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CN110914435B - 产依克多因酵母 - Google Patents

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CN110914435B CN201880046773.XA CN201880046773A CN110914435B CN 110914435 B CN110914435 B CN 110914435B CN 201880046773 A CN201880046773 A CN 201880046773A CN 110914435 B CN110914435 B CN 110914435B
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Abstract

本发明涉及依克多因的生物产生领域。本领域需要允许依克多因的高效合成和分泌的依克多因产生方法。本发明中提出的技术方案是如本文所述的包含许多修饰的经遗传修饰的酵母的用途。

Description

产依克多因酵母
技术领域
本发明涉及依克多因的生物产生领域。
背景技术
依克多因(1,4,5,6-四氢-2-甲基-4-嘧啶羧酸)是由自然界中的嗜盐生物自然产生的杂环氨基酸。实际上,为了在含盐环境中存活,这些生物产生依克多因作为相容性溶质,用作渗透平衡物。
依克多因确实也能够保护核酸、蛋白质、细胞膜以及整个细胞免受来自外界环境(诸如紫外线辐射、加热、冷冻或化学剂)的大量侵害所引起的变性,也能够免受由于干燥引起的变性(参见例如Lentzen G等人.Appl Microbiol Biot.2006;72:623-34,和Graf R等人.Clin Dermatol.2008;26:326-33)。因此,它用于护肤的化妆品中。
此外,已发现依克多因作为蛋白质稳定剂、化妆品添加剂、PCR增强剂和微生物干燥保护剂是令人关注的。
由于这些有利的性质,依克多因越来越多地通过细菌过程使用特别是嗜盐细菌、诸如伸长盐单胞菌(Halomonas elongata)产生。然而,这些方法需要高盐浓度,这使工艺复杂化并且导致考虑到设备的重要腐蚀所涉及的成本增加。
此外,通过细菌和酵母菌的生物合成途径产生必需氨基酸(诸如依克多因)需要大量的NADPH形式的还原力。然而,在这些微生物中、特别是在酵母中,葡萄糖代谢的主要途径是糖酵解,接着是仅产生NADH的发酵。因此,尽管在微生物中维持可接受的NADPH/NADH平衡是很复杂的,但其对于优化依克多因的生物产生同时维持可存活的重组微生物因此是至关重要的。
因此,在本领域中仍需要另外的允许依克多因的高效合成和分泌的依克多因产生方法。
发明内容
因此,本发明涉及产依克多因重组酵母,在其基因组中:
(A)(i)编码天冬氨酸激酶(aspartokinase)的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;和/或
(ii)编码天冬氨酸激酶(aspartate kinase)的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(B)编码天冬氨酸半醛脱氢酶的至少一种核酸和/或编码可以用作辅酶NAD和NADP两者的天冬氨酸半醛脱氢酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(C)编码二氨基丁酸氨基转移酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(D)(i)编码高丝氨酸-O-乙酰转移酶MET2的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(ii)编码高丝氨酸-O-乙酰转移酶METX的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(iii)编码二氨基丁酸乙酰转移酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(E)编码依克多因合酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(F)(i)编码高丝氨酸脱氢酶的至少一种内源核酸、优选所有内源核酸已经缺失和/或中断,和/或
(ii)编码高丝氨酸脱氢酶的至少一种核酸、优选所有核酸独立地:
-在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
-在弱启动子的控制下;和/或
-呈非稳定形式。
如所附示例所示,本发明的重组酵母具有增加的依克多因产生。
还通过将酵母与下文所述的其他修饰物重新组合,可以进一步提高所述有利的性质。
因此,产依克多因重组酵母可以有利地用于如下文所述的用于产生依克多因的方法中或用于产生依克多因。
本发明还涉及用于产生依克多因的方法,所述方法包括以下步骤:
(a)在培养基中培养本发明的重组酵母;和
(b)从所述培养基回收依克多因。
优选地,培养基至少包含碳源,优选选自由葡萄糖和蔗糖组成的组的碳源。
本发明还涉及根据本发明的重组酵母用于产生依克多因的用途。
具体实施方式
本发明人已经构想出经遗传修饰的微生物、特别是经遗传修饰的酵母,其具有与亲本微生物相比、特别是与亲本酵母相比增加的产生依克多因的能力。
在整个说明书中对这些经遗传修饰的微生物、包括这些经遗传修饰的酵母进行了描述。
定义
如本文所用的术语“微生物”是指未经人工修饰的酵母。如果微生物提供将整合到将表达外来遗传元件的微生物“受体”中的该遗传元件,或者如果微生物用作遗传构建或蛋白质表达的工具,则该微生物可以是“供体”。本发明的微生物选自表达用于依克多因的生物合成的基因的酵母。
如本文所用的术语“重组微生物”或“经遗传修饰的微生物”或“重组酵母”或“经遗传修饰的酵母”是指经遗传修饰的或经遗传工程化的酵母。根据这些术语的通常含义,这意味着本发明的微生物不是在自然界中发现的,并且通过引入或缺失或通过修饰自然界中发现的等效微生物的遗传元件而被修饰。也可以通过结合在特定选择压力下的定向诱变和进化来迫使新的代谢途径的发展和进化来对其进行修饰(参见例如WO 2004/076659)。
如果将外源基因引入具有所有允许它们在宿主微生物中表达的所有元件的微生物中,则可以修饰微生物以表达这些基因。可以修饰微生物以调控内源基因的表达水平。用外源DNA将微生物(如酵母)修饰或“转化”是本领域技术人员的常规任务。特别地,根据本发明的微生物的遗传修饰、更特别是本文定义的一种或多种遗传修饰可以通过使用CRISPR-Cas系统进行,如DiCarlo等人所述(Nucl.Acids Res.,第41卷,第7期,2013:4336-4343)。
术语“内源基因”意指该基因在任何遗传修饰之前存在于微生物的野生型菌株中。内源基因可以通过引入除了内源调控元件之外的异源序列或引入异源序列替代内源调控元件而过表达,或通过将一个或多个补充拷贝的基因引入染色体或质粒中而过表达。内源基因也可以被修饰以调控其表达和/或活性。例如,可以将突变引入编码序列以修饰基因产物,或者除了内源调控元件之外可以将异源序列引入,或可以将异源序列引入以替代内源调控元件。内源基因的调控可以导致基因产物活性的上调和/或增强,或可替选地,导致内源基因产物的活性的下调和/或减弱。增强内源基因表达的另一种方式是在染色体或质粒上引入一个或多个补充拷贝的基因。
术语“外源基因”意指该基因通过本领域技术人员熟知的方法被引入微生物中,而该基因在野生型微生物中不是天然存在的。如果将外源基因引入具有所有允许其在宿主微生物中表达的元件的微生物中,则该微生物可以表达这些基因。用外源DNA转化微生物是本领域技术人员的常规任务。外源基因可以被整合到宿主染色体中,或从质粒或载体中以染色体外的方式表达。在复制起点和在细胞中的拷贝数方面不同的各种质粒都是本领域已知的。外源基因的序列可以适合其在宿主微生物中的表达。实际上,本领域技术人员知道密码子使用偏向的概念,以及如何在不修改推导的蛋白质的情况下使核酸序列适应特定的密码子使用偏向。
术语“异源基因”意指该基因来源于不同于表达该基因的接受者微生物的一种微生物。它是指在微生物中不是天然存在的基因。
在本申请中,所有基因均以其通用名称并参考其核苷酸序列以及其氨基酸序列(如果出现的话)进行引用。使用已知基因的登录号中给出的编号,本领域技术人员能够确定其他生物体、细菌菌株、酵母、真菌、哺乳动物、植物等中的等效基因。该常规工作可以使用可以通过与来源于其他微生物的基因进行序列比对来确定的共有序列并设计简并探针以将相应的基因克隆在另一生物体中来有利地完成。
本领域技术人员知道调控内源基因表达、特别是上调或下调内源基因表达的不同方法。例如,增强内源基因的表达或过表达内源基因的一种方法是在染色体或质粒上引入一个或多个补充拷贝的基因。
另一种方法是用更强的启动子代替基因的内源启动子。这些启动子可以是同源的或异源的。在本说明书的其他地方更详细地描述了本发明中特别感兴趣的启动子。
核酸表达构建体还可以包含5’和/或3’识别序列和/或选择标记。
术语“过表达”意指与未修饰的微生物相比,基因或酶的表达增加。通过增加编码酶的基因的表达获得了所述酶的表达增加。可以通过本领域技术人员已知的所有技术来进行增加基因的表达。在这方面,可以特别引用在旨在过表达的核酸上游的强启动子的实现,或者在启动子、特别是强启动子和终止子之间引入多个拷贝的所述核酸。
术语“低表达”意指与未修饰的微生物相比,酶或基因的表达减少。通过减少编码酶的基因的表达来获得所述酶的表达减少。减少基因的表达可以通过本领域技术人员已知的所有技术来进行。在这方面,可以特别引用在旨在低表达的核酸上游的弱启动子的实现。也可以引用编码比亲本酶活性低的所述酶的变体的核酸或编码在细胞中比亲本酶更快速地降解的所述酶的变体的核酸的实现。与亲本酶相比降解更快的所述亲本酶的变体涵盖了降解决定子标记的酶。也可以引用感兴趣的基因的转录激活子的表达减少。
术语“诱导型启动子”用于限定在以下情况下活性被诱导(即增加)的启动子:
-在一种或多种特定代谢物的存在下。培养基中代谢物浓度越高,启动子活性越强;或者
-在存在低浓度的一种或多种代谢物或不存在一种或多种代谢物的情况下。这些代谢物不同于增加的存在诱导启动子活性的那些代谢物。培养基中的代谢物浓度越低,启动子活性越强。
术语“阻遏型启动子”用于限定在以下情况下活性被阻遏(即降低)的启动子:
-在一种或多种特定代谢物的存在下。培养基中代谢物浓度越高,启动子活性越弱;或者
-在存在低浓度的一种或多种代谢物或不存在一种或多种代谢物的情况下。这些代谢物不同于增加的存在阻遏启动子活性的那些代谢物。培养基中的代谢物浓度越低,启动子活性越弱。
如本文所用,“降解决定子标记的”酶意指包含添加的蛋白质降解信号氨基酸序列的酶,其用作将导致所述酶成为降解的对象的破坏信号,所述降解可以是(i)非泛素依赖性降解或(ii)泛素依赖性降解。所述添加的蛋白质降解信号在本领域中也称为“降解决定子”,涵盖用作破坏信号的氨基酸序列,所述氨基酸序列由引起靶向蛋白质降解的可转移降解信号组成。降解决定子涵盖“N-降解决定子”,其是可转移的N末端氨基酸,按照众所周知的N末端规则引起靶蛋白质降解(Bachmair等人,1986,Science,第234(4773)卷:179-186)。N-降解决定子的不稳定性质归因于其最初的氨基酸,所述氨基酸容易乙酰化修饰或精氨酰化修饰,并最终导致泛素化和降解。通常,降解决定子需要至少两种组分来确保靶向蛋白质降解:(i)靶降解识别标记,诸如聚泛素标记和(ii)与降解识别标记紧邻的非结构化氨基酸序列。为了对蛋白质进行降解决定子标记、特别是在本文中对酶进行降解决定子标记,本领域技术人员可以参考Yu等人(2015,Current Opinion in Biotechnology,第36卷:199-204)、Cho等人(2010,Genes&Development,第24卷:438-442)或Fortmann等人(2015,J MolBiol,第427(17)卷:2748-2756)、Ravid等人(2008,Nat Rev Mol Cell Biol,第9(9)卷:679-690)和Hochstrasser(1996,Annu Rev Genet,第30卷:405-439)。
酶的“活性”与术语“功能”可互换使用,并在本发明的上下文中表示酶催化所期望反应的能力。
术语酶的“降低的活性”或“减弱的活性”意指通过核苷酸序列的突变获得的蛋白质的比催化活性降低和/或通过核苷酸序列的突变或通过同源相应基因的缺失或还通过蛋白质的降解决定子标记获得的细胞中蛋白质浓度降低。
术语酶的“增强的活性”表示例如通过编码该酶的基因的过表达获得的酶的比催化活性增加和/或酶在细胞中的数量/可用性增加。
术语“编码(encoding)”或“编码(coding)”是指多核苷酸通过转录和翻译机制产生氨基酸序列的过程。
编码本发明中考虑的一种或多种酶的一种或多种基因可以是外源的或内源的。
基因的“减弱”意指与未修饰的微生物相比,基因的表达速度较差。减弱可以通过本领域技术人员已知的方式和方法来实现,并且含有通过同源重组获得的基因缺失、通过将外部元件插入基因中获得的基因减弱或在弱启动子下的基因表达。本领域技术人员知道表现出不同强度的多种启动子,以及哪些启动子用于弱遗传表达。
在本发明中实施的方法优选地需要使用一种或多种染色体整合构建体用于将异源核苷酸序列稳定引入染色体上的特定位置中或用于功能性破坏经遗传修饰的微生物细胞中的一个或多个靶基因。在一些实施方式中,靶基因的破坏阻止了相关的功能蛋白质的表达。在一些实施方式中,靶基因的破坏导致由被破坏的基因表达非功能蛋白质。
在本发明的实践中可以改变的染色体整合构建体的参数包括但不限于,同源序列的长度;同源序列的核苷酸序列;整合序列的长度;整合序列的核苷酸序列;以及靶基因座的核苷酸序列。在一些实施方式中,每个同源序列的长度的有效范围是20至5000个碱基对、优选50至100个碱基对。在特定的实施方式中,每个同源序列的长度为约50个碱基对。基因靶向所需的同源性长度的更多信息参见D.Burke等人,Methods in yeast Genetics-Acold spring harbor laboratory course Manual(2000)。
在一些实施方式中,(a)旨在插入上述一种或多种DNA构建体的一种或多种经破坏的基因可以有利地包含一种或多种用于选择转化的微生物细胞的可选标志物。优选地,所述一种或多种可选标志物被包含在根据本发明的一种或多种DNA构建体中。
在一些实施方式中,可选标志物是抗生素抗性标志物。抗生素抗性标志物的说明性实例包括但不限于NAT1、AURl-C、HPH、DSDA、KAN<R>和SH BLE基因产物。来自诺尔丝链霉菌(S.noursei)的NAT 1基因产物赋予了对诺尔丝菌素的抗性;来自酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)的AUR1-C基因产物赋予了对金担子素A(AbA)的抗性;肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumonia)的HPH基因产物赋予对潮霉素B的抗性;大肠杆菌(E.coli)的DSDA基因产物允许细胞在以D-丝氨酸为唯一氮源的板上生长;Tn903转座子的KAN<R>基因赋予对G418的抗性;以及来自印度斯坦链异壁菌(Streptoalloteichus hindustanus)的SH BLE基因产物赋予对Zeocin(博来霉素)的抗性。
在一些实施方式中,在分离出本发明的经遗传修饰的微生物细胞后,使抗生素抗性标志物缺失。本领域技术人员能够选择在特定的遗传背景下的适合标志物。
在一些实施方式中,可选的标志物拯救了经遗传修饰的微生物细胞中的营养缺陷(例如营养性营养缺陷)。在此类实施方式中,亲本微生物细胞包含在氨基酸或核苷酸生物合成途径中起作用的一种或多种基因产物(诸如例如在酵母中的HIS3、LEU2、LYS1、LYS2、MET 15、TRP1、ADE2和URA3基因产物)中的功能性破坏,使得亲本微生物细胞无法在没有补充一种或多种营养素的培养基中生长(营养缺陷型表型)。然后可以通过用编码破坏的基因产物的功能性拷贝的染色体整合转化亲本微生物细胞来拯救营养缺陷型表型(NB:该基因的功能性拷贝可以源自近缘种(诸如克鲁维酵母菌属(Kluveromyces)、假丝酵母(Candida)等)),并可以根据亲本微生物细胞的营养缺陷型表型的丧失来选择所产生的经遗传修饰的微生物细胞。
对于包含启动子序列、编码序列(例如酶编码序列)或终止子序列的核酸序列中的每一者,本文描述了参考序列。本说明书还涵盖了与参考核酸序列具有特定的核酸同一性百分比的核酸序列。
对于感兴趣的氨基酸序列中的每一者,在本文中描述了参考序列。本说明书还涵盖了与参考氨基酸序列具有特定的氨基酸同一性百分比的氨基酸序列(例如酶氨基酸序列)。
由于明显的原因,在所有本描述中,分别与所考虑的核苷酸同一性或氨基酸同一性相符的特定核酸序列或特定氨基酸序列应进一步导致获得显示所期望的生物活性的蛋白质(或酶)。如本文所用,两个核酸序列之间或两个氨基酸序列之间的“同一性百分比”均是经由通过比较窗比较这两者的最佳比对序列确定的。
因此,与参考序列(不包含添加或缺失)相比,比较窗中的核苷酸序列或氨基酸序列的一部分可以包含这些添加或这些缺失(例如“空位”),从而均获得这两者的序列之间的最佳比对。
同一性百分比通过以下计算:确定可以注意到的两者比较序列的同一核酸碱基或同一氨基酸残基的位置数,然后将可以在两者核酸碱基之间或在两者氨基酸残基之间观察到同一性的位置数除以比较窗中的位置总数,然后将结果乘以100来得出两个序列之间的核苷酸同一性百分比或两个序列之间的氨基酸同一性百分比。
序列最佳比对的比较可以由计算机使用已知算法来进行。
最优选地,使用CLUSTAL W软件(1.82版)来确定序列同一性百分比,参数设置如下:(1)CPU模式=ClustalW mp;(2)比对=“完全”;(3)输出格式=“aln w/数”;(4)输出指令=“比对的”;(5)颜色比对=“无”;(6)KTUP(字长)=“默认值”;(7)窗口长度=“默认值”;(8)评分类型=“百分比”;(9)TOPDIAG=“默认值”;(10)PAIRGAP=“默认值”;(11)系统发生树/树类型=“无”;(12)矩阵=“默认值”;(13)空位开放=“默认值”;(14)末端空位=“默认值”;(15)空位延伸=“默认值”;(16)空位距离=“默认值”;(17)树类型=“进化分枝图”和(18)树GRAP距离=“隐藏”。
“发酵”或“培养”通常在具有适合于所培养的微生物的适当培养基的发酵罐中进行,该培养基含有至少一种简单的碳源并且如果必需的话具有共底物。
本文公开的微生物可以在发酵培养基中生长以从草酰乙酸中产生产物。为了最大程度地产生依克多因,用作产生宿主的微生物菌株优选具有高的碳水化合物利用率。这些特征可以通过诱变和选择、遗传工程化赋予,或可以是天然的。本细胞的发酵培养基或“培养基”可以含有至少约10g/L的葡萄糖。另外的碳底物可以包括但不限于单糖,诸如果糖、甘露糖、木糖和阿拉伯糖;寡糖,诸如乳糖、麦芽糖、半乳糖或蔗糖;多糖,诸如淀粉或纤维素或其混合物,以及来自可再生原料的未纯化混合物,诸如奶酪乳清渗透玉米浸泡液、甜菜糖蜜和大麦麦芽。其他碳底物可以包括甘油。
因此,预期了本发明中使用的碳源可以涵盖各种各样的含碳底物,并且仅受生物体选择的限制。
尽管预期了所有上述碳底物及其混合物在本发明中都是适合的,但是优选的碳底物是葡萄糖、果糖和蔗糖、或这些与C5糖(诸如木糖和/或阿拉伯糖)的混合物用于经修饰的微生物使用C5糖,更特别是葡萄糖。
优选的碳底物是葡萄糖。
除了适当的碳源之外,发酵培养基可以含有本领域技术人员已知的适用于培养物生长和促进产生所期望的产物所必需的酶促途径的合适的矿物质、盐、辅因子、缓冲液和其他组分。
此外,可以考虑适用于根据本发明的重组微生物的生长的另外的遗传修饰。
术语“好氧条件”是指培养基中的足以使好氧微生物或兼性厌氧微生物使用双氧作为末端电子受体的氧浓度。
“微好氧条件”是指其中氧的浓度低于空气中的氧的浓度、即氧浓度最高为6%O2的培养基。
“适当的培养基”是指包含对细胞的维持和/或生长至关重要或有益的营养素的培养基(例如无菌液体培养基),所述营养素诸如碳源或碳底物、氮源(例如蛋白胨、酵母提取物、肉提取物、麦芽提取物、脲、硫酸铵、氯化铵、硝酸铵和磷酸铵);磷源,例如磷酸一钾或磷酸氢二钾;微量元素(例如金属盐),例如镁盐、钴盐和/或锰盐;以及生长因子,诸如氨基酸、维生素、生长促进剂等。根据本发明的术语“碳源”或“碳底物”或“碳的来源”表示本领域技术人员可以用来支持微生物正常生长的任何碳源,包括己糖(诸如葡萄糖、半乳糖或乳糖)、戊糖、单糖、寡糖、二糖(诸如蔗糖、纤维二糖或麦芽糖)、糖蜜、淀粉或其衍生物、纤维素、半纤维素及其组合。
根据本发明引入的遗传修饰的一般特征
-基因通过两种非互斥的修饰被过表达:
·将该基因置于强启动子的控制下;和/或
·插入多个拷贝的所考虑的基因。
-根据已知的遗传工程化技术,将所有的基因组修饰插入酵母中:
-在根据本发明的酵母基因组中引入的基因构建体中包含的连续基因具有以下结构:
Prom1-ORF1-term1-ORF2-基因2-term2-…/…-Promn-ORFn-termn,其中:
-Prom1是调控编码序列ORF1的表达的序列,
-ORF1是编码所期望的蛋白质PROT1(特别是所期望的酶PROT1)的核酸序列,
-Term1是转录终止子序列,其通过在新合成的mRNA中提供触发从转录复合物中释放mRNA的过程的信号来介导转录终止,并且
-“1”、“2”、…/…“n”可以描述相同的ORF(开放阅读框)、启动子或终止子或可以不描述相同的ORF、启动子或终止子。基因的顺序无关紧要。“n”是通常5至20的整数。将这些构建体在受控位置处插入酵母染色体中的一者。在一些实施方式中,插入位点对于插入的构建体的功能或所产生的经遗传修饰的酵母的存活力不是必需的。
-当酵母菌是例如酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)时,通常将引入到酵母菌基因组中且源自酿酒酵母以外的其他生物体的基因进行“转码”(通常是“密码子优化的”),这意味着这些基因是通过用于在酿酒酵母中表达的最佳密码子使用合成的。还对来自酿酒酵母的一些基因的核苷酸序列(而非蛋白质序列)进行了修饰(“转码”),以最小化与所述基因的内源拷贝的重组。
-可以通过酵母遗传工程化中使用的标准程序使基因缺失。在一些实施方式中,靶向缺失的基因可以被上述基因构建体中的一者的插入来中断,或者可替选地,靶向缺失的基因被一小段核苷酸替代。
-下调基因表达可以通过破坏基因的内源拷贝并在弱启动子的控制下用ORF拷贝替代来获得。弱启动子的列表和序列在本说明书的其他地方描述。
-通过使基因的内源拷贝缺失(如有必要)并将新拷贝的ORF置于诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,可以使基因是“诱导型的或阻遏型的”。诱导型启动子或阻遏型启动子是活性受到调控或控制(即随着环境条件或外部刺激的改变而增加或减少)的启动子。诱导或阻遏可以是人为控制的,其涵盖通过非生物因素(诸如在感兴趣的生物体中天然不存在的化学化合物、光、氧水平、热或冷)的诱导或阻遏。本说明书中其他地方描述了诱导型启动子或阻遏型启动子的列表和序列。
-如本文其他地方已指定的,可以通过使用Yu等人2015,(Current Opinion inBiotechnology,第36卷:199-204)描述的“降解决定子”技术去稳定来使蛋白质低表达。简而言之,该技术包括在蛋白质序列中引入靶向降解的修饰。它可以只包括遵循称为N端规则的原则的前两个氨基酸,或将整个蛋白质靶向泛素-蛋白酶体降解途径的较大序列。
根据本发明的重组酵母
本发明人已经构思了具有增加的产生依克多因能力的重组微生物、特别是重组酵母。
本发明涉及具有增加的依克多因产生的重组酵母,并且其中,增加的依克多因产生通过遗传工程化方法经由在其基因组中引入的多种改变而获得。
本发明涉及产依克多因重组酵母,在其基因组中:
(A)(i)编码天冬氨酸激酶HOM3的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;和/或
(ii)编码天冬氨酸激酶AK的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(B)编码天冬氨酸半醛脱氢酶HOM2的至少一种核酸和/或编码可以用作辅酶NAD和NADP两者的天冬氨酸半醛脱氢酶HOM2的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(C)编码二氨基丁酸氨基转移酶EctB的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(D)(i)编码高丝氨酸-O-乙酰转移酶MET2的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(ii)编码高丝氨酸-O-乙酰转移酶METX的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(iii)编码二氨基丁酸乙酰转移酶EctA的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(E)编码依克多因合酶EctC的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(F)(i)编码高丝氨酸脱氢酶HOM6的至少一种内源核酸、优选所有内源核酸已经缺失,和/或
(ii)编码高丝氨酸脱氢酶HOM6的至少一种核酸、优选所有核酸独立地:
-在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
-在弱启动子的控制下;和/或
-呈非稳定形式。
本发明人发现,通过在酵母细胞的基因组中引入多种遗传改变,可以实现这些酵母细胞的依克多因产生增加。如本文中充分描述的,所述多个遗传改变涵盖某些基因的过表达、某些其他基因的受控表达、以及另外其他基因的阻遏或缺失。
通过优化草酰乙酸和乙酰-CoA的代谢,本发明人已经实现了酵母细胞的依克多因产生增加,使得将随后的人工修饰的代谢途径主要导向了依克多因产生,而同时保持产生的经遗传修饰的酵母细胞的最佳存活力。
在漫长的研究时期之后,本发明人已经确定,通过增加草酰乙酸转化为依次的中间代谢物磷酸-天冬氨酰基-半醛和天冬氨酰基-半醛并且另外增强天冬氨酰基-半醛转化为依克多因,获得了酵母细胞的高依克多因产生,同时显著维持氧化还原状态并且更特别维持适合的NADH/NADPH平衡,使所得的重组酵母细胞具有良好的存活力。最后一点很重要,并且对本发明人在整个研究工作中构成了重大挑战。
根据本发明的提出的技术方案出乎意料地允许通过消耗较少的还原力、消耗呈NADH而不是NADPH的形式的还原力和/或产生NADH而不是NADPH来维持整个依克多因产生途径中酵母细胞中可行的NADH/NADPH平衡。
如本说明书中详细公开的,对所得的重组酵母细胞进行遗传修饰,以实现(i)天冬氨酸激酶编码基因(HOM3)和/或(ii)天冬氨酸激酶编码基因(AK)、特别是天冬氨酸激酶编码基因(AK)的过表达和/或受控表达,优选是天冬氨酸激酶基因(AK)的过表达。
此外,根据本发明的重组酵母包含另外的遗传修饰,以最佳使用中间代谢物磷酸-天冬氨酰基用于天冬氨酰基-半醛产生,所述另外的遗传修饰包含天冬氨酸半醛脱氢酶编码基因(HOM2)的过表达和/或受控表达和/或编码可以用作辅酶NADH和NADPH两者的天冬氨酸半醛脱氢酶的基因的过表达和/或受控表达。
此外,根据本发明的重组酵母还包含遗传修饰以最佳使用中间代谢物天冬氨酰基-半醛用于依克多因产生,所述另外的遗传修饰包含(i)二氨基丁酸氨基转移酶基因(EctB)的过表达和/或受控表达,(ii)高丝氨酸O-乙酰转移酶编码基因(MET2;METX)的过表达和/或受控表达和/或二氨基丁酸乙酰转移酶基因(EctA)的过表达和/或受控表达,(iii)依克多因合酶基因(EctC)的过表达和/或受控表达和(iv)高丝氨酸脱氢酶基因(HOM6)的低表达和/或受控表达。
在根据本发明的重组酵母的一些实施方式中,所述酵母包含另外的遗传修饰以用于最佳使用中间代谢物草酰乙酸用于天冬氨酸产生,所述另外的遗传修饰包含(i)天冬氨酸转氨酶基因(AAT2)的过表达和/或受控表达和/或(ii)将氧化戊二酸转化为谷氨酸的谷氨酸脱氢酶基因(GDH)的过表达和/或受控表达。
在根据本发明的重组酵母的一些实施方式中,所述酵母包含另外的遗传修饰以用于最佳分泌所产生的依克多因,所述另外的遗传修饰包含(i)一般氨基酸通透酶基因(AGP3)的低表达和/或受控表达,(ii)支链氨基酸通透酶3基因(BAP3)的低表达和/或受控表达,(iii)支链氨基酸通透酶2基因(BAP2)的低表达和/或受控表达,(iv)一般氨基酸通透酶基因(GAP1)的低表达和/或受控表达,(v)高亲和力谷氨酰胺通透酶基因(GNP1)的低表达和/或受控表达,(vi)一般氨基酸通透酶基因(AGP1)的低表达和/或受控表达,(vii)低亲和力甲硫氨酸通透酶基因(MUP3;MUP1)的低表达和/或受控表达,(viii)可能的转运蛋白基因(AQR1)的过表达和/或受控表达和/或(ix)多胺转运蛋白1基因(TPO1)的过表达和/或受控表达。
在特定的实施方式中,编码一般氨基酸通透酶、支链氨基酸通透酶3、支链氨基酸通透酶2、一般氨基酸通透酶GAP1、高亲和力谷氨酰胺通透酶GNP1、一般氨基酸通透酶AGP1、低亲和力甲硫氨酸通透酶MUP3和高亲和力甲硫氨酸通透酶MUP1的至少一种核酸独立地为来自酵母、优选来自酿酒酵母的核酸。
根据本发明的重组酵母以比不含上述遗传修饰的亲本酵母高的产量产生依克多因。
根据本发明的重组酵母已经遗传工程化以促进利用NADH而非NADPH的酶的表达,诸如适当的谷氨酸脱氢酶或适当的天冬氨酸半醛脱氢酶。
在根据本发明的重组酵母的一些实施方式中,过表达的天冬氨酸半醛脱氢酶由置于强启动子和/或诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下的酿酒酵母内源基因组成。
在一些实施方式中,天冬氨酸半醛脱氢酶优选由酿酒酵母HOM2基因编码。
在一些实施方式中,天冬氨酸半醛脱氢酶最优选由酿酒酵母HOM2基因的变体编码,所述基因编码使用NAD和NADP两者的经突变的HOM2蛋白质,如本文示例中所示。此类基因变体例如在示例中说明并且被称为HOM2-2。其对应于如下文讨论所突变的酿酒酵母HOM2基因。
目标是天冬氨酸半醛脱氢酶变体中多个氨基酸残基的突变以放松HOM2对作为辅酶的NADP的高选择性并增强该酶对NAD的亲和力的性质是本领域技术人员已知的,并且可以例如见于Faehnle,C.R.等人,Journal of Molecular Biology 1055-1068(2005)。特别地,可以提及对应于用核苷酸GAG替换核苷酸序列的位置115至117中的核苷酸TCT的突变S39至E39。
根据本领域技术人员众所周知的氨基酸的命名法,S表示丝氨酸,并且E表示谷氨酸。
在一些实施方式中,天冬氨酸激酶最优选由酿酒酵母HOM3基因编码,如本文的示例中所示。
天冬氨酸激酶编码基因过表达和/或受控表达
在根据本发明的重组酵母的一些实施方式中,天冬氨酸激酶编码基因的过表达通过在酵母基因组的一个或多个选定位置处插入一个或多个拷贝的包含天冬氨酸激酶编码序列的表达盒来获得。本发明涵盖的天冬氨酸激酶和天冬氨酸激酶编码基因在本说明书的其他地方详述。
在这些实施方式的一些实施方式中,包含天冬氨酸激酶编码序列的所述一个或多个拷贝的表达盒包含允许天冬氨酸激酶强表达的调控序列,诸如在酵母细胞中有功能的强启动子。
除了根据本发明的重组酵母的这些实施方式之外或作为根据本发明的重组酵母的这些实施方式的替选方式,至少一种天冬氨酸激酶编码基因可以在在酵母细胞中有功能的诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在这些实施方式中,天冬氨酸激酶编码基因的受控表达可以通过在天然酵母天冬氨酸激酶开放阅读框的位置处插入替换酵母基因组中在该基因组位置处最初存在的内源启动子的诱导型调控序列、诸如诱导型启动子或阻遏型启动子来获得。
在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,获得了天冬氨酸激酶编码基因的过表达、天冬氨酸至天冬氨酰基磷酸(天冬氨酰基-P,也称为磷酸-天冬氨酰基)的受控转化水平,这应有助于根据本发明的重组酵母的高水平的存活力。当至少一种天冬氨酸激酶编码序列在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下时,也同样适用。
在一些优选的实施方式中,所述天冬氨酸激酶编码基因是来自酿酒酵母的HOM3基因,如本文示例所示。
在优选的实施方式中,将所述天冬氨酸激酶编码基因置于强启动子pCCW12或诱导型启动子或阻遏型启动子pCUP-1-1的控制下。
说明性地,可以将天冬氨酸激酶基因插入HOM6基因内和/或SAM3基因内,如本文示例所示。
天冬氨酸激酶编码基因过表达和/或受控表达
可替选地、或者作为如上文所讨论的天冬氨酸激酶的过表达和/或受控表达的补充,根据本发明的重组酵母还可以使得其包含天冬氨酸激酶编码基因的过表达和/或受控表达。
因此,在根据本发明的重组酵母的优选实施方式中,天冬氨酸激酶编码基因的过表达通过在酵母基因组的一个或多个选定位置处插入一个或多个拷贝的包含天冬氨酸激酶编码序列的表达盒来获得。本发明涵盖的天冬氨酸激酶和天冬氨酸激酶编码基因在本说明书中的其他地方详述。
在这些实施方式的一些实施方式中,所述一个或多个拷贝的包含天冬氨酸激酶编码序列的表达盒包含允许天冬氨酸激酶的强表达的调控序列,诸如在酵母细胞中有功能的强启动子。
除了根据本发明的重组酵母的这些实施方式之外或作为根据本发明的重组酵母的这些实施方式的替选方式,至少一种天冬氨酸激酶编码基因可以在在酵母细胞中有功能的诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,在天冬氨酸激酶编码基因的受控表达的情况下,获得天冬氨酸至天冬氨酰基磷酸(天冬氨酰基-P)的受控转化水平,这将有助于根据本发明的重组酵母的高水平的存活力。
在优选的实施方式中,所述天冬氨酸激酶编码基因是来自枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)的AK基因,如本文示例中所示。
在优选的实施方式中,将所述天冬氨酸激酶编码基因置于诱导型启动子或阻遏型启动子pACU7的控制下。
说明性地,可以将天冬氨酸激酶基因插入TRP1基因内,如本文示例中所示。
天冬氨酸半醛脱氢酶编码基因过表达和/或受控表达
在根据本发明的重组酵母的优选实施方式中,天冬氨酸半醛脱氢酶编码基因的过表达通过在酵母基因组的一个或多个选定位置处插入一个或多个拷贝的包含天冬氨酸半醛脱氢酶编码序列的表达盒来获得。本发明涵盖的天冬氨酸半醛脱氢酶和天冬氨酸半醛脱氢酶编码基因在本说明书中的其他地方详述。
在这些实施方式的一些实施方式中,所述一个或多个拷贝的包含天冬氨酸半醛脱氢酶编码序列的表达盒包含允许天冬氨酸半醛脱氢酶强表达的调控序列,诸如在酵母细胞中有功能的强启动子。
除了根据本发明的重组酵母的这些实施方式之外或作为根据本发明的重组酵母的这些实施方式的替选方式,至少一种天冬氨酸半醛脱氢酶编码基因可以在在酵母细胞中有功能的诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,天冬氨酸半醛脱氢酶的过表达可以增强中间代谢物天冬氨酰基磷酸(天冬氨酰基-P)转化为天冬氨酰基半醛。当至少一种天冬氨酸半醛脱氢酶编码序列在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下时,也同样适用。
在一些实施方式中,天冬氨酸半醛脱氢酶可以是使用NADH或NADPH两者催化天冬氨酰基磷酸(天冬氨酰基-P)转化为天冬氨酰基半醛的酶变体。
在一些优选的实施方式中,所述天冬氨酸半醛脱氢酶编码基因是来自酿酒酵母的HOM2基因,或可替选地,是利用NADH和NADPH两者的HOM2的变体,如本文示例中所示和之前所讨论。
在优选的实施方式中,将所述天冬氨酸半醛脱氢酶编码基因置于诱导型启动子或阻遏型启动子pACU5或强启动子pCCW12的控制下。
说明性地,可以将天冬氨酸半醛脱氢酶基因插入HIS3基因内和/或MUP3基因内,如本文示例中所示。
二氨基丁酸氨基转移酶编码基因过表达和/或受控表达
在根据本发明的重组酵母的优选实施方式中,二氨基丁酸氨基转移酶编码基因的过表达通过在酵母基因组的一个或多个选定位置处插入一个或多个拷贝的包含二氨基丁酸氨基转移酶编码序列的表达盒来获得。本发明涵盖的二氨基丁酸氨基转移酶和二氨基丁酸氨基转移酶编码基因在本说明书中的其他地方详述。
在这些实施方式的一些实施方式中,所述一个或多个拷贝的包含二氨基丁酸氨基转移酶编码序列的表达盒包含允许二氨基丁酸氨基转移酶强表达的调控序列,诸如在酵母细胞中有功能的强启动子。
除了根据本发明的重组酵母的这些实施方式之外或作为根据本发明的重组酵母的这些实施方式的替选方式,至少一种二氨基丁酸氨基转移酶编码基因可以在在酵母细胞中有功能的诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,二氨基丁酸氨基转移酶的过表达可以增强中间代谢物天冬氨酰基半醛转化为2,4-二氨基丁酸。当至少一种二氨基丁酸氨基转移酶编码序列在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下时,也同样适用。
在优选的实施方式中,所述二氨基丁酸氨基转移酶编码基因是来自铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa)的EctB基因或来自伸长盐单胞菌(Halomonas elongata)(有时也称为需盐色盐杆菌(Chromohalobacter salexigens))的EctB基因,如本文示例中所示。
在优选的实施方式中,将所述二氨基丁酸氨基转移酶编码基因置于强启动子pCCW12和/或强启动子pTDH3的控制下。
说明性地,可以将二氨基丁酸氨基转移酶基因插入HOM6基因内和/或SAM3基因内和/或MUP3基因内和/或URA3基因内,如本文示例中所示。
高丝氨酸-O-乙酰转移酶编码基因过表达和/或受控表达
在根据本发明的重组酵母的优选实施方式中,高丝氨酸-O-乙酰转移酶编码基因的过表达通过在酵母基因组的一个或多个选定位置处插入一个或多个拷贝的包含高丝氨酸-O-乙酰转移酶编码序列的表达盒来获得。本发明涵盖的高丝氨酸-O-乙酰转移酶和高丝氨酸-O-乙酰转移酶编码基因在本说明书中的其他地方详述。
在这些实施方式的一些实施方式中,所述一个或多个拷贝的包含高丝氨酸-O-乙酰转移酶编码序列的表达盒包含允许高丝氨酸-O-乙酰转移酶的强表达的调控序列,诸如在酵母细胞中有功能的强启动子。
除了根据本发明的重组酵母的这些实施方式之外或作为根据本发明的重组酵母的这些实施方式的替选方式,至少一种高丝氨酸-O-乙酰转移酶编码基因可以在在酵母细胞中有功能的诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,高丝氨酸-O-乙酰转移酶的过表达在乙酰-CoA存在下允许并因此提高中间代谢物2,4-二氨基丁酸至乙酰-2,4-二氨基丁酸的转化水平。当至少一种高丝氨酸-O-乙酰转移酶编码序列在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下时,也同样适用。
在优选的实施方式中,所述高丝氨酸-O-乙酰转移酶编码基因是来自酿酒酵母的MET2基因,如本文示例中所示。
在优选的实施方式中,所述高丝氨酸-O-乙酰转移酶编码基因是来自谷氨酸棒状杆菌(Corynebacterium glutamicum)的METX基因,如本文示例中所示。
在特别优选的实施方式中,根据本发明的重组酵母包含至少一种高丝氨酸-O-乙酰转移酶编码基因(其是来自酿酒酵母的MET2基因)和至少一种高丝氨酸-O-乙酰转移酶编码基因(其是来自谷氨酸棒状杆菌的METX基因)。
在优选的实施方式中,如果存在多个拷贝,则对于每个拷贝的所述高丝氨酸-O-乙酰转移酶编码基因,将所述基因独立地置于强启动子pPDC1或诱导型启动子或阻遏型启动子pACU6的控制下。
说明性地,可以将高丝氨酸-O-乙酰转移酶基因插入SAM3基因内和/或HIS3基因内,如本文示例中所示。
二氨基丁酸乙酰转移酶编码基因过表达和/或受控表达
在根据本发明的重组酵母的优选实施方式中,二氨基丁酸乙酰转移酶编码基因的过表达通过在酵母基因组的一个或多个选定位置处插入一个或多个拷贝的包含二氨基丁酸乙酰转移酶编码序列的表达盒来获得。本发明涵盖的二氨基丁酸乙酰转移酶和二氨基丁酸乙酰转移酶编码基因在本说明书中的其他地方详述。
在这些实施方式的一些实施方式中,所述一个或多个拷贝的包含二氨基丁酸乙酰转移酶编码序列的表达盒包含允许二氨基丁酸乙酰转移酶的强表达的调控序列,诸如在酵母细胞中有功能的强启动子。
除了根据本发明的重组酵母的这些实施方式之外或作为根据本发明的重组酵母的这些实施方式的替选方式,至少一种二氨基丁酸乙酰转移酶编码基因可以在在酵母细胞中有功能的诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,二氨基丁酸乙酰转移酶的过表达在乙酰-CoA存在下允许并因此提高中间代谢物2,4-二氨基丁酸至乙酰-2,4-二氨基丁酸的转化水平。当至少一种二氨基丁酸乙酰转移酶编码序列在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下时,也同样适用。
在优选的实施方式中,所述二氨基丁酸乙酰转移酶编码基因是来自伸长盐单胞菌(有时也称为需盐色盐杆菌)的EctA基因,如本文示例中所示。
在优选的实施方式中,将所述二氨基丁酸乙酰转移酶编码基因置于强启动子pPDC1的控制下。
说明性地,可以将二氨基丁酸乙酰转移酶基因插入LYP1基因内和/或MUP3基因内,如本文示例中所示。
在特定的实施方式中,根据本发明的重组酵母使得其基因组包含:
-过表达的和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下并优选在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下的编码高丝氨酸-O-乙酰转移酶METX的至少一种核酸;和
-过表达的和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下并优选在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下的编码二氨基丁酸乙酰转移酶EctA的至少一种核酸。
依克多因合酶编码基因过表达和/或受控表达
在根据本发明的重组酵母的优选实施方式中,依克多因合酶编码基因的过表达通过在酵母基因组的一个或多个选定位置处插入一个或多个拷贝的包含依克多因合酶编码序列的表达盒来获得。本发明涵盖的依克多因合酶和依克多因合酶编码基因在本说明书中的其他地方详述。
在这些实施方式的一些实施方式中,所述一个或多个拷贝的包含依克多因合酶编码序列的表达盒包含允许依克多因合酶的强表达的调控序列,诸如在酵母细胞中有功能的强启动子。
除了根据本发明的重组酵母的这些实施方式之外或作为根据本发明的重组酵母的这些实施方式的替选方式,至少一种依克多因合酶编码基因可以在在酵母细胞中有功能的诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,依克多因合酶的过表达允许并因此提高中间代谢物乙酰-2,4-二氨基丁酸至依克多因的转化水平。当至少一种依克多因合酶编码序列在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下时,也同样适用。
在优选的实施方式中,所述依克多因合酶编码基因是来自伸长盐单胞菌的EctC基因,如本文示例中所示。
在优选的实施方式中,将所述依克多因合酶编码基因置于强启动子pTDH3和/或强启动子pTEF1的控制下。
说明性地,可以将依克多因合酶基因插入LYP1基因内和/或MUP3基因内和/或URA3基因内,如本文示例中所示。
高丝氨酸脱氢酶的缺失或低表达
根据本发明的重组酵母还被定义为具有基因组,其中:
(i)编码高丝氨酸脱氢酶HOM6的至少一种内源核酸、优选所有内源核酸已经缺失和/或中断,和/或
(ii)编码高丝氨酸脱氢酶HOM6的至少一种核酸、优选所有核酸独立地:
-在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
-在弱启动子的控制下;和/或
-呈非稳定形式。
在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,高丝氨酸脱氢酶基因的低表达应通过减少产生的天冬氨酰基半醛的由于其转化为高丝氨酸而导致的消耗来增加重组酵母的2,4-二氨基丁酸产生。
在一些实施方式中,例如通过将该基因的表达置于阻遏型调控序列(诸如诱导型启动子或阻遏型启动子)的控制下,可以使高丝氨酸脱氢酶的低表达成为条件性的。
用于阻遏基因表达、用于中断靶基因或用于缺失靶基因的方法是本领域技术人员熟知的。
高丝氨酸脱氢酶低表达还涵盖了编码非稳定的高丝氨酸脱氢酶的核酸的插入。非稳定的高丝氨酸脱氢酶是比亲本高丝氨酸脱氢酶在酵母细胞内更快降解的高丝氨酸脱氢酶变体。
在优选的实施方式中,非稳定的高丝氨酸脱氢酶由降解决定子标记的高丝氨酸脱氢酶蛋白质组成。
例如,高丝氨酸脱氢酶基因可以由loxP中断,或例如由URA3.Kl-loxP中断,并因此缺失(还可以被称为失活)。
如提交的示例中所示,它可以可替选地被包含感兴趣的基因的盒中断。
天冬氨酸激酶(HOM3)
天冬氨酸激酶是本文描述用于催化L-天冬氨酸在ATP的存在下转化为4-磷酸-L-天冬氨酸的蛋白质。由酿酒酵母的基因组编码的天冬氨酸激酶可以被称为HOM3。
为测量天冬氨酸激酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Stadtman等人(1961,J BiolChem,第236(7)卷:2033-2038)所述的方法。
本说明书中优选的天冬氨酸激酶是EC编号为NO.EC 2.7.2.4的酶。
根据优选的实施方式,编码天冬氨酸激酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自包括原核生物体和真核生物体的组的生物体的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码天冬氨酸激酶的一种或多种核酸可以为源自古细菌的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码天冬氨酸激酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自枯草芽孢杆菌和酵母的生物体的一种或多种核酸。在一些其他优选的实施方式中,编码天冬氨酸激酶的一种或多种核酸可以是源自酵母、特别是源自酿酒酵母的一种或多种核酸。
根据又一个优选的实施方式,编码天冬氨酸激酶的一种或多种核酸可以是选自由以下组成的组的一种或多种核酸:与SEQ ID NO:1的核酸具有至少25%、有利地至少65%、优选至少80%的核酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。SEQ ID NO:1的核酸编码也可以被称为HOM3的源自酿酒酵母的天冬氨酸激酶。
关于该序列的相同性质的生物活性是编码催化L-天冬氨酸在ATP的存在下转化为4-磷酸-L-天冬氨酸的酶的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少25%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少26%、至少27%、至少28%、至少29%、至少30%、至少31%、至少32%、至少33%、至少34%、至少35%、至少36%、至少37%、至少38%、至少39%、至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少65%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少80%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
对于来自酿酒酵母的天冬氨酸激酶的氨基酸序列,本领域的技术人员可以参考UniProt数据库中的登录号NP010972或本文所述的SEQ ID NO.2。
根据另一个特定的实施方式,编码天冬氨酸激酶的一种或多种核酸可以是编码选自由以下组成的组的氨基酸序列的一种或多种核酸:与SEQ ID NO:2的氨基酸序列具有至少25%、有利地至少65%、优选至少80%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。说明性地,源自Aquamarina atlantica的天冬氨酸激酶与SEQ ID NO.2的天冬氨酸激酶具有25%的氨基酸同一性。
关于该序列的相同性质的生物活性如前所述,即催化L-天冬氨酸在ATP的存在下转化为4-磷酸-L-天冬氨酸的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少25%氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少26%、至少27%、至少28%、至少29%、至少30%、至少31%、至少32%、至少33%、至少34%、至少35%、至少36%、至少37%、至少38%、至少39%、至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少65%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考氨基酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少80%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考氨基酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性的氨基酸序列。
如上所述,本发明中天冬氨酸激酶的表达水平受诸如在下文中更详细地定义的至少一种启动子和至少一种终止子的调控,其分别存在于编码所述天冬氨酸激酶的核酸序列的5’和3’位置中。
如在本说明书中其他地方指定,天冬氨酸激酶在根据本发明的重组酵母中过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在一些实施方式中,天冬氨酸激酶的过表达可以由于所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制导致。
在一些其他的实施方式中,天冬氨酸激酶的过表达可以由于在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的天冬氨酸激酶编码序列导致。
在仍然另外的实施方式中,天冬氨酸激酶的过表达可以由于(i)所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制和(ii)在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的天冬氨酸激酶编码序列两者导致。
天冬氨酸激酶(AK)
天冬氨酸激酶是本领域中描述的用于催化L-天冬氨酸在ATP存在下转化为4-磷酸-L-天冬氨酸的蛋白质。由枯草芽孢杆菌基因组编码的天冬氨酸激酶可以被称为AK。
为测量天冬氨酸激酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识,并且与先前针对天冬氨酸激酶所指示的方法相同。
根据优选的实施方式,编码天冬氨酸激酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自包括原核生物体和真核生物体的组的生物体的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码天冬氨酸激酶的一种或多种核酸可以是源自古细菌的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码天冬氨酸激酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自枯草芽孢杆菌和酵母的生物体的一种或多种核酸。在一些其他优选的实施方式中,编码天冬氨酸激酶的一种或多种核酸可以是源自酵母、特别是源自酿酒酵母的一种或多种核酸。
对于核酸序列,其可以被称为在NCBI数据库中在登录号NC_000964.3中公开的核酸序列。
根据又一个优选的实施方式,编码天冬氨酸激酶的一种或多种核酸可以是选自由以下组成的组的一种或多种核酸:与SEQ ID NO.3的核酸具有至少25%、有利地至少65%、优选至少80%的核酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。SEQ ID NO.3的核酸编码还可以称为AK的源自枯草芽孢杆菌的天冬氨酸激酶。
关于该序列的相同性质的生物活性是编码催化在ATP的存在下L-天冬氨酸转化为4-磷酸-L-天冬氨酸的酶的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少25%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少26%、至少27%、至少28%、至少29%、至少30%、至少31%、至少32%、至少33%、至少34%、至少35%、至少36%、至少37%、至少38%、至少39%、至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少65%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少80%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
对于来自枯草芽孢杆菌的天冬氨酸激酶的氨基酸序列,本领域的技术人员可以参考UniProt数据库中的登录号NP_389558.2或本文所述的SEQ ID NO.4。
根据另一个特定的实施方式,编码天冬氨酸激酶的一种或多种核酸可以是编码选自由以下组成的组的氨基酸序列的一种或多种核酸:与SEQ ID NO.4的氨基酸序列具有至少25%、有利地至少65%、优选至少80%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。说明性地,源自Aquamarina atlantica的天冬氨酸激酶与SEQ ID NO.4的天冬氨酸激酶具有25%的氨基酸同一性。
关于该序列的相同性质的生物活性如前所述,即催化L-天冬氨酸在ATP的存在下转化为4-磷酸-L-天冬氨酸的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少25%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少26%、至少27%、至少28%、至少29%、至少30%、至少31%、至少32%、至少33%、至少34%、至少35%、至少36%、至少37%、至少38%、至少39%、至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少65%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考氨基酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少80%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考氨基酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如上所述,本发明中天冬氨酸激酶的表达水平受诸如在下文中更详细地定义的至少一种启动子和至少一种终止子的调控,其分别存在于编码所述天冬氨酸激酶的核酸序列的5’和3’位置中。
如在本说明书中其他地方指定,天冬氨酸激酶在根据本发明的重组酵母中过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在一些实施方式中,天冬氨酸激酶的过表达可以由于所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制导致。
在一些其他的实施方式中,天冬氨酸激酶的过表达可以由于在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的天冬氨酸激酶编码序列导致。
在仍然另外的实施方式中,天冬氨酸激酶的过表达可以由于(i)所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制和(ii)在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的天冬氨酸激酶编码序列两者导致。
天冬氨酸半醛脱氢酶(HOM2)
天冬氨酸半醛脱氢酶是本领域已知的通过L-天冬氨酰基-4-磷酸的还原脱磷酸化来催化NADPH-依赖性L-天冬氨酸半醛形成的蛋白质。由酿酒酵母的基因组编码的天冬氨酸半醛脱氢酶可以被称为HOM2。
为测量天冬氨酸半醛脱氢酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
本说明书中优选的天冬氨酸半醛脱氢酶是EC编号为1.2.1.11的酶。
根据优选的实施方式,编码天冬氨酸半醛脱氢酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自包括原核生物体和真核生物体的组的生物体的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码天冬氨酸半醛脱氢酶的一种或多种核酸可以是源自古细菌的一种或多种核酸。在一些优选的实施方式中,编码天冬氨酸半醛脱氢酶的一种或多种核酸可以是源自酵母、特别是源自酿酒酵母的一种或多种核酸。
根据其他优选的实施方式,编码天冬氨酸半醛脱氢酶的核酸可以是来自酿酒酵母的天冬氨酸半醛脱氢酶的变体或突变体,其中,所述变体酶或所述突变体酶使用NADH或NADPH两者用于催化反应。此类变体酶或突变体酶是本领域中已知的并且之前在本文中讨论。
根据又一个优选的实施方式,编码天冬氨酸半醛脱氢酶的一种或多种核酸可以是选自由以下组成的组的一种或多种核酸:与选自由SEQ ID NO:5和SEQ ID NO.6的参考核酸序列组成的组的核酸具有至少27%、有利地至少65%、优选至少80%的核酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。SEQ ID NO:5和SEQ ID NO.6的核酸编码源自酿酒酵母的天冬氨酸半醛脱氢酶,其还可以在本文中被统称为HOM2。
关于该序列的相同性质的生物活性是编码通过L-天冬氨酰基-4-磷酸的还原脱磷酸化来催化NADPH-依赖性L-天冬氨酸半醛形成的酶的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少27%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少28%、至少29%、至少30%、至少31%、至少32%、至少33%、至少34%、至少35%、至少36%、至少37%、至少38%、至少39%、至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少65%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少80%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
对于来自酿酒酵母的天冬氨酸半醛脱氢酶的氨基酸序列,本领域的技术人员可以参考UniProt数据库中的登录号NP010442或本文所述的SEQ ID NO.7。
根据另一个特定的实施方式,编码天冬氨酸半醛脱氢酶的一种或多种核酸可以是编码选自由以下组成的组的氨基酸序列的一种或多种核酸:与SEQ ID NO:7的氨基酸序列具有至少27%、有利地至少65%、优选至少80%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。说明性地,源自Lactobacillus wasatchensis的天冬氨酸半醛脱氢酶与SEQID NO.7的天冬氨酸半醛脱氢酶具有27%的氨基酸同一性。
关于该序列的相同性质的生物活性如前所述,即通过L-天冬氨酰基-4-磷酸的还原脱磷酸化来催化NADPH依赖性L-天冬氨酸半醛形成的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少27%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少28%、至少29%、至少30%、至少31%、至少32%、至少33%、至少34%、至少35%、至少36%、至少37%、至少38%、至少39%、至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少65%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考氨基酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少80%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考氨基酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如上所述,本发明中天冬氨酸半醛脱氢酶的表达水平受诸如在下文中更详细地定义的至少一种启动子和至少一种终止子的调控,其分别存在于编码所述天冬氨酸半醛脱氢酶的核酸序列的5’和3’位置中。
如在本说明书中其他地方指定,天冬氨酸半醛脱氢酶在根据本发明的重组酵母中过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在一些实施方式中,天冬氨酸半醛脱氢酶的过表达可以由于在所述重组酵母的基因组内强启动子对相应的基因的控制导致。
在一些其他的实施方式中,天冬氨酸半醛脱氢酶的过表达可以由于在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的天冬氨酸半醛脱氢酶编码序列导致。
在仍然另外的实施方式中,天冬氨酸半醛脱氢酶的过表达可以由于(i)所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制和(ii)在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的天冬氨酸半醛脱氢酶编码序列两者导致。
二氨基丁酸氨基转移酶(EctB)
二氨基丁酸氨基转移酶是在本领域中描述的用于催化天冬氨酰基半醛在谷氨酸的存在下转化为2,4-二氨基丁酸的蛋白质。由伸长盐单胞菌的基因组编码的二氨基丁酸氨基转移酶可以被称为EctB或EctB.He。
为测量二氨基丁酸氨基转移酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Ono H等人,1999,Journal ofBacteriology,第91-99页所述的方法。
本说明书中优选的二氨基丁酸氨基转移酶是EC编号为NO.2.6.1.76的酶。
根据优选的实施方式,编码二氨基丁酸氨基转移酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自包括原核生物体和真核生物体的组的生物体的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码二氨基丁酸氨基转移酶的一种或多种核酸可以是源自古细菌的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码二氨基丁酸氨基转移酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自细菌,特别选自铜绿假单胞菌、伸长盐单胞菌或Sporocarcina newyorkensisn,优选选自铜绿假单胞菌或伸长盐单胞菌的生物体的一种或多种核酸。
根据又一个优选的实施方式,编码二氨基丁酸氨基转移酶的一种或多种核酸可以是选自由以下组成的组的一种或多种核酸:与SEQ ID NO.8或SEQ ID NO.9的核酸具有至少35%、有利地至少65%、优选至少80%的核酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。
关于该序列的相同性质的生物活性是编码催化天冬氨酰基半醛在谷氨酸的存在下转化为2,4-二氨基丁酸的酶的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少35%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少36%、至少37%、至少38%、至少39%、至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少65%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少80%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
对于来自伸长盐单胞菌的二氨基丁酸氨基转移酶的氨基酸序列,本领域的技术人员可以参考UniProt数据库中的登录号WP_013332345.1或本文所述的SEQ ID NO.10或SEQID NO.11。
根据另一个特定的实施方式,编码二氨基丁酸氨基转移酶的一种或多种核酸可以是编码选自由以下组成的组的氨基酸序列的一种或多种核酸:与SEQ ID NO.10或SEQ IDNO.11的氨基酸序列具有至少35%、有利地至少65%、优选至少80%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。
关于该序列的相同性质的生物活性如前所述,即催化天冬氨酰基半醛在谷氨酸的存在下转化为2,4-二氨基丁酸的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少35%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少36%、至少37%、至少38%、至少39%、至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少65%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考氨基酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少80%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考氨基酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如上所述,本发明中二氨基丁酸氨基转移酶的表达水平受诸如在下文中更详细地定义的至少一种启动子和至少一种终止子的调控,其分别存在于编码所述二氨基丁酸氨基转移酶的核酸序列的5’和3’位置中。
如在本说明书中其他地方指定,二氨基丁酸氨基转移酶在根据本发明的重组酵母中过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在一些实施方式中,二氨基丁酸氨基转移酶的过表达可以由于所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制导致。
在一些其他的实施方式中,二氨基丁酸氨基转移酶的过表达可以由于在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的二氨基丁酸氨基转移酶编码序列。
在仍然另外的实施方式中,二氨基丁酸氨基转移酶的过表达可以由于(i)所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制和(ii)在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的二氨基丁酸氨基转移酶编码序列两者导致。
高丝氨酸O-乙酰转移酶(MET2;METX)
高丝氨酸O-乙酰转移酶是本领域描述的用于催化乙酰-CoA和2,4-二氨基丁酸之间反应为CoA和乙酰-2,4-二氨基丁酸的蛋白质。由酿酒酵母的基因组编码的高丝氨酸O-乙酰转移酶可以被称为MET2。
为测量高丝氨酸O-乙酰转移酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Shuzo Yamagata(1987,TheJournal of Bacteriology,第169(8)卷:3458-3463)所述的方法。
本说明书中优选的高丝氨酸O-乙酰转移酶是EC编号为NO.EC 2.3.1.31的酶。
根据优选的实施方式,编码高丝氨酸O-乙酰转移酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自包括原核生物体和真核生物体的组的生物体的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码高丝氨酸O-乙酰转移酶的一种或多种核酸核酸可以是源自古细菌的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码高丝氨酸O-乙酰转移酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自谷氨酸棒状杆菌和酵母的生物体的一种或多种核酸。在一些其他优选的实施方式中,编码高丝氨酸O-乙酰转移酶的一种或多种核酸可以是源自酵母、特别是源自酿酒酵母的一种或多种核酸。
根据特定的实施方式,编码高丝氨酸-O-乙酰转移酶METX的核酸是来自细菌、特别是来自独立地选自由以下组成的组的细菌的核酸:谷氨酸棒状杆菌、大肠杆菌、流感嗜血杆菌(Haemophilius influenza)、淡紫灰链霉菌(Streptomyces lavendulae)、肾脏钩端螺旋体(Leptospira interrogans)、肺炎链球菌(Streptococcus pneumonia)和结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis)。
根据又一个优选的实施方式,编码高丝氨酸O-乙酰转移酶的一种或多种核酸可以是选自由以下组成的组的一种或多种核酸:与SEQ ID NO:12的核酸具有至少27%、有利地至少65%、优选至少80%的核酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。SEQ ID NO:12的核酸编码源自酿酒酵母的高丝氨酸O-乙酰转移酶,其还可以被称为MET2。源自谷氨酸棒状杆菌的高丝氨酸O-乙酰转移酶通常被称为METX。
关于该序列的相同性质的生物活性是编码催化乙酰-CoA和2,4-二氨基丁酸之间反应为CoA和乙酰-2,4-二氨基丁酸的酶的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少27%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少28%、至少29%、至少30%、至少31%、至少32%、至少33%、至少34%、至少35%、至少36%、至少37%、至少38%、至少39%、至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少65%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少80%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
对于来自酿酒酵母的高丝氨酸O-乙酰转移酶的氨基酸序列,本领域的技术人员可以参考UniProt数据库中的登录号NP014122或本文所述的SEQ ID NO.13。
根据另一个特定的实施方式,编码高丝氨酸O-乙酰转移酶的一种或多种核酸可以为编码选自由以下组成的组的氨基酸序列的一种或多种核酸:与SEQ ID NO:13的氨基酸序列具有至少27%、有利地至少65%、优选至少80%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。说明性地,源自Aquamarina atlantica的高丝氨酸O-乙酰转移酶与SEQ IDNO.13的高丝氨酸O-乙酰转移酶具有27%的氨基酸同一性。
关于该序列的相同性质的生物活性如前所述,即催化乙酰-CoA和2,4-二氨基丁酸之间反应为CoA和乙酰-2,4-二氨基丁酸的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少27%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少28%、至少29%、至少30%、至少31%、至少32%、至少33%、至少34%、至少35%、至少36%、至少37%、至少38%、至少39%、至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少65%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考氨基酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少80%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考氨基酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如上所述,本发明中高丝氨酸O-乙酰转移酶的表达水平受诸如在下文中更详细地定义的至少一种启动子和至少一种终止子的调控,其分别存在于编码所述高丝氨酸O-乙酰转移酶的核酸序列的5’和3’位置中。
如在本说明书中其他地方指定,在本发明的一些实施方式中,高丝氨酸O-乙酰转移酶在根据本发明的重组酵母中过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在一些实施方式中,高丝氨酸O-乙酰转移酶的过表达可以由于所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制导致。
在一些其他的实施方式中,高丝氨酸O-乙酰转移酶的过表达可以由于在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的高丝氨酸O-乙酰转移酶编码序列导致。
在仍然另外的实施方式中,高丝氨酸O-乙酰转移酶的过表达可以由于(i)所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制和(ii)在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的高丝氨酸O-乙酰转移酶编码序列两者导致。
二氨基丁酸乙酰转移酶(EctA)
二氨基丁酸乙酰转移酶是本领域中描述的用于催化2,4-二氨基丁酸在乙酰-CoA的存在下转化为乙酰-2,4-二氨基丁酸的蛋白质。由伸长盐单胞菌的基因组编码的二氨基丁酸乙酰转移酶可以被称为EctA或EctA.He。
为测量二氨基丁酸乙酰转移酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Ono H等人,1999,Journal ofBacteriology,第91-99页所述的方法。
本说明书中优选的二氨基丁酸乙酰转移酶是EC编号为NO.2.3.1.178的酶。
根据优选的实施方式,编码二氨基丁酸乙酰转移酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自包括原核生物体和真核生物体的组的生物体的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码二氨基丁酸乙酰转移酶的一种或多种核酸可以是源自古细菌的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码二氨基丁酸乙酰转移酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自细菌、特别选自需盐色盐杆菌、铜绿假单胞菌、索氏菌(Thaurea)sp.28或伸长盐单胞菌的生物体的一种或多种核酸。
根据又一个优选的实施方式,编码二氨基丁酸乙酰转移酶的一种或多种核酸可以是选自由以下组成的组的一种或多种核酸:与SEQ ID NO.14的核酸具有至少30%、有利地至少65%、优选至少80%的核酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。
关于该序列的相同性质的生物活性是编码催化2,4-二氨基丁酸在乙酰-CoA的存在下转化为乙酰-2,4-二氨基丁酸的酶的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少30%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少31%、至少32%、至少33%、至少34%、至少35%、至少36%、至少37%、至少38%、至少39%、至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少65%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少80%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
对于来自伸长盐单胞菌的二氨基丁酸乙酰转移酶的氨基酸序列,本领域的技术人员可以参考UniProt数据库中的登录号WP_035409657.1或本文所述的SEQ ID NO.15。
根据另一个特定的实施方式,编码二氨基丁酸乙酰转移酶的一种或多种核酸可以为编码选自由以下组成的组的氨基酸序列的一种或多种核酸:与SEQ ID NO.15的氨基酸序列具有至少30%、有利地至少65%、优选至少80%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。
关于该序列的相同性质的生物活性如前所述,即催化2,4-二氨基丁酸在乙酰-CoA的存在下转化为乙酰-2,4-二氨基丁酸的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少30%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少31%、至少32%、至少33%、至少34%、至少35%、至少36%、至少37%、至少38%、至少39%、至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少65%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考氨基酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少80%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考氨基酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如上所述,本发明中二氨基丁酸乙酰转移酶的表达水平受诸如在下文中更详细地定义的至少一种启动子和至少一种终止子的调控,其分别存在于编码所述二氨基丁酸乙酰转移酶的核酸序列的5’和3’位置中。
如在本说明书中其他地方指定,二氨基丁酸乙酰转移酶在根据本发明的重组酵母中过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在一些实施方式中,二氨基丁酸乙酰转移酶的过表达可以由于所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制导致。
在一些其他的实施方式中,二氨基丁酸乙酰转移酶的过表达可以由于在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的二氨基丁酸乙酰转移酶编码序列导致。
在仍然另外的实施方式中,二氨基丁酸乙酰转移酶的过表达可以由于(i)所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制和(ii)在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的二氨基丁酸乙酰转移酶编码序列两者导致。
依克多因合酶(EctC)
依克多因合酶是在本领域中描述的用于催化乙酰-2,4-二氨基丁酸转化为依克多因的蛋白质。由伸长盐单胞菌的基因组编码的依克多因合酶可以被称为EctC或EctC.He。
为测量依克多因合酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Ono H等人,1999,Journal ofBacteriology,第91-99页所述的方法。
本说明书中优选的依克多因合酶是EC编号为NO.4.2.1.108的酶。
根据优选的实施方式,编码依克多因合酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自包括原核生物体和真核生物体的组的生物体的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码依克多因合酶的一种或多种核酸可以是源自古细菌的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码依克多因合酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自细菌,特别选自铜绿假单胞菌、伸长盐单胞菌或藤黄微球菌(Micrococcus luteus)的生物体的一种或多种核酸。
根据又一个优选的实施方式,编码依克多因合酶的一种或多种核酸可以是选自由以下组成的组的一种或多种核酸:与SEQ ID NO.16的核酸具有至少35%、有利地至少65%、优选至少80%的核酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。
关于该序列的相同性质的生物活性是编码催化乙酰-2,4-二氨基丁酸转化为依克多因的酶的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少35%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少36%、至少37%、至少38%、至少39%、至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少65%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少80%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
对于来自伸长盐单胞菌的依克多因合酶的氨基酸序列,本领域的技术人员可以参考UniProt数据库中的登录号WP_013332346或本文所述的SEQ ID NO.17。
根据另一个特定的实施方式,编码依克多因合酶的一种或多种核酸可以是编码选自由以下组成的组的氨基酸序列的一种或多种核酸:与SEQ ID NO.17的氨基酸序列具有至少35%、有利地至少65%、优选至少80%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。
关于该序列的相同性质的生物活性如前所述,即催化乙酰-2,4-二氨基丁酸转化为依克多因的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少35%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考核酸序列具有至少36%、至少37%、至少38%、至少39%、至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少65%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考氨基酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少80%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与所述参考氨基酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如上所述,本发明中依克多因合酶的表达水平受诸如在下文中更详细地定义的至少一种启动子和至少一种终止子的调控,其分别存在于编码所述依克多因合酶的核酸序列的5’和3’位置中。
如在本说明书中其他地方指定,依克多因合酶在根据本发明的重组酵母中过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在一些实施方式中,依克多因合酶的过表达可以由于所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制导致。
在一些其他的实施方式中,依克多因合酶的过表达可以由于在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的依克多因合酶编码序列导致。
在仍然另外的实施方式中,依克多因合酶的过表达可以由于(i)所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制和(ii)在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的依克多因合酶编码序列两者导致。
高丝氨酸脱氢酶(HOM6)
高丝氨酸脱氢酶是在本领域中描述的用于催化L-高丝氨酸在NAD或NADP的存在下转化为L-天冬氨酸4-半醛的蛋白质。由酿酒酵母的基因组编码的高丝氨酸脱氢酶可以被称为HOM6。
为测量高丝氨酸脱氢酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Calnyanto等人(2006,Microbiology,第152卷:105-112)所述的方法。
本说明书中优选的高丝氨酸脱氢酶是EC编号为NO.1.1.1.3的酶。
根据优选的实施方式,编码高丝氨酸脱氢酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自包括原核生物体和真核生物体的组的生物体的一种或多种核酸。在一些优选的实施方式中,编码高丝氨酸脱氢酶的一种或多种核酸可以是源自酵母、特别是源自酿酒酵母的一种或多种核酸。
根据特定的实施方式,编码高丝氨酸脱氢酶的一种或多种核酸可以是SEQ ID NO:18的核酸。SEQ ID NO:18的核酸编码源自酵母菌(Saccharomyces)的高丝氨酸脱氢酶,其还可以被称为HOM6。
对于来自酿酒酵母的高丝氨酸脱氢酶的氨基酸序列,本领域的技术人员可以参考UniProt数据库中的登录号AJR75529或NP012673或本文所述的SEQ ID NO.19。
如上所述,本发明中高丝氨酸脱氢酶的表达水平受诸如在下文中更详细地定义的至少一种启动子和至少一种终止子的调控,其分别存在于编码所述高丝氨酸脱氢酶的核酸序列的5’和3’位置中。
如在本说明书中其他地方指定,在本发明的一些实施方式中,高丝氨酸脱氢酶在根据本发明的重组酵母中(a)完全缺失或部分缺失或中断,或(b)在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;在弱启动子的控制下;和/或呈非稳定形式。
产依克多因重组酵母的具体实施方式
天冬氨酸转氨酶过表达和/或受控表达
在根据本发明的重组酵母的优选实施方式中,编码天冬氨酸转氨酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
天冬氨酸转氨酶(也被称为天冬氨酸氨基转移酶)是本领域所述的用于催化L-天冬氨酸和2-氧化戊二酸反应以产生草酰乙酸和L-谷氨酸的蛋白质。由酿酒酵母的基因组编码的天冬氨酸转氨酶可以被称为AAT2。
根据这些实施方式,天冬氨酸转氨酶编码基因的过表达通过在酵母基因组的一个或多个选定位置处插入一个或多个拷贝的包含天冬氨酸转氨酶编码序列的表达盒来获得。本发明涵盖的天冬氨酸转氨酶和天冬氨酸转氨酶编码基因在本说明书中的其他地方详述。
在这些实施方式的一些实施方式中,所述一个或多个拷贝的包含天冬氨酸转氨酶编码序列的表达盒包含允许天冬氨酸转氨酶的强表达的调控序列,诸如在酵母细胞中有功能的强启动子。
除了根据本发明的重组酵母的这些实施方式之外或作为根据本发明的重组酵母的这些实施方式的替代方式,至少一种天冬氨酸转氨酶编码基因可以在在酵母细胞中有功能的诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,天冬氨酸转氨酶的过表达可以诱导草酰乙酸至天冬氨酸的高水平转化。当至少一种天冬氨酸转氨酶编码序列在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下时,也同样适用。
为测量天冬氨酸转氨酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考Yagi等人(1982,Biochem,第92卷:35-43)中所述的方法。
在一些实施方式中,所述天冬氨酸转氨酶编码基因是来自酿酒酵母的AAT2基因,如本文示例中所示。
在优选的实施方式中,天冬氨酸氨基转移酶由拟南芥(A.Thaliana)AAT2基因编码。
在优选的实施方式中,将所述天冬氨酸转氨酶编码基因置于诱导型启动子或阻遏型启动子pACU1或强启动子pADH1或强启动子pPGK1的控制下。
说明性地,可以将AAT2基因插入CAN1基因内和/或GNP1基因内和/或MUP3基因内,如在本文示例中所示。
本说明书中的优选天冬氨酸转氨酶由EC编号2.6.1.1已知。
编码天冬氨酸转氨酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自包括原核生物体和真核生物体的组的生物体的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码天冬氨酸转氨酶的一种或多种核酸可以是源自古细菌的一种或多种核酸。在一些优选的实施方式中,编码天冬氨酸转氨酶的一种或多种核酸可以是源自酵母生物体、最优选酿酒酵母的一种或多种核酸。
根据又一个优选的实施方式,编码天冬氨酸转氨酶或AAT2的一种或多种核酸可以是选自由以下组成的组的一种或多种核酸:与SEQ ID NO:20的核酸序列具有至少39%、有利地至少65%和优选至少80%的核酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。
关于该序列的相同性质的生物活性是编码催化L-天冬氨酸和2-氧化戊二酸反应以产生草酰乙酸和L-谷氨酸的酶的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少39%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与SEQ ID NO:20的核酸序列具有至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少65%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与SEQ ID NO:20的核酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少80%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与SEQ ID NO:20的核酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
对于来自酿酒酵母的天冬氨酸转氨酶AAT2的氨基酸序列,本领域的技术人员可以参考UniProt数据库中的登录号NP013127或本文所述的SEQ ID NO.21。说明性地,源自大肠杆菌的天冬氨酸转氨酶与SEQ ID NO.21的天冬氨酸转氨酶AAT2具有39%的氨基酸同一性。
根据另一个特定的实施方式,编码天冬氨酸转氨酶的一种或多种核酸可以为编码选自由以下组成的组的氨基酸序列的一种或多种核酸:与SEQ ID NO:21的氨基酸序列具有至少39%、有利地至少65%、优选至少80%的同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。
关于该序列的相同性质的生物活性如前所述,即催化L-天冬氨酸和2-氧化戊二酸反应以产生草酰乙酸和L-谷氨酸的能力。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少39%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与SEQ ID NO:21的氨基酸序列具有至少40%、至少41%、至少42%、至少43%、至少44%、至少45%、至少46%、至少47%、至少48%、至少49%、至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少65%氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与SEQ ID NO:21的氨基酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少80%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与SEQ ID NO:21的氨基酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如上所述,本发明中天冬氨酸转氨酶的表达水平受诸如在下文中更详细地定义的至少一种启动子和至少一种终止子的调控,其分别存在于编码所述天冬氨酸转氨酶的核酸序列的5’和3’位置中。
如在本说明书中其他地方指定,天冬氨酸转氨酶在根据本发明的重组酵母中过表达。
在一些实施方式中,天冬氨酸转氨酶的过表达可以由于所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制导致。
在一些其他的实施方式中,天冬氨酸转氨酶的过表达可以由于在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的天冬氨酸转氨酶编码序列导致。
在仍然另外的实施方式中,天冬氨酸转氨酶的过表达可以由于(i)所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制和(ii)在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的天冬氨酸转氨酶编码序列两者导致。
谷氨酸脱氢酶过表达和/或受控表达
在根据本发明的重组酵母的优选实施方式中,编码将氧化戊二酸转化为谷氨酸编码基因的谷氨酸脱氢酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
因此,在具体的实施方式中,本发明的重组酵母的基因组使得编码将氧化戊二酸转化为谷氨酸的谷氨酸脱氢酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
谷氨酸脱氢酶(也被称为NAD特异性谷氨酸脱氢酶)是本领域中描述的用于催化2-氧化戊二酸转化以产生L-谷氨酸的蛋白质。因此,谷氨酸脱氢酶是特异性地参与将2-氧化戊二酸在NADH的存在下转化为L-谷氨酸的化学反应的酶。
根据这些实施方式,谷氨酸脱氢酶编码基因的过表达通过在酵母基因组的一个或多个选定位置处插入一个或多个拷贝的包含谷氨酸脱氢酶编码序列的表达盒来获得。本发明涵盖的谷氨酸脱氢酶和谷氨酸脱氢酶编码基因在本说明书中的其他地方详述。
在这些实施方式的一些实施方式中,所述一个或多个拷贝的包含谷氨酸脱氢酶编码序列的表达盒包含允许谷氨酸脱氢酶强表达的调控序列,诸如在酵母细胞中有功能的强启动子。
除了根据本发明的重组酵母的这些实施方式之外或作为根据本发明的重组酵母的这些实施方式的替代方式,至少一种谷氨酸脱氢酶编码基因可以在在酵母细胞中有功能的诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,谷氨酸脱氢酶的过表达通过将氧化戊二酸转化为谷氨酸同时生成了NAD。当至少一种谷氨酸脱氢酶编码序列在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下时,也同样适用。
为测量谷氨酸脱氢酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考在Noor和Punekar(2005,Microbiology,第151卷:1409-1419)中所述的方法。
在优选的实施方式中,所述谷氨酸脱氢酶编码基因编码使用NADH替代NADPH的谷氨酸脱氢酶,更特别地是来自有尾内毛虫(Entodinium caudatum)(表示为GDH.Eca或GDH2.Eca)或酿酒酵母(表示为GDH2)的GDH基因,如本文示例中所示。在特定的实施方式中,所述谷氨酸脱氢酶编码基因编码来自有尾内毛虫的谷氨酸脱氢酶。
本说明书中优选的谷氨酸脱氢酶可以特别是EC编号为NO.EC 1.4.1.2的酶。
在优选的实施方式中,将所述谷氨酸脱氢酶编码基因置于强启动子pTDH3或诱导型启动子或阻遏型启动子pCUP1-1的控制下。
说明性地,可以将谷氨酸脱氢酶基因插入HIS3基因内和/或MUP3基因内,如在本文的示例中所示。
根据优选的实施方式,编码谷氨酸脱氢酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自包括原核生物体和真核生物体的组的生物体的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码谷氨酸脱氢酶的一种或多种核酸可以是源自古细菌的一种或多种核酸。在一些实施方式中,编码谷氨酸脱氢酶的一种或多种核酸可以是源自优选选自有尾内毛虫、枯草芽孢杆菌、共生梭菌(Clostridium symbiosium)的生物体的一种或多种核酸。
根据又一个优选的实施方式,编码谷氨酸脱氢酶的一种或多种核酸可以是选自由以下组成的组的一种或多种核酸:与SEQ ID NO:22的核酸序列具有至少49%、有利地至少65%、优选至少80%的核酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。SEQ ID NO.22的核酸编码源自有尾内毛虫的谷氨酸脱氢酶,所述核酸序列经密码子优化以在酵母、特别是在酿酒酵母中表达。
关于该序列的相同性质的生物活性是编码催化2-氧化戊二酸转化以产生L-谷氨酸的酶的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少49%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与SEQ ID NO:22的核酸序列具有至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少65%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与SEQ ID NO:22的核酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少80%的核苷酸同一性的核酸序列涵盖了与SEQ ID NO:22的核酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的核苷酸同一性并且还有相同性质的生物活性的核酸序列。
对于来自有尾内毛虫的谷氨酸脱氢酶的氨基酸序列,本领域的技术人员可以参考UniProt数据库中的登录号AAF15393或本文所述的SEQ ID NO.23。说明性地,源自肠贾第虫(Giardia intestinalis)的谷氨酸脱氢酶与SEQ ID NO.23的谷氨酸脱氢酶具有49%的氨基酸同一性。
根据另一个特定的实施方式,编码谷氨酸脱氢酶的一种或多种核酸可以是编码选自由以下组成的组的氨基酸序列的一种或多种核酸:与SEQ ID NO:23的氨基酸序列具有至少49%、有利地至少65%、优选至少80%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的序列。
关于该序列的相同性质的生物活性如前所述,即催化2-氧化戊二酸转化以产生L-谷氨酸的能力。
如本文所述,与参考核酸序列具有至少49%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与SEQ ID NO:23的氨基酸序列具有至少50%、至少51%、至少52%、至少53%、至少54%、至少55%、至少56%、至少57%、至少58%、至少59%、至少60%、至少61%、至少62%、至少63%、至少64%、至少65%、至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少65%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与SEQ ID NO:23的氨基酸序列具有至少66%、至少67%、至少68%、至少69%、至少70%、至少71%、至少72%、至少73%、至少74%、至少75%、至少76%、至少77%、至少78%、至少79%、至少80%、至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如本文所述,与参考氨基酸序列具有至少80%的氨基酸同一性的氨基酸序列涵盖了与SEQ ID NO:23的氨基酸序列具有至少81%、至少82%、至少83%、至少84%、至少85%、至少86%、至少87%、至少88%、至少89%、至少90%、至少91%、至少92%、至少93%、至少94%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%和至少99%的氨基酸同一性并且还有相同性质的生物活性的氨基酸序列。
如上所述,本发明中谷氨酸脱氢酶的表达水平受诸如在下文中更详细地定义的至少一种启动子和至少一种终止子的调控,其分别存在于编码所述谷氨酸脱氢酶的核酸序列的5’和3’位置中。
如在本说明书中其他地方指定,谷氨酸脱氢酶在根据本发明的重组酵母中过表达。
在一些实施方式中,谷氨酸脱氢酶的过表达可以由于在所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制导致。
在一些其他的实施方式中,谷氨酸脱氢酶的过表达可以由于在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的谷氨酸脱氢酶编码序列导致。
在仍然另外的实施方式中,谷氨酸脱氢酶的过表达可以由于(i)在所述重组酵母内强启动子对相应的基因的控制和(ii)在所述重组酵母的基因组内存在多个拷贝的谷氨酸脱氢酶编码序列两者导致。
感兴趣的化合物的输出
在根据本发明的重组酵母的另外实施方式中,通过(i)编码酵母通透酶的基因的低表达,通过(ii)编码氨基酸输出蛋白的基因的低表达,或通过(iii)编码酵母通透酶的基因的低表达和编码氨基酸输出蛋白的基因的低表达两者,可以增强所产生的依克多因输出酵母细胞外部。
一种或多种通透酶编码基因的低表达
如在下文中所述,可以在根据本发明的重组酵母中低表达的通透酶编码基因涵盖了AGP1、AGP3、BAP3、BAP2、GAP1、GNP1、MUP3和MUP1。
AGP1是来自酿酒酵母的一般氨基酸通透酶1。对于AGP1的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_009905。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001178671。
AGP3是来自酿酒酵母的一般氨基酸通透酶3。对于AGP3的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_116600。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001179912。
BAP3是来自酿酒酵母的缬氨酸氨基酸通透酶。对于BAP3的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_010331。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001180354。
BAP2是来自酿酒酵母的Leu/Val/Ile氨基酸通透酶。对于BAP2的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_009624。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001178416。
GAP1是来自酿酒酵母的一般氨基酸通透酶。对于GAP1的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_012965.3。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001179829。
GNP1是来自酿酒酵母的高亲和力谷氨酰胺通透酶。对于GNP1的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_010796。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001180816。
MUP3是来自酿酒酵母的低亲和力甲硫氨酸通透酶。对于MUP3的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_011827。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001179116。
MUP1是来自酿酒酵母的低亲和力甲硫氨酸通透酶。对于MUP的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_011569。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001181184。
在根据本发明的重组酵母的一些实施方式中,所述重组酵母还被定义为具有编码涵盖AGP1通透酶、AGP3通透酶、BAP3通透酶、BAP2通透酶、GAP1通透酶、GNP1通透酶、MUP3通透酶和MUP1通透酶的通透酶的一种或多种基因的低表达。
因此,在特定的实施方式中,本发明的重组酵母的基因组使得可以进行以下修饰中的至少一者:
(A)编码一般氨基酸通透酶AGP3的至少一种内源核酸、优选所有内源核酸已从所述酵母的基因组中缺失,以及任选地:
(i)编码一般氨基酸通透酶AGP3的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的一般氨基酸通透酶AGP3的至少一种核酸已经插入;
(B)编码支链氨基酸通透酶3的至少一种内源核酸、优选所有内源核酸已从所述酵母的基因组中缺失,以及任选地:
(i)编码支链氨基酸通透酶3的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的支链氨基酸通透酶3的至少一种核酸已经插入;
(C)编码支链氨基酸通透酶2的至少一种内源核酸、优选所有内源核酸已从所述酵母的基因组中缺失,以及任选地:
(i)编码支链氨基酸通透酶2的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的支链氨基酸通透酶2的至少一种核酸已经插入;
(D)编码一般氨基酸通透酶GAP1的至少一种内源核酸、优选所有内源核酸已从所述酵母的基因组中缺失,以及任选地:
(i)编码一般氨基酸通透酶GAP1的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的一般氨基酸通透酶GAP1的至少一种核酸已经插入;
(E)编码高亲和力谷氨酰胺通透酶GNP1的至少一种内源核酸、优选所有内源核酸已从所述酵母的基因组中缺失,以及任选地:
(i)编码高亲和力谷氨酰胺通透酶GNP1的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的高亲和力谷氨酰胺通透酶GNP1的至少一种核酸已经插入;
(F)编码一般氨基酸通透酶AGP1的至少一种内源核酸、优选所有内源核酸已从所述酵母的基因组中缺失,以及任选地:
(i)编码一般氨基酸通透酶AGP1的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的一般氨基酸通透酶AGP1的至少一种核酸已经插入;
(G)编码低亲和力甲硫氨酸通透酶MUP3的至少一种内源核酸、优选所有内源核酸已从所述酵母的基因组中缺失,以及任选地:
(i)编码低亲和力甲硫氨酸通透酶MUP3的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的低亲和力甲硫氨酸通透酶MUP3的至少一种核酸已经插入;
(H)编码高亲和力甲硫氨酸通透酶MUP1的至少一种内源核酸、优选所有内源核酸已从所述酵母的基因组中缺失,以及任选地:
(i)编码高亲和力甲硫氨酸通透酶MUP1的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的高亲和力甲硫氨酸通透酶MUP1的至少一种核酸已经插入;
(I)编码可能的转运蛋白AQR1的至少一种核酸过表达;和/或
(J)编码多胺转运蛋白1的至少一种核酸过表达。
在特定的实施方式中,可以进行这些修饰中的至少两者、特别是至少三者。
在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,通透酶基因中的任一者的低表达应增加所产生的依克多因在酵母细胞外部(例如在培养基中)的分泌。
关于通透酶,这些基因中的一种或多种的低表达涵盖了它们的表达的完全阻遏,例如通过所述一种或多种通透酶基因的中断或缺失。
在一些实施方式中,例如通过将通透酶编码基因的表达置于阻遏型调控序列(诸如诱导型启动子或阻遏型启动子)的控制下,可以使该基因的低表达是有条件的。
用于阻遏基因表达、用于中断靶基因或用于缺失靶基因的方法是本领域技术人员熟知的。
关于通透酶基因,低表达还涵盖了插入编码非稳定的通透酶蛋白质的核酸或插入编码非稳定的通透酶蛋白质的核酸或两者。
非稳定的通透酶是在酵母细胞内比亲本通透酶更快降解的通透酶的变体。
在优选的实施方式中,非稳定的通透酶由降解决定子标记的通透酶蛋白质组成。
如示例中说明,AGP3基因、BAP3基因、GAP1基因、GNP1基因和MUP3基因可以被loxP中断并因此缺失。
一种或多种氨基酸输出蛋白编码基因的过表达
如下所述,可以在根据本发明的重组酵母中过表达的输出蛋白编码基因涵盖了AQR1和TPO1。
AQR1是来自酿酒酵母的转运蛋白。对于AQR1的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_014334。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001182903。
TPO1是来自酿酒酵母的多胺转运蛋白。对于TPO1的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_013072。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001181848。
在根据本发明的重组酵母的优选实施方式中,转运蛋白编码基因的过表达通过在酵母基因组的一个或多个选定位置处插入一个或多个另外拷贝的包含所述转运蛋白编码序列的表达盒来获得。
在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,转运蛋白编码基因的过表达应增加所产生的依克多因在酵母细胞外(例如在培养基中)的分泌。
在一些实施方式中,转运蛋白编码基因的过表达通过在酵母基因组的一个或多个选定位置处插入一个或多个另外拷贝的包含转运蛋白基因编码序列的表达盒来获得。在这些实施方式的一些实施方式中,所述一个或多个拷贝的包含转运蛋白编码序列的表达盒包含允许所述转运蛋白的强表达的调控序列,诸如在酵母细胞中有功能的强启动子。
在一些其他的实施方式中,将一个拷贝的转运蛋白编码基因插入酵母基因组的选定位置处。在这些其他实施方式中,所述一个或多个拷贝的包含转运蛋白编码序列的表达盒包含允许所述转运蛋白的强表达的调控序列,诸如在酵母细胞中有功能的强启动子。
在优选的实施方式中,将所述氨基酸输出蛋白编码基因AQR1置于强启动子pTEF3的控制下。
说明性地,可以将AQR1基因插入PYK1基因内,如在本文示例中所示。
在优选的实施方式中,将所述氨基酸输出蛋白编码基因_TPO1置于强诱导型启动子或强阻遏型启动子pSAM4或强组成型启动子pTEF1的控制下。
TPO1-1可以替代TPO1来使用。TPO1-1是人工等位基因,其中,赖氨酸10、49、86、143、144和145被精氨酸替代。
本发明人相信,这些修饰保护TPO1免于通过泛素蛋白酶体途径降解,从而使其稳定。
在优选的实施方式中,将所述氨基酸输出蛋白编码基因_TPO1置于强启动子pTEF3的控制下。
说明性地,可以将TPO1基因插入PYK1基因内,如在本文示例中所示。
考虑到进一步增加依克多因产生,根据本发明的重组酵母可以包含另外的遗传变化,使得它们产生大量的中间产物草酰乙酸。这些任选的遗传变化在下文中描述。
产依克多因重组酵母的另外实施方式
根据本发明的重组酵母的一些实施方式,通过将所述重组酵母置于导致中间代谢物草酰乙酸产生增加的条件下,可以进一步增加依克多因的产生。
可以通过在酵母基因组中引入另外的遗传修饰,将所述重组酵母置于导致草酰乙酸产生增加的条件下。
本发明人发现,通过将另外的遗传变化引入下述的产依克多因重组酵母中,可以达到最佳增加的依克多因产生。
产依克多因重组酵母的第一另外实施方式
根据本发明的产依克多因重组酵母的这些第一另外的实施方式,进行了重组酵母的另外遗传工程化,目的是增加中间产物磷酸烯醇-丙酮酸(PEP)的产生。
在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,在产依克多因重组酵母中引入另外的遗传变化(i)导致NADPH过度产生,(ii)导致磷酸烯醇丙酮酸分别受控和平衡地转化为草酰乙酸和丙酮酸,和(iii)导致丙酮酸减少地转化为乙醇,并重新定向为将磷酸烯醇丙酮酸转化为草酰乙酸。
在根据本发明的产依克多因重组酵母中通过遗传工程化引入的这些另外的遗传变化在下面更详细地说明。
根据这些实施方式,引入遗传变化以便过表达葡萄糖-6-磷酸-1-脱氢酶(也称为MET19或ZWF1)和6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(脱羧)1(也称为GND1)。在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,MET19和GND1的过表达导致NADPH产生增加。
根据这些实施方式,引入遗传变化以便过表达磷酸烯醇丙酮酸羧化酶(也称为PEPC或PPC)和/或磷酸烯醇丙酮酸羧化激酶[ATP](也称为PCK1或PEPCK)。
根据这些实施方式,引入遗传变化以便低表达丙酮酸激酶1(也称为PYK1或CDC19)和丙酮酸激酶2(也称为PYK2)。在这些实施方式的一些实施方式中,PYK2基因可以被缺失而非低表达。
在这些实施方式的一些实施方式中,优选通过缺失使编码丙酮酸脱羧酶的一种或多种基因失活。丙酮酸脱羧酶编码基因分别涵盖了称为PDC1、PDC5和PDC6的那些基因。根据这些实施方式的一些实施方式,优选通过中断或缺失而使PDC1和/或PDC6基因失活,而另一种丙酮酸脱羧酶编码基因PDC5则保持不变;或者通过用弱启动子控制PDC5来使其表达减少。
在这些实施方式的一些实施方式中,通过改变一种或多种醇脱氢酶编码基因的表达来减少重组酵母的醇脱氢酶活性。在这些实施方式的一些实施方式中,通过将基因置于弱启动子的控制下或通过产生非稳定的ADH1酶来减少ADH1的表达。在这些实施方式的一些实施方式中,可以优选通过中断或缺失来使ADH3、ADH4和ADH5中的一种或多种失活。
在这些实施方式的一些实施方式中,可以将外源乙酰脱氢酶编码基因(也称为MHPF)引入酵母基因组中并过表达。
在这些实施方式的一些实施方式中,可以将外源乙酸激酶编码基因(也称为ACKA)引入酵母基因组中并过表达。
在这些实施方式的一些实施方式中,可以将外源磷酸乙酰转移酶编码基因(也称为PTA)引入酵母基因组中并过表达。
葡萄糖-6-磷酸-1-脱氢酶
葡萄糖-6-磷酸-1-脱氢酶是在本领域中描述的用于催化D-葡萄糖6-磷酸为6-磷酸-D-葡萄糖酸-1,5-内酯并同时将NADP还原为NADPH的蛋白质。
为测量葡萄糖-6-磷酸-1-脱氢酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Kuby,S.等人(1966)Dehydrogenases and Oxidases Methods in Enzymology 9,116-117所述的方法。
本说明书中优选的葡萄糖-6-磷酸-1-脱氢酶是EC编号为NO.1.1.1.49的酶。
对于葡萄糖-6-磷酸-1-脱氢酶(也称为MET19)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_014158.1。对于核酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NM_001183079.1。
6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(脱羧)1
6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(脱羧)1是在本领域中描述的用于催化6-磷酸葡萄糖酸的氧化脱羧为核酮糖5-磷酸和CO2并同时将NADP还原为NADPH的蛋白质。
为测量6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(脱羧)1的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考He W.等人(2007)BMC StructuralBiology,7:38中所述的方法。
本说明书中优选的6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(脱羧)1是EC编号为NO.1.1.1.44的酶。
对于6-磷酸葡萄糖酸脱氢酶(脱羧)1(也称为GND1)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_012053。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001179314。
丙酮酸激酶1
丙酮酸激酶1是本领域中描述的用于将丙酮酸在ATP的存在下转化为磷酸烯醇丙酮酸的蛋白质。
为测量丙酮酸激酶1的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Susan-resiga和Nowak(biochemistry,2004,43,15230-15245)所述的方法。
本说明书中优选的丙酮酸激酶1是EC编号为NO.2.7.1.40的酶。
对于丙酮酸激酶1(也称为PYK1)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_009362。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001178183。
丙酮酸激酶2
丙酮酸激酶2是在本领域中描述用于催化丙酮酸在ATP的存在下转化为磷酸烯醇丙酮酸的蛋白质。在糖酵解通量水平非常低的条件下,酵母细胞可以使用丙酮酸激酶2。
为测量丙酮酸激酶2的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Susan-resiga和Nowak(biochemistry,2004,43,15230-15245)所述的方法。
本说明书中优选的丙酮酸激酶2是EC编号为NO.2.7.1.40的酶。
对于丙酮酸激酶2(也称为PYK2)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_014992。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001183767。
丙酮酸脱羧酶同工酶1
丙酮酸脱羧酶同工酶1是在本领域中描述的参与在酒精发酵期间丙酮酸非氧化转化为乙醛和二氧化碳的蛋白质。
为测量丙酮酸脱羧酶同工酶1的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Wang等人(Biochemistry,2001,40:1755-1763)所述的方法。
本说明书中优选的丙酮酸脱羧酶同工酶1是EC编号为NO.4.1.1.1的酶。
对于丙酮酸脱羧酶同工酶1(也称为PDC1)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_013145。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001181931。
丙酮酸脱羧酶同工酶5
丙酮酸脱羧酶同工酶5是在本领域中描述的参与在酒精发酵期间丙酮酸非氧化转化为乙醛和二氧化碳的蛋白质。
为测量丙酮酸脱羧酶同工酶5的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Wang等人(Biochemistry,2001,40:1755-1763)所述的方法。
本说明书中优选的丙酮酸脱羧酶同工酶5是EC编号为NO.4.1.1.1的酶。
对于丙酮酸脱羧酶同工酶5(也称为PDC5)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_013235。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001182021。
丙酮酸脱羧酶同工酶6
丙酮酸脱羧酶同工酶6是在本领域中描述的参与在酒精发酵期间丙酮酸非氧化转化为乙醛和二氧化碳的蛋白质。
为测量丙酮酸脱羧酶同工酶5的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Wang等人(Biochemistry,2001,40:1755-1763)所述的方法。
本说明书中优选的丙酮酸脱羧酶同工酶6是EC编号为NO.4.1.1.1的酶。
对于丙酮酸脱羧酶同工酶6(也称为PDC6)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_013235。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001182021。
乙醛脱氢酶
乙醛脱氢酶是在本领域中描述的用于使用NAD和辅酶A催化乙醛转化为乙酰-CoA的蛋白质。
为测量乙醛脱氢酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Fisher等人(2013)Chemi.Biol.Interact.202 70-77所述的方法。
本说明书中优选的乙醛脱氢酶是EC编号为NO.1.1.1.10的酶。
对于乙醛脱氢酶(也称为MHPF)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_414885。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为在登录号NC_000913.3中公开的核酸序列。
乙酸激酶
乙酸激酶是在本领域中描述的用于由乙酸和ATP形成乙酰磷酸的蛋白质。
为测量乙酸激酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Sagers等人J.Bacteriology(1961)82 233-238所述的方法。
对于乙酸激酶(也称为ACKA)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_416799。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为在登录号NC_000913.3中公开的核酸序列。
磷酸乙酰转移酶
磷酸乙酰转移酶是在本领域中描述的用于催化乙酰-CoA和乙酰磷酸的可逆相互转化的蛋白质。
为测量磷酸乙酰转移酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Castano-Cerezo和Canovas,Microbial Cell Factories 2009,8:54所述的方法。
本说明书中优选的磷酸乙酰转移酶是EC编号为NO.2.3.1.8的酶。
对于磷酸乙酰转移酶(也称为PTA)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_416800。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为在登录号NC_000913中公开的核酸序列。
醇脱氢酶1
醇脱氢酶1是在本领域中描述的用于催化直链伯醇转化为其相应的醛的蛋白质。
为测量醇脱氢酶1的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Ganzhorn等人(1987)TheJournal of Biological Chemistry,262,3754-61所述的方法
本说明书中优选的醇脱氢酶1是EC编号为NO.1.1.1.1的酶。
对于醇脱氢酶1(也称为ADH1)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_014555。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001183340。
醇脱氢酶3
醇脱氢酶3是在本领域中描述的用于催化直链伯醇转化为其相应的醛的蛋白质。
为测量醇脱氢酶3的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Ganzhorn等人(1987)TheJournal of Biological Chemistry,262,3754-61所述的方法。
本说明书中优选的醇脱氢酶3是EC编号为NO.1.1.1.1的酶。
对于醇脱氢酶3(也称为ADH3)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_013800。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001182582。
醇脱氢酶4
醇脱氢酶4是在本领域中描述的用于催化直链伯醇转化为其相应的醛的蛋白质。
为测量醇脱氢酶4的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Ganzhorn等人(1987)TheJournal of Biological Chemistry,262,3754-61所述的方法。
本说明书中优选的醇脱氢酶4是EC编号为NO.1.1.1.1的酶。
对于醇脱氢酶4(也称为ADH4)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_011258。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001181122。
醇脱氢酶5
醇脱氢酶5是在本领域中描述的用于催化直链伯醇转化为其相应的醛的蛋白质。
为测量醇脱氢酶5的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Ganzhorn等人(1987)TheJournal of Biological Chemistry,262,3754-61所述的方法。
本说明书中优选的醇脱氢酶5是EC编号为NO.1.1.1.1的酶。
对于醇脱氢酶5(也称为ADH5)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_009703。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_001178493。
产依克多因重组酵母的第二另外实施方式
根据本发明的产依克多因重组酵母的这些另外的实施方式,进行了重组酵母的另外遗传工程化,目的是增加中间产物磷酸烯醇丙酮酸(PEP)的产生。
在不希望受任何特定理论束缚的情况下,本发明人相信,在产依克多因重组酵母中引入另外的遗传变化(i)导致NADPH过度产生,(ii)导致磷酸烯醇丙酮酸分别受控和平衡地转化为草酰乙酸和丙酮酸,和(iii)导致丙酮酸减少地转化为乙醇,并重新定向为将磷酸烯醇丙酮酸转化为草酰乙酸。
为此目的,本发明人构想了一种完全新的代谢途径,从磷酸烯醇丙酮酸开始,至产生草酰乙酸结束。
在根据本发明的产依克多因重组酵母中通过遗传工程化引入的这些另外的遗传变化在下面更详细地说明。
根据这些实施方式,引入遗传变化以便低表达丙酮酸激酶1(也称为PYK1),和还任选地低表达丙酮酸激酶2(也称为PYK2)。在这些实施方式的一些实施方式中,可以通过将基因置于弱启动子或诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下来低表达PYK1。在这些实施方式的一些实施方式中,例如通过中断或缺失可以使PYK2失活。在这些实施方式的一些实施方式中,PYK1基因可以被缺失而非低表达。在这些实施方式的一些实施方式中,PYK1基因和PYK2基因可以被缺失而非低表达。
根据这些实施方式,引入遗传变化以便(i)通过组成型过表达或(ii)通过诱导型过表达来过表达磷酸烯醇丙酮酸羧化激酶[ATP](也称为PCK或PCKA或PEPCK)。
根据这些实施方式,引入遗传变化以便(i)通过组成型过表达或(ii)通过诱导型过表达来在细胞质中过表达苹果酸脱氢酶,诸如过氧化物酶体苹果酸脱氢酶(也称为MDH3)。
根据这些实施方式,引入遗传变化以便(i)通过组成型过表达或(ii)通过诱导型过表达来过表达NADP-依赖性苹果酸酶3(也称为ME3或NADP-ME3)。
根据这些实施方式,引入遗传变化以便例如(i)通过将相应的编码序列置于弱启动子或诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,或(ii)通过产生非稳定形式的所述一种或多种醇脱氢酶,减少一种或多种醇脱氢酶、优选选自包括醇脱氢酶1(也称为ADH1)、醇脱氢酶3(也称为ADH3)、醇脱氢酶4(也称为ADH4)和醇脱氢酶5(也称为ADH5)的组的一种或多种醇脱氢酶的表达。
根据仍然这些实施方式,引入遗传变化以便(i)通过组成型过表达或(ii)通过诱导型过表达来过表达外源乙醛脱氢酶(也称为MHPF)。
磷酸烯醇丙酮酸羧化激酶(PPCK)
磷酸烯醇羧化激酶[ATP]是在本领域中描述的用于催化通过三磷酸核苷和草酰乙酸之间的直接磷酰基转移来将草酰乙酸转化为磷酸烯醇丙酮酸的蛋白质。
为测量磷酸烯醇羧化激酶[ATP]的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Bazaes S.等人(2007)TheProtein Journal,26,265-269和 J.Van der Werf等人·(1997)Arch Microbiol167:332–342所述的方法。
本说明书中优选的磷酸烯醇羧化激酶[ATP]是EC编号为NO.4.1.1.49的酶。
对于磷酸烯醇羧化激酶[ATP](也称为PCKA)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_417862。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NC_000913中公开的核酸序列。
根据本发明的优选的磷酸烯醇羧化激酶可以选自磷酸烯醇丙酮酸羧化激酶PPCK、诸如EC编号为NO.4.1.1.32的PEPCK。
苹果酸脱氢酶
苹果酸脱氢酶是在本领域中描述的用于催化苹果酸在NADH的存在下转化为草酰乙酸的蛋白质。
为测量苹果酸脱氢酶的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。例如可以提及由Sigma以标题“苹果酸脱氢酶测定试剂盒(Malate dehydrogenase assaykit)”、编号MAK196-1KT出售的商购试剂盒。
对于苹果酸脱氢酶(也称为MDH3)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_010205。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_00118037。
NADP-依赖性苹果酸酶3
NADP-依赖性苹果酸酶3是在本领域中描述的用于催化苹果酸在NADP存在下转化为丙酮酸的蛋白质。
为测量NADP-依赖性苹果酸酶3的活性水平而实施的方法属于本领域技术人员的常识。
在这方面,本领域的技术人员可以有利地参考由Gerrard-Wheeler等人FEBSJournal 276(2009)5665–5677所述的方法。
本说明书中优选的NADP-依赖性苹果酸酶3是EC编号为NO.1.1.1.40的酶。
对于NADP-依赖性苹果酸酶3(也称为NADP-ME3或ME3)的氨基酸序列,其可以在UniProt数据库中被称为登录号NP_197960。对于核酸序列,其可以在NCBI数据库中被称为登录号NM_122489。
醇脱氢酶1、醇脱氢酶3、醇脱氢酶4、醇脱氢酶5和乙醛脱氢酶如上文所指示。
启动子
如本文所公开的,为了获得根据本发明的重组酵母而经过遗传工程化的感兴趣的基因的表达包括在酵母细胞中、包括在酿酒酵母中有功能的适当调控序列。
如本说明书中所公开的,各种启动子可以用于感兴趣的编码序列的期望表达,其包括(i)组成型强启动子(在本文中也称为强启动子),(ii)组成型弱启动子(在本文中也称为弱启动子)和(iii)诱导型启动子或阻遏型启动子。可以在Keren等人(2013)MolecularSystems Biology 9:701中找到具有在不同培养基中的相对活性的酵母启动子的列表。
允许给定基因组成型过表达的启动子可以见于文献(Velculescu等人(1997)Cell88,243-251)中。
在本发明中更特别感兴趣的强启动子可以选自包括以下的组:
·pTDH3(SEQ ID NO.24),
·pENO2(SEQ ID NO.25),
·pTEF KI(SEQ ID NO.26),
·pTEF3(SEQ ID NO.27),
·pTEF1(SEQ ID NO.28),
·pADH1(SEQ ID NO.29),
·pGMP1(SEQ ID NO.30),
·pFBA1(SEQ ID NO.31),
·pPDC1(SEQ ID NO.32),
·pCCW12(SEQ ID NO.33),和
·pGK1(SEQ ID NO.34)。
根据特定的实施方式,根据本发明的强启动子独立地选自由以下组成的组:pTDH3、pENO2、pTEF-KI、pTEF3、pTEF1、pADH1、pGMP1、pFBA1、pPDC1、pCCW12和pGK1。
在本发明中更特别感兴趣的弱启动子可以选自包括以下的组:
·pURA3(SEQ ID NO.36),
·pRPLA1(SEQ ID NO.37),
·pNUP57(SEQ ID NO.119),和
·pGAP1(SEQ ID NO.120)。
根据特定的实施方式,根据本发明弱启动子独立地选自由以下组成的组:pURA3、pRPLA1、pNUP57和pGAP1。
如前所述,诱导型启动子或阻遏型启动子是其活性受生物因子或非生物因子的存在或不存在以及还有所述因子的量控制的启动子。因此,对于某些启动子,当给定因子的量增加或被增加时,其活性将特别被诱导并因此增加,并因此当所述因子的量减少或被减少时,这些相同启动子的活性可以被阻遏并因此降低。本领域技术人员可以决定并因此控制包含诱导型启动子或阻遏型启动子的本发明的重组酵母的培养基中所述一种或多种因子的量。
例如,增加包含pSAM4启动子的根据本发明的重组酵母的培养基中甲硫氨酸的量将诱导并因此增加在该启动子的控制下的基因的转录。相反,减少所述培养基中甲硫氨酸的量将导致在该启动子的控制下基因的转录受到阻遏并因此减少。
在另一个示例中,增加包含pCTR1启动子的根据本发明的重组酵母的培养基中铜的量将阻遏并因此减少在该启动子的控制下的基因的转录。相反,减少所述培养基中铜的量将导致在该启动子的控制下的该基因的转录被诱导并因此增加。
由于这个原因,以下启动子在本文中被称为“诱导型启动子或阻遏型启动子”。
根据第一实施方式,根据本发明的诱导型启动子或阻遏型启动子可以选自包括以下的组:用铜可诱导或可阻遏的启动子、用甲硫氨酸可诱导或可阻遏的启动子和用苏氨酸可诱导或可阻遏的启动子,并且特别选自由以下组成的组:
·pSAM4-甲硫氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.38),
·pCUP1-1–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.39),
·pCUP1.cgla–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.40),
·pCUP1.sba–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.41),
·pACU1–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.42),
·pACU2–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.43),
·pACU3p–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.44),
·pACU4p–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.45),
·pACU5–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.46),
·pACU6–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.47),
·pACU7–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.48),
·pACU8–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.49),
·pACU9–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.50),
·pACU10p–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.51),
·pACU11–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.52),
·pACU12–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.53),
·pACU13–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.54),
·pACU14–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.55),
·pACU15–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.56),
·pGAL/CUP1p–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.57),
·pCRS5–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.58),和
·pCHA1–苏氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.59)。
根据该实施方式,根据本发明的诱导型启动子或阻遏型启动子可以特别地、独立地选自由以下组成的组:pSAM4、pCUP1-1、pCUP1.Cgla、pCUP1.Sba、pACU1、pACU2、pACU3p、pACU4p、pACU5、pACU6、pACU7、pACU8、pACU9、pACU10p、pACU11、pACU12、pACU13、pACU14、pACU15、pGAL/CUP1p、pCRS5和pCHA1。
因此,如上所指示,这些启动子的活性被甲硫氨酸、铜或苏氨酸的增加的存在所诱导,并且当甲硫氨酸、铜或苏氨酸的量减少时,它们的活性降低、即被阻遏。
根据第二实施方式,根据本发明的诱导型启动子或阻遏型启动子可以选自包括以下的组:用铜可诱导或可阻遏的启动子、用赖氨酸可诱导或可阻遏的启动子和用甲硫氨酸可诱导或可阻遏的启动子,并且特别选自由以下组成的组:
·pCTR1–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.60),
·pCTR3–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.61),
·pCUR1–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.62),
·pCUR2–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.63),
·pCUR3–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.64),
·pCUR4–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.65),
·pCUR5p–铜可诱导或可阻遏的(SEQ IDNO.66),
·pCUR6–铜可诱导或可阻遏的(SEQ IDNO.67),
·pCUR7–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.68),
·pCUR8–铜可诱导或可阻遏的(SEQ IDNO.69),
·pCUR9–铜可诱导或可阻遏的(SEQ IDNO.70),
·pCUR10–铜可诱导或可阻遏的(SEQ IDNO.71),
·pCUR11–铜可诱导或可阻遏的(SEQ IDNO.72),
·pCUR12–铜可诱导或可阻遏的(SEQ IDNO.73),
·pCUR13–铜可诱导或可阻遏的(SEQ IDNO.74),
·pCUR14–铜可诱导或可阻遏的(SEQ IDNO.75),
·pCUR15–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.76),
·pCUR16–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.77),
·pCUR17–铜可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.78),
·pLYS1–赖氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.79),
·pLYS4–赖氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ IDNO.80),
·pLYS9–赖氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.81),
·pLYR1p–赖氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.82),
·pLYR2p–赖氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.83),
·pLYR3p–赖氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.84),
·pLYR4p–赖氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.85),
·pLYR5p–赖氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.86),
·pLYR6p–赖氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.87),
·pLYR7p–赖氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.88),
·pLYR8–赖氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.89),
·pLYR9–赖氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.90),
·pLYR10–赖氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.91),
·pLYR11–赖氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.92),
·pMET17–甲硫氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.93),
·pMET6–甲硫氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.94),
·pMET14–甲硫氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.95),
·pMET3–甲硫氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.96),
·pSAM1–甲硫氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.97),
·pSAM2–甲硫氨酸可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.98),
·pMDH2–葡萄糖可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.35),
·pJEN1–葡萄糖可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.118),
·pICL1–葡萄糖可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.119),
·pADH2–葡萄糖可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.120),和
·pMLS1–葡萄糖可诱导或可阻遏的(SEQ ID NO.121)。
根据该特定的实施方式,根据本发明的诱导型启动子或阻遏型启动子可以独立地选自由以下组成的组:pCTR1、pCTR3、pCUR1、pCUR2、pCUR3、pCUR4、pCUR5p、pCUR6、pCUR7、pCUR8、pCUR9、pCUR10、pCUR11、pCUR12、pCUR13、pCUR14、pCUR15、pCUR16、pCUR17、pLYS1、pLYS4、pLYS9、pLYR1p、pLYR2p、pLYR3p、pLYR4p、pLYR5p、pLYR6p、pLYR7p、pLYR8、pLYR9、pLYR10、pLYR11、pMET17、pMET6、pMET14、pMET3、pSAM1、pSAM2、pMDH2、pJEN1、pICL1、pADH2和pMLS1。
如上所指示,这些启动子的活性因此被甲硫氨酸、铜、赖氨酸或葡萄糖的增加的存在所阻遏,并且当甲硫氨酸、铜、赖氨酸或葡萄糖的量减少时,它们的活性增加、即被诱导。
在特定的实施方式中,根据本发明的诱导型启动子或阻遏型启动子可以选自包括以下的组:用铜可诱导或可阻遏的启动子、用葡萄糖可诱导或可阻遏的启动子、用赖氨酸可诱导或可阻遏的启动子、用甲硫氨酸可诱导或可阻遏的启动子和用苏氨酸可诱导或可阻遏的启动子。
在更特定的实施方式中,根据本发明的诱导型启动子或阻遏型启动子可以独立地选自由以下组成的组:pSAM4、pCUP1-1、pCUP1.Cgla、pCUP1.Sba、pACU1、pACU2、pACU3p、pACU4p、pACU5、pACU6、pACU7、pACU8、pACU9、pACU10p、pACU11、pACU12、pACU13、pACU14、pACU15、pGAL/CUP1p、pCRS5、pCHA1、pCTR1、pCTR3、pCUR1、pCUR2、pCUR3、pCUR4、pCUR5p、pCUR6、pCUR7、pCUR8、pCUR9、pCUR10、pCUR11、pCUR12、pCUR13、pCUR14、pCUR15、pCUR16、pCUR17、pLYS1、pLYS4、pLYS9、pLYR1p、pLYR2p、pLYR3p、pLYR4p、pLYR5p、pLYR6p、pLYR7p、pLYR8、pLYR9、pLYR10、pLYR11、pMET17、pMET6、pMET14、pMET3、pSAM1、pSAM2、pMDH2、pJEN1、pICL1、pADH2和pMLS1。
更特别地,所述启动子相同或不同,可以优选特征在于选自由以下组成的组的核酸序列:与SEQ ID NO:24至SEQ ID NO:98和SEQ ID NO:116至SEQ ID NO:121的序列具有至少80%的同一性的序列。
还可以使用如Blazeck&Alper(2013)Biotechnol.J.8 46-58所述的合成启动子。
本发明的强启动子、弱启动子和诱导型启动子或阻遏型启动子可以来源于来自任何酵母菌纲的生物体,并且特别是可以独立地来源于选自由以下组成的组的生物体:酿酒酵母、鲍氏酵母菌(Saccharomyces boulardii)、芽殖酵母(Saccharomyces castelii)、贝酵母(Saccharomyces bayanus)、耐寒酵母(Saccharomyces arboricola)、库德里阿兹威酵母(Saccharomyces kudriavzevii)、棉阿舒囊霉(Ashbya gossypii)、乳酸克鲁维酵母(Kluveromyces lactis)、巴斯德毕赤酵母(Pichia pastoris)、光滑假丝酵母(Candidaglabrata)、热带假丝酵母(Candida tropicalis)、卡氏德巴利酵母(Debaryomycescastelii)、解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolitica)和杰丁塞伯林德纳氏酵母(Cyberlindnera jadinii)。
本发明的强启动子、弱启动子和诱导型启动子或阻遏型启动子可以优选来源于选自由以下组成的组的生物体:酿酒酵母、芽殖酵母、贝酵母、耐寒酵母、库德里阿兹威酵母和乳酸克鲁维酵母。
终止子
如在本文中公开,已经遗传工程化以用于获得根据本发明的重组酵母的感兴趣的基因的表达包括在酵母细胞(包括酿酒酵母)中有功能的适当的转录终止子序列。
所述转录终止子相同或不同,可以见于文献Yamanishi等人,(2013)ACSsynthetic biology 2,337-347。
在本发明中更特别感兴趣的终止子可以选自包括以下的组:
·来自编码甘油醛-3-磷酸脱氢酶,同工酶2的基因的tTDH2(TDH2基因=序列SEQID NO.99),
·tCYC1(=序列SEQ ID NO.100),
·tTDH3(=序列SEQ ID NO.101),和
·来自编码醇脱氢酶的基因的tADH1(ADH1基因=序列SEQ ID NO.102),
·来自编码醇脱氢酶的基因的tADH2(ADH2基因=序列SEQ IDNO.103),
·来自编码磷酸丙糖异构酶的基因的tTPI1(TPI1基因=序列SEQ ID NO.104),
·来自编码O-乙酰高丝氨酸-O-乙酰丝氨酸硫化氢解酶的基因的tMET17(Met17基因=序列SEQ ID NO.105),
·来自编码烯醇化酶II的基因的tENO2(ENO2基因=序列SEQ ID NO.106),
·tMET3(=序列SEQ ID NO.107),和
·来自编码3-磷酸甘油酸激酶的基因的tPGK1(PGK1基因=序列SEQ ID NO.108),
·tDIT1(=序列SEQ ID NO.109)
·tRPL3(=序列SEQ ID NO.110)
·tRPL41B(=序列SEQ ID NO.111)
·tRPL15A(=序列SEQ ID NO.112)
·tIDP1(=序列SEQ ID NO.113)。
更具体地,所述相同或不同的终止子可以优选地特征在于选自由以下组成的组的核酸序列:与SEQ ID NO:99至SEQ ID NO:113的序列具有至少80%的同一性的序列。
重组酵母
通常,与细菌相比,酵母可以快速生长并且可以以更高的密度培养,并且在工业环境中不需要无菌环境。此外,与细菌细胞相比,酵母细胞可以更容易地从培养基中分离出来,从而大大简化了产物提取和纯化的过程。
优选地,本发明的酵母可以选自以下属:酵母属、假丝酵母属(Candida)阿舒囊霉属(Ashbya)、德克酵母属(Dekkera)、毕赤酵母属(Pichia)(汉逊酵母属(Hansenula))、德巴利酵母属(Debaryomyces)、棒孢酵母属(Clavispora)、洛德酵母(Lodderomyces)、耶氏酵母属(Yarrowia)、接合酵母属(Zigosaccharomyces)、裂殖酵母属(Schizosaccharomyces)、有孢圆酵母属(Torulaspora)、克鲁维酵母属(Kluyveromyces)、酒香酵母属(Brettanomycces)、隐球菌属(Cryptococcus)或(Malassezia)。
更优选地,酵母可以是酵母属、德克酵母属、裂殖酵母属、克鲁维酵母属、有孢圆酵母属/接合酵母属或酒香酵母属的克勒勃屈利(Crabtree)阳性酵母。
更优选地,酵母可以来自以下种:酿酒酵母、鲍氏酵母菌、道格拉氏酵母、巴氏酵母、拜耳接合酵母(Zigosaccharomyces bailii)、粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomycespombe)、布鲁塞尔德克酵母(Dekkera brucelensis)、间型德克酵母(Dekkeraintermedia)、卡斯酒香酵母(Brettanomycces custersii)、间型酒香酵母(Brettanomycces intermedius)、耐热克鲁维酵母(Kluyveromyces themotolerens)、球有孢圆酵母(Torulaspora globosa)或光滑有抱圆酵母(Torulaspora glabrata)。
更优选地,重组酵母可以属于酵母属,并且优选地属于酿酒酵母种。
如上所述,根据本发明的重组酵母具有被插入选自本说明书中公开的那些DNA构建体中的至少一种DNA构建体而减少的丙酮酸脱羧酶活性。
为将特异性的DNA构建体插入基因内而实施的方法属于本领域技术人员的常识。在下文的实施例中,更详细地描述了相关方法。
培养条件
本发明还涉及诸如以上定义的重组酵母用于产生依克多因的用途。
本发明还涉及产生依克多因的方法,其包括以下步骤:
-提供如前所述的重组微生物,在含有碳源的培养基中培养重组微生物,和
-回收依克多因。
通常,本发明的微生物在适当的培养基中在约20℃至约37℃范围内的温度下、优选在27℃至34℃范围内的温度下生长。
当根据本发明的重组酵母属于酿酒酵母种时,在适当的培养基中温度可以有利地在27℃至34℃的范围内。
适用于酵母的生长培养基是常见的商业制备培养基,诸如包含酵母氮基、硫酸铵和右旋糖作为碳源/能源的肉汤)或YPD培养基(用于生长最多的最佳比例的蛋白胨、酵母提取物和右旋糖的掺混物)。也可以使用其他限定的生长培养基或合成的生长培养基,并且微生物学或发酵科学领域的技术人员将知道用于特定微生物生长的适当培养基。
术语“适当的培养基”是上面定义的。
根据本发明的重组酵母的已知培养基的实例是本领域技术人员已知的,并在以下出版物D.Burke等人,Methods in yeast Genetics–A cold spring harbor laboratorycourse Manual(2000)中介绍。
适用于发酵的pH范围可以是pH 3.0至pH 7.5,其中优选pH 4.5至pH 6.5作为初始条件。
发酵可以在好氧条件或微好氧条件下进行。
发酵培养基中产物的量可以使用本领域已知的多种方法来确定,例如高效液相色谱(HPLC)或气相色谱(GC)。
本方法可以采用分批发酵方法。经典的分批发酵是封闭的系统,其中,培养基的组成在发酵开始时设置,并且在发酵期间不发生人为改变。因此,在发酵开始时,将培养基用所期望的一种或多种生物体接种,并允许在向系统中不添加任何物质的情况下进行发酵。通常,然而,“分批”发酵相对于碳源的添加是分批的,并且经常尝试控制诸如温度、pH和氧浓度的因素。在分批系统中,系统的代谢物和生物质组成在发酵停止之前一直在变化。在分批培养中,细胞通过静态滞后期进入高生长对数期,并最后进入静止期,在该静止期,生长速率降低或停止。如果不处理,固定相中的细胞将最终死亡。对数期的细胞通常负责最终产物或中间体的大量产生。
补料分批系统也可以用于本发明中。补料分批系统类似于典型的分批系统,不同之处在于,随着发酵的进行逐渐增加碳源底物。当分解代谢物阻遏(例如葡萄糖阻抑)易于抑制细胞的代谢并且希望在培养基中具有有限量的底物时,补料分批系统是有用的。在补料分批系统中,实际底物浓度的测量很困难,并因此根据可测量因素(诸如pH、溶解氧和废气、诸如CO2的分压)的变化进行估算。
发酵是本领域公知的,并且实例可以见于Sunderland等人,(1992),其通过引用并入本文。尽管本发明以分批模式进行,但是可以预期该方法将适用于连续发酵。
连续发酵是一种开放系统,其中,将限定的发酵培养基连续添加至生物反应器,并同时去除等量的条件培养基以进行处理。连续发酵通常使培养物保持恒定的高密度,其中,细胞主要处于对数生长期。
连续发酵允许调控影响细胞生长或终产物浓度的一种因素或任何数量的因素。例如,一种方法将有限的营养素(诸如碳源)或氮水平维持在固定速率,并允许所有其他参数变化。在其他系统中,影响生长的许多因素可以连续改变,而通过培养基浊度测量的细胞浓度保持恒定。连续系统努力维持稳态生长条件,并因此必须将由于培养基被抽出而引起的细胞损失针对发酵中的细胞生长速率进行平衡。在工业微生物学领域中,为连续发酵过程调控营养素和生长因子的方法以及使产物形成速率最大化的技术是众所周知的。
预期可以使用分批过程、补料分批过程或连续过程来实施本发明,并且任何已知的发酵模式都是适合的。另外,考虑将细胞作为全细胞催化剂固定在底物上,并使其经受发酵条件进行生产。
为了进一步提高依克多因产生,特定的实施方式可以包括在诸如上述的适当的培养基中培养重组酵母细胞,其中,所述培养基包含最佳量的碳源、特别是葡萄糖。
优选地,仅在整个培养持续时间的一部分期间在此类最佳培养基中培养细胞。在一些实施方式中,在培养开始后10小时或更长时间(涵盖在培养开始后11小时、12小时、13小时、14小时、15小时或16小时或更长时间),将酵母细胞孵育在所述最佳培养基中。
优选地,在培养开始后5小时至15小时(包括6小时至10小时,例如8小时)的时间段期间在此类最佳培养基中培养细胞。
在优选的实施方式中,所述最佳培养基中所含的碳源由葡萄糖组成。在优选的实施方式中,所述最佳培养基包含12%w/w或更多的葡萄糖,包括15%w/w或更多的葡萄糖。在优选的实施方式中,所述最佳培养基包含至多40%w/w的葡萄糖,其包含至多35%w/w的葡萄糖。
因此,在上述优选的实施方式中,根据本发明用于产生依克多因的方法还可以包括在步骤(a)和(c)之间的中间步骤(b),该步骤(b)包括在所述最佳培养基中培养酵母细胞。
依克多因的纯化
根据本发明的特定方面,依克多因的发酵产生包括从培养基中分离依克多因的步骤。从培养基中回收依克多因是本领域技术人员的常规任务。这可以通过本领域中众所周知的许多技术来实现,包括但不限于蒸馏、气提、渗透蒸发、选择性沉淀或液相萃取。本领域的专家知道如何根据待分离材料的特性来调整每种技术的参数。
保留了本发明中作为微生物模型的酵母,因为合成的依克多因完全输出到细胞外,从而简化了纯化过程。
合成的依克多因可以通过蒸馏收集。蒸馏可以涉及不同于培养基的任选组分,以通过形成共沸物并且尤其是与水形成共沸物来促进依克多因分离。该任选组分是有机溶剂,诸如环己烷、戊烷、丁醇、苯、甲苯、三氯乙烯、辛烷、二乙醚或其混合物。
用选自氦、氩、二氧化碳、氢、氮或其混合物的汽提气体实现气提。
用有机溶剂作为疏水相(诸如戊烷、己烷、庚烷或十二烷)进行液相萃取。
除非另有说明,否则术语“在...与...之间”和“从...至...的范围”应理解为包括端点值。
下面的实施例和附图是通过举例说明的方式提出的,并不意味着对本发明的限制。
实施例
实施例1:用于制备根据本发明的重组酿酒酵母菌株的方案
下文实施的所有重组酿酒酵母菌株均使用标准酵母分子遗传学程序(D.Burke,D.Dawson的Methods in yeast Genetics–A cold spring harbor laboratory courseManual(2000),T.Stearns CSHL Press)从标准菌株构建而成。
利用酵母有效重组具有序列同源性的游离DNA末端的能力,将下述基因的簇一次整合在重组酵母中。
此外,为了更好地理解以下基因型:
-ade2、his3、leu2、trp1和ura3是营养缺陷型标志物基因。
-小写字母意指所考虑的基因无活性,大写字母表示活性基因。
-“::”:在基因名称后,意指该基因被随后的物质中断(如果插入了多于一个基因,则将其在方括号[]中注明)。基因的中断伴随着编码序列的整个缺失,但保留了启动子。结果,紧跟着“::”的基因是无活性的,并以小写字母表示。如果未指定,则插入的基因的转录由破坏的基因的启动子控制。
-“gene.Kl”意指该基因起源于乳酸克鲁维酵母(Kluyveromyces lactis)。
更特别地,要克隆的编码序列是人工合成的。对于异源序列(非酵母),使用酵母密码子使用修饰了核酸序列,以获得同义编码序列。使用限制酶和经典克隆技术,将每个合成的序列克隆在转录启动子和转录终止子之间。每个启动子序列之前都有与上游基因终止子序列同源的50个至200个核苷酸序列。类似地,每个基因(包含启动子编码序列终止子的基因)的终止子后面有与紧跟的基因同源的序列。因此,每个待整合的单元都与上游单元和下游单元有50个至200个核苷酸的重叠。对于第一单元,启动子之前是与酵母染色体核苷酸在其将整合其中的基因座同源的50个至200个核苷酸。类似地,对于最后一个单元,终止子之后是与酵母染色体核苷酸在其将整合其中的基因座同源的50个至200个核苷酸。
然后从质粒构建体中PCR扩增每个单元,产生具有重叠序列的直链DNA的X单元。为了选择重组事件,该基因的至少一个是营养缺陷型标志物。所有直链片段都在酵母中一次转化,并选择重组酵母作为与所用标志物有关的营养缺陷型。然后通过PCR和测序验证序列的完整性。
实施例2:用于产生依克多因的比较性实施例
A.首先,获得了两种重组菌株:YA3370-20和YA3371-46。为了仅包含根据本发明的修饰的一部分,已经将这两种菌株重组。
因此,这两种菌株如下:
YA3370-20:adc2,can1::[pACU1-AAT2-tRPL3-pCUP1-1-PPC-5.Ec-tTPI1]x4,his3::[pACU5-HOM2-2-tRPL3-pTDH3-GDH-2.Eca-tIDP1]x4,hom6::[URA3-pCCW12-ECTB.He-tIDP1]x5,leu2,lyp1::[pPDC1-ECTA.He-tCYC1-pTDH3-ECTC.He-tTDH3]x2,pyk1::[LEU2.K1-RS,pTDH3-PEPCK-1.Ec-tIDP1,pTEF3-AQR1-tRPL41B,pCUR3-PYK1-tPYK1],sam3::[pPDC1-METX.Cg-tRPL3-pTDH3-MHPF.ec-tIDP1]x2,trp1::[pPDC1-PPC-5.Ec-tRPL3-pACU7-AK.Bs-tIDP1-TRP1]x6,ura3
YA3371-46:ade2,can1::[pACU1-AAT2-tRPL3-pCUP1-1-PPC-5.Ec-tTPI1]x4,his3::[pACU5-HOM2-2-tRPL3-pTDH3-GDH-2.Eca-tIDP1]x4,hom6::[URA3-pCCW12-ECTB.He-tIDP1]x5,leu2,lyp1::[pPDC1-ECTA.He-tCYC1-pTDH3-ECTC.He-tTDH3]x2,pyk1::[LEU2.K1-RS,pTDH3-PEPCK-1.Ec-tIDP1,pTEF3-AQR1-tRPL41B,pCUR3-PYK1-tPYK1],sam3::[pCCW12-ECTB.Pa-tRPL3-pTDH3-MHPF.Ec-tRPL41B]x4,trp1::[pPDC1-PPC-5.Ec-tRPL3-pACU7-AK.Bs-tIDP1-TRP1]x6,ura3
PEPCK-1是通过用甘氨酸修饰位置2中的精氨酸氨基酸来稳定的PEPCK形式。
PPC-5是更稳定的PPC形式,其中,在N+1中添加了丙氨酸。
所有这些菌株均在2%YE(酵母提取物)和8%葡萄糖中生长24小时,并在8小时后添加500μM CuSO4。24小时后,如制造商的建议,使用来自Waters的AccQ-Tag UltraDerivatization试剂盒,使用用于氨基酸测定的AccQ-Tag前置柱衍生化方法测定培养基中的依克多因含量。
用这些不同菌株获得的依克多因量分别为:
-YA3370-20:1g/L-1
-YA3371-46:1.55g/L-1
相比之下,天然菌株不产生依克多因。
由该对比实验得出的是,当在与不包含根据本发明的所有遗传修饰的其他重组菌株相同的条件下培养时,包含根据本发明的修饰的重组菌株产生更大量的依克多因。
B.还获得了其他五种重组菌株:YA3380-40B、YA3595-25和YA3595-34。
这三种菌株如下:
YA3380-40B:gnp1::[LEU2.K1-RS,pADH1-AAT2-tRPL15A,pTEF3-MDH3-1-tRPL3,pPDC1-PEPCK-1.Ec-tMET25,pTDH3-MHPF.Ec-tTPI1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tIDP1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tTPI1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tIDP1,pCCW12-ME3.At-tRPL3],his3::[pACU5-ME3.At-tRPL3-pACU6-METX-1.Cg-tIDP1]x11,hom6::[TRP1.K1,pCCW12.Sba-HOM3-tDIT1],leu2,mup3::[HIS5.Sp,pACU7-PEPCK-1.Ec-tRPL3,pCCW12-HOM2-1-tTDH3,pPGK1-AAT2-tTDH2,pENO2-MDH3-1-tRPL15A,pCUP1-1-GDH-2.Eca-tTPI1,pTDH3.Sba-ECTB.He-tIDP1,pPDC1-ECTA.He-tRPL41B,pTEF1.Sba-ECTC.He-tRPL15A],pyk1::[LEU2.K1,pTDH3-PEPCK-1.Ec-tIDP1,pPDC1-MDH3-1-tRPL15A,pTEF3-TPO1-tENO2,pCUR3-PYK1-7-tCYC1],trp1,ura3
YA3595-25:ade2,gnp1::[LEU2.K1-RS,pADH1-AAT2-tRPL15A,pTEF3-MDH3-1-tRPL3,pPDC1-PEPCK-1.Ec-tMET25,pTDH3-MHPF.Ec-tTPI1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tIDP1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tTPI1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tIDP1,pCCW12-ME3.At-tRPL3],his3,hom6::[TRP1.K1,pCCW12.Sba-HOM3-tDIT1],leu2,mup3::[HIS5.Sp,pACU7-PEPCK-1.Ec-tRPL3,pCCW12-HOM2-1-tTDH3,pPGK1-AAT2-tTDH2,pENO2-MDH3-1-tRPL15A,pCUP1-1-GDH-2.Eca-tTPI1,pTDH3.Sba-ECTB.He-tIDP1,pPDC1-ECTA.He-tRPL41B,pTEF1.Sba-ECTC.He-tRPL15A],pyk1::[LEU2.K1,pTDH3-PEPCK-1.Ec-tIDP1,pPDC1-MDH3-1-tRPL15A,pTEF3-TPO1-tENO2,pCUR3-PYK1-7-tCYC1],sam3::[pACU7-PEPCK-1.Ec-tRPL3-pCUP1-1-HOM3-tDIT1]x7,trp1,ura3::[pCCW12-ECTB.Ab-tRPL3-pTDH3-ECTC.He-tRPL41B.Sba]x14
YA3595-34:ade2,gnp1::[LEU2.K1-RS,pADH1-AAT2-tRPL15A,pTEF3-MDH3-1-tRPL3,pPDC1-PEPCK-1.Ec-tMET25,pTDH3-MHPF.Ec-tTPI1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tIDP1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tTPI1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tIDP1,pCCW12-ME3.At-tRPL3],his3,hom6::[TRP1.K1,pCCW12.Sba-HOM3-tDIT1],leu2,mup3::[HIS5.Sp,pACU7-PEPCK-1.Ec-tRPL3,pCCW12-HOM2-1-tTDH3,pPGK1-AAT2-tTDH2,pENO2-MDH3-1-tRPL15A,pCUP1-1-GDH-2.Eca-tTPI1,pTDH3.Sba-ECTB.He-tIDP1,pPDC1-ECTA.He-tRPL41B,pTEF1.Sba-ECTC.He-tRPL15A],pyk1::[LEU2.K1,PTDH3-PEPCK-1.Ec-tIDP1,pPDC1-MDH3-1-tRPL15A,pTEF3-TPO1-tENO2,pCUR3-PYK1-7-tCYC1],sam3::[PACU7-PEPCK-1.Ec-tRPL3-pCUP1-1-HOM3-tDIT1]x7,trp1,ura3::[pCCW12-ECTB.Ab-tRPL3-pTDH3-ECTC.He-tRPL41B.Sba]x9
将菌株YA3380-40B和YA3595-25在YPA培养基(1%酵母提取物、2%蛋白胨、0.01%半硫酸腺嘌呤)、葡萄糖8%、(NH4)2SO4 50mM和甲硫氨酸0.5mM和苏氨酸0.85mM中生长24小时。24小时后,如制造商的建议,使用来自Waters的AccQ-Tag Ultra Derivatization试剂盒,使用用于氨基酸测定的AccQ-Tag前置柱衍生化方法测定培养基中的依克多因含量。
PEPCK-1是通过用甘氨酸修饰位置2中的精氨酸氨基酸来稳定的PEPCK形式。
用这两种菌株获得的依克多因量分别为:
-YA3380-40B:211mg/L-1
-YA3595-25:1.29g/L-1
相比之下,天然菌株不产生依克多因。
将菌株YA3595-34以及菌株YA3595-25在YPA培养基(1%酵母提取物、2%蛋白胨、0.01%半硫酸腺嘌呤)、蔗糖8%、(NH4)2SO4 50mM和甲硫氨酸0.5mM和苏氨酸0.85mM中生长24小时。24小时后,如制造商的建议,使用来自Waters的AccQ-Tag Ultra Derivatization试剂盒,使用用于氨基酸测定的AccQ-Tag前置柱衍生化方法测定培养基中的依克多因含量。
用这两种菌株获得的依克多因量分别为:
-YA3595-25:2.63g/L-1
-YA3595-34:2.58g/L-1
相比之下,天然菌株不产生依克多因。
由该对比实验得出的是,当在与不包含根据本发明的所有遗传修饰的其他重组菌株相同的条件下培养时,包含根据本发明的修饰的重组菌株产生更大量的依克多因。
C.还获得了其他三种重组菌株:YA4440、YA4442和YA4444。
这三种菌株如下:
YA4440:MAT-α,gnp1::[LEU2.K1-RS,pADH1-AAT2-tRPL15A,pTEF3-MDH3-1-tRPL3,pPDC1-PEPCK-1.Ec-tMET17,pTDH3-MHPF.Ec-tTPI1,pCCWI2-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tIDPI,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tTPI1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tIDP1,pCCW12-ME3.At-tRPL3],his3::[HIS3-pACU5-ME3.At-tRPL3,pACU6-METX-1.Cg-tIDP1]x5,hom6::[TRP1.K1-RS,pCCW12.Sba-HOM3-tDIT1],leu2,lys2Δ201,mup3::[HIS5.sp-RS,pACU7-PEPCK-1.Ec-tRPL3,pCCW12-HOM2-1-tTDH3,pPGK1-AAT2-tTDH2,pENO2-MDH3-1-tRPL15A,pCUP1-1-GDH-21.Eca-tTPI1,pTDH3.Sba-ECTB.He-tIDP1,pPDC1-ECTA.He-tRPL41B,pTEF1.Sba-ECTC.He-tRPL15A],pyk1::[LEU2.K1-RS,pTDH3-PEPCK-1.Ec-tIDP1,pPDC1-MDH3-1-tRPL15A,pTEF3-TPO1-tENO2,pCUR3-PYK1-7-tCYC1],sam3::[pACU7-PEPCK-1.Ec-tRPL3,pCUP1-1-HOM3-tDIT1-sam3]x5,trp1,trp4::[LYS2-loxP,pCCW12-PEPCK-1.Ec-tTPI1,pCCW12-GDH2-tRPL3,pCCW12-METX-1.Cg-tRPL41B.Sba,pCCW12.Sba-HOM3-tRPL15A],ura3::[ECTB.Ab-ECTC.He-URA3]x7
YA4442:MAT-α,gnp1::[LEU2.K1-RS,pADH1-AAT2-tRPL15A,pTEF3-MDH3-1-tRPL3,pPDC1-PEPCK-1.Ec-tMET17,pTDH3-MHPF.Ec-tTPI1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tIDP1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tTPI1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tIDP1,pCCW12-ME3.At-tRPL3],his3::[HIS3-pACU5-ME3.At-tRPL3,pACU6-METX-1.Cg-tIDP1]x5,hom6::[TRP1.K1-RS,pCCW12.Sba-HOM3-tDIT1],Icu2,Iys2Δ201,mup3::[HIS5.sp-RS,pACU7-PEPCK-1.Ec-tRPL3,pCCW12-HOM2-1-tTDH3,pPGK1-AAT2-tTDH2,pENO2-MDH3-1-tRPL15A,pCUP1-1-GDH-21.Eca-tTPI1,pTDH3.Sba-ECTB.He-tIDP1,pPDC1-ECTA.He-tRPL41B,pTEF1.Sba-ECTC.He-tRPL15A],pyk1::[LEU2.K1-RS,pTDH3-PEPCK-1.Ec-tIDP1,pPDC1-MDH3-1-tRPL15A,pTEF3-TPO1-tENO2,pCUR3-PYK1-7-tCYC1],sam3::[pACU7-PEPCK-1.Ec-tRPL3,pCUP1-1-HOM3-tDIT1-sam3]x5,trp1,trp4::[LYS2-loxP,pCCW12-PEPCK-1.Ec-tTPI1,pCCW12-GDH1-tRPL3,pCCW12-METX-1.Cg-tRPL41B.Sba,pCCW12.Sba-HOM3-tRPL15A],ura3::[ECTB.Ab-ECTC.Hc-URA3]x7
YA4444:MAT-α,gnp1::[LEU2.K1-RS,pADH1-AAT2-tRPL15A,pTEF3-MDH3-1-tRPL3,pPDC1-PEPCK-1.Ec-tMET17,pTDH3-MHPF.Ec-tTPI1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tIDP1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tTPI1,pCCW12-ME3.At-tRPL3,pTDH3-MHPF.Ec-tIDP1,pCCW12-ME3.At-tRPL3],his3::[HIS3-pACU5-ME3.At-tRPL3,pACU6-METX-1.Cg-tIDP1]x5,hom6::[TRP1.K1-RS,pCCW12.Sba-HOM3-tDIT1],leu2,lys2Δ201,mup3::[HIS5.sp-RS,pACU7-PEPCK-1.Ec-tRPL3,pCCW12-HOM2-1-tTDH3,pPGK1-AAT2-tTDH2,pENO2-MDH3-1-tRPL15A,pCUP1-1-GDH-21.Eca-tTPI1,pTDH3.Sba-ECTB.He-tIDP1,pPDC1-ECTA.Hc-tRPL41B,pTEF1.Sba-ECTC.Hc-tRPL15A],pyk1::[LEU2.K1-RS,pTDH3-PEPCK-1.Ec-tIDP1,pPDC1-MDH3-1-tRPL15A,pTEF3-TPO1-tENO2,pCUR3-PYK1-7-tCYC1],sam3::[pACU7-PEPCK-1.Ec-tRPL3,pCUP1-1-HOM3-tDIT1-sam3[x5,trp1,trp4::[LYS2-loxP,pCCW12-PEPCK-1.Ec-tTPI1,pCCW12-GDH2.Eca-tRPL3,pCCW12-METX-1.Cg-tRPL41B.Sba,pCCW12.Sba-HOM3-tRPL15A],ura3::[ECTB.Ab-ECTC.He-URA3]x7
GDH1和GDH2是内源性酿酒酵母酶,而GDH2.Eca是来自尾状线虫(Entodimiumcaudatum)的GDH酶。
将这些菌株在28℃下在锥形瓶中于酵母提取物2%、蔗糖8%、甲硫氨酸0.5mM、苏氨酸4.2mM、尿素50mM、维生素B5 4μM、维生素B1 6μM、维生素B6 10μM、维生素B10 1.5μM、维生素B3 2.9μM、维生素B2 0.5μM、维生素B8 0.08μM、维生素B9 4.5nM,CuSO4 500μM中生长16小时。16小时后,添加500μM CuSO4和尿素100mM,并将培养物再生长8小时。
然后基本上按照Ono H,等人(1999)Journal of Bacteriology,第91-99页中所述评价依克多因产生,不同之处在于用HPLC-UV检测依克多因。
在这些条件下,YA4440产生6.4g/l依克多因,YA4442产生4.7g/l依克多因,并且YA4444产生6.1g/l依克多因。需要提醒的是,在这些相同条件下,野生型菌株(例如非重组)不产生可检测量的依克多因。
这三种菌株是相同的,但是GDH酶过表达。以上结果表明,NADH依赖性GDH(YA4440中的GDH2和YA4444中的GDH2.Eca)的过表达允许比NADPH依赖性GDH(YA4442中的GDH1)的过表达产生更多的依克多因。
因此,与NADPH依赖性谷氨酸脱氢酶(GDH1)的过表达相比,NADH依赖性谷氨酸脱氢酶的过表达允许产生更多的依克多因。
序列表
<110> 阿尔德里斯公司
<120> 产依克多因酵母
<130> PR75767
<150> EP17305910
<151> 2017-07-11
<160> 121
<170> BiSSAP 1.3.6
<210> 1
<211> 1583
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> 天冬氨酸激酶 (HOM3)
<220>
<223> 天冬氨酸激酶 (HOM3)
<400> 1
atgccaatgg atttccaacc tacatcaagt cattcgaact gggtcgtgca aaagttcggt 60
ggtacatctg tcggtaaatt tcccgtccaa atagtggatg acattgtgaa gcactattct 120
aaacctgacg gcccaaacaa taatgtcgct gtcgtttgtt ccgcccgttc ttcatacacc 180
aaggctgaag gtaccacttc tcgtcttttg aaatgttgtg atttggcttc gcaagaatct 240
gaatttcaag acattatcga agttatcaga caagaccata tcgataatgc cgaccgcttc 300
attctcaatc ctgccttgca agccaagtta gtggatgata ccaataaaga acttgaactg 360
gtcaagaaat atttaaatgc ttcaaaagtt ttgggtgaag tgagttcacg tacagtagat 420
ctggtgatgt catgtggtga gaagttgagt tgtttgttca tgactgcttt atgtaatgac 480
cgtggctgta aggccaaata tgtggatttg agccacattg ttccctctga tttcagtgcc 540
agcgctttgg ataacagttt ctacactttc ctggttcaag cattgaaaga aaaattggcc 600
ccctttgtaa gtgctaaaga gcgtatcgtt ccagtcttta cagggttttt tggtttagtt 660
ccaactggtc ttctgaatgg tgttggtcgt ggctataccg atttatgtgc cgctttgata 720
gcagttgctg taaatgctga tgaactacaa gtttggaagg aagttgatgg tatatttact 780
gctgatcctc gtaaggttcc tgaagcacgt ttgctagaca gtgttactcc agaagaagct 840
tctgaattaa catattatgg ttccgaagtt atacatcctt ttacgatgga acaagttatt 900
agggctaaga ttcctattag aatcaagaat gttcaaaatc cattaggtaa cggtaccatt 960
atctacccag ataatgtagc aaagaagggt gaatctactc caccacatcc tcctgagaac 1020
ttatcctcat ctttctatga aaagagaaag agaggtgcca ctgctatcac caccaaaaat 1080
gacattttcg tcatcaacat tcattccaat aagaaaaccc tatcccatgg tttcctagct 1140
caaatattta ccatcctgga taagtacaag ttagtcgtag atttaatatc tacttctgaa 1200
gttcatgttt cgatggcttt gcccattcca gatgcagact cattaaaatc tctgagacaa 1260
gctgaggaaa aattgagaat tttaggttct gttgatatca caaagaagtt gtctattgtt 1320
tcattagttg gtaaacatat gaaacaatac atcggcattg ctggtaccat gtttactact 1380
cttgctgaag aaggcatcaa cattgaaatg atttctcaag gggcaaatga aataaacata 1440
tcctgcgtta tcaatgaatc tgactccata aaagcgctac aatgtattca tgccaagtta 1500
ctaagtgagc ggacaaatac ttcaaaccaa tttgaacatg ccattgatga acgtttagaa 1560
caattgaaaa gacttggaat taa 1583
<210> 2
<211> 526
<212> PRT
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> 天冬氨酸激酶 (HOM3)
<220>
<223> 天冬氨酸激酶 (HOM3)
<400> 2
Pro Met Asp Phe Gln Pro Thr Ser Ser His Ser Asn Trp Val Val Gln
1 5 10 15
Lys Phe Gly Gly Thr Ser Val Gly Lys Phe Pro Val Gln Ile Val Asp
20 25 30
Asp Ile Val Lys His Tyr Ser Lys Pro Asp Gly Pro Asn Asn Asn Val
35 40 45
Ala Val Val Cys Ser Ala Arg Ser Ser Tyr Thr Lys Ala Glu Gly Thr
50 55 60
Thr Ser Arg Leu Leu Lys Cys Cys Asp Leu Ala Ser Gln Glu Ser Glu
65 70 75 80
Phe Gln Asp Ile Ile Glu Val Ile Arg Gln Asp His Ile Asp Asn Ala
85 90 95
Asp Arg Phe Ile Leu Asn Pro Ala Leu Gln Ala Lys Leu Val Asp Asp
100 105 110
Thr Asn Lys Glu Leu Glu Leu Val Lys Lys Tyr Leu Asn Ala Ser Lys
115 120 125
Val Leu Gly Glu Val Ser Ser Arg Thr Val Asp Leu Val Met Ser Cys
130 135 140
Gly Glu Lys Leu Ser Cys Leu Phe Met Thr Ala Leu Cys Asn Asp Arg
145 150 155 160
Gly Cys Lys Ala Lys Tyr Val Asp Leu Ser His Ile Val Pro Ser Asp
165 170 175
Phe Ser Ala Ser Ala Leu Asp Asn Ser Phe Tyr Thr Phe Leu Val Gln
180 185 190
Ala Leu Lys Glu Lys Leu Ala Pro Phe Val Ser Ala Lys Glu Arg Ile
195 200 205
Val Pro Val Phe Thr Gly Phe Phe Gly Leu Val Pro Thr Gly Leu Leu
210 215 220
Asn Gly Val Gly Arg Gly Tyr Thr Asp Leu Cys Ala Ala Leu Ile Ala
225 230 235 240
Val Ala Val Asn Ala Asp Glu Leu Gln Val Trp Lys Glu Val Asp Gly
245 250 255
Ile Phe Thr Ala Asp Pro Arg Lys Val Pro Glu Ala Arg Leu Leu Asp
260 265 270
Ser Val Thr Pro Glu Glu Ala Ser Glu Leu Thr Tyr Tyr Gly Ser Glu
275 280 285
Val Ile His Pro Phe Thr Met Glu Gln Val Ile Arg Ala Lys Ile Pro
290 295 300
Ile Arg Ile Lys Asn Val Gln Asn Pro Leu Gly Asn Gly Thr Ile Ile
305 310 315 320
Tyr Pro Asp Asn Val Ala Lys Lys Gly Glu Ser Thr Pro Pro His Pro
325 330 335
Pro Glu Asn Leu Ser Ser Ser Phe Tyr Glu Lys Arg Lys Arg Gly Ala
340 345 350
Thr Ala Ile Thr Thr Lys Asn Asp Ile Phe Val Ile Asn Ile His Ser
355 360 365
Asn Lys Lys Thr Leu Ser His Gly Phe Leu Ala Gln Ile Phe Thr Ile
370 375 380
Leu Asp Lys Tyr Lys Leu Val Val Asp Leu Ile Ser Thr Ser Glu Val
385 390 395 400
His Val Ser Met Ala Leu Pro Ile Pro Asp Ala Asp Ser Leu Lys Ser
405 410 415
Leu Arg Gln Ala Glu Glu Lys Leu Arg Ile Leu Gly Ser Val Asp Ile
420 425 430
Thr Lys Lys Leu Ser Ile Val Ser Leu Val Gly Lys His Met Lys Gln
435 440 445
Tyr Ile Gly Ile Ala Gly Thr Met Phe Thr Thr Leu Ala Glu Glu Gly
450 455 460
Ile Asn Ile Glu Met Ile Ser Gln Gly Ala Asn Glu Ile Asn Ile Ser
465 470 475 480
Cys Val Ile Asn Glu Ser Asp Ser Ile Lys Ala Leu Gln Cys Ile His
485 490 495
Ala Lys Leu Leu Ser Glu Arg Thr Asn Thr Ser Asn Gln Phe Glu His
500 505 510
Ala Ile Asp Glu Arg Leu Glu Gln Leu Lys Arg Leu Gly Ile
515 520 525
<210> 3
<211> 1215
<212> DNA
<213> 枯草芽孢杆菌
<220>
<223> 天冬氨酸激酶 (AK)
<220>
<223> 天冬氨酸激酶 (AK)
<400> 3
atggctatta tcgtccaaaa attcggagga actagcgtta aggatgacaa agggagaaag 60
ttggccttag ggcacattaa ggaggcaatt tcagagggtt ataaggtggt tgtagttgta 120
tcggctatgg gtagaaaagg ggacccctac gcgacggact cactattggg tttactttac 180
ggggatcaat cagcaatcag cccaagagag caggatctgc tgctatcatg tggagaaacc 240
atatcctcgg ttgtgttcac cagcatgtta ttagataatg gagtaaaagc agcagccctg 300
acgggagccc aggctggttt tttaaccaac gatcagcata ctaatgcaaa aattatagag 360
atgaagcctg aacgtctttt cagtgttctt gcaaaccacg acgcagttgt cgtcgctgga 420
tttcagggcg ctaccgagaa aggagatact accacaatcg gtagaggtgg ctcggacacg 480
tcagctgcag ccctaggtgc tgctgttgat gcagagtaca tagatatctt tactgacgta 540
gaaggggtga tgaccgcaga tccaagagta gtagaaaatg caaagccact accagtggta 600
acttataccg aaatctgcaa cttggcttac caaggtgcta aggtaatatc tccaagagct 660
gtggaaattg ctatgcaagc aaaggttcct atccgtgtta ggagtactta ttcaaacgat 720
aaaggtacgt tagtaactag tcatcatagt tccaaagttg gctctgacgt ctttgaaagg 780
ttaatcactg gtatcgcaca tgttaaagac gtcactcaat tcaaggtccc ggcgaaaata 840
ggtcaatata acgttcaaac agaagtgttt aaagcgatgg cgaatgccgg tatatctgtc 900
gatttcttta atattacacc ctctgaaata gtatatacag tcgcgggtaa taagactgaa 960
acagctcaaa ggattttgat ggatatgggc tatgatccta tggtcacaag aaattgtgcc 1020
aaggtgtctg ccgtgggtgc tggcattatg ggtgtcccag gtgtgacatc gaaaattgtt 1080
tctgccttat ctgaaaaaga aattccgatt ttgcaatctg ctgattccca tacaacaatt 1140
tgggttttgg ttcatgaagc cgatatggtt cctgctgtta atgccttgca cgaagttttt 1200
gaattgtcca aataa 1215
<210> 4
<211> 404
<212> PRT
<213> 枯草芽孢杆菌
<220>
<223> 天冬氨酸激酶 (AK)
<220>
<223> 天冬氨酸激酶 (AK)
<400> 4
Met Ala Ile Ile Val Gln Lys Phe Gly Gly Thr Ser Val Lys Asp Asp
1 5 10 15
Lys Gly Arg Lys Leu Ala Leu Gly His Ile Lys Glu Ala Ile Ser Glu
20 25 30
Gly Tyr Lys Val Val Val Val Val Ser Ala Met Gly Arg Lys Gly Asp
35 40 45
Pro Tyr Ala Thr Asp Ser Leu Leu Gly Leu Leu Tyr Gly Asp Gln Ser
50 55 60
Ala Ile Ser Pro Arg Glu Gln Asp Leu Leu Leu Ser Cys Gly Glu Thr
65 70 75 80
Ile Ser Ser Val Val Phe Thr Ser Met Leu Leu Asp Asn Gly Val Lys
85 90 95
Ala Ala Ala Leu Thr Gly Ala Gln Ala Gly Phe Leu Thr Asn Asp Gln
100 105 110
His Thr Asn Ala Lys Ile Ile Glu Met Lys Pro Glu Arg Leu Phe Ser
115 120 125
Val Leu Ala Asn His Asp Ala Val Val Val Ala Gly Phe Gln Gly Ala
130 135 140
Thr Glu Lys Gly Asp Thr Thr Thr Ile Gly Arg Gly Gly Ser Asp Thr
145 150 155 160
Ser Ala Ala Ala Leu Gly Ala Ala Val Asp Ala Glu Tyr Ile Asp Ile
165 170 175
Phe Thr Asp Val Glu Gly Val Met Thr Ala Asp Pro Arg Val Val Glu
180 185 190
Asn Ala Lys Pro Leu Pro Val Val Thr Tyr Thr Glu Ile Cys Asn Leu
195 200 205
Ala Tyr Gln Gly Ala Lys Val Ile Ser Pro Arg Ala Val Glu Ile Ala
210 215 220
Met Gln Ala Lys Val Pro Ile Arg Val Arg Ser Thr Tyr Ser Asn Asp
225 230 235 240
Lys Gly Thr Leu Val Thr Ser His His Ser Ser Lys Val Gly Ser Asp
245 250 255
Val Phe Glu Arg Leu Ile Thr Gly Ile Ala His Val Lys Asp Val Thr
260 265 270
Gln Phe Lys Val Pro Ala Lys Ile Gly Gln Tyr Asn Val Gln Thr Glu
275 280 285
Val Phe Lys Ala Met Ala Asn Ala Gly Ile Ser Val Asp Phe Phe Asn
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Ile Thr Pro Ser Glu Ile Val Tyr Thr Val Ala Gly Asn Lys Thr Glu
305 310 315 320
Thr Ala Gln Arg Ile Leu Met Asp Met Gly Tyr Asp Pro Met Val Thr
325 330 335
Arg Asn Cys Ala Lys Val Ser Ala Val Gly Ala Gly Ile Met Gly Val
340 345 350
Pro Gly Val Thr Ser Lys Ile Val Ser Ala Leu Ser Glu Lys Glu Ile
355 360 365
Pro Ile Leu Gln Ser Ala Asp Ser His Thr Thr Ile Trp Val Leu Val
370 375 380
His Glu Ala Asp Met Val Pro Ala Val Asn Ala Leu His Glu Val Phe
385 390 395 400
Glu Leu Ser Lys
<210> 5
<211> 1098
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> 天冬氨酸半醛脱氢酶 (HOM2)
<220>
<223> 天冬氨酸半醛脱氢酶 (HOM2)
<400> 5
atggctggaa agaaaattgc tggtgttttg ggtgctactg gttccgttgg tcaacgtttc 60
attctgttgt tggcaaatca ccctcatttc gaactgaaag ttcttggtgc ctcttctaga 120
tcagctggca agaaatacgt tgacgctgtg aactggaagc aaaccgattt gctaccggaa 180
tctgctaccg atattattgt ttccgaatgt aaatctgaat tctttaaaga gtgtgacatc 240
gtcttttccg gattggatgc tgactatgct ggcgctatcg aaaaggaatt catggaagct 300
ggtatcgcca ttgtttccaa tgccaagaat tatagaagag aacaagatgt gccattgatt 360
gttcctgttg tcaatcctga gcatttggat attgtagctc aaaagcttga caccgccaag 420
gctcaaggta agccaagacc agggttcatt atctgtattt ccaattgttc cactgcaggt 480
ttggttgcac cattgaagcc tttgattgaa aaattcggtc ctattgatgc tttgaccact 540
actactttgc aagcaatctc aggtgctggt ttctccccag gtgtaccagg tattgatatt 600
ctagacaata ttattccata cattggtggt gaagaagaca agatggaatg ggagaccaag 660
aaaatcttgg ctccattagc agaagacaag acacacgtca aactattgac tccagaagaa 720
atcaaagtct ctgctcaatg taacagagtc gctgtttccg atgggcacac cgaatgtatc 780
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gttttggaac aaccagacag acctcaacca aggttggaca ggaacagaga cagcggttac 960
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tcccacaaca ccattattgg tgccgctggt tctggtgtct tgattgccga aatcttacta 1080
gcaagaaact tgatttaa 1098
<210> 6
<211> 1098
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> 天冬氨酸半醛脱氢酶 (HOM2)
<220>
<223> 天冬氨酸半醛脱氢酶 (HOM2)
<400> 6
atggctggaa agaaaattgc tggtgttttg ggtgctactg gttccgttgg tcaacgtttc 60
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gcaagaaact tgatttaa 1098
<210> 7
<211> 365
<212> PRT
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> 天冬氨酸半醛脱氢酶 (HOM2)
<220>
<223> 天冬氨酸半醛脱氢酶 (HOM2)
<400> 7
Met Ala Gly Lys Lys Ile Ala Gly Val Leu Gly Ala Thr Gly Ser Val
1 5 10 15
Gly Gln Arg Phe Ile Leu Leu Leu Ala Asn His Pro His Phe Glu Leu
20 25 30
Lys Val Leu Gly Ala Ser Ser Arg Ser Ala Gly Lys Lys Tyr Val Asp
35 40 45
Ala Val Asn Trp Lys Gln Thr Asp Leu Leu Pro Glu Ser Ala Thr Asp
50 55 60
Ile Ile Val Ser Glu Cys Lys Ser Glu Phe Phe Lys Glu Cys Asp Ile
65 70 75 80
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Phe Met Glu Ala Gly Ile Ala Ile Val Ser Asn Ala Lys Asn Tyr Arg
100 105 110
Arg Glu Gln Asp Val Pro Leu Ile Val Pro Val Val Asn Pro Glu His
115 120 125
Leu Asp Ile Val Ala Gln Lys Leu Asp Thr Ala Lys Ala Gln Gly Lys
130 135 140
Pro Arg Pro Gly Phe Ile Ile Cys Ile Ser Asn Cys Ser Thr Ala Gly
145 150 155 160
Leu Val Ala Pro Leu Lys Pro Leu Ile Glu Lys Phe Gly Pro Ile Asp
165 170 175
Ala Leu Thr Thr Thr Thr Leu Gln Ala Ile Ser Gly Ala Gly Phe Ser
180 185 190
Pro Gly Val Pro Gly Ile Asp Ile Leu Asp Asn Ile Ile Pro Tyr Ile
195 200 205
Gly Gly Glu Glu Asp Lys Met Glu Trp Glu Thr Lys Lys Ile Leu Ala
210 215 220
Pro Leu Ala Glu Asp Lys Thr His Val Lys Leu Leu Thr Pro Glu Glu
225 230 235 240
Ile Lys Val Ser Ala Gln Cys Asn Arg Val Ala Val Ser Asp Gly His
245 250 255
Thr Glu Cys Ile Ser Leu Arg Phe Lys Asn Arg Pro Ala Pro Ser Val
260 265 270
Glu Gln Val Lys Thr Cys Leu Lys Glu Tyr Val Cys Asp Ala Tyr Lys
275 280 285
Leu Gly Cys His Ser Ala Pro Lys Gln Thr Ile His Val Leu Glu Gln
290 295 300
Pro Asp Arg Pro Gln Pro Arg Leu Asp Arg Asn Arg Asp Ser Gly Tyr
305 310 315 320
Gly Val Ser Val Gly Arg Ile Arg Glu Asp Pro Leu Leu Asp Phe Lys
325 330 335
Met Val Val Leu Ser His Asn Thr Ile Ile Gly Ala Ala Gly Ser Gly
340 345 350
Val Leu Ile Ala Glu Ile Leu Leu Ala Arg Asn Leu Ile
355 360 365
<210> 8
<211> 1413
<212> DNA
<213> 铜绿假单胞菌
<220>
<223> 二氨基丁酸氨基转移酶 (EctB)
<220>
<223> 二氨基丁酸氨基转移酶 (EctB)
<400> 8
atggctcacg ttgctacatc agttatcgag gaccaaccct tacgcgccac tcccgcagaa 60
ggcgagactc tgtacgagtt ctcccaatct cctctcttag aacgtcagtc tcgccaagag 120
agcaatgctc gaagctatcc acgtagaata ccacttgcat taaagaaggc ccgaggtctg 180
ctagtggaag acgtcgaagg gaggactttc attgactgtc tcgccggtgc aggaacccta 240
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ttgcccttgc acaccttaga tttgacgacc cctgtgaagg accaattcgt ccaggattta 360
tttgggttgc tcccacctgc tttggcagcg gaagccaaga tccaattctg tgggccaaca 420
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atactaagtt ttcaaggagg atatcacgga atgtcccaag gtgcactggg cttgatgggc 540
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tacccgtacg attacagatg tccattcggt ctgggtggcg aagctggagt caaggcgaat 660
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gtcattgttg aagttgtaca aggcgaaggt ggggtcgtgc cagcagattt ggactggtta 780
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agattcttgc cacctttgat tattggggca gaacagatag acgaagtggc gcgtagattt 1380
gccagggcat taggagctgc ccttgctggg taa 1413
<210> 9
<211> 1266
<212> DNA
<213> 伸长盐单胞菌
<220>
<223> 二氨基丁酸氨基转移酶 (EctB)
<220>
<223> 二氨基丁酸氨基转移酶 (EctB)
<400> 9
atgcagacac aaatcttgga acgtatggaa tccgacgtca gaacgtactc aagatctttc 60
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ctcaagagat tagaaagcat ttgtagagca aatgatattt tgttaatcat cgatgatata 720
caagccggct gcggaagaac tggaaagttc ttctcattcg aacatgctgg tattactcct 780
gatattgtca caaactcgaa atctttgtca ggatatggtt tgccctttgc tcatgtgctt 840
atgagaccgg agcttgataa atggaaacca ggacaatata acggaacatt ccggggtttc 900
aatctagctt tcgcgaccgc tgctgcagca atgaggaaat actggtcgga cgatacgttt 960
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<210> 10
<211> 470
<212> PRT
<213> 铜绿假单胞菌
<220>
<223> 二氨基丁酸氨基转移酶 (EctB)
<220>
<223> 二氨基丁酸氨基转移酶 (EctB)
<400> 10
Met Ala His Val Ala Thr Ser Val Ile Glu Asp Gln Pro Leu Arg Ala
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Thr Pro Ala Glu Gly Glu Thr Leu Tyr Glu Phe Ser Gln Ser Pro Leu
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Arg Ile Pro Leu Ala Leu Lys Lys Ala Arg Gly Leu Leu Val Glu Asp
50 55 60
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Ala Leu Gly His Asn His Pro Val Val Ile Glu Ala Ile Arg Gln Val
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Lys Asp Gln Phe Val Gln Asp Leu Phe Gly Leu Leu Pro Pro Ala Leu
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Ala Ala Glu Ala Lys Ile Gln Phe Cys Gly Pro Thr Gly Thr Asp Ala
130 135 140
Val Glu Ala Ala Leu Lys Leu Val Arg Thr Ala Thr Gly Arg Ser Thr
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Ile Leu Ser Phe Gln Gly Gly Tyr His Gly Met Ser Gln Gly Ala Leu
165 170 175
Gly Leu Met Gly Asn Leu Gly Pro Lys Lys Pro Leu Gly Ala Val Leu
180 185 190
Ser Thr Gly Val Gln Phe Leu Pro Tyr Pro Tyr Asp Tyr Arg Cys Pro
195 200 205
Phe Gly Leu Gly Gly Glu Ala Gly Val Lys Ala Asn Leu His Tyr Leu
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Glu Asn Leu Leu Asn Asp Pro Glu Gly Gly Val Gln Leu Pro Ala Ala
225 230 235 240
Val Ile Val Glu Val Val Gln Gly Glu Gly Gly Val Val Pro Ala Asp
245 250 255
Leu Asp Trp Leu Arg Gly Leu Arg Arg Ile Thr Glu Gln Ala Gly Val
260 265 270
Ala Leu Ile Val Asp Glu Ile Gln Ser Gly Phe Ala Arg Thr Gly Arg
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Met Phe Ala Phe Glu His Ala Gly Ile Val Pro Asp Val Val Val Leu
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Glu Trp Leu Asp Lys Trp Gln Pro Gly Ala His Ala Gly Thr Phe Arg
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Gly Asn Gln Met Ala Met Ala Ala Gly Ser Ala Val Met Arg Tyr Leu
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<210> 11
<211> 421
<212> PRT
<213> 伸长盐单胞菌
<220>
<223> 二氨基丁酸氨基转移酶 (EctB)
<220>
<223> 二氨基丁酸氨基转移酶 (EctB)
<400> 11
Met Gln Thr Gln Ile Leu Glu Arg Met Glu Ser Asp Val Arg Thr Tyr
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Gln Ala Gly Cys Gly Arg Thr Gly Lys Phe Phe Ser Phe Glu His Ala
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Gly Ile Thr Pro Asp Ile Val Thr Asn Ser Lys Ser Leu Ser Gly Tyr
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<211> 1461
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> 高丝氨酸 O-乙酰转移酶 (MET2; METX)
<220>
<223> 高丝氨酸 O-乙酰转移酶 (MET2; METX)
<400> 12
atgtcgcata ctttaaaatc gaaaacgctc caagagctgg acattgagga gattaaggaa 60
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gaagaagtta ccaactggta g 1461
<210> 13
<211> 486
<212> PRT
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> 高丝氨酸 O-乙酰转移酶 (MET2; METX)
<220>
<223> 高丝氨酸 O-乙酰转移酶 (MET2; METX)
<400> 13
Met Ser His Thr Leu Lys Ser Lys Thr Leu Gln Glu Leu Asp Ile Glu
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Glu Ile Lys Glu Thr Asn Pro Leu Leu Lys Leu Val Gln Gly Gln Arg
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Ala Asp Trp Trp Gly Pro Leu Leu Gly Asn Asp Leu Ala Phe Asp Pro
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115 120 125
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Ala Ser Thr Ala Ile Ala Gly Ile Ser Gly Gln Lys Gly Gln Ser Val
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Val Ser Thr Ala Ser Ser Ser Asp Ser Leu Asn Ser Ser Thr Ser Met
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Thr Ser Val Ser Ser Val Thr Gly Glu Val Lys Asp Ile Lys Pro Ala
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340 345 350
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385 390 395 400
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405 410 415
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<212> DNA
<213> 伸长盐单胞菌
<220>
<223> 酸乙酰转移酶 (EctA)
<220>
<223> 酸乙酰转移酶 (EctA)
<400> 14
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<211> 192
<212> PRT
<213> 伸长盐单胞菌
<220>
<223> 酸乙酰转移酶 (EctA)
<220>
<223> 酸乙酰转移酶 (EctA)
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<212> DNA
<213> 伸长盐单胞菌
<220>
<223> 依克多因合酶 (EctC)
<220>
<223> 依克多因合酶 (EctC)
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<211> 137
<212> PRT
<213> 伸长盐单胞菌
<220>
<223> 依克多因合酶 (EctC)
<220>
<223> 依克多因合酶 (EctC)
<400> 17
Met Ile Val Arg Asn Leu Glu Glu Ala Arg Gln Thr Asp Arg Leu Val
1 5 10 15
Thr Ala Glu Asn Gly Asn Trp Asp Ser Thr Arg Leu Ser Leu Ala Glu
20 25 30
Asp Gly Gly Asn Cys Ser Phe His Ile Thr Arg Ile Phe Glu Gly Thr
35 40 45
Glu Thr His Ile His Tyr Lys His His Phe Glu Ala Val Tyr Cys Ile
50 55 60
Glu Gly Glu Gly Glu Val Glu Thr Leu Ala Asp Gly Lys Ile Trp Pro
65 70 75 80
Ile Lys Pro Gly Asp Ile Tyr Ile Leu Asp Gln His Asp Glu His Leu
85 90 95
Leu Arg Ala Ser Lys Thr Met His Leu Ala Cys Val Phe Thr Pro Gly
100 105 110
Leu Thr Gly Asn Glu Val His Arg Glu Asp Gly Ser Tyr Ala Pro Ala
115 120 125
Asp Glu Ala Asp Asp Gln Lys Pro Leu
130 135
<210> 18
<211> 1080
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> 高丝氨酸脱氢酶 (HOM6)
<220>
<223> 高丝氨酸脱氢酶 (HOM6)
<400> 18
atgagcacta aagttgttaa tgttgccgtt atcggtgccg gtgttgttgg ttcagctttc 60
ttggatcaat tgttagccat gaagtctacc attacttaca atctagttct tttggctgaa 120
gctgagcgtt ctttaatctc caaggacttt tctccattaa atgttggttc tgattggaag 180
gctgctttag cagcctccac tactaaaacg ttgcctttgg atgatttaat tgctcatttg 240
aagacttcac ctaagccagt cattttggtt gataacactt ccagcgctta cattgctggt 300
ttttacacta agtttgtcga aaatggtatt tccattgcta ctccaaacaa gaaggccttt 360
tcctctgatt tggctacctg gaaggctctt ttctcaaata agccaactaa cggttttgtc 420
tatcatgaag ctaccgtcgg tgctggtttg cctatcatca gtttcttaag agaaattatt 480
caaaccggtg acgaagttga aaaaattgaa ggtatcttct ctggtactct atcttatatt 540
ttcaacgagt tctccactag tcaagctaac gacgtcaaat tctctgatgt tgtcaaagtt 600
gctaaaaaat tgggttatac tgaaccagat ccaagagatg atttgaatgg gttggatgtt 660
gctagaaagg ttaccattgt tggtaggata tctggtgtgg aagttgaatc tccaacttcc 720
ttccctgtcc agtctttgat tccaaaacca ttggaatctg tcaagtctgc tgatgaattc 780
ttggaaaaat tatctgatta cgataaagat ttgactcaat tgaagaagga agctgccact 840
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ggaattgaaa agtacgatta ctcacaccca ttcgcatcat tgaagggatc agataacgtt 960
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<212> PRT
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> 高丝氨酸脱氢酶 (HOM6)
<220>
<223> 高丝氨酸脱氢酶 (HOM6)
<400> 19
Met Ser Thr Lys Val Val Asn Val Ala Val Ile Gly Ala Gly Val Val
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Gly Ser Ala Phe Leu Asp Gln Leu Leu Ala Met Lys Ser Thr Ile Thr
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Tyr Asn Leu Val Leu Leu Ala Glu Ala Glu Arg Ser Leu Ile Ser Lys
35 40 45
Asp Phe Ser Pro Leu Asn Val Gly Ser Asp Trp Lys Ala Ala Leu Ala
50 55 60
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65 70 75 80
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Tyr Ile Ala Gly Phe Tyr Thr Lys Phe Val Glu Asn Gly Ile Ser Ile
100 105 110
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115 120 125
Ala Leu Phe Ser Asn Lys Pro Thr Asn Gly Phe Val Tyr His Glu Ala
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165 170 175
Leu Ser Tyr Ile Phe Asn Glu Phe Ser Thr Ser Gln Ala Asn Asp Val
180 185 190
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195 200 205
Pro Asp Pro Arg Asp Asp Leu Asn Gly Leu Asp Val Ala Arg Lys Val
210 215 220
Thr Ile Val Gly Arg Ile Ser Gly Val Glu Val Glu Ser Pro Thr Ser
225 230 235 240
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245 250 255
Ala Asp Glu Phe Leu Glu Lys Leu Ser Asp Tyr Asp Lys Asp Leu Thr
260 265 270
Gln Leu Lys Lys Glu Ala Ala Thr Glu Asn Lys Val Leu Arg Phe Ile
275 280 285
Gly Lys Val Asp Val Ala Thr Lys Ser Val Ser Val Gly Ile Glu Lys
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305
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<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> 天冬氨酸转氨酶 (AAT2)
<220>
<223> 天冬氨酸转氨酶 (AAT2)
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<210> 21
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<212> PRT
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> 天冬氨酸转氨酶 (AAT2)
<220>
<223> 天冬氨酸转氨酶 (AAT2)
<400> 21
Met Ser Ala Thr Leu Phe Asn Asn Ile Glu Leu Leu Pro Pro Asp Ala
1 5 10 15
Leu Phe Gly Ile Lys Gln Arg Tyr Gly Gln Asp Gln Arg Ala Thr Lys
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Val Asp Leu Gly Ile Gly Ala Tyr Arg Asp Asp Asn Gly Lys Pro Trp
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Ser Asn Ala Ala Lys Ile Ile Phe Gly Thr Gln Ser Asp Ala Phe Gln
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Gly Asp Leu Asp Lys Asp Ala Tyr Ala Val Arg Leu Gly Val Glu Lys
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Leu Ser Thr Val Ser Pro Val Phe Val Cys Gln Ser Phe Ala Lys Asn
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<212> DNA
<213> 有尾内毛虫
<220>
<223> 谷氨酸脱氢酶 (GDH)
<220>
<223> 谷氨酸脱氢酶 (GDH)
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gagaatggga taaacaccga cgagaaaatc aactacatgt tggaattaag agcctcaaat 840
aatgatgtgg ttgcgccatt tgcagagaag tttggtgcaa aattcatacc agggaagaag 900
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<210> 23
<211> 438
<212> PRT
<213> 有尾内毛虫
<220>
<223> 谷氨酸脱氢酶 (GDH)
<220>
<223> 谷氨酸脱氢酶 (GDH)
<400> 23
Met Ile Asp Leu Glu Ala Arg Asn Pro Ala Gln Pro Glu Phe Ile Gln
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195 200 205
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Ile Ala Ile Ser Gly Phe Gly Asn Val Ala Phe Gly Ala Val Leu Lys
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Ala Lys Gln Leu Gly Ala Lys Val Val Thr Ile Ser Gly Pro Asp Gly
245 250 255
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355 360 365
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<220>
<223> pTDH3
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ctatctcatt ttcttacacc ttctattacc ttctgctctc tctgatttgg aaaaagctga 360
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<212> DNA
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<220>
<223> pENO2
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<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
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tttaatctta ttttgagtta cattatagtt ccctaactgc aagagaagta acattaaaa 419
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<212> DNA
<213> 酿酒酵母
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tcacatacgt tgcatacgtc gatatagata ataatgataa tgacagcagg attatcgtaa 120
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<400> 32
ttatttacct atctctaaac ttcaacacct tatatcataa ctaatatttc ttgagataag 60
cacactgcac ccataccttc cttaaaaacg tagcttccag tttttggtgg ttccggcttc 120
cttcccgatt ccgcccgcta aacgcatatt tttgttgcct ggtggcattt gcaaaatgca 180
taacctatgc atttaaaaga ttatgtatgc tcttctgact tttcgtgtga tgaggctcgt 240
ggaaaaaatg aataatttat gaatttgaga acaattttgt gttgttacgg tattttacta 300
tggaataatc aatcaattga ggattttatg caaatatcgt ttgaatattt ttccgaccct 360
ttgagtactt ttcttcataa ttgcataata ttgtccgctg cccctttttc tgttagacgg 420
tgtcttgatc tacttgctat cgttcaacac caccttattt tctaactatt ttttttttag 480
ctcatttgaa tcagcttatg gtgatggcac atttttgcat aaacctagct gtcctcgttg 540
aacataggaa aaaaaaatat ataaacaagg ctctttcact ctccttgcaa tcagatttgg 600
gtttgttccc tttattttca tatttcttgt catattcctt tctcaattat tattttctac 660
tcataacctc acgcaaaata acacagtcaa atcaatcaaa 700
<210> 33
<211> 998
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pCCW12" <223> "pCCW12
<220>
<223> pCCW12
<220>
<223> pCCW12
<400> 33
aaccagggca aagcaaaata aaagaaactt aatacgttat gccgtaatga agggctacca 60
aaaacgataa tctcaactgt aaacaggtac aatgcggacc cttttgccac aaaacataca 120
tcattcattg ccggaaaaag aaagaagtga agacagcagt gcagccagcc atgttgcgcc 180
aatctaatta tagatgctgg tgccctgagg atgtatctgg agccagccat ggcatcatgc 240
gctaccgccg gatgtaaaat ccgacacgca aaagaaaacc ttcgaggttg cgcacttcgc 300
ccacccatga accacacggt tagtccaaaa ggggcagttc agattccaga tgcgggaatt 360
agcttgctgc caccctcacc tcactaacgc tgcggtgtgc ggatacttca tgctatttat 420
agacgcgcgt gtcggaatca gcacgcgcaa gaaccaaatg ggaaaatcgg aatgggtcca 480
gaactgcttt gagtgctggc tattggcgtc tgatttccgt tttgggaatc ctttgccgcg 540
cgcccctctc aaaactccgc acaagtccca gaaagcggga aagaaataaa acgccaccaa 600
aaaaaaaaat aaaagccaat cctcgaagcg tgggtggtag gccctggatt atcccgtaca 660
agtatttctc aggagtaaaa aaaccgtttg ttttggaatt ccccatttcg cggccaccta 720
cgccgctatc tttgcaacaa ctatctgcga taactcagca aattttgcat attcgtgttg 780
cagtattgcg ataatgggag tcttacttcc aacataacgg cagaaagaaa tgtgagaaaa 840
ttttgcatcc tttgcctccg ttcaagtata taaagtcggc atgcttgata atctttcttt 900
ccatcctaca ttgttctaat tattcttatt ctcctttatt ctttcctaac ataccaagaa 960
attaatcttc tgtcattcgc ttaaacacta tatcaata 998
<210> 34
<211> 700
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pGK1" <223> "pGK1
<220>
<223> pGK1
<220>
<223> pGK1
<400> 34
gtgagtaagg aaagagtgag gaactatcgc atacctgcat ttaaagatgc cgatttgggc 60
gcgaatcctt tattttggct tcaccctcat actattatca gggccagaaa aaggaagtgt 120
ttccctcctt cttgaattga tgttaccctc ataaagcacg tggcctctta tcgagaaaga 180
aattaccgtc gctcgtgatt tgtttgcaaa aagaacaaaa ctgaaaaaac ccagacacgc 240
tcgacttcct gtcttcctat tgattgcagc ttccaatttc gtcacacaac aaggtcctag 300
cgacggctca caggttttgt aacaagcaat cgaaggttct ggaatggcgg gaaagggttt 360
agtaccacat gctatgatgc ccactgtgat ctccagagca aagttcgttc gatcgtactg 420
ttactctctc tctttcaaac agaattgtcc gaatcgtgtg acaacaacag cctgttctca 480
cacactcttt tcttctaacc aagggggtgg tttagtttag tagaacctcg tgaaacttac 540
atttacatat atataaactt gcataaattg gtcaatgcaa gaaatacata tttggtcttt 600
tctaattcgt agtttttcaa gttcttagat gctttctttt tctctttttt acagatcatc 660
aaggaagtaa ttatctactt tttacaacaa atataaaaca 700
<210> 35
<211> 913
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pMDH2" <223> "pMDH2
<220>
<223> pMDH2
<220>
<223> pMDH2
<400> 35
ccttcgctaa ataataaacc tgaactgtac ttagcgaagc cttcatagca cctacgtaca 60
cgtatatata gacattttac gtaatggaga aactgaggtt tttgttttca ctttttttct 120
ttctttttca ctattgctcg aaccgcctgc gatgagctaa gaaaaaaaag tgaaagaaat 180
catagaaagc aaaaatgaga ttatatagcc cagagccctc ttctggcgcc tgtcccaagg 240
cggaccaaca acaacacttg cccaaaccta agaaaatccc ctcatacttt tccgtttgta 300
tctcctactt tcttacttcc tttttttctt ctttatttgc ttggtttacc attgaagtcc 360
atttttacta cagacaatag ctagtcattc gctatcttcc gtttgtcact ttttttcaaa 420
tttctcatct atatagcgaa gtacggaaaa gatgtcactt gccggcatct cggccttccc 480
cggccaaatg gactcatcat ctacgatacg gcccctttaa tccgcaatta ctttgcccat 540
tcggccgtag ccgttctaaa gccgccgtgc cttgccccca atactcccct aatgatccgg 600
gaagttccgg tttttttcct ttgtttagtg gcattttgtg ttgcccaagg ttgggaaggt 660
ccgatttgac tttaaggaac tacggaaggt atctaaggtt tctaaaaaca atatacacgc 720
gcgtgcgtag atatataaag ataaagattt atcgatatga gataaagatt gctgcatgat 780
tctccttctg attctttttc cctgtatata ttttctcccc ttctgtataa atcgtacagt 840
cagaagtagt ccagaatata gtgctgcaga ctattacaaa agttcaatac aatatcataa 900
aagttatagt aac 913
<210> 36
<211> 406
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pURA3" <223> "pURA3
<220>
<223> pURA3
<220>
<223> pURA3
<400> 36
ggtacccaaa ccgaagttat ctgatgtaga aaaggattaa agatgctaag agatagtgat 60
gatatttcat aaataatgta attctatata tgttaattac cttttttgcg aggcatattt 120
atggtgaagg ataagttttg accatcaaag aaggttaatg tggctgtggt ttcagggtcc 180
ataaagcttt tcaattcatc tttttttttt ttgttctttt ttttgattcc ggtttctttg 240
aaattttttt gattcggtaa tctccgagca gaaggaagaa cgaaggaagg agcacagact 300
tagattggta tatatacgca tatgtggtgt tgaagaaaca tgaaattgcc cagtattctt 360
aacccaactg cacagaacaa aaacctgcag gaaacgaaga taaatc 406
<210> 37
<211> 535
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pRPLA1" <223> "pRPLA1
<220>
<223> pRPLA1
<220>
<223> pRPLA1
<400> 37
tcaagttgga tactgatctg atctctccgc cctactacca gggaccctca tgattaccgc 60
tcgaatgcga cgtttcctgc ctcataaaac tggcttgaaa atatttattc gctgaacagt 120
agcctagctt ataaaaattt catttaatta atgtaatatg aaaactcaca tgccttctgt 180
ttctaaaatt gtcacagcaa gaaataacat taccatacgt gatcttatta aactctagta 240
tcttgtctaa tacttcattt aaaagaagcc ttaaccctgt agcctcatct atgtctgcta 300
catatcgtga ggtacgaata tcgtaagatg ataccacgca actttgtaat gatttttttt 360
ttttcatttt ttaaagaatg cctttacatg gtatttgaaa aaaatatctt tataaagttt 420
gcgatctctt ctgttctgaa taatttttag taaaagaaat caaaagaata aagaaatagt 480
ccgctttgtc caatacaaca gcttaaaccg attatctcta aaataacaag aagaa 535
<210> 38
<211> 400
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pSAM4" <223> "pSAM4
<220>
<223> pSAM4
<220>
<223> pSAM4
<400> 38
agattttggt gttagatggt actcttgcat atgtaacctt taataaattt tgcaaatcga 60
attcctttgt aacgtgcaaa gcattttata gcctggcgct cgcattgtta agcaacaggc 120
ggtgcggcaa cgttgaaatg tttcacgcag ggttttttac gtactgcacg gcattctgga 180
gtgaaaaaaa atgaaaagta cagctcgaag ttttttgtcc atcggttgta ctttgcagag 240
tattagtcat ttttgatatc agagtactac tatcgaagca tttttacgct tgaataactt 300
gaatattatt gaaagcttag ttcaaccaag ctgaaaagaa ccattattca acataattgg 360
aaatcatttc gttactaaat cgtccgaaaa ttgcagaaaa 400
<210> 39
<211> 505
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pCUP1-1" <223> "pCUP1-1
<220>
<223> pCUP1-1
<220>
<223> pCUP1-1
<400> 39
cggcaaactt caacgatttc tatgatgcat tttataatta gtaagccgat cccattaccg 60
acatttgggc gctatacgtg catatgttca tgtatgtatc tgtatttaaa acacttttgt 120
attatttttc ctcatatatg tgtataggtt tatacggatg atttaattat tacttcacca 180
ccctttattt caggctgata tcttagcctt gttactagtt agaaaaagac atttttgctg 240
tcagtcactg tcaagagatt cttttgctgg catttcttcc agaagcaaaa agagcgatgc 300
gtcttttccg ctgaaccgtt ccagcaaaaa agactaccaa cgcaatatgg attgtcagaa 360
tcatataaaa gagaagcaaa taactccttg tcttgtatca attgcattat aatatcttct 420
tgttagtgca atatcatata gaagtcatcg aaatagatat taagaaaaac aaactgtaca 480
atcaatcaat caatcatcac ataaa 505
<210> 40
<211> 500
<212> DNA
<213> 光滑假丝酵母
<220>
<223> pCUP1.Cgla" <223> "pCUP1.Cgla
<220>
<223> pCUP1.Cgla
<220>
<223> pCUP1.Cgla
<400> 40
cacaccacac aaccgtcagc accccggctg tacgtctgtg aaggctgcgg tatagacacg 60
gactgcgata cagaactcat gacttatatc tgtagactcc tctgcttcaa tgcgaactcc 120
aggatcaccg aatagcatgc gatgagctgt tgattcttat atataattat ctattgcatt 180
ttttttttaa tgctgcatgg gggggcctag taaatcaccc gtacaagtca cgcgtgagag 240
aaagagaagg gccctttcgt cgtggaagcg tggatcgtga gcgacctgtt tctaaatata 300
gcttttgggt aggatattat attaagtgaa attttattag agggtaaatg tatgtgaaag 360
ttatgtataa tatgttgcta aattagcgat cgtgaatgca tagaatctaa tcgttataga 420
aaaccgcaac ttgtgctgtt ttgttgtgtt ttcttgtcgt ttttttatat tatttatcta 480
gtattttgct ttagttgtta 500
<210> 41
<211> 425
<212> DNA
<213> 贝酵母
<220>
<223> pCUP1.Sba" <223> "pCUP1.Sba
<220>
<223> pCUP1.Sba
<220>
<223> pCUP1.Sba
<400> 41
agaaggaggg gtcctattac caatacttgg acgctatacg tgcatatgta catgtacgta 60
tctgtattta aacacttttg tattattttc tttatatatg tgtataggtt tacatggttg 120
acttttatca ttgtttgtgc acatttgcaa tggccatttt tttgtttttg agaaaggtat 180
tattgctgtc actattcgag atgcttttgc tgacattcct cctagaagcc aaaaggccga 240
tgcgtttttt ccgctgagag gataccagca aaaaaagcta ccagtacaag atgggacggc 300
aaaagcgtat aaaagaagaa gcaaaatgac cagatatgct ttcaatttca tcaatgtttc 360
tttctccctg ttatgatcca gaagaataat caaaagcaaa acatctattc aatcaatctc 420
ataaa 425
<210> 42
<211> 741
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pACU1" <223> "pACU1
<220>
<223> pACU1
<220>
<223> pACU1
<400> 42
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgaat 360
tcgaaaaaga catttttgct gtcagtcact gtcaagagat tcttttgctg gcatttcttc 420
cagaagcaaa aagagcgatg cgtcttttcc gctgaaccgt tccagcaaaa aagactacca 480
acgaattcta attaagttag tcaaggcgcc atcctcatga aaactgtgta acataataac 540
cgaagtgtcg aaaaggtggc accttgtcca attgaacacg ctcgatgaaa aaaataagat 600
atatataagg ttaagtaaag cgtctgttag aaaggaagtt tttccttttt cttgctctct 660
tgtcttttca tctactattt ccttcgtgta atacagggtc gtcagataca tagatacaat 720
tctattaccc ccatccatac a 741
<210> 43
<211> 757
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pACU2" <223> "pACU2
<220>
<223> pACU2
<220>
<223> pACU2
<400> 43
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccgaatt cgaaaaagac atttttgctg tcagtcactg 360
tcaagagatt cttttgctgg catttcttcc agaagcaaaa agagcgatgc gtcttttccg 420
ctgaaccgtt ccagcaaaaa agactaccaa cgaattccac gtgaagctgt cgatattggg 480
gaactgtggt ggttggcaaa tgactaatta agttagtcaa ggcgccatcc tcatgaaaac 540
tgtgtaacat aataaccgaa gtgtcgaaaa ggtggcacct tgtccaattg aacacgctcg 600
atgaaaaaaa taagatatat ataaggttaa gtaaagcgtc tgttagaaag gaagtttttc 660
ctttttcttg ctctcttgtc ttttcatcta ctatttcctt cgtgtaatac agggtcgtca 720
gatacataga tacaattcta ttacccccat ccataca 757
<210> 44
<211> 498
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pACU3p" <223> "pACU3p
<220>
<223> pACU3p
<220>
<223> pACU3p
<400> 44
ttatattgaa ttttcaaaaa ttcttacttt ttttttggat ggacgcaaag aagtttaata 60
atcatattac atggcattac caccatatac atatccatat ctaatcttac ttatatgttg 120
tggaaatgta aagagcccga attcgaaaaa gacatttttg ctgtcagtca ctgtcaagag 180
attcttttgc tggcatttct tccagaagca aaaagagcga tgcgtctttt ccgctgaacc 240
gttccagcaa aaaagactac caacgaattc ggatgataat gcgattagtt ttttagcctt 300
atttctgggg taattaatca gcgaagcgat gatttttgat ctattaacag atatataaat 360
ggaaaagctg cataaccact ttaactaata ctttcaacat tttcagtttg tattacttct 420
tattcaaatg tcataaaagt atcaacaaaa aattgttaat atacctctat actttaacgt 480
caaggagaaa aaactata 498
<210> 45
<211> 498
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pACU4p" <223> "pACU4p
<220>
<223> pACU4p
<220>
<223> pACU4p
<400> 45
ttatattgaa ttttcaaaaa ttcttacttt ttttttggat ggacgcaaag aagtttaata 60
atcatattac atggcattac caccatatac atatccatat ctaatcttac ttatatgttg 120
tggaaatgta aagagcccga attcgttggt agtctttttt gctggaacgg ttcagcggaa 180
aagacgcatc gctctttttg cttctggaag aaatgccagc aaaagaatct cttgacagtg 240
actgacagca aaaatgtctt tttcgaattc ggatgataat gcgattagtt ttttagcctt 300
atttctgggg taattaatca gcgaagcgat gatttttgat ctattaacag atatataaat 360
ggaaaagctg cataaccact ttaactaata ctttcaacat tttcagtttg tattacttct 420
tattcaaatg tcataaaagt atcaacaaaa aattgttaat atacctctat actttaacgt 480
caaggagaaa aaactata 498
<210> 46
<211> 530
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pACU5" <223> "pACU5
<220>
<223> pACU5
<220>
<223> pACU5
<400> 46
ggaggacgaa acaaaaaagt gaaaaaaaat gaaaattttt ttggaaaacc aagaaatgaa 60
ttatatttcc gtgtgagacg acatcgtcga atatgattca gggtaacagt attgatgtaa 120
tcaatttcct acctgaatct aaaattcccg gaattcgaaa aagacatttt tgctgtcagt 180
cactgtcaag agattctttt gctggcattt cttccagaag caaaaagagc gatgcgtctt 240
ttccgctgaa ccgttccagc aaaaaagact accaacgaat tccgagcaga tccgccaggc 300
gtgtatatat agcgtggatg gccaggcaac tttagtgctg acacatacag gcatatatat 360
atgtgtgcga cgacacatga tcatatggca tgcatgtgct ctgtatgtat ataaaactct 420
tgttttcttc ttttctctaa atattctttc cttatacatt aggacctttg cagcataaat 480
tactatactt ctatagacac acaaacacaa atacacacac taaattaata 530
<210> 47
<211> 867
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pACU6" <223> "pACU6
<220>
<223> pACU6
<220>
<223> pACU6
<400> 47
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgaat 360
tcgaaaaaga catttttgct gtcagtcact gtcaagagat tcttttgctg gcatttcttc 420
cagaagcaaa aagagcgatg cgtcttttcc gctgaaccgt tccagcaaaa aagactacca 480
acgaattcga aaaagacatt tttgctgtca gtcactgtca agagattctt ttgctggcat 540
ttcttccaga agcaaaaaga gcgatgcgtc ttttccgctg aaccgttcca gcaaaaaaga 600
ctaccaacga attctaatta agttagtcaa ggcgccatcc tcatgaaaac tgtgtaacat 660
aataaccgaa gtgtcgaaaa ggtggcacct tgtccaattg aacacgctcg atgaaaaaaa 720
taagatatat ataaggttaa gtaaagcgtc tgttagaaag gaagtttttc ctttttcttg 780
ctctcttgtc ttttcatcta ctatttcctt cgtgtaatac agggtcgtca gatacataga 840
tacaattcta ttacccccat ccataca 867
<210> 48
<211> 867
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pACU7" <223> "pACU7
<220>
<223> pACU7
<220>
<223> pACU7
<400> 48
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgaat 360
tcgttggtag tcttttttgc tggaacggtt cagcggaaaa gacgcatcgc tctttttgct 420
tctggaagaa atgccagcaa aagaatctct tgacagtgac tgacagcaaa aatgtctttt 480
tcgaattcgt tggtagtctt ttttgctgga acggttcagc ggaaaagacg catcgctctt 540
tttgcttctg gaagaaatgc cagcaaaaga atctcttgac agtgactgac agcaaaaatg 600
tctttttcga attctaatta agttagtcaa ggcgccatcc tcatgaaaac tgtgtaacat 660
aataaccgaa gtgtcgaaaa ggtggcacct tgtccaattg aacacgctcg atgaaaaaaa 720
taagatatat ataaggttaa gtaaagcgtc tgttagaaag gaagtttttc ctttttcttg 780
ctctcttgtc ttttcatcta ctatttcctt cgtgtaatac agggtcgtca gatacataga 840
tacaattcta ttacccccat ccataca 867
<210> 49
<211> 1119
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pACU8" <223> "pACU8
<220>
<223> pACU8
<220>
<223> pACU8
<400> 49
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgaat 360
tcgaaaaaga catttttgct gtcagtcact gtcaagagat tcttttgctg gcatttcttc 420
cagaagcaaa aagagcgatg cgtcttttcc gctgaaccgt tccagcaaaa aagactacca 480
acgaattcga aaaagacatt tttgctgtca gtcactgtca agagattctt ttgctggcat 540
ttcttccaga agcaaaaaga gcgatgcgtc ttttccgctg aaccgttcca gcaaaaaaga 600
ctaccaacga attcgaaaaa gacatttttg ctgtcagtca ctgtcaagag attcttttgc 660
tggcatttct tccagaagca aaaagagcga tgcgtctttt ccgctgaacc gttccagcaa 720
aaaagactac caacgaattc gaaaaagaca tttttgctgt cagtcactgt caagagattc 780
ttttgctggc atttcttcca gaagcaaaaa gagcgatgcg tcttttccgc tgaaccgttc 840
cagcaaaaaa gactaccaac gaattctaat taagttagtc aaggcgccat cctcatgaaa 900
actgtgtaac ataataaccg aagtgtcgaa aaggtggcac cttgtccaat tgaacacgct 960
cgatgaaaaa aataagatat atataaggtt aagtaaagcg tctgttagaa aggaagtttt 1020
tcctttttct tgctctcttg tcttttcatc tactatttcc ttcgtgtaat acagggtcgt 1080
cagatacata gatacaattc tattaccccc atccataca 1119
<210> 50
<211> 624
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pACU9" <223> "pACU9
<220>
<223> pACU9
<220>
<223> pACU9
<400> 50
tatagttttt tctccttgac gttaaagtat agaggtatat taacaatttt ttgttgatac 60
ttttatgaca tttgaataag aagtaataca aactgaaaat gttgaaagta ttagttaaag 120
tggttatgca gcttttccat ttatatatct gttaatagat caaaaatcat cgcttcgctg 180
attaattacc ccagaaataa ggctaaaaaa ctaatcgcat tatcatccga attcgaaaaa 240
gacatttttg ctgtcagtca ctgtcaagag attcttttgc tggcatttct tccagaagca 300
aaaagagcga tgcgtctttt ccgctgaacc gttccagcaa aaaagactac caacgaattc 360
gaaaaagaca tttttgctgt cagtcactgt caagagattc ttttgctggc atttcttcca 420
gaagcaaaaa gagcgatgcg tcttttccgc tgaaccgttc cagcaaaaaa gactaccaac 480
gaattcgggc tctttacatt tccacaacat ataagtaaga ttagatatgg atatgtatat 540
ggtggtaatg ccatgtaata tgattattaa acttctttgc gtccatccaa aaaaaaagta 600
agaatttttg aaaattcaat ataa 624
<210> 51
<211> 876
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pACU10p" <223> "pACU10p
<220>
<223> pACU10p
<220>
<223> pACU10p
<400> 51
ttatattgaa ttttcaaaaa ttcttacttt ttttttggat ggacgcaaag aagtttaata 60
atcatattac atggcattac caccatatac atatccatat ctaatcttac ttatatgttg 120
tggaaatgta aagagcccga attggttggt agtctttttt gctggaacgg ttcagcggaa 180
aagacgcatc gctctttttg cttctggaag aaatgccagc aaaagaatct cttgacagtg 240
actgacagca aaaatgtctt tttcgaattc gttggtagtc ttttttgctg gaacggttca 300
gcggaaaaga cgcatcgctc tttttgcttc tggaagaaat gccagcaaaa gaatctcttg 360
acagtgactg acagcaaaaa tgtctttttc gaattcgttg gtagtctttt ttgctggaac 420
ggttcagcgg aaaagacgca tcgctctttt tgcttctgga agaaatgcca gcaaaagaat 480
ctcttgacag tgactgacag caaaaatgtc tttttcgaat tcgttggtag tcttttttgc 540
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aagaatctct tgacagtgac tgacagcaaa aatgtctttt tccaattcgg atgataatgc 660
gattagtttt ttagccttat ttctggggta attaatcagc gaagcgatga tttttgatct 720
attaacagat atataaatgg aaaagctgca taaccacttt aactaatact ttcaacattt 780
tcagtttgta ttacttctta ttcaaatgtc ataaaagtat caacaaaaaa ttgttaatat 840
acctctatac tttaacgtca aggagaaaaa actata 876
<210> 52
<211> 633
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pACU11" <223> "pACU11
<220>
<223> pACU11
<220>
<223> pACU11
<400> 52
gctcagcatc tgcttcttcc caaagatgaa cgcggcgtta tgtcactaac gacgtgcacc 60
aacttgcggg aattcgaaaa agacattttt gctgtcagtc actgtcaaga gattcttttg 120
ctggcatttc ttccagaagc aaaaagagcg atgcgtcttt tccgctgaac cgttccagca 180
aaaaagacta ccaacgaatt ccaccgcacg ccttttttct gaagcccact ttcgtggact 240
ttgccatata tgcaaaattc atgaagtgtg ataccaagtc agcatacacc tcactagggt 300
agtttctttg gttgtattga tcatttggtt catcgtggtt cattaatttt ttttctccat 360
tgctttctgg ctttgatctt actatcattt ggatttttgt cgaaggttgt agaattgtat 420
gtgacaagtg gcaccaagca tatataaaaa aaaaaagcat tatcttccta ccagagttga 480
ttgttaaaaa cgtatttata gcaaacgcaa ttgtaattaa ttcttatttt gtatcttttc 540
ttcccttgtc tcaatctttt atttttattt tatttttctt ttcttagttt ctttcataac 600
accaagcaac taatactata acatacaata ata 633
<210> 53
<211> 1119
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pACU12" <223> "pACU12
<220>
<223> pACU12
<220>
<223> pACU12
<400> 53
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgaat 360
tggttggtag tcttttttgc tggaacggtt cagcggaaaa gacgcatcgc tctttttgct 420
tctggaagaa atgccagcaa aagaatctct tgacagtgac tgacagcaaa aatgtctttt 480
tcgaattcgt tggtagtctt ttttgctgga acggttcagc ggaaaagacg catcgctctt 540
tttgcttctg gaagaaatgc cagcaaaaga atctcttgac agtgactgac agcaaaaatg 600
tctttttcga attcgttggt agtctttttt gctggaacgg ttcagcggaa aagacgcatc 660
gctctttttg cttctggaag aaatgccagc aaaagaatct cttgacagtg actgacagca 720
aaaatgtctt tttcgaattc gttggtagtc ttttttgctg gaacggttca gcggaaaaga 780
cgcatcgctc tttttgcttc tggaagaaat gccagcaaaa gaatctcttg acagtgactg 840
acagcaaaaa tgtctttttc caattctaat taagttagtc aaggcgccat cctcatgaaa 900
actgtgtaac ataataaccg aagtgtcgaa aaggtggcac cttgtccaat tgaacacgct 960
cgatgaaaaa aataagatat atataaggtt aagtaaagcg tctgttagaa aggaagtttt 1020
tcctttttct tgctctcttg tcttttcatc tactatttcc ttcgtgtaat acagggtcgt 1080
cagatacata gatacaattc tattaccccc atccataca 1119
<210> 54
<211> 1497
<212> DNA
<213> 人工序列
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<223> pACU13
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ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgaat 360
tggttggtag tcttttttgc tggaacggtt cagcggaaaa gacgcatcgc tctttttgct 420
tctggaagaa atgccagcaa aagaatctct tgacagtgac tgacagcaaa aatgtctttt 480
tcgaattcgt tggtagtctt ttttgctgga acggttcagc ggaaaagacg catcgctctt 540
tttgcttctg gaagaaatgc cagcaaaaga atctcttgac agtgactgac agcaaaaatg 600
tctttttcga attcgttggt agtctttttt gctggaacgg ttcagcggaa aagacgcatc 660
gctctttttg cttctggaag aaatgccagc aaaagaatct cttgacagtg actgacagca 720
aaaatgtctt tttcgaattc gttggtagtc ttttttgctg gaacggttca gcggaaaaga 780
cgcatcgctc tttttgcttc tggaagaaat gccagcaaaa gaatctcttg acagtgactg 840
acagcaaaaa tgtctttttc gaattcgttg gtagtctttt ttgctggaac ggttcagcgg 900
aaaagacgca tcgctctttt tgcttctgga agaaatgcca gcaaaagaat ctcttgacag 960
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cagcggaaaa gacgcatcgc tctttttgct tctggaagaa atgccagcaa aagaatctct 1080
tgacagtgac tgacagcaaa aatgtctttt tcgaattcgt tggtagtctt ttttgctgga 1140
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atctcttgac agtgactgac agcaaaaatg tctttttcca attctaatta agttagtcaa 1260
ggcgccatcc tcatgaaaac tgtgtaacat aataaccgaa gtgtcgaaaa ggtggcacct 1320
tgtccaattg aacacgctcg atgaaaaaaa taagatatat ataaggttaa gtaaagcgtc 1380
tgttagaaag gaagtttttc ctttttcttg ctctcttgtc ttttcatcta ctatttcctt 1440
cgtgtaatac agggtcgtca gatacataga tacaattcta ttacccccat ccataca 1497
<210> 55
<211> 1011
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
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<220>
<223> pACU14
<220>
<223> pACU14
<400> 55
gctcagcatc tgcttcttcc caaagatgaa cgcggcgtta tgtcactaac gacgtgcacc 60
aacttgcggg aattggaaaa agacattttt gctgtcagtc actgtcaaga gattcttttg 120
ctggcatttc ttccagaagc aaaaagagcg atgcgtcttt tccgctgaac cgttccagca 180
aaaaagacta ccaacgaatt cgaaaaagac atttttgctg tcagtcactg tcaagagatt 240
cttttgctgg catttcttcc agaagcaaaa agagcgatgc gtcttttccg ctgaaccgtt 300
ccagcaaaaa agactaccaa cgaattcgaa aaagacattt ttgctgtcag tcactgtcaa 360
gagattcttt tgctggcatt tcttccagaa gcaaaaagag cgatgcgtct tttccgctga 420
accgttccag caaaaaagac taccaacgaa ttcgaaaaag acatttttgc tgtcagtcac 480
tgtcaagaga ttcttttgct ggcatttctt ccagaagcaa aaagagcgat gcgtcttttc 540
cgctgaaccg ttccagcaaa aaagactacc aaccaattcc accgcacgcc ttttttctga 600
agcccacttt cgtggacttt gccatatatg caaaattcat gaagtgtgat accaagtcag 660
catacacctc actagggtag tttctttggt tgtattgatc atttggttca tcgtggttca 720
ttaatttttt ttctccattg ctttctggct ttgatcttac tatcatttgg atttttgtcg 780
aaggttgtag aattgtatgt gacaagtggc accaagcata tataaaaaaa aaaagcatta 840
tcttcctacc agagttgatt gttaaaaacg tatttatagc aaacgcaatt gtaattaatt 900
cttattttgt atcttttctt cccttgtctc aatcttttat ttttatttta tttttctttt 960
cttagtttct ttcataacac caagcaacta atactataac atacaataat a 1011
<210> 56
<211> 398
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pACU15" <223> "pACU15
<220>
<223> pACU15
<220>
<223> pACU15
<400> 56
tatagttttt tctccttgac gttaaagtat agaggtatat taacaatttt ttgttgatac 60
ttttatgaca tttgaataag aagtaataca aactgaaaat gttgaaagta ttagttaaag 120
tggttatgca gcttttccat ttatatatct gttaatagat caaaaatcat cgcttcgctg 180
attaattacc ccagaaataa ggctaaaaaa ctaatcgcat tatcatccga attcgttggt 240
agtctttttt gctggaacgg ttcagcggaa aagacgcatc gctctttttg cttctggaag 300
aaatgccagc aaaagaatct cttgacagtg actgacagca aaaatgtctt tttcgaattc 360
gggctcttta catttccaca acatataagt aagattag 398
<210> 57
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<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pGAL/CUP1p" <223> "pGAL/CUP1p
<220>
<223> pGAL/CUP1p
<220>
<223> pGAL/CUP1p
<400> 57
ttatattgaa ttttcaaaaa ttcttacttt ttttttggat ggacgcaaag aagtttaata 60
atcatattac atggcattac caccatatac atatccatat ctaatcttac ttatatgttg 120
tggaaatgta aagagcccga attcgaaaaa gacatttttg ctgtcagtca ctgtcaagag 180
attcttttgc tggcatttct tccagaagca aaaagagcga tgcgtctttt ccgctgaacc 240
gttccagcaa aaaagactac caacgcaata tggattgtca gaatcatata aaagagaagc 300
aaataactcc ttgtcttgta tcaattgcat tataatatct tcttgttagt gcaatatcat 360
atagaagtca tcgaaataga tattaagaaa aacaaactgt acaatcaatc aatcaatcat 420
cacataaa 428
<210> 58
<211> 518
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
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<223> pCRS5
<220>
<223> pCRS5
<400> 58
gtggacgaaa agacataact gcagaagtac agctgccttt atttcttgtg gtcatttatt 60
gcttttattt tcaagtcaga tatacaagaa aatcaaatcc catcgtcaac gtcacgtata 120
aacgattaat ttacagtaat accatactct accaacatta ttttagtccg acgttcagtc 180
ctgtaggtgt tccaaatcct tctggcattg acttctgtgc agaaaccctt caaaatgagt 240
tccactttac gtcagatcgc ataacaaccg gtcatatatt tttttctttt gctaaacccc 300
ctactgcaag cacttttaag aaaaagaaca ataaatgcgt ctttattgct gtgtggaagt 360
gatttttgtc tttcggacaa aaaaaggata gggatgcgag agggctgtga agtagtgatc 420
aagcggggcc tatataagaa gggcgcacat cgtcccccct aagaatagcg aagcgatatt 480
acactgaaca ctacaatgtc aaatagtact caataaat 518
<210> 59
<211> 510
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pCHA1" <223> "pCHA1
<220>
<223> pCHA1
<220>
<223> pCHA1
<400> 59
gatctctgct gacgttgtat ccacagatct aattgcaaga tagcctcttg cgaccttatt 60
aaaagcctct ccgtgatatc ctctagggct tgggttgcca ttaatcgatg tgtccttgtt 120
tccttatgcg agctgtttct tatctatctt atggtcccat tctttactgc actgtttaca 180
ttttgatcaa ttgcgaaatg ttcctactat ttttcttttt ctcttttcgc gagtactaat 240
caccgcgaac ggaaactaat gagtcctctg cgcggagaca tgattccgca tgggcggctc 300
ctgttaagcc ccagcggaaa tgtaattcca ctgagtgtca ttaaatagtg ccaaagcttt 360
atcaaattgt ttgcgatgag ataagataaa agggacaata tgaggaggaa cacaggtata 420
taaatatcgc caaataaaag gaaaatgttt atacagtttt ctctttttta agtgctggat 480
agacaagaga caggaaaatt aaccagcgag 510
<210> 60
<211> 601
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pCTR1" <223> "pCTR1
<220>
<223> pCTR1
<220>
<223> pCTR1
<400> 60
caagtccgat tgttcctctt caggagcttc ctgaaccaaa ctttttccgc aaggccgcat 60
tttgaaccgt attttgctcg ttccagcctt tccacgtttt tgttatctaa gcaacttggc 120
acatttccct actatactac aaaccgatac gtaaatactt ccctaaatag catatgaatt 180
attcagtaat ttttaaggat cgaaactgca cctcaactat tcgttactgt ggttatgttc 240
tcatgtattg atgcaaatca tgggatattt gctcaagacg acggtaaaat gagcaaaaat 300
ggcacgatcc tgaaaagagc acttttcaag attcgggcta caaaatgcaa cataaaaaat 360
gttgtattgt catctcgaca gggtcttgta tgttttattc ctcttatgat tagttcacat 420
tagtaaaaca gatacgcagt gtgctcttaa taaacaacta ctccatagct ttatttgcat 480
aacaaaactt ttaagcacaa acttaaacag gtggagtaat agttcggcgg cgactcaaat 540
tacatttgtt ggaagaatcg aatagaaaat aaaaaaaagt gtattatatt tgacattcaa 600
a 601
<210> 61
<211> 522
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pCTR3" <223> "pCTR3
<220>
<223> pCTR3
<220>
<223> pCTR3
<400> 61
gatgtgatga caaaacctct tccgataaaa acatttaaac tattaacaaa caaatggatt 60
cattagatct attacattat gggtggtatg ttggaataaa aatcaactat catctactaa 120
ctagtattta cgttactagt atattatcat atacggtgtt agaagatgac gcaaatgatg 180
agaaatagtc atctaaatta gtggaagctg aaacgcaagg attgataatg taataggatc 240
aatgaatatt aacatataaa acgatgataa taatatttat agaattgtgt agaattgcag 300
attccctttt atggattcct aaatcctcca ggagaacttc tagtatatct acatacctaa 360
tattattgcc ttattaaaaa tggaatccca acaattacat caaaatccac attctcttca 420
cttctccgat agacttgtaa tttatcttat ttcatttcct aacactttga tcgaagaaga 480
gggataacaa cagacgaaaa cacatttaag ggctatacaa ag 522
<210> 62
<211> 675
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
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<220>
<223> pCUR1
<220>
<223> pCUR1
<400> 62
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgaat 360
tgtcatggga tatttgctca agacgacggt aaaatgagca aatatggcac gatcctcaat 420
tctaattaag ttagtcaagg cgccatcctc atgaaaactg tgtaacataa taaccgaagt 480
gtcgaaaagg tggcaccttg tccaattgaa cacgctcgat gaaaaaaata agatatatat 540
aaggttaagt aaagcgtctg ttagaaagga agtttttcct ttttcttgct ctcttgtctt 600
ttcatctact atttccttcg tgtaatacag ggtcgtcaga tacatagata caattctatt 660
acccccatcc ataca 675
<210> 63
<211> 674
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR2" <223> "pCUR2
<220>
<223> pCUR2
<220>
<223> pCUR2
<400> 63
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgatt 360
gaggatcgtg ccatatttgc tcattttacc gtcgtcttga gcaaatatcc catgacaatt 420
ctaattaagt tagtcaaggc gccatcctca tgaaaactgt gtaacataat aaccgaagtg 480
tcgaaaaggt ggcaccttgt ccaattgaac acgctcgatg aaaaaaataa gatatatata 540
aggttaagta aagcgtctgt tagaaaggaa gtttttcctt tttcttgctc tcttgtcttt 600
tcatctacta tttccttcgt gtaatacagg gtcgtcagat acatagatac aattctatta 660
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<210> 64
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<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR3" <223> "pCUR3
<220>
<223> pCUR3
<220>
<223> pCUR3
<400> 64
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgaat 360
taggatcgtg ccatatttgc tcattttacc gtcgtcttga gcaaatatcc catgacaatt 420
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tcatctacta tttccttcgt gtaatacagg gtcgtcagat acatagatac aattctatta 780
cccccatcca taca 794
<210> 65
<211> 850
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR4" <223> "pCUR4
<220>
<223> pCUR4
<220>
<223> pCUR4
<400> 65
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgaat 360
tgtcatggga tatttgctca agacgacggt aaaatgagca aatatggcac gatcctcaat 420
tgtcatggga tatttgctca agacgacggt aaaatgagca aatatggcac gatcctcaat 480
gtcatgggat atttgctcaa gacgacggta aaatgagcaa atatggcacg atcctcaatt 540
gtcatgggat atttgctcaa gacgacggta aaatgagcaa atatcccatg acaattctaa 600
ttaagttagt caaggcgcca tcctcatgaa aactgtgtaa cataataacc gaagtgtcga 660
aaaggtggca ccttgtccaa ttgaacacgc tcgatgaaaa aaataagata tatataaggt 720
taagtaaagc gtctgttaga aaggaagttt ttcctttttc ttgctctctt gtcttttcat 780
ctactatttc cttcgtgtaa tacagggtcg tcagatacat agatacaatt ctattacccc 840
catccataca 850
<210> 66
<211> 491
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR5p" <223> "pCUR5p
<220>
<223> pCUR5p
<220>
<223> pCUR5p
<400> 66
ttatattgaa ttttcaaaaa ttcttacttt ttttttggat ggacgcaaag aagtttaata 60
atcatattac atggcattac caccatatac atatccatat ctaatcttac ttatatgttg 120
tggaaatgta aagagcccga attgtcatgg gatatttgct caagacgacg gtaaaatgag 180
caaatatggc acgatcctca attgtcatgg gatatttgct caagacgacg gtaaaatgag 240
caaatatggc acgatcccaa ttcggatgat aatgcgatta gttttttagc cttatttctg 300
gggtaattaa tcagcgaagc gatgattttt gatctattaa cagatatata aatggaaaag 360
ctgcataacc actttaacta atactttcaa cattttcagt ttgtattact tcttattcaa 420
atgtcataaa agtatcaaca aaaaattgtt aatatacctc tatactttaa cgtcaaggag 480
aaaaaactat a 491
<210> 67
<211> 833
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR6" <223> "pCUR6
<220>
<223> pCUR6
<220>
<223> pCUR6
<400> 67
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccgaatt gaggatcgtg ccatatttgc tcattttacc 360
gtcgtcttga gcaaatatcc catgacaatt gaggatcgtg ccatatttgc tcattttacc 420
gtcgtcttga gcaaatatcc catgacaatt gaggatcgtg ccatatttgc tcattttacc 480
gtcgtcttga gcaaatatcc catgacaatt catgatcgca aaatggcaaa tggcacgtga 540
agctgtcgat attggggaac tgtggtggtt ggcaaatgac taattaagtt agtcaaggcg 600
ccatcctcat gaaaactgtg taacataata accgaagtgt cgaaaaggtg gcaccttgtc 660
caattgaaca cgctcgatga aaaaaataag atatatataa ggttaagtaa agcgtctgtt 720
agaaaggaag tttttccttt ttcttgctct cttgtctttt catctactat ttccttcgtg 780
taatacaggg tcgtcagata catagataca attctattac ccccatccat aca 833
<210> 68
<211> 803
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR7" <223> "pCUR7
<220>
<223> pCUR7
<220>
<223> pCUR7
<400> 68
gtgagtaagg aaagagtgag gaactatcgc atacctgcat ttaaagatgc cgatttgggc 60
gcgaatcctt tattttggct tcaccctcat actattatca gggccagaaa aaggaagtgt 120
ttccctcctt cttgaattga tgttaccctc ataaagcacg tggcctctta tcgagaaaga 180
aattaccgtc gctcgtgatt tgtttgcaaa aagaacaaaa ctgaattcag gatcgtgcca 240
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gacaattgag gatcgtgcca 300
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gagaattctt cctgtcttcc 360
tattgattgc agcttccaat ttcgtcacac aacaaggtcc tagcgacggc tcacaggttt 420
tgtaacaagc aatcgaaggt tctggaatgg cgggaaaggg tttagtacca catgctatga 480
tgcccactgt gatctccaga gcaaagttcg ttcgatcgta ctgttactct ctctctttca 540
aacagaattg tccgaatcgt gtgacaacaa cagcctgttc tcacacactc ttttcttcta 600
accaaggggg tggtttagtt tagtagaacc tcgtgaaact tacatttaca tatatataaa 660
cttgcataaa ttggtcaatg caagaaatac atatttggtc ttttctaatt cgtagttttt 720
caagttctta gatgctttct ttttctcttt tttacagatc atcaaggaag taattatcta 780
ctttttacaa caaatataaa aca 803
<210> 69
<211> 863
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR8" <223> "pCUR8
<220>
<223> pCUR8
<220>
<223> pCUR8
<400> 69
gtgagtaagg aaagagtgag gaactatcgc atacctgcat ttaaagatgc cgatttgggc 60
gcgaatcctt tattttggct tcaccctcat actattatca gggccagaaa aaggaagtgt 120
ttccctcctt cttgaattga tgttaccctc ataaagcacg tggcctctta tcgagaaaga 180
aattaccgtc gctcgtgatt tgtttgcaaa aagaacaaaa ctgaattcag gatcgtgcca 240
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gacaattgag gatcgtgcca 300
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gacaattgag gatcgtgcca 360
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gagaattctt cctgtcttcc 420
tattgattgc agcttccaat ttcgtcacac aacaaggtcc tagcgacggc tcacaggttt 480
tgtaacaagc aatcgaaggt tctggaatgg cgggaaaggg tttagtacca catgctatga 540
tgcccactgt gatctccaga gcaaagttcg ttcgatcgta ctgttactct ctctctttca 600
aacagaattg tccgaatcgt gtgacaacaa cagcctgttc tcacacactc ttttcttcta 660
accaaggggg tggtttagtt tagtagaacc tcgtgaaact tacatttaca tatatataaa 720
cttgcataaa ttggtcaatg caagaaatac atatttggtc ttttctaatt cgtagttttt 780
caagttctta gatgctttct ttttctcttt tttacagatc atcaaggaag taattatcta 840
ctttttacaa caaatataaa aca 863
<210> 70
<211> 863
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR9" <223> "pCUR9
<220>
<223> pCUR9
<220>
<223> pCUR9
<400> 70
gtgagtaagg aaagagtgag gaactatcgc atacctgcat ttaaagatgc cgatttgggc 60
gcgaatcctt tattttggct tcaccctcat actattatca gggccagaaa aaggaagtgt 120
ttccctcctt cttgaattga tgttaccctc ataaagcacg tggcctctta tcgagaaaga 180
aattaccgtc gctcgtgatt tgtttgcaaa aagaacaaaa ctgaattctc atgggatatt 240
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 300
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 360
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctgaattctt cctgtcttcc 420
tattgattgc agcttccaat ttcgtcacac aacaaggtcc tagcgacggc tcacaggttt 480
tgtaacaagc aatcgaaggt tctggaatgg cgggaaaggg tttagtacca catgctatga 540
tgcccactgt gatctccaga gcaaagttcg ttcgatcgta ctgttactct ctctctttca 600
aacagaattg tccgaatcgt gtgacaacaa cagcctgttc tcacacactc ttttcttcta 660
accaaggggg tggtttagtt tagtagaacc tcgtgaaact tacatttaca tatatataaa 720
cttgcataaa ttggtcaatg caagaaatac atatttggtc ttttctaatt cgtagttttt 780
caagttctta gatgctttct ttttctcttt tttacagatc atcaaggaag taattatcta 840
ctttttacaa caaatataaa aca 863
<210> 71
<211> 923
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR10" <223> "pCUR10
<220>
<223> pCUR10
<220>
<223> pCUR10
<400> 71
gtgagtaagg aaagagtgag gaactatcgc atacctgcat ttaaagatgc cgatttgggc 60
gcgaatcctt tattttggct tcaccctcat actattatca gggccagaaa aaggaagtgt 120
ttccctcctt cttgaattga tgttaccctc ataaagcacg tggcctctta tcgagaaaga 180
aattaccgtc gctcgtgatt tgtttgcaaa aagaacaaaa ctgaattctc atgggatatt 240
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 300
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 360
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 420
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctgaattctt cctgtcttcc 480
tattgattgc agcttccaat ttcgtcacac aacaaggtcc tagcgacggc tcacaggttt 540
tgtaacaagc aatcgaaggt tctggaatgg cgggaaaggg tttagtacca catgctatga 600
tgcccactgt gatctccaga gcaaagttcg ttcgatcgta ctgttactct ctctctttca 660
aacagaattg tccgaatcgt gtgacaacaa cagcctgttc tcacacactc ttttcttcta 720
accaaggggg tggtttagtt tagtagaacc tcgtgaaact tacatttaca tatatataaa 780
cttgcataaa ttggtcaatg caagaaatac atatttggtc ttttctaatt cgtagttttt 840
caagttctta gatgctttct ttttctcttt tttacagatc atcaaggaag taattatcta 900
ctttttacaa caaatataaa aca 923
<210> 72
<211> 983
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR11" <223> "pCUR11
<220>
<223> pCUR11
<220>
<223> pCUR11
<400> 72
gtgagtaagg aaagagtgag gaactatcgc atacctgcat ttaaagatgc cgatttgggc 60
gcgaatcctt tattttggct tcaccctcat actattatca gggccagaaa aaggaagtgt 120
ttccctcctt cttgaattga tgttaccctc ataaagcacg tggcctctta tcgagaaaga 180
aattaccgtc gctcgtgatt tgtttgcaaa aagaacaaaa ctgaattctc atgggatatt 240
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 300
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 360
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 420
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 480
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctgaattctt cctgtcttcc 540
tattgattgc agcttccaat ttcgtcacac aacaaggtcc tagcgacggc tcacaggttt 600
tgtaacaagc aatcgaaggt tctggaatgg cgggaaaggg tttagtacca catgctatga 660
tgcccactgt gatctccaga gcaaagttcg ttcgatcgta ctgttactct ctctctttca 720
aacagaattg tccgaatcgt gtgacaacaa cagcctgttc tcacacactc ttttcttcta 780
accaaggggg tggtttagtt tagtagaacc tcgtgaaact tacatttaca tatatataaa 840
cttgcataaa ttggtcaatg caagaaatac atatttggtc ttttctaatt cgtagttttt 900
caagttctta gatgctttct ttttctcttt tttacagatc atcaaggaag taattatcta 960
ctttttacaa caaatataaa aca 983
<210> 73
<211> 1043
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR12" <223> "pCUR12
<220>
<223> pCUR12
<220>
<223> pCUR12
<400> 73
gtgagtaagg aaagagtgag gaactatcgc atacctgcat ttaaagatgc cgatttgggc 60
gcgaatcctt tattttggct tcaccctcat actattatca gggccagaaa aaggaagtgt 120
ttccctcctt cttgaattga tgttaccctc ataaagcacg tggcctctta tcgagaaaga 180
aattaccgtc gctcgtgatt tgtttgcaaa aagaacaaaa ctgaattcag gatcgtgcca 240
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gacaattgag gatcgtgcca 300
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gacaattgag gatcgtgcca 360
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gagaattcag gatcgtgcca 420
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gacaattgag gatcgtgcca 480
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gacaattgag gatcgtgcca 540
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gagaattctt cctgtcttcc 600
tattgattgc agcttccaat ttcgtcacac aacaaggtcc tagcgacggc tcacaggttt 660
tgtaacaagc aatcgaaggt tctggaatgg cgggaaaggg tttagtacca catgctatga 720
tgcccactgt gatctccaga gcaaagttcg ttcgatcgta ctgttactct ctctctttca 780
aacagaattg tccgaatcgt gtgacaacaa cagcctgttc tcacacactc ttttcttcta 840
accaaggggg tggtttagtt tagtagaacc tcgtgaaact tacatttaca tatatataaa 900
cttgcataaa ttggtcaatg caagaaatac atatttggtc ttttctaatt cgtagttttt 960
caagttctta gatgctttct ttttctcttt tttacagatc atcaaggaag taattatcta 1020
ctttttacaa caaatataaa aca 1043
<210> 74
<211> 1043
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR13" <223> "pCUR13
<220>
<223> pCUR13
<220>
<223> pCUR13
<400> 74
gtgagtaagg aaagagtgag gaactatcgc atacctgcat ttaaagatgc cgatttgggc 60
gcgaatcctt tattttggct tcaccctcat actattatca gggccagaaa aaggaagtgt 120
ttccctcctt cttgaattga tgttaccctc ataaagcacg tggcctctta tcgagaaaga 180
aattaccgtc gctcgtgatt tgtttgcaaa aagaacaaaa ctgaattctc atgggatatt 240
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 300
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 360
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctgaattctc atgggatatt 420
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 480
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 540
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctgaattctt cctgtcttcc 600
tattgattgc agcttccaat ttcgtcacac aacaaggtcc tagcgacggc tcacaggttt 660
tgtaacaagc aatcgaaggt tctggaatgg cgggaaaggg tttagtacca catgctatga 720
tgcccactgt gatctccaga gcaaagttcg ttcgatcgta ctgttactct ctctctttca 780
aacagaattg tccgaatcgt gtgacaacaa cagcctgttc tcacacactc ttttcttcta 840
accaaggggg tggtttagtt tagtagaacc tcgtgaaact tacatttaca tatatataaa 900
cttgcataaa ttggtcaatg caagaaatac atatttggtc ttttctaatt cgtagttttt 960
caagttctta gatgctttct ttttctcttt tttacagatc atcaaggaag taattatcta 1020
ctttttacaa caaatataaa aca 1043
<210> 75
<211> 1223
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR14" <223> "pCUR14
<220>
<223> pCUR14
<220>
<223> pCUR14
<400> 75
gtgagtaagg aaagagtgag gaactatcgc atacctgcat ttaaagatgc cgatttgggc 60
gcgaatcctt tattttggct tcaccctcat actattatca gggccagaaa aaggaagtgt 120
ttccctcctt cttgaattga tgttaccctc ataaagcacg tggcctctta tcgagaaaga 180
aattaccgtc gctcgtgatt tgtttgcaaa aagaacaaaa ctgaattctc atgggatatt 240
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 300
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 360
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctgaattctc atgggatatt 420
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 480
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 540
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctgaattctc atgggatatt 600
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 660
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctcaattgtc atgggatatt 720
tgctcaagac gacggtaaaa tgagcaaata tggcacgatc ctgaattctt cctgtcttcc 780
tattgattgc agcttccaat ttcgtcacac aacaaggtcc tagcgacggc tcacaggttt 840
tgtaacaagc aatcgaaggt tctggaatgg cgggaaaggg tttagtacca catgctatga 900
tgcccactgt gatctccaga gcaaagttcg ttcgatcgta ctgttactct ctctctttca 960
aacagaattg tccgaatcgt gtgacaacaa cagcctgttc tcacacactc ttttcttcta 1020
accaaggggg tggtttagtt tagtagaacc tcgtgaaact tacatttaca tatatataaa 1080
cttgcataaa ttggtcaatg caagaaatac atatttggtc ttttctaatt cgtagttttt 1140
caagttctta gatgctttct ttttctcttt tttacagatc atcaaggaag taattatcta 1200
ctttttacaa caaatataaa aca 1223
<210> 76
<211> 1283
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR15" <223> "pCUR15
<220>
<223> pCUR15
<220>
<223> pCUR15
<400> 76
gtgagtaagg aaagagtgag gaactatcgc atacctgcat ttaaagatgc cgatttgggc 60
gcgaatcctt tattttggct tcaccctcat actattatca gggccagaaa aaggaagtgt 120
ttccctcctt cttgaattga tgttaccctc ataaagcacg tggcctctta tcgagaaaga 180
aattaccgtc gctcgtgatt tgtttgcaaa aagaacaaaa ctgaattcag gatcgtgcca 240
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gacaattgag gatcgtgcca 300
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gacaattgag gatcgtgcca 360
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gacaattgag gatcgtgcca 420
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gagaattcag gatcgtgcca 480
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gacaattgag gatcgtgcca 540
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gacaattgag gatcgtgcca 600
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gagaattcag gatcgtgcca 660
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gacaattgag gatcgtgcca 720
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gacaattgag gatcgtgcca 780
tatttgctca ttttaccgtc gtcttgagca aatatcccat gagaattctt cctgtcttcc 840
tattgattgc agcttccaat ttcgtcacac aacaaggtcc tagcgacggc tcacaggttt 900
tgtaacaagc aatcgaaggt tctggaatgg cgggaaaggg tttagtacca catgctatga 960
tgcccactgt gatctccaga gcaaagttcg ttcgatcgta ctgttactct ctctctttca 1020
aacagaattg tccgaatcgt gtgacaacaa cagcctgttc tcacacactc ttttcttcta 1080
accaaggggg tggtttagtt tagtagaacc tcgtgaaact tacatttaca tatatataaa 1140
cttgcataaa ttggtcaatg caagaaatac atatttggtc ttttctaatt cgtagttttt 1200
caagttctta gatgctttct ttttctcttt tttacagatc atcaaggaag taattatcta 1260
ctttttacaa caaatataaa aca 1283
<210> 77
<211> 686
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR16" <223> "pCUR16
<220>
<223> pCUR16
<220>
<223> pCUR16
<400> 77
gctcagcatc tgcttcttcc caaagatgaa cgcggcgtta tgtcactaac gacgtgcacc 60
aacttgcggg aattctcatg ggatatttgc tcaagacgac ggtaaaatga gcaaatatgg 120
cacgatcctc aattgtcatg ggatatttgc tcaagacgac ggtaaaatga gcaaatatgg 180
cacgatcctc aatgtcatgg gatatttgct caagacgacg gtaaaatgag caaatatggc 240
acgatcctga attccaccgc acgccttttt tctgaagccc actttcgtgg actttgccat 300
atatgcaaaa ttcatgaagt gtgataccaa gtcagcatac acctcactag ggtagtttct 360
ttggttgtat tgatcatttg gttcatcgtg gttcattaat tttttttctc cattgctttc 420
tggctttgat cttactatca tttggatttt tgtcgaaggt tgtagaattg tatgtgacaa 480
gtggcaccaa gcatatataa aaaaaaaaag cattatcttc ctaccagagt tgattgttaa 540
aaacgtattt atagcaaacg caattgtaat taattcttat tttgtatctt ttcttccctt 600
gtctcaatct tttattttta ttttattttt cttttcttag tttctttcat aacaccaagc 660
aactaatact ataacataca ataata 686
<210> 78
<211> 747
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pCUR17" <223> "pCUR17
<220>
<223> pCUR17
<220>
<223> pCUR17
<400> 78
gctcagcatc tgcttcttcc caaagatgaa cgcggcgtta tgtcactaac gacgtgcacc 60
aacttgcggg aattctcatg ggatatttgc tcaagacgac ggtaaaatga gcaaatatgg 120
cacgatcctc aattgtcatg ggatatttgc tcaagacgac ggtaaaatga gcaaatatgg 180
cacgatcctc aattctcatg ggatatttgc tcaagacgac ggtaaaatga gcaaatatgg 240
cacgatcctc aattctcatg ggatatttgc tcaagacgac ggtaaaatga gcaaatatgg 300
cacgatcctg aattccaccg cacgcctttt ttctgaagcc cactttcgtg gactttgcca 360
tatatgcaaa attcatgaag tgtgatacca agtcagcata cacctcacta gggtagtttc 420
tttggttgta ttgatcattt ggttcatcgt ggttcattaa ttttttttct ccattgcttt 480
ctggctttga tcttactatc atttggattt ttgtcgaagg ttgtagaatt gtatgtgaca 540
agtggcacca agcatatata aaaaaaaaaa gcattatctt cctaccagag ttgattgtta 600
aaaacgtatt tatagcaaac gcaattgtaa ttaattctta ttttgtatct tttcttccct 660
tgtctcaatc ttttattttt attttatttt tcttttctta gtttctttca taacaccaag 720
caactaatac tataacatac aataata 747
<210> 79
<211> 500
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pLYS1" <223> "pLYS1
<220>
<223> pLYS1
<220>
<223> pLYS1
<400> 79
gcaagttaac attagggaga acgtggggcc ttcctccatg agtgcagagc aattgaagat 60
gtttagaggt ttaaaggaga ataaccagtt gctggatagc tctgtgccag ctacagttta 120
tgccaaattg gcccttcatg gtattcctga cggtgttaat ggacagtact tgagctataa 180
tgaccctgcc ttggcggact ttatgccttg aggatagcag gtacatataa attgttacat 240
actaagtcga tgagtcaaaa aagactctta tacatttata cattttgcat tattattttt 300
tttttccagc ggaatttgga attccgctct caaccgccaa aattcccctg cgatttcagc 360
gacaaagagt cataaagtca tcctcgagaa accacgatga aatatataaa aagcccatct 420
tccctgacgg aaactggtat tttaggaggc ataccataag ataacaacga aaacgcttta 480
tttttcacac aaccgcaaaa 500
<210> 80
<211> 650
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pLYS4" <223> "pLYS4
<220>
<223> pLYS4
<220>
<223> pLYS4
<400> 80
ttgaaaaatg cgaagttgaa gtgccataga agagaaacag cccacacagg ggagaagccc 60
actggaaagg gggcactgac caactttaaa taggaaacag aagataccac aagccagcga 120
tacaacagca ccaaacaccg aaaagaatag ccaaagctgt cctctggtgt tggaaaaact 180
ggaaaaaacg caactgcgtt ggctgctacg gtgaaaaatt ttcctatgac ttttttcact 240
gcttgttcgt gcgaaattac cgcaaacccg gtaaaatgta cacgtatcaa gtgataaaca 300
atttcgtgtc aagtgagcag aatggagcga tttggaaaaa aaaaattttt attgtttttt 360
cccccgggat tttgctcgag atgactgaaa ttttgtaatc gatgagtcta taccagaggc 420
agcaaatatc accaacatac acaggtatac acaatctcat gtccacacac acgtacagac 480
acgcacatat atatatatat atatatatcc ccataggtat ttatatatac aaaagaatcc 540
tcgtgtgttt gtgtgtgcaa tagctagttt tgcgctgcct cttatagtag acaatatcac 600
tttttcaata aaatagaact tgcaaggaaa caaaattgta tcgcttcaag 650
<210> 81
<211> 500
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pLYS9" <223> "pLYS9
<220>
<223> pLYS9
<220>
<223> pLYS9
<400> 81
acatatgcaa gagtcttatg tatcgtatct aagtgccacg taggggattc ccatcatttg 60
atgatttcca aatataatac ctgtagagag cggtggagca aaagtcaaat tttaatcgca 120
actgcagaca agtcaagctg aggaaattgt ggatgatctc ttgtttcttt tgatattcac 180
cacaacagaa gtgaagagtg tgattgcggt tactactgac cacgaagcaa tgcgtttagt 240
agtgaaaaga attactcata ctctggaatc gaaattccgt tggaaaaatt cgctttgtag 300
tgaaaaataa agatgtcaat aaagggtatt gagaatttcc aatggaatta tcagcaatag 360
atgatagaaa gtagcacaga atttggctta atggtatata aaccgtaggg tcctggtaaa 420
attacatggg aaggatcctt aggcagtagg gaaaacttat caggacaatt gagttatatt 480
aacgtattat atattttaat 500
<210> 82
<211> 494
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pLYR1p" <223> "pLYR1p
<220>
<223> pLYR1p
<220>
<223> pLYR1p
<400> 82
ttatattgaa ttttcaaaaa ttcttacttt ttttttggat ggacgcaaag aagtttaata 60
atcatattac atggcattac caccatatac atatccatat ctaatcttac ttatatgttg 120
tggaaatgta aagagcccga attcctcata ctctggaatc gaaattccgt tggaaaaatt 180
cgctttgtag tgaaaaataa agatgtcaat aaagggtatt gagaatttcc aatggaatta 240
tcagcaatag atgatagaaa gaattcggat gataatgcga ttagtttttt agccttattt 300
ctggggtaat taatcagcga agcgatgatt tttgatctat taacagatat ataaatggaa 360
aagctgcata accactttaa ctaatacttt caacattttc agtttgtatt acttcttatt 420
caaatgtcat aaaagtatca acaaaaaatt gttaatatac ctctatactt taacgtcaag 480
gagaaaaaac tata 494
<210> 83
<211> 494
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pLYR2p" <223> "pLYR2p
<220>
<223> pLYR2p
<220>
<223> pLYR2p
<400> 83
ttatattgaa ttttcaaaaa ttcttacttt ttttttggat ggacgcaaag aagtttaata 60
atcatattac atggcattac caccatatac atatccatat ctaatcttac ttatatgttg 120
tggaaatgta aagagcccga attctttcta tcatctattg ctgataattc cattggaaat 180
tctcaatacc ctttattgac atctttattt ttcactacaa agcgaatttt tccaacggaa 240
tttcgattcc agagtatgag gaattcggat gataatgcga ttagtttttt agccttattt 300
ctggggtaat taatcagcga agcgatgatt tttgatctat taacagatat ataaatggaa 360
aagctgcata accactttaa ctaatacttt caacattttc agtttgtatt acttcttatt 420
caaatgtcat aaaagtatca acaaaaaatt gttaatatac ctctatactt taacgtcaag 480
gagaaaaaac tata 494
<210> 84
<211> 616
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pLYR3p" <223> "pLYR3p
<220>
<223> pLYR3p
<220>
<223> pLYR3p
<400> 84
ttatattgaa ttttcaaaaa ttcttacttt ttttttggat ggacgcaaag aagtttaata 60
atcatattac atggcattac caccatatac atatccatat ctaatcttac ttatatgttg 120
tggaaatgta aagagcccga attcctcata ctctggaatc gaaattccgt tggaaaaatt 180
cgctttgtag tgaaaaataa agatgtcaat aaagggtatt gagaatttcc aatggaatta 240
tcagcaatag atgatagaaa gaattcctca tactctggaa tcgaaattcc gttggaaaaa 300
ttcgctttgt agtgaaaaat aaagatgtca ataaagggta ttgagaattt ccaatggaat 360
tatcagcaat agatgataga aagaattcgg atgataatgc gattagtttt ttagccttat 420
ttctggggta attaatcagc gaagcgatga tttttgatct attaacagat atataaatgg 480
aaaagctgca taaccacttt aactaatact ttcaacattt tcagtttgta ttacttctta 540
ttcaaatgtc ataaaagtat caacaaaaaa ttgttaatat acctctatac tttaacgtca 600
aggagaaaaa actata 616
<210> 85
<211> 616
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pLYR4p" <223> "pLYR4p
<220>
<223> pLYR4p
<220>
<223> pLYR4p
<400> 85
ttatattgaa ttttcaaaaa ttcttacttt ttttttggat ggacgcaaag aagtttaata 60
atcatattac atggcattac caccatatac atatccatat ctaatcttac ttatatgttg 120
tggaaatgta aagagcccga attctttcta tcatctattg ctgataattc cattggaaat 180
tctcaatacc ctttattgac atctttattt ttcactacaa agcgaatttt tccaacggaa 240
tttcgattcc agagtatgag gaattctttc tatcatctat tgctgataat tccattggaa 300
attctcaata ccctttattg acatctttat ttttcactac aaagcgaatt tttccaacgg 360
aatttcgatt ccagagtatg aggaattcgg atgataatgc gattagtttt ttagccttat 420
ttctggggta attaatcagc gaagcgatga tttttgatct attaacagat atataaatgg 480
aaaagctgca taaccacttt aactaatact ttcaacattt tcagtttgta ttacttctta 540
ttcaaatgtc ataaaagtat caacaaaaaa ttgttaatat acctctatac tttaacgtca 600
aggagaaaaa actata 616
<210> 86
<211> 738
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pLYR5p" <223> "pLYR5p
<220>
<223> pLYR5p
<220>
<223> pLYR5p
<400> 86
ttatattgaa ttttcaaaaa ttcttacttt ttttttggat ggacgcaaag aagtttaata 60
atcatattac atggcattac caccatatac atatccatat ctaatcttac ttatatgttg 120
tggaaatgta aagagcccga attctttcta tcatctattg ctgataattc cattggaaat 180
tctcaatacc ctttattgac atctttattt ttcactacaa agcgaatttt tccaacggaa 240
tttcgattcc agagtatgag gaattctttc tatcatctat tgctgataat tccattggaa 300
attctcaata ccctttattg acatctttat ttttcactac aaagcgaatt tttccaacgg 360
aatttcgatt ccagagtatg aggaattctt tctatcatct attgctgata attccattgg 420
aaattctcaa taccctttat tgacatcttt atttttcact acaaagcgaa tttttccaac 480
ggaatttcga ttccagagta tgaggaattc ggatgataat gcgattagtt ttttagcctt 540
atttctgggg taattaatca gcgaagcgat gatttttgat ctattaacag atatataaat 600
ggaaaagctg cataaccact ttaactaata ctttcaacat tttcagtttg tattacttct 660
tattcaaatg tcataaaagt atcaacaaaa aattgttaat atacctctat actttaacgt 720
caaggagaaa aaactata 738
<210> 87
<211> 1104
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pLYR6p" <223> "pLYR6p
<220>
<223> pLYR6p
<220>
<223> pLYR6p
<400> 87
ttatattgaa ttttcaaaaa ttcttacttt ttttttggat ggacgcaaag aagtttaata 60
atcatattac atggcattac caccatatac atatccatat ctaatcttac ttatatgttg 120
tggaaatgta aagagcccga attgctcata ctctggaatc gaaattccgt tggaaaaatt 180
cgctttgtag tgaaaaataa agatgtcaat aaagggtatt gagaatttcc aatggaatta 240
tcagcaatag atgatagaaa gaattcctca tactctggaa tcgaaattcc gttggaaaaa 300
ttcgctttgt agtgaaaaat aaagatgtca ataaagggta ttgagaattt ccaatggaat 360
tatcagcaat agatgataga aagaattcct catactctgg aatcgaaatt ccgttggaaa 420
aattcgcttt gtagtgaaaa ataaagatgt caataaaggg tattgagaat ttccaatgga 480
attatcagca atagatgata gaaacaattg ctcatactct ggaatcgaaa ttccgttgga 540
aaaattcgct ttgtagtgaa aaataaagat gtcaataaag ggtattgaga atttccaatg 600
gaattatcag caatagatga tagaaagaat tcctcatact ctggaatcga aattccgttg 660
gaaaaattcg ctttgtagtg aaaaataaag atgtcaataa agggtattga gaatttccaa 720
tggaattatc agcaatagat gatagaaaga attcctcata ctctggaatc gaaattccgt 780
tggaaaaatt cgctttgtag tgaaaaataa agatgtcaat aaagggtatt gagaatttcc 840
aatggaatta tcagcaatag atgatagaaa caattcggat gataatgcga ttagtttttt 900
agccttattt ctggggtaat taatcagcga agcgatgatt tttgatctat taacagatat 960
ataaatggaa aagctgcata accactttaa ctaatacttt caacattttc agtttgtatt 1020
acttcttatt caaatgtcat aaaagtatca acaaaaaatt gttaatatac ctctatactt 1080
taacgtcaag gagaaaaaac tata 1104
<210> 88
<211> 1836
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pLYR7p" <223> "pLYR7p
<220>
<223> pLYR7p
<220>
<223> pLYR7p
<400> 88
ttatattgaa ttttcaaaaa ttcttacttt ttttttggat ggacgcaaag aagtttaata 60
atcatattac atggcattac caccatatac atatccatat ctaatcttac ttatatgttg 120
tggaaatgta aagagcccga attgtttcta tcatctattg ctgataattc cattggaaat 180
tctcaatacc ctttattgac atctttattt ttcactacaa agcgaatttt tccaacggaa 240
tttcgattcc agagtatgag gaattctttc tatcatctat tgctgataat tccattggaa 300
attctcaata ccctttattg acatctttat ttttcactac aaagcgaatt tttccaacgg 360
aatttcgatt ccagagtatg aggaattctt tctatcatct attgctgata attccattgg 420
aaattctcaa taccctttat tgacatcttt atttttcact acaaagcgaa tttttccaac 480
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ttggaaattc tcaataccct ttattgacat ctttattttt cactacaaag cgaatttttc 720
caacggaatt tcgattccag agtatgagga attctttcta tcatctattg ctgataattc 780
cattggaaat tctcaatacc ctttattgac atctttattt ttcactacaa agcgaatttt 840
tccaacggaa tttcgattcc agagtatgag caattgtttc tatcatctat tgctgataat 900
tccattggaa attctcaata ccctttattg acatctttat ttttcactac aaagcgaatt 960
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attccattgg aaattctcaa taccctttat tgacatcttt atttttcact acaaagcgaa 1080
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taattccatt ggaaattctc aatacccttt attgacatct ttatttttca ctacaaagcg 1200
aatttttcca acggaatttc gattccagag tatgagcaat tgtttctatc atctattgct 1260
gataattcca ttggaaattc tcaataccct ttattgacat ctttattttt cactacaaag 1320
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gattagtttt ttagccttat ttctggggta attaatcagc gaagcgatga tttttgatct 1680
attaacagat atataaatgg aaaagctgca taaccacttt aactaatact ttcaacattt 1740
tcagtttgta ttacttctta ttcaaatgtc ataaaagtat caacaaaaaa ttgttaatat 1800
acctctatac tttaacgtca aggagaaaaa actata 1836
<210> 89
<211> 981
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pLYR8" <223> "pLYR8
<220>
<223> pLYR8
<220>
<223> pLYR8
<400> 89
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgaat 360
tgctcatact ctggaatcga aattccgttg gaaaaattcg ctttgtagtg aaaaataaag 420
atgtcaataa agggtattga gaatttccaa tggaattatc agcaatagat gatagaaaga 480
attcctcata ctctggaatc gaaattccgt tggaaaaatt cgctttgtag tgaaaaataa 540
agatgtcaat aaagggtatt gagaatttcc aatggaatta tcagcaatag atgatagaaa 600
gaattcctca tactctggaa tcgaaattcc gttggaaaaa ttcgctttgt agtgaaaaat 660
aaagatgtca ataaagggta ttgagaattt ccaatggaat tatcagcaat agatgataga 720
aacaattcta attaagttag tcaaggcgcc atcctcatga aaactgtgta acataataac 780
cgaagtgtcg aaaaggtggc accttgtcca attgaacacg ctcgatgaaa aaaataagat 840
atatataagg ttaagtaaag cgtctgttag aaaggaagtt tttccttttt cttgctctct 900
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<210> 90
<211> 981
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pLYR9" <223> "pLYR9
<220>
<223> pLYR9
<220>
<223> pLYR9
<400> 90
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgaat 360
tgtttctatc atctattgct gataattcca ttggaaattc tcaataccct ttattgacat 420
ctttattttt cactacaaag cgaatttttc caacggaatt tcgattccag agtatgagga 480
attctttcta tcatctattg ctgataattc cattggaaat tctcaatacc ctttattgac 540
atctttattt ttcactacaa agcgaatttt tccaacggaa tttcgattcc agagtatgag 600
gaattctttc tatcatctat tgctgataat tccattggaa attctcaata ccctttattg 660
acatctttat ttttcactac aaagcgaatt tttccaacgg aatttcgatt ccagagtatg 720
agcaattcta attaagttag tcaaggcgcc atcctcatga aaactgtgta acataataac 780
cgaagtgtcg aaaaggtggc accttgtcca attgaacacg ctcgatgaaa aaaataagat 840
atatataagg ttaagtaaag cgtctgttag aaaggaagtt tttccttttt cttgctctct 900
tgtcttttca tctactattt ccttcgtgta atacagggtc gtcagataca tagatacaat 960
tctattaccc ccatccatac a 981
<210> 91
<211> 1225
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pLYR10" <223> "pLYR10
<220>
<223> pLYR10
<220>
<223> pLYR10
<400> 91
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
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aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgaat 360
tgtttctatc atctattgct gataattcca ttggaaattc tcaataccct ttattgacat 420
ctttattttt cactacaaag cgaatttttc caacggaatt tcgattccag agtatgagga 480
attctttcta tcatctattg ctgataattc cattggaaat tctcaatacc ctttattgac 540
atctttattt ttcactacaa agcgaatttt tccaacggaa tttcgattcc agagtatgag 600
gaattctttc tatcatctat tgctgataat tccattggaa attctcaata ccctttattg 660
acatctttat ttttcactac aaagcgaatt tttccaacgg aatttcgatt ccagagtatg 720
aggaattctt tctatcatct attgctgata attccattgg aaattctcaa taccctttat 780
tgacatcttt atttttcact acaaagcgaa tttttccaac ggaatttcga ttccagagta 840
tgaggaattc tttctatcat ctattgctga taattccatt ggaaattctc aatacccttt 900
attgacatct ttatttttca ctacaaagcg aatttttcca acggaatttc gattccagag 960
tatgagcaat tctaattaag ttagtcaagg cgccatcctc atgaaaactg tgtaacataa 1020
taaccgaagt gtcgaaaagg tggcaccttg tccaattgaa cacgctcgat gaaaaaaata 1080
agatatatat aaggttaagt aaagcgtctg ttagaaagga agtttttcct ttttcttgct 1140
ctcttgtctt ttcatctact atttccttcg tgtaatacag ggtcgtcaga tacatagata 1200
caattctatt acccccatcc ataca 1225
<210> 92
<211> 1347
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> pLYR11" <223> "pLYR11
<220>
<223> pLYR11
<220>
<223> pLYR11
<400> 92
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgaat 360
tgctcatact ctggaatcga aattccgttg gaaaaattcg ctttgtagtg aaaaataaag 420
atgtcaataa agggtattga gaatttccaa tggaattatc agcaatagat gatagaaaga 480
attcctcata ctctggaatc gaaattccgt tggaaaaatt cgctttgtag tgaaaaataa 540
agatgtcaat aaagggtatt gagaatttcc aatggaatta tcagcaatag atgatagaaa 600
gaattcctca tactctggaa tcgaaattcc gttggaaaaa ttcgctttgt agtgaaaaat 660
aaagatgtca ataaagggta ttgagaattt ccaatggaat tatcagcaat agatgataga 720
aagaattcct catactctgg aatcgaaatt ccgttggaaa aattcgcttt gtagtgaaaa 780
ataaagatgt caataaaggg tattgagaat ttccaatgga attatcagca atagatgata 840
gaaagaattc ctcatactct ggaatcgaaa ttccgttgga aaaattcgct ttgtagtgaa 900
aaataaagat gtcaataaag ggtattgaga atttccaatg gaattatcag caatagatga 960
tagaaagaat tcctcatact ctggaatcga aattccgttg gaaaaattcg ctttgtagtg 1020
aaaaataaag atgtcaataa agggtattga gaatttccaa tggaattatc agcaatagat 1080
gatagaaaca attctaatta agttagtcaa ggcgccatcc tcatgaaaac tgtgtaacat 1140
aataaccgaa gtgtcgaaaa ggtggcacct tgtccaattg aacacgctcg atgaaaaaaa 1200
taagatatat ataaggttaa gtaaagcgtc tgttagaaag gaagtttttc ctttttcttg 1260
ctctcttgtc ttttcatcta ctatttcctt cgtgtaatac agggtcgtca gatacataga 1320
tacaattcta ttacccccat ccataca 1347
<210> 93
<211> 686
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pMET17" <223> "pMET17
<220>
<223> pMET17
<220>
<223> pMET17
<400> 93
ttacattatc aatccttgcg tttcagcttc cactaattta gatgactatt tctcatcatt 60
tgcgtcatct tctaacaccg tatatgataa tatactagta acgtaaatac tagttagtag 120
atgatagttg atttttattc caacactaag aaataatttc gccatttctt gaatgtattt 180
aaagatattt aatgctataa tagacattta aatccaattc ttccaacata caatgggagt 240
ttggccgagt ggtttaaggc gtcagattta ggtggattta acctctaaaa tctctgatat 300
cttcggatgc aagggttcga atcccttagc tctcattatt ttttgctttt tctcttgagg 360
tcacatgatc gcaaaatggc aaatggcacg tgaagctgtc gatattgggg aactgtggtg 420
gttggcaaat gactaattaa gttagtcaag gcgccatcct catgaaaact gtgtaacata 480
ataaccgaag tgtcgaaaag gtggcacctt gtccaattga acacgctcga tgaaaaaaat 540
aagatatata taaggttaag taaagcgtct gttagaaagg aagtttttcc tttttcttgc 600
tctcttgtct tttcatctac tatttccttc gtgtaataca gggtcgtcag atacatagat 660
acaattctat tacccccatc cataca 686
<210> 94
<211> 510
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
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<220>
<223> pMET6
<220>
<223> pMET6
<400> 94
ccacaggaaa tatttcacgt gacttacaaa cagagtcgta cgtcaggacc ggagtcaggt 60
gaaaaaatgt gggccggtaa agggaaaaaa ccagaaacgg gactactatc gaactcgttt 120
agtcgcgaac gtgcaaaagg ccaatatttt tcgctagagt catcgcagtc atggcagctc 180
tttcgctcta tctcccggtc gcaaaactgt ggtagtcata gctcgttctg ctcaattgag 240
aactgtgaat gtgaatatgg aacaaatgcg atagatgcac taatttaagg gaagctagct 300
agttttccca actgcgaaag aaaaaaagga aagaaaaaaa aattctatat aagtgataga 360
tatttccatc tttactagca ttagtttctc ttttacgtat tcaatatttt tgttaaactc 420
ttcctttatc ataaaaaagc aagcatctaa gagcattgac aacactctaa gaaacaaaat 480
accaatataa tttcaaagta catatcaaaa 510
<210> 95
<211> 508
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
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<220>
<223> pMET14
<220>
<223> pMET14
<400> 95
cctatgcatg tttagagcaa gcgcctttgt gagccctccc ggttacgacg ccttggcaat 60
gtagcagata actctgcact tctagaatca ttccactacg acatttggct catcaccagc 120
tcgcgagaaa tgtaaataag ccaacaacca agaatgcgta acattaaaga atacagttgc 180
tttcatttcg gcgtgatggt acggcaccca cggttcctta cattattctc gaaaaatagc 240
tgcacgcttt tccaggaata aaagaccgtg ccactaattt cacgtgatca atatatttac 300
aagccacctc aaaaaatgtg gcaatggaga agaggatgaa cgactcaata tgacttcaac 360
ttcatgaatt tgtcaaaata tctatataag atgcaaaatt tctatacaac atcagttgcg 420
tatccgttaa tgtcgttcat tttctctctt tgttcgaact tgacatcaag aaaagttgga 480
attatttctc caagcacact gtacacca 508
<210> 96
<211> 552
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pMET3" <223> "pMET3
<220>
<223> pMET3
<220>
<223> pMET3
<400> 96
aacgatatgt acgtagtggt ataaggtgag ggggtccaca gatataacat cgtttaattt 60
agtactaaca gagacttttg tcacaactac atataagtgt acaaatatag tacagatatg 120
acacacttgt agcgccaacg cgcatcctac ggattgctga cagaaaaaaa ggtcacgtga 180
ccagaaaagt cacgtgtaat tttgtaactc accgcattct agcggtccct gtcgtgcaca 240
ctgcactcaa caccataaac cttagcaacc tccaaaggaa atcaccgtat aacaaagcca 300
cagttttaca acttagtctc ttatgaagtt acttaccaat gagaaataga ggctctttct 360
cgacaaatat gaatatggat atatatatat atatatatat atatatatat atatatatgt 420
aaacttggtt cttttttagc ttgtgatctc tagcttgggt ctctctctgt cgtaacagtt 480
gtgatatcgt ttcttaacaa ttgaaaagga actaagaaag tataataata acaagaataa 540
agtataatta ac 552
<210> 97
<211> 363
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
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<220>
<223> pSAM1
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gaaacggacg taagacggaa atagaatttg aagataaagt tatatatcac tacacacgaa 60
tactttcttt tttttttttc acaggaaaac tgtggtggcg cccttgccta ctagtgcatt 120
tcttttttcg ggttcttgtc tcgacgaaat tttagcctca tcgtagtttt tcactctggt 180
atcgatgaaa aagggaagag taaaaagttt tccgtttagt acttaatggg attggtttgg 240
gacgtatata tcgactggtg ttgtctgtta ttcatcgttg tttttcggtt agcttcgaaa 300
aaaaaataga gtaaaaacca ggaatttacc ctaaaaacaa gaaaaaataa gataaacgaa 360
aat 363
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<211> 500
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
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<220>
<223> pSAM2
<220>
<223> pSAM2
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gagctttgct ctattatata agataaaata tgcactaaaa gtttgcattt ctttacataa 60
ctaaaactaa gacattatgc atagcttacc tgatcaaaaa gtatgtaaac ttgttaacat 120
cttcacatgt gattcatctg gtcgtacttt cttgcggtgc agtgtaatat ttctacccac 180
gtgactataa ttgagcttga aaactgtggc gtttttccac cgatgggtcc acgccagata 240
ttaaccgaag ccaaaatacc gatgaaattt ctgagatagc tcttgtaaac gacgtcaaat 300
cttcatatgc aaggagatct tgatttcttt ttggtagtca tctgtcgtct tgaggcgtat 360
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ttttttcttt ttttaaaagg tttaaaaaac ataactgtct tcaatatatc cagtatttac 480
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<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
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<220>
<223> tTHD2
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atttaactcc ttaagttact ttaatgattt agtttttatt attaataatt catgctcatg 60
acatctcata tacacgttta taaaacttaa atagattgaa aatgtattaa agattcctca 120
gggattcgat ttttttggaa gtttttgttt ttttttcctt gagatgctgt agtatttggg 180
aacaattata caatcgaaag atatatgctt acattcgacc gttttagccg tgatcattat 240
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<210> 100
<211> 300
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
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<220>
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<220>
<223> tCYC1
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cctcctccca catccgctct aaccgaaaag gaaggagtta gacaacctga agtctaggtc 120
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<210> 101
<211> 300
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
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<220>
<223> tTDH3
<220>
<223> tTDH3
<400> 101
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tttcaattta tatactattt taatgacatt ttcgattcat tgattgaaag ctttgtgttt 120
tttcttgatg cgctattgca ttgttcttgt ctttttcgcc acatgtaata tctgtagtag 180
atacctgata cattgtggat gctgagtgaa attttagtta ataatggagg cgctcttaat 240
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<210> 102
<211> 354
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
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<220>
<223> tADH1
<220>
<223> tADH1
<400> 102
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tcggtgtgta ttttatgtcc tcagaggaca acacctgttg taatcgttct tcca 354
<210> 103
<211> 301
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
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<220>
<223> tADH2
<220>
<223> tADH2
<400> 103
gcggatctct tatgtcttta cgatttatag ttttcattat caagtatgcc tatattagta 60
tatagcatct ttagatgaca gtgttcgaag tttcacgaat aaaagataat attctacttt 120
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t 301
<210> 104
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<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
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<220>
<223> tTPI1
<220>
<223> tTPI1
<400> 104
gattaatata attatataaa aatattatct tcttttcttt atatctagtg ttatgtaaaa 60
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cgctttttct aataaaaaga agaaaagcat ttaacaattg aacacctcta tatcaacgaa 240
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<210> 105
<211> 299
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
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<220>
<223> tMET17
<220>
<223> tMET17
<400> 105
gtgtgcgtaa tgagttgtaa aattatgtat aaacctactt tctctcacaa gtactatact 60
tttataaaac gaactttatt gaaatgaata tccttttttt cccttgttac atgtcgtgac 120
tcgtactttg aacctaaatt gttctaacat caaagaacag tgttaattcg cagtcgagaa 180
gaaaaatatg gtgaacaaga ctcatctact tcatgagact actttacgcc tcctataaag 240
ctgtcacact ggataaattt attgtaggac caagttacaa aagaggatga tggaggttt 299
<210> 106
<211> 305
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> tENO2" <223> "tENO2
<220>
<223> tENO2
<220>
<223> tENO2
<400> 106
ggatcctaaa gtgcttttaa ctaagaatta ttagtctttt ctgcttattt tttcatcata 60
gtttagaaca ctttatatta acgaatagtt tatgaatcta tttaggttta aaaattgata 120
cagttttata agttactttt tcaaagactc gtgctgtcta ttgcataatg cactggaagg 180
ggaaaaaaaa ggtgcacacg cgtggctttt tcttgaattt gcagtttgaa aaataactac 240
atggatgata agaaaacatg gagtacagtc actttgagaa ccttcaatca gctggtaacg 300
tcttc 305
<210> 107
<211> 300
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> tMET3" <223> "tMET3
<220>
<223> tMET3
<220>
<223> tMET3
<400> 107
tcgtcataaa atgctcccat ctcaaaagta gggcaaaatt catgatcgac cgcgcaaaat 60
aaatagattt gcaaataagt tttgtatgta catttattaa tatatataat atatcaaaag 120
aaaaaaatca aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa ttgcactctt attcagtcat caattacaaa 180
acctagagat agcgatggtg catattcaat aaaaaactcc ttatactgtc gagaaagctt 240
attattggta cttctcgaag atactaaaaa aggttaattt ttggagacgg aggcaatagc 300
<210> 108
<211> 301
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> tPGK1" <223> "tPGK1
<220>
<223> tPGK1
<220>
<223> tPGK1
<400> 108
attgaattga attgaaatcg atagatcaat ttttttcttt tctctttccc catcctttac 60
gctaaaataa tagtttattt tattttttga atatttttta tttatatacg tatatataga 120
ctattattta tcttttaatg attattaaga tttttattaa aaaaaaattc gctcctcttt 180
taatgccttt atgcagtttt tttttcccat tcgatatttc tatgttcggg ttcagcgtat 240
tttaagttta ataactcgaa aattctgcgt tcgttaaagc tttcgagaag gatattattt 300
a 301
<210> 109
<211> 300
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> tDIT1" <223> "tDIT1
<220>
<223> tDIT1
<220>
<223> tDIT1
<400> 109
taaagtaaga gcgctacatt ggtctacctt tttgttcttt tacttaaaca ttagttagtt 60
cgttttcttt ttctcatttt tttatgtttc ccccccaaag ttctgatttt ataatatttt 120
atttcacaca attccattta acagaggggg aatagattct ttagcttaga aaattagtga 180
tcaatatata tttgcctttc ttttcatctt ttcagtgata ttaatggttt cgagacactg 240
caatggccct agttgtctaa gaggatagat gttactgtca aagatgatat tttgaatttc 300
<210> 110
<211> 300
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> tRPL3" <223> "tRPL3
<220>
<223> tRPL3
<220>
<223> tRPL3
<400> 110
gaagttttgt tagaaaataa atcatttttt aattgagcat tcttattcct attttattta 60
aatagtttta tgtattgtta gctacataca acagtttaaa tcaaattttc tttttcccaa 120
gtccaaaatg gaggtttatt ttgatgaccc gcatgcgatt atgttttgaa agtataagac 180
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ttttttgccg ttttgacttg gacctctggt ttgctatttc cttacaatct ttgctacaat 300
<210> 111
<211> 300
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> tRPL41B" <223> "tRPL41B
<220>
<223> tRPL41B
<220>
<223> tRPL41B
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tattttagac agagatctac tttatattta atatctagat attacataat ttcctctcta 180
ataaaatatc attaataaaa taaaaatgaa gcgatttgat tttgtgttgt caacttagtt 240
tgccgctatg cctcttgggt aatgctatta ttgaatcgaa gggctttatt atattaccct 300
<210> 112
<211> 300
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> tRPL15A" <223> "tRPL15A
<220>
<223> tRPL15A
<220>
<223> tRPL15A
<400> 112
gctggttgat ggaaaatata attttattgg gcaaactttt gtttatctga tgtgttttat 60
actattatct ttttaattaa tgattctata tacaaacctg tatatttttt ctttaaccaa 120
tttttttttt tatagaccta gagctgtact tttattctgc tatcaagcaa acccctaccc 180
cctcttctca atcctcccct caggcagaac ttatctacct gtatcaagga gcggacgagg 240
gagtcctaat tgttctacgt ataccaatgc tagcagctta cataggtggt ggcactacca 300
<210> 113
<211> 300
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> tIDP1" <223> "tIDP1
<220>
<223> tIDP1
<220>
<223> tIDP1
<400> 113
tcgaatttac gtagcccaat ctaccacttt tttttttcat tttttaaagt gttatactta 60
gttatgctct aggataatga actacttttt tttttttttt tttactgtta tcataaatat 120
atatacctta ttgttgtttg caaccgtcgg ttaattcctt atcaaggttc cccaagttcg 180
gatcattacc atcaatttcc aacattttca tgagttcttc ttcttcatta ccgtgtttta 240
gggggctgtt cgcacttcta atagggctat caccaagctg ttctaattcg tccaaaagtt 300
<210> 114
<211> 1089
<212> DNA
<213> 乳酸克鲁维酵母
<220>
<223> Leu2" <223> "Leu2
<220>
<223> Leu2
<220>
<223> Leu2
<400> 114
atgtctaaga atatcgttgt cctaccgggt gatcacgtcg gtaaagaagt tactgacgaa 60
gctattaagg tcttgaatgc cattgctgaa gtccgtccag aaattaagtt caatttccaa 120
catcacttga tcgggggtgc tgccatcgat gccactggca ctcctttacc agatgaagct 180
ctagaagcct ctaagaaagc cgatgctgtc ttactaggtg ctgttggtgg tccaaaatgg 240
ggtacgggcg cagttagacc agaacaaggt ctattgaaga tcagaaagga attgggtcta 300
tacgccaact tgagaccatg taactttgct tctgattctt tactagatct ttctcctttg 360
aagcctgaat atgcaaaggg taccgatttc gtcgtcgtta gagaattggt tggtggtatc 420
tactttggtg aaagaaaaga agatgaaggt gacggagttg cttgggactc tgagaaatac 480
agtgttcctg aagttcaaag aattacaaga atggctgctt tcttggcatt gcaacaaaac 540
ccaccattac caatctggtc tcttgacaag gctaacgtgc ttgcctcttc cagattgtgg 600
agaaagactg ttgaagaaac catcaagact gagttcccac aattaactgt tcagcaccaa 660
ttgatcgact ctgctgctat gattttggtt aaatcaccaa ctaagctaaa cggtgttgtt 720
attaccaaca acatgtttgg tgatattatc tccgatgaag cctctgttat tccaggttct 780
ttgggtttat taccttctgc atctctagct tccctacctg acactaacaa ggcattcggt 840
ttgtacgaac catgtcatgg ttctgcccca gatttaccag caaacaaggt taacccaatt 900
gctaccatct tatctgcagc tatgatgttg aagttatcct tggatttggt tgaagaaggt 960
agggctcttg aagaagctgt tagaaatgtc ttggatgcag gtgtcagaac cggtgacctt 1020
ggtggttcta actctaccac tgaggttggc gatgctatcg ccaaggctgt caaggaaatc 1080
ttggcttaa 1089
<210> 115
<211> 362
<212> PRT
<213> 乳酸克鲁维酵母
<220>
<223> Leu2 " <223> Leu2
<220>
<223> Leu2
<220>
<223> Leu2
<400> 115
Met Ser Lys Asn Ile Val Val Leu Pro Gly Asp His Val Gly Lys Glu
1 5 10 15
Val Thr Asp Glu Ala Ile Lys Val Leu Asn Ala Ile Ala Glu Val Arg
20 25 30
Pro Glu Ile Lys Phe Asn Phe Gln His His Leu Ile Gly Gly Ala Ala
35 40 45
Ile Asp Ala Thr Gly Thr Pro Leu Pro Asp Glu Ala Leu Glu Ala Ser
50 55 60
Lys Lys Ala Asp Ala Val Leu Leu Gly Ala Val Gly Gly Pro Lys Trp
65 70 75 80
Gly Thr Gly Ala Val Arg Pro Glu Gln Gly Leu Leu Lys Ile Arg Lys
85 90 95
Glu Leu Gly Leu Tyr Ala Asn Leu Arg Pro Cys Asn Phe Ala Ser Asp
100 105 110
Ser Leu Leu Asp Leu Ser Pro Leu Lys Pro Glu Tyr Ala Lys Gly Thr
115 120 125
Asp Phe Val Val Val Arg Glu Leu Val Gly Gly Ile Tyr Phe Gly Glu
130 135 140
Arg Lys Glu Asp Glu Gly Asp Gly Val Ala Trp Asp Ser Glu Lys Tyr
145 150 155 160
Ser Val Pro Glu Val Gln Arg Ile Thr Arg Met Ala Ala Phe Leu Ala
165 170 175
Leu Gln Gln Asn Pro Pro Leu Pro Ile Trp Ser Leu Asp Lys Ala Asn
180 185 190
Val Leu Ala Ser Ser Arg Leu Trp Arg Lys Thr Val Glu Glu Thr Ile
195 200 205
Lys Thr Glu Phe Pro Gln Leu Thr Val Gln His Gln Leu Ile Asp Ser
210 215 220
Ala Ala Met Ile Leu Val Lys Ser Pro Thr Lys Leu Asn Gly Val Val
225 230 235 240
Ile Thr Asn Asn Met Phe Gly Asp Ile Ile Ser Asp Glu Ala Ser Val
245 250 255
Ile Pro Gly Ser Leu Gly Leu Leu Pro Ser Ala Ser Leu Ala Ser Leu
260 265 270
Pro Asp Thr Asn Lys Ala Phe Gly Leu Tyr Glu Pro Cys His Gly Ser
275 280 285
Ala Pro Asp Leu Pro Ala Asn Lys Val Asn Pro Ile Ala Thr Ile Leu
290 295 300
Ser Ala Ala Met Met Leu Lys Leu Ser Leu Asp Leu Val Glu Glu Gly
305 310 315 320
Arg Ala Leu Glu Glu Ala Val Arg Asn Val Leu Asp Ala Gly Val Arg
325 330 335
Thr Gly Asp Leu Gly Gly Ser Asn Ser Thr Thr Glu Val Gly Asp Ala
340 345 350
Ile Ala Lys Ala Val Lys Glu Ile Leu Ala
355 360
<210> 116
<211> 499
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pNUP57
<220>
<223> pNUP57
<400> 116
tcatctgcgc aatgactatc aagaccttct gcaagaattt caaatctcac tgaaaatctt 60
gaccgaaaag tgtcttgaaa acccatcaag cctgcaaaac ctatctttga cattagtctc 120
cattataaaa acggcatagt tgggagaaaa cttttcatac ttcaattgtg gactgatata 180
agtattttgg ttttgcccgc atgatcatcc cacatggcta cagcagttct ctcataggaa 240
atagtacaat agctacgtga tataatctaa ataattgttg ccaatgtgta attatatcat 300
tttgaacgtt cgcgaaatgg attattttca aaaattttgt ttcttgaaat gagtaaaagc 360
aaaagtccaa ctctccaagt cgatgtaaac aactttttgc caaagggact gaaagactaa 420
atcgaggatt atcccgttca aactattcca gaaacgctcg ttagtaacaa aagacatacc 480
ttgttgacca attgatcac 499
<210> 117
<211> 451
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pGAP1
<220>
<223> pGAP1
<400> 117
cactttcacc agatcccaaa tgtcccgccc ctattcccgt gttccatcac gtaccataac 60
ttaccatttc atcacgttct ctatggcaca ctggtactgc ttcgactgct ttgcttcatc 120
ttctctatgg gccaatgagc taatgagcac aatgtgctgc gaaataaagg gatatctaat 180
ttatattatt acattataat atgtactagt gtggttattg gtaattgtac ttaattttga 240
tatataaagg gtggatcttt ttcattttga atcagaattg gaattgcaac ttgtctcttg 300
tcactattac ttaatagtaa ttatatttct tattaacctt ttttttaagt caaaacacca 360
aggacaagaa ctactcttca aaggtatttc aagttatcat acgtctcaca cacgcttcac 420
agtttcaagt aaaaaaaaag aatattacac a 451
<210> 118
<211> 998
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pJEN1
<220>
<223> pJEN1
<400> 118
aatgtgttta taaattattt tttttgctgg tagcaaaatc aactcattgt cttccattca 60
gagtctaatc gaacgttatc gcaatgcttg cacactttta aacaatacga tttagtttaa 120
gtggatggac ccccacgctt agtgttccac aggtttgtcc ccactgtttt tacattccac 180
tgtacatttt tgcaatagaa ggtcattgta tgctaccttg ggcggctaag aatacctgta 240
aaaatttgga gaaattagat tcgtaaagaa tgactcgcaa cgactccaat gatttcttct 300
tttcaccctt tgaacggccg atatccgcgc gggatcctga ccccgcaatt tactccacta 360
gaccggcgtg tttctctttt tccttttcct ggggttagag cccaagagct aatagccgac 420
aaacggactc caaaaaaaaa aggaggcaca ggacaaacgc agcacctgcg tcattcacgc 480
tgaagcggca gcaagcattt tcgatcagct ccaattaaat gaagactatt cgccgtaccg 540
ttcccagatg ggtgcgaaag tcagtgatcg aggaagttat tgagcgcgcg gcttgaaact 600
atttctccat ctcagagccg ccaagcctac cattattctc caccaggaag ttagtttgta 660
agcttctgca caccatccgg acgtccataa ttcttcactt aacggtcttt tgccccccct 720
tctactataa tgcattagaa cgttacctgg tcatttggat ggagatctaa gtaacactta 780
ctatctccta tggtactatc ctttaccaaa aaaaaaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaatcag 840
caaagtgaag taccctcttg atgtataaat acattgcaca tcattgttga gaaatagttt 900
tggaagttgt ctagtccttc tcccttagat ctaaaaggaa gaagagtaac agtttcaaaa 960
gtttttcctc aaagagatta aatactgcta ctgaaaat 998
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<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pICL1
<220>
<223> pICL1
<400> 119
ttttgctact cgtcatccga tgagaaaaac tgttcccttt tgccccaggt ttccattcat 60
ccgagcgatc acttatctga cttcgtcact ttttcatttc atccgaaaca atcaaaactg 120
aagccaatca ccacaaaatt aacactcaac gtcatctttc actacccttt acagaagaaa 180
atatccatag tccggactag catcccagta tgtgactcaa tattggtgca aaagagaaaa 240
gcataagtca gtccaaagtc cgcccttaac caggcacatc ggaattcaca aaacgtttct 300
ttattatata aaggagctgc ttcactggca aaattcttat tatttgtctt ggcttgctaa 360
tttcatctta tccttttttt cttttcacac ccaaatacct aacaattgag agaaaactct 420
tagcataaca taacaaaaag tcaacgaaaa 450
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<220>
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<223> pADH2
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tatcttaact gatagtttga tcaaaggggc aaaacgtagg ggcaaacaaa cggaaaaatc 60
gtttctcaaa ttttctgatg ccaagaactc taaccagtct tatctaaaaa ttgccttatg 120
atccgtctct ccggttacag cctgtgtaac tgattaatcc tgcctttcta atcaccattc 180
taatgtttta attaagggat tttgtcttca ttaacggctt tcgctcataa aaatgttatg 240
acgttttgcc cgcaggcggg aaaccatcca cttcacgaga ctgatctcct ctgccggaac 300
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atcaagctac aaaaagcata caatcaacta tcaactatta actatatcgt aatacaca 598
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<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<223> pMLS1
<220>
<223> pMLS1
<400> 121
tgtctaatgc gaaggtactt ttattttttt cagattcaaa gcaatattat ttagacaatt 60
gatactaagt gagcttaagg aggattaaac aactgtggaa tccttcacaa ggattcaata 120
tttgtttttc ctggttattt tgccatcatt caactttcct cagacgtaaa attcgtgctt 180
agtgatgtct caatattccc gcagggtaat aaaattcaat aactatcact atatacgcaa 240
cagtattacc ctacattgct atcggctcaa tggaaatccc catatcatag cttccattgg 300
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gggccgaggt tcggataaat tttgtattgt gttttgattc tgtcatgagt attacttatg 420
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tatttttcta cactggctac cgatttaact catcttcttg aaagtatata agtaacagta 660
aaatataccg tacttctgct aatgttattt gtcccttatt tttcttttct tgtcttatgc 720
tatagtacct aagaataacg actattgttt tgaactaaac aaagtagtaa aagcacataa 780
aagaattaag aaa 793

Claims (14)

1.一种产依克多因重组酵母,在其基因组中:
(A)(i)编码天冬氨酸激酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;和/或
(ii)编码天冬氨酸激酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(B)编码能够用作辅酶NAD和NADP两者的天冬氨酸半醛脱氢酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(C)编码二氨基丁酸氨基转移酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(D)(i)编码高丝氨酸-O-乙酰转移酶MET2的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(ii)编码高丝氨酸-O-乙酰转移酶METX的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(iii)编码二氨基丁酸乙酰转移酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(E)编码依克多因合酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
(F)(i)编码高丝氨酸脱氢酶的至少一种内源核酸已经缺失和/或中断,和/或
(ii)编码高丝氨酸脱氢酶的至少一种核酸独立地:
-在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下;
-在弱启动子的控制下;和/或
-呈非稳定形式。
2.根据权利要求1所述的重组酵母,在其基因组中,编码天冬氨酸转氨酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
3.根据权利要求1所述的重组酵母,在其基因组中,编码将氧化戊二酸转化为谷氨酸的谷氨酸脱氢酶的至少一种核酸过表达和/或在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下。
4.根据权利要求1所述的重组酵母,在其基因组中,已经进行以下修饰中的至少一者:
(A)编码一般氨基酸通透酶AGP3的至少一种内源核酸已经从所述酵母的基因组中缺失,以及:
(i)编码一般氨基酸通透酶AGP3的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的一般氨基酸通透酶AGP3的至少一种核酸已经插入;
(B)编码支链氨基酸通透酶3的至少一种内源核酸已经从所述酵母的基因组中缺失,以及:
(i)编码支链氨基酸通透酶3的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的支链氨基酸通透酶3的至少一种核酸已经插入;
(C)编码支链氨基酸通透酶2的至少一种内源核酸已经从所述酵母的基因组中缺失,以及:
(i)编码支链氨基酸通透酶2的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的支链氨基酸通透酶2的至少一种核酸已经插入;
(D)编码一般氨基酸通透酶GAP1的至少一种内源核酸已经从所述酵母的基因组中缺失,以及:
(i)编码一般氨基酸通透酶GAP1的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的一般氨基酸通透酶GAP1的至少一种核酸已经插入;
(E)编码高亲和力谷氨酰胺通透酶GNP1的至少一种内源核酸已经从所述酵母的基因组中缺失,以及:
(i)编码高亲和力谷氨酰胺通透酶GNP1的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的高亲和力谷氨酰胺通透酶GNP1的至少一种核酸已经插入;
(F)编码一般氨基酸通透酶AGP1的至少一种内源核酸已经从所述酵母的基因组中缺失,以及:
(i)编码一般氨基酸通透酶AGP1的至少一种核酸已经插入并且在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的一般氨基酸通透酶AGP1的至少一种核酸已经插入;
(G)编码低亲和力甲硫氨酸通透酶MUP3的至少一种内源核酸已经从所述酵母的基因组中缺失,以及:
(i)编码低亲和力甲硫氨酸通透酶MUP3的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的低亲和力甲硫氨酸通透酶MUP3的至少一种核酸已经插入;
(H)编码高亲和力甲硫氨酸通透酶MUP1的至少一种内源核酸已经从所述酵母的基因组中缺失,以及:
(i)编码高亲和力甲硫氨酸通透酶MUP1的至少一种核酸已经插入并在诱导型启动子或阻遏型启动子的控制下,和/或
(ii)编码非稳定的高亲和力甲硫氨酸通透酶MUP1的至少一种核酸已经插入;
(I)编码可能的转运蛋白AQR1的至少一种核酸过表达;和/或
(J)编码多胺转运蛋白1的至少一种核酸过表达。
5.根据权利要求4所述的重组酵母,在其基因组中,已经进行如权利要求4所指示的所述修饰中的至少两者。
6.根据权利要求1所述的重组酵母,其中,编码天冬氨酸激酶的所述核酸是来自酵母的核酸。
7.根据权利要求1所述的重组酵母,其中,编码高丝氨酸-O-乙酰转移酶METX的所述核酸是来自细菌的核酸。
8.根据权利要求1所述的重组酵母,其中,编码一般氨基酸通透酶、支链氨基酸通透酶3、支链氨基酸通透酶2、一般氨基酸通透酶GAP1、高亲和力谷氨酰胺通透酶GNP1、一般氨基酸通透酶AGP1、低亲和力甲硫氨酸通透酶MUP3和高亲和力甲硫氨酸通透酶MUP1的至少一种核酸独立地是来自酵母的核酸。
9.根据权利要求1所述的重组酵母,其中,过表达的所述核酸中的至少一者在强启动子的控制下。
10.根据权利要求1所述的重组酵母,其中,所述诱导型启动子或阻遏型启动子独立地选自由以下组成的组:用铜可诱导或可阻遏的启动子、用甲硫氨酸可诱导或可阻遏的启动子和用苏氨酸可诱导或可阻遏的启动子。
11.根据权利要求1所述的重组酵母,其中,所述弱启动子独立地选自由以下组成的组:pURA3、pRPLA1、pNUP57和pGAP1。
12.根据权利要求1所述的重组酵母,其中,所述诱导型启动子或阻遏型启动子独立地选自由以下组成的组:用铜可诱导或可阻遏的启动子、用赖氨酸可诱导或可阻遏的启动子和用甲硫氨酸可诱导或可阻遏的启动子。
13.一种用于产生依克多因的方法,所述方法包括以下步骤:
(a)在培养基中培养如权利要求1所限定的重组酵母;和
(b)从所述培养基回收所述依克多因。
14.根据权利要求13所述的方法,其中,所述培养基至少包含碳源。
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