CCL13

CCL13
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RA4
Ідентифікатори
Символи	CCL13, CKb10, MCP-4, NCC-1, NCC1, SCYA13, SCYL1, C-C motif chemokine ligand 13
Зовнішні ІД	OMIM: 601391 HomoloGene: 2241 GeneCards: CCL13
Онтологія гена Молекулярна функція • cytokine activity • chemokine activity • CCR chemokine receptor binding • signaling receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • monocyte chemotaxis • cell-cell signaling • eosinophil chemotaxis • хемотаксис • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • cytoskeleton organization • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • regulation of cell shape • GO:0072468 сигнальна трансдукція • inflammatory response • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • cellular calcium ion homeostasis • neutrophil chemotaxis • lymphocyte chemotaxis • chemokine-mediated signaling pathway • cellular response to interferon-gamma • cellular response to interleukin-1 • cellular response to tumor necrosis factor • regulation of signaling receptor activity • G protein-coupled receptor signaling pathway • cell chemotaxis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6357	24770
Ensembl	ENSG00000181374	ENSRNOG00000007159
UniProt	Q99616	P14844
RefSeq (мРНК)	NM_005408	NM_031530
RefSeq (білок)	NP_005399	NP_113718
Локус (UCSC)	Хр. 17: 34.36 – 34.36 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CCL13 (англ. C-C motif chemokine ligand 13) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 98 амінокислот, а молекулярна маса — 10 986.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKVSAVLLCL		LLMTAAFNPQ		GLAQPDALNV		PSTCCFTFSS		KKISLQRLKS
YVITTSRCPQ		KAVIFRTKLG		KEICADPKEK		WVQNYMKHLG		RKAHTLKT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до цитокінів. Задіяний у таких біологічних процесах, як запальна відповідь, хемотаксис. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Barinka C., Prahl A., Lubkowski J. (2008). Structure of human monocyte chemoattractant protein 4 (MCP-4/CCL13). Acta Crystallogr. D. 64: 273—278. PMID 18323622 DOI:10.1107/S0907444907066164
• Power C.A., Meyer A., Rison S.C.G., Guye-Coulin F., Wells T.N.C. (1996). Cloning and characterization of MCP-4, a novel CC chemokine related to MCP-1 and eotaxin. Eur. Cytokine Netw. 7: 513—513.

Див. також

• Хромосома 17