DDX31

DDX31
Ідентифікатори
Символи	DDX31, PPP1R25, DEAD-box helicase 31
Зовнішні ІД	OMIM: 616533 MGI: 2682639 HomoloGene: 6389 GeneCards: DDX31
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • hydrolase activity • ATP binding • GO:0008026 helicase activity • nucleic acid binding • RNA binding Клітинна компонента • комплекс Ґольджі • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинне ядро • ядерце • цитоплазма Біологічний процес • ribosome biogenesis • RNA secondary structure unwinding Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64794	227674
Ensembl	ENSG00000125485	ENSMUSG00000026806
UniProt	Q9H8H2	Q6NZQ2
RefSeq (мРНК)	NM_022779 NM_138620 NM_001322340 NM_001322341 NM_001322342 NM_001322343 NM_001322344	NM_001033294
RefSeq (білок)	NP_001309269 NP_001309270 NP_001309271 NP_001309272 NP_001309273 NP_073616 NP_619526	NP_001028466
Локус (UCSC)	Хр. 9: 132.59 – 132.67 Mb	Хр. 2: 28.73 – 28.8 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DDX31 (англ. DEAD-box helicase 31) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 851 амінокислот, а молекулярна маса — 94 087.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPDLASQRH		SESFPSVNSR		PNVILPGREG		RREGLPPGGG		TRGSLVPTRP
VPPSPAPLGT		SPYSWSRSGP		GRGGGAGSSR		VPRGVPGPAV		CAPGSLLHHA
SPTQTMAAAD		GSLFDNPRTF		SRRPPAQASR		QAKATKRKYQ		ASSEAPPAKR
RNETSFLPAK		KTSVKETQRT		FKGNAQKMFS		PKKHSVSTSD		RNQEERQCIK
TSSLFKNNPD		IPELHRPVVK		QVQEKVFTSA		AFHELGLHPH		LISTINTVLK
MSSMTSVQKQ		SIPVLLEGRD		ALVRSQTGSG		KTLAYCIPVV		QSLQAMESKI
QRSDGPYALV		LVPTRELALQ		SFDTVQKLLK		PFTWIVPGVL		MGGEKRKSEK
ARLRKGINIL		ISTPGRLVDH		IKSTKNIHFS		RLRWLVFDEA		DRILDLGFEK
DITVILNAVN		AECQKRQNVL		LSATLTEGVT		RLADISLHDP		VSISVLDKSH
DQLNPKDKAV		QEVCPPPAGD		KLDSFAIPES		LKQHVTVVPS		KLRLVCLAAF
ILQKCKFEED		QKMVVFFSSC		ELVEFHYSLF		LQTLLSSSGA		PASGQLPSAS
MRLKFLRLHG		GMEQEERTAV		FQEFSHSRRG		VLLCTDVAAR		GLDLPQVTWI
VQYNAPSSPA		EYIHRIGRTA		RIGCHGSSLL		ILAPSEAEYV		NSLASHKINV
SEIKMEDILC		VLTRDDCFKG		KRWGAQKSHA		VGPQEIRERA		TVLQTVFEDY
VHSSERRVSW		AKKALQSFIQ		AYATYPRELK		HIFHVRSLHL		GHVAKSFGLR
DAPRNLSALT		RKKRKAHVKR		PDLHKKTQSK		HSLAEILRSE		YSSGMEADIA
KVKKQNAPGE		PGGRPLQHSL		QPTPCFGRGK		TLKWRKTQKG		VQRDSKTSQK
V

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Abdelhaleem M., Maltais L., Wain H. (2003). The human DDX and DHX gene families of putative RNA helicases. Genomics. 81: 618—622. PMID 12782131 DOI:10.1016/S0888-7543(03)00049-1
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 9