PARVA

PARVA
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2K2R, 2VZC, 2VZD, 2VZG, 2VZI, 3KMU, 3KMW, 3REP
Ідентифікатори
Символи	PARVA, CH-ILKBP, MXRA2, parvin alpha
Зовнішні ІД	OMIM: 608120 MGI: 1931144 HomoloGene: 10077 GeneCards: PARVA
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • actin binding • cadherin binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • міжклітинні контакти • Z discdkac • цитоскелет • focal adhesion • actin cytoskeleton • клітинне ядро • lamellipodium Біологічний процес • actin cytoskeleton reorganization • cilium assembly • smooth muscle cell chemotaxis • heterotypic cell-cell adhesion • sprouting angiogenesis • outflow tract septum morphogenesis • establishment or maintenance of cell polarity • хемотаксис • actin-mediated cell contraction • адгезія клітин • cell projection organization • Ангіогенез • regulation of cell shape • substrate adhesion-dependent cell spreading • cell projection assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55742	57342
Ensembl	ENSG00000197702	ENSMUSG00000030770
UniProt	Q9NVD7	Q9EPC1
RefSeq (мРНК)	NM_018222	NM_020606
RefSeq (білок)	NP_060692	NP_065631
Локус (UCSC)	Хр. 11: 12.38 – 12.54 Mb	Хр. 7: 112.03 – 112.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PARVA (англ. Parvin alpha) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 372 амінокислот, а молекулярна маса — 42 244.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATSPQKSPS		VPKSPTPKSP		PSRKKDDSFL		GKLGGTLARR		KKAKEVSELQ
EEGMNAINLP		LSPIPFELDP		EDTMLEENEV		RTMVDPNSRS		DPKLQELMKV
LIDWINDVLV		GERIIVKDLA		EDLYDGQVLQ		KLFEKLESEK		LNVAEVTQSE
IAQKQKLQTV		LEKINETLKL		PPRSIKWNVD		SVHAKSLVAI		LHLLVALSQY
FRAPIRLPDH		VSIQVVVVQK		REGILQSRQI		QEEITGNTEA		LSGRHERDAF
DTLFDHAPDK		LNVVKKTLIT		FVNKHLNKLN		LEVTELETQF		ADGVYLVLLM
GLLEGYFVPL		HSFFLTPDSF		EQKVLNVSFA		FELMQDGGLE		KPKPRPEDIV
NCDLKSTLRV		LYNLFTKYRN		VE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, пдтримання форми клітини, ангіогенез, хемотаксис, біогенез та деградація війок, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах.

Література

• Tu Y., Huang Y., Zhang Y., Hua Y., Wu C. (2001). A new focal adhesion protein that interacts with integrin-linked kinase and regulates cell adhesion and spreading. J. Cell Biol. 153: 585—598. PMID 11331308 DOI:10.1083/jcb.153.3.585
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Aboulaich N., Vainonen J.P., Stralfors P., Vener A.V. (2004). Vectorial proteomics reveal targeting, phosphorylation and specific fragmentation of polymerase I and transcript release factor (PTRF) at the surface of caveolae in human adipocytes. Biochem. J. 383: 237—248. PMID 15242332 DOI:10.1042/BJ20040647
• Nikolopoulos S.N., Turner C.E. (2000). Actopaxin, a new focal adhesion protein that binds paxillin LD motifs and actin and regulates cell adhesion. J. Cell Biol. 151: 1435—1448. PMID 11134073 DOI:10.1083/jcb.151.7.1435
• Korenbaum E., Olski T.M., Noegel A.A. (2001). Genomic organization and expression profile of the parvin family of focal adhesion proteins in mice and humans. Gene. 279: 69—79. PMID 11722847 DOI:10.1016/S0378-1119(01)00743-0
• Zhang Y., Chen K., Tu Y., Wu C. (2004). Distinct roles of two structurally closely related focal adhesion proteins, alpha-parvins and beta-parvins, in regulation of cell morphology and survival. J. Biol. Chem. 279: 41695—41705. PMID 15284246 DOI:10.1074/jbc.M401563200

Див. також

• Хромосома 11