RDH16

RDH16
Ідентифікатори
Символи	RDH16, RODH-4, SDR9C8, retinol dehydrogenase 16 (all-trans), retinol dehydrogenase 16, hRDH-E
Зовнішні ІД	MGI: 2678390 HomoloGene: 129514 GeneCards: RDH16
Онтологія гена Молекулярна функція • electron transfer activity • oxidoreductase activity • NAD-retinol dehydrogenase activity • androstan-3-alpha,17-beta-diol dehydrogenase activity • protein homodimerization activity • androsterone dehydrogenase activity Клітинна компонента • integral component of membrane • organelle membrane • endoplasmic reticulum membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • ендоплазматичний ретикулум • мембрана Біологічний процес • lipid metabolism • Електронтранспортний ланцюг • steroid metabolic process • retinol metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8608	216453
Ensembl	ENSG00000139547	ENSMUSG00000054052
UniProt	O75452	G5E8H9
RefSeq (мРНК)	NM_003708 NM_001320108	NM_147222
RefSeq (білок)	NP_001307037 NP_003699	NP_671755
Локус (UCSC)	Хр. 12: 56.95 – 56.96 Mb	Хр. 10: 127.69 – 127.7 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RDH16 (англ. Retinol dehydrogenase 16 (all-trans)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 317 амінокислот, а молекулярна маса — 35 673.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MWLYLAVFVG		LYYLLHWYRE		RQVLSHLRDK		YVFITGCDSG		FGKLLARQLD
ARGLRVLAAC		LTEKGAEQLR		GQTSDRLETV		TLDVTKTESV		AAAAQWVKEC
VRDKGLWGLV		NNAGISLPTA		PNELLTKQDF		VTILDVNLLG		VIDVTLSLLP
LVRRARGRVV		NVSSVMGRVS		LFGGGYCISK		YGVEAFSDSL		RRELSYFGVK
VAMIEPGYFK		TAVTSKERFL		KSFLEIWDRS		SPEVKEAYGE		KFVADYKKSA
EQMEQKCTQD		LSLVTNCMEH		ALIACHPRTR		YSAGWDAKLL		YLPMSYMPTF
LVDAIMYWVS		PSPAKAL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, мікросомах.

Література

• Gough W.H., VanOoteghem S., Sint T., Kedishvili N.Y. (1998). cDNA cloning and characterization of a new human microsomal NAD+-dependent dehydrogenase that oxidizes all-trans-retinol and 3alpha-hydroxysteroids. J. Biol. Chem. 273: 19778—19785. PMID 9677409 DOI:10.1074/jbc.273.31.19778
• Lapshina E.A., Belyaeva O.V., Chumakova O.V., Kedishvili N.Y. (2003). Differential recognition of the free versus bound retinol by human microsomal retinol/sterol dehydrogenases: characterization of the holo-CRBP dehydrogenase activity of RoDH-4. Biochemistry. 42: 776—784. PMID 12534290 DOI:10.1021/bi026836r

Див. також

• Хромосома 12