DDX3X

DDX3X
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2I4I, 2JGN, 3JRV, 4O2C, 4O2E, 4O2F, 4PX9, 4PXA, 5E7J, 5E7M, 5E7I
Ідентифікатори
Символи	DDX3X, DBX, DDX14, DDX3, HLP2, CAP-Rf, MRX102, DEAD-box helicase 3, X-linked, DEAD-box helicase 3 X-linked, MRXSSB
Зовнішні ІД	OMIM: 300160 MGI: 103064 HomoloGene: 3425 GeneCards: DDX3X
Пов'язані генетичні захворювання
	X-linked mental retardation 102, X-linked intellectual disability, non-syndromic X-linked intellectual disability
Онтологія гена
Молекулярна функція	• DNA binding; • nucleotide binding; • nucleoside-triphosphatase activity; • CTPase activity; • GO:0008026 helicase activity; • poly(A) binding; • ribosomal small subunit binding; • RNA stem-loop binding; • GO:0004003 DNA helicase activity; • transcription factor binding; • ATPase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0006184 GTPase activity; • eukaryotic initiation factor 4E binding; • RNA binding; • nucleic acid binding; • mRNA 5'-UTR binding; • translation initiation factor binding; • hydrolase activity; • ATP binding; • RNA strand annealing activity; • cadherin binding; • protein serine/threonine kinase activator activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • eukaryotic translation initiation factor 3 complex; • nuclear speck; • мембрана; • мітохондріальна зовнішня мембрана; • cytosolic small ribosomal subunit; • мітохондрія; • cytoplasmic stress granule; • екзосома; • клітинне ядро; • extracellular region; • гіалоплазма; • secretory granule lumen; • ficolin-1-rich granule lumen; • ядерце;
Біологічний процес	• stress granule assembly; • GO:0097285 апоптоз; • negative regulation of translation; • negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • GO:0007243 intracellular signal transduction; • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated; • ribosome biogenesis; • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway; • процес імунної системи; • chromosome segregation; • GO:0106160 negative regulation of protein-containing complex assembly; • response to virus; • negative regulation of apoptotic process; • Wnt signaling pathway; • positive regulation of translation; • protein localization to cytoplasmic stress granule; • transcription, DNA-templated; • cellular response to osmotic stress; • positive regulation of G1/S transition of mitotic cell cycle; • intrinsic apoptotic signaling pathway; • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • positive regulation of cell growth; • GO:1901313 positive regulation of gene expression; • mature ribosome assembly; • cellular response to arsenic-containing substance; • negative regulation of cell growth; • positive regulation of chemokine (C-C motif) ligand 5 production; • RNA secondary structure unwinding; • positive regulation of apoptotic process; • positive regulation of viral genome replication; • GO:0022415 viral process; • вроджений імунітет; • positive regulation of translational initiation; • regulation of translation; • extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of interferon-beta production; • DNA duplex unwinding; • neutrophil degranulation; • positive regulation of protein serine/threonine kinase activity; • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway; • translational initiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1654
	13205
	ENSG00000215301
	ENSMUSG00000000787
	O00571
	Q62167
	NM_001193416; NM_001193417; NM_001356; NM_024005; NM_001363819
	NM_010028; NM_008015
	NP_001180345; NP_001180346; NP_001347; NP_001350748
	NP_034158
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DDX3X (англ. DEAD-box helicase 3, X-linked) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі X-хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 662 амінокислот, а молекулярна маса — 73 243^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSHVAVENAL	GLDQQFAGLD	LNSSDNQSGG	STASKGRYIP	PHLRNREATK
GFYDKDSSGW	SSSKDKDAYS	SFGSRSDSRG	KSSFFSDRGS	GSRGRFDDRG
RSDYDGIGSR	GDRSGFGKFE	RGGNSRWCDK	SDEDDWSKPL	PPSERLEQEL
FSGGNTGINF	EKYDDIPVEA	TGNNCPPHIE	SFSDVEMGEI	IMGNIELTRY
TRPTPVQKHA	IPIIKEKRDL	MACAQTGSGK	TAAFLLPILS	QIYSDGPGEA
LRAMKENGRY	GRRKQYPISL	VLAPTRELAV	QIYEEARKFS	YRSRVRPCVV
YGGADIGQQI	RDLERGCHLL	VATPGRLVDM	MERGKIGLDF	CKYLVLDEAD
RMLDMGFEPQ	IRRIVEQDTM	PPKGVRHTMM	FSATFPKEIQ	MLARDFLDEY
IFLAVGRVGS	TSENITQKVV	WVEESDKRSF	LLDLLNATGK	DSLTLVFVET
KKGADSLEDF	LYHEGYACTS	IHGDRSQRDR	EEALHQFRSG	KSPILVATAV
AARGLDISNV	KHVINFDLPS	DIEEYVHRIG	RTGRVGNLGL	ATSFFNERNI
NITKDLLDLL	VEAKQEVPSW	LENMAYEHHY	KGSSRGRSKS	SRFSGGFGAR
DYRQSSGASS	SSFSSSRASS	SRSGGGGHGS	SRGFGGGGYG	GFYNSDGYGG
NYNSQGVDWW	GN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, регуляція трансляції, імунітет, вроджений імунітет, взаємодія хазяїн-вірус, транскрипція, регуляція транскрипції, розходження хромосом, біогенез рибосом. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ДНК, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, мембрані, мітохондрії, зовнішній мембрані мітохондрій.

Література

Owsianka A.M., Patel A.H. (1999). Hepatitis C virus core protein interacts with a human DEAD box protein DDX3. Virology. 257: 330—340. PMID 10329544 DOI:10.1006/viro.1999.9659
Lahn B.T., Page D.C. (1997). Functional coherence of the human Y chromosome. Science. 278: 675—680. PMID 9381176 DOI:10.1126/science.278.5338.675
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Yedavalli V.S., Neuveut C., Chi Y.-H., Kleiman L., Jeang K.-T. (2004). Requirement of DDX3 DEAD box RNA helicase for HIV-1 Rev-RRE export function. Cell. 119: 381—392. PMID 15507209 DOI:10.1016/j.cell.2004.09.029
Franca R., Belfiore A., Spadari S., Maga G. (2007). Human DEAD-box ATPase DDX3 shows a relaxed nucleoside substrate specificity. Proteins. 67: 1128—1137. PMID 17357160 DOI:10.1002/prot.21433
Merz C., Urlaub H., Will C.L., Luhrmann R. (2007). Protein composition of human mRNPs spliced in vitro and differential requirements for mRNP protein recruitment. RNA. 13: 116—128. PMID 17095540 DOI:10.1261/rna.336807

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з DDX3X переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2745 (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017. [Архівовано 2017-08-21 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O00571 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома X

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Захворювання, генетично пов'язані з DDX3X переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2745 (англ.) . Архів оригіналу за 21 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017. [Архівовано 2017-08-21 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, O00571 (англ.) . Архів оригіналу за 23 серпня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

DDX3X

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук