DPH3

DPH3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2JR7
Ідентифікатори
Символи	DPH3, DELGIP, DELGIP1, DESR1, DPH3A, KTI11, ZCSL2, diphthamide biosynthesis 3
Зовнішні ІД	OMIM: 608959 MGI: 1922658 HomoloGene: 44717 GeneCards: DPH3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • нуклеоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of binding • negative regulation of protein secretion • peptidyl-diphthamide biosynthetic process from peptidyl-histidine • tRNA wobble uridine modification Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	285381	105638
Ensembl	ENSG00000154813	ENSMUSG00000021905
UniProt	Q96FX2	Q8K0W9
RefSeq (мРНК)	NM_206831 NM_001047434	NM_001047433 NM_001284346 NM_172254
RefSeq (білок)	NP_001040899 NP_996662	NP_001040898 NP_001271275 NP_758458
Локус (UCSC)	Хр. 3: 16.26 – 16.26 Mb	Хр. 14: 31.8 – 31.81 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DPH3 (англ. Diphthamide biosynthesis 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 82 амінокислот, а молекулярна маса — 9 240.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAVFHDEVEI		EDFQYDEDSE		TYFYPCPCGD		NFSITKEDLE		NGEDVATCPS
CSLIIKVIYD		KDQFVCGETV		PAPSANKELV		KC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Sjoelinder M., Uhlmann J., Ponstingl H. (2004). Characterisation of an evolutionary conserved protein interacting with the putative guanine nucleotide exchange factor DelGEF and modulating secretion. Exp. Cell Res. 294: 68—76. PMID 14980502 DOI:10.1016/j.yexcr.2003.09.033
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Liu S., Leppla S.H. (2003). Retroviral insertional mutagenesis identifies a small protein required for synthesis of diphthamide, the target of bacterial ADP-ribosylating toxins. Mol. Cell. 12: 603—613. PMID 14527407 DOI:10.1016/j.molcel.2003.08.003

Див. також

• Хромосома 3