TBL1XR1

TBL1XR1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4LG9
Ідентифікатори
Символи	TBL1XR1, C21, DC42, IRA1, TBLR1, MRD41, transducin (beta)-like 1 X-linked receptor 1, transducin beta like 1 X-linked receptor 1, TBL1X receptor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 608628 MGI: 2441730 HomoloGene: 69382 GeneCards: TBL1XR1
Пов'язані генетичні захворювання
Pierpont syndrome, autosomal dominant non-syndromic intellectual disability 41
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • beta-catenin binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • protein N-terminus binding • GO:0031493 histone binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • histone deacetylase complex • transcription repressor complex • нуклеоплазма • spindle microtubule • клітинне ядро • mitotic spindle Біологічний процес • fat pad development • response to dietary excess • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism growth • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • lipid catabolic process • regulation of triglyceride metabolic process • white fat cell differentiation • регуляція експресії генів • adipose tissue development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • histone deacetylation • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • regulation of lipid metabolic process • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • blastocyst hatching • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79718	81004
Ensembl	ENSG00000177565	ENSMUSG00000027630
UniProt	Q9BZK7	Q8BHJ5
RefSeq (мРНК)	NM_024665 NM_001321193 NM_001321194 NM_001321195 NM_001374327 NM_001374328 NM_001374329 NM_001374330	NM_030732
RefSeq (білок)	NP_001308122 NP_001308123 NP_001308124 NP_078941 NP_001361256 NP_001361257 NP_001361258 NP_001361259	NP_109657
Локус (UCSC)	Хр. 3: 177.02 – 177.23 Mb	Хр. 3: 22.13 – 22.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TBL1XR1 (англ. Transducin beta like 1 X-linked receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 514 амінокислот, а молекулярна маса — 55 595.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSISSDEVNF		LVYRYLQESG		FSHSAFTFGI		ESHISQSNIN		GALVPPAALI
SIIQKGLQYV		EAEVSINEDG		TLFDGRPIES		LSLIDAVMPD		VVQTRQQAYR
DKLAQQQAAA		AAAAAAAASQ		QGSAKNGENT		ANGEENGAHT		IANNHTDMME
VDGDVEIPPN		KAVVLRGHES		EVFICAWNPV		SDLLASGSGD		STARIWNLSE
NSTSGSTQLV		LRHCIREGGQ		DVPSNKDVTS		LDWNSEGTLL		ATGSYDGFAR
IWTKDGNLAS		TLGQHKGPIF		ALKWNKKGNF		ILSAGVDKTT		IIWDAHTGEA
KQQFPFHSAP		ALDVDWQSNN		TFASCSTDMC		IHVCKLGQDR		PIKTFQGHTN
EVNAIKWDPT		GNLLASCSDD		MTLKIWSMKQ		DNCVHDLQAH		NKEIYTIKWS
PTGPGTNNPN		ANLMLASASF		DSTVRLWDVD		RGICIHTLTK		HQEPVYSVAF
SPDGRYLASG		SFDKCVHIWN		TQTGALVHSY		RGTGGIFEVC		WNAAGDKVGA
SASDGSVCVL		DLRK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, регуляторів хроматину, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції, убіквітинування білків, поліморфізм, ацетиляція. Локалізований у ядрі.

Література

• Zhang J., Kalkum M., Chait B.T., Roeder R.G. (2002). The N-CoR-HDAC3 nuclear receptor corepressor complex inhibits the JNK pathway through the integral subunit GPS2. Mol. Cell. 9: 611—623. PMID 11931768 DOI:10.1016/S1097-2765(02)00468-9
• Zhang X., Dormady S.P., Basch R.S. (2000). Identification of four human cDNAs that are differentially expressed by early hematopoietic progenitors. Exp. Hematol. 28: 1286—1296. PMID 11063877 DOI:10.1016/S0301-472X(00)00539-7
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Perissi V., Aggarwal A., Glass C.K., Rose D.W., Rosenfeld M.G. (2004). A corepressor/coactivator exchange complex required for transcriptional activation by nuclear receptors and other regulated transcription factors. Cell. 116: 511—526. PMID 14980219 DOI:10.1016/S0092-8674(04)00133-3

Див. також

• Хромосома 3