ARHGAP45

ARHGAP45
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3D25, 3FT3
Ідентифікатори
Символи	ARHGAP45, HA-1, HLA-HA1, HMHA1, histocompatibility (minor) HA-1, Rho GTPase activating protein 45
Зовнішні ІД	OMIM: 601155 MGI: 1917969 HomoloGene: 69120 GeneCards: ARHGAP45
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0005097, GO:0005099, GO:0005100 GTPase activator activity Клітинна компонента • гіалоплазма • extracellular region • secretory granule lumen • azurophil granule lumen • цитоплазма • клітинна мембрана • мембрана • ruffle membrane • cell projection Біологічний процес • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of small GTPase mediated signal transduction • GO:0072468 сигнальна трансдукція • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23526	70719
Ensembl	ENSG00000180448	ENSMUSG00000035697
UniProt	Q92619	Q3TBD2
RefSeq (мРНК)	NM_001258328 NM_001282334 NM_001282335 NM_012292 NM_001321232	NM_001142701 NM_027521 NM_001347074
RefSeq (білок)	NP_001245257 NP_001269263 NP_001269264 NP_001308161 NP_036424	NP_001136173 NP_001334003 NP_081797
Локус (UCSC)	Хр. 19: 1.07 – 1.09 Mb	Хр. 10: 79.85 – 79.87 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARHGAP45 (англ. Rho GTPase activating protein 45) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 136 амінокислот, а молекулярна маса — 124 614.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFSRKKRELM		KTPSISKKNR		AGSPSPQPSG		ELPRKDGADA		VFPGPSLEPP
AGSSGVKATG		TLKRPTSLSR		HASAAGFPLS		GAASWTLGRS		HRSPLTAASP
GELPTEGAGP		DVVEDISHLL		ADVARFAEGL		EKLKECVLRD		DLLEARRPRA
HECLGEALRV		MHQIISKYPL		LNTVETLTAA		GTLIAKVKAF		HYESNNDLEK
QEFEKALETI		AVAFSSTVSE		FLMGEVDSST		LLAVPPGDSS		QSMESLYGPG
SEGTPPSLED		CDAGCLPAEE		VDVLLQRCEG		GVDAALLYAK		NMAKYMKDLI
SYLEKRTTLE		MEFAKGLQKI		AHNCRQSVMQ		EPHMPLLSIY		SLALEQDLEF
GHSMVQAVGT		LQTQTFMQPL		TLRRLEHEKR		RKEIKEAWHR		AQRKLQEAES
NLRKAKQGYV		QRCEDHDKAR		FLVAKAEEEQ		AGSAPGAGST		ATKTLDKRRR
LEEEAKNKAE		EAMATYRTCV		ADAKTQKQEL		EDTKVTALRQ		IQEVIRQSDQ
TIKSATISYY		QMMHMQTAPL		PVHFQMLCES		SKLYDPGQQY		ASHVRQLQRD
QEPDVHYDFE		PHVSANAWSP		VMRARKSSFN		VSDVARPEAA		GSPPEEGGCT
EGTPAKDHRA		GRGHQVHKSW		PLSISDSDSG		LDPGPGAGDF		KKFERTSSSG
TMSSTEELVD		PDGGAGASAF		EQADLNGMTP		ELPVAVPSGP		FRHEGLSKAA
RTHRLRKLRT		PAKCRECNSY		VYFQGAECEE		CCLACHKKCL		ETLAIQCGHK
KLQGRLQLFG		QDFSHAARSA		PDGVPFIVKK		CVCEIERRAL		RTKGIYRVNG
VKTRVEKLCQ		AFENGKELVE		LSQASPHDIS		NVLKLYLRQL		PEPLISFRLY
HELVGLAKDS		LKAEAEAKAA		SRGRQDGSES		EAVAVALAGR		LRELLRDLPP
ENRASLQYLL		RHLRRIVEVE		QDNKMTPGNL		GIVFGPTLLR		PRPTEATVSL
SSLVDYPHQA		RVIETLIVHY		GLVFEEEPEE		TPGGQDESSN		QRAEVVVQVP
YLEAGEAVVY		PLQEAAADGC		RESRVVSNDS		DSDLEEASEL		LSSSEASALG
HLSFLEQQQS		EASLEVASGS		HSGSEEQLEA		TAREDGDGDE		DGPAQQLSGF
NTNQSNNVLQ		APLPPMRLRG		GRMTLGSCRE		RQPEFV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів гтфаз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних відростках.

Література

• Kaminski W.E., Piehler A., Schmitz G. (2000). Genomic organization of the human cholesterol-responsive ABC transporter ABCA7: tandem linkage with the minor histocompatibility antigen HA-1 gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 278: 782—789. PMID 11095984 DOI:10.1006/bbrc.2000.3880
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Graziano C., Giorgi M., Malentacchi C., Mattiuz P.L., Porfirio B. (2005). Sequence diversity within the HA-1 gene as detected by melting temperature assay without oligonucleotide probes. BMC Med. Genet. 6: 36—36. PMID 16202172 DOI:10.1186/1471-2350-6-36
• van Lochem E., van der Keur M., Mommaas A.M., de Gast G.C., Goulmy E. (1996). Functional expression of minor histocompatibility antigens on human peripheral blood dendritic cells and epidermal Langerhans cells. Transpl. Immunol. 4: 151—157. PMID 8843592 DOI:10.1016/S0966-3274(96)80009-8
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 19