Introduction: Ancient DNA (aDNA)studies can support hypotheses regarding ancient populations; molecular studies can analyze the local population’s genetic composition, minimizing biases introduced by later migrations, demographic... more
Introduction: Ancient DNA (aDNA)studies can support hypotheses regarding ancient populations; molecular studies can analyze the local population’s genetic composition, minimizing biases introduced by later migrations, demographic expansions, mutations, and bottleneck effects. These analyses must be performed with special care because of the low DNA concentrations and contamination risk; therefore, it is necessary to establish protocols to guarantee the reproducibility and veracity of results. Objective: The present study aims to establish a protocol to obtain ancient DNA from 16 pre-Columbian bone samples found in an excavation performed in the area «Candelaria La Nueva» in Bogota, Colombia, dated in the period «Muisca Tardio». Methods: Four founder mitochondrial DNA Amerindian haplotypes were analyzed by high resolution restriction enzyme analyses, obtaining fragments between 121 and 186 base pairs (bp). Different analyses were performed following a strict control of authenticity c...
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La recolección y conservación de muestras biológicas con fines investigativos es una actividad ligada desde tiempo atrás con la historia y evolución de la ciencia y la medicina; hoy en día, la disponibilidad de bancos de conservación de... more
La recolección y conservación de muestras biológicas con fines investigativos es una actividad ligada desde tiempo atrás con la historia y evolución de la ciencia y la medicina; hoy en día, la disponibilidad de bancos de conservación de muestras adecuadamente validadas, está asociada con el desarrollo presente y futuro de la investigación científica. En general se entiende que un banco de conservación de muestras es un espacio físico que permite mantener en condiciones ideales una serie de muestras biológicas de manera organizada, observando los más altos estándares de calidad, apegados a la normatividad ética y legal establecida para estos casos y cuyo fin es la investigación biomédica tendiente a generar nuevo conocimiento, así como a diversas aplicaciones diagnósticas y terapéuticas. Los bancos de conservación de muestras constan, más allá de su infraestructura física, de una base de datos que permite conocer en tiempo real y al detalle el estado y condición de cada muestra, adem...
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Introduction: Abnormal levels of the enzyme methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) are associated with an increased risk of both cardiovascular and cerebrovascular disease and higher concentrations of homocysteine. Abnormal levels... more
Introduction: Abnormal levels of the enzyme methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) are associated with an increased risk of both cardiovascular and cerebrovascular disease and higher concentrations of homocysteine. Abnormal levels are also related to birth defects, pregnancy complications, cancer and toxicity to methotrexate (MTX). Polymorphisms of MTHFR affect the activity of the enzyme. Genetic associations have been related to treatment efficacy. Objective: To establish the frequency of the C> T polymorphism at nucleotide 677 of the MTHFR gene in a group of Colombian individuals. Methods: Data from pharmacogenetic microarrays that include MTX sensibility-associated polymorphisms were retrospectively collected (Pathway Genomics®). The frequency of the C> T MTHFR rs1801133 marker polymorphism was analyzed. Results: Microarray data from 68 men and 84 women were analyzed. Comparisons of genotype C/C vs. C/T and T/T were statistically significantly different (p= 0.00, p= 0....
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Objetivo. Este trabajo tiene como objetivo describir la frecuencia de alelos y de haplotipos de antígenos HLA de clases I y II en población mestiza colombiana.Metodología. Se estudiaron 197 individuos colombianos no emparentados y 157... more
Objetivo. Este trabajo tiene como objetivo describir la frecuencia de alelos y de haplotipos de antígenos HLA de clases I y II en población mestiza colombiana.Metodología. Se estudiaron 197 individuos colombianos no emparentados y 157 individuos emparentados que conformaban 53 familias, provenientes de diferentes regiones del país, remitidos para estudios de HLA de clases I y II por el método PCR-SSP a los laboratorios de inmunología del Hospital Militar Central de Bogotá y al Instituto de Referencia Andino.Resultados. El haplotipo HLA-A*24 B*35 DR*04 fue el más frecuente en la población estudiada, lo cual concuerda con otros estudios de mestizos colombianos.Conclusiones. El desequilibrio de Hardy-Weinberg hallado en la población analizada en el presente estudio, debe alertar sobre una eventual reducción en el repertorio de respuesta inmunitaria en los colombianos, lo cual podría ser el origen de una consecuente fragilidad de la población frente a nuevas infecciones que podrían conv...
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Objetivo. La resistencia a los medicamentos antirretrovirales se ha asociado con mutaciones características en los genes que codifican las enzimas que son el blanco de la terapia antirretroviral. En el presente trabajo se busca evaluar,... more
Objetivo. La resistencia a los medicamentos antirretrovirales se ha asociado con mutaciones características en los genes que codifican las enzimas que son el blanco de la terapia antirretroviral. En el presente trabajo se busca evaluar, desde el punto de vista cualitativo y cuantitativo, las diferentes mutaciones reveladas por la tipificación molecular de virus procedentes de diferentes pacientes remitidos al Instituto de Referencia Andino, en Bogotá, para la genotipificación con fines terapéuticos.Diseño: Se hizo la tipificación de un total de 1.064 mutaciones diferentes en virus procedentes de 16 pacientes no relacionados entre sí, con solicitud de genotipificación del VIH para análisis de sensibilidad a antirretrovirales. Se procedió a la tabulación de las mutaciones encontradas en cuatro categorías principales: a-mutaciones asociadas a resistencia, b- mutaciones silenciosas, c- polimorfismos genéticos por fuera de los sitios asociados a resistencia, y de mutaciones en sitios de ...
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Introducción: La tipificación molecular de ADN de cromosoma-Y es una herramienta de reconocida importancia en el proceso de identificación de individuos de género masculino en diversos casos forenses. Actualmente es una herramienta de... more
Introducción: La tipificación molecular de ADN de cromosoma-Y es una herramienta de reconocida importancia en el proceso de identificación de individuos de género masculino en diversos casos forenses. Actualmente es una herramienta de apoyo para los laboratorios de genética estatales en la identificación de víctimas del conflicto armado en Colombia, dentro de los procesos enmarcados en la Ley de Justicia y Paz. En este estudiose determina el haplotipo del cromosoma-Y que será comparado con parientes por línea paaterna de género masculino, con el fin de realizar el análisis estadístico de estos marcadores, aportar a una base de datos colombiana y comparar con parientes de la línea masculina. Objetivo: Realizar una caracterización de haplotipos mediante análisis de marcadores moleculares, STR del cromosoma-Y en una muestra de población del altiplano cundiboyacense colombiano. Metodología: De las muestras del «Programa de Banco de muestras de sangre de funcionarios de la Fiscalía Gener...
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Dendritic cells have been described as effective antigen presenting cells. Human dentritic cells are highly susceptible to lipopolysaccharide (LPS) tolerance, consisting of a differential deactivation state in which some cellular... more
Dendritic cells have been described as effective antigen presenting cells. Human dentritic cells are highly susceptible to lipopolysaccharide (LPS) tolerance, consisting of a differential deactivation state in which some cellular functions are impaired. LPS tolerance can be experimentally induced in vitro, in which the presence of LPS strongly affects the behavior of cultured dendritic cells. Recombinant proteins obtained from bacterial systems or protein extracts of ectoparasites containing LPS can be used as stimuli to enhance maturation processes in these cells. The present study evaluated the effect of LPS in human dendritic cell cultures, and the activity of polymyxin B as an inhibitor of the LPS effect. Dendritic cells were obtained from peripheral blood monocytes in the presence of IL-4 and GM-CSF, followed by exposure with LPS and PGE2/TNFalpha. Surface markers and cytokine levels were evaluated by flow cytometry. The dendritic cells pre-exposed to single doses of endotoxin ...
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Los tejidos vegetales provenientes de muestras de herbario contienen ADN que ha sufrido degradación post-mortem. Solo pequeñas cantidades de material genético eventualmente degradado, libre de químicos e impurezas, puede ser extraído de... more
Los tejidos vegetales provenientes de muestras de herbario contienen ADN que ha sufrido degradación post-mortem. Solo pequeñas cantidades de material genético eventualmente degradado, libre de químicos e impurezas, puede ser extraído de dichas muestras. El presente trabajo buscó comparar y determinar cuál de los tres protocolos de extracción seleccionados, que habían sido publicados previamente para ADN vegetal, permitía extraer ADN de buena calidad, susceptible de ser amplificado y secuenciado, a partir de exsicados de orquídeas conservadas en herbario hasta por 63 años. De los protocolos evaluados, el más eficaz permitió obtener y secuenciar productos amplificados en 6 de las 7 muestras estudiadas, con las mejores relaciones de pureza ADN / proteína.
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Research Interests: Chemistry, Cytokines, Dendritic Cells, LPS, Biomedica, and 3 moreLymphocytes, Linfocitos, and Citocinas
The kinetoplastid membrane protein 11, KMP-11, from Trypanosoma cruzi elicits humoral and cellular immunity in mice that protects them from infection against further parasite challenge. To characterize the expression of surface markers on... more
The kinetoplastid membrane protein 11, KMP-11, from Trypanosoma cruzi elicits humoral and cellular immunity in mice that protects them from infection against further parasite challenge. To characterize the expression of surface markers on dendritic cells from chronic chagasic patients and healthy individuals, in response to the KMP-11 protein from Trypanosoma cruzi and its N-terminal peptide K1. Monocyte-derived dendritic cells from seven chronic chagasic patients and seven healthy individuals were stimulated with the KMP-11 protein and the K1 peptide. Seven days after culturing, the CD83, CD86, and HLA-DR membrane expression as well as the production of cytokines were evaluated by flow cytometry. Neither KMP-11 protein nor K1 peptide elicited the expression of the maturation marker CD83 on dendritic cells of patients or healthy control individuals. Dendritic cells from chronic chagasic patients exposed to K1 and LPS at the same time presented a significant reduction in CD86 and CD8...
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La historia de la prioridad taxonómica de la orquídea Oncidium ornithorhynchum está aún por aclarar si se consideran las diferentes descripciones y publicaciones de esta especie propuestas en los siglos XVIII y XIX por botánicos como José... more
La historia de la prioridad taxonómica de la orquídea Oncidium ornithorhynchum está aún por aclarar si se consideran las diferentes descripciones y publicaciones de esta especie propuestas en los siglos XVIII y XIX por botánicos como José Celestino Mutis, John Lindley, Alexander von Humboldt, Aimé Bonpland y Carl S. Kunth, entre otros. Con el fin de resolver las inconsistencias en los reportes taxonómicos de esta especie en el transcurso del tiempo, y teniendo como base la reciente aclaración realizada por Jiménez y Hágsater sobre la identidad del ejemplar tipo conservado en París, hemos procedido a ordenar las fuentes primarias asociadas con su descripción y nomenclatura botánica.
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Ancient bone remains constitute an important source of biological information, and their genetic characterization allows the confirmation or rebuttal of human affiliations proposed on the basis of non-molecular approaches. Pre-Columbian... more
Ancient bone remains constitute an important source of biological information, and their genetic characterization allows the confirmation or rebuttal of human affiliations proposed on the basis of non-molecular approaches. Pre-Columbian history of the Eastern Andes in Colombia has been divided into three main periods: (i) an early colonization by groups of hunter-gatherers, (ii) an intermediate period…
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Page 1. Systematic Botany (1996), 21(3): pp. 417-432 ? Copyright 1997 by the American Society of Plant Taxonomists Phylogenetic Relationships among the Genera of the Subtribe Sonchinae (Asteraceae): Evidence from ITS Sequences ...
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Research Interests: Immune response, Archives, Dermatology, Adolescent, Dendritic Cells, and 15 moreLipopolysaccharide, Cell Differentiation, Humans, Child, Animals, Infant, Dendritic cell, Clinical Sciences, Lipopolysaccharides, American Medical Association, Bites and Stings, Antigens, Immunoglobulins, Interleukin, and Child preschool
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Research Interests: Evolutionary Biology, Geography, Archaeology, Anthropology, Medieval History, and 15 moreColombia, Phylogeography, Principal Component Analysis, Physical Anthropology, Medieval Islamic History, American Journal of Physical Anthropology, Mitochondrial DNA, Humans, South American Indians, Americas, Haplotypes, Ancient DNA, American, Genetic variation, and Bone and Bones
Research Interests: Evolutionary Biology, Geography, Archaeology, Anthropology, Biological Anthropology, and 15 moreHuman Evolution, Colombia, Evolutionary genetics, American Culture, Evolutionary Anthropology, Ethnology, Chibchan Languages, DISTRIBUTION, American Journal of Physical Anthropology, Haplotypes, Betweenness Centrality, Distribution, Anthropological genetics, Arsario, and Expansion
Research Interests: Genetics, Conservation Biology, Colombia, Phylogeography, Molecular Ecology (Ecology), and 15 morePopulation Genetics, Biology, Population genetics (Biology), Endangered Species, Medicine, Heredity, Molecular Ecology, Mitochondrial DNA, Sharks, Haplotypes, Animals, Genotype, Genetic variation, Conservation of Natural Resources, and Genetic Markers
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Human Epstein-Barr virus (EBV) specific cytotoxic T lymphocytes (CTL) play an important role in maintaining the virus/host equilibrium during persistent infections. We analysed precursors of antiEBV CTL by the limiting-dilution technique.... more
Human Epstein-Barr virus (EBV) specific cytotoxic T lymphocytes (CTL) play an important role in maintaining the virus/host equilibrium during persistent infections. We analysed precursors of antiEBV CTL by the limiting-dilution technique. Seven healthy EBV-seropositive and two EBVseronegative
donors were tested. All the donors seropositive for EBV gave clear-cut positive results, and it was remarkable that the frequency of CTL precursors (CTLp) observed was much higher than that reported for other viruses. In contrast, in the seronegative donors the frequency of CTLp was undetectable. The CTLp were derived from the CD4-CD8+ population only, although EBV-specific CD4+ cytolytic T cell clones have been described. A study of the HLA restriction showed that some
HLA-A or HLA-B antigens can function as preferential restricting molecules, but that CTLp restricted by the other HLA-A or HLA-B molecules also exist. However, the dominant population of
CTL present in primary responses is sometimes different from that of long term cell lines established from the same donor.
donors were tested. All the donors seropositive for EBV gave clear-cut positive results, and it was remarkable that the frequency of CTL precursors (CTLp) observed was much higher than that reported for other viruses. In contrast, in the seronegative donors the frequency of CTLp was undetectable. The CTLp were derived from the CD4-CD8+ population only, although EBV-specific CD4+ cytolytic T cell clones have been described. A study of the HLA restriction showed that some
HLA-A or HLA-B antigens can function as preferential restricting molecules, but that CTLp restricted by the other HLA-A or HLA-B molecules also exist. However, the dominant population of
CTL present in primary responses is sometimes different from that of long term cell lines established from the same donor.