[go: up one dir, main page]

CN109439663B - 甘蓝型油菜启动子pBnUnng0942890及其应用 - Google Patents

甘蓝型油菜启动子pBnUnng0942890及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN109439663B
CN109439663B CN201811552149.5A CN201811552149A CN109439663B CN 109439663 B CN109439663 B CN 109439663B CN 201811552149 A CN201811552149 A CN 201811552149A CN 109439663 B CN109439663 B CN 109439663B
Authority
CN
China
Prior art keywords
promoter
expression
plant
gene
seeds
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN201811552149.5A
Other languages
English (en)
Other versions
CN109439663A (zh
Inventor
范世航
李俊
匡琛
胡志勇
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Oil Crops Research Institute of Chinese Academy of Agriculture Sciences
Original Assignee
Oil Crops Research Institute of Chinese Academy of Agriculture Sciences
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Oil Crops Research Institute of Chinese Academy of Agriculture Sciences filed Critical Oil Crops Research Institute of Chinese Academy of Agriculture Sciences
Priority to CN201811552149.5A priority Critical patent/CN109439663B/zh
Publication of CN109439663A publication Critical patent/CN109439663A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN109439663B publication Critical patent/CN109439663B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/415Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from plants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8216Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
    • C12N15/8222Developmentally regulated expression systems, tissue, organ specific, temporal or spatial regulation
    • C12N15/8223Vegetative tissue-specific promoters
    • C12N15/8227Root-specific
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8216Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
    • C12N15/8222Developmentally regulated expression systems, tissue, organ specific, temporal or spatial regulation
    • C12N15/823Reproductive tissue-specific promoters
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/82Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for plant cells, e.g. plant artificial chromosomes (PACs)
    • C12N15/8216Methods for controlling, regulating or enhancing expression of transgenes in plant cells
    • C12N15/8222Developmentally regulated expression systems, tissue, organ specific, temporal or spatial regulation
    • C12N15/823Reproductive tissue-specific promoters
    • C12N15/8234Seed-specific, e.g. embryo, endosperm

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Reproductive Health (AREA)
  • Pregnancy & Childbirth (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Breeding Of Plants And Reproduction By Means Of Culturing (AREA)

Abstract

本发明公开了一种甘蓝型油菜启动子pBnUnng0942890及其应用,从甘蓝型油菜中克隆了基因BnUnng0942890的启动子,构建由该启动子调控的报告基因GUS的植物表达载体,采用农杆菌介导的花序浸染法转化拟南芥,对筛选的阳性转基因株系进行GUS组织化学法染色,结果表明,pBnUnng0942890具有驱动下游基因在根、花和种子中的优势表达,而在其他组织器官不表达或低表达的功能。该启动子在油菜转基因提高作物品质方面和人工创建种质资源等方面,具有良好的应用潜力。

Description

甘蓝型油菜启动子pBnUnng0942890及其应用
技术领域
本发明属于植物基因工程和生物技术领域,具体涉及一种甘蓝型油菜BnUnng0942890基因的启动子,命名为pBnUnng0942890(以下相同),该启动子可用于在植物的根、花和种子中优势表达目的基因。
背景技术
植物基因启动子在基因的表达调控中起着关键作用,位于结构基因5’端上游区域,含有顺式作用元件的一段DNA序列,决定着下游基因转录的特异性、方向和效率。此外,启动子在构建能够高水平表达异源表达载体的过程中起到关键作用,它决定了外源基因表达的时空顺序、表达强度、转录效率和基因的表达水平。所以,研究启动子的功能对于基因表达调控机制和日渐成熟的植物基因工程具有非常重要的科学意义。
通过对多种植物基因启动子区的分析发现,绝大多数功能蛋白基因的启动子都具有共同的结构模式,一般由启动子核心元件和上游元件组成。位于转录起始位点上游-20~-30bp处的TATA box为启动子的核心元件,是富含有AT的保守序列区,与DNA(脱氧核糖核酸)双链的解链有关,并决定转录起始点的选择,是绝大多数植物启动子正确表达所必需的。TATA box上游的保守序列称为启动子上游元件,包括-75bp处的CAAT box和-80~-110bp附近的GC box等一般上游启动子元件及其他特殊的上游元件,如茉莉酸类物质应答元件(JRE)、乙烯响应元件(ERE)等元件(张春晓,王文棋,蒋湘宁,等.植物基因启动子研究进展[J].遗传学报,2004,31(12):1455-1464;路静,赵华燕,何奕昆,等.高等植物启动子及其应用研究进展[J].自然科学进展,2004,8:002.)。其中,CAAT box是比较保守的序列,与RNA(核糖核酸)聚合酶的识别和结合有关,对基因转录具有较强的激活作用。只要具有了这些保守的结构框,那么就可以具有响应的启动下游基因表达的功能。
根据启动子的转录模式可将其分为3类:组成型启动子、组织或器官特异性启动子和诱导型启动子。
组成型启动子驱动的外源基因在转基因植物中的所有发育时期和组织中稳定表达。对许多双子叶植物的转化,通常都使用来自花椰菜病毒(CaMV)的35S启动子或来自细菌的胭脂氨酸合成酶nos启动子的质粒载体,而在单子叶植物转化中最常用的是含有水稻肌动蛋白Act启动子,玉米泛素Ubi启动子及35S启动子的质粒载体(关丽英,刘祥林,印莉萍.转基因植物中外源基因的有效表达及其安全性评价[J].首都师范大学学报:自然科学版,2002,23(2):52-56)。
但是很多时候外源基因在受体植物中的高效表达不仅造成生物体内能源的浪费,而且所有组织中的表达可能对植物本身具有毒害作用,甚至引起转基因安全问题(ShirongJ.Environment and Food Biosafety Assessment of Transgenic Plants[J].PROGRESSIN BIOTECHNOLOGY,1997,6)。因此,诱导型启动子和组织特异性启动子的研究和应用日益受到育种工作者的重视。在转基因植物中鉴定的诱导型启动子主要包括非生物胁迫诱导型启动子、生物胁迫诱导型启动子和激素诱导型启动子等(聂丽娜,夏兰琴,徐兆师,等.植物基因启动子的克隆及其功能研究进展[J].植物遗传资源学报,2008,9(3):385-391)。但是诱导型启动子的应用也具有一定的限制,对受体植物进行的外在条件处理,如热激,激素处理等可能引起生物体内一系列的生理生化反映而不利于植株的正常生长。此外,化学调控系统中用作诱导物的甲基脱氢皮质醇、雌二醇和四环素都对生态环境有害,不宜用于生产实践。
使用植物体内本身的组织特异性启动子就可以避免这种问题,外源基因的组织特异性表达将有效提高转基因作物的生物安全性(宋扬,周军会,张永强.植物组织特异性启动子研究[J].生物技術通報,2007,2007(6):21-24)。近些年来,关于组织特异性启动子的研究取得了很大的进步,包括叶片、韧皮部、维管束、根等器官特异性表达启动子和花粉、雄蕊、雌蕊、果实、种子等生殖器官特异表达启动子(宋扬,周军会,张永强.植物组织特异性启动子研究[J].生物技術通報,2007,2007(6):21-24)。如Ariizumi等利用GUS染色转基因拟南芥分离到了3个花药特异性表达启动子(Ariizumi T,Amagai M,Shibata D,etal.Comparative study of promoter activity of three anther-specific genesencoding lipid transfer protein,xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase andpolygalacturonase in transgenic Arabidopsis thaliana[J].Plant Cell Reports,2002,21(1):90-96)。Kim等同样通过转基因拟南芥检测GUS基因的表达,筛选得到芝麻中线粒体油酸脱氢酶基因FAD2的启动子为种子特异表达启动子,其中的E box和G box元件与三酰甘油的生物合成有关(Kim M J,Kim H,Shin J S,et al.Seed-specific expression ofsesame microsomal oleic acid desaturase is controlled by combinatorialproperties between negative cis-regulatory elements in the SeFAD2promoter andenhancers in the5′-UTR intron[J].Molecular Genetics and Genomics,2006,276(4):351-368)。耿安奇等从白菜型油菜、甘蓝型油菜、菜苔和橄榄中分离了4个启动子并转化烟草,GUS染色分析其为花器官特异表达的启动子(Geng AQ,Zhao Z J,Nie X L,etal.Expression analysis of four flower-specific promoters of Brassica spp.inthe heterogeneous host tobacco[J].African Journal of Biotechnology,2009,8(20))。此外,Mariani等将烟草花药绒毡层特异表达基因启动子TA29与核酸酶基因Barnase、RnaseT1融合后转化植物,核酸酶基因在花药中特异表达,并破坏绒毡层,获得雄性不育烟草和油菜(Marian C,De Beuckeleer M,Truettner J,et al.Induction of malesterility in plants by a chimaeric ribonuclease gene[J].Nature,1990,347:737-741)。目前TA29启动子已经在烟草、玉米、油菜、拟南芥、水稻等植物上应用并获得成功(宋扬,周军会,张永强.植物组织特异性启动子研究[J].生物技術通報,2007,2007(6):21-24)。由此可见,即使不同的植物物种之间的体内环境不同以及基因间存在互作差异,只要启动子具有保守的核心启动区域和相应保守的调控元件,就可以在其他不同植物中发挥启动下游基因表达的生物学功能。
以上这些报道都是利用转基因技术在不同的植物间进行启动子功能分析的例子,这些实例表明利用模式植物拟南芥、烟草等作为载体,通过转基因植物的表达分析证实来自其他植物的启动子的功能是被广泛认可和接受的。
种子在农业生产和国民经济中占有举足轻重的地位。统计数据表明,人类粮食的80%直接取自植物的种子,稻、麦等种子种富含淀粉,是人类赖以生存的主粮;大豆、花生、油菜、芝麻等种子的含油量高,是食用油的主要来源。种子中储存物质的多少和组成成分,直接影响作物的产量和品质。因此,提高粮食作物和油料作物产量、改善作物品质的根本在于提高和改善其种子中储藏物质的积累量和组成成分。尽管常规育种技术所培育的优良作物品种,为解决世界粮食安全问题、改善人民生活做出了重大贡献。然而,常规育种技术在继续提高作物产量和品质方面的潜力有限。因此,挖掘新的功能基因,利用转基因技术提高作物产量及种子的其他相关品质具有巨大的应用价值。
根系不仅是植物进行营养吸收、运输、储存与合成的重要器官,也是抵抗病虫害和在特殊生态环境下赖以生存不可缺少的组成部分。植物基因在根中特异性表达的研究是解释植物根系发生、分化和发育机制的有效途径,并在植物营养利用及病虫害基因工程研究中具有重要意义。
油菜是重要的食用油来源,油菜种子的相关性状关乎我们食用菜籽油的品质和质量,更与农业性状中的产量和含油量相关。同时,近年来我国农耕土地资源污染严重,病虫害也多有发生,根的防御能力是保证地上部分正常生长的必要条件。以上都是科研工作者炙手可热的课题,那么筛选根和种子特异性表达或优势表达的启动子就很有必要。本发明通过实验分析,发现启动子pBnUnng0942890呈现出很强的根、花和种子优势表达特性,在pBnUnng0942890转基因拟南芥中,其所驱动的报告基因GUS在转基因拟南芥的根、花和种子中都表现出很强的表达水平,这些数据充分表明pBnUnng0942890是一个很强的根、花和种子特异性表达启动子,在植物转基因育种中具有良好的应用前景。
发明内容
本发明的目的之一是在于提供一种甘蓝型油菜启动子pBnUnng0942890,其优点在于两个方面:首先,来源于油菜内源的特异组织优势表达启动子能够精确定位所调控的基因,驱动目的基因在转基因植物的特定组织或时期表达,避免造成植物自身能源和物质的浪费;其次,提高外源基因在转基因植物中的表达效率,限制其表达部位。因此,该启动子可应用于植物的基因工程研究和种质资源改良研究。
本发明的目的之二是在于提供了甘蓝型油菜pBnUnng0942890启动子的扩增引物。以甘蓝型油菜基因组DNA为模板,采用所述的特异性引物进行PCR扩增,获得甘蓝型油菜启动子pBnUnng0942890序列,操作简单,产物特异,结果稳定可靠。
本发明的目的之三是在于提供了一种含有植物高效表达启动子pBnUnng0942890的重组载体。所述的重组载体具体可以在植物表达载体DX2181G中插入启动子pBnUnng0942890,该载体大小适合,在植物中易于转化,所带有的标记基因GUS表达强度高,容易检测。
本发明的目的之四是在于提供了甘蓝型油菜启动子pBnUnng0942890在植物根、花和种子中优势表达目的基因的应用。在该启动子的驱动下,目的基因主要在植物的根、花和种子中优势表达,而在其他部位不表达或低表达。这一具有组织特异性优势表达的启动子在创建优良种质资源等基因工程和转基因安全中具有良好的应用价值。
为了完成上述目的,本发明采用如下技术方案:
启动子pBnUnng0942890的克隆:以甘蓝型油菜基因组DNA为模板进行PCR扩增,正向引物pBnUnng0942890-F为5'-GAGATCTACAGCGCTAAGCTTggaag gacaaaaccaaagctct-3',反向引物pBnUnng0942890-R为5'-GGACTGACCACCCGG GGATCCcttccttaactttctacacata-3'(引物pBnUnng0942890-F中,序列GAGATCTA CAGCGCT为载体DX2181融合位点的上游序列,序列AAGCTT为Hind III的酶切位点;引物pBnUnng0942890-R中,序列GGACTGACCACCCGG为载体DX2181融合位点的下游游序列,序列GGATCC为BamH I的酶切位点),获得甘蓝型油菜pBnUnng0942890的序列,如SEQ ID NO:1所示。
重组载体DX2181G-pBnUnng0942890的构建方法,其步骤是:
用Hind III和BamH I双酶切植物表达载体DX2181G,并经1%琼脂糖凝胶电泳检测回收;将启动子pBnUnng0942890与回收的酶切质粒按一步克隆试剂盒(
Figure BDA0001910419460000051
EntryOne Step Cloning Kit)说明书进行操作,37℃水浴30min后转化大肠杆菌感受态DH5α;长出的单克隆以载体上游引物DX2181G-F:TACGTCGCCGTCCAGCTCGA和目的序列特异引物pBnUnng0942890-R:GGACTGACCACCCGGGGATCCcttccttaactttctacacata进行阳性克隆检测,提取阳性克隆的表达载体质粒,该质粒即为重组载体DX2181G-pBnUnng0942890。
启动子pBnUnng0942890的功能分析及其在根、花和种子中优势表达中的应用:
通过启动子功能元件预测软件PlantCARE对该启动子顺式作用元件进行了在线预测分析,结果表明所克隆的启动子序列含有TATA box核心启动子序列,CAAT box等上游启动子元件和胚乳特异表达元件;在此基础上构建由该启动子调控的报告基因GUS的植物表达载体DX2181G-pBnUnng0942890;采用农杆菌介导的花序浸染法转化拟南芥,经潮霉素和PCR双重筛选获得转基因阳性植株;对阳性转基因株系进行GUS组织化学法染色,结果表明,该启动子驱动的GUS基因在拟南芥的根、花和种子中优势表达。由此可见,该启动子驱动的GUS基因具有一定的时空表达特异性,具有驱动下游基因在根、花和种子中的优势表达,其他组织器官等不表达或低表达的功能;这一具有组织特异性表达的启动子在人工创建优良种质资源、植物基因工程等方面具有很好的应用价值;如利用该启动子驱动油脂合成相关基因、根系抗倒伏抗胁迫相关基因,首先构建pBnUnng0942890驱动目的基因的过表达载体,转化受体植株,则目的基因在pBnUnng0942890启动子的驱动下,可以提高目的基因在上述组织部位中的表达量以达到提高种子或根系相关品质的目的。
与现有技术相比,本发明具有以下优点及有益效果:
1.该启动子可特异性驱动下游目的基因在植物根、花和种子中的优势表达,而不在其他组织、器官中表达或低表达,具有时空表达特异性。
2.种子和根都是植物的重要器官,育种专家可利用其特异性优势表达目的基因来改变植物的性状,如含油量、产量、非生物和生物胁迫抵抗力等,对于现代农业具有良好的应用潜力。pBnUnng0942890启动子在油菜利用转基因改良作物品质,人工创建优良种质资源等方面具有良好的应用潜力。
附图说明
图1为甘蓝型油菜BnUnng0942890基因启动子片段电泳图
泳道1为以基因组DNA为模板的PCR扩增的启动子片段结果;泳道2为DL2000的核酸Marker。
图2为pBnUnng0942890启动子序列分析结果图
TATA-box:启动子核心元件;CAAT-box:启动子和增强子的顺式作用元件;G-Box:光信号调控顺式作用元件;GT1-motif:光信号响应元件;MRE:光信号响应的MYB结合位点;P-box:赤霉素应答元件;ABRE:脱落酸响应顺式作用元件;ARE:厌氧感应必备顺式调控元件;TC-rich repeats:胁迫应答顺式作用元件;TCCC-motif:光信号应答元件;TGACG-motif:茉莉酸信号应答顺式调控元件。
图3为植物表达载体DX2181G的图谱。
图4为构建载体DX2181G-pBnUnng0942890的T-DNA区图谱。
图5为转基因植株PCR鉴定结果图
泳道1为DL2000的核酸Marker;泳道2为DX2181G-pBnUnng0942890阳性质粒对照;泳道3-9为转基因拟南芥。
图6为转基因拟南芥GUS组织化学染色结果图
A:5天幼苗;B:15天幼苗;C:25天幼苗;D:花;E:胚珠(幼嫩种子);F:种皮;G:胚胎。
具体实施方式
下述实施例中所用方法如无特别说明均为常规方法,所用引物均由武汉擎科生物科技有限公司合成,测序由武汉擎科生物科技有限公司完成,
Figure BDA0001910419460000071
Entry OneStep Cloning Kit购自南京诺唯赞生物科技有限公司,快速内切酶购自Thermo FisherScientific,DNA凝胶回收试剂盒、DNA Marker等购自大连宝生物公司,实验中所用的甘蓝型油菜品种为Darmor、哥伦比亚野生型拟南芥Arabidopsis Thaliana、大肠杆菌感受态菌株DH5α、农杆菌感受态菌株GV3101和改造后的植物遗传表达载体DX2181G等,均为本实验室保存。
实施例1:油菜启动子pBnUnng0942890的引物序列设计
根据油菜全基因组测序获得的BnUnng0942890基因上游的基因间隔序列1525bp设计一对引物进行PCR扩增,扩增获得油菜BnUnng0942890的5’上游启动子序列,所用引物为pBnUnng0942890-F:5'-GAGATCTACAGCGCTAAG CTTggaaggacaaaaccaaagctct-3'和pBnUnng0942890-R:5'-GGACTGACCACCCGG GGATCCcttccttaactttctacacata-3'。引物pBnUnng0942890-F中,序列GAGATCTA CAGCGCT为载体DX2181G融合位点的上游序列,序列AAGCTT为Hind III的酶切位点;引物pBnUnng0942890-R中,序列GGACTGACCACCCGG为载体DX2181G融合位点的下游游序列,序列GGATCC为BamH I的酶切位点。
实施例2:油菜启动子pBnUnng0942890的制备
本发明所用油菜为甘蓝型油菜(Brassica napus L.)Darmor,油菜播种于大田,正常田间管理。利用CTAB法提取油菜叶片基因组DNA,以提取的油菜全基因组DNA为模板进行聚合酶链式反应PCR(Polymerase chain reaction)。PCR体系为:2×Mix buffer 25μL,pBnUnng0942890-F:1μL,pBnUnng0942890-R:1μL,DNA 1μL,ddH2O 22μL。PCR程序为:94℃5min;94℃30s,56℃30s,72℃1min,35个循环;72℃10min;4℃∞。PCR产物大小为1525bp(见图1),经1.0%琼脂糖凝胶电泳鉴定并按试剂盒说明书进行纯化回收、检测浓度。
DX2181G载体质粒经Hind III和BamH I双酶切完全,并经1%琼脂糖凝胶电泳检测回收。回收的PCR产物与酶切质粒按一步克隆试剂盒(
Figure BDA0001910419460000081
Entry One StepCloning Kit)说明书进行操作(5×CE II Buffer 4μL,线性化克隆载体50~200ng,插入片段扩增产物20~200ng,
Figure BDA0001910419460000082
II 2μL,ddH2O补充至20μL),37℃水浴30min后转化大肠杆菌感受态DH5α。长出的单克隆以载体上游引物DX2181G-F:TACGTCGCCGTCCAGCTCGA和目的序列特异引物pBnUnng0942890-R:GGACTGACCACCCGGGGATCCcttccttaactttctacacata进行阳性克隆检测,经PCR检测为阳性单克隆的送武汉擎科生物科技有限公司进行测序,分析结果显示,获得了油菜BnUnng0942890基因全长启动子,其序列为SEQ ID NO:1所示核苷酸序列,命名为pBnUnng0942890。
实施例3:油菜启动子pBnUnng0942890的序列分析及功能预测
将所克隆并测序得到的pBnUnng0942890序列用启动子核心元件预测软件PLACE中的PlantCARE(Lescot M,Déhais P,Thijs G,et al.PlantCARE,a database of plantcis-acting regulatory elements and a portal to tools for in silico analysisof promoter sequences[J].Nucleic acids research,2002,30(1):325-327.http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)在线进行功能元件的预测分析。结果表明,如表1及图2所示,pBnUnng0942890含有真核生物启动子必需的核心元件TATAbox和CAAT box。进一步分析该启动子序列发现,除了必须的核心元件之外,pBnUnng0942890序列中还存在多种启动子功能元件:G-Box:cis-acting regulatoryelement involved in light responsiveness光信号调控顺式作用元件;GT1-motif:light responsive element光信号响应元件;MRE:MYB binding site involved in light光信号响应的MYB结合位点;P-box:gibberellin-responsive element赤霉素应答元件;ABRE:cis-acting element involved in the abscisic acid responsiveness脱落酸响应顺式作用元件;ARE:cis-acting regulatory element essential for the anaerobicinduction厌氧感应必备顺式调控元件;TC-rich repeats:cis-acting element involvedin defense and stress responsiveness胁迫应答顺式作用元件;TCCC-motif:part of alight responsive element光信号应答元件;TGACG-motif:cis-acting regulatoryelement involved in the MeJA-responsiveness茉莉酸信号应答顺式调控元件。由此申请人预测pBnUnng0942890可能是一个参与激素调节和胁迫应答的启动子,是一个很值得深入研究和挖掘的启动子。
实施例4:植物表达载体DX2181G-pBnUnng0942890的构建及根癌农杆菌菌株GV3101转化
重组载体DX2181G-pBnUnng0942890的构建方法,采用的是目的片段和酶切好的载体一步无缝克隆法(
Figure BDA0001910419460000091
II One Step Cloning Kit):一种简单、快速并且高效的DNA定向克隆技术,可将插入片段PCR产物定向克隆至任意载体的任意位点。将载体酶切进行线性化,并在插入片段PCR引物5’端引入线性化载体的末端序列,使得PCR产物5’和3’最末端分别带有和线性化载体两末端一致的序列(15bp~20bp)。这种两端带有载体末端序列的PCR产物和线性化载体按一定比例混合后,在Exnase的催化下,仅需反应30min即可进行转化,完成定向克隆。构建的重组载体是将质粒DX2181G上GUS基因上游的多克隆酶切位点用克隆得到的pBnUnng0942890片段重组替换而来。其步骤是:
1)用Hind III和BamH I双酶切植物表达载体DX2181G,并经1%琼脂糖凝胶电泳检测回收;
2)回收的PCR产物pBnUnng0942890与上述回收的酶切质粒按一步克隆试剂盒(
Figure BDA0001910419460000092
Entry One Step Cloning Kit)说明书进行操作(5×CE II Buffer4μL,线性化克隆载体50~200ng,插入片段扩增产物20~200ng,
Figure BDA0001910419460000093
II2μL,ddH2O直至终体积20μL),37℃水浴30min后转化大肠杆菌感受态DH5α;
3)长出的单克隆以载体上游引物DX2181G-F:TACGTCGCCGTCCAGCTCGA和目的序列特异引物pBnUnng0942890-R:GGACTGACCACCCGGGGATCCcttccttaactttctacacata进行阳性克隆检测,经PCR检测为阳性单克隆的送武汉擎科生物科技有限公司进行测序,分析结果显示,获得了油菜BnUnng0942890基因全长启动子,为SEQ ID NO:1所示核苷酸序列,提取的重组质粒命名为DX2181G-pBnUnng0942890。
利用冻融法转化农杆菌感受态细胞GV3101,步骤如下:
1)将保存于-80℃的农杆菌感受态细胞GV3101置于冰上融化;
2)用移液枪取3μL(100ng)表达载体质粒DX2181G-pBnUnng0942890,浸没枪头加入到感受态细胞中,置于冰上静止30min,液氮中急冻1min,然后在37℃恒温水浴锅中水浴5min;
3)加入600μL LB液体培养基(胰蛋白胨10g;酵母提取物5g;NaCl 10g),28℃,200rpm,振荡培养4h;
4)涂布于附加50μg/mL卡那霉素、50μg/mL庆大霉素和50μg/mL利福平的固体LB培养基(胰蛋白胨10g;酵母提取物5g;NaCl 10g;Agar 1.5%)上,28℃倒置培养36-48h;
5)长出的单克隆以植物表达载体上游引物DX2181G-F:TACGTCGCCGTCCAGCTCGA和目的序列特异引物pBnUnng0942890-R:GGACTGACCACCCGGGGATCCcttccttaactttctacacata进行阳性克隆检测,经PCR检测为阳性的单克隆摇菌至OD600=1.8-2.0(紫外分光光度计检测),用等体积的50%甘油保菌于-80℃超低温冰箱,以备后续研究使用。
实施例5:植物表达载体DX2181G-pBnUnng0942890在拟南芥中的遗传转化及转基因植物筛选
1、浸花法转化拟南芥:
1)拟南芥抽薹后剪去主花絮顶端,待侧枝生长一致且处于花蕾期时,准备材料进行转化;
2)用200mL含有50μg/mL卡那霉素、50μg/mL庆大霉素和100μg/mL利福平的LB液体培养基,接种携带目的基因的农杆菌DX2181G-pBnUnng0942890,28℃,200rpm,培养12-18h;
3)菌液装于离心瓶中,5000rpm,离心15min,用移液枪将上清吸走并弃之;
4)用100mL重悬液(5%的蔗糖,0.02%的表面活性剂),重悬农杆菌;将拟南芥花絮浸入菌液中30s,并轻柔搅动;
5)浸染完后,用塑料薄膜覆盖过夜,提高转化效率,可在5-7d后再转化一次;
6)大约一个月后,种子成熟,收获后置于37℃烘箱7d,脱粒后于4℃春化3d,标注为T0代种子。
2、筛选阳性转基因植株:
1)取适量(不超过EP管的1/5)脱粒干净的拟南芥种子于1.5mL EP管中;
2)加1mL75%酒精,震荡洗涤1min,8000rpm离心30s,用移液枪将上清吸走并弃之;
3)加1mL 10%的次氯酸钠,震荡洗涤5min,8 000rpm离心30s,用移液枪将上清吸走并弃之;
4)加1mL dd H2O,震荡洗涤1min,8 000rpm离心30s,用移液枪将上清吸走并弃之;
5)重复步骤4三次,加1mL ddH2O,于黑暗条件下,4℃,春化3d;
6)铺板种植于1/2MS培养基(MS粉2.15g;蔗糖10g;琼脂0.8%;pH5.8)上,含25mg/L的潮霉素,培养箱暗培养5d左右,转换为正常光照培养;
7)等长出两片真叶时,将下胚轴伸长、真叶生长正常的移苗于温室培养钵中(营养土:蛭石:珍珠岩=3:1:1);
8)活下来正常生长的植株待抽薹前取叶片抽提基因组DNA,以植物表达载体上游引物DX2181G-F:TACGTCGCCGTCCAGCTCGA和目的序列特异引物pBnUnng0942890-R:GGACTGACCACCCGGGGATCCcttccttaactttctacacata筛选阳性转基因植株,经PCR检测为阳性的转基因材料为T1代(见图5),单株收获,并依次编号保存。同样将T1代转基因材料经抗潮霉素筛选与PCR鉴定为T2代,单株收获,并依次编号保存。之后再次将T2代筛选,得到纯合的转基因株系。
实施例6:甘蓝型油菜pBnUnng0942890启动子的功能分析
采用组织化学染色法检测GUS在植株组织细胞中的表达。取实施例5制备的T2代转基因拟南芥不同部位,具体如:A:5天幼苗;B:15天幼苗;C:25天幼苗;D:花;E:胚珠(幼嫩种子);F:种皮;G:胚胎。取样后至小离心管或培养皿中,加入适量GUS染色液(50mmol/L PBS,pH 7.0;0.5mol/L X-Gluc;50mmol/L potassium ferricyanide;50mmol/L potassiumferrocyanide;10mmol/L EDTA、0.001%Triton X-100以及20%甲醇)。于37℃保温反应1h以上或过夜;然后转入70%乙醇中脱色后,利用体视镜(Olympus SZX7)进行观察拍照。植株被染成蓝色的部位就是GUS基因表达的部位,通过检测不同时空下GUS基因的表达部位和表达强度来探索pBnUnng0942890的时空表达模式。
结果表明(图6),该启动子驱动的GUS基因在拟南芥的根、花和种子中高效表达,在其他组织和器官中不表达或低表达。因此,该启动子局域驱动下游基因在植物根、花和种子中优势高效表达,而在其他部位不表达或低表达。这一具有组织特异性优势表达的启动子在植物基因工程中具有良好的应用价值。如:可以通过构建含有该启动子驱动提高种子含油量、提高根系抵御胁迫基因的载体,转化受体植株拟南芥或油菜,人工创造优质高产高油材料,应用于农业生产。
Figure BDA0001910419460000131
序列表
<110> 中国农业科学院油料作物研究所
<120> 甘蓝型油菜启动子pBnUnng0942890及其应用
<160> 1
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 1525
<212> DNA
<213> 人工序列(Artificial Sequence)
<400> 1
ggaaggacaa aaccaaagct ctaatctact accttagctt tcatacttgg caagcagtct 60
cgtagaagaa tacttcctca agcttttgag tttggagagt tgaagcaaag attatttggg 120
tgaaccaaag ctgtagaaaa aatagagaag caaagagagt cacgatcaaa aacctaacat 180
agttttcaag ctcacaaaca ttagttgacc atagagtaga acatgaaaag aacaaataaa 240
ctttactaga cttgcttata ctcttcagga ttaaaaggtt tgttgtcaaa atattctctg 300
tcttttgtgt ataacatggg attttaaaaa cagaaccaaa acagagaaga ttttgacaac 360
agaccttttg acagaacacc aaaggaacaa atcaatcgac gtgtgcctta gctcaacctc 420
agattcttca gagcacaaaa cctttttctc ggatccaacg aaaagctcga gacgaaatca 480
aatctaacaa tcaaagggct cccttcaggt ttgagagact ccaaaatcga atctttggct 540
tccaaaattg tcgacttggg tattgattca tgaacaagag ggaatcgaaa gttcagtact 600
tttctggaaa gcttcgtctc tgatctctcg cttccttgtt ctctctctgt tctcataggt 660
gtggtcaatt ttttatttga ttttgggtat ttccaaataa caggtacaat ggtgggattt 720
gtgtaacgat agttttgact gaaaataaca aaaaaaatag tttcaaatcc atttcataaa 780
gtttttcttt taaaattgtt tatcattgaa taacagtaga tttgatttac ttttggtaaa 840
ttgttaatta aataacagtg gattacaagt gattttaagc tactttagat aaatgtcata 900
ttcaatgaag aaaaaaaaat aaatcattag ttgaataaca gaaaatttta aaaaaatacc 960
aaaacactat aaaatcctct attcaataca cccccttaat cactaaatag aagtatcagg 1020
gaaagaaaga agcagatttg gtaaaagggt agaatcgaca atggaagcaa aaactgggtt 1080
aataaagtga cggagagatt ctctcactct tctgatctct caactctccc aagctaagac 1140
tctctctctc tctctctctc tctctctctc tctctctctc tctctatccg tttgatcatc 1200
atcctcgtcg ctcgtcggct tgttcggaaa atctccgatc cgttcgagtc tcgctctctg 1260
actgttcccg ccatctgcga tcatctgatc cgtcgatctc cctcgcgaaa ttgtaggtga 1320
ctcagaaaaa cgcactcttc ctagctactg atcaccattt tcgctatata cgtgtgaaaa 1380
tctgatgaat aaacgataat caaagcgacg aacacaccga tcgttgattg ttttgacctt 1440
tgtggtagaa tctttcattt tcagttgtag attgatgcta aacagtcacg tttgtgtgat 1500
tggtatgtgt agaaagttaa ggaag 1525

Claims (5)

1.甘蓝型油菜启动子,其特征在于,所述的启动子为SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列。
2.含有权利要求1所述启动子的重组载体。
3.权利要求1所述的启动子的扩增引物,其特征在于:正向引物为5'-GAGATCTACAGCGCTAAGCTTGGAAGGACAAAACCAAAGCTCT-3',反向引物为5'-GGACTGACCACCCGGGGATCCCTTCCTTAACTTTCTACACATA-3'。
4.权利要求1所述的启动子或权利要求2所述的重组载体在植物的根、花和种子中优势表达目的基因的应用。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述的植物包括拟南芥和油菜。
CN201811552149.5A 2018-12-18 2018-12-18 甘蓝型油菜启动子pBnUnng0942890及其应用 Active CN109439663B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201811552149.5A CN109439663B (zh) 2018-12-18 2018-12-18 甘蓝型油菜启动子pBnUnng0942890及其应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201811552149.5A CN109439663B (zh) 2018-12-18 2018-12-18 甘蓝型油菜启动子pBnUnng0942890及其应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN109439663A CN109439663A (zh) 2019-03-08
CN109439663B true CN109439663B (zh) 2021-07-30

Family

ID=65559936

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201811552149.5A Active CN109439663B (zh) 2018-12-18 2018-12-18 甘蓝型油菜启动子pBnUnng0942890及其应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN109439663B (zh)

Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111893118B (zh) * 2020-07-31 2022-10-21 四川大学 一种来源于甘蓝型油菜的双向启动子及其应用
CN112011541B (zh) * 2020-09-11 2021-09-28 西南大学 甘蓝型油菜Bna.A08IDD7基因启动子及其应用

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107099532A (zh) * 2017-06-05 2017-08-29 中国农业科学院油料作物研究所 甘蓝型油菜胚胎特异性启动子pBnaA09g21960D及其应用

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN107099532A (zh) * 2017-06-05 2017-08-29 中国农业科学院油料作物研究所 甘蓝型油菜胚胎特异性启动子pBnaA09g21960D及其应用

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Piriformospora indica promotes growth, seed yield and quality of Brassica napus L.;Zhen-zhu Su等;《MICROBIOLOGICAL RESEARCH》;20170227;第199卷;第29-39页 *
甘蓝型油菜胚胎特异启动子pBnaA09921960D的分析;范世航 等;《中国油料作物学报》;20171231;第39卷(第6期);第721-728页 *

Also Published As

Publication number Publication date
CN109439663A (zh) 2019-03-08

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN109439663B (zh) 甘蓝型油菜启动子pBnUnng0942890及其应用
CN101914539B (zh) 一种根部特异性表达启动子及其植物表达载体
CN107164382B (zh) 一种受光或生长素诱导的启动子hlp3
CN102220327B (zh) 甘蓝型油菜BnPABP8启动子及制备方法和应用
CN109536501B (zh) 甘蓝型油菜组成型启动子pBnaC05g31880D及其应用
CN107099532B (zh) 甘蓝型油菜胚胎特异性启动子pBnaA09g21960D及其应用
CN102965374B (zh) 油菜BnRabGDI3启动子的制备方法及其应用
CN102226181B (zh) 甘蓝型油菜BnPABP2启动子的制备方法及其应用
Kumar et al. Genetic transformation of Jatropha curcas: Current status and future prospects
CN114703199B (zh) 一种植物抗旱性相关的基因TaCML46及应用
CN102226180B (zh) 甘蓝型油菜BnPABP5-3启动子的制备方法及其应用
CN107488664B (zh) 甘蓝型油菜根特异性启动子pBn21194及其应用
CN108588070A (zh) 一种蒙古沙冬青保卫细胞特异表达启动子及其应用
CN116064568A (zh) 紫花苜蓿MsASG166基因及在提高植物耐旱中的用途
CN113717977A (zh) 甘蓝型油菜组织特异型p8启动子及其在制备转基因油菜中的应用
CN110627887B (zh) SlTLFP8蛋白及其相关生物材料在调控番茄抗旱性中的应用
CN112011541A (zh) 甘蓝型油菜Bna.A08IDD7基因启动子及其应用
CN105602957B (zh) 棉花纤维特异表达启动子tb7p1及其应用
CN113061172B (zh) 一种植物耐盐性相关的lip1蛋白质及其相关生物材料与应用
CN104673794A (zh) 一种水稻Os-ER-ANT1基因启动子及其应用
CN110656110B (zh) 棉花纤维特异表达启动子8dp2及其应用
CN115873858B (zh) 一种氨基酸和激素调控的水稻启动子以及含该启动子的表达载体及其应用
CN110229824B (zh) 盐芥TsHKT1;3启动子的克隆与应用
CN112662670B (zh) 花生脂酰-酰基载体蛋白硫酯酶AhFATB2基因启动子及其制备方法和应用
CN111718938B (zh) 一种植物绿色组织特异表达的高温诱导型启动子及应用

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant