SCIN

SCIN
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3FG6, 5A1K, 5A1M
Ідентифікатори
Символи	SCIN, scinderin
Зовнішні ІД	OMIM: 613416 MGI: 1306794 HomoloGene: 36296 GeneCards: SCIN
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • phosphatidylserine binding; • actin filament binding; • 1-phosphatidylinositol binding; • actin binding; • phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding; • зв'язування з іоном металу;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • cell cortex; • brush border; • екзосома; • цитоскелет; • podosome; • міжклітинні контакти; • cell projection; • клітинна мембрана; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• sequestering of actin monomers; • regulation of chondrocyte differentiation; • actin nucleation; • actin filament severing; • positive regulation of actin nucleation; • positive regulation of secretion; • actin filament capping; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of megakaryocyte differentiation; • negative regulation of cell population proliferation; • calcium-ion regulated exocytosis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	85477
	20259
	ENSG00000006747
	ENSMUSG00000002565
	Q9Y6U3
	Q60604
	NM_001112706; NM_033128
	NM_001146196; NM_009132
	NP_001106177; NP_149119
	NP_001139668; NP_033158
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

SCIN (англ. Scinderin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 715 амінокислот, а молекулярна маса — 80 489^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MARELYHEEF	ARAGKQAGLQ	VWRIEKLELV	PVPQSAHGDF	YVGDAYLVLH
TAKTSRGFTY	HLHFWLGKEC	SQDESTAAAI	FTVQMDDYLG	GKPVQNRELQ
GYESNDFVSY	FKGGLKYKAG	GVASGLNHVL	TNDLTAKRLL	HVKGRRVVRA
TEVPLSWDSF	NKGDCFIIDL	GTEIYQWCGS	SCNKYERLKA	NQVATGIRYN
ERKGRSELIV	VEEGSEPSEL	IKVLGEKPEL	PDGGDDDDII	ADISNRKMAK
LYMVSDASGS	MRVTVVAEEN	PFSMAMLLSE	ECFILDHGAA	KQIFVWKGKD
ANPQERKAAM	KTAEEFLQQM	NYSKNTQIQV	LPEGGETPIF	KQFFKDWRDK
DQSDGFGKVY	VTEKVAQIKQ	IPFDASKLHS	SPQMAAQHNM	VDDGSGKVEI
WRVENNGRIQ	VDQNSYGEFY	GGDCYIILYT	YPRGQIIYTW	QGANATRDEL
TTSAFLTVQL	DRSLGGQAVQ	IRVSQGKEPV	HLLSLFKDKP	LIIYKNGTSK
KGGQAPAPPT	RLFQVRRNLA	SITRIVEVDV	DANSLNSNDV	FVLKLPQNSG
YIWVGKGASQ	EEEKGAEYVA	SVLKCKTLRI	QEGEEPEEFW	NSLGGKKDYQ
TSPLLETQAE	DHPPRLYGCS	NKTGRFVIEE	IPGEFTQDDL	AEDDVMLLDA
WEQIFIWIGK	DANEVEKKES	LKSAKMYLET	DPSGRDKRTP	IVIIKQGHEP
PTFTGWFLGW	DSSKW

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до кепінгів актину, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину, іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах, клітинних відростках.

Література

Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Chumnarnsilpa S., Robinson R.C., Grimes J.M., Leyrat C. (2015). Calcium-controlled conformational choreography in the N-terminal half of adseverin. Nat. Commun. 6: 8254—8254. PMID 26365202 DOI:10.1038/ncomms9254
Marcu M.G., Zhang L., Nau-Staudt K., Trifaro J.M. (1996). Recombinant scinderin, an F-actin severing protein, increases calcium-induced release of serotonin from permeabilized platelets, an effect blocked by two scinderin-derived actin-binding peptides and phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate. Blood. 87: 20—24. PMID 8547642

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:21695 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q9Y6U3 (англ.) . Архів оригіналу за 18 квітня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.