CNOT3

CNOT3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4C0D, 4C0G, 5FU6, 5FU7
Ідентифікатори
Символи	CNOT3, LENG2, NOT3, NOT3H, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, IDDSADF
Зовнішні ІД	OMIM: 604910 MGI: 2385261 HomoloGene: 133900 GeneCards: CNOT3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • CCR4-NOT complex • гіалоплазма • P-body • клітинне ядро • CCR4-NOT core complex Біологічний процес • nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening • multicellular organism development • Сайленсинг генів • negative regulation of translation • regulation of stem cell population maintenance • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • trophectodermal cell differentiation • regulation of translation • transcription, DNA-templated • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, deadenylation-dependent decay • positive regulation of cold-induced thermogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4849	232791
Ensembl	ENSG00000088038 ENSG00000277600 ENSG00000277114 ENSG00000274616 ENSG00000275979 ENSG00000277615 ENSG00000276082 ENSG00000274176 ENSG00000274941 ENSG00000273943	ENSMUSG00000035632
UniProt	O75175	Q8K0V4
RefSeq (мРНК)	NM_014516	NM_146176
RefSeq (білок)	NP_055331	NP_666288
Локус (UCSC)	Хр. 19: 54.14 – 54.16 Mb	Хр. 7: 3.65 – 3.66 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CNOT3 (англ. CCR4-NOT transcription complex subunit 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 753 амінокислот, а молекулярна маса — 81 872.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADKRKLQGE		IDRCLKKVSE		GVEQFEDIWQ		KLHNAANANQ		KEKYEADLKK
EIKKLQRLRD		QIKTWVASNE		IKDKRQLIDN		RKLIETQMER		FKVVERETKT
KAYSKEGLGL		AQKVDPAQKE		KEEVGQWLTN		TIDTLNMQVD		QFESEVESLS
VQTRKKKGDK		DKQDRIEGLK		RHIEKHRYHV		RMLETILRML		DNDSILVDAI
RKIKDDVEYY		VDSSQDPDFE		ENEFLYDDLD		LEDIPQALVA		TSPPSHSHME
DEIFNQSSST		PTSTTSSSPI		PPSPANCTTE		NSEDDKKRGR		STDSEVSQSP
AKNGSKPVHS		NQHPQSPAVP		PTYPSGPPPA		ASALSTTPGN		NGVPAPAAPP
SALGPKASPA		PSHNSGTPAP		YAQAVAPPAP		SGPSTTQPRP		PSVQPSGGGG
GGSGGGGSSS		SSNSSAGGGA		GKQNGATSYS		SVVADSPAEV		ALSSSGGNNA
SSQALGPPSG		PHNPPPSTSK		EPSAAAPTGA		GGVAPGSGNN		SGGPSLLVPL
PVNPPSSPTP		SFSDAKAAGA		LLNGPPQFST		APEIKAPEPL		SSLKSMAERA
AISSGIEDPV		PTLHLTERDI		ILSSTSAPPA		SAQPPLQLSE		VNIPLSLGVC
PLGPVPLTKE		QLYQQAMEEA		AWHHMPHPSD		SERIRQYLPR		NPCPTPPYHH
QMPPPHSDTV		EFYQRLSTET		LFFIFYYLEG		TKAQYLAAKA		LKKQSWRFHT
KYMMWFQRHE		EPKTITDEFE		QGTYIYFDYE		KWGQRKKEGF		TFEYRYLEDR
DLQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як регуляція трансляції, транскрипція, регуляція транскрипції, РНК-залежне заглушення генів, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Aoki T., Okada N., Wakamatsu T., Tamura T.-A. (2002). TBP-interacting protein 120B, which is induced in relation to myogenesis, binds to NOT3. Biochem. Biophys. Res. Commun. 296: 1097—1103. PMID 12207886 DOI:10.1016/S0006-291X(02)02031-4
• Zwartjes C.G., Jayne S., van den Berg D.L., Timmers H.T. (2004). Repression of promoter activity by CNOT2, a subunit of the transcription regulatory Ccr4-not complex. J. Biol. Chem. 279: 10848—10854. PMID 14707134 DOI:10.1074/jbc.M311747200

Див. також

• Хромосома 19