Acidobacteria
| Acidobacteria | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | ||||||||||
| Біологічна класифікація | ||||||||||
| ||||||||||
Класи/ряди/родини/роди
| ||||||||||
| ||||||||||
Посилання
| ||||||||||
|
Acidobacteria — недавно визначений тип бактерій. Як вказує назва, відомі види типу ацидофільні. Попри те, що тип вивчений дуже мало, він — важлива складова частина багатьох екосистем, особливо, ґрунтів. Часто, більш ніж 30 % або навіть 50 % послідовностей мікроорганізмів у зразках ґрунту, згідно з аналізом їх 16S рРНК, належали до цього типу [1]. Вони домінували в молекулярних аналізах вологих ґрунтів Вісконсіна, безводих ґрунтів Аризони і в ризосфері масляних культурних рослин [2][3] Окремі послідовності представників Acidobacteria також були виявлені в прісноводих середовищах [4], мікробних матах гарячих джерел [4], густій грязі стічних вод [5], біореакторах очищення стічних вод [6] та інших середовищах.
Хоча тепер тип Acidobacteria містить тільки три описані види: Acidobacterium capsulatum, Geothrix fermentans і Holophaga foetida, та декілька недавно ідентифікованих ізолятів [7], більшість Acidobacteria ще не була культивирована і відома тільки за своїми послідовностями 16S рРНК. Фізіологічні дані про цю групу дуже обмежені. Окрім деяких фенотипичних рис трьох описаних видів, цей тип поки що тільки відомий одним геном і його відповідною послідовністю в суспільних базах даних (ендо-1-4-бета-ксиланаза бактерії A. capsulatum). Засновуючись на філогенетичному аналізі 16S рРНК, Acidobacteria може бути розділеними на шість головних груп [4], які відрізняються до 22 % своїми генами 16S рРНК. Розповсюдженість і велика кількість цих мікроорганізмів піднімає питання їх екологічної ролі і метаболічних процесів, в яких вони беруть участь, особливо в ґрунтових середовищах. Засновуючись на різноманітності їх філогенезу і екологічному розповсюдженні, очікується, що Acidobacteria метаболічно і генетично являють собою дуже різноманітну групу, порівнянну з такими групами, як Протеобактерії або грам-позитивні бактерії [4][1].
- ↑ а б Achim Quaiser, Torsten Ochsenreiter, Christa Lanz, Stephan C. Schuster, Alexander H. Treusch, Jürgen Eck and Christa Schleper (2003). Acidobacteria form a coherent but highly diverse group within the bacterial domain: evidence from environmental genomics. Molecular Microbiology. 50(2): 563.
- ↑ Kuske, C.R., Barns, S.M., and Busch, J.D. (1997). Diverse uncultivated bacterial groups from soils of the arid southwestern United States that are present in many geographic regions. Appl Environ Microbiol. 63: 3614—3621.
- ↑ Dunbar, J., Takala, S., Barns, S.M., Davis, J.A., and Kuske, C.R. (1999). Levels of bacterial community diversity in four arid soils compared by cultivation and 16S rRNA gene cloning. Appl Environ Microbiol. 65: 1662—1669.
- ↑ а б в г Barns, S.M., Takala, S.L., and Kuske, C.R. (1999). Wide distribution and diversity of members of the bacterial kingdom Acidobacterium in the environment. Appl Environ Microbiol. 65: 1731—1737.
- ↑ Layton, A.C., Karanth, P.N., Lajoie, C.A., Meyers, A.J., Gregory, I.R., Stapleton, R.D. та ін. (2000). Quantification of Hyphomicrobium populations in activated sludge from an industrial wastewater treatment system as determined by 16S rRNA analysis. Appl Environ Microbiol. 66: 1167—1174.
{{cite journal}}: Явне використання «та ін.» у:|author=(довідка) - ↑ LaPara, T.M., Nakatsu, C.H., Pantea, L., and Alleman, J.E. (2000). Phylogenetic analysis of bacterial communities in mesophilic and thermophilic bioreactors treating pharmaceutical wastewater. Appl Environ Microbiol. 66: 3951—3959.
- ↑ Janssen, P.H., Yates, P.S., Grinton, B.E., Taylor, P.M., and Sait, M (2002). Improved culturability of soil bacteria and isolation in pure culture of novel members of the divisions Acidobacteria, Actinobacteria, Proteobacteria, and Verrucomicrobia. Appl Environ Microbiol. 68: 2391—2396.