MAP1S

MAP1S
Ідентифікатори
Символи	MAP1S, BPY2IP1, C19orf5, MAP8, VCY2IP-1, VCY2IP1, microtubule associated protein 1S
Зовнішні ІД	OMIM: 607573 MGI: 2443304 HomoloGene: 10047 GeneCards: MAP1S
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • deoxyribonuclease activity • microtubule binding • tubulin binding • actin filament binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • beta-tubulin binding • identical protein binding • actin binding Клітинна компонента • гіалоплазма • cell projection • microtubule cytoskeleton • веретено поділу • синапс • міжклітинні контакти • soma • дендрит (нейробіологія) • ядерце • perinuclear region of cytoplasm • мікротрубочка • цитоскелет • клітинне ядро • цитоплазма • microtubule associated complex Біологічний процес • neuron projection morphogenesis • нейробіологія розвитку • автофагія • brain development • microtubule bundle formation • mitochondrion transport along microtubule • microtubule cytoskeleton organization • GO:0097285 апоптоз • DNA metabolic process • аксоноґенеза • dendrite development • regulation of microtubule depolymerization Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55201	270058
Ensembl	ENSG00000130479	ENSMUSG00000019261
UniProt	Q66K74	Q8C052
RefSeq (мРНК)	NM_001308363 NM_018174	NM_173013
RefSeq (білок)	NP_001295292 NP_060644	NP_766601
Локус (UCSC)	Хр. 19: 17.72 – 17.73 Mb	Хр. 8: 71.36 – 71.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

MAP1S (англ. Microtubule associated protein 1S) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 059 амінокислот, а молекулярна маса — 112 211.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAVAGSGAA		AAPSSLLLVV		GSEFGSPGLL		TYVLEELERG		IRSWDVDPGV
CNLDEQLKVF		VSRHSATFSS		IVKGQRSLHH		RGDNLETLVL		LNPSDKSLYD
ELRNLLLDPA		SHKLLVLAGP		CLEETGELLL		QTGGFSPHHF		LQVLKDREIR
DILATTPPPV		QPPILTITCP		TFGDWAQLAP		AVPGLQGALR		LQLRLNPPAQ
LPNSEGLCEF		LEYVAESLEP		PSPFELLEPP		TSGGFLRLGR		PCCYIFPGGL
GDAAFFAVNG		FTVLVNGGSN		PKSSFWKLVR		HLDRVDAVLV		THPGADSLPG
LNSLLRRKLA		ERSEVAAGGG		SWDDRLRRLI		SPNLGVVFFN		ACEAASRLAR
GEDEAELALS		LLAQLGITPL		PLSRGPVPAK		PTVLFEKMGV		GRLDMYVLHP
PSAGAERTLA		SVCALLVWHP		AGPGEKVVRV		LFPGCTPPAC		LLDGLVRLQH
LRFLREPVVT		PQDLEGPGRA		ESKESVGSRD		SSKREGLLAT		HPRPGQERPG
VARKEPARAE		APRKTEKEAK		TPRELKKDPK		PSVSRTQPRE		VRRAASSVPN
LKKTNAQAAP		KPRKAPSTSH		SGFPPVANGP		RSPPSLRCGE		ASPPSAACGS
PASQLVATPS		LELGPIPAGE		EKALELPLAA		SSIPRPRTPS		PESHRSPAEG
SERLSLSPLR		GGEAGPDASP		TVTTPTVTTP		SLPAEVGSPH		STEVDESLSV
SFEQVLPPSA		PTSEAGLSLP		LRGPRARRSA		SPHDVDLCLV		SPCEFEHRKA
VPMAPAPASP		GSSNDSSARS		QERAGGLGAE		ETPPTSVSES		LPTLSDSDPV
PLAPGAADSD		EDTEGFGVPR		HDPLPDPLKV		PPPLPDPSSI		CMVDPEMLPP
KTARQTENVS		RTRKPLARPN		SRAAAPKATP		VAAAKTKGLA		GGDRASRPLS
ARSEPSEKGG		RAPLSRKSST		PKTATRGPSG		SASSRPGVSA		TPPKSPVYLD
LAYLPSGSSA		HLVDEEFFQR		VRALCYVISG		QDQRKEEGMR		AVLDALLASK
QHWDRDLQVT		LIPTFDSVAM		HTWYAETHAR		HQALGITVLG		SNSMVSMQDD
AFPACKVEF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Liu L., McKeehan W.L. (2002). Sequence analysis of LRPPRC and its SEC1 domain interaction partners suggests roles in cytoskeletal organization, vesicular trafficking, nucleocytosolic shuttling, and chromosome activity. Genomics. 79: 124—136. PMID 11827465 DOI:10.1006/geno.2001.6679
• Liu L., Amy V., Liu G., McKeehan W.L. (2002). Novel complex integrating mitochondria and the microtubular cytoskeleton with chromosome remodeling and tumor suppressor RASSF1 deduced by in silico homology analysis, interaction cloning in yeast, and colocalization in cultured cells. In Vitro Cell. Dev. Biol. Anim. 38: 582—594. PMID 12762840 DOI:10.1290/1543-706X(2002)38<582:NCIMAT>2.0.CO;2
• Liu L., Vo A., Liu G., McKeehan W.L. (2005). Putative tumor suppressor RASSF1 interactive protein and cell death inducer C19ORF5 is a DNA binding protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 332: 670—676. PMID 15907802 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.05.006
• Liu L., Vo A., McKeehan W.L. (2005). Specificity of the methylation-suppressed A isoform of candidate tumor suppressor RASSF1 for microtubule hyperstabilization is determined by cell death inducer C19ORF5. Cancer Res. 65: 1830—1838. PMID 15753381 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-04-3896
• Liu L., Vo A., Liu G., McKeehan W.L. (2005). Distinct structural domains within C19ORF5 support association with stabilized microtubules and mitochondrial aggregation and genome destruction. Cancer Res. 65: 4191—4201. PMID 15899810 DOI:10.1158/0008-5472.CAN-04-3865

Див. також

• Хромосома 19