[go: up one dir, main page]

Idi na sadržaj

IGF2R

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
IGF2R
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1E6F, 1GP0, 1GP3, 1GQB, 1JPL, 1JWG, 1LF8, 2CNJ, 2V5N, 2V5O, 2V5P, 2L29, 2L2A, 2M68, 5IEI, 2M6T

Identifikatori
AliasiIGF2R
Vanjski ID-jeviOMIM: 147280 MGI: 96435 HomoloGene: 676 GeneCards: IGF2R
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za IGF2R
Genomska lokacija za IGF2R
Bend6q25.3Početak159,969,082 bp[1]
Kraj160,113,507 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 17 (miš)
Hrom.Hromosom 17 (miš)[2]
Hromosom 17 (miš)
Genomska lokacija za IGF2R
Genomska lokacija za IGF2R
Bend17 A1|17 8.64 cMPočetak12,901,293 bp[2]
Kraj12,988,551 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija retinoic acid binding
insulin-like growth factor binding
G protein-coupled receptor activity
transporter activity
phosphoprotein binding
insulin-like growth factor-activated receptor activity
insulin-like growth factor II binding
mannose binding
vezivanje identičnih proteina
vezivanje enzima
G-protein alpha-subunit binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
kringle domain binding
signaling receptor activity
Ćelijska komponenta citoplazma
integral component of membrane
endozom
late endosome
membrana
focal adhesion
clathrin coat
endocytic vesicle
integral component of plasma membrane
cell surface
lysosomal membrane
trans-Golđijeva mreža
early endosome
nuclear envelope lumen
perinuklearno područje citoplazme
trans-Golgi network transport vesicle
Lizozom
Egzosom
jedro
trans-Golgi network membrane
transport vesicle
Vanćelijsko
Golđijev aparat
ćelijska membrana
clathrin-coated vesicle membrane
secretory granule membrane
clathrin-coated vesicle
Biološki proces regulation of apoptotic process
G protein-coupled receptor signaling pathway
response to retinoic acid
post-embryonic development
receptor-mediated endocytosis
animal organ regeneration
Spermatogeneza
positive regulation of apoptotic process
liver development
GO:0072468 Transdukcija signala
insulin-like growth factor receptor signaling pathway
neutrophil degranulation
membrane organization
GO:0015915 transport
post-Golgi vesicle-mediated transport
lysosomal transport
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_000876

NM_010515

RefSeq (bjelančevina)

NP_000867

NP_034645

Lokacija (UCSC)Chr 6: 159.97 – 160.11 MbChr 17: 12.9 – 12.99 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Receptor insulinolikog faktora rasta 2 (IGF2R), znan i kao kation-neovisni receptor manoza-6-fosfata (CI-MPR) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom IGF2R.[5][6] IGF2R je multifunkcionalni proteinski receptor koji se veže insulinski faktor rasta 2 (IGF2) na ćelijskoj površini i manoza-6-fosfat (M6P) označeni protein u trans-Golgijevoj mreži.[6]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 2.491 aminokiselina, а molekulska težina 274.375 Da.[7]

1020304050
MGAAAGRSPHLGPAPARRPQRSLLLLQLLLLVAAPGSTQAQAAPFPELCS
YTWEAVDTKNNVLYKINICGSVDIVQCGPSSAVCMHDLKTRTYHSVGDSV
LRSATRSLLEFNTTVSCDQQGTNHRVQSSIAFLCGKTLGTPEFVTATECV
HYFEWRTTAACKKDIFKANKEVPCYVFDEELRKHDLNPLIKLSGAYLVDD
SDPDTSLFINVCRDIDTLRDPGSQLRACPPGTAACLVRGHQAFDVGQPRD
GLKLVRKDRLVLSYVREEAGKLDFCDGHSPAVTITFVCPSERREGTIPKL
TAKSNCRYEIEWITEYACHRDYLESKTCSLSGEQQDVSIDLTPLAQSGGS
SYISDGKEYLFYLNVCGETEIQFCNKKQAAVCQVKKSDTSQVKAAGRYHN
QTLRYSDGDLTLIYFGGDECSSGFQRMSVINFECNKTAGNDGKGTPVFTG
EVDCTYFFTWDTEYACVKEKEDLLCGATDGKKRYDLSALVRHAEPEQNWE
AVDGSQTETEKKHFFINICHRVLQEGKARGCPEDAAVCAVDKNGSKNLGK
FISSPMKEKGNIQLSYSDGDDCGHGKKIKTNITLVCKPGDLESAPVLRTS
GEGGCFYEFEWHTAAACVLSKTEGENCTVFDSQAGFSFDLSPLTKKNGAY
KVETKKYDFYINVCGPVSVSPCQPDSGACQVAKSDEKTWNLGLSNAKLSY
YDGMIQLNYRGGTPYNNERHTPRATLITFLCDRDAGVGFPEYQEEDNSTY
NFRWYTSYACPEEPLECVVTDPSTLEQYDLSSLAKSEGGLGGNWYAMDNS
GEHVTWRKYYINVCRPLNPVPGCNRYASACQMKYEKDQGSFTEVVSISNL
GMAKTGPVVEDSGSLLLEYVNGSACTTSDGRQTTYTTRIHLVCSRGRLNS
HPIFSLNWECVVSFLWNTEAACPIQTTTDTDQACSIRDPNSGFVFNLNPL
NSSQGYNVSGIGKIFMFNVCGTMPVCGTILGKPASGCEAETQTEELKNWK
PARPVGIEKSLQLSTEGFITLTYKGPLSAKGTADAFIVRFVCNDDVYSGP
LKFLHQDIDSGQGIRNTYFEFETALACVPSPVDCQVTDLAGNEYDLTGLS
TVRKPWTAVDTSVDGRKRTFYLSVCNPLPYIPGCQGSAVGSCLVSEGNSW
NLGVVQMSPQAAANGSLSIMYVNGDKCGNQRFSTRITFECAQISGSPAFQ
LQDGCEYVFIWRTVEACPVVRVEGDNCEVKDPRHGNLYDLKPLGLNDTIV
SAGEYTYYFRVCGKLSSDVCPTSDKSKVVSSCQEKREPQGFHKVAGLLTQ
KLTYENGLLKMNFTGGDTCHKVYQRSTAIFFYCDRGTQRPVFLKETSDCS
YLFEWRTQYACPPFDLTECSFKDGAGNSFDLSSLSRYSDNWEAITGTGDP
EHYLINVCKSLAPQAGTEPCPPEAAACLLGGSKPVNLGRVRDGPQWRDGI
IVLKYVDGDLCPDGIRKKSTTIRFTCSESQVNSRPMFISAVEDCEYTFAW
PTATACPMKSNEHDDCQVTNPSTGHLFDLSSLSGRAGFTAAYSEKGLVYM
SICGENENCPPGVGACFGQTRISVGKANKRLRYVDQVLQLVYKDGSPCPS
KSGLSYKSVISFVCRPEARPTNRPMLISLDKQTCTLFFSWHTPLACEQAT
ECSVRNGSSIVDLSPLIHRTGGYEAYDESEDDASDTNPDFYINICQPLNP
MHGVPCPAGAAVCKVPIDGPPIDIGRVAGPPILNPIANEIYLNFESSTPC
LADKHFNYTSLIAFHCKRGVSMGTPKLLRTSECDFVFEWETPVVCPDEVR
MDGCTLTDEQLLYSFNLSSLSTSTFKVTRDSRTYSVGVCTFAVGPEQGGC
KDGGVCLLSGTKGASFGRLQSMKLDYRHQDEAVVLSYVNGDRCPPETDDG
VPCVFPFIFNGKSYEECIIESRAKLWCSTTADYDRDHEWGFCRHSNSYRT
SSIIFKCDEDEDIGRPQVFSEVRGCDVTFEWKTKVVCPPKKLECKFVQKH
KTYDLRLLSSLTGSWSLVHNGVSYYINLCQKIYKGPLGCSERASICRRTT
TGDVQVLGLVHTQKLGVIGDKVVVTYSKGYPCGGNKTASSVIELTCTKTV
GRPAFKRFDIDSCTYYFSWDSRAACAVKPQEVQMVNGTITNPINGKSFSL
GDIYFKLFRASGDMRTNGDNYLYEIQLSSITSSRNPACSGANICQVKPND
QHFSRKVGTSDKTKYYLQDGDLDVVFASSSKCGKDKTKSVSSTIFFHCDP
LVEDGIPEFSHETADCQYLFSWYTSAVCPLGVGFDSENPGDDGQMHKGLS
ERSQAVGAVLSLLLVALTCCLLALLLYKKERRETVISKLTTCCRRSSNVS
YKYSKVNKEEETDENETEWLMEEIQLPPPRQGKEGQENGHITTKSVKALS
SLHGDDQDSEDEVLTIPEVKVHSGRGAGAESSHPVRNAQSNALQEREDDR
VGLVRGEKARKGKSSSAQQKTVSSTKLVSFHDDSDEDLLHI

Struktura

[uredi | uredi izvor]

Strukturno, IGF2R je transmembranski protein tipa I (to jest, ima jedan transmembranski domen sa svojim C-terminalom na citoplazmatskoj strani lipidne membrane s velikim vanćelijskim/lumenskim domenom i relativno kratkim citoplazmatskim repom.[8] Vanćelijski domen sastoji se od male regije homologne kolagen-vezujućem domenu fibronektina i od petnaest ponavljanja sa približno 147 aminokiselinskih ostataka. Svako od ovih ponavljanja homologno je vancitoplazmatskom domenu sa 157 ostataka receptora za manozu 6-fosfat. Vezivanje za IGF2 posreduje se kroz jedno od ponavljanja, dok su dva različita ponavljanja odgovorna za vezivanje za manoza-6-fosfat. IGF2R je veličine približno 300 kDa; čini se da postoji i funkcionira kao dimer.

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

IGF2R ima funkciju uklanjanja IGF2 sa ćelijske površine radi slabljenja signalizacije i transporta lizosomnih kiselohidrolaznih prekursora iz Golgijevog aparata u lizosom. Nakon vezanja IGF2 na ćelijskoj površini, IGF2R se akumuliraju u tvoreći klatrinom obložene vezikule i internalizirane. U lumenu trans-Golgijeve mreže, IGF2R veže teret označen kao M6P.[8] IGF2R (vezani za njihov teret) prepoznaju porodicu GGA, adapterskih klatrinskih proteina i akumuliraju se u tvoreći vezikule obložene klatrinom.[9] IGF2R sa ćelijske površine i iz Golgijevog aparata šalju se u rani endosom gdje, u njegovom relativno niskom pH okruženju, IGF2R oslobađaju svoj teret. IGF2R se reciklira natrag u Golgijevom aparatu, pomoću kompleksa retromera, opet putem interakcije s GGA i vezikulama. Proteini iz terea se zatim transportuju do lizosoma, preko kasnog endosoma nezavisno od IGF2R.

Interakcije

[uredi | uredi izvor]

Pokazano je da receptor faktora rasta sličan insulinu stupa u interakciju s M6PRBP1.[10][11]

Evolucija

[uredi | uredi izvor]

Funkcija receptora insulinolikog faktora rasta 2 evoluirala je iz kationski neovisnog receptora manoza 6-fosfata i prvi put se vidi u Monotremata. Mjesto vezanja IGF-2 vjerovatno je stečeno slučajno, stvaranjem klastera za pojačavanje mjesta egzonske prerade u egzonu 34, što je vjerojatno bilo potrebno zbog nekoliko kilobaza insercije ponavljajućih elemenata u prethodnom intronu. Zatim je uslijedilo šestostruko sazrijevanje afiniteta tokom evolucije, podudarajući se s početkom utiskivanja i u skladu s teorijom roditeljske protivrječnosti.[12]

Također pogledajte

[uredi | uredi izvor]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000197081 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000023830 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Oshima A, Nolan CM, Kyle JW, Grubb JH, Sly WS (februar 1988). "The human cation-independent mannose 6-phosphate receptor. Cloning and sequence of the full-length cDNA and expression of functional receptor in COS cells". J. Biol. Chem. 263 (5): 2553–62. doi:10.1016/S0021-9258(18)69243-9. PMID 2963003.
  6. ^ a b Laureys G, Barton DE, Ullrich A, Francke U (oktobar 1988). "Chromosomal mapping of the gene for the type II insulin-like growth factor receptor/cation-independent mannose 6-phosphate receptor in man and mouse". Genomics. 3 (3): 224–9. doi:10.1016/0888-7543(88)90083-3. PMID 2852162.
  7. ^ "UniProt, P11717" (jezik: engleski). Pristupljeno 8. 10. 2021.
  8. ^ a b Ghosh P, Dahms NM, Kornfeld S (mart 2003). "Mannose 6-phosphate receptors: new twists in the tale". Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 4 (3): 202–12. doi:10.1038/nrm1050. PMID 12612639. S2CID 16991464.
  9. ^ Ghosh P, Kornfeld S (juli 2004). "The GGA proteins: key players in protein sorting at the trans-Golgi network". Eur. J. Cell Biol. 83 (6): 257–62. doi:10.1078/0171-9335-00374. PMID 15511083.
  10. ^ Díaz E, Pfeffer SR (maj 1998). "TIP47: a cargo selection device for mannose 6-phosphate receptor trafficking". Cell. 93 (3): 433–43. doi:10.1016/S0092-8674(00)81171-X. PMID 9590177. S2CID 17161071.
  11. ^ Orsel JG, Sincock PM, Krise JP, Pfeffer SR (august 2000). "Recognition of the 300-kDa mannose 6-phosphate receptor cytoplasmic domain by 47-kDa tail-interacting protein". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97 (16): 9047–51. Bibcode:2000PNAS...97.9047O. doi:10.1073/pnas.160251397. PMC 16819. PMID 10908666.
  12. ^ Williams C, Hoppe HJ, Rezgui D, Strickland M, Forbes BE, Grutzner F, Frago S, Ellis RZ, Wattana-Amorn P, Prince SN, Zaccheo OJ, Nolan CM, Mungall AJ, Jones EY, Crump MP, Hassan AB (novembar 2012). "Exon splice enhancer primes IGF2:IGF2R binding site structure and function evolution". Science. 338 (6111): 1209–1213. Bibcode:2012Sci...338.1209W. doi:10.1126/science.1228633. PMC 4658703. PMID 23197533.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]

Kategoruja:Receptori