TRIM71

TRIM71
Ідентифікатори
Символи	TRIM71, LIN-41, LIN41, tripartite motif containing 71, E3 ubiquitin protein ligase, tripartite motif containing 71, HYDCC1
Зовнішні ІД	MGI: 2685973 HomoloGene: 9076 GeneCards: TRIM71
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • translation repressor activity • zinc ion binding • зв'язування з іоном металу • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • RNA binding • transferase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • miRNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • внутрішньоклітинний • P-body Біологічний процес • cellular response to organic substance • GO:1905616 regulation of gene silencing by miRNA • negative regulation of translation • stem cell proliferation • regulation of neural precursor cell proliferation • GO:1905618 positive regulation of gene silencing by miRNA • multicellular organism development • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • neural tube closure • miRNA-mediated gene silencing by inhibition of translation • Убіквітин-залежний протеоліз • neural tube development • GO:0061715 miRNA metabolic process • regulation of protein metabolic process • Сайленсинг генів • 3'-UTR-mediated mRNA destabilization • protein autoubiquitination • posttranscriptional regulation of gene expression • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA • G1/S transition of mitotic cell cycle • protein polyubiquitination • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	131405	636931
Ensembl	ENSG00000206557	ENSMUSG00000079259
UniProt	Q2Q1W2	Q1PSW8
RefSeq (мРНК)	NM_001039111	NM_001042503
RefSeq (білок)	NP_001034200	NP_001035968
Локус (UCSC)	Хр. 3: 32.82 – 32.9 Mb	Хр. 9: 114.34 – 114.39 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM71 (англ. Tripartite motif containing 71) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 868 амінокислот, а молекулярна маса — 93 385.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASFPETDFQ		ICLLCKEMCG		SPAPLSSNSS		ASSSSSQTST		SSGGGGGGPG
AAARRLHVLP		CLHAFCRPCL		EAHRLPAAGG		GAAGEPLKLR		CPVCDQKVVL
AEAAGMDALP		SSAFLLSNLL		DAVVATADEP		PPKNGRAGAP		AGAGGHSNHR
HHAHHAHPRA		SASAPPLPQA		PQPPAPSRSA		PGGPAASPSA		LLLRRPHGCS
SCDEGNAASS		RCLDCQEHLC		DNCVRAHQRV		RLTKDHYIER		GPPGPGAAAA
AQQLGLGPPF		PGPPFSILSV		FPERLGFCQH		HDDEVLHLYC		DTCSVPICRE
CTMGRHGGHS		FIYLQEALQD		SRALTIQLLA		DAQQGRQAIQ		LSIEQAQTVA
EQVEMKAKVV		QSEVKAVTAR		HKKALEEREC		ELLWKVEKIR		QVKAKSLYLQ
VEKLRQNLNK		LESTISAVQQ		VLEEGRALDI		LLARDRMLAQ		VQELKTVRSL
LQPQEDDRVM		FTPPDQALYL		AIKSFGFVSS		GAFAPLTKAT		GDGLKRALQG
KVASFTVIGY		DHDGEPRLSG		GDLMSAVVLG		PDGNLFGAEV		SDQQNGTYVV
SYRPQLEGEH		LVSVTLCNQH		IENSPFKVVV		KSGRSYVGIG		LPGLSFGSEG
DSDGKLCRPW		GVSVDKEGYI		IVADRSNNRI		QVFKPCGAFH		HKFGTLGSRP
GQFDRPAGVA		CDASRRIVVA		DKDNHRIQIF		TFEGQFLLKF		GEKGTKNGQF
NYPWDVAVNS		EGKILVSDTR		NHRIQLFGPD		GVFLNKYGFE		GALWKHFDSP
RGVAFNHEGH		LVVTDFNNHR		LLVIHPDCQS		ARFLGSEGTG		NGQFLRPQGV
AVDQEGRIIV		ADSRNHRVQM		FESNGSFLCK		FGAQGSGFGQ		MDRPSGIAIT
PDGMIVVVDF		GNNRILVF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як убіквітинування білків, РНК-залежне заглушення генів, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Maller Schulman B.R., Esquela-Kerscher A., Slack F.J. (2005). Reciprocal expression of lin-41 and the microRNAs let-7 and mir-125 during mouse embryogenesis. Dev. Dyn. 234: 1046—1054. PMID 16247770 DOI:10.1002/dvdy.20599
• Lee Y.S., Kim H.K., Chung S., Kim K.-S., Dutta A. (2005). Depletion of human micro-RNA miR-125b reveals that it is critical for the proliferation of differentiated cells but not for the down-regulation of putative targets during differentiation. J. Biol. Chem. 280: 16635—16641. PMID 15722555 DOI:10.1074/jbc.M412247200

Див. також

• Хромосома 3