表现出在第15天65％的TGI；抗体-药物偶联物(1)的单一给药表现出在第15天95％的TGI；抗体-药物偶联物(1)、卡铂和紫杉醇的联合给药表现出在第15天97％的TGI。此外，在第19天，抗体-药物偶联物(1)、卡铂和紫杉醇的联合给药表现出比卡铂和紫杉醇的联合给药显著更优的肿瘤生长抑制作用(P<0.001)，并且在第19天也表现出比抗体-药物偶联物(1)的单一给药显著更优的肿瘤生长抑制作用(P<0.001)。此外，单一给药组和联合给药组无一表现出任何特别值得注意的发现，如体重减轻。
[实施例5:抗肿瘤研究(4)]
小鼠：对雌性5周龄BALB/c裸小鼠(CHARLES RIVER LABORATORIES JAPAN,Inc.)进行实验。
测量和计算公式：在该研究中，用电子数字卡尺(CD15-CX，Mitutoyo Corp.)每周最多三次测量肿瘤的长轴和短轴，并计算肿瘤体积(mm3)。计算公式如下所示。肿瘤体积(mm3)＝1/2×长轴(mm)×[短轴(mm)]2。
将购自ATCC的人卵巢癌细胞系OV-90悬浮在Matrigel(Corning Inc.)中，以2.5×106个细胞皮下移植到雌性裸小鼠的右侧，并在移植后17天将小鼠随机分组(第0天)。在第0天将抗体-药物偶联物(1)(式4)(DAR:7.9)以3mg/kg的剂量静脉施用于尾静脉。在第0天、第7天和第14天将吉西他滨以15mg/kg的剂量静脉施用于尾静脉。设立各药物的单一给药组、联合给药组和作为对照组的溶剂给药组。
抗体-药物偶联物(1)和吉西他滨的组合的结果显示在图21中。吉西他滨的单一给药表现出在第21天23％的TGI。抗体-药物偶联物(1)的单一给药表现出79％的TGI。另一方面，抗体-药物偶联物(1)和吉西他滨的联合给药表现出比吉西他滨的单一给药显著更优的肿瘤生长抑制作用(P<0.001)，也表现出比抗体-药物偶联物(1)的单一给药显著更优的肿瘤生长抑制作用(P<0.001)；TGI为95％。此外，单一给药组和联合给药组无一表现出任何特别值得注意的发现，如体重减轻。
工业适用性
本发明提供具有内化活性的抗CDH6抗体和包含该抗体的抗体-药物偶联物。该抗体-药物偶联物可用作癌症的治疗药物等。

Claims (50)

1.用于治疗癌症的治疗方法，所述方法包括向有需要的受试者施用抗体-药物偶联物(ADC)。
2.根据权利要求1的治疗方法，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)具有由下式表示的结构：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子。
3.根据权利要求1或2的治疗方法，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)是抗CDH6抗体-药物偶联物。
4.根据权利要求1至3任一项的治疗方法，其中所述癌症选自肾细胞癌、卵巢癌、间皮瘤、甲状腺癌、子宫癌、胆管癌、胰腺癌、非小细胞肺癌、宫颈癌、脑肿瘤、头颈癌、肉瘤、骨肉瘤、小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。
5.根据权利要求1至3任一项的治疗方法，其中所述癌症选自卵巢癌、非小细胞肺癌、乳腺癌、膀胱癌、子宫内膜癌和去势抵抗性前列腺癌。
6.根据权利要求1至3任一项的治疗方法，其中所述癌症是卵巢癌。
7.根据权利要求6的治疗方法，其中所述卵巢癌选自上皮性卵巢癌、输卵管癌或原发性腹膜癌。
8.根据权利要求6或7的治疗方法，其中所述卵巢癌是转移性的。
9.根据权利要求1至8任一项的治疗方法，其中所述抗体是包含选自以下组合(1)至(4)的任一组合的轻链和重链的抗体，或所述抗体的功能片段：
(1)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，
(2)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，
(3)由SEQ ID NO:65中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:73中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链，和
(4)由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链。
10.根据权利要求1至9任一项的治疗方法，其中所述抗体是包含由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:69中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
11.根据权利要求1至9任一项的治疗方法，其中所述抗体是包含由SEQ ID NO:61中的位置21至233的氨基酸序列组成的轻链和由SEQ ID NO:77中的位置20至471的氨基酸序列组成的重链的抗体，或所述抗体的功能片段。
12.根据权利要求1至11任一项的治疗方法，其中所述重链或所述轻链已经经过选自以下的一种或多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
13.根据权利要求1至11任一项的治疗方法，其中所述重链或所述轻链已经经过选自以下的两种或更多种修饰：N-连接糖基化、O-连接糖基化、N-末端加工、C-末端加工、脱酰胺化、天冬氨酸异构化、甲硫氨酸氧化、向N-末端添加甲硫氨酸残基、脯氨酸残基的酰胺化、N-末端谷氨酰胺或N-末端谷氨酸转化成焦谷氨酸和从羧基末端删除一个或两个氨基酸。
14.根据权利要求1至13任一项的治疗方法，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在1至10的范围内。
15.根据权利要求1至14任一项的治疗方法，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在2至8的范围内。
16.根据权利要求1至14任一项的治疗方法，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在5至8的范围内。
17.根据权利要求1至14任一项的治疗方法，其中每抗体偶联的所选药物-连接子结构的单元的平均数在7至8的范围内。
18.根据权利要求1至17任一项的治疗方法，其中所述癌症包含一种或多种表达CDH6的肿瘤。
19.根据权利要求1至18任一项的治疗方法，其中所述受试者具有用包含铂类药物的化疗方案治疗的历史。
20.根据权利要求1至18任一项的治疗方法，其中所述受试者具有用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗的历史。
21.根据权利要求1至20任一项的治疗方法，其中所述受试者先前已经用包含铂类药物的化疗方案治疗。
22.根据权利要求1至20任一项的治疗方法，其中所述受试者先前已经用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗。
23.根据权利要求1至22任一项的治疗方法，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)与一种或多种化疗药物同时或在不同时间组合施用。
24.根据权利要求23的治疗方法，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)在所述一种或多种化疗药物之后施用。
25.根据权利要求23的治疗方法，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)和所述一种或多种化疗药物分开作为活性成分包含在不同制剂中并同时或在不同时间施用。
26.根据权利要求23的治疗方法，其中所述抗体-药物偶联物(ADC)和所述一种或多种化疗药物一起作为活性成分包含在同一制剂中并同时施用。
27.根据权利要求23至26任一项的治疗方法，其中所述一种或多种化疗药物是抗代谢物、铂类药物、紫杉烷、或铂类药物和紫杉烷。
28.根据权利要求1至27任一项的治疗方法，其中所述受试者已经在用包含铂类药物的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)、部分缓解(PR)或疾病稳定(SD)。
29.根据权利要求1至27任一项的治疗方法，其中所述受试者已经在用包含铂类药物的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)或部分缓解(PR)。
30.根据权利要求1至27任一项的治疗方法，其中所述受试者已经在用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)、部分缓解(PR)或疾病稳定(SD)。
31.根据权利要求1至27任一项的治疗方法，其中所述受试者已经在用包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗时表现出完全缓解(CR)或部分缓解(PR)。
32.根据权利要求1至31任一项的治疗方法，其中所述受试者具有对铂类化疗耐药的癌症。
33.根据权利要求1至32任一项的治疗方法，其中所述受试者具有对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案耐药的癌症。
34.根据权利要求1至33任一项的治疗方法，其中所述受试者在施用所述ADC之前表现出癌症复发。
35.根据权利要求34的治疗方法，其中所述癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的不到大约六个月或大约六个月内发生。
36.根据权利要求34的治疗方法，其中所述癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的不到大约六个月或大约六个月内发生。
37.根据权利要求34的治疗方法，其中所述癌症复发在包含铂类药物的化疗方案完成的大约六个月或之后发生。
38.根据权利要求34的治疗方法，其中所述癌症复发在包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案完成的大约六个月或之后发生。
39.根据权利要求1至38任一项的治疗方法，其中向受试者施用所述ADC与第二药物。
40.根据权利要求39的治疗方法，其中所述ADC在第二药物之前施用。
41.根据权利要求39的治疗方法，其中所述ADC在第二药物之后施用。
42.根据权利要求39的治疗方法，其中所述ADC与第二药物同时施用。
43.用于治疗癌症的治疗方法，所述方法包括向具有对铂类化疗耐药的卵巢癌和/或在施用所述药物组合物之前表现出卵巢癌复发的受试者施用药物组合物，其中所述药物组合物包含具有由下式表示的结构的抗体-药物偶联物(ADC)：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO:87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列。
44.用于治疗癌症的治疗方法，所述方法包括向具有卵巢癌并且先前已经用包含铂类药物、紫杉烷或铂类药物和紫杉烷的化疗方案治疗的受试者施用药物组合物，其中所述药物组合物包含具有由下式表示的结构的抗体-药物偶联物(ADC)：
[式4]
其中AB代表所述抗体或所述抗体的功能片段，n代表每抗体的与所述抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数，并且所述抗体经由衍生自所述抗体的巯基连接至连接子；并且其中所述ADC是其盐或所述ADC的水合物或所述盐的水合物，其中每抗体偶联的药物-连接子结构的单元的平均数为7至8，其中所述抗体包含：SEQ ID NO:87所示的重链氨基酸序列或由SEQ ID NO:87所示的氨基酸序列通过从其羧基末端删除一个或两个氨基酸而衍生的氨基酸序列；和SEQ ID NO:88所示的轻链氨基酸序列。
45.根据权利要求1至44任一项的治疗方法，所述方法包括使用来源于试验受试者的生物样品以检测所述生物样品中存在或不存在CDH6和向检测到CDH6的试验受试者施用药物组合物。
46.根据权利要求1至45任一项的治疗方法，其中所述癌症已对包含铂类药物的化疗方案获得耐药性。
47.根据权利要求1至45任一项的治疗方法，其中所述癌症已对包含铂类药物和紫杉烷的化疗方案获得耐药性。
48.根据权利要求1至47任一项的治疗方法，其中所述抗代谢物是吉西他滨。
49.根据权利要求1至47任一项的治疗方法，其中所述铂类药物是卡铂。
50.根据权利要求1至47任一项的治疗方法，其中所述铂类药物是卡铂并且所述紫杉烷是紫杉醇。
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