HLA-C

HLA-C
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BZF,%%s4NT6,%%s1EFX,%%s1IM9, 1QQD
Ідентифікатори
Символи	HLA-C, D6S204, HLA-JY3, HLC-C, PSORS1, major histocompatibility complex, class I, C, MHC
Зовнішні ІД	OMIM: 142840 HomoloGene: 133080 GeneCards: HLA-C
Пов'язані генетичні захворювання
хронічне обструктивне захворювання легень, psoriatic arthritis
Онтологія гена Молекулярна функція • peptide antigen binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • phagocytic vesicle membrane • комплекс Ґольджі • early endosome membrane • мембрана • Golgi membrane • клітинна мембрана • cell surface • ендоплазматичний ретикулум • MHC class I protein complex • ER to Golgi transport vesicle membrane • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • екзосома • secretory granule membrane • recycling endosome membrane Біологічний процес • antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent • процес імунної системи • interferon-gamma-mediated signaling pathway • antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-independent • type I interferon signaling pathway • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • regulation of immune response • GO:0022415 viral process • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3107	н/д
Ensembl	ENSG00000204525 ENSG00000233841 ENSG00000228299 ENSG00000225691 ENSG00000206435 ENSG00000237022 ENSG00000206452	н/д
UniProt	P10321	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_002117 NM_001243042	н/д
RefSeq (білок)	NP_001229971 NP_002108	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 31.27 – 31.27 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

HLA-C (англ. Major histocompatibility complex, class I, C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 366 амінокислот, а молекулярна маса — 40 649.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRVMAPRALL		LLLSGGLALT		ETWACSHSMR		YFDTAVSRPG		RGEPRFISVG
YVDDTQFVRF		DSDAASPRGE		PRAPWVEQEG		PEYWDRETQK		YKRQAQADRV
SLRNLRGYYN		QSEDGSHTLQ		RMSGCDLGPD		GRLLRGYDQS		AYDGKDYIAL
NEDLRSWTAA		DTAAQITQRK		LEAARAAEQL		RAYLEGTCVE		WLRRYLENGK
ETLQRAEPPK		THVTHHPLSD		HEATLRCWAL		GFYPAEITLT		WQRDGEDQTQ
DTELVETRPA		GDGTFQKWAA		VVVPSGQEQR		YTCHMQHEGL		QEPLTLSWEP
SSQPTIPIMG		IVAGLAVLVV		LAVLGAVVTA		MMCRRKSSGG		KGGSCSQAAC
SNSAQGSDES		LITCKA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.

Література

• Vilches C., Bunce M., de Pablo R., Herrero M.J., Kreisler M. (1995). Anchored PCR cloning of the novel HLA-Cw*0704 allele detected by PCR-SSP. Tissue Antigens. 46: 19—23. PMID 7482492 DOI:10.1111/j.1399-0039.1995.tb02471.x
• Cooper S.L., Adams E.J., Wells R.S., Walker C.M., Parham P. (1998). A major histocompatibility complex class I allele shared by two species of chimpanzee. Immunogenetics. 47: 212—217. PMID 9435339 DOI:10.1007/s002510050350
• Baurain J.-F., Coulie P.G. (1999). Correction of HLA-Cw*0501 and identification of HLA-Cw*0711. Tissue Antigens. 53: 510—512. PMID 10372547 DOI:10.1034/j.1399-0039.1999.530508.x
• Steinle A., Schendel D.J. (1994). HLA class I alleles of LCL 721 and 174 x CEM.T2 (T2). Tissue Antigens. 44: 268—270. PMID 7871529 DOI:10.1111/j.1399-0039.1994.tb02394.x
• van der Vlies S.A., Voorter C.E., van den Berg-Loonen E.M. (1999). There is more to HLA -C than exons 2 and 3: sequencing exons 1, 4 and 5. Tissue Antigens. 54: 169—177. PMID 10488744 DOI:10.1034/j.1399-0039.1999.540208.x
• Pohla H., Kuon W., Tabaczewski P., Doerner C., Weiss E.H. (1989). Allelic variation in HLA-B and HLA-C sequences and the evolution of the HLA-B alleles. Immunogenetics. 29: 297—307. PMID 2714852 DOI:10.1007/BF00352839

Див. також

• Хромосома 6