OPN1LW

OPN1LW
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1KPX
Ідентифікатори
Символи	OPN1LW, CBBM, CBP, COD5, RCP, ROP, opsin 1 (cone pigments), long-wave-sensitive, opsin 1, long wave sensitive
Зовнішні ІД	OMIM: 300822 MGI: 1097692 HomoloGene: 68064 GeneCards: OPN1LW
Пов'язані генетичні захворювання
blue cone monochromacy
Онтологія гена Молекулярна функція • G protein-coupled receptor activity • photoreceptor activity • signal transducer activity • G protein-coupled photoreceptor activity Клітинна компонента • integral component of membrane • integral component of plasma membrane • мембрана • photoreceptor outer segment • photoreceptor disc membrane Біологічний процес • positive regulation of cytokinesis • GO:0072468 сигнальна трансдукція • зір • retinoid metabolic process • відповідь на стимул • phototransduction • detection of visible light • G protein-coupled receptor signaling pathway • cellular response to light stimulus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5956	14539
Ensembl	ENSG00000102076	ENSMUSG00000031394
UniProt	P04000	O35599
RefSeq (мРНК)	NM_020061	NM_008106
RefSeq (білок)	NP_064445	NP_032132
Локус (UCSC)	Хр. X: 154.14 – 154.16 Mb	Хр. X: 73.17 – 73.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

OPN1LW (англ. Opsin 1 (cone pigments), medium-wave-sensitive (color blindness, deutan)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 359 амінокислот, а молекулярна маса — 40 218.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAQRLTGEQT		LDHYEDSTHA		SIFTYTNSNS		TKGPFEGPNY		HIAPRWVYHL
TSTWMILVVV		ASVFTNGLVL		AATMRFKKLR		HPLNWILVNL		AVADLAETII
ASTISVVNQI		YGYFVLGHPL		CVIEGYIVSL		CGITGLWSLA		IISWERWLVV
CKPFGNVRFD		AKLATVGIVF		SWVWAAIWTA		PPIFGWSRYW		PYGLKTSCGP
DVFSGTSYPG		VQSYMMVLMV		TCCIFPLSII		VLCYLQVWLA		IRAVAKQQKE
SESTQKAEKE		VTRMVVVMVF		AYCLCWGPYT		FFACFATAHP		GYAFHPLVAS
LPSYFAKSAT		IYNPIIYVFM		NRQFRNCILH		LFGKKVDDSS		ELSSTSKTEV
SSVSSVSPA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Білок має сайт для зв'язування з хромофором. Локалізований у мембрані.

Література

• Sun H., Macke J.P., Nathans J. (1997). Mechanisms of spectral tuning in the mouse green cone pigment. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 8860—8865. PMID 9238068 DOI:10.1073/pnas.94.16.8860
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома X