SNRNP70

SNRNP70
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2L5I, 2L5J, 3CW1, 3PGW, 4PJO, 4PKD
Ідентифікатори
Символи	SNRNP70, RNPU1Z, RPU1, SNRP70, Snp1, U1-70K, U170K, U1AP, U1RNP, SnRNP70, small nuclear ribonucleoprotein U1 subunit 70
Зовнішні ІД	OMIM: 180740 MGI: 98341 HomoloGene: 20672 GeneCards: SNRNP70
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • mRNA binding • U1 snRNP binding • U1 snRNA binding • RNA binding Клітинна компонента • nuclear speck • нуклеоплазма • precatalytic spliceosome • spliceosomal complex • commitment complex • U2-type prespliceosome • клітинне ядро • U1 snRNP • цитоплазма Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • negative regulation of chaperone-mediated autophagy • regulation of RNA splicing • Сплайсинг РНК • regulation of ATP-dependent activity • negative regulation of protein refolding • cellular response to tumor necrosis factor • cellular response to retinoic acid • cellular response to transforming growth factor beta stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6625	20637
Ensembl	ENSG00000104852	ENSMUSG00000063511
UniProt	P08621	Q62376
RefSeq (мРНК)	NM_001009820 NM_001301069 NM_003089	NM_009224
RefSeq (білок)	NP_001287998 NP_003080	NP_033250
Локус (UCSC)	Хр. 19: 49.09 – 49.11 Mb	Хр. 7: 45.03 – 45.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNRNP70 (англ. Small nuclear ribonucleoprotein U1 subunit 70) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 437 амінокислот, а молекулярна маса — 51 557.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTQFLPPNLL		ALFAPRDPIP		YLPPLEKLPH		EKHHNQPYCG		IAPYIREFED
PRDAPPPTRA		ETREERMERK		RREKIERRQQ		EVETELKMWD		PHNDPNAQGD
AFKTLFVARV		NYDTTESKLR		REFEVYGPIK		RIHMVYSKRS		GKPRGYAFIE
YEHERDMHSA		YKHADGKKID		GRRVLVDVER		GRTVKGWRPR		RLGGGLGGTR
RGGADVNIRH		SGRDDTSRYD		ERPGPSPLPH		RDRDRDRERE		RRERSRERDK
ERERRRSRSR		DRRRRSRSRD		KEERRRSRER		SKDKDRDRKR		RSSRSRERAR
RERERKEELR		GGGGDMAEPS		EAGDAPPDDG		PPGELGPDGP		DGPEEKGRDR
DRERRRSHRS		ERERRRDRDR		DRDRDREHKR		GERGSERGRD		EARGGGGGQD
NGLEGLGNDS		RDMYMESEGG		DGYLAPENGY		LMEAAPE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рибонуклеопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як процесінг мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Query C.C., Bentley R.C., Keene J.D. (1989). A common RNA recognition motif identified within a defined U1 RNA binding domain of the 70K U1 snRNP protein. Cell. 57: 89—101. PMID 2467746 DOI:10.1016/0092-8674(89)90175-X
• Spritz R.A., Strunk K., Surowy C.S., Mohrenweiser H.W. (1990). Human U1-70K ribonucleoprotein antigen gene: organization, nucleotide sequence, and mapping to locus 19q13.3. Genomics. 8: 371—379. PMID 2147422 DOI:10.1016/0888-7543(90)90295-6
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Blencowe B.J., Issner R., Nickerson J.A., Sharp P.A. (1998). A coactivator of pre-mRNA splicing. Genes Dev. 12: 996—1009. PMID 9531537 DOI:10.1101/gad.12.7.996
• Zhang W.-J., Wu J.Y. (1998). Sip1, a novel RS domain-containing protein essential for pre-mRNA splicing. Mol. Cell. Biol. 18: 676—684. PMID 9447963 DOI:10.1128/MCB.18.2.676
• Eldridge A.G., Li Y., Sharp P.A., Blencowe B.J. (1999). The SRm160/300 splicing coactivator is required for exon-enhancer function. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96: 6125—6130. PMID 10339552 DOI:10.1073/pnas.96.11.6125

Див. також

• Хромосома 19