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BR112019020185A2 - Métodos e composições para redução da imunogenicidade - Google Patents

Métodos e composições para redução da imunogenicidade Download PDF

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BR112019020185A2
BR112019020185A2 BR112019020185-8A BR112019020185A BR112019020185A2 BR 112019020185 A2 BR112019020185 A2 BR 112019020185A2 BR 112019020185 A BR112019020185 A BR 112019020185A BR 112019020185 A2 BR112019020185 A2 BR 112019020185A2
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C. Johnson Jeffrey
Dearth Lawrence
Hadjivassiliou Haralambos
Sun Jeonghoon
Hariharan Kandasamy
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Abstract

são fornecidos na presente invenção métodos e usos envolvendo a combinação de um anticorpo anti-cd20, por exemplo, rituximab com uma proteína terapêutica, por exemplo, um anticorpo (por exemplo, um anticorpo que se liga especificamente à cd47 humana).

Description

MÉTODOS E COMPOSIÇÕES PARA REDUÇÃO DA IMUNOGENICIDADE
ÁREA
[001] São proporcionados aqui métodos e usos envolvendo a combinação de um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab com uma proteína terapêutica, por exemplo, um anticorpo (p.ex., um anticorpo que se liga especificamente à CD47 humana).
ANTECEDENTES
[002] Embora as proteínas terapêuticas tenham sido usadas para tratar um número de doenças, eles podem desencadear uma resposta imunitária envolvendo produção de anticorpos antifármaco quando administrados a indivíduos. Isto pode resultar em eficácia reduzida do terapêutico e/ou atividade. Conformemente existe uma necessidade de métodos de redução desta resposta imunitária.
[003] CD47, também conhecida como proteína associada à integrina (IAP), antígeno do câncer dos ovários OA3, antígeno relacionado com Rh e MER6, é um receptor transmembranar de abrangência múltipla pertencendo à superfamília das imunoglobulinas. SIRPct (proteína regulador do sinal a) expressa em macrófagos interage com CD47, e esta interação controla negativamente a função efetora de células imunitárias inatas tais como fagocitose de células hospedeiras. A expressão e/ou atividade de CD47 têm sido implicadas em um número de doenças e disfunções. Conformemente existe uma necessidade de terapias que visem CD47.
SUMÁRIO
[004] São proporcionados aqui métodos e composições para redução da imunogenicidade em um indivíduo, compreendendo administração a um indivíduo de um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, em combinação com uma proteína terapêutica, em que a imunogenicidade é reduzida em comparação
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2/104 com a imunogenicidade em um indivíduo quando a proteína terapêutica é administrada sozinha. Em certos aspectos, a proteína terapêutica é um anticorpo terapêutico. Em certos aspectos, a proteína terapêutica é uma proteína de fusão, por exemplo, uma proteína de fusão contendo Fc, p.ex., uma proteína de fusão receptora solúvel. Em certos aspectos, a proteína terapêutica é uma citocina. Em certos aspectos, a proteína terapêutica é uma interleucina. Em certos aspectos, a proteína terapêutica não é uma enzima. Em certos aspectos, o indivíduo é um humano.
[005] Em certos aspectos dos métodos e composições proporcionados aqui, a proteína terapêutica é um anticorpo, em que o anticorpo terapêutico é um anticorpo que se liga à CD47 ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.
[006] Em aspectos específicos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma CDR1 de VH compreendendo SEQ ID NO: 50, uma CDR2 de VH compreendendo SEQ ID NO: 72, uma CDR3 de VH compreendendo SEQ ID NO: 52, uma CDR1 de VL compreendendo SEQ ID NO: 53, uma CDR2 de VL compreendendo SEQ ID NO: 71 e uma CDR3 de VL compreendendo SEQ ID NO: 55.
[007] Em aspectos específicos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma CDR1 de VH compreendendo SEQ ID NO: 50, uma CDR2 de VH compreendendo SEQ ID NO: 51, uma CDR3 de VH compreendendo SEQ ID NO: 52, uma CDR1 de VL compreendendo SEQ ID NO: 53, uma CDR2 de VL compreendendo SEQ ID NO: 54 e uma CDR3 de VL compreendendo SEQ ID NO: 55.
[008] Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma VH compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 5-30. Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do
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3/104 mesmo compreende uma VL compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 31-47. Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma VH compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 5-30 e uma VL compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 31-47.
[009] Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é um isotipo de IgG selecionado do grupo consistindo em isotipo IgG 1, isotipo lgG2, isotipo lgG3 e isotipo lgG4. Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é um isotipo de IgG selecionado de lgG4P e lgG4PE.
[0010] Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é um componente de uma composição farmacêutica compreendendo o anticorpo que se liga à CD47 ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo e um veículo farmaceuticamente aceitável.
[0011] Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é um anticorpo quimérico, humanizado ou totalmente humano.
[0012] Em certos aspectos, os métodos proporcionados aqui compreendem adicionalmente administração de um segundo terapêutico, p.ex., um terapêutico de pequena molécula, tal como um terapêutico de quimioterapia. Em aspectos específicos, a referida quimioterapia é radioterapia.
[0013] Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3, 1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg. Em certos aspectos, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450 ou 500 mg/m2. Em certos aspectos, o anticorpo anti-CD20 é rituximab.
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Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3,1, 2,4, 8,15, ou 20 mg/kg e o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450 ou 500 mg/m2. Em certos aspectos, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado antes da proteína terapêutica. Em certos aspectos, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado 1, 2, 3, 4, 5 ou 6 semanas antes da proteína terapêutica. Em certos aspectos, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado 1, 2, 3, 4, 5 ou 6 dias antes da proteína terapêutica. Em certos aspectos, o rituximab é administrado antes do anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo. Em certos aspectos, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado 1, 2, 3, 4, 5 ou 6 semanas antes do anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.
Em certos aspectos, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado 1, 2, 3, 4, 5 ou 6 dias antes do anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.
[0014] Em certos aspectos, os métodos proporcionados aqui não compreendem administração de um inibidor do proteossomo ao indivíduo. Em certos aspectos, os métodos proporcionados aqui não compreendem administração de bortezomibe ao indivíduo. Em certos aspectos, os métodos proporcionados aqui não compreendem administração de metotrexato ao indivíduo.
[0015] São proporcionados aqui métodos para tratamento de câncer, compreendendo o método administração a um indivíduo com sua necessidade de uma quantidade terapeuticamente eficaz de um anticorpo que se liga à CD47 ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, em que o método compreende adicionalmente administração de um anticorpo anti-CD20, p.ex.,
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5/104 rituximab, ao indivíduo. Em certos aspectos, o anticorpo anti-CD20 é rituximab. Em certos aspectos, o indivíduo é um humano. Em certos aspectos, os métodos proporcionados aqui compreendem adicionalmente administração de radiação ou quimioterapia. Em certos aspectos, os métodos proporcionados aqui compreendem adicionalmente administração de outro agente anticanceroso. Em certos aspectos, o câncer é um câncer hematológico. Em certos aspectos, o câncer é um câncer sólido. Em certos aspectos, o câncer é mieloma múltiplo, linfoma não-Hodgkin, leucemia mieloide aguda (AML), câncer da mama (p.ex., câncer da mama triplo negativo), câncer da bexiga, câncer/carcinoma do pulmão de células não pequenas, carcinoma hepatocelular (HCC), sarcoma ou câncer da cabeça e pescoço. Em certos aspectos, o câncer é mieloma múltiplo. Em certos aspectos, o câncer é linfoma não-Hodgkin. Em aspectos específicos, o linfoma não-Hodgkin é positivo quanto a CD20. Em aspectos específicos, o linfoma nãoHodgkin é recidivante ou refratário. Em aspectos específicos, o indivíduo recebeu previamente um regime terapêutico incluindo anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab.
[0016] São proporcionados aqui métodos para tratamento de câncer, compreendendo o método administração a um indivíduo com sua necessidade de uma quantidade terapeuticamente eficaz de um anticorpo que se liga à CD47 ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo. Em certos aspectos, o indivíduo é um humano. Em certos aspectos, os métodos proporcionados aqui compreendem adicionalmente administração de radiação ou quimioterapia. Em certos aspectos, os métodos proporcionados aqui compreendem adicionalmente administração de outro agente anticanceroso. Em certos aspectos, o câncer é um câncer hematológico. Em certos aspectos, o câncer é um câncer sólido. Em certos aspectos, o câncer é mieloma múltiplo, linfoma nãoHodgkin, leucemia mieloide aguda (AML), câncer da mama (p.ex., câncer da
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6/104 mama triplo negativo), câncer da bexiga, câncer/carcinoma do pulmão de células não pequenas, carcinoma hepatocelular (HCC), sarcoma ou câncer da cabeça e pescoço. Em certos aspectos, o câncer é mieloma múltiplo. Em certos aspectos, o câncer é linfoma não-Hodgkin. Em aspectos específicos, o linfoma não-Hodgkin é positivo quanto a CD20. Em aspectos específicos, o linfoma não-Hodgkin é recidivante ou refratário. Em aspectos específicos, o indivíduo recebeu previamente um regime terapêutico incluindo anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab.
[0017] Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3, 1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg. Em certos aspectos, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450 ou 500 mg/m2. Em certos aspectos, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado antes do anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.
[0018] Em certos aspectos, o método não compreende administração de um inibidor do proteossomo ao indivíduo. Em certos aspectos, o método não compreende administração de bortezomibe ao indivíduo. Em certos aspectos, o método não compreende administração de metotrexato ao indivíduo.
[0019] Em certos aspectos dos métodos de tratamento de câncer proporcionados aqui, a proteína terapêutica é um anticorpo, em que o anticorpo terapêutico é um anticorpo que se liga à CD47 ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.
[0020] Em aspectos específicos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma CDR1 de VH compreendendo SEQ ID NO: 50, uma CDR2 de VH compreendendo SEQ ID NO: 72, uma CDR3 de VH compreendendo SEQ ID NO: 52, uma CDR1 de VL
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7/104 compreendendo SEQ ID NO: 53, uma CDR2 de VL compreendendo SEQ ID NO: 71 e uma CDR3 de VL compreendendo SEQ ID NO: 55.
[0021] Em aspectos específicos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma CDR1 de VH compreendendo SEQ ID NO: 50, uma CDR2 de VH compreendendo SEQ ID NO: 51, uma CDR3 de VH compreendendo SEQ ID NO: 52, uma CDR1 de VL compreendendo SEQ ID NO: 53, uma CDR2 de VL compreendendo SEQ ID NO: 54 e uma CDR3 de VL compreendendo SEQ ID NO: 55.
[0022] Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma VH compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 5-30. Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma VL compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 31-47. Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma VH compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 5-30 e uma VL compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 31-47.
[0023] Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é um isotipo de IgG selecionado do grupo consistindo em isotipo IgG 1, isotipo lgG2, isotipo lgG3 e isotipo lgG4. Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é um isotipo de IgG selecionado de lgG4P e lgG4PE. Em certos aspectos, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é quimérico, humanizado ou totalmente humano.
DESCRIÇÃO DETALHADA
Métodos
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Métodos de redução da imunogenicidade
[0024] São proporcionados aqui métodos para redução da imunogenicidade em um indivíduo, compreendendo administração a um indivíduo de um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, em combinação com uma proteína terapêutica, em que a imunogenicidade é reduzida em comparação com a imunogenicidade no indivíduo quando se administra a proteína terapêutica sozinha. Em certas modalidades, a proteína terapêutica é um anticorpo terapêutico. Em certas modalidades, a proteína terapêutica é uma citocina. Em certas modalidades, a citocina é proteína morfogenética do osso (BMP), eritropoietina (EPO), fator estimulador de colônias de granulócitos (GCSF), fator estimulador de colônias de granulócitos e macrófagos (GM-CSF), interferon alfa (IFN-ct), interferon beta (IFN-β), interleucina 2 (IL-2), interleucina 11 (IL-11) ou interferon gama (IFN-γ). Em certas modalidades, a proteína terapêutica é uma interleucina. Em certas modalidades, a proteína terapêutica não é uma enzima.
[0025] Em certas modalidades dos métodos proporcionados aqui, a proteína terapêutica é um anticorpo terapêutico, em que o anticorpo terapêutico é um anticorpo que se liga à CD47 ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.
[0026] Em certas modalidades, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é um componente de uma composição farmacêutica compreendendo o anticorpo que se liga à CD47 ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo e um veículo farmaceuticamente aceitável.
[0027] Em certas modalidades, os métodos proporcionados aqui compreendem administração de quimioterapia. Em modalidades específicas, a referida quimioterapia é radioterapia.
[0028] Em certas modalidades, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é
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9/104 administrado antes do e/ou simultaneamente com a proteína terapêutica. Em certas modalidades, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado antes da proteína terapêutica. Em certas modalidades, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado simultaneamente com a proteína terapêutica.
[0029] Em certas modalidades, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado antes do e/ou simultaneamente com o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo. Em certas modalidades, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado antes do anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo. Em certas modalidades, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado simultaneamente com o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.
[0030] Em certas modalidades, os métodos proporcionados aqui não compreendem administração de um inibidor do proteossomo ao indivíduo. Em certas modalidades, os métodos proporcionados aqui não compreendem administração de bortezomibe ao indivíduo. Em certas modalidades, os métodos proporcionados aqui não compreendem administração de metotrexato ao indivíduo.
[0031] A imunogenicidade pode ser medida por qualquer método conhecido de um perito na técnica. Em certas modalidades, a imunogenicidade é medida por determinação do número e/ou concentração de anticorpos antifármaco presentes no soro. Em certas modalidades, a imunogenicidade é medida por determinação do título de anticorpos antifármaco presentes no soro. Em certas modalidades, a imunogenicidade é medida por determinação da quantidade de proteína terapêutica neutralizada por volume de soro. Em certas modalidades, a presença de imunogenicidade é indicada pela ocorrência de anafilaxia, síndrome de liberação de citocinas, reações de infusão,
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10/104 hipersensibilidade retardada e/ou reatividade cruzada com proteínas endógenas. Em certas modalidades, a imunogenicidade é medida por um ensaio de rastreamento. Em modalidades específicas, o ensaio de rastreamento é um ensaio imunossorbente ligado a enzimas (ELISA) com ligação direta, um ELISA em ponte, um ensaio de radioimunoprecipitação (RIPA), um ensaio de ressonância de plasmon de superfície (SPR), um ensaio Bethesda ou um ensaio de eletroquimioluminescência em ponte. Em certas modalidades, a imunogenicidade é medida por um ensaio de neutralização. Em modalidades específicas, o ensaio de neutralização é um ensaio biológico à base de células ou um ensaio de ligação ao ligando competitivo não à base de células. Em certas modalidades, os anticorpos antifármaco se ligam a proteína terapêutica. Em certas modalidades, os anticorpos antifármaco neutralizam a proteína terapêutica. Em certas modalidades, os anticorpos antifármaco se ligam a e neutralizam a proteína terapêutica.
[0032] Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida uma semana após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida duas semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida três semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida quatro semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida cinco semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida seis semanas após a primeira dose da proteína terapêutica.
[0033] Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida semanalmente após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida uma semana após a primeira dose da proteína terapêutica e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a
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11/104 imunogenicidade é medida duas semanas após a primeira dose da proteína terapêutica e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida três semanas após a primeira dose da proteína terapêutica e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida quatro semanas após a primeira dose da proteína terapêutica e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida cinco semanas após a primeira dose da proteína terapêutica e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida seis semanas após a primeira dose da proteína terapêutica e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida a cada duas semanas após a primeira dose da proteína terapêutica.
[0034] Em certos aspectos, a contagem de células B é medida uma semana após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida duas semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida três semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida quatro semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida cinco semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida seis semanas após a primeira dose da proteína terapêutica.
[0035] Em certos aspectos, a contagem de células B é medida uma semana após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida duas semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida três semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a contagem
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12/104 de células B é medida quatro semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida cinco semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida seis semanas após a primeira dose da proteína terapêutica.
[0036] Em certos aspectos, a contagem de células B é medida semanalmente após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida uma semana após a primeira dose da proteína terapêutica e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida duas semanas após a primeira dose da proteína terapêutica e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida três semanas após a primeira dose da proteína terapêutica e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida quatro semanas após a primeira dose da proteína terapêutica e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida cinco semanas após a primeira dose da proteína terapêutica e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida seis semanas após a primeira dose da proteína terapêutica e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida a cada duas semanas após a primeira dose da proteína terapêutica.
[0037] Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida uma semana após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida duas semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida três semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida quatro semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a
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13/104 imunogenicidade é medida cinco semanas após a primeira dose da proteína terapêutica. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida seis semanas após a primeira dose da proteína terapêutica.
[0038] Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida semanalmente após a primeira dose de anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab. Em certos aspectos, o anticorpo anti-CD20 é rituximab. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida uma semana após a primeira dose de rituximab e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida duas semanas após a primeira dose de rituximab e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida três semanas após a primeira dose de rituximab e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida quatro semanas após a primeira dose de rituximab e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida cinco semanas após a primeira dose de rituximab e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida seis semanas após a primeira dose de rituximab e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a imunogenicidade é medida a cada duas semanas após a primeira dose de rituximab.
[0039] Em certos aspectos, a contagem de células B é medida uma semana após a primeira dose de anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab. Em certos aspectos, o anticorpo anti-CD20 é rituximab. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida duas semanas após a primeira dose de rituximab. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida três semanas após a primeira dose de rituximab. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida quatro semanas após a primeira dose de rituximab. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida cinco semanas após a primeira dose de rituximab. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida seis semanas após a primeira dose
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14/104 de rituximab.
[0040] Em certos aspectos, a contagem de células B é medida uma semana após a primeira dose de anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab. Em certos aspectos, o anticorpo anti-CD20 é rituximab. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida duas semanas após a primeira dose de rituximab. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida três semanas após a primeira dose de rituximab. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida quatro semanas após a primeira dose de rituximab. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida cinco semanas após a primeira dose de rituximab. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida seis semanas após a primeira dose de rituximab.
[0041] Em certos aspectos, a contagem de células B é medida semanalmente após a primeira dose de anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab. Em certos aspectos, o anticorpo anti-CD20 é rituximab. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida uma semana após a primeira dose de rituximab e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida duas semanas após a primeira dose de rituximab e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida três semanas após a primeira dose de rituximab e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida quatro semanas após a primeira dose de rituximab e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida cinco semanas após a primeira dose de rituximab e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida seis semanas após a primeira dose de rituximab e semanalmente subsequentemente. Em certos aspectos, a contagem de células B é medida a cada duas semanas após a primeira dose de rituximab.
Métodos de tratamento de câncer
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[0042] São proporcionados aqui métodos para tratamento de câncer, compreendendo o método administração a um indivíduo com sua necessidade de uma quantidade terapeuticamente eficaz de um anticorpo que se liga à CD47 ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, em que o método compreende adicionalmente administração de anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, ao indivíduo. Em certas modalidades, o anticorpo anti-CD20 é rituximab. São também proporcionados aqui métodos para tratamento de câncer, compreendendo o método administração a um indivíduo com sua necessidade de uma quantidade terapeuticamente eficaz de um anticorpo que se liga à CD47 ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.
[0043] Em certas modalidades, os métodos para tratamento de câncer proporcionados aqui compreendem adicionalmente administração de radiação ou quimioterapia. Em certas modalidades, os métodos proporcionados aqui compreendem adicionalmente administração de outro agente anticanceroso. Em certas modalidades, o câncer é um câncer hematológico. Em certas modalidades, o câncer é um câncer sólido. Em certas modalidades, o câncer é mieloma múltiplo, linfoma não-Hodgkin, leucemia mieloide aguda (AML), câncer da mama (p.ex., câncer da mama triplo negativo), câncer da bexiga, câncer/carcinoma do pulmão de células não pequenas, carcinoma hepatocelular (HCC), sarcoma ou câncer da cabeça e pescoço. Em modalidades específicas, o câncer é linfoma não-Hodgkin. Em modalidades específicas, o linfoma nãoHodgkin é positivo quanto a CD20. Em modalidades específicas, o linfoma nãoHodgkin é recidivante ou refratário. Em modalidades específicas, o indivíduo foi previamente tratado com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab.
[0044] Em certas modalidades, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado antes do e/ou simultaneamente com o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo. Em certas modalidades,
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16/104 o anticorpo anti-CD20 é rituximab. Em certas modalidades, o anticorpo antiCD20, p.ex., rituximab, é administrado antes do anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo. Em certas modalidades, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado simultaneamente com o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.
[0045] Em certas modalidades, o método não compreende administração de um inibidor do proteossomo ao indivíduo. Em certas modalidades, o método não compreende administração de bortezomibe ao indivíduo. Em certas modalidades, o método não compreende administração de metotrexato ao indivíduo. Em certas modalidades, o método compreende adicionalmente administração de metotrexato ao indivíduo.
[0046] Em certas modalidades, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é um componente de uma composição farmacêutica compreendendo o anticorpo que se liga à CD47 ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo e um veículo farmaceuticamente aceitável.
[0047] Em certas modalidades são proporcionados aqui método de proteção contra uma condição ou disfunção, tal como câncer, usando um anticorpo anti-CD47 descrito aqui sozinho ou em combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab.
[0048] Em modalidades particulares são proporcionados aqui métodos para gestão, tratamento, prevenção ou proteção contra câncer, compreendendo administração a um indivíduo com sua necessidade de uma quantidade terapeuticamente eficaz de um anticorpo ou um fragmento de ligação ao antígeno que se liga especificamente à CD47 (p.ex., CD47 humana) sozinho ou em combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab. Em certas modalidades é proporcionado aqui um método de alívio, inibição ou redução da progressão ou gravidade de um ou mais sintomas associados a câncer.
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[0049] Como usado aqui, administrar ou administração se refere ao ato de injeção ou de outro modo administração física de uma substância (p.ex., anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab ou um anticorpo anti-CD47 proporcionado aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo) a um indivíduo ou um paciente (p.ex., humano), tal como por administração mucosal, tópica, intradérmica, parenteral, intravenosa, subcutânea, intramuscular e/ou qualquer outro método de administração física descrito aqui ou conhecido na técnica. Em certas modalidades, a administração do anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é realizada intravenosamente. Em certas modalidades, a administração de um anticorpo anti-CD47 proporcionado aqui é realizada intravenosamente. Em certas modalidades, a administração de rituximab e um anticorpo anti-CD47 proporcionado aqui é realizada intravenosamente.
[0050] Como usado aqui, o termo quantidade eficaz se refere a uma quantidade de uma composição (p.ex., um anticorpo ou composição farmacêutica proporcionado aqui ou um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, ou uma composição farmacêutica proporcionada aqui) que é suficiente para alcançar uma leitura específica, por exemplo, reduzir e/ou melhorar a gravidade e/ou duração de uma dada condição, disfunção ou doença (p.ex., câncer, metástase ou angiogênese) e/ou um sintoma relacionado com ela. Um tal termo engloba também uma quantia necessária para a redução, desaceleração ou melhoria do avanço ou progressão de uma dada doença, redução, desaceleração ou melhoria da recorrência, desenvolvimento ou início de uma dada doença e/ou para melhorar ou intensificar o(s) efeito(s) profilático(s) ou terapêutico(s) de outra terapia (p.ex., uma terapia sem ser um anticorpo anti-CD47 proporcionado aqui). Em algumas modalidades, quantidade eficaz como usado aqui se refere à quantidade do anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, associada a uma redução na imunogenicidade de uma proteína terapêutica, como descrito
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18/104 aqui.
[0051] As doses de anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, por exemplo, a serem administradas em combinação com uma proteína terapêutica, tal como um anticorpo anti-CD47, podem incluir cerca de 0,1 mg/kg de peso corporal a cerca de 100 mg/kg de peso corporal. As doses de rituximab, por exemplo, a serem administradas em combinação com uma proteína terapêutica, tal como um anticorpo anti-CD47, podem incluir cerca de 25 mg/m2 a cerca de 1500 mg/m2. Em algumas modalidades, o rituximab é administrado a um indivíduo a uma dose de 0,1 mg/kg, 0,5 mg/kg, 1 mg/kg, 2 mg/kg, 5 mg/kg, 10 mg/kg, 15 mg/kg, 20 mg/kg, 25 mg/kg, 30 mg/kg, 50 mg/kg, 75 mg/kg, 100 mg/kg ou maior. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,1, 0,3, 0,5, 1, 2, 4, 5, 8, 10, 15, 20, 25, 30, 50, 75 ou 100 mg/kg. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3,1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg. Em algumas modalidades, o rituximab é administrado a um indivíduo a uma dose de 25, 50, 75, 100, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, 500, 750, 1000, 1250, 1500 mg/m2 ou maior. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, ou 500 mg/m2. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2.
[0052] As frequências de dosagem de anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, podem variar, por exemplo, de duas vezes diariamente a uma vez por mês. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, ou 500 mg/m2 uma vez semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375,400,425,450, 475, ou 500 mg/m2 a cada duas semanas. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, ou 500 mg/m2 a cada quatro semanas. Em certas
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19/104 modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 uma vez semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 a cada duas semanas. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 a cada quatro semanas.
[0053] As doses do anticorpo anti-CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo, por exemplo, a serem administradas em combinação com anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, podem incluir cerca de 0,1 mg/kg de peso corporal a cerca de 100 mg/kg de peso corporal. Em algumas modalidades, um anticorpo anti-CD47 é administrado a um indivíduo a uma dose de 0,1 mg/kg, 0,5 mg/kg, 1 mg/kg, 2 mg/kg, 5 mg/kg, 10 mg/kg, 15 mg/kg, 20 mg/kg, 25 mg/kg, 30 mg/kg, 50 mg/kg, 75 mg/kg, 100 mg/kg ou maior. Em certas modalidades, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,1, 0,3, 0,5,1, 2, 4, 5, 8,10,15, 20, 25, 30, 50, 75 ou 100 mg/kg. Em certas modalidades, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3, 1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg.
[0054] As frequências de dosagem do anticorpo anti-CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo podem variar, por exemplo, de duas vezes diariamente a uma vez por semana. Em certas modalidades, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3, 1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg uma vez semanalmente. Em certas modalidades, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3,1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 8 mg/kg duas vezes semanalmente.
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Em certas modalidades, o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 20 mg/kg uma vez semanalmente.
[0055] Em algumas modalidades, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado a um indivíduo a uma dose de 25, 50, 75, 100, 125, 150, 175, 200, 225, 250, 275, 300, 325, 350, 375, 400, 425,450, 475, 500, 750, 1000, 1250,1500 mg/m2, e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,1, 0,3, 0,5, 1, 2, 4, 5, 8, 10, 15, 20, 25, 30, 50, 75 ou 100 mg/kg. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, ou 500 mg/m2 e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3,1, 2,4, 8,15, ou 20 mg/kg. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3, 1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375,400,425,450,475, ou 500 mg/m2 uma vez semanalmente e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3,1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg uma vez semanalmente.
[0056] Em certas modalidades, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, ou 500 mg/m2 a cada duas semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3, 1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, ou 500 mg/m2 a cada duas semanas e o anticorpo
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21/104 que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 8 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, ou 500 mg/m2 a cada duas semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 8 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, ou 500 mg/m2 a cada duas semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 20 mg/kg uma vez semanalmente.
[0057] Em certas modalidades, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, ou 500 mg/m2 a cada quatro semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3, 1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375,400,425,450,475, ou 500 mg/m2 a cada quatro semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 8 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, ou 500 mg/m2 a cada quatro semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 8 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450, 475, ou 500 mg/m2 a cada quatro semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 20 mg/kg uma vez semanalmente.
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[0058] Em certas modalidades, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 uma vez semanalmente e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3, 1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 uma vez semanalmente e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 8 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 uma vez semanalmente e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 8 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 uma vez semanalmente e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 20 mg/kg uma vez semanalmente.
[0059] Em certas modalidades, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 a cada duas semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3, 1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 a cada duas semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 8 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 a cada duas semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 8 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao
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23/104 indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 a cada duas semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 20 mg/kg uma vez semanalmente.
[0060] Em certas modalidades, o anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 a cada quatro semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3, 1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 a cada quatro semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 8 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 a cada quatro semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 8 mg/kg duas vezes semanalmente. Em certas modalidades, o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 375 mg/m2 a cada quatro semanas e o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é administrado ao indivíduo a uma dose de 20 mg/kg uma vez semanalmente.
[0061] Como usado aqui, o termo em combinação no contexto da administração de outras terapias se refere ao uso de mais do que uma terapia. O uso do termo em combinação não restringe a ordem na qual as terapias são administradas. As terapias podem ser administradas, p.ex., em série, sequencialmente, simultaneamente ou concomitantemente.
[0062] Em certas modalidades dos métodos proporcionados aqui, um anticorpo anti-CD20, p.ex.., rituximab, é administrado antes de uma proteína terapêutica, por exemplo, um anticorpo anti-CD47. Em certas modalidades dos métodos proporcionados aqui, um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é
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24/104 administrado simultaneamente com uma proteína terapêutica, por exemplo, um anticorpo anti-CD47. Em certas modalidades dos métodos proporcionados aqui, um anticorpo anti-CD20, p.ex.., rituximab, é administrado após uma proteína terapêutica, por exemplo, um anticorpo anti-CD47. Em certas modalidades dos métodos proporcionados aqui, um anticorpo anti-CD20, p.ex.., rituximab, é administrado antes de simultaneamente com uma proteína terapêutica, por exemplo, um anticorpo anti-CD47.
[0063] Como usado aqui, os termos indivíduo e paciente são usados indistintamente. Como usado aqui, um indivíduo é um mamífero tal como um não primata (p.ex., vacas, porcos, cavalos, gatos, cães, cabras, coelhos, camundongos, etc.) ou um primata (p.ex., macaco e humano), por exemplo um humano. Em uma modalidade, o indivíduo é um mamífero, p.ex., um humano, diagnosticado com uma condição ou disfunção proporcionada aqui (p.ex., câncer, metástase ou angiogênese). Em outra modalidade, o indivíduo é um mamífero, p.ex., um humano, em risco de desenvolver uma condição ou disfunção proporcionada aqui (p.ex., câncer, metástase ou angiogênese). Em outra modalidade, o indivíduo é humano.
[0064] Como usado aqui, câncer hematológico se refere a um câncer do sangue e inclui leucemia, linfoma e mieloma entre outros. Leucemia se refere a um câncer do sangue no qual demasiados glóbulos brancos que são ineficazes no combate de infeção são fabricados, eliminando assim as outras partes que constituem o sangue, tais como plaquetas e glóbulos vermelhos. É entendido que os casos de leucemia são classificados como agudos ou crônicos. Certas formas de leucemia incluem, a título de exemplo não limitante, leucemia linfocítica aguda (ALL); leucemia mieloide aguda (AML); leucemia linfocítica crônica (CLL); leucemia mielógena crônica (CML); Disfunção/neoplasma mieloproliferativo (MPDS); e síndrome de mielodisplasia. Linfoma pode se
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25/104 referir a um linfoma de Hodgkin, linfoma não-Hodgkin tanto indolente como agressivo, linfoma de Burkitt e linfoma folicular (células pequenas e células grandes), entre outros. Mieloma pode se referir a mieloma múltiplo (MM), mieloma de células gigantes, mieloma de cadeia pesada e mieloma de cadeia leve ou Bence-Jones. Em certas modalidades, o câncer hematológico é mieloma múltiplo. Em certas modalidades, o câncer hematológico é linfoma não-Hodgkin.
[0065] Exemplos não limitantes de uma condição que pode ser tratada ou gerida com um anticorpo anti-CD47 descrito aqui, sozinho ou em combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, incluem câncer hematológico e/ou tumores sólidos, bem como doenças ou disfunções relacionadas com expressão, atividade e/ou sinalização aberrantes de CD47, a título de exemplo não limitante, câncer hematológico e/ou tumores sólidos. Os cânceres hematológicos incluem, p.ex., leucemia, linfoma e mieloma. Certas formas de leucemia incluem, a título de exemplo não limitante, leucemia linfocítica aguda (ALL); leucemia mieloide aguda (AML); leucemia linfocítica crônica (CLL); leucemia mielógena crônica (CML); Disfunção/neoplasma mieloproliferativo (MPDS); e síndrome de mielodisplasia. Certas formas de linfoma incluem, a título de exemplo não limitante, linfoma de Hodgkin, linfoma não-Hodgkin tanto indolente como agressivo, linfoma de Burkitt e linfoma folicular (células pequenas e células grandes). Certas formas de mieloma incluem, a título de exemplo não limitante, mieloma múltiplo (MM), mieloma de células gigantes, mieloma de cadeia pesada e mieloma de cadeia leve ou Bence-Jones. Os tumores sólidos incluem, p.ex., tumores da mama, tumores dos ovários, tumores do pulmão, tumores pancreáticos, tumores da próstata, tumores de melanoma, tumores colorretais, tumores do pulmão, tumores da cabeça e pescoço, tumores da bexiga, tumores esofágicos, tumores do fígado e tumores do rim.
[0066] Os sintomas associados a cânceres e outras disfunções neoplásicas
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26/104 incluem, por exemplo, inflamação, febre, mal-estar geral, febre, dor, frequentemente localizada na área inflamada, perda de apetite, perda de peso, edema, dor de cabeça, fadiga, erupção cutânea, anemia, fraqueza muscular, fadiga muscular e sintomas abdominais tais como, por exemplo, dor abdominal, diarréia ou prisão de ventre.
[0067] Em aspectos específicos são proporcionados aqui anticorpos antiCD47 úteis, sozinhos ou em combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, no tratamento, retardamento da progressão de, impedimento, prevenção da recaída de ou alívio de um sintoma de um câncer (p.ex., MM, NHL, AML, câncer da mama (p.ex., câncer da mama triplo negativo), câncer da bexiga, câncer/carcinoma do pulmão de células não pequenas, carcinoma hepatocelular (HCC), sarcoma e câncer da cabeça e pescoço). Por exemplo, os anticorpos para CD47 descritos aqui são úteis, sozinhos ou em combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, no tratamento de malignidades e/ou tumores hematológicos, p.ex., malignidades e/ou tumores hematológicos. Por exemplo, os anticorpos para CD47 descritos aqui são úteis no tratamento de tumores CD47+. A título de exemplo não limitante, os anticorpos para CD47 descritos aqui são úteis no tratamento de linfoma não-Hodgkin (NHL), leucemia linfocítica aguda (ALL), leucemia mieloide aguda (AML), leucemia linfocítica crônica (CLL), leucemia mielógena crônica (CML), mieloma múltiplo (MM), câncer da mama (p.ex., câncer da mama triplo negativo), câncer dos ovários, câncer da cabeça e pescoço, câncer da bexiga, melanoma, câncer colorretal, câncer do pâncreas, câncer do pulmão, leiomioma, leiomiossarcoma, glioma, glioblastoma e assim por diante. Os tumores sólidos incluem, p.ex., tumores da mama, tumores dos ovários, tumores do pulmão (p.ex., NSCLC), tumores pancreáticos, tumores da próstata, tumores de melanoma, tumores colorretais, tumores do pulmão, tumores da cabeça e pescoço, tumores da bexiga, tumores esofágicos, tumores
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27/104 do fígado (p.ex., carcinoma hepatocelular), sarcoma e tumores do rim.
[0068] Em uma modalidade específica é proporcionado aqui um método de tratamento de câncer (p.ex., uma disfunção/câncer hematológico ou câncer sólido) em um indivíduo compreendendo administração (p.ex., administração simultânea ou sequencial) a um indivíduo com sua necessidade de (i) um anticorpo anti-CD47 descrito aqui ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga especificamente à CD47 tal como CD47 humana, sozinho ou em combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, e (ii) outro agente anticanceroso. Em certas modalidades, o agente anticanceroso é um agente quimioterapêutico (p.ex., bloqueador da desmontagem de microtúbulos, antimetabolito, inibidor de topoisomerase e reticulante ou agente danificador de DNA). Em certas modalidades, o agente anticanceroso é um inibidor de tirosina cinase (p.ex., GLEEVEC (mesilato de imatinib) ou SUTENT (SU11248 ou Sunitinib)). Outros exemplos não limitantes de inibidores de tirosina cinase incluem 706 e AMNI07 (nilotinib), RAD00I, PKC412, gefitinib (IRESSA™), erlotinib (TARCEVA ), sorafenib (NEXAVAR ), pazopanib (VOTRIENT™), axitinib, bosutinib, cediranib (RECENTIN ), SPRYCEL (dasatinib), lapatinib (TYKERB ), lestaurtinib, neratinib, nilotinib (TASIGNA ), semaxanib, toceranib (PALLADIA™), vandetanib (ZACTIMA™) e vatalanib.
[0069] Em um aspecto específico é proporcionado aqui um método de tratamento de câncer (p.ex., uma disfunção/câncer hematológico ou câncer sólido) em um indivíduo compreendendo administração (p.ex., administração simultânea ou sequencial) a um indivíduo com sua necessidade de (i) um anticorpo anti-CD47 descrito aqui ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo que se liga especificamente à CD47 tal como CD47 humana, sozinho ou em combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, e (ii) terapia de radiação.
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[0070] Em um aspecto particular é proporcionado aqui um método de promoção (p.ex., indução ou aumento) da fagocitose, p.ex., morte fagocítica mediada por macrófagos de células tumorais, compreendendo contato de uma quantidade eficaz de um anticorpo anti-CD47 descrito aqui que se liga especificamente à CD47 humana com células tumorais, sozinho ou em combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab. É também proporcionado aqui um método de promoção (p.ex., indução ou aumento) da fagocitose, p.ex., morte fagocítica mediada por macrófagos de células tumorais, em um indivíduo com sua necessidade (p.ex., um indivíduo com células tumorais, tais como células tumorais expressando CD47), compreendendo administração ao indivíduo de uma quantidade eficaz de um anticorpo anti-CD47 descrito aqui que se liga especificamente à CD47 humana, sozinho ou em combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab.
[0071] Em um aspecto particular é proporcionado aqui um método de redução do volume tumoral, compreendendo contato de uma quantidade eficaz de um anticorpo anti-CD47 descrito aqui que se liga especificamente à CD47 humana com o tumor, sozinho ou em combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab. É também proporcionado aqui um método de redução do volume tumoral em um indivíduo com sua necessidade (p.ex., um indivíduo com um tumor, tal como um tumor expressando CD47), compreendendo administração ao indivíduo de uma quantidade eficaz de um anticorpo anti-CD47 descrito aqui que se liga especificamente à CD47 humana, sozinho ou em combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab.
[0072] Em um aspecto particular é proporcionado aqui um método de inibição do crescimento ou proliferação de células cancerosas, compreendendo contato de uma quantidade eficaz de um anticorpo anti-CD47 descrito aqui que se liga especificamente à CD47 humana com células tumorais, sozinho ou em
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29/104 combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab. É também proporcionado aqui um método de inibição do crescimento ou proliferação de células cancerosas em um indivíduo com sua necessidade (p.ex., um indivíduo com células cancerosas, tais como células tumorais expressando CD47), compreendendo administração ao indivíduo de uma quantidade eficaz de um anticorpo anti-CD47 descrito aqui que se liga especificamente à CD47 humana, sozinho ou em combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab.
Composições
Terapêuticos de Proteína
[0073] As proteínas terapêuticas usados nos métodos descritos aqui, por exemplo, em combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, podem ser quaisquer terapêuticos de proteína conhecidos de um perito na técnica. Em certas modalidades, a proteína terapêutica é uma citocina. Em certas modalidades, a citocina é proteína morfogenética do osso (BMP), eritropoietina (EPO), fator estimulador de colônias de granulócitos (G-CSF), fator estimulador de colônias de granulócitos e macrófagos (GM-CSF), interferon alfa (IFN-ct), interferon beta (IFN-β), interleucina 2 (IL-2), interleucina 11 (IL-11) ou interferon gama (IFN-γ). Em certas modalidades, a proteína terapêutica é uma interleucina. Em certas modalidades, a proteína terapêutica não é uma enzima.
[0074] Em certas modalidades, a proteína terapêutica é uma proteína de fusão, por exemplo, uma proteína de fusão contendo Fc, p.ex., uma proteína de fusão receptora solúvel.
Anticorpos
[0075] As proteínas terapêuticas usados nos métodos descritos aqui, por exemplo, em combinação com um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, podem ser anticorpos terapêuticos. Em algumas modalidades, o anticorpo anti-CD20 é rituximab. Rituximab (RITUXAN®, Biogen/Genentech) é anticorpo IgGi kappa
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30/104 monoclonal de murino/humano quimérico dirigido contra o antígeno CD20. 0 rituximab tern um peso molecular aproximado de 145 kD e uma afinidade de ligação pelo antígeno CD20 de aproximadamente 8,0 nM. 0 rituximab é produzido por cultura em suspensão de células de mamífero (Ovário de Hamster Chinês) em um meio nutriente contendo o antibiótico gentamicina. A gentamicina não é detectável no produto final. RITUXAN é um concentrado líquido estéril, transparente, incolor, isento de conservantes para administração intravenosa. RITUXAN é fornecido a uma concentração de 10 mg/mL em frascos de uso único de 100 mg/10 mL ou 500 mg/50 mL. O produto é formulado em polissorbato 80 (0,7 mg/mL), cloreto de sódio (9 mg/mL), citrato de sódio dihidratado (7,35 mg/mL) e Água para Injeção. O pH é 6,5. Em algumas modalidades, o anticorpo anti-CD20 é ocrelizumab. Em algumas modalidades, o anticorpo anti-CD20 é ofatumumab. Em algumas modalidades, o anticorpo antiCD20 é obinutuzumab. Em algumas modalidades, o anticorpo anti-CD20 é tositumomab. Em algumas modalidades, o anticorpo anti-CD20 é ibritumomab. Em algumas modalidades, o anticorpo anti-CD20 é ocaratuzumab. Em algumas modalidades, o anticorpo anti-CD20 é veltuzumab.
[0076] Como usado aqui e a não ser que de outro modo especificado, os termos cerca de ou aproximadamente significam dentro de mais ou menos 10% de um dado valor ou gama. Em casos onde um número inteiro é requerido, os termos significam dentro de mais ou menos 10% de um dado valor ou gama, arredondado para cima ou para baixo até ao número inteiro mais próximo.
[0077] Como usado aqui, os termos anticorpo e imunoglobulina e Ig são termos da técnica e podem ser usados indistintamente aqui e se referem a uma molécula com um local de ligação ao antígeno que se liga especificamente a um antígeno.
[0078] Os anticorpos proporcionados aqui podem incluir, por exemplo,
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31/104 anticorpos monoclonais, anticorpos recombinantemente produzidos, anticorpos monoespecíficos, anticorpos multiespecíficos (incluindo anticorpos biespecíficos), anticorpos humanos, anticorpos humanizados, anticorpos murinos (p.ex., anticorpos de camundongo ou rato), anticorpos quiméricos, anticorpos sintéticos e anticorpos tetraméricos compreendendo duas moléculas de cadeia pesada e duas de cadeia leve. Em modalidades específicas, os anticorpos podem incluir, mas não estão limitados a, um monômero de cadeia leve de anticorpo, um monômero de cadeia pesada de anticorpo, um dímero de cadeia leve de anticorpo, um dímero de cadeia pesada de anticorpo, um par cadeia leve de anticorpo-cadeia pesada de anticorpo, intracorpos, anticorpos heteroconjugados, anticorpos de domínio único e anticorpos monovalentes. Em uma modalidade específica, os anticorpos podem incluir fragmentos de ligação ao antígeno ou fragmentos de ligação ao epítopo tais como, mas não se limitando a, anticorpos de cadeia única ou Fvs de cadeia única (scFv) (p.ex., incluindo monoespecíficos, biespecíficos, etc.), anticorpos camelizados, affybodies, fragmentos Fab, fragmentos F(ab'), fragmentos F(ab')2 e Fvs ligados em dissulfeto (sdFv). Em certas modalidades, os anticorpos descritos aqui se referem a populações de anticorpos policlonais.
[0079] Os anticorpos podem ser de qualquer tipo (p.ex., IgG, IgE, IgM, IgD, IgA ou IgY), qualquer classe (p.ex., IgG 1, IgGz, IgGs, IgGzi, IgAi ou IgAz) ou qualquer subclasse (p.ex., IgGza ou IgGzb) de molécula de imunoglobulina. Em certas modalidades, os anticorpos descritos aqui são anticorpos IgG ou uma sua classe (p.ex., IgGí, IgGz, IgGs ou lgG4 humana) ou subclasse. Em certas modalidades, os anticorpos descritos aqui são anticorpos IgGi (p.ex., IgGi humana) ou uma sua subclasse. Em certas modalidades, os anticorpos IgGi descritos aqui compreendem uma ou mais substituições e/ou deleções de aminoácidos na região constante. Em certas modalidades, os anticorpos descritos aqui são
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32/104 anticorpos lgG4 (p.ex., lgG4 humana) ou uma sua subclasse. Em certas modalidades, os anticorpos lgG4 descritos aqui compreendem uma ou mais substituições e/ou deleções de aminoácidos na região constante.
[0080] Como usado aqui, um antígeno é uma fração ou molécula que contém um epítopo ao qual um anticorpo pode se ligar especificamente. Como tal, um antígeno é também especificamente ligado por um anticorpo.
[0081] Como usado aqui, um epítopo é um termo na técnica e se refere a uma região localizada de um antígeno ao qual um anticorpo pode se ligar especificamente. Um epítopo pode ser um epítopo linear ou um epítopo conformacional, não linear ou descontínuo. No caso de um antígeno de polipeptídeo, por exemplo, um epítopo pode ser aminoácidos contíguos do polipeptídeo (um epítopo linear) ou um epítopo pode compreender aminoácidos de duas ou mais regiões não contíguas do polipeptídeo (um epítopo conformacional, não linear ou descontínuo). Será apreciado por um perito na técnica que, em geral, um epítopo linear pode ou não estar dependente da estrutura secundária, terciária ou quaternária.
[0082] Como usado aqui, o termo anticorpo monoclonal é um termo bem conhecido da técnica que se refere a um anticorpo obtido a partir de uma população de anticorpos homogêneos ou substancialmente homogêneos. O termo monoclonal não está limitado a qualquer método particular para fabricação do anticorpo. Geralmente, uma população de anticorpos monoclonais pode ser gerada por células, uma população de células ou uma linha de células. Em modalidades específicas, um anticorpo monoclonal, como usado aqui, é um anticorpo produzido por uma célula ou linha de células única em que o anticorpo se liga imunoespecificamente a um epítopo de CD47 como determinado, p.ex., por ELISA ou outro ensaio de ligação ao antígeno ou ligação competitiva conhecido na técnica ou nos Exemplos proporcionados aqui. Em
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33/104 modalidades particulares, um anticorpo monoclonal pode ser um anticorpo quimérico ou um anticorpo humanizado. Em certas modalidades, um anticorpo monoclonal é um anticorpo monovalente ou anticorpo multivalente (p.ex., bivalente).
[0083] Como usado aqui, o termo aminoácido não natural se refere a um aminoácido que não é um aminoácido proteinogênico ou uma sua variante póstranslacionalmente modificada. Em particular, o termo se refere a um aminoácido que não é um dos 20 aminoácidos comuns ou pirrolisina ou selenocisteína ou suas variantes pós-translacionalmente modificadas.
[0084] Como usado aqui, o termo anticorpos policlonais se refere a uma população de anticorpos que inclui uma variedade de diferentes anticorpos que se ligam imunoespecificamente aos mesmos e/ou a diferentes epítopos dentro de um antígeno ou antígenos.
[0085] Como usado aqui, os termos região variável ou domínio variável se referem a uma porção de um anticorpo, geralmente, uma porção de uma cadeia leve ou pesada de anticorpo, tipicamente cerca dos 110 a 120 aminoácidos amino-terminais em uma cadeia pesada madura e cerca dos 90 a 100 aminoácidos amino-terminais em uma cadeia leve madura. As regiões variáveis compreendem regiões determinantes de complementaridade (CDRs) flanqueadas por regiões de arcabouço (FRs). Geralmente, a orientação espacial de CDRs e FRs é como se segue, em uma direção N-terminal para C-terminal: FR1-CDR1-FR2-CDR2-FR3-CDR3-FR4. Sem desejar estar limitado por qualquer mecanismo ou teoria particular se acredita que as CDRs das cadeias leves e pesadas são principalmente responsáveis pela interação do anticorpo com antígeno e pela especificidade do anticorpo por um epítopo. Em uma modalidade específica, a numeração de posições de aminoácidos de anticorpos descritos aqui é de acordo com o índice EU, como em Kabat et al. (1991)
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Sequences of Proteins of Immunological Interest, Quinta Edição, U.S. Department of Health and Human Services, Publicação NIH No. 91-3242. Em certas modalidades, a região variável é uma região variável humana. Em certas modalidades, a região variável compreende CDRs de murino (p.ex., camundongo ou rato) e regiões de arcabouço (FRs) humanas. Em modalidades particulares, a região variável é uma região variável de primata (p.ex., humano ou primata não humano). Em certas modalidades, a região variável compreende CDRs de murino (p.ex., camundongo ou rato) e regiões de arcabouço (FRs) de primata (p.ex., humano ou primata não humano). Como um exemplo não limitante, uma região variável descrita aqui é obtida a partir da montagem de dois ou mais fragmentos de sequências humanas em uma sequência humana compósita.
[0086] Em certos aspectos, as CDRs de um anticorpo podem ser determinadas de acordo com (i) o sistema de numeração de Kabat (Kabat et al. (1971) Ann. NY Acad. Sci. 190: 382-391 e Kabat et al. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Quinta Edição, U.S. Department of Health and Human Services, Publicação NIH No. 91-3242); ou (ii) o esquema de numeração de Chothia, que será referido como as CDRs de Chothia (ver, p.ex., Chothia e Lesk, 1987, J. Mol. Biol., 196: 901-917; Al-Lazikani et al., 1997, J. Mol. Biol., 273: 927-948; Chothia etal., 1992, J. Mol. Biol., 227: 799-817; Tramontano A etal., 1990, J. Mol. Biol. 215 (1): 175-82; e Patente dos E.U.A: No. 7,709,226); ou (iii) o sistema de numeração ImMunoGeneTics (IMGT), por exemplo, como descrito em Lefranc, M.-P., 1999, The Immunologist, 7: 132-136 e Lefranc, M.-P. etal., 1999, Nucleic Acids Res., 27: 209-212 (CDRs de IMGT); ou (iv) MacCallum et al., 1996, J. Mol. Biol., 262: 732-745. Ver também, p.ex., Martin, A., Protein Sequence and Structure Analysis of Antibody Variable Domains, em Antibody Engineering, Kontermann e Dübel, eds., Capítulo 31, pp. 422-439, SpringerVerlag, Berlim (2001).
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[0087] No que diz respeito ao sistema de numeração de Kabat, as CDRs dentro de uma molécula de cadeia pesada de anticorpo estão tipicamente presentes nas posições de aminoácidos 31 a 35, que podem opcionalmente incluir um ou dois aminoácidos adicionais, após 35 (referido no esquema de numeração de Kabat como 35A e 35B) (CDR1), posições de aminoácidos 50 a 65 (CDR2) e posições de aminoácidos 95 a 102 (CDR3). Usando o sistema de numeração de Kabat, as CDRs dentro de uma molécula de cadeia leve de anticorpo estão tipicamente presentes nas posições de aminoácidos 24 a 34 (CDR1), posições de aminoácidos 50 a 56 (CDR2) e posições de aminoácidos 89 a 97 (CDR3). Como é bem conhecido dos peritos na técnica, usando o sistema de numeração de Kabat, a sequência linear de aminoácidos real do domínio variável de anticorpo pode conter menos ou mais aminoácidos devido a um encurtamento ou alongamento de uma FR e/ou CDR e, como tal, o número de Kabat de um aminoácido não é necessariamente o mesmo que seu número linear de aminoácidos.
[0088] Os anticorpos proporcionados aqui podem ser de qualquer tipo (p.ex., IgG, IgE, IgM, IgD, IgAou IgY), qualquer classe (p.ex., IgGi, IgGz, IgGs, IgGzi, IgAi ou IgAz) ou qualquer subclasse (p.ex., IgGza ou IgGzb ou uma sua mistura) de molécula de imunoglobulina. Em certas modalidades, os anticorpos descritos aqui são anticorpos IgG (p.ex., IgG humana) ou uma sua classe (p.ex., IgGi, IgGz, IgGs ou lgG4 humana) ou subclasse.
[0089] Em aspectos específicos é proporcionado aqui um anticorpo compreendendo uma cadeia leve e cadeia pesada de anticorpo, p.ex., uma cadeia leve e cadeia pesada separadas. No que diz respeito à cadeia leve, em uma modalidade específica, a cadeia leve de um anticorpo descrito aqui é uma cadeia leve kappa (κ). Em outra modalidade específica, a cadeia leve de um anticorpo descrito aqui é uma cadeia leve lambda (λ). Em outra modalidade, a
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36/104 cadeia leve é uma sequência mista, p.ex., a porção variável da cadeia leve compreende sequências de cadeia leves kappa e a região constante da cadeia leve compreende sequências de cadeia leve lambda ou vice-versa. Em certas modalidades, a cadeia leve de um anticorpo descrito aqui é uma cadeia leve kappa humana ou uma cadeia leve lambda humana. Exemplos não limitantes de sequências de região constante humana foram descritos na técnica, p.ex., ver Patente dos E.U.A. No. 5,693,780 e Kabat et al. (1991) Sequences of Proteins of Immunological Interest, Quinta Edição, U.S. Department of Health and Human Services, Publicação NIH No. 91-3242.
[0090] Em certas modalidades, um anticorpo anti-CD47 descrito aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende sequências de aminoácidos com certa percentagem de identidade em relação a um anticorpo original.
[0091] A determinação da percentagem de identidade entre duas sequências (p.ex., sequências de aminoácidos ou sequências de ácidos nucleicos) pode ser alcançada usando um algoritmo matemático. Um exemplo não limitante de um algoritmo matemático utilizado para a comparação de duas sequências é o algoritmo de Karlin e Altschul, 1990, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 2264 2268, modificado como em Karlin e Altschul, 1993, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 90: 5873 5877. Um tal algoritmo é incorporado nos programas NBLAST e XBLAST de Altschul et al., 1990, J. Mol. Biol. 215: 403. As pesquisas de nucleotídeos BLAST podem ser realizadas com os parâmetros do programa de nucleotídeos NBLAST definidos, p.ex., para pontuação=100, comprimento de palavra=12 para se obterem sequências de nucleotídeos homólogas de uma molécula de ácido nucleico descrita aqui. As pesquisas de proteínas BLAST podem ser realizadas com os parâmetros do programa de XBLAST definidos, p.ex., para pontuação 50, comprimento de palavra=3 para se obterem
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37/104 sequências de aminoácidos homólogas de uma molécula de proteína descrita aqui. Para se obterem alinhamentos com lacunas para propósitos de comparação, Gapped BLAST pode ser utilizado como descrito em Altschul et al., 1997, Nucleic Acids Res. 25: 3389 3402. Alternativamente, PSI BLAST pode ser usado para realizar uma pesquisa iterativa que detecta relações distantes entre moléculas (Id.). Quando se utilizam programas BLAST, Gapped BLAST e PSI Blast, os parâmetros padrão dos respectivos programas (p.ex., de XBLAST e NBLAST) podem ser usados (ver, p.ex., National Center for Biotechnology Information (NCBI) na worldwide web, ncbi.nlm.nih.gov). Outro exemplo não limitante, preferencial, de um algoritmo matemático utilizado para a comparação de sequências é o algoritmo de Myers e Miller, 1988, CABIOS 4: 11 17. Um tal algoritmo é incorporado no programa ALIGN (versão 2.0) que é parte do pacote de software de alinhamento de sequências GCG. Quando se utiliza o programa ALIGN para comparação de sequências de aminoácidos, uma tabela de resíduos ponderados PAM120, uma penalidade de comprimento de lacunas de 12 e uma penalidade de lacunas de 4 podem ser usadas.
[0092] A percentagem de identidade entre duas sequências pode ser determinada usando técnicas similares àquelas descritas acima, com ou sem permissão de lacunas. No cálculo da percentagem de identidade, tipicamente somente as correspondências exatas são contadas.
[0093] Os anticorpos anti-CD47 descritos aqui incluem também anticorpos monoclonais que se ligam especificamente à CD47, em que o anticorpo não promove (p.ex., induz ou aumenta), ou causa um nível significativo de, aglutinação, p.ex., hemaglutinação de glóbulos vermelhos (hemaglutinação de RBC).
[0094] As composições farmacêuticas de acordo com a invenção podem incluir um anticorpo da invenção e um veículo farmaceuticamente aceitável.
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[0095] Em algumas modalidades, o anticorpo ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo é um isotipo IgG. Em algumas modalidades, a região constante do anticorpo é de isotipo IgGl humano, tendo uma sequência de aminoácidos:
(SEQ ID NO: 1) ASTKGPSVFP LAPSSKSTSG GTAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSSLGTQT YICNVNHKPS NTKVDKKVEPEYKCKVSNKA LPAPIEKTIS KAKGQPREPQ VYTLPPSRDE LTKNQVSLTC LVKGFYPSDI AVEWESNGQP ENNYKTTPPV LDSDGSFFLY SKLTVDKSRW QQGNVFSCSV MHEALHNHYT QKSLSLSPGK
[0096] Em algumas modalidades, a região constante de IgGl humana é modificada no aminoácido Asn297 (Boxed, Numeração de Kabat) para prevenir a glicosilação do anticorpo, por exemplo Asn297Ala (N297A). Em algumas modalidades, a região constante do anticorpo é modificada no aminoácido Leu235 (Numeração de Kabat) para alterar as interações do receptor Fc, por exemplo Leu235Glu (L235E) ou Leu235Ala (L235A). Em algumas modalidades, a região constante do anticorpo é modificada no aminoácido Leu234 (Numeração de Kabat) para alterar as interações do receptor Fc, p.ex., Leu234Ala (L234A). Em algumas modalidades, a região constante do anticorpo é alterada em ambos os aminoácidos 234 e 235, por exemplo Leu234Ala e Leu235Ala (L234A/L235A) (índice EU de Kabat etal. 1991 Sequences of Proteins of Immunological Interest).
[0097] Em algumas modalidades, a região constante do anticorpo é de isotipo lgG2 humano, tendo uma sequência de aminoácidos:
SEQ ID NO: 2) ASTKGPSVFP LAPCSRSTSE STAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSNFGTQT YTCNVDHKPS
NTKVDKTVER KCCVECPPCP APPVAGPSVF LFPPKPKDTL MISRTPEVTC
VVVDVSHEDPKVSNKGLPAP IEKTISKTKG QPREPQVYTL PPSREEMTKN QVSLTCLVKG FYPSDISVEW ESNGQPENNY KTTPPMLDSD GSFFLYSKLT
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VDKSRWQQGN VFSCSVMHEA LHNHYTQKSL SLSPGK
[0098] Em algumas modalidades, a região constante de lgG2 humana é modificada no aminoácido Asn297 (Boxed, Numeração de Kabat) para prevenir a glicosilação do anticorpo, p.ex., Asn297Ala (N297A).
[0099] Em algumas modalidades, a região constante do anticorpo é de isotipo lgG3 humano, tendo uma sequência de aminoácidos:
(SEQ ID NO: 3) ASTKGPSVFP LAPCSRSTSG GTAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSSLGTQT YTCNVNHKPS NTKVDKRVEL KTPLGDTTHT CPRCPEPKSC DTPPPCPRCP EPKSCDTPPP CPRCPEPKSC DTPPPCPRCP APELLGGPSV FLFPPKPKDT LMISRTPEVT CVVVDVSHED CKVSNKALPA PIEKTISKTK GQPREPQVYT LPPSREEMTK NQVSLTCLVK GFYPSDIAVE WESSGQPENN YNTTPPMLDS DGSFFLYSKLTVDKSRWQQG
[00100] Em algumas modalidades, a região constante de lgG3 humana é modificada no aminoácido Asn297 (Boxed, Numeração de Kabat) para prevenir a glicosilação do anticorpo, p.ex., Asn297Ala (N297A). Em algumas modalidades, a região constante de lgG3 humana é modificada no aminoácido 435 para prolongar a meia-vida, p.ex., Arg435H é (R435H) (índice EU de Kabat et al. 1991 Sequences of Proteins of Immunological Interest).
[00101] Em algumas modalidades, a região constante do anticorpo é de isotipo lgG4 humano, tendo uma sequência de aminoácidos:
(SEQ ID NO: 4) ASTKGPSVFP LAPCSRSTSE STAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSSLGTKT YTCNVDHKPS NTKVDKRVES CKVSNKGLPS SIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSQEEMTK NQVSLTCLVK GFYPSDIAVE WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSRL TVDKSRWQEG NVFSCSVMHE ALHNHYTQKS LSLSLGK
[00102] Em algumas modalidades, a região constante de lgG4 humana é modificada dentro da região de charneira para prevenir ou reduzir a troca de
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40/104 fitas, p.ex., Ser228Pro (S228P). Em outras modalidades, a região constante de lgG4 humana é modificada no aminoácido 235 para alterar as interações do receptor Fc, p.ex., Leu235Glu (L235E). Em algumas modalidades, a região constante de lgG4 humana é modificada dentro da charneira e no aminoácido 235, p.ex., Ser228Pro e Leu235Glu (S228P/L235E). Em algumas modalidades, a região constante de lgG4 humana é modificada no aminoácido Asn297 (Numeração de Kabat) para prevenir a glicosilação do anticorpo, p.ex., Asn297Ala (N297A). Em algumas modalidades da invenção, a região constante de lgG4 humana é modificada nas posições de aminoácidos Ser228, Leu235 e Asn297 (p.ex., S228P/L235E/N297A). (índice EU de Kabat et al. 1991 Sequences of Proteins of Immunological Interest). Em outras modalidades da invenção, ο anticorpo é da subclasse de lgG4 humana e não tem glicosilação. Em estas modalidades, a glicosilação pode ser eliminada por mutação na posição 297 (numeração de Kabat), por exemplo N297A. Em outras modalidades, a glicosilação pode ser eliminada por produção do anticorpo em uma célula hospedeira que não tem a capacidade de glicosilação pós-translacional, por exemplo um sistema derivado de bactérias ou leveduras ou um sistema de expressão em células de mamífero modificado.
[00103] Em algumas modalidades, a região constante de IgG humana é modificada para intensificar a ligação a FcRn. Exemplos de mutações de Fc que intensificam a ligação a FcRn são Met252Tyr, Ser254Thr, Thr256Glu (M252Y, S254T, T256E, respectivamente) (numeração de Kabat, Dall'Acqua etal. 2006, J. Biol Chem Vol 281 (33) 23514-23524) ou Met428Leu e Asn434Ser (M428L, N434S) (Zalevsky et al. 2010 Nature Biotech, Vol 28 (2) 157-159). (índice EU de Kabat et al. 1991 Sequences of Proteins of Immunological Interest).
[00104] Em algumas modalidades, a região constante de IgGl humana é modificada para alterar a citotoxicidade celular dependente de anticorpos (ADCC)
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41/104 e/ou toxicidade dependente do complemento (CDC), p.ex., as modificações de aminoácidos descritas em Natsume et al., 2008 Cancer Res, 68 (10): 3863-72; Idusogie et al., 2001J Immunol, 166 (4): 2571-5; Moore et al., 2010 mAbs, 2 (2): 181-189; Lazar et al., 2006 PNAS, 103 (11): 4005-4010, Shields et al., 2001 JBC, 276 (9): 6591-6604; Stavenhagen et al., 2007 Cancer Res, 67 (18): 8882-8890; Stavenhagen et al., 2008 Advan. Enzyme Regul., 48: 152-164; Alegre et al., 1992 J Immunol, 148: 3461-3468; Revisto em Kaneko e Niwa, 2011 Biodrugs, 25 (1): 111.
[00105] Em algumas modalidades, a região constante de IgG humana é modificada para induzir a heterodimerização. Por exemplo, tendo uma modificação de aminoácido dentro do domínio CH3 em Thr366, que, quando substituído por um aminoácido mais volumoso, p.ex., Try (T366W), é capaz de emparelhar preferencialmente com um segundo domínio CH3 tendo modificações de aminoácidos para amino menos volumosos ácidos nas posições Thr366, Leu368 e Tyr407, p.ex., Ser, Ala e Vai, respectivamente (T366S/L368A/Y407V). A heterodimerização através de modificações de CH3 pode ser adicionalmente estabilizada pela introdução de uma ligação de dissulfeto, por exemplo por mudança de Ser354 para Cys (S354C) e Y349 para Cys (Y349C) em domínios CH3 opostos (Revisto em Carter, 2001 Journal of Immunological Methods, 248: 7-15).
[00106] Em outras formas de realização da invenção, o anticorpo não tem glicosilação, mas não é modificado no aminoácido Asn297 (numeração de Kabat). Em estas modalidades, a glicosilação pode ser eliminada por produção do anticorpo em uma célula hospedeira que não tem uma capacidade de glicosilação pós-translacional, por exemplo um sistema derivado de bactérias ou leveduras ou um sistema de expressão em células de mamífero modificado.
Anticorpos Anti-CD47 para Uso nos Métodos Proporcionados Aqui
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[00107] Em um aspecto específico, para uso nos métodos proporcionados aqui são anticorpos que se ligam especificamente à CD47 (p.ex., CD47 humana). Tais anticorpos anti-CD47 incluem todos os anticorpos divulgados no Pedido de Patente dos Estados Unidos No. de Publicação 2014/0140989, que é incorporada por referência aqui na sua totalidade. Tais anticorpos anti-CD47 incluem também todos os anticorpos divulgados no Pedido de Patente Internacional No. de Publicação WO 2016/109415, que é incorporada por referência aqui na sua totalidade.
[00108] Como usado aqui, os termos CD47 ou proteína associada à integrina ou ΊΑΡ ou antígeno do câncer dos ovários ou OA3 ou antígeno relacionado com Rh ou MER6 podem ser usados indistintamente e se referem a um receptor transmembranar de abrangência múltipla pertencendo à superfamília das imunoglobulinas. A sequência de aminoácidos de uma CD47 humana exemplificativa é proporcionada embaixo (No. de Acesso do GenBank Q08722.1 (GL1171879), incorporado aqui por referência). A sequência de sinal (aminoácidos 1-18) está sublinhada.
MWPLVAALLL GSACCGSAQL LFNKTKSVEF TFCNDTVVIP CFVTNMEAQN TTEVYVKWKF
KGRDIYTFDG ALNKSTVPTD FSSAKIEVSQ LLKGDASLKM DKSDAVSHTG NYTCEVTELT
121 REGETIIELK YRVVSWFSPN ENIUVIFPI FAILLFWGQF GIKTLKYRSG GMDEKTIALL
181 VAGLVITVIV IVGAILFVPG EYSLKNATGL GLIVTSTGIL ILLHYYVFST AIGLTSFVIA
241 ILVIQVIAYI LAVVGLSLCI AACIPMHGPL LISGLSILAL AQLLGLVYMK FVASNQKTIQ
301 PPRKAVEEPL NAFKESKGMM NDE (SEQ ID NO: 48)
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Para clareza, a sequência de aminoácidos de uma CD47 humana exemplificativa excluindo a sequência de sinal é proporcionada embaixo.
QLLFNKTKSV EFTFCNDTVV IPCFVTNMEA QNTTEVYVKW KFKGRDIYTF DGALNKSTVP
TDFSSAKIEV SQLLKGDASL KMDKSDAVSH TGNYTCEVTE LTREGETIIE LKYRVVSWFS
121 PNENILIVIF PIFAILLFWG QFGIKTLKYR SGGMDEKTIA LLVAGLVITV IVIVGAILFV
181 PGEYSLKNAT GLGLIVTSTG ILILLHYYVF STAIGLTSFV IAILVIQVIA YILAVVGLSL
241 CIAACIPMHG PLLISGLSIL ALAQLLGLVY MKFVASNQKT IQPPRKAVEE PLNAFKESKG
301 MMNDE (SEQ ID NO: 49)
[00109] A invenção também proporciona composições farmacêuticas que incluem um ou mais anticorpos monoclonais que se ligam à CD47 ou um fragmento imunologicamente ativo do mesmo, em que o anticorpo não causa um nível significativo de hemaglutinação de glóbulos vermelhos após administração.
[00110] A hemaglutinação é um exemplo de uma interação homotípica, em que duas células expressando CD47 são agregadas ou aglomeradas quando tratadas com uma entidade de ligação à CD47 bivalente. A capacidade dos anticorpos da presente invenção de se ligarem à CD47 na superfície celular e não causar um fenômeno de aglomeração celular não está limitada aos glóbulos vermelhos. Foi observado que os anticorpos da presente invenção se ligam exclusivamente à CD47 de uma maneira que não promove aglomeração de linhas de células positivas quanto à CD47, p.ex., células Daudi.
[00111] Em alguns casos, o anticorpo para uso nos métodos
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44/104 proporcionados aqui compreende uma região de cadeia pesada variável (VH) selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 5-30. O anticorpo compreende opcionalmente uma região de cadeia leve variável (VL) selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 31-47. Em alguns casos, o anticorpo compreende uma região de cadeia VH selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 5-30 e uma região de cadeia VL selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 3147. Os anticorpos da invenção incluem também anticorpos tendo uma cadeia pesada variável que é pelo menos 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais idêntica com a sequência apresentada em pelo menos uma de SEQ ID NOs: 5-30 e uma cadeia leve variável que é pelo menos 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% ou mais idêntica com a sequência apresentada em pelo menos uma de SEQ ID NOs: 31-47. Em outros aspectos, o anticorpo compreende uma região VH proporcionada em qualquer uma de SEQ ID NOs: 5, 7, 8, 11, 15-17, 20-22 e 27-30 emparelhada com uma região VL proporcionada em qualquer uma de SEQ ID NOs: 31-39,42, 43,44 e 47. Em outra modalidade, o anticorpo compreende uma região VH proporcionada em qualquer uma de SEQ ID NOs: 5, 7, 8, 11, 12, 15-17, 20-22 e 27-30 emparelhada com uma região VL proporcionada em qualquer uma de SEQ ID NOs: 31, 32, 35, 40, 41, 42, 43, 44 e 47. Em ainda outro aspecto, o anticorpo compreende uma combinação de uma região de cadeia VH e uma região de cadeia VL selecionadas das combinações listadas na Tabela 1.
Tabela 1. Combinações VH/VL de anticorpos anti-CD47 exemplificativas
Anticorpo Cadeia pesada variável (VH) Cadeia leve variável (VL)
2A1 SEQ ID NO: 5 SEQ ID NO: 31
2A1-XÍ SEQ ID NO: 5 SEQ ID NO: 32
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AB2,03 SEQ ID NO: 7 SEQ ID NO: 33
AB2,04 SEQ ID NO: 7 SEQ ID NO: 34
AB2,05 SEQ ID NO: 7 SEQ ID NO: 35
AB2,06 SEQ ID NO: 7 SEQ ID NO: 36
AB2,07 SEQ ID NO: 7 SEQ ID NO: 37
AB2,08 SEQ ID NO: 7 SEQ ID NO: 38
AB2,09 SEQ ID NO: 7 SEQ ID NO: 39
AB2,13 SEQ ID NO: 7 SEQ ID NO: 43
AB3,09 SEQ ID NO: 8 SEQ ID NO: 39
AB6,12 SEQ ID NO: 11 SEQ ID NO: 42
AB6,13 SEQ ID NO: 11 SEQ ID NO: 43
AB6,14 SEQ ID NO: 11 SEQ ID NO: 44
AB6,17 SEQ ID NO: 11 SEQ ID NO: 47
AB10,13 SEQ ID NO: 15 SEQ ID NO: 43
AB10,14 SEQ ID NO: 15 SEQ ID NO: 44
AB11,O5 SEQ ID NO: 16 SEQ ID NO: 35
AB12,05 SEQ ID NO: 17 SEQ ID NO: 35
AB15,05 SEQ ID NO: 20 SEQ ID NO: 35
AB16,05 SEQ ID NO: 21 SEQ ID NO: 35
AB17,05 SEQ ID NO: 22 SEQ ID NO: 35
AB22,05 SEQ ID NO: 27 SEQ ID NO: 35
AB23,05 SEQ ID NO: 28 SEQ ID NO: 35
AB24,05 SEQ ID NO: 29 SEQ ID NO: 35
AB25,05 SEQ ID NO: 30 SEQ ID NO: 35
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[00112] Em algumas modalidades, o anticorpo para CD47 ou fragmento de ligação ao antígeno do mesmo para uso nos métodos proporcionados aqui compreende uma sequência da região determinante de complementaridade 1 (CDR1) de VH apresentada em SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65 ou SEQ ID NO: 66, uma sequência de CDR2 de VH apresentada em SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 72, SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 75 ou SEQ ID NO: 76, uma sequência de CDR3 de VH apresentada em SEQ ID NO: 52 ou SEQ ID NO: 77, uma sequência de CDR1 de VL apresentada em SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 67 ou SEQ ID NO: 68, uma sequência de CDR2 de VL apresentada em SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 70 ou SEQ ID NO: 71 e uma sequência de CDR3 de VL apresentada em SEQ ID NO: 55. Por exemplo, o anticorpo ou fragmento imunologicamente ativo do mesmo compreende uma sequência de CDR1 de VH apresentada em SEQ ID NO: 50, uma sequência de CDR2 de VH apresentada em SEQ ID NO: 51, uma sequência de CDR3 de VH apresentada em SEQ ID NO: 52, uma sequência de CDR1 de VL apresentada em SEQ ID NO: 53, uma sequência de CDR2 de VL apresentada em SEQ ID NO: 54 e uma sequência de CDR3 de VL apresentada em SEQ ID NO: 55. Em outro exemplo, o anticorpo ou fragmento imunologicamente ativo do mesmo compreende uma sequência de CDR1 de VH apresentada em SEQ ID NO: 50, uma sequência de CDR2 de VH apresentada em SEQ ID NO: 72, uma sequência de CDR3 de VH apresentada em SEQ ID NO: 52, uma CDR1 de VL apresentada em SEQ ID NO: 53, uma sequência de CDR2 de VL apresentada em SEQ ID NO: 71 e uma sequência de CDR3 de VL apresentada em SEQ ID NO: 55.
[00113] Em um aspecto específico é proporcionado aqui um anticorpo, p.ex., um anticorpo monoclonal, que se liga especificamente à CD47 humana, em que um tal anticorpo anti-CD47 é uma variante de um anticorpo anti-CD47
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47/104 original, em que o anticorpo anti-CD47, quando produzido usando um sistema de expressão isento de células (CF), tem um título ou rendimento de expressão de anticorpos mais elevado em comparação com aquele do anticorpo anti-CD47 original quando expresso no sistema CF e em que o anticorpo anti-CD47 compreende uma ou mais modificações de aminoácidos, por exemplo, 1-15 modificações de aminoácidos, em relação ao anticorpo anti-CD47 original. Em um aspecto particular, a uma ou mais modificações de aminoácidos, por exemplo, 1-15 modificações de aminoácidos, são dentro da cadeia pesada ou VH (p.ex., SEQ ID NO: 6). Em um aspecto particular, a uma ou mais modificações de aminoácidos, por exemplo, 1-15 modificações de aminoácidos, são dentro da região de arcabouço de uma VH (p.ex., SEQ ID NO: 6). Em um certo aspecto, o anticorpo anti-CD47 proporcionado aqui é uma variante de um anticorpo antiCD47 original compreendendo as CDRs (p.ex., CDRs de Kabat) do anticorpo antiCD47 original.
[00114] Em um aspecto específico é proporcionado aqui um anticorpo, p.ex., um anticorpo monoclonal, que se liga especificamente à CD47 humana, em que um tal anticorpo anti-CD47 é uma variante de um anticorpo anti-CD47 original, em que o anticorpo anti-CD47, quando produzido usando um sistema de expressão isento de células (CF), tem um título ou rendimento de expressão de anticorpos mais elevado em comparação com aquele do anticorpo anti-CD47 original quando expresso no sistema CF e em que o anticorpo anti-CD47 compreende uma ou mais modificações de aminoácidos, por exemplo, 1-15 modificações de aminoácidos, em relação ao anticorpo anti-CD47 original. Em um aspecto particular, a uma ou mais modificações de aminoácidos, por exemplo, 5 ou 14 modificações de aminoácidos, são dentro da cadeia pesada ou VH (p.ex., SEQ ID NO: 6). Em um aspecto particular, a uma ou mais modificações de aminoácidos, por exemplo, 5,10, 13 ou 14 modificações de aminoácidos, são
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48/104 dentro da região de arcabouço de uma VH (p.ex., SEQ ID NO: 6). Em um aspecto particular, a uma ou mais modificações de aminoácidos, por exemplo, 5, 13 ou 14 modificações de aminoácidos, são dentro da região de arcabouço de uma VH (p.ex., SEQ ID NO: 6). Em um certo aspecto, o anticorpo anti-CD47 proporcionado aqui que é uma variante de um anticorpo anti-CD47 original compreendendo as CDRs (p.ex., CDRs de Kabat) do anticorpo anti-CD47 original. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo IgG 1, lgG2, lgG3 ou lgG4. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo IgGl. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo IgGl de alótipo Z. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo lgG4, tal como lgG4P ou lgG4PE.
[00115] Em um aspecto específico é proporcionado aqui um anticorpo, p.ex., um anticorpo monoclonal, que se liga especificamente à CD47 humana, em que um tal anticorpo anti-CD47 é uma variante de um anticorpo anti-CD47 original, em que o anticorpo anti-CD47, quando produzido usando um sistema de expressão isento de células (CF), tem um título ou rendimento de expressão de anticorpos mais elevado em comparação com aquele do anticorpo anti-CD47 original quando expresso no sistema CF. Em modalidades específicas, o anticorpo anti-CD47 original é o anticorpo AB6.12 (ver, p.ex., Pedido dos E.U.A. No. de Publicação US 2014/0140989 Al, que é incorporado aqui por referência na sua totalidade). As sequências de aminoácidos da região variável de cadeia pesada (VL) e região variável de cadeia leve (VL) do anticorpo AB6.12 são proporcionadas embaixo, em que as CDRs de Kabat estão sublinhadas. Em um certo aspecto, o anticorpo anti-CD47 proporcionado aqui é uma variante do anticorpo original AB6.12 e compreende as CDRs (p.ex., CDRs de Kabat) do anticorpo original AB6.12, por exemplo SEQ ID NOs: 50, 72, 52, 53, 71 e 55. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo IgGl, lgG2,
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49/104 lgG3 ou lgG4. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo IgGl. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo IgGl de alótipo Z. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo lgG4, tal como lgG4P ou lgG4PE.
[00116] Região variável de cadeia pesada (VH) do anticorpo anti-CD47 AB6.12 (as CDRs de Kabat 1-3 estão sublinhadas, SEQ ID NOs: 50, 72 e 52):
QMQLVQSGAEVKKTGSSVKVSCKASGFNIKDYYLHWVRQAPGQALEWMGWIDP DQGDTEYAQKFQDRVTITRDRSMSTAYMELSSLRSEDTAMYYCNAAYGSSSYPMDYWG QGTTVTV (SEQ ID NO: 6)
[00117] Região variável de cadeia leve (VL) do anticorpo anti-CD47 AB6.12 (as CDRs de Kabat 1-3 estão sublinhadas, SEQ ID NOs: 53, 71 e 55):
[00118] NIQMTQSPSAMSASVGDRVTITCKASQDIHRYLSWFQQKPGKVPKHLIY RANRLVSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCLQYDEFPYTFGGGTKVEIK (SEQ ID NO: 42)
[00119] Em uma modalidade específica, um anti-CD47 descrito aqui compreende uma ou mais modificações de aminoácidos (p.ex., 1-15 modificações de aminoácidos), por exemplo na região de arcabouço de VH, de um anticorpo original, p.ex., um anticorpo original selecionado de anticorpos anti-CD47 descritos aqui.
[00120] Em um aspecto específico é proporcionado aqui um anticorpo, p.ex., um anticorpo monoclonal, que se liga especificamente à CD47 humana, em que um tal anticorpo anti-CD47 é uma variante de um anticorpo anti-CD47 original, em que o anticorpo anti-CD47, quando produzido usando um sistema de expressão isento de células (CF), tem um título ou rendimento de expressão de anticorpos mais elevado em comparação com aquele do anticorpo anti-CD47 original quando expresso no sistema CF e em que o anticorpo anti-CD47 compreende uma VH compreendendo a seguinte sequência N-terminal para C
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50/104 terminal:
X1QX2QLVQSGAEVKKX3GX4SVKVSCKASG FNIKDYYLH WVRQAPGQX5LE WMG Wl DP DQG DTEYAQKX6QX7RVTX8TX9DX10SX11STAYM ELX12SLRSX13DTAX14YYCNAAYGSSS YPMDYWGQGTTVTV (SEQ ID NO: 89), em que os resíduos de aminoácidos sublinhados para Xi- X14 estão ordenados do terminal N para 0 terminal C, em que Xi é M ou não existe aminoácido na posição Xi, X2 é um aminoácido com cadeias laterais hidrofóbicas tal como M ou V, X3 é T ou P, X4 é S ou A, X5 é um aminoácido tendo cadeias laterais alifáticas tal como A ou G, Xg é F ou L, X7 é D ou G, Xs é um aminoácido com cadeias laterais hidrofóbicas tal como I ou Μ, X9 é R ou T, X10 é R ou T, Xn é M ou T, X12 é S ou R, X13 é um aminoácido negativamente carregado tal como E ou D e X14 é um aminoácido com cadeias laterais hidrofóbicas tal como M ou V.
[00121] Em aspectos particulares, um anticorpo anti-CD47 descrito aqui compreende uma VH compreendendo a sequência de SEQ ID NO: 89, em que o aminoácido na posição Xi é qualquer aminoácido tal como Μ, X2 não é Μ, X3 não é T, X4 não é S, X5 não é A, Xg não é F, X7 não é D, Xs não é I, X9 não é R, X10 não é R, Xn não é Μ, X12 não é S, X13 não é E e/ou X14 não é M. Em aspectos particulares, qualquer 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, ou 14 de Xi a X14 não são estes aminoácidos. Em aspectos particulares, a sequência de aminoácidos de VH não é a sequência de aminoácidos de VH do anticorpo AB6.12, por exemplo, a sequência de aminoácidos de VH não é SEQ ID NO: 6.
[00122] Em aspectos particulares, um anticorpo anti-CD47 descrito aqui compreende uma VH compreendendo a sequência de SEQ ID NO: 89, em que o aminoácido na posição X7 não é G, X9 não é A e/ou Xn não é S. Em aspectos particulares, qualquer 1, 2 ou 3 de X7, X9 e X11 não são estes aminoácidos. Em aspectos particulares, quando o aminoácido na posição X7 é G, então Xs é M e/ou X10 é T, X9 não é A e/ou Xn não é S.
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[00123] Em aspectos particulares, um anticorpo anti-CD47 descrito aqui compreende uma VH compreendendo a sequência de SEQ ID NO: 89, em que o aminoácido na posição X? não é G, X8 não é Μ, X9 não é E, X10 não é T e/ou X11 não é T. Em aspectos particulares, qualquer 1, 2, 3 ou 4 de X7 a X11 não são estes aminoácidos. Em aspectos particulares, quando o aminoácido na posição X7 é G, então X8 é Μ, X10 é T, X9 não é E e X11 é T.
[00124] Em um aspecto particular, um anticorpo anti-CD47 descrito aqui compreende uma VH compreendendo a sequência de SEQ ID NO: 89, em que a VH não compreende a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, ou 30, do Pedido dos E.U.A. No. de Publicação US2014/0140989 Al, que é incorporado aqui por referência na sua totalidade. Em um aspecto particular, um anticorpo anti-CD47 descrito aqui compreende uma VH compreendendo a sequência de consenso de SEQ ID NO: 89, em que a VH não compreende as regiões de arcabouço da sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 5, 6, 7, 8, 9, 10, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, ou 30, do Pedido dos
E. U.A. No. de Publicação US2014/0140989 Al, que é incorporado aqui por referência na sua totalidade.
[00125] Em aspectos particulares, Xi é Μ, X2 é V, X3 é P, X4 é A, X5 é G, Xe é L, X7 é G, X8 é M, X9 é T, Xi0 é T, Xn é T, X12 é R, X13 é D e/ou Xi4 é V. Em modalidades particulares, qualquer 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, ou 14 de Xi a X14 são estes aminoácidos.
[00126] Em aspectos particulares, Xi é Μ, X2 é Μ, X3 é P, X4 é S, X5 é A, Xe é
F, X7 é G, X8 é I, X9 é R, X10 é T, Xn é T, X12 é R, X13 é E e/ou X14 é V. Em modalidades particulares, qualquer 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, ou 14 de Xi a X14 são estes aminoácidos.
[00127] Em um aspecto particular, um anticorpo anti-CD47 proporcionado
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52/104 aqui não é o anticorpo AB6.12. Em um aspecto particular, um anticorpo antiCD47 proporcionado aqui não compreende uma VH (p.ex., SEQ ID NO: 6) e/ou uma VL (p.ex., SEQ ID NO: 42) do anticorpo AB6.12.
[00128] Em um aspecto específico, um anticorpo anti-CD47 proporcionado aqui compreende uma das seguintes sequências de aminoácidos de VH apresentadas na Tabela 2.
Tabela 2: Sequência de aminoácidos de VH
SEQ ID NO: Descrição Sequência de aminoácidos de VH
89 Consenso X1QX2QLVQSG AEVKKX3GX4SVKVSCKASG FN1KDYY LHWVRQAPGQX5LEWMGWIDPDQGDTEYAQKX6 QX7R VTX8TX9 DX10SX11STAY Μ E LX12S LRSX13 DTAX14 YYCNAAYGSSSYPMDYWG QGTTVTV
90 13m MQVQLVQSG AEVKKPG ASVKVSCKASG FN 1KDYYL HWVRQAPGQGLEWMGWIDPDQGDTEYAQKLQG RVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCNAAYGS SSYPMDYWG QGTTVTV
91 5m MQMQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGFNIKDYYL HWVRQAPGQALEWMGWIDPDQGDTEYAQKLQG RVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCNAAYGS SSYPMDYWG QGTTVTV
[00129] Em um aspecto específico é proporcionado aqui um anticorpo, p.ex., um anticorpo monoclonal, que se liga especificamente à CD47 humana, em que um tal anticorpo anti-CD47 é uma variante de um anticorpo anti-CD47 original, em que o anticorpo anti-CD47, quando produzido usando um sistema de expressão isento de células (CF), tem um título ou rendimento de expressão de anticorpos mais elevado em comparação com aquele do anticorpo anti-CD47 original quando expresso no sistema CF e em que o anticorpo anti-CD47
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53/104 compreende uma VH compreendendo SEQ ID NO: 90. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo IgGl, lgG2, lgG3 ou lgG4. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo IgGl. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo IgGl de alótipo Z. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo lgG4, tal como lgG4P ou lgG4PE.
[00130] Em um aspecto específico é proporcionado aqui um anticorpo, p.ex., um anticorpo monoclonal, que se liga especificamente à CD47 humana, em que um tal anticorpo anti-CD47 é uma variante de um anticorpo anti-CD47 original, em que o anticorpo anti-CD47, quando produzido usando um sistema de expressão isento de células (CF), tem um título ou rendimento de expressão de anticorpos mais elevado em comparação com aquele do anticorpo anti-CD47 original quando expresso no sistema CF e em que o anticorpo anti-CD47 compreende uma VH compreendendo SEQ ID NO: 91. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo IgGl, lgG2, lgG3 ou lgG4. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo IgGl. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo IgGl de alótipo Z. Em certos aspectos, tal anticorpo anti-CD47 é um anticorpo de isotipo lgG4, tal como lgG4P ou lgG4PE.
[00131] Em um aspecto particular, um anticorpo anti-CD47 (lgGl-13m) proporcionado aqui compreende uma cadeia pesada de IgGl compreendendo a sequência de aminoácidos como apresentado embaixo:
MQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFNIKDYYLHWVRQAPGQGLEWMGWI DPDQGDTEYAQKLQGRVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCNAAYGSSSYPMDY WGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSG VHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCP PCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNA
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KTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQ VYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYS KLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 81)
[00132] Em um aspecto particular, um anticorpo anti-CD47 (lgGl-13mZ) proporcionado aqui compreende uma cadeia pesada de alótipo IgGl-Z compreendendo a sequência de aminoácidos como apresentado embaixo:
MQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFNIKDYYLHWVRQAPGQGLEWMGWI DPDQGDTEYAQKLQGRVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCNAAYGSSSYPMDY WGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSG VHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCP PCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNA KTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQ VYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYS KLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 82)
[00133] Em um aspecto particular, um anticorpo anti-CD47 (lgGl-5m) proporcionado aqui compreende uma cadeia pesada de IgG 1 compreendendo a sequência de aminoácidos como apresentado embaixo:
MQMQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGFNIKDYYLHWVRQAPGQALEWMGWI DPDQGDTEYAQKFQGRVTITRDRSTSTAYMELRSLRSEDTAVYYCNAAYGSSSYPMDYW GQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGV HTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHTCPP CPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAK TKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQV YTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSK LTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK (SEQ ID NO: 83)
[00134] Em um aspecto particular, um anticorpo anti-CD47 (lgG4P-13m) proporcionado aqui compreende um anticorpo lgG4P compreendendo a
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55/104 sequência de aminoácidos como apresentado embaixo:
MQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFNIKDYYLHWVRQAPGQGLEWMGWI DPDQGDTEYAQKLQGRVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCNAAYGSSSYPMDY WGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSG VHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCP APEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKT KPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYT LPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLT VDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK (SEQ ID NO: 84)
[00135] Em um aspecto particular, um anticorpo anti-CD47 (lgG4P-5m) proporcionado aqui compreende uma cadeia pesada de lgG4P compreendendo a sequência de aminoácidos como apresentado embaixo:
MQMQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGFNIKDYYLHWVRQAPGQALEWMGWI DPDQGDTEYAQKFQGRVTITRDRSTSTAYMELRSLRSEDTAVYYCNAAYGSSSYPMDYW GQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVH TFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPE FLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPR EEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPP SQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVD KSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK (SEQ ID NO: 85)
[00136] Em um aspecto particular, um anticorpo anti-CD47 (lgG4PE-13m) proporcionado aqui compreende uma cadeia pesada de lgG4PE compreendendo a sequência de aminoácidos como apresentado embaixo:
MQVQLVQSGAEVKKPGASVKVSCKASGFNIKDYYLHWVRQAPGQGLEWMGWI DPDQGDTEYAQKLQGRVTMTTDTSTSTAYMELRSLRSDDTAVYYCNAAYGSSSYPMDY WGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSG VHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCP
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APEFEGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKT KPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYT LPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLT VDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK (SEQ ID NO: 86)
[00137] Em um aspecto particular, um anticorpo anti-CD47 (lgG4PE-5m) proporcionado aqui compreende uma cadeia pesada de lgG4PE compreendendo a sequência de aminoácidos como apresentado embaixo:
MQMQLVQSGAEVKKPGSSVKVSCKASGFNIKDYYLHWVRQAPGQALEWMGWI DPDQGDTEYAQKFQGRVTITRDRSTSTAYMELRSLRSEDTAVYYCNAAYGSSSYPMDYW GQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPCSRSTSESTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVH TFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTKTYTCNVDHKPSNTKVDKRVESKYGPPCPPCPAPE FEGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPR EEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPP SQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVD KSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK (SEQ ID NO: 87)
[00138] Em um aspecto específico é proporcionado aqui um anticorpo, p.ex., um anticorpo monoclonal, que se liga especificamente à CD47 humana, em que um tal anticorpo anti-CD47 é uma variante de um anticorpo anti-CD47 original, em que o anticorpo anti-CD47, quando produzido usando um sistema de expressão isento de células (CF), tem um título ou rendimento de expressão de anticorpos mais elevado em comparação com aquele do anticorpo anti-CD47 original quando expresso no sistema CF e em que o anticorpo anti-CD47 compreende uma cadeia leve compreendendo uma região constante de cadeia leve kappa ou lambda (p.ex., região constante de cadeia kappa ou lambda humana), por exemplo SEQ ID NO: 88.
[00139] Em um aspecto específico é proporcionado aqui um anticorpo, p.ex., um anticorpo monoclonal, que se liga especificamente à CD47 humana,
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57/104 em que um tal anticorpo anti-CD47 é uma variante de um anticorpo anti-CD47 original, em que o anticorpo anti-CD47, quando produzido usando um sistema de expressão isento de células (CF), tem um título ou rendimento de expressão de anticorpos mais elevado em comparação com aquele do anticorpo anti-CD47 original quando expresso no sistema CF e em que o anticorpo anti-CD47 compreende (i) uma VH descrita aqui (p.ex., SEQ ID NO: 89, 90 ou 91) ou uma cadeia pesada descrita aqui (p.ex., qualquer uma das SEQ ID Nos: 81-87) e (ii) uma cadeia leve compreendendo uma região constante de cadeia leve kappa ou lambda (p.ex., região constante de cadeia leve kappa ou lambda humana), por exemplo SEQ ID NO: 88, p.ex., como apresentado embaixo (cadeia leve de anticorpo anti-CD47 (IgK)), ou SEQ ID NO: 88 sem o aminoácido M no terminal M:
Μ NIQMTQSPSAMSASVG DRVTITCKASQDIH RYLSWFQQKPG KVPKH LI YRAN RL VSGVPSRFSGSGSGTEFTLTISSLQPEDFATYYCLQYDEFPYTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFI FPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSS TLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC (SEQ ID NO: 88).
[00140] Em certas modalidades, um anticorpo descrito aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende um domínio VL tendo pelo menos 80%, pelo menos 85%, pelo menos 90%, pelo menos 95%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequências com a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 42, em que o anticorpo se liga especificamente à CD47. Em certas modalidades, um anticorpo descrito aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende um domínio VL tendo pelo menos 80%, pelo menos 85%, pelo menos 90%, pelo menos 95%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequências com a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 42, em que o anticorpo se liga especificamente à CD47 e em que o anticorpo compreende CDRs (p.ex., CDRs 1-3 de VL) que são idênticas às CDRs
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58/104 (p.ex., CDRs 1-3 de VL) de SEQ ID NO: 42 (p.ex., SEQ ID NO: 53, 71 e 55).
[00141] Em certas modalidades, um anticorpo descrito aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma cadeia leve tendo pelo menos 80%, pelo menos 85%, pelo menos 90%, pelo menos 95%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequências com a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 88, em que o anticorpo se liga especificamente à CD47. Em certas modalidades, um anticorpo descrito aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende um domínio leve tendo pelo menos 80%, pelo menos 85%, pelo menos 90%, pelo menos 95%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequências com a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 88, em que o anticorpo se liga especificamente à CD47 e em que o anticorpo compreende CDRs (p.ex., CDRs 1-3 de VL) que são idênticas às CDRs (p.ex., CDRs 1-3 de VL) de SEQ ID NO: 88 (p.ex., SEQ ID NO: 53, 71 e 55).
[00142] Em certas modalidades, um anticorpo descrito aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende um domínio VH tendo pelo menos 80%, pelo menos 85%, pelo menos 90%, pelo menos 95%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequências com a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 6, em que o anticorpo se liga especificamente à CD47 e em que o anticorpo anti-CD47, quando produzido usando um sistema de expressão isento de células, tem um título ou rendimento de expressão de anticorpos mais elevado em comparação com o anticorpo original quando produzido no sistema de expressão CF. Em certas modalidades, um anticorpo descrito aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende um domínio VH tendo pelo menos 80%, pelo menos 85%, pelo menos 90%, pelo menos 95%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequências com a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 6, em que o anticorpo se liga especificamente à CD47 e em que o anticorpo compreende CDRs (p.ex., CDRs 1
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59/104 de VL) que são idênticas às CDRs (p.ex., CDRs 1-3 de VL) de SEQ ID NO: 6 (p.ex., SEQ ID NO: 50, 72 e 52).
[00143] Em certas modalidades, um anticorpo descrito aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma cadeia leve tendo pelo menos 80%, pelo menos 85%, pelo menos 90%, pelo menos 95%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequências com a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 78, em que o anticorpo se liga especificamente à CD47 e em que o anticorpo anti-CD47, quando produzido usando um sistema de expressão isento de células, tem um título ou rendimento de expressão de anticorpos mais elevado em comparação com o anticorpo original quando produzido no sistema de expressão CF. Em certas modalidades, um anticorpo descrito aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende um domínio pesado tendo pelo menos 80%, pelo menos 85%, pelo menos 90%, pelo menos 95%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequências com a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 78, em que o anticorpo se liga especificamente à CD47 e em que o anticorpo compreende CDRs (p.ex., CDRs 13 de VL) que são idênticas às CDRs (p.ex., CDRs 1-3 de VL) de SEQ ID NO: 78 (p.ex., SEQ ID NO: 53, 71 e 55).
[00144] Em certas modalidades, um anticorpo descrito aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma cadeia leve tendo pelo menos 80%, pelo menos 85%, pelo menos 90%, pelo menos 95%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequências com a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 79, em que o anticorpo se liga especificamente à CD47 e em que o anticorpo anti-CD47, quando produzido usando um sistema de expressão isento de células, tem um título ou rendimento de expressão de anticorpos mais elevado em comparação com o anticorpo original quando produzido no sistema de expressão CF. Em certas modalidades, um anticorpo
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60/104 descrito aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende um domínio pesado tendo pelo menos 80%, pelo menos 85%, pelo menos 90%, pelo menos 95%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequências com a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 79, em que o anticorpo se liga especificamente à CD47 e em que o anticorpo compreende CDRs (p.ex., CDRs 13 de VL) que são idênticas às CDRs (p.ex., CDRs 1-3 de VL) de SEQ ID NO: 79 (p.ex., SEQ ID NO: 53, 71 e 55).
[00145] Em certas modalidades, um anticorpo descrito aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende uma cadeia leve tendo pelo menos 80%, pelo menos 85%, pelo menos 90%, pelo menos 95%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequências com a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 80, em que o anticorpo se liga especificamente à CD47 e em que o anticorpo anti-CD47, quando produzido usando um sistema de expressão isento de células, tem um título ou rendimento de expressão de anticorpos mais elevado em comparação com o anticorpo original quando produzido no sistema de expressão CF. Em certas modalidades, um anticorpo descrito aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo compreende um domínio pesado tendo pelo menos 80%, pelo menos 85%, pelo menos 90%, pelo menos 95%, pelo menos 98% ou pelo menos 99% identidade de sequências com a sequência de aminoácidos de SEQ ID NO: 80, em que o anticorpo se liga especificamente à CD47 e em que o anticorpo compreende CDRs (p.ex., CDRs 13 de VL) que são idênticas às CDRs (p.ex., CDRs 1-3 de VL) de SEQ ID NO: 80 (p.ex., SEQ ID NO: 53, 71 e 55).
[00146] ATabela 3 proporciona uma tabela das sequências de aminoácidos de anticorpos anti-CD47 descritas aqui. Em certas modalidades, um anticorpo descrito aqui compreende qualquer sequência de região variável de cadeia leve da Tabela 3 e qualquer sequência de região variável de cadeia pesada da Tabela
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3.
Tabela 3. Sequências de aminoácidos de anticorpos anti-CD47.
SEQ ID NO: DESCRIÇÃO Sequência de Aminoácidos
1 IgGl ASTKGPSVFP LAPSSKSTSG GTAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSSLGTQT YICNVNHKPS NTKVDKKVEP EYKCKVSNKA LPAPIEKTIS KAKGQPREPQVYTLPPSRDE LTKNQVSLTC LVKGFYPSDI AVEWESNGQP ENNYKTTPPV LDSDGSFFLY SKLTVDKSRW QQGNVFSCSV MHEALHNHYT QKSLSLSPGK
2 lgG2 ASTKGPSVFP LAPCSRSTSE STAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSNFGTQT YTCNVDHKPS NTKVDKTVER KCCVECPPCP APPVAGPSVF LFPPKPKDTL MISRTPEVTC VVVDVSHEDP KVSNKGLPAP IEKTISKTKG QPREPQVYTL PPSREEMTKN QVSLTCLVKG FYPSDISVEW ESNGQPENNY KTTPPMLDSD GSFFLYSKLT VDKSRWQQGN VFSCSVMHEA LHNHYTQKSL SLSPGK
3 lgG3 ASTKGPSVFP LAPCSRSTSG GTAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSSLGTQT YTCNVNHKPS NTKVDKRVEL KTPLGDTTHT CPRCPEPKSC DTPPPCPRCP EPKSCDTPPP CPRCPEPKSC DTPPPCPRCP APELLGGPSV FLFPPKPKDT
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LMISRTPEVTCVVVDVSHED CKVSNKALPA PIEKTISKTK GQPREPQVYT LPPSREEMTK NQVSLTCLVK GFYPSDIAVE WESSGQPENN YNTTPPMLDS DGSFFLYSKLTVDKSRWQQG
4 lgG4 ASTKGPSVFP LAPCSRSTSE STAALGCLVK DYFPEPVTVS WNSGALTSGV HTFPAVLQSS GLYSLSSVVT VPSSSLGTKT YTCNVDHKPS NTKVDKRVES CKVSNKGLPS SIEKTISKAK GQPREPQVYT LPPSQEEMTK NQVSLTCLVK GFYPSDIAVE WESNGQPENN YKTTPPVLDS DGSFFLYSRLTVDKSRWQEG NVFSCSVMHE ALHNHYTQKS LSLSLGK
5 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 EVQLQQSGAE LVRSGASVKL SCTASGFNIK DYYLHWVKQR PEQGLEWIGW IDPDNGDTEF APKFQGKATM TADTSSNTAY LQLSSLTSED TAVYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTSVTV
6 Região variável de cadeia pesada do anticorpo anti- CD47 AB6.12 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFNIK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDQGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
7 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFNIK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY
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humanizado para CD47 MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
8 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 EVQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFNIK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
9 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFNIK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQGRVTM TADTSSNTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
10 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFNIK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQGRVTM TEDTSTDTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
11 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFNIK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDQGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
12 Região de QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFNIK
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cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDYGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
13 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFNIK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDSGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
14 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFNIK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNADTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
15 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFNIK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNTDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
16 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFNIK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY
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humanizado para CD47 MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSPYPMDYW GQGTTVTV*
17 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGYTFT YYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
18 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFTFT YYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
19 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGYNFT YYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
20 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGYTIT YYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
21 Região de QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGYTFK
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cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 YYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
22 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGYTFT DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
23 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFTFT DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
24 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFTIT DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
25 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGYTFK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY
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humanizado para CD47 MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
26 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFTFK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
27 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFNIK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY LQLSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
28 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 QMQLVQSGAE VKKTGSSVKV SCKASGFNIK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLTSED TAVYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
29 Região de cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 EVQLVQSGAE VKKPGATVKI SCKVSGFNIK DYYLHWVRQA PGQALEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
30 Região de EVQLVQSGAE VKKPGATVKI SCKVSGFNIK
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cadeia pesada variável de um anticorpo humanizado para CD47 DYYLHWVQQA PGKGLEWMGW IDPDNGDTEY AQKFQDRVTI TRDRSMSTAY MELSSLRSED TAMYYCNAAY GSSSYPMDYW GQGTTVTV
31 Região de cadeia leve variável de um anticorpo humanizado para CD47 DIKMTQSPSS LYASLGERVT ITCKASQDIH RYLSWFQQKP GKSPKILIYR ANRLVDGVPS RFSGSGSGQD YSLTISSLEY EDMGIYYCLQ YDEFPYTFGG GTKLEMK
32 Região de cadeia leve variável de um anticorpo humanizado para CD47 DIKMTQSPSS LYASLGERVT ITCKASQDIH RYLSWFQQKP GKSPKILIYR ANRLVDGVPS RFSGSGSGQD YSLTISSLEY EDMGIYYCLQ YDEFPYTFGG GTKLEIK
33 Região de cadeia leve variável de um anticorpo humanizado para CD47 DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCKASQDIH RYLSWYQQKP GKAPKLLIYR ANRLVDGVPS RFSGSGSGTD FTFTISSLQP EDIATYYCLQ YDEFPYTFGG GTKVEIK
34 Região de cadeia leve variável de um anticorpo DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCKASQDIH RYLSWFQQKP GKAPKSLIYR ANRLVDGVPS RFSGSGSGTD FTLTISSLQP
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humanizado para CD47 EDFATYYCLQ YDEFPYTFGG GTKVEIK
35 Região de cadeia leve variável de um anticorpo humanizado para CD47 NIQMTQSPSA MSASVGDRVT ITCKASQDIH RYLSWFQQKP GKVPKHLIYR ANRLVDGVPS RFSGSGSGTE FTLTISSLQP EDFATYYCLQ YDEFPYTFGG GTKVEIK
36 Região de cadeia leve variável de um anticorpo humanizado para CD47 DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCKASQDIH RYLSWYQQKP GKAPKRLIYR ANRLVDGVPS RFSGSGSGTE FTLTISSLQP EDFATYYCLQ YDEFPYTFGG GTKVEIK
37 Região de cadeia leve variável de um anticorpo humanizado para CD47 DIQMTQSPSS LSASVGDRVT ITCRASQDIH RYLAWYQQKP GKVPKLLIYR ANRLQSGVPS RFSGSGSGTD FTLTISSLQP EDVATYYCLQ YDEFPYTFGQ GTKVEIK
38 Região de cadeia leve variável de um anticorpo humanizado para CD47 EIVLTQSPAT LSLSPGERAT LSCRASQDIH RYLAWYQQKP GQAPRLLIYR ANRRATGIPA RFSGSGSGTD FTLTISSLEP EDFAVYYCLQYDEFPYTGFQGTRLEIK
39 Região de DIQMTQSPSA MSASVGDRVT ITCKASQDIH
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cadeia leve variável de um anticorpo humanizado para CD47 RYLSWFQQKP GKVPKHLIYR ANRLVDGVPS RFSGSGSGTE FTLTISSLQP EDFATYYCLQ YDEFPYTFGG GTKVEIK
40 Região de cadeia leve variável de um anticorpo humanizado para CD47 NIQMTQSPSA MSASVGDRVT ITCRARQGIH RYLSWFQQKP GKVPKHLIYR ANRLVDGVPS RFSGSGSGTE FTLTISSLQP EDFATYYCLQ YDEFPYTFGG GTKVEIK
41 Região de cadeia leve variável de um anticorpo humanizado para CD47 NIQMTQSPSA MSASVGDRVT ITCKASQDIH RYLSWFQQKP GKVPKILIYR ANRLVDGVPS RFSGSGSGTE FTLTISSLQP EDFATYYCLQ YDEFPYTFGG GTKVEIK
42 Região variável de cadeia leve do anticorpo anti-CD47 AB6.12 NIQMTQSPSA MSASVGDRVT ITCKASQDIH RYLSWFQQKP GKVPKHLIYR ANRLVSGVPS RFSGSGSGTE FTLTISSLQP EDFATYYCLQ YDEFPYTFGG GTKVEIK
43 Região de cadeia leve variável de um anticorpo humanizado NIQMTQSPSA MSASVGDRVT ITCRARQGIH RYLSWFQQKP GKVPKILIYR ANRLVDGVPS RFSGSGSGTE FTLTISSLQP EDFATYYCLQ YDEFPYTFGG GTKVEIK
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para CD47
44 Região de cadeia leve variável de um anticorpo humanizado para CD47 NIQMTQSPSA MSASVGDRVT ITCRARQGIH RYLSWFQQKP GKVPKHLIYR ANRLVSGVPS RFSGSGSGTE FTLTISSLQP EDFATYYCLQYDEFPYTFGG GTKVEIK
45 Região de cadeia leve variável de um anticorpo humanizado para CD47 NIQMTQSPSA MSASVGDRVT ITCKASQDIH RYLSWFQQKP GKVPKLLIYR ANRLVDGVPS RFSGSGSGTE FTLTISSLQP EDFATYYCLQYDEFPYTFGG GTKVEIK
46 Região de cadeia leve variável de um anticorpo humanizado para CD47 NIQMTQSPSA MSASVGDRVT ITCKASQDIH RYLSWFQQKP GKVPKLLIYR ANRLVSGVPS RFSGSGSGTE FTLTISSLQP EDFATYYCLQYDEFPYTFGG GTKVEIK
47 Região de cadeia leve variável de um anticorpo humanizado para CD47 NIQMTQSPSA MSASVGDRVT ITCRARQGIH RYLSWFQQKP GKVPKLLIYR ANRLVSGVPS RFSGSGSGTE FTLTISSLQP EDFATYYCLQ YDEFPYTFGG GTKVEIK
48 SEQUÊNCIA DE CD47 MWPLVAALLL GSACCGSAQL LFNKTKSVEF TFCNDTVVIP CFVTNMEAQN TTEVYVKWKF
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HUMANA EXEMPLIFICATI VA KGRDIYTFDG ALNKSTVPTD FSSAKIEVSQ LLKGDASLKM DKSDAVSHTG NYTCEVTELT REGETIIELK YRVVSWFSPN ENILIVIFPI FAILLFWGQF GIKTLKYRSG GMDEKTIALL VAGLVITVIV IVGAILFVPG EYSLKNATGL GLIVTSTGIL ILLHYYVFST AIGLTSFVIA 1LVIQVIAYI LAVVGLSLCI AACIPMHGPL LISGLSILAL AQLLGLVYMK FVASNQKTIQ PPRKAVEEPL NAFKESKGMM NDE
49 SEQUÊNCIA DE QLLFNKTKSV EFTFCNDTVV IPCFVTNMEA
CD47 QNTTEVYVKW KFKGRDIYTF DGALNKSTVP
HUMANA TDFSSAKIEV SQLLKGDASL KMDKSDAVSH
EXEMPLIFICATI TGNYTCEVTE LTREG ETIIE LKYRVVSWFS
VA SEM PNENILIVIF PIFAILLFWG QFGIKTLKYR
SEQUÊNCIA DE SGGMDEKTIA LLVAGLVITV IVIVGAILFV
SINAL PGEYSLKNATGLGLIVTSTG ILILLHYYVF STAIGLTSFV IAILVIQVIA YILAVVGLSL CIAACIPMHG PLLISGLSIL ALAQLLGLVY MKFVASNQKT IQPPRKAVEE PLNAFKESKG MMNDE
50 sequência de aminoácidos de CDR1de VH GFNIKDYYLH
51 sequência de aminoácidos de CDR2 de VH WiDPDNGDTE
52 sequência de NAAYGSSSYPMDY
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aminoácidos de CDR3 de VH
53 sequência de aminoácidos de CDR1 de VL KASQDIHRYLS
54 sequência de aminoácidos de CDR2 de VL RANRLVD
55 sequência de aminoácidos de CDR3 de VL LQYDEFPYT
56 epítopo de CD47 KGRD
57 sequência de aminoácidos de CDR1de VH GYTFTYYYLH
58 sequência de aminoácidos de CDR1de VH GFTFTYYYLH
59 sequência de aminoácidos de CDR1de VH GYNFTYYYLH
60 sequência de aminoácidos de CDR1de VH GYTITYYYLH
61 sequência de aminoácidos GYTFKYYYLH
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de CDR1de VH
62 sequência de aminoácidos de CDR1de VH GYTFTDYYLH
63 sequência de aminoácidos de CDR1de VH GFTFTDYYLH
64 sequência de aminoácidos de CDR1de VH GFTiTDYYLH
65 sequência de aminoácidos de CDR1de VH GYTFKDYYLH
66 sequência de aminoácidos de CDR1de VH GFTFKDYYLH
67 sequência de aminoácidos de CDR1 de VL RASQDiHRYLA
68 sequência de aminoácidos de CDR1 de VL RARQGIHRYLS
69 sequência de aminoácidos de CDR2 de VL RANRLQS
70 sequência de aminoácidos RANRRAT
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de CDR2 de VL
71 sequência de aminoácidos de CDR2 de VL RANRLVS
72 sequência de aminoácidos de CDR2 de VH WIDPDQGDTE
73 sequência de aminoácidos de CDR2 de VH WiDPDYGDTE
74 sequência de aminoácidos de CDR2 de VH WiDPDSGDTE
75 sequência de aminoácidos de CDR2 de VH WIDPDNADTE
76 sequência de aminoácidos de CDR2 de VH WiDPDNTDTE
77 sequência de aminoácidos de CDR3 de VH NAAYGSSPYPMDY
78 Cadeia pesada do anticorpo anti-CD47 IgGl MQMQLVQSGA EVKKTGSSVK VSCKASGFNI KDYYLHWVRQ APGQALEWMG WIDPDQGDTE YAQKFQDRVT ITRDRSMSTA YMELSSLRSE DTAMYYCNAA YGSSSYPMDY
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WGQGTTVTVS SASTKGPSVF PLAPSSKSTS GGTAALGCLV KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SGLYSLSSVV TVPSSSLGTQ TYICNVNHKP SNTKVDKKVE PKSCDKTHTC PPCPAPELLG GPSVFLFPPK PKDTLMISRT PEVTCVVVDV SHEDPEVKFN WYVDGVEVHN AKTKPREEQY NSTYRVVSVL TVLHQDWLNG KEYKCKVSNK ALPAPIEKTI SKAKGQPREP QVYTLPPSRD ELTKNQVSLT CLVKGFYPSD IAVEWESNGQ PENNYKTTPP VLDSDGSFFL YSKLTVDKSR WQQGNVFSCS VMHEALHNHY TQKSLSLSPG K
79 Cadeia pesada do anticorpo anti-CD47 lgG4P MQMQLVQSGA EVKKTGSSVK VSCKASGFNI KDYYLHWVRQ APGQALEWMG WIDPDQGDTE YAQKFQDRVT ITRDRSMSTA YMELSSLRSE DTAMYYCNAA YGSSSYPMDY WGQGTTVTVS SASTKGPSVF PLAPCSRSTS ESTAALGCLV KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SGLYSLSSVV
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TVPSSSLGTK TYTCNVDHKP SNTKVDKRVE SKYGPPCPPC PAPEFLGGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVVVDVSQE DPEVQFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQFNST YRVVSVLTVL HQDWLNGKEY KCKVSNKGLP SSIEKTISKA KGQPREPQVY TLPPSQEEMT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPVLD SDGSFFLYSR LTVDKSRWQE GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSLGK
80 Cadeia pesada do anticorpo anti-CD47 lgG4PE (compreenden do substituições S228P e L235E) MQMQLVQSGA EVKKTGSSVK VSCKASGFNI KDYYLHWVRQ APGQALEWMG WIDPDQGDTE YAQKFQDRVT ITRDRSMSTA YMELSSLRSE DTAMYYCNAA YGSSSYPMDY WGQGTTVTVS SASTKGPSVF PLAPCSRSTS ESTAALGCLV KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SGLYSLSSVV TVPSSSLGTK TYTCNVDHKP SNTKVDKRVE SKYGPPCPPC PAPEFEGGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVVVDVSQE DPEVQFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQFNST YRVVSVLTVL HQDWLNGKEY KCKVSNKGLP SSIEKTISKA KGQPREPQVY TLPPSQEEMT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN
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NYKTTPPVLD SDGSFFLYSR LTVDKSRWQE GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSLGK
81 Cadeia pesada do anticorpo anti-CD47 lgGl-13m MQVQLVQSGA EVKKPGASVK VSCKASGFNI KDYYLHWVRQ APGQGLEWMG WIDPDQGDTE YAQKLQGRVT MTTDTSTSTA YMELRSLRSD DTAVYYCNAA YGSSSYPMDY WGQGTTVTVS SASTKGPSVF PLAPSSKSTS GGTAALGCLV KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SG LYSLSSVV TVPSSSLGTQ TYICN VN Η KP SNTKVDKKVE PKSCDKTHTC PPCPAPELLG GPSVFLFPPK PKDTLMISRT PEVTCVVVDV SHEDPEVKFN WYVDGVEVHN AKTKPREEQY NSTYRVVSVLTVLHQDWLNG KEYKCKVSNK ALPAPIEKTI SKAKGQPREP QVYTLPPSRD ELTKNQVSLT CLVKGFYPSD IAVEWESNGQ PENNYKTTPP VLDSDGSFFL YSKLTVDKSR WQQGNVFSCS VMHEALHNHY TQKSLSLSPG K
82 Cadeia pesada do anticorpo anti-CD47 lgGl-13mZ MQVQLVQSGA EVKKPGASVK VSCKASGFNI KDYYLHWVRQ APGQGLEWMG WIDPDQGDTE YAQKLQGRVT MTTDTSTSTA YMELRSLRSD DTAVYYCNAA YGSSSYPMDY WGQGTTVTVS SASTKGPSVF PLAPSSKSTS GGTAALGCLV KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SG LYSLSSVV TVPSSSLGTQ TYICN VN Η KP SNTKVDKKVE PKSCDKTHTC PPCPAPELLG GPSVFLFPPK PKDTLMISRT PEVTCVVVDV SHEDPEVKFN WYVDGVEVHN AKTKPREEQY
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NSTYRVVSVLTVLHQDWLNG KEYKCKVSNK ALPAPIEKTI SKAKGQPREP QVYTLPPSRE EMTKNQVSLT CLVKGFYPSD IAVEWESNGQ PENNYKTTPP VLDSDGSFFL YSKLTVDKSR WQQGNVFSCS VMHEALHNHY TQKSLSLSPGK
83 Cadeia pesada do anticorpo anti-CD47 lgGl-5m MQMQLVQSGA EVKKPGSSVK VSCKASGFNI KDYYLHWVRQ APGQALEWMG WIDPDQGDTE YAQKFQGRVT ITRDRSTSTA YMELRSLRSE DTAVYYCNAA YGSSSYPMDY WGQGTTVTVS SASTKGPSVF PLAPSSKSTS GGTAALGCLV KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SG LYSLSSVV TVPSSSLGTQ TYICN VN Η KP SNTKVDKKVE PKSCDKTHTC PPCPAPELLG GPSVFLFPPK PKDTLMISRT PEVTCVVVDV SHEDPEVKFN WYVDGVEVHN AKTKPREEQY NSTYRVVSVLTVLHQDWLNG KEYKCKVSNK ALPAPIEKTI SKAKGQPREP QVYTLPPSRD ELTKNQVSLT CLVKGFYPSD IAVEWESNGQ PENNYKTTPP VLDSDGSFFL YSKLTVDKSR WQQGNVFSCS VMHEALHNHY TQKSLSLSPG K
84 Cadeia pesada do anticorpo anti-CD47 lgG4P-13m MQVQLVQSGA EVKKPGASVK VSCKASGFNI KDYYLHWVRQ APGQGLEWMG WIDPDQGDTE YAQKLQGRVT MTTDTSTSTA YMELRSLRSD DTAVYYCNAA YGSSSYPMDY WGQGTTVTVS SASTKGPSVF PLAPCSRSTS ESTAALGCLV KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SG LYSLSSVV TVPSSSLGTK TYTCNVDHKP
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SNTKVDKRVE SKYGPPCPPC PAPEFLGGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVVVDVSQE DPEVQFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQFNST YRVVSVLTVL HQDWLNGKEY KCKVSNKGLP SSIEKTISKA KGQPREPQVY TLPPSQEEMT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPVLD SDGSFFLYSR LTVDKSRWQE GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSLGK
85 Cadeia pesada do anticorpo anti-CD47 lgG4P-5m MQMQLVQSGA EVKKPGSSVK VSCKASGFNI KDYYLHWVRQ APGQALEWMG WIDPDQGDTE YAQKFQGRVT ITRDRSTSTA YMELRSLRSE DTAVYYCNAA YGSSSYPMDY WGQGTTVTVS SASTKGPSVF PLAPCSRSTS ESTAALGCLV KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SGLYSLSSVV TVPSSSLGTK TYTCNVDHKP SNTKVDKRVE SKYGPPCPPC PAPEFLGGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVVVDVSQE DPEVQFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQFNST YRVVSVLTVL HQDWLNGKEY KCKVSNKGLP SSIEKTISKA KGQPREPQVY TLPPSQEEMT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPVLD SDGSFFLYSR LTVDKSRWQE GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSLGK
86 Cadeia pesada do anticorpo anti-CD47 lgG4PE-13m MQVQLVQSGA EVKKPGASVK VSCKASGFNI KDYYLHWVRQ APGQGLEWMG WIDPDQGDTE YAQKLQGRVT MTTDTSTSTA YMELRSLRSD DTAVYYCNAA YGSSSYPMDY WGQGTTVTVS
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SASTKGPSVF PLAPCSRSTS ESTAALGCLV KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SGLYSLSSVV TVPSSSLGTK TYTCNVDHKP SNTKVDKRVE SKYGPPCPPC PAPEFEGGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVVVDVSQE DPEVQFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQFNST YRVVSVLTVL HQDWLNGKEY KCKVSNKGLP SSIEKTISKA KGQPREPQVY TLPPSQEEMT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPVLD SDGSFFLYSR LTVDKSRWQE GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSLGK
87 Cadeia pesada do anticorpo anti-CD47 lgG4PE-5m MQMQLVQSGA EVKKPGSSVK VSCKASGFNI KDYYLHWVRQ APGQALEWMG WIDPDQGDTE YAQKFQGRVT ITRDRSTSTA YMELRSLRSE DTAVYYCNAA YGSSSYPMDY WGQGTTVTVS SASTKGPSVF PLAPCSRSTS ESTAALGCLV KDYFPEPVTV SWNSGALTSG VHTFPAVLQS SGLYSLSSVV TVPSSSLGTK TYTCNVDHKP SNTKVDKRVE SKYGPPCPPC PAPEFEGGPS VFLFPPKPKD TLMISRTPEV TCVVVDVSQE DPEVQFNWYV DGVEVHNAKT KPREEQFNST YRVVSVLTVL HQDWLNGKEY KCKVSNKGLP SSIEKTISKA KGQPREPQVY TLPPSQEEMT KNQVSLTCLV KGFYPSDIAV EWESNGQPEN NYKTTPPVLD SDGSFFLYSR LTVDKSRWQE GNVFSCSVMH EALHNHYTQK SLSLSLGK
88 Cadeia leve MNIQMTQSPS AMSASVGDRV TITCKASQDI
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(Kappa de Ig) HRYLSWFQQK PGKVPKHLIY RANRLVSGVP SRFSGSGSGT EFTLTISSLQ PEDFATYYCL QYDEFPYTFG GGTKVEIKRT VAAPSVFIFP PSDEQLKSGT ASVVCLLNNF YPREAKVQWK VDNALQSGNS QESVTEQDSK DSTYSLSSTL TLSKADYEKH KVYACEVTHQ GLSSPVTKSF NRGEC
89 sequência de consenso para região variável de cadeia pesada do anticorpo antiCD47 X1QX2QLVQSG AEVKKX3GX4SVKVSCKASG FN1KDYY LHWVRQAPGQX5LEWMGWIDPDQGDTEYAQKX6 QX7RVTX8TX9DX10SX11STAYMELX12SLRSX13DTAX14 YYCNAAYGSSSYPMDYWGQGTTVTV
90 VH - 13m do anticorpo antiCD47 VQLVQSGAEV KKPGASVKVS CKASGFNIKD YYLHWVRQAP GQGLEWMGWI DPDQGDTEYA QKLQGRVTMTTDTSTSTAYM ELRSLRSDDT AVYYCNAAYG SSSYPMDYWG QGTTVTV
91 VH-5m do anticorpo antiCD47 MQMQLVQSGA EVKKPGSSVK VSCKASGFNI KDYYLHWVRQ APGQALEWMG WIDPDQGDTE YAQKLQGRVT MTTDTSTSTA YMELRSLRSD DTAVYYCNAA YGSSSYPMDY WGQGTTVTV
[00147] Em algumas modalidades, os anticorpos para CD47 descritos aqui são usados em conjugação com um ou mais agentes adicionais ou uma combinação de agentes adicionais. Agentes adicionais adequados incluem terapias farmacêuticas e/ou cirúrgicas para uma aplicação pretendida, tal como, por exemplo, câncer. Por exemplo, os anticorpos para CD47 podem ser usados em conjunção com um ou mais agentes quimioterapêuticos ou antineoplásicos
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83/104 adicionais. Alternativamente, o agente quimioterapêutico adicional é radioterapia. Em algumas modalidades, o agente quimioterapêutico é um agente indutor da morte celular. Em algumas modalidades, o agente quimioterapêutico induz uma perda de assimetria de fosfolipídeos ao longo da membrana plasmática, por exemplo causa exposição à superfície celular de fosfatidilserina (PS). Em algumas modalidades, o agente quimioterapêutico induz estresse do retículo endoplasmático (ER). Em algumas modalidades, o agente quimioterapêutico é um inibidor do proteossomo. Em algumas modalidades, o agente quimioterapêutico induz a translocação de proteínas do ER para a superfície celular. Em algumas modalidades, o agente quimioterapêutico induz a translocação e exposição à superfície celular de calreticulina.
[00148] Em algumas modalidades, o anticorpo para CD47 e agente adicional são formulados em uma composição terapêutica única, e o anticorpo para CD47 e agente adicional são administrados simultaneamente. Alternativamente, o anticorpo para CD47 e agente adicional são separados um do outro, p.ex., cada um é formulado em uma composição terapêutica separada, e o anticorpo para CD47 e o agente adicional são administrados simultaneamente, ou o anticorpo CD47 e o agente adicional são administrados em momentos diferentes durante um regime de tratamento. Por exemplo, o anticorpo para CD47 é administrado antes da administração do agente adicional, o anticorpo para CD47 é administrado subsequentemente à administração do agente adicional ou o anticorpo para CD47 e o agente adicional são administrados de um modo alternado. Como descrito aqui, o anticorpo para CD47 e agente adicional são administrados em doses únicas ou em doses múltiplas.
[00149] Em aspectos particulares, os anticorpos anti-CD47 proporcionados
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84/104 aqui compreendem um ou mais resíduos de aminoácidos não naturais em posições sítio-específicas. Ver, p.ex., Pedido dos E.U.A. No. de Publicação US 2014/0046030 Al, que é incorporado aqui por referência na sua totalidade. Em aspectos específicos, os resíduos de aminoácidos não naturais em posições sítioespecíficas têm vantagens para produção, rendimento, solubilidade, afinidade de ligação e/ou atividade do anticorpo. Exemplos não limitantes de aminoácidos não naturais foram descritos, ver, p.ex., Pedido dos E.U.A. No. de Publicação US 2014/0066598 Al.
[00150] Em um aspecto particular são proporcionados anticorpos antiCD47 conjugados a uma fração de conjugação ou um agente tal como uma etiqueta ou toxina. Uma fração de conjugação pode ser qualquer fração de conjugação considerada útil a um perito na técnica. Por exemplo, uma fração de conjugação pode ser um polímero, tal como poletilenoglicol, que pode melhorar a estabilidade do anticorpo in vitro ou in vivo. Uma fração de conjugação pode ter atividade terapêutica, originando deste modo um conjugado anticorpofármaco. Uma fração de conjugação pode ser uma carga líquida molecular que é prejudicial para células alvo. Uma fração de conjugação pode ser uma etiqueta útil para detecção ou diagnóstico. Em certos aspectos, uma fração de conjugação está ligada ao anticorpo através de uma ligação covalente direta. Em certos aspectos, uma fração de conjugação está ligada ao anticorpo através de uma ligante. Em aspectos particulares, uma fração de conjugação ou um ligante é anexado através de um dos aminoácidos não naturais de um anticorpo anti-CD47. Frações de conjugação e ligantes exemplificativas foram descritas, p.ex., ver Pedido dos E.U.A. No. de Publicação U52014/0046030 Al, que é incorporado aqui por referência na sua totalidade.
[00151] Os anticorpos ou um fragmento de ligação ao antígeno descritos aqui que se ligam imunoespecificamente à CD47 (p.ex., ECD de CD47 humana)
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85/104 podem ser produzidos por qualquer método conhecido na técnica.
[00152] Os anticorpos descritos aqui podem, por exemplo, incluir anticorpos quiméricos. Um anticorpo quimérico é uma molécula na qual diferentes porções do anticorpo são derivadas de diferentes moléculas de imunoglobulina. Por exemplo, um anticorpo quimérico pode conter uma região variável de um anticorpo monoclonal de camundongo ou rato fundido a uma região constante de um anticorpo humano. Métodos para produção de anticorpos quiméricos são conhecidos na técnica. Ver, p.ex., Morrison, 1985, Science 229: 1202; Oi et al., 1986, BioTechniques 4: 214; Gillies et al., 1989, J. Immunol. Methods 125: 191-202; e Patentes dos E.U.A. Nos. 5,807,715, 4,816,567, 4,816,397 e 6,331,415.
[00153] Os anticorpos ou fragmentos de ligação ao antígeno produzidos usando técnicas tais como aquelas descritas aqui podem ser isolados usando técnicas bem conhecidas, padrão. Por exemplo, os anticorpos ou fragmentos de ligação ao antígeno podem ser adequadamente separados de, p.ex., meio de cultura, fluido de ascite, soro, lisado celular, material de reação de síntese ou similares por procedimentos convencionais de purificação de imunoglobulinas tais como, por exemplo, proteína A-Sepharose, cromatografia de hidroxilapatita, eletroforese em gel, diálise ou cromatografia de afinidade. Como usado aqui, um anticorpo isolado ou purificado está substancialmente isento de material celular ou outras proteínas da fonte de células ou tecidos da qual o anticorpo é derivado ou substancialmente isento de precursores químicos ou outros químicos quando quimicamente sintetizado ou dos componentes do sistema de expressão CF usado para produzir os anticorpos.
[00154] Os anticorpos descritos aqui incluem fragmentos de anticorpos que reconhecem antígenos CD47 específicos e podem ser gerados por qualquer técnica conhecida dos peritos na técnica. Por exemplo, os fragmentos Fab e
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F(ab')2 descritos aqui podem ser produzidos por divagem proteolítica de moléculas de imunoglobulina, usando enzimas tais como papaína (para produzir fragmentos Fab) ou pepsina (para produzir fragmentos F(ab')2). Um fragmento Fab corresponde a um dos dois braços idênticos de uma molécula de anticorpo e contém a cadeia leve completa emparelhada com os domínios VH e CHI da cadeia pesada. Um fragmento F(ab')2 contém os dois braços de ligação ao antígeno de uma molécula de anticorpo ligados por ligações de dissulfeto na região de charneira. Alternativamente, os fragmentos de anticorpos descritos aqui podem ser rotineiramente produzidos através de técnicas de expressão recombinante bem conhecidas. Ver, p.ex., publicação PCT No. WO 92/22324; Mullinax et aí, 1992, BioTechniques 12 (6): 864-869; Sawai et aí, 1995, AJRI 34: 26-34; e Better etal., 1988, Science 240: 1041-1043.
[00155] Os anticorpos descritos aqui podem, por exemplo, incluir anticorpos humanizados, p.ex., anticorpos desimunizados ou humanos compósitos. Um anticorpo humanizado pode compreender sequências de região constante humana. Em certas modalidades, um anticorpo humanizado pode ser selecionado de qualquer classe de imunoglobulinas, incluindo IgM, IgG, IgD, IgA e IgE, e qualquer isotipo, incluindo IgGi, lgG2, lgG3 e IgGzi. Em certas modalidades, um anticorpo humanizado pode compreender sequências constantes de cadeia leve kappa ou lambda.
[00156] Os anticorpos humanizados podem ser produzidos usando uma variedade de técnicas conhecidas na técnica, incluindo, mas não se limitando a, enxertia de CDR (Patente Européia No. EP 239,400; Publicação internacional No. WO 91/09967; e Patentes dos E.U.A. Nos. 5,225,539, 5,530,101 e 5,585,089), veneering ou resurfacing (Patentes Européias Nos. EP 592,106 e EP 519,596; Padlan, 1991, Molecular Immunology 28 (4/5): 489-498; Studnicka et aí, 1994, Protein Engineering 7 (6): 805-814; e Roguska et aí, 1994, PNAS 91: 969-973),
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87/104 embaralhamento de cadeias (Patente dos E.U.A No. 5,565,332) e técnicas divulgadas, p.ex., na Pat. dos E.U.A. No. 6,407,213, Pat. dos E.U.A. No. 5,766,886, WO 9317105, Tan et al., J. Immunol. 169: 1119 25 (2002), Caldas et al., Protein Eng. 13 (5): 353-60 (2000), Morea et al., Methods 20 (3): 267 79 (2000), Baca et al., J. Biol. Chem. 272 (16): 10678-84 (1997), Roguska et al., Protein Eng. 9 (10): 895 904 (1996), Couto et al., Cancer Res. 55 (23 Sup): 5973s-5977s (1995), Couto etal., Cancer Res. 55 (8): 1717-22 (1995), Sandhu JS, Gene 150 (2): 409-10 (1994) e Pedersen etal.,J. Mol. Biol. 235 (3): 959-73 (1994). Ver também Patente dos E.U.A. No. de Pub. US 2005/0042664 Al (24 de fev., 2005), cada um dos quais é incorporado por referência aqui na sua totalidade.
[00157] Os anticorpos descritos aqui podem, por exemplo, ser anticorpos multiespecíficos, p.ex., biespecíficos. Métodos para fabricação de anticorpos multiespecíficos (p.ex., biespecíficos) foram descritos, ver, por exemplo, Patentes dos E.U.A. Nos. 7951917, 7183076, 8227577, 5837242, 5989830, 5869620, 6132992 e 8586713.
[00158] Os anticorpos de domínio único, por exemplo, anticorpos não tendo as cadeias leves, podem ser produzidos por métodos bem conhecidos na técnica. Ver Riechmann etal., 1999, J. Immunol. 231: 25-38; Nuttall etal., 2000, Curr. Pharm. Biotechnol. 1 (3): 253-263; Muylderman, 2001, J. Biotechnol. 74 (4): 277302; Patente dos E.U.A. No. 6,005,079; e Publicações Internacionais Nos. WO 94/04678, WO 94/25591 e WO 01/44301.
[00159] Os anticorpos humanos podem ser produzidos usando qualquer método conhecido na técnica. Por exemplo, camundongos transgênicos bem conhecidos que são incapazes de expressar imunoglobulinas murinas endógenas funcionais, mas que podem expressar genes de imunoglobulinas humanas, podem ser usados. Alternativamente, por exemplo, técnicas de exibição em fagos, descritas acima, podem ser utilizadas. Além do mais, em algumas
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88/104 modalidades, os anticorpos humanos podem, por exemplo, ser produzidos usando hibridomas camundongo-humano. Por exemplo, linfócitos do sangue periférico humano transformados com vírus de Epstein-Barr (EBV) podem ser fundidos com células do mieloma de camundongo para produzir hibridomas camundongo-humano secretando anticorpos monoclonais humanos, e estes hibridomas camundongo-humano podem ser rastreados para se determinar quais secretam anticorpos monoclonais humanos que se ligam imunoespecificamente a um antígeno alvo (p.ex., ECD de CD47 humana). Tais métodos são conhecidos e são descritos na técnica, ver, p.ex., Shinmoto et a!., Cytotechnology, 2004, 46: 19-23; Naganawa etal., Human Antibodies, 2005, 14: 27-31.
[00160] Os domínios variáveis de anticorpos com as especificidades de ligação desejadas (locais de combinação anticorpo-antígeno) podem ser fundidos a sequências de domínio constante de imunoglobulinas. A fusão é preferencialmente com um domínio constante de cadeia pesada de imunoglobulina, compreendendo, pelo menos, parte das regiões de charneira, CH2 e CH3. É preferencial ter a primeira região constante de cadeia pesada (CHI) contendo o local necessário para ligação à cadeia leve presente em, pelo menos, uma das fusões. DNAs codificando as fusões de cadeia pesada de imunoglobulina e, se desejado, a cadeia leve de imunoglobulina, são inseridos em vetores de expressão separados e são cotransfectados em um organismo hospedeiro adequado. Para detalhes adicionais de geração de anticorpos biespecíficos ver, por exemplo, Suresh et a!., Methods in Enzymology, 121: 210 (1986).
[00161] De acordo com outra abordagem descrita em WO 96/27011, a interface entre um par de moléculas de anticorpos pode ser manipulada para maximizar a percentagem de heterodímeros que são recuperados a partir da cultura de células recombinantes. A interface preferencial compreende pelo
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89/104 menos uma parte da região CH3 de um domínio constante de anticorpo. Em este método, uma ou mais cadeias laterais de aminoácidos pequenas da interface da primeira molécula de anticorpo são substituídas por cadeias laterais maiores (p.ex., tirosina ou triptofano). Cavidades compensatórias de tamanho idêntico ou similar à(s) cadeia(s) lateral(ais) maior(es) são criadas na interface da segunda molécula de anticorpo por substituição de cadeias laterais de aminoácidos grandes por mais pequenas (p.ex., alanina ou treonina). Isto proporciona um mecanismo para aumento do rendimento do heterodímero em detrimento de outros produtos finais indesejados tais como homodímeros.
[00162] Os anticorpos biespecíficos podem ser preparados como anticorpos de comprimento total ou fragmentos de anticorpos (p.ex., anticorpos biespecíficos F(ab')2). Técnicas para geração de anticorpos biespecíficos a partir de fragmentos de anticorpos foram descritas na literatura. Por exemplo, os anticorpos biespecíficos podem ser preparados usando ligação química. Brennan et al., Science 229: 81 (1985) descrevem um procedimento em que anticorpos intatos são proteoliticamente clivados para gerar fragmentos F(ab')2. Estes fragmentos são reduzidos na presença do agente complexante de tiol arsenito de sódio para estabilizar ditióis da vizinhança e prevenir formação de dissulfeto intermolecular. Os fragmentos Fab' gerados são depois convertidos em derivados de tionitrobenzoato (TNB). Um dos derivados de Fab'-ΤΝΒ é reconvertido no Fab'-tiol por redução com mercaptoetilamina e é misturado com uma quantidade equimolar do outro derivado de Fab'-TNB para formar o anticorpo biespecífico. Os anticorpos biespecíficos produzidos podem ser usados como agentes para a imobilização seletiva de enzimas.
Composições Farmacêuticas e Estojos
[00163] São proporcionadas aqui composições, composições farmacêuticas e estojos compreendendo um ou mais terapêuticos de proteína descritos aqui.
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São também proporcionadas aqui composições, composições farmacêuticas e estojos compreendendo um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, sozinho ou em combinação com terapêuticos de proteína descritos aqui. Em particular são proporcionadas aqui composições, composições farmacêuticas e estojos compreendendo um ou mais anticorpos (p.ex., anticorpos anti-CD47), descritos aqui, ou fragmentos de ligação ao antígeno do mesmo ou seus conjugados. Em certos aspectos, as composições (p.ex., composições farmacêuticas) descritas aqui podem ser para uso in vitro, in vivo ou ex vivo. Exemplos não limitantes de usos incluem usos para reduzir a imunogenicidade, usos para modular (p.ex., inibir ou induzir/intensificar) a atividade de CD47 e usos para gerir ou tratar uma disfunção, por exemplo, câncer. Em modalidades específicas é proporcionada aqui uma composição farmacêutica compreendendo um anticorpo (p.ex., um anticorpo humanizado) descrito aqui (ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo) e um veículo ou excipiente farmaceuticamente aceitável.
[00164] Como usado aqui, o termo farmaceuticamente aceitável significa ser aprovado por uma agência reguladora do governo federal ou estadual ou listado na Farmacopeia dos E.U.A., Farmacopeia Européia ou outra Farmacopeia geralmente reconhecida para uso em animais e, mais particularmente, em humanos.
[00165] As formulações contendo um ou mais anticorpos proporcionados aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo podem ser preparadas para armazenamento por mistura do anticorpo tendo o grau de pureza desejado com veículos, excipientes ou estabilizantes fisiologicamente aceitáveis (Remington's Pharmaceutical Sciences (1990) Mack Publishing Co., Easton, PA; Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 21^ ed. (2006) Lippincott Williams & Wilkins, Baltimore, MD). Tais formulações podem, por exemplo, estar na forma de, p.ex., formulações liofilizadas ou soluções aquosas. Os veículos
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91/104 farmacêuticos adequados para administração dos anticorpos proporcionados aqui incluem quaisquer tais veículos conhecidos dos peritos na técnica como sendo adequados para o modo de administração particular. Os veículos, excipientes ou estabilizantes aceitáveis não são tóxicos para os receptores às dosagens e concentrações empregues e incluem tampões tais como fosfato, citrato e outros ácidos orgânicos; e/ou tensoativos não iônicos tais como TWEEN™, PLURONICS™ ou polietilenoglicol (PEG).
[00166] As formulações a serem usadas para administração in vivo podem ser estéreis. Isto pode ser prontamente alcançado, por exemplo, por filtração através, p.ex., membranas de esterilização por filtração.
[00167] Em aspectos específicos, as composições farmacêuticas para uso nos métodos proporcionados aqui contêm quantidades terapeuticamente eficazes de um ou mais das proteínas terapêuticas proporcionados aqui em um veículo farmaceuticamente aceitável. Em aspectos específicos, as composições farmacêuticas para uso nos métodos proporcionados aqui contêm quantidades terapeuticamente eficazes de um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, sozinho ou em combinação com um ou mais das proteínas terapêuticas proporcionados aqui, em um veículo farmaceuticamente aceitável. Em aspectos específicos, as composições farmacêuticas para uso nos métodos proporcionados aqui contêm quantidades terapeuticamente eficazes de um ou mais dos anticorpos ou fragmentos de ligação ao antígeno proporcionados aqui em um veículo farmaceuticamente aceitável. Tais composições farmacêuticas são úteis na prevenção, tratamento, gestão ou melhoria de uma condição ou disfunção descrita aqui ou um ou mais seus sintomas.
[00168] As composições para uso nos métodos proporcionados aqui podem conter um ou mais terapêuticos de proteína proporcionados aqui. As composições para uso nos métodos proporcionados aqui podem conter
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92/104 rituximab, sozinho ou em combinação com um ou mais terapêuticos de proteína proporcionados aqui. As composições para uso nos métodos proporcionados aqui podem conter um ou mais anticorpos proporcionados aqui ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo. Em uma modalidade são proporcionadas composições em que os anticorpos ou fragmentos de ligação ao antígeno descritos aqui são formulados em preparações farmacêuticas adequadas, tais como soluções, suspensões, pós, formulações de liberação sustentada ou elixires em soluções ou suspensões estéreis para administração parenteral ou como preparação de adesivos transdérmicos e inaladores de pó seco.
[00169] Em uma modalidade, as composições para uso nos métodos proporcionados aqui são formuladas para administração de dosagem única. Para formular uma composição, a fração em peso do composto é dissolvida, suspensa, dispersa ou de outra forma misturada em um veículo selecionado a uma concentração eficaz tal que a condição tratada seja aliviada, prevenida ou um ou mais sintomas sejam melhorados.
[00170] Em certos aspectos, um anticorpo anti-CD20, p.ex., rituximab, é incluído no veículo farmaceuticamente aceitável em uma quantidade eficaz suficiente para exercer um efeito terapeuticamente útil na ausência de efeitos secundários indesejáveis, ou com efeitos secundários indesejáveis mínimos ou negligenciáveis, no paciente tratado.
[00171] Em certos aspectos, terapêuticos de proteína para uso nos métodos proporcionados aqui são incluídos no veículo farmaceuticamente aceitável em uma quantidade eficaz suficiente para exercer um efeito terapeuticamente útil na ausência de efeitos secundários indesejáveis, ou com efeitos secundários indesejáveis mínimos ou negligenciáveis, no paciente tratado.
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[00172] Em certos aspectos, anticorpos para uso nos métodos proporcionados aqui são incluídos no veículo farmaceuticamente aceitável em uma quantidade eficaz suficiente para exercer um efeito terapeuticamente útil na ausência de efeitos secundários indesejáveis, ou com efeitos secundários indesejáveis mínimos ou negligenciáveis, no paciente tratado.
[00173] As concentrações de uma proteína terapêutica, por exemplo, um anticorpo anti-CD47, em uma composição farmacêutica para uso nos métodos proporcionados aqui dependerão, p.ex., das características físico-químicas do anticorpo, do programa de dosagem e da quantidade administrada bem como outros fatores.
[00174] As composições farmacêuticas para uso nos métodos descritos aqui são proporcionadas para administração a humanos ou animais (p.ex., mamíferos) em formas de dosagem unitárias, tais como soluções ou suspensões parenterais (p.ex., intravenosas) estéreis contendo quantidades adequadas dos compostos ou seus derivados farmaceuticamente aceitáveis. As composições farmacêuticas são também proporcionadas para administração a humanos e animais em forma de dosagem unitária, tal como comprimidos, cápsulas, pílulas, pós, grânulos e soluções ou suspensões orais ou nasais e emulsões óleo-água contendo quantidades adequadas de uma proteína terapêutica ou seus derivados farmaceuticamente aceitáveis. A proteína terapêutica é, em uma modalidade, formulada e administrada em formas de dosagem unitária ou formas de dosagem múltipla. Formas de dose unitária como usado aqui se referem a unidades fisicamente discretas adequadas para indivíduos humanos ou animais (p.ex., mamífero) e empacotadas individualmente. Cada dose unitária contém uma quantidade predeterminada de uma proteína terapêutica suficiente para produzir o efeito terapêutico desejado, em associação ao veículo, veículo ou diluente farmacêutico requerido. Exemplos de formas de dose
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94/104 unitária incluem ampolas e seringas e comprimidos ou cápsulas individualmente empacotadas. As formas de dose unitária podem ser administradas em frações ou seus múltiplos. Uma forma de dose múltipla é uma pluralidade de formas de dose unitária idênticas empacotadas em um recipiente único a ser administrada em forma de dose unitária segregada. Exemplos de formas de dose múltipla incluem frascos, garrafas de comprimidos ou cápsulas ou garrafas. Consequentemente, em aspectos específicos, a forma de dose múltipla é um múltiplo de doses unitárias que não são segregadas no empacotamento.
[00175] Em certas modalidades, um ou mais terapêuticos de proteína para uso nos métodos descritos aqui estão em uma formulação farmacêutica líquida. As composições farmaceuticamente administráveis líquidas podem, por exemplo, ser preparadas por dissolução, dispersão ou de outro modo mistura de um anticorpo e adjuvantes farmacêuticos opcionais em um veículo, tal como, por exemplo, água, solução salina, dextrose aquosa, glicerol, glicóis e similares, para formar deste modo uma solução ou suspensão. Em certas modalidades, uma composição farmacêutica proporcionada aqui a ser administrada pode também conter quantidades mínimas de substâncias auxiliares não tóxicas tais como agentes molhantes, agentes emulsificantes, agentes solubilizantes e agentes tamponantes de pH e similares.
[00176] Métodos de preparação de tais formas de dosagem são conhecidos dos, ou serão aparentes aos, peritos em esta técnica; por exemplo, ver, p.ex., Remington's Pharmaceutical Sciences (1990) Mack Publishing Co., Easton, PA; Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 21^ ed. (2006) Lippincott Williams & Wilkins, Baltimore, MD.
[00177] A administração parenteral, em uma modalidade, é caracterizada por injeção, subcutaneamente, intramuscularmente ou intravenosamente, é também contemplada aqui. Os injetáveis podem ser preparados em formas
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95/104 convencionais, como soluções ou suspensões líquidas, formas sólidas adequadas para solução ou suspensão em líquido antes da injeção ou como emulsões. Os injetáveis, soluções e emulsões contêm também um ou mais excipientes. Excipientes adequados são, por exemplo, água, solução salina, dextrose, glicerol ou etanol. Outras vias de administração podem incluir administração enteral, administração intracerebral, administração nasal, administração intra-arterial, administração intracardíaca, infusão intraóssea, administração intratecal e administração intraperitoneal.
[00178] As preparações para administração parenteral incluem soluções estéreis prontas para injeção, produtos solúveis secos estéreis, tais como pós liofilizados, prontos para serem combinados com um solvente imediatamente antes do uso, incluindo comprimidos hipodérmicos, suspensões estéreis prontas para injeção, produtos insolúveis secos estéreis prontos para serem combinados com um veículo imediatamente antes do uso e emulsões estéreis. As soluções podem ser aquosas ou não aquosas.
[00179] Se administrados intravenosamente, veículos adequados incluem solução salina fisiológica ou solução salina tamponada com fosfato (PBS) e soluções contendo agentes espessantes e solubilizantes, tais como glucose, polietilenoglicol e polipropilenoglicol e suas misturas.
[00180] Os veículos farmaceuticamente aceitáveis usados em preparações parenterais incluem veículos aquosos, veículos não aquosos, agentes antimicrobianos, agentes isotônicos, tampões, antioxidantes, anestésicos locais, agentes de suspensão e dispersão, agentes emulsificantes, agentes sequestrantes ou quelantes e outras substâncias farmaceuticamente aceitáveis.
[00181] Os veículos farmacêuticos também incluem álcool de etila, polietilenoglicol e propilenoglicol para veículos miscíveis em água; e hidróxido de sódio, ácido clorídrico, ácido cítrico ou ácido láctico para ajuste do pH.
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[00182] Em certas modalidades, a infusão intravenosa ou intra-arterial de uma solução aquosa estéril contendo uma proteína terapêutica para uso nos métodos descritos aqui é um modo de administração eficaz. Outra modalidade é uma solução ou suspensão aquosa ou oleosa estéril contendo uma proteína terapêutica para uso nos métodos descritos aqui injetada como necessário para produzir o efeito farmacológico desejado.
[00183] Em modalidades específicas, uma proteína terapêutica para uso nos métodos descritos aqui pode estar suspensa em forma micronizada ou outra adequada. A forma da mistura resultante depende de um número de fatores, incluindo o modo de administração pretendido e a solubilidade do composto no veículo ou veículo selecionado.
[00184] Em outras modalidades, as formulações farmacêuticas são pós liofilizados, que podem ser reconstituídos para administração como soluções, emulsões e outras misturas. Podem ser também reconstituídas e formuladas como sólidos ou géis.
[00185] O pó liofilizado pode, por exemplo, ser preparado por dissolução de uma proteína terapêutica para uso nos métodos proporcionados aqui, em um solvente adequado. Em algumas modalidades, o pó liofilizado é estéril. Os solventes adequados podem conter um excipiente que melhora a estabilidade ou outro componente farmacológico do pó ou solução reconstituída, preparado a partir do pó. Excipientes que podem ser usados incluem, mas não estão limitados a, dextrose, sorbitol, frutose, xarope de milho, xilitol, glicerina, glucose, sacarose ou outro agente adequado. Um solvente adequado pode também conter um tampão, tal como citrato, fosfato de sódio ou potássio ou outro tal tampão conhecido dos peritos na técnica, em uma modalidade, a cerca de pH neutro. A esterilização por filtração subsequente da solução seguida por liofilização sob condições padrão conhecidas dos peritos na técnica proporciona
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97/104 um exemplo de uma formulação. Em uma modalidade, a solução resultante será repartida em frascos para liofilização. O pó liofilizado pode ser armazenado sob condições apropriadas, tal como a de cerca de 4 2C até à temperatura ambiente.
[00186] A reconstituição deste pó liofilizado com água para injeção proporciona uma formulação para uso em administração parenteral. Para reconstituição, o pó liofilizado é adicionado a água estéril ou outro veículo adequado.
[00187] Em certos aspectos, uma proteína terapêutica para uso nos métodos proporcionados aqui pode ser formulada para administração local ou aplicação tópica, tal como para aplicação tópica na pele e membranas mucosas, tal como no olho, na forma de géis, cremes, e loções e para aplicação no olho ou para aplicação intracisternal ou intraespinhal. A administração tópica é contemplada para administração transdérmica e também para administração aos olhos ou mucosa ou para terapias de inalação. Soluções nasais do composto ativo sozinho ou em combinação com outros excipientes farmaceuticamente aceitáveis podem ser também administradas.
[00188] Os anticorpos anti-CD47, anticorpos anti-CD20, p.ex., rituximab, e outras proteínas terapêuticas para uso nos métodos proporcionados aqui podem ser também formulados para serem visados a um tecido, órgão ou outra área específica do corpo do indivíduo a ser tratado. Muitos tais métodos de direcionamento são bem conhecidos dos peritos na técnica. Todos tais métodos de direcionamento são contemplados aqui para uso nas presentes composições. Para exemplos não limitantes de métodos de direcionamento ver, p.ex., Patentes dos E.U.A. Nos. 6,316,652, 6,274,552, 6,271,359, 6,253,872, 6,139,865, 6,131,570, 6,120,751, 6,071,495, 6,060,082, 6,048,736, 6,039,975, 6,004,534, 5,985,307, 5,972,366, 5,900,252, 5,840,674, 5,759,542 e 5,709,874. Em algumas modalidades, os anticorpos anti-CD47 descritos aqui são visados (ou de outra
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98/104 forma administrados) aos órgãos visuais, medula óssea, trato gastrointestinal, pulmões, cérebro ou articulações. Em modalidades específicas, um anticorpo anti-CD47 descrito aqui é capaz de atravessar a barreira hematoencefálica.
EXEMPLOS
[00189] Os exemplos em esta seção (/.e., Seção 5) são oferecidos a título de ilustração e não a título de limitação.
Exemplo 1: Codosagem de Rituximab e um Anticorpo Anti-CD47 em Macacos-Cinomólgos
[00190] O objetivo do estudo foi monitorizar quanto à imunogenicidade a um anticorpo anti-CD47 humanizado compreendendo as CDRs de região variável de cadeia pesada de SEQ ID Nos: 50, 72 e 52 e as CDRs de região variável de cadeia leve de SEQ ID NOs.: 53, 71 e 55 (doravante, o Anticorpo Anti-CD47) quando codoseado com rituximab ou rituximab e metotrexato e avaliar seu impacto na farmacocinética após administração intravenosa em macacoscinomólgos.
[00191] Na Parte Um deste estudo, o Anticorpo Anti-CD47 foi administrado como quatro injeções intravenosas (IV) a 3 grupos de macacos-cinomólgos (5 animais/grupo, 15 animais totais) nos Dias de Estudo 1, 8, 15 e 22 ao Grupo 1 e Dias de Estudo 15, 22, 29 e 36 aos Grupos 2 e 3, a doses de 20 mg/kg (Doses 1 até 4). O rituximab foi administrado como quatro injeções intravenosas aos animais dos Grupos 2 e 3, nos Dias de Estudo 1, 8, 15 e 22 a doses de 10 mg/kg. O metotrexato foi administrado como três injeções subcutâneas aos animais do Grupo 3, nos Dias de Estudo 15, 16 e 18 a doses de 0,4 mg/kg.
[00192] Na parte dois deste estudo, o Anticorpo Anti-CD47 foi administrado como uma injeção intravenosa única aos animais do Grupo 1 e Grupo 3 no Dia do Estudo 78 a uma dose de 20 mg/kg (Dose 5). O metotrexato foi administrado como múltiplas injeções subcutâneas aos animais do Grupo 3,
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99/104 nos Dias de Estudo 71, 72, 74, 78, 79, 81, 88, 95, 102 e 109 a uma dose de 0,4 mg/kg.
[00193] Os dados de concentração após a primeira, quarta e quinta doses do Anticorpo Anti-CD47 em macacos-cinomólgos foram usados para avaliações farmacocinéticas (PK), para entender o efeito de fármacos codoseados na PK do Anticorpo Anti-CD47. A imunogenicidade do Anticorpo Anti-CD47 foi avaliada por teste quanto aos títulos de anticorpos antifármaco (ADA) no soro (com o fármaco sendo o Anticorpo Anti-CD47), semanalmente ao longo do estudo. As contagens de células B foram seguidas semanalmente, ao longo do decurso do estudo.
[00194] Todos os animais doseados com o Anticorpo Anti-CD47 sozinho (Grupo 1) devolveram ADA positivos antes da Dose 4. A curva de concentraçãotempo na área sob a curva do Anticorpo Anti-CD47 do tempo zero às 168 h (AUCo-168) pós-Dose 4, uma medida da concentração no soro do Anticorpo AntiCD47, para os cinco animais do Grupo 1 foi 3-37% da AUCo-168 pós-Dose 1.
[00195] Esta diminuição na AUC pós-seroconversão foi atribuída à diminuição mediada por ADA na exposição a Anticorpo Anti-CD47 livre. Os números de células B CD20+ em estes animais estavam dentro da gama normal. Os números de células B CD20+ periféricas para todos os animais que receberam rituximab (Grupos 2 e 3) diminuíram rapidamente e foram < 100 células/pL no espaço de 24 horas da recepção da primeira dose de rituximab. Os números de células B começou a recuperar em torno do Dia 15 pós-primeira dose de rituximab em 8 de 10 animais nos Grupos 2 e 3. Esta recuperação de células B é atribuível a anticorpos antirrituximab, pois todos os animais tinham anticorpos antirrituximab detectáveis pelo Dia 15, com diminuições correspondentes nas concentrações no soro de rituximab. Os 8 animais que mostraram recuperação nos números de células B ficaram positivos quanto à presença de anticorpos
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100/104 antifármaco (ADA) pelo Dia 36, com títulos variáveis entre 5 e 625 e níveis variáveis de diminuições na exposição em todos os 8 animais variando de 2-53% da AUCo -168 pós-Dose 1.
[00196] Nos animais 11 e 15, onde foram mantidas concentrações significativas de rituximab, as contagens de células B CD20+ B periféricas permaneceram negligenciáveis até ao Dia 36, quando a quarta dose do Anticorpo Anti-CD47 foi administrada a estes animais. Estes dois animais, que receberam todas as 4 doses do Anticorpo Anti-CD47 no contexto do esgotamento eficaz de células B, permaneceram negativos quanto a ADA durante período prolongado, até o Dia 71 e ao final do estudo, respectivamente. As concentrações de anticorpo anti-CD47 pós-dose 4 foram similares às concentrações observadas pós-dose 1, com a AUC0-168 da Semana 4 sendo 115% e 83% das AUCs médias da semana 1 nos animais 11 e 15, respectivamente.
[00197] Os macacos tratados somente com o Anticorpo Anti-CD47 (Grupo 1) ou a combinação dos três agentes (Grupo 3) foram subsequentemente redesafiados com o Anticorpo Anti-CD47 às 12 semanas (Dia 78). Nos dois animais 11 e 15, onde o desenvolvimento de ADA foi mitigado com esgotamento eficaz de células B, os perfis PK à semana 12 foram comparáveis com perfis PK pós-Dose 1 do Anticorpo Anti-CD47, e a AUC0-168 à semana 12 foi 127% e 120% da AUCo -168 média pós-primeira dose, confirmando assim que não existiu perda mediada por ADA na exposição em estes animais. Adicionalmente, os níveis de anticorpos antifármaco no soro foram sustentados a baixos níveis em estes dois animais, com fármaco detectável estando presente durante três semanas pósúltima dose.
[00198] As concentrações de Anticorpo Anti-CD47 nos animais positivos quanto a ADA estavam abaixo do limite de quantificação para além dos 4 dias pós-última dose. Estes dados indicam que o esgotamento de células B com
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101/104 rituximab reduz a resposta imunitária ao Anticorpo Anti-CD47 e aumenta a exposição ao fármaco ao longo de períodos de tempo sustentados. Adicionalmente, não foi observada toxicidade nos macacos tratados com o Anticorpo Anti-CD47 mais rituximab ou o Anticorpo Anti-CD47 mais rituximab mais metotrexato.
Exemplo 2: Estudo Clínico de um Anticorpo Anti-CD47 em Combinação com Rituximab
[00199] É descrito aqui um estudo de escalonamento e expansão da dose de Fase 1, aberto do Anticorpo Anti-CD47 administrado por infusão intravenosa (IV), em indivíduos com cânceres sólidos e hematológicos refratários, avançados. O estudo é compreendido por 2 partes. A Parte A é uma fase de escalonamento da dose que utiliza doses crescentes do Anticorpo Anti-CD47, e a Parte B é uma fase de escalonamento e expansão da dose na qual o Anticorpo Anti-CD47 em combinação com rituximab é administrado em indivíduos com linfoma nãoHodgkin (NHL) positivo quanto a CD20. A expansão pode ocorrer à dose máxima tolerada (MTD) estabelecida na fase de escalonamento da dose e/ou a uma dose mais baixa, ou um programa de dosagem tolerável alternativo, com base na revisão dos dados de segurança, PK e farmacodinâmica da Parte A. Um desenho de escalonamento da dose 3 + 3 modificado é usado para identificar a toxicidade inicial do Anticorpo Anti-CD47. As coortes de 3 a 6 indivíduos avaliáveis são tratadas com o Anticorpo Anti-CD47 em programas de dosagem definidos e, no caso de toxicidade limitante da dose (DLT) em um indivíduo, as coortes são expandidas para a coorte total de 6 indivíduos avaliáveis. Em uma dada coorte de doses, os indivíduos número 4 a 6 podem ser inscritos antes de os 3 primeiros indivíduos completaram o Ciclo 1 para se obter informação adicional de segurança e para assegurar número suficiente de pacientes avaliáveis para avaliação da DLT. Não mais do que um indivíduo por dia é atribuído em uma dada
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102/104 coorte de escalonamento da dose.
[00200] As doses incluem 0,3 mg/kg IV uma vez semanalmente (QW) e 1, 2, 4, 8, 15 e 20 mg/kg IV uma vez a cada 2 semanas (Q2W). Durante o escalonamento da dose, a decisão de se avaliar uma coorte de dose mais baixa, coortes de doses intermediárias, um intervalo de dosagem alternado ou declarar uma MTD é determinada, com base na revisão dos dados de segurança clínica e laboratorial para coortes de doses prévias. Todos os tratamentos são administrados em ciclos de 28 dias, com o Anticorpo Anti-CD47 administrado no Dl e D15. Após a primeira dose ser administrada em qualquer coorte, os indivíduos são observados durante pelo menos 28 dias (Ciclo 1, janela de DLT) antes de a próxima coorte de dose especificada pelo protocolo, mais elevada puder começar.
[00201] A dose de partida para a Coorte 1 é 0,3 mg/kg no Dia 1 do Ciclo 1 seguida por 1 mg/kg QW subsequentemente.
[00202] Para a Parte B, em indivíduos com linfoma não-Hodgkin positiva quanto a CD20 recidivante ou refratário que receberam rituximab prévio, a dosagem de rituximab a 375 mg/m2 uma vez por semana começa duas semanas antes da administração do Anticorpo Anti-CD47. A dosagem de rituximab é em quatro doses semanais antes do e durante o Ciclo 1 (D-15, D-8, D-l, D8), uma vez a cada ciclo para os Ciclos 2-6 (no D8) e, se respondedora, a cada dois meses subsequentemente durante até 12 ciclos (Ciclos 8, 10 e 12). As contagens de células B em série e PK são avaliadas. Adicionalmente, as avaliações de PK, PD e ADA são realizadas como o são para a parte A.
Critérios de Inclusão:
[00203] 1. Homens e mulheres, 18 anos de idade ou mais velhos, com tumores sólidos recidivantes ou refratários, avançados, Mieloma Múltiplo (MM) ou linfoma não-Hodgkin (NHL) na Parte A.
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[00204] Na Parte B, somente indivíduos com NHL positivo quanto a CD20 recidivante ou refratário.
[00205] 2. Pelo menos um local de doença mensurável em indivíduos com tumores sólidos e NHL.
[00206] 3. Estado de Desempenho do Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG PS) de 0 ou 1.
[00207] 4. Os indivíduos têm de ter função hematopoiética, do fígado, renal e de coagulação adequada como avaliado por critérios laboratoriais específicos.
[00208] 5. As mulheres e os homens têm de concordar com métodos contraceptivos e evitar a concepção ao longo do estudo e durante até 8 semanas após a última dose do Anticorpo Anti-CD47. Se participando na Parte B, as mulheres em idade fértil devem continuar a usar métodos contraceptivos eficazes durante 12 meses após o tratamento com rituximab
Critérios de Exclusão:
[00209] 1. Linfomas de grau elevado (Burkitt ou linfoblástico), leucemia de células plasmáticas.
[00210] 2. Tumores sólidos de rápida proliferação, de grau elevado (p.ex., câncer do pulmão de células pequenas, tumores das células germinativas, neuroblastoma) com carga tumoral extensiva.
[00211] 3. Envolvimento de sistema nervoso central sintomático.
[00212] 4. Função cardíaca deficiente ou doença cardíaca clinicamente significativa.
[00213] 5. Transfusão Prévia de glóbulos vermelhos (RBC) < 3 meses antes do início do Anticorpo Anti-CD47.
[00214] 6. Transplante autólogo prévio de células-tronco < 3 meses antes do início do Anticorpo Anti-CD47.
[00215] 7. Transplante alogeneico prévio de células-tronco com
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104/104 condicionamento da intensidade padrão ou reduzido < 6 meses antes do início do Anticorpo Anti-CD47.
[00216] 8. Tratamentos sistêmicos dirigidos ao câncer prévios ou modalidades investigativas < 5 meias-vidas ou 4 semanas antes do início do Anticorpo Anti-CD47, o que for mais curto.
[00217] 9. Grande cirurgia < 2 semanas antes do início do Anticorpo AntiCD47.
[00218] 10. Mulheres grávidas ou amamentando.
[00219] 11. Infeção de HIV conhecida.
[00220] 12. Infeção crônica de hepatite B e C (HBV/HCV) conhecida.
[00221] 13. Tratamento continuado com dosagem terapêutica, crônica de anticoagulantes.
[00222] 14. Historiai de anemia hemolítica autoimune ou trombocitopenia autoimune.
[00223] 15. Historiai de segundos cânceres simultâneos requerendo tratamento sistêmico continuado, ativo.
[00224] Todas as referências (p.ex., publicações ou patentes ou pedidos de patentes) citadas aqui são incorporadas aqui por referência na sua totalidade e para todos os propósitos na mesma extensão como se cada referência individual (p.ex., publicação ou pedido de patente ou patente) fosse especificamente e individualmente indicada como estando incorporada por referência na sua totalidade para todos os propósitos.
[00225] Outras modalidades estão dentro das seguintes reivindicações.

Claims (50)

1. Um método de redução da imunogenicidade em um indivíduo, compreendendo administração a um indivíduo de rituximab em combinação com uma proteína terapêutica, em que a imunogenicidade é reduzida em comparação com a imunogenicidade no indivíduo quando se administra a proteína terapêutica sozinha.
2. 0 método da reivindicação 1, em que a proteína terapêutica é um anticorpo terapêutico.
3. 0 método reivindicação 1, em que a proteína terapêutica é uma citocina.
4. 0 método, da reivindicação 1, em que a proteína terapêutica é uma interleucina.
5. 0 método da reivindicação 1, em que a proteína terapêutica não é uma enzima.
6. 0 método da reivindicação 2, em que o anticorpo terapêutico é um anticorpo que se liga à CD47 ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo.
7. 0 método da reivindicação 6, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou seu fragmento de ligação ao antígeno compreende uma região determinante de complementaridade (CDR) 1 de cadeia pesada variável (VH) compreendendo SEQ ID NO: 50, uma CDR2 de VH compreendendo SEQ ID NO: 72, uma sequência de CDR3 de VH compreendendo SEQ ID NO: 52, uma CDR1 de cadeia leve variável (VL) compreendendo SEQ ID NO: 53, uma CDR2 de VL compreendendo SEQ ID NO: 71 e uma CDR3 de VL compreendendo SEQ ID NO: 55.
8. O método da reivindicação 6, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação do mesmo ao antígeno compreende uma VH compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 5-30.
9. O método da reivindicação 6, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou
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2/6 fragmento de ligação do mesmo ao antígeno compreende uma VL compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 31-47.
10. O método da reivindicação 6, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação do mesmo ao antígeno compreende uma VH compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 5-30 e uma VL compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 31-47.
11. O método da reivindicação 6, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação do mesmo ao antígeno compreende uma CDR1 de VH compreendendo SEQ ID NO: 50, uma CDR2 de VH compreendendo SEQ ID NO: 51, uma CDR3 de VH compreendendo SEQ ID NO: 52, uma CDR1 de VL compreendendo SEQ ID NO: 53, uma CDR2 de VL compreendendo SEQ ID NO: 54 e uma CDR3 de VL compreendendo SEQ ID NO: 55.
12. O método da reivindicação 6, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação do mesmo ao antígeno é um isotipo de IgG selecionado do grupo consistindo em isotipo IgG 1, isotipo lgG2, isotipo lgG3 e isotipo lgG4.
13. O método da reivindicação 6, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação do mesmo ao antígeno é um isotipo de IgG selecionado de lgG4P e lgG4PE.
14. O método da reivindicação 6, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação do mesmo ao antígeno é um componente de uma composição farmacêutica compreendendo o anticorpo que se liga à CD47 ou um fragmento de ligação ao antígeno do mesmo e um veículo farmaceuticamente aceitável.
15. O método de qualquer uma das reivindicações 6, a 14, em que o anticorpo é quimérico, humanizado ou totalmente humano.
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16. 0 método de qualquer uma das reivindicações 1 a 15, em que o indivíduo é um humano.
17. O método, de qualquer uma das reivindicações 1 a 15, compreendendo adicionalmente administração de quimioterapia.
18. O método da reivindicação 17, em que a referida quimioterapia é radioterapia.
19. O método de qualquer uma das reivindicações 7 a 17, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação do mesmo ao antígeno é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3, 1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg.
20. O método de qualquer uma das reivindicações 1 a 19, em que o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450 ou 500 mg/m2.
21. O método de qualquer uma das reivindicações 7 a 20, em que o rituximab é administrado antes do anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação do mesmo ao antígeno.
22. O método de qualquer uma das reivindicações 1 a 21, em que o método não compreende administração de um inibidor do proteossomo ao indivíduo.
23. O método da reivindicação 22, em que o método não compreende administração de bortezomibe ao indivíduo.
24. O método de qualquer uma das reivindicações 1 a 23, em que o método não compreende administração de metotrexato ao indivíduo.
25. Um método de tratamento de câncer, o método compreendendo administração a um indivíduo com sua necessidade de uma quantidade terapeuticamente eficaz de um anticorpo que se liga à CD47 ou um fragmento de ligação do mesmo ao antígeno, em que o método compreende adicionalmente administração de rituximab ao indivíduo.
26. O método da reivindicação 25, em que o rituximab é administrado antes
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A/Ç>
do anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação do mesmo ao antígeno.
27. O método da reivindicação 25 ou 26, compreendendo adicionalmente administração de radiação ou quimioterapia.
28. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 27, compreendendo adicionalmente administração de outro agente anticanceroso.
29. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 28, em que o câncer é um câncer hematológico.
30. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 28, em que o câncer é um câncer sólido.
31. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 28, em que o câncer é mieloma múltiplo, linfoma não-Hodgkin, leucemia mieloide aguda (AML), câncer da mama, câncer da bexiga, câncer/carcinoma do pulmão de células não pequenas, carcinoma hepatocelular (HCC), sarcoma, ou câncer da cabeça e pescoço.
32. O método da reivindicação 31, em que o câncer é linfoma não-Hodgkin.
33. O método da reivindicação 32, em que o linfoma não-Hodgkin é positivo quanto a CD20.
34. O método da reivindicação 31 ou 32, em que o linfoma não-Hodgkin é recidivante ou refratário.
35. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 34, em que o indivíduo foi previamente tratado com rituximab.
36. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 35, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação do mesmo ao antígeno é administrado ao indivíduo a uma dose de 0,3, 1, 2, 4, 8, 15, ou 20 mg/kg.
37. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 36, em que o rituximab é administrado ao indivíduo a uma dose de 300, 325, 350, 375, 400, 425, 450 ou 500 mg/m2.
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38. 0 método, de qualquer uma das reivindicações 25 a 37, em que o método não compreende administração de um inibidor do proteossomo ao indivíduo.
39. O método da reivindicação 38, em que o método não compreende administração de bortezomibe ao indivíduo.
40. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 39, em que o método não compreende administração de metotrexato ao indivíduo.
41. Método, de acordo com qualquer uma das reivindicações 25 a 40, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação do mesmo ao antígeno compreende uma CDR1 de VH compreendendo SEQ ID NO: 50, uma CDR2 de VH compreendendo SEQ ID NO: 72, uma sequência de CDR3 de VH compreendendo SEQ ID NO: 52, uma CDR1 de cadeia leve variável (VL) compreendendo SEQ ID NO: 53, uma CDR2 de VL compreendendo SEQ ID NO: 71 e uma CDR3 de VL compreendendo SEQ ID NO: 55.
42. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 40, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação do mesmo ao antígeno compreende uma VH compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 5-30.
43. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 40, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação do mesmo ao antígeno compreende uma VL compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 31-47.
44. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 40, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou seu fragmento de ligação ao antígeno compreende uma VH compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 5-30 e uma VL compreendendo uma sequência selecionada do grupo consistindo em SEQ ID NOs: 31-47.
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45. 0 método de qualquer uma das reivindicações 25 a 40, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou seu fragmento de ligação ao antígeno compreende uma CDR1 de VH compreendendo SEQ ID NO: 50, uma CDR2 de VH compreendendo SEQ ID NO: 51, uma CDR3 de VH compreendendo SEQ ID NO: 52, uma CDR1 de VL compreendendo SEQ ID NO: 53, uma CDR2 de VL compreendendo SEQ ID NO: 54 e uma CDR3 de VL compreendendo SEQ ID NO: 55.
46. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 45, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou fragmento de ligação do mesmo ao antígeno é um isotipo de IgG selecionado do grupo consistindo em isotipo IgGl, isotipo lgG2, isotipo lgG3 e isotipo lgG4.
47. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 45, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou seu fragmento de ligação ao antígeno é um isotipo de IgG selecionado de lgG4P e lgG4PE.
48. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 47, em que o anticorpo que se liga à CD47 ou seu fragmento de ligação ao antígeno é um componente de uma composição farmacêutica compreendendo o anticorpo que se liga à CD47 ou um seu fragmento de ligação ao antígeno e um veículo farmaceuticamente aceitável.
49. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 48, em que o anticorpo é quimérico, humanizado ou totalmente humano.
50. O método de qualquer uma das reivindicações 25 a 49, em que o indivíduo é um humano.
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