HMGCLL1

HMGCLL1
Ідентифікатори
Символи	HMGCLL1, bA418P12.1, er-cHL, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase-like 1, 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1, ERCHL
Зовнішні ІД	MGI: 2446108 HomoloGene: 27863 GeneCards: HMGCLL1
Онтологія гена Молекулярна функція • hydroxymethylglutaryl-CoA lyase activity • каталітична активність • зв'язування з іоном металу • lyase activity Клітинна компонента • цитоплазма • perinuclear region of cytoplasm • гіалоплазма • endoplasmic reticulum membrane • ендоплазматичний ретикулум • мембрана Біологічний процес • ketone body biosynthetic process • leucine catabolic process • lipid metabolism Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54511	208982
Ensembl	ENSG00000146151	ENSMUSG00000007908
UniProt	Q8TB92	Q8JZS7
RefSeq (мРНК)	NM_001042406 NM_001287741 NM_001287746 NM_001287753 NM_019036	NM_173731
RefSeq (білок)	NP_001035865 NP_001274670 NP_001274675 NP_001274682 NP_061909	NP_776092
Локус (UCSC)	Хр. 6: 55.43 – 55.58 Mb	Хр. 9: 75.92 – 76.04 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HMGCLL1 (англ. 3-hydroxymethyl-3-methylglutaryl-CoA lyase like 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 370 амінокислот, а молекулярна маса — 39 514.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGNVPSAVKH		CLSYQQLLRE		HLWIGDSVAG		ALDPAQTSLL		TNLHCFQPDV
SGFSVSLAGT		VACIHWETSQ		LSGLPEFVKI		VEVGPRDGLQ		NEKVIVPTDI
KIEFINRLSQ		TGLSVIEVTS		FVSSRWVPQM		ADHTEVMKGI		HQYPGVRYPV
LTPNLQGFHH		AVAAGATEIS		VFGAASESFS		KKNINCSIEE		SMGKFEEVVK
SARHMNIPAR		GYVSCALGCP		YEGSITPQKV		TEVSKRLYGM		GCYEISLGDT
IGVGTPGSMK		RMLESVMKEI		PPGALAVHCH		DTYGQALANI		LTALQMGINV
VDSAVSGLGG		CPYAKGASGN		VATEDLIYML		NGLGLNTGVN		LYKVMEAGDF
ICKAVNKTTN		SKVAQASFNA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ліаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Montgomery C., Pei Z., Watkins P.A., Miziorko H.M. (2012). Identification and characterization of an extramitochondrial human 3-Hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyase. J. Biol. Chem. 287: 33227—33236. PMID 22865860 DOI:10.1074/jbc.M112.393231

Див. також

• Хромосома 6