TET3

TET3
Ідентифікатори
Символи	TET3, hCG_40738, tet methylcytosine dioxygenase 3, BEFAHRS
Зовнішні ІД	OMIM: 613555 MGI: 2446229 HomoloGene: 35360 GeneCards: TET3
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • dioxygenase activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • oxidoreductase activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • methylcytosine dioxygenase activity • iron ion binding Клітинна компонента • цитоплазма • клітинне ядро • хромосома • female pronucleus • male pronucleus Біологічний процес • histone H3-K4 trimethylation • protein O-linked glycosylation • multicellular organism development • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • DNA demethylation of male pronucleus • DNA demethylation • 5-methylcytosine catabolic process • oxidative demethylation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	200424	194388
Ensembl	ENSG00000187605	ENSMUSG00000034832
UniProt	O43151	Q8BG87
RefSeq (мРНК)	NM_001287491 NM_001366022	NM_183138 NM_001347313
RefSeq (білок)	NP_001274420 NP_001352951	NP_001334242 NP_898961
Локус (UCSC)	Хр. 2: 73.98 – 74.11 Mb	Хр. 6: 83.34 – 83.44 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TET3 (англ. Tet methylcytosine dioxygenase 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 660 амінокислот, а молекулярна маса — 179 350.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDSGPVYHGD		SRQLSASGVP		VNGAREPAGP		SLLGTGGPWR		VDQKPDWEAA
PGPAHTARLE		DAHDLVAFSA		VAEAVSSYGA		LSTRLYETFN		REMSREAGNN
SRGPRPGPEG		CSAGSEDLDT		LQTALALARH		GMKPPNCNCD		GPECPDYLEW
LEGKIKSVVM		EGGEERPRLP		GPLPPGEAGL		PAPSTRPLLS		SEVPQISPQE
GLPLSQSALS		IAKEKNISLQ		TAIAIEALTQ		LSSALPQPSH		STPQASCPLP
EALSPPAPFR		SPQSYLRAPS		WPVVPPEEHS		SFAPDSSAFP		PATPRTEFPE
AWGTDTPPAT		PRSSWPMPRP		SPDPMAELEQ		LLGSASDYIQ		SVFKRPEALP
TKPKVKVEAP		SSSPAPAPSP		VLQREAPTPS		SEPDTHQKAQ		TALQQHLHHK
RSLFLEQVHD		TSFPAPSEPS		APGWWPPPSS		PVPRLPDRPP		KEKKKKLPTP
AGGPVGTEKA		APGIKPSVRK		PIQIKKSRPR		EAQPLFPPVR		QIVLEGLRSP
ASQEVQAHPP		APLPASQGSA		VPLPPEPSLA		LFAPSPSRDS		LLPPTQEMRS
PSPMTALQPG		STGPLPPADD		KLEELIRQFE		AEFGDSFGLP		GPPSVPIQDP
ENQQTCLPAP		ESPFATRSPK		QIKIESSGAV		TVLSTTCFHS		EEGGQEATPT
KAENPLTPTL		SGFLESPLKY		LDTPTKSLLD		TPAKRAQAEF		PTCDCVEQIV
EKDEGPYYTH		LGSGPTVASI		RELMEERYGE		KGKAIRIEKV		IYTGKEGKSS
RGCPIAKWVI		RRHTLEEKLL		CLVRHRAGHH		CQNAVIVILI		LAWEGIPRSL
GDTLYQELTD		TLRKYGNPTS		RRCGLNDDRT		CACQGKDPNT		CGASFSFGCS
WSMYFNGCKY		ARSKTPRKFR		LAGDNPKEEE		VLRKSFQDLA		TEVAPLYKRL
APQAYQNQVT		NEEIAIDCRL		GLKEGRPFAG		VTACMDFCAH		AHKDQHNLYN
GCTVVCTLTK		EDNRCVGKIP		EDEQLHVLPL		YKMANTDEFG		SEENQNAKVG
SGAIQVLTAF		PREVRRLPEP		AKSCRQRQLE		ARKAAAEKKK		IQKEKLSTPE
KIKQEALELA		GITSDPGLSL		KGGLSQQGLK		PSLKVEPQNH		FSSFKYSGNA
VVESYSVLGN		CRPSDPYSMN		SVYSYHSYYA		QPSLTSVNGF		HSKYALPSFS
YYGFPSSNPV		FPSQFLGPGA		WGHSGSSGSF		EKKPDLHALH		NSLSPAYGGA
EFAELPSQAV		PTDAHHPTPH		HQQPAYPGPK		EYLLPKAPLL		HSVSRDPSPF
AQSSNCYNRS		IKQEPVDPLT		QAEPVPRDAG		KMGKTPLSEV		SQNGGPSHLW
GQYSGGPSMS		PKRTNGVGGS		WGVFSSGESP		AIVPDKLSSF		GASCLAPSHF
TDGQWGLFPG		EGQQAASHSG		GRLRGKPWSP		CKFGNSTSAL		AGPSLTEKPW
ALGAGDFNSA		LKGSPGFQDK		LWNPMKGEEG		RIPAAGASQL		DRAWQSFGLP
LGSSEKLFGA		LKSEEKLWDP		FSLEEGPAEE		PPSKGAVKEE		KGGGGAEEEE
EELWSDSEHN		FLDENIGGVA		VAPAHGSILI		ECARRELHAT		TPLKKPNRCH
PTRISLVFYQ		HKNLNQPNHG		LALWEAKMKQ		LAERARARQE		EAARLGLGQQ
EAKLYGKKRK		WGGTVVAEPQ		QKEKKGVVPT		RQALAVPTDS		AVTVSSYAYT
KVTGPYSRWI

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до оксидоредуктаз, регуляторів хроматину, білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном заліза, ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Chen Q., Chen Y., Bian C., Fujiki R., Yu X. (2013). TET2 promotes histone O-GlcNAcylation during gene transcription. Nature. 493: 561—564. PMID 23222540 DOI:10.1038/nature11742

Див. також

• Хромосома 2