STAMBP

STAMBP
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2XZE, 3RZU, 3RZV
Ідентифікатори
Символи	STAMBP, AMSH, MICCAP, STAM binding protein
Зовнішні ІД	OMIM: 606247 MGI: 1917777 HomoloGene: 4719 GeneCards: STAMBP
Пов'язані генетичні захворювання
	microcephaly-capillary malformation syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein domain specific binding; • зв'язування з іоном металу; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • thiol-dependent deubiquitinase; • hydrolase activity; • metallopeptidase activity; • Lys63-specific deubiquitinase activity;
Клітинна компонента	• ендосома; • мембрана; • клітинна мембрана; • нуклеоплазма; • early endosome; • Борозна розщеплення; • екзосома; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process; • receptor signaling pathway via JAK-STAT; • mitotic cytokinesis; • протеоліз; • negative regulation of Ras protein signal transduction; • negative regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling; • positive regulation of cell population proliferation; • protein deubiquitination; • protein K63-linked deubiquitination;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	10617
	70527
	ENSG00000124356
	ENSMUSG00000006906
	O95630
	Q9CQ26
	NM_006463; NM_201647; NM_213622
	NM_024239; NM_001362078; NM_001362079; NM_001362080
NP_006454; NP_964010; NP_998787; NP_001340896; NP_001340897;
	NP_001340898; NP_001340899; NP_001340900; NP_001340901; NP_001340902; NP_001340903; NP_001340904; NP_001340905
	NP_077201; NP_001349007; NP_001349008; NP_001349009
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

STAMBP (англ. STAM binding protein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 424 амінокислот, а молекулярна маса — 48 077^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSDHGDVSLP	PEDRVRALSQ	LGSAVEVNED	IPPRRYFRSG	VEIIRMASIY
SEEGNIEHAF	ILYNKYITLF	IEKLPKHRDY	KSAVIPEKKD	TVKKLKEIAF
PKAEELKAEL	LKRYTKEYTE	YNEEKKKEAE	ELARNMAIQQ	ELEKEKQRVA
QQKQQQLEQE	QFHAFEEMIR	NQELEKERLK	IVQEFGKVDP	GLGGPLVPDL
EKPSLDVFPT	LTVSSIQPSD	CHTTVRPAKP	PVVDRSLKPG	ALSNSESIPT
IDGLRHVVVP	GRLCPQFLQL	ASANTARGVE	TCGILCGKLM	RNEFTITHVL
IPKQSAGSDY	CNTENEEELF	LIQDQQGLIT	LGWIHTHPTQ	TAFLSSVDLH
THCSYQMMLP	ESVAIVCSPK	FQETGFFKLT	DHGLEEISSC	RQKGFHPHSK
DPPLFCSCSH	VTVVDRAVTI	TDLR

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як убіквітинування білків, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, ендосомах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Wang P., Yu P., Gao P., Shi T., Ma D. (2009). Discovery of novel human transcript variants by analysis of intronic single-block EST with polyadenylation site. BMC Genomics. 10: 518—518. PMID 19906316 DOI:10.1186/1471-2164-10-518
Maytal-Kivity V., Reis N., Hofmann K., Glickman M.H. (2002). MPN+, a putative catalytic motif found in a subset of MPN domain proteins from eukaryotes and prokaryotes, is critical for Rpn11 function. BMC Biochem. 3: 28—28. PMID 12370088 DOI:10.1186/1471-2091-3-28
McCullough J., Clague M.J., Urbe S. (2004). AMSH is an endosome-associated ubiquitin isopeptidase. J. Cell Biol. 166: 487—492. PMID 15314065 DOI:10.1083/jcb.200401141
Li H., Seth A.K. (2004). An RNF11: Smurf2 complex mediates ubiquitination of the AMSH protein. Oncogene. 23: 1801—1808. PMID 14755250 DOI:10.1038/sj.onc.1207319

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з STAMBP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16950 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, O95630 (англ.) . Архів оригіналу за 14 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з STAMBP переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:16950 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, O95630 (англ.) . Архів оригіналу за 14 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

STAMBP

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук