FAT1

FAT1
Ідентифікатори
Символи	FAT1, CDHF7, CDHR8, FAT, ME5, hFat1, FAT atypical cadherin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 600976 MGI: 109168 HomoloGene: 66302 GeneCards: FAT1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • мембрана; • cell-cell junction; • focal adhesion; • Філоподія; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • міжклітинні контакти; • perinuclear region of cytoplasm; • екзосома; • клітинне ядро; • lamellipodium; • apical plasma membrane;
Біологічний процес	• actin filament organization; • cell-cell signaling; • anatomical structure morphogenesis; • establishment or maintenance of cell polarity; • адгезія клітин; • cell migration; • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules; • cell-cell adhesion; • epithelial cell morphogenesis; • establishment or maintenance of epithelial cell apical/basal polarity; • camera-type eye morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	2195
	14107
	ENSG00000083857
	ENSMUSG00000070047
	Q14517
	н/д
	NM_005245
	NM_001081286; NM_010179
	NP_005236
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

FAT1 (англ. FAT atypical cadherin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 588 амінокислот, а молекулярна маса — 506 273^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGRHLALLLL	LLLLFQHFGD	SDGSQRLEQT	PLQFTHLEYN	VTVQENSAAK
TYVGHPVKMG	VYITHPAWEV	RYKIVSGDSE	NLFKAEEYIL	GDFCFLRIRT
KGGNTAILNR	EVKDHYTLIV	KALEKNTNVE	ARTKVRVQVL	DTNDLRPLFS
PTSYSVSLPE	NTAIRTSIAR	VSATDADIGT	NGEFYYSFKD	RTDMFAIHPT
SGVIVLTGRL	DYLETKLYEM	EILAADRGMK	LYGSSGISSM	AKLTVHIEQA
NECAPVITAV	TLSPSELDRD	PAYAIVTVDD	CDQGANGDIA	SLSIVAGDLL
QQFRTVRSFP	GSKEYKVKAI	GGIDWDSHPF	GYNLTLQAKD	KGTPPQFSSV
KVIHVTSPQF	KAGPVKFEKD	VYRAEISEFA	PPNTPVVMVK	AIPAYSHLRY
VFKSTPGKAK	FSLNYNTGLI	SILEPVKRQQ	AAHFELEVTT	SDRKASTKVL
VKVLGANSNP	PEFTQTAYKA	AFDENVPIGT	TVMSLSAVDP	DEGENGYVTY
SIANLNHVPF	AIDHFTGAVS	TSENLDYELM	PRVYTLRIRA	SDWGLPYRRE
VEVLATITLN	NLNDNTPLFE	KINCEGTIPR	DLGVGEQITT	VSAIDADELQ
LVQYQIEAGN	ELDFFSLNPN	SGVLSLKRSL	MDGLGAKVSF	HSLRITATDG
ENFATPLYIN	ITVAASHKLV	NLQCEETGVA	KMLAEKLLQA	NKLHNQGEVE
DIFFDSHSVN	AHIPQFRSTL	PTGIQVKENQ	PVGSSVIFMN	STDLDTGFNG
KLVYAVSGGN	EDSCFMIDME	TGMLKILSPL	DRETTDKYTL	NITVYDLGIP
QKAAWRLLHV	VVVDANDNPP	EFLQESYFVE	VSEDKEVHSE	IIQVEATDKD
LGPNGHVTYS	IVTDTDTFSI	DSVTGVVNIA	RPLDRELQHE	HSLKIEARDQ
AREEPQLFST	VVVKVSLEDV	NDNPPTFIPP	NYRVKVREDL	PEGTVIMWLE
AHDPDLGQSG	QVRYSLLDHG	EGNFDVDKLS	GAVRIVQQLD	FEKKQVYNLT
VRAKDKGKPV	SLSSTCYVEV	EVVDVNENLH	PPVFSSFVEK	GTVKEDAPVG
SLVMTVSAHD	EDARRDGEIR	YSIRDGSGVG	VFKIGEETGV	IETSDRLDRE
STSHYWLTVF	ATDQGVVPLS	SFIEIYIEVE	DVNDNAPQTS	EPVYYPEIME
NSPKDVSVVQ	IEAFDPDSSS	NDKLMYKITS	GNPQGFFSIH	PKTGLITTTS
RKLDREQQDE	HILEVTVTDN	GSPPKSTIAR	VIVKILDEND	NKPQFLQKFY
KIRLPEREKP	DRERNARREP	LYHVIATDKD	EGPNAEISYS	IEDGNEHGKF
FIEPKTGVVS	SKRFSAAGEY	DILSIKAVDN	GRPQKSSTTR	LHIEWISKPK
PSLEPISFEE	SFFTFTVMES	DPVAHMIGVI	SVEPPGIPLW	FDITGGNYDS
HFDVDKGTGT	IIVAKPLDAE	QKSNYNLTVE	ATDGTTTILT	QVFIKVIDTN
DHRPQFSTSK	YEVVIPEDTA	PETEILQISA	VDQDEKNKLI	YTLQSSRDPL
SLKKFRLDPA	TGSLYTSEKL	DHEAVHQHTL	TVMVRDQDVP	VKRNFARIVV
NVSDTNDHAP	WFTASSYKGR	VYESAAVGSV	VLQVTALDKD	KGKNAEVLYS
IESGNIGNSF	MIDPVLGSIK	TAKELDRSNQ	AEYDLMVKAT	DKGSPPMSEI
TSVRIFVTIA	DNASPKFTSK	EYSVELSETV	SIGSFVGMVT	AHSQSSVVYE
IKDGNTGDAF	DINPHSGTII	TQKALDFETL	PIYTLIIQGT	NMAGLSTNTT
VLVHLQDEND	NAPVFMQAEY	TGLISESASI	NSVVLTDRNV	PLVIRAADAD
KDSNALLVYH	IVEPSVHTYF	AIDSSTGAIH	TVLSLDYEET	SIFHFTVQVH
DMGTPRLFAE	YAANVTVHVI	DINDCPPVFA	KPLYEASLLL	PTYKGVKVIT
VNATDADSSA	FSQLIYSITE	GNIGEKFSMD	YKTGALTVQN	TTQLRSRYEL
TVRASDGRFA	GLTSVKINVK	ESKESHLKFT	QDVYSAVVKE	NSTEAETLAV
ITAIGNPINE	PLFYHILNPD	RRFKISRTSG	VLSTTGTPFD	REQQEAFDVV
VEVTEEHKPS	AVAHVVVKVI	VEDQNDNAPV	FVNLPYYAVV	KVDTEVGHVI
RYVTAVDRDS	GRNGEVHYYL	KEHHEHFQIG	PLGEISLKKQ	FELDTLNKEY
LVTVVAKDGG	NPAFSAEVIV	PITVMNKAMP	VFEKPFYSAE	IAESIQVHSP
VVHVQANSPE	GLKVFYSITD	GDPFSQFTIN	FNTGVINVIA	PLDFEAHPAY
KLSIRATDSL	TGAHAEVFVD	IIVDDINDNP	PVFAQQSYAV	TLSEASVIGT
SVVQVRATDS	DSEPNRGISY	QMFGNHSKSH	DHFHVDSSTG	LISLLRTLDY
EQSRQHTIFV	RAVDGGMPTL	SSDVIVTVDV	TDLNDNPPLF	EQQIYEARIS
EHAPHGHFVT	CVKAYDADSS	DIDKLQYSIL	SGNDHKHFVI	DSATGIITLS
NLHRHALKPF	YSLNLSVSDG	VFRSSTQVHV	TVIGGNLHSP	AFLQNEYEVE
LAENAPLHTL	VMEVKTTDGD	SGIYGHVTYH	IVNDFAKDRF	YINERGQIFT
LEKLDRETPA	EKVISVRLMA	KDAGGKVAFC	TVNVILTDDN	DNAPQFRATK
YEVNIGSSAA	KGTSVVKVLA	SDADEGSNAD	ITYAIEADSE	SVKENLEINK
LSGVITTKES	LIGLENEFFT	FFVRAVDNGS	PSKESVVLVY	VKILPPEMQL
PKFSEPFYTF	TVSEDVPIGT	EIDLIRAEHS	GTVLYSLVKG	NTPESNRDES
FVIDRQSGRL	KLEKSLDHET	TKWYQFSILA	RCTQDDHEMV	ASVDVSIQVK
DANDNSPVFE	SSPYEAFIVE	NLPGGSRVIQ	IRASDADSGT	NGQVMYSLDQ
SQSVEVIESF	AINMETGWIT	TLKELDHEKR	DNYQIKVVAS	DHGEKIQLSS
TAIVDVTVTD	VNDSPPRFTA	EIYKGTVSED	DPQGGVIAIL	STTDADSEEI
NRQVTYFITG	GDPLGQFAVE	TIQNEWKVYV	KKPLDREKRD	NYLLTITATD
GTFSSKAIVE	VKVLDANDNS	PVCEKTLYSD	TIPEDVLPGK	LIMQISATDA
DIRSNAEITY	TLLGSGAEKF	KLNPDTGELK	TSTPLDREEQ	AVYHLLVRAT
DGGGRFCQAS	IVLTLEDVND	NAPEFSADPY	AITVFENTEP	GTLLTRVQAT
DADAGLNRKI	LYSLIDSADG	QFSINELSGI	IQLEKPLDRE	LQAVYTLSLK
AVDQGLPRRL	TATGTVIVSV	LDINDNPPVF	EYREYGATVS	EDILVGTEVL
QVYAASRDIE	ANAEITYSII	SGNEHGKFSI	DSKTGAVFII	ENLDYESSHE
YYLTVEATDG	GTPSLSDVAT	VNVNVTDIND	NTPVFSQDTY	TTVISEDAVL
EQSVITVMAD	DADGPSNSHI	HYSIIDGNQG	SSFTIDPVRG	EVKVTKLLDR
ETISGYTLTV	QASDNGSPPR	VNTTTVNIDV	SDVNDNAPVF	SRGNYSVIIQ
ENKPVGFSVL	QLVVTDEDSS	HNGPPFFFTI	VTGNDEKAFE	VNPQGVLLTS
SAIKRKEKDH	YLLQVKVADN	GKPQLSSLTY	IDIRVIEESI	YPPAILPLEI
FITSSGEEYS	GGVIGKIHAT	DQDVYDTLTY	SLDPQMDNLF	SVSSTGGKLI
AHKKLDIGQY	LLNVSVTDGK	FTTVADITVH	IRQVTQEMLN	HTIAIRFANL
TPEEFVGDYW	RNFQRALRNI	LGVRRNDIQI	VSLQSSEPHP	HLDVLLFVEK
PGSAQISTKQ	LLHKINSSVT	DIEEIIGVRI	LNVFQKLCAG	LDCPWKFCDE
KVSVDESVMS	THSTARLSFV	TPRHHRAAVC	LCKEGRCPPV	HHGCEDDPCP
EGSECVSDPW	EEKHTCVCPS	GRFGQCPGSS	SMTLTGNSYV	KYRLTENENK
LEMKLTMRLR	TYSTHAVVMY	ARGTDYSILE	IHHGRLQYKF	DCGSGPGIVS
VQSIQVNDGQ	WHAVALEVNG	NYARLVLDQV	HTASGTAPGT	LKTLNLDNYV
FFGGHIRQQG	TRHGRSPQVG	NGFRGCMDSI	YLNGQELPLN	SKPRSYAHIE
ESVDVSPGCF	LTATEDCASN	PCQNGGVCNP	SPAGGYYCKC	SALYIGTHCE
ISVNPCSSKP	CLYGGTCVVD	NGGFVCQCRG	LYTGQRCQLS	PYCKDEPCKN
GGTCFDSLDG	AVCQCDSGFR	GERCQSDIDE	CSGNPCLHGA	LCENTHGSYH
CNCSHEYRGR	HCEDAAPNQY	VSTPWNIGLA	EGIGIVVFVA	GIFLLVVVFV
LCRKMISRKK	KHQAEPKDKH	LGPATAFLQR	PYFDSKLNKN	IYSDIPPQVP
VRPISYTPSI	PSDSRNNLDR	NSFEGSAIPE	HPEFSTFNPE	SVHGHRKAVA
VCSVAPNLPP	PPPSNSPSDS	DSIQKPSWDF	DYDTKVVDLD	PCLSKKPLEE
KPSQPYSARE	SLSEVQSLSS	FQSESCDDNG	YHWDTSDWMP	SVPLPDIQEF
PNYEVIDEQT	PLYSADPNAI	DTDYYPGGYD	IESDFPPPPE	DFPAADELPP
LPPEFSNQFE	SIHPPRDMPA	AGSLGSSSRN	RQRFNLNQYL	PNFYPLDMSE
PQTKGTGENS	TCREPHAPYP	PGYQRHFEAP	AVESMPMSVY	ASTASCSDVS
ACCEVESEVM	MSDYESGDDG	HFEEVTIPPL	DSQQHTEV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані.

Література

Magg T., Schreiner D., Solis G.P., Bade E.G., Hofer H.W. (2005). Processing of the human protocadherin Fat1 and translocation of its cytoplasmic domain to the nucleus. Exp. Cell Res. 307: 100—108. PMID 15922730 DOI:10.1016/j.yexcr.2005.03.006
Hou R., Sibinga N.E. (2009). Atrophin proteins interact with the Fat1 cadherin and regulate migration and orientation in vascular smooth muscle cells. J. Biol. Chem. 284: 6955—6965. PMID 19131340 DOI:10.1074/jbc.M809333200

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3595 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q14517 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3595 (англ.) . Процитовано 30 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, Q14517 (англ.) . Архів оригіналу за 2 жовтня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

FAT1

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук