CN111793697B - 与苏姜猪生产性状相关的snp标记及其制备方法和应用 - Google Patents

Abstract

本发明公开了与苏姜猪生产性状相关的SNP标记，该所述SNP标记的位点选自如下位点的至少一种：(1)猪参考基因组11.1版本4号染色体第75690495位碱基（rs334240640）由C到T的位点突变；(2)猪参考基因组11.1版本4号染色体第75691055位碱基（rs326013678）由A到G的位点突变；(3)猪参考基因组11.1版本4号染色体第75693827位碱基（rs328675134）由A到G的位点突变，上述三个位点完全连锁。关联分析确定3个分子标记与苏姜猪生产性状呈显著相关，可以用于苏姜猪分子标记辅助选择育种中。

Description

与苏姜猪生产性状相关的SNP标记及其制备方法和应用

技术领域

本发明属于猪标记辅助选择(MAS)技术及遗传育种领域，涉及到3种可用于苏姜猪生产性状标记辅助选择的分子标记的制备与应用。

背景技术

随着生活水平的不断提高，人们对猪肉的需求正从数量向品质转变。中国地方猪具有产仔数高、肉质优良、耐粗饲和环境适应性强的特点，但瘦肉率低、生长速度慢、饲料转化率低。为满足人们日益增长的对优质猪肉的需求，国内掀起了利用西方猪和中国地方猪杂交培育新品种的热潮。苏姜猪的育种始于1996年，以姜曲海猪、枫泾猪为基础母本，杜洛克猪为父本，通过继代选育而成。2011年6月农业部广东种猪性能测定中心测定结果显示，苏姜猪肉质指标达到了优质猪肉的要求。2013年8月通过国家畜禽遗传资源委员会畜禽新品种审定，获得新品种证书((农01)新品种证字第22号)。

分子标记辅助选择(marker-assisted selection,MAS)是利用现代分子生物技术对性状的特定主效基因或数量性状基因座位进行基因分型，选留有利基因型个体。该方法适合遗传力低、表型值难以测定或测定费用高的性状，可以大大缩短世代间隔，提高选择强度，进而提高猪育种选择效率和准确性。开发与苏姜猪生产性状相关的分子标记应用于优质苏姜猪的选育，对满足人们对优质猪肉的需求，加快我国优质种猪的培育具有重要的促进作用。

多形性腺瘤基因1(PLAG1)是研究者在研究人类涎腺多形性腺瘤时首次通过定位克隆发现的。近几年研究发现PLAG1与牛的体型、胴体性状、出生体重及其他生长性状相关；在猪的生产性状的GWAS研究中，PLAG1也是候选基因之一。此外，PLAG1是IGF2的正调控因子，而IGF2在动物生长发育过程中具有重要作用。因此，PLAG1是一个影响猪生产性状的重要候选基因，其核苷酸序列中可能存在影响猪重要经济性状的有效分子标记。

发明内容

发明目的：本发明的目的在于开发可应用于苏姜猪生产性状辅助选育的分子标记，加速生产性状遗传改良进程。首先从影响猪生产性状的重要候选基因PLAG1中鉴定出潜在的可影响苏姜猪生产性状的遗传变异位点，然后建立相应遗传变异位点的简便的分子标记检测方法，并对分子标记的应用效果在苏姜猪群中进行了验证，结果表明所开发的分子标记可应用于苏姜猪体重、体长、体高、胸围、胸宽、臀宽与最后一根肋骨处活体背膘厚中至少一种性状的分子标记辅助选育。

本发明的目的可以通过以下技术方案实现：

一种与苏姜猪生产性状相关的SNP标记，所示SNP标记位于猪4号染色体上的PLAG1基因的核苷酸序列上，所示SNP标记的位点选自如下位点的至少一种：

(1)猪参考基因组11.1版本序列4号染色体序列第75690495位碱基(rs334240640)由C到T的位点突变，对应于SEQ ID NO:2所示序列中的第91为碱基处，同时对应于SEQ IDNO:1的第44504位碱基；

(2)猪参考基因组11.1版本4号染色体第75691055位碱基(rs326013678)由A到G的位点突变，对应于SEQ ID NO:2所示序列中的第651为碱基处，对应于SEQ ID NO:1所示序列中45064位碱基处；

(3)猪参考基因组11.1版本4号染色体第75693827位碱基(rs328675134)由A到G的位点突变，对应于SEQ ID NO:3所示序列中的第336位碱基处，同时对应于SEQ ID NO:1所示序列中47836位碱基。

其中，SEQ ID NO:1是基因全长序列加上600bp 5'侧翼序列和3'侧翼序列；SEQ IDNO:2(1091bp)是引物PLAG1-exon5.2F与PLAG1-exon5.2R扩增出的序列；SEQ ID NO:3(987bp)是引物PLAG1-exon6F与PLAG1-exon6R扩增出的序列，且上述三个位点完全连锁，即检测1个突变，另外2个突变的情况可以推导出来，且任何1个突变对生产性状的影响都一致，即rs334240640为C时rs326013678必为A且rs328675134必为A。图4为本发明三个位点的LD模式图分析图，其中，3个SNP处于完全连锁状态(r²＝1)。

其中，所述苏姜猪生产性状包括体重、体长、体高、胸围、胸宽、臀宽与最后一根肋骨处活体背膘厚性状中的至少一种。

本发明进一步提出了用于检测上述的SNP标记的引物对，包括(1)～(2)中的至少一种：

(1)检测猪参考基因组11.1版本4号染色体第75690495位碱基(rs334240640)C>T突变和第75691055位碱基(rs326013678)A>G突变的正、反向扩增测序引物的DNA序列如下所示：

正向引物(PLAG1-exon5.2F)：GTCTCCGTGCCCATCAAA

反向引物(PLAG1-exon5.2R)：AAGGTCAAAAGGTAGAGCCAT；

(2)检测猪参考基因组11.1版本4号染色体第75693827位碱基(rs328675134)A>G突变的正、反向扩增测序引物的DNA序列如下所示：

正向引物(PLAG1-exon6F)：GTGGAAGCCCTACTTTATTTTG

反向引物(PLAG1-exon6R)：CACATAGCGTGGAGGAAACC。

本发明还提出了一种与苏姜猪生产性状相关的SNP标记的制备方法，包括(Ⅰ)～(Ⅱ)中的至少一种：

(Ⅰ)采用引物PLAG1-exon5.2F与PLAG1-exon5.2R PCR扩增包含猪参考基因组11.1版本4号染色体第75690495位碱基(rs334240640)C>T突变和第75691055位碱基(rs326013678)A>G突变的基因片段，然后采用测序技术进行基因分型；

(Ⅱ)采用引物PLAG1-exon6F与PLAG1-exon6R PCR扩增包含猪参考基因组11.1版本4号染色体第75693827位碱基(rs328675134)A/G突变的基因片段，然后采用测序技术进行基因分型。

本发明进一步提出了上述的SNP标记、引物对及制备方法在苏姜猪生产性状辅助选育中的应用，所述的苏姜猪生产性状为体重、体长、体高、胸围、胸宽、臀宽与最后一根肋骨处活体背膘厚中的至少一种性状。

具体地，本发明提供了一种苏姜猪遗传改良的方法，通过继代选育猪参考基因组11.1版本4号染色体第75690495位碱基(rs334240640)位点的CC型和CT型个体，淘汰该位点的TT型个体；和/或继代选育猪参考基因组11.1版本4号染色体第75691055位碱基(rs326013678)位点的AA型和AG型的个体，淘汰该位点GG型的个体；和/或继代选育猪参考基因组11.1版本4号染色体第75693827位碱基(rs328675134)位点的AA型和AG型的个体，淘汰该位点GG型的个体。

有益效果：本发明从猪PLAG1基因鉴定出了3个有效的分子标记位点，其中第1个分子标记位于猪参考基因组11.1版本4号染色体第75690495位碱基(rs334240640)C/T突变位点上，第2个分子标记位于猪参考基因组11.1版本4号染色体第75691055位碱基(rs326013678)A/G突变位点上，第3个分子标记位于猪参考基因组11.1版本4号染色体第75693827位碱基(rs328675134)A/G突变位点上，针对上述3个SNP建立了2种方便可靠的多态性检测方法。通过将上述3个SNP位点与苏姜猪生产性状进行关联分析，发现其基因型对苏姜猪的体重、体长、体高、胸围、胸宽、臀宽与最后一根肋骨处活体背膘厚有显著影响(P<0.05)，使得上述3个SNP可以用于苏姜猪生产性状的标记辅助选择育种中。

附图说明

图1为本发明中LAG1-exon5.2F与PLAG1-exon5.2R引物扩增含猪参考基因组11.1版本4号染色体第75690495位碱基(rs334240640)C/T突变位点的基因片段测序结果图，其中：箭头所指处为处于猪参考基因组11.1版本4号染色体第75690495位碱基(rs334240640)C/T突变位点，自上至下分别为CC、TT和CT基因型的测序结果；

图2为本发明中LAG1-exon5.2F与PLAG1-exon5.2R引物扩增含猪参考基因组11.1版本4号染色体第75691055位碱基(rs326013678)A/G突变位点的基因片段测序结果图，其中：箭头所指处为处于猪参考基因组11.1版本4号染色体第75691055位碱基(rs326013678)A/G突变位点，自上至下分别为AA、GG和AG基因型的测序结果；

图3为本发明中PLAG1-exon6F与PLAG1-exon6R引物扩增含猪参考基因组11.1版本4号染色体第75693827位碱基(rs328675134)A/G突变位点的基因片段测序结果图，其中：箭头所指处为处于猪参考基因组11.1版本4号染色体第75693827位碱基(rs328675134)A/G突变位点，自上至下分别为AA、GG和AG基因型的测序结果；

图4位本发明三个位点的LD模式图分析图，其中，3个SNP处于完全连锁状态(r²＝1)。

具体实施方式

下面结合具体实施例对本发明名做进一步详细说明。给出了详细的实施方式和具体的操作过程，实施例将有助于理解本发明，但是本发明的保护范围不限于下述的实施例。

1、苏姜猪PLAG1基因遗传变异位点鉴定

(1)参考序列下载与引物设计

从Ensembl^ASIA数据库中下载猪参考基因组11.1版本PLAG1基因(ENSSSCG00000006247)序列SEQ ID NO:1(http://asia.ensembl.org/index.html)，包含外显子、内含子，以及600bp 5'侧翼序列和3'侧翼序列，针对外显子利用Primer 5.0设计PCR引物(如表1)。

表1 外显子PCR引物

(2)PCR扩增

随机挑选100个苏姜猪的DNA样本，均匀稀释为50ng/μL，每个样本取10μL，均匀混合，构建苏姜猪DNA混池。以混池DNA为模板进行PCR扩增。

反应体系：反应体系为25μL，包括2×Taq PCR Mastermix(天根)12.5μL，正向引物(F)1μL，反向引物(R)1μL，模板DNA 1.5μL，超纯水9μL。

反应程序：95℃变性5min；95℃30s，退火温度(表1)30s，72℃延伸(表1)，35个循环；72℃延伸10min；4℃保存。

(3)PCR产物测序

PCR产物送生工生物工程(上海)股份有限公司进行双向测序。对测序峰图进行分析发现如图1中的TC双峰、图2中的AG双峰和图3中的AG双峰，鉴定到了苏姜猪PLAG1基因的3个SNP位点，分别位于猪参考基因组11.1版本4号染色体第75690495位碱基(rs334240640)、第75691055位碱基(rs326013678)和第75693827位碱基(rs328675134)。

2、苏姜猪PLAG1基因3个SNP的基因型频率和等位基因频率分析

我们对鉴定到的3个SNP位点在苏姜猪群体中进行了基因分型，表2为3个SNP位点在苏姜猪群体中的基因型频率和等位基因频率分析结果。猪参考基因组11.1版本4号染色体第75690495位碱基(rs334240640)C/T突变位点在苏姜猪群体中成功分型了365个个体，结果表明CC基因型为148头，TT基因型为51头，TC基因型为166头。猪参考基因组11.1版本4号染色体第75691055位碱基(rs326013678)A/G突变位点在苏姜猪群体中成功分型了365个个体，结果表明AA基因型为148头，GG基因型为51头，AG基因型为166头。猪参考基因组11.1版本4号染色体第75693827位碱基(rs328675134)A/G突变位点在苏姜猪群体中成功分型了365个个体，结果表明AA基因型为148头，GG基因型为51头，AG基因型为166头。以上结果表明该3个SNP变异位点在苏姜猪群体中存在明显的多态性，具有分子标记开放的潜在价值。同时，我们对三个SNP位点的LD block图进行分析，如图4所示，3个SNP处于完全连锁状态(r²＝1)。

表2 苏姜猪PLAG1基因3个SNP的基因型频率和等位基因频率

3、苏姜猪PLAG1基因3个SNP位点多态性与生产性状的关联分析

我们在苏姜猪群体中对鉴定到的PLAG1基因3个SNP位点与苏姜猪生产性状进行了关联分析，用于关联分析的生产性状包括体重、体长、体高、胸围、胸宽、臀宽与最后一根肋骨处活体背膘厚。申请人利用SPSS 19.0软件中的单因素方差分析(One-Way ANOVA)统计群体中不同基因型与苏姜猪生产性状的关联性，结果用平均值±标准差表示；利用邓肯氏法(Duncan’s)进行差异显著性分析，以P<0.05为差异显著性判断标准。

从表3可以看出基因型为CC的苏姜猪个体在体重、体长、体高、胸宽和臀宽上显著大于基因型为CT和TT的个体(P<0.05)；基因型为CT的苏姜猪个体在体重、体长、体高上显著大于基因型为TT的个体(P<0.05)；基因型为CC和CT的苏姜猪个体在胸围上显著大于基因型为TT的个体(P<0.05)；基因型为CC和CT的苏姜猪个体在最后一根肋骨处活体背膘厚上显著小于基因型为TT的个体(P<0.05)。说明了此SNP比较显著影响苏姜猪的生产性状，可以通过对苏姜猪的该SNP位点进行辅助选择，从而加快该群体的生产性状的遗传进展。在育种工作中，应当选择苏姜猪PLAG1基因为CC、CT基因型的个体。

表3 rs334240640与苏姜猪生产性状的关联分析

注：表中在同一行中标有a、b、c为差异显著性水平P<0.05。

从表4可以看出基因型为AA的苏姜猪个体在体重、体长、体高、胸宽和臀宽上显著大于基因型为AG和GG的个体(P<0.05)；基因型为AG的苏姜猪个体在体重、体长、体高上显著大于基因型为GG的个体(P<0.05)；基因型为AA和AG的苏姜猪个体在胸围上显著大于基因型为GG的个体(P<0.05)；基因型为AA和AG的苏姜猪个体在最后一根肋骨处活体背膘厚上显著小于基因型为GG的个体(P<0.05)。说明了此SNP比较显著影响苏姜猪的生产性状，可以通过对苏姜猪的该SNP位点进行辅助选择，从而加快该群体的生产性状的遗传进展。在育种工作中，应当选择苏姜猪PLAG1基因为AA、AG基因型的个体。

表4 rs326013678与苏姜猪生产性状的关联分析

注：表中在同一行中标有a、b、c为差异显著性水平P<0.05。

从表5可以看出基因型为AA的苏姜猪个体在体重、体长、体高、胸宽和臀宽上显著大于基因型为AG和GG的个体(P<0.05)；基因型为AG的苏姜猪个体在体重、体长、体高上显著大于基因型为GG的个体(P<0.05)；基因型为AA和AG的苏姜猪个体在胸围上显著大于基因型为GG的个体(P<0.05)；基因型为AA和AG的苏姜猪个体在最后一根肋骨处活体背膘厚上显著小于基因型为GG的个体(P<0.05)。说明了此SNP比较显著影响苏姜猪的生产性状，可以通过对苏姜猪的该SNP位点进行辅助选择，从而加快该群体的生产性状的遗传进展。在育种工作中，应当选择苏姜猪PLAG1基因为AA、AG基因型的个体。

表5 rs328675134与苏姜猪生产性状的关联分析

注：表中在同一行中标有a、b、c为差异显著性水平P<0.05。

本发明检测方法简单、成本低，检测结果直接、可靠，适用于对苏姜猪PLAG1基因的大规模的筛查和诊断。

本发明提供了一种与苏姜猪生产形状相关的SNP标记以及该SNP标记用于苏姜猪生产性状辅助选育的思路及方法，具体实现该技术方案的方法和途径很多，以上所述仅是本发明的优选实施方式，应当指出，对于本技术领域的普通技术人员来说，在不脱离本发明原理的前提下，还可以做出若干改进和润饰，这些改进和润饰也应视为本发明的保护范围。本实施例中未明确的各组成部分均可用现有技术加以实现。

序列表

<110> 江苏农牧科技职业技术学院

<120> 与苏姜猪生产性状相关的SNP标记及其制备方法和应用

<160> 7

<170> SIPOSequenceListing 1.0

<210> 1

<211> 48974

<212> DNA

<213> 猪(Sus scrofa)

<400> 1

ttcgagcccc gcggcggccc aggaaagccc ctctcttccc gcagccgccg cggagggaag 60

ggcgggggac cactcacctc gcgctcgcgc ggaggcttcg ccagcgccca ggccgtctcc 120

agctccaaac acgtcaatgg ctcacgcagc cggaccttaa gtagcgcgca tcccaacatg 180

ctgcccccgc tccccggcgg cggcccgccc aatcggtgcg cgccgccgcc tgactgacag 240

ccgagcgggg tcctgagagg cgggggcggg cgggtctcgc cccgcccccg gccggcggga 300

ggagggccga ggcgggagga gtgggcgggg cggcgcgcgc ggccccgccc ccgcccccgc 360

cccgcagctc ccccctcgcc gctgtccgcc ccttagcgct ttggattgac gggcggcgcg 420

gcggaccaat cgctaggccg gatcccggcg gcgagggcgc ccagtggccg gccccagggc 480

ggagcgcgcc cgggggacgg gcacagcggc gggcgggggc agggggcggg ccggcgggag 540

gcgggggcgg tggccgaaca ggccggggga ggcggcggtg ggcgcgacgt cggcggcggc 600

ggcggcagcg gcggcggcgg cggcggcggc agctgcaagt tgggctgcag gggcagcgca 660

tacactacaa tggctgctgg aaagaggcgt aaggaaacaa tttccaggcc cgccgcgtcc 720

agcccgaaat atgagaaaaa aattattaga aattccgcgg gcggtgtaaa ggcggcggac 780

gggccggagg gaggatgtta aagccccgcg gtgagttctc ccggggtccg gggcggcgga 840

gaggcgttta gcgggagaaa tatcagggtt atttaaatta tgggactagc cgagggggca 900

gaggagcagc ggcggcggca ggaggaggaa aagtttgtgc tactctcagc ccctgctcag 960

gaccccagag agaaaaataa taataaaaaa taaaataaaa tcattcagcg ggggtgcgag 1020

gactcccgaa gtcgcttctg acagggcagg gggcgatgcg gctggagacc cgaaggtgag 1080

gtcggtggga aaaaaaaaaa accctttatt cagggtctgg aaagtttgaa aagttttcct 1140

cctcctcctc ctcctcctct ctggtgctgt gaatattgtg acagcggcag cggcagcagc 1200

gagagcggaa gacattagag acccgaaaaa taagggaaaa attaatataa attcagtttt 1260

gagagtaaac tctccgcatt ttccaccaaa acatcccggg ggaaggtcgc ttcccaaagg 1320

gcctggcgga aacccgcagt cggcaatatt tggggggcac tttgagtgac ttgggggaac 1380

tttgcccctt tttcaaaaga ggttttttct ttgggggaga aatgaatttg tttttgccct 1440

ttcctcaggt gggcgagtcg gggtcggggt gcggggtctg cggggaggtg tgagcccggg 1500

atgtgtggct gcgggggggg agggggtgct aaatgaaagc aggagatctg cacagagctg 1560

ggacagcttg ttgtcagtat cataaacaac caaaatggag ggagaactca ggcatataac 1620

caaataaaaa ttttttaaaa atcgcaaaaa aatcccaaaa aatccgggat gctccccctt 1680

ttctcgctca aggtaaaagt atgaaccgcc tttcccctga agtccatttt gactttgcag 1740

ggaccaagga gttaatattt atttattttt taaaactttc gaagggcaaa agccttttat 1800

aactcaaccg acaatgagaa aacgtgaaaa tccgatgctc gagaaggagg gggagggagg 1860

gggggagatg gtagtgcaga aactgctaaa cttattggta atgtggactg atctgagata 1920

agataaacac tatatttgct attttataac tcttttaatg atcgttgcgg gttttttttt 1980

ttttttcccc tggtggaaaa aaaaaagtga tgccattttc ttaatagagt taatatgtgt 2040

gattggaaga ataaaccttt ccggctctag attgcatttt cgtcgcattt ctgcttcagg 2100

ttttgttagt ggctccctcc tttctttaaa ctgggctcta cagaggaggg gtagagaggt 2160

gatgttgctc agagaggctg gtgtgcaaga ctggagcacc ttttggggtg gggtggggag 2220

ttgctgggtt tctcccttcc tgacacgttt gcttcacctg ttcatcctca ggaaagaatg 2280

ttaagctgag gttttctggt tttatgtatg gaaaaggatg gtgcctcttg catcacattg 2340

aagttagtgg gaaagtgctg ctgatgttgg ttccacgtgg gatgtgggac agagcagggc 2400

attttaaagg gacagcttct cttttcttag gattttcatc acctacacag aatccctgcg 2460

tgaggaccaa aagcagaggt gctgggaggg tgtggtgatg gaagagcctc ttctttccat 2520

gactcaagtg cacccacctt tagcagtgat ggagggaagg ggagggataa gtcagctccg 2580

cagaagatgg atattgtgta gatcagtttg tatccaagct gttcttttgt gtaacaagcc 2640

ctcccaggaa cttttcatgt tacattgctg tgctttggaa gctgattttg gaaggaattg 2700

tggaaaaatg gaaatagttt aaggtgtgtg gtgtaatggt atagcattat tgaacagtta 2760

tgaattctgt gcagtgagat caaagagctg tgtatgccca taatgtgatt ttacagccat 2820

tttgtaaaag ctgtaaaata cctaatattc aatttggctt aaggtacatt gaggacttct 2880

gcttgaaaac tgcaggcaga gtggtggaga ttcttttaca ctgcaagcag taggcatttc 2940

tttaagggga aaaaagcaca tgcaccagcc ccatggaaaa gtttacgtat acccatttta 3000

tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt tttttttttt ttgtcttttt 3060

gctatttctt gggccgctcc tgcggcatat ggaggttccc aggctagggg tcgaatcgga 3120

gccgtggcca ccggcctaca ccagagccac agcaacgcag gatccgagcc gcgtctgcaa 3180

cctacaccac agctcacggc aacgccggat cgttaaccca ctgagcaagg gcagggaccg 3240

aacccgcaac ctcatggttc ctagtcggat tcgttaacca ctgcgccacg acgggaactc 3300

ccgtataccc attttaaaat cccatcctat acatgtgctg taactctgca cttttgaaat 3360

tagaagattt tacaatcctg taacctgttg gtttgcatct tttaagctga atttatttgt 3420

gttatttaac aggaaatgtt tactgatcat aaactaccac taactctcat ggcttagatt 3480

gtcacaatat tttcaaaatt taaaatgtgt aaattgtttg ctatactctt ttgagattaa 3540

ggttaatctt gaatggaatt gacttgtgtt ccattttcca caggtatatg aagtttctgg 3600

aataaatgcc tattttcctt tgtttttatg gtgtatagaa atggattcaa attagggctg 3660

gatttttaga cttctcatat agaaggtttt tttttttcct tgccttgctg tacaaacaga 3720

ttattatttt gaagtgtagt gtgtgttaac ctgtgctcac atctgagctc ttatctgcac 3780

ctttctctca atacctccat aacagcatta cctcagtgta atgtttgagt aggtcacctt 3840

gtggtttctg attttggaag caattgcaac tttctaagaa ctcattaaaa aattaatccc 3900

atgaaccact gttaaatcag aactgattgg aaagtgattg aactgtcaat ggagaagaga 3960

aacttccttc cctccccaaa ataaccttcc cagaggtttc agaatgccat gaagacgtat 4020

aaaacctttg aaatgtatct gacatttcca tggtactttg gctcagcaca gtggcactga 4080

ctgtcagtag tcagaattag gctatgtgtt tgaaataagt gaaacttttc aatcgtgact 4140

cgttgccact tagacaaacc agttactgat attaatacat tcagtttctg tcaaagtaaa 4200

ggaagagtct tagatcattg agttattcag gttgtttgga cacttcaagt tatgattagt 4260

ttattgttcc tctaaataaa agtgctggta ctgtgatttt ttttccccca tctcacaaag 4320

gtagtataaa actttcttca tgtttgggtt ttacacagcc agctgcttgt gtgaatcaga 4380

agatgccctc agagtacaca agtgtaaaat ctgtaattct ttagtcttgt tcagatagga 4440

catgcataat tactaatgtg aattgattgt tttgagcttt tttaatgcct tagaaatact 4500

acctattgta acatcctttt tctgaggcta ctattaaatt ataccagttt acataaacaa 4560

gctaatgtta ttatatactc aagatcttta tttcagttaa aagtagagaa acctcataga 4620

ttgagattct tacttgaaat gtatatgcct cattttgctc tttgaaactc tataaggagt 4680

ttagctgctg tggaagatga gatataaatg tgggctaatt ctgataaaat tcagtatctg 4740

tgtatttatt ataatgtaaa tattttaata aacagacatc ttacagctca ataaattagc 4800

aaatatgttt ttattaatat agtttcaaaa ttttaaggat actctttgtg ttttaatatc 4860

atacaaaggt gttcgttttt tcctttgttt ttaacataat cctagttgtc actgtataca 4920

ttttggtttg gtattctgga aattttcctt tctaaggatt aaattgtttt ttgctgaatg 4980

aaatggaaag ctcctgtctc tgagatttga aaaacctgaa gactggaact gtatctatag 5040

ctatctttga agttttgttt tgataatcat ttgccttttg agctgtgtaa tccaaatatt 5100

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tgtatatgaa gaattacctg tctctctctc tctctctctc tctctctctc tctctctctc 5220

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tgatgtgttt gcaaatgtat agaaaataaa tataaatttt cctctttata ttgataacat 5400

cttaggttca ttagttaagt tatttgagta agggaagaat ttcagaagaa ggaaagaaca 5460

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ttgtcccttg agccattttt taaatgtttt aagaacctga taaacacctt atctgaaata 5580

tcaaatactt tgaaaacata tgagacactg caaaataaca aaaatagacc tttaatttct 5640

ttaattttaa caggaattaa tgtaggcagc atatttaacc aattagcaag tgtttaggta 5700

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caattttttt tgggggggag gggggaagcc tgaacttgac atctgctgtg ttactacttt 5940

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tatttaaaat gtgtacctaa atgaagtctt ctgaaaaatc tttgaaattg ttgaaaatta 7200

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ctttggctaa taggaaaaaa attagaaaaa tgttttaatc aattttgttc acttgaaaat 7980

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tgaatttgtt ctaaatttgc agttcacagg agagttgtca ctttgcatat ttggattaga 8400

tctattctaa ccttaaaaat aaatattaat atggtcatca tctgattata agtcacatct 8460

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taattttcct atgtttttct aatttgttat tgtctggagt aatttaattg ggtaaagttt 8580

cattttcaat tatgtttctc ttctaatatt aatagaattt tacttgaaaa ttactattca 8640

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cataaaattt gaacatcctc acagcttctg ttatgcaaac atataactaa tttaactgtg 8880

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ggtaaaatat gttaccataa ttatttaccc aaatcaaaat gaaaataaac tgtcaagtaa 9060

tcgttttact tagacataga atgaaggttt taaggattta actagataac ttgatgtaat 9120

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ctgtgttgca ttttggtaat tctcataata tttcaaactt ttttgttatt attatatttg 11040

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caaaggctca ggtgatgatt agcattgttt agcaataaag tatttttaat tacattgctt 11160

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tatacactgg gaaaacaaaa aaaaaaaact catgtgactt gctttttgca atatctgcta 11280

tattacagtg gtctggaacc tatcccacag tatctccaag gtatgcctgc aattccagtc 11340

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gccaacatta acctgatatc aaaaccagac aaggatgcta caagtaaaga aaattataag 11460

ccaatatttt tgatgaacgt agatgtcaaa atcctcaaca aaaatattag caaaccaaat 11520

tcagtaatac tttaaaagga ccatacacca tgatcaagtg ggatttattc cagggatgca 11580

aggatggttc aacattggca aatcagtcag catgatacat tatgttaaca aaatgaagga 11640

taaaaattct atcatcctct caatagatgc agaaaaggca tttaacaaaa tgcagtatcc 11700

atttataatt taaaaaactt tcaacagatt gcataaagag aaagtgtacc tgaacctagt 11760

gaaggccata tatgacaagc tcagagctaa catcacactc agtggtaaaa agcttttcct 11820

ctgagatagg gaaaaaacaa ggatgcccac tctcaccatt ttttatttaa catagtgttg 11880

gaagtcctgg ctgggccagt taggcaataa aaagaaataa aaggcatcta aattggaaag 11940

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gactcccctg ataaacctat taaaaataac aaatgaactc agtaaagttg cacaatgcaa 12060

aatcagtata caaaaagcta ttgcagttct atacactaat aatgaactat tagaaagtga 12120

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taaggaggtg aaagacctgt atgctgaaaa tgataagaca tttatgaaag aaattgaaga 12240

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aacagaatta agagacaacc tactgaatgg gagaaaatat tttcatacca tatatctgat 12960

aaggggctaa tattcaaaat atataaagaa gtcctacaac ttagtaccaa aaaaaaaaaa 13020

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tttcatgaaa attgtatata tacagtttta tcattaatct atatcattaa tcgtcaggga 13140

aatgcagatc aaaaccacga tgaggtatta ccttgtagct gctagaatgg ctattatcaa 13200

aaagactaga aataacaagt gttggtgagg atgtggagaa aagggaaccc ttatacacta 13260

ttggtgttaa ctggtgcagc tgctgcagaa aaccatatgg agggtcctca aaaaatgaaa 13320

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aacactacct tgaaaagata tatgcacccg tgttcattgc agtgttgttt acagtaggca 13440

aagtatggaa acaaactaag tgtccatcag tggatgagtg gataaggatg tggtgtgtgt 13500

gtgtgaatat tgtttcaacc ataaaagaga gtgaaatctc accatttgcg acaagatgag 13560

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tctcttatat gtggaatcta attaattaac taggttaatt ttttttaaaa cccaagctta 13680

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aggcaacagg aggggaagaa caggccaaag gggccgttct cggctccagt gcatccggat 16500

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acgttcacgt ccaagccatt ctccccaagt gtaatgtaca ccttcatcac aaccatctcc 17280

gagcctaaga ggaggattca gaatccgcaa cttgccggca cggtccatgt tgcctggact 17340

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ccacctcatc accgggtcca ggaggctgga ggaggagcca ggcgccagct gggacgtttc 17700

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tattcttttc tttttttttt tcttttttat tactcaaatg aattgatcac atctgtagtt 19200

acataatgat cataacaatc caatttcaca ggatttccat cccataaccc aagcacatcc 19260

cccacccccc aaactatctc ctccagagac cataagtttt ttaatgtctg tgagtcagca 19320

tctgttctgc aaagaagttc agtctgtcct tttttcaaat tccacatgtc agtgaaagca 19380

tttgatgttg gtgtctcatt gtatggctga cttcacttag catgatagtt tctaggtcca 19440

tccatgttgc taaaaatgct ggtatttcgt tcattttaat ggctgagtaa tattccattg 19500

tgtatatgta ccacatcttc ttgatctact cctctgttca aggacattta ggttgtttcc 19560

atgtcttagc tattgcaaat agtactgcaa tgaacattgg agtacatgtg tctttgccag 19620

tcgtggtttt ctctgggtag atgcccagga taaaacttat tattgtagaa aatttcaaaa 19680

atacgccaaa gtggaaagaa caatagactg cctcatctgc tacccagtct cagcagttat 19740

cacctcgctg acatctcatc tcatctgtcc ccctccccat gcctgtccct tcgcctgcca 19800

accattgtaa tacacaattg ttccatatca tttgtgtata tttgctgtgt attttcaaaa 19860

cattcacact ctttctaaag atatcatcac aatacaactg tcataccccc aaaggaacaa 19920

taatgcctta atatcatcaa atgtttagca ttcacatctc tgcagttgtc tctcaggtgt 19980

cttgtttcat ttttcaacag tttgcatgat tcaaatccaa taaggcatgt atctgcggtc 20040

agttaacact cctcttaagt ccattttaac ctacagggta ccccttcccc gtgccccctc 20100

cccacaaagt ttacttgttg aagaactggg tttggtttgg tttggggttt gtcctataaa 20160

gcttcccaca ggtctggatt ttgctcatag catccctgtt ggattgttgg acctgcttct 20220

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cccccaaacc ttggtaaccc aacttgatat cgttttgccc aagagtttgg tgccgaggga 21060

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tgttgcagtt caaaagaaag atcacggtat attaatactc catgttaagg tgaagggggt 21240

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taattattca cattacccga caattccttt ttaaaaaaat aaggattcaa attggcacct 21360

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aaatatttga atgtcatagt caagatactc tgaaattaca gtaaatccta aaaatacgtc 21480

ccatttgcat cgtgccctgc catgggtctt ggccccttga actgctcgtc tctgggagtc 21540

tgcacgctcg aggggtgggg gggggcggcc tcgctcctgc ccccagctcc gtgtccctgg 21600

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gaagcctctc gccttgcttc tcctttccct ggacttccag gtgcctggga cactccatga 21840

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gtgcagcttc atgtgcctgt cctcacattt gcagcgcctt ctcccagcca cagagcagtc 22020

agtccacttg agactgacat caggcgcagg gctgtctcat ggccaaggat ttgggactga 22080

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ttcagataca actttaatga cacctgaatc ggaagtttta aaaatgccct ttctggagtt 22200

cctgttgtga ctcagctgta acaacccgac tagtatccat gaggacgcgg gttggatccc 22260

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atccgtccat ctgtccatct gtcctgcaag tggaagagtt cctactcctg cctctccctt 22860

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actcgctgcc ctgaacaccc aggatggggc tcttaggagc gctgaccatt tcggcctgtg 23040

ccctccatat agcgcttatg ccccctaaca ggccggtagg gtttactgat ctcacttttc 23100

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atttcatggc atttttgcct tctatctgtg tgatcaataa ttttaagtat tggggggcag 23520

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attagatagt agagtttttt ttttttttag ccagaatttt gttcagaacc cctttccagg 23820

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agccgagaga gggaacaagg tgctcatgag tgctggacac caagggagtc caagctgtcg 24000

aatagaacca tccagccatt cctgatcatt cacagaggtg atccggtctg ctgggccact 24060

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cctccctgag ttgctcagca gatgtgtgtg cacgttctgt gcctcttgcg ttctaggtag 24180

taggggtcca gatatgcaca gtgaaaggca agatcttggc tctgatggtg ctcactctgc 24240

agcctctgct gagacccagc tgaaggtctt ggagacggac ccaaaagtct ttgctctcct 24300

ctgttcccct gaagtcactc tttccttcgc ccccagcaca gattgacccc tatgttttat 24360

gtcatccagt tgggtttcag tttaaaaagc aaaaggggag ttcccatcat ggctcagctg 24420

aaacgaatct gactagtatc catgaggatg cagattcgat ccctggcctt gctcaatggg 24480

ttaaggatct ggtgttgctg tgagctgtgg tgtcagtcac aggtacagct cggatctggt 24540

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tcaggaaggc cacaaagcat gttactatta cacaggttaa tacatgcaga aatatacatc 24840

attccatcat gtctctgtat cgtcattcca ttatgatcaa gatcaatgcc agtacagttt 24900

aaaaaaaaca aaacaagtcc aagattgtgg caggtgcctg tagataaatt ccacaaaccc 24960

tgctttgttg ctggaggtaa ctgtgtcaca aggtaggcct aacctaaatt tatttcgtta 25020

aaattacatt tagtgtttag aaacatttca tctgcaaggg gcaagtgaga gtatgagaac 25080

cataaagtat gatcacttag agatctcaaa aatcacacgt tgcttgtttg gaaacaagga 25140

gaagttactg tctctgacag cggccccccc ttatggccta aggcctcgtt gagtacacat 25200

gggaccgccg tctccccctg acccctaatc cctccatcag cctggcgctg caagacggca 25260

ttcagttcca taaacccatg ccaacccctg cttcggtttc aggaggatgg cagtggggga 25320

ttaatttgag atgctgtgtg aacagagaca tcccatgttg tgtaatacac agtgcggaaa 25380

cctggtttgc gaggcacttc ggtaaagttc agttttagga aaaacatgaa gcttgttccc 25440

tctgattttc atcatcttac tattttccca ggtgcattat aatctttggc cacagttaag 25500

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acttgactca gcacccaaag tgactgctgg ctccacggga cgggtttcat tttccctgtg 25620

atttgggatt gtgtcaccct ggccaccatg aaattgaagc tacgccccac ctccctcggg 25680

gagacaagaa gatccgaagt agactgtgtc atcaacagtc aggtttaatg tgactcacat 25740

ccctcgtgag ggcactgtct tcacaggaag tcctgccctt gtctgtcctt cagagattct 25800

gcctctggtg attctaggta ggagcctgtg cccccaaaaa agaaaaaaca aacagcctta 25860

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ctgaatccag tagtttggca ctttgagccc tcagaaccaa cccctgagac ctcccgcaca 25980

acacacacgt cacctcggtg acttcccata gtggcatgag gccttagttc ccatcgtgca 26040

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atgtgccctg taccacacac ccctcatcaa agtgggggct tgcaaatggg cggtggtcgg 26340

gggctccagg tcctggctga ggcttcagga aaggaccctg aagcctcgca ctgatggggt 26400

taaaccccct tttgttaatt acctgtcaac aaacattgca aaggtgtgag tttataatta 26460

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tcactgctaa attccatttc agaaagcaac aaaagcacac aaaggtttgt gatttgctga 26580

aaactaaaaa catggctggg gttgggagtg gggggagcga attgtacagg cacctacatt 26640

taggataatt tgtagctgat caggatatct taaatgttca ggccttggta acacgagtca 26700

tacccggctg ctccagcatt tccagcctca gggctcggtt ctgtctcact cttggctcca 26760

gaactaacaa gttgcctcaa gttacccaaa cccaccatac agtttctgac tcgatacacc 26820

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cttcactagg tacttcctct ggtatgtgat aagtggaact tgccccagaa ctctctctaa 27060

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acagaaagtg ggtttctgtg cagactccgg taaattcaca cgaagatttg ttttctcacc 27420

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ataattgata gctgataaac tgcacgtgtt tcaaatgtag tttgtcgggg tgtgacctcc 27540

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cggggtgaac ccactgcagc ttgtttgtcc atgcacacac ggacgggcat ttaggttgta 27900

cctcattttt tactattaca actaaaactg ctgtgaatat ccctgtcgac atctttgtat 27960

agacatggct tcacgtctct tgggttaata cttagatgtg aagtggctgt gtcacttgct 28020

aggcacatat gtaacttttt aagaaactgc caaaatctta aaacgtgact gtaccatttt 28080

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gtcaggtttt ttttaaatta tagtccttct ggtgggtaga cagctgtatt tgcttgtgga 28200

ataatttgca tttccctaat gatcagtgaa gctgagcatc ttttaatgtg cttatttgtt 28260

atctgtatat ctttactagt gaaatgttga tgcggatgct ttgcccattt tttaactggg 28320

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aagacatttg taaaacacag acaaatataa agcctctatc ctgctaattt tttgaactta 28800

cctaggcaca tttaagggta ttgtaggggg aataggcgat agttctaagt gtgtatttta 28860

caaaacctga atcatagtat attctgtatc ctgcttttaa aatttttggc attacagcag 28920

catttaatca tatgatttag tattctaaat gtgtggtttt tattttttaa tttattttta 28980

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ttacaaagtt gtgttagctt caggtgtaca gcaaagtgaa tccgtcttac atctgcatat 29220

atcctaaatg tatggttttt aatggctgca tagttattct attatataga catatcatac 29280

cttacccctt ttatgagaca ttatcaatct tcttaaaata tgctttaaat gtgcttaaac 29340

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ggctttgtat attatttcca caacgcattc caggaaagtt tcaacagtat acactcccaa 29460

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atagttaatt tacaatgtta tattagtttc aggtggacaa catagtgatt ccctgttttt 29580

atagattatg atccatttga agtcattata atccgttata aaagtcatta taaaatgaag 29640

tcatcacaaa gtcactgttg gttacagtcc ccgtgctgtg aattacatcc ttgtgtctta 29700

tttaaaaaat ttaatttttt acaccaagtt ttgcttgttt ggggaaaacc ctgaaagatg 29760

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ctgagaaggt tagaccaact ccttgcatcc tttgctcctt gtaccaagaa acctgccagg 29940

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attggaatcc ttgcaaggag tatttttccc ttactttgtg cataaaacgt ggagctgctg 32400

tcaaagctta tttgttcatg ttcctcaaat agcccatcag ataaactctt aagctcttcc 32460

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ggcaggtggg gccacgcctg ggggaggagg ctgggctgga ggctgagagc caggcagggt 32940

ctcacgtgct cgtgaacaga gctatgatca gataaagggc ccagaaacta atctgctgca 33000

attgtctggt cacagcatgc tttgaagact aagtgtgaga atcaagtcag aataaacttg 33060

ccatattata aatattataa atgttcttac atgtcgaaga agatgtccgt ggctttttag 33120

tgtaatgggt tataattttt tttcatgttc tgtttcattg tagtccttac acttgttttg 33180

aatgaagctt tattttggca gttaggagaa ggaaaaaaat ggtcactact tggcctcctc 33240

catttatgca gattctctcc tttttccttc ctcttgtatc tgtaatcagt caaacatttt 33300

ctctgacatt ttcgacatca tccccccgtt ttaatatcac ataagaacat cttcttgaaa 33360

gctttaaaat tttacgctgt tcctttttct tttccataaa acggcattca tttccaaacc 33420

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cacctgtaaa gtatttatat tatcaaaata gcacagtaca caaaataggc tttcatattc 38880

ctaattaccc taccaaaaaa ctcagtgtgt gccctgggca agtaagtatt tacaaagcta 38940

atttcattat tttgcagttt tgatgtgcag aattcagttc ttccatttat gcatgtcctg 39000

tgctttacca agaaatggag cttttgcttg aactttttaa acatccttta ttagtctaaa 39060

tttttatttt tcttgtcttt taaactacaa gaaaaacgct gctttcaaat atacccttag 39120

tacttttgta atgatgcttg aatgccctct cttaaatatt ttatttacac atcatccaat 39180

tcttaaagta agggaaaatt cgatttcagg ggagaataat tagatttgtg tttagaacat 39240

taagtaaaat ggttttcact taacttgtct ttggtgaatg ctattctttt ttaactgttt 39300

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tgctttggga ctattactcc tttcacattt acttgtacag tcaagaagta ttgacagatt 39480

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cttctcctga agcaaaccta tatttaactt cccttgcatg cttttgaaat ctaagagtta 39660

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taacacaaat gtggctcaga gaaacctgtg ttgcacaagc gcgtgcagtg tgagcccagg 39780

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aaatgtaaat tgtaataatg taaatggggt ttcactatat atatgaatat attatacaca 47040

cacgtatcgc acttcataga atcagagttg ctctcttaag gagcgttggc tcctgatctt 47100

ttatcatgct cctatctttt ttttaatcct gggagcagta gttttttgta cgtatgtatt 47160

taaattttat tattaaaagt tacattttat taaaaaaaat gtgttccaaa ggcattaaaa 47220

ttatatatgt taataaggaa atacatttaa aattttttca aactgctcct aagcttttga 47280

ttaggagact ctttgctctg aaagtaggct tctagcactg ctttattact gcttccttta 47340

gtttctatga aacagattgc ttacttaaat cattagttga atgattagtg ttcagtattg 47400

ctttaatcac catggggggg ggagaggaaa aagaaaagtg gtgacagagc acaaataaat 47460

agaaaaacct attttttaaa tagaaatcac aaatacgagt gtggaagccc tactttattt 47520

tgtctaaaat ttgcttaaag agaagtccaa ttaatgaact gagacattgg ccttagtagg 47580

ctgtatttca ctgctaataa aacatttaaa agggagtacc aggatttatt aactaaagca 47640

ttttggaaac ggggaatggc gccatgcagg tatatctact ttgagcctca ttctcaccct 47700

gtgtggattt cagatacacg aaaacacgtc ttccagggca ccagtgctga aatcgtggac 47760

tcttcacttg catatgtaca cacccccttg cctgttgctg cgcacagact cgaaataaca 47820

cttccaagga agaggaaagt cagctaagac attttttaaa ttgaccgcag tggtcactaa 47880

accctttttg agagaatctc tgttaaacat gaggcagact catttatctt aattgcacaa 47940

tggtctgaca aggctgtaac accaaaccgg cttttttttt tttttttttc ccctcctaga 48000

aaaacagttg atgcttattt ttatgtcaac tggatgtggt taaaaataat tattgccaat 48060

gctgttttca ttctccagtg gccagaatca tcatccttga aatttctagt agtgcctttg 48120

cttggtttaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaagggatta tcattaagta aagatatttc 48180

agtttagaat tcggacctca gacaagatat tgaacctcat tcagtttgac cttccacatg 48240

gttgtaccag ttagatcacc ggacacggaa gcacgaacgt ggaaggatct tggcaccata 48300

agcaatactc tgctttgacg taaggcagat accatcgtta cagttattgg tcactgttac 48360

caatttgcat tttaaactcc tcttcacaag gttctgcttt ctaaagcttc agttgtcctg 48420

gctgatcatg caccaaccac tctgtgcagc ttctccattt cacttagggt ttcctccacg 48480

ctatgtgttt ttgcctcttt gttgcttgtg ctttattatt cttagtcact tgtggaatag 48540

agtgatatat tgtgttaatt tggacagtag cggtttttaa aaaccatata ctgactgaaa 48600

catgagccag agctaattgc tttattaagc taataatgaa tgttaaaaga gtacatattt 48660

tcaggatcat tcatctagta agcaatacac atatataggc caatattttt ttaaaaaaat 48720

agagcttggt caacctctat actacacata ttacaagata tagcactttc aaaacgaatc 48780

taaaccttta cagaaacttt cttataggtt atgcctttta ttttaagact tattataatt 48840

tgtttcaagt gccattagat gatatatatg taggcctttg atatataatg ctttgtgttt 48900

gaaaatggta gatggtattt taaacaggta catttttaca gtgttttctt atcaatttgc 48960

tatattgcac agga 48974

<210> 2

<211> 1091

<212> DNA

<213> 猪(Sus scrofa)

<400> 2

gtctccgtgc ccatcaaaga cgagctcctc ccggtcatgt ccctgccctc cagcgaactg 60

ctgtccaagc ccttccccaa cacgctgcag ctgaacctct acaacactcc gttccagccc 120

atgcagagct cggggtcggc gcaccagatg atcaccactc tgccgctggg catgacgtgc 180

ccgctggaca tggacgctgt ccacccctcc caccacctgt ccttcaaata cccgttcggt 240

tctacctcat acgccatctc tattcccgag aaagaacagc cgctgaaggg ggagatcgag 300

agctatctga tggagctgca gggcggcgcg ccctcgtcct cgcaggactc tccagcgtcg 360

tcgtctaagc tcgggctgga gcccccgctg ggggccctgg atgacggcgc gggggacctc 420

gccctgtcca aaagctccat ttctatcagc gaccccctga acaccccggc cttggacttc 480

tcccagttgt ttaatttcat cccgctaaac ggccctccct ataacccgct gtcggtgggg 540

agcctgggca tgagctacgc ccaggaggaa gcgcattctt ccgtgtctca gctccccgcg 600

cctgcgcagg acctccagga tcctgccaac cccatagggc tcagctctct acactcgctg 660

tcggcggctt tcaccagtag tctgagcaca agcaccaccc tgccacgttt ccatcaagcg 720

tttcagtagg atcccaagac gtggatctgc gacagaaatg tatgtccacc cctgccttag 780

gtgaccgttt tcattttagt gcctacttta agacggtata caaatgtctg cttcagtata 840

gtaccaactt ccattaagcc agtataaaag agaaactagc tttttaaatg agctttggaa 900

ccgttcgtgt tcagttatgt ttacctgggt attttgtcct gattcactgc caattgtcag 960

ctctgaagat gatttctctc ctaggaaagc catcaagagt agtaaagtct tacagagtcg 1020

gtgttcagct tccttgtaga tctcaaaagt ttcatttttg tccgagaaca atggctctac 1080

cttttgacct t 1091

<210> 3

<211> 987

<212> DNA

<213> 猪(Sus scrofa)

<400> 3

gtggaagccc tactttattt tgtctaaaat ttgcttaaag agaagtccaa ttaatgaact 60

gagacattgg ccttagtagg ctgtatttca ctgctaataa aacatttaaa agggagtacc 120

aggatttatt aactaaagca ttttggaaac ggggaatggc gccatgcagg tatatctact 180

ttgagcctca ttctcaccct gtgtggattt cagatacacg aaaacacgtc ttccagggca 240

ccagtgctga aatcgtggac tcttcacttg catatgtaca cacccccttg cctgttgctg 300

cgcacagact cgaaataaca cttccaagga agaggaaagt cagctaagac attttttaaa 360

ttgaccgcag tggtcactaa accctttttg agagaatctc tgttaaacat gaggcagact 420

catttatctt aattgcacaa tggtctgaca aggctgtaac accaaaccgg cttttttttt 480

tttttttttc ccctcctaga aaaacagttg atgcttattt ttatgtcaac tggatgtggt 540

taaaaataat tattgccaat gctgttttca ttctccagtg gccagaatca tcatccttga 600

aatttctagt agtgcctttg cttggtttaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaagggatta 660

tcattaagta aagatatttc agtttagaat tcggacctca gacaagatat tgaacctcat 720

tcagtttgac cttccacatg gttgtaccag ttagatcacc ggacacggaa gcacgaacgt 780

ggaaggatct tggcaccata agcaatactc tgctttgacg taaggcagat accatcgtta 840

cagttattgg tcactgttac caatttgcat tttaaactcc tcttcacaag gttctgcttt 900

ctaaagcttc agttgtcctg gctgatcatg caccaaccac tctgtgcagc ttctccattt 960

cacttagggt ttcctccacg ctatgtg 987

<210> 4

<211> 18

<212> DNA

<213> PLAG1-exon5.2 F(Artificial Sequence)

<400> 4

gtctccgtgc ccatcaaa 18

<210> 5

<211> 21

<212> DNA

<213> PLAG1-exon5.2 R(Artificial Sequence)

<400> 5

aaggtcaaaa ggtagagcca t 21

<210> 6

<211> 22

<212> DNA

<213> PLAG1-exon6 F(Artificial Sequence)

<400> 6

gtggaagccc tactttattt tg 22

<210> 8

<211> 20

<212> DNA

<213> PLAG1-exon6 R(Artificial Sequence)

<400> 8

cacatagcgt ggaggaaacc 20

Claims (2)

1.用于检测与苏姜猪生产性状相关的SNP标记的引物对，其特征在于：包括（1）～（2）中的至少一种：

（1）检测猪参考基因组11.1版本4号染色体第75690495位碱基（rs334240640）C>T突变和第75691055位碱基（rs326013678）A>G突变的正、反向扩增测序引物的DNA序列如下所示：

正向引物（PLAG1-exon5.2 F）：GTCTCCGTGCCCATCAAA

反向引物（PLAG1-exon5.2 R）：AAGGTCAAAAGGTAGAGCCAT；

（2）检测猪参考基因组11.1版本4号染色体第75693827位碱基（rs328675134）A>G突变的正、反向扩增测序引物的DNA序列如下所示：

正向引物（PLAG1-exon6 F）：GTGGAAGCCCTACTTTATTTTG

反向引物（PLAG1-exon6 R）：CACATAGCGTGGAGGAAACC。

2.权利要求1所述的引物对在苏姜猪生产性状辅助选育中的应用，所述性状为苏姜猪体重、体长、体高、胸围、胸宽、臀宽与最后一根肋骨处活体背膘厚中的至少一种性状。

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