Phytoremédiation
Une « technologie verte » pour la
dépollution
Antoine Gravot
Cours M1 Biotechnologies Végétales Septembre 2007
Problème technologique : Mise au point de
méthodes de dépollution efficaces et
économiquement viables
Problématique scientifique : Comportement
des végétaux confrontés à des composés
toxiques
Mise en perspective: exemples de
techniques de remédiation des sols
Excavation et traitement hors site (400 000t)
Incinération
Enfouissement
Hydrocarbures : Traitement biologique en centre collectif
Excavation et traitement sur site (400 000t)
Hydrocarbures volatils : désorption thermique
Hydrocarbures et métaux : Lavage, Biotertres
Traitement in-situ sans excavation (450 000t)
Confinement
Bioaugmentation, Ventilation forcée
Phytoremédiation
Volumes traités en France (source :
ADEME http://www2.ademe.fr)
Problème :
Sols pollués
Eaux polluées
Excavation
+
désorption
thermique
Problème :
Sols pollués
Eaux polluées
Excavation
+
désorption Phytoremédiation
thermique
En general 10 fois
moins cher
Valeur ajoutée
Coût / Efficacité paysagère
Définition
Phytoremédiation = Utilisation de végétaux et
de leurs microorganismes associés pour la
dépollution de l’environnement
Dégradation et séquestration des
polluants organiques et
inorganiques
Aspects historiques
Phytoremédiation de l’eau :
Construction de zones humides artificielles épuratoires
1901 : 275 ha de zones humides construites à San Antonio
(Texas)
1950 études plus approfondies
1960 : lagunes à hauts rendements
Phytoremediation des sols
Ecole Russe du début du siècle métaux lourds
1980-1990 : vaste programme de phytorecultivation sur > 1
millions d’ha
École américaine
Aspects historiques
Années 90
Quelques pionniers dont Ilya Raskin développent le
concept de phytoextraction
1994 : premier brevet (Phytotech Inc)
Procédé d’extraction des ions métalliques du sol basé sur
la croissance de plantes cultivées de la famille des
Brassicacées sur des sols contaminés par des métaux.
Absorption racinaire
Exportation foliaire récolte
10 ans de R&D après…
2000 : Premier guide de la phytoremédiation
publié par l’agence nationale de l’environnement
des USA
Programme COST 837 en Europe
Champs d’application
Préventif :
Végétalisation de décharges
Traitement des effluents industriels et de stations
d’épuration
Zones tampons
Curatif
Accidents industriels
Friches industrielles
Activités minières
Pétrochimie et Agrochimie
Sols agricoles
Site militaires
Végétalisation de décharges
Source : http://www.ecolotree.com
Stations d’épuration
Traitement en aval : irrigation de zones
humides artificielles ou de taillis à rotation
courte par des effluents de station (suède)
I. Dimitriou et P. Aronsson
http://www.fao.org/docrep/008/a0026f/a0026f11.htm
Accidents industriels
Pollution accidentelle dans le
Wisconsin : hydrocarbures,
HAP et organochlorés
Source : http://www.ecolotree.com
Friches industrielles
Métaux
lourds
Cokerie d’Homécourt (Lorraine, Arcelor)
Hydrocarbures
aromatiques
polycycliques (HAP)
Aspects techniques essentiels
associés à la phytoremédiation
Typologie des techniques
Polluants inorganiques et organiques
Phytoextraction
Phytovolatilisation
Phytostabilisation
Rhizofiltration
Phytoextraction
Transfert des polluants vers
les parties aériennes:
Niveau de bioaccumulation ?
Niveau de translocation ?
Récolte
Moutarde brune /
Confinement ou recyclage cadmium :
•Feuilles 1000
•Racines 6000
Phytomining
Pilon-Smits 2005 Annu
Rev Plant Biol
Phytovolatilisation
Transfert des polluants
vers les parties
aériennes
Volatilisation et dilution
dans l’atmosphère
Composés volatils :
•Hg, dérivés du Se
•TCE
Pilon-Smits 2005 Annu
Rev Plant Biol
Phytostabilisation
Prévention :
Infiltrations
Flux horizontaux
Érosion
Conversion en formes
moins biodisponibles
Précipitation
Adsorption racinaire
Pb2+ et Cr3+ Pilon-Smits 2005 Annu Rev Plant Biol
Rhizofiltration
Extraction des polluants en milieu aqueux
Effluents
industriels
Pilon-Smits 2005 Annu
Rev Plant Biol
Filtration de l’arsenic par des fougères
Coût : adapté pour des faibles
volumes fortement contaminés
Elles et al. 2005 Water Research
Construction de zones humides
artificielles filtrantes
Se
Nitrate, phosphate, herbicides
Site de la TEMCO
http://www.rpdc.tas.gov.au/soer/image/280/index.php
Typologie des techniques
Dégradation des polluants organiques
Phytodégradation
Rhizostimulation ou Phytostimulation
Dégradation des composés
organiques
Phytodégradation
Dégradation des composés par le métabolisme
de la plante
Composés moyennement hydrophobes:
• TNT et TCE
Phytostimulation
Stimulation de la flore du sol capable de dégrader
les composés organiques
Composés très hydrophobes :
• PCBs (Polychlorinated Biphényls)
•HAP (Hydrocarbures aromatiques polycycliques)
Plante = végétal + microorganismes
associés
10-20% des photosynthétats exsudats racinaires
Densité microbienne augmentée de plusieurs ordres
de grandeur à 1mm
Inoculation
Des mécanismes additifs…
Éventuellement en
association avec
de la remédiation
classique
Pilon-Smits 2005 Annu Rev Plant Biol
Choix des espèces utilisées
en phytoremédiation
Critères :
Adaptation au milieu
Biomasse et vitesse de croissance
Tolérance aux polluants
Capacités d’accumulation ou de dégradation des polluants
Espèces classiques en zones
humides
Lentille
d’eau Spartine
Jacinthe
d’eau
Espèces classiques pour la dépollution
des sols ou des eaux souterraines
Peuplier Brassica juncea : la
moutarde brune
Les plantes hyperaccumulatrices
> 1 % Nickel
Alyssum bertolonii
Les plantes hyperaccumulatrices
> 1 % Zn et
0.1% Cd
Thlaspi caerulescens
Arabidopsis halleri
> 1 % Selenium
Astragalus bisulcatus
Facteurs physiologiques généralement
responsables de l’hyperaccumulation
Séquestration chimique
Glutathion, phytochélatines, histidine
Séquestration subcellulaire
Compartimentation vacuolaire
Compartimentation tissulaire
Translocation racines / feuilles
Accumulation dans les trichomes
Tolérance au stress oxydatif
« Insensibilité biochimique » aux métaux lourds
Cysteinyl-tRNA synthétase d’Astragalus bisulcatus
D’après Salt, Smith et
Phytoextraction continue Raskin 1998 Annu. Rev.
Plant Physiol. Plant Mol.
Biol. 49:643–68
Implique des
espèces :
Tolérantes
Accumulatrices
Phase de prélèvement
de métaux
Phase de croissance Récolte
D’après Salt, Smith et Raskin
Phytoextraction induite 1998 Annu. Rev. Plant Physiol.
Plant Mol. Biol. 49:643–68
Ajout des
chélatants
Phase de
prélèvement de
métaux
Phase de Récolte
croissance
Un exemple de chélatant : l’EDTA
Attention à la
percolation !!
Compromis biomasse / accumulation
Sol contaminé
en Zn + Cd Biomasse X Teneur Rendement d’extraction
Moutarde + 10 t / ha 500 mg / kg 5 kg / ha
EDTA
Thlaspi+ 5 t / ha 25 000 mg / kg 125 kg / ha
EDTA
Conclusions différentes en fonction du
couple espèce / pollution et des contraintes
agronomiques
Principaux polluants
concernés
Polluants inorganiques
Polluants organiques
Polluants inorganiques
Macroéléments
Métaux lourds et ETM
Radionucléides
Pollutions par des macroéléments
Pollutions inorganiques
Métaux lourds et éléments traces métalliques
(ETM)
Comment définir les métaux lourds ?
Masse volumique > 5 g / cm-3
« Métaux lourds » au sens large
« Éléments traces » Source naturelle +
irriguation
Traitement de surfaces
Traitement du bois
automobiles
Tanneries
Engrais
Batteries Orpaillage
Analyse de métaux lourds dans les sédiments
associés à la seine en amont et en aval de Troyes
Pb
Amont de Troyes Aval de Troyes
Plomb
Polluant métallique le plus courant
Ex: site de Metaleurop à Noyelles Godault :
500 ppm sur 500 ha
Faiblement biodisponible utilisation
nécessaire de chélatants
Arsenic
Sources :
Ancien fongicide (vert de Paris)
Traitement du bois : Chrome Cuivre Arsenic
Phytoremédiation : Pteris vittata
Mécanismes de tolérance :
Réduction de l’arsenate en arsenite
Translocation vers les parties aériennes
Stockage vacuolaire
Concentrations en arsenic dans les tissus de Pteris
vittata cultivées sur un sol contenant 97 ppm d’arsenic
Ma et al. Nature (2001) 409: 579
Nickel :
Rôle de
l’histidine dans
l’hypertolérance
Krämer et al. (1996) Nature 379, 635 - 638
Radionucléides
238U, 137Cs, 90Sr..
Essais de rhizofiltration de
137
Cs et 90Sr à Tchernobyl
Cooney, C.M., 1996, Sunflowers Remove
Radionuclides from Water in Ongoing
Phytoremediation Field Tests, Environmental
Science and Technology, 30 (5), pp.194A.
Composés organiques
Hydrocarbures dont HAP
Organochlorés
Solvants : TCE
Insecticides : DDT
PCB (pyralènes), PCDD (dioxines), PCDF (furanes)
Explosifs
TNT, RDX
Herbicides
Atrazine
Hydrocarbures aromatiques
polycycliques (HAP)
Log Kow
Cœfficient de
partage
octanol/eau
Gordon et al. 1996 Environmental Health
Phytodégradation du TCE
Perspectives. 106: 1001-1004.
par des peupliers
Cellule 8 non-
plantée
Approches transgéniques
Augmentation de la
tolérance au cadmium
Surexpression de la -ECS chez Brassica
juncea
Problématique
Si synthèse de phytochélatines, la - ECS est
limitante pour la synthèse de glutathion
Surexpression
de la -ECS
chez Brassica
juncea
Phénotype des transformants
Zhu et al. 1999 Plant Physiology
Augmentation de la translocation
de Cd vers les parties aériennes
Caractérisation fonctionnelle et
ATP surexpression d’une P-ATPase chez
ADP P
Arabidopsis
Cd chélaté,
séquestré
Problème : Cd2+
translocation<50% biodisponible
Canaux et transporteurs
calciques
Transporteurs de Fe
Identification de transporteurs potentiellement
intéressants pour la phytoremédiation
Arbre phylogénétique
des P-ATPases
d’Arabidopsis thaliana
Adressage membranaire d’AtHMA4
Témoin GFP
soluble
HMA4::GFP
Verret et al. FEBS 2004
Expression tissulaire d’AtHMA4
Verret et al. FEBS 2004
Phénotype du surexpresseur d’HMA4
Col-0 HMA4ox
Cd 40µM
Verret et al. FEBS 2004
Translocation des métaux chez le
surexpresseur d’HMA4
Verret el al. 2004 FEBS
Stimulation de la séquestration
vacuolaire de métaux lourds
Expression du transporteur YCF1 de la
levure chez Arabidopsis thaliana
Identification d’un facteur de tolérance
au cadmium chez la levure: YCF1
Song et al. (2003) Nature Biotechnology 21 (8): 914-919
Confirmation de l’adressage vacuolaire
de YCF1 exprimé chez Arabidopsis
Song et al. (2003) Nature Biotechnology 21 (8): 914-919
Amélioration de la tolérance et de
l’accumulation chez les surexpresseurs
Song et al. (2003) Nature Biotechnology 21 (8): 914-919
Phytovolatilisation du mercure par
une plante exprimant un gène
bactérien
MerA (mercurate réductase)
Problématique
Sources:
Feux de forêt, activité volcanique
Combustion du charbon, orpaillage, industries
diverses
Le Hg(II) n’est pas volatil
La conversion du Hg(II) en Hg(0) est réalisée
par une enzyme bactérienne
Rendement trop faibles pour une application
Expression de merA dans une
plante
Liriodendron tulipifera (Magnoliaceae)
Criblage des cals exprimant MerA
Rugh et al. 1998
Nature
Criblage des cals résistant au Hg(II)
Rugh et al. 1998
Nature
Biotechnology
Phénotype du transformant :
volatilisation du Hg(0)
Rugh et al. 1998
Nature
Mercure
Problème : conversion en méthylmercure
Phytoremédiation
Approche transgénique :
déméthylation du mercure (gène merB)
Réduction du Hg(II) en Hg(0) (gène merA)
volatilisation
Quelques exemples pour les composés
organiques
Favoriser la phytodégradation
Expression de gènes de mammifères (P450
TCE) ou de bactéries (TNT)
Favoriser la rhizostimulation
Endosymbiose avec une souche bacterienne
transformée
Phytodégradation du TNT par
une plante exprimant une
nitroréductase bactérienne
Hannink et al. 2001 Nature Biotech
Problématique
Les plantes sont capables de dégrader le
TNT mais avec une efficacité faible
croissance fortement réduite
La nitroréductase de Enterobacter cloacae
est efficace pour la dégradation du TNT
Expression de la NR dans le
tabac
Phénotype des transformants
témoin TNT 0.05 mM TNT 0.1 mM
Hannink et al. 2001
Nature Biotech
TNT résiduel dans les tissus
Hannink et al. 2001
Nature Biotech
Explosifs
RDX TNT
Effet de la surexpression chez une plante d’un
cytochrome P450 bactérien capable de dégrader le RDX
Conclusions
Pour les métaux lourds : recherche de facteurs
génétiques le plus souvent d’origine végétale
Pour le catabolisme des composés organiques :
gènes d’origines plus diverses
Connaissances émergentes sur les mécanismes
moléculaires susceptibles d’être manipulés par
génie génétique pour améliorer les génotypes
De très gros efforts de recherche qui commencent à
déboucher sur des applications intéressantes
Aspects économiques et
industriels
Aspects financiers
Aspects financiers de l’aide à la décision
Prédiagnostic: 2300 euros
Diagnostic : 30 000 euros
Étude de faisabilité : 75 000 euros
Source : ADEME
Entreprises de phytoremédiation
France
Phytorestaure
USA
Ecolotree
Treemediation
Edenspace System Corporation arsenic
Phytokinetics architecture racinaire
Applied Phytogenetics transgenèse et
remédiation du méthylmercure
